JP2010536009A - マイクロアレイシステム、およびマイクロアレイの製造方法 - Google Patents
マイクロアレイシステム、およびマイクロアレイの製造方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2010536009A JP2010536009A JP2009522740A JP2009522740A JP2010536009A JP 2010536009 A JP2010536009 A JP 2010536009A JP 2009522740 A JP2009522740 A JP 2009522740A JP 2009522740 A JP2009522740 A JP 2009522740A JP 2010536009 A JP2010536009 A JP 2010536009A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- microbeads
- subpopulation
- microbead
- microarray
- substrate
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
- C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B20/00—Methods specially adapted for identifying library members
- C40B20/02—Identifying library members by their fixed physical location on a support or substrate
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B30/00—Methods of screening libraries
- C40B30/04—Methods of screening libraries by measuring the ability to specifically bind a target molecule, e.g. antibody-antigen binding, receptor-ligand binding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
- G01N21/6452—Individual samples arranged in a regular 2D-array, e.g. multiwell plates
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54313—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals the carrier being characterised by its particulate form
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54366—Apparatus specially adapted for solid-phase testing
- G01N33/54373—Apparatus specially adapted for solid-phase testing involving physiochemical end-point determination, e.g. wave-guides, FETS, gratings
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/544—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals the carrier being organic
- G01N33/545—Synthetic resin
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T5/00—Image enhancement or restoration
- G06T5/50—Image enhancement or restoration by the use of more than one image, e.g. averaging, subtraction
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/0002—Inspection of images, e.g. flaw detection
- G06T7/0004—Industrial image inspection
- G06T7/0008—Industrial image inspection checking presence/absence
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
- G06T7/00—Image analysis
- G06T7/30—Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration
- G06T7/33—Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration using feature-based methods
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
- B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
- B01J2219/00313—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels being formed by arrays of wells in blocks
- B01J2219/00315—Microtiter plates
- B01J2219/00317—Microwell devices, i.e. having large numbers of wells
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00457—Dispensing or evacuation of the solid phase support
- B01J2219/00459—Beads
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/00457—Dispensing or evacuation of the solid phase support
- B01J2219/00459—Beads
- B01J2219/00466—Beads in a slurry
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00277—Apparatus
- B01J2219/0054—Means for coding or tagging the apparatus or the reagents
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00646—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being bound to beads immobilised on the solid supports
