JP2004303064A - サンプル管理方法、サンプル管理装置、端末装置、サンプル管理プログラムおよびそれを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体 - Google Patents

Abstract

【課題】例えばＤＮＡサンプルの受託解析を支援するシステムにおいて、依頼者が処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を柔軟に制御することを可能とする。
【解決手段】サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理サーバ１であって、サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理部１１と、通信ネットワークＮ１を介して接続された依頼者端末２から、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する再解析受付部２６とを備える。これにより、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を変更可能であるため、依頼者が自分で処理する場合のように、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を自由にやり直すことができる。
【選択図】 図１

Description

【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は、例えばＤＮＡサンプルの受託解析システムにおいてサンプルの管理を支援するサンプル管理方法、サンプル管理装置、端末装置、サンプル管理プログラムおよびそれを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体に関するものである。
【０００２】
【従来の技術】
遺伝子解析のために研究者が従来自分で行っていた培養から解析までの処理操作を、効率よく、高精度に行うために、専門の遺伝子解析センタによるＤＮＡサンプルの受託解析が行われている。そして、このような遺伝子解析センタでは、より速く、より安全・確実な処理操作を実現するために、多量のサンプルとそのデータを厳しく管理する必要がある。そのため、遺伝子解析センタでは、マイクロプレート等の管理機能を備え、多くの装置やソフトウェアと協調して、受託解析の処理操作を支援するサンプル管理システムが利用されている。
【０００３】
例えば、下記非特許文献１には、罹患頻度の高い多因子疾患の発症に関与する遺伝子群を同定するプロジェクトを支援するための解析システム（サンプル管理システムが記載されている。この解析システムは、各共同研究機関から提供された多数の検体を効率良く解析することを目的としている。具体的には、上記解析システムは、（ｉ）受託時に疾患リスト、診療記録、疫学調査等のデータを登録するとともに、サンプルに２Ｄコード（サンプルＩＤ，プレートＩＤ）を付与し、（ｉｉ）解析処理（希釈・分注、解析用ＰＣＲ、フラグメント解析、ＳＮＰｓ解析、遺伝子タイピング解析）の進捗状況を管理し、（ｉｉｉ）解析終了時にサンプル情報と解析結果をデータベース化するとともに、データを自動転送する、等の機能を有する。
【０００４】
【非特許文献１】
“Ｇｅｎｏｍｉｃｓ／Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓにおける実験データのラボ情報管理システム（ＬＩＭＳ）”、アプライドバイオシステムズジャパン株式会社、Ｂｉｏ ＷＡＶＥ、第２０号、２−５頁
【０００５】
【発明が解決しようとする課題】
ここで、遺伝子解析のために研究者が自分で培養から解析までの処理操作を行う場合、研究者は処理操作の途中あるいは終了後に自由にやり直すことが可能であった。
【０００６】
しかしながら、上記従来のサンプル管理システム、受託解析においてサンプルに所定の処理操作を効率良く行うためのものであるため、依頼者である研究者が処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を変更するための機能を備えていなかった。その結果、例えば、研究者がシーケンス結果を見て不適当であった場合に、プライマーを変更して、直ちに再解析することができなかった。
【０００７】
そこで、受託解析でありながら、依頼者（研究者）が自分で処理操作する場合のように、処理操作の途中あるいは終了後に自由にやり直すなど、依頼者による処理操作の柔軟な制御（再解析など）を可能とするサンプル管理システムが求められていた。
【０００８】
本発明は、上記の問題点を解決するためになされたもので、その目的は、例えばＤＮＡサンプルの受託解析を支援するシステムであって、依頼者が処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を柔軟に制御することを可能とするサンプル管理方法、サンプル管理装置、端末装置を提供することにある。また、本発明の目的には、上記サンプル管理装置を実現するサンプル管理プログラム、およびこれを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体を提供することも含まれる。
【０００９】
【課題を解決するための手段】
上記の課題を解決するために、本発明のサンプル管理方法は、サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理方法であって、サンプル管理装置において、上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理処理と、上記サンプル管理装置が、通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受信処理と、を含むことを特徴としている。
【００１０】
また、本発明のサンプル管理装置は、サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理装置であって、上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理手段と、通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受付手段と、を備えることを特徴としている。
【００１１】
上記の方法および構成により、サンプル管理装置は、サンプルに対する処理操作の途中あるいは終了後に、処理操作への制御指示を依頼者の端末装置から受信して、進捗管理に加えることができる。すなわち、サンプル管理装置は、サンプルに対する処理操作の途中あるいは終了後に、依頼者から、処理操作のやり直しや条件変更の指示を受けることができる。それゆえ、サンプル管理装置は、依頼者からの指示に従って処理操作装置を制御したり、処理操作の作業者に指示を提示することが可能になる。
【００１２】
よって、上記サンプル管理装置によれば、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を変更可能であるため、依頼者は自分で処理する場合のように、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を自由にやり直すことができる。すなわち、依頼者が処理操作を柔軟に制御可能なサービスを提供することが可能となる。
【００１３】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サービスがＤＮＡサンプルの解析処理であることを特徴としている。
【００１４】
上記の構成により、さらに、遺伝子解析の受託解析サービスにおいて、一連の処理操作の途中あるいは終了後に処理操作が変更可能となるため、依頼者が自分で処理する場合のように、処理操作の途中あるいは終了後に自由にやり直すことができる。例えば、培養の結果、菌数の増加が十分でなかった場合にやり直すことや、シーケンス結果が不適当であった場合にプライマーを変更するとともに、ＰＣＲ反応を温度を変えてやり直すことが可能となる。
【００１５】
よって、依頼者による処理操作の柔軟な制御が可能なＤＮＡサンプルの受託解析サービスを実現できる。しかも、従来依頼者が自分で行っていた培養から解析処理までの処理操作を、専門のセンタが代わりに行うことで、効率よく、高精度に行うという受託解析サービス本来の目的を害することがない。
【００１６】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記処理操作に、培養、ＤＮＡ精製、シークエンス反応、シーケンシング、アセンブル、相同性検索のいずれか１つが含まれることを特徴としている。
【００１７】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、培養、ＤＮＡ精製、シークエンス反応、シーケンシング、アセンブル、相同性検索等を含む処理操作を統一的に制御できる。よって、ウェットな実験系の流れとドライな情報処理の流れとを含むＤＮＡサンプルの受託解析処理サービスにおいて、依頼者が処理操作を柔軟に制御可能でありながら、正確かつ効率的にサンプルを管理できる。
【００１８】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記処理操作への制御指示が、サンプルの再解析の依頼であることを特徴としている。
【００１９】
上記の構成により、さらに、依頼者が、サンプル解析の途中あるいは終了後、依頼者の端末装置からサンプル解析のやり直し（再解析依頼）を依頼することが可能となる。
【００２０】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記制御指示受付手段が、上記端末装置から、サンプルの再解析の依頼とともに、使用するプライマーを指定したプライマー情報を受信するものであることを特徴としている。
【００２１】
上記の構成により、さらに、依頼者が、再解析を依頼する際、使用するプライマーを設定することが可能となる。
【００２２】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記プライマー情報で指定されたプライマーを使用してシークエンス反応およびシーケンシングを行うように解析装置を制御する解析装置制御手段を備えることを特徴としている。
【００２３】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、依頼者から再解析の指示とともに受信したプライマー情報で指定されたプライマーを使用して、シークエンス反応およびシーケンシングをやり直すことができる。
【００２４】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記プライマー情報が、あらかじめサンプル管理装置に登録された塩基配列を指定する情報を含むことを特徴としている。
【００２５】
上記の構成により、さらに、使用頻度の高いプライマーの塩基配列をあらかじめ登録しておくことにより、データベースのデータ構造が簡単化できるとともに、処理／解析装置を含むサンプル管理システムの動作を効率化できる。また、プライマーを指定する際、依頼者はあらかじめ登録されたプライマーを選択するだけでよく、具体的な塩基配列を設定する必要がない。よって、依頼者がプライマーを指定する際に行う操作を簡単化できる。
【００２６】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記プライマー情報が、塩基配列を定義した情報を含むことを特徴としている。
【００２７】
上記の構成により、さらに、依頼者は使用するプライマーの塩基配列として、任意の塩基配列を指定できる。
【００２８】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記端末装置から、相同性検索の検索条件を指定した相同性検索条件情報を受信するものであることを特徴としている。
【００２９】
上記の構成により、さらに、依頼者は操作端末から相同性検索の検索条件を設定することが可能となる。
【００３０】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サンプルに対する処理操作の進捗状況を、上記進捗管理手段から取得して、上記端末装置へ送信する進捗状況報告手段を備えることを特徴としている。
【００３１】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、所定のタイミングによって、あるいは、依頼者の端末装置からの要求に応じて、端末装置へサンプルに対する処理操作の進捗状況を通知できる。例えば、サンプル管理装置は、依頼者の端末装置から進捗状況の確認依頼をサンプル識別情報（サンプルＩＤ）とともに受信し、サンプル識別情報に基づきデータベースから進捗状況のデータを取得して、依頼者の端末装置へ送信する。なお、報告の形式としては、進捗状況を記載した文書をＨＴＭＬで作成して端末装置において表示させたり、電子メールアドレスへ送信したりすることができる。
【００３２】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サンプルに対する解析結果を、上記端末装置へ送信する解析結果報告手段を備えることを特徴としている。
【００３３】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、所定のタイミングによって、あるいは、依頼者の端末装置からの要求に応じて、端末装置へサンプルに対する解析結果を通知できる。例えば、サンプル管理装置は、依頼者の端末装置から進捗状況の確認依頼をサンプル識別情報（サンプルＩＤ）とともに受信し、サンプル識別情報に基づきデータベースから解析結果のデータ（シーケンス結果、クロマトチャート、相同性検索結果、等）を取得して、依頼者の端末装置へ送信する。なお、報告の形式としては、解析結果を記載した文書をＨＴＭＬで作成して端末装置において表示させたり、電子メールアドレスへ送信したりすることができる。
【００３４】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サンプルを依頼者から受領した時のサンプルの形態を示すサンプル形態情報に基づいて請求費用を算出する課金手段を備えることを特徴としている。
【００３５】
例えば、ＤＮＡサンプルの受託解析処理サービスにおいては、受託時のサンプルの送付形態に応じて、処理操作の開始段階が異なり、サービスのコストが異なる。
【００３６】
そこで、上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、処理操作の開始段階を考慮した請求費用を課金することができる。なお、サンプル管理装置は、受託時に依頼者の端末装置から受信した「サンプルの送付形態」の情報をサンプル形態情報としてデータベースに登録しておいてもよい。また、上記課金手段は、算出した請求費用を依頼者の端末装置やあらかじめ指定された決済機関へ送信してもよい。
【００３７】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報に基づいて請求費用を算出する課金手段を備えることを特徴としている。
【００３８】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報、すなわち再解析の回数を考慮した請求費用を課金することができる。なお、解析回数情報としては、サンプル識別情報（サンプルＩＤ）に含まれる「グリセロールストックからの複製回数」や、シーケンスプレート識別情報（シーケンスプレートＩＤ）に含まれる「同一内容のシーケンスプレートが存在する場合の通し番号」が利用できる。
【００３９】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記課金手段が、上記請求費用をあらかじめ設定された送信先へ送信するものであることを特徴としている。
【００４０】
上記の構成により、さらに、サンプル管理装置は、算出した請求費用を、あらかじめ設定された送信先、例えば、依頼者の端末装置や依頼者が指定した決済機関のコンピュータへ送信することができる。
【００４１】
また、本発明の端末装置は、上記のサンプル管理装置と通信ネットワークを介して接続されていることを特徴としている。
【００４２】
上記の構成により、依頼者は端末装置を使って、遠隔地からサンプル管理装置の機能を利用して、サンプルに所定の処理操作を施すサービス（例えば、ＤＮＡサンプルの解析処理）を受けることが可能となる。
【００４３】
また、本発明のサンプル管理プログラムは、コンピュータを上記の各手段として機能させるコンピュータ・プログラムである。
【００４４】
上記の構成により、コンピュータで上記サンプル管理装置の各手段を実現することによって、上記サンプル管理装置を実現することができる。
【００４５】
また、本発明のサンプル管理プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体は、上記の各手段をコンピュータに実現させて、上記サンプル管理装置を動作させるサンプル管理プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体である。
【００４６】
上記の構成により、上記記録媒体から読み出されたサンプル管理プログラムによって、上記サンプル管理装置をコンピュータ上に実現することができる。
【００４７】
【発明の実施の形態】
本発明の一実施の形態について図１から図５６に基づいて説明すれば、以下のとおりである。
【００４８】
図２に示すように、本実施の形態に係るサンプル管理システム１００は、ＤＮＡサンプルの受託解析を行ういわゆる遺伝子解析センタＡ１に設置され、通信ネットワークＮ１を介して、依頼者が所属する外部の依頼者サイトＡ２の依頼者端末２に接続されている。
【００４９】
遺伝子解析センタＡ１は、依頼者より郵便等で送付されたサンプルに各種の作業（培養、ＤＮＡ精製、シークエンス反応、シーケンシング、解析処理（アセンブル、相同性検索）等）を施し、得られたデータを依頼者に送付するサービスを提供する。遺伝子解析センタＡ１は、依頼者の依頼登録および解析結果の報告を、インターネット等の通信ネットワークＮ１を介してサンプル管理サーバ１によって行う。
【００５０】
そのため、サンプル管理サーバ１は、遺伝子解析センタＡ１におけるサンプルの管理、解析データの管理、作業の履歴の管理を行う。また、サンプル管理サーバ１は、遺伝子解析センタＡ１における受託解析サービスに関し、依頼者端末２に対して、依頼の登録、進捗状況の確認、結果データヘのアクセスなどの処理のインターフェイスを提供する。
【００５１】
なお、サンプル管理サーバ１は、遺伝子の受託解析サービスにおけるＤＮＡサンプルの管理に最適であるが、他の対象物の受託処理サービスにおける対象物の管理一般に適用可能である。また、ネットワークを含む装置構成、データ構造、表示画面は一例であり、これによって本発明が限定されるものではない。
【００５２】
詳細には、サンプル管理サーバ１は、サンプル、プレート、シーケンスプレート等にＩＤを付与し、このＩＤに従ってデータを管理する。プレートおよびシーケンスプレートには、プレートＩＤおよびシーケンスプレートＩＤのコードラベルが貼付される。サンプルＩＤおよびシーケンスプレートＩＤには、再解析の回数が含まれる。プレートおよびシーケンスプレートのコードラベルは、ＩＤが変更される度に貼り替えられる。さらに、サンプル管理サーバ１は、サンプルＩＤを用いて、再解析の回数を考慮した料金を算出し依頼者へ課金する。
【００５３】
サンプル管理サーバ１は、ユーザを３つの権限に分別して、権限によりユーザが使用できる機能を限定している。具体的には、解析依頼を行う依頼者には「依頼者権限」を、遺伝子解析センタＡ１での作業に従事する作業者には「作業者権限」を、サンプル管理サーバ１の管理者には「管理者権限」を与える。よって、サンプル管理サーバ１にアクセスするためには、あらかじめユーザ登録を行う必要がある。
【００５４】
依頼者のユーザ登録は、依頼者が電子メールやＦＡＸ等にてサンプル管理サーバ１の管理者宛てに所定の情報（例えば、氏名、所属、住所、電話番号、ＦＡＸ番号、電子メールアドレス、ログイン名、ＩＰ（ｉｎｔｅｒｎｅｔ ｐｒｏｔｏｃｏｌ）アドレス等）を通知し、管理者がユーザ登録して、ログイン名および初期パスワードを依頼者へ電子メールやＦＡＸ等にて通知する。また、作業者の場合も、依頼者のユーザ登録と同様の手順で登録できる。なお、ログイン名は、ユーザ間で重複しないように設定する。また、パスワードは、原則としてユーザでの自己管理とし、個々のユーザ本人以外は知らないものとする。管理者によるユーザ登録の作業については、管理者権限機能として後述する。
【００５５】
管理者によってユーザ登録処理およびファイアウォール装置（図示せず）へのアクセス許可の追加処理が完了すると、依頼者にアクセス用のログイン名と初期パスワードが連絡され、サンプル管理サーバ１ヘのアクセス試験を行うことが可能となる。
【００５６】
このように、サンプル管理サーバ１では、第三者によるデータの盗聴を防ぐために、ファイアウォール装置によるアクセス制限、および通信の暗号化を行う。よって、サンプル管理サーバ１では、外部より預かったサンプルの処理結果であるシーケンスデータを通信ネットワークＮ１を介して安全に参照可能である。
【００５７】
サンプル管理サーバ１のユーザは、端末（依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４）のＨＴＭＬ（Ｈｙｐｅｒ Ｔｅｘｔ Ｍａｒｋｕｐ Ｌａｎｇｕａｇｅ）ブラウザ２ａ，３ａ，４ａ（図１）を利用して、サンプル管理サーバ１にアクセスする。
【００５８】
ユーザが端末（依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４）からサンプル管理サーバ１にアクセスすると、サンプル管理サーバ１は端末にインターフェイスの画面を表示させるためのＨＴＭＬ文書を作成し、送信する。
【００５９】
通常、端末からサンプル管理サーバ１にアクセスすると、サンプル管理サーバ１は、端末のブラウザ２ａ，３ａ，４ａにログイン画面（図示せず）を表示させる。
【００６０】
このログイン画面では、ユーザが入力したログイン名とパスワード（ユーザが変更するまでは初期パスワード）に基づいて、ユーザ認証を行い、ユーザの権限を判別する。ユーザがログイン画面で正しいログイン名とパスワードを入力すると、サンプル管理サーバ１は、端末にメイン画面５０（図３）を表示させる。なお、ログイン名およびパスワードが一致しない場合、ログインは失敗し、エラー画面（図示せず）を表示させる。
【００６１】
図３に示すように、メイン画面５０は、左右に分割されており、左側のフレームに各機能へのメニューボタン５１が、右側のフレームに各機能に対応した画面が表示されるメイン表示領域５２が配されている。なお、メイン表示領域５２は初期段階では空白になっている。
【００６２】
ここで、サンプル管理サーバ１は、ユーザ権限に応じてメニューボタン５１を表示させる。すなわち、メイン画面５０は、ユーザ権限に応じて変化する。具体的には、依頼者権限では、［ログアウト］ボタンｂ１０、［依頼登録］ボタンｂ１１、［サンプル検索］ボタンｂ１２、［ＢＬＡＳＴ設定］ボタンｂ１３、［状況確認メール］ボタンｂ１４、［プライマー登録］ボタンｂ１５、［パスワード変更］ボタンｂ１６が表示され、他のボタンは表示されない。作業者権限では、依頼者権限で表示されるボタンｂ１１〜ｂ１６に加えて、［作業履歴登録］ボタンｂ２１、［コードラベル印刷］ボタンｂ２２、［プレートレイアウト］ボタンｂ２３、［サンプル処理登録］ボタンｂ２４が表示される。管理者権限では、依頼者権限で表示されるボタンｂ１１〜ｂ１６，ｂ２１〜ｂ２４に加えて、［ユーザ管理］ボタンｂ３１、［作業ＩＤ登録］ボタンｂ３２、［統計］ボタンｂ３３が表示される。すなわち、サンプル管理サーバ１のすべての機能を利用できるのは、管理者権限のあるユーザのみである。
【００６３】
つづいて、サンプル管理サーバ１の機能を、ユーザ権限ごとに、依頼者権限、作業者権限、管理者権限の順で説明する。
【００６４】
なお、サンプル管理サーバ１からのログアウトは、ユーザがメニューの［ログアウト］ボタンｂ１０を押すと確認ウィンドウ（図示せず）が表示され、この確認ウィンドウで［ＯＫ］ボタンが押すとログアウト処理が行われる。
【００６５】
［１］依頼者権限機能
まず、依頼者権限で利用可能な機能について説明する。以下では、ユーザを依頼者として説明するが、作業者あるいは管理者が利用する場合も同様である。
【００６６】
（１）依頼登録
依頼者によってメニューボタン５１の［依頼登録］ボタンｂ１１が押されると、サンプル管理サーバ１は依頼登録処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にサンプル種別選択画面ｗ１（図４）を表示させる。
【００６７】
図４に示すように、サンプル種別選択画面ｗ１では、新規サンプルによる「新規解析」と、登録済みサンプルによる「再解析」の２つが、ラジオボタンによって選択可能となっている。
【００６８】
ここで、「新規解析」の依頼について説明する。なお、「再解析」の依頼については後述する。
【００６９】
サンプル種別選択画面ｗ１において、依頼者が「新規解析」を選択後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１はサンプル登録設定処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にサンプル登録設定画面ｗ２（図５）を表示させる。
【００７０】
図５に示すように、サンプル登録設定画面ｗ２では、依頼者が新規登録するサンプルについて、「サンプル数」、「サンプル形態（サンプルの送付形態）」、「送付方法」、「返信方法」、「プライマー」を設定する。なお、図５は、依頼者が５本の精製ＤＮＡ（エッペンドルフチューブ）を遺伝子解析センタＡ１に郵送し、ユニバーサルプライマーと依頼者登録プライマーを使用して解析した結果をＭＯ（ｍａｇｎｅｔｏ−ｏｐｔｉｃａｌ）ディスクで受領するように設定した場合の表示例である。
【００７１】
「サンプル数」には、登録するサンプルの件数を数値入力して設定する。なお、サンプルの形態がプレート類の場合は１件ずつの登録となる。
【００７２】
「サンプル形態」には、依頼者が遺伝子解析センタＡ１にサンプルを送付する形態（媒体）を設定する。例えば、プルダウンメニューにより所定の容器（図６）の中から選択できる。
【００７３】
「送付方法」には、依頼者が遺伝子解析センタＡ１にサンプルを送付する方法（媒体）を設定する。例えば、プルダウンメニューにより、「郵送」か「持参」が選択できる。
【００７４】
「返信方法」には、依頼者が遺伝子解析センタＡ１からサンプルの解析結果を受領する方法を設定する。例えば、プルダウンメニューにより、「ＦＴＰ（ｆｉｌｅ ｔｒａｎｓｆｅｒ ｐｒｏｔｏｃｏｌ）」、「ＭＯ」、「ＣＤ−Ｒ」、「ＤＡＴ」から選択できる。なお、「ＦＴＰ」を選択した場合、通信ネットワークＮ１からのデータ取得を意味し、他の記録媒体での返送は行われない。また、「ＭＯ」「ＣＤ−Ｒ」「ＤＡＴ」を選択した場合、併せて「ＦＴＰ」によるデータの取得が可能である。
【００７５】
「プライマー」には、シーケンシング処理時に使用するプライマーを指定する。例えば、サンプル登録設定画面ｗ２では、「ユニバーサルプライマー」を使用するか否かと、「依頼者登録プライマー」使用するか否かとが、それぞれチェックボックスにより設定できる。また、右側のプルダウンメニューでは、あらかじめ登録されている依頼者登録プライマーから用いる件数を指定できる。依頼者プライマーが登録されていない場合には、依頼者登録プライマーに関する設定は表示されない。なお、使用するプライマーの詳細な設定は次の解析条件登録設定画面ｗ３（図７）で行う。また、依頼者登録プライマーの登録は、後述するようにプライマー情報入力画面ｗ１４（図１９）で行う。
