JP2003507070A - 活性化ｔリンパ球において発現される新規なポリヌクレオチドおよびそれによってコードされるタンパク質 - Google Patents

活性化ｔリンパ球において発現される新規なポリヌクレオチドおよびそれによってコードされるタンパク質

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シンシア ディー． グリーン，
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ジョン カルリー，
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キュラジェン コーポレイション
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Abstract

(57)【要約】 活性化Ｔリンパ球において発現される４つの新規なヒト核酸配列が開示される。これらの核酸配列によってコードされるポリペプチド、および本発明のポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体、またはこのポリペプチド、ポリヌクレオチド、もしくは抗体の任意の誘導体、改変体、変異体、もしくはフラグメントもまた提供される。本発明はさらに、これらの新規なヒトＴリンパ球タンパク質に関連した障害を処置および診断するための、治療方法、診断方法、および研究方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】 （発明の分野） 本発明は、一般的に、核酸およびポリペプチドに関し、そしてより詳細には、
活性化Ｔリンパ球において発現されるポリヌクレオチド、およびこのようなポリ
ヌクレオチドによってコードされるポリペプチド、ならびにこれらのポリペプチ
ドおよびポリヌクレオチドを産生するためのベクター、宿主細胞、抗体および組
換え方法に関する。
【０００２】 （発明の背景） 哺乳動物の免疫系は、細胞媒介性免疫応答および抗体媒介性免疫応答によって
特徴付けられ得る。細胞媒介性免疫応答は、Ｔリンパ球として公知のリンパ球の
型によってもたらされる。
【０００３】 Ｔリンパ球が抗原に対して産生的な応答を上昇させるためには、Ｔリンパ球は
、ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ発現細胞によって提示される抗原を認識しな
ければならない。Ｔ細胞は、代表的に、活性化されるまで、抗原に対して応答し
ない。Ｔ細胞が適切に活性化され損なうこと、または逆に、Ｔ細胞の不適切な活
性化は、個体に対して有害な結果を生じさせ得る。
【０００４】 Ｔ細胞活性化に関連するすべての遺伝子が同定されているわけではない。
【０００５】 （発明の要旨） 本発明は部分的に、活性化Ｔリンパ球において発現される新規なポリヌクレオ
チド配列の発見に基づく。これらの活性化Ｔリンパ球に関連した配列（本明細書
中では、「ＡＴＬＡＳ」）は、ＡＴＬＡＳ−１（新規なホスファターゼ調節因子
）、ＡＴＬＡＳ−２（新規なサイトカインレセプター）、ＡＴＬＡＳ−３（チオ
レドキシンおよびタンパク質ジスルフィドイソメラーゼファミリーの新規なメン
バー）、およびＡＴＬＡＳ−４（推定多発性硬化症病因物質に対する相同性を有
する新規なタンパク質）を含む。集合的に、ＡＴＬＡＳ−１、ＡＴＬＡＳ−２、
ＡＴＬＡＳ−３、およびＡＴＬＡＳ−４のヌクレオチド配列を、本明細書中では
、「ＡＴＬＡＳ−Ｘ」という。
【０００６】 １つの局面では、本発明は、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドに対して少なくとも
９０％同一なポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、単
離された核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、核酸分子は、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘ核酸配列のタンパク質コード配列を含む核酸分子に相補的な核酸配列に対
して、ストリンジェント条件下でハイブリダイズし得る。
【０００７】 また本発明に含まれるのは、オリゴヌクレオチド、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核
酸（例えば、配列番号１）の少なくとも６個連続するヌクレオチドを含む、１０
０ヌクレオチド長未満のオリゴヌクレオチド、またはこのオリゴヌクレオチドの
相補体である。
【０００８】 また本発明に含まれるのは、実質的に精製されたＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド
である。いくつかの実施形態では、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドは、配列番号２
、４、６、または８のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して少なくとも８０
％同一なアミノ酸配列を含む。
【０００９】 本発明はまた、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドに選択的に結合する抗体を特徴と
する。
【００１０】 別の局面では、本発明は、治療的または予防的に有効な量の治療剤および薬学
的に受容可能なキャリアを含む薬学的組成物を含む。この治療剤は、例えば、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘ核酸、およびＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド、またはＡＴＬＡＳ−Ｘ
ポリペプチドに対する抗体であり得る。さらなる局面では、本発明は、１以上の
容器中における、治療的または予防的に有効な量のこの薬学的組成物を含む。
【００１１】 さらなる局面では、本発明は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ＤＮＡ）を含む細胞を、このＤＮＡによってコードされるＡＴＬＡＳ−Ｘポリ
ペプチドの発現を可能にする条件下で培養することによって、ポリペプチドを産
生する方法を含む。所望される場合には、次いで、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド
を回収し得る。
【００１２】 別の局面では、本発明は、サンプル中におけるＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドの
存在を検出する方法を含む。この方法では、このポリペプチドに選択的に結合す
る化合物とサンプルを、このポリペプチドとこの化合物との間での複合体形成を
可能にする条件下で接触させる。この複合体は、存在する場合には検出され、そ
れによって、このサンプル中においてこのポリペプチドを同定する。
【００１３】 また本発明に含まれるのは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸プローブまたはプライマーと
サンプルを接触させること、およびこの核酸プローブまたはプライマーが、この
サンプル中のＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子に結合したか否かを検出することによって
、このサンプル中におけるＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子の存在を検出する方法である
。
【００１４】 さらなる局面では、本発明は、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドを含む細胞サンプ
ルを、このポリペプチドの活性を調節するに十分な量において、このポリペプチ
ドに結合する化合物と接触させることにより、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドの活
性を調節する方法を提供する。この化合物は、例えば、本明細書中でさらに記載
されるような低分子（例えば、核酸、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模擬体
（ｐｅｐｔｉｄｏｍｉｍｅｔｉｃ）、炭水化物、脂質、または他の有機（炭素含
有）もしくは無機分子）であり得る。
【００１５】 ヒト免疫系障害に関連した症候群を処置または予防するための医薬の製造にお
ける治療剤の使用もまた、本発明の範囲内である。この治療剤は、例えば、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ核酸、およびＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド、またはＡＴＬＡＳ−Ｘ抗
体であり得る。
【００１６】 本発明はさらに、免疫障害の調節因子についてスクリーニングするための方法
を含む。この方法は、試験化合物をＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドと接触させる工
程、およびこの試験化合物がこのポリペプチドに結合するか否かを決定する工程
を包含する。ポリペプチドへの試験化合物の結合は、この試験化合物が、免疫障
害に対する活性、または潜伏性もしくは素因の調節因子であることを示す。
【００１７】 免疫障害についての危険性の増大した試験動物に試験化合物を投与することに
よって、免疫障害に対する活性、または潜伏性もしくは素因の調節因子について
スクリーニングするための方法もまた、本発明の範囲内である。この試験動物は
、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸によってコードされる組換えポリペプチドを発現する。次
いで、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドの発現または活性を試験動物において測定し
、このタンパク質を組換え的に発現し、かつこの障害についての危険性の増大し
ていないコントロール動物におけるこのタンパク質の発現または活性も同様に測
定する。次に、試験動物およびコントロール動物におけるこのタンパク質の発現
を比較する。コントロール動物と比較した、試験動物におけるこのタンパク質の
活性の変化は、この試験化合物が、この障害の潜伏性の調節因子であることを示
す。好ましくは、この障害は自己免疫障害、免疫障害、Ｔリンパ球関連障害、細
胞増殖障害、細胞分化障害、または免疫欠損障害（ｏｒｄｅｒ）である。
【００１８】 別の局面では、本発明は、被験体（例えば、ヒト被験体）において、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘポリペプチド、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸または両方のレベルの変化に関連した
疾患の存在またはその疾患に対する素因を決定するための方法を含む。この方法
は、被験体由来の試験サンプル中におけるこのポリペプチドの量を測定する工程
、およびこの試験サンプル中のこのポリペプチドの量を、コントロールサンプル
中に存在するこのポリペプチドの量に対して比較する工程を包含する。コントロ
ールサンプルに対して比較した場合の試験サンプル中のポリペプチドレベルの変
化は、この被験体における疾患の存在、またはその疾患に対する素因を示す。
【００１９】 さらなる局面では、本発明は、哺乳動物において免疫系障害に関連した病理学
的状態を処置または予防する方法を含み、この方法は、この病理学的状態を改善
または予防するに十分な量で、被験体（例えば、ヒト被験体）にＡＴＬＡＳ−Ｘ
ポリペプチド、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸、またはＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体を投与すること
による。いくつかの実施形態では、免疫系に関連した障害は、自己免疫障害、免
疫障害、Ｔリンパ球関連障害、細胞増殖障害、細胞分化障害、または免疫欠損障
害である。
【００２０】 他に規定されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学
技術用語は、本発明が属する分野の当業者によって通常理解されるのと同じ意味
を有する。本明細書中に記載された方法および材料と類似した方法および材料、
または等価な方法および材料が、本発明の実施または試験において使用され得る
が、適切な方法および材料を以下に記載する。本明細書中で言及されたすべての
刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献が、それらの全体において参考と
して援用される。矛盾する場合には、定義を含む本明細書が制御する。さらに、
物質、方法、および実施例は、単に例示であり、そして制限されることを意図し
ない。
【００２１】 本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から
明らかである。
【００２２】 （発明の詳細な説明） 本発明は部分的に、活性化Ｔリンパ球においてコードされる核酸の発見、およ
びこれらの核酸によってコードされるポリペプチドの発見に基づく。これらの核
酸を、「活性化Ｔリンパ球関連配列１〜４」、または集合的に「ＡＴＬＡＳ−Ｘ
」と名づけた。代表的なＡＴＬＡＳ−Ｘ配列、またはこれらの配列の使用の実施
例を、次に簡潔に考察する。
【００２３】 （１．ＡＴＬＡＳ−１：新規なホスファターゼ調節因子） 本発明に従うＡＴＬＡＳ−１配列は、以前に記載されたホスファターゼ調節因
子と関連したポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。本発明に従う
ＡＴＬＡＳ−１核酸配列、およびこの核酸配列によってコードされるポリペプチ
ド配列の提示を、図１Ａ〜１Ｄに示す。図１Ａ〜１Ｄの配列は、３２９０ヌクレ
オチドのヌクレオチド配列を含む（配列番号１）。ヌクレオチド１〜２５８６は
、８６２アミノ酸残基のポリペプチド（配列番号２）をコードするオープンリー
ディングフレームを規定する。本発明に従うＡＴＬＡＳ−１ヌクレオチド配列は
また、クローン５．０２ｗ０ｃ０−６０．３中に存在する。ＡＴＬＡＳ−１遺伝
子は、ヒト染色体１７に位置づけられる。
【００２４】 ＡＴＬＡＳ−１タンパク質の計算された分子量は、９４，０１９．９ダルトン
である。このタンパク質は、４〜６個の疎水性領域を含む。ＢＬＡＳＴＰタンパ
ク質比較分析を使用すると、この推定タンパク質は、ラットニューラビンＩＩ（
ｎｅｕｒａｂｉｎ ＩＩ）（例えば、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７３（６）、
３４７０−３４７５（１９９８）を参照のこと）に対して８９％相同性（２６６
アミノ酸／２９６アミノ酸）、そしてラットスピノフィリン（ｓｐｉｎｏｐｈｉ
ｌｉｎ）（例えば、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９４
（１８）、９９５６−９９６１（１９９７）を参照のこと）に対して６８％相同
性（５９４アミノ酸のうち４０７アミノ酸）である。ラットスピノフィリンは、
ニューロンにおけるタンパク質ホスファターゼ−１の活性を調節することが報告
されている。
【００２５】 ニューラビンおよびスピノフィリンに対するその関連性に基づいて、本発明の
ＡＴＬＡＳ−１タンパク質の少なくとも１つの用途は、活性化Ｔリンパ球におい
て発現される新規なホスファターゼ調節因子としてである。従って、ＡＴＬＡＳ
−１タンパク質は、Ｔリンパ球の活性化を調節（例えば、刺激または抑制）し得
る。ＡＴＬＡＳ−１ポリペプチド、またはＡＴＬＡＳ−１ポリペプチドをコード
する核酸を使用して、低分子アゴニストおよびアンタゴニストを同定し得る。こ
の新規なホスファターゼ調節因子の天然の基質を同様に、Ｔリンパ球の活性化を
調節（例えば、刺激または抑制）する方法において使用し得、そして同様に、化
合物（例えば、免疫応答の低分子アゴニストおよびアンタゴニスト）を同定する
ために使用し得る。
【００２６】 （２．ＡＴＬＡＳ−２：新規なサイトカインレセプター） 本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸配列は、以前に記載されたサイトカインレセ
プターに関連したポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。図２Ａ〜
２Ｈは、本発明のＡＴＬＡＳ−２核酸配列、およびこのポリペプチドによってコ
ードされたポリペプチド配列の提示を含む。開示された核酸配列は、６４６１ヌ
クレオチド長であり（配列番号３）、このうちヌクレオチド１〜５５５３が、１
８５１アミノ酸のポリペプチド（配列番号４）をコードするオープンリーディン
グフレームを規定する。本発明に従うＡＴＬＡＳ−２ヌクレオチド配列はまた、
クローン５．０２ｒ０１１−１０２．５中に存在する。この配列は、ヒト染色体
１１ｐｌ５．５に位置づけられる。
【００２７】 図２Ａ〜２Ｈのタンパク質の計算された分子量は、２０２，５２３ダルトンで
ある。このタンパク質は、約２０個の疎水性領域を含み、これは膜貫通セグメン
トであり得る。タンパク質分析結果（「ＢＬＡＳＴＰ」）に従って、推定タンパ
ク質は、ラットバソプレシンレセプター（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ｑ）に対して
５２％同一（２５０アミノ酸／４５８アミノ酸）である。推定タンパク質は、ヒ
トアンギオテンシン／バソプレシンレセプター（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ｏ７５
４３４）に対して３７％同一（９８アミノ酸／２６３アミノ酸）である。
【００２８】 ラットバソプレシンレセプターおよびヒトアンギオテンシン／バソプレシンレ
セプターに対するその関連性に基づいて、ＡＴＬＡＳ−２タンパク質は、サイト
カインレセプターファミリーの新規なメンバーであるようである。この推定レセ
プター（これは、活性化Ｔリンパ球において発現される）に対して惹起された抗
体をブロックすることは、Ｔリンパ球エフェクター機能を調節（すなわち、刺激
または抑制）するために有用である。このレセプターはまた、免疫抑制性であり
得るか、または免疫刺激性であり得るリガンドを同定するために使用され得る。
このレセプターはまた、免疫抑制性であり得るかまたは免疫刺激性であり得る化
合物（例えば、低分子アゴニストまたはアンタゴニスト）を同定するために使用
され得る。
【００２９】 （３．ＡＴＬＡＳ−３：チオレドキシンおよびタンパク質ジスルフィドイソメ
ラーゼファミリーの新規なメンバー） 本発明に従うＡＴＬＡＳ−３核酸は、図３Ａ〜３Ｂに示される２５６４塩基対
の長さのヌクレオチド配列（配列番号５）を含む。また、図３Ａ〜３Ｂに示され
るものは、配列番号５のヌクレオチド９８〜９０４から翻訳される２６９アミノ
酸残基のポリペプチド（配列番号６）である。ＡＴＬＡＳ−３核酸配列は、クロ
ーン５．０２ｒ０１１−１４９にもまた存在する。
【００３０】 推定タンパク質の計算分子量は、３０，０４５ダルトンである。このタンパク
質は、小胞体保持シグナルを有し、そして細胞下の局在は、恐らく、小胞体（Ｅ
Ｒ）である。タンパク質分析結果（「ＢＬＡＳＴＰ」）に従って、推定タンパク
質は、マウスおよびヒトのタンパク質ジスルフィドイソメラーゼ（ＧｅｎＢａｎ
ｋ登録番号ｐ２７７７３［マウス］およびｐ３０１０１［ヒト］）に４３％同一
である。タンパク質ジスルフィドイソメラーゼは、ＫＤＥＬ標的シグナルを有す
る小胞体常在タンパク質である。
【００３１】 タンパク質ジスルフィドイソメラーゼに対するその関連性に基づいて、開示さ
れるＡＴＬＡＳ−３タンパク質は、チオレドキシンまたはタンパク質ジスルフィ
ドイソメラーゼファミリーの新規なメンバーである。
【００３２】 開示されるＡＴＬＡＳ−３タンパク質中の２つのドメインは、さらにチオレド
キシンと共通点がある。このチオレドキシンはＤＮＡ合成においてジチオール水
素供与体として作用する。チオレドキシンは、代謝プロセス（例えば、増殖制御
、酵素調節、レセプター活性、または転写制御）の調節に関与する。
【００３３】 ＡＴＬＡＳ−３タンパク質は、タンパク質折畳みシャペロン（ｐｒｏｔｅｉｎ
−ｆｏｌｄｉｎｇ ｃｈａｐｅｒｏｎｅ）として作用して、Ｔリンパ球活性化を
調節し得る。あるいは、またはさらに、ＡＴＬＡＳ−３タンパク質は、チオレド
キシンに類似した増殖調節因子として作用し得る。例えば、ＡＴＬＡＳ−３タン
パク質は、Ｔリンパ球基質として作用し得る。
【００３４】 ＡＴＬＡＳ−３タンパク質をまた用いて、免疫応答を調節（刺激または抑制）
し得る化合物（例えば、低分子）を同定し得る。さらに、ＡＴＬＡＳ−３タンパ
ク質を用いて、Ｔリンパ球において分泌された基質タンパク質（それ自身が免疫
調節性であり得る）を同定し得る。
【００３５】 （４．ＡＴＬＡＳ−４：推定多発性硬化症病因物質（ａｅｔｉｌｏｇｉｃ ａ
ｇｅｎｔ）に対する相同性を有する新規のタンパク質） 本発明に従うＡＴＬＡＳ−４核酸は、図４Ａ〜４Ｂに示されるような、１８２
８ヌクレオチドのヌクレオチド配列（配列番号７）を含む。図４Ａ〜４Ｂはまた
、配列番号７のヌクレオチド１〜１０７４から翻訳される３５８アミノ酸残基の
ポリペプチド（配列番号８）を示す。本発明に従うＡＴＬＡＳ−４核酸配列は、
クローン５．０２ｈ０ｎ０−１０３．１にもまた存在する。
【００３６】 タンパク質の計算分子量は、３８，１３３ダルトンである。２８個の疎水性残
基の推定シグナル配列は、１つの疎水性残基を有するアミノ酸１〜１２８に存在
する。タンパク質のアミノ末端およびカルボキシ末端に存在する８０残基は類似
する。これらのドメインは、５つの均一に間隔を空けた荷電した残基（ｅｖｅｎ
ｌｙ ｓｐａｃｅｄ ｃｈａｒｇｅｄ ｒｅｓｉｄｕｅｓ）および２つのシステ
イン残基を含む。
【００３７】 ＢＬＡＳＴＰ配列を分析は、推定されるタンパク質が、多発性硬化症関連レト
ロウィルス−１（ＭＳＲＶ−１、ＷＯ９８２３７５５−Ａ１に記載される）に関
する配列の一部６９％（６５ａａ／９４ａａ）に類似することを示す。Ｃｌｕｓ
ｔａｌ Ｗ分析は、ＡＴＬＡＳ−４タンパク質がまた、ＭＳＲＶ−１（これは、
ＷＯ９８２３７５５−Ａ１、ＦＲ２７６２６０１−Ａ１およびＷＯ９７０６２６
０に記載される）によりコードされる７つの関連ペプチドの一部に類似すること
を示す。
【００３８】 開示されるＡＴＬＡＳ−４核酸配列は、ヒト染色体１ｑ２３．３−２４．３に
局在する。
【００３９】 ＭＳＲＶ−１タンパク質に対するその相同性に基づいて、本発明のＡＴＬＡＳ
−４タンパク質はＴリンパ球に作用して、（例えば、免疫応答の刺激または抑制
における）免疫機能を調節し得る。
【００４０】 ＡＴＬＡＳ核酸配列、コードされるポリペプチド、ならびに種々の開示される
配列およびこれらの核酸を含むクローンに対応する配列識別番号（配列番号）の
概要を表１に示す。本明細書中で用いられる場合、「ＡＴＬＡＳ−Ｘ」は、ＡＴ
ＬＡＳ−１、ＡＴＬＡＳ−２、ＡＴＬＡＳ−３、またはＡＴＬＡＳ−４のいずれ
かに対応する。
【００４１】 （表１：開示される配列の配列および対応する配列番号）
【００４２】
【表１】 （ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸） 本発明の１つの局面は、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドまたはそれらの生物学的
に活性な部分をコードする単離された核酸分子に関する。また、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
をコードする核酸（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡ）を同定するためのハイ
ブリダイゼーションプローブとして使用するための十分な核酸フラグメントおよ
びＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子の増幅または変異のためのＰＣＲプライマーとして使
用するためのフラグメントも本発明に含まれる。本明細書において使用されるよ
うに、用語「核酸分子」は、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ
）、ＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ヌクレオチドアナログを使用して産生さ
れるＤＮＡまたはＲＮＡのアナログ、ならびにそれらの誘導体、フラグメントお
よびホモログを含むことが意図される。核酸分子は、一本鎖または二本鎖であり
得るが、好ましくは、二本鎖ＤＮＡである。
【００４３】 「プローブ」とは、種々の長さの核酸配列をいい、好ましくは、使用に依存し
て、少なくとも約１０ヌクレオチド（ｎｔ）、１００ｎｔ、または例えば、約６
，０００ｎｔほどの大きさの間である。プローブは、同一、類似または相補的な
核酸配列の検出において使用される。より長いプローブは、通常、天然供給源ま
たは組換え供給源から入手され、非常に特異的であり、そしてオリゴマーよりも
はるかに遅くハイブリダイズする。プローブは、一本鎖または二本鎖であり得、
そしてＰＣＲ、メンブレンベースのハイブリダイゼーション技術またはＥＬＩＳ
Ａのような技術において特異性を有するように設計される。
【００４４】 「単離された」核酸分子は、この核酸の天然の供給源中に存在するその他の核
酸分子から分離されているものである。好ましくは、「単離された」核酸は、こ
の核酸が由来する生物のゲノムＤＮＡ中でこの核酸に天然に隣接する配列（すな
わち、この核酸の５’末端および３’末端に位置する配列）を含まない。例えば
、種々の実施形態では、単離されたＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子は、この核酸が由来
する細胞（例えば、リンパ球、例えば、活性化Ｔリンパ球）のゲノムＤＮＡ中で
この核酸に天然で隣接する、約５ｋｂ、４ｋｂ、３ｋｂ、２ｋｂ、１ｋｂ、０．
５ｋｂ、または０．１ｋｂ未満のヌクレオチド配列を含み得る。さらに、「単離
された」核酸分子、例えば、ｃＤＮＡ分子は、組換え技術により産生される場合
、その他の細胞物質または培養培地を実質的に含まないか、または化学的に合成
される場合、化学物質前駆体もしくはその他の化学物質を実質的に含まないもの
であり得る。
【００４５】 本発明の核酸分子、例えば、配列番号１、３、５、７、９、１１、１２のヌク
レオチド配列、またはこれらのヌクレオチド配列の任意の相補鎖を有する核酸分
子は、標準的な分子生物学的技法および本明細書で提供される配列情報を用いて
単離され得る。ハイブリダイゼーションプローブとして、配列番号１、３、５、
または７の核酸の全部または一部を使用して、ＡＴＬＡＳ−Ｘ分子は、標準的な
ハイブリダイゼーションおよびクローニング技術（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら
（編）、ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹＹ
ＭＡＮＵＡＬ第２版、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔ
ｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ、１９８９
；およびＡｕｓｕｂｅｌら、（編）、ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ Ｉ
Ｎ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、
Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、１９９３）を用いて単離され得る。
【００４６】 本発明の核酸は、標準的なＰＣＲ増幅技法に従って、テンプレートとしてｃＤ
ＮＡ、ｍＲＮＡあるいはゲノムＤＮＡ、および適切なオリゴヌクレオチドプライ
マーを用いて増幅され得る。このように増幅された核酸は、適切なベクター中に
クローン化され、そしてＤＮＡ配列分析により特徴付けられ得る。さらに、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘヌクレオチド配列に対応するオリゴヌクレオチドは、標準的な合成技
術、例えば、自動化ＤＮＡ合成機を用いることにより調製され得る。
【００４７】 本明細書で用いられる用語「オリゴヌクレオチド」は、一連の連結されたヌク
レオチド残基をいい、このオリゴヌクレオチドは、ＰＣＲ反応で用いられる十分
な数のヌクレオチド塩基を有する。短いオリゴヌクレオチド配列は、ゲノム配列
もしくはｃＤＮＡ配列に基づき得るか、またはそれから設計され得、そして特定
の細胞もしくは組織において、同一、類似もしくは相補的ＤＮＡまたはＲＮＡを
増幅するか、確認するか、もしくはその存在を示すために用いられる。オリゴヌ
クレオチドは、約１０ｎｔ、５０ｎｔ、または１００ｎｔの長さ、好ましくは約
１５ｎｔ〜３０ｎｔの長さを有する核酸配列の部分を含む。１つの実施形態では
、１００ｎｔより少ない長さの核酸分子を含むオリゴヌクレオチドは、さらに、
配列番号１、３、５、７の少なくとも６個連続するヌクレオチド、またはその相
補鎖を含む。オリゴヌクレオチドは、化学的に合成され得、そしてプローブとし
て用いられ得る。
【００４８】 別の実施形態では、本発明の単離された核酸分子は、配列番号１、３、５、も
しくは７に示されるヌクレオチド配列、またはこのヌクレオチド配列の一部分の
相補鎖である核酸分子（例えば、プローブもしくはプライマーとして使用され得
るフラグメント、またはＡＴＬＡＳ−Ｘの生物学的に活性な部分をコードするフ
ラグメント）を含む。配列番号１、３、５、もしくは７に示されるヌクレオチド
配列に相補的であるヌクレオチド分子は、配列番号１、３、５、もしくは７に示
されるヌクレオチド配列に十分相補的であるヌクレオチド分子であり、配列番号
１、３、５、もしくは７に示されるヌクレオチド配列に対しミスマッチがほとん
どないかまたは全くなしに水素結合し得、それによって安定な二本鎖を形成する
。
【００４９】 本明細書で用いる用語「相補的」は、核酸分子のヌクレオチド単位間のＷａｔ
ｓｏｎ−ＣｒｉｃｋまたはＨｏｏｇｓｔｅｅｎ塩基対形成をいい、そして用語「
結合」は、２つのポリペプチドまたは化合物または関連ポリペプチドまたは化合
物またはその組合せ間の物理的または化学的相互作用を意味する。結合は、イオ
ン性相互作用、非イオン性相互作用、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互
作用などを含む。物理的相互作用は、直接的であるかまたは間接的であるかのい
ずれかであり得る。間接的相互作用は、別のポリペプチドまたは化合物を介する
か、またはその効果に起因し得る。直接的結合は、別のポリペプチドもしくは化
合物を介さないか、またはその効果に起因して生じない、その他の実質的な化学
的中間体がない相互作用をいう。
【００５０】 本明細書中に提供されるフラグメントは、少なくとも６個の（連続する）核酸
配列または少なくとも４個の（連続する）アミノ酸配列（それぞれ、核酸の場合
には、特異的なハイブリダイゼーションを可能にし、またはアミノ酸の場合には
、エピトープの特異的な認識を可能にするに十分な長さ）として規定され、そし
て全長配列未満のせいぜいいくらかの部分である。フラグメントは、選り抜きの
核酸配列またはアミノ酸配列の任意の連続する部分に由来し得る。誘導体は、直
接的にかまたは改変もしくは部分的置換によってかのいずれかでネイティブの化
合物から形成される核酸配列またはアミノ酸配列である。アナログは、ネイティ
ブの化合物に類似する構造を有する（しかし、同一ではない）が、特定の成分ま
たは側鎖に関してそれとは異なる核酸配列またはアミノ酸配列である。アナログ
は、合成物であり得るか、または進化的に異なる起源に由来し得、そして野生型
と比較して、類似の代謝活性または反対の代謝活性を有し得る。ホモログは、異
なる種に由来する特定の遺伝子の核酸配列およびアミノ酸配列である。
【００５１】 誘導体およびアナログは、以下に記載のように、誘導体またはアナログが、修
飾された核酸またはアミノ酸を含む場合、全長、または全長以外のものであり得
る。本発明の核酸またはタンパク質の誘導体またはアナログは、種々の実施形態
において、本発明の核酸もしくはタンパク質に、同一の大きさの核酸またはアミ
ノ酸配列にわたって、または整列した配と比較した場合（この整列は、当該分野
で公知であるコンピューター相同性プログラムによって実施される）、少なくと
も約３０％、５０％、７０％、８０％、もしくは９５％もの同一性（好ましい同
一性は、８０〜９９％）で実質的に相同であるか、あるいはそのコードする核酸
がストリンジェントの、中程度にストリンジェントの、または低いストリンジェ
ントの条件下で上記のタンパク質をコードする配列の相補鎖にハイブリダイズし
得る、領域を含む分子を含むが、これらに限定されない。例えば、Ａｕｓｕｂｅ
ｌら、ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩ
ＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、ＮＹ、
１９９３、および以下を参照のこと。。
【００５２】 「相同な核酸配列」もしくは「相同なアミノ酸配列」、またはその改変体とは
、上記で考察したように、ヌクレオチドレベルまたはアミノ酸レベルにおける相
同性によって特徴付けられる配列をいう。相同なヌクレオチド配列は、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘポリペプチドのアイソフォームをコードする配列をコードする。アイソフ
ォームは、例えば、ＲＮＡの選択的スプライシングの結果として、同一の生物の
異なる組織において発現され得る。あるいは、アイソフォームは、異なる遺伝子
によってコードされ得る。本発明において、相同なヌクレオチド配列は、ヒト以
外の種（哺乳動物が挙げられるが、これに限定されず、従って、例えば、マウス
、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ウシ、ウマおよび他の生物が挙げられ得る）の
ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。相同なヌク
レオチド配列はまた、天然に生じる対立遺伝子改変体および本明細書に記載され
るヌクレオチド配列の変異体が挙げられるが、これらに限定されない。しかし、
相同的ヌクレオチド配列は、ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコードするヌクレ
オチド配列を含まない。相同核酸配列は、配列番号１、３、５、、または７の保
存的アミノ酸置換（以下を参照のこと）、およびＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を有するポ
リペプチドをコードする核酸配列を含む。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の生物学的
活性は以下に記載されている。相同的アミノ酸配列は、ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘポリ
ペプチドのアミノ酸配列をコードしない。
【００５３】 ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸のオープンリーディング
フレーム（「ＯＲＦ」）によりコードされる。本発明は、配列番号１、３、５、
７、９、１０、１１、または１２の核酸配列のストレッチ（ｓｔｒｅｔｃｈ）を
含む核酸配列を含み、この核酸配列のストレッチは、これらの核酸配列のＯＲＦ
を含み、そして配列番号２、４、６、または８のポリペプチドをコードする。
【００５４】 「オープンリーディングフレーム」（「ＯＲＦ」）は、ポリペプチドに潜在的
に翻訳され得るヌクレオチド配列に対応する。ＯＲＦを含む核酸のストレッチは
、停止コドンにより途切れない。全長タンパク質についてのコード配列を示すＯ
ＲＦは、ＡＴＧ「開始」コドンにより開始し、そして３つの「停止」コドン（す
なわち、ＴＡＡ、ＴＡＧ、またはＴＧＡ）の１つにより停止する。本発明の目的
のために、ＯＲＦはコード配列の任意の部分（開始コドン、停止コドン、または
この両方を有するか、または有さない）であり得る。本物の細胞タンパク質をコ
ードする良い候補とみなされるＯＲＦについて、最小のサイズ要件は、頻繁に、
例えば、５０アミノ酸以上のタンパク質をコードするＤＮＡのストレッチに定め
られる。
【００５５】 ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子のクローニングから決定されたヌクレオチド配列は
、他の細胞型（例えば、他の組織由来）におけるＡＴＬＡＳ−Ｘホモログ、なら
びに他の哺乳動物由来のＡＴＬＡＳ−Ｘホモログを同定および／またはクローニ
ングする際の使用のために設計されるプローブおよびプライマーの作製を可能に
する。このプローブ／プライマーは、代表的には、実質的に精製されたオリゴヌ
クレオチドを含む。このオリゴヌクレオチドは、代表的には、配列番号１、３、
５、もしくは７の少なくとも約１２個、２５個、５０個、１００個、１５０個、
２００個、２５０個、３００個、３５０個または４００個の連続するセンス鎖ヌ
クレオチド配列；または配列番号１、３、５、もしくは７のアンチセンス鎖ヌク
レオチド配列；あるいは配列番号１、３、５、もしくは７の天然に存在する変異
体の少なくとも約１２個、２５個、５０個、１００個、１５０個、２００個、２
５０個、３００個、３５０個または４００個の連続するセンス鎖ヌクレオチド配
列に、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域
を含む。
【００５６】 ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘヌクレオチド配列に基づくプローブは、同じまたは相同な
タンパク質をコードする転写物またはゲノム配列を検出するために使用され得る
。種々の実施形態において、このプローブはさらに、プローブに付着した標識基
を含み、例えば、この標識基は放射性同位体、蛍光化合物、酵素、または酵素補
因子であり得る。このようなプローブは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を誤って発
現する細胞または組織を同定するための診断試験キットの一部として、例えば、
被験体由来の細胞のサンプル中のＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする核酸のレベルを測
定すること（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡレベルを検出すること、または
ゲノムＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子が変異しているかまたは欠失しているか否かを決定
すること）によって使用され得る。
【００５７】 「ＡＴＬＡＳ−Ｘの生物学的に活性な部分を有するポリペプチド」は、本発明
のポリペプチドの活性に類似するが必ずしも同一ではない活性を示すポリペプチ
ドをいい、用量依存性の有無に関わらず、特定の生物学的アッセイにおいて測定
されるような成熟形態を含む。「ＡＴＬＡＳ−Ｘの生物学的に活性な部分」をコ
ードする核酸フラグメントは、ＡＴＬＡＳ−Ｘの生物学的活性（ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質の生物学的活性は、以下に記載される）を有するポリペプチドをコー
ドする、配列番号１、３、５、もしくは７の一部を単離し、ＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質のコードされた部分を発現させ（例えば、インビトロでの組換え発現によ
って）、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘのコードされた部分の活性を評価することによっ
て調製され得る。例えば、ＡＴＬＡＳ−３の生物学的に活性な部分をコードし得
る核酸フラグメントは、配列番号６チオレドキシンドメインを含む。
【００５８】 （ＡＴＬＡＳ−Ｘの改変体） 本発明はさらに、遺伝コードの縮重に起因して、配列番号１、３、５、もしく
は７に示されるヌクレオチド配列とは異なる核酸分子を包含する。それにより、
これらの核酸は、配列番号配列番号１、３、５、もしくは７に示されるヌクレオ
チド配列によってコードされるタンパク質と同じＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコ
ードする。別の実施形態において、本発明の単離された核酸分子は、配列番号２
、４、６、もしくは８に示されるアミノ酸配列を有するタンパク質をコードする
ヌクレオチド配列を有する。
【００５９】 配列番号１、３、５、７、９、１１、もしくは１２に示されるヒトＡＴＬＡＳ
−Ｘヌクレオチド配列に加えて、ＡＴＬＡＳ−Ｘのアミノ酸配列における変化を
導くＤＮＡ配列多型は、集団（例えば、ヒト集団）内に存在し得ることが、当業
者によって理解される。ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子中のこのような遺伝的多型は、天
然の対立遺伝子のバリエーションに起因して、集団内の個体間に存在し得る。本
明細書中で使用される場合、用語「遺伝子」および「組換え遺伝子」は、ＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質、好ましくは哺乳動物のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコード
するオープンリーディングフレームを含む核酸分子をいう。このような天然の対
立遺伝子のバリエーションは、代表的には、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子のヌクレオチ
ド配列において１〜５％の変動性を生じ得る。天然の対立遺伝子バリエーション
の結果であり、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘの機能的活性を変化させない、ＡＴＬＡＳ
−Ｘ内の任意および全てのこのようなヌクレオチドのバリエーションならびに得
られるアミノ酸多型は、本発明の範囲内であると意図される。
【００６０】 さらに、他の種由来のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコードし、従って、配列番
号１、３、５、７、９、１１、もしくは１２のヒト配列とは異なるヌクレオチド
配列を有する核酸分子は、本発明の範囲内にあることが意図される。本発明のＡ
ＴＬＡＳ−ＸのｃＤＮＡの天然の対立遺伝子改変体およびホモログに対応する核
酸分子は、本明細書中に開示されるヒトＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸に対するその相同性
に基づいて、ストリンジェントハイブリダイゼーション条件下で、標準的なハイ
ブリダイゼーション技術に従うハイブリダイゼーションプローブとしてヒトｃＤ
ＮＡまたはその一部を用いて単離され得る。例えば、可溶性ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘ
ｃＤＮＡは、ヒトの膜結合ＡＴＬＡＳ−Ｘに対するその相同性に基づいて単離
され得る。同様に、膜結合ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘ ｃＤＮＡは、可溶性ヒトＡＴＬ
ＡＳ−Ｘに対するその相同性に基づいて単離され得る。
【００６１】 従って、別の実施形態では、本発明の単離された核酸分子は、少なくとも６ヌ
クレオチド長であり、そしてストリンジェント条件下で配列番号１、３、５、も
しくは７のヌクレオチド配列を含む核酸分子にハイブリダイズする。別の実施形
態では、この核酸は、少なくとも１０、２５、５０、１００、２５０、５００、
７５０、１０００、１５００、または２０００ヌクレオチド長である。別の実施
形態では、本発明の単離された核酸分子は、コード領域にハイブリダイズする。
本明細書中で用いられる場合、用語「ストリンジェント条件下でハイブリダイズ
する」は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄に関して、互いに少なくとも６０
％相同なヌクレオチド配列が代表的には互いにハイブリダイズしたままである条
件を記載することを意図する。
【００６２】 ホモログ（すなわち、ヒト以外の種由来のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコード
する核酸）または他の関連配列（例えば、パラログ（ｐａｒａｌｏｇｓ））は、
特定のヒト配列の全てまたは一部をプローブとし、核酸ハイブリダイゼーション
およびクローニングに関して当該分野で周知の方法を使用して、低い、中程度の
、または高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーションによって入手され得
る。
【００６３】 本明細書で用いられる場合、語句「ストリンジェントハイブリダイゼーション
条件」は、その条件下で、プローブ、プライマーまたはオリゴヌクレオチドが、
その標的配列にハイブリダイズするが、その他の配列にはハイブリダイズしない
条件をいう。ストリンジェントな条件は配列依存性であり、そして異なる状況で
異なる。より長い配列は、より短い配列より高い温度で特異的にハイブリダイズ
する。一般に、ストリンジェントな条件は、規定されたイオン強度およびｐＨで
、特定の配列の熱融解点（Ｔm）より約５℃低いように選択される。このＴｍは
、標的配列に相補的なプローブの５０％が、平衡状態で標的配列にハイブリダイ
ズする（規定されたイオン強度、ｐＨおよび核酸濃度下）温度である。標的配列
は一般に過剰に存在するので、Ｔｍでは、５０％のプローブが平衡状態で占有さ
れている。代表的には、ストリンジェントな条件は、ｐＨ７．０〜８．３で、塩
濃度が約１．０Ｍナトリウムイオンより少なく、代表的には約０．０１〜１．０
Ｍナトリウムイオン（またはその他の塩）、そして温度が短いプローブ、プライ
マーまたはオリゴヌクレオチド（例えば、１０ｎｔ〜５０ｎｔ）について少なく
とも約３０℃、そしてより長いプローブ、プライマーおよびオリゴヌクレオチド
について少なくとも約６０℃であるような条件である。ストリンジェントな条件
はまた、ホルムアミドのような、変性剤の添加で達成され得る。
【００６４】 ストリンジェント条件は、当業者に公知であり、そしてＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲ
ＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ，Ｊｏｈｎ Ｗｉ
ｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９），６．３．１−６．３．６に見出
され得る。好ましくは、この条件は、互いに少なくとも約６５％、約７０％、約
７５％、約８５％、約９０％、約９５％、約９８％または約９９％相同な配列が
、代表的には互いにハイブリダイズしたままであるような条件である。ストリン
ジェントハイブリダイゼーション条件の非限定的な例は、６×ＳＳＣ、５０ｍＭ
Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）、１ｍＭ ＥＤＴＡ、０．０２％ ＰＶＰ、
０．０２％ Ｆｉｃｏｌｌ、０．０２％ ＢＳＡ、および５００ｍｇ／ｍｌ変性
サケ精子ＤＮＡを含む高塩緩衝液中での６５℃でのハイブリダイゼーションであ
る。このハイブリダイゼーションに、０．２×ＳＳＣ、０．０１％ ＢＳＡ中で
の５０℃での１回以上の洗浄が続く。ストリンジェント条件下で配列番号１、３
、５、もしくは７の配列にハイブリダイズする、本発明の単離された核酸分子は
、天然に存在する核酸分子に対応する。本明細書中で使用される場合、「天然に
存在する」核酸分子とは、天然に存在する（例えば、天然のタンパク質をコード
する）ヌクレオチド配列を有する、ＲＮＡ分子またはＤＮＡ分子をいう。
【００６５】 第２の実施形態では、配列番号１、３、５、もしくは７、またはそれらのフラ
グメント、アナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む核酸分子に、中程
度のストリンジェンシー条件下でハイブリダイズし得る核酸配列が提供される。
中程度のストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件の非限定的な例は、５
５℃での６×ＳＳＣ、５×デンハルト溶液、０．５％ ＳＤＳおよび１００ｍｇ
／ｍｌ変性サケ精子ＤＮＡ中でのハイブリダイゼーション、続いて１×ＳＳＣ、
０．１％ ＳＤＳ中での３７℃での１回以上の洗浄である。用いられ得る中程度
のストリンジェンシーの他の条件は、当該分野で周知である。例えば、Ａｕｓｕ
ｂｅｌら（編），１９９３，ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯ
ＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ＮＹ
およびＫｒｉｅｇｌｅｒ，１９９０，ＧＥＮＥ ＴＲＡＮＳＦＥＲ ＡＮＤ Ｅ
ＸＰＲＥＳＳＩＯＮ，Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ，Ｓｔｏｃｋｔ
ｏｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹを参照のこと。
【００６６】 第３の実施形態では、配列番号１、３、５、もしくは７、またはそれらのフラ
グメント、アナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む核酸分子に、低ス
トリンジェンシー条件下でハイブリダイズし得る核酸が提供される。低ストリン
ジェンシーハイブリダイゼーション条件の非限定的な例は、３５％ホルムアミド
、５×ＳＳＣ、５０ ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．５）、５ｍＭ ＥＤＴ
Ａ、０．０２％ ＰＶＰ、０．０２％ Ｆｉｃｏｌｌ、０．２％ ＢＳＡ、１０
０ｍｇ／ｍｌの変性サケ精子ＤＮＡ、１０％（重量／容量）デキストラン硫酸中
での４０℃でのハイブリダイゼーション、続いて２×ＳＳＣ、２５ｍＭ Ｔｒｉ
ｓ−ＨＣｌ（ｐＨ７．４）、５ｍＭ ＥＤＴＡおよび０．１％ ＳＤＳ中での５
０℃での１回以上の洗浄である。用いられ得る低ストリンジェンシーの他の条件
は、当該分野で周知である（例えば、種交差ハイブリダイゼーションについて用
いられるように）。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌら（編），１９９３，ＣＵＲＲＥＮ
Ｔ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ，Ｊｏｈ
ｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ＮＹならびにＫｒｉｅｇｌｅｒ，１９９０，Ｇ
ＥＮＥ ＴＲＡＮＳＦＥＲ ＡＮＤ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ，Ａ ＬＡＢＯＲＡ
ＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ，Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ；Ｓｈｉｌｏお
よびＷｅｉｎｂｅｒｇ，１９８１，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ
ＳＡ ７８：６７８９−６７９２を参照のこと。
【００６７】 （保存的変異） 集団中に存在し得る、ＡＴＬＡＳ−Ｘ配列の天然に存在する対立遺伝子改変体
に加えて、当業者は、配列番号１、３、５、もしくは７のヌクレオチド配列への
変異によって変化が導入され得、それによって、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の機
能的能力を変更することなく、コードされるＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のアミノ
酸配列に変化がもたらされることをさらに理解する。例えば、「非必須」アミノ
酸残基にてアミノ酸置換をもたらすヌクレオチド置換は、配列番号１、３、５、
もしくは７の配列において行われ得る。「非必須」アミノ酸残基は、生物学的活
性を有意に変更することなく、ＡＴＬＡＳ−Ｘの野生型配列から、変更され得る
残基であり、一方、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性に必要とされる。例
えば、本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の間で保存されているアミノ酸残基は
、特に変更を受け入れ難いと予測される。保存的置換はなされ得るアミノ酸は、
当該分野で公知である。
【００６８】 本発明の別の局面は、活性に必須ではないアミノ酸残基における変化を含む、
ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコードする核酸分子に関する。このようなＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質は、アミノ酸配列が、配列番号２、４、６、および８とは異な
るが、生物学的活性をなお保持する。１つの実施形態では、単離された核酸分子
は、タンパク質をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、このタンパク質
は、それぞれ、配列番号２、４、６、もしくは８のアミノ酸配列に少なくとも約
４５％の相同性であるアミノ酸配列を含む。好ましくは、この核酸分子によって
コードされるタンパク質は、配列番号２、４、６、もしくは８に少なくとも約６
０％相同性であり、より好ましくは配列番号２、４、６、もしくは８に少なくと
も約７０％相同性であり、なおより好ましくは配列番号２、４、６、もしくは８
に少なくとも約８０％相同性であり、さらにより好ましくは配列番号２、４、６
、もしくは８に少なくとも約９０％相同性であり、そして最も好ましくは少なく
とも約９５％相同性である。
【００６９】 配列番号２、４、６、もしくは８のタンパク質に相同なＡＴＬＡＳ−Ｘタンパ
ク質をコードする単離された核酸分子は、配列番号２、４、６、もしくは８のヌ
クレオチド配列に１以上のヌクレオチドの置換、付加または欠失を導入すること
により作製され得、その結果、１以上のアミノ酸の置換，付加または欠失が、コ
ードされるタンパク質に導入される。
【００７０】 変異は、標準技術（例えば、部位特異的変異誘発およびＰＣＲ媒介変異誘発）
によって配列番号２、４、６、および８に導入され得る。好ましくは、保存的ア
ミノ酸置換が、１以上の推定非必須アミノ酸残基にて作製される。「保存的アミ
ノ酸置換」は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基と置換される、
アミノ酸置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該分
野で定義されている。これらのファミリーとしては、以下が挙げられる：塩基性
側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖
を有するアミノ酸（例えば、アルパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖
を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、ト
レオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、ア
ラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチ
オニン、トリプトファン）、β分枝側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン
、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシ
ン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）。従って、ＡＴＬＡＳ−
Ｘ中の推定された非必須アミノ酸残基は、同じ側鎖のファミリー由来の別のアミ
ノ酸残基で置換される。あるいは、別の実施形態では、変異は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
コード配列の全てまたは一部に沿って（例えば、飽和変異誘発（ｓａｔｕｒａｔ
ｉｏｎ ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）によって）ランダムに導入され得、そして得
られる変異体は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの生物学的活性についてスクリーニングされて
、活性を維持する変異体を同定し得る。配列番号２、４、６、もしくは８の変異
誘発に続いて、コードされるタンパク質は、当該分野で公知の任意の組換え技術
によって発現され得、そしてこのタンパク質の活性が決定され得る。
【００７１】 １つの実施形態では、変異ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、以下についてアッセ
イされ得る：（１）他のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、他の細胞表面タンパク質、
または生物学的に活性なそれらの部分と、タンパク質：タンパク質相互作用を形
成する能力、（２）変異ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質と、ＡＴＬＡＳ−Ｘのリガン
ドとの間の複合体形成；（３）変異ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が細胞内標的タン
パク質またはその生物学的に活性な部分に結合する能力；（例えば、アビジンタ
ンパク質）。
【００７２】 なお別の実施形態では、変異ＡＴＬＡＳ−Ｘは、ホスファターゼ活性を調節す
る（ＡＴＬＡＳ−１について）、サイトカインを結合する（ＡＴＬＡＳ−１につ
いて）、またはジチオール水素供与体（ＡＴＬＡＳ−３）として作用する能力に
ついてアッセイされ得る。
【００７３】 （アンチセンス） 本発明の別の局面は、配列番号１、３、５、７、またはそのフラグメント、ア
ナログもしくは誘導体のヌクレオチド配列を含む核酸分子にハイブリダイズし得
るかまたは相補的である、単離されたアンチセンス核酸分子に関する。「アンチ
センス」核酸は、タンパク質をコードする「センス」核酸に相補的である（例え
ば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるかまたはｍＲＮＡ配列に相補
的である）ヌクレオチド配列を含む。特定の局面では、少なくとも約１０、約２
５、約５０、約１００、約２５０もしくは約５００ヌクレオチドまたは全体のＡ
ＴＬＡＳ−Ｘコード鎖、またはそれらの一部のみに相補的な配列を含む、アンチ
センス核酸分子が提供される。配列番号２、４、６、もしくは８のＡＴＬＡＳ−
Ｘタンパク質のフラグメント、ホモログ、誘導体およびアナログをコードする核
酸分子、または配列番号１、３、５、もしくは７のＡＴＬＡＳ−Ｘの核酸配列に
相補的なアンチセンス核酸がさらに提供される。
【００７４】 １つの実施形態では、アンチセンス核酸分子は、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする
ヌクレオチド配列のコード鎖の「コード領域」に対してアンチセンスである。用
語「コード領域」とは、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含む、ヌクレオチド
配列の領域をいう（例えば、配列番号９、１０、１１、および１２にそれぞれ対
応する、ヒト（ｈｕｍａ）ＡＴＬＡＳ−１、２、３、および４のコード領域）。
別の実施形態では、このアンチセンス核酸分子は、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする
ヌクレオチド配列のコード鎖の「非コード領域」に対してアンチセンスである。
用語「非コード領域」とは、コード領域に隣接する、アミノ酸に翻訳されない、
５’配列および３’配列をいう（すなわち、５’非翻訳領域および３’非翻訳領
域ともいわれる）。
【００７５】 本明細書中に開示されるＡＴＬＡＳ−Ｘをコードするコード鎖配列（例えば、
配列番号９、１０、１１、および１２）を考慮すれば、本発明のアンチセンス核
酸は、ＷａｔｓｏｎおよびＣｒｉｃｋまたはＨｏｏｇｓｔｅｅｎの塩基対合の規
則に従って設計され得る。アンチセンス核酸分子は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡ
のコード領域全体に相補的であり得るが、より好ましくは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍ
ＲＮＡのコード領域または非コード領域の一部にのみアンチセンスであるオリゴ
ヌクレオチドである。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＡＴＬＡＳ
−Ｘ ｍＲＮＡの翻訳開始部位を取り囲む領域に相補的であり得る。アンチセン
スオリゴヌクレオチドは、例えば、長さが約５、約１０、約１５、約２０、約２
５、約３０、約３５、約４０、約４５または約５０ヌクレオチドであり得る。本
発明のアンチセンス核酸は、当該分野で公知の手順を用いて、化学的合成または
酵素連結反応を用いて構築され得る。例えば、アンチセンス核酸（例えば、アン
チセンスオリゴヌクレオチド）は、天然に存在するヌクレオチド、またはこの分
子の生物学的安定性を増大させるように、もしくはアンチセンス核酸とセンス核
酸との間で形成される二重鎖の物理的安定性を増大させるように設計された種々
に改変されたヌクレオチドを用いて化学的に合成され得る（例えば、ホスホロチ
オエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチドが用いられ得る）。
【００７６】 アンチセンス核酸を作製するために用いられ得る改変されたヌクレオチドの例
としては以下が挙げられる：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−
クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセ
チルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシメチル）ウラシル、５−カルボキシ
メチルアミノメチル２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラ
シル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルクエオシン（ｇａｌａｃｔｏｓ
ｙｌｑｕｅｏｓｉｎｅ）、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチ
ルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデ
ニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−
アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキ
シアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルクエオシン（ｍａｎｎ
ｏｓｙｌｑｕｅｏｓｉｎｅ）、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−
メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル
−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン、シュードウラシル、クエオシン（
ｑｕｅｏｓｉｎｅ）、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−
チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ
酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオ
ウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（
ａｃｐ３）ｗ、および２，６−ジアミノプリン。あるいは、このアンチセンス核
酸は、核酸がアンチセンス方向でサブクローニングされた発現ベクターを用いて
生物学的に生成され得る（すなわち、挿入された核酸から転写されたＲＮＡは、
以下の小節にさらに記載される、目的の標的核酸に対してアンチセンス方向であ
る）。
【００７７】 本発明のアンチセンス核酸分子は、代表的には被験体に投与されるか、または
インサイチュで生成され、その結果それらは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコー
ドする細胞性ｍＲＮＡおよび／またはゲノムＤＮＡとハイブリダイズするか、ま
たはそれに結合し、それによってこのタンパク質の発現を、例えば転写および／
または翻訳を阻害することによって阻害する。ハイブリダイゼーションは、安定
な二重鎖を形成する従来のヌクレオチド相補性によってか、または例えばＤＮＡ
二重鎖に結合するアンチセンス核酸分子の場合には、二重らせんのメジャーグル
ーブ（ｍａｊｏｒ ｇｒｏｏｖｅ）における特異的相互作用を介してであり得る
。本発明のアンチセンス核酸分子の投与経路の例としては、組織部位での直接的
注射が挙げられる。あるいは、アンチセンス核酸分子は、選択された細胞を標的
化するように改変され得、次いで全身に投与される。例えば、全身投与のために
、アンチセンス分子は、それらが選択された細胞表面上に発現されたレセプター
または抗原に特異的に結合するように改変され得る。これは、例えば、そのアン
チセンス核酸分子を細胞表面レセプターまたは抗原に結合するペプチドまたは抗
体に連結することによる。このアンチセンス核酸分子はまた、本明細書中に記載
されるベクターを用いて細胞に送達され得る。アンチセンス分子の十分な細胞内
濃度を達成するために、アンチセンス核酸分子が強力なｐｏｌ ＩＩプロモータ
ーまたはｐｏｌ ＩＩＩプロモーターの制御下に置かれているベクター構築物が
、好ましい。
【００７８】 なお別の実施形態において、本発明のアンチセンス核酸分子は、α−アノマー
核酸分子である。α−アノマー核酸分子は、相補的ＲＮＡと特異的な二本鎖ハイ
ブリッドを形成する。ここで、通常のβ−ユニットとは対照的に、鎖は、互いに
平行に走行する（Ｇａｕｌｔｉｅｒら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ
Ｒｅｓ １５：６６２５〜６６４１）。このアンチセンス核酸分子はまた、２
’−ｏ−メチルリボヌクレオチド（Ｉｎｏｕｅら、（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ
Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ １５：６１３１〜６１４８）またはキメラＲＮＡ−ＤＮ
Ａアナログ（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ ２１５：３２７〜
３３０）を含み得る。
【００７９】 （リボザイムおよびＰＮＡ部分） 核酸改変体としては、非限定例として、糖リン酸骨格が改変または誘導体化さ
れている、改変した塩基および核酸が挙げられる。これらの改変体は、改変した
核酸の化学的な安定性を増強するために少なくとも一部で実施される。その結果
、この改変体は、例えば、被験体での治療適用において、アンチセンス結合核酸
として使用され得る。
【００８０】 一つの実施形態において、本発明のアンチセンス核酸はリボザイムである。リ
ボザイムは、一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ）を切断し得るリボヌクレアーゼ活
性を有する触媒性ＲＮＡ分子であり、これらは、その一本鎖核酸に対して相補領
域を有する。従って、リボザイム（例えば、ハンマーヘッド型リボザイム（Ｈａ
ｓｅｌｈｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ ３３４：５８
５〜５９１に記載される））を使用して、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡ転写物を触
媒的に切断し、それによってＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡの翻訳を阻害し得る。Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘをコードする核酸に特異性を有するリボザイムは、本明細書中に開
示されるＡＴＬＡＳ−Ｘ ＤＮＡのヌクレオチド配列（すなわち、配列番号１、
３、５、７、９、１０、１１、もしくは１２）に基づいて設計され得る。例えば
、活性部位のヌクレオチド配列が、ＡＴＬＡＳ−ＸをコードするｍＲＮＡ内で切
断されるヌクレオチド配列に相補的である、テトラヒメナＬ−１９ ＩＶＳ Ｒ
ＮＡの誘導体が構築され得る。例えば、Ｃｅｃｈら、米国特許第４，９８７，０
７１号；およびＣｅｃｈら、米国特許第５，１１６，７４２号を参照のこと。あ
るいは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡを使用して、ＲＮＡ分子のプールから、特異
的リボヌクレアーゼ活性を有する触媒性ＲＮＡを選択し得る。例えば、Ｂａｒｔ
ｅｌら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１：１４１１〜１４１８を参照のこと
。
【００８１】 あるいは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子発現は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの調節領域（例えば
、ＡＴＬＡＳ−Ｘのプロモーターおよび／またはエンハンサー）に相補的なヌク
レオチド配列を標的化し、標的細胞中でＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の転写を妨害する
三重らせん構造を形成することによって阻害され得る。一般には、Ｈｅｌｅｎｅ
．（１９９１）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓ．６：５６９〜８４；
Ｈｅｌｅｎｅら（１９９２）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６０：２７
〜３６；およびＭａｈｅｒ（１９９２）Ｂｉｏａｓｓａｙｓ １４：８０７〜１
５を参照のこと。
【００８２】 種々の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘの核酸は、塩基部分、糖部分または
リン酸骨格で改変され、例えば、その分子の安定性、ハイブリダイゼーションま
たは可溶性を改善し得る。例えば、核酸のデオキシリボースリン酸骨格を改変し
て、ペプチド核酸を生成し得る（Ｈｙｒｕｐら（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇ Ｍｅ
ｄ Ｃｈｅｍ ４：５〜２３を参照のこと）。本明細書中で使用される場合、用
語「ペプチド核酸」または「ＰＮＡ」は、デオキシリボースリン酸骨格が偽ペプ
チド骨格によって置換され、そして４つの天然の核塩基（ｎｕｃｌｅｏｂａｓｅ
）のみが保持されている核酸模倣物（例えば、ＤＮＡ模倣物）をいう。ＰＮＡの
中性の骨格は、低いイオン強度の条件下でＤＮＡおよびＲＮＡに対する特異的ハ
イブリダイゼーションを可能にすることが示されている。ＰＮＡオリゴマーの合
成は、上記のＨｙｒｕｐら（１９９６）；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら（１９
９６）ＰＮＡＳ ９３：１４６７０〜６７５において記載されるような標準的固
相ペプチド合成プロトコルを用いて行われ得る。
【００８３】 ＡＴＬＡＳ−ＸのＰＮＡは、治療的適用および診断的適用において使用され得
る。例えば、ＰＮＡは、例えば転写または翻訳の停止を誘導することまたは複製
を阻害することによる、遺伝子発現の配列特異的調節のためのアンチセンスまた
は抗遺伝子剤として使用され得る。ＡＴＬＡＳ−ＸのＰＮＡはまた、例えばＰＮ
Ａ指向性ＰＣＲクランピングによる遺伝子における一塩基対変異の分析において
；他の酵素（例えば、Ｓ１ヌクレアーゼ）と組み合わせて使用される場合の人工
制限酵素として（Ｈｙｒｕｐ Ｂ．（１９９６）上記）；またはＤＮＡ配列およ
びハイブリダイゼーションのプローブもしくはプライマーとして（Ｈｙｒｕｐら
（１９９６）上記；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅ（１９９６）、上記）、使用さ
れ得る。
【００８４】 別の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−ＸのＰＮＡは、例えば、それらの安定性
または細胞性取り込みを増強するために、ＰＮＡに脂溶性基または他のヘルパー
基を結合することによって、ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの形成によって、またはリポ
ソームもしくは当該分野において公知の薬物送達の他の技術の使用によって改変
され得る。例えば、ＰＮＡおよびＤＮＡの有利な特性を組合せ得る、ＡＴＬＡＳ
−ＸのＰＮＡ−ＤＮＡキメラが生成され得る。ＰＮＡ部分が高い結合親和性およ
び特異性を提供する一方で、そのようなキメラは、ＤＮＡ認識酵素（例えば、Ｒ
Ｎａｓｅ ＨおよびＤＮＡポリメラーゼ）がＤＮＡ部分と相互作用するのを可能
にする。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラは、塩基のスタッキング、核塩基間の結合数およ
び方向を考慮して選択される適切な長さのリンカーを使用して連結され得る（Ｈ
ｙｒｕｐ（１９９６）上記）。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの合成は、Ｈｙｒｕｐ（１
９９６）上記およびＦｉｎｎら（１９９６）Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ ２
４：３３５７〜６３において記載されるように行われ得る。例えば、ＤＮＡ鎖は
、標準的なホスホラミダイトカップリング化学を用いて固体支持体上で合成され
得、そして改変されたヌクレオシドアナログ（例えば、５’−（４−メトキシト
リチル）アミノ−５’−デオキシ−チミジンホスホルアミダイト）が、ＰＮＡと
ＤＮＡの５’末端との間に使用され得る（Ｍａｇら（１９８９）Ｎｕｃｌ Ａｃ
ｉｄ Ｒｅｓ １７：５９７３〜８８）。次いで、ＰＮＡモノマーが段階様式で
カップリングされ、５’ＰＮＡセグメントおよび３’ＤＮＡセグメントを有する
キメラ分子を生成する（Ｆｉｎｎら（１９９６）上記）。あるいは、５’ＤＮＡ
セグメントおよび３’ＰＮＡセグメントを用いて、キメラ分子が合成され得る。
Ｐｅｔｅｒｓｅｎら（１９７５）Ｂｉｏｏｒｇ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ Ｌｅｔｔ
５：１１１９〜１１１２４を参照のこと。
【００８５】 他の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下のような他の付属の基を
含み得る：ペプチド（例えば、インビボで宿主細胞レセプターを標的化するため
）、または細胞膜を横切る輸送を容易にする因子（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ
ら、１９８９、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８６：６
５５３〜６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、１９８７、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃ
ａｄ．Ｓｃｉ．８４：６４８〜６５２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０を
参照のこと）、または血液脳関門（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３
４を参照のこと）。さらに、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイゼーション誘
発切断剤（例えば、Ｋｒｏｌら、１９８８、ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：
９５８〜９７６を参照のこと）、またはインターカレーター剤（例えば、Ｚｏｎ
，１９８８、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．５：５３９〜５４９を参照のこと）で改変さ
れ得る。この目的のために、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチ
ド、ハイブリダイゼーション誘発架橋剤、輸送剤、ハイブリダイゼーション誘発
切断剤など）に結合され得る。
【００８６】 （ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドは、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドのアミ
ノ酸配列を含むポリペプチドを含み、この配列は、図１Ａ〜１Ｄ、２Ａ〜２Ｈ、
３Ａ〜３Ｂおよび４Ａ〜４Ｂ（配列番号２、４、６、および８）に提供される。
本発明はまた、なおそのＡＴＬＡＳ−Ｘ活性および生理学的機能を維持するタン
パク質、またはその機能的フラグメントをコードするが、その任意の残基が、図
１Ａ〜１Ｄ、２Ａ〜２Ｈ、３Ａ〜３Ｂ、または４Ａ〜４Ｂに示される対応する残
基から変化し得る、変異体または改変体タンパク質を含む。いくつかの実施形態
において、この変異体または改変体タンパク質において、２０％までまたはそれ
以上の残基がそのように変化され得る。
【００８７】 一般に、ＡＴＬＡＳ−Ｘ様機能を保持するＡＴＬＡＳ−Ｘ改変体は、配列中の
特定位置の残基が他のアミノ酸により置換され、そしてさらに、親タンパク質の
２つの残基間にさらなる残基を挿入する可能性、および親配列から１つ以上の残
基を欠失する可能性を含む。任意のアミノ酸置換、挿入または欠失が、本発明に
包含される。好適な状況では、この置換は、上記で規定されるような保存的置換
である。
【００８８】 本発明の１つの局面は、単離されたＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、およびその生
物学的に活性な部分、またはその誘導体、フラグメント、アナログもしくはホモ
ログに関する。抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体を惹起するための免疫原としての使用に適
するポリペプチドフラグメントもまた提供される。１つの実施形態では、ネイテ
ィブなＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が、標準的なタンパク質精製技法を用いる適切
な精製スキームにより、細胞または組織供給源から単離され得る。別の実施形態
では、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、組換えＤＮＡ技法により生産される。組換
え発現の代替えとして、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはポリペプチドは、標準
的なペプチド合成技法を用いて化学的に合成され得る。
【００８９】 「単離された」もしくは「精製された」タンパク質またはその生物学的に活性
な部分は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の由来する細胞または組織供給源由来の細
胞性物質または他の夾雑タンパク質を実質的に含まないか、あるいは化学合成さ
れる場合に化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない。用語「細胞性物
質を実質的に含まない」は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の調製物を含み、この調
製物において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が単離または組換え産生される細胞の
細胞性成分から、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は分離されている。１つの実施形態
において、用語「細胞性物質を実質的に含まない」は、非ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパ
ク質（本明細書中において「夾雑タンパク質」とも呼ばれる）を約３０％未満（
乾燥重量にて）、より好ましくは非ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を約２０％未満、
なおより好ましくは非ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を約１０％未満、そして最も好
ましくは非ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を約５％未満有する、ＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質の調製物を含む。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な
部分が組換え産生される場合、好ましくは、調製物はまた培養培地を実質的に含
まない。すなわち、培養培地は、そのタンパク質調製物の容量の約２０％未満、
より好ましくは約１０％未満、そして最も好ましくは約５％未満を示す。
【００９０】 用語「化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」は、タンパク質が
、そのタンパク質の合成に関与する化学前駆体または他の化学物質から分離され
ているＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の調製物を含む。１つの実施形態において、用
語「化学前駆体または他の化学物質を実質的に含まない」は、化学前駆体または
非ＡＴＬＡＳ−Ｘの化学物質を約３０％未満（乾燥重量にて）、より好ましくは
化学前駆体または非ＡＴＬＡＳ−Ｘ化学物質を約２０％未満、なおより好ましく
は化学前駆体または非ＡＴＬＡＳ−Ｘ化学物質を約１０％未満、そして最も好ま
しくは化学前駆体または非ＡＴＬＡＳ−Ｘ化学物質を約５％未満有する、ＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質の調製物を含む。
【００９１】 ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の生物学的に活性な部分は、全長ＡＴＬＡＳ−Ｘタ
ンパク質より少ないアミノ酸を含み、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の少なく
とも１つの活性を示す、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のアミノ酸配列（例えば、配
列番号２、４、５、または８に示されるアミノ酸配列）に十分に相同なアミノ酸
配列、またはＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のアミノ酸配列に由来するアミノ酸配列
を含むペプチドを含む。代表的には、生物学的に活性な部分は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質の少なくとも１つの活性を有するドメインまたはモチーフを含む。Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の生物学的に活性な部分は、例えば、長さが１０、２５
、５０、１００またはそれより多いアミノ酸であるポリペプチドであり得る。
【００９２】 さらに、タンパク質の他の領域が欠失している他の生物学的に活性な部分は、
組換え技術によって調製され得、そしてネイティブなＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質
の機能的活性のうちの１つ以上について評価され得る。
【００９３】 １つの実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、配列番号２、４、６
、または８に示されるアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質は、配列番号２、４、６、または８に実質的に相同であり、そ
して以下に詳細に議論されるように、天然の対立遺伝子改変体または変異誘発に
起因してアミノ酸配列が異なるが、配列番号２、４、６、または８のタンパク質
の機能的活性を保持する。従って、別の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質は、配列番号２、４、６、または８のアミノ酸配列に少なくとも約４５％
相同なアミノ酸配列を含み、そして、配列番号２、４、６、または８のＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質の機能的活性を保持するタンパク質である。
【００９４】 （２つ以上の配列間の相同性の決定） ２つのアミノ酸配列または２つの核酸の相同性の百分率を決定するために、配
列は、至適な比較の目的のために整列される（例えば、ギャップは、第２アミノ
酸配列または核酸配列を用いて、最適な整列の第１アミノ酸の配列または核酸配
列に導入され得る）。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置で
のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第１の配列中の位置が、第２
の配列中の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められる場
合、分子はその位置で相同である（すなわち、本明細書中で使用される場合、ア
ミノ酸または核酸の「相同性」は、アミノ酸または核酸の「同一性」と等価であ
る）。
【００９５】 核酸配列の相同性は、２つの配列間の同一性の程度として決定され得る。相同
性は、当該分野において公知のコンピュータープログラム（例えば、ＧＣＧプロ
グラムパッケージにおいて提供されるＧＡＰソフトウェア）を用いて決定され得
る。ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ １９７０ Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ
４８：４４３〜４５３を参照のこと。核酸配列比較のための以下の設定（ＧＡ
Ｐ作製ペナルティー、５．０、およびＧＡＰ伸長ペナルティー、０．３）を用い
てＧＣＧ ＧＡＰソフトウェアを使用すると、上記で言及される類似の核酸配列
のコード領域は、配列番号１ヌクレオチド１〜２５８６、配列番号３のヌクレオ
チド１〜５５５３、配列番号５のヌクレオチド９８〜９０４、または配列番号７
のヌクレオチド１〜１０７４に対応するＤＮＡ配列のＣＤＳ（コード）部分と、
好ましくは少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくと
も８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少な
くとも９９％の同一性の程度を示す。
【００９６】 用語「配列同一性」は、２つのポリヌクレオチド配列またはポリペプチド配列
が、特定の比較領域にわたって、残基毎を基準として同一である程度をいう。用
語「配列同一性のパーセンテージ」は、以下により算出される：この比較領域に
わたって最適に整列された２つの配列を比較すること、両方の配列において同一
の核酸塩基（例えば、核酸の場合にはＡ、Ｔ、Ｃ、Ｇ、Ｕ、またはＩ）が存在す
る位置の数を決定し、一致した位置の数を導くこと、この一致した位置の数を、
比較領域の内の位置の総数（すなわち、ウインドウサイズ）で除算すること、お
よびその結果を１００で乗算して、配列同一性のパーセンテージを導くこと。用
語「実質的な同一性」は、本明細書中で使用される場合、ポリヌクレオチド配列
の特徴を示し、ここでこのポリヌクレオチドは、比較領域にわたり参照配列と比
較して、少なくとも８０％の配列同一性、好ましくは少なくとも８５％の配列同
一性、そして頻繁には９０〜９５％の配列同一性、より通常には少なくとも９９
％の配列同一性を有する配列を含む。
【００９７】 （キメラタンパク質および融合タンパク質） 本発明はまた、ＡＴＬＡＳ−Ｘキメラタンパク質または融合タンパク質を提供
する。本明細書中で使用される場合、ＡＴＬＡＳ−Ｘ「キメラタンパク質」また
はＡＴＬＡＳ−Ｘ「融合タンパク質」は、非ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドに作動
可能に連結された、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドを含む。「ＡＴＬＡＳ−Ｘポリ
ペプチド」は、ＡＴＬＡＳ−Ｘに対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドを
いうが、「非ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド」は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質に対
して実質的に相同ではないタンパク質（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質とは
異なり、かつ同一でかまたは異なる生物体に由来するタンパク質）に対応するア
ミノ酸配列を有するポリペプチドをいう。ＡＴＬＡＳ−Ｘ融合タンパク質におい
て、このＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のすべてま
たは一部分に対応し得る。１つの実施形態では、ＡＴＬＡＳ−Ｘ融合タンパク質
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の少なくとも１つの生物学的に活性な部分を含む
。別の実施形態では、ＡＴＬＡＳ−Ｘ融合タンパク質は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパ
ク質の少なくとも２つの生物学的に活性な部分を含む。融合タンパク質において
、用語「作動可能に連結された」は、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドおよび非ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘポリペプチドが、インフレームで互いに融合されていることを示すこ
とが意図される。非ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドは、ＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチ
ドのＮ末端またはＣ末端に融合され得る。
【００９８】 １つの実施形態では、この融合タンパク質は、ＧＳＴ−ＡＴＬＡＳ−Ｘ融合タ
ンパク質であり、ＡＴＬＡＳ−Ｘ配列は、ＧＳＴ（すなわち、グルタチオンＳ−
トランスフェラーゼ）配列のＣ−末端に融合される。このような融合タンパク質
は、組換えＡＴＬＡＳ−Ｘの精製を容易にし得る。
【００９９】 別の実施形態においては、この融合タンパク質は、Ｎ末端に非相同性シグナル
配列を含む、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質である。例えば、ネイティブＡＴＬＡＳ
−４シグナル配列（すなわち、配列番号８のアミノ酸約１〜２８）は、除去され
、そして別のタンパク質由来のシグナル配列で置換され得る。特定の宿主（例え
ば、哺乳動物の宿主細胞）において、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現および／または分泌
は、非相同性シグナル配列の使用を通じて増強され得る。
【０１００】 なお別の実施形態においては、この融合タンパク質は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ−免疫
グロブリン融合タンパク質であり、ここではＡＴＬＡＳ−Ｘ配列が、免疫グロブ
リンタンパク質ファミリーのメンバーに由来する配列に融合される。本発明のこ
のＡＴＬＡＳ−Ｘ−免疫グロブリン融合タンパク質は、薬学的組成物中に取り込
まれ、そして被験体に投与されて、細胞の表面上でＡＴＬＡＳ−ＸリガントとＡ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質との間の相互作用を阻害し、それによってインビボのＡ
ＴＬＡＳ−Ｘ媒介信号伝達を抑制し得る。このＡＴＬＡＳ−Ｘ−免疫グロブリン
融合タンパク質を用い、ＡＴＬＡＳ−Ｘ同族リガンドの生体利用性に影響を与え
得る。ＡＴＬＡＳ−Ｘリガンド／ＡＴＬＡＳ−Ｘ相互作用の阻害は、増殖障害お
よび分化障害の両方の処置、および細胞生存を調節（例えば、促進または阻害）
に、治療的に有用であり得る。さらに、本発明のこのＡＴＬＡＳ−Ｘ−免疫グロ
ブリン融合タンパク質は、被験体中で抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体を産生するための免
疫原として用いられ得、ＡＴＬＡＳ−Ｘリガンドを精製し、そしてＡＴＬＡＳ−
ＸリガンドとのＡＴＬＡＳ−Ｘの相互作用を阻害する分子を同定するスクリーニ
ングアッセイで用いられ得る。
【０１０１】 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘキメラまたは融合タンパク質は、標準的な組換えＤＮ
Ａ技法により産生され得る。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮ
Ａフラグメントを、従来の技法に従って、例えば、連結のための平滑末端または
粘着（ｓｔａｇｇｅｒ）末端、適切な末端を提供するための制限酵素消化、必要
に応じて粘着（ｃｏｈｅｓｉｖｅ）末端の平滑化、所望しない連結を避けるため
のアルカリホスファターゼ処理、および酵素的連結を採用することにより、イン
フレームで一緒に連結する。別の実施形態では、融合遺伝子を、自動化ＤＮＡ合
成機を含む従来技法により合成し得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ
増幅を、キメラ遺伝子配列を生成するために次いでアニールおよび再増幅され得
る、２つの連続遺伝子フラグメント間の相補的オーバハングを生じるアンカープ
ライマーを用いて実施し得る（例えば、Ａｕｓｂｅｌら（編）ＣＵＲＲＥＮＴ
ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ ＢＩＯＬＯＧＹ、Ｊｏｈｎ
Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、１９９２を参照のこと）。さらに、融合成分（例えば、
ＧＳＴポリペプチド）をすでにコードした多くの発現ベクターが市販されている
。ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする核酸は、この融合成分がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク
質にインフレーム連結されるように、このような発現ベクター中にクローン化さ
れ得る。
【０１０２】 （ＡＴＬＡＳ−Ｘアゴニストおよびアンタゴニスト） 本発明はまた、ＡＴＬＡＳ−Ｘアゴニスト（模倣物）として、またはＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘアンタゴニストとして機能するＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の改変体に関す
る。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の改変体、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の
離散した点変異または短縮型が、変異誘発により生成され得る。ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質のアゴニストは、天然に存在する形態のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質と
実質的に同じ生物学的活性、またはその生物学的活性のサブセットを保持し得る
。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のアンタゴニストは、天然に存在する形態のＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質の１つ以上の活性を、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を
含む細胞シグナル伝達カスケードの下流または上流メンバーに競合的に結合する
ことにより阻害し得る。従って、特異的生物学的効果が、限られた機能の改変体
を用いた処理により惹起され得る。１つの実施形態では、このタンパク質の天然
に存在する形態の生物学活性のサブセットを有する改変体を用いた被験体の処置
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の天然に存在する形態を用いた処置に対して被験
体におけるより少ない副作用を有する。
【０１０３】 ＡＴＬＡＳ−Ｘアゴニスト（模倣物）として、またはＡＴＬＡＳ−Ｘアンタゴ
ニストのいずれかとして機能するＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の改変体は、ＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質アゴニストまたはアンタゴニスト活性のためのＡＴＬＡＳ−
Ｘタンパク質の変異体、例えば短縮型変異体のコンビナトリアルライブラリーを
スクリーニングすることにより同定され得る。１つの実施形態では、ＡＴＬＡＳ
−Ｘ改変体の多彩なライブラリーは、核酸レベルのコンビナトリアル変異誘発に
より生成され、そして多彩な遺伝子ライブラリーによりコードされる。ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘ改変体の多彩なライブラリーは、例えば、合成オリゴヌクレオチドの混合
物を、潜在的なＡＴＬＡＳ−Ｘ配列の縮重セットが、個々のポリペプチドとして
、あるいは、その中にＡＴＬＡＳ−Ｘ配列のセットを含む（例えば、ファージデ
ィスプレイのための）より大きな融合タンパク質のセットとして発現可能である
ように、遺伝子配列に酵素的に連結することにより産生され得る。縮重オリゴヌ
クレオチド配列から潜在的なＡＴＬＡＳ−Ｘ改変体のライブラリーを産生するた
めに用いられ得る種々の方法がある。縮重遺伝子配列の化学的合成は、自動化Ｄ
ＮＡ合成機中で実施され得、次いでこの合成遺伝子は、適切な発現ベクター中に
連結される。遺伝子の縮重セットの使用は、１つの混合物において、潜在的なＡ
ＴＬＡＳ−Ｘ配列の所望のセットをコードする配列のすべての供給を可能にする
。縮重オリゴヌクレオチドを合成する方法は当該分野で公知である（例えば、Ｎ
ａｒａｎｇ（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ ３９：３；Ｉｔａｋｕｒａら
（１９８４）Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｂｉｏｃｈｅｍ ５３：３２３；Ｉｔａｋｕｒ
ａら（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ １９８：１０５６；Ｉｋｅら（１９８３）Ｎ
ｕｃｌ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ １１：４７７を参照のこと）。
【０１０４】 （ポリペプチドライブラリー） さらに、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質コード配列のフラグメントのライブラリー
を用いて、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の改変体のスクリーニングおよび引き続く
選択のためのＡＴＬＡＳ−Ｘフラグメントの多彩な集団を生成し得る。１つの実
施形態では、コード配列フラグメントのライブラリーは、ＡＴＬＡＳ−Ｘコード
配列の二本鎖ＰＣＲフラグメントを、１分子あたり約１つのみのニックが生じる
条件下、ヌクレアーゼで処理すること、二本鎖ＤＮＡを変性させること、異なる
ニック産物からのセンス／アンチセンス対を含み得る二本鎖ＤＮＡを形成するた
めにこのＤＮＡを再生すること、Ｓ１ヌクレアーゼを用いた処理により再形成さ
れた二本鎖から一本鎖部分を除去すること、および得られるフラグメントライブ
ラリーを発現ベクター中に連結することにより生成し得る。この方法により、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の種々のサイズのＮ末端および内部フラグメントをコー
ドする発現ライブラリーが派生し得る。
【０１０５】 点変異または短縮により作成されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産
物をスクリーニングするため、選択された性質を有する遺伝子産物のｃＤＮＡラ
イブラリーをスクリーニングするためのいくつかの技法が当該分野で公知である
。このような技法を、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のコンビナトリアル変異誘発に
より生成された遺伝子ライブラリーの迅速スクリーニングに適用可能である。大
きな遺伝子ライブラリーをスクリーニングするための、高スループット分析に適
した最も広く用いられる技法は、代表的には、遺伝子ライブラリーを複製可能な
発現ベクター中にクローニングすること、得られるベクターのライブラリーで適
切な細胞を形質転換すること、およびこのコンビナトリアル遺伝子を、所望の活
性の検出が、その産物が検出された遺伝子をコードするベクターの単離を容易に
する条件下で発現することを含む。ライブラリー中の機能的変異体の頻度を増大
する新規技法であるリクルーシブエンセブル変異誘発（ＲＥＭ）を、スクリーニ
ングアッセイと組み合わせて用い、ＡＴＬＡＳ−Ｘ改変体を同定し得る（Ａｒｋ
ｉｎおよびＹｏｕｒｖａｎ（１９９２）ＰＮＡＳ ８９：７８１１−７８１５；
Ｄｅｌｇｒａｖｅら（１９９３）Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ６
：３２７−３３１）。
【０１０６】 （抗−ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体） 本発明は、例えば、本発明のポリペプチドの任意に対して免疫特異的に結合す
るＦａｂまたは（Ｆａｂ）2のような抗体および抗体フラグメントを含む。
【０１０７】 単離されたＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはそれらの部分もしくはフラグメ
ントが、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体調製のための標準技術を使用
して、ＡＴＬＡＳ−Ｘに結合する抗体を生成するために免疫原として用いられ得
る。全長のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が用いられ得るか、あるいは本発明は、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘの抗原性のペプチドフラグメントを免疫原としての用途のために提
供する。ＡＴＬＡＳ−Ｘの抗原性のペプチドは、配列番号２、４、６、または８
に示されるアミノ酸配列の少なくとも４つのアミノ酸残基を含み、そしてＡＴＬ
ＡＳ−Ｘのエピトープを包含し、これによりこのペプチドに対して惹起された抗
体は、ＡＴＬＡＳ−Ｘとの特異的な免疫複合体を形成する。好ましくは、抗原性
のペプチドは、少なくとも６、８、１０、１５、２０、２０、または３０のアミ
ノ酸残基を含む。より長い抗原ペプチドは、使用に依存して、そして当業者に周
知の方法に従って、時々、より短い抗原ペプチドが好ましい。
【０１０８】 本発明の特定の実施形態では、抗原性ペプチドにより包含される少なくとも１
つのエピトープは、タンパク質の表面上に位置するＡＴＬＡＳ−Ｘの領域、例え
ば、親水性領域である。抗体産生を標的にする手段として、親水性および疎水性
の領域を示すヒドロパシープロットを、例えば、フーリエ変換とともにまたはな
しの、Ｋｙｔｅ ＤｏｏｌｉｔｔｌｅまたはＨｏｐｐ Ｗｏｏｄｓ法を含む、当
該分野で周知の任意の方法により生成し得る。例えば、それらの全体が本明細書
に参考として援用される、ＨｏｐｐおよびＷｏｏｄｓ、１９８１、Ｐｒｏｃ．Ｎ
ａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７８：３８２４−３８２８；Ｋｙｔｅおよび
Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅ １９８２、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５７：１０５−１４
２を参照のこと。
【０１０９】 本願明細書において開示されるように、配列番号２、４、６、８のＡＴＬＡＳ
−Ｘタンパク質配列、またはそれらの誘導体、フラグメント、アナログもしくは
ホモログは、これらのタンパク質成分に免疫特異的に結合する抗体の生成におい
て、免疫原として利用され得る。本願明細書において用いられる場合、用語「抗
体」は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分
（すなわち、抗原に特異的に結合する（これと免疫反応する）抗原結合部位を含
む分子）（例えばＡＴＬＡＳ−Ｘ）をいう。このような抗体としては、ポリクロ
ーナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、単鎖抗体、ＦabおよびＦ(ab')2 フラグメント、ならびにＦab発現ライブラリーが挙げられるがこれらに限定され
ない。特定の実施形態において、ヒトＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質に対する抗体が
、開示される。当該分野で公知の種々の手順が、配列番号２、４、６、８のＡＴ
ＬＡＳ−Ｘタンパク質配列、あるいはそれらの誘導体、フラグメント、アナログ
またはホモログに対するポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体の生産の
ために用いられ得る。これらのタンパク質のいくつかは、以下で議論される。
【０１１０】 ポリクローナル抗体の生成のため、種々の適切な宿主動物（例えば、ウサギ、
ヤギ、マウスまたは他の哺乳動物）がネイティブタンパク質もしくはそれの合成
改変体、またはそれらの誘導体を用いる注射によって免疫され得る。適切な免疫
原性調製物は、例え、ば組換え的に発現されたＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、また
は化学的に合成されたＡＴＬＡＳ−Ｘポリペチドを含み得る。調製物は、アジュ
バントをさらに含み得る。免疫学的応答を増加するために用いられる種々のアジ
ュバントとしては以下が挙げられるがこれらに限定されない：フロイント（完全
および不完全）アジュバント、鉱物ゲル（例えば、水酸化アルミニウム）アジュ
バント、界面活性物質（例えば、リゾレシチン、プルロニック（ｐｌｕｒｏｎｉ
ｃ）ポリオール、ポリアニオン、ペプチド、オイルエマルジョン、ジニトロフェ
ノール、など）、ヒトジュバント（例えば、Ｂａｃｉｌｌｅ Ｃａｌｍｅｔｔｅ
−ＧｕｅｒｉｎおよびＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐａｒｖｕｍ）または
類似した免疫刺激因子。所望の場合、ＡＴＬＡＳ−Ｘに対する抗体分子が、哺乳
動物（例えば、血液から）単離され得、そしてさらに、プロテインＡクロマトグ
ラフィーのような周知の技術によって精製され、ＩｇＧ画分を獲得し得る。
【０１１１】 本願明細書において用いられる場合、用語「モノクローナル抗体」または「モ
ノクローナル抗体組成物」とは、ＡＴＬＡＳ−Ｘの特定のエピトープと免疫反応
し得る抗原結合部位の１つの種のみを含む抗体分子の集団をいう。従って、モノ
クローナル抗体組成物は、代表的には、特に、それが免疫反応する、特定のＡＴ
ＬＡＳ−Ｘタンパク質に対して、単一の結合親和性を示す。特にＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質、またはそれらの誘導体、フラグメント、アナログ、もしくはホモロ
グに対するモノクローナル抗体の調製のために、連続的細胞株培養により抗体分
子の生成を提供する任意の技術が利用され得る。このような技術としては以下が
挙げられるがこれらに限定されない：ハイブリドーマ技術（Ｋｏｈｌｅｒおよび
Ｍｉｌｓｔｅｉｎ、１９７５ Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５〜４９７を参照の
こと）；トリオーマ技術；ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂｏｒら、１
９８３ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ ４：７２を参照のこと）およびヒトモノ
クローナル抗体を生産するＥＢＶハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅら、１９８５
ＭＯＮＯＣＬＯＮＡＬ ＡＮＴＩＢＯＤＩＥＳ ＡＮＤ ＣＡＮＣＥＲ ＴＨＥ
ＲＡＰＹ、Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，第７７〜９６頁を参照のこと）
。ヒトモノクローナル抗体は、本発明の実行において利用され得、ヒトハイブリ
ドーマを用いること（Ｃｏｔｅら、１９８３．Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ
Ｓｃｉ ＵＳＡ ８０：２０２６〜２０３０を参照のこと）、またはエプスタイ
ンバーウイルスを用いるインビトロでのヒトＢ細胞の形質転換（Ｃｏｌｅら、１
９８５：ＭＯＮＯＣＬＯＮＡＬ ＡＮＴＩＢＯＤＩＥＳ ＡＮＤ ＣＡＮＣＥＲ
ＴＨＥＲＡＰＹ、Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，第７７〜９６頁を参照
のこと）によって生成され得る。上記引用例の各々は、本明細書中でその全体が
参照として援用される。
【０１１２】 本発明に従って、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質に特異的な単鎖抗体の生成のため
に、技術は適応され得る（例えば、米国特許第４，９４６，７７８号を参照のこ
と）。さらに、方法論はＦab発現ライブラリーの構築に適応され（例えば、Ｈｕ
ｓｅら、１９８９ Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４６：１２７５〜１２８１を参照のこと
）、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはそれらの誘導体、フラグメント、アナロ
グ、もしくはホモログに対して所望の特性を有するモノクローナルＦabフラグメ
ントの迅速かつ効果的同定を可能にする。非ヒト抗体は、当該分野で周知の技術
により「ヒト化」され得る。例えば、米国特許第５，２２５，５３９号を参照の
こと。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質に対するイディオタイプを含む抗体フラグメン
トは、以下を含むがこれに限定されない当該分野で公知の技術により生成され得
る：（ｉ）抗体分子のペプシン消化によって生産されるＦ(ab')2フラグメント；
（ｉｉ）Ｆ(ab')2フラグメントのジスルフィド架橋を還元することによって生じ
るＦabフラグメント；（ｉｉｉ）パパインおよび還元剤での抗体分子の処理によ
って生じるＦabフラグメント、ならびに（ｉｖ）Ｆvフラグメント。
【０１１３】 さらに、ヒトおよび非ヒト部分の両方を含むキメラ抗体およびヒト化モノクロ
ーナル抗体のような、組換えの抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体（これらは、標準組換えＤ
ＮＡ技術を用いて作製され得る）は、本発明の範囲内である。このようなキメラ
抗体およびヒト化モノクローナル抗体は、当該分野で公知の組換えＤＮＡ技術に
より生成され得る。この技術は例えば、以下に記載の方法を用いる：ＰＣＴ国際
出願番号ＰＣＴ／ＵＳ８６／０２２６９；欧州特許出願番号１８４，１８７号；
欧州特許出願番号１７１，４９６；欧州特許出願番号１７３、４９４；ＰＣＴ国
際公開番号ＷＯ ８６／０１５３３；米国特許第４，８１６，５６７号；欧州特
許出願番号１２５，０２３号；Ｂｅｔｔｅｒら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２
４０：１０４１〜１０４３；Ｌｉｕら（１９８７）ＰＮＡＳ ８４：３４３９〜
３４４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３９：３５２１〜３５
２６；Ｓｕｎら（１９８７）ＰＮＡＳ ８４：２１４〜２１８；Ｎｉｓｈｉｍｕ
ｒａら（１９８７）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ４７：９９９〜１００５；Ｗｏｏｄ
ら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ ３１４：４４６〜４４９；Ｓｈａｗら（１９８８
）Ｊ Ｎａｔｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ ８０：１５５３〜１５５９）；Ｍｏ
ｒｒｉｓｏｎ（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：１２０２〜１２０７；Ｏｉ
ら（１９８６）ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ４：２１４；米国特許第５，２２
５，５３９号；Ｊｏｎｅｓら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５５２〜５２
５；Ｖｅｒｈｏｅｙａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９：１５３４；な
らびにＢｅｉｄｌｅｒら（１９８８）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４１：４０５３〜
４０６０。上記引用例の各々は、本明細書中でその全体が参照として援用される
。
【０１１４】 １つの実施形態において、所望の特異性を保有する抗体のスクリーニングのた
めの方法論は、当該分野内で公知の酵素結合抗体免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ
）および他の免疫学的に媒介された技術を含むが、これに限定されない。特定の
実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の特定のドメインに対して特異的
である抗体の選抜は、このようなドメインを所有しているＡＴＬＡＳ−Ｘタンパ
ク質のフラグメントに結合するハイブリドーマの生成により容易にされる。ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはそれらの誘導体、フラグメント、アナログまたは
ホモログがそれについてまたの内部のドメインについて特異的である抗体がまた
、本願明細書において提供される。
【０１１５】 抗−ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の局在化および／また
は定量化に関する当該分野で公知の方法において用いられ得る（例えば、適切な
生理学的なサンプル内のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のレベルを測定際の使用のた
めに、診断的方法における使用のために、タンパク質の画像化における使用のた
めに、など）。所定の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはそ
れらの誘導体、フラグメント、アナログまたはホモログの抗体（抗体由来の結合
ドメインを含む）は、薬理学的に活性な化合物［本明細書中、以降において「治
療剤」］として利用される。
【０１１６】 抗−ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体（例えば、モノクローナル抗体）は、標準技術（例え
ばアフィニティークロマトグラフィまたは免疫沈降）によって、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
を単離するために用いられ得る。抗−ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体は、細胞からの天然の
ＡＴＬＡＳ−Ｘ、そして宿主細胞において発現される組換え的に産生されたＡＴ
ＬＡＳ−Ｘの精製を容易にし得る。さらに、抗ＡＴＬＡＳ−Ｘの抗体が、（例え
ば、細胞の溶菌液または細胞上清における）ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を検出す
るために用いられＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の発現の量およびパターンを評価し
得る。抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体は、例えば、所定の治療レジメンの有効性を決定す
るために、臨床試験の手順の一部として組織におけるタンパク質レベルを診断的
にモニターするために用いられ得る。検出は、抗体を検出可能物質に連結する（
すなわち、（物理的に連結する）ことにより容易になり得る。検出可能物質の例
としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光材料、生物発光材料および
放射性物質が挙げられる。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダー
ゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエス
テラーゼが挙げられる；適切な補欠分子族複合体の例としては、ストレプトアビ
ジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられる；適切な蛍光物質の例と
しては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネー
ト、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミン（ｄｉｃｈｌｏｒｏｔｒｉａｚｉ
ｎｙｌａｍｉｎｅ）フルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリン
が挙げられる；発光材料の例としては、ルミノールが挙げられる；生物発光材料
の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられる；
そして、適切な放射性物質の例としては125Ｉ、131Ｉ、35Ｓまたは3Ｈが挙げら
れる。
【０１１７】 （ＡＴＬＡＳ−Ｘの組換え発現ベクターおよび宿主細胞） 本発明の別の局面はＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはそれらの誘導体、フラ
グメント、アナログ、もしくはホモログをコードする核酸を含むベクター、好ま
しくは発現ベクターに関する。本明細書中で使用される場合、用語「ベクター」
は、これが接続された別の核酸を輸送し得る核酸分子をいう。ベクターの１つの
型は「プラスミド」であり、これはさらなるＤＮＡセグメントが連結し得る環状
の二本鎖ＤＮＡループをいう。ベクターの別の型はウイルス性ベクターであり、
ここでさらなるＤＮＡセグメントはこのウイルス性ゲノムに連結され得る。特定
のベクターは宿主細胞中で自発的に複製し得、この中に導入される（例えば、細
菌の複製起源を有する細菌ベクターおよびエピソームの哺乳類ベクター）。他の
ベクター（例えば、非エピソーム哺乳類ベクター）は、宿主細胞に導入される際
に宿主細胞のゲノムに組み込まれ、そしてこれによって宿主のゲノムと同調して
複製される。さらに、特定のベクターは、これが作動可能に連結される遺伝子の
発現を指向し得る。このようなベクターは、本明細書中で「発現ベクター」とい
われる。一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、しばしばプ
ラスミドの形態である。本明細書において、「プラスミド」および「ベクター」
は、このプラスミドはベクターの最も一般的に使用される形態であるため、交換
可能に使用され得る。しかし、本発明は、ウイルス性ベクター（例えば、複製欠
損レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス）のような発現ベ
クターのこのような他の形態を含むことを意図し、これは等価な機能を果たす。
【０１１８】 本発明の組換え発現ベクターは、宿主細胞における核酸の発現に適切な形態の
本発明の核酸を含む。これは、組換え発現ベクターが、発現されるべき核酸配列
に作動可能に連結されている、発現に用いられるべき宿主細胞に基づいて選択さ
れる、１つ以上の調節配列を含むことを意味する。組換え発現ベクター内で、「
作動可能に連結する」とは、目的のヌクレオチド配列が、（例えば、インビトロ
の転写／翻訳系において、またはベクターが宿主細胞に導入される場合は、宿主
細胞において）ヌクレオチド配列の発現を可能にする様式で調節配列に連結され
るという意味を意図する。用語「調節配列」は、プロモーター、エンハンサーお
よび他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を含むことを
意図する。このような調節配列は、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ；ＧＥＮＥ ＥＸＰ
ＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯ
ＬＯＧＹ １８５、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、Ｃａ
ｌｉｆ．（１９９０）に記載されている。調節配列は、多くの型の宿主細胞にお
いてヌクレオチド配列の構成的発現を指向する配列、および特定の宿主細胞のみ
においてヌクレオチド配列の発現を指向する配列（例えば、組織特異的調節配列
）を含む。発現ベクターの設計が形質転換されるべき宿主細胞の選択、所望のタ
ンパク質の発現のレベルなどのような因子に依存し得ることは当業者には明白で
ある。本発明の発現ベクターは、宿主細胞に導入され得、それにより、本明細書
に記載される核酸によりコードされるタンパク質またはペプチド（融合タンパク
質またはペプチドを含む）（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはＡＴＬ
ＡＳ−Ｘの変異形態、融合タンパク質など）を生成し得る。
【０１１９】 本発明の組換え発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞における、
ＡＴＬＡＳ−Ｘ発現のために設計され得る。例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘは、細菌細
胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞（バキュロウイルス発現ベクターを用い
る）、酵母細胞または哺乳動物細胞において発現され得る。適切な宿主細胞は、
Ｇｏｅｄｄｅｌ；ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：Ｍ
ＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ １８５、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒ
ｅｓｓ、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ．（１９９０）にさらに考察されてい
る。あるいは、組換え発現ベクターは、例えば、Ｔ７プロモーター調節配列およ
びＴ７ポリメラーゼを用いて、インビトロで転写および翻訳され得る。
【０１２０】 原核生物におけるタンパク質の発現は、最も頻繁には、融合タンパク質または
非融合タンパク質のいずれかの発現を指向する構成的プロモーターまたは誘導性
プロモーターを含むベクターを有するＥ．ｃｏｌｉにおいて実行される。融合ベ
クターは、そこにコードされるタンパク質に、通常、組換えタンパク質のアミノ
末端に、多数のアミノ酸を付加する。このような融合ベクターは、代表的には、
以下の３つの目的のために役立つ：（１）組換えタンパク質の発現を増加させる
こと；（２）組換えタンパク質の可溶性を増加させること；および（３）アフィ
ニティー精製においてリガンドとして作用することによって組換えタンパク質の
精製の際に補助すること。しばしば、融合発現ベクターにおいて、タンパク質分
解の切断部位が、融合部分と組換えタンパク質との結合部に導入され、融合タン
パク質の精製の後に融合部分から組換えタンパク質を分離することが可能になる
。このような酵素、およびその同族の認識配列は、第Ｘａ因子、トロンビン、お
よびエンテロキナーゼを含む。代表的な融合発現ベクターとしては、グルタチオ
ンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、またはプ
ロテインＡを、それぞれ、標的の組換えタンパク質に融合するｐＧＥＸ（Ｐｈａ
ｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔｅｃｈ Ｉｎｃ．；Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｊｏｈｎｓｏ
ｎ（１９８８）Ｇｅｎｅ ６７：３１−４０）、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａ
ｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，Ｍａｓｓ．）およびｐＲＩＴ５（Ｐｈ
ａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，Ｎ．Ｊ．）が挙げられる。
【０１２１】 適切な誘導性非融合Ｅ．ｃｏｌｉ発現ベクターの例には、ｐＴｒｃ（Ａｍｒａ
ｎｎら（１９８８）Ｇｅｎｅ ６９：３０１−３１５）およびｐＥＴ １１ｄ（
Ｓｔｕｄｉｅｒら、ＧＥＮＥ ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：
ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐ
ｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．（１９９０）６０−８９）が挙げ
られる。
【０１２２】 Ｅ．ｃｏｌｉにおける組換えタンパク質発現を最大化するための１つのストラ
テジーは、組換えタンパク質をタンパク質分解的に切断する能力が損なわれた宿
主細菌中でタンパク質を発現することである。Ｇｏｔｔｅｓｍａｎ，ＧＥＮＥ
ＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮ ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ：ＭＥＴＨＯＤＳ ＩＮ ＥＮＺ
ＹＭＯＬＯＧＹ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ
，Ｃａｌｉｆ．（１９９０）１１９−１２８を参照のこと。別のストラテジーは
、各アミノ酸についての個々のコドンが、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて優先的に利用さ
れるコドンであるように発現ベクターに挿入される核酸の核酸配列を変更するこ
とである（Ｗａｄａら（１９９２）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２０
：２１１１−２１１８）。本発明のこのような核酸配列の変更は、標準的なＤＮ
Ａ合成技術によって実行され得る。
【０１２３】 別の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘ発現ベクターは、酵母発現ベクターで
ある。酵母Ｓ．ｃｅｒｉｖｉｓａｅにおける発現のためのベクターの例には、ｐ
ＹｅｐＳｅｃ１（Ｂａｌｄａｒｉら、（１９８７）ＥＭＢＯ Ｊ ６：２２９−
２３４）、ｐＭＦａ（ＫｕｒｊａｎおよびＨｅｒｓｋｏｗｉｔｚ、（１９８２）
Ｃｅｌｌ ３０：９３３−９４３）、ｐＪＲＹ８８（Ｓｃｈｕｌｔｚら、（１９
８７）Ｇｅｎｅ ５４：１１３−１２３）、ｐＹＥＳ２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ
Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．）、およびｐｉ
ｃＺ（ＩｎＶｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐ．，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆ．
）が挙げられる。
【０１２４】 あるいは、ＡＴＬＡＳ−Ｘは、バキュロウイルス発現ベクターを使用して、昆
虫細胞中で発現され得る。培養昆虫細胞（例えば、ＳＦ９細胞）中でのタンパク
質の発現のために利用可能なバキュロウイルスベクターには、ｐＡｃシリーズ（
Ｓｍｉｔｈら（１９８３）Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ３：２１５６−２１６
５）およびｐＶＬシリーズ（ＬｕｃｋｌｏｗおよびＳｕｍｍｅｒｓ（１９８９）
Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １７０：３１−３９）が挙げられる。
【０１２５】 なお別の実施形態において、本発明の核酸は、哺乳動物発現ベクターを使用し
て、哺乳動物細胞中で発現される。哺乳動物発現ベクターの例には、ｐＣＤＭ８
（Ｓｅｅｄ（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（
Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７）ＥＭＢＯ Ｊ ６：１８７−１９５）が挙げられ
る。哺乳動物細胞中で使用される場合、発現ベクターの制御機能は、しばしば、
ウイルスの調節エレメントによって提供される。例えば、一般に使用されるプロ
モーターは、ポリオーマ、アデノウイルス２、サイトメガロウイルス、およびシ
ミアンウイルス４０に由来する。原核生物細胞および真核生物細胞の両方のため
の他の適切な発現系については、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、ＭＯＬＥＣＵＬ
ＡＲ ＣＬＯＮＩＮＧ：Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ．第２版、Ｃ
ｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐ
ｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐ
ｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８９の第１６章および第１７章を参照
のこと。
【０１２６】 別の実施形態において、組換え哺乳動物発現ベクターは、特定の細胞型（例え
ば、組織特異的調節エレメントを使用して核酸を発現する）中で優先的に核酸の
発現を指向し得る。組織特異的調節エレメントは、当該分野で公知である。適切
な組織特異的なプロモーターの非限定的な例には、アルブミンプロモーター（肝
臓特異的；Ｐｉｎｋｅｒｔら（１９８７）Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ １：２６８−２
７７）、リンパ特異的プロモーター（ＣａｌａｍｅおよびＥａｔｏｎ（１９８８
）Ａｄｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４３：２３５−２７５）、Ｔ細胞レセプターの特定
のプロモーターにおいて（ＷｉｎｏｔｏおよびＢａｌｔｉｍｏｒｅ（１９８９）
ＥＭＢＯ Ｊ ８：７２９−７３３）および免疫グロブリンの特定のプロモータ
ーにおいて（Ｂａｎｅｒｊｉら（１９８３）Ｃｅｌｌ ３３：７２９−７４０；
ＱｕｅｅｎおよびＢａｌｔｉｍｏｒｅ（１９８３）Ｃｅｌｌ ３３：７４１−７
４８）、ニューロン特異的プロモーター（例えば、ニューロフィラメントプロモ
ーター；ＢｙｒｎｅおよびＲｕｄｄｌｅ（１９８９）ＰＮＡＳ ８６：５４７３
−５４７７）、膵臓特異的プロモーター（Ｅｄｌｕｎｄら（１９８５）Ｓｃｉｅ
ｎｃｅ ２３０：９１２−９１６）、ならびに乳腺特異的プロモーター（例えば
、ミルク乳清プロモーター；米国特許第４，８７３，３１６号および欧州出願公
開第２６４，１６６号）が挙げられる。発生的に調節されるプロモーターもまた
含まれる（例えば、マウスホックス（ｍｕｒｉｎｅ ｈｏｘ）プロモーター（Ｋ
ｅｓｓｅｌおよびＧｒｕｓｓ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：３７４−３
７９）およびα−フェトプロテインプロモーター（ＣａｍｐｅｓおよびＴｉｌｇ
ｈｍａｎ（１９８９）Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ ３：５３７−５４６）。
【０１２７】 本発明はさらに、アンチセンス方向で発現ベクターにクローニングされた本発
明のＤＮＡ分子を含む組換え発現ベクターを提供する。すなわち、そのＤＮＡ分
子は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡに対してアンチセンスであるＲＮＡ分子の発現
（ＤＮＡ分子の転写によって）を可能にする様式で調節配列に作動可能に連結さ
れる。調節配列は、種々の細胞型においてアンチセンスＲＮＡ分子の連続的な発
現を指向する、アンチセンス方向でクローニングされた核酸に作動可能に連結さ
れる調節配列（例えば、ウイルスプロモーターおよび／もしくはエンハンサー）
が選択され得るか、または例えば、アンチセンスＲＮＡの構成的発現、組織特異
的発現、または細胞型特異的発現を指向する調節配列が、選択され得る。アンチ
センス発現ベクターは、組換えプラスミド、ファージミド、または弱毒化された
ウイルスの形態であり得、ここではアンチセンス核酸は、高効率調節領域の制御
下で産生され、その活性は、ベクターが導入される細胞型によって決定され得る
。アンチセンス遺伝子を使用する遺伝子発現の調節の議論については、Ｗｅｉｎ
ｔｒａｕｂら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ＲＮＡ ａｓ ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ」、Ｒｅｖｉｅｗｓ−
−Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、第１巻（１）１９８６を参照のこと
。
【０１２８】 本発明の別の局面は、本発明の組換え発現べクターが導入された宿主細胞に関
する。用語「宿主細胞」および「組換え宿主細胞」は、本明細書中で、交換可能
に使用される。このような用語は、特定の対象の細胞をいうのみでなく、そのよ
うな細胞の子孫または潜在的な子孫をもいうことが理解される。変異または環境
的影響のいずれかに起因して、特定の改変が次の世代において生じ得るので、こ
のような子孫は、実際、親の細胞と同一でないかもしれないが、なお、本明細書
中で使用されるような用語の範囲内に含まれる。
【０１２９】 宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞、酵
母または哺乳動物細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）ま
たはＣＯＳ細胞）で発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である
。
【０１３０】 ベクターＤＮＡは、従来的な形質転換またはトランスフェクション技術を介し
て原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書中で使用される場
合、用語「形質転換」および「トランスフェクション」とは、外来性の核酸（例
えば、ＤＮＡ）を宿主細胞に導入するための当該分野で認識される種々の技術を
いうことを意図し、これらには、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウム共沈殿
、ＤＥＡＥデキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション、または
エレクトロポレーションが含まれる。宿主細胞を形質転換またはトランスフェク
ションするための適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ Ｃ
ＬＯＮＩＮＧ：Ａ ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＹ ＭＡＮＵＡＬ．第２版、Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８９）および他の実験室マニュアルに見出され
得る。
【０１３１】 安定な哺乳動物細胞のトランスフェクションのために、使用される発現ベクタ
ーおよびトランスフェクション技術に依存して、細胞のほんの一部のみが外来Ｄ
ＮＡをそのゲノムに組み込み得ることが知られている。これらの組込み物を同定
および選択するために、選択マーカー（例えば、抗生物質に対する耐性）をコー
ドする遺伝子が、一般的には目的の遺伝子とともに宿主細胞に導入される。種々
の選択マーカーには、薬物（例えば、Ｇ４１８、ハイグロマイシン、およびメト
トレキサート）に対する耐性を付与するものが含まれる。選択マーカーをコード
する核酸は、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードするベクターと同じベクター上で宿主細胞
に導入され得るか、あるいは別のベクター上で導入され得る。導入された核酸で
安定にトランスフェクトされた細胞は、薬物選択によって同定され得る（例えば
、選択マーカー遺伝子を取り込んだ細胞は生存し、一方他の細胞は死滅する）。
【０１３２】 本発明の宿主細胞（例えば、培養中の原核生物宿主細胞または真核生物宿主細
胞）は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を産生（すなわち、発現）するために使用さ
れ得る。従って、本発明はさらに、本発明の宿主細胞を使用して、ＡＴＬＡＳ−
Ｘタンパク質を産生するための方法を提供する。１つの実施形態において、本方
法は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が産生されるような適切な培地中で、本発明の
宿主細胞（ここに、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする組換え発現ベクターが導入され
た）を培養する工程を包含する。別の実施形態において、本方法はさらに、培地
または宿主細胞からＡＴＬＡＳ−Ｘを単離する工程を包含する。
【０１３３】 （トランスジェニック動物） 本発明の宿主細胞はまた、非ヒトトランスジェニック動物を作製するために使
用され得る。例えば、１つの実施形態において、本発明の宿主細胞は、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘコード配列が導入された、受精した卵母細胞または胚性幹細胞である。次
いで、このような宿主細胞は、外因性のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列がそのゲノムに導入
された非ヒトトランスジェニック動物、または内因性のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列が変
更された相同組換え動物を作製するために使用され得る。このような動物は、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘの機能および／または活性を研究するため、ならびにＡＴＬＡＳ−
Ｘ活性のモジュレーターを同定および／または評価するために有用である。本明
細書中で使用される場合、「トランスジェニック動物」とは、非ヒト動物であり
、好ましくは哺乳動物であり、より好ましくは、ラットまたはマウスのような齧
歯類であり、その動物の１つ以上の細胞が、導入遺伝子を含む。トランスジェニ
ック動物の他の例としては、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワト
リ、両生類などが挙げられる。導入遺伝子は、細胞（この細胞からトランスジェ
ニック動物が発生する）のゲノムに組み込まれかつ成熟動物のゲノムに残存する
、外因性のＤＮＡであり、それによって、トランスジェニック動物の１つ以上の
細胞型または組織においてコードされた遺伝子産物の発現を指示する。本明細書
中で使用される場合、「相同組換え動物」とは、非ヒト動物であり、好ましくは
哺乳動物であり、より好ましくはマウスであり、ここで内因性のＡＴＬＡＳ−Ｘ
遺伝子は、内因性の遺伝子と、その動物の発生の前にその動物の細胞（例えば、
その動物の胚細胞）に導入された外因性のＤＮＡ分子との間の相同組換えによっ
て変更されている。
【０１３４】 本発明のトランスジェニック動物は、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする核酸を、例
えば、マイクロインジェクション、レトロウイルス感染によって、受精した卵母
細胞の雄性前核に導入すること、および卵母細胞が偽妊娠した雌性養育動物（ｆ
ｏｓｔｅｒ ａｎｉｍａｌ）中で発生することを可能にすることによって作製さ
れ得る。配列番号１、３、５、７、９、１０、１１または１２の配列のヒトのＡ
ＴＬＡＳ−Ｘ ＤＮＡは、非ヒト動物のゲノムに導入遺伝子として導入され得る
。あるいは、ヒトのＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の非ヒトホモログ（例えば、マウスの
ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子）は、ヒトのＡＴＬＡＳ−Ｘ ｃＤＮＡに対するハイブリ
ダイゼーションに基づいて単離され得（上にさらに記載される）、そして導入遺
伝子として使用され得る。イントロン配列およびポリアデニル化シグナルもまた
導入遺伝子中に含まれ得、その導入遺伝子の発現の効率を増大させ得る。組織特
異的調節配列（単数または複数）は、特定の細胞に対して、ＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質の発現を指示するように、ＡＴＬＡＳ−Ｘ導入遺伝子に作動可能に連結さ
れ得る。胚の操作およびマイクロインジェクションを介するトランスジェニック
動物（特に、マウスのような動物）を生成するための方法は、当該分野で慣習的
になっており、そして例えば、米国特許第４，７３６，８６６号；同第４，８７
０，００９号；および同第４，８７３，１９１号；ならびにＨｏｇａｎ １９８
６、ＭＡＮＩＰＵＬＡＴＩＮＧ ＴＨＥ ＭＯＵＳＥ ＥＭＢＲＹＯ，Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ
Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．に記載されている。同様の方法は、他
のトランスジェニック動物の作製のために使用される。トランスジェニック初代
（ｆｏｕｎｄｅｒ）動物は、そのゲノムにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘ導入遺伝子の存
在および／またはその動物の組織もしくは細胞中のＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡの
発現に基づいて同定され得る。次いで、トランスジェニック初代動物は、導入遺
伝子を有するさらなる動物を繁殖させるために使用され得る。さらに、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘをコードする導入遺伝子を有するトランスジェニック動物は、さらに、他
の導入遺伝子を有する他のトランスジェニック動物に繁殖され得る。
【０１３５】 相同組換え動物を作製するために、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の少なくとも一部を
含むベクターを調製する。この遺伝子において、欠失、付加、または置換が導入
されて、それによってそのＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子が変化されている（例えば、機
能的に破壊される）。ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子はヒト遺伝子（例えば、配列番号１
、３、５または７）であり得るが、より好ましくは、ヒトのＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝
子の非ヒトホモログである。例えば、配列番号１、３、５または７のヒトのＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ遺伝子のマウスホモログは、マウスゲノムにおいて内因性のＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘ遺伝子を変更するのに適切な相同組換えベクターを構築するために使用さ
れ得る。１つの実施形態において、そのベクターは、相同組換えに際して、その
内因性のＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子が、機能的に破壊されるように設計される（すな
わち、機能的タンパク質をもはやコードしない；「ノックアウト」ベクターとも
いわれる）。
【０１３６】 あるいは、このベクターは、相同組換えに際して、内因性ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝
子が変異されるか、あるいはさもなければ、変更されるが、なお機能性タンパク
質をコードするように、設計され得る（例えば、上流の調節領域が変更され、そ
れによって内因性ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の発現を変更し得る）。相同組換え
ベクターにおいて、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の変更された部分は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
遺伝子のさらなる核酸によって、その５’末端および３’末端で隣接され、相同
組換えが、ベクターによって保有される外因性ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子と胚幹細胞
中の内因性ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子との間で起こることを可能にする。さらなる隣
接するＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸は、内因性遺伝子との首尾よい相同組換えのために十
分な長さである。代表的に、数キロベースの隣接するＤＮＡ（５’末端および３
’末端の両方における）が、ベクターに含まれる。例えば、相同組換えベクター
の記述についてＴｈｏｍａｓら（１９８７）Ｃｅｌｌ ５１：５０３を参照のこ
と。このベクターは、（例えば、エレクトロポレーションによって）胚幹細胞株
に導入され、導入されたＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子が内因性ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子と
相同組換えした細胞が、選択される（例えば、Ｌｉら（１９９２）Ｃｅｌｌ ６
９：９１５を参照のこと）。
【０１３７】 次いで、選択された細胞が、動物（例えば、マウス）の胚盤胞へ注入され、凝
集キメラを形成する。例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ（１９８７）のＴＥＲＡＴＯＣＡ
ＲＣＩＮＯＭＡＳ ＡＮＤ ＥＭＢＲＹＯＮＩＣ ＳＴＥＭ ＣＥＬＬＳ：Ａ
ＰＲＡＣＴＩＣＡＬ ＡＰＰＲＯＡＣＨ、Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ編、ＩＲＬ、Ｏｘ
ｆｏｒｄ、１１３頁〜１５２頁を参照のこと。次いで、キメラ胚が、適切な偽妊
娠雌性養育動物に移植され得、そしてその胚は分娩に到る。その生殖細胞中に相
同組換えされたＤＮＡを保有する子孫が、動物を繁殖させるために使用され得、
この動物の全ての細胞は、導入遺伝子の生殖系列伝達による、相同組換えされた
ＤＮＡを含む。相同組換えベクターおよび相同組換え動物を構築するための方法
が、さらに以下に記載される；Ｂｒａｄｌｅｙ（１９９１）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ
Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２：８２３−８２９；ＰＣＴ国際公開番号：ＷＯ９０
／１１８４；ＷＯ９１／０１１４０；ＷＯ９２／０９６８；およびＷＯ／９３／
０４１６９。
【０１３８】 別の実施形態において、導入遺伝子の調節された発現を可能にする選択された
系を含む非ヒトトランスジェニック動物が産生され得る。このような系の１つの
例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である。ｃ
ｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系の記述については、例えば、Ｌａｋｓｏら（１
９９２）ＰＮＡＳ ８９：６２３２−６２３６を参照のこと。リコンビナーゼ系
の別の例は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコ
ンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１
：１８１−１８５）。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系が導入遺伝子の発現を
調節するために使用される場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパ
ク質の両方をコードする導入遺伝子を含む動物が必要となる。このような動物は
、例えば、２種のトランスジェニック動物（一方は選択されたタンパク質をコー
ドする導入遺伝子を含み、他方はリコンビナーゼをコードする導入遺伝子を含む
）を交配することによる「二重の」トランスジェニック動物の構築によって提供
され得る。
【０１３９】 本明細書中に記載されるトランスジェニック非ヒト動物のクローンがまた、Ｗ
ｉｌｍｕｔら（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ ３８５：８１０−８１３に記載される
方法に従って、産生され得る。簡単には、トランスジェニック動物からの細胞（
例えば、体細胞）は単離および誘導され、増殖サイクルから脱し、そしてＧ0期
に入り得る。次いで、静止性細胞が、例えば、電気パルスの使用を介して、その
静止性細胞が単離される同種の動物から除核された卵母細胞へ融合され得る。次
いで、この再構築された卵母細胞は培養され、その結果、これは桑実胚または未
分化胚芽細胞に発達し、次いで、偽妊娠雌性養育動物に移される。この雌性養育
動物から産まれた子孫は、その細胞（例えば、その体細胞）が単離された動物の
クローンである。
【０１４０】 （薬学的組成物） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、および抗ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ抗体（これはまた、本明細書中で、「活性な化合物」ともいわれる）
、ならびにそれらの誘導体、フラグメント、アナログ、およびホモログが、投与
に適した薬学的組成物に組み込まれ得る。このような組成物は、典型的に、核酸
分子、タンパク質または抗体、および薬学的に受容可能なキャリアを含む。本明
細書中で使用される場合、「薬学的に受容可能なキャリア」は、薬学的な投与に
適合した、任意および全ての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌
剤、等張剤および吸収遅延剤（ｄｅｌａｙｉｎｇ ａｇｅｎｔ）などを含むこと
が意図される。適切なキャリアは、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅ
ｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（当該分野の標準的参考文献）（本明細書中に
参考として援用される）の最新版に記載される。このようなキャリアまたは希釈
剤の好ましい例としては、水、生理食塩水、フィンガー（ｆｉｎｇｅｒ）溶液、
デキストロース溶液、および５％ヒト血清アルブミンが挙げられるが、これらに
限定されない。リポソームおよび非水性ビヒクル（例えば、不揮発性油）もまた
、使用され得る。薬学的に活性な物質のためのこのような媒体および薬剤の使用
は、当該分野で周知である。任意の従来の媒体または薬剤が活性な化合物と不適
合である範囲を除いて、組成物におけるその使用が考慮される。補助活性化合物
もまた、組成物へ組み込まれ得る。
【０１４１】 本発明の薬学的組成物は、その意図される投与の経路と適合するように処方さ
れる。投与の経路の例には、非経口（例えば、静脈、皮内、皮下）投与、経口（
例えば、吸入）投与、経皮（局所的）投与、経粘膜（ｔｒａｎｓｍｕｃｏｓａｌ
）投与、および直腸投与が挙げられる。非経口適用、皮内適用または皮下適用の
ために使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含み得る：注射用水、生理
食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレング
リコールまたは他の合成溶媒のような、滅菌希釈剤；ベンジルアルコールまたは
メチルパラベンのような、抗菌剤；アスコルビン酸または重亜硫酸ナトリウムの
ような、抗酸化剤；エチレンジアミン四酢酸のような、キレート剤；酢酸塩、ク
エン酸塩またはリン酸塩のような、緩衝液、および塩化ナトリウムまたはデキス
トロースのような、張度の調節のための薬剤。ｐＨは、塩酸または水酸化ナトリ
ウムのような酸または塩基で調整され得る。非経口調製物は、アンプル、使い捨
てシリンジ、あるいはガラスまたはプラスチックから作製される多用量のバイア
ル中に入れられ得る。
【０１４２】 注入使用に適した薬学的組成物は、滅菌水性溶液（ここで、水溶解性）または
分散液、および滅菌の注入可能な溶液または分散液の即座の調製のための滅菌粉
末を含む。静脈投与において、適切なキャリアには、生理食塩水、静菌水、Ｃｒ
ｅｍｏｐｈｏｒ ＥＬTM（ＢＡＳＦ、Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ、Ｎ．Ｊ．）または
リン酸塩緩衝化生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、組成
物は、滅菌性でなければならず、そして容易な注入性（ｓｙｒｉｎｇａｂｉｌｉ
ｔｙ）が存在する程度に流動性であるべきである。これは、製造および保存の条
件下で安定でなければならず、そして、細菌および真菌のような微生物の汚染行
為に対して保護されるべきである。このキャリアは、例えば、以下を含む溶媒ま
たは分散媒であり得る：水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、
プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）ならびにそれ
らの適切な混合物。適切な流動性が、例えば、レシチンのようなコーティング剤
の使用によって、分散液の場合に、要求される粒子サイズを維持することによっ
て、および界面活性剤を使用することによって維持され得る。微生物の作用の防
止は、種々の抗菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、フ
ェノール、アスコルビン酸、チメロサールなど）によって達成され得る。多くの
場合、組成物中に等張剤（例えば、砂糖、ポリアルコール（例えば、マンニトー
ル（ｍａｎｉｔｏｌ）、ソルビトール）塩化ナトリウム）を含むことが好ましい
。注入可能組成物の長時間吸収は、組成物に吸収を遅らせる薬剤（例えば、アル
ミニウムモノステアレートおよびゼラチン）を含ませることによってもたらされ
得る。
【０１４３】 滅菌注射可能溶液は、必要量のこの活性化合物（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質あるいは抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体））を、適切な溶媒中に、上記で列挙され
る成分の１つまたは組み合わせと共に組み込み、必要な場合、続いて濾過滅菌す
ることによって調製され得る。一般的に、分散液は、活性化合物を、塩基性分散
媒および上記で列挙される成分から必要とされる他の成分を含む滅菌ビヒクル中
へ組み込むことによって調製される。滅菌注射可能液剤の調製のための滅菌散剤
の場合において、調製方法は、減圧乾燥および凍結乾燥であり、これにより、活
性成分および既に滅菌濾過されたその液剤からの任意のさらなる所望の成分の粉
末を得る。
【０１４４】 経口組成物は、一般的に、不活性希釈剤または食用キャリアを含む。これらは
、ゼラチンカプセルに封入され得るか、または錠剤へと圧縮され得る。経口治療
投与の目的のために、この活性化合物は、賦形剤とともに組み込まれ得、そして
錠剤、トローチ剤、またはカプセル剤の形態で使用され得る。経口組成物はまた
、マウスウォッシュとしての使用のために流体キャリアを使用して調製され得、
ここで、この流体キャリア中のこの化合物は、経口的に適用され、そしてさっと
動かされ、そして吐き出されるか、または飲み込まれる。薬学的に適合性の結合
剤、および／またはアジュバント材料が、この組成物の一部として含まれ得る。
錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤などが、任意の以下の成分または同様の性
質を有する化合物を含み得る：結合剤（例えば、微結晶セルロース、ガムトラガ
ントまたはゼラチン）；賦形剤（例えば、デンプンまたはラクトース）、崩壊剤
（例えば、アルギン酸）、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチ）；滑沢剤
（例えば、ステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ）；滑り剤（ｇｌ
ｉｄａｎｔ）（例えば、コロイド状二酸化ケイ素）；甘味剤（例えば、スクロー
スまたはサッカリン）；あるいは香味剤（例えば、ペパーミント、サリチル酸メ
チル、またはオレンジフレーバー）。
【０１４５】 吸入による投与について、この化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素
のような気体）を含む圧縮容器またはディスペンサー、あるいは噴霧器から、エ
アロゾル噴霧の形態で送達される。
【０１４６】 全身的投与はまた、経粘膜手段または経皮手段により得る。経粘膜投与または
経皮投与について、浸透される障壁に適切な浸透剤が、処方物において使用され
る。このような浸透剤は、一般的に、当該分野で公知であり、そして、例えば、
経粘膜投与については、界面活性剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が挙げ
られる。経粘膜投与は、鼻噴霧または坐剤の使用を介して達成され得る。経皮投
与については、この活性化合物は、当該分野で一般的に公知である軟膏剤、軟膏
、ゲル、またはクリーム剤へ処方される。
【０１４７】 この化合物はまた、直腸送達のための坐剤（例えば、ココアバターおよび他の
グリセリドのような従来の坐剤ベースと共に）または貯留（ｒｅｎｔｅｎｔｉｏ
ｎ）浣腸の形態で調製され得る。
【０１４８】 １つの実施形態において、この活性化合物は、身体からの迅速な排出に対して
この化合物を保護するキャリアを用いて調製され（例えば、制御放出処方物）、
これには、移植片およびマイクロカプセル化された送達系が挙げられる。酢酸エ
チレンビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステ
ル、およびポリ乳酸のような、生分解性、生体適合性ポリマーが使用され得る。
このような処方物の調製のための方法は、当該業者には明らかである。これらの
材料はまた、Ａｌｚａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｎｏｖａ Ｐｈａｒ
ｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．から市販され、手に入れることができる。リ
ポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を感染させた細胞へ
標的化されるリポソームを含む）がまた、薬学的に受容可能なキャリアとして使
用され得る。これらは、例えば米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるよ
うな、当業者に公知の方法に従って調製され得る。
【０１４９】 投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で、経口組成物ま
たは非経口組成物を処方することが、特に有益である。本明細書で使用される投
薬単位形態は、処置される被験体のための単位投薬量として適切な物理的に個々
の単位をいい；各単位は、必要とされる薬学的キャリアと関連して所望の治療的
効果を生じるように計算された、所定量の活性化合物を含む。本発明の投薬単位
形態についての詳細は、この活性化合物、および達成される特定の治療効果、な
らびに個体の処置のためのこのような活性化合物を調合する当該分野に固有の特
徴によって決定されるか、あるいはこれらに直接依存する。
【０１５０】 本発明の核酸分子は、ベクターに挿入され得、そして遺伝子治療ベクターとし
て使用され得る。遺伝子治療ベクターは、被験体へ、例えば、米国特許第５，７
０３，０５５号に記載されるように、任意の多くの経路によって送達され得る。
従って、送達にはまた、例えば静脈注射、局所投与（米国特許第５，３２８，４
７０号を参照のこと）によって、または定位注射（例えば、Ｃｈｅｎら（１９９
４）ＰＮＡＳ９１：３０５４−３０５７を参照のこと）が挙げられ得る。遺伝子
治療ベクターの薬学的調製物には、受容可能な希釈剤中の遺伝子治療ベクターが
挙げられ得、または遺伝子送達ビヒクルが組み込まれる除放性マトリックスが挙
げられ得る。あるいは、完全な遺伝子送達ベクターが組換え細胞からインタクト
で産生され得（例えば、レトロウイルスベクター）、薬学的調製物は、遺伝子送
達系を産生する１以上の細胞を含み得る。
【０１５１】 薬学的組成物は、キット（例えば、投与のための使用説明書と共の容器、包装
、またはディスペンサー）に含まれ得る。
【０１５２】 （発明のさらなる使用および方法） 本発明の単離された核酸分子は、以下にさらに説明されるように、ＡＴＬＡＳ
−Ｘタンパク質（例えば、遺伝子治療用途における宿主細胞中の組換え発現ベク
ター）を発現するため、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡ（例えば、生物学的サンプル
において）またはＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における遺伝子損傷を検出するため、な
らびにＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を調節するために使用され得る。さらに、ＡＴＬＡＳ
−Ｘタンパク質は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ活性または発現を調節する薬物または化合物
をスクリーニングするために、ならびにＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の不十分なも
しくは過剰な産生によって、あるいはＡＴＬＡＳ−Ｘ野生型タンパク質と比較し
て減少したもしくは異常な活性を有するＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質形態の産生に
よって特徴付けられる障害を処置するために使用され得る。さらに、本発明の抗
ＡＴＬＡＳ−Ｘ抗体が、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を検出して単離するため、お
よびＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を調節するために使用され得る。
【０１５３】 本発明は、さらに、上述のスクリーニングアッセイによって同定される新規の
薬剤、および本明細書中で記載されるような処置のためのそれらの使用に関する
。
【０１５４】 （スクリーニングアッセイ） 本発明は、調節因子、すなわち、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質に結合するか、あ
るいは例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現またはＡＴＬＡＳ−Ｘの活性に対して刺激
効果または阻害効果を有する、候補または試験化合物または薬剤（例えば、ペプ
チド、ペプチド模倣物、低分子または他の薬物）を同定するための方法（本明細
書中において「スクリーニングアッセイ」とも称される）を提供する。本発明は
また、本明細書中で記載されるスクリーニングアッセイで同定される化合物を含
む。
【０１５５】 １実施形態において、本発明は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはポリペプチ
ド、あるいはその生物学的に活性な部分の膜結合形態に結合するか、または膜結
合形態の活性を調節する、候補化合物もしくは試験化合物をスクリーニングする
ためのアッセイを提供する。本発明の試験化合物は、当該分野において公知のコ
ンビナトリアルライブラリー法における多数のアプローチの任意のものを使用し
て得られ得、これには、以下が挙げられる：生物学的ライブラリー；空間的にア
ドレス可能な平行固相もしくは溶液相ライブラリー；逆重畳を要する合成ライブ
ラリー法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフィニティークロマ
トグラフィー選択を使用する合成ライブラリー法。生物学的ライブラリーアプロ
ーチはペプチドライブラリーに限定されるが、他の４つのアプローチは、ペプチ
ド、非ペプチドオリゴマーもしくは化合物の低分子ライブラリーに適用可能であ
る（Ｌａｍ（１９９７）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓ １２：１４
５）。
【０１５６】 本明細書中で使用される場合、「低分子」とは、約５ｋＤ未満、最も好ましく
は約４ｋＤ未満の分子量を有する組成物を意味する。低分子は、例えば、核酸、
ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模倣物、炭水化物、脂質または他の有機（炭
素含有）または無機分子であり得る。化学的混合物および／または生物学的混合
物のライブラリ（例えば、真菌、細菌、または藻類抽出物）は、当該分野で公知
であり、そして本発明の任意のアッセイを用いてスクリーニングされ得る。
【０１５７】 分子ライブラリーの合成のための方法の例は、当該分野において、例えば以下
に見出され得る：ＤｅＷｉｔｔら（１９９３）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ
Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．９０：６９０９；Ｅｒｂら（１９９４）Ｐｒｏｃ Ｎａｔ
ｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．９１：１１４２２；Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎ
ら（１９９４）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ３７：２６７８；Ｃｈｏら（１９９３）
Ｓｃｉｅｎｃｅ ２６１：１３０３；Ｃａｒｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ
Ｃｈｅｍ Ｉｎｔ Ｅｄ Ｅｎｇｌ ３３：２０５９；Ｃａｒｅｌｌら（１９
９４）Ａｎｇｅｗ Ｃｈｅｍ Ｉｎｔ Ｅｄ Ｅｎｇｌ ３３：２０６１；およ
びＧａｌｌｏｐら（１９９４）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ３７：１２３３。
【０１５８】 化合物のライブラリーは、溶液中で（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ（１９９２）
ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １３：４１２〜４２１）、あるいはビーズ上（Ｌ
ａｍ（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８２〜８４）、チップ上（Ｆｏｄｏｒ
（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ ３６４：５５５〜５５６）、細菌（Ｌａｄｎｅｒ
米国特許第５，２２３，４０９号）、胞子（Ｌａｄｎｅｒ ＵＳＰ’４０９）、
プラスミド（Ｃｕｌｌら（１９９２）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ
ＵＳＡ ８９：１８６５〜１８６９）またはファージ上（ＳｃｏｔｔおよびＳｍ
ｉｔｈ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：３８６〜３９０；Ｄｅｖｌｉｎ（
１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：４０４〜４０６；Ｃｗｉｒｌａら（１９９
０）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．８７：６３７８〜６
３８２；Ｆｅｌｉｃｉ（１９９１）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２２：３０１〜３
１０；Ｌａｄｎｅｒ上記）において示され得る。
【０１５９】 １実施形態において、アッセイは細胞ベースのアッセイであり、ここで、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはその生物学的に活性な部分の膜結合形態を細胞表
面上に発現する細胞が、試験化合物と接触され、そしてこの試験化合物が、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘタンパク質に結合する能力が、決定される。例えば、細胞は、哺乳動
物起源または酵母細胞であり得る。この試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質
に結合する能力の決定は、例えば、その試験化合物を放射性同位体標識または酵
素標識とカップリングさせて、この試験化合物のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質また
はその生物学的に活性な部分に対する結合が複合体におけるその標識化合物を検
出することによって検出され得ることによって、達成され得る。例えば、試験化
合物は、125Ｉ、35Ｓ、14Ｃ、または3Ｈで直接的または間接的のいずれかで標識
され得、そしてその放射性同位体が、放射線放射の直接の計数により、またはシ
ンチレーション計数により、検出され得る。あるいは、試験化合物は、例えば、
西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼ
で酵素的に標識され得、そしてこの酵素的標識が、適切な基質の生成物への転換
を決定することにより、検出され得る。１実施形態において、このアッセイは、
ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、またはその生物学的に活性な部分の膜結合形態をそ
の細胞表面上に発現する細胞を、ＡＴＬＡＳ−Ｘと結合する公知の化合物と接触
させて、アッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験化合物に接
触させる工程、ならびにこの試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質と相互作用
する能力を決定する工程を包含し、ここでこの試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質と相互作用する能力を決定する工程が、この試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘ
、またはその生物学的に活性な部分と、公知の化合物と比較して優先的に結合す
る能力を決定する工程を包含する。
【０１６０】 別の実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な部分の膜結合形態を細胞表面上で
発現する細胞を、試験化合物と接触させる工程、ならびにこの試験化合物が、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な部分の活性を調節（例えば
、刺激または阻害）する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物がＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ、またはその生物学的に活性な部分の活性を調節する能力の決定は、
例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が、ＡＴＬＡＳ−Ｘ標的分子に結合またはこ
れら標的分子と相互作用する能力を決定することによって、達成され得る。本明
細書中において使用する場合には、「標的分子」とは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク
質が自然に結合または相互作用する分子であり、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ相互作
用タンパク質を発現する細胞の表面の分子、第二の細胞の表面上の分子、細胞外
の環境の分子、細胞膜の内部表面と会合する分子、または細胞質分子である。Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘ標的分子は、本発明の非ＡＴＬＡＳ−Ｘ分子またはＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質またはポリペプチドであり得る。１実施形態において、ＡＴＬＡＳ−
Ｘ標的分子は、シグナル伝達経路の構成要素であり、これは、細胞膜を通って細
胞内への細胞外シグナル（例えば、化合物が膜結合ＡＴＬＡＳ−Ｘ分子に結合す
ることにより発生するシグナル）の伝達を促進する。その標的は、例えば、触媒
活性を有する第二の細胞内タンパク質または下流シグナル分子のＡＴＬＡＳ−Ｘ
との会合を容易にするタンパク質であり得る。
【０１６１】 ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質がＡＴＬＡＳ−Ｘ標的分子に結合するかまたはその
標的分子と相互作用する能力の決定は、直接的結合を決定するための上記方法の
１つにより、達成され得る。１つの実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク
質がＡＴＬＡＳ−Ｘ標的分子に結合するかまたはその標的分子と相互作用する能
力の決定は、その標的分子の活性を決定することにより、達成され得る。例えば
、この標的分子の活性は、その標的の細胞セカンドメッセンジャー（すなわち、
細胞内Ｃａ2+、ジアシルグリセロール、ＩＰ3など）の誘導を検出すること、適
切な基質への標的の触媒活性／酵素活性を検出すること、レポーター遺伝子（検
出可能なマーカー（例えば、ルシフェラーゼ）をコードする核酸に作動的に連結
されたＡＴＬＡＳ−Ｘ応答性調節エレメントを含む）の誘導を検出すること、ま
たは細胞応答（例えば、細胞生存度、細胞分化、または細胞増殖）を検出するこ
とにより、決定され得る。
【０１６２】 なお別の実施形態において、本発明のアッセイは、無細胞アッセイであり、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な部分を試験化合物に接触さ
せる工程、ならびにその試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物
学的に活性な部分と結合する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物の
、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質への結合は、上記のように、直接的または間接的に
のいずれかで決定され得る。１つのこのような実施形態において、このアッセイ
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な部分を、ＡＴＬＡＳ
−Ｘを結合する公知の化合物に接触させて、アッセイ混合物を形成する工程、こ
のアッセイ混合物を試験化合物に接触させる工程、ならびにその試験化合物がＡ
ＴＬＡＳ−Ｘタンパク質と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、
この試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質と相互作用する能力を決定する工程
は、この試験化合物が、公知の化合物と比較して、ＡＴＬＡＳ−Ｘ、またはその
生物学的に活性な部分と優先的に相互作用する能力を決定する工程を包含する。
【０１６３】 別の実施形態において、アッセイは、無細胞アッセイであり、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質またはその生物学的に活性な部分を試験化合物と接触させる工程、な
らびにその試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはその生物学的に活性な
部分の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力を決定する工程を包含す
る。この試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘの活性を調節する能力の決定は、例えば、
ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が、ＡＴＬＡＳ−Ｘ標的分子に結合する能力を、直接
的結合の決定のための上記方法の１つによって決定することにより、達成され得
る。代替の実施形態において、この試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の活
性を調節する能力の決定は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が、ＡＴＬＡＳ−Ｘ標的
分子をさらに調節する能力を決定することにより、達成され得る。例えば、この
標的分子の適切な基質に対する触媒活性／酵素活性は、上記のように決定され得
る。
【０１６４】 なお別の実施形態において、無細胞アッセイは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質ま
たはその生物学的に活性な部分を、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を結合する公知の
化合物に接触させてアッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験
化合物と接触させる工程、ならびにこの試験化合物がＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質
と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、この試験化合物がＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質と相互作用する能力の決定は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が
、ＡＴＬＡＳ−Ｘ標的分子と優先的に結合するか、またはその標的分子の活性を
優先的に調節する能力を決定する工程を包含する。
【０１６５】 本発明の無細胞アッセイは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の、可溶性の形態また
は膜結合形態の両方の使用に受け入れられる。膜結合形態のＡＴＬＡＳ−Ｘタン
パク質を含む無細胞アッセイの場合には、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の膜結合形
態が溶液中に維持されるように、可溶化剤を利用することが望ましくあり得る。
このような可溶化剤の例には、非イオン性界面活性剤が挙げられ、例えば、ｎ−
オクチルグルコシド、ｎ−ドデシルグルコシド、ｎ−ドデシルマルトシド、オク
タノイル−Ｎ−メチルグルカミド、デカノイル−Ｎ−メチルグルカミド、Ｔｒｉ
ｔｏｎ（登録商標）Ｘ−１００、Ｔｒｉｔｏｎ（登録商標）Ｘ−１１４、Ｔｈｅ
ｓｉｔ（登録商標）、イソトリデシルポリ（エチレングリコールエーテル）n（
Ｉｓｏｔｒｉｄｅｃｙｐｏｌｙ（ｅｔｈｙｌｅｎｅ ｇｌｙｃｏｌ ｅｔｈｅｒ
）n、Ｎ−ドデシル−Ｎ，Ｎ−ジメチル−３−アンモニオ−１−プロパンスルホ
ネート、３−（３−コラミドプロピル）ジメチルアンモニオ−１−プロパンスル
ホネート（３−（３−ｃｈｏｌａｍｉｄｏｐｒｏｐｙｌ）ｄｉｍｅｔｈｙｌａｍ
ｍｉｎｉｏｌ−１−ｐｒｏｐａｎｅ ｓｕｌｆｏｎａｔｅ）（ＣＨＡＰＳ）、ま
たは３−（３−コラミドプロピル）ジメチルアンモニオ−２−ヒドロキシ−１−
プロパンスルホネート（３−（３−ｃｈｏｌａｍｉｄｏｐｒｏｐｙｌ）ｄｉｍｅ
ｔｈｙｌａｍｍｉｎｉｏｌ−２−ｈｙｄｒｏｘｙ−１−ｐｒｏｐａｎｅ ｓｕｌ
ｆｏｎａｔｅ）（ＣＨＡＰＳＯ）である。
【０１６６】 本発明の上記アッセイ方法の１つより多い実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質またはその標的分子のいずれかを固定して、そのタンパク質の一方ま
たは両方の非複合形態からの複合形態の分離を促進し、そしてそのアッセイの自
動化に適用させることが、望ましくあり得る。試験化合物の、ＡＴＬＡＳ−Ｘタ
ンパク質への結合、または候補化合物の存在下および非存在下での、ＡＴＬＡＳ
−Ｘタンパク質の標的分子との相互作用は、これらの反応物を収容するために適
切な任意の容器内で、達成され得る。このような容器の例には、マイクロタイタ
ープレート、試験管、および微小遠心管が挙げられる。１実施形態において、そ
のタンパク質の一方または両方がマトリックスに結合することを可能にするドメ
インを付加する融合タンパク質が、提供され得る。例えば、ＧＳＴ−ＡＴＬＡＳ
−Ｘ融合タンパク質またはＧＳＴ標的融合タンパク質は、グルタチオンセファロ
ースビーズ（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）または
グルタチオン誘導体化マイクロタイタープレート上に吸着され得、次いでこれら
は、試験化合物と合わせられるか、あるいは試験化合物および吸着されない標的
タンパク質、またはＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のいずれかと合わせられ、そして
この混合物が、複合体形成に貢献する条件下（例えば、塩およびｐＨに関して生
理学的条件）でインキュベートされる。インキュベーションに続いて、ビーズま
たはマイクロタイタープレートウェルを洗浄して、結合していないあらゆる成分
を除去し、ビーズの場合にはマトリックスを固定し、例えば上記のように、複合
体を直接的または間接的のいずれかで決定する。あるいは、複合体がマトリック
スから解離され得、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の結合レベルまたは活性レ
ベルを、標準的な技術を使用して決定し得る。
【０１６７】 タンパク質をマトリックスに固定するための他の技術がまた、本発明のスクリ
ーニングアッセイにおいて使用され得る。例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、
またはその標的分子のいずれかが、ビオチンとストレプトアビジンとの結合を利
用して、固定され得る。ビオチニル化ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、または標的分
子は、当該分野において周知の技術を使用して、ビオチン−ＮＨＳ（Ｎ−ヒドロ
キシスクシンイミド）から調製され得（例えば、ビオチニル化キット、Ｐｉｅｒ
ｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、Ｉｌｌ．）、そしてストレプト
アビジンで被覆した９６ウェルのプレート（Ｐｉｅｒｃｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ）
のウェルに固定され得る。あるいは、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、または標的分
子と反応性であるがＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質のその標的分子への結合を妨害し
ない抗体が、そのプレートのウェルに誘導体化され得、そして結合していない標
的またはＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質が、抗体の結合によってウェル内にトラップ
され得る。このような複合体を検出するための方法には、ＧＳＴ固定複合体に関
しての上記のものに加えて、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質または標的分子と反応性
の抗体を使用する、複合体の免疫検出、ならびにＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、ま
たは標的分子に関する酵素活性の検出に依存する酵素結合アッセイが挙げられる
。
【０１６８】 別の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質発現のモジュレーターは、
細胞を候補化合物と接触させ、そして細胞中のＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたは
タンパク質の発現を決定する方法において同定される。候補化合物の存在下での
ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現レベルは、候補化合物の非存
在下でのＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現レベルと比較される
。次いで、候補化合物は、この比較に基づいて、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまた
はタンパク質発現のモジュレーターとして同定され得る。例えば、ＡＴＬＡＳ−
Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が候補化合物の非存在下より、その存在下
における方が大きい（すなわち、統計的に有意に大きい）場合、この候補化合物
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現の刺激物質として同定さ
れる。あるいは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が候補化合
物の非存在下よりその存在下の方が少ない（統計的に有意に少ない）場合、この
候補化合物は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のインヒビタ
ーとして同定される。細胞中のＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質の発
現レベルは、ＡＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡまたはタンパク質を検出するために本明
細書中に記載の方法によって決定され得る。
【０１６９】 本発明のなお別の局面において、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、ツーハイブリ
ッドアッセイまたはスリーハイブリッドアッセイにおいて「ベイトタンパク質」
として使用されて（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら
（１９９３）Ｃｅｌｌ ７２：２２３−２３２；Ｍａｄｕｒａら、１９９３ Ｊ
．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６−１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら、１
９９３ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４：９２０−９２４；Ｉｗａｂｕｃｈ
ｉら、１９９３ Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎ
ｔ ＷＯ９４／１０３００を参照のこと）、ＡＴＬＡＳ−Ｘ（「ＡＴＬＡＳ−Ｘ
結合タンパク質」または「ＡＴＬＡＳ−Ｘ−ｂｐ」）に結合するか、またはこれ
と相互作用し、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を調節する他のタンパク質を同定し得
る。このようなＡＴＬＡＳ−Ｘ結合タンパク質はまた、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
経路の上流または下流エレメントとしてＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質によるシグナ
ル伝達に関与するようである。
【０１７０】 ツーハイブリッドシステムは、分離可能なＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ド
メインからなる、大部分の転写因子のモジュール的性質に基づく。簡潔には、こ
のアッセイは、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。一方の構築物においては
、ＡＴＬＡＳ−Ｘをコードする遺伝子が公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）
のＤＮＡ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。他方の構築物において
は、ＤＮＡ配列のライブラリー由来の、未同定タンパク質（「プレイ」または「
サンプル」）をコードするＤＮＡ配列が、公知の転写因子の活性化ドメインをコ
ードする遺伝子に融合される。「ベイト」および「プレイ」タンパク質がインビ
ボで相互作用して、ＡＴＬＡＳ−Ｘ依存性複合体を形成し得る場合、この転写因
子のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインは、非常に近くにある。近位にあ
ることにより、転写因子に応答性の転写調節部位に作動可能に連結されたレポー
ター遺伝子（例えば、ＬａｃＺ）の転写を可能にする。レポーター遺伝子の発現
が検出され得、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーは、単離され得、そし
てＡＴＬＡＳ−Ｘと相互作用するタンパク質をコードするクローニングされた遺
伝子を得るために使用され得る。
【０１７１】 本発明はさらに、上記のスクリーニングアッセイにより同定される新規な薬剤
および本明細書中に記載されるような処置のためのこの薬剤の使用に関する。
【０１７２】 （検出アッセイ） 本明細書中で同定されるｃＤＮＡ配列の部分またはフラグメント（および対応
する完全遺伝子配列）は、ポリヌクレオチド試薬として多くの方法で使用され得
る。例えば、これらの配列は、（ｉ）それぞれの遺伝子を染色体上にマッピング
し；それによって遺伝病に関連する遺伝子領域を位置決めする；そして（ｉｉ）
微小な生物学的サンプルから個体を同定する（組織型決定）；そして（ｉｉｉ）
生物学的サンプルの法医学的同定の補助のために使用され得る。これらの用途の
いくつかは、以下の小節で記載される。
【０１７３】 （染色体マッピング） 一旦、遺伝子の配列（または配列の部分）が単離されると、この配列は、染色
体上の遺伝子の位置をマッピングするために使用され得る。このプロセスは、染
色体マッピングとよばれる。従って、本明細書中に記載される、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
の配列の部分またはフラグメントは、それぞれ、染色体上のＡＴＬＡＳ−Ｘの遺
伝子の位置をマッピングするために使用され得る。染色体に対するＡＴＬＡＳ−
Ｘの配列のマッピングは、これらの配列と疾患に関連する遺伝子とを関連付ける
最初の重要な工程である。
【０１７４】 手短には、ＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの配列からＰＣＲプラ
イマー（好ましくは１５〜２５ｂｐの長さ）を調製することによって染色体にマ
ッピングされ得る。ＡＴＬＡＳ−Ｘの配列のコンピュータ分析は、ゲノムＤＮＡ
中の１つより多いエキソン（従って、増幅プロセスを複雑にする）に及ばないプ
ライマーを素早く選択するために使用され得る。次いで、これらのプライマーは
、個々のヒト染色体を含む体細胞ハイブリッドのＰＣＲスクリーニングのために
使用され得る。ＡＴＬＡＳ−Ｘ配列に対応するヒト遺伝子を含むこれらのハイブ
リッドのみが、増幅されたフラグメントを産生する。
【０１７５】 体細胞ハイブリッドは、異なる哺乳動物（例えば、ヒトおよびマウス細胞）由
来の体細胞を融合することによって調製される。ヒトおよびマウス細胞のハイブ
リッドが増殖および分裂する場合、これらは次第に、ランダムな順序でヒト染色
体を喪失するが、マウスの染色体を保持する。特定の酵素を欠くのでマウス細胞
は増殖し得ないが、ヒト細胞は増殖し得る媒地を使用することによって、必要と
される酵素をコードする遺伝子を含む１つのヒト染色体が保持される。種々の媒
地を使用することによって、ハイブリッド細胞株のパネルが確立され得る。パネ
ルにおける各細胞株は、単一のヒト染色体または少数のヒト染色体のいずれか、
およびマウス染色体の全セットを含み、特定のヒト染色体に対する個々の遺伝子
の容易なマッピングを可能にする。（Ｄ’Ｅｕｓｔａｃｈｉｏら、（１９８３）
Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２０：９１９−９２４）。ヒト染色体のフラグメントのみを
含む体細胞ハイブリッドはまた、転座および欠失を有するヒト染色体を使用する
ことによって産生され得る。
【０１７６】 体細胞ハイブリッドのＰＣＲマッピングは、特定の配列を特定の染色体に割り
当てるための素早い手順である。単一のサーマルサイクラー（ｔｈｅｒｍａｌ
ｃｙｃｌｅｒ）を使用して、１日当たり、３個以上の配列が割り当てられ得る。
オリゴヌクレオチドプライマーを設計するために、ＡＴＬＡＳ−Ｘの配列を使用
して、特定の染色体由来のフラグメントのパネルを用いて、副局在（ｓｕｂｌｏ
ｃａｌｉｚａｔｉｏｎ）が達成され得る。
【０１７７】 ＤＮＡ配列の中期染色体スプレッド（ｓｐｒｅａｄ）に対する蛍光インサイチ
ュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）は、さらに、一工程で正確な染色体位置
を提供するために使用され得る。染色体スプレッドは、紡錘体を破壊するコルセ
ミドのような化合物によって中期で分裂がブロックされた細胞を使用して作製さ
れ得る。染色体は、トリプシンで手短に処理され、次いで、Ｇｉｅｍｓａで染色
される。明るいおよび暗いバンドのパターンが各染色体上で生成し、その結果、
染色体が個々に同定され得る。このＦＩＳＨ技術は、５００または６００個の塩
基ほどの短さのＤＮＡ配列を用いて使用され得る。しかし、１，０００個の塩基
よりも大きいクローンは、簡単な検出に十分なシグナル強度を有する独特の染色
体位置に結合する可能性がより高い。好ましくは、１，０００個の塩基、そして
より好ましくは、２，０００個の塩基は、合理的な時間の量で良好な結果を得る
のに十分である。この技術の総説については、Ｖｅｒｍａら、ＨＵＭＡＮ ＣＨ
ＲＯＭＯＳＯＭＥＳ：Ａ ＭＡＮＵＡＬ ＯＦ ＢＡＳＩＣ ＴＥＣＨＮＩＱＵ
ＥＳ（Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ １９８８）を参照の
こと。
【０１７８】 染色体マッピングのための試薬は、単一の染色体またはその染色体上の単一の
部位をマークするために個々に使用され得るか、あるいは試薬のパネルが複数の
部位および／または複数の染色体をマークするために使用され得る。実際、遺伝
子の非コード領域に対応する試薬が、マッピングの目的のために好ましい。コー
ド配列は、遺伝子ファミリー内でより保存されているようであり、それゆえ染色
体マッピングの間、クロスハイブリダイゼーションの機会が増加する。
【０１７９】 一旦、配列が正確な染色体位置にマッピングされると、染色体上の配列の物理
的位置が遺伝子マップデータと相関され得る。このようなデータは、例えば、Ｊ
ｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｗｅｌｃｈ Ｍｅｄｉｃａ
ｌ Ｌｉｂｒａｒｙからオンラインで入手可能な、ＭｃＫｕｓｉｃｋ、ＭＥＮＤ
ＥＬＩＡＮ ＩＮＨＥＲＩＴＡＮＣＥ ＩＮ ＭＡＮに見出される。次いで、同
じ染色体領域にマッピングされる、遺伝子と疾患との間の関係は、連鎖分析（物
理的に隣接する遺伝子の同時遺伝性）によって同定され得、例えば、Ｅｇｅｌａ
ｎｄら（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ、３２５：７８３−７８７に記載される。
【０１８０】 さらに、ＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子と関連する疾患に感染した個体と感染してい
ない個体との間のＤＮＡ配列における差が決定され得る。変異がいくらかのまた
は全ての感染した個体において観測されるが、感染していないいずれの個体にお
いても観測されない場合、この変異は、特定の疾患の原因因子であるようである
。感染した個体と感染していない個体との比較は、一般的に、まず、染色体スプ
レッドから可視であるかまたはそのＤＮＡ配列に基づくＰＣＲを使用して検出可
能な欠失または転座のような、染色体における構造的変化を探すことを包含する
。最終的に、幾人かの個体からの遺伝子の完全な配列決定が、変異の存在を確認
するため、そして多型性由来の変異を区別するために実施され得る。
【０１８１】 （組織型決定（ｔｉｓｓｕｅ ｔｙｐｉｎｇ）） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列はまた、わずかな生物学的サンプルから個体を識
別するために使用され得る。この技術において、個体のゲノムＤＮＡは、１つ以
上の制限酵素で消化され、そして同定のために独特のバンドを生成するためにサ
ザンブロット上でプローブされる。本発明の配列は、ＲＦＬＰ（米国特許第５，
２７２，０５７号に記載の「制限フラグメント長多型」）のためのさらなるＤＮ
Ａマーカーとして有用である。
【０１８２】 さらに、本発明の配列を用いて、個体のゲノムの選択された部分について実際
の塩基ごとにＤＮＡ配列を決定する代替的技術を提供し得る。従って、本明細書
中に記載のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列を用いて、配列の５’末端および３’末端から２
つのＰＣＲプライマーを調製し得る。次いで、これらのプライマーを使用して、
個体のＤＮＡを増幅し得、引き続いて、配列決定し得る。
【０１８３】 この様式で調製された個体由来の対応するＤＮＡ配列のパネルは、各個体が、
対立遺伝子差異に起因するこのようなＤＮＡ配列の独特のセットを有するので、
唯一の個体識別を提供し得る。本発明の配列は、個体由来および組織由来の配列
のこのような識別を得るために使用され得る。本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列は、
ヒトゲノムの部分を独特に表す。対立遺伝子変異は、これらの配列のコード領域
においてある程度生じ、そして非コード領域においてより大きな程度に生じる。
個々のヒト間での対立遺伝子変異は、各５００塩基につき約１回の頻度で生じる
と見積もられる。対立遺伝子変異の多さは、制限フラグメント長多型（ＲＦＬＰ
）を含む単一ヌクレオチド多型（ＳＮＰ）に起因する。
【０１８４】 本明細書中で記載の配列の各々は、ある程度、標準物質（これに対して個体か
らのＤＮＡが識別の目的で比較され得る）として使用され得る。より多くの多型
が非コード領域で生じるので、個体を区別するために、それほど多くの配列が必
要であるわけではない。配列番号１、３、５または７の非コード配列は、おそら
く１０〜１，０００プライマーのパネルを用いてポジティブな個体識別を不自由
なく提供し得る。これらのプライマーは、各々が１００塩基の増幅された非コー
ド配列を生じる。推定コード配列（例えば、配列番号１のヌクレオチド１〜 ２５８６、配列番号３のヌクレオチド１〜５５５３、配列番号５のヌクレオチド
９８〜９０４、または配列番号７のヌクレオチド１〜１０７４、における配列）
が使用される場合、ポジティブな個体識別に関するプライマーのより適切な数は
、５００〜２，０００である。
【０１８５】 （予測医療） 本発明はまた、診断アッセイ、予後アッセイ、薬理ゲノム（ｐｈａｒｍａｃｏ
ｇｅｎｏｍｉｃｓ）およびモニタリング臨床試験が、予後（予測）の目的に使用
され、これによって個体を予防的に処置する、予測医療の分野に関する。従って
、本発明の１つの局面は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質および／または核酸の発現
、ならびにＡＴＬＡＳ−Ｘの活性を、生物学的サンプル（例えば、血液、血清、
細胞、組織）の関連で決定し、これによって、異常なＡＴＬＡＳ−Ｘの発現また
は活性に関連して、個体が疾患または障害に罹患するかどうか、あるいは障害を
発症するリスクがあるかどうかを決定するための診断アッセイに関する。本発明
はまた、個体が、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、核酸の発現または活性と関連し
た障害を発症するリスクがあるかどうかを決定するための予後的（または予測的
）アッセイを提供する。例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における変異が、生物学
的サンプルにおいてアッセイされ得る。このようなアッセイは、予後的または予
測的な目的に使用され、これによってＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、核酸の発現
または活性によって特徴付けられるかまたはそれに関連した障害の発病の前に個
体を予防的に処置し得る。
【０１８６】 本発明の別の局面は、個体におけるＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、核酸の発現ま
たは活性を決定するための方法を提供し、これによって、その個体についての適
切な治療的または予防的因子（本明細書において「薬理ゲノム」とよばれる）を
選択する。薬理ゲノムは、個体の遺伝型（例えば、特定の因子に対して応答する
個体の能力を決定するために試験された個体の遺伝型）に基づいた、個体の治療
的または予防的処置のための因子（例えば、薬物）の選択を可能にする。
【０１８７】 本発明のなお別の局面は、臨床試験におけるＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性
に対する因子（例えば、薬剤、化合物）の影響をモニタリングすることに関する
。
【０１８８】 これらおよび他の因子は、以下の節でさらに詳細に記載される。
【０１８９】 （診断アッセイ） 生物学的サンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘの存在または非存在を検出するため
の例示的な方法は、試験被験体から生物学的サンプルを得る工程、およびその生
物学的サンプルをＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質またはＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を
コードする核酸（例えば、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ）を検出し得る化合物もしく
は薬剤とを接触させ、その結果、ＡＴＬＡＳ−Ｘの存在が、その生物学的サンプ
ルにおいて検出される、工程を包含する。ＡＴＬＡＳ−ＸのｍＲＮＡまたはゲノ
ムＤＮＡを検出するための薬剤は、ＡＴＬＡＳ−ＸのｍＲＮＡまたはゲノムＤＮ
Ａにハイブリダイズし得る、標識された核酸プローブである。この核酸プローブ
は、例えば、全長のＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸（例えば、配列番号１、３、５、７また
はその部分の核酸（例えば、少なくとも、１５、３０、５０、１００、２５０も
しくは５００ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドであり、そしてストリンジェ
ントな条件下でＡＴＬＡＳ−ＸのｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡと特異的にハイブ
リダイズするに十分である核酸））であり得る。本発明の診断アッセイにおける
使用のための他の適切なプローブは本明細書中に記載される。
【０１９０】 ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質を検出するための１つの薬剤は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタ
ンパク質と結合し得る抗体、好ましくは、検出可能な標識を有する抗体である。
抗体は、ポリクローナルであり得るか、またはより好ましくはモノクローナル抗
体であり得る。インタクトな抗体またはそのフラグメント（例えば、Ｆａｂまた
はＦ（ａｂ’）2）が使用され得る。用語「標識（された）」とは、プローブま
たは抗体に関して、検出可能な物質をそのプローブもしくは抗体にカップリング
させる（すなわち、物理的に連結する）ことによって、そのプローブまたは抗体
を直接標識すること、ならびに、直接標識される別の試薬との反応性によって、
そのプローブもしくは抗体を間接的に標識をすることを包含することが意図され
る。間接的な標識の例としては、蛍光標識された二次抗体を用いる一次抗体の検
出、および蛍光標識されたストレプトアビジンを用いて検出され得るようにビオ
チンを用いるＤＮＡプローブの末端標識が挙げられる。用語「生物学的サンプル
」とは、被験体から単離された、組織、細胞および生物学的流体ならびに被験体
に存在する組織、細胞および流体を含むことが意図される。すなわち、本発明の
検出方法を用いて、生物学的サンプル中のＡＴＬＡＳ−ＸのｍＲＮＡ、タンパク
質またはゲノムＤＮＡを、インビトロおよびインビボで検出し得る。例えば、Ａ
ＴＬＡＳ−Ｘ ｍＲＮＡの検出のためのインビトロ技術としては、ノーザンハイ
ブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。
ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の検出のためのインビトロ技術としては、酵素結合免
疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、ウェスタンブロット、免疫沈降および免疫蛍光
が挙げられる。ＡＴＬＡＳ−ＸゲノムＤＮＡを検出するためのインビトロ技術と
しては、サザンハイブリダイゼーションが挙げられる。さらに、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
タンパク質の検出のためのインビボ技術としては、標識された抗ＡＴＬＡＳ−Ｘ
抗体を被験体に導入することが挙げられる。例えば、その抗体は、放射性マーカ
ーを用いて標識され得る。この被験体における放射性マーカーの存在および位置
は、標準的な画像化技術によって検出され得る。
【０１９１】 １つの実施形態において、この生物学的サンプルは、その試験被験体からのタ
ンパク質分子を含む。あるいは、その生物学的サンプルは、その試験被験体から
のｍＲＮＡ分子またはその試験被験体からのゲノムＤＮＡ分子を含み得る。好ま
しい生物学的サンプルは、被験体から従来の手段によって単離された末梢血白血
球サンプルである。
【０１９２】 別の実施形態において、本方法はさらに、コントロール被験体からコントロー
ル生物学的サンプルを得る工程、そのコントロールサンプルを、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
のタンパク質、ｍＲＮＡもしくはゲノムＤＮＡを検出し得る化合物または薬剤と
接触させ、その結果、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮ
Ａの存在がその生物学的サンプルにおいて検出される、工程、およびそのコント
ロールサンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤ
ＮＡの存在と、その試験サンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮ
ＡまたはゲノムＤＮＡの存在とを比較する工程を包含する。
【０１９３】 本発明はまた、生物学的サンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘの存在を検出するた
めのキットを包含する。例えば、このキットは、以下を備え得る：生物学的サン
プルにおいてＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質またはｍＲＮＡを検出し得る、標識さ
れた化合物または薬剤；そのサンプルにおいてＡＴＬＡＳ−Ｘの量を決定するた
めの手段；およびそのサンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘの量を標準と比較するた
めの手段。この化合物または薬剤は、適切な容器内にパッケージングされ得る。
このキットは、さらに、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質または核酸を検出するために
キットを用いるための説明書を備え得る。
【０１９４】 （予後アッセイ） 本明細書において記載された診断方法をさらに利用して、ＡＴＬＡＳ−Ｘの異
常発現または異常活性に関連した疾患もしくは障害を有するか、またはその発症
の危険性を有する被験体を同定し得る。例えば、本明細書に記載されるアッセイ
（例えば、上述の診断アッセイまたは下記のアッセイ）を利用して、ＡＴＬＡＳ
−Ｘのタンパク質、核酸の発現または活性に関連する障害（例えば、癌、免疫系
関連障害（例えば、多発性硬化症）、または線維症性障害）を有するかまたはそ
の発症の危険性を有する被験体を同定し得る。あるいは、この予後アッセイを利
用して、疾患または障害を有するかまたはその発症の危険性を有する被験体を同
定し得る。従って、本発明は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの異常発現または異常活性に関連
する疾患もしくは障害を同定するための方法を提供する。ここで、試験サンプル
は、被験体から得られ、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質または核酸（例えば
、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ）が検出され、ここで、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質
または核酸の存在は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの異常発現または異常活性に関連する疾患
または障害を有するかまたはその発症の危険性を有する被験体についての診断指
標である。本明細書において使用される場合「試験サンプル」とは、目的の被験
体から得られた生物学的サンプルをいう。例えば、試験サンプルは、生物学的流
体（例えば、血清）、細胞サンプル、または組織であり得る。
【０１９５】 さらに、本明細書に記載される予後アッセイを使用して、被験体に薬剤（例え
ば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核
酸、低分子、または他の薬物候補）を投与してＡＴＬＡＳ−Ｘの異常発現または
異常活性に関連する疾患または障害を処置し得るか否かを、決定し得る。例えば
、このような方法を使用して、被験体が障害（例えば、癌、免疫系関連障害）の
ための薬剤で有効に処置され得るか否かを決定し得る。従って、本発明は、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘの異常発現または異常活性に関連する障害についての薬剤を用いて、
被験体が有効に処置され得るか否かを決定するための方法を提供する。ここで、
試験サンプルが得られ、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質または核酸が検出さ
れる（例えば、ここで、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質または核酸の存在は、この
薬剤が投与されてＡＴＬＡＳ−Ｘの異常発現または異常活性に関連する障害が処
置され得る被験体についての、診断指標である）。
【０１９６】 本発明の方法はまた、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における遺伝的損傷を検出し、そ
れによって、その損傷遺伝子を有する被験体が異常な細胞増殖および／または分
化によって特徴付けられる障害についての危険性を有するか否かを決定するため
にも使用され得る。種々の実施形態において、この方法は、その被験体からの細
胞のサンプルにおいて、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質をコードする遺伝子の統合性
に影響を与える少なくとも１つの変更によって特徴付けられる遺伝的損傷の存在
または非存在、あるいはＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の誤発現を検出する工程を包含す
る。例えば、そのような遺伝的損傷は、以下の少なくとも１つの存在を確認する
ことによって検出され得る：（１）ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子からの１つ以上のヌク
レオチドの欠失；（２）ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子への１つ以上のヌクレオチドの付
加；（３）ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の１つ以上のヌクレオチドの置換、（４）ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ遺伝子の染色体再配置；（５）ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子のメッセンジャ
ーＲＮＡ転写物のレベルにおける変更、（６）ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の異常改変
（例えば、ゲノムＤＮＡのメチル化パターンの異常改変）、（７）ＡＴＬＡＳ−
Ｘ遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物の非野生型スプライシングパターンの存
在、（８）ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の非野生型レベル、（９）ＡＴＬＡＳ−Ｘ
遺伝子の対立遺伝子の欠失、ならびに（１０）ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の不適
切な翻訳後修飾。本明細書において記載されるように、当該分野において、ＡＴ
ＬＡＳ−Ｘ遺伝子における損傷を検出するために使用され得る、多数の公知のア
ッセイ技術が存在する。好ましい生物学的サンプルは、従来手段によって被験体
から単離された末梢血白血球サンプルである。しかし、有核細胞を含む任意の生
物学的サンプルが使用され得、これには、例えば、頬粘膜細胞が挙げられる。
【０１９７】 特定の実施形態において、損傷の検出は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（
例えば、米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号を参
照のこと）（例えば、アンカーＰＣＲまたはＲＡＣＥ ＰＣＲ）、あるいは、連
結連鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、Ｌａｎｄｅｇｒａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎ
ｃｅ ２４１：１０７７−１０８０；およびＮａｋａｚａｗａら（１９９４）Ｐ
ＮＡＳ ９１：３６０−３６４を参照のこと）におけるプローブ／プライマーの
使用を包含する。後者は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における点変異を検出するため
に特に有用であり得る）（Ａｂｒａｖａｙａら，１９９５ Ｎｕｃｌ Ａｃｉｄ
ｓ Ｒｅｓ ２３：６７５−６８２を参照のこと）。この方法は、患者から細胞
のサンプルを収集する工程、核酸（例えば、ゲノム、ｍＲＮＡまたはその両方）
をそのサンプルの細胞から単離する工程、ＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子に特異的にハ
イブリダイズする１つ以上のプライマーとその核酸サンプルとを、ＡＴＬＡＳ−
Ｘ遺伝子（存在する場合）のハイブリダイゼーションおよび増幅が生じるような
条件下で接触させる工程、ならびに増幅産物の存在もしくは非存在を検出する工
程、またはその増幅産物のサイズを検出する工程およびその長さをコントロール
サンプルと比較する工程を包含し得る。ＰＣＲおよび／またはＬＣＲは、本明細
書中に記載される変異を検出するために使用される技術のいずれかとともに予備
的増幅工程として使用されることが望ましくあり得ることが予想される。
【０１９８】 代替的な増幅方法としては、以下が挙げられる：当業者に周知な技術を用いた
、その増幅された分子の検出の前の、自己維持配列複製（Ｇｕａｔｅｌｌｉら、
１９９０、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１８７４−
１８７８を参照のこと）、転写増幅系（Ｋｗｏｈら、１９８９、Ｐｒｏｃ．Ｎａ
ｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：１１７３−１１７７を参照のこと）、
Ｑβレプリカーゼ（Ｌｉｚａｒｄｉら、１９８８、ＢｉｏＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ
６：１１９７を参照のこと）、または他の任意の核酸増幅方法。これらの検出
スキームは、核酸分子が非常に極少数で存在する場合に、そのような核酸分子の
検出のために特に有用である。
【０１９９】 代替の実施形態において、サンプル細胞からのＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における
変異は、制限酵素切断パターンにおける変更によって同定され得る。例えば、サ
ンプルおよびコントロールのＤＮＡが単離され、増幅され（必要に応じて）、１
つ以上の制限エンドヌクレアーゼを用いて消化され、そしてフラグメント長の大
きさがゲル電気泳動によって決定され、そして比較される。サンプルＤＮＡとコ
ントロールＤＮＡとの間のフラグメント長の大きさにおける差異は、そのサンプ
ルＤＮＡにおける変異を示す。さらに、配列特異的なリボザイムの使用（例えば
、米国特許第５，４９３，５３１号を参照のこと）を使用して、リボザイム切断
部位の発生または喪失によって特異的な変異の存在についてスコア付けし得る。
【０２００】 他の実施形態において、ＡＴＬＡＳ−Ｘにおける遺伝子変異は、サンプル核酸
およびコントロール核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を、数百または数千の
オリゴヌクレオチドプローブを含む高密度アレイに対してハイブリダイズさせる
ことによって同定され得る（Ｃｒｏｎｉｎら（１９９６）Ｈｕｍａｎ Ｍｕｔａ
ｔｉｏｎ ７：２４４−２５５；Ｋｏｚａｌら（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ．Ｍｅ
ｄｉｃｉｎｅ．２：７５３−７５９）。例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘにおける遺伝子
変異は、Ｃｒｏｎｉｎら（前出）に記載されるように光生成ＤＮＡプローブを含
む二次元アレイにおいて同定され得る。手短には、プローブの第一ハイブリダイ
ゼーションアレイを用いて、サンプルおよびコントロールにおける長いストレッ
チのＤＮＡにわたって走査し、連続的に重複するプローブの線形アレイを作成す
ることによって、その配列間の塩基変化を同定し得る。この工程は、点変異の同
定を可能にする。この工程に第二のハイブリダイゼーションアレイが続き、これ
は、検出される全ての改変体または変異体に相補的な、より小さな特化されたプ
ローブアレイを用いることによる特定の変異の特徴付けを可能にする。各変異ア
レイは、一方が野生型遺伝子に対して相補的であり、そして他方が変異遺伝子に
対して相補である並行プローブセットから構成される。
【０２０１】 なお別の実施形態において、当該分野で公知の種々の配列決定反応のいずれか
を使用して、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子を直接配列決定し得、そしてサンプルＡＴＬ
ＡＳ−Ｘ配列と対応する野生型（コントロール）配列とを比較することによって
、変異を検出し得る。配列決定反応の例としては、ＭａｘｉｍおよびＧｉｌｂｅ
ｒｔ（１９７７）ＰＮＡＳ ７４：５６０またはＳａｎｇｅｒ（１９７７）ＰＮ
ＡＳ ７４：５４６３によって開発された技術に基づくものが挙げられる。診断
アッセイを実施する場合、種々の自動化配列決定手順のいずれかを利用し得るこ
ともまた意図される（Ｎａｅｖｅら（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ
１９：４４８）。これらには、質量分析法による配列決定法（例えば、ＰＣＴ国
際公開番号ＷＯ ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら（１９９６）Ａｄｖ Ｃｈｒ
ｏｍａｔｏｇｒ ３６：１２７−１６２；およびＧｒｉｆｆｉｎら（１９９３）
Ａｐｐｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ３８．：１４７−１５９を
参照のこと）が含まれる。
【０２０２】 ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子における変異を検出するための他の方法としては、切断
剤からの保護を使用して、ＲＮＡ／ＲＮＡもしくはＲＮＡ／ＤＮＡのヘテロ二重
鎖に基づくミスマッチ塩基を検出する方法が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら（１９８
５）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３０：１２４２）。一般に、「ミスマッチ切断」の当該
分野の技術は、野生型のＡＴＬＡＳ−Ｘ配列を含む（標識された）ＲＮＡまたは
ＤＮＡを、組織サンプルから得られた潜在的な変異体ＲＮＡまたはＤＮＡとハイ
ブリダイズさせることによって形成されるヘテロ二重鎖を提供する工程によって
始まる。この二本鎖の二重鎖を、二重鎖の一本鎖領域（例えば、そのコントロー
ルとサンプルの鎖との間の塩基対ミスマッチに起因して存在するもの）を切断す
る薬剤を用いて処理する。例えば、ＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖を、ＲＮａｓｅを用い
て処理し得、そしてＤＮＡ／ＤＮＡハイブリッドを、そのミスマッチ領域を酵素
的に消化することに対して、Ｓ１ヌクレアーゼを用いて処理し得る。他の実施形
態において、ＤＮＡ／ＤＮＡまたはＲＮＡ／ＤＮＡのいずれかの二重鎖を、ミス
マッチ領域を消化するために、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウム、お
よびピペリジンを用いて処理し得る。そのミスマッチ領域の消化後、次いで、得
られた物質を変性ポリアクリルアミドゲル上で、大きさにより分離して、変異の
部位を決定する。例えば、Ｃｏｔｔｏｎら（１９８８）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａ
ｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８５：４３９７；Ｓａｌｅｅｂａら（１９９２）Ｍｅ
ｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ ２１７：２８６−２９５を参照のこと。１つの実
施形態において、コントロールのＤＮＡまたはＲＮＡは、検出のために標識され
得る。
【０２０３】 なお別の実施形態において、ミスマッチ切断反応は、二本鎖ＤＮＡにおけるミ
スマッチ塩基対を認識する１つ以上のタンパク質（いわゆる「ＤＮＡミスマッチ
修復」酵素）を、細胞のサンプルから得られたＡＴＬＡＳ−Ｘ ｃＤＮＡにおけ
る点変異を検出およびマッピングするために規定された系において使用する。例
えば、Ｅ．ｃｏｌｉのｍｕｔＹ酵素は、Ｇ／ＡミスマッチでＡを切断し、そして
ＨｅＬａ細胞からのチミジンＤＮＡグリコシラーゼは、Ｇ／ＴミスマッチでＴを
切断する（Ｈｓｕら（１９９４）Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ １５：１６５
７〜１６６２）。例示的な実施形態に従って、ＡＴＬＡＳ−Ｘ配列（例えば、野
生型ＡＴＬＡＳ−Ｘ配列）に基づくプローブは、試験細胞由来のｃＤＮＡまたは
他のＤＮＡ産物にハイブリダイズされる。二重鎖は、ＤＮＡミスマッチ修復酵素
を用いて処理され、そしてその切断産物（もしあれば）は、電気泳動プロトコル
などから検出され得る。例えば、米国特許第５，４５９，０３９号を参照のこと
。
【０２０４】 他の実施形態において、電気泳動の移動度における変化は、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺
伝子における変異を同定するために使用される。例えば、一本鎖コンホメーショ
ン多型（ＳＳＣＰ）は、変異体と野生型核酸との間の電気泳動の移動度における
差異を検出するために使用され得る（Ｏｒｉｔａら（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａ
ｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ：８６：２７６６、またＣｏｔｔｏｎ（１９９
３）Ｍｕｔａｔ Ｒｅｓ ２８５：１２５〜１４４；Ｈａｙａｓｈｉ（１９９２
）Ｇｅｎｅｔ Ａｎａｌ Ｔｅｃｈ Ａｐｐｌ ９：７３〜７９を参照のこと）
。サンプルおよびコントロールＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸の一本鎖ＤＮＡフラグメント
は、変性され、そして再生される。一本鎖核酸の二次構造は、配列に従って変化
し、電気泳動の移動度において得られる変化は、１つの塩基変化の検出さえも可
能にする。ＤＮＡフラグメントは、標識され得るか、または標識されたプローブ
を用いて検出され得る。アッセイの感度は、ＤＮＡよりもむしろ、二次構造が配
列中の変化に対してより感受的であるＲＮＡを使用することによって増強され得
る。１つの実施形態において、本発明の方法は、ヘテロ二重鎖分析を利用して、
電気泳動の移動度における変化に基づいて二本鎖のヘテロ二重鎖分子を分離する
（Ｋｅｅｎら（１９９１）Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ ７：５）。
【０２０５】 なお別の実施形態において、一定勾配の変性剤を含有するポリアクリルアミド
ゲルにおける変異体または野生型フラグメントの移動は、変性勾配ゲル電気泳動
（ＤＧＧＥ）を使用してアッセイされる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｎａｔｕｒ
ｅ ３１３：４９５）。ＤＧＧＥが分析の方法として使用される場合、ＤＮＡは
、例えば、ＰＣＲにより約４０ｂｐの高融点ＧＣリッチＤＮＡのＧＣクランプを
付加することによって、完全には変性されないことを確実するように改変される
。さらなる実施形態において、温度勾配は、コントロールおよびサンプルＤＮＡ
の移動度における差異を同定するために、変性剤勾配の代わりに使用される（Ｒ
ｏｓｅｎｂａｕｍおよびＲｅｉｓｓｎｅｒ（１９８７）Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｃｈｅ
ｍ ２６５：１２７５３）。
【０２０６】 点変異を検出するための他の技術の例としては、以下が挙げられるが、これら
に限定されない：選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増
幅、または選択的プライマー伸長。例えば、オリゴヌクレオチドプライマーは、
既知の変異が中心的に配置されるように調製され得、次いで、完全なマッチが見
出される場合にのみハイブリダイゼーションを許容する条件下で標的ＤＮＡにハ
イブリダイズされる（Ｓａｉｋｉら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ ３２４：１６３
）；Ｓａｉｋｉら（１９８９）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ＵＳＡ
８６：６２３０）。このような対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドは、この
オリゴヌクレオチドがハイブリダイズ膜に付着され、そして標識された標的ＤＮ
Ａとハイブリダイズされる場合に、ＰＣＲ増幅された標的ＤＮＡまたは多くの異
なる変異にハイブリダイズされる。
【０２０７】 あるいは、選択的ＰＣＲ増幅に依存する対立遺伝子特異的増幅技術は、本発明
と合わせて使用され得る。特異的増幅についてのプライマーとして使用されるオ
リゴヌクレオチドは、分子の中心において（その結果、増幅は、差次的ハイブリ
ダイゼーションに依存する）（Ｇｉｂｂｓら（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃ
ｉｄｓ Ｒｅｓ １７：２４３７〜２４４８）か、あるいは適切な条件下でミス
マッチが妨げられ得るかまたはポリメラーゼ伸長を減少し得る、１つのプライマ
ーの３’の最末端で、目的の変異を保有し得る（Ｐｒｏｓｓｎｅｒ（１９９３）
Ｔｉｂｔｅｃｈ １１：２３８）。さらに、変異領域に新規な制限部位を導入す
ることは、切断に基づく検出を行うために望ましくあり得る（Ｇａｓｐａｒｉｎ
ｉら（１９９２）Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｐｒｏｂｅｓ ６：１）。特定の実施形態
において、増幅はまた、増幅用Ｔａｑリガーゼを使用して実施され得ることが予
測される（Ｂａｒａｎｙ（１９９１）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ
ＵＳＡ ８８：１８９）。このような場合において、連結は、５’配列の３’末
端に完全なマッチが存在する場合にのみ生じ、増幅の存在または非存在を探索す
ることによって、特定の部位における既知の変異の存在を検出することを可能に
する。
【０２０８】 本明細書中に記載される方法は、例えば、本明細書中に記載される少なくとも
１つのプローブ核酸または抗体試薬を含む、予めパッケージングされた診断キッ
トを利用することによって実施され得、これは、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子
を含む疾患または疾病の症状または家族病歴を示す患者を診断するための臨床的
設定において簡便に使用され得る。
【０２０９】 さらに、ＡＴＬＡＳ−Ｘが発現される任意の細胞型または組織（好ましくは、
末梢血白血球）は、本明細書中に記載される予後アッセイにおいて利用され得る
。しかし、有核細胞を含む任意の生物学的サンプル（例えば、頬粘膜細胞を含む
）が、使用され得る。
【０２１０】 （薬理ゲノム学（Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ）） ＡＴＬＡＳ−Ｘ活性（例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子発現）に対する刺激性ま
たは阻害性の影響を有する因子、すなわちモジュレーターは、本明細書中に記載
されるスクリーニングアッセイによって同定されるように、異常なＡＴＬＡＳ−
Ｘ活性に関連する障害（例えば、癌）または免疫障害を処置（予防的または治療
的に）するために個体に投与され得る。このような処置と合わせて、個体の薬理
ゲノム学（すなわち、個体の遺伝子型と外来化合物または薬物に対するその個体
の応答との間の関係についての研究）が、考慮され得る。治療剤の代謝における
差異は、薬理学的に活性な薬物の用量と血中濃度との間の関係を変更することに
よって、重篤な毒性または治療の失敗を導き得る。従って、個体の薬理ゲノム学
は、個体の遺伝子型の考慮に基づく予防的または治療的処置のために有効な薬剤
（例えば、薬物）の選択を許容する。このような薬理ゲノム学は、さらに、適切
な投薬量および治療剤レジメンを決定するために使用され得る。従って、ＡＴＬ
ＡＳ−Ｘタンパク質の活性、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸の発現、あるいは個体における
ＡＴＬＡＳ−Ｘ遺伝子の変異含量が決定されて、それによって個体の治療的また
は予防的処置のために適切な薬剤を選択し得る。
【０２１１】 薬理ゲノム学は、罹患された人における変更された薬物の性質および異常な作
用に起因して、薬物に応答する臨床的に有意な遺伝性変更を扱う。例えば、Ｅｉ
ｃｈｅｌｂａｕｍ、Ｃｌｉｎ Ｅｘｐ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ，
１９９６，２３：９８３〜９８５およびＬｉｎｄｅｒ、Ｃｌｉｎ Ｃｈｅｍ，１
９９７，４３：２５４〜２６６を参照のこと。一般に、２つの型の薬理ゲノム学
状態が、区別され得る。薬物が身体に作用する方法を変更する１つの因子として
伝達される遺伝的状態（変更された薬物作用）、または身体が薬物に作用する方
法を変更する１つの因子として伝達される遺伝的状態（変更された薬物代謝）。
これらの薬理ゲノム学状態は、稀な欠損としてか、または多型としてのいずれか
で生じ得る。例えば、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ（Ｇ６ＰＤ）欠
損は、一般的な遺伝性酵素病であり、この主な臨床的合併症は、酸化剤薬物（抗
マラリア剤、スルホンアミド、鎮痛薬、ニトロフラン）の摂取およびソラマメの
消費後の溶血である。
【０２１２】 例示的な実施形態として、薬物代謝酵素の活性は、薬物作用の強度および持続
期間の両方の主要な決定因子である。薬物代謝酵素（例えば、Ｎ−アセチルトラ
ンスフェラーゼ２（ＮＡＴ２）およびシトクロムＰ４５０酵素ＣＹＰ２Ｄ６およ
びＣＹＰ２Ｃ１９）の遺伝的多型の発見は、幾人かの患者が予期される薬物効果
を得ないか、または標準的かつ安全な用量の薬物を摂取した後に過大な薬物応答
および深刻な毒性を示すことに関しての説明を提供した。これらの多型は、集団
において２つの表現型（高い代謝能を持つ人（ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｍｅｔａｂ
ｏｌｉｚｅｒ）（ＥＭ）および低い代謝能を持つ人（ｐｏｏｒ ｍｅｔａｂｏｌ
ｉｚｅｒ）（ＰＭ））で表現される。ＰＭの有病率は、異なる集団の間で異なる
。例えば、ＣＹＰ２Ｄ６をコードする遺伝子は高度に多型であり、そしていくら
かの変異がＰＭにおいて同定されており、この全ては機能的ＣＹＰ２Ｄ６の非存
在に至る。ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９の低い代謝能を持つ人は、彼らが
標準的な用量を受ける場合に、かなり頻繁に過大な薬物応答および副作用を経験
する。代謝産物が活性な治療的部分である場合、そのＣＹＰ２Ｄ６形成代謝産物
であるモルヒネによって媒介されるコデインの鎮痛効果について実証されるよう
に、ＰＭは治療的応答を示さない。他の極端なものは、標準的な用量に応答しな
い、いわゆる超迅速な代謝能を持つ人である。最近、超迅速な代謝の基準となる
分子は、ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子増幅に起因していることが同定されている。
【０２１３】 従って、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質の活性、ＡＴＬＡＳ−Ｘの核酸の発現、
あるいは個体におけるＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子の変異内容を決定して、それによ
って、その個体の治療的または予防的処置のために適切な薬剤を選択し得る。さ
らに、薬理ゲノム学の研究を使用して、個体の薬物応答性の表現型の同定に対し
て薬物代謝酵素をコードする多型対立遺伝子の遺伝子型を適用し得る。この知見
は、用量または薬物選択に適用される場合、有害な反応または治療の失敗を回避
し得、従って、被験体をＡＴＬＡＳ−Ｘの調節因子（例えば、本明細書中に記載
される例示的なスクリーニングアッセイの１つによって同定される調節因子）を
用いて処置する場合に治療的または予防的効率を増強し得る。
【０２１４】 （臨床試験中の効果のモニタリング） ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性（例えば、異常な細胞増殖および／または分
化を調節する能力）に対する薬剤（例えば、薬物、化合物）の影響をモニタリン
グすることは、基本的な薬物スクリーニングのみならず、臨床試験にも適用され
得る。例えば、本明細書中に記載されるようなスクリーニングアッセイによって
決定される、ＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子発現、タンパク質レベルを増加するため、
またはＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を上方調節する薬剤の効力は、減少したＡＴＬＡＳ−
Ｘの遺伝子発現、タンパク質レベル、または下方調節したＡＴＬＡＳ−Ｘの活性
を示す被験体の臨床試験においてモニターされ得る。あるいは、スクリーニング
アッセイによって決定される、ＡＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子発現、タンパク質レベル
を減少、またはＡＴＬＡＳ−Ｘの活性を下方調節する薬剤の効力は、増加したＡ
ＴＬＡＳ−Ｘの遺伝子発現、タンパク質レベル、または上方調節したＡＴＬＡＳ
−Ｘの活性を示す被験体の臨床試験においてモニターされ得る。このような臨床
試験において、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性、および好ましくは、例えば、
細胞増殖または免疫障害に関与するような他の遺伝子が、「リードアウト（読み
出し）（ｒｅａｄ ｏｕｔ）」、すなわち、特定の免疫細胞の応答性のマーカー
として使用され得る。
【０２１５】 例えば、そして限定の目的ではないが、ＡＴＬＡＳ−Ｘを含む遺伝子（これは
、ＡＴＬＡＳ−Ｘ活性（例えば、本明細書中に記載されるようなスクリーニング
アッセイにおいて同定される）を調節する薬剤（例えば、化合物、薬物または低
分子）を用いる処置によって、細胞内で調節される）が、同定され得る。従って
、細胞性増殖障害に対する薬剤の効果を研究するために、例えば、臨床試験にお
いて、細胞が単離され得、そしてＲＮＡが調製され得、そしてＡＴＬＡＳ−Ｘお
よびこの障害に関与する他の遺伝子の発現のレベルについて分析され得る。遺伝
子発現のレベル（すなわち、遺伝子発現パターン）は、本明細書中に記載される
ように、ノーザンブロット分析もしくはＲＴ−ＰＣＲによるか、あるいは産生さ
れるタンパク質の量を測定することによるか、本明細書中に記載されるような方
法の１つによるか、あるいはＡＴＬＡＳ−Ｘまたは他の遺伝子の活性のレベルを
測定することによって、定量され得る。この様式で、この遺伝子発現パターンは
、この薬剤に対する細胞の生理学的応答の指標であるマーカーとして作用し得る
。従って、この応答状態は、この薬剤を用いる個体の処置の前、および処置の間
の種々の時点で、決定され得る。
【０２１６】 １つの実施形態において、本発明は、薬剤（例えば、アゴニスト、アンタゴニ
スト、タンパク質、ペプチド、ペプチド模倣物、核酸、低分子、または本明細書
中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される他の薬物候補物）を
用いる、被験体の処置の効力をモニタリングするための方法を提供し、これは、
以下の工程を包含する：（ｉ）薬剤の投与の前に、被験体から投与前サンプルを
得る工程；（ｉｉ）この投与前サンプルにおいて、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質
、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現のレベルを検出する工程；（ｉｉｉ）こ
の被験体から１つ以上の投与後サンプルを得る工程；（ｉｖ）この投与後サンプ
ルにおいて、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発
現または活性のレベルを検出する工程；（ｖ）この投与前サンプルにおけるＡＴ
ＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現または活性のレ
ベルを、この投与後サンプルにおけるＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質、ｍＲＮＡ、
またはゲノムＤＮＡの発現または活性のレベルと比較する工程；ならびに（ｖｉ
）従って、この被験体に対する薬剤の投与を変更する工程。例えば、この薬剤の
増加した投与は、検出されるよりも高いレベルにＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活
性を増加することが（すなわち、この薬剤の効力を増加すること）望ましくあり
得る。あるいは、この薬剤の減少した投与は、検出されるよりも低いレベルにＡ
ＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性を減少すること（すなわち、この薬剤の効力を減
少すること）が望ましくあり得る。
【０２１７】 （処置方法） 本発明は、異常なＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性に関連する障害の危険性の
ある（または感受性）か、またはこの障害を有する被験体を処置する予防的およ
び治療的の両方の方法を提供する。
【０２１８】 （障害） （その疾患または障害に罹患していない被験体と比較して）増加したレベルま
たは生物学的活性によって特徴付けられる疾患および障害は、活性を拮抗する（
すなわち、低減または阻害する）治療剤を用いて処置され得る。活性を拮抗する
治療剤は、治療的または予防的な様式で、投与され得る。利用され得る治療剤と
しては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：（ｉ）上記ペプチド、ま
たはそのアナログ、誘導体、フラグメントもしくはホモログ；（ｉｉ）上記ペプ
チドに対する抗体；（ｉｉｉ）上記ペプチドをコードする核酸；（ｉｖ）相同組
換えによって上記ペプチドの内因性機能を「ノックアウトする」ために利用され
る、アンチセンス核酸および「機能不全性」である（すなわち、上記ペプチドに
対するコード配列のコード配列内の異種挿入に起因する）核酸の投与（例えば、
Ｃａｐｅｃｃｈｉ、１９８９、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１２８８〜１２９２を
参照のこと）；または（ｖ）上記ペプチドとその結合パートナーとの間の相互作
用を変化させる、調節因子（すなわち、インヒビター、アゴニストおよびアンタ
ゴニスト（本発明のさらなるペプチド模倣物または本発明のペプチドに対して特
異的な抗体を含む））。
【０２１９】 （その疾患または障害に罹患していない被験体と比較して）減少したレベルま
たは生物学的活性によって特徴付けられる疾患および障害は、活性を増加させる
（すなわち、活性に対するアゴニストである）治療剤を用いて処置され得る。活
性を上方調節する治療剤は、治療的または予防的な様式で、投与され得る。利用
され得る治療剤としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：上記ペ
プチド、またはそのアナログ、誘導体、フラグメントもしくはホモログ；あるい
はバイオアベイラビリティーを増加させるアゴニスト。
【０２２０】 増加したレベルまたは減少したレベルは、ペプチドおよび／またはＲＮＡを定
量することによって、容易に検出され得る。この定量は、患者の組織サンプルを
（例えば、生検組織から）入手し、そしてそのサンプルを、その発現したペプチ
ド（または上記ペプチドのｍＲＮＡ）のＲＮＡレベルまたはペプチドレベル、構
造および／または活性をインビトロでアッセイすることによる。当該分野におい
て周知の方法としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：イムノア
ッセイ（例えば、ウェスタンブロット分析、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）
ポリアクリルアミドゲル電気泳動が後に続く免疫沈降、免疫細胞化学などによる
）および／またはｍＲＮＡの発現を検出するためのハイブリダイゼーションアッ
セイ（例えば、ノーザンアッセイ、ドットブロット、インサイチュハイブリダイ
ゼーションなど）。
【０２２１】 （予防的方法） １つの局面において、本発明は、被験体において異常なＡＴＬＡＳ−Ｘの発現
または活性と関連する疾患または状態を、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または少なくと
も１つのＡＴＬＡＳ−Ｘ活性を調節する薬剤をこの被験体に投与することによっ
て予防するための方法を提供する。異常なＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性によ
って引き起こされるかまたはこれらに起因する、疾患にかかる危険がある被験体
は、例えば、本明細書中に記載の診断アッセイまたは予後アッセイのいずれか、
またはそれらの組み合わせによって、同定され得る。予防薬剤の投与は、疾患ま
たは障害が予防されるか、あるいはその進行を遅らせられるように、このＡＴＬ
ＡＳ−Ｘ異常の特徴である症状の発現の前に行い得る。このＡＴＬＡＳ−Ｘ異常
の型に依存して、例えば、ＡＴＬＡＳ−Ｘアゴニスト薬剤またはＡＴＬＡＳ−Ｘ
アンタゴニスト薬剤が、その被験体を処置するために使用され得る。その適切な
薬剤は、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイに基づいて決定され得る。
本発明の予防方法は、以下の小区分において、さらに議論される。
【０２２２】 （治療方法） 本発明の別の局面は、治療目的のためにＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性を調
節する方法に関する。本発明の調節方法は、細胞を、その細胞に関するＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質活性の活性のうちの１つ以上を調節する薬剤と接触させる工程
を包含する。ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質活性を調節する薬剤は、核酸またはタン
パク質、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質の天然に存在する同族リガンド、ペプチド、
ＡＴＬＡＳ−Ｘペプチド模倣物、または他の低分子のような、本明細書中に記載
されるような薬剤であり得る。１つの実施形態において、この薬剤は、ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘタンパク質活性のうちの１つ以上を刺激する。このような刺激薬剤の例と
しては、活性なＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質、およびその細胞に導入されたＡＴＬ
ＡＳ−Ｘをコードする核酸分子が挙げられる。別の実施形態において、この薬剤
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質活性のうちの１つ以上を阻害する。このような阻
害薬剤の例としては、アンチセンスＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸分子、および抗ＡＴＬＡ
Ｓ−Ｘ抗体が挙げられる。これらの調節方法は、インビトロで（例えば、その薬
剤とともにその細胞を培養することによって）、あるいはインビボで（例えば、
被験体にその薬剤を投与することによって）実施され得る。このように、本発明
は、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質または核酸分子の、異常な発現または異常な活
性によって特徴付けられる、疾患または障害に罹患した個体を処置する方法を提
供する。１つの実施形態において、この方法は、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活
性を調節する（例えば、上方調節または下方調節する）薬剤（例えば、本明細書
中に記載のスクリーニングアッセイによって同定される薬剤）あるいはそのよう
な薬剤の組み合わせを投与する工程を包含する。別の実施形態において、この方
法は、ＡＴＬＡＳ−Ｘのタンパク質または核酸分子を、低減したかまたは異常な
、ＡＴＬＡＳ−Ｘの発現または活性を補償するための治療として、投与する工程
を包含する。
【０２２３】 ＡＴＬＡＳ−Ｘ活性の刺激は、ＡＴＬＡＳ−Ｘが異常に下方調節されている状
況、および／またはＡＴＬＡＳ−Ｘ活性の増加が有益な効果を有するようである
状況において、望ましい。このような状況の１つの例は、被験体が、異常な細胞
増殖および／または細胞分化によって特徴付けられる障害（例えば、癌または免
疫関連障害）を有する場合である。このような状況の別の例は、被験体が妊娠疾
患（例えば、プレクランプシア（ｐｒｅｃｌａｍｐｓｉａ））を有する場合であ
る。
【０２２４】 （治療剤の生物学的効果の決定） 本発明の種々の実施形態において、適切なインビトロまたはインビボアッセイ
を行って、特定の治療剤の効果およびその投与が罹患組織の処置を示すか否かを
決定する。
【０２２５】 種々の特定の実施形態において、インビトロアッセイが患者の障害に関与する
代表的な細胞型で行われ、所定の治療剤がこの細胞型に対して所望の効果を発揮
するか否かを決定し得る。治療において使用する化合物は、ヒト被験体において
試験する前に適切な動物モデル系において試験され得る。これらの動物モデル系
としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ラット、マウス、ニワ
トリ、ウシ、サル、ウサギなど。同様に、インビボ試験については、当該分野で
公知の任意の動物モデル系が、ヒト被験体に対する投与の前に使用され得る。
【０２２６】 （悪性疾患） 本発明の治療剤は、細胞の過剰増殖および／または細胞増殖の制御の欠損（例
えば、癌、悪性疾患および腫瘍）に関連する疾患または障害の治療的処置または
予防的処置において有用であり得る。そのような過剰増殖障害の総説について、
例えば、Ｆｉｓｈｍａｎら、１９８５、ＭＥＤＩＣＩＮＥ、第２版、Ｊ．Ｂ．Ｌ
ｉｐｐｉｎｃｏｔｔ Ｃｏ．、Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ、ＰＡを参照のこと。
【０２２７】 本発明の治療剤を、悪性疾患および関連する障害の処置または予防における効
力について、当該分野内において公知の任意の方法によってアッセイし得る。そ
のようなアッセイとしては、形質転換された細胞または患者の腫瘍由来の細胞を
利用するインビトロアッセイ、ならびに癌または悪性疾患の動物モデルを使用す
るインビボアッセイが挙げられるが、これらに限定されない。可能性のある有効
な治療剤は、例えば、コントロールと比較して、培養物中での腫瘍由来細胞また
は形質転換細胞の増殖を阻害するか、または動物モデルにおいて腫瘍の後退を生
じる治療剤である。
【０２２８】 本発明の実施において、一旦、悪性疾患または癌が、活性を調節すること（す
なわち、阻害するか、アンタゴナイズするか、またはアゴナイズする）による処
置に対して感受性であることが示されると、引き続いて、その癌または悪性疾患
が、タンパク質機能を調節するように作用する治療剤の投与によって処置または
予防され得る。
【０２２９】 （前悪性状態） 癌または悪性疾患の治療または予防処置において有効な本発明の治療剤はまた
、前悪性状態の処置および／または前悪性から新生物状態もしくは悪性疾患状態
への進行を防ぐための処置のために投与され得る。そのような予防的用途または
治療的用途が、先行する新生物または癌への進行が知られているか、またはそれ
が疑われる状態（特に、過形成、化生、または最も特に、異形成からなる非新生
物細胞増殖が生じた場合）において、示される。そのような異常な細胞増殖の総
説について、例えば、ＲｏｂｂｉｎｓおよびＡｎｇｅｌｌ、１９７６、ＢＡＳＩ
Ｃ ＰＡＴＨＯＬＯＧＹ、第２版、Ｗ．Ｂ．Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ．、Ｐｈｉ
ｌａｄｅｌｐｈｉａ、ＰＡを参照のこと。
【０２３０】 過形成は、細胞の構造または機能における有意な変化なしに、組織または器官
における細胞数の増加を含む、制御された細胞の増殖の形態である。例えば、子
宮内膜の過形成は、しばしば子宮内膜癌に進行することが実証されている。化生
は、成熟した細胞または十分に分化した細胞の１つの型が、成熟した細胞の別の
型に置換する、制御された細胞増殖の形態である。化生は、上皮組織細胞または
結合組織細胞において生じ得る。異形成は、一般に癌の前駆体であると考えられ
、そして上皮において主に見出される。異形成は、非新生物細胞増殖の最も無秩
序な形態であり、個々の細胞の均一性および細胞の構築上の配向の損失を含む。
異形成は、慢性の刺激または炎症が存在する場所で特徴的に生じ、そしてしばし
ば、頸部、気道、口腔、および胆嚢において見出される。
【０２３１】 あるいは、または過形成、化生、または異形成として特徴付けられる異常な細
胞増殖の存在に加えて、患者由来の細胞サンプル内で、インビボまたはインビト
ロのいずれかにおいて示される形質転換表現型または悪性疾患表現型の１つ以上
の特徴の存在が、上記のタンパク質の活性を調節する能力を有する治療剤の予防
的／治療的投与の望ましさの指標である。形質転換された表現型の特徴としては
、以下が挙げられるが、これらに限定されない：（ｉ）形態学的変化；（ｉｉ）
よりゆるい、下層への付着；（ｉｉｉ）細胞間接触阻止の喪失；（ｉｖ）足場依
存性の喪失；（ｖ）プロテアーゼ放出；（ｖｉ）増加した糖輸送；（ｖｉｉ）減
少した血清要求性；（ｖｉｉｉ）胎児抗原の発現；（ｉｘ）２５０ｋＤａ細胞表
面タンパク質の消滅など。例えば、Ｒｉｃｈａｒｄｓら１９８６、ＭＯＬＥＣＵ
ＬＡＲ ＰＡＴＨＯＬＯＧＹ、Ｗ．Ｂ．Ｓａｕｎｄｅｒｓ Ｃｏ、Ｐｈｉｌａｄ
ｅｌｐｈｉａ、ＰＡを参照のこと。
【０２３２】 本発明の特定の実施形態において、悪性疾患についての以下の１つ以上の素因
を示す患者が、治療剤の有効量の投与によって処置される：（ｉ）悪性疾患に関
連する染色体転座（例えば、慢性骨髄性白血病についてのフィラデルフィア染色
体（ｂｃｒ／ａｂｌ）および濾胞性リンパ腫についてのｔ（１４；１８）など）
；（ｉｉ）家族性ポリープ症またはガードナー症候群（結腸癌の可能性のある前
兆）；（ｉｉｉ）未確認の重要性の単一クローン性高ガンマグロブリン血症（多
発性骨髄腫の可能性のある前駆体）；ならびに（ｖｉ）メンデル（遺伝子）遺伝
パターンを示す癌または前癌疾患（例えば、結腸の家族性ポリープ症、ガードナ
ー症候群、遺伝性外骨腫症、多発性内分泌腺腫症（ｐｏｌｙｅｎｄｏｃｒｉｎｅ
ａｄｅｎｏｍａｔｏｓｉｓ）、ポイツ−ジェガーズ症候群、フォン・レックリ
ングハウゼン病の神経線維腫症、アミロイド産生および褐色細胞腫をともなう甲
状腺髄様癌（ｍｅｄｕｌｌａｒｙ ｔｈｙｒｏｉｄ ｃａｒｉｃｉｎｏｍａ）、
網膜芽細胞腫、頸動脈小体腫瘍、皮膚の黒色癌、眼内の黒色癌、色素性乾皮症、
毛細血管拡張性運動失調、チェディアック−東症候群、白子症、ファンコーニ再
生不良性貧血およびブルーム症候群）を有する人の一親等。
【０２３３】 別の実施形態において、本発明の治療剤が、ヒト患者に投与されて、乳癌、結
腸癌、肺癌、膵臓癌、または子宮癌、あるいは黒色腫または肉腫の進行を防ぐ。
【０２３４】 （過剰増殖性障害および異常増殖性（ｄｙｓｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｖｅ）障
害） 本発明の１つの実施形態において、治療剤が、過剰増殖性障害または良性の異
常増殖性障害の治療的処置または予防的処置において投与される。過剰増殖性疾
患または障害の処置または予防における本発明の治療剤の効力が、当該分野にお
いて公知の任意の方法によってアッセイされ得る。そのようなアッセイとしては
、インビトロの細胞増殖アッセイ、過剰増殖性疾患または障害の動物モデルを使
用するインビトロまたはインビボアッセイなどが挙げられる。可能性のある効果
的な治療剤は、例えば、コントロールとの比較において、培養物中の細胞増殖を
促進し得るか、あるいは動物モデルにおける増殖または細胞増殖を生じ得る。
【０２３５】 本発明の特定の実施形態は、肝臓の肝硬変（瘢痕が、通常の肝臓再生プロセス
を上回る状態）；瘢痕プロセスが通常の再生を妨げる、皮膚の形状を損じること
を生じるケロイド（過形成性瘢痕）形成の処置；乾癬（皮膚の過剰な増殖および
適切な細胞運命の決定の遅延によって特徴付けられる一般的な皮膚の状態）；良
性腫瘍；線維性嚢状態および組織肥厚（例えば、良性膵臓肥厚）の処置または予
防に関する。
【０２３６】 （神経変性障害） ＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、細胞成熟の脱調節およびアポトーシス（この両
方が神経変性疾患の特徴である）に関係し得る。従って、本発明の治療剤（限定
されることはないが、特に上記のタンパク質の活性を調節（または供給）する治
療剤）が、神経変性疾患の処置または予防において効果的であり得る。神経変性
障害に関与する上記のタンパク質の活性を調節する本発明の治療剤を、そのよう
な神経変性疾患および障害を処置または予防することにおける効力について、当
該分野において公知の任意の方法によってアッセイし得る。そのようなアッセイ
としては、調節された細胞成熟もしくはアポトーシスの阻害についてのインビト
ロアッセイ、または神経変性疾患または障害の動物モデルを使用するインビボア
ッセイ、あるいは以下に記載する任意のアッセイが挙げられる。可能性のある効
果的な治療剤は、例えば限定されないが、コントロールと比較して、調節された
細胞成熟を促進し、培養物中の細胞アポトーシスを防ぎ、あるいは動物モデルに
おける神経変性を減少する。
【０２３７】 一旦、神経変性疾患または障害が、調節活性による処置に対して感受性である
ことが示されると、その神経変性疾患または障害が、活性を調節する治療剤の投
与によって処置または予防され得る。そのような疾患としては、加齢に関与する
全ての変性性障害（特に、変形性関節症および神経変性障害）が挙げられる。
【０２３８】 （器官移植に関連する障害） ＡＴＬＡＳ−Ｘは、器官移植に関連する障害（特に、限定されないが、器官拒
絶反応）に関係し得る。本発明の治療剤（特に、活性を調節（または供給）する
治療剤）は、器官移植に関連する疾患または障害の処置または予防において効果
的であり得る。本発明の治療剤（特に、上記タンパク質のレベルまたは活性を調
節する治療剤）は、このような器官移植に関連する疾患および障害の処置または
予防における効力について、当該分野で公知の任意の方法によってアッセイされ
得る。このようなアッセイとしては、下記のような細胞培養モデルを使用するイ
ンビトロアッセイ、または器官移植に関連する疾患および障害の動物モデルを使
用するインビボアッセイが挙げられ、例えば、以下を参照のこと。潜在的に効果
的な治療剤は、例えば、限定されないが、コントロールに対して比較して、動物
モデルにおける免疫拒絶応答を減少する。
【０２３９】 従って、一旦、器官移植に関連する疾患および障害が、活性の調節による処置
に対して感受性であることが示されると、このような疾患または障害は、活性を
調節する治療剤の投与によって処置または予防され得る。
【０２４０】 （心臓血管疾患） ＡＴＬＡＳ−Ｘは、アテローム性動脈硬化症のプラーク形成を含む、心臓血管
障害に関係し得る。心臓血管疾患（脳血栓症または脳出血を含む）、虚血性心疾
患または虚血性腎疾患、末梢血管疾患、または他の主要な血管の血栓症、および
他の疾患（真性糖尿病、高血圧、甲状腺機能不全、コレステロールエステル貯蔵
病、全身性エリテマトーデス、ホモシステイン症（ｈｏｍｏｃｙｓｔｅｉｎｅｍ
ｉａ）、および家族性のタンパク質または脂質プロセシング疾患などを含む）の
ような疾患は、アテローム性動脈硬化症に直接的または間接的のいずれかで関連
する。従って、本発明の治療剤（特に、活性または形成を調節（または供給）す
る治療剤）は、アテローム性動脈硬化症に関連する疾患または障害の処置または
予防に有効であり得る。本発明の治療剤（特に、レベルまたは活性を調節する治
療剤）は、このような疾患および障害の処置または予防における効力について、
当該分野で公知の任意の方法（以下に記載の方法を含む）によってアッセイされ
得る。
【０２４１】 広範な動物モデルおよび細胞培養モデルが、アテローム性動脈硬化症に関与す
るプロセスについて存在する。動物モデルの限定的かつ非排他的な列挙としては
、以下が挙げられる：早発性アテローム性動脈硬化症についてのノックアウトマ
ウス（ＫｕｒａｂａｙａｓｈｉおよびＹａｚａｋｉ，１９９６、Ｉｎｔ．Ａｎｇ
ｉｏｌ．１５：１８７−１９４）、アテローム動脈硬化症のトランスジェニック
マウスモデル（Ｋａｐｐｅｌら、１９９４、ＦＡＳＥＢ Ｊ．８：５８３−５９
２）、動物モデルのアンチセンスオリゴヌクレオチド処置（Ｃａｌｌｏｗ，１９
９５、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃａｒｄｉｏｌ．１０：５６９−５７６）、アテロ
ーム性動脈硬化症についてのトランスジェニックウサギモデル（Ｔａｙｌｏｒ，
１９９７，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ ８１１：１４６−１５２）、高
コレステロール血症動物モデル（Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄ，１９９６，Ｄｉａｂｅｔ
ｅｓ Ｒｅｓ．Ｃｌｉｎ．Ｐｒａｃｔ．３０（補遺）：１−１１）、高脂血症マ
ウス（Ｐａｉｇｅｎら、１９９４、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｌｉｐｉｄｏｌ．５：
２５８−２６４）、および動物におけるリポキシゲナーゼの阻害（Ｓｉｇａｌら
、１９９４、Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．７１４：２１１−２２４）。
さらに、インビトロ細胞モデルとしては、以下が挙げられるが、これらに限定さ
れない：低密度リポタンパク質に曝露された単球（Ｆｒｏｓｔｅｇａｒｄら、１
９９６、Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ １２１：９３−１０３）、クローン
化された血管平滑筋細胞（Ｓｕｔｔｌｅｓら、１９９５、Ｅｘｐ．Ｃｅｌｌ Ｒ
ｅｓ．２１８：３３１−３３８）、内皮細胞由来の化学誘引物質に曝されたＴ細
胞（Ｋａｔｚら、１９９４、Ｊ．Ｌｅｕｋｏｃ．Ｂｉｏｌ．５５：５６７−５７
３）、培養されたヒト大動脈内皮細胞（Ｆａｒｂｅｒら、１９９２、Ａｍ．Ｊ．
Ｐｈｙｓｉｏｌ．２６２：Ｈ１０８８−１０８５）、および泡沫細胞培養物（Ｌ
ｉｂｂｙら、１９９６、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｌｉｐｉｄｏｌ ７：３３０−３
３５）。潜在的に効果的な治療剤は、例えば、限定されないが、コントロールに
対して比較して、細胞培養モデルにおける泡沫細胞形成、またはアテローム性動
脈硬化症の高コレステロール血症マウスモデルにおけるアテローム性動脈硬化症
のプラーク形成を減少する。
【０２４２】 従って、一旦、アテローム性動脈硬化症に関連する疾患または障害が、活性ま
たは形成の調節による処置に対して感受性であることが示されると、この疾患ま
たは障害は、活性を調節する治療剤の投与によって処置または予防され得る。
【０２４３】 （サイトカインおよび細胞増殖／分化活性） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、サイトカイン活性、細胞増殖活性（誘
導するか、または阻害するかのいずれか）、または細胞分化活性（誘導するか、
または阻害するかのいずれか）を示し得るか、あるいは特定の細胞集団における
他のサイトカインの産生を誘導し得る。全ての既知のサイトカインを含む、現在
までに発見された多くのタンパク質因子は、因子依存性の１以上の細胞増殖アッ
セイにおいて活性を示し、従って、これらのアッセイは、サイトカイン活性の簡
便な確認法として作用する。本発明のタンパク質の活性は、以下を含むが、これ
らに限定されない細胞株についての多くの従来の因子依存性細胞増殖アッセイの
任意の１つによって確認される：３２Ｄ、ＤＡ２、ＤＡ１Ｇ、Ｔ１０、Ｂ９、Ｂ
９／１１、ＢａＦ３、ＭＣ９／Ｇ、Ｍ＋（ｐｒｅＢ Ｍ＋）、２Ｅ８、ＲＢ５、
ＤＡ１、１２３、Ｔ１１６５、ＨＴ２、ＣＴＬＬ２、ＴＦ−１、Ｍｏ７ｅおよび
ＣＭＫ。
【０２４４】 本発明のタンパク質の活性は、数ある方法でもとりわけ、以下の方法によって
測定され得る：以下に記載されるアッセイを含むが、これらに限定されない、Ｔ
細胞増殖または胸腺細胞増殖についてのアッセイ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏ
ｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｇｒｅｅｎ Ｐ
ｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒ
ｓｃｉｅｎｃｅ（第３章および第７章）；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ
１３７：３４９４−３５００、１９８６；Ｂｅｒｔａｇｎｏｉｌｉら、Ｊ Ｉｍ
ｍｕｎｏｌ １４５：１７０６−１７１２、１９９０；Ｂｅｒｔａｇｎｏｌｌｉ
ら、Ｃｅｌｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３３：３２７−３４１、１９９１；Ｂｅｒｔ
ａｇｎｏｌｌｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４９：３７７８−３７８３、１９９
２；Ｂｏｗｍａｎら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５２：１７５６−１７６１，１９
９４。
【０２４５】 脾細胞、リンパ節細胞または胸腺細胞のサイトカイン産生および／または増殖
についてのアッセイとしては、ＫｒｕｉｓｂｅｅｋおよびＳｈｅｖａｃｈ：Ｃｕ
ｒｒｅｎｔ Ｐｒｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎ
ら編、第１巻、３．１２．１−１４頁、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎ
ｓ，Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９４；およびＳｃｈｒｅｉｂｅｒ：Ｃｕｒｒｅｎｔ
Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、第１
巻、６．８．１−８頁、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｔｏｒｏｎ
ｔｏ １９９４に記載のアッセイが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２４６】 造血細胞およびリンパ球産生細胞の増殖および分化についてのアッセイとして
は、以下によって記載されるアッセイが挙げられるが、これに限定されない：Ｂ
ｏｔｔｏｍｌｙら：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏ
ｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、第１巻、６．３．１−６．３．１２頁、Ｊｏｈ
ｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９１；ｄｅＶｒｉｅ
ｓら、Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ １７３：１２０５−１２１１，１９９１；Ｍｏｒｅ
ａｕら、Ｎａｔｕｒｅ ３３６：６９０−６９２、１９８８；Ｇｒｅｅｎｂｅｒ
ｇｅｒら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．８０：２９３
１−２９３８，１９８３；Ｎｏｒｄａｎ：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ
ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、第１巻、６．６．１−５
頁、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９１；Ｓ
ｍｉｔｈら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ．Ｓ．Ａ．８３：１８
５７−１８６１，１９８６；Ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔ ｏｆ ｈｕｍａｎ Ｉｎ
ｔｅｒｌｅｕｋｉｎ １１−Ｂｅｎｎｅｔｔら：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃ
ｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、第１巻、６．１５
．１頁、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９１
；Ｃｉａｒｌｅｔｔａら：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍ
ｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、第１巻、６．１３．１頁、Ｊｏｈｎ Ｗ
ｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９１。
【０２４７】 抗原に対するＴ細胞クローン応答についてのアッセイ（とりわけ、増殖および
サイトカイン産生を測定することによって、ＡＰＣ−Ｔ細胞相互作用に影響し、
そしてＴ細胞の効果を指向するタンパク質を同定する）としては、以下に記載さ
れるアッセイが挙げられるが、これらに限定されない：Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏ
ｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｇｒｅｅｎ
Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔ
ｅｒｓｃｉｅｎｃｅ（第３章、第６章および第７章）；Ｗｅｉｎｂｅｒｇｅｒら
、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７７：６０９１−６０９５
，１９８０；Ｗｅｉｎｂｅｒｇｅｒら、Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎ １１：４０５
−４１１，１９８１；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３７：３４９４−
３５００，１９８６；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４０：５０８−５
１２，１９８８。
【０２４８】 （免疫刺激活性または免疫抑制活性） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質はまた、免疫刺激活性または免疫抑制活性
（アッセイが本明細書中に記載される活性を含むが、これらに限定されない）を
示し得る。タンパク質は、種々の免疫不全および免疫障害（重症複合型免疫不全
（ＳＣＤＩ）を含む）の処置（例えば、Ｔリンパ球および／またはＢリンパ球の
成長および増殖の（上方または下方）調節、ならびにＮＫ細胞および他の細胞集
団の細胞溶解活性の誘発）において有用であり得る。これらの免疫不全は、遺伝
性であり得るか、またはウイルス（例えば、ＨＩＶ）および細菌感染または真菌
感染によって引き起こされ得るか、あるいは自己免疫障害から生じ得る。より詳
細には、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染または他の感染によって引き起こさ
れる感染性疾患は、本発明のタンパク質を使用して処置可能であり得、この感染
としては、ＨＩＶ、肝炎ウイルス、ヘルペスウイルス、ミコバクテリア、リーシ
ュマニア種、マラリア種による感染、およびカンジダ症のような種々の真菌感染
が挙げられる。もちろん、この点に関して、本発明のタンパク質はまた、免疫系
に対するブーストが、一般に所望され得る（すなわち、癌の処置において）場合
に有用であり得る。
【０２４９】 本発明のタンパク質を使用して処置され得る自己免疫障害としては、例えば、
以下が挙げられる：結合組織疾患、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、慢
性関節リウマチ、自己免疫性肺炎、ギヤン−バレー症候群、自己免疫性甲状腺炎
、インスリン依存性真性糖尿病、重症筋無力症、対宿主性移植片病および自己免
疫性炎症性眼疾患。本発明のこのようなタンパク質はまた、喘息（特に、アレル
ギー性喘息）または他の呼吸系障害のような、アレルギー反応およびアレルギー
状態の処置に有用であり得る。免疫抑制が所望される他の状態（例えば、器官移
植を含む）もまた、本発明のタンパク質を使用して処置可能であり得る。
【０２５０】 本発明のタンパク質を使用してまた、多くの方法で、免疫応答することが可能
であり得る。下方調節は、すでに進行中の免疫応答を阻害またはブロックする形
態であり得るか、免疫応答の誘導を妨げることを含み得る。活性化Ｔ細胞の機能
は、Ｔ細胞応答を抑制することによってか、またはＴ細胞における特異的寛容を
誘導することによってか、あるいはその両方によって阻害され得る。Ｔ細胞応答
の免疫抑制は、一般に、抑制剤に対するＴ細胞の連続的曝露を必要とする、能動
的な非抗原特異的プロセスである。寛容（Ｔ細胞における非応答性またはアネル
ギー（ｅｎｅｒｇｙ）を誘導することを含む）は、免疫抑制と識別可能である。
つまり、寛容は、一般的に抗原特異的であり、そして寛容化剤に対する曝露が停
止した後で持続する。操作的には、寛容は、寛容化剤の非存在下における特異的
抗原に対する再曝露の際に、Ｔ細胞応答の欠如によって実証され得る。
【０２５１】 １以上の抗原機能を（Ｂリンパ球抗原機能（例えば、Ｂ７のような）を含むが
、限定されない）を下方調節するか、または妨げること（例えば、活性化Ｔ細胞
による高レベルのリンホカイン合成を妨げること）は、組織、皮膚および器官の
移植の状況、ならびに対宿主性移植片病（ＧＶＨＤ）において有用である。例え
ば、Ｔ細胞機能のブロックは、組織移植における組織破壊の減少を生じるはずで
ある。代表的に、組織移植において、移植片の拒絶は、Ｔ細胞によるその外来と
しての認識、それに続く移植片を破壊する免疫反応を介して開始される。移植前
の、Ｂ７リンパ球抗原の免疫細胞上のその天然のリガンドとの相互作用を阻害ま
たはブロックする分子（例えば、可溶性の、Ｂ７−２活性を有するペプチドのモ
ノマー形態単独、あるいは別のＢリンパ球抗原（例えば、Ｂ７−１、Ｂ７−３）
またはブロッキング抗体の活性を有するペプチドのモノマー形態との組み合わせ
）の投与は、対応する同時刺激シグナルの移行を伴わずに、その分子の免疫細胞
上の天然のリガンドへの結合を導き得る。このような形態でＢリンパ球抗原機能
をブロックすることは、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）によるサイトカイン合成を
妨げ、従って、免疫抑制剤として作用する。さらに、同時刺激の欠如はまた、Ｔ
細胞を活性化して、それによって被験体において寛容を誘導するのに十分であり
得る。Ｂリンパ球抗原ブロッキング試薬による長期の寛容の誘導は、これらのブ
ロッキング試薬の繰り返しの投与の必要性を回避し得る。被験体において十分な
免疫抑制または寛容を達成するために、Ｂリンパ球抗原の機能をブロックするこ
とがまた必要であり得る。
【０２５２】 器官移植片拒絶またはＧＶＨＤの予防における特定のブロッキング試薬の効力
は、ヒトにおける効力を予測する動物モデルを使用して評価され得る。使用され
得る適切なシステムの例は、ラットにおける同種異系の心臓移植片およびマウス
における外因性膵臓島細胞移植片が挙げられ、その両方は、Ｌｅｎｓｃｈｏｗら
、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５７：７８９−７９２（１９９２）およびＴｕｒｋａら、
Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ、８９：１１１０２−１１１０
５（１９９２）に記載されるようなインビボでのＣＴＬＡ４Ｉｇ融合タンパク質
の免疫抑制効果を試験するために使用されている。さらに、ＧＶＤＨのマウスモ
デル（Ｐａｕｌ編、ＦＵＮＤＡＭＥＮＴＡＬ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ、Ｒａｖｅ
ｎ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９８９、８４６〜８４７頁を参照のこと
）は、その疾患の発症に対する、インビボでのＢリンパ球抗原機能のブロックの
効果を決定するために使用され得る。
【０２５３】 抗原機能をブロックすることはまた、自己免疫疾患の処置に治療的に有用であ
り得る。多くの自己免疫疾患は、自己組織に対して反応性であり、そしてその疾
患の病理に関係するサイトカインおよび自己抗体の産生を促進する、Ｔ細胞の不
適切な活性化の結果である。自己反応性Ｔ細胞の活性化の予防は、疾患の症状を
軽減し得るか、または排除し得る。Ｂリンパ球抗原のレセプター：リガンド相互
作用を破壊することによってＴ細胞の同時刺激をブロックする試薬の投与は、Ｔ
細胞の活性化を阻害し、そしてその疾患プロセスに関係し得る自己抗体またはＴ
細胞誘導性サイトカインの産生を妨げるために使用され得る。さらに、ブロッキ
ング試薬は、疾患の長期の軽減を導き得る自己反応性Ｔ細胞の抗原特異的寛容を
誘導し得る。自己免疫障害の予防または軽減におけるブロッキング試薬の効力は
、ヒト自己免疫疾患のよく特徴付けられた多くの動物モデルを使用して決定され
得る。例としては、マウス実験用自己免疫脳炎、ＭＲＬ／ｌｐｒ／ｌｐｒマウス
またはＮＺＢハイブリッドマウスにおける全身性エリテマトーデス、マウス自己
免疫コラーゲン関節炎、ＮＯＤマウスおよびＢＢラットにおける真性糖尿病、お
よびマウス実験用重症筋無力症が挙げられる（Ｐａｕｌ編、ＦＵＮＤＡＭＥＮＴ
ＡＬ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ、Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１
９８９、８４０〜８５６頁を参照のこと）。
【０２５４】 免疫応答を上方制御する手段として、抗原機能（好ましくは、Ｂリンパ球抗原
機能）の上方制御もまた、治療に有用であり得る。免疫応答の上方制御は、既存
の免疫応答を増強するか、または開始免疫応答を誘発する形態であり得る。例え
ば、Ｂリンパ球抗原機能の刺激を介して免疫応答を増強することは、ウイルス感
染の場合において有用であり得る。さらに、全身性ウイルス疾患（例えば、イン
フルエンザ、感冒および脳炎）は、Ｂリンパ球抗原の刺激形態の全身性投与によ
って軽減され得る。
【０２５５】 あるいは、抗ウイルス免疫応答は、患者からＴ細胞を除去し、本発明のペプチ
ドを発現するか、または本発明の可溶性ペプチドの刺激形態を伴うかのいずれか
の、ウイルス抗原をパルスしたＡＰＣで、このＴ細胞をインビトロで同時刺激し
、そして患者にこのインビトロ活性化Ｔ細胞を再導入することによって、感染患
者において増強され得る。抗ウイルス免疫応答を増強する別の方法は、患者から
感染細胞を単離し、本明細書中に記載されるような本発明のタンパク質をコード
する核酸で、この感染細胞をトランスフェクトして（その結果、これらの細胞が
その表面上でこのタンパク質の全てまたは一部を発現する）、そしてこのトラン
スフェクト細胞を患者に再導入することである。ここで、この感染細胞は、イン
ビボでＴ細胞に対して同時刺激シグナルを送達し、それによってＴ細胞を活性化
することが可能である。
【０２５６】 別の適用では、抗原機能（好ましくはＢリンパ球抗原機能）の上方制御または
増大が腫瘍免疫の誘導において有用であり得る。本発明の少なくとも１つのペプ
チドをコードする核酸でトランスフェクトされた腫瘍細胞（例えば、肉腫、黒色
腫、リンパ腫、白血病、神経芽細胞腫、癌腫）を、被験体中の腫瘍特異的耐性を
克服するために被験体に投与され得る。所望であれば、腫瘍細胞はトランスフェ
クトされてペプチドの組み合わせを発現し得る。例えば、患者から得られた腫瘍
細胞を、Ｂ７−２−様活性を有するペプチド単独、またはＢ７−１−様活性およ
び／またはＢ７−３−様活性を有するペプチドを組み合わせての発現を指向する
発現ベクターを用いて、エキソビボでトランスフェクトされ得る。このトランス
フェクトされた腫瘍細胞は、患者に戻され、トランスフェクトされた細胞の表面
上にペプチドの発現を生じる。あるいは、遺伝子治療技法を用いて、インビボの
トランスフェクションのために腫瘍細胞を標的化し得る。
【０２５７】 腫瘍細胞の表面上のＢ細胞リンパ球抗原の活性を有する本発明のペプチドの存
在は、Ｔ細胞に対する必要な同時刺激シグナルを提供し、トランスフェクトされ
た腫瘍細胞に対するＴ細胞媒介免疫応答を誘導する。さらに、ＭＨＣクラスＩま
たはＭＨＣクラスＩＩ分子を欠くか、または十分な量のＭＨＣクラスＩまたはＭ
ＨＣクラスＩＩ分子を再発現しない腫瘍細胞は、ＭＨＣクラスＩα鎖タンパク質
およびβ2ミクログロブリンタンパク質、またはＭＨＣクラスＩＩａ鎖タンパク
質およびＭＨＣクラスＩＩβ鎖タンパク質のすべてまたは一部（例えば、細胞質
−ドメイン切り欠き部分）をコードする核酸でトランスフェクトされ得、それに
よって細胞表面上にＭＨＣクラスＩまたはＭＨＣクラスＩＩタンパク質を発現す
る。Ｂリンパ球抗原（例えば、Ｂ７−１、Ｂ７−２、Ｂ７−３）の活性を有する
ペプチドと組み合わせた適切なクラスＩまたはクラスＩＩ ＭＨＣの発現は、ト
ランスフェクトされた腫瘍細胞に対する、Ｔ細胞媒介性免疫応答を誘導する。必
要に応じて、不変鎖のようなＭＨＣクラスＩＩ関連タンパク質の発現をブロック
するアンチセンス構築物をコードする遺伝子もまた、Ｂリンパ球抗原の活性を有
するペプチドをコードするＤＮＡで同時トランスフェクトされ得、腫瘍関連抗原
の提示を促進し、そして腫瘍特異的免疫を誘導する。従って、ヒト被験体におけ
るＴ細胞媒介免疫応答の誘導は、被験体における腫瘍特異的耐性を克服するに十
分であり得る。
【０２５８】 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法により測定され得る：制
限されないで、ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＩＭＭＵＮＯＬＯ
ＧＹ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃ
ｉａｔｅｓ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ（第３章、第７章
）；Ｈｅｒｒｍａｎｎら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７
８：２４８８−２４９２、１９８１；Ｈｅｒｒｍａｎｎら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ
１２８：１９６８−１９７４、１９８２；Ｈａｎｄａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ
１３５：１５６４−１５７２、１９８５：Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ
１３７：３４９４−３５００、１９８６；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ
１４０：５０８−５１２、１９８８；Ｈｅｒｒｍａｎｎら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔ
ｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ７８：２４８８−２４９２、１９８１；Ｈｅｒ
ｒｍａｎｎら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １２８：１９６８−１９７４、１９８２；
Ｈａｎｄａら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３５：１５６４−１５７２、１９８５；
Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３７：３４９４−３５００、１９８６；
Ｂｏｗｍａｎら、Ｊ Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ６１：１９９２−１９９８；Ｔａｋａ
ｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４０：５０８−５１２、１９８８；Ｂｅｒｔａｇ
ｎｏｌｌｉら、Ｃｅｌｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３３：３２７−３４１、１９９１
；Ｂｒｏｗｎら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５３：３０７９−３０９２、１９９４
に記載のアッセイを含む、胸腺細胞または脾細胞の細胞傷害性のための適切なア
ッセイ。
【０２５９】 Ｔ細胞依存性免疫グロブリン応答およびアイソタイプスイッチングのための（
特に、Ｔ細胞依存性抗体応答を調節し、そしてＴｈ１／Ｔｈ２プロフィールに影
響するタンパク質を同定する）アッセイは：Ｍａｌｉｓｚｅｗｓｋｉ、Ｊ Ｉｍ
ｍｕｎｏｌ １４４：３０２８−３０３３、１９９０；ならびにＣＵＲＲＥＮＴ
ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ、Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｖ
ｏｌ １、３．８．１−３．８．１６、Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎ
ｓ、Ｔｏｒｏｎｔｏ １９９４中のＭｏｎｄおよびＢｒｕｎｓｗｉｃｋに記載の
ようなアッセイを含むがこれらに限定されない。
【０２６０】 混合リンパ球反応（ＭＬＲ）アッセイ（特に、優先的にＴｈ１およびＣＴＬ応
答を生成するタンパク質を同定するアッセイ）は：ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯ
ＣＯＬＳ ＩＮ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ．Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｇｒｅｅｎｅ
Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅ
ｒｓｃｉｅｎｃｅ（第３章、第７章）；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １
３７：３４９４−３５００、１９８６；Ｔａｋａｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １
４０：５０８−５１２、１９８８；Ｂｅｒｔａｇｎｏｌｌｉら、Ｊ Ｉｍｍｕｎ
ｏｌ １４９：３７７８−３７８３、１９９２に記載のアッセイを含むがこれら
に限定されない。
【０２６１】 樹状細胞依存性アッセイ（特に、ネイティブＴ細胞を活性化する樹状細胞によ
り発現されるタンパク質を同定するアッセイ）は：Ｇｕｅｒｙら、Ｊ Ｉｍｍｕ
ｎｏｌ １３４：５３６−５４４、１９９５；Ｉｎａｂａら、Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅ
ｄ １７３：５４９−５５９、１９９１；Ｍａｃａｔｏｎｉａら、Ｊ Ｉｍｍｕ
ｎｏｌ １５４：５０７１−５０７９、１９９５；Ｐｏｒｇａｄｏｒら、Ｊ Ｅ
ｘｐ Ｍｅｄ １８２：２５５−２６０、１９９５；Ｎａｉｒら、Ｊ Ｖｉｒｏ
ｌ ６７：４０６２−４０６９、１９９３；Ｈｕａｎｇら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２
６４：９６１−９６５、１９９４；Ｍａｃａｔｏｎｉａら、Ｊ．Ｅｘｐ Ｍｅｄ
１６９：１２５５−１２６４、１９８９；Ｂｈａｒｄｗａｊら、Ｊ Ｃｌｉｎ
Ｉｎｖｅｓｔｉｇ ９４：７９７−８０７、１９９４；およびＩｎａｂａら、
Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ １７２：６３１−６４０、１９９０に記載のアッセイを含
むが、これらに限定されない。
【０２６２】 リンパ球生存／アポトーシスのためのアッセイ（特に、スーパー抗原誘導後ア
ポトーシスを妨げるタンパク質およびリンパ球ホメオスタシスを調節するタンパ
ク質を同定する）は：Ｄａｒｚｙｎｋｉｅｗｉｃｚら、Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ １
３：７９５−８０８、１９９２；Ｇｏｒｃｚｙｃａら、Ｌｅｕｋｅｍｉａ ７：
６５９−６７０、１９９３；Ｇｏｒｃｚｙｃａら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５３
：１９４５−１９５１、１９９３；Ｉｔｏｈら、Ｃｅｌｌ ６６：２３３−２４
３、１９９１；Ｚａｃｈａｒｃｈｕｋ、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １４５：４０３７
−４０４５、１９９０；Ｚａｍａｉら、Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ １４：８９１−８
９７、１９９３；Ｇｏｒｃｚｙｃａら、Ｉｎｔｅｒｎａｔ Ｊ Ｏｎｃｏｌ １
：６３９−６４８、１９９２に記載のアッセイを含むがこれらに限定されない。
【０２６３】 Ｔ細胞の拘束および発生の初期工程に影響するタンパク質のアッセイは：Ａｎ
ｔｉｃａら、Ｂｌｏｏｄ ８４：１１１−１１７、１９９４；Ｆｉｎｅら、Ｃｅ
ｌｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５５：１１１−１２２、１９９４；Ｇａｌｙら、Ｂｌ
ｏｏｄ ８５：２７７０−２７７８、１９９５；Ｔｏｋｉら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔ
Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８８：７５４８−７５５１、１９９１に記載のア
ッセイを含むが、これらに限定されない。
【０２６４】 （造血調節活性） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質は、造血の調節において、そして結果とし
て骨髄細胞欠損またはリンパ球細胞欠損の処置において有用であり得る。コロニ
ー形成性細胞またはファクター依存性細胞株を支援する周縁の生物学的活性でさ
え、造血を調節することにおける、例えば、単独またはその他のサイトカインと
の組み合わせで、赤血球系前駆体細胞の成長および増殖を支援することにおける
関与を示し、それによって、例えば、種々の貧血を処置することにおけるか、ま
たは赤血球系前駆体細胞および／または赤血球細胞の産生を刺激するための照射
／化学的療法と組み合わせた使用のための有用性；例えば、結果として骨髄抑制
を防ぐかまたは処置するための化学的療法と組み合わせて有用な、顆粒球のよう
な骨髄細胞および単球／マクロファージの成長および増殖を支持する（すなわち
伝統的なＣＳＦ活性）ことにおける有用性；巨核球そして結果として血小板の成
長および増殖を支持し、それによって血小板減少症のような種々の血小板障害の
予防または処置を可能にすること、そして一般に、血小板輸血に代わる使用か、
またはそれへの優待のための有用性；および／または上記の造血幹細胞の任意お
よびすべてに成熟し得、そしてそれ故、種々の幹細胞障害（制限されずに、再生
不良性貧血および発作性夜行性ヘモグロビン尿を含む、通常、移植で処置される
ような障害）における治療有用性を見出す造血幹細胞の成長および増殖を支持す
ることにおける有用性、ならびに正常細胞または遺伝子治療のために遺伝子操作
された細胞として、インビボまたはエキソビボ（すなわち、骨髄移植または末梢
前駆体細胞移植（同種または異種）と組み合わせた）のいずれかで、照射／化学
的療法後に幹細胞区画を再増殖させることにおける有用性、を示す。
【０２６５】 本発明のタンパク質の活性は、特に、以下の方法で測定される： 種々の造血株の増殖および分化の適切なアッセイは上記で引用される。
【０２６６】 胚幹細胞分化のアッセイ（特に、胚分化造血に影響するタンパク質を同定する
アッセイ）は：Ｊｏｈａｎｓｓｏｎら、Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １
５：１４１−１５１、１９９５；Ｋｅｌｌｅｒら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ
．１３：４７３−４８６、１９９３；ＭｃＣｌａｎａｈａｎら、Ｂｌｏｏｄ ８
１：２９０３−２９１５、１９９３に記載のアッセイを含むがこれらに限定され
ない。
【０２６７】 幹細胞生存および分化のアッセイ（特にリンパ−造血を調節するタンパク質を
同定するアッセイ）は：メチルセルロースコロニー形成アッセイ、ＣＵＬＴＵＲ
Ｅ ＯＦ ＨＥＭＡＴＯＰＯＩＥＴＩＣ ＣＥＬＬＳ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙら（編
）Ｖｏｌ ２６５−２６８頁、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．Ｎｅｗ Ｙｏｒ
ｋ、Ｎ．Ｙ １９９４における、Ｆｒｅｓｈｎｅｙ；Ｈｉｒａｙａｍａら、Ｐｒ
ｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：５９０７−５９１１、１９
９２；ＣＵＬＴＵＲＥ ＯＦ ＨＥＭＡＴＯＰＯＩＥＴＩＣ ＣＥＬＬＳ．Ｆｒ
ｅｓｈｎｅｙら（編）Ｖｏｌ ２３−３９頁、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．
Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ １９９４における、ＭｃＮｉｅｃｅおよびＢｒｉｄ
ｄｅｌｉ；Ｎｅｂｅｎら、Ｅｘｐ Ｈｅｍａｔｏｌ ２２：３５３−３５９、１
９９４；ＣＵＬＴＵＲＥ ＯＦ ＨＥＭＡＴＯＰＯＩＥＴＩＣ ＣＥＬＬＳ．Ｆ
ｒｅｓｈｎｅｙら編、Ｖｏｌ １−２１頁、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．Ｎ
ｅｗ Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．１９９４における、Ｐｌｏｅｍａｃｈｅｒ；ＣＵＬＴ
ＵＲＥ ＯＦ ＨＥＭＡＴＯＰＯＩＥＴＩＣ ＣＥＬＬＳ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙら
（編）Ｖｏｌ １６３−１７９頁、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．Ｎｅｗ Ｙ
ｏｒｋ、Ｎ．Ｙ １９９４における、Ｓｐｏｏｎｃｅｒｅｔら；ＣＵＬＴＵＲＥ
ＯＦ ＨＥＭＡＴＯＰＯＩＥＴＩＣ ＣＥＬＬＳ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙら（編）
Ｖｏｌ １３９−１６２頁、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ
、Ｎ．Ｙ １９９４における、Ｓｕｔｈｅｒｌａｎｄ、に記載のアッセイを含む
がこれらに限定されない。
【０２６８】 （組織増殖活性） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質はまた、骨、軟骨、腱、靭帯および／また
は神経組織成長または再生のために使用される組成物、ならびに創傷治癒および
組織修復および組織置換のために使用される組成物、そして火傷、切開および潰
瘍の処置における有用性を有し得る。
【０２６９】 本発明のタンパク質は、骨が正常に形成されない状況で軟骨および／または骨
増殖を誘導し、ヒトおよびその他の動物における骨折および軟骨損傷または欠損
の治癒における適用を有する。本発明のタンパク質を採用するこのような調製物
は、閉鎖骨折整復および開放骨折整復における予防的使用、そしてまた人工間接
の改善された固定における予防的な使用を有し得る。骨形成剤により誘導された
デノボ骨形成は、先天的、外傷誘導、または腫瘍切除誘導脳顔面頭蓋欠陥の修復
に寄与し、そしてまた美容成形手術に有用である。
【０２７０】 本発明のタンパク質はまた、歯周病の処置において、およびその他の歯修復プ
ロセスで用いられ得る。このような薬剤は、骨形成性細胞を誘因するか、骨形成
性細胞の増殖を刺激するか、骨形成性細胞の前駆体の分化を誘導する環境を提供
し得る。本発明のタンパク質はまた、骨および／または軟骨修復の刺激によるか
、または炎症プロセスにより媒介される組織破壊の炎症またはプロセス（コラゲ
ナーゼ活性、破骨細胞活性など）をブロックすることによるような、骨粗鬆症ま
たは変形性関節炎の処置で有用であり得る。
【０２７１】 本発明のタンパク質に寄与し得る組織再生活性の別のカテゴリーは、腱／靭帯
形成である。このような組織が通常形成されない状況で、腱／靭帯様組織または
その他の組織形成を誘導する本発明のタンパク質は、ヒトおよびその他の動物に
おける、腱または靭帯断裂、変形およびその他の腱または靭帯欠陥の治癒におけ
る適用を有する。腱／靭帯様組織誘導性タンパク質を採用するこのような調製物
は、腱または靭帯組織への損傷を防ぐことにおける予防的使用、ならびに腱また
は靭帯の骨またはその他の組織の改善された固定、および腱または靭帯組織への
欠陥を修復することにおける使用を有し得る。本発明の組成物により誘導される
デノボの腱／靭帯様組織形成は、先天的、外傷誘導、またはその他の起源のその
他の腱または靭帯欠陥の修復に寄与し、そしてまた腱または靭帯の付着または修
復のための美容成形手術で有用である。本発明の組成物は、腱形成性細胞または
靭帯形成性細胞を誘引するか、腱形成性細胞または靭帯形成性細胞の増殖を刺激
するか、腱形成性細胞または靭帯形成性細胞の前駆体の分化を誘導するか、また
は組織修復を行うためにインビボに戻すためにエキソビボで腱／靭帯の細胞また
は前駆体の増殖を誘導する環境を提供し得る。本発明の組成物はまた、腱炎、毛
根管症候群およびその他の腱または靭帯欠陥の処置において有用であり得る。こ
の組成物はまた、当該分野で周知であるキャリアとして、適切なマトリックスお
よび／または金属イオン封鎖剤を含み得る。
【０２７２】 本発明のタンパク質はまた、ニューロン細胞の増殖のため、および神経および
脳組織の再生のために、すなわち、中枢神経系疾患および末梢神経系疾患および
神経障害、ならびにニューロン細胞または神経組織への変性、死滅または外傷を
含む機械的および外傷障害の処置のために有用であり得る。より詳細には、タン
パク質は、末梢神経損傷、末梢神経障害および局所神経障害のような末梢神経系
の疾患、ならびにアルツハイマー病，パーキンソン病、ハンチントン病、筋萎縮
側索硬化症、およびシャイ−ドレーガー症候群のような中枢神経系の疾患の処置
で用いられ得る。本発明に従って処置され得るさらなる症状は、脊髄障害，頭部
外傷および発作のような脳血管性疾患のような機械的および外傷的障害を含み得
る。化学的療法またはその他の医療治療から生じる抹消神経障害もまた、本発明
のタンパク質を用いて治療可能であり得る。
【０２７３】 本発明のタンパク質はまた、圧迫性潰瘍、血管不全に関連する潰瘍、手術また
は外傷創傷などを含むがこれらに限定されない非治癒創傷のより良好な、または
より迅速な閉鎖を促進するために有用であり得る。
【０２７４】 本発明のタンパク質がまた、器官（例えば、膵臓、肝臓、腸、腎臓、皮膚、内
皮を含む）、筋肉（平滑筋、骨格筋または心筋）および血管（血管内皮を含む）
組織のような他の組織の生成または再生に、またはこのような組織を含む細胞の
増殖を促進するために活性を示し得ることが予想される。所望の効果の一部分は
、繊維症瘢痕の阻害または調整によってであり得、正常組織を再生させる。本発
明のタンパク質はまた、血管形成活性を示し得る。
【０２７５】 本発明のタンパク質はまた、腸の保護または再生のため、および肺もしくは肝
臓の繊維症、種々の組織における再灌流傷害、および全身サイトカイン損傷から
生じる症状の処置のために有用であり得る。
【０２７６】 本発明のタンパク質はまた、前駆体組織または細胞から上記の組織の分化を促
進もしくは阻害するため；または上記の組織の増殖を阻害するために有用であり
得る。
【０２７７】 本発明のタンパク質の活性はまた、特に、以下の方法により測定され得る： 組織生成活性のためのアッセイは：国際特許公開番号ＷＯ９５／１６０３５（
骨、軟骨、腱）；国際特許公開番号ＷＯ９５／０５８４６（神経、ニューロン）
；国際特許公開番号ＷＯ９１／０７４９１（皮膚、内皮）に記載されるアッセイ
を含むが、これらに限定されない。
【０２７８】 創傷治癒活性のためのアッセイとしては：ＥａｇｌｓｔｅｉｎおよびＭｅｎｚ
、Ｊ．Ｉｎｖｅｓｔ．Ｄｅｒｍａｔｏｌ ７１：３８２−８４（１９７８）によ
って改変されるような、Ｗｉｎｔｅｒ、ＥＰＩＤＥＲＭＡＬ ＷＯＵＮＤ ＨＥ
ＡＬＩＮＧ、７１−１１２頁（ＭａｉｂａｃｈおよびＲｏｖｅｅ編）、Ｙｅａｒ
Ｂｏｏｋ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ、Ｉｎｃ．、Ｃｈｉｃａｇ
ｏに記載のアッセイを含むがこれらに限定されない。
【０２７９】 （アクチビン／インヒビン活性） 本発明のＡＴＬＡＳ−Ｘタンパク質はまた、アクチビン関連活性またはインヒ
ビン関連活性を示し得る。インヒビンは、卵胞刺激ホルモン（ＦＳＨ）の放出を
阻害するその能力によって特徴付けられ、一方、アクチビンは、卵胞刺激ホルモ
ン（ＦＳＨ）の放出を刺激するその能力によって特徴付けられる。従って、本発
明のタンパク質は、単独またはインヒビンファミリーのメンバーとのヘテロ二量
体において、雌性哺乳動物における受胎能を減少し、そして雄性哺乳動物におけ
る精子形成を減少するインヒビンの能力に基づく避妊薬として有用であり得る。
他のインヒビンの十分な量の投与は、これら哺乳動物における不妊症を誘導し得
る。あるいは、本発明のタンパク質は、ホモ二量体としてか、またはインヒビン
ｂ群の他のタンパク質サブユニットとのヘテロ二量体として、下垂体前葉の細胞
からのＦＳＨ放出を刺激するアクチビン分子の能力に基づいて、受胎能誘導治療
として有用であり得る。例えば、米国特許第４，７９８，８８５号を参照のこと
。本発明のタンパク質はまた、ウシ、ヒツジ、およびブタのような家畜の一生の
生殖効率を増加するように、性的に未熟な哺乳動物における受胎能の開始の促進
のために有用であり得る。
【０２８０】 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法によって測定され得る： アクチビン／インヒビン活性のアッセイとしては、以下に記載されるものが挙
げられるが、これらに限定されない：Ｖａｌｅら、Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌｏｇｙ
９１：５６２〜５７２、１９７２；Ｌｉｎｇら、Ｎａｔｕｒｅ ３２１：７７
９〜７８２、１９８６；Ｖａｌｅら、Ｎａｔｕｒｅ ３２１：７７６〜７７９、
１９８６；Ｍａｓｏｎら、Ｎａｔｕｒｅ ３１８：６５９〜６６３、１９８５；
Ｆｏｒａｇｅら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８３：３０
９１〜３０９５、１９８６。
【０２８１】 （走化性／ケモキネシス活性） 本発明のタンパク質は、哺乳動物細胞（例えば、単球、線維芽細胞、好中球、
Ｔ細胞、肥満細胞、好酸球、上皮細胞および／または内皮細胞を含む）について
の走化性またはケモキネシス活性（例えば、ケモカインとして作用する）を有し
得る。走化性およびケモキネシスタンパク質を使用して、所望の細胞集団を所望
の作用部位に動員または誘引し得る。走化性またはケモキネシスタンパク質は、
組織に対する創傷および他の外傷の処置、ならびに局所的感染の処置において、
特に利点を提供する。例えば、リンパ球、単球、好中球の、腫瘍または感染部位
への誘引は、腫瘍または感染因子に対する改善された免疫応答を生じ得る。
【０２８２】 タンパク質またはペプチドは、それが直接的または間接的に、特定の細胞集団
の指向された方向付けまたは移動を刺激し得る場合、そのような細胞集団につい
て走化性活性を有する。好ましくは、タンパク質またはペプチドは、細胞の志向
された移動を直接刺激する能力を有する。特定のタンパク質が細胞の集団につい
て走化性活性を有するか否かは、細胞の走化性についての任意の公知のアッセイ
において、そのようなタンパク質またはペプチドを使用することによって、容易
に決定され得る。
【０２８３】 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法によって測定され得る： 走化性活性についてのアッセイ（走化性を誘導するか、または妨げるタンパク
質を同定する）は、細胞の膜を横切っての移動を誘導するタンパク質の能力、な
らびに１つの細胞集団の別の細胞集団に対する接着を誘導するタンパク質の能力
を測定するアッセイからなる。移動および接着についての適切なアッセイとして
は以下に記載されるものが挙げられるが、これらに限定されない：ＣＵＲＲＥＮ
Ｔ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ、Ｃｏｌｉｇａｎら編（
第６．１２章、ＭＥＡＳＵＲＥＭＥＮＴ ＯＦ ＡＬＰＨＡ ＡＮＤ ＢＥＴＡ
ＣＨＥＭＯＫＩＮＥＳ ６．１２．１〜６．１２．２８）；Ｔａｕｂら、Ｊ
Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ ９５：１３７０〜１３７６、１９９５；Ｌｉｎｄら、
ＡＰＭＩＳ １０３：１４０〜１４６、１９９５；Ｍｕｌｌｅｒら、Ｅｕｒ Ｊ
Ｉｍｍｕｎｏｌ ２５：１７４４〜１７４８；Ｇｒｕｂｅｒｅｔら、Ｊ Ｉｍ
ｍｕｎｏｌ １５２：５８６０〜５８６７、１９９４；Ｊｏｈｎｓｔｏｎら、Ｊ
Ｉｍｍｕｎｏｌ １５３：１７６２〜１７６８、１９９４。
【０２８４】 （うっ血活性および血栓崩壊活性） 本発明のタンパク質はまた、うっ血活性または血栓崩壊活性を示し得る。結果
として、そのようなタンパク質は、種々の凝固障害（血友病のような遺伝性疾患
を含む）の処置において有用であること、または凝固および外傷、外科手術また
は他の原因によって生じる創傷の処置における他のうっ血事象を促進することが
予測される。本発明のタンパク質はまた、血栓症の溶解または形成阻害のため、
およびそこから生じる状態（例えば、心臓血管および中枢神経系血管の梗塞（例
えば、発作））の処置および予防のために有用であり得る。
【０２８５】 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法によって測定され得る： うっ血および血栓崩壊活性のアッセイとしては、以下に記載されるものが挙げ
られるが、これらに限定されない：Ｌｉｎｅｔら、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａ
ｃｏｌ．２６：１３１〜１４０、１９８６；Ｂｕｒｄｉｃｋら、Ｔｈｒｏｍｂｏ
ｓｉｓ Ｒｅｓ．４５：４１３〜４１９、１９８７；Ｈｕｍｐｈｒｅｙら、Ｆｉ
ｂｒｉｎｏｌｙｓｉｓ ５：７１〜７９（１９９１）；Ｓｃｈａｕｂ、Ｐｒｏｓ
ｔａｇｌａｎｄｉｎｓ ３５：４６７〜４７４、１９８８。
【０２８６】 （レセプター／リガンド活性） 本発明のタンパク質はまた、レセプター、レセプターリガンドまたはレセプタ
ー／リガンド相互作用のインヒビターもしくはアゴニストとしての活性を実証し
得る。そのようなレセプターおよびリガンドの例としては、限定することなく、
サイトカインレセプターおよびそのリガンド、レセプターキナーゼおよびそのリ
ガンド、レセプターホスファターゼおよびそのリガンド、細胞間相互作用に関与
するレセプターおよびそのリガンド（限定することなく、細胞接着分子（例えば
、セレクチン、インテグリンおよびそれらのリガンド）、ならびに抗原提示、抗
原認識および細胞性免疫応答および液性免疫応答の発生に関与するレセプター／
リガンド対を含む）が挙げられる。レセプターおよびリガンドはまた、関連する
レセプター／リガンド相互作用の可能性のあるペプチドまたは低分子インヒビタ
ーのスクリーニングにおいて有用である。本発明のタンパク質（限定することな
く、レセプターおよびリガンドのフラグメントを含む）が、それ自体で、レセプ
ター／リガンド相互作用のインヒビターとして有用であり得る。
【０２８７】 本発明のタンパク質の活性は、とりわけ、以下の方法によって測定され得る： レセプター−リガンド活性の適切なアッセイとしては、限定することなく、以
下に記載されるものが挙げられる：ＣＵＲＲＥＮＴ ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ ＩＮ
ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＹ、Ｃｏｌｉｇａｎら編、Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂｌｉｓｈ
ｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ ａｎｄ Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃ
ｅ（第７．２８章、Ｍｅａｓｕｒｅｍｅｎｔ ｏｆ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ａｄｈ
ｅｓｉｏｎ ｕｎｄｅｒ ｓｔａｔｉｃ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ ７．２８．１
−７．２８．２２）、Ｔａｋａｉら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ
ＵＳＡ ８４：６８６４〜６８６８、１９８７；Ｂｉｅｒｅｒら、Ｊ．Ｅｘｐ．
Ｍｅｄ．１６８：１１４５〜１１５６、１９８８；Ｒｏｓｅｎｓｔｅｉｎら、Ｊ
．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６９：１４９〜１６０ １９８９；Ｓｔｏｌｔｅｎｂｏｒ
ｇら、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ １７５：５９〜６８、１９９４；
Ｓｔｉｔｔら、Ｃｅｌｌ ８０：６６１〜６７０、１９９５。
【０２８８】 （抗炎症活性） 本発明のタンパク質はまた、抗炎症活性を示し得る。抗炎症活性は、炎症応答
に関与する細胞に対する刺激を提供すること（細胞間相互作用（例えば、細胞接
着）を阻害するか、または促進することによって）によってか、炎症プロセスに
関与する細胞の走化性を阻害するか、または促進することによってか、細胞の血
管外遊出を阻害するか、または促進するかによってか、あるいは炎症応答を直接
的により阻害するか、またはより促進する他の因子の産生を刺激するか、または
抑制することによって、達成され得る。そのような活性を示すタンパク質を使用
して、炎症状態（慢性状態または急性状態を含む）（限定することなく、感染に
関連する炎症（例えば、敗血症性ショック、敗血症または全身性炎症応答症候群
（ＳＩＲＳ））、虚血−灌流損傷、内毒素の致死性、関節炎、補体媒介性激症拒
絶症、腎炎、サイトカイン誘導性肺損傷またはケモカイン誘導性肺損傷、炎症性
腸疾患、クローン病、またはＴＮＦもしくはＩＬ−１のようなサイトカインの過
剰産生より生じるものが挙げられる）を処置し得る。本発明のタンパク質はまた
、抗原性物質または抗原性材料に対する、アナフィラキシーおよび過敏症の処置
のためにも、有用であり得る。
【０２８９】 （腫瘍阻害活性） 腫瘍の免疫学的処置または予防について上記に記載された活性に加えて、本発
明のタンパク質は、他の抗腫瘍活性を示し得る。タンパク質は、直接的または間
接的（例えば、ＡＤＣＣを介して）腫瘍増殖を阻害し得る。タンパク質は、腫瘍
組織または腫瘍前駆体組織に作用することによって、腫瘍増殖を支持するために
必要な組織の形成を阻害することによって（例えば、新脈管形成を阻害すること
によって）、腫瘍増殖を阻害する他の因子、物質または細胞型の産生を生じるこ
とによって、あるいは腫瘍増殖を促進する因子、物質または細胞型を、抑制、除
去または阻害することによって、その腫瘍阻害活性を示し得る。
【０２９０】 （他の活性） 本発明のタンパク質はまた、以下のさらなる活性または効果の１つ以上を示し
得る：限定はされないが、細菌、ウイルス、真菌および他の寄生生物を含む感染
因子の、増殖、感染または機能を阻害するか、あるいは死滅させること；身体的
特徴（限定することなく身長、体重、髪の色、目の色、皮膚、赤肉に対する脂肉
の比、または他の組織色素沈着、あるいは器官または身体部分のサイズまたは形
状（例えば、胸部増大または減少、骨の形態または形状の変化）が挙げられる）
に影響（抑制または増大）すること；バイオリズムあるいはサーカディアンサイ
クルまたはサーカディアンリズムを生じること；雄性被験体または雌性被験体の
受胎能を生じること；食事脂肪、脂質、タンパク質、炭水化物、ビタミン、ミネ
ラル、補因子または他の栄養因子もしくは栄養成分の、代謝、異化作用、同化作
用、プロセシング、利用、貯蔵または除去を生じること；行動的特徴（食欲、性
欲、ストレス、認識（認識障害を含む）、うつ病（抑うつ障害を含む）および狂
暴症を含むが、これらに限定されない）を生じること；鎮痛性効果または他の疼
痛減少効果を提供すること；造血系列以外の系列における胚性幹細胞の分化また
は増殖を促進すること；ホルモン活性または内分泌活性；酵素の場合、酵素の欠
損を矯正すること、および欠損関連疾患を処置すること；過剰増殖障害（例えば
、乾癬）の処置；免疫グロブリン様活性（例えば、抗原または補体に結合する活
性）；ならびにワクチン組成物において抗原として作用し、そのようなタンパク
質または別の物質あるいはそのようなタンパク質と交差反応する実体に対する免
疫応答を惹起する能力。
【０２９１】 （他の実施形態） 本発明は、その詳細な説明と関連して記載されるが、前述の記載は、添付の特
許請求の範囲によって規定される本発明の範囲を例示することが意図されており
、本発明の範囲を限定するようには意図されないことが理解されるべきである。
他の局面、利点および改変は、上記の特許請求の範囲内である。
【図面の簡単な説明】
【図１Ａ】 図１Ａ〜１Ｄは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−１核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号１）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号２）を表す。
【図１Ｂ】 図１Ａ〜１Ｄは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−１核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号１）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号２）を表す。
【図１Ｃ】 図１Ａ〜１Ｄは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−１核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号１）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号２）を表す。
【図１Ｄ】 図１Ａ〜１Ｄは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−１核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号１）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号２）を表す。
【図２Ａ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｂ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｃ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｄ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｅ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｆ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｇ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図２Ｈ】 図２Ａ〜２Ｈは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−２核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号３）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号４）を表す。
【図３Ａ】 図３Ａ〜３Ｂは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−３核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号５）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号６）を表す。
【図３Ｂ】 図３Ａ〜３Ｂは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−３核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号５）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号６）を表す。
【図４Ａ】 図４Ａ〜４Ｂは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−４核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号７）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号８）を表す。
【図４Ｂ】 図４Ａ〜４Ｂは、本発明に従うＡＴＬＡＳ−４核酸およびポリペプチドの核酸
配列（配列番号７）およびコードされるアミノ酸配列（配列番号８）を表す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｐ 1/16 Ａ６１Ｐ 9/00 ４Ｃ０８４ 1/18 9/10 ４Ｃ０８５ 9/00 17/06 ４Ｈ０４５ 9/10 25/00 17/06 25/28 25/00 31/00 25/28 35/00 31/00 37/02 35/00 Ｃ０７Ｋ 14/47 37/02 16/18 Ｃ０７Ｋ 14/47 Ｃ１２Ｎ 1/15 16/18 1/19 Ｃ１２Ｎ 1/15 1/21 1/19 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ 1/21 Ｃ１２Ｑ 1/68 Ａ 5/10 Ｇ０１Ｎ 33/15 Ｚ Ｃ１２Ｐ 21/02 33/50 Ｚ Ｃ１２Ｑ 1/68 33/53 Ｄ Ｇ０１Ｎ 33/15 Ｍ 33/50 33/566 33/53 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ 5/00 Ａ 33/566 Ａ６１Ｋ 37/02 (31)優先権主張番号 ０９／５６０，９４８ (32)優先日 平成12年４月28日(2000．4．28) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ０９／５６０，１０１ (32)優先日 平成12年４月28日(2000．4．28) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (31)優先権主張番号 ０９／５６０，３６５ (32)優先日 平成12年４月28日(2000．4．28) (33)優先権主張国 米国（ＵＳ） (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＭＺ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＴＺ，ＵＧ ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ， ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＧ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ， ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＢＺ，Ｃ Ａ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＲ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＤＭ ，ＤＺ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ，ＧＨ， ＧＭ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，ＪＰ，Ｋ Ｅ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＡ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ， ＭＷ，ＭＸ，ＭＺ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，Ｒ Ｕ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ，ＴＭ ，ＴＲ，ＴＴ，ＴＺ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ，ＶＮ， ＹＵ，ＺＡ，ＺＷ (72)発明者 ペイマン， ジョン エイ． アメリカ合衆国 コネチカット 06515， ニュー ヘイベン， ウエスト ロック アベニュー 336 (72)発明者 グリーン， シンシア ディー． アメリカ合衆国 コネチカット 06443， マディソン， ツイン ブリッジ ロー ド 29 (72)発明者 スー， アンドロ アメリカ合衆国 コネチカット 06511， ニュー ヘイベン， オレンジ ストリ ート 412 (72)発明者 ブラウニング， ジェフリー エイ． アメリカ合衆国 マサチューセッツ 02446， ブルックライン， ミルトン ロード 32 (72)発明者 カルリー， ジョン アメリカ合衆国 マサチューセッツ 01772， サウスボロウ， ハリス ドラ イブ ９ Ｆターム(参考） 2G045 AA25 AA29 AA40 BB20 CA26 CB01 CB17 DA12 DA13 DA14 DA36 DA77 FB02 FB03 FB04 FB07 4B024 AA01 AA11 BA07 BA63 BA80 CA03 CA04 CA12 GA11 HA12 HA17 4B063 QA01 QQ03 QQ08 QQ41 QR56 QR62 QS34 4B064 AG01 CA01 CA19 CC24 DA01 DA13 4B065 AA26X AA72X AA90X AA91X AA93Y AA94X AB01 AC14 BA02 CA24 CA44 CA46 4C084 AA02 AA07 AA13 AA14 BA01 BA08 BA22 BA23 BA35 CA17 CA18 CA53 CA56 CA59 DA45 NA01 NA13 NA14 ZA022 ZA362 ZA452 ZA662 ZA752 ZA892 ZB072 ZB262 ZB352 4C085 AA13 AA14 AA16 AA38 BB11 CC04 CC22 CC23 CC32 DD88 EE01 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 CA40 DA75 EA22 EA50 FA72 FA73 FA74

Claims (37)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 配列番号２、配列番号４、配列番号６、もしくは配列番号８
    に対して少なくとも９０％同一なポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチ
    ドをコードする単離された核酸分子、または該核酸分子の相補体。
  2. 【請求項２】 前記分子が、以下： 配列番号１のヌクレオチド１〜２５８６、 配列番号３のヌクレオチド１〜５５５３、 配列番号５のヌクレオチド９８〜９０４、および 配列番号７のヌクレオチド１〜１０７４ からなる群から選択される配列を含む核酸分子に相補的な核酸配列に対して、ス
    トリンジェントな条件下でハイブリダイズする、請求項１に記載の単離された核
    酸分子、または該核酸分子の相補体。
  3. 【請求項３】 前記分子が、以下： 配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、もしくは配列番号２のアミノ
    酸配列において１以上の置換を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド； 配列番号４のアミノ酸配列を含むポリペプチド、もしくは配列番号４のアミノ
    酸配列において１以上の置換を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド； 配列番号６のアミノ酸配列を含むポリペプチド、もしくは配列番号６のアミノ
    酸配列において１以上の置換を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド；および 配列番号８のアミノ酸配列を含むポリペプチド、もしくは配列番号８のアミノ
    酸配列において１以上の置換を含むアミノ酸配列を含むポリペプチド からなる群から選択されるポリペプチドをコードする、請求項１に記載の単離さ
    れた核酸分子、または該核酸分子の相補体。
  4. 【請求項４】 １以上の前記アミノ酸置換が保存的アミノ酸置換である、請
    求項３に記載の核酸分子。
  5. 【請求項５】 ヌクレオチド配列分子が、以下： 配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、 配列番号４のアミノ酸配列を含むポリペプチド、 配列番号６のアミノ酸配列を含むポリペプチド、および 配列番号８のアミノ酸配列を含むポリペプチド からなる群から選択されるポリペプチドをコードする、請求項１に記載の核酸分
    子、または該核酸分子の相補体。
  6. 【請求項６】 前記核酸分子が、以下： 配列番号１のヌクレオチド１〜２５８６、 配列番号３のヌクレオチド１〜５５５３、 配列番号５のヌクレオチド９８〜９０４、および 配列番号７のヌクレオチド１〜１０７４ からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載の核酸分子
    、または該核酸分子の相補体。
  7. 【請求項７】 前記核酸分子が、配列番号１、配列番号３、配列番号５、お
    よび配列番号７からなる群から選択されるヌクレオチドを含む、請求項１に記載
    の核酸分子、または該核酸分子の相補体。
  8. 【請求項８】 請求項１に記載の核酸分子を含む、核酸ベクター。
  9. 【請求項９】 請求項１に記載の核酸分子を含む、宿主細胞。
  10. 【請求項１０】 請求項１に記載の核酸分子および薬学的に受容可能なキャ
    リアを含む、薬学的組成物。
  11. 【請求項１１】 長さが１００ヌクレオチド未満であり、かつ配列番号１、
    配列番号３、配列番号５、および配列番号７からなる群から選択される核酸分子
    の少なくとも６個連続するヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド、またはそ
    の相補体。
  12. 【請求項１２】 実質的に精製されたポリペプチドであって、以下： 配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、 配列番号４のアミノ酸配列を含むポリペプチド、 配列番号６のアミノ酸配列を含むポリペプチド、および 配列番号８のアミノ酸配列を含むポリペプチド からなる群から選択されるポリペプチドに対して少なくとも８０％同一なアミノ
    酸配列を含む、ポリペプチド。
  13. 【請求項１３】 前記ポリペプチドが、ホスファターゼポリペプチドに結合
    するか、またはサイトカインに結合する、請求項１２に記載のポリペプチド。
  14. 【請求項１４】 前記ポリペプチドが、配列番号２、配列番号４、配列番号
    ６、および配列番号８からなる群から選択されるポリペプチドのアミノ酸配列を
    含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
  15. 【請求項１５】 請求項１２に記載のポリペプチドおよび薬学的に受容可能
    なキャリアを含む、薬学的組成物。
  16. 【請求項１６】 請求項１２に記載のポリペプチドに選択的に結合する、抗
    体。
  17. 【請求項１７】 請求項１６に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリ
    アを含む、薬学的組成物。
  18. 【請求項１８】 １以上の容器中に、ＡＴＬＡＳ−Ｘ核酸、ＡＴＬＡＳ−Ｘ
    ポリペプチド、およびＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチドに対する抗体からなる群から
    選択される化合物を含むキットであって、ここでＸが１、２、３、または４であ
    る、キット。
  19. 【請求項１９】 前記化合物が、薬学的に受容可能なキャリアと共に存在す
    る、請求項１８に記載のキット。
  20. 【請求項２０】 ポリペプチドを産生する方法であって、該方法は、請求項
    １に記載の核酸分子を含む細胞を、該核酸分子によってコードされるポリペプチ
    ドの発現を可能にする条件下で培養する工程を包含する、方法。
  21. 【請求項２１】 サンプル中における請求項１に記載の核酸分子の存在を検
    出する方法であって、該方法は、該サンプルを、該核酸分子に選択的に結合する
    核酸プローブまたは核酸プライマーと接触させる工程、および該核酸プローブま
    たは該核酸プライマーが、該サンプル中に存在する請求項１に記載の核酸分子に
    結合したか否かを決定する工程を包含する、方法。
  22. 【請求項２２】 サンプル中における請求項１２に記載のポリペプチドの存
    在を検出する方法であって、該方法は、該ポリペプチドに選択的に結合する化合
    物と該サンプルを、該ポリペプチドと該化合物との間での複合体形成を可能にす
    る条件下で接触させる工程、および該複合体が存在する場合には、該複合体を検
    出する工程であって、それによって該サンプル中において該ポリペプチドを同定
    する、工程、を包含する、方法。
  23. 【請求項２３】 請求項１２に記載のポリペプチドの活性を調節する方法で
    あって、該方法は、該ポリペプチドを含む細胞サンプルを、該ポリペプチドの活
    性を調節するに十分な量において、該ポリペプチドに結合する化合物と接触させ
    る工程を包含する、方法。
  24. 【請求項２４】 ヒト免疫系障害に関連した症候群を処置または予防するた
    めの医薬の製造における治療剤の使用であって、ここで該治療剤は、ＡＴＬＡＳ
    −Ｘ核酸、およびＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプチド、およびＡＴＬＡＳ−Ｘポリペプ
    チドに対する抗体からなる群から選択され、ここでＸが１、２、３、または４で
    ある、使用。
  25. 【請求項２５】 免疫障害に対する活性、または潜伏性もしくは素因の調節
    因子についてスクリーニングするための方法であって、該方法は、以下： 試験化合物を請求項１２に記載のポリペプチドと接触させる工程；および 該試験化合物が該ポリペプチドに結合するか否かを決定する工程 を包含し、ここで該ポリペプチドへの該試験化合物の結合は、該試験化合物が、
    免疫障害に対する活性、または潜伏性もしくは素因の調節因子であることを示す
    、方法。
  26. 【請求項２６】 免疫障害に対する活性、または潜伏性もしくは素因の調節
    因子についてスクリーニングするための方法であって、該方法は、以下 該障害についての危険性の増大した試験動物に試験化合物を投与する工程であ
    って、ここで該試験動物は、請求項１に記載の核酸配列によってコードされるポ
    リペプチドを組換え的に発現する、工程、 該タンパク質の活性の発現を該試験動物において測定する工程、 該タンパク質を組換え的に発現し、かつ該障害のいずれか１つについての危険
    性の増大していないコントロール動物における該タンパク質の活性を測定する工
    程、ならびに 該試験動物および該コントロール動物における該タンパク質の発現を比較する
    工程 を包含し、ここで該コントロール動物と比較した、該試験動物における該タンパ
    ク質の活性の変化は、該試験化合物が、該障害のいずれか１つの潜伏性の調節因
    子であることを示し、そしてここで、該障害が自己免疫障害、免疫障害、Ｔリン
    パ球関連障害、細胞増殖障害、細胞分化障害、および免疫欠損障害からなる群か
    ら選択される、方法。
  27. 【請求項２７】 前記試験動物が、野生型試験動物と比較して増加したレベ
    ルで、プロモーター制御下の試験タンパク質導入遺伝子を発現するか、または該
    導入遺伝子を発現する、組換え試験動物であって、ここで該プロモーターが、該
    導入遺伝子のネイティブな遺伝子プロモーターではない、請求項２６に記載の方
    法。
  28. 【請求項２８】 被験体における請求項１２に記載のポリペプチドのレベル
    変更と関連した疾患の存在または素因を決定するための方法であって、該方法は
    、以下： ａ）該被験体由来のサンプル中において、該ポリペプチドの量を測定する工程
    ；および ｂ）工程（ａ）における該ポリペプチドの量を、コントロールサンプル中に存
    在する該ポリペプチドの量と比較する工程、 を包含し、ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の、工程（ａ）にお
    ける該ポリペプチドのレベルの変更は、該被験体における疾患の存在または素因
    を示す、方法。
  29. 【請求項２９】 前記被験体がヒトである、請求項２８に記載の方法。
  30. 【請求項３０】 被験体における請求項１に記載の核酸分子のレベル変更と
    関連した疾患の存在または素因を決定するための方法であって、該方法は、以下
    ： ａ）哺乳動物被験体由来のサンプル中において、該核酸の量を測定する工程；
    および ｂ）工程（ａ）における該核酸の量を、コントロールサンプル中に存在する該
    核酸の量と比較する工程、 を包含し、ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の、工程（ａ）にお
    ける該核酸のレベルの変更は、該被験体における該疾患の存在または素因を示す
    、方法。
  31. 【請求項３１】 前記被験体がヒトである、請求項３０に記載の方法。
  32. 【請求項３２】 哺乳動物において免疫系障害と関連する病理学的状態を処
    置または予防する方法であって、該方法は、該病理学的状態を改善または予防す
    るに十分な量で、被験体に請求項１２に記載のポリペプチドを投与する工程を包
    含し、 ここで、該免疫系と関連する障害は、自己免疫障害、免疫障害、Ｔリンパ球関
    連障害、細胞増殖障害、細胞分化障害、および免疫欠損障害からなる群から選択
    される、 方法。
  33. 【請求項３３】 前記被験体がヒトである、請求項３２に記載の方法。
  34. 【請求項３４】 哺乳動物において免疫障害と関連する病理学的状態を処置
    または予防する方法であって、該方法は、該病理学的状態を処置または予防する
    に十分な量で、被験体に請求項１に記載の核酸を投与する工程を包含し、 ここで、該免疫系と関連する障害は、自己免疫障害、免疫障害、Ｔリンパ球関
    連障害、細胞増殖障害、細胞分化障害、および免疫欠損障害からなる群から選択
    される、 方法。
  35. 【請求項３５】 前記被験体がヒトである、請求項３４に記載の方法。
  36. 【請求項３６】 哺乳動物において病理学的状態を処置または予防する方法
    であって、該方法は、該病理学的状態を改善または予防するに十分な量で、被験
    体に請求項１６に記載の抗体を投与する工程を包含し、 ここで、免疫系と関連する障害は、自己免疫障害、免疫障害、Ｔリンパ球関連
    障害、細胞増殖障害、細胞分化障害、および免疫欠損障害からなる群から選択さ
    れる、 方法。
  37. 【請求項３７】 前記被験体がヒトである、請求項３６に記載の方法。
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