- B01J2219/00648—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being bound to beads immobilised on the solid supports by the use of solid beads
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00659—Two-dimensional arrays
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
- B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
- B01J2219/00677—Ex-situ synthesis followed by deposition on the substrate
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/0068—Means for controlling the apparatus of the process
- B01J2219/00702—Processes involving means for analysing and characterising the products
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/00722—Nucleotides
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
- B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
- B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
- B01J2219/0072—Organic compounds
- B01J2219/0074—Biological products
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B50/00—Methods of creating libraries, e.g. combinatorial synthesis
- C40B50/14—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support
- C40B50/16—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support involving encoding steps
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B50/00—Methods of creating libraries, e.g. combinatorial synthesis
- C40B50/14—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support
- C40B50/18—Solid phase synthesis, i.e. wherein one or more library building blocks are bound to a solid support during library creation; Particular methods of cleavage from the solid support using a particular method of attachment to the solid support
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B60/00—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries
- C40B60/14—Apparatus specially adapted for use in combinatorial chemistry or with libraries for creating libraries
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Quality & Reliability (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Multimedia (AREA)
Abstract
Description
1)生体分子の位置は、基板上への生体分子のトランスファーに先立って指定される(「規則的生体分子配置(ordered biomolecule deposition)」);および
2)生体分子の位置は、基板上にランダムに割り当てられる(「ランダム生体分子配置(random biomolecule deposition)」)。
1)プリンターと表面との間に物理的接触が無い技術;および
2)印刷チップ(printing tip)と基板との間の物理的接触を利用する技術。
マイクロビーズの母集団を少なくとも1つの基準を有する基板上に配置する工程であって、前記母集団が少なくとも2つの亜集団からなり、各亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な既知の活性物質を含み、前記亜集団が互いに別々の期間に順次配置される当該工程;
各亜集団の配置後ごとに前記基板のイメージを作成する工程;および
前記基準を参照として用いて前記イメージを比較し、各イメージ間の相違に基づいてマイクロビーズ各々の位置を決定して、前記亜集団およびその既知の活性物質を同定する工程
を含む、マイクロアレイ製造方法が提供される。
第1の亜集団のマイクロビーズを少なくとも1つの基準を有する基板上に配置し、前記亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な活性物質を含み;
前記の第1の亜集団のマイクロビーズをイメージングし;
第2の亜集団のマイクロビーズを前記基板上に配置し、前記の第2の亜集団は、前記第1の母集団の標的分析物とは異なる少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能である既知の活性物質を含み;
前記第1の亜集団および第2の亜集団のマイクロビーズをイメージングし;
前記第1の亜集団および第2の亜集団のイメージを比較して、前記少なくとも1つの基準に対するマイクロビーズ各々の位置、およびその亜集団を決定すること;
を含む、マイクロアレイの製造方法が提供される。
試料中の1種または複数種の標的分析物の存在を同定するためのマイクロアレイシステムであって、
少なくとも1つの基準を有する基板表面上に配置されたマイクロビーズのランダムな母集団であって、前記母集団が少なくとも2つの亜集団からなり、各亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な既知の活性物質を含み、前記亜集団が互いに別々の期間に順次配置されたものである当該母集団;
