JP2012505657A5 - - Google Patents
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Claims (15)
- （ａ）１５ヌクレオチド〜１９ヌクレオチドからなり、標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である第１のＲＮＡ配列；
（ｂ）前記第１の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である配列を含み、１０ヌクレオチドから１９ヌクレオチドの間の長さを有し、
ｉ．前記第１のＲＮＡ配列が前記第２のＲＮＡ配列に直接結合する、又は
ｉｉ．前記第１のＲＮＡ配列が前記第２のＲＮＡ配列にループ配列によって結合する、第２のＲＮＡ配列；および
（ｃ）任意に、１〜２ヌクレオチドからなるヌクレオチド突出、を含むＲＮＡ分子。 - （ａ）１０ヌクレオチド〜１６ヌクレオチドからなり、標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である第１のＲＮＡ配列；
前記第１の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である配列を含み、１０ヌクレオチドから１６ヌクレオチドの間の長さを有する第２のＲＮＡ配列；
前記第１の配列と前記第２の配列の間に配置され、７〜９ヌクレオチドからなるループ配列；および
任意に、１〜２ヌクレオチドからなるヌクレオチド突出、を含む；
（ｂ）１０ヌクレオチド〜１８ヌクレオチドからなり、標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である第１のＲＮＡ配列；
前記第１の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である配列を含み、１０ヌクレオチドから１７ヌクレオチドの間の長さを有する第２のＲＮＡ配列；
前記第１の配列と前記第２の配列の間に配置され、５〜６ヌクレオチドからなるループ配列；および
任意に、１〜２ヌクレオチドからなるヌクレオチド突出、を含む；又は、
（ｃ）１０ヌクレオチド〜１８ヌクレオチドからなり、標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である第１のＲＮＡ配列；
前記第１の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である配列を含み、１０ヌクレオチドから１８ヌクレオチドの間の長さを有する第２のＲＮＡ配列；
前記第１の配列と前記第２の配列の間に配置され、３〜４ヌクレオチドからなるループ配列；および
任意に、１〜２ヌクレオチドからなるヌクレオチド突出、を含む、ＲＮＡ分子。 - ｉ．前記第１のＲＮＡ配列が１９ヌクレオチドからなり、前記第２のＲＮＡ配列が１７〜１８ヌクレオチドからなる；又は
ｉｉ．前記第１のＲＮＡ配列が１９ヌクレオチドからなり、前記第２のＲＮＡ配列が１９ヌクレオチドからなり、第１のＲＮＡ配列と第２のＲＮＡ配列が直接又は１ヌクレオチドからナルループを介して結合する、請求項１に記載のＲＮＡ分子。 - ｉ．前記第１のＲＮＡ配列が１６ヌクレオチド〜１８ヌクレオチドからなり、前記第２のＲＮＡ配列が第１のＲＮＮＡ配列と同数のヌクレオチドを有する；又は
ｉｉ．前記第１のＲＮＡ配列が１６ヌクレオチド〜１９ヌクレオチドからなり、前記第２のＲＮＡ配列が第１のＲＮＡ配列より１少ない数のヌクレオチドを有する、請求項１又は２に記載のＲＮＡ分子。 - 前記ループが、前記標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である、請求項２に記載のＲＮＡ分子。
- ｉ．前記第２の配列が、第１の配列の少なくとも一部に少なくとも８５％相補的である配列を含む、
ｉｉ．前記第２の配列が、第１の配列の５’末端部分に少なくとも８５％相補的である配列を含む、又は
ｉｉｉ．前記第２の配列の３’末端の配列が、第１の配列の５’末端部分に少なくとも８５％相補的である、
請求項１から５のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。 - 前記ＲＮＡ分子が任意のループ配列を含み、当該ループ配列が任意に少なくとも１つの非ヌクレオチド分子を含む、請求項１から６のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- 前記ヌクレオチド突出が、ＲＮＡ分子の３’末端にある、請求項１から７のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- 前記ＲＮＡ分子が第１の配列と第２の配列の間に１個または２個のミスマッチを含む、請求項１から８のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- 前記第１の配列が第２の配列に対して５’である、請求項１から９のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- 前記分子が標的ヌクレオチド配列の発現を阻害することができる、請求項１から１０のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- 前記標的ヌクレオチド配列がウイルス配列である、請求項１から１１のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子。
- （ａ）１５ヌクレオチド〜１９ヌクレオチドからなり、標的ヌクレオチド配列に少なくとも部分的に相補的である第１のＲＮＡ配列；
（ｂ）前記第１の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である配列を含み、１０ヌクレオチドから１９ヌクレオチドの間の長さを有する第２のヌクレオチド；
（ｃ）（ｉ）第１の配列及び（ｉｉ）第２の配列の少なくとも一部に少なくとも部分的に相補的である第３のＲＮＡ配列；及び
（ｄ）任意に、１〜２ヌクレオチドからなるヌクレオチド突出、を含むＴ字型ＲＮＡ分子。 - 請求項１から１３のいずれか一項に記載のＲＮＡをコードする配列を含むＤＮＡ配列、又は前記ＤＮＡ配列を含むベクターであって、発現ベクター又はレトロウイルスベクターであるベクター。
- 請求項１から１３のいずれか一項に記載のＲＮＡ分子、あるいは請求項１４に記載のＤＮＡ配列又はベクター、および任意に薬学的に許容可能な賦形剤を含む、ヒト又は動物におけるウイルス疾患の治療に使用するための組成物。
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| ATE519774T1 (de) | 2002-02-20 | 2011-08-15 | Sirna Therapeutics Inc | Durch eine störung der rna vermittelte inhibierung der genexpression des hepatitis c virus (hcv) mit kurzer, störender nukleinsäure (short interfering nucleic acid, sina) |
| US20040053876A1 (en) * | 2002-03-26 | 2004-03-18 | The Regents Of The University Of Michigan | siRNAs and uses therof |
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| US20090004739A1 (en) * | 2003-09-22 | 2009-01-01 | Taku Demura | Efficient Method of Preparing Dna Inverted Repeat |
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| US20050164210A1 (en) * | 2004-01-23 | 2005-07-28 | Vivek Mittal | Regulated polymerase III expression systems and related methods |
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| WO2006015365A1 (en) * | 2004-07-30 | 2006-02-09 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Npc1l1 and npc1l1 inhibitors and methods of use thereof |
| US20090170794A1 (en) | 2004-09-10 | 2009-07-02 | Somagenics Inc. | Small interfering rnas that efficiently inhibit viral expression and methods of use thereof |
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