JP2012501631A - 輸血関連急性肺障害(trali)に関するスクリーニング方法 - Google Patents
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Abstract
【選択図】なし
Description
配列番号1 − ヒトHNA−3aタンパク質
HNA−3aおよびHNA−3bの同定
HNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体を生じるHNA−3aまたはHNA−3bの抗原性断片のエピトープマッピングは、当該技術分野で標準な方法、例えば部位特異的突然変異誘発、遺伝子工学処理、CTL2ペプチドライブラリーの解析、予測アルゴリズム、機能的分析、例えばELISpotまたは細胞内サイトカイン染色、および細胞結合検定を用いて同定され得る。ペプチドライブラリーの解析のための高処理量系、例えばREVEAL&ProVE(商標)系(Proimmune, Springfield. VA)が、市販されている。
本発明は、生物学的試料中のHNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体の検出方法を提供する。本発明は、HNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体を検出することとともに、HNA−1、HNA−2またはHLAに特異的な抗体のような他の抗体を検出することも意図する。抗体の検出方法としては、非特異的および特異的検定、例えば顆粒球免疫蛍光試験、顆粒球免疫蛍光フローサイトメトリー検定(GIFT−FC)、顆粒球抗原のモノクローナル抗体固定化(MAIGA)検定、一元放射免疫拡散検定(SRID)、酵素免疫検定および赤血球凝集抑制検定(HAI)が挙げられる。
生物学的試料中のHNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体を検出するための本明細書中に記載される技法のどの技法を用いても、特定の抗体がHNA−3aまたはHNA−3bと特異的に結合するか否かを識別し得る。これらの検定は、全長ポリペプチド、またはアミノ酸154を含むペプチドを用いて実行される。特に、これらの検定に用いられるペプチドは、HNA−3aおよびHNA−3bエピトープを識別する任意の二次または三次構造を保有し得る。
本発明は、生物学的試料中のHNA−3aまたはHNA−3bの検出方法を提供する。「HNA−3a」という用語は、配列番号1の全長配列または配列番号1のアミノ酸配列の少なくとも一断片を指す。「HNA−3b」という用語は、配列番号2の全長アミノ酸配列または配列番号2のアミノ酸配列の少なくとも一断片を指す。特異的抗体を生成する特定のエピトープを含むHNA−3aまたはHNA−3bの抗原性断片が注目される。例えば、細胞表面に曝露される配列番号1または2のアミノ酸配列の領域は、エピトープを含む可能性がより高い。
本発明は、配列番号3の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブを用いて生物学的試料中のHNA−3a核酸を検出する方法を提供する。本発明は、配列番号4の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブを用いて生物学的試料中のHNA−3b核酸を検出する方法を提供する。HNA−3aまたはHNA−3b特異的オリゴヌクレオチドプローブのハイブリダイゼーションは、ノーザンブロット分析、サザンブロット分析、スロット−ブロット分析またはin situハイブリダイゼーション分析、あるいは当該技術分野で慣例的な任意の他の方法、例えばSambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories (New York, 1989)に記載された技法を用いて検出され得る。
本発明は、本発明の方法のいずれかを実行するためのキットを提供する。本発明によるキットは、生物学的試料中のHNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体を検出するための構成成分を含む。本キットは、生物学的試料中のHNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体ならびに陽性対照に関する既知のHNA−3aまたはHNA−3b特異的抗体と複合体を形成する、単離または組換えHNA−3aまたはHNA−3bポリペプチドあるいはその抗原性断片を含み得る。本発明はさらに、HNA−3aまたはHNA−3bに特異的な抗体のほかに、HNA−1およびHNA−2に特異的な抗体を検出するためのキットであって、HNA−1検出のためのFc−γ受容体IIIbまたはその抗原性断片、およびHNA−2の検出のためのCD177またはその抗原性断片、ならびにHNA−1およびHNA−2に特異的である既知の抗体を含有するキットを提供する。本発明はさらに、HNA−3aまたはHNA−3bに特異的な抗体のほかに、HNA−4および/またはHNA−5に特異的な抗体を検出するためのキットであって、HNA−4検出のためのCD11b(CR3)またはその抗原性断片、およびHNA−5の検出のためのCD11a(LFA−1)またはその抗原性断片、ならびにHNA−4およびHNA−5に特異的である既知の抗体を含有するキットを提供する。さらに、本発明は、HNAに特異的な抗体のほかに、生物学的試料中のHLAに特異的な抗体を検出するためのキットであって、HLA抗原を含有するポリペプチドおよびHLAに特異的である既知の抗体を含有するキットを提供する。
顆粒球単離
選択されたドナー血を、1.25%EDTAおよび0.5%デキストランと混合した。沈澱後、上清をフィコール密度遠心分離のためにさらに用いた。得られたペレットを洗浄後、赤血球を溶血させた。残存する顆粒球を洗浄し、出発物質として種々の細胞濃度で用いた。
HNA−3a陽性および陰性血漿の獲得
選択ドナー血を、1.25%EDTAと混合し、次いで、細胞を遠心分離により分離した。上清を対応する血漿として用いた。
顆粒球表面タンパク質のビオチニル化
ウエスタンブロットによる分析のために、EZ−Link Sulfo−NHS−LC−LC−ビオチン(PIERCE:Rockford, IL)を用いて精製顆粒球をビオチニル化した。
血漿との顆粒球のインキュベーション
(ビオチニル化または非ビオチニル化された)顆粒球を、37℃で少なくとも30分間、HNA−3a陽性または陰性血漿とともにインキュベートした。バッチを洗浄後、全細胞のFACS分析が行なわれるか、トリトン−X100を含有する緩衝液による細胞溶解を実行した。細胞破片を遠心分離後、タンパク質を含有する上清を分析した。
蛍光活性化細胞選別(FACS分析)フローサイトメトリー
HNA−3a陽性および陰性ドナーの単離顆粒球を、(抗HNA−3a抗体を有するおよび有しない)血漿とともにインキュベートし、洗浄した。その後、細胞を、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)標識ウサギF(ab’)2−抗ヒトIgGとともにインキュベートした。洗浄後、細胞懸濁液をFACSで検査して、顆粒球の蛍光強度を確定した。高強度は、HNA−3a陽性結果を示した。
磁気ビーズによる免疫沈降
プロテインG被覆磁気ビーズを、抗ヒトIgG(Fc特異的)と結合させた。洗浄後、これらのビーズを、実施例4に記載したように、タンパク質を含有する上清とともにインキュベートした。ビーズを新たに洗浄し、消磁した後、タンパク質を、SDSを含有する試料緩衝液を用いて溶離する(SDS−PAGEおよびウエスタンブロットによる分析のため)か、あるいはトリプシンを含有する緩衝液中で直接消化した(フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析(FTICR−MS)による分析のため)。
SDS−PAGE/ウエスタンブロット
免疫沈降の溶出液(ビオチニル化バッチ)をSDS−PAGE(7.5%分離ゲル)により分離し、ニトロセルロース膜上にブロットした。ビオチニル化タンパク質と結合するために、膜を、遮断および洗浄ステップ後、ストレプトアビジンに結合されたアルカリ性ホスファターゼ(AP)とともにインキュベートした。1〜15分間、NBT(塩化ニトロブルーテトラゾリウム)/BCIP(5−ブロモ−4−クロロ−3’−インドリルホスフェートp−トルイジン塩)を付加することにより、検出を実行した。
フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴(FTICR−MS)
C18物質(ZipTip)を用いて、免疫沈降タンパク質(ビオチニル化バッチでない)のトリプシン消化を予備清浄化し、MSにより分析した。SEQUEST SorcererおよびScaffold2ソフトウェア(データバンク:uniprot−sprot−human_re154)を用いたデータバンク比較により、ペプチドスペクトルの評価を実行した。
HNA−3aおよびHNA−3bの異種発現
HNA−3aタンパク質(配列番号1)をコードするDNA配列を有するcDNAクローンを、大腸菌およびCHO細胞中で発現させた。この合成したタンパク質をSDS−PAGEゲル電気泳動で分離して(実施例7に記載)、ウエスタンブロットにおけるヒト抗HNA−3a抗体の結合により特異性を示した。タンパク質HNA−3b(配列番号2)の発現のためのDNA配列を用いてcDNAクローンに関して、類似の手順を実行した。
ペプチド断片の異種発現
pGEX−2TKベクター(GE Healthcare, Chalfont St Giles, UK)および制限酵素BamHIおよびHindII(Roche, Basel, Switzerland)を用いて、HNA−3aDNA断片をクローン化した。cDNAクローンNM_020428.2(OriGene, Rockville, MD)を鋳型DNAとして用いて、グルタチオンS−Tトランスフェラーゼ遺伝子領域(GST)融合物を生成した。配列番号1のアミノ酸22〜231(「HNA−3a(22〜231)」と表示される)および配列番号1のアミノ酸145〜167(「HNA−3a(145〜167)と表示される」)をコードするDNA断片をベクターJHC27中に挿入して、GST−HNA−3a融合ペプチドをコードした。配列番号1のアミノ酸114〜164(「HNA−3a(114〜164)」と表示される)をコードするDNA断片をpTB25ベクター中に挿入して、GST融合ペプチドGST−HNA−3a(114〜164)をコードした。
ヒト血漿からのHNA−3a抗体のアフィニティー精製
ヒト血漿からのHNA−3a抗体のアフィニティー精製のために、GST−HNA−3a(114〜164)を実施例10に記載したように産生し、濃縮し、カップリング緩衝液(0.2M NaHCO3、0.5M NaCl、pH8.3)に対して透析した。HiTrap NHS活性化HPカラム(GE Healthcare, Uppsala, Sweden)を、6mlの氷冷1mM HClで平衡させて;その後、1mlの濃縮GST−HNA−3a(114〜164)ペプチドをカラム上に注入した(3mg/ml)。25℃で30分間インキュベーション後、メーカーの使用説明書に従ってカラムを洗浄した。
HNA−3aの抗原性断片の同定
HNA−3aアミノ酸配列(配列番号1)のエピトープをマッピングするために、HNA−3aアミノ酸配列の細胞外断片を含む組換えペプチドを、実施例10に記載したようにGST融合ペプチドとして生成した。ウエスタンブロットにより確定した場合のこれらのペプチドとHNA−3a血清との反応性を、以下の表1に示す。
HNA−3aおよびHNA−3bに関する遺伝子型分類
HNA−3多形に関するPCRを、以下のように実行した。0.5pmol対立遺伝子特異的センスプライマー(5’−AGT GGC TGA GCT TCG 3’;配列番号49;HNA−3a)または(5’−GAG TGG CTG AGG TGC TTC A−3’;配列番号50;HNA−3b)、ならびに部分的イントロンアンチセンスプライマー(5’GTG CGC CAA TAT CCT CAC TTG−3’;配列番号51)を用いて、50〜100ngDNAのアリコートを増幅した。20μLの総容積中で、0.2mmolのデオキシリボヌクレオチドトリホスフェートおよび2.0単位のHot Start Taq DNAポリメラーゼ(GeneCraft, Germany)を用いて、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)をサーマルサイクラー(GeneAmp PCR System 2700, Applied Biosystems, Germany)で実施した。95℃で10分間加熱後、以下の条件下で、2段階PCRを実施した:変性(30秒、95℃)、アニーリング(40秒、64℃)、伸長(30秒、72℃)を20サイクル、ならびに最終伸長(5分、72℃)。内部陽性対照として、hGH遺伝子の439bp断片を増幅する0.0625pmolのヒト成長ホルモン(hGH)プライマーを用いた(5’−CAG TGC CTT CCC AAC CAT TCC CTT A−3’(配列番号52)、5’−ATC CAC TCA CGG ATT TCT GTT GTG TTT C−3’(配列番号53))。トリスホウ酸塩EDTA緩衝液(TBE−緩衝液;5 Prime, Germany)を用いて、1.5%アガロースゲルで、PCR産物(291bp)を分析した。
抗HNA−3抗体の製造方法
特定のHNA−3エピトープを含むペプチドで免疫感作することにより、HNA−3aまたはHNA−3bタンパク質に特異的な抗体を獲得し得る。抗体を生成するための適切な手法としては、Hudson and Hay, Practical Immunology, 2nd Edition, Blackwell Scientific Publications (1980)に記載された手法が挙げられる。HNA−3a特異的抗体を生成するために用いられ得る抗原性断片の例としては、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42が挙げられる。HNA−3b特異的抗体を生成するために用いられ得る抗原性断片の例としては、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26が挙げられる。
Claims (106)
- 移植片または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を誘発する(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3a抗原を発現する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)ヒト被験者に移植または輸血することを意図した前記組織の試料を獲得すること、
