JP2011510634A5 - - Google Patents

Claims (14)

1. 4-デオキシ-L-エリスロ-5-ヘキソースウロースウロナート（DEHU）を2-ケト-3-デオキシ-D-グルコナート（KDG）に変換するための高効率の微生物系であって、該微生物系は組換え微生物を含み、該組換え微生物は、発現制御領域に作動可能に連結された単離されたポリヌクレオチドを含み、該ポリヌクレオチドは、ヒドロゲナーゼ活性を有するADHポリペプチドをコードし、該ヒドロゲナーゼ活性はDEHUヒドロゲナーゼ活性である、前記微生物系。
2. 前記コードされるADHポリペプチドが、配列番号：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38又は78のいずれか1つに記載された配列と少なくとも80%の配列同一性を共有するアミノ酸配列を有する、請求項1記載の微生物系。
3. 前記コードされるADHポリペプチドが、配列番号78に記載された配列と少なくとも80%の配列同一性を共有するアミノ酸配列を有する、請求項1記載の微生物系。
4. 前記コードされるADHポリペプチドが、以下からなる群から選択されるニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（NAD+）、NADH、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸（NADP+）、若しくはNADPH結合モチーフの少なくとも1つを含む、請求項1〜3のいずれかに記載の微生物系：
   

   

   （式中、Yは、独立してアラニン、グリシン、及びセリンから選択され、式中Gは、グリシンであり、かつXは、独立して遺伝的にコードされるアミノ酸から選択される）。
5. 前記微生物が大腸菌である、請求項1〜4のいずれかに記載の微生物系。
6. 前記微生物が酵母である、請求項1〜4のいずれかに記載の微生物系。
7. 前記微生物がアセトバクター・アセチ（Acetobacter aceti）、アクロモバクター（Achromobacter）、アシジフィリウム属（Acidiphilium）、アシネトバクター属（Acinetobacter）、アクチノマデュラ属（Actinomadura）、アクチノプラネス属（Actinoplanes）、超好熱性古細菌（Aeropyrum pernix）、アグロバクテリウム属（Agrobacterium）、アルカリゲネス属（Alcaligenes）、パインアップル（Ananas comosus）（M）、アルトロバクター属（Arthrobacter）、クロコウジカビ（Aspargillus niger）、コウジカビ（Aspargillus oryze）、アスペルギルス・メレウス（Aspergillus melleus）、アスペルギルス・プルベルレンツス（Aspergillus pulverulentus）、アスペルギルス・サイトイ（Aspergillus saitoi）、ショウユコウジカビ（Aspergillus sojea）、アスペルギルス・ウサミ（Aspergillus usamii）、バチルス・アルカロフィラス（Bacillus alcalophilus）、バチルス・アミロリクエファシエンス（Bacillus amyloliquefaciens）、バチルス・ブレビス（Bacillus brevis）、バチルス・サーキュランス（Bacillus circulans）、バチルス・クラウシイ（Bacillus clausii）、バチルス・レンタス（Bacillus lentus）、バチルス・リケニホルミス（Bacillus licheniformis）、バチルス・マセランス（Bacillus macerans）、バチルス・ステアロサーモフィルス（Bacillus stearothermophilus）、枯草菌（Bacillus subtilis）、ビフィドバクテリウム属（Bifidobacterium）、ブレビバチルス・ブレビス（Brevibacillus brevis）、バークホルデリア・セパシア（Burkholderia cepacia）、カンジダ・シリンドラセア（Candida cylindracea）、カンジダ・ルゴサ（Candida rugosa）、パパイヤ（Carica papaya）（L）、セルロシミクロビウム属（Cellulosimicrobium）、セファロスポリウム属（Cephalosporium）、ケトミウム・エラチカム（Chaetomium erraticum）、ケトミウム・グラシエ（Chaetomium gracile）、クロストリジウム属（Clostridium）、酪酸菌（Clostridium butyricum）、クロストリジウム・アセトブチリクム (Clostridium acetobutylicum)、クロストリジウム・サーモセラム（Clostridium thermocellum）、コリネバクテリウム属（Corynebacterium）（グルタミカム（glutamicum））、コリネバクテリウム・エフィシエンス（Corynebacterium efficiens）、大腸菌（Escherichia coli）、エンテロコッカス（Enterococcus）、黒脚病菌（Erwina chrysanthemi）、グルコノバクター属（Gliconobacter）、グルコンアセトバクター属（Gluconacetobacter）、ハロアーキュラ属（Haloarcula）、フミコラ・インソレンス（Humicola insolens）、フミコラ・ンソレンス（Humicola