JP2011528804A - 結腸直腸癌の検出及び治療のための組成物 - Google Patents

結腸直腸癌の検出及び治療のための組成物 Download PDF

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Abstract

本発明は、第1の環境状態では細胞により発現するが、第2の環境状態では発現しないタンパク質及びポリペプチド、並びにそれらの同起源のポリヌクレオチドを同定する方法を提供する。本発明はまた、癌(例えば、結腸直腸癌)の治療及び検出のための組成物を提供する。
【選択図】 図1

Description

本発明は、第1の環境状態では細胞により発現するが、第2の環境状態では発現しないタンパク質及びポリペプチド、並びにそれらの同起源のポリヌクレオチドを同定する方法、並びに、癌(例えば、結腸直腸癌)の治療及び検出のための組成物に関する。
優先権
本出願は、米国出願第61/081,926号(2008年7月18日出願)に基づく優先権を主張する。この仮出願は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
政府の権利
本発明は、NIH/NCI/SBIRのグラントNo.1R43CA124006−01A1によって部分的に助成されている。米国政府は、本発明に対して一定の権利を有する。
ある状態又は状況から別の状態又は状況へと細胞が変化を受ける時に作られるタンパク質、ポリペプチド及びその他の細胞成分の同定は、かかる分子が、変化が存在する又は変化が生じていることを示すものとして機能する可能性が大変高いことから、重要であり得る。第1の状態が健康状態であり、第2の状態が疾患状態である場合、かかる「変化が介在する」タンパク質、ポリペプチド又はその他の細胞成分の同定は、新しい診断法の開発のための優れたターゲットを提供するはずであり、同様に、疾患の治療に役立つ様々なタイプの抗生物治療薬(例えば、ワクチン)のためのターゲットを提供し得る。
特定の場合に、変化が介在する分子は、疾患組織から放出され、比較的容易に回収される体液中に侵入し得る。体液中の疾患(例えば、癌)組織から放出された細胞成分の同定は、このように放出されるタンパク質が、活動性疾患の理想的診断ターゲットとして機能する候補である可能性が大変高いことから、重要であり得る。例えば、結腸直腸癌細胞等の癌細胞中で異なって発現されるポリペプチド、及び癌細胞において特異的に発現されるポリペプチド、及び体液中へ癌細胞から放出されるポリペプチドは、抗癌化合物のスクリーニングのため、治療組成物の開発のため、及びその他の用途のため、癌の厳密かつ正確な診断を提供するために使用し得る。
本発明の一実施形態は、対象における癌又は癌の発症に対する素因を検出する方法を提供する。この方法は、対象からの生物学的サンプル中において、タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1;又は、その任意の組み合わせ(「本発明にかかるポリペプチド」)、からなる群より選択される癌関連ポリヌクレオチド、タンパク質、又はポリペプチドの発現レベルを測定する工程を含む。対照サンプルと比較して、生物学的サンプル、例えば、体液中の癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルの増大は、対象が、癌を有する又は癌の発症に対する素因を有することを示す。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。癌は結腸直腸癌であり得る。この方法は、1以上又は2以上の癌関連タンパク質又はポリペプチドの発現レベルを測定する工程をさらに含み得る。癌関連タンパク質又はポリペプチドの発現レベルは、(a)タンパク質又はポリペプチドの存在を検出する工程、(b)癌関連ポリヌクレオチドによってコードされるタンパク質又はポリペプチドの生物学的活性を検出する工程、及び(c)癌関連ポリヌクレオチドのmRNAを検出する工程、からなる群より選択される方法によって測定し得る。生物学的サンプルは、細胞、細胞抽出物、組織、体液、及び実質的に細胞を含まない体液(例えば、約1、5、又は10%未満の細胞)、例えば、血清、尿、涙、乳汁、精液、前立腺液、肺洗浄液、及び唾液を含み得る。癌関連タンパク質又はポリペプチドのレベルは、変化が介在するタンパク質又はポリペプチドに特異的なタンパク質又はポリペプチドのエピトープと結合する抗体を用いて、生物学的サンプル中のそのレベルを測定することにより、又は、当技術分野において公知のその他の手段によって検出し得る。
本発明の別の実施形態は、本発明にかかるタンパク質又はポリペプチド、或いは、その任意の組み合わせと特異的に結合する単離された抗体又はその抗原結合断片を提供する。本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。抗体は、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、一本鎖抗体、単一特異性一本鎖抗体、二重特異性一本鎖抗体、二価一本鎖抗体、四価一本鎖抗体、キメラ抗体、抗体の抗原結合断片、又はヒト化抗体であり得る。
本発明のさらに別の実施形態は、抗癌化合物のためのスクリーニング方法を提供する。この方法は、試験化合物の存在下、第1の生物学的サンプル中の、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物のレベルを、試験化合物の非存在下、第2の生物学的サンプル中の、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物のレベルと比較する工程を含む。変化が介在する発現産物は、本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド、又は本発明にかかるポリペプチドをコードするmRNA、又はその任意の組み合わせを含む。第2の生物学的サンプルの場合と比較した時に、第1の生物学的サンプル中の発現産物のレベルを低下させる試験化合物が、抗癌剤として同定される。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
さらに本発明の別の実施形態は、癌を治療又は予防するための化合物のスクリーニング方法を提供する。この方法は、(a)候補化合物を、本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド、又はその任意の組み合わせを発現する細胞と接触させる工程、及び、(b)このタンパク質又はポリペプチドの発現レベルを低下させる化合物を選択する工程、を含む。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
本発明の別の実施形態は、哺乳類における癌の検出のためのキットを提供する。このキットは、(a)本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドのエピトープと特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片、及び(b)抗体とタンパク質又はポリペプチドとの間の結合反応を検出するための1以上の試薬を含む。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列又はその任意の組み合わせを含み得る。
本発明のさらに別の実施形態は、本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに特異的である少なくとも1つのポリヌクレオチドプライマー又はプローブを含む、生物学的サンプル中の癌細胞を検出するためのキットを提供する。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列又はその任意の組み合わせを含み得る。キットは、本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに特異的な少なくとも2つのポリヌクレオチドプライマーを含み得る。
さらに本発明の別の実施形態は、少なくとも2つの本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド又はその任意の組み合わせを含む融合タンパク質を提供する。少なくとも2つのタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列からなる群より選択され得る。
本発明のさらに別の実施形態は、生理学的に許容される担体及び免疫刺激剤からなる群より選択される第1の成分と、本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド、又はその任意の組み合わせ;本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、又はその任意の組み合わせ;本発明にかかる抗体又はその任意の組み合わせ;並びに、本発明にかかる融合タンパク質又はその任意の組み合わせ、からなる群より選択される第2の成分とを含む組成物を提供する。このタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列又はその任意の組み合わせを含み得る。
本発明の別の実施形態は、配列番号1〜157として示される本発明にかかる2以上のタンパク質又はポリペプチドのタンパク質又はポリペプチド発現パターンを含む、結腸直腸癌参照発現プロファイルを提供する。
本発明の別の実施形態は、本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド、又はその任意の組み合わせをコードする2以上のポリヌクレオチドのポリヌクレオチド発現パターンを含む、結腸直腸癌参照発現プロファイルを提供する。本発明にかかるポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
さらに本発明の別の実施形態は、本発明にかかる1つのタンパク質又はポリペプチド、又は本発明にかかる2以上のポリペプチド、又はその任意の組み合わせ、をコードする2以上のポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズする2以上のポリヌクレオチドを含むアレイを提供する。本発明にかかるポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
本発明のさらに別の実施形態は、癌を治療するための組成物を提供する。この組成物は、本発明にかかるタンパク質若しくはポリペプチド、又はその任意の組み合わせと特異的に結合する、薬学的有効量の抗体又はその抗原結合断片を含む。本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
本発明のさらに別の実施形態は、癌を治療するための組成物を提供する。この組成物は、薬学的有効量の本発明にかかるポリペプチド又は本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。本発明にかかるポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。
本発明の別の実施形態は、対象における癌を治療するための、或いは、対象における免疫反応、例えば、抗腫瘍免疫反応、又は、任意のその他のタイプの免疫反応を刺激するための方法を提供する。この方法は、(a)薬学的有効量の本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドを対象に投与する工程;(b)本発明にかかるポリペプチドをコードする薬学的有効量のポリヌクレオチド又はその断片を対象に投与する工程;又は、(c)本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドと特異的に結合する薬学的有効量の抗体又はその抗原結合断片を対象に投与する工程を含む。本発明にかかるタンパク質又はポリペプチドは、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含み得る。癌は結腸直腸癌であり得る。
本発明のさらに別の実施形態は、第1の環境状態では第1の宿主によって発現されるが、第2の環境状態では発現されない、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド及びその同起源の遺伝子又はポリヌクレオチドを単離する方法を提供する。この方法は、以下の工程:
(a)第1の環境状態の第1の宿主から細胞、組織又は液状サンプルを取得する工程、及び、任意で、サンプル中の潜在的に対象となる(すなわち、変化が介在する)タンパク質、ポリペプチド、及びその他の成分を保存するための条件で(例えば、凍結させて)、それを保存する工程;
(b)動物、任意で、第1の宿主とは系統学的に遠い動物を、任意で、強力なアジュバントを用いて、強力な、広範な抗体反応を誘発させ、免疫化した動物を得るために、(a)からのサンプルを用いて、免疫化する工程;
(c)免疫化した動物から抗体を回収する工程、及び、任意で、抗体を精製する工程;
(d)抗体を、第2の環境状態の第2の宿主からの(任意で、(a)で使用されたものと同じ種又は同じ個体の)組織、ホモジナイズされた組織、細胞、細胞抽出物又は液状サンプルに吸着させる工程;
(e)非吸着抗体を単離する工程;及び
(f)第1の環境状態の第1の宿主の細胞、組織又は液状サンプル中には存在するが、第2の環境状態の宿主の細胞、組織又は液状サンプル中には存在しない、タンパク質、ポリペプチド又はその他の構成成分(例えば、脂質、炭水化物、又は糖タンパク質)を単離するために、非吸着抗体を使用する工程;並びに、任意で、
(g)単離したタンパク質、ポリペプチド又はその他の成分を同定する工程、
を含む。
第1の環境状態は、疾患、癌、又は自己免疫疾患であり得る。第2の環境状態は、正常状態、健康状態、非疾患状態、又は第1の環境状態と異なる環境状態であり得る。細胞及び組織は、宿主の任意の部分に由来し得る。宿主が動物である場合、体液は、尿、涙、血漿、乳汁、洗浄液、前立腺液、精液、唾液、血清、痰、及び胸水であり得る。植物からの体液は、篩部又は木部から抽出し得る。体液は、細胞を実質的に欠如し得る。第1の宿主が動物である場合、免疫化した動物は、第1の宿主動物と同じ種、又は第1の宿主動物とは異なる種類の動物であり得る。本方法はさらに、第1の状態の宿主から採取した細胞又は組織のホモジネート又は抽出物から、対象となるタンパク質、ペプチド又はその他の成分を直接単離する工程を含み得る。或いは、タンパク質又はペプチドは、第1の環境状態の宿主から取得したDNA又はmRNAを用いて構築したライブラリー(このライブラリーは、発現ライブラリー又は表示ライブラリーである)から、非吸着抗体を用いて捕捉され得る。「ライブラリーの精査」は、
(a)固体支持体上に非吸着抗体を固定化する工程;
(b)第1の状態の第1の宿主の細胞若しくは組織ホモジネート若しくは液状物、又は、第1の状態の第1の宿主のDNA若しくはRNAから作製したゲノム発現ライブラリー若しくは表面表示ライブラリーの発現タンパク質を添加する工程;
(c)固体支持体から、非吸着タンパク質若しくはファージライブラリーからのメンバーを洗浄する工程;
(d)固体支持体に結合しているタンパク質及びポリペプチド又は表面表示ライブラリーのメンバーを回収する工程;及び
(e)特異的に捕捉されたタンパク質及びポリペプチド、又は、表面表示ライブラリーの精査の場合には、抗体によって捕捉された同起源のタンパク質若しくはポリペプチドの発現を担う遺伝子若しくはポリヌクレオチド、を同定する工程、を含み得る。
固体支持体は、ホモジネート、液状物、又はライブラリーを、非特異的結合を減少させるために添加する前に、ブロッキング剤を用いてブロッキングし得る。固体支持体は、ニトロセルロース、ナイロン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ラテックス、グラスファイバー、ガラス、ミクロスフェア、リポソーム、セファロース、セファデックス、及び磁気粒子からなる群より選択され得る。抗体は、ヒト、ヒヒ、チンパンジー、マカク、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、ラット、マウス、ニワトリ、アヒル、及び魚類からなる群より選択される免疫化した動物に由来し得る。細胞、組織、及び体液サンプルは、第1の環境状態の宿主から取得した直後に凍結し得る。第2の環境状態の第2の宿主からの細胞、組織、及び体液サンプルは、必要な分子の分解を最小限にして、変化を介在しない成分を吸着させ、除去するために、取得直後に凍結し得る。捕捉されたタンパク質、ポリペプチド又はその他の成分(例えば、脂質、炭水化物、又は糖タンパク質)の同定は、分離法を伴う質量分析法(例えば、GeLC−MS/MS)等の当技術分野において公知の従来法を用いて実施し得る。
疾患又は変化が介在する状態に応じて宿主によって発現される単離タンパク質/ポリペプチドの特定的に発現された特性を確認及び検証する方法もまた提供される。その方法は、
(a)天然又は組み換えタンパク質又はポリペプチドを精製する工程;
(b)このポリペプチドに対して非交差反応性の(例えば、モノクローナル)抗体を産生させる工程;
(c)(b)の抗体を用いて、第1及び第2の環境状態の宿主の細胞、細胞抽出物、体液、又は組織を精査する工程;及び
(d)第1の環境状態にあり、第2の環境状態にはない、サンプルを用いて、抗体の相対的反応性を示す工程、を含み得る。
これにより、同定されるタンパク質又はポリペプチド及びその同起源のポリヌクレオチドは、第1の環境状態にあり、第2の環境状態にはない宿主から得られる細胞、細胞抽出物、体液、又は組織と、抗体が特異的に結合する場合には、第1の環境状態で発現され、第2の環境状態では発現されない、変化が介在する分子として確認される。
図1は、ドットイムノブロットアッセイによる、ステージIVヒト結腸直腸癌組織のホモジネートを用いてニワトリに産生させたポリクローナル卵抗体(YPAbs)と、ステージIV結腸直腸癌を有する患者のプール血清との反応性の評価を示す。スポットされたステージIV結腸癌患者からのプール血清の異なる反応性を、年齢、性別及び民族性を合わせた健康な患者からの対照血清(スポット4)、BSA(スポット3)、及び、健常組織のホモジネート(スポット1)のスポットと比較した。ステージIV癌組織のホモジネートは、陽性対照であった(スポット2)。
発明の詳細な説明
本明細書中及び添付される特許請求の範囲において使用される場合、単数形「a」、「an」及び「the」は、明らかに示されていない限り、複数形への言及も含む。
癌細胞において示差的に調節されるタンパク質の同定
プロテオミクスに基づく変化が介在する抗原技術(PCMAT)は、細胞が変化(例えば、正常・健康な細胞から疾患状態の細胞への変化)を受けるか、又は、環境状態の変化(例えば、湿気のある状態から湿気の無い状態への植物細胞の変化)に曝露された場合に特異的に発現されるタンパク質及びポリペプチド及びそれらの同起源の遺伝子又はポリヌクレオチドを同定する方法である。PCMATは、細胞が疾患状態又は癌になった場合にアップレギュレートされる又は特異的に発現されるタンパク質及びポリペプチド及びそれらの同起源の遺伝子又はポリヌクレオチドを同定するために使用し得る。
「特異的に発現される」とは、タンパク質又はポリペプチドが、第2の環境状態と比較した場合に、第1の環境状態において、より多く又はより少なく発現されることを意味する。例えば、タンパク質又はポリペプチドが、第1の環境状態では発現されるが、第2の環境状態では発現されない場合もある。或いは、タンパク質又はポリペプチドが、第2の環境状態と比較した場合に、第1の環境状態において、より多くの割合、例えば、10%、20%、50%、100%、200%、又はそれ以上多く発現される場合もある。
第1の環境状態としては、限定するものではないが、疾患状態(例えば、ウイルス性疾患、細菌性疾患、真菌性疾患、プリオンによって引き起こされる疾患、原虫によって引き起こされる疾患、寄生虫性疾患、癌、自己免疫疾患(例えば、関節炎、慢性炎症性腸疾患、又は糖尿病)、発熱、風邪、毒性化学物質への曝露、薬物への曝露、化学療法薬又は化学療法治療計画への曝露、ストレスへの曝露、有害金属への曝露、放射線への曝露、毒物への曝露、抗生物質への曝露、微生物を死滅させる又はその増殖を遅延させることが意図される化学物質(例えば、殺菌剤、抗ウイルス剤、及び、静菌剤又は静ウイルス剤、低酸素状態、高酸素状態、低pH状態、高pH状態)への曝露、鉄への曝露、低栄養素レベルへの曝露が挙げられる。
第2の環境状態は、例えば、正常状態、健康状態、非疾患状態、及び/又は、第1の環境状態が存在しない状態であり得る。本発明の一実施形態において、第1の環境状態は、疾患の1つのステージ又はフェーズ(例えば、初期、中期、後期、慢性期、治療後、治療前、特定の時間量の治療後、回復期)であり得るし、第2の環境状態は、疾患の第2の異なるステージ(例えば、初期、中期、後期、慢性期、治療後、治療前、特定の時間量の治療後、回復期)であり得る。
本発明の一実施形態は、第1の環境状態(例えば、疾患状態)では発現されるが、第2の環境状態(例えば、健康又は非疾患状態)では発現されない、タンパク質、ポリペプチド又は細胞のその他の成分(例えば、脂質、炭水化物、又は糖タンパク質)を同定するための方法を提供する。一般的に、この方法は、第1の状態(例えば、疾患状態)にある宿主から第1のサンプルを取得し、この宿主サンプルを第2の動物に免疫化する工程を含む。免疫化した動物から抗体を回収し、第2の環境状態(例えば、健康状態)の第2の宿主から回収した宿主サンプルに抗体を吸着させる。第2の宿主は、第2の環境状態の同じ個別の第1の宿主(例えば、第1の宿主からの健康な組織若しくは細胞)、又は、第1の宿主と同じ若しくは異なる種の異なる宿主であり得る。非吸着抗体は回収され、疾患組織若しくは第1の宿主の液状物から直接的に、又は宿主のDNA若しくはRNA若しくは類似するDNA若しくはRNAの発現ライブラリー若しくは表示ライブラリーから、異なって発現されるタンパク質、ポリペプチド又はその他の成分を回収するために、非吸着抗体は使用され得る。
第1の環境状態に曝露される宿主は、任意のタイプの生物、例えば、ヒト、ヒヒ、チンパンジー、マカク、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、ラット、又はマウス等の哺乳類であり得る。動物はまた、例えば、ニワトリ、アヒル、昆虫、又は魚類であり得る。宿主はまた、植物界又は微生物界の仲間であり得る。
宿主が動物界に由来する場合、第1の環境状態の宿主から回収されるサンプルは、例えば、細胞、細胞抽出物、組織、体液、実質的に細胞を含まない体液(例えば、約1、5、又は10%未満の細胞)、血清、尿、涙、乳汁、精液、前立腺液、肺洗浄液、唾液、粘膜細胞、腫瘍細胞、癌細胞、生検サンプル、洗浄サンプル、痰、血漿、血液、糞便サンプル、リンパ節サンプル、骨髄、結腸組織、直腸組織、又は胸水サンプルであり得る。宿主が植物である場合、サンプルは、例えば、細胞、組織、細胞抽出物、師部からの液状物、木部(xylum)からの液状物であり得る。宿主が、微生物、細菌、ウイルス又はプリオンである場合、サンプルは、細胞若しくは細胞抽出物、又は、その微生物に感染若しくはコロニー化された宿主の細胞若しくは細胞抽出物であり得る。
第1の環境状態の動物宿主からのサンプルは、免疫化のために、回収して、直ぐプロセシングされ得るし、又は、サンプルを採取した時点における、宿主動物サンプル中に存在した潜在的エピトープを可能な限り全てを保存するために、後からプロセシングするため、迅速に凍結される。異なる時間間隔において、又は異なるサンプリング場所から、又は同じ第1の環境状態若しくは類似の環境状態に曝露された異なる動物から、回収された個別のサンプル又はプールされたサンプルを用いて、抗体反応を得るために動物を免疫化し得る。
免疫化した動物から、抗体を回収する。免疫化される動物は、液性免疫反応を備え得る任意のタイプの動物、例えば、ヒト、ヒヒ、チンパンジー、マカク、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、ラット、又はマウス等の哺乳類であり得る。動物はまた、例えば、ニワトリ、アヒル、昆虫、又は魚類であり得る。一実施形態において、免疫化される動物は、第1の宿主動物と同じ種である。別の実施形態において、免疫化される動物は、第1の宿主動物とは異なる種である。別の実施形態において、免疫化される動物は、第1の宿主動物とは異なる種であり、この免疫化される動物が、第1の宿主動物とは遠く関係する(例えば、第1の宿主動物がヒトであり、免疫化される動物がニワトリである)。
体液を免疫原として使用する場合、液状サンプルは、第1の環境状態の場所に由来する必要は無い。すなわち、体液は、疾患組織又は癌病巣の直接の部位から回収する必要は無いが、その代わり、例えば、疾患組織又は癌病巣から離れた場所から採取した血清であり得る。
抗体産生のための抗原サンプルを用いた動物の免疫化は、当技術分野において周知である。例えば、Antibody Techniques,Malik&Lillehoj,eds.,Academic Press(1994);Antibodies:A Laboratory Manual,Harlow&Lane,eds.,Cold Spring Harbor Laboratories(1988)を参照されたい。サンプルは、動物への投与前にホモジナイズし得る。投与は、例えば、筋肉内、腹腔内、皮下、皮内、静脈内、若しくは経鼻/吸入、又はその組み合わせにより得る。
動物へのサンプルの投与は、アジュバントと組み合わせ得る。或いは、アジュバントは、別個に動物に投与し得る。アジュバントは、抗原に対する免疫反応を増大し得る。アジュバントは、例えば、完全フロインドアジュバント(CFA)、不完全フロインドアジュバント(IFA)、モンタニドISA(不完全セピックアジュバント)、リビアジュバントシステム(RAS)、TiterMax(登録商標)、シンンテックスアジュバント処方物(SAF)、アルミニウム塩アジュバント、ニトロセルロース吸着抗原、カプセル化又は捕捉抗原、免疫刺激複合体(ISCOMs)、例えば、Quil A又はQS−21、及びGerbu(登録商標)アジュバントであり得る。当業者は、特定のサンプルのための適当なアジュバントを選択し得る。
第1の環境状態からの宿主サンプルの追加免疫投与を、免疫化の2週間後、1ヶ月後、2ヶ月後、又は3ヶ月後にその動物に行い得る。
免疫反応が動物に生じた後、抗体サンプルを、免疫化した動物から回収する。サンプルは、例えば、免疫化した動物の血清を含み得る。動物の血清は、第1の環境状態(例えば、疾患状態)で宿主動物によって発現される抗原に特異的な抗体等の抗体を含み得る。個々の免疫化した動物から回収した抗体を使用し得るし、又は、2以上の動物からプールした抗体も使用し得る。例えば、約2、5、25、100、500、又は1,000体の動物から回収した抗体を使用し得る。
第2の環境状態、例えば、健康又は非疾患状態で産生される抗原に対する抗体は、抗体のサンプルから差し引かれる。結果的に得られるのは「非吸着抗体」サンプルである。免疫化した動物から抗体を回収し、抗体を、サンプルが第2の環境状態(例えば、健康、正常又は第1の環境状態とは異なる状態)から得られること以外は、抗体を産生させるために使用されるものに相当する、動物宿主サンプルに吸着させる。動物宿主サンプル(すなわち、第2の環境状態の宿主動物から回収した宿主サンプル)は、例えば、細胞、細胞抽出物、組織、体液、実質的に細胞を含まない体液(例えば、約1、5、又は10%未満の細胞)、血清、尿、涙、乳汁、精液、前立腺液、肺洗浄液、唾液、粘膜細胞、腫瘍細胞、癌細胞、生検サンプル、洗浄サンプル、痰、血漿、血液、糞便サンプル、リンパ節サンプル、骨髄、結腸組織、直腸組織、胸水サンプル、微生物又は植物の細胞、組織、又は細胞抽出物であり得る。吸着は、第2の環境状態(例えば、疾患の無い状態)の宿主によって作られるタンパク質及びその他の細胞成分と反応性を示す抗体を除去する。第1の環境状態の動物宿主によって発現される抗原と反応性を示す非吸着抗体は、回収され、第1の環境状態の宿主によって特異的に発現されるタンパク質、ポリペプチド及びその他の成分を捕捉するために使用される。タンパク質及びポリペプチドの供給源は、第1の環境状態の動物からの組織又は体液の抽出物であり得る。或いは、宿主のDNA又はRNAの発現又は表示ライブラリーは、タンパク質の供給源として使用し得る。吸着抗体によって特異的に捕捉されるタンパク質が、溶出、濃縮され、当業者に公知のプロテオミクス方法(例えば、GeLC−MS/MS)によって同定される。表面表示ライブラリーが使用される場合、表示されたタンパク質をコードするクローニングされた遺伝子断片を配列決定し、この断片から発現されるタンパク質が推定される。
吸着工程は、例えば、抗体サンプルを、ニトロセルロース膜又はラテックスビーズ等の固体支持体上に固定化された第2の環境状態からの宿主サンプルに接触させることにより、実施し得る。Brady&Daphtary,J.Infect.Dis.158:965−972(1988)を参照されたい。任意で、第2の環境状態からの宿主サンプルは、さらなる免疫反応性エピトープに曝露するために使用する前に、(例えば、加熱することにより)変性させ得る。2つ以上の連続する吸着工程は、同じ又は異なる吸着方法を用いて実施し得る。
対応する抗原が第2の環境状態の宿主に由来する、抗体サンプル中の全て又は実質的に全ての抗体は、これらの抗原と結合して免疫複合体を形成し得る。しかしながら、第1の環境状態で特異的に発現される抗原に対して向けられた抗体は、それらの対応する抗原は第2の環境状態の宿主サンプル中には存在しないことから、複合体を形成しないままであり得る。複合体を形成しない抗体は、非吸着抗体サンプルを含む。
ポリペプチドは、本発明にかかるポリヌクレオチドから発現させ得る。次に、ポリペプチドは、本発明にかかるポリペプチド中に存在する免疫学的エピトープと特異的に結合する抗体を作製するために使用され得る。本発明にかかる抗体は、本発明にかかるポリペプチド又はその断片と特異的に結合する抗体分子である。本発明にかかる抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、一本鎖抗体(scFv)、又は抗体の抗原結合断片であり得る。
第1の環境状態で誘導される抗原は、例えば、疾患部位から採取される生物学的サンプルを直接精査することにより、又は、当技術分野において公知の任意の方法によって体液サンプルから、第1の環境状態に反応する動物宿主によって実際に発現されるものとして、直接検証され得る。例えば、変化が介在するタンパク質に対して作製されるモノクローナル抗体を、産生し、試験サンプル中に存在する又は存在し得ることが知られるその他のタンパク質又はポリペプチドに対するそれらの特異性及び交差反応性について試験し得る。変化が介在するタンパク質又はポリペプチド上のエピトープに対して適当な特異性を示すモノクローナル抗体は、様々な方法により標識することができ、第1及び第2の両方の環境状態の宿主からの組織又は体液等の適当な生物学的サンプルとのそれらの反応性について試験し得る。標識抗体は、状態1(すなわち、疾患状態)の宿主からの生物学的サンプルと反応し得るが、状態2(すなわち、健康又は非疾患状態)の宿主からの生物学的サンプルとは反応し得ない。これらの結果は、宿主が、第1の環境状態で、対象となる抗原を特異的に発現し、かつ、そのように同定された変化が介在するタンパク質又はポリペプチドが、疾患状態の診断、予防、及び治療において使用される可能性を有するという直接的証拠を提供する。
疾患の経過を通じて定期的な間隔で採取したサンプルは、一過性に発現され得るタンパク質及びその他の潜在的に重要な細胞成分の存在を保証し得る。採取されるサンプルが多ければ多いほど、特異的に発現される成分の全体のアレイが取得される可能性が良好なものとなる。疾患の異なる時間ステージ又は第1の状態で得られるサンプルは、免疫化のために組み合わせ得る。或いは、特定のタンパク質又はその他の細胞成分が発現される、疾患時におけるおよその時間を測定するために、別々に免疫化するためにそれらを使用し得る。
例えば、疾患の様々なステージにおいて第1の環境状態で発現される動物宿主のタンパク質及びポリペプチドを比較することは、第1の環境状態の1以上の動物宿主サンプルを含む第1のサンプルを用いて動物を免疫化することを含み得、この場合、1以上の宿主サンプルのそれぞれは、疾患の進行又は治療フェーズのほぼ同じステージにある(例えば、初期、中期、後期、慢性期、治療後、治療前、特定の時間量の治療後、回復期)。第1の状態のステージ又は治療フェーズは、例えば、医療専門家によって確認され得る。免疫化した動物から抗体を回収し、第2の環境状態(例えば、健康又は正常状態)の宿主サンプルに吸着させる。非吸着抗体は回収され、回復を伴い又は回復を伴わず、及び、治療を伴い又は治療を伴わず、疾患の時間的経過全体を通じて発現される、変化が介在するタンパク質及びポリペプチドを同定するために、上記のように使用される。
動物は、第1の環境状態の1以上の動物宿主サンプルを含む第2のサンプルを用いて免疫化され、この場合、1以上の宿主サンプルのそれぞれは、疾患の進行のほぼ同じステージ又はほぼ同じ治療フェーズにあり、このステージ又はフェーズは、上記したステージ又はフェーズとは異なる。免疫化した動物から抗体を回収し、第2の環境状態の宿主サンプルに吸着させる。非吸着抗体は回収され、疾患の特定のステージに特異的に発現されるか、又は、回復若しくは治療に応じて特異的に発現される、変化が介在するタンパク質及びポリペプチドを同定するために、上記のように使用される。
PCMAT技術の結腸直腸癌への適用
PCMAT及びPCMATの変法が、健常な結腸直腸細胞が癌性の結腸直腸細胞になる時に発現されるポリヌクレオチドを同定するために、本発明において使用された。腺癌組織は、Asterand XpressBank(Detroit,MI)から得られた。サンプルを回収し、回収時において存在するインタクトな任意の潜在的抗原を保存するために迅速に凍結した。疾患組織の同定及びステージングは、臨床的及び組織病理学的検査によって実施された。組織サンプルの完全性は、RNAプロファイルによって確認された。約200の利用可能な組織サンプルの潜在的リストから、4サンプルが、以下の条件に基づいて選択された:腺癌が主要診断であった;ステージ1、2、3及び4は、AJCC/UICC分類スキームに基づいて表された;サンプルを回収して、迅速に凍結した後の期間、最小限の組織分解が起こっていることを、RNAプロファイルは示した;疾患組織は大腸から取得した;一組の(同種の)、健常組織(臨床的及び組織病理学的検査によって確認されている)が利用可能であった;及び、サンプルは、男性及び女性の両方に相当した。
4つの各癌組織サンプル(ステージ1、2、3及び4)は、独立して処理され、次に、PCMATに供され、これにより、健常腸組織において発現されるタンパク質と比較して、腺癌サンプルにおいて特異的に発現される、タンパク質及びポリペプチドが同定された。
簡潔に述べるならば、腺癌サンプルをPBS中でホモジナイズし、各癌ステージからのサンプルを、適当な動物を免疫化するために独立して使用した。ヒトとは系統学的に遠いニワトリが、免疫反応の強さ及び広さを最適化するためのこのステップにおいて選択された。強力なアジュバント(完全フロインドアジュバント)もまた、この目的のために使用された。結腸直腸癌ステージ特異的ポリクローナル免疫グロブリン(PAbs)を、免疫化した動物の卵黄から取得した。結腸腺癌組織に固有のタンパク質抗原に対して向けられた免疫ウロブリンを選択的に富化するため、と同時に、健常組織及び癌組織の両方を含む細胞によって発現されるタンパク質抗原に対して向けられた免疫グロブリンを枯渇させるために、疾患組織に関して、健常な同系腸組織のホモジネートを調製した。健常腸組織によって発現されるタンパク質と反応性を示す抗体は、健常組織からのタンパク質を共有結合させたUltraBindアフィニティーメンブレンを用いて吸着させることにより、免疫グロブリンから枯渇させられた。吸着された免疫グロブリンと一組の健常な組織ホモジネートとの間において、ELISA又はウェスタンブロットで反応性が本質的に見られなくなるまで、この手順は繰り返された。健常組織から構成的に発現されるタンパク質抗原と反応性を示す抗体の枯渇した免疫グロブリンを、cDNAライブラリー中の不純物質と反応性を示す又は交差反応性を示す任意の抗体を除去するために、インデューサー(1mM IPTG)を用いて増殖させた大腸菌宿主株/pET30の全細胞又は溶解物とのさらなる吸着工程に供した。
変化が介在するタンパク質は、2つの異なる供給源を用いた吸着工程後に残存している非吸着抗体を用いて捕捉した。第1の供給源は、動物を免疫化するために使用した疾患組織(ステージ1、2、3、及び4)のホモジネートであった。第2の供給源は、規格化されたcDNAライブラリー、NCI_CGAP_Co14であり、これは、I.M.A.G.E.コンソーシアムから取得した。このライブラリーは、伝えられるところによれば、中程度に分化した結腸腺癌から単離されたmRNAの逆転写により作製されたcDNAを用いて、シャトルベクターpCMV−SPORT6中にクローニングすることにより構築された。
「荷電」磁気ビーズを作製するために、製造業者(Dynal Biotech)の説明書にしたがって、吸着免疫グロブリン調製物を、M−280トシル活性化Dynabeadsに共有結合的に結合させた。免疫捕捉のために、5mlの予め調製された疾患組織ホモジネート又は1mg/mlの濃度で組み換えタンパク質を含むcDNA発現ライブラリー画分を、傾斜回転させながら、2時間、4℃にて、0.5mlの荷電ビーズと一緒にインキュベートした。免疫捕捉後、荷電ビーズは、10倍ビーズ容量の洗浄バッファー(PBS−0.2%NOG)を用いて洗浄した。
特異的に結合しているタンパク質を、1M酢酸を用いて3回溶出させた。全ての洗浄及び溶出画分を、分析のために回収した。溶出後、特異的に結合しているタンパク質を、10倍容量の0.2M Na2PO4(pH7.4)の添加により直ぐに中和し、さらに使用するまで、0.02%アジ化ナトリウムの存在下、4℃にて保存する。陰性対照は、免疫前の免疫グロブリンを用いて帯電させられ、非特異的に結合しているタンパク質を捕捉するために上記のように処理された、同一体積のビーズから構成された。cDNAライブラリーからの可溶性溶解物を用いて処理した荷電カラムからの溶出物、及び腫瘍のホモジネートは、陰性対照には存在しないタンパク質の存在を明らかに示した。
吸着している免疫グロブリンによって電荷を有するカラムに特異的に結合しているタンパク質は、フロリダ大学バイオテクノロジー研究学際領域センター(ICBR)のGeLC−MS/MSによって同定された。上記荷電カラムから溶出された特異的に結合している組み換えタンパク質は、濃縮され、1D SDS−PAGE上で分画化され、タンデムMS/MSの前にゲル中でトリプシンにより切断した。1D−レーンの画分は、還元してアルキル化し、トリプシン(Promega)を用いて切断した。酵素的に切断したサンプルは、ギ酸勾配を用いて溶出させるC18 Pep Map HPLCカラムを用いて分離した。GeLC−MS/MS分析は、ハイブリッド四重極−TOF質量分析装置(QSTAR,Applied Biosystems,Framingham,MA)で行った。全てのMS/MSサンプルは、Mascotバージョン2.0.01(Matrix Science,London,UK)及びScaffold(バージョン−01−06−03,Proteome Software Inc.,Portland,OR)を用いて分析した。同定された変化が介在する抗原を、ヒトゲノム配列データベースに問い合わせを行うことにより、バイオインフォマティクスを介して分析した。
ステージI癌細胞においてアップレギュレートされるタンパク質及びそれらの同起源のポリヌクレオチドが同定された。同定されたポリペプチド及びタンパク質は、以下の通りである:タイチン(TTN横紋筋肉腫抗原MU−RMS40としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q8WZ42−2(配列番号1));HBA1(例えば、GenBank登録番号P69905(配列番号2));インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R)(例えば、GenBank登録番号P08069(配列番号3));ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q9Y493−1(配列番号4));潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4)(例えば、UniProt登録番号A6NCG8(配列番号5));ASXL1(付加的性コーム様1)(例えば、GenBank登録番号Q8IXJ9−1(配列番号6));βグロビン(HBB)(例えば、GenBank登録番号P68871(配列番号7));BMP15−骨形成タンパク質(例えば、GenBank登録番号NM_005448.1(UniProt登録番号O95972も参照されたい)(配列番号8));TRIM49(RNF18;三部分モチーフ含有49としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q9NS80(配列番号9));DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体(例えば、GenBank登録番号Q9UBS4(配列番号10));未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027(MDS027 hHBrk1 HSPC300としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q9NZ47(配列番号11));未同定タンパク質ALB(例えば、UniProt登録番号A6NBZ8(配列番号12));sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q8TER0−4(配列番号13));ペリフェリンのアイソフォーム2(例えば、GenBank登録番号P41219−2(配列番号14));ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22(例えば、GenBank登録番号P82650(配列番号15));翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε(例えば、GenBank登録番号Q13144(配列番号16));エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1(例えば、GenBank登録番号P14061(配列番号17));XRCC6BP1(例えば、GenBank登録番号Q8N4L5(配列番号18));脳特異的血管新生阻害物質1前駆体(例えば、GenBank登録番号O14514(配列番号19));リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2(例えば、GenBank登録番号Q9HBD1−2(配列番号20));ヘモグロビンサブユニットβ(例えば、GenBank登録番号P68871(配列番号21));遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q96AE4−1(配列番号22));ガレクチン−3(例えば、GenBank登録番号P17931(配列番号23));リゾチームC前駆体(例えば、GenBank登録番号P61626(配列番号24));アクチン,α骨格筋(例えば、GenBank登録番号P68133(配列番号25));ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2(例えば、GenBank登録番号P14618−1(配列番号26));AGR2(例えば、GenBank登録番号O95994(配列番号27));好中球デフェンシン1前駆体(例えば、GenBank登録番号P59665(配列番号28));ミエロブラスチン前駆体(例えば、GenBank登録番号P24158(配列番号29));未同定タンパク質PSME2(例えば、GenBank登録番号Q9UL46(配列番号30));チューブリンβ−2C鎖(例えば、UniProt登録番号P68371(配列番号31));チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ(例えば、GenBank登録番号Q16762(配列番号32));熱ショック70kDaタンパク質1(例えば、GenBank登録番号P08107(配列番号33));Igκ鎖V−III領域SIE(例えば、GenBank登録番号P01620(配列番号34));マクロファージ遊走阻止因子(例えば、GenBank登録番号P14174(配列番号35));ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性(例えば、GenBank登録番号O75947−1(配列番号36));未同定タンパク質ENSP00000374051(例えば、GenBank登録番号A6NGM3(配列番号37));イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性(例えば、UniProt登録番号O75874(配列番号38));ヘモグロビンサブユニットδ(例えば、GenBank登録番号P02042(配列番号39));スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q16629−1(配列番号40));mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号O60942−1(配列番号41));LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体(例えば、GenBank登録番号P36776(配列番号42));シグナル認識粒子54kDaタンパク質(例えば、GenBank登録番号P61011(配列番号43));ガレクチン−9のアイソフォームロング(例えば、GenBank登録番号O00182−1(配列番号44));インテグリン結合タンパク質キナーゼ(例えば、GenBank登録番号Q13418(配列番号45));二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素(例えば、GenBank登録番号P07814(配列番号46));ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号O43670−1(配列番号47));無機ピロホスファターゼ(例えば、GenBank登録番号Q15181(配列番号48));カルポニン−2(例えば、GenBank登録番号Q99439(配列番号49));マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q9NUK0−1(配列番号50));カテプシンG前駆体(例えば、GenBank登録番号P08311(配列番号51));ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34(例えば、GenBank登録番号Q8NCN2(配列番号52));アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(例えば、GenBank登録番号P07741(配列番号53));40Sリボソームタンパク質S9(例えば、GenBank登録番号P46781(配列番号54));タリン−1(例えば、GenBank登録番号Q9Y490(配列番号55));ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(例えば、GenBank登録番号Q96AG4(配列番号56));ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体(例えば、GenBank登録番号P25705(配列番号57));タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7(例えば、GenBank登録番号O94979−7(配列番号58));ジヒドロキシアセトンキナーゼ(例えば、GenBank登録番号Q3LXA3(配列番号59));異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体(例えば、ENSEMBL登録番号ENST0000342709(GenBank登録番号NM_004500.3及びUNIPARC登録番号IPI00868835)(配列番号60)も参照されたい);18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554(配列番号61));寒冷凝集素FS−1 L−鎖(例えば、GenBank登録番号A2NB45(配列番号62));異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1(例えば、UniProt登録番号Q14103−1(配列番号63));DAZAP1/MEF2D融合タンパク質(例えば、GenBank登録番号Q5IRN2(配列番号64))。
ステージIV癌細胞においてアップレギュレートされるタンパク質及びそれらの同起源のポリヌクレオチドも同定された。これらのポリヌクレオチドは、以下のポリペプチドをコードする:同定されたポリペプチド及びタンパク質は、以下の通りである:POTE2(ANKRD26様ファミリーC,メンバー1Aとしても知られる)(例えば、GenBank登録番号NP_001077007(配列番号65));ケラチン18(KRT18)(例えば、GenBank登録番号NP_000215(配列番号66));PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1(プロソームマクロペイン、アクチベーターサブユニット4としても知られる)(例えば、GenBank登録番号NP_055429(配列番号67));マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33)(例えば、GenBank登録番号NP_004626(配列番号68));補体成分1,sサブコンポーネント(C1S)(例えば、GenBank登録番号NP_001725(配列番号69));リゾチームC前駆体(LYZ)(例えば、GenBank登録番号NP_000230(配列番号70));ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20)(例えば、GenBank登録番号NP_061883(配列番号71));RNASE3(ECP RNS3,リボヌクレアーゼ,RNaseAファミリー3としても知られる)(例えば、GenBank登録番号NP_002926(配列番号72));アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1)(例えば、GenBank登録番号NP_000683(配列番号73));CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185(例えば、GenBank登録番号Q8N7I6(配列番号74));フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB(例えば、GenBank登録番号P23142−2(配列番号75));ヌクレオバインディン1(NUCB1)(例えば、GenBank登録番号NP_006175(配列番号76));ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA)(例えば、GenBank登録番号NP_001019770(配列番号77));三部分モチーフ含有28(TRIM28)(例えば、GenBank登録番号NP_005753(配列番号78));ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI)(例えば、GenBank登録番号NP_006108(配列番号79));ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB)(例えば、GenBank登録番号NP_000933(配列番号80));40Sリボソームタンパク質S17類似体(例えば、GenBank登録番号IP00743305(配列番号81));真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G)(例えば、GenBank登録番号IPI00747497(配列番号82));ケラチン8(KRT8)(例えば、GenBank登録番号NP_002264(配列番号83));フィビュリン2(FBLN2)(例えば、GenBank登録番号NP_001989(配列番号84));VIM(例えば、GenBank登録番号NP_003371(配列番号85));フィブリノーゲンα鎖(FGA)(例えば、GenBank登録番号NP_000499(配列番号86));アネキシンA2(ANXA2)(例えば、GenBank登録番号NP_001002858(配列番号87));H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ)(例えば、GenBank登録番号NP_808760(配列番号88));アクチンα,心筋1(ACTC1)(例えば、GenBank登録番号NP_005150(配列番号89));ケラチン19(KRT19)(例えば、GenBank登録番号NP_002267(配列番号90));免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質)(例えば、GenBank登録番号Q6PIQ7(配列番号91));免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM)(例えば、GenBank登録番号Q8WUK1(配列番号92));EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1)(例えば、GenBank登録番号Q12805−3(配列番号93));三部分モチーフ含有タンパク質34(例えば、GenBank登録番号NP_067629(配列番号94));AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号NP_542117(配列番号95));プロフィリン(Proflin)−1(例えば、GenBank登録番号NP_005013(配列番号96));ヒストンH4(例えば、GenBank登録番号NP_001029249(配列番号97));ヘモグロビンサブユニットα(例えば、GenBank登録番号NP_000549(配列番号98));トランスゲリン(TAGLNとしても知られる)(例えば、GenBank登録番号NP_001001522(配列番号99));ルミカン前駆体(例えば、GenBank登録番号NP_002336(配列番号100));ヘモグロビンβ(HBD CD113tとしても知られる)(例えば、GenBank登録番号NP_000509(配列番号101));フィブリノーゲンβ鎖前駆体(例えば、GenBank登録番号NP_005132(配列番号102));免疫グロブリンκ定常部位(IGKC)(例えば、GenBank登録番号Q6GMX8(配列番号103));未同定タンパク質ALB(アルブミンとしても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q56G89(配列番号104))。
別の実施例においては、疾患状態、すなわち、ステージIV結腸直腸癌時に体液中に放出されるタンパク質を同定するために、PCMATが使用された。実施例1を参照されたい。この研究は、ステージIVヒト結腸直腸癌組織の抗原性が増強された(adjuvanted)ホモジネートに対してニワトリで産生させたYPAbs(ポリクローナルIgY抗体)を使用した。ステージIV腫瘍組織から得られたYPAbsを、固体支持体に結合させた健康な対象からの血清に吸着させた。健康な血清中に存在する抗原と反応する抗体は残っていないことを、ウェスタンブロット及びドットブロットを用いて確認した後、残っている非吸着抗体を、上記のように荷電カラムを作製するために固体支持体の樹脂に結合させた。ステージIV結腸直腸癌の患者からの血清を、カラムに通し、非特異的に結合しているタンパク質及びペプチドを、洗浄することによって除去した。特異的に結合しているタンパク質は、酢酸を用いて除去し、それらは、上記のようにGeLC−MS/MSによって同定した。配列番号108〜157を同定するために、ステージII腫瘍組織が同様に使用され、それらは以下の通りである:アクチン,細胞質性1(アクチンβ)(例えば、GenBank登録番号NP_001092(配列番号108));ヘモグロビンβ(例えば、GenBank登録番号O95408(配列番号109));ヘモグロビンサブユニットα(例えば、GenBank登録番号P69905(配列番号110));POTE−2αアクチン(例えば、GenBank登録番号A5A3E0(配列番号111));SLC4A10(例えば、GenBank登録番号Q6U841(配列番号112));リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7)(例えば、GenBank登録番号O75817(配列番号113));核RNA排出因子1(NXF1)(例えば、GenBank登録番号Q59E96(配列番号114));コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA(例えば、GenBank登録番号Q05DB3(配列番号115));未同定タンパク質C13ORF27(例えば、GenBank登録番号Q5JUR7(配列番号116));sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q8TER0(配列番号117));ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10):(例えば、GenBank登録番号Q8IVF4(配列番号118));ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43)(例えば、GenBank登録番号P17302(配列番号119));キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q5SZU8(配列番号120));GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(例えば、GenBank登録番号P04406(配列番号121));未同定タンパク質ALB(例えば、GenBank登録番号P02768(配列番号122));ガレクチン−3,LGALS3(例えば、GenBank登録番号NP_002297(配列番号123));NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体(例えば、GenBank登録番号O15069(配列番号124));アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1(例えば、GenBank登録番号NP_000010(配列番号125));KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2(例えば、GenBank登録番号NP_003676(配列番号126));プロフィリン1(PFN1)(例えば、GenBank登録番号NP_005013(配列番号127));塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1(例えば、GenBank登録番号NP_001279(配列番号128));ジンクフィンガータンパク質831(例えば、GenBank登録番号NP_848552(配列番号129));エンドプラスミン(例えば、GenBank登録番号NP_003290(配列番号130));リボソームタンパク質S10(RPS10)(例えば、GenBank登録番号P46783(配列番号131));スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3(例えば、GenBank登録番号NP_003008(配列番号132));ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋)(例えば、GenBank登録番号P62736(配列番号133));ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットα,SCN8Aのアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_055006配列番号134));ガレクチン−9のアイソフォームロング(例えば、GenBank登録番号NP_033665配列番号135));T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5(例えば、GenBank登録番号NP_036205(配列番号136));α−エノラーゼ,肺特異性(例えば、GenBank登録番号CAA47179(配列番号137));癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS(例えば、GenBank登録番号NP_005363(配列番号138));β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_001608(配列番号139));アポリポタンパク質E(APOE)(例えば、GenBank登録番号NP_000032配列番号140));ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質)(例えば、GenBank登録番号NP_064516(配列番号141));Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9)(例えば、GenBank登録番号NP_003336(配列番号142));ミオシン−15(MYH15)(例えば、GenBank登録番号NP_055796(配列番号143)):FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK)(例えば、GenBank登録番号NP_057392(配列番号144));インテレクチン−1(ITLN1)(例えば、GenBank登録番号NP_060095(配列番号145));アポリポタンパク質A−IV(APOA4)(例えば、GenBank登録番号Q13784(配列番号146));ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1)(例えば、GenBank登録番号P08559(配列番号147));ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59)(例えば、GenBank登録番号NP_060979(配列番号148));60Sリボソームタンパク質L37A.(RPL37A)(例えば、GenBank登録番号NP_000989(配列番号149));ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1)(例えば、GenBank登録番号Q53HM1(配列番号150));アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1)(例えば、GenBank登録番号NP_000687(配列番号151));チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q16881(配列番号152));核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1)(例えば、GenBank登録番号NP_003260(配列番号153));陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATPER3)(例えば、GenBank登録番号NP_821138(配列番号154));膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1)(例えば、GenBank登録番号NP_006849(配列番号155));タンパク質FAM154A(FAM154A)(例えば、GenBank登録番号NP_714918(配列番号156));転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_002495(配列番号157))。
ステージIV癌細胞においてアップレギュレートされる、放出され変化が介在するタンパク質及びそれらの同起源のポリヌクレオチドが同定された。このポリヌクレオチドは、配列番号105〜107(.ApoA1 例えば、GenBank登録番号P02647(配列番号105);C4A(例えば、GenBank登録番号P0C0L4(配列番号106);及び、C3 187kDaタンパク質(例えば、GenBank登録番号P01024(配列番号107))中に示されるポリペプチドをコードする。
一般的に、PCMATは、その速さ(プロジェクトにおけるバイオマーカーの探索部分全体が6ヶ月未満で実施され得る)、費用対効果、及び、最も重要なことに、その感度、を含む、多数の優れた特性を有する。一般的に、ニワトリは、高い力価で、広い反応性を示す抗体を産生させるための優れた宿主として役立つ:ニワトリは、非常に強力なアジュバントを極めて良好に許容し、ヒトとは系統学的に遠く、このことは、癌研究においてヒト免疫原に対する反応傾向を増大し、ニワトリは、非常に多くの免疫レパートリーを有し、膨大な量の精製IgY(IgGと本質的に同じ)が、それらの卵から容易に取得し得る。強力なアジュバントの使用は、少ない量のタンパク質であっても抗体反応を誘導し、抗体を回収し得ることを確実にするために役立つ。感度を増大させるPCMATの別の特徴は、荷電カラムのサイズ及びそれを通し得る体液の量が重要であり得るということである。さらに、この特徴は、少量のタンパク質を見つける可能性も増大させる。最終的に、背景のタンパク質と反応性を示す抗体を除去するために健康な対象からの液状物を使用するサブトラクション工程は、大変高いシグナルノイズ比をもたらす。PCMATによってもたらされる感度の必要性は、どんなに記載しても記載し過ぎることはない。体液中に放出される癌タンパク質は、比較的少量であり、したがって、現在使われているストラテジーによって見過ごされる可能性が非常に高い。癌によって放出されるタンパク質を見つけるためにPCMATを使用することは、癌診断の開発のための新規ターゲットの同定のための他に類をみない機会をもたらす。
これらのポリペプチドの全てが、本明細書中において、「本発明にかかるポリペプチド」又は「癌関連抗原若しくはポリペプチド」と呼ばれる。本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、本明細書中において、「本発明にかかるポリヌクレオチド」又は「癌関連ポリヌクレオチド」と呼ばれる。
ポリペプチド
ポリペプチドは、アミド結合によって共有結合している、3個以上のアミノ酸のポリマーである。ポリペプチドは、翻訳後に修飾され得る。精製されたポリペプチドとは、細胞性物質、その他のタイプのポリペプチド、ポリペプチドの合成において使用される化学物質前駆体、化学物質、又はその組み合わせを実質的に含まないポリペプチド調製物である。ポリペプチドの合成において使用される細胞性物質、培養培地、化学物質前駆体、及び/又は化学物質を実質的に含まないポリペプチド調製物とは、約30%未満、20%、10%、5%、1%又はそれ以上の、合成において使用されるその他のポリペプチド、培養培地、化学物質前駆体、及び/又はその他の化学物質を含む。したがって、精製されたポリペプチドは、約70%、80%、90%、95%、99%又はそれ以上純粋である。
本発明にかかるポリペプチドは、ポリペプチドのアミノ末端及びカルボキシ末端の一方又は両方と直接連続する、少なくとも1、2、3、4、5、10、25、100、500、1,000個又はそれ以上の天然のアミノ酸を含み得る。
本発明にかかるポリペプチドは、全長ポリペプチド若しくはタンパク質、又はポリペプチド若しくはタンパク質の断片のいずれかであり得る。例えば、本発明にかかるポリペプチドの断片は、本発明にかかるポリペプチドの、約5、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100、250、500、750、1,000、2,000、3,000、4,000、5,000個若しくはそれ以上の連続するアミノ酸、又は、5〜5,000の間の任意の値若しくは範囲を含み得る。本発明にかかるポリペプチドの例としては、配列番号1〜157に示されるものが挙げられる。変異体ポリペプチドは、配列番号1〜157に示されるポリペプチド配列に対して、少なくとも約80、又は約85%、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99%又はそれ以上同一である。変異体ポリペプチドは、1以上の保存的アミノ酸変異又はその他のわずかな修飾を有し、又、生物学的活性を保持する(すなわち、生物機能的に同等である)。生物学的活性同等物は、対応する野生型ポリペプチドと比較した場合に、実質的に同等の機能を有する。
パーセント配列同一性は、その意義が認められている技術を有し、2つのポリペプチド又はポリヌクレオチド間の配列の同一性を調べるための多数の方法が存在する。例えば、Lesk,Ed.,Computational Molecular Biology,Oxford University Press,New York,(1988);Smith,Ed.,Biocomputing:Informatics And Genome Projects,Academic Press,New York,(1993);Griffin&Griffin,Eds.,Computer Analysis Of Sequence Data,Part I,Humana Press,New Jersey,(1994);von Heinje,Sequence Analysis In Molecular Biology,Academic Press,(1987);and Gribskov&Devereux,Eds.,Sequence Analysis Primer,M Stockton Press,New York,(1991)を参照されたい。ポリヌクレオチド又はポリペプチドを整列させるための方法は、コンピュータープログラムとして体系化されており、例えば、GCGプログラムパッケージ(Devereux et al.,Nuc.Acids Res.12:387(1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA(Atschul et al.,J.Molec.Biol.215:403(1990))、並びに、Smith及びWaterman(Adv.App.Math.,2:482−489(1981)の局所的相同性アルゴリズムを使用するBestfitプログラム(Wisconsin配列分析パッケージ,Unix用バージョン8,Genetics Computer Group,University Research Park,575 Science Drive,Madison,WI 53711)が挙げられる。例えば、FASTAアルゴリズムを利用するコンピュータープログラムALIGNは、−12のギャップオープンペナルティーと、−2のギャップエクステンションペナルティーとを用いる、アフィンギャップサーチを用いて使用し得る。
特定の配列が、例えば、参照配列と約95%同一であるか否かを測定するために、任意の配列アラインメントプログラムを使用する場合、参照ポリヌクレオチドの全長に亘って同一性のパーセンテージが計算され、参照ヌクレオチド中のヌクレオチド数全体の最大5%の同一性のギャップが許容されるように、パラメーターは設定される。
変異体は、一般的に、本発明にかかるポリペプチドの1つを改変し、それが生物学的に同等であるか否かを調べるために改変ポリペプチドの特性を評価することにより、同定し得る。例えば、免疫組織化学的アッセイ、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、免疫酵素アッセイ又はウェスタンブロットアッセイ等のアッセイにおいて、本発明にかかるポリペプチドと実質的に同じように反応する場合には、例えば、元のポリペプチドの活性の90〜110%を有する場合には、変異体は生物学的に同等である。一実施形態において、アッセイは競合アッセイであり、この場合、生物学的に同等なポリペプチドは、本発明にかかるポリペプチドの対応する反応性抗原又は抗体への結合を約80、95、99、又は100%低下させ得る。対応する野生型ポリペプチドと特異的に結合する抗体は、変異体ポリペプチドとも特異的に結合する。本発明にかかる変異体ポリペプチドは、約1、2、3、4、5、10、20、30、40、50、60、70、80、100、200個又はそれ以上の保存的アミノ酸置換、又は、約1〜約200個の間の任意の値又は範囲の置換を含み得る。
保存的置換は、類似した特性を有する別のアミノ酸とアミノ酸が置換されているものであり、したがって、ペプチド化学の技術分野における当業者であれば、実質的に変化しないポリペプチドの二次構造及びヒドロパシー特性を予想し得る。保存的置換としては、例えば、脂肪族又は疎水性アミノ酸Ala、Val、Leu及びIleの置換;ヒドロキシル残基Ser及びThrの置換;酸性残基Asp及びGluの置換;アミド残基Asn及びGlnの置換、塩基性残基Lys、Arg、及びHis;芳香族残基Phe、Tyr、及びTrpの置換、並びに、低分子アミノ酸Ala、Ser、Thr、Met、及びGlyの置換等のアミノ酸グループ内の交換が挙げられる。
本発明にかかるポリペプチドは、タンパク質の移送を翻訳と同時に又は翻訳後に指示するシグナル(又はリーダー)配列をさらに含み得る。ポリペプチドはまた、ポリペプチドの合成、精製又は同定を簡易にするための(例えば、ポリHis)、又は、ポリペプチドの固体支持体への結合を促進させるための、リンカー又はその他の配列を含み得る。本発明にかかるポリペプチドは、タンパク質の移送を翻訳と同時に又は翻訳後に指示するシグナル(又はリーダー)配列をさらに含み得る。ポリペプチドはまた、ポリペプチドの合成、精製又は同定を簡易にするための(例えば、ポリHis)、又は、ポリペプチドの固体支持体への結合を促進させるための、リンカー又はその他の配列を含み得る。例えば、ポリペプチドは、免疫グロブリンFc領域又はウシ血清アルブミンに結合させ得る。
ポリペプチドは、そのポリペプチドが天然には結合していないアミノ酸に、共有結合的に又は非共有結合的に結合させ得る。ポリペプチドはまた、アミノ酸以外の化合物又は分子に、共有結合的に又は非共有結合的に連結させ得る。本発明の一実施形態において、タンパク質精製リガンドは、例えば、本発明にかかるポリペプチドのアミノ末端又はカルボキシ末端における1以上のアミノ酸残基であり得る。アミノ酸スペーサーは、本発明にかかるポリペプチドと天然においては通常、結合していないアミノ酸の配列である。アミノ酸スペーサーは、約1、5、10、20、100、500、1,000個又はそれ以上のアミノ酸を含み得る。
所望であれば、ポリペプチドは、その他のアミノ酸配列、例えば、アミノ酸リンカー、アミノ酸スペーサー、シグナル配列、TMR移送停止配列、膜貫通ドメイン、及び、タンパク質精製に有用なリガンド、例えば、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ、ヒスチジンタグ、及びブドウ球菌タンパク質A、又はその組み合わせをも含む、融合タンパク質であり得る。2以上の本発明にかかるポリペプチドが、融合タンパク質中には存在し得る。本発明にかかるポリペプチドの断片は、本発明にかかる融合タンパク質中に存在し得る。本発明にかかる融合タンパク質は、1以上の配列番号1〜157、その断片、又はその組み合わせを含み得る。
本発明にかかるポリペプチドは、マルチマーの形態をとり得る。ポリペプチドは、配列番号1〜157の1以上のコピー又はその組み合わせを含み得る。マルチマーポリペプチドは、多重抗原ペプチド(MAP)であり得る。例えば、Tam,J.Immunol.Methods,196:17−32(1996)を参照されたい。
本発明にかかるポリペプチドは、抗体によって認識される抗原を含み得る。抗原は、1以上のエピトープ(すなわち、抗原決定基)を含み得る。エピトープは、直線状エピトープ、連続エピトープ又は立体構造エピトープであり得る。本発明にかかるポリペプチド中のエピトープは、複数の方法によって同定され得る。例えば、米国特許第4,554,101号;Jameson&Wolf,CABIOS 4:181−186(1988)を参照されたい。例えば、本発明にかかるポリペプチドは、単離及びスクリーニングされ得る。全体のポリペプチド配列に一緒に広がる一連の短いペプチドを、タンパク質分解的切断によって調製し得る。例えば、100merポリペプチド断片を始めとして、各断片を、ELISAにおいて認識されるエピトープの存在について試験し得る。例えば、ELISAアッセイにおいて、100merポリペプチド断片等のポリペプチドを、プラスチック製マルチウェルプレートのウェル等の固体支持体に付着させる。抗体集団を標識して、固体支持体に添加し、非特異的吸着がブロックされる条件下で、標識していない抗原を結合させ、全ての結合していない抗体及びその他のタンパク質は洗い流す。抗体の結合は、例えば、無色基質を有色反応生成物に変換する反応によって検出される。次に、漸進的により小さな断片及び重複する断片を、対象となるエピトープをマッピングするために、同定された100merから試験し得る。
本発明にかかるポリペプチドは、組み換え技術によって作製し得る。本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、当技術分野において周知の技術を用いて、適当な発現宿主細胞系中で発現し得る、組み換え発現ベクター中に導入し得る。様々な細菌、酵母、植物、哺乳類及び昆虫発現系が当技術分野において利用可能であり、かかる任意の発現系を使用し得る。任意に、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、無細胞翻訳系において翻訳し得る。ポリペプチドはまた、化学的に合成するか、又は、癌細胞から取得し得る。
本発明にかかる免疫原性ポリペプチドは、配列番号1〜157に示されるアミノ酸配列を含み得る。免疫原性ポリペプチドは、配列番号1〜157を有するポリペプチドのエピトープを認識する抗体又はその他の免疫反応(例えば、免疫系におけるT細胞応答)を誘導し得る。本発明にかかる免疫原性ポリペプチドはまた、配列番号1〜157に示されるアミノ酸配列を有するポリペプチドの断片であり得る。本発明にかかる免疫原性ポリペプチド断片は、約5、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100、250、500、750、1,000、2,000、3,000、4,000、5,000個若しくはそれ以上のアミノ酸長、又は、約5〜約5,000アミノ酸長の間の任意の値若しくは範囲であり得る。
ポリヌクレオチド
本発明にかかるポリヌクレオチドは、全ゲノムよりは短い核酸を含み、一本鎖又は二本鎖の核酸であり得る。ポリヌクレオチドは、RNA、mRNA、DNA、cDNA、ゲノムDNA、化学合成されたRNA若しくはDNA、又はその組み合わせであり得る。ポリヌクレオチドは、その他の成分、例えば、タンパク質、脂質及びその他のポリヌクレオチドを含まずに精製し得る。例えば、ポリヌクレオチドは、50%、75%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%精製し得る。本発明にかかるポリヌクレオチドは、上記したポリペプチドをコードする。本発明の一実施形態において、本発明にかかるポリペプチド及び配列番号1〜157に示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、その相補鎖、又はその組み合わせ。本発明にかかるポリヌクレオチドは、その他のヌクレオチド配列、例えば、リンカー、シグナル配列、TMR移送停止配列、膜貫通ドメイン、又はタンパク質精製に有用なリガンド、例えば、グルタチオン−S−トランスフェラーゼ、ヒスチジンタグ、及びブドウ球菌タンパク質Aをコードする配列を含み得る。
本発明にかかるポリヌクレオチドは単離し得る。単離ポリヌクレオチドとは、天然にそのポリヌクレオチドが関連するゲノム配列に隣接する5’及び3’の一方又は両方とは直接連続しないポリヌクレオチドである。単離ポリヌクレオチドは、天然のゲノム中において、組み換えDNA分子と直接隣接することが天然に見られる核酸配列が、除去されている場合又は存在しない場合に、例えば、任意の長さの組み換えDNA分子であり得る。単離ポリヌクレオチドは、非天然の核酸分子も含む。例えば、cDNA又はゲノムライブラリー、又はゲノムDNAの制限酵素消化物を含むゲルスライス内の数百から数百万のその他の核酸分子中に存在する核酸分子は、単離された又は精製されたポリヌクレオチドとはみなされない。
本発明にかかるポリヌクレオチドは、免疫原性ポリペプチドをコードする断片も含み得る。本発明にかかるポリヌクレオチドは、全長ポリペプチド又はタンパク質、ポリペプチド断片、及び変異体又は融合ポリペプチドをコードし得る。
本発明にかかるポリペプチドをコードする縮重ヌクレオチド配列、並びに、本発明にかかるポリヌクレオチド配列及びその相補配列と、少なくとも約80%、又は約85、90、95、96、97、98、99%又はそれ以上同一である相同ヌクレオチド配列もまた、本発明にかかるポリヌクレオチドである。パーセント配列同一性は、「ポリペプチド」の項において記載されるようにして計算し得る。縮重ヌクレオチド配列とは、本発明にかかるポリペプチド又はその断片をコードするが、遺伝コードの縮重により、野生型のポリヌクレオチド配列とは核酸配列が異なるポリヌクレオチドである。生物学的機能を有する本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの相補DNA(cDNA)分子、種間ホモログ、及び変異体もまた、本発明にかかるポリヌクレオチドである。本発明にかかるポリヌクレオチドは、例えば、生物学的サンプル、例えば、個々の患者からの血液、血清、唾液、又は組織中に存在する核酸配列から単離し得る。ポリヌクレオチドはまた、研究室において、例えば、自動合成装置を用いて、合成し得る。PCR等の増幅方法を用いて、ゲノムDNA又は、ポリペプチドをコードするcDNAのいずれかからポリヌクレオチドを増幅し得る。
本発明にかかるポリヌクレオチドは、天然のポリペプチドのコード配列を含み得るし、又は、天然には存在しない改変された配列をコードし得る。所望であれば、ポリヌクレオチドは、例えば、複製開始点、プロモーター、エンハンサー、又は、宿主細胞中で本発明にかかるポリヌクレオチドの発現を推進するその他の調節エレメント等の発現調節エレメントを含む発現ベクター中にクローニングし得る。発現ベクターは、例えば、pBR322、pUC、又はColE1等のプラスミド、又は、アデノウイルス2型ベクター又は5型ベクター等のアデノウイルスベクターであり得る。任意に、その他のベクターも使用し得る、例えば、限定するものではないが、シンドビスウイルス、シミアンウイルス40、アルファウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、及びサイトメガロウイルス、並びに、マウス肉腫ウイルス、マウス乳腺腫瘍ウイルス、モロニーマウス白血病ウイルス、及びラウス肉腫ウイルス等のレトロウイルスベクターが挙げられる。MC及びMC1等のミニ染色体、バクテリオファージ、ファージミド、酵母人工染色体、細菌人工染色体、ウイルス粒子、ウイルス様粒子、コスミド(ファージλのcos部位が挿入されたプラスミド)及びレプリコン(細胞中においてそれ自体の調節下において複製し得る遺伝子エレメント)もまた使用し得る。
発現調節配列と機能し得るように連結されたポリヌクレオチドの調製方法及び宿主細胞中でのそれらの発現方法は、当技術分野において周知である。例えば、米国特許第4,366,246号を参照されたい。本発明にかかるポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドの転写及び/又は翻訳を指示する1以上の発現調節エレメントに隣接して又は近くにそれが位置した場合には、機能し得るように連結される。
本発明にかかるポリヌクレオチドは、サンプル、例えば、生物学的サンプル、中のポリヌクレオチドの存在を検出するために、例えば、プローブ又はプライマーとして、例えば、PCRプライマーとして使用し得る。本発明にかかるポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズするかかるプローブ及びプライマーの能力は、所定のサンプル中において相補配列の存在を検出する場合にそれらを使用することを可能にする。本発明にかかるポリヌクレオチドプローブ及びプライマーは、サンプル中、例えば、唾液、痰、血液、尿、糞便、脳脊髄液、羊水、傷からの浸出液、又は組織等の生物学的サンプル中において、相補配列とハイブリダイズし得る。サンプルからのポリヌクレオチドは、例えば、ゲル電気泳動又はその他のサイズ分離技術に供し得るし、又は、サイズ分離を行うことなく、固定化し得る。ポリヌクレオチドプローブ又はプライマーは、標識し得る。プローブ及びプライマーを標識するための適当な標識及び方法は、当技術分野において公知であり、例えば、ニック翻訳若しくはキナーゼによって取り込まれる放射活性標識、ビオチン標識、蛍光標識、化学発光標識、生物発光標識、金属キレート標識及び酵素標識が挙げられる。サンプルからのポリヌクレオチドは、適当なストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で、プローブ又はプライマーと接触させる。
用途に応じて、標的配列に向かうプローブ又はプライマーの様々な選択性を達成するために、様々なハイブリダイゼーション条件が使用され得る。高い選択性を必要とする用途のためには、例えば、約0.02M〜約0.15Mの塩、又は約0.02M〜約0.15Mの塩の間の任意の値又は範囲の塩濃度、約50℃〜約70℃、又は約50℃〜70℃の範囲の任意の値又は範囲の温度によって提供される低い塩濃度及び/又は高い温度条件等の比較的ストリンジェントな条件が使用され得る。低い選択性を必要とする用途のためには、ストリンジェンシーがより低いハイブリダイゼーション条件が使用され得る。例えば、約0.14M〜約0.9Mの塩、又は約0.14M〜約0.9Mの塩の間の任意の値又は範囲の塩濃度、約20℃〜約55℃、又は約20℃〜55℃の範囲の任意の値又は範囲の温度。プローブ又はプライマーと、試験サンプルからの相補ポリヌクレオチドとを含む、ハイブリダイズした複合体の存在は、サンプル中における癌の存在を示し得る。
抗体
本発明にかかる抗体は、本発明にかかるポリペプチド又はその断片と特異的かつ安定的に結合する抗体分子である。本発明にかかる抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、一本鎖抗体(scFv)、単一特異性一本鎖抗体、二重特異性一本鎖抗体、二価一本鎖抗体、四価一本鎖抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、又は抗体の抗原結合断片であり得る。抗原と結合する抗体の断片は、インタクトな抗体の抗原結合部位又は可変領域を含むインタクトな抗体の部分であり、この部分は、インタクトな抗体のFc領域の定常重鎖ドメインは含まない。抗原と結合する抗体断片の例としては、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)2及びFv断片が挙げられる。
単離された抗体は、その天然の環境からは実質的に分離されている。例えば、単離された抗体は、それが由来する生物源から実質的に分離されている。精製された抗体は、その天然の環境においては抗体に関連するその他の物質を実質的に含まない。例えば、精製された抗体は、それが由来する細胞又は組織からの細胞性物質又はその他のタンパク質又は抗体を実質的に含まない。この用語は、単離された抗体が、少なくとも約70%〜80%(w/w)の純度、より好ましくは、少なくとも約80%〜90%(w/w)の純度、さらにより好ましくは、約90〜95%の純度、及び、最も好ましくは、少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、又は100%(w/w)の純度である調製物のことをいう。
本発明にかかる抗体は、例えば、IgG(IgG1、IgG2、IgG4)、IgM、IgA、IgD、IgE、及びIgYを含む、任意の抗体クラス及び任意のサブタイプであり得る。抗体又はその抗原結合断片は、本発明にかかるポリペプチドのエピトープと結合する。抗体は適当な実験動物中でインビボで又は組み換えDNA技術を用いてインビトロで作製し得る。抗体の調製及び特性決定のための手段は当技術分野において周知である。例えば、Dean,Methods Mol.Biol.80:23−37(1998);Dean,Methods Mol.Biol.32:361−79(1994);Baileg,Methods Mol.Biol.32:381−88(1994);Gullick,Methods Mol.Biol.32:389−99(1994);Drenckhahn et al.Methods Cell.Biol.37:7−56(1993);Morrison,Ann.Rev.Immunol.10:239−65(1992);Wright et al.Crit.Rev.Immunol.12:125−68(1992)を参照されたい。例えば、ポリクローナル抗体は、ヒト又はその他の霊長類、マウス、ラット、ウサギ、モルモット、ヤギ、ブタ、イヌ、ウシ、ヒツジ、ロバ、ニワトリ、又はウマ等の動物に本発明にかかるポリペプチドを投与することにより作成し得る。免疫化した動物から血清を回収し、抗体は、硫安沈殿、次に、クロマトグラフィー、例えば、アフィニティークロマトグラフィーにより血漿から精製する。ポリクローナル抗体の製造及びプロセシングのための技術は当技術分野において公知である。
「特異的に結合する」又は「〜に対して特異的である」とは、第1の抗原、例えば、本発明にかかるポリペプチドが、その他の非特異的分子よりも高い親和性で、本発明にかかる抗体を認識し、結合することを意味する。非特異的分子は、第1の抗原とは共通のエピトープを有しない抗原である。この場合、本発明にかかるポリペプチドは、通常、非特異的対照分子の望ましい選択肢とはなり得ないであろう。例えば、非特異的抗原に対してよりも効率的に結合する、第1の抗原(例えば、ペプチド)に対して産生させた抗体は、第1の抗原と特異的に結合すると記載し得る。好ましい実施形態において、107l/mol又はそれ以上の結合親和性Kaで結合する場合に、抗体又はその抗原結合部分は、配列番号1〜157又はその断片等の本発明にかかるポリペプチドと特異的に結合する。特異的結合は、当技術分野において周知の方法を用いて、例えば、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、又はウェスタンブロット法を用いて調べ得る。
さらに、本発明にかかるポリペプチド上に存在するエピトープに対して向けられたモノクローナル抗体も、容易に作製し得る。例えば、本発明にかかるポリペプチドを用いて免疫化したマウス等の哺乳類からの正常B細胞を、例えば、HAT感受性マウスミエローマ細胞と融合させることにより、ハイブリドーマを作製し得る。抗体を産生するハイブリドーマは、RIA又はELISAを用いて同定し得、又、半固体寒天中でのクローニング又は限界希釈法により単離し得る。ポリペプチド−特異的抗体を産生するクローンは、別のラウンドのスクリーニングによって単離される。モノクローナル抗体は、標準的技法を用いて、例えば、本発明にかかるポリペプチドをマイクロタイタープレートに結合させ、ELISAアッセイによってモノクローナル抗体の結合を測定することにより、特異性に対してスクリーニングし得る。モノクローナル抗体の製造及びプロセシングのための技術は当技術分野において公知である。例えば、Kohler&Milstein,Nature,256:495(1975)を参照されたい。特定のアイソタイプのモノクローナル抗体は、初期融合体から選択することにより、直接的に調製するか、又は、クラススイッチ変異体を単離するための同胞選抜法を用いることにより、様々なアイソタイプのモノクローナル抗体を分泌する親ハイブリドーマから、二次的に調製し得る。Steplewskiら,P.N.A.S. U.S.A.82:8653 1985;Spriaら,J.Immunolog.Meth.74:307,1984を参照されたい。本発明にかかるモノクローナル抗体は、組み換えモノクローナル抗体であり得る。例えば、米国特許第4,474,893号;米国特許第4,816,567号を参照されたい。本発明にかかる抗体は、化学的に構築し得る。例えば、米国特許第4,676,980号を参照されたい。
本発明にかかる抗体は、キメラ抗体(例えば、米国特許第5,482,856号を参照されたい)、ヒト化抗体(例えば、Jones et al.,Nature 321:522(1986);Reichmann et al.,Nature 332:323(1988);Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593(1992)を参照されたい)、又はヒト抗体であり得る。ヒト抗体は、例えば、直接不死化法(direct immortilization)、ファージディスプレイ、トランスジェニックマウス、又は、トリメラ法(Trimera methodology)によって作製し得る、例えば、Reisener et al.,Trends Biotechnol.16:242−246(1998)を参照されたい。
抗原(例えば、本発明にかかるポリペプチド)と特異的に結合する抗体は、癌を有することが疑われる動物、例えば、ヒトからのサンプル、例えば、血清、血液、尿、組織、又は唾液サンプル中の癌関連抗原を検出するために特に有用である。癌関連抗原のためのイムノアッセイは、1つの抗体又は複数の抗体を利用し得る。癌関連抗原に対するイムノアッセイは、例えば、本発明にかかるポリペプチドの1つのエピトープに対して向けられたモノクローナル抗体、本発明にかかる1つのポリペプチドのエピトープに対して向けられたモノクローナル抗体の組み合わせ、本発明にかかる異なるポリペプチドのエピトープに対して向けられたモノクローナル抗体、本発明にかかるポリペプチドからの同じ抗原に対して向けられたポリクローナル抗体、異なる抗原に対して向けられたポリクローナル抗体、又は、モノクローナル抗体及びポリクローナル抗体の組み合わせを使用し得る。イムノアッセイのプロトコールは、例えば、標識抗体を用いた、例えば、競合反応、直接反応、又はサンドイッチ型アッセイに基づき得る。本発明にかかる抗体は、例えば、蛍光、化学発光、放射活性、酵素、コロイド金属、放射性同位体及び生物発光標識を含む、当技術分野において公知の任意のタイプの標識を用いて標識し得る。
本発明にかかる抗体は、(a)本発明にかかるポリペプチド、例えば、配列番号1〜157、又は、その抗原結合断片との結合について、参照抗体と競合する;(b)本発明にかかるポリペプチド、例えば、配列番号1〜157、又は、その抗原結合断片の、参照抗体と同じエピトープと結合する;(c)参照抗体と実質的に同じKdを有する、本発明にかかるポリペプチド、例えば、配列番号1〜157、又は、その抗原結合断片と結合する;及び/又は、(d)参照抗体が、107l/mol又はそれ以上の結合親和性Kaを有する本発明にかかるポリペプチド、例えば、配列番号1〜157又はその抗原結合断片と、特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片である、参照抗体と実質的に同じオフ速度(off rate)を有する、本発明にかかるポリペプチド、例えば、配列番号1〜157又はその抗原結合断片と結合する、抗体及びその抗原結合断片を含む。
本発明にかかる抗体又はその抗原結合断片は、支持体に結合させて、癌関連抗原の存在を検出するために使用し得る。支持体としては、例えば、ガラス、ポリスチレン、ポリプロピレン、ポリエチレン、デキストラン、ナイロン、アミラーゼ、天然及び修飾セルロース、ポリアクリルアミド、アガロース及びマグネタイト(magletite)が挙げられる。
本発明にかかる抗体はさらに、イムノアフィニティーカラムにより癌関連抗原を単離するために使用し得る。抗体は、抗体が免疫選択活性を保持するように、例えば、吸着又は共有結合により固体支持体に固定し得る。任意に、抗体の抗原結合部位が接近可能なままとなるように、スペーサーグループを含め得る。固定化された抗体は、例えば、唾液、血清、痰、血液、尿、糞便、脳脊髄液、羊水、傷からの浸出液、又は組織を含む生物サンプル等のサンプルから、癌関連抗原を結合するために使用し得る。結合した癌関連抗原は、例えばpHの変化によりカラムのマトリクスから回収される。
本発明にかかる抗体はまた、免疫局在性の研究において、多様な細胞現象又は生理的条件の間での本発明にかかるポリペプチドの存在および分布を分析するために、使用し得る。抗体は、受動免疫に関与する分子を同定するため、及び非タンパク質抗原の生合成に関与する分子を同定するためにも使用され得る。かかる分子の同定は、ワクチン開発において有用となり得る。例えば、モノクローナル抗体及び一本鎖抗体等の本発明にかかる抗体は、癌の回復の経過をモニターするために使用し得る。本発明にかかるステージIVポリヌクレオチド(すなわち、配列番号65〜107をコードするポリヌクレオチド)は、本方法において特に有用であるが、ステージI(すなわち、配列番号1〜64をコードするポリヌクレオチド)及びステージII(すなわち、配列番号108〜157をコードするポリヌクレオチド)は、本方法において使用し得る。動物からの試験サンプル中の癌関連抗原に対する抗体の増加又は減少を測定することにより、癌の回復を目的とした特定の治療計画が有効か否かを決定し得る。抗体は、例えば、RIA、ELISA、又はウエスタンブロットアッセイ等の直接結合アッセイを用いて、検出及び/又は定量化し得る。
癌の検出方法
対象における癌、癌を発症する素因、又は癌を発症する感受性を検出する方法が、本発明において提供される。癌に対する素因とは、対象が、癌、例えば、結腸直腸癌に罹りやすいか、又は、正常な個体若しくは正常な個体群よりも癌を発症する可能性が高いことを意味する。対象は、ヒト、非ヒト霊長類、マウス、ラット、イヌ、ネコ、ヒツジ、ブタ、ウマ、又はウシ等の哺乳類であり得る。結腸直腸癌組織において特異的に発現されるポリペプチド(すなわち、癌組織においては発現されるが、健常組織においては、発現されないか、若しくは、低レベルで発現されるポリペプチド)が107個、同定された。これらのポリペプチドは、癌関連ポリペプチドであり、癌関連ポリヌクレオチドによってコードされている。ステージIのポリペプチド及びポリヌクレオチドは、早期診断のために特に有用である。本発明にかかるポリペプチドをコードする1以上の癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルは、対象からの生物学的サンプル中において測定することができ、この場合、ポリヌクレオチドの正常な対照発現レベルと比較して、癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルの増大は、対象が癌を有するか、又は、癌の発症リスクがあることを示す。健常な細胞及び組織においては、本発明にかかるポリヌクレオチドが発現されないか、又は、低レベルで発現されることから、正常な対照発現レベルとの比較は必要とされない。
一般的に、広範な癌に対して、PCMATを適用し得る。癌は、結腸癌(結腸直腸癌又は大腸癌とも知られ、又、本明細書中においても言及される)、腺癌、上皮性悪性腫瘍、非上皮性悪性腫瘍、リンパ腫、白血病、前立腺(prostrate)癌、胃癌、肺癌、膀胱癌、メラノーマ、膵臓癌、乳癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肛門癌、皮膚癌、骨肉腫、脳腫瘍、消化管癌、食道癌、胆管癌、眼癌、胆嚢癌、グリオーマ、頭頸部癌、肝臓癌、腎臓癌、喉頭癌、口唇部癌、中皮腫、小腸癌、精巣癌、甲状腺癌、尿道癌、子宮癌、膣癌、外陰癌、陰茎癌、又はその任意の組み合わせ若しくはサブセットであり得る。生物学的サンプルは、例えば、粘膜細胞、腫瘍細胞、癌細胞、生検サンプル、洗浄サンプル、痰サンプル、血清サンプル、胃液分泌サンプル、血漿サンプル、血液サンプル、糞便サンプル、リンパ節サンプル、骨髄サンプル、尿サンプル、組織サンプル、結腸直腸組織サンプル、胸水サンプル、細胞、細胞抽出物、体液、実質的に細胞を含まない体液(例えば、約1、5、又は10%未満の細胞、涙、乳汁、精液、前立腺液、肺洗浄液、又は唾液であり得る。
癌関連タンパク質又はポリペプチドの発現レベルは、癌関連ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドを検出することにより検出し得る。ポリペプチドの発現レベルは、ELISA、免疫組織化学的アッセイ、免疫細胞化学的アッセイ、及び抗体標識細胞のフローサイトメトリーアッセイ等のイムノアッセイを用いて検出し得る。ポリペプチドの発現レベルは、例えば、そのポリペプチドと特異的に結合する抗体を用いて検出し得る。癌関連タンパク質及びポリペプチドの発現レベルもまた、癌関連ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドの生物学的活性を検出することにより測定し得る。ポリペプチドの生物学的活性の検出方法は当技術分野において周知である。
本発明にかかるポリヌクレオチド(すなわち、「癌関連ポリヌクレオチド」)の発現レベルは、癌関連ポリヌクレオチドのmRNA発現レベルを検出することにより測定し得る。癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルは、患者由来の生物学的サンプルのポリヌクレオチド転写物に対する癌関連ポリヌクレオチドプローブのハイブリダイゼーションを検出することにより測定し得る。ハイブリダイゼーションは、例えば、ポリヌクレオチドアレイを用いて検出し得る。例えば、本発明にかかる癌関連ポリヌクレオチドに対応するRNA配列を検出するためのプローブは、例えば、ノーザンブロットハイブリダイゼーションアッセイにおいて使用し得る。或いは、本発明にかかるポリヌクレオチドは、例えば、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)、ポリメラーゼ連鎖反応増幅(PCR)、リガーゼ連鎖反応増幅(LCR)、鎖置換増幅(SDA)、及び核酸配列ベース増幅(NASBA)等の増幅反応に基づく検出法において、ポリヌクレオチドを特異的に増幅するプライマーを構築するために使用し得る。
試験サンプル中の本発明にかかる1以上の癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルを、対照サンプル中の癌関連ポリヌクレオチドの発現レベルと比較し得る。対照サンプルは、例えば、癌性サンプル又は非癌性サンプル(例えば、健常な結腸直腸組織等の健常組織)であり得る。
対照サンプルが非癌性である場合、試験サンプル及び対照サンプル中の類似するタンパク質又はポリヌクレオチド発現レベルは、試験サンプルが非癌性であることを示す。試験サンプルは、複数の対照サンプルと比較し得る。したがって、試験サンプルは、例えば、癌細胞を含む第2の対照サンプル、及び、例えば、非癌性細胞を含む第2の対照と比較し得る。
本発明にかかるタンパク質、ポリペプチド及びポリヌクレオチドは、ある薬剤が特定の対象において適当な抗癌剤であるか否かを調べるために、特定の対象からの試験サンプル中において、治療的又は予防的抗癌剤、例えば、抗結腸直腸抗癌剤、として推定される薬剤を試験するために使用され得る。特定の対象のために適当な抗癌剤を同定するために、試験サンプル、例えば、対象から取得される癌細胞又は腫瘍サンプル、が、この抗癌剤に曝露される。本発明にかかる1以上のポリヌクレオチドの発現が調べられる。試験サンプルにおける癌関連ポリヌクレオチドの発現パターンを、測定し、1以上の対照プロファイル、例えば、結腸直腸癌参照発現プロファイル又は非結腸直腸癌参照発現プロファイル、と比較し得る。好ましくは、細胞集団を、生体外で、薬剤又は活性形態の抗癌剤と接触させる。
試験サンプル中の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を、次に、対照サンプル中の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現と比較する。対照サンプルは、その癌の状態が知られている細胞であり得る。対照サンプルが非癌性である場合、試験サンプルと対照サンプルとの間で類似する遺伝子発現プロファイルは、抗癌剤が対象の癌を治療するために適当であることを示す。試験サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現と、対照サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現との間の発現の相違は、抗癌剤が対象の癌を治療するために適当でないことを示す。癌組織からの対照サンプルと比較して、試験サンプル中の1以上の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現の減少は、薬剤が治療的であることを示す。
本発明にかかるポリペプチド又はポリヌクレオチドはまた、癌、例えば、結腸直腸癌、を治療するための候補治療薬を同定するために使用し得る。候補治療薬は、癌状態、例えば、結腸直腸癌状態に特徴的な癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現プロファイルを、非癌状態が示すパターンへと、候補治療薬が変化させ得るか否かを調べるためにスクリーニングされる。
