JP2008054637A - 混合培養による二次代謝産物のスクリーニング方法及び製造方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】16SrRNA遺伝子の塩基配列が特定の配列からなり該配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の被検菌を混合培養し、培養液中に二次代謝産物が含まれているかを確認することを含む二次代謝産物のスクリーニング方法、培養液中に生産される二次代謝産物を採取する二次代謝産物の製造方法および培養液中に二次代謝産物を蓄積させた培養物からなる。
【選択図】なし
Description
Bibb M, The regulation of antibiotic production in Streptomyces coelicolorA3(2).Microbiology. 1996 142:1335-44 田中晴雄、土屋友房編、微生物薬品化学改訂第4版、P325-326 南江堂
[1]16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の被検菌を混合して培養し、培養液中に二次代謝産物が含まれているかを確認することを含む二次代謝産物のスクリーニング方法。
[2]コリネ型細菌に属する微生物が、共存する微生物の二次代謝産物産生を誘導する能力をもつ微生物である、[1]に記載のスクリーニング方法。
[3]コリネ型細菌に属する微生物が、ストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans)の色素産生を誘導する能力をもつ微生物である、[1]に記載のスクリーニング方法。
[4]コリネ型細菌に属する微生物が、ツカムレラ (Tsukamullera)属 に属する微生物である、[1]〜[3]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
[5]ツカムレラ(Tsukamullera)属に属する微生物が、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) に属する微生物である、[4]に記載のスクリーニング方法。
[6]ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) に属する微生物が、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) TP-B0596株である、[5]に記載のスクリーニング方法。
[7]被検菌が放線菌または糸状菌である[1]〜[6]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
[8]放線菌が、クリプトバクテリウム(Cryptobacterium)、ルブロバクター(Rubrobacter)、アクチノバチュラム(Actinobaculum)、アクチノマイセス(Actinomyces)、コリネバクテリウム(Corynebacterium)、ゴルドニア(Gordonia)、マイコバクテリウム(Mycobacterium)、ノカルディア(Nocardia)、ロドコッカス(Rhodococcus)、ミクロスファエラ(Microsphaera)、クリプトスポランギウム(Cryptosporangium)、ミクロコッカス(Micrococcus)、アースロバクター(Arthrobacter)、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)、セルロモナス(Cellulomonas)、ミクロバクテリウム(Microbacterium)、アグロマイセス(Agromyces)、クリオバクテリウム(Cryobacterium)、ミクロモノスポラ(Micromonospora)、アクチノプラネス(Actinoplanes)、ダクチロスポランギウム(Dactylosporangium)、ノカルディオイデス(Nocardioides)、シュードノカルディア(Pseudonocardia)、アクチノビスポラ (Actinobispora)、アミコラトプシス(Amycolatopsis)、サッカロモノスポラ(Saccharomonospora)、アクチノシネマ(Actinosynnema)、アクチノキネオスポラ(Actinokineospora)、ストレプトマイセス(Streptomyces)、キタサトスポラ(Kitasatospora)、ストレプトスポランギウム(Streptosporangium)、ミクロビスポラ(Microbispora)、ミクロテトラスポラ(Microtetraspora)、ノノムラエ(Nonomuraea)、ノカルディオプシス(Nocardiopsis)、アクチノマデュラ(Actinomadura)、キネオコッカス(Kineococcus)、キネオスポリア(Kineosporia)及びサーモビスポラ(Thermobispora)からなる群より選択されるいずれかの属に属する放線菌である[7]に記載のスクリーニング方法。