前記少なくとも1つの基準に対するマイクロビーズ各々の位置およびその亜集団を記録する記憶部であって、前記マイクロビーズ各々の位置およびその亜集団が前記互いに別々の順次配置期間の間で前記マイクロビーズのイメージを比較することにより決定されたものである当該記憶部;
前記試料との接触時における前記マイクロビーズの変化を検出するための検出器;および、
前記記憶部に問い合わせを行い、前記検出器から受け取ったデータを比較し、各マイクロビーズ各々の位置およびその亜集団に基づいて前記試料中の前記1種または複数種の標的分析物の存在を同定するためのプログラム命令に応答するプロセッサー;
を含む、当該マイクロアレイシステムが提供される。
第3の態様で定義される前記マイクロアレイに前記試料を接触させる工程;
前記活性物質が前記試料中に存在する標的分析物に結合したことの指標となる変化をした前記マイクロビーズ亜集団を同定する工程;および
前記変化を示す前記マイクロビーズの位置および既知の活性物質に基づき、前記試料中に存在する任意の標的分析物の存在を同定する工程;
を含む。
本明細書で用いられる次の単語および用語は以下に示された意味を有するものとする。
i)1種または複数種の標的分析物を含む試料をマイクロアレイとともにインキュベートする工程。
ii)光学的サインを、蛍光もしくは色素、またはナノゴールドもしくは量子ドットで標識された生体分子の形態で加え、バイオアッセイの性能を促進してマイクロビーズ表面で光学的サインを生成する工程。この生体分子は、オリゴヌクレオチドもしくは標的分子、またはdNTPもしくは酵素基質である。
iii)検出器を用いて光学的サインからマイクロアレイを光学的に読み取る工程。顕微鏡もしくはスキャナー、またはデジタルカメラもしくはビデオカメラシステムの使用により、または写真フィルムの使用により、表面に光学的サインを有するマイクロビーズの全ての位置を検出および決定する。符号化/復号化データ表は、全マイクロビーズの空間的位置をそれらの各亜集団に固有の活性物質とともに含むコンピューターの記憶部から回収することができる。
iv)符号化/復号化データ表および光学的マイクロアレイ読み取りから作成したデータ表からのデータを用いて復号化し、これら2つのデータ表を組み合わせて比較し、2つのデータセット中の対応するマイクロビーズを同定してこのマイクロビーズおよび試料中のそれらの標的分析物を同定することによって、試料中の標的分析物の検出を行う工程。復号化工程はコンピューター内のソフトウェアを用いることにより自動化することができ、および/または復号化データセット情報の一部が特定の利用者に制限されていてもよく、および/または復号化データセットもしくは復号化データセットの一部が利用者にインターネットまたは無線通信手段により伝達されてもよい。
i)基板材料を提供する工程。基板材料は多数のチップ(例えば100〜10000)からなっていてよく、または後に多数のチップに四角く切られてもよい。
ii)識別番号などの基準を、単一チップ各々の領域上に付与する工程。例えば、レーザー刻印装置を用いることによって付与する。同時に、基準、またはxおよびy位置(例えば0,0)を定義する参照座標が基板上に刻まれてもよい。
iii)基板表面上に接着層を提供する工程。
iv)生体認識または酵素反応に基づいたバイオアッセイを行うための、特定の既知の生物活性物質を有するマイクロビーズの各亜集団に対応するバルク組成物懸濁液を調製する工程。
v)十分な数のマイクロビーズが各チップの領域上に固定されるよう、マイクロビーズの第1の亜集団で基板を処理する工程。典型的にはその数は5〜20である。
vi)緩く固定されているマイクロビーズを除去する工程。
vii)固定されたマイクロビーズをイメージングし、対応するチップ番号と共に、各単一マイクロビーズおよびチップに対応するxおよびy位置の値を記憶部内の復号化データ表に保存する工程。
viii)2〜n個の所望の数のマイクロビーズ亜集団を用いて、工程iv)〜vi)を反復する工程。
ix)亜集団1〜nのイメージファイルをデータ処理する工程。その後、1〜n個の各マイクロビーズ亜集団に対する各単一マイクロビーズのx、y位置の値を用いて、各単一チップに対する復号化データ表を作成する工程。
x)チップをチップホルダーもしくはチップデバイス、またはフローチャンバーもしくはインキュベーションチャンバーに取り付けて包装する工程。
以後、「チップ」という語は、アレイまたはマイクロアレイの四角く切られた一部を意味する。
2mmあたりのマイクロビーズの平均数=2000mm/(5μm+5μm)=200。
したがって、チップあたりの平均マイクロビーズ数は:200×200=40000
亜集団あたりのマイクロビーズの平均数(sub−pn)は、亜集団の数がn個であるとき:sub−pn=40000/n。
マルチチップの製造
上記の順次工程において、基板表面上に懸濁液を単にアプライすることにより、またはマイクロビーズ懸濁液を用いてエアブラシ法を行うことにより、例えば20cm×20cmのサイズの基板をマイクロビーズ粒子懸濁液で処理してマイクロアレイを形成する。
アレイはホルダー、流動装置、側流(lateral flow)装置、横断流(transversal flow)装置に取り付けることができる。いずれの場合もアレイは試料、および試薬と接触させられる。試薬は、それらを例えば側方流装置または移動流(transferal flow)装置内の放出パッドから放出することにより、またはそれらをアレイの表面上に配置することにより、あるいはそれらをアレイへのアプライに先立って試料と混合することにより提供される。透明な窓がアレイの上の10〜500μmの距離に取り付けられ、分析物/試薬混合液を満たすことができる空洞が形成される。この空洞は流路の一部であってもよい。
アプライ前、または装置内で、試薬は試料と混合される。典型的な側流型装置において、試料は毛細管力により装置を通って添加、輸送される。試薬は通常、放出パッドから放出されてマイクロアレイに到達するためには、このパッドを介して試料が移動する必要がある。マイクロアレイ上へ試料を継続的に輸送するために、マイクロアレイの裏面に吸収パッドが設置されていてもよい。アレイからの試料および試薬は、毛細管力に基づいた輸送、および/またはバッファーもしくは水を用いた洗浄、および/または遠心力により除去される。
試料とインキュベーションし、未反応成分を分離した後、アレイは、蛍光測定、反射測光法、および透過測光発光測定により読み取ることができる。パーソナルコンピューターにより操作可能な最先端のスキャナーまたは光学式ドライブが光学検出器として用いられる。読み取りデータは、使用されるスキャナーに特異的に適合させたキャリブレーションまたはソフトウェアプログラムを用いて、改変または補正することができる。読み取りの間に、次のデータが得られる:
(i)全マイクロビーズの強度またはシグナルを含むイメージ;
(ii)全てのマイクロビーズに対する、基準の位置をマーク(mark)の形態で含んだイメージ;
(iii)アレイの製造と関連する情報、特に亜集団数、製造日、アレイ数、および/またはアレイを用いた分析に必要とされる任意の他の情報もしくはエンコードされた情報、を含んだイメージ。
i)マークに対して定義されたx,y位置における全てのビーズの強度/シグナル
ii)アレイを用いた分析に必要とされる任意の他のデータ、特に補正符号化データセットをアレイに関連づけるためのデータ。
この実施例では、マイクロビーズに基づいたマイクロアレイの、一塩基多型(SNP)検出への応用について説明する。
この実施例では、マイクロビーズに基づいたマイクロアレイの、環境試料中の糞便汚染指標細菌(fecal indicator bacteria)検出への応用について説明する。
