JP2008501328A5 - - Google Patents
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Description
一局面では、本発明は、少なくとも一つのＨＩＶ標的を検出する方法であって、少なくとも２つのオリゴヌクレオチドによって、少なくとも一つの単位複製配列を生成するステップを含み、
該オリゴヌクレオチドが、
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４２８１〜４４３６（配列番号２）；および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４２８１〜４４２９（配列番号３０６）、４２８３〜４４２９（配列番号３０７）、４２８３〜４４３１（配列番号３０８）から選択される配列番号２のフラグメント；
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４３３６〜４４９１（配列番号４）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４３３６〜４４８４（配列番号３１０）、４３３８〜４４８４（配列番号３１１）から選択される配列番号４のフラグメント；
− Ｍ３０５０２ ＨＩＶ２基準分離体の位置４８８９〜５０３６（配列番号５）；
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４１７６〜４４３６（配列番号１）、および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４１７６〜４４２９（配列番号３０５）と同一である、配列番号１のフラグメント；ならびに
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４２３１〜４４９１（配列番号３）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４２３１〜４４８４（配列番号３０９）と同一である、配列番号３のフラグメント；
からなる群から選択される少なくとも一つの基準鋳型配列の特異的増幅で使用するのに適当である方法を提供する。
該オリゴヌクレオチドが、
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４２８１〜４４３６（配列番号２）；および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４２８１〜４４２９（配列番号３０６）、４２８３〜４４２９（配列番号３０７）、４２８３〜４４３１（配列番号３０８）から選択される配列番号２のフラグメント；
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４３３６〜４４９１（配列番号４）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４３３６〜４４８４（配列番号３１０）、４３３８〜４４８４（配列番号３１１）から選択される配列番号４のフラグメント；
− Ｍ３０５０２ ＨＩＶ２基準分離体の位置４８８９〜５０３６（配列番号５）；
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４１７６〜４４３６（配列番号１）、および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４１７６〜４４２９（配列番号３０５）と同一である、配列番号１のフラグメント；ならびに
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４２３１〜４４９１（配列番号３）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４２３１〜４４８４（配列番号３０９）と同一である、配列番号３のフラグメント；
からなる群から選択される少なくとも一つの基準鋳型配列の特異的増幅で使用するのに適当である方法を提供する。
別の局面では、本発明は、少なくとも一つのＨＩＶ標的を検出する方法であって、少なくとも２つのオリゴヌクレオチドによって、少なくとも一つの単位複製配列を生成するステップ
ここで、前記オリゴヌクレオチドは、
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４２８１〜４４３６（配列番号２）；および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４２８１〜４４２９、４２８３〜４４２９、４２８３〜４４３１から選択される配列番号２のフラグメント（配列番号３０６、３０７、および３０８）；
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４３３６〜４４９１（配列番号４）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４３３６〜４４８４、４３３８〜４４８４から選択される配列番号４のフラグメント（配列番号３１０および３１１）；
− Ｍ３０５０２ ＨＩＶ２基準分離体の位置４８８９〜５０３６（配列番号５）；
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４１７６〜４４３６（配列番号１）、および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４１７６〜４４２９（配列番号３０５）と同一である、配列番号１のフラグメント；ならびに
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４２３１〜４４９１（配列番号３）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４２３１〜４４８４（配列番号３０９）と同一である、配列番号３のフラグメント；
からなる群から選択される少なくとも一つの基準鋳型配列の特異的増幅で使用するのに適当な「定量に配慮されている」かつ／または「マルチプレックス法に配慮されている」プライマーである、
を含む方法を提供する。
ここで、前記オリゴヌクレオチドは、
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４２８１〜４４３６（配列番号２）；および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４２８１〜４４２９、４２８３〜４４２９、４２８３〜４４３１から選択される配列番号２のフラグメント（配列番号３０６、３０７、および３０８）；
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４３３６〜４４９１（配列番号４）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４３３６〜４４８４、４３３８〜４４８４から選択される配列番号４のフラグメント（配列番号３１０および３１１）；
− Ｍ３０５０２ ＨＩＶ２基準分離体の位置４８８９〜５０３６（配列番号５）；
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ 基準分離体の位置４１７６〜４４３６（配列番号１）、および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４１７６〜４４２９（配列番号３０５）と同一である、配列番号１のフラグメント；ならびに
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４２３１〜４４９１（配列番号３）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４２３１〜４４８４（配列番号３０９）と同一である、配列番号３のフラグメント；
からなる群から選択される少なくとも一つの基準鋳型配列の特異的増幅で使用するのに適当な「定量に配慮されている」かつ／または「マルチプレックス法に配慮されている」プライマーである、
を含む方法を提供する。
Claims (1)
- 少なくとも一つのＨＩＶ標的を検出する方法であって、
少なくとも２つのオリゴヌクレオチドによって、少なくとも一つの単位複製配列を生成するステップを含み、
該オリゴヌクレオチドは、
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ基準分離体の位置４２８１〜４４３６（配列番号２）；および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４２８１〜４４２９（配列番号３０６）、４２８３〜４４２９（配列番号３０７）、４２８３〜４４３１（配列番号３０８）から選択される配列番号２のフラグメント；
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４３３６〜４４９１（配列番号４）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４３３６〜４４８４（配列番号３１０）、４３３８〜４４８４（配列番号３１１）から選択される配列番号４のフラグメント；
− Ｍ３０５０２ ＨＩＶ２基準分離体の位置４８８９〜５０３６（配列番号５）；
− Ｋ０３４５５ ＨＩＶ１−Ｍ基準分離体の位置４１７６〜４４３６（配列番号１）、および該ＨＩＶ１−Ｍ分離体の位置４１７６〜４４２９（配列番号３０５）と同一である、配列番号１のフラグメント；ならびに
− Ｌ２０５８７ ＨＩＶ１−Ｏ基準分離体の位置４２３１〜４４９１（配列番号３）、および該ＨＩＶ１−Ｏ分離体の位置４２３１〜４４８４（配列番号３０９）と同一である、配列番号３のフラグメント；
からなる群から選択される少なくとも一つの基準鋳型配列の特異的増幅で使用するのに適当なプライマーであり、
該基準鋳型配列は、ＨＩＶ１−Ｍ、ＨＩＶ１−Ｏ、ＨＩＶ２−Ａ、およびＨＩＶ２−Ｂのサブタイプの少なくとも一つをリアルタイムで定量的にマルチプレックスで検出できるようにするプライマーを構築および生成するのに適した基準であるという特異的技術的特徴を共有し；
および、場合により、少なくとも一つのプローブによって該単位複製配列を検出するステップを含む、方法。
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