【００７６】
つぎに、サンプル登録設定画面ｗ２（図５）において、依頼者がサンプル登録設定情報を入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は依頼者端末２のメイン表示領域５２に解析条件登録設定画面ｗ３（図７）を表示させる。
【００７７】
図７に示すように、解析条件登録設定画面ｗ３では、ＢＬＡＳＴ検索の要否設定と、使用するプライマーの選択とが可能である。
【００７８】
「サンプル名」は、サンプルを特定するための名称である。よって、全サンプルを通じて名称の重複がないように設定される。なお、遺伝子解析センタＡ１での作業において複数のサンプルが派生する場合は、指定されたサンプル名の後ろに通し番号を付加して登録される。また、プレート形態の依頼の場合、内包されるサンプルは、プレート名にプレート上のウェルの座標が付加された符号がサンプル名として登録される。サンプル管理サーバ１が通し番号等を追加するので、設定可能な文字数に制限がある場合にはサンプル名を短めに設定することが望ましい。
【００７９】
「ＢＬＡＳＴ」では、ＢＬＡＳＴ検索自動処理の要／不要を設定する。例えば、チェックボックスをチェックするとＢＬＡＳＴ検索自動処理を行う設定となる。なお、ＢＬＡＳＴ検索自動処理のパラメータは、後述するＢＬＡＳＴパラメータ設定画面ｗ１２（図１７）で設定する。また、「ｃＤＮＡ ｌｉｂｒａｒｙ（ｔｕｂｅ）」および「ａｇａｒ ｐｌａｔｅ」での依頼の場合、この設定は行わない。
【００８０】
「プライマー」では、シーケンシング処理時に使用するプライマーを指定する。ここでは、個々のサンプルヘの設定ではなく、サンプル登録設定に含まれる全てのサンプルに対して共通の設定となる。別のプライマーの設定は、別のサンプル登録設定を行うことで可能である。
【００８１】
なお、サンプル管理サーバ１は、サンプル登録設定画面ｗ２のプライマー設定欄の設定に基づき、解析条件登録設定画面ｗ３のプライマー選択欄を作成する。
【００８２】
解析条件登録設定画面ｗ３では、ユニバーサルプライマーの選択はチェックボックスで行い、依頼者登録されているプライマーはプルダウンメニューより選択する。ユニバーサルプライマーは、遺伝子解析センタＡ１においてあらかじめ設定されている配列である。依頼者登録プライマーは、依頼者がサンプル管理サーバ１に登録したプライマーである。
【００８３】
つぎに、解析条件登録設定画面ｗ３において、依頼者が解析条件登録設定情報を入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は依頼者端末２のメイン表示領域５２にサンプル登録結果画面ｗ４（図８）を表示させる。
【００８４】
サンプル登録結果画面ｗ４では、サンプル登録および解析条件の設定内容が確認できる。サンプル登録結果画面ｗ４において、依頼者が登録内容が正しいことを確認後、［登録］ボタンを押すことで新規解析依頼の登録が行われる。一方、登録内容に誤りがある場合、依頼者が［修正］ボタンを押すことでサンプル登録設定画面ｗ２（図５）に戻る。
【００８５】
サンプル管理サーバ１は、サンプル登録結果画面ｗ４において［登録］ボタンが押されたことを受信すると、ユーザ登録時に登録した電子メールアドレス宛に登録内容を記載した電子メールを送信する。これで、新規解析（新規サンプル）の依頼登録が完了する。その後、依頼者は、実際に遺伝子解析センタＡ１へサンプルを送付する際、サンプル登録結果画面ｗ４を印刷した紙（登録情報のプリントアウト）を同封する。
【００８６】
ここで、サンプル登録結果画面ｗ４では、各サンプルごとにコードラベル（例えば、２次元コード）が表示される。これは、サンプル登録設定画面ｗ２（図５）および解析条件登録設定画面ｗ３（図７）での設定内容に基づいて、サンプル管理サーバ１が発行したものであり、依頼者端末２がサンプルＩＤとともに受信して表示する。遺伝子解析センタＡ１では、依頼者から受領したサンプルに同封された登録情報のプリントアウトのコードラベルを読み取ることによって、サンプル管理サーバ１に登録されている情報と、サンプルの実物との対応をとることができる。なお、依頼者は、反応条件等の詳細な指定を記載したメモを作成してサンプルに同封する。
【００８７】
（２）サンプル検索
依頼者によってメニューボタン５１の［サンプル検索］ボタンｂ１２が押されると、サンプル管理サーバ１はサンプル検索処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にサンプル検索設定画面ｗ５（図９）を表示させる。
【００８８】
依頼者がサンプル情報の閲覧および処理結果の参照を行う場合、サンプル検索設定画面ｗ５で検索条件を設定して、サンプル管理サーバ１に登録されているサンプルから対象のサンプルを検索する。例えば、図９に示したサンプル検索設定画面ｗ５では、サンプル検索条件として「サンプル名」、「サンプルＩＤ」、「登録日」、「状態」が設定される。なお、サンプル検索条件の項目および内容の詳細は図１０に示すとおりである。
【００８９】
サンプル検索設定画面ｗ５では、検索項目左側のチェックボックスをチェックすることで、検索条件を選択することができる。複数のチェックボックスが選択されている場合、選択されている項目でのＡＮＤ検索を実施する。また、チェックボックスが１つもチェックされていない場合、全てのサンプルのデータを表示する。
【００９０】
「サンプル名」および「サンプルＩＤ」欄への設定は前方一致での検索となる。例えば、「サンプル名」欄に「Ｓａｍｐｌｅ」と入力すると、「Ｓａｍｐｌｅ」、「Ｓａｍｐｌｅ−１」、「Ｓａｍｐｌｅ−ａ」、「Ｓａｍｐｌｅ−ｐｒｅｐ」等が全てヒットする。また、ワイルドカード（％）を用いた指定も可能である。「Ｓ％１」と指定を行った場合、「“Ｓ”から始まって“１”で終わるもの」という指定となる。
【００９１】
なお、作業者権限および依頼者権限では、自己のデータのみが検索対象となる。一方、管理者権限では、上記検索条件に加えて、ユーザのログイン名が設定できる。
【００９２】
サンプル検索設定画面ｗ５において、依頼者がサンプル検索条件を設定後［検索］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１はサンプル検索処理を行い、サンプル検索結果画面ｗ６ａ（図１１（ａ））を表示する。
【００９３】
サンプル検索結果画面ｗ６ａでは、解析依頼の登録日、サンプル名、サンプルＩＤ、該当サンプルの解析の進捗状態、シーケンス結果のＩＤ、使用プライマー名、シーケンス処理結果画面ｗ７（図１２）へのリンク、ＢＬＡＳＴ検索結果画面ｗ８（図１３）へのリンクが表示される。なお、管理者権限では、上記項目に加えて、ユーザのログイン名が表示される。
【００９４】
また、サンプル検索結果画面ｗ６ｂ（図１１（ｂ））は、シーケンス処理が行われていないサンプルの場合の表示例である。よって、シーケンス結果画面へのリンクの欄には「シーケンス待ち」と、ＢＬＡＳＴ検索結果画面へのリンクの欄には「検索待ち」あるいは「検索なし」と表示される。
【００９５】
また、サンプル検索設定画面ｗ５（図９）において、依頼者がサンプル検索条件を設定後［メール］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１はサンプル検索処理を行い、サンプル検索結果画面ｗ６ａの表示内容のテキストデータを依頼者の電子メールアドレス宛へ送信する。なお、送信するテキストデータは、ＣＳＶ（Ｃｏｍｍａ Ｓｅｐａｒａｔｅｄ Ｖａｌｕｅ）形式のデータにして添付できる。
【００９６】
また、サンプル検索結果画面ｗ６ａにおいて、依頼者がシーケンシング欄の［シーケンス結果］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は設定されているリンクに従ってシーケンス処理結果画面ｗ７（図１２）を別ウィンドウで表示させる。さらに、シーケンス処理結果画面ｗ７において、依頼者が［波形データファイルダウンロード］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は表示しているシーケンス結果を得た波形データ（クロマトチャート）ファイルを依頼者端末２へ送信する。
【００９７】
また、サンプル検索結果画面ｗ６ａにおいて、依頼者がＢＬＡＳＴ欄の［検索結果］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は設定されているリンクに従ってＢＬＡＳＴ検索結果画面ｗ８（図１３）を別ウィンドウで表示させる。なお、ＢＬＡＳＴ検索結果画面ｗ８を表示させる際、サンプル管理サーバ１は、依頼者にユーザ名とパスワードの入力を求める。
【００９８】
（３）メール報告
依頼者によってメニューボタン５１の［状況確認メール］ボタンｂ１４が押されると、サンプル管理サーバ１は報告対象サンプル検索設定画面（図示せず）を表示する。なお、報告対象サンプル検索設定画面は、上述のサンプル検索設定画面ｗ５（図９）と同様である。
【００９９】
そして、サンプル管理サーバ１は、検索結果から依頼者によって選択されたサンプルに関する情報をあらかじめ設定された電子メールアドレス宛へ送信する。
【０１００】
（４）再解析依頼
つづいて、登録済みサンプルに対する再解析依頼について説明する。
【０１０１】
上述したように、依頼者によってメニューボタン５１の［依頼登録］ボタンｂ１１が押されると、サンプル管理サーバ１は依頼登録処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にサンプル種別選択画面ｗ１（図４）を表示させる。サンプル種別選択画面ｗ１において、依頼者が「再解析」を選択後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は再解析設定処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２に再解析サンプル登録設定画面ｗ９（図１４）を表示させる。
【０１０２】
図１４に示すように、再解析サンプル登録設定画面ｗ９には、使用プライマー指定部６１と、サンプル検索条件指定部６２が設けられている。
【０１０３】
使用プライマー指定部６１では、チェックボックスをチェックすることにより、使用するプライマーの指定を行う。なお、「Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ＿Ｆ」および「Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ＿Ｒ」はユニバーサルプライマー、「Ｐｒｉｍｅｒ＿Ａ」は依頼者登録プライマーである。
【０１０４】
サンプル検索条件指定部６２では、すでに登録されているサンプルから再解析を行う再解析対象サンプルを選択する。サンプル検索条件指定部６２におけるサンプルの検索条件の指定方法は、サンプル情報を閲覧する際のサンプル検索設定画面ｗ５（図９）と同様である。
【０１０５】
つぎに、再解析サンプル登録設定画面ｗ９において、依頼者が使用プライマーおよびサンプル検索条件を指定後、［検索］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は対象サンプルの検索を行い、依頼者端末２のメイン表示領域５２に再解析対象組合せ選択画面ｗ１０（図１５）を表示させる。
【０１０６】
図１５に示すように、再解析対象組合せ選択画面ｗ１０では、サンプルとプライマーの２次元表となっており、再解析を実施する組合せをチェックボックスで選択する。なお、図１５は、選択状態の一例を示す。
【０１０７】
つぎに、再解析対象組合せ選択画面ｗ１０において、依頼者が再解析するサンプルとプライマーとの組み合わせを入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は依頼者端末２のメイン表示領域５２に再解析対象組合せ確認画面ｗ１１（図１６）を表示させる。
【０１０８】
再解析対象組合せ確認画面ｗ１１では、再解析を実施するサンプルとプライマーの組合せが確認できる。再解析対象組合せ確認画面ｗ１１において、依頼者が登録内容が正しいことを確認後、［登録］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は再解析依頼の登録を行う。一方、登録内容に誤りがある場合、依頼者が［修正］ボタンを押すと、再解析対象組合せ選択画面ｗ１０（図１５）に戻る。
【０１０９】
ここで、サンプル管理サーバ１は、再解析対象組合せ確認画面ｗ１１において、依頼者が［登録］ボタンを押すと、ユーザ登録時に登録した電子メールアドレス宛に再解析の登録内容を記載した電子メールを送信する。これで、再解析の依頼登録が完了する。
【０１１０】
（５）ＢＬＡＳＴ検索自動処理設定
つづいて、ＢＬＡＳＴ（Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ：基礎的局所アラインメント検索法）検索自動処理用の設定編集について説明する。
【０１１１】
依頼者によってメニューボタン５１の［ＢＬＡＳＴ設定］ボタンｂ１３が押されると、サンプル管理サーバ１はＢＬＡＳＴ検索自動処理用の設定編集処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にＢＬＡＳＴパラメータ設定画面ｗ１２（図１７）を表示させる。
【０１１２】
図１７に示すように、ＢＬＡＳＴパラメータ設定画面ｗ１２では、例えば、ＧＥＮＢＡＮＫデータベースに対する検索パラメータと、ＧＥＮＰＥＰＴデータベースに対する検索パラメータとを同時に設定できる。具体的には、各データベースに対して、類似配列の出現期待数の閾値（Ｅｘｐｅｃｔ）（実数（０〜１０．０））、ワードサイズ（ＷｏｒｄＳｉｚｅ）（整数）、フィルタリングの使用の有無（Ｆｉｌｔｅｒ）（ＯＮ／ＯＦＦ）、候補配列の最大表示数（Ｄｅｓｃｒｉｐｔｉｏｎｓ）（整数）、候補配列のアライメントの最大表示数（Ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓ）（整数（０〜２５０））が設定可能である。
【０１１３】
ＢＬＡＳＴパラメータ設定画面ｗ１２において、依頼者がパラメータを設定後、［設定保存］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は設定をデータベース１１（図１）に保存する。一方、依頼者が［破棄］ボタンを押すと、画面上での変更がキャンセルされ、変更前の設定が表示される。
【０１１４】
（６）サンプル情報メール
つづいて、サンプル情報メールについて説明する。
【０１１５】
依頼者によってメニューボタン５１の［状況確認メール］ボタンｂ１４が押されると、サンプル管理サーバ１はログイン名から特定した依頼者より受けたすべての依頼の情報を電子メールで、依頼者の電子メールアドレス宛へ送信する。
【０１１６】
（７）プライマー登録、プライマー情報確認
つづいて、シーケンシングの際に使用するプライマーの登録およびプライマー情報の確認について説明する。
【０１１７】
依頼者によってメニューボタン５１の［プライマー登録］ボタンｂ１５が押されると、サンプル管理サーバ１はシーケンシングプライマーの登録および確認の処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にプライマー情報画面ｗ１３（図１８）を表示させる。
【０１１８】
図１８に示すように、プライマー情報画面ｗ１３は、［登録］か［検索］かを選択できるラジオボタンと、検索する際のプライマーＩＤおよびプライマー名を入力するテキストボックスを備えている。
【０１１９】
プライマー情報画面ｗ１３において、依頼者が［登録］のラジオボタンを選択後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は新規プライマー登録処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にプライマー情報入力画面ｗ１４（図１９）を表示させる。
【０１２０】
図１９に示すように、プライマー情報入力画面ｗ１４では、プライマー名（Ｐｒｉｍｅｒ Ｎａｍｅ）、塩基配列（Ｓｅｑｕｅｎｃｅ）、コメント（Ｃｏｍｍｅｎｔ）が入力できる。なお、プライマー名の入力は必須である。また、登録したプライマーは、サンプル解析依頼登録時の解析条件登録設定画面ｗ３（図７）において選択可能となる。依頼者登録プライマーは登録を行った依頼者でのみ使用可能となる。
【０１２１】
プライマー情報入力画面ｗ１４において、依頼者が各項目を入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は依頼者端末２のメイン表示領域５２にプライマー情報登録内容確認画面ｗ１５（図２０）を表示させる。図２０は、プライマー情報登録内容確認画面ｗ１５の入力例を示す。
【０１２２】
この時、サンプル管理サーバ１はプライマー名と塩基配列とをチェックする。具体的には、プライマー名は解析依頼時のプライマー指定を行う際のキーとなるため、すでに使用されているプライマー名での登録は行えない。そこで、使用済みのプライマー名で登録しようとした場合、警告画面（図示せず）を表示し、登録を行わない。また、塩基配列が同じプライマーが登録済みであった場合も、警告画面（図示せず）を表示して、登録を行わない。
【０１２３】
上記チェックの結果エラーがない場合、プライマー情報登録内容確認画面ｗ１５において、依頼者が各項目の内容確認後、［登録］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は設定されたプライマーをその依頼者の依頼者登録プライマーとしてデータベース１１に格納する。設定内容に問題があり、依頼者が［キャンセル］ボタンを押した場合、プライマー情報入力画面ｗ１４（図１９）に戻る。
【０１２４】
一方、プライマー情報画面ｗ１３（図１８）において、依頼者が［検索］のラジオボタンを選択し検索条件であるプライマーＩＤ（Ｐｒｉｍｅｒ ＩＤ）およびプライマー名（Ｐｒｉｍｅｒ Ｎａｍｅ）を入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は依頼者の依頼者登録プライマーから該当するプライマーを検索して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にプライマー情報画面ｗ１６（図２１）を表示させる。
【０１２５】
例えば、プライマーの検索では、前方一致で行い、プライマーＩＤとプライマー名の双方が指定されている場合はＡＮＤ検索を行う。なお、検索条件が入力されていない場合、使用可能なプライマー全ての情報を表示する。
【０１２６】
（８）パスワード変更
つづいて、ログイン時のユーザ認証のパスワードの変更について説明する。
【０１２７】
依頼者によってメニューボタン５１の［パスワード変更］ボタンｂ１６が押されると、サンプル管理サーバ１はパスワード変更処理を開始して、依頼者端末２のメイン表示領域５２にパスワード変更画面（図示せず）を表示させる。サンプル管理サーバ１は、パスワード変更画面で依頼者が入力した新たなパスワードの書式等をチェックし、適当であれば、データベース１１に登録する。
【０１２８】
［２］作業者権限機能
次に、作業者権限で利用可能な機能について説明する。なお、以下では、ユーザを作業者として説明するが、管理者が利用する場合も同様である。
【０１２９】
（１）作業履歴登録
作業者によってメニューボタン５１の［作業履歴登録］ボタンｂ２１が押されると、サンプル管理サーバ１は作業履歴登録処理を開始して、作業者端末３のメイン表示領域５２に作業履歴登録画面ｗ２１（図２２）を表示させる。
【０１３０】
作業者は、解析作業の履歴を登録する際、対象のサンプルのサンプルＩＤ、作業に割り当てられた作業ＩＤ、作業者自身の作業者ＩＤを管理情報として登録する。具体的には、作業者は、コードリーダ３ｃ（図１）を用いて、サンプルＩＤ、作業ＩＤ、作業者ＩＤをあらかじめプリントされたそれぞれのコードラベルから読み取り、作業履歴登録画面ｗ２１の各入力フィールドへ転送することで入力する。その後、作業者が［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は各ＩＤを作業履歴データに登録する。なお、サンプルＩＤ欄にプレートｌＤを指定した場合は、プレートに内包されているサンプル全てに関する作業履歴データを登録する。
【０１３１】
（２）コードラベル印刷
コードラベルは、ＩＤを直接入力しての印刷と、ＤＢに登録されているＩＤから選択しての印刷の二通りの方法で印刷できる。作業者によってメニューボタン５１の［コードラベル印刷］ボタンｂ２２が押されると、サンプル管理サーバ１はコードラベル印刷処理を開始して、作業者端末３のメイン表示領域５２にＩＤ種別選択画面ｗ２２（図２３）を表示させる。
【０１３２】
図２３に示すように、ＩＤ種別選択画面ｗ２２では、サンプルＩＤ、プレートＩＤ、依頼者ＩＤ、作業者ＩＤ、作業ＩＤのいずれかをラジオボタンで選択できる。そして、ＩＤ種別選択画面ｗ２２において、作業者がｌＤ種別を選択後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にＩＤ指定画面ｗ２３（図２４）を表示させる。
【０１３３】
図２４に示すように、ＩＤ指定画面ｗ２３では、「ＩＤ入力」、「ＤＢ選択」のいずれかをラジオボタンで選択できる。そして、ＩＤ指定画面ｗ２３において、作業者が「ＩＤ入力」を選択するとともに、右隣のＩＤ入力欄にＩＤを入力し後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は指定されたコードラベルの画像データを作業者端末３へ送信し、作業者端末３がこれをプリンタ３ｂ（図１）に出力する。
【０１３４】
一方、ＩＤ指定画面ｗ２３において、作業者が「ＤＢ選択」を選択するとともに、右隣の検索条件入力欄に条件を入力した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は検索条件に合致したＩＤのリストを作業者端末３に送信して、メイン表示領域５２にＩＤ検索結果画面（図示せず）に表示させる。なお、検索条件は、例えば前方一致で設定してもよい。そして、ＩＤ検索結果画面において作業者がＩＤを選択してコードラベルの印刷を指示すると、サンプル管理サーバ１は指定されたコードラベルの画像データを作業者端末３へ送信し、作業者端末３がこれをプリンタ３ｂ（図１）に出力する。
【０１３５】
（３）プレートレイアウト
遺伝子解析センタＡ１でプレートを作成する場合には、プレートデータの作成・登録処理を行う。
【０１３６】
作業者によってメニューボタン５１の［プレートレイアウト］ボタンｂ２３が押されると、サンプル管理サーバ１はプレートレイアウト処理を開始して、作業者端末３のメイン表示領域５２にプレート種別選択画面ｗ２４（図２５）を表示させる。
【０１３７】
図２５に示すように、プレート種別選択画面ｗ２４では、「Ｇｌｙｃｅｒｏｌ Ｓｔｏｃｋ Ｐｌａｔｅ」、「Ｄｅｅｐ Ｗｅｌｌ ｐｌａｔｅ」、「ＤＮＡ ｐｌａｔｅ」、「９６−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」、「３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」のいずれかをラジオボタンによって選択できる。そして、作業者が、作成するプレートの種類を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２に選択されたプレートに応じた設定画面を表示させる。ここで、プレートの種類によって設定画面および操作方法が異なるため、以下、（ｉ）「Ｇｌｙｃｅｒｏｌ Ｓｔｏｃｋ Ｐｌａｔｅ」、「Ｄｅｅｐ Ｗｅｌｌ ｐｌａｔｅ」、「ＤＮＡ ｐｌａｔｅ」、（ｉｉ）「９６−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」、（ｉｉｉ）「３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」の３つに分けて説明する。
【０１３８】
（ｉ）「Ｇｌｙｃｅｒｏｌ Ｓｔｏｃｋ Ｐｌａｔｅ」、「Ｄｅｅｐ Ｗｅｌｌ ｐｌａｔｅ」、「ＤＮＡ ｐｌａｔｅ」
プレート種別選択画面ｗ２４において、作業者が「Ｇｌｙｃｅｒｏｌ Ｓｔｏｃｋ Ｐｌａｔｅ」、「Ｄｅｅｐ Ｗｅｌｌ ｐｌａｔｅ」、「ＤＮＡ ｐｌａｔｅ」のいずれかを選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定方法選択画面ｗ２５（図２６）を表示させる。
【０１３９】
図２６に示すように、レイアウト設定方法選択画面ｗ２５では、レイアウト指定方法として「サンプル個別指定」および「ＣＳＶファイルアップロード」のいずれかをラジオボタンによって選択できる。
【０１４０】
レイアウト設定方法選択画面ｗ２５において、作業者が「サンプル個別指定」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定画面ｗ２６（図２７）を表示させる。
【０１４１】
図２７に示すように、レイアウト設定画面ｗ２６では、プレート上の個々のウェルに対して１つずつサンプルＩＤを指定できる。なお、図２７は、プレートを横向きに置き、上から見た場合の配置でサンプル指定欄が配置されている。
【０１４２】
レイアウト設定画面ｗ２６において、作業者が個々の入力欄ヘサンプルＩＤを指定した後、［送信］ボタンを押すと、設定した内容を示す設定内容確認画面（図示せず）に切り替わり、この設定内容確認画面で作業者が［登録］ボタンを押すと、レイアウトがサンプル管理サーバ１のデータベース１１に登録される。なお、レイアウト設定画面ｗ２６において、［リセット］ボタンを押すと、全ての入力が取り消され、入力画面が初期状態に戻る。
【０１４３】
一方、レイアウト設定方法選択画面ｗ２５（図２６）において、作業者が「ＣＳＶファイルアップロード」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にファイルアップロード画面（図示せず）を表示させる。このファイルアップロード画面では、プレート上のサンプルＩＤレイアウトを記載したＣＳＶファイルを、ファイル名等を指定して作業者端末３に読み込むことができる。ＣＳＶファイルからのデータ読み込みに成功すると、作業者端末３のメイン表示領域５２にはレイアウト設定画面ｗ２６と同様の画面が表示される。そして、その後の操作は、「サンプル個別指定」の場合と同じである。なお、ファイルアップロード時に規定のフォーマットに則っていない場合は、エラー画面が表示される。
【０１４４】
（ｉｉ）「９６−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」
プレート種別選択画面ｗ２４（図２５）において、作業者が「９６−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定方法選択画面ｗ２７（図２８）を表示させる。
【０１４５】
図２８に示すように、レイアウト設定方法選択画面ｗ２７では、レイアウト指定方法として「チューブから作成」、「プレートから作成」、「ＣＳＶファイルアップロード」のいずれかをラジオボタンによって選択できる。「チューブから作成」は、チューブ形態のサンプルからシーケンサ用の９６ウェルプレートを作成する際に使用する。「プレートから作成」は、プレート上のサンプルからシーケンサ用の９６ウェルプレートを作成する際に使用する。「ＣＳＶファイルアップロード」は、プレート上のサンプルＩＤレイアウトを定義したＣＳＶデータファイルより情報を読み込み登録する際に使用する。
【０１４６】
レイアウト設定方法選択画面ｗ２７において、作業者が「チューブから作成」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定画面ｗ２８（図２９）を表示させる。
【０１４７】
図２９に示すように、レイアウト設定画面ｗ２８では、下部にプレート上のレイアウト設定部６３があり、上部にプライマー設定部６４がある。
【０１４８】
レイアウト設定部６３では、プレート上の個々のウェルに対してチューブ１つずつサンプルｌＤを指定できる。具体的には、図２９は、プレートを横向きに置き上から見た場合の配置であり、各ウェルに対し、サンプルＩＤとプライマーの指定欄が配置してあり、個々の入力欄ヘチューブに割り当てられているサンプルＩＤを指定することができる。
【０１４９】
プライマー設定部６４では、プライマーの指定方法を、プレート全体に１つ指定する方法と、個々のウェルヘ個別に指定する方法との二つから選択できる。
【０１５０】
一つのプライマーをプレート全体に使用する場合は、「Ａｐｐｌｙ ｔｈｉｓ ｐｒｉｍｅｒ ｔｏ ａｌｌ ｗｅｌｌ」側のラジオボタンをチェックし、その隣のメニューより使用するプライマーを選択する。また、個々のウェルに対して個別にプライマーを指定する場合は、「Ｓｐｅｃｉｆｙ ｐｒｉｍｅｒ ｔｏ ｅａｃｈ ｗｅｌｌ」側のラジオボタンをチェックし、レイアウト設定欄のメニューで使用するプライマーを選択する。
【０１５１】
さらに、一度プレート全体を１つのプライマーに指定して特定のウェルのみ別のプライマーを指定する場合は、「Ａｐｐｌｙ ｔｈｉｓ ｐｒｉｍｅｒ ｔｏ ａｌｌ ｗｅｌｌ」側のプライマー選択メニューで使用するプライマーを選択後、隣の［変更］ボタンを押すことで全てのウェルのプライマー指定を変更した後に特定のウェルのプライマー指定を変更することで対応可能である。
【０１５２】
レイアウト設定画面ｗ２８において、作業者がレイアウト設定後、［送信］ボタンを押すと、設定した内容を示す設定内容確認画面（図示せず）に切り替わり、この設定内容確認画面で作業者が［登録］ボタンを押すと、レイアウトがサンプル管理サーバ１のデータベース１１に登録される。なお、レイアウト設定画面ｗ２８において、［リセット］ボタンを押すと、全ての入力が取り消され、入力画面が初期状態に戻る。
【０１５３】
また、レイアウト設定方法選択画面ｗ２７（図２８）において、作業者が「プレートから作成」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定画面ｗ２９（図３０）を表示させる。
【０１５４】
図３０に示すように、レイアウト設定画面ｗ２９は、「チューブから作成」の場合のレイアウト設定画面ｗ２８（図２９）とほぼ同じである。異なるのは、レイアウト設定画面ｗ２９では、各ウェルに対する指定欄がプレートＩＤの指定欄とそのプレート上と座標指定欄の２つになっている点のみである。よって、「プレートから作成」場合、個々のウェルに対するサンプルの指定をサンプルを取り出したプレートのＩＤと座標を指定すること以外は、上述した「チューブから作成」の場合と同様であるので、説明を省略する。
【０１５５】
また、レイアウト設定方法選択画面ｗ２７（図２８）において、作業者が「ＣＳＶファイルアップロード」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にファイルアップロード画面ｗ３０（図３１）を表示させる。
【０１５６】
図３１に示すように、ファイルアップロード画面ｗ３０は、レイアウト定義ファイル指定部６５と、プライマー指定部６６とで構成されている。
【０１５７】
レイアウト定義ファイル指定部６５では、プレート上のサンプルＩＤレイアウトを記載したＣＳＶファイルのファイル名等を指定する。
【０１５８】
プライマー指定部６６では、プレート全体へ１つのプライマーを指定する方法と、各ウェルヘのプライマー指定定義ファイルにより指定する方法といずれかでプライマーを指定する。プレート全体へ１つのプライマーを指定する場合、「プライマー選択」のラジオボタンを選択し、その後メニューによりプライマーを指定する。一方、定義ファイルによる指定を行う場合、「ＣＳＶファイル」のラジオボタンを選択し、［参照］ボタンを利用して定義ファイルを指定する。
【０１５９】
ファイルアップロード画面ｗ３０において、作業者がレイアウトおよびプライマーを指定後、［アップロード］ボタンを押すことでデータが読み込まれ、アップロード後の操作は他のプレートレイアウト作成時と同じとなる。なお、ファイルアップロード時に規定のフォーマットに則っていないＣＶＳファイル用いた場合はエラー画面が表示される。
【０１６０】
（ｉｉｉ）「３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」
プレート種別選択画面ｗ２４（図２５）において、作業者が「３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅ」を選択した後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２にレイアウト設定画面ｗ３１（図３２）を表示させる。
【０１６１】
図３２に示すように、レイアウト設定画面ｗ３１は、３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅを横向きで置いた場合の左上側４ウェル分の設定画面となっている。４枚の９４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅから１枚の３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅを作成する場合、３８４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅのレイアウトは９４−Ｗｅｌｌ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｐｌａｔｅのレイアウトが市松模様状に配置されたものとなる。そのため、レイアウト設定画面ｗ３１では、左上の４ウェルにそれぞれ入るシーケンスプレートのＩＤを設定欄に指定する。
【０１６２】
レイアウト設定画面ｗ３１において、作業者がそれぞれの入力欄にプレートｌＤを指定後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は作業者端末３のメイン表示領域５２に設定確認画面（図示せず）を表示させる。なお、以降の操作は他プレートレイアウト作成時と同様であるため、説明を省略する。
【０１６３】
（４）サンプル処理登録
作業者によってメニューボタン５１の［サンプル処理登録］ボタンｂ２４が押されると、サンプル管理サーバ１はサンプル処理登録を開始して、作業者端末３のメイン表示領域５２にサンプル処理登録画面ｗ３２（図３３）を表示させる。サンプル処理登録では、遺伝子解析センタＡ１の作業で、サンプルを分岐させた場合の登録処理を行う。
【０１６４】
図３３に示すように、サンプル処理登録画面ｗ３２は、処理指定部６７と、処理内容設定部６８とから構成されている。
【０１６５】
処理指定部６７では、「ｃＤＮＡライブラリからシャーレを作成する場合（ｃＤＮＡ ｌｉｂｒａｒｙ Ｔｕｂｅ−＞Ａｇａｒ Ｐｌａｔｅ）」か、「シャーレからＤＮＡチューブを切り分けする場合（Ａｇａｒ Ｐｌａｔｅ−＞Ｐｕｒｉｆｉｅｄ ＤＮＡ Ｔｕｂｅ）」かのいずれであるかを指定する。
【０１６６】
処理内容設定部６８では、処理により作成されたサンプルの数である「サンプル数（Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ｓａｍｐｌｅｓ）」、および、処理を行ったサンルのＩＤである「オリジナルサンプルＩＤ（Ｏｒｉｇｉｎａｌ Ｒｅｑｕｅｓｔ ＩＤ）」を指定する。
【０１６７】
サンプル処理登録画面ｗ３２において、作業者がそれぞれの入力欄に入力後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は登録処理を行うとともに、作業者端末３のメイン表示領域５２に登録内容を表示させる。なお、作成されたサンプル名は元となった“サンプル名”＋“＿”＋“通し番号”となる。
【０１６８】
［３］管理者権限機能
次に、管理者権限で利用可能な機能について説明する。
【０１６９】
（１）ユーザ管理
管理者によってメニューボタン５１の［ユーザ管理］ボタンｂ３１が押されると、サンプル管理サーバ１はユーザ管理処理を開始して、管理者端末４のメイン表示領域５２にユーザ管理処理選択画面（図示せず）を表示させる。このユーザ管理処理選択画面では、「新規ユーザ登録」および「ユーザ情報編集」から実行する処理を選択できる。
【０１７０】
上記ユーザ管理処理選択画面において、管理者が「新規ユーザ登録」を選択した場合、サンプル管理サーバ１は管理者端末４のメイン表示領域５２にユーザ情報登録画面ｗ４１（図３４）を表示させる。
【０１７１】
図３４に示すように、ユーザ情報登録画面ｗ４１では、「依頼者ＩＤ（Ｃｌｉｅｎｔ ＩＤ）」、「ログイン名（ｌｏｇｉｎ ｎａｍｅ）」、「ユーザ名（Ｎａｍｅ）」、「所属（Ａｆｆｉｌｉａｔｉｏｎ）」、「グループ（Ｇｒｏｕｐ）」、「エイリアス（Ａｌｉａｓ）」、「住所（Ａｄｄｒｅｓｓ）」、「電話番号（Ｔｅｌｅｐｈｏｎｅ ｎｕｍｂｅｒ）」、「ＦＡＸ番号（Ｆａｘ ｎｕｍｂｅｒ）」、「電子メールアドレス（Ｅ−Ｍａｉｌ ａｄｄｒｅｓｓ）」、「コメント（Ｃｏｍｍｅｎｔ）」、「ユーザ権限（Ａｕｔｈｏｒｉｔｙ）」、「初期パスワード（Ｉｎｉｔｉａｌ ｐａｓｓｗｏｒｄ）」を登録できる。
【０１７２】
なお、「ログイン名」は、サンプル管理システム１ヘのログイン時の認証名であり、重複登録は不可である。「ユーザ権限」は、「依頼者（Ｃｌｉｅｎｔ Ｕｓｅｒ）」、「作業者（Ｏｐｅｒａｔｏｒ）」、「管理者（Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｏｒ）」のうちから選択される。「エイリアス」は、所属＋名前であり、ユーザ整理用のデータである。「住所」は、解析結果の返送先として使用される。「コメント」は、自由入カ欄である。
【０１７３】
ユーザ情報登録画面ｗ４１において、管理者が各項目を設定後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は登録処理を実行し、管理者端末４のメイン表示領域５２に登録内容確認画面（図示せず）を表示させる。
【０１７４】
上記ユーザ管理処理選択画面において、管理者が「ユーザ情報編集」を選択した場合、サンプル管理サーバ１は管理者端末４のメイン表示領域５２に各ユーザのユーザＩＤやログイン名を示したユーザ一覧画面（図示せず）を表示させる。ユーザ一覧画面からは、選択したユーザの情報を編集するユーザ情報編集画面（図示せず）やパスワードを変更するパスワード設定画面（図示せず）を呼び出すことができる。なお、ユーザ情報編集画面は、上記ユーザ情報登録画面ｗ４１（図３４）とほぼ同じ構成であり、同じ項目が編集できる。
【０１７５】
（２）作業ＩＤ登録
管理者によってメニューボタン５１の［作業ＩＤ登録］ボタンｂ３２が押されると、サンプル管理サーバ１は作業ＩＤ登録処理を開始して、管理者端末４のメイン表示領域５２に作業ＩＤ登録画面ｗ４２（図３５）を表示させる。作業ＩＤ登録処理では、管理者が作業ＩＤの登録を行う。
【０１７６】
図３５に示すように、作業ＩＤ登録画面ｗ４２では、新規に登録する作業ＩＤおよび作業名を設定できる。また、図３５では、下部に既存ｌＤの作業ＩＤおよび作業名の一覧が表示されている。作業ＩＤ登録画面ｗ４２において、管理者が新規ＩＤを設定後、［送信］ボタンを押すと、サンプル管理サーバ１は登録処理を実行する。なお、作業ＩＤとして既存のＩＤを指定した場合はエラーとなり登録処理は行われない。
【０１７７】
（３）リクエスト統計情報表示
管理者によってメニューボタン５１の［統計］ボタンｂ３３が押されると、サンプル管理サーバ１は統計処理を開始して、管理者端末４のメイン表示領域５２に統計情報画面ｗ４３（図３６）を表示させる。統計情報としては、例えば、当月の依頼受付総数と日付ごとの依頼受付件数とを集計して表示する。
【０１７８】
つづいて、図１および図２を参照しながら、サンプル管理システム１００の各部の構成について詳細に説明する。
【０１７９】
図１および図２に示すように、遺伝子解析センタＡ１の構内には、サンプル管理サーバ（サンプル管理装置）１、作業者端末３、管理者端末４、処理／解析装置５が、通信ネットワークＮ２を介して接続されている。また、サンプル管理サーバ１は、依頼者サイトＡ２に設けられた依頼者端末（端末装置）２と、通信ネットワークＮ１を介して接続されている。
【０１８０】
上述のように、サンプル管理サーバ１は、遺伝子解析センタＡ１におけるＤＮＡサンプルの受託解析サービスを支援するためにサンプルを管理するものである。特に、サンプル管理サーバ１は、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作をやり直す、すなわち、サンプルの再解析の依頼を処理する機能を有する。
【０１８１】
再解析が必要となる原因としては、次のものがある。例えば、▲１▼ＤＮＡを含む菌を培養したときに、菌の生育が著しく悪かった場合、▲２▼ＤＮＡ精製を行った際、ＤＮＡの収量が著しく低かった場合。これらの場合は、グリセロールストックから再度複製を行うことになる。また、▲３▼機械、試薬、反応等によりシーケンス処理に不具合が発生した場合、すなわち、シーケンス反応において反応自体に起因する問題（操作ミスなども含む）、あるいは、シーケンサー（解析装置）にかけた際の電気泳動などの不具合により、要求する品質のデータが全く得られなかった場合。この場合、同一内容のシーケンスプレートを改めて作り、解析することになる。なお、別プライマーによる再解析も含まれる。
【０１８２】
なお、再解析が必要となる原因は、もっぱら上記列挙した項目のものであり、これらは「グリセロールストックからの複製」と「同一内容のシーケンスプレート」の作成のいずれかにより対処できる。よって、いずれの場合（▲１▼〜▲３▼）も、「グリセロールストックからの複製」と「同一内容のシーケンスプレート」とを原則として同時に発生させない。これにより、再解析に関するコストを最低限に抑えることができる。
【０１８３】
したがって、サンプル管理サーバ１は、サンプルＩＤの「グリセロールストックからの複製回数」、および、シーケンスプレートＩＤの「同一内容のシーケンスプレートが存在する場合の通し番号」を管理する。そして、これら２つのデータは、基本的に独立して変更されるものであり、連動しない。ここで、サンプルＩＤの「グリセロールストックからの複製回数」は、グリセロールストックより復元処理を行った場合にのみカウントアップされる。また、シーケンスプレートＩＤの「同一内容のシーケンスプレートが存在する場合の通し番号」は、反応プレートから複数のシーケンスプレートを分注（作成）する場合、内容は同一なシーケンスプレートが複数作成されるので、その分別のための番号である。なお、サンプル管理サーバ１において、他に再解析の回数を示す情報がある場合は、適宜追加できることは言うまでもない。
【０１８４】
図１に示すように、依頼者端末２は、サンプル管理サーバ１のユーザインターフェイスとしてＨＴＭＬ文書を閲覧するためのブラウザ２ａ、依頼情報や報告を印刷するためのプリンタ２ｂ、電子メールを送受信するためのメーラ２ｃを少なくとも備えている。
【０１８５】
作業者端末３は、サンプル管理サーバ１のユーザインターフェイスとしてＨＴＭＬ文書を閲覧するためのブラウザ３ａ、プレートＩＤおよびシーケンスプレートＩＤをシール紙等に印刷するためのプリンタ３ｂ、プレートおよびシーケンスプレートに貼付されたコードラベルからプレートＩＤおよびシーケンスプレートＩＤを読み取るためのコードリーダ３ｃを少なくとも備えている。
【０１８６】
なお、作業者端末３は、処理操作の作業ごと、処理／解析装置５ごと、あるいは作業者ごとに配置されることが望ましい。これにより、処理器具（プレート、シーケンスプレート、等）のＩＤを操作時に読み取り、処理操作の進捗をデータベース１１へ登録することが容易となる。また、ＩＤは２次元コードやバーコードでコードラベルに印刷できる。ただし、コードの形態は任意であり、ＩＣタグを利用することも可能である。
【０１８７】
管理者端末４は、サンプル管理サーバ１のユーザインターフェイスとしてＨＴＭＬ文書を閲覧するためのブラウザ４ａを少なくとも備えている。
【０１８８】
処理／解析装置５は、遺伝子解析にともなう一連の処理操作を行う装置、具体的には、培養、ＤＮＡ精製、シークエンス反応、シーケンシング、アセンブル、相同性検索等を行う装置である。処理／解析装置５には、サンプル管理サーバ１から自動制御できるものも含まれている。
【０１８９】
つづいて、サンプル管理サーバ１の構成について説明する。サンプル管理サーバ１は、データベース１１、データ管理部１２、報告処理部１３、処理／解析装置制御部（解析装置制御手段）１４、メール通信部１５、ＨＴＭＬ通信部１６、制御通信部１７を備えて構成されている。
【０１９０】
データベース１１は、サンプル管理サーバ１に関わるデータ（ユーザ情報、サンプル情報、解析結果、等）を格納している。なお、格納するデータの詳細は後述する。
【０１９１】
データ管理部１２は、進捗管理部（進捗管理手段、サンプル受領確認手段）２１、ＩＤ管理部（識別情報管理手段、サンプル識別情報送信手段、サンプル識別情報変更手段）２２、ユーザ情報管理部２３、サンプル情報管理部２４、処理／解析結果管理部２５、再解析受付部（制御指示受付手段）２６を備えている。
【０１９２】
進捗管理部２１は、サンプルに対する処理操作の進捗をサンプルＩＤおよび他のＩＤを用いて管理する（進捗管理処理）。進捗管理部２１は、サンプルに対する処理操作の履歴登録やスケジューリングを行う。例えば、サンプルの処理操作の際、作業者が作業者端末３のコードリーダ３ｃを用いてプレートＩＤ、シーケンスプレートＩＤ、作業ＩＤ、作業者ＩＤ等を読み取らせ、各ＩＤと関連付けて処理操作の進捗をデータベース１１に登録する。なお、プレートＩＤおよびシーケンスプレートＩＤは、プレートおよびシーケンスプレートに貼付されたコードラベル（２次元コード等）から取得できる。また、サンプルＩＤと、プレートＩＤおよびシーケンスプレートＩＤとの対応関係は、ＩＤ管理部２２によって管理されている。
【０１９３】
また、サンプルを依頼者から受領した時、作業者は、サンプルとともに送付されたプリント紙のコードラベルを作業者端末３のコードリーダ３ｃを用いて読み取ったサンプルＩＤをサンプル管理サーバ１へ送信する。これにより、進捗管理部２１は、サンプルを依頼者から受領したことを確認し、データベース１１に登録できる。なお、サンプルＩＤは、依頼者端末２から依頼した時に、ＩＤ管理部２２によって生成され、依頼者端末２へ送信される。
【０１９４】
ＩＤ管理部２２は、サンプル管理サーバ１で使用するすべてのＩＤを生成し、管理する。主なＩＤとしては、サンプルに付与するサンプルＩＤ、プレートに付与するプレートＩＤ、シーケンスプレートに付与するシーケンスプレートＩＤが挙げられる。そして、ＩＤ管理部２２は、サンプルＩＤ、プレートＩＤ、シーケンスプレートＩＤの対応関係をデータベース１１に格納して管理する。
【０１９５】
また、ＩＤ管理部２２は、サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報を含めてサンプルＩＤを決定するとともに、再解析が発生した時、サンプルＩＤに含まれる解析回数情報を変更する（サンプル識別情報変更処理）。サンプルＩＤに含まれる解析回数情報としては、「グリセロールストックからの複製回数」と「シーケンス反応プレートへ分注された回数」が利用できる。
【０１９６】
また、ＩＤ管理部２２は、サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報を含めてシーケンスプレートＩＤを決定するとともに、再解析が発生した時、シーケンスプレートＩＤに含まれる解析回数情報を変更する。シーケンスプレートＩＤに含まれる解析回数情報としては、同一内容のシーケンスプレートが存在する場合の通し番号が利用できる。
【０１９７】
また、ＩＤ管理部２２は、依頼者端末２から依頼を受けた時、生成したサンプルＩＤを依頼者端末２へ送信する。なお、ＩＤ管理部２２は、依頼者端末２から依頼を受けた時に仮のサンプルＩＤを発行し、サンプルを受領した時に正式のサンプルＩＤを発行してもよい。
【０１９８】
ユーザ情報管理部２３は、サンプル管理サーバ１におけるユーザに関する情報を、データベース１１に格納して管理する。
【０１９９】
サンプル情報管理部２４は、サンプル管理サーバ１におけるサンプルに関する情報を、データベース１１に格納して管理する。
【０２００】
処理／解析結果管理部２５は、処理／解析装置５および作業者端末３から収集された進捗や解析結果の情報を、データベース１１に格納して管理する。
【０２０１】
再解析受付部２６は、依頼者端末２から処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受付け、ＩＤ管理部２２にサンプルＩＤの変更を指示する。また、サンプルの再解析の依頼とともに、使用するプライマーを指定したプライマー情報を受け取れば、サンプル情報管理部２４へ通知する。
【０２０２】
報告処理部１３は、主に依頼者への報告を行う。そのために、報告処理部１３は、進捗状況報告部（進捗状況報告手段）３１、解析結果報告部（解析結果報告手段）３２、課金部（課金手段）３３を備えている。
【０２０３】
進捗状況報告部３１は、サンプルに対する処理操作の進捗状況を、進捗管理部２１から取得して、依頼者端末２へ送信する。具体的には、依頼者端末２から進捗状況の確認依頼をサンプルＩＤとともに受信すると、進捗管理部２１がサンプルＩＤに基づきデータベース１１から進捗状況のデータを取得し、このデータを進捗状況報告部３１がＨＴＭＬ通信部１６および／あるいはメール通信部１５を通じて依頼者端末２へ送信する。
【０２０４】
解析結果報告部３２は、サンプルに対する解析結果を、サンプル情報管理部２４から取得して、依頼者端末２へ送信する。具体的には、依頼者端末２から解析結果の送信依頼をサンプルＩＤとともに受信すると、サンプル情報管理部２４がサンプルＩＤに基づきデータベース１１から解析結果のデータを取得し、このデータを解析結果報告部３２がＨＴＭＬ通信部１６を通じて依頼者端末２へ送信する。
【０２０５】
課金部３３は、サンプルＩＤに含まれる解析回数情報に基づいて請求費用を算出する。これにより、サンプルに施された解析回数、すなわち、やり直し（再解析依頼）回数を考慮した請求費用を算出できる。
【０２０６】
また、課金部３３は、サンプルを依頼者から受領した時のサンプルの形態を示すサンプル形態情報に基づいて請求費用を算出する。なお、サンプル形態情報は、受託時に依頼者端末２から受信して、データベース１１に登録される。これにより、解析の開始段階を考慮した請求費用を算出できる。
【０２０７】
そして、課金部３３は、算出した請求費用をあらかじめ設定された送信先へ電子メール等で送信する。送信先としては、例えば、依頼者端末２や依頼者によって指定された決済機関のコンピュータが挙げられる。
【０２０８】
処理／解析装置制御部１４は、処理／解析装置５から進捗情報や解析結果（シーケンス結果、クロマトチャート、相同性検索結果、等）を取得する。また、処理／解析装置制御部１４は、自動制御可能な処理／解析装置５について、所定のタイミングで起動の可否を判定して、処理／解析を自動実行させることができる。上記判定には、プレートＩＤあるいはシーケンスプレートＩＤが利用できる。
【０２０９】
また、処理／解析装置制御部１４は、プライマー情報で指定されたプライマーを使用してシークエンス反応およびシーケンシングを行うように、シーケンサ等を制御する。なお、プライマー情報は、あらかじめサンプル管理装置に登録された塩基配列（ユニバーサルプライマー）を指定する情報であっても、塩基配列（依頼者登録プライマー）を定義した情報であってもよい。また、処理／解析装置制御部１４は、依頼者が指定した相同性検索の検索条件（相同性検索条件情報）に従って、ＢＬＡＳＴ検索を実施する。
【０２１０】
メール通信部１５は、進捗状況、解析結果、課金情報等を、依頼者端末２からの要求により、あるいは、自動的に、あらかじめ指定された電子メールアドレス宛（メーラ２ｃ）に送信する。
【０２１１】
ＨＴＭＬ通信部１６は、依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４のブラウザ２ａ，３ａ，４ａに、サンプル管理サーバ１とのユーザインターフェイスを実現するために、ＨＴＭＬ文書の作成および送受信を行う。
【０２１２】
制御通信部１７は、処理／解析装置５からのデータを収集するとともに、処理／解析装置制御部１４からの制御信号を処理／解析装置５へ送信する。
【０２１３】
つづいて、図３７から図５６を参照しながら、サンプル管理サーバ１で扱うデータのデータ構造およびＩＤの付与規則について詳細に説明する。
【０２１４】
図３７、図４０、図４２から図４６は、サンプルＩＤ、プレートＩＤ、シーケンスプレートＩＤ、プライマーＩＤ、作業者ＩＤ、作業ＩＤ、依頼者ＩＤのそれぞれのフォーマットを示す説明図である。また、図４７は、サンプル情報の関連を示す説明図である。図４８は、依頼者・作業者情報の関連を示す説明図である。また、図４９から図５５は、サンプルＩＤ、プレートＩＤ、シーケンスプレートＩＤ、プライマーＩＤ、作業者ＩＤ、作業ＩＤ、依頼者ＩＤに関連するそれぞれのテーブル情報を示す説明図である。
【０２１５】
これらのＩＤは、適当なタイミングでＩＤ管理部２２によって付与され、他のデータと関連づけられてデータベース１１に格納される。これにより、例えば図５６の作業履歴テーブルｔｂｌが各サンプルＩＤについて生成できる。
【０２１６】
サンプルＩＤ（サンプル識別情報）に含まれる「グリセロールストックからの複製回数」と「シーケンス反応プレートへ分注された回数」が、サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報である（図３７）。また、サンプルＩＤのテーブル情報に含まれる「ＲｅｑｕｅｓｔテーブルのＴｙｐｅ」が、サンプルを依頼者から受領した時のサンプルの形態を示すサンプル形態情報である（図４９）。
【０２１７】
サンプルＩＤは、サンプルのリクエスト、受領、プレート作成、シーケンシングという一連の流れにおいて、ＩＤ管理部２２により状態に応じたＩＤが付与される。
【０２１８】
具体的には、図３８に示すように、リクエスト（図面左の破線枠内）に対しては、例えば次のようにＩＤが付与される。
【０２１９】
まず、サンプルＩＤ“２６００１”は、チューブに入ったライブラリ（図６）としてサンプルを受領した場合を示している。これをペトリディッシュ内の寒天培地に撒くことにより複数のコロニーが生じる。このときのペトリディッシュに対するサンプルＩＤが“２６００２”、“２６００３”、…となる。そして、各ペトリディッシュのコロニーを液体培養に移したとき、“２６００２００１００”、“２６００３００１００”等のＩＤが付与される。液体培養した菌から精製したＤＮＡに対してはそれぞれ同一のＩＤが付与される。また、一枚のペトリディッシュから通常複数のコロニーを選ぶので、この場合ＩＤは“２６００２００２００”、“２６００２００３００”、…のように付与される。
【０２２０】
また、サンプルＩＤ“２６００４”は、コロニーが発生した寒天培地を含むペトリディッシュの形態（図６）でサンプルを受領した場合を示している。このとき派生するサンプルのＩＤ“２６００４００１００”、…は、上述の例と同じである。
【０２２１】
また、サンプルＩＤ“２６００５”は、精製ＤＮＡを含むチューブ（図６）の集合としてサンプルを受領した場合を示している。その中の個々のサンプルに対しては“２６００５００１００”、“２６００５００２００”、…のようにＩＤが付与される。
【０２２２】
また、サンプルＩＤ“２６００６”は、マイクロタイタープレートの個々の穴に異なるＤＮＡを含むものとしてサンプルを受領した場合を示している。その中に含まれるサンプルは“２６００６０？？００”の集合体であり、例えばサンプルＩＤは“２６００６００１００”、“２６００６００２００”、…のように付与される。
【０２２３】
次に、精製ＤＮＡおよびディープウェルグリセロールストックプレート（図面中央の破線枠内）に対しては、例えば次のようにＩＤが付与される。上記の各リクエスト（図面左の破線枠内）に示された各形態の受領サンプルから派生するＤＮＡサンプルを含むものとしてプレートＩＤを発生させる。図３８では、“２６００２００１００”（これに加えてどのようなサンプルＩＤのＤＮＡと組み合わせてもよい）を含むプレートとして“Ｐ２６００１０Ｄ”を示している。なお、内包するサンプルＩＤとプレートＩＤとの間では、ＩＤ付与（命名）規則について何ら相関はないが、データベース上で相互に関連づけられている。
【０２２４】
次に、シーケンス用プレート（図面右の破線枠内）に対しては、例えば次のようにＩＤが付与される。まず、プレート中の個々のＤＮＡについてシーケンス反応を行うとき、反応ごとにプライマーとの組み合わせが定義され、これがサンプルＩＤの末尾桁に反映される。例えば、サンプルＩＤ“２６００２００１００”のサンプルに対して行ったシーケンス反応の１つには“２６００２００１０１”というＩＤが付与され、それを含むシーケンス用プレートとして“Ｓ２６０００１１”が発生する。
【０２２５】
また、同一のＤＮＡ“２６００２００１００”に対し異なるプライマーの組み合わせで反応を行って“２６００２００１０２”、“２６００２００１０３”、…が発生し、これを含むシーケンス用プレートに対しては“Ｓ２６０００２１”のＩＤが発生する。
【０２２６】
また、例えば“Ｓ２６０００２１”についてシーケンス反応あるいはシーケンサー（解析装置）にかけた際の電気泳動等の不具合により要求する品質のデータが得られなかったとき、“Ｓ２６０００２１”中に含まれていたものと全て同一のＤＮＡサンプルとプライマーの組み合わせで反応をやり直した場合、そのシーケンス用プレートには“Ｓ２６０００２２”のシーケンスプレートＩＤが付与される。このように、シーケンスプレートＩＤでは、「同一内容のシーケンスプレートが存在する場合の通し番号」が繰り上げて付与される。
【０２２７】
グリセロールストックが発生する場合には、ＩＤ管理部２２によりサンプルＩＤ（サンプル識別情報）に含まれる「グリセロールストックからの複製回数」を増加させ、個々のサンプルが判別できるようＩＤが付与される。
【０２２８】
具体例として、図３９に、グリセロールストック（菌体）からのサンプルＩＤの流れの例を示す。
【０２２９】
▲１▼（図面の中段）まず、チューブ“２６００１００１００”が出発サンプルのグリセロールストック（図６の凍結ストックに相当）である。これを“Ｐ２６００１０Ｂ”のプレート中で培養する。このときそのサンプルのＩＤは“２６００１００１００”のまま不変である。培養後、ＤＮＡ精製を行い、新たにプレートＩＤ“Ｐ２６００１０Ｄ”が発生する。その中のサンプルＩＤは“２６００１００１００”のまま不変である。このＤＮＡについてシーケンス反応を行うと、シーケンスプレートＩＤ“Ｓ２６０００１１”が発生する。その中には、例えば、サンプル“２６００１００１０１”、“２６００１００１０２”が含まれる。なお、この例では、同一ＤＮＡについて異なるプライマーの組み合わせで２つの反応を行っている。
【０２３０】
▲２▼（図面の上段）次に、上記▲１▼の“２６００１００１００”（グリセロールストック）からの複製を行うと、サンプルＩＤ“２６００１００１１０”（図面の上段）が発生する。これは菌の培養サンプルに相当する。培養後、ＤＮＡ精製を行い、サンプルＩＤ“２６００１００１１０”のＤＮＡ溶液（上段左から２番目）が得られる。このＤＮＡ溶液を含むプレートを作成した際、そのプレートＩＤは“Ｐ２６００２０Ｄ”となる。同一サンプルに対するＩＤは“２６００１００１１０”のまま不変である。このＤＮＡについてシーケンス反応を行う場合に作成されるシーケンス用プレートのＩＤは、“Ｓ２６０００２１”となる。その中には、例えば、同一ＤＮＡについて異なるプライマーとの組み合わせで行った２つの反応液“２６００１００１１１”、“２６００１００１１２”が含まれる。
【０２３１】
▲３▼（図面の下段）次に、上記▲１▼で作成した菌の培養プレート“Ｐ２６００１０Ｂ”を複製すると、プレート“Ｐ２６００１０Ｇ”（図面の下段）の凍結ストックが得られる。この中のサンプルＩＤは▲１▼、▲２▼の過程を前提とすると、末尾２桁目が繰り上がって“２６００１００１２０”となる。このグリセロールストックから複製を作成し、培養、ＤＮＡ精製を行う場合、それぞれ“Ｐ２６００１１Ｂ”、“Ｐ２６００１１Ｄ”のプレートが得られる。その中のサンプルＩＤは“２６００１００１２０”のまま不変で推移する。得られたＤＮＡについてシーケンス反応を行い、作成されたシーケンスプレートＩＤは“Ｓ２６０００３１”となる。その中には、例えば、同一ＤＮＡについて異なるプライマーとの組み合わせで行った２つの反応液“２６００１００１２１”、“２６００１００１２２”が含まれる。
【０２３２】
プレートは処理の状態によってグリセロールストック、ディープウェルプレート、精製ＤＮＡプレートと変化するが、プレートに含まれるサンプルは変化しない。この変化はプレートＩＤの８桁目のアルファベットで識別する。
【０２３３】
具体例として、図４１に、プレートＩＤの流れの例を示す。図４１では、図中の３段目、４段目、２段目、１段目の順にＩＤが発生する。
【０２３４】
まず、３段目左のグリセロールストックプレート“Ｐ２６００１１Ｇ”が出発サンプルであり、これから培養を行うことにより、中央のディープウェルプレート“Ｐ２６００１１Ｂ”が発生する。さらに、ＤＮＡ精製を行って右の精製ＤＮＡプレート“Ｐ２６００１１Ｄ”が発生する。培養時に菌が生育しない、あるいは、ＤＮＡ精製時の収量が極めて低い場合には、複製が必要となるので、４段目に示すように複製の操作を行う（操作内容は３段目と同じである）。
【０２３５】
ここで、上記プレート中のウェルに含まれるサンプルは各座標でいずれも同一のものであるが、座標を変えたものが発生した場合（新規サンプルを含んだウェルが生じる場合を含む）、２段目中央のように“ＸＸＸ”の桁（図４０参照）が繰り上がったプレートＩＤ“２６００２１Ｂ”が発生する。このプレートは培養のためのディープウェルプレートであり、これに対応するグリセロールストックプレートのＩＤ“Ｐ２６００２１Ｇ”を仮想的に発生させることができる（２段目左）。また、同ＩＤのグリセロールストックプレートを作成することもでる。
【０２３６】
２段目右は、この培養からＤＮＡ精製を行い、得られたＤＮＡを含むプレート“Ｐ２６００２１Ｄ”である。
【０２３７】
１段目は、受領サンプルの形態が個別のチューブに入った凍結ストック（図６参照）である場合であり、これを培養するために中央のディープウェルプレート“Ｐ２６００３１Ｂ”を作成する。これに対応するグリセロールストックプレートのＩＤ“Ｐ２６００３１Ｇ”を仮想的に発生させることができる（１段目左）。また、受領サンプルであるチューブから、まずグリセロールストックプレートを実際に発生させ、そこから培養を行うことも可能である（図中点線）。この場合でも付与されるプレートＩＤはそれぞれ同じものになる。このサンプルについてＤＮＡ精製を行い得られたプレートに対しては、１段目右のようにプレートＩＤ“Ｐ２６００３１Ｄ”が付与される。
【０２３８】
ここで、サンプル管理サーバ１は、ワークステーションやパーソナルコンピュータ等の汎用のコンピュータをベースに構成できる。また、依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４は、パーソナルコンピュータ等の汎用のコンピュータをベースに構成できる。
【０２３９】
すなわち、上記のサンプル管理サーバ１、依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４は、それぞれの機能を実現するプログラムの命令を実行するＣＰＵ（ｃｅｎｔｒａｌ ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ ｕｎｉｔ ）、ブートロジックを格納したＲＯＭ（ｒｅａｄ ｏｎｌｙ ｍｅｍｏｒｙ）、上記プログラムを展開するＲＡＭ（ｒａｎｄｏｍ ａｃｃｅｓｓ ｍｅｍｏｒｙ）、上記プログラムおよび各種データベースを格納するハードディスク等の記憶装置（記録媒体）、キーボードやマウス等の入力機器、モニタ、スピーカー、プリンタ等の出力機器、外部のネットワークに接続するネットワーク接続機器が、内部バスによって接続されて構成されている。
【０２４０】
そして、上記のサンプル管理サーバ１、依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４の機能は、記憶装置に格納されたプログラムを必要に応じてＲＡＭに展開してＣＰＵで実行することでそれぞれ実現される。
【０２４１】
依頼者端末２、作業者端末３、管理者端末４は、サンプル管理サーバ１に対してクライアント端末であり、サーバであるサンプル管理サーバ１に通信ネットワークＮ１を介して接続可能であり、標準的なインターネット閲覧機能（ＨＴＭＬブラウザ）を有していればよい。なお、上記ＨＴＭＬブラウザは、（ａ）フレーム表示に対応していること、（ｂ）ＪａｖａＳｃｒｉｐｔ（登録商標）の動作が可能であること、（ｃ）Ｃｏｏｋｉｅが有効であること、が望ましい。
【０２４２】
通信ネットワークＮ１としては専らインターネットを想定しているが、これに限定されず他のイントラネット、エキストラネット、ＬＡＮ、ＩＳＤＮ、ＶＡＮ、ＣＡＴＶ通信網、仮想専用網（ｖｉｒｔｕａｌ ｐｒｉｖａｔｅ ｎｅｔｗｏｒｋ）、電話回線網、移動体通信網、衛星通信網等も適用可能である。
【０２４３】
本発明の目的は、上述した機能を実現するソフトウェアであるサンプル管理プログラムのプログラムコード（実行形式プログラム、中間コードプログラム、ソースプログラム）をコンピュータで読み取り可能に記録した記録媒体を、システムあるいは装置に供給し、そのシステムあるいは装置のコンピュータ（またはＣＰＵやＭＰＵ、ＤＳＰ）が記録媒体に記録されているプログラムコードを読み出し実行することによっても、達成可能である。この場合、記録媒体から読み出されたプログラムコード自体が上述した機能を実現することになり、そのプログラムコードを記録した記録媒体は本発明を構成することになる。
【０２４４】
具体的には、上記サンプル管理サーバ１が備えるデータ管理部１２、報告処理部１３、処理／解析装置制御部１４、メール通信部１５、ＨＴＭＬ通信部１６、制御通信部１７は、サンプル管理サーバ１のメモリ（図示せず）に格納された所定のプログラムを、マイクロプロセッサなどが実行することにより実現される。
【０２４５】
上記プログラムコードを供給するための記録媒体は、システムあるいは装置と分離可能に構成することができる。また、上記記録媒体は、プログラムコードを供給可能であるように固定的に担持する媒体であってもよい。そして、上記記録媒体は、記録したプログラムコードをコンピュータが直接読み取ることができるようにシステムあるいは装置に装着されるものであっても、外部記憶装置としてシステムあるいは装置に接続されたプログラム読み取り装置を介して読み取ることができるように装着されるものであってもよい。
【０２４６】
例えば、上記記録媒体としては、磁気テープやカセットテープ等のテープ系、フロッピー（登録商標）ディスク／ハードディスク等の磁気ディスクやＣＤ−ＲＯＭ／ＭＯ／ＭＤ／ＤＶＤ／ＣＤ−Ｒ等の光ディスクを含むディスク系、ＩＣカード（メモリカードを含む）／光カード等のカード系、あるいはマスクＲＯＭ／ＥＰＲＯＭ／ＥＥＰＲＯＭ／フラッシュＲＯＭ等の半導体メモリ系などを用いることができる。
【０２４７】
また、上記プログラムコードは、コンピュータが記録媒体から読み出して直接実行できるように記録されていてもよいし、記録媒体から主記憶のプログラム記憶領域へ転送された後コンピュータが主記憶から読み出して実行できるように記録されていてもよい。
【０２４８】
さらに、システムあるいは装置を通信ネットワークと接続可能に構成し、上記プログラムコードを通信ネットワークを介して供給してもよい。そして、通信ネットワークとしては、特に限定されず、具体的には、インターネット、イントラネット、エキストラネット、ＬＡＮ、ＩＳＤＮ、ＶＡＮ、ＣＡＴＶ通信網、仮想専用網（ｖｉｒｔｕａｌ ｐｒｉｖａｔｅ ｎｅｔｗｏｒｋ）、電話回線網、移動体通信網、衛星通信網等が利用可能である。また、通信ネットワークを構成する伝送媒体としては、特に限定されず、具体的には、ＩＥＥＥ１３９４、ＵＳＢ、電力線搬送、ケーブルＴＶ回線、電話線、ＡＤＳＬ回線等の有線でも、ＩｒＤＡやリモコンのような赤外線、Ｂｌｕｅｔｏｏｔｈ、８０２．１１無線、ＨＤＲ、携帯電話網、衛星回線、地上波デジタル網等の無線でも利用可能である。
【０２４９】
なお、プログラムコードを記録媒体から読み出して主記憶に格納するためのプログラム、および、通信ネットワークからプログラムコードをダウンロードするためのプログラムは、コンピュータによって実行可能にあらかじめシステムあるいは装置に格納されているものとする。
【０２５０】
上述した機能は、コンピュータが読み出した上記プログラムコードを実行することによって実現されるだけでなく、そのプログラムコードの指示に基づき、コンピュータ上で稼働しているＯＳなどが実際の処理の一部または全部を行うことによっても実現される。
【０２５１】
さらに、上述した機能は、上記記録媒体から読み出された上記プログラムコードが、コンピュータに装着された機能拡張ボードやコンピュータに接続された機能拡張ユニットに備わるメモリに書込まれた後、そのプログラムコードの指示に基づき、その機能拡張ボードや機能拡張ユニットに備わるＣＰＵなどが実際の処理の一部または全部を行うことによっても実現される。
【０２５２】
【発明の効果】
以上のように、本発明のサンプル管理方法は、サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理方法であって、サンプル管理装置において、上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理処理と、上記サンプル管理装置が、通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受信処理と、を含む方法である。
【０２５３】
また、本発明のサンプル管理装置は、サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理装置であって、上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理手段と、通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受付手段と、を備える構成である。
【０２５４】
それゆえ、上記のサンプル管理方法およびサンプル管理装置によれば、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を変更可能であるため、依頼者は自分で処理する場合のように、処理操作の途中あるいは終了後に処理操作を自由にやり直すことができる。したがって、依頼者が処理操作を柔軟に制御可能なサービスを提供することが可能となるという効果を奏する。
【０２５５】
さらに、本発明のサンプル管理装置は、上記サービスがＤＮＡサンプルの解析処理である。
【０２５６】
それゆえ、さらに、依頼者による処理操作の柔軟な制御が可能なＤＮＡサンプルの受託解析サービスを実現できるという効果を奏する。しかも、従来依頼者が自分で行っていた培養から解析処理までの処理操作を、専門のセンタが代わりに行うことで、効率よく、高精度に行うという受託解析サービス本来の目的を害することがない。
【図面の簡単な説明】
【図１】本発明の一実施の形態に係るサンプル管理システムの詳細を示す機能ブロック図である。
【図２】図１に示したサンプル管理システムの概略を示す説明図である。
【図３】図１に示した依頼者端末、作業者端末、管理者端末の表示画面を示す説明図である。
【図４】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図５】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図６】図１に示したサンプル管理システムで扱うサンプルの概要を示す説明図である。
【図７】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図８】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図９】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１０】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１１】図１１（ａ）および図１１（ｂ）は、図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１２】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１３】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１４】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１５】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１６】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１７】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１８】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図１９】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２０】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２１】図１に示した依頼者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２２】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２３】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２４】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２５】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２６】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２７】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２８】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図２９】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３０】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３１】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３２】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３３】図１に示した作業者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３４】図１に示した管理者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３５】図１に示した管理者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３６】図１に示した管理者端末の表示画面を示す説明図である。
【図３７】図１に示したサンプル管理システムで扱うサンプルＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図３８】図１に示したサンプル管理システムにおけるサンプルＩＤの流れを示す説明図である。
【図３９】図１に示したサンプル管理システムにおけるサンプルＩＤの流れを示す説明図である。
【図４０】図１に示したサンプル管理システムで扱うプレートＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４１】図１に示したサンプル管理システムにおけるプレートＩＤの流れを示す説明図である。
【図４２】図１に示したサンプル管理システムで扱うシーケンスプレートＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４３】図１に示したサンプル管理システムで扱うプライマーＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４４】図１に示したサンプル管理システムで扱う作業者ＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４５】図１に示したサンプル管理システムで扱う作業ＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４６】図１に示したサンプル管理システムで扱う依頼者ＩＤのフォーマットを示す説明図である。
【図４７】図１に示したサンプル管理システムで扱うサンプル情報の関連を示す説明図である。
【図４８】図１に示したサンプル管理システムで扱う依頼者・作業者情報の関連を示す説明図である。
【図４９】図１に示したサンプル管理システムで扱うサンプルＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５０】図１に示したサンプル管理システムで扱うプレートＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５１】図１に示したサンプル管理システムで扱うシーケンスプレートＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５２】図１に示したサンプル管理システムで扱うプライマーＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５３】図１に示したサンプル管理システムで扱う作業者ＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５４】図１に示したサンプル管理システムで扱う作業ＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５５】図１に示したサンプル管理システムで扱う依頼者ＩＤに関連するテーブル情報を示す説明図である。
【図５６】図１に示したサンプル管理システムの動作の概略を示す説明図である。
【符号の説明】
１ サンプル管理サーバ（サンプル管理装置）
２ 依頼者端末（端末装置）
１４ 処理／解析装置制御部（解析装置制御手段）
２１ 進捗管理部（進捗管理手段、サンプル受領確認手段）
２２ ＩＤ管理部（識別情報管理手段、サンプル識別情報送信手段、サンプル識別情報変更手段）
２６ 再解析受付部（制御指示受付手段）
３１ 進捗状況報告部（進捗状況報告手段）
３２ 解析結果報告部（解析結果報告手段）
３３ 課金部（課金手段）
Ｎ１ 通信ネットワーク

Claims (18)

1. サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理方法であって、
   サンプル管理装置において、上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理処理と、
   上記サンプル管理装置が、通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受信処理と、を含むことを特徴とするサンプル管理方法。
2. サンプルに所定の処理操作を施すサービスを支援するサンプル管理装置であって、
   上記サンプルに対する処理操作の進捗を管理する進捗管理手段と、
   通信ネットワークを介して接続された依頼者の端末装置から、上記処理操作の途中あるいは終了後に処理操作への制御指示を受信する制御指示受付手段と、を備えることを特徴とするサンプル管理装置。
3. 上記サービスがＤＮＡサンプルの解析処理であることを特徴とする請求項２に記載のサンプル管理装置。
4. 上記処理操作に、培養、ＤＮＡ精製、シークエンス反応、シーケンシング、アセンブル、相同性検索のいずれか１つが含まれることを特徴とする請求項２または３に記載のサンプル管理装置。
5. 上記処理操作への制御指示が、サンプルの再解析の依頼であることを特徴とする請求項３または４に記載のサンプル管理装置。
6. 上記制御指示受付手段が、上記端末装置から、サンプルの再解析の依頼とともに、使用するプライマーを指定したプライマー情報を受信するものであることを特徴とする請求項５に記載のサンプル管理装置。
7. 上記プライマー情報で指定されたプライマーを使用してシークエンス反応およびシーケンシングを行うように解析装置を制御する解析装置制御手段を備えることを特徴とする請求項６に記載のサンプル管理装置。
8. 上記プライマー情報が、あらかじめサンプル管理装置に登録された塩基配列を指定する情報を含むことを特徴とする請求項６または７に記載のサンプル管理装置。
9. 上記プライマー情報が、塩基配列を定義した情報を含むことを特徴とする請求項６または７に記載のサンプル管理装置。
10. 上記端末装置から、相同性検索の検索条件を指定した相同性検索条件情報を受信することを特徴とする請求項３から９のいずれか１項に記載のサンプル管理装置。
11. 上記サンプルに対する処理操作の進捗状況を、上記進捗管理手段から取得して、上記端末装置へ送信する進捗状況報告手段を備えることを特徴とする請求項２から１０のいずれか１項に記載のサンプル管理装置。
12. 上記サンプルに対する解析結果を、上記端末装置へ送信する解析結果報告手段を備えることを特徴とする請求項３から１１のいずれか１項に記載のサンプル管理装置。
13. 上記サンプルを依頼者から受領した時のサンプルの形態を示すサンプル形態情報に基づいて請求費用を算出する課金手段を備えることを特徴とする請求項２から１２のいずれか１項に記載のサンプル管理装置。
14. 上記サンプルに施された解析回数を示す解析回数情報に基づいて請求費用を算出する課金手段を備えることを特徴とする請求項３から１３のいずれか１項に記載のサンプル管理装置。
15. 上記課金手段が、上記請求費用をあらかじめ設定された送信先へ送信するものであることを特徴とする請求項１３または１４に記載のサンプル管理装置。
16. 請求項２から１５のいずれか１項に記載のサンプル管理装置と通信ネットワークを介して接続されていることを特徴とする端末装置。
17. 請求項２から１５のいずれか１項に記載のサンプル管理装置を動作させるサンプル管理プログラムであって、コンピュータを上記の各手段として機能させるためのサンプル管理プログラム。
18. 請求項１７に記載のサンプル管理プログラムを記録したコンピュータ読み取り可能な記録媒体。

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