JP2010507371A - 病原体を同定するためのアッセイ及び装置 - Google Patents

Abstract

病原体から単離されるリボソームからのタンパク質翻訳に基づく、病原体を同定するための方法及び装置を提供する。

Description

代謝産物、核酸及びそのタンパク質を含む、対象に感染した細菌の検出は、医学的障害の診断及び治療ならびに研究における基本要素である。現在、多くの方法が検出のために使用されている。
これらの方法は、通常、タンパク質に対する抗体に基づく診断アッセイ（細菌の成分又は疾患の副産物の何れか）及び細菌の成分をコードする遺伝物質などの核酸に対する診断アッセイに分けることができる。

核酸検出に対する既存の方法には、反応条件が複雑であるため、信頼性を得るために高い技術的能力が必要とされ（例えば、ＰＣＲには熱サイクリングが必要である。）、混入に対する感受性が非常に高くなる可能性があり（結果として偽陽性となる。）；これらは、定性的ではなく定量的に使用することは困難であり、従って、これらの感度は低下する。さらに、これらは、完了するのに時間を要することが多い。タンパク質検出のための方法は、一般に、シグナル生成及び増幅を上昇させるために、（通常はさらなるアッセイ成分に対する）酵素の結合に依存する。これらのさらなるリガンドの使用によって、その系のノイズが増加し、バックグラウンドが高くなり、偽陽性が増え、いくつかのレベルの対照反応の必要性が高まる。

例えば、診断又は治療目的に対して、病原体を同定するために病原体からのリボソームを用いる方法を提供する。リボソームは、特定の病原体に特異的であり、従って、病原体のリボソームに対して特異的な結合剤を用いて単離されたリボソームとともに核酸鋳型を用いてポリペプチドを産生することができるか否かを調べることに基づき、試料中の病原体の同定又は有無を調べ得る。本方法は、複雑な反応条件を回避して、１つの温度で行われ得る。さらに、リボソームによる鋳型の増幅は迅速であり、１０秒毎に少なくとも約２０，０００の標的分子が産生され、非常に感度が高い。さらにまた、増幅反応そのものは一般的であり、検出しようとする病原体に基づき、試験ごとに異なるリボソームを固定化するために使用するのは核酸鋳型及び結合剤のみである。このようにして、試験キットの製造及び本方法の実施のための装置が劇的に簡素化され得る。

本方法は、本方法の実施に適切なあらゆる試験方式又は装置に組み込まれ得る。また、本方法の実施のための、キット、試薬なども提供される。

本方法のさらなる目的及び長所は、説明が進むに従い明らかとなろう。本発明の範囲を完全に理解するために、本発明の様々な態様を組み合わせて、本発明の所望の実施形態を得ることができることが認められよう。

発明の詳細な説明
上記で別段の定義がない限り、本明細書中で使用される全ての技術及び科学用語は、本発明が属する技術分野の通常の技術者により一般に理解されるものと同じ意味を有する。用語が単数で与えられる場合、発明者らはまた、その用語の複数も意図する。本明細書中で使用される命名法及び下記に記載の手段は、当技術分野において周知であり一般的に使用されるものである。

「アミノ酸」という用語は、天然であれ合成であれ、全ての分子を包含するものとし、これらは、アミノ官能基及び酸性官能基の両方を含み、天然アミノ酸のポリマー中に含まれ得る。代表的なアミノ酸は、天然アミノ酸；その類似体、誘導体及びコンジナー；種々の側鎖を有するアミノ酸類似体；及び前記の何れかの全ての立体異性体を含む。天然アミノ酸の名称は、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢの推奨に従い、本明細書中で略記する。

「抗体」という用語は、免疫グロブリン、特異的結合能を維持するその誘導体及び免疫グロブリン結合ドメインと相同であるか又は相同性が高い結合ドメインを有するタンパク質を指す。これらのタンパク質は、天然のソース由来又は部分的もしくは全体的に合成産生されたものであり得る。抗体は、モノクローナル又はポリクローナルであり得る。抗体は、ヒトクラス：ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ及びＩｇＥの何れかを含む、あらゆる免疫グロブリンクラスのメンバーであり得る。代表的な実施形態において、本明細書中に記載の方法及び組成物とともに使用される抗体は、ＩｇＧクラスの誘導体である。

「抗体断片」という用語は、全長より短い抗体の何らかの誘導体を指す。代表的な実施形態において、抗体断片は、少なくとも全長抗体の特異的結合能のかなりの部分を保持する。抗体断片の例には、以下に限定されないが、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、ｓｃＦｖ、Ｆｖ、ｄｓＦｖダイアボディ及びＦｄ断片が含まれる。抗体断片は、何らかの手段で作製され得る。例えば、抗体断片は、完全な抗体の断片化によって、酵素的又は化学的に作製され得るか、部分的抗体配列をコードする遺伝子から組み換えにより作製され得るか、又はこれは、完全又は部分的に合成によって作製され得る。抗体断片は、場合によっては、１本鎖抗体断片であり得る。あるいは、この断片は、例えばジスルフィド結合により１つに連結される複数の鎖を含み得る。この断片はまた、場合によっては、複数分子の複合体でもあり得る。機能的抗体断片は、通常、少なくとも約５０アミノ酸を含み、より典型的には、少なくとも約２００アミノ酸を含む。

「含む（Ｃｃｏｍｐｒｉｓｅ及びｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、包含的で、オープンセンスで、さらなる要素が含まれ得る意味において、使用される。

「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語は、本明細書中で、「含むが限定されない」という意味で使用される。「含む」及び「含むが限定されない」は、交換可能に使用される。

「ｍＲＮＡ」という用語は、メッセンジャーＲＮＡ又は、細胞におけるタンパク質合成に対する鋳型となるＲＮＡを指す。ｍＲＮＡの鎖の配列は、合成されるべきタンパク質をコードする配列を含むＤＮＡの相補的鎖の配列に基づく。

「核酸」は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）及び、場合によってはリボ核酸（ＲＮＡ）などのポリヌクレオチドを指す。この用語は、また、同等物として、ヌクレオチド類似体から作製された、ＲＮＡ又はＤＮＡの何れかの類似体、及び、記載される実施形態に適用可能な場合は、１本鎖（センス又はアンチセンス）及び２本鎖ポリヌクレオチドも含むものと理解されたい。ＥＳＴ、染色体、ｃＤＮＡ、ｍＲＮＡs及びｒＲＮＡは、核酸と呼ばれ得る分子の代表例である。

「病原体」という用語は、細菌、菌類、寄生生物、ウイルスなど、対象において疾患を引き起こし得る何らかの生物を指す。

「タンパク質（１本鎖の場合）」、「ポリペプチド」及び「ペプチド」は、遺伝子産物を指す場合（例えば、コード配列によりコードされ得る場合）、本明細書中で交換可能に使用される。本明細書中で「ポリペプチド」を指す場合、当業者にとって当然のことながら、文脈において別段の指定が明確にない限り、代わりにタンパク質を使用することができる。「タンパク質」はまた、１以上のポリペプチドの会合も指し得る。

「試料」という用語は、リボソームを含有する病原体を含有する可能性がある何らかの試料を指す。

「リボソームＲＮＡ」又は「ｒＲＮＡ」という用語は、リボソームサブユニットのＲＮＡ成分を指す。リボソーム及びそれらのサブユニットを下記でさらに説明する。

ある態様において、
（ａ）リボソームを結合させるとができる結合剤を含む支持体を、リボソームを含む試料と接触させること；
（ｂ）試料との接触後に支持体を洗浄すること；
（ｃ）溶液中でｍＲＮＡをポリペプチドに翻訳するために、リボソームを結合剤に結合させられるようにするのに適切な条件下で、ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液の存在下で支持体を温置すること；
（ｄ）ポリペプチドの存在を調べること、
を含む方法が提供される。

ある種の実施形態において、リボソームは病原体に特異的であり、本方法は、ポリペプチドの存在に基づき試料中の病原体の存在を調べることをさらに含む。

別の態様において、
（ａ）リボソームを結合させることができる結合剤を使用して支持体上でリボソームを捕捉すること；
（ｂ）ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液とともに捕捉されたリボソームを温置すること；
（ｃ）温置され、捕捉されたリボソームにより産生されるポリペプチドを検出すること、を含む方法が提供される。

リボソームは、原核及び真核生物の両方に存在するリボヌクレオタンパク質である。これらは、約３分の２のＲＮＡ及び３分の１のタンパク質を含む。リボソームは、タンパク質合成に関与する細胞器官である。遺伝子発現中、リボソームは、メッセンジャーＲＮＡ中にコードされる遺伝情報をタンパク質に翻訳する（Ｇａｒｒｅｔｔら（２０００）「Ｔｈｅ ｒｉｂｏｓｏｍｅ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，Ｆｕｎｃｔｉｏｎ，Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｓ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ」、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ、Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ、Ｄ．Ｃ．）。

リボソームは、２つの同等ではないリボヌクレオタンパク質サブユニットを含む。大きいサブユニット（「リボソーム大サブユニット」としても知られる。）は、小さいサブユニット（「リボソーム小サブユニット」としても知られる。）の約２倍の大きさである。リボソーム小サブユニットは、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）に結合し、ｍＲＮＡと転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）アンチコドン間の相互作用（翻訳の忠実度はこれに依存する。）に介在する。リボソーム大サブユニットは、ペプチド結合形成を触媒し（−タンパク質合成のペプチジルトランスフェラーゼ反応）、（少なくとも）２つの異なるｔＲＮＡ結合部位：入ってくるアミノアシル−ｔＲＮＡを受け入れるＡ−部位（これは、伸長するペプチド鎖にそのアミノ酸を導こうとすることである。）及びペプチジル−ｔＲＮＡ複合体（即ち、これまでのところペプチド鎖に付加されてきた全てのアミノ酸に連結したｔＲＮＡ）を受け入れるＰ−部位を含む。リボソーム大サブユニットはまた、タンパク質合成の開始、伸長及び停止期に関与するＧ−タンパク質因子に対する１以上の結合部位も含む。リボソーム大及び小サブユニットは、タンパク質合成の開始期には独立して振舞うが、これらは、伸長が開始される頃には完全なリボソームの構造になる。

従って、本明細書中で使用される場合、「リボソーム」という用語は、リボソーム大サブユニット及びリボソーム小サブユニットを含む複合体を指す。リボソーム大サブユニット及びリボソーム小サブユニットは、細菌においてはそれぞれ５０Ｓ及び３０Ｓサブユニットであり、真核生物においてはそれぞれ６０Ｓ及び４０Ｓサブユニットである。

リボソームを含む試料の調製を説明するプロトコールは文献において入手可能であり、当業者により必要とされる場合、適合させることができる。例えば、基本的にＹｏｕｍａｎｓ及びＹｏｕｍａｎｓ、１９６５により記載のように、細菌からのリボソームの調製を行うことができ、Ｇｒｅｇｏｒｙら、１９８３により記載のように適合させることができる。一般に、しかし、特に毒性微生物（病原性）を使用する場合、例えば、Ｍｉｃｈａｌｅｋ及びＭｃＧｈｅｅ、１９７７により記載されるようにホルマリンでの処理によって、さらなる使用の前に細胞を死滅させ、１０^８細菌又は菌類細胞／ｍＬ又は１０^７個原生動物／ｍＬに濃度を調整することが推奨される。ヒツジ血液及びミティス・サリバリウス（Ｍｉｔｉｓ Ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）寒天（ＤＩＦＣＯ）又はその他の適合富栄養培地上での接種時に複製が起こらない場合、この調製物が滅菌状態であり得ることが証明される。−８０℃でアリコートを保存する。次に、これらを３７℃で急速に凍結融解し、３μｇ／ｍＬ Ｄｎａｓｅ（ＳＩＧＭＡ）が添加されたＰＭＢ １ｍＬ中の微小ガラスビーズ１ｇ（０．１７−０．１８ｍｍ）とともに全細胞の１ｇを再懸濁する。２分間のサイクルを３回、Ｂｒａｕｎホモジェナイザー中で振ることにより細胞を破壊する。２回遠心（２７．０００．ｔｉｍｅ．ｇの後、４７.０００．ｔｉｍｅ．ｇ；各１０分間）を行うことにより、無傷の細胞及び細胞の破片を除去する。

菌類及び原生動物からのリボソームの調製は、基本的に、同じ手順に従うが、培養条件及び溶解法の改変が必要である。培養可能な病原性微生物の培養条件が公開文献で広く入手可能である場合、このような微生物からのリボソーム調製は、当業者にとって十分に可能である。

リボソームサブユニットが完全な状態であることは重要である。特に、ＭｇＣｌ_２によって与えられるものなどの二価陽イオンにより囲まれた大きなリボソームＲＮＡの安定化に対して、微生物及び使用される抽出プロトコールによって濃度を調整することが必要であり得る。１８０．０００から２５０．０００．ｔｉｍｅ．ｇで２から３時間の遠心によって、上清中のリボソームを回収し、次いで各２から３時間、１８０．０００から２５０．０００．ｔｉｍｅ．ｇでＰＭＢ中で５回連続洗浄を行うことができる。次に、リボソーム調製物を４７．０００ｔｉｍｅ．ｇで２０分間、２回遠心することによって２回透明化し、滅菌０．４５ミクロンＭｉｌｌｉｐｏｒｅフィルター（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ Ｆｉｌｔｅｒ Ｃｏｒｐ．）を通じて上清をろ過する。Ｍ．Ｍ．Ｙｕｓｕｐｏｖ及びＡ．Ｓ．Ｓｐｉｒｉｎ、１９８８に記載のように改変してＳｔａｅｈｉｌｉｎら、１９６９の方法に従い、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）ＭＲＥ６００などのグラム陰性のＲｎａｓｅマイナス突然変異細菌から非解離（＝無傷）リボソームを調製することができる。次に、例えば標準物質としてウシ血清アルブミンを用いて、標準的タンパク質定量法によるタンパク質含量に基づき、例えば２０ｍｇ／ｍＬに調製物を調整し、使用まで−８０℃で維持することができる。リボソームタンパク質及び潜在的な混入タンパク質の有無を評価することを可能にするＤＮＡポリアクリルアミドゲル電気泳動によってリボソームＲＮＡの混入を調べるために、２３５、２８０及び２６０ｎｍでのスペクトル分析により、リボソーム分画の特徴及び純度を調べることができる。ＭｇＣｌ_２の適切な濃度を含有する１０％から４０％のショ糖勾配に元のホモジェネートの試料を添加すること及び遠心によって、無傷の程度を評価することができる。ショ糖勾配の溶出プロファイルは、様々な分画を示す：１００Ｓ＝７０Ｓリボソームの二量体、７０Ｓ＝無傷のリボソーム、６０Ｓ＝相互作用する５０Ｓ及び３０Ｓリボソームサブユニット、５０Ｓ＝リボソーム大サブユニット、３０Ｓ＝リボソーム小サブユニット、３０Ｓ未満の物質＝分解産物及び夾雑物。非解離リボソームを標的とする良好な調製において、７０Ｓピークは、全ての物質の８０％を超えるものを含有する。場合によっては、標的の非解離リボソームを含有する７０Ｓピークは、全物質の少なくとも５０％、６０％、７０％又は９０％を構成し得る。

上記方法を用いて検出し得る病原体には、リボソームを含むあらゆる生物が含まれる。リボソームが単離され得る生物には、以下に限定されないが、次のものが含まれる：
アシネトバクター・カルコアセティカス（Ａｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃａｌｃｏａｃｅｔｉｃｕｓ）、Ａ．ヘモリチクス（Ａ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、エアロモナス・ヒドロフィリア（Ａｅｒｏｍｏｎａｓ ｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉａ）、バクテロイド・フラジリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ）、Ｂ．ディスタスノシス（Ｂ．ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、バクテロイド（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）３４５２Ａホモロジー群、Ｂ．ブルガツス（Ｂ．ｖｕｌｇａｔｕｓ）、Ｂ．オバルス（Ｂ．ｏｖａｌｕｓ）、Ｂ．テタイオタオミクロン（Ｂ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、Ｂ．ユニホルミス（Ｂ．ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、Ｂ．エガーシイ（Ｂ．ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ）、Ｂ．スプランキニクス（Ｂ．ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、ブラナメラ・カタラリス（Ｂｒａｎｈａｍｅｌｌａ ｃａｔａｒｒｈａｌｉｓ）、カンピロバクターフェトゥス（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒｆｅｔｕｓ）、Ｃ．ジェジュニ（Ｃ．ｊｅｊｕｎｉ）、Ｃ．コリ（Ｃ．ｃｏｌｉ）、シトロバクター・フロインデイ（Ｃｉｔｒｏｂａｃｔｅｒｆｒｅｕｎｄｉｉ）、クロストリジウム・ディフィシル（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ）、Ｃ．ジフテリエ（Ｃ．ｄｉｐｈｔｈｅｒｉａｅ）、Ｃ．ウルセランス（Ｃ．ｕｌｃｅｒａｎｓ）、Ｃ．アコレンス（Ｃ．ａｃｃｏｌｅｎｓ）、Ｃ．アフェルメンタンス（Ｃ．ａｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｃ．アミコラトゥム（Ｃ．ａｍｙｃｏｌａｔｕｍ）、Ｃ．アルゲントレンス（Ｃ．ａｒｇｅｎｔｏｒｅｎｓｅ）、Ｃ．アウリス（Ｃ．ａｕｒｉｓ）、Ｃ．ボビス（Ｃ．ｂｏｖｉｓ）、Ｃ．コンフスム（Ｃ．ｃｏｎｆｕｓｕｍ）、Ｃ．コイレア（Ｃ．ｃｏｙｌｅａｅ）、Ｃ．ドゥルム（Ｃ．ｄｕｒｕｍ）、Ｃ．ファルセニ（Ｃ．ｆａｌｓｅｎｉｉ）、Ｃ．グルクロノリチクム（Ｃ．ｇｌｕｃｕｒｏｎｏｌｙｔｉｃｕｍ）、Ｃ．イミタンス（Ｃ．ｉｍｉｔａｎｓ）、Ｃ．ジェイケイウム（Ｃ．ｊｅｉｋｅｉｕｍ）、Ｃ．クツシェリ（Ｃ．ｋｕｔｓｃｈｅｒｉ）、Ｃ．クロッペンステッティイ（Ｃ．ｋｒｏｐｐｅｎｓｔｅｄｔｉｉ）、Ｃ．リポフィルム（Ｃ．ｌｉｐｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｃ．マクギンレイ（Ｃ．ｍａｃｇｉｎｌｅｙｉ）、Ｃ．マトルコティ（Ｃ．ｍａｔｒｕｃｈｏｔｉ）、Ｃ．ムシファシエンス（Ｃ．ｍｕｃｉｆａｃｉｅｎｓ）、Ｃ．ピロスム（Ｃ．ｐｉｌｏｓｕｍ）、Ｃ．プロピンクーム（Ｃ．ｐｒｏｐｉｎｑｕｕｍ）、Ｃ．レナーレ（Ｃ．ｒｅｎａｌｅ）、Ｃ．リエゲリ（Ｃ．ｒｉｅｇｅｌｉｉ）、Ｃ．サンギニス（Ｃ．ｓａｎｇｕｉｎｉｓ）、Ｃ．シングラレ（Ｃ．ｓｉｎｇｕｌａｒｅ）、Ｃ．ストリアトゥム（Ｃ．ｓｔｒｉａｔｕｍ）、Ｃ．スンズバレンス（Ｃ．ｓｕｎｄｓｖａｌｌｅｎｓｅ）、Ｃ．トムセニ（Ｃ．ｔｈｏｍｓｓｅｎｉｉ）、Ｃ．ウレアリティクム（Ｃ．ｕｒｅａｌｙｔｉｃｕｍ）、Ｃ．キセロシス（Ｃ．ｘｅｒｏｓｉｓ）、エンテロバクター・クロアカエ（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｃｌｏａｃａｅ）、Ｅ．エアロゲネス（Ｅ．ａｅｒｏｇｅｎｅｓ）、エンテロコッカス・アビウム（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ ａｖｉｕｍ）、Ｅ．カッセリフラブス（Ｅ．ｃａｓｓｅｌｉｆｌａｖｕｓ）、Ｅ．セコルム（Ｅ．ｃｅｃｏｒｕｍ）、Ｅ．ディスパー（Ｅ．ｄｉｓｐａｒ）、Ｅ．ドゥランス（Ｅ．ｄｕｒａｎｓ）、Ｅ．フェカリス（Ｅ．ｆａｅｃａｌｉｓ）、Ｅ．フェシウム（Ｅ．ｆａｅｃｉｕｍ）、Ｅ．フラベセンス（Ｅ．ｆｌａｖｅｓｃｅｎｓ）、Ｅ．ガリナルム（Ｅ．ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、Ｅ．ヒラエ（Ｅ．ｈｉｒａｅ）、Ｅ．マロドラトゥス（Ｅ．ｍａｌｏｄｏｒａｔｕｓ）、Ｅ．マンティ（Ｅ．ｍｕｎｄｔｉｉ）、Ｅ．シュードアビウム（Ｅ．ｐｓｅｕｄｏａｖｉｕｍ）、Ｅ．ラフィノサス（Ｅ．ｒａｆｆｉｎｏｓｕｓ）、Ｅ．ソリタリウス（Ｅ．ｓｏｌｉｔａｒｉｕｓ）、フランシセラ・トゥラレンシス（Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ ｔｕｌａｒｅｎｓｉｓ）、ガルドネレラ・バギナリス（Ｇａｒｄｎｅｒｅｌｌａ ｖａｇｉｎａｌｉｓ）、ヘリコバクター・ピロリ（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ ｐｙｌｏｒｉ）、キンゲラ・デントリフィカンス（Ｋｉｎｇｅｌｌａ ｄｅｎｔｒｉｆｉｃａｎｓ）、Ｋ．キンガエ（Ｋ．ｋｉｎｇａｅ）、Ｋ．オラリス（Ｋ．ｏｒａｌｉｓ）、クレブシエラ・ニューモニア（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｋ．オキシトカ（Ｋ．ｏｘｙｔｏｃａ）、モラクセラ・カタラリス（Ｍｏｒａｘｅｌｌａ ｃａｔａｒｒｈａｌｉｓ）、Ｍ．アトランタエ（Ｍ．ａｔｌａｎｔａｅ）、Ｍ．ラクナタ（Ｍ．ｌａｃｕｎａｔａ）、Ｍ．ノンリケファシエンス（Ｍ．ｎｏｎｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ）、Ｍ．オスロエンシス（Ｍ．ｏｓｌｏｅｎｓｉｓ）、Ｍ．フェニルピルビカ（Ｍ．ｐｈｅｎｙｌｐｙｒｕｖｉｃａ）、モルガネラ・モルガニイ（Ｍｏｒｇａｎｅｌａ ｍｏｒｇａｎｉｉ）、パラクラミジアアミジア・アカントアメーバ（Ｐａｒａｃｈｌａｍｙｄｉａ ａｃａｎｔｈａｍｏｅｂａｅ）、パスツレラ・ムルトシダ（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａ ｍｕｌｔｏｃｉｄａ）、Ｐ．ヘモリチカ（Ｐ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃａ）、プロテウス・ミラビリス（Ｐｒｏｔｅｕｓ ｍｉｒａｂｉｌｉｓ）、プロテウス・ブルガリス（Ｐｒｏｔｅｕｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ）、プロビデンシア・アルカリファシエンス（Ｐｒｏｖｉｄｅｎｃｉａ ａｌｃａｌｉｆａｃｉｅｎｓ）、Ｐ．レトゲリ（Ｐ．ｒｅｔｔｇｅｒｉ）、Ｐ．ストゥアルティ（Ｐ．ｓｔｕａｒｔｉｉ）、セラチア・マルセセンス（Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ）、シムカニア・ネゲベンシス（Ｓｉｍｋａｎｉａ ｎｅｇｅｖｅｎｓｉｓ）、ストレプトコッカス・ニューモニア（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｓ．アガラクチエ（Ｓ．ａｇａｌａｃｔｉａｅ）、Ｓ．ピロゲネス（Ｓ．ｐｙｒｏｇｅｎｅｓ）、トレポネマ・パリドゥム（Ｔｒｅｐｏｎｅｍａ ｐａｌｌｉｄｕｍ）、ビブリオ・コレラ（Ｖｉｂｒｉｏ ｃｈｏｌｅｒａｅ）及びＶ．パラヘモリチクス（Ｖ．ｐａｒａｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）などの細菌由来のリボソーム。