癌性サンプルは、試験薬に又は(連続的若しくは同時に)試験薬の組み合わせに曝露し、サンプル中の1以上の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を測定する。試験サンプル中の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を、試験薬に曝露していない対照サンプル中の癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現レベルと比較する。治療的試験薬は、癌細胞においてアップレギュレートされている癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を低下させ得る。
対照サンプルは、癌細胞、例えば、癌性の結腸直腸癌細胞であり得る。試験薬の非存在下における対照サンプルの発現プロファイルから、試験薬の存在下における癌関連ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現への低下は、試験薬が、癌、例えば、結腸直腸癌を治療するための候補治療薬であることを示す。
また、試験サンプル中の本発明にかかる1以上のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を、疾患ステージの範囲全体に亘って患者から得られる対照サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現と比較することにより、癌、例えば、結腸直腸癌を有する対象の予後を評価する方法も提供される。試験サンプルと対照サンプル中の本発明にかかる1以上のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を比較することにより、又は、対象に由来する試験サンプル中において、時間をかけて、ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現パターンを比較することにより、対象の予後を評価し得る。1以上のステージIVのポリペプチド又はポリヌクレオチド(すなわち、配列番号65〜107をコードするポリペプチド又はポリヌクレオチド)の発現は、予後が悪いことを示し得る。1以上のステージIVのポリヌクレオチドの発現ではなくて、1以上のステージIのポリペプチド又はポリヌクレオチド(すなわち、配列番号1〜64をコードするポリペプチド又はポリヌクレオチド)の発現は、良好な予後を示し得る。
対照サンプルは、健常サンプル、又は癌サンプル、例えば、結腸直腸癌サンプルであり得る。或いは、対照サンプルは、癌発現プロファイル、例えば、結腸直腸癌発現プロファイルである。対照サンプルが癌である場合、本発明にかかる1以上のポリペプチドの発現の増大は、予後が好ましくないことを示す。本発明にかかるポリペプチドの発現の低下は、対象の予後が好ましいことを示す。或いは、対照サンプルが健常サンプルである場合、本発明にかかる1以上のポリペプチドの発現の増大は、対象の予後が好ましくないことを示すのに対して、低下又は同様の発現は、より好ましい予後を示す。
本発明はまた、本発明にかかる2以上のポリペプチド又はポリヌクレオチドのポリペプチド又はポリヌクレオチド発現パターンを含み、任意で、疾患経過全体に亘る、結腸直腸癌参照発現プロファイルを提供する。発現プロファイルは、結腸直腸癌又は疾患の発症の素因の診断のため、治療経過をモニタリングするため、及び疾患を有する対象の予後を評価するための対照として役立つ。
本発明はまた、癌の高度又は低度の転移拡散の傾向を予測するための方法を提供する。癌サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物の存在及び/又はレベルは、検出及び/又は定量化することができ、腫瘍が転移する傾向に相関し得る。1以上のステージIVのポリペプチド又はポリヌクレオチド(すなわち、配列番号65〜107をコードするポリペプチド又はポリヌクレオチド)の発現は、高度な癌の転移拡散を示し得る。1以上のステージIVのポリヌクレオチドの発現ではなくて、1以上のステージIのポリヌクレオチド(すなわち、配列番号1〜64をコードするポリペプチド又はポリヌクレオチド)の発現は、低度な癌の転移拡散を示し得る。
本発明にかかるポリペプチド及びポリヌクレオチドはまた、癌、例えば、結腸直腸癌の治療経過をモニタリングするために使用し得る。癌、例えば、結腸直腸癌の治療を受けている対象から、試験サンプルが取得される。試験サンプルは、治療前、治療中、又は治療後の様々な時点で対象から取得し得る。試験サンプル中の本発明にかかる1以上のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現を測定し、既知の癌状態を示す細胞を含む対照サンプルと比較する。好ましくは、対照サンプルは、治療されていない。本発明にかかるステージIVのポリペプチド又はポリヌクレオチド(すなわち、配列番号65〜107のポリペプチド又は配列番号65〜107をコードするポリヌクレオチド)は、本方法において特に有用であるが、ステージI(すなわち、配列番号1〜64のポリペプチド又は配列番号1〜64をコードするポリヌクレオチド)及びステージII(すなわち、配列番号108〜157のポリペプチド又は配列番号108〜157をコードするポリヌクレオチド)も本方法において使用し得る。
対照サンプルが非癌性細胞を含む場合、試験サンプル中と対照サンプル中との間の本発明にかかるポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現の類似性は、治療が有効であることを示す。しかしながら、対照サンプルと比較した場合に、試験サンプル中の本発明にかかるポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現の低下は、治療が有効でないことを示す。
有効とは、治療が、癌、例えば、結腸直腸癌、の大きさ、有病率、又は転移の可能性の低下をもたらすことを意味する。治療が予防的に適用される場合に、有効とは、治療が、癌、例えば、結腸直腸癌、の形成を抑制、遅延、又は防ぐことを意味する。有効性は、癌、例えば、結腸直腸癌、を診断又は治療するための任意の公知の方法を用いて測定し得る。
対照サンプルが癌性である場合、例えば、対照サンプルが、治療開始前ではあるが、診断時における、対象から採取した癌細胞を含む場合、試験サンプルと対照サンプルとの間の発現パターンの類似性は、治療が有効でないことを示す。試験サンプル中及び対照サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現の違い(すなわち、試験サンプル中における低下)は、治療が有効であることを示す。対照サンプルが非癌性細胞を含む場合、対照サンプルと比較して、試験サンプル中の本発明にかかる1以上のポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現の低下は、治療が有効であることを示す。
癌の治療方法
本発明は、例えば、(a)薬学的有効量の本発明にかかるポリペプチドを対象に投与する工程;(b)本発明にかかるポリペプチドをコードする薬学的有効量のポリヌクレオチドを対象に投与する工程;又は、(c)本発明にかかるポリペプチドと特異的に結合する薬学的有効量の抗体又はその抗原結合断片を投与する工程を含む、対象における癌、例えば、結腸直腸癌を治療するための又は対象における免疫反応を刺激するための方法を提供する。
本発明は、例えば、本発明にかかるポリペプチドを抗原提示細胞と接触させる工程、又は、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド若しくはポリヌクレオチドを含むベクターを抗原提示細胞に導入し、次に、対象に抗原提示細胞を投与する工程を含む、対象における抗腫瘍免疫性を誘導するための方法も提供する。
治療薬の投与は、疾患リスクを有する(又は、疾患に対して感受性を有する)対象、又は、異なって発現される本発明にかかるポリヌクレオチドが関連する疾患を有する対象に対して、予防的又は治療的であり得る。本発明にかかるポリヌクレオチドの1以上の発現産物の発現、機能、又はその両方は、対象を予防的又は治療的に処置するために低下され得る。対象に、本発明にかかるポリヌクレオチドの発現を抑制又は低下させるポリヌクレオチド、例えば、アンチセンス分子又はsiRNA分子を、投与することにより、発現は抑制又は低下され得る。
本発明にかかるポリヌクレオチドに対応するアンチセンス分子及びsiRNAは、癌、例えば、結腸直腸癌の治療のために有用である。アンチセンス分子及びsiRNA分子は、標的配列に対して全体的に相補性であるか、又は、アンチセンス分子及びsiRNA分子が、標的配列と特異的にハイブリダイズし得る範囲で、1以上のヌクレオチドのミスマッチを有し得る。例えば、アンチセンス分子又はsiRNA分子は、本発明にかかるポリヌクレオチド又はその相補鎖に対して、少なくとも15連続ヌクレオチドの範囲に亘って、少なくとも80%又はそれ以上、より好ましくは90%又はそれ以上、さらにより好ましくは95%又はそれ以上の相同性を有するポリヌクレオチドを含む。当技術分野において公知のアルゴリズムを、相同性を測定するために使用し得る。
本発明にかかるアンチセンス分子、siRNA分子及びポリヌクレオチドは、標準的なベクター及び/又は遺伝子送達系によって対象に送達し得る。適当な遺伝子送達系としては、リポソーム、受容体介在型送達系、裸のDNA、及び、ウイルスベクター、例えば、特に、ヘルペスウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス、が挙げられる。
アンチセンス分子又はsiRNA分子は、本発明にかかるポリヌクレオチドの発現を抑制するので、本発明にかかるポリペプチドの生物学的活性を抑制するために有用である。したがって、本発明にかかるポリヌクレオチドを標的とするアンチセンス分子又はsiRNA分子を含む組成物は、癌、例えば、結腸直腸癌、を治療する場合に有用である。
本発明の別の実施形態において、本発明にかかるポリヌクレオチドの1以上の発現産物の機能は、発現産物と結合する又は発現産物の機能を抑制する化合物を投与することにより、抑制し得る。化合物は、例えば、本発明にかかるポリヌクレオチドの発現産物と特異的に結合する抗体であり得る。
利用し得る治療化合物としては、例えば、(i)配列番号1〜157のポリペプチド又はその断片;(ii)配列番号1〜157と特異的に結合する抗体又はその特異的結合断片;(iii)配列番号1〜157をコードするポリヌクレオチド又はその断片;(iv)配列番号1〜157をコードするポリヌクレオチド(又はその相補鎖)又はその断片に特異的なアンチセンス分子;(v)配列番号1〜157をコードするポリヌクレオチド(又はその相補鎖)又はその断片に特異的なsiRNA分子;及び、(vi)モジュレーター(すなわち、本発明にかかるポリペプチドとその結合パートナーとの間の相互作用を変化させる、阻害剤、アゴニスト及びアンタゴニスト)が挙げられる。
予防的医薬組成物の投与は、疾患又は障害が防がれるように、或いは、その進行が遅延させられるように、疾患又は障害に特徴的な症候の発現よりも前に起こり得る。
本発明は、本発明にかかるポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド、又はそのポリペプチドの免疫学的に活性な断片、又はそのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、又はその断片、を含む免疫学的組成物(すなわち、対象に抗体又はその他の免疫反応を誘発し得る組成物)を対象に投与する工程を含む、対象における癌、例えば、結腸直腸癌、の治療又は予防方法にも関する。ポリペプチドの投与は、対照において抗腫瘍免疫性を誘発し得る。一実施形態において、本発明にかかるポリペプチド又はその断片は、T細胞受容体(TCR)と結合した形態で投与してもよく、又は、マクロファージ、樹状細胞(DC)又はB細胞等の抗原提示細胞(APC)によって提供してもよい。
本発明において、癌、例えば、結腸直腸癌、に対する免疫学的組成物は、対象に接種した際に、抗腫瘍免疫性を誘発するように機能し得る。本発明にかかるポリペプチドは、癌、例えば、結腸直腸癌、に対する強力かつ特異的な免疫反応を誘発し得る。一般的に、抗腫瘍免疫性は、腫瘍に対する細胞傷害性リンパ球の誘導、腫瘍を認識する抗体の誘導、及び抗腫瘍サイトカイン産生の誘導を含む。
抗腫瘍免疫性は、本発明にかかる免疫学的組成物を投与することにより誘導され、抗腫瘍免疫性の誘導は、癌、例えば、結腸直腸癌、の治療及び予防を可能にする。
免疫学的活性を有する本発明にかかるポリペプチド又はそのポリペプチドをコードするベクターは、アジュバントと組み合わせてもよい。アジュバントは、免疫学的活性を有するポリペプチドと一緒に(又は連続的に)投与した場合に、ポリペプチドに対する免疫反応を増大し得る。免疫学的組成物は、全身的又は局所的に投与される。免疫学的組成物の投与は、単回投与によって行ってもよく、又は、複数回投与によって追加免疫してもよい。
別の態様において、本発明は、本明細書中に記載される1以上の治療化合物を含む医薬的、すなわち治療的、組成物を含む。医薬製剤は、経口、経直腸、経鼻、局所(例えば、口腔内及び舌下)、経膣、又は非経口(例えば、筋肉内、腹腔内、腫瘍内、皮下及び静脈内)投与、又は吸入若しくはガス注入による投与に適したものを含み得る。製剤は、適切な場合に、個別の投与単位で便利に提供し得るし、製薬学の技術分野において周知の方法のいずれかによって調製し得る。かかる製薬学的方法の全てには、活性化合物を、液体担体、又は細かく分離された固体担体、又は必要な場合にはその両方と結合させる工程、次に、必要な場合に、生成物を所望の製剤へと成形する工程を含む。
経口投与のための医薬製剤は、それぞれが予め決められた量の活性成分を含む、個別の単位、例えば、カプセル、カシェ剤、又は錠剤として;粉末又は顆粒として;溶液、懸濁液として、又は、乳濁液として便利に提供し得る。錠剤又はカプセルは、任意に、その中の活性成分が徐放又は放出制御されるように製剤化してもよい。活性成分はまた、ボーラス舐剤又はペーストとして提供してもよく、又、純粋な形態、すなわち、担体を含まない形態であってもよい。経口液体調製物は、例えば、水性又は油性懸濁液、溶液、乳濁液、シロップ又はエリキシルの形態であってもよく、又は、使用前に水若しくはその他の適当なビヒクルと構成させるための乾燥製品として提供してもよい。かかる液体調製物は、懸濁化剤、乳化剤、非水性ビヒクル(食用油も含み得る)、又は保存剤等の従来の添加剤を含んでもよい。
非経口投与のための製剤としては、抗酸化剤、バッファー、静菌剤、及び、製剤を意図される受容者の血液と等張にする溶質を含んでもよい、水性及び非水性の無菌注射溶液が挙げられる。製剤は、単位用量又は複数回用量用容器、例えば、密封されたアンプル及びバイアル中に入れて提供してもよいし、使用直前に、無菌液体担体、例えば、生理食塩水、注射用水、の添加のみを必要とするフリーズドライされた(凍結乾燥された)状態で保存してもよい。或いは、製剤は、持続注入のために提供してもよい。即時注射溶液及び懸濁液は、従前に記載された種類の無菌粉末、顆粒及び錠剤から調製してもよい。
経直腸投与のための製剤は、カカオバター又はポリエチレングリコール等の通常の担体を用いた坐剤として提供してもよい。口中の局所投与、例えば、口腔内投与又は舌下投与のための製剤としては、ショ糖等の風味基剤及びアカシア又はトラガカント中に活性成分を含むロゼンジ剤、並びに、ゼラチン及びグリセリン又はショ糖及びアカシア等の基剤中に活性成分を含むトローチ剤が挙げられる。経鼻投与のために、本発明にかかる化合物は、液状スプレー又は分散性パウダーとして、又はドロップの形態で使用し得る。ドロップは、1以上の分散剤、可溶化剤又は懸濁化剤をも含む水性又は非水性の基剤と一緒に製剤化し得る。液状スプレーは、加圧パックから便利に送達される。
吸入投与のために、化合物は、ガス注入器(insufflator)、ネブライザー、加圧パック、又はエアロゾルスプレーを送達するためのその他の便利な手段から、便利に送達される。加圧パックは、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素又はその他の適当なガス等の適当な噴射剤を含んでもよい。加圧エアロゾルの場合、用量単位は、定量を送達するためのバルブを装備することにより決定してもよい。
或いは、吸入又はガス注入による投与のために、化合物は、ドライパウダー組成物、例えば、化合物と、乳糖又はデンプン等の適当な粉体基剤との粉体混合物、の形態をとってもよい。粉体組成物は、単位投与形態として、例えば、吸入器又はガス注入器を用いて、粉体をそこから投与し得るカプセル、カートリッジ、ゼラチン又はブリスターパックとして提供してもよい。
所望の場合には、活性成分の持続的放出を可能にするために適合させた上記製剤を、使用してもよい。医薬組成物はまた、抗菌剤、免疫抑制剤又は保存剤等のその他の活性成分を含んでもよい。
上記条件のそれぞれに対して、組成物は、1日あたり、約0.1〜約250mg/kgの用量で、経口的に、又は注射によって投与してもよい。成人ヒトのための用量範囲は、通常、約5mg〜約17.5g/日、好ましくは、約5mg〜約10g/日、及び、最も好ましくは、約100mg〜約3g/日である。錠剤又は個別の単位で提供されるその他の単位投与形態は、かかる用量で又はその複数回の用量で有効である量、例えば、約5mg〜約500mg、通常は、約100mg〜約500mgを含む単位、を便利に含み得る。使用される用量は、対象の年齢及び性別、治療される正確な疾患、及びその重篤度を含む、多くの要素に依存し得る。
抗癌化合物のスクリーニング方法
本発明は、抗癌化合物、例えば、抗結腸直腸癌化合物、のためのスクリーニング方法を提供する。例えば、抗癌化合物は、試験化合物の存在下、第1の生物学的サンプル(例えば、癌サンプル)中におけるポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物のレベルを、試験化合物の非存在下、第2の生物学的サンプル(例えば、癌サンプル)中におけるポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物のレベルを比較することにより、同定し得る;この場合、ポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物は、例えば、配列番号1〜157からなる群より選択されるポリペプチド、又はこのポリペプチドをコードするmRNAを含む。第2の生物学的サンプルと比較した場合に、第1の生物学的サンプル中のポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物のレベルを低下させる試験化合物が、抗癌剤として同定される。本発明の一実施形態において、試験化合物は、第2の生物学的サンプル中の発現産物のレベルと比較した場合に、第1の生物学的サンプル中において、ポリペプチド又はポリヌクレオチド発現産物のレベルを、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%(又は、約10%と約90%の間の任意の値若しくは範囲)低下させる。
本発明の一実施形態において、抗癌化合物、例えば、抗結腸直腸癌化合物、のためのスクリーニングは、試験化合物の存在下、第1の生物学的サンプル中の本発明にかかるポリペプチドの生物学的活性のレベルを、試験化合物の非存在下、第2の生物学的サンプル中の生物学的活性のレベルと比較する工程を含み得;この場合、第2の生物学的サンプル中と比較した場合に、第1の生物学的サンプル中の生物学的活性のレベルを低下させる化合物が、抗癌剤として同定される。
本発明の一実施形態において、抗癌化合物、例えば、抗結腸直腸癌化合物、のためのスクリーニングは、a)試験化合物を、本発明にかかるポリペプチドと接触させる工程;b)ポリペプチドと試験化合物との間の結合活性を検出する工程;及び、c)ポリペプチドと結合する化合物を選択する工程、を含み得る。
本発明の一実施形態において、抗癌化合物、例えば、抗結腸直腸癌化合物、のためのスクリーニングは、a)候補化合物を、1以上の本発明にかかるポリペプチドを発現する試験細胞と接触させる工程;及び、b)1以上の本発明にかかるポリペプチドの発現レベルを低下させる化合物を選択する工程、を含み得る。試験細胞は、結腸直腸癌細胞を含み得る。
本発明の一実施形態において、抗癌化合物、例えば、抗結腸直腸癌化合物、のためのスクリーニングは、a)候補化合物を、転写調節領域の制御下で発現される1以上のマーカー遺伝子及びレポーター遺伝子の転写調節領域を含み、この場合、これら1以上のマーカー遺伝子が、配列番号1〜157をコードするポリヌクレオチドからなる群より選択されるベクターを導入された細胞と接触させる工程;)レポーター遺伝子の活性を測定する工程;及び、c)対照と比較した場合に、レポーター遺伝子の発現レベルを低下させる化合物を選択する工程、を含み得る。
本発明は、例えば、診断法において使用するためのキットを提供する。キットの成分は、例えば、化合物、試薬、容器及び/又は装置を含み得る。例えば、キット中の1つの容器は、本発明にかかるポリペプチドと特異的に結合するモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を含んでもよい。抗体又は抗原結合断片は、例えば、支持材に結合させ得る。1以上のさらなる容器は、アッセイにおいて使用するための試薬又はバッファー等の要素を含み得る。キットは、或いは、特異的な抗体の結合の直接的又は間接的検出に適したレポーター基を含む検出試薬をも含み得る。
或いは、キットは、例えば、生物学的サンプル中における本発明にかかるポリペプチドをコードするmRNAのレベルを検出するために使用し得る。かかるキットは、本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(又はその相補鎖)とハイブリダイズする、少なくとも1つ、2つ、又はそれ以上のポリヌクレオチドプローブ又はプライマーを含み得る。かかるポリヌクレオチドは、例えば、増幅アッセイ(例えば、RT−PCR)又はハイブリダイゼーションアッセイ内で使用し得る。かかるキット中に存在し得るさらなる構成要素は、第2のポリヌクレオチド、及び/又は、本発明にかかるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの検出を容易にするための診断試薬若しくは容器を含む。
本明細書中において例示的に記載される発明は、本明細書中に具体的に開示されない任意の要素又は限定の存在しない条件下で、適当に実施され得る。すなわち、例えば、本明細書中における各場合において、用語「含んでなる」、「から本質的に成る」、及び「から成る」のいずれも、これらの用語の通常の意味を変えることなく他の2つの用語のいずれかと交換してもよい。使用される用語及び表現は、限定の言葉としてではなく、記述の言葉として使用され、かかる用語及び表現を使用する場合、示され及び記載される特徴の任意の同等物又はその部分を除外することは全く意図されず、様々な変更が、請求される本発明の範囲において可能であることが認識される。したがって、本発明は、好ましい実施形態によって具体的に開示されているが、任意的な特徴、本明細書中で開示される概念の修飾及び変更を、当業者が用い得ること、及び、かかる修飾及び変更が、明細書及び添付される特許請求の範囲に規定される本発明の範囲内であると考えられること、を理解すべきである。
さらに、本発明の特徴又は態様が、マーカッシュグループ又はその他のグループ化方法で選択肢が記載されている場合、当業者であれば、それによって、本発明が、マーカッシュグループ又はその他のグループの任意の個別のメンバー又はサブグループによっても記載されていることが認識されるであろう。
本開示において引用されている全ての参考文献は、参照により、それら全体として本明細書中に組み込まれる。さらにまた、本明細書中において列記された、GenBank、ENSEMBL、UNIPARC、及びUniProt登録番号(及び、それに関連するデータ)の(本願の出願時における)内容は、参照により、それら全体として本明細書中に組み込まれる。
タイチン(TTN横紋筋肉腫抗原MU−RMS40としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q8WZ42−2(配列番号1)
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29341 tvencnrnda gkytltvenn sgsksitftv kvldtpgppg pitfkdvtrg satlmwdapl
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29461 yempepivat eqpapprrld vvdtskssav lawlkpdhdg gsritgylle mrqkgsdfwv
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29641 dsgryfltle ntagvktfsv tvvvigrpgp vtgpievssv saescvlswg epkdgggtei
29701 tnyivekres gttawqlvns svkrtqikvt hltkymeysf rvssenrfgv skplesapii
29761 aehpfvppsa ptrpevyhvs anamsirwee pyhdggskii gywvekkern tilwvkenkv
29821 pclecnykvt glvegleyqf rtyalnaagv skaseasrpi maqnpvdapg rpevtdvtrs
29881 tvsliwsapa ydggskvvgy iierkpvsev gdgrwlkcny tivsdnfftv talsegdtye
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30001 kpepkiiwtk gdkeldlcek vslqytgkra tavikfcdrs dsgkytltvk nasgtkavsv
30061 mvkvldspgp cgkltvsrvt qekctlawsl pqedggaeit hyiverrets rlnwvivege
30121 cptlsyvvtr liknneyifr vravnkygpg vpvesepiva rnsftipspp gipeevgtgk
30181 ehiiiqwtkp esdggneisn ylvdkrekks lrwtrvnkdy vvydtrlkvt slmegcdyqf
30241 rvtavnaagn sepseasnfi screpsytpg ppsaprvvdt tkhsislawt kpmydggtdi
30301 vgyvlemqek dtdqwyrvht natirnteft vpdlkmgqky sfrvaavnvk gmseysesia
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30421 dttesyslli vdkvnrydag kytieaenqs gkksatvlvk vydtpgpcps vkvkevsrds
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30601 ckagterwmk vvtlkptvle htvtslnege qylfriraqn ekgvsepret vtavtvqdlr
30661 vlptidlstm pqktihvpag rpvelvipia grpppaaswf fagsklrese rvtvethtkv
30721 akltiretti rdtgeytlel knvtgttset ikviildkpg pptgpikide idatsitisw
30781 eppeldggap lsgyvveqrd ahrpgwlpvs esvtrstfkf trltegneyv frvaatnrfg
30841 igsylqsevi ecrssiripg ppetlqifdv srdgmtltwy ppeddggsqv tgyiverkev
30901 radrwvrvnk vpvtmtryrs tgltegleye hrvtainarg sgkpsrpskp ivamdpiapp
30961 gkpqnprvtd ttrtsvslaw svpedeggsk vtgyliemqk vdqhewtkcn ttptkireyt
31021 lthlpqgaey rfrvlacnag gpgepaevpg tvkvtemley pdyelderyq egifvrqggv
31081 irltipikgk pfpickwtke gqdiskrami atsethtelv ikeadrgdsg tydlvlenkc
31141 gkkavyikvr vigspnspeg pleyddiqvr svrvswrppa ddggadilgy ilerrevpka
31201 awytidsrvr gtslvvkglk enveyhfrvs aenqfgiskp lkseepvtpk tplnppepps
31261 nppevldvtk ssvslswsrp kddggsrvtg yyierketst dkwvrhnktq itttmytvtg
31321 lvpdaeyqfr iiaqndvgls etspasepvv ckdpfdkpsq pgeleilsis kdsvtlqwek
31381 pecdggkeil gywveyrqsg dsawkksnke rikdkqftig glleateyef rvfaenetgl
31441 srprrtamsi ktkltsgeap girkemkdvt tklgeaaqls cqivgrplpd ikwyrfgkel
31501 iqsrkykmss dgrthtltvm teeqedegvy tciatnevge vetssklllq atpqfhpgyp
31561 lkekyygavg stlrlhvmyi grpvpamtwf hgqkllqnse nitientehy thlvmknvqr
31621 kthagkykvq lsnvfgtvda ildveiqdkp dkptgpivie allknsavis wkppaddggs
31681 witnyvvekc eakegaewql vssaisvttc rivnltenag yyfrvsaqnt fgisdplevs
31741 svviikspfe kpgapgkpti tavtkdscvv awkppasdgg akirnyylek rekkqnkwis
31801 vtteeiretv fsvknliegl eyefrvkcen lggesewsei sepitpksdv piqaphfkee
31861 lrnlnvryqs natlvckvtg hpkpivkwyr qgkeiiadgl kyriqefkgg yhqliiasvt
31921 dddatvyqvr atnqggsvsg taslevevpa kihlpktleg mgavhalrge vvsikipfsg
31981 kpdpvitwqk gqdlidnngh yqvivtrsft slvfpngver kdagfyvvca knrfgidqkt
32041 veldvadvpd pprgvkvsdv srdsvnltwt epasdggski tnyivekcat taerwlrvgq
32101 aretrytvin lfgktsyqfr viaenkfgls kpsepsepti tkedktramn ydeevdetre
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32221 keisilniar hrnilhlhes fesmeelvmi fefisgldif erintsafel nereivsyvh
32281 qvcealqflh shnighfdir peniiyqtrr sstikiiefg qarqlkpgdn frllftapey
32341 yapevhqhdv vstatdmwsl gtlvyvllsg inpflaetnq qiienimnae ytfdeeafke
32401 isieamdfvd rllvkerksr mtasealqhp wlkqkiervs tkvirtlkhr ryyhtlikkd
32461 lnmvvsaari scggairsqk gvsvakvkva sieigpvsgq imhavgeegg hvkyvckien
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32581 aelfvkgvre vydyycrrtm kkikrrtdtm rllerppeft lplynktayv genvrfgvti
32641 tvhpephvtw yksgqkikpg dndkkytfes dkglyqltin svttdddaey tvvarnkyge
32701 dsckakltvt lhppptdstl rpmfkrllan aecqegqsvc feirvsgipp ptlkwekdgq
32761 plslgpniei ihegldyyal hirdtlpedt gyyrvtatnt agstscqahl qverlrykkq
32821 efkskeeher hvqkqidktl rmaeilsgte svpltqvake alreaavlyk pavstktvkg
32881 efrleieekk eerklrmpyd vpeprkykqt tieedqrikq fvpmsdmkwy kkirdqyemp
32941 gkldrvvqkr pkrirlsrwe qfyvmplpri tdqyrpkwri pklsqddlei vrparrrtps
33001 pdydfyyrpr rrslgdisde elllpiddyl amkrteeerl rleeelelgf sasppsrspp
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33241 trprspspvs serslsrfer sarfdifsry esmkaalktq ktserkyevl sqqpftldha
33301 pritlrmrsh rvpcgqntrf ilnvqskpta evkwyhngve lqesskihyt ntsgvltlei
33361 ldchtddsgt yravctnykg easdyatldv tggdyttyas qrrdeevprs vfpeltrtea
33421 yavssfkkts emeasssvre vksqmtetre slssyehsas aemksaalee ksleeksttr
33481 kikttlaari ltkprsmtvy egesarfscd tdgepvptvt wlrkgqvlst sarhqvtttk
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33601 kspeavkspk rvkspepshp kavsptetkp tptekvqhlp vsappkitqf lkaeaskeia
33661 kltcvvessv lrakevtwyk dgkklkengh fqfhysadgt yelkinnlte sdqgeyvcei
33721 sgeggtsktn lqfmgqafks ihekvskise tkksdqktte stvtrktepk apepisskpv
33781 ivtglqdttv ssdsvakfav katgeprpta iwtkdgkait qggkyklsed kggffleihk
33841 tdtsdsglyt ctvknsagsv sssckltika ikdteaqkvs tqktseitpq kkavvqeeis
33901 qkalrseeik mseaksqekl alkeeaskvl iseevkksaa tsleksivhe eitktsqase
33961 evrthaeika fstqmsineg qrlvlkania gatdvkwvln gveltnseey rygvsgsdqt
34021 ltikqashrd egiltciskt kegivkcqyd ltlskelsda pafisqprsq ninegqnvlf
34081 tceisgepsp eiewfknnlp isissnvsis rsrnvyslei rnasvsdsgk ytikaknfrg
34141 qcsataslmv lplveepsre vvlrtsgdts lqgsfssqsv qmsaskqeas fssfssssas
34201 smtemkfasm saqsmssmqe sfvemssssf mgisnmtqle sstskmlkag irgippkiea
34261 lpsdisideg kvltvacaft geptpevtws cggrkihsqe qgrfhientd dlttliimdv
34321 qkqdgglytl slgnefgsds atvnihirsi
HBA1(例えば、GenBank登録番号P69905(配列番号2):
1 mvlspadktn vkaawgkvga hageygaeal ermflsfptt ktyfphfdls hgsaqvkghg
61 kkvadaltna vahvddmpna lsalsdlhah klrvdpvnfk llshcllvtl aahlpaeftp
121 avhasldkfl asvstvltsk yr
インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R)(例えば、GenBank登録番号P08069(配列番号3):
1 mksgsgggsp tslwgllfls aalslwptsg eicgpgidir ndyqqlkrle nctviegylh
61 illiskaedy rsyrfpkltv iteylllfrv agleslgdlf pnltvirgwk lfynyalvif
121 emtnlkdigl ynlrnitrga irieknadlc ylstvdwsli ldavsnnyiv gnkppkecgd
181 lcpgtmeekp mcekttinne ynyrcwttnr cqkmcpstcg kractennec chpeclgscs
241 apdndtacva crhyyyagvc vpacppntyr fegwrcvdrd fcanilsaes sdsegfvihd
301 gecmqecpsg firngsqsmy cipcegpcpk vceeekktkt idsvtsaqml qgctifkgnl
361 linirrgnni aselenfmgl ievvtgyvki rhshalvsls flknlrlilg eeqlegnysf
421 yvldnqnlqq lwdwdhrnlt ikagkmyfaf npklcvseiy rmeevtgtkg rqskgdintr
481 nngerasces dvlhftsttt sknriiitwh ryrppdyrdl isftvyykea pfknvteydg
541 qdacgsnswn mvdvdlppnk dvepgillhg lkpwtqyavy vkavtltmve ndhirgakse
601 ilyirtnasv psipldvlsa snsssqlivk wnppslpngn lsyyivrwqr qpqdgylyrh
661 nycskdkipi rkyadgtidi eevtenpkte vcggekgpcc acpkteaekq aekeeaeyrk
721 vfenflhnsi fvprperkrr dvmqvanttm ssrsrnttaa dtynitdpee leteypffes
781 rvdnkertvi snlrpftlyr idihscnhea eklgcsasnf vfartmpaeg addipgpvtw
841 eprpensifl kwpepenpng lilmyeikyg sqvedqrecv srqeyrkygg aklnrlnpgn
901 ytariqatsl sgngswtdpv ffyvqaktgy enfihliial pvavllivgg lvimlyvfhr
961 krnnsrlgng vlyasvnpey fsaadvyvpd ewevarekit msrelgqgsf gmvyegvakg
1021 vvkdepetrv aiktvneaas mrerieflne asvmkefnch hvvrllgvvs qgqptlvime
1081 lmtrgdlksy lrslrpemen npvlappsls kmiqmageia dgmaylnank fvhrdlaarn
1141 cmvaedftvk igdfgmtrdi yetdyyrkgg kgllpvrwms peslkdgvft tysdvwsfgv
1201 vlweiatlae qpyqglsneq vlrfvmeggl ldkpdncpdm lfelmrmcwq ynpkmrpsfl
1261 eiissikeem epgfrevsfy yseenklpep eeldlepenm esvpldpsas ssslplpdrh
1321 sghkaengpg pgvlvlrasf derqpyahmn ggrkneralp lpqsstc
ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q9Y493−1(配列番号4):
1 mvppvwtlll lvgaalfrke kppdqklvvr ssrdnyvltq cdfeddakpl cdwsqvsadd
61 edwvrasgps ptgstgapgg ypngegsylh mesnsfhrgg varllspdlw eqgplcvhfa
121 hhmfglswga qlrllllsge egrrpdvlwk hwntqrpswm lttvtvpagf tlptrlmfeg
181 trgstayldi aldalsirrg scnrvcmmqt csfdipndlc dwtwiptasg akwtqkkgss
241 gkpgvgpdgd fsspgsgcym lldpknarpg qkavllspvs lssgclsfsf hyilrgqspg
301 aalhiyasvl gsirkhtlfs gqpgpnwqav svnytavgri qfavvgvfgk tpepavavda
361 tsiapcgegf pqcdfednah pfcdwvqtsg dgghwalghk ngpvhgmgpa ggfpnagghy
421 iyleadefsh agqsvrlvsr pfcapgdicv efayhmyglg egtmlelllg spagsppipl
481 wkrvgsqrpy wqntsvtvps ghqqpmqlif kgiqgsntas vvamgfilin pgtcpvkvlp
541 elppvspvss tgpsettglt enptistkkp tvsiekpsvt tekptvpkek ptiptekpti
601 stekptipse kpnmpsekpt ipsekptilt ekptipsekp tipsekptis tekptvptee
661 pttpteettt smeepvipte kpsiptekps iptekptism eetiistekp tispekptip
721 tekptiptek stispekptt ptekptipte kptispekpt tptekptisp ekltiptekp
781 tiptekptip tekptistee pttpteetti stekpsipme kptlpteett tsveettist
841 ekltipmekp tistekptip tekptispek ltipteklti ptekptipie ettisteklt
901 iptekptisp ekptistekp tiptekptip teettistek ltiptekpti spekltipte
961 kptistekpt iptekltipt ekptiptekp tiptekltal rpphpsptat glaalvmsph
1021 apstpmtsvi lgttttsrss tercppnary escacpasck sprpscgplc regcvcnpgf
1081 lfsdnhciqa sscncfynnd yyepgaewfs pnctehcrcw pgsrvecqis qcgthtvcql
1141 kngqygchpy agtatclvyg dphyvtfdgr hfgfmgkcty ilaqpcgnst dpffrvtakn
1201 eeqgqegvsc lskvyvtlpe stvtllkgrr tlvggqqvtl paipskgvfl gasgrfvelq
1261 tefglrvrwd gdqqlyvtvs stysgklcgl cgnydgnsdn dhlkldgspa gdkeelgnsw
1321 qtdqdedqec qkyqvvnsps cdsslqssms gpgfcgrlvd thgpfetcll hvkaasffds
1381 cmldmcgfqg lqhllcthms tmtttcqdag havkpwreph fcpmacppns kyslcakpcp
1441 dtchsgfsgm fcsdrcveac ecnpgfvlsg leciprsqcg clhpagsyfk vgerwykpgc
1501 kelcvcesnn rircqpwrcr aqefcgqqdg iygchaqgaa tctasgdphy ltfdgalhhf
1561 mgtctyvltr pcwsrsqdsy fvvsatnenr ggilevsyik avhvtvfdls isllrgckvm
1621 lnghrvalpv wlaqgrvtir lssnlvllyt nfglqvrydg shlvevtvps syggqlcglc
1681 gnynnnsldd nlrpdrklag dsmqlgaawk lpessepgcf lvggkpsscq ensmadawnk
1741 ncailinpqg pfsqchqvvp pqssfascvh gqcgtkgdtt alcrslqaya slcaqagqap
1801 awrnrtfcpm rcppgssysp csspcpdtcs sinnprdcpk alpcaescec qkghilsgts
1861 cvplgqcgct dpagsyhpvg erwytentct rlctcsvhnn itcfqstckp nqicwaldgl
1921 lhcrasgvgv cqlpgeshyv sfdgsnhsip dactlvlvkv chpamalplf kisakhekee
1981 ggteafrlhe vyidiydaqv tlqkghrvli nskqvtlpai sqipgvsvks ssiytivnik
2041 igvqvkfdgn hlleieiptt yygkvcgmcg nfndeeedel mmpsdevans dsefvnswkd
2101 kdidpscqsl pvdeqqipae qqenpsgncr aadlrrarek ceaalrapvw aqcasridlt
2161 pflvdcantl cefgglyqal cqalqafgat cqsqglkppl wrnssfcple cpayssytnc
2221 lpscspscwd ldgrcegakv psacaegcic qpgyvlsedk cvprsqcgck dahggsiplg
2281 kswvssgcte kcvctggaiq cgdfrcpsgs hcqltsdnsn sncvsdkseq csvygdpryl
2341 tfdgfsyrlq grmtyvlikt vdvlpegvep llvegrnkmd pprssiflqe vittvygykv
2401 qlqaglelvv nnqkmavpyr pnehlrvtlr gqrlylvtdf elvvsfggrk navislpsmy
2461 eglvsglcgn ydknrkndmm lpsgaltqnl ntfgnswevk tedallrfpr aipaeeegqg
2521 aelglrtglq vsecspeqla snstqacrvl adpqgpfaac hqtvapepfq ehcvldlcsa
2581 qdpreqeelr cqvlsghgvs sryhiselyd tlpsilcqpg rprglrgplr grlrqhprlc
2641 lqwhpeppla dcgctsngiy yqlgssflte dcsqrctcas srillcepfs cragevctlg
2701 nhtqgcfpes pclqnpcqnd gqcreqgatf tcecevgygg glcmeprdap pprkpasnlv
2761 gvllgllvpv vvvllavtre ciyrtrrkre ktqegdrlar lvdtdtvldc ac
潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4)(例えば、GenBank登録番号A6NCG8(配列番号5):
mplanhrdde hgvasmvsvh vehpqeasvv vhqvervsgp weeadaeava 50
raeaaaraea aapytvlaqs apredgysda sgfgycfrel rggecasplp 100
glrtqevccr gaglawgvhd cqlcserlgn servsapdgp cptgfervng 150
scedvdecat ggrcqhgeca ntrggytcvc pdgflldssr sscisqhvis 200
eakgpcfrvl rdggcslpil rnitkqiccc srvgkawgrg cqlcppfgse 250
gfreicpagp gyhysasdlr yntrplgqep prvslsqprt lpatsrpsag 300
flpthrlepr peprpdprpg pelplpsipa wtgpeipesg pssgmcqrnp 350
qvcgpgrcis rpsgytcacd sgfrlspqgt rcidvdecrr vpppcapgrc 400
enspgsfrcv cgpgfragpr aaecldvdec hrvpppcdlg rcentpgsfl 450
cvcpagyqaa phgascqdvd ectqspglcg rgacknlpgs frcvcpagfr 500
gsaceedvde caqepppcgp grcdntagsf hcacpagfrs rgpgapcqdv 550
decarspppc tygrcenteg sfqcvcpmgf qpntagsece dvdecenhla 600
cpgqecvnsp gsfqcrtcps ghhlhrgrct dvdecssgap pcgphghctn 650
tegsfrcsca pgyrapsgrp gpcadvnecl egdfcfphge clntdgsfac 700
tcapgyrpgp rgascldvde cseedlcqsg ictntdgsfe cicppghrag 750
pdlascldvd ecrergpalc gsqrcenspg syrcvrdcdp gyhagpegtc 800
ddvdecqeyg peicgaqrce ntpgsyrctp acdpgyqptp gggcqdvdec 850
rnrsfcgaha vcqnlpgsfq clcdqyegar dgrhcvdvne cetlqgvcga 900
alcenvegsf lcvcpnspee fdpmtgrcvp prtsagtfpg sqpqapaspv 950
lparpppppl prrpstprqg pvgsgrrecy fdtaapdacd nilarnvtwq 1000
eccctvgegw gsgcriqqcp gtetaeyqsl cphgrgylap sgdlslrrdv 1050
decqlfrdqv cksgvcvnta pgyscycsng yyyhtqrlec idndecadee 1100
paceggrcvn tvgsyhctce pplvldgsqr rcvsnesqsl ddnlgvcwqe 1150
vgadlvcshp rldrqatyte ccclygeawg mdcalcpaqd sddfealcnv 1200
lrppaysppr pggfglpyey gpdlgppyqg lpygpelypp palpydpypp 1250
ppgpfarrea pygaprfdmp dfeddggpyg eseapappgp gtrwpyrsrd 1300
trrsfpepee ppeggsyags laepyeelea eecgildgct ngrcvrvpeg 1350
ftcrcfdgyr ldmtrmacvd inecdeaeaa splcvnarcl ntdgsfrcic 1400
rpgfapthqp hhcaparpra 1420
ASXL1(付加的性コーム様1)(例えば、GenBank登録番号Q8IXJ9−1(配列番号6):
1 mkdkqkkkke rtwaeaarlv lenysdapmt pkqilqviea eglkemrsgt splaclnaml
61 hsnsrggegl fyklpgrisl ftlkkdalqw srhpatvege epedtadves cgsneastvs
121 gendvsldet ssnascstes qsrplsnprd syrassqank qkkktgvmlp rvvltplkvn
181 gahvesasgf sgchadgesg spsssssgsl algsaairgq aevtqdpapl lrgfrkpatg
241 qmkrnrgeei dfetpgsilv ntnlralins rtfhalpshf qqqllfllpe vdrqvgtdgl