この実施例では、抗体抗原相互作用を用いた抗体に基づいたアッセイと、DNA/DNAまたはDNA/RNAハイブリダイゼーションを用いたDNAに基づいたアッセイとを、同一チップ上で並行して行った際の性能を示す。
抗体(ポリクローナルマウスIgGおよびポリクローナルマウス抗IgG)を約2mg/mlに希釈した。ビオチン−NHS(10mg/ml、DMSO中に溶解)を、1:1、5:1、および10:1(Mビオチン:M抗体)のモル比で抗体溶液に添加した。反応チューブを25℃で一晩インキュベートした。ビオチン化抗体をゲル濾過カラム(D−Saltデキストラン脱塩カラム、Pierce社)を用いて精製した。ビオチン化抗体をPBSに溶解し、−20℃で貯蔵した。
抗体(ポリクローナルマウスIgGおよびポリクローナルマウス抗IgG、Arista Biological inc.)を約2mg/mlに希釈した。FITC(10mg/ml、DMSO中に溶解)を、5:1、10:1、および20:1(Mビオチン:M抗体)のモル比で抗体溶液に添加した。反応物をチューブ内において25℃で一晩インキュベートした。FITC−抗体をゲル濾過カラム(D−Saltデキストラン脱塩カラム、Pierce Biotechnology Inc.)を用いて精製した。FITC−抗体をPBSに溶解し、−20℃で貯蔵した。
抗体の固定化には、直径9.95μmのストレプトアビジンコートポリスチレンビーズ(Bangs Laboratories社、インディアナ州フィッシャーズ)を用いた。ビオチン化抗体を、前記ビーズ懸濁液に、もとのマイクロビーズ1μLあたり0.5μgの量で添加した(2.5倍過剰量)。25℃で一晩インキュベートした。未結合の抗体をPBST−B(1×PBS、0.05% Tween−20、1% ウシ血清アルブミン)を用いて2〜3回、使用前に洗い流した。次いで、図4Aに示すように、これらのビーズを基板上へ配置した。
オリゴヌクレオチドの固定化には、直径9.95μmのストレプトアビジンコートポリスチレンビーズ(Bangs Laboratories社、インディアナ州フィッシャーズ)を用いた。100μLのストックビーズ(固形物1%)をTTLバッファー(100mM Tris−HCl、pH8.0、0.1% Tween20、1M NaCl)中で3回リンスし、沈殿させ、次いで20μLのTTL中に再懸濁した。これに続き、0.5μLのストックプローブ(0.5μg/μl)をマイクロビーズの結合能に対して過剰量加えた。この結合能は、マイクロビーズ1mgあたり約330ngのDNAであることが分かった。5’末端がビオチン化された捕捉プローブ(5’−GCCCTCACGATCTCTTCC−3’)を、室温で12時間穏やかに混合することにより、ビオチン−ストレプトアビジン結合を介してマイクロビーズ上に固定化した。固定化後、マイクロビーズをリンスし、沈殿させ、TTEバッファー(100mM Tris−HCl、pH8.0、0.1% Tween20、20mM EDTA)中で80℃で10分間再懸濁して、不安定なビオチン−ストレプトアビジン結合を除いた。次いで、図4Bに示すように、これらのビーズを、抗体コートマイクロビーズを含むマイクロアレイに加えた。
上述のように、抗体コートビーズのビーズ亜集団(亜集団1)(図4A)、およびオリゴヌクレオチドコートビーズのビーズ亜集団(亜集団2)(図4B)をマイクロアレイ基板上に配置した。ネガティブコントロールであり、どのような活性物質も含まないマイクロビーズの第3の亜集団を、基板上へ配置してもよい(図4C)。装置は、Bind Silane(GE Healthcare社、ニュージャージー州ピスカタウェイ)によってあらかじめ処理された、ガラススライド上に作製された19×24のポリアクリルアミドゲルパッドのアレイ(Corning社、ニューヨーク州コーニング)からなっていた。ゲルパッドは300μmの水平および縦ピッチを有しており、各ゲルパッドはさらに、10μmの水平および縦ピッチを有する微小柱(10×10×10μm)の10×10アレイを含んでいた。
抗原、および相補的DNAを含んだ試料をアレイとともにインキュベートした。試料は、0.1ng/μLのCy3標識化DNA標的(5’−AGGAAGAGATCGTGAGGGCA−3’)およびFITC標識化抗IgG、500mM NaCl、ならびにPBS−Tバッファーを含んでいた。10μLの試料をビーズマイクロアレイ上にスポットした。30分間のインキュベーション後、アレイを500mM NaClとPBS−Tとを含む20μlの溶液で簡単にリンスし、次いで蛍光顕微鏡によりシグナルを記録した。マイクロビーズに結合したFITC標識化抗IgGは、図4Dにおいて励起蛍光の円として示されている。マイクロビーズに結合したCy3標識化DNAは、図4Eにおいて励起蛍光の円として示されている。各マイクロビーズの正確な位置は既知であるため、試料中の標的分析物を同定する過程で複数の光学的サインを用いる必要がないということに注目すべきである。この実施例におけるFITCおよびCy3標識の使用は、単に説明を目的とするためのものである。
既知の第1の生物活性物質を含んだ第1の亜集団のマイクロビーズを基板に添加し、次いで洗浄し、データイメージを取得し(図3Bi)、符号化/復号化データ表の形式で保存する。次に既知の第2の生物活性物質を含んだ第2の亜集団のビーズを別の基板に加え、その後洗浄し、データイメージを取得し(図3Bii)、符号化/復号化データ表の形式で保存する。次にこの2つの符号化/復号化データ表を組み合わせ、以下の表1に示す符号化/復号化データ統合表を形成する。基準(図3Bに示すX=0,Y=0)に対する各々のマイクロビーズの位置は、以下の表1に示す符号化/復号化データ統合表のデータを比較することにより決定することができる。蛍光色素に結合した潜在的標的分析物を含んだ試料をマイクロビーズのマイクロアレイに添加する。マイクロアレイを洗浄し、蛍光顕微鏡下で観察し(図3Bii)、イメージを記録して以下の表1に示す符号化/復号化データ統合表と比較して、試料中に存在する標的分析物を同定する。
Claims (22)
- マイクロアレイの製造方法であって、
マイクロビーズの母集団を少なくとも1つの基準を有する基板上に配置する工程であって、前記母集団が少なくとも2つの亜集団からなり、各亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な既知の活性物質を含み、前記亜集団が互いに別々の期間に順次配置される当該工程;
各亜集団の配置後ごとに前記基板のイメージを作成する工程;および、
前記基準を参照として用いて前記イメージを比較し、各イメージ間の相違に基づいてマイクロビーズ各々の位置を決定して、前記亜集団およびその既知の活性物質を同定する工程
を含む当該方法。 - 前記マイクロビーズ各々の位置およびその亜集団を示すデータを記録する工程を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記記録工程がコンピューター記憶部内に前記データを記録することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記活性物質が生物活性物質である、請求項1に記載の方法。
- 前記生物活性物質が、タンパク質、核酸、酵素、細胞、ウイルス粒子および抗体からなる群より選択される少なくとも1つである、請求項4に記載の方法。
- 前記マイクロビーズを化学反応基で官能化する工程を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記マイクロビーズが100nm〜500μmの範囲内のサイズである、請求項1に記載の方法。
- 各亜集団の配置後に前記基板に付着しなかったマイクロビーズを除去することを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記基板上に少なくとも1つの基準を形成する工程を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記基板が、シリコン、プラスチック、ガラス、セラミック、ゴム、ポリマーまたはこれらの複合材料からなる群より選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記マイクロビーズを基板上に封じ込めることを容易にするために前記基板内で3次元構造を形成する、請求項1に記載の方法。
- 前記3次元構造が実質的に平坦な基板に形成されたくぼみである、請求項11に記載の方法。
- 互いに別々の期間における前記亜集団の順次配置が1〜10,000回行われる、請求項1に記載の方法。
- 前記マイクロビーズと前記標的分析物との結合を示すための光学的サインを提供する工程を含む、請求項1に記載の方法。
- 試料中の1種または複数種の標的分析物の存在を同定するためのシステムにおいて用いられるマイクロアレイであって、
前記マイクロアレイが少なくとも1つの基準を有する基板表面上に配置されたマイクロビーズのランダムな母集団を含み、前記母集団が少なくとも2つの亜集団からなり、各亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な既知の活性物質を含み、
前記亜集団の各々が互いに別々の期間に順次配置されて、前記別々の配置期間に取得された比較イメージから前記基準に対するマイクロビーズ各々の位置およびその亜集団を決定することが可能となる、当該マイクロアレイ。 - 試料中の1種または複数種の標的分析物の存在を同定するためのマイクロアレイシステムであって、
少なくとも1つの基準を有する基板表面上に配置されたマイクロビーズのランダムな母集団であって、前記母集団が少なくとも2つの亜集団からなり、各亜集団が少なくとも1種の標的分析物に特異的に結合可能な既知の活性物質を含み、前記亜集団が互いに別々の期間に順次配置されたものである当該母集団;
前記少なくとも1つの基準に対するマイクロビーズ各々の位置およびその亜集団を記録する記憶部であって、前記マイクロビーズ各々の位置およびその亜集団が前記別々の順次配置期間の間で前記マイクロビーズのイメージを比較することにより決定されたものである当該記憶部;
前記試料との接触時における前記マイクロビーズの変化を検出するための検出器;および、
前記記憶部に問い合わせを行い、前記検出器から受け取ったデータを比較し、マイクロビーズ各々の位置およびその亜集団に基づいて前記試料中の前記1種または複数種の標的分析物の存在を同定するためのプログラム命令に応答するプロセッサー;
を含む、当該マイクロアレイシステム。 - 前記記憶部内で保存するための復号化データを含み、前記復号化データは前記マイクロビーズ各々の前記基準に対する位置および既知の活性物質を示すデータを含む、請求項16に記載のマイクロアレイシステム。
- 前記復号化データがコンピューターネットワークを介して転送するためのフォーマットである、請求項17に記載のマイクロアレイシステム。
- 前記復号化データにアクセスするために識別子が必要とされる、請求項17に記載のマイクロアレイシステム。
- 試料中の標的分析物を同定するための方法であって:
請求項15に記載の前記マイクロアレイに前記試料を接触させる工程;
前記活性物質が前記試料中に存在する標的分析物に結合したことの指標となる変化をした前記マイクロビーズ亜集団を同定する工程;および
前記変化を示す前記マイクロビーズの位置および既知の活性物質に基づき、前記試料中に存在する任意の標的分析物の存在を同定する工程;
を含む当該方法。 - 前記変化が光学的変化である請求項20に記載の方法。
- 前記マイクロビーズと前記標的分析物との結合を示す光学的サインを提供する工程を含む、請求項21に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US83564806P | 2006-08-03 | 2006-08-03 | |
PCT/SG2007/000232 WO2008016335A1 (en) | 2006-08-03 | 2007-08-03 | A microarray system and a process for producing microarrays |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2010536009A true JP2010536009A (ja) | 2010-11-25 |
JP4866462B2 JP4866462B2 (ja) | 2012-02-01 |
Family
ID=38997441
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009522740A Expired - Fee Related JP4866462B2 (ja) | 2006-08-03 | 2007-08-03 | マイクロアレイシステム、およびマイクロアレイの製造方法 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US8927465B2 (ja) |
EP (1) | EP2054711B1 (ja) |
JP (1) | JP4866462B2 (ja) |
CN (1) | CN101529227B (ja) |
DK (1) | DK2054711T3 (ja) |
WO (1) | WO2008016335A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015523575A (ja) * | 2012-07-20 | 2015-08-13 | ナショナル ユニヴァーシティー オブ シンガポール | マイクロアレイ用結合エンコード法 |
Families Citing this family (29)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US11237171B2 (en) | 2006-02-21 | 2022-02-01 | Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
US8460879B2 (en) | 2006-02-21 | 2013-06-11 | The Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
US20180011120A9 (en) | 2006-08-03 | 2018-01-11 | AyoxxA Biosystems GmbH | Source controlled decodable microarray system and methods for use |
WO2009029073A1 (en) | 2007-08-30 | 2009-03-05 | The Trustees Of Tufts College | Methods for determining the concentration of an analyte in solution. |