ボルデテラ・ペルトゥシス（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．パラペルトゥシス（Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ブロンキセプチカ（Ｂ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａ）、ブルコルデリア・セパシア（Ｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ ｃｅｐａｃｉａ）、エスケリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）、ヘモフィルス・アクチノミセトコミタンス（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ｈ．エギプチクス（Ｈ．ａｅｇｙｐｔｉｕｓ）、Ｈ．アフロフィルス（Ｈ．ａｐｈｒｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｈ．ドゥクレイ（Ｈ．ｄｕｃｒｅｙｉ）、Ｈ．フェリス（Ｈ．ｆｅｌｉｓ）、Ｈ．ヘモグロビノフィルス（Ｈ．ｈａｅｍｏｇｌｏｂｉｎｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｈ．ヘモリチクス（Ｈ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｈ．インフルエンザ（Ｈ．ｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ）、Ｈ．パラガリナルム（Ｈ．ｐａｒａｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、Ｈ．パラヘモリチクス（Ｈ．ｐａｒａｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｈ．パラインフルエンザ（Ｈ．ｐａｒａｉｎｆｌｕｅｎｚａｅ）、Ｈ．パラフロヘモリチクス（Ｈ．ｐａｒａｐｈｒｏｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｈ．パラフロフィルス（Ｈ．ｐａｒａｐｈｒｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｈ．パラスイス（Ｈ．ｐａｒａｓｕｉｓ）、Ｈ．ピシウム（Ｈ．ｐｉｓｃｉｕｍ）、Ｈ．セグニス（Ｈ．ｓｅｇｎｉｓ）、Ｈ．ソムヌス（Ｈ．ｓｏｍｎｕｓ）、Ｈ．バギナリス（Ｈ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ）、レジオネラ・アデライデンシス（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ ａｄｅｌａｉｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．アニサ（Ｌ．ａｎｉｓａ）、Ｌ．ベリアルデンシス（Ｌ．ｂｅｌｉａｒｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ビルミンガメンシス（Ｌ．ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ボゼマニイ（Ｌ．ｂｏｚｅｍａｎｉｉ）、Ｌ．ブルネンシス（Ｌ．ｂｒｕｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ケリイ（Ｌ．ｃｈｅｒｒｉｉ）、Ｌ．シンシナチエンシス（Ｌ．ｃｉｎｃｉｎｎａｔｉｅｎｓｉｓ）、レジオネラ・ドロザンスキイ（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ ｄｒｏｚａｎｓｋｉｉ）、Ｌ．ドゥモフリ（Ｌ．ｄｕｍｏｆｆｌｉ）、Ｌ．エリスラ（Ｌ．ｅｒｙｔｈｒａ）、Ｌ．ファイルフィエルデンシス（Ｌ．ｆａｉｒｆｉｅｌｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ファロニイ（Ｌ．ｆａｌｌｏｎｉｉ）、Ｌ．フェエレイ（Ｌ．ｆｅｅｌｅｉｉ）、Ｌ．ゲエスチアナ（Ｌ．ｇｅｅｓｔｉａｎａ）、Ｌ．ゴルマニイ（Ｌ．ｇｏｒｍａｎｉｉ）、Ｌ．グラチアナ（Ｌ．ｇｒａｔｉａｎａ）、Ｌ．グレシレンシス（Ｌ．ｇｒｅｓｉｌｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ハッケリエ（Ｌ．ｈａｃｋｅｌｉａｅ）、Ｌ．イスラレンシス（Ｌ．ｉｓｒａｅｌｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ジョルダニス（Ｌ．ｊｏｒｄａｎｉｓ）、Ｌ．ランシンゲンシス（Ｌ．ｌａｎｓｉｎｇｅｎｓｉｓ）、レジオネラ・ロンディニエンシス（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ ｌｏｎｄｉｎｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ロングビーカエ（Ｌ．ｌｏｎｇｂｅａｃｈａｅ）、レジオネラ・リチカ（Ｌｅｇｉｏｎｅｌｌａ ｌｙｔｉｃａ）、Ｌ．マセケルニイ（Ｌ．ｍａｃｅａｃｈｅｒｎｉｉ）、Ｌ．ミクダデイ（Ｌ．ｍｉｃｄａｄｅｉ）、Ｌ．モラビカ（Ｌ．ｍｏｒａｖｉｃａ）、Ｌ．ナウタルム（Ｌ．ｎａｕｔａｒｕｍ）、Ｌ．オアクリドゲンシス（Ｌ．ｏａｋｒｉｄｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．パリシエンシス（Ｌ．ｐａｒｉｓｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ピッツブルゲンシス（Ｌ．ｐｉｔｔｓｂｕｒｇｈｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ニューモフィラ（Ｌ．ｐｎｅｕｍｏｐｈｉｌａ）、Ｌ．クアテイレンシス（Ｌ．ｑｕａｔｅｉｒｅｎｓｉｓ）、Ｌ．キンリバニイ（Ｌ．ｑｕｉｎｌｉｖａｎｉｉ）、Ｌ．ロウボサミイ（Ｌ．ｒｏｗｂｏｔｈａｍｉｉ）、Ｌ．ルブリルセンス（Ｌ．ｒｕｂｒｉｌｕｃｅｎｓ）、Ｌ．セインセレンシ（Ｌ．ｓａｉｎｔｈｅｌｅｎｓｉ）、Ｌ．サンチクルシス（Ｌ．ｓａｎｔｉｃｒｕｃｉｓ）、Ｌ．シャケスペレイ（Ｌ．ｓｈａｋｅｓｐｅａｒｅｉ）、Ｌ．スピリテンシス（Ｌ．ｓｐｉｒｉｔｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ステイガワルチ（Ｌ．ｓｔｅｉｇｅｒｗａｌｔｉｉ）、Ｌ．タウリネンシス（Ｌ．ｔａｕｒｉｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．タクソネンシス（Ｌ．ｔｕｃｓｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ワズワーチ（Ｌ．ｗａｄｓｗｏｒｔｈｉｉ）、Ｌ．ワルテルシ（Ｌ．ｗａｌｔｅｒｓｉｉ）、Ｌ．ウォルスレイエンシス（Ｌ．ｗｏｒｓｌｅｉｅｎｓｉｓ）、リステリア・デントリフィカンス（Ｌｉｓｔｅｒｉａ ｄｅｎｔｒｉｆｉｃａｎｓ）、Ｌ．グライ（Ｌ．ｇｒａｙｉ）、Ｌ．イノキュア（Ｌ．ｉｎｎｏｃｕａ）、Ｌ．イバノビ（Ｌ．ｉｖａｎｏｖｉｉ）、Ｌ．モノシトゲネス（Ｌ．ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、Ｌ．シーリンゲリ（Ｌ．ｓｅｅｌｉｇｅｒｉ）、Ｌ．ウェルシメリ（Ｌ．ｗｅｌｓｈｉｍｅｒｉ）、ミコバクテリウム・アブセサス（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｂｓｃｅｓｓｕｓ）、Ｍ．アフリカヌム（Ｍ．ａｆｒｉｃａｎｕｍ）、Ｍ．アグリ（Ｍ．ａｇｒｉ）、Ｍ．アイチエンス（Ｍ．ａｉｃｈｉｅｎｓｅ）、Ｍ．アルベイ（Ｍ．ａｌｖｅｉ）、Ｍ．アジアティクム（Ｍ．ａｓｉａｔｉｃｕｍ）、Ｍ．アウルム（Ｍ．ａｕｒｕｍ）、Ｍ．アウストロアフリカヌム（Ｍ．ａｕｓｔｒｏａｆｒｉｃａｎｕｍ）、Ｍ．アビウム（Ｍ．ａｖｉｕｍ）、Ｍ．ボヘミクム（Ｍ．ｂｏｈｅｍｉｃｕｍ）、Ｍ．ボビス（Ｍ．ｂｏｖｉｓ）、Ｍ．ブランデリ（Ｍ．ｂｒａｎｄｅｒｉ）、Ｍ．ブルメ（Ｍ．ｂｒｕｍａｅ）、Ｍ．セラトゥム（Ｍ．ｃｅｌａｔｕｍ）、Ｍ．ケロナエ（Ｍ．ｃｈｅｌｏｎａｅ）、Ｍ．チタエ（Ｍ．ｃｈｉｔａｅ）、Ｍ．クロロフェノリクム（Ｍ．ｃｈｌｏｒｏｐｈｅｎｏｌｉｃｕｍ）、Ｍ．チュブエンス（Ｍ．ｃｈｕｂｕｅｎｓｅ）、Ｍ．コンフルエンチス（Ｍ．ｃｏｎｆｌｕｅｎｔｉｓ）、Ｍ．コンスピクム（Ｍ．ｃｏｎｓｐｉｃｕｕｍ）、Ｍ．コッキイ（Ｍ．ｃｏｏｋｉｉ）、Ｍ．ディエルノフェリ（Ｍ．ｄｉｅｒｎｈｏｆｅｒｉ）、Ｍ．ドリクム（Ｍ．ｄｏｒｉｃｕｍ）、Ｍ．ドゥバリイ（Ｍ．ｄｕｖａｌｉｉ）、Ｍ．エレファンチス（Ｍ．ｅｌｅｐｈａｎｔｉｓ）、Ｍ．ファラックス（Ｍ．ｆａｌｌａｘ）、Ｍ．ファルシノゲネス（Ｍ．ｆａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓ）、Ｍ．フラベセンス（Ｍ．ｆｌａｖｅｓｃｅｎｓ）、Ｍ．ホルトゥイトゥム（Ｍ．ｆｏｒｔｕｉｔｕｍ）、Ｍ．フレデリクスベルゲンス（Ｍ．ｆｒｅｄｅｒｉｋｓｂｅｒｇｅｎｓｅ）、Ｍ．ガディウム（Ｍ．ｇａｄｉｕｍ）、Ｍ．ガストリ（Ｍ．ｇａｓｔｒｉ）、Ｍ．ゲナベンス（Ｍ．ｇｅｎａｖｅｎｓｅ）、Ｍ．ギルブム（Ｍ．ｇｉｌｖｕｍ）、Ｍ．グッディイ（Ｍ．ｇｏｏｄｉｉ）、Ｍ．ゴルドネ（Ｍ．ｇｏｒｄｏｎａｅ）、Ｍ．ヘモフィルム（Ｍ．ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｍ．ハッシアクム（Ｍ．ｈａｓｓｉａｃｕｍ）、Ｍ．ヘッケスホルネンス（Ｍ．ｈｅｃｋｅｓｈｏｒｎｅｎｓｅ）、Ｍ．ハイデルベルゲンス（Ｍ．ｈｅｉｄｅｌｂｅｒｇｅｎｓｅ）、Ｍ．ヒベルニエ（Ｍ．ｈｉｂｅｒｎｉａｅ）、Ｍ．イムノゲヌム（Ｍ．ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｕｍ）、Ｍ．イントラセルラレ（Ｍ．ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒｅ）、Ｍ．インテルゲクトゥム（Ｍ．ｉｎｔｅｒｊｅｃｔｕｍ）、Ｍ．インテルメディウム（Ｍ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｍ）、Ｍ．カンサシイ（Ｍ．ｋａｎｓａｓｉｉ）、Ｍ．コモセンス（Ｍ．ｋｏｍｏｓｓｅｎｓｅ）、Ｍ．クビカエ（Ｍ．ｋｕｂｉｃａｅ）、Ｍ．レンチフラブム（Ｍ．ｌｅｎｔｉｆｌａｖｕｍ）、Ｍ．レプラエ（Ｍ．ｌｅｐｒａｅ）、Ｍ．レプレムリウム（Ｍ．ｌｅｐｒａｅｍｕｒｉｕｍ）、Ｍ．ルテウム（Ｍ．ｌｕｔｅｕｍ）、Ｍ．マダガスカリエンス（Ｍ．ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｅ）、Ｍ．マゲリテンス（Ｍ．ｍａｇｅｒｉｔｅｎｓｅ）、Ｍ．マルモエンス（Ｍ．ｍａｌｍｏｅｎｓｅ）、Ｍ．マリヌム（Ｍ．ｍａｒｉｎｕｍ）、Ｍ．ミクロチ（Ｍ．ｍｉｃｒｏｔｉ）、Ｍ．モリオカエンス（Ｍ．ｍｏｒｉｏｋａｅｎｓｅ）、Ｍ．ムコゲニクム（Ｍ．ｍｕｃｏｇｅｎｉｃｕｍ）、Ｍ．ムラレ（Ｍ．ｍｕｒａｌｅ）、Ｍ．ネオアウルム（Ｍ．ｎｅｏａｕｒｕｍ）、Ｍ．ノンクロモゲニクム（Ｍ．ｎｏｎｃｈｒｏｍｏｇｅｎｉｃｕｍ）、Ｍ．ノボカストレンス（Ｍ．ｎｏｖｏｃａｓｔｒｅｎｓｅ）、Ｍ．オブエンス（Ｍ．ｏｂｕｅｎｓｅ）、Ｍ．パルクホルトゥイトゥム（Ｍ．ｐａｒｑｆｏｒｔｕｉｔｕｍ）、Ｍ．パラツベルクロシス（Ｍ．ｐａｒａｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、Ｍ．ペレグリヌム（Ｍ．ｐｅｒｅｇｒｉｎｕｍ）、Ｍ．ファージ（Ｍ．ｐｈａｇｅ）、Ｍ．フェレイ（Ｍ．Ｐｈｌｅｉ）、Ｍ．ポルシヌム（Ｍ．ｐｏｒｃｉｎｕｍ）、Ｍ．ポリフェラエ（Ｍ．ｐｏｒｉｆｅｒａｅ）、Ｍ．プルベリス（Ｍ．ｐｕｌｖｅｒｉｓ）、Ｍ．ロデシアエ（Ｍ．ｒｈｏｄｅｓｉａｅ）、Ｍ．スクロフラセウム（Ｍ．ｓｃｒｏｆｕｌａｃｅｕｍ）、Ｍ．セネガレンス（Ｍ．ｓｅｎｅｇａｌｅｎｓｅ）、Ｍ．セプチクム（Ｍ．ｓｅｐｔｉｃｕｍ）、Ｍ．セプチクム（Ｍ．ｓｅｐｔｉｃｕｍ）、Ｍ．シモイデイ（Ｍ．ｓｈｉｍｏｉｄｅｉ）、Ｍ．シミアエ（Ｍ．ｓｉｍｉａｅ）、Ｍ．スメグマチス（Ｍ．ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）、Ｍ．スファグニ（Ｍ．ｓｐｈａｇｎｉ）、Ｍ．スズルガイ（Ｍ．ｓｚｕｌｇａｉ）、Ｍ．テラエ（Ｍ．ｔｅｒｒａｅ）、Ｍ．テルモレシスチビレ（Ｍ．ｔｈｅｒｍｏｒｅｓｉｓｔｉｂｉｌｅ）、Ｍ．トカイエンス（Ｍ．ｔｏｋａｉｅｎｓｅ）、Ｍ．トリプレックス（Ｍ．ｔｒｉｐｌｅｘ）、Ｍ．トリビアレ（Ｍ．ｔｒｉｖｉａｌｅ）、Ｍ．ツベルクロシス（Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、Ｍ．ツシアエ（Ｍ．ｔｕｓｃｉａｅ）、Ｍ．ウルセランス（Ｍ．ｕｌｃｅｒａｎｓ）、Ｍ．バッカエ（Ｍ．ｖａｃｃａｅ）、Ｍ．ウォリンスキイ（Ｍ．ｗｏｌｉｎｓｋｙｉ）、Ｍ．キセノピ（Ｍ．ｘｅｎｏｐｉ）、ネイセリア・アニマリス（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｎ．カニス（Ｎ．ｃａｎｉｓ）、Ｎ．シネレア（Ｎ．ｃｉｎｅｒｅａ）、Ｎ．デニトリフィカンス（Ｎ．ｄｅｎｉｔｒｉｆｉｃａｎｓ）、Ｎ．デンチアエ（Ｎ．ｄｅｎｔｉａｅ）、Ｎ．エロンガタ（Ｎ．ｅｌｏｎｇａｔａ）、Ｎ．フラバ（Ｎ．ｆｌａｖａ）、Ｎ．フラベセンス（Ｎ．ｆｌａｖｅｓｃｅｎｓ）、Ｎ．ゴノロエ（Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ）、Ｎ．イグアナエ（Ｎ．ｉｇｕａｎａｅ）、Ｎ．ラクタミカ（Ｎ．ｌａｃｔａｍｉｃａ）、Ｎ．マカカ（Ｎ．ｍａｃａｃａｅ）、Ｎ．メニンギチジス（Ｎ．ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）、Ｎ．ムコサ（Ｎ．ｍｕｃｏｓａ）、Ｎ．オビス（Ｎ．ｏｖｉｓ）、Ｎ．ペルフラバ（Ｎ．ｐｅｒｆｌａｖａ）、Ｎ．ファリンギス・バー・フラバ（Ｎ．ｐｈａｒｙｎｇｉｓ ｖａｒ．ｆｌａｖａ）、Ｎ．ポリサッカレア（Ｎ．ｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｅａ）、Ｎ．シッカ（Ｎ．ｓｉｃｃａ）、Ｎ．サブフラバ（Ｎ．ｓｕｂｆｌａｖａ）、Ｎ．ウェアベリ（Ｎ．ｗｅａｖｅｒｉ）、シュードモナス・エルギノーサ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）、Ｐ．アルカリゲネス（Ｐ．ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）、Ｐ．クロロラフィス（Ｐ．ｃｈｌｏｒｏｒａｐｈｉｓ）、Ｐ．フルオレセンス（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ｐ．ルテオラ（Ｐ．ｌｕｔｅｏｌａ）、Ｐ．メンドシナ（Ｐ．ｍｅｎｄｏｃｉｎａ）、Ｐ．モンテイリ（Ｐ．ｍｏｎｔｅｉｌｉｉ）、Ｐ．オリジハビタンス（Ｐ．ｏｒｙｚｉｈａｂｉｔａｎｓ）、Ｐ．ペルトシノゲナ（Ｐ．ｐｅｒｔｏｃｉｎｏｇｅｎａ）、Ｐ．シュードアルカリゲネス（Ｐ．ｐｓｅｕｄａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓ）、Ｐ．プチダ（Ｐ．ｐｕｔｉｄａ）、Ｐ．スツェリ（Ｐ．ｓｔｕｔｚｅｒｉ）、サルモネラ・バクテリオファージ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｂａｃｔｅｒｉｏｐｈａｇｅ）、Ｓ．ボンゴリ（Ｓ．ｂｏｎｇｏｒｉ）、Ｓ．コレレスイス（Ｓ．ｃｈｏｌｅｒａｅｓｕｉｓ）、Ｓ．エンテリカ（Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｃａ）、Ｓ．エンテリチジス（Ｓ．ｅｎｔｅｒｉｔｉｄｉｓ）、Ｓ．パラチフィ（Ｓ．ｐａｒａｔｙｐｈｉ）、Ｓ．チフィ（Ｓ．ｔｙｐｈｉ）、Ｓ．チフィムリウム（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓ．チフィムリウム（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓ．チフィムリウム（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓ．チフィムリウム（Ｓ．ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）バクテリオファージ、シゲラ・ボイディ（Ｓｈｉｇｅｌｌａ ｂｏｙｄｉｉ）、Ｓ．ディセンテリエ（Ｓ．ｄｙｓｅｎｔｅｒｉａｅ）、Ｓ．フレクスネリ（Ｓ．ｆｌｅｘｎｅｒｉ）、Ｓ．ソネイ（Ｓ．ｓｏｎｎｅｉ
）、スタフィロコッカス・アーレッタエ（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｒｌｅｔｔａｅ）、Ｓ．アウレウス（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）、Ｓ．アウリクラリス（Ｓ．ａｕｒｉｃｕｌａｒｉｓ）、Ｓ．バクテリオファージ（Ｓ．ｂａｃｔｅｒｉｏｐｈａｇｅ）、Ｓ．カピチス（Ｓ．ｃａｐｉｔｉｓ）、Ｓ．カプレ（Ｓ．ｃａｐｒａｅ）、Ｓ．カルノサス（Ｓ．ｃａｒｎｏｓｕｓ）、Ｓ．カセオリチクス（Ｓ．ｃａｓｅｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．クロモゲネス（Ｓ．ｃｈｒｏｍｏｇｅｎｅｓ）、Ｓ．コーニイ（Ｓ．ｃｏｈｎｉｉ）、Ｓ．デルフィニ（Ｓ．ｄｅｌｐｈｉｎｉ）、Ｓ．エピデルミジス（Ｓ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、Ｓ．エクオルム（Ｓ．ｅｑｕｏｒｕｍ）、Ｓ．フェリス（Ｓ．ｆｅｌｉｓ）、Ｓ．フレウレッティイ（Ｓ．ｆｌｅｕｒｅｔｔｉｉ）、Ｓ．ガリナルム（Ｓ．ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、Ｓ．ヘモリチクス（Ｓ．ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．ホミニス（Ｓ．ｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｓ．ヒクス（Ｓ．ｈｙｉｃｕｓ）、Ｓ．インテルメディウス（Ｓ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、Ｓ．クルーシイ（Ｓ．ｋｌｏｏｓｉｉ）、Ｓ．レントゥス（Ｓ．ｌｅｎｔｕｓ）、Ｓ．ルグドゥネンシス（Ｓ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ）、Ｓ．ルトレ（Ｓ．ｌｕｔｒａｅ）、Ｓ．ムスカエ（Ｓ．ｍｕｓｃａｅ）、Ｓ．ミュータンス（Ｓ．ｍｕｔａｎｓ）、Ｓ．パスツーリ（Ｓ．ｐａｓｔｅｕｒｉ）、Ｓ．ファージ（Ｓ．ｐｈａｇｅ）、Ｓ．ピシフェルメンタンス（Ｓ．ｐｉｓｃｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｓ．プルベレリ（Ｓ．ｐｕｌｖｅｒｅｒｉ）、Ｓ．サッカロリチクス（Ｓ．ｓａｃｃｈａｒｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．サプロフィチクス（Ｓ．ｓａｐｒｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、Ｓ．シュレイフェリ（Ｓ．ｓｃｈｌｅｉｆｅｒｉ）、Ｓ．スシウリ（Ｓ．ｓｃｉｕｒｉ）、Ｓ．シミュランス（Ｓ．ｓｉｍｕｌａｎｓ）、Ｓ．スクシヌス（Ｓ．ｓｕｃｃｉｎｕｓ）、Ｓ．ビトゥリヌス（Ｓ．ｖｉｔｕｌｉｎｕｓ）、Ｓ．ワルネリ（Ｓ．ｗａｒｎｅｒｉ）、Ｓ．キシロサス（Ｓ．ｘｙｌｏｓｕｓ）、ウレアプラズマ・ウレアリチクム（Ｕｒｅａｐｌａｓｍａ ｕｒｅａｌｙｔｉｃｕｍ）、エルシニア・アルドバーエ（Ｙｅｒｓｉｎｉａ ａｌｄｏｖａｅ）、Ｙ．ベルコビエリ（Ｙ．ｂｅｒｃｏｖｉｅｒｉ）、Ｙ．エンテロコリチカ（Ｙ．ｅｎｔｅｒｏｃｏｌｉｔｉｃａ）、Ｙ．フレデリクセニイ（Ｙ．ｆｒｅｄｅｒｉｋｓｅｎｉｉ）、Ｙ．インテルメディア（Ｙ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａ）、Ｙ．クリステンセニイ（Ｙ．ｋｒｉｓｔｅｎｓｅｎｉｉ）、Ｙ．モラレティイ（Ｙ．ｍｏｌｌａｒｅｔｉｉ）、Ｙ．ペスチス（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．フィロミラジア（Ｙ．ｐｈｉｌｏｍｉｒａｇｉａ）、Ｙ．シュードツベルクロシス（Ｙ．ｐｓｅｕｄｏｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、Ｙ．ローデイ（Ｙ．ｒｏｈｄｅｉ）及びＹ．ルケリ（Ｙ．ｒｕｃｋｅｒｉ）などの通性細胞内細菌由来のリボソーム。