301 lrlsssalnn effthaaqsw rerladgeft hemqvrirqe mekekkveqw kekffedyyg
361 qklgltkees lqqnvgqeea eiksglcvpg esvriqrgpa trqrdghfkk rsrpdlrtra
421 rrnlykkqes eqagvakdak svasdvplyk dgeaktdpag lssphlpgts saapdlegpe
481 fpvesvasri qaepdnlara saspdripsl pqetvdqepk dqkrksfeqa asasfpekkp
541 rledrqsfrn tiesvhtekp qptkeepkvp piriqlsrik ppwvvkgqpt yqicpriipt
601 tesscrgwtg artladikar alqvrgargh hchreaatta igggggpggg gggatdeggg
661 rgsssgdgge acghpeprgg pstpgkctsd lqrtqllppy plngehtqag tamsrarred
721 lpslrkeesc llqratvglt dglgdasqlp vaptgdqpcq alpllssqts vaerlveqpq
781 lhpdvrtece sgttswesdd eeqgptvpad ngpipslvgd dtlekgtgqa ldshptmkdp
841 vnvtpsstpe ssptdclqnr afddelglgg scppmresdt rqenlktkal vsnsslhwip
901 ipsndevvkq pkpesrehip svepqvgeew ekaaptppal pgdltaeegl dpldsltslw
961 tvpsrggsds ngsycqqvdi eklkingdse alsphgestd tasdfeghlt edsseadtre
1021 aavtkgssvd kdekpnwnqs aplskvngdm rlvtrtdgmv apqswvsrvc avrqkipdsl
1081 llasteyqpr avclsmpgss veatnplvmq llqgslplek vlppahddsm sespqvpltk
1141 dqshgslrmg slhglgknsg mvdgsspssl ralkepllpd scetgtglar ieatqapgap
1201 qknckavpsf dslhpvtnpi tssrkleemd skeqfssfsc edqkevrams qdsnsnaapg
1261 kspgdlttsr tprfsspnvi sfgpeqtgra lgdqsnvtgq gkklfgsgnv aatlqrprpa
1321 dpmplpaeip pvfpsgklgp stnsmsggvq tpredwapkp hafvgsvkne ktfvggplka
1381 naenrkatgh splelvghle gmpfvmdlpf wklprepgkg lseplepssl psqlsikqaf
1441 ygklsklqls stsfnyssss ptfpkglags vvqlshkanf gashsaslsl qmftdsstve
1501 sislqcacsl kamimcqgcg afchddcigp sklcvlclvv r
βグロビン(HBB)(例えば、GenBank登録番号P68871(配列番号7):
1 mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61 vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
BMP15−骨形成タンパク質(例えば、GenBank登録番号NM_005448.1(UniProt登録番号O95972も参照されたい)(配列番号8):
1 mvllsilril flcelvlfme hraqmaeggq ssiallaeap tlplieelle espgeqprkp
61 rllghslrym lelyrrsads hghprenrti gatmvrlvkp ltnvarphrg twhiqilgfp
121 lrpnrglyql vratvvyrhh lqltrfnlsc hvepwvqknp tnhfpssegd sskpslmsna
181 wkemditqlv qqrfwnnkgh rilrlrfmcq qqkdsgglel whgtssldia flllyfndth
241 ksirkakflp rgmeefmere sllrrtrqad gisaevtass skhsgpennq cslhpfqisf
301 rqlgwdhwii appfytpnyc kgtclrvlrd glnspnhaii qnlinqlvdq svprpscvpy
361 kyvpisvlmi eangsilyke yegmiaesct cr
TRIM49(RNF18;三部分モチーフ含有49としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q9NS80(配列番号9):
1 mnsgilqvfq gelicplcmn yfidpvtidc ghsfcrpcfy lnwqdipflv qcsectkste
61 qinlktnihl kkmaslarkv slwlflssee qmcgthretk kifcevdrsl lcllcsssqe
121 hryhrhrpie waaeehrekl lqkmqslwek acenhrnlnv ettrtrcwkd yvnlrleair
181 aeyqkmpafh heeekhnlem lkkkgkeifh rlhlskakma hrmeilrgmy eelnemchkp
241 dvellqafgd ilhrsesvll hmpqplnpel sagpitglrd rlnqfrvhit lhheeanndi
301 flyeilrsmc igcdhqdvpy ftatprsfla wgvqtftsgk yywevhvgds wnwafgvcnm
361 yrkeknqnek idgkaglfll gcvkndiqcs lfttsplmlq yipkptsrvg lfldceaktv
421 sfvdvnqssl iytipncsfs pplrpifcci hf
DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体(例えば、GenBank登録番号Q9UBS4(配列番号10):
1 mapqnlstfc llllyligav iagrdfykil gvprsasikd ikkayrklal qlhpdrnpdd
61 pqaqekfqdl gaayevlsds ekrkqydtyg eeglkdghqs shgdifshff gdfgfmfggt
121 prqqdrnipr gsdiivdlev tleevyagnf vevvrnkpva rqapgkrkcn crqemrttql
181 gpgrfqmtqe vvcdecpnvk lvneertlev eiepgvrdgm eypfigegep hvdgepgdlr
241 frikvvkhpi ferrgddlyt nvtislvesl vgfemdithl dghkvhisrd kitrpgaklw
301 kkgeglpnfd nnnikgslii tfdvdfpkeq lteearegik qllkqgsvqk vynglqgy
未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027(MDS027 hHBrk1 HSPC300としても知られる)(例えば、GenBank登録番号Q9NZ47(配列番号11):
1 mrgidtpsdr kkslkmslqa kwgpgldlsk strnwwvsnn ilwqphcqgm svltrtaphf
61 ppkvgrrqrl fteavqrq
未同定タンパク質ALB(例えば、GenBank登録番号A6NBZ8(配列番号12):
mkwvtfisll flfssaysrg vfrrdahkse vahrfkdlge enfkalvlia 50
faqylqqcpf edhvklvnev tefaktcvad esaencdksl htlfgdklct 100
vatlretyge madccakqep ernecflqhk ddnpnlprlv rpevdvmcta 150
fhdneetflk kylyeiarrh pyfyapellf fakrykaaft eccqaadkaa 200
cllpkldelr degkassakq rlkcaslqkf gerafkawav arlsqrfpka 250
efaevsklvt dltkvhtecc hgdllecadd radlakyice nqdsissklk 300
eccekpllek shciaevend empadlpsla adfveskdvc knyaeakdvf 350
lgmflyeyar rhpdysvvll lrlaktyett lekccaaadp hecyakvfde 400
fkplveepqn likqncelfe qlgeykfqna llvrytkkvp qvstptlvev 450
srnlgkvgsk cckhpeakrm pcaedylsvv lnqlcvlhek tpvsdrvtkc 500
cteslvnrrp cfsalevdet yvpkefnaet ftfhadictl sekerqikkq 550
talvelvkhk pkatkeqlka vmddfaafve kcckaddket cfaeegqktc 600
cckssclrli tshlkasqpt mrirerk 627
sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q8TER0−4(配列番号13):
1 mrhgvawall vaaalglgar gvrgavalad fypfgaergd avtpkqddgg sglrplsvpf
61 pffgaehsgl yvnnngiisf lkevsqftpv afpiakdrcv vaafwadvdn rragdvyyre
121 atdpamlrra tedvrhyfpe lldfnatwvf vatwyrvtff ggsssspvnt fqtvlitdgk
181 lsftifnyes ivwttgthas sggnatglgg iaaqagfnag dgqryfsipg srtadmaeve
241 tttnvgvpgr wafriddaqv rvggcghtts vclalrpcln ggkciddcvt gnpsytcscl
301 sgftgrrchl dvnecasqpc qnggtcthgi nsfrcqcpag fggptcetaq spcdtkecqh
361 ggqcqvengs avcvcqagyt gaacemdvdd cspdpclngg scvdlvgnyt clcaepfkgl
421 rcetgdhpvp daclsapchn ggtcvdadqg yvcecpegfm gldcrervpd dcecrnggrc
481 lganttlcqc plgffgllce feitampcnm ntqcpdggyc mehggsylcv chtdhnashs
541 lpspcdsdpc fnggscdahd dsytcecprg fhgkhcekar phlcssgpcr nggtckeagg
601 eyhcscpyrf tgrhceigkp dscasgpchn ggtcfhyigk ykcdcppgfs grhceiapsp
661 cfrspcvngg tcedrdtdff chcqagymgr rcqaevdcgp peevkhatlr fngtrlgava
721 lyacdrgysl sapsrirvcq phgvwseppq cleidecrsq pclhggscqd rvagylclcs
781 tgyegahcel erdecrahpc rnggscrnlp gayvcrcpag fvgvhcetev dacdsspcqh
841 ggrcesggga ylcvcpesff gyhcetvsdp cfsspcggrg yclasngshs ctckvgytge
901 dcakelfppt alkmervees gvsiswnppn gpaarqmldg yavtyvssdg syrrtdfvdr
961 trsshqlqal aagraynisv fsvkrnsnnk ndisrpavll artrprpveg fevtnvtast
1021 isvqwalhri rhatvsgvrv sirhpealrd qatdvdrsvd rftfrallpg krytiqlttl
1081 sglrgeehpt eslatapthv wtrplppanl taarvtatsa hvvwdaptpg slleayvinv
1141 ttsqstksry vpngklasyt vrdllpgrry qlsviavqst elgpqhsepa hlyiitsprd
1201 gadrrwhqgg hhprvlknrp pparlpelrl lndhsapetp tqpprfselv dgrgrvsarf
1261 ggspskaatv rsqptasaql enmeeapkrv slalqlpehg skdignvpgn csenpcqngg
1321 tcvpgadahs cdcgpgfkgr rcelacikvs rpctrlfset kafpvweggv chhvykrvyr
1381 vhqdicfkes cestslkktp nrkqsksqtl eks
ペリフェリンのアイソフォーム2(例えば、GenBank登録番号P41219−2(配列番号14):
1 mshhpsglra gfsstsyrrt fgpppslspg afsyssssrf sssrllgsas psssvrlgsf
61 rspragagal lrlpserldf smaealnqef latrsnekqe lqelndrfan fiekvrfleq
121 qnaalrgels qargqepara dqlcqqelre lrrelellgr erdrvqverd glaedlaalk
181 qrleeetrkr edaehnlvlf rkdvddatls rlelerkies lmdeieflkk lheeelrdlq
241 vsvesqqvqq veveatvkpe ltaalrdira qyesiaaknl qeaeewyksk yadlsdaanr
301 nhealrqakq emnesrrqiq sltcevdglr gtneallrql releeqfale aggyqagaar
361 leeelrqlke emarhlreyq ellnvkmald ieiatyrkll egeesrisvp vhsfaslnik
421 ttvpeveppq dshsrktvli ktietrngev vtesqkeqrs eldkssahsy
ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22(例えば、GenBank登録番号P82650(配列番号15):
1 maplgttvll wsllrsspgv ervcfrariq pwhggllqpl pcsfemglpr rrfsseaaes
61 gspetkkptf mdeevqsilt kmtglnlqkt fkpaiqelkp ptyklmtqaq leeatrqave
121 aakvrlkmpp vleervpind vlaedkileg tettkyvftd isysiphrer fivvrepsgt
181 lrkasweerd rmiqvyfpke grkiltpiif keenlrtmys qdrhvdvlnl cfaqfepdst
241 eyikvhhkty edidkrgkyd llrstryfgg mvwyfvnnkk idgllidqiq rdliddatnl
301 vqlyhvlhpd gqsaqgakdq aaeginlikv fakteaqkga yieltlqtyq ealsrhsaas
翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε(例えば、GenBank登録番号Q13144(配列番号16):
1 maapvvappg vvvsrankrs gagpggsggg gargaeeepp pplqavlvad sfdrrffpis
61 kdqprvllpl anvalidytl efltatgvqe tfvfccwkaa qikehllksk wcrptslnvv
121 riitselyrs lgdvlrdvda kalvrsdfll vygdvisnin itraleehrl rrkleknvsv
181 mtmifkessp shptrchedn vvvavdsttn rvlhfqktqg lrrfafplsl fqgssdgvev
241 rydlldchis icspqvaqlf tdnfdyqtrd dfvrgllvne eilgnqihmh vtakeygarv
301 snlhmysavc advirrwvyp ltpeanftds ttqscthsrh niyrgpevsl ghgsileenv
361 llgsgtvigs ncfitnsvig pgchigdnvv ldqtylwqgv rvaagaqihq sllcdnaevk
421 ervtlkprsv ltsqvvvgpn itlpegsvis lhppdaeede ddgefsddsg adqekdkvkm
481 kgynpaevga agkgylwkaa gmnmeeeeel qqnlwglkin meeesesese qsmdseepds
541 rggspqmddi kvfqnevlgt lqrgkeenis cdnlvleins lkyaynislk evmqvlshvv
601 lefplqqmds pldssrycal llpllkawsp vfrnyikraa dhlealaaie dfflehealg
661 ismakvlmaf yqleilaeet ilswfsqrdt tdkgqqlrkn qqlqrfiqwl keaeeessed
721 d
エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1(例えば、GenBank登録番号P14061(配列番号17):
1 martvvlitg cssgiglhla vrlasdpsqs fkvyatlrdl ktqgrlweaa ralacppgsl
61 etlqldvrds ksvaaarerv tegrvdvlvc naglgllgpl ealgedavas vldvnvvgtv
121 rmlqaflpdm krrgsgrvlv tgsvgglmgl pfndvycask faleglcesl avlllpfgvh
181 lsliecgpvh tafmekvlgs peevldrtdi htfhrfyqyl ahskqvfrea aqnpeevaev
241 fltalrapkp tlryftterf lpllrmrldd psgsnyvtam hrevfgdvpa kaeagaeagg
301 gagpgaedea grsavgdpel gdppaapq
XRCC6BP1(例えば、GenBank登録番号Q8N4L5(配列番号18):
1 magapderrr gpaageqlqq qhvscqvfpe rlaqgnpqqg ffssfftcnq kcqlrllktl
61 etsrshdlea vvpqngsetg warkglgntw pgasgsaqsl drlgimgagl ga
脳特異的血管新生阻害物質1前駆体(例えば、GenBank登録番号O14514(配列番号19):
1 mrgqaaapgp vwilapllll llllgrrara aagadagpgp epcatlvqgk ffgyfsaaav
61 fpanasrcsw tlrnpdprry tlymkvakap vpcsgpgrvr tyqfdsfles trtylgvesf
121 devlrlcdps aplaflqask qflqmrrqqp pqhdglrpra gppgptddfs veylvvgnrn
181 psraacqmlc rwldaclags rsshpcgimq tpcaclggea ggpaagplap rgdvclrdav
241 aggpenclts ltqdrgghga tggwklwslw gectrdcggg lqtrtrtclp apgvegggce
301 gvleegrqcn reacgpagrt ssrsqslrst darrreelgd elqqfgfpap qtgdpaaeew
361 spwsvcsstc gegwqtrtrf cvsssystqc sgplreqrlc nnsavcpvhg awdewspwsl
421 csstcgrgfr drtrtcrppq fggnpcegpe kqtkfcnial cpgravdgnw newsswsacs
481 ascsqgrqqr trecngpsyg gaecqghwve trdcflqqcp vdgkwqawas wgscsvtcga
541 gsqrrervcs gpffggaacq gpqdeyrqcg tqrcpephei cdednfgavi wketpageva
601 avrcprnatg lilrrcelde egiayweppt yircvsidyr niqmmtrehl akaqrglpge
661 gvseviqtlv eisqdgtsys gdllstidvl rnmteifrra yysptpgdvq nfvqilsnll
721 aeenrdkwee aqlagpnake lfrlvedfvd vigfrmkdlr dayqvtdnlv lsihklpasg
781 atdisfpmkg wratgdwakv pedrvtvsks vfstgltead easvfvvgtv lyrnlgsfla
841 lqrnttvlns kvisvtvkpp prslrtplei efahmyngtt nqtcilwdet dvpsssappq
901 lgpwswrgcr tvpldalrtr clcdrlstfa ilaqlsadan mekatlpsvt livgcgvssl
961 tllmlviiyv svwryirser svilinfcls iissnalili gqtqtrnkvm ctlvaaflhf
1021 fflssfcwvl teawqsymav tghlrnrlir krflclgwgl palvvaisvg ftkakgystm
1081 nycwlslegg llyafvgpaa avvlvnmvig ilvfnklvsk dgitdkklke ragaslwssc
1141 vvlpllaltw msavlavtdr rsalfqilfa vfdslegfvi vmvhcilrre vqdavkcrvv
1201 drqeegngds ggsfqnghaq lmtdfekdvd lacrsvlnkd iaacrtatit gtlkrpslpe
1261 eeklklahak gpptnfnslp anvsklhlhg sprypggplp dfpnhsltlk rdkapkssfv
1321 gdgdifkkld selsraqeka ldtsyvilpt atatlrpkpk eepkysihid qmpqtrlihl
1381 stapeaslpa rsppsrqpps ggppeappaq pppppppppp ppqqplpppp nlepappslg
1441 dpgepaahpg pstgpstkne nvatlsvssl errksryael dfekimhtrk rhqdmfqdln
1501 rklqhaaekd kevlgpdskp ekqqtpnkrp weslrkahgt ptwvkkelep lqpsplelrs
1561 vewersgati plvgqdiidl qtev
リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2(例えば、GenBank登録番号Q9HBD1−2(配列番号20):
1 mpvqaaqwte flscpicyne fdenvhkpis lgcshtvckt clnklhrkac pfdqtaintd
61 idvlpvnfal lqlvgaqvpd hqsiklsnlg enkhyevakk cvedlalylk plsggkgvas
121 lnqsalsrpm qrklvtlvnc qlveeegrvr amraarslge rtvtelilqh qnpqqlsanl
181 waavrargcq flgpamqeea lklvllaled gsalsrkvlv lfvvqrlepr fpqasktsig
241 hvvqllyras cfkvtkrded sslmqlkeef rsyealrreh daqivhiame aglrispeqw
301 ssllygdlah kshmqsiidk lqspesfaks vqeltivlqr tgdpanlnrl rphlellani
361 dpnpdavspt weqlenamva vktvvhglvd fiqnysrkgh etpqpqpnsk yktsmcrdlr
421 qqggcprgtn ctfahsqeel ekyrlrnkki natvrtfpll nkvgvnntvt ttagnvisvi
481 gstettgkiv pstngisnae nsvsqlisrs tdstlralet vkkvgkvgan gqnaagpsad
541 svtenkigsp pktpvsnvaa tsagpsnvgt elnsvpqkss pfltrvpvyp phseniqyfq
601 dprtqipfev pqypqtgyyp ppptvpagva pcvprfvrsn nvpesslppa smpyadhyst
661 fsprdrmnss pyqppppqpy gpvppvpsgm yapvydsrri wrppmyqrdd iirsnslppm
721 dvmhssvyqt slrerynsld gyysvacqpp seprttvplp repcghlkts ceeqirrkpd
781 qwaqyhtqka plvsstlpva tqsptppspl fsvdfradfs esvsgtkfee dhlshyspws
841 cgtigscina idsepkdvia nsnavlmdld sgdvkrrvhl fetqrrtkee dpiipfsdgp
901 iiskwgaisr ssrtgyhttd pvqatasqgs atkpisvsdy vpyvnavdsr wssygneats
961 sahyverdrf ivtdlsghrk hsstgdllsl elqqaksnsl llqreanala mqqkwnslde
1021 grhltlnlls keielrngel qsdytedatd tkpdrdiele lsaldtdepd gqsepieeil
1081 diqlgissqn dqllngmave nghpvqqhqk eppkqkkqsl gedhvileeq ktilpvtscf
1141 sqplpvsisn asclpittsv sagnlilkth vmsedkndfl kpvangkmvn s
ヘモグロビンサブユニットβ(例えば、GenBank登録番号P68871(配列番号21):
1 mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61 vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q96AE4−1(配列番号22):
1 madystvppp ssgsaggggg ggggggvnda fkdalqrarq iaakiggdag tslnsndygy
61 ggqkrpledg dqpdakkvap qndsfgtqlp pmhqqqsrsv mteeykvpdg mvgfiigrgg
121 eqisriqqes gckiqiapds gglperscml tgtpesvqsa krlldqivek grpapgfhhg
181 dgpgnavqei mipaskaglv igkggetikq lqeragvkmv miqdgpqntg adkplritgd
241 pykvqqakem vlelirdqgg frevrneygs riggnegidv piprfavgiv igrngemikk
301 iqndagvriq fkpddgttpe riaqitgppd rcqhaaeiit dllrsvqagn pggpgpggrg
361 rgrgqgnwnm gppgglqefn fivptgktgl iigkggetik sisqqsgari elqrnpppna
421 dpnmklftir gtpqqidyar qlieekiggp vnplgppvph gphgvpgphg ppgppgpgtp
481 mgpynpapyn pgppgpaphg ppapyapqgw gnayphwqqq appdpakagt dpnsaawaay
541 yahyyqqqaq pppaapagap tttqtngqgd qqnpapagqv dytkaweeyy kkmgqavpap
601 tgappggqpd ysaawaeyyr qqaayyaqts pqgmpqhppa pqgq
ガレクチン−3(例えば、GenBank登録番号P17931(配列番号23):
1 madnfslhda lsgsgnpnpq gwpgawgnqp agaggypgas ypgaypgqap pgaypgqapp
61 gayhgapgay pgapapgvyp gppsgpgayp ssgqpsapga ypatgpygap agplivpynl
121 plpggvvprm litilgtvkp nanrialdfq rgndvafhfn prfnennrrv ivcntkldnn
181 wgreerqsvf pfesgkpfki qvlvepdhfk vavndahllq ynhrvkklne isklgisgdi
241 dltsasytmi
リゾチームC前駆体(例えば、GenBank登録番号P61626(配列番号24):
1 mkalivlglv llsvtvqgkv fercelartl krlgmdgyrg islanwmcla kwesgyntra
61 tnynagdrst dygifqinsr ywcndgktpg avnachlscs allqdniada vacakrvvrd
121 pqgirawvaw rnrcqnrdvr qyvqgcgv
アクチン,α骨格筋(例えば、GenBank登録番号P68133(配列番号25):
1 mcdedettal vcdngsglvk agfagddapr avfpsivgrp rhqgvmvgmg qkdsyvgdea
61 qskrgiltlk ypiehgiitn wddmekiwhh tfynelrvap eehptlltea plnpkanrek
121 mtqimfetfn vpamyvaiqa vlslyasgrt tgivldsgdg vthnvpiyeg yalphaimrl
181 dlagrdltdy lmkiltergy sfvttaerei vrdikeklcy valdfenema taasssslek
241 syelpdgqvi tignerfrcp etlfqpsfig mesagihett ynsimkcdid irkdlyannv
301 msggttmypg iadrmqkeit alapstmkik iiapperkys vwiggsilas lstfqqmwit
361 kqeydeagps ivhrkcf
ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2(例えば、GenBank登録番号P14618−1(配列番号26):
1 mskphseagt afiqtqqlha amadtflehm crldidsppi tarntgiict igpasrsvet
61 lkemiksgmn varlnfshgt heyhaetikn vrtatesfas dpilyrpvav aldtkgpeir
121 tglikgsgta evelkkgatl kitldnayme kcdenilwld yknickvvev gskiyvddgl
181 islqvkqkga dflvteveng gslgskkgvn lpgaavdlpa vsekdiqdlk fgveqdvdmv
241 fasfirkasd vhevrkvlge kgknikiisk ienhegvrrf deileasdgi mvargdlgie
301 ipaekvflaq kmmigrcnra gkpvicatqm lesmikkprp traegsdvan avldgadcim
361 lsgetakgdy pleavrmqhl iareaeaaiy hlqlfeelrr lapitsdpte atavgaveas
421 fkccsgaiiv ltksgrsahq varyrprapi iavtrnpqta rqahlyrgif pvlckdpvqe
481 awaedvdlrv nfamnvgkar gffkkgdvvi vltgwrpgsg ftntmrvvpv p
AGR2(例えば、GenBank登録番号O95994(配列番号27):
1 mekipvsafl llvalsytla rdttvkpgak kdtkdsrpkl pqtlsrgwgd qliwtqtyee
61 alyksktsnk plmiihhlde cphsqalkkv faenkeiqkl aeqfvllnlv yettdkhlsp
121 dgqyvprimf vdpsltvrad itgrysnrly ayepadtall ldnmkkalkl lktel
好中球デフェンシン1前駆体(例えば、GenBank登録番号P59665(配列番号28):
1 mrtlailaai llvalqaqae plqaradeva aapeqiaadi pevvvslawd eslapkhpgs
61 rknmacycri paciagerry gtciyqgrlw afcc
ミエロブラスチン前駆体(例えば、GenBank登録番号P24158(配列番号29):
1 mahrppspal asvllallls gaaraaeivg gheaqphsrp ymaslqmrgn pgshfcggtl
61 ihpsfvltaa hclrdipqrl vnvvlgahnv rtqeptqqhf svaqvflnny daenklndvl
121 liqlsspanl sasvatvqlp qqdqpvphgt qclamgwgrv gahdppaqvl qelnvtvvtf
181 fcrphnictf vprrkagicf gdsggplicd giiqgidsfv iwgcatrlfp dfftrvalyv
241 dwirstlrrv eakgrp
未同定タンパク質PSME2(例えば、GenBank登録番号Q9UL46(配列番号30):
makpcgvrls gearkqvevf rqnlfqeaee flyrflpqki iylnqllqed 50
slnvadltsl rapldipipd pppkddemet dkqekkevpk cgflpgnekv 100
lsllalvkpe vwtlkekcil vitwiqhlip kiedgndfgv aiqekvlerv 150
navktkveaf qttiskyfse rgdavakask ethvmdyral vherdeaayg 200
elramvldlr afyaelyhii ssnlekivnp kgeekpsmy 239
チューブリンβ−2C鎖(例えば、GenBank登録番号P68371(配列番号31):
1 mreivhlqag qcgnqigakf wevisdehgi dptgtyhgds dlqlerinvy yneatggkyv
61 pravlvdlep gtmdsvrsgp fgqifrpdnf vfgqsgagnn wakghytega elvdsvldvv
121 rkeaescdcl qgfqlthslg ggtgsgmgtl liskireeyp drimntfsvv pspkvsdtvv
181 epynatlsvh qlventdety cidnealydi cfrtlklttp tygdlnhlvs atmsgvttcl
241 rfpgqlnadl rklavnmvpf prlhffmpgf apltsrgsqq yraltvpelt qqmfdaknmm
301 aacdprhgry ltvaavfrgr msmkevdeqm lnvqnknssy fvewipnnvk tavcdipprg
361 lkmsatfign staiqelfkr iseqftamfr rkaflhwytg egmdemefte aesnmndlvs
421 eyqqyqdata eeegefeeea eeeva
チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ(例えば、GenBank登録番号Q16762(配列番号32):
1 mvhqvlyral vstkwlaesi rtgklgpglr vldaswyspg trearkeyle rhvpgasffd
61 ieecrdtasp yemmlpseag faeyvgrlgi snhthvvvyd gehlgsfyap rvwwmfrvfg
121 hrtvsvlngg frnwlkeghp vtsepsrpep avfkatldrs llktyeqvle nleskrfqlv
181 dsrsqgrflg tepepdavgl dsghirgavn mpfmdflted gfekgpeelr alfqtkkvdl
241 sqpliatcrk gvtachvala aylcgkpdva vydgswsewf rrappesrvs qgkseka
熱ショック70kDaタンパク質1(例えば、GenBank登録番号P08107(配列番号33):
1 makaaaigid lgttyscvgv fqhgkveiia ndqgnrttps yvaftdterl igdaaknqva
61 lnpqntvfda krligrkfgd pvvqsdmkhw pfqvindgdk pkvqvsykge tkafypeeis
121 smvltkmkei aeaylgypvt navitvpayf ndsqrqatkd agviaglnvl riineptaaa
181 iaygldrtgk gernvlifdl gggtfdvsil tiddgifevk atagdthlgg edfdnrlvnh
241 fveefkrkhk kdisqnkrav rrlrtacera krtlssstqa sleidslfeg idfytsitra
301 rfeelcsdlf rstlepveka lrdakldkaq ihdlvlvggs tripkvqkll qdffngrdln
361 ksinpdeava ygaavqaail mgdksenvqd lllldvapls lgletaggvm talikrnsti
421 ptkqtqiftt ysdnqpgvli qvyegeramt kdnnllgrfe lsgippaprg vpqievtfdi
481 dangilnvta tdkstgkank ititndkgrl skeeiermvq eaekykaede vqrervsakn
541 alesyafnmk savedeglkg kiseadkkkv ldkcqevisw ldantlaekd efehkrkele
601 qvcnpiisgl yqgaggpgpg gfgaqgpkgg sgsgptieev d
Igκ鎖V−III領域sie(例えば、GenBank登録番号P01620(配列番号34):
1 eivltqspgt lslspgerat lscrasqsvs nsylawyqqk pgqaprlliy gassratgip
61 drfsgsgsgt dftltisrle pddfavyycq qygsspqtfg qgskveikr
マクロファージ遊走阻止因子(例えば、GenBank登録番号P14174(配列番号35):
1 mpmfivntnv prasvpdgfl seltqqlaqa tgkppqyiav hvvpdqlmaf ggssepcalc
61 slhsigkigg aqnrsyskll cgllaerlri spdrvyinyy dmnaanvgwn nstfa
ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性(例えば、GenBank登録番号O75947−1(配列番号36):
1 magrklalkt idwvafaeii pqnqkaiass lkswnetlts rlaalpenpp aidwayykan
61 vakaglvddf ekkfnalkvp vpedkytaqv daeekedvks caewvslska riveyekeme
121 kmknlipfdq mtiedlneaf petkldkkky pywphqpien l
未同定タンパク質ENSP00000374051(例えば、GenBank登録番号A6NGM3(配列番号37):
mvvdknkrlt kggkkgakkk vvdpfskkdw ydvnapamfn irnigktlvt 50
rtqgtkiasd grvfevslad lqndevafrk fklitedvqg kncltnfhgv 100
dltsdkmcsm vkkwqtmiea hvdvkttdgy llrlfcvgft kkrnnqirkt 150
syaqhqqvlt sqirkkmmei mtrevqtndl kevvnklipd sigkdvekac 200
qsiyplhdvf vrkvkmlkkp kfelgklmel hgegcssgka tgdetgvkve 250
radgyelpvq esv 263
イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性(例えば、GenBank登録番号O75874(配列番号38):
1 mskkisggsv vemqgdemtr iiwelikekl ifpyveldlh sydlgienrd atndqvtkda
61 aeaikkhnvg vkcatitpde krveefklkq mwkspngtir nilggtvfre aiickniprl
121 vsgwvkpiii grhaygdqyr atdfvvpgpg kveitytpsd gtqkvtylvh nfeegggvam
181 gmynqdksie dfahssfqma lskgwplyls tkntilkkyd grfkdifqei ydkqyksqfe
241 aqkiwyehrl iddmvaqamk seggfiwack nydgdvqsds vaqgygslgm mtsvlvcpdg
301 ktveaeaahg tvtrhyrmyq kgqetstnpi asifawtrgl ahrakldnnk elaffanale
361 evsietieag fmtkdlaaci kglpnvqrsd ylntfefmdk lgenlkikla qakl
ヘモグロビンサブユニットδ(例えば、GenBank登録番号P02042(配列番号39):
1 mvhltpeekt avnalwgkvn vdavggealg rllvvypwtq rffesfgdls spdavmgnpk
61 vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfsqls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlarnfg
121 keftpqmqaa yqkvvagvan alahkyh
スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q16629−1(配列番号40):
1 msrygrygge tkvyvgnlgt gagkgelera fsyygplrtv wiarnppgfa fvefedprda
61 edavrgldgk vicgsrvrve lstgmprrsr fdrpparrpf dpndrcyecg ekghyaydch
121 rysrrrrsrs rsrshsrsrg rrysrsrsrs rgrrsrsasp rrsrsislrr srsaslrrsr
181 sgsikgsryf qspsrsrsrs rsisrprssr sksrspspkr srspsgsprr saspermd
mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号O60942−1(配列番号41):
1 mahnkipprw lncprrgqpv agrflplktm lgprydsqva eenrfhpsml snylkslkvk
61 mgllvdltnt srfydrndie kegikyiklq ckghgecptt entetfirlc erfnernppe
121 ligvhcthgf nrtgflicaf lvekmdwsie aavatfaqar ppgiykgdyl kelfrrygdi
181 eeappppllp dwcfeddede dededgkkes epgssasfgk rrkerlklga iflegvtvkg
241 vtqvttqpkl gevqqkchqf cgwegsgfpg aqpvsmdkqn iklldlkpyk vswkadgtry
301 mmlidgtnev fmidrdnsvf hvsnlefpfr kdlrmhlsnt lldgemiidr vngqavpryl
361 iydiikfnsq pvgdcdfnvr lqciereiis prhekmktgl idktqepfsv rnkpffdict
421 srkllegnfa kevshemdgl ifqptgkykp grcddilkwk ppslnsvdfr lkitrmggeg
481 llpqnvglly vggyerpfaq ikvtkelkqy dnkiieckfe nnswvfmrqr tdksfpnayn
541 tamavcnsis npvtkemlfe fidrctaasq gqkrkhhldp dtelmppppp krprplt
LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体(例えば、GenBank登録番号P36776(配列番号42):
1 maastgyvrl wgaarcwvlr rpmlaaaggr vptaagawll rgqrtcdasp pwalwgrgpa
61 iggqwrgfwe assrgggafs ggedasegga eegaggaggs agagegpvit altpmtipdv
121 fphlpliait rnpvfprfik iievknkklv ellrrkvrla qpyvgvflkr ddsnesdvve
181 sldeiyhtgt faqihemqdl gdklrmivmg hrrvhisrql evepeepeae nkhkprrksk
241 rgkkeaedel sarhpaelam eptpelpaev lmvevenvvh edfqvteevk altaeivkti
301 rdiialnply resvlqmmqa gqrvvdnpiy lsdmgaaltg aeshelqdvl eetnipkrly
361 kalsllkkef elsklqqrlg reveekikqt hrkyllqeql kiikkelgle kddkdaieek
421 frerlkelvv pkhvmdvvde elsklglldn hssefnvtrn yldwltsipw gkysnenldl
481 araqavleed hygmedvkkr ilefiavsql rgstqgkilc fygppgvgkt siarsiaral
541 nreyfrfsvg gmtdvaeikg hrrtyvgamp gkiiqclkkt ktenplilid evdkigrgyq
601 gdpssallel ldpeqnanfl dhyldvpvdl skvlfictan vtdtipeplr drmeminvsg
661 yvaqeklaia erylvpqara lcgldeskak lssdvltlli kqycresgvr nlqkqvekvl
721 rksaykivsg eaesvevtpe nlqdfvgkpv ftvermydvt ppgvvmglaw tamggstlfv
781 etslrrpqdk dakgdkdgsl evtgqlgevm kesariaytf araflmqhap andylvtshi
841 hlhvpegatp kdgpsagcti vtallslamg rpvrqnlamt gevsltgkil pvggikekti
901 aakragvtci vlpaenkkdf ydlaafiteg levhfvehyr eifdiafpde qaealaver
シグナル認識粒子54kDaタンパク質(例えば、GenBank登録番号P61011(配列番号43):
1 mvladlgrki tsalrslsna tiineevlna mlkevctall eadvniklvk qlrenvksai
61 dleemasgln krkmiqhavf kelvklvdpg vkawtptkgk qnvimfvglq gsgktttcsk
121 layyyqrkgw ktclicadtf ragafdqlkq natkaripfy gsytemdpvi iasegvekfk
181 nenfeiiivd tsgrhkqeds lfeemlqvan aiqpdnivyv mdasigqace aqakafkdkv
241 dvasvivtkl dghakgggal savaatkspi ifigtgehid dfepfktqpf iskllgmgdi
301 eglidkvnel klddnealie klkhgqftlr dmyeqfqnim kmgpfsqilg mipgfgtdfm
361 skgneqesma rlkklmtimd smndqeldst dgakvfskqp griqrvargs gvstrdvqel
421 ltqytkfaqm vkkmggikgl fkggdmsknv sqsqmaklnq qmakmmdprv lhhmggmagl
481 qsmmrqfqqg aagnmkgmmg fnnm
ガレクチン−9のアイソフォームロング(例えば、GenBank登録番号O00182−1(配列番号44):
1 mafsgsqapy lspavpfsgt iqgglqdglq itvngtvlss sgtrfavnfq tgfsgndiaf
61 hfnprfedgg yvvcntrqng swgpeerkth mpfqkgmpfd lcflvqssdf kvmvngilfv
121 qyfhrvpfhr vdtisvngsv qlsyisfqnp rtvpvqpafs tvpfsqpvcf pprprgrrqk
181 ppgvwpanpa pitqtvihtv qsapgqmfst paippmmyph paypmpfitt ilgglypsks
241 illsgtvlps aqrfhinlcs gnhiafhlnp rfdenavvrn tqidnswgse erslprkmpf
301 vrgqsfsvwi lceahclkva vdgqhlfeyy hrlrnlptin rlevggdiql thvqt
インテグリン結合タンパク質キナーゼ(例えば、GenBank登録番号Q13418(配列番号45):
1 mddiftqcre gnavavrlwl dntendlnqg ddhgfsplhw acregrsavv emlimrgari
61 nvmnrgddtp lhlaashghr divqkllqyk adinavnehg nvplhyacfw gqdqvaedlv
121 angalvsicn kygempvdka kaplrellre raekmgqnln ripykdtfwk gttrtrprng
181 tlnkhsgidf kqlnfltkln enhsgelwkg rwqgndivvk vlkvrdwstr ksrdfneecp
241 rlrifshpnv lpvlgacqsp paphptlith wmpygslynv lhegtnfvvd qsqavkfald
301 margmaflht lepliprhal nsrsvmided mtarismadv kfsfqcpgrm yapawvapea
361 lqkkpedtnr rsadmwsfav llwelvtrev pfadlsnmei gmkvaleglr ptippgisph
421 vcklmkicmn edpakrpkfd mivpilekmq dk
二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素(例えば、GenBank登録番号P07814(配列番号46):
1 matlsltvns gdpplgalla vehvkddvsi sveegkenil hvsenviftd vnsilrylar
61 vattaglygs nlmehteidh wlefsatkls scdsftstin elnhclslrt ylvgnslsla
121 dlcvwatlkg naawqeqlkq kkapvhvkrw fgfleaqqaf qsvgtkwdvs ttkarvapek
181 kqdvgkfvel pgaemgkvtv rfppeasgyl highakaall nqhyqvnfkg klimrfddtn
241 pekekedfek viledvamlh ikpdqftyts dhfetimkya ekliqegkay vddtpaeqmk