b)前記試料を、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、試料中のHNA−3a特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記ドナー組織がHNA−3a抗原を発現するヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記抗原性断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項1記載の方法。
- 移植または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を誘発する(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3b抗原を発現する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)前記ヒト被験者に移植または輸血することを意図した組織の試料を獲得すること、
b)前記試料を、配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、試料中のHNA−3b特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記ドナー組織がHNA−3b抗原を発現するヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記抗原性断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項3に記載の方法。
- 以下の:
d)前記試料を、Fc−γ受容体IIIbポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のHNA−1特異的抗体と複合体を形成させること、
e)前記試料を、CD177ポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のHNA−2特異的抗体と複合体を形成させること、
f)前記試料を、CD11bポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のHNA−4特異的抗体と複合体を形成させること、
g)前記試料を、CD11aポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のHNA−5特異的抗体と複合体を形成させること、
h)前記試料をHLA抗原と接触させて、前記試料中のHLA特異的抗体と複合体を形成させること、そして
i)前記試料がヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを前記複合体のいずれかの存在が示す前記複合体を検出すること
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。 - 移植または輸血組織を拒絶することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織はHNA−3aポリペプチドまたはその抗原性断片を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−3a特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記ヒト移植片または輸血レシピエントが移植または輸血組織を拒絶することに対して感受性である、ということを前記生物学的試料中の複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記抗原性断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項6に記載の方法。
- 移植または輸血組織を拒絶することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織はHNA−3bポリペプチドまたはその抗原性断片を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−3b特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記ヒト移植片または輸血レシピエントが移植または輸血組織を拒絶することに対して感受性である、ということを前記生物学的試料中の複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記抗原性断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項8に記載の方法。
- 以下の:
d)前記生物学的試料を、Fc−γ受容体IIIbポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−1特異的抗体と複合体を形成させること、
e)前記生物学的試料を、CD177ポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−2特異的抗体と複合体を形成させること、
f)前記生物学的試料を、CD11bポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−4特異的抗体と複合体を形成させること、
g)前記生物学的試料を、CD11aポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−5特異的抗体と複合体を形成させること、
h)前記生物学的試料をHLA抗原と接触させて、前記生物学的試料中のHLA特異的抗体と複合体を形成させること、そして
i)ヒトの移植片または輸血のレシピエントが移植または輸血組織の拒絶を発生することに対して感受性である、ということを前記生物学的試料中の複合体のいずれかの存在が示す前記複合体を検出すること(ここで、前記ドナー組織はHNA−1、HNA−2、HNA−3a、HNH−4、HNA−5およびHLAのいずれかを含有する)
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項6〜9のいずれか一項に記載の方法。 - 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織は抗HNA−3a抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号1のアミノ酸配列を含むHNA−3aポリペプチドまたはその断片と特異的に結合する抗体と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−3aと複合体を形成させること、そして
c)前記ヒトの移植片または輸血のレシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること
を包含する方法。 - 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織は抗HNA−3b抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号2のアミノ酸配列を含むHNA−3bポリペプチドまたはその断片と特異的に結合する抗体と接触させて、前記生物学的試料中のHNA−3bと複合体を形成させること、そして
c)前記ヒト移植片または輸血レシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること
を包含する方法。 - 以下の:
d)前記試料を、HNA−1と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のHNA−1と複合体を形成させること、
e)前記試料を、HNA−2と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のHNA−2と複合体を形成させること、
f)前記試料を、HNA−4と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のHNA−4と複合体を形成させること、
g)前記試料を、HNA−5と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のHNA−5と複合体を形成させること、
h)前記試料をHLA抗原と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のHLAと複合体を形成させること、そして
i)前記試料がヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを前記複合体のいずれかの存在が示す前記複合体を検出すること
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項11または12記載の方法。 - 前記抗体が、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項11〜13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記複合体が二次抗体を用いて検出される請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
- 前記二次抗体が、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項15に記載の方法。
- 移植または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3a特異的抗体を発現する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血のために意図された組織の試料を獲得すること、
b)前記試料から核酸を抽出すること、
c)前記核酸を、配列番号3の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
d)前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること(ここで、前記プローブのハイブリダイゼーションはHNA−3a核酸の存在を示し、前記試料中のHNA−3a核酸の存在は、HNA−3a特異的抗体を発現するヒトレシピエントにおいて前記試料が拒絶されやすい、ということを示す)
を包含する方法。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む請求項17に記載の方法。
- 移植または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3b特異的抗体を発現する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血のために意図された組織の試料を獲得すること、
b)前記試料から核酸を抽出すること、
c)前記核酸を、配列番号4の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
d)前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること(ここで、前記プローブのハイブリダイゼーションはHNA−3b核酸の存在を示し、前記試料中のHNA−3b核酸の存在は、HNA−3b特異的抗体を発現するヒトレシピエントにおいて前記試料が拒絶されやすい、ということを示す)
を包含する方法。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む請求項19に記載の方法。
- 以下の:
d)前記試料を、配列番号5の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
e)前記試料を、配列番号7の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
f)前記試料を、配列番号9の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
g)前記試料を、配列番号11の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、または
h)前記試料を、HLA抗原をコードするヌクレオチド配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
i)前記核酸との前記プローブのハイブリダイズを検出すること(ここで、前記プローブのいずれかのハイブリダイゼーションは、前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNH−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれかの存在を示し、そして前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNH−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれか1つの存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい、ということを示す)
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項17〜20のいずれか一項に記載の方法。 - 配列番号5の断片が、配列番号5のヌクレオチド141、ヌクレオチド147、ヌクレオチド226、ヌクレオチド227、ヌクレオチド277またはヌクレオチド349の少なくともいずれか1つを含む請求項21に記載の方法。
- 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織は抗HNA−3a特異的抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血の前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料から核酸を抽出すること、
c)前記核酸を、配列番号1のヌクレオチド配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
d)前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること(ここで、前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションは前記生物学的試料中のHNA−3a核酸の存在を示し、前記生物学的試料中のHNA−3aの存在は、ヒト輸血または移植片レシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを示す)、
とを包含する方法。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む請求項23に記載の方法。
- 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織はHNA−3b特異的抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血の前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料から核酸を抽出すること、
c)前記核酸を、配列番号2のヌクレオチド配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
d)前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること(ここで、前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションは前記生物学的試料中のHNA−3b核酸の存在を示し、前記生物学的試料中のHNA−3bの存在は、ヒトの輸血または移植片のレシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを示す)、
とを包含する方法。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を含む請求項25に記載の方法。
- 以下の:
d)前記試料を、配列番号5の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
e)前記試料を、配列番号7の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
f)前記試料を、配列番号9の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
g)前記試料を、配列番号11の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、または
h)前記試料を、HLA抗原をコードするヌクレオチド配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
i)前記核酸との前記プローブのハイブリダイズを検出すること(ここで、前記プローブのいずれかのハイブリダイゼーションは、前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNH−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれかの存在を示し、そして前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNH−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれか1つの存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを示す)
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項23〜26のいずれか一項に記載の方法。 - 配列番号5の断片が、配列番号5のヌクレオチド141、ヌクレオチド147、ヌクレオチド226、ヌクレオチド227、ヌクレオチド277またはヌクレオチド349の少なくともいずれか1つを含む請求項27に記載の方法。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブが、膜、フィルター、ビーズおよびチップからなる群から選択される支持体に固定される請求項17〜28記載の方法。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブがアレイ状の請求項17〜29記載の方法。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブが、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項17〜30のいずれか一項に記載の方法。
- 移植片または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3a特異的抗体を有する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)前記組織から試料を獲得すること、
b)前記試料から核酸を抽出すること、
c)HNA−3a核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から配列番号3のHNA−3a核酸の断片を増幅すること、そして
d)前記試料中のHNA−3a核酸の断片を検出すること(ここで、前記試料中のHNA−3a核酸の存在は、HNA−3a特異的抗体を有するヒトレシピエントにおいて前記試料が拒絶されやすい、ということを示す)、
とを包含する方法。 - HNA−3a核酸の前記断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードする請求項32に記載の方法。
- 移植または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい(ここで、前記ヒトレシピエントはHNA−3b特異的抗体を有する)か否かを判定する方法であって、以下の:
a)前記組織から試料を獲得すること、
b)前記試料から核酸を抽出すること、
c)HNA−3b核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から配列番号4のHNA−3b核酸の断片を増幅すること、そして
d)前記試料中のHNA−3b核酸の断片を検出すること(ここで、前記試料中のHNA−3b核酸の存在は、HNA−3b特異的抗体を有するヒトレシピエントにおいて前記試料が拒絶されやすい、ということを示す)、
とを包含する方法。 - HNA−3b核酸の前記断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードする請求項34に記載の方法。
- 以下の:
d)HNA−1核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−1核酸の断片(配列番号5)を増幅すること、
e)HNA−2核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−2核酸の断片(配列番号7)を増幅すること、
f)HNA−4核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−4核酸の断片(配列番号9)を増幅すること、
g)HNA−5核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−5核酸の断片(配列番号11)を増幅すること、または
h)HLA核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HLA核酸の断片を増幅すること、そして
i)前記試料中の任意のHNAまたはHLA核酸の前記断片を検出すること(ここで、前記試料中のHNAまたはHLA核酸の存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい、ということを示す)
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項32〜35のいずれか一項に記載の方法。 - 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒトの移植片または輸血のレシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織はHNA−3a特異的抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血の前に、前記ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料から核酸を抽出すること、
c)前記生物学的試料中のHNA−3a核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から前記HNA−3a核酸の断片(配列番号3)を増幅すること、そして
d)前記生物学的試料中のHNA−3a核酸の存在を検出すること(ここで、前記生物学的試料中のHNA−3aの存在は、前記ヒトの輸血または移植片のレシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを示す)、
とを包含する方法。 - HNA−3a核酸配列の前記断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードする請求項37に記載の方法。
- 輸血関連急性肺障害(TRALI)または移植片対宿主病(GVHD)を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性(ここで、前記ドナー組織は抗HNA−3b抗体を含有する)を判定する方法であって、以下の:
a)移植または輸血の前に、前記ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料から核酸を抽出すること、
c)HNA−3b核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から前記HNA−3b核酸の断片(配列番号4)を増幅すること、そして
d)前記生物学的試料中のHNA−3b核酸の存在を検出すること(ここで、前記生物学的試料中のHNA−3b核酸の存在は、ヒトの輸血または移植片のレシピエントがTRALIまたはGVHDを発症することに対して感受性である、ということを示す)、
とを包含する方法。 - HNA−3b核酸配列の前記断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードする請求項39に記載の方法。
- 以下の:
d)HNA−1核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−1核酸の断片(配列番号5)を増幅すること、
e)HNA−2核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−2核酸の断片(配列番号7)を増幅すること、
f)HNA−4核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−4核酸の断片(配列番号9)を増幅すること、
g)HNA−5核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HNA−5核酸の断片(配列番号11)を増幅すること、または
h)HLA核酸に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、HLA核酸の断片を増幅すること、そして
i)前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNA−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれか1つの前記断片を検出すること(ここで、前記試料中のHNA−1、HNA−2、HNA−3b、HNA−4、HNA−5またはHLA核酸のいずれか1つの存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいてTRALIまたはGVHDを誘発しやすい、ということを示す)
というステップのうちの1つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項37〜40のいずれか一項に記載の方法。 - 前記組織試料または生物学的試料が、血液、血液誘導体、血漿、血清、細胞および組織からなる群から選択される請求項1〜41のいずれか一項に記載の方法。
- 前記試料が細胞である請求項42に記載の方法。
- 前記細胞が好中球である請求項43に記載の方法。
- 以下の:
a)配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片、ならびに
b)Fc−γ受容体IIIbポリペプチド(HNA−1)、CD177ポリペプチド(HNA−2)、CD11bポリペプチド(HNA−4)、CD11aポリペプチド(HNA−5)およびHLA抗原からなる群から選択される1つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片
を包含するキット。 - HNA−3aに特異的な抗体をさらに包含する請求項45に記載のキット。
- HNA−1、HNA−2、HNA−4、HNA−5およびHLAからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する1つもしくは複数の抗体をさらに包含する請求項45または46に記載のキット。
- 前記HNA−3aポリペプチド断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項45〜47のいずれか一項に記載のキット。
- 配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項45〜48のいずれか一項に記載のキット。
- 以下の:
a)HNA−3aに特異的な抗体、ならびに
b)HNA−1、HNA−2、HNA−4、HNA−5またはHLAからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する1つもしくは複数の抗体
を包含するキット。 - 配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項50記載のキット。
- Fc−γ受容体IIIbポリペプチド、CD177ポリペプチド、CD11bポリペプチド、CD11aポリペプチドおよびHLA抗原からなる群から選択される1つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項50または請求項51のいずれか一項に記載のキット。
- HNA−3bに特異的なポリペプチドまたは抗体をさらに包含する請求項50〜52のいずれか一項に記載のキット。
- 以下の:
a)配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片、ならびに
b)Fc−γ受容体IIIbポリペプチド、CD177ポリペプチド、CD11bポリペプチド、CD11aポリペプチドおよびHLA抗原からなる群から選択される1つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片
を包含するキット。 - HNA−3bに特異的な抗体をさらに包含する請求項54に記載のキット。
- HNA−1、HNA−2、HNA−4、HNA−5およびHLAからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する1つもしくは複数の抗体をさらに包含する請求項54または請求項55に記載のキット。
- 前記HNA−3bポリペプチド断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項54〜56のいずれか一項に記載のキット。
- 以下の:
a)HNA−3bに特異的な抗体、ならびに
b)HNA−1、HNA−2、HNA−4、HNA−5およびHLAからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する1つもしくは複数の抗体
を包含するキット。 - 配列番号2のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項58に記載のキット。
- Fc−γ受容体IIIbポリペプチド、CD177ポリペプチド、CD11bポリペプチド、CD11aポリペプチドおよびHLA抗原からなる群から選択される1つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項58または59のいずれか一項に記載のキット。
- 配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項58〜60のいずれか一項に記載のキット。
- 二次抗体をさらに包含する請求項58〜61のいずれか一項に記載のキット。
- 前記二次抗体が、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項62に記載のキット。
- 前記抗体が、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項50〜63のいずれか一項に記載のキット。
- 以下の:
a)配列番号3の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブ、ならびに
b)配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11およびHLAヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片とハイブリダイズする1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプローブ
を包含するキット。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列の断片を含む請求項65に記載のキット。
- 配列番号4の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブをさらに含む請求項65または請求項66に記載のキット。
- 以下の:
a)配列番号4の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブ、ならびに
b)配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11およびHLAヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片とハイブリダイズする1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプローブ
を包含するキット。 - 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列の断片を含む請求項68に記載のキット。
- 配列番号2の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブをさらに包含する請求項68または請求項69に記載のキット。
- 前記オリゴヌクレオチドプローブが、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項65〜70のいずれか一項に記載のキット。
- ゲルローディング用の緩衝液をさらに包含する請求項71に記載のキット。
- 以下の:
a)配列番号3のHNA−3a核酸の断片を増幅するための1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー、ならびに
b)配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11およびHLAヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片を増幅するための1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー
を包含するキット。 - 配列番号4のHNA−3b核酸の断片を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに包含する請求項73に記載のキット。
- 以下の:
a)配列番号4のHNA−3b核酸の断片を増幅するための1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー、ならびに
b)配列番号5、配列番号7、配列番号9、配列番号11およびHLAヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片を増幅するための1つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー
を包含するキット。 - 配列番号2のHNA−3a核酸の断片を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに包含する請求項75に記載のキット。
- PCR増幅のための緩衝液、dNTPおよびゲルローディングのための緩衝液をさらに包含する請求項75または76に記載のキット。
- 配列番号2のアミノ酸配列を含む単離ポリペプチド。
- 断片が少なくとも7アミノ酸長、少なくとも10アミノ酸長、少なくとも20アミノ酸長または少なくとも50アミノ酸長である請求項78に記載の前記ポリペプチドの断片を含む単離ポリペプチド。
- 前記断片が配列番号2のアミノ酸残基154を含む請求項79に記載の単離ポリペプチド。
- 前記断片が配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26のアミノ酸配列を含み、HNA−3b特異的同種異系抗体と反応する請求項80に記載の単離ポリペプチド。
