JP2003501096A - ストレプトアビジン発現性遺伝子融合およびその使用方法 - Google Patents

ストレプトアビジン発現性遺伝子融合およびその使用方法

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スコット ストール グレイブス,
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ユカン リン,
ジェイムス アレン サンダーソン,
ジョン エム. レノ,
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、ゲノムストレプトアビジン融合カセットの発現のためのベクターを提供する。種々の実施形態において、これらのベクターから産生される融合タンパク質が提供される。特定の実施形態において、単鎖抗体およびゲノムストレプトアビジンを含む融合タンパク質は、単鎖抗体およびゲノムストレプトアビジンをコードするベクターであるように提供される。また提供されるのは、本発明の融合タンパク質の使用方法であり、特に、診断マーカーまたは細胞特異的標的化因子としてのscFvSA融合タンパク質の使用である。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、一般的には、ストレプトアビジンを発現する遺伝子融合構築物に関
し、そしてより詳細には、ゲノムのストレプトアビジンを発現する遺伝子融合体
、ならびに、診断適用および治療適用においてこれらの構築物を使用する方法に
関する。
【0002】 (発明の背景) ストレプトアビジン(「SA」)は、Streptomyces avidi
nniによって産生される159アミノ酸のタンパク質である。そしてこれは、
水可溶性のビオチンに対して特異的に結合する(Chaietら、Arch.B
iochem.Biophys.106:1−5、1964)。ストレプトアビ
ジンは天然においてはほぼ64,000ダルトンの四量体タンパク質である。従
って、これは、それぞれがほぼ16,000ダルトンの分子量を有している4個
の同一のサブユニットから構成される(SanoおよびCantor、Proc
.Natl.Acad.Sci.USA 87:142−46、1990)。ス
トレプトアビジンは、アビジンといくつかの共通の特性(例えば、分子量、サブ
ユニットの組成、および高い親和性(KD=10-15)でビオチンに結合する能力
)を共有する(Green,Adv.Prot.Chem.29:85−133
,1975)。さらに、ストレプトアビジンとアビジンは、それらのアミノ酸組
成において異なるが、両方ともが通常ではない高いスレオニンおよびトリプトフ
ァン含有量を有する。さらに、ストレプトアビジンは、おそらく、ストレプトア
ビジン上に炭水化物が存在しないことに起因して、生理学的なpHでビオチンに
対してはるかにより特異的である点で、アビジンとは異なる。アビジンおよびス
トレプトアビジンの種々の比較特性および単離が、Greenら、Method
s in Enzymology 184:51−67、1990、およびBa
yerら、Methods in Enzymology 184:80−89
、1990に記載されている。
【0003】 ストレプトアビジン遺伝子は、クローン化されており、そしてE.coli中
で発現されている(SanoおよびCantor、Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA 87(1):142−146、1990;Agarana
ら、Nucleic Acids Res.14(4):1871−1882、
1986)。種々のタンパク質(単鎖抗体を含む)とのストレプトアビジンの融
合構築物、およびその短縮形態もまた、E.coli中で(SanoおよびCa
ntor、Biotechnology(NY)9(12):1378−138
1、1991;SanoおよびCantor、Biochem.Biophys
.Res.Commun.176(2):571−577、1991;Sano
ら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89(5):1534−
1538、1992;WalshおよびSwaisgood、Biotech.
Bioeng.44:1348−1354、1994;Leら、Enzyme
Microb.Technol.16(6):496−500、1994;Du
belら、J.Immunol.Methods 178(2):201−20
9、1995;Kipriyanovら、Hum.Antibodies Hy
bridomas 6(3):93−101、1995;Kipriyanov
ら、Protein Eng.9(2):203−211、1996;Ohno
ら、Biochem.Mol.Med.58(2):227−233、1996
;OhnoおよびMeruelo、DNA Cell Biol.15(5):
401−406、1996;Pearceら、Biochem.Mol.Bio
l.Int.42(6):1179−1188、1997;Kooら、Appl
ied Environ.Microbiol.64(7):2497−250
2、1998)、および他の生物体中で(Karpら、Biotechniqu
es 20(3):452−459、1996)発現されている。Sanoおよ
びCantor(PNAS、前出)は、ストレプトアビジンの全長の形態の発現
が、E.coli宿主細胞に対して致死的であり、そして短縮形態で発現され得
る(T7プロモーターシステムの下で)場合には、わずかな発現または変更され
た発現が観察され、そしてタンパク質は封入体の中のままであることを見出した
。しかし、E.coli中での可溶性のストレプトアビジンの発現の公開された
報告が存在する(Galliziaら、Protein Expr.Purif
.14(2):192−196、1998;Veikoら、Bioorg.Kh
im.25(3):184−188、1999)。当業者は、しばしば、「コア
ストレプトアビジン(core streptavidin)」(残基14〜1
36)または同様の短縮形態を、融合構築物の調製において使用する。コア残基
14〜136の使用の根拠は、S.avidiniiの培養培地から精製された
ストレプトアビジン調製物が、通常は、このコア構造またはその機能的な形態を
産生するために、N末端およびC末端の両方でタンパク質溶解を受けるという観
察である(Argaranaら、前出)。
【0004】 現在は、ストレプトアビジンを発現する遺伝子融合体の調製は、通常は、細菌
中でコアストレプトアビジンを含有している構築物を発現させることによって行
われている。ここでは、封入体が形成される。このような産生は、封入体からの
精製の厳しさおよび費用、きつい変性剤(例えば、塩酸グアニジン)を使用する
必要性、ならびに経済的な様式でのスケールアップの難しさを含む、いくつかの
欠点を有する。よりすくない程度に、可溶性の形態でのコアストレプトアビジン
を含有している構築物のペリプラズム発現が報告されている(Dubelら、前
出)。
【0005】 従って、容易に、コスト的に効率良く、そしてスケールアップが可能な方法で
のストレプトアビジン融合タンパク質の産生が、当該分野で必要とされている。
従って、本発明は、いくつかの重要な利点を提供する。例えば、1つの実施形態
においては、ゲノムのストレプトアビジンを発現する遺伝子融合体が、細菌のペ
リプラズム空間に可溶性のタンパク質として発現され、そして自発的なフォール
ディングを受ける。従って、このような発現は、ペリプラズムが低ビオチンの環
境にあり、そしてきつい変性条件下でのタンパク質の精製およびフォールディン
グを必要としないという利点を付与する。きつい変性条件は、ゲノムのストレプ
トアビジン核酸分子に対して融合された異種核酸分子によってコードされるポリ
ペプチドに対して致死的であることが証明され得る。本発明は、この要件を満た
し、一方で他の関連する利点をさらに提供する。
【0006】 (発明の要旨) 本発明は、一般的には、ゲノムのストレプトアビジンを含有している発現カセ
ット、およびそれによってコードされる融合構築物を提供する。本発明の1つの
局面においては、本発明は、ストレプトアビジン融合タンパク質の発現のための
ベクター構築物を提供する。これは、少なくとも129アミノ酸のストレプトア
ビジンをコードする第1の核酸配列(図4)、またはその機能的な変異体、第1
の核酸配列に対して作動可能に連結されるプロモーター、およびプロモーターと
第1の核酸配列との間に挿入されるストレプトアビジンと融合されるポリペプチ
ドをコードする第2の核酸配列のためのクローニング部位またはその挿入のため
のクローニング部位を含む。あるいは、第2の核酸は、構築物のストレプトアビ
ジン部分をコードし得、そして第1の核酸がストレプトアビジンと融合されるポ
リペプチドをコードする。
【0007】 特定の実施形態においては、プロモーターは、誘導性であるかまたは構成性で
ある。他の実施形態においては、第1の核酸配列が、図4のストレプトアビジン
の、少なくともアミノ酸14から150、14から151、14から152、1
4から153、14から154、14から155、14から156、14から1
57、または14から158をコードする。なお他の実施形態においては、第1
の核酸配列は、図4の少なくともアミノ酸5から150〜158、または図4の
1から150〜158をコードする。
【0008】 ゲノムのストレプトアビジン発現カセットを含有している宿主細胞もまた、そ
れによって発現される融合タンパク質がそうであるように提供される。特定の実
施形態においては、単鎖抗体を含有している融合タンパク質が提供される。なお
他の実施形態においては、単鎖抗体は、細胞表面抗原に対して指向される。なお
他の実施形態においては、単鎖抗体は、細胞表面抗原または、以下を含むがそれ
らに限定されない細胞に関連する間質もしくはマトリックス抗原に対して指向さ
れる:CD20、CD22、CD45、CD52、CD56、CD57、EGP
40(またはEPCAMもしくはKSA)、NCAM、CEA、TAG−72、
ムチン(MUC−1からMUC−7)、β−HCG、EGFレセプター、IL−
2レセプター、her2/neu、Lewis Y、GD2、GM2、ネテイシ
ン(tenascin)、シアル化されたネテイシン、ソマトスタチン、活性化
された腫瘍間質抗原、または新抗原形成性(neoangiogenic)抗原
【0009】 本発明の他の局面においては、腫瘍細胞を標的化するための方法が提供される
。この方法は、融合タンパク質の投与を包含し、上記の融合タンパク質は、末端
対末端で連結された少なくとも第1および第2のポリペプチドを含有している。
ここで、上記の第1のポリペプチドは、ストレプトアビジン(図4)の少なくと
も129アミノ酸、またはその保存的に置換された変異体を含む。ここでは、上
記の第2のポリペプチドは、腫瘍細胞上の細胞表面タンパク質に結合するポリペ
プチドであり、ここでは、融合タンパク質は、腫瘍細胞上の細胞表面タンパク質
に結合する。そしてここでは、融合タンパク質のストレプトアビジン部分は、ビ
オチンに結合し得る。特定の実施形態においては、第2のポリペプチドは、抗体
またはその抗原結合フラグメントである。
【0010】 本発明の他の局面においては、ゲノムのストレプトアビジン融合構築物を含有
している薬学的組成物が、提供される。
【0011】 本発明のこれらおよび他の局面が、以下の詳細な説明および添付の図面を参照
して明らかとなる。
【0012】 (発明の詳細な説明) 本発明を示す前に、本明細書中以後に使用される特定の用語の定義を示すこと
は本発明の理解を助け得る。
【0013】 「コアストレプトアビジン」は、本明細書中で使用される場合は、図4のスト
レプトアビジンの中心のアミノ酸残基14〜136からなるストレプトアビジン
分子、ならびにまた米国特許第4,839,293号の図3のストレプトアビジ
ン分子、およびATCC番号第X03591号に寄託されるストレプトアビジン
分子をいう。
【0014】 「ゲノムのストレプトアビジン」は、本明細書中で使用される場合は、図4に
示される配列の少なくとも129残基を含有している配列をいう。従って、ゲノ
ムのストレプトアビジンは、コアストレプトアビジンのN末端、C末端、または
N末端およびC末端の両方の延長を有するストレプトアビジン分子をいう。N末
端およびC末端の伸張は、図4の1〜13、137〜159、およびいくつかの
場合には−1〜−24から選択される任意の数のアミノ酸を含み得る。
【0015】 本発明のゲノムのストレプトアビジン分子はまた、天然のタンパク質配列の改
変体(対立遺伝子を含む)を含む。簡潔には、このような改変体は、天然の多型
によって生じ得るか、または組換えDNA方法論によって合成され得、そして1
つ以上のアミノ酸置換、挿入、欠失などによって野生型のタンパク質とは異なる
。改変体は、一般的には、少なくとも75%のヌクレオチド同一性を天然の配列
に対して有し、好ましくは、少なくとも80%〜85%、そして最も好ましくは
、少なくとも90%のヌクレオチド同一性を有する。代表的には、操作される場
合は、アミノ酸置換は保存的(すなわち、極性、非極性、芳香族、荷電など)ア
ミノ酸のグループ内でのアミノ酸の置換である。天然の配列に対する相同性に関
して、改変体は、好ましくは、少なくとも90%のアミノ酸配列同一性を有し、
そして特定の実施形態においては、92%、95%、または97%より大きい同
一性を有するようである。このようなアミノ酸配列同一性は、デフォルトパラメ
ーターを使用して、標準的な方法論(www.ncbi.nlm.nih.go
vで入手可能なNational Center for Biotechno
logy Information BLAST検索方法論の使用を含む)によ
って決定され得る。最も好ましい同一性の方法論は、米国特許第5,691,1
79号およびAltschulら、Nucleic Acids Res.25
:3389−3402、1997に記載されている方法論である。
【0016】 当業者に明らかであるように、ヌクレオチド配列およびコードされるゲノムの
ストレプトアビジンまたはその改変体は、コドンの縮重、ヌクレオチドの多型、
またはアミノ酸の差異に起因して、既知の天然の配列とは異なり得る。特定の実
施形態においては、改変体は、通常のストリンジェンシーの条件で、天然のヌク
レオチド配列に対して優先的にハイブリダイズする。通常のストリンジェンシー
の条件は、天然の二本鎖のTmより約25〜30℃下である(例えば、5×SS
PE、0.5%のSDS、5×デンハルト溶液、50%のホルムアミドで42℃
、または同等の条件;一般的には、Sambrookら、Molecular
Cloning:A Laboratory Manual、第2版、Cold
Spring Harbor Press、1989;Ausubelら、C
urrent Protocols in Molecular Biolog
y、Greene Publishing,1995を参照のこと)。比較によ
って、低ストリンジェンシーのハイブリダイゼーションが、Tmより約40℃下
の条件を利用し、そして高ストリンジェンシーのハイブリダイゼーションが、T
mより約10℃下の条件を利用する。
【0017】 「ポリペプチド」は、本明細書中で使用される場合は、5個以上の一連のアミ
ノ酸をいう。
【0018】 「単離された核酸分子」は、分離したフラグメントの形態での、または大きな
核酸構築物の成分としての、ポリヌクレオチド分子をいう。これは、その供給源
の細胞(それが通常は入っている染色体を含む)から少なくとも1回分離されて
おり、そして好ましくは、実質的に純粋な形態である。核酸分子は、DNA、R
NA、ヌクレオチドアナログ、またはそれらの組合せを含む、広範な種々のヌク
レオチドから構成され得る。
【0019】 用語「異種核酸配列」は、本明細書中で使用される場合は、プロモーターのよ
うな調節配列と作動可能に結合した少なくとも1つの構造遺伝子をいう。核酸配
列は、外来種に起源するか、または本来の形態から実質的に改変される場合には
、同じ種に起源する。例えば、用語「異種核酸配列」は、このような配列が、天
然のプロモーターまたは野生型のプロモーターとは異なるプロモーターと作動可
能に結合される場合には、同じ種に起源する核酸を含む。
【0020】 「抗体」は、本明細書中で使用される場合は、ポリクローナル抗体およびモノ
クローナル抗体の両方;霊長類化(例えば、ヒト化);マウス;マウス−ヒト;
マウス−霊長類;およびキメラを含み;そして、完全な分子、そのフラグメント
(例えば、scFv、Fv、Fd、Fab、Fab’、およびF(ab)’2
フラグメント)、あるいは完全な分子および/またはフラグメントの多量体また
は凝集体であり得;そして天然に存在し得るか、または例えば、免疫、合成、も
しくは遺伝子操作によって産生され得る;「抗体フラグメント」は、本明細書中
で使用される場合には、抗体に由来するかまたは関連するフラグメントをいい、
これは、抗原に結合し、そしていくつかの実施形態においては、例えば、ガラク
トース残基の取り込みによる、クリアランスおよび取り込みを促進する構造的な
特徴を示すように誘導体化され得る。これには、例えば、F(ab)、F(ab
)’2、scFv、軽鎖可変領域(VL)、重鎖可変領域(VH)、およびそれら
の組合せが含まれる。
【0021】 用語「タンパク質」は、本明細書中で使用される場合は、タンパク質、ポリペ
プチド、およびペプチドを含み;そして完全な分子、そのフラグメント、または
完全な分子および/もしくはフラグメントの多量体もしくは凝集体であり得;そ
して天然に存在し得るか、または例えば、合成(キメラおよび/もしくは酵素的
を含む)または遺伝子操作によって産生され得る。
【0022】 (A.ストレプトアビジン遺伝子および遺伝子産物) (1.ストレプトアビジン核酸分子およびその改変体) 本発明は、種々の長さのストレプトアビジン核酸分子を含むストレプトアビジ
ン融合構築物を提供する。特定の実施形態においては、これは、当該分野で利用
可能であり、そして米国特許第4,839,293号;同第5,272,254
号、およびATCC登録番号第X03591号に詳細に記載されている、全長の
ゲノムのストレプトアビジン核酸分子から構築される。
【0023】 本明細書中で提供される種々のストレプトアビジン核酸分子は、天然の改変体
(例えば、多型、スプライシング改変体、変異体)から操作され得るか、合成さ
れ得るか、または構築され得る。改変体を作成するための多くの方法が、開発さ
れている(一般的には、Sambrookら、Molecular Cloni
ng:A Laboratory Manual Cold Spring H
arbor Press、1989、およびAusubelら、Current
Protocols in Molecular Biology、Gree
