JP2003515343A - クラミジア感染の処置および診断のための化合物および方法 - Google Patents

クラミジア感染の処置および診断のための化合物および方法

Info

Publication number
JP2003515343A
JP2003515343A JP2001542539A JP2001542539A JP2003515343A JP 2003515343 A JP2003515343 A JP 2003515343A JP 2001542539 A JP2001542539 A JP 2001542539A JP 2001542539 A JP2001542539 A JP 2001542539A JP 2003515343 A JP2003515343 A JP 2003515343A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
sequence
polypeptide
cells
antigen
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
JP2001542539A
Other languages
English (en)
Inventor
ペーター プロプスト，
アジャイ バティア，
ヤシル エイ． ダブリュー． スカイキー，
スティーブン ピー． フライング，
ジョン スカラー，
Original Assignee
コリクサ コーポレイション
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US09/556,877 external-priority patent/US6432916B1/en
Application filed by コリクサ コーポレイション filed Critical コリクサ コーポレイション
Publication of JP2003515343A publication Critical patent/JP2003515343A/ja
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/295—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Chlamydiales (O)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

(57)【要約】 クラミジア感染の診断および処置のための化合物および方法を開示する。提供される化合物としては、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の少なくとも１つの抗原性部分を含むポリペプチドおよびこのようなポリペプチドをコードするＤＮＡ配列が挙げられる。このようなポリペプチドまたはＤＮＡ配列を含む薬学的組成物およびワクチンもまた、このようなポリペプチドに対する抗体と共に提供される。このようなポリペプチドまたはＤＮＡ配列、および適切な検出試薬を備える、診断キットは、患者および生物学的サンプルにおけるクラミジア感染の検出のために使用され得る。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】 （技術分野） 本発明は一般に、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染の検出および処置に関する。詳細に
は、本発明は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原を含むポリペプチド、ならびにＣｈｌａ
ｍｙｄｉａ感染の血清診断および処置のためのそのようなポリペプチドの使用に
関する。
【０００２】 （発明の背景） Ｃｈｌａｍｙｄｉａｅは、広範な種々の重要なヒト感染および動物感染の原因
である、細胞内の細菌性病原体である。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａ
ｔｉｓは、最も一般的な性感染病の原因の一つであり、そして骨盤炎症性疾患（
ＰＩＤ）を導き得、そして卵管閉塞および不妊をもたらす。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓはまた、雄性不妊症においても役割を果たし得る。１
９９０年に、米国においてＰＩＤを処置する費用は、４０億ドルであると見積も
られた。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓによる眼の感染に起因す
るトラコーマは、世界中の予防可能な失明の主な原因である。Ｃｈｌａｍｙｄｉ
ａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａは、ヒトにおける急性気道感染の主な原因であり、そし
てまた、アテローム性動脈硬化の病因において、特に冠状心臓疾患において役割
を果たすと考えられる。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａに対する高い
力価の抗体を有する個体は、冠状心臓疾患を患う可能性が、セロネガティブ個体
の少なくとも２倍であることが示されている。従って、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染
は、米国および世界中における重要な健康の問題を構成する。
【０００３】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染はしばしば、無症候性である。例えば、女性がＰＩＤ
についての医学的注意を要求するときまでは、不可逆的な損傷が既に生じていて
、不妊を生じ得る。従って、当該分野では、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染の予防およ
び処置のための改善されたワクチンおよび薬学的組成物についての必要性が依然
として存在する。本発明は、この必要性を満たし、そして関連の他の利点をさら
に提供する。
【０００４】 （発明の要旨） 本発明は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染の診断および治療のための組成物および方
法を提供する。１つの局面では、本発明は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原またはこの
ような抗原の改変体の免疫原性部分を含むポリペプチドを提供する。特定の部分
および他の改変体は、免疫原性であり、その結果、この改変体が抗原特異的抗血
清と反応する能力は、実質的に減少していない。特定の実施形態では、このポリ
ペプチドは、以下からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列によってコー
ドされるアミノ酸配列を含む：（ａ）配列番号１、１５、２１〜２５、４４〜６
４、６６〜７６、７９〜８８、１１０〜１１９、１２０、１２２、１２４、１２
６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１６９〜１７４、１８１〜１８
８、２６３、２６５および２６７〜２９０の配列；（ｂ）上記配列の相補体；な
らびに（ｃ）（ａ）または（ｂ）の配列に、中程度にストリンジェントな条件下
でハイブリダイズする配列。特定の実施形態では、本発明のポリペプチドは、以
下に記載される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むＣｈｌａｍｙ
ｄｉａタンパク質の少なくとも一部を含む：配列番号５〜１４、１７〜２０、２
６、２８、３０〜３２、３４、３９〜４３、６５、８９〜１０９、１３８〜１５
８、１６７、１６８、２２４〜２６２、２４６、２４７、２５４〜２５６、２９
２、２９４〜３０５およびそれらの改変体。
【０００５】 本発明は、上記のポリペプチドまたはその一部（例えば、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ
タンパク質の少なくとも１５アミノ酸残基をコードする一部）をコードするポリ
ヌクレオチド、このようなポリヌクレオチドを含む発現ベクター、およびこのよ
うな発現ベクターで形質転換またはトランスフェクトした宿主細胞をさらに提供
する。
【０００６】 関連する局面では、上記のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列、
これらのポリヌクレオチド配列の１つ以上を含む組換え発現ベクター、およびこ
のような発現ベクターで形質転換またはトランスフェクトした宿主細胞もまた提
供される。
【０００７】 別の局面では、本発明は、薬学的組成物およびそのワクチンとして使用するた
めに、生理学的に受容可能なキャリアまたは免疫促進剤と組み合わせた、本発明
のポリペプチドを含む融合タンパク質、あるいは、本発明のポリペプチドおよび
公知のＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原を含む融合タンパク質、ならびにこのような融合
タンパク質をコードするポリヌクレオチドを提供する。
【０００８】 本発明はさらに、以下を含む薬学的組成物を提供する：（ａ）Ｃｈｌａｍｙｄ
ｉａタンパク質に特異的に結合する、ポリクローナルおよびモノクローナルの両
方の抗体またはその抗原結合フラグメント；ならびに（ｂ）生理学的に受容可能
なキャリア。他の局面では、本発明は、本明細書中に開示される１以上のＣｈｌ
ａｍｙｄｉａポリペプチドまたはこのようなポリペプチドをコードするポリヌク
レオチド分子、および生理学的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を提供
する。本発明はまた、開示されたポリペプチドのうちの１以上および本明細書中
で定義されたような免疫促進剤を含む、予防または治療の目的のためのワクチン
を、このようなポリペプチドをコードする１以上のポリヌクレオチド配列および
免疫促進剤を含むワクチンとともに提供する。
【０００９】 なお別の局面では、患者において防御免疫を誘導するための方法が提供され、
この方法は、有効量の１以上の上記の薬学的組成物またはワクチンを患者に投与
する工程を含む。
【００１０】 なおさらなる局面では、患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染の処置方法が提
供され、この方法は、この患者由来の末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を入手する工
程、このＰＢＭＣを本発明のポリペプチド（またはこのようなポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチド）とともにインキュベートして、インキュベートされ
たＴ細胞を提供する工程、およびこのインキュベートされたＴ細胞をこの患者に
投与する工程を含む。本発明はさらに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染の処置方法を提
供し、この方法は、抗原提示細胞を、本発明のポリペプチド（またはこのような
ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド）とともにインキュベートしてイン
キュベートされた抗原提示細胞を提供する工程、およびこのインキュベートされ
た抗原提示細胞をこの患者に投与する工程を含む。増殖した細胞は、その患者へ
の投与の前にクローニングされてもよいが、その必要はない。特定の実施形態で
は、この抗原提示細胞は、以下からなる群より選択される：樹状細胞、マクロフ
ァージ、単球、Ｂ細胞および線維芽細胞。本発明のポリペプチドまたはポリヌク
レオチドとともにインキュベートされたＴ細胞または抗原提示細胞を含む、Ｃｈ
ｌａｍｙｄｉａ感染の処置のための組成物もまた提供される。関連する局面では
、以下を含むワクチンが提供される：（ａ）上に記載されるようなポリペプチド
を発現する抗原提示細胞および（ｂ）免疫促進剤。
【００１１】 本発明はさらに、他の局面において、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染細胞を生物学的
サンプルから除去するための方法を提供し、この方法は、生物学的サンプルを、
Ｃｈｌａｍｙｄｉａタンパク質と特異的に反応するＴ細胞と接触させる工程を含
み、ここでこの接触させる工程は、このタンパク質を発現する細胞の、このサン
プルからの除去を可能にするに十分な条件下および時間で行われる。
【００１２】 関連する局面では、患者においてＣｈｌａｍｙｄｉａ感染の発症を阻害するた
めの方法が提供され、この方法は、上に記載されるように処理した生物学的サン
プルを患者に投与する工程を含む。本発明のさらなる局面では、患者におけるＣ
ｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出するための方法および診断キットが提供される。１
つの実施形態では、この方法は以下を含む：（ａ）生物学的サンプルを、本明細
書中に開示されたポリペプチドまたは融合タンパク質のうちの少なくとも１つと
接触させる工程；および（ｂ）このサンプルにおいて、このポリペプチドまたは
融合タンパク質に結合する結合因子の存在を検出し、それによってこの生物学的
サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出する工程。適切な生物学的サン
プルとしては、全血、痰、血清、血漿、唾液、脳脊髄液および尿が挙げられる。
１つの実施形態では、診断キットは、本明細書中に開示されたポリペプチドまた
は融合タンパク質のうちの１以上を、検出試薬と組み合わせて含む。なお別の実
施形態では、診断キットは、本発明のポリペプチドと結合する、モノクローナル
抗体またはポリクローナル抗体のいずれかを含む。
【００１３】 本発明はまた、以下を含むＣｈｌａｍｙｄｉａ感染の検出方法を提供する：（
ａ）患者から生物学的サンプルを入手する工程；（ｂ）このサンプルを、ポリメ
ラーゼ連鎖反応における少なくとも２つのオリゴヌクレオチドプライマーと接触
させる工程であって、このオリゴヌクレオチドプライマーのうちの少なくとも一
方は、本明細書中に開示されたポリヌクレオチド配列と特異的である、工程；お
よび（ｃ）このサンプルにおいて、このオリゴヌクレオチドプライマーの存在下
で増幅するポリヌクレオチド配列を検出する工程。１つの実施形態では、このオ
リゴヌクレオチドプライマーは、本明細書中に開示されるペプチドのポリヌクレ
オチド配列またはそれにハイブリダイズする配列のうちの少なくとも約１０個連
続したヌクレオチドを含む。
【００１４】 さらなる局面では、本発明は、以下を含む、患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ
感染の検出方法を提供する：（ａ）生物学的サンプルを患者から入手する工程；
（ｂ）このサンプルを、本明細書中に開示されるポリヌクレオチド配列に特異的
なオリゴヌクレオチドプローブと接触させる工程；および（ｃ）このサンプルに
おいて、このオリゴヌクレオチドプローブにハイブリダイズするポリヌクレオチ
ド配列を検出する工程。１つの実施形態では、このオリゴヌクレオチドプローブ
は、本明細書中に開示されるポリヌクレオチド配列またはそれにハイブリダイズ
する配列のうちの少なくとも約１５個連続したヌクレオチドを含む。
【００１５】 本発明のこれらおよび他の局面は、以下の詳細な説明を参照すれば明らかにな
る。本明細書中に開示される全ての参考文献は、あたかも各々が個々に援用され
たかのように、その全体が本明細書中に参考として援用される。
【００１６】 （配列の識別名） 配列番号１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローン１−Ｂ１−６６について
の決定されたＤＮＡ配列である。
【００１７】 配列番号２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローン４−Ｄ７−２８について
の決定されたＤＮＡ配列である。
【００１８】 配列番号３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローン３−Ｇ３−１０について
の決定されたＤＮＡ配列である。
【００１９】 配列番号４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローン１０−Ｃ１０−３１につ
いての決定されたＤＮＡ配列である。
【００２０】 配列番号５は、１−Ｂ１−６６についての推定アミノ酸配列である。
【００２１】 配列番号６は、４−Ｄ７−２８についての推定アミノ酸配列である。
【００２２】 配列番号７は、３−Ｇ３−１０についての第１の推定アミノ酸配列である。
【００２３】 配列番号８は、３−Ｇ３−１０についての第２の推定アミノ酸配列である。
【００２４】 配列番号９は、３−Ｇ３−１０についての第３の推定アミノ酸配列である。
【００２５】 配列番号１０は、３−Ｇ３−１０についての第４の推定アミノ酸配列である。
【００２６】 配列番号１１は、３−Ｇ３−１０についての第５の推定アミノ酸配列である。
【００２７】 配列番号１２は、１０−Ｃ１０−３１についての推定アミノ酸配列である。
【００２８】 配列番号１３は、合成ペプチド１−Ｂ１−６６／４８−６７のアミノ酸配列で
ある。
【００２９】 配列番号１４は、合成ペプチド１−Ｂ１−６６／５８−７７のアミノ酸配列で
ある。
【００３０】 配列番号１５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型ＬＧＶ ＩＩクロー
ン２Ｃ７−８についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００３１】 配列番号１６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｄゲノムの２Ｃ７−
８がマッピングされる領域由来の推定オープンリーディングフレームのＤＮＡ配
列である。
【００３２】 配列番号１７は、配列番号１６のＤＮＡ配列によってコードされる推定アミノ
酸配列である。
【００３３】 配列番号１８は、合成ペプチドＣｔＣ７．８−１２のアミノ酸配列である。
【００３４】 配列番号１９は、合成ペプチドＣｔＣ７．８−１３のアミノ酸配列である。
【００３５】 配列番号２０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｄ由来の第２の推定
オープンリーディングフレームによってコードされる推定アミノ酸配列である。
【００３６】 配列番号２１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のクローン
４Ｃ９−１８についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００３７】 配列番号２２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来の、リポア
ミドデヒドロゲナーゼに相同な決定されたＤＮＡ配列である。
【００３８】 配列番号２３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来の、ハイポ
セティカルタンパク質に相同な決定されたＤＮＡ配列である。
【００３９】 配列番号２４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来の、ユビキ
ノンメチルトランスフェラーゼ（Ｕｂｉｑｕｉｎｏｎｅ Ｍｅｈｔｙｌｔｒａｎ
ｓｆｅｒａｓｅ）に相同な決定されたＤＮＡ配列である。
【００４０】 配列番号２５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のクローン
４Ｃ９−１８＃２ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳについての決定されたＤＮＡ配列であ
る。
【００４１】 配列番号２６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来の４Ｃ９−
１８＃２についての推定アミノ酸配列である。
【００４２】 配列番号２７は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ株ＴＷＡＲ由来のＣｐ−ＳＷＩＢに
ついての決定されたＤＮＡ配列である。
【００４３】 配列番号２８は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ株ＴＷＡＲ由来のＣｐ−ＳＷＩＢに
ついての推定アミノ酸配列である。
【００４４】 配列番号２９は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ株ＴＷＡＲ由来のＣｐ−Ｓ１３につ
いての決定されたＤＮＡ配列である。
【００４５】 配列番号３０は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ株ＴＷＡＲ由来のＣｐ−Ｓ１３につ
いての推定アミノ酸配列である。
【００４６】 配列番号３１は、ＣｔＣ７．８−１２およびＣｔＣ７．８−１３由来の１０マ
ーのコンセンサスペプチドについてのアミノ酸配列である。
【００４７】 配列番号３２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のクローン
２Ｃ７−８についての推定アミノ酸配列である。
【００４８】 配列番号３３は、クローン２Ｃ７−８に対する相同性を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈ
ｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｄゲノムのヌクレオチド５９７３０４−５９７１４５に
対応するＤＮＡ配列（ＮＣＢＩ、ＢＬＡＳＴＮ検索）である。
【００４９】 配列番号３４は、配列番号３３の配列によってコードされる推定されたアミノ
酸配列である。
【００５０】 配列番号３５は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣ．ｐ．ＳＷＩＢ Ｎｄｅ（
５’プライマー）についてのＤＮＡ配列である。
【００５１】 配列番号３６は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣ．ｐ．ＳＷＩＢ ＥｃｏＲ
Ｉ（３’プライマー）についてのＤＮＡ配列である。
【００５２】 配列番号３７は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣ．ｐ．Ｓ１３ Ｎｄｅ（５
’プライマー）についてのＤＮＡ配列である。
【００５３】 配列番号３８は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣ．ｐ．Ｓ１３ ＥｃｏＲＩ
（３’プライマー）についてのＤＮＡ配列である。
【００５４】 配列番号３９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔＳｗ
ｉｂ ５２−６７ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【００５５】 配列番号４０は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣｐＳｗｉｂ ５３−６８ペ
プチドについてのアミノ酸配列である。
【００５６】 配列番号４１は、ヒトＳＷＩドメイン由来のＨｕＳｗｉｂ ２８８−３０２ペ
プチドについてのアミノ酸配列である。
【００５７】 配列番号４２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのトポイソメラーゼ−ＳＷＩＢ
融合体由来のＣｔＳＷＩ−Ｔ ８２２−８３７ペプチドについてのアミノ酸配列
である。
【００５８】 配列番号４３は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａのトポイソメラーゼ−ＳＷＩＢ融合
体由来のＣｐＳＷＩ−Ｔ ８２８−８４２ペプチドについてのアミノ酸配列であ
る。
【００５９】 配列番号４４は、３’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８３．３，ｊｅｎ．ｓｅｑ（１＞５０９）ＣＴＬ２＃１１−３
’についての第１の決定されたＤＮＡ配列である。
【００６０】 配列番号４５は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８３．４，ｊｅｎ．ｓｅｑ（１＞４８１）ＣＴＬ２＃１１−５
’についての第２の決定されたＤＮＡ配列である。
【００６１】 配列番号４６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９７
８４ＣＴＬ２ １２ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ．ｓｅｑ（１＞４２７）ＣＴＬ２＃１２
についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６２】 配列番号４７は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８５．４，ｊｅｎ．ｓｅｑ（１＞６００）ＣＴＬ２＃１６−５
’についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６３】 配列番号４８は、３’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８６．３，ｊｅｎ．ｓｅｑ（１＞６００）ＣＴＬ２＃１８−３
’についての第１の決定されたＤＮＡ配列である。
【００６４】 配列番号４９は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８６．４，ｊｅｎ．ｓｅｑ（１＞６００）ＣＴＬ２＃１８−５
’についての第２の決定されたＤＮＡ配列である。
【００６５】 配列番号５０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９７
８８ＣＴＬ２ ２１ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ．ｓｅｑ（１＞４０６）ＣＴＬ２＃２１
についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６６】 配列番号５１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９７
９０ＣＴＬ２ ２３ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ．ｓｅｑ（１＞６０２）ＣＴＬ２＃２３
についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６７】 配列番号５２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９７
９１ＣＴＬ２ ２４ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ．ｓｅｑ（１＞１４５）ＣＴＬ２＃２４
についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６８】 配列番号５３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣＴＬ
２＃４についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００６９】 配列番号５４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣＴＬ
２＃８ｂについての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７０】 配列番号５５は、リポアミドデヒドロゲナーゼ遺伝子ＣＴ５５７に対する相同
性を共有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンｌ５−Ｇ１
−８９についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７１】 配列番号５６は、チオール特異的抗酸化遺伝子ＣＴ６０３に対する相同性を共
有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１４−Ｈ１−４に
ついての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７２】 配列番号５７は、ハイポセティカルタンパク質ＣＴ６２２に対する相同性を共
有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１２−Ｇ３−８３
についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７３】 配列番号５８は、リポアミドデヒドロゲナーゼ遺伝子ＣＴ５５７に対する相同
性を共有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１２−Ｂ３
−９５についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７４】 配列番号５９は、ｄｎａＫ遺伝子ＣＴ３９６に対する相同性を共有する、Ｃ．
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１１−Ｈ４−２８についての決
定されたＤＮＡ配列である。
【００７５】 配列番号６０は、ＰＧＰ６−Ｄ毒性タンパク質およびＬ１リボソーム遺伝子Ｃ
Ｔ３１８に対する部分的相同性を共有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧ
Ｖ ＩＩクローン１１−Ｈ３−６８についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７６】 配列番号６１は、マレイン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子ＣＴ３７６およびグリコ
ーゲンデヒドロゲナーゼ遺伝子ＣＴ０４２に対する部分的相同性を共有する、Ｃ
．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１１−Ｇ１−３４についての
決定されたＤＮＡ配列である。
【００７７】 配列番号６２は、ハイポセティカルタンパク質ＣＴ６１０に対する相同性を共
有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１１−Ｇ１０−４
６についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００７８】 配列番号６３は、ＯＭＰ２遺伝子ＣＴ４４３に対する相同性を共有する、Ｃ．
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１１−Ｃ１２−９１についての
決定されたＤＮＡ配列である。
【００７９】 配列番号６４は、ＨＡＤスーパーファミリー遺伝子ＣＴ１０３に対する相同性
を共有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１１−Ａ３−
９３についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８０】 配列番号６５は、チオール特異的抗酸化遺伝子ＣＴ６０３に対する相同性を共
有する、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１４−Ｈ１−４に
ついての決定されたアミノ酸配列である。
【００８１】 配列番号６６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃９についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８２】 配列番号６７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃７についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８３】 配列番号６８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃６についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８４】 配列番号６９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃５についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８５】 配列番号７０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃２についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８６】 配列番号７１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＃１についての決定されたＤＮＡ配列である。
【００８７】 配列番号７２は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン２３５０９．２ＣｔＬ２＃３−５’についての第１の決定されたＤＮ
Ａ配列である。
【００８８】 配列番号７３は、３’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン２３５０９．１ＣｔＬ２＃３−３’についての第２の決定されたＤＮ
Ａ配列である。
【００８９】 配列番号７４は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン２２１２１．２ＣｔＬ２＃１０−５’について第１の決定されたＤＮ
Ａ配列である。
【００９０】 配列番号７５は、３’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン２２１２１．１ＣｔＬ２＃１０−３’について第２の決定されたＤＮ
Ａ配列である。
【００９１】 配列番号７６は、５’末端を示す、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ Ｉ
Ｉクローン１９７８７．６ＣｔＬ２＃１９−５’について決定されたＤＮＡ配列
である。
【００９２】 配列番号７７は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｐＳ１
３−Ｈｉｓについて決定されたＤＮＡ配列である。
【００９３】 配列番号７８は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｐ＿Ｓ
ＷＩＢ−Ｈｉｓについて決定されたＤＮＡ配列である。
【００９４】 配列番号７９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２３−
Ｇ７−６８について決定されたＤＮＡ配列であり、Ｌ１１、Ｌ１０およびＬ１リ
ボソームタンパク質に対する部分的相同性を共有する。
【００９５】 配列番号８０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２２−
Ｆ８−９１について決定されたＤＮＡ配列であり、ｐｍｐＣ遺伝子に対する相同
性を共有する。
【００９６】 配列番号８１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２１−
Ｅ８−９５について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ６１０−ＣＴ６１３遺伝
子に対する相同性を共有する。
【００９７】 配列番号８２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９−
Ｆ１２−５７について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ８５８およびｒｅｃＡ
遺伝子に対する相同性を共有する。
【００９８】 配列番号８３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９−
Ｆ１２−５３について決定されたＤＮＡ配列であり、グルタミルｔＲＮＡシンテ
ターゼをコードするＣＴ４４５遺伝子に対する相同性を共有する。
【００９９】 配列番号８４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１９−
Ａ５−５４について決定されたＤＮＡ配列であり、潜在プラスミド遺伝子に対す
る相同性を共有する。
【０１００】 配列番号８５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１７−
Ｅ１１−７２について決定されたＤＮＡ配列であり、ＯｐｐＣ＿２およびｐｍｐ
Ｄ遺伝子に対する部分的相同性を共有する。
【０１０１】 配列番号８６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１７−
Ｃ１−７７について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ８５７およびＣＴ８５８
オープンリーディングフレームに対する部分的相同性を共有する。
【０１０２】 配列番号８７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１５−
Ｈ２−７６について決定されたＤＮＡ配列であり、ｐｍｐＤおよびＳｙｃＥ遺伝
子ならびにＣＴ０８９ＯＲＦに対する部分的相同性を共有する。
【０１０３】 配列番号８８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１５−
Ａ３−２６について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ８５８ ＯＲＦに対する
相同性を共有する。
【０１０４】 配列番号８９は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅクローンＣｐ＿ＳＷＩＢ−Ｈｉｓ
について決定されたアミノ酸配列である。
【０１０５】 配列番号９０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＿ＬＰＤＡ＿ＦＬについて決定されたアミノ酸配列である。
【０１０６】 配列番号９１は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅクローンＣｐＳ１３−Ｈｉｓにつ
いて決定されたアミノ酸配列である。
【０１０７】 配列番号９２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローンＣｔＬ
２＿ＴＳＡ＿ＦＬについて決定されたアミノ酸配列である。
【０１０８】 配列番号９３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ４３−６１ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１０９】 配列番号９４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ４８−６７ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１０】 配列番号９５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ５２−７１ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１１】 配列番号９６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ５８−７７ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１２】 配列番号９７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ６３−８２ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１３】 配列番号９８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ由来のＣｔ−Ｓ
ｗｉｂ５１−６６ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１４】 配列番号９９は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣｐ−Ｓｗｉｂ５２−６７ペ
プチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１５】 配列番号１００は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣｐ−Ｓｗｉｂ３７−５１
ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１６】 配列番号１０１は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣｐ−Ｓｗｉｂ３２−５１
ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１７】 配列番号１０２は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ由来のＣｐ−Ｓｗｉｂ３７−５６
ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１８】 配列番号１０３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓｗｉｂ３６−
５０ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１１９】 配列番号１０４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓ１３ ４６−
６５ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２０】 配列番号１０５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓ１３ ６０−
８０ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２１】 配列番号１０６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓ１３ １−２
０ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２２】 配列番号１０７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓ１３ ４６−
６５ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２３】 配列番号１０８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＣｔ−Ｓ１３ ５６−
７５ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２４】 配列番号１０９は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ由来のＣｐ−Ｓ１３ ５６−７
５ペプチドについてのアミノ酸配列である。
【０１２５】 配列番号１１０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２１
−Ｇ１２−６０について決定されたＤＮＡ配列であり、ハイポセティカルタンパ
ク質ＣＴ８７５、ＣＴ２２９およびＣＴ２２８についての部分的オープンリーデ
ィングフレームを含む。
【０１２６】 配列番号１１１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２２
−Ｂ３−５３について決定されたＤＮＡ配列であり、ＧｒｏＥＬのＣＴ１１０
ＯＲＦに対する相同性を共有する。
【０１２７】 配列番号１１２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２２
−Ａ１−４９について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ６６０およびＣＴ６５
９ ＯＲＦに対する部分的相同性を共有する。
【０１２８】 配列番号１１３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１７
−Ｅ２−９について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ６１１およびＣＴ６１０
ＯＲＦに対する部分的相同性を共有する。
【０１２９】 配列番号１１４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１７
−Ｃ１０−３１について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ８５８ ＯＲＦに対
する部分的相同性を共有する。
【０１３０】 配列番号１１５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２１
−Ｃ７−６６について決定されたＤＮＡ配列であり、ｄｎａＫ様遺伝子に対する
相同性を共有する。
【０１３１】 配列番号１１６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン２０
−Ｇ３−４５について決定されたＤＮＡ配列であり、ｐｍｐＢ遺伝子ＣＴ４１３
の部分を含む。
【０１３２】 配列番号１１７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１８
−Ｃ５−２について決定されたＤＮＡ配列であり、Ｓ１リボソームタンパク質Ｏ
ＲＦに対する相同性を共有する。
【０１３３】 配列番号１１８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１７
−Ｃ５−１９について決定されたＤＮＡ配列であり、ＣＴ４３１およびＣＴ４３
０についてのＯＲＦの部分を含む。
【０１３４】 配列番号１１９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１６
−Ｄ４−２２について決定されたＤＮＡ配列であり、哺乳動物細胞内で増殖のた
めのプラスミドのＯＲＦ３およびＯＲＦ４の部分的配列を含む。
【０１３５】 配列番号１２０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型ＬＧＶ ＩＩ Ｃ
ａｐ１遺伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１３６】 配列番号１２１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型ＬＧＶ ＩＩ Ｃ
ａｐ１遺伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１３７】 配列番号１２２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｅ Ｃａｐ１遺伝
子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１３８】 配列番号１２３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｅ Ｃａｐ１遺伝
子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１３９】 配列番号１２４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型１Ａ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１４０】 配列番号１２５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型１Ａ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１４１】 配列番号１２６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｇ Ｃａｐ１遺伝
子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１４２】 配列番号１２７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｇ Ｃａｐ１遺伝
子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１４３】 配列番号１２８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｆ１ ＮＩＩ Ｃ
ａｐ１遺伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１４４】 配列番号１２９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｆ１ ＮＩＩ Ｃ
ａｐ１遺伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１４５】 配列番号１３０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ１ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１４６】 配列番号１３１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ１ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１４７】 配列番号１３２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ３ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１４８】 配列番号１３３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ３ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１４９】 配列番号１３４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｂａ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１５０】 配列番号１３５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｂａ Ｃａｐ１遺
伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ酸配列である。
【０１５１】 配列番号１３６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型ＭＯＰＮ Ｃａｐ
１遺伝子ＣＴ５２９について決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１５２】 配列番号１３７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型ＭＯＰＮ Ｃａｐ
１遺伝子ＣＴ５２９について推定された全長アミノ配列である。
【０１５３】 配列番号１３８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１２４−１３９について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５４】 配列番号１３９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３２−１４７について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５５】 配列番号１４０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３８−１５５について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５６】 配列番号１４１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１４６−１６３について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５７】 配列番号１４２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１５４−１７１について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５８】 配列番号１４３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１６３−１７８について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１５９】 配列番号１４４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３８−１４７について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６０】 配列番号１４５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３９−１４７について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６１】 配列番号１４６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１４０−１４７について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６２】 配列番号１４７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３８−１４６について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６３】 配列番号１４８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃１３８−１４５について決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６４】 配列番号１４９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃Ｆ１４０−＞Ｉについて決定されたアミノ酸配列
である。
【０１６５】 配列番号１５０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃＃Ｓ１３９＞Ｇａについて決定されたアミノ酸配
列である。
【０１６６】 配列番号１５１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のＣａｐ１
ＣＴ５２９ ＯＲＦペプチド＃＃Ｓ１３９＞Ｇｂについて決定されたアミノ酸配
列である。
【０１６７】 配列番号１５２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２の２１６ａａ
ＯＲＦのペプチド＃２Ｃ７．８−６について決定されたアミノ酸配列である。
【０１６８】 配列番号１５３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２の２１６ａａ
ＯＲＦのペプチド＃２Ｃ７．８−７について決定されたアミノ酸配列である。
【０１６９】 配列番号１５４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２の２１６ａａ
ＯＲＦのペプチド＃２Ｃ７．８−８について決定されたアミノ酸配列である。
【０１７０】 配列番号１５５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２の２１６ａａ
ＯＲＦのペプチド＃２Ｃ７．８−９について決定されたアミノ酸配列である。
【０１７１】 配列番号１５６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２の２１６ａａ
ＯＲＦのペプチド＃２Ｃ７．８−１０について決定されたアミノ酸配列である
。
【０１７２】 配列番号１５７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のクローン２
Ｃ７．８内の２１６ａａ ＯＲＦの５３アミノ酸残基ペプチドについて決定され
たアミノ酸配列である。
【０１７３】 配列番号１５８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２のクローン２
Ｃ７．８内のＣＴ５２９ ＯＲＦの５２アミノ酸残基ペプチドについて決定され
たアミノ酸配列である。
【０１７４】 配列番号１５９は、全長ＣＴ５２９血液型亜型Ｌ２をクローニングするための
５’（正方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０１７５】 配列番号１６０は、全長ＣＴ５２９血液型亜型Ｌ２をクローニングするための
５’（逆方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０１７６】 配列番号１６１は、Ｌ２およびＭＯＰＮ以外の血液型亜型の全長ＣＴ５２９を
クローニングするための５’（正方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配
列である。
【０１７７】 配列番号１６２は、Ｌ２およびＭＯＰＮ以外の血液型亜型の全長ＣＴ５２９を
クローニングするための５’（逆方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配
列である。
【０１７８】 配列番号１６３は、全長ＣＴ５２９血液型亜型ＭＯＰＮをクローニングするた
めの５’（正方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０１７９】 配列番号１６４は、全長ＣＴ５２９血液型亜型ＭＯＰＮをクローニングするた
めの５’（逆方向）プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０１８０】 配列番号１６５は、ｐＢＩＢ−ＫＳのための５’（正方向）プライマーについ
て決定されたＤＮＡ配列である。
【０１８１】 配列番号１６６は、ｐＢＩＢ−ＫＳのための５’（逆方向）プライマーについ
て決定されたＤＮＡ配列である。
【０１８２】 配列番号１６７は、血液型亜型Ｌ２由来の９マーエピトープペプチドＣａｐ１
＃１３９−１４７について決定されたアミノ酸配列である。
【０１８３】 配列番号１６８は、血液型亜型Ｄ由来の９マーエピトープペプチドＣａｐ１＃
１３９−１４７について決定されたアミノ酸配列である。
【０１８４】 配列番号１６９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＩ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１８５】 配列番号１７０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１８６】 配列番号１７１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１８７】 配列番号１７２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１８８】 配列番号１７３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１８９】 配列番号１７４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＢ遺伝子について決
定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１９０】 配列番号１７５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＩ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９１】 配列番号１７６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９２】 配列番号１７７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９３】 配列番号１７８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９４】 配列番号１７９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９５】 配列番号１８０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＢ遺伝子について推
定された全長アミノ酸配列である。
【０１９６】 配列番号１８１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＩ遺伝子について決
定されたＤＮＡ配列（シグナル配列を含まない）である。
【０１９７】 配列番号１８２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子について続
いて決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０１９８】 配列番号１８３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子について決
定されたＤＮＡ配列（シグナル配列を含まない）である。
【０１９９】 配列番号１８４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子についての
カルボキシ末端を示す第１の決定されたＤＮＡ配列である。
【０２００】 配列番号１８５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子についての
アミノ末端を示す第２の決定されたＤＮＡ配列（シグナル配列を含まない）であ
る。
【０２０１】 配列番号１８６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子についての
カルボキシ末端を示す第１の決定されたＤＮＡ配列である。
【０２０２】 配列番号１８７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子についての
アミノ末端を示す第２の決定されたＤＮＡ配列（シグナル配列を含まない）であ
る。
【０２０３】 配列番号１８８は、Ｒａ１２との融合分子におけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ血液型亜型ＭＯＭＰＳ ｐｍｐ遺伝子を示す決定されたＤＮＡ配列である。
【０２０４】 配列番号１８９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＩ遺伝子について推
定されたアミノ酸配列（シグナル配列を含まない）である。
【０２０５】 配列番号１９０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子について続
いて推定されたアミノ酸配列である。
【０２０６】 配列番号１９１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子について推
定されたアミノ酸配列（シグナル配列を含まない）である。
【０２０７】 配列番号１９２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子についての
カルボキシ末端を示す第１の推定されたアミノ酸配列である。
【０２０８】 配列番号１９３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子についての
アミノ末端を示す推定されたアミノ酸配列（シグナル配列を含まない）である。
【０２０９】 配列番号１９４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子についての
カルボキシ末端を示す第１の推定されたアミノ酸配列である。
【０２１０】 配列番号１９５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子についての
アミノ末端を示す第２の推定されたアミノ酸配列である。
【０２１１】 配列番号１９６は、Ｒａ１２との融合分子におけるＣ．ｐｅｎｅｕｍｏｎｉａ
ｅ血液型亜型ＭＯＭＰＳ ｐｍｐ遺伝子を示す推定されたアミノ酸配列である。
【０２１２】 配列番号１９７は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２１３】 配列番号１９８は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２１４】 配列番号１９９は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＣ遺伝子をクローニングするための挿入配列について決定されたＤ
ＮＡ配列である。
【０２１５】 配列番号２００は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２１６】 配列番号２０１は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２１７】 配列番号２０２は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＤ遺伝子をクローニングするための挿入配列について決定されたＤ
ＮＡ配列である。
【０２１８】 配列番号２０３は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２１９】 配列番号２０４は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２０】 配列番号２０５は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２１】 配列番号２０６は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２２】 配列番号２０７は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＣ遺伝子のアミノ末端部分をクローニングするための５’オリゴプラ
イマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２３】 配列番号２０８は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＣ遺伝子のアミノ末端部分をクローニングするための３’オリゴプラ
イマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２４】 配列番号２０９は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＣ遺伝子のカルボキシ末端部分をクローニングするための５’オリゴ
プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２５】 配列番号２１０は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＣ遺伝子のカルボキシ末端部分をクローニングするための３’オリゴ
プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２６】 配列番号２１１は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＤ遺伝子のアミノ末端部分をクローニングするための５’オリゴプラ
イマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２７】 配列番号２１２は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＤ遺伝子のアミノ末端部分をクローニングするための３’オリゴプラ
イマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２８】 配列番号２１３は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＤ遺伝子のカルボキシ末端部分をクローニングするための５’オリゴ
プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２２９】 配列番号２１４は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＤ遺伝子のカルボキシ末端部分をクローニングするための３’オリゴ
プライマーについて決定されたＤＮＡ配列である。
【０２３０】 配列番号２１５は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。
【０２３１】 配列番号２１６は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。 配列番号２１７は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための挿入配列について決定されたＤＮ
Ａ配列である。
【０２３２】 配列番号２１８は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＥ遺伝子をクローニングするための挿入配列についてのアミノ酸配列
である。
【０２３３】 配列番号２１９は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。
【０２３４】 配列番号２２０は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。
【０２３５】 配列番号２２１は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための挿入配列についてのアミノ酸配列
である。
【０２３６】 配列番号２２２は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＩ遺伝子をクローニングするための５’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。
【０２３７】 配列番号２２３は、ｐＥＴ１７ｂベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ ｐｍｐＩ遺伝子をクローニングするための３’オリゴプライマーについて決
定されたＤＮＡ配列である。
【０２３８】 配列番号２２４は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド１〜２０に
ついて決定されたアミノ酸配列である。
【０２３９】 配列番号２２５は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド６〜２５に
ついて決定されたアミノ酸配列である。
【０２４０】 配列番号２２６は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド１２〜３１
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４１】 配列番号２２７は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド１７〜３６
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４２】 配列番号２２８は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド２２〜４１
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４３】 配列番号２２９は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド２７〜４６
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４４】 配列番号２３０は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド４２〜６１
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４５】 配列番号２３１は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド４６〜６５
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４６】 配列番号２３２は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド５１〜７０
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４７】 配列番号２３３は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド５６〜７５
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４８】 配列番号２３４は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド６１〜８０
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２４９】 配列番号２３５は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｓｗｉｂペプチド６６〜８７
について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５０】 配列番号２３６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１０３〜
１２２について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５１】 配列番号２３７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１０８〜
１２７について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５２】 配列番号２３８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１１３〜
１３２について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５３】 配列番号２３９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１１８〜
１３７について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５４】 配列番号２４０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１２３〜
１４３について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５５】 配列番号２４１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１２８〜
１４７について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５６】 配列番号２４２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１３３〜
１５２について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５７】 配列番号２４３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１３７〜
１５６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５８】 配列番号２４４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１４２〜
１６１について決定されたアミノ酸配列である。
【０２５９】 配列番号２４５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１４７〜
１６６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６０】 配列番号２４６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１５２〜
１７１について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６１】 配列番号２４７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１５７〜
１７６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６２】 配列番号２４８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１６２〜
１８１について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６３】 配列番号２４９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１６７〜
１８６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６４】 配列番号２５０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１７１〜
１９０について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６５】 配列番号２５１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１７１〜
１８６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６６】 配列番号２５２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１７５〜
１８６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６７】 配列番号２５２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＯＭＣＢペプチド１７５〜
１８６について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６８】 配列番号２５３は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ ＯＭＣＢペプチド１８５〜１
９８について決定されたアミノ酸配列である。
【０２６９】 配列番号２５４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド９６〜１１
５について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７０】 配列番号２５５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１０１〜１
２０について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７１】 配列番号２５６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１０６〜１
２５について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７２】 配列番号２５７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１１１〜１
３０について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７３】 配列番号２５８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１１６〜１
３５について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７４】 配列番号２５９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１２１〜１
４０について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７５】 配列番号２６０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１２６〜１
４５について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７６】 配列番号２６１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１３１〜１
５０について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７７】 配列番号２６２は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＴＳＡペプチド１３６〜１
５５について決定されたアミノ酸配列である。
【０２７８】 配列番号２６３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＣＴ５２９／Ｃａｐ １遺
伝子血液型亜型Ｉについて決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０２７９】 配列番号２６４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＣＴ５２９／Ｃａｐ １遺
伝子血液型亜型Ｉについて予測された全長アミノ配列である。
【０２８０】 配列番号２６５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＣＴ５２９／Ｃａｐ １遺
伝子血液型亜型Ｋについて決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０２８１】 配列番号２６６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＣＴ５２９／Ｃａｐ １遺
伝子血液型亜型Ｋについて予測された全長アミノ配列である。
【０２８２】 配列番号２６７は、ｓｅｒＤにおけるＤＮＡ関連（ＤＮＡ−ｄｉｒｒｅｃｔｅ
ｄ）ＲＮＡポリメラーゼβサブユニット−ＣＴ３１５のＯＲＦの一部に対する相
同性を共有するＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローン１７−Ｇ４−３６について
決定されたＤＮＡ配列である。
【０２８３】 配列番号２６８は、クローン２Ｅ１０におけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
ＣＴ０１６遺伝子の部分配列について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２８４】 配列番号２６９は、クローン２Ｅ１０におけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
ｔＲＮＡシンターゼ遺伝子の部分配列について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２８５】 配列番号２７０は、クローン２Ｅ１０におけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
ｃｌｐＸ遺伝子の部分配列について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２８６】 配列番号２７１は、５’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−３０について決定された第１のＤＮＡ配列である。
【０２８７】 配列番号２７２は、３’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−３０について決定された第２のＤＮＡ配列である。
【０２８８】 配列番号２７３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
８について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２８９】 配列番号２７４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
７について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９０】 配列番号２７５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
６について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９１】 配列番号２７６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
４について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９２】 配列番号２７７は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
３について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９３】 配列番号２７８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
１について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９４】 配列番号２７９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−１
８について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９５】 配列番号２８０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−１
７について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９６】 配列番号２８１は、５’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−１５について決定された第１のＤＮＡ配列である。
【０２９７】 配列番号２８２は、３’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−１５について決定された第２のＤＮＡ配列である。
【０２９８】 配列番号２８３は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−１
３について決定されたＤＮＡ配列である。
【０２９９】 配列番号２８４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−１
０について決定されたＤＮＡ配列である。
【０３００】 配列番号２８５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−８
について決定されたＤＮＡ配列である。
【０３０１】 配列番号２８６は、５’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−６について決定された第１のＤＮＡ配列である。
【０３０２】 配列番号２８７は、３’末端を示すＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔ
Ｌ２ｇａｍ−６について決定された第２のＤＮＡ配列である。
【０３０３】 配列番号２８８は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−５
について決定されたＤＮＡ配列である。
【０３０４】 配列番号２８９は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−２
について決定されたＤＮＡ配列である。
【０３０５】 配列番号２９０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓクローンＣｔＬ２ｇａｍ−１
について決定されたＤＮＡ配列である。
【０３０６】 配列番号２９１は、ＣＴ５２９遺伝子のＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅホモログに
ついて決定された全長ＤＮＡ配列である。
【０３０７】 配列番号２９２は、ＣＴ５２９遺伝子のＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅホモログに
ついて予測された全長アミノ酸配列である。
【０３０８】 配列番号２９３は、ＳＫＢワクチンベクターにおけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｐｍｐＧ遺伝子をクローニングするための挿入配列について決定されたＤ
ＮＡ配列である。
【０３０９】 配列番号２９４は、クローンＣＴ６０３のオープンリーディングフレームのア
ミノ酸配列である。
【０３１０】 配列番号２９５は、クローンＣＴ８７５の第１のオープンリーディングフレー
ムのアミノ酸配列である。
【０３１１】 配列番号２９６は、クローンＣＴ８７５の第２のオープンリーディングフレー
ムのアミノ酸配列である。
【０３１２】 配列番号２９７は、クローンＣＴ８５８の第１のオープンリーディングフレー
ムのアミノ酸配列である。
【０３１３】 配列番号２９８は、クローンＣＴ８５８の第２のオープンリーディングフレー
ムのアミノ酸配列である。
【０３１４】 配列番号２９９は、クローンＣＴ６２２のオープンリーディングフレームのア
ミノ酸配列である。
【０３１５】 配列番号３００は、クローンＣＴ６１０のオープンリーディングフレームのア
ミノ酸配列である。
【０３１６】 配列番号３０１は、クローンＣＴ３９６のオープンリーディングフレームのア
ミノ酸配列である。
【０３１７】 配列番号３０２は、クローンＣＴ３１８のオープンリーディングフレームのア
ミノ酸配列である。
【０３１８】 配列番号３０４は、改変型Ｎ末端配列（６−Ｈｉｓタグ）を有するＣ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２ｒＣｔ５２９ｃ１−１２５についてのアミノ酸
配列である。
【０３１９】 配列番号３０５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２ｒＣｔ５２９
ｃ１−１２５についてアミノ酸配列である。
【０３２０】 配列番号３０６は、ＰｍｐＡ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３２１】 配列番号３０７は、ＰｍｐＡ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３２２】 配列番号３０８は、ＰｍｐＡ（Ｎ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３２３】 配列番号３０９は、ＰｍｐＡ（Ｎ末）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３２４】 配列番号３１０は、ＰｍｐＡ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３２５】 配列番号３１１は、ＰｍｐＡ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３２６】 配列番号３１２は、ＰｍｐＡ（Ｃ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３２７】 配列番号３１３は、ＰｍｐＡ（Ｃ末）融合タンパク質をのアミノ酸配列である
。
【０３２８】 配列番号３１４は、ＰｍｐＦ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３２９】 配列番号３１５は、ＰｍｐＦ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３３０】 配列番号３１６は、ＰｍｐＦ（Ｎ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３３１】 配列番号３１７は、ＰｍｐＦ（Ｎ末）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３３２】 配列番号３１８は、ＰｍｐＦ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３３３】 配列番号３１９は、ＰｍｐＦ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３３４】 配列番号３２０は、ＰｍｐＦ（Ｃ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３３５】 配列番号３２１は、ＰｍｐＦ（Ｃ末）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３３６】 配列番号３２２は、ＰｍｐＨ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３３７】 配列番号３２３は、ＰｍｐＨ（Ｎ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３３８】 配列番号３２４は、ＰｍｐＨ（Ｎ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３３９】 配列番号３２５は、ＰｍｐＨ（Ｎ末）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３４０】 配列番号３２６は、ＰｍｐＨ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたセン
スプライマーである。
【０３４１】 配列番号３２７は、ＰｍｐＨ（Ｃ末）融合タンパク質の合成に使用されたアン
チセンスプライマーである。
【０３４２】 配列番号３２８は、ＰｍｐＨ（Ｃ末）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列
である。
【０３４３】 配列番号３２９は、ＰｍｐＨ（Ｃ末）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３４４】 配列番号３３０は、ＰｍｐＢ（１）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３４５】 配列番号３３１は、ＰｍｐＢ（１）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３４６】 配列番号３３２は、ＰｍｐＢ（１）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３４７】 配列番号３３３は、ＰｍｐＢ（１）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３４８】 配列番号３３４は、ＰｍｐＢ（２）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３４９】 配列番号３３５は、ＰｍｐＢ（２）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３５０】 配列番号３３６は、ＰｍｐＢ（２）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３５１】 配列番号３３７は、ＰｍｐＢ（２）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３５２】 配列番号３３８は、ＰｍｐＢ（３）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３５３】 配列番号３３９はＰｍｐＢ（３）融合タンパク質の合成に使用されたアンチセ
ンスプライマーである。
【０３５４】 配列番号３４０は、ＰｍｐＢ（３）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３５５】 配列番号３４１は、ＰｍｐＢ（３）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３５６】 配列番号３４２は、ＰｍｐＢ（４）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３５７】 配列番号３４３は、ＰｍｐＢ（４）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３５８】 配列番号３４４は、ＰｍｐＢ（４）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３５９】 配列番号３４５は、ＰｍｐＢ（４）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３６０】 配列番号３４６は、ＰｍｐＣ（１）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３６１】 配列番号３４７は、ＰｍｐＣ（１）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３６２】 配列番号３４８は、ＰｍｐＣ（１）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３６３】 配列番号３４９は、ＰｍｐＣ（１）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３６４】 配列番号３５０は、ＰｍｐＣ（２）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３６５】 配列番号３５１は、ＰｍｐＣ（２）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３６６】 配列番号３５２は、ＰｍｐＣ（２）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３６７】 配列番号３５３は、ＰｍｐＣ（２）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３６８】 配列番号３５４は、ＰｍｐＣ（３）融合タンパク質の合成に使用されたセンス
プライマーである。
【０３６９】 配列番号３５５は、ＰｍｐＣ（３）融合タンパク質の合成に使用されたアンチ
センスプライマーである。
【０３７０】 配列番号３５６は、ＰｍｐＣ（３）融合タンパク質をコードするＤＮＡ配列で
ある。
【０３７１】 配列番号３５７は、ＰｍｐＣ（３）融合タンパク質のアミノ酸配列である。
【０３７２】 （発明の詳細な説明） 上記のように、本発明は、一般に、クラミジア感染の診断および処置のための
組成物および方法に関する。１つの局面において、本発明の組成物は、Ｃｈｌａ
ｍｙｄｉａ抗原の少なくとも１つの免疫原性部分またはその改変体を含むポリペ
プチドを含む。
【０３７３】 特定の実施形態において、本発明は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分
を含むポリペプチドを開示する。ここで、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原は、（ａ）配
列番号１、１５、２１〜２５、４４〜６４、６６〜７６、７９〜８８、１１０〜
１１９、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、
１３６、１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９
０に記載されたヌクレオチド配列、（ｂ）このヌクレオチド配列の相補体、なら
びに（ｃ）このような配列の改変体からなる群より選択される配列を含むポリヌ
クレオチド分子によりコードされるアミノ酸配列を含む。
【０３７４】 本明細書中で記載される場合、用語「ポリペプチド」は、任意の長さ（全長タ
ンパク質を含む）のアミノ酸鎖（すなわち、抗原）を含む。ここで、このアミノ
酸残基は、共有ペプチド結合により連結されている。従って、本発明の抗原のう
ちの１つの免疫原性部分を含むポリペプチドは、免疫原性部分全体からなっても
よいし、さらなる配列を含んでいてもよい。このさらなる配列は、ネイティブな
Ｃｌａｍｙｄｉａ抗原から誘導されてもよいし、異種でもよく、そしてこのよう
な配列は、免疫原性であり得る（しかし、必要ではない）。
【０３７５】 本明細書中で使用される場合、用語「ポリヌクレオチド」は、デオキシリボヌ
クレオチドまたはリボヌクレオチドの塩基の一本鎖または二本鎖のポリマーを意
味し、そしてＤＮＡおよび対応するＲＮＡ分子（ＨｎＲＮＡおよびｍＲＮＡの分
子を含む）、センス鎖およびアンチセンス鎖の両方を含み、ｃＤＮＡ、ゲノムＤ
ＮＡおよび組換えＤＮＡ、ならびに合成ポリヌクレオチドの全体または一部を含
む。ＨｎＲＮＡ分子はイントロンを含み、そして一般的に一対一の様式でＤＮＡ
分子に対応する。ｍＲＮＡ分子は、イントロンが切り出されたＨｎＲＮＡ分子お
よびＤＮＡ分子に対応する。ポリヌクレオチドは、遺伝子全体、またはその一部
からなり得る。作動可能なアンチセンスポリヌクレオチドは、対応するポリヌク
レオチドのフラグメントを含み得、従って、「ポリヌクレオチド」の定義は、こ
のような全ての作動可能なアンチセンスフラグメントを含む。
【０３７６】 抗原の「免疫原性部分」は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染個体から得た血清と反応
し得る（すなわち、感染個体由来の血清を用いた吸光度読み取り（これは、本明
細書に記載の代表的ＥＬＩＳＡアッセイにおいて、非感染個体由来の血清を用い
て得た吸光度を少なくとも３標準偏差上回る）を生成する）部分である。このよ
うな免疫原性部分は、一般に、少なくとも約５アミノ酸残基、より好ましくは、
少なくとも１０、そして最も好ましくは少なくとも２０アミノ酸残基を含む。公
知の配列の抗原の免疫原性部分を調製および同定するための方法は、当該分野で
周知であり、そしてＰａｕｌ，Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ
、第３版，Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ，１９９３，第２４３〜２４７頁およびそこ
に引用されている参考文献に要約されている方法を含む。このような技術として
は、抗原特異的抗体、抗血清および／またはＴ細胞株もしくはクローンと反応す
る能力についてポリペプチドをスクリーニングする技術を含む。本明細書におい
て用いる場合、抗血清および抗体は、抗原に特異的に結合する場合、「抗原特異
的」である（すなわち、抗血清および抗体は、ＥＬＩＳＡまたは他のイムノアッ
セイにおいてそのタンパク質と反応し、そして関連しないタンパク質とは検出可
能に反応しない）。このような抗血清および抗体は、本明細書において記載され
るように、そして周知の技術を用いて調製され得る。ネイティブなＣｈｌａｍｙ
ｄｉａタンパク質の免疫原性部分は、（例えば、ＥＬＩＳＡおよび／またはＴ細
胞反応性アッセイにおいて）全長ポリペプチドの反応性よりも実質的に低いレベ
ルで、このような抗血清および／またはＴ細胞と反応する部分である。このよう
な免疫原性部分は、このようなアッセイにおいて、全長ポリペプチドの反応性と
類似かまたはより大きいレベルで反応し得る。このようなスクリーニングは、一
般に当業者に周知の方法（例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ａｎｔｉｂｏ
ｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，１９８８に記載の方法）を用いて実行
され得る。例えば、ポリペプチドは、固体支持体上に固定され得、そして患者の
血清と接触されて、固定されたポリペプチドに対する血清内の抗体の結合を可能
にする。次いで、非結合血清は、取り出され得、そして例えば、125Ｉ標識プロ
テインＡを用いて検出した抗体と結合され得る。
【０３７７】 本発明により意図される抗原の免疫原性部分の例としては、例えば、配列番号
９、１０、１８、１９、３１、３９、９３〜９６、９８、１００〜１０２、１０
６、１０８、１３８〜１４０、１５８、１６７、１６８、２４６、２４７および
２５４〜２５６において提供されるＴ細胞刺激エピトープが挙げられる。本明細
書に記載されるとおり、１つ以上のＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原の少なくとも１つの
免疫原性部分を含むポリペプチドは、一般に、患者のＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を
検出するために、単独かまたは組み合わせて、用いられ得る。
【０３７８】 本発明の組成物および方法はまた、上記のポリペプチドおよびポリヌクレオチ
ド分子の改変体を含む。このような改変体としては、本発明の配列の天然に存在
する対立遺伝子改変体が挙げられるがこれらに限定されない。特に、改変体は、
他のＣｈｌａｍｙｄｉａｅの血清型亜型（例えば、血清型亜型Ｄ、ＥおよびＦ、
ならびにいくつかのＬＧＶ血清型亜型（本明細書に記載される、本発明のポリペ
プチドおよびポリヌクレオチド分子と相同性を共有する））を含む。好ましくは
、この血清型相同体は、本明細書に記載される対応するポリペプチド配列に対し
て９５〜９９％の相同性を示す。
【０３７９】 本明細書において用いる場合、ポリペプチドの「改変体」は、保存的置換およ
び／または改変のみにおいて示されたポリペプチドとは異なるポリペプチドであ
り、従ってこのポリペプチドの抗原特性は保持されている。好ましい実施形態に
おいて、改変ポリペプチドは、５つ以下のアミノ酸の置換、欠失または付加によ
って、同定された配列とは異なる。このような改変体は、一般に、上記のポリペ
プチド配列のうちの１つを改変すること、および、例えば、本明細書において記
載されている代表的な手順を使用して、改変ポリペプチドの抗原特性を評価する
ことによって、同定され得る。換言すれば、抗原特異的抗血清と反応する改変体
の能力は、ネイティブなタンパク質に対して、強化され得るかもしくは不変であ
り得、またはネイティブなタンパク質に対して、５０％未満および好ましくは２
０％未満程度減少され得る。このような改変体は、一般に、本明細書において記
載のように上記のポリペプチド配列のうちの１つを改変すること、および抗原特
異的抗体または抗血清との改変ポリペプチドの反応性を評価することよって同定
され得る。好ましい改変体は、１つ以上の部分（例えば、Ｎ末端リーダー配列ま
たは膜貫通ドメイン）が除去された改変体を含む。他の好ましい改変体は、小さ
い部分（例えば、１〜３０アミノ酸、好ましくは５〜１５アミノ酸）が、成熟タ
ンパクのＮ末端および／またはＣ末端から除去されている改変体を含む。
【０３８０】 本明細書において用いる場合、「保存的置換」とは、１つのアミノ酸が、類似
の性質を有する別のアミノ酸と置換されている、置換であり、従って、ペプチド
化学の当業者は、ポリペプチドの二次構造および疎水性親水性指標の性質が実質
的に不変であると予期する。アミノ酸置換は、一般に、残基の極性、電荷、溶解
度、疎水性、親水性および／または両親媒性の性質の類似性に基づいて行われ得
る。例えば、負に荷電されるアミノ酸としては、アスパラギン酸およびグルタミ
ン酸が挙げられる；正に荷電したアミノ酸としては、リジンおよびアルギニンが
挙げられる；そして、類似の親水性値を有する荷電してない極性のヘッド基を有
するアミノ酸としては、以下が挙げられる：ロイシン、イソロイシンおよびバリ
ン；グリシンおよびアラニン；アスパラギンおよびグルタミン；ならびに、セリ
ン、トレオニン、フェニルアラニンおよびチロシン。保存的変化を表し得るアミ
ノ酸の他の群としては、以下が挙げられる：（１）ａｌａ、ｐｒｏ、ｇｌｙ、ｇ
ｌｕ、ａｓｐ、ｇｌｎ、ａｓｎ、ｓｅｒ、ｔｈｒ；（２）ｃｙｓ、ｓｅｒ、ｔｙ
ｒ、ｔｈｒ；（３）ｖａｌ、ｉｌｅ、ｌｅｕ、ｍｅｔ、ａｌａ、ｐｈｅ；（４）
ｌｙｓ、ａｒｇ、ｈｉｓ；ならびに（５）ｐｈｅ、ｔｙｒ、ｔｒｐ、ｈｉｓ。改
変体はまた、あるいは非保存的変化を含んでもよい。好ましい実施形態において
、改変体ポリペプチドは、５つ以下のアミノ酸の置換、欠失または付加によって
ネイティブな配列と異なる。改変体はまた（あるいは）、例えば、ポリペプチド
の免疫原性、二次構造および疎水性親水性指標の性質に対して最小の影響しか有
さないアミノ酸の欠失または付加によって改変され得る。改変体はまた（あるい
は）、ポリペプチドの抗原特性、二次構造および疎水性親水性指標性質に対して
最小の影響しか有さないアミノ酸の欠失または付加を含む、他の改変を含み得る
。例えば、ポリペプチドは、翻訳同時的に（ｃｏ−ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ
ｌｙ）または翻訳後的に（ｐｏｓｔ−ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌｌｙ）タンパ
クの移動を指向するタンパクのＮ末端における、シグナル配列（またはリーダー
配列）に対して結合体化し得る。このポリペプチドはまた、ポリペプチド（例え
ば、ポリ−Ｈｉｓ）の合成、精製または同定の容易さのために、または、固体支
持体へのポリペプチドの結合を強化するために、リンカーまたは他の配列に対し
て結合体化され得る。例えば、ポリペプチドは、免疫グロブリンのＦｃ領域に対
して結合体化され得る。
【０３８１】 ポリヌクレオチドの「改変体」とは、コードされたポリペプチドの免疫原性が
低下しないように、ネイティブなタンパク質に対して、１つ以上のヌクレオチド
の欠失、置換または付加を有して、列挙されたヌクレオチド配列と異なる配列で
ある。本明細書において記載されるように、コードされたポリペプチドの免疫原
性に対する効果は、一般に評価され得る。このような改変は、例えば、Ａｄｅｌ
ｍａｎら（ＤＮＡ、２：１８３、１９８３）によって教示されるように、オリゴ
ヌクレオチド指向性部位特異的変異誘発のような標準的な変異誘発技術を用いて
容易に誘導され得る。ヌクレオチド改変体は、以下に議論されたような、天然に
存在する対立遺伝子改変体であってもよいし、または天然に存在しない改変体で
あってもよい。本発明によって提供されるポリペプチドは、実質的に、本明細書
中において特に列挙されるポリヌクレオチド配列の１つ以上に対して相同である
ポリヌクレオチド配列によって、コードされる改変体を含む。本明細書において
用いる場合、「実質的な相同性」とは、適度にストリンジェントな条件下でハイ
ブリダイズし得るポリヌクレオチド配列をいう。適切な適度にストリンジェント
な条件は、以下を含む：５×ＳＳＣ、０．５％ＳＤＳ、１．０ｍＭ ＥＤＴＡ（
ｐＨ８．０）の溶液中でのプレ洗浄；一晩、５０〜６５℃、５×ＳＳＣでのハイ
ブリダイゼーション、または種間交差相同性の事象の場合には、０．５×ＳＳＣ
を用いる４５℃でのハイブリダイゼーション；その後の、０．１％ＳＤＳを含有
する２×ＳＳＣ、０．５×ＳＳＣおよび０．２×のＳＳＣのいずれかでの６５℃
で２０分間の２回の洗浄。このようなハイブリダイズするポリヌクレオチド配列
はまた、本発明のポリペプチドと同じポリペプチドをコードする（コドン縮重に
起因して）ヌクレオチド配列がそうであるように、本発明の範囲内である。
【０３８２】 ２つのヌクレオチド配列またはポリペプチド配列は、この２つの配列中のヌク
レオチド配列またはアミノ酸残基の配列が、下記のように最大一致について整列
されるときに、同じである場合、「同一である」といわれる。２つの配列間の比
較は、代表的に、比較ウインドウにわたって配列を比較することによって実行さ
れ、配列類似性の局所領域を同定および、比較する。本明細書において用いられ
る場合、「比較ウインドウ（ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｗｉｎｄｏｗ）」とは、少
なくとも約２０の隣接する位置のセグメント（通常約３０〜約７５、４０〜約５
０）のセグメントをいう。ここで、配列は、２つの配列が最適に整列されたあと
、連続する位置の同数の参照配列と比較され得る。
【０３８３】 比較のための配列の最適の整列は、デフォルトパラメータを用いて、バイオイ
ンフォマティクスのソフトウェアのＬａｓｅｒｇｅｎｅパッケージソフト（ｓｕ
ｉｔｅ）（ＤＮＡＳＴＡＲ，Ｉｎｃ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）における、Ｍｅ
ｇａｌｉｇｎプログラムを用いて行われ得る。このプログラムは、以下の参考文
献に記載されているいくつかの整列スキームを具体化する：Ｄａｙｈｏｆｆ，Ｍ
．Ｏ．（１９７８）Ａ ｍｏｄｅｌ ｏｆ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｃｈａ
ｎｇｅ ｉｎ ｐｒｏｔｅｉｎｓ−Ｍａｔｒｉｃｅｓ ｆｏｒ ｄｅｔｅｃｔｉ
ｎｇ ｄｉｓｔａｎｔ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ、Ｄａｙｈｏｆｆ，Ｍ．Ｏ
．編、Ａｔｌａｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ Ｓｔｒ
ｕｃｔｕｒｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓａｒｃｈ Ｆ
ｏｕｎｄａｔｉｏｎ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ ＤＣ 第５巻，補遺３，第３４５
〜３５８頁；Ｈｅｉｎ Ｊ．（１９９０）Ｕｎｉｆｉｅｄ Ａｐｐｒｏａｃｈ
ｔｏ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ａｎｄ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｓ 第６２６〜６４５
頁、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、第１８３巻，Ａｃａｄｅｍ
ｉｃ Ｐｒｅｓｓ， Ｉｎｃ．，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ；Ｈｉｇｇｉｎｓ，
Ｄ．Ｇ．およびＳｈａｒｐ，Ｐ．Ｍ．（１９８９）Ｆａｓｔ ａｎｄ ｓｅｎｓ
ｉｔｉｖｅ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓ ｏ
ｎ ａ ｍｉｃｒｏｃｏｍｐｕｔｅｒ ＣＡＢＩＯＳ ５：第１５１〜１５３頁
；Ｍｙｅｒｓ，Ｅ．Ｗ．およびＭｕｌｌｅｒ Ｗ．（１９８８）Ｏｐｔｉｍａｌ
ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓ ｉｎ ｌｉｎｅａｒ ｓｐａｃｅ ＣＡＢＩＯＳ ４
：１１〜１７；Ｒｏｂｉｎｓｏｎ，Ｅ．Ｄ．（１９７１）Ｃｏｍｂ．Ｔｈｅｏｒ
１１：１０５；Ｓａｎｔｏｕ，Ｎ．Ｎｅｓ，Ｍ．（１９８７）Ｔｈｅ ｎｅｉ
ｇｈｂｏｒ ｊｏｉｎｉｎｇ ｍｅｔｈｏｄ．Ａ ｎｅｗ ｍｅｔｈｏｄ ｆｏ
ｒ ｒｅｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｎｇ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅｓ
Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． Ｅｖｏｌ．４：４０６〜４２５；Ｓｎｅａｔｈ，Ｐ．Ｈ
．Ａ．およびＳｏｋａｌ，Ｒ．Ｒ．（１９７３）Ｎｕｍｅｒｉｃａｌ Ｔａｘｏ
ｎｏｍｙ−ｔｈｅ Ｐｒｉｎｃｉｐｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｎ
ｕｍｅｒｉｃａｌ Ｔａｘｏｎｏｍｙ，Ｆｒｅｅｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ
Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ；Ｗｉｌｂｕｒ，Ｗ．Ｊ．およびＬｉｐｍａｎ，Ｄ．
Ｊ．（１９８３）Ｒａｐｉｄ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ ｓｅａｒｃｈｅｓ ｏｆ
ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ａｎｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｄａｔａ ｂａｎｋｓ
Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．，Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８０：７２６〜７３０。
【０３８４】 あるいは、比較のために最適な配列の整列は、ＳｍｉｔｈおよびＷａｔｅｒｍ
ａｎ（１９８１）Ａｄｄ．ＡＰＬ．Ｍａｔｈ ２：４８２の局所的な同一性アル
ゴリズムによるか、ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（１９７０）Ｊ．Ｍ
ｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３の同一性整列アルゴリズムによるか、Ｐｅａｓｏ
ｎおよびＬｉｐｍａｎ（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（
Ｕ．Ｓ．Ａ．）８５：２４４４の類似的な方法についての検索によるか、これら
のアルゴリズムのコンピューター処理した実行（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｇｅｎｅ
ｔｉｃｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕ
ｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ（ＧＣＧ），５７５ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓ
ｏｎ，ＷＩにおけるＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＢＬＡＳＴ、ＦＡＳＴＡ、および
ＴＦＡＳＴＡ）によるか、または検査により、行われ得る。
【０３８５】 配列の同一性パーセントおよび配列の類似性パーセントを決定するために適切
であるアルゴリズムの１つの具体的な例としては、以下が挙げられる：ＢＬＡＳ
ＴおよびＢＬＡＳＴ ２．０アルゴリズム（これらは、各々、Ａｌｔｓｃｈｕｌ
ら（１９７７）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２およ
びＡｌｔｓｃｈｕｌら（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４
１０に記載されている）。ＢＬＡＳＴよびＢＬＡＳＴ ２．０を、例えば、本明
細書中に記載されるパラメーターとともに使用して、本発明のポリヌクレオチド
およびポリペプチドに対する配列の同一性パーセントを決定し得る。ＢＬＡＳＴ
分析を実施するためのソフトウエアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏ
ｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ｈｔｔｐ：／／ｗ
ｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を介して公式に利用可能である。１つの具
体的な例として、累積供給源を、ヌクレオチド配列に対して、パラメーターＭ（
マッチする残基の対に対する応報（ｒｅｗａｒｄ）スコア；常に＞０）およびパ
ラメーターＮ（ミスマッチする残基に対するペナルティスコア；常に＞０）を用
いて算出し得る。アミノ酸配列について、スコアリング（ｓｃｏｒｉｎｇ）マト
リクスを用いて、累積するスコアを算出し得る。各方向におけるワードヒット（
ｗｏｒｄ ｈｉｔｓ）の伸長を、以下の場合停止する：累積アライメントスコア
が、その最大に達した値由来の量Ｘまで低下するか；１つ以上のネガティブスコ
アリング残基整列の蓄積に起因して、累積スコアがゼロ以下となるか；または、
どちらかの配列の末端が達する場合。ＢＬＡＳＴアルゴリズムパラメーターＷ、
Ｔ、およびＸは、その感受性およびそのアライメントの速度を決定する。ＢＬＡ
ＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列に対する）は、デフォルトとして１１のワ
ード長（ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ）（Ｗ）、および１０の期待値（Ｅ）、そしてＢ
ＬＯＵＭ６２スコアリングマトリクス（ＨｅｎｉｋｏｆｆおよびＨｅｎｉｋｏｆ
ｆ（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：１０９
１５を参照のこと）整列、５０の（Ｂ）、１０の期待値（Ｅ）、Ｍ＝５、Ｎ＝−
４、および両鎖の比較を使用する。
【０３８６】 好ましくは、「配列同一性のパーセンテージ」は、少なくとも２０の位置の比
較のウインドウにわたる２つの最適に整列された配列を比較することにより決定
される。ここで、比較ウインドウのポリヌクレオチド配列またはアミノ酸配列の
部分は、２つの配列の最適整列について、参照配列（これは、付加または欠失を
含まない）と比較した場合、２０パーセント未満、通常５〜１５パーセントまた
は、１０〜１２パーセントの付加または欠失（すなわち、ギャップ）を含み得る
。このパーセンテージは、同一の核酸塩基またはアミノ酸残基が両方の配列で生
じる位置の数を決定してマッチした位置の数を得ること、マッチした位置の数を
、参照配列（すなわち、ウインドウサイズ）における位置の総数で割ること、そ
して、結果に１００を掛けて配列同一性のパーセンテージを得ることにより算出
される。
【０３８７】 従って、本発明は、本明細書に開示された配列に実質的な同一性を有するポリ
ヌクレオチド配列およびポリペプチド配列を提供し、例えば、これらの配列は、
少なくとも５０％以上、好ましくは少なくとも５５％、６０％、６５％、７０％
、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または
９９％以上の配列同一性を含み、この配列同一性は、本明細書において記載され
る方法を用いて、本発明のポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列と比較
されたものである（例えば、以下に記載されるような標準的なパラメーターを用
いるＢＬＡＳＴ分析）。当業者は、これらの値を、コドン縮重、アミノ酸の類似
性、リーディングフレームの位置決めなどを考慮して、２つのポリヌクレオチド
配列によりコードされるタンパク質の対応する同一性を決定するために適切に調
整し得ることを理解する。
【０３８８】 さらなる実施形態において、本発明は、本明細書に開示された配列の１つ以上
に対して同一であるかまたは相補的である配列の種々の長さの隣接するストレッ
チを含む単離したポリヌクレオチドまたはポリペプチドを提供する。例えば、本
発明に包含されるポリヌクレオチドおよびポリペプチドは、この開示された配列
の１つ以上の、少なくとも１５、２０、３０、４０、５０、７５、１００、１５
０、２００、３００、４００，５００、または１０００以上の隣接するヌクレオ
チドならびにその間の中間長全てを含み得る。本文中における、「中間長」とは
、引用された値（例えば、１６、１７、１８、１９、など；２１、２２、２３な
ど；３０、３１、３２など；５０、５１、５２、５３など；１００、１０１、１
０２、１０３、など；１５０、１５１、１５２、１５３、など；２００〜５００
にわたる全ての整数を含む；５００〜１，０００など）の間の任意の長さを意味
することが容易に理解される。
【０３８９】 本発明のポリヌクレオチドまたはそのフラグメント（それ自体のコード配列の
長さに関係なく）は、他のＤＮＡ配列（例えば、プロモーター、ポリアデニル化
シグナル、さらなる制限酵素部位、複数のクローニング部位、他のコードセグメ
ント、など）と組合せられ得、その結果、これらの全長は、かなり変化し得る。
従って、任意の長さのほとんどの核酸フラグメントが、容易な調製によって好ま
しく制限される全長使用とともに用いられ得、そして目的の組換えＤＮＡプロト
コールにおいて使用され得ることが考慮される。例えば、約１０，０００塩基対
長、約５０００塩基対長、約３０００塩基対長、約２，０００塩基対長、約１，
０００塩基対長、約５００塩基対長、約２００塩基対長、約１００塩基対長、約
５０塩基対長など（全ての中間長を含む）の総長を有する具体的なＤＮＡセグメ
ントは、本発明の多くの実施において有用であるべきであることが考慮される。
【０３９０】 本明細書において列挙されるヌクレオチド配列をコードする遺伝子のアレイは
また、本発明の範囲に含まれる。本明細書において用いる場合、「対立遺伝子」
または「対立遺伝子配列」は、核酸配列中の少なくとも１つの変異から生じ得る
遺伝子の別の形態である。対立遺伝子は、変化したｍＲＮＡまたはポリペプチド
を生じ得、その構造または機能が変更されていてもされていなくてもよい。任意
の所定の遺伝子は、対立遺伝子形態を有さないか、１つ有するか、または多数有
し得る。対立遺伝子を生じる共通の変異性変化は、一般にヌクレオチドの天然の
欠失、付加または置換だとされる。これらの型の変化のそれぞれは、所定の配列
中で１回以上、単独かまたは他と組み合わせて生じ得る。特定の実施形態におい
て、本発明は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原（またはこのような抗原の改変体）の少
なくとも免疫原性部分を含むポリペプチドを開示する。このポリペプチドは、以
下：（ａ）配列番号１〜４、１５、２１〜２５、４４〜６４、６６〜７６および
７９〜８８からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列、（ｂ）このような
ＤＮＡ配列の相補体、または（ｃ）（ａ）もしくは（ｂ）の配列に実質的に相同
であるＤＮＡ配列、によりコードされるアミノ酸配列の１つ以上を含む。以下の
実施例において記載するように、本明細書において開示されるいくつかのＣｈｌ
ａｍｙｄｉａ抗原は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣｈ
ｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの両方に感染した単核球由来樹状細胞を
認識するＴ細胞株を認識する。このことは、それらの抗原がＣｈｌａｍｙｄｉａ
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅに
より共有される免疫反応性エピトープを意味し得ることを示す。従ってこの抗原
は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ生殖管感染およびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ感染
の両方のためにワクチンにおいて働き得る。交差反応性の程度を決定するための
、Ｃｈｌａｍｉｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐ
ｎｅｕｍｏｎｉａ由来の、これらのＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原のさらなる特徴付け
が、実施例６に提供される。さらに、実施例４は、Ｃｈｌａｍｉｄｉａ特異的マ
ウスＣＤ８＋Ｔ細胞株を刺激し得るタンパク質（配列番号１７〜１９および３２
）をコードするＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓから単離されたｃＤＮＡフラグメン
ト（配列番号１５、１６および３３）を記載する。
【０３９１】 一般に、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原、およびこのような抗原をコードするポリヌ
クレオチド配列は、任意の種々の手順を用いて調製され得る。例えば、Ｃｈｌａ
ｍｙｄｉａ抗原をコードするポリヌクレオチド分子は、下記のようにＣｈｌａｍ
ｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株を用いるスクリーニングにより、Ｃｈｌａｍｙｄｉａゲ
ノムライブラリーまたはＣｈｌａｍｙｄｉａのｃＤＮＡ発現ライブラリーから単
離され得、そして当業者に周知の技術を用いて配列決定され得る。さらに、ポリ
ヌクレオチドは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ関連発現のためのｃＤＮＡのマイクロアレ
イ（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ）をスクリーニングすること（すなわち、本明細書に
おいて提供される代表的なアッセイを用いて決定した場合、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ
感染細胞においてコントロールより少なくとも２倍大きい発現）によって、以下
により詳細に記載したように、同定され得る。このようなスクリーニングは、製
造業者の指示書に従ってＳｙｎｔｅｎｉマイクロアレイ（Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ、
ＣＡ）を用いて、（そして、本質的にＳｃｈｅｎａら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａ
ｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：１０６１４〜１０６１９、１９９６およびＨｅ
ｌｌｅｒら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９４：２１５０
〜２１５５，１９９７によって記載されるように）実施され得る。あるいは、ポ
リペプチドは、本明細書において記載されるタンパク質を発現する細胞から調製
されたｃＤＮＡから増幅され得る。このようなポリヌクレオチドは、ポリメラー
ゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を介して増幅され得る。このアプローチのために、配列特
異的プライマーは、本明細書において提供される配列に基づいて設計され得、そ
して購入され得るかまたは合成され得る。
【０３９２】 下記のように、抗原は、発現ベクターに抗原をコードするポリヌクレオチド配
列を挿入すること、および適切な宿主において抗原を発現することよって組換え
的に産生され得る。抗原は、所望の性状（例えば、本明細書において記載のよう
に、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染した個体から得られる血清と反応する能力）につい
て評価され得、そして例えば、従来のエドマン化学を使用して配列決定され得る
。ＥｄｍａｎおよびＢｅｒｇ、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．８０：１１６〜１
３２、１９６７を参照のこと。
【０３９３】 抗原をコードするポリヌクレオチド配列はまた、単離された抗原の部分アミノ
酸配列に由来する縮重オリゴヌクレオチドにハイブリダイズするポリヌクレオチ
ド配列について、適切なＣｈｌａｍｙｄｉａのｃＤＮＡライブラリーまたはゲノ
ムＤＮＡライブラリーをスクリーニングすることによって得られ得る。このよう
なスクリーニングにおける使用のための縮重オリゴヌクレオチド配列は、設計さ
れ、合成され得、そして、このスクリーニングは、（例えば）Ｓａｍｂｒｏｏｋ
ら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎ
ｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，
Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ（およびそこに引用される参考文
献）に記載されるように、実行され得る。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）もま
た、使用され得る。ここでは、当該分野で周知の方法において上記のオリゴヌク
レオチドを用いて、ｃＤＮＡライブラリーまたはゲノムライブラリーから核酸プ
ローブを単離し得る。次いで、単離したプローブを用いてライブラリースクリー
ニングを実施し得る。
【０３９４】 増幅した部分は、周知の技術を用いて、適切なライブラリー（例えば、Ｃｈｌ
ａｍｙｄｉａ ｃＤＮＡライブラリー）から全長遺伝子を単離するために用いら
れ得る。このような技術の範囲内で、ライブラリー（ｃＤＮＡライブラリー、ま
たは、ゲノムライブラリー）を、増幅に適切な１つ以上のポリヌクレオチドプロ
ーブまたはプライマーを用いてスクリーニングする。好ましくは、ライブラリー
をより大きい分子を含むためようにサイズ選択する。ランダムプライムしたライ
ブラリーはまた、遺伝子の５’領域および上流領域を同定するために好適であり
得る。ゲノムライブラリーは、イントロンを得て、５’配列を延長するために好
ましい。
【０３９５】 ハイブリダイゼーション技術のため、部分配列は、周知の技術を用いて（例え
ば、ニックトランスレーションまたは32Ｐを用いる末端標識によって）、標識さ
れ得る。次いで、変性した細菌コロニー（またはファージプラークを含むクロー
ン）を含有するフィルターと標識したプローブとをハイブリダイゼーションする
ことにより、細菌ライブラリーまたはバクテリオファージライブラリーをスクリ
ーニングする（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉ
ｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈ
ａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏ
ｒ，ＮＹ，１９８９を参照のこと）。ハイブリダイゼーションコロニーまたはプ
ラークを選択し増殖して、そしてＤＮＡをさらなる分析のために単離する。ｃＤ
ＮＡクローンは、例えば、部分的配列由来のプライマーおよびベクター由来のプ
ライマーを用いるＰＣＲによって、さらなる配列の量を決定するために分析され
得る。１つ以上の重複クローンを同定するために、制限地図および部分配列が生
成され得る。次いで、一連の欠失クローンを生成する工程を包含し得る、標準的
な技術を用いて完全配列が決定され得る。次いで、得られた重複配列は、単一の
連続する配列にアセンブリされる。全長ｃＤＮＡ分子は、周知の技術を用いて、
適切なフラグメントを連結することによって生成され得る。
【０３９６】 あるいは、部分的なｃＤＮＡ配列から全長コード配列を得るための多数の増幅
技術が存在する。このような技術の範囲内で、増幅は、一般にＰＣＲを経て実行
される。任意の様々な市販のキットが、増幅工程を実行するために用いられ得る
。プライマーは、当該分野で周知の技術を用いて設計され得（例えば、Ｍｕｌｌ
ｉｓら、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｓｙｍｐ．Ｑｕａｎｔ．Ｂｉ
ｏｌ．５１：２６３，１９８７；Ｅｒｌｉｃｈ編、ＰＣＲ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇ
ｙ、Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，１９８９）、そして当該分野で周知
のソフトウェアもまた使用され得る。プライマーは好ましくは２２〜３０のヌク
レオチド長であり、少なくとも５０％のＧＣ含量を有し、そして約６８℃〜７２
℃の温度で標的配列にアニーリングする。この増幅された領域は、上記のように
配列決定され得、そして重複配列は連続する配列にアセンブリされ得る。
【０３９７】 このような増幅技術の１つは、逆ＰＣＲである（Ｔｒｉｇｌｉａら、Ｎｕｃｌ
．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１６：８１８６，１９８８を参照のこと）。これは、遺
伝子の既知領域のフラグメントを生成する制限酵素を用いる。次いで、このフラ
グメントは、分子内連結により環状化され、そして既知領域に由来する相違する
プライマーとともにＰＣＲのための鋳型として用いられる。代替のアプローチに
おいて、部分配列に隣接した配列は、リンカー配列に対するプライマーおよび既
知領域に特異的なプライマーを用いる増幅によって回復され得る。増幅された配
列は、代表的に、同じリンカープライマーおよび既知領域に特異的な第２のプラ
イマーを用いる２回目の増幅に供される。この手順上の変更（これは既知配列か
ら反対方向の伸長を始める２つのプライマーを使用する）は、ＷＯ９６／３８５
９１に記載されている。さらなる技術としては、捕捉ＰＣＲ（Ｌａｇｅｒｓｔｒ
ｏｍら、ＰＣＲ Ｍｅｔｈｏｄｓ Ａｐｐｌｉｃ．１：１１１−１９、１９９１
）およびウォーキングＰＣＲ（Ｐａｒｋｅｒら、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ
．１９：３０５５−６０，１９９１）が挙げられる。転写媒介増幅（Ｔｒａｎｓ
ｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ−Ｍｅｄｉａｔｅｄ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）すな
わちＴＭＡは、特許番号ＰＣＴ／ＵＳ９１／０３１８４にて記載したように、Ｄ
ＮＡ、ｒＲＮＡまたはｍＲＮＡの増幅のために利用され得る別の方法である。こ
の自己触媒的かつ等温の、ＰＣＲに基づかない方法は、２つのプライマーおよび
以下の２つの酵素を利用する：ＲＮＡポリメラーゼおよび逆転写酵素。１つのプ
ライマーは、ＲＮＡポリメラーゼのためのプロモーター配列を含む。第１の増幅
において、プロモーター−プライマーは、規定の部位で標的ｒＲＮＡにハイブリ
ダイズする。逆転写酵素は、プロモーター−プライマーの３’末端からの伸長に
よって標的ｒＲＮＡのＤＮＡコピーをつくる。得られる複合体中のＲＮＡは、分
解され、そして、第２のプライマーはＤＮＡコピーに結合する。ＤＮＡの新しい
鎖は、二本鎖ＤＮＡをつくっている逆転写酵素によってプライマーの末端から合
成される。ＲＮＡポリメラーゼは、ＤＮＡ鋳型におけるプロモーター配列を認識
して、転写を始める。新しく合成されたＲＮＡアンプリコンの各々は、ＴＭＡプ
ロセスに再び入って、ＲＮＡアンプリコンの指数関数的な増大を導く複製の新し
い回のための鋳型として役立つ。増幅を用いる他の方法はまた、全長ｃＤＮＡ配
列を得るために使用され得る。
【０３９８】 特定の例において、発現された配列タグ（ＥＳＴ）のデータベース中に提供さ
れる配列（例えば、ＧｅｎＢａｎｋから入手可能な配列）の分析により全長ｃＤ
ＮＡ配列を得ることが可能である。重複するＥＳＴの検索は、一般に周知のプロ
グラム（例えば、ＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴ ｓｅａｒｃｈｅｓ）を用いて実行され
得、そして、このようなＥＳＴは連続する全長配列を生成するために用いられ得
る。全長ｃＤＮＡ配列はまた、ゲノムフラグメントの分析によって得られ得る。
【０３９９】 ポリヌクレオチド改変体は、一般に、例えば、固相ホスホルアミダイト化学合
成による化学合成を含む、当該分野において公知の任意の方法により調製され得
る。ポリヌクレオチド配列における修飾はまた、標準的な変異誘発技術（例えば
、オリゴヌクレオチド−定方向部位特異的変異誘発（Ａｄｅｌｍａｎら、ＤＮＡ
２：１８３，１９８３を参照のこと））を用いて導入され得る。あるいは、Ｒ
ＮＡ分子は、クラミジアタンパク質をコードするＤＮＡ配列、またはその一部の
インビトロまたはインビボでの転写により生成され得る。但し、このＤＮＡは、
適切なポリメラーゼＲＮＡプロモーター（例えば、Ｔ７またはＳＰ６）を用いて
ベクター中に取り込まれる。特定の部分を用いて、本明細書中に記載されるよう
に、コードされるポリペプチドを調製し得る。さらに、または代替として、一部
を患者に投与して、その結果コードされるポリペプチドを、（例えば、抗原提示
細胞（例えば、樹状細胞）を、クラミジアポリペプチドをコードするｃＤＮＡ構
築物を用いてトランスフェクトし、そしてトランスフェクトした細胞を患者に投
与することにより）インビボで生成させ得る。
【０４００】 コード配列に相補的な配列（すなわち、アンチセンスポリヌクレオチド）の一
部はまた、プローブとしてか、または遺伝子発現を調節するために用いられ得る
。アンチセンスＲＮＡへと転写され得るｃＤＮＡ構築物をまた、組織の細胞中に
導入させて、アンチセンスＲＮＡの産生を容易にし得る。アンチセンスポリヌク
レオチドを、本明細書中に記載されるように用いて、クラミジアタンパク質の発
現を阻害し得る。アンチセンス技術を用いて、三重鎖形成を介して遺伝子発現を
制御し得る。この技術は、ポリメラーゼ、転写因子、または調節分子の結合のた
めに十分に開く二重螺旋の能力を損なう（Ｇｅｅら、Ｉｎ Ｈｕｂｅｒ ａｎｄ
Ｃａｒｒ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃ Ａｐｐｒ
ｏａｃｈｅｓ，Ｆｕｔｕｒａ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．（Ｍｔ．Ｋｉｓｃ
ｏ，ＮＹ；１９９４）を参照のこと）。あるいは、アンチセンス分子は、遺伝子
の制御領域（例えば、プロモーター、エンハンサー、または転写開始部位）とハ
イブリダイズし、そして遺伝子の転写をブロックするように設計され得るか；ま
たはリボソームに対する転写物の結合を阻害することにより、翻訳をブロックす
るように設計され得る。
【０４０１】 コード配列の一部、または相補的な配列の一部はまた、遺伝子発現を検出する
ためのプローブまたはプライマーとして設計され得る。プローブは、種々のレポ
ーター群（例えば、放射性ヌクレオチドおよび酵素）を用いて標識され得、そし
て好ましくは、少なくとも１０ヌクレオチドの長さであり、より好ましくは、少
なくとも２０ヌクレオチドの長さであり、そしてなおより好ましくは、少なくと
も３０ヌクレオチドの長さである。上記のようなプライマーは、好ましくは２２
〜３０ヌクレオチドの長さである。
【０４０２】 任意のポリヌクレオチドを、さらに修飾して、インビボでの安定性を増加させ
得る。可能な修飾としては、以下を含むが、それらに限定されない：５’末端お
よび／または３’末端での隣接配列の付加；骨格におけるリン酸ジエステル結合
ではなくホスホロチオエートまたは２’Ｏ−メチルの使用；および／または非伝
統的塩基（例えば、イノシン、キューオシンおよびワイブトシン、ならびにアデ
ニン、シトシン、グアニン、チミン、およびウリジンのアセチル−、メチル−、
チオ−、ならびに他の修飾形態）の含有。
【０４０３】 本明細書中に記載されるようなヌクレオチド配列は、確立された組換えＤＮＡ
技術を用いて、種々の他のヌクレオチド配列に連結され得る。例えば、ポリヌク
レオチドは、種々のクローニングベクター（プラスミド、ファージミド、λファ
ージ誘導体、およびコスミドを含む）のいずれかにクローニングされ得る。特に
目的のベクターとしては、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター
、および配列決定ベクターが挙げられる。一般に、ベクターは、少なくとも１つ
の生物において機能的な複製起点、都合の良い制限エンドヌクレアーゼ部位、お
よび一つ以上の選択マーカーを含む。他のエレメントは、所望の使用に依存し、
そして当業者に明らかである。
【０４０４】 約１００未満のアミノ酸、および一般に約５０未満のアミノ酸を有する合成ポ
リペプチドは、当該分野で周知の技術を用いて生成され得る。例えば、このよう
なポリペプチドは、市販の固相技術（例えば、Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ固相合成法
）のいずれかを用いて合成され得る。ここでアミノ酸は、伸長しているアミノ酸
鎖に連続的に添加される。Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ
．８５：２１４９−２１４６，１９６３を参照のこと。ポリペプチドの自動合成
のための装置は、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ／Ａｐｐｌｉｅｄ ＢｉｏＳｙｓｔ
ｅｍｓ Ｄｉｖｉｓｉｏｎ，Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡのような供給業者か
ら市販されており、そして製造業者の指示に従って操作され得る。
【０４０５】 上記のように、クラミジア抗原の免疫原性部分は、周知の技術（例えば、Ｐａ
ｕｌ、Ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、第３版、Ｒａｖｅｎ
Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２４３−２４７頁およびそこに引用される参考文献に要
約される技術）を用いて調製され、そして同定され得る。このような技術は、免
疫原性特性に関してネイティブな抗原のポリペプチド部分をスクリーニングする
ことを含む。本明細書中に記載される代表的なＥＬＩＳＡは、一般に、これらの
スクリーニングに用いられる。ポリペプチドの免疫原性部分は、このような例示
的アッセイにおいて、全長抗原により生成されるシグナルに実質的に類似する、
このようなアッセイにおけるシグナルを生成する部分である。換言すれば、クラ
ミジア抗原の免疫原性部分は、本明細書中に記載されるように、モデルＥＬＩＳ
Ａにおいて全長抗原により誘導されるシグナルの、少なくとも約２０％、そして
好ましくは約１００％を生成する。
【０４０６】 クラミジア抗原の一部および他の改変体は、合成手段または組換え手段により
生成され得る。ネイティブ抗原の改変体は、一般に、標準的な変異誘発技術（例
えば、オリゴヌクレオチド−定方向部位特異的変異誘発）を用いて調製され得る
。ポリペプチド配列の部分はまた、標準的な技術を用いて取り出され得、短縮型
ポリペプチドの調製を可能にする。
【０４０７】 ネイティブの抗原の一部および／または改変体を含む組換えポリペプチドは、
当業者に周知の種々の技術を用いてポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
配列から容易に調製され得る。例えば、培養培地中に組換えタンパク質を分泌す
る適切な宿主／ベクター系由来の上清は、市販のフィルターを用いて初めに濃縮
され得る。濃縮の後、濃縮物は、適切な精製マトリクス（例えば、アフィニティ
ーマトリクスまたはイオン交換樹脂）に適用され得る。最終的に、１つ以上の逆
相ＨＰＬＣ工程を用いて、組換えタンパク質をさらに精製し得る。
【０４０８】 当業者に公知の種々の発現ベクターのいずれかを用いて、本明細書中に記載さ
れるような組換えポリペプチドを発現し得る。発現は、組換えポリペプチドをコ
ードするポリヌクレオチド分子を含む発現ベクターを用いて形質転換またはトラ
ンスフェクトされた任意の適切な宿主細胞において達成される。適切な宿主細胞
としては、原核生物細胞、酵母および高等真核生物細胞が挙げられる。好ましく
は、用いられる宿主細胞は、Ｅ．ｃｏｌｉ、酵母、または哺乳動物細胞株（例え
ば、ＣＯＳまたはＣＨＯ）である。この様式で発現されるＤＮＡ配列は、天然に
存在する抗原、天然に存在する抗原の一部、またはそれらの他の改変体をコード
し得る。
【０４０９】 一般に、調製の方法にかかわらず、本明細書中に開示されるポリペプチドは、
単離され、実質的に純粋な形態で調製される。好ましくは、ポリペプチドは、少
なくとも約８０％純粋、より好ましくは、少なくとも約９０％純粋、そして最も
好ましくは少なくとも約９９％純粋である。
【０４１０】 特定の実施形態では、ポリペプチドは、本明細書中に記載されるような複数の
ポリペプチドを含む融合タンパク質か、または本明細書中に記載されるような少
なくとも１つのポリペプチドおよび公知のクラミジアタンパク質のような無関係
の配列を含む融合タンパク質であり得る。融合パートナーは、例えば、Ｔヘルパ
ーエピトープ（免疫学的融合パートナー）、好ましくは、ヒトにより認識される
Ｔヘルパーエピトープの提供を補助し得るか、ネイティブな組換えタンパク質よ
りも高い収量でのタンパク質（発現エンハンサー）の発現を補助し得る。特定の
好ましい融合パートナーは、免疫学的融合パートナーおよび発現増強融合パート
ナーの両方である。他の融合パートナーは、タンパク質の溶解性を増加させるか
、またはタンパク質を所望の細胞内区画に標的化し得るように選択される。なお
さらなる融合パートナーとしては、アフィニティータグが挙げられる。アフィニ
ティータグは、タンパク質の精製を容易にする。本発明の融合パートナーをコー
ドするＤＮＡ配列は、例えば、第１および第２のポリペプチドをコードする別個
のＤＮＡ配列を適切な発現ベクター中に構築するための公知の組換えＤＮＡ技術
を用いて構築され得る。第１のポリペプチドをコードするＤＮＡ配列の３’末端
は、ペプチドリンカーを用いて、または用いずに、第２のポリペプチドをコード
するＤＮＡ配列の５’末端に連結され、その結果、配列のリーディングフレーム
は、第１および第２のポリペプチドの両方の生物学的活性を保持する単一の融合
タンパク質への２つのＤＮＡ配列のｍＲＮＡ翻訳を可能にする同じ相にある。
【０４１１】 ペプチドリンカー配列を用いて、各々のポリペプチドが、その二次構造および
三次構造に折りたたまれることを保証するのに十分な距離で、第１および第２の
ポリペプチドを引き離し得る。このようなペプチドリンカー配列は、当該分野で
周知の標準的な技術を用いて融合タンパク質へと取りこまれる。適切なペプチド
リンカー配列は、以下の要素に基づいて選択され得る：（１）可撓性の伸張した
立体配座に適合するそれらの能力；（２）第１および第２のポリペプチド上の機
能的エピトープと相互作用し得る二次構造に適合するそれらの無能力；および（
３）ポリペプチドの機能的エピトープと反応し得る疎水性残基または荷電残基の
欠如。好ましいペプチドリンカー配列は、Ｇｌｙ残基、Ａｓｎ残基およびＳｅｒ
残基を含む。他の中性に近いアミノ酸（例えば、ＴｈｒおよびＡｌａ）はまた、
リンカー配列に用いられ得る。リンカーとして有用に用いられ得るアミノ酸配列
としては、Ｍａｒａｔｅａら，Ｇｅｎｅ ４０：３９−４６，１９８５；Ｍｕｒ
ｐｈｙら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８３：８２５８−
８５６２，１９８６；米国特許第４，９３５，２３３号、および同第４，７５１
，１８０号に開示される配列が挙げられる。リンカー配列は、１〜約５０のアミ
ノ酸の長さであり得る。ペプチドリンカー配列の使用の代替として（所望される
場合に）、第１および第２のポリペプチドにおける非必須Ｎ末端アミノ酸領域を
（存在する場合に）利用して、機能的ドメインを引き離しかつ立体障害を防ぎ得
る。
【０４１２】 連結したＤＮＡ配列は、適切な転写調節因子または翻訳調節因子に作動可能に
連結される。ＤＮＡの発現の原因である調節因子は、第１のポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ配列の５’側にのみ配置される。同様に、翻訳を終結するために必
要とされる停止コドン、および転写終結シグナルは、第２のポリペプチドをコー
ドするＤＮＡ配列の３’側にのみ存在する。
【０４１３】 融合タンパク質はまた、無関係の免疫原性タンパク質と共に本発明のポリペプ
チドを含むように提供される。好ましくは、免疫原性タンパク質は、リコール（
ｒｅｃａｌｌ）応答を誘発し得る。このようなタンパク質の例としては、テタヌ
スタンパク質、結核タンパク質、および肝炎タンパク質が挙げられる（例えば、
Ｓｔｏｕｔｅら、Ｎｅｗ Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３３６：８６９１，１９９
７を参照のこと）。
【０４１４】 好ましい実施形態において、免疫学的融合パートナーは、プロテインＤ（グラ
ム陰性細菌ＨａｅｍｏｐｈｉｌｕｓインフルエンザＢ（ＷＯ ９１／１８９２６
）の表面タンパク質）に由来する。好ましくは、プロテインＤ誘導体は、タンパ
ク質（例えば、はじめのＮ末端１００〜１１０アミノ酸）の約１／３を含み、そ
してプロテインＤ誘導体は脂質化され得る。特定の好ましい実施形態において、
リポプロテインＤ融合パートナーのはじめの１０９残基は、Ｎ末端上に含まれて
、さらなる外因性Ｔ細胞エピトープを有するポリペプチドを提供し、かつＥ．ｃ
ｏｌｉにおける発現レベルを増加する（従って、発現エンハンサーとして機能す
る）。脂質テイルは、抗原提示細胞に対する抗原の最適な提示を保証する。他の
融合パートナーとしては、インフルエンザウイルス、ＮＳ１（赤血球凝集素）由
来の非構造タンパク質が挙げられる。代表的には、Ｎ末端の８１アミノ酸を用い
るが、Ｔヘルパーエピトープを含む異なるフラグメントが、用いられ得る。
【０４１５】 別の実施形態では、免疫学的融合パートナーは、ＬＹＴＡとして知られている
タンパク質であるか、その一部（好ましくは、Ｃ末端部分）である。ＬＹＴＡは
、Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅに由来する。Ｓｔｒｅｐ
ｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅは、アミダーゼＬＹＴＡとして知られ
ている、Ｎ−アセチル−Ｌ−アラニンアミダーゼ（ＬｙｔＡ遺伝子によりコード
される；Ｇｅｎｅ ４３：２６５−２９２，１９８６）を合成する。ＬＹＴＡは
、ペプチドグリカン骨格における特定の結合を特異的に分解する自己溶解素であ
る。ＬＹＴＡタンパク質のＣ末端ドメインは、コリンまたはＤＥＡＥのようない
くつかのコリンアナログに対する親和性の原因である。この特性は、融合タンパ
ク質の発現に有用であるプラスミドを発現するＥ．ｃｏｌｉ Ｃ−ＬＹＴＡの開
発のために開発された。アミノ末端にＣ−ＬＹＴＡフラグメントを含むハイブリ
ッドタンパク質の精製は、記載されている（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０
：７９５−７９８，１９９２を参照のこと）。好ましい実施形態において、ＬＹ
ＴＡの反復部分は、融合タンパク質に取りこまれ得る。反復部分は、残基１７８
で開始するＣ末端領域において見出される。特に好ましい反復部分は、残基１８
８〜３０５に取り込まれる。
【０４１６】 別の実施形態において、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓ
ｉｓ誘導Ｒａ１２ポリヌクレオチドは、本発明のポリヌクレオチドの少なくとも
１つの免疫原性部分に連結される。Ｒａ１２組成物および異種ポリヌクレオチド
配列の発現の増大におけるその使用方法は、米国特許出願６０／１５８，５８５
において記載され、この開示はその全体において本明細書中で参考として援用さ
れる。手短に言うと、Ｒａ１２とは、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒ
ｃｕｌｏｓｉｓ ＭＴＢ３２Ａ核酸の部分配列であるポリヌクレオチド領域をい
う。ＭＴＢ３２Ａは、Ｍ．ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓの病原性および非病原性の
菌株中の遺伝子によってコードされる、３２ＫＤの分子量のセリンプロテアーゼ
である。ＭＴＢ３２Ａのヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、記載されてい
る（米国特許出願６０／１５８，８５８；Ｓｋｅｉｋｙら、Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ
ａｎｄ Ｉｍｍｕｎ．（１９９９）６７：３９９８−４００７（本明細書中で
参考として援用される）もまた参照のこと）。１つの実施形態において、融合ポ
リペプチドの生成において使用されるＲａ１２ポリペプチドは、これが融合され
る異種クラミジア抗原性ポリペプチドの発現および／または免疫原性を増大する
ために有効なＭＴＢ３２Ａコード配列のＣ末端フラグメントを含む。別の実施形
態において、Ｒａ１２ポリペプチドは、ＭＴＢ３２Ａのアミノ酸残基１９２〜３
２３のうちのある程度または全てを含む、約１４ｋＤのＭＴＢ３２ＡのＣ末端ン
フラグメントに対応する。
【０４１７】 Ｒａ１２ポリペプチドおよび目的の異種クラミジアポリペプチドを含む融合ポ
リペプチドをコードする組換え核酸は、通常の遺伝子操作技術によって容易に構
築され得る。組換え核酸は、好ましくは、Ｒａ１２ポリヌクレオチド配列が、選
択された異種クラミジアポリヌクレオチド配列に対して５’に位置するように構
築される。Ｒａ１２ポリヌクレオチド配列が、選択された異種ポリヌクレオチド
配列に対して３’に位置するか、または異種ポリヌクレオチド配列が、Ｒａ１２
ポリヌクレオチド配列内の部位に挿入されることもまた、適切であり得る。
【０４１８】 さらに、Ｒａ１２あるいはその部分または他の改変体をコードする任意の適切
なポリヌクレオチドは、Ｒａ１２および本明細書中で開示される１つ以上のクラ
ミジアポリヌクレオチドを含む組換え融合ポリヌクレオチドの構築において、使
用され得る。好ましいＲａ１２ポリヌクレオチドは、一般に、Ｒａ１２ポリペプ
チドの一部をコードする、少なくとも約１５個連続したヌクレオチド、少なくと
も約３０個のヌクレオチド、少なくとも約６０個のヌクレオチド、少なくとも約
１００個のヌクレオチド、少なくとも約２００個のヌクレオチド、または少なく
とも約３００個のヌクレオチドを含む。
【０４１９】 Ｒａ１２ポリヌクレオチドは、ネイティブな配列（すなわち、Ｒａ１２ポリペ
プチドまたはその一部をコードする内因性配列）を含み得るか、またはこのよう
な配列の改変体を含み得る。Ｒａ１２ポリヌクレオチドの改変体は、コードされ
た融合ポリペプチドの生物学的活性が、ネイティブなＲａ１２ポリペプチドを含
む融合ポリペプチドと比較して実質的に減少しないように、１つ以上の置換、付
加、欠失、および／または挿入を含み得る。改変体は、ネイティブなＲａ１２ポ
リペプチドまたはその一部をコードするポリヌクレオチド配列に対して、好まし
くは少なくとも約７０％の同一性、より好ましくは少なくとも約８０％の同一性
、そして最も好ましくは少なくとも約９０％の同一性を示す。
【０４２０】 別の局面では、本発明は、１つ以上の上記のポリペプチドまたは融合タンパク
質（またはこのようなポリペプチドまたは融合タンパク質をコードするポリヌク
レオチド）を用いるための方法を提供して、患者におけるクラミジア感染に対す
る防御免疫を誘導する。本明細書中で用いられる場合「患者」とは、任意の温血
動物、好ましくはヒトのことをいう。患者は、疾患に罹患していてもよいし、検
出可能な疾患および／または感染がなくてもよい。換言すれば、防御免疫は、ク
ラミジア感染を予防または処置するために誘導され得る。
【０４２１】 この局面において、ポリペプチド、融合タンパク質、またはポリヌクレオチド
分子は、一般に、薬学的組成物またはワクチン中に存在する。薬学的組成物は、
１つ以上のポリペプチド（これらの各々は、１つ以上の上記配列（またはその改
変体）を含み得る）、および生理学的に受容可能なキャリアを含み得る。ワクチ
ンは、１つ以上の上記ポリペプチドおよび免疫賦形剤（例えば、アジュバントま
たはリポソーム）（この中にポリペプチドが取り込まれる）を含み得る。このよ
うな薬学的組成物およびワクチンはまた、クラミジア抗原（組み合わせたポリペ
プチド中に組み込まれるか、または別々のポリペプチド内に存在する）を、含み
得る。
【０４２２】 あるいは、ワクチンは上記のような１つ以上のポリペプチドまたは融合タンパ
ク質をコードするポリヌクレオチドを含み得、その結果、ポリペプチドは、イン
サイチュで生成される。このようなワクチンにおいて、ポリヌクレオチドは、当
業者に公知の種々の送達系のいずれかの中に存在し得る。この送達系としては、
核酸発現系、細菌発現系、およびウイルス発現系が挙げられる。適切な核酸発現
系は、患者における発現のために必要なポリヌクレオチド配列（例えば、適切な
プロモーターおよび停止シグナル）を含む。細菌送達系は、その細胞表面上のポ
リペプチドの免疫原性部分を発現する細菌（例えば、Ｂａｃｉｌｌｕｓ−Ｃａｌ
ｍｅｔｔｅ−Ｇｕｅｒｒｉｎ）の投与を含む。好ましい実施形態では，ポリヌク
レオチドは、ウイルス発現系（例えば、ワクシニアまたは他のポックスウイルス
、レトロウイルス、あるいはアデノウイルス）を用いて導入され得る。これらの
ウイルス発現系は、非病原性（欠損）ウイルスを用いて導入され得る。このよう
な発現系にポリヌクレオチドを組み込むための技術は、当業者に周知である。ポ
リヌクレオチドはまた、例えば、Ｕｌｍｅｒら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５９：１７
４５−１７４９，１９９３およびＣｏｈｅｎによる総説、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５
９：１６９１−１６９２，１９９３に記載されるような「裸の」プラスミドベク
ターとして投与され得る。このようなベクターにＤＮＡを組み込むための技術は
、当業者に周知である。レトロウイルスベクターは、さらに、選択マーカーにつ
いての遺伝子（形質導入した細胞の同定または選択を補助し得る）および／また
は標的部分（例えば、特定の標的細胞上のレセプターに対するリガンドをコード
する遺伝子）を移入するか、または取り込んで、ベクターに標的特異性を与え得
る。標的化はまた、抗体を用いて、当業者に公知の方法により達成され得る。
【０４２３】 治療目的のための他の処方としては、コロイド分散系（例えば、巨大分子複合
体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ）、ならびに水中油懸濁液、ミセル
、混合ミセル、およびリポソームを含む、脂質ベースの系が挙げられる。インビ
トロおよびインビボでの送達ビヒクルとしての使用のための、好ましいコロイド
分散系は、リポソーム（すなわち、人工膜小胞）である。裸のポリヌクレオチド
の取りこみは、生分解性ビーズ内および／または上にポリヌクレオチドを取り込
むことにより増加され得る。生分解性ビーズは、細胞中へ有効に輸送される。こ
のような系の調製および使用は、当該分野で周知である。
【０４２４】 関連する局面において、上記のようなポリヌクレオチドのワクチンは、本発明
のポリペプチドまたは公知のクラミジア抗原のいずれかと、同時にもしくは連続
して投与され得る。例えば、本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレオチ
ドの投与（「裸」または上記のような送達系においてのいずれかで）に続いて、
ワクチンの防御免疫効果を増強するために抗原が投与され得る。
【０４２５】 本明細書中に開示されるポリペプチドおよびポリヌクレオチドはまた、クラミ
ジア感染の処置のために養子免疫治療において用いられ得る。養子免疫治療は、
能動的または受動的免疫治療のいずれかに広範に分類され得る。能動的免疫治療
において、処置は、免疫応答改変剤（ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ−ｍｏｄ
ｉｆｙｉｎｇ ａｇｅｎｔ）（例えば、ワクチン、細菌アジュバント、および／
またはサイトカイン）の投与を用いる内因性宿主免疫系のインビボ刺激に依存す
る。
【０４２６】 受動的免疫治療において、処置は、確立された免疫反応性（ｅｓｔａｂｌｉｓ
ｈｅｄ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅａｃｔｉｖｉｔｙ）（例えば、エフェクター細胞ま
たは抗体）を用いる生物学的薬剤の送達に関し、これは、抗クラミジア効果を直
接的または間接的に媒介し得、そしてインタクトな宿主免疫系に依存する必要が
ない。エフェクター細胞の例としては、Ｔリンパ球（例えば、ＣＤ８＋細胞傷害
性Ｔ−リンパ球、ＣＤ４＋ Ｔ−ヘルパー）、キラー細胞（例えば、ナチュラル
キラー細胞、リンホカイン−活性化キラー細胞）、Ｂ細胞、または開示される抗
原を発現する抗原提示細胞（例えば、樹状細胞およびマクロファージ）が挙げら
れる。本明細書中に開示されるポリペプチドはまた、受動性免疫治療のために、
抗体または抗イディオタイプ抗体（米国特許第４，９１８，１６４号のような）
を生成するために用いられる得る。
【０４２７】 養子免疫治療のために十分な数のＴ細胞を産生する主な方法は、インビトロで
免疫Ｔ細胞を増殖させることである。単一の抗原特異的Ｔ細胞を、インビボでの
抗原認識の保持を伴って数十億の数まで増殖するための培養条件は、当該分野で
周知である。これらのインビトロ培養条件は、代表的には、しばしばサイトカイ
ン（例えば、ＩＬ−２）、および非分裂支持細胞の存在下で、抗原による断続的
刺激を利用する。上記のように、本明細書中に記載される免疫反応性ポリペプチ
ドを用いて、免疫治療のために十分な数の細胞を生成するために、抗原特異的Ｔ
細胞培養物を迅速に増殖し得る。詳細には、抗原提示細胞（例えば、樹状細胞）
、マクロファージ、単球、線維芽細胞、またはＢ細胞は、免疫反応性ポリペプチ
ドを用いてパルスされ得るか、あるいはポリヌクレオチド配列は、当該分野で周
知の種々の標準的な技術を用いて、抗原提示細胞中に導入され得る。例えば、抗
原提示細胞は、ポリヌクレオチド配列を用いてトランスフェクトまたは形質導入
され得、ここでこの配列は、発現を増大させるのに適切なプロモーター領域を含
み、そして組換えウイルスまたは他の発現系の一部として発現され得る。いくつ
かのウイルスベクター（ポックスウイルス、ワクシニアウイルス、およびアデノ
ウイルスを含む）を用いて、抗原提示細胞を形質導入され；また抗原提示細胞は
、種々の手段（遺伝子銃技術、脂質媒介送達、エレクトロポレーション、浸透圧
衝撃、および粒子送達機構を含む）により、本明細書中に開示されるポリヌクレ
オチド配列を用いてトランスフェクトされて、当業者により決定されるような有
効かつ受容可能な発現レベルを生じ得る。治療において効果的である培養された
Ｔ細胞について、培養されたＴ細胞は、広範に増殖および分布すること、ならび
にインビボで長い期間、生存することが可能でなければならない。研究は、培養
したＴ細胞が、ＩＬ−２を補充した抗原を用いる刺激を繰り返すことにより、イ
ンビボで増殖すること、およびかなりの数が長い期間生存することを誘導し得る
ことを実証した（例えば、Ｃｈｅｅｖｅｒ，Ｍ．ら、「Ｔｈｅｒａｐｙ Ｗｉｔ
ｈ Ｃｕｌｔｕｒｅｄ Ｔ Ｃｅｌｌｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ Ｒｅｖｉｓｉ
ｔｅｄ」、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ，１５７：１７７，１
９９７を参照のこと）。
【０４２８】 本明細書中に開示されるポリペプチドをまた用いて、クラミジア反応性Ｔ細胞
を生成および／または単離し得る。次いで、クラミジア反応性Ｔ細胞は、患者に
投与され得る。１つの技術において、抗原特異的Ｔ細胞株は、開示されるポリペ
プチドの免疫原性部分に対応する短いペプチドを用いてインビボで免疫により生
成され得る。得られた抗原特異的ＣＤ８＋またはＣＤ４＋ Ｔ細胞クローンは、
患者から単離され得、標準的な組織培養技術を用いて増殖され得、そして患者に
戻され得る。
【０４２９】 あるいは、ポリペプチドの免疫原性部分に対応するペプチドを用いて、例えば
、Ｃｈａｎｇら、（Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｏｎｃｏｌ．Ｈｅｍａｔｏｌ．，２２（
３），２１３，１９９６）に記載されるように、引き続いて、患者に移され得る
抗原特異的Ｔ細胞を提供するために自己Ｔ細胞の選択的インビトロ刺激および増
殖により、クラミジア反応性Ｔ細胞サブセットを生成する。免疫系の細胞（例え
ば、Ｔ細胞）は、市販の細胞分離システム（例えば、ＩｓｏｌｅｘTM Ｓｙｓｔ
ｅｍ、Ｎｅｘｅｌｌ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．Ｉｒｖｉｎｅ，ＣＡ
から入手可能）を用いて、患者の末梢血から単離され得る。分離された細胞は、
送達ビヒクル（例えば、ミクロスフェア）内に含まれる１つ以上の免疫反応性ポ
リペプチドで刺激されて、抗原特異的Ｔ細胞を提供する。次いで、抗原特異的Ｔ
細胞の集団は、標準的な技術を用いて増殖され、そして細胞は、患者に再び投与
される。
【０４３０】 他の実施形態において、本明細書中に開示されるポリペプチドに特異的なＴ細
胞および／または抗体レセプターは、クローニングされ、増殖され、そして養子
免疫治療に用いるための他のベクターまたはエフェクター細胞に移される。詳細
には、Ｔ細胞は、適切な遺伝子を用いてトランスフェクトされて、細胞外認識エ
レメントとして、クラミジア特異的モノクローナル抗体由来の可変ドメインを発
現し得、そしてＴ細胞レセプターシグナル伝達鎖に結合され得、Ｔ細胞の活性化
、特異的溶解、およびサイトカイン放出を生じる。これは、Ｔ細胞を、その特異
性を、ＭＨＣ非依存様式で再指向させ得る。例えば、Ｅｓｈｈａｒ，Ｚ．，Ｃａ
ｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ，４５（３−４）：１３１−
６，１９９７およびＨｗｕ，Ｐ．ら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ，５５（１５）：３
３６９−７３，１９９５を参照のこと。別の実施形態としては、Ｃｏｌｅ，ＤＪ
ら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ，５５（４）：７４８−５２，１９９５のように、ク
ラミジア抗原特異的αおよびβＴ細胞レセプター鎖の、別のＴ細胞へのトランス
フェクションが挙げられ得る。
【０４３１】 さらなる実施形態では、同系または自系の樹状細胞を、本明細書中に開示され
るポリペプチドの少なくとも免疫原性部分に対応するペプチドを用いて適用（ｐ
ｕｌｓｅ）し得る。生じる抗原特異的樹状細胞は、患者に移入されるか、または
Ｔ細胞を刺激して抗原特異的Ｔ細胞（これが、次いで、患者に投与され得る）を
提供するために使用されるかのいずれかであり得る。抗原特異的Ｔ細胞を生成す
るためのペプチド適用した樹状細胞の使用、およびマウスモデルにおいて疾患を
根絶するためのこのような抗原特異的Ｔ細胞の引き続く使用は、Ｃｈｅｅｖｅｒ
ら、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ １５７：１７７、１９９７
により実証された。さらに、開示されたポリヌクレオチドを発現するベクターは
、患者から採取された幹細胞中に導入され得、そして同じ患者に自系移植片を戻
すために、インビトロでクローン的に増殖され得る。
【０４３２】 特定の局面では、本明細書中に開示されるポリペプチド、ポリヌクレオチド、
Ｔ細胞および／または結合因子を、薬学的組成物または免疫原性組成物（すなわ
ち、ワクチン）中に組み込み得る。あるいは、薬学的組成物は、抗原提示細胞が
クラミジアポリペプチドを発現するように、クラミジアポリヌクレオチドでトラ
ンスフェクトされた抗原提示細胞（例えば、樹状細胞）を含み得る。薬学的組成
物は、１つ以上のこのような化合物および生理的に受容可能なキャリアを含む。
ワクチンは、１つ以上のこのような化合物および免疫促進剤を含み得る。免疫促
進剤は、外因性の抗原に対する免疫応答を増強または強化する任意の物質であり
得る。免疫促進剤の例としては、アジュバント、生分解性ミクロスフェア（例え
ば、ポリ乳酸ガラクチド（ｐｏｌｙｌａｃｔｉｃ ｇａｌａｃｔｉｄｅ）および
リポソーム（この中に、化合物を取り込む；例えば、Ｆｕｌｌｅｒｔｏｎ、米国
特許第４，２３５，８７７号を参照のこと）が挙げられる。ワクチン調製物は、
一般的に、例えば、Ｍ．Ｆ．ＰｏｗｅｌｌおよびＭ．Ｊ．Ｎｅｗｍａｎ編、「Ｖ
ａｃｃｉｎｅ Ｄｅｓｉｇｎ（ｔｈｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ ａｄｊｕｖａ
ｎｔ ａｐｐｒｏａｃｈ）」、Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ（ＮＹ、１９９５）に
記載される。本発明の範囲内にある薬学的組成物およびワクチンはまた、生物学
的に活性または不活性であり得る他の化合物を含み得る。例えば、他のＣｈｌａ
ｍｙｄｉａｌ抗原の１つ以上の免疫原性部分は、組成物またはワクチンにおいて
、融合ポリペプチドに組み込まれてかまたは個々の化合物としてのいずれかで存
在し得る。
【０４３３】 薬学的組成物またはワクチンは、上記のような１つ以上のポリペプチドをコー
ドするＤＮＡを含み得、その結果、そのポリペプチドはインサイチュで生成され
る。上記のように、ＤＮＡは、当業者に公知の種々の任意の送達系（核酸発現系
、細菌性発現系、およびウイルス性発現系を含む）において存在し得る。多数の
遺伝子技術が当該分野において周知である（例えば、Ｒｏｌｌａｎｄ、Ｃｒｉｔ
．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒａｐ．Ｄｒｕｇ Ｃａｒｒｉｅｒ Ｓｙｓｔｅｍｓ １５：
１４３−１９８、１９９８およびその中で引用される参考文献により記載される
技術）。適切な核酸発現系は、患者における発現のために必要なＤＮＡ配列を含
む（例えば、適切なプロモーターおよび終結シグナル）。細菌性送達系は、細胞
表面上でポリペプチドの免疫原性部分を発現するかまたはそのようなエピトープ
を分泌する細菌（例えば、Ｂａｃｉｌｌｕｓ−Ｃａｌｍｅｔｔｅ−Ｇｕｅｒｒｉ
ｎ）の投与を含む。
【０４３４】 好ましい実施形態では、ウイルス性発現系（例えば、ワクシニアもしくは他の
ポックスウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス、バキュロウイルス、トガ
ウイルス、バクテリオファージなど）を使用してＤＮＡを導入し得る。このウイ
ルス発現系は、非病原性（欠損性）複製コンピテントなウイルスの使用を含み得
る。
【０４３５】 例えば、多くのウイルス発現ベクターが、レトロウイルス科のファミリーにウ
イルスから誘導されている。このファミリーは、マウス白血病ウイルス、マウス
乳房腫瘍ウイルス、ヒト泡沫状ウイルス、ラウス肉腫ウイルス、および免疫疾患
ウイルス（ヒト、サル、およびネコを含む）。レトロウイルス発現ベクターを設
計する場合の考察が、Ｃｏｍｓｔｏｃｋら（１９９７）に議論される。
【０４３６】 優れたマウス白血病ウイルス（ＭＬＶ）ベースのウイルス発現ベクターは、Ｋ
ｉｍら（１９９８）によって、開発されている。ＭＬＶベクターの作製において
、Ｋｉｍらは。中上流領域と一緒になって、ｇａｇ配列全体が、ウイルスパッケ
ージングまたは遺伝子発現に有意に影響することなく欠失されることを見出した
。さらに、ほとんど、Ｕ３領域全体が、有害な効果を伴うことなく、ヒトサイト
メガロウイルスの中初期プロモーターを置換され得ることが見出された。さらに
、ＭＣＲおよび内部リボソームエントリー部位（ＩＲＥＳ）が、有害な効果を伴
うことなく付加され得る。それらの観察に基づいて、Ｋｉｍらは、上記の特徴の
１つ以上を含む、一連のＭＬＶベースの発現ベクターを設計した。
【０４３７】 ヒト泡沫状ウイルス（ＨＦＶ）について、より学ばれているように、発現ベク
ターとしてのその使用について好ましいＨＦＶの特徴が発見されている。これら
の特徴は、スプライシングによりｐｏｌの発現および規定された開始コドンでの
翻訳の開始を含む。ＨＦＶウイルス発現ベクターの他の局面は、Ｂｏｄｅｍら（
１９９７）によって総説される。
【０４３８】 Ｍｕｒａｋａｍｉら（１９９７）は、異種遺伝子を高レベルで発現するための
、ラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）ベースの複製コンピテントトリレトロウイルス
であるＩＲ１およびＩＲ２を記載する。これらのベクターにおいて、脳心筋炎ウ
イルス（ＥＭＣＶ）由来のＩＲＥＳが、ｅｎｖ遺伝子と異種遺伝子との間に挿入
された。ＩＲ１ベクターは、ｅｎｖ遺伝子の下流に存在するスプライス−アクセ
プター部位を保持するが、ＩＲ２ベクターはそれを欠失する。Ｍｕｒａｋａｍｉ
らは、これらのベクターによって、いくつかの異なる異種遺伝子の高レベル の発現を示した。
【０４３９】 最近、多くのレンチウイルスベースのレトロウイルス発現バクターが、開発さ
れている。Ｋａｆｒｉら（１９９７）は、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）ベー
スの発現ベクターによって、肝臓および筋肉に直接送達される遺伝子の持続する
発現を示した。この系の１つの利点は、非分裂細胞に形質導入するＨＩＶに固有
の能力である。Ｋａｆｒｉらのウイルウスは、小胞口内炎ウイルスＧ糖タンパク
（ＶＳＶＧ）を有する偽型であるので、それらは、広範な範囲の組織および相棒
型を形質導入し得る。
【０４４０】 多数のアデノウイルスベースの発現ベクターが、主に、遺伝子治療適用におけ
るこれらのベクターによって提供される利点に起因して、開発されてきた。アデ
ノウイルス発現ベクターおよびこのようなベクターを使用する方法は、多くの米
国特許（米国特許第５，６９８，２０２号、米国特許第５，６１６，３２６号、
米国特許第５，５８５，３６２号、および米国特許第５，５１８，９１３号を含
み、これら全てが参考として援用される）の目的である。
【０４４１】 さらなるアデノウイルス構築物が、Ｋｈａｔｒｉら（１９９７）およびＴｏｍ
ａｎｉｎら（１９９７）に記載される。Ｋｈａｔｒｉらは、新規なヒツジアデノ
ウイルス発現ベクター、およびウシ鼻甲介およびウサギ腎細胞ならびにヒト細胞
型（肺および包皮線維芽細胞ならびに肝臓、前立腺、乳房、結腸および網膜系列
を含む）に感染させる能力を記載する。Ｔｏｍａｎｉｎらは、Ｔ７ ＲＮＡポリ
メラーゼ遺伝子を含むアデノウイルス発現ベクターを記載する。Ｔ７プロモータ
ーに作動可能に連結された異種遺伝子を含む細胞に導入される場合、これらのベ
クターは、Ｔ７プロモーターから遺伝子発現を駆動し得た。著者らは、この系が
、細胞傷害性タンパク質をコードする遺伝子のクローニングおよび発現のために
有用であることを示唆する。
【０４４２】 ポックスウイルスは、哺乳動物細胞における異種遺伝子の発現のために広範に
使用される。数年に渡り、これらのベクターは、異種遺伝子の高い発現を可能に
し、そして複数の異種遺伝子の単一分子への組込みを単純化するように改善され
ている。細胞変性効果を減少させ、そして安全性を増加させる試みにおいて、哺
乳動物において不発性感染を受けるワクシニアウイルス変異体および他のポック
スウイルスが、特別の注目を受けている（Ｏｅｒｔｌｉら、１９９７）。ポック
スウイルス発現ベクターとしての使用は、ＣａｒｒｏｌｌおよびＭｏｓｓ（１９
９７）に総説されている。
【０４４３】 トガウイルス発現ベクター（これは、アルファウイルス属の発現ベクターを含
む）が、タンパク質の構造および機能を研究するために、ならびに生成目的のた
めに使用されている。トガウイルス属の発現ベクターは、惹きつけられる特性は
、迅速で効率的な遺伝子発現、広範な宿主範囲、およびＲＮＡゲノムである（Ｈ
ｕａｎｇ，１９９６）。また、アルファウイルスに基づく組換えワクチンは、良
好な免疫学的メモリーおよび保護効果を有する、強力な体液性免疫応答および細
胞性免疫応答を誘導することが示されている（Ｔｕｂｕｌｅｋａｓら、１９９７
）。アルファウイルス発現ベクターおよびその用途が、例えば、Ｌｕｎｄｓｔｒ
ｏｍ（１９９７）に議論されている。
【０４４４】 １つの研究において、ＬｉおよびＧａｒｏｆｆ（１９９６）は、Ｓｅｍｌｉｋ
ｉ Ｆｏｒｅｓｔウイルス（ＳＦＶ）発現ベクターを使用して、ＢＨＫＬ−２１
細胞において、レトロウイルス遺伝子を発現し、そしてレトロウイルス粒子を生
成する。この方法によって生成された粒子は、プロテアーゼおよび逆転写酵素活
性を有し、そして感染性である。さらに、ヘルパーウイルスは、ウイルスストッ
クにおいて検出され得なかった。従って、この系は、遺伝子治療プロトコルにお
けつその用途について魅力的である特徴を有する。
【０４４５】 バキュロウイルス発現ベクターは、伝統的に、昆虫細胞において異種タンパク
質を発現するために使用されている。タンパク質の例としては、哺乳動物ケモカ
インレセプター（Ｗａｎｇら、１９９７）、レセプタータンパク質（例えば、グ
リーン蛍光タンパク質）（Ｗｕら、１９９７）、およびＦＬＡＧ融合タンパク質
（Ｗｕら、１９９７；Ｋｏｈら、１９９７）を参照のこと。バキュロウイルス発
現ベクター技術における最近に進展（ビリオンディスプレイベクターおよび哺乳
動物細胞における発現におけるそれらの使用を含む）は、Ｐｏｓｓｅｅ（１９９
７）によって総説される。バキュロウイルス発現バクターに対する他の総説は、
ＪｏｎｅｓおよびＭｏｒｉｋａｗａ（１９９６）およびＯ’Ｒｅｉｌｌｙ（１９
９７）を含む。
【０４４６】 他の適切なウイルス発現系は、例えば、以下において開示される：Ｆｉｓｈｅ
ｒ−Ｈｏｃｈら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：３１
７−３２１、１９８９；Ｆｌｅｘｎｅｒら、Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ
．５６９：８６−１０３、１９８９；Ｆｌｅｘｎｅｒら、Ｖａｃｃｉｎｅ ８：
１７−２１、１９９０；米国特許第４，６０３，１１２号、同第４，７６９，３
３０号、および同第５，０１７，４８７号；ＷＯ ８９／０１９７３；米国特許
第４，７７７，１２７号；ＧＢ ２，２００，６５１；ＥＰ ０，３４５，２４
２；ＷＯ ９１／０２８０５；Ｂｅｒｋｎｅｒ、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ
６：６１６−６２７、１９８８；Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５
２：４３１−４３４、１９９１；Ｋｏｌｌｓら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ
．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：２１５−２１９、１９９４；Ｋａｓｓ−Ｅｉｓｌｅｒ
ら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：１１４９８−１１
５０２、１９９３；Ｇｕｚｍａｎら、Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ ８８：２８３８
−２８４８、１９９３；およびＧｕｚｍａｎら、Ｃｉｒ．Ｒｅｓ．７３：１２０
２−１２０７、１９９３。このような発現系にＤＮＡを組み込む技術は、当業者
に周知である。別の系において、ＤＮＡはまた、例えば、Ｕｌｍｅｒら、Ｓｃｉ
ｅｎｃｅ ２５９：１７４５−１７４９、１９９３において記載され、そしてＣ
ｏｈｅｎ、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５９：１６９１−１６９２、１９９３によって概
説されるように、「裸」であり得る。裸のＤＮＡの取り込みは、生分解性ビーズ
（これは、細胞に効率的に輸送される）上にＤＮＡをコーティングすることによ
って増加され得る。
【０４４７】 ワクチンは、所望ならば、ポリヌクレオチドおよび／またはポリペプチド成分
を含み得ることが明らかである。ワクチンがまた、本明細書中に提供されるポリ
ヌクレオチドおよび／またはポリペプチドの薬学的に受容可能な塩を含み得るこ
ともまた明らかである。このような塩は、薬学的に受容可能な非毒性塩基（例え
ば、有機塩基（例えば、１級、２級および３級アミンの塩、および塩基性アミノ
酸）および無機塩基（例えば、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩、アンモ
ニウム塩、カルシウム塩、およびマグネシウム塩）を含む）。当業者に公知の任
意の適切なキャリアが、本発明の薬学的組成物において使用され得るが、キャリ
アの型は、投与の様式に依存して変化する。本発明の組成物は、任意の適切な投
与の様式（例えば、局所的投与、経口投与、経鼻投与、静脈内投与、頭蓋内投与
、腹腔内投与、皮下投与、または筋内投与を含む）について処方され得る。非経
口投与（例えば、皮下注射）については、キャリアは、好ましくは、水、生理食
塩水、アルコール、脂肪、ろう、または緩衝液を含む。経口投与については、任
意の上記のキャリアまたは固体キャリア（例えば、マンニトール、ラクトース、
デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ナトリウムサッカリン、タルク、セルロ
