JP2004527218A - 紫外線応答性皮膚損傷の検出に有用な遺伝子マーカー - Google Patents

紫外線応答性皮膚損傷の検出に有用な遺伝子マーカー Download PDF

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Abstract

紫外線曝露に対する細胞の応答が、高密度遺伝子配列体技術を使用して分子レベルで特徴化されている。紫外線曝露に対する応答において発現を抑制または誘起された核酸分子および蛋白質分子は、紫外線曝露後の時間的な変異発現パターンにより識別される。これら紫外線で制御を受ける分子を紫外線曝露のマーカーとして利用した方法が開示されている。本発明の他のスクリーニング方法は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を識別するために設計されている。本発明は、薬物スクリーニングまたは医薬品目的に有用な組成物も提供する。
【選択図】図1B

Description

【0001】
【発明の属する技術分野】
本発明は、分子生物学、細胞生物学および皮膚科学の分野に関する。更に詳細には、本発明は、細胞の紫外線曝露に対する応答の根底にある分子的異変、およびそれによって進展する急速な組織老化と癌化に向かう分子プロセスに関する。
【0002】
【従来の技術及び発明が解決しようとする課題】
ヒトの皮膚は比較的単純な組織であるが、温度調節、ビタミンD前駆体の産生、尿素排泄、炭水化物および脂質の貯蔵といった多様で複雑な機能を果たしている。皮膚には特異な細胞型が多数存在し、皮膚の特異な機能を招来している。概略的に言えば、皮膚は真皮と皮下脂肪を覆う上皮と基底膜領域からなる。皮膚組織は発生学的には外胚葉、神経外胚葉および中胚葉に由来する。上皮、毛髪および皮脂腺(毛髪皮脂単位)、汗腺(外分泌単位)および爪は全て外胚葉由来である。神経外胚葉由来の中にはメラノ細胞、神経、および特別な神経受容体が挙げられ、他方、中胚葉由来にはコラーゲン、レチクリン、弾性繊維、血管、筋肉、脂肪が挙げられる。皮膚の最も重要な機能は保護機能であろう。すなわち、皮膚は多くの物質に対し透過不能な障壁的表面を産生し、免疫能を有する細胞が緻密な網目構造を形成して潜在的に有害な抗原を常に監視し、また太陽からの有害な紫外線を濾去する色素を産生する。
【0003】
紫外線は主要な環境加害性作用物であり、皮膚に皮膚悪性疾患のような光損傷および光老化を招来する(一般論はFitzpatrick’s Dermatology in Medicine, 5th Ed. I.M.Freedberg, et al., eds., McGraw−Hill(1999)を参照)。光老化の臨床的特徴には、しわ、皮膚のたるみおよび荒れ、色素沈着疾患等がある。光老化の組織学的兆候は以前から知られていたが、その原因となる分子メカニズムは最近ようやく協調して行われる研究の焦点となってきた。
【0004】
太陽光線には広範囲スペクトルのエネルギー波長が含まれており、(可視光線スペクトルが約490と690ナノメーターの間に起こるのに対して)紫外線は比較的短い波長に属する100と400ナノメーターの間で起こる。紫外線は、A、B、およびCと呼称される三つの部分から構成される。紫外線C(100と280ナノメーターの間)は地球のオゾン層で濾去されるので、健康に脅威とは認識されていない。しかし、紫外線A(315と400ナノメーターの間)および紫外線B(280と315ナノメーターの間)の両方に曝露されると皮膚の健康および眼の健康に短期長期の悪影響が及ぶという証拠がある。例えば、紫外線は皮膚癌および皮膚の急速な老化の進展に重要な役割を演ずることが認識されている。
【0005】
紫外線の影響を最も受けるヒトの細胞は角質細胞である。紫外線に照射されると角質細胞は三個の一般的に重複しない過程を辿って反応する。第一に、角質細胞によってDNAの修復応答が起動する。この過程はDNAの損傷自身により活性化される(Herrlick et al. (1994) Adv.Enzyme Reg.34:381−95)。第二に、角質細胞は周囲の組織に前炎症性サイトカイン、例えばIL−1およびTNFαを放出することによりシグナルを送る(Ullrich et al. (2000) J. Dermatol. Sci. 23: S10−2; Ouhtit.et al. (2000) Am. J. Pathol. 156: 201−7; Beissert et al. (1999) J. Investig. Dermatol. Symp.Proc. 4:61−4)。第三に、角質細胞は、遺伝子発現の制御、細胞骨格の再構成、細胞消滅の誘導等の生理性における変更によって紫外線への固有の応答を活性化する(Zhuang et al. (2000) J. Interferon Cytokine Res.20: 445−54; Assefa et al. (1997) J. Invest. Dermatol. 108: 886−891)。
【0006】
角質細胞の紫外線に対する固有の応答は、他の細胞外シグナルへの応答から類推して、二つの相、すなわち即時相と遅延相に分けられる。即時相には紫外線特異的シグナルを導入する生理過程が存在し、結果的には転写因子を活性化する。遅延相では遺伝子発現の変化が見られる。ヒト上皮角質細胞において紫外線応答により誘導および制御される遺伝子の特徴化を本発明は明らかにする。
【0007】
上皮レベルにおける光老化の組織学的兆候には以下が挙げられる。(1)上皮の厚さの変化(観察部位により萎縮または過形成)、(2)細胞の異型性(Kligman et al. (1986) Photodermatol.3: 215−227)、(3)細胞極性の喪失、(4)角質層の不均一、(5)ランゲルハンス細胞の数の減少(Lavker et al. (1987) J. Invest. Dermatol. 88: 44s−51s)、(6)モザイク模様によって特徴化される色素沈着および色素沈着の欠乏または過多の領域、及び(7)真皮上皮間接合の線状化(Lavker (1979) J. Invest. Dermatol. 73: 59)。皮膚光老化の概観は、Skin and Aging Processis, 1989,CRC Press参照。
【0008】
紫外線に曝露された細胞の生物学的応答は、大腸菌からヒトまで広汎な系で研究されてきた。ヒトにおける紫外線の分子的影響にはDNA損傷、すなわちJun−N末端キナーゼ(JNK)および核因子κβ(NFκB)のアポトーシスと活性化が挙げられる。共に最近研究されているが、紫外線の主要な標的である上皮角質細胞では重点的になされていない。紫外線への分子応答に関する研究は、主に紫外線に応答するc−Jun転写因子に結合してこれを活性化する蛋白質キナーゼが同定(Derijard et al. (1994) Cell 76: 1025−1037)されたことにより促進された。このキナーゼは、Jun−N末端キナーゼ、略して「JNK」またはストレス活性化プロテインキナーゼ、略して「SAPK」と命名された(Kyriakis et al. (1994) Nature, 369: 156−160)。JNKは紫外線に加えて、いくつかの細胞外シグナル、例えば浸透圧ショック、砒酸塩、前炎症性サイトカインに応答することが直ぐに判った(Rosette et al. (1996) Science, 274: 1194−7; Cavigelli et al. (1996) E.M.B.O. Journal, 15: 6269−79)。JNKはEIk1やATF2等の追加の転写因子を燐酸化することができる(Kallunki et al. (1996) Cell, 87: 929−39)。JNK自体は「JNKKs」と呼ばれる少数の比較的に特異的なキナーゼによって活性化される。JNKKKsと呼ばれるキナーゼの多くは広汎な刺激に応答して「JNKKs」を燐酸化してこれを活性化する。紫外線応答性JNKKKはまだ同定されていない(Fanger et al. (1997) Curr. Opin. Genet.Dev. 7: 67−74)。
【0009】
紫外線の他の明瞭な影響は、NFκB転写因子の活性化である(Devary et al. (1993) Science, 261: 1442−5)。紫外線によるNFκBの活性化はDNA損傷とは関連しておらず、核DNAの存在しない細胞質体でも起こる(Devary et al. (1993) Science 261: 1442−5; Simon et al. (1994) J. Invest. Dermatol. 102: 422−7)。細胞質中に存在するNFκBはIκB蛋白と結合して不活性状態にある。巨大で異質な細胞外刺激によって活性化されると、IκBは燐酸化され蛋白質分解への指示を受ける。この結果、NFκBは遊離し、次に核内に自由に入って遺伝子転写を活性化する(Barnes et al.(1997) NE J. Med. 336: 1066−71)。IκBを分解へと導く紫外線応答性キナーゼはまだ同定されていない(Lie et al.(1998) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 95: 13012−13017)。
【0010】
皮膚または皮膚に存在する細胞への光損傷を判定する方法は、当分野で公表済みである。例えば、米国特許6,079,415号には真皮に対する、更に詳細には真皮の繊維芽細胞によるコラーゲンの産生に対する紫外線A照射損傷を確認するのに有用な方法とマーカーが提示されている。更に、皮膚または皮膚に存在する細胞への光損傷を防止するのに有用な方法が開示されている。例えば、米国特許5,908,836号には硫酸化糖を使用して皮膚を紫外線損傷から防護する方法が提示されており、また米国特許5,916,880号には硫酸化糖で処理することによりしわを減少する方法が提示されている。当分野では他に多数の例が開示されており、例えば、米国特許5,939,457号にはしわの減少に有用なオキシ酸生産物の用途が開示され、米国特許5,939,082号には皮膚老化の兆候を制御するビタミンB化合物の用途が開示されており、米国特許5,962,534号にはある種のレテノイドの使用が開示されている。
【0011】
しかし、これまでは、紫外線曝露に対する皮膚及び特定の皮膚細胞の応答を検討する研究は、専らある特別な細胞プロセスに特異的な一以上の遺伝子及び/又は蛋白質に限定されている。例えば、Garmynらの研究((1991) Lab. Invest. 65: 471−478)には紫外線曝露に対する角質細胞応答の即時かつ急速な一時的パターンが開示されているが、この研究は僅か数個の遺伝子の発現パターン解析に限定された。更に、紫外線曝露に対する皮膚及び/又は特定の皮膚細胞の完全な応答を首尾よく解析して提示した研究はない。例えば、Abtsらの研究((1997) Photochem. Photobio. 66(3): 363−367)ではmRNA微分表示の方法を利用して紫外線曝露が媒介した遺伝子発現の変異を研究したが、この研究では使用した技法が難しいために、非常に少数の紫外線制御遺伝子が確認されたに過ぎない。
【0012】
紫外線誘起型皮膚癌の誘導における紫外線Bの役割は明瞭に証明されている。主要な発色団として存在している核酸、特にデオキシリボ核酸に、紫外線が障害及び/又は変異を誘起する(Eller, in Photodamage, pp.26−56, Blackwell,ed. (1995))。更に、紫外線Bは、乾燥荒れの臨床所見が特徴的で、弾性の喪失と明瞭なしわを伴う皮膚の急速な老化と関連している。
【0013】
遺伝子配列体の技術は、遺伝子発現を監視する有力な新規技法であり、巨大な遺伝子の組の発現における変化を包括的に観察することが可能になる。この技法は多くの生物プロセスの研究に応用されている(例えば、Lockhart et al. (1994) Nat. Biotechnol. 14: 1675−1680; Johnston (1998) Curr. Biol. 8: 171−174 参照)。例えば、この技法は癌の研究(Scherf et al. (2000) Nat. Genet. 24: 236−44; Ross et al. (2000) Nat. Genet. 24: 227−35; Welford et al. (1998) Nuc. Acids Res. 26: 3059−3065; Alon et al. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 96: 6745−6750; Golub et al. (1999) Science 286: 531−537)、遺伝子発現の複雑な経路の研究(Fambrough et al. (1999) Cell 97: 727−741; Galitsky et al. (1999) Science 251−254)、老化プロセスの研究(Cheol−Koo Lee (1999) Science 285: 1390−1393; Ly et al. (2000) Science 287: 2486−92; Harkin (1999) Cell 97: 575−586)、及び特定の損傷性薬剤に対する細胞のストレス応答の研究(Jelinsky et al. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 96: 1486−1491)に使用されている。
【0014】
光損傷を受けた皮膚の治療に有用な薬理学的薬剤は確認されている。例えば、光損傷を受けた皮膚における通常の修復プロセスが薬理学的に促進されている。最初にこの特性の評価を受けたのはトレチノイン(全−trans−レチノイン酸)であった。研究から、トレチノイン処理マウスでは新生コラーゲンの再構築領域が有意に深部にまで及び、促進される修復は投与量と時間に相関することが証明された。また新生コラーゲンは組織化学的にも、超微細構造的にも、生化学的にも正常であった。放射免疫測定法による測定によると、トレチノイン処理皮膚ではコラーゲン含有量が2倍に増加し、I型とIII型のコラーゲンに対するmRNAが2ないし3倍に増加した。蛍光免疫測定法によると、新生コラーゲンの合成は組織学的に明瞭な再構築領域に局在しており、新生エラスチンの存在とフィブロネクチンの増加もこの領域で達成された。イソトレチノイン(13−cis−レチノイン酸)もマウスでの皮膚修復を促進することが証明されている。この修復活性はレチノイド特異性のまま存続する。(Fitzpatrick’s Dermatology in Medicine, fifth Edition, I.M. Freedberg, et al., eds., McGraw−hill (1999), pp.1717−1721)。
【0015】
分子レベルの研究から、紫外線Bによってコラーゲン分解酵素であるコラゲナーゼおよびゲラチナーゼが上昇するが、トレチノインによってこれら酵素のmRNA、蛋白質及び活性が50ないし80%減少することが判っている。同上書1721頁。したがって、紫外線曝露による蛋白質および核酸分子の変異発現から生じた皮膚損傷を薬理学的薬剤によって修復することは可能である。
【0016】
皮膚の特定の細胞の紫外線に対する曝露は、皮膚癌の発生および急速な老化の過程で重要な役割を演ずる。したがって、紫外線曝露に対する皮膚の全応答を分子レベルで特徴化することは有益である。本発明はそのような情報を提供するものであって、この情報は当分野において以前は欠如していた。更に、外界の紫外線の主たる標的である表皮の角質細胞をモデル系に使用することはめったにない。本明細書に記載の発明は当分野のこの不足を補うものである。また紫外線に制御される皮膚細胞中の核酸分子および蛋白質分子、並びに本発明で提示する方法は、皮膚癌および皮膚の急速老化の予防治療用薬剤を識別する有用な手段である。
【0017】
【課題を解決するための手段】
細胞が紫外線への曝露に応答する際にある種の分子的現象が起こることが発見されている。更に詳細には、複数の核酸分子および蛋白質の発現が紫外線曝露への応答において制御を受けることが判っている。ここで使用されている「制御を受ける」という言葉の意味は、紫外線曝露に細胞が応答している際にRNA分子及び/又はそこにコードされている蛋白質の発現が、紫外線照射されていない細胞での発現レベルに比較して増加または減少することを言う。これら紫外線の制御を受ける核酸分子および蛋白質は、細胞応答(第一応答、第二応答、および第三応答)との関連で時間的に更に特徴化され、また紫外線に曝露されていない細胞での発現レベルとの関連で定量的な態様(誘起または抑制)で特徴化されている。
【0018】
これらの知見を利用して本発明が得られ、本発明には、物質組成物、医薬組成物、紫外線に曝露された細胞の確認方法、紫外線曝露に対する細胞応答、すなわちその細胞中の核酸分子及び/又は蛋白質の変異発現を含む応答を調節する化合物を確認するスクリーニング方法が含まれる。
【0019】
本発明が定義する細胞応答とは、紫外線に曝露された細胞におけるRNA分子及び/又は蛋白質分子の変異発現に関する。これらの応答は以下を含む。(1)第一次の第一応答、第一次の第二応答、および第一次の第三応答であって、これらは全て紫外線に曝露された細胞におけるRNA分子の変異発現に関する、(2)第二次の第一応答、第二次の第二応答、および第二次の第三応答であって、これらは全て紫外線に曝露された細胞におけるRNA分子の変異発現に関する、(3)第三次の第一応答、第三次の第二応答、および第三次の第三応答であって、これらは全て紫外線に曝露された細胞における蛋白質分子の変異発現に関する、および(4)第四次の第一応答、第四次の第二応答、および第四次の第三応答であって、これらは全て紫外線に曝露された細胞における蛋白質分子の変異発現に関する。本発明は、紫外線に細胞が曝露された際に制御を受けるRNA分子または蛋白質の多数のグループを提示する。それらグループは以下を含む。(1)第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ、および第一次の第三応答グループであって、これらは全て紫外線に曝露された細胞におけるRNA分子の変異発現に関する、(2)第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ、および第二次の第三応答グループであって、これらは全て紫外線に曝露された細胞におけるRNA分子の変異発現に関する、(3)第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループ、および第三次の第三応答グループであって、これらは全て紫外線に曝露された細胞における蛋白質分子の変異発現に関する、および(4)第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、および第四次の第三応答グループであって、これらは全て紫外線に曝露された細胞における蛋白質分子の変異発現に関する。これらグループ間の特異的な差異を後に詳説する。
【0020】
本発明の他の態様によれば、以下を含む物質組成物が提供される。すなわち、(1)紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループと少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子、および(2)(1)の核酸分子と結合するのに適する基質である。紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループには以下が含まれる;M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930, X53065, M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2, L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード, M21302 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N, L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小 蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード, Y00787 ヒト mRNA、MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, M22918 ミオシン,軽鎖,アルカリ,平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, X70326 マックマーク, X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する, S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1, M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード, L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード, U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード, L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード, M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性 蛋白質 A20 mRNA, 完全コード, Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する, X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する, L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード, D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード, M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード, X54489 ヒト 遺伝子、黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する, M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード, Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する, M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード, M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード, X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する, X67325 ホモサピエンス p27 mRNA, U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード, M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード, L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード, M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード、 3’にAlu反復配列, AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード, M22918 ミオシン,軽鎖,アルカリ,平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1, M22919 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス, V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する, V00599 チューブリン, ベータ, X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する, M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード, U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード, M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード, S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞株, mRNA, 453 nt], D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA, S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt], M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード, U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7, X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する, M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード, X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード, AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード, U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード, M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード, D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニット ベータに対する, 完全コード, X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2, X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子, X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来, X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性 蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する, Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体, D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード, X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する, S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22, X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533), Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する, D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード, X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード, M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kD/15−kD 蛋白質 mRNA, 完全コード, M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード, D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジン エンドパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード, M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード, V00599 チューブリン, ベータ 2, U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード, K02574, X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する, D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード, M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード, X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44, X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する, M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード, L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム, Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する, X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2), U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード, X61123 ヒト BTG1 mRNA, J04456 ヒト 14 kD レクチン mRNA, 完全コード, Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA, U70660 ヒト 銅輸送 蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード, D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード, Y07604 ホモサピエンス mRNA、ヌクレオシド二燐酸キナーゼに対する, AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード, Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する, L26336 熱ショック 蛋白質, 70 KD (Gb:Y00371), M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード, Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA, U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード, M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード, X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する, Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード, U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード, D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120 kD 核 蛋白質 p120に対する, 部分コード(carbox, L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード, X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する, D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード, M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4, M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA、IkB−様活性をコード, 完全コード, D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード, M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12), L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード, M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3, U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード, U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード, M22960 ヒト 保護 蛋白質 mRNA, 完全コード, D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード, L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード, M19309 ヒト 遅骨格筋トロポニン T mRNA, クローン H22h, D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード, U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード, J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード, U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード, X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード, X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する, X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する, M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5, D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード, D10923 ヒト mRNA、HM74に対する, M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード, U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc, X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する, X82200 ホモサピエンス Staf50 mRNA, L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード, U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード, M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード, X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータ サブユニットに対する, U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード, U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA, c, AF006041 ホモサピエンス Fas−結合性 蛋白質 (DAXX) mRNA, 部分コード, U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード, M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード, U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード, U13991 ヒト TATA−結合性 蛋白質 関連 因子 30 kD サブユニット (tafII30) mRNA, 完全コード, J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード, U51586 ヒト siah 結合性 蛋白質 1 (SiahBP1) mRNA, 部分コード, M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード, X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する, X94563 ホモサピエンス dbi/acbp 遺伝子 エクソン 1 & 2, X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する, X56681 ヒト junD mRNA, V01512 ヒト 細胞性 発癌遺伝子 c−fos (完全配列), U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード, L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード, U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列, M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード, L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード, X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性 蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する, X52560 核因子 Nf−Il6, X78549 ホモサピエンス brk mRNA、チロシン キナーゼに対する, L11066 ヒト mRNA 配列, X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する, X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する, S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt], D13705 ヒト mRNA、脂肪酸 オメガ−水酸化酵素 (シトクローム P−450HKV)に対する, 完全コード, D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード, U17327 ヒト ニューロンの 酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード, U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB, D85527 ホモサピエンス mRNA、LIM 領域に対する, 部分コード, L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517), M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード, U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kD サブユニット, M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード, M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA, X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する, X89267 ホモサピエンス DNA、ウロポルフィリノーゲン 脱炭酸酵素 遺伝子に対する, X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する, L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード, X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA, L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード, D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10, X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子, L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード, U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード, M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード, L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA, L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード, L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座(4:11), D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード, S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−ind, L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード, L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18, D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード, X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する, D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード, M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード, M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード, J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード, M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード, U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード, X04412 ヒト mRNA、プラズマゲルゾリンに対する, L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード, U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード, M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751), U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コードl, Z11585 カリウムチャンネル 蛋白質 (Gb:Z11585), M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード, D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード, M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード, U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード, J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114, U68142 ヒト RalGDS−様 2 (RGL2) mRNA, 部分コード, U88898 ヒト 内因性レトロウイルス H プロテアーゼ/インテグラーゼ由来 ORF1 mRNA, 完全コード, M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード, Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bp に対する, X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー, D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード, U63825 ヒト 肝炎 デルタ 抗原 相互作用性 蛋白質 A (dipA) mRNA, 完全コード, S78825 Id1, M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード, X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する, X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム L)に対する, D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード, L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード, U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード, M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード, U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード, U66616 ヒト SWI/SNF コンプレックス 170 KD サブユニット (BAF170) mRNA, 完全コード, U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード, D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード, D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード, D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード, M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード, U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード, X75342 ホモサピエンス SHB mRNA, D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード, X59434 ヒト rohu mRNA、ロダニーズに対する, M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード, D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード, D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード, Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ, X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する, Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する, M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード, L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード, D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード, M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード, X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード, M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード, J05211 デスモプラキン I, D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード, X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する, X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA, Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する, U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR, L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード, U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列, U28480 非結合性 蛋白質 Ucp, X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する, M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード, U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード, D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード, X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する, D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード, L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画, D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード, S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞, L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端, M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード, X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する, U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード, L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード, M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41, L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク, U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード, L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード, U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード, U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード, U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード, M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステイン シンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード, D90209 ヒト mRNA、DNA 結合性 蛋白質 TAXREB67に対する, D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード, U42031 ヒト 54 kD プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード, M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード, D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード, J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード, M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード, M95787 ヒト 22kD 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード, U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード, K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード, X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する, X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA, U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード, X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA, J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化, U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード, L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード, X76534 ホモサピエンス NMB mRNA, M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード, M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード, U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード, X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する, M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード, D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード, X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する。紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドのこのグループを、以後、紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドの「完全応答グループ」と呼ぶことにする。
【0021】
本発明の他の態様によれば、以下を含む物質組成物が提供される。すなわち、(1)紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループと少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子、および(2)(1)の核酸分子と結合するのに適する基質である。紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループには以下が含まれる:M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930, X53065, M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2, L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード, M21302 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N, L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小 蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード, Y00787 ヒト mRNA、MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する, D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, M22918 ミオシン,軽鎖,アルカリ,平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, X70326 マックマーク, X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する, S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1, M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード, L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード, U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード, L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード, M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性 蛋白質 A20 mRNA, 完全コード, Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する, X57985 ホモサピエンス 遺伝子,ヒストン H2B.1 および H2Aに対する, L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード, D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード, M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード, X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する, M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード, Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する, M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード, M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード, X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する, X67325 ホモサピエンス p27 mRNA, U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード, M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード, L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード, M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード、 3’にAlu反復配列, AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード, M22918 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1, M22919 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス, V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する, V00599 チューブリン, ベータ, X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する, M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード, U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード, M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード, S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt], D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA, S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt], M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード, U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7, X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する, M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード, X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード, AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード, U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード, M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード, D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニット ベータに対する, 完全コード, X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2, X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子, X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来, X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性 蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する, Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体, D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード, t X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する, S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22, X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533), Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する, D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード, X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード, M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kD/15−kD 蛋白質 mRNA, 完全コード, M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード, 8235_s_at D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジン エンドパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード, M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード, V00599 チューブリン, ベータ 2, U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード, K02574, X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する, D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ−様蛋白質に対する, 完全コード, M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷−誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード, X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44, X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する, M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード, L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム, Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する, X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2), 37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード, X61123 ヒト BTG1 mRNA, J04456 ヒト 14 kD レクチン mRNA, 完全コード, Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA, U70660 ヒト 銅輸送 蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード, D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード, AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード, Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する, M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード, Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA, U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード, M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード, X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する, Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード, U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード, D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120 kD 核 蛋白質 p120に対する, 部分コード(carbox, L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード, X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する, D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード, M26730 ヒト ミトコンドリア ユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4, M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA、IkB−様活性をコード, 完全コード, D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード, L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード, M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3, U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード, U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード, M22960 ヒト 保護 蛋白質 mRNA, 完全コード, D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード, M19309 ヒト 遅骨格筋トロポニン T mRNA, クローン H22h, D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード, U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード, J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード, U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード, X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード, X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する, D10923 ヒト mRNA、HM74に対する, M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード, U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc, X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する, L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード, U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード, M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード, X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータ サブユニットに対する, U13991 ヒト TATA−結合性 蛋白質 関連 因子 30 kD サブユニット (tafII30) mRNA, 完全コード, J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード, U51586 ヒト siah 結合性 蛋白質 1 (SiahBP1) mRNA, 部分コード, M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード, X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する, X56681 ヒト junD mRNA, V01512 ヒト 細胞性 発癌遺伝子 c−fos (完全配列), U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード, L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード, U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列, M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード, L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード, X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性 蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する, X52560 核因子 Nf−Il6, M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード, U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kD サブユニット, M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード, M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA, D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10, L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11), D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード, X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する, L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード, U68142 ヒト RalGDS−様 2 (RGL2) mRNA, 部分コード, U63825 ヒト 肝炎 デルタ 抗原 相互作用性 蛋白質 A (dipA) mRNA, 完全コード, X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する, L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード, M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード, J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード, S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化。紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドのこのグループを、以後、紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドの「誘起応答グループ」と呼ぶことにする。
【0022】
本発明の他の態様によれば、以下を含む物質組成物が提供される。すなわち、(1)紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループと少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子、および(2)(1)の核酸分子と結合するのに適する基質である。紫外線曝露に応答して細胞が制御するポリヌクレオチドのグループには以下が含まれる: D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード, X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する, D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ−様蛋白質に対する, 完全コード, L26336 熱ショック 蛋白質, 70 KD (Gb:Y00371), M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12), L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード, X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する, M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5, D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード, U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード, U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA, c, AF006041 ホモサピエンス Fas−結合性 蛋白質 (DAXX) mRNA, 部分コード, U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード, M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード, U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード, X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する, X94563 ホモサピエンス dbi/acbp 遺伝子 エクソン 1 & 2, L11066 ヒト mRNA 配列, X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する, X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する, S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt], D13705 ヒト mRNA、脂肪酸 オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード, D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード, U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード, U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB, D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード, L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517), X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する, X89267 ホモサピエンス DNA、ウロポルフィリノーゲン 脱炭酸酵素 遺伝子に対する, X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する, L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード, X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA, L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード, X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子, L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード, U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード, M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード, L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA, L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード, D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード, S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−ind, L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード, L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18, D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード, X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する, t D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード, M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード, M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード, J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード, M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード, U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード, U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード, M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751), U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コードl, M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード, D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード, M76482 ヒト 130−kD ペムフィガス ブルガリス抗原 mRNA, 完全コード, U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード, J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114, U88898 ヒト 内因性レトロウイルス H プロテアーゼ/インテグラーゼ由来 ORF1 mRNA, 完全コード, M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード, Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bp に対する, X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー, D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレン エポキシダーゼに対する, 部分コード, S78825 Id1, M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード, X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する, D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード, U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード, M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード, U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード, U66616 ヒト SWI/SNF コンプレックス 170 KD サブユニット (BAF170) mRNA, 完全コード, U29607 ヒト メチオニン アミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード, D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード, D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード, D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード, t M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード, U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード, X75342 ホモサピエンス SHB mRNA, t D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード, X59434 ヒト rohu mRNA、ロダニーズに対する, M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード, D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード, D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード, Y13647 ステアロイル補酵素 デサチュラーゼ, X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する, Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する, t M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード, L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード, D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード, M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード, X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード, M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード, J05211 デスモプラキン I, D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード, X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジン フォスフォリラーゼに対する, X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA, Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する, U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR, L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード, U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列, U28480 非結合性 蛋白質 Ucp, X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する, M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード, U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード, D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード, X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する, D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード, L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画, D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード, S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞, L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端, M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード, X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する, U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード, L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード, M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41, L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク, U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード, L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード, U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード, U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード, U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード, M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステイン シンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード, D90209 ヒト mRNA、DNA 結合性 蛋白質 TAXREB67に対する, D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード, U42031 ヒト 54 kD プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード, M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード, 134. D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード, J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード, M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード, M95787 ヒト 22kD 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード, U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード, K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード, X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する, X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA, U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード, X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA, J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化, U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード, L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード, X76534 ホモサピエンス NMB mRNA, M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード, M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード, U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード, X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する, M77836 ヒト ピロリン 5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード, D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード, X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する。紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドのこのグループを、以後、紫外線の制御を受けるポリヌクレオチドの「抑制応答グループ」と呼ぶことにする。
【0023】
一つの実施例では、物質組成物が遺伝子発現を監視するのに適する遺伝子配列体である。一つの実施例では、この遺伝子配列体は低密度遺伝子配列体である。他の実施例では、この遺伝子配列体は高密度遺伝子配列体である。低または高密度遺伝子配列体の構成に使用されるポリヌクレオチドには、ゲノムクローン、cDNA、オリゴヌクレオチド等を含む。
【0024】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞応答を調節する医薬組成物が提供される。本発明の医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞応答を調節するのに十分な量の化合物と薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。紫外線曝露に対する細胞応答は発現パターンを含み、それは第一応答グループ、第二応答グループおよび第三応答グループの中の少なくとも一つを含んでいる。一つの実施例では、第一応答グループは、転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む。第二応答グループは、分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む。第三応答グループは、アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、角化エンベロープ蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む。
【0025】
これらのグループを、以後、それぞれ「第一次の第一応答グループ」、「第一次の第二応答グループ」および「第一次の第三応答グループ」と呼ぶことにする。
【0026】
他の実施例での本発明医薬組成物には、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、(1)第一次の第一応答グループ、または(2)第一次の第二応答グループ、または(3)第一次の第三応答グループ、の中の少なくとも一つを含む発現パターンを含む応答を調節するのに十分な量の化合物が含まれている。他の実施例では、このパターンが第一次の第一応答グループおよび第一次の第二応答グループを含んでいる。他の実施例では、このパターンが第一次の第一応答グループおよび第一次の第三応答グループを含んでいる。更に他の実施例では、このパターンが第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループを含んでいる。もう一つ別の実施例では、このパターンが第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループを含んでいる。
【0027】
本発明の他の実施例では、紫外線曝露であって、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線曝露に対する細胞の応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる医薬組成物が提供される。一つの実施例では、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞の応答を調節する医薬組成物が提供される。
【0028】
更に他の実施例での本発明医薬組成物には、紫外線曝露に対する細胞の応答、すなわち、第一応答グループ、第二応答グループ、および第三応答グループの中の少なくとも一つを含む発現パターンを含む応答を調節するのに十分な量の化合物、及び薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。第一応答グループは、以下から成る群から選択される核酸分子と少なくとも90%の同一性を有する、少なくとも一つのポリヌクレオチドを含んでいる:M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード, X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する, L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11), X56681 ヒト junD mRNA, U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード, L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード, D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード, M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード, D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード, L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード, U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列, X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する, L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード, X61123 ヒト BTG1 mRNA, M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード, L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード, X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する, D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10, M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード, L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード, D13705 ヒト mRNA、脂肪酸 オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード, U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード, D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード, U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード, D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード, L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード, D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード, D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード, U28480 非結合性 蛋白質 Uc, D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード, M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード, U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P, D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード, J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード, D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード, U17327 ヒト ニューロンの 酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード, D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード, D85527 ホモサピエンス mRNA、LIM 領域に対する, 部分コード, U42031 ヒト 54 kD プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード, X59434 ヒト rohu mRNA、ロダニーズに対する, M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, J05211 デスモプラキン。
【0029】
この実施例の第二応答グループは、以下から成る群から選択される核酸分子と少なくとも90%の同一性を有する、少なくとも一つのポリヌクレオチドを含んでいる:M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード, S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1, Y00787 ヒト mRNA、MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する, X54489 ヒト 遺伝子、黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する, M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード, M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード, M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード, X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する, X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性 蛋白質−2ベータ(MIP2ベータ)に対する, L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード, AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード, X56681 ヒト junD mRNA, S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化, M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード, M21302 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N, V00599 チューブリン, Bet, X70326 マックマーク, D10923 ヒト mRNA、HM74に対する, D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード, D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード, M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷−誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード, X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する, L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード, M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード, U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード, X52560 核因子 Nf−Il, X61123 ヒト BTG1 mRNA, U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード, U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード, M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA、IkB−様活性をコード, 完全コード, X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する, S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt], X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する, X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する, U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列, X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する, D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する, U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード, L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード, M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12), U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード, S78825 Id1, D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード, U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA, U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB, M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード, D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード, U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード, L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード, X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する, U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード, X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する, U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード, X76534 ホモサピエンス NMB mRNA, D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード, U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード, M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード, U29607 ヒト メチオニン アミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード, M76482 ヒト 130−kD ペムフィガス ブルガリス抗原 mRNA, 完全コード, U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード, K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード, X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー, M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード, U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード, D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード, L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード, D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード, S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in, X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する, X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する, D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード, M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード, M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード, X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA, U42031 ヒト 54 kD プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード, U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード, X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する, U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード, L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク, L26336 熱ショック 蛋白質, 70 KD (Gb:Y00371, L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA, S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞, J05211 デスモプラキン, L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18, Y13647 ステアロイル−補酵素 デサチュラーゼ, X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する, M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステイン シンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード, M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレン エポキシダーゼに対する, 部分コード, X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114。
【0030】
この実施例の第三応答グループは、以下から成る群から選択される核酸分子と少なくとも90%の同一性を有する、少なくとも一つのポリヌクレオチドを含んでいる:M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930, X53065, M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2, M22918 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード, M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード, M21302 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N, Y00787 ヒト mRNA、MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する, X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する, L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小 蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード, X70326 マックマーク, X67325 ホモサピエンス p27 mRNA, L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード, S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1, D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニット ベータに対する, 完全コード, Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA, M22918 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス, X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44, V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する, M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード, U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード, Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する, X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム− 結合性 蛋白質A13に対する, U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード, L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード, L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード, M13755 ヒト インターフェロン−誘起 17−kD/15−kD 蛋白質 mRNA, 完全コード, M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード, AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード, X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する, M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード, D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード, V00599 チューブリン, ベータ, U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード, M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード, M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード, Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する, L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード, D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA, M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性 蛋白質 A20 mRNA, 完全コード, S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt], Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA, M22919 ミオシン, 軽鎖, アルカリ, 平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス, U70660 ヒト 銅輸送 蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード, AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード, X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する, D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード, M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード, S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22, X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する, t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード, X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード, M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード, U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード, M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード, Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード, M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード, M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列, X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1, X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来, X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する, U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード, D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジン エンドパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード, Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する, M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード, D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード, U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード. D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120 kD 核 蛋白質 p120に対する, 部分コード(carbox), L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード, X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する, J04456 ヒト 14 kD レクチン mRNA, 完全コード, S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt], M26730 ヒト ミトコンドリア ユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4, U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード, X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する, Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体, L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム, M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード, U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7, X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する, M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3, U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード, X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する, M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード, M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード, X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2), D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード, D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード, AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード, L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード, J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード, X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子, M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード, Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する, M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード, X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する, X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2, D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ−様蛋白質に対する, 完全コード, M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷−誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード, M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード, D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード, X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533), Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する, K02574, U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc, X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する, J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード, U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード, X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性 蛋白質−2ベータ(MIP2ベータ)に対する, V00599 チューブリン, ベータ 2, U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード, X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性 蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する, U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード, M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード, M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード, U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kD サブユニット, X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する, M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA, D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード, X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード, X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する, X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する, L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード, L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画, D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード, X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する, M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5, L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード, M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード, U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード, L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41, X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する, t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード, L11066 ヒト mRNA 配列, J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード, M95787 ヒト 22kD 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード, L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517), X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する, L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード, U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR, U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード, U28480 非結合性 蛋白質 Ucp, X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子, L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード, M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード, Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する, M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751), X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA, M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード, X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する, D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード, M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード, M76482 ヒト 130−kD ペムフィガス ブルガリス抗原 mRNA, 完全コード, X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する, X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA, L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード, X75342 ホモサピエンス SHB mRNA, U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード, U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード, S78825 Id1, U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード, M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード, D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード, D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード, Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する, L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端, J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114, U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード, U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード, L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード, L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク, U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード, M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード, U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード, L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード, U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列, L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード, M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード, X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する, D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード, J05211 デスモプラキン I, M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード, X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA, M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード, D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード, D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード, U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード, K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード, D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード, Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する, D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード, D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード, X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する, M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード, X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する, M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード, X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する, U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード, U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード, D90209 ヒト mRNA、DNA 結合性 蛋白質 TAXREB67に対する, X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA, X76534 ホモサピエンス NMB mRNA, U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード, M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード, U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード, L09229 ヒト 長鎖 アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード, S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞, M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード, M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード, HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化, U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード, U42031 ヒト 54 kD プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード, M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード, X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する, D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード, M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステイン シンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード, J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する。
【0031】
これらのグループを、以後、それぞれ「第二次の第一応答グループ」、「第二次の第二応答グループ」、および「第二次の第三応答グループ」と呼ぶことにする。
【0032】
本発明の他の態様では、本発明医薬組成物が、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第一応答グループ、第二応答グループ、および第三応答グループから選択されたポリヌクレオチドによってコードされる蛋白質の変異制御を含む応答を調節するのに十分な量の化合物、及び薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。更にこの実施例では、第一応答グループは、少なくとも一つの転写因子蛋白質、少なくとも一つのシグナル導入蛋白質、および少なくとも一つのミトコンドリア蛋白質の変異発現を含む。第二応答グループは、少なくとも一つの分泌成長因子、少なくとも一つのサイトカイン、および少なくとも一つのケモカインの変異発現を含む。第三応答グループは、少なくとも一つのアクチン結合性蛋白質、少なくとも一つのデスモゾーム蛋白質、少なくとも一つのチューブリン蛋白質の変異発現を含む。
【0033】
これらのグループを、以後、それぞれ「第三次の第一応答グループ」、「第三次の第二応答グループ」、および「第三次の第三応答グループ」と呼ぶことにする。したがって、第一次の第一応答、第二応答及び第三応答のグループは核酸分子に関連するのに対し、第三次の第一応答、第二応答および第三応答のグループは、第一次グループの核酸分子によってコードされる蛋白質に関連する。
【0034】
本発明の他の実施例では、本発明医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、(1)第三次の第一応答グループ、または(2)第三次の第二応答グループ、または(3)第三次の第三応答グループ、または(4)第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、または(5)第三次の第一応答グループと第三次の第三応答グループ、または(6)第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、または(7)第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、の中の少なくとも一つを含む発現パターンを含む応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる。
【0035】
これに関する追加の実施例で、紫外線曝露であって、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線曝露に対する細胞の応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる医薬組成物が提供される。この発明の他の実施例では、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞の、紫外線への応答における応答の発現を調節する医薬組成物が提供される。
【0036】
更に他の実施例での本発明の医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第一応答グループ、第二応答グループ、および第三応答グループの中の少なくとも一つを含む応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる。この実施例で第一応答グループは、第二次の第一応答グループから成る群から選択された核酸分子に少なくとも90%の同一性を有するポリヌクレオチドによってそれぞれコードされる複数の蛋白質分子の変異発現を含む。第二応答グループは、第二次の第二応答グループから成る群から選択された核酸分子に少なくとも90%の同一性を有するポリヌクレオチドによってそれぞれコードされる複数の蛋白質分子の変異発現を含む。第三応答グループは、第二次の第三応答グループから成る群から選択された核酸分子に少なくとも90%の同一性を有するポリヌクレオチドによってそれぞれコードされる複数の蛋白質分子の変異発現を含む。これら第一応答グループ、第二応答グループおよび第三応答グループを、以後、それぞれ「第四次の第一応答グループ」、「第四次の第二応答グループ」および「第四次の第三応答グループ」と呼ぶことにする。これらのグループは、要するに、第二次の第一応答、第二応答および第三応答グループの核酸分子によってコードされる蛋白質分子である。
【0037】
他の実施例では、本発明医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、(1)第四次の第一応答グループ、または(2)第四次の第二応答グループ、または(3)第四次の第三応答グループ、または(4)第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループ、または(5)第四次の第一応答グループと第四次の第三応答グループ、または(6)第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、または(7)第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループを含む応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる。
【0038】
これに関する追加の実施例で、紫外線曝露であって、(1)約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線曝露に対する細胞の応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる医薬組成物が提供される。この発明の他の実施例では、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞の、紫外線への応答を調節する治療組成物が提供される。
【0039】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する医薬組成物が提供される。この医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ、および第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つ含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。これらの実施例で細胞応答を調節するとは、紫外線曝露によって誘起されるRNA発現を阻止する、または紫外線曝露によって抑制されるRNA発現を阻止することである。
【0040】
本発明の更に他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する医薬組成物が提供される。この医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ、および第二次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物を含んでいる。
【0041】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する医薬組成物が提供される。この医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループ、および第三次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。これらの実施例で細胞応答を調節するとは、紫外線曝露によって誘起される蛋白質発現を阻止する、または紫外線曝露によって抑制される蛋白質発現を阻止することである。
【0042】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する医薬組成物が提供される。この医薬組成物は、紫外線曝露に対する細胞の応答であって、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、および第四次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体を含んでいる。これらの実施例で細胞応答を調節するとは、紫外線曝露によって誘起される蛋白質発現を阻止する、または紫外線曝露によって抑制される蛋白質発現を阻止することである。これらの実施例で細胞応答を調節するとは、紫外線曝露によって誘起される蛋白質発現を阻止する、または紫外線曝露によって抑制される蛋白質発現を阻止することである。
【0043】
本発明の他の態様では、紫外線への細胞曝露を検出する方法が提供される。この方法は、細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その測定において発現パターンが確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。各種の実施例において、この発現パターンは第一応答グループ、第二応答及び/又は第三応答を含む。一つの実施例では、その第一応答グループは前記第一次の第一応答グループであり、第二応答は前記第一次の第二応答グループであり、および、第三応答は前記第一次の第三応答グループである。本発明のこの態様の他の実施例では、(1)発現パターンが第一次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第一次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第一次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、を含む。
【0044】
これの追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。この他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0045】
他の態様では、紫外線への細胞曝露を検出する方法が、少なくとも一時点における、細胞中の複数のRNA分子のレベルを測定し、その測定において発現パターンを確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。この実施例において、発現パターンは、前記第二次の第一応答グループである第一応答グループ、前記第二次の第二応答である第二応答、および前記第一次の第三応答である第三応答を含む。
【0046】
この各種実施例において、発現パターンは第一応答グループ及び/又は第二応答及び/又は第三応答を含む。この実施例では、第一応答グループが前記第二次の第一応答グループであり、第二応答が前記第二次の第二応答であり、および第三応答が前記第二次の第三応答である。これらの実施例には、(1)発現パターンが第二次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第二次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第二次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、を含む。
【0047】
これの追加的な実施例では検出方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)220nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)290nmないし320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)320nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0048】
また本発明では、複数のRNA分子のレベルを発現配列体の分析によって測定する、紫外線への細胞曝露を検出する方法が提供される。これらの方法では、紫外線曝露後のある時点で細胞からRNAを単離する。このRNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成する。検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体のデータセットを作成し、次にそれを対照発現配列体のデータと対比する。次に細胞中の複数RNA分子のレベルを分析して細胞の応答パターンを確定し、紫外線に曝露された細胞の応答パターンは、(i)転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第一応答;(ii)分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第二応答;及び/又は(iii)アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、および角化エンベロープ蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第三応答;を含んでいる。この検定用発現配列体のデータセットが紫外線への細胞の応答に実質的に類似していれば、その細胞は紫外線に曝露されたのである。
【0049】
他の態様では、紫外線への細胞曝露を検出する他の方法が提供される。これらの方法では、細胞中の複数の蛋白質分子の測定を含み、その測定において発現パターンを確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。各種実施例において、この発現パターンは第一応答グループ、第二応答及び/又は第三応答を含む。一つの実施例では、第一応答グループは前記第三次の第一応答グループ、第二応答は前記第三次の第二応答、および第三応答は前記第三次の第三応答である。この方法の実施例には、(1)発現パターンが第三次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第三次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第三次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、が含まれる。
【0050】
これの追加的な実施例では方法が提供され、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線に細胞が曝露される。この態様の他の実施例では方法が提供され、紫外線に曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0051】
他の実施例では、紫外線への細胞曝露を検出する方法が、少なくとも一時点における細胞中の複数蛋白質分子のレベルの測定を含み、その測定において発現パターンを確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。この実施例において、発現パターンは、前記第四次の第一応答グループである第一応答グループ、前記第四次の第二応答である第二応答、および前記第三次の第三応答である第三応答を含む。
【0052】
他の実施例では、第一の応答グループが前記第四次の第一応答グループであり、第二の応答が前記第四次の第二応答であり、及び第三の応答が前記第四次の第三応答である。更に他の実施例では、発現パターンが第四次の第一応答グループ、発現パターンが第四次の第二応答グループ、発現パターンが第四次の第三応答グループ、発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループ、発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第三応答グループ、発現パターンが第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、または発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループである。
【0053】
これの追加的な実施例では方法が提供され、紫外線曝露が、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。この態様の他に提供される実施例では、紫外線に曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。一つの実施例では複数の蛋白質分子のレベルをELISAによって測定する。
【0054】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。このスクリーニング方法は、細胞をある化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して紫外線曝露に対する細胞の応答を誘起し、紫外線曝露後の細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、この測定において第一応答、第二応答及び/又は第三応答になんらかの変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。この一つの実施例では応答は、第一次の第一応答グループである第一応答グループ、第一次の第二応答である第二応答、および第一次の第三応答である第三応答の中の少なくとも一つを含む。
【0055】
この他の実施例では、応答、あるいは発現パターンは、(1)発現パターンが第一次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第一次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第一次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、を含んでいる。
【0056】
これの追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0057】
他の実施例では、細胞の紫外線に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して紫外線曝露に対する細胞の応答を誘起し、紫外線曝露後の細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、この測定において第一応答、第二応答及び/又は第三応答になんらかの変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。この実施例では、発現パターンは、第二次の第一応答グループである第一応答グループ、第二次の第二応答である第二応答、及び/又は第二次の第三応答である第三応答を含む。
【0058】
この各種実施例では、この発現パターンは、第一応答グループ、及び/又は第二応答、及び/又は第三応答を含む。この実施例では、第一応答グループが前記第二次の第一応答グループであり、第二応答が前記第二次の第二応答であり、および第三応答が前記第二次の第三応答である。この実施例には、(1)発現パターンが第二次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第二次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第二次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、が含まれる。
【0059】
この本発明態様の追加的実施例では検出方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)220nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0060】
また本発明では、細胞の紫外線に対する応答を調節する化合物を検出する方法であって、複数RNA分子のレベルを発現配列体の分析によって判定する方法が提供される。この方法では、紫外線曝露後の時点で細胞からRNAを単離する。このRNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成する。検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体のデータセットを作成し、次にそれを対照発現配列体のデータと対比して、曝露された細胞の調節応答を識別する。調節されていれば、その化合物は細胞の紫外線に対する応答を調節することを示す。次に細胞中の複数RNA分子のレベルを分析して細胞の応答パターン、すなわち第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む応答パターンを確定する。
【0061】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線に対する応答を調節する化合物を検出する他の方法が提供される。これらの方法では、細胞中の複数蛋白質分子の測定を含み、その測定において発現パターンを確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。各種実施例において、この発現パターンは、第一応答グループ、第二応答、及び/又は第三応答を含む。一つの実施例では、第一応答グループが前記第三次の第一応答グループであり、第二応答が前記第三次の第二応答であり、および第三応答が前記第三次の第三応答である。この方法の実施例には、(1)発現パターンが第三次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第三次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第三次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、または(6)発現パターンが第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、が含まれる。
【0062】
これの追加的な実施例では方法が提供され、細胞が、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線に曝露される。この態様の他の実施例では、紫外線に曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である方法が提供される。
【0063】
他の実施例では、細胞の紫外線に対する応答を調節する化合物を検出する方法は、少なくとも一時点で細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定することを含み、その測定において発現パターンを確定し、そのパターンによって紫外線曝露が示される。この実施例において、発現パターンは、前記第四次の第一応答グループである第一応答グループ、前記第四次の第二応答である第二応答、および前記第四次の第三応答である第三応答を含む。
【0064】
他の実施例において、第一応答グループは前記第四次の第一応答グループ、第二応答が前記第四次の第二応答、および第三応答は前記第四次の第三応答である。更に他の実施例には、発現パターンが第四次の第一応答グループ、発現パターンが第四次の第二応答グループ、発現パターンが第四次の第三応答グループ、発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループ、発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第三応答グループ、発現パターンが第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループである。
【0065】
これの追加的な実施例では方法が提供され、紫外線曝露は、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。この態様の他の実施例では、紫外線に曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される。一つの実施例では複数の蛋白質分子のレベルをELISAによって測定する。
【0066】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その少なくとも一つのRNA分子のレベルが、紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第一次の第一応答グループである第一応答グループ、第一次の第二応答グループである第二応答、および第一次の第三応答グループである第三応答の中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子のレベルが第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ及び/又は第一次の第三応答グループに見られる変異発現と実質的に類似しているとの判定は、その化合物が紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートすることを示す。
【0067】
この紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法の他の実施例には、(1)発現パターンが第一次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第一次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第一次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、が含まれる。
【0068】
これの追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される。
【0069】
他の実施例では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法であり、この方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その少なくとも一つのRNA分子のレベルが紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。
【0070】
他の実施例では、この応答には、(1)発現パターンが第二次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第二次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第二次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第二次の第一応答グループと第二次の第二応答グループと第二次の第三応答グループ、が含まれる。
【0071】
この態様の追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)220nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0072】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質分子のレベルを測定し、その少なくとも一つの蛋白質分子のレベルが紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第三次の第一応答グループである第一応答グループ、第三次の第二応答グループである第二応答グループ、および第三次の第三応答グループである第三応答グループの中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つの蛋白質分子のレベルが第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループ及び/又は第三次の第三応答グループに見られる変異発現と実質的に類似しているとの判定は、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートすることを示す。
【0073】
他の実施例では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質分子のレベルを測定し、その少なくとも一つの蛋白質分子のレベルが紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループ、および第三次の第三応答グループの中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。
【0074】
他の実施例では、この応答には、(1)発現パターンが第三次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第三次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第三次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、が含まれる。
【0075】
この態様の追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)220nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0076】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その少なくとも一つの蛋白質分子のレベルが紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第四次の第一応答グループである第一応答グループ、第四次の第二応答グループである第二応答グループ、および第四次の第三応答グループである第三応答グループの中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子のレベルが第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ及び/又は第一次の第三応答グループに見られる変異発現と実質的に類似しているとの判定は、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートすることを示す。
【0077】
他の実施例では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質分子のレベルを測定し、その少なくとも一つの蛋白質分子のレベルが紫外線曝露に対する細胞応答、すなわち第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、および第四次の第三応答グループの中の少なくとも一つによって特徴づけられる細胞応答に見られるものと実質的に類似しているかを判定することを含む。
【0078】
他の実施例では、この応答には、(1)発現パターンが第四次の第一応答グループ、または(2)発現パターンが第四次の第二応答グループ、または(3)発現パターンが第四次の第三応答グループ、または(4)発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループ、または(5)発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第三応答グループ、または(6)発現パターンが第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、または(7)発現パターンが第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、が含まれる。
【0079】
この態様の追加的な実施例では方法が提供され、細胞の紫外線曝露が、(1)220nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(2)約290nmないし320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(3)約320nmないし440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または(4)約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。これの他に提供される実施例では、曝露される細胞が皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0080】
他の態様で、本発明により、細胞の紫外線に対する応答を検出する別の方法が提供される。この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;およびアクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子、および角化エンベロープ蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0081】
この方法の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法は、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によって変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0082】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0083】
本発明では、変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む方法の実施例も提供される。したがって、一つの特別な実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0084】
本発明では、細胞の紫外線曝露を検出する他の方法も提供される。この方法は、少なくとも一時点における細胞中の複数RNA分子のレベルの測定を含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;及び第二次の第三応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0085】
この方法の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法は、また、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によって変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0086】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0087】
本発明では、その方法の実施例も含み、それでは変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む。したがって、一つの特別な実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0088】
本発明の更に他の態様では、細胞中の複数RNA分子のレベルを発現配列体の分析によって測定することを含む、細胞の紫外線に対する応答を検出する方法が提供される。この方法は、紫外線曝露後の細胞からRNAを単離し、そのRNAと相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成することを含む。細胞中の複数RNA分子のレベルを分析して細胞の発現応答パターンを確定する。細胞の紫外線曝露は変異発現パターンによって示され、この変異発現パターンには、(1)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;(2)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答、およびおよびケモカインをコードする核酸分子;(3)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子、および角化エンベロープ蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0089】
この方法の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例も、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によって変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0090】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0091】
本発明では、その方法の実施例も含まれ、それでは変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む。したがって、一つの特別な実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0092】
他の実施例では、本方法は少なくとも一時点における細胞中の複数RNA分子のレベルの測定を含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;及び第二次の第三応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0093】
他の態様で、本発明により、細胞の紫外線に対する曝露を検出する別の方法が提供される。この方法では、少なくとも一時点における細胞中の複数蛋白質のレベルの測定を含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、転写因子蛋白質、シグナル導入蛋白質、およびミトコンドリア蛋白質から成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第一応答;分泌成長因子、サイトカイン、およびケモカインから成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第二応答;およびアクチン結合性蛋白質、デスモゾーム蛋白質、チューブリン蛋白質、および角化エンベロープ蛋白質から成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0094】
この方法の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例も、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によって変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0095】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0096】
本発明では、本方法の実施例を含み、それでは変異発現が蛋白質レベルの増加または減少を含む。したがって、一つの特別な実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0097】
他の態様で、本発明により、細胞の紫外線に対する曝露を検出する別の方法が提供される。この方法は、少なくとも一時点における細胞中の複数蛋白質のレベルの測定を含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択されるポリヌクレオチドがコードするポリペプチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。
【0098】
紫外線曝露を受けた細胞の蛋白質発現プロフィールに関する各種実施例では、ELISAを使用して紫外線曝露を受けたと推定される細胞中の複数蛋白質のレベルを測定する。
【0099】
本発明の他の態様は、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するためのスクリーニング方法に関する。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;(2)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および(3)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子、および角化エンベロープ蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;を含む変異発現パターンを誘起する。次に、細胞中の複数RNA分子のレベルを紫外線曝露後の少なくとも一時点について測定する。第一応答、第二応答及び/又は第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。
【0100】
この方法の一つの実施例では、細胞をin vitroで化合物に接触させる。
【0101】
この方法のもう一つの実施例では、細胞をin vivoで化合物に接触させる。この方法の他の実施例では、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によっても変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0102】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0103】
本発明では、変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む方法の実施例も含む。したがって、一つの特別な実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0104】
本発明の他の態様は、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するためのスクリーニング方法に関する。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、変異発現パターンである応答を誘起する。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;が含まれる。細胞中の複数RNA分子のレベルを紫外線曝露後の少なくとも一時点について測定し、第一応答グループ、第二応答グループ及び/又は第三応答グループの変異発現パターンに変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。
【0105】
この方法の実施例で、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によっても変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0106】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0107】
本発明の更に他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するためのスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞をその化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、変異発現パターンである応答を誘起することを含む。この方法では、紫外線曝露後の細胞からRNAを単離し、このRNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成し、この検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体データセットを作成し、この検定用発現配列体データセットを、薬物の不存在下で紫外線曝露を受けた細胞の応答、すなわち第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループを含む変異発現パターンである応答と対比することを含む。第一次の第一応答、第一次の第二応答及び/又は第一次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。
【0108】
この方法の実施例で、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によっても変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0109】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0110】
本発明には、この方法の他の実施例が含まれる。例えば、一つの実施例では、細胞と化合物の接触は局部的な接触である。別の実施例では、紫外線によって誘起されたRNA発現を阻止することによって、化合物が細胞応答を調節する。別の実施例では、化合物は紫外線によって抑制された発現を阻止する。後の二つの実施例で、紫外線によって誘起された発現は「誘起応答グループ」であり、紫外線によって抑制された発現は「抑制応答グループ」である。
【0111】
本発明の他の態様は、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するためのスクリーニング方法に関する。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)第三次の第一応答グループ;(2)第三次の第二応答グループ;および(3)第三次の第三応答グループ;を含む変異発現パターンを誘起し、細胞中の複数RNA分子のレベルを紫外線曝露後の少なくとも一時点について測定することを含む。第三次の第一応答、第三次の第二応答及び/又は第三次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。
【0112】
このスクリーニング方法の各種実施例において、細胞はin vitroまたはin vivoで化合物に接触する。このスクリーニング方法の他の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線の波長及び/又は紫外線の全量によっても変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0113】
このスクリーニング方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0114】
このスクリーニング方法に関する各種実施例において、ELISAを使用して細胞の複数蛋白質のレベルを測定することにより、その化合物の存在下および不存在下での細胞の紫外線に対する応答を判定する。
【0115】
本発明の他の態様は、紫外線曝露に対する細胞の応答を調節する化合物を検出するためのスクリーニング方法に関する。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)第四次の第一応答グループ;(2)第四次の第二応答グループ;および(3)第四次の第三応答グループ;を含む変異発現パターンを誘起し、細胞中の複数RNA分子のレベルを紫外線曝露後の少なくとも一時点について測定することを含む。第四次の第一応答、第四次の第二応答及び/又は第四次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は紫外線曝露に対する細胞の応答を調節することを示す。
【0116】
このスクリーニング方法の各種実施例において、細胞はin vitroまたはin vivoで化合物に接触する。このスクリーニング方法の他の実施例において、細胞は皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。この方法の実施例は、紫外線の波長及び/又は細胞が曝露される紫外線の全量によっても変化する。例えば、各種実施例において、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0117】
このスクリーニング方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を決定する紫外線曝露後の期間に応じて変化する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、かつ第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0118】
このスクリーニング方法に関する各種実施例において、ELISAを使用して細胞の複数蛋白質のレベルを測定することにより、その化合物の存在下および不存在下での細胞の紫外線に対する応答を判定する。
【0119】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するためのスクリーニング方法が提供される。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その化合物に曝露された後の少なくとも一つの細胞中RNA分子のレベルが、紫外線曝露に応答した細胞中に見られるRNAのレベル、すなわち、細胞の紫外線曝露に対する応答であって第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる応答に実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子の発現レベルが、第一次の第一応答、第一次の第二応答または第一次の第三応答の際にRNA分子に見られる変異発現に実質的に類似していると判定されれば、この化合物は細胞の紫外線に対する応答をシミュレートすることを示す。
【0120】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するためのスクリーニング方法が提供される。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その化合物に曝露された後の少なくとも一つの細胞中RNA分子のレベルが、紫外線曝露に応答した細胞中に見られるRNAのレベル、すなわち、細胞の紫外線曝露に対する応答であって第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる応答に実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子の発現レベルが、第二次の第一応答、第二次の第二応答または第二次の第三応答の際にRNA分子に見られる変異発現に実質的に類似していると判定されれば、この化合物は細胞の紫外線に対する応答をシミュレートすることを示す。
【0121】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するためのスクリーニング方法が提供される。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルを測定し、その化合物に曝露された後の少なくとも一つの細胞中蛋白質のレベルが、紫外線曝露に応答した細胞中に見られる蛋白質のレベル、すなわち、細胞の紫外線曝露に対する応答であって第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループおよび第三次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる応答に実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つの蛋白質の発現レベルが、第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループまたは第三次の第三応答グループの際に蛋白質に見られる変異発現に実質的に類似していると判定されれば、この化合物は細胞の紫外線に対する応答をシミュレートすることを示す。
【0122】
本発明の他の態様では、紫外線曝露に対する細胞の応答をシミュレートする化合物を検出するためのスクリーニング方法が提供される。このスクリーニング方法は、細胞をその化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルを測定し、その化合物に曝露された後の少なくとも一つの細胞中蛋白質のレベルが、紫外線曝露に応答した細胞中に見られる蛋白質のレベル、すなわち、細胞の紫外線曝露に対する応答であって第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループおよび第四次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる応答に実質的に類似しているかを判定することを含む。少なくとも一つの蛋白質の発現レベルが、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループまたは第四次の第三応答グループの際に蛋白質に見られる変異発現に実質的に類似していると判定されれば、この化合物は細胞の紫外線に対する応答をシミュレートすることを示す。
好ましい実施例の詳細な説明
本明細書に引用されている特許および科学文献は、当業者に入手可能な知識を確立する。ここに挙げた米国特許、許可された出願、公開外国出願および参考文献は、参照によりここに取り込む。
【0123】
本発明の態様は、分子生物学、細胞生物学および免疫学の分野に共通の技術および方法を利用する。これらの形式の方法についての有用な研究用文献が当業者に容易に入手可能である。例えば、Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd, edition, Sambrook,J., Fritsch, B,F, and Maniatis,T.,(1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press; Current Protocol In Molecular Biology and Current Protocols in Immunology, Wiley Interscience, New York(19 ); Harlow & Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor,N.Y.(1988)。適切なGenBankアクセッション番号で識別される全核酸配列とそれによってコードされる各アミノ酸配列は、参照によりここに取り込む。この情報は、この中に提供された適切な表によっても開示される。
【0124】
本発明では、細胞の紫外線曝露に対する応答の根底にある分子的異変の詳細な解析を、紫外線曝露に対する応答において発現制御を受ける複数の核酸分子および蛋白質分子の同定によって提示する。これら紫外線で制御を受ける核酸および蛋白質分子は、細胞応答(第一応答、第二応答、および第三応答)との関連で、および発現レベルとの関連で定量的様式(誘起または抑制)にて、更に時間的に特徴づけられる。これらのデータを以下の表に示す。
【0125】
表1は、遺伝子配列上に二回以上生起し、遺伝子配列体ハイブリダイゼーションの正確性に対するモニターとして使用された遺伝子配列のリストを示している。
【表1】
Figure 2004527218
【0126】
および
表2は、紫外線で制御を受けるDNA代謝およびDNA修復遺伝子のリストを示す。
【表2】:紫外線で制御を受ける DNA 代謝および修復の 遺伝子
Figure 2004527218
【0127】
および
表3は、紫外線で制御を受けるシグナルトランスジューサおよび転写因子蛋白質のリストを示す。
【表3】:紫外線で制御を受けるシグナルトランスジューサおよび転写因子
Figure 2004527218
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Figure 2004527218
Figure 2004527218
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【0128】
および
表4は、紫外線で制御を受ける細胞骨格および構造蛋白質のリストを示す。
【表4】:紫外線で制御を受ける細胞骨格および構造蛋白質
Figure 2004527218
Figure 2004527218
【0129】
および
表5は、紫外線で制御を受ける分泌ペプチドのリストを示す。
【表5】:紫外線で制御を受ける分泌ペプチド
Figure 2004527218
【0130】
および
表6は、紫外線で制御を受けるミトコンドリア蛋白質のリストを示す。
【表6】:紫外線で制御を受けるミトコンドリア蛋白質
Figure 2004527218
【0131】
表7は、紫外線で制御を受ける第一、第二および第三応答グループ遺伝子セットのリストを示す。
【表7】:紫外線で制御を受ける第一、第二および第三応答遺伝子セット
Figure 2004527218
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Figure 2004527218
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【0132】
および
表8は、紫外線曝露に対する応答で発現が誘起される遺伝子のリストを示す。
【表8】:紫外線で制御を受ける誘起遺伝子セット
Figure 2004527218
Figure 2004527218
Figure 2004527218
Figure 2004527218
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【0133】
および
表9は、紫外線曝露に対する応答で発現が抑制される遺伝子のリストを示す。
【表9】:紫外線で抑制される遺伝子セット
Figure 2004527218
Figure 2004527218
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【0134】
I. 本発明組成物
本発明は、紫外線曝露を受けた細胞中でのRNAと蛋白質の発現パターンに関する発見を利用している。本発明物質組成物には、紫外線の制御を受けると本発明が確認した複数特定の核酸および蛋白質分子が含まれる。一つの態様では、本発明組成物は、紫外線の制御を受ける核酸分子(表7)の完全リスト群に、ヌクレオチド配列のレベルにおいて少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%。98%、99%、または100%の同一性を有する核酸分子に関する。他の態様では、本発明組成物は、完全リスト群(表7)の相補配列に、ヌクレオチド配列レベルにおいて少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%。98%、99%、または100%の同一性を有する核酸分子に関する。
【0135】
本明細書で使用している「核酸」または「核酸分子」の語は、一本鎖か二本鎖のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドのポリマーと定義され、特に限定しない限り、天然ヌクレオチドの相同物であって天然起源のヌクレオチドと同様の機能が可能であるものを包含する。「オリゴヌクレオチド」は12個塩基プラスN個塩基の一本鎖核酸であり、ここでNは0から500の整数を表す。核酸は当業者に公知の技術を駆使して単離および精製、クローン化、または合成することができる。それらの中には、非天然起源のヌクレオチド相同物、例えば修飾を加えてハイブリダイゼーションを可能にしたものも含まれる。
【0136】
当業者には公知であるが、「配列の同一性比率」または「同一性」は、最適に整列した二つの配列またはサブ配列を比較の窓または長さ全域に渉って比較することにより決定することができる。ここで比較の窓内にあるポリヌクレオチド配列の部分には、比較のための参照配列との二つの配列を最適に整列した場合に(参照配列には含まれていない)追加部分または削除部分(すなわちgaps)が任意に含含まれていてもよい。比率の計算は、先ず両配列において同一のサブユニット(例えば核酸塩基またはアミノ酸残基)が生じている位置の数を勘定して一致位置数を決定し、次にその一致位置数を比較窓内の全位置数で割ってその結果に100を乗じ、配列同一性比率を得る。GAPまたはBESTFITのプログラムを使用して計算すると(上記参照)、gapの重量をデフォルト状態にして配列同一性比率が計算される。
【0137】
比較のために配列を最適に整列するためには、SmithとWatermanの局部的相同アルゴリズム(Adv.Appl.Math.(1981) 2: 482)よっても、NeedlemanとWunschの相同整列アルゴリズム(J.Mol.Biol.(1970) 48: 443)によっても、PearsonとLipmanの類似検査法(Proc.Natl.Acad.Sci.(USA) (1988) 85: 24444)によっても、これらアルゴリズムのコンピュータ処理(Intelligenetics (Mountain View, CA)のPC/GeneプログラムのCLUSTAL、Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group(GCG) (Madison, WI)のGAP、BESTFIT、FASTA、およびTFASTAを含むがこれに限定されない)によっても、あるいは点検によっても行ってよい。特にCLUSTALプログタムを使用する整列配列法はHigginsとSharp (Gene (1988) 73: 237−244)、(CABIOS (1989) 5: 151−153)、またBLASTとPSI−BLASTのプログラムの両者(Altschul, et al. (1997), Nucleic Acids Res.25: 3389−3402)によってよく説明されている。
【0138】
一つの態様として、本発明により、紫外線曝露により発現変異した複数の核酸分子を含む物質組成物が提供される。この組成物の核酸分子は、第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ、および第一次の第三応答グループの少なくとも一つから選択される。または別の実施例として、その組成物は、前記完全リスト群から選択された少なくとも1個、または少なくとも2個、または少なくとも3個、または少なくとも4個、または少なくとも5個、または少なくとも6個、または少なくとも7個、または少なくとも8個、または少なくとも9個、または少なくとも10個であると特定される複数の核酸分子を含む。
【0139】
他の実施例では、物質組成物は複数の核酸分子を含み、その各々は、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ、および第二次の第三応答グループの少なくとも一つから選択されたポリヌクレオチドに、配列レベル上で少なくとも90%、少なくとも91%、、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有する。また他の実施例では、物質組成物は複数の核酸分子を含み、その各々は、前記完全リスト群から選択された少なくとも1個、または少なくとも2個、または少なくとも3個、または少なくとも4個、または少なくとも5個、または少なくとも6個、または少なくとも7個、または少なくとも8個、または少なくとも9個、または少なくとも10個の核酸分子からなるポリヌクレオチド群の中の一員に、配列レベル上で少なくとも90%、少なくとも91%、、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有する。
【0140】
本発明物質組成物は、ここでは「遺伝子配列体」と集合的に呼ぶDNAまたはオリゴヌクレオチドの配列体を生産するのに有用である。遺伝子配列体には、一以上の基質または面(例えば固体、膜、またはゲル)に接合する複数の異なる「プローブ」または「標的」核酸(または他の化合物)が含まれている。遺伝子配列体は、低密度または高密度のフォーマットに構築することができる。高密度遺伝子配列体であれば、1回のテストで多数のハイブリダイゼーションを迅速に、基本的には同時に、評価可能となる。好ましい実施例では、複数の核酸分子(または他の部分)を、1個の連続面または配列体フォーマット内の相互に並列する多数の面に接合する。こうすれば、多数の異なるハイブリダイゼーション反応を基本的に「併行」して進行させることができる。配列体ベースのフォーマット内でハイブリダイゼーション反応を実施する方法は当業者に周知である(例えば、Pastinen (1997) Genome Res. 7: 606−614; Jackson (1996) Nature Biotechnol. 14: 1685; Chee (1995) Science 274: 610; WO96/17958; およびPinkel et al. (1998) Nature Genetics 20: 207−211、これらを参照によりここに取り込む)。
【0141】
本発明の別の実施例は、低密度または高密度の核酸およびオリゴヌクレオチドの配列体に関する。目的用途に応じて、オリゴヌクレオチド、cDNA、ゲノムクローン等を使用して配列体を構築してよく、その判断は当業者の知識範囲内である。典型的には、オリゴヌクレオチド配列体を高密度フォーマットで利用する。したがって、本発明には、紫外線曝露への応答で制御を受けると本発明で確認された核酸分子から特定のオリゴヌクレオチドを選択するオリゴ発現配列体も包まれる。低密度体には、ゲノムクローン、cDNAおよび約500塩基対を越える他のポリヌクレオチドが容易に利用されるが、これらのポリヌクレオチドで高密度配列体を得るには、基質に対してロボットを利用するのが最も簡単である。米国特許5,143,854号、PCT特許公開WO90/15070号およびWO92/10092号には、組合せ光合成を使用する高密度オリゴヌクレオチド配列体が教示されており、また米国特許5,744,305号、5,800,992号、および5,445,934号にも高密度配列体の合成が記載されている。
【0142】
各種基質に核酸を固定化する方法は当分野で、多数既知である。広く各種の、天然または合成の有機および無機ポリマーが、他の材料と共に、遺伝子配列体の固体表面用材料として利用可能である。代表的な固体表面には、例えばニトロセルローズ、ナイロン、ガラス、石英、ジアゾ化した膜(紙またはナイロン)、シリコーン、ポリフォルムアルデヒド、セルローズ、酢酸セルローズが含まれる。更にポリエチレン、ポリプロピレン、ポリスチレン等のプラスチックスが使用可能である。使用可能な他の物質には、紙、セラミックス、金属、半金属、半伝導性材料等が含まれるが、これらに限定されない。更にゲルを形成する物質も使用可能である。そのような材料には、例えば蛋白質(例えばゼラチン)、脂質多糖、珪酸塩、アガローズおよびポリアクリルアミドが含まれる。固体表面が多孔質である場合には、系の性質に応じて各種の孔径が使用可能である。
【0143】
本発明の遺伝子配列体は、市販品としても準備できる。例えば、GeneChip(登録商標)の製造者であるAffymetrix, Inc. (Santa Clara, CA)が提供するサービス部門は独自の合成システムを利用してガラス基質上に核酸の発現配列体を作成している。Affymetrix配列体の構成には多数の遺伝子配列が包含されており、その各々は遺伝子の3’末端側に偏した多数のプローブ対によってプローブ配列体上に示されている。更に、各プローブ対は完全マッチおよびミスマッチのオリゴヌクレオチドから成る。ミスマッチオリゴヌクレオチドは、中央の塩基位置がホモミスマッチであるのを除くと、完全マッチオリゴヌクレオチドと配列は同一なので、この対合関係を利用すれば、非特異的なハイブリダイゼーションと背景シグナルの同定と減算に役立つ。
【0144】
特に好ましい実施例では、物質組成物は、約12個塩基プラスN個塩基の長さのオリゴヌクレオチドとして選択された核酸分子を含む。ここでNは0から500の整数を表す。特に好ましい他の実施例では、物質組成物は、約21個塩基の長さのオリゴヌクレオチドを含み、最も好ましい実施例では、物質組成物が遺伝子配列体として特徴づけられる。オリゴヌクレオチドの特定の配列は、前記完全リスト群(表7)の核酸配列から、または第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ、第二次の第三応答グループ、誘起グループ及び/又は抑制グループの、全て既述の、かつそれぞれ表8と9に見られるものから選択される。
【0145】
更に他の実施例では、物質組成物は複数の核酸分子を含み、各々は、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ、第二次の第三応答グループ、誘起グループ及び/又は抑制グループから成るポリヌクレオチド群の一員の相補性ヌクレオチド配列に少なくとも90%、または91%、または92%、または93%、または94%、または95%、または96%、または97%、または98%、または99%、または100%の同一性を有する。本明細書で使用する「相補性ヌクレオチド配列」の語は、塩基対をマッチングすることにより二本鎖構造を形成することができる核酸塩基配列を指す。例えば、G−T−A−Cに対する相補性配列はC−A−T−Gである。「塩基対のマッチング」の語は、二本鎖核酸(DNAまたはRNA等)の対向鎖に由来する所定のヌクレオチド(アデニンとチミン、グアニンとシトシン)間に生じる水素結合を指す。
【0146】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供される。本発明の医薬組成物には、細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ、第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つの応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。これの各種実施例では、応答は、第一次の第一応答グループ、または第一次の第二応答グループ、または第一次の第三応答グループ、または第一次の第一応答グループと第一次の第二応答グループ、または第一次の第一応答グループと第一次の第三応答グループ、または第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループ、または第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループと第一次の第三応答グループである。
【0147】
細胞が曝露される紫外線には、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーが含まれる。好ましくは、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーに細胞が曝露される。細胞の応答は第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ及び/又は第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つである。この応答が得られる細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞である。
【0148】
本明細書で使用されている「約」の語は「ほぼ」または「概略」または「周辺」または「の範囲における」を意味する。「約」が数値範囲に連結して使用される場合には、この語によってその数値範囲は調整され、その境界は設定数値の上下に拡張する。一般に、本明細書で使用の「約」の語によって、数値はその記載値の上下に20%の変動で調整される。したがって、「約320nm」の句はその数字には20%の変動があることを意味すると解釈する。例えば約320nmは、320nmマイナス(320)(0.2)と、320nmプラス(320)(0.2)の間の全ての数値を指す。
【0149】
特定波長の紫外線に細胞を曝露し紫外線曝露に対する細胞応答を誘起することを当業者は容易に遂行する。限定範囲内または特定波長の紫外線の所定出力を有する紫外線光源を市販品で入手してもよい。例えば、FG15T電球を備えたStratagene 2000照明器を使用すると、紫外線B波長の範囲において最大出力が得られる。また、当業者は、細胞を紫外線に曝露した際に細胞に到達する紫外線エネルギーの全量を決定するための所要の知識を有している。例えば、National Biological Corp.(Twisburg, OH)の照度計UVB−500Cは、紫外線曝露で細胞が受ける紫外線エネルギーの全量を測定するのに有用である。
【0150】
本発明では、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物も提供される。この医薬組成物には、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節するのに十分な量の化合物および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。ここで、その応答は第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ及び/又は第二次の第三応答グループを含む発現パターンによって特徴づけられる。
【0151】
これの他の実施例では、医薬組成物は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節するのに十分な量の化合物および薬理学的に受容可能な担体である。この実施例では、応答は、少なくとも1個、または少なくとも2個、または少なくとも3個、または少なくとも4個、または少なくとも5個、または少なくとも6個、または少なくとも7個、または少なくとも8個、または少なくとも9個、または少なくとも10個の核酸分子の変異発現であって、その各々は、ヌクレオチド配列のレベルにおいて第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ及び/又は第二次の第三応答グループ由来のポリヌクレオチド配列に少なくとも90%、少なくとも91%、、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有する。
【0152】
これの他の特別な実施例では、本発明により細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供される。この実施例では、応答は、紫外線曝露により誘起されるか抑制されるかの発現パターンによって特徴づけられる。更に詳細には、これらの実施例では、応答は誘起応答グループ(表8)または抑制応答グループ(表9)である。
【0153】
本明細書で使用する「細胞」の語には、培地、組織または器官の皮膚細胞(例えば表皮または真皮)またはその前駆体が含まれる。特別な例では、細胞は角質細胞、メラニン細胞、ランゲルハンス細胞、または繊維芽細胞である。
【0154】
「複数のRNA分子」は複合性の高いRNA試料を意味し、ここで使用する「複合性」の語はBritten et al. (Meth. Enzymol. (1974) 29:363)が確定したこの語の標準的な意味に従う。
【0155】
RNA分子または複数のRNA分子のレベルは、当分野で既知の方法で測定してよい。核酸ハイブリダイゼーション法を使用して一以上の遺伝子または本発明のEST(s)(例えばmRNAまたはそれから作られたcDNA)の転写を検出及び/又は定量する方法は当業者に既知である。例えば、遺伝子またはESTの逆転写cDNAの存在、不存在、または存在量を測定する一つの方法には、核酸ハイブリダイゼーション法を使用するサザーンブロットによる転写とその後の定量が必要である。別法ではノーザンブロットでmRNAを直接に測定する。概略すると、mRNAを所与の細胞試料から、例えば酸グアニジウム−フェノール−クロロフォルム抽出法により単離する。次にmRNAを電気泳動してmRNA種を分離し、そのmRNAをゲルからニトロセルローズ膜に転写する。サザンブロットと同様に、標識化プローブを使用して標的mRNAを同定及び/又は定量する。
【0156】
遺伝子及び/又は本発明のEST(s)の検出に使用するプローブの長さはその遺伝子またはESTの全長と同じか短い。短いプローブは、特異性用に経験的にテストされる。核酸プローブの長さは20塩基以上が好ましい(Sambrook et al.前記、核酸ハイブリダイゼーションで使用する核酸プローブ配列を選択する方法、参照)。ハイブリッドした部分を可視化することにより、遺伝子及び/又は本発明のEST(s)の存在または不存在の定性的な判定が可能である。
【0157】
本発明の他の態様で、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供され、それには、細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第三次の第一応答グループ、及び/又は第三次の第二応答グループ及び/又は第三次の第三応答グループを含む発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。その発現パターンは第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループ、及び/又は第三次の第三応答グループであってもよい。他の実施例では、応答は、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、及び/又は第四次の第三応答グループである。応答は、誘起グループから選択された、または抑制グループから選択されたポリヌクレオチドによってコードされる、少なくとも1個、少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、少なくとも5個、少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、または少なくとも10個の蛋白質分子の調節であってもよい。
【0158】
了解事項であるが、ヒト患者に投与される場合には、本発明医薬組成物の一日の全用量は、担当医師によって的確な医療判断の範囲内で決定される。特定の患者に対する特別の治療効果投与量は、例えば以下を含む各種要因に依拠する。すなわち、達成すべき応答の型と程度、もしあれば特別な組成による他の薬剤の使用、患者の年齢、体重、健康状態、性別および食餌、投与時間、投与経路および組成物の排泄速度、治療期間、本発明の特定組成物と組合せまたは同時に使用する薬物(化学療法剤等)、医療分野で周知の同様な因子である。当分野で既知の適切な製剤は、Remington’s Pharmaceutical Sciences (最新版), Mark Publishing Company (Easton, Pa)に見ることができる。
【0159】
更に、医薬組成物は、局所、皮内、皮下、静脈内、腹腔内、筋肉内、または経口等の適切な方法で投与してよい。医薬組成物は、特定の症状の治療及び/又は予防に有効な量で投与される。例示だが、医薬組成物を適用する特別な症状には、皮膚のしわ、皮膚の変色、良性な角質細胞腫瘍(角化棘細胞腫および脂漏性角化症)、前悪性化学線角化症(太陽性角化症)、基底細胞腫や鱗状細胞腫等の悪性皮膚腫瘍、および悪性メラノーマ(これは四つの型に分類される、すなわち、(1)表面拡散性メラノーマ、(2)悪性黒子メラノーマ、(3)肢端黒子症メラノーマ、および(4)結節性メラノーマ)が含まれるがこれらに限られない。
【0160】
本発明の他の態様で、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供され、それには細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。この実施例で、細胞応答の調節は、紫外線曝露で誘起されたRNA発現の阻止または紫外線曝露で抑制されたRNA発現の阻止である。
【0161】
更に他の態様で、本発明により、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供され、それには細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。
【0162】
本発明の他の態様で、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供され、それには細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループおよび第三次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。この実施例で、細胞応答の調節は、紫外線曝露で誘起された蛋白質発現の阻止または紫外線曝露で抑制された蛋白質発現の阻止である。
【0163】
本発明の他の態様で、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する医薬組成物が提供され、それには細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループおよび第四次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む変異発現パターンである応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。この実施例で、細胞応答の調節は、紫外線曝露で誘起された蛋白質発現の阻止または紫外線曝露で抑制された蛋白質発現の阻止である。この実施例で、細胞応答の調節は、紫外線曝露で誘起された蛋白質発現の阻止または紫外線曝露で抑制された蛋白質発現の阻止である。
【0164】
更に他の態様で、本発明により細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち遺伝子発現配列体の分析により判定した変異発現パターンである応答を調節する医薬組成物が提供される。その医薬組成物には、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節するのに十分な量の化合物、および薬理学的に受容可能な担体が含まれる。
【0165】
II. 本発明の方法
A.細胞の紫外線曝露の確認方法
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法は、細胞中の複数のRNA分子または蛋白質分子のレベルの測定を含み、そこでは細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち変異発現パターンを確定し、それによって細胞が紫外線に曝露されたことを示す。これの各種実施例では、細胞応答は第一応答グループ、第二応答グループ及び/又は第三応答グループの中の少なくとも一つを含む。
【0166】
本明細書で使用し、当業者が理解している「変異発現」の語は、一以上の核酸、好ましくは一以上のRNA分子の発現レベルが増加または減少することを指してもよい。また、「変異発現」の語は、一以上の蛋白質分子の発現レベルにおける相対的な増減を指してもよい。また、当業者の了解事項であるが、発現レベルの増減は、被曝したRNAまたは蛋白質分子のいずれかの、RNA分子または蛋白質分子の合成速度、すなわちRNAの転写速度および蛋白質の翻訳速度によって、または安定性変化によってもたらされる。したがって、ここに説明された、紫外線に曝露された細胞の「応答」は、紫外線に曝露されなかった細胞中で発現される核酸分子(例えばRNA)または蛋白質との対比において、全て「変異発現」である。
【0167】
本発明では、紫外線曝露に対する細胞の各種応答が記述される。遺伝子配列体の発現分析を通して、本発明により、紫外線曝露を受けた細胞中で発現変異した遺伝子および蛋白質の範疇化及びリスト化が提供される。下記実施例1で更に詳細に開示するが、遺伝子配列体の発現分析で検討した7,080個の登録遺伝子のうち、およそ3,000が紫外線曝露後の一時点で角質細胞に存在し、そのうちのほぼ1,400は角質細胞が紫外線曝露に対して応答している間は常に存在したと記録された。登録遺伝子のうち308は、少なくとも一時点で少なくとも2.5倍各種の制御を受けた。これら308遺伝子配列のうち、遺伝子上の多重プローブ(例えば、jun−B、c−Myc、Cox−2に対する遺伝子配列)により表示された遺伝子には、特に注意を払った。「制御倍率」の実際の値は変動したが、これらの多重プローブセットには大変に類似した制御パターンが見られ、このことから、ハイブリダイゼーションの忠実度への信頼性が得られた(表1)。ある時点で2.5倍以上の制御を受けると判った308遺伝子のうち、9個の遺伝子配列は別々の時点で2.5以上の誘起および抑制を受けたが、残りの299個の遺伝子配列は誘起グループと抑制グループにそれぞれほぼ同数(152対147)づつに分かれている。
【0168】
クラスター化アルゴリズムを使用して、紫外線曝露後の七つの時点(図2)を、各配列に対する変異発現の時間的生起に従ってグループ化した。時間的に最も密接に関連したのは0.5、1および2時間の時点で、これらは制御を受ける遺伝子および蛋白質の第一の波を形成した。また16および24時間の時点は大変に類似しており、制御を受ける遺伝子および蛋白質の第三の波を形成した。4および8時間の時点は、解析した他の時点とよりも相互に類似し、したがってこれらはグループとして制御を受ける遺伝子および蛋白質の第二の波を形成した。かくして、紫外線曝露によって発現変異する遺伝子および蛋白質の識別に加えて、本発明は、紫外線曝露後の最初の24時間における応答の時間的グループ化、すなわち第一応答(約0.5時間から約2時間)、第二応答(約4時間から約8時間)および第三応答(約16時間から約24時間)のグループ化を提供する。これらの第一、第二、および第三応答は前記にて詳説したように種々に定義されている。
【0169】
一つの実施例で、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法では、応答は第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む。紫外線曝露を受ける細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択される細胞であってよい。細胞は、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む紫外線に曝露される。
【0170】
この方法は更に、第一次の第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に生起する、第一次の第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に生起する、及び/又は第一次の第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に生起することによって特徴づけられる応答を含む。応答は、紫外線曝露を受けていないコントロール細胞における発現との対比で、発現レベルの増加または減少を含む。これらの実施例で、応答は誘起グループ応答かまたは抑制グループ応答である。
【0171】
更に他の実施例では、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法は、細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その方法では、その応答、すなわち発現パターンを確定し、そのパターンによって細胞が紫外線に曝露されたことを示す。この実施例では、応答は第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの中の少なくとも一つの変異応答である。
【0172】
これのある実施例では、応答は、少なくとも1個、または少なくとも2個、または少なくとも3個、または少なくとも4個、または少なくとも5個、または少なくとも6個、または少なくとも7個、または少なくとも8個、または少なくとも9個、または少なくとも10個の核酸分子であって、その各々は、ヌクレオチド配列のレベルにおいて、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ及び/又は第二次の第三応答グループ由来のポリヌクレオチド配列に少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の同一性を有する核酸分子の調節された発現を含む。
【0173】
また、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法は細胞中の複数RNA分子のレベルを発現配列体分析によって測定することを含む。発現配列体の分析は、紫外線曝露後の細胞からRNAを単離し、そのRNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成し、検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体データセットを作成し、検定用発現配列体データセットをコントロールの発現配列体データセットと対比して発現レベルの変異を識別することを含む。次に複数RNA分子のレベルを分析して細胞の応答パターンを確定する。ここで、細胞の紫外線曝露は、第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループ及び/又は第一次の第三応答グループの中の少なくとも一つを含む応答パターンによって示される。
【0174】
この方法では、細胞の応答は、紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に生起する第一応答、紫外線曝露後の約4時間から約8時間に生起する第二応答、および紫外線曝露後の約16時間から約24時間に生起する第三応答によって特徴づけられるときがある。応答は、発現レベルの増加または減少を含む。
【0175】
本発明の他の態様により、細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供される。その方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定することを含み、そこでは蛋白質発現のパターンが確定され、そのパターンによって細胞が紫外線に曝露されたことが示される。この各種実施例で、この発現パターンは第一応答、第二応答及び/又は第三応答を含む。その一つの実施例では、第一応答は前記第三次の第一応答であり、第二応答は前記第三次の第二応答であり、第三応答は前記第三次の第三応答である。発現パターンは、第三次の第一応答、第三次の第二応答グループ、第三次の第三応答グループ、第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループ、第三次の第一応答グループと第三次の第三応答グループ、第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループ、または第三次の第一応答グループと第三次の第二応答グループと第三次の第三応答グループである。
【0176】
他の実施例では、細胞の紫外線曝露を検出する方法は少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定することを含み、その方法では蛋白質発現のパターンを確定し、そのパターンによって細胞が紫外線に曝露されたことが示される。この各種実施例で、第一応答は前記第四次の第一応答であり、第二応答は前記第四次の第二応答であり、第三応答は前記第三次の第三応答である。発現パターンは、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、第四次の第三応答グループ、第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループ、第四次の第一応答グループと第四次の第三応答グループ、第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループ、または第四次の第一応答グループと第四次の第二応答グループと第四次の第三応答グループである。
【0177】
複数蛋白質分子のレベルは、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)により測定するのが好ましい。本発明の他の実施例で、本発明により紫外線で制御を受けると確認された遺伝子配列がコードするポリペプチドは、当業者に周知の多数の方法のいずれかによって検出し定量してよい。これらには、電気泳動、毛細管電気泳動、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、薄層クロマトグラフィー(TLC)、高拡散クロマトグラフィー等の生化学的な分析方法、あるいは流体またはゲル沈降反応、免疫拡散(シングルまたはダブル)、免疫電気泳動、放射線免疫測定(RIA)、蛍光免疫測定、ウエスタンブロット等の各種免疫測定法が含まれる。
【0178】
当業者に既知であるが、ELISA法(Coligan, et al.(1991) Curr. Protocols Immunol.1(2): Chapter 6)では、標的蛋白質に特異的な抗体(好ましくはモノクロナール抗体)の作成を含む。更に、そのモノクロナール抗体に対するレポータ抗体を作成する。放射性同位体、蛍光性タグ、または酵素(例えばセイヨウワサビペルオキシダーゼ)等の検出可能な試薬がレポータ抗体に接合される。試料を宿主から取り、試料中の蛋白質に結合する固相担体(例えばポリスチレン皿)上でインキュベートする。次にウシ血清アルブミンのような非特異的な蛋白質とインキュベートすることにより、皿上の、あらゆるフリーな蛋白質結合性部位を被覆する。次にポリスチレン皿に接合しているあらゆる標的抗体にモノクロナール抗体が接合する。結合しなかったモノクロナール抗体は全て緩衝液で洗去される。次にレポータ抗体を皿に入れる。その結果、レポータ抗体が標的蛋白質に結合したあらゆるモノクロナール抗体に結合する。次に接合しなかったレポータ抗体を皿から洗去する。次に検出可能な試薬を検出し、それによって標的蛋白質に特異的な抗体が結合した問題の蛋白質を識別する。例えば、セイヨウワサビペルオキシダーゼを検出可能なラベルとして使用した場合、ペルオキダーゼの基質を皿に加え、所定の時間内に発色した量が、標準曲線と対比して、所与容積の試料中に存在する標的蛋白質量の測定値である。
【0179】
蛋白質レベルの測定に有用な他の測定法には、放射線免疫検定、競合的結合検定、ウエスタンブロット解析および「サンドイッチ」検定等が含まれる。代表的なサンドイッチ検定法では、標的蛋白質を、固相支持体を覆って通過させ、固相支持体に接合している標的特異性抗体に結合させる。次に第二の抗体を標的蛋白質に結合させる。次に第二の抗体に特異的な、標識化した第三の抗体を固相支持体を覆って通過させ、第二の抗体に結合させる。かくして標的蛋白質の量が間接的に定量可能となる。競合検定法では、標的蛋白質に特異的な抗体を固相支持体に接合し、標識化標的蛋白質と宿主由来の試料を固相支持体上を覆って通過させる。例えば液体シンチレーションクロマトグラフィーで検出した標識の量は、試料中の標的蛋白質の量に相関可能である。
【0180】
遺伝子の転写レベルを定量化する場合に使用する「定量化する」の語は、絶対的または相対的定量化を指すことができる。既知濃度の一以上の標的核酸があり、かつ未知核酸と既知標的核酸とのハイブリダイゼーション強度を参照すれば(例えば標準曲線を作成して)、絶対的定量化を達成することが可能である。他方、二以上の遺伝子間、または二以上の処理物間のハイブリダイゼーションシグナルを比較してハイブリダイゼーション強度および、暗に、転写レベルの変化を定量化することにより、相対的定量化を達成することが可能である。蛋白質の定量化についても同様な方法を採用することができる。
【0181】
別の態様で、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法は、細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち遺伝子発現配列体の分析で測定した変異発現パターンである応答をスクリーニングすることによる。この方法は、(1)紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中複数RNA分子のレベルを測定し、検定用発現パターンを確定すること、および(2)検定用発現パターンを細胞の紫外線曝露に対する応答と対比すること、を含む。細胞の発現パターンが、細胞の紫外線曝露に対する応答に実質的に類似していれば、この細胞は紫外線に曝露されたのである。
【0182】
別の態様で、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する方法が提供され、その方法は細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち遺伝子発現配列体の分析で判断した変異発現パターンである応答をスクリーニングすることによる。この方法は、(1)紫外線曝露後の少なくとも一時点での、細胞中の複数蛋白質のレベルを測定し、検定用発現パターンを確定すること、および(2)検定用発現パターンを細胞の紫外線曝露に対する応答と対比すること、を含む。細胞の発現パターンが細胞の紫外線曝露に対する応答に実質的に類似していれば、この細胞は紫外線に曝露されたのである。
B.細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を識別するスクリーニング方法
本発明には、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が含まれる。このスクリーニング方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して紫外線曝露に対する細胞の応答を誘起し、紫外線曝露後の細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含む。紫外線に対する第一、第二、及び/又は第三応答に変異があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。複数RNA分子のレベルの測定は、紫外線曝露後の一時点または幾つかの時点で行われてよい。
【0183】
「化合物」の語には、有機分子と無機分子の両方が含まれる。また化合物の語は蛋白質、核酸分子、炭水化物、脂質およびこれらの組合せを包含する。
【0184】
当業者が了解していることであるが、細胞を化合物に「接触」させる方法は多数ある。接触はin vivoまたはin vitroでよい。例えば、化合物を燐酸緩衝生理食塩水(PBS)や組織培養培地等のキャリヤー液状媒体中に置き、細胞をこの媒体中でインキュベートするときに、化合物が細胞に接触または作用する。あるいは、局部適用のクリームまたはゲルを介して接触してもよい。
【0185】
化合物に接触した細胞は、培地中の細胞、単離した組織中の細胞、または生物体中の細胞であって、皮膚細胞(表皮または真皮)のような細胞である。すなわち、細胞を角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択してもよい。細胞は、約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギー、または約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーから成る紫外線に曝露される。
【0186】
細胞の応答は、紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に生起する第一次の第一応答、紫外線曝露後の約4時間から約8時間に生起する第一次の第二応答、及び/又は紫外線曝露後の約16時間から約24時間に生起する第一次の第三応答、の少なくとも一つによって特徴づけられる。発現パターンは、発現レベルの増加または減少を含む。これらの実施例で、応答は誘起応答または抑制応答のいずれか、または誘起応答と抑制応答の両方を含む。
【0187】
好ましくは、このスクリーニング方法により、細胞の紫外線に対する応答、すなわち少なくとも1個、または少なくとも2個、または少なくとも3個、または少なくとも4個、または少なくとも5個、または少なくとも6個、または少なくとも7個、または少なくとも8個、または少なくとも9個、または少なくとも10個の核酸分子であって、その各々がヌクレオチド配列のレベルにおいて、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループ及び/又は第二次の第三応答グループ由来のポリヌクレオチド配列に少なくとも90%、または少なくとも91%、または少なくとも92%、または少なくとも93%、または少なくとも94%、または少なくとも95%、または少なくとも96%、または少なくとも97%、または少なくとも98%、または少なくとも99%、または100%の同一性性を有する核酸分子の変異発現である応答を調節する化合物が提供される。
【0188】
このスクリーニング方法では、発現配列体の分析により複数RNAのレベルが測定されるのが好ましい。この分析は、紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞からRNAを単離し、この単離RNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成し、検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体データセットを作成することを含む。次に検定用およびコントロール用のデータセットを対比し、紫外線に曝露された細胞の応答を調節するかを識別する。調節があれば、その化合物は紫外線に曝露された細胞の応答を調節することを示す。紫外線に曝露される細胞のタイプ、および紫外線エネルギーレベルは前記と同じである。
【0189】
ある実施例では、細胞の応答は、紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に生起する第二次の第一応答、紫外線曝露後の約4時間から約8時間に生起する第二次の第二応答、および紫外線曝露後の約16時間から約24時間に生起する第二次の第三応答によって特徴づけられる。上記方法の他の各種実施例には、「変異発現」が発現レベルの増加を含む、または「変異発現」が発現レベルの減少を含む方法が含まれる。
【0190】
別の態様で、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する他の方法が提供される。この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定しそれによって紫外線曝露が示される。このパターンには、転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;およびアクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答を含む。
【0191】
この方法の実施例で、細胞は、培地中の、単離した組織中の、または生物体中の細胞であって、例えば皮膚細胞(表皮または真皮)である。例えば、細胞は角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞または繊維芽細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全照射曝露エネルギーを含む。
【0192】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0193】
また本発明により、変異発現にRNAレベルの増加または減少が含まれる方法の実施例が提供される。したがって、特殊な一つの実施例では、第一応答グループ及び/又は第二応答グループ及び/又は第三応答グループの一つの発現レベルが増加する。他の実施例では第一応答グループ及び/又は第二応答グループ及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0194】
本発明によって、細胞の紫外線曝露を検出する別の方法も提供される。この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定しそれによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答が含まれる。
【0195】
この方法の実施例で、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全照射曝露エネルギーを含む。
【0196】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0197】
本発明には、変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む方法の実施例も含まれる。したがって、特殊な一つの実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0198】
本発明の更に他の態様では、細胞の紫外線曝露を検出する方法であって、発現配列体の分析により細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含む方法が提供される。この方法は、紫外線曝露後の細胞からRNAを単離し、この単離RNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成することを含む。細胞中の複数RNA分子のレベルを分析することにより、細胞の発現応答パターンを確定する。細胞の紫外線曝露は、(1)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;(2)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および(3)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;を含む変異発現パターンによって示される。
【0199】
この方法の実施例で、細胞は、培地中の、単離した組織中の、または生物体中の細胞であって、例えば皮膚細胞(表皮または真皮)である。例えば、細胞は角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞または繊維芽細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば、各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0200】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0201】
本発明には、変異発現がRNAレベルの増加または減少を含む方法の実施例が含まれる。したがって、特殊な一つの実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0202】
他の実施例では、この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答が含まれる。
【0203】
別の態様で、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する他の方法が提供される。この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、転写因子蛋白質、シグナル導入蛋白質、およびミトコンドリア蛋白質から成る群から選択された少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第一応答;分泌成長因子、サイトカイン、およびケモカインから成る群から選択された少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第二応答;およびアクチン結合性蛋白質、デスモゾーム蛋白質、チューブリン蛋白質、および角化エンベロープ蛋白質から成る群から選択された少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第三応答が含まれる。
【0204】
この方法の実施例で、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば、各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0205】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0206】
本発明には、変異発現が蛋白質レベルの増加または減少を含む方法の実施例も含まれる。したがって、特殊な一つの実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0207】
他の実施例では、本発明により細胞の紫外線曝露を検出する別の方法が提供される。この方法は、少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定することを含み、その測定において変異発現パターンを確定し、それによって紫外線曝露が示される。このパターンには、第二次の第一応答グループから成る群から選択されたポリヌクレオチドがコードするポリペプチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答が含まれる。
【0208】
紫外線に曝露された細胞の蛋白質発現プロフィールを作成することに関連する各種実施例では、ELISAを使用して、曝露されたとされる細胞中に発現した複数蛋白質のレベルを測定する。
【0209】
本発明の他の態様は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法に関する。この方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;(2)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および(3)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子、角化エンベロープ蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答、を含む変異発現パターンである応答を誘起し、そして紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含む。第一応答、第二応答及び/又は第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0210】
この方法の一つの実施例では、細胞をin vitroで化合物に接触させる。
【0211】
この方法の他の実施例では、細胞をin vivoで化合物に接触させる。この方法の他の実施例では、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば、各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含有する。
【0212】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0213】
本発明には、変異発現にRNAレベルの増加または減少が含まれる方法の実施例も含まれる。したがって、特殊な一つの実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが増加する。他の実施例では、第一応答グループ、及び/又は第二応答グループ、及び/又は第三応答グループの一員の発現レベルが減少する。
【0214】
本発明の他の態様は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法に関する。この方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、変異発現パターンである応答を誘起する。このパターンは、第二次の第一応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;第二次の第二応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および第二次の第三応答グループから成る群から選択された少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答、を含む。紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定し、第一応答グループ、第二応答グループ及び/又は第三応答グループの変異発現パターンに変化があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0215】
この方法の実施例では、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0216】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0217】
本発明の更に他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、変異発現パターンである応答を誘起することを含む。この方法は、紫外線曝露後の細胞からRNAを単離し、そのRNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを経由して検定用発現配列体を作成し、検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体データセットを作成し、検定用発現配列体データセットを薬物の不存在下で紫外線曝露した細胞の応答、すなわち第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループを含む変異発現パターンである応答と対比することを含む。第一次の第一応答、第一次の第二応答及び/又は第一次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0218】
この方法の実施例では、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0219】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0220】
本発明には、この方法の他の実施例が含まれる。例えば、一つの実施例では、細胞と化合物の接触は局所接触であり、または他の実施例では化合物は紫外線で誘起されるRNA発現を阻止することにより細胞応答を調節し、または他の実施例では化合物は紫外線で抑制されるRNA発現を阻止することにより細胞応答を調節する。後者の二つの実施例で、紫外線で誘起されるRNA発現は「誘起応答グループ」であり、紫外線で抑制されるRNA発現は「抑制応答グループ」である。
【0221】
本発明の他の態様は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法に関する。このスクリーニング方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)第三次の第一応答グループ;(2)第三次の第二応答グループ;および(3)第三次の第三応答グループ、を含む変異発現パターンを誘起し、そして紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含む。第三次の第一応答、第三次の第二応答及び/又は第三次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0222】
この方法の各種実施例では、細胞をin vitroまたはin vivoで化合物に接触させる。このスクリーニング方法の他の実施例では、細胞は、皮膚細胞(表皮または真皮)、あるいは角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択された細胞である。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0223】
この方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0224】
このスクリーニング方法に関連する各種実施例では、化合物の存在下および不存在下における細胞の紫外線に対する応答を測定する際に、ELISAを使用して細胞中の複数蛋白質のレベルを測定する。
【0225】
本発明の他の態様は、細胞の紫外線曝露に対する応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法に関する。このスクリーニング方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して細胞の応答、すなわち、(1)第四次の第一応答グループ;(2)第四次の第二応答グループ;および(3)第四次の第三応答を含む変異発現パターンを誘起し、そして紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定することを含む。第四次の第一応答、第四次の第二応答及び/又は第四次の第三応答の変異発現パターンに変化があれば、その化合物は細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0226】
このスクリーニング方法の各種実施例では、細胞をin vitroまたはin vivoで化合物に接触させる。細胞は、培地、組織、または生物体の中の細胞であって、例えば皮膚細胞(表皮または真皮)である。細胞は、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞であってよい。この方法の実施例は、細胞が曝露される紫外線波長及び/又は紫外線の全量によっても変動する。例えば、各種実施例で、紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長の紫外線エネルギーを含み、または紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含む。
【0227】
このスクリーニング方法の他の実施例は、第一応答、第二応答および第三応答を定義する紫外線曝露後の時間によって変動する。一つの実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する。他の実施例では、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する。他の実施例では、第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。他の実施例では、第一応答が紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在し、第二応答が紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在し、および第三応答が紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する。
【0228】
このスクリーニング方法に関連する各種実施例では、化合物の存在下および不存在下における細胞の紫外線に対する応答を測定する際に、ELISAを使用して細胞中の複数蛋白質のレベルを測定する。
【0229】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供され、この方法は、細胞を化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その化合物に曝露後の細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルが、紫外線曝露への応答、すなわち、第一次の第一応答グループ、第一次の第二応答グループおよび第一次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる、細胞の紫外線曝露に対する応答の際に細胞中に見られるRNAレベルに実質的に類似するかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子の発現レベルが第一次の第一応答、第一次の第二応答または第一次の第三応答におけるRNA分子の変異発現に実質的に類似していると判定されれば、その化合物が細胞の紫外線曝露をシミュレートすることを示す。
【0230】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供され、この方法は、細胞を化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルを測定し、その化合物に曝露後の細胞中の少なくとも一つのRNA分子のレベルが紫外線曝露への応答、すなわち、第二次の第一応答グループ、第二次の第二応答グループおよび第二次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる、細胞の紫外線曝露に対する応答の際に細胞中に見られるRNAレベルに実質的に類似するかを判定することを含む。少なくとも一つのRNA分子の発現レベルが、第二次の第一応答、第二次の第二応答または第二次の第三応答におけるRNA分子の変異発現に実質的に類似していると判定されれば、その化合物が細胞の紫外線曝露をシミュレートすることを示す。
【0231】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供され、この方法は、細胞を化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルを測定し、その化合物に曝露後の細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルが紫外線曝露への応答、すなわち、第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループおよび第三次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる、細胞の紫外線曝露に対する応答の際に細胞中に見られる蛋白質レベルに実質的に類似するかを判定することを含む。少なくとも一つの蛋白質の発現レベルが、第三次の第一応答グループ、第三次の第二応答グループまたは第三次の第三応答グループにおける蛋白質の変異発現に実質的に類似していると判定されれば、その化合物が細胞の紫外線曝露をシミュレートすることを示す。
【0232】
本発明の他の態様では、細胞の紫外線曝露に対する応答をシミュレートする化合物を検出するスクリーニング方法が提供され、この方法は、細胞を化合物に接触させ、接触細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルを測定し、その化合物に曝露後の細胞中の少なくとも一つの蛋白質のレベルが紫外線曝露への応答、すなわち、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループおよび第四次の第三応答グループの変異発現によって特徴づけられる、細胞の紫外線曝露に対する応答の際に細胞中に見られる蛋白質レベルに実質的に類似するかを判定することを含む。少なくとも一つの蛋白質の発現レベルが、第四次の第一応答グループ、第四次の第二応答グループ、または第四次の第三応答グループにおける蛋白質の変異発現に実質的に類似していると判定されれば、その化合物が細胞の紫外線曝露をシミュレートすることを示す。
【0233】
更に他の態様で、本発明により、細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち遺伝子発現配列体の分析によって決定した変異発現パターンである応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して紫外線曝露に対する細胞の応答を誘起し、紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを遺伝子発現配列体の分析によって測定することを含む。細胞の紫外線曝露に対する応答に変化があれば、その化合物が細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0234】
更に他の態様で、本発明により、細胞の紫外線曝露に対する応答、すなわち遺伝子発現配列体の分析によって決定した変異発現パターンである応答を調節する化合物を検出するスクリーニング方法が提供される。この方法は、細胞を化合物に接触させ、その細胞を紫外線に曝露して紫外線曝露に対する細胞の応答を誘起し、紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質のレベルを遺伝子発現配列体の分析によって測定することを含む。細胞の紫外線曝露に対する応答に変化があれば、その化合物が細胞の紫外線曝露に対する応答を調節することを示す。
【0235】
C. 治療方法
本発明により、個体の皮膚の急速な老化、ならびに皮膚癌および他の疾患を治療または予防する方法が提供される。個体のためのこのような治療の立案において、本発明の、紫外線で制御を受ける核酸分子および蛋白質を使用することができる。本明細書で使用する「個体」の語は、哺乳動物、更に好ましくはヒトを指す。
【0236】
本発明の一つの実施例では、治療上の処置は、既知の遺伝子治療技法により達成される。遺伝子治療の適用に適する遺伝子運搬用担体は当業者に周知である。例えば、遺伝子運搬用担体は好ましくはウイルスベクターであり、更に好ましくは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、ヘルペスウイルス、あるいはアルファウイルスベクターである。ウイルスベクターには、アストロウイルス、コロナウイルス、オルトミクソウイルス、パポバウイルス、パラミクソウイルス、パルボウイルス、ピコルナウイルス、ポックスウイルス、またはトガウイルスのウイルスベクターも可能である(Jolly (1994) Cancer Gene Ther. 1: 51−64; Kimura (1994) Hum. Gene Ther. 5: 845−852; Connelly (1995) Hum. Gene Ther. 6: 185−193;および Kaplitt (1994) Nat. Genet. 6: 143−153)。
【0237】
本発明の遺伝子治療構造体の細胞への運搬体は、上記のウイルスベクターに限定されない。他の運搬方法と媒体、例えば核酸発現ベクター、死滅アデノウイルス単体に結合または非結合のポリカチオン性縮合DNA(例えば、Curiel (1992) Hum. Gene Ther. 3: 147−154参照)、リガンド結合DNA(例えばWu (1989) J. Biol. Chem. 264: 16985− 16987参照)、光重合ヒドロゲル材の沈殿物、携帯用遺伝子導入粒子銃(例えば、米国特許5,149,655号)、イオン化照射(例えば、米国特許5,206,152号およびPCT特許公開WO92/11033号)、あるいは核の電荷の中和または細胞膜との融合、も採用してよい。更なるアプローチはPhilip ((1994) Mol. Cell. Biol. 14: 2411−2418)およびWoffendin ((1994) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA)91: 1581−1585)に記載されている。
【0238】
概要すると、問題の配列は、高レベル発現のための通常の制御配列を含有する通常のベクトルに挿入し、次にポリリジン、プロタミン、アルブミンのごとき重合体DNA結合性カチオン等の合成遺伝子導入分子であって、Wu et al. (J. Biol. Chem. (1987) 262: 4429−4432)に記載のアシアロオロソムコイド、Hucked (Biochem. Pharmacol. (1990) 40: 253−263)に記載のインシュリン、Plank (Bioconjugate Chem. (1992) 3: 533−539)に記載のガラクトース、ラクトースまたはトランスフェリン等の細胞標的リガンドに結合したものとインキュベートすることができる。また裸のDNAを使用してもよい。裸のDNAを導入する典型的な方法は、PCT特許公開WO90/11092号および米国特許5,580,859号に記載されている。生分解性ラテックスビーズを使用すると、導入効率は向上する可能性がある。DNAを被覆したラテックスビーズで細胞へのエンドサイトーシスを開始してからビーズを細胞中に移植すると効率的である。この方法は、ビーズを処理してその疎水性を増加し、それによってエンドソームの破壊とDNAの細胞質内への導入を容易にすることにより、更に改良される。遺伝子運搬担体として機能するリポソームは、米国特許5,422,120号、PCT特許公開WO95/13796号、WO94/23697号、WO91/144445号、及びEP特許524,968号に記載されている。
【0239】
遺伝子治療の可能な標的細胞には、皮膚細胞(表皮および真皮)、および更に具体的には角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラノ細胞、及び/又は繊維芽細胞が含まれる。表皮細胞に特異的な遺伝子治療は当分野で公知である(Ohsawa et al. (2000) J. Dermatol. 27(4):244−251; Ina et al. (2000) Acta. Derm. Venereol. 80(1):10−13; Bevan et al. (1999) Biotechnol. Genet. Eng. Rev. 16:231−256; および Pellegrini et al. (1998) Med. Biol. Eng. Comput. 36(6):778−790)。
【0240】
本発明によって、ここに、紫外線曝露で制御を受ける多数の核酸分子および蛋白質分子の識別が提供される。これら分子のいずれか一以上を遺伝子治療プロトコールで使用する標的にしてもよい。
【0241】
紫外線曝露で制御を受ける核酸の中には、数種類の異なるかつ明瞭に区別される機能的範疇にグループ分け可能な遺伝子がある。すなわち、(1)誘起されたDNAの代謝と修復の遺伝子;(2)全ての実験時点で誘起及び/又は抑制されるシグナル導入蛋白質と転写因子;(3)中間時点での分泌増殖因子、ケモカイン、サイトカイン;(4) 誘起および抑制される構造蛋白質;および(5)ミトコンドリア蛋白質、これは紫外線曝露に応答して最初に誘起される仲間である。更に、紫外線により制御を受けるのは、翻訳機構、RNA加工、脂質、アミノ酸および尿素の代謝に係わる蛋白質、内在性膜蛋白質と細胞表面蛋白質、プロテアーゼとその阻止剤、以上の範疇に分類できない蛋白質、ならびに識別されない数種のESTに対する遺伝子である。
【0242】
(1)DNAの代謝と修復に係わる蛋白質
紫外線の最も悪評の高い効果の一つは、DNAの損傷とその結果としての突然変異誘発である。哺乳動物の細胞では、各種のDNA損傷性薬剤が各種の修復プロセスを活性化する(例えば Wang, et al. (1998) Curr. Opin. Cell Biol. 10(3): 416); および Wang et al. (1998) Curr. Opin. Cell Biol. 10: 240−7))。紫外線で起きたDNAの障害は、主としてヌクレオチドの切除修復システム(NER)により修復される(Lowndes, et al. (2000) Curr. Opin. Genet. Dev. 10: 17−25; Batty et al. (2000) Gene 241: 193−204)。紫外線を受けると、DNA鎖間架橋の修復に必須な蛋白質であるERCC4の発現が誘起される(表2)。他の数種の修復酵素、例えば切除修復蛋白質ERCC1、ミスマッチ修復蛋白質hmlh1が、XP−C,XP−G,XP−EおよびXRCC1と共に、角質細胞に存在しているが、紫外線によって更に誘起されることはない。また紫外線により、DNA合成のための建築用ブロックを生産する酵素、例えばグアニル酸キナーゼ、ヌクレオチド−ジ燐酸キナーゼ、シチジン脱アミン酵素、トランスアルドラーゼに対する遺伝子が誘起される。同様に、紫外線により、幼弱なDNAを損傷から防護する役割を演ずるヒストンH2A.2、 H2B.1、 H2A.X、 H1xおよび H2A.Zの発現が誘起される。DNA修復蛋白質の大部分は紫外線処理前でさえも角質細胞に十分存在するが、紫外線曝露後に、細胞はdNTPとヒストンを一層生産し、新に修復されるDNAの構築と防護を行う。
【0243】
紫外線により、DNA損傷誘起性蛋白質gadd45, シクリン G1 および BTG2の発現が制御される。これらの蛋白質は細胞サイクルの停止に役割を有し、この停止により角質細胞はスペルミジン/スペルミンni−アセチル基転移酵素と共に、DNAを、また数種の増殖制御性癌遺伝子を修復することができる(Jin, et al. (2000) J. Biol. Chem. 275: 16602−16608; Cortes, et al. (2000) Mol. Carcinog. 27: 57−64; van Lookeren Campagne, et al. (1998) J. Neurosci. Res. 53: 279−296; および Alhonen et al. (1999) Mol. Pharmacol. 55: 693−698)。予期されるように、これら蛋白質の制御は、しばしば複雑である。例えば、シクリンG1の発現は紫外線曝露後の4時間および8時間の時点では抑制されるが、24時間の時点では誘起される(表2)。これらの蛋白質はDNAの修復と細胞サイクルとを統合していると考えられる。
【0244】
(2)シグナルトランスデューサおよび転写因子
角質細胞中の紫外線で制御を受けるシグナル蛋白質は、かなり複雑な制御パターンを呈する。シグナル蛋白質には、誘起されるもの、抑制されるも、最初は誘起され次に抑制されるもの、またこれと反対のものがある。シグナル蛋白質は、紫外線によって影響を受ける多様なプロセスに応じて、数種の範疇にグループ分けできる。
【0245】
細胞表面の受容体(表3)は、ウロキナーゼ型プラスミノーゲンの受容体を除いて、紫外線で抑制される。これらには、IL−4−R、TNFαR、TGF−βIIR、T−細胞受容体活性β−鎖、LDL受容体、v−erbA 関連 ear−2 受容体、システインに富む繊維芽増殖因子受容体(CFR−1)および新規増殖因子受容体が含まれる。受容体関連蛋白質も一般に抑制される。これらには、Fas−結合性蛋白質 (DAXX)、HM74、pSK1 インターフェロンガンマ受容体補助因子−1、および SH2含有蛋白質であるSHBが含まれる。EGFR 関連蛋白質である BTG1 (Tob)は紫外線により誘起され、他方近い親戚(BTG2 Job2、TIS21、PC3)は抑制されるが、両者とも抗増殖性である。対照的に、種々の受容体、増殖因子およびサイトカインに対するリガンドは、照射後4および8時間で誘起される(後記参照)。
【0246】
重要なことに、紫外線により約12個の小さなGTP結合性蛋白質とその関連因子は制御を受ける(表3)。Rasファミリーの一員であるRadや、Ly−GDI、RGL2 および G(i) 蛋白質αサブユニットは、種々の時点で紫外線により誘起され、他方ADPリボシル化因子hARF1 および hARF6、Rab GDI、ras ファミリーのrab2 YPTI−関連メンバー(全て嚢胞輸送に関連)およびGAP因子であるチューブリン TSC2は全て、種々の時点で抑制される。また、数種の容易には分類されないシグナル蛋白質、例えばプロゲステロン受容体−関連イムノフィリン FKBP54 および α−4、ラパマイシン−感受性経路蛋白質、ならびに二つの熱ショック蛋白質、熱ショック蛋白質40および熱ショック蛋白質70、および HSP−関連蛋白質(表3)は、紫外線によって種々の時点で抑制される。
【0247】
細胞内シグナルの大部分のプロセスには蛋白質の燐酸化が関与しているので、蛋白質のキナーゼとフォスファターゼは制御を受ける遺伝子に属する(表3)。二重の特異性を有するフォスファターゼCL100は、紫外線由来シグナルの導入を停止する役割を有するマウスMKPIのヒトでの相同体であるが、これも紫外線により誘起される(Hirsch et al. (1997) J. Biol. Chem. 272: 4568−4575)。三つのRING3ファミリーの蛋白質、MAPKAPキナーゼ(3pK) および蛋白質キナーゼ阻止剤である嚢胞性繊維症抗原は紫外線により種々の時点で誘起される。反対に、以下のキナーゼは種々の時点で抑制される。すなわち、G 蛋白質−結合受容体キナーゼ GRK6、セリン/スレオニン蛋白質キナーゼ (A−Raf−1)、カゼインキナーゼ CKI−α および CKII−α、ERK3、LIMK−2、精巣−特異性蛋白質キナーゼα−サブユニット、H−pim−1 および raf関連蛋白質 pks/a−raf。またフォスファターゼ PP2A,−Cα、PPlγ および PTP1も抑制される。
【0248】
数種の転写因子は初期時点で誘起される遺伝子に属する(表3)。最初の二時間で最高に誘起されるのは、前初期遺伝子であるjunb、junD、およびc−fos、ETR101, A20およびGOS24 (a/k/a TTP、Nup475、Zfp36 および TIS11 (Heximer SP、Forsdyke DRI))である。これらの誘起は短命であり、4時間までに大部分が、16時間までには全てが、バックグランドのレベルの発現になるか、またはかえって抑制される。junB、junD、および c−fos は AP1ファミリーの蛋白質をコードする遺伝子である。これらには、例えばマトリックス金属プロテアーゼのように、既知の紫外線で活性化する多数の遺伝子を誘起する役割がある。AP1蛋白質は生体表皮においてin vivoで紫外線により活性化され、ヒトでの太陽損傷の原因となっている可能性がある。これらの機能はレチノイドにより阻害される。レチノイン酸受容体の皮膚特異的な異型体RARyは紫外線で抑制される。四つの転写因子、Nup475 (a/k/a TTP、Zfp36 および TIS11)、HRY、XBP−1、および EGR1 (a/k/a Krox−24)での他の前初期遺伝子は、紫外線により先ず誘起され、次に抑制される。
【0249】
AP1−RARγ、NFκB−IκB および C/EBPp−CHOPのように、拮抗的に結合した転写対の一方が増強され他方が抑制されるモチーフは、c−Mycの抑制因子であるMMIを誘起し、他方c−Myc自体を強力かつ持続的に抑制することに注目すべきである。これは、c−Mycの役割、すなわち、細胞増殖を調節解除し、ゲノムの不安定性を促進し、アポトーシスに向け増感し、そしてDNA損傷により誘起される増殖停止蛋白質gadd34, gadd45 および gadd153を抑制する機能に整合している (Amundson et al. (1998) Oncogene, 17:2149−54); Felsher et al. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci (USA), 96:3940−4; Pelengaris, et al. (2000) Curr. Opin. Genet. Dev., 10:100−5)。c−Mycが上皮を標的にして過剰発現すると、良性ではあるが、前悪性の拡大型上皮増殖が起こり、これは紫外線で誘起されたDNA損傷がある場合には不利益である。
【0250】
紫外線によりNFκBは抑制され、他方IκB−様蛋白質は誘起される。このことが特に興味深い理由は、NFκB転写因子は紫外線により活性化されるからである。これの合成が抑制され、これの抑制因子が誘起されると、紫外線の最初のシグナルは減衰する可能性がある。これは、二重の特異性を有しJNK経路を減衰させるキナーゼであるMKP1を誘起するのと似ている。同様に、C/EBPβは誘起され、他方それの抑制因子である CHOP (GADD153) および C/EBPεは抑制される。
【0251】
遅い時点で顕著に誘起されるのは、RNA pol 11の三つの成分、すなわちその最大のサブユニットであるRP135 および RPB10、ならびにTATA−box結合性蛋白質関連因子であるtaf1130であり、転写を増強するように細胞に働きかける。反対に、転写延長化因子ELL2およびSIIは紫外線により抑制される。転座により発癌遺伝子となる二つの転写因子ALL−1およびPML−2は紫外線により誘起される。逆に二つのホメオボックス蛋白質TGIFおよびHB9は抑制される。
【0252】
その他の数種の転写因子、例えばets−2, BTEB2, SRF, ZFY, ERF−2, HLH−lR21, HTF10, AREB6等は紫外線により抑制される。角質細胞の基底細胞マーカーを合成する任務の転写因子AP2は、紫外線により抑制される。見かけ上、角質細胞は、紫外線に応答した場合には基底細胞の表現型を放棄し、代わりに、傷の癒えたあるいは乾癬状の角質細胞にもっと類似する、活性化した表現型に切換わる。
【0253】
(3)分泌ポリペプチド、増殖因子、サイトカインおよびケモカイン
中間的な応答において、制御を受けた遺伝子の中で最も顕著なグループは分泌蛋白質、増殖因子、サイトカインおよびケモカインである(表5)。特にIL−8ファミリーのメンバー、すなわちIL−8, gro−a, gro−0, および MIP2−0が誘起される (Geiser et al. (1993) J. Biol. Chem. 268: 15419−24; Kemeny et al. (1995) Int. Arch. Allergy Immunol. 106: 351−6)。これらのペプチドは走化性であり、活性化して好中球、好塩基球およびマクロファージに作用し、およびおそらく紫外線で損傷を受けた組織に炎症性細胞を誘致する役割を演じている。重要なことに、これらはまたメラニン細胞を活性化し、それが紫外線に対する応答においてタンニン化を招来する可能性がある。
【0254】
ヘパリン結合性増殖因子 (HB−EGF) は誘起され、他方アンフィレギュリン (AR) は抑制される。両者とも EGF 受容体の活性化因子であり、おそらく角質細胞を活性化する自己分泌性因子である。14 kD レクチン、apo−E およびCTGF 等の他の更なる分泌蛋白質も誘起される。ペプチジル−プロリルイソメラーゼであるSCYLPも誘起され、これは光老齢化に関連するコラーゲンおよび他のプロリンに富む細胞外マトリックス蛋白質の成熟に役割を演じている可能性がある。
【0255】
分泌ペプチドには、損傷が生起していることを周囲の組織に警告する機能がある。その効果は、パラ分泌、すなわちメラニン細胞、内皮細胞、好中球および繊維芽細胞の活性化、ならびに自己分泌、あるいは角質細胞自体への警告である。
【0256】
IL−8等、紫外線で誘起される数種の遺伝子はインターフェロンγによって誘起可能であることが以前に判っている(Fujisawa et al. (1997) J. Interferon Cytokine Res. 17:347−353; Aragane et al. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 94: 11490−11495)。これらの遺伝子は紫外線照射後の遅い時点で誘起され、p27, 17−kD/15−kD蛋白質, IRF 7A, 1−81 遺伝子, hPA28−β, インターフェロンガンマ受容体補助因子−1 および STAT 5が挙げられる。これらの結果は、紫外線とインターフェロン−7シグナリングの間に因果関係があること示しているかもしれない。
【0257】
(4)構造蛋白質
紫外線で制御を受ける構造蛋白質で主要なものは、細胞骨格蛋白質、特にアクチン結合性蛋白質 (ABPs), デスモソーム成分、および三つのチューブリンサブユニット、ならびに角化エンベロープの成分、角質細胞分化のマーカーである(表4)。
【0258】
アクチンは原形質膜の形状に影響を及ぼし、細胞の自動性を可能にし、細胞の形状と極性を維持する。これらの仕事を達成するために、アクチンは、ほぼ60の各種 ABPsと共同作業をする。この各種 ABPs は相互に協調または競合して、アクチン活性を補佐する (Kreis および Vale, Guidebook to the cytoskeletal and Motor Proteins, 2nd ed., New York: Oxford University Press (1999))。初期に紫外線で誘起されるABPs は、ゲルソリンおよびトロポニンをコードする遺伝子である。ゲルソリンはアクチン重合の核となるが、Ca2+濃度が高い場合にはアクチンのフィラメント化に寄与し、次に放出されてアクチン遊離末端の重合を可能にする。したがって、ゲルソリンによって大細胞の細胞質流動が起こり、そのプロセスで代謝物の細胞質内均等分布が維持され、細胞形状が変化する。ゲルソリンを欠くマウス細胞では細胞の自動性が欠乏する (Barkalow et al. (1996) J. Cell Biol. 134: 389−399; Witke et al. (1995) Cell 81: 41−51)。また蛋白質を供与して細胞皮質を液状化すると、膜の適切な接触および膜に結合した嚢胞の細胞内融合が可能になる。トロポニンもCa2+結合により活性化され、筋肉細胞内で筋肉繊維の短小化を惹起する蛋白質の一つである。
【0259】
もっと遅い時点で誘起されるABP遺伝子には、マックマーク、ミオシン軽鎖、Arp 2/3、フィラミン、トロポミオシン、チモシンおよびスムーセリンが含まれる。マックマークは、照射後の4時間で誘起され、繊維状アクチンに結合および架橋する MARCKSの相同体である。マックマークは、細胞移動、ファゴサイトーシス、膜輸送、および細胞−細胞接着の間にアクチン構造を制御する。ミオシン軽鎖は、ミオシン重鎖のATPアーゼ活性を制御することができ、したがってミオシンヘッドとアクチン繊維の間の相互作用をコントロールすることができる。全ミオシンI 蛋白質によって嚢胞はアクチン繊維に沿って移動し、その間にミオシン11によってアクチン繊維相互は相手を越えて滑走する。蛋白質複合Arp2/3 はアクチン繊維形成の中核をなし、繊維を網目構造に架橋し、繊維末端が脱重合化するのを防止する。フィラミンはアクチン繊維を架橋してそれらのゲル形成を惹起する。トロポミオシンはアクチン繊維の長さ方向に沿って結合し、それの強度を増加しおよび他の蛋白質へのそれの親和性を変化させる。チモシンはアクチン単量体に結合し、アクチンの重合化を阻止し、および、アポトーシスを防止する役割を演じている可能性がある (Niu et al. (2000) Cell Adhes. Commun. 7: 311−320)。
【0260】
誘起される遺伝子とは反対に、B−スペクトリンをコードする遺伝子は照射後の初期段階で紫外線により抑制される。B−スペクトリンはスペクトリンの一成分であって、内在性膜蛋白質の分布を制御することにより細胞膜に堅牢性と安定性を付与し、アクチンに結合してこれを捕捉する。アデュシンの発現は紫外線により抑制される。アデュシンはアクチンに蓋をして束ね、スペクトリンとアクチンとの間の接触を形成する。
【0261】
紫外線による細胞骨格蛋白質の制御に関する全体像によれば、脱重合化が開始され、最初の2時間でアクチンの細胞骨格が軟化し、次にアクチン繊維が再重合して細胞骨格の網目構造が再構築される(Maekawa et al. (1996) Clin. Exp. Immunol. 105: 389−396; Malorni, et al. (1994) J. Photochem. Photobiol. 26: 265−270)。また紫外線によりLIM 蛋白質であるトランスゲリンおよびミオシン重鎖の発現が抑制される。またチューブリン Al、 B および B2 および ケラチンK13 および K19 は全て照射後の遅い時点で誘起される。K17 は培養角質細胞中に高レベルで既に発現されており、紫外線による更なる誘起は観察されなかった。この際に使用した条件下では、紫外線により他のケラチンが有意に制御を受けるとは思われない。
【0262】
全体として最も強力に誘起される遺伝子は、角化エンベロープの成分である角質細胞分化マーカーである。これらには、プロリンに富む四つの小蛋白質SPRR1、 2A、 2B および 21、ならびにインボルクリン、デスモグレインIII および S100 カルシウム結合性 A13 および A12が含まれる。以前、プロリンに富む小蛋白質のみが紫外線に誘起されることが示された (Kartasova et al. (1988) Mol. Cell Biol. 8:2195−2203; Gibbs et al. (1990) Nucleic acids Res. 18:4401−4407)。上皮分化マーカーの中で角化エンベロープ成分のみが誘起され、他方ケラチンおよびフィラグリンは誘起されない。これらの蛋白質は全てヒト染色体1上の上皮マーカーの座にコードされており、照射後の遅い時点、すなわち16時間と24時間に誘起される。分化マーカーの中で紫外線により抑制されるものはないようだ。見かけ上、紫外線に対する上皮の一つの応答は角質層の産生強化であり、これにより皮膚の死んだ防護層が増大する。
【0263】
(5)ミトコンドリア蛋白質
紫外線曝露直後に強力に誘起される遺伝子の中に、数種のミトコンドリア蛋白質がある(表6)。特に、シトクロムc−1は時間の最初に誘起される。24時間の時点では、それの合成はバックグランドのレベルに戻り、かえって抑制される。シトクロム c 酸化酵素サブユニット Vb、Vila−L、Vilb、および シトクロム b 軽鎖も照射後の初期に誘起される。反対に、シトクロム酸化酵素アッセンブリー蛋白質 OXA1 Hsは抑制される。他の数種のミトコンドリア蛋白質、例えばミトコンドリアNADH脱水素酵素、ミトコンドリアユビキノン結合性蛋白質、ミトコンドリアATP合成酵素、ミトコンドリアリボソーム蛋白質、および電子伝達フラビン蛋白質は強力に誘起される。細胞は照射を受けると、エネルギー追加の必要を感知しミトコンドリア蛋白質を誘起してこの要求に対処する様に思われる。
【0264】
紫外線の照射によりエネルギー追加が必要になるという更なる徴候は、紫外線により数種のエネルギー産生酵素が誘起されるという事実に基づく。これらには、α−エノラーゼ、クレアチンキナーゼ−B、ピルビン酸脱水素酵素、およびプロトン−ATPアーゼ様蛋白質が含まれる。反対に糖新生酵素、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ、およびガンマアミノブチルアルデヒド脱水素酵素、ならびに乳酸塩、ピルビン酸塩およびグルコースの輸送体は、抑制される。また脂質合成のための酵素は抑制され、例えば ATP−クエン酸リアーゼ、スクワレンエポキシダーゼ、アシル−補酵素Aシンテターゼ、ステアロイル−補酵素−Aデサチュラーゼ、およびメチルステロール酸化酵素が含まれる。更に、脂肪酸オメガ水酸化酵素、シトクロムP−450HKVも最も早期の時点で抑制される。脂質と蛋白質成分は共に角質層の形成に寄与しているので、角化エンベロープ蛋白質が誘起されながら、脂質新生が強力に阻止されるのは矛盾しているように見える。
【0265】
角質細胞ミトコンドリア遺伝子の紫外線に対する応答は、リンパ腫細胞のミトコンドリア遺伝子のイオン化照射に対する応答とは全く異なる (Voehringer, et al. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 97: 2680−2685)。イオン化照射に対する応答だけが異なる二つの細胞ラインを比較してVoehringerらは、抵抗性のある細胞ラインでは、ミトコンドリア蛋白質フラクトース−1, 6−ビフォスファターゼ、VDAC、脂肪酸への結合性蛋白質および非結合性蛋白質が高レベルで発現されることを見出した。これらはイオン化照射処理によって更に増加する。高度に発現した蛋白質により抵抗性細胞はアポトーシスから防護されるが、これらの蛋白質を欠く繊細な細胞は防護されずに死滅する。本明細書に記載の分析方法で測定すると、角質細胞が紫外線に応答している際にこれらの蛋白質は有意に変化しない。角質細胞は、紫外線量に基づいて存命またはアポトーシスするが、これらの蛋白質を増加すると角質細胞は存命傾向になる。しかしこれは潜在的には危険な応答である。
【0266】
紫外線により抑制されるミトコンドリア蛋白質には、アルデヒド脱水素酵素1、ロダニーズ (チオサルフェート:シアナイド スルファー転移酵素)、および発熱非結合性蛋白質UCPが含まれる。これらの蛋白質は直接的にはエネルギー産生に関連しない。ウロポーフィリノーゲンシンテターゼはLIVにより誘起されるが、ウロポーフィリノーゲンを分解する酵素ウロポーフィリノーゲンデカルボキシラーゼは抑制されるので、このことからミトコンドリアはウロポーフィリノーゲンおよび多分他の鉄結合性蛋白質のレベルの上昇を必要としている可能性があることが示される。
【0267】
ミトコンドリア蛋白質の変化は、上皮の紫外線に対する応答において大変に重要であり、おそらく数種の機能を有している。その機能には、呼吸蛋白質がはじけて紫外線起因の損傷に対処するのに必要な追加のエネルギーが提供されること、および解毒プロセスとして活性酸素種を除去する酵素が増加すること、が含まれる。更に、ミトコンドリアの役割はアポトーシスを制御することにあるので、照射を受けた角質細胞はミトコンドリアを準備してアポトーシスを立ち上げる可能性がある。
【0268】
紫外線により数種の抗酸化性解毒蛋白質の誘起が顕在化する。具体的には、二つのチオール特異的抗酸化性蛋白質であるメタロチオネインおよび銅輸送蛋白質 HAH1、ならびにアルデヒド還元酵素およびアルデヒド脱水素酵素6が誘起される(Hanada et al. (1998) J. Invest. Dermatol. 111: 582−585)。反対に、MTの異型体であるメタロチオネイン 1 L およびアルデヒド脱水素酵素、ALDI−18は特異的に抑制される。チオレドキシン相互作用性蛋白質であるHHCPA78相同体はチオレドキシン還元酵素およびガンマグルタミルシステインシンテターゼで抑制される。
【0269】
以下の実施例は、本発明を作成しまた実施する好ましい態様を示すが、別の方法を使用しても同様な結果が得られるかもしれないので、本発明の範囲を限定することを意図しない。
【0270】
【実施例】
実施例1 紫外線B曝露により制御を受ける遺伝子と蛋白質の配列の識別
A. 角質細胞培養および紫外線B
ヒト包皮由来の上皮角質細胞の培養を記載(Simon, et al. (1984) Cell 36:827−834)通り3T3栄養層を使用して開始し、次に液体窒素中に凍結して保存した。一旦解凍後、角質細胞を栄養細胞なしで、0.05g/lウシ脳下垂体抽出物、5ng/ml上皮増殖因子、および1%ペニシリン/ストレプトマイシン(KGM、Gibco−BRL (Rockville, MD)より入手)を補充した所定の無血清角質細胞増殖培地(KGM)にて増殖した。角質細胞を37℃、5%COにて維持した。培地を二日ごとに交換した。実験のための三つの継代を通して細胞は増加した。0.5mg/mlのトリプシン阻害剤で中和した0.025%トリプシンで細胞をトリプシン化した。血清は角質細胞の分化を促進できるので、除いた。実験全てにおいて、第三継代の角質細胞を合流点に到達後の一日目で使用した。
【0271】
紫外線Bとしては、特別にFG15T電球を備えたStratagene 2000 (Strategene, LaJolla, CA)照射器を使用した。このライトでは、最大出力は紫外線B波長領域にある。細胞培養液から培地を除き、角質細胞を、開放皿中で8mJ/cmにて照射した。紫外線B曝露後直ちに同じ培地を交換した。コントロール細胞を同じ手順で処理した。ただし照射は単に真似で済ませた。
【0272】
以上のプロトコールを選択した理由は二つあった。第一は、合流した角質細胞は更に継代したものより皮膚に類似しているから、第二は、培養液ごとにほぼ同一の条件が信頼性よくかつ再現性よく達成されたからである。紫外線B曝露量は、紫外線量を増加させながら角質細胞培養液を処理し、培地を交換し、処理24時間後の細胞生存率を測定することにより最適化した。紫外線Bの量は、少なくとも10%、ただし20%未満の細胞が紫外線B曝露によって死滅するように選択し、特に8J/Mが最適であることが判った。
【0273】
角質細胞培養液を一回量8J/Mの紫外線Bで照射し、0.5、1、2、4、8、16、および24時間後に細胞を収穫した。コントロールとして照射の真似だけをした細胞を、処理の1、4、8、16、および24時間後に収穫した。照射の真似をした1時間培養液を0.5、1および2時間時点に対するコントロールとして使用し、他方その後の時点には全て同一時点のコントロールを当てた。
【0274】
B. 全RNAの単離およびプローブの合成
培養皿を掻いて細胞を収穫した。Qiagen (Chatsworth, CA)販売のキットを使用し、この製造者のプロトコールに従ってRNAを準備した。Qiashreddersを使用し、細胞溶解液を1800gで2分間遠心して均質にした。RNeasy Midi Kitを使用してRNAを抽出した。Qiagen RNAses−free DNAse Setを使用してカラム上のDNAアーゼ消化によりDNAを除去した。
【0275】
このRNAを、RNAを調製した後であって、遺伝子配列体ハイブリダイゼーションに使用する前に、c−fos遺伝子に対応するプローブとのノーザンブロットハイブリダイゼーションでテストした。
【0276】
ノーザンブロットのために、10μgのRNAを1.0%のアガロース−フォルムアルデヒドゲル上に載せ、100Vで3ないし4時間移動させた。RNAをナイロン膜(Amersham Life Science, Piscataway, NJ)に一夜転移し、Stratalinker (Stratagene, LaJolla, CA) で架橋した。c−fos およびIL−6 に対するプローブを、角質細胞RNA由来の逆転写−PCR およびAmbion (Austin, TX) 販売のRT−PCR キットを使用して合成した。American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA)から入手したcDNAクローンから追加のプローブを誘導した。各クローンは5’ および 3’ 両末端から配列を決定し、その同一性を確認した。[32P] dCTP (3000 Ci/mmol Dupont (NEN, Boston, MA) およびマルチプライム DNA 標識システム (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ)を使用して32P標識プローブを作成し、D−Salt Excellulose Plastic Desalting Columns (Pierce, Rockford, IL)を使用して精製した。
【0277】
ハイブリダイゼーションは、ExpressHyb 溶液(Clontech, Palo Alto, CA)を使用して68℃、1時間行った。膜を、2xSSC、0.05%SDS溶液で室温、30分間の連続振蕩にて3回、および0.1xSSC、0.1%SDSで50℃40分間洗浄した。膜を Kodak (Toronto, Canada) BIOMAX MS フィルムに−80℃で曝し、ラジオグラフを走査し、MultiImagine Light Cabinet AlphaImagine 2000 のドキュメンテーション解析システム(Alpha Innotech Corporation, San Leandro, CA) で解析した。RNAレベルをグリセルアルデヒド−3−フォスフェート脱水素酵素(GAPDH)mRNAに対して正規化した。
【0278】
図1Aに示すごとく、c−fos 遺伝子の発現が適切に誘起されていることが観察されたので、発現配列体ハイブリダイゼーションの検討にこのRNA試料を使用することの正当性が得られた。引き続き、配列体からの結果を確認するために、ノーザンブロットを使用して、制御を受けた遺伝子の発現を検討した(図1B)。表示した遺伝子について、配列体データとブロットとの間に強固な関連が見られた。
【0279】
遺伝子配列体と共に使用するプローブを合成するには、8マイクログラムの全RNAを逆転写し、増幅し、前記 (Mahadevappa et al. (1999) J.A. Nature Biotechnol. 17:1134−1136)のごとく標識した。逆転写に使用するプライマーの配列を決定したところ、得られたcDNA体にはcRNAプローブを合成し遺伝子配列体をスクリーニングするのに使用するRNAポリメラーゼプロモーターが含まれていた。
【0280】
C. 遺伝子配列体ハイブリダイゼーション
HU6800配列体(Affymetrix Inc., Santa Clara, CA)に、この配列体の製造者が推奨する条件で、標識化cRNAをハイブリッドした。配列体を洗浄し、抗ビオチンストレプトアビジン−フィコエリトリン標識抗体で染色し、GeneChip システム (Hewlett−Packard, Miami, FL)を使用して走査した。GeneChip 3.0 ソフトウエアを使用して各遺伝子の発現を決定した。各配列体の型に対応する総合シグナルを計算して強度値をスケール化した。
【0281】
紫外線曝露細胞とコントロール細胞とのシグナル強度値の比を計算して分化発現を決定した。潜在的に偽りの正の分化発現を示す遺伝子を除去するために、任意のペアーで比較した場合にシグナル強度が100を越える遺伝子のみを選択した。
【0282】
データ解釈のために、Cluster and Tree Viewソフトウエア(http://rana.standford.edu/softwareで入手可能) を使用した。まず、データをタブで仕切ったフォーマットでCluster and Tree Viewソフトウエアに入れた。311個の制御を受けた遺伝子の発現パターンを含有するデータセットを二つの方式、すなわち24時間の時間経過にわたる遺伝子発現の類似性に基づいて判断する方式、およびで異なる時点間の類似性に基づいて判断する方式でクラスター化した。そのクラスターをTree Viewプログラムで観察した。
【0283】
D. ノーザンブロット分析
ノーザンブロットのために、10μgRNAを1.0%アガロース−フォルムアルデヒドゲル上に載せ、100Vで3ないし4時間移動させた。RNAをナイロン膜(Amersham Life Science, Piscataway, NJ)に一夜転移し、紫外線CStratalinker (Stratagene, LaJolla, CA)で架橋した。c−fos およびIL−6 に対するプローブを、角質細胞RNA由来の逆転写−PCR およびAmbion Austin, TX 販売のRT−PCR キットを使用して合成した。ATCCから入手したcDNAクローンから追加のプローブを誘導した。各クローンは5’ および 3’ 両末端から配列を決定し、その同一性を確認した。[32P] dCTP (3000 Ci/mmol Dupont NEN および Multiprime DNA 標識システム (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ)を使用して 32P 標識プローブを作成し、D−Salt Excellulose Plastic Desalting Column (Pierce, Rockford, IL) を使用して精製した。
【0284】
ハイブリダイゼーションは、ExpressHyb 溶液(Clontech, Palo Alto, CA)を使用して68℃、1時間行った。膜を、2xSSC、0.05%SDS溶液で室温30分間の連続振蕩にて3回,および0.1xSSC、0.1%SDSで50℃40分間洗浄した。膜を Kodak (Toronto, Canada) BIOMAX MS フィルムに−80℃で曝し,ラジオグラフを走査し、MultiImagine Light Cabinet AlphaImagine 2000 のドキュメンテーション解析システム(Alpha Innotech Corporation, San Leandro, CA) で解析した。RNAレベルをGAPDHmRNAに対して正規化した。
【0285】
E. ウエスタンブロット分析
全体細胞溶解液を調製するために、細胞を冷燐酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄し、50mM HEPES、pH7.5、150mM NaCl、1mM EDTA、1mM EGTA、10% グリセロール、1% triton X−100、25mM NaF、10mM ZnCl2、1mM PMSFおよび10mg/mlロイペプチンを含有するIPP緩衝液中で溶解した。溶解液を4℃、3分間、1000×gで遠心分離した。各試料の蛋白質濃度をBio−Rad蛋白質アッセイ試薬で測定した。50μgの蛋白質を10%または20% SDS−ポリアクリルアミドゲル上に載せ、半乾燥転移細胞 (BioRad, Hercules, CA) を使用してImmobilon−P (ポリビニリデンジフルオライド) 膜に転移し、TBST(50mM Tris、pH7.5、150mM NaCl、0.05% Tween 20)中5% BSAにて封鎖した。膜を一次抗体と共に一夜4℃でTBST中2.0% BSAにてインキュベートし、次にTBSTで広範囲に洗浄し、1::5000抗ウサギまたは抗マウスセイヨウワサビペルオキシダーゼ (HRP)−結合二次抗体 (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ)とインキュベートした。蛋白質を ECL 検出キット (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ)で可視化した。各ウエルに蛋白質を均等に載せたことを膜のポンソー染色により確認した。
【0286】
Cox−2蛋白質に対して特異的な一次抗体を Transduction Labs (Lexington, KY)から、GRO−ベータに対して特異的な一次抗体をLeinco Technologies (St. Louis, MO)から、Jun−Dに対して特異的な一次抗体をAbcam (Cambridge, UK)から、IL−8、C−MYC、MCL−1およびシトクローム Cに対して特異的な一次抗体をResearch Diagnostics (Flanders, NJ)から購入した。アンフィレギュリン Ab−2, HDJ−2, インボルクリンおよび AB−1 抗体に対して特異的な一次抗体をNeoMarkers (Fremont, CA)から購入した。
【0287】
図3に示すごとく、蛋白質抽出物を照射角質細胞から調製し、紫外線照射後の0.5、1、2、4、8、16、24時間に収穫した。これら試料を蛋白質 c−Myc、 c−jun、 COX−2、インボルクリン、groβおよび LDL 受容体に特異的な抗体でスクリーニングした。JNK1 蛋白質に特異的な抗体を、ゲルに載せることのコントロールとして使用した。図3に示すごとく、ウエスタンブロット分析で確認した紫外線で制御を受けた蛋白質の発現レベルは、ここに得られた発現分析の結果と密接に相関している。
【0288】
角質細胞培養モデルの系で確認された紫外線で制御を受ける遺伝子は紫外線に対するin vivoの応答に相関することが、皮膚器官培養の系で蛋白質発現のレベルを検討することにより確認された。正常なヒト皮膚の器官培養外植片を前記培地(Fisher, G. J., et al., (1996) Nature 379, 335−339; および Varani, J., et al., (1993) American Journal of Pathology 142, 189−198) で維持した。概略すると、正常なヒト皮膚片を手術直後に入手し、ほぼ5mm3に切断し、湿潤培養器内の角質細胞基底培地 (KBM) (角質細胞−SFM, Gibco−BRL, Gaithersburg, MD) 中37℃で24時間インキュベートした。各ウエル(24−ウエルの培養皿)当りほぼ5片の組織を使用し、外植片を丁度覆うのに十分な培地をウエルに加えた。紫外線曝露のために培地をウエルから除き、外植片を100mJ/cm紫外線−Bに曝露した。曝露後に、外植した組織を培養培地に再び浸漬した。
【0289】
紫外線曝露試料とコントロールである非紫外線曝露試料との間の蛋白質発現レベルを決定するために、外植組織試料中の蛋白質を免疫蛍光染色によりin situ で可視化した。概略すると、紫外線曝露後の所望の時点で外植組織試料を組織用Tec OCT 化合物 (Sakura Finetek, Japan)に載せ、凍結し、厚さ4ないし6μmの断片に切断した。試料をスライドに載せ、メタノール/アセトンで10分間固定した。切片試料を一夜、マウス抗インボルクリン抗体 (NeoMarkers, Lab Vision Corporation, Fremont, CA)と4℃でインキュベートし、過酸化酵素結合抗マウス IgG 二次抗体 (Vecstatin ABC−マウス IgG キット 、Vector Laboratories, Burlingame, CAより) で室温1時間処理し、ABC コンプレックス(Vector Laboratories, Burlingame, CA)と室温1時間インキュベートし、そして3,3’−ジアミノベンジジン−テトラヒドロクロライド (Dojindo Corp., Japan)およびTris pH7.6中、0.01%H2O2で2分間処理した。切片を光学顕微鏡(Microphot−FXA, Nikon, Japan)下で観察し撮影した。
【0290】
図4に示すごとく、免疫組織染色から、紫外線曝露により、紫外線照射後の2、8および16時間にヒト皮膚器官培養でのインボルクリンの発現が増強されることが判る。インボルクリン抗体での上皮の超基底染色は紫外線照射後16時間に大きく増加していることに注目せよ。
【0291】
F. 配列体データ解析
7,080の登録試料の中で、3,000は少なくとも一時点で角質細胞に存在し、またほぼ1,400は全ての時点で存在することが記録されている。登録試料の中で、308は少なくとも一時点で少なくとも2と1/2倍の分化的な制御を受ける。2.5倍の制御は有意と判断されるので、これら308遺伝子に留意した。配列体上の、例えばJun−D、Tob、Cox−2等の複数のプローブによって表示される遺伝子に特に留意した。これら複数のプローブセットについて、かなり類似の制御パターンが観察され、得られるハイブリダイゼーションの正確性に更なる確信が得られた(表1)。308遺伝子の中で、9個は、異なる時点で、2.5倍以上の誘起および抑制の両方を受けた。残りは誘起グループと抑制グループに、約半分づつ(152対147)に分かれる。
【0292】
クラスター化アルゴリズムを使用して、七つの時点のデータを紫外線曝露後の三つ波にグループ化した(図2)。この図には解析した遺伝子の小部分だけを示してある。最も密接に関連していたのは0.5、1および2時間時点であった。これらは制御遺伝子の初期の波を形成する。16および24時間時点もかなり類似しており、晩期の波を形成する。4および8時間時点は相互の間の方が他の時点との間よりも類似しており、これらは中期の波を形成した。したがって、紫外線曝露後の最初の24時間における遺伝子発現の変異は、三つの「波」の変化、すなわち、約0.5時間から約2時間に至る初期または第一応答、約4時間から約8時間に至る中期または第二応答、および約16時間から約24時間に至る晩期または第三応答、に都合よくグループ化することができる。
【0293】
制御を受ける遺伝子の大部分は、それらの機能に基づいて数種の異なる明瞭に区分けされる機能カテゴリーにグループ化できる。これらには、(1)誘起されたDNA代謝および修復遺伝子の誘起、(2)シグナル導入蛋白質および転写因子(二つの最大のカテゴリーであり、全ての実験時点で誘起と抑制の両方のメンバーを含む)、(3)構造蛋白質(最も細胞骨格性であり、誘起と抑制の両方のメンバーを含有する)、(4)分泌増殖因子、ケモカインおよびサイトカイン(中期時点で最も強力に誘起される)、および(5)ミトコンドリア蛋白質(重要なカテゴリーの蛋白質で、最初に誘起される仲間)が含まれる。更に、翻訳機構、RNA加工、脂質とアミノ酸と尿素の代謝、内在性膜、及び細胞表面蛋白質、プロテアーゼおよびその抑制剤、およびこれらのカテゴリーに分類できなかった蛋白質、ならびに数種の未確定ESTに関連する蛋白質に対する遺伝子が紫外線により制御を受けることが見出された。
【0294】
実施例2 紫外線A曝露により制御を受ける遺伝子および蛋白質の配列の識別
A. 角質細胞培養および紫外線A
ヒト包皮由来の上皮角質細胞の培養を記載(Simon, et al. (1984) Cell 36: 827−834)通り3T3栄養層を使用して開始し、次に液体窒素中に凍結して保存した。一旦解凍後、角質細胞を、栄養細胞なしで、0.05g/lウシ脳下垂体抽出物、5ng/ml上皮増殖因子、および1%ペニシリン/ストレプトマイシン (KGM Gibco−BRL (Rockville, MD).販売)を補充した所定の無血清角質細胞増殖培地(KGM)にて増殖した。角質細胞を37℃、5%COにて維持した。培地を二日ごとに交換した。細胞は、実験のための三つの継代を通して増加した。0.5mg/mlのトリプシン阻害剤で中和した0.025%トリプシンで、細胞をトリプシン化した。血清は角質細胞の分化を促進できるので、除した。実験全てにおいて、第三継代の角質細胞を合流点に到達後の一日目で使用した。
【0295】
紫外線Aには、紫外線A波長領域の光出力を産出するように特別に装備された照射器を使用した。例えば、Mutzhas Supersun 5000−型太陽光シミュレータ (Mutzhas, Munich, Germany) を使用し、フィルタリングして紫外線−A (315 nm−390 nm).の放射を得た。細胞培養液から培地を除き、角質細胞を開放皿にて照射した。紫外線A曝露後直ちに、培養液を同じ培地で交換した。コントロール細胞を同じ手順で処理した。ただし照射は単に照射の真似で済ませた。
【0296】
このプロトコールを選択する理由は二つあり、第一は、合流した角質細胞は更に継代したものより皮膚に類似しているから、第二は、培養液ごとにほぼ同一の条件が信頼性よくかつ再現性よく達成されるからである。紫外線A曝露量は、角質細胞培養液を紫外線量を増加させながら処理し、培地を交換し、処理24時間後の細胞生存率を決定することにより最適化した。紫外線A照射量は、少なくとも10%、ただし20%未満の細胞が紫外線−A曝露によって死滅するように選択した。
【0297】
角質細胞培養液を一回量の紫外線Aで照射し、細胞を0.5、1、2、4、8、16、および24時間後に収穫した。紫外線Aの具体的な波長は約315nmから約390nmであった。コントロールとして照射の真似だけをした細胞を処理の1、4、8、16、および24時間後に収穫した。照射の真似をした1時間培養液を0.5、1および2時間時点に対するコントロールとして使用し、他方それより後の時点には全て同一時点のコントロールを充てた。
【0298】
B. 全RNAの単離およびプローブの合成
培養皿を掻いて細胞を収穫した。Qiagen (Chatsworth, CA)販売のキットを使用し、この製造者のプロトコールに従ってRNAを準備した。Qiashredders を使用し、細胞溶解液を1800gで2分間遠心して均質にした。RNeasy Midi Kitを使用してRNAを抽出した。Qiagen RNAses−free DNAse Set を使用してカラム上のDNAアーゼ消化によりDNAを除去した。
【0299】
全RNAを調製した後、遺伝子配列体ハイブリダイゼーションに使用する前に、これらのRNAを、c−fos遺伝子に対応するプローブとのノーザンブロットハイブリダイゼーションでテストした。
【0300】
ノーザンブロットのために、10μgRNAを1.0%アガロース−フォルムアルデヒドゲル上に載せ、100Vで3ないし4時間移動させた。RNAをナイロン膜 (Amersham Life Science, Piscataway, NJ) に一夜転移し、Stratalinker (Stratagene, LaJolla, CA) で架橋した。c−fos およびIL−6 に対するプローブを角質細胞RNA由来の逆転写−PCR およびAmbion (Austin, TX) 販売のRT−PCR キットを使用して合成した。American Type Culture Collection (ATCC, Manassas, VA)から入手したcDNAクローンから追加のプローブを誘導した。各クローンは5’ および 3’ 両末端から配列を決定し、その同一性を確認した。[32P] dCTP (3000 Ci/mmol)(Dupont NEN, Boston, MA) およびマルチプライムDNA標識システム (Amersham Pharmacia Biotech, Piscataway, NJ)を使用して32P標識プローブを作成し、D−Salt Excelloulse Plastic Desalting Columns (Pierce, Rockford, IL).を使用して精製した。
【0301】
ハイブリダイゼーションは、ExpressHyb溶液(Clontech, Palo, Alto, CA)を使用して68℃、1時間行った。膜を、2xSSC、0.05%SDS溶液で室温30分間の連続振蕩にて3回、および0.1xSSC、0.1%SDSで50℃、40分間洗浄した。膜をKodak (Toronto, Canada) BIOMAX MS フィルムに−80℃で曝し、ラジオグラフを走査し、MultiImagine Light Cabinet Alphalmagine 2000 のドキュメンテーション解析システム (Alpha Innotech Corporation, San Leandro, CA).で解析した。RNAレベルをグリセルアルデヒド−3−フォスフェート脱水素酵素 (GAPDH) mRNAに対して正規化した。
【0302】
遺伝子配列体と共に使用するプローブを合成するには、8マイクログラムの全RNAを逆転写し、増幅し、前記 (Mahadevappa et al. (1999) J.A. Nature Biotechnol. 17: 1134−1136)のごとく標識した。逆転写に使用するプライマーの配列を決定したところ、得られたcDNA体にはcRNAプローブを合成し遺伝子配列体をスクリーニングするのに使用するRNAポリメラーゼプロモーターが含まれていた。
【0303】
C.遺伝子配列体ハイブリダイゼーション
標識化cRNAをHU6800 配列体(Affymetrix Inc., Santa Clara, CA)に、この配列体の製造者が推奨する条件でハイブリッドした。配列体を洗浄し、抗ビオチンストレプトアビジン−フィコエリトリン標識抗体で染色し、GeneChip システム(Hewlett−Packard, Miami, FL)を使用して走査した。GeneChip 3.0ソフトウエアを使用して各遺伝子の発現を決定した。各配列体の型に対応する総合シグナルを計算して強度値をスケール化した。
【0304】
紫外線曝露細胞とコントロール細胞とのシグナル強度値の比を計算して分化発現を決定した。潜在的に偽りの正の分化発現を示す遺伝子を除去するために、任意のペアーで比較した場合にシグナル強度が100を越える遺伝子のみを選択した。
【0305】
データ解釈のために、Cluster and Tree Viewソフトウエア(http://rana.standford.edu/softwareで入手可能) を使用した。まず、データをタブで仕切ったフォーマットでCluster and Tree Viewソフトウエアに入れた。311個の制御を受けた遺伝子の発現パターンを含有するデータセットを二つの方式、すなわち24時間の時間経過にわたる遺伝子発現の類似性に基づいて判断する方式、およびで異なる時点間の類似性に基づいて判断する方式でクラスター化した。そのクラスターをTree Viewプログラムで観察した。
【0306】
均等例
当業者は、本明細書に記載の本発明特定実施例に対する多数の均等例を、日常的に過ぎない実験手技を駆使して認識または確認することができる。かかる均等例は特許請求の範囲に包含されるものである。
【図面の簡単な説明】
【図1】図1Aは、ノーザンブロットの描示であり、紫外線曝露した細胞から単離したRNAをスクリーニングして、発現配列体ハイブリダイゼーションを利用する実験で使用する前にそのRNAの性質をモニターする。紫外線照射0.5、1、2、4、8、16、24時間後の時点で角質細胞からRNA試料を単離した。グリセルアルデヒド−3−燐酸デヒドロゲナーゼ(GAPDH)をコントロールとして使用し、また0.5、1および2時間処理試料のコントロールとして、1時間不処理試料を使用した。
図1Bは、ノーザンブロットの描示である。RNA試料を角質細胞から単離し、紫外線照射0.5、1、2、4、8、16、24時間後の時点で収穫した。これらRNA試料を、紫外線の制御を受ける四つのRNA分子、すなわちc−Myc、jun−B、SPRRII、およびgro−βRNAsに特異的なプローブにハイブリッドした。ノーザンブロット分析により得られたデータは、発現配列体分析を使用して得た結果としっかり相関している。各レーンに負荷したRNAの量をモニターするコントロールとしてGAPDHプローブを使用した。
【図2】図2は、代表的なデータセット分析のグラフ表示であり、紫外線曝露後に制御を受けた発現異変の三つの波を示す。クラスター化アルゴリズムを使用して時点をグループ化した。末端からの枝の高さが相互に最も近い時点同志を密接に関連づける。例えば、1時間と2時間の時点に対する末端からの枝は最も短く、またグラフ中の他の枝より相互に最も類似している。したがってこの二つの時点は群化される。
【図3】図3Aは、ウエスタンブロットの描示であり、紫外線で誘起された蛋白質レベルの変化がmRNAレベルの変化に平行していることを証明する。照射角質細胞から蛋白質抽出物を調製し、紫外線照射0.5、1、2、4、8、16及び24時間後の時点で収穫した。これらの試料を、c−Myc、jun−B、COX−2、インボルクリン、gro−β、およびLDL受容体蛋白質に特異的な抗体でスクリーニングした。JNK1蛋白質に特異的な抗体をゲル負荷のコントロールとして使用した。
図3Bは、ウエスタンブロットの描示であり、紫外線で誘起された蛋白質レベルの変化がmRNAレベルの変化に平行していることを証明する。照射角質細胞から蛋白質抽出物を調製し、紫外線照射0.5、1、2、3、4、8、12、16及び24時間後の時点で収穫した。これらの試料を、γ−Gly−Cysシンテターゼおよびスクワレンオキシダーゼに特異的な抗体でスクリーニングした。
【図4】図4は、免疫組織染色を示し、ヒトの皮膚器官培養におけるインボルクリンの発現が紫外線曝露により促進されることを紫外線照射2、8、16時間後の時点で証明する。インボルクリン抗体で表皮を超基底染色すると、染色は紫外線16時間で大きく増加する。

Claims (97)

  1. 細胞の紫外線に対する応答を検出する方法であって、紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中複数RNA分子のレベルを測定して発現パターンを確定するステップを含んで成り、紫外線曝露に対する細胞の応答が以下:
    (a)転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第一応答;
    (b)分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第二応答;および
    (c)アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第三応答;
    の中の少なくとも一つを含んで成り、前記細胞での発現パターンが細胞の紫外線に対する応答に実質的に類似している場合には細胞は紫外線に曝露されたとすることを特徴とする方法。
  2. パターンが第一応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  3. パターンが第二応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  4. パターンが第三応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  5. パターンが第一応答および第二応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  6. パターンが第一応答および第三応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  7. パターンが第二応答および第三応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  8. パターンが第一応答、第二応答および第三応答からなることを特徴とする請求項1記載の方法。
  9. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項1記載の方法。
  10. 紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項1記載の方法。
  11. 紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項10記載の方法。
  12. 紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項10記載の方法。
  13. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全曝露エネルギーを含むことを特徴とする請求項10記載の方法。
  14. パターンが、紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する第一応答を更に含むことを特徴とする請求項1記載の方法。
  15. パターンが、紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する第二応答を更に含むことを特徴とする請求項1記載の方法。
  16. パターンが、紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する第三応答を更に含むことを更に特徴とする請求項1記載の方法。
  17. パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一応答;
    (b)紫外線曝露後の約4時間から約8時間に起こる第二応答;および
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三応答、
    によって更に特徴づけられる請求項1記載の方法。
  18. 変異発現がRNAレベルの増加または減少を含むことを特徴とする請求項1記載の方法。
  19. (a)第一応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有し;
    (b)第二応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有し;かつ、
    (c)第三応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する;
    ことを特徴とする請求項1記載の方法。
  20. パターンが第一応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  21. パターンが第二応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  22. パターンが第三応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  23. パターンが第一応答グループおよび第二応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  24. パターンが第一応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  25. パターンが第二応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  26. パターンが第一応答グループ、第二応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項19記載の方法。
  27. 細胞の紫外線曝露を検出する方法であって下記を含んで成り、(a)(I)紫外線曝露後に細胞からRNAを単離するステップ、
    (ii)前記RNAに相補性の標識化プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションによって検定用発現配列体を作成するステップ、
    (iii)前記検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体のデータセットを作成するステップ、
    (iv)前記検定用発現配列体のデータセットを対照用発現配列体のデータセットと対比するステップ、
    を含む発現配列体分析によって細胞中の複数RNA分子のレベルを測定し、および
    (b)複数RNA分子のレベルを分析することによって前記細胞の発現パターンを確定し、紫外線曝露に対する細胞の応答が以下:
    (i)転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第一応答;
    (ii)分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第二応答;および
    (iii)アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第三応答;の中の少なくとも一つを含み、
    前記細胞での発現パターンが細胞の紫外線に対する応答に実質的に類似している場合には、細胞は紫外線に曝露されたとすることを特徴とする方法。
  28. パターンが第一応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  29. パターンが第二応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  30. パターンが第三応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  31. パターンが第一応答および第二応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  32. パターンが第一応答および第三応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  33. パターンが第二応答および第三応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  34. パターンが第一応答、第二応答および第三応答からなることを特徴とする請求項27記載の方法。
  35. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項27記載の方法。
  36. 紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項27記載の方法。
  37. 紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含むすることを特徴とする請求項36記載の方法。
  38. 紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項36記載の方法。
  39. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全曝露エネルギーを含むことを特徴とする請求項27記載の方法。
  40. パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一応答;
    (b)紫外線曝露後の約4時間から約8時間に起こる第二応答;および
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三応答;
    によって更に特徴づけられる請求項27記載の方法。
  41. 変異発現がRNAレベルの増加または減少を含むことを特徴とする請求項27記載の方法。
  42. (a)第一応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有し;
    (b)第二応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有し;かつ、
    (c)第三応答が少なくとも3個の核酸分子の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する;
    ことを特徴とする請求項27記載の方法。
  43. パターンが第一応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  44. パターンが第二応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  45. パターンが第三応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  46. パターンが第一応答グループおよび第二応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  47. パターンが第一応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  48. パターンが第二応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  49. パターンが第一応答グループ、第二応答グループおよび第三応答グループからなることを特徴とする請求項42記載の方法。
  50. 細胞の紫外線曝露を検出する方法であって、紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質分子のレベルを測定して発現パターンを確定するステップを含んで成り、前記紫外線曝露に対する細胞の応答が以下:
    (a)転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を主要とする第一応答;
    (b)分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を主要とする第二応答;および
    (c)アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を主要とする第三応答;の中の少なくとも一つを含み、
    前記細胞での発現パターンが実質的に細胞の紫外線に対する応答に類似している場合には、細胞は紫外線に曝露されたとすることを特徴とする方法。
  51. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項50記載の方法。
  52. 紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項50記載の方法。
  53. 紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項52記載の方法。
  54. 紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含むことを特徴とする請求項52記載の方法。
  55. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全曝露エネルギーを含むことを特徴とする請求項50記載の方法。
  56. パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一応答;
    (b)紫外線曝露後の約4時間から約8時間に起こる第二応答;かつ
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三応答、
    によって更に特徴づけられる請求項50記載の方法。
  57. 変異調節が蛋白質レベルの増加または減少を含むことを特徴とする請求項50記載の方法。
  58. (a)第一応答が少なくとも3個の蛋白質の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する核酸分子によってコードされ;
    (b)第二応答が少なくとも3個の蛋白質の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する核酸分子によってコードされ;かつ、
    (c)第三応答が少なくとも3個の蛋白質の変異発現を更に含んで成り、その各々は以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されたポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する核酸分子によってコードされる;
    ことを特徴とする請求項50記載の方法。
  59. 複数蛋白質分子のレベルをELISAによって測定することを特徴とする請求項50記載の方法。
  60. (a)紫外線曝露による変異発現を検出することができる複数の核酸分子であって、
    (i)転写因子蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第一応答グループ;
    (ii)分泌成長因子をコードする少なくとも一つの核酸分子、サイトカインをコードする少なくとも一つの核酸分子、およびケモカインをコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第二応答グループ;および
    (iii)アクチン結合性蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子、およびチューブリン蛋白質をコードする少なくとも一つの核酸分子の変異発現を含む第三応答グループ;
    から成る群から選択される核酸分子、および
    (b)前記核酸分子に結合するのに適する基質、
    を含んで成る物質組成物。
  61. (a)第一応答グループが以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群のポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子からなり;
    (b)第二応答グループが以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群のポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子からなり;かつ
    (c)第三応答グループが以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群のポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する複数の核酸分子からなる;
    ことを特徴とする請求項60記載の組成物。
  62. 選択された核酸分子が12プラスN塩基の長さであり、Nは0から500の整数であることを特徴とする請求項60記載の組成物。
  63. 選択された核酸分子が約21塩基の長さであることを特徴とする請求項62記載の物質組成物。
  64. 発現配列体として更に特徴づけられる請求項60記載の物質組成物。
  65. 少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定するステップを含んで成り、以下記載のパターン:
    (a)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;
    (b)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および
    (c)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、およびチューブリン蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;
    を含む変異発現パターンを確定し、かつ、変異発現パターンが紫外線曝露を示すことを特徴とする細胞の紫外線曝露を検出する方法。
  66. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項65記載の方法。
  67. 紫外線曝露が約220nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  68. 紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  69. 紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  70. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  71. パターンが、紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に存在する第一応答を更に含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  72. パターンが、紫外線曝露後の約4時間から約8時間に存在する第二応答を更に含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  73. パターンが、紫外線曝露後の約16時間から約24時間に存在する第三応答を更に含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  74. パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一の応答;
    (b)紫外線曝露後の約4時間から約8時間に起こる第二の応答;かつ
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三の応答;
    によって更に特徴づけられる請求項65記載の方法。
  75. 変異発現がRNAレベルの増加または減少を含んでなることを特徴とする請求項65記載の方法。
  76. (a)第一応答が以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成り;
    (b)第二応答が以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成り;かつ、
    (c)第三応答が以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成る;
    ことを特徴とする請求項65記載の方法。
  77. (a)以下を含んでなる、発現配列体分析により細胞中の複数RNA分子のレベルを測定するステップ:
    (i)紫外線曝露後の細胞からRNAを単離するステップ、
    (ii)前記RNAに相補性の標識プローブと発現配列体基質との間の核酸ハイブリダイゼーションを介して検定用発現配列体を作成するステップ、
    (iii)検定用発現配列体を分析して検定用発現配列体データセットを作成するステップ、及び
    (iv)検定用発現配列体データセットをコントロールの発現配列体データと対比するステップ;および
    (b)前記複数RNA分子のレベルを分析し、それによって細胞の応答パターンを確定するステップ、ここで、細胞の紫外線曝露は以下を含む変異発現パターンによって示されることを特徴とし:
    (i)転写因子蛋白質をコードする核酸分子、シグナル導入蛋白質をコードする核酸分子、およびミトコンドリア蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第一応答;
    (ii)分泌成長因子をコードする核酸分子、サイトカインをコードする核酸分子、およびケモカインをコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第二応答;および
    (iii)アクチン結合性蛋白質をコードする核酸分子、デスモゾーム蛋白質をコードする核酸分子、チューブリン蛋白質をコードする核酸分子から成る群から選択される少なくとも一つのポリヌクレオチドの変異発現パターンを含む第三応答;
    を含んで成る細胞の紫外線曝露を検出する方法。
  78. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項77記載の方法。
  79. 紫外線曝露が220nmないし440nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項77記載の方法。
  80. 紫外線曝露の中に約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項77記載の方法。
  81. 紫外線曝露の中に約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項77記載の方法。
  82. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある全紫外線曝露エネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項77記載の方法。
  83. パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一応答;
    (b)紫外線曝露後の約4時間から約8時間に起こる第二応答;および
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三応答、
    によって更に特徴づけられる請求項77記載の方法。
  84. 変異発現がRNAレベルの増加または減少を含んで成ることを特徴とする請求項77記載の方法。
  85. (a)第一応答が以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成り;
    (b)第二応答が以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも三つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成り;かつ
    (c)第三応答が以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの核酸分子の変異発現パターンを更に含んで成る;
    ことを特徴とする請求項77記載の方法。
  86. 細胞中の複数蛋白質のレベルを測定するステップを含んで成り、以下記載のパターン:
    (a)転写因子蛋白質、シグナル導入蛋白質、およびミトコンドリア蛋白質から成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第一応答;
    (b)分泌成長因子蛋白質、サイトカイン蛋白質、およびケモカイン蛋白質から成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第二応答;および
    (c)アクチン結合性蛋白質、デスモゾーム蛋白質、およびチューブリン蛋白質から成る群から選択される少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを含む第三応答;
    を含む変異発現パターンを確定し、かつ、変異発現パターンが紫外線曝露を示すことを特徴とする細胞の紫外線曝露を検出する方法。
  87. 細胞が、角質細胞、ランゲルハンス細胞、メラニン細胞および繊維芽細胞から成る群から選択されることを特徴とする請求項86記載の方法。
  88. 紫外線曝露が220nmないし440nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項86記載の方法。
  89. 紫外線曝露が約290nmないし約320nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項86記載の方法。
  90. 紫外線曝露が約320nmないし約440nmの範囲における波長のエネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項86記載の方法。
  91. 紫外線曝露が約0.2mJ/cmないし約40mJ/cmの範囲にある紫外線エネルギーを含んで成ることを特徴とする請求項86記載の方法。
  92. 発現パターンが、
    (a)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第一応答;
    (b)紫外線曝露後の約0.5時間から約2時間に起こる第二応答;および
    (c)紫外線曝露後の約16時間から約24時間に起こる第三応答、
    によって更に特徴づけられる請求項86記載の方法。
  93. 変異発現パターンが蛋白質レベルの増加または減少を含んで成ることを特徴とする請求項86記載の方法。
  94. (a)第一応答が少以下記載の:
    (i) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (ii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (iii) L04731 ホモサピエンス 染色体4へのALL−1遺伝子の転座 T(4:11),
    (iv) X56681 ヒト junD mRNA,
    (v) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (vi) L38951 ホモサピエンス インポーチン ベータ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (vii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (viii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (ix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (x) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分,
    (xi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (xii) D86988 ヒト mRNA、KIAA0221 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) U62317 染色体 22q13 BAC クローン CIT987SK−384D8 完全配列,
    (xv) X04412 ヒト mRNA、プラズマ ゲルソリンに対する,
    (xvi) L27706 ヒト チャペロニン 蛋白質 (Tcp20) 遺伝子 完全コード,
    (xvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xviii) M60974増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xix) L19437 ヒト トランスアルドラーゼ mRNA、転移因子を含有, 完全コード,
    (xx) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (xxi) D90086 ヒト ピルビン酸脱水素酵素 (EC 1.2.4.1) ベータ サブユニット 遺伝子, エクソン 1−10,
    (xxii) M34182 ヒト 精巣特異的 蛋白質 キナーゼ ガンマ−サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxiii) L16862 ホモサピエンス G 蛋白質−結合 受容体 キナーゼ (GRK6) mRNA, 完全コード,
    (xxiv) D13705 ヒト mRNA、脂肪酸オメガ−水酸化酵素(シトクロームP−450HKV)に対する, 完全コード,
    (xxv) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxvi) D45906 ホモサピエンス mRNA、LIMK−2に対する, 完全コード,
    (xxvii) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (xxviii) D87438 ヒト mRNA、KIAA0251 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxix) L37042 ホモサピエンス カゼイン キナーゼ I アルファ 異型 (CSNK1A1) mRNA, 完全コード,
    (xxx) D14043 ヒト mRNA、MGC−24に対する, 完全コード,
    (xxxi) D13988 ヒト rab GDI mRNA, 完全コード,
    (xxxii) U28480 非結合性 蛋白質 Uc,
    (xxxiii) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (xxxiv) M55265 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M96803 ヒト ゼネラル ベータ−スペクトリン (SPTBN1) mRNA, 完全コード,
    (xxxvi) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス P,
    (xxxvii) D87442 ヒト mRNA、KIAA0253 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxxviii) J03161 ヒト 血清応答因子 (SRF) mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xl) U17327 ヒト ニューロンの酸化窒素合成酵素 (NOS1) mRNA, 完全コード,
    (xli) D86966 ヒト mRNA、KIAA0211 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xlii) D85527 ホモサピエンス mRNA、 LIM 領域に対する, 部分コード,
    (xliii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (xliv) X59434 ヒト rohu mRNA、 ロダニーズに対する,
    (xlv) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード, および
    (xlvi) J05211 デスモプラキン,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを更に含んで成り;
    (b)第二応答が以下記載の:
    (i) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (ii) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (iii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (iv) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (v) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (vi) M62831 ヒト 転写因子 ETR101 mRNA, 完全コード,
    (vii) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (viii) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (ix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (x) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xi) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xii) X56681 ヒト junD mRNA,
    (xiii) S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (xiv) M84739 ヒト 自己抗原 カルレチクリン mRNA, 完全コード,
    (xv) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (xvi) V00599 チューブリン, Bet,
    (xvii) X70326 マックマーク,
    (xviii) D10923 ヒト mRNA、HM74に対する,
    (xix) D64142 ヒト mRNA、ヒストン H1xに対する, 完全コード,
    (xx) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xxi) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (xxii) X68277 ホモサピエンス CL 100 mRNA、蛋白質チロシンフォスファターゼに対する,
    (xxiii) L13391 ヒト ヘリックス−ループ−ヘリックス 塩基性 燐蛋白質 (G0S8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxiv) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (xxv) U40369 ヒト スペルミジン/スペルミンN1−アセチル転移酵素 (SSAT) 遺伝子, 完全コード,
    (xxvi) X52560 核因子 Nf−Il,
    (xxvii) X61123 ヒト BTG1 mRNA,
    (xxviii) U20734 ヒト 転写因子 junB (junB) 遺伝子, 5’ 領域 および 完全コード,
    (xxix) U35048 ヒト TSC−22 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxx) M69043 ホモサピエンス MAD−3 mRNA , IkB−様活性をコード, 完全コード,
    (xxxi) X51345 ヒト jun−B mRNA、JUN−B 蛋白質に対する,
    (xxxii) S68616 Na+/H+ 交換体 NHE−1 異型 [ヒト, 心臓, mRNA, 4516 nt],
    (xxxiii) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (xxxiv) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    (xxxv) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (xxxvi) X52541 ヒト mRNA、初期増殖応答 蛋白質 1 (hEGR1)に対する,
    (xxxvii) D50683 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ IIR アルファに対する, 完全コード,
    (xxxviii) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (xxxix) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (xl) U05875 ヒト クローン pSK1 インターフェロン ガンマ 受容体 補助因子−1 (AF−1) mRNA, 完全コード,
    (xli) L19314 ヒト HRY 遺伝子, 完全コード,
    (xlii) M30703 ヒト アムフィレギュリン (AR) 遺伝子, エクソン 6, クローン ラムダ−ARH(6,12),
    (xliii) U34252 ヒト ガンマ−アミノブチルアルデヒド脱水素酵素 mRNA, 完全コード,
    (xliv) S78825 Id1,
    (xlv) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (xlvi) U41766 ヒト メタロプロテアーゼ/ディスインテグリン/システイン−リッチ 蛋白質 前駆体 (MDC9) mRNA,
    (xlvii) U89336 ヒト HLA クラス III 領域、NOTCH4 遺伝子を含有, 部分配列, ホメオボックス PB,
    (xlviii) M69181 ヒト 非筋肉ミオシン重鎖−B (MYH10) mRNA, 部分コード,
    (xlix) D15050 ヒト mRNA、転写因子 AREB6に対する, 完全コード,
    (l) U28386 ヒト 核局在 配列 受容体 hSRP1アルファ mRNA, 完全コード,
    (li) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (lii) X64330 ホモサピエンス mRNA、ATP−クエン酸 リアーゼに対する,
    (liii) U37122 ヒト アデュシン ガンマ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (liv) X74008 ホモサピエンス mRNA、蛋白質 フォスファターゼ 1 ガンマに対する,
    (lv) U60205 ヒト メチルステロール 酸化酵素 (ERG25) mRNA, 完全コード,
    (lvi) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (lvii) D87071 ヒト mRNA、KIAA0233 遺伝子に対する, 完全コード,
    (lviii) U90716 ヒト 細胞表面 蛋白質 HCAR mRNA, 完全コード,
    (lix) M91083 ヒト DNA−結合性 蛋白質 (HRC1) mRNA, 完全コード,
    (lx) U29607 ヒト メチオニンアミノペプチダーゼ mRNA, 完全コード,
    (lxi) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (lxii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (lxiv) X12953 ヒト rab2 mRNA, YPT1−関連 および rasファミリーメンバー,
    (lxv) M60483 ヒト 蛋白質 フォスファターゼ 2A 触媒 サブユニット−アルファ 遺伝子, 完全コード,
    (lxvi) U72649 ヒト BTG2 (BTG2) mRNA, 完全コード,
    (lxvii) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (lxviii) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (lxix) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (lxxi) S74017 Nrf2=NF−E2−様 塩基性ロイシンジッパー転写活性化因子 [ヒト, ヘミン−in,
    (lxxii) X87241 ホモサピエンス mRNA、hFat 蛋白質に対する,
    (lxxiii) X52425 ヒト IL−4−R mRNA、インターロイキン 4 受容体に対する,
    (lxxiv) D79994 ヒト mRNA、KIAA0172 遺伝子に対する, 部分コード,
    (lxxv) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (lxxvi) M13829 ヒト 推定 raf 関連 蛋白質 (pks/a−raf) mRNA, 部分コード,
    (lxxvii) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (lxxviii) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (lxxix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (lxxx) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (lxxxi) U28749 ヒト 高移動性グループ 燐蛋白質 異型 I−C (HMGIC) mRNA, 完全コード,
    (lxxxii) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (lxxxiii) L26336 熱ショック 蛋白質, 70 Kda (Gb:Y00371,
    (lxxxiv) L08246 ヒト 骨髄細胞分化 蛋白質 (MCL1) mRNA,
    (lxxxv) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞
    (lxxxvi) J05211 デスモプラキン,
    (lxxxvii) L00352 ヒト 低密度脂質蛋白質 受容体 遺伝子, エクソン 18,
    (lxxxviii) Y13647 ステアロイル補酵素デサチュラーゼ,
    (lxxxix) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する,
    (xc) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (xci) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (xcii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (xciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA, および
    (xciv) J00120癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf, 114,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを更に含んで成り;かつ、
    (c)第三応答が以下記載の:
    (i) M20030 ヒト プロリンリッチな小 蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 930,
    (ii) X53065,
    (iii) M13903 ヒト インボルクリン 遺伝子, エクソン 2,
    (iv) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (v) L10343 ヒト エラフィン 遺伝子, 完全コード,
    (vi) M63573 ヒト 分泌シクロフィリン−様 蛋白質 (SCYLP) mRNA, 完全コード,
    (vii) M21302 ヒト プロリンリッチな小蛋白質 (sprII) mRNA, クローン 174N,
    (viii) Y00787 ヒト mRNA、 MDNCF(単球由来好中球走化性因子)に対する,
    (ix) X57985 ホモサピエンス 遺伝子、ヒストン H2B.1 および H2Aに対する,
    (x) L05188 ホモサピエンス プロリンリッチな小蛋白質 2 (SPRR2B) 遺伝子, 完全コード,
    (xi) X70326 マックマーク,
    (xii) X67325 ホモサピエンス p27 mRNA,
    (xiii) L19779 ホモサピエンス ヒストン H2A.2 mRNA, 完全コード,
    (xiv) S81914 IEX−1=照射誘起性 前初期 遺伝子 [ヒト, 胎盤, mRNA 部分, 1,
    (xv) D45248 ヒト mRNA、プロテアソーム活性化因子 hPA28 サブユニットベータに対する, 完全コード,
    (xvi) Z22548 ホモサピエンス チオール特異的抗酸化性 蛋白質 mRNA,
    (xvii) M22918 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 非筋肉, 選択的スプライス,
    (xviii) X06956 チューブリン, アルファ 1, 異型 44,
    (xix) V00594 ヒト mRNA、カドミウム処理細胞由来メタロチオネインに対する,
    (xx) M80254 ホモサピエンス シクロフィリン 異型 (hCyP3) mRNA, 完全コード,
    (xxi) U04636 ヒト シクロオキシゲナーゼ−2 (hCox−2) 遺伝子, 完全コード,
    (xxii) Z14244 ホモサピエンス coxVIIb mRNA、シトクローム c 酸化酵素 サブユニット VIIbに対する,
    (xxiii) X99920 ホモサピエンス mRNA、S100カルシウム−結合性 蛋白質A13に対する,
    (xxiv) U62800 ヒト シスタチン M (CST6) mRNA, 完全コード,
    (xxv) L08069 ヒト 熱ショック 蛋白質, 大腸菌 DnaJ 相同 mRNA, 完全コード,
    (xxvi) L20688 ヒト GDP−解離抑制因子 蛋白質 (Ly−GDI) mRNA, 完全コード,
    (xxvii) M13755 ヒト インターフェロン誘起 17−kDa/15−kDa 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (xxviii) M60278 ヒト ヘパリン−結合性 EGF−様 増殖因子 mRNA, 完全コード,
    (xxix) AF001294 ホモサピエンス IPL (IPL) mRNA, 完全コード,
    (xxx) X54489 ヒト 遺伝子、 黒色腫増殖刺激活性 (MGSA)に対する,
    (xxxi) M21186 ヒト 好中球 シトクローム b 軽鎖 p22 食細胞 b−シトクローム mRNA, 完全コード,
    (xxxii) D42040 ヒト mRNA、KIAA9001 遺伝子に対する, 完全コード,
    (xxxiii) V00599 チューブリン, ベータ,
    (xxxiv) U37690 ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット (hsRPB10) mRNA, 完全コード,
    (xxxv) M21005 ヒト 遊走抑制因子−関連 蛋白質 8 (MRP8) 遺伝子, 完全コード,
    (xxxvi) M37583 ヒト ヒストン (H2A.Z) mRNA, 完全コード,
    (xxxvii) Z49989 ホモサピエンス mRNA、スムーセリンに対する,
    (xxxviii) L24564 ヒト Rad mRNA, 完全コード,
    (xxxix) D49824 ヒト HLA−B ヌル対立遺伝子 mRNA,
    (xl) M59465 ヒト 腫瘍壊死因子 アルファ 誘起性蛋白質 A20 mRNA, 完全コード,
    (xli) S54005 チモシン ベータ−10 [ヒト, 転移黒色腫細胞系列, mRNA, 453 nt],
    (xlii) Z49254 ホモサピエンス L23−関連 mRNA,
    (xliii) M22919 ミオシン、軽鎖、アルカリ、平滑筋 (Gb:U02629), 平滑筋, 選択的スプライス ,
    (xliv) U70660 ヒト 銅輸送蛋白質 HAH1 (HAH1) mRNA, 完全コード,
    (xlv) AF006084 ホモサピエンス Arp2/3 蛋白質 コンプレックス サブユニット p41−Arc (ARC41) mRNA, 完全コード,
    (xlvi) X62083 ホモサピエンス mRNA、ショウジョウバエ雌無菌ホメオティック (FSH) 相同に対する,
    (xlvii) D86974 ヒト mRNA、KIAA0220 遺伝子に対する, 部分コード,
    (xlviii) M72885 ヒト GOS2 遺伝子, 5’ フランク および コード,
    (xlix) S80437 脂肪酸合成酵素 {3’ 領域} [ヒト, 胸 および HepG2 細胞, mRNA 部分, 22,
    (l) X04654 ヒト mRNA、U1 RNA−関連 70K 蛋白質に対する,
    (li) t M26311 ヒト 嚢胞性繊維症抗原 mRNA, 完全コード,
    (lii) X14850 ヒト H2A.X mRNA、ヒストン H2A.Xをコード,
    (liii) M14328 ヒト アルファ エノラーゼ mRNA, 完全コード,
    (liv) U07919 ヒト アルデヒド脱水素酵素 6 mRNA, 完全コード,
    (lv) M28130 ヒト インターロイキン 8 (IL8) 遺伝子, 完全コード,
    (lvi) Z21507 ホモサピエンス EF−1デルタ 遺伝子、ヒト伸長因子−1−デルタをコード,
    (lvii) M92934 ヒト 結合組織 増殖因子, 完全コード,
    (lviii) M27436 ヒト 組織因子 遺伝子, 完全コード, 3’にAlu反復配列,
    (lix) X74874 ホモサピエンス 遺伝子、RNA pol II 最大 サブユニットに対する, エクソン 1,
    (lx) X57351 ヒト 1−8D 遺伝子、インターフェロン誘起性遺伝子ファミリー由来,
    (lxi) X52979 ヒト 遺伝子、小核リボヌクレオ蛋白質 SmB および SmB’に対する,
    (lxii) U41515 ヒト 分断手/分断足での削除 1 (DSS1) mRNA, 完全コード,
    (lxiii) D28235 ヒト PTGS2 遺伝子、プロスタグランジンパーオキサイド合成酵素−2に対する, 完全コード,
    (lxiv) Y00503 ヒト mRNA、ケラチン 19に対する.
    (lxv) M57731 ヒト gro−ベータ mRNA, 完全コード,
    (lxvi) D50840 ホモサピエンス mRNA、セラミド グルコシル転移酵素に対する, 完全コード,
    (lxvii) U52101 ヒト YMP mRNA, 完全コード.
    (lxviii) D13413 ヒト mRNA、腫瘍−関連 120kDa 核蛋白質 p120’に対する, 部分コード(carbox,
    (lxix) L42379 ホモサピエンス 骨由来 増殖因子 (BPGF−1) mRNA, 完全コード,
    (lxx) X52426 ホモサピエンス mRNA、シトケラチン 13に対する,
    (lxxi) J04456 ヒト 14 kd レクチン mRNA, 完全コード,
    (lxxii) S78771 NAT=CG島−関連 遺伝子 [ヒト, mRNA, 1741 nt],
    (lxxiii) M26730 ヒト ミトコンドリアユビキノン−結合性 蛋白質 (QP) 遺伝子, エクソン 4,
    (lxxiv) U26727 ヒト p16INK4/MTS1 mRNA, 完全コード,
    (lxxv) X92896 ホモサピエンス mRNA、ITBA2 蛋白質に対する,
    (lxxvi) Z69043 ホモサピエンス mRNA トランスロコン−関連 蛋白質 デルタ サブユニット 前駆体,
    (lxxvii) L76568 ホモサピエンス 切除および架橋修復 蛋白質 (ERCC4) 遺伝子, 完全ゲノム,
    (lxxviii) M12125 ヒト 繊維芽細胞筋肉型トロポミオシン mRNA, 完全コード,
    (lxxix) U09937 ヒト ウロキナーゼ型プラスミノーゲン 受容体, エクソン 7,
    (lxxx) X15822 ヒト COX VIIa−L mRNA、肝特異的シトクローム c 酸化酵素(EC 1.9.3.1.)に対する,
    (lxxxi) M34516 ヒト オメガ 軽鎖 蛋白質 14.1 (Ig ラムダ 鎖 関連) 遺伝子, エクソン 3,
    (lxxxii) U53830 ホモサピエンス インターフェロン 制御因子 7A mRNA, 完全コード,
    (lxxxiii) X82693 ホモサピエンス mRNA、E48 抗原に対する,
    (lxxxiv) M58026 ヒト NB−1 mRNA, 完全コード,
    (lxxxv) M90657 ヒト 腫瘍 抗原 (L6) mRNA, 完全コード,
    (lxxxvi) X57579 ホモサピエンス アクチビン ベータ−A サブユニット (エクソン 2),
    (lxxxvii) D38251 ヒト mRNA、RPB5 (XAP4)に対する, 完全コード,
    (lxxxviii) D89667 ホモサピエンス mRNA、c−myc 結合性蛋白質に対する, 完全コード,
    (lxxxix) AB000584 ホモサピエンス mRNA、TGF−ベータ スーパーファミリー蛋白質に対する, 完全コード,
    (xc) L76200 ヒト グアニレート キナーゼ (GUK1) mRNA, 完全コード,
    (xci) J04794 ヒト アルデヒド還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (xcii) X52882 ヒト t−複合ポリペプタイド 1 遺伝子,
    (xciii) M79463 ヒト PML−2 mRNA, 完全コード,
    (xciv) Y09022 ホモサピエンス mRNA、Not56−様 蛋白質に対する,
    (xcv) M12529 ヒト アポ脂質蛋白質 E mRNA, 完全コード,
    (xcvi) X71129 ホモサピエンス mRNA、電子伝達フラボプロテイン ベータサブユニットに対する,
    (xcvii) X83416 ホモサピエンス PrP 遺伝子, エクソン 2,
    (xcviii) D89052 ホモサピエンス mRNA、プロトン−ATPアーゼ様蛋白質に対する, 完全コード,
    (xcix) M60974 ヒト 増殖停止 および DNA−損傷 誘起性 蛋白質 (gadd45) mRNA, 完全コード,
    (c) M16364 ヒト クレアチン キナーゼ−B mRNA, 完全コード,
    (ci) D38305 ヒト mRNA、Tobに対する, 完全コード,
    (cii) X87679 主要組織親和性コンプレックス, クラス I, E (Gb:M21533),
    (ciii) Z29505 ホモサピエンス mRNA、核酸結合性蛋白質 sub2.3に対する,
    (civ) K02574,
    (cv) U09813 ヒト ミトコンドリアATP合成酵素 サブユニット 9, P3 遺伝子 コピー, mRNA, 核 遺伝子 enc,
    (cvi) X67951 ホモサピエンス mRNA、増殖関連遺伝子 (pag)に対する,
    (cvii) J04611 ヒト ループス p70 (Ku) 自己抗原 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (cviii) U09578 ホモサピエンス MAPKAP キナーゼ (3pK) mRNA, 完全コード,
    (cix) X53800 ヒト mRNA、マクロファージ炎症性蛋白質−2 ベータ(MIP2ベータ)に対する,
    (cx) V00599 チューブリン, ベータ 2,
    (cxi) U69126 ヒト FUSE 結合性 蛋白質 2 (FBP2) mRNA, 部分コード,
    (cxii) X53416 ヒト mRNA、アクチン結合性蛋白質(フィラミン)(ABP−280)に対する,
    (cxiii) U90546 ヒト ブチロフィリン (BTF4) mRNA, 完全コード,
    (cxiv) M58459 ヒト リボソーム 蛋白質 (RPS4Y) 異型 mRNA, 完全コード,
    (cxv) M19961 ヒト シトクローム c 酸化酵素 サブユニット Vb (coxVb) mRNA, 完全コード,
    (cxvi) U65579 ヒト ミトコンドリア NADH 脱水素酵素−ユビキノン Fe−S 蛋白質 8, 23 kDa サブユニット,
    (cxvii) X77794 ホモサピエンス mRNA、シクリン G1に対する
    (cxviii) M29064 ヒト hnRNP B1 蛋白質 mRNA,
    (cxix) D21853 ヒト mRNA、KIAA0111 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxx) X78687 ホモサピエンス G9 遺伝子、シアリダーゼをコード,
    (cxxi) X15729 ヒト mRNA、核 p68 蛋白質に対する,
    (cxxii) X04828 ヒト mRNA、G(i) 蛋白質 アルファ−サブユニット (アデニレートシクラーゼ抑制性GTP−バインドに対する,
    (cxxiii) L27943 ホモサピエンス シチジン脱アミノ酵素 (CDA) mRNA, 完全コード,
    (cxxiv) L40391 ホモサピエンス (クローン s153) mRNA 分画,
    (cxxv) D42123 ホモサピエンス mRNA、ESP1/CRP2に対する, 完全コード,
    (cxxvi) X74104 ホモサピエンス mRNA、TRAP ベータ サブユニットに対する,
    (cxxvii) M84332 ヒト ADP−リボシル化因子 1 遺伝子, エクソン 2−5,
    (cxxviii) L37127 ホモサピエンス RNA ポリメラーゼ II mRNA, 完全コード,
    (cxxix) M92843 ホモサピエンス ジンクフィンガー 転写制御因子 mRNA, 完全コード,
    (cxxx) U07664 ヒト HB9 ホメオボックス 遺伝子, エクソン 2 および 3 および 完全コード,
    (cxxxi) L48546 ホモサピエンス チューベリン (TSC2) 遺伝子, エクソン 38, 39, 40 および 41,
    (cxxxii) X53586 ヒト mRNA、インテグリン アルファ 6に対する,
    (cxxxiii) t D21852 ヒト mRNA、KIAA0029 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxxxiv) L11066 ヒト mRNA 配列,
    (cxxxv) J04444 ヒト シトクローム c−1 遺伝子, 完全コード,
    (cxxxvi) M95787 ヒト 22kDa 平滑筋 蛋白質 (SM22) mRNA, 完全コード,
    (cxxxvii) L07517 ムチン 6, 胃 (Gb:L07517),
    (cxxxviii) X91247 ホモサピエンス mRNA、チオレドキシン還元酵素に対する,
    (cxxxix) L11672 ヒト クルッペル 関連 ジンクフィンガー 蛋白質 (HTF10) mRNA, 完全コード,
    (cxl) U30999 ヒト (memc) mRNA, 3’UTR,
    (cxli) U01337 ヒト Ser/Thr 蛋白質 キナーゼ (A−RAF−1) 遺伝子, 完全コード,
    (cxlii) U28480 非結合性 蛋白質 Ucp,
    (cxliii) X12794 ヒト v−erbA 関連 ear−2 遺伝子,
    (cxliv) L22005 ヒト ユビキチン抱合化酵素 mRNA, 部分コード,
    (cxlv) M12886 ヒト T−細胞 受容体 活性 ベータ−鎖 mRNA, 完全コード,
    (cxlvi) Y08915 ホモサピエンス mRNA、アルファ 4 蛋白質に対する,
    (cxlvii) M24547 アミロイド ベータ (A4) 前駆体 蛋白質, 選択的スプライス 2, A4(751),
    (cxlviii) X76717 ホモサピエンス MT−1l mRNA,
    (cxlix) M64347 ヒト 新規 増殖因子 受容体 mRNA, 3’ コード,
    (cl) X05409 ヒト RNA、ミトコンドリア アルデヒド脱水素酵素 I ALDH I(EC 1.2.1.3)に対する,
    (cli) D87469 ヒト mRNA、KIAA0279 遺伝子に対する, 部分コード,
    (clii) M58603 ヒト 核因子 カッパ−B DNA 結合性 サブユニット (NF−カッパ−B) mRNA, 完全コード,
    (cliii) M76482 ヒト 130−kD ペムフィガスブルガリス抗原 mRNA, 完全コード,
    (cliv) X06323 ヒト MRL3 mRNA、リボソーム 蛋白質 L3 相同 (MRL3=哺乳動物リボソーム Lに対する,
    (clv) X78992 ホモサピエンス ERF−2 mRNA,
    (clvi) L41351 ホモサピエンス プロスタシン mRNA, 完全コード,
    (clvii) X75342 ホモサピエンス SHB mRNA,
    (clviii) U83115 ヒト 非−レンズ ベータ ガンマ−クリスタリン 様 蛋白質 (AIM1) mRNA, 部分コード,
    (clix) U88629 ヒト RNA ポリメラーゼ II 伸長因子 ELL2, 完全コード,
    (clx) S78825 Id1,
    (clxi) U28811 ヒト システインリッチな繊維芽細胞 増殖因子 受容体 (CFR−1) mRNA, 完全コード,
    (clxii) M58286 ホモサピエンス 腫瘍壊死因子 受容体 mRNA, 完全コード,
    (clxiii) D78129 ホモサピエンス mRNA、スクワレンエポキシダーゼに対する, 部分コード,
    (clxiv) D14874 ホモサピエンス mRNA、アドレノメデュリン 前駆体に対する, 完全コード,
    (clxv) Z26317 ホモサピエンス mRNA、デスモグレイン 2に対する,
    (clxvi) L19267 ホモサピエンス 59 蛋白質 mRNA, 3’ 末端,
    (clxvii) J00120 癌原遺伝子 C−Myc, 選択的スプライス 3, Orf 114,
    (clxviii) U33821 ヒト tax1−結合性 蛋白質 TXBP151 mRNA, 完全コード,
    (clxix) U52100 ヒト XMP mRNA, 完全コード,
    (clxx) L31801 ホモサピエンス モノカルボキシレート輸送体 1 (SLC16A1) mRNA, 完全コード,
    (clxxi) L00058 ヒト (GH) 生殖細胞系列 c−myc 癌原遺伝子, エクソン 3 および 3’ フランク,
    (clxxii) U52426 ホモサピエンス GOK (STIM1) mRNA, 完全コード,
    (clxxiii) M80244 ヒト E16 mRNA, 完全コード,
    (clxxiv) U56418 ヒト リソフォスファチジン酸アシル転移酵素−ベータ mRNA, 完全コード,
    (clxxv) L38490 ホモサピエンス ADP−リボシル化因子 mRNA, 完全コード,
    (clxxvi) U14603 ヒト 蛋白質−チロシン フォスファターゼ (HU−PP−1) mRNA, 部分配列,
    (clxxvii) L77886 ヒト 蛋白質 チロシン フォスファターゼ mRNA, 完全コード,
    (clxxviii) M38258 ヒト レチノイン酸 受容体 ガンマ 1 mRNA, 完全コード,
    (clxxix) X89750 ホモサピエンス mRNA、TGIF 蛋白質に対する,
    (clxxx) D85429 ホモサピエンス 遺伝子、熱ショック 蛋白質 40に対する, 完全コード,
    (clxxxi) J05211 デスモプラキン I,
    (clxxxii) M31627 ヒト X box 結合性 蛋白質−1 (XBP−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxiii) X80695 ホモサピエンス OXA1Hs mRNA,
    (clxxxiv) M54915 ヒト h−pim−1 蛋白質 (h−pim−1) mRNA, 完全コード,
    (clxxxv) D83777 ヒト mRNA、KIAA0193 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvi) D31883 ヒト mRNA、KIAA0059 遺伝子に対する, 完全コード,
    (clxxxvii) U00968 ヒト SREBP−1 mRNA, 完全コード,
    (clxxxviii) K03195 ヒト (HepG2) グルコース輸送体 遺伝子 mRNA, 完全コード,
    (clxxxix) D86965 ヒト mRNA、KIAA0210 遺伝子に対する, 完全コード,
    (cxc) Z30643 ホモサピエンス mRNA、クロライドチャンネル (推定) 2139bpに対する,
    (cxci) D14520 ヒト mRNA、GC−Box 結合性 蛋白質 BTEB2に対する, 完全コード,
    (cxcii) D87462 ヒト mRNA、KIAA0272 遺伝子に対する, 部分コード,
    (cxciii) X80692 ホモサピエンス ERK3 mRNA,
    (cxciv) X90858 ホモサピエンス mRNA、ウリジンフォスフォリラーゼに対する,
    (cxcv) M57763 ヒト ADP−リボシル化因子 (hARF6) mRNA, 完全コード,
    (cxcvi) X92720 ホモサピエンス mRNA、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシキナーゼに対する,
    (cxcvii) M81601 ヒト 転写 伸長因子 (SII) mRNA, 完全コード,
    (cxcviii) X52611 ヒト mRNA、転写因子 AP−2に対する,
    (cxcix) U09587 ヒト グリシル−tRNA シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (cc) U14550 ヒト シアリル転移酵素 SThM (sthm) mRNA, 完全コード,
    (cci) D90209 ヒト mRNA、DNAT 結合性 蛋白質 AXREB67に対する,
    (ccii) X77366 ホモサピエンス HBZ17 mRNA,
    (cciii) X76534 ホモサピエンス NMB mRNA,
    (cciv) U37519 ヒト アルデヒド脱水素酵素 (ALDH8) mRNA, 完全コード,
    (ccv) M83667 ヒト NF−IL6−ベータ 蛋白質 mRNA, 完全コード,
    (ccvi) U53347 ヒト 中性アミノ酸輸送体 B mRNA, 完全コード,
    (ccvii) L09229 ヒト 長鎖アシル補酵素 A シンテターゼ (FACL1) mRNA, 完全コード,
    (ccviii) S73591 脳発現 HHCPA78 相同 [ヒト, HL−60 急性前骨髄性白血病細胞,
    (ccix) M13929 ヒト c−myc−P64 mRNA, プロモータ POから開始, (HLmyc2.5) 部分コード,
    (ccx) M55268 ヒト カゼイン キナーゼ II アルファ’ サブユニット mRNA, 完全コード,
    (ccxi) M77836 ヒト ピロリン5−カルボキシレート還元酵素 mRNA, 完全コード,
    (ccxii) HG2724−HT2820_at S75762 発癌遺伝子 Tls/Chop, 融合活性化,
    (ccxiii) U72066 ホモサピエンス CtBP 相互作用性 蛋白質 CtIP (CtIP) mRNA, 完全コード,
    (ccxiv) U42031 ヒト 54 kDa プロゲステロン 受容体−関連 イムノフィリン FKBP54 mRNA, 部分コード,
    (ccxv) M27396 ヒト アスパラギン シンテターゼ mRNA, 完全コード,
    (ccxvi) X01630 ヒト mRNA、アルギニノコハク酸シンテターゼに対する,
    (ccxvii) D32050 ヒト mRNA、アラニル−tRNA シンテターゼに対する, 完全コード,
    (ccxviii) M90656 ヒト ガンマ−グルタミルシステインシンテターゼ (GCS) mRNA, 完全コード,
    (ccxix) J04102 ヒト 赤芽球症ウイルス 発癌遺伝子 相同 2 (ets−2) mRNA, 完全コード, および
    (ccxx) X69111 ホモサピエンス HLH 1R21 mRNA、ヘリックス−ループ−ヘリックス 蛋白質に対する,
    から成る群から選択されるポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドに少なくとも90%の同一性を有する少なくとも一つの蛋白質の変異発現パターンを更に含んで成る;
    ことを特徴とする請求項86記載の方法。
  95. 複数蛋白質のレベルをELISAによって測定することを特徴とする請求項86記載の方法。
  96. 細胞の紫外線曝露に対する応答をスクリーニングすることにより細胞の紫外線曝露を検出する方法であって、前記応答が遺伝子発現配列体分析によって決定した変異発現パターンであり、下記:
    (a)紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数RNA分子のレベルを測定して検定発現パターンを確立するステップ、および
    (b)前記検定発現パターンを細胞の紫外線曝露に対する応答と対比するステップ、
    を含んで成り、前記細胞での発現パターンが細胞の紫外線に対する応答に実質的に類似している場合には、前記細胞は紫外線曝露されたとすることを特徴とする方法。
  97. 細胞の紫外線曝露に対する応答をスクリーニングすることにより細胞の紫外線曝露を検出する方法であって、前記応答が遺伝子発現配列体分析によって決定した変異発現パターンであり、下記:
    (a)紫外線曝露後の少なくとも一時点での細胞中の複数蛋白質のレベルを測定して検定発現パターンを確立するステップ;および
    (b)前記検定発現パターンを細胞の紫外線曝露に対する応答と対比するステップ;および、
    (c)前記細胞での発現パターンが細胞の紫外線に対する応答に実質的に類似している場合には、前記細胞は紫外線曝露されたとすること;
    を含んで成る方法。
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