[9]糸状菌がアクレモニウム(Acremonium)、アルテルナリア(Alternaria)、アスペルギルス(Aspergillus)、ボーベリア(Beauveria)、ボトリティス(Botorytis)カララ(Chalara)、セルコスポラ(Cercospora)、セファロスフォリウム(Cephalosporium)、クリソスポリウム(Chrysosporium)、コクシジオイデス(Coccidioides)、クリプトコッカス(Cryptococcus)、クルブラリア(Curvularia)、シリンドロカルポン(Cylindrocarpon)、シリンドロクラディウム(Cylindrocladium)、カニングハメラ(Cunninghamella)、ドレクスレラ(Drechslera)、エピコッカム(Epicoccum)、ユーペニシリウム(Eupenicillium)、フザリウム(Fusarium)、ジオトリカム(Geotrichum)、グリオクラディウム(Gliocladium)、グラフィウム(Graphium)、ヘルミントスポリウム(Helminthosporium)、ヒアロデンドロン(Hyalodendron)、イサリア(Isaria)、メタルヒジウム(Metarhizium)、モニリア(Monilia)、モルティレラ(Mortierella)、ムコール(Mucor)、ノデュリオスポリウム(Nodulisporium)、パエシロマイセス(Paecilomyces)、ペニシリウム(Penicillium)、ピリキュラリア(Pyricularia)、フィアロマイセス(Phialomyces)、リゾクトニア(Rhizoctonia)、スポロスリクス(Sporopthrix)、トリコヒートン(Trichophyton)、トリコデルマ(Trichocderma)及びトリコセシウム(Trichothecium)からなる群より選択されるいずれかの属に属する糸状菌である[7]に記載のスクリーニング方法。
[10]二次代謝産物が抗菌性抗生物質、制癌性抗生物質、抗寄生虫物質または酵素阻害剤である[1]〜[9]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
[11]前記コリネ型細菌及び被検菌株がいずれも生菌体として共存した状態で培養することを特徴とする[1]〜[10]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
[12]16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の放線菌または糸状菌を混合して培養し、培養液中に生産される二次代謝産物を採取することを特徴とする二次代謝産物の製造方法。
[13]コリネ型細菌に属する微生物が、共存する放線菌または糸状菌の二次代謝産物産生を誘導する能力をもつ微生物である、[12]に記載の二次代謝産物の製造方法。
[14]コリネ型細菌に属する微生物が、ストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans)の色素産生を誘導する能力をもつ微生物である、[12]に記載の二次代謝産物の製造方法。
[15]コリネ型細菌に属する微生物が、ツカムレラ (Tsukamullera)属 に属する微生物である、[12]〜[14]のいずれかに記載の二次代謝産物の製造方法。
[16]ツカムレラ(Tsukamullera)属に属する微生物が、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) に属する微生物である、[15]に記載の二次代謝産物の製造方法。
[17]ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) に属する微生物が、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) TP-B0596株である、[16]に記載の二次代謝産物の製造方法。
[18]放線菌が、クリプトバクテリウム(Cryptobacterium)、ルブロバクター(Rubrobacter)、アクチノバチュラム(Actinobaculum)、アクチノマイセス(Actinomyces)、コリネバクテリウム(Corynebacterium)、ゴルドニア(Gordonia)、マイコバクテリウム(Mycobacterium)、ノカルディア(Nocardia)、ロドコッカス(Rhodococcus)、ミクロスファエラ(Microsphaera)、クリプトスポランギウム(Cryptosporangium)、ミクロコッカス(Micrococcus)、アースロバクター(Arthrobacter)、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)、セルロモナス(Cellulomonas)、ミクロバクテリウム(Microbacterium)、アグロマイセス(Agromyces)、クリオバクテリウム(Cryobacterium)、ミクロモノスポラ(Micromonospora)、アクチノプラネス(Actinoplanes)、ダクチロスポランギウム(Dactylosporangium)、ノカルディオイデス(Nocardioides)、シュードノカルディア(Pseudonocardia)、アクチノビスポラ (Actinobispora)、アミコラトプシス(Amycolatopsis)、サッカロモノスポラ(Saccharomonospora)、アクチノシネマ(Actinosynnema)、アクチノキネオスポラ(Actinokineospora)、ストレプトマイセス(Streptomyces)、キタサトスポラ(Kitasatospora)、ストレプトスポランギウム(Streptosporangium)、ミクロビスポラ(Microbispora)、ミクロテトラスポラ(Microtetraspora)、ノノムラエ(Nonomuraea)、ノカルディオプシス(Nocardiopsis)、アクチノマデュラ(Actinomadura)、キネオコッカス(Kineococcus)、キネオスポリア(Kineosporia)及びサーモビスポラ(Thermobispora)からなる群より選択されるいずれかの属に属する放線菌である[12]〜[17]のいずれかに記載の二次代謝産物の製造方法。
[19]糸状菌がアクレモニウム(Acremonium)、アルテルナリア(Alternaria)、アスペルギルス(Aspergillus)、ボーベリア(Beauveria)、ボトリティス(Botorytis)カララ(Chalara)、セルコスポラ(Cercospora)、セファロスフォリウム(Cephalosporium)、クリソスポリウム(Chrysosporium)、コクシジオイデス(Coccidioides)、クリプトコッカス(Cryptococcus)、クルブラリア(Curvularia)、シリンドロカルポン(Cylindrocarpon)、シリンドロクラディウム(Cylindrocladium)、カニングハメラ(Cunninghamella)、ドレクスレラ(Drechslera)、エピコッカム(Epicoccum)、ユーペニシリウム(Eupenicillium)、フザリウム(Fusarium)、ジオトリカム(Geotrichum)、グリオクラディウム(Gliocladium)、グラフィウム(Graphium)、ヘルミントスポリウム(Helminthosporium)、ヒアロデンドロン(Hyalodendron)、イサリア(Isaria)、メタルヒジウム(Metarhizium)、モニリア(Monilia)、モルティレラ(Mortierella)、ムコール(Mucor)、ノデュリオスポリウム(Nodulisporium)、パエシロマイセス(Paecilomyces)、ペニシリウム(Penicillium)、ピリキュラリア(Pyricularia)、フィアロマイセス(Phialomyces)、リゾクトニア(Rhizoctonia)、スポロスリクス(Sporopthrix)、トリコヒートン(Trichophyton)、トリコデルマ(Trichocderma)及びトリコセシウム(Trichothecium)からなる群より選択されるいずれかの属に属する糸状菌である[12]〜[17]のいずれかに記載の二次代謝産物の製造方法。
[20]二次代謝産物が抗菌性抗生物質、制癌性抗生物質、抗寄生虫物質または酵素阻害剤である[12]〜[19]のいずれかに記載の二次代謝産物の製造方法。
[21]前記コリネ型細菌及び放線菌または糸状菌がいずれも生菌体として共存した状態で培養することを特徴とする[12]〜[20]のいずれかに記載の二次代謝産物の製造方法。
[22]16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の放線菌または糸状菌を混合して培養し、培養液中に二次代謝産物を蓄積させた培養物。
本発明の二次代謝産物のスクリーニング方法は、16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の被検菌を混合して培養し、培養液中に二次代謝産物が含まれているかを確認することを含む。
本発明の二次代謝産物の製造方法は、16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の放線菌または糸状菌を混合して培養し、培養液中に産生される二次代謝産物を採取することを特徴とする。
本発明は、16SrRNA遺伝子の塩基配列が配列番号1記載の塩基配列と95%以上の相同性を示すコリネ型細菌に属する少なくとも1種の微生物及び少なくとも1種の放線菌または糸状菌を混合して培養し、培養液中に二次代謝産物を蓄積させた培養物も包含する。この培養物は、上記本発明の製造方法において、所定量の二次代謝産物が産生され、培養液に蓄積された時点で培養を終了して得られる培養液であることができる。あるいは、この培養液をさらに処理や加工したものであることもできる。この培養物は、二次代謝産物を含有しており、そのままあるいはさらに処理や加工を施して、二次代謝産物含有物として利用することができる。
ツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis) TP-B0596株の分離と同定
ニュートリエントブロース軟寒天にストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans) TK23株の胞子約100万個を混ぜ、ベネットグルコース培地上に重層する。さらにその軟寒天の上に被検菌をエーゼで接種し、30℃で培養する。2〜3日後にストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans)が一面に生育した際、被検菌を中心として、赤色色素が誘導されている菌株を得る。被検菌には自然環境より分離した82菌株を使用し、赤色色素を誘導したツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis) TP-B0596株を得た。
0.8 % Nutrient Broth(Difco)、0.5 % 寒天末
0.1 % 酵母抽出物、0.1 % 肉エキス(エルリッヒ)、0.2 % NZ Amine TypeA、1 %グルコース、2 %寒天、pH 7.2
培養温度30℃〜37℃
桿菌(0.8 x 2.0〜3.0 mm)
グラム陽性
胞子形成能無し
運動性無し
・プライマーの配列(下記9種類のプライマーを使用)
9F 5'-GAGTTTGATCCTGGCTCAG (配列番号2)
339F 5'-CTCCTACGGGAGGCAGCAG (配列番号3)
515F 5'-GTGCCAGCAGCCGCGGT (配列番号4)
785F 5'-GGATTAGATACCCTGGTAGTC (配列番号5)
1099F 5'-GCAACGAGCGCAACCC (配列番号6)
1541R 5'-AAGGAGGTGATCCAGCC (配列番号7)
1115R 5'-AGGGTTGCGCTCGTTG (配列番号8)
802R 5'-TACCAGGGTATCTAATCC (配列番号9)
536R 5'-GTATTACCGCGGCTGCTG (配列番号10)
混合培養を用いた抗生物質スクリーニング方法
自然環境から分離した放線菌をV-22液体培地で30℃3日間培養した。一方、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis) TP-B0596株をV-22液体培地で30℃、1日間培養した。培養液をそれぞれ3 %、1 %づつA-3M培地に植菌し、30℃で5〜10日間培養した。培養液を等量のブタノールで抽出し、抗菌アッセイ用サンプルとした。
0.1 % 澱粉、0.5 % グルコース、0.3 % NZ-case、0.2 % 酵母抽出物、0.5 % トリペプトン、0.1 % K2HPO4、0.5 % MgSO4・7H2O、0.3 % CaCO3、pH 7.0
A-3M培地
0.5 % グルコース、0.2 % グリセロール、0.2 % 澱粉、1.5 % ファーマメディア(Pharmamedia)、0.3 %酵母抽出物、0.1 % HP-20 (脱気したあとpH調整後に混合した)、pH 7.0
実施例2
混合培養を用いた抗生物質スクリーニング方法(放線菌)
ツカムレラ・パウロメタボラ(Tsukamurella paurometabola) NBRC 16120をNo.702液体培地で30℃、2日間振とう培養した。また、ツカムレラ・ウラチスラビエンシス(Tsukamurella wratislaviensis )JCM 9689、ツカムレラ・ストランドジェルデイ(Tsukamurella strandjordii )JCM 11487、ツカムレラ・スプマエ(Tsukamurella spumae) JCM 12608及びツカムレラ・シュードスプマエ(Tsukamurella pseudospumae )JCM 13375を使用した場合、ISP-2液体培地で28℃、3日間振とう培養した。いずれかの培養液1%と凍結保存されている自然環境分離放線菌の培養液1%をC液体培地に植菌し、28℃で4日間振とう培養した。培養液をブタノールで抽出し、抗菌アッセイ用サンプルとした。
1 % ポリペプトン、0.2 % 酵母抽出物、0.1 % MgSO4・7H2O、pH 7.0
ISP-2液体培地
0.4 % Bacto酵母抽出物、1 % Bacto 麦芽抽出物、0.4 % グルコース、pH 7.3
C液体培地
2 % グルコース、2 % 澱粉2 % Soy Pro、0.5%酵母抽出物、0.25 % NaCl、0.32 % CaCO3、0.4 % グルコース、0.2 % ミネラル溶液 (CuSO4 5H2O、1.25 g、ZnSO4 7H2O、1.25 g、MnCl2 4H2O、1.25 g/500 ml)、pH 7.4
混合培養を用いた抗生物質スクリーニング方法(糸状菌)
自然環境分離糸状菌をF1液体培地で25℃、3日間培養した。一方、ツカムレラ・パウロメタボラ(Tsukamurella paurometabola) NBRC 16120をNo.702液体培地で30℃、2日間振とう培養した。また、ツカムレラ・ウラチスラビエンシス(Tsukamurella wratislaviensis )JCM 9689、ツカムレラ・ストランドジェルデイ(Tsukamurella strandjordii )JCM 11487、ツカムレラ・スプマエ(Tsukamurella spumae) JCM 12608及びツカムレラ・シュードスプマエ(Tsukamurella pseudospumae )JCM 13375を使用した場合、ISP-2液体培地で28℃、3日間振とう培養した。ツカムレラ(Tsukamurella)の培養液1%と自然環境分離糸状菌の培養液1%をF1液体培地に植菌し、25℃で4日間振とう培養する。培養液をブタノールで抽出し、抗菌アッセイ用サンプルとした。
1 % グルコース、2 % 澱粉、2 % Soy Pro、0.1 % KH2PO4、0.05 % MgSO4 7H2O、pH無調製
ストレプトマイセス(Streptomyces) sp. S-501株が混合培養により生産するカイニンの単離・精製、構造決定
実施例1において(表1参照)、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)を産生することが確認されたストレプトマイセス(Streptomyces) sp. S-501株を用い、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)の製造を試みた。
V-22培地にS-501株を接種して、30℃で4日間回転振盪培養し(200rpm)、種母(1)を得た。
V-22培地にツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis)TP-B0596株を接種し30℃で1日、回転振盪培養し(200rpm)、種母(2)を得た。
A-3M培地100 mlを含む500 ml容K型フラスコ30本に上記の種母(1)を3 %(v/v) 、種母(2)を0.3%(v/v)加え、30℃で7日間回転振盪培養した(200rpm)。
1)で得た培養液(10L)を遠心(8,000rpm、10分間)分離し、上清部分と菌体部分に分離した。得られた菌体に100%アセトン1.5Lを加え、1時間撹拌した。これを遠心(8,000rmp、10分間)分離し、菌体抽出液と菌体部分に分離した。さらに、この菌体部分に100%アセトン1.5Lを加え、1時間撹拌した。これを遠心(8,000rpm、10分間)分離し、菌体抽出液と菌体部分に分離した。
この粗抽出物100mgを分取し、30%含水メタノール 5mlで洗浄し、遠心(3,000rpm、5分間)分離した。その不溶分を減圧下で乾燥した。この操作を30回に分けて行い、S-501株生産物の精製物(2.09g)を得た。
S-501株生産物は、LC/MSにより分子量は610と推定された。1H-NMR、13C-NMR、各種二次元NMR解析により構造解析を行った。
ストレプトマイセス(Streptomyces)sp. S-522株が混合培養により生産するアルキベマイシン A(Alchivemycin A)の単離・精製、構造決定
実施例1において(表1参照)、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)を産生することが確認されたストレプトマイセス(Streptomyces) sp. S-522株を用い、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)の製造を試みた。
V-22培地にS-522株を接種して、30℃で4日間回転振盪培養し(200rpm)、種母(1)を得た。
V-22培地にツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis ) TP-B0596株を接種し30℃で1日間回転振盪培養し(200rpm)、種母(2)を得た。
A-3M培地100 mlを含む500 ml容K型フラスコ30本に上記の種母(1)を3 %(v/v) 、種母(2)を0.3%(v/v)加え、30℃で7日間回転振盪培養した(200rpm)。
1)で得た培養液(3.0L)に半量のn-ブタノールを加え1時間攪拌抽出し、n-ブタノール層を取り出した。得られたn-ブタノール層を減圧下で濃縮して粗抽出物(8g)を得た。粗抽出物をシリカゲルカラム(関東化学製、シリカゲル60N、63〜210 nm、220 x 40 mm I.D.)に吸着させ、クロロホルム/メタノール(20:1〜0:1)で溶出した。各溶出画分は高速液体クロマトグラフィー(HPLC)で分析し、クロロホルム/メタノール(4:1)と(2:1)の画分を集め、これを減圧下で溶媒を留去し、さらに半量の酢酸エチルで抽出した。この酢酸エチル抽出液を減圧下で濃縮し、濃縮物を適量のDMSOに溶解して逆層型ODS結合シリカゲルカラム(YMC製、ODS-A、250×55 mm I.D.)に吸着させ、アセトニトリル/0.15%リン酸二水素カリウム液(pH 3.5)(8:2〜2:8)で溶出した。アセトニトリル/0.15%リン酸二水素カリウム液(pH 3.5) (8:2)の画分を集め、溶媒を減圧下で留去した後、半量の酢酸エチルで抽出した。この酢酸エチル抽出液を減圧下で濃縮し、さらに半量の酢酸エチルで抽出し、S-522株生産物の精製物 (25 mg)を得た。
S-522株生産物の高分解能FABMS解析を行い、found 648.3754 [M+H]+, calcd 648.3745 (for C35H54O10N)の値を得た。また1H-NMR、13C-NMR、各種二次元NMR解析により構造解析を行った。
ストレプトマイセス(Streptomyces)sp. S-558株が混合培養により生産する抗生物質Antibiotic A 33853の単離・精製、構造決定
実施例1において(表1参照)、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)を産生することが確認されたストレプトマイセス(Streptomyces)sp. S-558株を用い、TP-B0596株との混合培養で抗菌成分(二次代謝産物)の製造を試みた。
V-22培地にS-558株を接種して、30℃で4日間回転振盪培養した(200rpm)、種母(1)を得た。
V-22培地にツカムレラ・プルモニス(Tsukamullera pulmonis) TP-B0596株を接種し30℃で1日間回転振盪培養(200rpm)、種母(2)を得た。
A-3M培地100 mlを含む500 ml容K型フラスコ30本に上記の種母(1)を3 %(v/v) 、種母(2)を0.3%(v/v)加え、30℃で6日間回転振盪培養した(200rpm)。
1)で得た培養液(30L)に半量のn-ブタノールを加え1時間攪拌抽出し、n-ブタノール層を取り出した。得られたn-ブタノール層を減圧下で濃縮して粗抽出物(42g)を得た。粗抽出物をシリカゲルカラム(関東化学製、シリカゲル60N、63〜210 nm、220 x 40 mm I.D.)に吸着させ、クロロホルム/メタノール(20:1〜0:1)で溶出した。クロロホルム/メタノール(4:1)の画分を集め、その溶媒を減圧下で留去し、さらに半量の酢酸エチルで抽出した。この酢酸エチル抽出液を減圧下で濃縮し、濃縮物を適量のDMSOに溶解して逆層型ODS結合シリカゲルカラム(YMC製、ODS-A、250×55 mm I.D.)に吸着させ、アセトニトリル/0.15%リン酸二水素カリウム液(pH 3.5)(8:2〜2:8)で溶出した。アセトニトリル/0.15%リン酸二水素カリウム液(pH 3.5)(6:4)の画分を集め、溶媒を減圧下で留去した後、半量の酢酸エチルで抽出した。この酢酸エチル抽出液を減圧下で濃縮して粗精製物を得た。得られた粗精製物をDMSOに溶解しHPLC( Nacalai tesque製、COSMOSIL、10×2 mm)を利用して分取した。各溶出画分の溶媒を減圧下で留去した後、半量の酢酸エチルで抽出し、薄い黄色粉末のS-558株生産物の精製物(2.9 mg)を得た。
S-558株生産物はLC/MSにより分子量は372と推定された。1H-NMR、13C-NMR、各種二次元NMR解析により構造解析を行い、ストレプトマイセス(Streptomyces) sp.S-558株が混合培養により生産する物質は、組成式がC20H13N3O6であるAntibiotic A 33853であると同定した。Antibiotic A 33853は1984年にK. H. Michelらによって報告された物質である。[Michel KH, Boeck LD, Hoehn MM, Jones ND, Chaney MO. The discovery, fermentation, isolation, and structure of antibiotic A33853 and its tetraacetyl derivative. J Antibiot (Tokyo). 1984 37(5):441-5.]
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