JP2007526999A - 多重検出プローブ - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は包括的に化学分析の分野に関する。より詳細には、標的分子の高感度で高スループットの検出及び分析用のタグ試薬に関する。
本願は、2004年2月27日付けで出願された、米国仮出願番号第60/548,635号に対する優先権を主張する非仮出願である。
化学標識、他にタグ又はシグナル基として知られているものは、化学分析において広範に用いられている。使用される分子の種類としては、放射性原子、蛍光試薬、発光試薬、金属含有化合物、電子吸収物質及び光吸収化合物が挙げられる。多数の異なる種類の分子は、質量分析法により識別されることができるタグとして用いられている。化学シグナル基は反応性基と組み合わすことができ、そのため、標的と共有結合することが可能であり、物質が検出される。
本発明の実施の形態は、標的分子の検出及び分析用の放出(release)タグ化合物の使用に関する組成物及び方法を提供する。これらは分子プローブのシグナル強度を増強させ、高感度で高スループットの多重分析を可能とする。リポソームの実施の形態は好ましくは、1〜2×108の数の範囲である複数の質量タグ分子を含有し、この質量タグ分子はより強力なシグナリングを提供し、且つ分子のかなり高感度な多重分析を可能とする。他の実施の形態では、桁違いに多くの(many orders of magnitude more)質量タグ分子を含むこともできる。例えば、0.5μmの直径を有する固体粒子は、最大2×1010個の質量タグ分子を含むことができる。さらに他の実施の形態では、実施の形態のサイズ及び質量タグ分子の密度に応じていっそう多くの質量タグ分子を含むことができる。しかし、通常1×1020個未満、及びより好ましくは1×1015個未満の分子が存在する。
する分子である。本明細書中に用いられる場合、「ベシクル」は、分子をベシクル内に被包してもよい。実施の形態としては、被包ベシクル、単層ベシクル及び多層ベシクルが挙げられるが、これらに限定されない。多様なベシクルは好ましくは、複数のリン脂質を好ましくは含むリポソームを含んでいる。特定の実施の形態では、質量タグ分子がリン脂質自体と結合できる。他の分子、例えばコレステロール又は他の疎水性分子も、質量タグ分子として疎水性相互作用を介して脂質二層中に被包されることができる。
もよい可溶性ビーズ、又は可溶性カプセルを含む。さらなる実施の形態では、第1のプローブ及び第2のプローブが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子を含み、この分子が固定化されてもよい。さらなる実施の形態では、第1の質量タグ分子及び第2の質量タグ分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド若しくは多糖等の生体高分子;ブロックコポリマー等の合成高分子;生体高分子若しくは合成高分子と結合した両親媒性分子、又はポリヌクレオチド、ポリペプチド、多糖等、若しくはブロックコポリマーと結合した両親媒性分子である。
ル膜のそれぞれの上に吸着される。さらなる実施の形態では、質量タグ分子が、ベシクル膜の少なくとも一部を構成する。さらなる実施の形態では、第1の外側のベシクル及び第2の外側のベシクルのそれぞれが、少なくとも1つの被包されたベシクル、すなわち質量タグ分子を含む外側のベシクルと被包されたベシクルの少なくとも一部をさらに含み、外側のベシクルと被包されたベシクルが、容易に破壊されて、質量タグ分子を放出する。さらなる実施の形態では、外側のベシクルが、リポソーム、ポリマーソーム、又は油/水型(O/W)エマルジョン、水/油/水型(W/O/W)エマルジョン若しくは固体/油/水型(S/O/W)エマルジョン等のエマルジョンである。さらなる実施の形態では、プローブが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子をそれぞれ含み、この分子が固定化されてもよい。さらなる実施の形態では、第1の質量タグ分子及び第2の質量タグ分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド若しくは多糖等の生体高分子;ブロックコポリマー等の合成高分子;ポリヌクレオチド、ポリペプチド若しくは多糖等の生体高分子に、又はブロックコポリマー等の合成高分子と結合した両親媒性分子であってもよい。
質量タグ分子が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスによる検出プローブの刺激後に回収される。さらなる実施の形態では、質量タグ分子が、質量分析法、電気泳動又はクロマトグラフィによって定量される。
本発明の実施形態は、様々な形態のベシクルを利用して、複数の質量タグ分子を保持する検出プローブを含む。質量タグ分子は、米国特許第6,635,452号に開示されており、その全体は参照により本明細書に援用される。質量タグ分子を、標識又はシグナルと称してもよい。本発明で使用される質量タグ分子の種類の例としては、化合物のレパートリー、好ましくは、複数の質量標識の変形体の合成を合理化するために、類似の質量分析脱離特性を共有し、且つ類似又は同一のカップリング化学特性を有する化合物である。本発明の質量タグ分子は、質量分析法によって検出可能である。質量分析技法の代表的な種類としては、マトリクス支援レーザー離脱イオン化法、ダイレクトレーザー脱離、エレクトロスプレーイオン化法、二次中性粒子質量分析法及び二次イオン質量分析法が挙げら
れ、レーザー脱離イオン化法が好ましい。質量スペクトルの測定結果のダイナミックレンジは通常、シグナルの処理及び分析の際に対数増幅器の使用及び/又は様々な減衰によって拡大される。
(O−CH2−CH2)n−CO2−Na+)が挙げられる。
ホロチオエート、メチルホスホネート、ボラノホスフェート、アミド、エステル、エーテルを含むホスホジエステル修飾又は置換;及び光切断可能ニトロフェニル部位等の切断する結合部(cleavage linkages)を含む基本的又は完全なヌクレオチド間置換を含む。これらの修飾は、当業者によって既知であり、Sanger(1983)に記載される原理に基づいており、これは参照により本明細書に援用される。
上記の被包されたベシクルプローブ、単層ベシクルプローブ及び多層ベシクルプローブを、ハイブリダイゼーションアッセイを用いて試験した。
おいて、「オリゴ(dA)」及び「オリゴ(dT)」は、それぞれオリゴ(dT)20を固定化したマイクロプレートによって捕捉される、オリゴ(dA)20結合ベシクル及びオリゴ(dT)20結合ベシクルである。「W/oオリゴ」は、オリゴ(dT)20マイクロプレートによって捕捉される、オリゴヌクレオチドを含まないベシクルであり、「ブランク」は100%メタノールである。被包されたベシクルにおいて、「質量タグ」は、スルホローダミンBであり、m/z=580.60の質量ピークで定量される。単層ベシクル及び多層ベシクルにおいて、「質量タグ」はDPPCであり、m/z=756.05の質量ピークで定量される。
図3のサンプルP1、P2、P3等からのメッセンジャーRNA又はそれらの転写されたcDNA(遺伝子A、B、C等)は、質量タグプローブ(P1、P2、P3等にそれぞれ対応するp1、p2、p3等)によって標識され、それらのそれぞれのサンプル源を識別する。標識化は、プローブ上の活性残基との化学反応、プローブに結合したdNTPの取り込み、及びオリゴ(dT)又はプローブに結合される特異的な配列プライマーを用いたcDNA合成等の数種の方法によって達成される。これらの標識された遺伝子は、まとめられ、特異的な配列ポリヌクレオチド(遺伝子A、B、C等とそれぞれ相補的な遺伝子a、b、c等)が固定化されている複数のスポットを有する表面に適用される。ハイブリダイゼーション及び数回の洗浄後、それぞれの遺伝子スポットが、そのそれぞれの相補的な遺伝子を複数のサンプルから捕捉する。各スポット上へのレーザー照射は、スポット上のプローブを破壊して、質量分析法(MALDI等)のために質量タグ分子をイオン化する。あるいは、有機溶媒の添加がプローブを破壊して、質量分析法(ESI等)又は他の分析方法のために質量タグ分子を回収する。各遺伝子スポットから得られる質量タグ分子の質量ピークは同時に、様々なサンプルで発現されるその相補的な遺伝子の量を提供する。
図4のサンプルP1、P2、P3等からの抗体(A、B、C等)は、質量タグプローブ(P1、P2、P3等にそれぞれ対応するp1、p2、p3等)によって標識される。標識された抗体は、まとめられ、各ウェルが異なる抗原(抗体A、B、C等とそれぞれ特異的に結合するa、b、c等)を有するマイクロプレートに適用される。インキュベーション及び数回の洗浄後、各ウェルが、そのそれぞれの抗体を複数のサンプルから捕捉する。各ウェル上へのレーザー照射が、スポット上のプローブを破壊して、質量分析法(MALDI等)のために質量タグ分子をイオン化するか、又は、有機溶媒の添加がプローブを破壊して、質量分析法(ESI等)のために質量タグ分子を回収する。各ウェルから得られる質量タグ分子の質量ピークは同時に、様々なサンプルで発現される対応する抗体の量を提供する。
対応する配列特異的オリゴヌクレオチド(標的遺伝子、すなわち遺伝子a、b、c等とそれぞれ相補的であるオリゴA、B、C等)と結合した複数のハイブリダイゼーションプローブ(プローブP1、P2、P3等)を図5で図示されるように調製する。これらのプローブは、まとめられ、ハイブリダイゼーション(オリゴ(dT)で被覆された表面により捕捉されるmRNA等)、物理的吸着(ガラス繊維表面上に捕捉されるDNA/RNA等)、合成(ポリメラーゼ又は化学反応によるDNA/RNA合成等)又は当業者に既知の他の方法によって固体表面上に固定化されているサンプルDNA又はRNAに適用される。ハイブリダイゼーション及び数回の洗浄後、サンプル中で発現される遺伝子に対応するプローブのみが、表面上に捕捉される。それゆえ、表面上の質量タグ分子の濃度を分析することにより同時に、サンプルDNA/RNA中の複数の遺伝子プロファイルを提供する。
複数のオリゴヌクレオチドと結合したプローブを調製して、ゲノムDNA上の、このプローブの対応するCpGメチル化部位の特異的配列に対してハイブリダイズさせる。これらのプローブは、まとめられ、CpG−メチル特異的抗体又は化学残基で被覆される表面上に捕捉されるフラグメント化されたサンプルDNAに適用される。インキュベーション及び数回の洗浄後、サンプル中で発現されるCpGメチルに対応するプローブのみが、表面上に捕捉される。それゆえ、表面上の「質量タグ」分子の濃度を分析することにより同時に、サンプル中の複数のCpGメチル化部位の発現プロファイルを提供する。
図6に図示されるように、プローブ又は標的に特異的なプローブ(ハイブリダイゼーションプローブ、抗体プローブ等)で標識される生物学的なサンプル(DNA、RNA、タンパク質、小さい化合物等)を調製し、まとめて、キャピラリー61に適用する。キャピラリー61の壁の内側に、特異的な標的分子又はサンプル(DNA、RNA、タンパク質、小さい化合物等)を固定化する。インキュベーション及び数回の洗浄後、特異的に結合した分子が、分子間相互作用、例えばハイブリダイゼーション、タンパク質−タンパク質相互作用又は抗原−抗体相互作用等によってキャピラリーの壁の内側に捕捉される。有機溶媒62がキャピラリー61を通過する際に、有機溶媒62の一定限度量が、壁上のプローブ64を破壊して、「質量タグ」分子63を一定限度の容量で回収する。このため、回収された「質量タグ」分子63は、高濃度で分析される。
Claims (116)
- ベシクル膜を形成する複数の両親媒性分子を含む外側のベシクル、
該ベシクル内、もしくは該ベシクル膜に被包されるか、又は該ベシクル膜上に吸着された複数の質量タグ分子、及び
ベシクルに連結されたプローブ、
を含む、検出プローブ。 - 前記外側のベシクルが、容易に破壊されて、前記質量タグ分子を放出する、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記複数の質量タグ分子が、前記ベシクル膜の少なくとも一部を構成する、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルに被包された少なくとも1つのベシクルをさらに含み、前記外側のベシクルと被包されたベシクルの少なくとも一部が、前記質量タグ分子を含む、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルと被包されたベシクルが、容易に破壊されて、前記質量タグ分子を放出する、請求項4に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルがリポソームである、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルがポリマーソームである、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルがエマルジョンである、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記外側のベシクルが、油/水型(O/W)エマルジョン、水/油/水型(W/O/W)エマルジョン又は固体/油/水型(S/O/W)エマルジョンである、請求項8に記載の検出プローブ。
- 前記プローブが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子を含む、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記分子が固定化されている、請求項10に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が生体高分子である、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド又は多糖である、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が合成高分子である、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子がブロックコポリマーである、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が、生体高分子又は合成高分子と結合した両親媒性分子である、請求項1に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、多糖又はブロックコポリマーと結合した両親媒性分子である、請求項1に記載の検出プローブ。
- 物理的刺激又は化学的刺激を受けると可溶性となることができる材料と少なくとも1つの質量タグ分子とを含む本体、及び
該本体に連結されたプローブ
を含む、検出プローブ。 - 前記本体が可溶性ビーズを含む、請求項18に記載の検出プローブ。
- 前記可溶性ビーズが多孔性である、請求項19に記載の検出プローブ。
- 前記本体が可溶性カプセルを含む、請求項18に記載の検出プローブ。
- 前記プローブが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子を含む、請求項18に記載の検出プローブ。
- 前記分子が固定化されている、請求項22に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が生体高分子である、請求項18に記載の検出プローブ。
- 前記質量タグ分子が合成高分子である、請求項18に記載の検出プローブ。
- 物理的刺激又は化学的刺激を受けると可溶性となることができる材料と少なくとも1つの第1の質量タグ分子とを含む第1の本体、及び
該第1の本体に連結された第1のプローブ
を含む第1の検出プローブと、
物理的刺激又は化学的刺激を受けると可溶性となることができる材料と少なくとも1つの第2の質量タグ分子とを含む第2の本体、及び
該第2の本体に連結された第2のプローブ
を含む第2の検出プローブと
を含み、該第1の質量タグ分子の質量が、該第2の質量タグ分子の質量と異なる、検出プローブセット。 - 前記第1の本体及び前記第2の本体が可溶性ビーズを含む、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記可溶性ビーズが多孔性である、請求項27に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の本体及び前記第2の本体が可溶性カプセルを含む、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記第1のプローブ及び前記第2のプローブが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子を含む、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記分子が固定化されている、請求項30に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が生体高分子である、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記生体高分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド又は多糖である、請求項32に記
載の検出プローブセット。 - 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が合成高分子である、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記合成高分子がブロックコポリマーである、請求項34に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が、生体高分子又は合成高分子と結合した両親媒性分子である、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド、多糖又はブロックコポリマーと結合した両親媒性分子である、請求項26に記載の検出プローブセット。
- 複数の異なる生物学的サンプルを同時に検査する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
該サンプルのそれぞれから該分析対象物を表面上に固定化する工程、
請求項26に記載の検出プローブセットと該表面をインキュベートする工程、
結合していない検出プローブを除去する工程、
結合した検出プローブから前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記第1の検出プローブ及び前記第2の検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項38に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項39に記載の方法。
- 前記第1の検出プローブ及び前記第2の検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項38に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項38に記載の方法。
- 前記第1の検出プローブ及び前記第2の検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項38に記載の方法。
- 前記第1の検出プローブ及び前記第2の検出プローブの結合が、化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項38に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記第1の検出プローブ及び前記第2の検出プローブの刺激後に回収される、請求項38に記載の方法。
- 前記刺激が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスである、請求項45に記載の方法。
- 前記定量化方法が、質量分析法、電気泳動又はクロマトグラフィからなる群より選択される、請求項38に記載の方法。
- 複数の異なる生物学的サンプルを分析する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
請求項18に記載の検出プローブでそれぞれのサンプルを標識する工程であって、それぞれのサンプルを標識する検出プローブの前記質量タグ分子が異なる質量を有する工程、
該分析対象物の1つと特異的に結合することができる固定化された標的分子と共に、該標識されたサンプルをインキュベートする工程、
結合していない標識サンプルを除去する工程、
結合したプローブから前記質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された前記質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項48に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項48に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項48に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項48に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項48に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、前記化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項48に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記検出プローブの刺激後に回収される、請求項48に記載の方法。
- 第1のベシクル膜を形成する複数の両親媒性分子を含む第1の外側のベシクル、
該第1の外側のベシクル内、もしくは該第1のベシクル膜内に被包されるか、又は該第1のベシクル膜上に吸着された複数の第1の質量タグ分子、及び
該第1の外側のベシクルに連結されたプローブ
を含む第1の検出プローブと、
第2のベシクル膜を形成する複数の両親媒性分子を含む第2の外側のベシクル、
該第2の外側のベシクル内、もしくは該第2のベシクル膜内に被包されるか、又は該第2のベシクル膜上に吸着された複数の第2の質量タグ分子、及び
該第2の外側のベシクルに連結されたプローブ
を含む第2の検出プローブと
を含み、該第1の質量タグ分子の質量が、該第2の質量タグ分子の質量と異なる、検出プローブセット。 - 前記第1の外側のベシクル及び前記第2の外側のベシクルが、容易に破壊されて、前記質量タグ分子を放出する、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子のそれぞれが、前記第1の外側のベシクル及び前記第2の外側のベシクルのそれぞれの中に被包されている、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子のそれぞれが、前記第1のベシクル膜及び前記第2のベシクル膜のそれぞれの中に被包されている、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子のそれぞれが、前記第1のベシクル膜及び前記第2のベシクル膜のそれぞれの上に吸着された、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記質量タグ分子が、前記ベシクル膜の少なくとも一部を構成する、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の外側のベシクル及び前記第2の外側のベシクルが、少なくとも1つの被包されたベシクルをさらに含み、前記外側のベシクルと被包されたベシクルの少なくとも一部が前記質量タグ分子を含む、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記外側のベシクルと被包されたベシクルが、容易に破壊されて、前記質量タグ分子を放出する、請求項62に記載の検出プローブセット。
- 前記外側のベシクルがリポソームである、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記外側のベシクルがポリマーソームである、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記外側のベシクルがエマルジョンである、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記エマルジョンが、油/水型(O/W)エマルジョン、水/油/水型(W/O/W)エマルジョン又は固体/油/水型(S/O/W)エマルジョンである、請求項66に記載の検出プローブセット。
- 前記プローブのそれぞれが、化学残基、ポリヌクレオチド、ポリペプチド及び炭水化物からなる群より選択される少なくとも1つの分子を含む、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記分子が固定化されている、請求項68に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が、生体高分子である、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記生体分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド又は多糖である、請求項70に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が、合成高分子である、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記合成高分子がブロックコポリマーである、請求項72に記載の検出プローブセット。
- 前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子が、生体高分子又は合成高分子と結合した両親媒性分子である、請求項56に記載の検出プローブセット。
- 前記生体分子が、ポリヌクレオチド、ポリペプチド又は多糖である、請求項74に記載の検出プローブセット。
- 前記合成高分子がブロックコポリマーである、請求項74に記載の検出プローブセット。
- 複数の異なる生物学的サンプルを同時に検査する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
該サンプルのそれぞれから該分析対象物を表面上に固定化する工程、
請求項56に記載の検出プローブセットと共に該表面をインキュベートする工程、
結合していない検出プローブを除去する工程、
結合した検出プローブから前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された前記第1の質量タグ分子及び前記第2の質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項77に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項78に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項77に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項77に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項77に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項77に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記検出プローブの刺激後に回収される、請求項77に記載の方法。
- 前記刺激が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスである、請求項84に記載の方法。
- 前記定量化方法が、質量分析法、電気泳動及びクロマトグラフィからなる群より選択される、請求項77に記載の方法。
- 複数の異なる生物学的サンプルを分析する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
請求項1に記載の検出プローブでそれぞれのサンプルを標識する工程であって、それぞれのサンプルを標識する検出プローブの前記質量タグ分子が異なる質量を有する工程、
該分析対象物の1つと特異的に結合することができる固定化された標的分子と共に、該標識されたサンプルをインキュベートする工程、
結合していない標識されたサンプルを除去する工程、
結合したプローブから前記質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された前記質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項87に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項88に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項87に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項87に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項87に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項87に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記検出プローブの刺激後に回収される、請求項87に記載の方法。
- 前記刺激が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスである、請求項94に記載の方法。
- 前記定量化方法が、質量分析法、電気泳動及びクロマトグラフィからなる群より選択される、請求項87に記載の方法。
- 複数の異なる生物学的サンプルを同時に検査する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
該サンプルのそれぞれから該分析対象物を表面上に固定化する工程、
第1のベシクル膜を形成する複数の第1の質量タグ分子を含む第1の外側のベシクル、及び該第1の外側のベシクルに連結されたプローブを含む第1の検出プローブと、第2のベシクル膜を形成する複数の第2の質量タグ分子を含む第2の外側のベシクル、及び該第2の外側のベシクルに連結されたプローブを含む第2の検出プローブとを含む検出プローブセットと共に該表面をインキュベートする工程、
結合していない検出プローブを除去する工程、
結合した検出プローブから該第1の質量タグ分子及び該第2の質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された該第1の質量タグ分子及び該第2の質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項97に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項98に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項97に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項97に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項97に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項97に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記検出プローブの刺激後に回収される、請求項97に記載の方法。
- 前記刺激が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスである、請求項104に記載の方法。
- 前記定量化方法が、質量分析法、電気泳動又はクロマトグラフィからなる群より選択される、請求項97に記載の方法。
- 複数の異なる生物学的サンプルを分析する方法であって、該サンプルのそれぞれが複数の分析対象物を含み、該方法が、
ベシクル膜を形成する複数の質量タグ分子を含む外側のベシクル、及び該ベシクルに連結されたプローブを含む検出プローブでそれぞれのサンプルを標識する工程であって、それぞれのサンプルを標識する検出プローブの該質量タグ分子が異なる質量を有する工程、
該分析対象物の1つと特異的に結合することができる固定化された標的分子と共に、該標識されたサンプルをインキュベートする工程、
結合していない標識されたサンプルを除去する工程、
結合したプローブから該質量タグ分子を回収する工程、及び
回収された該質量タグ分子を定量する工程
を含む、方法。 - 前記検出プローブの結合が、分子の結合に起因する、請求項107に記載の方法。
- 前記分子が、DNA、RNA、アプタマー、タンパク質、ペプチド、多糖、生体分子上の化学残基、又は低分子化合物である、請求項108に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、相補的ヌクレオチド配列の結合に起因する、請求項107に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、抗原−抗体結合に起因する、請求項107に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、タンパク質−タンパク質結合に起因する、請求項107に記載の方法。
- 前記検出プローブの結合が、化学残基と生体分子との結合に起因する、請求項107に記載の方法。
- 前記質量タグ分子が、前記検出プローブの刺激後に回収される、請求項107に記載の方法。
- 前記刺激が、溶媒の変更、化学物質の添加、pHの変更、攪拌、音波処理、加熱、レーザー照射、光照射又は凍結融解プロセスである、請求項114に記載の方法。
- 前記定量化方法が、質量分析法、電気泳動及びクロマトグラフィからなる群より選択される、請求項107に記載の方法。
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