301 aereqriesk hrknpieknl qmweemkkgs qfghscclra kidmssnngc mrdptlyrck
361 iqphprtgnk ynvyptydfa cpivdsiegv thalrtteyh drdeqfywii ealgirkpyi
421 weysrlnlnn tvlskrkltw fvneglvdgw ddprfptvrg vlrrgmtveg lkqfiaaqgs
481 srsvvnmewd kiwafnkkvi dpvapryval lkkevipvnv peaqeemkev akhpknpevg
541 lkpvwyspkv fiegadaetf segemvtfin wgnlnitkih knadgkiisl dakfnlenkd
601 ykkttkvtwl aetthalpip vicvtyehli tkpvlgkded fkqyvnknsk heelmlgdpc
661 lkdlkkgdii qlqrrgffic dqpyepvspy sckeapcvli yipdghtkem ptsgskektk
721 veatknetsa pfkerptpsl nnncttseds lvlynrvavq gdvvrelkak kapkedvdaa
781 vkqllslkae ykektgqeyk pgnppaeigq nissnssasi leskslydev aaqgevvrkl
841 kaekspkaki neavecllsl kaqykektgk eyipgqppls qssdssptrn sepagletpe
901 akvlfdkvas qgevvrklkt ekapkdqvdi avqellqlka qyksligvey kpvsatgaed
961 kdkkkkeken ksekqnkpqk qndgqrkdps knqggglsss gagegqgpkk qtrlgleakk
1021 eenladwysq vitksemiey hdisgcyilr pwayaiweai kdffdaeikk lgvencyfpm
1081 fvsqsaleke kthvadfape vawvtrsgkt elaepiairp tsetvmypay akwvqshrdl
1141 piklnqwcnv vrwefkhpqp flrtreflwq eghsafatme eaaeevlqil dlyaqvyeel
1201 laipvvkgrk tekekfaggd ytttieafis asgraiqggt shhlgqnfsk mfeivfedpk
1261 ipgekqfayq nswglttrti gvmtmvhgdn mglvlpprva cvqvviipcg itnalseedk
1321 ealiakcndy rrrllsvnir vradlrdnys pgwkfnhwel kgvpirlevg prdmkscqfv
1381 avrrdtgekl tvaeneaetk lqailediqv tlftrasedl kthmvvantm edfqkildsg
1441 kivqipfcge idcedwikkt tardqdlepg apsmgakslc ipfkplcelq pgakcvcgkn
1501 pakyytlfgr sy
ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号O43670−1(配列番号47):
1 mgrkkkkqlk pwcwycnrdf ddekiliqhq kakhfkchic hkklytgpgl aihcmqvhke
61 tidavpnaip grtdieleiy gmegipekdm derrrlleqk tqesqkkkqq ddsdeydddd
121 saastsfqpq pvqpqqgyip pmaqpglppv pgapgmppgi pplmpgvppl mpgmppvmpg
181 mppgmmpmgg mmppgpgipp lmpgmppgmp ppvprpgipp mtqaqavsap gilnrppapt
241 atvpapqppv tkplfpsagq mgtpvtssst assnseslsa sskalfpsta qaqaavqgpv
301 gtdfkplnst pattteppkp tfpaytqsta sttsttnsta akpaasitsk patltttsat
361 sklihpdedi sleerraqlp kyqrnlprpg qapignppvg piggmmppqp gipqqqgmrp
421 pmpphgqygg hhqgmpgylp gamppygqgp pmvppyqggp prppmgmrpp vmsqggry
無機ピロホスファターゼ(例えば、GenBank登録番号Q15181(配列番号48):
1 msgfsteera apfsleyrvf lknekgqyis pfhdipiyad kdvfhmvvev prwsnakmei
61 atkdplnpik qdvkkgklry vanlfpykgy iwnygaipqt wedpghndkh tgccgdndpi
121 dvceigskvc argeiigvkv lgilamideg etdwkviain vddpdaanyn dindvkrlkp
181 gyleatvdwf rrykvpdgkp enefafnaef kdkdfaidii ksthdhwkal vtkktngkgi
241 scmnttlses pfkcdpdaar aivdalpppc esactvptdv dkwfhhqkn
カルポニン−2(例えば、GenBank登録番号Q99439(配列番号49):
1 msstqfnkgp syglsaevkn rllskydpqk eaelrtwieg ltglsigpdf qkglkdgtil
61 ctlmnklqpg svpkinrsmq nwhqlenlsn fikamvsygm npvdlfeand lfesgnmtqv
121 qvsllalagk aktkglqsgv digvkysekq ernfddatmk agqcviglqm gtnkcasqsg
181 mtaygtrrhl ydpknhilpp mdhstislqm gtnkcasqvg mtapgtrrhi ydtklgtdkc
241 dnssmslqmg ytqganqsgq vfglgrqiyd pkycpqgtva dgapsgtgdc pdpgevpeyp
301 pyyqeeagy
マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q9NUK0−1(配列番号50):
1 mtavnvalir dtkwltlevc refqrgtcsr adadckfahp prvchvengr vvacfdslkg
61 rctrenckyl hppphlktql eingrnnliq qktaaamfaq qmqlmlqnaq msslgsfpmt
121 psipanppma fnpyiphpgm glvpaelvpn tpvlipgnpp lampgavgpk lmrsdklevc
181 refqrgnctr gendcryahp tdasmieasd ntvticmdyi kgrcsrekck yfhppahlqa
241 rlkaahhqmn hsaasamalq pgtlqlipkr salekpngat pvfnptvfhc qqaltnlqlp
301 qpafipagpi lcmapasniv pmmhgatptt vsaattpats vpfaapttgn qlkf
カテプシンG前駆体(例えば、GenBank登録番号P08311(配列番号51):
1 mqplllllaf llptgaeage iiggresrph srpymaylqi qspagqsrcg gflvredfvl
61 taahcwgsni nvtlgahniq rrentqqhit arrairhpqy nqrtiqndim llqlsrrvrr
121 nrnvnpvalp raqeglrpgt lctvagwgrv smrrgtdtlr evqlrvqrdr qclrifgsyd
181 prrqicvgdr rerkaafkgd sggpllcnnv ahgivsygks sgvppevftr vssflpwirt
241 tmrsfklldq metpl
ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34(例えば、GenBank登録番号Q8NCN2(配列番号52):
1 msvemdsssf iqfdvpeyss tvlsqlnelr lqgklcdiiv hiqgqpfrah kavlaasspy
61 frdhsalstm sglsisvikn pnvfeqllsf cytgrmslql kdvvsfltaa sflqmqcvid
121 kctqilesih skisvgdvds vtvgaeenpe srngvkdssf fanpveispp ycsqgrqpta
181 ssdlrmettp skalrsrlqe eghsdrgssg svseyeiqie gdheqgdllv resqitevkv
241 kmeksdrpsc sdssslgddg yhtemvdgeq vvavnvgsyg svlqhaysys qaasqptnvs
301 eafgslsnss psrsmlscfr ggrarqkral svhlhsdlqg lvqgsdseam mnnpgyessp
361 rersarghwy pynerliciy cgksfnqkgs ldrhmrlhmg itpfvckfcg kkytrkdqle
421 yhirghtddk pfrceicgkc fpfqgtlnqh lrknhpgvae vrsriesper tdvyveqkle
481 ndasasemgl dsrmeihtvs dapd
アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(例えば、GenBank登録番号P07741(配列番号53):
1 madselqlve qrirsfpdfp tpgvvfrdis pvlkdpasfr aaigllarhl kathggridy
61 iagldsrgfl fgpslaqelg lgcvlirkrg klpgptlwas ysleygkael eiqkdalepg
121 qrvvvvddll atggtmnaac ellgrlqaev lecvslvelt slkgreklap vpffsllqye
40Sリボソームタンパク質S9(例えば、GenBank登録番号P46781(配列番号54):
1 mpvarswvcr ktyvtprrpf eksrldqelk ligeyglrnk revwrvkftl akirkaarel
61 ltldekdprr lfegnallrr lvrigvldeg kmkldyilgl kiedflerrl qtqvfklgla
121 ksihharvli rqrhirvrkq vvnipsfivr ldsqkhidfs lrspygggrp grvkrknakk
181 gqggagagdd eeed
タリン−1(例えば、GenBank登録番号Q9Y490(配列番号55):
1 mvalslkisi gnvvktmqfe pstmvydacr iireripeap agppsdfglf lsdddpkkgi
61 wleagkaldy ymlrngdtme yrkkqrplki rmldgtvkti mvddsktvtd mlmticarig
121 itnhdeyslv relmeekkee itgtlrkdkt llrdekkmek lkqklhtdde lnwldhgrtl
181 reqgveehet lllrrkffys dqnvdsrdpv qlnllyvqar ddilngshpv sfdkacefag
241 fqcqiqfgph neqkhkagfl dlkdflpkey vkqkgerkif qahkncgqms eieakvryvk
301 larslktygv sfflvkekmk gknklvprll gitkecvmrv dektkeviqe wnltnikrwa
361 aspksftldf gdyqdgyysv qttegeqiaq liagyidiil kkkkskdhfg legdeestml
421 edsvspkkst vlqqqynrvg kvehgsvalp aimrsgasgp enfqvgsmpp aqqqitsgqm
481 hrghmpplts aqqaltgtin ssmqavqaaq atlddfdtlp plgqdaaska wrknkmdesk
541 heihsqvdai tagtasvvnl tagdpaetdy tavgcavtti ssnltemsrg vkllaalled
601 eggsgrpllq aakglagavs ellrsaqpas aeprqnllqa agnvgqasge llqqigesdt
661 dphfqdalmq lakavasaaa alvlkaksva qrtedsglqt qviaaatqca lstsqlvact
721 kvvaptissp vcqeqlveag rlvakavegc vsasqaated gqllrgvgaa atavtqalne
781 llqhvkahat gagpagrydq atdtiltvte nifssmgdag emvrqarila qatsdlvnai
841 kadaegesdl ensrkllsaa kiladatakm veaakgaaah pdseeqqqrl reaaeglrma
901 tnaaaqnaik kklvqrleha akqaaasatq tiaaaqhaas tpkasagpqp llvqsckava
961 eqipllvqgv rgsqaqpdsp saqlaliaas qsflqpggkm vaaakasvpt iqdqasamql
1021 sqcaknlgta laelrtaaqk aqeacgplem dsalsvvqnl ekdlqevkaa ardgklkplp
1081 getmekctqd lgnstkavss aiaqllgeva qgnenyagia ardvagglrs laqaargvaa
1141 ltsdpavqai vldtasdvld kasslieeak kaaghpgdpe sqqrlaqvak avtqalnrcv
1201 sclpgqrdvd nalravgdas krllsdslpp stgtfqeaqs rlneaaagln qaatelvqas
1261 rgtpqdlara sgrfgqdfst fleagvemag qapsqedraq vvsnlkgism sssklllaak
1321 alstdpaapn lksqlaaaar avtdsinqli tmctqqapgq kecdnalrel etvrellenp
1381 vqpindmsyf gcldsvmens kvlgeamtgi sqnakngnlp efgdaistas kalcgfteaa
1441 aqaaylvgvs dpnsqagqqg lveptqfara nqaiqmacqs lgepgctqaq vlsaativak
1501 htsalcnscr lasarttnpt akrqfvqsak evanstanlv ktikaldgaf teenraqcra
1561 ataplleavd nlsafasnpe fssipaqisp egraamepiv isaktmlesa ggliqtaral
1621 avnprdppsw svlaghsrtv sdsikklits mrdkapgqle cetaiaalns clrdldqasl
1681 aavsqqlapr egisqealht qmltavqeis hlieplanaa raeasqlghk vsqmaqyfep
1741 ltlaavgaas ktlshpqqma lldqtktlae salqllytak eaggnpkqaa htqealeeav
1801 qmmteavedl tttlneaasa agvvggmvds itqainqlde gpmgepegsf vdyqttmvrt
1861 akaiavtvqe mvtksntspe elgplanqlt sdygrlasea kpaavaaene eigshikhrv
1921 qelghgcaal vtkagalqcs psdaytkkel iecarrvsek vshvlaalqa gnrgtqacit
1981 aasavsgiia dldttimfat agtlnregte tfadhregil ktakvlvedt kvlvqnaags
2041 qeklaqaaqs svatitrlad vvklgaaslg aedpetqvvl inavkdvaka lgdlisatka
2101 aagkvgddpa vwqlknsakv mvtnvtsllk tvkavedeat kgtraleatt ehirqelavf
2161 cspeppakts tpedfirmtk gitmatakav aagnscrqed viatanlsrr aiadmlrack
2221 eaayhpevap dvrlralhyg recangylel ldhvlltlqk pspelkqqlt ghskrvagsv
2281 teliqaaeam kgtewvdped ptviaenell gaaaaieaaa kkleqlkpra kpkeadesln
2341 feeqileaak siaaatsalv kaasaaqrel vaqgkvgaip analddgqws qglisaarmv
2401 aaatnnlcea anaavqghas qeklissakq vaastaqllv ackvkadqds eamkrlqaag
2461 navkrasdnl vkaaqkaaaf eeqenetvvv kekmvggiaq iiaaqeemlr kereleeark
2521 klaqirqqqy kflpselrde h
ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(例えば、GenBank登録番号Q96AG4(配列番号56):
1 mtkagskggn lrdkldgnel dlslsdlnev pvkelaalpk atildlscnk lttlpsdfcg
61 lthlvkldls knklqqlpad fgrlvnlqhl dllnnklvtl pvsfaqlknl kwldlkdnpl
121 dpvlakvagd cldekqckqc ankvlqhmka vqadqererq rrlevereae kkreakqrak
181 eaqerelrkr ekaeekerrr keydalkaak reqekkpkke anqapksksg srprkppprk
241 htrswavlkl llllllfgva gglvacrvte lqqqplctsv ntiydnavqg lrrheilqwv
301 lqtdsqq
ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体(例えば、GenBank登録番号P25705(配列番号57):
1 mlsvrvaaav vralprragl vsrnalgssf iaarnfhasn thlqktgtae mssileeril
61 gadtsvdlee tgrvlsigdg iarvhglrnv qaeemvefss glkgmslnle pdnvgvvvfg
121 ndklikegdi vkrtgaivdv pvgeellgrv vdalgnaidg kgpigsktrr rvglkapgii
181 prisvrepmq tgikavdslv pigrgqreli igdrqtgkts iaidtiinqk rfndgsdekk
241 klyciyvaig qkrstvaqlv krltdadamk ytivvsatas daaplqylap ysgcsmgeyf
301 rdngkhalii yddlskqava yrqmslllrr ppgreaypgd vfylhsrlle raakmndafg
361 ggsltalpvi etqagdvsay iptnvisitd gqifletelf ykgirpainv glsvsrvgsa
421 aqtramkqva gtmklelaqy revaafaqfg sdldaatqql lsrgvrltel lkqgqyspma
481 ieeqvaviya gvrgyldkle pskitkfena flshvvsqhq allgtiradg kiseqsdakl
541 keivtnflag fea
タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7(例えば、GenBank登録番号O94979−7(配列番号58):
1 mklkevdrta mqawspaqnh piylatgtsa qqldatfstn asleifeldl sdpsldmksc
61 atfssshryh kliwgpykmd skgdvsgvli aggengniil ydpskiiagd kevviaqndk
121 htgpvraldv nifqtnlvas ganeseiyiw dlnnfatpmt pgaktqpped isciawnrqv
181 qhilasasps gratvwdlrk nepiikvsdh snrmhcsgla whpdvatqmv laseddrlpv
241 iqmwdlrfas splrvlenha rgilaiawsm adpelllscg kdakilcsnp ntgevlyelp
301 tntqwcfdiq wcprnpavls aasfdgrisv ysimggstdg lrqkqvdkls ssfgnldpfg
361 tgqplpplqi pqqtaqhsiv lplkkppkwi rrpvgasfsf ggklvtfenv rmpshqgaeq
421 qqqqhhvfis qvvtekefls rsdqlqqavq sqgfinycqk kidasqtefe knvwsflkvn
481 feddsrgkyl ellgyrkedl gkkialalnk vdganvalkd sdqvaqsdge espaaeeqll
541 gehikeekee seflpssggt fnisvsgdid glitqalltg nfesavdlcl hdnrmadaii
601 laiaggqell artqkkyfak sqskitrlit avvmknwkei vescdlknwr ealaavltya
661 kpdefsalcd llgtrleneg dsllqtqacl cyicagnvek lvacwtkaqd gshplslqdl
721 iekvvilrka vqltqamdts tvgvllaakm sqyanllaaq gsiaaalafl pdntnqpnim
781 qlrdrlcraq gepvaghesp kipyekqqlp kgrpgpvagh hqmprvqtqq yyphgenppp
841 pgfimhgnvn pnaagqlpts pghmhtqvpp ypqpqpyqpa qpypfgtggs amyrpqqpva
901 pptsnaypnt pyissassyt gqsqlyaaqh qassptsspa tsfppppssg asfqhggpga
961 ppsssayalp pgttgtlpaa selpasqrtg pqngwndppa lnrvpkkkkm penfmppvpi
1021 tspimnplgd pqsqmlqqqp sapvplssqs sfpqphlpgg qpfhgvqqpl gqtgmppsfs
1081 kpniegapga pigntfqhvq slptkkitkk pipdehlilk ttfedliqrc lssatdpqtk
1141 rklddaskrl eflydklreq tlsptitsgl hniarsietr nysegltmht hivstsnfse
1201 tsafmpvlkv vltqanklgv
ジヒドロキシアセトンキナーゼ(例えば、GenBank登録番号Q3LXA3(配列番号59):
1 mtskklvnsv agcaddalag lvacnpnlql lqghrvalrs dldslkgrva llsgggsghe
61 pahagfigkg mltgviagav ftspavgsil aairavaqag tvgtllivkn ytgdrlnfgl
121 areqaraegi pvemvvigdd saftvlkkag rrglcgtvli hkvagalaea gvgleeiakq
181 vnvvtkamgt lgvslsscsv pgskptfels adevelglgi hgeagvrrik matadeivkl
241 mldhmtnttn ashvpvqpgs svvmmvnnlg glsflelgii adatvrsleg rgvkiaralv
301 gtfmsalemp gisltlllvd epllklidae ttaaawpnva avsitgrkrs rvapaepqea
361 pdstaaggsa skrmalvler vcstllglee hlnaldraag dgdcgtthsr aaraiqewlk
421 egpppaspaq llsklsvlll ekmggssgal yglfltaaaq plkaktslpa wsaamdagle
481 amqkygkaap gdrtmldslw aagqelqawk spgadllqvl tkavksaeaa aeatknmeag
541 agrasyissa rleqpdpgav aaaailrail evlqs
異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)類似体.アイソフォーム4 ENSEMBL登録番号ENST0000342709(配列番号60)(GenBank登録番号NM_004500.3及びUNIPARC登録番号IPI00868835も参照されたい):
masnvtnktdprsmnsrvfignlntlvvkksdveaifskygkivgcsvhkgfaffqyvnernaraavagedgrmiagqvldinlaaepkvnrgkagvkrsaaemygssfdldcdfqrdyydrmysyparvpppppiaraaikreltqikqkvdsflenlekiekeqskqavemnnvkseeeqssssvkkdetnvkmeseggaddsaeegdllddddnedggmtsws
18kDaタンパク質UNIPARC登録番号IPI00796554(配列番号61):
marsrtsssp aisqetevgg grkaiiifvp vpqlksfqki qvrlvrelek kfsgkhvvfi
aqrrilpkpt qksrtknkqk cprsrtltav hdafledlvf pseivgkrip vkldssrlik
vhldkaqqnn vehkvetfsg vykkltgkdv nfefpefql
寒冷凝集素FS−1 L−鎖(例えば、GenBank登録番号A2NB45(配列番号62):
divmtqspls lpvtpgepas iscrssqsll hsngfnylhw ylqkpgqspr 50
lliylgsnra sgvpdrfsgs gsgtdftlki srveaddvgi yycmqalqsp 100
ytfgqgtkle ikr 113
異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q14103−1(配列番号63):
1 mseeqfggdg aaaaataavg gsageqegam vaatqgaaaa agsgagtggg tasggteggs
61 aesegakida skneedeghs nssprhseaa taqreewkmf igglswdttk kdlkdyfskf
121 gevvdctlkl dpitgrsrgf gfvlfkeses vdkvmdqkeh klngkvidpk rakamktkep
181 vkkifvggls pdtpeekire yfggfgeves ielpmdnktn krrgfcfitf keeepvkkim
241 ekkyhnvgls kceikvamsk eqyqqqqqwg srggfagrar grgggpsqnw nqgysnywnq
301 gygnygynsq gyggyggydy tgynnyygyg dysnqqsgyg kvsrrgghqn sykpy
DAZAP1/MEF2D融合タンパク質(例えば、GenBank登録番号Q5IRN2(配列番号64):
1 mnnsgadeig klfvggldws ttqetlrsyf sqygevvdcv imkdkttnqs rgfgfvkfkd
61 pncvgtvlas rphtldgrni dpkpctprgm qpertrpkeg wqkgprsdns ksnkifvggi
121 phncgetelr eyfkkfgvvt evvmiydaek qrprgngyvs araspgllpv angnslnkvi
181 paksppppth stqlgapsrk pdlrvitsqa gkglmhhlte dhldlnnaqr lgvsqsthsl
241 ttpvvsvatp sllsqglpfs smptayntdy qltsaelssl pafsspggls lgnvtawqqp
301 qqpqqpqqpq ppqqqppqpq qpqpqqpqqp qqppqqqshl vpvslsnlip gsplphvgaa
361 ltvtthphis iksepvspsr erspappppa vfpaarpepg dglsspaggs yetgdrddgr
421 gdfgptlgll rpapepeaeg savkrmrldt wtlk
POTE2(例えば、GenBank登録番号NP_001077007(配列番号65)):
1 mvvevdsmpa assvkkpfgl rskmgkwccr cfpcyresgk snvgtsgdhd dsamktlrsk
61 mgkwchhcfp ccrgsgksnv gasgdhddsa mktlrnkmgk wcchcfpccr gsgkskvgaw
121 gdyddsafme pryhvrgedl dklhraawwg kvprkdlivm lrdtdvnkkd kqkrtalhla
181 sangnsevvk llldrrcqln vldnkkrtal ikavqcqede calmllehgt dpnipdeygn
241 ttlhyaiyne dklmakalll ygadiesknk hgltplllgv heqkqqvvkf likkkanlna
301 ldrygrtali lavccgsasi vsllleqnid vssqdlsgqt areyavsshh hvicqllsdy
361 kekqmlkiss ensnpeqelk ltseeesqrf kgsensqpek msqeleinkd gdreveeemk
421 khesnnvgll enltngvtag ngdnglipqr ksrtpenqqf pdneseeyhr icellsdyke
481 kqmpkyssen snpeqdlklt seeesqrlkg sengqpekrs qepeinkdgd relenfmaie
541 emkkhgsthv gfpenltnga tagngddgli pprksrtpes qqfpdtenee yhsdeqndtq
601 kqfceeqntg ilhdeilihe ekqievvekm nselslsckk ekdvlhenst lreeiamlrl
661 eldtmkhqsq lrekkyledi esvkkkndnl lkalqlnelt mdddtavlvi dngsgmckag
721 fagddaprav fpsivgrprq qgmmggmhqk esyvgkeaqs krgiltlkyp mehgiitnwd
781 dmekiwhhtf ynelrvapee hpillteapl npkanrekmt qimfetfntp amyvaiqavp
841 slytsgrttg ivmdsgdgvt htvpiyegna lphatlrldl agrelpdylm kiltergyrf
901 ttmaereivr dikeklcyva ldfeqemata assssleksy elpdgqviti gnerfrcpea
961 lfqpcflgme scgihettfn simksdvdir kdlytntvls ggttmypgma hrmqkeiaal
1021 apsmmkirii appkrkysvw vggsilasls tfqqmwiskq eydesgpsiv hrkcf
ケラチン18(KRT18)(例えば、GenBank登録番号NP_000215(配列番号66)):
1 msfttrstfs tnyrslgsvq apsygarpvs saasvyagag gsgsrisvsr stsfrggmgs
61 gglatgiagg lagmggiqne ketmqslndr lasyldrvrs letenrrles kirehlekkg
121 pqvrdwshyf kiiedlraqi fantvdnari vlqidnarla addfrvkyet elamrqsven
181 dihglrkvid dtnitrlqle teiealkeel lfmkknheee vkglqaqias sgltvevdap
241 ksqdlakima diraqydela rknreeldky wsqqieestt vvttqsaevg aaettltelr
301 rtvqsleidl dsmrnlkasl enslrevear yalqmeqlng illhlesela qtraegqrqa
361 qeyeallnik vkleaeiaty rrlledgedf nlgdaldssn smqtiqkttt rrivdgkvvs
421 etndtkvlrh
PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニット4のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_055429(配列番号67)):
1 mepaeragvg eppepggrpe pgprgfvpqk eivynkllpy aerldaesdl qlaqikcnlg
61 ravqlqelwp gglfwtrkls tyirlygrkf skedhvlfik llyelvsipk leismmqgfa
121 rllinllkkk ellsradlel pwrplydmve rilysktehl glnwfpnsve nilktlvksc
181 rpyfpadata emleewrplm cpfdvtmqka ityfeiflpt slppelhhkg fklwfdelig
241 lwvsvqnlpq wegqlvnlfa rlatdnigyi dwdpyvpkif trilrslnlp vgssqvlvpr
301 fltnaydigh aviwitammg gpsklvqkhl aglfnsitsf yhpsnngrwl nklmkllqrl
361 pnsvvrrlhr erykkpswlt pvpdshkltd qdvtdfvqci iqpvllamfs ktgsleaaqa
421 lqnlalmrpe lvippvlert ypaletltep hqltatlscv igvarslvsg grwfpegpth
481 mlpllmralp gvdpndfskc mitfqfiatf stlvplvdcs svlqerndlt everelcsat
541 aefedfvlqf mdrcfglies stleqtreet etekmthles lvelglsstf stiltqcske
601 ifmvalqkvf nfstshifet rvagrmvadm craavkccpe eslklfvphc csvitqltmn
661 ddvlndeeld kellwnlqll seitrvdgrk lllyreqlvk ilqrtlhltc kqgytlscnl
721 lhhllrsttl iypteycsvp ggfdkppsey fpikdwgkpg dlwnlgiqwh vpsseevsfa
781 fylldsflqp elvklqhcgd gklemsrddi lqsltivhnc ligsgnllpp lkgepvtnlv
841 psmvsleetk lytgleydls renhreviat virkllnhil dnseddtksl fliikiigdl
901 lqfqgshkhe fdsrwksfnl vkksmenrlh gkkqhirall idrvmlqhel rtltvegcey
961 kkihqdmird llrlstssys qvrnkaqqtf faalgaynfc crdiiplvle flrpdrqgvt
1021 qqqfkgalyc llgnhsgvcl anlhdwdciv qtwpaivssg lsqamslekp sivrlfddla
1081 ekihrqyeti gldftipksc veiaellqqs knpsinqill spekikegik rqqeknadal
1141 rnyenlvdtl ldgveqrnlp wkfehigigl lslllrddrv lplrairffv enlnhdaivv
1201 rkmaisavag ilkqlkrthk kltinpceis gcpkptqiia gdrpdnhwlh ydsktiprtk
1261 kewesscfve kthwgyytwp knmvvyagve eqpklgrsre dmteaeqiif dhfsdpkfve
1321 qlitflsled rkgkdkfnpr rfclfkgifr nfddaflpvl kphlehlvad shestqrcva
1381 eiiaglirgs khwtfekvek lwellcpllr talsnitvet yndwgaciat scesrdprkl
1441 hwlfellles plsgeggsfv dacrlyvlqg glaqqewrvp ellhrllkyl epkltqvykn
1501 vrerigsvlt yifmidvslp nttptisphv peftarilek lkplmdvdee iqnhvmeeng
1561 igeedertqg ikllktilkw lmasagrsfs tavteqlqll plffkiapve ndnsydelkr
1621 daklclslms qgllyphqvp lvlqvlkqta rssswharyt vltylqtmvf ynlfiflnne
1681 davkdirwlv islledeqle vremaattls gllqcnfltm dspmqihfeq lcktklpkkr
1741 krdpgsvgdt ipsaelvkrh agvlglgacv lsspydvptw mpqllmnlsa hlndpqpiem
1801 tvkktlsnfr rthhdnwqeh kqqftddqll vltdllvspc yya
マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33)(例えば、GenBank登録番号NP_004626(配列番号68)):
1 mdgetaeeqg gpvpppvapg gpglggapgg rrepkkyavt ddyqlskqvl glgvngkvle
61 cfhrrtgqkc alkllydspk arqevdhhwq asggphivci ldvyenmhhg krclliimec
121 meggelfsri qergdqafte reaaeimrdi gtaiqflhsh niahrdvkpe nllytskekd
181 avlkltdfgf akettqnalq tpcytpyyva pevlgpekyd kscdmwslgv imyillcgfp
241 pfysntgqai spgmkrrirl gqygfpnpew sevsedakql irlllktdpt erltitqfmn
301 hpwinqsmvv pqtplhtarv lqedkdhwde vkeemtsala tmrvdydqvk ikdlktsnnr
361 llnkrrkkqa gsssasqgcn nq
補体成分1,sサブコンポーネント(C1S)(例えば、GenBank登録番号NP_001725(配列番号69)):
1 mwcivlfsll awvyaeptmy geilspnypq aypseveksw dievpegygi hlyfthldie
61 lsencaydsv qiisgdteeg rlcgqrssnn phspiveefq vpynklqvif ksdfsneerf
121 tgfaayyvat dinectdfvd vpcshfcnnf iggyfcscpp eyflhddmkn cgvncsgdvf
181 taligeiasp nypkpypens rceyqirlek gfqvvvtlrr edfdveaads agncldslvf
241 vagdrqfgpy cghgfpgpln ietksnaldi ifqtdltgqk kgwklryhgd pmpcpkedtp
301 nsvwepakak yvfrdvvqit cldgfevveg rvgatsfyst cqsngkwsns klkcqpvdcg
361 ipesiengkv edpestlfgs virytceepy yymengggge yhcagngswv nevlgpelpk
421 cvpvcgvpre pfeekqriig gsdadiknfp wqvffdnpwa ggalineywv ltaahvvegn
481 reptmyvgst svqtsrlaks kmltpehvfi hpgwkllevp egrtnfdndi alvrlkdpvk
541 mgptvspicl pgtssdynlm dgdlglisgw grtekrdrav rlkaarlpva plrkckevkv
601 ekptadaeay vftpnmicag gekgmdsckg dsggafavqd pndktkfyaa glvswgpqcg
661 tyglytrvkn yvdwimktmq enstpred
リゾチームC前駆体(LYZ)(例えば、GenBank登録番号NP_000230(配列番号70)):
1 mkalivlglv llsvtvqgkv fercelartl krlgmdgyrg islanwmcla kwesgyntra
61 tnynagdrst dygifqinsr ywcndgktpg avnachlscs allqdniada vacakrvvrd
121 pqgirawvaw rnrcqnrdvr qyvqgcgv
ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20)(例えば、GenBank登録番号NP_061883(配列番号71)):
1 mdfsrrsfhr slssslqapv vstvgmqrlg ttpsvyggag grgirisnsr htvnygsdlt
61 gggdlfvgne kmamqnlndr lasylekvrt leqsnsklev qikqwyetna pragrdysay
121 yrqieelrsq ikdaqlqnar cvlqidnakl aaedfrlkye tergirltve adlqglnkvf
181 ddltlhktdl eiqieelnkd lallkkehqe evdglhkhlg ntvnvevdaa pglnlgvimn
241 emrqkyevma qknlqeakeq ferqtavlqq qvtvnteelk gtevqltelr rtsqsleiel
301 qshlsmkesl ehtleetkar yssqlanlqs llssleaqlm qirsnmerqn neyhilldik
361 trleqeiaty rrllegedvk tteyqlstle erdikktrki ktvvqevvdg kvvssevkev
421 eeni
RNASE3(例えば、GenBank登録番号NP_002926(配列番号72)):
1 mvpklftsqi clllllglmg vegslharpp qftraqwfai qhislnpprc tiamrainny
61 rwrcknqntf lrttfanvvn vcgnqsircp hnrtlnnchr srfrvpllhc dlinpgaqni
121 snctyadrpg rrfyvvacdn rdprdspryp vvpvhldtti
アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1)(例えば、GenBank登録番号NP_000683(配列番号73)):
1 mlrflaprll slqgrtarys saaalpspil npdipynqlf innewqdavs kktfptvnpt
61 tgevighvae gdradvdrav kaareafrlg spwrrmdase rgrllnrlad lverdrvyla
121 sletldngkp fqesyaldld evikvyryfa gwadkwhgkt ipmdgqhfcf trhepvgvcg
181 qiipwnfplv mqgwklapal atgntvvmkv aeqtplsaly laslikeagf ppgvvniitg
241 ygptagaaia qhvdvdkvaf tgstevghli qkaagdsnlk rvtlelggks psivladadm
301 ehaveqchea lffnmgqccc agsrtfvees iyneflertv ekakqrkvgn pfeldtqqgp
361 qvdkeqferv lgyiqlgqke gakllcgger fgergffikp tvfggvqddm riakeeifgp
421 vqplfkfkki eevverannt ryglaaavft rdldkamyft qalqagtvwv ntynivtcht
481 pfggfkesgn grelgedglk aytevktvti kvpqkns
CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185(例えば、GenBank登録番号Q8N7I6(配列番号74)):
1 mwicpggggg gggggggggg dredarpapl ccgrcwrsgc aarpprmvsi glrgavrgar
61 gchlgrpfsp svllcvgrpg saagaerghs lgsrefghrr gplpwcpanr rgspptagvp
121 rqppgfpaap aprgpgpltr llgrreagsk sqkllfrsar vqgggqfcps gsaflgvere
181 ptaglggaer rnarfwrger gqgrqakrpa psqpasplpg ggtwagcvgl vwmgtgfcga
241 pef
フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB(例えば、GenBank登録番号P23142−2(配列番号75)):
1 meraapsrrv plpllllggl allaagvdad vlleaccadg hrmathqkdc slpyateske
61 crmvqeqcch sqleelhcat gislaneqdr catphgdnas leatfvkrcc hccllgraaq
121 aqgqsceysl mvgyqcgqvf raccvksqet gdldvgglqe tdkiieveee qedpylndrc
181 rgggpckqqc rdtgdevvcs cfvgyqllsd gvscedvnec itgshscrlg escintvgsf
241 rcqrdsscgt gyeltednsc kdidecesgi hnclpdficq ntlgsfrcrp klqcksgfiq
301 dalgncidin eclsisapcp ightcinteg sytcqknvpn cgrgyhlnee gtrcvdvdec
361 appaepcgkg hrcvnspgsf rcecktgyyf dgisrmcvdv necqrypgrl cghkcentlg
421 sylcscsvgf rlsvdgrsce dinecssspc sqecanvygs yqcycrrgyq lsdvdgvtce
481 didecalptg ghicsyrcin ipgsfqcscp ssgyrlapng rncqdidecv tgihncsine
541 tcfniqggfr clafecpeny rrsaatlqqe ktdtvrciks crpndvtcvf dpvhtishtv
601 islptfreft rpeeiiflra itpphpasqa niifditegn lrdsfdiikr ymdgmtvgvv
661 rqvrpivgpf havlklemny vvggvvshrn vvnvrifvse ywf
ヌクレオバインディン1(NUCB1)(例えば、GenBank登録番号NP_006175(配列番号76)):
1 mppsgprgtl lllpllllll lravlavple rgapnkeetp atespdtgly yhrylqevid
61 vletdghfre klqaanaedi ksgklsreld fvshhvrtkl delkrqevsr lrmllkakmd
121 aeqdpnvqvd hlnllkqfeh ldpqnqhtfe ardlelliqt atrdlaqyda ahheefkrye
181 mlkeherrry leslgeeqrk eaerkleeqq rrhrehpkvn vpgsqaqlke vweeldgldp
241 nrfnpktffi lhdinsdgvl deqelealft kelekvydpk needdmreme eerlrmrehv
301 mknvdtnqdr lvtleeflas tqrkefgdtg egwetvemhp ayteeelrrf eeelaareae
361 lnakaqrlsq etealgrsqg rleaqkrelq qavlhmeqrk qqqqqqqghk apaahpegql
421 kfhpdtddvp vpapagdqke vdtsekklle rlpevevpqh l
ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA)(例えば、GenBank登録番号NP_001019770(配列番号77)):
1 mpdpaksapa pkkgskkavt kvqkkdgkkr krsrkesysv yvykvlkqvh pdtgisskam
61 gimnsfvndi feriageasr lahynkrsti tsreiqtavr lllpgelakh avsegtkavt
121 kytssk
三部分モチーフ含有28(TRIM28)(例えば、GenBank登録番号NP_005753(配列番号78)):
1 maasaaaasa aaasaasgsp gpgegsagge krstapsaaa sasasaaass pagggaeale
61 llehcgvcre rlrpereprl lpclhsacsa clgpaapaaa nssgdggaag dgtvvdcpvc
121 kqqcfskdiv enyfmrdsgs kaatdaqdan qcctscedna patsycvecs eplcetcvea
181 hqrvkytkdh tvrstgpaks rdgertvycn vhkheplvlf cescdtltcr dcqlnahkdh
241 qyqfledavr nqrkllaslv krlgdkhatl qkstkevrss irqvsdvqkr vqvdvkmail
301 qimkelnkrg rvlvndaqkv tegqqerler qhwtmtkiqk hqehilrfas walesdnnta
361 lllskkliyf qlhralkmiv dpvephgemk fqwdlnawtk saeafgkiva erpgtnstgp
421 apmapprapg plskqgsgss qpmevqegyg fgsgddpyss aephvsgvkr srsgegevsg
481 lmrkvprvsl erldldltad sqppvfkvfp gsttedynli viergaaaaa tgqpgtapag
541 tpgapplagm aivkeeetea aigapptate gpetkpvlma laegpgaegp rlaspsgsts
601 sglevvapeg tsapgggpgt lddsaticrv cqkpgdlvmc nqcefcfhld chlpalqdvp
661 geewscslch vlpdlkeedg slsldgadst gvvaklspan qrkcervlla lfchepcrpl
721 hqlatdstfs ldqpggtldl tlirarlqek lsppysspqe faqdvgrmfk qfnkltedka
781 dvqsiiglqr ffetrmneaf gdtkfsavlv epppmslpga glssqelsgg pgdgp
ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI)(例えば、GenBank登録番号NP_006108(配列番号79)):
1 mnrtamrasq kdfensmnqv kllkkdpgne vklklyalyk qategpcnmp kpgvfdlink
61 akwdawnalg slpkeaarqn yvdlvsslsp slesssqvep gtdrkstgfe tlvvtsedgi
121 tkimfnrpkk knaintemyh eimralkaas kddsiitvlt gngdyyssgn dltnftdipp
181 ggveekaknn avllrefvgc fidfpkplia vvngpavgis vtllglfdav yasdratfht
241 pfshlgqspe gcssytfpki mspakateml ifgkkltage acaqglvtev fpdstfqkev
301 wtrlkafakl ppnalriske virkrerekl havnaeecnv lqgrwlsdec tnavvnflsr
361 kskl
ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB)(例えば、GenBank登録番号NP_000933(配列番号80)):
1 mlrlsernmk vllaaaliag svfflllpgp saadekkkgp kvtvkvyfdl rigdedvgrv
61 ifglfgktvp ktvdnfvala tgekgfgykn skfhrvikdf miqggdftrg dgtggksiyg
121 erfpdenfkl khygpgwvsm anagkdtngs qffittvkta wldgkhvvfg kvlegmevvr
181 kvestktdsr dkplkdviia dcgkievekp faiake
40Sリボソームタンパク質S17類似体(例えば、GenBank登録番号IP00743305(配列番号81)):
mgrvrtktvkkaarviiekyytrlgndfhtnkrvceeiaiipskklrnkipeilgtdrrtsdwrgdqlscipvpfpnstm
elakglqdnsrscvhssktccryhtvgppqlakigstgqvdqsgrprppnradlamepshaekdnhsalstpeagqsthg
真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G)(例えば、GenBank登録番号IPI00747497(配列番号82)):
avgtlytypenwrafkaliaaqysgaqvrvlsapphfhfgqtnrtpeflrkfpagkvpaf
egddgfcvfesnaiayyvsneelrgstpeaaaqvvqwvsfadsdivppastwvfptlgim
hhnkqatenakeevrrilglldaylktrtflvgervtladitvvctllwlykqvlepsfr
qafpntnrwfltcinqpqfravlgevklcekmaqfdakkfaetqpkkdtprkekgsreek
qkpqaerkeekkaaapapeeemdeceqalaaepkakdpfahlpkstfvldefkrkysned
tlsvalpyfwehfdkdgwslwyseyrfpeeltqtfmscnlitgmfqrldklrknafasvi
lfgtnnsssisgvwvfrgqelafplspdwqvdyesytwrkldpgseetqtlvreyfsweg
afqhvgkafnqgkifk
ケラチン8(KRT8)(例えば、GenBank登録番号NP_002264(配列番号83)):
1 msirvtqksy kvstsgpraf ssrsytsgpg srissssfsr vgssnfrggl gggyggasgm
61 ggitavtvnq sllsplvlev dpniqavrtq ekeqiktlnn kfasfidkvr fleqqnkmle
121 tkwsllqqqk tarsnmdnmf esyinnlrrq letlgqeklk leaelgnmqg lvedfknkye
181 deinkrteme nefvlikkdv deaymnkvel esrlegltde inflrqlyee eirelqsqis
241 dtsvvlsmdn srsldmdsii aevkaqyedi anrsraeaes myqikyeelq slagkhgddl
301 rrtkteisem nrnisrlqae ieglkgqras leaaiadaeq rgelaikdan aklseleaal
361 qrakqdmarq lreyqelmnv klaldieiat yrkllegees rlesgmqnms ihtkttsgya
421 gglssayggl tspglsyslg ssfgsgagss sfsrtsssra vvvkkietrd gklvsessdv
481 lpk
フィビュリン2(FBLN2)(例えば、GenBank登録番号NP_001989(配列番号84)):
1 mvllwepaga wlalglalal gpsvaaaapr qdctgvecpp lencieeale pgaccatcvq
61 qgcacegyqy ydclqggfvr grvpagqsyf vdfgstecsc ppgggkiscq fmlcpelppn
121 cieavvvads cpqcgqvgcv haghkyaagh tvhlppcrac hcpdaggeli cyqlpgchgn
181 fsdaeegdpe rhyedpysyd qevaeveaat alggevqaga vqagaggppa algggsqpls
241 tiqappwpav lprptaaaal gppapvqaka rrvtedseee eeeeeereem avteqlaagg
301 hrgldglptt apagpslpiq eeraeagara eagarpeenl ildaqatsrs tgpegvthap
361 slgkaalvpt qavpgsprdp vkpsphnils tslpdaawip ptrevprkpq vlphshveed
421 tdpnsvhsip rsspegstkd lietccaagq qwaidndecl eipesgtedn vcrtaqrhcc
481 vsylqekscm agvlgakege tcgaedndsc gislykqccd ccglglrvra egqscesnpn
541 lgypcnhvml sccegeepli vpevrrppep aaaprrvsea emagrealsl gteaelpnsl
601 pgddqdecll lpgelcqhlc intvgsyhca cfpgfslqdd grtcrpeghp pqpeapqepa
661 lksefsqvas ntiplplpqp ntckdngpck qvcstvggsa icscfpgyai madgvscedi
721 necvtdlhtc srgehcvntl gsfhcykalt cepgyalkdg ecedvdecam gthtcqpgfl
781 cqntkgsfyc qarqrcmdgf lqdpegncvd inectslsep crpgfscint vgsytcqrnp
841 licargyhas ddgtkcvdvn ecetgvhrcg egqvchnlpg syrcdckagf qrdafgrgci
901 dvnecwaspg rlcqhtcent lgsyrcscas gfllaadgkr cedvneceaq rcsqecaniy
961 gsyqcycrqg yqlaedghtc tdidecaqga gilctfrcln vpgsyqcacp eqgytmtang
1021 rsckdvdeca lgthncseae tchniqgsfr clrfecppny vqvsktkcer ttchdflecq
1081 nsparithyq lnfqtgllvp ahifrigpap aftgdtialn iikgneegyf gtrrlnaytg
1141 vvylqravle prdfaldvem klwrqgsvtt flakmhifft tfal
VIM(例えば、GenBank登録番号NP_003371(配列番号85)):
1 mstrsvssss yrrmfggpgt asrpsssrsy vttstrtysl gsalrpstsr slyasspggv
61 yatrssavrl rssvpgvrll qdsvdfslad aintefkntr tnekvelqel ndrfanyidk
121 vrfleqqnki llaeleqlkg qgksrlgdly eeemrelrrq vdqltndkar veverdnlae
181 dimrlreklq eemlqreeae ntlqsfrqdv dnaslarldl erkveslqee iaflkklhee
241 eiqelqaqiq eqhvqidvdv skpdltaalr dvrqqyesva aknlqeaeew ykskfadlse
301 aanrnndalr qakqesteyr rqvqsltcev dalkgtnesl erqmremeen faveaanyqd
361 tigrlqdeiq nmkeemarhl reyqdllnvk maldieiaty rkllegeesr islplpnfss
421 lnlretnlds lplvdthskr tlliktvetr dgqvinetsq hhddle
フィブリノーゲンα鎖(FGA)(例えば、GenBank登録番号NP_000499(配列番号86)):
1 mfsmrivclv lsvvgtawta dsgegdflae gggvrgprvv erhqsackds dwpfcsdedw
61 nykcpsgcrm kglidevnqd ftnrinklkn slfeyqknnk dshslttnim eilrgdfssa
121 nnrdntynrv sedlrsriev lkrkviekvq hiqllqknvr aqlvdmkrle vdidikirsc
181 rgscsralar evdlkdyedq qkqleqviak dllpsrdrqh lplikmkpvp dlvpgnfksq
241 lqkvppewka ltdmpqmrme lerpggneit rggstsygtg setesprnps sagswnsgss
301 gpgstgnrnp gssgtggtat wkpgssgpgs tgswnsgssg tgstgnqnpg sprpgstgtw
361 npgssergsa ghwtsessvs gstgqwhses gsfrpdspgs gnarpnnpdw gtfeevsgnv
421 spgtrreyht eklvtskgdk elrtgkekvt sgsttttrrs csktvtktvi gpdghkevtk
481 evvtsedgsd cpeamdlgtl sgigtldgfr hrhpdeaaff dtastgktfp gffspmlgef
541 vsetesrgse sgiftntkes sshhpgiaef psrgksssys kqftsstsyn rgdstfesks
601 ykmadeagse adhegthstk rghaksrpvr dcddvlqthp sgtqsgifni klpgsskifs
661 vycdqetslg gwlliqqrmd gslnfnrtwq dykrgfgsln degegefwlg ndylhlltqr
721 gsvlrveled wagneayaey hfrvgseaeg yalqvssyeg tagdaliegs veegaeytsh
781 nnmqfstfdr dadqweenca evygggwwyn ncqaanlngi yypggsydpr nnspyeieng
841 vvwvsfrgad yslravrmki rplvtq
アネキシンA2(ANXA2)(例えば、GenBank登録番号NP_001002858(配列番号87)):
1 mgrqlagcgd agkkasfkms tvheilckls legdhstpps aygsvkaytn fdaerdalni
61 etaiktkgvd evtivniltn rsnaqrqdia fayqrrtkke lasalksals ghletvilgl
121 lktpaqydas elkasmkglg tdedslieii csrtnqelqe inrvykemyk tdlekdiisd
181 tsgdfrklmv alakgrraed gsvidyelid qdardlydag vkrkgtdvpk wisimtersv
241 phlqkvfdry ksyspydmle sirkevkgdl enaflnlvqc iqnkplyfad rlydsmkgkg
301 trdkvlirim vsrsevdmlk irsefkrkyg kslyyyiqqd tkgdyqkall ylcggdd
H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ)(例えば、GenBank登録番号NP_808760(配列番号88)):
1 msgrgkqggk vrakaksrss raglqfpvgr vhrllrkgny aervgagapv ylaavleylt
61 aeilelagna ardnkktrii prhlqlairn deelnkllgk vtiaqggvlp niqavllpkk
121 tesqktksk
アクチンα,心筋1(ACTC1)(例えば、GenBank登録番号NP_005150(配列番号89)):
1 mcddeettal vcdngsglvk agfagddapr avfpsivgrp rhqgvmvgmg qkdsyvgdea
61 qskrgiltlk ypiehgiitn wddmekiwhh tfynelrvap eehptlltea plnpkanrek
121 mtqimfetfn vpamyvaiqa vlslyasgrt tgivldsgdg vthnvpiyeg yalphaimrl
181 dlagrdltdy lmkiltergy sfvttaerei vrdikeklcy valdfenema taasssslek
241 syelpdgqvi tignerfrcp etlfqpsfig mesagihett ynsimkcdid irkdlyannv
301 lsggttmypg iadrmqkeit alapstmkik iiapperkys vwiggsilas lstfqqmwis
361 kqeydeagps ivhrkcf
ケラチン19(KRT19)(例えば、GenBank登録番号NP_002267(配列番号90)):
1 mtsysyrqss atssfgglgg gsvrfgpgva frapsihggs ggrgvsvssa rfvsssssga
61 ygggyggvlt asdgllagne kltmqnlndr lasyldkvra leaangelev kirdwyqkqg
121 pgpsrdyshy yttiqdlrdk ilgatiensr ivlqidnarl aaddfrtkfe teqalrmsve
181 adinglrrvl deltlartdl emqieglkee laylkknhee eistlrgqvg gqvsvevdsa
241 pgtdlakils dmrsqyevma eqnrkdaeaw ftsrteelnr evaghteqlq msrsevtdlr
301 rtlqgleiel qsqlsmkaal edtlaetear fgaqlahiqa lisgieaqlg dvradserqn
361 qeyqrlmdik srleqeiaty rsllegqedh ynnlsaskvl
免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質)(例えば、GenBank登録番号Q6PIQ7(配列番号91)):
1 mawallllsl ltqgtgswaq saltqprsvs gspgqsvtip ctgtssdvgn ynyvswyrqh
61 pgkapklmiy dvnkrpsgvp drfsgsksgn tasltisglq aedeadyycc syagtytfgv
121 fgggtkltvl gqpkaapsvt lfppsseelq ankatlvcli sdfypgavtv awkadsspvk
181 agvetttpsk qsnnkyaass ylsltpeqwk shksyscqvt hegstvektv aptecs
免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM)(例えば、GenBank登録番号Q8WUK1(配列番号92)):
1 mefglswvfl vallrgvqcq vqlvesgggv vqpgrslrls caasgftfss ygmhwvrqap
61 gkglewvavi sydgsnkyya dsvkgrftis rdnskntlyl qmnslraedt avyycakdws
121 egvetfdiwg qgtmvtvssg sasaptlfpl vscenspsdt ssvavgclaq dflpdsitfs
181 wkyknnsdis strgfpsvlr ggkyaatsqv llpskdvmqg tdehvvckvq hpngnkeknv
241 plpviaelpp kvsvfvpprd gffgnprksk licqatgfsp rqiqvswlre gkqvgsgvtt
301 dqvqaeakes gpttykvtst ltikesdwls qsmftcrvdh rgltfqqnas smcvpdqdta
361 irvfaippsf asifltkstk ltclvtdltt ydsvtiswtr qngeavktht niseshpnat
421 fsavgeasic eddwnsgerf tctvthtdlp splkqtisrp kgvalhrpdv yllppareql
481 nlresatitc lvtgfspadv fvqwmqrgqp lspekyvtsa pmpepqapgr yfahsiltvs
541 eeewntgety tcvvahealp nrvtertvdk stegevsade egfenlwata stfivlflls
601 lfysttvtlf kvk
EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1)(例えば、GenBank登録番号Q12805−3(配列番号93)):
1 mlkalfltml tlalvksqdt eetitytqct dgyewdpvrq qckdidecdi vpdackggmk
61 cvnhyggylc lpktaqiivn neqpqqetqp aegtsgattg vvaassmats gvlpgggfva
121 saaavagpem qtgrnnfvir rnpadpqrip snpshriqca agyeqsehnv cqdidectag
181 thncradqvc inlrgsfacq cppgyqkrge qcvdidecti ppychqrcvn tpgsfycqcs
241 pgfqlaanny tcvdinecda snqcaqqcyn ilgsficqcn qgyelssdrl ncedidecrt
301 ssylcqyqcv nepgkfscmc pqgyqvvrsr tcqdinecet tnecredemc wnyhggfrcy
361 prnpcqdpyi ltpenrcvcp vsnamcrelp qsivykymsi rsdrsvpsdi fqiqattiya
421 ntintfriks gnengefylr qtspvsamlv lvkslsgpre hivdlemltv ssigtfrtss
481 vlrltiivgp fsf
三部分モチーフ含有タンパク質34(例えば、GenBank登録番号NP_067629(配列番号94)):
1 maskillnvq eevtcpicle llteplsldc ghslcracit vsnkeavtsm ggksscpvcg
61 isysfehlqa nqhlaniver lkevklspdn gkkrdlcdhh geklllfcke drkvicwlce
121 rsqehrghht vlteevfkec qeklqavlkr lkkeeeeaek leadireekt swkyqvqter
181 qriqtefdql rsilnneeqr elqrleeeek ktldkfaeae delvqqkqlv relisdvecr
241 sqwstmellq dmsgimkwse iwrlkkpkmv skklktvfha pdlsrmlqmf reltavrcyw
301 vdvtlnsvnl nlnlvlsedq rqvisvpiwp fqcynygvlg sqyfssgkhy wevdvskkta
361 wilgvycrty srhmkyvvrr canrqnlytk yrplfgywvi glqnkckygv feeslssdpe
421 vltlsmavpp crvgvfldye agivsffnvt shgsliykfs kccfsqpvyp yfnpwncpap
481 mtlcppss
AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号NP_542117(配列番号95)):
1 malrpgagsg gggaagagag saggggfmfp vaggirppqa glmpmqqqgf pmvsvmqpnm
61 qgimgmnyss qmsqgpiamq agipmgpmpa agmpylgqap flgmrppgpq ytpdmqkqfa
121 eeqqkrfeqq qklleeerkr rqfeeqkqkl rllssvkpkt geksrddale aikgnldgfs
181 rdakmhptpa shpkkpgpsl eekflvscdi stsgqeqikl ntsevghkal gpgsskkyps
241 lmasngvavd gcvsgtttae aentsdqnls ieesgvgvfp sqdpaqprmp pwiyneslvp
301 daykkilett mtptgidtak lypilmssgl pretlgqiwa lanrttpgkl tkeelytvla
361 miavtqrgvp amspdalnqf paapiptlsg fsmtlptpvs qptvipsgpa gsmplslgqp
421 vmginlvgpv ggaaaqassg fiptypanqv vkpeeddfqd fqdasksgsl ddsfsdfqel
481 passktsnsq hgnsapsllm plpgtkalps mdkyavfkgi aadkssentv ppgdpgdkys
541 afreleqtae nkplgesfae frsagtddgf tdfktadsvs plepptkdkt fppsfpsgti
601 qqkqqtqvkn plnladldmf ssvncssekp lsfsavfsts ksvstpqstg saatmtalaa
661 tktssladdf gefslfgeys glapvgeqdd fadfmafsns sisseqkpdd kydalkeeas
721 pvpltsnvgs tvkggqnsta astkydvfrq lslegsglgv edlkdntpsg ksdddfadfh
781 sskfssinsd kslgekavaf rhtkedsasv ksldlpsigg ssvgkedsed alsvqfdmkl
841 advggdlkhv msdssldlpt vsgqhppaad iedlkyaafg syssnfavst ltsydwsdrd
901 datqgrklsp fvlsagsgsp satsilqkke tsfgssenit mtslskvttf vsedalpett
961 fpalasfkdt ipqtseqkey enrdykdftk qdlptaersq eatcpspass gasqetpnec
1021 sddfgefqse kpkiskfdfl vatsqskmks seemiksela tfdlsvqgsh krslslgdke
1081 isrsspspal eqpfrdrsnt lnekpalpvi rdkykdltge veeneryaye wqrclgsaln
1141 vikkandtln gissssvcte viqsaqgmey llgvvevyrv tkrvelgika tavcseklqq
1201 llkdidkvwn nligfmslat ltpdensldf sscmlrpgik naqelacgvc llnvdsrsra
1261 fnsetdsfkl aygghqyhas canfwincve pkppglvlpd ll
プロフィリン(Proflin)−1(例えば、GenBank登録番号NP_005013(配列番号96)):
1 magwnayidn lmadgtcqda aivgykdsps vwaavpgktf vnitpaevgv lvgkdrssfy
61 vngltlggqk csvirdsllq dgefsmdlrt kstggaptfn vtvtktdktl vllmgkegvh
121 gglinkkcye mashlrrsqy
ヒストンH4(例えば、GenBank登録番号NP_001029249(配列番号97)):
1 msgrgkggkg lgkggakrhr kvlrdniqgi tkpairrlar rggvkrisgl iyeetrgvlk
61 vflenvirda vtytehakrk tvtamdvvya lkrqgrtlyg fgg
ヘモグロビンサブユニットα(例えば、GenBank登録番号NP_000549(配列番号98)):
1 mvlspadktn vkaawgkvga hageygaeal ermflsfptt ktyfphfdls hgsaqvkghg
61 kkvadaltna vahvddmpna lsalsdlhah klrvdpvnfk llshcllvtl aahlpaeftp
121 avhasldkfl asvstvltsk yr
トランスゲリン(例えば、GenBank登録番号NP_001001522(配列番号99)):
1 mankgpsygm srevqskiek kydeeleerl vewiivqcgp dvgrpdrgrl gfqvwlkngv
61 ilsklvnsly pdgskpvkvp enppsmvfkq meqvaqflka aedygviktd mfqtvdlfeg
121 kdmaavqrtl malgslavtk ndghyrgdpn wfmkkaqehk reftesqlqe gkhviglqmg
181 snrgasqagm tgygrprqii s
ルミカン前駆体(例えば、GenBank登録番号NP_002336(配列番号100)):
1 mslsaftlfl aliggtsgqy ydydfplsiy gqsspncape cncpesypsa mycdelklks
61 vpmvppgiky lylrnnqidh idekafenvt dlqwlildhn llenskikgr vfsklkqlkk
121 lhinhnnlte svgplpksle dlqlthnkit klgsfeglvn ltfihlqhnr lkedavsaaf
181 kglksleyld lsfnqiarlp sglpvslltl yldnnkisni pdeyfkrfna lqylrlshne
241 ladsgipgns fnvsslveld lsynklknip tvnenlenyy levnqlekfd iksfckilgp
301 lsyskikhlr ldgnrisets lppdmyeclr vanevtln
ヘモグロビンβ(例えば、GenBank登録番号NP_000509(配列番号101)):
1 mvhltpeeks avtalwgkvn vdevggealg rllvvypwtq rffesfgdls tpdavmgnpk
61 vkahgkkvlg afsdglahld nlkgtfatls elhcdklhvd penfrllgnv lvcvlahhfg
121 keftppvqaa yqkvvagvan alahkyh
フィブリノーゲンβ鎖前駆体(例えば、GenBank登録番号NP_005132(配列番号102)):
1 mkrmvswsfh klktmkhlll lllcvflvks qgvndneegf fsarghrpld kkreeapslr
61 papppisggg yrarpakaaa tqkkverkap daggclhadp dlgvlcptgc qlqeallqqe
121 rpirnsvdel nnnveavsqt ssssfqymyl lkdlwqkrqk qvkdnenvvn eysselekhq
181 lyidetvnsn iptnlrvlrs ilenlrskiq klesdvsaqm eycrtpctvs cnipvvsgke
241 ceeiirkgge tsemyliqpd ssvkpyrvyc dmntenggwt viqnrqdgsv dfgrkwdpyk
301 qgfgnvatnt dgknycglpg eywlgndkis qltrmgptel liemedwkgd kvkahyggft
361 vqneankyqi svnkyrgtag nalmdgasql mgenrtmtih ngmffstydr dndgwltsdp
421 rkqcskedgg gwwynrchaa npngryywgg qytwdmakhg tddgvvwmnw kgswysmrkm
481 smkirpffpq q
免疫グロブリンκ定常部位(IGKC)(例えば、GenBank登録番号Q6GMX8(配列番号103)):
1 mdmrvpaqll gllllwfpgs rcdiqmtqsp ssvsasvgdr vtitcrasqg isswlawyqq
61 kpgkapklli yaasslqsgv psrfsgsgsg tdftltissl qpedfatyyc qqahsfpftf
121 gpgtkvdikr tvaapsvfif ppsdeqlksg tasvvcllnn fypreakvqw kvdnalqsgn
181 sqesvteqds kdstyslsst ltlskadyek hkvyacevth qglsspvtks fnrgec
未同定タンパク質ALB(例えば、GenBank登録番号Q56G89(配列番号104)):
1 mkwvtfisll flfssaysrg vfrrdahkse vahrfkdlge enfkalvlia faqylqqcpf
61 edhvklvnev tefaktcvad esaencdksl htlfgdklct vatlretyge madccakqep
121 ernecflqhk ddnpnlprlv rpevdvmcta fhdneetflk kylyeiarrh pyfyapellf
181 fakrykaaft eccqaadkaa cllpkldelr degkassakq glkcaslqkf gerafkawav
241 arlsqrfpka efaevsklvt dltkvhtecc hgdllecadd radlakyice nqdsissklk
301 eccekpllek shciaevend empadlpsla adfvgskdvc knyaeakdvf lgmflyeyar
361 rhpdysvvll lrlaktyett lekccaaadp hecyakvfde fkplveepqn likqncelfe
421 qlgeykfqna llvrytkkvp qvstptlvev srnlgkvgsk cckhpeakrm pcaedclsvf
481 lnqlcvlhek tpvsdrvtkc cteslvngrp cfsalevdet yvpkefnaet ftfhadictl
541 sekerqikkq talvelvkhk pkatkeqlka vmddfaafve kcckaddket cfaeegkklv
601 aasqaalgl
ApoA1(例えば、GenBank登録番号P02647(配列番号105)):
MKAAVLTLAV LFLTGSQARH FWQQDEPPQS PWDRVKDLAT VYVDVLKDSG RDYVSQFEGS
ALGKQLNLKL LDNWDSVTST FSKLREQLGP VTQEFWDNLE KETEGLRQEM SKDLEEVKAK
VQPYLDDFQK KWQEEMELYR QKVEPLRAEL QEGARQKLHE LQEKLSPLGE EMRDRARAHV
DALRTHLAPY SDELRQRLAA RLEALKENGG ARLAEYHAKA TEHLSTLSEK AKPALEDLRQ
GLLPVLESFK VSFLSALEEY TKKLNTQ
C4A(例えば、GenBank登録番号P0C0L4(配列番号106)):
MRLLWGLIWA SSFFTLSLQK PRLLLFSPSV VHLGVPLSVG VQLQDVPRGQ VVKGSVFLRN
PSRNNVPCSP KVDFTLSSER DFALLSLQVP LKDAKSCGLH QLLRGPEVQL VAHSPWLKDS
LSRTTNIQGI NLLFSSRRGH LFLQTDQPIY NPGQRVRYRV FALDQKMRPS TDTITVMVEN
SHGLRVRKKE VYMPSSIFQD DFVIPDISEP GTWKISARFS DGLESNSSTQ FEVKKYVLPN
FEVKITPGKP YILTVPGHLD EMQLDIQARY IYGKPVQGVA YVRFGLLDED GKKTFFRGLE
SQTKLVNGQS HISLSKAEFQ DALEKLNMGI TDLQGLRLYV AAAIIESPGG EMEEAELTSW
YFVSSPFSLD LSKTKRHLVP GAPFLLQALV REMSGSPASG IPVKVSATVS SPGSVPEVQD
IQQNTDGSGQ VSIPIIIPQT ISELQLSVSA GSPHPAIARL TVAAPPSGGP GFLSIERPDS
RPPRVGDTLN LNLRAVGSGA TFSHYYYMIL SRGQIVFMNR EPKRTLTSVS VFVDHHLAPS
FYFVAFYYHG DHPVANSLRV DVQAGACEGK LELSVDGAKQ YRNGESVKLH LETDSLALVA
LGALDTALYA AGSKSHKPLN MGKVFEAMNS YDLGCGPGGG DSALQVFQAA GLAFSDGDQW
TLSRKRLSCP KEKTTRKKRN VNFQKAINEK LGQYASPTAK RCCQDGVTRL PMMRSCEQRA
ARVQQPDCRE PFLSCCQFAE SLRKKSRDKG QAGLQRALEI LQEEDLIDED DIPVRSFFPE
NWLWRVETVD RFQILTLWLP DSLTTWEIHG LSLSKTKGLC VATPVQLRVF REFHLHLRLP
MSVRRFEQLE LRPVLYNYLD KNLTVSVHVS PVEGLCLAGG GGLAQQVLVP AGSARPVAFS
VVPTAAAAVS LKVVARGSFE FPVGDAVSKV LQIEKEGAIH REELVYELNP LDHRGRTLEI
PGNSDPNMIP DGDFNSYVRV TASDPLDTLG SEGALSPGGV ASLLRLPRGC GEQTMIYLAP
TLAASRYLDK TEQWSTLPPE TKDHAVDLIQ KGYMRIQQFR KADGSYAAWL SRDSSTWLTA
FVLKVLSLAQ EQVGGSPEKL QETSNWLLSQ QQADGSFQDP CPVLDRSMQG GLVGNDETVA
LTAFVTIALH HGLAVFQDEG AEPLKQRVEA SISKANSFLG EKASAGLLGA HAAAITAYAL
SLTKAPVDLL GVAHNNLMAM AQETGDNLYW GSVTGSQSNA VSPTPAPRNP SDPMPQAPAL
WIETTAYALL HLLLHEGKAE MADQASAWLT RQGSFQGGFR STQDTVIALD ALSAYWIASH
TTEERGLNVT LSSTGRNGFK SHALQLNNRQ IRGLEEELQF SLGSKINVKV GGNSKGTLKV
LRTYNVLDMK NTTCQDLQIE VTVKGHVEYT MEANEDYEDY EYDELPAKDD PDAPLQPVTP
LQLFEGRRNR RRREAPKVVE EQESRVHYTV CIWRNGKVGL SGMAIADVTL LSGFHALRAD
LEKLTSLSDR YVSHFETEGP HVLLYFDSVP TSRECVGFEA VQEVPVGLVQ PASATLYDYY
NPERRCSVFY GAPSKSRLLA TLCSAEVCQC AEGKCPRQRR ALERGLQDED GYRMKFACYY
PRVEYGFQVK VLREDSRAAF RLFETKITQV LHFTKDVKAA ANQMRNFLVR ASCRLRLEPG
KEYLIMGLDG ATYDLEGHPQ YLLDSNSWIE EMPSERLCRS TRQRAACAQL NDFLQEYGTQ
GCQV
C3 187kDaタンパク質(例えば、GenBank登録番号P01024(配列番号107)):
MGPTSGPSLL LLLLTHLPLA LGSPMYSIIT PNILRLESEE TMVLEAHDAQ GDVPVTVTVH
DFPGKKLVLS SEKTVLTPAT NHMGNVTFTI PANREFKSEK GRNKFVTVQA TFGTQVVEKV
VLVSLQSGYL FIQTDKTIYT PGSTVLYRIF TVNHKLLPVG RTVMVNIENP EGIPVKQDSL
SSQNQLGVLP LSWDIPELVN MGQWKIRAYY ENSPQQVFST EFEVKEYVLP SFEVIVEPTE
KFYYIYNEKG LEVTITARFL YGKKVEGTAF VIFGIQDGEQ RISLPESLKR IPIEDGSGEV
VLSRKVLLDG VQNPRAEDLV GKSLYVSATV ILHSGSDMVQ AERSGIPIVT SPYQIHFTKT
PKYFKPGMPF DLMVFVTNPD GSPAYRVPVA VQGEDTVQSL TQGDGVAKLS INTHPSQKPL
SITVRTKKQE LSEAEQATRT MQALPYSTVG NSNNYLHLSV LRTELRPGET LNVNFLLRMD
RAHEAKIRYY TYLIMNKGRL LKAGRQVREP GQDLVVLPLS ITTDFIPSFR LVAYYTLIGA
SGQREVVADS VWVDVKDSCV GSLVVKSGQS EDRQPVPGQQ MTLKIEGDHG ARVVLVAVDK
GVFVLNKKNK LTQSKIWDVV EKADIGCTPG SGKDYAGVFS DAGLTFTSSS GQQTAQRAEL
QCPQPAARRR RSVQLTEKRM DKVGKYPKEL RKCCEDGMRE NPMRFSCQRR TRFISLGEAC
KKVFLDCCNY ITELRRQHAR ASHLGLARSN LDEDIIAEEN IVSRSEFPES WLWNVEDLKE
PPKNGISTKL MNIFLKDSIT TWEILAVSMS DKKGICVADP FEVTVMQDFF IDLRLPYSVV
RNEQVEIRAV LYNYRQNQEL KVRVELLHNP AFCSLATTKR RHQQTVTIPP KSSLSVPYVI
VPLKTGLQEV EVKAAVYHHF ISDGVRKSLK VVPEGIRMNK TVAVRTLDPE RLGREGVQKE
DIPPADLSDQ VPDTESETRI LLQGTPVAQM TEDAVDAERL KHLIVTPSGC GEQNMIGMTP
TVIAVHYLDE TEQWEKFGLE KRQGALELIK KGYTQQLAFR QPSSAFAAFV KRAPSTWLTA
YVVKVFSLAV NLIAIDSQVL CGAVKWLILE KQKPDGVFQE DAPVIHQEMI GGLRNNNEKD
MALTAFVLIS LQEAKDICEE QVNSLPGSIT KAGDFLEANY MNLQRSYTVA IAGYALAQMG
RLKGPLLNKF LTTAKDKNRW EDPGKQLYNV EATSYALLAL LQLKDFDFVP PVVRWLNEQR
YYGGGYGSTQ ATFMVFQALA QYQKDAPDHQ ELNLDVSLQL PSRSSKITHR IHWESASLLR
SEETKENEGF TVTAEGKGQG TLSVVTMYHA KAKDQLTCNK FDLKVTIKPA PETEKRPQDA
KNTMILEICT RYRGDQDATM SILDISMMTG FAPDTDDLKQ LANGVDRYIS KYELDKAFSD
RNTLIIYLDK VSHSEDDCLA FKVHQYFNVE LIQPGAVKVY AYYNLEESCT RFYHPEKEDG
KLNKLCRDEL CRCAEENCFI QKSDDKVTLE ERLDKACEPG VDYVYKTRLV KVQLSNDFDE
YIMAIEQTIK SGSDEVQVGQ QRTFISPIKC REALKLEEKK HYLMWGLSSD FWGEKPNLSY
IIGKDTWVEH WPEEDECQDE ENQKQCQDLG AFTESMVVFG CPN
アクチン,細胞質性1(アクチンβ)(例えば、GenBank登録番号NP_001092(配列番号108):
>refseqp|NP_001092|NP_001092 βアクチン[ヒト]。
MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQS
KRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMT
QIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDL
AGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSY
ELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLS
GGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQ
EYDESGPSIVHRKCF
ヘモグロビンβ(例えば、GenBank登録番号O95408(配列番号109):
>uniprot|O95408|O95408_ヒトβグロビン;
MVHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVIYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMG
ヘモグロビンサブユニットα(例えば、GenBank登録番号P69905(配列番号110):
>uniprot|P69905|HBA_ヒトヘモグロビンサブユニットα;
MVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHG
KKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
POTE−2αアクチン(例えば、GenBank登録番号A5A3E0(配列番号111):
>uniprot|A5A3E0|POTEF_ヒトPOTEアンキリンドメインファミリーメンバーF;
MVVEVDSMPAASSVKKPFGLRSKMGKWCCRCFPCCRESGKSNVGTSGDHDDSAMKTLRSK
MGKWCRHCFPCCRGSGKSNVGASGDHDDSAMKTLRNKMGKWCCHCFPCCRGSSKSKVGAW
GDYDDSAFMEPRYHVRGEDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDVNKQDKQKRTALHLA
SANGNSEVVKLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECALMLLEHGTDPNIPDEYGN
TTLHYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKHGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNA
LDRYGRTALILAVCCGSASIVSLLLEQNIDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICQLLSDY
KEKQMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRFKGSENSQPEKMSQEPEINKDGDREVEEEMK
KHESNNVGLLENLTNGVTAGNGDNGLIPQRKSRTPENQQFPDNESEEYHRICELLSDYKE
KQMPKYSSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKGSENGQPEKRSQEPEINKDGDRELENFMAIE
EMKKHRSTHVGFPENLTNGATAGNGDDGLIPPRKSRTPESQQFPDTENEEYHSDEQNDTQ
KQFCEEQNTGILHDEILIHEEKQIEVVEKMNSELSLSCKKEKDILHENSTLREEIAMLRL
ELDTMKHQSQLREKKYLEDIESVKKRNDNLLKALQLNELTMDDDTAVLVIDNGSGMCKAG
FAGDDAPRAVFPSIVGRPRQQGMMGGMHQKESYVGKEAQSKRGILTLKYPMEHGIITNWD
DMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEATLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVL
SLYTSGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGNALPHATLRLDLAGRELPDYLMKILTEHGYRF
TTMAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATVASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEA
LFQPCFLGMESCGIHETTFNSIMKSDVDIRKDLYTNTVLSGGTTMYPGMAHRMQKEIAAL
APSMMKIRIIAPPKRKYSVWVGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCL
SLC4A10(例えば、GenBank登録番号Q6U841(配列番号112):
>uniprot|Q6U841|S4A10_ヒトナトリウム駆動性塩素イオン重炭酸イオン交換物質;
MEIKDQGAQMEPLLPTRNDEEAVVDRGGTRSILKTHFEKEDLEGHRTLFIGVHVPLGGRK
SHRRHRHRGHKHRKRDRERDSGLEDGRESPSFDTPSQRVQFILGTEDDDEEHIPHDLFTE
LDEICWREGEDAEWRETARWLKFEEDVEDGGERWSKPYVATLSLHSLFELRSCILNGTVL
LDMHANTLEEIADMVLDQQVSSGQLNEDVRHRVHEALMKQHHHQNQKKLTNRIPIVRSFA
DIGKKQSEPNSMDKNAGQVVSPQSAPACVENKNDVSRENSTVDFSKGLGGQQKGHTSPCG
MKQRHEKGPPHQQEREVDLHFMKKIPPGAEASNILVGELEFLDRTVVAFVRLSPAVLLQG
LAEVPIPTRFLFILLGPLGKGQQYHEIGRSIATLMTDEVFHDVAYKAKDRNDLVSGIDEF
LDQVTVLPPGEWDPSIRIEPPKNVPSQEKRKIPAVPNGTAAHGEAEPHGGHSGPELQRTG
RIFGGLILDIKRKAPYFWSDFRDAFSLQCLASFLFLYCACMSPVITFGGLLGEATEGRIS
AIESLFGASMTGIAYSLFGGQPLTILGSTGPVLVFEKILFKFCKEYGLSYLSLRASIGLW
TATLCIILVATDASSLVCYITRFTEEAFASLICIIFIYEALEKLFELSEAYPINMHNDLE
LLTQYSCNCVEPHNPSNGTLKEWRESNISASDIIWENLTVSECKSLHGEYVGRACGHDHP
YVPDVLFWSVILFFSTVTLSATLKQFKTSRYFPTKVRSIVSDFAVFLTILCMVLIDYAIG
IPSPKLQVPSVFKPTRDDRGWFVTPLGPNPWWTVIAAIIPALLCTILIFMDQQITAVIIN
RKEHKLKKGCGYHLDLLMVAVMLGVCSIMGLPWFVAATVLSITHVNSLKLESECSAPGEQ
PKFLGIREQRVTGLMIFILMGSSVFMTSILKFIPMPVLYGVFLYMGASSLKGIQFFDRIK
LFWMPAKHQPDFIYLRHVPLRKVHLFTIIQMSCLGLLWIIKVSRAAIVFPMMVLALVFVR
KLMDLLFTKRELSWLDDLMPESKKKKLEDAEKEEEQSMLAMEDEGTVQLPLEGHYRDDPS
VINISDEMSKTALWRNLLITADNSKDKESSFPSKSSPS
リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7)(例えば、GenBank登録番号O75817(配列番号113)
>uniprot|O75817|POP7_ヒトリボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットp20;
MAENREPRGAVEAELDPVEYTLRKRLPSRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGA
RGQNACSEIYIHGLGLAINRAINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDTREP
LTRIRNNSAIHIRVFRVTPK
核RNA排出因子1(NXF1)(例えば、GenBank登録番号Q59E96(配列番号114):
>uniprot|Q59E96|Q59E96_ヒト核RNA排出因子1変異体;
RPAPEPALDLRCGMADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGI
RSSRLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDRAPPERGG
AGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDAS
TASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTILNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQAL
DLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIV
QKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYIRSVVACVSP
PGDLHPLGG
コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA(例えば、GenBank登録番号Q05DB3(配列番号115):>uniprot|Q05DB3|Q05DB3_ヒトUACAタンパク質;
MMNCWFSCTPKNRHAADWNKYDDRLMKAAERGDVEKVTSILAKKGVNPGKLDVEGRSVFH
VVTSKGNLECLNAILIHGVDITTSDTAGRNALHLAAKYGHALCLQKLLQYNCPTEHADLQ
GRTALHDAAMADCPSSIQLLCDHGASVNAKDVDGRTPLVLATQMSRPTICQLLIDRGADV
NSRDKQNRTALMLGCEYGCRDAVEVLIKNGADISLLDALGHDSSYYARIGDNLDILTLLK
TASENTNKGRELWKKGPSLQQRNLTHMQDEVNVKSHQREHQNIQDLEIENEDLKERLRKI
QQEQRILLDKVNGLQLQLNEEVMVADDLESEREKLKSLLAAKEKQHEESLRTIEALKNRF
KYFESDHLGSGSHFSNRKEDMLLKQGQMYMADSQCTSPGIPAHMQSRSMLRPLELSLPSQ
TSYSENEILKKELEAMRTFCESAKQDRLKLQNELAHKVAECKALALECERVKEDSDEQIK
QLEDALKDVQKRMYESEGKVKQMQTHFLALKEHLTSEAASGNHRLTEELKDQLKDLKVKY
EGASAEVGKLRNQIKQNEMIVEEFKRDEGKLIEENKRLQKELSMCEMEREKKGRKVTEME
GQAKELSAKLALSIPAEKFENMKSSLSNEVNEKAKKKK
未同定タンパク質C13ORF27(例えば、GenBank登録番号Q5JUR7(配列番号116):
>uniprot|Q5JUR7|CM027_ヒト未同定タンパク質C13ORF27;
MSHTEVKLKIPFGNKLLDAVCLVPNKSLTYGIILTHGASGDMNLPHLMSLASHLASHGFF
CLRFTCKGLNIVHRIKAYKSVLNYLKTSGEYKLAGVFLGGRSMGSRAAASVMCHIEPDDG
DDFVRGLICISYPLHHPKQQHKLRDEDLFRLKEPVLFVSGSADEMCEKNLLEKVAQKMQA
PHKIHWIEKANHSMAVKGRSTNDVFKEINTQILFWIQEITEMDKKCH
sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q8TER0(配列番号117):
>swissprot|Q8TER0|SNED1_ヒトSushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1;
MRHGVAWALLVAAALGLGARGVRGAVALADFYPFGAERGDAVTPKQDDGGSGLRPLSVPF
PFFGAEHSGLYVNNNGIISFLKEVSQFTPVAFPIAKDRCVVAAFWADVDNRRAGDVYYRE
ATDPAMLRratEDVRHYFPELLDFNATWVFVATWYRVTFFGGSSSSPVNTFQTVLITDGK
LSFTIFNYESIVWTTGTHASSGGNATGLGGIAAQAGFNAGDGQRYFSIPGSRTADMAEVE
TTTNVGVPGRWAFRIDDAQVRVGGCGHTTSVCLALRPCLNGGKCIDDCVTGNPSYTCSCL
SGFTGRRCHLDVNECASQPCQNGGTCTHGINSFRCQCPAGFGGPTCETAQSPCDTKECQH
GGQCQVENGSAVCVCQAGYTGAACEMDVDDCSPDPCLNGGSCVDLVGNYTCLCAEPFKGL
RCETGDHPVPDACLSAPCHNGGTCVDADQGYVCECPEGFMGLDCRERVPDDCECRNGGRC
LGANTTLCQCPLGFFGLLCEFEITAMPCNMNTQCPDGGYCMEHGGSYLCVCHTDHNASHS
LPSPCDSDPCFNGGSCDAHDDSYTCECPRGFHGKHCEKARPHLCSSGPCRNGGTCKEAGG
EYHCSCPYRFTGRHCEIGKPDSCASGPCHNGGTCFHYIGKYKCDCPPGFSGRHCEIAPSP
CFRSPCVNGGTCEDRDTDFFCHCQAGYMGRRCQAEVDCGPPEEVKHATLRFNGTRLGAVA
LYACDRGYSLSAPSRIRVCQPHGVWSEPPQCLEIDECRSQPCLHGGSCQDRVAGYLCLCS
TGYEGAHCELERDECRAHPCRNGGSCRNLPGAYVCRCPAGFVGVHCETEVDACDSSPCQH
GGRCESGGGAYLCVCPESFFGYHCETVSDPCFSSPCGGRGYCLASNGSHSCTCKVGYTGE
DCAKELFPPTALKMERVEESGVSISWNPPNGPAARQMLDGYAVTYVSSDGSYRRTDFVDR
TRSSHQLQALAAGRAYNISVFSVKRNSNNKNDISRPAVLLARTRPRPVEGFEVTNVTAST
ISVQWALHRIRHATVSGVRVSIRHPEALRDQATDVDRSVDRFTFRALLPGKRYTIQLTTL
SGLRGEEHPTESLATAPTHVWTRPLPPANLTAARVTATSAHVVWDAPTPGSLLEAYVINV
TTSQSTKSRYVPNGKLASYTVRDLLPGRRYQLSVIAVQSTELGPQHSEPAHLYIITSPRD
GADRRWHQGGHHPRVLKNRPPPARLPELRLLNDHSAPETPTQPPRFSELVDGRGRVSARF
GGSPSKAATVRSQPTASAQLENMEEAPKRVSLALQLPEHGSKDIGNVPGNCSENPCQNGG
TCVPGADAHSCDCGPGFKGRRCELACIKVSRPCTRLFSETKAFPVWEGGVCHHVYKRVYR
VHQDICFKESCESTSLKKTPNRKQSKSQTLEKS
ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10):(例えば、GenBank登録番号Q8IVF4(配列番号118):
>uniprot|Q8IVF4|DYH10_ヒトダイニン重鎖10,軸糸性;
MVPEEVEVEIDEIPVLSEEGEEEEETYSQKVESVDKVRAKRVSLRTESLGQPLNREDEEM
DKEISEKLPSKRTAKHIMEKMHLHMLCTPLPEEFLDQNVVFFLRNTKEAISEATDMKEAM
EIMPETLEYGIINANVLHFLKNIICQVFLPALSFNQHRTSTTVGVTSGEVSNSSEHESDL
PPMPGEAVEYHSIQLIRDEFLMNVQKFASNIQRTMQQLEGEIKLEMPIISVEGEVSDLAA
DPETVDILEQCVINWLNQISTAVEAQLKKTPQGKGPLAEIEFWRERNATLSALHEQTKLP
IVRKVLDVIKESDSMLVANLQPVFTELFKFHTEASDNVRFLSTVERYFKNITHGSGFHVV
LDTIPAMMSALRMVWIISRHYNKDERMIPLMERIAWEIAERVCRVVNLRTLFKENRASAQ
SKTLEARNTLRLWKKAYFDTRAKIEASGREDRWEFDRKRLFERTDYMATICQDLSDVLQV
LEEFYNIFGPELKAVTGDPKRIDDVLCRVDGLVTPMENLTFDPFSIKSSQFWKYVMDEFK
IEVLIDIINKIFVQNLENPPLYKNHPPVAGAIYWERSLFFRIKHTILRFQEVQEILDSDR
GQEVKQKYLEVGRTMKEYEDRKYEQWMEVTEQVLPALMKKSLLTKSSIATEEPSTLERGA
VFAINFSPALREIINETKYLEQLGFTVPELARNVALQEDKFLRYTAGIQRMLDHYHMLIG
TLNDAESVLLKDHSQELLRVFRSGYKRLNWNSLGIGDYITGCKQAIGKFESLVHQIHKNA
DDISSRLTLIEAINLFKYPAAKSEEELPGVKEFFEHIERERASDVDHMVRWYLAIGPLLT
KVEGLVVHTNTGKAPKLASYYKYWEKKIYEVLTKLILKNLQSFNSLILGNVPLFHTETIL
TAPEIILHPNTNEIDKMCFHCVRNCVEITKHFVRWMNGSCIECPPQKGEEEEVVIINFYN
DISLNPQIIEQAVMIPQNVHRILINLMKYLQKWKRYRPLWKLDKAIVMEKFAAKKPPCVA
YDEKLQFYSKIAYEVMRHPLIKDEHCIRLQLRHLANTVQENAKSWVISLGKLLNESAKEE
LYNLHEEMEHLAKNLRKIPNTLEDLKFVLATIAEIRSKSLVMELRYRDVQERYRTMAMYN
LFPPDAEKELVDKIESIWSNLFNDSVNVEHALGDIKRTFTELTRGEIMNYRVQIEEFAKR
FYSEGPGSVGDDLDKGVELLGVYERELARHEKSRQELANAEKLFDLPITMYPELLKVQKE
MSGLRMIYELYEGLKVAKEEWSQTLWINLNVQILQEGIEGFLRALRKLPRPVRGLSVTYY
LEAKMKAFKDSIPLLLDLKNEALRDRHWKELMEKTSVFFEMTETFTLENMFAMELHKHTD
VLNEIVTAAIKEVAIEKAVKEILDTWENMKFTVVKYCKGTQERGYILGSVDEIIQSLDDN
TFNLQSISGSRFVGPFLQTVHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYLESIFIGGDIRSQL
PEEAKKFDNIDKVFKRIMGETLKDPVIKRCCEAPNRLSDLQNVSEGLEKCQKSLNDYLDS
KRNAFPRFFFISDDELLSILGSSDPLCVQEHMIKMYDNIASLRFNDGDSGEKLVSAMISA
EGEVMEFRKIVRAEGRVEDWMTAVLNEMRRTNRLITKEAIFRYCEDRSRVDWMLLYQGMV
VLAASQVWWTWEVEDVFHKAQKGEKQAMKNYGRKMHRQIDELVTRITMPLSKNDRKKYNT
VLIIDVHARDIVDSFIRGSILEAREFDWESQLRFYWDREPDELNIRQCTGTFGYGYEYMG
LNGRLVITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALGLLCVVTNCGE
GMDYRAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIRNALIHQLTTFQFEGQ
EISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIMLFSEGFLEAKT
LAKKMTVLYKLAREQLSKQYHYDFGLRALKSVLVMAGELKRGSSDLREDVVLMRALRDMN
LPKFVFEDVPLFLGLISDLFPGLDCPRVRYPDFNDAVEQVLEENGYAVLPIQVDKVVQMF
ETMLTRHTTMVVGPTRGGKSVVINTLCQAQTKLGLTTKLYILNPKAVSVIELYGILDPTT
RDWTDGVLSNIFREINKPTDKKERKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNRLLTLANGERIR
LQAHCALLFEVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNLKYRPYWKKWVNQIPNKVEQYNLNSL
FEKYVPYLMDVIVEGIVDGRQAEKLKTIVPQTDLNMVTQLAKMLDALLEGEIEDLDLLEC
YFLEALYCSLGASLLEDGRMKFDEYIKRLASLSTVDTEGVWANPGELPGQLPTLYDFHFD
NKRNQWVPWSKLVPEYIHAPERKFINILVHTVDTTRTTWILEQMVKIKQPVIFVGESGTS
KTATTQNFLKNLSEETNIVLMVNFSSRTTSMDIQRNLEANVEKRTKDTYGPPMGKRLLVF
MDDMNMPRVDEYGTQQPIALLKLLLEKGYLYDRGKELNCKSIRDLGFIAAMGKAGGGRNE
VDPRFISLFSVFNVPFPSEESLHLIYSSILKGHTSTFHESIVAVSGKLTFCTLALYKNIV
QDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFNGLVLTNPERFQTVAQMVRVWRNECLRVFHDRLISET
DKQLVQQHIGSLVVEHFKDDVEVVMRDPILFGDFQMALHEGEPRIYEDIQDYEAAKALFQ
EILEEYNESNTKMNLVLFDDALEHLTRVHRIIRMDRGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAFTA
SCEVFEILLSRGYSENSFREDLKSLYLKLGIENKAMIFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTS
GIVPALFSEEEKESILSQIGQEALKQGMGPAKESVWQYFVNKSANNLHIVLGMSPVGDTL
RTWCRNFPGMVNNTGIDWFMPWPPQALHAVAKSFLGYNPMIPAENIENVVKHVVLVHQSV
DHYSQQFLQKLRRSNYVTPKNYLDFINTYSKLLDEKTQCNIAQCKRLDGGLDKLKEATIQ
LDELNQKLAEQKIVLAEKSAACEALLEEIAVNTAVAEEKKKLAEEKAMEIEEQNKVIAME
KAEAETTLAEVMPILEAAKLELQKLDKSDVTEIRSFAKPPKQVQTVCECILIMKGYKELN
WKTAKGVMSDPNFLRSLMEIDFDSITQSQVKNIKGLLKTLNTTTEEMEAVSKAGLGMLKF
VEAVMGYCDVFREIKPKREKVARLERNFYLTKRELERIQNELAAIQKELETLGAKYEAAI
LEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENIRWLNDLDELMHRRVKLLGDCLLCAAFLS
YEGAFTWEFRDEMVNRIWQNDILEREIPLSQPFRLESLLTDDVEISRWGSQGLPPDELSV
QNGILTTRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEEKNNLRVASFNDPDFLKQLEMSIKYGTPFL
FRDVDEYIDPVIDNVLEKNIKVSQGRQFIILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSPSVF
GKAMVINYTVTLKGLEDQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLEDSLLREL
ATSTGNMLDNVDLVHTLEETKSKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAILFF
VLSEMALVNSMYQYSLIAFLEVFRLSLKKSLPDSILMKRLRNIMDTLTFSIYNHGCTGLF
ERHKLLFSFNMTIKIEQAEGRVPQEELDFFLKGNISLEKSKRKKPCAWLSDQGWEDIILL
SEMFSDNFGQLPDDVENNQTVWQEWYDLDSLEQFPVPLGYDNNITPFQKLLILRCFRVDR
VYRAVTDYVTVTMGEKYVQPPMISFEAIFEQSTPHSPIVFILSPGSDPATDLMKLAERSG
FGGNRLKFLAMGQGQEKVALQLLETAVARGQWLMLQNCHLLVKWLKDLEKSLERITKPHP
DFRLWLTTDPTKGFPIGILQKSLKVVTEPPNGLKLNMratYFKISHEMLDQCPHPAFKPL
VYVLAFFHAVVQERRKFGKIGWNVYYDFNESDFQVCMEILNTYLTKAFQQRDPRIPWGSL
KYLIGEVMYGGRAIDSFDRRILTIYMDEYLGDFIFDTFQPFHFFRNKEVDYKIPVGDEKE
KFVEAIEALPLANTPEVFGLHPNAEIGYYTQAARDMWAHLLELQPQTGESSSGISRDDYI
GQVAKEIENKMPKVFDLDQVRKRLGTGLSPTSVVLLQELERFNKLVVRMTKSLAELQRAL
AGEVGMSNELDDVARSLFIGHIPNIWRRLAPDTLKSLGNWMVYFLRRFSQYMLWVTESEP
SVMWLSGLHIPESYLTALVQATCRKNGWPLDRSTLFTQVTKFQDADEVNERAGQGCFVSG
LYLEGADWDIEKGCLIKSKPKVLVVDLPILKIIPIEAHRLKLQNTFRTPVYTTSMRRNAM
GVGLVFEADLFTTRHISHWVLQGVCLTLNSD
ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43)(例えば、GenBank登録番号P17302(配列番号119):
>uniprot|P17302|CXA1_ヒトギャップジャンクションα−1タンパク質;
MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
YNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQPLAIVD
QRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号Q5SZU8(配列番号120):
>uniprot|Q5SZU8|Q5SZU8_ヒトキネシンファミリーメンバー25;
CRAVGSASKLMELVHGGLQLRAKHPTLVHADSSRSHLIITVTLTTASCSDSTADQACSAT
LPREQTEAGRAGRSRRASQGALAPQLVPGNPAGHAEQVQARLQLVDSAGSECVGGDAKLL
VILCISPSQRHLAQTLQGLGFGIRARQVQRGPARKKPPSSQTEGKRRPD
GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(例えば、GenBank登録番号P04406(配列番号121):
>uniprot|P04406|G3P_ヒトグリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;
MGKVKVGVNGFGRIGRLVTRAAFNSGKVDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGKFHGTV
KAENGKLVINGNPITIFQERDPSKIKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEKAGAHLQGGAKRVI
ISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHA
ITATQKTVDGPSGKLWRDGRGALQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTANV
SVVDLTCRLEKPAKYDDIKKVVKQASEGPLKGILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAG
IALNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMAHMASKE
未同定タンパク質ALB(例えば、GenBank登録番号P02768(配列番号122):
>uniprot|P02768|ALBU_ヒト血清アルブミン;
MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPF
EDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEP
ERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLF
FAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAV
ARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLK
ECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYAR
RHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFE
QLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVV
LNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTL
SEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLV
AASQAALGL
ガレクチン−3,LGALS3(例えば、GenBank登録番号NP_002297(配列番号123):
>refseqp|NP_002297|NP_002297 ガレクチン3[ヒト]。
MADNFSLHDALSGSGNPNPQGWPGAWGNQPAGAGGYPGASYPGAYPGQAPPGAYPGQAPP
GAYPGAPGAYPGAPAPGVYPGPPSGPGAYPSSGQPSATGAYPATGPYGAPAGPLIVPYNL
PLPGGVVPRMLITILGTVKPNANRIALDFQRGNDVAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKLDNN
WGREERQSVFPFESGKPFKIQVLVEPDHFKVAVNDAHLLQYNHRVKKLNEISKLGISGDI
DLTSASYTMI
NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体(例えば、GenBank登録番号O15069(配列番号124):>uniprot|O15069|NACAD_ヒトNAC−αドメイン含有タンパク質1;
MPGEAARAELLLPEADRPGPRTDLSCDAAAATTILGGDRREPCALTPGPSHLALTFLPSK
PGARPQPEGASWDAGPGGAPSAWADPGEGGPSPMLLPEGLSSQALSTEAPLPATLEPRIV
MGEETCQALLSPRAARTALRDQEGGHASPDPPPELCSQGDLSVPSPPPDPDSFFTPPSTP
TKTTYALLPACGPHGDARDSEAELRDELLDSPPASPSGSYITADGDSWASSPSCSLSLLA
PAEGLDFPSGWGLSPQGSMVDERELHPAGTPEPPSSESSLSADSSSSWGQEGHFFDLDFL
ANDPMIPAALLPFQGSLIFQVEAVEVTPLSPEEEEEEAVADPDPGGDLAGEGEEDSTSAS
FLQSLSDLSITEGMDEAFAFRDDTSAASSDSDSASYAEADDERLYSGEPHAQATLLQDSV
QKTEEESGGGAKGLQAQDGTVSWAVEAAPQTSDRGAYLSQRQELISEVTEEGLALGQEST
ATVTPHTLQVAPGLQVEVATRVTPQAGEEETDSTAGQESAAMAMPQPSQEGISEILGQES
VTAEKLPTPQEETSLTLCPDSPQNLKEEGGLDLPSGRKPVAAATIVPRQAKEDLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDSVMTPPLPLQDTELSSAPKPV
AAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATLVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPV
AAATIVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATIVSQQAEEGLTLPQDS
AMTPPLPLQDTDLSSAPKPVAAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTPPLPLQDTDLSSAPKPV
AAATPVSQQAEEGLTLPQDSAMTAPLPLQDTGPTSGPEPLAVATPQTLQAEAGCAPGTEP
VATMAQQEVGEALGPRPAPEEKNAALPTVPEPAALDQVQQDDPQPAAEAGTPWAAQEDAD
STLGMEALSLPEPASGAGEEIAEALSRPGREACLEARAHTGDGAKPDSPQKETLEVENQQ
EGGLKLLAQEHGPRSALGGAREVPDAPPAACPEVSQARLLSPAREERGLSGKSTPEPTLP
SAVATEASLDSCPESSVGAVSSLDRGCPDAPAPTSAPTSQQPEPVLGLGSVEQPHEVPSV
LGTPLLQPPENLAKGQPSTPVDRPLGPDPSAPGTLAGAALPPLEPPAPCLCQDPQEDSVE
DEEPPGSLGLPPPQAGVQPAAAAVSGTTQPLGTGPRVSLSPHSPLLSPKVASMDAKDLAL
QILPPCQVPPPSGPQSPAGPQGLSAPEQQEDEDSLEEDSPRALGSGQHSDSHGESSAELD
EQDILAPQTVQCPAQAPAGGSEETIAKAKQSRSEKKARKAMSKLGLRQIQGVTRITIQKS
KNILFVIAKPDVFKSPASDTYVVFGEAKIEDLSQQVHKAAAEKFKVPSEPSALVPESAPR
PRVRLECKEEEEEEEEEVDEAGLELRDIELVMAQANVSRAKAVRALRDNHSDIVNAIMEL
TM
アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1(例えば、GenBank登録番号NP_000010(配列番号125):
>refseqp|NP_000010|NP_000010 アセチル−コエンザイムA アセチルトランスフェラーゼ1前駆体[ヒト]。
MAVLAALLRSGARSRSPLLRRLVQEIRYVERSYVSKPTLKEVVIVSATRTPIGSFLGSLS
LLPATKLGSIAIQGAIEKAGIPKEEVKEAYMGNVLQGGEGQAPTRQAVLGAGLPISTPCT
TINKVCASGMKAIMMASQSLMCGHQDVMVAGGMESMSNVPYVMNRGSTPYGGVKLEDLIV
KDGLTDVYNKIHMGSCAENTAKKLNIARNEQDAYAINSYTRSKAAWEAGKFGNEVIPVTV
TVKGQPDVVVKEDEEYKRVDFSKVPKLKTVFQKENGTVTAANASTLNDGAAALVLMTADA
AKRLNVTPLARIVAFADAAVEPIDFPIAPVYAASMVLKDVGLKKEDIAMWEVNEAFSLVV
LANIKMLEIDPQKVNINGGAVSLGHPIGMSGARIVGHLTHALKQGEYGLASICNGGGGAS
AMLIQKL
KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2(例えば、GenBank登録番号NP_003676(配列番号126):
>refseqp|NP_003676|NP_003676 KH−型スプライシング調節タンパク質(FUSE結合タンパク質2)[ヒト]。
MSDYSTGGPPPGPPPPAGGGGGAGGAGGGPPPGPPGAGDRGGGGPGGGGPGGGSAGGPSQ
PPGGGGPGIRKDAFADAVQRARQIAAKIGGDAATTVNNSTPDFGFGGQKRQLEDGDQPES
KKLASQGDSISSQLGPIHPPPRTSMTEEYRVPDGMVGLIIGRGGEQINKIQQDSGCKVQI
SPDSGGLPERSVSLTGAPESVQKAKMMLDDIVSRGRGGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMI
PAGKAGLVIGKGGETIKQLQERAGVKMILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYKVQQACEMVM
DILRERDQGGFGDRNEYGSRIGGGIDVPVPRHSVGVVIGRSGEMIKKIQNDAGVRIQFKQ
DDGTGPEKIAHIMGPPDRCEHAARIINDLLQSLRSGPPGPPGGPGMPPGGRGRGRGQGNW
GPPGGEMTFSIPTHKCGLVIGRGGENVKAINQQTGAFVEISRQLPPNGDPNFKLFIIRGS
PQQIDHAKQLIEEKIEGPLCPVGPGPGGPGPAGPMGPFNPGPFNQGPPGAPPHAGGPPPH
QYPPQGWGNTYPQWQPPAPHDPSKAAAAAADPNAAWAAYYSHYYQQPPGPVPGPAPAPAA
PPAQGEPPQPPPTGQSDYTKAWEEYYKKIGQQPQQPGAPPQQDYTKAWEEYYKKQAQVAT
GGGPGAPPGSQPDYSAAWAEYYRQQAAYYGQTPGPGGPQPPPTQQGQQQAQ
プロフィリン1(PFN1)(例えば、GenBank登録番号NP_005013(配列番号127):
>refseqp|NP_005013|NP_005013 プロフィリン1[ヒト]。
MAGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGKTFVNITPAEVGVLVGKDRSSFY
VNGLTLGGQKCSVIRDSLLQDGEFSMDLRTKSTGGAPTFNVTVTKTDKTLVLLMGKEGVH
GGLINKKCYEMASHLRRSQY
塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1(例えば、GenBank登録番号NP_001279(配列番号128):
>refseqp|NP_001279|NP_001279 塩素細胞内チャンネル1[ヒト]。
MAEEQPQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCP
GGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKN
SNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNL
LPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKAL
K
ジンクフィンガータンパク質831(例えば、GenBank登録番号NP_848552(配列番号129):
>refseqp|NP_848552|NP_848552 ジンクフィンガータンパク質831[ヒト]。
MEVPEPTCPAPPARDQPAPTPGPPGAPGGQASPHLTLGPVLLPPEQGLAPPTVFLKALPI
PLYHTVPPGGLQPRAPLVTGSLDGGNVPFILSPVLQPEGPGPTQVGKPAAPTLTVNIVGT
LPVLSPGLGPTLGSPGKVRNAGKYLCPHCGRDCLKPSVLEKHIRSHTGERPFPCATCGIA
FKTQSNLYKHRRTQTHLNNSRLSSESEGAGGGLLEEGDKAGEPPRPEGRGESRCQGMHEG
ASERPLSPGAHVPLLAKNLDVRTEAAPCPGSAFADREAPWDSAPMASPGLPAASTQPWRK
LPEQKSPTAGKPCALQRQQATAAEKPWDAKAPEGRLRKCESTDSGYLSRSDSAEQPHAPC
SPLHSLSEHSAESEGEGGPGPGPGVAGAEPGAREAGLELEKKRLEERIAQLISHNQAVVD
DAQLDNVRPRKTGLSKQGSIDLPTPYTYKDSFHFDIRALEPGRRRAPGPVRSTWTPPDKS
RPLFFHSVPTQLSTTVECVPVTRSNSLPFVEGSRTWLEPREPRDPWSRTQKPLSPRPGPA
RLGCRSGLSSTDVPSGHPRALVRQAAVEDLPGTPIGDALVPAEDTDAKRTAAREAMAGKG
RAGGRKCGQRRLKMFSQEKWQVYGDETFKRIYQKMKASPHGGKKAREVGMGSGAELGFPL
QKEAAGSSGTVPTQDRRTPVHEDISAGATPEPWGNPPALEASLVTEPTKHGETVARRGDS
DRPRVEEAVSSPALGGRDSPCSGSRSPLVSPNGRLELGWQMPPAPGPLKGGDVEAPRPVW
PDPKLEGGARGVGDVQETCLWAQTVLRWPSRGSGEDKLPSERKKLKVEDLHSWKQPEPVS
AETPGGPTQPASLSSQKQDADPGEVPGGSKESARQVGEPLESSGASLAAASVALKRVGPR
DKATPLHPAAPAPAEHPSLATPPQAPRVLSALADNAFSPKYLLRLPQAETPLPLPIPWGP
RHSQDSLCSSGWPEERASFVGSGLGTPLSPSPASGPSPGEADSILEDPSCSRPQDGRKGA
QLGGDKGDRMATSRPAARELPISAPGAPREATSSPPTPTCEAHLVQDMEGDSHRIHRLCM
GSTLARARLSGDVLNPWVPNWELGEPPGNAPEDPSSGPLVGPDPCSPLQPGSFLTALTRP
QGVPPGWPELALSSHSGTSRSHSTRSPHSTQNPFPSLKAEPRLTWCCLSRSVPLPAEQKA
KAASVYLAVHFPGSSLRDEGPNGPPGSNGGWTWTSPGEGGPAQMSKFSYPTVPGVMPQHQ
VSEPEWKKGLPWRAKMSRGNSKQRKLKINPKRYKGNFLQSCVQLRASRLRTPTWVRRRSR
HPPALEGLKPCRTPGQTSSEIAGLNLQEEPSCATSESPPCCGKEEKKEGDCRQTLGTLSL
GTSSRIVREMDKRTVKDISPSAGEHGDCTTHSTAATSGLSLQSDTCLAVVNDVPLPPGKG
LDLGLLETQLLASQDSVSTDPKPYIFSDAQRPSSFGSKGTFPHHDIATSVAAVCISLPVR
TDHIAQEIHSAESRDHSQTAGRTLTSSSPDSKVTEEGRAQTLLPGRPSSGQRISDSVPLE
STEKTHLEIPASGPSSASSHHKEGRHKTFFPSRGQYGCGEMTVPCPSLGSDGRKRQVSGL
ITRKDSVVPSKPEQPIEIPEAPSKSLKKRSLEGMRKQTRVEFSDTSSDDEDRLVIEI
エンドプラスミン(例えば、GenBank登録番号NP_003290(配列番号130):
>refseqp|NP_003290|NP_003290 熱ショックタンパク質90kDaβ,メンバー1[ヒト]。
MRALWVLGLCCVLLTFGSVRADDEVDVDGTVEEDLGKSREGSRTDDEVVQREEEAIQLDG
LNASQIRELREKSEKFAFQAEVNRMMKLIINSLYKNKEIFLRELISNASDALDKIRLISL
TDENALSGNEELTVKIKCDKEKNLLHVTDTGVGMTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTE
AQEDGQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSVIADPRGNT
LGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPMEEEEAAK
EEKEESDDEAAVEEEEEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYK
SFSKESDDPMAYIHFTAEGEVTFKSILFVPTSAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITD
DFHDMMPKYLNFVKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADDKY
NDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHPTDITSLDQYVERMKEKQDKIYF
MAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDE
SEKTKESREAVEKEFEPLLNWMKDKALKDKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMER
IMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRIKEDEDDKTVLDLAVVLFET
ATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLRLSLNIDPDAKVEEEPEEEPEETAEDTTEDTEQDEDE
EMDVGTDEEEETAKESTAEKDEL
リボソームタンパク質S10(RPS10)(例えば、GenBank登録番号P46783(配列番号131):
>uniprot|P46783|RS10_ヒト40Sリボソームタンパク質S10;
MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKE
QFAWRHFYWYLTNEGIQYLRDYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRG
EADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATEFQFRGGFGRGRGQPPQ
スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3(例えば、GenBank登録番号NP_003008(配列番号132):
>refseqp|NP_003008|NP_003008 スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3[ヒト]。
MHRDSCPLDCKVYVGNLGNNGNKTELERAFGYYGPLRSVWVARNPPGFAFVEFEDPRDAA
DAVRELDGRTLCGCRVRVELSNGEKRSRNRGPPPSWGRRPRDDYRRRSPPPRRRSPRRRS
FSRSRSRSLSRDRRRERSLSRERNHKPSRSFSRSRSRSRSNERK
ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋)(例えば、GenBank登録番号P62736(配列番号133):
>uniprot|P62736|ACTA_ヒトアクチン,大動脈平滑筋;
MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEA
QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREK
MTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRL
DLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEK
SYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNV
LSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWIS
KQEYDEAGPSIVHRKCF
ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A(例えば、GenBank登録番号NP_055006 配列番号134):
>refseqp|NP_055006|NP_055006 ナトリウムチャンネル,電位依存性,タイプVIII,α[ヒト]。
MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE
AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL
IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR
GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPINFNESYLENGTKGF
DWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAF
LALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQA
TLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEI
SKLSSKSAKERRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKF
SIMNQSLLSIPGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESEGRRDS
LFIPIRARERRSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIG
GRLLPEATTEVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCP
PCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQ
FEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGL
SVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKS
YKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMV
MVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQ
AHFKQREADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIID
EDHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSKDKLDDTSSSEGSTIDIK
PEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWF
ETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFF
TNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNAL
VGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLM
EGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYM
YIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKP
QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV
FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR
LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA
GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS
VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT
QFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSG
ELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKT
TSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC
ガレクチン−9のアイソフォームロング(例えば、GenBank登録番号NP_033665配列番号135):
>refseqp|NP_033665|NP_033665 ガレクチン−9アイソフォームロング[ヒト]。
MAFSGSQAPYLSPAVPFSGTIQGGLQDGLQITVNGTVLSSSGTRFAVNFQTGFSGNDIAF
HFNPRFEDGGYVVCNTRQNGSWGPEERKTHMPFQKGMPFDLCFLVQSSDFKVMVNGILFV
QYFHRVPFHRVDTISVNGSVQLSYISFQNPRTVPVQPAFSTVPFSQPVCFPPRPRGRRQK
PPGVWPANPAPITQTVIHTVQSAPGQMFSTPAIPPMMYPHPAYPMPFITTILGGLYPSKS
ILLSGTVLPSAQRFHINLCSGNHIAFHLNPRFDENAVVRNTQIDNSWGSEERSLPRKMPF
VRGQSFSVWILCEAHCLKVAVDGQHLFEYYHRLRNLPTINRLEVGGDIQLTHVQT
T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5(例えば、GenBank登録番号NP_036205(配列番号136):
>refseqp|NP_036205|NP_036205 シャペロニン含有TCP1,サブユニット5(ε)[ヒト]。
MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
CHRQMAEIAVNAVLTVADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMP
KKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLA
ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESE
E
α−エノラーゼ,肺特異性(例えば、GenBank登録番号CAA47179(配列番号137):
MSILKIIHARDIFESRGNPTVEVDLYTNKGGLFGRAAVPSGASTG
IYEALLELRDNDKTRYMGGKGVSKAVEHIINKTIAPALISKNVNVVEQDKIDNLMLDMD
GSENKSKFGANAILGVSLAVCSNAGATAEKGVPLYRHIADLAGNNPEVILPVPAFNVIN
GGSHAGNKLAMQEFMIPPCGADRFNDAIRIGAEVYHNLKNVIKEKYGKDATNVGDEGGF
APNILENKEALELLKTAIGKAGYSDKVVIGMDVAASEFYRDGKYDLDFNSPDDPSRYIS
PDQLADLYKGFVLGHAVKNYPVGVSIEDPPFDQDDWGAWKKLFTGSLVGIQVVGDDLTV
TKPEARIAKAVEEVKACNCLLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSNGWGVMPVSHRLSGET
EDTFMADLVVGLCTGQIKTGPTCRSERLAKYNQLLRIEEAEAGSKARFAGRNFRNPRIN
癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS(例えば、GenBank登録番号NP_005363(配列番号138):
>refseqp|NP_005363|NP_005363 v−mosモロニーマウス肉腫ウイルス癌原遺伝子ホモログ[ヒト]。
MPSPLALRPYLRSEFSPSVDARPCSSPSELPAKLLLGATLPRAPRLPRRLAWCSIDWEQV
CLLQRLGAGGFGSVYKATYRGVPVAIKQVNKCTKNRLASRRSFWAELNVARLRHDNIVRV
VAASTRTPAGSNSLGTIIMEFGGNVTLHQVIYGAAGHPEGDAGEPHCRTGGQLSLGKCLK
YSLDVVNGLLFLHSQSIVHLDLKPANILISEQDVCKISDFGCSEKLEDLLCFQTPSYPLG
GTYTHRAPELLKGEGVTPKADIYSFAITLWQMTTKQAPYSGERQHILYAVVAYDLRPSLS
AAVFEDSLPGQRLGDVIQRCWRPSAAQRPSARLLLVDLTSLKAELG
β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_001608(配列番号139):
>refseqp|NP_001608|NP_001608 アデュシン2 アイソフォームa[ヒト]。
MSEETVPEAASPPPPQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTMILQS
PSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTSSMNVSMMTPINDLHT
ADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEV
TASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMK
WGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVE
EAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRL
GEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTKHKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR
QHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQRSMGSPRPKTTWMKADEVEKSSSGMPIRIE
NPNQFVPLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPSTESQLMSK
GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKKEVERKKLELDGEKETAPEEPGSPAKSAPAS
PVQSPAKEAETKSPLVSPSKSLEEGTKKTETSKAATTEPETTQPEGVVVNGREEEQTAEE
ILSKGLSQMTTSADTDVDTSKDKTESVTSGPMSPEGSPSKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKK
KEKVES
アポリポタンパク質E(APOE)(例えば、GenBank登録番号NP_000032配列番号140):
>refseqp|NP_000032|NP_000032 アポリポタンパク質E前駆体[ヒト]。
MKVLWAALLVTFLAGCQAKVEQAVETEPEPELRQQTEWQSGQRWELALGRFWDYLRWVQT
LSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQLTPVAEETRARLSKELQAAQA
RLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVY
QAGAREGAERGLSAIRERLGPLVEQGRVRAATVGSLAGQPLQERAQAWGERLRARMEEMG
SRTRDRLDEVKEQVAEVRAKLEEQAQQIRLQAEAFQARLKSWFEPLVEDMQRQWAGLVEK
VQAAVGTSAAPVPSDNH
ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質)(例えば、GenBank登録番号NP_064516(配列番号141):
>refseqp|NP_064516|NP_064516 アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質[ヒト]。
MAEPSGAETRPPIRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKEFKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKI
LKDGDTLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATASSPSTPDPASAPSTTPASPATPAQ
PSTSGSASSDAGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATASILSGFGGILGLGSLGLGSANFME
LQQQMQRQLMSNPEMLSQIMENPLVQDMMSNPDLMRHMIMANPQMQQLMERNPEISHMLN
NPELMRQTMELARNPAMMQEMMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMFSAAREQ
FGNNPFSSLAGNSDSSSSQPLRTENREPLPNPWSPSPPTSQAPGSGGEGTGGSGTSQVHP
TVSNPFGINAASLGSGMFNSPEMQALLQQISENPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFA
AQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPESLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQ
TEAPGLVPSLGSFGISRTPAPSAGSNAGSTPEAPTSSPATPATSSPTGASSAQQQLMQQM
IQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNSMGFINREANLQALIATGGDINAAIERLLGSQL
S
Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9)(例えば、GenBank登録番号NP_003336(配列番号142):
>refseqp|NP_003336|NP_003336 ユビキチン結合酵素E2I[ヒト]。
MSGIALSRLAQERKAWRKDHPFGFVAVPTKNPDGTMNLMNWECAIPGKKGTPWEGGLFKL
RMLFKDDYPSSPPKCKFEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIKQILLGIQELL
NEPNIQDPAQAEAYTIYCQNRVEYEKRVRAQAKKFAPS
ミオシン−15(MYH15)(例えば、GenBank登録番号NP_055796(配列番号143):
>refseqp|NP_055796|NP_055796 ミオシン,重ポリペプチド15[ヒト]。
MVESCLLTFRAFFWWIALIKMDLSDLGEAAAFLRRSEAELLLLQATALDGKKKCWIPDGE
NAYIEAEVKGSEDDGTVIVETADGESLSIKEDKIQQMNPPEFEMIEDMAMLTHLNEASVL
HTLKRRYGQWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYQKEVMAAYKGKRRSEAPPHIFAVANNAF
QDMLHNRENQSILFTGESGAGKTVNSKHIIQYFATIAAMIESRKKQGALEDQIMQANTIL
EAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRMHFGARGMLSSVDIDIYLLEKSRVIFQQAGERNYHIFY
QILSGQKELHDLLLVSANPSDFHFCSCGAVTVESLDDAEELLATEQAMDILGFLPDEKYG
CYKLTGAIMHFGNMKFKQKPREEQLEADGTENADKAAFLMGINSSELVKCLIHPRIKVGN
EYVTRGQTIEQVTCAVGALSKSMYERMFKWLVARINRALDAKLSRQFFIGILDITGFEIL
EYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNWHMFVLEQEEYKKESIEWVSIGFGLDLQACIDLIEKPM
GILSILEEECMFPKATDLTFKTKLFDNHFGKSVHLQKPKPDKKKFEAHFELVHYAGVVPY
NISGWLEKNKDLLNETVVAVFQKSSNRLLASLFENYMSTDSAIPFGEKKRKKGASFQTVA
SLHKENLNKLMTNLKSTAPHFVRCINPNVNKIPGILDPYLVLQQLRCNGVLEGTRICREG
FPNRLQYADFKQRYCILNPRTFPKSKFVSSRKAAEELLGSLEIDHTQYRFGITKVFFKAG
FLGQLEAIRDERLSKVFTLFQARAQGKLMRIKFQKILEERDALILIQWNIRAFMAVKNWP
WMRLFFKIKPLVKSSEVGEEVAGLKEECAQLQKALEKSEFQREELKAKQVSLTQEKNDLI
LQLQAEQETLANVEEQCEWLIKSKIQLEARVKELSERVEEEEEINSELTARGRKLEDECF
ELKKEIDDLETMLVKSEKEKRTTEHKVKNLTEEVEFLNEDISKLNRAAKVVQEAHQQTLD
DLHMEEEKLSSLSKANLKLEQQVDELEGALEQERKARMNCERELHKLEGNLKLNRESMEN
LESSQRHLAEELRKKELELSQMNSKVENEKGLVAQLQKTVKELQTQIKDLKEKLEAERTT
RAKMERERADLTQDLADLNERLEEVGGSSLAQLEITKKQETKFQKLHRDMEEATLHFETT
SASLKKRHADSLAELEGQVENLQQVKQKLEKDKSDLQLEVDDLLTRVEQMTRAKANAEKL
CTLYEERLHEATAKLDKVTQLANDLAAQKTKLWSESGEFLRRLEEKEALINQLSREKSNF
TRQIEDLRGQLEKETKSQSALAHALQKAQRDCDLLREQYEEEQEVKAELHRTLSKVNAEM
VQWRMKYENNVIQRTEDLEDAKKELAIRLQEAAEAMGVANARNASLERARHQLQLELGDA
LSDLGKVRSAAARLDQKQLQSGKALADWKQKHEESQALLDASQKEVQALSTELLKLKNTY
EESIVGQETLRRENKNLQEEISNLTNQVREGTKNLTEMEKVKKLIEEEKTEVQVTLEETE
GALERNESKILHFQLELLEAKAELERKLSEKDEEIENFRRKQQCTIDSLQSSLDSEAKSR
IEVTRLKKKMEEDLNEMELQLSCANRQVSEATKSLGQLQIQIKDLQMQLDDSTQLNSDLK
EQVAVAERRNSLLQSELEDLRSLQEQTERGRRLSEEELLEATERINLFYTQNTSLLSQKK
KLEADVARMQKEAEEVVQECQNAEEKAKKAAIEAANLSEELKKKQDTIAHLERTRENMEQ
TITDLQKRLAEAEQMALMGSRKQIQKLESRVRELEGELEGEIRRSAEAQRGARRLERCIK
ELTYQAEEDKKNLSRMQTQMDKLQLKVQNYKQQVEVAETQANQYLSKYKKQQHELNEVKE
RAEVAESQVNKLKIKAREFGKKVQEE
FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK)(例えば、GenBank登録番号NP_057392(配列番号144):
refseqp|NP_057392|NP_057392 UMP−CMPキナーゼ1アイソフォームa[ヒト]。
MLSRCRSGLLHVLGLSFLLQTRRPILLCSPRLMKPLVVFVLGGPGAGKGTQCARIVEKYG
YTHLSAGELLRDERKNPDSQYGELIEKYIKEGKIVPVEITISLLKREMDQTMAANAQKNK
FLIDGFPRNQDNLQGWNKTMDGKADVSFVLFFDCNNEICIERCLERGKSSGRSDDNRESL
EKRIQTYLQSTKPIIDLYEEMGKVKKIDASKSVDEVFDEVVQIFDKEG
インテレクチン−1(ITLN1)(例えば、GenBank登録番号NP_060095(配列番号145):
>refseqp|NP_060095|NP_060095 インテレクチン[ヒト]。
MNQLSFLLFLIATTRGWSTDEANTYFKEWTCSSSPSLPRSCKEIKDECPSAFDGLYFLRT
ENGVIYQTFCDMTSGGGGWTLVASVHENDMRGKCTVGDRWSSQQGSKAVYPEGDGNWANY
NTFGSAEAATSDDYKNPGYYDIQAKDLGIWHVPNKSPMQHWRNSSLLRYRTDTGFLQTLG
HNLFGIYQKYPVKYGEGKCWTDNGPVIPVVYDFGDAQKTASYYSPYGQREFTAGFVQFRV
FNNERAANALCAGMRVTGCNTEHHCIGGGGYFPEASPQQCGDFSGFDWSGYGTHVGYSSS
REITEAAVLLFYR
アポリポタンパク質A−IV(APOA4)(例えば、GenBank登録番号Q13784(配列番号146):
>uniprot|Q13784|Q13784_ヒトAPOA4タンパク質;
LEPYADQLRTQVNTQAEQLRRQLDPLAQRMERVLRENADSLQASLRPHADELKAKIDQNV
EELKGRLTPYADEFKVKIDQTVEELRRSLAPYAQDTQEKLNHQLEGLTFQMKKNAEELKA
RISASAEELRQRLAPLAEDVRGNLKGNTEGLQKSLAELGGHLDQQVEEFRRRVEPYGENF
NKALVQQMEQLRQKLGPHAGDVEGHLSFLEKDLRDKVNSFFSTFKEKESQDKTLSLPELE
QQQE
ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1)(例えば、GenBank登録番号P08559(配列番号147):
>uniprot|P08559|ODPA_ヒトピルビン酸デヒドロゲナーゼE1成分サブユニットA,体細胞型,ミトコンドリア性;
MRKMLAAVSRVLSGASQKPASRVLVASRNFANDATFEIKKCDLHRLEEGPPVTTVLTRED
GLKYYRMMQTVRRMELKADQLYKQKIIRGFCHLCDGQEACCVGLEAGINPTDHLITAYRA
HGFTFTRGLSVREILAELTGRKGGCAKGKGGSMHMYAKNFYGGNGIVGAQVPLGAGIALA
CKYNGKDEVCLTLYGDGAANQGQIFEAYNMAALWKLPCIFICENNRYGMGTSVERAAAST
DYYKRGDFIPGLRVDGMDILCVREATRFAAAYCRSGKGPILMELQTYRYHGHSMSDPGVS
YRTREEIQEVRSKSDPIMLLKDRMVNSNLASVEELKEIDVEVRKEIEDAAQFATADPEPP
LEELGYHIYSSDPPFEVRGANQWIKFKSVS
ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59)(例えば、GenBank登録番号NP_060979(配列番号148):
>refseqp|NP_060979|NP_060979 ロイシンリッチリピート含有59[ヒト]。
MTKAGSKGGNLRDKLDGNELDLSLSDLNEVPVKELAALPKATILDLSCNKLTTLPSDFCG
LTHLVKLDLSKNKLQQLPADFGRLVNLQHLDLLNNKLVTLPVSFAQLKNLKWLDLKDNPL
DPVLAKVAGDCLDEKQCKQCANKVLQHMKAVQADQERERQRRLEVEREAEKKREAKQRAK
EAQERELRKREKAEEKERRRKEYDALKAAKREQEKKPKKEANQAPKSKSGSRPRKPPPRK
HTRSWAVLKLLLLLLLFGVAGGLVACRVTELQQQPLCTSVNTIYDNAVQGLRRHEILQWV
LQTDSQQ
60Sリボソームタンパク質L37A.(RPL37A)(例えば、GenBank登録番号NP_000989(配列番号149):
>refseqp|NP_000989|NP_000989 リボソームタンパク質L37a[ヒト]。
MAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSC
MKTVAGGAWTYNTTSAVTVKSAIRRLKELKDQ
ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1)(例えば、GenBank登録番号Q53HM1(配列番号150):
>uniprot|Q53HM1|Q53HM1_ヒトウリジンキナーゼ;
MAAPPARADADPSPTSPPTARDTPGRQAEKSETACEDRSNAESLDRLLPPVGTGRSPRKR
TTSQCKSEPPLLRTSKRTIYTAGRPPWYNEHGTQSKEAFAIGLGGGSASGKTTVARMIIE
ALDVPWVVLLSMDSFYKVLTEQQQEQAAHNNFNFDHPDAFDFDLIIFTLKKLKQGKSVKV
PIYDFTTHSRKKDWKTLYGANVIIFEGIMAFADKTLLELLDMKIFVDTDSDIRLVRRLRR
DISERGRDIEGVIKQYNKFVKPSFDQYIQPTMRLADIVVPRGSGNTVAIDLIVQHVHSQL
EERELSVRAALASAHQCHPLPRTLSVLKSTPQVRGMHTIIRDKETSRDEFIFYSKRLMRL
LIEHALSFLPFQDCVVQTPQGQDYAGKCYAGKQITGVSILRAGETMEPALRAVCKDVRIG
TILIQTNQLTGEPELHYLRLPKDISDDHVILMDCTVSTGAAAMMAVRVLLDHDVPEDKIF
LLSLLMAEMGVHSVAYAFPRVRIITTAVDKRVNDLFRIIPGIGNFGDRYFGTDAVPDGSD
EEEVAYTG
アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1)(例えば、GenBank登録番号NP_000687(配列番号151):
>refseqp|NP_000687|NP_000687 アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1[ヒト]。
MFLRAGLAALSPLLRSLRPSPVAAMSTGTFVVSQPLNYRGGARVEPADASGTEKAFEPAT
GRVIATFTCSGEKEVNLAVQNAKAAFKIWSQKSGMERCRILLEAARIIREREDEIATMEC
INNGKSIFEARLDIDISWQCLEYYAGLAASMAGEHIQLPGGSFGYTRREPLGVCVGIGAW
NYPFQIASWKSAPALACGNAMVFKPSPFTPVSALLLAEIYSEAGVPPGLFNVVQGGAATG
QFLCQHPDVAKVSFTGSVPTGMKIMEMSAKGIKPVTLELGGKSPLIIFSDCDMNNAVKGA
LMANFLTQGQVCCNGTRVFVQKEILDKFTEEVVKQTQRIKIGDPLLEDTRMGPLINRPHL
ERVLGFVKVAKEQGAKVLCGGDIYVPEDPKLKDGYYMRPCVLTNCRDDMTCVKEEIFGPV
MSILSFDTEAEVLERANDTTFGLAAGVFTRDIQRAHRVVAELQAGTCFINNYNVSPVELP
FGGYKKSGFGRENGRVTIEYYSQLKTVCVEMGDVESAF
チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3(例えば、GenBank登録番号Q16881(配列番号152):
>uniprot|Q16881|TRXR1_ヒトチオレドキシン還元酵素1,細胞質性;
MGCAEGKAVAAAAPTELQTKGKNGDGRRRSAKDHHPGKTLPENPAGFTSTATADSRALLQ
AYIDGHSVVIFSRSTCTRCTEVKKLFKSLCVPYFVLELDQTEDGRALEGTLSELAAETDL
PVVFVKQRKIGGHGPTLKAYQEGRLQKLLKMNGPEDLPKSYDYDLIIIGGGSGGLAAAKE
AAQYGKKVMVLDFVTPTPLGTRWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAALLGQALQDSRNYGWKV
EETVKHDWDRMIEAVQNHIGSLNWGYRVALREKKVVYENAYGQFIGPHRIKATNNKGKEK
IYSAERFLIATGERPRYLGIPGDKEYCISSDDLFSLPYCPGKTLVVGASYVALECAGFLA
GIGLDVTVMVRSILLRGFDQDMANKIGEHMEEHGIKFIRQFVPIKVEQIEAGTPGRLRVV
AQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGRDACTRKIGLETVGVKINEKTGKIPVTDEEQTNVPYIY
AIGDILEDKVELTPVAIQAGRLLAQRLYAGSTVKCDYENVPTTVFTPLEYGACGLSEEKA
VEKFGEENIEVYHSYFWPLEWTIPSRDNNKCYAKIICNTKDNERVVGFHVLGPNAGEVTQ
GFAAALKCGLTKKQLDSTIGIHPVCAEVFTTLSVTKRSGASILQAGCUG
核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1)(例えば、GenBank登録番号NP_003260(配列番号153):
>refseqp|NP_003260|NP_003260 核内受容体サブファミリー2,グループE,メンバー1[ヒト]。
MSKPAGSTSRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYACDGCSGFFKRSIRRNRTYVCKSGNQGGC
PVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNMNKDAVQHERGPRTSTIRKQVALYFRGHKEENGAAAHF
PSAALPAPAFFTAVTQLEPHGLELAAVSTTPERQTLVSLAQPTPKYPHEVNGTPMYLYEV
ATESVCESAARLLFMSIKWAKSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDAN
TLLAVSGMNGDNTDSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTH
SGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPALRSISPSTIEE
VFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI
陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATPER3)(例えば、GenBank登録番号NP_821138(配列番号154):
>refseqp|NP_821138|NP_821138 陽イオンチャンネル,精子関連3[ヒト]。
MSQHRHQRHSRVISSSPVDTTSVGFCPTFKKFKRNDDECRAFVKRVIMSRFFKIIMISTV
TSNAFFMALWTSYDIRYRLFRLLEFSEIFFVSICTSELSMKVYVDPINYWKNGYNLLDVI
IIIVMFLPYALRQLMGKQFTYLYIADGMQSLRILKLIGYSQGIRTLITAVGQTVYTVASV
LLLLFLLMYIFAILGFCLFGSPDNGDHDNWGNLAAAFFTLFSLATVDGWTDLQKQLDNRE
FALSRAFTIIFILLASFIFLNMFVGVMIMHTEDSIRKFERELMLEQQEMLMGEKQVILQR
QQEEISRLMHIQKNADCTSFSELVENFKKTLSHTDPMVLDDFGTSLPFIDIYFSTLDYQD
TTVHKLQELYYEIVHVLSLMLEDLPQEKPQSLEKVDEK
膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1)(例えば、GenBank登録番号NP_006849(配列番号155):
>refseqp|NP_006849|NP_006849 インターロイキン1受容体様1リガンド前駆体[ヒト]。
MMAAGAALALALWLLMPPVEVGGAGPPPIQDGEFTFLLPAGRKQCFYQSAPANASLETEY
QVIGGAGLDVDFTLESPQGVLLVSESRKADGVHTVEPTEAGDYKLCFDNSFSTISEKLVF
FELIFDSLQDDEEVEGWAEAVEPEEMLDVKMEDIKESIETMRTRLERSIQMLTLLRAFEA
RDRNLQEGNLERVNFWSAVNVAVLLLVAVLQVCTLKRFFQDKRPVPT
タンパク質FAM154A(FAM154A)(例えば、GenBank登録番号NP_714918(配列番号156):
>refseqp|NP_714918|NP_714918 仮説タンパク質LOC158297[ヒト]。
MKTKCICELCSCGRHHCPHLPTKIYDETEKPCLLSEYTENYPFYHSYLPRESFKPRREYQ
KGSIPMEGLTTSRRDFGPHKVAPVKVHQYDQFVPSEENMDLLTTYKKDYNPYPVCRVDPI
KPRDSKYPCSDKMECLPTYKADYLPWNQPRREPLRLEHKYQPASVRFDNRTTHQDDYPIK
GLVKTISCKPLAMPKLCNIPLEDVTNYKMSYVAHPVEKRFVHEAEKFRPCEIPFESLTTQ
KQSYRGLMGEPAKSLKPLARPPGLDMPFCNTTEFRDKYQAWPMPRMFSKAPITYVPPEDR
MDLLTTVQAHYTCPKGAPAQSCRPALQIKKCGRFEGSSTTKDDYKQWSSMRTEPVKPVPQ
LDLPTEPLDCLTTTRAHYVPHLPINTKSCKPHWSGPRGNVPVESQTTYTISFTPKEMGRC
LASYPEPPGYTFEEVDALGHRIYKPVSQAGSQQSSHLSVDDSENPNQRELEVLA
転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1(例えば、GenBank登録番号NP_002495(配列番号157):
>refseqp|NP_002495|NP_002495 核転写因子,X−ボックス結合1アイソフォーム1[ヒト]。
MAEAPPVSGTFKFNTDAAEFIPQEKKNSGLNCGTQRRLDSNRIGRRNYSSPPPCHLSRQV
PYDEISAVHQHSYHPSGSKPKSQQTSFQSSPCNKSPKSHGLQNQPWQKLRNEKHHIRVKK
AQSLAEQTSDTAGLESSTRSESGTDLREHSPSESEKEVVGADPRGAKPKKATQFVYSYGR
GPKVKGKLKCEWSNRTTPKPEDAGPESTKPVGVFHPDSSEASSRKGVLDGYGARRNEQRR
YPQKRPPWEVEGARPRPGRNPPKQEGHRHTNAGHRNNMGPIPKDDLNERPAKSTCDSENL
AVINKSSRRVDQEKCTVRRQDPQVVSPFSRGKQNHVLKNVETHTGSLIEQLTTEKYECMV
CCELVRVTAPVWSCQSCYHVFHLNCIKKWARSPASQADGQSGWRCPACQNVSAHVPNTYT
CFCGKVKNPEWSRNEIPHSCGEVCRKKQPGQDCPHSCNLLCHPGPCPPCPAFMTKTCECG
RTRHTVRCGQAVSVHCSNPCENILNCGQHQCAELCHGGQCQPCQIILNQVCYCGSTSRDV
LCGTDVGKSDGFGDFSCLKICGKDLKCGNHTCSQVCHPQPCQQCPRLPQLVRCCPCGQTP
LSQLLELGSSSRKTCMDPVPSCGKVCGKPLPCGSLDFIHTCEKLCHEGDCGPCSRTSVIS
CRCSFRTKELPCTSLKSEDATFMCDKRCNKKRLCGRHKCNEICCVDKEHKCPLICGRKLR
CGLHRCEEPCHRGNCQTCWQASFDELTCHCGASVIYPPVPCGTRPPECTQTCARVHECDH
PVYHSCHSEEKCPPCTFLTQKWCMGKHEFRSNIPCHLVDISCGLPCSATLPCGMHKCQRL
CHKGECLVDEPCKQPCTTPRADCGHPCMAPCHTSSPCPVTACKAKVELQCECGRRKEMVI
CSEASSTYQRIAAISMASKITDMQLGGSVEISKLITKKEVHQARLECDEECSALERKKRL
AEAFHISEDSDPFNIRSSGSKFSDSLKEDARKDLKFVSDVEKEMETLVEAVNKGKNSKKS
HSFPPMNRDHRRIIHDLAQVYGLESVSYDSEPKRNVVVTAIRGKSVCPPTTLTGVLEREM
QARPPPPIPHHRHQSDKNPGSSNLQKITKEPIIDYFDVQD
本明細書中において例示的に記載される発明は、本明細書中に具体的に開示されない任意の要素又は限定の存在しない条件下で、適当に実施され得る。すなわち、例えば、本明細書中における各場合において、用語「含んでなる」、「から本質的に成る」、及び「から成る」のいずれも、これらの用語の通常の意味を維持しながら他の2つの用語のいずれかと交換してもよい。使用される用語及び表現は、限定の言葉としてではなく、記述の言葉として使用され、かかる用語及び表現を使用する場合、示され及び記載される特徴の任意の同等物又はその部分を除外することは全く意図されず、様々な変更が、請求される本発明の範囲において可能であることが認識される。したがって、本発明は、実施形態によって具体的に開示されているが、任意的な特徴、本明細書中で開示される概念の修飾及び変更を、当業者が用い得ること、及び、かかる修飾及び変更が、明細書及び添付される特許請求の範囲に規定される本発明の範囲内であると考えられること、を理解すべきである。
さらに、本発明の特徴又は態様が、マーカッシュグループ又はその他のグループ化方法で選択肢が記載されている場合、当業者であれば、それによって、本発明が、マーカッシュグループ又はその他のグループの任意の個別のメンバー又はサブグループによっても記載されていることが認識されるであろう。
[実施例1]
一組の同系結腸腺癌及び健常組織サンプル
腫瘍に隣接する大腸の領域からの結腸腺癌ステージI−IV及び同系健常組織を、Asterand XpressBank(Detroit, MI)から取得した。Asterandによって提供されたサンプルを回収して、回収時に存在するインタクトな任意の潜在的抗原を保存するために迅速に凍結した。組織の最小限の分解が、RNAプロファイルによって確認された。組織は、使用するまで−80℃で保存した。
ニワトリにおけるポリクローナル抗体(YPAbs)の作製のための組織及びサンプル調製
約50mgの凍結したステージI−IVの結腸癌組織サンプルを、別々に薄く削り、氷上で融解して、ホモジナイズする。フロインド完全アジュバントを混合し、サンプルあたり2羽のニワトリを免疫及び追加免疫するために使用して、サンプルのタンパク質濃度を1mg/mlに調整した。次の最終追加免疫の3週間後に卵から得られた、結腸癌のステージI−IV特異的免疫YPAbsを、対応するステージ特異的腫瘍組織ホモジネートに対するウェスタンブロットを用いて反応性について試験した(データ示さず)。強力かつ広範に反応性を示すYPabsを、ニワトリあたり6個の卵から精製し、一定量に分配して、使用するまで4℃で保存した。ステージIVの結腸癌組織に対する結果のみを示す。
ステージIVのYPAbsの、ステージIVの結腸癌を有すると診断された患者のプール血清との反応性の評価
反応性は、ドットイムノブロットアッセイを用いて評価した。結果(図1に示す)は、年齢、性別及び民族性を合わせた健康な患者からの対照血清(スポット4)、BSA(スポット3)、及び、健常組織のホモジネート(スポット1)のスポットと比較した時の、スポットされたステージIV結腸癌患者からのプール血清の示差的反応性を示す。ステージIV癌組織のホモジネートは、陽性対照であった(スポット2)。
健常組織によって発現されるタンパク質と反応性を示す抗体のサブトラクション
第4ステージの各結腸癌からの腫瘍組織のホモジネートによって誘発される高力価で広い反応性を示すYPAbsを、同系宿主から得られた健常腸組織のホモジネートを用いて、繰り返し吸着させた。ホモジネート中のタンパク質を固体支持体に結合させ、YPAbsを、4℃で緩やかに振動しながら一晩インキュベートした。結合していない抗体を回収し、ELISA及びウェスタンブロットが、健常組織中に存在するタンパク質との反応性を実質的に示さなくなるまで、吸着工程を2回以上繰り返した。残存している抗体を回収し、次の工程で使用するために精製した。或いは、一研究において、ステージIVの腫瘍組織に対して産生させた抗体を、健常対象からの血清を用いてサブトラクトした。血清成分を固体支持体に結合させ、上記のように抗体調製物を処理することにより、サブトラクションを行った。
変化が介在する抗原の捕捉及びタンパク質の同定
吸着していない抗体を回収して精製し、「荷電」磁気ビーズを作製するために、製造業者(Dynal Biotech)の説明書にしたがって、M−280トシル活性化されたDynabeadsに共有結合的に結合させた。免疫捕捉のために、段階的な腫瘍のホモジネート(1mg/ml)を、それらの適当に段階的に帯電したビーズに適合させた。5mlのホモジネートを、傾斜回転させながら、1時間、4℃にて、0.5mlの荷電ビーズと一緒にインキュベートした。免疫捕捉後、荷電ビーズは、10倍ビーズ容量の洗浄バッファー(PBS−0.2%NOG)を用いて洗浄した。特異的に結合しているタンパク質を、1M酢酸を用いて3回溶出させた。多くの放出されたタンパク質が同定された(配列番号1〜157)。陰性対照は、ホモジネートからタンパク質を免疫捕捉するために使用される同一体積の非荷電ビーズからの溶離液で構成された。荷電ビーズに特異的に結合しているタンパク質及び対照を、1D SDS−PAGE上で分画化して、クマシーブルーを用いて染色し、切片化する。各ゲル片中に含まれるタンパク質を、酵素トリプシンで切断し、ゲル片から溶出して、フロリダ大学バイオテクノロジー研究学際領域センター(ICBR)のGeLC−MS/MS及びMascotデータベース検索(IPIヒトタンパク質データベース)によって同定した。
放出された変化が介在するタンパク質について、ステージIVの癌患者の血清をパニングするために、同様の方式を使用した。5人の患者から各1mlの血清(合計5ml)をプールして、傾斜回転させながら、1時間、4℃にて、0.5mlの荷電ビーズと一緒にインキュベートした。免疫捕捉後、荷電ビーズは、10倍ビーズ容量の洗浄バッファー(PBS−0.2%NOG)を用いて洗浄した。特異的に結合しているタンパク質を、1M酢酸を用いて3回溶出させた。3つの放出されたタンパク質を同定した。詳細を表1に示す。

Claims (50)

  1. 対象における癌又は癌の発症に対する素因を検出する方法であって、対象からの生物学的サンプル中、ミエロブラスチン前駆体(例えば、配列番号29);タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;
    フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又はその任意の組み合わせ、からなる群より選択される癌関連タンパク質、ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現レベルを測定する工程を含み、対照サンプルと比較した場合に、前記生物学的サンプル中の癌関連タンパク質、ポリペプチド又はポリヌクレオチドの発現レベルの増大が、対象が癌を有するか、又は、癌を発症する素因を有することを示す、検出方法。
  2. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項1に記載の方法。
  3. 前記癌が結腸直腸癌である、請求項1に記載の方法。
  4. 前記方法が、2以上の癌関連タンパク質、ポリペプチド、又はポリヌクレオチドの発現レベルを測定する工程をさらに含む、請求項1に記載の方法。
  5. 前記癌関連ポリヌクレオチド、ポリペプチド又はタンパク質の発現レベルが、(a)前記ポリペプチド、タンパク質、又はポリヌクレオチドの存在を検出する工程、(b)前記癌関連ポリヌクレオチドのmRNAを検出する工程、及び(c)前記癌関連ポリヌクレオチドによってコードされるタンパク質又はポリペプチドの生物学的活性を検出する工程、からなる群より選択される方法によって測定される、請求項1に記載の方法。
  6. 前記生物学的サンプルが、細胞、細胞抽出物、組織、体液、細胞を実質的に含まない体液、血清、尿、涙、乳汁、精液、前立腺液、肺洗浄液、唾液、粘膜細胞、腫瘍細胞、癌細胞、生検サンプル、洗浄サンプル、痰サンプル、血清サンプル、血漿サンプル、血液サンプル、糞便サンプル、リンパ節サンプル、骨髄サンプル、尿サンプル、組織サンプル、結腸直腸組織サンプル、又は胸水サンプルを含む、請求項1に記載の方法。
  7. 前記癌関連タンパク質又はポリペプチドの発現レベルが、該ポリペプチドと特異的に結合する抗体を用いて、前記サンプル中における該ポリペプチドの発現レベルを検出することによって測定される、請求項5に記載の方法。
  8. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又はその任意の組合せ、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドと特異的に結合する、単離された抗体又はその抗原結合断片。
  9. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項8に記載の単離された抗体。
  10. 前記抗体が、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、一本鎖抗体、単一特異性一本鎖抗体、二重特異性一本鎖抗体、二価一本鎖抗体、四価一本鎖抗体、キメラ抗体、抗体の抗原結合断片、又はヒト化抗体である、請求項8に記載の単離された抗体。
  11. 抗癌化合物のためのスクリーニング方法であって、試験化合物の存在下、第1の生物学的サンプル中の、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物のレベルを、試験化合物の非存在下、第2の生物学的サンプル中の、前記変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物のレベルと比較する工程を含み、該変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物が、以下:タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1又はその任意の組み合わせ、からなる群より選択されるポリペプチド、又は、該ポリペプチドをコードするmRNA若しくはその任意の組み合わせを含み、前記第2の生物学的サンプルの場合と比較した時に、前記第1の生物学的サンプル中の前記変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物のレベルを低下させる試験化合物が、抗癌剤として同定される、スクリーニング方法。
  12. 前記変化が介在するタンパク質又はポリペプチド発現産物が、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項11に記載の方法。
  13. (a)候補化合物を、以下:タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドを発現する細胞と接触させる工程、並びに、(b)該タンパク質又はポリペプチドの発現レベルを低下させる化合物を選択する工程、を含む、癌を治療又は予防するための化合物のスクリーニング方法。
  14. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項13に記載の方法。
  15. (a)タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドのエピトープと特異的に結合する抗体又はその抗原結合断片、及び(b)該抗体と該ポリペプチドとの間の結合反応を検出するための1以上の試薬、を含む、哺乳類における癌の検出のためのキット。
  16. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項15に記載のキット。
  17. 少なくとも1つのポリヌクレオチドプライマー又はプローブを含む、生物学的サンプル中の癌細胞を検出するためのキットであって、該ポリヌクレオチドプライマー又はプローブが、以下:タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質:アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);and 転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1;からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、又はその相補鎖、又はこれらの任意の組み合わせ、に特異的である、キット。
  18. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項17に記載のキット。
  19. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、又はその相補体、又はこれらの任意の組み合わせ、に特異的な少なくとも2つのポリヌクレオチドプライマーを含む、請求項17に記載の癌細胞を検出するためのキット。
  20. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;and C3 187 kDa タンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択される少なくとも2つのタンパク質又はポリペプチドを含んでなる融合タンパク質。
  21. 前記少なくとも2つのタンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列からなる群より選択される、請求項20に記載の融合タンパク質。
  22. 生理学的に許容される担体及び免疫刺激剤からなる群より選択される第1の成分と、(a)タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチド;(b)(a)のタンパク質又はポリペプチドをコードするポリヌクレオチド;(c)請求項8に記載の抗体;並びに、(d)請求項20に記載の融合タンパク質又はその任意の組み合わせ、からなる群より選択される第2の成分とを含んでなる、組成物。
  23. 前記ポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項22に記載の組成物。
  24. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択される2以上のタンパク質又はポリペプチドのタンパク質又はポリペプチド発現パターンを含む、結腸直腸癌参照発現プロファイル。
  25. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドをコードする2以上のポリヌクレオチドのポリヌクレオチド発現パターンを含む、結腸直腸癌参照発現プロファイル。
  26. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含む、請求項24又は25に記載の結腸直腸癌参照発現プロファイル。
  27. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるポリペプチド、又は、タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;
    フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンフ
    ァミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるポリペプチドをコードする、2以上のポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズする2以上のポリヌクレオチドを含む、アレイ。
  28. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項27に記載のアレイ。
  29. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;
    イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;, アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;
    癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又は、その任意の組み合わせ、からなる群より選択されるタンパク質又はポリペプチドと特異的に結合する薬学的有効量の抗体又はその抗原結合断片を含んでなる、癌を治療するための組成物。
  30. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項29に記載の組成物。
  31. タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);及び、未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、からなる群より選択される薬学的有効量のタンパク質若しくはポリペプチド、又は、前記ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド若しくはその任意の組み合わせ、を含んでなる、癌を治療するための組成物。
  32. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項31に記載の組成物。
  33. (a)タイチン;HBA1;インスリン様増殖因子1受容体(IGF1R);ゾナドヘシン前駆体のアイソフォーム3;潜在型形質転換増殖因子β結合タンパク質4(LTBP4);ASXL1(付加的性コーム様1);βグロビン(HBB);BMP15−骨形成タンパク質;TRIM49;DNAJホモログサブファミリーBメンバー11前駆体;未同定造血幹細胞/前駆細胞タンパク質MDS027;未同定タンパク質ALB;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ペリフェリンのアイソフォーム2;ミトコンドリア28Sリボソームタンパク質S22;翻訳開始因子EIF−2Bサブユニットε;エストラジオール17−β−デヒドロゲナーゼ1;XRCC6BP1;脳特異的血管新生阻害物質1前駆体;リングフィンガー及びCCCH−型ジンクフィンガードメイン含有タンパク質2のアイソフォーム2;ヘモグロビンサブユニットβ;遠位上流エレメント結合タンパク質1のアイソフォーム1;ガレクチン−3;リゾチームC前駆体;アクチン,α骨格筋;ピルビン酸キナーゼアイソザイムM1/M2のアイソフォームM2;AGR2;好中球デフェンシン1前駆体;ミエロブラスチン前駆体;未同定タンパク質PSME2;チューブリンβ−2C鎖;チオ硫酸サルファトランスフェラーゼ;熱ショック70kDaタンパク質1;Igκ鎖V−III領域sie;マクロファージ遊走阻止因子;ATPシンターゼサブユニットDのアイソフォーム1,ミトコンドリア性;未同定タンパク質ENSP00000374051;イソクエン酸デヒドロゲナーゼ[NADP]細胞質性;ヘモグロビンサブユニットδ;スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ7のアイソフォーム1;mRNA−キャッピング酵素のアイソフォーム1;LONプロテアーゼホモログ,ミトコンドリア前駆体;シグナル認識粒子54kDaタンパク質;ガレクチン−9のアイソフォームロング;インテグリン結合タンパク質キナーゼ;二官能性アミノアシル−tRNA合成酵素;ジンクフィンガータンパク質207のアイソフォーム1;無機ピロホスファターゼ;カルポニン−2;マッスルブラインド様タンパク質3のアイソフォーム1;カテプシンG前駆体;ジンクフィンガー及びBTBドメイン含有タンパク質34;アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ;40Sリボソームタンパク質S9;タリン−1;ロイシンリッチリピート含有タンパク質59;ATPシンターゼサブユニットα,ミトコンドリア前駆体;タンパク質輸送タンパク質SEC31Aのアイソフォーム7;ジヒドロキシアセトンキナーゼ;異種核内リボ核タンパク質C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2)アイソフォーム4タンパク質類似体;18kDaタンパク質(例えば、UNIPARC登録番号IPI00796554;寒冷凝集素FS−1 L−鎖;異種核内リボ核タンパク質d0のアイソフォーム1;DAZAP1/MEF2D融合タンパク質;POTE2;ケラチン18(KRT18);PSME4 プロテアソ−ムアクチベーター複合体サブユニットのアイソフォーム1;マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ活性化タンパク質キナーゼ(MAPKAPK33);補体成分1,sサブコンポーネント(C1S);リゾチームC前駆体(LYZ);ケラチン(Keritin)型細胞骨格20(KRT20);RNASE3;アルデヒドデヒドロゲナーゼX,ミトコンドリア前駆体(ALDH1B1);CDNA FLJ25506 fis,クローンCBR05185;フィビュリン(fibulin)−1前駆体(FBLN1)のアイソフォームB;ヌクレオバインディン1(NUCB1);ヒストンクラスター2,H2ba(HIST2H2BA);三部分モチーフ含有28(TRIM28);ペルオキシソームD3,D2エノイル−CoAイソメラーゼ(PECI);ペプチジルプロリルイソメラーゼB(PPIB);40Sリボソームタンパク質S17類似体;真核生物翻訳伸長因子1γ(EEF1G);ケラチン8(KRT8);フィビュリン2(FBLN2);VIM;フィブリノーゲンα鎖(FGA);アネキシンA2(ANXA2);H2Aヒストンファミリー,メンバーJ(H2AFJ);アクチンα,心筋1(ACTC1);ケラチン19(KRT19);免疫グロブリン(Immunoglobin)λ遺伝子座(IGL@タンパク質);免疫グロブリン重鎖定常部位μ(IGHM);EGF含有フィビュリン様細胞外基質タンパク質1(EFEMP1);三部分モチーフ含有タンパク質34;AP1−サブユニットγ結合タンパク質1のアイソフォーム3;プロフィリン(Proflin)−1;ヒストンH4;ヘモグロビンサブユニットα;トランスゲリン);ルミカン前駆体;ヘモグロビンβ;フィブリノーゲンβ鎖前駆体;免疫グロブリンκ定常部位(IGKC);未同定タンパク質ALB;ApoA1;C4A;C3 187kDaタンパク質;, アクチン,細胞質性1(アクチンβ);ヘモグロビンβ;ヘモグロビンサブユニットα;POTE−2αアクチン;SLC4A10;リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットP20(POP7);核RNA排出因子1(NXF1);コイルドコイルドメイン及びアンキリンリピートを有するUVEAL自己抗原,UACA;未同定タンパク質C13ORF27;sushi、ナイドジェン及びEGF−様ドメイン含有タンパク質1前駆体のアイソフォーム3;ダイニン重鎖10のアイソフォーム1,軸糸性(DNAH10);ギャップジャンクションα−1タンパク質(GJA1/Connexion43);キネシン様タンパク質KIF25(KIF25)のアイソフォーム1;GAPDH−グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ;未同定タンパク質ALB;ガレクチン−3,LGALS3;NAC−αドメイン含有タンパク質1(NACAD)類似体;アセチル−CoAアセチルトランスフェラーゼ,ミトコンドリア性,ACAT1;KH−型スプライシング調節タンパク質,FUBP2;プロフィリン1(PFN1);塩素細胞内チャンネルタンパク質1,CLIC1;ジンクフィンガータンパク質831;エンドプラスミン;リボソームタンパク質S10(RPS10);スプライシング因子,アルギニン/セリン−リッチ3;ACTA2タンパク質(αアクチン,平滑筋);ナトリウムチャンネルタンパク質タイプ8サブユニットαのアイソフォーム1,SCN8A;ガレクチン−9のアイソフォームロング;T−複合体タンパク質1サブユニットε,CCT5;α−エノラーゼ,肺特異性;癌原遺伝子セリン/スレオニン−タンパク質キナーゼMOS;β−アデュシン(ADD2)のアイソフォーム1;アポリポタンパク質E(APOE);ユビキリン−4(UBQLN4)(アタキシン−1ユビキチン様相互作用タンパク質);Sumo結合酵素UB21(酵母におけるホモログUBC9);ミオシン−15(MYH15);FLJ93091,ヒトUMP−CMPキナーゼ(UMP−CMPK);インテレクチン−1(ITLN1);アポリポタンパク質A−IV(APOA4);ミトコンドリアピルビン酸デヒドロゲナーゼ(リポアミド)α1(PDHA1);ロイシンリッチリピート含有タンパク質59(LRRC59);60Sリボソームタンパク質L37A(RPL37A);ウリジン−シチジンキナーゼ1−様1(UCKL1);アルデヒドデヒドロゲナーゼ9A1(ALDH9A1);チオレドキシン還元酵素1,細胞質性(TXNRD1)のアイソフォーム3;核内受容体サブファミリー2グループEメンバー1(NR2E1);陽イオンチャンネル精子関連タンパク質3(CATSPER3);膜貫通EMP24ドメイン含有タンパク質1(TMED1);タンパク質FAM154A(FAM154A);及び、転写リプレッサーNF−X1(NFX1)のアイソフォーム1、又はその断片、又はその任意の組み合わせ、からなる群より選択される薬学的有効量のタンパク質又はポリペプチドを対象に投与する工程;(b)前記タンパク質又はポリペプチド又はその任意の組み合わせをコードする薬学的有効量のポリヌクレオチド又はその断片を対象に投与する工程;或いは、(c)前記タンパク質又はポリペプチドと特異的に結合する薬学的有効量の抗体又はその抗原結合断片を対象に投与する工程を含む、対象における癌を治療するための又は対象における免疫反応を刺激するための方法。
  34. 前記タンパク質又はポリペプチドが、配列番号1〜157として示されるアミノ酸配列を含んでなる、請求項33に記載の方法。
  35. 前記癌が結腸直腸癌である、請求項33に記載の方法。
  36. 前記免疫性が抗腫瘍免疫性である、請求項33に記載の方法。
  37. 第1の環境状態では宿主によって発現されるが、第2の環境状態では発現されない、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド及びその同起源の遺伝子又はポリヌクレオチドを単離する方法であって、以下の工程:
    (a)第1の環境状態の第1の宿主から細胞、組織又は液状サンプルを取得する工程;
    (b)(a)のサンプルを動物に免疫する工程;
    (c)該免疫化した動物から抗体を回収する工程;
    (d)該抗体を、第2の環境状態の第2の宿主動物の組織のホモジネート又は液状物に吸着させる工程;
    (e)非吸着抗体を単離する工程;及び、
    (f)第1の環境状態では第1の宿主によって発現されるが、第2の環境状態では発現されない、変化が介在するタンパク質又はポリペプチド、又はその同起源の遺伝子又はポリヌクレオチドを単離するために、非吸着抗体を使用する工程;
    を含む、単離方法。
  38. 前記第1の環境状態が、疾患、癌、又は自己免疫疾患である、請求項37に記載の方法。
  39. 前記第2の環境状態が、正常状態、健康状態、非疾患状態、又は第1の環境状態とは異なる環境状態である、請求項37に記載の方法。
  40. 前記液状物が、尿、涙、血漿、乳汁、洗浄液、前立腺液、精液、唾液、血清、痰、及び胸水、細胞抽出物、師部抽出物、又は木部(xylum)抽出物である、請求項37に記載の方法。
  41. 前記体液が、実質的に細胞を含まない、請求項37に記載の方法。
  42. 前記第1の宿主からの細胞、細胞抽出物、組織又は液状物に対して産生させた抗体を、第1の宿主とは異なる第2の宿主から得られた組織又は液状物に吸着させる、請求項37に記載の方法。
  43. 前記第1の宿主からの細胞、細胞抽出物、組織又は液状物に対して産生させた抗体を、第1の宿主とは異なるが、同じ種である第2の宿主から得られた細胞、細胞抽出物、組織又は液状物に吸着させる、請求項37に記載の方法。
  44. 前記免疫化した動物が、ヒト、ヒヒ、チンパンジー、マカク、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、ラット、マウス、ニワトリ、アヒル、及び魚類からなる群より選択される、請求項37に記載の方法。
  45. 前記細胞、組織、又は液状サンプルが、第1の環境状態の第1の宿主から得られた直ぐ後に凍結される、請求項37に記載の方法。
  46. 第1の環境状態に反応して第1の宿主によって発現される請求項36に記載の単離されたタンパク質、ポリペプチド又はポリヌクレオチドの確認方法であって、以下の工程:
    (a)請求項36に記載の単離されたポリヌクレオチドからポリペプチドを発現させて単離する工程、又は、請求項36に記載のタンパク質又はポリペプチドを単離する工程;
    (b)前記タンパク質又はポリペプチドに対する抗体を産生させる工程;及び、
    (c)第1の環境状態の第1の宿主又は別の宿主の細胞、細胞抽出物、液状物、又は組織を、(b)の抗体を用いて精査する工程;を含み、
    これにより、該抗体が該細胞、細胞抽出物、体液、又は組織と特異的に結合している場合には、同定されたポリヌクレオチド、タンパク質又はポリペプチドは、第1の環境状態に反応して第1の宿主によって発現していることが確認される、確認方法。
  47. 前記免疫化した動物が、第1の宿主から系統学的に遠い、請求項37に記載の方法。
  48. 前記動物の免疫化前に、前記(a)のサンプルにアジュバントが添加される、請求項37に記載の方法。
  49. 前記変化が介在するタンパク質又はポリペプチドが、固体支持体上に(e)の非吸着抗体を固定化する工程、及び、第1の環境状態の第1の宿主の細胞、細胞抽出物、組織、又は液状物を添加する工程、及び、固体支持体と結合するタンパク質又はポリペプチドを回収する工程、とによって単離される、請求項37に記載の方法。
  50. 前記固体支持体と結合するタンパク質又はポリペプチドが、マススペクトロメトリーによって同定される、請求項49に記載の方法。

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