JP2006519983A - １６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を使用する、疼痛および疼痛障害を処置する方法および組成物 - Google Patents

１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を使用する、疼痛および疼痛障害を処置する方法および組成物 Download PDF

Info

Publication number
JP2006519983A
JP2006519983A JP2006503231A JP2006503231A JP2006519983A JP 2006519983 A JP2006519983 A JP 2006519983A JP 2006503231 A JP2006503231 A JP 2006503231A JP 2006503231 A JP2006503231 A JP 2006503231A JP 2006519983 A JP2006519983 A JP 2006519983A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
modulator
protein
gene
polypeptide
activity
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
JP2006503231A
Other languages
English (en)
Inventor
イマキュラーダ シロス−サンティアゴ，
ベンカテスワール カリチェッティ，
スコット ディー． エリアソフ，
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Millennium Pharmaceuticals Inc
Original Assignee
Millennium Pharmaceuticals Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Millennium Pharmaceuticals Inc filed Critical Millennium Pharmaceuticals Inc
Publication of JP2006519983A publication Critical patent/JP2006519983A/ja
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/04—Centrally acting analgesics, e.g. opioids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/286—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against neuromediator receptors, e.g. serotonin receptor, dopamine receptor
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/665—Assays involving proteins derived from pro-opiomelanocortin, pro-enkephalin or pro-dynorphin
    • G01N2333/68—Melanocyte-stimulating hormone [MSH]

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本発明は、疼痛または有痛性障害の診断および処置のための方法に関する。具体的には、本発明は、正常状態もしくは非有痛性疾患状態における発現と比較して、および／または疼痛に関する操作に応答して、疼痛感知に関する組織における１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の差次的発現を同定する。

Description

（関連出願）
本願は、米国仮出願第６０／４４４，７８１号（２００３年２月４日出願）の利益、米国仮出願第６０／４５２，２９１号（２００３年３月５日出願）の利益、米国仮出願大６０／４５４，５４０号（２００３年３月１３日出願）、米国仮出願第６０／４７８，８０５号（２００３年６月１６日出願）の利益、および米国仮出願第６０／４９１，０４８号（２００３年７月３０日出願）の利益を請求する。これらの仮特許出願の内容全体は、本明細書中に参考として援用される。
（発明の背景）
疼痛の感覚は、２つの型（末梢疼痛および中枢疼痛）へと分類され得る。末梢疼痛は、３つの広い領域（侵害受容疼痛、炎症疼痛および神経障害疼痛）へと分類され得る。侵害受容疼痛はまた、生理的疼痛とも呼ばれ、動物界全体を通して防御機構として作用する。炎症疼痛は、重篤な創傷から生じ、そして／または炎症浸潤に関連し、非ステロイド抗炎症薬物（ＮＳＡＩＤ）様薬物、ステロイドおよびアヘン剤により十分に制御され得る。しかし、神経障害疼痛の病因および管理は、十分には理解されていない。神経障害疼痛は、感覚ニューロンにおける固有の欠損から、結果として交感ニューロンにおいて生じると考えられ、外傷に続き得る。
末梢疼痛は、２つの型の主要感覚ニューロンの種類であるＡｄ線維およびＣ線維により媒介され、その細胞体は、脊髄神経節内に存在する。神経障害疼痛の生成機構はほとんど理解されていないが、いくつかの要因（すなわち、化学的環境の変化、感覚ニューロンの発火の異所生成および交感神経発火）が、疼痛刺激の知覚および伝達に影響することが、明らかである。神経障害疼痛に関連する最も一般的な症候群のうちのいくつかは、小感覚線維の破壊（またはおそらく、小線維対大線維の比の変化）から生じる。なぜなら、これは、外傷後状況において一般的であるからである。疼痛の他の病因は、糖尿病性神経障害に起因する小線維損傷、薬物誘導損傷（化学療法薬物）、アルコール中毒、癌に起因する損傷、および種々の遺伝的小細胞神経障害および大細胞神経障害から生じる。本発明者らは、末梢神経系に由来する標的は、候補化合物が血液脳関門を通る必要がなく、中心的副作用を誘導することなく疼痛の開始に対して作用し得るという点で、戦略上有益であり得ると理論付ける。
中心的機構が、疼痛の受容および調節に関与していることが、長らく確立されている。中脳中心灰白質（ｐｅｒｉａｑｕｅｄｕｃｔａｌ ｇｒａｙ）（ＰＡＧ）領域の電気刺激が、他の感覚を失うことなく、痛覚脱失を生じる。ＰＡＧおよび縫線核から発する下行疼痛経路は、脊髄後部（ｄｏｒｓａｌ ｓｐｉｎａｌ ｃｏｒｄ）領域に突き当たり、ここで、一次侵害受容求心性線維が終わる。また、傍延髄巨大細胞核（ｐａｒａｇｉｇａｎｔｏｃｅｌｌｕｌａｒｉｓ ｎｕｃｌｅｕｓ ｉｎ ｈｔｅ ｍｅｄｕｌｌａ ｏｂｌｏｎｇａｔａ）のような領域の刺激は、痛覚脱失を生じる。最後に、アヘン剤レセプターは、オピオイドアルカロイドおよびオピオイドペプチドにより刺激された場合に、痛覚脱失を生じ、これらの部位は、ＰＡＧ、視床核および皮質領域を含む、脳中の重要な「疼痛中心」に位置する。これらのＣＮＳ領域における遺伝子および動物疼痛モデル由来の脊髄視床路における遺伝子の同定は、疼痛調節のための重要な標的を解明し得る。
（発明の詳細な説明）
本発明は、疼痛を経験している被験体または有痛性障害に罹患している被験体の診断および処置のための方法および組成物を提供する。好ましくは、その被験体は、ヒト（例えば、疼痛を有する患者または本明細書中に開示される疼痛関連障害を有する患者）である。例えば、その被験体は、組織損傷（例えば、炎症、感染、虚血）から誘発される疼痛を有する患者；筋骨格障害に関連する疼痛（例えば、関節痛、歯痛、頭痛（例えば、片頭痛））を有する患者；手術に関連する疼痛を有する患者；炎症（例えば、過敏性腸症候群）に関連する疼痛を有する患者；または胸痛を有する患者であり得る。その被験体は、複合限局性疼痛症候群（ＣＲＰＳ）、反射性交感神経性ジストロフィー（ＲＳＤ）、カウザルギー、神経痛、中枢性疼痛（ｃｅｎｔｒａｌ ｐａｉｎ）および知覚不全症候群、頸動脈圧痛、神経性疼痛、反射性頸腕痛症候群、筋筋膜痛症候群、頭蓋下顎疼痛機能不全症候群、慢性特発性疼痛症候群、コステン痛機能不全、急性胸部痛症候群、婦人科学的疼痛症候群、膝蓋大腿痛症候群、膝前部痛症候群、小児における再発性腹痛、仙痛、背部下部疼痛症候群、神経障害性疼痛、切断からの想像（ｐｈａｎｔｏｍ）疼痛、想像（ｐｈａｎｔｏｍ）歯痛、または疼痛象徴不能を有する患者であり得る。その被験体は、癌患者（例えば、脳癌、骨癌、または前立腺癌を有する患者）であり得る。他の実施形態において、その被験体は、非ヒト動物（例えば、実験動物（例えば、慢性疼痛関節炎ラットモデル、神経障害性疼痛の慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）ラットモデル、またはフロイント完全アジュバント（ＦＣＡ）の足底内（ｉｎｔｒａｐｌａｎｔａｒ）注射による片側性炎症疼痛のラットモデル）であり得る。
「処置」とは、本明細書中で使用される場合、疾患もしくは障害、疾患もしくは障害の症状、または疾患もしくは障害への素因を、治療（ｃｕｒｅ）、治癒（ｈｅａｌ）、緩和（ａｌｌｅｖｉａｔｅ）、軽減（ｒｅｌｉｅｖｅ）、変化（ａｌｔｅｒ）、矯正（ｒｅｍｅｄｙ）、改善（ａｍｅｌｉｏｒａｔｅ）、改善（ｉｍｐｒｏｖｅ）もしくは影響（ａｆｆｅｃｔ）するための、その疾患もしくは障害を有する患者への治療剤の適用もしくは投与、またはその疾患もしくは障害を有する患者から単離した組織もしくは細胞株への治療剤の適用もしくは投与として、規定される。治療剤としては、本明細書中に記載される、低分子、ペプチド、抗体、リボザイム、およびアンチセンスオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。
本発明は、核酸分子およびタンパク質分子（下記）が、疼痛動物モデルならびに疼痛に関連することが公知である末梢神経系組織および中枢神経系組織（例えば、脊髄神経節（ＤＲＧ））において差次的に発現されるという発見に、少なくとも部分的には基づく。本発明の方法によって同定される、本発明の分子の調節因子（ｍｏｄｕｌａｔｏｒ）は、疼痛および有痛状態を調節（例えば、阻害、処置、または予防）するために使用され得る。
「差次的発現」とは、本明細書中で使用される場合、遺伝子の時間的発現パターンおよび／または組織発現パターンにおける、量的差異および質的差異の両方を包含する。従って、差次的に発現される遺伝子は、有痛性疾患状態（例えば、実験的疼痛モデル系（例えば、疼痛についての動物モデル））に対して正常状態において活性化または不活化している発現を有し得る。正常状態対処置状態またはコントロール状態対実験状態において発現が異なる程度は、標準的特徴付け技術（例えば、定量的ＰＣＲ、ノーザン分析、差引きハイブリダイゼーション）を介して可視化されるに十分に大きいことだけしか必要としない。差次的に発現される遺伝子の発現パターンは、予後判定評価もしくは診断評価の一部として使用され得るか、または疼痛および有痛性障害の処置のために有用な化合物を同定するための方法において、使用され得る。さらに、疼痛または有痛性障害に関与する差次的に発現される遺伝子は、標的遺伝子を示し得、その結果、標的遺伝子発現のレベルの調節もしくは標的遺伝子産物活性レベルの調節が、疼痛もしくは有痛性状態の処置において使用され得る。標的遺伝子発現または標的遺伝子産物の活性を調節する化合物は、疼痛または有痛性状態の処置において使用され得る。本明細書中に記載される遺伝子が、疼痛に関して差次的に発現され得、そして／またはその産物は、疼痛にとって重要な遺伝子産物と相互作用しうるが、それらの遺伝子はまた、さらなる細胞プロセスにとって重要な機構に関与し得る。
（本発明の分子）
本発明の分子としては、イオンチャネル（例えば、カリウムチャネル）、トランスポーター（例えば、アミノ酸トランスポーター）、レセプター（例えば、Ｇタンパク質共役レセプター）および酵素（例えば、キナーゼ）が挙げられるが、これらに限定されない。
ナトリウムイオン、カリウムイオン、カルシウムイオンおよび塩素イオンの伝導を選択的に媒介する膜貫通イオンチャネルタンパク質は、感覚ニューロンの電気的活性を媒介し、従って、侵害受容において重要である。詳細には、カリウムチャネルは、ニューロン発火の頻度およびパターンを調節する際に重要な役割を果す。カリウムチャネルの発現およびピーク電流は、異なる炎症モデルおよび慢性疼痛モデル後に調節されることが示されている。さらに、カルシウムイオンは、重要な細胞内シグナル伝達の役割（他のイオンチャネルの調節ならびにプロテインキナーゼおよび他の酵素活性の調節を含む）を果す。確立された三次元構造および作用機構を有する細胞表面タンパク質として、イオンチャネルの孔形成αサブユニットは、理想的な薬物標的を生成する。αサブユニットに加えて、これらのチャネルは、βサブユニットと、チャネル活性を調節しかつそのチャネルの薬理学的操作のための良好な標的である他の相互作用タンパク質とからなり得る。従って、イオンチャネルは、疼痛および有痛性状態を処置する際に有用である。
内因性可溶性因子が、侵害受容ニューロンの末梢端においてか、またはこれらの侵害受容器からの入力を受容する中心ニューロンにおいてのいずれかで、特定の膜貫通レセプターへの結合によって、疼痛感覚を媒介する。これらの可溶性因子としては、セロトニン、ヒスタミン、ブラジキニン、タキキニン（サブスタンスＰおよびニューロキニンＡ）、オピオイド、エイコサノイド（ロイコトリエン、プロスタグランジン、トロンボキサン）プリン、興奮性アミノ酸および異なるタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、ヒトにおける臨床試験を含む増加中の証拠は、ＩＬ−１、ＴＮＦ−α、およびニューロトロフィンファミリーメンバーが、有痛性刺激の伝達におけるいくつかの段階に関与することを示す。水素イオン（プロトン）は、バニロイドレセプターカルシウムチャネルまたはアミロリド感受性ナトリウムチャネルを活性化することによって、炎症に（および酸味とも）関連する疼痛を調節し得る。さらに、多数の外因性因子が、内因性可溶性因子を模倣することによって、疼痛を媒介する。例えば、濫用されるアヘン剤は、内因性オピオイドのレセプターに結合することによって痛覚脱失効果を発揮し、カプサイシンは、バニロイドレセプターに結合することによって、疼痛感覚を刺激する。これらの可溶性因子のレセプターは、いくつかのシグナル伝達機構（チロシンキナーゼ活性（例えば、ニューロトロフィンレセプター）、細胞質チロシンキナーゼ動員（例えば、ＴＮＦαおよびＩＬ−１のサイトカインレセプター）、イオンチャネル開口、およびＧタンパク質共役レセプターを含む）に関連する。これらの細胞表面レセプターは、その膜貫通位置に起因して、理想的な薬物標的であり、そしてその目標は、疼痛機構を調節する際に重要な役割を果し得る、既知のリガンドまたは代理リガンドを有するＧタンパク質共役レセプターを発見することである。
細胞内キナーゼ（例えば、プロテインキナーゼＡおよびプロテインキナーゼＣ）は、感覚ニューロンにおける疼痛に対する応答に関与する。同様に、酵素（例えば、シクロオキシゲナーゼおよびトロンボキサンシンセターゼ）は、プロスタグランジン、ロイコトリエン、およびトロンボキサンの生成において重要であることが公知である。これらの特定の標的は、炎症疼痛においてより重要であり得るが、長期疼痛または神経障害性疼痛におけるこの遺伝子ファミリーの役割は、重要である。
（遺伝子ＩＤ１６３８６）
ヒト１６３８６配列（配列番号１）（脳スルホトランスフェラーゼ様タンパク質（ｈＢＲ−ＳＴＬ）としても公知）は、非翻訳領域を含む約２４１９ヌクレオチド長である。配列番号１の核酸およそ２１〜８７５に位置するコード配列は、２８４アミノ酸のタンパク質（配列番号２）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、１６３８６ ｍＲＮＡは、ラットおよびヒトの組織サンプルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において主に発現された。さらに、１６３８６ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。１６３８６ ｍＲＮＡはまた、神経根切断後の脊髄サンプルにおいてダウンレギュレートされることが示された。１６３８６ ｍＲＮＡは、軸索切断、完全フロイントアジュバント（ＤＦＡ）、カプサイシン、移植（ｓｐａｒｅｄ）神経損傷（ＳＮＩ）、または脛骨神経損傷（ＴＮＩ）の後のＤＲＧにおいて、２倍のアップレギュレートを示した。さらに、１６３８６ ｍＲＮＡはまた、軸索切断、ＤＦＡ、カプサイシン、ＳＮＩ、ＴＮＩまたはＣＣＩの後の脊髄において２倍のアップレギュレーションを示した。
１６３８６は、チロシン誘導体化合物に作用するスルホトランスフェラーゼである。１６３８６は、硫酸化によるドパミンの阻害および除去を担っている可能性が高い。ドパミンは、脊髄および中枢神経系における鎮痛効果を有する。従って、１６３８６の阻害は、鎮痛効果を有する可能性が高く、従って、疼痛の新規のインヒビターである。脊髄神経節および脊髄における１６３８６の発現とその機能的役割に起因して、１６３８６活性の調節因子は、疼痛および疼痛障害の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１６３８６ポリペプチドは、１６３８６活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１５４０２）
ヒト１５４０２配列（配列番号３）（ＨＮＫ１スルホトランスフェラーゼとしても公知）は、非翻訳領域を含む約２８７７ヌクレオチド長である。配列番号３の核酸およそ３８７〜１４５７に位置するコード配列は、３５６アミノ酸のタンパク質（配列番号４）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、１５４０２ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系の組織において主に発現された。１５４０２ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）および軸索切断後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において強力にアップレギュレートされた。１５４０２ ｍＲＮＡは、神経根切断後のＤＲＧおよび脛骨神経損傷（ＴＮＩ）後の脊髄においてダウンレギュレートされた。
１５４０２トランスフェラーゼは、ミエリン関連糖タンパク質（ＭＡＧ）に存在するＨＮＫ−１糖認識部位に硫酸塩を輸送する。硫酸化されたＭＡＧは、脱髄性ニューロパシーを有する患者におけるモノクローナルＩｇＭの主要な標的である。従って、１５４０２の阻害は、ＭＡＧとの抗体相互作用をブロックする可能性が高く、従って、脱髄性ニューロパシーによって生じる疼痛を阻害し得る。脊髄および脊髄神経節における１５４０２の発現とその機能的役割に起因して、１５４０２活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１５４０２ポリペプチドは、１５４０２活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ２１１６５）
ヒト２１１６５配列（配列番号５）（ラクトシルセラミド（ＬａｃＣｅｒ）シンターゼとしても公知）は、非翻訳領域を含む約３９３１ヌクレオチド長である。配列番号５の核酸およそ２９８〜１４４６に位置するコード配列は、３８２アミノ酸のタンパク質（配列番号６）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、２１１６５ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系の組織において主に発現された。２１１６５ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において強力にアップレギュレートされた。２１１６５ ｍＲＮＡは、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）および長期のカプサイシン処理の後のＤＲＧおよび脊髄においてダウンレギュレートされた。２１１６５ ｍＲＮＡはまた、移植神経損傷（ＳＮＩ）、完全フロイントアジュバント（ＤＦＡ）および神経根切断の後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされた。
２１１６５またはラクトシルセラミド（ＬａｃＣＥＲ）シンターゼの阻害は、ＮＧＦ経路を阻害する。さらに、２１１６５の阻害は、ニューロン機能を阻害する。２１１６５のレベルは、種々の末梢ニューロパシーにおいて著しく増加し、そして外因性２１１６５は、疼痛の媒介に関与することが知られているＮＦ−κ−Ｂ経路を活性化する。外因性２１１６５はまた、スーパーオキシドの生成およびＥＲＫ−１を引き起こし、これらの両方は、種々の疼痛モデルにおいてアップレギュレートすることが証明されている。最後に、２１１６５合成は、ＴＮＦ−α（ニューロパシー性の疼痛の十分に確立されたメディエータ）によってアップレギュレートされ、そしてこのアップレギュレーションは、ＩＣＡＭ−１（これは、ヒトおよび動物の両方における種々の疼痛状態においてアップレギュレートされることが示されている）の増加を生じる。従って、種々の様式で、２１１６５のインヒビターは、疼痛阻害のための新規のメカニズムである可能性が高い。脊髄および脊髄神経節における２１１６５の発現とその機能的役割に起因して、２１１６５活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の２１１６５ポリペプチドは、２１１６５活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１４２３）
ヒト１４２３配列（配列番号７）（Ｎ−メチル−Ｄ−アスパラギン酸（ＮＭＤＡ）レセプターとしても公知）は、非翻訳領域を含む約３９２４ヌクレオチド長である。配列番号７の核酸およそ１〜３１６８に位置するコード配列は、１０５５アミノ酸のタンパク質（配列番号８）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１４２３ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系の組織において主に発現された。１４２３ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）および軸策切断後の脊髄においてアップレギュレートされた。
ＮＭＤＡレセプターの活性化は、疼痛応答を担う基本的な機構の１つである。エフリン（ｅｐｈｒｉｎ）Ｂ２（ｅｐｈＢ２）の活性化を拮抗することによるＮＭＤＡレセプターの活性の調節は、疼痛応答をブロックするだけではなく、疼痛挙動の維持に関与するシナプス形成性をブロックし得る。脊髄および脊髄神経節における１４２３ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、１４２３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１４２３ポリペプチドは、１４２３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ６３６）
ヒト６３６配列（配列番号９）（カリウム電位型チャネルサブファミリーＡメンバー（ＫＣＮＡ６）；カリウムチャネルＫｖ１．６；またはＨＢＫ２カリウムチャネルとしても公知）は、非翻訳領域を含む約４２３４ヌクレオチド長である。配列番号９の核酸およそ８６３〜２４５２に位置するコード配列は、５２９アミノ酸のタンパク質（配列番号１０）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、６３６ ｍＲＮＡは、ラットパネルおよびヒトパネルの中枢神経系の組織において主に発現された。６３６ ｍＲＮＡは、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）および脊髄（ＳＣ）においてアップレギュレートされた。６３６ ｍＲＮＡが、神経根切断後の脊髄（ＳＣ）およびカプサイシン処理後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、６３６ ｍＲＮＡは、サル組織およびラット組織の両方の脊髄、脳およびＤＲＧニューロンのサブ集団において発現されたことを示した。
カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。いくつかの電位型カリウムチャネルが、痛覚に関与するニューロンを含む感覚ニューロンのサブ集団において発現される。一般に、いくつかの電位型カリウムチャネルの発現は、軸索切断後のＤＲＧニューロンにおいて減少し、そしてカリウム電流のピークは、慢性炎症の間、感覚ニューロンにおいて減少することが示されている。さらに、カリウムチャネル開放因子（ｏｐｅｎｅｒ）の投与は、α−２−アデノレセプターのアゴニストまたはモルヒネにより生じる鎮痛を増強した。脊髄神経節および脊髄における６３６ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、６３６活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の６３６ポリペプチドは、６３６活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１２３０３）
ヒト１２３０３配列（配列番号１１）（カリウムチャネルＫＣＮＫ４；ＴＲＡＡＫ；または２孔Ｋ＋チャネルＫＴ４．１としても公知）は、非翻訳領域を含む約２７４７ヌクレオチド長である。配列番号１１の核酸およそ５１〜１３１０に位置するコード配列は、４１９アミノ酸のタンパク質（配列番号１２）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１２３０３ ｍＲＮＡは、サルパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において主に発現された。１２３０３ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において、およびカプサイシン処理後の脊髄においてアップレギュレートされた。１２３０３ ｍＲＮＡは、神経根切断後の脊髄においてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、１２３０３ ｍＲＮＡが、サルおよびラットのＤＲＧのほとんどのニューロンおよび脊髄組織に存在したことを示した。
カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。いくつかの電位型カリウムチャネルが、痛覚に関与するニューロンを含む感覚ニューロンのサブ集団において発現される。一般に、いくつかの電位型カリウムチャネルの発現は、軸索切断後のＤＲＧニューロンにおいて減少し、そしてカリウム電流のピークは、慢性炎症の間、感覚ニューロンにおいて減少することが示されている。さらに、カリウムチャネル開放因子の投与は、α−２−アデノレセプターのアゴニストまたはモルヒネにより生じる鎮痛を増強した。モルヒネのくも膜下内注射により生じる鎮痛は、グリベンクラミド（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルのブロッカー）によって、用量依存性の様式でブロックされ、そしてニコランジル（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルの開放因子）によって増強される。１２３０３（カルシウムチャネルＴＲＡＡＫ）は、痛覚ニューロンの発火パターンの調節に重要である。１２３０３を開く薬物は、おそらく、疼痛の阻害のための新規の機構である。脊髄および脊髄神経節における１２３０３の発現とその機能的役割に起因して、１２３０３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１２３０３ポリペプチドは、１２３０３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ２１４２５）
ヒト２１４２５配列（配列番号１３）（ＥＬＫ２カリウムチャネルとしても公知）は、非翻訳領域を含む約３９８５ヌクレオチド長である。配列番号１３の核酸およそ３５９〜３６１０に位置するコード配列は、１０８３アミノ酸のタンパク質（配列番号１４）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、２１４２５ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において排他的に発現された。２１４２５ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）および軸索切断の後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてアップレギュレートされた。２１４２５ ｍＲＮＡはまた、カプサイシン、移植神経損傷（ＳＮＩ）およびＴＮＩの後の脊髄においてアップレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、２１４２５ ｍＲＮＡが、ニューロンの大部分において、サル脳で高度に発現されたことを示した。
ヒトＥＬＫ２Ｋチャネルまたは２１４２５は、異なる疼痛状態における過敏性に重要であり、従って、疼痛に対する固有の標的を示し得る。脊髄および脊髄神経節における２１４２５の発現とその機能的役割に起因して、２１４２５活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の２１４２５ポリペプチドは、２１４２５活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ２７４１０）
ヒト２４７１０配列（配列番号１５）（カリウムチャネルサブファミリーＫメンバー１７（ＫＣＮＫ１７）；ＴＷＩＫ関連アルカリ性ｐＨ活性化Ｋ＋チャネル２（ＴＡＬＫ−２）；またはＴＷＩＫ関連酸感受性Ｋ＋チャネル４（ＴＡＳＫ−４）としても公知）は、非翻訳領域を含む約１７６４ヌクレオチド長である。配列番号１５の核酸およそ２６８〜１２６６に位置するコード配列は、３３２アミノ酸のタンパク質（配列番号１６）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、２７４１０ ｍＲＮＡは、肺、脊髄、脊髄神経節（ＤＲＧ）および肝臓において低レベルで発現された。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、２７４１０ ｍＲＮＡが、ヒトおよびラットの脳、脊髄およびＤＲＧ組織における広範な発現を示したことを示した。
カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。いくつかの電位型カリウムチャネルが、痛覚に関与するニューロンを含む感覚ニューロンのサブ集団において発現される。一般に、いくつかの電位型カリウムチャネルの発現は、軸索切断後のＤＲＧニューロンにおいて減少し、そしてカリウム電流のピークは、慢性炎症の間、感覚ニューロンにおいて減少することが示されている。さらに、カリウムチャネル開放因子の投与は、α−２−アデノレセプターのアゴニストまたはモルヒネにより生じる鎮痛を増強した。モルヒネのくも膜下内注射により生じる鎮痛は、グリベンクラミド（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルブロッカー）によって、用量依存性の様式でブロックされ、そしてニコランジル（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルの開放因子）によって増強される。２７４１０は、痛覚ニューロンの発火パターンの調節に重要である。２７４１０を開く薬物は、疼痛の阻害のための新規の機構である。脊髄および脊髄神経節における２７４１０の発現とその機能的役割に起因して、２７４１０活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の２７４１０ポリペプチドは、２７４１０活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ３８５５４）
ヒト３８５５４配列（配列番号１７）（溶質キャリアファミリー２１メンバー１４（ＳＬＣ２１Ａ１４）；有機アニオントランスポーターＦ（ＯＡＴＰ−Ｆ）；有機アニオン輸送ポリペプチド１４（ＯＡＴＰ１４）；または有機アニオントランスポーターポリペプチド関連タンパク質５（ＯＡＴＰＲＰ５）としても公知）は、非翻訳領域を含む約３２２７ヌクレオチド長である。配列番号１７の核酸およそ３４５〜２４８３に位置するコード配列は、７１２アミノ酸のタンパク質（配列番号１８）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、３８５５４ ｍＲＮＡは、ラットパネルおよびヒトパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において優勢に発現された。３８５５４ ｍＲＮＡは、軸索切断後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてアップレギュレートされ、そして移植神経損傷（ＳＮＩ）、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）および長期のカプサイシン処理の後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされた。３８５５４ ｍＲＮＡはまた、ＳＮＩ（８週間）後の脊髄においてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、３８５５４ ｍＲＮＡが、脳、脊髄、脈絡叢およびＤＲＧ組織において、特にグリア細胞全体にわたって発現されたことを示した。
３８５５４は、ＯＡＴＰ−Ｆ（有機アニオントランスポーターポリペプチド（ＯＡＴＰ）ファミリーのメンバー）である。ＯＡＴＰ−Ｆは、エストロン−３−スルフェートおよびジヒドロエピアンドロステロンスルフェートを輸送することが示されている。ＯＡＴＰファミリーの他のメンバー（例えば、ヒトＯＡＴＰ８、ＯＡＴＰ−ＡおよびＯＡＴＰ−Ｃ）は、オピオイドレセプターアゴニスト［Ｄ−ペニシラミン（２，５）］エンケファリンを輸送する。ＯＡＴＰ８およびＯＡＴＰ−Ａはまた、オピオイドレセプターアゴニストデルトルフィンを輸送する（Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ １２０：５２５；Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ ２９４（１）：７３）。
３８５５４は、疼痛における重要な遺伝子である。なぜなら、３８５５４は、疼痛伝達に関与することが知られているオピオイドレセプターアンタゴニストを輸送するトランスポーターのファミリーのメンバーであるからである。３８５５４のブロッカーは、内在性オピオイドレセプター化合物を増加させ得、従って、疼痛阻害のための新規の機構であり得る。脊髄および脊髄神経節における３８５５４の発現とその機能的役割に起因して、３８５５４活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の３８５５４ポリペプチドは、３８５５４活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ３８５５５）
ヒト３８５５５配列（配列番号１９）（溶質キャリアファミリー２１メンバー１１（ＳＬＣ２１Ａ１１）；有機アニオン輸送ポリペプチドＤ（ＯＡＴＰ−Ｄ）；有機アニオントランスポーターポリペプチド関連タンパク質３（ＯＡＴＰＲＰ３）；またはＰＧＥ１トランスポーターＯＡＰＴ−Ｄとしても公知）は、非翻訳領域を含む約２１３３ヌクレオチド長である。配列番号１９の核酸およそ１〜２１３３に位置するコード配列は、７１０アミノ酸のタンパク質（配列番号２０）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、３８５５５ ｍＲＮＡは、ラットパネルおよびヒトパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において高レベルで発現された。３８５５４ ｍＲＮＡは、軸索切断後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において、ならびに慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）および脛骨神経損傷（ＴＮＩ）の後の脊髄においてアップレギュレートされた。３８５５５ ｍＲＮＡは、移植神経損傷（ＳＮＩ）またはＴＮＩ後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、３８５５５ ｍＲＮＡが、脳、脊髄、心臓、ＤＲＧにおける小さいかまたは中程度のサイズのニューロン、ならびに交換ニューロンにおいて発現されたことを示した。
３８５５５は、ＯＡＴＰ−Ｄ（有機アニオントランスポーターポリペプチド（ＯＡＴＰ）ファミリーのメンバー）である。ＯＡＴＰ−Ｄは、エストロン−３−スルフェート、ベンジルペニシリンおよびプロスタグランジンＥ２を輸送することが示されている（Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ２７３：２５１）。プロスタグランジンＥ２は、ラットの後脚のアデノシンの皮内注射によって生じるブラジキニン誘導性痛覚過敏を媒介することが示されている（Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ １９９０；３８（３）：７５７−６２）。ＯＡＴＰファミリーの他のメンバー（例えば、ヒトＯＡＴＰ８、ＯＡＴＰ−ＡおよびＯＡＴＰ−Ｃ）は、オピオイドレセプターアゴニスト［Ｄ−ペニシラミン（２，５）］エンケファリンを輸送する。ＯＡＴＰ８およびＯＡＴＰ−Ａはまた、オピオイドレセプターアゴニストデルトルフィンを輸送する（Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ １２０：５２５；Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｅｘｐ Ｔｈｅｒ ２９４（１）：７３）。
３８５５５は、疼痛における重要な遺伝子である。なぜなら、３８５５５は、プロスタグランジンＥ２を輸送し、かつ疼痛伝達に関与することが知られているいくつかの他の分子をさらに輸送し得るからである。さらに、３８５５５は、ＤＲＧの痛覚ニューロンに存在する。従って、３８５５５のブロッカーは、疼痛阻害のための新規の機構である。脊髄および脊髄神経節における３８５５５の発現とその機能的役割に起因して、３８５５５活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の３８５５５ポリペプチドは、３８５５５活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ５５０６３）
ヒト５５０６３配列（配列番号２１）（ＮＭＤＡレセプターサブユニット３Ａ（ＮＲ３Ａ）または（ＮＭＤＡＲ−Ｌ）としても公知）は、非翻訳領域を含む約４１９７ヌクレオチド長である。配列番号２１の核酸およそ１〜３３４８に位置するコード配列は、１１１５アミノ酸のタンパク質（配列番号２２）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、５５０６３ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において優勢に発現された。５５０６３ ｍＲＮＡはまた、軸索切断、神経根切断、カプサイシン、移植神経損傷（ＳＮＩ）、および脛骨神経損傷（ＴＮＩ）疼痛モデルの後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、５５０６３ ｍＲＮＡが、脊髄中のニューロンのサブ集団、薄膜および皮質中のニューロンのサブ集団に制限されたことを示す。
５５０６３は、ＮＲ３Ａ（ａ．ｋ．ａ．ＮＭＤＡＲ−Ｌ）である。このＮＭＤＡレセプターサブユニットは、それ自体では機能的ではなく、ＮＲ１サブユニットまたはＮＲ２サブユニットのいずれかと共に同時発現された場合に、機能的サブユニットを形成する（Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ １５（１０）：６４９８；Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ １５（１０）：６５０９；Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ ２１（４）：１１２８）。ＮＭＤＡレセプターは、疼痛伝達の周知のメディエータである。さらに、ＮＭＤＡレセプターの下流効果の多くが、ＮＭＤＡレセプター媒介性の疼痛伝達を担っていると考えられている（最近の総説については、Ａｎｎ Ｎ Ｙ Ａｃａｄ Ｓｃｉ．９３３：１４２−５６；Ｃｕｒｒ Ｐｈａｒｍ Ｄｅｓ．８（１０）：８８７−９１２；Ｚ Ｒｈｅｕｍａｔｏｌ．６０（６）：４０４−１５；Ｔｒｅｎｄｓ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｓｃｉ．２２（１２）：６３６−４１を参照のこと）。しかし、ＮＭＤＡレセプターブロッカーは、中枢神経系におけるその主要な役割に起因する多数の負の副作用を有することが周知である。従って、ＮＲ３Ａの機能を増大し得る薬物は、ＮＭＤＡ機能を低下させることによって、およびＮＭＤＡレセプターを介するカルシウム流入を減少させることによって、ＮＭＤＡレセプター媒介性の疼痛伝達を減少させ得る。さらに、ＮＲ３ＡはＮＭＤＡレセプター活性を破壊しないので、副作用は、ＮＭＤＡレセプターアンタゴニストによって生じる副作用よりも小さくあり得る。
５５０６３は、疼痛において重要な役割を果たす。なぜなら、５５０６３は、痛覚ニューロンが終結する脊髄の領域におけるニューロンのサブ集団に局在化し、かつ５５０６３は、疼痛のいくつかのモデルのＤＥＧにおいてダウンレギュレートされるからである。さらに、５５０６３は、ＮＭＤＡレセプター媒介電流およびカルシウム流入を減少させることが知られている。ＮＭＤＡレセプター機能およびカルシウム流入は、明らかに、疼痛と関連しており、従って、５５０６３発現の減少は、疼痛伝達を増加させる。従って、５５０６３機能を増加させる薬物は、ＮＭＤＡレセプター機能を完全に破壊するアンタゴニストを用いて一般に見られる副作用を伴うことなく、疼痛伝達を減少させる新規の機構である。脊髄および脊髄神経節における５５０６３の発現とその機能的役割に起因して、５５６３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の５５０６３ポリペプチドは、５５０６３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ５７１４５）
ヒト５７１４５配列（配列番号２３）（有機カチオントランスポーター５（ＯＣＴ５）としても公知）は、非翻訳領域を含む約２５６１ヌクレオチド長である。配列番号２３の核酸およそ１８４〜１８３０に位置するコード配列は、５４８アミノ酸のタンパク質（配列番号２４）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、５７１４５ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの中枢神経系の組織において主に発現された。５７１４５ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）および完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）の後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてアップレギュレートされた。５７１４５ ｍＲＮＡはまた、神経根切断後のＤＲＧおよび脊髄において、ならびにＣＣＩ、ＤＦＡおよび軸索切断の後の脊髄においてダウンレギュレートされた。５７１４５ ｍＲＮＡに対して実施されたインサイチュハイブリだぜーション実験は、サルの脳、脊髄およびＤＲＧニューロンにおける広範な発現を示した。５７１４５ ｍＲＮＡはまた、ＴＲＧ、ＳＣＧニューロンにおいて発現される。
５７１４５は、有機カチオンファミリーの新規のメンバーである。有機トランスポーター活性は、ＰＫＣ、カルモジュリン（ＣａＭ）、プロテインキナーゼＡおよびＣａＭキナーゼＩＩによって増加され（Ｊ Ａｍ Ｓｏｃ Ｎｅｐｈｒｏｌ １１：１２１６；Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２８４：ｆ２９３）、これは、疼痛伝達の重要なメディエータであることが知られている（最近の総説については、Ｅｕｒ Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ ４２９：２３−３７；Ａｎｎ Ｎ Ｙ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ９３３：１４２−５６を参照のこと）。さらに、疼痛のＣＣＩモデルおよびホルマリン注射モデルは、脊髄痛覚ニューロンにおけるサイトゾルから膜へのＰＫＣの移動（ＰＫＣ活性の増加と関連することが知られている効果）を引き起こす。このＰＫＣの転移は、痛覚過敏の増加とよく相関している（Ｊ Ｎｅｕｒｏｐｈｙｓｉｏｌ ７０：４７０；Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｌｅｔｔ １９８：７５；Ｐａｉｎ ９４：１７）。さらに、ＰＫＣの活性化は、疼痛のＤＦＡモデルにおけるＮＭＤＡレセプター活性の増加を媒介する。なぜなら、ＰＫＣインヒビターは、このＮＭＤＡレセプターの増加をブロックするからである（Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ ５３７：１１５）。疼痛のＣＣＩモデルおよびＣＦＡモデルが、有機カチオン輸送活性を増加させるＰＫＣレベルを増加させるので、５７１４５の低分子インヒビターは、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。
５７１４５は、疼痛伝達における重要な役割を果たす。なぜなら、５７１４５は、疼痛のＣＣＩおよびＤＦＡモデルの後のＤＲＧにおいてアップレギュレートされるからである。ＣＣＩおよびＤＦＡはＰＫＣ（重要な疼痛メディエータとして公知）の活性を増加し、これにより次いで、有機カチオン輸送活性が増加するので、５７１４５の低分子インヒビターは、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄および脊髄神経節における５７１４５の発現とその機能的役割に起因して、５７１４５活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の５７１４５ポリペプチドは、５７１４５活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ５９９１４）
ヒト５９９１４配列（配列番号２５）（コリントランスポーター様３（ＣＴＬ３）としても公知）は、非翻訳領域を含む約２５００ヌクレオチド長である。配列番号２５の核酸およそ１０５〜２２５８に位置するコード配列は、７１７アミノ酸のタンパク質（配列番号２６）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、５９９１４ ｍＲＮＡは、ヒトの脳、筋肉および脊髄サンプルにおいて主に発現された。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、５９９１４ ｍＲＮＡが、ヒトおよびラットの両方の脳、脊髄および脊髄神経節（ＤＲＧ）ニューロンの大部分において発現されたことを示した。
多くの研究は、コリン作用性レセプター（ＡｃｈＲ）アゴニストが、疼痛を阻害する（ここで、アンタゴニストが疼痛を増加させる）ことを実証した（総説については、Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｐｈｙｓｉｏｌ ３９：４５７−８２を参照のこと）。しかし、最近の研究は、非サブタイプ゜選択的ｎＡＣｈＲアンタゴニストであるメカミラミンが、ホルマリン注射の後に、早期に疼痛の阻害を生じ得、かつ後期に疼痛の増加を生じことを証明し、このことは、ｎＡＣｈｒが、持続性の疼痛に対して急性の疼痛に対する反対の効果を及ぼし得ることを示唆する（Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ ８８８（１）：１０２−１０６）。５９９１４は、新規のコリントランスポーターであり、これは、アセチルコリンエステラーゼによるアセチルコリンの放出および破壊の後に、コリン作用性神経末端にコリンを輸送し戻すように働き得る。従って、５９９１４の阻害は、アセチルコリンのＤＲＧニューロンを枯渇させ、従って、急性形態の疼痛伝達を阻害し得る。
５９９１４は、ＤＲＧおよび脊髄ニューロンに局在化するため、疼痛において重要な役割を果たす。５９９１４の阻害は、おそらく、コリン作用性ニューロンへのコリンの再取り込みを防止し、それにより、アセチルコリンのコリン作用性細胞を枯渇させる。疼痛伝達におけるアセチルコリンの重要性に起因して、このような５９９１４インヒビターは、急性疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄における５９９１４の発現とその機能的役割に起因して、５９９１４活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の５９９１４ポリペプチドは、５９９１４活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ９４９２１）
ヒト９４９２１配列（配列番号２７）（平衡ヌクレオシドトランスポーター４（ＥＮＴ４）としても公知）は、非翻訳領域を含む約２７６３ヌクレオチド長である。配列番号２７の核酸およそ３４〜１６２６に位置するコード配列は、５３０アミノ酸のタンパク質（配列番号２８）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、９４９２１ ｍＲＮＡは、ヒトの脳、膵臓、脊髄、およびラットの神経系組織サンプルにおいて主に発現された。９４９２１ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）および軸索切断の後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてアップレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、９４９２１ ｍＲＮＡが、マウスの脳、脊髄、およびＤＲＧニューロンのサブ集団（小さいサイズおよび中程度のサイズ）において発現されたことを示した。
９４９２１は、平衡ヌクレオシドトランスポーター（ＥＮＴ）ファミリー（これは、プリンおよびピリミジンの両方を輸送する）の新規のメンバーである。このファミリーは、平衡状態であるので、これは濃度勾配に依存して、ヌクレオシドを取り込むかまたは放出し得る。細胞外プリンは、栄養因子（例えば、神経成長因子（ＮＧＦ）、Ｓ１００βタンパク質および星状細胞由来のトランスフォーミング増殖因子）の合成および放出を刺激する（総説については、Ｉｎｔ Ｊ Ｄｅｖ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ １９（４）：３９５−４１４を参照のこと）。多くの研究は、増殖因子（例えば、ＮＧＦ）が、ニューロパシー性疼痛（例えば、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）モデルにおいて生じる疼痛）のメディエータであることを示す（総説については、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ１（１）：６６−７２を参照のこと）。ＮＧＦおよび９４９２１の両方のレベルは、ＣＣＩ後のＤＲＧにおいて増加し、このことは、９４９２１が、ＮＧＦの増加の主な原因であり得ることを示唆する。従って、９４９２１のブロックが、ＣＣＩ後のＮＧＦレベルにおける増加を防止し得、従って、ニューロパシーに関連する疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。
９４９２１は、疼痛性ニューロパシーの間の疼痛伝達において重要な役割を果たす。なぜなら、９４９２１およびＮＧＦのレベルは、ＣＣＩ後のＤＲＧにおいて増加するからである。９４９２１は、アデノシン（疼痛伝達における公知のプレイヤー）を輸送するので、９４９２１を阻害する薬剤は、ニューロパシー後のＮＧＦレベルを阻害する新規の方法であり得、従って、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄および脊髄神経節における９４９２１発現とその機能的役割に起因して、９４９２１活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の９４９２１ポリペプチドは、９４９２１活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１６８５２）
ヒト１６８５２配列（配列番号２９）（大伝導性カルシウム活性化カリウムチャネル（スローポーク（ｓｌｏｗｐｏｋｅ）βサブユニットＫＣＮＭＢ４）としても公知）は、非翻訳領域を含む約１１０７ヌクレオチド長である。配列番号２９の核酸およそ５６〜６８８に位置するコード配列は、２１０アミノ酸のタンパク質（配列番号３０）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、１６８５２ ｍＲＮＡは、ヒトパネルおよびラットパネルの中枢神経系の組織において主に発現された。１６８５２ ｍＲＮＡは、軸索切断、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）および移植神経損傷（ＳＮＩ）の後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において、ならびにＣＣＩおよび軸索切断の後の脊髄においてアップレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、１６８５２ ｍＲＮＡが、ヒト、サルおよびラットの脳、ならびにサル脊髄の両方で発現され、かつＤＲＧニュウーロンの小さいサイズおよび中程度のサイズにおいて発現されたことを示した。
カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。いくつかの電位型カリウムチャネルが、痛覚に関与するニューロンを含む感覚ニューロンのサブ集団において発現される。一般に、いくつかの電位型カリウムチャネルの発現は、軸索切断後のＤＲＧニューロンにおいて減少し、そしてカリウム電流のピークは、慢性炎症の間、感覚ニューロンにおいて減少することが示されている。さらに、カリウムチャネル開放因子の投与は、α−２−アデノレセプターのアゴニストまたはモルヒネにより生じる鎮痛を増強した。モルヒネのくも膜下内注射により生じる鎮痛は、グリベンクラミド（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルのブロッカー）によって、用量依存性の様式でブロックされ、そしてニコランジル（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルの開放因子）によって増強される。
１６８５２は、大伝導性のカルシウム依存性Ｋ＋チャネルのｂサブユニット（スローポーク）である。スローポークと同時発現された場合、１６８５２は、その活性化範囲をより脱分極電圧にシフトし、そしてその活性化反応速度を遅くすることによって、スローポークチャネルの活性をダウンレギュレートする。１６８５２は、疼痛伝達において重要な役割を果たし得る。なぜなら、１６８５２は、いくつかの疼痛モデルにおいてアップレギュレートされるからである。１６８５２のインヒビターは、大伝導性のカルシウム依存性カリウムチャネルの活性を増加し、従って、ニューロン発火を減少させる。従って、１６８５２を阻害する薬物は、疼痛の阻害のための新規のモデルであり得る。脊髄および脊髄神経節における１６８５２の発現とその機能的役割に起因して、１６８５２活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１６８５２ポリペプチドは、１６８５２活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ３３２６０）
ヒト３３２６０配列（配列番号３１）（カリウム電位型チャネルサブファミリーＨメンバー１（ＫＣＮＨ１）；またはエーテル−ａ−ｇｏ−ｇｏカリウムチャネル１（ｈＥＡＧ１）としても公知）は、非翻訳領域を含む約３０８３ヌクレオチド長である。配列番号３１の核酸およそ３７〜３００６に位置するコード配列は、９８９アミノ酸のタンパク質（配列番号３２）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析によって評価した場合、３３２６０ ｍＲＮＡは、サルパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において主に発現された。３３２６０ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において、およびカプサイシン処理後の脊髄においてアップレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、３３２６０ ｍＲＮＡが、サルおよびラットのＤＲＧニューロンのサブ集団において、ならびに脊髄において発現され、サルおよびラットの両方において、後角の表在性薄膜におけるレベルが最高であったことを示した。３３２６０はまた、サルおよびラットの両方の表層ニューロンのサブ集団において発現されたことが示されている。
カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。いくつかの電位型カリウムチャネルが、痛覚に関与するニューロンを含む感覚ニューロンのサブ集団において発現される。一般に、いくつかの電位型カリウムチャネルの発現は、軸索切断後のＤＲＧニューロンにおいて減少し、そしてカリウム電流のピークは、慢性炎症の間、感覚ニューロンにおいて減少することが示されている。さらに、カリウムチャネル開放因子の投与は、α−２−アデノレセプターのアゴニストまたはモルヒネにより生じる鎮痛を増強した。モルヒネのくも膜下内注射により生じる鎮痛は、グリベンクラミド（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルのブロッカー）によって、用量依存性の様式でブロックされ、そしてニコランジル（ＡＴＰ感受性Ｋ＋チャネルの開放因子）によって増強される。
３３２６０（カリウムチャネルＥＡＧ−１）は、痛覚ニューロンの発火パターンの調節に重要である。従って、３３２６０を開く薬物は、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄および脊髄神経節における３３２６０の発現とその機能的役割に起因して、３３２６０活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の３３２６０ポリペプチドは、３３２６０活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ５８５７３）
ヒト５８５７３配列（配列番号３３）（重炭酸ナトリウム共トランスポーターＮＢＣ４としても公知）は、非翻訳領域を含む約６３１３ヌクレオチド長である。配列番号３３の核酸およそ３４８〜３７１３に位置するコード配列は、１１２１アミノ酸のタンパク質（配列番号３４）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、５８５７３ ｍＲＮＡは、サルパネルおよびラットパネルの両方の中枢神経系（ＣＮＳ）の組織および腎臓組織サンプルにおいて発現された。５８５７３ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）、および神経根切断の４週間後のＣ５−Ｔ１ ＤＲＧにおいてアップレギュレートされた。５８５７３ ｍＲＮＡは、軸索切断後の脊髄においてアップレギュレートされた。５８５７３ ｍＲＮＡは、完全フロイントアジュバント（ＤＦＡ）後のＤＲＧおよび神経根切断の４週間後のＣ３ ＤＲＧにおいてダウンレギュレートされた。５８５７３ ｍＲＮＡは、移植神経損傷（ＳＮＩ）、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）、および長期のカプサイシン処理の後のＤＲＧおよび脊髄においてダウンレギュレートされた。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、５８５７３ ｍＲＮＡが、ＤＲＧの小ニューロンのサブ集団において、およびサルの視床ニューロンのサブ集団において発現されたことを示した。
５８５７３は、疼痛の感覚における重要な遺伝子である。なぜなら、５８５７３は、ＤＲＧの痛覚ニューロンおよび感覚視床ニューロンに存在し、そして疼痛のいくつかのモデルのＤＲＧおよび脊髄においてアップレギュレートされるからである。５８５７３は、重炭酸ナトリウム共トランスポーター（ＮＢＣ）ファミリーのメンバーである。ＮＢＣは、重炭酸塩を細胞に輸送することが知られており、そしてニューロン活性後の細胞外酸性化を少なくとも部分的に担っていると考えられている。プロトンは、疼痛の公知のメディエータであるので、５８５７３の阻害は、疼痛の阻害のための新規の機構である。脊髄および脊髄神経節における８５８７３の発現とその機能的役割に起因して、５８５７３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の５８５７３ポリペプチドは、５８５７３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ３０９１１）
ヒト３０９１１配列（配列番号３５）（ナトリウム−プロトン交換体（ＮＨＥ５）としても公知）は、非翻訳領域を含む約３７６１ヌクレオチド長である。配列番号３５の核酸およそ７０〜２７６０に位置するコード配列は、８９６アミノ酸のタンパク質（配列番号３６）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、３０９１１ ｍＲＮＡは、ヒトモデルおよびラットモデルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において最も高いレベルで発現された。３０９１１ ｍＲＮＡは、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）において、複数の時点でアップレギュレートされた。３０９１１ ｍＲＮＡは、移植神経損傷（ＳＮＩ）および長期のカプサイシン処理の後のＤＲＧの早期の時点で、ダウンレギュレートされた。
３０９１１は、疼痛の感覚において重要な遺伝子である。なぜなら、３０９１１は、疼痛のニューロパシーモデルのＤＲＧにおいてアップレギュレートされるからである。３０９１１は、ナトリウム−プロトン交換体（ＮＨＥ）ファミリーのメンバーである。ＮＨＥは、ｐＨ調節において重要な役割を果たす。なぜなら、これらは、細胞からプロトンをポンピングするからである。プロトンは、疼痛の公知のメディエータであるので、３０９１１の阻害は、疼痛の阻害のための新規の機構である。脊髄神経節における３０９１１ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、３０９１１活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の３０９１１ポリペプチドは、３０９１１活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ８５９１３）
ヒト８５９１３配列（配列番号３７）（過分極活性化環状ヌクレオチドゲートカリウムチャネルファミリー（ＨＣＮ１）のメンバー）は、非翻訳領域を含む約４０６９ヌクレオチド長である。配列番号３７の核酸およそ４３〜２６９１に位置するコード配列は、８８２アミノ酸のタンパク質（配列番号３８）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、８５９１３ ｍＲＮＡは、ヒトモデルおよびラットモデルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において、最も高いレベルで発現された。８５９１３はまた、ラット膀胱組織サンプルにおいて高度に発現された。さらに、８５９１３は、軸索切断、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）および移植神経損傷（ＳＮＩ）の後の脊髄神経節（ＤＲＧ）サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。８５９１３はまた、軸索切断、完全フロイントアジュバント（ＣＦＡ）、ＳＮＩおよび神経根切断の後の脊髄サンプルにおいてダウンレギュレートされることが示された。８５９１３はさらに、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）、ＣＦＡおよび神経根切断の後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされることが示された。カプサイシン処理後のＤＲＧおよび脊髄サンプルにおいて、調節は観察されなかった。インサイチュハイブリダイゼーション実験は、８５９１３がヒトおよびラットの両方の脳、後角または脊髄、およびＤＲＧニューロンのサブ集団において発現されたことを示した。
８５９１３（ＨＣＮ１としても公知）は、過分極活性化環状ヌクレオチド電位型カリウムチャネルファミリーのメンバーである。ＨＣＮチャネルは、Ｎａ＋およびＫ＋の両方を透過させ、そして過分極の際に開く。これらは負の電位で細胞を脱分極するので、これらは「ペースメーカー」チャネルとして働き、活動電位発火速度を増加するための機構を提供する（総説については、Ｎｅｗｓ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｓｃｉ １７：３２−７を参照のこと）。８５９１３は、脊髄の後角およびＤＲＧニューロンのサブ集団に局在し、８５９１３は痛覚ニューロンからの活動電位速度を増加するために重要であり得るので、８５９１３は疼痛情報の伝達において重要な役割を果たし得る。従って、理論に束縛されることはないが、８５９１３の阻害は、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄神経節における８５９１３ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、８５９１３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の８５９１３ポリペプチドは、８５９１３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１４３０３）
ヒト１４３０３配列（配列番号３９）（ナトリウム−プロトン交換体（ＮＨＥ６））は、非翻訳領域を含む約４４５２ヌクレオチド長である。配列番号３９の核酸およそ３６〜２０４５に位置するコード配列は、６６９アミノ酸のタンパク質（配列番号４０）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１４３０３ ｍＲＮＡは、ヒトモデルおよびラットモデルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において最も高いレベルで発現された。さらに、１４３０３は、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。１４３０３はまた、脛骨神経損傷（ＴＮＩ）後のＤＲＧおよび脊髄サンプルにおいてダウンレギュレートされることが示され、そして１４３０３は、移植神経損傷（ＳＮＩ）後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートすることが示された。１４３０３はさらに、神経根切断後のＣ３ ＤＲＧにおいてダインレギュレートされることが示され、そして１４３０３は、長期のカプサイシン処理後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされることが示された。
インサイチュハイブリダイゼーション実験は、１４３０３が、ＤＲＧの全てのニューロン、脊髄および皮質において発現されたことを示した。１４３０３はまた、サル前立腺筋肉細胞において発現されることが示された。
１４３０３はまた、ナトリウム−プロトン交換体（ＮＨＥ）としても公知であり、これは、ニューロン活性後の細胞からプロトンをポンピングすることによる、ニューロンにおいておよびニューロンの周りでの、ｐＨの重要な調節因子であると考えられている（例えば、Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ １０４（５）６３７−４５；Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｒｅｓ ５６（４）：３５８−７０；Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｒｅｓ １９９８ Ｒｅｂ １５；５１（１４）：４３１−４１を参照のこと）。細胞外酸性化は、疼痛を媒介することが示されている。ヒトにおける低ｐＨ溶液の連続的な投与は、疼痛および痛覚過敏を引き起こす（Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｌｅｔｔ １５４：１１３−１１６．さらに、プロトン選択性は、永続的な興奮およびラット皮膚における痛覚の機械的刺激に対する感作をインビトロで引き起こす（Ｊ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ １２（１）：８６−９５）。最も重要なことに、プロトンは、ＤＲＧの痛覚ニューロンに存在するＶＲ−１レセプターを直接活性化する（Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ ４３３：１４５−６１；ＴＩＰＳ ２０：（３）：１１２−８）。ＶＲ−１レセプターは、疼痛に関与する経路における重要なプレイヤーである。従って、１４３０３は、疼痛の感覚における重要な遺伝子であり得る。なぜなら、１４３０３は、疼痛のニューロパシーモデルのＤＲＧにおいてアップレギュレートされるからである。１４３０３は、ナトリウム−プロトン交換体（ＮＨＥ）ファミリーのメンバーである。ＮＨＥは、細胞からプロトンをポンピングするため、ｐＨ調節において重要な役割を果たすと考えられている。プロトンは、疼痛の公知のメディエータであるので、１４３０３の阻害は、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄神経節における１４３０３ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、１４３０３活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１４３０３ポリペプチドは、１４３０３活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１６８１６）
ヒト１６８１６配列（配列番号４１）（ホスホリパーゼＣδ４）は、非翻訳領域を含む約３１１６ヌクレオチド長である。配列番号４１の核酸およそ２０５〜２４９３に位置するコード配列は、７６２アミノ酸のタンパク質（配列番号４２）をコードする。
ヒト組織パネルを使用するＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１６８１６ ｍＲＮＡは、骨格筋組織で最も高レベルに発現され、次いで、膀胱組織サンプルおよび中枢神経系（ＣＮＳ）の組織で発現された。ラット組織パネルに対するさらなるＴａｑＭａｎ実験は、骨格筋、膀胱およびＣＮＳ組織サンプルにおける発現を示した。さらに、１６８１６は、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）においてアップレギュレートおよびダウンレギュレートされることが示された。１６８１６は、ＤＲＧにおいてダウンレギュレートレギュレートされ、そして移植神経損傷（ＳＮＩ）後の脊髄サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。
インサイチュハイブリダイゼーション実験は、１６８１６がサルおよびラットの両方のＤＲＧサンプルの痛覚ニューロンにおいて発現されることを示した。また、１６８１６がサル脳（葉状体）および筋肉組織サンプルにおいて発現されることも示された。
１６８１６はまた、ファチジルイノシトール特異的ホスホリパーゼＣ（ＰＬＣ）としても公知であり、これは、ホスファチジルイノシトール４，５−ビスホスフェート（ＰＩＰ２）から、２つの第２メッセンジャー分子であるイノシトール１，４，５−トリホスフェート（ＩＰ３）およびジアシルグリセロール）を生成することによって、レセプター媒介性シグナル伝達において重要な役割を果たす。ＰＬＣは、痛覚経路に関与することが周知である。例えば、２つの前疼痛性因子であるブラジキニンおよび神経成長因子（ＮＧＦ）が、それぞれ、Ｇタンパク質結合（ＢＫ２）レセプターおよびチロシンキナーゼ（ＴｒｋＡ）レセプターを活性化して、原発性求心性ニューロンにおけるホスホリパーゼＣ（ＰＬＣ）シグナル伝達経路を刺激することが十分に確立されている。インビボにおける感受性のブラジキニンまたはＮＧＦ媒介性増加は、疼痛に関与する十分に確立されたレセプターであるＶＲ１の発現を必要とすることが示されている。抗体隔離およびＰＬＣ媒介性加水分解による原形質膜ホスファチジルイノシトール−４，５−ビスホスフェート（ＰｔｄＩｎｓ（４，５）Ｐ２）レベルの低下は、細胞レベルでのブラジキニンまたはＮＧＦの増加効果を模倣する。さらに、ＴｒｋＡへのＰＬＣ−γのリクルートは、チャネル活性のＮＧＦ媒介性増加に不可欠であり、生化学研究は、ＶＲ１がこの複合体と関連することを示唆する（Ｎａｔｕｒｅ．２００１ ４１１（６８４０）：９５７−６２）。疼痛経路におけるＰＬＣの重要性を考えると、１６８１６を調節する薬物は、疼痛の処置に重要であり得る。脊髄神経節における１６８１６ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、１６８１６活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１６８１６ポリペプチドは、１６８１６活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ１７８２７）
ヒト１７８２７配列（配列番号４３）（カリウムチャネルＫＣＮＫ１２（ＴＨＩＫ２））は、非翻訳領域を含む約１９４３ヌクレオチド長である。配列番号４３の核酸およそ４６６〜１７５８に位置するコード配列は、４３０アミノ酸のタンパク質（配列番号４４）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、１７８２７ ｍＲＮＡは、ヒトモデルおよびラットモデルの中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において最も高いレベルで発現された。１７８２７の発現はさらに、ラットパネルの胚、前立腺および気管組織サンプルにおいて観察された。さらに、１７８２７は、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。１７８２８はまた、移植神経損傷（ＳＮＩ）後の脊髄サンプルにおいてアップレギュレートされることが示された。１７８２７はさらに、８４日後の移植神経損傷（ＳＮＬ）後のＬ５、Ｌ６ ＤＲＧサンプルにおいてダウンレギュレートされることが示された。
インサイチュハイブリダイゼーション実験は、１７８２７が、サルおよびラットの両方の全てのサイズのＤＲＧニューロンであるＴＲＧにおいて発現されたことを示す。１７８２７はまた、サルおよびラットの脊髄および脳サンプルにおいて発現されることが示された。
１７８２７は、ＤＲＧニューロンに存在するカリウムチャネルである。カリウムチャネルの活性化は、ニューロン発火の頻度およびパターンに影響を与える。カリウムチャネルの調節は、痛覚ニューロンの発火パターンに重要であり得る。従って、１７８２７と相互作用する薬物は、疼痛の阻害のための新規の機構であり得る。脊髄神経節および脊髄における１７８２７ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、１７８２７活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の１７８２７ポリペプチドは、１７８２７活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
（遺伝子ＩＤ３２６２０）
ヒト３２６３０配列（配列番号４５）（ナトリウム−グルコースコトランスポータＳＭＩＴ２）は、非翻訳領域を含む約２３８４ヌクレオチド長である。配列番号４５の核酸およそ２３３〜２２６０に位置するコード配列は、６７５アミノ酸のタンパク質（配列番号４６）をコードする。
ＴａｑＭａｎ分析により評価した場合、３２６２０ ｍＲＮＡは、ヒトモデルおよびラットモデル中枢神経系（ＣＮＳ）の組織において最も高いレベルで発現された。３２６２０の発現はさらに、ヒトパネルの結腸および小腸組織サンプルにおいて、ならびにラットパネルの肝臓、前立腺および十二指腸サンプルにおいて観察された。さらに、３２６２０は、慢性狭窄損傷（ＣＣＩ）後の脊髄神経節（ＤＲＧ）サンプルにおいてダウンレギュレートされることが示された。３２６２０はまた、軸索切断後のＤＲＧおよび脊髄においてアップレギュレートされることが示された。３２６２０はさらに、移植神経損傷（ＳＮＩ）後のＤＲＧにおいてダウンレギュレートされることが示された。
インサイチュハイブリダイゼーション実験は、３２６２０が小さい直径のＤＲＧのニューロンにおいて主に発現されたことを示した。３２６２０はまた、サル組織の脊髄および皮質のグリア細胞において発現されることが示された。
３２６２０は、ナトリウム依存性様式で、ミオイノシトールを輸送する。ミオイノシトール（２．５ｍｇ）のくも膜下内注射は、リチウムのくも膜下内注射の抗痛覚過敏効果および抗異痛効果の両方を有意に退行させた（Ｐａｉｎ ２０００ ８５：５９−６４）。従って、３２６２０と相互作用する薬物は、疼痛の処置に重要であり得る。脊髄神経節および脊髄における３２６２０ ｍＲＮＡの発現とその機能的役割に起因して、３２６２０活性の調節因子は、疼痛および疼痛疾患の処置に関連する障害を処置する際に有用である。本発明の３２６２０ポリペプチドは、３２６２０活性の調節因子についてスクリーニングする際に有用である。
本発明の種々の局面は、以下の小節でより詳細に記載される。
（スクリーニングアッセイ：）
本発明は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質に結合するか、例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性に対して刺激効果または阻害効果を有するか、あるいは例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質の発現または活性に対して刺激効果または阻害効果を有する、調節因子（すなわち、候補化合物もしくは試験化合物または候補薬剤もしくは試験薬剤（例えば、ペプチド、ペプチドミメティック、低分子（有機または無機）または他の薬物））を同定するための方法（これは、本明細書中で「スクリーニングアッセイ」とも呼ばれる）を提供する。本明細書中に記載のアッセイを使用して同定される化合物は、疼痛および疼痛性状態を処置するのに有用であり得る。
これらのアッセイは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質に結合する化合物、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と相互作用する他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質に結合する化合物、および他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質と１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質との相互作用を妨害する化合物を同定するように設計されている。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質（これは、膜貫通レセプター型タンパク質である）の場合、このような技術は、このようなレセプターのためのリガンドを同定し得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質のリガンドまたは基質は、例えば、疼痛および疼痛性状態を改善するために使用され得る。このような化合物としては、ペプチド、抗体、または有機低分子もしくは無機低分子が挙げられ得るがこれらに限定されない。このような化合物はまた、他の細胞性タンパク質を含み得る。
アッセイ（例えば、本明細書に記載のアッセイ）によって同定される化合物は、例えば、疼痛および疼痛性状態を処置するのに有用であり得る。疼痛状態が、細胞または組織における、全体的に低いレベルの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子発現および／または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質により生じる場合、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と相互作用する化合物は、結合した１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の活性を強調するかまたは増幅する化合物を含み得る。このような化合物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質活性のレベルの効果的な増大を引き起し、したがって、症状を改善する。
他の例において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子における変異により、異常型または過剰量の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質が、疼痛にいたる有害な効果を有するようになる。同様に、生理学的状態は、疼痛にいたる、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子発現の過剰な増大を引き起こし得る。このような場合、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質に結合する化合物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の活性を阻害するタンパク質として同定され得る。本節で記載されるような技術によって同定される化合物の有効性を試験するためのアッセイは、本明細書中に議論されている。
１つの実施形態において、本発明は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはポリペプチドあるいはそれらの生物学的に活性な部分の基質である候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。別の実施形態において、本発明は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはポリペプチドあるいはその生物学的活性な部分に結合するかまたはその活性を調節する候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。本発明の試験化合物は、以下に挙げられる当該分野で公知のコンビナトリアルライブラリー法における多くのアプローチのうちの任意のものを使用して得られ得る：生物学的ライブラリー；空間的に処理可能な並列固相ライブラリーまたは溶液相ライブラリー；デコンボルーション処理を必要とする合成ライブラリー法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフィニティクロマトグラフィー選択法を使用する合成ライブラリー法。生物学的ライブラリーアプローチは、ペプチドライブラリーに限定されるが、他の４つのアプローチは、化合物の、ペプチドライブラリー、非ペプチドオリゴマーライブラリー、または低分子ライブラリーに利用可能である（Ｌａｍ、Ｋ．Ｓ．（１９９７）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓ．１２：１４５）。
分子ライブラリーの合成のための方法の例は、例えば、以下において、当該分野で見出され得る：ＤｅＷｉｔｔら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６９０９；Ｅｒｂら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：１１４２２；Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎら（１９９４）、Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：２６７８；Ｃｈｏら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１：１３０３；Ｃａｒｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０５９；Ｃａｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０６１；およびＧａｌｌｏｐら（１９９４）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：１２３３。
化合物のライブラリーは、溶液中（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ（１９９２）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １３：４１２〜４２１）、ビーズ上（Ｌａｍ（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８２〜８４）、チップ上（Ｆｏｄｏｒ（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ ３６４：５５５〜５５６）、細菌上（Ｌａｄｎｅｒ、米国特許第５，２２３，４０９号）、芽胞上（Ｌａｄｎｅｒ、ＵＳＰ’４０９号）、プラスミド上（Ｃｕｌｌら（１９９２）ＰｒｏｃＮａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：１８６５〜１８６９）またはファージ上（ＳｃｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：３８６〜３９０）；（Ｄｅｖｌｉｎ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：４０４〜４０６）；（Ｃｗｉｒｌａら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８７：６３７８〜６３８２）；（Ｆｅｌｉｃｉ（１９９１）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：３０１〜３１０）；（Ｌａｄｎｅｒ 前出）に存在し得る。
１つの実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、ここで１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはその生物学的に活性な部分を発現する細胞を、試験化合物と接触させ、そして試験化合物が１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する能力を決定する。試験化合物が１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する能力の決定を、例えば、細胞内カルシウム、ＩＰ３、ｃＡＭＰ、またはジアシルグリセロール濃度、細胞内タンパク質のリン酸化プロフィール、細胞増殖および／または移動、例えば、細胞表面接着分子もしくは鎮痛に関連する遺伝子の遺伝子発現、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節転写因子の活性をモニタリングすることによって達成し得る。この細胞は、哺乳動物由来（例えば、神経細胞由来）であり得る。１つの実施形態において、レセプタードメインと相互作用する化合物が、リガンドとして（すなわち、レセプターに結合し、シグナル伝達経路を調節するよう）機能するそれらの能力についてスクリーニングされ得る。リガンドの同定、およびリガンド−レセプター複合体の活性の測定は、この相互作用の調節因子（例えば、アンタゴニスト）の同定に導く。このような調節因子は、疼痛および疼痛性状態の処置に有用であり得る。
試験化合物が、基質への１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合を調節する能力、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に結合する能力もまた、決定し得る。基質への１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合を調節する試験化合物の能力の決定は、例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質を、放射性同位体または酵素標識とカップリングさせることによって達成され得、その結果、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０への１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質の結合は、複合体中の標識された１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質を検出することによって、決定され得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０はまた、放射性同位体または酵素標識とカップリングされて、複合体中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質への１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合を調節する試験化合物の能力をモニタリングし得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と結合する試験化合物の能力の決定は、例えば、その化合物と、放射性同位体または酵素標識とをカップリングさせることによって達成され得、その結果、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０へのこの化合物の結合は、複合体中の標識された１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の化合物を検出することによって決定され得る。例えば、化合物（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のリガンドまたは基質）を、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３Ｈで、直接的または間接的のいずれかで標識し得、そしてこの放射性同位体が、放射線照射の直接的な計数によってか、またはシンチレーション計数によってかで検出され得る。化合物はさらに、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼで酵素標識され得、そして適切な基質の産物への変換を測定することによって、この酵素標識を検出し得る。
化合物（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のリガンドまたは基質）が、いかなる相互作用物質（ｉｎｔｅｒａｃｔａｎｔ）も標識化せずに１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と相互作用する能力を、決定することもまた、本発明の範囲内である。例えば、マイクロフィジオメーター（ｍｉｃｒｏｐｈｙｓｉｏｍｅｔｅｒ）を使用して、化合物または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のいずれかの標識化を伴わずに１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０との化合物の相互作用を検出し得る（ＭｃＣｏｎｎｅｌｌ，Ｈ．Ｍ．ら（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５７：１９０６−１９１２）。本明細書中で使用される場合、「マイクロフィジオメーター」（例えば、Ｃｙｔｏｓｅｎｓｏｒ）は、光アドレス可能な電位差測定センサー（ＬＡＰＳ）を使用して、細胞がその環境を酸性化する速度を測定する、分析装置である。この酸性化速度の変化は、化合物と１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０との間の相互作用の指標として使用され得る。
別の実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の基質）を発現する細胞を、試験化合物と接触させる工程、および１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子の活性を調節する（例えば、刺激または阻害する）試験化合物の能力を決定する工程を包含する。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子の活性を調節する試験化合物の能力の決定は、例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に結合するかまたは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と相互作用する、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の能力を決定することによって達成され得る。
１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に結合するかまたはそれらと相互作用する１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質またはそれらの生物学的に活性なフラグメントの能力の決定は、直接結合の決定についての上記方法の１つにより達成され得る。好ましい実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に結合するかまたはそれらと相互作用する１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の能力の決定は、その標的分子の活性を決定することによって達成され得る。例えば、標的分子の活性は、標的の細胞性セカンドメッセンジャー（すなわち、細胞内Ｃａ２＋、ジアシルグリセロール、ＩＰ３、ｃＡＭＰ）の誘導を検出するか、適切な基質に対するその標的の触媒／酵素活性を検出するか、レポーター遺伝子（検出マーカー（例えば、ルシフェラーゼ）をコードする核酸に作動可能に連結された標的応答性調節エレメントを含む）の誘導を検出するか、または標的により調節される細胞応答（例えば、遺伝子発現）を検出することによって、決定され得る。
さらに別の実施形態において、本発明のアッセイは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質またはその生物学的に活性な部分が、試験化合物と接触させられ、そして１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質またはその生物学的に活性な部分に結合する試験化合物の能力が決定される、無細胞アッセイである。本発明のアッセイにおいて使用される１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の好ましい生物学的に活性な部分としては、非１６３８６分子、非１５４０２分子、非２１１６５分子、非１４２３分子、非６３６分子、非１２３０３分子、非２１４２５分子、非２７４１０分子、非３８５５４分子、非３８５５５分子、非５５０６３分子、非５７１４５分子、非５９９１４分子、非９４９２１分子、非１６８５２分子、非３３２６０分子、非５８５７３分子、非３０９１１分子、非８５９１３分子、非１４３０３分子、非１６８１６分子、非１７８２７分子、または非３２６２０分子との相互作用に関与するフラグメント（例えば、高い表面確率スコアを有するフラグメント）が挙げられる。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質への試験化合物の結合は、上記のように直接的かまたは間接的かのいずれかで決定され得る。好ましい実施形態において、このアッセイは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質またはその生物学的に活性な部分と、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に結合する既知の化合物とを接触させて、アッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物と、試験化合物を接触させる工程、および１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質と相互作用する試験化合物の能力を決定する工程（ここで、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質と相互作用する試験化合物の能力を決定する工程は、既知の化合物と比較して１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０またはその生物学的に活性な部分と優先的に結合する試験化合物の能力を決定する工程を包含する）を包含する。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と、既知の標的タンパク質との相互作用を調節する化合物は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質（特に、変異体１６３８６タンパク質、変異体１５４０２タンパク質、変異体２１１６５タンパク質、変異体１４２３タンパク質、変異体６３６タンパク質、変異体１２３０３タンパク質、変異体２１４２５タンパク質、変異体２７４１０タンパク質、変異体３８５５４タンパク質、変異体３８５５５タンパク質、変異体５５０６３タンパク質、変異体５７１４５タンパク質、変異体５９９１４タンパク質、変異体９４９２１タンパク質、変異体１６８５２タンパク質、変異体３３２６０タンパク質、変異体５８５７３タンパク質、変異体３０９１１タンパク質、変異体８５９１３タンパク質、変異体１４３０３タンパク質、変異体１６８１６タンパク質、変異体１７８２７タンパク質、または変異体３２６２０タンパク質）の活性を調節するのに有用であり得る。
別の実施形態において、アッセイは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはその生物学的に活性な部分が試験化合物と接触され、そして１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはその生物学的に活性な部分の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する試験化合物の能力が決定される、無細胞アッセイである。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の活性を調節する試験化合物の能力の決定は、例えば、直接結合の決定についての上記の方法の１つにより、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に結合する１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の能力を決定することによって達成され得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に結合する１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の能力の決定はまた、リアルタイムＢｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ（ＢＩＡ）（Ｓｊｏｌａｎｄｅｒ，Ｓ．およびＵｒｂａｎｉｃｚｋｙ，Ｃ．（１９９１）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．６３：２３３８−２３４５ならびにＳｚａｂｏら（１９９５）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．５：６９９−７０５）のような技術を用いて達成され得る。本明細書中で使用する場合、「ＢＩＡ」は、いかなる相互作用物質も標識することなく、生物特異的相互作用をリアルタイムで研究するための技術である（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ）。表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）の光学的現象の変化は、生物学的分子間のリアルタイムの反応の指標として使用され得る。
別の実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の活性を調節する試験化合物の能力の決定は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子の下流エフェクターの活性をさらに調節する１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の能力を決定することにより達成され得る。例えば、適切な標的に対するエフェクター分子の活性が決定され得るか、または適切な標的へのエフェクターの結合が、以前に記載されたように決定され得る。
なお別の実施形態において、無細胞アッセイは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはその生物学的に活性な部分と、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質に結合する既知の化合物とを接触させてアッセイ混合物を形成する工程、そのアッセイ混合物と試験化合物を接触させる工程、および１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と相互作用する試験化合物の能力を決定する工程（ここで、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と相互作用する試験化合物の能力を決定する工程は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子に優先的に結合するかまたはその活性を調節する１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の能力を決定する工程を包含する）を包含する。
本発明の上記アッセイ方法の１つより多くの実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０またはその標的分子のいずれかを固定化して、そのタンパク質の１つまたは両方の複合体化形態と非複合体化形態との分離を容易にすること、ならびにこのアッセイの自動化に適応させることが望ましくあり得る。候補化合物の存在下および非存在下での、試験化合物と、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質との結合、あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と、標的分子との相互作用は、反応物を収容するのに適した任意の容器で達成され得る。このような容器の例としては、マイクロタイタープレート、試験管、およびマイクロ遠心分離管が挙げられる。１つの実施形態において、１つまたは両方のタンパク質がマトリクスに結合することを可能にするドメインを付加した融合タンパク質が、提供され得る。例えば、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の融合タンパク質またはグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／標的融合タンパク質が、グルタチオンセファロースビーズ（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）またはグルタチオン誘導体化マイクロタイタープレート上に吸着され得、これらは、次いで、試験化合物、あるいは試験化合物および非吸着標的タンパク質または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質のいずれかと合わされ、そしてこの混合物は、複合体形成が生じる条件下（例えば、塩およびｐＨについての生理学的条件）でインキュベートされる。インキュベーション後、このビーズまたはマイクロタイタープレートウェルは、全ての非結合成分を除去するために洗浄され、ビーズの場合、マトリクスが固定化され、複合体が、例えば、上記のように、直接的にかまたは間接的にかのいずれかで決定される。あるいは、複合体は、マトリクスから解離され得、そして標準的な技術を用いて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合または活性のレベルが決定される。
タンパク質をマトリクス上に固定化するための他の技術がまた、本発明のスクリーニングアッセイにおいて使用され得る。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的分子のいずれかは、ビオチンとストレプトアビジンとの結合体を使用して固定化され得る。ビオチン化された１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または標的分子を、当該分野において公知の技術を使用して、ビオチン−ＮＨＳ（Ｎ−ヒドロキシ−スクシンイミド）から調製し得（例えば、ビオチン化キット、Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、ＩＬ）、そしてストレプトアビジンでコーティングした９６ウェルのプレート（Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ）のウェル中に固定し得る。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または標的分子と反応性であるが、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質のその標的への結合と干渉しない抗体を、プレートのウェルに誘導体化し得、そして非結合標的または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質が、抗体結合体化によってウェルに捕捉される。このような複合体を検出する方法としては、ＧＳＴ固定化複合体についての上記方法に加えて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または標的分子と反応性の抗体を用いる複合体の免疫検出、ならびに１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または標的分子と関連する酵素活性の検出に基づく酵素連結アッセイが挙げられる。
別の実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現の調節因子は、細胞が候補化合物と接触され、そして細胞中での１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が決定される方法が同定される。候補化合物の存在下での１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルは、候補化合物の非存在下での１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルと比較される。次いで、候補化合物は、この比較に基づき、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現の調節因子として同定され得る。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下で多い（統計的に有意に多い）場合、候補化合物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質発現の刺激物質として同定される。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下でより低い（統計学的に有意に低い）場合、候補化合物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質発現のインヒビターとして同定される。細胞中での１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質のレベルは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはタンパク質の検出について本明細書中に記載される方法により決定され得る。
本発明のなお別の局面において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質は、ツーハイブリッドアッセイまたはスリーハイブリッドアッセイ（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら、（１９９３）Ｃｅｌｌ ７２：２２３〜２３２；Ｍａｄｕｒａら（１９９３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６〜１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４：９２０〜９２４；Ｉｗａｂｕｃｈｉら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎｔ ＷＯ９４／１０３００を参照のこと）において「ベイト（ｂａｉｔ）タンパク質」として使用されて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０（「１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合タンパク質」あるいは「１６３８６−ｂｐ、１５４０２−ｂｐ、２１１６５−ｂｐ、１４２３−ｂｐ、６３６−ｂｐ、１２３０３−ｂｐ、２１４２５−ｂｐ、２７４１０−ｂｐ、３８５５４−ｂｐ、３８５５５−ｂｐ、５５０６３−ｂｐ、５７１４５−ｂｐ、５９９１４−ｂｐ、９４９２１−ｂｐ、１６８５２−ｂｐ、３３２６０−ｂｐ、５８５７３−ｂｐ、３０９１１−ｂｐ、８５９１３−ｂｐ、１４３０３−ｂｐ、１６８１６−ｂｐ、１７８２７−ｂｐ、または３２６２０−ｂｐ」）と結合または相互作用し、そして１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性に関与する他のタンパク質を同定し得る。このような１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合タンパク質はまた、例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の媒介性シグナル伝達経路の下流エレメントのような、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の標的によるシグナル伝播に関与する可能性がある。あるいは、このような１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合タンパク質は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のインヒビターである可能性がある。
ツーハイブリッドシステムは、分離可能なＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインからなる大半の転写因子のモジュラー性質に基づく。手短には、このアッセイは、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。１つの構築物において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質をコードする遺伝子は、公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）のＤＮＡ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。もう一方の構築物において、同定されていないタンパク質（「プレイ（ｐｒｅｙ）」または「サンプル」）をコードするＤＮＡ配列のライブラリー由来のＤＮＡ配列は、公知の転写因子の活性化ドメインをコードする遺伝子に融合される。「ベイト」タンパク質および「プレイ」タンパク質がインビボで相互作用して１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に依存性の複合体を形成し得る場合、転写因子のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインは、近接する。このように近接することにより、転写因子に応答性の転写調節部位に作動可能に連結されたレポーター遺伝子（例えば、ＬａｃＺ）の転写が可能になる。レポーター遺伝子の発現が、検出され得、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーは、単離され得、そして１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質と相互作用するタンパク質をコードするクローン化遺伝子を得るために使用され得る。
別の局面において、本発明は、本明細書中に記載されるアッセイの２つ以上の組み合わせに関する。例えば、調節剤は、細胞ベースのアッセイまたは無細胞アッセイを用いて同定され得、そして１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の活性を調節する因子の能力は、例えば、動物（例えば、本明細書中に記載される、疼痛の動物モデル）においてインビボで確認され得る。
本発明はさらに、上記のスクリーニングアッセイによって同定される新規薬剤に関する。従って、適切な動物モデルにおいて、本明細書中で記載されるように同定された薬剤をさらに使用することは本発明の範囲内である。例えば、本明細書中に記載されるように同定された薬剤（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節剤、アンチセンスの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に特異的な抗体、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の結合パートナー）は、このような薬剤を用いる処置の効果、毒性、または副作用を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。あるいは、本明細書中に記載されるように同定される薬剤は、このような薬剤の作用の機構を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。さらに、本発明は、本明細書中に記載されるような処置についての上記スクリーニングアッセイによって同定された新規薬剤の使用に関する。
任意の化合物（上記アッセイ系において同定されるような化合物が挙げられるがこれらに限定されない）が、疼痛を改善する能力について試験され得る。このような疼痛を改善する能力を示す化合物の同定のための細胞ベースのアッセイおよび動物モデルベースのアッセイは、本明細書中に記載される。
さらに、疼痛の動物ベースのモデル（例えば、本明細書中に記載されるようなモデル）は、疼痛および疼痛状態を処置し得る化合物を同定するために使用され得る。このような動物モデルは、疼痛を処置する上で有効であり得る薬物、医薬品、治療、および介入の同定のための試験基質として使用され得る。例えば、動物モデルは、疼痛を処置する能力を示すことが予測される化合物に対して、曝露された動物における疼痛のこのような改善を導くのに十分な濃度および十分な時間、曝露され得る。この曝露に対する動物の応答は、処置の前および後の疼痛の徴候の逆転を評価することによりモニタリングされ得る。
本発明に関して、疼痛の任意の局面を逆転する（すなわち鎮痛効果を有する）任意の処置が、ヒト疼痛治療介入の候補として考慮されるべきである。試験薬剤の投薬量は、用量応答曲線を得ることによって決定され得る。
さらに、遺伝子発現パターンは、疼痛を改善する化合物の能力を評価するために使用され得る。例えば、１つ以上の遺伝子の発現パターンは、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」の一部を形成し得、次いで、このような評価において使用され得る。本明細書中で使用される場合、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」は、所定のセットの条件下で、所定の組織または細胞型について獲得されるｍＲＮＡ発現のパターンを含む。遺伝子発現プロフィールは、例えば、差次的表示手順、ノーザン分析、および／またはＲＴ−ＰＣＲを使用することによって、生成され得る。１つの実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子配列は、このような遺伝子発現プロフィールの生成および確証のためのプローブおよび／またはＰＣＲプライマーとして使用され得る。
遺伝子発現プロフィールは、細胞および／または動物ベースのモデル系における、既知の状態（疼痛障害または正常のいずれか）について特徴付けられ得る。その後、これらの既知の遺伝子発現プロフィールは、試験化合物が有する効果を確認するために比較されて、このような遺伝子発現プロフィールを改変し、そしてそのプロフィールをより望ましいプロフィールの化合物とより緊密に類似させ得る。
例えば、化合物の投与は、疼痛疾患モデル系の遺伝子発現プロフィールを、コントロール系とより緊密に類似させ得る。あるいは、化合物の投与は、コントロール系の遺伝子発現プロフィールに、疼痛または疼痛疾患状態を模倣させ始め得る。このような化合物は、例えば、目的の化合物のさらなる特徴付けにおいて使用され得るか、または、さらなる動物モデルの作製において使用され得る。
（細胞ベースおよび動物ベースのモデル系）
疼痛のためのモデルとしての役割を果たす、細胞ベースおよび動物ベースの系が、本明細書中に記載される。これらの系は、種々の適用において使用され得る。例えば、細胞ベースおよび動物ベースのモデル系を使用して、疼痛または疼痛障害に関連する、差次的に発現される遺伝子（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０）をさらに特徴付けし得る。さらに動物ベースおよび細胞ベースのアッセイは、以下に記載されるような疼痛を改善し得る化合物を同定するように設計された、スクリーニングストラテジーの一部として使用され得る。従って、動物ベースおよび細胞ベースのモデルを使用して、疼痛または疼痛障害を処置する際に有効であり得る薬物、医薬品、治療および介入を同定し得る。さらに、このような動物モデルを使用して、動物被験体におけるＬＤ５０およびＥＤ５０を決定し得、そしてこのようなデータを使用して、潜在的な疼痛処置のインビボでの効力を決定し得る。
（動物ベースの系）
疼痛の動物ベースのモデル系としては、非組換え動物および操作されたトランスジェニック動物が挙げられ得るがこれらに限定されない。
疼痛についての非組換え動物モデルとしては、例えば、遺伝的モデルが挙げられ得る。
さらに、疼痛を示す動物モデルは、例えば、当業者に周知であるトランスジェニック動物を作製するための技術とともに、上記の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子配列を使用することによって、操作され得る。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子配列が、目的の動物のゲノムに導入され得、そしてこの目的の動物のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、またはあるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子発現を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
本発明の宿主細胞をまた使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得る。例えば、１つの実施形態において、本発明の宿主細胞は、受精卵または胚性幹細胞であり、この細胞に、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のコード配列が導入されている。次いで、このような宿主細胞を使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得、ここにおいて、外因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の配列が、それらのゲノムまたは相同組換え動物に導入され、ここで、内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の配列が、変更されている。このような動物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の機能および／または活性を研究するため、ならびに１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性の調節因子を同定および／または評価するのに有用である。本明細書中で使用される場合、「トランスジェニック動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、ラットまたはマウスのようなげっ歯類であり、ここで、これらの動物の１つ以上の細胞が、導入遺伝子を含む。トランスジェニック動物の他の例としては、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、両生類などが挙げられる。導入遺伝子は、外因性ＤＮＡであり、この外因性ＤＮＡは、トランスジェニック動物が成長する細胞のゲノムに取り込まれ、かつ成熟動物のゲノムにおいて維持され、それによってこのトランスジェニック動物の１つ以上の細胞型または組織における、コードされた遺伝子産物の発現を指向する。本明細書中で使用される場合、「相同組換え動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、マウスであり、ここで、内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子は、この内因性遺伝子と、その動物の成長前にこの動物の細胞（例えば、動物の胚細胞）に導入された外因性ＤＮＡ分子との間の相同組換えによって変更されている。
本発明の方法において使用されるトランスジェニック動物は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のコード核酸を、受精卵の雄前核に、例えば、マイクロインジェクション、レトロウイルス感染によって導入し、そして卵母細胞を偽妊娠雌養母動物において成長させることによって作製され得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｃＤＮＡ配列は、導入遺伝子として、非ヒト動物のゲノムに導入され得る。あるいは、ヒトの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の非ヒトホモログ（例えば、マウスまたはラットの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子）が、導入遺伝子として使用され得る。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子ホモログ（例えば、別の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のファミリーメンバー）は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｃＤＮＡ配列へのハイブリダイゼーションに基づいて単離され得、そして導入遺伝子として使用され得る。イントロン配列およびポリアデニル化シグナルもまた、導入遺伝子の発現の効力を増加させるように、この導入遺伝子に含まれ得る。組織特異的調節配列は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の導入遺伝子に作動可能に連結されて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の発現を特定の細胞に指向し得る。胚操作およびマイクロインジェクションを介して、トランスジェニック動物（特に、マウスのような動物）を作製するための方法は、当該分野において慣習的であり、例えば、以下に記載されている：米国特許第４，７３６，８６６号および同第４，８７０，００９号（両方が、Ｌｅｄｅｒらによる）、米国特許第４，８７３，１９１号（Ｗａｇｎｅｒらによる）、ならびにＨｏｇａｎ，Ｂ．，Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ ｔｈｅ Ｍｏｕｓｅ Ｅｍｂｒｙｏ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８６）。類似の方法が、他のトランスジェニック動物の作製のために使用される。トランスジェニック始原（ｆｏｕｎｄｅｒ）動物は、そのゲノムにおける１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の導入遺伝子の存在、および／あるいは動物の組織または細胞における１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡの発現に基づいて、同定され得る。次いで、トランスジェニック始原動物を使用して、導入遺伝子を保有するさらなる動物を育種し得る。さらに、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質をコードする導入遺伝子を有するトランスジェニック動物はさらに、他の導入遺伝子を有する他のトランスジェニック動物を産出し得る。
相同組換え動物を作製するために、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の少なくとも一部を含むベクターが調製され、このベクターに、欠失、付加または置換が導入されて、それによって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子が変更される（例えば、機能的に破壊される）。この１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子は、ヒト遺伝子であり得るが、より好ましくは、ヒトの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の非ヒトホモログである。例えば、ラットの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子を使用して、マウスゲノムにおいて内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子を変更するのに適切な、相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）を構築し得る。好ましい実施形態において、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子が機能的に破壊される（すなわち、もはや機能的タンパク質をコードしない；「ノックアウト」ベクターとも呼ばれる）ように、設計される。あるいは、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子が変異されるか、さもなければ変更されるが依然として機能的タンパク質をコードする（例えば、上流の調節領域が変更され、それによって内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の発現を変更し得る）ように、設計され得る。相同組換え核酸分子において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の変更された部分は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子のさらなる核酸配列によって、その５’末端および３’末端に隣接され、相同組換え核酸分子によって保有される外因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子と、細胞（例えば、胚性幹細胞）における内因性１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子との間に、相同組換えが生じることを可能にする。隣接するさらなる１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸配列は、内因性遺伝子との首尾よい相同組換えに十分な長さの核酸配列である。代表的には、隣接したＤＮＡ（５’末端と３’末端との両方）の数キロベースが、この相同組換え核酸分子に含まれる（例えば、相同組換えベクターの記載については、Ｔｈｏｍａｓ，Ｋ．Ｒ．およびＣａｐｅｃｃｈｉ，Ｍ．Ｒ．（１９８７）Ｃｅｌｌ ５１：５０３を参照のこと）。相同組換え核酸分子は、細胞（例えば、胚性幹細胞株）に（例えば、エレクトロポーションによって）導入され、そして導入された１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子が内因性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子と相同に組み換わる細胞が、選択される（例えば、Ｌｉ，Ｅ．ら（１９９２）Ｃｅｌｌ ６９：９１５を参照のこと）。次いで、これらの選択された細胞は、動物（例えば、マウス）の胚盤胞に注射され、凝集キメラを形成し得る。（例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．Ｔｅｒａｔｏｃａｒｃｉｎｏｍａｓ ａｎｄ Ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅ．Ｊ．Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ編（ＩＲＬ，Ｏｘｆｏｒｄ，１９８７）１１３−１５２頁）を参照のこと）。次いで、キメラ胚は、適切な偽妊娠雌養母動物に移植され得、そしてこの胚は、生殖（ｔｅｒｍ）され得る。生殖細胞において相同組換えされたＤＮＡを含む子孫を使用して、動物を繁殖させ得、ここで、この動物の全ての細胞は、導入遺伝子の生殖系列伝達によって相同組換えされたＤＮＡを含む。相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）または相同組換え動物を構築するための方法は、以下にさらに記載される：Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．（１９９１）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２：８２３−８２９、およびＬｅ Ｍｏｕｅｌｌｅｃらによる、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ ９０／１１３５４；Ｓｍｉｔｈｉｅｓらによる、ＷＯ ９１／０１１４０；Ｚｉｊｌｓｔｒａらによる、ＷＯ ９２／０９６８；およびＢｅｒｎｓらによる、ＷＯ ９３／０４１６９。
別の実施形態において、本発明の方法において使用するためのトランスジェニック非ヒト動物が作製され得、この動物は、導入遺伝子の調節された発現を可能にする、選択された系を含む。このような系の１つの例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系の記載については、例えば、Ｌａｋｓｏら（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：６２３２−６２３６を参照のこと。リコンビナーゼ系の別の例は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１：１３５１−１３５５）。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系を使用して導入遺伝子の発現を調節する場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパク質の両方をコードする導入遺伝子を含む動物が、必要とされる。このような動物は、「二重」トランスジェニック動物の構築によって（例えば、２種のトランスジェニック動物（一方は、選択されたタンパク質をコードする導入遺伝子を含み、他方は、リコンビナーゼをコードする導入遺伝子を含む）を交配させることによって）提供され得る。
本明細書中に記載される非ヒトトランスジェニック動物のクローンはまた、以下に記載される方法に従って作製され得る：Ｗｉｌｍｕｔ，Ｉ．ら（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ ３８５：８１０−８１３およびＰＣＴ国際公開番号ＷＯ ９７／０７６６８およびＷＯ ９７／０７６６９。簡潔には、トランスジェニック動物由来の細胞（例えば、体細胞）が単離され得、そして増殖周期を出てＧ０期に入るように誘導され得る。次いで、休止細胞は、例えば、電気パルスの使用を介して、この休止細胞が単離される同じ種の動物由来の除核された卵母細胞に融合され得る。次いで、この再構築された卵母細胞は、桑実胚または未分化胚芽細胞が成長するように培養され、次いで、偽妊娠雌養母動物に移される。この雌養母動物の子孫は、細胞（例えば、体細胞）が単離される動物のクローンである。
次いで、容易に検出可能なレベルの１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡあるいは１６３８６ペプチド、１５４０２ペプチド、２１１６５ペプチド、１４２３ペプチド、６３６ペプチド、１２３０３ペプチド、２１４２５ペプチド、２７４１０ペプチド、３８５５４ペプチド、３８５５５ペプチド、５５０６３ペプチド、５７１４５ペプチド、５９９１４ペプチド、９４９２１ペプチド、１６８５２ペプチド、３３２６０ペプチド、５８５７３ペプチド、３０９１１ペプチド、８５９１３ペプチド、１４３０３ペプチド、１６８１６ペプチド、１７８２７ペプチド、または３２６２０ペプチド（１６３８６エピトープ、１５４０２エピトープ、２１１６５エピトープ、１４２３エピトープ、６３６エピトープ、１２３０３エピトープ、２１４２５エピトープ、２７４１０エピトープ、３８５５４エピトープ、３８５５５エピトープ、５５０６３エピトープ、５７１４５エピトープ、５９９１４エピトープ、９４９２１エピトープ、１６８５２エピトープ、３３２６０エピトープ、５８５７３エピトープ、３０９１１エピトープ、８５９１３エピトープ、１４３０３エピトープ、１６８１６エピトープ、１７８２７エピトープ、または３２６２０エピトープに対する抗体を使用して、免疫細胞化学的に検出される）を発現する、１６３８６トランスジェニック動物、１５４０２トランスジェニック動物、２１１６５トランスジェニック動物、１４２３トランスジェニック動物、６３６トランスジェニック動物、１２３０３トランスジェニック動物、２１４２５トランスジェニック動物、２７４１０トランスジェニック動物、３８５５４トランスジェニック動物、３８５５５トランスジェニック動物、５５０６３トランスジェニック動物、５７１４５トランスジェニック動物、５９９１４トランスジェニック動物、９４９２１トランスジェニック動物、１６８５２トランスジェニック動物、３３２６０トランスジェニック動物、５８５７３トランスジェニック動物、３０９１１トランスジェニック動物、８５９１３トランスジェニック動物、１４３０３トランスジェニック動物、１６８１６トランスジェニック動物、１７８２７トランスジェニック動物、または３２６２０トランスジェニック動物は、特徴的な疼痛を表示する動物を同定するために、さらに評価されるべきである。
（細胞ベースの系）
１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードする、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子配列を含み、かつこれらを発現し、そしてさらに疼痛に関連する細胞表現型を示す細胞を使用して、鎮痛効果を示す化合物を同定し得る。このような細胞としては、以下が挙げられ得る：非組換え単球細胞株（例えば、Ｕ９３７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１５９３）、ＴＨＰ−１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−２０２）、およびＰ３８８Ｄ１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−６３））；内皮細胞（例えば、ヒト臍静脈内皮細胞（ＨＵＶＥＣ）、ヒト微小血管内皮細胞（ＨＭＶＥＣ）、およびウシ大動脈内皮細胞（ＢＡＥＣ））；ならびに、一般的な哺乳動物細胞株（例えば、ＨｅＬａ細胞およびＣＯＳ細胞（例えば、ＣＯＳ−７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１６５１）、および神経細胞株））。さらに、このような細胞としては、組換え細胞株、トランスジェニック細胞株が挙げられ得る。例えば、上で議論される、本発明の疼痛動物モデルを使用して、この障害に対する細胞培養モデルとして使用され得る細胞株（これは、痛覚に関与する１種以上の細胞型を含有する）を作製し得る。本発明の疼痛モデルのトランスジェニック動物由来の一次培養物が利用され得るが、連続した細胞株の作製が、好ましい。トランスジェニック動物から連続した細胞株を誘導するために使用され得る技術の例については、Ｓｍａｌｌら（１９８５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．５：６４２−６４８を参照のこと。
あるいは、痛覚に関与することが知られている細胞型の細胞は、細胞内での１６３８６遺伝子発現、１５４０２遺伝子発現、２１１６５遺伝子発現、１４２３遺伝子発現、６３６遺伝子発現、１２３０３遺伝子発現、２１４２５遺伝子発現、２７４１０遺伝子発現、３８５５４遺伝子発現、３８５５５遺伝子発現、５５０６３遺伝子発現、５７１４５遺伝子発現、５９９１４遺伝子発現、９４９２１遺伝子発現、１６８５２遺伝子発現、３３２６０遺伝子発現、５８５７３遺伝子発現、３０９１１遺伝子発現、８５９１３遺伝子発現、１４３０３遺伝子発現、１６８１６遺伝子発現、１７８２７遺伝子発現、または３２６２０遺伝子発現の量を増加または低下させ得る配列でトランスフェクトされ得る。例えば、１６３８６遺伝子配列、１５４０２遺伝子配列、２１１６５遺伝子配列、１４２３遺伝子配列、６３６遺伝子配列、１２３０３遺伝子配列、２１４２５遺伝子配列、２７４１０遺伝子配列、３８５５４遺伝子配列、３８５５５遺伝子配列、５５０６３遺伝子配列、５７１４５遺伝子配列、５９９１４遺伝子配列、９４９２１遺伝子配列、１６８５２遺伝子配列、３３２６０遺伝子配列、５８５７３遺伝子配列、３０９１１遺伝子配列、８５９１３遺伝子配列、１４３０３遺伝子配列、１６８１６遺伝子配列、１７８２７遺伝子配列、または３２６２０遺伝子配列は、目的の細胞のゲノムに導入され得、そしてこの目的の動物のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の１６３８６遺伝子配列、１５４０２遺伝子配列、２１１６５遺伝子配列、１４２３遺伝子配列、６３６遺伝子配列、１２３０３遺伝子配列、２１４２５遺伝子配列、２７４１０遺伝子配列、３８５５４遺伝子配列、３８５５５遺伝子配列、５５０６３遺伝子配列、５７１４５遺伝子配列、５９９１４遺伝子配列、９４９２１遺伝子配列、１６８５２遺伝子配列、３３２６０遺伝子配列、５８５７３遺伝子配列、３０９１１遺伝子配列、８５９１３遺伝子配列、１４３０３遺伝子配列、１６８１６遺伝子配列、１７８２７遺伝子配列、または３２６２０遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、またはあるいは、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子を過剰発現させるために、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子のコード部分は、目的の細胞型（例えば、内皮細胞）において遺伝子発現を駆動し得る調節配列に連結され得る。このような調節領域は、当業者に周知であり、そして過度な実験を行うことなく利用され得る。標的遺伝子を発現させるための組換え方法は、上に記載されている。
内因性の１６３８６遺伝子配列、１５４０２遺伝子配列、２１１６５遺伝子配列、１４２３遺伝子配列、６３６遺伝子配列、１２３０３遺伝子配列、２１４２５遺伝子配列、２７４１０遺伝子配列、３８５５４遺伝子配列、３８５５５遺伝子配列、５５０６３遺伝子配列、５７１４５遺伝子配列、５９９１４遺伝子配列、９４９２１遺伝子配列、１６８５２遺伝子配列、３３２６０遺伝子配列、５８５７３遺伝子配列、３０９１１遺伝子配列、８５９１３遺伝子配列、１４３０３遺伝子配列、１６８１６遺伝子配列、１７８２７遺伝子配列、または３２６２０遺伝子配列の過少発現のために、このような配列は、単離され得、そして目的の細胞型のゲノムに再導入された場合、内因性の１６３８６対立遺伝子、１５４０２対立遺伝子、２１１６５対立遺伝子、１４２３対立遺伝子、６３６対立遺伝子、１２３０３対立遺伝子、２１４２５対立遺伝子、２７４１０対立遺伝子、３８５５４対立遺伝子、３８５５５対立遺伝子、５５０６３対立遺伝子、５７１４５対立遺伝子、５９９１４対立遺伝子、９４９２１対立遺伝子、１６８５２対立遺伝子、３３２６０対立遺伝子、５８５７３対立遺伝子、３０９１１対立遺伝子、８５９１３対立遺伝子、１４３０３対立遺伝子、１６８１６対立遺伝子、１７８２７対立遺伝子、または３２６２０対立遺伝子が不活化されるように、操作され得る。好ましくは、この操作された１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列は、遺伝子ターゲティングを介して導入され、その結果、内因性の１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列は、操作された１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列を、細胞のゲノムに組み込む際に破壊される。１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子を用いた、宿主細胞のトランスフェクションは、上で考察されている。
化合物で処置されたかあるいは１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子を用いてトランスフェクトされた細胞は、痛覚に関連する表現型について試験され得る。
１６３８６核酸、１５４０２核酸、２１１６５核酸、１４２３核酸、６３６核酸、１２３０３核酸、２１４２５核酸、２７４１０核酸、３８５５４核酸、３８５５５核酸、５５０６３核酸、５７１４５核酸、５９９１４核酸、９４９２１核酸、１６８５２核酸、３３２６０核酸、５８５７３核酸、３０９１１核酸、８５９１３核酸、１４３０３核酸、１６８１６核酸、１７８２７核酸、または３２６２０核酸のトランスフェクションは、標準的な技術（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ（１９８９）前出、に記載される）を使用することによって、達成され得る。トランスフェクトされた細胞は、１６３８６組換え遺伝子配列、１５４０２組換え遺伝子配列、２１１６５組換え遺伝子配列、１４２３組換え遺伝子配列、６３６組換え遺伝子配列、１２３０３組換え遺伝子配列、２１４２５組換え遺伝子配列、２７４１０組換え遺伝子配列、３８５５４組換え遺伝子配列、３８５５５組換え遺伝子配列、５５０６３組換え遺伝子配列、５７１４５組換え遺伝子配列、５９９１４組換え遺伝子配列、９４９２１組換え遺伝子配列、１６８５２組換え遺伝子配列、３３２６０組換え遺伝子配列、５８５７３組換え遺伝子配列、３０９１１組換え遺伝子配列、８５９１３組換え遺伝子配列、１４３０３組換え遺伝子配列、１６８１６組換え遺伝子配列、１７８２７組換え遺伝子配列、または３２６２０組換え遺伝子配列の存在について、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡの発現および蓄積について、ならびに１６３８６組換えタンパク質、１５４０２組換えタンパク質、２１１６５組換えタンパク質、１４２３組換えタンパク質、６３６組換えタンパク質、１２３０３組換えタンパク質、２１４２５組換えタンパク質、２７４１０組換えタンパク質、３８５５４組換えタンパク質、３８５５５組換えタンパク質、５５０６３組換えタンパク質、５７１４５組換えタンパク質、５９９１４組換えタンパク質、９４９２１組換えタンパク質、１６８５２組換えタンパク質、３３２６０組換えタンパク質、５８５７３組換えタンパク質、３０９１１組換えタンパク質、８５９１３組換えタンパク質、１４３０３組換えタンパク質、１６８１６組換えタンパク質、１７８２７組換えタンパク質、または３２６２０組換えタンパク質の産生の存在について、評価されるべきである。１６３８６遺伝子発現、１５４０２遺伝子発現、２１１６５遺伝子発現、１４２３遺伝子発現、６３６遺伝子発現、１２３０３遺伝子発現、２１４２５遺伝子発現、２７４１０遺伝子発現、３８５５４遺伝子発現、３８５５５遺伝子発現、５５０６３遺伝子発現、５７１４５遺伝子発現、５９９１４遺伝子発現、９４９２１遺伝子発現、１６８５２遺伝子発現、３３２６０遺伝子発現、５８５７３遺伝子発現、３０９１１遺伝子発現、８５９１３遺伝子発現、１４３０３遺伝子発現、１６８１６遺伝子発現、１７８２７遺伝子発現、または３２６２０遺伝子発現の減少が望ましい場合において、標準的な技術を使用して、内因性の１６３８６遺伝子発現、１５４０２遺伝子発現、２１１６５遺伝子発現、１４２３遺伝子発現、６３６遺伝子発現、１２３０３遺伝子発現、２１４２５遺伝子発現、２７４１０遺伝子発現、３８５５４遺伝子発現、３８５５５遺伝子発現、５５０６３遺伝子発現、５７１４５遺伝子発現、５９９１４遺伝子発現、９４９２１遺伝子発現、１６８５２遺伝子発現、３３２６０遺伝子発現、５８５７３遺伝子発現、３０９１１遺伝子発現、８５９１３遺伝子発現、１４３０３遺伝子発現、１６８１６遺伝子発現、１７８２７遺伝子発現、または３２６２０遺伝子発現および／あるいは１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質産生の低下が達成されるか否かを、実証し得る。
内在性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が、内在性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の発現を通常では制御しない調節配列の制御下にある、細胞またはその精製調製物（例えば、ヒト細胞）もまた提供される。細胞（例えば、細胞株または微生物）内の内在性遺伝子の発現特性は、挿入された調節エレメントが内在性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子と作動可能に連結されるように、異種ＤＮＡ調節エレメントをこの細胞のゲノムに挿入することによって、改変され得る。例えば、内在性の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子（例えば、「転写的にサイレントな」遺伝子、例えば、通常は発現されないか、もしくは非常に低レベルでしか発現されない遺伝子）は、この細胞で通常発現される遺伝子産物の発現を促進し得る調節エレメントを挿入することによって活性化され得る。標的化相同組換えのような技術が、例えば、Ｃｈａｐｐｅｌ，ＵＳ５，２７２，０７１；ＷＯ９１／０６６６７（１９９１年５月１６日公開）に記載されるように、異種ＤＮＡを挿入するために使用され得る。
（予測医学）
本発明はまた、予測医学の分野に関し、ここにおいて、診断アッセイ、予後アッセイ、臨床試験のモニタリングが、予後（予測）目的のために使用され、それによって個体を予防的に処置する。従って、本発明の１つの局面は、生物学的サンプル（例えば、血液、血清、細胞（例えば、内皮細胞）、または組織（例えば、血管組織））の状況において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質および／または核酸の発現、ならびに１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を決定し、それによって、個体が、素因に罹患しているかまたは疼痛を被っているか否かを決定するための診断アッセイに関する。本発明はまた、個体が疼痛性疾患を発病する危険性があるか否かを決定するための、予後（または予測）アッセイを提供する。例えば、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における変異が、生物学的サンプルにおいてアッセイされ得る。このようなアッセイは、予後目的または予測目的のために使用され得、それによって個体を、疼痛性疾患の発症前に、予防的に（ｐｈｏｐｈｙｌａｃｔｉｃａｌｌｙ）処置する。
本発明の別の局面は、臨床試験における、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性に対する、１６３８６調節因子、１５４０２調節因子、２１１６５調節因子、１４２３調節因子、６３６調節因子、１２３０３調節因子、２１４２５調節因子、２７４１０調節因子、３８５５４調節因子、３８５５５調節因子、５５０６３調節因子、５７１４５調節因子、５９９１４調節因子、９４９２１調節因子、１６８５２調節因子、３３２６０調節因子、５８５７３調節因子、３０９１１調節因子、８５９１３調節因子、１４３０３調節因子、１６８１６調節因子、１７８２７調節因子、または３２６２０調節因子（例えば、抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体、あるいは１６３８６リボザイム、１５４０２リボザイム、２１１６５リボザイム、１４２３リボザイム、６３６リボザイム、１２３０３リボザイム、２１４２５リボザイム、２７４１０リボザイム、３８５５４リボザイム、３８５５５リボザイム、５５０６３リボザイム、５７１４５リボザイム、５９９１４リボザイム、９４９２１リボザイム、１６８５２リボザイム、３３２６０リボザイム、５８５７３リボザイム、３０９１１リボザイム、８５９１３リボザイム、１４３０３リボザイム、１６８１６リボザイム、１７８２７リボザイム、または３２６２０リボザイム）の影響のモニタリングに関する。
これらの因子および他の因子は、以下の節で、さらに詳細に記載される。
（診断アッセイ）
被験体が疾患に罹患しているか否かを決定するために、生物学的サンプルが被験体から得られ得、そしてこの生物学的サンプルは、この生物学的サンプル中で、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質、あるいは１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードする核酸（例えば、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡ）を検出することができる、化合物または因子と接触され得る。１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出するために好ましい因子は、標識核酸プローブであり、このプローブは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡにハイブリダイズし得る。この核酸プローブは、例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示される１６３８６核酸、１５４０２核酸、２１１６５核酸、１４２３核酸、６３６核酸、１２３０３核酸、２１４２５核酸、２７４１０核酸、３８５５４核酸、３８５５５核酸、５５０６３核酸、５７１４５核酸、５９９１４核酸、９４９２１核酸、１６８５２核酸、３３２６０核酸、５８５７３核酸、３０９１１核酸、８５９１３核酸、１４３０３核酸、１６８１６核酸、１７８２７核酸、もしくは３２６２０核酸またはそれらの一部（例えば、少なくとも１５ヌクレオチド長、２０ヌクレオチド長、２５ヌクレオチド長、３０ヌクレオチド長、２５ヌクレオチド長、４０ヌクレオチド長、４５ヌクレオチド長、５０ヌクレオチド長、１００ヌクレオチド長、２５０ヌクレオチド長または５００ヌクレオチド長であり、かつストリンジェントな条件下で、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡに特異的にハイブリダイズするに十分であるオリゴヌクレオチド）であり得る。本発明の診断アッセイにおいて使用するのに適切な他のプローブが、本明細書中に記載されている。
サンプル中の、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質を検出するのに好ましい因子は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質に結合し得る抗体であり、好ましくは、検出可能な標識を有する抗体である。抗体は、ポリクローナル抗体であり得、より好ましくは、モノクローナル抗体であり得る。インタクトな抗体、またはそのフラグメント（例えば、ＦａｂまたはＦ（ａｂ’）２）が、使用され得る。プローブまたは抗体に関して、用語「標識（された）」は、検出可能な物質をそのプローブまたは抗体にカップリング（すなわち、物理的に連結する）し、そして直接的に標識される別の試薬との反応性によってこのプローブまたは抗体を間接的に標識することによる、プローブまたは抗体の直接的な標識を含むことが意図される。間接的な標識の例は、蛍光標識された二次抗体を使用し、そして蛍光標識されたストレプトアビジンで検出され得るように、ビオチンでＤＮＡプローブを末端標識する、一次抗体の検出を含む。
用語「生物学的サンプル」は、被験体から単離された組織、細胞、および生物学的流体、ならびに被験体内に存在する組織、細胞、および流体を含むことが意図される。すなわち、本発明の検出方法を使用して、インビトロおよびインビボで、生物学的サンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡ、タンパク質、またはゲノムＤＮＡを検出し得る。例えば、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、ノーザンハイブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質を検出するためのインビトロ技術としては、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）、ウエスタンブロット、免疫沈降および免疫蛍光検査法が挙げられる。１６３８６ゲノムＤＮＡ、１５４０２ゲノムＤＮＡ、２１１６５ゲノムＤＮＡ、１４２３ゲノムＤＮＡ、６３６ゲノムＤＮＡ、１２３０３ゲノムＤＮＡ、２１４２５ゲノムＤＮＡ、２７４１０ゲノムＤＮＡ、３８５５４ゲノムＤＮＡ、３８５５５ゲノムＤＮＡ、５５０６３ゲノムＤＮＡ、５７１４５ゲノムＤＮＡ、５９９１４ゲノムＤＮＡ、９４９２１ゲノムＤＮＡ、１６８５２ゲノムＤＮＡ、３３２６０ゲノムＤＮＡ、５８５７３ゲノムＤＮＡ、３０９１１ゲノムＤＮＡ、８５９１３ゲノムＤＮＡ、１４３０３ゲノムＤＮＡ、１６８１６ゲノムＤＮＡ、１７８２７ゲノムＤＮＡ、または３２６２０ゲノムＤＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、サザンハイブリダイゼーションが挙げられる。さらに、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質を検出するためのインビボ技術は、被験体に、標識された抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体を導入することを含む。例えば、抗体は、被験体における存在および位置が、標準的な画像化技術によって検出され得る放射標識マーカーで、標識され得る。
別の実施形態において、本発明はさらに、以下の工程を包含する：コントロール被験体から、コントロールの生物学的サンプルを得る工程；このコントロールサンプルを、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出することができる化合物または因子と接触させる工程であって、その結果、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在が、生物学的サンプル中で検出される、工程；ならびに、コントロールサンプルにおける１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在を、試験サンプルにおける１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在と比較する工程。
（予後アッセイ）
本発明はさらに、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の異常な発現または活性に関連する疾患を有するかまたはそのような疾患を発症する危険性のある被験体を同定するための方法に関する。
本明細書中で使用される場合、用語「異常な」は、野生型の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性から逸脱した、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を含む。異常な発現または活性は、増大または減少した、発現または活性ならびに野生型の発生的な発現パターンまたは細胞内発現パターンに従わない、発現または活性を含む。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の異常な発現または活性は、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における変異により、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子が、過少発現または過剰発現される場合、ならびにこのような変異によって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の非機能的なタンパク質または野生型様式では機能しないタンパク質（例えば、１６３８６基質、１５４０２基質、２１１６５基質、１４２３基質、６３６基質、１２３０３基質、２１４２５基質、２７４１０基質、３８５５４基質、３８５５５基質、５５０６３基質、５７１４５基質、５９９１４基質、９４９２１基質、１６８５２基質、３３２６０基質、５８５７３基質、３０９１１基質、８５９１３基質、１４３０３基質、１６８１６基質、１７８２７基質、または３２６２０基質と相互作用しないタンパク質、または非１６３８６基質、非１５４０２基質、非２１１６５基質、非１４２３基質、非６３６基質、非１２３０３基質、非２１４２５基質、非２７４１０基質、非３８５５４基質、非３８５５５基質、非５５０６３基質、非５７１４５基質、非５９９１４基質、非９４９２１基質、非１６８５２基質、非３３２６０基質、非５８５７３基質、非３０９１１基質、非８５９１３基質、非１４３０３基質、非１６８１６基質、非１７８２７基質、または非３２６２０基質と相互作用するタンパク質）が生じる状況、を含むことが意図される。
本明細書中に記載されるアッセイ（例えば、前述の診断アッセイまたは以下のアッセイ）を使用して、疾患を有する被験体または疾患を発症する危険性のある被験体を同定し得る。生物学的サンプルを、被験体より取得し得、そして遺伝的変更の存在または非存在について試験し得る。例えば、このような遺伝的変更は、以下の少なくとも１つの存在を確認することにより検出され得る：１）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子からの１つ以上のヌクレオチドの欠失、２）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子への１つ以上のヌクレオチドの付加、３）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の１つ以上のヌクレオチドの置換、４）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の染色体再構築、５）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物のレベルにおける変更、６）ゲノムＤＮＡのメチル化パターンのような、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の異常な改変、７）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物の非野生型スプライシングパターンの存在、８）１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の非野生型レベル、９）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の対立遺伝子喪失、ならびに１０）１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の不適切な翻訳後修飾。
本明細書中で記載されるように、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における遺伝的変更を検出するために使用され得る、当該分野において公知の多くのアッセイが、存在する。例えば、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における遺伝的変更は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（例えば、米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号を参照のこと）（例えば、アンカーＰＣＲまたはＲＡＣＥ ＰＣＲ）あるいは、ライゲーション連鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、Ｌａｎｄｅｇｒａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：１０７７−１０８０；およびＮａｋａｚａｗａら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：３６０−３６４を参照のこと）においてプローブ／プライマーを使用して検出され得、これらのうちの後者は、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における点変異を検出するために特に有用であり得る（Ａｂｒａｖａｙａら（１９９５）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２３：６７５−６８２を参照のこと）。この方法は、以下の工程を包含する：被験体から生物学的サンプルを収集する工程、このサンプルから核酸（例えば、ゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡまたはこれらの両方）を単離する工程、（存在するならば）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子のハイブリダイゼーションおよび増幅が生じるような条件下で、この核酸サンプルを、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子に特異的にハイブリダイズする１つ以上のプライマーと接触させる工程、ならびに増幅産物の存在または非存在を検出するかまたは増幅産物のサイズを検出しそしてコントロールサンプルと長さを比較する工程。ＰＣＲおよび／またはＬＣＲが、本明細書中に記載される変異を検出するために使用される任意の技術と組合わせて予備的増幅工程として使用されることが所望され得ることは、明白である。
代替の増幅法としては以下が挙げられる：自己維持的配列複製（ｓｅｌｆ ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ）（Ｇｕａｔｅｌｌｉ，Ｊ．Ｃ．ら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１８７４−１８７８）、転写増幅系（Ｋｗｏｈ，Ｄ．Ｙ．ら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：１１７３−１１７７）、Ｑ−βレプリカーゼ（Ｌｉｚａｒｄｉ，Ｐ．Ｍ．ら（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ６：１１９７）、または他の核酸増幅法のいずれか、その後の当業者に周知の技術を使用する増幅分子の検出。これらの検出スキームは、このような分子が非常に少数で存在する場合に、核酸分子の検出に特に有用である。
代替の実施形態において、生物学的サンプル由来の１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における変異は、制限酵素切断パターンにおける変更によって同定され得る。例えば、サンプルおよびコントロールＤＮＡが、単離され、（必要に応じて）増幅され、１つ以上の制限エンドヌクレアーゼで消化され、そしてフラグメント長サイズが、ゲル電気泳動によって決定され、そして比較される。サンプルとコントロールＤＮＡとの間のフラグメント長サイズの差異は、サンプルＤＮＡ中の変異を示す。さらに、配列特異的リボザイム（例えば、米国特許第５，４９８，５３１号を参照のこと）の使用は、リボザイム切断部位の発生または喪失によって、特異的変異の存在についてスコア付けするために使用され得る。
他の実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０における遺伝的変異は、生物学的サンプル由来の核酸およびコントロール核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を、何百個または何千個のオリゴヌクレオチドプローブを含む高密度アレイにハイブリダイズさせることによって同定され得る（Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）Ｈｕｍａｎ Ｍｕｔａｔｉｏｎ ７：２４４−２５５；Ｋｏｚａｌ，Ｍ．Ｊ．ら（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ２：７５３−７５９）。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０における遺伝的変異は、Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）（上述）に記載されるような光生成ＤＮＡプローブを含む２次元アレイにおいて同定され得る。簡単には、プローブの第１のハイブリダイゼーションアレイを使用して、連続的で重複するプローブの線状アレイを作製することによって、サンプルおよびコントロールにおけるＤＮＡの長鎖を通して走査して配列間の塩基変化を同定し得る。この工程は、点変異の同定を可能にする。この工程の後、検出される全ての改変体または変異体に相補的なより小さな特定化されたプローブアレイを使用することによって、特異的変異の特徴付けを可能にする第２のハイブリダイゼーションアレイが続く。各変異アレイは、パラレルプローブセット、野生型遺伝子に対するある相補体および変異遺伝子に対する他の相補体から構成される。
なお別の実施形態において、当該分野において公知の種々の配列決定反応のいずれかを使用して、生物学的サンプル中の１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子を直接的に配列決定し得、そして生物学的サンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の配列を、対応する野生型（コントロール）配列と比較することによって変異を検出し得る。配列決定反応の例としては、ＭａｘａｍおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７４：５６０またはＳａｎｇｅｒ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７４：５４６３によって開発された技術に基づく反応が挙げられる。種々の自動化配列決定手順のいずれかが、質量分析法による配列決定（例えば、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら（１９９６）Ａｄｖ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．３６：１２７−１６２；およびＧｒｉｆｆｉｎら（１９９３）Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３８：１４７−１５９を参照のこと）を含む診断アッセイ（Ｎａｅｖｅ，Ｃ．Ｗ．（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １９：４４８−５３）を行う場合に利用され得ることもまた、企図される。
１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子における変異を検出するための他の方法としては、切断剤からの保護がＲＮＡ／ＲＮＡヘテロ二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡヘテロ二重鎖中でミスマッチした塩基を検出するために使用される方法が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３０：１２４２）。一般に、「ミスマッチ切断」の分野の技術は、野生型の１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列を含む（標識された）ＲＮＡまたはＤＮＡを、組織サンプルより得られた潜在的変異ＲＮＡまたはＤＮＡとハイブリダイズさせることによって形成されるヘテロ二重鎖を提供することによって開始する。二本鎖二重鎖は、コントロール鎖とサンプル鎖との間の塩基対ミスマッチに起因して存在するような二重鎖の一本鎖領域を切断する因子で処理される。例えば、ミスマッチ領域を酵素的に消化するために、ＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖はＲＮａｓｅで処理され得、ＤＮＡ／ＤＮＡハイブリッドはＳ１ヌクレアーゼで処理され得る。他の実施形態において、ＤＮＡ／ＤＮＡ二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ二本鎖のいずれかが、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウムで処理され得、そして、ミスマッチ領域を消化するためにピペリジンで処理され得る。ミスマッチ領域の消化後、次いで生じた物質が、変異部位を決定するために変性ポリアクリルアミドゲル上でサイズで分けられる。例えば、Ｃｏｔｔｏｎら（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８５：４３９７およびＳａｌｅｅｂａら（１９９２）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：２８６−２９５を参照のこと。好ましい実施形態において、コントロールＤＮＡまたはＲＮＡが、検出のために標識され得る。
さらに別の実施形態において、ミスマッチ切断反応は、細胞のサンプルより得られた１６３８６ｃＤＮＡ、１５４０２ｃＤＮＡ、２１１６５ｃＤＮＡ、１４２３ｃＤＮＡ、６３６ｃＤＮＡ、１２３０３ｃＤＮＡ、２１４２５ｃＤＮＡ、２７４１０ｃＤＮＡ、３８５５４ｃＤＮＡ、３８５５５ｃＤＮＡ、５５０６３ｃＤＮＡ、５７１４５ｃＤＮＡ、５９９１４ｃＤＮＡ、９４９２１ｃＤＮＡ、１６８５２ｃＤＮＡ、３３２６０ｃＤＮＡ、５８５７３ｃＤＮＡ、３０９１１ｃＤＮＡ、８５９１３ｃＤＮＡ、１４３０３ｃＤＮＡ、１６８１６ｃＤＮＡ、１７８２７ｃＤＮＡ、または３２６２０ｃＤＮＡ中の点変異を検出およびマッピングするために規定された系において二本鎖ＤＮＡ中のミスマッチ塩基対を認識する１つ以上のタンパク質（「ＤＮＡミスマッチ修復」酵素と呼ばれる）を使用する。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉのｍｕｔＹ酵素は、Ｇ／ＡミスマッチでＡを切断し、そしてＨｅＬａ細胞由来のチミジンＤＮＡグリコシラーゼは、Ｇ／ＴミスマッチでＴを切断する（Ｈｓｕら（１９９４）Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ １５：１６５７−１６６２）。例示的実施形態に従って、１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列（例えば、野生型の１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列）に基づくプローブは、試験細胞からのｃＤＮＡ産物または他のＤＮＡ産物にハイブリダイズされる。二重鎖は、ＤＮＡミスマッチ修復酵素で処理され、そして存在する場合、切断産物は、電気泳動的プロトコルなどから検出され得る。例えば、米国特許第５，４５９，０３９号を参照のこと。
他の実施形態において、電気泳動移動度における変化を使用して、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子における変異を同定する。例えば、一本鎖コンフォメーション多型（ＳＳＣＰ）を使用して、変異体核酸と野生型核酸との間の電気泳動移動度における差異を検出し得る（Ｏｒｉｔａら、（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ ８６：２７６６；Ｃｏｔｔｏｎ（１９９３）Ｍｕｔａｔ．Ｒｅｓ．２８５：１２５−１４４およびＨａｙａｓｈｉ（１９９２）Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．Ｔｅｃｈ．Ａｐｐｌ．９：７３−７９のもまた、参照のこと）。サンプルおよびコントロールの１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸の一本鎖ＤＮＡフラグメントは変性され、そして再生が可能である。一本鎖核酸の二次構造は、配列に従って変動し、そして電気泳動移動度において得られた変化は、単一の塩基変化さえ検出することを可能とする。ＤＮＡフラグメントは、標識され得るか、または標識したプローブを用いて検出され得る。アッセイの感度は、（ＤＮＡよりはむしろ）ＲＮＡを用いることによって増強され得、ここで二次構造は、配列における変化に対してより感受性である。好ましい実施形態において、本発明の方法は、ヘテロ二重鎖分析を利用して、電気泳動移動度における変化に基づいて二本鎖ヘテロ二重鎖分子を分離する（Ｋｅｅｎら、（１９９１）Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ ７：５）。
なお別の実施形態において、変性剤の勾配を含むポリアクリルアミドにおける変異体または野生型フラグメントの移動は、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を使用してアッセイされる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ ３１３：４９５）。ＤＧＧＥが分析の方法として使用される場合、ＤＮＡは、例えば、ＰＣＲによって約４０ｂｐの高融解ＧＣリッチＤＮＡのＧＣクランプを付加することによって、完全には変性しないことを保証するように改変される。さらなる実施形態において、温度勾配は、コントロールＤＮＡおよびサンプルＤＮＡの移動度における差異を同定するために、変性勾配の代わりに使用される（ＲｏｓｅｎｂａｕｍおよびＲｅｉｓｓｎｅｒ（１９８７）Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｃｈｅｍ ２６５：１２７５３）。
点変異を検出するための他の技術の例としては、選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増幅、または選択的プライマー伸張が挙げられるがこれらに限定されない。例えば、オリゴヌクレオチドプライマーが調製され得、ここで、公知の変異が主としてなされ、次いで完全な一致が見出される場合のみハイブリダイゼーションが可能となる条件下で標的ＤＮＡにハイブリダイズされる（Ｓａｉｋｉら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２４：１６３；Ｓａｉｋｉら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ ８６：６２３０）。このような対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドは、このオリゴヌクレオチドがハイブリダイズする膜に結合され、標識された標的ＤＮＡとハイブリダイズされる場合に、ＰＣＲ増幅した標的ＤＮＡまたは多数の異なる変異にハイブリダイズされる。
あるいは、選択的ＰＣＲ増幅に依存する対立遺伝子（ａｌｌｅｌｅ）特異的増幅技術は、本発明と組み合わせて使用され得る。特異的増幅のためのプライマーとして使用されるオリゴヌクレオチドは、分子の中心において（Ｇｉｂｂｓら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１７：２４３７−２４４８）、または適切な条件下でミスマッチがポリメラーゼ伸張を防ぐかまたは減少し得る１つのプライマーの最も３’末端にて（Ｐｒｏｓｓｎｅｒ（１９９３）Ｔｉｂｔｅｃｈ １１：２３８）目的の変異をもたらし得る（その結果、増幅は差次的ハイブリダイゼーションに依存する）。さらに、変異の領域に新規な制限部位を導入して、切断に基づく検出をおこすことが望ましくあり得る（Ｇａｓｐａｒｉｎｉら、（１９９２）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ ６：１）。特定の実施形態において、増幅はまた、増幅のためのＴａｑリガーゼを使用して行われ得ることが予期される（Ｂａｒａｎｙ（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ ８８：１８９）。このような場合において、連結は、増幅の存在または非存在について探索することによって特定の部位での公知の変異の存在を検出し得る５’配列の３’末端にて、完全な一致が存在する場合にのみ生じる。
さらに、本明細書中に記載される予後アッセイは、被験体が疾患を有効に処置するために１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または低分子）を投与され得るか否かを決定するために使用され得る。
（臨床試験の間の効果のモニタリング）
本発明はさらに、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子（例えば、本明細書中において同定された１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子）の、疾患の処置に対する有効性を決定するための方法を提供する。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の発現増加、タンパク質レベル増加、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のアップレギュレートにおける、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子の有効性は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のダウンレギュレートを示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のダウンレギュレートにおける１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子の有効性は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現増加、タンパク質レベル増加、あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性の増加を示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。このような臨床試験において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子、および好ましくは、痛覚に関与する他の遺伝子の発現または活性が、「読み出し」すなわち特定の細胞の表現型のマーカーとして使用され得る。
例えば（限定のためではなく）、（例えば、本明細書中に記載されるようなスクリーニングアッセイにおいて同定される）１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する因子での処置によって細胞において調節される、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を含む遺伝子が、同定され得る。従って、疼痛障害を罹患する被験体に対する１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する因子の効果を（例えば、臨床試験において）研究するために、細胞が単離され得、そしてＲＮＡが調製され得、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０、および疼痛障害に関連する他の遺伝子の発現レベルについて分析され得る。遺伝子発現レベル（例えば、遺伝子発現パターン）は、本明細書中に記載されるようなノザンブロット分析またはＲＴ−ＰＣＲによって、あるいは生成されるタンパク質の量を測定することによって、本明細書中に記載される方法の１つによって、あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０、または他の遺伝子の活性レベルを測定することによって、定量され得る。この方法において、遺伝子発現パターンは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する因子に対する細胞の生理学的応答を示すマーカーとして作用し得る。この応答状態は、個体を１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する因子で処置する前、およびその間の種々の時点で決定され得る。
好ましい実施形態において、本発明は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する因子（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される低分子）での被験体の処置の有効性をモニタリングするための方法を提供し、以下の工程を包含する：（ｉ）この因子の投与前に予め投与するサンプルを被験体から得る工程；（ｉｉ）この投与前サンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルを検出する工程；（ｉｉｉ）投与後の１つ以上のサンプルを被験体から得る工程；（ｉｖ）これらの投与後のサンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを検出する工程；（ｖ）投与前サンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを、投与後サンプル中の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルと比較する工程；ならびに（ｖｉ）被験体に対する因子の投与を適宜変更する工程。例えば、因子の投与増加は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を増加させる）レベルよりも高いレベルに増加することが、好ましくあり得る。あるいは、因子の投与減少は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を減少させる）レベルよりも低いレベルに減少することが、望ましくあり得る。このような実施形態に従って、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性は、観察可能な表現型応答の非存在下ですら、因子の有効性の指標として使用され得る。
（処置方法）
本発明は、被験体（例えば、疾患の危険性のある（または疾患に罹患している疑いのある）ヒト）を処置する予防法および治療法の両方を提供する。処置の予防法および治療法の両方の観点で、このような処置は、薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ）の分野から得られる知識に基づいて、特異的に仕立てられ（ｔａｉｌｏｒｅ）得るかまたは改変され得る。「薬理ゲノム学」は、本明細書中で使用される場合、遺伝子配列決定、統計的遺伝学および遺伝子発現分析のようなゲノム技術の、臨床開発および市場での薬物に対する適用をいう。より詳細には、この用語は、患者の遺伝子がどのように薬物に対する患者の応答（例えば、患者の「薬物応答表現型」または「薬物応答遺伝子型」）を決定するのかについての研究をいう。
従って、本発明の別の局面は、個々の薬物応答遺伝子型に従って、本発明の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の分子、または、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子のいずれかを用いる被験体の予防処置または治療処置を仕立てるための方法を提供する。薬理ゲノム学によって、臨床医（ｃｌｉｎｉｃｉａｎ）または内科医（ｐｈｙｓｉｃｉａｎ）は、この処置から最も利益を得る患者に対して予防処置または治療処置を標的化することが可能になり、そして毒性薬物関連副作用を被る患者の処置を避けることが可能になる。
（予防方法）
一局面において、本発明は、１６３８６発現、１５４０２発現、２１１６５発現、１４２３発現、６３６発現、１２３０３発現、２１４２５発現、２７４１０発現、３８５５４発現、３８５５５発現、５５０６３発現、５７１４５発現、５９９１４発現、９４９２１発現、１６８５２発現、３３２６０発現、５８５７３発現、３０９１１発現、８５９１３発現、１４３０３発現、１６８１６発現、１７８２７発現、または３２６２０発現、あるいは１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子を被験体に投与することによって、被験体における疾患を防ぐ方法を提供する。疼痛障害（例えば、神経痛または片頭痛）に対する危険性のある被験体は、例えば、本明細書中に記載の任意の診断的もしくは予後的なアッセイまたはそれらの組み合わせによって同定され得る。予防薬の投与は、異常な１６３８６発現、１５４０２発現、２１１６５発現、１４２３発現、６３６発現、１２３０３発現、２１４２５発現、２７４１０発現、３８５５４発現、３８５５５発現、５５０６３発現、５７１４５発現、５９９１４発現、９４９２１発現、１６８５２発現、３３２６０発現、５８５７３発現、３０９１１発現、８５９１３発現、１４３０３発現、１６８１６発現、１７８２７発現、または３２６２０発現あるいは異常な１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性の特徴的症状の発生に先立って生じ得、これによって疾患が予防されるか、あるいは、その進行が遅延される。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の異常の型に依存して、例えば、１６３８６アゴニスト薬剤、１５４０２アゴニスト薬剤、２１１６５アゴニスト薬剤、１４２３アゴニスト薬剤、６３６アゴニスト薬剤、１２３０３アゴニスト薬剤、２１４２５アゴニスト薬剤、２７４１０アゴニスト薬剤、３８５５４アゴニスト薬剤、３８５５５アゴニスト薬剤、５５０６３アゴニスト薬剤、５７１４５アゴニスト薬剤、５９９１４アゴニスト薬剤、９４９２１アゴニスト薬剤、１６８５２アゴニスト薬剤、３３２６０アゴニスト薬剤、５８５７３アゴニスト薬剤、３０９１１アゴニスト薬剤、８５９１３アゴニスト薬剤、１４３０３アゴニスト薬剤、１６８１６アゴニスト薬剤、１７８２７アゴニスト薬剤、または３２６２０アゴニスト薬剤、あるいは１６３８６アンタゴニスト薬剤、１５４０２アンタゴニスト薬剤、２１１６５アンタゴニスト薬剤、１４２３アンタゴニスト薬剤、６３６アンタゴニスト薬剤、１２３０３アンタゴニスト薬剤、２１４２５アンタゴニスト薬剤、２７４１０アンタゴニスト薬剤、３８５５４アンタゴニスト薬剤、３８５５５アンタゴニスト薬剤、５５０６３アンタゴニスト薬剤、５７１４５アンタゴニスト薬剤、５９９１４アンタゴニスト薬剤、９４９２１アンタゴニスト薬剤、１６８５２アンタゴニスト薬剤、３３２６０アンタゴニスト薬剤、５８５７３アンタゴニスト薬剤、３０９１１アンタゴニスト薬剤、８５９１３アンタゴニスト薬剤、１４３０３アンタゴニスト薬剤、１６８１６アンタゴニスト薬剤、１７８２７アンタゴニスト薬剤、または３２６２０アンタゴニスト薬剤が、被験体の処置のために使用され得る。適切な薬剤は、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイに基づいて決定され得る。
（治療的方法）
疼痛を改善し得る方法および組成物が、本明細書中に記載されている。特定の疼痛障害は、少なくとも部分的に遺伝子産物の過度のレベルによって、あるいは異常または過剰な活性を示す遺伝子産物の存在によってもたらされる。このように、このような遺伝子産物のレベルおよび／または活性の減少は、疼痛の改善をもたらす。遺伝子発現のレベルまたはタンパク質の活性の減少に関する技術は、以下に議論される。
あるいは、特定の他の疼痛障害は、少なくとも一部、遺伝子発現のレベルの欠損もしくは減少、またはタンパク質の活性のレベルの減少によってもたらされる。このように、遺伝子の発現および／またはこのようなタンパク質の活性のレベルの増加は、疼痛の改善をもたらす。
いくつかの場合において、疾患状態における遺伝子の上方調節は、疾患状態に対する応答において、その遺伝子産物に対する保護的な役割を反映する。このような遺伝子発現または遺伝子産物の活性の促進は、それが影響する保護的な効果を強固にする。いくつかの疼痛の状態は、このような保護的遺伝子の活性のレベルの異常に低い値に起因し得る。これらの場合において、また、遺伝発現のレベルおよび／またはこのような遺伝子産物の活性のレベルの増加は、疼痛の改善をもたらす。標的遺伝子発現レベルまたは標的遺伝子産物活性レベルを増加させるための技術は本明細書中に議論される。
従って、本発明の別の局面は、治療的目的での１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性の調節方法に関する。従って、例示的な実施形態において、本発明の調節的な方法は、細胞に、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０あるいは細胞（例えば、内皮細胞または卵巣細胞）に関連し得る１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質活性の１つ以上の活性を調節する薬剤を接触させる工程を包含する。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質活性を調節する薬剤は、本明細書中に記載されるような薬剤であり得、例えば、核酸またはタンパク質、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の天然に存在する標的分子（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のリガンドまたは基質）、１６３８６抗体、１５４０２抗体、２１１６５抗体、１４２３抗体、６３６抗体、１２３０３抗体、２１４２５抗体、２７４１０抗体、３８５５４抗体、３８５５５抗体、５５０６３抗体、５７１４５抗体、５９９１４抗体、９４９２１抗体、１６８５２抗体、３３２６０抗体、５８５７３抗体、３０９１１抗体、８５９１３抗体、１４３０３抗体、１６８１６抗体、１７８２７抗体、または３２６２０抗体、１６３８６アゴニスト、１５４０２アゴニスト、２１１６５アゴニスト、１４２３アゴニスト、６３６アゴニスト、１２３０３アゴニスト、２１４２５アゴニスト、２７４１０アゴニスト、３８５５４アゴニスト、３８５５５アゴニスト、５５０６３アゴニスト、５７１４５アゴニスト、５９９１４アゴニスト、９４９２１アゴニスト、１６８５２アゴニスト、３３２６０アゴニスト、５８５７３アゴニスト、３０９１１アゴニスト、８５９１３アゴニスト、１４３０３アゴニスト、１６８１６アゴニスト、１７８２７アゴニスト、または３２６２０アゴニスト、あるいは１６３８６アンタゴニスト、１５４０２アンタゴニスト、２１１６５アンタゴニスト、１４２３アンタゴニスト、６３６アンタゴニスト、１２３０３アンタゴニスト、２１４２５アンタゴニスト、２７４１０アンタゴニスト、３８５５４アンタゴニスト、３８５５５アンタゴニスト、５５０６３アンタゴニスト、５７１４５アンタゴニスト、５９９１４アンタゴニスト、９４９２１アンタゴニスト、１６８５２アンタゴニスト、３３２６０アンタゴニスト、５８５７３アンタゴニスト、３０９１１アンタゴニスト、８５９１３アンタゴニスト、１４３０３アンタゴニスト、１６８１６アンタゴニスト、１７８２７アンタゴニスト、または３２６２０アンタゴニスト、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のアゴニストまたはアンタゴニストのペプチド模倣物、または他の低分子である。一実施形態において、薬剤は１つ以上の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を刺激する。このような刺激薬剤の例として、活性な、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質および細胞内に導入されている１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードする核酸分子が挙げられる。別の実施形態において、薬剤は、１つ以上の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を阻害する。このような阻害薬剤の例としては、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のアンチセンス核酸分子、抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体、および１６３８６インヒビター、１５４０２インヒビター、２１１６５インヒビター、１４２３インヒビター、６３６インヒビター、１２３０３インヒビター、２１４２５インヒビター、２７４１０インヒビター、３８５５４インヒビター、３８５５５インヒビター、５５０６３インヒビター、５７１４５インヒビター、５９９１４インヒビター、９４９２１インヒビター、１６８５２インヒビター、３３２６０インヒビター、５８５７３インヒビター、３０９１１インヒビター、８５９１３インヒビター、１４３０３インヒビター、１６８１６インヒビター、１７８２７インヒビター、または３２６２０インヒビターが挙げられる。これらの調節方法は、インビトロで（例えば、細胞を薬剤と共に培養することによって）、あるいは、インビボで（例えば、被験体に薬剤を投与することによって）実行され得る。このように、本発明は、異常なまたは望まない１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質あるいは１６３８６核酸分子、１５４０２核酸分子、２１１６５核酸分子、１４２３核酸分子、６３６核酸分子、１２３０３核酸分子、２１４２５核酸分子、２７４１０核酸分子、３８５５４核酸分子、３８５５５核酸分子、５５０６３核酸分子、５７１４５核酸分子、５９９１４核酸分子、９４９２１核酸分子、１６８５２核酸分子、３３２６０核酸分子、５８５７３核酸分子、３０９１１核酸分子、８５９１３核酸分子、１４３０３核酸分子、１６８１６核酸分子、１７８２７核酸分子、または３２６２０核酸分子の発現または活性によって特徴付けられる、疾患または障害を罹患する個体を処置する方法を提供する。一実施形態において、この方法は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を調節（例えば、上方調節または下方調節）する薬剤（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される薬剤）または薬剤の組み合わせの投与工程を包含する。別の実施形態において、この方法は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が減少したか、異常であるかまたは望まない発現または活性の補償のための治療として、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子の投与工程を包含する。
１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性の刺激は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が異常に下方調節される状況、および／または増加した１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性が利益的な効果を有するようである状況において所望される。同様に、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性の阻害は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が異常に上方調節される状況および／あるいは減少した１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性が、利益的な効果を有するようである状況において所望される。
（標的遺伝子の発現、合成、または活性を阻害する方法）
上記のように、疼痛または痛みのある障害に関与する遺伝子は、遺伝子活性のレベルの上昇を介して、このような障害を引き起こし得る。いくつかの場合において、このような上方調節は、疾患の状態に対する原因となる効果または悪化効果を有し得る。種々の技術が、このような遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を阻害するために使用され得る。
例えば、上記のアッセイによって同定したもののような化合物は、阻害的活性を示し、本発明に従って使用され、疼痛を回復し得る。このような分子として、有機低分子、ペプチド、抗体など挙げられ得るが、これらに限定されない。
例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質に対する内因性のリガンドと競合する化合物が、投与され得る。リガンド結合した、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の量の得られた減少は、内皮細胞の生理学を調節する。この目的に対して特に有用であり得る化合物としては、例えば、可溶性タンパク質またはペプチド（例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の１つ以上の細胞外ドメインを含むペプチド、あるいはそれらの部分および／またはアナログ（例えば、Ｉｇテイル融合タンパク質のような可溶性融合タンパク質が挙げられる））が挙げられる。（Ｉｇ−テイル融合タンパク質の産生についての考察について、例えば、米国特許第５，１１６，９６４号を参照のこと）。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のレセプター部位に結合するが、タンパク質を活性化しない、リガンドアナログまたは抗体のような化合物（例えば、レセプター−リガンドアンタゴニスト）は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質活性を阻害するのに有効であり得る。
さらに、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の発現を阻害するアンチセンス分子およびリボザイム分子もまた、本発明に従って、異常な、１６３８６遺伝子活性、１５４０２遺伝子活性、２１１６５遺伝子活性、１４２３遺伝子活性、６３６遺伝子活性、１２３０３遺伝子活性、２１４２５遺伝子活性、２７４１０遺伝子活性、３８５５４遺伝子活性、３８５５５遺伝子活性、５５０６３遺伝子活性、５７１４５遺伝子活性、５９９１４遺伝子活性、９４９２１遺伝子活性、１６８５２遺伝子活性、３３２６０遺伝子活性、５８５７３遺伝子活性、３０９１１遺伝子活性、８５９１３遺伝子活性、１４３０３遺伝子活性、１６８１６遺伝子活性、１７８２７遺伝子活性、または３２６２０遺伝子活性を阻害するために使用され得る。なおさらに、３重らせん分子は、異常な、１６３８６遺伝子活性、１５４０２遺伝子活性、２１１６５遺伝子活性、１４２３遺伝子活性、６３６遺伝子活性、１２３０３遺伝子活性、２１４２５遺伝子活性、２７４１０遺伝子活性、３８５５４遺伝子活性、３８５５５遺伝子活性、５５０６３遺伝子活性、５７１４５遺伝子活性、５９９１４遺伝子活性、９４９２１遺伝子活性、１６８５２遺伝子活性、３３２６０遺伝子活性、５８５７３遺伝子活性、３０９１１遺伝子活性、８５９１３遺伝子活性、１４３０３遺伝子活性、１６８１６遺伝子活性、１７８２７遺伝子活性、または３２６２０遺伝子活性を阻害する際に利用され得る。
本発明の方法において使用されるアンチセンス核酸分子は、典型的に被験体に投与されるか、またはインサイチュで生成され、その結果、それらは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードする細胞ｍＲＮＡおよび／またはゲノムＤＮＡにハイブリダイズまたは結合し、それによってこれらのタンパク質の発現を阻害する（例えば、転写および／または翻訳を阻害することによって）。このハイブリダイゼーションは、安定な二重鎖を形成する従来のヌクレオチド相補性により得るか、あるいは、例えばＤＮＡ二重鎖と結合するアンチセンス核酸分子の場合、二重らせんの主溝における特異的相互作用を介し得る。本発明のアンチセンス核酸分子の投与経路の例は、組織部位での直接的な注射を含む。あるいは、アンチセンス核酸分子は、選択された細胞を標的とするように改変され得、次いで、全身に投与され得る。例えば、全身の投与に関して、アンチセンス分子は、調節され得、その結果、アンチセンス分子は、選択された細胞表面上に発現するレセプターまたは抗原に特異的に結合するように（例えば、アンチセンス核酸分子を細胞表面レセプターまたは抗原に結合するペプチドまたは抗体に結合することによって）改変され得る。アンチセンス核酸分子は、また、本明細書中に記載のベクターを使用して細胞に送達され得る。アンチセンス分子の十分な細胞内濃度を達成するために、アンチセンス核酸分子が、強力なｐｏｌＩＩまたはｐｏｌＩＩＩプロモーターのコントロールの制御下に配置される、ベクター構築物が好ましい。
さらに別の実施形態において、本発明の方法において使用されるアンチセンス核酸分子は、α−アノマー型核酸分子である。α−アノマー型核酸分子は、相補的なＲＮＡと特異的な二本鎖ハイブリッドを形成し、ここで、通常のβユニットに反して、鎖は互いに平行になる（Ｇａｕｌｔｉｅｒら、（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１５：６６２５−６６４１）。アンチセンス核酸分子はまた、２’−ｏ−メチルリボヌクレオチド（Ｉｎｏｕｅら、（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１５：６１３１−６１４８）またはキメラＲＮＡ−ＤＮＡアナログ（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．２１５：３２７−３３０）を含み得る。
なお別の実施形態において、本発明の方法に使用されるアンチセンス核酸は、リボザイムである。リボザイムは、これらのリボザイムが相補的領域を有する、一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ）を切断し得るリボヌクレアーゼ活性を有する触媒性ＲＮＡ分子である。従って、リボザイム（例えば、ハンマーヘッドリボザイム（ＨａｓｅｌｈｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ ３３４：５８５−５９１に記載される））は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡ転写物を触媒的に切断するために使用されて、それによって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡの翻訳を阻害し得る。１６３８６コード核酸、１５４０２コード核酸、２１１６５コード核酸、１４２３コード核酸、６３６コード核酸、１２３０３コード核酸、２１４２５コード核酸、２７４１０コード核酸、３８５５４コード核酸、３８５５５コード核酸、５５０６３コード核酸、５７１４５コード核酸、５９９１４コード核酸、９４９２１コード核酸、１６８５２コード核酸、３３２６０コード核酸、５８５７３コード核酸、３０９１１コード核酸、８５９１３コード核酸、１４３０３コード核酸、１６８１６コード核酸、１７８２７コード核酸、または３２６２０コード核酸に対して特異性を有するリボザイムは、本明細書中に開示される１６３８６ｃＤＮＡ、１５４０２ｃＤＮＡ、２１１６５ｃＤＮＡ、１４２３ｃＤＮＡ、６３６ｃＤＮＡ、１２３０３ｃＤＮＡ、２１４２５ｃＤＮＡ、２７４１０ｃＤＮＡ、３８５５４ｃＤＮＡ、３８５５５ｃＤＮＡ、５５０６３ｃＤＮＡ、５７１４５ｃＤＮＡ、５９９１４ｃＤＮＡ、９４９２１ｃＤＮＡ、１６８５２ｃＤＮＡ、３３２６０ｃＤＮＡ、５８５７３ｃＤＮＡ、３０９１１ｃＤＮＡ、８５９１３ｃＤＮＡ、１４３０３ｃＤＮＡ、１６８１６ｃＤＮＡ、１７８２７ｃＤＮＡ、または３２６２０ｃＤＮＡ（すなわち、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３）のヌクレオチド配列に基づいて設計され得る。例えば、Ｔｅｔｒａｈｙｍｅｎａ Ｌ−１９ ＩＶＳ ＲＮＡの誘導体は、活性部位のヌクレオチド配列が、１６３８６コードｍＲＮＡ、１５４０２コードｍＲＮＡ、２１１６５コードｍＲＮＡ、１４２３コードｍＲＮＡ、６３６コードｍＲＮＡ、１２３０３コードｍＲＮＡ、２１４２５コードｍＲＮＡ、２７４１０コードｍＲＮＡ、３８５５４コードｍＲＮＡ、３８５５５コードｍＲＮＡ、５５０６３コードｍＲＮＡ、５７１４５コードｍＲＮＡ、５９９１４コードｍＲＮＡ、９４９２１コードｍＲＮＡ、１６８５２コードｍＲＮＡ、３３２６０コードｍＲＮＡ、５８５７３コードｍＲＮＡ、３０９１１コードｍＲＮＡ、８５９１３コードｍＲＮＡ、１４３０３コードｍＲＮＡ、１６８１６コードｍＲＮＡ、１７８２７コードｍＲＮＡ、または３２６２０コードｍＲＮＡ中の切断されるべきヌクレオチド配列に対して相補的であるように構築され得る（例えば、Ｃｅｃｈら、米国特許第４，９８７，０７１号；およびＣｅｃｈら、米国特許第５，１１６，７４２号を参照のこと）。あるいは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡを使用して、ＲＮＡ分子のプールから特異的なリボヌクレアーゼ活性を有する触媒性ＲＮＡを選択し得る（例えば、Ｂａｒｔｅｌ，Ｄ．およびＳｚｏｓｔａｋ，Ｊ．Ｗ．（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１：１４１１−１４１８を参照のこと）。
１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の発現はまた、標的細胞中で１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の転写を阻害する三重ヘリックス構造を形成するように、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節領域（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のプロモーターおよび／またはエンハンサー）に相補的なヌクレオチド配列を標的化することによって阻害され得る（例えば、Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃ．（１９９１）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓ．６（６）：５６９−８４；Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃ．ら（１９９２）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６０：２７−３６；およびＭａｈｅｒ，Ｌ．Ｊ．（１９９２）Ｂｉｏａｓｓａｙｓ １４（１２）：８０７−１５を参照のこと）。
１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質に特異的であり、かつその活性を妨害する抗体もまた、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質機能を調節または阻害するために使用され得る。このような抗体は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質自体、あるいはこのタンパク質の部分に対応するペプチドに対して、本明細書中に記載される標準的技術を使用して作製され得る。このような抗体としては、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、Ｆａｂフラグメント、単鎖抗体、またはキメラ抗体が挙げられるが、これらに限定されない。
標的遺伝子タンパク質が細胞内に存在し、かつ全抗体が使用される例において、内部移行（ｉｎｔｅｒｎａｌｉｚｉｎｇ）抗体が好ましくあり得る。リポフェクチンリポソームは、標的エピトープに結合する抗体またはＦａｂ領域のフラグメントを細胞内に送達するために使用され得る。抗体のフラグメントが使用される場合、標的タンパク質の結合ドメインに結合する最小の阻害性フラグメントが、好ましい。例えば、標的遺伝子タンパク質に結合する抗体の可変領域のドメインに対応するアミノ酸配列を有するペプチドが使用され得る。このようなペプチドは、当該分野で周知の方法を使用して、化学的に合成され得るかまたは組換えＤＮＡ技術を介して産生され得る（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ（１９８３）、前出；およびＳａｍｂｒｏｏｋら、（１９８９）前出に記載される）。細胞内標的遺伝子エピトープに結合する単鎖中和抗体もまた、投与され得る。このような単鎖抗体は、例えば、Ｍａｒａｓｃｏら、（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：７８８９−７８９３に記載されるような技術を利用することにより、例えば、標的細胞集団内で単鎖抗体をコードするヌクレオチド配列を発現させることによって、投与され得る。
いくつかの例において、標的遺伝子タンパク質は、細胞外タンパク質であるか、または膜貫通タンパク質（例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質）である。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の１つ以上の細胞外ドメインに特異的であり、かつその活性を妨害する抗体は、障害の処置に特に有用である。このような抗体は、特に効率的である。なぜなら、これらは、血流から直接的に標的ドメインにアクセスし得るからである。ペプチド投与に適切な、以下に記載される任意の投与技術が、阻害性標的遺伝子抗体をそれらの作用部位に効率的に投与するために利用され得る。
（標的遺伝子活性を回復または増強させる方法）
疼痛を生じる遺伝子は、疼痛または痛みのある障害の状況内で過小発現され得る。あるいは、このような遺伝子のタンパク質産物の活性は、低下され得、疼痛の発症を導く。このような遺伝子発現のダウンレギュレーションまたはタンパク質活性の低下は、疾患状態に対する原因となる効果または悪化効果を有し得る。
いくつかの場合、疾患状態においてアップレギュレートされる遺伝子は、保護効果を発揮し得る。種々の技術が、疼痛状態に応じて保護効果を発揮する、遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を増大させるために用いられ得る。
この節に記載されるものは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のレベルを、疼痛が改善されるレベルまで、増大させ得る方法である。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のレベルは、例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子発現のレベルを増加させるか、または存在する活性な１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のレベルを増加させることのいずれかによって、増加され得る。
例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、疼痛を改善するのに十分なレベルで、このような症状を示す患者に投与され得る。以下で議論される技術のいずれかが、このような投与のために用いられ得る。当業者は、以下に記載されるような技術を利用して、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の有効な、非毒性用量の濃度を決定する方法を容易に知る。
さらに、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードするＲＮＡ配列は、疼痛を示す患者に、疼痛が改善されるような１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のレベルを生じるのに十分な濃度で、直接投与され得る。化合物の細胞内投与を達成する以下に記載される技術（例えば、リポソーム投与）のいずれかは、このようなＲＮＡ分子の投与のために用いられ得る。ＲＮＡ分子は、例えば、本明細書中に記載されるような組換え技術により作製され得る。
さらに、被験体は、遺伝子置換治療により処置され得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の機能を有する、正常な１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の産生を指向する、１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子、あるいはその一部の１以上のコピーは、ＤＮＡを細胞へと導入する他の粒子（例えば、リポソーム）に加えて、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、およびレトロウイルスベクターを含むが、これらに限定されないベクターを用いて、細胞へと挿入され得る。さらに、上記のような技術は、ヒト細胞への、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の遺伝子配列の導入のために用いられ得る。
次いで、細胞、好ましくは、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現遺伝子配列を含む自系の細胞は、疼痛の改善を可能にする位置で被験体へと導入または再導入され得る。このような細胞置換技術は、例えば、遺伝子産物が分泌された細胞外遺伝子産物である場合、好ましくあり得る。
（薬学的組成物）
本発明の別の局面は、疾患に罹患した被験体を処置するための方法に関する。これらの方法は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を調節する因子（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイにより同定される因子）、またはこのような因子の組み合わせを、被験体に投与する工程を包含する。別の実施形態では、この方法は、低下した、異常な、または望ましくない、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現または活性を補償するための治療として、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質または核酸分子を、被験体に投与する工程を包含する。
１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性の刺激は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が異常にダウンレギュレートされる状況、および／または増加した１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性が有益な効果を有する可能性のある状況において所望される。同様に、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性の阻害は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０が異常にアップレギュレートされる状況、および／または減少した１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性が有益な効果を有する可能性のある状況において、所望される。
１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子は、被験体への投与に適切な薬学的組成物を用いて被験体に投与され得る。このような組成物は、典型的には因子（例えば、核酸分子、タンパク質または抗体）および薬学的に受容可能なキャリアを含む。本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に受容可能なキャリア」は、薬剤投与に適合可能な溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などのいずれかおよび全てを含むことが意図される。このような媒体及び因子の、薬学的に活性な物質のための使用は、当該分野において周知である。任意の慣用的な媒体または因子が活性化合物に適合し得ない場合を除いて、組成物におけるこれらの使用が企図される。補充される活性化合物はまた、組成物中に組み込まれ得る。
本発明の治療法において使用される薬学的組成物は、その意図される投与経路に適合性であるように処方される。投与経路の例としては、非経口投与（例えば、静脈内投与、皮内投与、皮下投与）、経口投与（例えば、吸入投与）、経皮投与（局所投与）、経粘膜投与、および直腸投与が挙げられる。非経口適用、皮内適用または皮下適用に使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含み得る：滅菌希釈剤（例えば、注入水、生理食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒）；抗菌剤（例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン）；抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウム）；キレート剤（例えば、エチレンジアミン四酢酸）；緩衝液（例えば、酢酸、クエン酸またはリン酸）および張性の調整のための因子（例えば、塩化ナトリウムまたはデキストロース）。ｐＨは、酸または塩基（例えば、塩酸または水酸化ナトリウム）で調整され得る。非経口調製物は、ガラス製またはプラスチック製のアンプル、ディスポーサブルシリンジまたは複数用量のバイアル中に封入され得る。
注入可能な用途に適切な薬学的組成物としては、滅菌水溶液（水溶性の場合）または滅菌水性分散物、および滅菌注入可能な溶液もしくは分散物の即時調製のための滅菌粉末が挙げられる。静脈内投与について、適切なキャリアとしては、生理学的生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ，Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，ＮＪ）またはリン酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、組成物は滅菌されていなければならず、そして容易な注射可能性が存在する程度に流体であるべきである。組成物は、製造および保存の条件下で安定でなければならず、そして、細菌および真菌のような微生物の夾雑作用に対して保護されなければならない。キャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、およびこれらの適切な混合物を含む、溶媒または分散媒体であり得る。適切な流動性が、例えば、コーティング（例えば、レシチン）の使用によって、分散物の場合に必要とされる粒子サイズの維持によって、および界面活性剤の使用によって、維持され得る。微生物の作用からの保護は、種々の抗菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなど）によって達成され得る。多くの場合において、等張剤（例えば、糖）、ポリアルコール（例えば、マンニトール、ソルビトール）および塩化ナトリウムを組成物中に含むことが、好ましい。注入可能な組成物の延長された吸収は、吸収を遅延させる因子（例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチン）を組成物中に含ませることによってもたらされ得る。
滅菌注入可能な溶液は、上記で列挙した成分の１つまたは組合わせとともに、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子（例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のフラグメントまたは抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体）を適切な溶媒中に必要とされる量で組み込み、必要ならば、続いて濾過滅菌することによって調製され得る。一般に、分散物は、基本分散媒体および上記で列挙された成分から必要とされる他の成分を含む滅菌ビヒクル中に活性化合物を組み込むことによって調製される。滅菌注入可能な溶液の調製のための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、真空乾燥および凍結乾燥であり、これにより、予め滅菌濾過したその溶液から活性成分および任意のさらなる所望の成分の粉末を得る。
経口組成物は、一般的に、不活性希釈剤または食用キャリアを含む。これらは、ゼラチンカプセルに封入され得るか、または錠剤へ圧縮され得る。経口治療投与の目的のために、この活性化合物は、賦形剤とともに組み込まれ得、そして錠剤、トローチ剤、またはカプセル剤の形態で使用され得る。経口組成物はまた、うがい薬（ｍｏｕｔｈｗａｓｈ）としての使用のために流体キャリアを使用して調製され得、ここで、この流体キャリア中のこの化合物は、経口的に適用され、そして素早く動かされ（ｓｗｉｓｈ）、そして吐き出されるか、または飲み込まれる。薬学的に適合性の結合剤、および／またはアジュバント材料が、この組成物の一部として含まれ得る。錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤などが、以下のいずれかの成分または同様の性質を有する化合物を含み得る：結合剤（例えば、微結晶セルロース、トラガカントガムまたはゼラチン）；賦形剤（例えば、デンプンまたはラクトース）、崩壊剤（例えば、アルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチ）；滑沢剤（例えば、ステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ）；潤滑剤（ｇｌｉｄａｎｔ）（例えば、コロイド状二酸化ケイ素）；甘味剤（例えば、スクロースまたはサッカリン）；あるいは香味剤（例えば、ペパーミント、サリチル酸メチル、またはオレンジフレーバー）。
吸入による投与について、この化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素のような気体）を含む加圧容器またはディスペンサー、あるいは噴霧器から、エアロゾルスプレーの形態で送達される。
全身的投与はまた、経粘膜手段または経皮手段により得る。経粘膜投与または経皮投与について、浸透されるバリアに対して適切な浸透剤が、処方において使用される。このような浸透剤は、一般的に、当該分野で公知であり、そして、例えば、経粘膜投与としては、界面活性剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、鼻スプレーまたは坐剤の使用を通じて達成され得る。経皮投与については、この活性化合物は、当該分野で一般的に公知である軟膏（ｏｉｎｔｍｅｎｔ）、軟膏（ｓａｌｖｅ）、ゲル、またはクリーム剤へ処方される。
１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子はまた、直腸送達のための坐剤の形態（例えば、ココアバターおよび他のグリセリドのような従来の坐剤基剤と共に）または保持浣腸の形態で調製され得る。
１つの実施形態において、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子は、身体からの迅速な排出に対してこの化合物を保護するキャリアを用いて調製され（例えば、制御放出処方物）、これには、移植片およびマイクロカプセル化された送達系が挙げられる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸のような、生分解性、生体適合性ポリマーが使用され得る。このような処方物の調製のための方法は、当業者には明らかである。これらの材料はまた、Ａｌｚａ ＣｏｒｐｏｒａｔｉｏｎおよびＮｏｖａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．からの販売によって入手され得る。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を有する、感染細胞へ標的化されるリポソームを含む）がまた、薬学的に受容可能なキャリアとして使用され得る。これらは、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるような、当業者に公知の方法に従って調製され得る。
投与の容易さおよび投薬の均一性のために、投薬単位形態で、経口組成物または非経口組成物を処方することが、特に有益である。本明細書で使用される投薬単位形態は、処置される被験体のための単位投薬量として適切な、物理的に別の単位をいい；各単位は、必要とされる薬学的キャリアと共に、所望の治療的効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含む。本発明の投薬単位形態についての詳細は、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する因子の固有の特性、および達成される特定の治療効果、ならびに被験体の処置のためのこのような因子を調合する当該分野に固有の制限によって、そしてこれらに直接依存して、決定される。
このような因子の毒性および治療効力は、例えば、ＬＤ５０（集団の５０％に致死的な量）およびＥＤ５０（集団の５０％において治療的に有効な量）を決定するための、細胞培養または実験動物における標準的な薬学的手順によって決定され得る。毒性と治療効果との間での用量比は、治療指数であり、そしてこれは、ＬＤ５０／ＥＤ５０比として表され得る。大きな治療指数を示す因子が好ましい。毒性の副作用を示す因子が使用され得るが、治療は、感染していない細胞に対する可能性のある損傷を最少にし、それによって副作用が減少するように、患部組織の部位に対してそのような因子を標的化する送達システムを設計するように、行われるべきである。
細胞培養アッセイおよび動物実験から得られたデータは、ヒトでの使用のための投与量の範囲を処方する際に使用され得る。このような１６３８６調節因子、１５４０２調節因子、２１１６５調節因子、１４２３調節因子、６３６調節因子、１２３０３調節因子、２１４２５調節因子、２７４１０調節因子、３８５５４調節因子、３８５５５調節因子、５５０６３調節因子、５７１４５調節因子、５９９１４調節因子、９４９２１調節因子、１６８５２調節因子、３３２６０調節因子、５８５７３調節因子、３０９１１調節因子、８５９１３調節因子、１４３０３調節因子、１６８１６調節因子、１７８２７調節因子、または３２６２０調節因子の投与量は、好ましくは、わずかな毒性を有するかまたは毒性を全く有さないでＥＤ５０を含む、循環している濃度の範囲内である。投与量は、使用される投与量形態および利用される投与の経路に依存して、この範囲内で変化し得る。本発明の治療方法において使用される任意の因子については、治療有効用量は、細胞培養アッセイから最初に概算され得る。用量は、細胞培養物中で決定されるような、ＩＣ５０（すなわち、症状の最大の半分の抑制を達成する試験化合物の濃度）を含む、循環している血漿濃度の範囲を達成するように、動物モデルにおいて処方し得る。このような情報は、ヒトにおける有用な用量をより正確に決定するために使用され得る。血漿中でのレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。
本明細書中に規定されるように、タンパク質またはポリペプチドの治療有効量（すなわち、有効投薬量）は、約０．００１〜３０ｍｇ／ｋｇ体重まで、好ましくは約０．０１〜２５ｍｇ／ｋｇ体重まで、より好ましくは約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重まで、およびさらにより好ましくは約１〜１０ｍｇ／ｋｇまで、２〜９ｍｇ／ｋｇまで、３〜８ｍｇ／ｋｇまで、４〜７ｍｇ／ｋｇまで、または５〜６ｍｇ／ｋｇ体重の範囲である。疾患または障害の重篤度、事前の処置、被験体の一般的な健康状態および／もしくは年齢、ならびに他の疾患の存在を含むがこれらに限定されない特定の要因が、被験体を効果的に処置するために必要とされる投与量に影響を与え得ることが、当業者に明らかである。さらに、治療有効量のタンパク質、ポリペプチドまたは抗体での被験体の処置は、単回の処置を含み得るか、または好ましくは、一連の処置を含み得る。
好ましい例においては、被験体は、約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重の範囲の抗体、タンパク質またはポリペプチドを用いて、約１〜１０週間の間、好ましくは２〜８週間の間、より好ましくは約３〜７週間の間、およびさらにより好ましくは約４、５、または６週間の間、１週間に１回、処置される。処置のために使用される抗体、タンパク質またはポリペプチドの有効投与量が、特定の処置の経過にわたって増大し得るかまたは減少し得ることもまた、明らかである。投与量の変化が生じ得、そして本明細書中に記載されているような診断アッセイの結果から明白となる。
本発明は、発現または活性を調節する因子を含む。因子は、例えば、低分子であり得る。例えば、このような低分子としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない：ペプチド、ペプチド模倣物、アミノ酸、アミノ酸アナログ、ポリヌクレオチド、ポリヌクレオチドアナログ、ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ、約１０，０００ｇ／モル未満の分子量を有する有機化合物または無機化合物（すなわち、へテロ有機化合物および有機金属化合物を含む）、約５，０００ｇ／モル未満の分子量を有する有機化合物または無機化合物、約１，０００ｇ／モル未満の分子量を有する有機化合物または無機化合物、約５００ｇ／モル未満の分子量を有する有機化合物または無機化合物、ならびにこのような化合物の塩、エステル、および薬学的に受容可能な他の形態。低分子因子の適切な用量が当該分野の医師、獣医師または研究者の知識内の多くの要因に依存することが、理解される。低分子の用量は、例えば、処置される被験体またはサンプルの正体、サイズおよび状態に依存して、適用可能な場合、この組成物が投与される経路、およびこの低分子が有していることを実施者が所望する、本発明の核酸またはポリペプチドに対する効果にさらに依存して、変化する。
代表的な用量は、被験体またはサンプル重量１ｋｇあたりｍｇまたはμｇの量の低分子を含む（例えば、約１μｇ／ｋｇ〜約５００ｍｇ／ｋｇ、約１００μｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ、または約１μｇ／ｋｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ）。低分子の適切な用量は、調節されるべき発現または活性に対するこの低分子の効力に依存することがさらに理解される。このような適切な用量は、本明細書中で記載されるアッセイを使用して、決定され得る。これらの低分子の１つ以上が、本発明のポリペプチドまたは核酸の発現または活性を調節するために、動物（例えば、ヒト）に投与される場合、医師、獣医または研究者は、例えば、初めに比較的低い用量を処方し、続いて、適切な応答が得られるまで、この用量を増加し得る。さらに、任意の特定の動物被験体についての特定の用量レベルは、用いられる特定の化合物の活性、被験体の年齢、体重、身体全体の健康状態、性別および食餌、投与時間、投与経路、排泄速度、任意の薬物の組合せ、ならびに調節されるべき発現または活性の程度を含む種々の因子に依存することが、理解される。
さらに、抗体（またはそのフラグメント）が、治療的部分（例えば、細胞毒、治療剤または放射性金属イオン）に結合体化され得る。細胞毒または細胞毒性剤としては、細胞に対して有害な任意の因子が挙げられる。例としては、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロールおよびプロマイシン、ならびにそれらのアナログまたはホモログが挙げられる。治療剤としては、代謝拮抗剤（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルデカルバジン）、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオエパクロランブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロソスファミド（ｃｙｃｌｏｔｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、ならびにｃｉｓ−ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（以前は、ダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（以前は、アクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシンおよびアントラマイシン（ＡＭＣ））、ならびに抗有糸分裂剤（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明の結合体は、所定の生物学的応答を調節するために使用され得、薬物部分は、古典的な化学療法剤に限定されると解釈されるべきではない。例えば、薬物部分は、所望の生物学的活性を有するタンパク質またはポリペプチドであり得る。このようなタンパク質としては、例えば、毒素（例えば、アブリン、リシンＡ、シュードモナス体外毒素またはジフテリア毒素）；タンパク質（例えば、腫瘍壊死因子、αインターフェロン、βインターフェロン、神経成長因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲンアクチベータ；または生物学的応答調節因子（例えば、リンホカイン、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」）、または他の増殖因子））が挙げられ得る。
このような治療的部分を抗体に結合体化するための技術は、周知である。例えば、Ａｒｎｏｎら．，「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｏｆ Ｄｒｕｇｓ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ」，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｒｅｉｓｆｅｌｄら（編），ｐｐ．２４３−５６（Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．１９８５）；Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍら，「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」，Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（第２版），Ｒｏｂｉｎｓｏｎら（編），ｐｐ．６２３−５３（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．１９８７）；Ｔｈｏｒｐｅ，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｃａｒｒｉｅｒｓ Ｏｆ Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ Ａｇｅｎｔｓ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ Ｒｅｖｉｅｗ」，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｐｉｎｃｈｅｒａら（編），ｐｐ．４７５−５０６（１９８５）；「Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，Ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ Ｏｆ Ｔｈｅ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｕｓｅ Ｏｆ Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ」，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ Ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｂａｌｄｗｉｎら（編），ｐｐ．３０３−１６（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ １９８５），およびＴｈｏｒｐｅら、「Ｔｈｅ Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ Ａｎｄ Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ Ｏｆ Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ」，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．，６２：１１９−５８（１９８２）を参照のこと。あるいは、抗体は、米国特許第４，６７６，９８０号（Ｓｅｇａｌ）により記載されるように、第２の抗体と結合体化して、抗体ヘテロ結合体を形成し得る。
本発明の方法において使用される核酸分子は、ベクターに挿入され、遺伝子治療ベクターとして使用され得る。遺伝子治療ベクターは、例えば、静脈注射、局所投与（米国特許第５，３２８，４７０号を参照のこと）または定位注射（例えば、Ｃｈｅｎら、（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：３０５４−３０５７を参照のこと）によって、被験体に送達され得る。遺伝子治療ベクターの薬学的調製物は、受容可能な希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含み得るか、または遺伝子送達ビヒクルが埋め込まれる徐放マトリクスを含み得る。あるいは、完全な遺伝子送達ベクター（例えば、レトロウイルスベクター）が組換え細胞からインタクトで産生され得る場合、薬学的調製物は、遺伝子送達系を産生する１つ以上の細胞を含み得る。
（薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ））
本発明の治療方法と共に、薬理ゲノム学（すなわち、被験体の遺伝子型とこの被験体の外来化合物または薬物に対する応答との間の関係の研究）が、考慮され得る。治療剤の代謝における差異は、薬理学的に活性な薬物の用量と血液濃度との間の関係を変更することにより、重篤な毒性または治療の失敗をもたらし得る。従って、医師または臨床医は、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する薬剤を投与するか否かを決定する際、ならびに１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する薬剤を用いる処置の投薬量および／または治療レジメンを変更する際に、関連の薬理ゲノム学研究において得られた知識を適用することを考慮し得る。
薬理ゲノム学は、変更された薬物の性質および罹患した個人における異常な作用に起因する、薬物に対する応答における臨床学的に有意な遺伝的変異を扱う。例えば、Ｅｉｃｈｅｌｂａｕｍ，Ｍ．ら、（１９９６）Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．２３（１０−１１）：９８３−９８５およびＬｉｎｄｅｒ，Ｍ．Ｗ．ら、（１９９７）Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４３（２）：２５４−２６６を参照のこと。一般に、２つの型の薬理遺伝子学状態が、区別され得る。薬物が身体に作用する様式を変更する単一因子（変更された薬物作用）として伝達される遺伝的状態、または身体が薬物に作用する様式を変更する単一因子（変更された薬物代謝）として伝達される遺伝的状態。これらの薬理遺伝子学状態は、稀な遺伝子欠損としてかまたは天然に存在する多型としてかの、いずれかとして生じ得る。例えば、グルコース−６−ホスフェートアミノペプチダーゼ欠損（Ｇ６ＰＤ）は、一般的な遺伝性酵素病であり、ここで、主な臨床学的合併症は、酸化薬剤（抗マラリア薬、スルホンアミド、鎮痛薬、ニトロフラン）の摂取およびソラマメの消費後の溶血である。
「ゲノムワイドアソシエーション（ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）」として知られている、薬物応答を予測する遺伝子を同定するための、１つの薬理ゲノム学アプローチは、すでに知られている遺伝子関連マーカー（例えば、「二座対立」遺伝子マーカーマップ（これは、ヒトゲノム上の６０，０００〜１００，０００の多型または可変性部位からなり、これらの各々が、２つの改変体を有する））からなるヒトゲノムの高解像度マップに、主に依存する。このような高解像度遺伝子マップは、特定の観察された薬物応答または副作用に関連したマーカーを同定するために、第ＩＩ期／第ＩＩＩ期の薬物試験に参加した統計学的に有意な数の患者の各々のゲノムのマップと比較され得る。あるいは、このような高解像度マップは、ヒトゲノムにおいて、数千万の公知の単一ヌクレオチド多型（ＳＮＰ）の組み合わせから生じ得る。本明細書中で使用される場合、「ＳＮＰ」は、ＤＮＡのストレッチにおいて、単一ヌクレオチド塩基において生じる一般的な変更である。例えば、ＳＮＰは、ＤＮＡの１０００塩基毎に１回起き得る。ＳＮＰは、疾患プロセスに関与し得るが、大部分は、疾患に関連しないかもしれない。このようなＳＮＰの存在に基づく遺伝子マップが与えられると、個体は、個々のゲノム中の、ＳＮＰの特定のパターンに依存して、遺伝子のカテゴリーに分類され得る。このような様式において、処置レジメンは、このような遺伝学的に類似の個体の間で共通であり得る形質を考慮して、遺伝学的に類似の個体の群に対して調整され得る。
あるいは、「候補遺伝子アプローチ」と称される方法は、薬物応答を予見する遺伝子を同定するために利用され得る。この方法によれば、薬物標的をコードする遺伝子が既知である場合（例えば、本発明の方法において使用される１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質）、その遺伝子のすべての共通の改変体は、集団中で完全に容易に同定され得、そして別のバージョンに対して遺伝子の１つのバージョンを有することが、特定の薬物応答に関連するか否かが決定され得る。
例示の実施形態として、薬物代謝酵素の活性は、薬物作用の強度および持続時間の両方の主要な決定要因である。薬物代謝酵素（例えば、Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ２（ＮＡＴ２）およびシトクロームＰ４５０酵素（ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９））の遺伝子多型の発見は、薬物の標準的および安全用量を摂取した後、なぜ特定の患者が期待された薬物効果を得ないか、または過大な薬物応答および重篤な毒性を示すかに関する説明を提供した。これらの多型は、集団において、２つの表現型（拡張代謝型（ＥＭ）および低減代謝型（ＰＭ））で発現される。ＰＭの罹患率は、異なる集団の間で異なる。例えば、ＣＹＰ２Ｄ６をコードする遺伝子は高度に多型であり、そしてＰＭ中にいくつかの変異が同定され、これらはすべて機能的ＣＹＰ２Ｄ６の不在に至る。ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９の低減代謝型は、極めて頻繁に、それらが標準的用量を受けるとき、過大な薬物応答および副作用を経験する。代謝産物が活性な治療部分である場合、ＰＭは、そのＣＹＰ２Ｄ６形成代謝産物モルヒネによって媒介されるコデインの鎮痛効果について示されるように、治療応答を示さない。他の極端なもの（ｅｘｔｒｅｍｅ）は、標準的な用量に応答しない、いわゆる超迅速代謝者（ｕｌｔｒａ−ｒａｐｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｚｅｒ）である。近年、超迅速代謝の分子的な基礎がＣＹＰ２Ｄ６遺伝子増幅に起因することが同定されている。
あるいは、「遺伝子発現プロファイリング」と呼ばれる方法を利用して、薬物応答を予測する遺伝子を同定し得る。例えば、薬物（例えば、本発明の方法において使用される、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の分子、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の調節因子）が投与された動物の遺伝子発現は、毒性に関連する遺伝子経路がオンになっているか否かの指標を与え得る。
上記の薬理ゲノミクスアプローチの１より多くから作成された情報を用いて、被験体の予防処置または治療処置に適切な投薬量および処置レジメンを決定し得る。この知識は、投与または薬物の選択に適用される場合、有害な反応または治療の失敗を回避し得、従って、疼痛または有通性障害（例えば、片頭痛）に罹患した被験体を、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を調節する薬剤を用いて処置する場合に、治療効率または予防効率を高め得る。
（本発明の方法において用いられる、組換え発現ベクターおよび宿主細胞）
本発明の方法（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイ）は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質（またはその一部分）をコードする核酸を含むベクター（好ましくは、発現ベクター）の使用を含む。本明細書中で使用される場合、用語「ベクター」とは、連結された別の核酸を輸送し得る核酸分子をいう。１つの型のベクターは、「プラスミド」であり、プラスミドとは、さらなるＤＮＡセグメントが連結され得る、環状２本鎖ＤＮＡループをいう。別の型のベクターは、ウイルスベクターであり、ここで、さらなるＤＮＡセグメントは、ウイルスゲノムに連結され得る。特定のベクターは、導入される宿主細胞中で自律複製し得る（例えば、細菌ベクターは、細菌の複製起点およびエピソーム性哺乳動物ベクターを有する）。他のベクター（例えば、非エピソーム性哺乳動物ベクター）は、宿主細胞への導入の際に宿主細胞のゲノム中に組み込まれ、それにより、宿主ゲノムと共に複製される。さらに、特定のベクターは、作動可能に連結された遺伝子の発現を指向し得る。このようなベクターは、本明細書中で、「発現ベクター」と呼ばれる。一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、しばしば、プラスミドの形態である。本明細書中では、「プラスミド」および「ベクター」は、交換可能に使用され得る。なぜなら、プラスミドは、最も一般に用いられる形態のベクターであるからである。しかし、本発明は、同等の機能を果たす、このような他の形態の発現ベクター（例えば、ウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス））を包含することを意図する。
本発明の方法において使用されるべき組換え発現ベクターは、宿主細胞中での核酸の発現に適切な形態の本発明の核酸を含む。このことは、この組換え発現ベクターが、発現に使用されるべき宿主細胞に基づいて選択され、発現されるべき核酸配列に作動可能に連結される、１以上の調節配列を含むことを意味する。組換え発現ベクターにおいては、「作動可能に連結される」は、目的のヌクレオチド配列が、このヌクレオチド配列の発現を可能にする様式で（例えば、インビトロ転写／翻訳系において、またはこのベクターが宿主細胞に導入される場合は宿主細胞において）、調節配列に連結されることを意味することを意図する。用語「調節配列」は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を包含することを意図する。このような調節配列は、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８５：３−７に記載される。調節配列としては、多くの種類の宿主細胞におけるヌクレオチド配列の構成的発現を指向する調節配列、および特定の宿主細胞のみにおけるヌクレオチド配列の発現を指向する調節配列（例えば、組織特異的調節配列）が挙げられる。発現ベクターの設計が、形質転換されるべき宿主細胞、所望のタンパク質発現レベルなどのような因子に依存し得ることは、当業者によって認識される。本発明の発現ベクターは、宿主細胞へと導入されて、それにより、本明細書中に記載されるような核酸によってコードされる、タンパク質またはペプチド（融合タンパク質または融合ペプチドが挙げられる）（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の変異形態、融合タンパク質など）を生成し得る。
本発明の方法において使用されるべき組換え発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞における、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の発現のために設計され得る。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞（バキュロウイルス発現ベクターを用いて）、酵母細胞、または哺乳動物細胞において発現され得る。適切な宿主細胞は、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）前出にさらに考察される。あるいは、組換え発現ベクターは、例えば、Ｔ７プロモーター調節配列およびＴ７ポリメラーゼを用いて、インビトロで転写および翻訳され得る。
原核生物におけるタンパク質の発現は、最も頻繁には、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて、融合タンパク質または非融合タンパク質のいずれかの発現を指向する、構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターを含むベクターを用いて実施される。融合ベクターは、多数のアミノ酸を、そこでコードされるタンパク質に、通常は組換えタンパク質のアミノ末端側にて付加する。このような融合ベクターは代表的に、以下の３つの目的を果たす：１）組換えタンパク質の発現を増加させること；２）組換えタンパク質の溶解度を増加させること；および３）アフィニティー精製におけるリガンドとして作用することにより、組換えタンパク質の精製を補助すること。しばしば、融合発現ベクターでは、タンパク質分解切断部位は、融合部分の連結部に導入され、そしてこの組換えタンパク質は、融合タンパク質の精製後の融合部分からの組換えタンパク質の分離を可能にする。このような酵素およびそれらの同族の認識配列としては、第Ｘａ因子、トロンビンおよびエンテロキナーゼが挙げられる。代表的融合体発現ベクターとしては、ｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔｅｃｈ Ｉｎｃ；Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｂ．およびＪｏｈｎｓｏｎ，Ｋ．Ｓ．（１９８８）Ｇｅｎｅ ６７：３１−４０）、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）ならびにｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）（これらは、それぞれ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合部位、またはプロテインＡを、標的組換えタンパク質に融合する）が挙げられる。
精製された融合タンパク質は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性のアッセイ（例えば、以下に詳細に記載される、直接的アッセイもしくは競合アッセイ）において、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質に特異的な抗体を生成するために、利用され得る。好ましい実施形態では、本発明のレトロウイルス発現ベクターにおいて発現される、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の融合タンパク質は、骨髄細胞を感染させるために利用され得、その後、この骨髄細胞は、照射されたレシピエントに移植される。次いで、被験体レシピエントの病理が、充分な時間（例えば、６週間）の経過後に調べられる。
別の実施形態では、本発明の核酸は、哺乳動物発現ベクターを用いて、哺乳動物細胞において発現される。哺乳動物発現ベクターの例としては、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，Ｂ．（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７）ＥＭＢＯ Ｊ．６：１８７−１９５）が挙げられる。哺乳動物細胞において用いられる場合、発現ベクターの制御機能にはしばしば、ウイルス調節エレメントが提供される。例えば、通常用いられるプロモーターは、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルスおよびシミアンウイルス４０から誘導される。原核生物細胞および真核生物細胞の両方に関して、他の適切な発現系については、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ．第２版，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９の第１６章および第１７章を参照のこと。
別の実施形態では、組換え哺乳動物発現ベクターは、特定の細胞型において優先的に、核酸の発現を指向し得る（例えば、組織特異的調節エレメントを用いて、この核酸は発現される）。
本発明の方法は、発現ベクター中にアンチセンス方向でクローニングされた本発明のＤＮＡ分子を含む組換え発現ベクターをさらに使用し得る。すなわち、このＤＮＡ分子は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡに対してアンチセンスであるＲＮＡ分子の発現を（ＤＮＡ分子の転写によって）可能にする様式で、調節配列に作動可能に連結される。種々の細胞型におけるアンチセンスＲＮＡ分子の連続発現を指向する、アンチセンス方向でクローニングされた核酸に作動可能に連結された調節配列（例えば、ウイルスプロモーターおよび／またはエンハンサー）が選択され得るか、またはアンチセンスＲＮＡの構成的発現、組織特異的発現、もしくは細胞型特異的発現を指向する調節配列が選択され得る。アンチセンス発現ベクターは、アンチセンス核酸が、高効率の調節領域の制御下で産生される、組換えプラスミド、ファージミド、または弱毒ウイルスの形態であり得、その活性は、そのベクターが導入される細胞型によって決定され得る。アンチセンス遺伝子を用いた遺伝子発現の調節の考察に関しては、Ｗｅｉｎｔｒａｕｂ，Ｈ．ら，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ＲＮＡ ａｓ ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｖｉｅｗｓ−Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．１（１）１９８６を参照のこと。
本発明の別の局面は、本発明の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子（例えば、組換え発現ベクター内の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子、または宿主細胞のゲノムの特定の部位に相同組換えするのを可能にする配列を含む、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子）が導入された宿主細胞の使用に関する。用語「宿主細胞」および「組換え宿主細胞」は、本明細書中で交換可能に用いられる。このような用語が、特定の被験体細胞だけでなく、このような細胞の子孫または潜在的子孫をもいうことが理解される。変異または環境の影響のいずれかに起因して、その後の世代において特定の改変が生じ得るので、このような子孫は、実際は、親細胞と同一でなくてもよいが、これらは依然として、本明細書中で使用される場合、この用語の範囲に含まれる。
宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞、酵母細胞または哺乳動物細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）もしくはＣＯＳ細胞）中で発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。
ベクターＤＮＡは、従来の形質転換技術またはトランスフェクション技術を介して、原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書中で用いられる場合、用語「形質転換」および「トランスフェクション」は、外来核酸（例えば、ＤＮＡ）を宿主細胞へと導入するための、当該分野で認識される種々の技術（リン酸カルシウム共沈または塩化カルシウム共沈、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション、またはエレクトロポレーションが挙げられるがこれらに限定されない）をいうことが意図される。宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトするために適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ．第２版，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９）および他の実験マニュアルに見出され得る。
本発明の方法において用いられる宿主細胞（例えば、培養中の原核生物宿主細胞または真核生物宿主細胞）は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質を生成する（すなわち、発現する）ために用いられ得る。従って、本発明は、本発明の宿主細胞を用いて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質を生成するための方法をさらに提供する。１つの実施形態では、この方法は、本発明の宿主細胞（１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質をコードする組換え発現ベクターが導入されている）を、適切な培地中で培養し、その結果、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質が生成される工程を包含する。別の実施形態では、この方法は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質を、この培地または宿主細胞から単離する工程をさらに包含する。
（本発明の方法において用いられる、単離された核酸分子）
本発明の方法は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはそれらの生物学的に活性な部分をコードする単離された核酸分子、ならびに１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードする核酸分子（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のｍＲＮＡ）を同定するためのハイブリダイゼーションプローブとしての使用に充分な核酸フラグメント、および１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子の増幅もしくへ変異のためのＰＣＲプライマーとして使用するためのフラグメントの使用を含む。本明細書中で使用される場合、用語「核酸分子」は、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）およびＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ならびにヌクレオチドアナログを用いて生成される、ＤＮＡまたはＲＮＡのアナログを包含することが意図される。この核酸分子は、１本鎖または２本鎖であり得るが、好ましくは２本鎖ＤＮＡである。
本発明の方法において用いられる核酸分子（例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３のヌクレオチド配列またはその一部分を有する核酸分子）は、標準的分子生物学的技術および本明細書中に提供される配列情報を用いて単離され得る。配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の核酸配列の全てまたは一部をハイブリダイゼーションプローブとして用いて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の核酸分子は、標準的ハイブリダイゼーション技術およびクローニング技術（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ、Ｊ．、Ｆｒｉｔｓｈ、Ｅ．Ｆ．、およびＭａｎｉａｔｉｓ、Ｔ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ．第２版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ、１９８９に記載される通り）を用いて単離され得る。
さらに、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の全てまたは一部を含む核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の配列に基づいて設計される合成オリゴヌクレオチドプライマーを用いたポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって単離され得る。
本発明の方法において用いられる核酸は、ｃＤＮＡ、ｍＲＮＡ、あるいは、ゲノムＤＮＡをテンプレートとして用いて、そして適切なオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、標準的なＰＣＲ増幅技術に従って増幅され得る。さらに、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のヌクレオチド配列に対応するオリゴヌクレオチドは、標準的合成技術によって、例えば、自動ＤＮＡ合成機を用いて調製され得る。
好ましい実施形態では、本発明の方法において用いられる単離された核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列の相補体、またはこれらのヌクレオチド配列のいずれかの一部分を含む。配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列に相補的である核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列に充分に相補的であり、その結果、これが、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列にハイブリダイズし、それによって安定な二重鎖を形成し得る、核酸分子である。
なお別の好ましい実施形態では、本発明の方法において用いられる、単離された核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３、またはこのヌクレオチド配列のいずれかの一部分に示されるヌクレオチド配列の全長に対して少なくとも約５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く同一であるヌクレオチド配列を含む。
さらに、本発明の方法において用いられる核酸分子は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の核酸配列のほんの一部分（例えば、プローブもしくはプライマーとして用いられ得るフラグメント）、または１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の一部をコードするフラグメント（例えば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質の生物学的に活性な部分）を含み得る。プローブ／プライマーは代表的に、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドを含む。オリゴヌクレオチドは代表的に、ストリンジェントな条件下で、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３のうちの、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３のアンチセンス配列のうちの、または配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の天然に存在する対立遺伝子改変体もしくは変異体のうちの、少なくとも約１２もしくは１５、好ましくは約２０もしくは２５、より好ましくは約３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、もしくは７５ヌクレオチド連続したセンス配列にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列の１領域を含む。１つの実施形態では、本発明の方法において用いられる核酸分子は、１００、１００〜２００、２００〜３００、３００〜４００、４００〜５００、５００〜６００、６００〜７００、７００〜８００、８００〜９００、９００〜１０００、１０００〜１１００、１１００〜１２００、１２００〜１３００、またはより多くのヌクレオチド長であって、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の核酸分子にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。
本明細書中で使用される場合、用語「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」は、互いに有意に同一であるかまたは相同であるヌクレオチド配列が、互いにハイブリダイズしたままである、ハイブリダイゼーションおよび洗浄についての条件を記載することを意図する。好ましくは、この条件は、互いに少なくとも約７０％、より好ましくは少なくとも約８０％、さらにより好ましくは少なくとも約８５％または９０％同一な配列が、互いにハイブリダイズしたままである条件である。このようなストリンジェントな条件は、当業者に公知であり、そしてＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ａｕｓｕｂｅｌら編，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（１９９５），第２節、第４節および第６節に見出され得る。さらなるストリンジェントな条件は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｓａｍｂｒｏｏｋら，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ（１９８９）、第７章、第９章および第１１章に見出され得る。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の好ましい非限定的な例としては、４×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）中での、約６５〜７０℃におけるハイブリダイゼーション（または４×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中での、約４２〜５０℃におけるハイブリダイゼーション）、続いて１×ＳＳＣ中での、約６５〜７０℃における１回以上の洗浄が挙げられる。高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の、好ましい、非限定的な例としては、１×ＳＳＣ中での、約６５〜７０℃におけるハイブリダイゼーション（または１×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中での、約４２〜５０℃におけるハイブリダイゼーション）、続いて０．３×ＳＳＣ中での、約６５〜７０℃における１回以上の洗浄が挙げられる。好ましい、低下したストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、４×ＳＳＣ中での、約５０〜６０℃におけるハイブリダイゼーション（あるいは、６×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中での、約４０〜４５℃におけるハイブリダイゼーション）、続いて２×ＳＳＣ中での、約５０〜６０℃における１回以上の洗浄が挙げられる。上記に記載した値に対して中間の範囲（例えば、６５〜７０℃または４２〜５０℃）もまた、本発明によって包含されることが意図される。ＳＳＰＥ（１×ＳＳＰＥは、０．１５Ｍ ＮａＣｌ、１０ｍＭ ＮａＨ２ＰＯ４、および１．２５ｍＭ ＥＤＴＡ、ｐＨ７．４である）は、ハイブリダイゼーション緩衝液および洗浄緩衝液中でＳＳＣ（１×ＳＳＣは、０．１５Ｍ ＮａＣｌおよび１５ｍＭクエン酸ナトリウムである）の代用をし得る；洗浄は、ハイブリダイゼーションが完了した後、各々１５分間行われる。５０塩基対長未満であることが予想されるハイブリッドについてのハイブリダイゼーション温度は、このハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）よりも５〜１０℃低いべきであり、ここで、Ｔｍは、以下の式に従って決定される。１８塩基対長未満のハイブリッドについては、Ｔｍ（℃）＝２（Ａ塩基＋Ｔ塩基の数）＋４（Ｇ塩基＋Ｃ塩基の数）。１８塩基対長と４９塩基対長との間のハイブリッドについては、Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ１０［Ｎａ＋］）＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−（６００／Ｎ）、ここで、Ｎは、ハイブリッド中の塩基の数であり、そして［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーション緩衝液中のナトリウムイオンの濃度（１×ＳＳＣについての［Ｎａ＋］＝０．１６５Ｍ）である。ハイブリダイゼーション緩衝液および／または洗浄緩衝液にさらなる試薬（ブロッキング剤（例えば、ＢＳＡまたはサケ精子キャリアＤＮＡもしくはニシン精子キャリアＤＮＡ）、界面活性剤（例えば、ＳＤＳ）、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）、Ｆｉｃｏｌｌ、ＰＶＰなどが挙げられるがこれらに限定されない）を添加して、メンブレン（例えば、ニトロセルロースメンブレンまたはナイロンメンブレン）に対する核酸分子の非特異的ハイブリダイゼーションを減少させ得ることもまた、当業者によって認識される。ナイロンメンブレンを用いる場合、特に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件のさらに好ましい非限定的な例は、０．２５〜０．５Ｍ ＮａＨ２ＰＯ４、７％ ＳＤＳ中での、約６５℃におけるハイブリダイゼーション、続いて０．０２Ｍ ＮａＨ２ＰＯ４、１％ ＳＤＳにて６５℃における１回以上の洗浄である。例えば、ＣｈｕｒｃｈおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９８４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８１：１９９１−１９９５（あるいは、０．２×ＳＳＣ、１％ ＳＤＳ）を参照のこと。
好ましい実施形態において、プローブは、プローブに結合した標識基をさらに含む（例えば、標識基は、放射性同位元素、蛍光化合物、酵素または酵素補因子であり得る）。このようなプローブは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質を誤発現する（ｍｉｓｅｘｐｒｅｓｓ）細胞または組織を同定するための診断的試験キットの一部として使用され得る（例えば、被験体由来の細胞サンプル中の１６３８６コード核酸、１５４０２コード核酸、２１１６５コード核酸、１４２３コード核酸、６３６コード核酸、１２３０３コード核酸、２１４２５コード核酸、２７４１０コード核酸、３８５５４コード核酸、３８５５５コード核酸、５５０６３コード核酸、５７１４５コード核酸、５９９１４コード核酸、９４９２１コード核酸、１６８５２コード核酸、３３２６０コード核酸、５８５７３コード核酸、３０９１１コード核酸、８５９１３コード核酸、１４３０３コード核酸、１６８１６コード核酸、１７８２７コード核酸、または３２６２０コード核酸のレベルを測定すること、例えば、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡレベルを検出するか、またはゲノムの１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子が変異されているか除去されているかを決定することによって）。
本発明の方法は、遺伝暗号の縮重に起因して、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列とは異なり、従って、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に示されるヌクレオチド配列によってコードされるタンパク質と同じ１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードする核酸分子の使用をさらに含む。別の実施形態において、本発明の方法に含まれる単離された核酸分子は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に示されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する。
本発明の方法は、ヒト１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の対立遺伝子改変体（例えば、機能的対立遺伝子改変体および非機能的対立遺伝子改変体）の使用をさらに含む。機能的対立遺伝子改変体は、ヒト１６３８６タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト２１１６５タンパク質、ヒト１４２３タンパク質、ヒト６３６タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト２１４２５タンパク質、ヒト２７４１０タンパク質、ヒト３８５５４タンパク質、ヒト３８５５５タンパク質、ヒト５５０６３タンパク質、ヒト５７１４５タンパク質、ヒト５９９１４タンパク質、ヒト９４９２１タンパク質、ヒト１６８５２タンパク質、ヒト３３２６０タンパク質、ヒト５８５７３タンパク質、ヒト３０９１１タンパク質、ヒト８５９１３タンパク質、ヒト１４３０３タンパク質、ヒト１６８１６タンパク質、ヒト１７８２７タンパク質、またはヒト３２６２０タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を維持するアミノ酸配列改変体である。機能的対立遺伝子改変体は、代表的に、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４の１つ以上のアミノ酸の保存的置換、またはそのタンパク質の非必須領域における非必須残基の置換、欠失、もしくは挿入のみを含む。
非機能的対立遺伝子改変体は、ヒト１６３８６タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト２１１６５タンパク質、ヒト１４２３タンパク質、ヒト６３６タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト２１４２５タンパク質、ヒト２７４１０タンパク質、ヒト３８５５４タンパク質、ヒト３８５５５タンパク質、ヒト５５０６３タンパク質、ヒト５７１４５タンパク質、ヒト５９９１４タンパク質、ヒト９４９２１タンパク質、ヒト１６８５２タンパク質、ヒト３３２６０タンパク質、ヒト５８５７３タンパク質、ヒト３０９１１タンパク質、ヒト８５９１３タンパク質、ヒト１４３０３タンパク質、ヒト１６８１６タンパク質、ヒト１７８２７タンパク質、またはヒト３２６２０タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を有さないアミノ酸配列改変体である。非機能的対立遺伝子改変体は、代表的には、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４のアミノ酸配列の非保存的な置換、欠失、もしくは挿入または未成熟短縮化（ｐｒｅｍａｔｕｒｅ ｔｒｕｎｃａｔｉｏｎ）、あるいはこのタンパク質の必須残基または必須領域の置換、挿入、または欠失を含む。
本発明の方法は、ヒト１６３８６タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト２１１６５タンパク質、ヒト１４２３タンパク質、ヒト６３６タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト２１４２５タンパク質、ヒト２７４１０タンパク質、ヒト３８５５４タンパク質、ヒト３８５５５タンパク質、ヒト５５０６３タンパク質、ヒト５７１４５タンパク質、ヒト５９９１４タンパク質、ヒト９４９２１タンパク質、ヒト１６８５２タンパク質、ヒト３３２６０タンパク質、ヒト５８５７３タンパク質、ヒト３０９１１タンパク質、ヒト８５９１３タンパク質、ヒト１４３０３タンパク質、ヒト１６８１６タンパク質、ヒト１７８２７タンパク質、またはヒト３２６２０タンパク質の非ヒトオルソログをさらに使用し得る。ヒト１６３８６タンパク質、ヒト１５４０２タンパク質、ヒト２１１６５タンパク質、ヒト１４２３タンパク質、ヒト６３６タンパク質、ヒト１２３０３タンパク質、ヒト２１４２５タンパク質、ヒト２７４１０タンパク質、ヒト３８５５４タンパク質、ヒト３８５５５タンパク質、ヒト５５０６３タンパク質、ヒト５７１４５タンパク質、ヒト５９９１４タンパク質、ヒト９４９２１タンパク質、ヒト１６８５２タンパク質、ヒト３３２６０タンパク質、ヒト５８５７３タンパク質、ヒト３０９１１タンパク質、ヒト８５９１３タンパク質、ヒト１４３０３タンパク質、ヒト１６８１６タンパク質、ヒト１７８２７タンパク質、またはヒト３２６２０タンパク質のオルソログは、非ヒト生物から単離され、そして同じ１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の活性を有するタンパク質である。
本発明の方法は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３のヌクレオチド配列あるいはそれらの一部を含む核酸分子であって、変異が導入されている核酸分子の使用をさらに包含する。変異は、「非必須」アミノ酸残基または「必須」アミノ酸残基でのアミノ酸置換を導き得る。「非必須」アミノ酸残基とは、その生物学的活性を変化することなく１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の野生型配列（例えば、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４の配列）から変化され得る残基であり、一方、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性のために必要とされる。例えば、本発明の１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の間で保存されたアミノ酸残基は、変化を受容する可能性は低い。
変異は、標準技術（例えば、部位特異的変異誘発およびＰＣＲ媒介変異誘発）により配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３に導入され得る。好ましくは、保存的アミノ酸置換が、１つ以上の予想される非必須アミノ酸残基でなされる。「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるアミノ酸置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが、当該分野において規定されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、無荷電の極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β−分枝鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。従って、好ましくは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質において予想される非必須アミノ酸残基は、同じ側鎖のファミリーからの別のアミノ酸残基で置換される。あるいは、別の実施形態において、変異は、例えば、飽和変異誘発（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）によって、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のコード配列の全てまたは一部に沿って、ランダムに導入され得、そして得られた変異体は、活性を保持する変異体を同定するために、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の生物学的活性についてスクリーニングされ得る。配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３の変異誘発の後、コードされたタンパク質が、組換え発現され得、そしてそのタンパク質の活性が、本明細書中に規定されたアッセイを用いて決定され得る。
本発明の別の局面は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、または４３のヌクレオチド配列に対するアンチセンスである単離された核酸分子の使用に関する。「アンチセンス」核酸は、タンパク質をコードする「センス」核酸に相補的である（例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるかまたはｍＲＮＡ配列に相補的である）ヌクレオチド配列を含む。従って、アンチセンス核酸は、センス核酸に水素結合し得る。アンチセンス核酸は、全長１６３８６コード鎖、１５４０２コード鎖、２１１６５コード鎖、１４２３コード鎖、６３６コード鎖、１２３０３コード鎖、２１４２５コード鎖、２７４１０コード鎖、３８５５４コード鎖、３８５５５コード鎖、５５０６３コード鎖、５７１４５コード鎖、５９９１４コード鎖、９４９２１コード鎖、１６８５２コード鎖、３３２６０コード鎖、５８５７３コード鎖、３０９１１コード鎖、８５９１３コード鎖、１４３０３コード鎖、１６８１６コード鎖、１７８２７コード鎖、または３２６２０コード鎖または、それらの一部のみに相補的であり得る。１実施形態において、アンチセンス核酸分子は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「コード領域」に対するアンチセンスである。用語「コード領域」とは、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含むヌクレオチド配列の領域をいう。別の実施形態において、このアンチセンス核酸分子は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「非コード領域」に対するアンチセンスである。用語「非コード領域」とは、コード領域に隣接する５’配列および３’配列であって、アミノ酸に翻訳されない配列をいう（５’および３’の非翻訳領域ともいう）。
本明細書中に開示される１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードするコード鎖配列を考慮して、本発明のアンチセンス核酸は、ＷａｔｓｏｎおよびＣｒｉｃｋの塩基対形成の法則に従って、設計され得る。アンチセンス核酸分子は、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡの全コード領域に相補的であり得るが、より好ましくは、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡのコード領域または非コード領域の一部のみに対してアンチセンスであるオリゴヌクレオチドである。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、１６３８６ｍＲＮＡ、１５４０２ｍＲＮＡ、２１１６５ｍＲＮＡ、１４２３ｍＲＮＡ、６３６ｍＲＮＡ、１２３０３ｍＲＮＡ、２１４２５ｍＲＮＡ、２７４１０ｍＲＮＡ、３８５５４ｍＲＮＡ、３８５５５ｍＲＮＡ、５５０６３ｍＲＮＡ、５７１４５ｍＲＮＡ、５９９１４ｍＲＮＡ、９４９２１ｍＲＮＡ、１６８５２ｍＲＮＡ、３３２６０ｍＲＮＡ、５８５７３ｍＲＮＡ、３０９１１ｍＲＮＡ、８５９１３ｍＲＮＡ、１４３０３ｍＲＮＡ、１６８１６ｍＲＮＡ、１７８２７ｍＲＮＡ、または３２６２０ｍＲＮＡの翻訳開始部位の周辺領域に相補的であり得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、約５ヌクレオチド長、１０ヌクレオチド長、１５ヌクレオチド長、２０ヌクレオチド長、２５ヌクレオチド長、３０ヌクレオチド長、３５ヌクレオチド長、４０ヌクレオチド長、４５ヌクレオチド長または５０ヌクレオチド長であり得る。本発明のアンチセンス核酸は、当該分野で公知の手順を使用して、化学的合成および酵素的連結反応を使用して構築され得る。例えば、アンチセンス核酸（例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド）は、天然に存在するヌクレオチド、あるいは分子の生物学的安定性を増大するように、またはアンチセンス核酸とセンス核酸との間に形成される二重鎖の物理的安定性を増大するように設計された、種々に改変されたヌクレオチドを使用して、化学的に合成され得る。例えば、ホスホロチオエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチドが使用され得る。アンチセンス核酸を生成するために使用され得る改変ヌクレオチドの例としては、以下が挙げられる：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセチルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルキューオシン、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキシアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルキューオシン、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン（ｗｙｂｕｔｏｘｏｓｉｎｅ）、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（ａｃｐ３）ｗおよび２，６−ジアミノプリン。あるいは、アンチセンス核酸は、核酸がアンチセンス方向でサブクローニングされた発現ベクターを使用して、生物学的に生成され得る（すなわち、挿入された核酸から転写されるＲＮＡは、目的の標的核酸に対してアンチセンス方向のＲＮＡである）。本発明の方法において使用されるアンチセンス核酸分子は、さらに、上記の第ＩＶ節において記載される。
なお別の実施形態において、本発明の方法において使用される１６３８６核酸分子、１５４０２核酸分子、２１１６５核酸分子、１４２３核酸分子、６３６核酸分子、１２３０３核酸分子、２１４２５核酸分子、２７４１０核酸分子、３８５５４核酸分子、３８５５５核酸分子、５５０６３核酸分子、５７１４５核酸分子、５９９１４核酸分子、９４９２１核酸分子、１６８５２核酸分子、３３２６０核酸分子、５８５７３核酸分子、３０９１１核酸分子、８５９１３核酸分子、１４３０３核酸分子、１６８１６核酸分子、１７８２７核酸分子、または３２６２０核酸分子は、塩基部分、糖部分またはリン酸骨格において改変されて、例えば、分子の安定性、ハイブリダイゼーションまたは可溶性を改善し得る。例えば、核酸分子のデオキシリボースリン酸骨格は、ペプチド核酸を生成するために改変され得る（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ４（１）：５−２３を参照のこと）。本明細書中で使用される場合、用語「ペプチド核酸」すなわち「ＰＮＡ」は、核酸模倣物（例えば、ＤＮＡ模倣物）をいい、ここで、デオキシリボースリン酸骨格は、偽ペプチド骨格によって置換され、そして４種の天然の核酸塩基だけが維持される。ＰＮＡの中性の骨格は、低イオン強度の条件下で、ＤＮＡおよびＲＮＡへの特異的ハイブリダイゼーションを可能にすることが示されている。ＰＮＡオリゴマーの合成は、標準的な固相ペプチド合成プロトコルを使用して、Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９３：１４６７０−６７５に記載されるように実施され得る。
１６３８６核酸分子、１５４０２核酸分子、２１１６５核酸分子、１４２３核酸分子、６３６核酸分子、１２３０３核酸分子、２１４２５核酸分子、２７４１０核酸分子、３８５５４核酸分子、３８５５５核酸分子、５５０６３核酸分子、５７１４５核酸分子、５９９１４核酸分子、９４９２１核酸分子、１６８５２核酸分子、３３２６０核酸分子、５８５７３核酸分子、３０９１１核酸分子、８５９１３核酸分子、１４３０３核酸分子、１６８１６核酸分子、１７８２７核酸分子、または３２６２０核酸分子のＰＮＡは、本明細書中に記載される治療適用および診断適用において使用され得る。例えば、ＰＮＡは、例えば、転写もしくは翻訳の停止を誘導するか、または複製を阻害することによって、遺伝子発現の配列特異的調節のためのアンチセンス因子またはアンチ遺伝子（ａｎｔｉｇｅｎｅ）因子として使用され得る。１６３８６核酸分子、１５４０２核酸分子、２１１６５核酸分子、１４２３核酸分子、６３６核酸分子、１２３０３核酸分子、２１４２５核酸分子、２７４１０核酸分子、３８５５４核酸分子、３８５５５核酸分子、５５０６３核酸分子、５７１４５核酸分子、５９９１４核酸分子、９４９２１核酸分子、１６８５２核酸分子、３３２６０核酸分子、５８５７３核酸分子、３０９１１核酸分子、８５９１３核酸分子、１４３０３核酸分子、１６８１６核酸分子、１７８２７核酸分子、または３２６２０核酸分子のＰＮＡはまた、遺伝子中の単一塩基対の変異の分析において（例えば、ＰＮＡ指向性のＰＣＲクランピングによって）；他の酵素と組み合わせて使用する場合には、「人工制限酵素」として（例えば、Ｓ１ヌクレアーゼ（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）前出））；またはＤＮＡ配列決定もしくはハイブリダイゼーションのためのプローブもしくはプライマーとして（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）前出）、使用され得る。
別の実施形態において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のＰＮＡは、（例えば、ＰＮＡの安定性または細胞取り込みを増強するために）、ＰＮＡに親油性もしくは他のヘルパー基を結合させることによってか、ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの形成によってか、またはリポソームもしくは当該分野で公知の他の薬物送達技術の使用によって、改変され得る。例えば、ＰＮＡおよびＤＮＡの有利な特性を組み合わせ得る１６３８６核酸分子、１５４０２核酸分子、２１１６５核酸分子、１４２３核酸分子、６３６核酸分子、１２３０３核酸分子、２１４２５核酸分子、２７４１０核酸分子、３８５５４核酸分子、３８５５５核酸分子、５５０６３核酸分子、５７１４５核酸分子、５９９１４核酸分子、９４９２１核酸分子、１６８５２核酸分子、３３２６０核酸分子、５８５７３核酸分子、３０９１１核酸分子、８５９１３核酸分子、１４３０３核酸分子、１６８１６核酸分子、１７８２７核酸分子、または３２６２０核酸分子のＰＮＡ−ＤＮＡキメラが、生成され得る。このようなキメラは、ＤＮＡ認識酵素（例えば、ＲＮＡｓｅ ＨおよびＤＮＡポリメラーゼ）に、ＤＮＡ部分と相互作用させ、一方、ＰＮＡ部分は、高い結合親和性および結合特異性を提供する。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラは、塩基スタッキング、核酸塩基間の結合の数および方向に関して選択される、適切な長さのリンカーを使用して、連結され得る（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）前出）。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの合成は、Ｈｙｒｕｐ Ｂ．ら、（１９９６）前出およびＦｉｎｎ Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２４（１７）：３３５７−６３に記載されるように実施され得る。例えば、ＤＮＡ鎖は、標準的なホスホロアミダイトカップリング化学および改変ヌクレオシドアナログを使用して、固体支持体上で合成され得る。例えば、５’−（４−メトキシトリチル）アミノ−５’−デオキシ−チミジンホスホラミダイトが、ＰＮＡとＤＮＡの５’末端との間として使用され得る（Ｍａｇ、Ｍ．ら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１７：５９７３−８８）。次いで、ＰＮＡモノマーは、段階的な様式でカップリングされて、５’ＰＮＡセグメントおよび３’ＤＮＡセグメントを有するキメラ分子を生成する（Ｆｉｎｎ Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）前出）。あるいは、キメラ分子は、５’ＤＮＡセグメントおよび３’ＰＮＡセグメントを用いて合成され得る（Ｐｅｔｅｒｓｅｒ、Ｋ．Ｈ．ら、（１９７５）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．５：１１１９−１１１２４）。
他の実施形態において、本発明の方法において使用されるオリゴヌクレオチドは、他の付随的な基（例えば、（例えば、インビボで宿主細胞レセプターを標的化するための）ペプチド）、または細胞膜（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：６５５３−６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４：６４８−６５２；ＰＣＴ公開番号Ｗ０８８／０９８１０を参照のこと）もしくは血液脳関門（例えば、ＰＣＴ公開番号Ｗ０８９／１０１３４を参照のこと）を横切る輸送を促進するための因子を含み得る。さらに、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイゼーション誘発性切断因子（例えば、Ｋｒｏｌら、（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：９５８−９７６を参照のこと）またはインターカレート剤を用いて改変され得る（例えば、Ｚｏｎ（１９８８）Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．５：５３９−５４９を参照のこと）。このために、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチド、ハイブリダイゼーション誘発性架橋剤、輸送因子またはハイブリダイゼーション誘発性切断因子）に結合体化され得る。
（本発明の方法において使用される単離された１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質、ならびに抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体）
本発明の方法は、単離された１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質およびこれらの生物学的に活性な部分、ならびに抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体を惹起するための免疫原として使用されるのに適切なポリペプチドフラグメントの使用を包含する。１つの実施形態において、ネイティブの１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、標準的なタンパク質精製技術を使用する、適切な精製スキームによって、細胞供給源または組織供給源から単離され得る。別の実施形態において、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、組換えＤＮＡ技術によって生成される。組換え発現に代えて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質またはポリペプチドは、標準的なペプチド合成技術を使用して、化学的に合成され得る。
本明細書中で使用する場合、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の「生物学的に活性な部分」は、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を有する、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のフラグメントを含む。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の生物学的に活性な部分は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のアミノ酸配列に十分に同一であるか、あるいはこれらに由来するアミノ酸配列（例えば、全長の１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質より少ないアミノ酸を含み、かつ１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の少なくとも１つの活性を示す、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に示されるアミノ酸配列）を含むペプチドを含む。代表的には、生物学的に活性な部分は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の少なくとも１つの活性を有するドメインまたはモチーフ（例えば、アポトーシス活性の調節に関与すると考えられている、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のＮ末端領域）を含む。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の生物学的に活性な部分は、例えば、２５、５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００以上のアミノ酸長である、ポリペプチドであり得る。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の生物学的に活性な部分は、１６３８６活性、１５４０２活性、２１１６５活性、１４２３活性、６３６活性、１２３０３活性、２１４２５活性、２７４１０活性、３８５５４活性、３８５５５活性、５５０６３活性、５７１４５活性、５９９１４活性、９４９２１活性、１６８５２活性、３３２６０活性、５８５７３活性、３０９１１活性、８５９１３活性、１４３０３活性、１６８１６活性、１７８２７活性、または３２６２０活性を調節する薬剤を開発するための標的として使用され得る。
好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に示されるアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に対して実質的に同一であり、そして配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４のタンパク質の機能的活性を保持するが、上記第Ｖ節において詳細に記載されるように、天然の対立遺伝子改変体または変異誘発に起因して、アミノ酸配列が異なる。従って、別の実施形態において、本発明の方法において使用される１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に対して少なくとも約５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ以上同一なアミノ酸配列を含むタンパク質である。
２つのアミノ酸配列、または２つの核酸配列のパーセント同一性を決定するために、これらの配列は、最適な比較目的で整列される（例えば、ギャップは、最適な整列のために、第１および第２のアミノ酸配列または核酸配列の一方または両方に導入され得、そして非同一配列は、比較目的で無視され得る）。好ましい実施形態において、比較目的で整列される参照配列の長さは、参照配列の少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、およびさらにより好ましくは、少なくとも７０％、８０％または９０％の長さである（例えば、５００アミノ酸残基を有する、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４の、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のアミノ酸配列に対しての第二の配列を整列させる場合、少なくとも７５、好ましくは少なくとも１５０、より好ましくは少なくとも２２５、なおより好ましくは少なくとも３００およびなおより好ましくは少なくとも４００またはそれ以上のアミノ酸残基が整列される）。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが、比較される。第１の配列における位置が、第２の配列の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められる場合、これらの分子は、その位置で同一である（本明細書中で使用される場合、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と等しい）。２つの配列間のパーセント同一性は、それらの配列により共有される同一の位置の数の関数である（ギャップの数、および、２つの配列の最適なアラインメントのために導入される必要のある各ギャップの長さが考慮される）。
配列の比較および２つの配列間のパーセント同一性の決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。好ましい実施形態において、２つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムに組み込まれたＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４−４５３（１９７０））のアルゴリズムを用い、Ｂｌｏｓｕｍ ６２マトリクスまたはＰＡＭ２５０マトリクスのいずれか、ならびにギャップウェイト１６、１４、１２、１０、８、６、または４およびレングスウェイト（ｌｅｎｇｔｈ ｗｅｉｇｈｔ）１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態において、２つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを用い、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリクスならびにギャップウェイト４０、５０、６０、７０、または８０およびレングスウェイト１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。別の実施形態において、２つのアミノ酸配列間または２つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０または２．０Ｕ）に組みこまれたＥ．ＭｅｙｅｒｓおよびＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（Ｃｏｍｐｕｔ．Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｓｃｉ．４：１１−１７（１９８８））のアルゴリズムを使用し、ＰＡＭ１２０ウェイトレジデューテーブル（ｗｅｉｇｈｔ ｒｅｄｉｄｕｅ ｔａｂｌｅ）、ギャップレングスペナルティー１２、およびギャップペナルティー４を用いて決定され得る。
本発明の方法はまた、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のキメラタンパク質または融合タンパク質を使用し得る。本明細書中で使用される場合、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の「キメラタンパク質」または「融合タンパク質」は、非１６３８６ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非２１１６５ポリペプチド、非１４２３ポリペプチド、非６３６ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非２１４２５ポリペプチド、非２７４１０ポリペプチド、非３８５５４ポリペプチド、非３８５５５ポリペプチド、非５５０６３ポリペプチド、非５７１４５ポリペプチド、非５９９１４ポリペプチド、非９４９２１ポリペプチド、非１６８５２ポリペプチド、非３３２６０ポリペプチド、非５８５７３ポリペプチド、非３０９１１ポリペプチド、非８５９１３ポリペプチド、非１４３０３ポリペプチド、非１６８１６ポリペプチド、非１７８２７ポリペプチド、または非３２６２０ポリペプチドに作動可能に連結された、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドを含む。「１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチド」は、１６３８６分子、１５４０２分子、２１１６５分子、１４２３分子、６３６分子、１２３０３分子、２１４２５分子、２７４１０分子、３８５５４分子、３８５５５分子、５５０６３分子、５７１４５分子、５９９１４分子、９４９２１分子、１６８５２分子、３３２６０分子、５８５７３分子、３０９１１分子、８５９１３分子、１４３０３分子、１６８１６分子、１７８２７分子、または３２６２０分子に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをいうが、一方、「非１６３８６ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非２１１６５ポリペプチド、非１４２３ポリペプチド、非６３６ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非２１４２５ポリペプチド、非２７４１０ポリペプチド、非３８５５４ポリペプチド、非３８５５５ポリペプチド、非５５０６３ポリペプチド、非５７１４５ポリペプチド、非５９９１４ポリペプチド、非９４９２１ポリペプチド、非１６８５２ポリペプチド、非３３２６０ポリペプチド、非５８５７３ポリペプチド、非３０９１１ポリペプチド、非８５９１３ポリペプチド、非１４３０３ポリペプチド、非１６８１６ポリペプチド、非１７８２７ポリペプチド、または非３２６２０ポリペプチド」は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質に実質的に相同でないタンパク質に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチド（例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質とは異なり、かつ同じ生物または異なる生物由来のタンパク質）をいう。１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質において、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の全てまたは一部に対応し得る。好ましい実施形態において、１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の生物学的に活性な部分のうち少なくとも１つを含む。別の好ましい実施形態において、１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の生物学的に活性な部分のうち少なくとも２つを含む。融合タンパク質において、用語「作動可能に連結した」は、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドおよび非１６３８６ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非２１１６５ポリペプチド、非１４２３ポリペプチド、非６３６ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非２１４２５ポリペプチド、非２７４１０ポリペプチド、非３８５５４ポリペプチド、非３８５５５ポリペプチド、非５５０６３ポリペプチド、非５７１４５ポリペプチド、非５９９１４ポリペプチド、非９４９２１ポリペプチド、非１６８５２ポリペプチド、非３３２６０ポリペプチド、非５８５７３ポリペプチド、非３０９１１ポリペプチド、非８５９１３ポリペプチド、非１４３０３ポリペプチド、非１６８１６ポリペプチド、非１７８２７ポリペプチド、または非３２６２０ポリペプチドは、互いにインフレームで融合される。非１６３８６ポリペプチド、非１５４０２ポリペプチド、非２１１６５ポリペプチド、非１４２３ポリペプチド、非６３６ポリペプチド、非１２３０３ポリペプチド、非２１４２５ポリペプチド、非２７４１０ポリペプチド、非３８５５４ポリペプチド、非３８５５５ポリペプチド、非５５０６３ポリペプチド、非５７１４５ポリペプチド、非５９９１４ポリ



ペプチド、非９４９２１ポリペプチド、非１６８５２ポリペプチド、非３３２６０ポリペプチド、非５８５７３ポリペプチド、非３０９１１ポリペプチド、非８５９１３ポリペプチド、非１４３０３ポリペプチド、非１６８１６ポリペプチド、非１７８２７ポリペプチド、または非３２６２０ポリペプチドは、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端に融合され得る。
例えば、１つの実施形態において、融合タンパク質は、ＧＳＴ−１６３８６融合タンパク質、ＧＳＴ−１５４０２融合タンパク質、ＧＳＴ−２１１６５融合タンパク質、ＧＳＴ−１４２３融合タンパク質、ＧＳＴ−６３６融合タンパク質、ＧＳＴ−１２３０３融合タンパク質、ＧＳＴ−２１４２５融合タンパク質、ＧＳＴ−２７４１０融合タンパク質、ＧＳＴ−３８５５４融合タンパク質、ＧＳＴ−３８５５５融合タンパク質、ＧＳＴ−５５０６３融合タンパク質、ＧＳＴ−５７１４５融合タンパク質、ＧＳＴ−５９９１４融合タンパク質、ＧＳＴ−９４９２１融合タンパク質、ＧＳＴ−１６８５２融合タンパク質、ＧＳＴ−３３２６０融合タンパク質、ＧＳＴ−５８５７３融合タンパク質、ＧＳＴ−３０９１１融合タンパク質、ＧＳＴ−８５９１３融合タンパク質、ＧＳＴ−１４３０３融合タンパク質、ＧＳＴ−１６８１６融合タンパク質、ＧＳＴ−１７８２７融合タンパク質、またはＧＳＴ−３２６２０融合タンパク質であり、ここで、１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列は、ＧＳＴ配列のＣ末端に融合されている。このような融合タンパク質は、組換え１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の精製を容易にし得る。
別の実施形態において、この融合タンパク質は、そのＮ末端において異種シグナル配列を含む１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質である。特定の宿主細胞（例えば、哺乳動物宿主細胞）において、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の発現および／または分泌は、異種シグナル配列の使用によって増大され得る。
本発明の方法において使用される１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質は、薬学的組成物中に組み込まれ得、そして被験体にインビボで投与され得る。１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質は、１６３８６基質、１５４０２基質、２１１６５基質、１４２３基質、６３６基質、１２３０３基質、２１４２５基質、２７４１０基質、３８５５４基質、３８５５５基質、５５０６３基質、５７１４５基質、５９９１４基質、９４９２１基質、１６８５２基質、３３２６０基質、５８５７３基質、３０９１１基質、８５９１３基質、１４３０３基質、１６８１６基質、１７８２７基質、または３２６２０基質のバイオアベイラビリティーに影響を与えるために使用され得る。１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質の使用は、例えば、以下によって引き起こされる障害の処置のために治療的に有用であり得る：（ｉ）１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質をコードする遺伝子の異常な改変または変異；（ｉｉ）１６３８６遺伝子、１５４０２遺伝子、２１１６５遺伝子、１４２３遺伝子、６３６遺伝子、１２３０３遺伝子、２１４２５遺伝子、２７４１０遺伝子、３８５５４遺伝子、３８５５５遺伝子、５５０６３遺伝子、５７１４５遺伝子、５９９１４遺伝子、９４９２１遺伝子、１６８５２遺伝子、３３２６０遺伝子、５８５７３遺伝子、３０９１１遺伝子、８５９１３遺伝子、１４３０３遺伝子、１６８１６遺伝子、１７８２７遺伝子、または３２６２０遺伝子の誤調節；ならびに（ｉｉｉ）１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の異常な翻訳後修飾。
さらに、本発明の方法において使用される１６３８６融合タンパク質、１５４０２融合タンパク質、２１１６５融合タンパク質、１４２３融合タンパク質、６３６融合タンパク質、１２３０３融合タンパク質、２１４２５融合タンパク質、２７４１０融合タンパク質、３８５５４融合タンパク質、３８５５５融合タンパク質、５５０６３融合タンパク質、５７１４５融合タンパク質、５９９１４融合タンパク質、９４９２１融合タンパク質、１６８５２融合タンパク質、３３２６０融合タンパク質、５８５７３融合タンパク質、３０９１１融合タンパク質、８５９１３融合タンパク質、１４３０３融合タンパク質、１６８１６融合タンパク質、１７８２７融合タンパク質、または３２６２０融合タンパク質は、被験体において抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体を産生するための免疫原として、１６３８６リガンド、１５４０２リガンド、２１１６５リガンド、１４２３リガンド、６３６リガンド、１２３０３リガンド、２１４２５リガンド、２７４１０リガンド、３８５５４リガンド、３８５５５リガンド、５５０６３リガンド、５７１４５リガンド、５９９１４リガンド、９４９２１リガンド、１６８５２リガンド、３３２６０リガンド、５８５７３リガンド、３０９１１リガンド、８５９１３リガンド、１４３０３リガンド、１６８１６リガンド、１７８２７リガンド、または３２６２０リガンドを精製するために、そして１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の、１６３８６基質、１５４０２基質、２１１６５基質、１４２３基質、６３６基質、１２３０３基質、２１４２５基質、２７４１０基質、３８５５４基質、３８５５５基質、５５０６３基質、５７１４５基質、５９９１４基質、９４９２１基質、１６８５２基質、３３２６０基質、５８５７３基質、３０９１１基質、８５９１３基質、１４３０３基質、１６８１６基質、１７８２７基質、または３２６２０基質との相互作用を阻害する分子を同定するためのスクリーニングアッセイにおいて、使用され得る。
好ましくは、本発明の方法において使用される１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のキメラタンパク質または融合タンパク質は、標準的な組換えＤＮＡ技術によって産生される。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮＡフラグメントは、従来技術に従って、例えば、連結のために平滑末端または付着末端を使用し、適切な末端を提供するための制限酵素消化を使用し、適切な場合粘着末端をフィルインし、所望でない連結を回避するためのアルカリホスファターゼ処理を使用し、そして酵素的連結を使用することによって一緒にインフレームで連結される。別の実施形態において、融合遺伝子は、自動化ＤＮＡ合成機を含む従来技術によって合成され得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増幅は、引き続いてアニーリングおよび再増幅されてキメラ遺伝子配列を生成し得る２つの連続遺伝子フラグメント間の相補的オーバーハングを生じるアンカープライマーを使用して実施され得る（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ａｕｓｕｂｅｌら、編、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ：１９９２を参照のこと）。さらに、すでに融合部分（例えば、ＧＳＴポリペプチド）をコードしている多くの発現ベクターが市販されている。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０をコードする核酸は、この融合部分が、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質にインフレームで連結されるように、このような発現ベクター中にクローニングされ得る。
本発明はまた、１６３８６アゴニスト、１５４０２アゴニスト、２１１６５アゴニスト、１４２３アゴニスト、６３６アゴニスト、１２３０３アゴニスト、２１４２５アゴニスト、２７４１０アゴニスト、３８５５４アゴニスト、３８５５５アゴニスト、５５０６３アゴニスト、５７１４５アゴニスト、５９９１４アゴニスト、９４９２１アゴニスト、１６８５２アゴニスト、３３２６０アゴニスト、５８５７３アゴニスト、３０９１１アゴニスト、８５９１３アゴニスト、１４３０３アゴニスト、１６８１６アゴニスト、１７８２７アゴニスト、または３２６２０アゴニスト（模倣物）、あるいは１６３８６アンタゴニスト、１５４０２アンタゴニスト、２１１６５アンタゴニスト、１４２３アンタゴニスト、６３６アンタゴニスト、１２３０３アンタゴニスト、２１４２５アンタゴニスト、２７４１０アンタゴニスト、３８５５４アンタゴニスト、３８５５５アンタゴニスト、５５０６３アンタゴニスト、５７１４５アンタゴニスト、５９９１４アンタゴニスト、９４９２１アンタゴニスト、１６８５２アンタゴニスト、３３２６０アンタゴニスト、５８５７３アンタゴニスト、３０９１１アンタゴニスト、８５９１３アンタゴニスト、１４３０３アンタゴニスト、１６８１６アンタゴニスト、１７８２７アンタゴニスト、または３２６２０アンタゴニストのいずれかとして機能する、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の改変体の使用に関する。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の改変体は、変異誘発（例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の別個の点変異または短縮）によって生成され得る。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のアゴニストは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性と実質的に同じ生物学的活性またはそのサブセットを保持し得る。１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のアンタゴニストは、例えば、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の、１６３８６媒介性、１５４０２媒介性、２１１６５媒介性、１４２３媒介性、６３６媒介性、１２３０３媒介性、２１４２５媒介性、２７４１０媒介性、３８５５４媒介性、３８５５５媒介性、５５０６３媒介性、５７１４５媒介性、５９９１４媒介性、９４９２１媒介性、１６８５２媒介性、３３２６０媒介性、５８５７３媒介性、３０９１１媒介性、８５９１３媒介性、１４３０３媒介性、１６８１６媒介性、１７８２７媒介性、または３２６２０媒介性の活性を拮抗的に調節することによって、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の天然に存在する形態の活性の１以上を阻害し得る。従って、特定の生物学的効果は、機能が限定された改変体を用いる処置によって誘発され得る。１つの実施形態において、タンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性のサブセットを有する改変体を用いる被験体の処置は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の天然に存在する形態を用いた処置と比較して、被験体における副作用がより小さい。
１つの実施形態において、１６３８６アゴニスト、１５４０２アゴニスト、２１１６５アゴニスト、１４２３アゴニスト、６３６アゴニスト、１２３０３アゴニスト、２１４２５アゴニスト、２７４１０アゴニスト、３８５５４アゴニスト、３８５５５アゴニスト、５５０６３アゴニスト、５７１４５アゴニスト、５９９１４アゴニスト、９４９２１アゴニスト、１６８５２アゴニスト、３３２６０アゴニスト、５８５７３アゴニスト、３０９１１アゴニスト、８５９１３アゴニスト、１４３０３アゴニスト、１６８１６アゴニスト、１７８２７アゴニスト、または３２６２０アゴニスト（模倣物）、あるいは１６３８６アンタゴニスト、１５４０２アンタゴニスト、２１１６５アンタゴニスト、１４２３アンタゴニスト、６３６アンタゴニスト、１２３０３アンタゴニスト、２１４２５アンタゴニスト、２７４１０アンタゴニスト、３８５５４アンタゴニスト、３８５５５アンタゴニスト、５５０６３アンタゴニスト、５７１４５アンタゴニスト、５９９１４アンタゴニスト、９４９２１アンタゴニスト、１６８５２アンタゴニスト、３３２６０アンタゴニスト、５８５７３アンタゴニスト、３０９１１アンタゴニスト、８５９１３アンタゴニスト、１４３０３アンタゴニスト、１６８１６アンタゴニスト、１７８２７アンタゴニスト、または３２６２０アンタゴニストのいずれかとして機能する、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の改変体は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のアゴニスト活性またはアンタゴニスト活性について、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の変異体（例えば、短縮変異体）のコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって、同定され得る。１つの実施形態において、１６３８６改変体、１５４０２改変体、２１１６５改変体、１４２３改変体、６３６改変体、１２３０３改変体、２１４２５改変体、２７４１０改変体、３８５５４改変体、３８５５５改変体、５５０６３改変体、５７１４５改変体、５９９１４改変体、９４９２１改変体、１６８５２改変体、３３２６０改変体、５８５７３改変体、３０９１１改変体、８５９１３改変体、１４３０３改変体、１６８１６改変体、１７８２７改変体、または３２６２０改変体の多様なライブラリーは、核酸レベルでのコンビナトリアル変異誘発によって生成され、そして多様な遺伝子ライブラリーによってコードされる。１６３８６改変体、１５４０２改変体、２１１６５改変体、１４２３改変体、６３６改変体、１２３０３改変体、２１４２５改変体、２７４１０改変体、３８５５４改変体、３８５５５改変体、５５０６３改変体、５７１４５改変体、５９９１４改変体、９４９２１改変体、１６８５２改変体、３３２６０改変体、５８５７３改変体、３０９１１改変体、８５９１３改変体、１４３０３改変体、１６８１６改変体、１７８２７改変体、または３２６２０改変体の多様なライブラリーは、例えば、合成オリゴヌクレオチドの混合物を遺伝子配列に酵素的に連結することによって生成され得、その結果、潜在的な１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列の縮重セットは、個々のポリペプチドとしてか、あるいはその中に１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列のセットを含むより大きい融合タンパク質のセットとして（例えば、ファージディスプレイについて）発現可能である。縮重オリゴヌクレオチド配列から潜在的な１６３８６改変体、１５４０２改変体、２１１６５改変体、１４２３改変体、６３６改変体、１２３０３改変体、２１４２５改変体、２７４１０改変体、３８５５４改変体、３８５５５改変体、５５０６３改変体、５７１４５改変体、５９９１４改変体、９４９２１改変体、１６８５２改変体、３３２６０改変体、５８５７３改変体、３０９１１改変体、８５９１３改変体、１４３０３改変体、１６８１６改変体、１７８２７改変体、または３２６２０改変体のライブラリーを生成するために、種々の方法が使用され得る。縮重遺伝子配列の化学的合成は、自動化ＤＮＡ合成機において実施され得、次いで、この合成遺伝子は、適切な発現ベクター中に連結され得る。遺伝子の縮重セットの使用は、潜在的な１６３８６配列、１５４０２配列、２１１６５配列、１４２３配列、６３６配列、１２３０３配列、２１４２５配列、２７４１０配列、３８５５４配列、３８５５５配列、５５０６３配列、５７１４５配列、５９９１４配列、９４９２１配列、１６８５２配列、３３２６０配列、５８５７３配列、３０９１１配列、８５９１３配列、１４３０３配列、１６８１６配列、１７８２７配列、または３２６２０配列の所望のセットをコードする全ての配列を１つの混合物中で準備することを可能にする。縮重オリゴヌクレオチドを合成するための方法は、当該分野で公知である（例えば、Ｎａｒａｎｇ、Ｓ．Ａ．（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ ３９：３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５３：３２３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ １９８：１０５６；Ｉｋｅら、（１９８３）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１１：４７７を参照のこと）。
さらに、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質コード配列のフラグメントのライブラリーは、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質の改変体のスクリーニングおよび引き続く選択のために、１６３８６フラグメント、１５４０２フラグメント、２１１６５フラグメント、１４２３フラグメント、６３６フラグメント、１２３０３フラグメント、２１４２５フラグメント、２７４１０フラグメント、３８５５４フラグメント、３８５５５フラグメント、５５０６３フラグメント、５７１４５フラグメント、５９９１４フラグメント、９４９２１フラグメント、１６８５２フラグメント、３３２６０フラグメント、５８５７３フラグメント、３０９１１フラグメント、８５９１３フラグメント、１４３０３フラグメント、１６８１６フラグメント、１７８２７フラグメント、または３２６２０フラグメントの多様な集団を生成するために使用され得る。１つの実施形態において、コード配列フラグメントのライブラリーは、１６３８６コード配列、１５４０２コード配列、２１１６５コード配列、１４２３コード配列、６３６コード配列、１２３０３コード配列、２１４２５コード配列、２７４１０コード配列、３８５５４コード配列、３８５５５コード配列、５５０６３コード配列、５７１４５コード配列、５９９１４コード配列、９４９２１コード配列、１６８５２コード配列、３３２６０コード配列、５８５７３コード配列、３０９１１コード配列、８５９１３コード配列、１４３０３コード配列、１６８１６コード配列、１７８２７コード配列、または３２６２０コード配列の二本鎖ＰＣＲフラグメントを、ニック形成が１分子当たりほぼ１回だけ生じるような条件下でヌクレアーゼで処理し、二本鎖ＤＮＡを変性し、異なるニック形成産物由来のセンス／アンチセンス対を含み得る二本鎖ＤＮＡを形成するためにＤＮＡを再生し、Ｓ１ヌクレアーゼでの処理によって、再形成された二重鎖から一本鎖部分を除去し、そして得られたフラグメントライブラリーを発現ベクター中に連結することによって、生成され得る。この方法によって、種々のサイズの１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のＮ末端フラグメント、Ｃ末端フラグメントおよび内部フラグメントをコードする、発現ライブラリーが誘導され得る。
点変異または短縮によって作成されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングするためのいくつかの技術、および選択された特性を有する遺伝子産物についてのｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするためのいくつかの技術が、当該分野で公知である。このような技術は、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質のコンビナトリアル変異誘発によって生成された遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングのために適合可能である。大きい遺伝子ライブラリーをスクリーニングするための高スループットの分析に使用されやすい、最も広く使用される技術は、代表的に、遺伝子ライブラリーを複製可能な発現ベクター中にクローニングする工程、ベクターの得られたライブラリーで適切な細胞を形質転換する工程、および所望の活性の検出が、産物が検出された遺伝子をコードするベクターの単離を容易にするような条件下でコンビナトリアル遺伝子を発現する工程を包含する。再帰的アンサンブル変異誘発（ｒｅｃｕｒｓｉｖｅ ｅｎｓｅｍｂｌｅ ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ （ＲＥＭ））（これは、ライブラリー中の機能的変異体の頻度を増強する新たな技術である）は、１６３８６改変体、１５４０２改変体、２１１６５改変体、１４２３改変体、６３６改変体、１２３０３改変体、２１４２５改変体、２７４１０改変体、３８５５４改変体、３８５５５改変体、５５０６３改変体、５７１４５改変体、５９９１４改変体、９４９２１改変体、１６８５２改変体、３３２６０改変体、５８５７３改変体、３０９１１改変体、８５９１３改変体、１４３０３改変体、１６８１６改変体、１７８２７改変体、または３２６２０改変体を同定するためのスクリーニングアッセイと組み合わせて使用され得る（ＡｒｋｉｎおよびＹｏｕｒｖａｎ（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：７８１１−７８１５；Ｄｅｌｇｒａｖｅら、（１９９３）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ６（３）：３２７−３３１）。
本発明の方法はさらに、抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体の使用を包含する。単離された１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質、あるいはそれらの一部分またはフラグメントは、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の調製のための標準的な技術を用いて、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に結合する抗体を生成するための抗原として使用され得る。全長の１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のタンパク質が使用され得るか、あるいは１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の抗原性ペプチドフラグメントが免疫原として使用され得る。１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の抗原性ペプチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、および４４に示されるアミノ酸配列の少なくとも８アミノ酸残基を含み、そしてこのペプチドに対して惹起された抗体が、１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質と特異的に免疫複合体を形成するように、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のエピトープを含む。好ましくは、抗原性ペプチドは、少なくとも１０アミノ酸残基、より好ましくは、少なくとも１５アミノ酸残基、さらにより好ましくは、少なくとも２０アミノ酸残基、そして最も好ましくは、少なくとも３０アミノ酸残基を含む。
抗原性ペプチドにより含まれる、好ましいエピトープは、タンパク質の表面に局在される１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の領域（例えば、親水性領域）、および高抗原性を有する領域である。
１６３８６免疫原、１５４０２免疫原、２１１６５免疫原、１４２３免疫原、６３６免疫原、１２３０３免疫原、２１４２５免疫原、２７４１０免疫原、３８５５４免疫原、３８５５５免疫原、５５０６３免疫原、５７１４５免疫原、５９９１４免疫原、９４９２１免疫原、１６８５２免疫原、３３２６０免疫原、５８５７３免疫原、３０９１１免疫原、８５９１３免疫原、１４３０３免疫原、１６８１６免疫原、１７８２７免疫原、または３２６２０免疫原は、代表的には、適切な被験体（例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、または他の哺乳動物）をその免疫原で免疫することによって抗体を調製するために使用される。適切な免疫原性製調製物は、例えば、組み換え法で発現される１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質あるいは化学合成１６３８６ポリペプチド、化学合成１５４０２ポリペプチド、化学合成２１１６５ポリペプチド、化学合成１４２３ポリペプチド、化学合成６３６ポリペプチド、化学合成１２３０３ポリペプチド、化学合成２１４２５ポリペプチド、化学合成２７４１０ポリペプチド、化学合成３８５５４ポリペプチド、化学合成３８５５５ポリペプチド、化学合成５５０６３ポリペプチド、化学合成５７１４５ポリペプチド、化学合成５９９１４ポリペプチド、化学合成９４９２１ポリペプチド、化学合成１６８５２ポリペプチド、化学合成３３２６０ポリペプチド、化学合成５８５７３ポリペプチド、化学合成３０９１１ポリペプチド、化学合成８５９１３ポリペプチド、化学合成１４３０３ポリペプチド、化学合成１６８１６ポリペプチド、化学合成１７８２７ポリペプチド、または化学合成３２６２０ポリペプチドを包含し得る。調製物はさらに、フロインドの完全アジュバントまたは不完全アジュバント、または同様な免疫刺激性薬剤のようなアジュバントを含み得る。適切な被験体を、免疫原性の１６３８６調製物、１５４０２調製物、２１１６５調製物、１４２３調製物、６３６調製物、１２３０３調製物、２１４２５調製物、２７４１０調製物、３８５５４調製物、３８５５５調製物、５５０６３調製物、５７１４５調製物、５９９１４調製物、９４９２１調製物、１６８５２調製物、３３２６０調製物、５８５７３調製物、３０９１１調製物、８５９１３調製物、１４３０３調製物、１６８１６調製物、１７８２７調製物、または３２６２０調製物で免疫することによって、ポリクローナル抗１６３８６抗体反応、ポリクローナル抗１５４０２抗体反応、ポリクローナル抗２１１６５抗体反応、ポリクローナル抗１４２３抗体反応、ポリクローナル抗６３６抗体反応、ポリクローナル抗１２３０３抗体反応、ポリクローナル抗２１４２５抗体反応、ポリクローナル抗２７４１０抗体反応、ポリクローナル抗３８５５４抗体反応、ポリクローナル抗３８５５５抗体反応、ポリクローナル抗５５０６３抗体反応、ポリクローナル抗５７１４５抗体反応、ポリクローナル抗５９９１４抗体反応、ポリクローナル抗９４９２１抗体反応、ポリクローナル抗１６８５２抗体反応、ポリクローナル抗３３２６０抗体反応、ポリクローナル抗５８５７３抗体反応、ポリクローナル抗３０９１１抗体反応、ポリクローナル抗８５９１３抗体反応、ポリクローナル抗１４３０３抗体反応、ポリクローナル抗１６８１６抗体反応、ポリクローナル抗１７８２７抗体反応、またはポリクローナル抗３２６２０抗体反応が誘導される。
本明細書中で使用される用語「抗体」は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫的に活性な部位（すなわち、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０のような抗原と特異的に結合する（免疫反応する）抗原結合部位を含む分子）をいう。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部位の例は、酵素（例えば、ペプシン）で、抗体を処理することによって生成され得るＦ（ａｂ）フラグメントおよびＦ（ａｂ’）２フラグメントを含む。本発明は、１６３８６分子、１５４０２分子、２１１６５分子、１４２３分子、６３６分子、１２３０３分子、２１４２５分子、２７４１０分子、３８５５４分子、３８５５５分子、５５０６３分子、５７１４５分子、５９９１４分子、９４９２１分子、１６８５２分子、３３２６０分子、５８５７３分子、３０９１１分子、８５９１３分子、１４３０３分子、１６８１６分子、１７８２７分子、または３２６２０分子と結合するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を提供する。本明細書中で使用される場合、用語「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０の特定のエピトープと免疫反応することができる抗原結合部位の１つの種のみを含む抗体分子の集団をいう。従って、モノクローナル抗体組成物は、代表的には、それが免疫反応する特定の１６３８６タンパク質、１５４０２タンパク質、２１１６５タンパク質、１４２３タンパク質、６３６タンパク質、１２３０３タンパク質、２１４２５タンパク質、２７４１０タンパク質、３８５５４タンパク質、３８５５５タンパク質、５５０６３タンパク質、５７１４５タンパク質、５９９１４タンパク質、９４９２１タンパク質、１６８５２タンパク質、３３２６０タンパク質、５８５７３タンパク質、３０９１１タンパク質、８５９１３タンパク質、１４３０３タンパク質、１６８１６タンパク質、１７８２７タンパク質、または３２６２０タンパク質に対して単一結合親和性を示す。
ポリクローナル抗１６３８６抗体、ポリクローナル抗１５４０２抗体、ポリクローナル抗２１１６５抗体、ポリクローナル抗１４２３抗体、ポリクローナル抗６３６抗体、ポリクローナル抗１２３０３抗体、ポリクローナル抗２１４２５抗体、ポリクローナル抗２７４１０抗体、ポリクローナル抗３８５５４抗体、ポリクローナル抗３８５５５抗体、ポリクローナル抗５５０６３抗体、ポリクローナル抗５７１４５抗体、ポリクローナル抗５９９１４抗体、ポリクローナル抗９４９２１抗体、ポリクローナル抗１６８５２抗体、ポリクローナル抗３３２６０抗体、ポリクローナル抗５８５７３抗体、ポリクローナル抗３０９１１抗体、ポリクローナル抗８５９１３抗体、ポリクローナル抗１４３０３抗体、ポリクローナル抗１６８１６抗体、ポリクローナル抗１７８２７抗体、またはポリクローナル抗３２６２０抗体は、上記のように、適切な被験体を、１６３８６免疫原、１５４０２免疫原、２１１６５免疫原、１４２３免疫原、６３６免疫原、１２３０３免疫原、２１４２５免疫原、２７４１０免疫原、３８５５４免疫原、３８５５５免疫原、５５０６３免疫原、５７１４５免疫原、５９９１４免疫原、９４９２１免疫原、１６８５２免疫原、３３２６０免疫原、５８５７３免疫原、３０９１１免疫原、８５９１３免疫原、１４３０３免疫原、１６８１６免疫原、１７８２７免疫原、または３２６２０免疫原で免疫することによって、調製され得る。免疫される被験体中における抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体の力価は、標準的技術（例えば、免疫化１６３８６、免疫化１５４０２、免疫化２１１６５、免疫化１４２３、免疫化６３６、免疫化１２３０３、免疫化２１４２５、免疫化２７４１０、免疫化３８５５４、免疫化３８５５５、免疫化５５０６３、免疫化５７１４５、免疫化５９９１４、免疫化９４９２１、免疫化１６８５２、免疫化３３２６０、免疫化５８５７３、免疫化３０９１１、免疫化８５９１３、免疫化１４３０３、免疫化１６８１６、免疫化１７８２７、または免疫化３２６２０を用いる、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）のような）によって経時的にモニターされ得る。所望であれば、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０に対して指向された抗体分子は、哺乳動物から（例えば、血液から）単離され得、さらに、ＩｇＧ画分を得るための、タンパク質Ａ クロマトグラフィーのような、周知の技術によって精製され得る。免疫後の適切な時間で、例えば、抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体の力価が最高のときに、抗体産生細胞は、被験体から得られ得、そして例えば、ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ２５６；４９５−４９７に初めに記載されるハイブリドーマ技術（Ｂｒｏｗｎら（１９８１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２７；５３９−４６；Ｂｒｏｗｎら（１９８０）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５５：４９８０−８３；Ｙｅｈら（１９７６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７６：２９２７−３１；およびＹｅｈら（１９８２）Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ ２９：２６９−７５もまた参照のこと）、より最近のヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂｏｒら（１９８３）Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ ４：７２）、ＥＢＶハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅら（１９８５）Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ、Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，７７−９６頁）またはトリオーマ技術のような標準的技術によって、モノクローナル抗体を調製するために使用され得る。モノクローナル抗体ハイブリドーマを産生するための技術は、周知である（一般的に、Ｋｅｎｎｅｔｈ，Ｒ．Ｈ．Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｎｅｗ Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎ Ｉｎ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｎａｌｙｓｅｓ，Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｒｐ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８０）；Ｌｅｒｎｅｒ，Ｅ．Ａ．（１９８１）Ｙａｌｅ Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｍｅｄ．５４：３８７−４０２；Ｇｅｆｔｅｒ，Ｍ．Ｌ．ら（１９７７）Ｓｏｍａｔｉｃ Ｃｅｌｌ Ｇｅｎｅｔ．３：２３１−３６を参照のこと）。簡単に言えば、不死化細胞株（代表的には骨髄腫）が、上記のように、１６３８６免疫原、１５４０２免疫原、２１１６５免疫原、１４２３免疫原、６３６免疫原、１２３０３免疫原、２１４２５免疫原、２７４１０免疫原、３８５５４免疫原、３８５５５免疫原、５５０６３免疫原、５７１４５免疫原、５９９１４免疫原、９４９２１免疫原、１６８５２免疫原、３３２６０免疫原、５８５７３免疫原、３０９１１免疫原、８５９１３免疫原、１４３０３免疫原、１６８１６免疫原、１７８２７免疫原、または３２６２０免疫原で免疫される哺乳動物からのリンパ球（代表的には脾臓細胞）と融合され、そして得られるハイブリドーマ細胞の培養上清は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定するために、スクリーニングされる。
リンパ球と不死化細胞株とを融合するために使用される任意の多くの周知のプロトコルが、抗１６３８６モノクローナル抗体、抗１５４０２モノクローナル抗体、抗２１１６５モノクローナル抗体、抗１４２３モノクローナル抗体、抗６３６モノクローナル抗体、抗１２３０３モノクローナル抗体、抗２１４２５モノクローナル抗体、抗２７４１０モノクローナル抗体、抗３８５５４モノクローナル抗体、抗３８５５５モノクローナル抗体、抗５５０６３モノクローナル抗体、抗５７１４５モノクローナル抗体、抗５９９１４モノクローナル抗体、抗９４９２１モノクローナル抗体、抗１６８５２モノクローナル抗体、抗３３２６０モノクローナル抗体、抗５８５７３モノクローナル抗体、抗３０９１１モノクローナル抗体、抗８５９１３モノクローナル抗体、抗１４３０３モノクローナル抗体、抗１６８１６モノクローナル抗体、抗１７８２７モノクローナル抗体、または抗３２６２０モノクローナル抗体を生成する目的で使用され得る（例えば、Ｇ．Ｇａｌｆｒｅら（１９７７）Ｎａｔｕｒｅ ２６６：５５０５２；Ｇｅｆｔｅｒら（１９７７）前述；Ｌｅｒｎｅｒ（１９８１）前述；およびＫｅｎｎｅｔｈ（１９８０）前述を参照のこと）。さらに、当業者は、これもまた有用であるような方法の多くのバリエーションがあることを認識する。代表的には、不死化細胞株（例えば、骨髄腫細胞株）は、リンパ球と同じ哺乳動物種に由来する。例えば、マウスハイブリドーマは、本発明の免疫原性調製物で免疫されたマウスからのリンパ球と、不死化マウス細胞株とを融合することによって作製され得る。好ましい不死化細胞株は、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含む培養培地（「ＨＡＴ培地］）に感受性であるマウス骨髄細胞株である。任意の多くの骨髄細胞株（例えば、Ｐ３−ＮＳ１／１−Ａｇ４−１，Ｐ３−ｘ６３−Ａｇ８．６５３またはＳｐ２／Ｏ−Ａｇ１４骨髄細胞株）は、標準的技術に従って、融合パートナーとして使用され得る。このような骨髄細部株は、ＡＴＣＣから入手可能である。代表的に、ＨＡＴ感受性マウス骨髄細胞は、ポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）を用いて、マウス脾臓細胞と融合される。その融合から生じるハイブリドーマ細胞は、次にＨＡＴ培地を用いて選択され、その培地は、融合されない骨髄腫細胞および非増殖的に融合した骨髄腫細胞を殺す（融合しなかった脾臓細胞は、形質転換されていないので、数日後に死ぬ）。本発明のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞は、（例えば、標準的なＥＬＩＳＡアッセイを用いて）１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と結合する抗体についてハイブリドーマ培養上清をスクリーニングすることによって、検出される。
モノクローナル抗体分泌ハイブリドーマを調製する代わりに、抗９９４９モノクローナル抗体、抗１４２３０モノクローナル抗体、抗７６０モノクローナル抗体、抗６２５５３モノクローナル抗体、抗１２２１６モノクローナル抗体、抗１７７１９モノクローナル抗体、抗４１８９７モノクローナル抗体、抗４７１７４モノクローナル抗体、抗３３４０８モノクローナル抗体、抗１０００２モノクローナル抗体、抗１６２０９モノクローナル抗体、抗３１４モノクローナル抗体、抗６３６モノクローナル抗体、抗２７４１０モノクローナル抗体、抗３３２６０モノクローナル抗体、抗６１９モノクローナル抗体、抗１５９８５モノクローナル抗体、抗６９１１２モノクローナル抗体、抗２１５８モノクローナル抗体、抗２２４モノクローナル抗体、抗６１５モノクローナル抗体、抗４４３７３モノクローナル抗体、抗９５４３１モノクローナル抗体、抗２２２４５モノクローナル抗体、抗２３８７モノクローナル抗体、抗１６６５８モノクローナル抗体、抗５５０５４モノクローナル抗体、抗１６３１４モノクローナル抗体、抗１６１３モノクローナル抗体、抗１６７５モノクローナル抗体、抗９５６９モノクローナル抗体または抗１３４２４モノクローナル抗体は、１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を用いて組み換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリー（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリー）をスクリーニングすることによって、同定および単離され得、それによって１６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０と結合する免疫グロブリンライブラリーメンバーを単離する。ファージディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングするためのキットは、市販されている（例えば、Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ Ｐｈａｇｅ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｓｙｓｔｅｍ，カタログ番号２７−９４００−０１；およびＳｔｒａｔａｇｅｎｅ ＳｕｒｆＺＡＰＴＭ Ｐｈａｇｅ Ｄｉｓｐｌａｙ Ｋｉｔ，カタログ番号２４０６１２）。さらに、抗体ディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングする使用のために特に受け入れやすい方法および試薬の例は、例えば、Ｌａｄｎｅｒら、米国特許第５，２２３，４０９号；Ｋａｎｇら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１８６１９；Ｄｏｗｅｒら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９１／１７２７１；Ｗｉｎｔｅｒら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／２０７９１；Ｍａｒｋｌａｎｄら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１５６７９；Ｂｒｅｉｔｌｉｎｇら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９３／０１２８８；ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／０１０４７；Ｇａｒｒａｒｄら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／０９６９０；Ｌａｄｎｅｒら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９０／０２８０９；Ｆｕｃｈｓら、（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：１３７０−１３７２；Ｈａｙら、（１９９２）Ｈｕｍ．Ａｎｔｉｂｏｄ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ ３：８１−８５；Ｈｕｓｅら、（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４６：１２７５−１２８１；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓら、（１９９３）ＥＭＢＯ Ｊ １２：７２５−７３４；Ｈａｗｋｉｎｓら、（１９９２）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２６：８８９−８９６；Ｃｌａｒｋｓｏｎら、（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４−６２８；Ｇｒａｍら、（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：３５７６−３５８０；Ｇａｒｒａｄら、（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：１３７３−１３７７；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら、（１９９１）Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１９：４１３３−４１３７；Ｂａｒｂａｓら、（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８８：７９７８−７９８２；およびＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら（１９９０）Ｎａｔｕｒｅ ３４８：５５２−５５４）において見出され得る。
さらに、キメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体のような、ヒト部分および非ヒト部分の両方を含み、標準的な組み換えＤＮＡ技術を用いて作製され得る、組み換え抗９９４９抗体、抗１４２３０抗体、抗７６０抗体、抗６２５５３抗体、抗１２２１６抗体、抗１７７１９抗体、抗４１８９７抗体、抗４７１７４抗体、抗３３４０８抗体、抗１０００２抗体、抗１６２０９抗体、抗３１４抗体、抗６３６抗体、抗２７４１０抗体、抗３３２６０抗体、抗６１９抗体、抗１５９８５抗体、抗６９１１２抗体、抗２１５８抗体、抗２２４抗体、抗６１５抗体、抗４４３７３抗体、抗９５４３１抗体、抗２２２４５抗体、抗２３８７抗体、抗１６６５８抗体、抗５５０５４抗体、抗１６３１４抗体、抗１６１３抗体、抗１６７５抗体、抗９５６９抗体または抗１３４２４抗体は、本発明の方法の範囲内である。そのようなキメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体は、当該分野で公知の組み換えＤＮＡ技術、例えば、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ８６／０２２６９；Ａｋｉｒａら、欧州特許出願第１８４，１８７号；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉ，Ｍ．，欧州特許出願第１７１，４９６号；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら、欧州特許出願第１７３，４９４号；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ８６／０１５３３；Ｃａｂｉｌｌｙら、米国特許第４，８１６，５６７号；Ｃａｂｉｌｌｙら、欧州特許出願第１２５，０２３号；Ｂｅｔｔｅｒら、（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４０：１０４１−１０４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４：３４３９−３４４３；Ｌｉｕら、（１９８７）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３９：３５２１−３５２６；Ｓｕｎら、（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８４：２１４−２１８；Ｎｉｓｈｉｍｕｒａら（１９８７）Ｃａｎｃ．Ｒｅｓ．４７：９９９−１００５；Ｗｏｏｄら、（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ ３１４：４４６−４４９；Ｓｈａｗら、（１９８８）Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．８０：１５５３−１５５９；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓ．Ｌ．（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：１２０２−１２０７；Ｏｉら、（１９８６）ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ４：２１４；Ｗｉｎｔｅｒ米国特許第５，２２５，５３９号；Ｊｏｎｅｓら、（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５５２−５２５；Ｖｅｒｈｏｅｙａｎら、（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９：１５３４；およびＢｅｉｄｌｅｒら、（１９８８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４１：４０５３−４０６０に記載される方法を用いて産生され得る。
抗９９４９抗体、抗１４２３０抗体、抗７６０抗体、抗６２５５３抗体、抗１２２１６抗体、抗１７７１９抗体、抗４１８９７抗体、抗４７１７４抗体、抗３３４０８抗体、抗１０００２抗体、抗１６２０９抗体、抗３１４抗体、抗６３６抗体、抗２７４１０抗体、抗３３２６０抗体、抗６１９抗体、抗１５９８５抗体、抗６９１１２抗体、抗２１５８抗体、抗２２４抗体、抗６１５抗体、抗４４３７３抗体、抗９５４３１抗体、抗２２２４５抗体、抗２３８７抗体、抗１６６５８抗体、抗５５０５４抗体、抗１６３１４抗体、抗１６１３抗体、抗１６７５抗体、抗９５６９抗体または抗１３４２４抗体は、９９４９タンパク質、１４２３０タンパク質、７６０タンパク質、６２５５３タンパク質、１２２１６タンパク質、１７７１９タンパク質、４１８９７タンパク質、４７１７４タンパク質、３３４０８タンパク質、１０００２タンパク質、１６２０９タンパク質、３１４タンパク質、６３６タンパク質、２７４１０タンパク質、３３２６０タンパク質、６１９タンパク質、１５９８５タンパク質、６９１１２タンパク質、２１５８タンパク質、２２４タンパク質、６１５タンパク質、４４３７３タンパク質、９５４３１タンパク質、２２２４５タンパク質、２３８７タンパク質、１６６５８タンパク質、５５０５４タンパク質、１６３１４タンパク質、１６１３タンパク質、１６７５タンパク質、９５６９タンパク質または１３４２４タンパク質の存在量および発現パターンを評価するために、９９４９タンパク質、１４２３０タンパク質、７６０タンパク質、６２５５３タンパク質、１２２１６タンパク質、１７７１９タンパク質、４１８９７タンパク質、４７１７４タンパク質、３３４０８タンパク質、１０００２タンパク質、１６２０９タンパク質、３１４タンパク質、６３６タンパク質、２７４１０タンパク質、３３２６０タンパク質、６１９タンパク質、１５９８５タンパク質、６９１１２タンパク質、２１５８タンパク質、２２４タンパク質、６１５タンパク質、４４３７３タンパク質、９５４３１タンパク質、２２２４５タンパク質、２３８７タンパク質、１６６５８タンパク質、５５０５４タンパク質、１６３１４タンパク質、１６１３タンパク質、１６７５タンパク質、９５６９タンパク質または１３４２４タンパク質（例えば、細胞溶解物または細胞上清中の）を検出するために使用され得る。抗９９４９抗体、抗１４２３０抗体、抗７６０抗体、抗６２５５３抗体、抗１２２１６抗体、抗１７７１９抗体、抗４１８９７抗体、抗４７１７４抗体、抗３３４０８抗体、抗１０００２抗体、抗１６２０９抗体、抗３１４抗体、抗６３６抗体、抗２７４１０抗体、抗３３２６０抗体、抗６１９抗体、抗１５９８５抗体、抗６９１１２抗体、抗２１５８抗体、抗２２４抗体、抗６１５抗体、抗４４３７３抗体、抗９５４３１抗体、抗２２２４５抗体、抗２３８７抗体、抗１６６５８抗体、抗５５０５４抗体、抗１６３１４抗体、抗１６１３抗体、抗１６７５抗体、抗９５６９抗体または抗１３４２４抗体は、診断的に使用されて、臨床試験手順（例えば、所定の処置レジメンの効力を決定するために）の一部として、組織におけるタンパク質のレベルをモニタリングし得る。検出は、検出可能な物質に抗体を結合させる（すなわち、物理的連結）ことによって促進され得る。検出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、および放射性物質が挙げられる。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子族複合体の例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられ；そして適切な放射活性物質の例としては、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓまたは３Ｈが挙げられる。
本発明はさらに、限定と解釈されるべきではない以下の実施例によって例示される。本願、ならびに図面および配列表を通して引用される全ての参考文献、特許および公開された特許出願の内容は、本明細書中に参考として援用される。
（実施例１ ＴａｑＭａｎＴＭ分析を用いる組織の分布）
本実施例は、ＴａｑＭａｎＴＭ手順を記載する。ＴａｑＭａｎＴＭ手順は、ｍＲＮＡを検出するための、定量的な逆転写ＰＣＲベースのアプローチである。このＲＴ−ＰＣＲ反応は、ＰＣＲの間に、ＴａｑＭａｎＴＭプローブを切断するために、ＡｍｐｌｉＴａｑ ＧｏｌｄＴＭ ＤＮＡポリメラーゼの５’ヌクレアーゼ活性を活用する。簡単に言えば、ｃＤＮＡを目的のサンプル（例えば、心臓、腎臓、肝臓、骨格筋、および種々の脈管）から生成し、そしてＰＣＲ増幅のための出発物質として使用した。５’遺伝子特異的プライマーおよび３’遺伝子特異的プライマーに加えて、遺伝子特異的オリゴヌクレオチドプローブ（増幅されている領域に相補的である）を、この反応（すなわち、ＴａｑＭａｎＴＭプローブ）に含めた。ＴａｑＭａｎＴＭプローブは、プローブの５’末端に共有結合した蛍光レポーター色素（例えば、ＦＡＭ（６−カルボキシフルオレセイン）、ＴＥＴ（６−カルボキシ−４，７，２’，７’−テトラクロロフルオレセイン）、ＪＯＥ（６−カルボキシ−４，５−ジクロロ−２，７−ジメトキシフルオレセイン）、もしくはＶＩＣ）、およびこのプローブの３’末端にクエンチャー色素（ＴＡＭＲＡ（６−カルボキシ−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルローダミン）を有するオリゴヌクレオチドを含む。
ＰＣＲ反応の間、プローブの切断は、レポーター色素とクエンチャー色素とを分離し、結果としてレポーターの蛍光を増強する。ＰＣＲ産物の蓄積を、レポーター色素の蛍光増強をモニタリングすることによって直接検出する。プローブがインタクトな場合、クエンチャー色素に対してレポーター色素の近位にレポーター蛍光の抑制が生じる。ＰＣＲの間、目的の標的が存在する場合、このプローブは順方向プライマー部位と逆方向プライマー部位との間に特異的にアニーリングする。ＡｍｐｌｉＴａｑＴＭＧｏｌｄ ＤＮＡポリメラーゼの５’−３’ヌクレオチド分解性（ｎｕｃｌｅｏｌｙｔｉｃ）活性は、プローブが標的にハイブリダイズする場合のみ、レポーターとクエンチャーとの間でプローブを切断する。次いで、プローブフラグメントを、標的と置換し、そして鎖の重合を続ける。ＰＣＲの間、プローブの伸長を防ぐように、このプローブの３’末端をブロックする。このプロセスは全てのサイクルで生じ、そして産物の指数関数的な蓄積を妨害しない。ＲＮＡを、トリゾール方法を使用して調製し、そして汚染したゲノムＤＮＡを除去するためにＤＮａｓｅで処理した。標準的な技術を使用してｃＤＮＡを合成した。逆転写酵素の非存在下において、コントロール遺伝子の検出可能なＰＣＲ増幅を有さないサンプルに生じるＭｏｃｋ ｃＤＮＡ合成により、ゲノムＤＮＡ汚染の効率的な除去が確証される。
（実施例２：インサイチュ分析を用いる組織分布）
インサイチュ分析について、種々の組織（例えば、正常な結腸、乳房、肺および卵巣正常組織、ならびに結腸腫瘍、乳房腫瘍、肺腫瘍および卵巣腫瘍、結腸から肺への転移、および血管形成性組織から得られた組織）を、初めにドライアイスで凍結させた。１０マイクロメートル厚の組織切片を、ＤＥＰＣ処理した１×リン酸緩衝化生理食塩水中４％のホルムアルデヒドで、室温で１０分間後固定し、その後，ＤＥＰＣ １×リン酸緩衝化生理食塩水で２回、そして０．１Ｍトリエタノールアミン−ＨＣｌ（ｐＨ８．０）で一回リンスした。０．２５％無水酢酸−０．１Ｍトリエタノールアミン−ＨＣｌ中で１０分間インキュベートした後、切片をＤＥＰＣ ２×ＳＳＣ（１×ＳＳＣは、０．１５Ｍ ＮａＣｌ＋０．０１５Ｍクエン酸ナトリウムである）でリンスした。次いで、組織を、一連のエタノール洗浄によって脱水し、１００％クロロホルム中で５分間インキュベートし、その後１００％エタノールで１分間、および９５％エタノールで１分間リンスして、風乾させた。
３５Ｓ−放射性標識した（５×１０７ｃｐｍ／ｍｌ）ｃＲＮＡプローブを用いてハイブリダイゼーションを行った。６００ｍＭ ＮａＣｌ、１０ｍＭ Ｔｒｉｓ（ｐＨ７．５）、１ｍＭ ＥＤＴＡ、０．０１％ 剪断サケ精子ＤＮＡ、０．０１％ 酵母ｔＲＮＡ、０．０５％ 酵母総ＲＮＡＸ１型、１×デンハート溶液、５０％ ホルムアミド、１０％ デキストランスルフェート、１００ｍＭ ジチオトレイトール、０．１％ ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）および０．１％ チオ硫酸ナトリウムを含む溶液の存在下で、プローブを５５度で１８時間インキュベートした。
ハイブリダイゼーション後、スライドを２×ＳＳＣで洗浄した。次いで、切片を、ＴＮＥ（１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．６）、５００ｍＭ ＮａＣｌおよび１ｍＭＥＤＴＡを含む溶液）中で３７℃で１０分間、１ｍｌあたり１０μｇ／ｍｌのＲＮａｓｅ Ａを含むＴＮＥ中で３０分間、最後にＴＮＥ中で１０分間、連続的にインキュベートした。次いで、スライドを、室温で、２×ＳＳＣを用いてリンスし、２×ＳＳＣを用いて、５０℃で１時間洗浄し、０．２×ＳＳＣを用いて、５５度で１時間洗浄し、そして０．２×ＳＳＣを用いて６０℃で１時間洗浄した。次いで、切片を、一連のエタノール−０．３Ｍ酢酸ナトリウム濃縮物により迅速に脱水し、その後風乾させ、そしてＫｏｄａｋ Ｂｉｏｍａｘ ＭＲ科学画像化フィルムに２４時間曝露し、その後ＮＢ−２フォトエマルジョンに浸け、そして４℃で７日間露光し、その後現像し、そしてカウンター染色した。
（等価物）
当業者は、本明細書中に記載される本発明の特定の実施形態の多くの等価物を、慣用的にすぎない実験法を使用して認識するか、または確認し得る。このような等価物は、添付の特許請求の範囲に含まれるべきであることが意図される。

Claims (23)

  1. 疼痛または疼痛障害を処置し得る化合物を同定するための方法であって、該方法は、以下：
    ａ）試験されるべき化合物を、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドと、該試験化合物が該ポリペプチドに結合するのに適した条件下で合わせる工程；および
    ｂ）該ポリペプチドへの該試験化合物の結合を検出し、それにより該ポリペプチドに結合する化合物を同定する工程、
    を包含する、方法。
  2. 前記化合物が、低分子、ペプチドまたは抗体からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
  3. 前記ポリペプチドが、異種配列をさらに含む、請求項１に記載の方法。
  4. 前記ポリペプチドが、単離されたポリペプチド、単離されたポリペプチドの膜結合形態、または該ポリペプチドを含む細胞である、請求項１に記載の方法。
  5. 前記障害が、異常な侵害受容に関連する障害である、請求項１に記載の方法。
  6. 前記障害が疼痛である、請求項１に記載の方法。
  7. 請求項１に記載の方法であって、前記試験化合物の前記ポリペプチドへの結合が、以下：
    ａ）競合結合アッセイ；
    ｂ）イムノアッセイ；および
    ｃ）酵母ツーハイブリッドアッセイ、
    からなる群から選択される方法によって検出される、方法。
  8. 疼痛または疼痛障害を処置し得る化合物を同定する方法であって、該方法は、以下：
    ａ）試験されるべき化合物を、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチドを発現する宿主と、該試験化合物が該ポリペプチドに結合するのに適した条件下で合わせる工程；および
    ｂ）該ポリペプチドへの該試験化合物の結合を検出し、それにより該ポリペプチドに結合する化合物を同定する工程、
    を包含する、方法。
  9. 前記化合物が、低分子、ペプチド、抗体またはアンチセンス核酸からなる群から選択される、請求項８に記載の方法。
  10. 前記ポリペプチドが、異種配列をさらに含む、請求項８に記載の方法。
  11. 前記障害が、異常な侵害受容に関連する障害である、請求項８に記載の方法。
  12. 前記障害が、疼痛である、請求項８に記載の方法。
  13. 請求項８に記載の方法であって、前記試験化合物の前記ポリペプチドへの結合が、以下：
    ａ）競合結合アッセイ；
    ｂ）イムノアッセイ；および
    ｃ）酵母ツーハイブリッドアッセイ、
    からなる群から選択される方法によって検出される、方法。
  14. 疼痛もしくは疼痛障害を有する被験体、または疼痛もしくは疼痛障害を発症する危険性のある被験体を同定する方法であって、該方法は、以下：
    ａ）ポリペプチドを含む被験体から得られたサンプルと、１６３８６結合物質、１５４０２結合物質、２１１６５結合物質、１４２３結合物質、６３６結合物質、１２３０３結合物質、２１４２５結合物質、２７４１０結合物質、３８５５４結合物質、３８５５５結合物質、５５０６３結合物質、５７１４５結合物質、５９９１４結合物質、９４９２１結合物質、１６８５２結合物質、３３２６０結合物質、５８５７３結合物質、３０９１１結合物質、８５９１３結合物質、１４３０３結合物質、１６８１６結合物質、１７８２７結合物質、または３２６２０結合物質とを接触させる工程；および
    ｂ）該１６３８６結合物質、１５４０２結合物質、２１１６５結合物質、１４２３結合物質、６３６結合物質、１２３０３結合物質、２１４２５結合物質、２７４１０結合物質、３８５５４結合物質、３８５５５結合物質、５５０６３結合物質、５７１４５結合物質、５９９１４結合物質、９４９２１結合物質、１６８５２結合物質、３３２６０結合物質、５８５７３結合物質、３０９１１結合物質、８５９１３結合物質、１４３０３結合物質、１６８１６結合物質、１７８２７結合物質、または３２６２０結合物質に結合する、該サンプル中のポリペプチドの存在を検出し、それにより疼痛もしくは疼痛障害を有する被験体、または疼痛もしくは疼痛障害を発症する危険性のある被験体を同定する工程、
    を包含する、方法。
  15. 前記結合物質が、抗体である、請求項１４に記載の方法。
  16. 前記結合物質が、検出可能に標識されている、請求項１４に記載の方法。
  17. 異常な１６３８６ポリペプチド活性、１５４０２ポリペプチド活性、２１１６５ポリペプチド活性、１４２３ポリペプチド活性、６３６ポリペプチド活性、１２３０３ポリペプチド活性、２１４２５ポリペプチド活性、２７４１０ポリペプチド活性、３８５５４ポリペプチド活性、３８５５５ポリペプチド活性、５５０６３ポリペプチド活性、５７１４５ポリペプチド活性、５９９１４ポリペプチド活性、９４９２１ポリペプチド活性、１６８５２ポリペプチド活性、３３２６０ポリペプチド活性、５８５７３ポリペプチド活性、３０９１１ポリペプチド活性、８５９１３ポリペプチド活性、１４３０３ポリペプチド活性、１６８１６ポリペプチド活性、１７８２７もしくは３２６２０ポリペプチド活性、または異常な１６３８６核酸発現、１５４０２核酸発現、２１１６５核酸発現、１４２３核酸発現、６３６核酸発現、１２３０３核酸発現、２１４２５核酸発現、２７４１０核酸発現、３８５５４核酸発現、３８５５５核酸発現、５５０６３核酸発現、５７１４５核酸発現、５９９１４核酸発現、９４９２１核酸発現、１６８５２核酸発現、３３２６０核酸発現、５８５７３核酸発現、３０９１１核酸発現、８５９１３核酸発現、１４３０３核酸発現、１６８１６核酸発現、１７８２７もしくは３２６２０核酸発現によって特徴付けられる疼痛または疼痛障害を有する被験体を処置する方法であって、１６３８６モジュレータ、１５４０２モジュレータ、２１１６５モジュレータ、１４２３モジュレータ、６３６モジュレータ、１２３０３モジュレータ、２１４２５モジュレータ、２７４１０モジュレータ、３８５５４モジュレータ、３８５５５モジュレータ、５５０６３モジュレータ、５７１４５モジュレータ、５９９１４モジュレータ、９４９２１モジュレータ、１６８５２モジュレータ、３３２６０モジュレータ、５８５７３モジュレータ、３０９１１モジュレータ、８５９１３モジュレータ、１４３０３モジュレータ、１６８１６モジュレータ、１７８２７モジュレータ、または３２６２０モジュレータを、該被験体に投与し、それにより疼痛または疼痛障害を有する被験体を処置する工程を包含する、方法。
  18. 前記障害が、異常な侵害受容に関連する障害である、請求項１７に記載の方法。
  19. 前記障害が、疼痛である、請求項１７に記載の方法。
  20. 前記１６３８６モジュレータ、１５４０２モジュレータ、２１１６５モジュレータ、１４２３モジュレータ、６３６モジュレータ、１２３０３モジュレータ、２１４２５モジュレータ、２７４１０モジュレータ、３８５５４モジュレータ、３８５５５モジュレータ、５５０６３モジュレータ、５７１４５モジュレータ、５９９１４モジュレータ、９４９２１モジュレータ、１６８５２モジュレータ、３３２６０モジュレータ、５８５７３モジュレータ、３０９１１モジュレータ、８５９１３モジュレータ、１４３０３モジュレータ、１６８１６モジュレータ、１７８２７モジュレータ、または３２６２０モジュレータが、薬学的に受容可能な処方物の形態で投与される、請求項１７に記載の方法。
  21. 前記１６３８６モジュレータ、１５４０２モジュレータ、２１１６５モジュレータ、１４２３モジュレータ、６３６モジュレータ、１２３０３モジュレータ、２１４２５モジュレータ、２７４１０モジュレータ、３８５５４モジュレータ、３８５５５モジュレータ、５５０６３モジュレータ、５７１４５モジュレータ、５９９１４モジュレータ、９４９２１モジュレータ、１６８５２モジュレータ、３３２６０モジュレータ、５８５７３モジュレータ、３０９１１モジュレータ、８５９１３モジュレータ、１４３０３モジュレータ、１６８１６モジュレータ、１７８２７モジュレータ、または３２６２０モジュレータが、１６３８６ポリペプチド、１５４０２ポリペプチド、２１１６５ポリペプチド、１４２３ポリペプチド、６３６ポリペプチド、１２３０３ポリペプチド、２１４２５ポリペプチド、２７４１０ポリペプチド、３８５５４ポリペプチド、３８５５５ポリペプチド、５５０６３ポリペプチド、５７１４５ポリペプチド、５９９１４ポリペプチド、９４９２１ポリペプチド、１６８５２ポリペプチド、３３２６０ポリペプチド、５８５７３ポリペプチド、３０９１１ポリペプチド、８５９１３ポリペプチド、１４３０３ポリペプチド、１６８１６ポリペプチド、１７８２７ポリペプチド、または３２６２０ポリペプチド活性を調節し得る、請求項１７に記載の方法。
  22. 前記１６３８６モジュレータ、１５４０２モジュレータ、２１１６５モジュレータ、１４２３モジュレータ、６３６モジュレータ、１２３０３モジュレータ、２１４２５モジュレータ、２７４１０モジュレータ、３８５５４モジュレータ、３８５５５モジュレータ、５５０６３モジュレータ、５７１４５モジュレータ、５９９１４モジュレータ、９４９２１モジュレータ、１６８５２モジュレータ、３３２６０モジュレータ、５８５７３モジュレータ、３０９１１モジュレータ、８５９１３モジュレータ、１４３０３モジュレータ、１６８１６モジュレータ、１７８２７モジュレータ、または３２６２０モジュレータが、抗１６３８６抗体、抗１５４０２抗体、抗２１１６５抗体、抗１４２３抗体、抗６３６抗体、抗１２３０３抗体、抗２１４２５抗体、抗２７４１０抗体、抗３８５５４抗体、抗３８５５５抗体、抗５５０６３抗体、抗５７１４５抗体、抗５９９１４抗体、抗９４９２１抗体、抗１６８５２抗体、抗３３２６０抗体、抗５８５７３抗体、抗３０９１１抗体、抗８５９１３抗体、抗１４３０３抗体、抗１６８１６抗体、抗１７８２７抗体、または抗３２６２０抗体である、請求項２１に記載の方法。
  23. 前記１６３８６モジュレータ、１５４０２モジュレータ、２１１６５モジュレータ、１４２３モジュレータ、６３６モジュレータ、１２３０３モジュレータ、２１４２５モジュレータ、２７４１０モジュレータ、３８５５４モジュレータ、３８５５５モジュレータ、５５０６３モジュレータ、５７１４５モジュレータ、５９９１４モジュレータ、９４９２１モジュレータ、１６８５２モジュレータ、３３２６０モジュレータ、５８５７３モジュレータ、３０９１１モジュレータ、８５９１３モジュレータ、１４３０３モジュレータ、１６８１６モジュレータ、１７８２７モジュレータ、または３２６２０モジュレータが、１６３８６核酸発現、１５４０２核酸発現、２１１６５核酸発現、１４２３核酸発現、６３６核酸発現、１２３０３核酸発現、２１４２５核酸発現、２７４１０核酸発現、３８５５４核酸発現、３８５５５核酸発現、５５０６３核酸発現、５７１４５核酸発現、５９９１４核酸発現、９４９２１核酸発現、１６８５２核酸発現、３３２６０核酸発現、５８５７３核酸発現、３０９１１核酸発現、８５９１３核酸発現、１４３０３核酸発現、１６８１６核酸発現、１７８２７核酸発現、または３２６２０核酸発現を調節し得る、請求項１７に記載の方法。
JP2006503231A 2003-02-04 2004-01-30 １６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を使用する、疼痛および疼痛障害を処置する方法および組成物 Withdrawn JP2006519983A (ja)

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US44478103P 2003-02-04 2003-02-04
US45229103P 2003-03-05 2003-03-05
US45454003P 2003-03-13 2003-03-13
US47880503P 2003-06-16 2003-06-16
US49104803P 2003-07-30 2003-07-30
PCT/US2004/002851 WO2004071411A2 (en) 2003-02-04 2004-01-30 Methods and compositions in treating pain and painful disorders using 16386, 15402, 21165, 1423, 636, 12303, 21425, 27410, 38554, 38555, 55063, 57145, 59914, 94921, 16852, 33260, 58573, 30911, 85913, 14303, 16816, 17827 or 32620

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2006519983A true JP2006519983A (ja) 2006-08-31

Family

ID=32873066

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2006503231A Withdrawn JP2006519983A (ja) 2003-02-04 2004-01-30 １６３８６、１５４０２、２１１６５、１４２３、６３６、１２３０３、２１４２５、２７４１０、３８５５４、３８５５５、５５０６３、５７１４５、５９９１４、９４９２１、１６８５２、３３２６０、５８５７３、３０９１１、８５９１３、１４３０３、１６８１６、１７８２７、または３２６２０を使用する、疼痛および疼痛障害を処置する方法および組成物

Country Status (4)

Country Link
US (1) US7169751B2 (ja)
EP (1) EP1589985A4 (ja)
JP (1) JP2006519983A (ja)
WO (1) WO2004071411A2 (ja)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2018190365A1 (ja) * 2017-04-12 2018-10-18 国立大学法人九州大学 神経障害性疼痛マーカー及びその使用

Families Citing this family (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8399663B2 (en) 2009-04-03 2013-03-19 Astellas Pharma Inc. Salt of 1,3,5-triazine-2,4,6-triamine derivative
TWI380992B (zh) * 2010-03-11 2013-01-01 Univ Ishou 一種抑制ｎｍｄａ受體ｎｒ１之小段干擾ｒｎａ、該小段干擾ｒｎａ用以抑制皮下組織ｎｍｄａ受體ｎｒ１之方法、該小段干擾ｒｎａ之用途以及一種減緩皮膚炎症性疼痛之藥物化合物
US9950194B2 (en) 2014-09-09 2018-04-24 Mevion Medical Systems, Inc. Patient positioning system

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000014251A2 (en) * 1998-09-10 2000-03-16 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human transferase proteins
WO2002018541A2 (en) 2000-09-01 2002-03-07 Trustees Of Boston University A neural specific cystosolic sulfotransferase for drug screening
US20040058326A1 (en) * 2001-07-27 2004-03-25 Brooksbank Robert Alan Identification and use of molecules implicated in pain
US20030138803A1 (en) * 2001-07-27 2003-07-24 Brooksbank Robert Alan Identification and use of molecules implicated in pain

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2018190365A1 (ja) * 2017-04-12 2018-10-18 国立大学法人九州大学 神経障害性疼痛マーカー及びその使用
JPWO2018190365A1 (ja) * 2017-04-12 2020-05-14 国立大学法人九州大学 神経障害性疼痛マーカー及びその使用
JP7067800B2 (ja) 2017-04-12 2022-05-16 国立大学法人九州大学 神経障害性疼痛マーカー及びその使用

Also Published As

Publication number Publication date
WO2004071411A2 (en) 2004-08-26
EP1589985A4 (en) 2007-06-06
EP1589985A2 (en) 2005-11-02
US20040204359A1 (en) 2004-10-14
US7169751B2 (en) 2007-01-30
WO2004071411A3 (en) 2005-03-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7258971B2 (en) Methods and compositions for treating urological disorders using carboxypeptidase Z identified as 8263
US20060100152A1 (en) Methods and compositions in treating pain and painful disorders using 9949, 14230, 760, 62553, 12216, 17719, 41897, 47174, 33408, 10002, 16209, 314, 636, 27410, 33260, 619, 15985, 69112, 2158, 224, 615, 44373, 95431, 22245, 2387, 16658, 55054, 16314, 1613, 1675, 9569 or 13424 molecules
JP2005516605A (ja) 心血管疾患を処置するための方法および組成物
US20060088881A1 (en) Methods and compositions for treating urological disorders using 1435, 559, 34021, 44099, 25278, 641, 260, 55089, 21407, 42032, 46656, 62553, 302, 323, 12303, 985, 13237, 13601, 18926, 318, 2058 or 6351 molecules
JP2005512528A (ja) １４１９、５８７６５および２２１０を用いて心血管疾患を処置するための方法および組成物
US7169751B2 (en) Method of identifying a compound capable of treating a pain or a painful disorder
JP2005516604A (ja) １３１、１４８、１９９、１２３０３、１３９０６、１５５１３、１７８２２、３０２、５６７７、１９４、１４３９３、２８０５９、７３６６、１２２１２、１９８１、２６１、１２４１６、２７０、１４１０、１３７、１８７１、１３０５１、１８４７、１８４９、１５４０２、３４０、１０２１７、８３７、１７６１、８９９０または１３２４９分子を用いて血液障害を処置するための方法および組成物
US20070179102A1 (en) Methods and compositions for the treatment and diagnosis of pain disorders using 9805, 2047, 46566, 57749, 577, 20739, 57145, 1465, 1587, 2146, 2207, 32838, 336 or 52908
JP2005514013A (ja) １４６５、１５８７、２１４６、２２０７、３２８３８、３３６、および５２９０８を使用して疼痛および有痛性障害を処置する際の方法および組成物
US20030152970A1 (en) Methods and compositions to treat pain and painful disorders using 577, 20739 or 57145
JP2005507673A (ja) １３９、２５８、１２６１、１４８６、２３９８、２４１４、７６６０、８５８７、１０１８３、１０５５０、１２６８０、１７９２１、３２２４８、６０４８９または９３８０４を用いる心血管疾患を治療するための方法および組成物
JP2006523311A (ja) ９１４５、１７２５、３１１、８３７、５８３０５、１５６、１４１７５、５０３５２、３２６７８、５５６０、７２４０、８８６５、１２３９６、１２３９７、１３６４４、１９９３８、２０７７、１７３５、１７８６、１０２２０、１７８２２、３３９４５、４３７４８、４７１６１、８１９８２または４６７７７を使用してａｉｄｓおよびｈｉｖ関連障害を処置するための方法および組成物
US20020151480A1 (en) Methods and compositions for treating cardiovascular disease using 10218
US20030104455A1 (en) Methods and compositions for treating urological disorders using 313, 333, 5464, 18817 or 33524
US20030124596A1 (en) Methods and compositions for treating hematological disorders using 232, 2059, 10630, 12848, 13875, 14395, 14618, 17692 or 58874
US20060099656A1 (en) Methods and compositions for treating hematological disorders using 232, 2059, 10630, 12848, 13875, 14395, 14618, 17692, 58874, 252, 304, 1980, 14717, 9941, 1941, 19310, or 17832

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821

Effective date: 20060713

RD02 Notification of acceptance of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7422

Effective date: 20060713

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20060713

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20070112

A761 Written withdrawal of application

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A761

Effective date: 20070731