- 配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列を含み、HNA−3a特異的同種異系抗体と反応する単離ポリペプチド。
- 請求項78〜82のいずれか一項に記載のポリペプチド配列をコードするヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチド。
- HNA−3a特異的同種異系抗体の同定のための請求項82に記載のポリペプチドまたはその断片の使用。
- HNA−3b特異的同種異系抗体の同定のための請求項78〜81のいずれか一項に記載のポリペプチドまたはその断片の使用。
- HNA−3a遺伝子型の確定のための、HNA−3a特異的同種異系抗体と反応するタンパク質をコードする配列番号3のポリヌクレオチドまたはその断片の使用。
- HNA−3b遺伝子型の確定のための請求項87記載のポリヌクレオチドまたはその断片の使用。
- 前記断片がコドン154を含む請求項87に記載の使用。
- 前記HNA−3a抗原に対する抗体の同定のための血液試料または血漿の分析における、HNA−3a特異的同種異系抗体と反応する配列番号1のアミノ酸を含むタンパク質またはその断片、あるいは請求項82に記載のタンパク質断片の使用。
- 前記HNA−3b抗原に対する抗体の同定のための血液試料または血漿の分析における請求項78〜81のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。
- 血液試料または血漿から抗体を分離するためにタンパク質またはタンパク質断片を用いるプロセスにおける、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその断片、あるいは請求項82に記載のポリペプチドの使用。
- 血液試料または血漿から抗体を分離するためにタンパク質またはタンパク質断片を用いるプロセスにおける請求項78〜83のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。
- 抗体、好ましくはモノクローナル抗体を産生するためにタンパク質またはタンパク質断片を用いるプロセスにおける、配列番号1のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその断片、あるいは請求項82に記載のポリペプチドの使用。
- 抗体、好ましくはモノクローナル抗体を産生するためにタンパク質またはタンパク質断片を用いるプロセスにおける請求項78〜81のいずれか一項に記載のポリペプチドの使用。
- ヒト被験者におけるHNA−3b遺伝子型に関するスクリーニング方法であって、以下の:
a)前記ヒト被験者から生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料から核酸を抽出すること、そして
c)前記生物学的試料中の配列番号4の核酸配列の断片を検出すること(ここで、前記断片は配列番号4のコドン154を含み、前記配列番号4のコドン154の検出は、前記ヒト被験者がHNA−3b遺伝子型を有するということを示す)、
とを包含する方法。 - 前記検出ステップが、前記核酸を、配列番号4の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させることを包含する請求項95に記載の方法。
- 前記検出ステップが、配列番号4の断片に特異的な少なくとも1つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて前記抽出核酸から配列番号4の断片を増幅することを包含する請求項95に記載の方法。
- 前記生物学的試料が、血液、血液誘導体、血漿、血清、細胞および組織からなる群から選択される請求項95〜97のいずれか一項に記載の方法。
- 生物学的試料中のHNA−3a特異的抗体の検出方法であって、以下の:
a)生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号1のHNA−3aポリペプチドまたはその断片を発現するよう形質転換されたかまたはトランスフェクトされた細胞と接触させて、前記試料中のHNA−3a抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記生物学的試料がHNA−3a特異的抗体を含有する、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記細胞がB細胞である請求項99に記載の方法。
- 前記抗原性断片が、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号25、配列番号27、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41および配列番号42からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項99または請求項100に記載の方法。
- 生物学的試料中のHNA−3b特異的抗体の検出方法であって、以下の:
a)生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号2のHNA−3bポリペプチドまたはその断片を発現するよう形質転換されたかまたはトランスフェクトされた細胞と接触させて、前記試料中のHNA−3b抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記生物学的試料がHNA−3b特異的抗体を含有する、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 前記細胞がB細胞である請求項98に記載の方法。
- 前記抗原性断片が、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24および配列番号26からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む請求項102または請求項103に記載の方法。
- 生物学的試料中のHNA−3a特異的抗体の検出方法であって、以下の:
a)生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号1のHNA−3aポリペプチドの抗原性断片を模倣するアプタマーと接触させて、前記試料中のHNA−3a特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記生物学的試料がHNA−3a特異的抗体を含有する、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。 - 生物学的試料中のHNA−3b特異的抗体の検出方法であって、以下の:
a)生物学的試料を獲得すること、
b)前記生物学的試料を、配列番号2のHNA−3bポリペプチドの抗原性断片を模倣するアプタマーと接触させて、前記試料中のHNA−3b特異的抗体と複合体を形成させること、そして
c)前記生物学的試料がHNA−3b特異的抗体を含有する、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること
を包含する方法。
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