JP2003535599A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2003535599A5 JP2003535599A5 JP2002502165A JP2002502165A JP2003535599A5 JP 2003535599 A5 JP2003535599 A5 JP 2003535599A5 JP 2002502165 A JP2002502165 A JP 2002502165A JP 2002502165 A JP2002502165 A JP 2002502165A JP 2003535599 A5 JP2003535599 A5 JP 2003535599A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- probe
- sequence
- nucleic acid
- complementary
- target
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 35
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 27
- 230000000295 complement Effects 0.000 description 25
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 description 21
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 10
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 10
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- 210000004940 Nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
Description
【特許請求の範囲】
【請求項1】 標的核酸配列を含む分子にハイブリダイズさせるための単分子プローブであって、
(i)標的配列に相補的な第一の核酸配列、および、
(ii)第一の核酸配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成するための、標的および第一の配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子プローブ。
【請求項2】 第二の核酸配列から離れた位置にあるプローブの一端に位置し、前記一組の条件下でハイブリダイズして第二の分子内二本鎖を含む第二のヘアピン構造を形成するように互いに相補的で、かつ、互いに連結している第三および第四の核酸配列をさらに含む、請求項1記載のプローブ。
【請求項3】 第二の核酸配列に相補的でない、第一の核酸配列の一部が、第二の核酸配列から離れた位置にあり、標的および第一の配列がハイブリダイズするための核形成部位として機能するために十分な長さをもち、第二の分子内二本鎖に隣接した位置にある、請求項2記載のプローブ。
【請求項4】 分子間二本鎖が形成されると、分子間二本鎖と第二の分子内二本鎖とがニックされた二本鎖を形成するよう、標的分子の末端配列になっている標的核酸配列と組み合わされている、請求項2記載のプローブ。
【請求項5】 前記一組の条件下で、第一の分子内二本鎖が第二の分子内二本鎖よりも低いTm値をもつ、請求項2記載のプローブ。
【請求項6】 第一の分子内二本鎖が第二の分子内二本鎖よりも長くなく、第二の分子内二本鎖のG:C含量が、第一の分子内二本鎖のものよりも高い、請求項2〜5のいずれか一項記載のプローブ。
【請求項7】 試料中に標的核酸を含む標的分子が存在するか否かを検出するための単分子プローブであって、A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gからなる群より選択される分子を含み、ここで、
(i)A、C、D、E、およびGはそれぞれ核酸配列であり、
(ii)EおよびGが互いに相補的であって、Fによって互いに共有結合することにより、規定された一組の条件下で第一の分子内二本鎖を形成し、
(iii)(b)A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gの分子のそれぞれについては、(1)Eの配列全体とDの少なくとも一部、または(2)Eの配列全体とDの少なくとも一部およびFの少なくとも一部とが一緒になって、標的分子の標的核酸配列に対して実質的に相補的な核酸配列を形成し、また、前記条件下でプローブと標的分子とが分子間二本鎖を形成するよう、A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gの分子のそれぞれと標的分子とが互いにハイブリダイズし、さらに、
(c)A−B−C−D−E−F−G分子のAおよびCが互いに相補的であって、Bによって互いに共有結合することにより、前記一組の条件下で第二の分子内二本鎖を形成する、プローブ。
【請求項8】 分子A−B−C−D−E−F−GのA−B−CのAおよびCの配列が、分子A−B−C−D−E−F−GのE−F−Gによって形成されるヘアピンよりもより安定なヘアピンをA−B−Cが形成するように選択されている、請求項7記載のプローブ。
【請求項9】 等式Tm=[(A+Tの個数)×2℃+(G+Cの個数)×4℃]によって計算すると、より安定なヘアピンの分子内二本鎖のTmが、より安定でない二本鎖の分子内二本鎖よりも高くなる、請求項8記載のプローブ。
【請求項10】 より安定なヘアピンの二本鎖の長さが、より安定でないヘアピンの二本鎖の長さよりも16個以上、14個以上、12個以上、10個以上、8個以上、または6個以上の核酸塩基対上回る、請求項8記載のプローブ。
【請求項11】 プローブが固相支持体に結合している、前記請求項のいずれか一項記載のプローブ。
【請求項12】 複数のプローブ集団を含むプローブのレパートリーであって、各集団の各プローブが、集団の他の各プローブと同じであり、かつ、請求項7〜10のいずれか一項記載のプローブであり、各プローブについて、標的配列に相補的なプローブの核酸配列が、レパートリーの他のすべてのプローブと同じ長さである、プローブのレパートリー。
【請求項13】 集団の各プローブについて、標的配列に相補的なプローブの核酸配列が、異なる集団のすべての他のプローブの前記配列と、2核酸以上、または3核酸以上、または4核酸以上、または5核酸以上、または6核酸以上異なる、請求項12記載のプローブのレパートリー。
【請求項14】 前記請求項のいずれか一項に記載のプローブを複数含む、プローブのレパートリー。
【請求項15】 各プローブの第一の核酸配列が、他の全てのプローブと長さにおいて同じである、請求項14記載のプローブのレパートリー。
【請求項16】 複数の微粒子の混合物を含む組成物であって、レパートリー中の異なるプローブの実質的にすべてが、異なる微粒子に付着するように、各微粒子が請求項14または15記載のプローブのレパートリーから選択されたプローブを付着させている、組成物。
【請求項17】 複数の微粒子の混合物を含む組成物であって、各微粒子が標的核酸配列を検出するためのプローブを付着させていて、各プローブが、
(i)標的配列に相補的な第一のタグ配列、および、
(ii)第一のタグ配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成させるための、標的およびタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子を含む、組成物。
【請求項18】 各プローブが、前記請求項のいずれか一項に記載のプローブである、請求項17記載の組成物。
【請求項19】 10個以上の異なる微粒子集団を含み、一つの集団の各微粒子が、別の集団とは異なるプローブを付着させていて、微粒子の各集団が、他の各集団の標的核酸配列とは異なる標的核酸配列を検出するためのものである、請求項17または18記載の組成物。
【請求項20】 一つの集団の各プローブのタグ配列が、その微粒子に付着している他のすべてのプローブのタグ配列と同一である、請求項19記載の組成物。
【請求項21】 各集団の各タグ配列が10ヌクレオチド以上の長さであって、前記集団の各タグ配列の配列が、異なる集団の前記タグ配列の配列とは3塩基以上異なる、請求項17記載の組成物。
【請求項22】 オリゴヌクレオチドタグ相補配列のレパートリーであって、各相補配列が、類似相補配列集団に属し、かつ、
(i)標的タグ配列に相補的な第一の相補配列、および、
(ii)第一の相補配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)上記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成するための、相補配列とタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子部分であり、
前記タグ相補配列集団が10以上あり、一つの集団の各タグが、レパートリー中の他の集団すべてにおけるタグの相補配列とは異なる前記相補配列をもつ、レパートリー。
【請求項23】 各相補配列が、前記請求項のいずれか一項に記載のプローブを含む、請求項22記載のレパートリー。
【請求項24】 ポリヌクレオチドを選別および同定するためのキットであって、共有結合した実質的に同一のプローブの均一な集団をそれぞれが含む空間的に隔離された一つ以上の領域をもつ固相支持体を含み、各プローブが、
(i)同定しようとする前記ポリヌクレオチドの標的配列に相補的な第一のタグ配列、および、
(ii)第一のタグ配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列
を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成させるための、標的およびタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子部分である、キット。
【請求項25】 各プローブが、請求項1〜6のいずれか一項記載のプローブである、請求項24記載のキット。
【請求項26】 一種類以上の固相支持体が平面状の基質であり、空間的に隔離された一つ以上の領域が、複数の空間的にアドレス可能な領域である、請求項24または25記載のキット。
【請求項27】 一種類以上の固相支持体の各々が微粒子である、請求項24または25記載のキット。
【請求項1】 標的核酸配列を含む分子にハイブリダイズさせるための単分子プローブであって、
(i)標的配列に相補的な第一の核酸配列、および、
(ii)第一の核酸配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成するための、標的および第一の配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子プローブ。
【請求項2】 第二の核酸配列から離れた位置にあるプローブの一端に位置し、前記一組の条件下でハイブリダイズして第二の分子内二本鎖を含む第二のヘアピン構造を形成するように互いに相補的で、かつ、互いに連結している第三および第四の核酸配列をさらに含む、請求項1記載のプローブ。
【請求項3】 第二の核酸配列に相補的でない、第一の核酸配列の一部が、第二の核酸配列から離れた位置にあり、標的および第一の配列がハイブリダイズするための核形成部位として機能するために十分な長さをもち、第二の分子内二本鎖に隣接した位置にある、請求項2記載のプローブ。
【請求項4】 分子間二本鎖が形成されると、分子間二本鎖と第二の分子内二本鎖とがニックされた二本鎖を形成するよう、標的分子の末端配列になっている標的核酸配列と組み合わされている、請求項2記載のプローブ。
【請求項5】 前記一組の条件下で、第一の分子内二本鎖が第二の分子内二本鎖よりも低いTm値をもつ、請求項2記載のプローブ。
【請求項6】 第一の分子内二本鎖が第二の分子内二本鎖よりも長くなく、第二の分子内二本鎖のG:C含量が、第一の分子内二本鎖のものよりも高い、請求項2〜5のいずれか一項記載のプローブ。
【請求項7】 試料中に標的核酸を含む標的分子が存在するか否かを検出するための単分子プローブであって、A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gからなる群より選択される分子を含み、ここで、
(i)A、C、D、E、およびGはそれぞれ核酸配列であり、
(ii)EおよびGが互いに相補的であって、Fによって互いに共有結合することにより、規定された一組の条件下で第一の分子内二本鎖を形成し、
(iii)(b)A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gの分子のそれぞれについては、(1)Eの配列全体とDの少なくとも一部、または(2)Eの配列全体とDの少なくとも一部およびFの少なくとも一部とが一緒になって、標的分子の標的核酸配列に対して実質的に相補的な核酸配列を形成し、また、前記条件下でプローブと標的分子とが分子間二本鎖を形成するよう、A−B−C−D−E−F−GおよびD−E−F−Gの分子のそれぞれと標的分子とが互いにハイブリダイズし、さらに、
(c)A−B−C−D−E−F−G分子のAおよびCが互いに相補的であって、Bによって互いに共有結合することにより、前記一組の条件下で第二の分子内二本鎖を形成する、プローブ。
【請求項8】 分子A−B−C−D−E−F−GのA−B−CのAおよびCの配列が、分子A−B−C−D−E−F−GのE−F−Gによって形成されるヘアピンよりもより安定なヘアピンをA−B−Cが形成するように選択されている、請求項7記載のプローブ。
【請求項9】 等式Tm=[(A+Tの個数)×2℃+(G+Cの個数)×4℃]によって計算すると、より安定なヘアピンの分子内二本鎖のTmが、より安定でない二本鎖の分子内二本鎖よりも高くなる、請求項8記載のプローブ。
【請求項10】 より安定なヘアピンの二本鎖の長さが、より安定でないヘアピンの二本鎖の長さよりも16個以上、14個以上、12個以上、10個以上、8個以上、または6個以上の核酸塩基対上回る、請求項8記載のプローブ。
【請求項11】 プローブが固相支持体に結合している、前記請求項のいずれか一項記載のプローブ。
【請求項12】 複数のプローブ集団を含むプローブのレパートリーであって、各集団の各プローブが、集団の他の各プローブと同じであり、かつ、請求項7〜10のいずれか一項記載のプローブであり、各プローブについて、標的配列に相補的なプローブの核酸配列が、レパートリーの他のすべてのプローブと同じ長さである、プローブのレパートリー。
【請求項13】 集団の各プローブについて、標的配列に相補的なプローブの核酸配列が、異なる集団のすべての他のプローブの前記配列と、2核酸以上、または3核酸以上、または4核酸以上、または5核酸以上、または6核酸以上異なる、請求項12記載のプローブのレパートリー。
【請求項14】 前記請求項のいずれか一項に記載のプローブを複数含む、プローブのレパートリー。
【請求項15】 各プローブの第一の核酸配列が、他の全てのプローブと長さにおいて同じである、請求項14記載のプローブのレパートリー。
【請求項16】 複数の微粒子の混合物を含む組成物であって、レパートリー中の異なるプローブの実質的にすべてが、異なる微粒子に付着するように、各微粒子が請求項14または15記載のプローブのレパートリーから選択されたプローブを付着させている、組成物。
【請求項17】 複数の微粒子の混合物を含む組成物であって、各微粒子が標的核酸配列を検出するためのプローブを付着させていて、各プローブが、
(i)標的配列に相補的な第一のタグ配列、および、
(ii)第一のタグ配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成させるための、標的およびタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子を含む、組成物。
【請求項18】 各プローブが、前記請求項のいずれか一項に記載のプローブである、請求項17記載の組成物。
【請求項19】 10個以上の異なる微粒子集団を含み、一つの集団の各微粒子が、別の集団とは異なるプローブを付着させていて、微粒子の各集団が、他の各集団の標的核酸配列とは異なる標的核酸配列を検出するためのものである、請求項17または18記載の組成物。
【請求項20】 一つの集団の各プローブのタグ配列が、その微粒子に付着している他のすべてのプローブのタグ配列と同一である、請求項19記載の組成物。
【請求項21】 各集団の各タグ配列が10ヌクレオチド以上の長さであって、前記集団の各タグ配列の配列が、異なる集団の前記タグ配列の配列とは3塩基以上異なる、請求項17記載の組成物。
【請求項22】 オリゴヌクレオチドタグ相補配列のレパートリーであって、各相補配列が、類似相補配列集団に属し、かつ、
(i)標的タグ配列に相補的な第一の相補配列、および、
(ii)第一の相補配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列を含み、
(iii)上記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成するための、相補配列とタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子部分であり、
前記タグ相補配列集団が10以上あり、一つの集団の各タグが、レパートリー中の他の集団すべてにおけるタグの相補配列とは異なる前記相補配列をもつ、レパートリー。
【請求項23】 各相補配列が、前記請求項のいずれか一項に記載のプローブを含む、請求項22記載のレパートリー。
【請求項24】 ポリヌクレオチドを選別および同定するためのキットであって、共有結合した実質的に同一のプローブの均一な集団をそれぞれが含む空間的に隔離された一つ以上の領域をもつ固相支持体を含み、各プローブが、
(i)同定しようとする前記ポリヌクレオチドの標的配列に相補的な第一のタグ配列、および、
(ii)第一のタグ配列の一部に相補的であり、かつ、規定された一組の条件下でそれにハイブリダイズして第一の分子内二本鎖を形成することができる第二の核酸配列
を含み、
(iii)前記一組の条件下で、分子間二本鎖を形成させるための、標的およびタグ配列とのハイブリダイゼーションが起こる単分子部分である、キット。
【請求項25】 各プローブが、請求項1〜6のいずれか一項記載のプローブである、請求項24記載のキット。
【請求項26】 一種類以上の固相支持体が平面状の基質であり、空間的に隔離された一つ以上の領域が、複数の空間的にアドレス可能な領域である、請求項24または25記載のキット。
【請求項27】 一種類以上の固相支持体の各々が微粒子である、請求項24または25記載のキット。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US20959500P | 2000-06-06 | 2000-06-06 | |
US60/209,595 | 2000-06-06 | ||
PCT/CA2001/000820 WO2001094625A2 (en) | 2000-06-06 | 2001-06-06 | Capture moieties for nucleic acids and uses thereof |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2003535599A JP2003535599A (ja) | 2003-12-02 |
JP2003535599A5 true JP2003535599A5 (ja) | 2008-07-17 |
Family
ID=22779412
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2002502165A Pending JP2003535599A (ja) | 2000-06-06 | 2001-06-06 | 核酸の捕捉部とその使用 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US7230092B2 (ja) |
EP (1) | EP1313881A2 (ja) |
JP (1) | JP2003535599A (ja) |
AU (1) | AU2001267191A1 (ja) |
WO (1) | WO2001094625A2 (ja) |
Families Citing this family (38)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2001267191A1 (en) | 2000-06-06 | 2001-12-17 | Tm Bioscience Corporation | Capture moieties for nucleic acids and uses thereof |
US7601497B2 (en) | 2000-06-15 | 2009-10-13 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Detection of nucleic acids by target-specific hybrid capture method |
US7901713B2 (en) * | 2001-06-20 | 2011-03-08 | Metaproteomics, Llc | Inhibition of COX-2 and/or 5-LOX activity by fractions isolated or derived from hops |
CA2467460A1 (en) | 2001-11-19 | 2003-05-30 | Parallele Bioscience, Inc. | Multiplex oligonucleotide addition and target amplification |
US20110151438A9 (en) | 2001-11-19 | 2011-06-23 | Affymetrix, Inc. | Methods of Analysis of Methylation |
US7291459B2 (en) * | 2002-12-10 | 2007-11-06 | University Of Alabama At Huntsville | Nucleic acid detector and method of detecting targets within a sample |
FR2852317B1 (fr) * | 2003-03-13 | 2006-08-04 | Biopuces a sondes et leurs methodes d'utilisation | |
US20050059049A1 (en) * | 2003-07-07 | 2005-03-17 | One Cell Systems, Inc. | Hairpin-labeled probes and methods of use |
JP2005304489A (ja) * | 2004-03-24 | 2005-11-04 | Sysmex Corp | 標的物質検出用プローブセット及び標的物質検出方法。 |
DE102004026120A1 (de) * | 2004-05-28 | 2005-12-22 | Sirs-Lab Gmbh | Adressierbare Molekülsondenanordnung |
DK1778867T3 (da) * | 2004-07-01 | 2010-08-02 | Gen Probe Inc | Fremgangsmåder og sammensætninger til detektering af nucleinsyrer i en biologisk prøve |
US20070015176A1 (en) * | 2005-02-18 | 2007-01-18 | Applera Corporation | Small nucleic acid detection probes and uses thereof |
US20060223066A1 (en) * | 2005-03-29 | 2006-10-05 | Applera Corporation | Methods for normalizing and for identifying small nucleic acids |
US9297036B2 (en) * | 2005-07-01 | 2016-03-29 | Agilent Technologies, Inc | Nucleic acid probes for analysis of small RNAs and other polynucleotides |
GB0600927D0 (en) * | 2006-01-17 | 2006-02-22 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Assay and materials therefor |
US7754475B2 (en) * | 2006-01-25 | 2010-07-13 | Agilent Technologies, Inc. | Nucleic acid probes and microarrays for analysis of polynucleotides |
CA2648702A1 (en) * | 2006-04-04 | 2007-10-11 | Arcxis Biotechnologies, Inc. | Cooperative probes and methods of using them |
FR2900158A1 (fr) * | 2006-04-25 | 2007-10-26 | Biomerieux Sa | Nouvelle sonde de detection agissant par reconnaissance moleculaire |
US7833716B2 (en) | 2006-06-06 | 2010-11-16 | Gen-Probe Incorporated | Tagged oligonucleotides and their use in nucleic acid amplification methods |
JP2008029333A (ja) * | 2006-07-03 | 2008-02-14 | Fujifilm Corp | 新規遺伝子増幅法に用いられるプライマー |
US9938641B2 (en) * | 2006-12-18 | 2018-04-10 | Fluidigm Corporation | Selection of aptamers based on geometry |
EP2806037B1 (en) | 2008-05-13 | 2016-09-21 | Gen-Probe Incorporated | Inactivatable target capture oligomers for use in the selective hybridization and capture of target nucleic acid sequences |
US20100068711A1 (en) * | 2008-07-18 | 2010-03-18 | Xenomics, Inc. | Methods of PCR-Based Detection of "Ultra Short" Nucleic Acid Sequences |
US8288520B2 (en) | 2008-10-27 | 2012-10-16 | Qiagen Gaithersburg, Inc. | Fast results hybrid capture assay and system |
AU2009324884B2 (en) | 2008-11-25 | 2013-10-03 | Gen-Probe Incorporated | Compositions and methods for detecting small RNAs, and uses thereof |
US9587270B2 (en) * | 2009-06-29 | 2017-03-07 | Luminex Corporation | Chimeric primers with hairpin conformations and methods of using same |
AU2010276236B2 (en) | 2009-07-21 | 2014-03-20 | Gen-Probe Incorporated | Methods and compositions for quantitative detection of nucleic acid sequences over an extended dynamic range |
WO2013116774A1 (en) * | 2012-02-01 | 2013-08-08 | Gen-Probe Incorporated | Asymmetric hairpin target capture oligomers |
GB201217770D0 (en) * | 2012-10-04 | 2012-11-14 | Base4 Innovation Ltd | Biological probes and the use thereof |
WO2015045666A1 (ja) * | 2013-09-25 | 2015-04-02 | 国立大学法人東京大学 | 流体デバイス、エキソソームの分析方法、生体分子分析方法及び生体分子検出方法 |
GB2520763A (en) * | 2013-12-02 | 2015-06-03 | Vanadis Diagnostics Ab | Nucleic acid probe and method of detecting genomic fragments |
GB2520765A (en) | 2013-12-02 | 2015-06-03 | Vanadis Diagnostics Ab | Multiplex detection of nucleic acids |
CA2932943C (en) | 2014-03-11 | 2023-09-26 | President And Fellows Of Harvard College | High-throughput and highly multiplexed imaging with programmable nucleic acid probes |
EP3250716B1 (en) * | 2015-01-30 | 2021-07-07 | President and Fellows of Harvard College | Microscope-free imaging |
US10544458B2 (en) * | 2015-02-25 | 2020-01-28 | Agency For Science, Technology And Research | Device and method for detecting target molecules |
ES2788737T3 (es) | 2015-09-18 | 2020-10-22 | Vanadis Diagnostics | Conjunto de sondas para analizar una muestra de ADN y método para usar el mismo |
CN109923213B (zh) | 2016-09-20 | 2023-02-28 | 哈佛学院院长及董事 | 分子验证系统 |
JPWO2021215428A1 (ja) * | 2020-04-22 | 2021-10-28 |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683202A (en) * | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4683195A (en) * | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US5374524A (en) * | 1988-05-10 | 1994-12-20 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Solution sandwich hybridization, capture and detection of amplified nucleic acids |
US6200753B1 (en) * | 1993-06-03 | 2001-03-13 | Intelligene Ltd. | Detection of nucleic acid sequences |
US5925517A (en) * | 1993-11-12 | 1999-07-20 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detectably labeled dual conformation oligonucleotide probes, assays and kits |
SE9400522D0 (sv) * | 1994-02-16 | 1994-02-16 | Ulf Landegren | Method and reagent for detecting specific nucleotide sequences |
US5681702A (en) * | 1994-08-30 | 1997-10-28 | Chiron Corporation | Reduction of nonspecific hybridization by using novel base-pairing schemes |
US5604097A (en) * | 1994-10-13 | 1997-02-18 | Spectragen, Inc. | Methods for sorting polynucleotides using oligonucleotide tags |
US5846719A (en) * | 1994-10-13 | 1998-12-08 | Lynx Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide tags for sorting and identification |
US5770365A (en) * | 1995-08-25 | 1998-06-23 | Tm Technologies, Inc. | Nucleic acid capture moieties |
AU723678B2 (en) * | 1996-03-18 | 2000-08-31 | Molecular Biology Resources, Inc. | Target nucleic acid sequence amplification |
WO1998010096A1 (en) * | 1996-04-12 | 1998-03-12 | The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. | Detection probes, kits and assays |
US5866336A (en) * | 1996-07-16 | 1999-02-02 | Oncor, Inc. | Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon |
US6117635A (en) | 1996-07-16 | 2000-09-12 | Intergen Company | Nucleic acid amplification oligonucleotides with molecular energy transfer labels and methods based thereon |
DE19637339A1 (de) * | 1996-09-13 | 1998-03-19 | Hoechst Ag | Verfahren zur Amplifikation von Nukleinsäuren |
US6025133A (en) * | 1996-12-30 | 2000-02-15 | Gen-Probe Incorporated | Promoter-sequestered oligonucleoside and method of use |
JP3944996B2 (ja) * | 1998-03-05 | 2007-07-18 | 株式会社日立製作所 | Dnaプローブアレー |
US6235480B1 (en) * | 1998-03-13 | 2001-05-22 | Promega Corporation | Detection of nucleic acid hybrids |
US6307041B1 (en) * | 1998-03-28 | 2001-10-23 | University Of Utah Research Foundation | Circular, hairpin, circular/hairpin, lariat, and hairpin-lariat hammerhead ribozymes |
JP2004500109A (ja) * | 2000-03-22 | 2004-01-08 | クァンタム・ドット・コーポレイション | ビーズベースの核酸アッセイにおける半導体ナノクリスタルの使用方法 |
AU2001267191A1 (en) | 2000-06-06 | 2001-12-17 | Tm Bioscience Corporation | Capture moieties for nucleic acids and uses thereof |
-
2001
- 2001-06-06 AU AU2001267191A patent/AU2001267191A1/en not_active Abandoned
- 2001-06-06 WO PCT/CA2001/000820 patent/WO2001094625A2/en active Application Filing
- 2001-06-06 EP EP01944793A patent/EP1313881A2/en not_active Withdrawn
- 2001-06-06 US US10/297,539 patent/US7230092B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-06-06 JP JP2002502165A patent/JP2003535599A/ja active Pending
-
2007
- 2007-05-25 US US11/807,328 patent/US7914989B2/en not_active Expired - Fee Related
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2003535599A5 (ja) | ||
Batut et al. | High-fidelity promoter profiling reveals widespread alternative promoter usage and transposon-driven developmental gene expression | |
DE69918130T2 (de) | Verwendung von vereinigten sonden zur genetischen analyse | |
KR102105236B1 (ko) | 무효소 및 무증폭 시퀀싱 | |
US8383344B2 (en) | Methods for quantification of microRNAs and small interfering RNAs | |
Buske et al. | Potential in vivo roles of nucleic acid triple-helices | |
US8629262B2 (en) | Detection of chromosomal inversions using non-repetitive nucleic acid probes | |
Gerasimova et al. | A single molecular beacon probe is sufficient for the analysis of multiple nucleic acid sequences | |
Silahtaroglu et al. | FISHing with locked nucleic acids (LNA): evaluation of different LNA/DNA mixmers | |
JP2004526433A5 (ja) | ||
JP2002519998A5 (ja) | ||
JP2001517086A (ja) | Vntr対立遺伝子の抽出および利用 | |
BRPI0206747B1 (pt) | polinucleotídeos para uso como etiquetas e complementos de etiquetas, fabricação e uso dos mesmos | |
CN105925671B (zh) | 一种从核酸样品富集目标序列核酸的方法 | |
CN108026568A (zh) | 通过结合条形码标记的多核苷酸探针进行核酸分析 | |
KR20150028063A (ko) | 리포터 및 소광자가 결합된 프로브를 이용한 액상형 어레이 및 이를 이용한 표적핵산 또는 돌연변이 검출방법 | |
KR20210061962A (ko) | 화학 조성물 및 이의 사용 방법 | |
EP1854883B1 (en) | Assist probes and method of using the same | |
Chen et al. | Parallel triplex structure formed between stretched single-stranded DNA and homologous duplex DNA | |
JP2002535999A (ja) | ゲノム分析方法 | |
KR100682923B1 (ko) | 허들 dna와 인공적인 미스매치가 도입된 프로브를이용한 단일 염기 미스매치에 대한 구별 향상 방법 | |
US9758815B2 (en) | Kits for characterization of chromosomal inversions using probes | |
WO2007133740A1 (en) | Method for identification of novel physical linkage of genomic sequences | |
CA2529793C (en) | Probes, libraries and kits for analysis of mixtures of nucleic acids and methods for constructing the same | |
Ju et al. | Microsatellite primers for the endangered beech tree, Fagus hayatae (Fagaceae) |