nsolens）、キタサトスポラ・セタエ（Kitasatospora setae）、クレブシエラ属（Klebsiella）、クレブシエラ・オキシトーカ（Klebsiella oxytoca）、クリベロマイセス属（Kluyveromyces）、クリベロマイセス・フラジリス（Kluyveromyces fragilis）、クリベロマイセス・ラクチス（Kluyveromyces lactis）、コクリア属（Kocuria）、ラクトラクティス（Lactlactis）、乳酸桿菌属（Lactobacillus）、発酵乳酸桿菌（Lactobacillus fermentum）、ラクトバシラス・サケ（Lactobacillus sake）、ラクトコッカス属（Lactococcus）、ラクトコッカス・ラクティス（Lactococcus lactis）、ロイコノストック属（Leuconostoc）、メチロシスチス属（Methylocystis）、メタノロブス・シシリアエ（Methanolobus siciliae）、メタノゲニウム・オルガノフィラム（Methanogenium organophilum）、メタノバクテリウム・ブライアンティイ（Methanobacterium bryantii）、ミクロバクテリウム・インペリアレ（Microbacterium imperiale）、ミクロコッカス・リソディクティカス（Micrococcus lysodeikticus）、ミクロルナタス属（Microlunatus）、ムコール・ジャバニカス（Mucor javanicus）、マイコバクテリウム属（Mycobacterium）、ミロセシウム属（Myrothecium）、硝酸菌属（Nitrobacter）、ニトロソモナス属（Nitrosomonas）、ノカルジア属（Nocardia）、パパイヤ（Papaya carica）、ペディオコッカス属（Pediococcus）、醤油乳酸菌（Pediococcus halophilus）、ペニシリウム属（Penicillium）、ペニシリウム・カマンベルティ（Penicillium camemberti）、ペニシリウム・シトリヌム（Penicillium citrinum）、ペニシリウム・エメルソニィ（Penicillium emersonii）、ペニシリウム・ロックフォルティ（Penicillium roqueforti）、ペニシリウム・リラクチナム（Penicillium lilactinum）、ペニシリウム・マルチカラー（Penicillium multicolor）、パラコッカス・パントトロファス（Paracoccus pantotrophus）、プロピオニバクテリウム属（Propionibacterium）、シュードモナス属（Pseudomonas）、蛍光菌（Pseudomonas fluorescens）、シュードモナス・デニトリフィカンス（Pseudomonas denitrificans）、パイロコッカス属（Pyrococcus）、パイロコッカス・フリオサス（Pyrococcus furiosus）、パイロコッカス・ホリコシイ（Pyrococcus horikoshii）、根粒菌属（Rhizobium）、リゾムコール・マイハイ（Rhizomucor miehei）、リゾムコール・プシルス・リント（Rhizomucor pusillus Lindt）、リゾプス属（Rhizopus）、リゾプス・デレマー（Rhizopus delemar）、リゾプス・ジャポニカス（Rhizopus japonicus）、リゾプス・ニベウス（Rhizopus niveus）、リゾプス・オリゼ（Rhizopus oryzae）、リゾプス・オリゴスポラス（Rhizopus oligosporus）、ロドコッカス属（Rhodococcus）、サッカロマイセス・セレビシエ（Saccharomyces cerevisiae）、スクレロチナ・リベルチナ（Sclerotina libertina）、スフィンゴバクテリウム・マルチボラム（Sphingobacterium multivorum）、スフィンゴビウム属（Sphingobium）、スフィンゴモナス属（Sphingomonas）、連鎖球菌属（Streptococcus）、ストレプトコッカス・サーモフィルス（Streptococcus thermophilus）Y-1、ストレプトマイセス属（Streptomyces）、ストレプトマイセス・グリセウス（Streptomyces griseus）、ストレプトマイセス・リビダンス（Streptomyces lividans）、ストレプトマイセス・ムリヌス（Streptomyces murinus）、ストレプトマイセス・ルビギノーサス（Streptomyces rubiginosus）、ストレプトマイセス・バイオラセオルバー（Streptomyces violaceoruber）、ストレプトベルティシリウム・モバラエンス（Streptoverticillium mobaraense）、テトラジェノコッカス属（Tetragenococcus）、サームス属（Thermus）、チオスファエラ・パントトロファ（Thiosphaera pantotropha）、ホウロクタケ属（Trametes）、トリコデルマ属（Trichoderma）、トリコデルマ・ロンギブラキアータム（Trichoderma longibrachiatum）、トリコデルマ・レッセイ（Trichoderma reesei）、トリコデルマ・ビリデ（Trichoderma viride）、トリコスポロン・ペニシラタム（Trichosporon penicillatum）、ビブリオ・アルギノリチカス（Vibrio alginolyticus）、ザントモナス属（Xanthomonas）、酵母、ジゴサッカロマイセス・ロキシー（Zygosaccharomyces rouxii）、ザイモモナス属（Zymomonas）、及びザイモモナス・モビリス（Zymomonus mobilis）から選択される、請求項1〜4のいずれかに記載の微生物系。
8. 水生又は海洋バイオマスをコモディティケミカルに変換するための、4-デオキシ-L-エリスロ-5-ヘキソースウロースウロナート（DEHU）ヒドロゲナーゼ活性を有するポリペプチドを含む微生物系の使用。
9. 前記微生物系が請求項1〜7のいずれかに定義されたものである、請求項8記載の使用。
10. 前記コモディティケミカルが生物燃料である、請求項8又は9記載の使用。
11. 前記コモディティケミカルが、メタン、メタノール、エタン、エテン、エタノール、n-プロパン、1-プロペン、1-プロパノール、プロパナール、アセトン、プロピオナート、n-ブタン、1-ブテン、1‐ブタノール、ブタナール、ブタノエート、イソブタナール、イソブタノール、2-メチルブタナール、2-メチルブタノール、3-メチルブタナール、3-メチルブタノール、2-ブテン、2-ブタノール、2-ブタノン、2,3-ブタンジオール、3-ヒドロキシ-2-ブタノン、2,3-ブタンジオン、エチルベンゼン、エテニルベンゼン、2-フェニルエタノール、フェニルアセトアルデヒド、1-フェニルブタン、4-フェニル-1-ブテン、4-フェニル-2-ブテン、1-フェニル-2-ブテン、1-フェニル-2-ブタノール、4-フェニル-2-ブタノール、1-フェニル-2-ブタノン、4-フェニル-2-ブタノン、1-フェニル-2,3-ブタンジオール、1-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、4-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、1-フェニル-2,3-ブタンジオン、n-ペンタン、エチルフェノール、エテニルフェノール、2-(4-ヒドロキシフェニル)エタノール、4-ヒドロキシフェニルアセトアルデヒド、1-(4-ヒドロキシフェニル)ブタン、4-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ブテン、4-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ブテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノール、4-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノン、4-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ブタンジオール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、4-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ブタノンジオン、インドリルエタン、インドリルエテン、2-(インドール-3-）エタノール、n-ペンタン、1-ペンテン、1-ペンタノール、ペンタナール、ペンタノアート、2-ペンテン、2-ペンタノール、3-ペンタノール、2-ペンタノン、3-ペンタノン、4-メチルペンタナール、4-メチルペンタノール、2,3-ペンタンジオール、2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、2,3-ペンタンジオン、2-メチルペンタン、4-メチル-1-ペンテン、4-メチル-2-ペンテン、4-メチル-3-ペンテン、4-メチル-2-ペンタノール、2-メチル-3-ペンタノール、4-メチル-2-ペンタノン、2-メチル-3-ペンタノン、4-メチル-2,3-ペンタンジオール、4-メチル-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、4-メチル-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、4-メチル-2,3-ペンタンジオン、1-フェニルペンタン、1-フェニル-1-ペンテン、1-フェニル-2-ペンテン、1-フェニル-3-ペンテン、1-フェニル-2-ペンタノール、1-フェニル-3-ペンタノール、1-フェニル-2-ペンタノン、1-フェニル-3-ペンタノン、1-フェニル-2,3-ペンタンジオール、1-フェニル-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、1-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、1-フェニル-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-フェニルペンタン、4-メチル-1-フェニル-1-ペンテン、4-メチル-1-フェニル-2-ペンテン、4-メチル-1-フェニル-3-ペンテン、4-メチル-1-フェニル-3-ペンタノール、4-メチル-1-フェニル-2-ペンタノール、4-メチル-1-フェニル-3-ペンタノン、4-メチル-1-フェニル-2-ペンタノン、4-メチル-1-フェニル-2,3-ペンタンジオール、4-メチル-1-フェニル-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、4-メチル-1-フェニル-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)ペンタン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ペンテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンタノール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンタノール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ペンタンジオール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)ペンタン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンテン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンテン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ペンテン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンタノール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンタノール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ペンタノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ペンタノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ペンタンジオール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、1-インドール-3-ペンタン、1-(インドール-3)-1-ペンテン、1-(インドール-3)-2-ペンテン、1-(インドール-3)-3-ペンテン、1-(インドール-3)-2-ペンタノール、1-(インドール-3)-3-ペンタノール、1-(インドール-3)-2-ペンタノン、1-(インドール-3)-3-ペンタノン、1-(インドール-3)-2,3-ペンタンジオール、1-(インドール-3)-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、1-(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、1-(インドール-3)-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-(インドール-3-）ペンタン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ペンテン、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ペンテン、4-メチル-1-(インドール-3)-1-ペンテン、4-メチル-2-(インドール-3)-3-ペンタノール、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ペンタノール、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ペンタノン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ペンタノン、4-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ペンタンジオール、4-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ペンタンジオン、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ペンタノン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ヒドロキシ-3-ペンタノン、n-ヘキサン、1-ヘキセン、1‐ヘキサノール、ヘキサナール、ヘキサノアート、2-ヘキセン、3-ヘキセン、2-ヘキサノール、3-ヘキサノール、2-ヘキサノン、3-ヘキサノン、2,3-ヘキサンジオール、2,3-ヘキサンジオン、3,4-ヘキサンジオール、3,4-ヘキサンジオン、2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、3-ヒドロキシ-4-ヘキサノン、4-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、2-メチルヘキサン、3-メチルヘキサン、2-メチル-2-ヘキセン、2-メチル-3-ヘキセン、5-メチル-1-ヘキセン、5-メチル-2-ヘキセン、4-メチル-1-ヘキセン、4-メチル-2-ヘキセン、3-メチル-3-ヘキセン、3-メチル-2-ヘキセン、3-メチル-1-ヘキセン、2-メチル-3-ヘキサノール、5-メチル-2-ヘキサノール、5-メチル-3-ヘキサノール、2-メチル-3-ヘキサノン、5-メチル-2-ヘキサノン、5-メチル-3-ヘキサノン、2-メチル-3,4-ヘキサンジオール、2-メチル-3,4-ヘキサンジオン、5-メチル-2,3-ヘキサンジオール、5-メチル-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-2,3-ヘキサンジオール、4-メチル-2,3-ヘキサンジオン、2-メチル-3-ヒドロキシ-4-ヘキサノン、2-メチル-4-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、5-メチル-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、5-メチル-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、4-メチル-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、4-メチル-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、2,5-ジメチルヘキサン、2,5-ジメチル-2-ヘキセン、2,5-ジメチル-3-ヘキセン、2,5-ジメチル-3-ヘキサノール、2,5-ジメチル-3-ヘキサノン、2,5-ジメチル-3,4-ヘキサンジオール、2,5-ジメチル-3,4-ヘキサンジオン、2,5-ジメチル-3-ヒドロキシ-4-ヘキサノン、5-メチル-1-フェニルヘキサン、4-メチル-1-フェニルヘキサン、5-メチル-1-フェニル-1-ヘキセン、5-メチル-1-フェニル-2-ヘキセン、5-メチル-1-フェニル-3-ヘキセン、4-メチル-1-フェニル-1-ヘキセン、4-メチル-1-フェニル-2-ヘキセン、4-メチル-1-フェニル-3-ヘキセン、5-メチル-1-フェニル-2-ヘキサノール、5-メチル-1-フェニル-3-ヘキサノール、4-メチル-1-フェニル-2-ヘキサノール、4-メチル-1-フェニル-3-ヘキサノール、5-メチル-1-フェニル-2-ヘキサノン、5-メチル-1-フェニル-3-ヘキサノン、4-メチル-1-フェニル-2-ヘキサノン、4-メチル-1-フェニル-3-ヘキサノン、5-メチル-1-フェニル-2,3-ヘキサンジオール、4-メチル-1-フェニル-2,3-ヘキサンジオール、5-メチル-1-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、5-メチル-1-フェニル-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、4-メチル-1-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、4-メチル-1-フェニル-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、5-メチル-1-フェニル-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-1-フェニル-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)ヘキサン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ヘキセン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキセン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキセン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-1-ヘキセン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキセン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキセン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキサノール、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキサノール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキサノール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキサノール、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキサノン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキサノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヘキサノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヘキサノン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ヘキサンジオール、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ヘキサンジオール、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、5-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-1-(インドール-3-)ヘキサン、5-メチル-1-(インドール-3)-1-ヘキセン、5-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキセン、5-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキセン、4-メチル-1-(インドール-3)-1-ヘキセン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキセン、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキセン、5-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキサノール、5-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキサノール、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキサノール、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキサノール、5-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキサノン、5-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキサノン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ヘキサノン、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ヘキサノン、5-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ヘキサンジオール、4-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ヘキサンジオール、5-メチル-1-(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、5-メチル-1-(インドール-3)-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、4-メチル-1-(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ヘキサノン、4-メチル-1-(インドール-3)-2-ヒドロキシ-3-ヘキサノン、5-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ヘキサンジオン、4-メチル-1-(インドール-3)-2,3-ヘキサンジオン、n-ヘプタン、1-ヘプテン、1-ヘプタノール、ヘプタナール、ヘプタノエート、2-ヘプテン、3-ヘプテン、2-ヘプタノール、3-ヘプタノール、4-ヘプタノール、2-ヘプタノン、3-ヘプタノン、4-ヘプタノン、2,3-ヘプタンジオール、2,3-ヘプタンジオン、3,4-ヘプタンジオール、3,4-ヘプタンジオン、2-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、3-ヒドロキシ-2-ヘプタノン、3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、2-メチルヘプタン、3-メチルヘプタン、6-メチル-2-ヘプテン、6-メチル-3-ヘプテン、2-メチル-3-ヘプテン、2-メチル-2-ヘプテン、5-メチル-2-ヘプテン、5-メチル-3-ヘプテン、3-メチル-3-ヘプテン、2-メチル-3-ヘプタノール、2-メチル-4-ヘプタノール、6-メチル-3-ヘプタノール、5-メチル-3-ヘプタノール、3-メチル-4-ヘプタノール、2-メチル-3-ヘプタノン、2-メチル-4-ヘプタノン、6-メチル-3-ヘプタノン、5-メチル-3-ヘプタノン、3-メチル-4-ヘプタノン、2-メチル-3,4-ヘプタンジオール、2-メチル-3,4-ヘプタンジオン、6-メチル-3,4-ヘプタンジオール、
    6-メチル-3,4-ヘプタンジオン、5-メチル-3,4-ヘプタンジオール、5-メチル-3,4-ヘプタンジオン、2-メチル-3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、2-メチル-4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、6-メチル-3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、6-メチル-4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、5-メチル-3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、5-メチル-4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、2,6-ジメチルヘプタン、2,5-ジメチルヘプタン、2,6-ジメチル-2-ヘプテン、2,6-ジメチル-3-ヘプテン、2,5-ジメチル-2-ヘプテン、2,5-ジメチル-3-ヘプテン、3,6-ジメチル-3-ヘプテン、2,6-ジメチル-3-ヘプタノール、2,6-ジメチル-4-ヘプタノール、2,5-ジメチル-3-ヘプタノール、2,5-ジメチル-4-ヘプタノール、2,6-ジメチル-3,4-ヘプタンジオール、2,6-ジメチル-3,4-ヘプタンジオン、2,5-ジメチル-3,4-ヘプタンジオール、2,5-ジメチル-3,4-ヘプタンジオン、2,6-ジメチル-3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、2,6-