GB0913258D0 (en) | 2009-07-29 | 2009-09-02 | Dynex Technologies Inc | Reagent dispenser |
US9523701B2 (en) | 2009-07-29 | 2016-12-20 | Dynex Technologies, Inc. | Sample plate systems and methods |
WO2011031895A2 (en) * | 2009-09-09 | 2011-03-17 | Life Technologies Corporation | Systems and methods for identifying microparticles |
US8236574B2 (en) | 2010-03-01 | 2012-08-07 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules or particles using beads or other capture objects |
WO2011109379A1 (en) | 2010-03-01 | 2011-09-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
US8415171B2 (en) | 2010-03-01 | 2013-04-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
NZ603547A (en) * | 2010-04-15 | 2015-01-30 | Digital Sensing Ltd | Microarrays |
KR101152642B1 (ko) * | 2010-10-28 | 2012-06-07 | 한국과학기술연구원 | 폴리머 기반의 미세유체 장치의 제조방법 |
US9952237B2 (en) | 2011-01-28 | 2018-04-24 | Quanterix Corporation | Systems, devices, and methods for ultra-sensitive detection of molecules or particles |
EP2492340B1 (en) * | 2011-02-07 | 2015-04-22 | Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives | Soft substrate for cell culture and process for preparing the same |
US8399262B2 (en) | 2011-03-23 | 2013-03-19 | Darrel A. Mazzari | Biosensor |
WO2012142301A2 (en) | 2011-04-12 | 2012-10-18 | Quanterix Corporation | Methods of determining a treatment protocol for and/or a prognosis of a patients recovery from a brain injury |
CN103217431A (zh) * | 2012-01-19 | 2013-07-24 | 昆山思拓机器有限公司 | 一种smt网板的图像检测方法 |
WO2014113502A1 (en) | 2013-01-15 | 2014-07-24 | Quanterix Corporation | Detection of dna or rna using single molecule arrays and other techniques |
US10470379B1 (en) * | 2014-06-12 | 2019-11-12 | Iowa State University Research Foundation, Inc. | High-throughput large-scale plant phenotyping instrumentation |
EP3165920B1 (de) | 2015-11-06 | 2019-07-03 | imusyn GmbH & Co. KG | Verfahren zur analyse von serum auf anti-erythrozytäre antikörper |
US10878562B2 (en) * | 2015-12-10 | 2020-12-29 | Qiagen GmgH | Method for determining the overall brightness of at least one object in a digital image |
WO2018059445A1 (zh) * | 2016-09-28 | 2018-04-05 | 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 | 基于编码芯片的微阵列、其制备方法及应用 |
GB201701686D0 (en) | 2017-02-01 | 2017-03-15 | Illunina Inc | System & method with fiducials having offset layouts |
US11896944B2 (en) * | 2017-02-01 | 2024-02-13 | Illumina, Inc. | System and method with fiducials responding to multiple excitation frequencies |
JP6959755B2 (ja) | 2017-04-14 | 2021-11-05 | シスメックス株式会社 | 蛍光画像分析装置、蛍光画像の分析方法及びコンピュータプログラム |
JP2020533612A (ja) | 2017-09-07 | 2020-11-19 | アデプトリックス コーポレーションAdeptrix Corp. | プロテオミクス用のマルチプレックスビーズアレイ |
JP7376245B2 (ja) | 2019-03-29 | 2023-11-08 | シスメックス株式会社 | 蛍光画像分析装置及び蛍光画像分析方法 |
EP4214678A2 (en) * | 2020-09-18 | 2023-07-26 | 10X Genomics, Inc. | Sample handling apparatus and image registration methods |
EP4325206A1 (en) | 2022-08-18 | 2024-02-21 | F. Hoffmann-La Roche AG | Method for compensating defective partitions of a microfluidic chip |
Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000047996A2 (en) * | 1999-02-09 | 2000-08-17 | Illumina, Inc. | Arrays comprising a fiducial and automated information processing in randomly ordered arrays |
WO2002012897A2 (en) * | 2000-08-09 | 2002-02-14 | Illumina, Inc. | Automated information processing in randomly ordered arrays |
