JP7032732B2 - プラテンシマイシンの製造方法 - Google Patents
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Description
受託番号NITE P-02560のストレプトマイセス・ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus)HOK021株と、細胞壁にミコール酸を含有する微生物を混合して培養する工程と、
得られた培養物からプラテンシマイシンを採取する工程と、を含む。
1.製造方法
[HOK021の分離]
東京大学大学院農学生命科学研究科付属演習林(北海道演習林、北海道富良野市)において採取した土壌から希釈フェノール法及びISP4培地(培地成分:1% Soluble starch, 0.1% K2HPO4, 0.1% MgSO4, 0.1% NaCl, 0.2% (NH4)2SO4, 0.2% CaCO3, 0.0001% FeSO4, 0.0001% MnCl2, 0.0001% ZnSO4, 2.0% agar.)を用いて放線菌を分離した。分離放線菌HOK021株の部分16S rDNA配列をPCRにより増幅し、サンガー法により塩基配列を決定したところ、基準株であるStreptomyces hygroscopicus subsp. glebosus(遺伝子登録番号AB184479)と99.6%(1463/1469)の相同性を示した。HOK021株をストレプトマイセス・ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus) HOK021株と命名した。
Streptomyces hygroscopicus HOK021株の胞子液グリセロールストック(-80℃保存)をISP2寒天培地(培地成分:0.4% Yeast extract, 1% Malt extract, 0.4% glucose, 2.0% agar.)に植菌し、30℃で5日間静置培養を行った。ミコール酸含有菌であるツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis)TP-B0596の菌体グリセロールストック(-80℃保存)をISP2寒天培地に植菌し、30℃で3日間静置培養を行った。K-1型フラスコに100mlのV-22培地(培地成分:1% Soluble starch, 0.5% Glucose, 0.3% NZ-case, 0.2% Yeast extract, 0.1% Tryptone, 0.1% K2HPO4, 0.05% MgSO4, 0.3% CaCO3(pH 7))を入れた培地に、寒天培地に生育したHOK021株菌体を植菌し、3日間(30℃、200rpm)前培養を行った。K-1型フラスコに100mlのV-22培地を入れた培地に、寒天培地に生育したTP-B0596株菌体を植菌し、2日間(30℃、200rpm)前培養を行った。HOK021株の前培養液を3ml、TP-B0596株の前培養液1mlを、K-1型フラスコに100mlのA-3M培地(培地成分:2% Soluble starch, 2% Glycerol, 1.5% Pharmamedia, 0.5% Glucose, 0.3% Yeast extract, 1% Diaion(登録商標)HP-20(pH 7))を入れた培地に同時に植菌し、その後8日間(30℃、200rpm)本培養を行った。
本培養液(合計10.8L)を等量の酢酸エチル(10.8L、Wako 特級試薬)を用いて一回目の撹拌抽出(約1時間)を行い、遠心分離によって酢酸エチル相と水相を分離し、酢酸エチル相を回収した。残った水相に対し、さらに等量の酢酸エチル(10.8L)を用いて二回目の撹拌抽出(約1時間)を行い、遠心分離によって酢酸エチル相と水相を分離し、酢酸エチル相を回収した。回収した一回目と二回目の酢酸エチル相を合わせ、エバポレーターによる減圧下、酢酸エチルを留去し、約8.8gのクルード抽出物を得た。
最初に、移動相にアセトニトリル(Wako特級試薬)とmilliQ(登録商標)水を用いた中圧ODSカラムを使用し、クルード抽出物の粗精製を行った。クルード抽出物一回のカラムにつき約0.6gをDMSOにより0.1g/ml濃度に溶解し、20%アセトニトリル溶媒に置換したODSカラム(4i.d.×24cm、約300ml)に添加した。20%アセトニトリル溶媒、40%アセトニトリル溶媒、60%アセトニトリル溶媒、80%アセトニトリル溶媒、100%アセトニトリル溶媒、それぞれ300mlを用いて溶出した。分取した60%アセトニトリル溶媒の前半150mlにプラテンシマイシンを含む画分を得た。エバポレーターを用いてアセトニトリルを留去し、残った水相を-80℃ディープフリーザー中で凍結させ、凍結乾燥により残った水相を留去し、152mgの粗精製物を得た。
次に、移動相にアセトニトリル(Wako特級試薬)と0.1%ギ酸緩衝液を用いたC18カラムを使用し、HPLC精製を行った。粗精製物152mgをDMSOにより約50mg/ml 濃度に溶解し、45%アセトニトリル溶媒に置換したXTerra(登録商標)カラム(5μm、10i.d.×150mm、Waters)に、一回に20μLずつ注入した。流速3.0 ml/min、アイソクラティックで溶出し、保持時間14.0分に溶出したピークを分取し、プラテンシマイシンを含む画分を得た。エバポレーターを用いてアセトニトリルを留去し、残った緩衝液相を-80℃ディープフリーザー中で凍結させ、凍結乾燥により残った水相を留去し、粗精製物を得た。
次に、移動相にアセトニトリル(Wako特級試薬)と0.1%ギ酸緩衝液を用いたC18カラムを使用し、粗精製物からプラテンシマイシンのHPLC精製を行った。精製物をDMSOにより約50mg/ml 濃度に溶解し、65%アセトニトリル溶媒に置換したCOSMOSIL(登録商標)5PE-MSカラム(5μm、10i.d.×250mm、ナカライ)に、一回に20μLずつ注入した。流速3.0ml/min、アイソクラティックで溶出し、保持時間11.7分に溶出したピークを分取し、プラテンシマイシンを含む画分を得た。エバポレーターを用いてアセトニトリル及び緩衝液相を留去し、3.8mgの精製物を得た。
[プラテンシマイシンの精製(3)]で得られた精製物の物理化学的特性を以下に示す。
(A)外観:淡黄色粉末
(B)分子量:442.48
(C)分子式:C24H27NO7
(D)HR QTOF ESI MS(ポジティブ):実測値442.1860 [M+H]+
計算値442.1860 (for C24H28NO7 +)
精製物の1H-NMRデータを表1に示す。なお、表1中の「No.」欄の数字は、[化1]に示すプラテンシマイシンを構成する炭素の位置番号に対応している(IUPAC命名法に従うものではない)。化学シフト(δH)は、ppmで表現され、1H-NMRは500MHzで分析され、重溶媒として、ピリジン-d5を用いた。
Claims (1)
- 受託番号NITE P-02560のストレプトマイセス・ハイグロスコピカス(Streptomyces hygroscopicus)HOK021株と、ツカムレラ・プルモニス(Tsukamurella pulmonis)TP-B0596株を混合して培養する工程と、
得られた培養液からプラテンシマイシンを搾取する工程と、を含むプラテンシマイシンの製造方法。
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JP2018036077A JP7032732B2 (ja) | 2018-03-01 | 2018-03-01 | プラテンシマイシンの製造方法 |
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第32回(2017年度)日本放線菌学会大会講演要旨集,2017年09月07日,P18, 111 |
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