ース、グルコース、スクロース、および炭酸マグネシウム）を使用し得る。生分
解性ミクロスフェア（例えば、ポリラクテートポリグリコレート）もまた、本発
明の薬学的組成物のためのキャリアとして使用され得る。適切な生分解性ミクロ
スフェアは、例えば、米国特許第４，８９７，２６８号および同第５，０７５，
１０９号に開示される。
【０４４８】 このような組成物はまた、以下を含み得る：緩衝液（中性の緩衝化生理食塩水
またはリン酸緩衝化生理食塩水）、炭水化物（例えば、グルコース、マンノース
、スクロース、またはデキストラン）、マンニトール、タンパク質、ポリペプチ
ド、またはアミノ酸（例えば、グリシン）、抗酸化薬、キレート剤（例えば、Ｅ
ＤＴＡまたはグルタチオン）、アジュバント（例えば、水酸化アルミニウム）、
および／または誘導体。あるいは、本発明の組成物は、凍結乾燥物（ｌｙｏｐｈ
ｉｌｉｚａｔｅ）として処方され得る。化合物はまた、周知技術を使用して、リ
ポソーム内にカプセル化され得る。
【０４４９】 任意の種々の免疫促進剤が、本発明のワクチンにおいて使用され得る。例えば
、アジュバントが含められ得る。大半のアジュバントは、迅速な異化作用から抗
原を保護するために設計された物質（例えば、水酸化アルミニウムまたは鉱油）
、および免疫応答の刺激物質（例えば、リピドＡ、Ｂｏｒｔａｄｅｌｌａ ｐｅ
ｒｔｕｓｓｉｓまたはＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ
由来のタンパク質）を含む。適切なアジュバントは、例えば、フロイントの不完
全アジュバントおよび完全アジュバント（Ｄｉｆｃｏ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅ
ｓ、Ｄｅｔｒｏｉｔ、ＭＩ）；Ｍｅｒｃｋ Ａｄｊｕｖａｎｔ ６５（Ｍｅｒｃ
ｋ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｉｎｃ．、Ｒａｈｗａｙ、ＮＪ）；ＡＳ−２（Ｓ
ｍｉｔｈＫｌｉｎｅ Ｂｅｅｃｈａｍ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ）；ア
ルミニウム塩（例えば、水酸化アルミニウムゲル（ミョウバン）またはリン酸ア
ルミニウム）；カルシウム、鉄、または亜鉛の塩；アシル化チロシンの不溶性懸
濁液；アシル化糖；カチオン的またはアニオン的に誘導体化されたポリサッカリ
ド；ポリフォスファゼン（ｐｏｌｙｐｈｏｓｐｈａｚｅｎｅ）；生分解性ミクロ
スフェア；モノホスホリルリピドＡおよびクイルＡ（ｑｕｉｌ Ａ）のように市
販されている。ＧＭ−ＣＳＦまたはインターロイキン−２、インターロイキン−
７、もしくはインターロイキン−１２のようなサイトカインもまた、アジュバン
トとして使用され得る。
【０４５０】 本明細書中に提供されるワクチンでは、選択状況下で、アジュバント組成物は
、優勢にＴｈ１型またはＴｈ２型の免疫応答を誘導するように設計され得る。高
レベルのＴｈ１型サイトカイン（例えば、ＩＦＮ−γ、ＴＮＦα、ＩＬ−２およ
びＩＬ−１２）は、投与された抗原に対する細胞媒介性免疫応答の誘導に有利な
傾向がある。対照的に、高レベルのＴｈ２型サイトカイン（例えば、ＩＬ−４、
ＩＬ−５、ＩＬ−６およびＩＬ−１０）は、体液性免疫応答の誘導に有利な傾向
がある。本明細書中に提供されるようなワクチンの適用後、患者は、Ｔｈ１型応
答およびＴｈ２型応答を含む免疫応答を支持する。応答が優勢にＴｈ１型である
好ましい実施形態では、Ｔｈ１型サイトカインのレベルは、Ｔｈ２型サイトカイ
ンのレベルよりも高い程度に増加する。これらのサイトカインのレベルは、標準
的アッセイを使用して容易に評価され得る。サイトカインのファミリーの概説に
ついては、ＭｏｓｍａｎｎおよびＣｏｆｆｍａｎ、Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎ
ｏｌ．７：１４５−１７３、１９８９を参照のこと。
【０４５１】 優勢にＴｈ１型応答を誘発する際の使用のために好ましいアジュバントとして
は、例えば、モノホスホリルリピドＡ（好ましくは、３−デ−Ｏ−アシル化モノ
ホスホルリピドＡ（３Ｄ−ＭＰＬ）とアルミニウム塩との組み合わせが挙げられ
る。ＭＰＬアジュバントは、Ｒｉｂｉ ＩｍｍｕｎｏＣｈｅｍ Ｒｅｓｅａｒｃ
ｈ Ｉｎｃ．（Ｈａｍｉｌｔｏｎ、ＭＴ）から入手可能である（米国特許第４，
４３６，７２７号；同第４，８７７，６１１号；同第４，８６６，０３４号；お
よび同第４，９１２，０９４号を参照のこと）。ＣｐＧを含有するオリゴヌクレ
オチド（ここで、ＣｐＧジヌクレオチドはメチル化されていない）もまた、優勢
にＴｈ１応答を誘導する。このようなオリゴヌクレオチドは周知であり、そして
例えば、ＷＯ ９６／０２５５５およびＷＯ ９９／３３４８８に記載されてい
る。免疫刺激ＤＮＡ配列はまた、例えば、Ｓａｔｏら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２７３
：３５２に記載される。別の好ましいアジュバントはサポニン（好ましくは、Ｑ
Ｓ２１）であり、これは単独または他のアジュバントと組み合わせて使用され得
る。例えば、増強される系としては、モノホスホルリピドＡとサポニン誘導体の
組み合わせ（例えば、ＷＯ ９４／００１５３に記載のようなＱＳ２１と３Ｄ−
ＭＰＬの組み合わせ）、またはＷＯ ９６／３３７３９に記載のような、反応原
性の低い組成物（ここでは、ＱＳ２１は、コレステロールでクエンチされる）が
挙げられる。他の好ましい処方物は、水中油エマルジョンおよびトコフェロール
が挙げられる。水中油エマルジョン中にＱＳ２１、３Ｄ−ＭＰＬおよびトコフェ
ロールを含有する特定の強力なアジュバント処方物が、ＷＯ ９５／１７２１０
中に記載される。本明細書中に提供されるいずれのワクチンも、抗原、免疫応答
エンハンサー、および適切なキャリアまたは賦形剤の組み合わせを生じる周知の
方法を使用して調製され得る。
【０４５２】 他の好ましいアジュバントとしては、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅ ＩＳＡ ７２０（
Ｓｅｐｐｉｃ、Ｆｒａｎｃｅ）、ＳＡＦ（Ｃｈｉｒｏｎ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ
，Ｕｎａｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ）、ＩＳＣＯＭＳ（ＣＳＬ）、ＭＦ−５９（Ｃ
ｈｉｒｏｎ）、アジュバントのＳＢＡＳシリーズ（例えば、ＳＢＡＳ−２または
ＳＢＡＳ−４、ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ Ｂｅｅｃｈａｍ，Ｒｉｘｅｎｓａｒｔ，
Ｂｅｌｇｉｕｍ）、Ｄｅｔｏｘ（Ｃｏｒｉｘａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ；Ｓｅ
ａｔｔｌｅ，ＷＡ）、ＲＣ−５２９（Ｃｏｒｉｘａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ；
Ｓｅａｔｔｌｅ，ＷＡ）および他のアミノアルキルグリコサミド４−ホスフェー
ト（ＡＧＰ）（例えば、継続中の米国特許出願番号０８／８５３，８２６号およ
び０９／０７４，７２０号に記載されるもの、これらの開示は、その全体が、参
考として本明細書中で援用される）。
【０４５３】 本明細書中に記載される任意のワクチンは、抗原、免疫促進剤および適切なキ
ャリアまたは賦形剤の組合せを生じる周知の方法を使用して調製され得る。本明
細書中に記載される組成物は、投与後に化合物の緩徐な放出をもたらす徐放処方
物（すなわち、カプセル、スポンジ、またはゲル（ポリサッカリドから構成され
る）などのような処方物）の部分として投与され得る。このような処方物は、一
般的に、周知技術（例えば、Ｃｏｏｍｂｅｓら、Ｖａｃｃｉｎｅ １４：１４２
９−１４３８、１９９６を参照のこと）を使用して調製され得、そして、例えば
、経口、直腸、もしくは皮下移植によってか、または所望される標的部位での移
植によって投与され得る。徐放処方物は、キャリアマトリクス中に分散されたポ
リペプチド、ポリヌクレオチドもしくは抗体を含み得るか、および／または速度
制御する膜によって取り囲まれたリザーバ中に含まれ得る。
【０４５４】 このような処方物における使用のためのキャリアは生体適合性であり、そして
また生分解性でもあり得る；好ましくは、処方物は、比較的一定レベルの活性成
分放出を提供する。このようなキャリアとしては、ポリ（ラクチド−ｃｏ−グリ
コリド）、ならびにポリアクリレート、ラテックス、デンプン、セルロール、お
よびデキストランのマイクロ粒子が挙げられる。他の徐放性キャリアとしては、
超分子バイオベクターが挙げられ、これは、非液体の親水性コア（例えば、架橋
ポリサッカリドまたはオリゴサッカリド）を含み、必要に応じて外層は、両親媒
性化合物（例えば、リン脂質）を含む（例えば、米国特許第５，１５１，２５４
合およびＰＣＴ公開ＷＯ ９４／２００７８，ＷＯ ９４／２３７０１およびＷ
ｏ ９６／０６６３８を参照のこと）。徐放処方物中に含まれる活性化合物の量
は、移植の部位、放出の速度および予期される持続期間、ならびに処置または予
防される状態の性質に依存する。
【０４５５】 任意の種々の送達ビヒクルが、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染した細胞を標的化する
抗原特異的な免疫応答の産生を容易にするために、薬学的組成物およびワクチン
において使用され得る。送達ビヒクルは、抗原提示細胞（ＡＰＣ）（例えば、樹
状細胞、マクロファージ、Ｂ細胞、単球、および効率的なＡＰＣとなるように操
作され得る他の細胞）を含む。このような細胞は、抗原を提示する能力を増加さ
せるために、Ｔ細胞応答の活性化および／または維持を改善するために、抗Ｃｈ
ｌａｍｙｄｉａ効果自体を有するように、および／または受け手（すなわち、整
合したＨＬＡハプロタイプ）と免疫学的に適合性であるように、遺伝的に改変さ
れ得るが、必要ではない。ＡＰＣは、一般的に、任意の種々の生物学的液体およ
び器官から単離され得、そして自系、同種異系、同系または異種の細胞であり得
る。
【０４５６】 本発明の特定の好ましい実施形態は、抗原提示細胞として、樹状細胞またはそ
の前駆体を使用する。樹状細胞は、非常に強力なＡＰＣであり（Ｂａｎｃｈｅｒ
ｅａｕおよびＳｔｅｉｎｍａｎ、Ｎａｔｕｒｅ ３９２：２４５−２５１、１９
９８）、そして予防的または治療的な免疫を誘発するための生理的アジュバント
として有効であることが示された（ＴｉｍｍｅｒｍａｎおよびＬｅｖｙ、Ａｎｎ
．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．５０：５０７−５２９、１９９９を参照のこと）。一般的に
、樹状細胞は、その典型的な形状（インサイチュで星状、インビトロで可視的な
顕著な細胞質突起（樹状突起）を有する）、高い効率で抗原を取りこみ、プロセ
スし、そして提示するその能力、そして未処理のＴ細胞応答を活性化するその能
力に基づいて同定され得る。樹状細胞は、当然のことながら、インビボまたはエ
キソビボでは樹状細胞において一般に見出されない特定の細胞表面レセプターま
たはリガンドを発現するように操作され得、そしてこのように改変された樹状細
胞が、本発明によって意図される。樹状細胞に対する代替物として、分泌小胞抗
原を負荷した樹状細胞（エキソソーム（ｅｘｏｓｏｍｅ）と呼ばれる）を、ワク
チンにおいて使用し得る（Ｚｉｔｖｏｇｅｌら、Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄ．４：５
９４−６００、１９９８を参照のこと）。
【０４５７】 樹状細胞および前駆体は、末梢血、骨髄、リンパ節、脾臓、皮膚、臍帯血、ま
たは任意の他の適切な組織もしくは液体から獲得され得る。例えば、樹状細胞は
、末梢血から回収された単球の培養物に対して、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−４、ＩＬ
−１３および／またはＴＮＦαのようなサイトカインの組み合わせを添加するこ
とによって、エキソビボで分化され得る。あるいは、末梢血、臍帯血、または骨
髄から回収されたＣＤ３４陽性細胞は、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−３、ＴＮＦα、Ｃ
Ｄ４０リガンド、ＬＰＳ、ｆｌｔ３リガンドおよび／または樹状細胞の分化、成
熟、および増殖を誘導する他の化合物の組み合わせを、培養培地に添加すること
によって、樹状細胞に分化され得る。
【０４５８】 樹状細胞は、都合よく、「未成熟」および「成熟」細胞として分類分けされる
。これは、２つの十分に特徴付けられた表現型の間を識別するための単純な方法
を与える。しかし、この命名法は、分化の全ての可能な中間ステージを排除する
と解釈されるべきではない。未成熟樹状細胞は、抗原の取り込みおよびプロセシ
ングについての高い能力（これは、Ｆｃγレセプターおよびマンノースレセプタ
ーの高発現と相関する）を有するＡＰＣとして、特徴付けられる。成熟表現型は
、代表的に、これらのマーカーのより低い発現（しかし、クラスＩおよびクラス
ＩＩ ＭＨＣ、接着分子（例えば、ＣＤ５４およびＣＤ１１）、ならびに同時刺
激分子（例えば、ＣＤ４０、ＣＤ８０、ＣＤ８６、および４−１ＢＢ）のような
、Ｔ細胞活性化を担う細胞表面分子の高発現）によって特徴付けられる。
【０４５９】 ＡＰＣは、一般的に、Ｃｈｌａｍｙｄｉａｌタンパク質（または、その部分も
しくは他の改変体）をコードするポリヌクレオチドでトランスフェクトされ得、
その結果、Ｃｈｌａｍｙｄｉａｌポリペプチド、またはその免疫原性部分が、そ
の細胞表面において発現される。このようなトランスフェクションは、エキソビ
ボで生じ得、次いで、このようなトランスフェクトされた細胞を含む組成物また
はワクチンが、本明細書中に記載のような治療目的のために使用され得る。ある
いは、樹状細胞または他の抗原提示細胞を標的化する遺伝子送達ビヒクルが患者
に投与され得、インビボで生じるトランスフェクションを生じさせる。樹状細胞
のインビボおよびエキソビボでのトランスフェクションなどは、一般的に、当該
分野において公知の任意の方法（例えば、ＷＯ ９７／２４４４７に記載される
方法、またはＭａｈｖｉら、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｃｅｌｌ Ｂｉｏ
ｌｏｇｙ ７５：４５６−４６０、１９９７に記載される遺伝子銃アプローチ）
を使用して実施され得る。樹状細胞の抗原負荷は、Ｃｈｌａｍｉｄｉａｌのポリ
ペプチド、ＤＮＡ（裸またはプラスミドベクター中）もしくはＲＮＡと共に；ま
たは、抗原を発現する組換え細菌もしくはウイルス（例えば、ワクシニア、鶏痘
、アデノウイルス、またはレンチウイルスのベクター）と共に、樹状細胞または
前駆細胞をインキュベートすることによって、達成され得る。負荷の前に、ポリ
ペプチドは、Ｔ細胞補助を提供する免疫学的パートナー（例えば、キャリア分子
）と共有結合的に結合体化され得る。あるいは、樹状細胞に、個々にかまたはポ
リペプチドの存在下で、結合体化されていない免疫学的パートナーを適用し得る
。
【０４６０】 薬学的組成物およびワクチンの投与の経路および頻度、ならびに投薬量は、個
体間で変動する。一般的に、薬学的組成物およびワクチンは、注射（例えば、皮
内、筋内、静脈内、または皮下）、鼻腔内（例えば、吸入）、または経口によっ
て投与され得る。１と３との間の用量が、１〜３６週間にわたって投与され得る
。好ましくは、３〜４ヶ月の間隔で、３用量が投与され、そしてブースターワク
チン接種が、その後定期的に与えられ得る。代替のプロトコールが、個々の患者
に適切であり得る。適切な用量は、上記のように投与される場合に、少なくとも
１〜２年間患者をＣｈｌａｍｙｄｉａｌ感染から防御するに十分に、免疫した患
者において免疫応答を惹起し得るポリペプチドまたはＤＮＡの量である。一般的
に、１用量中に存在する（または、１用量中のＤＮＡによってインサイチュで産
生される）ポリペプチドの量は、宿主１ｋｇあたり約１ｐｇ〜約１００ｍｇ、代
表的には、約１０ｐｇ〜約１ｍｇ、そして好ましくは約１００ｐｇ〜約１μｇの
範囲である。適切な用量サイズは、患者のサイズに伴って変化するが、代表的に
は、約０．１ｍＬ〜約５ｍＬの範囲である。
【０４６１】 当業者に公知の任意の適切なキャリアが、本発明の薬学的組成物において使用
され得るが、キャリアの型は投与の様式に依存して変化する。非経口投与（例え
ば、皮下注射）について、キャリアは、好ましくは、水、生理食塩水、アルコー
ル、脂肪、ワックス、または緩衝液を含む。経口投与について、マンニトール、
ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ナトリウムサッカリン、タ
ルク、セルロース、グルコース、スクロース、および炭酸マグネシウムのような
、任意の上記のキャリアまたは固体キャリアが使用され得る。生分解性ミクロス
フェア（例えば、ポリ乳酸ガラクチド）もまた、本発明の薬学的組成物のキャリ
アとして使用され得る。適切な生分解性ミクロスフェアは、例えば、米国特許第
４，８９７，２６８号および同第５，０７５，１０９号に開示される。
【０４６２】 一般的に、適切な投薬量および処置レジメンは、治療的および／または予防的
利点を提供するに十分な量で活性化合物を提供する。このような応答は、処置さ
れていない患者と比較して、処置された患者において改善された臨床的結果を確
証することによって、モニターされ得る。クラミジアタンパク質に対する既存の
免疫応答の増加は、一般的に改善された臨床的結果と相関する。このような免疫
応答は、一般的に、標準的な増殖アッセイ、細胞傷害性アッセイ、またはサイト
カインアッセイを使用して評価され得、これらは、処置前および処置後の患者か
ら得られるサンプルを用いて実施され得る。
【０４６３】 別の局面では、本発明は、クラミジア感染を診断するために、上記されるポリ
ペプチドを使用する方法を提供する。この局面では、方法は、１つ以上の上記の
ポリペプチドを単独または組み合わせのいずれかで使用して、生物学的サンプル
におけるＣｈｌａｍｙｄｉａｌ感染を検出するために提供される。明確さのため
に、用語「ポリペプチド」は、本発明の診断方法の特定の実施形態を記載する場
合に使用される。しかし、本発明の融合タンパク質がまた、このような方法にお
いて使用され得ることは、当業者に明らかである。
【０４６４】 本明細書中で使用される場合、「生物学的サンプル」は、患者から得られる任
意の抗体を含有するサンプルである。好ましくは、サンプルは、全血、痰、血清
、血漿、唾液、脳脊髄液または尿である。より好ましくは、サンプルは、患者か
ら得られる血液サンプル、血清サンプル、または血漿サンプルである。ポリペプ
チドは、以下に記載されるように、予め決定されたカットオフ値に関して、サン
プル中のポリペプチドに対する抗体の存在または非存在を決定するためのアッセ
イにおいて用いられる。このような抗体の存在は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原に対
する以前の感作を示し、これは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染の指標であり得る。
【０４６５】 １つより多いポリペプチドが使用される実施形態では、使用されるポリペプチ
ドは、好ましくは、補完的である（すなわち、１つの成分ポリペプチドが、別の
成分ポリペプチドによって感染が検出されないサンプルにおいて、感染を検出す
る傾向にある）。補完的ポリペプチドは、一般的に各ポリペプチドを個々に使用
して、Ｃｈｌａｍｙｄｉａに感染したことが既知の一連の患者から得られた血清
サンプルを評価することによって同定され得る。いずれのサンプルが、各ポリペ
プチドと（以下に記載のように）陽性かを試験し決定した後、大半またはすべて
の試験したサンプルにおいて感染を検出し得る２つ以上のポリペプチドの組み合
わせが処方され得る。
【０４６６】 サンプル中で抗体を検出するために１つ以上のポリペプチドを使用するための
、種々のアッセイ様式が当業者に公知である。例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａ
ｎｅ、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏ
ｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、１９８８（これを
、本明細書中で参考として援用する）を参照のこと。好ましい実施形態では、ア
ッセイは、サンプル由来の抗体に結合し、そしてそれを取り除くために、固体支
持体上に固定されたポリペプチドの使用を含む。次いで、結合した抗体を、レポ
ーター基を含む検出試薬を用いて検出し得る。適切な検出試薬は、レポーター基
で標識された、抗体／ポリペプチド複合体および遊離ポリペプチドに結合する抗
体を含む（すなわち、半競合的アッセイにおいて）。あるいは、競合的アッセイ
が利用され得、ここではポリペプチドに結合する抗体をレポーター基で標識し、
そして抗原とサンプルとのインキュベーションの後、固定された抗原に結合させ
る。サンプルの成分がポリペプチドへの標識化抗体の結合を阻害する程度は、固
定されたポリペプチドとのサンプルの反応性の指標である。
【０４６７】 固体支持体は、当業者に公知の、抗原が付着され得る任意の固体物質であり得
る。例えば、固体支持体は、マイクロタイタープレート中の試験ウェル、または
ニトロセルロースもしくは他の適切な膜であり得る。あるいは、支持体は、ビー
ズまたはディスク（例えば、ガラス、繊維ガラス、ラテックス、またはプラスチ
ック材料（例えば、ポリスチレンまたはポリ塩化ビニル））であり得る。支持体
はまた、磁気粒子または光ファイバーセンサー（ｆｉｂｅｒ ｏｐｔｉｃ ｓｅ
ｎｓｏｒ）（例えば、米国特許第５，３５９，６８１号に開示されたもの）であ
り得る。
【０４６８】 ポリペプチドは、当業者に公知の種々の技術を使用して、固体支持体に結合さ
れ得る。本発明の状況において、用語「結合した（された）」は、非共有結合性
会合（例えば、吸着）および共有結合性付着（これは、支持体上での抗原と官能
基との間の直接的な結合であり得るか、または架橋剤による結合であり得る）の
両方をいう。マイクロタイタープレート中のウェルまたは膜への吸着による結合
が好ましい。このような場合、吸着は、適切な緩衝液中で適切な量の時間、ポリ
ペプチドを固体支持体と接触させることにより達成され得る。接触時間は、温度
に伴って変動するが、代表的に、約１時間と１日との間である。一般的に、プラ
スチックマイクロタイタープレート（例えば、ポリスチレンまたはポリ塩化ビニ
ル）のウェルを、約１０ｎｇ〜約１μｇの範囲（そして好ましくは、約１００ｎ
ｇ）の量のポリペプチドと接触させることは、十分な量の抗原を結合するに十分
である。
【０４６９】 固体支持体へのポリペプチドの共有結合は、一般的に、最初にその支持体を二
官能性試薬と反応させることによって達成され得る。その二官能性試薬は、支持
体と官能基（例えば、ポリペプチド上のヒドロキシル基またはアミノ基）の両方
と反応する。例えば、そのポリペプチドは、ベンゾキノンを使用することにより
、または支持体上のアルデヒド基の、ポリペプチド上のアミンと活性水素との縮
合によって、適切なポリマー被覆を有する支持体に結合され得る（例えば、Ｐｉ
ｅｃｅ Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｃａｔａｌｏｇ ａｎｄ Ｈａｎ
ｄｂｏｏｋ、１９９１、Ａ１２〜Ａ１３を参照のこと）。
【０４７０】 特定の実施形態において、アッセイは、酵素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）である
。このアッセイは、固体支持体（一般的には、マイクロタイタープレートのウェ
ル）上に固定化されたポリペプチド抗原を、サンプルと最初に接触させることに
よって行い得、その結果、サンプル中のポリペプチドに対する抗体は、固定され
たポリペプチドに結合することが可能になる。次いで、未結合のサンプルが固定
化されたポリペプチド複合体から取り除かれ、そして固定化された抗体−ポリペ
プチドに結合し得る検出試薬が添加される。次いで、固体支持体に結合したまま
残っている検出試薬の量が、特定の検出試薬に対して適切な方法を使用して決定
される。
【０４７１】 より具体的には、上記のように、一旦ポリペプチドが支持体に固定化されるな
らば、支持体上の残っているタンパク質結合部位は、代表的にはブロックされる
。当業者に公知である任意の適切なブロッキング試薬（例えば、ウシ血清アルブ
ミン（ＢＳＡ）またはＴｗｅｅｎ２０TM（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏ
．，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ））が利用され得る。次いで、固定化されたポリペ
プチドは、サンプルとともにインキュベートされ、そして抗体を抗原に結合させ
る。サンプルは、インキュベーションに先立って、適切な希釈剤（例えば、リン
酸緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ））で希釈され得る。一般的には、適切な接触時間
（すなわち、インキュベーション時間）は、ＨＧＥ−感染したサンプル中の抗体
の存在を検出するに十分な時間の期間である。好ましくは、接触時間は、結合し
た抗体と未結合の抗体との間の平衡において達成される結合レベルの少なくとも
９５％の結合のレベルを達成するのに十分である。当業者は、平衡を達成するの
に十分な時間が、ある期間に渡って発生する結合のレベルをアッセイすることに
よって容易に決定され得ることを理解する。室温において、約３０分間のインキ
ュベーション時間が、一般的に十分である。
【０４７２】 次いで、未結合のサンプルは、適切な緩衝液（例えば、０．１％ Ｔｗｅｅｎ
２０TMを含有するＰＢＳ）で固体支持体を洗浄することによって除去され得る。
次いで、検出試薬は固体支持体に添加され得る。適切な検出試薬は、固定化され
た抗体−ポリペプチド複合体に結合し、そして当業者に公知の種々の手段のいず
れかによって検出され得る任意の化合物である。好ましくは、検出試薬は、レポ
ーター基と結合体化された結合剤（例えば、プロテインＡ、プロテインＧ、免疫
グロブリン、レクチン、または遊離の抗原など）を含む。好ましいレポーター基
は、酵素（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ）、基質、補因子、インヒビタ
ー、色素、放射性核種、発光基、蛍光基、およびビオチンを含む。レポーター基
への結合剤の結合体化は、当業者に公知の標準的な方法を用いて達成され得る。
種々のレポーター基に結合体化された一般的な結合剤はまた、多くの商業的な供
給源（例えば、Ｚｙｍｅｄ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉ
ｓｃｏ，ＣＡおよびＰｉｅｒｃｅ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）から購入され得る
。
【０４７３】 次いで、検出試薬を、結合抗体を検出するのに十分な長さの時間、固定化され
た抗体−ポリペプチド複合体とともにインキュベートする。適切な時間の長さは
、一般的に、製造業者の指示書から、または時間の期間にわたって起こる結合の
レベルをアッセイすることによって決定され得る。次いで、未結合の検出試薬を
除去し、そしてレポーター基を用いて結合した検出試薬を検出する。レポーター
基を検出するために利用される方法は、レポーター基の性質に依存する。放射性
活性基については、シンチレーション計数またはオートラジオグラフィー法が一
般的には適切である。分光学的方法は、色素、発光基および蛍光基を検出するた
めに使用され得る。ビオチンは、異なるレポーター基（一般的には、放射活性基
もしくは蛍光基または酵素）と結合したアビジンを使用して検出され得る。酵素
レポーター基は、一般的に、基質の添加によって検出され得（一般的には、特定
の時間の期間）、続いて反応生成物の分光学的分析または他の分析を行う。
【０４７４】 サンプル中の抗Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗体の存在または非存在を決定するために
、固体支持体に結合したまま残っているレポーター基から検出されたシグナルは
、一般的に、所定のカットオフ値に対応するシグナルと比較される。１つの好ま
しい実施形態において、カットオフ値は、固定化された抗原が非感染患者由来の
サンプルとともにインキュベートされる場合に得られる平均のシグナルである。
一般的に、上記の所定のカットオフ値よりも上の３つの標準偏差であるシグナル
を生成するサンプルは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染について陽性であるとみなされ
る。代替的な好ましい実施形態において、カットオフ値は、Ｓａｃｋｅｔｔら、
Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ：Ａ Ｂａｓｉｃ Ｓｃｉｅｎｃ
ｅ ｆｏｒ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，Ｌｉｔｔｌｅ Ｂｒｏｗｎ
ａｎｄ Ｃｏ．，１９８５、１０６〜１０７頁の方法に従って、Ｒｅｃｅｉｖ
ｅｒ Ｏｐｅｒａｔｏｒ Ｃｕｒｖｅを使用して決定される。手短に言えば、こ
の実施形態において、カットオフ値は、真の陽性の割合（すなわち、感受性）の
対、および診断試験の結果についての各々の可能なカットオフ値に対応する擬陽
性の割合（１００％特異性）のプロットから決定され得る。上部の左側の端に最
も近接するプロット上のカットオフ値（すなわち、最も大きい領域を取り囲む値
）は、最も正確はカットオフ値であり、そしてこの方法によって決定されたカッ
トオフ値よりも高いシグナルを産生するサンプルが陽性であるとみなされ得る。
あるいは、カットオフ値は、プロットに沿って左にシフトして、擬陽性の割合を
最小化し得るか、または右にシフトして、偽陰性の割合を最小化し得る。一般的
に、この方法によって決定されるカットオフ値よりも高いシグナルを産生するサ
ンプルは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａｌ感染について陽性であるとみなされる。
【０４７５】 関連する実施形態において、アッセイは、迅速フロースルーまたはストリップ
試験形式で実行され、ここで抗原は、メンブレン（例えば、ニトロセルロース）
上に固定化される。フロースルー試験において、サンプル中の抗体は、サンプル
がメンブレンを通過する際に固定化されたポリペプチドに結合する。次いで、検
出試薬（例えば、プロテインＡ−コロイド金）は、検出試薬を含む溶液がメンブ
レンを通して流れるにつれて、抗体−ポリペプチド複合体に結合する。次いで、
結合した検出試薬の検出が上記のように行われ得る。ストリップ試験形式におい
て、ポリペプチドが結合するメンブレンの一方の端は、サンプルを含有する溶液
中に浸漬される。サンプルは、検出試薬を含む領域を通してメンブレンに沿って
移動し、そして固定化されたポリペプチドの領域まで移動する。ポリペプチドで
の検出試薬の濃度は、サンプル中の抗Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗体の存在を示す。代
表的には、その部位での検出試薬の濃度は、視覚的に読みとれ得るようなパター
ン（例えば、線）を作製する。このようなパターンの非存在は、ネガティブな結
果を示す。一般的に、メンブレン上に固定化されたポリペプチドの量は、生物学
的サンプルが、上記のように、ＥＬＡＳＡにおいてポジティブシグナルを生成す
るのに十分なレベルの抗体を含有する場合に、視覚的に識別可能なパターンを生
成するように選択される。好ましくは、メンブレン上に固定化されたポリペプチ
ドの量は、約２５ｎｇ〜約１μｇ、そしてより好ましくは、約５０ｎｇ〜約５０
０ｎｇの範囲である。このような試験は、代表的には、非常に少量（例えば、１
滴）の患者の血清または血液で行われ得る。
【０４７６】 当然、本発明のポリペプチドを伴う使用のために適切な多数の他のアッセイプ
ロトコルが存在する。上記の記載は、例示のみを意図する。このような方法にお
いて有用に使用され得る代替的なアッセイプロトコルの１つの例は、ウェスタン
ブロットであり、ここで生物学的サンプル中に存在するタンパク質はゲル中で分
離され、その後結合剤に曝される。このような技術は、当業者に周知である。
【０４７７】 本発明はさらに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａタンパク質に特異的に結合する抗体およ
びその抗体フラグメントのような因子を提供する。本明細書中で使用される場合
、抗体またはその抗原結合フラグメントは、検出可能なレベルでＣｈｌａｍｙｄ
ｉａｌタンパク質と反応し、かつ同様の条件下で関連しないタンパク質と検出可
能に反応しない場合（例えば、ＥＬＩＳＡ中で）に、Ｃｈｌａｍｙｄｉａｌタン
パク質に「特異的に結合する」と言われる。本明細書中で使用される場合、「結
合する」とは、複合体が形成されるように２つの別々の分子間の非共有的結合を
いう。結合する能力は、例えば、複合体の形成についての結合定数を決定するこ
とによって評価され得る。結合定数は、複合体の濃度が成分濃度の積で割られた
場合に得られる値である。一般的に、複合体形成についての結合定数が、約１０ 3 Ｌ／ｍｏｌを超える場合に、２つの成分は、本発明の文脈において「結合する
」といわれる。結合定数は、当該分野で周知の方法を使用して決定され得る。
【０４７８】 結合剤はさらに、本明細書中で提供される代表的なアッセイを使用して、Ｃｈ
ｌａｍｙｄｉａ感染を有する患者とＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を有さない患者との
間を区別し得る。言い換えれば、Ｃｈｌａｍｙｄｉａタンパク質に結合する抗体
または他の結合剤は、疾患を有する少なくとも約２０％の患者においてＣｈｌａ
ｍｙｄｉａ感染の存在を示すシグナルを産生し、そして感染を有さない少なくと
も約９０％の個体において疾患の非存在を示す陰性のシグナルを産生する。結合
剤がこの要件を満たすか否かを決定するために、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染を有す
る患者およびＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を有さない患者（標準的な臨床試験を用い
て決定される）由来の生物学的サンプル（例えば、血液、血清、痰、尿、および
／または組織生検）を、結合剤に結合するポリペプチドの存在について、本明細
書中で記載されるようにアッセイし得る。統計学的に有意な数の、疾患を有する
サンプルおよび疾患を有さないサンプルがアッセイされるべきであることは明ら
かである。各結合剤は、上記の判断基準を満たすべきである；しかし、当業者は
、結合剤が、感度を改善するために組み合わせて使用され得ることを理解する。
【０４７９】 上記の要件を満たす任意の薬剤は結合剤であり得る。例えば、結合剤は、ペプ
チド成分を含むかまたは含まないリボソーム、ＲＮＡ分子、またはポリペプチド
であり得る。好ましい実施形態において、結合剤は、抗体またはその抗原結合フ
ラグメントである。抗体は、当業者に公知の種々の技術のいずれかによって調製
され得る。例えば、ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ
Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ
Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，１９８８を参照のこと。一般的に、抗体は、組換え抗
体の産生を可能にするために、細胞培養技術（本明細書中で記載されるようなモ
ノクローナル抗体の生成を含む）によって、または適切な細菌細胞宿主または哺
乳動物細胞宿主への抗体遺伝子のトランスフェクションを介して生成され得る。
１つの技術において、ポリペプチドを含む免疫原は、最初に、広範な種々の哺乳
動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジ、またはヤギ）のいずれかに注
入される。この段階において、本発明のポリペプチドは、改変することなく免疫
原として働き得る。あるいは、特に比較的短いポリペプチドについて、卓越した
免疫応答は、ポリペプチドがキャリアタンパク質（例えば、ウシ血清アルブミン
またはキーホールリンペットヘモシアニン）と結合される場合に誘発され得る。
免疫原は、好ましくは、１回以上のブースター免疫を組み込む所定のスケジュー
ルに従って動物宿主に注入され、そして動物を定期的に採血する。次いで、ポリ
ペプチドに特異的なポリクローナル抗体を、このような抗血清から、例えば、適
切な固体支持体に結合させたポリペプチドを使用するアフィニティークロマトグ
ラフィーによって精製し得る。
【０４８０】 目的の抗原性ポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体は、例えば、Ｋｏｈ
ｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ、Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：５１１−５
１９、１９７６の技術およびそれに対する改良を使用して、調製され得る。手短
に言えば、これらの方法は、所望の特異性（すなわち、目的のポリペプチドとの
反応性）を有する抗体を産生し得る不死化細胞株の調製を含む。このような細胞
株は、例えば、上記のように免疫化された動物から得られた脾臓細胞から生成さ
れ得る。次いで、脾臓細胞を、例えば、ミエローマ細胞融合パートナー（好まし
くは免疫化された動物と同系であるもの）との融合によって不死化する。種々の
融合技術が利用され得る。例えば、脾臓細胞およびミエローマ細胞は、非イオン
性界面活性剤とともに数分間混合し得、次いでハイブリッド細胞の増殖を支持す
るが、ミエローマ細胞の増殖を支持しない選択培地上で低密度でプレーティング
し得る。好ましい選択技術は、ＨＡＴ（ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミ
ジン）選択を使用する。十分な時間（通常１〜２週間）の後、ハイブリッドのコ
ロニーを観察する。単一のコロニーを選択し、そしてそれらの培養上清をポリペ
プチドに対する結合活性について試験する。高い反応性および特異性を有するハ
イブリドーマが好ましい。
【０４８１】 モノクローナル抗体を、増殖しているハイブリドーマコロニーの上清から単離
し得る。さらに、種々の技術（例えば、適切な脊椎動物宿主（例えば、マウス）
の腹膜腔へのハイブリドーマ細胞株の注入）が、収量を増大させるために利用さ
れ得る。次いで、モノクローナル抗体を、腹水または血液から収集し得る。夾雑
物を、通常の技術（例えば、クロマトグラフィー、ゲルろ過、沈殿、および抽出
）によって抗体から除去し得る。本発明のポリペプチドを、例えば、アフィニテ
ィークロマトグラフィー工程における精製プロセスにおいて使用し得る。
【０４８２】 特定の実施形態において、抗体の抗原結合フラグメントの使用が好ましい。こ
のようなフラグメントは、標準的な技術を使用して調製され得るＦａｂフラグメ
ントを含む。手短には、免疫グロブリンを、プロテインＡビーズカラム上のアフ
ィニティークロマトグラフィー（ＨａｒｌｏｗおよびＬａｎｅ、Ａｎｔｉｂｏｄ
ｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、１９８８）によってウサギ血清から精製
し得、そしてパパインによって消化して、ＦａｂフラグメントおよびＦｃフラグ
メントを産生し得る。ＦａｂフラグメントおよびＦｃフラグメントは、プロテイ
ンＡビーズカラム上のアフィニティークロマトグラフィーによって分離され得る
。
【０４８３】 本発明のモノクローナル抗体は、１つ以上の治療薬剤に結合され得る。この点
において適切な薬剤は、放射性核種、分化誘導剤、薬物、毒素、およびその誘導
体を含む。好ましい放射性核種には、90Ｙ、123Ｉ、125Ｉ、131Ｉ、186Ｒｅ、18 8 Ｒｅ、211Ａｔ、および212Ｂｉが含まれる。好ましい薬物には、メトトレキセ
ート、ならびにピリミジンアナログおよびプリンアナログが含まれる。好ましい
分化誘導剤には、ホルボールエステルおよび酪酸が含まれる。好ましい毒素には
、リシン、アブリン、ジフテリア毒素、コレラ毒素、ゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ
）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ体外毒素、Ｓｈｉｇｅｌｌａ毒素、およびヤマゴボ
ウ抗ウイルスタンパク質が含まれる。
【０４８４】 治療剤は、直接的または間接的に（例えば、リンカー基を介して）適切なモノ
クローナル抗体とカップリング（例えば、共有結合によって）され得る。薬剤と
抗体との直接的な反応は、各々が互いに反応し得る置換基を有する場合に可能で
ある。例えば、一方の求核基（例えば、アミノ基またはスルフヒドリル基）は、
もう一方のカルボニル含有基（例えば、無水物もしくは酸ハロゲン化物）と、ま
たは良好な遊離基（例えば、ハロゲン化物）を含むアルキル基と反応し得る。
【０４８５】 あるいは、リンカー基を介して治療剤と抗体とをカップリングさせることが所
望され得る。リンカー基は、結合の可能性の妨害を回避するために抗体を薬剤か
ら隔てるためのスペーサーとして機能し得る。リンカー基はまた、薬剤または抗
体上の置換基の化学的反応性を増加させるために働き得、従ってカップリング効
率を増大させる。化学的な反応性の増大はまた、薬剤または薬剤上の官能基の使
用を容易にし得る（さもなければ可能ではない）。
【０４８６】 種々の二官能性または多官能性試薬、ホモ官能性とヘテロ官能性との両方（例
えば、Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬのカ
タログ中に記載されるもの）が、リンカー基として使用され得ることが、当業者
に明らかである。カップリングは、例えば、アミノ基、カルボキシル基、スルフ
ヒドリル基、または酸化された炭水化物残基を介してもたらされ得た。このよう
な方法論を記載する多数の参考文献（例えば、Ｒｏｄｗｅｌｌらへの米国特許第
４，６７１，９５８号）が存在する。
【０４８７】 本発明の免疫結合体の抗体部分がないときに治療剤がより強力である場合、細
胞中への内部移行の間に、またはその際に切断可能なリンカー基を使用すること
が所望であり得る。多数の異なる切断可能なリンカー基が記載されてきた。これ
らのリンカー基からの薬剤の細胞内放出についての機構は、ジスルフィド結合の
還元（例えば、Ｓｐｉｔｌｅｒらへの米国特許第４，４８９，７１０号）、感光
性結合の照射（例えば、Ｓｅｎｔｅｒらへの米国特許第４，６２５，０１４号）
、誘導体化されたアミノ酸側鎖の加水分解（例えば、Ｋｏｈｎらへの米国特許第
４，６３８，０４５号）、血清補体媒介性加水分解（例えば、Ｒｏｄｗｅｌｌら
への米国特許第４，６７１，９５８号）、および酸によって触媒される加水分解
（例えば、Ｂｌａｔｔｌｅｒらへの米国特許第４，５６９，７８９号）による切
断を含む。
【０４８８】 １つより多い薬剤を抗体にカップリングさせることが所望され得る。１つの実
施形態において、複数の薬剤の分子が１つの抗体分子にカップリングされる。別
の実施形態において、１つより多い薬剤の型が１つの抗体にカップリングされ得
る。特定の実施形態に関わらず、１つより多い薬剤を有する免疫結合体は、種々
の方法で調製され得る。例えば、１つより多い薬剤が、抗体分子に直接的にカッ
プリング抗体分子に直接的にカップリングされ得るか、または付着のための複数
の部位を提供するリンカーが使用され得る。あるいは、キャリアが使用され得る
。
【０４８９】 キャリアは、種々の方法（直接的にまたはリンカー基を介するかのいずれかの
共有結合を含む）で薬剤を保有し得る。適切なキャリアには、アルブミンのよう
なタンパク質（例えば、Ｋａｔｏらへの米国特許第４，５０７，２３４号）、ペ
プチド、およびアミノデキストランのようなポリサッカリド（例えば、Ｓｈｉｈ
らへの米国特許第４，６９９，７８４号）を含み得る。キャリアはまた、例えば
リポソームベシクル内に、非共有結合によって、またはカプセル化によって、薬
剤を保有し得る（例えば、米国特許第４，４２９，００８号および同第４，８７
３、０８８号）。放射性核種剤に特異的なキャリアは、放射性ハロゲン化された
低分子およびキレート化合物を含む。例えば、米国特許第４，７３５，７９２号
は、代表的な放射性ハロゲン化低分子およびそれらの合成を開示する。放射性核
種キレートは、金属、または金属酸化物、放射性核種の結合のためのドナー原子
として窒素原子および硫黄原子を含むキレート化合物から形成され得る。例えば
、Ｄａｖｉｓｏｎらへの米国特許第４，６７３，５６２号は、代表的なキレート
化合物およびそれらの合成を開示する。
【０４９０】 抗体および免疫結合体についての投与の種々の経路が使用され得る。代表的に
は、投与は、静脈内、筋肉内、皮下、または適切な方法による部位特異的領域に
おいてである。抗体／免疫結合体の正確な用量は、使用される抗体、抗原密度、
および抗体のクリアランスの速度に依存して変化することは明白である。
【０４９１】 抗体は、上記に詳述されたアッセイおよび当業者に周知の他の技術と同様なア
ッセイを使用する、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の存在を検出するための診断試験に
おいて使用され得、それによって患者においてＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出す
るための方法を提供する。
【０４９２】 本発明の診断試薬はまた、１つ以上の上記のポリペプチドをコードするＤＮＡ
配列、または１つ以上のその部分を含み得る。例えば、少なくとも２つのオリゴ
ヌクレオチドプライマーは、生物学的サンプル由来のＣｈｌａｍｙｄｉａ特異的
ｃＤＮＡを増幅するためのポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）に基づくアッセイに
おいて利用され得、ここで、少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーが
、本発明のポリペプチドをコードするＤＮＡ分子に特異的である。次いで、増幅
されたｃＤＮＡの存在が、当該分野で周知の技術（例えば、ゲル電気泳動）を使
用して検出される。同様に、本発明のポリペプチドをコードするＤＮＡ分子に特
異的なオリゴヌクレオチドプローブは、生物学的サンプル中の本発明のポリペプ
チドの存在を検出するためのハイブリダイゼーションアッセイにおいて使用され
得る。
【０４９３】 本明細書中で使用される場合、用語「ＤＮＡ分子に特異的なオリゴヌクレオチ
ドプライマー／プローブ」とは、問題のＤＮＡ分子に少なくとも約８０％、好ま
しくは少なくとも約９０％、およびより好ましくは少なくとも約９５％の同一性
を有するオリゴヌクレオチド配列を意味する。本発明の診断方法において有用に
利用され得るオリゴヌクレオチドプライマーおよび／またはプローブは、好まし
くは少なくとも約１０〜４０ヌクレオチドを有する。好ましい実施形態において
、オリゴヌクレオチドプライマーは、本明細書中に開示される１つのポリペプチ
ドをコードするＤＮＡ分子の少なくとも約１０の連続するヌクレオチドを含む。
好ましくは、本発明の診断方法において使用するためのオリゴヌクレオチドプロ
ーブは、本明細書中で開示される１つのポリペプチドをコードするＤＮＡ分子の
少なくとも約１５の連続するオリゴヌクレオチドを含む。ＰＣＲに基づくアッセ
イおよびハイブリダイゼーションアッセイとの両方についての技術は、当該分野
において周知である（例えば、Ｍｕｌｌｉｓら、前記；Ｅｈｒｌｉｃｈ、前記を
参照のこと）。従って、プライマーまたはプローブは、生物学的サンプル中のＣ
ｈｌａｍｙｄｉａ特異的配列を検出するために使用され得る。上記のオリゴヌク
レオチド配列を含むＤＮＡプローブまたはＤＮＡプライマーは、単独でまたは互
いに組み合わせて使用され得る。
【０４９４】 以下の実施例は、例示の目的で提供され、限定の目的で提供されるのではない
。
【０４９５】 （実施例１） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原をコードするＤＮＡ配列の単離） 本発明のＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原を、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａ
ｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩのゲノムＤＮＡライブラリーの発現クローニングによって
、本質的にＳａｎｄｅｒｓｏｎら（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１９９５、１８２：１
７５１〜１７５７）に記載されるように単離し、そして免疫反応性Ｔ細胞株にお
いてＰＢＭＣ増殖およびＩＦＮ−γを誘導することを示した。
【０４９６】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株を、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍ
ａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩの基本小体を使用してクラミジア生殖管感染の既往症の
ない正常なドナー由来のＰＢＭＣを刺激することによって生成した。このＴ細胞
株（ＴＣＬ−８といわれる）は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
およびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａの両方に感染した単球由来の樹
状細胞の認識することが見出された。
【０４９７】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩの無作為に剪断
したゲノムライブラリーを、λＺＡＰ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ、Ｌａ Ｊｏｌｌ
ａ、ＣＡ）において構築し、そしてこの増幅されたライブラリーを、３０クロー
ン／ウェルの密度で、９６ウェルマイクロタイタープレートにプレートした。細
菌を、２ｍＭ ＩＰＴＧの存在下で組換えタンパク質を発現するように、３時間
誘導し、次いで、ペレットにして、そして２００μｌのＲＰＭＩ １０％ＦＢＳ
中に再懸濁した。１０μｌの誘導された細菌懸濁液を、自己単球由来の樹状細胞
を含む９６ウェルプレートに移した。２時間のインキュベーションの後に、樹状
細胞を洗浄して、フリーのＥ．ｃｏｌｉを除去し、そしてＣｈｌａｍｙｄｉａ特
異的Ｔ細胞を添加した。陽性Ｅ．ｃｏｌｉプールを、このプールに応答するＩＦ
Ｎ−γ産生およびＴ細胞の増殖を決定することにより同定した。
【０４９８】 ４つの陽性プールを同定した。これを破壊して、４つの純粋なクローン（１−
Ｂ１−６６、４−Ｄ７−２８、３−Ｇ３−１０および１０−Ｃ１０−３１といわ
れる）を、それぞれ、４８１ｂｐ、１８３ｂｐ、１１０ｂｐおよび１４００ｂｐ
のインサートの大きさで得た。１−Ｂ１−６６、４−Ｄ７−２８、３−Ｇ３−１
０および１０−Ｃ１０−３１について決定されたＤＮＡ配列を、それぞれ、配列
番号１〜４に提供する。クローン１−Ｂ１−６６は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓゲノムのおよその領域５３６６９０（ＮＣＢＩ Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
データベース）にある。クローン１−Ｂ１−６６内には、以前に同定された９ｋ
Ｄａタンパク質（Ｓｔｅｐｈｅｎｓら、Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＥ００１３２
０）をコードするオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）が同定されており（
ヌクレオチド１１５〜３７５）、この配列を、配列番号５に提供する。クローン
４−Ｄ７−２８は、同じＯＲＦのより小さな領域である（１−Ｂ１−６６のアミ
ノ酸２２〜８２）。クローン３−Ｇ３−１０は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓゲ
ノムのおよその領域７４５５９にある。このインサートを、このゲノムのその配
向に関してアンチセンスの配向においてクローニングする。クローン１０−Ｃ１
０−３１は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ由来のＳ１３リボソ
ームタンパク質について以前に公開された配列に対応するオープンリーディング
フレームを含む（Ｇｕ，Ｌ．ら、Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ、１７７：２５
９４〜２６０１、１９９５）。４−Ｄ７−２８および１０−Ｃ１０−３１につい
ての推定タンパク質配列を、それぞれ、配列番号６および１２に提供する。３−
Ｇ３−１０についての推定タンパク質配列を、配列番号７〜１１に提供する。
【０４９９】 関連する一連のスクリーニング研究において、さらなるＴ細胞株を使用して、
上記のＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩのゲノムＤ
ＮＡライブラリーをスクリーニングした。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株（
ＴＣＴ−１）は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ
の基本小体に感染した自己単球由来の樹状細胞を有する患者のＰＢＭＣを刺激す
ることによってクラミジア生殖管を患う患者から誘導された。１２５６ｂｐのイ
ンサートを含む、１つのクローンである４Ｃ９−１８（配列番号２１）は、標準
的な増殖アッセイによって測定されるように、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞
株ＴＣＴ−１からの特異的免疫応答を誘発した。その後の分析により、このクロ
ーンは、以下の３つの既知の配列を含むことが明らかにされた：配列番号２２に
おいて開示される、リポアミドデヒドロゲナーゼ（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＥ
００１３２６）；配列番号２３において開示される、ハイポセティカルタンパク
質ＣＴ４２９（Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号ＡＥ００１３１６）；および配列番号２
４において開示される、ユビキノンメチルトランスフェラーゼＣＴ４２８（Ｇｅ
ｎｂａｎｋ登録番号ＡＥ００１３１６）のオープンリーディングフレームの一部
。
【０５００】 クローン４Ｃ９−１８（配列番号２１）に関するさらなる研究において、Ｃ．
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ（ＬＧＶ ＩＩ）由来のリポアミドデヒドロゲナーゼの
全長アミノ酸配列（配列番号２２）を、配列番号９０に開示されるクローンＣｔ
Ｌ２−ＬＰＤＡ−ＦＬ中に発現させた。
【０５０１】 Ｔ細胞刺激エピトープを含むオープンリーディングフレームをさらに特徴付け
るために、６×ヒスチジンタグをアミノ末端にコードするｃＤＮＡ配列を有する
クローン４Ｃ９−１８のヌクレオチド１〜６９５を含むｃＤＮＡフラグメントを
、ｐＥＴ１７ｂベクター（Ｎｏｖａｇｅｎ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）のＮｄｅＩ
／ＥｃｏＲＩ部位にサブクローニングし（クローン４Ｃ９−１８♯２ ＢＬ２１
ｐＬｙｓＳ（配列番号２５、配列番号２６に提供される対応するアミノ酸配列
を有する）と言われる）、そしてＥ．ｃｏｌｉ中に形質転換した。２ｍＭ ＩＰ
ＴＧでの３時間の、形質転換されたＥ．ｃｏｌｉの選択的誘導は、標準的なクマ
シー染色したＳＤＳ−ＰＡＧＥにより確証されるように、クローン４Ｃ９−１８
♯２ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳから２６ｋＤａのタンパク質の発現を生じた。クロ
ーン４Ｃ９−１８♯２ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳによりコードされるタンパク質の
免疫原性を決定するために、２６ｋＤａのタンパク質を発現するＥ．ｃｏｌｉを
、１×１０4の単球由来の樹状細胞上での力価測定し、そして２時間インキュベ
ートした。樹状細胞培養物を、洗浄し、そして２．５×１０4のＴ細胞（ＴＣＴ
−１）を、添加して、そしてさらに７２時間インキュベートさせて、その時点で
、培養物上清におけるＩＦＮ−γのレベルを、ＥＬＩＳＡにより決定した。図１
に示されるように、Ｔ細胞株ＴＣＴ−１は、ＩＦＮ−ｇにより測定されるように
、誘導した培養物に応答することが見出され、これは、リポアミドデヒドロゲナ
ーゼ配列に対するＣｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞応答を示す。同様に、クロー
ン４Ｃ９−１８♯２ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳによりコードされるタンパク質は、
標準的な増殖アッセイによりＴＣＴ−１ Ｔ細胞株を刺激することが示された。
【０５０２】 上記のＣＤ４＋ Ｔ細胞発現クローニング技術を使用して、さらなるＣｈｌａ
ｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ抗原を同定するその後の研究は、さらなる
クローンを生じた。ＴＣＴ−１およびＴＣＬ−８ Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ
細胞株、ならびにＴＣＰ−２１ Ｔ細胞株を利用して、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔ
ｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶＩＩゲノムライブラリーをスクリーニングした。
ＴＣＰ−２１ Ｔ細胞株は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｕｅｍｏｎｉａｅに対す
る液性免疫応答を有する患者に由来した。ＴＣＴ−１細胞株は、３７の陽性プー
ルを同定し、ＴＣＴ−３細胞株は、４１の陽性プールを同定し、そしてＴＣＰ−
２１細胞株は、２つの陽性プールを同定した。以下のクローンは、これらの陽性
プールのうちの１０個に由来した。ＴＣＰ−２１細胞株により同定される、クロ
ーン１１−Ａ３−９３（配列番号６４）は、ＨＡＤスーパーファミリー（ＣＴ１
０３）に対する相同性を共有する１３３９ｂｐのゲノムフラグメントである。同
じクローンにおける第２のインサートは、相補鎖上に存在するｆａｂＩ遺伝子（
ＣＴ１０４）と相同性を共有する。ＴＣＰ−２１細胞株を使用して同定された、
クローン１１−Ｃ１２−９１（配列番号６３）は、ＯＭＰ２遺伝子（ＣＴ４４３
）の一部である２６９ｂｐインサートを有し、そしてＣ．ｐｎｕｅｍｏｎｉａｅ
の６０ｋＤａのシステインに富む外膜タンパク質と相同性を共有する。
【０５０３】 ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定された、クローン１１−Ｇ１０−４６（配列
番号６２）は、ハイポセティカルタンパク質ＣＴ６１０に対して相同性を共有す
る６８８ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定された、ク
ローン１１−Ｇ１−３４（配列番号６１）は、１２１５ｂｐのインサートの大き
さを有する、２つの部分的なオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を有する
。一方のＯＲＦは、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ遺伝子（ＣＴ３７６）に対して相
同性を共有し、そして他方のＯＲＦは、グリコーゲンヒドロラーゼ遺伝子（ＣＴ
０４２）に対して相同性を共有する。ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定された、
クローン１１−Ｈ３−６８（配列番号６０）は、全体のインサートの大きさが１
１８０ｂｐである、２つのＯＲＦを有する。一方の部分的なＯＲＦは、プラスミ
ドによりコードされるＰＧＰ６−Ｄ病原性タンパク質をコードし、一方、第２の
ＯＲＦは、Ｌ１リボソーム遺伝子（ＣＴ３１８）について完全なＯＲＦである。
ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定される、クローン１１−Ｈ４−２８（配列番号
５９）は、５５２ｂｐのインサートの大きさを有し、そしてｄｎａＫ遺伝子（Ｃ
Ｔ３９６）についてＯＲＦの一部である。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定され
る、クローン１２−Ｂ３−９５（配列番号５８）は、４６３ｂｐのインサートの
大きさを有し、そしてリポアミドデヒドロゲナーゼ遺伝子（ＣＴ５５７）のＯＲ
Ｆの一部である。クローン１５−Ｇ１−８９および１２−Ｂ３−９５は同一であ
り（それぞれ、配列番号５５および５８）、ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定さ
れ、４６３ｂｐのインサートの大きさを有し、そしてリポアミドデヒドロゲナー
ゼ遺伝子（ＣＴ５５７）のＯＲＦの一部である。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同
定される、クローン１２−Ｇ３−８３（配列番号５７）は、１５３７ｂｐのイン
サートの大きさを有し、そしてハイポセティカルタンパク質ＣＴ６２２のＯＲＦ
の一部を有する。
【０５０４】 ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定される、クローン２３−Ｇ７−６８（配列番
号７９）は、９５０ｂｐのインサートを含み、そしてＬ１１リボソームＯＲＦの
小さな部分、Ｌ１リボソームタンパク質のＯＲＦ全体、およびＬ１０リボソーム
タンパク質のＯＲＦの一部を含む。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定された、ク
ローン２２−Ｆ８−９１（配列番号８０）は、このクローンの相補鎖上のｐｍｐ
Ｃ ＯＲＦの一部を含む３９５ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−３細胞株を使
用して同定された、クローン２１−Ｅ８−９５（配列番号８１）は、ＣＴ６１３
ＯＲＦの一部、ＣＴ６１２の完全ＯＲＦ、ＣＴ６１１の完全ＯＲＦおよびＣＴ
６１０のＯＲＦの一部を含む、２，０８５ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−３
細胞株を使用して同定された、クローン１９−Ｆ１２−５３（配列番号８２）は
、ＣＴ８５８ ＯＲＦの部分およびｒｅｃＡ ＯＲＦの小さな部分を含む、４０
５ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定された、クローン
１９−Ｆ１２−５３（配列番号８３）は、グルタミルｔＲＮＡシンテターゼをコ
ードするＣＴ４５５のＯＲＦの一部である、３７９ｂｐのインサートを含む。Ｔ
ＣＴ−３細胞株を使用して同定された、クローン１９−Ａ５−５４（配列番号８
４）は、潜在性プラスミドのＯＲＦ３（このクローンの相補鎖）の一部である７
１５ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定された、クロー
ン１７−Ｅ１１−７２（配列番号８５）は、Ｏｐｐ ２およびｐｍｐＤのＯＲＦ
の一部である、４７６ｂｐのインサートを含む。このクローンのｐｍｐＤ領域は
、クローン１５−Ｈ２−７６のｐｍｐＤ領域に含まれる。ＴＣＴ−３細胞株を使
用して同定された、クローン１７−Ｃ１−７７（配列番号８６）は、ＣＴ８５７
ＯＲＦの一部、およびＣＴ８５８ ＯＲＦの一部である、１５５１ｂｐのイン
サートを含む。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定された、クローン１５−Ｈ２−
７６（配列番号８７）は、ｐｍｐＤ ＯＲＦの大きな部分、ＣＴ０８９ ＯＲＦ
の一部、およびＳｙｃＥのＯＲＦの一部を含む、３，０３１ｂｐのインサートを
含む。クローン１５−Ａ３−２６（配列番号８８）は、ＣＴ８５８のＯＲＦの一
部を含む９７６ｂｐのインサートを含む。ＴＣＴ−１０細胞株を使用して同定さ
れた、クローン１７−Ｇ４−３６（配列番号２６７）は、プラスミド中にβ−ｇ
ａｌをインフレーム（ｉｎ ｆｒａｍｅ）で含み、そしてＤＮＡ指向性ＲＮＡポ
リメラーゼβサブユニット（ＳｅｒＤにおけるＣＴ３１５）のＯＲＦの一部に対
して相同性を共有する、６８０ｂｐのインサートを含む。
【０５０５】 上記のいくつかのクローンは、種々の多型性膜タンパク質に対して相同性を共
有する。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのゲノム配列は、ｐｍｐ
といわれる、９つの多型性膜タンパク質遺伝子のファミリーを含む。これらの遺
伝子は、ｐｍｐＡ、ｐｍｐＢ、ｐｍｐＣ、ｐｍｐＤ、ｐｍｐＥ、ｐｍｐＦ、ｐｍ
ｐＧ、ｐｍｐＨ、およびｐｍｐＩと命名される。これらの遺伝子から発現される
タンパク質は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染に応答する防御免疫応答の生成において
生物学的関連性があると考えられている。特に、ｐｍｐＣ、ｐｍｐＤ、ｐｍｐＥ
およびｐｍｐＩは、推定シグナルペプチドを含み、このことは、それらが外膜タ
ンパク質であること、従って、潜在的な免疫学的標的であることを示唆する。
【０５０６】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ血液型亜型配列
に基づいて、プライマー対を、ｐｍｐＣ、ｐｍｐＤ、ｐｍｐＥ、ｐｍｐＧ、ｐｍ
ｐＨおよびｐｍｐＩの全長フラグメントをＰＣＲ増幅するために設計した。得ら
れたフラグメントを、ＤＮＡワクチンベクターＪＡ４３０４またはＪＡＬ（これ
は、改変したリンカーを有するＪＡ４３０４である）（ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ
Ｂｅｅｃｈａｍ、Ｌｏｎｄｏｎ、Ｅｎｇｌａｎｄ）中にサブクローニングした。
詳細には、ｐｍｐＣを、それぞれ、配列番号１９７および１９８において提供さ
れる、以下：
【０５０７】
【化１】 を使用して、ＪＡＬベクター中にサブクローニングした。当該分野で周知の条件
下でのこの遺伝子のＰＣＲ増幅、およびＪＡＬベクターの５’ＡＳＣＩ／３’
ＭｌｕＩ部位中への連結を、Ｋｏｚａｋ様配列を作製するためにＡＴＧの上流に
短いヌクレオチド配列ＧＣＡＡＴＣ（配列番号１９９）を挿入することによって
完了した。得られた発現ベクターは、ハイポセティカルシグナル配列を含む５３
２５個のヌクレオチド（配列番号１７３）を含む全長ｐｍｐＣ遺伝子（これは、
１８７ｋＤのタンパク質（配列番号１７９）をコードする）を含んだ。ｐｍｐＤ
遺伝子を、以下のオリゴ：
【０５０８】
【化２】 を使用して、この遺伝子をＰＣＲ増幅した後に、ＪＡ４３０４ワクチンベクター
中にサブクローニングした。この遺伝子を、当該分野において周知の標準的な技
術を使用して、ＪＡ４３０４ワクチンベクターの５’平滑化ＨＩＩＩ／３’Ｍｌ
ｕＩ部位中に連結した。ＣＡＡＴＣ（配列番号２０２）を、ＡＴＧの上流に挿入
して、Ｋｏｚａｋ様配列を作製した。このクローンは、Ｋｏｚａｋ様配列の最後
のグリシンと同様に、ＨｉｎｄＩＩＩ部位の最後のトレオニンが平滑手順に起因
して欠けているという点で独特である。インサートの４５９３ヌクレオチドフラ
グメント（配列番号１７２）は、ハイポセティカルシグナル配列を含むｐｍｐＤ
の全長遺伝子（これは、１６１ｋＤのタンパク質（配列番号１７８）をコードす
る）である。ｐｍｐＥを、以下：
【０５０９】
【化３】 を使用して、ＪＡ４３０４ベクター中にサブクローニングした。ＰＣＲ増幅の後
に、この遺伝子を、ＪＡ４３０４の５’平滑化ＨＩＩＩ／３’ ＭｌｕＩ部位中
に連結した。これを容易にするために、短いヌクレオチド配列であるＴＧＣＡＡ
ＴＣ（配列番号２９３）を、Ｋｏｚａｋ様配列を作製し、かつＨｉｎｄＩＩＩ部
位を再構成するために、開始コドンの上流に付加した。このインサートは、ハイ
ポセティカルシグナル配列を含む全長ｐｍｐＥ遺伝子（配列番号１７１）である
。ｐｍｐＥ遺伝子は、１０５ｋＤのタンパク質（配列番号１７７）をコードする
。ｐｍｐＧ遺伝子を、以下：
【０５１０】
【化４】 を使用して、ＰＣＲ増幅し、そしてＪＡ４３０４ベクター中にサブクローニング
した。同様のクローニングストラテジーは、ｐｍｐＩ遺伝子およびｐｍｐＫ遺伝
子についても従った。さらに、プライマー対を、ｐｍｐ遺伝子の全長フラグメン
トまたは重複フラグメントをＰＣＲ増幅するために設計し、次いで、これは、ｐ
ＥＴ１７ｂベクター（Ｎｏｖａｇｅｎ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）中でのタンパク
質発現のためにサブクローニングし、そして発現、およびＮｏｖａｇｅｎによる
ヒスチジン−ニッケルクロマトグラフィー方法論を利用するその後の精製のため
にＥ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳ中にトランスフェクトした。以下に記載
されるような、組換えタンパク質をコードするいくつかの遺伝子は、このタンパ
ク質の発現を容易にするためにネイティブなシグナル配列を欠く。ｐｍｐＣの全
長タンパク質の発現を、２つの重複フラグメント（アミノ酸末端およびカルボキ
シ末端を示す）の発現を通して達成した。シグナル配列を欠くｐｍｐＣアミノ末
端部分（配列番号１８７、配列番号１９５に提供される対応するアミノ酸配列を
有する）のサブクローニングは、このベクターの５’ＮｄｅＩ／３’ＫＰＮクロ
ーニング部位に、以下：
【０５１１】
【化５】 を使用した。この遺伝子のカルボキシ末端部分であるｐｍｐＣカルボキシ末端フ
ラグメント（配列番号１８６、配列番号１９４に提供される対応するアミノ酸配
列を有する）を、以下のプライマー：
【０５１２】
【化６】 を使用して、発現ベクターの５’ＮｈｅＩ／３’ＫＰＮクローニング部位中にサ
ブクローニングした。ｐｍｐＤもまた、２つの重複タンパク質として発現させた
。シグナル配列を欠くｐｍｐＤアミノ酸末端部分（配列番号１８５、配列番号１
９３に提供される対応するアミノ酸配列を有する）は、ｐＥＴ１７ｂの開始コド
ンを含み、そして８０ｋＤのタンパク質として発現する。タンパク質の発現およ
び精製の目的のために、６個のヒスチジンのタグを開始コドンに続けて、そして
この遺伝子の２８番目のアミノ酸（ヌクレオチド８４）に融合させる。ベクター
の５’ＮｄｅＩ／３’ＫＰＮクローニング部位中にスプライスするために、以下
のプライマーを使用した：
【０５１３】
【化７】 。ｐｍｐＤカルボキシ末端部分（配列番号１８４）を、９２ｋＤａのタンパク質
（配列番号１９２）として発現させた。発現およびその後の精製のために、さら
なるメチオニン、アラニンおよびセリン（これは、ｐＥＴ１７ｂベクター由来の
開始コドンおよび最初の２つのアミノ酸を示す）を、含ませた。メチオニン、ア
ラニン、およびセリンの下流の６個のヒスチジンのタグを、この遺伝子の６９１
番目のアミノ酸（ヌクレオチド２０７３）に融合させる。以下：
【０５１４】
【化８】 を使用して、インサートを、発現ベクターの５’ＮｈｅＩ／３’ＫＰＮクローニ
ング部位中にサブクローニングした。ｐｍｐＥを、１０６ｋＤのタンパク質（配
列番号１８３、配列番号１９１に提供される対応するアミノ酸配列を有する）と
して発現させた。ｐｍｐＥインサートはまた、ネイティブなシグナル配列を欠く
。当該分野において周知の条件下での、この遺伝子のＰＣＲ増幅を、以下のオリ
ゴプライマー：
【０５１５】
【化９】 を使用して行い、そして増幅されたインサートをＪＡ４３０４の５’ＢａｍＨＩ
／３’ＥｃｏＲＩ部位中に連結した。配列番号２１７に提供される、短いヌクレ
オチド配列を、Ｋｏｚａｋ様配列を作製し、かつＨｉｎｄＩＩＩ部位を再構成す
るために、開始コドンの上流に挿入した。発現されたタンパク質は、ｐＥＴ１７
ｂ発現ベクター由来の開始コドンおよび下流の２１個のアミノ酸（すなわち、Ｍ
ＡＳＭＴＧＧＱＱＭＧＲＤＳＳＬＶＰＳＳＤＰ（配列番号２１８））を含む。さ
らに、６個のヒスチジンのタグを、上記の配列の上流に含ませ、そしてこの遺伝
子の２８番目のアミノ酸（ヌクレオチド８４）（これは、ハイポセティカルシグ
ナルペプチドを除去する）に融合する。配列番号１９１に提供される対応するア
ミノ酸を有する配列番号１８３に提供される配列は、これらのさらなる配列を含
まない。ｐｍｐＧ遺伝子（配列番号１８２、配列番号１９０に提供される対応す
るアミノ酸配列を有する）を、以下のオリゴプライマー：
【０５１６】
【化１０】 を使用して当該分野において周知の条件下でＰＣＲ増幅し、そして発現ベクター
の５’ＫＰＮ／３’ＮｏｔＩクローニング部位中に連結した。発現されたタンパ
ク質は、アミノ末端にさらなるアミノ酸配列（すなわち、ＭＡＳＭＴＧＧＱＱＮ
ＧＲＤＳＳＬＶＰＨＨＨＨＨＨ（配列番号２２１））を含み、これは、ｐＥＴ１
７ｂ発現ベクター由来の開始コドンおよびさらなる配列を含む。ｐｍｐＩ遺伝子
（配列番号１８１、配列番号１８９に提供される対応するアミノ酸配列を有する
）を、以下のオリゴプライマー：
【０５１７】
【化１１】 を使用して、当該分野において周知の条件下でＰＣＲ増幅し、そして発現ベクタ
ーに５’ＮｈｅＩ／３’ＳｐｅＩクローニング部位において連結した。９５ｋＤ
の発現したタンパク質は、このタンパク質のアミノ末端に、ｐＥＴ１７ｂベクタ
ーに由来する、開始コドンとさらなるアラニンおよびセリンとを含む。さらに、
６個のヒスチジンのタグを、この遺伝子の２１番目のアミノ酸に融合させる。こ
れは、ハイポセティカルシグナルペプチドを除去する。
【０５１８】 ＴＣＴ−３細胞株を使用して同定された、クローン１４Ｈ１−４（配列番号５
６）は、ＴＳＡ遺伝子（チオール特異的抗酸化因子−ＣＴ６０３）の完全なＯＲ
Ｆを含む（ＣＴ６０３ ＯＲＦは、Ｃ．ｐｎｕｅｍｏｎｉａｅ由来のＣＰｎ０７
７８のホモログである）。クローン１４−Ｈ１−４におけるＴＳＡオープンリー
ディングフレームを、発現したタンパク質がさらなるメチオニンおよび６×ヒス
チジンタグ（アミノ末端）を有するように増幅した。増幅されたインサートを、
ｐＥＴ１７ｂベクターのＮｄｅ／ＥｃｏＲＩ部位中にサブクローニングした。Ｉ
ＰＴＧによるこのクローンの誘導の際に、２２．６ｋＤａのタンパク質を、Ｎｉ
−ＮＴＡアガロースアフィニティークロマトグラフィーによって精製した。ＴＳ
Ａ遺伝子をコードするクローン１４−Ｈ１−４の１９５個のアミノ酸のＯＲＦに
ついて決定されたアミノ酸配列を、配列番号６５に提供する。さらなる分析によ
り、ＴＳＡ遺伝子の全長クローン（ＣＴＬ２−ＴＳＡ−ＦＬといわれる）が生成
された。これは、配列番号９２に提供される全長アミノ酸配列を有する。
【０５１９】 さらなる研究により、上記のようにＴＣＴ−１およびＴＣＴ−３ Ｔ細胞株に
より同定される１０個のさらなるクローンが生成された。ＴＣＴ−１株により同
定されたクローンは、１６−Ｄ４−２２、１７−Ｃ５−１９、１８−Ｃ５−２、
２０−Ｇ３−４５および２１−Ｃ７−６６であり；ＴＣＴ−３細胞株により同定
されたクローンは、１７−Ｃ１０−３１、１７−Ｅ２−９、２２−Ａ１−４９お
よび２２−Ｂ３−５３である。クローン２１−Ｇ１２−６０は、ＴＣＴ−１細胞
株およびＴＣＴ−３ Ｔ細胞株の両方によって認識された。ＴＣＴ−１細胞株を
使用して同定された、クローン１６−Ｄ４−２２（配列番号１１９）は、２つの
遺伝子（哺乳動物細胞内での増殖のためのＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓプラスミ
ドのオープンリーディングフレーム３（ＯＲＦ３）およびＯＲＦ４の一部）を含
む９５３ｂｐのインサートを含む。クローン１７−Ｃ５−１９（配列番号１１８
）は、ｃｌｐＰ １プロテアーゼをコードする、ＤＴ４３１のＯＲＦの一部、お
よびＣＴ４３０（ジアミノピメレート（ｄｉａｍｉｎｏｐｉｍｅｌａｔｅ）エピ
メラーゼ）のＯＲＦの一部を含む、９５１ｂｐのインサートを含む。クローン１
８−Ｃ５−２（配列番号１１７）は、ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定された４
４６ｂｐのインサートを有する、Ｓ１リボソームタンパク質のＯＲＦの一部であ
る。ＴＣＴ−１細胞株を使用して同定された、クローン２０−Ｇ３−４５（配列
番号１１６）は、ｐｍｐＢ遺伝子（ＣＴ４１３）の一部である４３７ｂｐのイン
サートを含む。ＴＣＴ−１株により同定された、クローン２１−Ｃ７−６６（配
列番号１１５）は、ｄｎａＫ様タンパク質の一部をコードする、９９５ｂｐのイ
ンサートを含む。このクローンのインサートは、ｄｎａＫ遺伝子ＣＴ３９６の一
部であることが示された、ＴＣＴ−３クローン１１−Ｈ４−２８（配列番号５９
）のインサートと重複しない。ＴＣＴ−３細胞株により同定された、クローン１
７−Ｃ１０−３１（配列番号１１４）は、９７６ｂｐのインサートを含む。この
クローンは、ＣＴ８５８のＯＲＦの一部（ＩＲＢＰドメインおよびＤＨＲドメイ
ンを含むプロテアーゼ）を含む。クローン１７−Ｅ２−９（配列番号１１３）は
、２つの遺伝子（ＣＴ６１１およびＣＴ６１０）のＯＲＦの一部を含み、これは
、１１４２ｂｐのインサートに及ぶ。ＴＣＴ−３株を使用して同定された、クロ
ーン２２−Ａ１−４９（配列番号１１２）もまた、６９８ｂｐのインサート中に
２つの遺伝子を含む。ＣＴ６６０（ＤＮＡジャイレース（ｇｙｒＡ ２）のＯＲ
Ｆの一部は、上鎖（ｔｏｐ ｓｔｒａｎｄ）上に存在し、ここでハイポセティカ
ルタンパク質ＣＴ６５９の完全ＯＲＦは、相補鎖上に存在する。ＴＣＴ−１株に
より同定された、クローン２２−Ｂ３−５３（配列番号１１１）は、ＧｒｏＥＬ
（ＣＴ１１０）のＯＲＦの一部をコードする２６７ｂｐのインサートを有する。
ＴＣＴ−１細胞株およびＴＣＴ−３細胞株の両方によって同定された、クローン
２１−Ｇ１２−６０（配列番号１１０）は、ハイポセティカルタンパク質ＣＴ８
７５、ＣＴ２２９およびＣＴ２２８の部分的ＯＲＦを含む１４６１ｂｐのインサ
ートを含む。
【０５２０】 さらなるＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原を、いくつかのＣｈｌａｍｙｄｉａ感染個体
からプールした血清を用いてＬａｍｂｄａ Ｓｃｒｅｅｎ−１ベクター（Ｎｏｖ
ａｇｅｎ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）中のＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａ
ｔｉｓ（ＬＧＶ ＩＩ 血清型亜型）のゲノム発現ライブラリーを、当該分野に
おいて周知の技術を用いてスクリーニングすることによって得た。引き続き、免
疫反応性クローンを同定し、そしてＣｈｌａｍｙｄｉａ遺伝子を含むインサート
を配列決定した：ＣＴＬ２＃１（配列番号７１）；ＣＴＬ２＃２（配列番号７０
）；ＣＴＬ２＃３−５’（配列番号７２、５’末端を示す、第１の決定されたゲ
ノム配列）；ＣＴＬ２＃３−３’（配列番号７３、３’末端を示す、第２の決定
されたゲノム配列）；ＣＴＬ２＃４（配列番号５３）；ＣＴＬ２＃５（配列番号
６９）；ＣＴＬ２＃６（配列番号６８）；ＣＴＬ２＃７（配列番号６７）；ＣＴ
Ｌ２＃８ｂ（配列番号５４）；ＣＴＬ２＃９（配列番号６６）；ＣＴＬ２＃１０
−５’（配列番号７４、５’末端を示す、第１の決定されたゲノム配列）；ＣＴ
Ｌ２＃１０−３’（配列番号７５、３’末端を示す、第２の決定されたゲノム配
列）；ＣＴＬ２＃１１−５’（配列番号４５、５’末端を示す、第１の決定され
たゲノム配列）；ＣＴＬ２＃１１−３’（配列番号４４、３’末端を示す、第２
の決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２＃１２（配列番号４６）；ＣＴＬ２＃１６
−５’（配列番号４７）；ＣＴＬ２＃１８−５’（配列番号４９、５’末端を示
す、第１の決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２＃１８−３’（配列番号４８、３
’末端を示す、第２の決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２＃１９−５’（配列番
号７６、５’末端を示す、決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２＃２１（配列番号
５０）；ＣＴＬ２＃２３（配列番号５１）；およびＣＴＬ２＃２４（配列番号５
２）。
【０５２１】 さらなるＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ抗原を、血清学的発現
クローニングによって同定した。これらの研究で、上記のように、いくつかのＣ
ｈｌａｍｙｄｉａ感染個体からプールした血清を用いたが、ＩｇＡ抗体およびＩ
ｇＭ抗体を、二次抗体としてＩｇＧに加えて用いた。クローンを、Ｃｈｌａｍｙ
ｄｉａ感染に対する早期免疫応答（すなわち、粘膜体液性免疫応答）によって認
識される抗原の増強した検出を、この方法によってスクリーニングした。以下の
免疫反応性クローンを、特徴付け、そしてＣｈｌａｍｙｄｉａ遺伝子を含むイン
サートを、配列決定した：ＣＴＬ２ｇａｍ−１（配列番号２９０）；ＣＴＬ２ｇ
ａｍ−２（配列番号２８９）；ＣＴＬ２ｇａｍ−５（配列番号２８８）；ＣＴＬ
２ｇａｍ−６−３’（配列番号２８７、３’末端を示す、第２の決定されたゲノ
ム配列）；ＣＴＬ２ｇａｍ−６−５’（配列番号２８６、５’末端を示す、第１
の決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２ｇａｍ−８（配列番号２８５）；ＣＴＬ２
ｇａｍ−１０（配列番号２８４）；ＣＴＬ２ｇａｍ−１３（配列番号２８３）；
ＣＴＬ２ｇａｍ−１５−３’（配列番号２８２、３’末端を示す、第２の決定さ
れたゲノム配列）；ＣＴＬ２ｇａｍ−１５−５’（配列番号２８１、５’末端を
示す、第１の決定されたゲノム配列）；ＣＴＬ２ｇａｍ−１７（配列番号２８０
）；ＣＴＬ２ｇａｍ−１８（配列番号２７９）；ＣＴＬ２ｇａｍ−２１（配列番
号２７８）；ＣＴＬ２ｇａｍ−２３（配列番号２７７）；ＣＴＬ２ｇａｍ−２４
（配列番号２７６）；ＣＴＬ２ｇａｍ−２６（配列番号２７５）；ＣＴＬ２ｇａ
ｍ−２７（配列番号２７４）；ＣＴＬ２ｇａｍ−２８（配列番号２７３）；ＣＴ
Ｌ２ｇａｍ−３０−３’（配列番号２７２、３’末端を示す、第２の決定された
ゲノム配列）；およびＣＴＬ２ｇａｍ−３０−５’（配列番号２７１、５’末端
を示す、第１の決定されたゲノム配列）。
【０５２２】 （実施例２） （Ｃｈｌａｍｉｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ抗原によるＴ細胞増殖および
インターフェロン−γ産生の誘導） 組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ抗原がＴ細胞増殖および
インターフェロン−γ産生を誘導する能力を、以下のように決定する。
【０５２３】 タンパク質をＩＰＴＧで誘導し、そしてＮｉ−ＮＴＡアガロースアフィニティ
クロマトグラフィー（Ｗｅｂｂら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １５７：５０３
４〜５０４１、１９９６）によって精製した。次いで、精製したポリペプチドを
、ＰＢＭＣ調製物においてＴ細胞増殖を誘導する能力についてスクリーニングす
る。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ親由来のＰＢＭＣ、およびそのＴ細胞がＣｈｌ
ａｍｙｄｉａ抗原に応答して増殖することが既知である正常なドナー由来のＰＢ
ＭＣを、１０％のプールしたヒト血清および５０μｇ／ｍｌのゲンタマイシンを
補充したＲＰＭＩ １６４０を含む培地中で培養する。精製したポリペプチドを
、０．５〜１０μｇ／ｍＬの濃度で２連で加える。２００μｌ容量の９６ウェル
丸底プレート中で６日間の培養後に、下記のようにＩＦＮ−γレベルを決定する
ために５０μｌの培地を各ウェルから取り出す。次いで、プレートを、さらに１
８時間、１μＣｉ／ウェルのトリチウム化チミジンで標識（ｐｕｌｓｅ）し、収
集し、そしてトリチウムの取りこみをガスシンチレーションカウンターを用いて
決定した。両方の複製物において、培地単独中で培養される細胞において観察さ
れる増殖よりも３倍高い増殖を生じる画分を、陽性と見なす。
【０５２４】 ＩＦＮ−γを酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）を用いて測定す
る。ＥＬＩＳＡプレートを、ＰＢＳ中のヒトＩＦＮ−γに対するマウスモノクロ
ーナル抗体（ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）で、室温で４
時間コートする。次いで、ウェルを５％（Ｗ／Ｖ）脱脂粉乳を含有するＰＢＳで
、室温で１時間ブロックする。プレートをＰＢＳ／０．２％ ＴＷＥＥＮ−２０
で６回洗浄し、そして、ＥＬＩＳＡプレート中で培養培地に１：２に希釈したサ
ンプルを、室温で一晩インキュベートする。プレートを再度洗浄し、そしてＰＢ
Ｓ／１０％正常ヤギ血清中に１：３０００に希釈したポリクローナルウサギ抗ヒ
トＩＦＮ−γ血清を、各ウェルに添加する。次いで、プレートを室温で２時間イ
ンキュベートし、洗浄し、そして西洋ワサビペルオキシダーゼ結合抗ウサギＩｇ
Ｇ（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｏ．，Ｓｔ，Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）を、Ｐ
ＢＳ／５％脱脂粉乳中に１：２０００希釈で添加する。室温でのさらなる２時間
のインキュベートの後、プレートを洗浄し、そしてＴＭＢ基質を添加する。反応
を２０分後に１Ｎ 硫酸で停止する。参照波長として５７０ｎｍを用いて、光学
密度を４５０ｎｍで決定する。両方の複製物に生じる、培地単独で培養した細胞
由来の平均ＯＤより２倍高いＯＤおよび３標準偏差を示す画分を、陽性とみなす
。
【０５２５】 上記の方法論を用いて、組換え１Ｂ１−６６タンパク質（配列番号５）および
配列番号５のアミノ酸残基４８−６７（配列番号１３；１−Ｂ１−６６／４８−
６７と称する）およびアミノ酸残基５８−７７（配列番号１４；１−Ｂ１−６６
／５８−７７と称する）にそれぞれ対応する２つの合成ペプチドが、Ｃ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩのゲノムライブラリーをスクリーニングするた
めに用いたＣｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株において、増殖応答およびＩＦＮ
−γ産生を誘導することを見出した。
【０５２６】 さらなる研究は、リボソームＳ１３タンパク質中のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ特異的Ｔ細胞エピトープを同定した。当該分野において周知の、標準エピトー
プマッピング技術を使用して、リボソームＳ１３タンパク質（ｒＳ１３）中の２
つのＴ細胞エピトープを、ドナーＣＬ−８（Ｔ細胞株ＴＣＬ−８ ＥＢ／ＤＣ）
由来のＣｈｌａｍｉｄｉａ特異的Ｔ細胞株で同定した。図８は、第一のペプチド
、ｒＳ１３ １−２０（配列番号１０６）が、対応するＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ
ｅ配列と１００％同一であることを示し、このことは組換えＣ．ｔｒａｃｈｏｍ
ａｔｉｓ−ｒＳ１３およびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ｒＳ１３に対するＴ細胞
株の交差反応性を説明する。第二のペプチドｒＳ１３ ５６−７５（配列番号１
０８）に対する応答は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ特異的であり、このことは
、この健常な無症候性ドナーにおけるｒＳ１３応答がＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓに対する曝露によって誘発されたが、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅに対する曝露
によっても、他の任意の微生物感染によっても誘発されなかったことを示す。
【０５２７】 実施例１に記載されるように、ＴＣＰ−２１細胞株を用いて同定されたクロー
ン１１−Ｃ１２−９１（配列番号６３）は、ＯＭＰ２遺伝子（ＣＴ４４３）の一
部であり、かつＯＭＣＢと称されるＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの６０ｋＤａシス
テインリッチ外膜タンパク質と相同性を有する２６９ｂｐのインサートを有する
。反応性エピトープをさらに決定するために、エピトープマッピングを一連の重
複ペプチドおよび以前に記載されたイムノアッセイを用いて実施した。簡単には
、増殖応答を、１×１０4の単球由来樹状細胞の存在下で、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍ
ａｔｉｓおよびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ由来の非感染性基本小体、またはＣ．
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓもしくはＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのＯＭＣＢタンパク
質のタンパク質配列由来のペプチドのいずれか（０．１μｇ／ｍｌ）を用いて、
２．５×１０4ＴＣＰ−２１ Ｔ細胞を刺激することによって決定した。ＴＣＰ
−２１ Ｔ細胞は、エピトープＣＴ−ＯＭＣＢ ＃１６７−１８６、ＣＴ−ＯＭ
ＣＢ ＃１７１−１９０、ＣＴ−ＯＭＣＢ ＃１７１−１８６、および、より低
い程度にＣＴ−ＯＭＣＢ ＃１７５−１８６（それぞれ、配列番号２４９〜２５
２）に応答した。特に、ＴＣＰ−２１ Ｔ細胞株はまた、相同なＣ．ｐｎｅｕｍ
ｏｎｉａｅペプチドＣＰ−ＯＭＣＢ ＃１７１−１８６（配列番号２５３）に対
する増殖応答を示し、このペプチドに対する応答は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓペプチドに対する応答に等しいか、またはそれよりも高い。２位でのアミノ酸
置換（すなわち、ＧｌｕからＡｓｐ）および４位でのアミノ酸置換（すなわち、
ＳｅｒからＣｙｓ）は、Ｔ細胞の増殖応答を変えず、したがって、このエピトー
プがＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓとＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅとの間の交差反応
性エピトープであることを示した。
【０５２８】 上記のエピトープをさらに決定するために、さらなるＴ細胞株であるＴＣＴ−
３を、エピトープマッピング実験に用いた。イムノアッセイを、Ｃ．ｔｒａｃｈ
ｏｍａｔｉｓ由来のペプチドのみを試験したことを除いて、上記のように実施し
た。Ｔ細胞は、２つのペプチド（ＣＴ−ＯＭＣＢ ＃１５２−１７１およびＣＴ
−ＯＭＣＢ ＃１５７−１７６（それぞれ、配列番号２４６および２４７））に
増殖応答を与え、それにより、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのシステインリッチ
外膜タンパク質中にさらなる免疫原性エピトープを決定した。
【０５２９】 クローン１４Ｈ１−４（配列番号５６、配列番号９２に提供される全長アミノ
酸配列に対応する）を、以前に記載されたＣＤ４ Ｔ細胞発現クローニング系中
のＴＣＴ−３細胞株を用いて同定し、そして、ＴＳＡと称されるチオール特異的
抗酸化遺伝子（ＣＴ６０３）に関する完全ＯＲＦを含むことを示した。エピトー
プマッピングイムノアッセイを、上記のように実施し、エピトープをさらに規定
した。ＴＣＴ−３ Ｔ細胞株は、重複ペプチドＣＴ−ＴＳＡ ＃９６−１１５、
ＣＴ−ＴＳＡ ＃１０１−１２０およびＣＴ−ＴＳＡ ＃１０６−１２５（それ
ぞれ、配列番号２５４〜２５６）に対する強力な増殖性応答を示し、Ｃ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型ＬＧＶ ＩＩのチオール特異的抗酸化遺伝子中にお
ける免疫反応性のエピトープを示した。
【０５３０】 （実施例３） （合成ポリペプチドの調製） ポリペプチドを、ＨＰＴＵ（Ｏ−ベンゾトリアゾール−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−
テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート）活性を有するＦＭＯＣ
化学を用いる、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ ９０５０ ペプチド合成器で合成し得る。
Ｇｌｙ−Ｃｙｓ−Ｇｌｙ配列を、ペプチドのアミノ末端に結合し、ペプチドの結
合法または標識法を提供し得る。固体支持相からのペプチドの切断を、以下の切
断混合物を用いて実施し得る：トリフルオロ酢酸：エタンジチオール：チオアニ
ソール：水：フェノール（４０：１：２：２：３）。２時間の切断の後、ペプチ
ドを冷メチル−ｔ−ブチルエーテルで沈殿し得る。次いで、ペプチドペレットを
、０．１％のトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）含有水に溶解し、そしてＣ１８逆相Ｈ
ＰＬＣによる精製の前に凍結乾燥し得る。水（０．１％のＴＦＡを含有）中０〜
６０％のアセトニトリル勾配（０．１％のＴＦＡを含有）を用いて、ペプチドを
溶出し得る。純粋画分の凍結乾燥後、ペプチドをエレクトロスプレー質量分析を
用いて、およびアミノ酸分析によって特徴付け得る。
【０５３１】 （実施例４） （レトロウイルス発現ベクター系および部分配列免疫学的解析を用いるＣｈｌ
ａｍｙｄｉａ抗原をコードするＤＮＡ配列の単離および特徴付け） Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩのゲノムライブ
ラリーを、ＢａｍＨＩ、ＢｇｌＩＩ、ＢｓｔＹｉおよびＭｂｏＩの制限酵素を用
いる制限消化によって構築した。続いて、制限消化フラグメントを、レトロウイ
ルスベクターｐＢＩＢ−ＫＳ１，２，３のＢａｍＨＩ部位に連結した。このベク
ターセットを改変して、図２に示すような、短いＤＮＡゲノムフラグメント由来
のタンパク質を発現することを可能にするためのＫｏｓａｋ翻訳開始部位および
停止コドンを含むように改変した。８０クローンのＤＮＡプールを調製し、そし
て、Ｐｅａｒ，Ｗ．Ｓ．、Ｓｃｏｔｔ，Ｍ．Ｌ．およびＮｏｌａｎ，Ｇ．Ｐ．、
Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｏｆ Ｈｉｇｈ Ｔｉｔｒｅ，Ｈｅｌｐｅｒ−ｆｒｅｅ
ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ ｂｙ Ｔｒａｎｓｉｅｎｔ Ｔｒａｎｓｆｅｃｔ
ｉｏｎ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ：Ｇｅ
ｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ、Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ、Ｔｏ
ｔｏｗａ、ＮＪ、４１−５７頁に記載のように、レトロウイルスパッケージング
株Ｐｈｏｅｎｉｘ−Ａｍｐｈｏにトランスフェクトした。次いで、レトロウイル
ス形態のＣｈｌａｍｕｄｉａライブラリーを、Ｈ２−Ｌｄ発現Ｐ８１５細胞に形
質導入し、次いで、この細胞を、抗原特異的Ｔ細胞株を刺激するための標的細胞
として用いた。
【０５３２】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的、マウスＨ２d拘束ＣＤ８＋Ｔ細胞株を、Ｓｔａｒ
ｎｂａｃｈ，Ｍ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５３：５１８３、１９９４に記載の
ように、照射したＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ感染Ｊ７７４細胞および照射した
同系脾臓細胞を用いる反復回の刺激によって培養中で拡大させた。Ｃｈｌａｍｙ
ｄｉａ特異的Ｔ細胞株を用いて、レトロウイルス形質導入Ｐ８１５細胞によって
発現される上記のＣｈｌａｍｙｄｉａゲノムライブラリーをスクリーニングした
。陽性ＤＮＡプールを、Ｅｌｉｓｐｏｔ分析（Ｌａｌｖａｎｉら、Ｊ．Ｅｘｐｅ
ｒｉｍｅｎｔａｌ Ｍｅｄｃｉｎｅ １８６：８５９−８６５、１９９７を参照
のこと）を用いるＩＦＮ−γ産生の検出によって同定した。
【０５３３】 ２つの陽性プール（２Ｃ７および２Ｅ１０と称する）を、ＩＦＮ−γ Ｅｌｉ
ｓｐｏｔ分析によって同定した。プール２Ｃ７由来のＰ８１５細胞の安定した形
質導入物を、限界希釈によってクローニングし、個々のクローンを、Ｃｈｌａｍ
ｙｄｉａ特異的ＣＴＬ株からＩＦＮ−γ産生を誘発するこれらの能力に基づいて
選択した。このスクリーニングプロセスから、４つの陽性クローン（２Ｃ７−８
、２Ｃ７−９、２Ｃ７−１９および２Ｃ７−２１と称する）を選択した。同様に
、陽性プール２Ｅ１０をさらにスクリーニングし、３つのインサートを含むさら
なる陽性クローンを生じた。この３つのインサートは、ＣＴ０１６、ｔＲＮＡシ
ンターゼおよびｃｌｐＸの遺伝子（それぞれ、配列番号２６８〜２７０）のフラ
グメントである。
【０５３４】 これら４つの陽性２Ｃ７クローン由来のトランスジェニックＤＮＡを、ｐＢＩ
Ｂ−ＫＳ特異的プライマーを用いてＰＣＲ増幅し、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ＤＮＡ
インサートを特異的に増幅した。増幅されたインサートをゲル精製し、そして配
列決定した。１つの免疫反応性クローンである２Ｃ７−８（配列番号１５、配列
番号３２に提供される推定アミノ酸を有する）は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ，血清型亜型Ｄ（ＮＣＢＩ，ＢＬＡＳＴＮ検索；配列番号３３
、配列番号３４に提供される推定アミノ酸を有する）のヌクレオチド５９７３０
４−５９７１４５に相同性を有する１６０ｂｐのフラグメントである。クローン
２Ｃ７−８の配列は、直前に記載された高い相同性の領域由来の、２つの推定オ
ープンリーディングフレーム内にマッピングする。そして、特に、２９８アミノ
酸フラグメント（配列番号１６、配列番号１７に提供される推定アミノ酸配列を
有する）からなる、これらの推定オープンリーディングフレームの１つは、免疫
学的活性を示すことが実証された。
【０５３５】 血清型亜型Ｌ２由来の２９８アミノ酸フラグメント（ＣＴ５２９および／また
はＣａｐ１遺伝子と称される）の全長クローニングを、５’−ｔｔｔｔｇａａｇ
ｃａｇｇｔａｇｇｔｇａａｔａｔｇ（順方向）（配列番号１５９）プライマーお
よび５’−ｔｔａａｇａａａｔｔｔａａａａａａｔｃｃｃｔｔａ（逆方向）（配
列番号１６０）プライマーを用いて、テンプレートとして精製Ｃ．ｔｒａｃｈｏ
ｍａｔｉｓ Ｌ２ゲノムＤＮＡを用いて、ＰＣＲ増幅によって得た。このＰＣＲ
産物をゲル精製し、配列決定のためにｐＣＲＢｌｕｎｔ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ
、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）にクローニングした。次いで、ｐＢＩＢ−ＫＳの誘
導体ｐＢＩＢ−ＫＭＳのＥｃｏＲＩ部位に、発現のためにサブクローニングした
。ＣＴ５２９のＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｕｅｍｏｎｉａｅホモログを、配列番
号２９２に提供される対応するアミノ酸配列を有する配列番号２９１に提供する
。
【０５３６】 種々のＣＴ５２９血清型亜型をコードする全長ＤＮＡを、１０5ＩＦＵを含有
する細菌溶解物からＰＣＲによって（本質的に、Ｄｅｎａｍｕｒ，Ｅ．、Ｃ．Ｓ
ａｙａｄａ、Ａ．Ｓｏｕｒｉａｕ、Ｊ．Ｏｒｆｉｌａ、Ａ．Ｒｏｄｏｌａｋｉｓ
およびＪ．Ｅｌｉｏｎ、１９９１ Ｊ．Ｇｅｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１３７：
２５２５に記載されるように）増幅した。以下の血清型亜型を、記載されるよう
に増幅した：Ｂａ（配列番号１３４、配列番号１３５に提供される対応する推定
アミノ酸配列を有する）；Ｅ（ＢＯＵＲ）およびＥ（ＭＴＷ４４７）（配列番号
１２２、配列番号１２３に提供される対応する推定アミノ酸配列を有する）；Ｆ
（ＮＩ１）（配列番号１２８、配列番号１２９に提供される対応する推定アミノ
酸配列を有する）；Ｇ（配列番号１２６、配列番号１２７に提供される対応する
推定アミノ酸配列を有する）；Ｉａ（配列番号１２４、配列番号１２５に提供さ
れる対応する推定アミノ酸配列を有する）；Ｌ１（配列番号１３０、配列番号１
３１に提供される対応する推定アミノ酸配列を有する）；Ｌ３（配列番号１３２
、配列番号１３３に提供される対応する推定アミノ酸配列を有する）；Ｉ（配列
番号２６３、配列番号２６４に提供される対応する推定アミノ酸配列を有する）
；Ｋ（配列番号２６５、配列番号２６６に提供される対応する推定アミノ酸配列
を有する）；およびＭｏＰｎ（配列番号１３６、配列番号１３７に提供される対
応する推定アミノ酸配列を有する）。ＰＣＲ反応を、Ａｄｖａｎｔａｇｅ Ｇｅ
ｎｏｍｉｃ ＰＣＲ Ｋｉｔ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ、Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ、ＣＡ）
を用いて、血清型亜型Ｌ２ ＤＮＡ（ＯＲＦの外側）に特異的なプライマーを用
いて、実施した。プライマー配列は、５’−ｔｔｔｔｇａａｇｃａｇｇｔａｇｇ
ｔｇａａｔａｔｇ（順方向、配列番号１６３）および５’−ｔｔｔａｃａａｔａ
ａｇａａａａｇｃｔａａｇｃａｃｔｔｔｇｔ（逆方向、配列番号１６４）を必要
とするＭｏＰｎを除いて、５’−ｇｇｔａｔａａｔａｔｃｔｃｔｃｔａａａｔｔ
ｔｔｇ（順方向、配列番号１６１）および５’−ａｇａｔａａａａａａｇｇｃｔ
ｇｔｔｔｃ’（逆方向、配列番号１６２）であった。ＰＣＲ増幅されたＤＮＡを
、ＱＩＡｑｕｉｃｋ ＰＣＲ ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅ
ｎ、Ｖａｌｅｎｃｉａ、ＣＡ）を用いて精製し、そして配列決定のためにｐＣＲ
２．１（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）にクローニングした
。
【０５３７】 免疫反応性のクローンのＰＣＲ増幅されたインサート由来のＤＮＡの配列決定
を、自動配列決定装置（ＡＢＩ３７７）で、ｐＢＩＢ−ＫＳ特異的順方向プライ
マーである５’−ｃｃｔｔａｃａｃａｇｔｃｃｔｇｃｔｇａｃ（配列番号１６５
）および逆方向プライマーである３’−ｇｔｔｔｃｃｇｇｇｃｃｃｔｃａｃａｔ
ｔｇ（配列番号１６６）の両方を用いて行った。ＣＴ５２９血清型亜型Ｌ２をコ
ードするＤＮＡをクローニングしたＰＣＲＢｌｕｎｔ、およびＣＴ５２９血清型
亜型Ｂａ、Ｅ（ＢＯＵＲ）、Ｅ（ＭＴＷ４４７）、Ｆ（ＮＩ１）、Ｇ、Ｉａ、Ｋ
、Ｌ１、Ｌ３およびＭｏＰｎをコードするＤＮＡをクローニングしたｐＣＲ２．
１を、Ｔ７プロモータープライマーおよび汎用Ｍ１３順方向プライマーもしくは
Ｍ１３逆方向プライマーを用いて、配列決定した。
【０５３８】 これら２つの推定オープンリーディングフレーム（配列番号１６および２０）
が、関連する免疫学的機能を有するタンパク質をコードするか否かを決定するた
めに、２つのオープンリーディングフレームの長さにわたる重複ペプチド（１７
〜２０アミノ酸長）を、実施例３に記載されるように合成した。標準クロム放出
アッセイを利用して、ペプチド標識（ｐｕｌｓｅ）されたＨ２d拘束標的細胞の
パーセント特異的溶解を決定した。このアッセイにおいて、Ｐ８１５細胞（Ｈ２ d ）のアリコートを、３７℃で１時間、１００μＣｉの51Ｃｒを用いて、１μｇ
／ｍｌの示されたペプチドの存在下または非存在下において標識した。このイン
キュベート後、標識Ｐ８１５細胞を洗浄し、過剰な51Ｃｒおよびペプチドを除き
、続いて、１，０００細胞／ウェルの濃度でマイクロカルチャー（ｍｉｃｒｏｃ
ｕｌｔｕｔｅ）プレートに二連でプレートした。エフェクターＣＴＬ（Ｃｈｌａ
ｍｙｄｉａ特異的ＣＤ８ Ｔ細胞）を、示されたエフェクター：標的の比で加え
た。４時間のインキュベートの後、上清を回収し、51Ｃｒの上清への放出につい
てガンマカウンターで計測した。２９８アミノ酸オープンリーディングフレーム
由来の２つの重複ペプチドは、ＣＴＬ株を特異的に刺激した。配列番号１３８−
１５６に示されるペプチドを合成し、ＣＴ５２９（Ｃａｐ１遺伝子）についての
血清型亜型Ｄ オープンリーディングフレームのＬ２ホモログおよび２１６アミ
ノ酸オープンリーディングフレームの翻訳を示す。図３に示されるように、Ｃｔ
Ｃ７．８−１２（配列番号１８、Ｃａｐ１＃１３２−１４７としてもまた称され
る、配列番号１３９）およびＣｔＣ７．８−１３（配列番号１９、Ｃａｐ１＃１
３８−１５５としてもまた称される、配列番号１４０）は、エフェクター：標的
の比が１０：１で、それぞれ３８％〜５２％特異的溶解を誘導し得る。特に、こ
れら２つのペプチド間の重複は、予想されるＨ２d（ＫdおよびＬd）結合ペプチ
ドを含んだ。１０アミノ酸のペプチドを合成して、この重複配列（配列番号３１
）に対応させ、そしてｅｌｉｓｐｏｔアッセイによって抗Ｃｈｌａｍｙｄｉａ
ＣＴＬ株から強力な免疫応答を産生することを見出した。特に、もっとも新しい
Ｇｅｎｂａｎｋデータベースの検索は、これまでにこの遺伝子に関する何のタン
パク質も記載されていないことを明らかにした。従って、２Ｃ７−８（配列番号
１５）をコードする推定オープンリーディングフレームは、ＭＨＣ−Ｉ拘束様式
において、抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞を刺激し得るＣｈｌａｍｙｄｉａ由来の
抗原を含む遺伝子を規定し、このことは、この抗原がＣｈｌａｍｙｄｉａに対す
るワクチンを開発させるのに用いられ得ることを実証した。
【０５３９】 これらの結果を確認するため、およびそのエピトープをさらにマッピングする
ために、短縮された（ｔｒｕｎｃａｔｅｄ）ペプチド（配列番号１３８〜１５６
）を作製し、そしてＩＦＮ−ｇ ＥＬＩＳＰＯＴアッセイにおいてＴ細胞による
認識について試験した。Ｓｅｒ１３９（Ｃａｐ１＃１４０〜１４７、配列番号１
４６）またはＬｅｕ１４７（Ｃａｐ１＃１３８〜１４６、配列番号１４７）のい
ずれかの短縮がＴ細胞認識を失わせる。これらの結果は、９マーペプチドＣａｐ
１＃１３９−１４７（ＳＦＩＧＧＩＴＹＬ、配列番号１４５）が、Ｃｈｌａｍｉ
ｄｉａ特異的なＴ細胞によって認識される最小エピトープであることを示す。
【０５４０】 Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ（配列番号１２１、１２３、１２５、１２７、１
２９、１３１、１３３、１３５、１３７および１３９）の選択された血液型亜型
からのＣａｐ（ＣＴ５２９）の配列アラインメントは、提案されたエピトープの
２位において１つのアミノ酸の差違が見出されることを示す。この相同な血液型
亜型Ｄペプチドは、ＳＩＧＧＩＴＹＬ（配列番号１６８）である。ＳＦＩＧＧＩ
ＴＹＬおよびＳＩＩＧＧＩＴＹＬがＣｈｌａｍｙｄｉａ特異的なＴ細胞による認
識について細胞を標識する能力を比較した。各ペプチドの段階希釈物を、上記の
ように、Ｐ８１５細胞とともにインキュベートし、そして51Ｃｒ放出アッセイに
おけるＴ細胞による認識について試験した。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的なＴ細胞
は、血液型亜型Ｌ２ペプチドを最小濃度１ｎＭで、そして血液型亜型Ｄペプチド
を最小濃度１０ｎＭで認識する。
【０５４１】 さらなる研究によって、Ｃａｐ１＃１３９−１４７特異的Ｔ細胞クローンがＣ
．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに感染した細胞を認識することが示された。Ｃａｐ１ 139-147 がＣｈｌａｍｙｄｉａに感染した細胞の表面に提示されているか否かを
確認するために、Ｂａｌｂ−３Ｔ３（Ｈ−２d）細胞を試験して、Ｃ．ｔｒａｃ
ｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２に感染させ、そしてこれらの細胞が、Ｃａｐ１＃
１３９−１４７エピトープ（配列番号１４５）に対して特異的なＣＤ８＋Ｔ細胞
クローンによって認識されるか否かを決定した。Ｃａｐ１＃１３９−１４７エピ
トープに対して特異的なＴ細胞クローンを、Ｔ細胞６９株の限界希釈を行うこと
によって得た。このＴ細胞クローンは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａに感染した細胞を特
異的に認識した。これらの実験において、標的細胞は、Ｃ．ｔｒａｃｈｍａｔｉ
ｓに感染したＢａｌｂ／３Ｔ３細胞（陽性コントロール）または感染していない
Ｂａｌｂ／３Ｔ３細胞であり、これらは、それぞれ４５％および３６％および３
０％が、３０：１、１０：１および３：１のエフェクター対標的の比で特異的な
溶解を示した。あるいは、Ｃａｐ１＃１３９−１４７エピトープ（配列番号１４
５）でコーティングしたＰ８１５細胞、または処置されていないＰ８１５細胞は
、それぞれ、８３％、７５％および５８％が、エフェクター対標的の比で３０：
１、１０：１および３：１での特異的な溶解を示した（すべての場合において陰
性コントロールは、５％未満の溶解を有した）。このデータは、このエピトープ
が感染の間に提示されることを示唆する。
【０５４２】 インビボ研究によって、Ｃａｐ１＃１３９−１４７エピトープ特異的なＴ細胞
がＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのマウス感染の間に初回刺激されることが示され
る。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓでの感染が、Ｃａｐ１＃１３９−１４７エピト
ープ特異的なＴ細胞応答をプライム刺激するか否かを決定するために、マウスに
腹腔内投与で、１０8ＩＦＵのＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血液型亜型Ｌ２を感
染させた。感染後２週間で、このマウスを屠殺し、そして脾細胞を、Ｃａｐ１＃
１３９−１４７エピトープペプチドでパルス刺激した照射した同系脾細胞に対し
て刺激した。５日間の刺激の後、その培養物を、標準的な51Ｃｒ放出アッセイに
おいて使用して、Ｃａｐ１＃１３９−１４７エピトープ特異的なＴ細胞がその培
養物に存在するか否かを決定した。具体的には、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血
液型亜型Ｌ２で免疫したマウス、またはＰＢＳを注射したコントロールマウスか
らの脾細胞は、Ｃａｐ１＃１３９−１４７ペプチドコーティングした同系脾細胞
およびＣａｐ１＃１３９−１４７エピトープを特異的に認識し得るＣＤ８＋Ｔ細
胞とともに５日間培養した後に、それぞれ、７３％、６０％および３２％が、３
０：１、１０：１および３：１のエフェクター対標的の比で特異的な溶解を与え
た。このコントロールマウスは、３０：１のエフェクター対標的比でおよそ１０
％の溶解％を有し、そしてＥ：Ｔ比率を下げると安定して減少した。標的細胞は
、Ｃａｐ１＃１３９−１４７ペプチドコーティングされたＰ８１５細胞または処
置されていない細胞であった。これらのデータは、Ｃａｐ１＃１３９−１４７ペ
プチド特異的なＴ細胞がＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓによるマウス感染の間に初
回刺激されることを示唆する。
【０５４３】 研究が行われ、Ｃｔ５２９（これは、本明細書中でＣａｐ−１と呼ばれる）は
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに感染した細胞の封入体膜に局在化し、そして基
本小体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ ｂｏｄｙ）または網状小体（ｒｅｔｉｃｕｌａ
ｔｅ ｂｏｄｙ）と関連しないことを示した。上記のように、Ｃａｐ−１は、Ｃ
Ｄ８＋ ＣＴＬを刺激するＣｈｌａｍｙｄｉａ由来の産物として同定された。こ
れらのＣＴＬは、感染のマウスモデルにおいて防御的であり、従って、Ｃａｐ−
１をよりワクチン候補とする。さらに、これらのＣＴＬは、ＭＨＣ−Ｉ制限され
ているので、Ｃａｐ−１遺伝子は、感染細胞のサイトゾルにアクセスしなくては
ならず、これは、特異的なＣｈｌａｍｙｄｉａ遺伝子産物の固有の特徴であり得
る。従って、遺伝子産物の細胞局在化の決定はＣａｐ−１をワクチン候補として
特徴付ける際に有用である。Ｃａｐ−１の細胞内局在性を検出するために、Ｃａ
ｐ−１のＮ末端の１２５のアミノ酸を含む組換えポリペプチド（配列番号３０５
、配列番号３０４で提供されるＮ末端６−Ｈｉｓタグを含むアミノ酸配列を有す
る）に対するウサギのポリクローナル抗体を使用して、Ｃｈｌａｍｙｄｉａで感
染されたＭｃＣｏｙ細胞を染色した。
【０５４４】 ウサギ抗Ｃａｐ−１ポリクローナル抗体を、Ｃａｐ−１のＮ末端部分を含む組
換えポリペプチドｒＣｔ５２９ｃ１−１２５（配列番号３０５）によるウサギの
過免疫化によって得た。組換えｒＣｔ５２９ｅ１−１２５タンパク質を、Ｃａｐ
−１のＮ末端の１〜１２５のアミノ酸をコードするヌクレオチド１〜３７５をコ
ードするｐＥＴ発現プラスミド（上記）によって形質転換されたＥ．ｃｏｌｉか
ら得た。組換えタンパク質は、当該分野において周知の技術を用いてＮｉ−ＮＴ
Ａによって精製された。陽性コントロール抗血清として、基本小体に対するポリ
クローナル抗血清を、精製したＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ基本小体（Ｂｉｏｄ
ｅｓｉｇｎ、Ｓａｃｃｏ、Ｍａｉｎｅ）によってウサギを免疫することによって
作製した。Ｃａｐ−１ポリペプチドによる免疫前のウサギに由来する免疫前血清
を陰性コントロールとして用いた。
【０５４５】 免疫細胞学を、１ｍｌ当たり１０6ＩＦＵ（Ｉｎｃｌｕｓｉｏｎ Ｆｏｒｍｉ
ｎｇ Ｕｎｉｔ）の濃度で、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｌ２かＣ．
ｐｓｉｔａｃｃｉ、株６ＢＣかのいずれかを接種したガラスカバーガラス上で増
殖させたＭｃＣｏｙ細胞単層膜で行った。２時間後、培地を吸引し、そしてシク
ロヘキシミド（１．０μｇ／ｍｌ）を補充した新鮮なＲＰ−１０培地と取り換え
た。感染細胞を７％ＣＯ2中で２４時間インキュベートし、そして培地を吸引す
ることによって固定し、ＰＢＳで細胞を一度リンスし、そして５分間メタノール
固定した。抗原染色のために、固定した細胞単層膜をＰＢＳで洗浄し、そして特
定の抗血清またはコントロール抗血清の１：１００希釈物と共に、３７℃で２時
間インキュベートした。細胞をＰＢＳでリンスし、そして蛍光イソチオシアネー
ト（ＦＩＴＣ）標識化された抗ウサギＩｇＧ（ＫＰＬ、Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒ
ｇ）と共に１時間インキュベートし、そしてＰＢＳ中でＥｖａｎｓ ｂｌｕｅ（
０．０５％）で染色した。蛍光を１００×対物レンズ（Ｚｅｉｓｓ ｅｐｉｆｌ
ｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｅ）で観察し、そして写真撮影した
（Ｎｉｋｏｎ ＵＦＸ−１１Ａカメラ）。
【０５４６】 この研究からの結果は、Ｃａｐ−１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに感染し
た細胞の封入体膜に局在することを示す。Ｃａｐ−１特異的抗体は、Ｃ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓに感染した細胞の封入体膜を標識したが、これらの封入体に含
まれるか、または固定プロセスによって放出されるＣｈｌａｍｙｄｉａ基本小体
を標識しなかった。逆に、抗基本小体抗原は、封入体内の細菌体のみではなく、
固定プロセスによって放出されたものも明白に標識した。抗Ｃａｐ−１抗体の特
異性は、それが、Ｃ．ｐｓｉｔｔａｃｉに感染した細胞を染色しないという事実
によって示される。Ｃａｐ−１標識の特異性はまた、免疫前の血清において反応
性がないことによって示される。これらの結果は、Ｃａｐ−１は、細菌から放出
され、そしてＣｈｌａｍｙｄｉａ封入体膜に関連していくことを示唆する。従っ
て、Ｃａｐ−１は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａによって引き起こされる感染に対するワ
クチンの開発の際にＣＤ８＋Ｔ細胞を刺激するために有用であり得る遺伝子産物
である。
【０５４７】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染に対するワクチンにおけるＣａｐ−１遺伝子の潜在的
なＣＴＬ抗原としての関連性は、さらに、２つのさらなる一連の研究によって説
明される。第１に、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのＣａｐ−１ ＣＴ５２９＃１
３８−１４７ペプチドのＭＨＣ−Ｉエピトープに特異的なＣＴＬ（配列番号１４
４）は、天然の感染の間、高頻度まで初回刺激されることが示された。具体的に
は、Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、１０6Ｉ．Ｆ．Ｕ．のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
、血清型亜型Ｌ２と共にインキュベートした。２週間後、脾臓を収集し、そして
Ｅｌｉｓｐｏｔ分析によって、Ｃａｐ−１＃１３８−１４７ペプチドパルスされ
た抗原提示細胞に対する応答において、ＩＦＮ−γ分泌細胞の数について定量し
た。２つの実験において、１０5脾細胞におけるＩＦＮ−γ分泌細胞の数は、全
ＣＤ８＋Ｔ細胞の約１％であった。ＭＨＣ−１エピトープ（Ｃａｐ−１ ＣＴ５
２９ ＃１３８−１４７ペプチド）に応答するＣＤ８＋ ＣＴＬのこの高頻度は
、Ｃａｐ−１が感染において高度に免疫原性であることを示唆する。
【０５４８】 第２の一連の研究からの結果は、Ｃａｐ−１タンパク質は、感染時に、宿主細
胞のサイトゾルにほとんどすぐにアクセス可能であることを示した。これは、Ｃ
ａｐ−１ ＣＴ５２９ ＃１３８−１４７ペプチド提示の時間経過において示さ
れる。簡潔には、３Ｔ３細胞を、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ血清型亜型Ｌ２で
種々の長さの時間感染させ、次いで、Ｃａｐ−１ ＣＴ５２９ ＃１３８−１４
７ペプチド特異的ＣＴＬによる認識について試験した。その結果は、Ｃ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ感染した３Ｔ３細胞は、感染のたった２時間後に、抗原特異的
ＣＴＬによる認識について標的化されることを示す。これらの結果は、Ｃａｐ−
１は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ基本小体の網状小体への発展において合成さ
れる初期タンパク質であることを示唆する。感染初期において発現する遺伝子産
物に対するＣＤ８＋ ＣＴＬ免疫応答は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染に対するワク
チンにおいて特に有効であり得る。
【０５４９】 （実施例５） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原で免疫されたマウスにおける抗体応答およびＴ細胞
応答の生成） 免疫原性研究を行って、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅアジュバントを用いて処方された
、精製されたＳＷＩＢタンパク質もしくはＳ１３タンパク質のいずれか、または
ＳＷＩＢもしくはＳ１３に関するＤＮＡ配列を含むｐｃＤＮＡ−３発現ベクター
でのＤＮＡベースの免疫を用いて免疫されたマウスにおける抗体およびＣＤ４＋
Ｔ細胞応答を決定した。ＳＷＩＢはまた、クローン１−Ｂ１−６６（配列番号１
、対応するアミノ酸配列は配列番号５において提供される）とも称され、そして
Ｓ１３リボソームタンパク質はまた、クローン１０−Ｃ１０−３１（配列番号４
、対応するアミノ酸配列は、配列番号１２に提供される）とも称される。第一の
実験において、３匹のＣ５７ＢＬ／６マウスの群を２回免疫し、そして抗体およ
びＣＤ４＋Ｔ細胞応答についてモニタリングした。ＤＮＡ免疫を尾の根元で皮内
で行い、そしてポリペプチド免疫を皮下経路で投与した。免疫されたマウスから
の脾細胞の標準的な3Ｈ取り込みアッセイの結果は、精製された組換えＳＷＩＢ
ポリペプチド（配列番号５）で免疫した群からの強力な増殖応答を示す。以前に
記載されるようなサイトカイン誘導アッセイによるさらなる分析によって、ＳＷ
ＩＢポリペプチドにより免疫された群が測定可能なＩＦＮ−γおよびＩＬ−４の
応答を生成したことが実証された。ＳＷＩＢポリペプチドで免疫した実験群にお
ける優性な抗体アイソタイプ応答を決定するための、続いてのＥＬＩＳＡベース
のアッセイを行った。図４は、ＳＷＩＢ免疫された群が主にＩｇＧ１である体液
性応答を与えたことを例示する。
【０５５０】 第二の実験において、Ｃ３Ｈマウスを、３回、３週間の間隔で、ＰＢＳもしく
はＭｏｎｔａｎｉｄｅのいずれかにおいて処方された１０μｇの精製されたＳＷ
ＩＢタンパク質（これはまた、クローン１−Ｂ１−６６、配列番号５とも呼ばれ
る）で免疫し、そして第三回の免疫の２週間後に採取した。ＳＷＩＢタンパク質
に対して指向される抗体力価を、当該分野で周知の標準的なＥＬＩＳＡベースの
技術によって決定し、Ｍｏｎｔａｎｉｄｅアジュバントで処方したＳＷＩＢタン
パク質が強力な体液性免疫応答を誘導したことを実証した。Ｔ細胞増殖応答を、
ＸＴＴベースのアッセイによって決定した（Ｓｃｕｄｉｅｒｏら、Ｃａｎｃｅｒ
Ｒｅｓｅａｒｃｈ、１９８８、４８：４８２７）。図５に示されるように、Ｓ
ＷＩＢポリペプチドおよびＭｏｎｔａｎｉｄｅで免疫したマウス由来の脾細胞は
、抗原特異的な増殖応答を惹起した。さらに、免疫された動物からの脾細胞が可
溶性の組換えＳＷＩＢポリペプチドに応答してＩＦＮ−γを分泌する能力を、以
前に記載されるようなサイトカイン誘導アッセイを用いて決定した。Ｍｏｎｔａ
ｎｉｄｅアジュバントを用いて処方したＳＷＩＢポリペプチドで免疫した群にお
けるすべての動物由来の脾細胞は、ＳＷＩＢ Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原への曝露
に応答してＩＦＮ−γを分泌し、これは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的な免疫応答
を実証した。
【０５５１】 さらなる実験において、Ｃ３Ｈマウスを、３回別個の時点で、尾の根元で、Ｓ
ＢＡＳ２アジュバント（ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ Ｂｅｅｃｈａｍ、Ｌｏｎｄｏｎ
、Ｅｎｇｌａｎｄ）を用いて処方された、精製された１０μｇのＳＷＩＢタンパ
ク質もしくはＳ１３タンパク質（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、ＳＷＩＢタンパ
ク質、クローン１−Ｂ１−６６、配列番号５、およびＳ１３タンパク質、クロー
ン１０−Ｃ１０−３１、配列番号４）で免疫した。抗原特異的な抗体力価を、Ｅ
ＬＩＳＡによって測定し、両方のポリペプチドが、１×１０-4〜１×１０-5の力
価の範囲の強力なＩｇＧ応答を誘導したことを示した。この応答のＩｇＧ１およ
びＩｇＧ２ａの成分は、ほぼ等価量で存在した。免疫されたマウスから単離され
た脾細胞に対する標準的な3Ｈ取り込みアッセイによって決定された、抗原特異
的なＴ細胞増殖応答は、ＳＷＩＢに対してかなり強力であり（陰性コントロール
よりも５０、０００ｃｐｍ高い）、そしてｓ１３についてはさらにより強力であ
った（陰性コントロールよりも１００、０００ｃｐｍ高い）。このＩＦＮγ産生
を、増殖中の培養物からの上清から、標準的なＥＬＩＳＡ技術によりアッセイし
た。Ｓ１３タンパク質でのその培養物のインビトロ再刺激は、高レベルのＩＦＮ
−γ産生を誘導し、これは、陰性コントロールについての２ｎｇ／ｍｌに対して
、およそ２５ｎｇ／ｍｌであった。ＳＷＩＢタンパク質での再刺激はまた、ＩＦ
Ｎγを誘導したが、より少ない程度であった。
【０５５２】 関連する実験において、Ｃ３Ｈマウスを、３回別個の時点で、１０μｇのコレ
ラ毒素と混合した、１０μｇの精製されたＳＷＩＢもしくはＳ１３タンパク質（
Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、ＳＷＩＢタンパク質、クローン１−Ｂ１−６６、
配列番号５、およびＳ１３タンパク質、クローン１０−Ｃ１０−３１、配列番号
４）で免疫した。粘膜免疫を、鼻腔内接種を通じてであった。抗原特異的抗体応
答を標準的なＥＬＩＳＡ技術によって決定した。抗原特異的なＩｇＧ抗体は、Ｓ
ＷＩＢ免疫されたマウスの血液中に存在し、その力価は、１×１０-3〜１０-4の
範囲であったが、Ｓ１３免疫した動物では検出不可能であった。ＩＦＮγ産生に
よって測定された単離された脾細胞からの抗原特異的なＴ細胞応答は、全身免疫
についてすぐ上記したようなものに類似の結果を与えた。
【０５５３】 動物研究を行って、ＣＴ５２９血液型亜型ＬＧＶＩＩ ＣＴＬエピトープ（Ｃ
Ｔ５２９ １０マーコンセンサスペプチド（ＣＳＦＩＧＧＩＴＹＬ、配列番号３
１））（これは、Ｈ２−Ｋｄ制限されたＣＴＬエピトープとして同定された）に
よって規定された）の免疫原性を決定した。ＢＡＬＢ／ｃマウス（１群あたり３
匹のマウス）を、３回、種々のアジュバントと組み合わせた２５μｇのペプチド
で免疫した。このペプチドを、ＳＫＢ Ａｄｊｕｖａｎｔ Ｓｙｓｔｅｍ ＳＢ
ＡＳ−２’’、ＳＢＡＳ−７（ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ Ｂｅｅｃｈａｍ、Ｌｏｎ
ｄｏｎ、Ｅｎｇｌａｎｄ）、またはＭｏｎｔａｎｉｄｅのいずれかの中で尾の根
元で全身投与した。このペプチドをまた、１０μｇのコレラ毒素（ＣＴ）と混合
して鼻腔内投与した。未刺激のマウスをコントロールとして使用した。３回目の
免疫後４週間で、脾細胞を、３つの異なるエフェクター対ＬＰＳ刺激比（１×１
０6細胞／ｍｌで６、１．５および０．４）で１０μｇ／ｍｌのＣＴ５２９ １
０マーコンセンサスペプチドを用いてパルス刺激したＬＰＳ刺激（ｂｌａｓｔ）
で再刺激した。２回の再刺激後、エフェクター細胞を、ペプチドパルス刺激され
たＰ８１５細胞を溶解するその能力について、標準的なクロム放出アッセイを用
いて試験した。鶏卵オボアルブミンからの無関連のペプチドを陰性コントロール
として用いた。その結果は、有意な免疫応答が、ＣＴ５２９ １０マーコンセン
サスペプチドに対して惹起され、そしてペプチドパルス刺激された標的を溶解し
得る抗原特異的Ｔ細胞がそのペプチドでの免疫に応答して惹起されたことを実証
した。具体的には、抗原特異的溶解活性は、ＳＢＡＳ−７およびＣＴでアジュバ
ント補助された群において見出されたが、ＭｏｎｔａｎｉｄｅおよびＳＢＡＳ−
２’’では、ＣＴＬエピトープ免疫をアジュバント補助しなかった。
【０５５４】 （実施例６） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｙｍｏｎｉａｅ遺伝子の発現および特徴付け
） ヒトＴ細胞株ＴＣＬ−８（実施例１に記載される）は、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａに感染
した単球由来の樹状細胞を認識する。このことは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａが交叉反応性
のＴ細胞エピトープをコードし得ることを示唆する。Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒ
ａｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩクローン１Ｂ１−６６（これはまた、ＳＷＩ
Ｂ（配列番号１）と呼ばれる）およびクローン１０Ｃ１０−３１（これはまた、
Ｓ１３リボゾームタンパク質（配列番号４）とも呼ばれる）に相同なＣｈｌａｍ
ｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａ遺伝子を単離するために、ＨｅＬａ２２９細胞を
、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ株ＴＷＡＲ（ＣＤＣ／ＣＷＬ−０２９）に感染させた
。３日間のインキュベーション後、このＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ感染させたＨｅ
Ｌａ細胞を採取し、洗浄し、そして２００μｌの水に再懸濁し、そして２０分間
沸騰水浴中で加熱した。１０μｌの破壊された細胞懸濁物をＰＣＲテンプレート
として用いた。
【０５５５】 Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ特異的なプライマーをクローン１Ｂ１−６６およびク
ローン１０Ｃ１０−３１について設計し、その結果、５’末端が、挿入された６
×ヒスチジンタグおよびＮｄｅＩ部位を有し、そして３’末端が、包含された終
止コドンおよびＢａｍＨＩ部位を有した（図６）。ＰＣＲ産物を、当該分野にお
いて周知の標準的な技術によって増幅し、そして配列決定した。Ｃ．ｐｎｅｕｍ
ｏｎｉａ特異的なＰＣＲ産物を発現ベクターｐＥＴ１７Ｂ（Ｎｏｖａｇｅｎ，Ｍ
ａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）中にクローニングし、そして発現およびＮｏｖａｇｅｎに
よって提供されるヒスチジン−ニッケルクロマトグラフィー方法論を利用した続
きの精製のために、Ｅ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１ ｐＬｙｓＳへとトランスフェクト
した。従って、Ｃ．ｐｎｅｒｕｍｏｎｉａからの２つのタンパク質が生成された
：１０−１１ｋＤａのタンパク質（ＣｐＳＷＩＢ（配列番号２７）と呼ばれる）
および６×Ｈｉｓタグを有する配列番号７８（これは、それぞれ、配列番号２８
に提供される対応するアミノ酸配列を有する）、ＣｐＳ１３と呼ばれる１５ｋＤ
ａタンパク質（配列番号２９、および配列番号７７（６×Ｈｉｓタグを有する）
、これらは、それぞれ配列番号３０および９１において提供される対応するアミ
ノ酸配列を有する）。
【０５５６】 （実施例７） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ抗原による、Ｔ細胞増殖および
インターフェロンγ産生の誘導） 組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ抗原がＴ細胞増殖およびイ
ンターフェロンγ産生を誘導する能力を以下のように決定した。
【０５５７】 タンパク質を、ＩＰＴＧにより誘導し、そしてＮｉ−ＮＴＡアガロースアフィ
ニティークロマトグラフィーによって精製する（Ｗｅｂｂら、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏ
ｌｏｇｙ １５７：５０３４−５０４１、１９９６）。次いで、この精製された
ポリペプチドを、Ｔ細胞増殖をＰＢＭＳ調製物中で誘導する能力についてスクリ
ーニングする。Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ患者からのＰＢＭＣおよびそのＴ細胞
がＣｈｌａｍｙｄｉａ抗原に応答して増殖することが公知の正常ドナーからのＰ
ＢＭＣを、１０％のプールされたヒト血清および５０μｇ／ｍｌゲンタマイシン
を補充したＲＰＭＩ１６４０を含む培地中で培養する。精製されたポリペプチド
を、二連で、０．５〜１０μｇ／ｍＬの濃度で添加する。容量２００μＬの容量
中、９６ウェルの丸底プレート中での６日間の培養後、５０μＬの培地を各ウェ
ルから、以下に記載するように、ＩＦＮ−γレベルの決定のために取り出した。
次いで、このプレートを１μＣｉ／ウェルのトリチウムチミジンでさらに１８時
間パルス刺激し、採取し、そしてトリチウム取り込みを、ガスシンチレーション
カウンタを用いて決定した。二連両方で、培地単独において培養された細胞にお
いて観察される増殖よりも３倍多い増殖をもたらした画分を陽性とみなす。
【０５５８】 ＩＦＮ−γを、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）を用いて測定
した。ＥＬＩＳＡプレートを、ＰＢＳ中のヒトＩＦＮ−γに対して指向されるマ
ウスモノクローナル抗体（ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）
で室温で４時間コーティングした。次いで、ウェルを５％（Ｗ／Ｖ）の脱脂乾燥
乳を含むＰＢＳを用いて、室温で１時間ブロックする。このプレートを、ＰＢＳ
／０．２％ ＴＷＥＥＮ−２０中で６回洗浄し、そしてＥＬＩＳＡプレート中の
培養培地中で１：２に希釈したサンプルを、室温で一晩インキュベートする。こ
のプレートを再び洗浄し、そしてＰＢＳ／１０％正常ヤギ血清中で１：３０００
に希釈したポリクローナルウサギ抗ヒトＩＦＮ−γ血清を各ウェルに添加する。
次いで、このプレートを室温で２時間インキュベートし、洗浄し、そして西洋ワ
サビペルオキシダーゼ連結抗ウサギＩｇＧ（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓ
ｏ．，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）を、ＰＢＳ／５％脱脂乾燥乳中に１：２０００
希釈で添加した。さらに２時間の室温でのインキュベーション後、そのプレート
を洗浄し、そしてＴＭＢ基質を添加する。この反応を、２０分後、１Ｎ硫酸を用
いて終結させる。光学密度を５７０ｎｍを参照波長として用いて４５０ｎｍで測
定する。二連両方で、培地単独で培養された細胞からの平均ＯＤおよび３標準偏
差より２倍大きなＯＤを与えることを生じる画分を陽性とみなす。
【０５５９】 Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａに対して交叉反応
し得るヒト抗Ｃｈｌａｍｙｄｉａ Ｔ細胞株（ＴＣＬ−８）を用いて、上記実施
例において記載される発現されたタンパク質（すなわち、ＣｐＳＷＩＢ、配列番
号２７、および６×Ｈｉｓタグを有する配列番号７８（これらはそれぞれ、配列
番号２８において提供される対応するアミノ酸配列を有する）、ならびにＣｐＳ
１３と呼ばれる１５ｋＤａタンパク質（配列番号２９）、および６×Ｈｉｓタグ
を有する配列番号７７（これらは、それぞれ、配列番号３０および９１に提供さ
れる対応するアミノ酸配列を有する））が、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよび
Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの両方に共通するＴ細胞エピトープを有するか否かを
決定した。手短には、Ｃｈｌａｍｙｄｉａのタンパク質を発現するＥ．ｃｏｌｉ
を、１×１０4単球由来の樹状細胞に対して滴定した。２時間後、この樹状細胞
培養物を洗浄し、そして２．５×１０4Ｔ細胞（ＴＣＬ−８）を添加し、そして
さらに７２時間インキュベートさせた。次いで、その培養上清中のＩＮＦ−γの
量を、ＥＬＩＳＡによって決定した。図７Ａおよび７Ｂにおいて示すように、Ｔ
ＣＬ−８ Ｔ細胞株は、ＩＦＮ−γの抗原特異的誘導によって実証されるように
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａの両方由来のＳ１
３リボソームタンパク質を特異的に認識したが、他方で、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａ
ｔｉｓからのＳＷＩＢタンパク質のみがそのＴ細胞株によって認識された。これ
らの結果を確認するために、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢのＴ細胞エ
ピトープを、一連の重複するペプチドおよびＴ細胞株ＴＣＬ−８を用いてパルス
刺激した標的細胞を用いてエピトープマッピングすることによって同定した。３
Ｈチミジン取り込みアッセイは、そのペプチド（Ｃ．ｔ．ＳＷＩＢと称される、
配列番号３８の５２−６７）がＴＣＬ−８株の最も強力な増殖を与えたことを実
証した。Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ配列のＳＷＩＢ（配列番号４０）、Ｃ．ｐｎ
ｅｕｍｏｎｉａｅ のトポイソメラーゼ−ＳＷＩＢ融合物（配列番号４３）およ
びＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ （配列番号４２）、ならびにヒトＳＷＩドメイ
ン（配列番号４１）に対応する相同ペプチドを合成し、そして上記アッセイにお
いて試験した。Ｔ細胞株ＴＣＬ−８は、配列番号３９のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓペプチドのみを認識し、そして対応するＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅペプチド
（配列番号４０）も、上記の他の対応するポリペプチド（配列番号４１〜４３）
をも認識しなかった。
【０５６０】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的なＴ細胞株を、それぞれＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓまたはＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅに感染させた単球由来の樹状細胞のいずれか
を用いてドナーＰＢＭＣを刺激することによって、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅに
対する陽性血清力価を有するドナーＣＰ−２１から生成した。Ｃ．ｐｎｅｕｍｏ
ｎｉａｅに対して生成されたＴ細胞は、組換えＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷ
ＩＢに対して応答したが、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＳＷＩＢには応答せず
、他方で、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対して生成されたＴ細胞株は、Ｃ．ｔ
ｒａｃｈｏｍａｔｉｓにもＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢにもいずれにも
応答しなかった（図９を参照のこと）。ドナーＣＰ−２１の、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏ
ｎｉａｅ−ＳＷＩＢ特異的な免疫応答は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ感染を確認
し、そしてインビボのＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ感染の間のＣ．ｐｎｅｕｍｏｎ
ｉａｅ−ＳＷＩＢ特異的なＴ細胞の惹起を示唆する。
【０５６１】 Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ−ＳＷＩＢに対するＴ細胞応答のエピトープマッピン
グは、Ｃｐ−ＳＷＩＢ特異的なＴ細胞が重複するペプチドＣｐ−ＳＷＩＢ３２−
５１（配列番号１０１）およびＣｐ−ＳＷＩＢ３７−５６（配列番号１０２）に
応答したことを示し、このことは、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢ特異的
Ｔ細胞エピトープＣｐ−ＳＷＩＢ３７−５１（配列番号１００）を示す。
【０５６２】 さらなる実験において、Ｔ細胞株を、ドナーＣＰ１（これもまた、Ｃ．ｐｎｅ
ｕｍｏｎｉａｅ血清陽性ドナー）から、それぞれＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓお
よびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅからの非感染性基本小体（ｅｌｅｍｅｎｔａｒｙ
ｂｏｄｙ）を用いてＰＢＭＣを刺激することによって、生成した。特に、増殖
応答を、１×１０4単球由来樹状細胞ならびにＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよ
びＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ由来の非感染性基本小体または組換えＣ．ｔｒａｃ
ｈｏｍａｔｉｓもしくはＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのいずれかのＳＷＩＢタンパ
ク質の存在下で２．５×１０4のＴ細胞を刺激することによって決定した。ＳＷ
ＩＢに対するＴ細胞応答は、ＣＰ−２１からのＴ細胞株を用いて得られたデータ
に対して、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＳＷＩＢではなくＣ．ｐｎｅｕｍｏｎ
ｉａｅ−ＳＷＩＢがＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ Ｔ細胞株による応答を惹起する
という点において類似した。さらに、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ Ｔ細胞株は
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢにもＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ ＳＷ
ＩＢにもいずれに応答しても増殖しなかったが、この株は、ＣＴとＣＰの両方の
基本小体に応答して増殖した。実施例１に記載されるように、クローン１１−Ｃ
２１−９１（配列番号６３）（ＴＣＰ−２１細胞株を用いて同定された）は、２
６９ｂｐのインサートを有する。このインサートは、ＯＭＰ２遺伝子（ＣＴ４４
３）の一部であり、そしてＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅの６０ｋＤａシステインリ
ッチの外膜タンパク質（ＯＭＣＢと呼ばれる）と相同性を共有する。反応性エピ
トープをさらに規定するために、エピトープマッピングを、一連の重複するポリ
ペプチドおよび以前に記載されるイムノアッセイを用いて行った。手短には、増
殖応答を、１×１０4単球由来の樹状細胞の存在下で、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓおよびＣ．ｐｎｅｒｕｍｏｎｉａｅに由来する非感染性基本小体、またはＣ
．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓもしくはＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅのＯＭＢＣタンパ
ク質のタンパク質配列に由来するペプチド（０．１μｇ／ｍｌ）のいずれかを用
いて、２．５×１０4のＴＣＰ−２１Ｔ細胞を刺激することによって決定した。
ＴＣＰ−２１ Ｔ細胞は、エピトープＣＴ−ＯＭＣＢ＃１６７−１８６、ＣＴ−
ＯＭＣＢ＃１７１−１９０、ＣＴ−ＯＭＣＢ＃１７１−１８６に対して応答し、
そしてＣＴ−ＯＭＣＢ＃１７５−１８６に対してはより少ない程度で応答した（
それぞれ、配列番号２４９〜２５２）。顕著なことに、このＴＣＰ−２１のＴ細
胞株はまた、相同なＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅペプチドＣＰ−ＯＭＣＢ＃１７１
−１８６（配列番号２５３）に対して増殖性の応答を与え、この応答は、Ｃ．ｔ
ｒａｃｈｏｍａｔｉｓペプチドに対する応答に等しいかまたはそれを超えた。２
位でのアミノ酸置換（すなわち、ＧｌｕについてＡｓｐ）および４位でのアミノ
酸置換（すなわち、ＳｅｒについてのＣｙｓ）は、Ｔ細胞の増殖応答を変更せず
、そして従ってこのエピトープがＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓとＣ．ｐｎｅｕｍ
ｏｉｎｉａｅとの間の交叉反応性エピトープであることを実証した。
【０５６３】 （実施例８） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原に対するヒトＰＢＭＣおよびＴ細胞株の免疫応答） 本明細書において提供される実施例は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに感染し
、そしてＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ感染を制御する防御性免疫応答を生成した
一般的な集団の中に健常ドナーの集団が存在することを示唆する。これらのドナ
ーは、臨床的には無症候のままであり、そしてＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対
して血清陰性のままであった。ＣＤ４発現クローニングによって同定された、ｃ
ｈｌａｍｙｄｉａ抗原に対する正常なドナーの免疫応答を特徴付けるために、１
２の健常ドナーから得たＰＢＭＣを、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＳＷＩＢ、
Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢおよびＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−Ｓ１
３、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−Ｓ１３を含む組換えｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の
パネルに対して試験した。このデータを、以下の表Ｉにまとめる。すべてのドナ
ーが、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対して血清陰性であったが、６／１２がＣ
．ｐｎｅｕｍｏｎｉｅに対して陽性力価を有した。陽性応答としての４倍を超え
る刺激指数を用いて、１１／１２の被験体が、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓの基
本小体に応答し、そして１２／１２がＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉｅの基本小体に応答
した。１つのドナーＡＤ １０４は、組換えＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−Ｓ１３
タンパク質に応答したが、組換えＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−Ｓ１３タンパク
質には応答しなかった。このことは、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ特異的な応答を
示す。１２のドナーのうち３つがＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＳＷＩＢを有し
たが、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢ特異的な応答を有さず、このことは
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ感染を確認した。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−
Ｓ１３およびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−Ｓ１３は、８／１２のドナーにおいて
応答を惹起し、このことは、クラミジア感染を示唆する。これらのデータは、Ｓ
ＷＩＢおよびＳ１３が正常な研究被験体のＰＢＭＣにおいて、Ｔ細胞応答を惹起
する能力を実証する。
【０５６４】
【表１】 ＣＴ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ；ＣＰ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉ
ａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ；ＥＢ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉａ基本小体；Ｓｗｉｂ＝組
換えＣｈｌａｍｙｄｉａ Ｓｗｉｂタンパク質；Ｓ１３＝組換えＣｈｌａｍｙｄ
ｉａ Ｓ１３タンパク質；ｌｐｄＡ＝組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ ｌｐｄＡタン
パク質；ＴＳＡ＝組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ ＴＳＡタンパク質。値は、標準増
殖アッセイからの結果を示す。増殖応答を、それぞれの組換え抗原または基本小
体（ＥＢ）とともにプレインキュベートした１×１０4の単球由来樹状細胞を用
いて３×１０5のＰＢＭＣを刺激することによって決定した。アッセイを、最後
の１８時間、3Ｈチミジンパルスを用いて、６日後に収集した。 ＳＩ：刺激指標 ＋／−： ＳＩ〜 ４ ＋： ＳＩ＞ ４ ＋＋： ＳＩ １０〜３０ ＋＋＋： ＳＩ＞ ３０ 第１の一連の実験において、Ｔ細胞株を、以前に記載されたようなＣ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ ＬＧＶ ＩＩ基本小体を用いてＴ細胞を刺激することによっ
て、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対する生殖器曝露（ｇｅｎｉｔａｌ ｅｘｐ
ｏｓｕｒｅ）歴を有する、健常な女性個体（ＣＴ−１０）から作成した。この研
究被験体を、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対して曝露したが、この被験体は、
セロコンバーションを起こさず、そして臨床的症状を現さなかった。このことは
、ドナーＣＴ−１０がＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに対して防御免疫応答を発達
させたかもしれないことを示唆する。図１０に示されるように、ドナーＣＴ−１
０由来の初代Ｃｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓ−ＳＷＩＢに応答したが、しかし、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢ組換
えタンパク質には応答しなかった。このことは、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓに
対するＣＴ−１０の曝露を確証する。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＳＷＩＢに
対するＴ細胞応答のエピトープマッピングは、図１１に示されるように、このド
ナーが、Ｔ細胞株ＴＣＬ−８と同じエピトープＣｔ−ＳＷＩＢ ５２−６７（配
列番号３９）に応答したことを示した。
【０５６５】 さらなるＴ細胞株を、種々のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者について上記の
ように作製した。患者の臨床プロフィールならびに種々のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａ
ｔｉｓおよびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉｅの基本小体および組換えタンパク質に対す
る増殖応答の要約を、表ＩＩに要約する。
【０５６６】
【表２】 ＮＧＵ＝非淋菌性尿道炎；ＢＶ＝細菌性腟炎；ＣＴ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔ
ｒａｃｈｏｍａｔｉｓ；ＣＰ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ；Ｅ
Ｂ＝Ｃｈｌａｍｙｄｉａ基本小体；Ｓｗｉｂ＝組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ Ｓｗ
ｉｂタンパク質；Ｓ１３＝組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ Ｓ１３タンパク質；ｌｐ
ｄＡ＝組換えＣｈｌａｍｙｄｉａ ｌｐｄＡタンパク質；ＴＳＡ＝組換えＣｈｌ
ａｍｙｄｉａ ＴＳＡタンパク質。
【０５６７】 値は、標準増殖アッセイからの結果を示す。増殖応答を、それぞれの組換え抗
原または基本小体（ＥＢ）とともにプレインキュベートした１×１０4の単球由
来樹状細胞を用いて３×１０5のＰＢＭＣを刺激することによって決定した。ア
ッセイを、最後の１８時間、3Ｈチミジンパルスを用いて、６日後に得た。 ＳＩ：刺激指標 ＋／−： ＳＩ〜 ４ ＋： ＳＩ＞ ４ ＋＋： ＳＩ １０〜３０ ＋＋＋： ＳＩ＞ ３０ 表ＩおよびＩＩに要約されるような、無症候性（上記に規定される通り）研究
被験体およびＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者のパネルを使用して、この２つの
群由来のＰＢＭＣの免疫応答の総合的な研究を行った。簡潔には、Ｃ．ｐｎｅｕ
ｍｏｎｉａｅ患者由来のＰＢＭＣならびに正常ドナー由来のＰＭＢＣを、１０％
のプールされたヒト血清および５０μｇ／ｍｌゲンタマイシンを補充したＲＰＭ
Ｉ １６４０を含有する培地中で培養する。精製したポリペプチド、組換えｃｈ
ｌａｍｙｄｉａ抗原のパネル（Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−、Ｃ ｐｎｅｕｍ
ｏｎｉａｅ−ＳＷＩＢおよびＳ１３を含む）、ならびにＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ ｌｐｄＡおよびＴＳＡを、０．５〜１０μｇ／ｍＬの濃度で二連に添加す
る。２００μｌの容量での９６ウェル丸底プレートでの６日間の培養後、以下に
記載されるように、５０μｌの培地を、ＩＦＮ−γレベルの決定のために各ウェ
ルから取り出す。次いで、このプレートを、１μＣｉ／ウェルのトリチウム化チ
ミジンを用いてさらに１８時間パルスし、収集し、そしてトリチウム取り込みを
、気体シンチレーションカウンターを使用して決定する。両方の複製物において
、培地単独で培養した細胞において観察される増殖よりも３倍多い増殖を生じる
画分は、陽性であるとみなされる。
【０５６８】 組換えＣｈｌａｍｙｄｉａｅ抗原に対する増殖応答は、無症候性ドナーおよび
Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者の大部分が、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ Ｓ
１３抗原を認識し（８／１２）、そしてＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者の大部
分が、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ Ｓ１３抗原を認識し（８／１２）、４／１２の
無症候性ドナーもまた、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ Ｓ１３抗原を認識することを
、示した。また、１２人のＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者のうち６人、および
１２人の無症候性ドナーのうちの４人は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓのｌｐｄ
Ａ抗原に対する増殖応答を与えた。これらの結果は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉ
ｓおよびＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ Ｓ１３抗原、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ
Ｓｗｉｂ抗原およびＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｌｐｄＡ抗原が、無症候性ド
ナーによって認識されることを示し、これらの抗原が、Ｃｈｌａｍｙｄｉａに対
する曝露の間に認識され、そして免疫応答がそれらに対して惹起されたことを示
す。このことは、これらの抗原が、ヒト宿主において防御免疫を付与する際に役
割を果たし得ることを意味する。さらに、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣ
．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ Ｓ１３抗原は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者の間で
等しく十分に認識され、それゆえに、Ｓ１３タンパク質においてＣ．ｔｒａｃｈ
ｏｍａｔｉｓとＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａとの間で共有されるエピトープが存在し
得ることを示す。表ＩＩＩは、これらの研究の結果を要約する。
【０５６９】
【表３】 一連の研究を、無症候性ドナーおよびＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者から作
製された短期（ｓｈｏｒｔ ｔｅｒｍ）Ｔ細胞株に対する細胞性免疫応答を決定
するために開始した。細胞性免疫応答を、実施例７に記載されるように、標準的
な増殖アッセイおよびＩＦＮ−γによって測定した。詳細には、抗原の大部分は
、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原を発現する単一のＥ．ｃｏｌｉクローンの形態であっ
たが、いくつかの組換えタンパク質もまた、このアッセイにおいて使用された。
この単一のＥ．ｃｏｌｉクローンを、１×１０4単球由来樹状細胞上で力価滴定
（ｔｉｔｅｒ）し、そして２時間後、この培養物を洗浄し、そして２．５×１０ 4 Ｔ細胞を添加した。組換えタンパク質を使用するアッセイを、以前に記載され
るように実施した。増殖を、最後の１８時間、標準的3Ｈチミジンパルスを用い
て、４日後に決定した。ＩＦＮ−γの誘導を、上記のように、標準的ＥＬＩＳＡ
アッセイを使用して４日後に収集した培養上清から決定した。この結果は、試験
されたＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ抗原すべて（Ｃ．Ｔ．Ｓｗｉｂを除いて）が
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者由来の１つ以上の異なるＴ細胞株から増殖応
答を惹起したことを示す。さらに、増殖応答は、以下のＣｈｌａｍｙｄｉａ遺伝
子：ＣＴ６２２、ｇｒｏＥＬ、ｐｍｐＤ、ＣＴ６１０およびｒＳ１３、について
、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ患者および無症候性ドナーの両方から惹起された
。
【０５７０】 １２Ｇ３−８３クローンはまた、ＣＴ６２２に加えて、ＣＴ７３４およびＣＴ
７６４に対する配列を含み、従って、これらの遺伝子配列はまた、免疫反応性エ
ピトープを有し得る。同様に、クローン２１Ｇ１２−６０は、ＣＴ８７５に加え
て、ハイポセティカルタンパク質遺伝子ＣＴ２２９およびＣＴ２２８に対する配
列を含み；そして１５Ｈ２−７６はまた、ＣＴ８１２およびＣＴ０８８からの配
列を含み、そしてｓｙｃＥ遺伝子に対する相同性を共有する。クローン１１Ｈ３
−６１はまた、ＰＧＰ６−Ｄビルレンスタンパク質に対する相同性を共有する配
列を含む。
【０５７１】
【表４】 （実施例９） （Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原を使用する防御研究） 防御研究を、マウスにおいて、ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原を用いる免疫がｃｈｌ
ａｍｙｄｉａ接種から生じる生殖管疾患に対して影響を及ぼし得るか否かを決定
するために実施した。２つのモデルを利用した：Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｐｓｉｔ
ｔａｃｉ（ＭＴＷ４４７）の株を含むヒト分離菌を使用する膣内接種のモデル、
およびＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、血液型亜型Ｆ（株ＮＩ１
）として同定されたヒト単離菌を含む子宮内接種のモデル。両方の株は、上部生
殖管（ｕｐｐｅｒ ｇｅｎｉｔａｌ ｔｒａｃｔ）において炎症を誘導し、この
炎症は、女性においてＣｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓによって引
き起こされる子宮内膜炎および卵管炎に類似する。第１の実験において、Ｃ３Ｈ
マウス（１群あたり４匹のマウス）を、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢ
ＤＮＡ（配列番号１、配列番号５において提供される対応するアミノ酸配列を
有する）を含有する１００μｇのｐｃＤＮＡ−３発現ベクターを用いて３回免疫
した。接種を、全身性免疫のために尾の基部（ｂａｓｅ）で行った。最後の免疫
の２週間後、動物を、プロゲステロン処置し、そして膣を介してかまたは子宮へ
の接種物の注射によってのいずれかで感染させた。感染の２週間後、このマウス
を屠殺し、そして生殖管を切り出し、染色し、そして組織病理学について試験し
た。炎症レベルをスコア付けした（非常に軽度な＋から、非常に重篤な＋＋＋＋
＋まで）。各々単一の卵管／卵巣に帰するスコアを合計し、そして試験された器
官の数で除算して、その群についての炎症の平均スコアを得た。子宮接種のモデ
ルにおいて、空のベクターを受ける免疫した陰性コントロール動物は、ＤＮＡで
免疫した群についての２．６２とは対照的に、６．１２の卵巣／卵管平均炎症ス
コアをともなう一貫した炎症を示した。膣接種および感染の上昇のモデルにおい
て、免疫した陰性コントロールマウスは、ＤＮＡで免疫した群についての５．０
０に対して、８．３７の卵巣／卵管平均炎症スコアを有した。また、後者のモデ
ルにおいて、ワクチン接種したマウスは、管の閉塞の徴候を示さなかったが、一
方、ワクチン接種した陰性コントロール群は、卵管の管腔において炎症性細胞を
有した。
【０５７２】 第２の実験において、Ｃ３Ｈマウス（１群あたり４匹のマウス）を、ポリラク
チドｃｏ−グリコリドマイクロスフェア（ＰＬＧ）でカプセル化されたＣ．ｔｒ
ａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢ ＤＮＡ（配列番号１、配列番号５において提供
される対応するアミノ酸配列を有する）を含有する５０μｇのｐｃＤＮＡ−３発
現ベクターを用いて３回免疫し；免疫を、腹腔内で行った。最後の免疫の２週間
後、動物を、プロゲステロン処置し、そして膣におけるＣ．ｐｓｉｔｔａｃｉの
接種によって感染させた。感染の２週間後、マウスを屠殺し、そして生殖管を切
り出し、染色し、そして組織病理学について試験した。炎症レベルを、以前に記
載されるようにスコア付けした。各々単一の卵管／卵巣に帰するスコアを合計し
、そして試験された器官の数で除算して、その群についての炎症の平均を得た。
ＰＬＧでカプセル化した空のベクターを受ける、免疫した陰性コントロール動物
は、ＰＬＧでカプセル化したＤＮＡで免疫した群についての５．７１に対して、
７．２８の卵巣／卵管平均炎症スコアをともなう一貫した炎症を示した。腹膜に
おける炎症は、コントロールについての３．７５に対して、ワクチン接種した群
について１．７５であった。
【０５７３】 第３の実験において、Ｃ３Ｈマウス（１群あたり４匹）を、コレラ毒素（ＣＴ
）と混合した１０μｇの精製組換えタンパク質（ＳＷＩＢ（配列番号１、配列番
号５において提供される対応するアミノ酸配列を有する）またはＳ１３（配列番
号４、配列番号１２において提供される対応するアミノ酸配列を有する）のいず
れか）を用いて３回免疫し；その調製物を、２０μＬ容量で麻酔の際に鼻内投与
した。最後の免疫の２週間後、動物を、プロゲステロン処置し、そしてＣ．ｐｓ
ｉｔｔａｃｉの膣への接種によるかまたは子宮におけるＣ．ｔｒａｃｈｏｍａｔ
ｉｓ血液型亜型Ｆの注射によるかのいずれかで感染させた。感染の２週間後、こ
のマウスを屠殺し、そして生殖管を切り出し、染色し、そして組織病理学につい
て試験した。炎症の程度を、上記のようにスコア付けした。各々単一の卵管／卵
巣に帰するスコアを合計し、そして試験された器官の数で除算して、その群につ
いての炎症の平均スコアを得た。子宮接種のモデルにおいて、コレラ毒素単独を
受ける、免疫した陰性コントロール動物は、ｓ１３およびコレラ毒素で免疫した
群についての５．００、ならびにＳＷＩＢおよびコレラ毒素で免疫した群につい
ての１．００に対して、４．２５（分析した２匹のマウスのみ；他の２匹は死ん
だ）の卵巣／卵管平均炎症スコアを示した。未処置の感染動物は、７の卵巣／卵
管平均炎症スコアを有した。膣接種および感染の上昇のモデルにおいて、免疫し
た陰性コントロールマウスは、ｓ１３およびコレラ毒素で免疫した群についての
６．７５、ならびにＳＷＩＢおよびコレラ毒素で免疫した群についての５．３７
に対して、７．３７の卵巣／卵管平均炎症スコアを有した。未処置の感染動物は
、８の卵巣／卵管平均炎症スコアを有した。
【０５７４】 上記の３つの実験は、ＳＷＩＢ特異的防御が得られ得ることを示唆する。この
防御効果は、相同感染のモデルにおいて、より顕著であるが、しかしＣ．ｐｓｉ
ｔｔａｃｉを用いる異種チャレンジ感染における場合においてなお存在する。
【０５７５】 本発明は、理解を明確にする目的で、例示および実施例によって幾分詳細に記
載されているが、変更および改変は、本発明の範囲から逸脱することなく実施さ
れ得、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲の範囲によってのみ限定されるこ
とが意図される。
【０５７６】 （実施例１０） （Ｐｍｐ／Ｒａ１２融合タンパク質） 種々のＰｍｐ／Ｒａ１２融合構築物を、ＮｏｔＩ制限部位を含むプライマーを
使用して、Ｐｍｐ遺伝子のＰＣＲフラグメントを合成することによって作製した
。次いで、各ＰＣＲフラグメントをｐＣＲＸ１のＮｏｔＩ制限部位に連結した。
ｐＣＲＸ１ベクターは、融合体の６ＨｉｓＲａ１２部分を含む。融合構築物のＲ
ａ１２部分は、米国特許出願６０／１５８，５８５（この開示は、本明細書中に
参考として援用される）に記載されるように、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔ
ｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ ＭＴＢ３２Ａのアミノ酸１９２〜３２３に対応するポ
リペプチドをコードする。各インサートの正確な方向は、その制限酵素パターン
によって決定され、そしてその配列を検証した。以下にさらに記載されるように
、ＰｍｐＡ、ＰｍｐＢ、ＰｍｐＣ、ＰｍｐＦおよびＰｍｐＨについて、多数の融
合構築物を作製した： （ＰｍｐＡ融合タンパク質） ＰｍｐＡは、９８２アミノ酸を含む１０７ｋＤタンパク質であり、血液型亜型
Ｅからクローン化された。ＰｍｐＡタンパク質を２つの重複フラグメント（Ｐｍ
ｐＡ（Ｎ末端）および（Ｃ末端）部分に分けた。
【０５７７】 ＰｍｐＡ（Ｎ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５７８】
【化１２】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３０８に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＡのセグメント１〜４７３を発現する６６ｋ
Ｄタンパク質（６１９アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸配列
は、配列番号３０９に示される。
【０５７９】 ＰｍｐＡ（Ｃ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５８０】
【化１３】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３１２に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＡのセグメント４３８〜９８２を発現する７
４ｋＤタンパク質（６９１アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸
配列は、配列番号３１３に示される。
【０５８１】 （ＰｍｐＦ融合タンパク質） ＰｍｐＦは、１０３４アミノ酸を含む１１２ｋＤタンパク質であり、血液型亜
型Ｅからクローン化された。ＰｍｐＦタンパク質を２つの重複フラグメント（Ｐ
ｍｐＦ（Ｎ末端）および（Ｃ末端））部分に分けた。
【０５８２】 ＰｍｐＦ（Ｎ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５８３】
【化１４】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３１６に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＦのセグメント１〜４９９を発現する６９ｋＤタ
ンパク質（６４６アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸配列は、
配列番号３１７に示される。
【０５８４】 ＰｍｐＦ（Ｃ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５８５】
【化１５】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３２０に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＦのセグメント４６６〜１０３４を発現する７７
ｋＤタンパク質（７１５アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸配
列は、配列番号３２１に示される。
【０５８６】 （ＰｍｐＨ融合タンパク質） ＰｍｐＨは、１０１６アミノ酸を含む１０８ｋＤタンパク質であり、血液型亜
型Ｅからクローン化された。ＰｍｐＨタンパク質を２つの重複フラグメント（Ｐ
ｍｐＡ（Ｎ末端）および（Ｃ末端）部分に分けた。
【０５８７】 ＰｍｐＨ（Ｎ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５８８】
【化１６】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３２４に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＨのセグメント１〜４８４を発現する６４ｋＤタ
ンパク質（６３１アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸配列は、
配列番号３２５に示される。
【０５８９】 ＰｍｐＨ（Ｃ末端）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５９０】
【化１７】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３２８に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＨのセグメント４４９〜１０１６アミノ酸を
発現する７７ｋＤタンパク質（７１５アミノ酸）をコードする。融合タンパク質
のアミノ酸配列は、配列番号３２９に示される。
【０５９１】 （ＰｍｐＢ融合タンパク質） ＰｍｐＢは、１７５０アミノ酸を含む１８３ｋＤタンパク質であり、血液型亜
型Ｅからクローン化された。ＰｍｐＢタンパク質を４つの重複フラグメント（Ｐ
ｍｐＢ（１）、（２）、（３）および（４））に分けた。
【０５９２】 ＰｍｐＢ（１）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５９３】
【化１８】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３３２に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＢのセグメント１〜３７２アミノ酸を発現する５
３ｋＤタンパク質（５１８アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミノ酸
配列は、配列番号３３３に示される。
【０５９４】 ＰｍｐＢ（２）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５９５】
【化１９】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３３６に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＢのセグメント３３０〜７６７アミノ酸を発現す
る６０ｋＤタンパク質（５８５アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミ
ノ酸配列は、配列番号３３７に示される。
【０５９６】 ＰｍｐＢ（３）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５９７】
【化２０】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３４０に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＢのセグメント７３２〜１２３６アミノ酸を発現
する６７ｋＤタンパク質（６５４アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のア
ミノ酸配列は、配列番号３４１に示される。
【０５９８】 ＰｍｐＢ（４）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０５９９】
【化２１】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３４４に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＢのセグメント１１６０〜１７５０を発現す
る７６ｋＤタンパク質（７００アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミ
ノ酸配列は、配列番号３４５に示される。
【０６００】 （ＰｍｐＣ融合タンパク質） ＰｍｐＣは、１７７４アミノ酸を含む１８７ｋＤタンパク質であり、血液型亜
型Ｅ／Ｌ２からクローン化された。ＰｍｐＣタンパク質を３つの重複フラグメン
ト（ＰｍｐＣ（１）、（２）および（３））に分けた。
【０６０１】 ＰｍｐＣ（１）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０６０２】
【化２２】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３４８に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＣのセグメント１〜３４０アミノ酸を発現す
る５１ｋＤタンパク質（４８７アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミ
ノ酸配列は、配列番号３４９に示される。
【０６０３】 ＰｍｐＣ（２）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０６０４】
【化２３】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合体は、配列番号３５２に示されるＤＮ
Ａ配列を有し、これは、ＰｍｐＣのセグメント３０５〜７４１アミノ酸を発現す
る６０ｋＤタンパク質（５８３アミノ酸）をコードする。融合タンパク質のアミ
ノ酸配列は、配列番号３５３に示される。
【０６０５】 ＰｍｐＣ（３）をセンスプライマーおよびアンチセンスプライマー：
【０６０６】
【化２４】 によってそれぞれ増幅した。得られた融合構築物は、配列番号３５６に示される
ＤＮＡ配列を有し、これは、ＰｍｐＣのセグメント７１４〜１２５０アミノ酸を
発現する７０ｋＤタンパク質（６８３アミノ酸）をコードする。融合タンパク質
のアミノ酸配列は、配列番号３５７に示される。
【０６０７】 本発明は、理解を明確にする目的で、例示および実施例によって幾分詳細に記
載されているが、変更および改変は、本発明の範囲から逸脱することなく実施さ
れ得、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲の範囲によってのみ限定されるこ
とが意図される。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図１】 図１は、クローン４Ｃ９−１８＃２を発現する標的細胞により活性化されるＣ
ｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞株からのＩＮＦ−γの誘導を示す。
【図２】 図２は、コザック翻訳開始部位および終止コドンを含むように改変されたレト
ロウイルスベクターｐＢＩＢ−ＫＳ１，２，３を示す。
【図３】 図３は、ＣｈｌａｍｙｄｉａペプチドＣｔＣ７．８−１２（配列番号１８）お
よびＣｔＣ７．８−１３（配列番号１９）とパルスしたＰ８１５細胞のクロム放
出アッセイの特異的溶解を示す。
【図４】 図４は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢタンパク質で免疫したＣ５７
Ｂｌ／６マウスにおける抗体アイソタイプの力価を示す。
【図５】 図５は、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢタンパク質で免疫したＣ３Ｈ
マウス由来の脾細胞におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ特異的Ｔ細胞増殖応答を示す。
【図６】 図６は、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ由来のＳＷＩＢおよびＳ１３の遺伝子を単
離するために使用した、Ｃ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅから設計した５’および３’
プライマー配列を示す。
【図７】 図７Ａおよび７Ｂは、Ｃｈｌａｍｙｄｉａのタンパク質を発現する単球由来の
樹状細胞による活性化の際に、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓおよびＣ．ｐｎｅｕ
ｍｏｎｉａｅに対して交差反応し得るヒト抗ＣｈｌａｍｙｄｉａＴ細胞株（ＴＣ
Ｌ−８）からのＩＦＮ−γの誘導を示す。
【図８】 図８は、Ｔ細胞株ＴＣＬ ８ ＥＢ／ＤＣを用いた、Ｃｈｌａｍｙｄｉａのリ
ボソームＳ１３タンパク質におけるＴ細胞エピトープの同定を示す。
【図９】 図９は、Ｃ．ｐｎｕｅｍｏｎｉａｅ感染樹状細胞に対して生成されたＣＰ−２
１ Ｔ細胞の、組換えＣ．ｐｎｅｕｍｏｎｉａ−ＳＷＩＢタンパク質に対する増
殖性応答を示すが、Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢタンパク質に対して
は示さなかった。
【図１０】 図１０は、無症候性ドナー由来の初代Ｔ細胞株（ＴＣＴ−１０ ＥＢ）のＣ．
ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ特異的ＳＷＩＢ増殖性応答を示す。
【図１１】 図１１は、抗原特異的Ｔ細胞株（ＴＣＬ−１０ ＥＢ）を用いた、Ｃ．ｔｒａ
ｃｈｏｍａｔｉｓ ＳＷＩＢにおけるＴ細胞エピトープの同定を示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｋ 48/00 Ｃ０７Ｋ 14/295 ４Ｃ０８５ Ａ６１Ｐ 31/04 16/12 ４Ｈ０４５ Ｃ０７Ｋ 14/295 19/00 16/12 Ｃ１２Ｎ 1/19 19/00 1/21 Ｃ１２Ｎ 1/19 Ｃ１２Ｑ 1/68 Ａ 1/21 Ｇ０１Ｎ 33/53 Ｄ 5/10 Ｍ Ｃ１２Ｑ 1/68 33/566 Ｇ０１Ｎ 33/53 33/569 Ｆ 33/571 33/566 Ｃ１２Ｐ 21/08 33/569 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ 33/571 5/00 Ｂ // Ｃ１２Ｐ 21/08 Ａ６１Ｋ 37/02 (31)優先権主張番号 ０９／５９８，４１９ (32)優先日 平成12年６月20日(2000．6．20) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ，ＴＲ)，ＯＡ(ＢＦ ，ＢＪ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ， ＭＬ，ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，Ｇ Ｍ，ＫＥ，ＬＳ，ＭＷ，ＭＺ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＴＺ ，ＵＧ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ， ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＧ，ＡＬ，ＡＭ， ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，Ｂ Ｚ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＲ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ ，ＤＭ，ＤＺ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ， ＧＨ，ＧＭ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，Ｊ Ｐ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＡ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ， ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＭＺ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，Ｒ Ｏ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＴＺ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ， ＶＮ，ＹＵ，ＺＡ，ＺＷ (72)発明者 スカイキー， ヤシル エイ． ダブリュ ー． アメリカ合衆国 ワシントン 98006， ベルビュー， エスイー 47ティーエイチ プレイス 15106 (72)発明者 フライング， スティーブン ピー． アメリカ合衆国 ワシントン 98110， バインブリッジ アイランド， ピンヨン アベニュー ノースイースト 11414 (72)発明者 スカラー， ジョン アメリカ合衆国 ワシントン 98107， シアトル， 32エヌディー アベニュー エヌダブリュー 6208 Ｆターム(参考） 4B024 AA01 AA13 BA31 CA04 DA02 DA06 DA12 HA12 HA14 HA15 HA17 4B063 QA19 QQ03 QQ43 QR08 QR55 QR62 QS25 QS33 QS34 QX02 4B064 AG27 CA02 DA01 DA15 4B065 AB01 BA02 CA24 CA45 CA46 4C084 AA13 BA35 CA04 NA14 ZB351 4C085 AA03 AA14 AA19 AA38 BA45 DD86 FF24 4H045 AA10 AA11 AA30 BA41 CA11 DA76 DA86 EA31 EA52

Claims (71)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む、単離された
    ポリペプチドであって、ここで、該抗原は、以下：（ａ）配列番号１６９〜１７
    ４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９０に示される配列；（
    ｂ）（ａ）の配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリンジェントな
    条件下で（ａ）または（ｂ）の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列
    、からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列によってコードされるアミノ
    酸配列を含む抗原である、単離されたポリペプチド。
  2. 【請求項２】 前記ポリペプチドが、配列番号１７５〜１８０、１８９〜１
    ９６、２６４および２６６からなる群より選択される配列を含む、請求項１に記
    載のポリペプチド。
  3. 【請求項３】 請求項１および２のいずれか１項に記載のポリペプチドをコ
    ードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
  4. 【請求項４】 請求項３に記載のポリヌクレオチド分子を含む、組換え発現
    ベクター。
  5. 【請求項５】 請求項４に記載の発現ベクターで形質転換された、宿主細胞
    。
  6. 【請求項６】 前記宿主細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞、酵母細胞および哺乳動
    物細胞からなる群より選択される、請求項５に記載の宿主細胞。
  7. 【請求項７】 請求項１および２のいずれか１項に記載のポリペプチドを含
    む、融合タンパク質。
  8. 【請求項８】 請求項７に記載の融合タンパク質であって、ここで、該融合
    タンパク質は、発現エンハンサーを含み、該発現エンハンサーは、該融合タンパ
    ク質をコードするポリヌクレオチドでトランスフェクトされた宿主細胞において
    、該融合タンパク質の発現を増加させる発現エンハンサーである、融合タンパク
    質。
  9. 【請求項９】 請求項１に記載のポリペプチド中に存在しないＴヘルパーエ
    ピトープを含む、請求項７に記載の融合タンパク質。
  10. 【請求項１０】 アフィニティータグを含む、請求項７に記載の融合タンパ
    ク質。
  11. 【請求項１１】 請求項７に記載の融合タンパク質をコードする、単離され
    たポリヌクレオチド。
  12. 【請求項１２】 請求項１に記載のポリヌクレオチド配列または該ポリヌク
    レオチド配列のいずれかの相補体によってコードされるアミノ酸配列を含むＣｈ
    ｌａｍｙｄｉａタンパク質に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体
    またはその抗原結合フラグメント。
  13. 【請求項１３】 請求項１に記載のポリペプチドおよび生理学的に受容可能
    なキャリアを含む、薬学的組成物。
  14. 【請求項１４】 請求項３に記載のポリヌクレオチド分子および生理学的に
    受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
  15. 【請求項１５】 ポリペプチドおよび生理学的に受容可能なキャリアを含む
    、薬学的組成物であって、ここで、該ポリペプチドは、以下：（ａ）配列番号１
    ６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示され
    る配列；（ｂ）（ａ）の配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリン
    ジェントな条件下で（ａ）または（ｂ）の配列にハイブリダイズする配列、から
    なる群より選択されるポリヌクレオチド分子によってコードされるポリペプチド
    である、薬学的組成物。
  16. 【請求項１６】 ポリヌクレオチド分子および生理学的に受容可能なキャリ
    アを含む、薬学的組成物であって、ここで、該ポリヌクレオチド分子は、以下：
    （ａ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７
    〜２９１に示される配列；（ｂ）（ａ）の配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）
    中程度にストリンジェントな条件下で（ａ）または（ｂ）の配列にハイブリダイ
    ズする配列、からなる群より選択される配列を含むポリヌクレオチド分子である
    、薬学的組成物。
  17. 【請求項１７】 生理学的に受容可能なキャリアならびに以下： （ａ）請求項７に記載の融合タンパク質； （ｂ）請求項１１に記載のポリヌクレオチド；および （ｃ）請求項１２に記載の抗体； からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む、薬学的組成物。
  18. 【請求項１８】 請求項１に記載のポリペプチドおよび免疫促進剤を含む、
    ワクチン。
  19. 【請求項１９】 請求項３に記載のポリヌクレオチド分子および免疫促進剤
    を含む、ワクチン。
  20. 【請求項２０】 ポリペプチドおよび免疫促進剤を含む、ワクチンであって
    、ここで、該ポリペプチドは、以下：（ａ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜
    １８８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列；（ｂ）（ａ）の
    配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ａ
    ）または（ｂ）の配列にハイブリダイズする配列、からなる群より選択される配
    列によってコードされるポリペプチドである、ワクチン。
  21. 【請求項２１】 ＤＮＡ分子および免疫促進剤を含む、ワクチンであって、
    ここで、該ＤＮＡ分子は、以下：（ａ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８
    ８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列；（ｂ）（ａ）の配列
    に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ａ）ま
    たは（ｂ）の配列にハイブリダイズする配列、からなる群より選択される配列を
    含むＤＮＡ分子である、ワクチン。
  22. 【請求項２２】 免疫促進剤ならびに以下： （ａ）請求項７に記載の融合タンパク質； （ｂ）請求項１１に記載のポリヌクレオチド；および （ｃ）請求項１２に記載の抗体； からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む、ワクチン。
  23. 【請求項２３】 前記免疫促進剤が、アジュバントである、請求項１８〜２
    ２のいずれか１項に記載のワクチン。
  24. 【請求項２４】 患者において保護免疫を誘導するための方法であって、請
    求項１３〜１７のいずれか１項に記載の薬学的組成物を患者に投与する工程を包
    含する、方法。
  25. 【請求項２５】 患者において保護免疫を誘導するための方法であって、請
    求項１８〜２２のいずれか１項に記載のワクチンを患者に投与する工程を包含す
    る、方法。
  26. 【請求項２６】 請求項１に記載のポリヌクレオチド配列または該ポリヌク
    レオチド配列のいずれかの相補体によってコードされるアミノ酸配列を含むＣｈ
    ｌａｍｙｄｉａタンパク質に特異的に結合する、単離されたポリクローナル抗体
    またはその抗原結合フラグメント。
  27. 【請求項２７】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出するための方
    法であって、以下： （ａ）該患者から生物学的サンプルを得る工程； （ｂ）該サンプルに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含むポリペプ
    チドを接触させる工程であって、ここで、該抗原は、以下：（ｉ）配列番号１６
    ９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される
    配列；（ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリン
    ジェントな条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列にハイブリダイズするポリヌク
    レオチド配列、からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列によってコード
    されるアミノ酸配列を含む抗原である、工程；ならびに （ｃ）該ポリペプチドに結合する抗体の存在を検出する工程、 を包含する、方法。
  28. 【請求項２８】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出するための方
    法であって、以下： （ａ）該患者から生物学的サンプルを得る工程； （ｂ）該サンプルに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含むポリペプ
    チドを含む融合タンパク質を接触させる工程であって、ここで、該抗原は、以下
    ：（ｉ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６
    ７〜２９１に示される配列；（ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列；ならびに（
    ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列にハイブ
    リダイズするポリヌクレオチド配列、からなる群より選択されるポリヌクレオチ
    ド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む抗原である、工程；ならびに （ｃ）該融合タンパク質に結合する抗体の存在を検出する工程、 を包含する、方法。
  29. 【請求項２９】 前記生物学的サンプルが、全血、血清、血漿、唾液、脳脊
    髄液および尿からなる群より選択される、請求項２７および２８のいずれか１項
    に記載の方法。
  30. 【請求項３０】 生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出
    するための方法であって、以下： （ａ）該サンプルに、ポリメラーゼ連鎖反応において、少なくとも２つのオリ
    ゴヌクレオチドプライマーを接触させる工程であって、ここで、該オリゴヌクレ
    オチドプライマーの少なくとも１つは、配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８
    ８、２６３、２６５および２６７〜２９１の配列を含むポリヌクレオチド分子に
    特異的なプライマーである、工程；および （ｂ）該サンプルにおいて、該オリゴヌクレオチドプライマーの存在下で増幅
    されるポリヌクレオチド配列を検出し、これによって、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染
    を検出する工程、 を包含する、方法。
  31. 【請求項３１】 前記オリゴヌクレオチドプライマーの少なくとも１つが、
    配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９
    １のポリヌクレオチド配列のうちの少なくとも約１０個連続するヌクレオチドを
    含む、請求項３０に記載の方法。
  32. 【請求項３２】 生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出
    するための方法であって、以下： （ａ）該サンプルに、配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２
    ６５および２６７〜２９１の配列を含むポリヌクレオチド分子に特異的な１以上
    のオリゴヌクレオチドプローブを、接触させる工程；および （ｂ）該サンプルにおいて、該オリゴヌクレオチドプローブにハイブリダイズ
    するポリヌクレオチド配列を検出し、これによって、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ感染を
    検出する工程、 を包含する、方法。
  33. 【請求項３３】 前記プローブが、配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８
    ８、２６３、２６５および２６７〜２９１のポリヌクレオチド配列のうちの少な
    くとも約１５個連続するヌクレオチドを含む、請求項３２に記載の方法。
  34. 【請求項３４】 生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出
    するための方法であって、以下： （ａ）該生物学的サンプルに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む
    ポリペプチドに結合し得る結合剤を接触させる工程であって、ここで、該抗原は
    、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５およ
    び２６７〜２９１に示される配列、（ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列、なら
    びに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列に
    ハイブリダイズするポリヌクレオチド配列、からなる群より選択されるポリヌク
    レオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む抗原である、工程；なら
    びに （ｂ）該サンプルにおいて、該結合剤に結合するポリペプチドを検出し、これ
    によって、該生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出する工程
    、 を包含する、方法。
  35. 【請求項３５】 生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出
    する方法であって、以下： （ａ）該生物学的サンプルに、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む
    ポリペプチドを含む融合タンパク質に結合し得る結合剤を、接触させる工程であ
    って、ここで、該抗原は、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８
    ８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列、（ｉｉ）（ｉ）の配
    列に相補的な配列、ならびに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ｉ）
    または（ｉｉ）の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列、からなる群
    より選択されるポリヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む
    抗原である、工程；ならびに （ｂ）該サンプルにおいて、該結合剤に結合するポリペプチドを検出し、これ
    によって、該生物学的サンプルにおけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を検出する工程
    、 を包含する、方法。
  36. 【請求項３６】 前記結合剤が、モノクローナル抗体である、請求項３４お
    よび３５のいずれか１項に記載の方法。
  37. 【請求項３７】 前記結合剤が、ポリクローナル抗体である、請求項３４お
    よび３５のいずれか１項に記載の方法。
  38. 【請求項３８】 前記生物学的サンプルが、全血、痰、血清、血漿、唾液、
    脳脊髄液および尿からなる群より選択される、請求項３４および３５のいずれか
    １項に記載の方法。
  39. 【請求項３９】 以下： （ａ）Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む、ポリペプチドであって
    、ここで、該抗原は、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、
    ２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列、（ｉｉ）（ｉ）の配列に
    相補的な配列、ならびに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ｉ）また
    は（ｉｉ）の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列、からなる群より
    選択されるポリヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む抗原
    である、ポリペプチド；ならびに （ｂ）検出試薬、 を備える、診断キット。
  40. 【請求項４０】 以下： （ａ）Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含むポリペプチドを含む、融
    合タンパク質であって、ここで、該抗原は、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１７
    ４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列；（
    ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列；ならびに（ｃ）中程度にストリンジェント
    な条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチド
    配列、からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列によってコードされるア
    ミノ酸配列を含む抗原である、融合タンパク質：ならびに （ｂ）検出試薬、 を備える、診断キット。
  41. 【請求項４１】 前記ポリペプチドが、固体支持体上に固定化されている、
    請求項３９または４０に記載のキット。
  42. 【請求項４２】 前記検出試薬が、結合剤に結合体化されたレポーター基を
    含む、請求項３９または４０に記載のキット。
  43. 【請求項４３】 前記結合剤が、抗免疫グロブリン、プロテインＧ、プロテ
    インＡおよびレクチンからなる群より選択される、請求項４２に記載のキット。
  44. 【請求項４４】 前記レポーター基が、放射性同位体、蛍光基、発光基、酵
    素、ビオチンおよび色素粒子からなる群より選択される、請求項４２に記載のキ
    ット。
  45. 【請求項４５】 少なくとも２つのオリゴヌクレオチドプライマーを含む、
    診断キットであって、該オリゴヌクレオチドプライマーの少なくとも１つは、配
    列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１
    のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド分子に特異的なプライマーであ
    る、診断キット。
  46. 【請求項４６】 前記オリゴヌクレオチドプライマーの少なくとも１つが、
    配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９
    １の配列のうちの少なくとも約１０個連続するヌクレオチドを含む、請求項４３
    に記載の診断キット。
  47. 【請求項４７】 少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプローブを含む、診
    断キットであって、該オリゴヌクレオチドプローブは、配列番号１６９〜１７４
    、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１の配列を含むポリヌク
    レオチド分子に特異的なプローブである、診断キット。
  48. 【請求項４８】 前記オリゴヌクレオチドプローブが、配列番号１６９〜１
    ７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１のポリヌクレオチ
    ド配列のうちの少なくとも約１５個連続するヌクレオチドを含む、請求項４７に
    記載のキット。
  49. 【請求項４９】 以下： （ａ）請求項２２に記載の少なくとも１つの抗体またはその抗原結合フラグメ
    ント；および （ｂ）検出試薬、 を備える、診断キット。
  50. 【請求項５０】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための方
    法であって、以下の工程： （ａ）該患者から末梢血細胞を得る工程； （ｂ）Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む少なくとも１つのポリペ
    プチドの存在下で、該細胞をインキュベートする工程であって、ここで、該抗原
    は、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１７４、１８１〜１８８、２６３、２６５お
    よび２６７〜２９１に示される配列、（ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列、な
    らびに（ｃ）中程度にストリンジェントな条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列
    にハイブリダイズするポリヌクレオチド配列、からなる群より選択されるポリヌ
    クレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む抗原であり、その結果
    、Ｔ細胞が増殖する、工程：ならびに （ｃ）該患者に、該増殖されたＴ細胞を投与する工程、 を包含する、方法。
  51. 【請求項５１】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための方
    法であって、以下の工程： （ａ）該患者から末梢血細胞を得る工程； （ｂ）少なくとも１つのポリヌクレオチドの存在下で、該細胞をインキュベー
    トする工程であって、該ポリヌクレオチドは、以下：（ｉ）配列番号１６９〜１
    ７４、１８１〜１８８、２６３、２６５および２６７〜２９１に示される配列、
    （ｉｉ）（ｉ）の配列に相補的な配列、ならびに（ｃ）中程度にストリンジェン
    トな条件下で（ｉ）または（ｉｉ）の配列にハイブリダイズするポリヌクレオチ
    ド配列、からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチ
    ドであり、その結果、Ｔ細胞が増殖する、工程；ならびに （ｃ）該患者に、該増殖されたＴ細胞を投与する工程、 を包含する、方法。
  52. 【請求項５２】 前記Ｔ細胞をインキュベートする工程が、１回以上繰り返
    される、請求項５０および５１のいずれか１項に記載の方法。
  53. 【請求項５３】 工程（ａ）が、前記末梢血細胞からＴ細胞を分離する工程
    をさらに包含し、そして工程（ｂ）においてインキュベートされる細胞が、該Ｔ
    細胞である、請求項５０および５１のいずれか１項に記載の方法。
  54. 【請求項５４】 工程（ａ）が、前記末梢血細胞からＣＤ４＋細胞またはＣ
    Ｄ８＋Ｔ細胞を分離する工程をさらに包含し、そして工程（ｂ）において増殖さ
    れる細胞が、ＣＤ４＋Ｔ細胞またはＣＤ８＋Ｔ細胞である、請求項５０および５
    １のいずれか１項に記載の方法。
  55. 【請求項５５】 工程（ａ）が、前記末梢血細胞からγ／δＴリンパ球を分
    離する工程をさらに包含し、そして工程（ｂ）において増殖される細胞が、γ／
    δＴリンパ球である、請求項５０および５１のいずれか１項に記載の方法。
  56. 【請求項５６】 工程（ｂ）が、前記ポリペプチドの存在下で増殖される１
    以上のＴ細胞をクローニングする工程をさらに包含する、請求項５０および５１
    のいずれか１項に記載の方法。
  57. 【請求項５７】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための薬
    学的組成物であって、請求項１に記載のポリペプチドの存在下で増殖されたＴ細
    胞を、生理学的に受容可能なキャリアと組み合わせて含む、薬学的組成物。
  58. 【請求項５８】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための薬
    学的組成物であって、請求項３に記載のポリヌクレオチドの存在下で増殖された
    Ｔ細胞を、生理学的に受容可能なキャリアと組み合わせて含む、薬学的組成物。
  59. 【請求項５９】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための方
    法であって、以下の工程： （ａ）請求項１に記載の少なくとも１つのポリペプチドの存在下で、抗原提示
    細胞をインキュベートする工程； （ｂ）該患者に、該インキュベートした抗原提示細胞を投与する工程、 を包含する、方法。
  60. 【請求項６０】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための方
    法であって、以下の工程： （ａ）請求項３に記載の少なくとも１つのポリヌクレオチドを、抗原提示細胞
    に導入する工程； （ｂ）該患者に、該抗原提示細胞を投与する工程、 を包含する、方法。
  61. 【請求項６１】 前記抗原提示細胞が、樹状細胞、マクロファージ細胞、Ｂ
    細胞線維芽細胞、単球細胞および幹細胞からなる群より選択される、請求項５９
    または６０に記載の方法。
  62. 【請求項６２】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための薬
    学的組成物であって、請求項１に記載のポリペプチドの存在下でインキュベート
    された抗原提示細胞を、生理学的に受容可能なキャリアと組み合わせて含む、薬
    学的組成物。
  63. 【請求項６３】 患者におけるＣｈｌａｍｙｄｉａ感染を処置するための薬
    学的組成物であって、請求項３に記載のポリヌクレオチドの存在下でインキュベ
    ートされた抗原提示細胞を、生理学的に受容可能なキャリアと組み合わせて含む
    、薬学的組成物。
  64. 【請求項６４】 Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性部分を含む、ポリペプ
    チドであって、ここで、該免疫原性部分は、配列番号２４６、２４７および２５
    ４〜２５６の配列を含む部分である、ポリペプチド。
  65. 【請求項６５】 配列番号２４６、２４７または２５４〜２５６の配列を含
    む、Ｃｈｌａｍｙｄｉａ抗原の免疫原性エピトープ。
  66. 【請求項６６】 配列番号２２４〜２６２、２４６、２４７、２５４〜２５
    ６、２９２および２９４〜３０５のいずれか１つに示される配列を含む、単離さ
    れたポリペプチド。
  67. 【請求項６７】 Ｒａ１２ポリペプチドのアミノ酸配列およびクラミジアポ
    リペプチドのアミノ酸配列を含む、組換え融合ポリペプチド。
  68. 【請求項６８】 前記クラミジアポリペプチドが、Ｐｍｐポリペプチドであ
    る、請求項６７に記載の組換えポリペプチド。
  69. 【請求項６９】 前記クラミジアポリペプチドが、ＰｍｐＡ、ＰｍｐＦ、Ｐ
    ｍｐＨ、ＰｍｐＢ、またはＰｍｐＣである、請求項６７に記載の組換えポリペプ
    チド。
  70. 【請求項７０】 前記融合ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号３０９
    、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５
    、３４９、３５３および３５７からなる群より選択される配列である、請求項６
    ７に記載の組換えポリペプチド。
  71. 【請求項７１】 請求項６７に記載の融合ポリペプチドをコードする、組換
    えＤＮＡ分子。
JP2001542539A 1999-12-03 2000-12-04 クラミジア感染の処置および診断のための化合物および方法 Withdrawn JP2003515343A (ja)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US45468499A 1999-12-03 1999-12-03
US09/454,684 1999-12-03
US09/556,877 2000-04-19
US09/556,877 US6432916B1 (en) 1998-12-08 2000-04-19 Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
US09/598,419 2000-06-20
US09/598,419 US6565856B1 (en) 1998-12-08 2000-06-20 Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
PCT/US2000/032919 WO2001040474A2 (en) 1999-12-03 2000-12-04 Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2003515343A true JP2003515343A (ja) 2003-05-07

Family

ID=27412613

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2001542539A Withdrawn JP2003515343A (ja) 1999-12-03 2000-12-04 クラミジア感染の処置および診断のための化合物および方法

Country Status (16)

Country Link
US (1) US6565856B1 (ja)
EP (1) EP1238084A2 (ja)
JP (1) JP2003515343A (ja)
KR (1) KR20020073136A (ja)
CN (1) CN1437652A (ja)
AU (1) AU1815901A (ja)
BR (1) BR0016066A (ja)
CA (1) CA2390088A1 (ja)
CZ (1) CZ20021897A3 (ja)
HU (1) HUP0203705A2 (ja)
IL (1) IL149754A0 (ja)
MX (1) MXPA02005504A (ja)
NO (1) NO20022592L (ja)
NZ (1) NZ518917A (ja)
PL (1) PL355977A1 (ja)
WO (1) WO2001040474A2 (ja)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8052975B2 (en) * 1998-12-08 2011-11-08 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection

Families Citing this family (51)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030219453A1 (en) * 1998-03-19 2003-11-27 Smithkline Beecham Biologicals, Sa Vaccines
US7459524B1 (en) * 1997-10-02 2008-12-02 Emergent Product Development Gaithersburg Inc. Chlamydia protein, sequence and uses thereof
US6686339B1 (en) 1998-08-20 2004-02-03 Aventis Pasteur Limited Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein C of Chlamydia
AU5366099A (en) 1998-08-20 2000-03-14 Connaught Laboratories Limited Nucleic acid molecules encoding inclusion membrane protein of (chlamydia)
WO2000011180A1 (en) 1998-08-20 2000-03-02 Connaught Laboratories Limited NUCLEIC ACID MOLECULES ENCODING POMP91A PROTEIN OF $i(CHLAMYDIA)
US6649370B1 (en) 1998-10-28 2003-11-18 Aventis Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof
US6607730B1 (en) 1998-11-02 2003-08-19 Aventis Pasteur Limited/Aventis Pasteur Limitee Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof
WO2000032784A1 (en) 1998-12-01 2000-06-08 Aventis Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof
US6565856B1 (en) 1998-12-08 2003-05-20 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
WO2000034483A2 (en) * 1998-12-08 2000-06-15 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
US6555115B1 (en) 1998-12-08 2003-04-29 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
US20080213264A1 (en) * 1998-12-08 2008-09-04 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
GB9828000D0 (en) 1998-12-18 1999-02-10 Chiron Spa Antigens
US7297341B1 (en) 1998-12-23 2007-11-20 Sanofi Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof
US6808713B1 (en) 1998-12-28 2004-10-26 Aventis Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding DNA fragments and uses thereof
CA2356057A1 (en) 1998-12-28 2000-07-06 Aventis Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof
GB9902555D0 (en) 1999-02-05 1999-03-24 Neutec Pharma Plc Medicament
JP4832646B2 (ja) 1999-03-12 2011-12-07 サノフィ、パストゥール、リミテッド クラミジア抗原および対応するｄｎａ断片ならびにその使用
JP4695763B2 (ja) 1999-05-03 2011-06-08 サノフィ、パストゥール、リミテッド クラミジア抗原および対応するｄｎａ断片ならびにその使用
DE60037900T2 (de) 1999-09-20 2009-02-12 Sanofi Pasteur Ltd., Toronto Chlamydia antigene und entsprechende dna-fragmente und ihre verwendungen
US6632663B1 (en) 1999-09-22 2003-10-14 Aventis Pasteur Limited DNA immunization against chlamydia infection
EP1240331B1 (en) 1999-12-22 2010-04-07 Aventis Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof
US20030175700A1 (en) * 2000-04-21 2003-09-18 Ajay Bhatia Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
US6919187B2 (en) * 2000-04-21 2005-07-19 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
EP1282718B1 (en) 2000-05-08 2006-12-20 Sanofi Pasteur Limited Chlamydia antigens and corresponding dna fragments and uses thereof
AU2001276619A1 (en) 2000-07-03 2002-01-14 Chiron S.P.A. Immunisation against chlamydia pneumoniae
US7537772B1 (en) * 2000-10-02 2009-05-26 Emergent Product Development Gaithersburg Inc. Chlamydia protein, gene sequence and the uses thereof
US7731980B2 (en) * 2000-10-02 2010-06-08 Emergent Product Development Gaithersburg Inc. Chlamydia PMP proteins, gene sequences and uses thereof
GB0103169D0 (en) * 2001-02-08 2001-03-28 Smithkline Beecham Biolog Vaccine composition
US6925469B2 (en) * 2001-03-30 2005-08-02 Intertainer, Inc. Digital entertainment service platform
CA2469620A1 (en) 2001-12-12 2003-06-19 Chiron Srl. Immunisation against chlamydia trachomatis
GB0203403D0 (en) 2002-02-13 2002-04-03 Chiron Spa Chlamydia cytotoxic-T cell epitopes
CN102861325A (zh) * 2003-11-10 2013-01-09 Uab研究基金会 减少细菌携带和中枢神经系统侵害的组合物及其使用方法
US8541007B2 (en) 2005-03-31 2013-09-24 Glaxosmithkline Biologicals S.A. Vaccines against chlamydial infection
EP2392348A3 (en) 2005-03-31 2012-01-18 GlaxoSmithKline Biologicals S.A. Vaccines against chlamydial infection
WO2007082105A2 (en) * 2006-01-16 2007-07-19 Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Chlamydia vaccine
WO2008022298A2 (en) * 2006-08-17 2008-02-21 The Uab Research Foundation Immunogenic pcpa polypeptides and uses thereof
NL1033345C1 (nl) 2007-02-06 2008-08-07 Vereniging Voor Christelijk Ho Werkwijze voor het detecteren van Chlamydia trachomatis en een kit daarvoor.
EP2517725A1 (en) * 2007-05-01 2012-10-31 Board Of Regents, The University Of Texas Chlamydial antigens as reagents for diagnosis and treatment of chlamydial infection and disease
WO2009020553A2 (en) * 2007-08-03 2009-02-12 President And Fellows Of Harvard College Chlamydia antigens
US7892567B2 (en) * 2007-10-01 2011-02-22 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods and compositions for immunization against chlamydial infection and disease
AU2008331800A1 (en) * 2007-12-03 2009-06-11 President And Fellows Of Harvard College Chlamydia antigens
JP4798125B2 (ja) * 2007-12-13 2011-10-19 株式会社デンソー 照度センサ
WO2010042206A1 (en) 2008-10-09 2010-04-15 Board Of Regents, University Of Texas System Methods and compositions for chlamydial antigens for diagnosis and treatment of chlamydial infection and disease
US8204859B2 (en) * 2008-12-10 2012-06-19 Commvault Systems, Inc. Systems and methods for managing replicated database data
EP2403526B1 (en) 2009-03-06 2019-05-15 GlaxoSmithKline Biologicals SA Chlamydia antigens
EP2557156B1 (en) 2010-03-23 2015-02-11 Wako Pure Chemical Industries, Ltd. Primer and probe for detecting chlamydia trachomatis, and method for detecting chlamydia trachomatis using same
CN112105376A (zh) 2018-03-08 2020-12-18 应用分子运输公司 用于经口递送的毒素衍生的递送构建体
WO2020096695A1 (en) * 2018-11-07 2020-05-14 Applied Molecular Transport Inc. Cholix-derived carriers for oral delivery of heterologous payload
TW202120521A (zh) 2019-08-16 2021-06-01 美商應用分子運輸公司 組合物、配方及介白素生產及純化
CN112779248B (zh) * 2021-02-04 2022-12-02 杭州遂曾生物技术有限公司 一种沙眼衣原体一体化核酸检测卡盒

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4118469A (en) 1976-04-27 1978-10-03 Research Corporation Antigen for trachoma lymphogranuloma venereum (LGV) and non-gonococcal urethritis (NGU)
US4497863A (en) 1984-03-07 1985-02-05 Milliken Research Corporation Laminated weft insertion fabric
US5166053A (en) 1990-02-23 1992-11-24 Miles Inc. Specimen adequacy control for chlamydia assays
JP3018553B2 (ja) 1990-05-08 2000-03-13 日立化成工業株式会社 クラミジア・トラコマティス抗体測定方法及びクラミジア・トラコマティス感染症診断用製剤
US5549978A (en) 1992-10-30 1996-08-27 Kabushiki Kaisha Toshiba Magnetoresistance effect element
US6165478A (en) 1994-09-20 2000-12-26 Hitachi Chemical Company, Ltd. DNA encoding Chlamydia pneumoniae antigenic polypeptide
GB9516293D0 (en) 1995-08-09 1995-10-11 Immunova Ltee Novel peptides and their use as vaccines
NZ334114A (en) 1996-07-12 2000-06-23 Univ Manitoba DNA immunization against chlamydia infection comprising a major outer membrane protein (MOMP) or a MOMP fragment linked to a promoter sequence
US6464979B1 (en) 1996-09-12 2002-10-15 Aventis Pasteur Limited Chlamydial vaccines and methods of preparation thereof
ATE352624T1 (de) 1997-11-21 2007-02-15 Serono Genetics Inst Sa Chlamydia pneumoniae genomische sequenzen und polypeptiden, fragmenten und anwendungen davon für nachweis, prevention und heilung
EP2228385A1 (en) 1997-11-28 2010-09-15 Merck Serono Biodevelopment Chlamydia trachomatis genomic sequence and polypeptides, fragments thereof and uses thereof, in particular for the diagnosis, prevention and treatment of infection
NZ507378A (en) 1998-04-07 2002-12-20 Corixa Corp Fusion proteins of mycobacterium tuberculosis antigens and their uses
WO2000034483A2 (en) 1998-12-08 2000-06-15 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
US6565856B1 (en) 1998-12-08 2003-05-20 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8052975B2 (en) * 1998-12-08 2011-11-08 Corixa Corporation Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection

Also Published As

Publication number Publication date
CN1437652A (zh) 2003-08-20
NO20022592L (no) 2002-07-19
EP1238084A2 (en) 2002-09-11
US6565856B1 (en) 2003-05-20
HUP0203705A2 (hu) 2003-03-28
PL355977A1 (en) 2004-05-31
WO2001040474A2 (en) 2001-06-07
CA2390088A1 (en) 2001-06-07
WO2001040474A3 (en) 2002-03-07
CZ20021897A3 (cs) 2003-02-12
KR20020073136A (ko) 2002-09-19
MXPA02005504A (es) 2002-10-31
NO20022592D0 (no) 2002-05-31
BR0016066A (pt) 2003-06-10
IL149754A0 (en) 2002-11-10
AU1815901A (en) 2001-06-12
NZ518917A (en) 2004-06-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2003515343A (ja) クラミジア感染の処置および診断のための化合物および方法
US8052975B2 (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
EP1144642B1 (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
ZA200104414B (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection.
US20080213264A1 (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection
ZA200204359B (en) Compounds and methods for treatment and diagnosis of chlamydial infection.

Legal Events

Date Code Title Description
A300 Application deemed to be withdrawn because no request for examination was validly filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A300

Effective date: 20080205