JP2012517588A - 質量分析方法 - Google Patents
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Abstract
Description
サンプル上の複数の知られている位置において対象サンプルをイオン化するステップと、
質量分析計を使用して、前記複数の知られている位置の各々においてイオン化サンプルの質量スペクトルを生成するステップと、
サンプル全体の全体スペクトルを作成するステップと、
全体スペクトル内のいくつかのピークを選択するステップと、
前記選択されたピークのうち少なくともいくつかの走査分布を作成するステップと、
サンプル内の異なるアナライトの間の相関を特定するために走査分布を比較するステップと、を含む。
サンプル上の複数の知られている位置において対象サンプルをイオン化するステップと、
質量分析計を使用して、前記複数の知られている位置の各々においてイオン化サンプルの質量スペクトルを生成するステップと、
サンプル全体の全体スペクトルを作成するステップと、
全体スペクトル内のいくつかのピークを選択するステップと、
前記選択されたピークのうち少なくともいくつかの走査分布を作成するステップと、
サンプル内の異なるアナライトの間の相関を特定するために走査分布を比較するステップと、を含む。
統計学的手法を実証するために、冷凍マウス子宮組織切片の分析から得られたMALDIイメージングデータが使用された。この方式を試験するために、MALDI MSイメージングおよびMALDI IMS−MSイメージングの両方からのデータが使用された。イオン移動度の使用は、非常に複雑なサンプルデータセットにもう1つの分離の次元を提供する。データ解釈ワークフローは、各m/z値の走査分布の抽出から始まる。各m/z値について、走査分布は、その空間座標を考慮することなく、その画素分割された画像を示す。平滑化、バックグラウンド除去、雑音除去、および/または正規化を含んでもよい処理の後、データセットは、クラスタリングまたは主成分分析(PCA)などの異なる多変量統計的アルゴリズムを使用して、照会可能である。PCAは、予備知識なしに、組織全体にわたって類似の分布を呈するm/z値を迅速に分類することができる。この手法は、たとえば、外因性分子と内因性分子との区別、ならびに画像内の構造的特徴の識別を容易にする。
本発明の範囲を逸脱することなく、上述の特定の実施形態に対して様々な変形例が作成されてもよいことは、明らかとなる。
Claims (16)
- 基質のイメージングから生成されるデータの分析方法であって、
サンプル上の複数の所定位置において対象サンプルをイオン化するステップと、
質量分析器を使用して、前記複数の所定位置の各々においてイオン化サンプルの質量スペクトルを生成するステップと、
サンプル全体の全体スペクトルを作成するステップと、
全体スペクトル内のいくつかのピークを選択するステップと、
前記選択されたピークのうち少なくともいくつかの走査分布を作成するステップと、
サンプル内の異なるアナライトの間の相関を特定するために走査分布を比較するステップと、を含む方法。 - イオン化サンプルが前記所定位置から生成されるように、各所定位置が1組の座標によって特定可能である、請求項1に記載の方法。
- 前記質量分析器が飛行時間型質量分析器である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記サンプルのイオン化がMALDIを使用して実行される、請求項1から3のいずれかに記載の方法。
- 各所定位置において生成されたイオンのIMSデータを作成するステップをさらに含む、請求項1から4のいずれかに記載の方法。
- 各所定位置において生成されたイオンのMSMSデータを作成するステップをさらに含む、請求項1から5のいずれかに記載の方法。
- ピークの強度のX%の減算によってスペクトル雑音のわずかな変動を排除するステップをさらに含む、請求項1から6のいずれかに記載の方法。
- Xが15%までの値である、請求項7に記載の方法。
- Xが1から10%の範囲内である、請求項8に記載の方法。
- Xが3から7%の範囲内である、請求項9に記載の方法。
- 前記走査分布が、相互に対するピークをスケーリングするために正規化される、請求項1から10のいずれかに記載の方法。
- バックグラウンド除去を実行するために、前記全体質量スペクトルデータをフィルタリングするステップをさらに含む、請求項1から11のいずれかに記載の方法。
- 基質が組織サンプルである、請求項1から12のいずれかに記載の方法。
- 前記組織情報内の薬物および薬物代謝産物に関する情報または生成物の分析のための、請求項13に記載の方法。
- 前記走査分布の比較が主成分分析の実行するステップを含む、請求項1から14のいずれかに記載の方法。
- 実質的に上記に記載されたような基質のイメージングから生成されたデータの分析方法。
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