JP2003315336A (ja) * | 2002-04-19 | 2003-11-06 | Hitachi Ltd | 微粒子アレー作製方法およびその装置 |
JP2004012460A (ja) * | 2002-06-11 | 2004-01-15 | Eastman Kodak Co | マイクロアレイ較正手段 |
JP2005147718A (ja) * | 2003-11-11 | 2005-06-09 | Tokyoto Igaku Kenkyu Kiko | マイクロビーズアレイ作製法 |
JP2008538609A (ja) * | 2005-04-20 | 2008-10-30 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | マルチプレックスマイクロ粒子システム |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5143854A (en) * | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
DE69132531T2 (de) | 1990-12-06 | 2001-09-13 | Affymetrix Inc | Verbindungen und ihre Verwendung in einer binären Synthesestrategie |
US5244636A (en) * | 1991-01-25 | 1993-09-14 | Trustees Of Tufts College | Imaging fiber optic array sensors, apparatus, and methods for concurrently detecting multiple analytes of interest in a fluid sample |
US5250264A (en) | 1991-01-25 | 1993-10-05 | Trustees Of Tufts College | Method of making imaging fiber optic sensors to concurrently detect multiple analytes of interest in a fluid sample |
US5556752A (en) | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US7041510B2 (en) * | 1996-04-25 | 2006-05-09 | Bioarray Solutions Ltd. | System and method for programmable illumination pattern generation |
US6327410B1 (en) | 1997-03-14 | 2001-12-04 | The Trustees Of Tufts College | Target analyte sensors utilizing Microspheres |
EP1003904B1 (en) | 1997-05-23 | 2007-07-11 | BioArray Solutions Ltd. | Color-encoding and in-situ interrogation of matrix-coupled chemical compounds |
EP2045334A1 (en) * | 1998-06-24 | 2009-04-08 | Illumina, Inc. | Decoding of array sensors with microspheres |
US7510841B2 (en) * | 1998-12-28 | 2009-03-31 | Illumina, Inc. | Methods of making and using composite arrays for the detection of a plurality of target analytes |
US6514768B1 (en) | 1999-01-29 | 2003-02-04 | Surmodics, Inc. | Replicable probe array |
US20020150909A1 (en) | 1999-02-09 | 2002-10-17 | Stuelpnagel John R. | Automated information processing in randomly ordered arrays |
JP2002541226A (ja) | 1999-04-09 | 2002-12-03 | グラクソ グループ リミテッド | 固相化学ライブラリーのためのコードスキーム |
US7057704B2 (en) * | 2000-09-17 | 2006-06-06 | Bioarray Solutions Ltd. | System and method for programmable illumination pattern generation |
AU2003215240A1 (en) * | 2002-02-14 | 2003-09-04 | Illumina, Inc. | Automated information processing in randomly ordered arrays |
US20040106114A1 (en) * | 2002-12-02 | 2004-06-03 | Eastman Kodak Company | Simplified detection process for colored bead random microarrays |
WO2004066210A1 (en) | 2003-01-22 | 2004-08-05 | Cyvera Corporation | Hybrid random bead/chip based microarray |
-
2007
- 2007-08-03 US US12/376,040 patent/US8927465B2/en active Active
- 2007-08-03 DK DK07794246.4T patent/DK2054711T3/da active
- 2007-08-03 JP JP2009522740A patent/JP4866462B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-08-03 EP EP07794246.4A patent/EP2054711B1/en active Active
- 2007-08-03 WO PCT/SG2007/000232 patent/WO2008016335A1/en active Application Filing
- 2007-08-03 CN CN2007800289823A patent/CN101529227B/zh active Active
-
2013
- 2013-10-21 US US14/059,164 patent/US9395360B2/en active Active
-
2016
- 2016-06-15 US US15/182,626 patent/US10927406B2/en active Active
Patent Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2000047996A2 (en) * | 1999-02-09 | 2000-08-17 | Illumina, Inc. | Arrays comprising a fiducial and automated information processing in randomly ordered arrays |
WO2002012897A2 (en) * | 2000-08-09 | 2002-02-14 | Illumina, Inc. | Automated information processing in randomly ordered arrays |
JP2003315336A (ja) * | 2002-04-19 | 2003-11-06 | Hitachi Ltd | 微粒子アレー作製方法およびその装置 |
JP2004012460A (ja) * | 2002-06-11 | 2004-01-15 | Eastman Kodak Co | マイクロアレイ較正手段 |
JP2005147718A (ja) * | 2003-11-11 | 2005-06-09 | Tokyoto Igaku Kenkyu Kiko | マイクロビーズアレイ作製法 |
JP2008538609A (ja) * | 2005-04-20 | 2008-10-30 | ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー | マルチプレックスマイクロ粒子システム |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2015523575A (ja) * | 2012-07-20 | 2015-08-13 | ナショナル ユニヴァーシティー オブ シンガポール | マイクロアレイ用結合エンコード法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2054711A1 (en) | 2009-05-06 |
US10927406B2 (en) | 2021-02-23 |
US20160291006A1 (en) | 2016-10-06 |
US20100075865A1 (en) | 2010-03-25 |
JP4866462B2 (ja) | 2012-02-01 |
EP2054711B1 (en) | 2020-11-25 |
CN101529227A (zh) | 2009-09-09 |
CN101529227B (zh) | 2011-05-25 |
WO2008016335A1 (en) | 2008-02-07 |
DK2054711T3 (da) | 2020-12-14 |
US8927465B2 (en) | 2015-01-06 |
EP2054711A4 (en) | 2013-05-01 |
US9395360B2 (en) | 2016-07-19 |
US20140045721A1 (en) | 2014-02-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4866462B2 (ja) | マイクロアレイシステム、およびマイクロアレイの製造方法 | |
US6653151B2 (en) | Dry deposition of materials for microarrays using matrix displacement | |
US6713309B1 (en) | Microarrays and their manufacture | |
Cass et al. | Immobilized biomolecules in analysis: a practical approach | |
US7122384B2 (en) | Resonant light scattering microparticle methods | |
US7179638B2 (en) | Microarrays and their manufacture by slicing | |
EP2839030B1 (en) | Combinatoric encoding methods for microarrays | |
US20110086771A1 (en) | Biochip | |
US20050019944A1 (en) | Colorable microspheres for DNA and protein microarray | |
JP2005524059A (ja) | 多機能マイクロアレイおよび方法 | |
WO2015158911A1 (en) | Encoded device and method for encoding and decoding reference areas on a substrate | |
US7736888B2 (en) | Stage and platform for building a biochip and biochip | |
US20040009584A1 (en) | Method for manufacturing microarrays based on the immobilization of porous substrates on thermally modifiable surfaces | |
Mandal et al. | Cytophobic surface modification of microfluidic arrays for in situ parallel peptide synthesis and cell adhesion assays | |
WO2002010761A1 (en) | Microarrays and their manufacture by slicing | |
EP1258730A1 (en) | Method for detecting substance | |
US20040115722A1 (en) | Biopolymeric arrays and methods of producing the same | |
Preininger | DNA and protein sensor arrays | |
JPH10510994A (ja) | オリゴヌクレオチドを固形支持物質に固定する方法および支持体に結合したオリゴヌクレオチドを用いる方法 | |
Anderson | Microarrays and their manufacture by slicing | |
Saaem et al. | Arrayed Nanohydrogels for Protein Array Technology |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20111013 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20111018 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20111111 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20141118 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 4866462 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |