JP2003512041A - ヒトおよびネズミの接着タンパク質(BIgR)をコードするポリヌクレオチド - Google Patents

ヒトおよびネズミの接着タンパク質(BIgR)をコードするポリヌクレオチド

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JP2003512041A JP2001531881A JP2001531881A JP2003512041A JP 2003512041 A JP2003512041 A JP 2003512041A JP 2001531881 A JP2001531881 A JP 2001531881A JP 2001531881 A JP2001531881 A JP 2001531881A JP 2003512041 A JP2003512041 A JP 2003512041A
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カニンガム,ソニア・エイ
バロス,マリア・ピア・トリンダツド・アラーテ
トラン,チユアン・ミン
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テキサス・バイオテクノロジー・コーポレイシヨン
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    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; CARE OF BIRDS, FISHES, INSECTS; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)

Abstract

(57)【要約】 本発明は、ヒト接着タンパク質またはネズミ接着タンパク質をコード鎖売る単離および精製されたポリヌクレオチドに関する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 発明の技術分野 本発明は分子生物学に関する。より詳細には、本発明は、ヒトまたはネズミの
接着タンパク質をコードするポリヌクレオチド、前記ポリヌクレオチドによって
コードされるポリペプチド、および前記ポリペプチドを発現する組換えベクター
に関する。
【0002】 発明の背景 細胞接着は、多細胞生物の形成および機能的維持には非常に重要である。接着
タンパク質は、細胞間の結合を媒介し、かつ/または細胞−基質の相互作用に関
与する細胞表面分子として分類することができる。それらの細胞内ドメインは、
細胞骨格に対する機能的な連結を提供し、そしてこのことが、効率的な細胞−細
胞の接着を生じさせるためには重要であると考えられている。接着タンパク質は
特徴的な時空的系列で発現する。種々のスーパーファミリーが記載されており、
これには、免疫グロブリン(以降、「Ig」)、カドヘリン、インテグリン、セ
レクチンが含まれる(Alpin AE、Howe A、Alahari SK
、Juliano RL、(1998)Pharmacol.Rev.50:1
97〜263)。免疫グロブリンスーパーファミリーに属する接着タンパク質は
、同種的様式および/または異種的様式の両方で作用し得る。共通した構成ブロ
ックはIgドメインであり、そしてその原型は、5つのIgドメインを有する神
経細胞接着分子(以降、「NCAM」)である。このファミリーは、白血球−内
皮細胞の相互作用、神経堤細胞遊走、神経突起誘導および腫瘍侵入を含む多様な
生物学的機能に関与している。
【0003】 Igスーパーファミリーの炎症メンバーは、血管壁を介して、白血球と相互作
用し、かつ白血球の接着、侵入および遊走に関与していることが十分に明らかに
されている(Gonzalez−Amaro R、Diaz−Gonzalez
F、Sanchez−Madrid F、(1998)Drugs、56:9
77〜88)。セレクチンは、白血球と活性化された内皮細胞との初期の相互作
用(束縛/ローリング)に関与しているが、インテグリンおよびIgスーパーフ
ァミリーのCAMは、これらの細胞の強固な接着およびそれらのその後の管外遊
出を媒介している。
【0004】 強固接合部(以降、「TJ」)および付着性接合部(以降、「AJ」)は、向
合う内皮細胞と上皮細胞との間に存在する特殊化された構造である。それらは、
動的であり、かつ調節される半透過性の細胞内拡散バリアを形成する。明らかに
、これらの構造は、循環から白血球の通過を容易にするためには破壊されるか、
または再構成されなければならない。血小板内皮細胞接着分子のPECAM−1
(Igスーパーファミリーの接着タンパク質のメンバー)は内皮細胞間の外側膜
に局在化している(Zocchi MR、Ferrero E、Leone B
E、Rovere P、Bianchi E、Toninelli E、Par
di R、(1996)Eur.J.Immunol.26:759〜67)。
しかし、これはTJ構造およびAJ構造と結合していない(Ayalon O、
Sabanai H、Lampugnani MG、Dejana E、Gei
ger B、(1994)J.Cell.Bio.126(1):247〜58
)。白血球の管外組織へのパラ細胞的(paracellular)遊走におけ
るPECAM−1の極めて重要な役割が明らかにされている(Muller W
A、Weigl SA、Deng X、Phillips DM、(1993)
J.Exp.Med.178:449〜60)。Igスーパーファミリーの別の
細胞−細胞接着分子であるネクチン(以降、「PRP」)は、新規なタンパク質
のアファジンにおけるPDZドメインとの相互作用によってAJに動員される(
Takahashi K、Nakanishi H、Miyahara M、M
andai K、Satoh K、Satoh A、Nishioka H、A
oki J、Nomoto A、Mizoguchi A、Takai Y、(
1999)J.Cell.Biol.145:539〜49)。
【0005】 強固接合部は、血液脳関門(以降、「BBB」)および血状網膜関門(以降、
「BRB」)の維持には極めて重要な構造である。場合により、TJを選択的に
破壊することが望ましい場合がある。例えば、BBBの破壊により、血管を介し
て治療剤を脳に送達する方法が提供され得る(Muldoon LL、Page
l MA、Kroll RA、Roman−Goldstein S、Jone
s RS、Neuwelt EA、(1999)Am.J.Neuroradi
ol.20:217〜22)。一方、BBBの破壊は、多発性硬化症および卒中
の病理の一部である。この場合、TJの再構成を防止することが望ましい。
【0006】 1998年に、新規なマウス接合接着分子(以降、「JAM」)がクローン化
され、強固接合部のさらなる膜貫通タンパク質成分として同定された(Mart
in−Padura I、Lostaglio S、Schneemann M
、Williams L、Romano M、Fruscella P、Pan
zeri C、Stoppacciaro A、Ruco L、Villa A
、Simmons D、Dejana E、(1998)J.Cell.Bio
l.142(1):117〜27)。JAMは、2つのIgドメイン、1個の膜
貫通ドメインおよび短い細胞内ドメインを有する。したがって、これは接着分子
のIgスーパーファミリーに属し、そして証拠により、JAMもまた免疫細胞の
パラ細胞的移動に影響することが示唆される。その細胞外ドメインが異種的な相
互作用に関わっているかどうかは依然として評価されなければならない。
【0007】 マウスJAMのヌクレオチド配列を利用して、Igスーパーファミリーに属す
る新規な仮想的な接着タンパク質が同定された。
【0008】 発明の概要 本発明は、ヒト接着ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする単離お
よび精製されたヒト接着ポリヌクレオチドに関する。さらに、本発明はさらに、
配列番号1のヌクレオチド配列を有する単離および精製されたポリヌクレオチド
に関する。このヒト接着ポリヌクレオチドは、配列番号2に示されるアミノ酸配
列を有する。
【0009】 本発明は、ネズミ接着ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする単離
および精製されたネズミ接着ポリヌクレオチドに関する。さらに、本発明はさら
に、配列番号3のヌクレオチド配列を有する単離および精製されたポリヌクレオ
チドに関する。このネズミ接着ポリヌクレオチドは、配列番号4に示されるアミ
ノ酸配列を有する。
【0010】 本発明はまた組換えベクターに関する。このベクターは、ヒト接着タンパク質
またはネズミ接着タンパク質のいずれかをコードする、配列番号1または配列番
号3のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含有する。ポリヌクレオチ
ドは、ヌクレイチド配列および終結セグメントの発現を制御するプロモーターに
機能的に連結されている。
【0011】 本発明はまた、組換えベクターを含有する宿主細胞に関する。宿主細胞は、細
菌細胞、動物細胞または植物細胞であり得る。本発明はまた、ポリヌクレオチド
のヌル変異を有するトランスジェニック哺乳動物、または本明細書中に記載され
るポリヌクレオチドを過剰に発現する動物に関する。
【0012】 本発明はまた、配列番号1または配列番号3のヌクレオチド配列のヌル変異を
含むトランスジェニック哺乳動物に関する。あるいは、本発明はまた、配列番号
1または配列番号3のヌクレオチド配列を過剰に発現するトランスジェニック哺
乳動物に関する。
【0013】 最後に、本発明は、本明細書中前記に記載されるポリペプチドの一方または両
方に結合する抗体に関する。
【0014】 図面の簡単な説明 図1Aは、www.ncbi.nlm.nih.govにおける国立バイオテ
クノロジー情報センターのホームページからアクセスできるデータベースから得
られる相同的発現配列タグ(以降、「EST」として示される)と、ネズミの接
合接着タンパク質(以降、「マウスJAM」として示される)のオープンリーデ
ィングフレームとのアラインメントを示す。同一性がアミノ酸レベルで示されて
いる。図1Bは、停止コドンを含む、ヒト脳免疫グロブリンスーパーファミリー
受容体(以降、「ヒトBIgR」として示される)の様々な部分をコードする重
複するESTのアラインメントを示す。図1Cは、ヒトBIgRの全長オープン
リーディングフレームを得るために用いられたcDNA末端の迅速増幅(以降、
「RACE」として示される)法を要約する。それぞれの反応から同定された最
長クローンがアラインメントされている。
【0015】 図2は、RACE反応物1および2から得られた配列のGenBankアクセ
ション番号AF062733とのアラインメントを示す。単離されたRACE反
応物2は、AF062733と比較して、34アミノ酸の欠失を有するクローン
である。
【0016】 図3は、ヒトBIgRの全長のcDNA配列およびアミノ酸配列を示す。予測
されるシグナル配列および膜貫通ドメインには下線が付けられている。N結合型
グリコシル化部位が、細胞外ドメインの免疫グロブリン様フォールド内における
ジスルフィド結合を形成するシステイン残基と同様に強調されている。◆:34
アミノ酸の挿入耐の位置および配列(下記) 図4は、ヒトBIgRの細胞内ドメインと、グリコフォリンCおよびショウジ
ョウバエのニューレキシンとのアラインメントを示す。これらの配列の少なくと
も2つに間に保存されている残基が強調されている。
【0017】 図5は、ネズミ接着タンパク質(以降、「マウスBIgR」として示される)
の完全なcDNA配列およびタンパク質配列を示す。保存されているシステイン
残基が強調されている。
【0018】 図6は、マウス(上段)およびヒト(下段)のBIgRアミノ酸配列のアライ
ンメントを示す。
【0019】 図7は、[α−32P]dCTPのBIgRプローブを用いて高ストリンジェ
ンシーのもとでプローブされた多組織ノーザンブロットにおいて同定された転写
物を示す。矢印はヒトBIgR転写物を強調している。
【0020】 図8は、転写物が、[α−32P]dCTPのBIgR(A)またはβ−アク
チン(B)を用いて高ストリンジェンシーのもとでプローブされた正規化ヒト脳
多組織ノーザンブロットにおいて同定されたことを示す。矢印はヒトBIgR転
写物を強調している。
【0021】 図9は、ウサギ抗BIgR抗体を用いてプローブされたCos細胞(コントロ
ール細胞およびBIgR発現細胞)のウエスタンブロットである 図10は、CHO細胞において発現させたときのBIgRの細胞レベル以下で
の局在化を明らかにする。免疫蛍光を、ウサギ抗BIgR抗体を用いて行い、N
oranTM共焦点レーザー走査顕微鏡(Noran Instruments
、Middleton、WI)を使用して画像化した。
【0022】 図11は、様々な白血球細胞株におけるBIgR対抗受容体のスクリーニング
を示す。カルセイン負荷細胞を、96ウエルプレートに捕捉されたBIgR−F
cに加えた。結合をTBS中(n=6)またはTBS+1Mn中(n=6)にお
いて行った。ウエルを洗浄し、保持された細胞を溶解して、蛍光を、励起485
nm/放射530nmにおいて蛍光計で定量した。代表的な実験から得られたデ
ータ。平均±SEM。
【0023】 発明の詳細な説明 I.本発明 本発明は、ヒト接着タンパク質(本明細書中では「ヒトBIgR」と示される
)およびネズミ接着タンパク質(本明細書中では「マウスBIgR」と示される
)をコードする単離および精製されたポリペプチド配列に関する。別の実施形態
において、本発明は、ヒトBIgRおよびマウスBIgRに対するポリペプチド
に関する。さらに別の実施形態において、本発明は、発現したときにヒトBIg
RまたはマウスBIgRを産生させる組換えベクターに関する。本発明はまた、
このような組換えベクターで形質転換された宿主細胞に関する。
【0024】 II.配列表 本出願はまた、10個の配列を含む配列表を含む。配列表はヌクレオチド配列
およびアミノ酸配列を含む。ヌクレオチド配列の場合、塩基対は下記の塩基コー
ドによって表される: 記号: 意味 A A;アデニン C C;シトシン G G;グアニン T T;チミン U U;ウラシル M AまたはC R AまたはG W AまたはT/U S CまたはG 記号: 意味 Y CまたはT/U K GまたはT/U V AまたはCまたはG;T/Uではない H AまたはCまたはT/U;Gではない D AまたはGまたはT/U;Cではない B CまたはGまたはT/U;Aではない N (AまたはCまたはGまたはT/U) 本出願において示されるアミノ酸はL形態であり、アミノ酸の下記の3文字略
号によって表される: 略号 アミノ酸名 Ala L−アラニン Arg L−アルギニン Asn L−アスパラギン Asp L−アスパラギン酸 Asx L−アスパラギン酸またはアスパラギン Cys L−システイン Glu L−グルタミン酸 Gln L−グルタミン Glx L−グルタミンまたはグルタミン酸 Gly L−グリシン His L−ヒスチジン Ile L−イソロイシン Leu L−ロイシン Lys L−リシン Met L−メチオニン Phe L−フェニルアラニン Pro L−プロリン Ser L−セリン Thr L−トレオニン Trp L−トリプトファン Tyr L−チロシン Val L−バリン Xaa L−不明またはその他 III.ポリヌクレオチド 1つの態様において、本発明は、ヒトBIgRをコードする単離および精製さ
れたポリヌクレオチドを提供する。別の態様において、本発明は、マウスBIg
Rをコードする単離および精製されたポリヌクレオチドを提供する。これらのポ
リヌクレオチドは、遺伝子配列、cDNAまたは合成DNAなどのDNA分子で
あり得る。DNA分子は二本鎖または一本鎖であり得るが、一本鎖である場合に
はコード鎖であってもよい。さらに、ポリヌクレオチドは、mRNAなどのRN
A分子であり得る。
【0025】 本発明はまた、コード配列に対して相補的である非コード鎖(アンチセンス)
、ならびにそのようなコード配列に対して同一であるか、または相補的であるR
NA配列を提供する。当業者は、対応するRNA配列がウラシル(U)をチミジ
ンの代わりに含有することを容易に理解する。
【0026】 1つの実施形態において、本発明のポリヌクレオチドは、ヒトBIgRのコー
ド配列を含む単離および精製されたcDNA分子である。例示的なcDNA分子
が配列番号1として示されている。別の実施形態において、本発明のポリヌクレ
オチドは、マウスBIgRのコード配列を含む単離および精製されたcDNA分
子である。例示的なcDNA分子が配列番号3として示されている。
【0027】 当分野でよく知られるように、遺伝コードの縮重のために、配列番号1または
配列番号3によってコードされるものと同じポリペプチドをコードすることがで
きる数多くの他のDNAおよびRNA分子、またはこれらの一部分または断片が
存在する。本発明では、配列番号1または配列番号3に示される配列と少なくと
も70%の相同性、好ましくは少なくとも80%の相同性、最も好ましくは90
%の相同性を有する相同的ポリヌクレオチドも企図する。本明細書で使用する「
相同性」という語は、相補性の程度を表す。部分的な相同性または完全な相同性
(すなわち同一性)が存在してよい。部分的に相補的な配列は、同一の配列の標
的核酸とのハイブリダイズを少なくとも部分的に阻害する配列である。機能的な
用語「ほぼ相同性である」を使用することが好ましい。低ストリンジェンシーの
条件下でハイブリダイゼーションアッセイ(サザンまたはノーザンブロット、溶
液ハイブリダイゼーションなど)を使用して、完全に相補的な配列の標的配列へ
のハイブリダイゼーションの阻害を調べることができる。ほぼ相同性である配列
またはプローブは競合し、完全に相同的な配列の結合(すなわちそのハイブリダ
イゼーション)を阻害するか、または低ストリンジェンシーの条件下で標的配列
へプローブする。低ストリンジェンシーの条件が非特異的な結合を可能にするよ
うな条件であるということはできない。低ストリンジェンシーの条件では、2つ
の配列のお互いへの結合が特異的(すなわち選択的)相互作用であることが必要
である。部分的な程度の相補性さえも欠けている(たとえば同一性が約30%未
満)第2の標的配列を使用することによって、非特異的な結合が存在しないこと
を試験することができる。非特異的な結合が存在しない場合、プローブは第2の
非相補的な標的配列とはハイブリダイズしないはずである。さらに本発明では、
天然に存在する対立遺伝子の変異体および前述のcDNA配列の突然変異体も企
図する。ただし、これらの変異体および突然変異体は、発現体上に本発明のヒト
またはネズミの接着性タンパク質をコードしている。本発明は、ヒトおよびネズ
ミのBIgRポリヌクレオチドのスプライス変異体も含む。
【0028】 当分野でよく知られる技法を使用して、マーカー目的の選択において、本発明
のポリヌクレオチドを使用することができる。マーカー目的の選択は、遺伝子の
完全な配列を必要としない。その代わりに、部分的な配列をハイブリダイゼーシ
ョンプローブまたはオリゴヌクレオチドプライマー用のベースとして使用して、
PCRまたはヒトまたはネズミの接着性タンパク質に特異的なヌクレオチドを他
のホ乳類中で同定するための他の方法によって増幅させることができる。
【0029】 IV.ポリペプチド 本発明は、ヒトBIgRおよびネズミのBIgRをコードしているポリペプチ
ドも提供する。ヒトBIgRタンパク質のアミノ酸配列を配列番号2中に提供し
、これは398個のアミノ酸残基を含む。マウスBIgR接着性タンパク質のア
ミノ酸配列を配列番号4中に提供し、これは396個のアミノ酸残基を含む。
【0030】 本発明は、本明細書で述べるアミノ酸残基とほぼ複製的な配列も企図し、その
結果これらの配列は開示する配列のような生物学的活性を示す。このような企図
される配列には、アミノ酸残基の配列またはタイプ(たとえば保存的に置換され
ている配列)の最小限の変化によって特徴付けられる配列があり、本質的ではな
い変化によってポリペプチドの基本的性質および生物学的活性が変わることはな
い。
【0031】 ペプチドの生物学的機能をほとんど変化させずに、ポリペプチドの構造を改変
および変化させることができることが、当分野でよく知られている。たとえば、
所与のポリペプチド中では、機能をほとんど損失させることなくある種のアミノ
酸を他のアミノ酸で置換することができる。このように変化させる際には、比較
的類似な側鎖置換体、たとえばそのサイズ、電荷、疎水性、親水性などをベース
に、アミノ酸残基のような置換体を作製することができる。
【0032】 米国特許第4,554,101号中に詳細に記載され、参照によって本明細書
に組み込まれるように、以下の疎水値がアミノ酸に割り当てられている。Arg
(+3.0);Asp(+3.0);Glu(+3.0);Ser(+0.3)
;Asn(+0.2);Gln(+0.2);Gly(0);Pro(−0.5
);Thr(−0.4);Ala(−0.5);His(−0.5);Cys(
−1.0);Met(−1.3);Val(−1.5);Leu(−1.8);
Ile(−1.8);Tyr(−2.3);Phe(−2.5);およびTrp
(−3.4)。アミノ酸残基は、類似の疎水値(プラスマイナス2.0の値内で
)を有し生物学的に均等なポリペプチドを依然として有する他のアミノ酸残基で
置換することができることが理解される。
【0033】 同様の方法で、親水性インデックスの類似性をベースに、置換体を作製するこ
とができる。その疎水性および電荷の性質をベースに、それぞれのアミノ酸残基
に親水性インデックスが割り当てられている。これらの親水性インデックス値は
以下の通りである。Ile(+4.5);Val(+4.2);Leu(+3.
8);Phe(+2.8);Cys(+2.5);Met(+1.9);Ala
(+1.8);Gly(−0.4);Thr(−0.7);Ser(−0.8)
;Trp(−0.9);Tyr(−1.3);Pro(−1.6);His(−
3.2);Glu(−3.5);Gln(−3.5);Asp(−3.5);L
ys(−3.9);およびArg(−4.5)。親水性インデックスをベースに
置換体を作製する際には、プラスまたはマイナス2.0以内の値が好ましい。
【0034】 V.組換えベクター 本発明は、本発明のポリヌクレオチド、本発明の組換えベクターを用いて遺伝
子工学的に処理した宿主細胞を含む組換えベクター、および組換え技法によるポ
リペプチドの生成にも関する。
【0035】 本発明のポリヌクレオチドは、当分野でよく知られる組換え技法を使用してポ
リペプチドを生成させるために使用することができる。たとえばポリヌクレオチ
ドは、ポリペプチドを発現するためのさまざまな発現ベクターの任意の1つに含
まれていてよい。このようなベクターには染色体性、非染色体性および合成DN
A配列、たとえばSV40の誘導体、細菌性プラスミド、ファージDNA、バキ
ュロウイルス、酵母菌のプラスミド、プラスミドとファージDNAの組み合わせ
に由来するベクター、バッシニア、アデノウイルス、フォウルポックスウイルス
、偽狂犬病などのウイルス性DNAおよびがある。遺伝的要素を得るための最も
一般的なベクターの1つは、よく知られているクローニングベクターpBR32
2(American Type Culture Cpllection、M
anassas、Virginiaから受託番号37017として入手可能であ
る)からのものである。pBR322の「バックボーン」部分を適切なプロモー
ターと組み合わせて、その構造配列を発現させることができる。しかしながら、
宿主中で複製可能で生命力がある限りは他のベクターを使用することができる。
【0036】 本発明のポリヌクレオチド配列を、前述の組換えベクターの1つに正または逆
方向に挿入することができる。当分野でよく知られるさまざまな手順を使用して
、これを達成することができる。一般には、適切な制限エンドヌクレアーゼの部
位にポリヌクレオチドを挿入する。
【0037】 適切な発現ベクターに挿入すると、本発明のポリヌクレオチドはプロモーター
などの適切な発現調節配列に動作可能に結合して、mRNAを直接合成する。本
明細書で使用するように、「動作可能に結合する」という語は、プロモーターと
第2の配列の間の機能的結合に関することを含み、このプロモーター配列が第2
の配列に対応するDNA配列の転写を開始させ仲介する。一般に、動作可能に結
合するとは、連結しているヌクレオチド配列が隣接しており、同じリーヂングフ
レーム中でそこが2つのタンパク質コード領域を結びつけるのに必要であること
を意味する。ヘテロ構造の配列は、所望の性質(発現される組換え生成物が安定
であるか精製が簡単であることなど)を有する、N末端またはC末端が同定され
ているペプチドを含む融合タンパク質をコードすることができる。
【0038】 クロラムフェニコールトランスファーゼ(CAT)ベクターまたは選択可能な
マーカーを有する他のベクターを使用して、任意の望ましい遺伝子からプロモー
ター領域を選択することができる。このようなプロモーターは、3−ホスホグリ
セレートキナーゼ(PGK)、α因子、酸性ホスファターゼ、または熱ショック
タンパク質などの糖酵素をコードしているオペロンに由来する可能性がある。使
用することができる細菌のプロモーターの例には、lacI、lacZ、T3、
T7、gtp、lambda P、Pがあるが、これらだけには限られない
。原核プロモーターの例には、レトロウイルスおよびマウスのメタロチオネイン
−Iからの、CMVイミディエートキナーゼ、HSVリミジンキナーゼ、アーリ
ーおよびレイトSV40、LTRがある。使用することができる他のプロモータ
ーの例には、バキュロウイルスのポリヘドリンプロモーターがある。
【0039】 典型的には組換え発現ベクターは、複製の起点を含みベクターのメンテナンス
を保証する。これらは1つまたは複数の選択可能なマーカー遺伝子を含み、形質
転換した細胞の選択用に表現型形質を提供することが好ましい。使用することが
できる選択可能なマーカー遺伝子の例には、ジヒドロフォラレリダクターゼ、原
核細胞培養物に耐性があるネオマイシンまたはブラスティジン、大腸菌およびS
.cerevisiaeのTRPI遺伝子に耐性があるテトラサイクリンまたは
アンピシリンがあるが、これらだけには限られない。発現ベクターは、翻訳開始
用のリボソーム結合部位および転写終結断片を含んでもよい。ベクターは、発現
を増幅させるための適切な配列を含んでもよい。
【0040】 真核および原核宿主と共に使用するのに適切なクローニングおよび発現ベクタ
ーは、Sambrook他のMolecukar Cloning:A Lab
oratory Manual、Second Edition、Cold S
pring Harbor、N.Y.、(1989)に記載されており、これは
参照によって本明細書に取り込まれている。数多くの適切なベクターおよびプロ
モーターが市販されており、本発明において使用することができる。使用するこ
とができるベクターの例には、細菌性:pQE70、pQE60、pQE9(Q
iagen)、pBS、pD10、ファージスクリプト、psiX174、pB
luescript SK、pSKS、pNH8A、pkrH8A、pNH46
A(Stratagene)、ptrc99a、PKK223−3、PKK23
3−3、pDR540、pRIT5(Pharmacia)、pGEM(Pro
mega)、原核:pWLNEO、pSV2CAT、p)G44、pXT1、p
SG(Stratagene)、pSVK3、pBPV、pMSG、pSVL(
Pharmacia)、pcDNA3、pcDNA6(InVitrogen)
があるが、これらだけには限られない。
【0041】 他の実施形態では、本発明は、前に記載した組換えベクターを含む宿主細胞に
関する。前に記載したポリヌクレオチドを含むベクター(クローニングまたは発
現ベクターなど)を使用して、適切な宿主を形質転換、形質導入またはトランス
フェクトすることができ、宿主にタンパク質を発現させることができる。本発明
において使用することができる適切な宿主には大腸菌、Streptomyce
s、Bacillus subrilis、Salmonella ryphi
murium、および一般のPseudomonas、Streptomyce
s、およびStaphylococcus内のさまざまな種などの真核細胞があ
るが、これらだけには限られない。酵母菌などの低級の原核細胞、およびDro
sophila S2およびSpodoptera St9およびSt21など
の昆虫細胞。リン酸カルシウム、DEAE−Dextranまたはリポソーム仲
介型トランスフェクション、またはエレクトロポレーションによって、組換え構
築体の宿主細胞への導入を行うことができる(参照によって本明細書に取り込ま
れているDavis、L.、Dibner、M.、Barrey、L.Basi
c Methods in Molecular Biology(1986)
を参照のこと)。
【0042】 ホ乳類細胞培養系などのさまざまな高級な真核細胞を使用して、組換えタンパ
ク質を発現させることもできる。ホ乳類発現系の例には、Gluzman Ce
ll、23:175(1981)によって記載されるサル腎臓線維芽細胞のCO
S−7細胞株、および競合的なベクターを発現することができる他の細胞株、た
とえばC127、3T3、CHO、HeLaおよびBHK細胞株がある。ホ乳類
の発現ベクターは、複製の起点、適切なプロモーターおよびエンハンサー、およ
びあらゆる必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナー
および受容部位、転写終結配列、および5’側面の転写されていない配列を含む
はずである。SV40スプライス、ポリアデニル化部位に由来するDNA配列を
使用して、必要とされる転写されていない遺伝的要素を提供することができる。
【0043】 プロモーターを活性化させるため、形質転換体を選択するため、あるいは本発
明のヒトの接合接着タンパク質をコードする遺伝子を増幅させるために、適切に
改質した従来型の栄養培地中で、工学処理した宿主細胞を培養することができる
。温度、pHなどの培養条件は、発現用に選択した宿主細胞に関して以前に使用
した条件と同様であり、当分野でよく知られている技法を使用して、実験によっ
てこの条件を決定することができる。
【0044】 エンハンサー配列をベクター中に挿入することによって、高級な真核生物によ
る本発明のポリペプチドをコードしているポリヌクレオチドの転写を増大させる
ことができる。エンハンサーはDNAのシス活性化型要素であり、約10〜約3
00の塩基対の長さであり、プロモーターに働きかけてその転写を増大させる。
本発明において使用することができる適切なエンハンサーの例には、複製起点の
塩基対100〜270の後側のSV40エンハンサー、サイトメガロウイルスア
ーリープロモーターのエンハンサー、複製起点の後側のポリオマエンハンサー、
およびアデノウイルスのエンハンサーがある。
【0045】 適切な宿主細胞の形質転換、および宿主菌株の適切な細胞群への生育に続き、
適切な手段(温度シフトまたは化学的誘導など)によって選択したプロモーター
を誘導し、さらなる時間それらの細胞を培養する。典型的には遠心分離によって
細胞を採取し、物理的または化学的手段によって破壊し、その結果生じる未精製
抽出物をさらなる精製のために保持する。凍結解凍サイクリング、超音波処理、
機械的破壊、または細胞溶解剤の使用を含めた任意の好都合な方法によって、タ
ンパク質の発現において使用される微生物の細胞を破壊することができる。これ
らの方法は、当業者にはよく知られている。
【0046】 組換え細胞の培養物、細胞集合体から、またはそうでなければ当分野で知られ
ているタンパク質化学の方法に従って、本発明のポリペプチドを回収し精製する
ことができる。たとえば、硫酸アンモニウムまたはエタノール沈殿、酸性抽出物
、およびさまざまな形のクロマトグラフィ、たとえばアニオン/カチオン交換、
ホスホセルロース、疎水性相互作用、免疫親和性を含めた親和性クロマトグラフ
ィ、レクチンおよびヒドロキシルアパライトクロマトグラフィ。他の方法には透
析、限外濾過、ゲル濾過、SDS−PAGEおよび等電フォーカシングがあって
よい。成熟タンパク質の形状を完成させる際に、必要に応じてタンパク質を再び
折りたたむステップを使用することができる。最後に、最終的な精製ステップの
ために、正常または逆の系などで高性能液体クロマトグラフィ(以後は「HPL
C」)を使用することができる。
【0047】 BIgRを使用して、相同的組換えによる内生遺伝子を不活性化させることが
でき、これによってBIgR欠失細胞、組織または動物が作製される。次いでこ
のような細胞、組織または動物を使用して、正常ではBIgRに依存する特異的
なin vivoでのプロセスを定義することができる。
【0048】 cDNA配列を使用して、peninent位置で突然変異しているwtBI
gRまたはBIgRのいずれかを発現している安定性のある細胞株を作製するこ
とができ、分子のどの部分が機能を担っているのかを判定することができる。5
’または3’端にタグ、たとえばV5またはHAエピトープを有するBIgRを
用いて、安定性があるかまたは一過性の細胞株を作製して、BIgRの機能/改
質/細胞相互作用を監視することができる。
【0049】 BIgRの細胞外配列を使用して、ヒトまたはマウスIgGのFc領域に融合
する組換えタンパク質を作製することができる。このタンパク質を使用して以下
のことができる。
【0050】 a)BIgRリガンドを検査すること。BIgRが接着性タンパク質である場
合、白血球/好中球だけには限らないが、これらに関する相互作用が分析される
。簡潔に言えば、BIgR−Fc融合体をELISAプレート上で捕らえること
ができる。炎症性サイトカインで刺激を与えた培養した細胞、コントロールはカ
ルシエン色素で標識し、固定されたBIgR−Fcと共にインキュベートし、洗
浄し蛍光性を監視することができる。代替的に、BIgRを固形担体に結合させ
て、次いでこれを使用して、さまざまな細胞/組織に由来する固形タンパク質を
精製するためのカラムを作製することができる。次いでペプチドの配列決定を使
用して、リガンドを同定することができる。他の手法は、BIgR−Fcを細胞
溶解物に結合させてDSSと交差結合させるものであろう。
【0051】 b)BIgRリガンドの同定の際に、BIgR−Fcを使用して、小さな分子
に関するBIgRのヘテロ型またはホモ型相互作用の阻害物質を検査することが
できる。
【0052】 c)BIgR機能、ヘテロ型またはホモ型相互作用を中和するためのツール。
【0053】 d)BIgRがヘテロ型/ホモ型相互作用を示す場合、融合体を使用してBI
gRまたはそのリガンドのいずれかに結合させて、細胞の応答を開始させること
ができる。
【0054】 細胞外領域に由来する組換えタンパク質は同型の相互作用を分析するために使
用することができる。そのようなタンパク質はFc Tagを保有しないであろ
う。単一の免疫グロブリン類似領域が、どれが同型の相互作用に対応しているか
を判定するようにされ得る。別々の領域のお互いの、または3つすべてのIg類
似領域を保有する組換え型との相互作用は様々な手段で評価することができる。
その例はDSSとの架橋、分析学的超遠心分離あるいはサイズ分けカラムである
【0055】 BIgR配列は、アンチセンスのオリゴヌクレオチドを細胞系でのBIgR機
能の阻害に関して識別するために使用することができる。さらに、ポリメラーゼ
連鎖反応によってこの族の追加的な構成要素を識別するのを補助するために変性
オリゴヌクレオチドを設計することができる。別の選択肢では、cDNAライブ
ラリーの低緊縮ハイブリッド形成が緊密に関連する配列を識別するためにBIg
Rで実施される。
【0056】 BIgRの細胞内領域はイーストのツーハイブリッド系で新たな相互作用相手
を「釣り上げる」のに使用することができる。
【0057】 加えて、組換え型の精製したBIgRおよび組換えBIgRを発現する細胞系
はBIgRの低分子阻害物質を選別するのに使用することができる。
【0058】 胎盤での低い発現は別として、BIgRは独占的に脳に局在する。BIgRは
グリア細胞、神経細胞または内皮細胞に局在する可能性がある。もしも脳の内皮
細胞で発現されるならば、それは血液脳関門に役割りを果たす可能性がある。B
IgRが接着タンパク質であるならば、限定はされないが、神経可塑性、成長円
錐誘導および神経突起の外部成長に役割りを果たしているかもしれない。それは
もしかすると脳卒中および多発性硬化症に含まれるかもしれない。
【0059】 VI.抗体 本発明のポリペプチド、その断片、または前記ポリペプチドを発現する細胞は
抗体を産生するための免疫原として使用することができる。これらの抗体は、例
えば、ポリクローナルまたはモノクローナル抗体であってもよい。本発明はまた
、キメラ、一本鎖、および人体適合性の抗体、ならびにFab断片、またはFa
b発現ライブラリーの産生物質をも含む。
【0060】 本発明のポリペプチドに対して生成する抗体は、好ましくはヒト以外の動物に
このポリペプチドを投与することによって得られる。本発明のポリペプチドのほ
んの断片をコードする配列でさえ、自然界の完全なポリペプチドに結合する抗体
を生成させるのに使用することができる。その後、そのような抗体はそのポリペ
プチドを発現する組織からポリペプチドを単離するために使用することができる
【0061】 モノクローナル抗体の調製については、連続的な細胞系培養により生成される
抗体を供給するすべての技術が使用可能である。その例には、(ここで参考資料
として取り入れたKohler and Milstein、1975、Nat
ure、256:495−497により述べられた)ハイブリドーマ技術、トリ
オーマ技術、(ここで参考資料として取り入れたKozborら、1983,I
mmunology Today 4:72により述べられた)ヒトB細胞ハイ
ブリドーマ技術、および(ここで参考資料として取り入れたColeら、198
5、Monoclonal Antibodies and Cancer T
herapy、Alan R.Liss,Inc.、pp77−96により述べ
られた)ヒトモノクローナル抗体を生成するためのEBVハイブリドーマ技術が
含まれる。
【0062】 ポリクローナル抗体の調製については、当該技術で知られているそのような抗
体を供給するすべての技術が使用可能である。
【0063】 ここでは参考資料として取り入れた米国特許第4,946,778号に述べら
れたような、一本鎖の抗体を生成するための技術は本発明の免疫原ポリペプチド
に対する一本鎖の抗体を生成するのに適している。
【0064】 さらに別の実施形態では、本発明は内因性のヒトまたはマウスの接着タンパク
質を発現するヒトまたはマウス細胞を識別する方法に関する。この方法は、ここ
で述べたヒトまたはマウスの接着タンパク質と同じ機能を有するタンパク質を発
現する細胞を識別し、その後、当該技術で知られている技術を使用して前記タン
パク質を産生するのに必要不可欠な細胞を特性付ける方法を含む。ここに述べた
技術に従って準備される抗体はBIgRを選別するため、および内因性のBIg
Rを発現する被検体(ヒトまたは動物)の細胞(疾病または正常)を識別するた
めに使用することができる。
【0065】 本発明の抗体は以下のために使用することができる。
【0066】 a)被検体(ヒトまたは動物)の細胞(疾病または正常)内で内因性BIgR
の細胞内局在/発現を試験すること。
【0067】 b)細胞から内因性BIgRを、または感染細胞から組換えBIgRを免疫沈
降させてグリコシル化、リン酸化などによって化学修飾されるかどうかを判定す
ること。この方式でBIgRを付随するタンパク質の共同沈降もまた識別可能。
【0068】 c)異型ないし同型の相互作用のいずれかでBIgR機能を中和するツールと
して。BIgR機能を乱すためにin vivoで抗BIgR抗体を様々な動物
モデルに投与してもよい。別の選択肢では、概念立証の実験をin vitro
で実施することもできる。
【0069】 d)BIgR分子の機能性エピトープをマップ化する。
【0070】 限定されるものではないが、例を挙げるために本発明の実施例をここで示す。
【0071】 実施例I:ヒトBIgR cDNAのクローニングおよびBIgR遺伝子のマ
ップ化 SEQ ID NO:1およびSEQ ID NO:3に示したポリヌクレオ
チド配列は電気的および一般的な技術の組み合わせを使用してクローニングした
。使用した電気的技術はNational Center for Biote
chnology Infomation(NCBI)のホームページwww.
ncbi.nlm.nih.govを介してアクセスしたExpressed
Sequence Tag(EST)データベースを含むものであった。ここで
は参考資料として取り入れたMartin−Padula I、Lostagl
io S、Schneemann M、Williams L、Romano
M、Fruscella P、Panzeri C、Stoppacciaro
A、Ruco L、Villa A、Simmons D、Dejana E
、J.Cell.Biol.(1998)142(I):117−27により発
表された正常マウスのJunctional Adhesion Protei
n(JAM)のcDNA配列を電気的なクローニングのための鋳型として使用し
た。マウスのJAM cDNA配列はGenBank(アクセス番号U8991
5)でも入手可能である。進歩型のBasic Local Alignmen
t Search Tool(BLAST2.0)を使用してマウスJAMとの
相同性を示すESTを識別した。
【0072】 電気的クローニング タンパク質の質問の配列を全リーディングフレームで動的に翻訳されたヌクレ
オチド配列と比較する(blast)プログラムを使用して、マウスJAMペプ
チドの完全な配列(Acc.No.U89915)をヒトEST配列との相同性
について調べた。完全なマウスJAMタンパク質配列は長さで300アミノ酸で
ある。開始コドンは塩基対(以降は“bp”とする)71で始まりストップコド
ンは971である(図1A参照)。
【0073】 EST R88252内でコードされるいくらかの116アミノ酸はマウスJ
AMの129アミノ酸のストレッチと38%の類似性および28%の同一性を示
した(図1A参照)。その後のSWISS−PROTタンパク質配列データベー
スの調査から、このESTが他の知られている接着タンパク質との類似性を示す
ことが明らかになった。このこと、および免疫グロブリン類似の折れ曲がりの形
成に重要なシステインの保存に基づいて、さらにEST R88252をさらに
分析した。仮想の配列を組み立てる間を通じて、仮想のタンパク質の開始および
終結の推定されるコドンを識別するためにすべてのリーディングフレームについ
て翻訳を連続的にモニタした。使用可能な場所で、配列エラーを確認するために
オーバーラップするESTを調べた。
【0074】 blastプログラムを使用して、R88252の5’の150bpをnrヒ
トdbEST(a non−redundant sub−category
of the EST database containing only
human ESTs)を介してブラスト処理した。EST T08949は1
09bpにわたってオーバーラップして100%の同一性を示し、大部分の付加
的5’配列を与えた(図1B)。nrヒトESTデータベースを介したT089
49のblast分析は5’末端の付加的塩基を単離することでは不成功であっ
た。したがって、推定される開始コドンはこの方法でこのタンパク質については
識別できなかった。
【0075】 R88252の最後の120bpはblastプログラムを使用してnrヒト
ESTを介してブラスト処理した。HI4720は229bpにわたって97%
の同一性を示し、3’末端の147の付加的塩基を与えた(図1B参照)。
【0076】 HI4720の3’の106bpはblastプログラムを使用してnrヒト
ESTを介してブラスト処理した。EST R15338は170bpにわたっ
て95%の同一性を示し、367bpで新たな配列を伸長した(図1B参照)。
この配列内に推定されるストップコドンが識別された。したがって、データベー
スのさらなる調査を終結した。
【0077】 一般的なクローニング このcDNAについてさらに5’配列を得るために、RACE技術を実施した
。ヒト胎児脳のmRNAを42℃にてAMVリバーストランスクリプターゼ(C
lontech Palo Alto,CA)で逆転写した。Marathon
cDNA増幅キット(Clontech)および2つのアンチセンスプライマ
ー(下記参照)のうちのいずれかを使用して増幅反応を実施した。以下のプログ
ラムを使用した、すなわち、94℃、30秒間で1サイクル、94℃、5秒間お
よび72℃、4分間を5サイクル、94℃、5秒間および70℃、4分間を5サ
イクル、94℃、5秒間および68℃、4分間を25サイクルである。反応産物
はpCR−Blunt II−TOPOベクター(Invitrogen)に連
結し、ABI配列分析器(Seqwright,TX)を使用して配列分析した
【0078】 最初のRACE反応に使用したプライマーは部位176bpでEST T08
949(5’−CCCAGAAGACTGAGAGTTTAGGGTGGCTG
−3’)(SEQ ID NO:5)に向けられた。この反応の反応産物はBI
gRの付加的な272bpを単離することを可能にした(図1C参照)。2番目
のRACE反応に使用したプライマーは部位86bpでEST T08949(
5’−GCGCAGTGACGAGGGACTTGGCAGTTC−3’)(S
EQ ID NO:6)に向けられた。最も長い生成物はT08949bpの5
’末端から232bpの延長を与えた(図1C参照)。
【0079】 最も興味深いことに、各々のRACE反応から配列を整列させるとT0894
9の5’末端の上流のいくらかの204ヌクレオチドで配列は発散した(図3参
照)。いずれの生成物も開始のATGと上流ストップコドンとの推定の一致をも
たなかった。
【0080】 この結果と一致して、さらなるデータベース調査は、cDNA(アクセス番号
AF062733)を含む最新のGenBankの公開(1999年3月4日)
の配列を整列させるとRACE反応の生成物が全オープンリーディングフレーム
クローンから41アミノ酸短くなることが示された(図2参照)。さらに、RA
CE反応2から得られた配列の比較から34アミノ酸を消失したAF06273
3のスプライス変異体が単離された。
【0081】 フルレングスBIgRの形成 フルレングスのヒトBIgRを形成するために、アクセス番号AF06273
3の5’非翻訳領域に向けたセンスオリゴヌクレオチドを、ATGの上流のいく
つかの45bpで設計した。このオリゴヌクレオチド5’−TTCAGGCTC
GCCAGCGCCCAG−3’(SEQ ID NO:7)をTAGストップ
コドンを組み入れたアンチセンスプライマー5’−CTAGATGAAATAT
TCCTTCTTGTCGTC−3’(SEQ ID NO:8)と結合させた
。ヒト胎児脳のmRNAを逆転写し、以下のプログラムを使用して増幅した、す
なわち、95℃で7分間を1サイクル、95℃で20秒、60℃で20秒、72
℃で20秒を35サイクル、72℃で5分間を1サイクルである。生成物はE.
coliベクターに連結し、ABI配列分析器(Seqwright,TX)を
使用して配列分析した。
【0082】 配列の特徴 ポリメラーゼ連鎖反応により、BIgRの2つの異なる完全長アイソフォーム
を同定することが可能になった。RACE反応に従い、クローンを、シグナル配
列の直後にある追加の34個のアミノ酸およびこれらの残基がスプライシングさ
れているクローンと共に単離した。図3には、398個のアミノ酸を有するより
短いスプライス変異体の完全コード領域が表示されている。その下に、34アミ
ノ酸(配列番号:11)インサートに対応する配列が示されている。配列決定に
よって、これらの残基がGenBank受託番号AF062733の配列と同一
であることが証明された。BIgRは、推定シグナル配列(下線箇所)、3つの
免疫グロブリン様フォールド、単一の膜貫通ドメイン(下線箇所)、および短い
細胞内ドメインを特徴とする(図3参照)。したがって、タンパク質は免疫グロ
ブリン科に属する。各免疫グロブリン様ドメイン内にジスルフィド結合を形成す
ることが予測されるシステイン残基は強調表示されている。第1および第2のシ
ステインは第1の免疫グロブリン様フォールドに、第3および第4のシステイン
は第2の免疫グロブリン様フォールドに、第5および第6のシステインは第3の
免疫グロブリン様フォールドに、それぞれ位置付けられている。アミノ酸25お
よび353にある2つのコンセンサスN結合型糖鎖形成部位(NxS/T)が強
調表示されている(最初のものが、予測されるシグナル配列内に含まれるが)。
【0083】 BIgRポリペプチドとGenBank受託番号AF062733の相違 配列番号:2で示されるBIgRポリペプチドは、2箇所がAF062733
とは異なっている。第1に、本発明のポリペプチドは、欠失する34個のアミノ
酸を有するので、より小さいアイソフォームである(図2、図3参照)。第2に
、34個のアミノ酸が保たれているかまたはスプライシングされるかに関係なく
、配列番号:2の位置104で単一のグルタミン酸欠失が生じる。したがって、
配列番号:2はアミノ酸100からALAD_EGEYを読み取り、AF062
733は、これと同じ領域でALADEEGEYを読み取る。
【0084】 BIgR細胞外および細胞内ドメインに相同的なタンパク質 BIgRは接合性接着分子族のメンバではない。それにもかかわらず、ブラス
ト分析によれば、その様々な免疫グロブリン様ドメインが、他の新規な推定され
る接着分子に対して類似性を示すことが実証される。
【0085】 最も興味深いことは、BIgRの細胞内ドメインが、グリコホリンC、すなわ
ちタンパク質4.1を赤血球に固定するのに必要とされるタンパク質に対し、6
6%の類似性および53%の同一性を示すことである。さらに、ショウジョウバ
エ4.1タンパク質、コラクルを、セプテートジャクションに局在化させるのに
必要とされるこのDrosophilia(ショウジョウバエ属)膜貫通タンパ
ク質Neurexin IVとの相同性も、表示されている(図4参照)。
【0086】 染色体のマッピング BIgR cDNAと同一な染色体配列のセグメントを、公用非冗長データベ
ースから検索した。結果は、いくつかのエキソン境界の端部で分離された塩基の
二重指定のため、若干手を加える必要があった。正しい指定は、5’および3’
スプライス部位コンセンサス配列に基づいていた。公用データベースを使用して
、BIgRに関する10個のエキソンが確認された。エキソン/イントロン構造
は、ヒト染色体lq21.2−22から得られた受託番号AL035403から
決定しされた。全てのイントロン/エキソン境界は、GT/AG規則に従う。B
IgR遺伝子の構造は、スプライシング中のエキソン2の除外によって本明細書
で述べる34アミノ酸欠失が生じることを示すことが、最も適切である。
【0087】
【表1】
【0088】 実施例II:マウスBIgRのクローニング データベースの探索(実施例I参照)では、任意のマウスESTコード化GI
gRが同定されない。実施例Iで述べたプライマーを使用して完全長ヒトBIg
Rをクローニングし、マウス脳mRNA(Clontech)からの産物を増幅
した。3つの独立したPCR反応の配列決定により、細胞外ドメインに34アミ
ノ酸欠失を有するアイソフォーム(図5参照)が分離されたことが示された。図
6は、アミノ酸レベルでマウス配列とヒト配列が95%の同一性および96%の
類似性を表すことを示している。顕著な相違は、シグナル配列のセリンおよびロ
イシンの欠失である。さらに、マウスBIgRは、細胞外ドメインのALAD_
EGEY配列中に追加のグルタミン酸残基を持っていない。
【0089】 実施例III:BIgRの発現パターン BIgRの組織発現に関し、細胞外ドメインから得られた[α−32P]dC
TP標識プローブを用いて、標準化されたヒトマルチプルノーザンブロット(C
lontech)上で試験を行った。その結果は、BIgRが、約2.6および
3.8kbの2つの転写物として発現することを示している(図7参照)。ブロ
ットは高ストリンジェンシーで精査され、したがってこれら2つの種は、代替と
してスプライシングされた産物に相当すると考えられる。図7は、ヒトBIgR
が脳内に豊富に発現し、胎盤には極めて低いレベルで発現することを示している
。これは、この後者の組織において、PCRを使用することにより独立に確認さ
れた(以下の表2参照)。BIgRをさらに局在化させるため、脳の様々な領域
での発現(図8参照)について試験を行った。発現は全体にわたって認められる
が、明らかに、小脳はこの遺伝子を他の領域よりも高いレベルで発現する。小脳
では、約6.5kbの追加の少量の転写物が明らかに識別できる。mRNAは、
髄質および脊髄では辛うじて検出可能である。全ての場合において、3.8kb
の転写物は、2.6kbの種よりも高いレベルで発現する。
【0090】 ESTデータベースにより、BIgRは、乳児および成人の脳で発現する脳特
異転写物であることが確認される(以下の表2参照)。全てのEST配列データ
は脳cDNAライブラリーから得られた。
【0091】
【表2】
【0092】 実施例IV:昆虫細胞の細胞外ドメインの発現およびポリクローナル抗体の生
成 完全長クローンからヒトBIgRの細胞外ドメインが増幅されるように、オリ
ゴヌクレオチドを設計した。EcoRVおよびKpnl制限部位(下線部位)を
それぞれ有するセンス5’−CCGGATATCGCGATGGGGGCCCC
A−3’(配列番号:9)およびアンチセンス5’−GATGGTACCGTG
GTAGGTGCTGGAGGA−3’(配列番号:10)オリゴヌクレオチド
を使用することにより、マウスIgG−2aの定常領域を含むSacl/Kpn
l制限pFastBacl(Life Technologies、GIBCO
BRL、Grand Island、NY)ベクターへのサブクローニングが
可能になった(Fc;Cunningham SA、Tran TM、Arra
te MP、Brock TA、(1999)J.Biol.Chem.274
:18421〜7)。このベクターは、ポリヘドリンプロモーターからのタンパ
ク質の発現を推進する。
【0093】 分泌された組換えBIgR−Fcを、Hi−Trapタンパク質Aカラムを使
用して、感染Sf21細胞の培地(Amersham Pharmacia B
iotech.、Piscataway、NJ)から精製した。Fc融合は、ト
ロンビン消化により除去された。メスのニュージーランド白ウサギ(生後12週
間、Myrtle’s Rabbitry、Thompson Station
、TN)に対し、同体積のフロインドアジュバントで乳化した500μgのBI
gRを用いて免疫化を行った。それから6週間経過した後、この動物に対し、さ
らに、不完全フロインドアジュバンドで乳化した500μgのBIgRを用いて
追加の免疫化を行った。この追加免疫化の14日後に、血清を収集した。
【0094】 抗体の特異性を試験するため、BIgR cDNAをpcDNA6ベクターに
サブクローニングし、FuGENE6(Roche)を使用してCos細胞に1
0μgをトランスフェクトした。トランスフェクションの3日後、プロテアーゼ
インヒビターカクテルセットIII(Calbiochem、La Iowa、
CA)を含めて、細胞をトリス緩衝液(pH7.5)/1%Triton X−
100中に分解した。図9は、BIgRポリクローナル血清が、トランスフェク
トされたCos細胞中に46kDaのタンパク質種を検出することを示す。抗体
は、模擬トランスフェクトされたCos細胞と交差反応しない。 実施例V:哺乳動物細胞中の完全長クローンの発現および細胞下での局在化 pcDNA6ベクターのBIgRの完全長クローンのC末端を、PCR突然変
異誘発によって修飾し、追加の検出目的でV5エピトープタグを組み込んだ。数
10μgのpcDNA6−BIgRを、FuGENE6(Roche)を使用し
てCHO細胞にトランスフェクトした。トランスフェクションの3日後、細胞を
分割し、クローン選択のため10μl/mlブラストサイジン中に維持した。
【0095】 対照またはBIgRを発現したCHO−K1をガラススライド上で成長させて
合流させ、これを、1%パラホルムアルデヒドで定着させ、1:10倍希釈の免
疫前血清または抗BIgRウサギポリクローナル血清で染色した。1:100倍
のGAR−FITIを二次的に使用した。FITC検出のため、アルゴンレーザ
および適切な光学系およびフィルタモジュールを備えたNoran TM共焦点
レーザ顕微鏡(Noran Instruments、Middleton、W
I)を使用して、蛍光が観察された。デジタル画像が、光倍率400倍で得られ
た。図10は、BIgRがCHO細胞の原形質膜に分布されるほか、細胞−細胞
接触の部位に分割されることを示す。この局在化パターンは、同型相互作用によ
りBIgRが動作することを裏付ける証拠を提供する。前に述べたように、細胞
間分布がJAM族の特徴であり、したがって、この特徴が維持される。
【0096】 実施例VI:BigR−Fcの白血球細胞株への接着 参照により本明細書に組み込まれるTodderud,G.、J.Leuko
c.Biol.、52:85(1992)96に本質的に記載されているウェル
プレートで、In vitro接着アッセイを行った。簡単に言うと、50μl
のヤギ抗マウスIgG2aをPBS中5μg/mlで被覆し、これを使用して4
.8pmolのBIgR−FcまたはmIgG2a(対照)を取り込んだ。様々
な白血球細胞株、すなわちTリンパ球、HSB、TK−1;Bリンパ球、RAM
OS;単球細胞、HL60および赤白血病、K562株を、50μg/mlのカ
ルセイン(Molecular Probes Inc.、Eugenic、O
R)で25分間、37℃で標識したが、このとき250、000細胞/ウェルで
あり、これを結合緩衝液、すなわちトリス緩衝生理食塩水に1mM MnCl を添加したものと添加しないものに入れて行った。ウェルを、3回洗浄し分解し
たがこのとき50mMトリス(pH7.7)、5mM EDTA、1% NP4
0を用い、蛍光による読取りを、励起が485/20nm、放射が530/25
nmのCytofluorで行った。特定の結合を、BIgR−Fcによる蛍光
からmgG2aによる蛍光を差し引いたものとして計算した。
【0097】 図11は、BIgR−EcがRAMOS Bリンパ球細胞株を取り込むことが
できるが、試験をしたTリンパ球、単球、または赤白血病細胞を取り込まないこ
とを示す。BIgRとこれらの細胞との相互作用は、緩衝液へのマンガンの添加
に左右された。これらの結果は、BIgRが接着タンパク質であり、インテグリ
ン反レセプターに係り合うことで動作可能であるという仮説を支持している。
【0098】 BIgRは、細胞内および細胞外の両方の領域で、機能既知のタンパク質と同
様の役割を果たす。しかしながらBIgRは、その長さ全体にわたり、染色体1
1q23.2上に局在する機能未知であって広く発現される推定接着タンパク質
であるIgSF4(参照番号NP_055148)に最も近接して配置されてい
る(Gomyo et al.、Genomics 62:139−146、1
999)。このファミリーの別のものは、参照番号AAC32740の染色体1
9q13.2上で確認された仮定の遺伝子であると考えられる。IGSF4とA
AC32740についての同一性パーセントはそれぞれ38.5%および35%
である。そこでこれら3種類のタンパク質は、新たなファミリーを形成するもの
と考えられる。
【0099】 BIgRの機能は、それが細胞間膜に分配する能力とともに、それの脳特異的
発現および機能既知の他のタンパク質とのそれの相同性から推定することができ
る(図4、7、8、10参照)。BIgRは、第1のIg層におけるβ−シート
Fから膜横断領域まで、ポリオウイルスウィルス(PVR)と45%の類似性を
示す。PVRの細胞機能は不明である。しかしながら、ポリオウィルスに対する
結合部位は、Ig−層1NaIに含まれているように思われ、BIgRがその結
合能力を共有する可能性は低い。PVRファミリーの他のものには、別名ネクチ
ン−1、ネクチン−2およびネクチン−3として知られるポリオウィルス関連受
容体(PRR)がある。ネクチン−1およびネクチン−2は、α−ヘルペスウイ
ルス侵入介在物質として働く。ネクチンファミリーは、カルシウム非依存性ホモ
フィリック(homophilic)接着分子である。それは、トランスホモ相
互作用(trans−homointeraction)およびトランスヘテロ
相互作用(trans−heterointeraction)以外に、シス−
ホモ二量化を示す。ネクチン−2の場合、Ig層1は、細胞間でのネクチン−2
の接着には必須であるが、シスホモ二量化には必須ではない。ネクチン−1およ
びネクチン−2は、237および231のアミノ酸重複において、BIgRと4
3%および41%の類似性を示す。この領域は、主としてIg層2および3に相
当する。ネクチン−3は、3種類のIg層全てを含む280アミノ酸重複におい
て43%の類似性を示す。非常に興味深い点として、ネクチンファミリーは、接
着接合部に局在している。そこで本発明者らは、BIgRが、特にCHO細胞に
おけるBIgRの細胞発現によって明らかなようにトランスで、同型相互作用を
行うことができると考えている。さらに本発明者らは、BIgRにおける非常に
関連の深い相同体間または他の接着細胞表面タンパク質間での異型相互作用が起
こったものと考えている(図11参照)。BIgRは、ウィルス侵入のための受
容体としても働く場合がある。脳においては、IgG細胞接着分子は、成長円錘
誘導、神経突起伸長およびシナプス発生において役割を果たし、IgRはこれら
のいずれのプロセスにも関与し得る。
【0100】 実施例1で考察したように、BIgRの短い細胞内領域は、グリコホリンC、
ショウジョウバエニューレキシンIVおよびCaspr2と高い相同性を共有す
る。相同性は、新規な推定接着タンパク質IgSF4間で最も高い(下記の表3
参照)。これらのタンパク質はいずれも、タンパク質4.1ファミリーのものに
おける膜近接結合部位を保存しており、いずれも最も端のC末端にPDZ結合単
位を有する(Csprを除く)。脳におけるcasprとタンパク質4.1の間
の直接相互作用が示されている。類推すると、BIgR細胞内領域とタンパク質
4.1の間の複合体が予測される。最も最近では、タンパク質4.1ファミリー
の新規なものの脳特異的発現が示されている。脳における帯域4.1が、小脳に
おけるシナプス前終末での膜骨格成分として、シナプスの形成および維持に関与
することが示唆されている。BIgRはそのような複合体の成分である可能性が
あることが理解できる。さらに、脳4.1を持たないマウスは、運動、協調、均
衡および学習において欠陥を有する。従ってBIgRは、これらの経路を侵害す
る可能性がある。
【0101】 帯域4.1は、FERM領域を有するタンパク質の成長するスーパーファミリ
ー(NF2/ERM/4.1)に属する。その領域の保存特性は、1個の膜横断
部分を有するタンパク質のC末端細胞質尾部の膜近位領域へ結合する能力である
。それは、細胞表面膜横断タンパク質を細胞骨格分子に連結する機能を有する。
BIgRは、これらのスーパーファミリーのものに連結することができる。
【0102】
【表3】
【0103】 PDZ領域を有するタンパク質は、主として細胞膜に局在しており、細胞−細
胞接触の特殊部位に集合する。PDZ領域は、膜関連グアニル酸キナーゼ(MA
GUK)ファミリー、いくつかのタンパク質ホスファターゼおよびキナーゼ、ニ
ューロン一酸化窒素シンターゼおよびいくつかのジストロフィン関連タンパク質
など、多様な膜関連タンパク質において認められる。BIgRは、これらカテゴ
リーのタンパク質のPDZ領域と相互作用することができる。
【0104】 MAGUKタンパク質ファミリーのものは、複数の領域を用いてシナプスおよ
び細胞接合部でイオンチャンネル、受容体、接着分子および細胞質ゾルシグナル
伝達タンパク質を密集させる。それらは、シナプス前細胞膜およびシナプス後細
胞膜の両方で基本的調整の役割を果たす。従って、シナプス前末端からの信号の
有効な伝達において、BIgRが、直接または間接にこれらの構造および機能に
局在する可能性がある。BIgRにおけるPDZ領域相互作用を裏付けるものと
して、ニューレキシンIVとディスクス・ロスト(DLT)との確認されている
相互作用があり、それの突然変異によってニューレキシンIVの異常局在および
上皮細胞極性の同時喪失を生じる。別の例としては、タンパク質4.1との三元
複合体におけるグリコフォリンCのp55との相互作用がある。
【0105】 ニューレキシンは、シナプス前部位で認められ、ニューロン間の相互作用に介
在するが、Caspr2は有鞘神経の節近位近接(juxtaparanoda
l)領域に局在し、ニューロン−グリア相互作用に介在すると考えられる。従っ
て、BIgRがこれらの部位に動員され、軸索−グリア細胞間接合に関与してい
る可能性が非常に高い。やはり、CHO細胞で発現される際のBIgRの細胞間
局在が、その可能性を裏付けている。軸索−グリア接合が、節領域および節近位
領域の軸索鞘タンパク質領域の確立および維持において機能することが提案され
ている。実際、Caspr2が、この領域におけるKチャンネル、すなわちそ
れに依存する相互作用と、C末端PDZ結合領域単位を連結させることが認めら
れている。BIgRがチャンネルクラスター化において同様の役割を果たすもの
と仮定することができる。
【0106】 最後に、BIgRが内皮細胞で転写されることが認められたとしたら、本発明
者らは、それが隔膜接合部におけるショウジョウバエニューレキシンIVの機能
と同様の、血液−脳関門の維持において何らかの役割を果たす可能性があると考
える。それはまた、卒中および多発性硬化症の際に生じるものなどの脳における
炎症反応に関与している可能性がある。
【0107】 以上の説明および実施例によって、本発明を説明した。前述の記載を考慮すれ
ば、当業者には多くの別形態が明らかになることから、上記説明は説明のための
ものであって、本発明を限定するものではない。添付の特許請求の範囲および精
神の範囲内にあるそのような別形態はいずれも、本発明に包含されるものである
【0108】 添付の特許請求の範囲で定義の本発明の概念および範囲から逸脱しない限りに
おいて、本明細書に記載の本発明の方法の組成、操作および配置に対して変更を
行うことが可能である。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1Aは、www.ncbi.nlm.nih.govにおける国立バイオテ
クノロジー情報センターのホームページからアクセスできるデータベースから得
られる相同的発現配列タグ(以降、「EST」として示される)と、ネズミの接
合接着タンパク質(以降、「マウスJAM」として示される)のオープンリーデ
ィングフレームとのアラインメントを示す図である。同一性がアミノ酸レベルで
示されている。図1Bは、停止コドンを含む、ヒト脳免疫グロブリンスーパーフ
ァミリー受容体(以降、「ヒトBIgR」として示される)の様々な部分をコー
ドする重複するESTのアラインメントを示す図である。図1Cは、ヒトBIg
Rの全長オープンリーディングフレームを得るために用いられたcDNA末端の
迅速増幅(以降、「RACE」として示される)法を要約する。それぞれの反応
から同定された最長クローンがアラインメントされている図である。
【図2】 RACE反応物1および2から得られた配列のGenBankアクセション番
号AF062733とのアラインメントを示す図である。単離されたRACE反
応物2は、AF062733と比較して、34アミノ酸の欠失を有するクローン
である。
【図3】 ヒトBIgRの全長のcDNA配列およびアミノ酸配列を示す図である。予測
されるシグナル配列および膜貫通ドメインには下線が付けられている。N結合型
グリコシル化部位が、細胞外ドメインの免疫グロブリン様フォールド内における
ジスルフィド結合を形成するシステイン残基と同様に強調されている。◆:34
アミノ酸の挿入耐の位置および配列(下記)
【図4】 ヒトBIgRの細胞内ドメインと、グリコフォリンCおよびショウジョウバエ
のニューレキシンとのアラインメントを示す図である。これらの配列の少なくと
も2つに間に保存されている残基が強調されている。
【図5】 ネズミ接着タンパク質(以降、「マウスBIgR」として示される)の完全な
cDNA配列およびタンパク質配列を示す図である。保存されているシステイン
残基が強調されている。
【図6】 マウス(上段)およびヒト(下段)のBIgRアミノ酸配列のアラインメント
を示す図である。
【図7】 [α−32P]dCTPのBIgRプローブを用いて高ストリンジェンシーの
もとでプローブされた多組織ノーザンブロットにおいて同定された転写物を示す
図である。矢印はヒトBIgR転写物を強調している。
【図8】 転写物が、[α−32P]dCTPのBIgR(A)またはβ−アクチン(B
)を用いて高ストリンジェンシーのもとでプローブされた正規化ヒト脳多組織ノ
ーザンブロットにおいて同定されたことを示す図である。矢印はヒトBIgR転
写物を強調している。
【図9】 ウサギ抗BIgR抗体を用いてプローブされたCos細胞(コントロール細胞
およびBIgR発現細胞)のウエスタンブロットである。
【図10】 CHO細胞において発現させたときのBIgRの細胞レベル以下での局在化を
明らかにする図である。免疫蛍光を、ウサギ抗BIgR抗体を用いて行い、No
ranTM共焦点レーザー走査顕微鏡(Noran Instruments、
Middleton、WI)を使用して画像化した。
【図11】 様々な白血球細胞株におけるBIgR対抗受容体のスクリーニングを示す図で
ある。カルセイン負荷細胞を、96ウエルプレートに捕捉されたBIgR−Fc
に加えた。結合をTBS中(n=6)またはTBS+1Mn中(n=6)におい
て行った。ウエルを洗浄し、保持された細胞を溶解して、蛍光を、励起485n
m/放射530nmにおいて蛍光計で定量した。代表的な実験から得られたデー
タ。平均±SEM。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 5/10 C12N 5/00 B C (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ,UG ,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD, RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT, AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,BZ,C A,CH,CN,CR,CU,CZ,DE,DK,DM ,DZ,EE,ES,FI,GB,GD,GE,GH, GM,HR,HU,ID,IL,IN,IS,JP,K E,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS ,LT,LU,LV,MA,MD,MG,MK,MN, MW,MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,RO,R U,SD,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM ,TR,TT,TZ,UA,UG,UZ,VN,YU, ZA,ZW (72)発明者 バロス,マリア・ピア・トリンダツド・ア ラーテ アメリカ合衆国、テキサス・77096、ヒユ ーストン、アパートメント・ナンバー・ 268・ブレイスモント・8849 (72)発明者 トラン,チユアン・ミン アメリカ合衆国、テキサス・77088、ヒユ ーストン、ハーウツド・フオウレスト・ド ライブ・5659 Fターム(参考) 4B024 AA01 AA11 BA44 BA63 CA04 DA02 DA05 DA11 EA02 EA03 EA04 FA02 FA06 GA01 GA11 HA01 HA03 HA11 4B065 AA01X AA57X AA90X AA91Y AA93Y AB01 AB02 BA01 BA08 CA24 CA25 CA44 CA46 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 CA40 DA50 DA76 EA20 EA50 FA72 FA74

Claims (11)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号1を含む単離および精製されたポリヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 配列番号3を含む単離および精製されたポリヌクレオチド。
  3. 【請求項3】 配列番号2のアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む単
    離および精製されたポリペプチド。
  4. 【請求項4】 配列番号4のアミノ酸配列またはそのフラグメントを含む単
    離および精製されたポリペプチド。
  5. 【請求項5】 配列番号1または配列番号3のヌクレオチド配列を有するポ
    リヌクレオチドまたはそのフラグメントを含む組換えベクターであって、前記ポ
    リヌクレオチドが、前記ポリヌクレオチド配列および終止セグメントの発現を制
    御するプロモーターに機能的に連結されている組換えベクター。
  6. 【請求項6】 前記プロモーターが、LTRプロモーター、SV40プロモ
    ーター、大腸菌プロモーター、lacプロモーター、trpプロモーターまたは
    ファージラムダPプロモーターである、請求項5に記載のベクター。
  7. 【請求項7】 請求項5に記載される組換えベクターを含む宿主細胞。
  8. 【請求項8】 宿主細胞が、細菌細胞、動物細胞または植物細胞である、請
    求項7に記載の宿主細胞。
  9. 【請求項9】 配列番号1または配列番号3のヌクレオチド配列のヌル変異
    を含むトランスジェニック哺乳動物。
  10. 【請求項10】 配列番号1または配列番号3のヌクレオチド配列を過剰に
    発現するトランスジェニック哺乳動物。
  11. 【請求項11】 請求項3または4に記載されるポリペプチドに結合する抗
    体。
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