アナプラズマ・ボビス（Ａｎａｐｌａｓｍａ ｂｏｖｉｓ）、Ａ．カウダーツム（Ａ．ｃａｕｄａｔｕｍ）、Ａ．セントラレ（Ａ．ｃｅｎｔｒａｌｅ）、Ａ．マルギナレ（Ａ．ｍａｒｇｉｎａｌｅ）、Ａ．オビス（Ａ．ｏｖｉｓ）、Ａ．ファゴサイトフィラ（Ａ．ｐｈａｇｏｃｙｔｏｐｈｉｌａ）、Ａ．プラチス（Ａ．ｐｌａｔｙｓ）、バルトネラ・バチリフォルミス（Ｂａｒｔｏｎｅｌｌａ ｂａｃｉｌｌｉｆｏｒｍｉｓ）、Ｂ．クラリゲイエ（Ｂ．ｃｌａｒｒｉｄｇｅｉａｅ）、Ｂ．エリザベサエ（Ｂ．ｅｌｉｚａｂｅｔｈａｅ）、Ｂ．ヘンセラ（Ｂ．ｈｅｎｓｅｌａｅ）、Ｂ．ヘンセラ（Ｂ．ｈｅｎｓｅｌａｅ）ファージ、Ｂ．クインタナ（Ｂ．ｑｕｉｎｔａｎａ）、Ｂ．タイロリ（Ｂ．ｔａｙｌｏｒｉｉ）、Ｂ．ビンソニイ（Ｂ．ｖｉｎｓｏｎｉｉ）、ボレリア・アフゼリイ（Ｂｏｒｒｅｌｉａ ａｆｚｅｌｉｉ）、Ｂ．アンデルソニイ（Ｂ．ａｎｄｅｒｓｏｎｉｉ）、Ｂ．アンセリナ（Ｂ．ａｎｓｅｒｉｎａ）、Ｂ．ビッセティイ（Ｂ．ｂｉｓｓｅｔｔｉｉ）、Ｂ．ブルグドルフェリ（Ｂ．ｂｕｒｇｄｏｒｆｅｒｉ）、Ｂ．クロキデュレ（Ｂ．ｃｒｏｃｉｄｕｒａｅ）、Ｂ．ガリニイ（Ｂ．ｇａｒｉｎｉｉ）、Ｂ．ヘルムシイ（Ｂ．ｈｅｒｍｓｉｉ）、Ｂ．ジャポニカ（Ｂ．ｊａｐｏｎｉｃａ）、Ｂ．ミヤモトイ（Ｂ．ｍｉｙａｍｏｔｏｉ）、Ｂ．パルケリ（Ｂ．ｐａｒｋｅｒｉ）、Ｂ．レクレンチス（Ｂ．ｒｅｃｕｒｒｅｎｔｉｓ）、Ｂ．ツルディ（Ｂ．ｔｕｒｄｉ）、Ｂ．ツリカテ（Ｂ．ｔｕｒｉｃａｔａｅ）、Ｂ．バライシアナ（Ｂ．ｖａｌａｉｓｉａｎａ）、ブルセラ・アボルツス（Ｂｒｕｃｅｌｌａ ａｂｏｒｔｕｓ）、Ｂ．メリテンシス（Ｂ．ｍｅｌｉｔｅｎｓｉｓ）、クラミジア・ニューモニエ（Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｃ．シタッシ（Ｃ．ｐｓｉｔｔａｃｉ）、Ｃ．トラコマチス（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）、コウドリア・ルミナンチウム（Ｃｏｗｄｒｉａ ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ）、コキシエラ・ブルネティイ（Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｂｕｒｎｅｔｉｉ）、エーリキア・カニス（Ｅｈｒｌｉｃｈｉａ ｃａｎｉｓ）、Ｅ．シャフェンシス（Ｅ．ｃｈａｆｆｅｅｎｓｉｓ）、Ｅ．エクイ（Ｅ．ｅｑｕｉ）、Ｅ．エウィンギイ（Ｅ．ｅｗｉｎｇｉｉ）、Ｅ．ムリス（Ｅ．ｍｕｒｉｓ）、Ｅ．ファゴシトフィラ（Ｅ．ｐｈａｇｏｃｙｔｏｐｈｉｌａ）、Ｅ．プラティス（Ｅ．ｐｌａｔｙｓ）、Ｅ．リスチシイ（Ｅ．ｒｉｓｔｉｃｉｉ）、Ｅ．ルミナンチウム（Ｅ．ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ）、Ｅ．センネツ（Ｅ．ｓｅｎｎｅｔｓｕ）、ヘモバルトネラ・カニス（Ｈａｅｍｏｂａｒｔｏｎｅｌｌａ ｃａｎｉｓ）、Ｈ．フェリス（Ｈ．ｆｅｌｉｓ）、Ｈ．ムリス（Ｈ．ｍｕｒｉｓ）、マイコプラズマ・アルツリディティス（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ ａｒｔｈｒｉｄｉｔｉｓ）、Ｍ．ブッカレ（Ｍ．ｂｕｃｃａｌｅ）、Ｍ．ファウシウム（Ｍ．ｆａｕｃｉｕｍ）、Ｍ．フェルメンタンス（Ｍ．ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｍ．ゲニタリウム（Ｍ．ｇｅｎｉｔａｌｉｕｍ）、Ｍ．ホミニス（Ｍ．ｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｍ．ライドラウィイ（Ｍ．ｌａｉｄｌａｗｉｉ）、Ｍ．リポフィルム（Ｍ．ｌｉｐｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｍ．オラレ（Ｍ．ｏｒａｌｅ）、Ｍ．ペネトランス（Ｍ．ｐｅｎｅｔｒａｎｓ）、Ｍ．ピルム（Ｍ．ｐｉｒｕｍ）、Ｍ．ニューモニエ（Ｍ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、Ｍ．サリバリウム（Ｍ．ｓａｌｉｖａｒｉｕｍ）、Ｍ．スペルマトフィルム（Ｍ．ｓｐｅｒｍａｔｏｐｈｉｌｕｍ）、リケッチア・オーストラリス（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａ ａｕｓｔｒａｌｉｓ）、Ｒ．コノリイ（Ｒ．ｃｏｎｏｒｉｉ）、Ｒ．フェリス（Ｒ．ｆｅｌｉｓ）、Ｒ．ヘルベチカ（Ｒ．ｈｅｌｖｅｔｉｃａ）、Ｒ．ジャポニカ（Ｒ．ｊａｐｏｎｉｃａ）、Ｒ．マッシリエ（Ｒ．ｍａｓｓｉｌｉａｅ）、Ｒ．モンタネンシス（Ｒ．ｍｏｎｔａｎｅｎｓｉｓ）、Ｒ．ピーコキイ（Ｒ．ｐｅａｃｏｃｋｉｉ）、Ｒ．プロワゼキイ（Ｒ．ｐｒｏｗａｚｅｋｉｉ）、Ｒ．リピセファリ（Ｒ．ｒｈｉｐｉｃｅｐｈａｌｉ）、Ｒ．リケッチイ（Ｒ．ｒｉｃｋｅｔｔｓｉｉ）、Ｒ．シビリカ（Ｒ．ｓｉｂｉｒｉｃａ）及びＲ．チフィ（Ｒ．ｔｙｐｈｉ）などの偏性細胞内細菌由来のリボソーム。

カンジダ・カンジダ・アーセリ（Ｃａｎｄｉｄａ Ｃａｎｄｉｄａ ａａｓｅｒｉ）、Ｃ．アシドサーモフィルム（Ｃ．ａｃｉｄｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｃ．アクツス（Ｃ．ａｃｕｔｕｓ）、Ｃ．アルビカンス（Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓ）、Ｃ．アナトミエ（Ｃ．ａｎａｔｏｍｉａｅ）、Ｃ．アピス（Ｃ．ａｐｉｓ）、Ｃ．アピス・バー・ガラクタ（Ｃ．ａｐｉｓ ｖａｒ．ｇａｌａｃｔａ）、Ｃ．アトランチカ（Ｃ．ａｔｌａｎｔｉｃａ）、Ｃ．アトモスフェリカ（Ｃ．ａｔｍｏｓｐｈｅｒｉｃａ）、Ｃ．アウリンギエンシス（Ｃ．ａｕｒｉｎｇｉｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ベルテ（Ｃ．ｂｅｒｔａｅ）、Ｃ．ベルツテ・バー・キロエンシス（Ｃ．ｂｅｒｔｈｔａｅ ｖａｒ．ｃｈｉｌｏｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ベルテティイ（Ｃ．ｂｅｒｔｈｅｔｉｉ）、Ｃ．ブランキイ（Ｃ．ｂｌａｎｋｉｉ）、Ｃ．ボイディニイ（Ｃ．ｂｏｉｄｉｎｉｉ）、Ｃ．ボレチコラ（Ｃ．ｂｏｌｅｔｉｃｏｌａ）、Ｃ．ボンビ（Ｃ．ｂｏｍｂｉ）、Ｃ．ボンビコラ（Ｃ．ｂｏｍｂｉｃｏｌａ）、Ｃ．ブイネンシス（Ｃ．ｂｕｉｎｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ブチリ（Ｃ．ｂｕｔｙｒｉ）、Ｃ．カカオイ（Ｃ．ｃａｃａｏｉ）、Ｃ．カンタレリイ（Ｃ．ｃａｎｔａｒｅｌｌｉｉ）、Ｃ．カリオシリグニコラ（Ｃ．ｃａｒｉｏｓｉｌｉｇｎｉｃｏｌａ）、Ｃ．カステリイ（Ｃ．ｃａｓｔｅｌｌｉｉ）、Ｃ．カストレンシス（Ｃ．ｃａｓｔｒｅｎｓｉｓ）、Ｃ．カテヌラタ（Ｃ．ｃａｔｅｎｕｌａｔａ）、Ｃ．キレンシス（Ｃ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ）、Ｃ．キロプテロルム（Ｃ．ｃｈｉｒｏｐｔｅｒｏｒｕｍ）、Ｃ．コイポメンシス（Ｃ．ｃｏｉｐｏｍｅｎｓｉｓ）、Ｃ．デンドロネマ（Ｃ．ｄｅｎｄｒｏｎｅｍａ）、Ｃ．デセルチコラ（Ｃ．ｄｅｓｅｒｔｉｃｏｌａ）、Ｃ．ディッデンシエ（Ｃ．ｄｉｄｄｅｎｓｉａｅ）、Ｃ．ジベルサ（Ｃ．ｄｉｖｅｒｓａ）、Ｃ．エントマエ（Ｃ．ｅｎｔｏｍａｅａ）、Ｃ．エントモフィラ（Ｃ．ｅｎｔｏｍｏｐｈｉｌａ）、Ｃ．エルガテンシス（Ｃ．ｅｒｇａｔｅｎｓｉｓ）、Ｃ．エルノビイ（Ｃ．ｅｒｎｏｂｉｉ）、Ｃ．エタノリカ（Ｃ．ｅｔｈａｎｏｌｉｃａ）、Ｃ．エタノサーモフィルム（Ｃ．ｅｔｈａｎｏｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｃ．ファマタ（Ｃ．ｆａｍａｔａ）、Ｃ．フルビオチリス（Ｃ．ｆｌｕｖｉｏｔｉｌｉｓ）、Ｃ．フラガリオルム（Ｃ．ｆｒａｇａｒｉｏｒｕｍ）、Ｃ．フラギコラ（Ｃ．ｆｒａｇｉｃｏｌａ）、Ｃ．フリードリッヒ（Ｃ．ｆｒｉｅｄｒｉｃｈｉｉ）、Ｃ．フルクトゥス（Ｃ．ｆｒｕｃｔｕｓ）、Ｃ．ゲオカレス（Ｃ．ｇｅｏｃｈａｒｅｓ）、Ｃ．グラブラタ（Ｃ．ｇｌａｂｒａｔａ）、Ｃ．グレボサ（Ｃ．ｇｌａｅｂｏｓａ）、Ｃ．グロペンギエッセリ（Ｃ．ｇｒｏｐｅｎｇｉｅｓｓｅｒｉ）、Ｃ．グイリエルモンディイ（Ｃ．ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ）、Ｃ．グイリエルモンディ・バー・ガラクトサ（Ｃ．ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ ｖａｒ．ｇａｌａｃｔｏｓａ）、Ｃ．グイリエルモンディイ・バー・ソヤ（Ｃ．ｇｕｉｌｌｉｅｒｍｏｎｄｉｉ ｖａｒ．ｓｏｙａ）、Ｃ．ヘムロニイ（Ｃ．ｈａｅｍｕｌｏｎｉｉ）、Ｃ．ハロフィラ（Ｃ．ｈａｌｏｐｈｉｌａ）／Ｃ．ベルサチリス（Ｃ．ｖｅｒｓａｔｉｌｉｓ）、Ｃ．ホルミイ（Ｃ．ｈｏｌｍｉｉ）、Ｃ．フミリス（Ｃ．ｈｕｍｉｌｉｓ）、Ｃ．ヒドロカルボフマリカ（Ｃ．ｈｙｄｒｏｃａｒｂｏｆｕｍａｒｉｃａ）、Ｃ．インコンスピキュア（Ｃ．ｉｎｃｏｎｓｐｉｃｕａ）、Ｃ．インセクタレンス（Ｃ．ｉｎｓｅｃｔａｌｅｎｓ）、Ｃ．インセクタマンス（Ｃ．ｉｎｓｅｃｔａｍａｎｓ）、Ｃ．インテルメディア（Ｃ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉａ）、Ｃ．ジャバニカ（Ｃ．ｊａｖａｎｉｃａ）、Ｃ．ケフィル（Ｃ．ｋｅｆｙｒ）、Ｃ．クリシイ（Ｃ．ｋｒｉｓｓｉｉ）、Ｃ．クルセイ（Ｃ．ｋｒｕｓｅｉ）、Ｃ．クルソイデス（Ｃ．ｋｒｕｓｏｉｄｅｓ）、Ｃ．ラムビカ（Ｃ．ｌａｍｂｉｃａ）、Ｃ．ルシタニエ（Ｃ．ｌｕｓｉｔａｎｉａｅ）、Ｃ．マグノリエ（Ｃ．ｍａｇｎｏｌｉａｅ）、Ｃ．マルトサ（Ｃ．ｍａｌｔｏｓａ）、Ｃ．マミレ（Ｃ．ｍａｍｉｌｌａｅ）、Ｃ．マリス（Ｃ．ｍａｒｉｓ）、Ｃ．マリチマ（Ｃ．ｍａｒｉｔｉｍａ）、Ｃ．メリビオシカ（Ｃ．ｍｅｌｉｂｉｏｓｉｃａ）、Ｃ．メリニイ（Ｃ．ｍｅｌｉｎｉｉ）、Ｃ．メチリカ（Ｃ．ｍｅｔｈｙｌｉｃａ）、Ｃ．ミレリ（Ｃ．ｍｉｌｌｅｒｉ）、Ｃ．モギイ（Ｃ．ｍｏｇｉｉ）、Ｃ．モリシアナ（Ｃ．ｍｏｌｉｓｃｈｉａｎａ）、Ｃ．モンタナ（Ｃ．ｍｏｎｔａｎａ）、Ｃ．ムルチス−ゲミス（Ｃ．ｍｕｌｔｉｓ−ｇｅｍｍｉｓ）、Ｃ．ムセ（Ｃ．ｍｕｓａｅ）、Ｃ．ネオデンドラ（Ｃ．ｎａｅｏｄｅｎｄｒａ）、Ｃ．ネモデンドラ（Ｃ．ｎｅｍｏｄｅｎｄｒａ）、Ｃ．ニトラトフィラ（Ｃ．ｎｉｔｒａｔｏｐｈｉｌａ）、Ｃ．ノルベゲンシス（Ｃ．ｎｏｒｖｅｇｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ノルベジカ（Ｃ．ｎｏｒｖｅｇｉａ）、Ｃ．オレオフィラ（Ｃ．ｏｌｅｏｐｈｉｌａ）、Ｃ．オレゴネンシス（Ｃ．ｏｒｅｇｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｃ．オソルネンシス（Ｃ．ｏｓｏｒｎｅｎｓｉｓ）、Ｃ．パルディゲナ（Ｃ．ｐａｌｕｄｉｇｅｎａ）、Ｃ．パラシロシス（Ｃ．ｐａｒａｐｓｉｌｏｓｉｓ）、Ｃ．パラルゴサ（Ｃ．ｐａｒａｒｕｇｏｓａ）、Ｃ．ペリフェロスム（Ｃ．ｐｅｒｉｐｈｅｌｏｓｕｍ）、Ｃ．ペトロフエンシス（Ｃ．ｐｅｔｒｏｈｕｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ペトロフィルム（Ｃ．ｐｅｔｒｏｐｈｉｌｕｍ）、Ｃ．フィリラ（Ｃ．ｐｈｉｌｙｌａ）、Ｃ．ピグナリエ（Ｃ．ｐｉｇｎａｌｉａｅ）、Ｃ．ピントロペシイ バー・ピントロペシイ（Ｃ．ｐｉｎｔｏｌｏｐｅｓｉｉ ｖａｒ．ｐｉｎｔｏｌｏｐｅｓｉｉ）、Ｃ．ピントロペシイ バー．スルーフィエ（Ｃ．ｐｉｎｔｏｌｏｐｅｓｉｉ ｖａｒ．ｓｌｏｏｆｆｉａｅ）、Ｃ．ピヌス（Ｃ．ｐｉｎｕｓ）、Ｃ．ポリモルファ（Ｃ．ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ）、Ｃ．ポプリ（Ｃ．ｐｏｐｕｌｉ）、Ｃ．シュードインテルメディア（Ｃ．ｐｓｅｕｄｏｉｎｔｅｒｍｅｄｉａ）、Ｃ．クエルシトラサ（Ｃ．ｑｕｅｒｃｉｔｒａｓａ）、Ｃ．ライレネンシス（Ｃ．ｒａｉｌｅｎｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ラギイ（Ｃ．ｒｈａｇｉｉ）、Ｃ．ルゴペリキュローサ（Ｃ．ｒｕｇｏｐｅｌｌｉｃｕｌｏｓａ）、Ｃ．ルゴサ（Ｃ．ｒｕｇｏｓａ）、Ｃ．サケ（Ｃ．ｓａｋｅ）、Ｃ．サルマンチセンシス（Ｃ．ｓａｌｍａｎｔｉｃｅｎｓｉｓ）、Ｃ．サボニカ（Ｃ．ｓａｖｏｎｉｃａ）、Ｃ．セクアネンシス（Ｃ．ｓｅｑｕａｎｅｎｓｉｓ）、Ｃ．シェハテ（Ｃ．ｓｈｅｈａｔａｅ）、Ｃ．シルベ（Ｃ．ｓｉｌｖａｅ）、Ｃ．シルビキュルトリクス（Ｃ．ｓｉｌｖｉｃｕｌｔｒｉｘ）、Ｃ．ソラニ（Ｃ．ｓｏｌａｎｉ）、Ｃ．ソノレンシス（Ｃ．ｓｏｎｏｒｅｎｓｉｓ）、Ｃ．ソルボフィラ（Ｃ．ｓｏｒｂｏｐｈｉｌａ）、Ｃ．スパンドベンシス（Ｃ．ｓｐａｎｄｏｖｅｎｓｉｓ）、Ｃ．スフェリカ（Ｃ．ｓｐｈａｅｒｉｃａ）、Ｃ．ステラタ（Ｃ．ｓｔｅｌｌａｔａ）、Ｃ．スッキフィラ（Ｃ．ｓｕｃｃｉｐｈｉｌａ）、Ｃ．テヌイス（Ｃ．ｔｅｎｕｉｓ）、Ｃ．テレブラ（Ｃ．ｔｅｒｅｂｒａ）、Ｃ．トロピカリス（Ｃ．ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ）、Ｃ．ウチリス（Ｃ．ｕｔｉｌｉｓ）、Ｃ．バリダ（Ｃ．ｖａｌｉｄａ）、Ｃ．バンデルワルティイ（Ｃ．ｖａｎｄｅｒｗａｌｔｉｉ）、Ｃ．バルチオバアライ（Ｃ．ｖａｒｔｉｏｖａａｒａｉ）、Ｃ．ベロネ（Ｃ．ｖｅｒｏｎａｅ）、Ｃ．ビニ（Ｃ．ｖｉｎｉ）、Ｃ．ウィケラミイ（Ｃ．ｗｉｃｋｅｒｈａｍｉｉ）、Ｃ．キセトビイ（Ｃ．ｘｅｓｔｏｂｉｉ）、Ｃ．ゼイラノイデス（Ｃ．ｚｅｙｌａｎｏｉｄｅｓ）及びヒストプラズマ・カプスラツム（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ ｃａｐｓｕｌａｔｕｍ）などの通性細胞内菌類由来のリボソーム。

ブラキオラ・ベシキュラルム（Ｂｒａｃｈｉｏｌａ ｖｅｓｉｃｕｌａｒｕｍ）、Ｂ．コノリ（Ｂ．ｃｏｎｎｏｒｉ）、エンセファリトゾーン・クニクリ（Ｅｎｃｅｐｈａｌｉｔｏｚｏｏｎ ｃｕｎｉｃｕｌｉ）、Ｅ．ヘレム（Ｅ．ｈｅｌｌｅｍ）、Ｅ．インテスチナリス（Ｅ．ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、エンテロシトゾーン・ビエヌーシ（Ｅｎｔｅｒｏｃｙｔｏｚｏｏｎ ｂｉｅｎｅｕｓｉ）、リーシュマニア・エチオピカ（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ ａｅｔｈｉｏｐｉｃａ）、Ｌ．アマゾネシス（Ｌ．ａｍａｚｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ブラジリエンシス（Ｌ．ｂｒａｚｉｌｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．チャガシ（Ｌ．ｃｈａｇａｓｉ）、Ｌ．ドノバニ（Ｌ．ｄｏｎｏｖａｎｉ）、Ｌ．ドノバニ チャガシ（Ｌ．ｄｏｎｏｖａｎｉ ｃｈａｇａｓｉ）、Ｌ．ドノバニ ドノバニ（Ｌ．ｄｏｎｏｖａｎｉ ｄｏｎｏｖａｎｉ）、Ｌ．ドノバニ インファンツム（Ｌ．ｄｏｎｏｖａｎｉ ｉｎｆａｎｔｕｍ）、Ｌ．エンリエッティイ（Ｌ．ｅｎｒｉｅｔｔｉｉ）、Ｌ．ギアネンシス（Ｌ．ｇｕｙａｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．インファンツム（Ｌ．ｉｎｆａｎｔｕｍ）、Ｌ．メジャー（Ｌ．ｍａｊｏｒ）、Ｌ．メキシカーナ（Ｌ．ｍｅｘｉｃａｎａ）、Ｌ．パナメンシス（Ｌ．ｐａｎａｍｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ペルビアナ（Ｌ．ｐｅｒｕｖｉａｎａ）、Ｌ．ピファノイ（Ｌ．ｐｉｆａｎｏｉ）、Ｌ．タレントレ（Ｌ．ｔａｒｅｎｔｏｌａｅ）、Ｌ．トロピカ（Ｌ．ｔｒｏｐｉｃａ）、マイクロスポリジウム・セイロネンシス（Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ ｃｅｙｌｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｍ．アフリカヌム（Ｍ．ａｆｒｉｃａｎｕｍ）、ノセマ・コンノリ（Ｎｏｓｅｍａ ｃｏｎｎｏｒｉ）、Ｎ．オクラルム（Ｎ．ｏｃｕｌａｒｕｍ）、Ｎ．アルゲレ（Ｎ．ａｌｇｅｒａｅ）、プラスモディウム・ベルゲイ（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ ｂｅｒｇｈｅｉ）、Ｐ．ブラシリアヌム（Ｐ．ｂｒａｓｉｌｉａｎｕｍ）Ｐ．チャバウディ（Ｐ．ｃｈａｂａｕｄｉ）、Ｐ．チャバウディ アダミ（Ｐ．ｃｈａｂａｕｄｉ ａｄａｍｉ）、Ｐ．チャバウディ チャバウディ（Ｐ．ｃｈａｂａｕｄｉ ｃｈａｂａｕｄｉ）、Ｐ．シノモルジ（Ｐ．ｃｙｎｏｍｏｌｇｉ）、Ｐ．ファルシパルム（Ｐ．ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ）、Ｐ．フラギレ（Ｐ．ｆｒａｇｉｌｅ）、Ｐ．ガリナセウム（Ｐ．ｇａｌｌｉｎａｃｅｕｍ）、Ｐ．ノウレシ（Ｐ．ｋｎｏｗｌｅｓｉ）、Ｐ．ロフレ（Ｐ．ｌｏｐｈｕｒａｅ）、Ｐ．マラリエ（Ｐ．ｍａｌａｒｉａｅ）、Ｐ．オバレ（Ｐ．ｏｖａｌｅ）、Ｐ．レイケノウィ（Ｐ．ｒｅｉｃｈｅｎｏｗｉ）、Ｐ．シミオバレ（Ｐ．ｓｉｍｉｏｖａｌｅ）、Ｐ．シミウム（Ｐ．ｓｉｍｉｕｍ）、Ｐ．ビンケイペッテリ（Ｐ．ｖｉｎｃｋｅｉｐｅｔｔｅｒｉ）、Ｐ．ビンケイ ビンケイ（Ｐ．ｖｉｎｃｋｅｉ ｖｉｎｃｋｅｉ）、Ｐ．ビバックス（Ｐ．ｖｉｖａｘ）、Ｐ．ヨエリイ（Ｐ．ｙｏｅｌｉｉ）、Ｐ．ヨエリイ ニゲリエンシス（Ｐ．ｙｏｅｌｉｉ ｎｉｇｅｒｉｅｎｓｉｓ）、Ｐ．ヨエリイ ヨエリイ（Ｐ．ｙｏｅｌｉｉ ｙｏｅｌｉｉ）、プレイストフォラ・アンギラルム（Ｐｌｅｉｓｔｏｐｈｏｒａ ａｎｇｕｉｌｌａｒｕｍ）、Ｐ．ヒッポグロッソイデオス（Ｐ．ｈｉｐｐｏｇｌｏｓｓｏｉｄｅｏｓ）、Ｐ．ミランデレ（Ｐ．ｍｉｒａｎｄｅｌｌａｅ）、Ｐ．オバリエ（Ｐ．ｏｖａｒｉａｅ）、Ｐ．ティピカリス（Ｐ．ｔｙｐｉｃａｌｉｓ）、セプタータ・インテスティナリス（Ｓｅｐｔａｔａ ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、トキソプラズマ・ゴンディイ（Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉ）、トランキプレイストフォラ・ホミニス（Ｔｒａｎｃｈｉｐｌｅｉｓｔｏｐｈｏｒａ ｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｔ．アンスロポフテラ（Ｔ．ａｎｔｈｒｏｐｏｐｈｔｈｅｒａ）、ビッタフォルマ・コルネエ（Ｖｉｔｔａｆｏｒｍａ ｃｏｒｎｅａｅ）、トリパノソーマ・アビウム（Ｔｒｙｐａｎｏｓｏｍａ ａｖｉｕｍ）、Ｔ．ブルセイ（Ｔ．ｂｒｕｃｅｉ）、Ｔ．ブルセイ ブルセイ（Ｔ．ｂｒｕｃｅｉ ｂｒｕｃｅｉ）、Ｔ．ブルセイ ガンビエンス（Ｔ．ｂｒｕｃｅｉ ｇａｍｂｉｅｎｓｅ）、Ｔ．ブルセイ ロデシエンス（Ｔ．ｂｒｕｃｅｉ ｒｈｏｄｅｓｉｅｎｓｅ）、Ｔ．コビチス（Ｔ．ｃｏｂｉｔｉｓ）、Ｔ．コンゴレンス（Ｔ．ｃｏｎｇｏｌｅｎｓｅ）、Ｔ．クルジ（Ｔ．ｃｒｕｚｉ）、Ｔ．シクロプス（Ｔ．ｃｙｃｌｏｐｓ）、Ｔ．エクイペルドゥム（Ｔ．ｅｑｕｉｐｅｒｄｕｍ）、Ｔ．エバンシ（Ｔ．ｅｖａｎｓｉ）、Ｔ．ディオニシイ（Ｔ．ｄｉｏｎｉｓｉｉ）、Ｔ．ゴドフレイ（Ｔ．ｇｏｄｆｒｅｙｉ）、Ｔ．グライ（Ｔ．ｇｒａｙｉ）、Ｔ．レウィシ（Ｔ．ｌｅｗｉｓｉ）、Ｔ．メガ（Ｔ．ｍｅｇａ）、Ｔ．ミクロティ（Ｔ．ｍｉｃｒｏｔｉ）、Ｔ．ペスタナイ（Ｔ．ｐｅｓｔａｎａｉ）、Ｔ．ランゲリ（Ｔ．ｒａｎｇｅｌｉ）、Ｔ．ロタトリウム（Ｔ．ｒｏｔａｔｏｒｉｕｍ）、Ｔ．シミエ（Ｔ．ｓｉｍｉａｅ）、Ｔ．テイレリ（Ｔ．ｔｈｅｉｌｅｒｉ）、Ｔ．バラニ（Ｔ．ｖａｒａｎｉ）、Ｔ．ベスペルチリオニス（Ｔ．ｖｅｓｐｅｒｔｉｌｉｏｎｉｓ）及びＴ．ビバクス（Ｔ．ｖｉｖａｘ）などの偏性細胞内原生動物由来のリボソーム。