ne Publishing Associates and Wiley−I
nterscience,New York、1995を参照のこと)。簡潔に
は、ヌクレオチド置換を作成するための好ましい方法は、変異される塩基(単数
または複数)にまたがり、そして変異した塩基(単数または複数)を含むオリゴ
ヌクレオチドを利用する。このオリゴヌクレオチドは、相補的な一本鎖の核酸に
対してハイブリダイズさせられ、そして第2鎖の合成がこのオリゴヌクレオチド
からプライムされる。宿主細胞(代表的には、E.coliであるが、あるいは
、他の原核生物、酵母、または他の真核生物)への形質転換のための二本鎖の核
酸が調製される。DNAのスクリーニングおよび単離および配列決定のための標
準的な方法が、変異配列を同定するために使用された。
【0024】 同様に、ストレプトアビジン核酸分子の欠失および/または挿入が、前記に議
論されるような、任意の種々の公知の方法によって構築され得る。例えば、核酸
分子は、制限酵素で消化され得、そして再度連結され得、それによって欠失させ
られ得るかまたはさらなる配列(例えば、リンカー)を有する配列を再度連結し
得る。その結果、挿入または大きな置換が作成される。当該分野で公知の方法(
例えば、Sambrookら、前出;Ausubelら、前出に記載されている
方法)を使用する改変体配列を作成する他の手段が、使用され得る。改変体配列
のバリエーションは、代表的には、制限酵素マッピング、配列分析、またはプロ
ーブハイブリダイゼーションによって達成される。特定の局面においては、その
コードされる生成物がビオチンに結合し得るストレプトアビジン核酸分子の改変
体が、本発明の状況において有用である。他の局面においては、改変体ストレプ
トアビジンのビオチンに結合する能力は、増大させられ得るか、減少させられ得
るか、または、天然のストレプトアビジンの能力と実質的に類似であり得る。な
お他の実施形態においては、改変体形態が天然のストレプトアビジンのものと同
様の典型的な四量体構造に自己を組立てする能力を残している限りは、ビオチン
に結合する能力は必要ではない。このような四量体構造は、抗体またはそのフラ
グメントをコードする配列に対して融合される場合は、四量体抗体の形成のよう
な種々の用途を有する。
【0025】 (2.ゲノムのストレプトアビジンおよびそれを含有している発現カセット) 本発明のゲノムのストレプトアビジン融合構築発現カセットは、ストレプトア
ビジン遺伝子またはその改変体の全ての遺伝子配列を利用することによって作成
され得る。特定の実施形態においては、発現カセットは、図4の少なくとも12
9個の連続しているアミノ酸またはその機能的な改変体をコードする核酸配列を
含む。種々の他の実施形態においては、核酸配列は、図4の少なくともアミノ酸
残基14から140をコードする。さらなる実施形態においては、核酸配列は、
図4のストレプトアビジンの、少なくともアミノ酸14〜150、14〜151
、14〜152、14〜153、14〜154、14〜155、14〜156、
14〜157、14〜158、または14〜159をコードする。なお他の実施
形態においては、核酸配列は、図4の少なくともアミノ酸10から150〜15
8、または図4の少なくともアミノ酸5から150〜158、または図4の少な
くともアミノ酸1から150〜158をコードする。なお他の実施形態において
は、核酸配列は、図4の少なくともアミノ酸残基1〜159をコードする。さら
になお他の実施形態においては、発現カセットは、図4の−1から−24の少な
くとも10アミノ酸残基をコードする核酸配列を含む。
【0026】 上記のように、本発明の核酸分子をコードするゲノムのストレプトアビジンは
、当該分野で公知の種々の方法によって利用可能なストレプトアビジン配列から
構築され得る。好ましい方法は、個々の領域を選択的に増幅するための増幅(例
えば、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR))であり、そしてこれはpCR2.1(
Invitrogen)のようなクローニングベクター中に配置される。さらに
、このようなPCR反応は、増幅のために使用されるプライマーがベクター中へ
の挿入を容易にするための特異的な制限エンドヌクレアーゼ部位を含むように、
種々の方法で行われ得る。
【0027】 さらに、PCR以外の種々の他の方法論が、所望される構築物を得るために使
用され得る。例えば、当業者は、目的のヌクレオチド配列を増幅するために、配
列を切り出しそして挿入するためのヌクレオチド配列中に存在している既存の制
限エンドヌクレアーゼ部位を使用するか、または部位指向型変異誘発、続く切り
出しおよび挿入による、異なる制限エンドヌクレアーゼ部位の導入による、等温
方法を使用し得る。これらおよび他の方法が、Sambrookら、前出;Au
subelら、前出に記載されている。簡潔には、1つの方法論は、一本鎖のス
トレプトアビジンをコードするDNAを作成し、続いて、所望される変更(例え
ば、小さい挿入、欠失、または変異であり、その結果、特有の制限部位がドメイ
ンの間に作成される)を除いて相補的であるプライマーとアニーリングさせるこ
とである。細菌細胞が形質転換され、そして所望される構築物を含むこれらの細
胞についてスクリーニングされる。この構築物は、次いで、所望の配列を開放す
るために消化され、これは次いで、精製され得、そして適切な方向で再度連結さ
れ得る。
【0028】 当業者は、発現カセットを設計する場合には、ビオチンに結合し得、そして細
菌宿主のペリプラズム空間ヘと発現され得る形態を利用することと比較した際に
、ゲノムのストレプトアビジンの絶対的な長さのみが第2の考慮であることを認
識する。このような構築物は、当該分野で公知のアッセイおよび本明細書中に記
載されているアッセイによって、ペリプラズム空間においてビオチンに結合しそ
して可溶性を維持するそれらの能力について容易に試験され得る。従って、ビオ
チン結合能力およびビオチン解離速度の測定のような実験は、当該分野で周知で
あり、そしてこれに関して適用可能である。簡潔には、このような構築物は、種
々の手段によってビオチンに結合するそれらの能力について試験され得る。これ
らには、放射性標識したビオチンの半飽和(subsaturating)レベ
ルで融合タンパク質を標識すること、次いで、解離を開始するために飽和レベル
の100倍のビオシチンを添加することを含む。遊離の放射性標識されたビオチ
ンが、一定の時間の間隔で測定される。
【0029】 (B.ベクター、宿主細胞、およびタンパク質を発現しかつ産生する方法) 本発明の発現カセットは、プロモーターを必ず含む必要はない。しかし、ベク
ター系への挿入の際には、カセットに含まれる配列は、プロモーターまたは他の
調節配列に一旦連結されて発現され得なければならない。1つの実施形態におい
ては、発現カセット自体がプロモーターを含む。さらに、カセットは好ましくは
、ゲノムのストレプトアビジンをコードする配列に対して融合/連結される異種
核酸配列の挿入のためのクローニング部位を含む。1つの例示的なカセットが図
1に示される。しかし、クローニング部位は、ゲノムのストレプトアビジン配列
の5’である必要はないが、ストレプトアビジン配列の3’に配置され得ること
に、注目すべきである。従って、コードされる融合タンパク質は、ゲノムのスト
レプトアビジンポリペプチドを、それに対して融合されるコードされるポリペプ
チドのN末端またはC末端のいずれかに、含み得る。さらに、種々の他の核酸配
列がゲノムのストレプトアビジンをコードする配列に連結され得るが、1つの実
施形態においては、この配列が抗体フラグメントをコードし、そして特定の実施
形態においては単鎖抗体(scFv)をコードすることに注目すべきである。
【0030】 クローニング部位に加えて、カセットは、リンカー分子を含み得る。リンカー
分子は、代表的には、融合タンパク質の状況で利用され、そして当該分野で周知
である。図2に説明されるように、リンカーは代表的には、ゲノムのストレプト
アビジン配列をそれに対して連結される他の配列からゲノムのストレプトアビジ
ン配列を分離するため、およびscFvのVHおよびVLを分離するために利用さ
れる。連結配列は、短いペプチドをコードし得るか、またはより長いポリペプチ
ドをコードし得る。好ましいリンカー配列は、少なくとも2個のアミノ酸をコー
ドするが、機能的な活性が保持される限りは、所望され得る限り多くのアミノ酸
をコードし得る。種々の実施形態においては、リンカー配列は、5、6、7、8
、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、
21、22、23、24、25、および35個のアミノ酸をコードする。特定の
実施形態においては、コードされるリンカーは、標準的なリンカー(例えば、(
Gly4Ser)xであり、ここでxは、任意の整数であり得るが、好ましくは1
から10である)であり得る。長さおよび組成は、最適な発現および生化学的な
特徴を与えるように、経験的に決定され得る。例えば、リンカーの組成は、分子
の等電点を上昇させるかまたは下げるように変更され得る。さらに、当業者は、
可変軽鎖および可変重鎖の間のリンカーの長さが、少なくとも2つのドメイン間
での結合を容易にするために十分な長さを必要とするが、ストレプトアビジンと
抗体フラグメントとの間のリンカーは、機能性が維持される限りは、0から10
0以上のアミノ酸のまでで変化し得ることことを理解する。従って、軽鎖と重鎖
との間のリンカーは代表的には、5より多くのアミノ酸であり、そして好ましく
は、10より多く、そしてより好ましくは、15アミノ酸より多い長さである。
【0031】 発現カセットは、種々の宿主生物体中で発現を指向するように、ベクター中で
使用され得る。特定の実施形態においては、ゲノムのストレプトアビジンを発現
する遺伝子融合体が細菌(例えば、E.coli)または哺乳動物細胞(例えば
、CHOおよびCOS−7)中で産生される。それらについて多くの発現ベクタ
ーが開発されており、そして利用可能である。他の適切な宿主生物体として、他
の細菌種および真核生物(例えば、酵母(例えば、Saccharomyces
cerevisiae)、植物、および昆虫細胞(例えば、Sf9))が挙げ
られる。
【0032】 1つの実施形態においては、ゲノムのストレプトアビジン融合タンパク質をコ
ードするDNA配列が、宿主細胞に対して適切な発現ベクター中に導入される。
上記に議論するように、配列は、複数のコドンを伴って、それぞれのアミノ酸に
ついて選択的なコドン(alternative codon)を含み得る。選
択的なコドンは、宿主種について「最適」であるように選択され得る。制限部位
は、代表的には、プライマー配列中に組込まれ、そしてベクターのクローニング
部位に関して選択される。必要である場合は、翻訳開始コドンおよび翻訳終結コ
ドンが、プライマー配列中に操作され得る。
【0033】 ベクターは、最少で、プロモーター配列を含む。本明細書中で使用される場合
は、「プロモーター」は、連結された遺伝子の転写を指向するエレメントを含む
ヌクレオチド配列をいう。プロモーターは、最少で、RNAポリメラーゼ結合部
位を含む。より代表的には、真核生物において、プロモーター配列は、遺伝子発
現の速度およびタイミングを制御する他の転写因子の結合部位を含む。このよう
な部位として、TATAボックス、CAATボックス、POUボックス、AP1
結合部位などが挙げられる、プロモーター領域はまた、エンハンサーエレメント
を含み得る。プロモーターが、遺伝子の転写を可能にするように遺伝子に対して
連結される場合は、それは「作動可能に連結される」。
【0034】 本明細書中で使用される発現ベクターとして、宿主細胞(例えば、細菌)中の
タンパク質の発現のために設計されたプロモーターが挙げられる。適切なプロモ
ーターが広範に利用可能であり、そして当該分野で周知である。誘導性または構
成性のプロモーターが好ましい。細菌中での発現のためのこのようなプロモータ
ーとして、T7ファージおよび他のファージに由来するプロモーター(例えば、
T3、T5、およびSP6)、ならびにtrp、lpp、およびlacオペロン
が挙げられる。tacおよびtrcのようなハイブリッドプロモーター(米国特
許第4,551,433号を参照のこと)もまた、使用され得る。真核生物細胞
中での発現のためのプロモーターとして、バキュロウイルス/昆虫細胞の発現系
のP10またはポリヘドロン(polyhedoron)遺伝子プロモーター(
例えば、米国特許第5,243,041号、同第5,242,687号、同第5
,266,317号、同第4,745,051号、および同第5,169,78
4号を参照のこと)、MMTV LTR、CMV IEプロモーター、RSV
LTR、SV40、メタロチオネインプロモーター(例えば、米国特許第4,8
70,009号を参照のこと)、エクジソン応答エレメント系、テトラサイクリ
ン可逆サイレンシング系(tet−オン、tet−オフ)などが挙げられる。
【0035】 ゲノムのストレプトアビジン融合構築物の転写を制御するプロモーターは、そ
れ自体が、リプレッサーによって制御され得る。いくつかの系においては、プロ
モーターは、細胞の生理学的条件を変更することによって(例えば、リプレッサ
ーに競合的に結合する分子の添加によってか、または増殖培地の温度を変更する
ことによって)脱抑制され得る。好ましいリプレッサータンパク質として、IP
TG誘導に応答性であるE.coli lacIリプレッサー、温度感受性のλ
cI857リプレッサーなどが挙げられる。
【0036】 他の調節配列が含まれ得る。このような配列として、転写終結配列、分泌シグ
ナル配列(例えば、米国特許第5,272,254号の図2Bのヌクレオチド4
80〜551)、リボソーム結合部位、複製起点、選択マーカーなどが挙げられ
る。調節配列は、転写、翻訳を可能にするように、または分泌を促進するように
、互いに作動可能に結合される。本発明の調節配列としてまた、米国特許第5,
272,254号に記載されているようなストレプトアビジン遺伝子の上流の領
域(例えば、米国特許第5,272,254号の図2A〜2Bに示される核酸残
基174〜551)が挙げられる。従って、100〜300塩基対の上流の配列
が、分泌および/または発現を促進するために発現構築物中で利用され得る。こ
のような上流の非翻訳領域が、ヌクレオチド174〜479として米国特許第5
,272,254号の図2Aおよび2Bに示されている。好ましい実施形態にお
いては、上記の配列の核酸残基408〜479が、発現構築物中で利用される。
【0037】 他の任意の実施形態においては、ベクターはまた、転写終結配列を含む。「転
写終結領域」は、選択されたプロモーターを認識するポリメラーゼによって転写
を終結するシグナルおよび/またはポリアデニル化のためのシグナル配列のいず
れかを提供する配列を有する。
【0038】 1つの局面においては、ベクターが、宿主細胞中で複製され得る。従って、宿
主細胞が細菌である場合は、ベクターは好ましくは、細菌の複製起点を含む。細
菌の複製起点として、f1−oriおよびcol E1複製起点、特に、pUC
プラスミドに由来するoriが挙げられる。酵母中では、ARSまたはCEN配
列が、複製を確実にするために使用され得る。哺乳動物細胞中で良好に使用され
る系は、SV40 oriである。
【0039】 好ましくは、プラスミドはまた、宿主中で機能的である少なくとも1つの選択
マーカーを含む。選択マーカー遺伝子として、形質転換された細胞が同定されそ
して選択的に増殖することを可能にする、宿主に表現形を付与する任意の遺伝子
が挙げられる。細菌宿主に適切な選択マーカー遺伝子として、アンピシリン耐性
遺伝子(Ampr)、テトラサイクリン耐性遺伝子(Tcr)、およびカナマイシ
ン耐性遺伝子(Kanr)が挙げられる。アンピシリン耐性およびカナマイシン
耐性遺伝子は、本発明に好ましい。真核生物に適切なマーカーは通常は、宿主中
での相補性欠損を必要とする(例えば、tk−宿主中でのチミジンキナーゼ(t
k))。しかし、薬物マーカーもまた利用可能である(例えば、G418耐性お
よびハイグロマイシン耐性)。
【0040】 ゲノムのストレプトアビジン融合タンパク質をコードするヌクレオチド配列と
してまた、分泌シグナル(例えば、リーダー配列の一部、このリーダー配列は、
分泌シグナルの一部を含有している遺伝子の上流の領域である)が挙げられ得る
。それによって、得られるペプチドは、プロセシングされそして分泌された前駆
体タンパク質である。得られるプロセシングされたタンパク質は、ペリプラズム
空間または醗酵培地から回収され得る。使用に適切な分泌シグナルが広範に利用
可能であり、そして当該分野で周知である(von Heijne、J.Mol
.Biol.184:99−105、1985;von Heijne、Eur
.J.Biochem.133:17−21,1983)。E.coli(また
は他の宿主)中で機能的である原核生物および真核生物の分泌シグナルが使用さ
れ得る。本発明に好ましい分泌シグナルとして、以下の細菌遺伝子によってコー
ドされる分泌シグナルが挙げられるが、これらに限定されない:ストレプトアビ
ジン、pelB(Leiら、J.Bacteriol.169:4379、19
87)、phoA、ompA、ompT、ompF、ompC、β−ラクタマー
ゼ、およびアルカリホスファターゼ。
【0041】 発現を増大させる他の成分もまた、ストレプトアビジン融合体の発現を指向す
るベクター中、または別のベクター中のいずれかに含まれ得る。このような成分
として、例えば、細菌のシャペロンタンパク質(例えば、SicA、GroEL
、GroE、DnaK、CesT、SecB、FkpA、SkpAなど)が挙げ
られる。
【0042】 当業者は、細菌細胞中での発現に適切でありそして用意に入手可能である広範
な種々のベクターが存在することを認識する。pETシリーズ(Novagen
、Madison,Wisconsin)、tac、およびtrcシリーズ(P
harmacia、Uppsala、Sweden)、pTTQ18(Amer
sham International plc、England)、pACY
C 177、pGEXシリーズなどのようなベクターが、ゲノムのストレプトア
ビジン融合タンパク質の発現に適切である。ゲノムのストレプトアビジン融合タ
ンパク質の発現のための宿主の選択は、一部ベクターによって示される。商業的
に入手可能なベクターは、適切な宿主と対である。
【0043】 真核生物細胞中での発現に適切な広範な種々のベクターもまた利用可能である
。このようなベクターとして、pCMVLacI、pXT1(Stratage
ne Cloning Systems,La Jolla、Californ
ia);pCDNAシリーズ、pREPシリーズ、pEBVHis、pDisp
lay(Invitrogen、Carlsbad、California)が
挙げられる。特定の実施形態においては、ゲノムのストレプトアビジン融合タン
パク質をコードする核酸分子は、pMC1neo、pOGシリーズのベクター(
Stratagene Cloning Systems)のような遺伝子標的
化ベクター中にクローン化される。
【0044】 上記のように、好ましい宿主細胞として、例として、Escherichia
coliのような細菌;チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、COS
細胞、骨髄腫細胞のような哺乳動物細胞;Saccharomyces cer
evisiaeのような酵母細胞;Spodoptera frugiperd
aのような昆虫細胞;トウモロコシのような植物細胞、他の宿主細胞などが挙げ
られる。
【0045】 昆虫細胞は、組換えタンパク質の高い発現が可能である。これに関して、バキ
ュロウイルスベクター(例えば、pBlueBac(例えば、米国特許第5,2
78,050号、同第5,244,805号、同第5,243,041号、同第
5,242,687号、同第5,266,317号、同第4,745,051号
、および同第5,169,784号を参照のこと;Invitrogen,Sa
n Diego,Californiaから入手可能))が、Spodopte
ra frugiperda Sf9細胞のような昆虫細胞中での発現に使用さ
れ得る(米国特許第4,745,051号を参照のこと)。昆虫細胞または昆虫
中での発現は、好ましくは、バキュロウイルスポリヘドリンプロモーターの転写
制御下で異種タンパク質を発現し得る組換えバキュロウイルスベクターを使用し
て達成される(例えば、米国特許第4,745,051号は、バキュロウイルス
/昆虫細胞発現系に関連している)。ポリヘドリンは、高度に発現されるタンパ
ク質であり、従ってそのプロモーターは、十分な異種タンパク質の産生を提供す
る。好ましいバキュロウイルスは、Autographa californi
ca(ACMNPV)である。適切なバキュロウイルスベクターは、Invit
rogenから市販される。
【0046】 また、本発明の融合構築物は、トランスジェニック動物中で発現され得る。例
えば、ゲノムのストレプトアビジンを含有している発現カセットは、乳汁特異的
プロモーターのような乳房組織中で特異的に活性化されるプロモーターに作動可
能に連結され得る。このような方法は、米国特許第4,873,316号および
米国特許第5,304,498号に記載されている。
【0047】 ゲノムのストレプトアビジン遺伝子融合体はまた、植物(例えば、トランスジ
ェニックな植物体、植物組織、植物の種子、および植物細胞)中で発現され得る
。このような方法は、米国特許第5,202,422号に記載されている。
【0048】 選択される特定のシステムにかかわらず、組換えタンパク質の発現に適切なシ
ステムの設計は周知であり、そして組換え融合タンパク質の発現に関する上記に
同定された参考文献によって立証されているように、当業者の範囲内である。
【0049】 従って、本明細書中の本文および実施例によって証明されるように、ゲノムの
ストレプトアビジン発現遺伝子融合構築物の状況での融合タンパク質の発現は、
いくつかの重要な利点を提供する。例えば、1つの実施形態においては、ゲノム
のストレプトアビジン融合タンパク質は、細菌のペリプラズム空間中に可溶性の
タンパク質として発現され、そして自発的なフォールディングを受ける。従って
、このような発現は、ペリプラズムが低ビオチンであり、酸化の環境であり、そ
して可溶性の機能的な分子を生じるという利点を付与する。このことは、過酷な
変性条件下でタンパク質を下で精製しそしてフォールディングされなければなら
ないことを回避する。過酷な変性条件は、異種核酸分子によってコードされるポ
リペプチドに対して致命的であることが証明され得る。
【0050】 ゲノムのストレプトアビジンを発現する遺伝子融合体は、当業者に公知の種々
の方法によって単離され得る。しかし、好ましくは、精製方法は、機能的なスト
レプトアビジン分子の存在を、精製を補助する際にその高い親和性結合を利用す
ることによって利用する。従って、好ましい精製方法は、固体の表面上に固定さ
れたイムノビオチンの使用による。
【0051】 (C.融合成分としての抗体) 広範な種々のゲノムのストレプトアビジン発現遺伝子融合分子が、本明細書中
に記載されている方法によって設計され得るが、特に有用な融合タンパク質は、
抗体とゲノムのストレプトアビジンとの融合タンパク質、特に、抗体−ゲノムス
トレプトアビジン発現遺伝子融合体(Ab−SA)である。好ましい実施形態に
おいては、発現構築物は、抗体のFvまたはscFv部分をコードする。さらに
好ましい実施形態においては、構築物は、分子の重鎖部分または軽鎖部分のいず
れかの末端を通じてストレプトアビジンが連結され得る、Fabフラグメントま
たはその機能的な誘導体をコードする。従って、目的のFv領域をコードするD
NAは、例えば、ハイブリドーマのcDNAからのポリメラーゼ連鎖反応のよう
な、縮重オリゴヌクレオチドを使用する増幅技術、リガーゼ連鎖反応(LCR)
(WuおよびWallace、Genomics、4:560、1989、La
ndegrenら、Science、241:1077、1988、ならびにB
arringerら、Gene、89:117、1990を参照のこと)、転写
に基づく増幅(Kwohら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA
86:1173、1989を参照のこと)、ならびに自己維持配列複製(Gua
telliら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、87:187
4、1990を参照のこと)、適切な配列のクローニングおよび制限、あるいは
Narangら、Meth.Enzymol.68:90−99、1979のホ
スホトリエステル法;Brownら、Meth.Enzymol.68:109
−151、1979のホスホジエステル法;Beaucageら、Tetra.
Lett.,22:1859−1862、1981のジエチルホスホルアミダイ
ト法のような方法による、直接的な化学合成;ならびに米国特許第4,458,
066号および米国特許第5,608,039号および同第5,840,300
号、ならびにPCT出願番号第WO98/41641号の固体支持方法を含む、
任意の適切な方法によって調製され得る。目的の領域(例えば、Fabまたはs
cFV)をコードするDNAはまた、ファージディスプレイライブラリーによっ
て単離され得る。
【0052】 当業者は、本明細書中に提供される開示を考慮すれば、任意の数の結合対のメ
ンバーが利用され得、そして従ってストレプトアビジン/ビオチンの結合に限定
されないことを容易に認識する。これに関して、抗体/エピトープ対または任意
のリガンド/抗リガンド対が利用され得る。当業者はまた、本開示が、4価の抗
体の調製のための一般的な方法を提供することを認識する。その同族の抗原につ
いての抗体のアビディティは一般的にはその結合価の関数であるので、4価の抗
体が2価の抗体より好ましい多くの適用が存在する。このような適用として、イ
ムノアッセイ、免疫治療、免疫親和性クロマトグラフィーなどが挙げられるが、
これらに限定されない。
【0053】 化学合成もまた、一本鎖のオリゴヌクレオチドを産生するために利用され得る
。これは、相補配列とのハイブリダイゼーションによって二本鎖のDNAに転換
され得るか、または鋳型として一本鎖を使用するDNAポリメラーゼを用いる重
合によって二本鎖のDNAに転換され得る。単鎖のFv領域全体の化学合成が可
能であるが、後で互いに連結される多数のより短い配列(約100〜150塩基
)を合成することが好ましい。
【0054】 あるいは、部分配列がクローン化され得、そして適切な部分配列が適切な制限
酵素を使用して切断され得る。フラグメントは、次いで、所望のDNA配列を産
生するために連結され得る。
【0055】 一旦、可変の軽鎖(VL)および重鎖(VH)のDNAが得られると、直接また
はペプチドリンカーをコードするDNA配列を通じてのいずれかで、当業者に周
知の技術を使用して配列が互いに連結され得る。好ましい実施形態においては、
重鎖および軽鎖の領域が、可撓性のポリペプチドリンカー(例えば、(Gly4
Ser)x、またはpKOD配列、または以下に提供される他のもの)によって
連結される。これらは、軽鎖のFvドメインのカルボキシル末端で始まり、そし
て重鎖のFvドメインのアミノ末端で終わるか、またはその逆であり、Fvドメ
インの順序は、軽鎖−重鎖または重鎖−軽鎖のいずれであってもよい。配列全体
は、単鎖抗原結合タンパク質の形態でFvドメインをコードする。
【0056】 イムノグロブリンの組換え発現のための種々の方法が存在する。以下の参考文
献は、一般的に組換えイムノグロブリンおよび融合タンパク質の発現について適
切な方法および宿主系の代表である:Weidleら、Gene 51:21−
29、1987;Doraiら、J.Immunol.13(12):4232
−4241、1987;De Waeleら、Eur.J.Biochem.1
76:287−295、1988;Colcherら、Cancer Res.
49:1738−1745、1989;Woodら、J.Immunol.14
5(a):3011−3016、1990;Bulensら、Eur.J.Bi
ochem.195:235−242 1991;Beggingtonら、B
iol.Technology 10:169、1992;Kingら、Bio
chem.J.281:317−323、1992;Pageら、Biol.T
echnology 9:64、1991;Kingら、Biochem.J.
290:723−729、1993;Chaudaryら、Nature 33
9:394−397、1989;Jonesら、Nature 321:522
−525、1986;MorrisonおよびOi、Adv.Immunol.
44:65−92、1988;Benharら、Proc.Natl.Acad
.Sci.USA 91:12051−12055、1994;Singerら
、J.Immunol.150:2844−2857、1993;Cootoら
、Hybridoma 13(3):215−219、1994;Queenら
、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:10029−100
33、1989;Caronら、Cancer Res.32:6761−67
67、1992;Dubelら、J.Immunol.Methods 178
:201−209、1995;Batraら、J.Biol.Chem.265
:15198−15202、1990;Batraら、Proc.Natl.A
cad.Sci.USA、86:8545−8549、1989;Chaudh
aryら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、87:1066−
1070、1990(これらのいくつかは、種々の単鎖抗体発現遺伝子融合体の
調製を記載している)。
【0057】 従って、一旦、発現された場合に特異的結合活性を示すFv領域をコードする
DNA配列が同定されると、そのFv領域を含有している融合タンパク質は、当
業者に公知の方法によって調製され得る。Fv領域は、本発明の発現カセット中
でゲノムのストレプトアビジンに対して直接融合され得るか、あるいは、ペプチ
ドもしくはポリペプチドリンカーを通じてゲノムのストレプトアビジンに対して
直接連結され得、それによって連結された生成物を形成する。リンカーは、Fv
と融合されたゲノムのストレプトアビジンとの間に空間を提供するように単純に
存在し得るか、または互いにそれらの最適な立体構造を達成することを可能にす
るようにこれらの領域の間の移動を容易にするように存在し得る。ゲノムのスト
レプトアビジン−抗体発現カセットは、代表的には、適切なリンカーによって融
合される重鎖および軽鎖の可変配列の両方、ならびにゲノムのストレプトアビジ
ンと軽鎖および重鎖とを融合するリンカーの発現を提供し、それによって単鎖抗
体:ゲノムのストレプトアビジン(scFvSA)結合体をコードする、単一の
ベクターを含む。1つの実施形態においては、可変軽鎖および可変重鎖を連結す
るリンカーは、可撓性を可能にするために十分な長さであるかまたはそのように
側鎖が選択される。1つの実施形態においては、リンカーは、上記に記載されて
いる(Gly4Ser)xのような標準的なリンカーであり、一方、別の実施形態
においては、リンカーは、pKODリンカー(GlyLeuGluGlySer
ProGluAlaGlyLeuSerProAspAlaGlySerGly
Ser)(配列番号9)である。種々のリンカーが使用され得るが、いくつかの
実施形態においては、抗体軽鎖と抗体重鎖とを分離するリンカーが、可撓性を可
能にし、そしてゲノムのストレプトアビジン配列に対してscFvを付着するリ
ンカーが極めて剛直であり得るかまたは極めて可撓性であり得ることがが好適で
あり得ることが、理解されるはずである。さらに、リンカーに加えて、さらなる
アミノ酸は、リンカーであることは必ずしも意図されず、このようなこれらのア
ミノ酸が、利用される構築方法に依存して、本明細書中の構築物中に含まれ手も
含まれなくともよいので、リンカーの挿入および関連する組換えDNA操作を容
易にする制限部位の付加によってコードされ得る。
【0058】 例示的なリンカーが、当業者に公知である。例えば、ポリペプチドリンカーに
よって互いに結び付けられた抗体の重鎖および軽鎖のFv部分が、それらの全長
の2つの鎖の対応部分と同じ結合特性を有し得る(Birdら、Science
,242:423−26、1988およびHustonら、Proc.Natl
.Acad.Sci.USA,85:5879−83、1988)。いくつかの
例においては、毒素に対して連結された単鎖抗体から構成される融合タンパク質
は、単鎖抗体の結合能力、ならびに毒素の活性を保持し得ることもまた示されて
いる(Chaudaryら、Nature、339:394−97、1989;
Batraら、J.Biol.Chem.,265;15198−15202、
1990;Batraら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 8
6:8545−8549、1989;Chaudaryら、Proc.Natl
.Acad.Sci.USA 87:1066−1070、1990)。ストレ
プトアビジンを含有している例示的な融合構築物が、Sheldonら、App
l.Radiat.Isot.43(11):1399−1402、1992;
SanoおよびCantor、Bio/Technology 9:1378−
1381、1991;Spoonerら、Human Pathology 2
5(6):606−614、1994;Dubelら、J.Immun.Met
hods 178:201−209、1995;Kipriyanovら、Pr
otein Engineering 9(2):203―211、1996に
よって記載されている。リンカーを含むDNA配列はまた、クローニングを容易
にするプライマー部位もしくは制限部位のような配列を提供し得るか、またはs
cFvをコードする配列とゲノムのストレプトアビジンをコードする配列との間
にリーディングフレームを保存し得る。このようなリンカーの設計は、当業者に
周知である。
【0059】 さらに、当業者は、ゲノムのストレプトアビジン−抗体発現遺伝子融合体の、
適切なリガンドに結合する能力を試験することが慣用的であることを見出す。意
図される実施形態においては、このリガンド抗原は、細胞表面抗原、細胞に会合
した間質もしくはマトリックス抗原、または細胞によって分泌される抗原(CD
19、CD20、CD22、CD25、CD33、CD45、CD52、CD5
6、CD57、EGP40(またはEPCAMもしくはKSA)、NCAM、C
EA、TAG−72、ムチン(MUC−1からMUC−7)、β−HCG、EG
Fレセプターおよびそれらの変異体、IL−2レセプター、her2/neu、
Lewis y、GD2、GM2、Lewis x、葉酸レセプター、線維芽細
胞活性化タンパク質、テネイシン、シアル化されたテネイシン、ソマトスタチン
、活性化された腫瘍間質抗原、また新脈管形成性(neoangiogenic
)抗原を含むがこれらに限定されない)であり得る。さらに、抗体の、このよう
な抗原のエピトープに結合する能力を評価するための方法が公知である。
【0060】 (D.ゲノムのストレプトアビジンを発現する融合構築物の適用可能な用途) 任意の異種核酸配列がゲノムのストレプトアビジンをコードするように連結さ
れ得、そして本明細書中に記載されるように発現され得るが、特に、有用な発現
される融合構築物は、ゲノムのストレプトアビジンに連結されたscFvを含有
しているものであり、scFvSAと先に呼ばれた。従って、本発明の1つの局
面においては、抗体のscFvフラグメントは、医学的な診断および治療目的の
ための方法においてツールとして有用である。哺乳動物宿主中の標的部位の存在
もしくは非存在を検出するため、またはそれを処置するための、診断または治療
方法が、記載されている。治療目的のためのインビボでの投与のために抗体また
は抗体結合体を使用するための基準を決定する場合には、一般的には、到達可能
な標的比が高いこと、および腫瘍に送達される治療薬の絶対的な用量が有意な腫
瘍応答を誘発するために十分であることが所望される。本発明に記載されている
このような抗体を利用するための方法は、例えば、米国特許第4,877,86
8号、同第5,175,343号、同第5,213,787号、5,120,5
26号、および同第5,200,169号に見出され得る。治療または診断目的
のためのインビボでの投与の際には、治療薬に対する非標的組織の暴露を制限す
ることもまた所望される。
【0061】 診断または治療薬に対する非標的組織の暴露を減少させるための1つの方法は
、標的部位に対して標的化部分(例えば、scFvSA)を「プレターゲティン
グさせること」、次いで続いて、標的部位で「プレターゲティングされた」標的
部分に結合し得る、迅速にクリアする診断薬もしくは治療薬結合体を投与するこ
とを含む。この方法においては、一般的に記載されるように、最適な中間工程は
、結合していない標的化部分結合体の、活性な試薬結合体の投与の前の循環から
の効率的な除去を補助するクリア試薬の投与を含み得る。種々のクリア試薬(c
learing agent)およびキレート(例えば、DOTA)の記載を含
む、プレターゲティング技術の実施形態の記載は、米国特許第4,863,71
3号、同第5,578,287号、同第5,608,060号、同第5,616
,690号、同第5,630,996号、同第5,624,896号;ならびに
PCT国際公開番号第WO93/25240号、同第WO95/15978号、
同第WO97/46098号、同第WO97/46099号(これらは本明細書
中でそれらの全体において援用されている)に見出され得る。
【0062】 プレターゲティングアプローチにおいては、活性な試薬の薬物動態学は、標的
化部分のものとは分離される。リガンド/抗−リガンド対のメンバーに結合させ
られた標的化部分は、標的部位への癒着(accrete)を可能にされる。従
って、本発明の1つの実施形態においては、scFvSAは、標的化部分(sc
Fv)とリガンド(ストレプトアビジン)との結合体(融合体)である。癒着が
生じ、そして標的に関連しない結合体の実質的な画分が、内在性のクリアランス
によって、またはリガンドもしくは抗リガンドを含有しているクリア試薬の投与
によるかのいずれかによって、レシピエントの循環からクリアされた後、活性な
試薬が、標的化結合体のものと相補的であるリガンド/抗リガンド対のメンバー
に対する結合体として、投与される(例えば、ビオチンは、例示的な実施形態に
おける相補的なメンバーである)。好ましくは、試薬−リガンドまたは試薬−抗
リガンドは、短い血清半減期を有し、そして腎臓の経路を通じて排泄される。こ
の様式においては、治療薬は、その治療または診断能力の発揮が所望される標的
部位に対して癒着するか、またはそれがレシピエントから迅速に除去されるかの
いずれかである。活性な試薬のこの分布は、所望されない毒性からのレシピエン
トの正常な組織の保護を容易にする。腎臓の排泄を増強するために、腎臓の排泄
を促進する生体分布を指向する分子に対する結合体が使用され得る。本質的には
、このようなプレターゲティング方法は、従来のガンの診断または治療と比較し
て、標的細胞の部位に対する標的化の比を改善するか、または標的細胞部位に対
する絶対的なな用量を増大させることによって、特徴付けられる。
【0063】 プレターゲティング方法論の1つの実施形態においては、標的化部分は、目的
の標的細胞に関連する特定の抗原について特異的な本発明の抗体融合体を含む。
関連する局面においては、抗原マーカーは、以下を含むがそれらに限定されない
、ガンに関連し得る:リンパ腫(例えば、CD20);白血病(例えば、CD4
5);前立腺(例えば、TAG−72);卵巣(例えば、TAG−72);乳房
(例えば、MUC−1);結腸(例えば、CEA);および膵臓(例えば、TA
G−72)。例えば、CD20抗原は、リンパ腫の処置のために標的化され得る
。ここでは、リガンド/抗リガンド結合対は、ビオチン/アビジン(例えば、ス
トレプトアビジン遺伝子融合体(scFvSA))であり得、そして活性な試薬
は、プレターゲティング方法における放射性核種である。さらに、例えば以下の
ような、種々の抗原が標的化され得る:例えば、CD45抗原に対する抗体によ
って媒介される標的化を使用することによる、広範な血液学の悪性腫瘍の任意の
1つを有している患者を処置するための、プレターゲティングされた放射性免疫
治療(PRIT)のためCD45抗原標的化。CD45は、最も広範に発現され
る公知の血液学的な抗原であり、本質的に全ての白血球細胞およびそれらの前駆
体(好中球、単球、およびマクロファージ、全てのリンパ球、骨髄前駆体および
リンパ前駆体、ならびに約90%の急性骨髄性白血病(AML)細胞を含む)に
おいて見出される。従って、診断または治療目的のための標的化に利用可能な抗
原が多数である場合には、本発明は、これらの抗原の任意のものを標的化するこ
とを促進するように使用され得る。
【0064】 プレターゲティング方法におけるさらなる工程(上記で同定した工程を含む)
は、結合していない標的化部分(すなわち、リガンドまたは抗リガンドには結合
していない)の最初の投与、あるいは、この最初の工程における結合させられた
形態と同時にこの結合していない標的化部分を投与すること、従って、最初に接
触されるこれらの標的をブロックすることを含む。このようなブロックは、例え
ば、非ホジソンリンパ腫の処置において特に有用であり得る。ここでは、標的化
された組織の第1のセットは脾臓であるが、ほとんどの腫瘍は、深いリンパ節に
見出される。このような予めブロックすることは、活性な試薬での後の処置から
の脾臓細胞の実質的な保護を可能にする。結合していない標的化試薬は、必ずし
も同じエピトープに結合する必要はないが、有効であるためには、標的化部分の
結合体による結合が除外されるはずである。
【0065】 当業者は、治療効果または診断の有用性を増強するために、同じ細胞型に結合
する異なる抗体を含有している、複数の標的化部分の結合体を使用し得る。Ab
ramsに対して発行された米国特許第4,867,962号は、標的部位に対
して活性な試薬を送達するためのこのような改善された方法を記載している。こ
の方法は、活性な試薬−標的化部分結合体を使用する。簡潔には、Abrams
の方法は、2つ以上の活性な試薬−標的化部分結合体のレシピエントに対する投
与を意図する。ここでは、それぞれの結合体は、標的化部分として異なる抗体種
を含む。利用される抗体種のそれぞれは、異なる標的部位のエピトープ(同じで
あるかまたは異なる標的部位抗原に関連する)と反応し、一方、非標的組織との
抗体種の交差反応性のパターンは重複していない。この様式においては、異なる
抗体が、所望される標的部位で付加的に蓄積するが、任意の型の非標的組織での
全ての種の蓄積は、より少ない。従って、投与される試薬のより高い割合が、非
標的組織よりも標的部位で、インビボで局在化する。本発明は、これと同様のア
プローチを、ならびにプレターゲティング形式で、含み得る。1つの実施形態に
おいては、例えば、それぞれが本発明に従って調製された、異なるエピトープに
対して指向され、そして重複していない交差反応性を有する、抗体との2つ以上
の種の標的化結合体(融合体)が、診断またはと治療の有用性を改善するように
、プレターゲティング方法に従って投与される。さらなる実施形態は、ストレプ
トアビジンの単量体が天然においては四量体を形成するように会合する特性を利
用する。従って、ストレプトアビジンの単量体の形態に対してそれぞれが結合さ
せられた(融合体の)2つ以上の抗体が、選択的に混合され、そして四量体のス
トレプトアビジンの形成の際に、標的部位の複数のエピトープについての特異性
を伴って単一の種を生じる。
【0066】 記載されている方法が、改変され得、そして所望される効果をなお達成し得る
ことが、理解されるはずである。例えば、それらのそれぞれの交差反応性に関し
て、同じ抗原または細胞型について特異的な2つの抗体が、使用され得る。これ
らの方法に不可欠である全ては、標的化部分−リガンド/抗リガンド結合体が優
先的に標的細胞に結合すること、および活性な試薬−結合体が実質的に予め標的
された細胞に局在化し、そしてそうでなければ循環から実質的にクリアされるこ
とである。
【0067】 あるいは、抗体に基づくまたは抗体以外に基づく標的化部分は、調節されてい
ない抗原を保有している標的部位に対してリガンド/抗リガンドを送達するため
に使用され得る。好ましくは、調節されていない抗原のような天然の結合剤が、
この目的のために使用される。
【0068】 本明細書中に記載されているプレターゲティング方法は、必要に応じて、クリ
ア試薬の投与を含む。クリア試薬の投与量は、循環からの予め投与された標的化
部分−リガンド/抗リガンド結合体の実質的なクリアに十分である量である。一
般的には、クリア試薬を投与するタイミングの決定は、標的の取り込みおよび標
的化部分結合体の内因性のクリアランスに依存する。特に好ましいクリア試薬は
、ガラクトシル化されたタンパク質(例えば、ガラクトシル化されたビオチン化
ヒト血清アルブミン、およびN−アセチルガラクトサミンおよびビオチンを含有
している低分子クリア試薬)のような、Ashwellレセプターによって媒介
されるクリアランスを提供するものである。
【0069】 本明細書中で有用な活性な試薬(診断または治療)の型として、放射性核種、
毒素、抗腫瘍薬、薬物、遺伝子、およびサイトカインが挙げられる。例えば、上
記のように、ビオチンに対するこのような試薬の結合体は、プレターゲティング
アプローチにおいて有用であり得る。これに関して、治療用抗体(例えば、アポ
トーシスを誘導するかまたは血管形成を阻害する抗体)が、プレターゲティング
するような治療様式において使用され得る。診断薬の融合に関して、治療薬の融
合とは対照的に、増強された標的細胞のインターナリゼーションは、当業者が診
断薬−標的化部分結合体を投与する場合には、不利である。診断結合体のインタ
ーナリゼーションは、細胞の代謝および結合体の崩壊を生じる。崩壊の際には、
診断薬の小さい付加物または診断薬自体が、細胞から放出され得、従って、標的
特異的様式で結合体を検出する能力を排除し得る。
【0070】 本明細書中で有用な診断薬または治療薬として、放射性核種、薬物、抗腫瘍薬
、毒素、遺伝子、およびサイトカインが挙げられる。本発明において有用な放射
性核種として、γ放射体、陽電子放射体、Auger電子放射体、X線放射体、
および蛍光放射体が挙げられ、治療的な使用にはβ−またはα−放射体が好まし
い。放射性核種は当該分野で周知であり、そして123I、125I、130I、131I、 133 I、135I、47Sc、72As、72Se、90Y、88Y、97Ru、100Pd、101m
Rh、119Sb、128Ba、197Hg、211At、212Bi、153Sm、169Eu、212 Pb、109Pd、111In、67Ga、68Ga、64Cu、67Cu、75Br、76Br、 77 Br、99mTc、11C、13N、15O、166Ho、および18Fが挙げられる。好ま
しい治療用の放射性核種として、188Re、186Re、203Pb、212Bi、213
i、109Pb、64Cu、67Cu、90Y、125I、131I、77Br、211At、97Ru
105Rh、198Au、および199Ag、166Ho、または177Luが挙げられる。
【0071】 当業者が、容易に適用可能であり得る場合には、上記のストレプトアビジン遺
伝子融合体が、「プレターゲティングすること」が放射線感作試薬の使用と組み
合わせられる場合のような、組合せ治療において利用され得る。このような放射
線感作試薬として、ゲンシタビン(gemcitabine)、5−フルオロウ
ラシル、パクリタキセルなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【0072】 本発明において有用な強力な毒素のいつくかは、A鎖およびB鎖から構成され
る。A鎖は細胞毒性部分であり、そしてB鎖はインタクトな毒素分子のレセプタ
ー結合部分(ホロ毒素)である。毒素B鎖が非標的細胞の結合を媒介し得るので
、これは、しばしば、標的部分(例えば、分子)に対して毒素A鎖だけが結合す
るために有利である。しかし、毒素B鎖の排除は、非特異的細胞毒性を減少させ
るが、これはまた、一般的には、対応するホロ毒素の結合体と比較した場合には
、結合した毒素A鎖の能力の低下を導く。
【0073】 これに関して好ましい毒素として、ホロ毒素(例えば、アブリン、リシン、モ
デシン、Pseudomonas外毒素A、ジフテリア毒素、百日咳毒素、シガ
毒素、およびbryototoxin;ならびにA鎖または「A鎖様」分子(例
えば、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、Pseudomonas外毒
素Aの酵素部分、ジフテリア毒素A鎖、百日咳毒素の酵素部分、シガ毒素の酵素
部分、ゲロニン(gelonin)、アメリカヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質
、サポリン、トリチン、オオムギ毒素、およびヘビ毒液ペプチド)が挙げられる
。トランス配置能力および細胞結合能力を欠失している天然に存在しているタン
パク質合成のインヒビターである、リボソーム不活化タンパク質(RIP)もま
た、本明細書中での使用に適切である。高度に毒性である毒素(例えば、パリト
キシン(palytoxin)など)もまた、本発明の実施における使用のため
に意図される。しかし、治療用薬物は、それ自体が、複合体のインターナリゼー
ションを促進し得る。
【0074】 標的化させられた結合体として投与される治療薬もまた、本明細書中に含まれ
る。再び、目的は、最も高い可能な濃度の薬物(標的組織の暴露を最大にするた
め)の投与であるが、これはなお、受容可能ではない正常な器官の毒性(非標的
組織の暴露に起因する)の限界未満である。しかし、放射性同位元素とは異なり
、治療薬は、細胞毒性効果を発揮するために標的細胞中に取り込まれる必要があ
る。標的化部分−治療薬結合体の場合においては、標的化部分−薬物結合体の増
強された標的細胞でのインターナリゼーションのために手段と、標的化部分の相
対的な標的特異性を組合せることが有利である。
【0075】 本明細書中での使用に適切な治療薬として、従来の化学療法薬(例えば、ビン
ブラスチンブ、ドキソルビシン、レオマイシン、メトトレキセート、5−フルオ
ロウラシル、6−チオグアニン、シタラビン、シクロホスファミド、およびシス
−プラチン、ならびに以下に記載されているものを含む他の従来の化学療法薬:
Principles and Practice of Oncology、
第2版、V.T.DeVita、Jr.S.Hellman,S.A.Rose
nberg,J.B.Lippincott Co.,Philadelphi
a,Pennsylvania、1985、第14章、ならびにアナログが親分
子のものよりも大きな能力を有する場合には、そのような薬物のアナログが挙げ
られる。本発明の範囲内の別の薬物は、トリコテセンである。本発明の実施にお
いて診断薬または治療薬として本明細書中での使用に適切な他の好ましい薬物と
して、1987年11月に改正された、NCI Investigationa
l Drugs、Pharmaceutical Data 1987、NIH
Publication 第88−2141号に記載されているものを含む、
実験用の薬物が挙げられる。
【0076】 他の抗腫瘍薬(例えば、増殖しつつある細胞に対して活性である試薬)が、本
発明に従って投与される。例示的な抗腫瘍薬として、プロアポトーシス性抗体、
抗血管形成性抗体、サイトカイン(例えば、IL−2、腫瘍開始因子など)、レ
クチン炎症応答プロモーター(セレクチン(例えば、L−セレクチン、E−セレ
クチン、P−セレクチンなど))、ならびに同様の分子が挙げられる。
【0077】 当業者は、本出願および本明細書中で参照される出願における教示に基づいて
、有用な診断または治療投与量および処置プロトコールを容易に決定し得る。こ
れは、例えば、特定の選択される治療薬もしくは診断薬、送達経路、標的部位(
単数または複数)の型、目的の標的部位についての標的化部分の親和性、正常な
組織との標的化部分の任意の交差反応性、患者の状態、のようなの因子に依存し
、とりわけ、処置が単独で行われるかまたは他の処置(中でも、他の因子)と組
み合わせられるかどうかに依存する。治療有効投与量は、患者の生存時間を延長
することによって患者を処置するものである。好ましくは、治療はさらに、腫瘍
の増殖を停止させることによって患者を処置し、そして最も好ましくは、治療は
さらに、腫瘍を根絶させる。
【0078】 一貫して議論される特許および特許出願を含む全ての参考文献が、それらの全
体において本明細書中で参考として援用される。
【0079】 本発明はさらに、以下の実施例の説明を通じて記載される。これらの実施例は
、例示のために提供され、そして限定のためではない。
【0080】 (実施例) (実施例I) (huNR−LU−10単鎖抗体−ゲノムストレプトアビジン融合物の構築) 一般的に、単鎖Fv/ストレプトアビジン(scFvSA)融合タンパク質は
Streptomyces avidiniiのゲノムのストレプトアビジンに
対する可変領域(scFv)の単鎖抗体の遺伝的融合から発現される。scFv
遺伝子は、DNAリンカー配列(例えば、図2)によって分離されている軽鎖(
L)および重鎖(VH)の可変領域から成る。ストレプトアビジンをコードして
いる配列は、scFV遺伝子の3’末端に連結されており、そして2つの遺伝子
が、2番目のDNAリンカー配列により、インフレームで分離されている。スト
レプトアビジン遺伝子由来のシグナル配列は、E.coliのペリプラズム腔へ
と直接発現させるためにscFV SA遺伝子の5’末端に融合されている。s
cFVSA遺伝子は、lacプロモーターの支配下にあり、発現した融合タンパ
ク質は、E.coliから抽出および精製され、そして約172,000の分子
量の可溶性テトラマーを形成する。
【0081】 trcプロモーターを取り除くために、プラスミドpKK233−2(Ame
rsham Pharmacia Biotech、 Piscataway、
NJ)をBamHIおよびNcoIで消化した。lacプロモーターを、ポリ
メラーゼ連鎖反応(PCR)によりpBR322から増幅し、pKK233−2
のBamHI/NcoI部位にクローニングした。この過程において、EcoR
I部位を、NcoI部位のすぐ5’側に導入した。プラスミドはNcoIおよび
PstIにより消化され、そしてpelBリーダー配列をコードするオリゴヌク
レオチドと連結された。プラスミド上の、用いられたNcoI部位は、再生され
なかった。そして、新たなNcoI部位が、pelBをコードしている配列の3
’側に導入された。この結果、得られたプラスミドは、pKK−lac/pel
Bといわれた(図5)。pKK−lac/pelBおよびpUC18を、Prv
uおよびPvuIIを用いて消化した。lacプロモーターおよびマルチクロー
ニング部位を含むpKK−lac/pelBの2.9kbのフラグメントが、プ
ラスミドpEX−1を作るための複製起点を含むpUV18の1.4kbのフラ
グメントへとライゲーションされた(図6)。
【0082】 ストレプトアビジンおよびhuNR−LU10 scFV遺伝子(40kDの
上皮糖タンパク質である抗原EGP40あるいはEPCAMに結合するモノクロ
ーナル抗体)を、huNP−LU−10 scFvSA遺伝子の構築に先立って
、別々のプラスミドにクローニングした。ストレプトアビジン遺伝子、シグナル
配列、および、およそ300bpの上流配列を、Streptomyces a
vidinii(ATCC 27419)のゲノムDNAからPCRにより増幅
し、pEX318を形成するために、EcoRI/HindIIIフラグメント
としてpEX−1へとクローニングした(図7)。huNR−LU−10 sc
FVは、ヒト化抗体プラスミドpNRX451に由来する(Gravesら、C
lin.Cancer Res.、5:899−908、1999)。重鎖およ
び軽鎖の可変領域は、別々にpNRX451からPCR増幅し、次いで、配列決
定PCRに組み合わされた。この過程で用いられたオリゴヌクレオチドは、リー
ディングVLおよびトレイリングVHの間に、(Gly4Ser)3リンカーを導入
するように設計された。生じるPCR産物を、プラスミドpEX−scFv3.
2.1を作るために、NcoI/HindIIIフラグメントとしてpEX−1
へとクローニングした(図7)。scFVおよびストレプトアビジン遺伝子を、
pEX−scFV3.2.1およびpEX318からそれぞれ増幅し、そして図
8に示されているように融合物に組合わせた。これらの反応で用いられたオリゴ
ヌクレオチドは、リーディングscFvの3’末端とトレイリングストレプトア
ビジンの5’末端との間に重複を形成し、5つのアミノ酸リンカー(GSGSA
)をコードしていた。そのフラグメントを、外側のプライマー用いて、PCRに
より結合した。生じた1.25kbのフラグメントを、ベクターpET3a(N
ovagen)のNdeIおよびBamHI部位へとクローニングし、pET3
a−41Bを産生した。このプラスミドを、XhoIおよびHindIIIで消
化し、そしてVH−SAコーディング領域を含む1.3kbのフラグメントおよ
び転写ターミネーターを、VLコード領域、lacプロモーター、およびアンピ
シリン耐性遺伝子(pYL256)を含むpEX−3.2.1の4.6kbのX
hoI/HindIIIフラグメントに連結した。ストレプトアビジン調節領域
およびシグナル配列を、pEX318からPCR増幅し、そしてpEX94Bを
形成するためにpYL256のEcoRI/NcoI部位にクローニングした(
図8)。
【0083】 Tn5カナマイシン耐性遺伝子(neo)を、以下のようにhuNR−LU−
10 scFvSA発現プラスミドpEX94Bに挿入した(図9):プラスミ
ドpNEO(Amersham Pharmacia)を、BamHIで消化し
、Pfuポリメラーゼ(Stratagene、La Jolla、CA)を使
用してヌクレオチドよる末端の平滑化を行った後、さらにHindIIIで消化
した。カナマイシン耐性遺伝子を含む1494bpのフラグメントを、Hind
III/ScaIで消化したpEX94Bプラスミドへ連結し、プラスミドpE
X94Bneoを生じた。プラスミドpEX94BおよびpEX94Bneoの
、1.6kbpのEcoRI〜BamHIフラグメントのDNA配列を、図10
に示す。
【0084】 (実施例II) (B9E9 scFvSA融合物の構築) さらに、ゲノムストレプトアビジンを含む単鎖抗体を、上記の方法と似た方法
で構築した。scFvSAバージョンの抗CD mAb、B9E9を、(Gly 4 Ser)3(配列番号10)リンカーあるいはpKODと記されるリンカー(ア
ミノ酸GLEGSPEAGLSPDAGSGS)(配列番号9)のいずれかで、
LH配向で構築した。簡単に書くと、B9E9−1D3ハイブリドーマ細胞(
1×107)(BioprobeBV、Amstelveen、The Net
herlandsによる)を回収し、そして、全RNAを調製した。B9E9の
カッパー鎖および重鎖のcDNAを、それぞれ、RX207およびRX215の
プライマーを用いた逆転写反応により得た。カッパー鎖および重鎖の可変領域の
PCRフラグメントを、上述のcDNAおよびオリゴの組を用いて取得した(R
X207およびNX54はカッパー鎖用;RX215およびNX50は重鎖用)
。PCRフラグメントを、EcoRIおよびNotIで消化し、そしてあらかじ
めEcoRIおよびNotIで制限されたpPICαAベクター(Invitr
ogen,Sorrento Valley,CA)へとクローニングした。得
られたC58−1およびC58−16プラスミドは、B9E9カッパー鎖および
重鎖をそれぞれ保持した。二つの鎖をさらに、オリゴの組を用いたPCRにより
C58−1およびC58−16からクローニングした(RX468およびRX4
69はカッパー鎖用;RX470およびRX471は重鎖用)。カッパー鎖フラ
グメントを、NcoIおよびBglIIで、そして、重鎖をXhoI−SacI
でそれぞれ消化した。カッパー鎖をベクターとしてpEX94B(NcoI−B
glII)へとクローニングし、そして、重鎖をpEX94BにXhoI−Sa
cI部位でクローニングした。得られたプラスミド(C74−2はカッパー鎖用
、C76−10は重鎖用)を、XhoIおよびHindIIIで消化した。C7
6−10由来の小さなフラグメントを、同じ酵素で消化したC74−2ベクター
に連結した。得られたプラスミド(C87−14)を、カッパー鎖と重鎖の間に
(G4S)3(配列番号10)リンカーを有するB9E9 scFvSA融合タン
パク質を保有した。C87−14をさらにBglIIおよびXhoIで消化し、
2つのオリゴ(pInew5’およびpInew3’)で調製されたpKODリ
ンカーと連結し、C136−1を産生した。図11Aおよび11Bは、B9E9
pKOD scFvSAの決定された各酸配列および推定アミノ酸配列を示して
いる。
【0085】 他のバージョンのB9E9 scFvSAを、延長された25merの(Gl
4Ser)5(配列番号11)リンカーを有してVHL配向で構築した。scF
Vを含むC87−14のNcoI−SacIフラグメントを、VL領域にセリン
残基を加えるための1組のプライマー(RX633およびRX471)を用いた
PCRによりさらにサブクローニングした。PCRフラグメントを、NcoIお
よびSacIで消化し、そしてNcoIおよびSacIで制限したpEX94B
ベクターへとクローニングした。得られたプラスミドD59−3を、VHあるい
はVLフラグメントを作るために、それぞれRX78およびRX782、あるい
は、RX729およびRX780を用いたPCRによりサブローニングに供した
。VHPCRフラグメントをNcoIおよびBglIIで消化し、同じ部位でp
EX94Bベクターへとクローニングし、D142−6が形成した。VLPCR
フラグメントを、XhoIおよびSacIで消化し、同じ部位でpEX94Bベ
クターへとクローニングし、D142−1を形成した。D142−1由来のXh
oI−HindIIIフラグメントを単離し、そしてD142−6のXhoI−
HindIIIフラグメントと置換し、D148−1を産生した(VH−VL
cFvSA)。前述のようなneo遺伝子を含むHindIII−BamHIフ
ラグメント(BamHI側で平滑にされている)を、D148−1のHindI
II−BamHIフラグメントを置換するために使用し、D164−13を形成
した。D148−1はまた、リンカーフラグメントを取り除くために、BglI
IおよびXhoIで消化された後、25merのリンカー(RX838およびR
X839を用いてアニールされた)と連結し、E5−2−6を形成した。VH
L scFvSAを含むE5−2−6のEcoRI−HindIIIフラグメ
ントを、切り出した後、あらかじめEcoRIおよびHindIIIで制限した
D164−13ベクターに連結し、E31−2−20を形成した。E5−2−6
(カルベニシリン耐性)およびE31−2−20(カナマイシン耐性)両プラス
ミドは、B9E9 scFvSA融合タンパク質を発現する。図11Cは、B9
E9 scFvSA(VH−LH 25mer)の核酸配列および予想されるアミ
ノ酸配列を示している。
【0086】 下に載せられた全てのオリゴヌクレオチドプライマーは、Operon Te
chnologies、Inc.(Alameda、CA)により合成された。
【0087】 NX50(配列番号12) TGCCGTGAATTCGTSMARCTGCAGSARTCWGG NX54(配列番号13) TGCCGTGAATTCCATTSWGCTGACCARTCTC RX207(配列番号14) TAGCTGGCGGCCGCCCTGTTGAAGCTCTTGACAA RX215(配列番号15) TAGCTGGCGGCCGCTTTCTTGTCCACCTTGGTGC RX468(配列番号16) TTACGGCCATGGCGTACATCGTGCTGCAGTCTCCA
GCAATCCTGTCT RX469(配列番号17) CACCAGAGATCTTCAGCTCCAGCTTGGTCCCAG RX470(配列番号18) CGGAGGCTCGAGCCAGGTTCAGCTGGTCCAGTCAG
GGGCTGAGCTGGTGAA RX471(配列番号19) GAGCCAGAGCTCACGGTGACCGTGGTCCCTGCGCC
CCATTCCGGC pInew5’(配列番号20) GATCTCTGGTCTGGAAGGCAGCCCGGAAGCAGGTC
TGTCTCCGGACGCAGG pInew3’(配列番号21) TCGAGCCGGAACCTGCGTCCGGAGACAGACCTGCT
TCCGGGCTGCCTTCCAGACCAGA RX633(配列番号22) TTACGGCCATGGCTGACATCGTGCTGTCGCAGTCT
CCAGCAATCCTGTCT RX779(配列番号23) TTCCGGCTCGAGCGACATCGTGCTGTCGCAGTCTC
CA RX780(配列番号24) GAGCCAGAGCTCTTCAGCTCCAGCTTGGTCCC RX781(配列番号25) TTACGGCCATGGCTCAGGTTCAGCTGGTCCAGTCA RX782(配列番号26) AGACCAGAGATCTTGCTCACGGTGACCGTGGTCCC RX838(配列番号27) GATCTCTGGTGGCGGTGGCTCGGGCGGTGGTGGGT
CGGGTGGCGGCGGCTCGGGTGGTGGTGGGTCGGGCG
GCGGCGGC RX839(配列番号28) TCGAGCCGCCGCCGCCCGACCCACCACCACCCGAG
CCGCCGCCACCCGACCCACCACCGCCCGAGCCACCG
CCACCAGA (実施例III) (huNR−LU−10 scFvSAおよびB9E9 scFvSAタンパ
ク質の発現) プラスミドpEX94B(huNR−LU−10 scFvSA)あるいはE
5−2−6(B9E9 scFvSA)を含むE.coli XL1−Blue
株(Stratagene,La Jolla,CA)の形質転換体を、カルベ
ニシリン(50μg/ml)を含むTerrific broth(20ml;
Sigma)中で30℃で一晩培養した。培養液を新鮮な培地で100倍に希釈
した後、振とう培養器で30℃で培養した。培養液が、0.3〜0.5Aの60
0になったときに、IPTG(Amersham Pharmacia Bio
tech、Piscataway、NJ)を0.2mMの終濃度になるように添
加し、そして一晩インキュベートした。scFvSA発現レベルを定量的に解析
するために、ペリプラズム抽出液を調製した。細胞を、20%スクロース、2m
M EDTA、30mM Tris(pH8.0)、およびリゾチーム(2.9
mg/ml)の氷冷した溶液に再懸濁し、そして氷上で30分間インキュベート
した。上清を、非還元、非煮沸条件下で、4〜20%のTris−glycin
e SDS−PAGEゲル(Novex)で分析し、そしてゲルをGoomas
sie Blueで染色した。振とうフラスコにおける発現を、IPTG濃度お
よびタイミング、温度、培地、炭素源などのような異なる環境パラメーター、あ
るいは、異なるプロモーターあるいはシグナル配列といった遺伝学的要因を試す
ことにより、最適化した。
【0088】 クローンをさらに、8Lファーメンターを用いて培養し、発現レベルを解析し
た。はじめの接種物(50mL)を、50μg/mlのカナマイシン(プラスミ
ドpEX94BneoあるいはE31−2−20)あるいはカルベニシリン(プ
ラスミドpEX94BあるいはE5−2−6)を添加したTerrific b
rothを含む振とうフラスコを用いて、30℃で一晩培養した。これはプラス
ミドの選択マーカーに依存している。その後、培養液を、同じ培地中に100倍
に希釈し、そして、さらに4〜5時間、30℃で培養した。2回目の接種物(0
.5L)を、8LのE.coli用完全培地[1Lあたり:6g Na2HPO4 、3g KH2PO4、0.5g NaCl、3g (NH42SO4、48g
yeast extract(Difco)、0.25ml Mazu DF2
04 消泡剤(PPG Industries Inc.、Pittsburg
h、PA)、0.79g MgSO4−7H2O、0.044g CaCl2−2
2O、および3mlのトレースエレメント(1Lあたり:0.23g CoC
2、0.57g H3BO3、0.2g CuCl2−2H2O、3.5g Fe
Cl3−6H2O、4.0g MnCl2−4H2O、0.5g ZnCl、1.3
5g チアミン、および0.5g Na2MoO4−2H2O)]を含む14Lの
BioFlo3000ファーメンター(New Brunswick Scie
ntific)に移した。その培地は、はじめの5g/Lのガラクトースを炭素
源として含み、そして、プラスミド保持についての50μg/mlのカナマイシ
ンあるいはカルベニシリンを含んだ。培養液を30℃で培養し、そして接種の6
時間後に、IPTG(0.2mM)で誘導した。pHを、リン酸あるいはNaO
Hのいずれかを自動添加する事により、7.0に保持した。溶存酸素濃度を、4
00〜800rpmの攪拌速度および必要量の酸素の供給により、期間中、30
%以上に維持した。ガラクトース溶液(50%)を、培養液中に存在したはじめ
のガラクトースを使い切ってから9時間後に、全部で1Lあたり20〜25gに
なるように添加した。細胞を、接種(B9E9 scFvSA)の24〜26時
間後、あるいは接種(huNR−LU−10 scFvSA)の48〜56時間
後に、連続流加遠心機(continous flow centrifuge
)(Pilot Powerfuge、Carr Separations、F
ranklin、MA)中に回収し、PBS(10mM リン酸ナトリウム、1
50mM NaCl、pH7.2)で洗浄し、遠心によりペレット化した。典型
的な発酵により、培地1Lあたり80〜90gの細胞(湿重量)を産生した。
【0089】 発現レベルを決定するために、細胞をPBSで二回洗浄し、元の量まで再懸濁
し、氷上で超音波破砕(Branson Ultrasonics、Danbu
ry、CT)あるいは2サイクルの微小流動化(microfluidizat
ion)(Microfluidics International、New
ton、MA)のいずれかにより破砕された。粗溶解産物の遠心サンプルの上清
中における融合タンパク質を定量するために、2つのアッセイ法を用いた。はじ
めに、ELISAアッセイを用いた。このアッセイでは、ビオチン化アルブミン
(100ng/ウエル(PBS中))を、4℃で96ウェルプレートに一晩コー
ティングし、そしてHPLC精製融合タンパク質(200ng/ml)あるいは
テストサンプルのいずれかを連続2倍希釈物と共にインキュベートした。検出に
はペルオキシダーゼ標識したヤギ抗ストレプトアビジンポリクローナル抗体(Z
ymed、So.San Francisco、CA)およびABTS(Sig
ma)基質緩衝液を用いた。プレートを、2波長自動プレートリーダーを用いて
415/490nmの波長を読みとった。融合タンパク質の定量のために、一次
log x/log y回帰解析を行った。
【0090】 あるいは、より速く結果を得るために、ローダミン−ビオチンHPLCアッセ
イを工夫した。遠心分離された溶解物中の融合タンパク質は、過剰のローダミン
誘導ビオチンと複合体を作った。これは、次のように調製された:5−(および
−6−)−カルボキシテトラメチルローダミン、スクシニンイミジルエステル(
Molecular Probes、Eugene OR)は、安定なアミド結
合の形成を通して、ビオシチン(Pierce、Rockford IL)と結
合した。反応混合物を、Dynamax semi−preparative
C−18カラム(Rainin Instrument Co.、Woburn
、MA)を用いたHPLCにより精製した。流出物を547nmでモニターし、
そしてピーク画分を集め、質量分析により解析した。分子量がビオチン−ローダ
ミン結合体と一致する画分をプールし、roto−エバポレーションにより濃縮
した(Buchii、Switzerland)。粗溶解物を清祥にするために
、過剰量の精製ビオチン−ローダミン結合体を添加し、そして15% DMSO
を含む20mMのリン酸ナトリウム中で平衡化されたZorbax GF−25
0カラム(MAC−MOD、Chadds Ford PA)を用いたサイズ排
除クロマトグラフィーにより、1.0ml/1分の流速で解析した。流出液を、
Varian Dynamax PDA−2検出器を用いて547nmでモニタ
ーし、そして融合タンパク質の溶出に対応するピークの面積を、Varian
Dynamax HPLC Data System(Waltnut Cre
ek、CA)を用いて決定した。粗溶解物中の融合タンパク質濃度を、同じ条件
下で解析されたスタンダードとの比較により算出した。融合タンパク質スタンダ
ードに対するモル吸光係数は、以前に記載された280nmにおけるアミノ酸吸
収の相対的寄与率を合計する方法により計算した(Gill and von
Hippel、Analyt.Chem.182:319−326、1989)
【0091】 ファーメンターで培養した細胞での発現レベルは、huNR−LU−10 s
cFvSAでは100〜130mg/L、B9E9KOD scFvSAでは4
0mg/L、およびB9E9 scFvSA(VH−VL25mer)では270
〜300mgであった。
【0092】 (実施例IV) (種々のリンカーおよびシグナル配列を用いたB9E9 scFvSAの発現
) 異なる長さおよび組成のリンカー、ならびに異なる順序の可変領域を含む多く
の遺伝的変異体を構築した(表1)。始めに、これらの構築物を、振とうフラス
コによる培養で発現および誘導し、そしてペリプラズムのタンパク質をクマシー
染色された、非還元のSDSゲルで可視化することにより、発現を定量的に評価
した。高発現構築物を、ガラクトース流加培養プロトコルを用いて8Lファーメ
ンターでさらに調べ、そしてそれらの発現レベルをローダミン誘導ビオチンを用
いたサイズ排除HPLCにより定量的に決定した。これらの基準を最もよく満た
した構築物は、VH−VL配向で、scFvを有する25merのGly4Ser
リンカーを含んだ。
【0093】 (表1.B9E9 scFvSA遺伝的変異体の発現レベルの要約)
【0094】
【表1】 (実施例V) (E.coliのペリプラズムにおけるscFv融合タンパク質の発現の上昇
) E.coli fkpA遺伝子は、FK506結合タンパク質(FKBPs)
のファミリーのメンバーであり、そしてタンパク質のフォールディングに関与す
るペリプラズ成分の一つである。それは、E.coliのペリプラズムに発現さ
れ、そしてペプチジル−プロリルイソメラーゼ(PPIase)活性を有する。
FkpA遺伝子産物のPPIase非依存生シャペロン活性はまた、in vi
voおよびin vitroの両方で実証されている。FkpAシャペロンタン
パク質は、ペリプラズムにおいてフォールディング中間体を安定化することによ
り、タンパク質フォールディングプロセスに関与する。単一シャペロンタンパク
質遺伝子(fkpA)の共発現が、scFv融合タンパク質の発現を刺激しうる
かどうかが試験した。特に、以前には、E.coli内で十分に発現しなかった
タンパク間について試験した。
【0095】 fkpA遺伝子のDNAフラグメントをクローニングするために、E.col
i XL1−Blue細胞(Stratagene)から染色体DNAを抽出し
、そしてXhoIで消化した。35サイクルのPCRを、1組のオリゴヌクレオ
チド(RX1229:ACGACGGTTGCTGCGGCGGTC(配列番号
32);RX1231:AGGCTCATTAATGATGCGGGT(配列番
号33);共にOperon Technologies、Inc.から入手)
および、300ngの消化されたゲノムDNAを鋳型として用いて行った。PC
R混合物を、2回目のPCR(30サイクル)に供した。これには、一組のネス
ト化されたオリゴヌクレオチド(RX1230:GGATCCAAGCTTAC
GATCACGGTCATGAACACG(配列番号34);RX1232:C
TCGAGAAGCTTTAACTAAATTAATACAGCGGA(配列番
号35))が用いた。PCRフラグメントを、1%アガロースゲルで分離し、そ
して1.6kbのフラグメントを単離した。抽出されたDNAを、TAベクター
(Invitrogen)にクローニングし、そしてDNA配列決定により配列
を確かめた。クローンを、オリゴヌクレオチドRX1230およびRX1232
に組み込まれている部位を用いて、HindIIIで消化し、そして抗−CEA
T84.66 scFvSA融合遺伝子(City of Hope、Dua
rte、CAからのT84.66 cDNA)を保持するHindIII消化ベ
クターE84−2−8(NeoRx Corp.)と連結した。得られたプラス
ミド(F115−1−1)を、振とうフラスコ発現のためにXL1−Blue
E.coliに形質転換に使用した。ペリプラズム成分を抽出し、そして4〜2
0%SDS−PAGEで解析した。電気泳動解析のために、20μlのscFv
SAペリプラズム融合タンパク質の溶液を、ゲルの各レーンにロードした。電気
泳動に続き、ゲルをCoomassie Blue R250で染色した。約3
0,000の分子量を持つFkpAタンパク質は、fkpA遺伝子を持つ全ての
サンプル(+)において優性に存在した。その一方で、例えば、図19に示され
ているこの遺伝子を欠いているサンプル(−)存在しなかった。Novexから
入手したSeeBlue分子標準マーカー(M)中の7つの成分の分子量は、ゲ
ルの下端から、サイズが増えていく順に列挙され、16,000;30,000
;36,000;50,000;64,000;98,000;および250,
000である。図19に示されているように、T84.66 svFvSA融合
タンパク質の発現は、fkpA遺伝子を欠く親の構築物(E84−2−8)に比
べ、FkpAシャペロンタンパク質と共発現したとき、劇的に増加した。さらな
るscFvSA融合タンパク質を、すでにNcoIおよびSacIで切断されて
いたF115−1−1ベクターへ、NcoI−SacIフラグメントを移すこと
により構築した。得られたプラスミドを、E.coli XL1−Blueの発
現が振とうフラスコ培養で調べらた。電気泳動解析において、図19および表 2に示されているように、幾つかは、融合タンパク質の発現増加を示した。本明
細書中に要約された結果は、(Gly4Ser)5(配列番号11)リンカーを取
り込んでいるVH−VL−SA構造にのみ関与する。表2に要約されるように、振
とうフラスコ実験における融合タンパク質の発現レベルは、+++++の割り当
てられた、もっと高いレベルに定量的に見積もられた。
【0096】 (表2 E.coliにおけるscFvSA融合タンパク質の定量的な発現)
【0097】
【表2】 (実施例VI) (huNR−LU−10 scFvSAおよびB9E9 scFvSAタンパ
ク質の精製) イムノビオチンアフィニティーマトリックスを、エポキシド活性化Macro
−prepマトリックス(BioRad、Hercules CA)を0.2M
炭酸緩衝液中のマトリックス1gあたり112μmのN−(3−アミノプロピル
)−1,3プロパンジアミン(Sigma)と反応させることにより調製した。
反応を、8時間後にスラリーをシンダード(scintered)ガラスロート
を通してろ過し、そして蒸留水でマトリックスを洗浄することにより停止した。
残ったエポキシドを、マトリックスと0.1Mの硫酸を80℃で4時間反応させ
ることにより不活性化し、そして、マトリックスを再びリンスした。アミンで誘
導体化されたマトリックスをPBSに懸濁し、10%の容量の0.5Mホウ酸ナ
トリウム(pH8.5)を加えることにより、pHを8.5まで上げた。NHS
−イムノビオチン(Pierce)をDMSOに溶解し、そして2.6mg/g
のマトリックスの割合になるように懸濁されたマトリックスに添加した。4時間
反応後、マトリックスを蒸留水でリンスし、続いてpH11の炭酸ナトリウム緩
衝液およびpH4の酢酸ナトリウム緩衝液を数回交換して洗浄した後、最終的に
蒸留水で洗浄した。マトリックスを、スラリーとして、20%エタノール中に保
存された。
【0098】 細胞(650−750g、湿重量)を、PBSで二回洗浄し、氷冷した30m
M Tris、1mM EDTA、pH8.0で10〜20重量%まで再懸濁し
、そして2サイクルの微小流動化により破砕された。溶解物を、1cmあたり4
6−48mSeの範囲の濁度で、50mM グリシン、450mM NaCl、
pH9.6に調製し、その後、12000rpmで90分間遠心分離した。上清
をろ過し(0.2μm)、次いで固定化イムノビオチンによってアフィニティー
精製した。イムノビオチンマトリックスはカラムを詰め、そして1cmあたり4
6−48mSeの濁度で、50mM グリシン、500mM NaCl、pH9
.6に平衡化した。組換えストレプトアビジン(Roche Biochemi
cal、Indianapolis、IN)を用いたときの許容量は、2ml/
cm2/分の流速条件下では、1mlのベットボリュームあたり2mgであった
。0.2μmろ過された細胞ホモジナイズ上清を、室温で、100gの細胞あた
り80mlの総容積を用いて、1分あたり2ml/cm2で汲み出した。20総
容積のカラム平衡化緩衝液による洗浄後、scFvSA融合タンパク質を、0.
2M酢酸ナトリウム、0.1M NaCl、pH4.0で溶出し、Tris緩衝
液で中和し、次いで冷やしたPBS中で徹底的に透析した。
【0099】 タンパク質の凝集を減らすために、精製されたscFvSAを、10%DMS
Oで室温で5〜7時間処理し、そしてPBS中で透析した。精製されたタンパク
質を、Amicon YM30膜装置を用いて濃縮し、4℃で無菌的に保存する
ためにフィルター滅菌した。2〜3mg/mlの濃度において、精製された調製
物は、典型的に、約5〜8%の凝集物を含んだ。
【0100】 イムノビオチンクロマトグラフィーからの典型的な回収率は50〜60%であ
り、通過および洗浄への混入は5%未満であった。残りのものは、凝集/トラッ
プされた物質としてカラム中に残った。溶出緩衝液へのDMSOの添加により、
さらに5%以下の精製されたタンパク質が得られた。様々なイオン性および非イ
オン性界面活性剤を用いても、回収量は改善されなかった。溶出された融合タン
パク質の、HPLCサイズ排除解析により、40%までのタンパク質が凝集した
形で存在することが示された。光散乱HPLCにより、400,000〜400
万の間の凝集物のサイズが示された。10%DMSOで数時間処理する事により
、融合タンパク質のゆっくりとした脱凝集が起こり、その結果、3mg/ml未
満の濃度でPBS中で冷蔵保存された時にも92%よりも多く残るような四量体
種を生じることが示された。
【0101】 (実施例VII:huNR−LU−10 scFvSA およびB9E9 s
cFvSAタンパク質の生化学的特徴) (SDS−PAGE分析.)4〜20% Tris−グリシン SDS−PA
GEゲル(Novex,San Diego,CA)を用いて、非還元条件下で
精製融合タンパク質を分析した。電気泳動前に、試料をSDS−ローディング緩
衝液と混合し、室温または95oCのどちらかで5分間インキュベーションを行
った。ゲルをクーマシーブルーで染色した。
【0102】 SDS−PAGEによって、イムノビオチンクロマトグラフィー後、融合タン
パク質が95%を超える均一性で精製されたことが示された(図12、レーン2
および3;huNR−LU−10データのみ)。主要なバンドは、およそ173
kDaの予測分子量に移動しており、微量なアイソフォームがはっきりと分かっ
た。また、これらのアイソフォームを、ポリクローナル抗ストレプトアビジン抗
体を用いて、ウエスタンゲル分析により検出した(データは示していない)。し
かしながら、電気泳動前にタンパク質を煮沸したとき、約43kDaの単一種に
分割されたバンド全てが、完全にその均一なサブユニットに解離され得る単一の
タンパク質実体と一致する(図12、レーン4および5)。Novexより入手
可能なSeeBlue分子標準マーカーの7成分の分子量(図12、レーン1)
については、実施例Vにおいて記載している。
【0103】 (サイズ排除HPLCおよびレーザー光散乱分析.) Zorbax GF−
250カラム上で、20mM リン酸ナトリウム/0.5M NaCl 移動相
を用いて、サイズ排除HPLCによって精製タンパク質調製物を分析した。Va
rian Star 9040屈折率検出器およびMiniDawn光散乱装置
(Wyatt Technologies,Santa Barbara,CA
)を直列に連結したZorbaxシステムを用いて、融合構造物の分子量を測定
した。緩衝水溶液における、タンパク質に対するdn/dc値0.185を用い
て、分子量算出を行った。
【0104】 HPLCサイズ排除クロマトグラフィーにより、微量(8%未満)な凝集体ピ
ークとともに、huNR−LU−10四量体については適切な保持時間で主要な
ピークが示された(図13)。B9E9 scFvSAは、非常に似たプロファ
イルを示した(グラフを示していない)。これらの分析によって、全ての精製タ
ンパク質が四量体またはその凝集体であることが示された。huNR−LU−1
0 scFvSAに対する光散乱分析により、四量体について予測されたように
、172,600の分子量が示された。
【0105】 (アミノ末端配列決定.) Procise 494シークエンサー(App
lied Biosystems,Inc.,Foster City,CA)
を用いて、自動アミノ酸配列決定を行った。この配列決定により、可変領域の最
初のアミノ酸に隣接する、予想されたシグナルペプチダーゼ部位でhuNR−L
U−10 scFvSAおよびB9E9 scFvSA両方のリーダー配列が切
断されていることが明らかとなった。
【0106】 (B9E9 scFvSAの分子量測定.) Jupiter C18カラム
(300△,3.2×50mm,5μ)およびC18「SafeGuard」カ
ラム(Phenomenex,Torrance,CA)を装備したHewle
tt Packardシリーズ1100システムを用いて、流速500μl/分
で、液相クロマトグラフィーによる分離を行った。移動相は、水/1%ギ酸(緩
衝液A)およびアセトニトリル/1%ギ酸(緩衝液B)により構成された。適用
した勾配は、2%Bを3分間流し、7分間で99%まで上昇させるというもので
あった。保持時間8.7分で、B9E9 scFvSA(10μl)を溶出した
。分析カラムを、Thermoquest/Finnigan ESI LCQ
イオントラップマススペクトロメーター(San Jose,CA)と連結した
。ミオグロビンを用いて機器を較正し、陽イオンモードで、200oCに設定し
た加熱キャピラリーおよび5.1kVにしたエレクトロスプレー針を用いて操作
した。フルスキャンMSモード(m/z[500〜2000 Da/z])で、
3つのマイクロスキャンおよび最大イオン時間を500msとした自動的ゲイン
コントロールを用いて、データを得た。
【0107】 B9E9単量体のマススペクトルによって、デコンボルーションした分子量と
して43,401が示された。この値は、最も量的に多い質量計算値43,40
0と一致した。
【0108】 (HuNR−LU−10競合的免疫反応性ELISA.) ヒト化NR−LU
−10完全抗体およびhuNR−LU−10融合タンパク質の連続希釈を、ペル
オキシダーゼ標識マウスNR−LU−10完全抗体と、ヒト腫瘍細胞株LS−1
74(ATCC#CL188)由来の0.1%NP40膜抽出物結合に対して競
合させた。データのlog−logit変換後(このデータにおいて、曲線は同
一の傾きに合っていた)、50%阻害(k)を示す競合抗体の濃度を計算した。
式:k(融合タンパク質標準試料)/k(完全抗体標準試料)×100、に従っ
て、パーセント免疫反応性を決定した。huNR−LU−10融合タンパク質が
、インタクトな2価のヒト化抗体よりも優れた(約225%)免疫反応性を保持
することが分かった(図14)。
【0109】 (B9E9競合免疫反応性FACSアッセイ.) 様々な濃度の非標識抗体存
在下で、CD20陽性Ramos細胞株(バーキットリンパ腫;ATCC CR
L−1596)に対するフルオレセイン標識B9E9の結合を測定する、フロー
サイトメトリーを用いた競合的結合アッセイにおいて免疫反応性を評価した。フ
ルオレセインN−ヒドロキシスクシンイミデートを用いてB9E9 mAbを標
識し、最適化されたこの標識量を、連続希釈(3〜200ng/ml)のB9E
9 mAb標準試薬または、等モルのB9E9 scFvSAと混合し、1×1
6細胞とともに、4℃にて30分間インキュベーションを行った。試料を洗浄
し、単レーザーFACSCalibur(Becton Dickinson)
で分析した。一つ一つの細胞を流入させた後、蛍光のヒストグラムプロットから
幾何平均蛍光強度を決定した。非線形回帰分析を用いて、単一部位の結合に対し
て、フルオレセインB9E9結合を50%阻害するために必要な競合抗体の濃度
(IC50)を計算した。パーセント免疫反応性=[IC50scFvSA/IC50 mAb]×100である。
【0110】 scFvSAは、1モルあたり、2価B9E9抗体のおよそ2倍の免疫反応性
(約185%)であり、四価であることを考慮して調整した場合、B9E9 m
Abとほぼ等しい(93%)の免疫反応性があった(グラフを示していない)。
【0111】 (B9E9 scFvSAアビディティー.) 飽和結合実験を用いてアビデ
ィティーを決定した。この実験では、過剰量の抗原(107細胞)存在下で、平
衡状態で、放射性標識したmAbまたは融合タンパク質(0.025〜50ng
/ml)の特異的な結合を測定する。過剰量の放射性標識していないmAbまた
は融合タンパク質(50μg/ml)存在下で、非特異的結合を測定した。上記
のように、混合物をインキュベーションし、遠心分離した。免疫反応性に応じて
調整された抗体濃度を用いて、nM結合 対 nM放射性リガンドの非線形回帰
分析から、平衡解離定数(Kd)を計算した。Ramos 細胞に対する放射性
標識結合により測定されたように(表3)、B9E9融合タンパク質は、B9E
9 mAbと同じ相対的ナノモル濃度アビディティーを保持していた。
【0112】
【表3】 (ビオチン結合および解離.) 9倍モル過剰の[3H]ビオチン(NEN
Research Products,Boston,MA)とともに、既知量
の融合タンパク質のインキュベーションを行い、ビオチン結合能を測定した。ス
トレプトアビジン固定化ビーズ(Pierce Chemical;Rockf
ord,IL)を用いて、複合体を形成していないビオチンを除去した後、融合
タンパク質と結合している[3H]ビオチン量を測定した。
【0113】 組換えストレプトアビジンが4つのビオチン結合部位を持つことと比較して、
HuNR−LU−10 scFvSAおよびB9E9 scFvSAは、平均3
.0および3.6ビオチンとそれぞれ結合可能だった。
【0114】 HuNR−LU−10 scFvSAに対して、37oCにて、10μM 融
合タンパク質または組換えストレプトアビジンのいずれか、および飽和状態未満
のレベルの[90Y]DOTA−ビオチンを含む0.25M リン酸、0.15塩
化ナトリウム、pH7.0中で、DOTA−ビオチン解離の速度を評価した。解
離測定を開始するために、100倍飽和レベルのビオシチン(Sigma)を添
加した。決められた時間間隔で、0.5%仔牛血清アルブミン含有PBSでイン
キュベート溶液のアリコートを希釈した。タンパク質を沈殿させるために、それ
ぞれの希釈アリコートに硫酸亜鉛を添加し、最終濃度が0.06Mになるように
、それぞれに対して水酸化ナトリウムを添加した。微量遠心分離後、Hewle
tt Packardベータカウンターを用いて上清中の遊離[90Y]DOTA
−ビオチンを評価した。huNR−LU−10 scFvSAのDOTA−ビオ
チン解離速度は、組換えストレプトアビジンの解離速度と匹敵した(huNR−
LU−10 scFvSAに関してt1/2が58分間であるのに対して、組換え
ストレプトアビジンに関してt1/2は47分間;図15)。
【0115】 B9E9 scFvSAに対して、[90Y]DOTA−ビオチンの代わりに[ 3 H]ビオチンを用いたことを除いて、上記と同じようにビオチン解離を測定し
た。ビオチン解離に関する計算t1/2値は、B9E9 scFvSAの場合は3
79分、対して組換えストレプトアビジンの場合は364分(グラフは示さない
)であった。
【0116】 (実施例VIII:HUNR−LU−10 scFvSAでのプレターゲティ
ング後の、111In−DOTA−ビオチンの生体内分布の分析) 完全プレターゲットプロトコールで、右脇腹皮下にSW−22ヒト結腸癌異種
移植片(100〜200mg)を移植した雌ヌードマウスを用いて、発現された
huNR−LU−10 scFvSA遺伝子融合について試験した。これらの実
験において、575μgの125I−標識融合タンパク質を静脈内(iv)注射し
、100μgの合成洗浄剤(sCA)をIV注射する前に、18時間循環させた
(例えば、PCT公開番号WO97/46098およびWO95/15978を
参照のこと)。sCA注射の3時間後、本質的にはビオチン標識した放射性核種
を含むキレート剤である1.0μgの111In−DOTA−ビオチンを注射した
(米国特許第5,578,287号および第5,608,060号を参照)。11 1 In−DOTA−ビオチンを注射してから2、24、48および120時間後
にマウスから血液を採取し、屠殺して解剖を行った。
【0117】 sCAの錯体形成および引き続く肝臓によるクリアランスによって誘導された
低血液プール濃度に起因して、血中および最もよく灌流された軟組織における12 5 I−huNR−LU−10 scFvSA放射能の濃度は非常に低かった。例
外は、肝臓と腫瘍であった。融合タンパク質の肝臓取り込みおよび保持は、洗浄
剤の作用機構によるものであり、また多少は、ストレプトアビジン含有融合タン
パク質の分解が阻害されたことによるもので、ストレプトアビジンおよびhuN
R−LU−10とストレプトアビジンの化学結合体(huNR−LU−10/S
A)の両実験において観察される同じような結果と矛盾しなかった(データは示
さない)。125I−huNR−LU−10 scFvSAにより、全ての時点で
、腫瘍において比較的高い放射性標識濃度が保持されることからインビボでの免
疫反応性が明らかになった(化学量論的に、かつ血液プール濃度に対して相対的
に)。腫瘍濃度 対 血液濃度の比は23時間から143時間で連続的に上昇し
た。洗浄剤により誘導された低血液プール値は、その比が劇的に上昇し、平均値
は洗浄剤がない場合に観察された値の2倍を超えた(データは示さない)。
【0118】 プレターゲットされた111In−DOTA−ビオチン生体内分布を、図16で
示す。化学結合体huNR−LU−10/SAを用いたプレターゲティングの結
果と一致して、血中および全ての異種移植でない片軟組織において、111In−
DOTA−ビオチン放射能濃度は非常に低かった。上記のように肝臓において高
濃度にも関わらず、肝臓での111In−DOTA−ビオチン取り込みおよび保持
は明らかではなく、融合タンパク質が効果的にインターナリゼーションされてお
り、続いて投与されたラジオビオチンの結合には利用できないことが示された。 111 In−DOTA−ビオチンの最高濃度は、全ての時点において、腫瘍におい
て観察された。(図16での組織の順番は、血液、尾、肺、脾臓、胃、腎臓、腸
および腫瘍である。)採取した最初の時点でピーク濃度に達するような急速な取
り込みは、プレターゲティングの証明である。腫瘍における、111In−DOT
A−ビオチンの、効果的、終始変化しない輸送および保持もまた観察された。腫
瘍における111In−DOTA−ビオチンのピーク濃度は、化学的NR−LU−
10/SA結合体(20〜25%注射用量/g)を用いて矛盾せずに起こり得る
範囲内であった(データは示していない)。
【0119】 (実施例IX: huNR−LU−10 scFvSA 対 huNR−LU
−10/ストレプトアビジン化学結合体の血液クリアランスおよび腫瘍での取り
込みの分析) huNR−LU−10 scFvSAの場合の、腫瘍 対 血液比は、DOT
A−ビオチン注射後2時間での値である100付近から、24時間で数千まで上
昇した。腫瘍へのラジオビオチン輸送の効力を示し、血液および腫瘍についての
曲線下面積(AUC)値に対応する、huNR−LU−10/SA化学結合体お
よび融合タンパク質に対する相対的な結果を図17に示す。
【0120】 融合タンパク質を用いた全体の腫瘍AUCは、化学結合体のAUCよりもいく
らか低かった(0〜120時間の時間間隔に関して1726 対 典型的化学結
合体実験に関して2047)。しかしながら、血液プール中の111In−DOT
A−ビオチン濃度において劇的な相違があった(融合タンパク質グループの濃度
は、一貫して全ての時点においてより低かった)。血中における放射能のこの減
少保持による最大の効果は、融合タンパク質で処理された動物が、化学結合体に
より処理された動物よりも高い治療指標(腫瘍/血液)を示すことである。
【0121】 (実施例X:B9E9 scFvSAのプレターゲット生体内分布) 十分に樹立されたRamosヒト癌異種移植片(100〜400mg)を有す
る雌ヌードマウスにおいて、プレターゲット放射性免疫治療研究を行った。実験
開始する10〜25日前に、Bkl:BALB/c/nu/nuヌードマウスの
側面の正中線(side midline)の皮下に5〜25×106個の培養
細胞を移植することにより、腫瘍を形成させた。マウスに125I−標識B9E9
scFvSA(600μg)を静脈内注射し、20時間後に100μgの合成
洗浄剤を静脈内注射した。洗浄剤投与から4時間後に、それぞれのマウスに対し
て、111In−標識DOTA−ビオチン(1.0μg)を静脈内注射した。各時
点につき3匹のマウスで1つのグループとし、111In−DOTA−ビオチン注
射から2、24、48時間後に採血し、屠殺した。全ての器官および組織を摘出
、重量を測定し、ガンマカウンターを用いて放射能測定を行った。
【0122】 図18で示すように、血中および全ての異種移植片以外の軟組織において111
In−DOTA−ビオチン放射能は、注射用量/gの2%未満であった。さらに
、肝臓における111In−DOTA−ビオチン取り込みおよび保持は検出されな
かったことから、添加した洗浄剤によって融合タンパク質が肝臓に効果的にイン
ターナリゼーションされており、その後投与されたラジオビオチンの結合に利用
できないことが示される。腫瘍における111In−DOTA−ビオチンの安定し
た輸送および保持を観察した。全ての時点において、ラジオビオチンの最高濃度
は、腫瘍(化学量論的に、かつ血液プール濃度に対して相対的に)で見られた。
腫瘍における111In−DOTA−ビオチンのピーク濃度は、注射用量/gの1
7〜24%(平均21.66、s.d.3.17)であった。腫瘍 対 血液比
は、DOTA−ビオチン注射から2時間後の値であるおよそ90から、24時間
で700をこえるまでに上昇した。これらの実験において、融合タンパク質、洗
浄試薬またはDOTA−ビオチンの用量を最適化する努力も、これらの成分を投
与するスケジュールを最適化する努力も払っていない(図18において、組織は
順に、血液、尾、肺、肝臓、脾臓、胃、腎臓、腸および腫瘍である)。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図1】 図1は、異種タンパク質−ゲノムのストレプトアビジンを発現する遺伝子構築
物の模式図である。
【図2】 図2は、単鎖抗体−ゲノムストレプトアビジン融合構築物の模式図である。
【図3】 図3は、単鎖抗体(huNR−LU−10)−ゲノムのストレプトアビジン融
合構築物を含有しているpEX94B発現ベクターの模式図である。
【図4】 図4は、シグナル配列および推定のアミノ酸配列(配列番号2)を含有してい
る、ゲノムのストレプトアビジン(配列番号1)の配列である。
【図5】 図5は、pKKlac/pelBベクターの構築の模式図である。
【図6】 図6は、pEX−1ベクターの構築の模式図である。
【図7】 図7は、pEX−SA318およびpEX−scFv3.2.1ベクターの構
築の模式図である。
【図8】 図8は、pEX94Bベクターの構築の模式図である。
【図9】 図9は、pEX94B neoベクターの構築の模式図である。
【図10】 図10は、huNR−LU−10単鎖抗体−ゲノムのストレプトアビジン融合
体についての、決定された核酸配列(配列番号3)および推定のアミノ酸配列(
配列番号4)を示す。ストレプトアビジン調節領域、シグナル配列、およびコー
ド配列は、単鎖抗体の種々のリンカー、ならびに軽鎖および重鎖がそうであるよ
うに示される。
【図11A】 図11Aおよび11Bは、B9E9 scFvSA融合構築物の決定された核
酸(配列番号5)および推定のアミノ酸配列(配列番号6)であり、VLとVH
の間にpKODリンカーを有する。リンカーは、箱で囲まれ、そして方向は、V L −リンカー−VH−リンカー−ストレプトアビジンである。
【図11B】 図11Aおよび11Bは、B9E9 scFvSA融合構築物の決定された核
酸(配列番号5)および推定のアミノ酸配列(配列番号6)であり、VLとVH
の間にpKODリンカーを有する。リンカーは、箱で囲まれ、そして方向は、V L −リンカー−VH−リンカー−ストレプトアビジンである。
【図11C】 図11Cは、VH−リンカー−VL−リンカー−ストレプトアビジンをコードす
るB9E9 scFvSA融合構築物の、核酸配列(配列番号7)および推定の
アミノ酸配列(配列番号8)を含有している発現カセットである。
【図12】 図12は、huNR−LU−10 scFvSAのSDS−PAGE分析を示
すスキャンした画像である。
【図13】 図13は、huNR−LU−10 scFvSAのサイズ排除HPLC分析を
示すグラフである。
【図14】 図14は、huNR−LU−10 mAbと比較した場合の、huNR−LU
−10 scFvSA(97−20.0および98−01.0)の競合免疫反応
アッセイを示すプロットである。
【図15】 図15は、組換えストレプトアビジン(r−SA)と比較した場合の、huN
R−LU−10 scFvSA(97−13.0)からのDOTA−ビオチンの
解離の速度を示すプロットである。
【図16】 図16は、プレターゲティングされたhuNR−LU−10 scFvSAの
生体分布を示すグラフである。
【図17】 図17は、化学的に結合させた形態に対する、huNR−LU−10 scF
vSAの血液のクリアランスおよび腫瘍の取り込みを示すグラフである。
【図18】 図18は、プレターゲティングされたB9E9 scFvSAの生体分布を示
す棒グラフである。
【図19】 図19は、FkpAの存在下および非存在下での、scFvSA融合タンパク
質の発現のSDS−PAGE分析のスキャンした画像である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C07K 16/28 C12N 1/21 4H045 19/00 C12Q 1/02 C12N 1/21 G01N 33/53 U 5/10 33/574 D C12Q 1/02 C12N 15/00 ZNAA G01N 33/53 5/00 B 33/574 C A61K 37/02 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,MZ,SD,SL,SZ,TZ,UG ,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD, RU,TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT, AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,C H,CN,CR,CU,CZ,DE,DK,DM,DZ ,EE,ES,FI,GB,GD,GE,GH,GM, HR,HU,ID,IL,IN,IS,JP,KE,K G,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT ,LU,LV,MA,MD,MG,MK,MN,MW, MX,MZ,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,S D,SE,SG,SI,SK,SL,TJ,TM,TR ,TT,TZ,UA,UG,US,UZ,VN,YU, ZA,ZW (72)発明者 シュルツ, ジョアンネ イレイン アメリカ合衆国 ワシントン 98112, シアトル, イースト アロハ ストリー ト 2610 (72)発明者 リン, ユカン アメリカ合衆国 ワシントン 98028, ケンモア, 61エスティー アベニュー エヌ.イー.−18216 (72)発明者 サンダーソン, ジェイムス アレン アメリカ合衆国 ワシントン 98125, シアトル, エヌ.イー.103アールディ ー ストリート 1539 (72)発明者 レノ, ジョン エム. アメリカ合衆国 ワシントン 98036, ブライアー, エルム ドライブ 2452 Fターム(参考) 4B024 AA11 BA43 BA80 CA04 CA07 DA01 DA02 DA05 EA01 EA02 EA03 EA04 FA02 FA10 GA11 HA01 HA11 4B063 QA01 QA18 QA19 QQ01 QR33 QR60 QR75 QR77 QR78 QR80 QS05 QS15 QS36 QX02 4B065 AA01X AA01Y AA87X AA90Y AB01 BA01 CA24 CA46 4C076 CC27 EE59 4C084 AA01 AA02 AA13 BA01 BA08 BA21 CA04 CA53 DC50 MA05 NA14 ZB26 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 BA10 BA41 CA11 CA40 DA00 DA75 EA50 FA72 FA74

Claims (66)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 ストレプトアビジン融合タンパク質の発現のためのベクター
    構築物であって、以下: (a)ゲノムストレプトアビジンまたはその機能的な変異体をコードする第1の
    核酸配列; (b)該第1の核酸配列に作動可能に連結されたプロモーター;および (c)ストレプトアビジンに融合され、該プロモーターと該第1の核酸配列との
    間に配置されるポリペプチドをコードする第2の核酸配列の挿入のためのクロー
    ニング部位、 を含む、ベクター構築物。
  2. 【請求項2】 前記構築物が、前記クローニング部位に挿入された前記第2
    の核酸配列をさらに含む、請求項1に記載の構築物。
  3. 【請求項3】 前記プロモーターが誘導プロモーターである、請求項1に記
    載の構築物。
  4. 【請求項4】 前記プロモーターがLacプロモーターである、請求項3に
    記載の構築物。
  5. 【請求項5】 前記プロモーターが構成プロモーターである、請求項1に記
    載の構築物。
  6. 【請求項6】 前記プロモーターと前記クローニング部位との間に配置され
    たS.avidinii調節配列をさらに含む、請求項1に記載の構築物。
  7. 【請求項7】 前記調節配列がストレプトアビジン調節配列である、請求項
    6に記載の構築物。
  8. 【請求項8】 前記調節配列と前記クローニング部位との間に配置された細
    菌リーダー配列をさらに含む、請求項1に記載の構築物。
  9. 【請求項9】 前記リーダー配列がシグナル配列を含む、請求項8に記載の
    構築物。
  10. 【請求項10】 前記リーダー配列がS.avidiniiストレプトアビ
    ジンシグナル配列を含む、請求項8に記載の構築物。
  11. 【請求項11】 前記シグナル配列が、図4のヌクレオチド50〜121を
    含む、請求項10に記載の構築物。
  12. 【請求項12】 選択マーカーであるタンパク質をコードする核酸配列をさ
    らに含む、請求項1に記載の構築物。
  13. 【請求項13】 前記タンパク質が抗生物質耐性を与える、請求項12に記
    載の構築物。
  14. 【請求項14】 前記第1の核酸配列が、少なくとも図4のストレプトアビ
    ジンのアミノ酸14〜150をコードする、請求項1に記載の構築物。
  15. 【請求項15】 前記第1の核酸配列が、少なくとも図4のストレプトアビ
    ジンの1〜158、5〜158、14〜150、14〜151、14〜152、
    14〜153、14〜154、14〜155、14〜156、14〜157、ま
    たは14〜158からなる群より選択されるアミノ酸をコードする、請求項1に
    記載の構築物。
  16. 【請求項16】 請求項1の構築物でトランスフェクトされた、宿主細胞。
  17. 【請求項17】 前記細胞が、細菌細胞、昆虫細胞、植物細胞、および哺乳
    動物細胞からなる群より選択される、請求項16に記載の宿主細胞。
  18. 【請求項18】 末端同士が連結された第1のポリペプチドおよび第2のポ
    リペプチドを少なくとも含む融合タンパク質であって、ここで該第1のポリペプ
    チドが、図4のストレプトアビジンの少なくとも129のアミノ酸またはその機
    能的変異体を含み、そして該第2のポリペプチドが、該第1のポリペプチドとは
    少なくとも1残基異なるアミノ酸配列を含む、融合タンパク質。
  19. 【請求項19】 前記第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、少
    なくとも2つのアミノ酸のリンカーによって分けられる、請求項18に記載の融
    合タンパク質。
  20. 【請求項20】 前記リンカーが少なくとも4のアミノ酸である、請求項1
    9に記載の融合タンパク質。
  21. 【請求項21】 前記リンカーが、4、5、6、7、8、9、10、11、
    12、13、14、15、16、17、18、19、および20のアミノ酸の間
    である、請求項20に記載の融合タンパク質。
  22. 【請求項22】 前記リンカーが5〜10のアミノ酸の間である、請求項2
    1に記載の融合タンパク質。
  23. 【請求項23】 前記第2のポリペプチドが抗体またはそのフラグメントで
    ある、請求項18に記載の融合タンパク質。
  24. 【請求項24】 請求項23に記載の融合タンパク質であって、ここで該融
    合タンパク質が、第2、第3および第4の融合タンパク質と四量体複合体を形成
    し得、該第2、第3および第4の融合タンパク質は、末端同士が連結された第1
    および第2のポリペプチドを少なくとも含み、ここで該第1のポリペプチドが、
    図4のストレプトアビジンの少なくとも129のアミノ酸またはその機能的改変
    体を含み、そして該第2のポリペプチドが、該第1のポリペプチドとは少なくと
    も1残基異なるアミノ酸配列を含む、融合タンパク質。
  25. 【請求項25】 前記抗体がB9E9である、請求項23に記載の融合タン
    パク質。
  26. 【請求項26】 前記抗体が1本鎖Fvフラグメント(scFV)である、
    請求項23に記載の融合タンパク質。
  27. 【請求項27】 前記1本鎖Fvフラグメントが抗体B9E9由来である、
    請求項26に記載の融合タンパク質。
  28. 【請求項28】 リンカーが、前記単鎖抗体の可変軽鎖と可変重鎖とを接続
    する、請求項26に記載の融合タンパク質。
  29. 【請求項29】 前記リンカーが少なくとも10のアミノ酸残基を含む、請
    求項28に記載の融合タンパク質。
  30. 【請求項30】 前記リンカーが少なくとも15のアミノ酸を含む、請求項
    29に記載の融合タンパク質。
  31. 【請求項31】 前記リンカーが少なくとも20のアミノ酸を含む、請求項
    30に記載の融合タンパク質。
  32. 【請求項32】 前記リンカーが少なくとも4のGly4Serリンカーを
    含む、請求項31に記載の融合タンパク質。
  33. 【請求項33】 前記抗体が、細胞表面タンパク質または細胞関連間質タン
    パク質もしくは細胞関連性マトリックスタンパク質に特異的である、請求項23
    に記載の融合タンパク質。
  34. 【請求項34】 前記抗体が霊長類化抗体である、請求項33に記載の融合
    タンパク質。
  35. 【請求項35】 前記抗体がマウス抗体である、請求項33に記載の融合タ
    ンパク質。
  36. 【請求項36】 前記細胞表面タンパク質または前記細胞関連性間質タンパ
    ク質もしくは細胞関連性マトリックスタンパク質が、CD20、CD45、EG
    P40、CEA、TAG72、NCAM、β−HCG、ムチン、および新脈管形
    成抗原からなる群より選択される、請求項33に記載の融合タンパク質。
  37. 【請求項37】 前記細胞表面タンパク質がCD20である、請求項36に
    記載の融合タンパク質。
  38. 【請求項38】 前記第1のポリペプチドが、少なくとも図4のストレプト
    アビジンのアミノ酸14〜150を含む、請求項18に記載の融合タンパク質。
  39. 【請求項39】 前記第1のポリペプチドが、少なくとも図4のストレプト
    アビジンの1〜158、5〜158、14〜150、14〜151、14〜15
    2、14〜153、14〜154、14〜155、14〜156、14〜157
    、または14〜158からなる群より選択されるアミノ酸を含む、請求項18に
    記載の融合タンパク質。
  40. 【請求項40】 融合タンパク質の投与を含む腫瘍細胞の標的化方法であっ
    て、該融合タンパク質は、末端同士で連結された第1のポリペプチドおよび第2
    のポリペプチドを少なくとも含み、ここで該第1のポリペプチドは、図4のスト
    レプトアビジンの少なくとも129のアミノ酸またはその保存的に置換された変
    異体を含み、ここで該第2のポリペプチドは、腫瘍細胞上の細胞表面タンパク質
    または細胞関連性間質タンパク質もしくは細胞関連性マトリックスタンパク質に
    結合するポリペプチドであり、ここで該融合タンパク質は、腫瘍細胞上の細胞表
    面タンパク質または細胞関連性間質タンパク質もしくは細胞関連性マトリックス
    タンパク質に結合し、そして該融合タンパク質の該ストレプトアビジン部分は、
    ビオチンに結合し得る、方法。
  41. 【請求項41】 前記融合タンパク質が、腫瘍細胞上の細胞表面タンパク質
    レセプターまたは細胞関連性間質タンパク質もしくは細胞関連性マトリックスタ
    ンパク質、ならびにビオチン化放射性核種を含む化合物に結合する、請求項40
    に記載の方法。
  42. 【請求項42】 前記第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドが、少
    なくとも2のアミノ酸のリンカーによって分けられる、請求項40に記載の方法
  43. 【請求項43】 前記リンカーが少なくとも4のアミノ酸である、請求項4
    2に記載の方法。
  44. 【請求項44】 前記リンカーが、4、5、6、7、8、9、10、11、
    12、13、14、15、16、17、18、19、および20のアミノ酸の間
    である、請求項43に記載の方法。
  45. 【請求項45】 前記リンカーが5〜10のアミノ酸の間である、請求項4
    4に記載の方法。
  46. 【請求項46】 前記第2のポリペプチドが抗体である、請求項40に記載
    の方法。
  47. 【請求項47】 前記抗原がB9E9である、請求項46に記載の方法。
  48. 【請求項48】 前記抗体が1本鎖Fvフラグメント(scFV)である、
    請求項40に記載の方法。
  49. 【請求項49】 前記1本鎖Fvフラグメントが抗体B9E9由来である、
    請求項48に記載の方法。
  50. 【請求項50】 リンカーが、前記単鎖抗体の可変軽鎖と可変重鎖とを接続
    する、請求項48に記載の方法。
  51. 【請求項51】 前記リンカーが少なくとも10のアミノ酸残基を含む、請
    求項50に記載の方法。
  52. 【請求項52】 前記リンカーが少なくとも15のアミノ酸を含む、請求項
    51に記載の方法。
  53. 【請求項53】 前記リンカーが少なくとも20のアミノ酸を含む、請求項
    52に記載の方法。
  54. 【請求項54】 前記リンカーが少なくとも4のGly4Serリンカーを
    含む、請求項53に記載の方法。
  55. 【請求項55】 前記抗体が、CD20、CD22、CD45、CD52、
    CD56、CD57、EGP40、CEA、TAG−72、NCAM、β−HC
    G、ムチン、EGFレセプター、IL−2レセプター、her2/neu、Le
    wis y、GD2、GM2、テネイシン、シアリル化テネイシン、ソマトスタ
    チン、活性化腫瘍間質抗原および新脈間形成抗原からなる群より選択される細胞
    表面タンパク質、または細胞関連性間質タンパク質もしくは細胞関連性マトリッ
    クスタンパク質に特異的に結合する、請求項40に記載の方法。
  56. 【請求項56】 前記抗体が霊長類化抗体である、請求項40に記載の方法
  57. 【請求項57】 前記抗体がマウス抗体である、請求項40に記載の方法。
  58. 【請求項58】 前記第1のポリペプチドが、少なくとも図4のストレプト
    アビジンのアミノ酸14〜158を含む、請求項40に記載の方法。
  59. 【請求項59】 前記第1のポリペプチドが、少なくとも図4のストレプト
    アビジンのアミノ酸5〜158を含む、請求項58に記載の方法。
  60. 【請求項60】 前記第1のポリペプチドが、少なくとも図4のストレプト
    アビジンのアミノ酸1〜158を含む、請求項59に記載の方法。
  61. 【請求項61】 腫瘍細胞が、腺癌および血液学的な悪性疾患からなる群よ
    り選択される癌と関連する、請求項40に記載の方法。
  62. 【請求項62】 前記腺癌が、神経膠腫、前立腺、卵巣、胸、結腸、直腸、
    膵臓および肺からなる群より選択される、請求項61に記載の方法。
  63. 【請求項63】 請求項61に記載の方法であって、前記血液学的な悪性疾
    患が、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、T細胞リンパ腫、急性リンパ性
    白血病、急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、多発性骨
    髄腫、およびヴァルデンストレームマクログロブリン血症からなる群より選択さ
    れる、方法。
  64. 【請求項64】 四価の抗体の構築方法であって、該方法は、請求項23に
    記載の四量体複合体を形成し得る前記融合タンパク質を、第2、第3および第4
    の融合タンパク質と接触させる工程を包含し、該第2、第3および第4の融合タ
    ンパク質はまた、四量体複合体を形成し得、そして末端同士で連結された第1の
    ポリペプチドおよび第2のポリペプチドを少なくとも含み、ここで該第1のポリ
    ペプチドは、図4のストレプトアビジンの129のアミノ酸またはその機能的変
    異体を含み、そして該第2のポリペプチドは、該第1のポリペプチドとは少なく
    とも1残基異なるアミノ酸配列を含む、方法。
  65. 【請求項65】 請求項18〜39のいずれか1項に記載の融合タンパク質
    を含む、薬学的組成物。
  66. 【請求項66】 ストレプトアビジン融合タンパク質の発現のためのベクタ
    ー構築物であって、以下: (a)ストレプトアビジンに融合されたポリペプチドをコードする第1の核酸配
    列; (b)該第1の核酸配列に作動可能に連結されたプロモーター;および (c)少なくとも図4のストレプトアビジンの129のアミノ酸をコードする第
    2の核酸配列またはその機能的変異体の挿入のためのクローニング部位、 を含む、ベクター構築物。
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