JP2004283153A - Q熱菌のPCR(Polymerasechainreaction)法による高精度迅速検出法 - Google Patents
Q熱菌のPCR(Polymerasechainreaction)法による高精度迅速検出法 Download PDFInfo
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Abstract
【課題】Q熱菌を検出するためのPCR法として、伸張反応を1サイクルのみしか行わず、しかも鮮明なバンドをつくることを可能とするプライマー。
【解決手段】プライマーとして、CB1(5‘−ACTCAACGCACTGGAACCGC−3’)とCB2(5‘−TAGCTGAAGCCAATTCGCC3’)のペアーあるいはTrans1(5‘TATGTATCCACCGTAGCCAGTC−3’)とTrans2(5‘CCCAACAACACCTCCTTATTC−3’)のペアーを用いることにより、伸張反応を1サイクルのみの短時間で、Q熱菌に特異的な位置に明確なバンドをつくることを可能にした。
【選択図】 なし
【解決手段】プライマーとして、CB1(5‘−ACTCAACGCACTGGAACCGC−3’)とCB2(5‘−TAGCTGAAGCCAATTCGCC3’)のペアーあるいはTrans1(5‘TATGTATCCACCGTAGCCAGTC−3’)とTrans2(5‘CCCAACAACACCTCCTTATTC−3’)のペアーを用いることにより、伸張反応を1サイクルのみの短時間で、Q熱菌に特異的な位置に明確なバンドをつくることを可能にした。
【選択図】 なし
Description
【0001】
【発明が属する技術分野】
本発明は、PCR(Polymerase chain reaction)法でQ熱菌を検出するためのプライマーに関するものである。
【0002】
【従来の技術】
生卵、生肉あるいは生乳汁などの生食品には、心内膜炎などを引き起こすQ熱菌(Coxiella burnetil コクシェラ・バーネティ)がしばしば生息している。このため、食品を対象としてQ熱菌に対する検査も行われており、検査法としてはPCR法が汎用されている。Q熱菌に関するPCR法は、Q熱菌のDNAのうち、Q熱菌に特異的な塩基配列部分のみを繰り返し伸張合成する反応である。この繰り返し伸張合成した部分を電気泳動にかけ、Q熱菌に特異的な塩基配列の部分を蛍光下で肉眼観察する。しかし、繰り返し伸張反応を行っている間に、目的以外の塩基配列もつくられ、このようなミスあるいは非特異的な塩基配列部分の合成をできるだけ少なくすることが必要になっている。このため、伸張反応を1サイクル行った後、別のプライマーを用いて2サイクル目を行う、いわゆるネステットPCR法が行われている。このネステットPCR法は2サイクル行うため、時間と人手がかかる。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】
解決しようとする課題は、PCRにおいて1サイクルの伸張反応のみでQ熱菌に対応する明確なバンドをつくるプライマーがないことである。
【0004】
【問題を解決するための手段】
本発明は、Q熱菌を検出するためのPCR用プライマーとして、ネステット法のように2サイクル行う必要はなく、1サイクルのみの伸張反応で、特異性が高く、しかも、鮮明なバンドをつくるプライマーである。
【0005】
【発明の実施の形態】
プライマーとして、CB1(5‘−ACTCAACGCACTGGAACCGC−3’)とCB2(5‘−TAGCTGAAGCCAATTCGCC3’)のペアーあるいはTrans1(5‘TATGTATCCACCGTAGCCAGTC−3’)とTrans2(5‘CCCAACAACACCTCCTTATTC−3’)のペアーを用いることにより、1サイクルの伸張反応のみでQ熱菌に特異的で、しかも、鮮明なバンドをつくることができた。
【0006】
【実施例1】Q熱菌を検出するためのプライマーとしてCB1とCB2のペアーを用いたPCR法
【0007】(A)検体試料および試験方法
イ)試料の調製法
試験管にマヨネーズをとり、リン酸緩衝液(PBS)に懸濁した後、この懸濁液を遠心分離した。この沈殿をproteinaseKで処理し、再び遠心分離を行い、沈殿をPBSに溶かしてPCR用試料液とした。陽性コントロールとしては、Q熱菌・Coxiella burnetii(コクシェイラ・バーネティ)アメリカ株、Nine Mile菌を細胞培養し、この培養液をPBSに懸濁した液を用いた。陰性コントロールとしては、PBSを用いた。
ロ)PCR法
試験管に、水、PBS,デオキシヌクレオチド(dNTP)、塩化マグネシウム、DNAポリメラーセとプライマーであるCB1およびCB2を入れた。この中に、PCA用試料液を加え混合した。この混合液を常法のサーモサイクラーでPCRを行った。すなわち、熱変性は95℃、30秒、アニーリングは58℃、30秒、伸張反応は72℃、2分間行った。この条件で30サイクル繰り返し反応を行った。繰り返し反応が終った液をアガロースゲル電気泳動にかけた。この電気泳動したゲルを臭化エチジウム液に浸した後、UV照射することにより現れたバンドを肉眼観察した。
【0008】(B)試験結果および考察
検体としてマヨネーズを用いたPCRの電気泳動のバンドを図1に示した。マヨネーズ1では、陽性コントロールと同じ位置に鮮明なバンドを認めた。一方、マヨネーズ2では、陽性コントロールの位置にバンドは認めなかった。このように、プライマーとしてCB1とCB2のペアーを用いてPCRを行うことにより、マヨネーズなど食品中におけるQ熱菌の検出を精度よく迅速に検査することを可能にした。
【0009】
【実施例2】Q熱菌を検出するためのプライマーとしてTrans1およびTrans2のペアーを用いたPCR法
【0010】(A)検体試料および試験方法
検体試料および試験方法は実施例1に準じて行った。ただし、サーモサイクラーの条件は次のとおりである。熱変性は94℃、30秒、アニーリングは66℃、30秒、伸張反応は72℃で1分間行った。
【0011】(B)試験結果および考察
検体としてマヨネーズを用いたPCRの電気泳動のバンドを図2に示した。実施例1と同様に、マヨネーズ1では、陽性コントロールと同じ位置に鮮明なバンドを認めた。一方、マヨネーズ2では、陽性コントロールの位置にバンドは認めなかった。このように、プライマーとしてTrans1とTrans2のペアーを用いてPCRを行うことによって、マヨネーズなど食品中におけるQ熱菌の検出を精度よく迅速に検査することを可能にした。
【発明の効果】
上述したとおり、PCR用プライマーとしてCB1とCB2のペアあるいはTrans1とTrans2のペアを用いることによって、Q熱菌を特異的で精度よくかつ迅速に検出することを可能にした。
【図面の簡単な説明】
【図1】プライマーとしてCB1とCB2のペアを用いてPCRを行った電気泳動の図である。
【図2】プライマーとしてTrans1とTrans2のペアを用いてPCRを行った電気泳動の図である。
【発明が属する技術分野】
本発明は、PCR(Polymerase chain reaction)法でQ熱菌を検出するためのプライマーに関するものである。
【0002】
【従来の技術】
生卵、生肉あるいは生乳汁などの生食品には、心内膜炎などを引き起こすQ熱菌(Coxiella burnetil コクシェラ・バーネティ)がしばしば生息している。このため、食品を対象としてQ熱菌に対する検査も行われており、検査法としてはPCR法が汎用されている。Q熱菌に関するPCR法は、Q熱菌のDNAのうち、Q熱菌に特異的な塩基配列部分のみを繰り返し伸張合成する反応である。この繰り返し伸張合成した部分を電気泳動にかけ、Q熱菌に特異的な塩基配列の部分を蛍光下で肉眼観察する。しかし、繰り返し伸張反応を行っている間に、目的以外の塩基配列もつくられ、このようなミスあるいは非特異的な塩基配列部分の合成をできるだけ少なくすることが必要になっている。このため、伸張反応を1サイクル行った後、別のプライマーを用いて2サイクル目を行う、いわゆるネステットPCR法が行われている。このネステットPCR法は2サイクル行うため、時間と人手がかかる。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】
解決しようとする課題は、PCRにおいて1サイクルの伸張反応のみでQ熱菌に対応する明確なバンドをつくるプライマーがないことである。
【0004】
【問題を解決するための手段】
本発明は、Q熱菌を検出するためのPCR用プライマーとして、ネステット法のように2サイクル行う必要はなく、1サイクルのみの伸張反応で、特異性が高く、しかも、鮮明なバンドをつくるプライマーである。
【0005】
【発明の実施の形態】
プライマーとして、CB1(5‘−ACTCAACGCACTGGAACCGC−3’)とCB2(5‘−TAGCTGAAGCCAATTCGCC3’)のペアーあるいはTrans1(5‘TATGTATCCACCGTAGCCAGTC−3’)とTrans2(5‘CCCAACAACACCTCCTTATTC−3’)のペアーを用いることにより、1サイクルの伸張反応のみでQ熱菌に特異的で、しかも、鮮明なバンドをつくることができた。
【0006】
【実施例1】Q熱菌を検出するためのプライマーとしてCB1とCB2のペアーを用いたPCR法
【0007】(A)検体試料および試験方法
イ)試料の調製法
試験管にマヨネーズをとり、リン酸緩衝液(PBS)に懸濁した後、この懸濁液を遠心分離した。この沈殿をproteinaseKで処理し、再び遠心分離を行い、沈殿をPBSに溶かしてPCR用試料液とした。陽性コントロールとしては、Q熱菌・Coxiella burnetii(コクシェイラ・バーネティ)アメリカ株、Nine Mile菌を細胞培養し、この培養液をPBSに懸濁した液を用いた。陰性コントロールとしては、PBSを用いた。
ロ)PCR法
試験管に、水、PBS,デオキシヌクレオチド(dNTP)、塩化マグネシウム、DNAポリメラーセとプライマーであるCB1およびCB2を入れた。この中に、PCA用試料液を加え混合した。この混合液を常法のサーモサイクラーでPCRを行った。すなわち、熱変性は95℃、30秒、アニーリングは58℃、30秒、伸張反応は72℃、2分間行った。この条件で30サイクル繰り返し反応を行った。繰り返し反応が終った液をアガロースゲル電気泳動にかけた。この電気泳動したゲルを臭化エチジウム液に浸した後、UV照射することにより現れたバンドを肉眼観察した。
【0008】(B)試験結果および考察
検体としてマヨネーズを用いたPCRの電気泳動のバンドを図1に示した。マヨネーズ1では、陽性コントロールと同じ位置に鮮明なバンドを認めた。一方、マヨネーズ2では、陽性コントロールの位置にバンドは認めなかった。このように、プライマーとしてCB1とCB2のペアーを用いてPCRを行うことにより、マヨネーズなど食品中におけるQ熱菌の検出を精度よく迅速に検査することを可能にした。
【0009】
【実施例2】Q熱菌を検出するためのプライマーとしてTrans1およびTrans2のペアーを用いたPCR法
【0010】(A)検体試料および試験方法
検体試料および試験方法は実施例1に準じて行った。ただし、サーモサイクラーの条件は次のとおりである。熱変性は94℃、30秒、アニーリングは66℃、30秒、伸張反応は72℃で1分間行った。
【0011】(B)試験結果および考察
検体としてマヨネーズを用いたPCRの電気泳動のバンドを図2に示した。実施例1と同様に、マヨネーズ1では、陽性コントロールと同じ位置に鮮明なバンドを認めた。一方、マヨネーズ2では、陽性コントロールの位置にバンドは認めなかった。このように、プライマーとしてTrans1とTrans2のペアーを用いてPCRを行うことによって、マヨネーズなど食品中におけるQ熱菌の検出を精度よく迅速に検査することを可能にした。
【発明の効果】
上述したとおり、PCR用プライマーとしてCB1とCB2のペアあるいはTrans1とTrans2のペアを用いることによって、Q熱菌を特異的で精度よくかつ迅速に検出することを可能にした。
【図面の簡単な説明】
【図1】プライマーとしてCB1とCB2のペアを用いてPCRを行った電気泳動の図である。
【図2】プライマーとしてTrans1とTrans2のペアを用いてPCRを行った電気泳動の図である。
Claims (2)
- Q熱菌のPCR法による検査法としてプライマーの塩基配列がCB1(5‘−ACTCAACGCACTGGAACCGC−3’)とCB2(5‘−TAGCTGAAGCCAATTCGCC3’)のペアーを用いた高精度で迅速な検出法である。試料としては、血液、卵、乳汁、糞、塵埃、各種動物臓器・体毛・体液・骨などを用いることができる。
- Q熱菌のPCR法による検査法としてプライマーの塩基配列がTrans1(5‘TATGTATCCACCGTAGCCAGTC−3’)とTrans2(5‘CCCAACAACACCTCCTTATTC−3’)のペアーを用いた高精度で迅速な検出法である。試料としては、血液、卵、乳汁、糞、塵埃、各種動物臓器・体毛・体液・骨などを用いることができる。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003120742A JP2004283153A (ja) | 2003-03-19 | 2003-03-19 | Q熱菌のPCR(Polymerasechainreaction)法による高精度迅速検出法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003120742A JP2004283153A (ja) | 2003-03-19 | 2003-03-19 | Q熱菌のPCR(Polymerasechainreaction)法による高精度迅速検出法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2004283153A true JP2004283153A (ja) | 2004-10-14 |
Family
ID=33296538
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003120742A Pending JP2004283153A (ja) | 2003-03-19 | 2003-03-19 | Q熱菌のPCR(Polymerasechainreaction)法による高精度迅速検出法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP2004283153A (ja) |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006136639A1 (es) * | 2005-06-17 | 2006-12-28 | Instituto De Salud Carlos Iii | Método y kit de detección de especies bacterianas mediante análisis de adn |
ES2264642A1 (es) * | 2005-06-17 | 2007-01-01 | Instituto De Salud Carlos Iii | Metodo y kit de detecion de especies bacterianas mediante analisis de adn. |
CN102803512A (zh) * | 2011-01-26 | 2012-11-28 | 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所 | 检测呼吸道病原体的方法和试剂盒 |
RU2525059C2 (ru) * | 2012-07-19 | 2014-08-10 | Федеральное бюджетное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера" (ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера) | Набор для выявления возбудителя ку-лихорадки в биологическом материале методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (пцр-рв) |
US9024223B2 (en) | 2012-03-27 | 2015-05-05 | Satake Corporation | Optical type granule sorting machine |
-
2003
- 2003-03-19 JP JP2003120742A patent/JP2004283153A/ja active Pending
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006136639A1 (es) * | 2005-06-17 | 2006-12-28 | Instituto De Salud Carlos Iii | Método y kit de detección de especies bacterianas mediante análisis de adn |
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US8445195B2 (en) | 2005-06-17 | 2013-05-21 | Instituto De Salud Carlos Iii | Method and kit for the detection of bacterial species by means of DNA analysis |
CN102803512A (zh) * | 2011-01-26 | 2012-11-28 | 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所 | 检测呼吸道病原体的方法和试剂盒 |
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