病原体由来のリボソームは、結合剤を介して支持体に結合し得る（即ち固定化される。）。支持体に対してリボソームなどの複合体を固定化することは、当技術分野における技術内である。ある種の実施形態において、結合剤は、リボソームに特異的に結合し得、例えば、特定の病原体由来のリボソームに特異的である。例えば、結合剤は、ポリクローナルもしくはモノクローナル抗体又は、例えば捕捉されるべきリボソームに特異的な抗体断片であり得る。例えば、この抗体又は抗体断片は、リボソームを含むリボソームタンパク質に特異的であり得る。その他の実施形態において、結合剤は、捕捉されるべきリボソームに特異的なリボソーム結合タンパク質である。その他の実施形態において、結合剤は、リボソームＲＮＡに結合することができ、核酸、即ち、捕捉されるべきリボソームのリボソームＲＮＡに相補的又は特異的な核酸であり得る。さらにその他の実施形態において、結合剤は、リボソームＲＮＡに結合するタンパク質、例えばＲＮＡ結合タンパク質、である。

支持体は、上述の結合剤の何れかを介してリボソームを固定化するための何らかの適切な物質であり得る。ある種の実施形態において、支持体は、多孔質材、例えばニトロセルロースである。その他の実施形態において、支持体は、粒子、例えば磁性粒子である。ある種の実施形態において、支持体は複数の粒子からなる。

ある種の実施形態において、支持体は、テストストリップ又はテストチャンバーの一部である。ある実施形態において、支持体はテストストリップである。その他の実施形態において、支持体は、側方流動機器の一部である。さらにその他の実施形態において、支持体は、レジン又はカラム中に充填するのに適切なその他の物質である。さらにその他の実施形態において、支持体は、ウェル又は試験管つきのプレートである。

支持体は、未結合リボソーム及びその他の物質を除去するのに十分でありながらリボソームの生物学的機能を維持するのに適切な何らかの緩衝液で洗浄され得る。残ったリボソームがｍＲＮＡを翻訳しないようにするために、洗浄緩衝液は、リボソーム活性の適切な阻害剤を含有しなければならない。あるいは、又は阻害剤の添加に加えて、リボソーム活性を破壊するために、洗浄緩衝液をオートクレーブにかけ得る。従って、適切なｐＨ、グリセロール又はその他の安定化分子、例えばリガンド、ポリエチレングリコールなど及び還元剤、キレート剤、補因子、界面活性剤、プロテアーゼ阻害剤、リボソーム活性阻害剤の有無は、全て、重要な検討材料である。例えば、支持体が、カラム、側方流動又は洗浄液が支持体全体に流れるその他の方式中に含まれる実施形態において、未結合リボソームを支持体から除去するために、各洗浄緩衝液の約５から２０体積の何れかで、支持体を洗浄し得る。支持体が粒子であるある種の実施形態において、洗浄液は、ある液体、例えば試料から別の液体、例えば洗浄液に、粒子を動かすことを含み得る。ある種の実施形態において、ウイルスを検出するために上述の方法を改変し得る。ＲＮＡウイルスの場合、ウイルス及びリボソームに対する抗体を含む表面にＲＮＡウイルスを含む可能性がある試料を流し得る。試料を表面に流す場合、存在するならばウイルスを抗体により捕捉し得る。未結合物質を除去するための上述のような洗浄段階後、結合ウイルスを含む表面に溶解溶液を流すことによってウイルスを溶解し得る。溶解によって、ＲＮＡが放出されるが、これは、次のようなリボソームによる翻訳に対して利用可能である。

洗浄後、溶液中のｍＲＮＡをポリペプチドへと翻訳するために、結合剤へのリボソームの結合を可能とするのに適切な条件下で、ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液存在下で支持体を温置する。ある種の実施形態において、温置中、一定温度を維持する。

その溶液は、タンパク質合成のための化学的エネルギーを提供する１以上のエネルギー源を含み得る。さらに、この溶液は、少なくとも１つの核酸鋳型、例えばｍＲＮＡ、を含む。この溶液は、酵素、翻訳因子又は補因子を含み得る。ある種の実施形態において、この溶液は、アミノ酸、アルギニン、プロリン、グリシン、ロイシン又はイソロイシンに対するｔＲＮＡから選択される、Ｅ．コリのｒａｒｅ ｔ−ＲＮＡを含み得る。さらに、この溶液は、脂質、コレステロール又は膜を含み得る。

この溶液はまた、鋳型又はホスファターゼ、プロテアーゼ、ヌクレアーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ又はリボヌクレアーゼなどの翻訳反応に必要なその他の酵素を分解する酵素の阻害剤も含み得る。さらに、これは、加水分解又はホスホジエステル結合の形成を触媒するための酵素を含み得る。

またさらに、この溶液は、少なくとも１つの分子シャペロン又はフォールダーゼを含み得る。分子シャペロン又はフォールダーゼには、以下に限定されないが、ＧｒｏＥＬ／ＥＳ、ＧｒｏＥＬ、ＧｒｏＥＳ、ＴＦ、ＤｎａＫ、ＤｎａＪ、ＧｒｐＥ、ＣｌｐＢ、ＦｋｐＡ、Ｓｋｐ、ＤｓｂＡ、ＤｓｂＣ、ペプチジルプロリル・シス／トランスイソメラーゼ（ＰＰＩ）、シャペロニン６０、シャペロニン１０、ＴＣＰ１、ＴＦ５５、熱ショックタンパク質６０、Ｃｐｎ６０、熱ショックタンパク質１０、Ｃｐｎ１０、Ｌｉｍタンパク質又はシグナル認識粒子が含まれる。

特異的酵素活性、ＵＶ又は可視光吸収又は蛍光など様々な手段によって、翻訳反応において産生されたタンパク質の量を測定することができる。タンパク質合成の産物はまた、抗体に基づくアッセイを用いることによって検出し得る。インビトロ転写翻訳反応を組み合わせて産生されるタンパク質の量を定量するための別の方法は、^３ＳＳ−メチオニン又は^３Ｈ−ロイシンなどの既知の量の放射性標識アミノ酸を用いて反応を行い、続いて新たに合成されたタンパク質に取り込まれた放射性標識アミノ酸の量を測定することである。取り込みアッセイは、短縮型タンパク質産物を含むインビトロ翻訳反応で産生される全タンパク質中の放射性標識アミノ酸の量を測定する。

新生タンパク質を検出するためのその他の方法は、米国公開特許出願２００５００３２０７８に記載されている。

診断及び上記で示唆されるその他の適用における使用に対して、上述の方法の実施のためのキット及び装置もまた提供される。本方法の実施のための装置には、側方流動装置（ここで、この反応に使用される試薬は、装置中に含有されるクロマトグラフィー支持体上で乾燥させられ得る。）、テストストリップ又は本方法の実施のためのその他の支持体が含まれる。キットには、核酸鋳型、関心のある病原体のリボソームに特異的な結合剤、支持体及び洗浄及び温置イオン緩衝液が含まれ得る。このようなキット及び装置は、試薬又は構成成分のあらゆる数又は組み合わせを含有し得る。このキットは、個別の容器、試験管、バイアルなどのあらゆる数の中の上記の構成成分の１以上を含み得るか又は、このような構成成分は、このような容器において様々な組み合わせで組み合わされ得る。キットの構成成分は、先述の方法の手動での実施又は部分的もしくは完全に自動化された実施の何れかのために包装され得る。さらに、装置又はキットとともにその装置又はキットの使用のための説明書が含まれ得る。このようなキット及び装置は、例えば、診断、治療又はその他の適用を含む様々な用途を有し得る。

図１は、ストレプトコッカスＡ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ Ａ）細菌を検出するための、リボソーム増幅の使用の、代表的な実施形態の概略を示す。

本発明を全般的に説明してきたが、単に本発明のある一定の態様及び実施形態の説明目的のために含まれるものであり、何ら本発明を限定するものではない、次の実施例を参照することにより、より容易に理解できよう。全ての表題は読者の便宜のためであり、断りがない限り、表題に続く文章の意味を限定するために使用されるものではない。

図１は、ストレプトコッカス Ａ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ Ａ）細菌を検出するためのリボソーム増幅の使用を示す。簡潔に述べると、ストレプトコッカス Ａの特異的なリボソームタンパク質に対する抗体を支持体に結合させる。試験されるべき試料を抽出し、試料中に含有される細菌を溶解し、リボソームを放出させる（細菌細胞１個あたりおよそ２０，０００個のリボソーム）。次に、放出されたリボソームが抗体に結合できるように、支持体に試料を流す。支持体から未結合リボソーム及びその他の物質を除去するために、この試料を洗浄し、酵素、アミノ酸及び基質をコードするｍＲＮＡの包括的溶液を支持体に流す。抗体に結合したリボソームは、ＰＣＲとは異なり、一貫した温度で、連続的にｍＲＮＡを酵素に翻訳するはずである。翻訳時の酵素は、基質を分解し、この変化は光学的に検出され得る。

同等性
当業者は、本明細書中に記載の本発明の具体的な実施形態に対する多くの同等物を認めるか、又は通常の実験以外のものを使用せずに確認できよう。本発明の具体的な実施形態を考察してきたが、上記の明細書は例証であり、限定的なものではない。この明細書を検討すれば、本発明の多くの変化が当業者にとって明らかとなろう。本発明の全範囲は、同等物のその完全範囲及び明細書とともに、かかる変化とともに、特許請求の範囲を参照して決定されるものである。かかる同等物は、次の特許請求の範囲により包含されるものとする。

Claims (21)

1. （ａ）リボソームを結合させることができる結合剤を含む支持体を、リボソームを含む試料と接触すること；
   （ｂ）試料との接触後に支持体を洗浄すること；
   （ｃ）溶液中でｍＲＮＡをポリペプチドに翻訳するために、リボソームを結合剤に結合させられるようにするのに適切な条件下で、ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液の存在下で支持体を温置すること；
   （ｄ）ポリペプチドの存在を調べること、
   を含む方法。
2. リボソームが病原体に特異的であり、さらに、ポリペプチドの存在に基づき試料中の病原体の存在を調べることを含む、請求項１に記載の方法。
3. 病原体が細菌である、請求項２に記載の方法。
4. 結合剤が、リボソームに特異的に結合できる、請求項１に記載の方法。
5. リボソームが細菌性リボソームであり、少なくとも１つの細菌からリボソームを放出させることをさらに含む、請求項３に記載の方法。
6. 支持体が多孔質材である、請求項１に記載の方法。
7. 多孔質材がニトロセルロースである、請求項３に記載の方法。
8. 結合剤が抗体である、請求項１に記載の方法。
9. 結合剤が、リボソームＲＮＡに結合することができる、請求項１に記載の方法。
10. リボソームＲＮＡに結合することができる物質が核酸である、請求項９に記載の方法。
11. ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液が基質をさらに含む、請求項１に記載の方法。
12. ポリペプチドが酵素である、請求項１１に記載の方法。
13. ポリペプチドを調べることが、酵素に対する基質との酵素の反応の結果得られる反応産物の存在を調べることを含む、請求項１２に記載の方法。
14. ポリペプチドを調べることが、反応産物の存在を光学的に検出することを含む、請求項１３に記載の方法。
15. （ａ）リボソームに結合することができる結合剤を使用して支持体上でリボソームを捕捉すること；
    （ｂ）ｍＲＮＡ及びアミノ酸を含む溶液を用いて捕捉されたリボソームを温置すること；
    （ｃ）温置され、捕捉されたリボソームにより産生されるポリペプチドを検出すること、
    を含む方法。
16. リボソームに結合することができる結合剤を含む支持体を含む、装置。
17. 支持体が多孔質材である、請求項１６に記載の装置。
18. 多孔質材がニトロセルロースである、請求項１７に記載の装置。
19. 結合剤が抗体である、請求項１６に記載の装置。
20. 結合剤が、リボソームＲＮＡに結合することができる物質である、請求項１６に記載の装置。
21. リボソームＲＮＡに結合できる試薬が核酸である、請求項２０に記載の装置。

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