ジメチル-4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、2,5-ジメチル-3-ヒドロキシ-4-ヘプタノン、2,5-ジメチル-4-ヒドロキシ-3-ヘプタノン、n-オクタン、1-オクテン、2-オクテン、1-オクタノール、オクタナール、オクタノアート、3-オクテン、4-オクテン、4-オクタノール、4-オクタノン、4,5-オクタンジオール、4,5-オクタンジオン、4-ヒドロキシ-5-オクタノン、2-メチルオクタン、2-メチル-3-オクテン、2-メチル-4-オクテン、7-メチル-3-オクテン、3-メチル-3-オクテン、3-メチル-4-オクテン、6-メチル-3-オクテン、2-メチル-4-オクタノール、7-メチル-4-オクタノール、3-メチル-4-オクタノール、6-メチル-4-オクタノール、2-メチル-4-オクタノン、7-メチル-4-オクタノン、3-メチル-4-オクタノン、6-メチル-4-オクタノン、2-メチル-4,5-オクタンジオール、2-メチル-4,5-オクタンジオン、3-メチル-4,5-オクタンジオール、3-メチル-4,5-オクタンジオン、2-メチル-4-ヒドロキシ-5-オクタノン、2-メチル-5-ヒドロキシ-4-オクタノン、3-メチル-4-ヒドロキシ-5-オクタノン、3-メチル-5-ヒドロキシ-4-オクタノン、2,7-ジメチルオクタン、2,7-ジメチル-3-オクテン、2,7-ジメチル-4-オクテン、2,7-ジメチル-4-オクタノール、2,7-ジメチル-4-オクタノン、2,7-ジメチル-4,5-オクタンジオール、2,7-ジメチル-4,5-オクタンジオン、2,7-ジメチル-4-ヒドロキシ-5-オクタノン、2,6-ジメチルオクタン、2,6-ジメチル-3-オクテン、2,6-ジメチル-4-オクテン、3,7-ジメチル-3-オクテン、2,6-ジメチル-4-オクタノール、3,7-ジメチル-4-オクタノール、2,6-ジメチル-4-オクタノン、3,7-ジメチル-4-オクタノン、2,6-ジメチル-4,5-オクタンジオール、2,6-ジメチル-4,5-オクタンジオン、2,6-ジメチル-4-ヒドロキシ-5-オクタノン、2,6-ジメチル-5-ヒドロキシ-4-オクタノン、3,6-ジメチルオクタン、3,6-ジメチル-3-オクテン、3,6-ジメチル-4-オクテン、3,6-ジメチル-4-オクタノール、3,6-ジメチル-4-オクタノン、3,6-ジメチル-4,5-オクタンジオール、3,6-ジメチル-4,5-オクタンジオン、3,6-ジメチル-4-ヒドロキシ-5-オクタノン、n-ノナン、1-ノネン、1‐ノナノール、ノナナール、ノナノアート、2-メチルノナン、2-メチル-4-ノネン、2-メチル-5-ノネン、8-メチル-4-ノネン、2-メチル-5-ノナノール、8-メチル-4-ノナノール、2-メチル-5-ノナノン、8-メチル-4-ノナノン、8-メチル-4,5-ノナンジオール、8-メチル-4,5-ノナンジオン、8-メチル-4-ヒドロキシ-5-ノナノン、8-メチル-5-ヒドロキシ-4-ノナノン、2,8-ジメチルノナン、2,8-ジメチル-3-ノネン、2,8-ジメチル-4-ノネン、2,8-ジメチル-5-ノネン、2,8-ジメチル-4-ノナノール、2,8-ジメチル-5-ノナノール、2,8-ジメチル-4-ノナノン、2,8-ジメチル-5-ノナノン、2,8-ジメチル-4,5-ノナンジオール、2,8-ジメチル-4,5-ノナンジオン、2,8-ジメチル-4-ヒドロキシ-5-ノナノン、2,8-ジメチル-5-ヒドロキシ-4-ノナノン、2,7-ジメチルノナン、3,8-ジメチル-3-ノネン、3,8-ジメチル-4-ノネン、3,8-ジメチル-5-ノネン、3,8-ジメチル-4-ノナノール、3,8-ジメチル-5-ノナノール、3,8-ジメチル-4-ノナノン、3,8-ジメチル-5-ノナノン、3,8-ジメチル-4,5-ノナンジオール、3,8-ジメチル-4,5-ノナンジオン、3,8-ジメチル-4-ヒドロキシ-5-ノナノン、3,8-ジメチル-5-ヒドロキシ-4-ノナノン、n-デカン、1-デセン、1-デカノール、デカノアート、2,9-ジメチルデカン、2,9-ジメチル-3-デセン、2,9-ジメチル-4-デセン、2,9-ジメチル-5-デカノール、2,9-ジメチル-5-デカノン、2,9-ジメチル-5,6-デカンジオール、2,9-ジメチル-6-ヒドロキシ-5-デカノン、2,9-ジメチル-5,6-デカンジオン、n-ウンデカン、1-ウンデセン、1-ウンデカノール、ウンデカナール、ウンデカノアート、n-ドデカン、1-ドデセン、1-ドデカノール、ドデカナール、ドデカノアート、n-ドデカン、1-デカデセン、1-ドデカノール、ドデカナール（ddodecanal）、ドデカノアート、n-トリデカン、1-トリデセン、1-トリデカノール、トリデカナール、トリデカノアート、n-テトラデカン、1-テトラデセン、1‐テトラデカノール、テトラデカナール、テトラデカノアート、n-ペンタデカン、1-ペンタデセン、1-ペンタデカノール、ペンタデカナール、ペンタデカノアート、n-ヘキサデカン、1-ヘキサデセン、1-ヘキサデカノール、ヘキサデカナール、ヘキサデカノアート、n-ヘプタデカン、1-ヘプタデセン、1-ヘプタデカノール、ヘプタデカナール、ヘプタデカノアート、n-オクタデカン、1-オクタデセン、1-オクタデカノール、オクタデカナール、オクタデカノアート、n-ノナデカン、1-ノナデセン、1-ノナデカノール、ノナデカナール、ノナデカノアート、エイコサン、1-エイコセン、1-エイコサノール、エイコサナール、エイコサノアート、3-ヒドロキシプロパナール、1,3-プロパンジオール、4-ヒドロキシブタナール、1,4-ブタンジオール、3-ヒドロキシ-2-ブタノン、2,3-ブタンジオール、1,5-ペンタンジオール、ホモシトラート、ホモイソシトラート、b-ヒドロキシアジパート、グルタラート、グルタルセミアルデヒド、グルタルアルデヒド、2-ヒドロキシ-1-シクロペンタノン、1,2-シクロペンタンジオール、シクロペンタノン、シクロペンタノール、(S)-2-アセトラクタート、(R)-2,3-ジヒドロキシ-イソバレレート、2-オキソイソバレレート、イソブチリル-CoA、イソブチレート、イソブチルアルデヒド、5-アミノペントアルデヒド、1,10-ジアミノデカン、1,10-ジアミノ-5-デセン、1,10-ジアミノ-5-ヒドロキシデカン、1,10-ジアミノ-5-デカノン、1,10-ジアミノ-5,6-デカンジオール、1,10-ジアミノ-6-ヒドロキシ-5-デカノン、フェニルアセトアルデヒド、1,4-ジフェニルブタン、1,4-ジフェニル-1-ブテン、1,4-ジフェニル-2-ブテン、1,4-ジフェニル-2-ブタノール、1,4-ジフェニル-2-ブタノン、1,4-ジフェニル-2,3-ブタンジオール、1,4-ジフェニル-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニルブタン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-1-ブテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-2-ブテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-2-ブタノール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-2,3-ブタンジオール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、1-(インドール-3)-4-フェニルブタン、1-(インドール-3)-4-フェニル-1-ブテン、1-(インドール-3)-4-フェニル-2-ブテン、1-(インドール-3)-4-フェニル-2-ブタノール、1-(インドール-3)-4-フェニル-2-ブタノン、1-(インドール-3)-4-フェニル-2,3-ブタンジオール、1-(インドール-3)-4-フェニル-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、4-ヒドロキシフェニルアセトアルデヒド、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)ブタン、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-1-ブテン、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブテン、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノール、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-2-ブタノン、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-2,3-ブタンジオール、1,4-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3-)ブタン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3)-1-ブテン、1-ジ(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3)-2-ブテン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3)-2-ブタノール、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3)-2-ブタノン、1-(4-ヒドロキシフェニル)-4-(インドール-3)-2,3-ブタンジオール、1-(4-ヒドロキシフェニル-4-(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、インドール-3-アセトアルデヒド、1,4-ジ(インドール-3-)ブタン、1,4-ジ(インドール-3)-1-ブテン、1,4-ジ(インドール-3)-2-ブテン、1,4-ジ(インドール-3)-2-ブタノール、1,4-ジ(インドール-3)-2-ブタノン、1,4-ジ(インドール-3)-2,3-ブタンジオール、1,4-ジ(インドール-3)-3-ヒドロキシ-2-ブタノン、スクシナートセミアルデヒド、ヘキサン-1,8-ジカルボン酸、3-ヘキセン-1,8-ジカルボン酸、3-ヒドロキシ-ヘキサン-1,8-ジカルボン酸、3-ヘキサノン-1,8-ジカルボン酸、3,4-ヘキサンジオール-1,8-ジカルボン酸、及び4-ヒドロキシ-3-ヘキサノン-1,8-ジカルボン酸から選択される、請求項8〜10のいずれかに記載の使用。
12. 前記コモディティケミカルが、1‐ブタノール、2-ブタノール、又はイソブタノールである、請求項8〜11のいずれかに記載の使用。
13. 前記コモディティケミカルがエタノールである、請求項8〜11のいずれかに記載の使用。
14. 前記水生又は海洋バイオマスが、ケルプ、ジャイアントケルプ、ホンダワラ、海草、藻類、海洋ミクロフローラ、微細藻類、及び海草から選択される、請求項8〜13のいずれかに記載の使用。