JP2006503310A - 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 - Google Patents
短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2006503310A JP2006503310A JP2005501416A JP2005501416A JP2006503310A JP 2006503310 A JP2006503310 A JP 2006503310A JP 2005501416 A JP2005501416 A JP 2005501416A JP 2005501416 A JP2005501416 A JP 2005501416A JP 2006503310 A JP2006503310 A JP 2006503310A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- protein
- antibody
- sample
- binding
- digital
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 644
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 627
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 463
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims abstract description 463
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 162
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 388
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 331
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 141
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 63
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 52
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 44
- 239000013074 reference sample Substances 0.000 claims description 15
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 abstract description 8
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 570
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 141
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 112
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 101
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 101
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 97
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 70
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 47
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 45
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 35
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 34
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 34
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 30
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 28
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 28
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 23
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 23
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 22
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 22
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 22
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 22
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 21
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 20
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 20
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 19
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 17
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 16
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 16
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 16
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 16
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 15
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 15
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 15
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 13
- 241000894007 species Species 0.000 description 13
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 12
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 12
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 12
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 12
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 12
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 11
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 11
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 11
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 11
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 11
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 11
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 10
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 10
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 10
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 description 9
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 9
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 9
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 9
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 8
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 8
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 8
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 8
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 8
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 8
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 8
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 7
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 7
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 7
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 7
- 238000005094 computer simulation Methods 0.000 description 7
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 7
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 7
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 7
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 7
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 7
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- -1 Sulfosuccinimide ester Chemical class 0.000 description 6
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 6
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 6
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 6
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 6
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 6
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 6
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 6
- UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L di(octadecanoyloxy)lead Chemical compound [Pb+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O UQLDLKMNUJERMK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 6
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 6
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 6
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 6
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 6
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 6
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 6
- 239000002159 nanocrystal Substances 0.000 description 6
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 6
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 6
- 230000008569 process Effects 0.000 description 6
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 6
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 6
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 5
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 5
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 5
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 5
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 5
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 5
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 5
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical compound BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 5
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 5
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 5
- 238000000370 laser capture micro-dissection Methods 0.000 description 5
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 5
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 5
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 5
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 5
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 5
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 4
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 4
- 101710144111 Non-structural protein 3 Proteins 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 4
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 4
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 4
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 4
- 239000013043 chemical agent Substances 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 4
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 4
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 4
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 4
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 4
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 4
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 4
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 4
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 4
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 4
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 description 4
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 4
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 4
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 4
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 4
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101000979001 Homo sapiens Methionine aminopeptidase 2 Proteins 0.000 description 3
- 101000969087 Homo sapiens Microtubule-associated protein 2 Proteins 0.000 description 3
- 101000969594 Homo sapiens Modulator of apoptosis 1 Proteins 0.000 description 3
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 3
- 102100023174 Methionine aminopeptidase 2 Human genes 0.000 description 3
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 description 3
- 101100131116 Oryza sativa subsp. japonica MPK3 gene Proteins 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 241000726445 Viroids Species 0.000 description 3
- 239000005083 Zinc sulfide Substances 0.000 description 3
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 238000003491 array Methods 0.000 description 3
- 238000013528 artificial neural network Methods 0.000 description 3
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- UHYPYGJEEGLRJD-UHFFFAOYSA-N cadmium(2+);selenium(2-) Chemical compound [Se-2].[Cd+2] UHYPYGJEEGLRJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 3
- 238000002967 competitive immunoassay Methods 0.000 description 3
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 3
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 3
- 239000011258 core-shell material Substances 0.000 description 3
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 3
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 3
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 3
- 102000015694 estrogen receptors Human genes 0.000 description 3
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 3
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 3
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 3
- 238000000539 two dimensional gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052984 zinc sulfide Inorganic materials 0.000 description 3
- DRDVZXDWVBGGMH-UHFFFAOYSA-N zinc;sulfide Chemical compound [S-2].[Zn+2] DRDVZXDWVBGGMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HONKEGXLWUDTCF-YFKPBYRVSA-N (2s)-2-amino-2-methyl-4-phosphonobutanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@](N)(C)CCP(O)(O)=O HONKEGXLWUDTCF-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- RMBMWXHVTXYPQN-UHFFFAOYSA-N 1-[3-[(1-hydroxy-2,5-dioxopyrrolidin-3-yl)methyl]phenyl]pyrrole-2,5-dione Chemical compound O=C1N(O)C(=O)CC1CC1=CC=CC(N2C(C=CC2=O)=O)=C1 RMBMWXHVTXYPQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 2
- 108010077805 Bacterial Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 2
- 241000589876 Campylobacter Species 0.000 description 2
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 2
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 2
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 2
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 2
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 2
- 108091060211 Expressed sequence tag Proteins 0.000 description 2
- 108010051815 Glutamyl endopeptidase Proteins 0.000 description 2
- 101000616438 Homo sapiens Microtubule-associated protein 4 Proteins 0.000 description 2
- 102000010781 Interleukin-6 Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010038501 Interleukin-6 Receptors Proteins 0.000 description 2
- 102100021794 Microtubule-associated protein 4 Human genes 0.000 description 2
- 102100021440 Modulator of apoptosis 1 Human genes 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 2
- 108700019535 Phosphoprotein Phosphatases Proteins 0.000 description 2
- 241000607768 Shigella Species 0.000 description 2
- 241000295644 Staphylococcaceae Species 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 2
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000001261 affinity purification Methods 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 230000005775 apoptotic pathway Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 2
- 239000002981 blocking agent Substances 0.000 description 2
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000008235 cell cycle pathway Effects 0.000 description 2
- 230000007910 cell fusion Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 2
- 230000001268 conjugating effect Effects 0.000 description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- JYGXADMDTFJGBT-VWUMJDOOSA-N hydrocortisone Chemical compound O=C1CC[C@]2(C)[C@H]3[C@@H](O)C[C@](C)([C@@](CC4)(O)C(=O)CO)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 JYGXADMDTFJGBT-VWUMJDOOSA-N 0.000 description 2
- 210000004201 immune sera Anatomy 0.000 description 2
- 229940042743 immune sera Drugs 0.000 description 2
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 2
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 230000029226 lipidation Effects 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 2
- 238000010258 microfractionation Methods 0.000 description 2
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 2
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 2
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N periodic acid Chemical compound OI(=O)(=O)=O KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 238000012509 protein identification method Methods 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010845 search algorithm Methods 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 2
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 2
- 238000005063 solubilization Methods 0.000 description 2
- 230000007928 solubilization Effects 0.000 description 2
- 230000009211 stress pathway Effects 0.000 description 2
- 210000001768 subcellular fraction Anatomy 0.000 description 2
- 230000004960 subcellular localization Effects 0.000 description 2
- FYSNRJHAOHDILO-UHFFFAOYSA-N thionyl chloride Chemical compound ClS(Cl)=O FYSNRJHAOHDILO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KGLPWQKSKUVKMJ-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydrophthalazine-1,4-dione Chemical compound C1=CC=C2C(=O)NNC(=O)C2=C1 KGLPWQKSKUVKMJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 7-hydroxycoumarin Natural products O1C(=O)C=CC2=CC(O)=CC=C21 CJIJXIFQYOPWTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000005020 Acaciella glauca Species 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 101710159080 Aconitate hydratase A Proteins 0.000 description 1
- 101710159078 Aconitate hydratase B Proteins 0.000 description 1
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 1
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 1
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 1
- 241000712891 Arenavirus Species 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 208000035404 Autolysis Diseases 0.000 description 1
- 102000019260 B-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010012919 B-Cell Antigen Receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000193738 Bacillus anthracis Species 0.000 description 1
- 229920002799 BoPET Polymers 0.000 description 1
- 241000588832 Bordetella pertussis Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 241000589562 Brucella Species 0.000 description 1
- 241001493160 California encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 102000000584 Calmodulin Human genes 0.000 description 1
- 108010041952 Calmodulin Proteins 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 206010057248 Cell death Diseases 0.000 description 1
- 206010008631 Cholera Diseases 0.000 description 1
- 241000193155 Clostridium botulinum Species 0.000 description 1
- 101710094648 Coat protein Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 201000003075 Crimean-Congo hemorrhagic fever Diseases 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 1
- XUIIKFGFIJCVMT-GFCCVEGCSA-N D-thyroxine Chemical compound IC1=CC(C[C@@H](N)C(O)=O)=CC(I)=C1OC1=CC(I)=C(O)C(I)=C1 XUIIKFGFIJCVMT-GFCCVEGCSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 102000052510 DNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101710096438 DNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 101100239628 Danio rerio myca gene Proteins 0.000 description 1
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000725619 Dengue virus Species 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 241000710945 Eastern equine encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 241001115402 Ebolavirus Species 0.000 description 1
- 108010013369 Enteropeptidase Proteins 0.000 description 1
- 102100029727 Enteropeptidase Human genes 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000283073 Equus caballus Species 0.000 description 1
- 244000187656 Eucalyptus cornuta Species 0.000 description 1
- 208000010201 Exanthema Diseases 0.000 description 1
- 108010074860 Factor Xa Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000724791 Filamentous phage Species 0.000 description 1
- 241000711950 Filoviridae Species 0.000 description 1
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 1
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 108010031186 Glycoside Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000005744 Glycoside Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 241000190708 Guanarito mammarenavirus Species 0.000 description 1
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 description 1
- 241000589989 Helicobacter Species 0.000 description 1
- 101710154606 Hemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 241000711549 Hepacivirus C Species 0.000 description 1
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 1
- 241000709721 Hepatovirus A Species 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 238000012450 HuMAb Mouse Methods 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 238000012351 Integrated analysis Methods 0.000 description 1
- 241000710842 Japanese encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 241000712890 Junin mammarenavirus Species 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 206010023927 Lassa fever Diseases 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090001060 Lipase Proteins 0.000 description 1
- 102000004882 Lipase Human genes 0.000 description 1
- 239000004367 Lipase Substances 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150039798 MYC gene Proteins 0.000 description 1
- 241000712898 Machupo mammarenavirus Species 0.000 description 1
- 101710125418 Major capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 241001115401 Marburgvirus Species 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010058780 Meningitis neonatal Diseases 0.000 description 1
- 108090001040 Microtubule-associated protein 1B Proteins 0.000 description 1
- 102000004866 Microtubule-associated protein 1B Human genes 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 101710141454 Nucleoprotein Proteins 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 1
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 1
- 241000713112 Orthobunyavirus Species 0.000 description 1
- 101710093908 Outer capsid protein VP4 Proteins 0.000 description 1
- 101710135467 Outer capsid protein sigma-1 Proteins 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 1
- 102000015731 Peptide Hormones Human genes 0.000 description 1
- 108010038988 Peptide Hormones Proteins 0.000 description 1
- 108010030544 Peptidyl-Lys metalloendopeptidase Proteins 0.000 description 1
- 108700020962 Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 102000045595 Phosphoprotein Phosphatases Human genes 0.000 description 1
- 102000004160 Phosphoric Monoester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000608 Phosphoric Monoester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000224016 Plasmodium Species 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 101710083689 Probable capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 229940124158 Protease/peptidase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101710176177 Protein A56 Proteins 0.000 description 1
- 229940096437 Protein S Drugs 0.000 description 1
- 108010066124 Protein S Proteins 0.000 description 1
- 102000029301 Protein S Human genes 0.000 description 1
- 102000002727 Protein Tyrosine Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 102000044126 RNA-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 101710105008 RNA-binding protein Proteins 0.000 description 1
- 241000711798 Rabies lyssavirus Species 0.000 description 1
- 241000606701 Rickettsia Species 0.000 description 1
- 241000713124 Rift Valley fever virus Species 0.000 description 1
- 229910006124 SOCl2 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241000293871 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Species 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 101100456045 Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) map3 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 1
- 108090001109 Thermolysin Proteins 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 108010034949 Thyroglobulin Proteins 0.000 description 1
- 102000009843 Thyroglobulin Human genes 0.000 description 1
- 241000710771 Tick-borne encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 206010043841 Tick-borne fever Diseases 0.000 description 1
- 241000723792 Tobacco etch virus Species 0.000 description 1
- 229940122618 Trypsin inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 101710162629 Trypsin inhibitor Proteins 0.000 description 1
- 208000037386 Typhoid Diseases 0.000 description 1
- 101150117115 V gene Proteins 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 241000710959 Venezuelan equine encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241000607626 Vibrio cholerae Species 0.000 description 1
- 241000710886 West Nile virus Species 0.000 description 1
- 241000710951 Western equine encephalitis virus Species 0.000 description 1
- 238000012452 Xenomouse strains Methods 0.000 description 1
- 101100459258 Xenopus laevis myc-a gene Proteins 0.000 description 1
- 241000710772 Yellow fever virus Species 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000012870 ammonium sulfate precipitation Methods 0.000 description 1
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000676 anti-immunogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 229940065181 bacillus anthracis Drugs 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003638 chemical reducing agent Substances 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000009137 competitive binding Effects 0.000 description 1
- 230000006957 competitive inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 1
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000003436 cytoskeletal effect Effects 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 125000001295 dansyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013523 data management Methods 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 239000003599 detergent Substances 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 1
- 230000000369 enteropathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N ethylene glycol bis(2-aminoethyl)tetraacetic acid Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCOCCOCCN(CC(O)=O)CC(O)=O DEFVIWRASFVYLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 201000005884 exanthem Diseases 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000078673 foodborn pathogen Species 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 description 1
- 239000000383 hazardous chemical Substances 0.000 description 1
- 231100000206 health hazard Toxicity 0.000 description 1
- 239000000185 hemagglutinin Substances 0.000 description 1
- 229920000140 heteropolymer Polymers 0.000 description 1
- 229960000890 hydrocortisone Drugs 0.000 description 1
- 238000003119 immunoblot Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- SZVJSHCCFOBDDC-UHFFFAOYSA-N iron(II,III) oxide Inorganic materials O=[Fe]O[Fe]O[Fe]=O SZVJSHCCFOBDDC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010045069 keyhole-limpet hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 239000004816 latex Substances 0.000 description 1
- 229920000126 latex Polymers 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 235000019421 lipase Nutrition 0.000 description 1
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 1
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 230000000986 microtubule polymerisation Effects 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000009448 modified atmosphere packaging Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 235000019837 monoammonium phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 1
- 238000003909 pattern recognition Methods 0.000 description 1
- 239000000813 peptide hormone Substances 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 229920002981 polyvinylidene fluoride Polymers 0.000 description 1
- 230000000644 propagated effect Effects 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000013777 protein digestion Effects 0.000 description 1
- 108020000494 protein-tyrosine phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 206010037844 rash Diseases 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 235000003499 redwood Nutrition 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000003938 response to stress Effects 0.000 description 1
- 238000011076 safety test Methods 0.000 description 1
- 238000005185 salting out Methods 0.000 description 1
- 230000028043 self proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical group 0.000 description 1
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 108010059339 submandibular proteinase A Proteins 0.000 description 1
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N texas red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- SRVJKTDHMYAMHA-WUXMJOGZSA-N thioacetazone Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(\C=N\NC(N)=S)C=C1 SRVJKTDHMYAMHA-WUXMJOGZSA-N 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 229960002175 thyroglobulin Drugs 0.000 description 1
- 229940034208 thyroxine Drugs 0.000 description 1
- XUIIKFGFIJCVMT-UHFFFAOYSA-N thyroxine-binding globulin Natural products IC1=CC(CC([NH3+])C([O-])=O)=CC(I)=C1OC1=CC(I)=C(O)C(I)=C1 XUIIKFGFIJCVMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 239000002753 trypsin inhibitor Substances 0.000 description 1
- 201000008297 typhoid fever Diseases 0.000 description 1
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 description 1
- ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(O)=CC=C21 ORHBXUUXSCNDEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N umbelliferone Natural products Cc1cc2C=CC(=O)Oc2cc1OCC=CC(C)(C)O HFTAFOQKODTIJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 229940118696 vibrio cholerae Drugs 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 244000000028 waterborne pathogen Species 0.000 description 1
- 229940051021 yellow-fever virus Drugs 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B30/00—Methods of screening libraries
- C40B30/04—Methods of screening libraries by measuring the ability to specifically bind a target molecule, e.g. antibody-antigen binding, receptor-ligand binding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/12—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria
- C07K16/1203—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria
- C07K16/1217—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from bacteria from Gram-negative bacteria from Neisseriaceae (F)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/40—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
本出願は、2002年10月15日出願および2003年8月18日出願の、米国仮出願第60/418,277号および第____の優先権利益を主張するものである。なお、前記両出願の内容の全体を引用することにより本出願に含める。
本発明は一般に、短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、および、タンパク分析法におけるその使用に関する。
適用されず。
プロテオミクスは、遺伝子活性のタンパクレベルにおける測定を含む。今日、プロテオミクス目的にとってもっとも一般的なツールは、2次元ゲル電気泳動と質量分析の組み合わせ(2D−MS)である。このシステムにはいくつか限界がある。先ず、検出感度と2D電気泳動の解像度が低い。第二に、質量分析の使用でコストは格段に上がる。最後に、2D電気泳動は時間がかかる。極めて良く設備の整った実験室でも毎週約200から400個の2Dゲルしか実行できない。従って、タンパク分析法の改良が求められている。
本発明は、複数組のディジタル抗体、およびディジタル抗体の使用を含む方法を提供する。
本発明は、小型のポリペプチドエピトープを認識する抗体、従来技術ではよく「交差反応抗体」と呼ばれる抗体は、組み合わせて用いると、一組の抗体と、サンプル中のタンパクとの間の結合に関して特徴的なパターンを生成し、そのタンパク結合パターン−タンパク結合プロフィールと呼ばれる−を、そのタンパクサンプルの特性解明に、または、「フィンガープリンティング」に使用することが可能であるという発見から生まれたものである。本発明は、交差反応抗体(すなわち、小型エピトープを認識する抗体であって、そのために多様なタンパクに結合することが予想される抗体)を組み合わせて用いることによって、サンプルの特性を解明し、一意に特定し(サンプル中の1種以上の成分の特定を含む)、および/または、相互に区別することを可能とするほど十分な特異性を持つタンパク結合プロフィールを生成することが可能であろうという予見から生まれたものである。従って、抗体結合から生じる結果および情報の特異性は、特異性検出のために従来技術で一般に行われるように、僅かに1種または数種のタンパクに結合するだけの単一抗体の結合によってではなく、複数組のディジタル抗体の結合を通じて、サンプル中のタンパクに付与される(それを通じて、ある特定のタンパク結合プロフィールが生成される)。一般に、タンパク結合パターンは、各ディジタル抗体と、サンプル中のタンパク(単複)の間のタンパク結合の存在(または不在)、および/または、タンパク結合の強度(量)に関する情報を含む。タンパク結合プロフィールを用いて、例えば、タンパクサンプルの起源(例えば、病原体由来のもの、ガン細胞由来のもの)を特定するのに使用が可能であり、または、従来未知の因子、例えば、新規病原体を特定または検出するのに使用が可能である。
本発明の実施は、別様に指示しない限り、従来技術の範囲に含まれる、分子生物学(組み換え技術を含む)、微生物学、細胞生物学、生化学および免疫学の通例技術を用いる。このような技術は、文献に、例えば、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、second edition(Sambrook et al.,1989)、Cold Spring Harbor Press; Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait,ed.,1984);Methods in Molecular Biology,Humana Press;Cell Biology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis,ed.,1998)Academic Press;Animal Cell Culture(R.I.Freshney,ed.,1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather and P.E.Roberts,1998)Plenum Press;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle,J.B.Griffiths,and D.G.Newell,eds.,1993−8)J.Wiley and Sons;Methods in Enzymology(Academic Press,Inc.);Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir and C.C.Blackwell,eds.);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.Miller and M.P.Calos,eds.,1987);Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel et al.,eds.,1987);PCR:The Polymerase Chain Reaction(Mullis et al.,eds.,1994);Current Protocols in Immunology(J.E.Coligan et al.,eds.,1991);Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999);Immunobiology(C.A.Janeway and P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:a practical approach(D.Catty.,ed.,IRL Press,1988−1989);Monoclonal antibodies:a practical approach(P.Shepherd and C.Dean,eds.,Oxford University Press,2000);Using antibodies:a laboratory manual(E.Harlow and D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999);および、The Antibodies(M.Zanetti and J.D.Capra,eds.,Harwood Academic Publishers,1995)に十分に説明されている。
「抗体」とは免疫グロブリン分子であって、標的、例えば、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、ポリペプチド等に、その免疫グロブリン分子の可変領域に位置する、少なくとも1個の抗原認識部位を通じて特異的に結合することが可能な免疫グロブリン分子である。本明細書で使用する場合、この用語は、元のままのポリクロナール抗体またはモノクロナール抗体のみならず、その断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv)、一本鎖(ScFv)、それらの変異体、抗体部分を含む融合タンパク、および、必要な特異性を持つ抗原認識部位を含む、その他の全ての免疫グロブリン分子の修飾形を含む。抗体は、全てのクラスの抗体、例えば、IgG、IgAまたはIgM(またはそのサブクラス)を含み、かつ、抗体はある特定のクラスのものである必要はない。免疫グロブリンは、その重鎖の定常ドメインの抗体アミノ酸配列に応じて、異なるクラスに振り分けることが可能である。免疫グロブリンには5個の主要クラス、IgA、IgD、IgE,IgGおよびIgMがあり、この内のいくつかはさらにサブクラス(イソタイプ)、例えば、IgG1,IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2に分割することが可能である。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する、重鎖定常ドメインは、それぞれ、アルファ、デルタ、イプシロン、ガンマおよびミューと呼ばれる。各種クラスの免疫グロブリンのサブユニット構造および3次元形態はよく知られている。
本発明は、複数組のディジタル抗体であって、一組は少なくとも約15種のディジタル抗体を含み、各ディジタル抗体は異なる小型直線状ペプチドエピトープを認識することを特徴とする、複数組のディジタル抗体を提供する。本明細書で用いる「ディジタル抗体」とは、連続する3個のアミノ酸、連続する4個のアミノ酸、または、連続する5個のアミノ酸から成る、小型の直線的ポリペプチドエピトープに結合する(一般的に、特異的に結合する)抗体である。本発明は、小型で、高頻度に出現するポリペプチドエピトープを認識する抗体(従来技術ではよく「交差反応抗体」と呼ばれる)は、組み合わせて用いると、タンパク結合プロフィール(抗体に対する結合のパターン、および/または、抗体に対する結合の強度)を生成するのに有用であるという予見から生まれたものである。エピトープの特異性により、ディジタル抗体は一般に、抗体が結合する小型エピトープを含む複数のタンパクを認識する。従って、結合パターンの特異性は、特異性検出のために従来技術で一般に行われるように、僅かに1種または数種のタンパクに結合するだけの単一抗体の結合によってではなく、複数組のディジタル抗体がサンプル中のタンパクに結合することを通じて形成される。抗体によって結合される小型エピトープが既知である限り、ディジタル抗体による結合は、そのディジタル抗体によって結合される(単複)のアミノ酸内容に関する情報を提供する。ディジタル抗体、およびディジタル抗体作成法は、本明細書にさらに詳述され、実施例で例示される。
(タンパク結合プロフィールを生成する方法)
別の局面では、本発明はさらに、複数組のディジタル抗体を用いる方法を提供する。本発明は、小型のポリペプチドエピトープを認識する抗体、従来技術ではよく「交差反応抗体」と呼ばれる抗体は、組み合わせて用いると、一組の抗体と、サンプル中のタンパクとの間の結合に関して特徴的なパターンを生成し、そのタンパク結合パターン−タンパク結合プロフィールと呼ばれる−を、そのタンパクサンプルの特性解明に、または、「フィンガープリンティング」に使用することが可能であるという発見から生まれたものである。従って、抗体結合から生じる結果および情報の特異性は、特異性検出のために従来技術で一般に行われるように、僅かに1種または数種のタンパクに結合するだけの単一抗体の結合によってではなく、複数組のディジタル抗体の結合を通じて、サンプル中のタンパクに付与される(それを通じて、ある特定のタンパク結合プロフィールが生成される)。
タンパク結合ライブラリーは、異なる2種以上のサンプル、例えば、病原性細菌または非病原性細菌サンプルに対するタンパク結合プロフィールを編集することによって生成することが可能である。タンパク結合プロフィールは、それらタンパク結合プロフィール間の類似性および/または相違を識別するために、定性的に、または定量的に相互に比較することが可能である。ライブラリー中のこれらのタンパク結合プロフィールは、様々の供給源由来(例えば、様々の組織または細胞タイプ、病状、または、様々の微生物)のサンプルのタンパク結合プロフィールの比較評価を含む方法にも使用が可能である。例えば、本明細書にさらに詳述するように、タンパク結合プロフィールのライブラリーは、タンパクサンプルの特性解明法、細菌またはウィルス感染の診断法、および/または、細菌または感染因子の検出および/または分類学的区分のための方法において有用である。例えば、未特定サンプルから調製されたタンパク結合プロフィールは、既知の細菌病原体のタンパク結合プロフィールのライブラリーと比較することによって、そのサンプルの特性を解明する、および/または、特定するのに使用してもよい。
別の局面では、本発明は、本発明の方法に従って生成されたタンパク結合プロフィール(タンパク結合プロフィールのライブラリーを含む)を用いる方法を提供する。従って、本発明は、本明細書にさらに詳述するように、試験サンプル(例えば、対象サンプルを含むことが疑われているサンプル)の特性を解明する方法、試験サンプルの有無を検出する、および/または、特定する方法、細胞、細菌および/またはウィルスの特性を解明する方法、試験タンパクを特定する方法、タンパク複合体の特性解明、有無の検出、および/または、特定のための方法、および、スクリーニング法を提供する。
本発明はまた、タンパクを特定する方法であって、(a)そのタンパクを含むサンプルから生成されたタンパク結合プロフィール、および、(b)サンプルタンパクに結合するディジタル抗体によって認識されるエピトープのアミノ酸配列を用い、これによって一組約5種以上の(例えば、約6、約7、約8種またはそれ以上)のディジタル抗体(一般に、約15−18個のアミノ酸配列情報を提供する)の結合によって、そのタンパクのアミノ酸内容に関して、そのタンパクが特定されるほど十分な情報が得られるようになるタンパク特定法を提供する。例を挙げて示すならば、エピトープQAP、TPG、LTG、VSRおよびWDQを認識するディジタル抗体の、試験タンパクにたいする同時的結合は、そのタンパクがHCV NS3タンパクであると特定する。なぜなら、HCV NS3が、これら6種の3マーアミノ酸配列を含むことが知られる唯一のタンパクだからである。
本発明は、対象サンプル、例えば、細胞を含む、または、細胞から得られたサンプルの検出(診断を含む)、有無の決定、および/または、特定のための方法であって、その細胞は、例えば、前核細胞(例えば細菌、例えば病原性細菌)、真核細胞、哺乳類細胞(例えば、ガン細胞または前ガン細胞)であり、または、その他の感染、汚染、疾患および/または異常(ガンのタイプおよび/または段階の検出、または、前ガン細胞の特定を含む)の検出および/または、有無の診断のための方法を提供する。ある実施態様では、細胞は哺乳類(例えばヒト)のものである。別の実施態様では、細胞は非ヒト哺乳類(例えば、ウシ、ウマまたはイヌ)のものである。ある実施態様では、細胞は、ヒト、げっ歯類または霊長類のものである。
タンパク結合プロフィールはサンプルの特性解明に使用することが可能であるが、この特性解明は、一般に、様々の供給源(例えば、様々の組織または細胞タイプ、病状、様々な処置を受けた細胞、または、様々の微生物)から得られたサンプルのタンパク結合プロフィールの比較による評価を含む。ある実施態様では、本法は、試験サンプルから生成されたタンパク結合プロフィールと、参照タンパク結合プロフィール(例えば、コントロールサンプルから生成されたタンパク結合プロフィール(単複)、または平均値)との、または、本明細書に記述する方法の内から任意に選ばれる方法によって生成されたプロフィールのライブラリーとの比較を含む。
大抵の細胞機能にとっては特異的タンパク−タンパク相互作用が重要である。このタンパク−タンパク相互作用は、細胞外刺激によって変わることがよくある。細胞内のタンパク−タンパク相互作用を測定することは、相互作用の生理的重要性を裏付けるためにも、また、生理的な刺激(薬剤、またはその他の化学物質の使用による刺激を含む)に反応して細胞または微生物の中に起こる変化を特定するのにも役立つ。従って、ある局面で、本発明は、タンパク複合体の特性解明法を提供する。一般に、タンパク複合体の特性解明法は、タンパク複合体のタンパク結合プロフィールの生成法を含む。一般的概論として、タンパク複合体(例えば、受容体関連タンパク複合体、またはシグナル変換関連性タンパク複合体)は、従来技術で既知の方法を用いて調製され、変性されるか、または元の状態のままで精製され、タンパク結合プロフィールが、本明細書に記述される方法の内から任意に選ばれる方法によって生成される。
別の局面で、本発明は、本明細書に記述される複数組のディジタル抗体の内から任意に選ばれる一組を含む組成物を提供する。ある実施態様では、この組成物は、本明細書に記述される方法の内から任意に選ばれる方法(例えば、タンパク結合プロフィールを生成する方法)において使用される。ある実施態様では、この組成物は、複数のタンパク結合プロフィールを生成する方法(タンパク結合プロフィールのライブラリーを生成する方法を含む)において使用される。別の実施態様では、本発明は、本明細書にさらに詳述するように、試験サンプル(例えば、対象サンプルを含むことが疑われているサンプル)の特性を解明する方法、試験サンプルの有無を検出する、および/または、特定する方法、細胞、細菌および/またはウィルスの特性を解明する方法、試験タンパクを特定する方法、タンパク複合体の特性解明、有無の検出、および/または、特定のための方法、および、スクリーニング法において使用される。
本発明はまた、本明細書に記述される複数組のディジタル抗体の内から任意に選ばれる一組を含むキットを提供する。従って、ある実施態様では、本発明は、少なくとも約15種のディジタル抗体を含むキットであって、各ディジタル抗体は異なるエピトープに結合し、かつ、各ディジタル抗体は、連続する3個のアミノ酸、連続する4個のアミノ酸、または連続する5個のアミノ酸から成るエピトープに結合することを特徴とするキットを提供する。ある実施態様では、このキットは、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000個、またはそれを越える数の内から任意に選ばれる種類の抗体を少なくとも含む。別の実施態様では、このキットは、少なくとも約100種のディジタル抗体を含む。別の実施態様では、このキットは、連続する3個のアミノ酸(3マーエピトープとも呼ばれる)から成るエピトープを認識する、少なくとも約100種のディジタル抗体を含む。ある実施態様では、このキットは、連続する3個のアミノ酸から成るエピトープを認識する、少なくとも約100個のディジタル抗体、および、連続する4個のアミノ酸から成るエピトープ(4マーエピトープとも呼ばれる)を認識する、少なくとも約100個のディジタル抗体を含む。ある実施態様では、このキットは、連続する3個のアミノ酸から成るエピトープを認識する、少なくとも約100個のディジタル抗体、連続する4個のアミノ酸から成るエピトープを認識する、少なくとも約100個のディジタル抗体、および、連続する5個のアミノ酸から成るエピトープを認識する、少なくとも約100個のディジタル抗体を含む。別の実施態様では、このキットは、連続する4個のアミノ酸から成るエピトープを認識する、少なくとも約1000個のディジタル抗体を含む。抗体は、アレイのような固相または半固相の表面に、固定および/または結合(付着)されてもよい。ある実施態様では、キットはさらにラベル(例えば、タンパクを標識するのに使用されるラベル)を含む。さらに別の実施態様では、抗体は標識される。さらに別の実施態様では、キットは競合ポリペプチド(単複)を含む。一般に、競合ポリペプチド(単複)は、ディジタル抗体セットによって認識される1種以上の認識エピトープのアミノ酸配列を含む。ある実施態様では、競合ポリペプチドは標識される。ある実施態様では、競合ポリペプチドはMAPである。
(サンプル)
本明細書で使用する「サンプル」は、各種サンプルタイプおよび/または起源、例えば、血液および、生物起源の他の液体サンプル、固体組織サンプル、例えば、バイオプシー標本または組織培養、またはそれから得られた細胞、およびその子孫を含む。本定義はまた、その取得後何らかのやり方で操作されたサンプル、例えば、試薬による処理、可溶化、または、ある成分、例えばあるサブグループのタンパクの濃縮のように操作されたサンプルも含む。この「サンプル」という用語は臨床サンプルを含み、また培養細胞、細胞上清、細胞分解物、血清、血漿、生物学的流体、および、例えば、サンプルを、それから細菌またはウィルスサンプルを増加する、濃縮する、および/または、実質的に精製するために(または、ある実施態様では、細菌および/またはウィルスを含むサンプルの量を増やすために)培養する場合に見られるように、上記の任意のものから得られる純粋な、または濃縮された細菌またはウィルスサンプルを含む。サンプルは、微生物、例えば、細菌、酵母、ウィルス、ウィロイド、カビ、真菌、植物、ヒトのような哺乳類を含む動物由来のものであってよい。サンプルは、単一細胞を、または単一細胞を越えるものを含んでいてもよい。
抗体を、サンプル中のタンパクと接触させるための方法および条件は、従来技術でよく知られる。抗体は、サンプルに対して、一時に一つずつ、または、ディジタル抗体セットの内の数グループについて接触させてよい。ある実施態様では、接触は、連続的(継時的または反復的)であり、例えば、ある単一の、または一群の抗体がサンプルと接触させられ、分離され、第二の抗体、または二群の抗体がサンプルと接触させられ、分離され、これを繰り返す。別の実施態様では、接触は平行的であり、例えば、一群の抗体がサンプルと接触させられ、分離される。様々な群の抗体が連続的にサンプルに接触させられる場合のように、接触は、平行的と連続的の両方の形を取ってもよい。抗体のグループは、その組成が重複していてもよい(例えば、グループ1=抗体A,B,C,D;グループ2=抗体B,C,D,E、等)し、組成が異なっていてもよい。
ある実施態様では、本発明の方法はさらに、サンプルをタンパク切断剤で処理し、ポリペプチド断片を生成する工程を含む。抗体−タンパク複合体からタンパクを分離する工程を含む実施態様では、サンプルをディジタル抗体に接触させる工程の前に、そのサンプルをタンパク切断剤によって処理することが可能である。
前記ディジタル抗体のセットに結合する、サンプル中のタンパクは、従来技術で既知の任意の手段によって検出することが可能である。ある実施態様では、タンパクは、従来技術で既知の任意の方法によって標識される。「標識」という用語は、分光光学的な、光化学的な、生化学的な、免疫化学的な、または化学的な手段によって検出可能な組成物を指す。例えば、標的タンパクを、1種以上の標的機能基で標識し、タンパク−抗体複合体を検出すること、および、比較サンプル中にそのような複合体の欠如することを比較によって明らかにすることの両方を実現可能としてもよい。標識機能基は、光化学的、分光光度的、生化学的、免疫化学的、化学的、光学的、電気的、バイオ電子的等の手段によって検出が可能な組成物を含む。例えば、有用なタンパク標識としては、32P、35S、蛍光染色料、高電子密度試薬、酵素(例えば、ELISAで一般的に使用されるもの)、ビオチン、ジオキシゲニン、または、それにたいして抗血清またはモノクロナール抗体が利用可能であるハプテンおよびタンパクが挙げられる。多種多様な標識および接合技術が知られており、科学的文献と特許文献の両方に広範に報告されており、かつ、タンパクの標識のために本発明に一般に応用が可能である。適当な標識としては、放射性核種、酵素、基質、補因子、阻害剤、蛍光性機能基、化学発光性機能基、磁気粒子等が挙げられる。標識剤は随意に、例えば、モノクロナール抗体、ポリクロナール抗体、タンパク、または、アフィニティー基質のようなその他のポリマー、炭水化物、または、脂質を含む。標識タンパクの検出は、いくつかの方法−イムノブロッティング、放射性または生物発光マーカーの追跡を含む方法、または、サイズ、電荷またはアフィニティーに基づいて分子を追跡するその他の方法の内から任意に選ばれる方法によって行われてよい。使用される特定のラベルまたは検出可能な機能基、および特定のアッセイ法は、本発明を左右するほどの重要な局面ではない。検出可能な機能基は、検出可能な物理的または化学的性質を持つ物質であればどのようなものであってもよい。そのような検出可能なラベルは、ゲル、カラム、および固相基質の分野で十分に発達しており、一般に、このような方法で有用なラベルは、本発明にも適用が可能である。従って、ラベルは、分光光度的、光化学的、生化学的、免疫化学的、電気的、光学的、または、化学的手段によって検出可能な組成物であればどのような組成物であってもよい。本発明において有用なラベルとしては、蛍光染料(例えば、フルオレセインイソチオシアネート、テキサスレッド、ローダミン等)、放射性ラベル(例えば、3H、125I、35S、14C、または、32P)、酵素(例えば、LacZ、CAT、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、および、その他、マーカー遺伝子産物、またはELISAにおいて、一般に検出可能な酵素として使用されるものが挙げられる。
ラベルは、従来技術でよく知られる方法に従ってタンパクに直接または間接に結合される。タンパクに対してラベルを付着および/または結合する(共有的または非共有的に、直接的に、または間接的に、例えば、リンカーを介して)方法は従来技術でよく知られている。前述のように、多種多様のラベルの使用が可能であるが、ラベルの選択は、必要な感度、化合物の接合の容易さ、安定性要求、利用可能な装置配備、および、処分用設備に依存する。非放射性ラベルは間接的手段によって付着されることが多い。ある実施態様では、リガンド分子(例えば、ビオチン)がポリマーに共有的に結合される。次に、このリガンドは、内在的に検出可能な抗リガンド分子か、または、シグナルシステム、例えば、検出可能な酵素、蛍光化合物、または、化学発光化合物に共有的に結合される抗リガンド分子(例えば、ストレプトアビジン)に結合される。いくつかのリガンドおよび抗リガンドの使用が可能である。リガンドが、天然の抗リガンド、例えば、ビオチン、チロキシンおよびコーティゾルを有する場合、そのリガンドは、標識された抗リガンド組み合わせて使用することが可能である。別に、任意のハプテンまたは抗原性化合物を抗体と組み合わせて用いることも可能である。
下記の材料が、American Type Culture Collection,10801 University Boulevard,マナサス、バージニア州、米国(ATCC)に預託された。
多抗原性ペプチド(MAP)の形式を持つ5種の免疫化ペプチドが、表4に示すように設計された。これらの配列は組み合わせて、異なるMAPにおいて異なる位置に同じ配列が含められることを利用して、誘導抗体同士の交差反応性を評価するのにも用いられた。各免疫化ペプチドを用い、標準法により4匹のBalb/Cマウスを免疫化した。
ペプチドMAP1:HSLFHPEDTGQV、PSA由来、アミノ酸#79−89。KKTTNV:髄膜炎菌のOpaタンパク由来、公表された3マー抗体エピトープKTTを含む(Malorny,Morelli et al.1998)。
Claims (28)
- ディジタル抗体のセットであって、前記セットは少なくとも約15種のディジタル抗体を含み、各ディジタル抗体は異なるエピトープに結合し、各ディジタル抗体は、連続する3個のアミノ酸、または連続する4個のアミノ酸から成るエピトープに結合することを特徴とする、ディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する3個のアミノ酸から成るエピトープに結合する100種のディジタル抗体を含むことを特徴とする、請求項1に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する4個のアミノ酸から成るエピトープに結合する100種のディジタル抗体をさらに含むことを特徴とする、請求項2に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する5個のアミノ酸から成るエピトープに結合する100種のディジタル抗体をさらに含むことを特徴とする、請求項3に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、少なくとも約100、200、300、400、500、600、700、800、900、または1000種のディジタル抗体を含むことを特徴とする、請求項1に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する4個のアミノ酸から成るエピトープに結合する少なくとも1000種のディジタル抗体を含むことを特徴とする、請求項1に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する5個のアミノ酸から成るエピトープに結合する少なくとも100種のディジタル抗体をさらに含むことを特徴とする、請求項6に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記セットは、連続する3個のアミノ酸から成るエピトープに結合する少なくとも100種のディジタル抗体をさらに含むことを特徴とする、請求項7に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記ディジタル抗体は表面上に固定されることを特徴とする、請求項1に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記ディジタル抗体は表面上に固定されることを特徴とする、請求項4に記載のディジタル抗体のセット。
- 前記表面はアレイであることを特徴とする、請求項9または10に記載のディジタル抗体のセット。
- タンパク結合プロフィールを生成する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、および、
(c)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、
を含む方法。 - 前記方法は、ディジタル抗体のセットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させる工程(a)の前に、サンプルをタンパク切断剤で処理する工程をさらに含むことを特徴とする、請求項12に記載の方法。
- タンパク結合プロフィールのライブラリーを生成する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(c)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(e)少なくとも二つのサンプルについて工程(a)から(c)までを繰り返すこと、
を含む方法。 - 前記方法は、ディジタル抗体のセットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させる工程(a)の前に、サンプルをタンパク切断剤で処理する工程をさらに含むことを特徴とする、請求項14に記載の方法。
- タンパク結合プロフィールのライブラリーであって、請求項14に記載の方法を用いて調製されることを特徴とするライブラリー。
- 試験サンプルの特性を解明する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体の複数セットに、結合を可能とする条件下で試験サンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(c)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(d)試験サンプルのタンパク結合プロフィールを参照サンプルのタンパク結合プロフィールと比較し、試験サンプルの特性を該比較によって明らかにすること、
を含む方法。 - 前記比較工程(d)がタンパク結合プロフィールのライブラリーとの比較であり、該タンパク結合プロフィールのライブラリーが、
(i)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させること、
(ii)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(iii)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(iv)少なくとも二つのサンプルについて工程(i)から(iii)までを繰り返すこと、
を含む方法によって生成されることを特徴とする、請求項17に記載の方法。 - サンプルにおける細菌、ウィルスまたは細胞の有無を決定する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下で試験サンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(c)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(d)試験サンプルのタンパク結合プロフィールを参照サンプルのタンパク結合プロフィールと比較し、試験サンプルにおける細菌、ウィルスまたは細胞の有無を該比較によって確定すること、
を含む方法。 - 前記比較工程(d)がタンパク結合プロフィールのライブラリーとの比較であり、該タンパク結合プロフィールのライブラリーが、
(i)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させること、
(ii)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(iii)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(iv)少なくとも二つのサンプルについて工程(i)から(iii)までを繰り返すこと、
を含む方法によって生成されることを特徴とする、請求項19に記載の方法。 - 細菌、ウィルスまたは細胞を特定する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下で試験サンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(c)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(d)試験サンプルのタンパク結合プロフィールを参照サンプルのタンパク結合プロフィールと比較し、試験サンプルにおける細菌、ウィルスまたは細胞を該比較によって確定すること、
を含む方法。 - 前記比較工程(d)がタンパク結合プロフィールのライブラリーとの比較であり、該タンパク結合プロフィールのライブラリーが、
(i)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させること、
(ii)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(iii)抗体に対するタンパクの結合を検出し、それによってタンパク結合プロフィールを生成すること、および、
(iv)少なくとも二つのサンプルについて工程(i)から(iii)までを繰り返すこと、
を含む方法によって生成されることを特徴とする、請求項21に記載の方法。 - 試験タンパクを特定する方法であって、
(a)請求項1に記載のディジタル抗体セットに、結合を可能とする条件下で試験タンパクを含むサンプルを接触させること、
(b)必要に応じて未結合タンパクを除去すること、
(c)該抗体セットに対するタンパクの結合の有無を検出し、その際少なくとも約6種のディジタル抗体がタンパクに結合し、結合の存在は該タンパクにおいて少なくとも約6種のエピトープが存在することを示し、該少なくとも約6種のエピトープの同一性を用いて該タンパクを特定すること、
を含む方法。 - 少なくとも約7、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約20、または約25種のディジタル抗体がタンパクに結合することを特徴とする、請求項23に記載の方法。
- 前記サンプルは、細胞タンパク、または、細胞タンパクの分画を含むことを特徴とする、請求項12、14、17、19、21、または23のいずれか1項に記載の方法。
- 前記サンプルは細胞またはウィルスのサンプルであることを特徴とする、請求項12、14、17、19、21、または23のいずれか1項に記載の方法。
- 前記方法は、ディジタル抗体のセットに、結合を可能とする条件下でサンプルを接触させる工程(a)の前に、サンプルをタンパク切断剤で処理する工程をさらに含むことを特徴とする、請求項17、19、21、または23のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1に記載のディジタル抗体のセットを含むキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US41827702P | 2002-10-15 | 2002-10-15 | |
US49612403P | 2003-08-18 | 2003-08-18 | |
PCT/US2003/032574 WO2004035742A2 (en) | 2002-10-15 | 2003-10-15 | Sets of digital antibodies directed against short epitopes, and methods using same |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009272931A Division JP2010054514A (ja) | 2002-10-15 | 2009-11-30 | 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2006503310A true JP2006503310A (ja) | 2006-01-26 |
JP2006503310A5 JP2006503310A5 (ja) | 2006-04-13 |
JP4584828B2 JP4584828B2 (ja) | 2010-11-24 |
Family
ID=32110146
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2005501416A Expired - Fee Related JP4584828B2 (ja) | 2002-10-15 | 2003-10-15 | 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 |
JP2009272931A Pending JP2010054514A (ja) | 2002-10-15 | 2009-11-30 | 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009272931A Pending JP2010054514A (ja) | 2002-10-15 | 2009-11-30 | 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US7252954B2 (ja) |
EP (1) | EP1552300B1 (ja) |
JP (2) | JP4584828B2 (ja) |
CN (1) | CN1726394B (ja) |
AT (1) | ATE517340T1 (ja) |
AU (1) | AU2003282832B2 (ja) |
CA (1) | CA2502246A1 (ja) |
HK (1) | HK1074670A1 (ja) |
WO (1) | WO2004035742A2 (ja) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2007502837A (ja) * | 2003-08-18 | 2007-02-15 | テシス バイオサイエンス, インコーポレイテッド | 小型エピトープ抗体を使用するサンプルの複雑さを低減するための方法 |
JP2009531679A (ja) * | 2006-03-31 | 2009-09-03 | エヌエムイー ナトゥルヴィッセンシャフトリヘス ウント メディツィニシェス インスティトゥト アン ダー ウニヴェルジテート テュービンゲン | 複合タンパク質混合物中の被分析タンパク質および/または被分析ペプチドを検出および/または増幅するための方法 |
JP2020514746A (ja) * | 2016-12-01 | 2020-05-21 | ノーティラス バイオテクノロジー インコーポレイテッド | タンパク質をアッセイする方法 |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7252954B2 (en) * | 2002-10-15 | 2007-08-07 | Abmetrix, Inc. | Sets of digital antibodies directed against short epitopes, and methods using same |
US20070274196A1 (en) * | 2003-03-17 | 2007-11-29 | Vidco, Inc. | Secure optical information disc having a recess for accommodating a security tag |
JP2007502983A (ja) * | 2003-08-15 | 2007-02-15 | ユニバーシティ オブ ピッツバーグ オブ ザ コモンウェルス システム オブ ハイヤー エデュケイション | がん検出のための多因子アッセイ |
US20070218503A1 (en) * | 2006-02-13 | 2007-09-20 | Mitra Robi D | Methods of polypeptide identification, and compositions therefor |
WO2008076139A1 (en) * | 2006-03-10 | 2008-06-26 | Tethys Bioscience, Inc. | Multiplex protein fractionation |
CA2686039A1 (en) * | 2007-05-03 | 2008-11-13 | Tethys Bioscience, Inc. | Binding reagents that contain small epitope binding molecules |
US7682789B2 (en) * | 2007-05-04 | 2010-03-23 | Ventana Medical Systems, Inc. | Method for quantifying biomolecules conjugated to a nanoparticle |
WO2009108170A2 (en) * | 2007-11-16 | 2009-09-03 | Invitrogen Corporation | Compositions and methods for determining immune status |
AU2015204268B2 (en) * | 2009-03-09 | 2017-03-02 | Bioatla, Llc | Mirac Proteins |
DE102011109063B3 (de) | 2011-07-28 | 2012-12-20 | NMI Naturwissenschaftliches und Medizinisches Institut an der Universität Tübingen | Verfahren zum Nachweis von Biomolekülen |
CN105968197B (zh) * | 2016-05-13 | 2019-08-16 | 湖北工业大学 | 一种抗3型解脲支原体mb蛋白抗体及应用该抗体的免疫层析试剂盒 |
CN111566261A (zh) | 2017-08-18 | 2020-08-21 | 诺迪勒思生物科技公司 | 选择结合试剂的方法 |
US11721412B2 (en) | 2017-10-23 | 2023-08-08 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Methods for identifying a protein in a sample of unknown proteins |
MX2020006803A (es) | 2017-12-29 | 2020-10-28 | Nautilus Biotechnology Inc | Estrategias de descodificacion para identificacion de proteinas. |
WO2019195633A1 (en) | 2018-04-04 | 2019-10-10 | Ignite Biosciences, Inc. | Methods of generating nanoarrays and microarrays |
MX2021005757A (es) | 2018-11-15 | 2021-08-11 | Quantum Si Inc | Metodos y composiciones para la secuenciacion de proteinas. |
WO2020106889A1 (en) | 2018-11-20 | 2020-05-28 | Nautilus Biotechnology, Inc. | Design and selection of affinity reagents |
AU2021378290A1 (en) | 2020-11-11 | 2023-06-29 | Nautilus Subsidiary, Inc. | Affinity reagents having enhanced binding and detection characteristics |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002502038A (ja) * | 1998-01-29 | 2002-01-22 | ミラー,サミュエル | プロテオーム分析のための高密度アレイ及びその方法及び組成物 |
WO2002006834A2 (en) * | 2000-07-19 | 2002-01-24 | Pointilliste, Inc. | Nested sorting and high throughput screening |
JP2002502977A (ja) * | 1998-02-04 | 2002-01-29 | インビトロジェン コーポレイション | マイクロアレイとその使用 |
WO2002012893A2 (en) * | 2000-08-03 | 2002-02-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Microarrays of functional biomolecules, and uses therefor |
Family Cites Families (15)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US38319A (en) * | 1863-04-28 | Improvement in stoves | ||
CN85107855A (zh) * | 1984-08-28 | 1987-05-06 | 海布里蒂克公司 | 用于诊断检验的制品 |
US4774339A (en) | 1987-08-10 | 1988-09-27 | Molecular Probes, Inc. | Chemically reactive dipyrrometheneboron difluoride dyes |
US5217869A (en) * | 1987-10-13 | 1993-06-08 | Terrapin Technologies, Inc. | Method to produce immunodiagnostic reagents |
US5538897A (en) | 1994-03-14 | 1996-07-23 | University Of Washington | Use of mass spectrometry fragmentation patterns of peptides to identify amino acid sequences in databases |
NZ516848A (en) | 1997-06-20 | 2004-03-26 | Ciphergen Biosystems Inc | Retentate chromatography apparatus with applications in biology and medicine |
US6410245B1 (en) * | 1998-04-01 | 2002-06-25 | Affymax, Inc. | Compositions and methods for detecting ligand-dependent nuclear receptor and coactivator interactions |
US6406921B1 (en) | 1998-07-14 | 2002-06-18 | Zyomyx, Incorporated | Protein arrays for high-throughput screening |
CA2373146A1 (en) | 1999-05-07 | 2000-11-16 | Quantum Dot Corporation | A method of detecting an analyte using semiconductor nanocrystals |
US20020015952A1 (en) * | 1999-07-30 | 2002-02-07 | Anderson Norman G. | Microarrays and their manufacture by slicing |
CN1301867A (zh) * | 1999-12-27 | 2001-07-04 | 国家人类基因组南方研究中心 | 人的肽链硫氧化的甲硫氨酸还原酶及其编码序列 |
AU8356201A (en) * | 2000-08-11 | 2002-02-25 | Agilix Corp | Ultra-sensitive detection systems |
US7473535B2 (en) | 2002-08-20 | 2009-01-06 | The Institute For Systems Biology | Chemical reagents and methods for detection and quantification of proteins in complex mixtures |
US7252954B2 (en) * | 2002-10-15 | 2007-08-07 | Abmetrix, Inc. | Sets of digital antibodies directed against short epitopes, and methods using same |
CN1864068B (zh) * | 2003-08-18 | 2010-10-13 | 特提斯生物科学公司 | 用小表位抗体降低样品复杂度的方法 |
-
2003
- 2003-10-15 US US10/687,174 patent/US7252954B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2003-10-15 AU AU2003282832A patent/AU2003282832B2/en not_active Ceased
- 2003-10-15 JP JP2005501416A patent/JP4584828B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2003-10-15 CA CA002502246A patent/CA2502246A1/en not_active Abandoned
- 2003-10-15 CN CN2003801062344A patent/CN1726394B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2003-10-15 WO PCT/US2003/032574 patent/WO2004035742A2/en active Application Filing
- 2003-10-15 AT AT03774830T patent/ATE517340T1/de not_active IP Right Cessation
- 2003-10-15 EP EP03774830A patent/EP1552300B1/en not_active Expired - Lifetime
-
2005
- 2005-10-04 HK HK05108778.6A patent/HK1074670A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2007
- 2007-02-06 US US11/703,404 patent/US20080090250A1/en not_active Abandoned
-
2009
- 2009-11-30 JP JP2009272931A patent/JP2010054514A/ja active Pending
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002502038A (ja) * | 1998-01-29 | 2002-01-22 | ミラー,サミュエル | プロテオーム分析のための高密度アレイ及びその方法及び組成物 |
JP2002502977A (ja) * | 1998-02-04 | 2002-01-29 | インビトロジェン コーポレイション | マイクロアレイとその使用 |
WO2002006834A2 (en) * | 2000-07-19 | 2002-01-24 | Pointilliste, Inc. | Nested sorting and high throughput screening |
WO2002012893A2 (en) * | 2000-08-03 | 2002-02-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Microarrays of functional biomolecules, and uses therefor |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2007502837A (ja) * | 2003-08-18 | 2007-02-15 | テシス バイオサイエンス, インコーポレイテッド | 小型エピトープ抗体を使用するサンプルの複雑さを低減するための方法 |
JP2009531679A (ja) * | 2006-03-31 | 2009-09-03 | エヌエムイー ナトゥルヴィッセンシャフトリヘス ウント メディツィニシェス インスティトゥト アン ダー ウニヴェルジテート テュービンゲン | 複合タンパク質混合物中の被分析タンパク質および/または被分析ペプチドを検出および/または増幅するための方法 |
JP2020514746A (ja) * | 2016-12-01 | 2020-05-21 | ノーティラス バイオテクノロジー インコーポレイテッド | タンパク質をアッセイする方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2004035742A3 (en) | 2005-03-10 |
CA2502246A1 (en) | 2004-04-29 |
CN1726394B (zh) | 2010-10-13 |
EP1552300B1 (en) | 2011-07-20 |
JP2010054514A (ja) | 2010-03-11 |
AU2003282832A1 (en) | 2004-05-04 |
JP4584828B2 (ja) | 2010-11-24 |
EP1552300A2 (en) | 2005-07-13 |
AU2003282832B2 (en) | 2009-09-10 |
WO2004035742A2 (en) | 2004-04-29 |
CN1726394A (zh) | 2006-01-25 |
US20040166106A1 (en) | 2004-08-26 |
US20080090250A1 (en) | 2008-04-17 |
EP1552300A4 (en) | 2008-09-03 |
HK1074670A1 (en) | 2005-11-18 |
US7252954B2 (en) | 2007-08-07 |
ATE517340T1 (de) | 2011-08-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2010054514A (ja) | 短いエピトープに対して向けられる複数組のディジタル抗体、およびその使用 | |
RU2276790C2 (ru) | Микроанализ на аллергены | |
US20080241934A1 (en) | Methods for reducing complexity of a sample using small epitope antibodies | |
US20040053340A1 (en) | Protein arrays | |
CA2720472A1 (en) | Method of screening single cells for the production of biologically active agents | |
JP2009544014A (ja) | セルスポット・アプリケーション | |
JP2016222725A (ja) | モノクローナル抗体を生成し、検証し、そして使用するための方法およびシステム | |
CA2645159A1 (en) | Multiplex protein fractionation | |
CA2655563A1 (en) | Methods for detecting molecular complexes | |
JP4414138B2 (ja) | 蛍光染料を通した分子のエピトープの免疫検出及び分子の相互作用の検出のための方法 | |
CA2408835A1 (en) | Compositions and methods for epitope mapping | |
US20030044849A1 (en) | Methods for screening monoclonal antibodies on heterogeneous antigen substrates | |
CN114729014A (zh) | 单克隆抗体及其用途 | |
Pharmingen | Alexa Fluor® 555 Mouse anti-H2AX (pS139) |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20060911 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20090427 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20090528 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20090812 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20090819 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20091130 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20100324 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100604 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20100818 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20100902 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130910 Year of fee payment: 3 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |