JP2003310282A - 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法 - Google Patents
化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法Info
- Publication number
- JP2003310282A JP2003310282A JP2003010742A JP2003010742A JP2003310282A JP 2003310282 A JP2003310282 A JP 2003310282A JP 2003010742 A JP2003010742 A JP 2003010742A JP 2003010742 A JP2003010742 A JP 2003010742A JP 2003310282 A JP2003310282 A JP 2003310282A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleic acid
- seq
- sequence
- detecting
- probe
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Abandoned
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/142—Toxicological screening, e.g. expression profiles which identify toxicity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
(57)【要約】
【課題】 化学物質の内分泌撹乱性を特異的に検出する
ための方法、核酸、プローブおよびプライマー、プロー
ブ固定化チップ、並びに抗体を提供する。 【解決手段】 化学物質の内分泌撹乱性を検出するため
の核酸であって、配列番号1に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列およびその
相補的配列、配列番号4に記載の塩基配列およびその相
補的配列、配列番号5に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号14に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号15に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補
配列、並びに配列番号28に記載の塩基配列およびその
相補配列からなる群より選択される塩基配列。
ための方法、核酸、プローブおよびプライマー、プロー
ブ固定化チップ、並びに抗体を提供する。 【解決手段】 化学物質の内分泌撹乱性を検出するため
の核酸であって、配列番号1に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列およびその
相補的配列、配列番号4に記載の塩基配列およびその相
補的配列、配列番号5に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号14に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号15に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補
配列、並びに配列番号28に記載の塩基配列およびその
相補配列からなる群より選択される塩基配列。
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、化学物質の内分泌
撹乱性を特異的に検出するための方法、核酸、プローブ
およびプライマー、プローブ固定化チップ、並びに抗体
に関する。
撹乱性を特異的に検出するための方法、核酸、プローブ
およびプライマー、プローブ固定化チップ、並びに抗体
に関する。
【0002】
【従来の技術】近年、化学物質にホルモン類似作用や抗
ホルモン作用が見出された。これらの化学物質は内分泌
撹乱物質と呼ばれ、通称、環境ホルモンと呼ばれる。内
分泌撹乱物質は、生殖系をはじめ免疫系や神経系に変化
を引き起こす毒性を有することが明らかになっている。
現在、ダイオキシンをはじめとする70種類以上の化学
物質が内分泌撹乱性を有すると疑われている。その他に
も、その毒性の不明な化学物質も数多く存在している。
また一方では、新規化学物質が日々開発されている。
ホルモン作用が見出された。これらの化学物質は内分泌
撹乱物質と呼ばれ、通称、環境ホルモンと呼ばれる。内
分泌撹乱物質は、生殖系をはじめ免疫系や神経系に変化
を引き起こす毒性を有することが明らかになっている。
現在、ダイオキシンをはじめとする70種類以上の化学
物質が内分泌撹乱性を有すると疑われている。その他に
も、その毒性の不明な化学物質も数多く存在している。
また一方では、新規化学物質が日々開発されている。
【0003】従来から使用される化学物質の内分泌撹乱
性の迅速な検出方法としては、例えば、DNAチップを
用いた方法が挙げられる(宝酒造社製、IntelliGeneTM
Human DNA CHIP for Endocline Disruption Study)。
この種のDNAチップにおいて用いられる遺伝子プロー
ブは、核内レセプター遺伝子群、レセプター共役因子遺
伝子群、性腺分化遺伝子群、および細胞周期に関与する
遺伝子群などから選抜された既知遺伝子群である。しか
しながら、これらの遺伝子群は、化学物質の内分泌撹乱
性に対して特異的に応答する遺伝子ではない。そのた
め、従来の方法では、化学物質の内分泌撹乱性を特異的
に検出することは困難である。
性の迅速な検出方法としては、例えば、DNAチップを
用いた方法が挙げられる(宝酒造社製、IntelliGeneTM
Human DNA CHIP for Endocline Disruption Study)。
この種のDNAチップにおいて用いられる遺伝子プロー
ブは、核内レセプター遺伝子群、レセプター共役因子遺
伝子群、性腺分化遺伝子群、および細胞周期に関与する
遺伝子群などから選抜された既知遺伝子群である。しか
しながら、これらの遺伝子群は、化学物質の内分泌撹乱
性に対して特異的に応答する遺伝子ではない。そのた
め、従来の方法では、化学物質の内分泌撹乱性を特異的
に検出することは困難である。
【0004】
【特許文献1】特表2002−523112号公報
【0005】
【特許文献2】特開2002−17355号公報
【0006】
【発明が解決しようとする課題】上記の状況に鑑み、本
発明の目的は、化学物質の内分泌撹乱性を特異的に検出
するための方法、核酸、プローブおよびプライマー、プ
ローブ固定化チップ、並びに抗体を提供することであ
る。
発明の目的は、化学物質の内分泌撹乱性を特異的に検出
するための方法、核酸、プローブおよびプライマー、プ
ローブ固定化チップ、並びに抗体を提供することであ
る。
【0007】
【課題を解決するための手段】本発明の第1の態様に従
うと、化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸で
あって、配列番号1に記載の塩基配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列およびその相補的配
列、配列番号4に記載の塩基配列およびその相補的配
列、並びに配列番号5に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号14に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号15に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補
配列、配列番号28に記載の塩基配列およびその相補配
列からなる群より選択される塩基配列で示される核酸が
提供される。
うと、化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸で
あって、配列番号1に記載の塩基配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列およびその相補的配
列、配列番号4に記載の塩基配列およびその相補的配
列、並びに配列番号5に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号14に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号15に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補
的配列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補
配列、配列番号28に記載の塩基配列およびその相補配
列からなる群より選択される塩基配列で示される核酸が
提供される。
【0008】本発明の第2の態様に従うと、第1の態様
に従う塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩
基よりなる核酸、並びに、配列番号6により示される核
酸、配列番号7により示される核酸、配列番号8により
示される核酸、配列番号9により示される核酸、配列番
号10により示される核酸、配列番号11により示され
る核酸、配列番号12により示される核酸、配列番号1
3により示される核酸、配列番号17により示される核
酸、配列番号18により示される核酸、配列番号19に
より示される核酸、配列番号20により示される核酸、
配列番号21により示される核酸、配列番号22により
示される核酸、配列番号25により示される核酸および
配列番号26により示される核酸からなる群より選択さ
れる核酸を含む核酸検出用プローブが提供される。
に従う塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩
基よりなる核酸、並びに、配列番号6により示される核
酸、配列番号7により示される核酸、配列番号8により
示される核酸、配列番号9により示される核酸、配列番
号10により示される核酸、配列番号11により示され
る核酸、配列番号12により示される核酸、配列番号1
3により示される核酸、配列番号17により示される核
酸、配列番号18により示される核酸、配列番号19に
より示される核酸、配列番号20により示される核酸、
配列番号21により示される核酸、配列番号22により
示される核酸、配列番号25により示される核酸および
配列番号26により示される核酸からなる群より選択さ
れる核酸を含む核酸検出用プローブが提供される。
【0009】本発明の第3の態様に従うと、第1の態様
に従う塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩
基よりなる核酸、並びに配列番号6により示される核
酸、配列番号7により示される核酸、配列番号8により
示される核酸、配列番号9により示される核酸、配列番
号10により示される核酸、配列番号11により示され
る核酸、配列番号12により示される核酸、配列番号1
3により示される核酸、配列番号17により示される核
酸、配列番号18により示される核酸、配列番号19に
より示される核酸、配列番号20により示される核酸、
配列番号21により示される核酸、配列番号22により
示される核酸、配列番号25により示される核酸および
配列番号26により示される核酸からなる群より選択さ
れる核酸を含む核酸検出用プライマ−が提供される。
に従う塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩
基よりなる核酸、並びに配列番号6により示される核
酸、配列番号7により示される核酸、配列番号8により
示される核酸、配列番号9により示される核酸、配列番
号10により示される核酸、配列番号11により示され
る核酸、配列番号12により示される核酸、配列番号1
3により示される核酸、配列番号17により示される核
酸、配列番号18により示される核酸、配列番号19に
より示される核酸、配列番号20により示される核酸、
配列番号21により示される核酸、配列番号22により
示される核酸、配列番号25により示される核酸および
配列番号26により示される核酸からなる群より選択さ
れる核酸を含む核酸検出用プライマ−が提供される。
【0010】本発明の第4の態様に従うと、基体と、前
記基体に固相化された、第2の態様に従う核酸検出用プ
ローブを少なくとも1種類具備するプローブ固定化チッ
プが提供される。
記基体に固相化された、第2の態様に従う核酸検出用プ
ローブを少なくとも1種類具備するプローブ固定化チッ
プが提供される。
【0011】本発明の第5の態様に従うと、化学物質の
内分泌撹乱性を検出する方法であって、(a)検体に対
して前記化学物質を作用させることと、(b)前記化学
物質を作用させた後に前記検体から検体核酸を得ること
と、(c)前記検体核酸と第2の態様に従う核酸検出用
プローブとを反応させることと、(d)核酸検出用プロ
ーブと標的核酸とのハイブリダイゼーションを検出する
とにより前記標的核酸の発現程度を得ることと、(e)
前記(d)で得られた前記標的核酸の発現程度と、検体
に対して前記化合物を作用させない場合の前記標的核酸
の発現程度とを比較することによって、前記化学物質の
内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方法が提供
される。
内分泌撹乱性を検出する方法であって、(a)検体に対
して前記化学物質を作用させることと、(b)前記化学
物質を作用させた後に前記検体から検体核酸を得ること
と、(c)前記検体核酸と第2の態様に従う核酸検出用
プローブとを反応させることと、(d)核酸検出用プロ
ーブと標的核酸とのハイブリダイゼーションを検出する
とにより前記標的核酸の発現程度を得ることと、(e)
前記(d)で得られた前記標的核酸の発現程度と、検体
に対して前記化合物を作用させない場合の前記標的核酸
の発現程度とを比較することによって、前記化学物質の
内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方法が提供
される。
【0012】本発明の第6の態様に従うと、化学物質の
内分泌撹乱性を検出する方法であって、(a)検体に対
して前記化学物質を作用させることと、(b)前記化学
物質を作用させた後に前記検体から検体核酸を得ること
と、(c)前記検体核酸を、第3の態様に従う核酸検出
用プライマーの2種類以上と核酸増幅用酵素とを用いて
増幅産物を得ることと、(d)前記(c)で得た増幅産
物を解析するとにより前記標的核酸の発現程度を得るこ
とと、(e)前記(d)で得られた前記標的核酸の発現
程度と、検体に対して前記化合物を作用させない場合の
前記標的核酸の発現程度とを比較することによって、前
記化学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備す
る方法が提供される。
内分泌撹乱性を検出する方法であって、(a)検体に対
して前記化学物質を作用させることと、(b)前記化学
物質を作用させた後に前記検体から検体核酸を得ること
と、(c)前記検体核酸を、第3の態様に従う核酸検出
用プライマーの2種類以上と核酸増幅用酵素とを用いて
増幅産物を得ることと、(d)前記(c)で得た増幅産
物を解析するとにより前記標的核酸の発現程度を得るこ
とと、(e)前記(d)で得られた前記標的核酸の発現
程度と、検体に対して前記化合物を作用させない場合の
前記標的核酸の発現程度とを比較することによって、前
記化学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備す
る方法が提供される。
【0013】本発明の第7の態様に従うと、配列番号
2、配列番号16および配列番号24の何れか1に記載
のアミノ酸配列により示されるペプチドが提供される。
2、配列番号16および配列番号24の何れか1に記載
のアミノ酸配列により示されるペプチドが提供される。
【0014】本発明の第8の態様に従うと、第7の態様
に従うペプチドを認識する抗体が提供される。
に従うペプチドを認識する抗体が提供される。
【0015】また更に、本発明の第9の態様に従うと、
配列番号1、配列番号3、配列番号15および配列番号
23の何れか1に記載の塩基配列がコードするペプチド
と、それに対する抗体が提供される。
配列番号1、配列番号3、配列番号15および配列番号
23の何れか1に記載の塩基配列がコードするペプチド
と、それに対する抗体が提供される。
【0016】また更に、本発明の第10の態様に従う
と、基体と、前記基体に固相化された第8または第9の
態様に従う抗体を少なくとも1種類プローブとして具備
するプローブ固定化チップが提供される。
と、基体と、前記基体に固相化された第8または第9の
態様に従う抗体を少なくとも1種類プローブとして具備
するプローブ固定化チップが提供される。
【0017】また更に、本発明の第11の態様に従う
と、化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法であって、
(a)検体に対して前記化学物質を作用させることと、
(b)前記化学物質を作用させた後に前記検体から検体
試料を得ることと、(c)前記検体試料と、検出用プロ
ーブとしての第8または第9の態様に従う抗体とを反応
させることと、(d)前記抗体と標的物質との結合を検
出することにより、前記標的物質の存在を検出すること
と、(e)前記(d)で得られた検出結果と、検体に対
して前記化学物質を作用させない場合の前記標的物質の
存在を検出した結果とを比較することによって、前記化
学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方
法が提供される。
と、化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法であって、
(a)検体に対して前記化学物質を作用させることと、
(b)前記化学物質を作用させた後に前記検体から検体
試料を得ることと、(c)前記検体試料と、検出用プロ
ーブとしての第8または第9の態様に従う抗体とを反応
させることと、(d)前記抗体と標的物質との結合を検
出することにより、前記標的物質の存在を検出すること
と、(e)前記(d)で得られた検出結果と、検体に対
して前記化学物質を作用させない場合の前記標的物質の
存在を検出した結果とを比較することによって、前記化
学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方
法が提供される。
【0018】
【発明の実施の形態】ここにおいて使用される「内分泌
撹乱物質」の語は、生体の恒常性、生殖、発生または行
動に関する種々の生体内ホルモンの合成、貯蔵、分泌、
体内輸送、受容体結合、ホルモン作用または排出等の諸
過程を阻害するまたは促進する外因性化学物質を指し、
外因性内分泌撹乱物質、内分泌撹乱物質、内分泌撹乱化
学物質、内分泌障害性物質または環境ホルモンなどとも
称される化学物質を示す語でもある。また、本明細書に
おいて、「外因性内分泌撹乱物質」、「内分泌撹乱物
質」、「内分泌撹乱化学物質」、「内分泌障害性物質」
および「環境ホルモン」の語は相互に交換可能に使用さ
れる。
撹乱物質」の語は、生体の恒常性、生殖、発生または行
動に関する種々の生体内ホルモンの合成、貯蔵、分泌、
体内輸送、受容体結合、ホルモン作用または排出等の諸
過程を阻害するまたは促進する外因性化学物質を指し、
外因性内分泌撹乱物質、内分泌撹乱物質、内分泌撹乱化
学物質、内分泌障害性物質または環境ホルモンなどとも
称される化学物質を示す語でもある。また、本明細書に
おいて、「外因性内分泌撹乱物質」、「内分泌撹乱物
質」、「内分泌撹乱化学物質」、「内分泌障害性物質」
および「環境ホルモン」の語は相互に交換可能に使用さ
れる。
【0019】ここにおいて使用される「内分泌撹乱性」
の語は、内分泌系ホルモンの作用を撹乱することによっ
て、ホルモンにより維持される細胞の本来の恒常性を崩
壊する作用を指す。例えば、内分泌撹乱物質は、細胞核
内に存在する内分泌系ホルモンの受容体に作用し、それ
によって当該受容体に本来的に作用すべき内分泌系ホル
モンの作用を撹乱する。
の語は、内分泌系ホルモンの作用を撹乱することによっ
て、ホルモンにより維持される細胞の本来の恒常性を崩
壊する作用を指す。例えば、内分泌撹乱物質は、細胞核
内に存在する内分泌系ホルモンの受容体に作用し、それ
によって当該受容体に本来的に作用すべき内分泌系ホル
モンの作用を撹乱する。
【0020】I.内分泌撹乱性によりその発現量が特異
的に影響を受ける遺伝子 本発明の1側面に従うと、検体におけるその発現量が内
分泌撹乱性によって特異的に影響される遺伝子を含む核
酸が開示される。
的に影響を受ける遺伝子 本発明の1側面に従うと、検体におけるその発現量が内
分泌撹乱性によって特異的に影響される遺伝子を含む核
酸が開示される。
【0021】発明者らは、トリヨードチロニン存在下で
マウス神経芽細胞Neuro2aに対して、2,3,7,8-テ
トラクロロ−ベンゾ−p−ジオキシン(2,3,7,8-tetrac
hloro-benzo-p-dioxin;以下、TCDDと称する)を作
用させた場合と、前記細胞に対してTCDDを作用させ
なかった場合とについて、それぞれの細胞において発現
した前記RNAをディファレンシャル・ディスプレイ法
により比較した。その結果、TCDDにより特異的にそ
の発現量が変化した遺伝子を明らかにした。
マウス神経芽細胞Neuro2aに対して、2,3,7,8-テ
トラクロロ−ベンゾ−p−ジオキシン(2,3,7,8-tetrac
hloro-benzo-p-dioxin;以下、TCDDと称する)を作
用させた場合と、前記細胞に対してTCDDを作用させ
なかった場合とについて、それぞれの細胞において発現
した前記RNAをディファレンシャル・ディスプレイ法
により比較した。その結果、TCDDにより特異的にそ
の発現量が変化した遺伝子を明らかにした。
【0022】ここで使用されたNeuro2aは、内分
泌系ホルモンに感受性のある細胞である。即ち、その細
胞の培養系に内分泌系ホルモンが存在している条件下で
は、そのホルモンの支配を受けて種々の細胞機能の発現
等が制御されるが、該培養系に内分泌系ホルモンが存在
していない条件下では該ホルモンによって該発現が制御
されない細胞である。従って、トリヨードチロニンを内
分泌系ホルモンとして存在させながらNeuro2aに
対して内分泌撹乱物質を作用させれば、前記内分泌撹乱
物質の内分泌撹乱性のみの作用を前記細胞に対して負荷
することが可能である。従って、このような条件による
解析により、その発現が内分泌撹乱性により特異的に影
響を受ける遺伝子が明らかにできた。
泌系ホルモンに感受性のある細胞である。即ち、その細
胞の培養系に内分泌系ホルモンが存在している条件下で
は、そのホルモンの支配を受けて種々の細胞機能の発現
等が制御されるが、該培養系に内分泌系ホルモンが存在
していない条件下では該ホルモンによって該発現が制御
されない細胞である。従って、トリヨードチロニンを内
分泌系ホルモンとして存在させながらNeuro2aに
対して内分泌撹乱物質を作用させれば、前記内分泌撹乱
物質の内分泌撹乱性のみの作用を前記細胞に対して負荷
することが可能である。従って、このような条件による
解析により、その発現が内分泌撹乱性により特異的に影
響を受ける遺伝子が明らかにできた。
【0023】本発明者らが特定した内分泌撹乱性によっ
て特異的にその発現量が減少された遺伝子を含む核酸
は、配列番号3に記載される塩基配列で示されるND8
3−3である。これはクローン名IMAGE:3496
023(Database Accession No.BC007484、American Ty
pe Culture Collection(ATCC)寄託受付番号5670434)と
94%の相同性を示すものである。
て特異的にその発現量が減少された遺伝子を含む核酸
は、配列番号3に記載される塩基配列で示されるND8
3−3である。これはクローン名IMAGE:3496
023(Database Accession No.BC007484、American Ty
pe Culture Collection(ATCC)寄託受付番号5670434)と
94%の相同性を示すものである。
【0024】また、本発明者らが特定した更なる核酸
は、配列番号5に記載される塩基配列により示されるN
D83−4である。この塩基配列と85%以上の相同性
を示すクローンは以下の6クローン、RIKEN:G4
31004A07(Database Accession No.BB795235)、
IMAGE:3156947(Database Accession No.A
W910492、ATCC 寄託受付番号5670434)、IMAGE:5
40238(Database Accession No.AI427138、ATCC 寄
託受付番号 997352)、IMAGE:805651(Datab
ase Accession No.AI467121、ATCC 寄託受付番号106791
7)、UI−M−CD1−azs−c−11−0−UI(D
atabase Accession No.BE953230)、マウスRP24−3
88P13(Database Accession No.101915)である。
は、配列番号5に記載される塩基配列により示されるN
D83−4である。この塩基配列と85%以上の相同性
を示すクローンは以下の6クローン、RIKEN:G4
31004A07(Database Accession No.BB795235)、
IMAGE:3156947(Database Accession No.A
W910492、ATCC 寄託受付番号5670434)、IMAGE:5
40238(Database Accession No.AI427138、ATCC 寄
託受付番号 997352)、IMAGE:805651(Datab
ase Accession No.AI467121、ATCC 寄託受付番号106791
7)、UI−M−CD1−azs−c−11−0−UI(D
atabase Accession No.BE953230)、マウスRP24−3
88P13(Database Accession No.101915)である。
【0025】
【表1】
【0026】また、本発明者らが特定した更なる核酸
は、配列番号14に記載される塩基配列により示される
ND118−1である。この塩基配列はマウス11番染色
体上の107213067から107213304の領
域にコードされている。
は、配列番号14に記載される塩基配列により示される
ND118−1である。この塩基配列はマウス11番染色
体上の107213067から107213304の領
域にコードされている。
【0027】また、本発明者らが特定した更なる核酸
は、配列番号27に記載される塩基配列により示される
ND818−2である。マウス3番染色体上10547
6953から1054477260にコードされてお
り、同領域の近傍にはマウス仮想タンパク質MGC:7
720(Accession No. NM030249)がコードされる。MG
C:7720はND818−2の最初の塩基対から29
73番目の塩基対までの領域が99%の相同性を示す。
は、配列番号27に記載される塩基配列により示される
ND818−2である。マウス3番染色体上10547
6953から1054477260にコードされてお
り、同領域の近傍にはマウス仮想タンパク質MGC:7
720(Accession No. NM030249)がコードされる。MG
C:7720はND818−2の最初の塩基対から29
73番目の塩基対までの領域が99%の相同性を示す。
【0028】また、本発明者らが特定した更なる核酸
は、配列番号28に記載される塩基配列により示される
ND87−3である。マウス10番染色体上の7646
283から7646436の領域にコードされており、
同領域にはEnsemblが予測した機能未知遺伝子
(Accession No. AK014406)が
コードされていた。
は、配列番号28に記載される塩基配列により示される
ND87−3である。マウス10番染色体上の7646
283から7646436の領域にコードされており、
同領域にはEnsemblが予測した機能未知遺伝子
(Accession No. AK014406)が
コードされていた。
【0029】ND83−3、ND83−4、ND118
−1、ND818−2およびND87−3の塩基配列で
示される核酸の発現の程度は、内分泌撹乱性を有する化
学物質により影響を受ける。従って、ND83−3、N
D83−4、ND118−1、ND818−2およびN
D87−3の塩基配列で示される核酸の発現程度を解析
することによって、内分泌撹乱性に関して未知の化学物
質について、内分泌撹乱性の有無および内分泌撹乱性の
程度を解析することが可能である。従って、本発明の1
態様として提供される核酸、ND83−3、ND83−
4、ND118−1、ND818−2およびND87−
3と同様の塩基配列で示される核酸は、内分泌撹乱性の
マーカーとして使用され得る。
−1、ND818−2およびND87−3の塩基配列で
示される核酸の発現の程度は、内分泌撹乱性を有する化
学物質により影響を受ける。従って、ND83−3、N
D83−4、ND118−1、ND818−2およびN
D87−3の塩基配列で示される核酸の発現程度を解析
することによって、内分泌撹乱性に関して未知の化学物
質について、内分泌撹乱性の有無および内分泌撹乱性の
程度を解析することが可能である。従って、本発明の1
態様として提供される核酸、ND83−3、ND83−
4、ND118−1、ND818−2およびND87−
3と同様の塩基配列で示される核酸は、内分泌撹乱性の
マーカーとして使用され得る。
【0030】本発明の1態様として提供され得る化学物
質の内分泌撹乱性を検出するための核酸は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸であって、配列番号
1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号3
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号4に
記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号5に記
載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号14に記
載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号15に記
載の塩基配列およびその相補的配列、並びに配列番号2
3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号2
7に記載の塩基配列およびその相補配列、配列番号28
に記載の塩基配列およびその相補配列からなる群より選
択される塩基配列で示される核酸であればよい。
質の内分泌撹乱性を検出するための核酸は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸であって、配列番号
1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号3
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号4に
記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号5に記
載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号14に記
載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号15に記
載の塩基配列およびその相補的配列、並びに配列番号2
3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号2
7に記載の塩基配列およびその相補配列、配列番号28
に記載の塩基配列およびその相補配列からなる群より選
択される塩基配列で示される核酸であればよい。
【0031】ここで、配列番号3に記載の塩基配列は、
配列番号1の塩基配列の1969位から2509位まで
を含む配列である。また、配列番号5に記載の塩基配列
は、配列番号4の塩基配列の269位から678位まで
を含む配列である。
配列番号1の塩基配列の1969位から2509位まで
を含む配列である。また、配列番号5に記載の塩基配列
は、配列番号4の塩基配列の269位から678位まで
を含む配列である。
【0032】また、化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸は、配列番号1に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列と85%から100
%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配
列番号4に記載の記載の塩基配列と85%から100%
で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、並び
に配列番号5に記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号14に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号15に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、並びに
配列番号23に記載の記載の塩基配列と85%から10
0%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、
配列番号27に記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号28に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列からなる群より
選択される塩基配列で示される核酸であればよい。
ための核酸は、配列番号1に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列と85%から100
%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配
列番号4に記載の記載の塩基配列と85%から100%
で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、並び
に配列番号5に記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号14に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号15に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、並びに
配列番号23に記載の記載の塩基配列と85%から10
0%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、
配列番号27に記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号28に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列からなる群より
選択される塩基配列で示される核酸であればよい。
【0033】本発明の更なる1態様として提供され得る
化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸は、配列
番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配
列番号5に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号14に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号15に記載の塩基配列およびその相補的配列、並び
に、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補的配
列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補配
列、配列番号28に記載の塩基配列およびその相補配列
からなる群より選択される塩基配列に含まれる連続した
15塩基から30塩基よりなる核酸であってよい。
化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸は、配列
番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配
列番号5に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号14に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号15に記載の塩基配列およびその相補的配列、並び
に、配列番号23に記載の塩基配列およびその相補的配
列、配列番号27に記載の塩基配列およびその相補配
列、配列番号28に記載の塩基配列およびその相補配列
からなる群より選択される塩基配列に含まれる連続した
15塩基から30塩基よりなる核酸であってよい。
【0034】また、化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸は、配列番号1に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列と85%から100
%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配
列番号4に記載の記載の塩基配列と85%から100%
で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列
番号5に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号14
に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号15
に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、並びに配列番
号23に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号27に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号28
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る核酸配列およびその相補的配列からなる群より選択さ
れる塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩基
よりなる核酸であってもよい。
ための核酸は、配列番号1に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号3に記載の塩基配列と85%から100
%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配
列番号4に記載の記載の塩基配列と85%から100%
で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列
番号5に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号14
に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号15
に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、並びに配列番
号23に記載の記載の塩基配列と85%から100%で
相同性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番
号27に記載の塩基配列と85%から100%で相同性
を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号28
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る核酸配列およびその相補的配列からなる群より選択さ
れる塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩基
よりなる核酸であってもよい。
【0035】ここにおいて使用される「核酸」の語は、
天然に存在する種々のDNAおよびRNA、並びにペプ
チド核酸、モルホリノ核酸、メチルホスフォネート核酸
およびS-オリゴ核酸などの人工的に合成された核酸類
似体などを指す。
天然に存在する種々のDNAおよびRNA、並びにペプ
チド核酸、モルホリノ核酸、メチルホスフォネート核酸
およびS-オリゴ核酸などの人工的に合成された核酸類
似体などを指す。
【0036】ここにおいて使用される「85%から10
0%で相同性を有する」の語は、2つの塩基配列が互い
に85%から100%に相同性であり、残りの0%から
25%の塩基配列は、1以上の塩基が欠失されるか、お
よび/または1以上の塩基が置換されるか、および/ま
たは1以上の塩基が付加されるかによって、修飾されて
いることにより相同性を有していない部分であることを
示す。
0%で相同性を有する」の語は、2つの塩基配列が互い
に85%から100%に相同性であり、残りの0%から
25%の塩基配列は、1以上の塩基が欠失されるか、お
よび/または1以上の塩基が置換されるか、および/ま
たは1以上の塩基が付加されるかによって、修飾されて
いることにより相同性を有していない部分であることを
示す。
【0037】ここで、各配列中の「N」または「n」は
アデニン、チミン、グアニンまたはシトシンの何れかの
ヌクレオチドでよい。
アデニン、チミン、グアニンまたはシトシンの何れかの
ヌクレオチドでよい。
【0038】II.核酸検出用プローブ
本発明の1側面に従うと、上述の化学物質の内分泌撹乱
性を検出するための核酸またはその一部は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブとし
て使用することが可能である。そのような化学物質の内
分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブも本発
明の範囲内にある。
性を検出するための核酸またはその一部は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブとし
て使用することが可能である。そのような化学物質の内
分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブも本発
明の範囲内にある。
【0039】本発明に従って、化学物質の内分泌撹乱性
を検出するために好ましい核酸検出用プローブは、配列
番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号5
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号14
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号15
に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配列
番号23に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号27に記載の塩基配列およびその相補配列、配列番
号28に記載の塩基配列およびその相補配列からなる群
より選択される塩基配列に含まれる連続した15塩基か
ら30塩基よりなる核酸を含む核酸検出用プローブであ
ってよい。
を検出するために好ましい核酸検出用プローブは、配列
番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号5
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号14
に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号15
に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配列
番号23に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号27に記載の塩基配列およびその相補配列、配列番
号28に記載の塩基配列およびその相補配列からなる群
より選択される塩基配列に含まれる連続した15塩基か
ら30塩基よりなる核酸を含む核酸検出用プローブであ
ってよい。
【0040】また、化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸検出用プローブは、配列番号1に記載の塩基
配列と85%から100%で相同性を有する核酸配列お
よびその相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と85
%から100%で相同性を有する核酸配列およびその相
補的配列、配列番号5に記載の塩基配列と85%から1
00%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、配列番号14に記載の記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、配列番号15に記載の記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、並びに、配列番号23に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号27に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号28に記載の塩基配列と85%から10
0%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列か
らなる群より選択される塩基配列に含まれる連続した1
5塩基から30塩基よりなる核酸を含んでいてもよい。
ための核酸検出用プローブは、配列番号1に記載の塩基
配列と85%から100%で相同性を有する核酸配列お
よびその相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と85
%から100%で相同性を有する核酸配列およびその相
補的配列、配列番号5に記載の塩基配列と85%から1
00%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、配列番号14に記載の記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、配列番号15に記載の記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配
列、並びに、配列番号23に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号27に記載の塩基配列と85%か
ら100%で相同性を有する核酸配列およびその相補的
配列、配列番号28に記載の塩基配列と85%から10
0%で相同性を有する核酸配列およびその相補的配列か
らなる群より選択される塩基配列に含まれる連続した1
5塩基から30塩基よりなる核酸を含んでいてもよい。
【0041】また更に、化学物質の内分泌撹乱性を検出
するための核酸検出用プローブの好ましい例は、配列番
号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号
10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配
列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号2
0、配列番号21、配列番号22、配列番号25、配列
番号26に記載の塩基配列により示される核酸を含む。
するための核酸検出用プローブの好ましい例は、配列番
号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号
10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配
列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号2
0、配列番号21、配列番号22、配列番号25、配列
番号26に記載の塩基配列により示される核酸を含む。
【0042】本発明の1側面に従うと、化学物質の内分
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブは、所望
の標識物質を含んでいてもよい。また、化学物質の内分
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブは、上述
の核酸に加えて更なる配列を含んでいてもよい。
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブは、所望
の標識物質を含んでいてもよい。また、化学物質の内分
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プローブは、上述
の核酸に加えて更なる配列を含んでいてもよい。
【0043】III.核酸検出用プローブを用いた内分
泌撹乱性の検出方法 このような核酸検出用プローブを用いることにより、次
のような手順によって化学物質の内分泌撹乱性を検出す
ることが可能である。まず、検査対象である化学物質を
検体に作用させる。次に、前記検体から検体核酸を調製
する。得られた検体核酸と、前記核酸検出用プローブと
を反応させる。検体核酸中に標的配列が含まれる場合に
は、ハイブリダイゼーションが生じる。続いて、このハ
イブリダイゼーションの有無および程度を検出する。こ
の結合の検出は、例えば、予め検出可能な標識物質によ
り標識した核酸検出用プローブを用いてハイブリダイゼ
ーションを行い、ハイブリダイゼーション後に前記標識
物質を検出することにより行うことが可能である。
泌撹乱性の検出方法 このような核酸検出用プローブを用いることにより、次
のような手順によって化学物質の内分泌撹乱性を検出す
ることが可能である。まず、検査対象である化学物質を
検体に作用させる。次に、前記検体から検体核酸を調製
する。得られた検体核酸と、前記核酸検出用プローブと
を反応させる。検体核酸中に標的配列が含まれる場合に
は、ハイブリダイゼーションが生じる。続いて、このハ
イブリダイゼーションの有無および程度を検出する。こ
の結合の検出は、例えば、予め検出可能な標識物質によ
り標識した核酸検出用プローブを用いてハイブリダイゼ
ーションを行い、ハイブリダイゼーション後に前記標識
物質を検出することにより行うことが可能である。
【0044】また、検査対象である化学物質の内分泌撹
乱性の有無および程度の判定は、前記化学物質を作用さ
せないこと以外は同様の条件で処理された検体から採取
された対照核酸を用いて得た検出結果と比較することに
よって行うことが可能である。また、そのような対照核
酸における結果との比較により予め閾値を設定してお
き、その閾値を越えるか否かによって検査対象である化
学物質の内分泌撹乱性の有無および程度の判定を行って
もよい。このような化学物質の内分泌撹乱性を検出する
方法も本発明の更なる1態様として提供される。
乱性の有無および程度の判定は、前記化学物質を作用さ
せないこと以外は同様の条件で処理された検体から採取
された対照核酸を用いて得た検出結果と比較することに
よって行うことが可能である。また、そのような対照核
酸における結果との比較により予め閾値を設定してお
き、その閾値を越えるか否かによって検査対象である化
学物質の内分泌撹乱性の有無および程度の判定を行って
もよい。このような化学物質の内分泌撹乱性を検出する
方法も本発明の更なる1態様として提供される。
【0045】ここで使用される「検体」の語は、検査対
象である化学物質を作用させるための生体を指す。例え
ば、マウス、ラット、ネコ、イヌ、ウシ、ヤギ、ブタ、
ヒツジまたはサルなどの生物個体であってもよく、また
はヒトを含む動物生体に由来する培養細胞および組織で
あってもよい。
象である化学物質を作用させるための生体を指す。例え
ば、マウス、ラット、ネコ、イヌ、ウシ、ヤギ、ブタ、
ヒツジまたはサルなどの生物個体であってもよく、また
はヒトを含む動物生体に由来する培養細胞および組織で
あってもよい。
【0046】また、検体として生物個体を使用する場合
には、検体核酸は、個体から得た血液、血清、リンパ液
および組織などから調製すればよい。その場合、必要に
応じて、ホモジネートおよび抽出等の必要な任意の前処
理を行ってもよい。このような前処理は、対象となる試
料に応じて当業者によって選択され得るであろう。また
検体が培養細胞または組織である場合、同様に前処理を
行ってから以下のような検体核酸の抽出を行っても、前
処理なしに抽出を行ってもよい。
には、検体核酸は、個体から得た血液、血清、リンパ液
および組織などから調製すればよい。その場合、必要に
応じて、ホモジネートおよび抽出等の必要な任意の前処
理を行ってもよい。このような前処理は、対象となる試
料に応じて当業者によって選択され得るであろう。また
検体が培養細胞または組織である場合、同様に前処理を
行ってから以下のような検体核酸の抽出を行っても、前
処理なしに抽出を行ってもよい。
【0047】検体核酸は、使用した検体からそれ自身公
知の手段により調製すればよい。ここで使用される「検
体核酸」の語は、一般的には対象において発現されるm
RNAまたは全RNAを指す。対象から被検核酸を得る
工程はそれ自身公知の手段により行うことが可能であ
る。例えば、市販のキットを使用しても、オリゴdTカ
ラムなどの担体を用いる固液抽出法を使用しても、例え
ば、フェノールー−クロロホルム法等の液−液抽出法を
使用してもよいが、これに限定されるのもではない。
知の手段により調製すればよい。ここで使用される「検
体核酸」の語は、一般的には対象において発現されるm
RNAまたは全RNAを指す。対象から被検核酸を得る
工程はそれ自身公知の手段により行うことが可能であ
る。例えば、市販のキットを使用しても、オリゴdTカ
ラムなどの担体を用いる固液抽出法を使用しても、例え
ば、フェノールー−クロロホルム法等の液−液抽出法を
使用してもよいが、これに限定されるのもではない。
【0048】また、検体核酸の量が少ないときには、必
要に応じてポリヌクレオチドを増幅する操作を行っても
よい。増幅操作は、例えば、逆転写ポリメラーゼ連鎖反
応(RT-PCR)およびポリメラーゼ連鎖反応(以下PCRと略
記する)などによって行ってよい。
要に応じてポリヌクレオチドを増幅する操作を行っても
よい。増幅操作は、例えば、逆転写ポリメラーゼ連鎖反
応(RT-PCR)およびポリメラーゼ連鎖反応(以下PCRと略
記する)などによって行ってよい。
【0049】ここで使用される「標的配列」の語は、上
述した本発明に従う化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸またはその一部分に対して相補的な配列であ
り、上述の本発明に従う核酸検出用プローブとハイブリ
ダイズすることが可能な配列である。
述した本発明に従う化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸またはその一部分に対して相補的な配列であ
り、上述の本発明に従う核酸検出用プローブとハイブリ
ダイズすることが可能な配列である。
【0050】また、上述の増幅操作において使用するプ
ライマーとして、後述する本発明の核酸検出用プライマ
ーを使用してもよい。
ライマーとして、後述する本発明の核酸検出用プライマ
ーを使用してもよい。
【0051】IV.プローブ固定化チップ
上述した本発明に従う核酸検出用プローブは、基板上に
固定化されてプローブ固定化チップとして提供されても
よい。また、そのようなプローブ固定化チップも本発明
の範囲内に含まれる。
固定化されてプローブ固定化チップとして提供されても
よい。また、そのようなプローブ固定化チップも本発明
の範囲内に含まれる。
【0052】本発明の更なる側面に従うと、プローブ固
定化チップは、上述した核酸検出用プローブを、以下の
ような基板に固定化することにより製作することが可能
である。本発明に従って使用される基板の例は、多孔質
体、マイクロタイタープレート、ビーズ、球状物質、粒
子状物質、磁性体および磁気ビーズ等の基体などであ
る。また、核酸検出用プローブを固定化すべき基体の材
質、大きさおよび形状などは特に限定されるものではな
い。
定化チップは、上述した核酸検出用プローブを、以下の
ような基板に固定化することにより製作することが可能
である。本発明に従って使用される基板の例は、多孔質
体、マイクロタイタープレート、ビーズ、球状物質、粒
子状物質、磁性体および磁気ビーズ等の基体などであ
る。また、核酸検出用プローブを固定化すべき基体の材
質、大きさおよび形状などは特に限定されるものではな
い。
【0053】前記プローブ固定化チップを用いた試料物
質中の核酸の配列の検出は、例えば、検体から採取した
試料物質から核酸成分の抽出を行った後、前記試料核酸
とプローブ固定化チップとを接触させ、プローブ固定化
チップ上のプローブと試料核酸とのハイブリダイゼーシ
ョン反応を検知すればよい。
質中の核酸の配列の検出は、例えば、検体から採取した
試料物質から核酸成分の抽出を行った後、前記試料核酸
とプローブ固定化チップとを接触させ、プローブ固定化
チップ上のプローブと試料核酸とのハイブリダイゼーシ
ョン反応を検知すればよい。
【0054】前記プローブ固定化チップ上のプローブと
試料中の核酸成分とのハイブリダイゼーション反応を検
知するには、主に、(1)標識物質を用いる方法、
(2)電気化学的方法の2種類が考えられる。
試料中の核酸成分とのハイブリダイゼーション反応を検
知するには、主に、(1)標識物質を用いる方法、
(2)電気化学的方法の2種類が考えられる。
【0055】(1)の標識物質を用いる方法の場合に
は、試料核酸は、予めFITC、Cy3、Cy5若しく
はローダミンなどの蛍光色素、またはビオチン、ハプテ
ン、オキシダーゼ若しくはホスファターゼ等の酵素、ま
たはフェロセン若しくはキノン類等の電気化学的に活性
な物質で標識してもよい。或いは前述した物質で標識し
たセカンドプローブを用いることで検出を行ってもよ
い。複数の標識物質を同時に使用してもよい。
は、試料核酸は、予めFITC、Cy3、Cy5若しく
はローダミンなどの蛍光色素、またはビオチン、ハプテ
ン、オキシダーゼ若しくはホスファターゼ等の酵素、ま
たはフェロセン若しくはキノン類等の電気化学的に活性
な物質で標識してもよい。或いは前述した物質で標識し
たセカンドプローブを用いることで検出を行ってもよ
い。複数の標識物質を同時に使用してもよい。
【0056】(2)の電気化学的方法の場合、プローブ
を固定化する基体として導電性物質を用い、プローブ固
定化チップを電極として使用する。この電極を用いたハ
イブリダイゼーション反応の存在の検出は他の一般的な
電気化学的検出法と同じように、この電極の他に、対極
や参照極を使用してよい。参照極を配置する場合、例え
ば、銀/塩化銀電極や水銀/塩化水銀電極などの一般的
な参照極を使用し得る。異なる塩基配列を有するプロー
ブは、それぞれ別々の異なる導電性基体に固定化して同
一の基板などに配設されたチップを構成してよい。これ
により精度の高い測定を行うことが可能である。その場
合、各電極から得られる電気化学的信号がどのプローブ
に対応したものであるのか検知する。
を固定化する基体として導電性物質を用い、プローブ固
定化チップを電極として使用する。この電極を用いたハ
イブリダイゼーション反応の存在の検出は他の一般的な
電気化学的検出法と同じように、この電極の他に、対極
や参照極を使用してよい。参照極を配置する場合、例え
ば、銀/塩化銀電極や水銀/塩化水銀電極などの一般的
な参照極を使用し得る。異なる塩基配列を有するプロー
ブは、それぞれ別々の異なる導電性基体に固定化して同
一の基板などに配設されたチップを構成してよい。これ
により精度の高い測定を行うことが可能である。その場
合、各電極から得られる電気化学的信号がどのプローブ
に対応したものであるのか検知する。
【0057】試料物質から抽出した核酸成分とプローブ
固定化チップに固定化されたプローブとのハイブリダイ
ゼーション反応は、例えば、以下のように行うことが望
ましい。即ち、ハイブリダイゼーション反応溶液は、イ
オン強度0.01〜5の範囲で、pH5〜10の範囲の
緩衝液中で行う。この溶液中にはハイブリダイゼーショ
ン促進剤である硫酸デキストラン、並びに、サケ精子D
NA、牛胸腺DNA、EDTAおよび界面活性剤などを
添加してもよい。ここに抽出した核酸成分を添加し、9
0℃以上で熱変性させればよい。プローブ固定化チップ
の挿入は、変性直後、或いは0℃に急冷後に行ってよ
い。また、基体上に液を滴下することでハイブリダイゼ
ーション反応を行うことも可能である。反応中は、撹
拌、或いは振とうなどの操作で反応速度を高めてもよ
い。反応温度は、例えば、10℃〜90℃の範囲で、反
応時間は1分以上1晩程度で行えばよい。ハイブリダイ
ゼーション反応後、電極を取り出し洗浄を行う。洗浄に
は、例えば、イオン強度0.01〜5の範囲で、pH5
〜10の範囲の緩衝液を用いればよい。
固定化チップに固定化されたプローブとのハイブリダイ
ゼーション反応は、例えば、以下のように行うことが望
ましい。即ち、ハイブリダイゼーション反応溶液は、イ
オン強度0.01〜5の範囲で、pH5〜10の範囲の
緩衝液中で行う。この溶液中にはハイブリダイゼーショ
ン促進剤である硫酸デキストラン、並びに、サケ精子D
NA、牛胸腺DNA、EDTAおよび界面活性剤などを
添加してもよい。ここに抽出した核酸成分を添加し、9
0℃以上で熱変性させればよい。プローブ固定化チップ
の挿入は、変性直後、或いは0℃に急冷後に行ってよ
い。また、基体上に液を滴下することでハイブリダイゼ
ーション反応を行うことも可能である。反応中は、撹
拌、或いは振とうなどの操作で反応速度を高めてもよ
い。反応温度は、例えば、10℃〜90℃の範囲で、反
応時間は1分以上1晩程度で行えばよい。ハイブリダイ
ゼーション反応後、電極を取り出し洗浄を行う。洗浄に
は、例えば、イオン強度0.01〜5の範囲で、pH5
〜10の範囲の緩衝液を用いればよい。
【0058】(1)の標識物質を用いる方法の場合、ハ
イブリダイゼーション反応の検出は、標識の種類に応じ
た適宜の検出装置を用いて、試料中の標識された塩基配
列又は2次プローブ中の標識を検出することによって行
えばよい。標識が蛍光物質の場合には、例えば、蛍光検
出器を用いて標識を検出すればよい。
イブリダイゼーション反応の検出は、標識の種類に応じ
た適宜の検出装置を用いて、試料中の標識された塩基配
列又は2次プローブ中の標識を検出することによって行
えばよい。標識が蛍光物質の場合には、例えば、蛍光検
出器を用いて標識を検出すればよい。
【0059】(2)の電気化学的方法の場合、以下のよ
うな手順で検出を行えばよい。基体は洗浄後、電極表面
に形成した二本鎖部分に選択的に結合する二本鎖認識体
を作用させ、電気化学的な測定を行えばよい。ここで用
いられる二本鎖認識体は特に限定されるものではない
が、例えば、ヘキスト33258、アクリジンオレン
ジ、キナクリン、ドウノマイシン、メタロインターカレ
ーター、ビスアクリジン等のビスインターカレーター、
トリスインターカレーターおよびポリインターカレータ
ー等を用いることが可能である。更に、これらのインタ
ーカレーターを電気化学的に活性な金属錯体、例えば、
フェロセン、ビオロゲン等で修飾しておくことも可能で
ある。DNA結合物質の濃度は、その種類によって異な
るが、一般的には1ng/mL〜1mg/mLの範囲で
使用する。この際には、イオン強度0.001〜5の範
囲で、pH5〜10の範囲の緩衝液を用いればよい。電
極を二本鎖認識体と反応させた後、洗浄し、電気化学的
な測定を行えばよい。
うな手順で検出を行えばよい。基体は洗浄後、電極表面
に形成した二本鎖部分に選択的に結合する二本鎖認識体
を作用させ、電気化学的な測定を行えばよい。ここで用
いられる二本鎖認識体は特に限定されるものではない
が、例えば、ヘキスト33258、アクリジンオレン
ジ、キナクリン、ドウノマイシン、メタロインターカレ
ーター、ビスアクリジン等のビスインターカレーター、
トリスインターカレーターおよびポリインターカレータ
ー等を用いることが可能である。更に、これらのインタ
ーカレーターを電気化学的に活性な金属錯体、例えば、
フェロセン、ビオロゲン等で修飾しておくことも可能で
ある。DNA結合物質の濃度は、その種類によって異な
るが、一般的には1ng/mL〜1mg/mLの範囲で
使用する。この際には、イオン強度0.001〜5の範
囲で、pH5〜10の範囲の緩衝液を用いればよい。電
極を二本鎖認識体と反応させた後、洗浄し、電気化学的
な測定を行えばよい。
【0060】電気化学的な測定では、二本鎖認識体が電
気化学的に反応する電位以上の電位を印加し、二本鎖認
識体に由来する反応電流値を測定すればよい。この際、
電位は定速で掃引するか、或いはパルスで印加するか、
或いは定電位を印加することができる。測定には、例え
ば、ポテンショスタット、デジタルマルチメーターおよ
びファンクションジェネレーター等の装置を用いて電
流、電圧を制御してもよい。得られた電流値を基に、検
量線から標的核酸の濃度が算出され得る。
気化学的に反応する電位以上の電位を印加し、二本鎖認
識体に由来する反応電流値を測定すればよい。この際、
電位は定速で掃引するか、或いはパルスで印加するか、
或いは定電位を印加することができる。測定には、例え
ば、ポテンショスタット、デジタルマルチメーターおよ
びファンクションジェネレーター等の装置を用いて電
流、電圧を制御してもよい。得られた電流値を基に、検
量線から標的核酸の濃度が算出され得る。
【0061】電極を用いた塩基配列検出装置は、例え
ば、核酸抽出部、核酸反応部、二本鎖認識体反応部、電
気化学測定部および洗浄部等から構成される。
ば、核酸抽出部、核酸反応部、二本鎖認識体反応部、電
気化学測定部および洗浄部等から構成される。
【0062】また、電気化学的な手法に基づくプローブ
固定化チップの他の例は、例えば、以下の文献に開示さ
れている(Hashimoto et al. 199
4,Wang et al. 1998)。この文献は
引用することにより本明細書に組み込まれる。
固定化チップの他の例は、例えば、以下の文献に開示さ
れている(Hashimoto et al. 199
4,Wang et al. 1998)。この文献は
引用することにより本明細書に組み込まれる。
【0063】(A) 蛍光検出法により検出されるプロ
ーブ固定化チップの作製 上述した本発明に従う核酸検出用プローブを基板に固定
化する。基板は、例えば、ガラス基板およびシリコン基
板等、従来用いられる何れの基板も使用することが可能
である。固定化手段は、スポッター等を使用する手段、
一般的な半導体技術を使用した手段等、当業者にそれ自
身公知の手段を用いて固定することが可能である。
ーブ固定化チップの作製 上述した本発明に従う核酸検出用プローブを基板に固定
化する。基板は、例えば、ガラス基板およびシリコン基
板等、従来用いられる何れの基板も使用することが可能
である。固定化手段は、スポッター等を使用する手段、
一般的な半導体技術を使用した手段等、当業者にそれ自
身公知の手段を用いて固定することが可能である。
【0064】(B)電気化学的方法により検出されるプ
ローブ固定化チップの作製 上述した本発明に従う核酸検出用プローブを、基板、例
えば、電極基板、に共有結合、イオン結合、物理吸着ま
たは化学吸着等によって固定化する。電気化学的方法に
より検出されるプローブ固定化チップの例は、平成8年
10月24日に登録された特許番号第2573443号
の自動遺伝子検出装置等であるが、これに限られるもの
ではない。当該文献は引用することによりここに組み込
まれる。
ローブ固定化チップの作製 上述した本発明に従う核酸検出用プローブを、基板、例
えば、電極基板、に共有結合、イオン結合、物理吸着ま
たは化学吸着等によって固定化する。電気化学的方法に
より検出されるプローブ固定化チップの例は、平成8年
10月24日に登録された特許番号第2573443号
の自動遺伝子検出装置等であるが、これに限られるもの
ではない。当該文献は引用することによりここに組み込
まれる。
【0065】本発明の更なる1側面に従うと、基板と、
前記基板に固定化された上述した本発明に従う核酸検出
用プローブとを具備するプローブ固定化チップを提供す
るものであり、そのようなプローブ固定化チップも本発
明の範囲内にある。
前記基板に固定化された上述した本発明に従う核酸検出
用プローブとを具備するプローブ固定化チップを提供す
るものであり、そのようなプローブ固定化チップも本発
明の範囲内にある。
【0066】本発明の1側面に従うと、上述の化学物質
の内分泌撹乱性を検出するための核酸またはその一部
は、化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸検出
用プローブとして使用することが可能である。そのよう
な化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用
プローブも本発明の範囲内にある。
の内分泌撹乱性を検出するための核酸またはその一部
は、化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸検出
用プローブとして使用することが可能である。そのよう
な化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用
プローブも本発明の範囲内にある。
【0067】以下に本発明の態様に従うプローブ固定化
チップの例を示す。
チップの例を示す。
【0068】第1の例
図4に本発明の態様に従い使用され得るプローブ固定化
基体の第1の例を模式的に示した。第1の例であるプロ
ーブ固定化基体は、基体16とその表面に存在する1以
上の固定化領域15に夫々1以上で固定化されたプロー
ブ11から14を具備する(図4)。本発明の態様に従
うと、少なくとも、例えば、プローブ11として第1の
プローブを固定化し、プローブ12として第2のプロー
ブを固定化すればよい。
基体の第1の例を模式的に示した。第1の例であるプロ
ーブ固定化基体は、基体16とその表面に存在する1以
上の固定化領域15に夫々1以上で固定化されたプロー
ブ11から14を具備する(図4)。本発明の態様に従
うと、少なくとも、例えば、プローブ11として第1の
プローブを固定化し、プローブ12として第2のプロー
ブを固定化すればよい。
【0069】このようなプローブ固定化基体は、例え
ば、それ自身公知の手段によりシリコン基板などの基体
に対してプローブを固定化することにより製造すること
が可能である。
ば、それ自身公知の手段によりシリコン基板などの基体
に対してプローブを固定化することにより製造すること
が可能である。
【0070】本発明の態様に従うと、1つの基体に配置
する固定化領域15の数も、そこに固定化されるプロー
ブの数もこれに限定するものではなく、所望に応じて変
更してよい。また、複数種類の塩基配列をプローブとし
て1つの基体に配置してもよい。複数および/または複
数種類のプローブの基体への固相パターンは、当業者が
必要に応じて適宜設計変更することが可能である。この
ようなプローブ固定化基体は本発明の範囲内である。
する固定化領域15の数も、そこに固定化されるプロー
ブの数もこれに限定するものではなく、所望に応じて変
更してよい。また、複数種類の塩基配列をプローブとし
て1つの基体に配置してもよい。複数および/または複
数種類のプローブの基体への固相パターンは、当業者が
必要に応じて適宜設計変更することが可能である。この
ようなプローブ固定化基体は本発明の範囲内である。
【0071】第2の例
図5を用いて、本発明の態様において使用され得るプロ
ーブ固定化基体の第2の例を説明する。第2例であるプ
ローブ固定化基体は、基体22に具備された1以上の電
極23に夫々1以上で固定化されたプローブ17から2
0を具備する(図5)。電極23は、電気的情報を取り
出すためのパット24に接続されている。
ーブ固定化基体の第2の例を説明する。第2例であるプ
ローブ固定化基体は、基体22に具備された1以上の電
極23に夫々1以上で固定化されたプローブ17から2
0を具備する(図5)。電極23は、電気的情報を取り
出すためのパット24に接続されている。
【0072】このようなプローブ固定化基体は、例え
ば、それ自身公知の手段によりシリコン基板などの基体
に電極を配置し、その電極表面に対してプローブを固定
化することにより製造することが可能である。本発明の
態様に従うと、少なくとも、例えば、プローブ17とし
て第1のプローブを固定化し、プローブ18として第2
のプローブを固定化すればよい。
ば、それ自身公知の手段によりシリコン基板などの基体
に電極を配置し、その電極表面に対してプローブを固定
化することにより製造することが可能である。本発明の
態様に従うと、少なくとも、例えば、プローブ17とし
て第1のプローブを固定化し、プローブ18として第2
のプローブを固定化すればよい。
【0073】本態様においては、電極の数を5としたが
1つの基体に配置する電極の数はこれに限定するもので
はない。また、電極の配置パターンも図5に示したもの
に限定されるものではなく、当業者が必要に応じて適宜
設計変更することが可能である。必要に応じて参照電極
および対極を設けてもよい。そのようなプローブ固定化
基体も本発明の範囲内である。
1つの基体に配置する電極の数はこれに限定するもので
はない。また、電極の配置パターンも図5に示したもの
に限定されるものではなく、当業者が必要に応じて適宜
設計変更することが可能である。必要に応じて参照電極
および対極を設けてもよい。そのようなプローブ固定化
基体も本発明の範囲内である。
【0074】上記の例に記載するような蛍光検出を行う
ためのプローブ固定化基体の場合は、上記の何れかの基
体に対してプローブを固定化すればよい。また、上記の
第2の例に記載するような電気化学的検出を行うための
プローブ固定化基体の場合は、上記の何れかの基体に電
気化学的な検出が可能であるように電極を配置し、その
電極上にプローブを固定化すればよい。
ためのプローブ固定化基体の場合は、上記の何れかの基
体に対してプローブを固定化すればよい。また、上記の
第2の例に記載するような電気化学的検出を行うための
プローブ固定化基体の場合は、上記の何れかの基体に電
気化学的な検出が可能であるように電極を配置し、その
電極上にプローブを固定化すればよい。
【0075】V.核酸検出用プライマー
本発明の1側面に従うと、上述の化学物質の内分泌撹乱
性を検出するための核酸またはその一部は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーと
して使用することも可能である。そのような化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーも
本発明の範囲内にある。
性を検出するための核酸またはその一部は、化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーと
して使用することも可能である。そのような化学物質の
内分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーも
本発明の範囲内にある。
【0076】本発明に従って、化学物質の内分泌撹乱性
を検出するために好ましい核酸検出用プライマーは、配
列番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
5に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号1
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号1
5に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配
列番号23に記載の塩基配列およびその相補的配列、配
列番号27に記載の塩基配列およびその相補配列、配列
番号28に記載の塩基配列およびその相補配列からなる
群より選択される塩基配列に含まれる連続した15塩基
から30塩基よりなる核酸を含む核酸検出用プライマー
であってよい。
を検出するために好ましい核酸検出用プライマーは、配
列番号1に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列
番号3に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番
号4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号
5に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号1
4に記載の塩基配列およびその相補的配列、配列番号1
5に記載の塩基配列およびその相補的配列、並びに、配
列番号23に記載の塩基配列およびその相補的配列、配
列番号27に記載の塩基配列およびその相補配列、配列
番号28に記載の塩基配列およびその相補配列からなる
群より選択される塩基配列に含まれる連続した15塩基
から30塩基よりなる核酸を含む核酸検出用プライマー
であってよい。
【0077】また、化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ための核酸検出用プライマーは、配列番号1に記載の塩
基配列と85%から100%で相同性を有する核酸配列
およびその相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列と
85%から100%で相同性を有する核酸配列およびそ
の相補的配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号5に記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列、配列番号14に記
載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、配列番号15に記
載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、並びに配列番号2
3に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同
性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号2
7に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、配列番号28に記
載の塩基配列と85%から100%で相同性を有する核
酸配列およびその相補的配列からなる群より選択される
塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩基より
なる核酸を含んでいてもよい。
ための核酸検出用プライマーは、配列番号1に記載の塩
基配列と85%から100%で相同性を有する核酸配列
およびその相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列と
85%から100%で相同性を有する核酸配列およびそ
の相補的配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する核酸配列およびその
相補的配列、配列番号5に記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する核酸配列、配列番号14に記
載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、配列番号15に記
載の記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、並びに配列番号2
3に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相同
性を有する核酸配列およびその相補的配列、配列番号2
7に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有
する核酸配列およびその相補的配列、配列番号28に記
載の塩基配列と85%から100%で相同性を有する核
酸配列およびその相補的配列からなる群より選択される
塩基配列に含まれる連続した15塩基から30塩基より
なる核酸を含んでいてもよい。
【0078】また更に、化学物質の内分泌撹乱性を検出
するための核酸検出用プライマーの好ましい例は、ND
83−3を検出するためには、配列番号6、配列番号
7、配列番号10、配列番号11に記載の塩基配列によ
り示される核酸が含まれる。また、より好ましくは配列
番号6と配列番号7、配列番号10と配列番号11を、
それぞれ、フォワードプライマーとリバースプライマー
として使用する。
するための核酸検出用プライマーの好ましい例は、ND
83−3を検出するためには、配列番号6、配列番号
7、配列番号10、配列番号11に記載の塩基配列によ
り示される核酸が含まれる。また、より好ましくは配列
番号6と配列番号7、配列番号10と配列番号11を、
それぞれ、フォワードプライマーとリバースプライマー
として使用する。
【0079】ND83−4を検出するために好ましく
は、配列番号8、配列番号9、配列番号12および配列
番号13に記載の塩基配列により示される核酸が含まれ
る。また、より好ましくは配列番号8と配列番号9、配
列番号12と配列番号13を、それぞれフォワードプラ
イマーとリバースプライマーとして使用する。
は、配列番号8、配列番号9、配列番号12および配列
番号13に記載の塩基配列により示される核酸が含まれ
る。また、より好ましくは配列番号8と配列番号9、配
列番号12と配列番号13を、それぞれフォワードプラ
イマーとリバースプライマーとして使用する。
【0080】ND118−1を検出するために好ましく
は、配列番号17、配列番号18に記載の塩基配列によ
り示される核酸が含まれる。より好ましくは配列番号1
7と配列番号18をフォワードプライマーとリバースプ
ライマーとして使用する。
は、配列番号17、配列番号18に記載の塩基配列によ
り示される核酸が含まれる。より好ましくは配列番号1
7と配列番号18をフォワードプライマーとリバースプ
ライマーとして使用する。
【0081】ND818−2を検出するために好ましく
は、配列番号19、配列番号20、配列番号21および
配列番号22に記載の塩基配列により示される核酸が含
まれる。また、より好ましくは配列番号19と配列番号
20、および配列番号21と配列番号22を、それぞれ
フォワードプライマーとリバースプライマーとして使用
する。
は、配列番号19、配列番号20、配列番号21および
配列番号22に記載の塩基配列により示される核酸が含
まれる。また、より好ましくは配列番号19と配列番号
20、および配列番号21と配列番号22を、それぞれ
フォワードプライマーとリバースプライマーとして使用
する。
【0082】ND87−3を検出するために好ましく
は、配列番号25および配列番号26に記載の塩基配列
により示される核酸が含まれる。より好ましくは配列番
号25と配列番号26を、それぞれフォワードプライマ
ーとリバースプライマーとして使用する。
は、配列番号25および配列番号26に記載の塩基配列
により示される核酸が含まれる。より好ましくは配列番
号25と配列番号26を、それぞれフォワードプライマ
ーとリバースプライマーとして使用する。
【0083】本発明の1側面に従うと、化学物質の内分
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーは、所
望の標識物質を含んでいてもよい。また、化学物質の内
分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーは、
上述の核酸に加えて更なる配列を含んでいてもよい。
泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーは、所
望の標識物質を含んでいてもよい。また、化学物質の内
分泌撹乱性を検出するための核酸検出用プライマーは、
上述の核酸に加えて更なる配列を含んでいてもよい。
【0084】VI.核酸検出用プライマーを用いた内分
泌撹乱性の検出方法 このような核酸検出用プライマーを用いることにより、
次のような手順によって化学物質の内分泌撹乱性を検出
することが可能である。まず、検査対象である化学物質
を検体に作用させる。次に、前記検体から検体核酸を調
製する。得られた検体核酸を上記の本発明に従うプライ
マーと、核酸増幅用酵素を用いて増幅する。次に、得ら
れた増幅産物と、前記化学物質を作用させないこと以外
は同様の条件で処理された検体から採取された対照核酸
から得た対照増幅産物とを比較すればよい。
泌撹乱性の検出方法 このような核酸検出用プライマーを用いることにより、
次のような手順によって化学物質の内分泌撹乱性を検出
することが可能である。まず、検査対象である化学物質
を検体に作用させる。次に、前記検体から検体核酸を調
製する。得られた検体核酸を上記の本発明に従うプライ
マーと、核酸増幅用酵素を用いて増幅する。次に、得ら
れた増幅産物と、前記化学物質を作用させないこと以外
は同様の条件で処理された検体から採取された対照核酸
から得た対照増幅産物とを比較すればよい。
【0085】ここで使用される「検体」の語は、検査対
象である化学物質を作用させるための生体を指す。例え
ば、マウス、ラット、ネコ、イヌ、ウシ、ヤギ、ブタ、
ヒツジまたはサルなどの生物個体であってもよく、また
はヒトを含む動物生体に由来する培養細胞および組織で
あってもよい。
象である化学物質を作用させるための生体を指す。例え
ば、マウス、ラット、ネコ、イヌ、ウシ、ヤギ、ブタ、
ヒツジまたはサルなどの生物個体であってもよく、また
はヒトを含む動物生体に由来する培養細胞および組織で
あってもよい。
【0086】また、検体として生物個体を使用する場合
には、検体核酸は、個体から得た血液、血清、リンパ液
および組織などから調製すればよい。その場合、必要に
応じて、ホモジネートおよび抽出等の必要な任意の前処
理を行ってもよく、このような前処理は、対象となる試
料に応じて当業者によって選択され得るであろう。また
検体が培養細胞または組織である場合、同様に前処理を
行ってから以下のような検体核酸の抽出を行っても、前
処理なしに抽出を行ってもよい。
には、検体核酸は、個体から得た血液、血清、リンパ液
および組織などから調製すればよい。その場合、必要に
応じて、ホモジネートおよび抽出等の必要な任意の前処
理を行ってもよく、このような前処理は、対象となる試
料に応じて当業者によって選択され得るであろう。また
検体が培養細胞または組織である場合、同様に前処理を
行ってから以下のような検体核酸の抽出を行っても、前
処理なしに抽出を行ってもよい。
【0087】検体核酸は、使用した検体からそれ自身公
知の手段により調製すればよい。ここで使用される「検
体核酸」の語は、一般的には対象において発現されるm
RNAまたは全RNAを指す。対象から被検核酸を得る
工程はそれ自身公知の手段により行うことが可能であ
る。例えば、市販のキットを使用しても、オリゴdTカ
ラムなどの担体を用いる固液抽出法を使用しても、例え
ば、フェノールー−クロロホルム法等の液−液抽出法を
使用してもよいが、これに限定されるのもではない。
知の手段により調製すればよい。ここで使用される「検
体核酸」の語は、一般的には対象において発現されるm
RNAまたは全RNAを指す。対象から被検核酸を得る
工程はそれ自身公知の手段により行うことが可能であ
る。例えば、市販のキットを使用しても、オリゴdTカ
ラムなどの担体を用いる固液抽出法を使用しても、例え
ば、フェノールー−クロロホルム法等の液−液抽出法を
使用してもよいが、これに限定されるのもではない。
【0088】ここで使用され得る核酸増幅用酵素は、核
酸を増幅するために使用される何れかの酵素であればよ
い。例えば、DNAポリメラーゼおよび逆転写活性を有
するDNAポリメラーゼなどであってよい。
酸を増幅するために使用される何れかの酵素であればよ
い。例えば、DNAポリメラーゼおよび逆転写活性を有
するDNAポリメラーゼなどであってよい。
【0089】VI.内分泌撹乱性によりその発現量が特
異的に影響を受けるペプチド 本発明の1側面に従うと、検体におけるその発現量が内
分泌撹乱性によって特異的に影響される遺伝子に由来す
るペプチドも提供される。そのようなペプチドも化学物
質の内分泌撹乱性の検出に利用することが可能である。
異的に影響を受けるペプチド 本発明の1側面に従うと、検体におけるその発現量が内
分泌撹乱性によって特異的に影響される遺伝子に由来す
るペプチドも提供される。そのようなペプチドも化学物
質の内分泌撹乱性の検出に利用することが可能である。
【0090】ここで使用される「ペプチド」の語は、複
数のアミノ酸同士がペプチド結合により互いに連結され
たものを示し、少数のアミノ酸がペプチド結合で繋がっ
たペプチド、多数のアミノ酸がペプチド結合で繋がった
ポリペプチド、および単一または複数のポリペプチドか
らなる蛋白質を総括的に指し示す。
数のアミノ酸同士がペプチド結合により互いに連結され
たものを示し、少数のアミノ酸がペプチド結合で繋がっ
たペプチド、多数のアミノ酸がペプチド結合で繋がった
ポリペプチド、および単一または複数のポリペプチドか
らなる蛋白質を総括的に指し示す。
【0091】本発明に従うと、化学物質の内分泌撹乱性
を検出するためのペプチドは、配列番号1に記載の塩基
配列、配列番号3に記載の塩基配列、配列番号15に記
載の塩基配列、並びに、配列番号23に記載の塩基配列
からなる群より選択される塩基配列がコードする配列番
号2、配列番号16並びに配列番号24のペプチドであ
ればよい。
を検出するためのペプチドは、配列番号1に記載の塩基
配列、配列番号3に記載の塩基配列、配列番号15に記
載の塩基配列、並びに、配列番号23に記載の塩基配列
からなる群より選択される塩基配列がコードする配列番
号2、配列番号16並びに配列番号24のペプチドであ
ればよい。
【0092】また、配列番号1に記載の塩基配列と85
%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号3
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る塩基配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と85
%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号5
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る塩基配列、配列番号14に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号
15に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相
同性を有する塩基配列、並びに配列番号23に記載の記
載の塩基配列と85%から100%で相同性を有する塩
基配列からなる群より選択される塩基配列で示される核
酸がコードするペプチドであってもよい。
%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号3
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る塩基配列、配列番号4に記載の記載の塩基配列と85
%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号5
に記載の塩基配列と85%から100%で相同性を有す
る塩基配列、配列番号14に記載の記載の塩基配列と8
5%から100%で相同性を有する塩基配列、配列番号
15に記載の記載の塩基配列と85%から100%で相
同性を有する塩基配列、並びに配列番号23に記載の記
載の塩基配列と85%から100%で相同性を有する塩
基配列からなる群より選択される塩基配列で示される核
酸がコードするペプチドであってもよい。
【0093】更に、化学物質の内分泌撹乱性を検出する
ためのペプチドは、上記のペプチドを含む蛋白質であっ
てもよい。
ためのペプチドは、上記のペプチドを含む蛋白質であっ
てもよい。
【0094】(1)ND83−3がコードするペプチド
の作製 本発明の1側面に従う化学物質の内分泌撹乱性を検出す
るためのペプチドは、例えば、以下のように作製するこ
とが可能である。
の作製 本発明の1側面に従う化学物質の内分泌撹乱性を検出す
るためのペプチドは、例えば、以下のように作製するこ
とが可能である。
【0095】ND83−3がコードするペプチドは、配
列番号1によって提供される核酸配列を用いて組換えD
NA技術を使用して取得することが可能である。例え
ば、配列番号1に含まれるペプチドの翻訳領域をpGE
X、pET、pYESなどの公知の発現ベクターに組み
換えることによって、大腸菌などの原核生物や酵母、昆
虫細胞、哺乳類細胞および植物細胞などの真核細胞で、
ND83−3がコードするペプチドを大量に作製するこ
とができる。このとき得られるペプチドは発現ベクター
のシステムによっては他のタンパク質との融合ペプチド
であってもよい。
列番号1によって提供される核酸配列を用いて組換えD
NA技術を使用して取得することが可能である。例え
ば、配列番号1に含まれるペプチドの翻訳領域をpGE
X、pET、pYESなどの公知の発現ベクターに組み
換えることによって、大腸菌などの原核生物や酵母、昆
虫細胞、哺乳類細胞および植物細胞などの真核細胞で、
ND83−3がコードするペプチドを大量に作製するこ
とができる。このとき得られるペプチドは発現ベクター
のシステムによっては他のタンパク質との融合ペプチド
であってもよい。
【0096】或いは、配列番号1で提供される核酸配列
をpBlueScriptIIなどのベクターに組み込
みインビトロ転写によってRNAを調製し、これを鋳型
としてインビトロ翻訳によってND83−3がコードす
るペプチドを作製してもよい。また、配列番号1によっ
て提供されるアミノ酸配列にもとづき化学合成によって
ペプチドを合成することもできる。
をpBlueScriptIIなどのベクターに組み込
みインビトロ転写によってRNAを調製し、これを鋳型
としてインビトロ翻訳によってND83−3がコードす
るペプチドを作製してもよい。また、配列番号1によっ
て提供されるアミノ酸配列にもとづき化学合成によって
ペプチドを合成することもできる。
【0097】また、同様にND818−2およびND8
7−3がコードするペプチドを、それぞれ、配列番号1
5および配列番号23に示される塩基配列を基に作製す
ることが可能である。
7−3がコードするペプチドを、それぞれ、配列番号1
5および配列番号23に示される塩基配列を基に作製す
ることが可能である。
【0098】また、他のそれ自身公知の方法により、配
列番号1、配列番号3、配列番号15および配列番号2
3を基にして所望のペプチドを作製することも可能であ
る。このようなペプチドも本発明の範囲内にある。
列番号1、配列番号3、配列番号15および配列番号2
3を基にして所望のペプチドを作製することも可能であ
る。このようなペプチドも本発明の範囲内にある。
【0099】配列番号2、配列番号16および配列番号
24に示されるアミノ酸配列は、上記のようにして得ら
れるペプチドの例である。
24に示されるアミノ酸配列は、上記のようにして得ら
れるペプチドの例である。
【0100】また、更に、本発明の更なる側面によれ
ば、上述のペプチドを認識するポリクローナル抗体およ
びモノクローナル抗体も提供される。例えば、そのよう
なポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体は、そ
れ自身公知の方法により作製することが可能である。ポ
リクローナル抗体およびモノクローナル抗体をそれぞれ
作製する方法の例を以下に示す。
ば、上述のペプチドを認識するポリクローナル抗体およ
びモノクローナル抗体も提供される。例えば、そのよう
なポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体は、そ
れ自身公知の方法により作製することが可能である。ポ
リクローナル抗体およびモノクローナル抗体をそれぞれ
作製する方法の例を以下に示す。
【0101】(2)ペプチドを認識するポリクローナル
抗体の作製 上記(1)の「ND83−3がコードするペプチドの作
製」に記載の方法により取得したペプチドを抗原とし
て、たとえばウサギ、ヤギ、ラット、マウス、ハムスタ
ーなどに投与する。抗原として投与するペプチドは、牛
チログロブリンなどのキャリア蛋白に共有結合させたも
のを用いてもよい。抗原の投与は、1回目の投与の後1
〜2週間おきに3〜10回行い、各投与後3〜7日目に
採血して、血清が免疫に用いた抗原と反応することを酵
素免疫測定法などで確認する。血清が充分な抗体価を示
した動物から血清を取得し、分離、精製することでポリ
クローナル抗体を取得する。抗原として使用したペプチ
ドが他のタンパク質との融合ペプチドであった場合に
は、たとえばペプチドに融合したタンパク質部分を固定
化したアフィニティーカラムなどを使用してペプチド部
以外を認識する抗体を除く必要がある。
抗体の作製 上記(1)の「ND83−3がコードするペプチドの作
製」に記載の方法により取得したペプチドを抗原とし
て、たとえばウサギ、ヤギ、ラット、マウス、ハムスタ
ーなどに投与する。抗原として投与するペプチドは、牛
チログロブリンなどのキャリア蛋白に共有結合させたも
のを用いてもよい。抗原の投与は、1回目の投与の後1
〜2週間おきに3〜10回行い、各投与後3〜7日目に
採血して、血清が免疫に用いた抗原と反応することを酵
素免疫測定法などで確認する。血清が充分な抗体価を示
した動物から血清を取得し、分離、精製することでポリ
クローナル抗体を取得する。抗原として使用したペプチ
ドが他のタンパク質との融合ペプチドであった場合に
は、たとえばペプチドに融合したタンパク質部分を固定
化したアフィニティーカラムなどを使用してペプチド部
以外を認識する抗体を除く必要がある。
【0102】(3)ペプチドを認識するモノクローナル
抗体の作製 (1)の「ND83−3がコードするペプチドの作製」
で取得したペプチドを抗原として免疫したマウスの脾臓
細胞と骨髄腫細胞を細胞融合して、ハイブリドーマ群を
作製する。(1)で作製したペプチドを、例えば、酵素
免疫測定法用のマイクロタイタープレートなどに固定化
し、アッセイプレートを作製する。作製したハイブリド
ーマ群から、上記のアッセイプレートを使用して、ペプ
チドを特異的に認識する抗体を産生するハイブリドーマ
のみを選定する。抗原として使用したペプチドが他のタ
ンパク質との融合ペプチドであった場合には、ペプチド
に融合したタンパク質部分のみを固定化したアッセイプ
レートを作製して、融合した蛋白質部分を認識する抗体
を除く必要がある。得られたハイブリドーマは、例えば
限界希釈法などでクローニングした後、マウス腹腔に注
射して、該ハイブリドーマが産生するモノクローナル抗
体を得る。
抗体の作製 (1)の「ND83−3がコードするペプチドの作製」
で取得したペプチドを抗原として免疫したマウスの脾臓
細胞と骨髄腫細胞を細胞融合して、ハイブリドーマ群を
作製する。(1)で作製したペプチドを、例えば、酵素
免疫測定法用のマイクロタイタープレートなどに固定化
し、アッセイプレートを作製する。作製したハイブリド
ーマ群から、上記のアッセイプレートを使用して、ペプ
チドを特異的に認識する抗体を産生するハイブリドーマ
のみを選定する。抗原として使用したペプチドが他のタ
ンパク質との融合ペプチドであった場合には、ペプチド
に融合したタンパク質部分のみを固定化したアッセイプ
レートを作製して、融合した蛋白質部分を認識する抗体
を除く必要がある。得られたハイブリドーマは、例えば
限界希釈法などでクローニングした後、マウス腹腔に注
射して、該ハイブリドーマが産生するモノクローナル抗
体を得る。
【0103】本発明の更なる側面に従うと、上述のペプ
チド並びにポリクローナル抗体およびモノクローナル抗
体からなる群より選択されたものを利用して、それに対
して特異的に結合する抗原を検出することによって、化
学物質の内分泌撹乱性を検出する方法も提供される。
チド並びにポリクローナル抗体およびモノクローナル抗
体からなる群より選択されたものを利用して、それに対
して特異的に結合する抗原を検出することによって、化
学物質の内分泌撹乱性を検出する方法も提供される。
【0104】ここで使用される「検体試料」の語は、検
体から採取された所望の試料であればよい。例えば、検
体が個体である場合、その個体から得た血液、血清、リ
ンパ液および組織などであってよく、また、培養細胞、
培養組織およびそれらの培養液であってもよい。また、
それらは必要に応じて、ホモジネートおよび抽出等の必
要な任意の前処理を行っておいてもよい。このような前
処理は、対象となる試料に応じて当業者によって選択さ
れ得るであろう。
体から採取された所望の試料であればよい。例えば、検
体が個体である場合、その個体から得た血液、血清、リ
ンパ液および組織などであってよく、また、培養細胞、
培養組織およびそれらの培養液であってもよい。また、
それらは必要に応じて、ホモジネートおよび抽出等の必
要な任意の前処理を行っておいてもよい。このような前
処理は、対象となる試料に応じて当業者によって選択さ
れ得るであろう。
【0105】そのような方法は以下のように行うことと
が可能である。まず、検体に対して化学物質を作用さ
せ、その後に前記検体から検体試料を得る。次に、前記
検体試料と、前記ペプチドを認識するポリクローナル抗
体およびモノクローナル抗体からなる群より選択された
少なくとも1の検出用プローブを反応させる。反応後、
前記検出用プローブと標的物質との反応を検出するとに
より前記標的物質の存在を検出する。この検出によって
得られた検出結果と、検体に対して前記化合物を作用さ
せない場合の前記標的物質の存在の検出結果とを比較す
ることによって、前記化学物質の内分泌撹乱性を検出す
ることが可能になる。
が可能である。まず、検体に対して化学物質を作用さ
せ、その後に前記検体から検体試料を得る。次に、前記
検体試料と、前記ペプチドを認識するポリクローナル抗
体およびモノクローナル抗体からなる群より選択された
少なくとも1の検出用プローブを反応させる。反応後、
前記検出用プローブと標的物質との反応を検出するとに
より前記標的物質の存在を検出する。この検出によって
得られた検出結果と、検体に対して前記化合物を作用さ
せない場合の前記標的物質の存在の検出結果とを比較す
ることによって、前記化学物質の内分泌撹乱性を検出す
ることが可能になる。
【0106】このような検出は、上記の抗体を基体に固
相化することにより作製したプローブ固相化チップ(一
般的に、プロテインチップと称される)を用いて行うこ
とも可能である。これにより、そのようなペプチドを簡
便に検出することが可能になる。このようなプローブ固
相化チップも本発明の範囲内に含まれる。そのようなプ
ローブ固相化チップは以下のように作製することが可能
である。
相化することにより作製したプローブ固相化チップ(一
般的に、プロテインチップと称される)を用いて行うこ
とも可能である。これにより、そのようなペプチドを簡
便に検出することが可能になる。このようなプローブ固
相化チップも本発明の範囲内に含まれる。そのようなプ
ローブ固相化チップは以下のように作製することが可能
である。
【0107】(4)プロテインチップの作製
上記の(2)「ペプチドを認識するポリクローナル抗体
の作製」または(3)「ペプチドを認識するモノクロー
ナル抗体の作製」に記載した方法で得られた抗体を基板
上、例えばガラス基板上に市販のスポッタ−を用いて集
積化し、化学物質の内分泌撹乱性を検出することが可能
なプローブ固定化チップを作製できる。
の作製」または(3)「ペプチドを認識するモノクロー
ナル抗体の作製」に記載した方法で得られた抗体を基板
上、例えばガラス基板上に市販のスポッタ−を用いて集
積化し、化学物質の内分泌撹乱性を検出することが可能
なプローブ固定化チップを作製できる。
【0108】
【実施例】例1:TCDD応答性の高い遺伝子の検索
(1)Neuro2aの培養
まず、マウス神経芽細胞Neuro2aの培養に使用す
るためのトリヨードチロニン除去牛胎児血清を調製し
た。まず、陰イオン交換樹脂AG1−X8と牛胎児血清
とを、血清1mL当たり樹脂50mgの割合で混合し、
室温で5時間インキュベートした。続いて、1000×
gで10分間遠心して樹脂を除去した。続いて、新しい
前記樹脂を血清1mL当たり樹脂50mgの割合で添加
し、更に室温で18時間インキュベートした。その後、
1000×gおよび30,000×gでそれぞれ20分
間の遠心を行い、樹脂を完全に除去した。次に、0.2
2μm孔サイズのフィルターにより滅菌を行い、トリヨ
ードチロニン除去牛胎児血清を調製した。
るためのトリヨードチロニン除去牛胎児血清を調製し
た。まず、陰イオン交換樹脂AG1−X8と牛胎児血清
とを、血清1mL当たり樹脂50mgの割合で混合し、
室温で5時間インキュベートした。続いて、1000×
gで10分間遠心して樹脂を除去した。続いて、新しい
前記樹脂を血清1mL当たり樹脂50mgの割合で添加
し、更に室温で18時間インキュベートした。その後、
1000×gおよび30,000×gでそれぞれ20分
間の遠心を行い、樹脂を完全に除去した。次に、0.2
2μm孔サイズのフィルターにより滅菌を行い、トリヨ
ードチロニン除去牛胎児血清を調製した。
【0109】Neuro2aの培養に使用したDF培地
は、上記の方法により得られたトリヨードチロニン除去
牛胎児血清を10%で含むダルベッコMEM培地とハム
培地を1:1の割合で混合することにより調製した。
は、上記の方法により得られたトリヨードチロニン除去
牛胎児血清を10%で含むダルベッコMEM培地とハム
培地を1:1の割合で混合することにより調製した。
【0110】まず、Neuro2aを、DF培地中で3
7℃、5%二酸化炭素存在下で1日間培養した。次に、
30nMのトリヨードチロニンをその培養液に添加し、
37℃、5%二酸化炭素存在下で3日間培養した。この
培養の後、得られた細胞を2つの培養容器に分注するこ
とにより2つの区に分けた。片方の区には、2,3,7,8-テ
トラクロロ−ベンゾ−p−ジオキシン(2,3,7,8-tetrac
hloro-benzo-p-dioxin;以下、TCDDと称する)を終
濃度が10nMとなるように加えた(以下、これをTC
DD添加区と称する)。これに対してもう一方の区には
TCDDを加えなかった(以下、これをTCDD未添加
区と称する)。これら2つの区のNeuro2aを24
時間培養した。
7℃、5%二酸化炭素存在下で1日間培養した。次に、
30nMのトリヨードチロニンをその培養液に添加し、
37℃、5%二酸化炭素存在下で3日間培養した。この
培養の後、得られた細胞を2つの培養容器に分注するこ
とにより2つの区に分けた。片方の区には、2,3,7,8-テ
トラクロロ−ベンゾ−p−ジオキシン(2,3,7,8-tetrac
hloro-benzo-p-dioxin;以下、TCDDと称する)を終
濃度が10nMとなるように加えた(以下、これをTC
DD添加区と称する)。これに対してもう一方の区には
TCDDを加えなかった(以下、これをTCDD未添加
区と称する)。これら2つの区のNeuro2aを24
時間培養した。
【0111】(2)TCDD添加区およびTCDD未添
加区において発現された遺伝子の比較 上記(1)に記載の方法により培養した2つの条件の区
(TCDD添加区およびTCDD未添加区)の細胞にお
いて発現された遺伝子をディファレンシャル・ディスプ
レイ法を用いて比較した。
加区において発現された遺伝子の比較 上記(1)に記載の方法により培養した2つの条件の区
(TCDD添加区およびTCDD未添加区)の細胞にお
いて発現された遺伝子をディファレンシャル・ディスプ
レイ法を用いて比較した。
【0112】まず、上記(1)に記載の2つの区の細胞
から、それぞれ全RNAを抽出した。この抽出は、RN
A Extraction Kit(ファルマシア社
製)を用いて、付属のマニュアルに従って行った。この
抽出により得られた全RNAから、DNAを除去するた
めにDNaseIを処理した。その後、得られた溶液中
に含まれる全RNA量を分光光度計で測定し、1μL当
たりのRNAが250pmolとなるように濃度を調節
した。
から、それぞれ全RNAを抽出した。この抽出は、RN
A Extraction Kit(ファルマシア社
製)を用いて、付属のマニュアルに従って行った。この
抽出により得られた全RNAから、DNAを除去するた
めにDNaseIを処理した。その後、得られた溶液中
に含まれる全RNA量を分光光度計で測定し、1μL当
たりのRNAが250pmolとなるように濃度を調節
した。
【0113】蛍光ディファレンシャル・ディスプレイ法
は、Takara FDD KitFluoresce
in Version 1.1(宝酒造社製)を用い
て、付属のマニュアルに従って行った。
は、Takara FDD KitFluoresce
in Version 1.1(宝酒造社製)を用い
て、付属のマニュアルに従って行った。
【0114】全RNAからcDNAを合成するためのプ
ライマーには、アンカープライマーとして設計された前
記キット付属のDownstreem Primer
No.1およびNo.8、即ち、(dT)プライマーを
用いた。
ライマーには、アンカープライマーとして設計された前
記キット付属のDownstreem Primer
No.1およびNo.8、即ち、(dT)プライマーを
用いた。
【0115】PCRには、cDNA合成時と同じアンカ
ープライマー(即ち、Downstreem Prim
er No.1およびNo.8;これは(dT)プライ
マーである)を下流プライマーとして使用した。上流プ
ライマーには、キットに付属のランダムプライマーであ
るUpstream Primer No.1からN
o.24までの24種類のプライマーを使用した。
ープライマー(即ち、Downstreem Prim
er No.1およびNo.8;これは(dT)プライ
マーである)を下流プライマーとして使用した。上流プ
ライマーには、キットに付属のランダムプライマーであ
るUpstream Primer No.1からN
o.24までの24種類のプライマーを使用した。
【0116】前記(1)TCDD添加区とTCDD未添
加区から抽出した全RNAに対して、上記のプライマー
を用いてcDNAを合成し、更に前記プライマーを用い
てPCRを行った後、4%のポリアクリルアミドゲルで
電気泳動を行った。この電気泳動によって、PCRの増
幅産物は分子量に基付いて分離された。分離後、ゲル中
のポリヌクレオチドを蛍光イメージスキャナにより可視
化した。その状態で10nMのTCDD添加区とTCD
D未添加区を比較し、濃さに違いのあるバンドをゲルか
ら切り出した。切り出して得たバンドを含むゲルに、滅
菌水を加え、室温に30分以上放置した。その後、これ
に対して100℃で10分間の熱抽出を行い、ポリヌク
レオチドを回収した。更に上述に記載の条件で再増幅を
行い、アガロースゲルを用いた電気泳動により精製を行
った。得られた7つの遺伝子断片の塩基配列を決定し
た。得られた遺伝子断片であるポリヌクレオチドを、そ
れぞれ、ND81−1、ND83−2、ND83−3、
ND83−4、ND118−1、ND818−2および
ND87−3と命名した。
加区から抽出した全RNAに対して、上記のプライマー
を用いてcDNAを合成し、更に前記プライマーを用い
てPCRを行った後、4%のポリアクリルアミドゲルで
電気泳動を行った。この電気泳動によって、PCRの増
幅産物は分子量に基付いて分離された。分離後、ゲル中
のポリヌクレオチドを蛍光イメージスキャナにより可視
化した。その状態で10nMのTCDD添加区とTCD
D未添加区を比較し、濃さに違いのあるバンドをゲルか
ら切り出した。切り出して得たバンドを含むゲルに、滅
菌水を加え、室温に30分以上放置した。その後、これ
に対して100℃で10分間の熱抽出を行い、ポリヌク
レオチドを回収した。更に上述に記載の条件で再増幅を
行い、アガロースゲルを用いた電気泳動により精製を行
った。得られた7つの遺伝子断片の塩基配列を決定し
た。得られた遺伝子断片であるポリヌクレオチドを、そ
れぞれ、ND81−1、ND83−2、ND83−3、
ND83−4、ND118−1、ND818−2および
ND87−3と命名した。
【0117】(3)ND83−3、ND83−4、ND
118−1、ND818−2およびND87−3の配列 上記(2)で決定したND83−3、ND83−4、N
D118−1、ND818−2およびND87−3の塩
基配列をそれぞれ配列番号3、配列番号5、配列番号1
4、配列番号27および配列番号28に示す。これらを
特異的に増幅できるPCRプライマーの例として次のプ
ライマーを設計した。
118−1、ND818−2およびND87−3の配列 上記(2)で決定したND83−3、ND83−4、N
D118−1、ND818−2およびND87−3の塩
基配列をそれぞれ配列番号3、配列番号5、配列番号1
4、配列番号27および配列番号28に示す。これらを
特異的に増幅できるPCRプライマーの例として次のプ
ライマーを設計した。
【0118】ND83−3を増幅するためのPCRプラ
イマーは、上流プライマーが配列番号6に記載の塩基配
列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが
配列番号7に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチド
である。
イマーは、上流プライマーが配列番号6に記載の塩基配
列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが
配列番号7に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチド
である。
【0119】ND83−4を増幅するためのPCRプラ
イマーは上流プライマーが配列番号8に記載の塩基配列
を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが配
列番号9に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチドで
ある。
イマーは上流プライマーが配列番号8に記載の塩基配列
を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが配
列番号9に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチドで
ある。
【0120】ND118−1を増幅するためのPCRプ
ライマーは上流プライマーが配列番号17に記載の塩基
配列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマー
が配列番号18に記載の塩基配列を有するポリヌクレオ
チドである。
ライマーは上流プライマーが配列番号17に記載の塩基
配列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマー
が配列番号18に記載の塩基配列を有するポリヌクレオ
チドである。
【0121】ND818−2を増幅するためのPCRプ
ライマーは上流プライマーが配列番号19に記載の塩基
配列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマー
が配列番号20に記載の塩基配列を有するポリヌクレオ
チドである。
ライマーは上流プライマーが配列番号19に記載の塩基
配列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマー
が配列番号20に記載の塩基配列を有するポリヌクレオ
チドである。
【0122】ND87−3を増幅するためのPCRプラ
イマーは上流プライマーが配列番号25に記載の塩基配
列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが
配列番号26に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチ
ドである。
イマーは上流プライマーが配列番号25に記載の塩基配
列を有するポリヌクレオチドであり、下流プライマーが
配列番号26に記載の塩基配列を有するポリヌクレオチ
ドである。
【0123】新たに、上記(1)に記載の方法と同じ条
件で、但し、TCDD添加濃度は0、10および100
nMでNeuro2aを培養した。それらの各区につい
て全RNAを抽出した。抽出した全RNAから(dT)
プライマーを用いて逆転写反応を行った後で、PCRを
行った。このPCRでは、上記のND83−3、ND8
3−4、ND118−1、ND818−2およびND8
7−3に特異的なPCRプライマーをそれぞれ用いて増
幅した。結果を図1に示す。
件で、但し、TCDD添加濃度は0、10および100
nMでNeuro2aを培養した。それらの各区につい
て全RNAを抽出した。抽出した全RNAから(dT)
プライマーを用いて逆転写反応を行った後で、PCRを
行った。このPCRでは、上記のND83−3、ND8
3−4、ND118−1、ND818−2およびND8
7−3に特異的なPCRプライマーをそれぞれ用いて増
幅した。結果を図1に示す。
【0124】図1から明かであるように、ND83−
3、ND83−4、ND118−1、ND818−2お
よびND87−3は前記PCRによって特異的に増幅さ
れた。ND83−3およびはND83−4は、10nM
TCDDの添加によって発現量は減少した(図1)更
に、100nMのTCDDを添加すると10nMを添加
した場合よりも発現量は減少した(図1)。従って、N
D83−3およびND83−4はTCDD応答性である
ことが確認できた。またND118−1およびND87
−3は、10nMTCDDの添加によって発現量は減少
した(図1)。ND818−2は、10nMTCDDの
添加によって発現量は増加した(図1)。従って、ND
118−1、ND818−2およびND87−3はTC
DD応答性であることが確認できた。
3、ND83−4、ND118−1、ND818−2お
よびND87−3は前記PCRによって特異的に増幅さ
れた。ND83−3およびはND83−4は、10nM
TCDDの添加によって発現量は減少した(図1)更
に、100nMのTCDDを添加すると10nMを添加
した場合よりも発現量は減少した(図1)。従って、N
D83−3およびND83−4はTCDD応答性である
ことが確認できた。またND118−1およびND87
−3は、10nMTCDDの添加によって発現量は減少
した(図1)。ND818−2は、10nMTCDDの
添加によって発現量は増加した(図1)。従って、ND
118−1、ND818−2およびND87−3はTC
DD応答性であることが確認できた。
【0125】本発明の態様に従うとTCDD応答性の遺
伝子が提供される。また、その遺伝子の核酸配列を基
に、化学物質の内分泌核酸作用を特異的に検出するため
の核酸検出用プライマ−が提供された。
伝子が提供される。また、その遺伝子の核酸配列を基
に、化学物質の内分泌核酸作用を特異的に検出するため
の核酸検出用プライマ−が提供された。
【0126】(4)TCDD応答遺伝子の選抜
上記(2)で得られた遺伝子断片群についてTCDD応
答性を比較した。
答性を比較した。
【0127】まず、上記(2)で得られた塩基配列を基
に、各遺伝子断片を特異的に増幅できるPCRプライマ
ーを設計した。
に、各遺伝子断片を特異的に増幅できるPCRプライマ
ーを設計した。
【0128】一方、上記(1)と同じ条件で、但し、T
CDD添加濃度は0、10および100nMでNeur
o2aを培養した。それらの各区について全RNAを抽
出した。抽出した全RNAから(dT)プライマーを用
いて逆転写反応を行った。その後、各遺伝子断片を特異
的に増幅できるPCRプライマーを用いて各遺伝子断片
を増幅した。その増幅産物を電気泳動し、得られたバン
ドを比較することによって、TCDDによる発現量を比
較した。
CDD添加濃度は0、10および100nMでNeur
o2aを培養した。それらの各区について全RNAを抽
出した。抽出した全RNAから(dT)プライマーを用
いて逆転写反応を行った。その後、各遺伝子断片を特異
的に増幅できるPCRプライマーを用いて各遺伝子断片
を増幅した。その増幅産物を電気泳動し、得られたバン
ドを比較することによって、TCDDによる発現量を比
較した。
【0129】TCDDに対する応答性の見られた遺伝子
断片のうちの7つについて、その結果を図2に示す。図
2に示すように、ND83−3、ND83−4、ND1
18−1、ND818−2およびND87−3の5遺伝
子は、TCDD添加によりその発現量が大きく変化して
いた。従って、ND83−3、ND83−4、ND11
8−1、ND818−2およびND87−3はTCDD
応答性の高い遺伝子断片であるので、化学物質の内分泌
撹乱性の判定に使用可能な遺伝子マーカーとして選抜し
た。
断片のうちの7つについて、その結果を図2に示す。図
2に示すように、ND83−3、ND83−4、ND1
18−1、ND818−2およびND87−3の5遺伝
子は、TCDD添加によりその発現量が大きく変化して
いた。従って、ND83−3、ND83−4、ND11
8−1、ND818−2およびND87−3はTCDD
応答性の高い遺伝子断片であるので、化学物質の内分泌
撹乱性の判定に使用可能な遺伝子マーカーとして選抜し
た。
【0130】本発明の態様に従うと、化学物質の内分泌
核酸作用を特異的に検出するための核酸検出用プライマ
−が提供された。
核酸作用を特異的に検出するための核酸検出用プライマ
−が提供された。
【0131】例2:ND83−3、ND83−4、ND
118−1、ND818−2およびND87−3の同定 例1で塩基配列を決定した遺伝子断片のうち、ND83
−3およびND83−4について相同性検索を行った。
相同性検索は、日本DNAデータバンク(DDBJ)の
データベースに対して、FASTAプログラムを実行す
ることにより行った。その結果、ND83−3と85%
以上の相同性を示したのは、IMAGE:349602
3のみであった。その相同性は94%である。また、こ
のクローンは、NIH(National Institute of Healt
h;国立衛生研究所)が登録したEST(Expressed Sequ
ence Tags;発現配列タグ)クローンであり、遺伝子の機
能は未知であった。この同定から明らかにされたND8
3−3のcDNA全長の塩基配列を配列番号1に記載し
た。また、このcDNAがコードするアミノ酸は配列の
1例を配列番号2に記載した。
118−1、ND818−2およびND87−3の同定 例1で塩基配列を決定した遺伝子断片のうち、ND83
−3およびND83−4について相同性検索を行った。
相同性検索は、日本DNAデータバンク(DDBJ)の
データベースに対して、FASTAプログラムを実行す
ることにより行った。その結果、ND83−3と85%
以上の相同性を示したのは、IMAGE:349602
3のみであった。その相同性は94%である。また、こ
のクローンは、NIH(National Institute of Healt
h;国立衛生研究所)が登録したEST(Expressed Sequ
ence Tags;発現配列タグ)クローンであり、遺伝子の機
能は未知であった。この同定から明らかにされたND8
3−3のcDNA全長の塩基配列を配列番号1に記載し
た。また、このcDNAがコードするアミノ酸は配列の
1例を配列番号2に記載した。
【0132】また、ND83−4と85%以上の相同性
を示すクローンは6クローン存在した。RIKEN:G
431004A07は理化学研究所が登録したマウスE
STクローンであり、遺伝子の機能は未知であった。I
MAGE:3156947、IMAGE:54023
8、IMAGE:805651、UI−M−CD1−a
zs−c−11−0−UIは何れもNIHが登録したマ
ウスESTクローンであり、遺伝子の機能は全て未知で
あった。また、マウスRP24−388P13はマウス
のゲノミッククローンであり、遺伝子の機能は未知であ
った。この同定から明らかにされたND83−4のcD
NA全長の塩基配列を配列番号4に記載した。
を示すクローンは6クローン存在した。RIKEN:G
431004A07は理化学研究所が登録したマウスE
STクローンであり、遺伝子の機能は未知であった。I
MAGE:3156947、IMAGE:54023
8、IMAGE:805651、UI−M−CD1−a
zs−c−11−0−UIは何れもNIHが登録したマ
ウスESTクローンであり、遺伝子の機能は全て未知で
あった。また、マウスRP24−388P13はマウス
のゲノミッククローンであり、遺伝子の機能は未知であ
った。この同定から明らかにされたND83−4のcD
NA全長の塩基配列を配列番号4に記載した。
【0133】またND118−1、ND818−2およ
びND87−3についても相同性検索をおこなった.相
同性検索はマウスゲノムデータベースに対して、SSA
HAプログラムを実行することにより行なった.その結
果、ND118−1は、ほぼ全長にあたる252塩基対
がマウス11番染色体上の107213067から10
7213304の領域と100%の相同性を示したが、
同領域から機能が既知である遺伝子に関する情報は得ら
れなかった。
びND87−3についても相同性検索をおこなった.相
同性検索はマウスゲノムデータベースに対して、SSA
HAプログラムを実行することにより行なった.その結
果、ND118−1は、ほぼ全長にあたる252塩基対
がマウス11番染色体上の107213067から10
7213304の領域と100%の相同性を示したが、
同領域から機能が既知である遺伝子に関する情報は得ら
れなかった。
【0134】ND818−2はマウス3番染色体上の1
05476953から1054477260の領域にコ
ードされていた.同領域の近傍には生物工学情報センタ
ー(NCBI)が登録した参照塩基配列(RefSe
q)中の機能未知遺伝子であるマウス仮想タンパク質M
GC:7720(Accession No. NM0
30249)がコードされていた。この同定から明らか
にされたND87−3のcDNA全長の塩基配列を配列
番号15に記載した。また、このcDNAがコードする
アミノ酸配列の1例を配列番号16に記載した。
05476953から1054477260の領域にコ
ードされていた.同領域の近傍には生物工学情報センタ
ー(NCBI)が登録した参照塩基配列(RefSe
q)中の機能未知遺伝子であるマウス仮想タンパク質M
GC:7720(Accession No. NM0
30249)がコードされていた。この同定から明らか
にされたND87−3のcDNA全長の塩基配列を配列
番号15に記載した。また、このcDNAがコードする
アミノ酸配列の1例を配列番号16に記載した。
【0135】ND87−3はマウス10番染色体上の7
646283から7646436の領域にコードされて
いた。同領域にはEnsemblが予測した機能未知遺
伝子(Accession No. AK01440
6)がコードされていた。この同定から明らかにされた
ND87−3のcDNA全長の塩基配列を配列番号23
に記載した。また、このcDNAがコードするアミノ酸
配列の1例を配列番号24に記載した。
646283から7646436の領域にコードされて
いた。同領域にはEnsemblが予測した機能未知遺
伝子(Accession No. AK01440
6)がコードされていた。この同定から明らかにされた
ND87−3のcDNA全長の塩基配列を配列番号23
に記載した。また、このcDNAがコードするアミノ酸
配列の1例を配列番号24に記載した。
【0136】例3:更なるプライマー
上記の例2で決定したND83−3、ND83−4およ
びND818−2の塩基配列を基に、更なるプライマー
を設計した。
びND818−2の塩基配列を基に、更なるプライマー
を設計した。
【0137】ND83−3に特異的な更なるプライマー
は、配列番号10に記載の塩基配列を有するフォワード
プライマーと、配列番号11に記載の塩基配列を有する
リバースプライマーである。
は、配列番号10に記載の塩基配列を有するフォワード
プライマーと、配列番号11に記載の塩基配列を有する
リバースプライマーである。
【0138】ND83−4に特異的な更なるプライマー
は、配列番号12に記載の塩基配列を有するフォワード
プライマーと、配列番号13に記載の塩基配列を有する
リバースプライマーである。
は、配列番号12に記載の塩基配列を有するフォワード
プライマーと、配列番号13に記載の塩基配列を有する
リバースプライマーである。
【0139】ND818−2に特異的な更なるプライマ
ーは、配列番号21に記載の塩基配列を有するフォワー
ドプライマーと、配列番号22に記載の塩基配列を有す
るリバースプライマーである。
ーは、配列番号21に記載の塩基配列を有するフォワー
ドプライマーと、配列番号22に記載の塩基配列を有す
るリバースプライマーである。
【0140】上述した例1の(1)に記載の方法により
培養した2つの条件の区(10nMのTCDD添加区お
よびTCDD未添加区)の細胞から全RNAを抽出し
た。得られた抽出産物について上記のプライマーを用い
て逆転写PCR法を行い、それぞれの遺伝子の発現量を
比較した。その結果、ND83−3、ND83−4は1
0nMのTCDDの添加によってその発現量が減少した
(図3)。ND818−2は10nMのTCDDの添加
によってその発現量が増加した(図3)。
培養した2つの条件の区(10nMのTCDD添加区お
よびTCDD未添加区)の細胞から全RNAを抽出し
た。得られた抽出産物について上記のプライマーを用い
て逆転写PCR法を行い、それぞれの遺伝子の発現量を
比較した。その結果、ND83−3、ND83−4は1
0nMのTCDDの添加によってその発現量が減少した
(図3)。ND818−2は10nMのTCDDの添加
によってその発現量が増加した(図3)。
【0141】本発明の態様に従うと、化学物質の内分泌
核酸作用を特異的に検出するための更なる核酸検出用プ
ライマ−が提供された。
核酸作用を特異的に検出するための更なる核酸検出用プ
ライマ−が提供された。
【0142】例4
上記例1に記載した条件でNeuro2aを培養し、1
0nMのTCDD添加区および未添加区について全RN
Aを抽出した。抽出されたRNAを変性条件下でゲル電
気泳動を行い、分子量による分離を行った。次に、分離
後のRNAを前記ゲルからナイロン膜に転写した。
0nMのTCDD添加区および未添加区について全RN
Aを抽出した。抽出されたRNAを変性条件下でゲル電
気泳動を行い、分子量による分離を行った。次に、分離
後のRNAを前記ゲルからナイロン膜に転写した。
【0143】上記例1で単離した核酸ND83−3およ
びND83−4、並びにND118−1、ND818−
2およびND87−3を検出可能な核酸検出用プローブ
として、それぞれ、配列番号11および配列番号13、
並びに配列番号18、配列番号20、配列番号22およ
び配列番号26に記載の塩基配列を有する核酸検出用プ
ローブを用いた。まず、これらの核酸検出用プローブを
化学標識した。その後、それぞれを前記ナイロン膜に対
してハイブリダイズした。その後、化学発光を検出し
た。
びND83−4、並びにND118−1、ND818−
2およびND87−3を検出可能な核酸検出用プローブ
として、それぞれ、配列番号11および配列番号13、
並びに配列番号18、配列番号20、配列番号22およ
び配列番号26に記載の塩基配列を有する核酸検出用プ
ローブを用いた。まず、これらの核酸検出用プローブを
化学標識した。その後、それぞれを前記ナイロン膜に対
してハイブリダイズした。その後、化学発光を検出し
た。
【0144】その結果、ND83−3およびND83−
4、並びにND118−1、およびND87−3に対応
する核酸検出用プローブを用いた場合には、10nMの
TCDDの添加によってハイブリダイゼーションで得ら
れるシグナルは減少した。またND818−2に対応す
る核酸検出用プローブを用いた場合には、10nMのT
CDDの添加によってハイブリダイゼーションで得られ
るシグナルは増加した.本発明の態様に従うと、化学発
光を指標にする検出により内分泌撹乱性を特異的に検出
することが可能な方法が提供された。
4、並びにND118−1、およびND87−3に対応
する核酸検出用プローブを用いた場合には、10nMの
TCDDの添加によってハイブリダイゼーションで得ら
れるシグナルは減少した。またND818−2に対応す
る核酸検出用プローブを用いた場合には、10nMのT
CDDの添加によってハイブリダイゼーションで得られ
るシグナルは増加した.本発明の態様に従うと、化学発
光を指標にする検出により内分泌撹乱性を特異的に検出
することが可能な方法が提供された。
【0145】例5
上記例1で単離した核酸ND83−3およびND83−
4、並びにND118−1、ND818−2およびND
87−3を検出可能な核酸検出用プローブとして、それ
ぞれ、配列番号11および配列番号13、並びに配列番
号18、配列番号20、配列番号22および配列番号2
6に記載の塩基配列を有する核酸検出用プローブを用い
た。これらの核酸検出用プローブを基板に固定化してプ
ローブ固定化チップを作成した。上記例1に記載した条
件でNeuro2aを培養し、10nMのTCDD添加
区および未添加区について全RNAを抽出し、蛍光標識
した。その後、蛍光標識した全RNAを前記の核酸検出
用チップのポリヌクレオチドに対してハイブリダイズし
た。その結果、ND83−3およびND83−4、並び
にND118−1およびND87−3については、その
チップ上で観察されるシグナルは、10nMのTCDD
を添加した区の方が減少した。また、ND818−2に
ついては、そのチップ上で観察されるシグナルは、10
nMのTCDDを添加した区の方が増加した。
4、並びにND118−1、ND818−2およびND
87−3を検出可能な核酸検出用プローブとして、それ
ぞれ、配列番号11および配列番号13、並びに配列番
号18、配列番号20、配列番号22および配列番号2
6に記載の塩基配列を有する核酸検出用プローブを用い
た。これらの核酸検出用プローブを基板に固定化してプ
ローブ固定化チップを作成した。上記例1に記載した条
件でNeuro2aを培養し、10nMのTCDD添加
区および未添加区について全RNAを抽出し、蛍光標識
した。その後、蛍光標識した全RNAを前記の核酸検出
用チップのポリヌクレオチドに対してハイブリダイズし
た。その結果、ND83−3およびND83−4、並び
にND118−1およびND87−3については、その
チップ上で観察されるシグナルは、10nMのTCDD
を添加した区の方が減少した。また、ND818−2に
ついては、そのチップ上で観察されるシグナルは、10
nMのTCDDを添加した区の方が増加した。
【0146】本発明の態様に従うと、内分泌撹乱性を特
異的に検出することが可能なプローブ固定化チップが提
供された。
異的に検出することが可能なプローブ固定化チップが提
供された。
【0147】例6
上記例1で単離した核酸ND83−3およびND83−
4、並びにND118−1、ND818−2およびND
87−3を検出可能な核酸検出用プローブとして、それ
ぞれ、配列番号11および配列番号13、並びに、並び
に配列番号18、配列番号20、配列番号22および配
列番号26に記載の塩基配列を有する核酸検出用プロー
ブを用いた。これらの核酸検出用プローブをそれぞれ異
なる金電極上の所定の位置に固定化してプローブ固定化
チップを作成した。上記例1に記載した条件でNeur
o2aを培養し、10nMのTCDD添加区および未添
加区について全RNAを抽出した。それを前記核酸検出
用チップに対して反応させた。ハイブリダイズしている
核酸から電気信号を得るための試薬にはヘキスト332
58を使用した。その結果、ND83−3およびND8
3−4、並びにND118−1およびND87−3に対
する核酸検出用プローブから得られる電流値は、10n
MのTCDDの添加によって減少した。またND818
−2に対する核酸検出用プローブから得られる電流値
は、10nMのTCDDの添加によって増加した。
4、並びにND118−1、ND818−2およびND
87−3を検出可能な核酸検出用プローブとして、それ
ぞれ、配列番号11および配列番号13、並びに、並び
に配列番号18、配列番号20、配列番号22および配
列番号26に記載の塩基配列を有する核酸検出用プロー
ブを用いた。これらの核酸検出用プローブをそれぞれ異
なる金電極上の所定の位置に固定化してプローブ固定化
チップを作成した。上記例1に記載した条件でNeur
o2aを培養し、10nMのTCDD添加区および未添
加区について全RNAを抽出した。それを前記核酸検出
用チップに対して反応させた。ハイブリダイズしている
核酸から電気信号を得るための試薬にはヘキスト332
58を使用した。その結果、ND83−3およびND8
3−4、並びにND118−1およびND87−3に対
する核酸検出用プローブから得られる電流値は、10n
MのTCDDの添加によって減少した。またND818
−2に対する核酸検出用プローブから得られる電流値
は、10nMのTCDDの添加によって増加した。
【0148】本発明の態様に従うと、内分泌撹乱性を特
異的に検出することが可能な電気化学的に検出が行われ
るプローブ固定化チップが提供された。
異的に検出することが可能な電気化学的に検出が行われ
るプローブ固定化チップが提供された。
【0149】例7:大腸菌によるGST融合ペプチドの
作製 ND83−3について、次のようにGST融合ペプチド
を作製した。5’末端に制限酵素EcoRIの認識配列
を付加した上流プライマ−(即ち、5’-GGGAATTCGGACGCG
TGGGCTTGATGC-3’)と5’末端にNotIの認識配列を
付加した下流プライマ−(即ち、5’-CCGCGGCCGCTCAAACA
CTGTGGATGT-3’)を用いて配列番号1に示した核酸配列
をPCRで増幅した後、発現ベクター:pGEX−6P
−2(アマシャムバイオサイエンス社製)のEcoRI
とNotI部位に組み込んだ。塩基配列の解析を行い核
酸断片が正しく発現ベクターに挿入されていることを確
認した後に、宿主大腸菌BL21の形質転換を行った。
LB培地中で37℃で5時間培養した後、IPTGを最
終濃度0.4mMになるように加え、更に37℃で2.
5時間培養した。その後、菌体を遠心によって回収し
た。回収した菌体は、溶解溶液(50mMのTris-HCl(pH7.
5)、1mMのEDTA、1%のTriton X-100、0.2%のSDS、0.2mM
のPMSF)に懸濁してから超音波破砕した。破砕後、10
00gで30分遠心し、上清にグルタチオンセファロー
ス4Bを加えて、4℃で1時間インキュベートした。ビ
ーズを十分洗浄した後、溶出溶液(10mMのTris-HCl(pH7.
5)、50mMのク゛ルタチオン)で融合ペプチドを溶出した。 また、ND818−2については、5’末端に制限酵素
EcoRIの認識配列を付加した上流プライマー(即
ち、5’-CCGGAATTCATGAATCTGGAAAAACTCAGCAAGC -3’)
と、5’末端にNotIの認識配列を付加した下流プラ
イマ−(即ち、5’-GGGCGGCCGCTACTGCTGGTAGGCAAAAGTAT
CTC-3’)を用い、発現ベクターとしてpGEX−6P
−1を用いたこと以外は、上述のND83−3と同様に
GST融合ペプチドを作製した。
作製 ND83−3について、次のようにGST融合ペプチド
を作製した。5’末端に制限酵素EcoRIの認識配列
を付加した上流プライマ−(即ち、5’-GGGAATTCGGACGCG
TGGGCTTGATGC-3’)と5’末端にNotIの認識配列を
付加した下流プライマ−(即ち、5’-CCGCGGCCGCTCAAACA
CTGTGGATGT-3’)を用いて配列番号1に示した核酸配列
をPCRで増幅した後、発現ベクター:pGEX−6P
−2(アマシャムバイオサイエンス社製)のEcoRI
とNotI部位に組み込んだ。塩基配列の解析を行い核
酸断片が正しく発現ベクターに挿入されていることを確
認した後に、宿主大腸菌BL21の形質転換を行った。
LB培地中で37℃で5時間培養した後、IPTGを最
終濃度0.4mMになるように加え、更に37℃で2.
5時間培養した。その後、菌体を遠心によって回収し
た。回収した菌体は、溶解溶液(50mMのTris-HCl(pH7.
5)、1mMのEDTA、1%のTriton X-100、0.2%のSDS、0.2mM
のPMSF)に懸濁してから超音波破砕した。破砕後、10
00gで30分遠心し、上清にグルタチオンセファロー
ス4Bを加えて、4℃で1時間インキュベートした。ビ
ーズを十分洗浄した後、溶出溶液(10mMのTris-HCl(pH7.
5)、50mMのク゛ルタチオン)で融合ペプチドを溶出した。 また、ND818−2については、5’末端に制限酵素
EcoRIの認識配列を付加した上流プライマー(即
ち、5’-CCGGAATTCATGAATCTGGAAAAACTCAGCAAGC -3’)
と、5’末端にNotIの認識配列を付加した下流プラ
イマ−(即ち、5’-GGGCGGCCGCTACTGCTGGTAGGCAAAAGTAT
CTC-3’)を用い、発現ベクターとしてpGEX−6P
−1を用いたこと以外は、上述のND83−3と同様に
GST融合ペプチドを作製した。
【0150】ND87−3については、5’末端に制限
酵素EcoRIの認識配列を付加した上流プライマー
(即ち、5’-CCGGATTCCATGGCGGTTCTCTTGGAGACCACTC-
3’)と、5’末端にNotIの認識配列を付加した下
流プライマ−(即ち、5’-GGGCGGCCGCTCATCTGTACTTGGAT
TTTTCTT-3’)を用い、発現ベクターとしてpGEX−
6P−3を用いたこと以外は、上述のND83−3と同
様にGST融合ペプチドを作製した。
酵素EcoRIの認識配列を付加した上流プライマー
(即ち、5’-CCGGATTCCATGGCGGTTCTCTTGGAGACCACTC-
3’)と、5’末端にNotIの認識配列を付加した下
流プライマ−(即ち、5’-GGGCGGCCGCTCATCTGTACTTGGAT
TTTTCTT-3’)を用い、発現ベクターとしてpGEX−
6P−3を用いたこと以外は、上述のND83−3と同
様にGST融合ペプチドを作製した。
【0151】例8:ポリクローナル抗体の作製
例7で作製したGST融合ペプチドを抗原として、ウサ
ギ1羽あたり100μgを腹腔内に注射した。1回目の
投与後、約2週間おきに3〜10回、抗原の投与を続け
た。各投与後は、3〜7日目に眼底静脈叢より採血し、
得られた血清が免疫に用いた抗原と反応することを酵素
免疫測定法で確認した。免疫に用いた抗原に対して充分
な抗体価を示したウサギから血清をとり、40%飽和硫
安沈殿画分からGSTアフィニティーカラムによってG
ST抗体を除いた後、素通り画分を更にGST誘導ペプ
チドの抗原カラムで精製した。
ギ1羽あたり100μgを腹腔内に注射した。1回目の
投与後、約2週間おきに3〜10回、抗原の投与を続け
た。各投与後は、3〜7日目に眼底静脈叢より採血し、
得られた血清が免疫に用いた抗原と反応することを酵素
免疫測定法で確認した。免疫に用いた抗原に対して充分
な抗体価を示したウサギから血清をとり、40%飽和硫
安沈殿画分からGSTアフィニティーカラムによってG
ST抗体を除いた後、素通り画分を更にGST誘導ペプ
チドの抗原カラムで精製した。
【0152】例9:モノクローナル抗体の作製
(1)ハイブリドーマの作製
例7で作製したGST融合ペプチドとコンプリートアジ
ュバンドを等量で、それぞれ1mLのシリンジにとり、
ジョイントで繋いで乳化するまでよく攪拌した。これを
マウスの腹腔内に注射して免疫を行なった。1回目の免
疫の2週間後に2回目の免疫を行い、その更に2週間後
にブーストとして免疫し、ブースト3日後に細胞融合操
作を行なった。細胞融合は免疫マウスの頚椎を脱臼して
脾臓を取り出し予めRPMIを5mL入れた6cmのデ
ィッシュに移した。この脾臓から余分な脂肪などを除去
し、更に新たに2枚の5mLのRPMI入りの6cmの
ディッシュを用いて洗った。洗浄した脾臓を、2つに折
った5cm角のステンレス製金属網の間にピンセットで
擦り移し、遠心により10mLのPRMIで2回洗浄し
た。沈殿した細胞に0.17MのNH4Clを加え、氷
中に5分間つけて溶血させた。この溶血操作の後、5m
LのRPMIを加えて1,600rpmで5分間遠心し
て洗浄し、更に20mLにメスアップして脾臓細胞懸濁
液とした。一方対数増殖期にある骨髄腫細胞の2〜4デ
ィッシュ分を、1,200rpm、5分間の遠心で集
め、血清を含まないRPMIで2回洗い、最後に10m
LのRPMIに懸濁して骨髄腫細胞懸濁液とした。脾臓
細胞懸濁液と骨髄腫細胞懸濁液の細胞数を数えて、骨髄
腫細胞が脾臓細胞の1/5〜1/20になるように脾臓
細胞懸濁液に骨髄腫細胞懸濁液を加えた。この骨髄腫細
胞懸濁液を5分間遠心して上清を除き、得られた沈殿に
0.3mLの50%ポリエチレングリコール1500を
一気に加え、直ちによく攪拌した。攪拌を続けながら、
40mLのRPMIを加えた。この懸濁液を1,000
rpmで5分間遠心し、得られた沈殿にHAT培地(最
終濃度で、1X10-7Mのヒポキサンチン、4X10-4Mのアミノ
プテリン、16X10-4Mのチミジンを含むRPMI-FCS)を50
mL加えて、100μL/ウェルずつ96ウェルプレー
ト約3枚に播いた。4〜5日後、96ウェルプレートに
は約100μL/ウェルのHAT培地を加えた。この結
果、約1週間で殆どのウェルにハイブリドーマが増殖し
た。
ュバンドを等量で、それぞれ1mLのシリンジにとり、
ジョイントで繋いで乳化するまでよく攪拌した。これを
マウスの腹腔内に注射して免疫を行なった。1回目の免
疫の2週間後に2回目の免疫を行い、その更に2週間後
にブーストとして免疫し、ブースト3日後に細胞融合操
作を行なった。細胞融合は免疫マウスの頚椎を脱臼して
脾臓を取り出し予めRPMIを5mL入れた6cmのデ
ィッシュに移した。この脾臓から余分な脂肪などを除去
し、更に新たに2枚の5mLのRPMI入りの6cmの
ディッシュを用いて洗った。洗浄した脾臓を、2つに折
った5cm角のステンレス製金属網の間にピンセットで
擦り移し、遠心により10mLのPRMIで2回洗浄し
た。沈殿した細胞に0.17MのNH4Clを加え、氷
中に5分間つけて溶血させた。この溶血操作の後、5m
LのRPMIを加えて1,600rpmで5分間遠心し
て洗浄し、更に20mLにメスアップして脾臓細胞懸濁
液とした。一方対数増殖期にある骨髄腫細胞の2〜4デ
ィッシュ分を、1,200rpm、5分間の遠心で集
め、血清を含まないRPMIで2回洗い、最後に10m
LのRPMIに懸濁して骨髄腫細胞懸濁液とした。脾臓
細胞懸濁液と骨髄腫細胞懸濁液の細胞数を数えて、骨髄
腫細胞が脾臓細胞の1/5〜1/20になるように脾臓
細胞懸濁液に骨髄腫細胞懸濁液を加えた。この骨髄腫細
胞懸濁液を5分間遠心して上清を除き、得られた沈殿に
0.3mLの50%ポリエチレングリコール1500を
一気に加え、直ちによく攪拌した。攪拌を続けながら、
40mLのRPMIを加えた。この懸濁液を1,000
rpmで5分間遠心し、得られた沈殿にHAT培地(最
終濃度で、1X10-7Mのヒポキサンチン、4X10-4Mのアミノ
プテリン、16X10-4Mのチミジンを含むRPMI-FCS)を50
mL加えて、100μL/ウェルずつ96ウェルプレー
ト約3枚に播いた。4〜5日後、96ウェルプレートに
は約100μL/ウェルのHAT培地を加えた。この結
果、約1週間で殆どのウェルにハイブリドーマが増殖し
た。
【0153】(2)ペプチドを固相化したアッセイプレ
ートの作製 例7で作成したGST融合ペプチドを30μg/mLと
なるようにPBSに溶解した後、酵素免疫測定法用の9
6穴マイクロタイタープレートに50μLずつ分注し
た。4℃に一晩静置した後、溶液を吸引除去してハイブ
リドーマ選定用のアッセイプレートとした。同様の方法
によってGSTタンパク質のみを吸着させたアッセイプ
レートも作成した。
ートの作製 例7で作成したGST融合ペプチドを30μg/mLと
なるようにPBSに溶解した後、酵素免疫測定法用の9
6穴マイクロタイタープレートに50μLずつ分注し
た。4℃に一晩静置した後、溶液を吸引除去してハイブ
リドーマ選定用のアッセイプレートとした。同様の方法
によってGSTタンパク質のみを吸着させたアッセイプ
レートも作成した。
【0154】(3)ペプチドを認識する抗体を産生する
ハイブリドーマの選定 上記(2)で作製したGSTタンパク質のアッセイプレ
ートを1%BSA−PBSで1時間ブロッキング処理し
た後、前記(1)で調製したハイブリドーマの二倍希釈
した培養上清を20μL加え、4℃に16時間静置し
た。アッセイプレートを1%BSA−PBSで3回洗浄
して非結合の抗体を除去した後、フルオロセインで蛍光
標識したプロテインA溶液50μLをウェルに加えて2
時間、室温に静置した後、非結合のプロテインAを除く
ために1%BSA−PBSで洗浄した。洗浄後、アッセ
イプレートを蛍光検出器にかけ、フルオロセインの蛍光
が観察されるウェルに存在したハイブリドーマをGST
タンパク質を認識する抗体を産生するハイブリドーマと
して除いた。次にGST融合ペプチドのアッセイプレー
トを用いて上記と同様の操作を行い、ここでフルオロセ
インの蛍光が観察されたウェルに存在したハイブリドー
マをペプチドを特異的に認識する抗体を産生するハイブ
リドーマとして選定した。
ハイブリドーマの選定 上記(2)で作製したGSTタンパク質のアッセイプレ
ートを1%BSA−PBSで1時間ブロッキング処理し
た後、前記(1)で調製したハイブリドーマの二倍希釈
した培養上清を20μL加え、4℃に16時間静置し
た。アッセイプレートを1%BSA−PBSで3回洗浄
して非結合の抗体を除去した後、フルオロセインで蛍光
標識したプロテインA溶液50μLをウェルに加えて2
時間、室温に静置した後、非結合のプロテインAを除く
ために1%BSA−PBSで洗浄した。洗浄後、アッセ
イプレートを蛍光検出器にかけ、フルオロセインの蛍光
が観察されるウェルに存在したハイブリドーマをGST
タンパク質を認識する抗体を産生するハイブリドーマと
して除いた。次にGST融合ペプチドのアッセイプレー
トを用いて上記と同様の操作を行い、ここでフルオロセ
インの蛍光が観察されたウェルに存在したハイブリドー
マをペプチドを特異的に認識する抗体を産生するハイブ
リドーマとして選定した。
【0155】(4)クローニング
上記(3)で選定したハイブリドーマを取り出し、その
一部を用いて、血球計数板で細胞数を数えた。ハイブリ
ドーマを適当に希釈し、40個のハイブリドーマとマウ
スから調製した約1X108個の脾臓細胞とを40mL
のRPMI中で混合した。混合した細胞懸濁液を200
μLずつ96ウェルプレート約2枚に分注して、37℃
で培養を行った。1週間に2回、培地を交換し、約2週
間培養を続けた。2週間後、ウェルの上清をとって抗体
活性を確認した。抗体活性を示したウェルのハイブリド
ーマを、今度は24ウェルプレートで更に培養を行っ
た。この培養により細胞密度が十分に高くなった後で、
35mmプレートで培養した。更にもう1度同様の操作
を繰り返した後、確立されたハイブリドーマとして凍結
保存した。
一部を用いて、血球計数板で細胞数を数えた。ハイブリ
ドーマを適当に希釈し、40個のハイブリドーマとマウ
スから調製した約1X108個の脾臓細胞とを40mL
のRPMI中で混合した。混合した細胞懸濁液を200
μLずつ96ウェルプレート約2枚に分注して、37℃
で培養を行った。1週間に2回、培地を交換し、約2週
間培養を続けた。2週間後、ウェルの上清をとって抗体
活性を確認した。抗体活性を示したウェルのハイブリド
ーマを、今度は24ウェルプレートで更に培養を行っ
た。この培養により細胞密度が十分に高くなった後で、
35mmプレートで培養した。更にもう1度同様の操作
を繰り返した後、確立されたハイブリドーマとして凍結
保存した。
【0156】(5)ペプチドを認識するモノクローナル
抗体の選定 約4週齢のマウスの腹腔内に0.5mLのプリスタンを
注射した。プリスタン注射の約1週間後に、あらかじめ
培養しておいたハイブリドーマを遠心によって集め、3
7℃に温めておいたRPMIで約4X106個/mLに
分散させた。そのうちの500μLをマウスの腹腔内に
注射した。約2週間後、腹水が溜まりマウスの腹が膨れ
てきた段階で、マウスの腹部を切開し、パスツールピペ
ットを用いて腹水を採取した。採取した0.2mLのN
aN3EDTA溶液を入れた15mLの遠心管に入れ
た。2,000rpm、10分間の遠心し、得られた上
清をモノクローナル抗体溶液として取得した。
抗体の選定 約4週齢のマウスの腹腔内に0.5mLのプリスタンを
注射した。プリスタン注射の約1週間後に、あらかじめ
培養しておいたハイブリドーマを遠心によって集め、3
7℃に温めておいたRPMIで約4X106個/mLに
分散させた。そのうちの500μLをマウスの腹腔内に
注射した。約2週間後、腹水が溜まりマウスの腹が膨れ
てきた段階で、マウスの腹部を切開し、パスツールピペ
ットを用いて腹水を採取した。採取した0.2mLのN
aN3EDTA溶液を入れた15mLの遠心管に入れ
た。2,000rpm、10分間の遠心し、得られた上
清をモノクローナル抗体溶液として取得した。
【0157】例10:ペプチドに対する抗体をもちいた
化学物質の内分泌撹乱性の検出 例1の(1)に記載した方法でTCDDを作用させた細
胞から、タンパク質を抽出した後、SDSポリアクリル
アミドゲル電気泳動を行なった。泳動後、ゲルをガラス
板からはずし、蒸留水の入ったプラスチック容器に入れ
て洗浄した後、ゲル中の蛋白質をエレクトロトランスフ
ァー法でPVDF膜上に転写した。PVDF膜をブロッ
クエース(雪印乳業)中に浸して室温で2時間ブロッキ
ングを行った。続いてPBSで希釈した例9で得た抗体
中に浸して室温で2時間抗体と反応させた。2時間後、
PVDF膜をTBS中に移して室温、15分間の洗浄を
3回行なった後、ペルオキシダ−ゼで標識された抗マウ
ス−ウサギ二次抗体を含む10%のブロックエースに浸
して室温で1時間反応させた。二次抗体との反応が終了
した後、発色液(50mg/mLのDAB、50mMのTris-HCl緩衝液
(pH7.5)、過酸化水素)中にPVDF膜を浸して発色させ
た。
化学物質の内分泌撹乱性の検出 例1の(1)に記載した方法でTCDDを作用させた細
胞から、タンパク質を抽出した後、SDSポリアクリル
アミドゲル電気泳動を行なった。泳動後、ゲルをガラス
板からはずし、蒸留水の入ったプラスチック容器に入れ
て洗浄した後、ゲル中の蛋白質をエレクトロトランスフ
ァー法でPVDF膜上に転写した。PVDF膜をブロッ
クエース(雪印乳業)中に浸して室温で2時間ブロッキ
ングを行った。続いてPBSで希釈した例9で得た抗体
中に浸して室温で2時間抗体と反応させた。2時間後、
PVDF膜をTBS中に移して室温、15分間の洗浄を
3回行なった後、ペルオキシダ−ゼで標識された抗マウ
ス−ウサギ二次抗体を含む10%のブロックエースに浸
して室温で1時間反応させた。二次抗体との反応が終了
した後、発色液(50mg/mLのDAB、50mMのTris-HCl緩衝液
(pH7.5)、過酸化水素)中にPVDF膜を浸して発色させ
た。
【0158】例11:蛍光検出型プロテインチップの作
製 ビオチン化したBSAでコートしたガラス基板をストレ
プトアビジンで更にコーティングした。例9で得たペプ
チドを認識する抗体をビオチン化して、上記のガラス基
板上に市販のスポッターを用いて固定化し、蛍光検出型
のプロテインチップを作製した。
製 ビオチン化したBSAでコートしたガラス基板をストレ
プトアビジンで更にコーティングした。例9で得たペプ
チドを認識する抗体をビオチン化して、上記のガラス基
板上に市販のスポッターを用いて固定化し、蛍光検出型
のプロテインチップを作製した。
【0159】例12:電流検出型プロテインチップの作
製 例9で得たペプチドを認識する抗体を市販のスポッター
で金電極上にスポッティングして化学的に結合させるこ
とで、電流検出型のプロテインチップを作製した。
製 例9で得たペプチドを認識する抗体を市販のスポッター
で金電極上にスポッティングして化学的に結合させるこ
とで、電流検出型のプロテインチップを作製した。
【0160】
【発明の効果】以上のように、本発明により、化学物質
の内分泌撹乱性を特異的に検出するための方法、核酸、
プローブおよびプライマー、プローブ固定化チップ、並
びに抗体を提供された。
の内分泌撹乱性を特異的に検出するための方法、核酸、
プローブおよびプライマー、プローブ固定化チップ、並
びに抗体を提供された。
【0161】
【配列表】
SEQUENCE LISTING
<110> TOSHIBA CORPORATION
<120> Nucleic acid for detecting the endocrine disruptive action of che
micals, probe and primer including the nucleic acid for detecting the ac
tion, probe-immobilized chip comprising the probe, peptide derived from
the nucleic acid and the antibody recognizing the nucleic acid, probe-im
mobilized chip comprising the peptide or the antibody, and method for de
tecting the endocrine disruptive action of chemicals with them
<130> 02S0899
<160> 26
<210> 1
<211> 2560
<212> DNA
<213> mouse
<400> 1
cggacgcgtg ggcttgatgc ccactgtgag gtggcagtta actggtatgc tccacttgta 60
gcccccatat ctaaggacag aaccatttgc actgtgccga ttatagatgt cataagcggc 120
aacacatatg aaattatacc ccaagggggt ggtgatgaag atgggtatgc ccgaggagca 180
tgggactgga gtatgctctg gaaacgggtg cctctgacct ctcgagagaa gagactgaga 240
aagacaaaaa ctgagccgta tcggtctcca gctatggcgg gtggattgtt tgccatagag 300
aaggacttct tcttcgaact gggtctctat gatcctggtc tccagatctg gggtggtgaa 360
aactttgaaa tttcatacaa gatctggcag tgcggtggca aattgttatt tgtgccttgt 420
tctcgtgttg ggcacatcta ccgtcttgag ggctggcaag gaaacccccc acccctttac 480
gttggctcct ctccaactct gaagaattat gttagagtcg tggaagtctg gtgggatgaa 540
tataaagact acttctatgc tagccgtcct gagtcaaagg cgctgcccta cggggacata 600
tctgagctga agaaatttcg agaagatcac aactgcaaaa gtttcaagtg gtttatggaa 660
gaaatcgctt atgacatcac tgcccactac cctttgcccc ccagaaatgt cgagtggggt 720
gaaatccgag gcctcgaaac tgcatactgt attgatagca tggggaagac gaatggaggc 780
ttcgtggagc taggaccctg ccacaggatg ggtgggaacc agcttttccg aatcaatgaa 840
gcaaaccagc tcatgcagta cgaccagtgt ttgacaaagg ggcctgatgg atccaaagtc 900
atgatcacac actgtaacct aaatgaattt aaggaatggc agtacttcaa gagcctgcac 960
aggtttacgc acatcacttc cggaaagtgc ttagatcgat cggaggtcct gcatcaagtg 1020
ttcatctcca cctgtgactc cagtaaaatg actcagaagt gggagatgaa taacatccac 1080
agtgtttgac aagaacagag gaaaccaaca atctacctac tgacaagtac atttatggag 1140
gactgaaaac cgcctggaac ctgctgcaac cattattact aattttgtac agctccaaac 1200
ctggaacctc tctgatcagt tggaaggggc attgataaac tgtgatttta caataacatt 1260
atcatctgca gtgactgttt acaaaactgc tcttacctta aactctagat gtttacatcg 1320
ttttttgttt tgttttatga tgatgttggt aatttgtgcc tttaactcgg tttcctgaac 1380
cgccgagtta aagcatgtgt tgtcttcttt gggaatacac tcaggggtct ggaaggcagt 1440
ttggtttttt ttgttgttga tgatgttgtt cttgtttttt aacacacttg aaaaaaaaaa 1500
aaggttggag taagcagact ttcacatccg acttggtgat gatcaacctg ctgtgtattt 1560
aattttacat ctttcggaag cactgccacg ggtcgttggc cagggtggcc ttccttcagt 1620
tacgctgctg tttgaaaggt gaatttcaac acatttagtg cctctttcat ttctcagtat 1680
attgtttgag agcttctagt gacacttcta tgatggtgac aatgaatgtc acctggggaa 1740
cccgtctgtt actcacagga gaatttcttg gctatgaagt ggaatgttgt atggctgggt 1800
cgaggacaac agtgggccca actcaaggct gttccgtggg gcttgaagat tctgtggcat 1860
tacctccctg gcctctgttc acaccagctt ctaggctagc aaaggagtcc ttcttctaaa 1920
aggaggggtt ggtttttgcc catctacatt ttgcatctgc tttccccagt accagtcata 1980
gaaaactaaa cataattctc agtttgaaac ttgaaggggg gttgaggggc agggaaacaa 2040
cacaataaag ccctagtgtg gacgccttag gttggtcctg aggtaaaaat ccccaagccc 2100
ttgtgagatg gaagccttag agaaccacct cgaagcacaa gctgtgcaca gagataaact 2160
gacactttgt ctacattcaa aggaaattcc atgagcattc tctttaattt aggaaaatta 2220
gtatctaatt ttctattctt agatcttatt atctaagaat acaaatcatc aacaaatgtg 2280
gacgacattc tgcgaagtta gatgctagct ctgtagggtt ccttaatttc ttttttaaga 2340
agtataaatt ttttttatat tccccaggga aaagaagatt taatttgaac atttattaat 2400
acaataccta ctttaagaga accaaatgtt gaaaacttta atttctagga agtctcttat 2460
tacacccccc ttcccccaag ataaaatgtc tacattgagt gctaaaaaaa aaaaaaaaaa 2520
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2560
<210> 2
<211> 362
<212> PRT
<213> mouse
<400> 2
Arg Thr Arg Gly Leu Asp Ala His Cys Glu Val Ala Val Asn Trp Tyr
1 5 10 15
Ala Pro Leu Val Ala Pro Ile Ser Lys Asp Arg Thr Ile Cys Thr Val
20 25 30
Pro Ile Ile Asp Val Ile Ser Gly Asn Thr Tyr Glu Ile Ile Pro Gln
35 40 45
Gly Gly Gly Asp Glu Asp Gly Tyr Ala Arg Gly Ala Trp Asp Trp Ser
50 55 60
Met Leu Trp Lys Arg Val Pro Leu Thr Ser Arg Glu Lys Arg Leu Arg
65 70 75 80
Lys Thr Lys Thr Glu Pro Tyr Arg Ser Pro Ala Met Ala Gly Gly Leu
85 90 95
Phe Ala Ile Glu Lys Asp Phe Phe Phe Glu Leu Gly Leu Tyr Asp Pro
100 105 110
Gly Leu Gln Ile Trp Gly Gly Glu Asn Phe Glu Ile Ser Tyr Lys Ile
115 120 125
Trp Gln Cys Gly Gly Lys Leu Leu Phe Val Pro Cys Ser Arg Val Gly
130 135 140
His Ile Tyr Arg Leu Glu Gly Trp Gln Gly Asn Pro Pro Pro Leu Tyr
145 150 155 160
Val Gly Ser Ser Pro Thr Leu Lys Asn Tyr Val Arg Val Val Glu Val
165 170 175
Trp Trp Asp Glu Tyr Lys Asp Tyr Phe Tyr Ala Ser Arg Pro Glu Ser
180 185 190
Lys Ala Leu Pro Tyr Gly Asp Ile Ser Glu Leu Lys Lys Phe Arg Glu
195 200 205
Asp His Asn Cys Lys Ser Phe Lys Trp Phe Met Glu Glu Ile Ala Tyr
210 215 220
Asp Ile Thr Ala His Tyr Pro Leu Pro Pro Arg Asn Val Glu Trp Gly
225 230 235 240
Glu Ile Arg Gly Leu Glu Thr Ala Tyr Cys Ile Asp Ser Met Gly Lys
245 250 255
Thr Asn Gly Gly Phe Val Glu Leu Gly Pro Cys His Arg Met Gly Gly
260 265 270
Asn Gln Leu Phe Arg Ile Asn Glu Ala Asn Gln Leu Met Gln Tyr Asp
275 280 285
Gln Cys Leu Thr Lys Gly Pro Asp Gly Ser Lys Val Met Ile Thr His
290 295 300
Cys Asn Leu Asn Glu Phe Lys Glu Trp Gln Tyr Phe Lys Ser Leu His
305 310 315 320
Arg Phe Thr His Ile Thr Ser Gly Lys Cys Leu Asp Arg Ser Glu Val
325 330 335
Leu His Gln Val Phe Ile Ser Thr Cys Asp Ser Ser Lys Met Thr Gln
340 345 350
Lys Trp Glu Met Asn Asn Ile His Ser Val
355 360
<210> 3
<211> 942
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 3
gnccagtacc agtcatagaa aactaaacat aattctcagt ttgaaacttg aaggggggtt 60
gaggggcagg gaaacaacac aataaagccc tagtgtggac gccttaggtt ggtcctgagg 120
taaaaatccc caagcccttg tgagatggaa gccttagaga accacctcga agcacaagct 180
gtgcacagag ataaactgac actttgtcta cattcaaagg aaattccatg agcattcttt 240
ttaatttagg aaaattagta tctaattttc tattcttaga tcttattatc taagaataca 600
aatcatcaac aaatgtggac gacattctgc naagttagat gctanctctg tanggttcct 360
taattncttt tttaanaant ataaattttt tttatattcc ccangnaaaa naaaatttaa 420
tttnaacatt tattaataca atacctactt taacaaaacc aaatnttnaa aactttaatt 480
tctaaataaa nctcttatta caccccccct tccccnaata taaaatttcc tcnttaantn 540
ccatatnnnn actcnccttn nccntctttt tncatcctcc tnncctctnn tncnccnttn 600
cntnnnnccn nctcnctttt tttncncccc nntnccntct nnncntcttn ttnnctnncc 660
nttnctccnn tccccnnntt tntctntatt cntcntnctt tncctctntt ctcntncccn 720
ttntttctcc ctttcccctt cnntncnntn ctntnttttc tcttcctcct nnctnntnnc 780
ttnttcnctt ccncttttct cttcnctttn cccntcctnn ccctncccnn cntnncctct 840
nttctctntc cctttnnctn ccctcntctt ctnncncntn ctnctntctn tnntncntct 900
ccttctctnc tcnntcttcc cnntctccnc nnnttntccc cn 942
<210> 4
<211> 678
<212> DNA
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 4
aaatattatt catgttgtac caanctagta tagtatgtat gttttgtggg tgtgtatata 60
cgtaatatat tttatatata natanatatg agagagagng ntttagtgac tttgatacgg 120
gttggtgcag gtgantttat tactgagcca aatgaggcac ataccgagtc agcagttgga 180
gtccagggca ttcagtgctg tgcatggttg gcatacatgt acagtgccta tcccgtgcag 240
taagaatcac caccggcatg ccacatccag tactcagaac tcagagccag caatatttta 300
tttgtagaca atcagcttga atctatagat tttatgactg gcaaatgatt ataatcctga 360
acccataacg ctcgcaaaag gagacccaga gcgtcttgga gagacgtttg gtttggtttt 420
gtgcctggga gtcagtcagt acaacagcaa ctgtatgtgc ttatgttagt ctcaagatcc 480
ttaacttgtt gaccttatta ttttggaaat ttttttgtat tatatttgtg ggaaggtaaa 540
ataatgattt taagattttt atcaaatatg gagattagtt atttatgaaa aacaaagaaa 600
tgtctatttt tgtttctttg ttcccaatta atgtagataa ctttttaaaa tgcattaaag 660
caatggtgaa gaaaatgt 678
<210> 5
<211> 412
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 5
gnccagtact cagaactcag agccagcaat attttatttg tagacaatca gcttgaatct 60
atagatttta tgactggcaa atgattataa tcctgaaccc ataacgctcg caaaaggaga 120
cccagagcgt cttggagaga cgtttggttt ggttttgtgc ctgggagtca gtcagtacaa 180
cagcaactgt atgtgcttat gttagtctca agatccttaa cttgttgacc ttattatttt 240
ggaaattttt ttgtattata tttgtgggaa ggtaaaataa tgattttaag atttttatca 300
aatatggaga ttagttattt atgaaaaaca aagaaatgtc tatttttgtt tctttgttcc 360
caattaatgt agataacttt ttaaaatgca ttaaagcaat ggtgaagaaa at 412
<210> 6
<211> 16
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 6
aaatgtggac gacatt 16
<210> 7
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 7
tttggttttg ttaaagtagg t 21
<210> 8
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 8
agacaatcag cttgaatcta t 21
<210> 9
<211> 18
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 9
aggtcaacaa gttaagga 18
<210> 10
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse
<400> 10
gaggtggcag ttaactggta t 21
<210> 11
<211> 19
<212> DNA
<213> mouse
<400> 11
cgcactgcca gatcttgta 19
<210> 12
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 12
tagtgacttt gatacgggtt g 21
<210> 13
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 13
cccaggcaca aaaccaaacc a 21
<210> 14
<211> 271
<212> DNA
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 14
ggagnnnnnn cgtacaggtc cagagccaag ggtgaagaca aagacaaagc ctcttgatag 60
gaaaaaaaag gcttgtgggc tggagagatg gctcagcggt taagagtaca gactgctcta 120
ccagaggtcc tgacttcaat tcccagtaac cacatgttgg cccacaacca tctataatgg 180
gatctgatac cctcttctgg tgtgtctgaa gacagcaaca gtgtactcac atacataaaa 240
caaataaata tatcttaaaa aaaaaaaaaa a 271
<210> 15
<211> 4818
<212> DNA
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 15
ggagcgccga ggccagtgtt ggacactttc ccaccatgcc gacaacagtt taaatatctg 60
tcagctttct aaaagtttaa ctgaaggaaa cctctaagac ttcgtacctg aggaccaaag 120
tgcagccacc aattatcaga ctttcaggat gaatctggaa aaactcagca agcctgaac 180
tcctgacactg ttcagtatcc ttgaaggaga acttgaagca agagaccttg ttatagaagc 240
tttaaaggcc caacacagag atactttcat tgaagaacgc tatggaaaat ataacatcag 300
tgaccctcta atggctcttc agagagattt tgaaacactg aaggagaaaa atgatagtga 360
gaagcagcca gtgtgcacaa accccctctc tgtcctcaag gcggtgatga agcagtgcaa 420
gaacatgcag gagcgcatgc tgtcccagct ggccgcagcc gagagcaggc accgcaaggt 480
gatcctcgac cttgaagaag aaagacagag gcatgcacag gacactgctg aaggagatga 540
tgtcacctac atgctggaga aggagaggga gagactgacg cagcagttgg aatttgagaa 600
gtcccaagtg aaaaagtttg aaaaagaaca aaagaagctg tccagtcagt tggaggagga 660
gcgcacccgc cacaagcagc tctcttccat gctggtgctc gagtgcagga aggccactag 720
caaggcagcc gaggaagggc agaaggccgg agagctgagc ctgaaactgg acaaggagaa 780
gagccgggcg agcaagctag aggaagagtt ggcagccgag aggaagcggg gcctgcagac 840
ggaggcccag gtggagaagc agctgtctga gttcgatatc gaaagggagc agctgagagc 900
caaactgaac cgagaggaga accggacccg tgccctgaag gaggaggtgg agagcctgaa 960
gaagcttgtg aaagacctag aggcagccca gcagcaccgc agcaccagtg agcagggcag 1020
ggagccagtg accatgtcca gaggcacagc cacggagcct cccatgcgag tgtctgcgtt 1080
ttgtcaaaca gagagtgttc agacagaaag aagccacggg agtgtcataa ccaagctgac 1140
agacactggt cttccaggtc ccaccacggc tgcttactca tatgctaaag ctaatggcca 1200
ctgtgaccca gagatacaga ctaccaggga gttgacctca gacagcagca cagaaaacca 1260
agggcctcca cgggagaaat ctgcagtagc ggctcaggag aaaccagtgg agaatggtgg 1320
gtgtcctgta ggaactgaga ctccagtcac gatgcctagt cacctccctt ccagtggcag 1380
ctccctgtct cccagcagca cagcctcttc ctctctgaca tcatctcctt gctcctcccc 1440
agttctaacc aagcgtctct tggggtcagc agccagcagc ccgggctacc agtcttccta 1500
ccaagtcggg atcaaccagc gcttccatgc cgctcggcac aaatttcagt cccaggcgga 1560
tcaggatcag caagccagcg gtctccagag ccctccatcc agggacctgt cccctaccct 1620
gttagacaac tctgctgcca agcagctggc ccgaaacaca gtcactcagg tgctctccag 1680
attcactaac caagggccaa ttaagcccgt ctctcccaac agttctccct ttgggacaga 1740
ctaccgaaat ctggccagca ctgccagccc aagaggtgac accagccatt cacccactcc 1800
agggaaagtg tccagccctc tgagccccct ctctccagga atcaagtccc caaccatccc 1860
cagagctgag agaggaaacc ctccgccaat cccgcccaaa aagcctggcc tcaccccttc 1920
gcagtctgcc accactccag taaccaagac tcattcccag gcatcctccc tggccgccac 1980
agaagacctc gccagcagct gctcccccag tgccgtggtg gccaatggca aagatgttga 2040
gatacttttg cctaccagca gctagtccct agggctgagt ctccacattt gacattccat 2100
cagactcggg ccaagagctc agcgttaaac cctggagtca aatcatgtta tttatttgat 2160
agtagctaca gccatctgta taatacattc agtgtattta cctttttgta tttttttaag 2220
tagaaattga atactttgga tttttatgac tcacctcttt gtactaagct agaaggggac 2280
ctcatagaca tagcgcatct caagctctgc acttgccagc gtgctgcgac gaggcggctg 2340
actggggacc aggcggtgct actgccagtc ggggagctag aattcattac tcagcactca 2400
tttcaaatta tgcagaagcg gttcgtgcag atttttattc cagatgaaca tgttttaaaa 2460
gtgcctgaaa tcgcctgcca cgggaatgtg attctgcggc agaaacaaaa gacagagcat 2520
ttcttgcagc aaatgagatc ctctgtgaat ctgaatgtca aaaaaaccaa cactgctttt 2580
aatcctctct gactgtttaa tgccagcttt gtgttctgaa ccgaggtttg cataagtaga 2640
gtggaaatcc ttctgaaggg cgggaactct gtcaggctga gctctgtaaa gccctcaaga 2700
aaccctccag aacacttagc agttggggtg ctgattttct tgtgctttgg aaaaccttaa 2760
gtcattctcc gtttcctgca tcacttcttg agtagtgaag tcacgtctcc attcaaacca 2820
accctcaagc atcggccatg ggaacttctg attctggttg cttttacttg aataggaaat 2880
gacataatga actctttatt ctgtgatcaa aaagcaataa cttaacaagt cagtctttgt 2940
aatactgtaa gtcagaatta tacagatttt accaaattgt tacattcact ctccatgctg 3000
ccagcacttc tatctatgga accaaatggg cgtatatctg tatctgtata gtacacaccc 3060
cttttacatg ttcagcattc tcacactcaa gcacataagt attagtgcaa ttgtatctct 3120
ggagcttgca gctgtagcat aaaggacaaa gtagaatcaa tcgcatgtta agattaccta 3180
ccaaagcaat tagactgtga cttggagcca gtcagtcaac aaagaaatcc atttgacaag 3240
gaagtggaca atcccaaact aagctcacat catcagcatc ataggaaagc ccattaaatc 3300
gtcctagtgc cacagaactc agctagccat gtgagtgagt gagacagcac agcccctcaa 3360
gtgctatcca ctcagccata gcatcctagc cccgtgtaat ggggccaccc ctttgagccc 3420
cagctcctgt catgcaaaaa ttgcagatgg aggttaccaa ttctctaaac gttcatggaa 3480
ttgagattcc cacaagaaga ttctcattct gattttaaat gttttttaaa tgctgctgat 3540
tagacaaaca tggctgcaaa tgactttagc ttgcaggcta ccaagctgca gcctctccct 3600
ccctagaacc tgtgctgttt cccttgtagt gagttgtaca gacagaaacc cccaggcttc 3660
tccactgtgt cagctacatc tgaccaagtc cacagagcag gacagccttg ctcttggcaa 3720
gcagaacccc cgacacacca gctcaggaca ctggttacac agttttttat ccagagtaag 3780
agagaggaag gccttggtgt ctttacataa attgttctgg ccagcatcta cccagaagcc 3840
cctgcactac tgtaaccgtt tatagggaag gagaatgggt gatcattgga aacacctgat 3900
catgtttggc aaaaccaaag gattcagtgg gcccattcag atgagtcaca aggaattagc 3960
aattgatgtc cgtctggaac cacagagctg aaaacaaaaa gtctccctaa taatttagct 4020
aatagctctt aagtaaaatt ttattaaccc tttgagtcag tgggcaagag gcaggtgatt 4080
aaaatcttgg tgggcaagtc aacaacaggg tatactgttg actctccagc ttacagttta 4140
aatggttaag gtaaatgcat gacacatgaa agtgtggctg gtgtctgctg aaatgatgga 4200
gacatgtgaa actgtcccga gcgatcctgc atggaattta ctcctattgc ggacgcaaaa 4260
tagaccagtg atgatcaaac gctgaacctt ctcctcagga gagactgcag ggcctcagtg 4320
ttcttacctc tcttgcttta aatggtaatc ttaaaagctg tgttgtgctc ttcctctgtt 4380
tggagacaga tatatataga gaaagagaaa tgctataggg gagtttattt cttggggggg 4440
atgcactgaa caatatttct tttacagtat aatacagggg tgggatatgc aaaagaaatg 4500
tgtatttttg ctagttccta tcttctgaga taataagcac aatcctgaaa tggatccaat 4560
aattcagcta gatattatag attagtattt cagtttgcag tagattgtga gtgtgtgcgc 4620
taagtaaaag ttccatgatt cacaatttgg gtattaacca tatcaaagaa gctgttactg 4680
gtcagcagaa tctaatgatg tgctcggtgt aacacaagcg ttaactaagt cattaacatt 4740
tgtaaggcca agtgcagaag tcttcatttt tatagtagac tacattaaaa caagttaaat 4800
cgcaaaaaaa aaaaaaaa 4818
<210> 16
<211> 600
<212> PRT
<213> mouse, bone marrow stroma cell
<400> 16
Met Asn Leu Glu Lys Leu Ser Lys Pro Glu Leu Leu Thr Leu Phe Ser
1 5 10 15
Ile Leu Glu Gly Glu Leu Glu Ala Arg Asp Leu Val Ile Glu Ala Leu
20 25 30
Lys Ala Gln His Arg Asp Thr Phe Ile Glu Glu Arg Tyr Gly Lys Tyr
35 40 45
Asn Ile Ser Asp Pro Leu Met Ala Leu Gln Arg Asp Phe Glu Thr Leu
50 55 60
Lys Glu Lys Asn Asp Ser Glu Lys Gln Pro Val Cys Thr Asn Pro Leu
65 70 75 80
Ser Val Leu Lys Ala Val Met Lys Gln Cys Lys Asn Met Gln Glu Arg
85 90 95
Met Leu Ser Gln Leu Ala Ala Ala Glu Ser Arg His Arg Lys Val Ile
100 105 110
Leu Asp Leu Glu Glu Glu Arg Gln Arg His Ala Gln Asp Thr Ala Glu
115 120 125
Gly Asp Asp Val Thr Tyr Met Leu Glu Lys Glu Arg Glu Arg Leu Thr
130 135 140
Gln Gln Leu Glu Phe Glu Lys Ser Gln Val Lys Lys Phe Glu Lys Glu
145 150 155 160
Gln Lys Lys Leu Ser Ser Gln Leu Glu Glu Glu Arg Thr Arg His Lys
165 170 175
Gln Leu Ser Ser Met Leu Val Leu Glu Cys Arg Lys Ala Thr Ser Lys
180 185 190
Ala Ala Glu Glu Gly Gln Lys Ala Gly Glu Leu Ser Leu Lys Leu Asp
195 200 205
Lys Glu Lys Ser Arg Ala Ser Lys Leu Glu Glu Glu Leu Ala Ala Glu
210 215 220
Arg Lys Arg Gly Leu Gln Thr Glu Ala Gln Val Glu Lys Gln Leu Ser
225 230 235 240
Glu Phe Asp Ile Glu Arg Glu Gln Leu Arg Ala Lys Leu Asn Arg Glu
245 250 255
Glu Asn Arg Thr Arg Ala Leu Lys Glu Glu Val Glu Ser Leu Lys Lys
260 265 270
Leu Val Lys Asp Leu Glu Ala Ala Gln Gln His Arg Ser Thr Ser Glu
275 280 285
Gln Gly Arg Glu Pro Val Thr Met Ser Arg Gly Thr Ala Thr Glu Pro
290 295 300
Pro Met Arg Val Ser Ala Phe Cys Gln Thr Glu Ser Val Gln Thr Glu
305 310 315 320
Arg Ser His Gly Ser Val Ile Thr Lys Leu Thr Asp Thr Gly Leu Pro
325 330 335
Gly Pro Thr Thr Ala Ala Tyr Ser Tyr Ala Lys Ala Asn Gly His Cys
340 345 350
Asp Pro Glu Ile Gln Thr Thr Arg Glu Leu Thr Ser Asp Ser Ser Thr
355 360 365
Glu Asn Gln Gly Pro Pro Arg Glu Lys Ser Ala Val Ala Ala Gln Glu
370 375 380
Lys Pro Val Glu Asn Gly Gly Cys Pro Val Gly Thr Glu Thr Pro Val
385 390 395 400
Thr Met Pro Ser His Leu Pro Ser Ser Gly Ser Ser Leu Ser Pro Ser
405 410 415
Ser Thr Ala Ser Ser Ser Leu Thr Ser Ser Pro Cys Ser Ser Pro Val
420 425 430
Leu Thr Lys Arg Leu Leu Gly Ser Ala Ala Ser Ser Pro Gly Tyr Gln
435 440 445
Ser Ser Tyr Gln Val Gly Ile Asn Gln Arg Phe His Ala Ala Arg His
450 455 460
Lys Phe Gln Ser Gln Ala Asp Gln Asp Gln Gln Ala Ser Gly Leu Gln
465 470 475 480
Ser Pro Pro Ser Arg Asp Leu Ser Pro Thr Leu Leu Asp Asn Ser Val
485 490 495
Ala Lys Gln Leu Ala Arg Asn Thr Val Thr Gln Val Leu Ser Arg Phe
500 505 510
Thr Asn Gln Gly Pro Ile Lys Pro Val Ser Pro Asn Ser Ser Pro Phe
515 520 525
Gly Thr Asp Tyr Arg Asn Leu Ala Ser Thr Ala Ser Pro Arg Gly Asp
530 535 540
Thr Ser His Ser Pro Gly Thr Pro Ser Gln Ser Ala Thr Thr Pro Val
545 550 555 560
Thr Lys Thr His Ser Gln Ala Ser Ser Leu Ala Ala Thr Glu Asp Leu
565 570 575
Ala Ser Ser Cys Ser Pro Ser Ala Val Val Ala Asn Gly Lys Asp Val
580 585 590
Glu Ile Leu Leu Pro Thr Ser Ser
595 600
<210> 17
<211> 19
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 17
acaaagcctc ttgatagga 19
<210> 18
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 18
agacacacca gaagagggta t 21
<210> 19
<211> 20
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 19
attgtgagtg tgtgcgctaa 20
<210> 20
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 20
gacttctgca cttggcctta c 21
<210> 21
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 21
ctctgtcctc aaggcggtga t 21
<210> 22
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 22
gagctgcttg tggcgggtgc g 21
<210> 23
<211> 2896
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 23
gtgtttgttc ctgcggagga gccggcgcca tggcggttct cttggagacc actctgggcg 60
acgtggtcat cgacttgtac actgaagagc gtccccgggc ttgcttgaat tttttgaagc 120
tgtgcaaaat aaaatattac aactattgcc tcatacacaa tgtacagagg gattttatca 180
tacaaacagg agatcccacg gggactggcc gcggaggaga gtctatattt ggacaactgt 240
atggtgatca agcaagcttt tttgaagcag aaaaagtacc aaggataaag cacaagaaga 300
aaggcactgt gtccatggtg aacaacggca gtgaccagca cgggtctcag tttcttatca 360
ctacaggaga aaacttagat taccttgacg gtgttcatac agtgtttggt gaagtgacag 420
aaggcatgga catagttaag aaaatcaatg agacctttgt ggacaaggat tttgtaccat 480
atcaagatat aaggataaat catacagtga ttttagatga tccatttgat gaccctcctg 540
atttattaat tcctgatcga tcacccgagc ctacaaagga acaattagat agtggtcgaa 600
taggagcaga tgaagaaatt gatgacttca aaggaagatc agctgaagaa gtagaagaaa 660
taaaggcaga aaaagaggct aaaactcaag ctattctctt ggagatggtg ggagacttac 720
ctgatgcaga tattaaacct ccagaaaatg tgctgtttgt gtgtaaattg aatccagtga 780
ccacagatga ggacttggag ataatattct caagatttgg gccaataaga agttgtgaag 840
ttatccggga ttggaaaaca ggagagtccc tctgttatgc ttttattgaa tttgaaaagg 900
aagaagactg tgagaaagca ttcttcaaaa tggataatgt gcttatagat gacaggagga 960
tacatgtgga tttcagccag tctgttgcaa aggttaaatg gaaaggaaaa ggtgggaaat 1020
ataccaagag tgatttcaag gagtatgaaa aggaacagga taaaccagcc aatttggttc 1080
tgaaagaaaa agtaaagccc aaacaggatg caaaatatga tcttatacta gatgagcagg 1140
gagaagactc caaatcaagt cactcacaca caagtaaaaa gcacaaaaag aaaacacgcc 1200
actgctccga agaaaaagaa gatgaagagt acatgccaat caaaaatcct aatcaggata 1260
tctacaggga aatgggtttt ggtcattatg aagaagaaga aagctgttgg gagaaacaga 1320
agaatgaaaa gagagaccga cgtcagaacc gcagtcgtag ccggtctcga gaaagggatg 1380
gtcactatag caacagccac aaacccaagt accagacaga accttatgag agggaaagaa 1440
gcagaaagag ggacagaagc aggagtccaa agaaatccaa agctaaagaa aaatccaagt 1500
acagatgagc agaggaggtg gacaattgta gcaggtctgc tccggcctga gctggggcac 1560
gcagacgcac tcagtgcctg ccagcacagc tgactgcggt ttcgatgtta gcgttgttgc 1620
ctttcaggtt acactgatgg tgtggggctc tggaagagag ggaggcattt tgtgtatact 1680
ttttatacaa attttattgt tgtgcataca tggtaacgtt catatttgac atctttcata 1740
gtttcagtct tttaagaatg aatcatttca tatcacagaa gtccataaac ttgtatgtaa 1800
agcataaaac agaaaatgta cctggctgca gcgcaagagg taagagtgtc actcactatg 1860
aaagctccat atatcccttc tccttgcagg aattattctg agttgtgttt accctgctgt 1920
taattttgta tgtttttgaa ttttatacaa atggcacaat gtatattttc cttctgtgac 1980
tttctttttt taagagtcca tttattttta ttgttacata gttgtgaatg tactacgctt 2040
gatctgttga tggactttta ggttgtttgt tagtttttgc tatctgagga atgccactgt 2100
gaacatttca actgagcatg gcactttctg gccatgtggt ttgagttttc aatgcattta 2160
tagttatggt tgctgtaatt tacctggtat gtgaattgta tggggtcagg ggtagccaca 2220
agagtagtta gtctaccata cagctcagag cacatttgct ccattattgt acatagtttt 2280
gactaccaat agaaaaggct taactatatc aggagctagc atcttttcta gggagatggc 2240
tcagtgggta cagtgtttcc tcatcagcac aggactgagt tcagatcctc accacatacc 2400
cagtgcatgc gactaataat ccagtactgg ggagacagga gcgggggaag ctccaggcag 2460
ttcgagtgac cgaggaagac actcggcact gacctcttgc ctccacatac tgtacaaact 2520
cgtgcgtgca ggcacacaca cacccgaata cacagctgtt ctgcatacag aacggtaggt 2580
gttgctcaca cagatgaacc taaaacatgg tctagaagaa tgagcaggga caggctggaa 2640
gcaacgagaa gtcatccact gactgcggag actcgattta agagctctgg agtattgaaa 2700
taggaaaatg tatgcaccaa gcgtttcaag gaaaacatat ccttgattcc aaatgataag 2760
aaaccgtttt atttttccta tgtatttgac agtaactata tgcttatggg agtgtaatat 2820
gtttgctata tgttaatatt ctggaacaag taaatccatt tgcagacata tcagcttact 2880
tttttctttc ttttgg 2896
<210> 24
<211> 493
<212> PRT
<213> mouse, Neuro2a
<400> 24
Met Ala Val Leu Leu Glu Thr Thr Leu Gly Asp Val Val Ile Asp Leu
1 5 10 15
Tyr Thr Glu Glu Arg Pro Arg Xaa Xaa Cys Leu Asn Phe Leu Lys Leu
20 25 30
Cys Lys Ile Lys Tyr Tyr Asn Tyr Cys Leu Ile His Asn Val Gln Arg
35 40 45
Asp Phe Ile Ile Gln Thr Gly Asp Pro Thr Gly Thr Gly Arg Gly Gly
50 55 60
Glu Ser Ile Phe Gly Gln Leu Tyr Gly Asp Gln Ala Ser Phe Phe Glu
65 70 75 80
Ala Glu Lys Val Pro Arg Ile Lys His Lys Lys Lys Gly Thr Val Ser
85 90 95
Met Val Asn Asn Gly Ser Asp Gln His Gly Ser Gln Phe Leu Ile Thr
100 105 110
Thr Gly Glu Asn Leu Asp Tyr Leu Asp Gly Val His Thr Val Phe Gly
115 120 125
Glu Val Thr Glu Gly Met Asp Ile Val Lys Lys Ile Asn Glu Thr Phe
130 135 140
Val Asp Lys Asp Phe Val Pro Tyr Gln Asp Ile Arg Ile Asn His Thr
145 150 155 160
Val Ile Leu Asp Asp Pro Phe Asp Asp Pro Pro Asp Leu Leu Ile Pro
165 170 175
Asp Arg Ser Pro Glu Pro Thr Lys Glu Gln Leu Asp Ser Gly Arg Ile
180 185 190
Gly Ala Asp Glu Glu Ile Asp Asp Phe Lys Gly Arg Ser Ala Glu Glu
195 200 205
Val Glu Glu Ile Lys Ala Glu Lys Glu Ala Lys Thr Gln Ala Ile Leu
210 215 220
Leu Glu Met Val Gly Asp Leu Pro Asp Ala Asp Ile Lys Pro Pro Glu
225 230 235 240
Asn Val Leu Phe Val Cys Lys Leu Asn Pro Val Thr Thr Asp Glu Asp
245 250 255
Leu Glu Ile Ile Phe Ser Arg Phe Gly Pro Ile Arg Ser Cys Glu Val
260 265 270
Ile Arg Asp Trp Lys Thr Gly Glu Ser Leu Cys Tyr Ala Phe Ile Glu
275 280 285
Phe Glu Lys Glu Glu Asp Cys Glu Lys Ala Phe Phe Lys Met Asp Asn
290 295 300
Val Leu Ile Asp Asp Arg Arg Ile His Val Asp Phe Ser Gln Ser Val
305 310 315 320
Ala Lys Val Lys Trp Lys Gly Lys Gly Gly Lys Tyr Thr Lys Ser Asp
325 330 335
Phe Lys Glu Tyr Glu Lys Glu Gln Asp Lys Pro Ala Asn Leu Val Leu
340 345 350
Lys Glu Lys Val Lys Pro Lys Gln Asp Ala Lys Tyr Asp Leu Ile Leu
355 360 365
Asp Glu Gln Gly Glu Asp Ser Lys Ser Ser His Ser His Thr Ser Lys
370 375 380
Lys His Lys Lys Lys Thr Arg His Cys Ser Glu Glu Lys Glu Asp Glu
385 390 395 400
Glu Tyr Met Pro Ile Lys Asn Pro Asn Gln Asp Ile Tyr Arg Glu Met
405 410 415
Gly Phe Gly His Tyr Glu Glu Glu Glu Ser Cys Trp Glu Lys Gln Lys
420 425 430
Asn Glu Lys Arg Asp Arg Arg Gln Asn Arg Ser Arg Ser Arg Ser Arg
435 440 445
Glu Arg Asp Gly His Tyr Ser Asn Ser His Lys Pro Lys Tyr Gln Thr
450 455 460
Glu Pro Tyr Glu Arg Glu Arg Ser Arg Lys Arg Asp Arg Ser Arg Ser
465 470 475 480
Pro Lys Lys Ser Lys Ala Lys Glu Lys Ser Lys Tyr Arg
485 490
<210> 25
<211> 20
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 25
aataggaaaa tgtatgcacc 20
<210> 26
<211> 21
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 26
tagcaaacat attacactcc c 21
<210> 27
<211> 348
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 27
gatacagggg tgggatatgc aaaagaaatg tgtatttttg ctagttccta tcttctgaga 60
taataagcac aatcctgaaa tggatccaat aattcagcta gatattatag attagtattt 120
cagtttgcag tagattgtga gtgtgtgcgc taagtaaaag ttccatgatt cacaatttgg 180
gtattaacca tatcaaagaa gctgttactg gtcagcagaa tctaatgatg tgctcggtgt 240
aacacaagcg ttaactaagt cattaacatt tgtaaggcca agtgcagaag tcttcatttt 300
tatagtagac tacattaaaa caagttaaat cgcaaaaaaa aaaaaaaa 34
8
<210> 28
<211> 280
<212> DNA
<213> mouse, Neuro2a
<400> 28
gncatggtcc ataanaatga gcagggacag gcnggangcn acnanaangc ntccactgnc 60
tgcggngact cnantcaana gctntggngn atngaaatag gaaaatgtat gcaccaagcg 120
ttncaaggaa aacatatcct tgattccaaa tgataagaaa ccgttttatt tttcctatgt 180
atttgacagt aactatatgc ttatgggagt gtaatatgtt tgctatatgt taatattctg 240
gaacaagtaa atccatttgc agncatanca aaaaaaaaaa 280
【図1】 例1において行った電気泳動の結果を示す模
式図。
式図。
【図2】 例1において行った電気泳動の結果を示す模
式図。
式図。
【図3】 例3において行った電気泳動の結果を示す模
式図。
式図。
【図4】 本発明の態様に従うプローブ固定化基体の1
例を示す図。
例を示す図。
【図5】 本発明の態様に従うプローブ固定化基体の1
例を示す図。
例を示す図。
11,12,13,14,17,18,19,20,2
1.プローブ 15.固定化領域 16,22.基
体 23.電極 24.パット
1.プローブ 15.固定化領域 16,22.基
体 23.電極 24.パット
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
G01N 33/53 G01N 37/00 102
C12N 15/00 ZNAA
37/00 102 F
Fターム(参考) 4B024 AA11 BA80 CA04 CA05 CA06
CA07 CA09 CA11 DA02 DA06
EA04 FA10 GA11 GA18 GA19
HA03 HA08 HA12 HA14
4B063 QA01 QA18 QQ20 QQ52 QR08
QR14 QR32 QR38 QR41 QR42
QR55 QR62 QR66 QR82 QS12
QS25 QS34 QS39 QX02
4H045 AA10 AA11 AA30 BA10 CA40
DA75 DA86 EA50 FA72 FA74
GA26
(54)【発明の名称】 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸
検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来
するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱
性を検出する方法
Claims (10)
- 【請求項1】 化学物質の内分泌撹乱性を検出するため
の核酸であって、配列番号1に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号3に記載の塩基配列およびその
相補的配列、配列番号4に記載の塩基配列およびその相
補的配列、並びに配列番号5に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号14に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号15に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号23に記載の塩基配列およびそ
の相補的配列、配列番号27に記載の塩基配列およびそ
の相補配列、配列番号28に記載の塩基配列およびその
相補配列からなる群より選択される塩基配列で示される
核酸。 - 【請求項2】 請求項1に記載の塩基配列と85%から
100%で相同性を有する塩基配列により示される核
酸。 - 【請求項3】 請求項1に記載の塩基配列に含まれる連
続した15塩基から30塩基よりなる核酸。 - 【請求項4】 請求項3に記載の核酸、並びに、配列番
号6により示される核酸、配列番号7により示される核
酸、配列番号8により示される核酸、配列番号9により
示される核酸、配列番号10により示される核酸、配列
番号11により示される核酸、配列番号12により示さ
れる核酸、配列番号13により示される核酸、配列番号
17により示される核酸、配列番号18により示される
核酸、配列番号19により示される核酸、配列番号20
により示される核酸、配列番号21により示される核
酸、配列番号22により示される核酸、配列番号25に
より示される核酸および配列番号26により示される核
酸からなる群より選択される核酸を含む核酸検出用プロ
ーブ。 - 【請求項5】 請求項3に記載の核酸、並びに配列番号
6により示される核酸、配列番号7により示される核
酸、配列番号8により示される核酸、配列番号9により
示される核酸、配列番号10により示される核酸、配列
番号11により示される核酸、配列番号12により示さ
れる核酸、配列番号13により示される核酸、配列番号
17により示される核酸、配列番号18により示される
核酸、配列番号19により示される核酸、配列番号20
により示される核酸、配列番号21により示される核
酸、配列番号22により示される核酸、配列番号25に
より示される核酸および配列番号26により示される核
酸からなる群より選択される核酸を含む核酸検出用プラ
イマ−。 - 【請求項6】 基体と、前記基体に固相化された、請求
項4に記載の核酸検出用プローブを少なくとも1種類具
備するプローブ固定化チップ。 - 【請求項7】 化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法
であって、 (a)検体に対して前記化学物質を作用させることと、 (b)前記化学物質を作用させた後に前記検体から検体
核酸を得ることと、 (c)前記検体核酸と請求項4に記載の核酸検出用プロ
ーブとを反応させることと、 (d)核酸検出用プローブと標的核酸とのハイブリダイ
ゼーションを検出するとにより前記標的核酸の発現程度
を得ることと、 (e)前記(d)で得られた前記標的核酸の発現程度
と、検体に対して前記化合物を作用させない場合の前記
標的核酸の発現程度とを比較することによって、前記化
学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方
法。 - 【請求項8】 化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法
であって、 (a)検体に対して前記化学物質を作用させることと、 (b)前記化学物質を作用させた後に前記検体から検体
核酸を得ることと、 (c)前記検体核酸を、請求項5に記載の核酸検出用プ
ライマーの2種類以上と核酸増幅用酵素とを用いて増幅
産物を得ることと、 (d)前記(c)で得た増幅産物を解析するとにより前
記標的核酸の発現程度を得ることと、 (e)前記(d)で得られた前記標的核酸の発現程度
と、検体に対して前記化合物を作用させない場合の前記
標的核酸の発現程度とを比較することによって、前記化
学物質の内分泌撹乱性を検出することと、を具備する方
法。 - 【請求項9】 配列番号2、配列番号16および配列番
号24の何れか1に記載のアミノ酸配列により示される
ペプチド。 - 【請求項10】 請求項9の何れか1項に記載のペプチ
ドを認識する抗体。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003010742A JP2003310282A (ja) | 2002-02-19 | 2003-01-20 | 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法 |
US10/367,687 US20040002087A1 (en) | 2002-02-19 | 2003-02-19 | Nucleic acid for detecting endocrine disrupting property of chemical substance, nucleic acid detecting probe and nucleic acid detecting primer containing the nucleic acid, probe-immobilized chip comprising the nucleic acid detecting probe, peptide derived from the nucleic acid and antibody recognizing the peptide, probe-immobilized chip comprising the antibody, and method of detecting endocrine disrupting property of chemical substance using them |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2002041975 | 2002-02-19 | ||
JP2002-41975 | 2002-02-19 | ||
JP2003010742A JP2003310282A (ja) | 2002-02-19 | 2003-01-20 | 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2003310282A true JP2003310282A (ja) | 2003-11-05 |
Family
ID=29551701
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003010742A Abandoned JP2003310282A (ja) | 2002-02-19 | 2003-01-20 | 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20040002087A1 (ja) |
JP (1) | JP2003310282A (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111020709A (zh) * | 2019-12-31 | 2020-04-17 | 江苏猎阵生物科技有限公司 | 一种基因芯片及试剂盒 |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP4548359B2 (ja) * | 2006-02-20 | 2010-09-22 | 株式会社島津製作所 | 反応キット処理装置 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5776672A (en) * | 1990-09-28 | 1998-07-07 | Kabushiki Kaisha Toshiba | Gene detection method |
US6228589B1 (en) * | 1996-10-11 | 2001-05-08 | Lynx Therapeutics, Inc. | Measurement of gene expression profiles in toxicity determination |
US6160105A (en) * | 1998-10-13 | 2000-12-12 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Monitoring toxicological responses |
-
2003
- 2003-01-20 JP JP2003010742A patent/JP2003310282A/ja not_active Abandoned
- 2003-02-19 US US10/367,687 patent/US20040002087A1/en not_active Abandoned
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111020709A (zh) * | 2019-12-31 | 2020-04-17 | 江苏猎阵生物科技有限公司 | 一种基因芯片及试剂盒 |
CN111020709B (zh) * | 2019-12-31 | 2023-06-30 | 江苏猎阵生物科技有限公司 | 一种基因芯片及试剂盒 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20040002087A1 (en) | 2004-01-01 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102114412B1 (ko) | 위장관췌장 신경내분비 신생물 (GEP-NENs)의 예측 방법 | |
KR101446626B1 (ko) | 신장암 진단, 신장암 환자 예후 예측을 위한 조성물 및 방법 | |
US20150218620A1 (en) | Methods to capture and/or remove highly abundant rnas from a heterogenous rna sample | |
AU2013277971B2 (en) | Molecular malignancy in melanocytic lesions | |
RU2721916C2 (ru) | Способы прогнозирования рака предстательной железы | |
US20030228617A1 (en) | Method for predicting autoimmune diseases | |
US20230416827A1 (en) | Assay for distinguishing between sepsis and systemic inflammatory response syndrome | |
CN111183233A (zh) | 使用靶基因表达的数学建模评估Notch细胞信号传导途径活性 | |
CN109863251A (zh) | 对肺鳞状细胞癌亚型分型的方法 | |
KR20200123450A (ko) | 전립선암 검출 및 치료 방법 | |
US20030190639A1 (en) | Genes involved in intestinal inflamatory diseases and use thereof | |
JP2003159059A (ja) | 痛みに関連する分子の同定及び使用 | |
DK3201630T3 (en) | Multiplex assay for simultaneous detection of TP53 / CEN17 / B cell gene protein and uniquely specific probes for 19Q12, INSR, ATM, DLEU2, TP53 and 13Q12 | |
US20080199480A1 (en) | Methods for Identifying Risk of Type II Diabetes and Treatments Thereof | |
KR102046839B1 (ko) | 대장암의 시험관내 진단 또는 예후 예측 방법 | |
US20020137077A1 (en) | Genes regulated in activated T cells | |
CN110541031A (zh) | 一种用于卵巢癌的体外诊断或预后的方法 | |
JP2003235573A (ja) | 糖尿病性腎症マーカーおよびその利用 | |
CN109628604A (zh) | 与肌内脂肪相关的新circRNA及其应用 | |
JP2003310282A (ja) | 化学物質の内分泌撹乱性を検出するための核酸、その核酸を含む核酸検出用プローブおよび核酸検出用プライマー、その核酸検出用プローブを具備するプローブ固定化チップ、その核酸に由来するペプチドおよびそのペプチドを認識する抗体、並びにそれらを用いた化学物質の内分泌撹乱性を検出する方法 | |
US20220251651A1 (en) | Methods of characterizing resistance to modulators of cereblon | |
KR102480128B1 (ko) | 면역력 강화 소 African Humped Cattle (AFH) 품종 특이적 단일염기다형성 및 그의 용도 | |
KR102480124B1 (ko) | 생식능 강화 소 African Humped Cattle (AFH) 품종 특이적 단일염기다형성 및 그의 용도 | |
CN101300348A (zh) | 肾癌诊断、肾癌患者预后预测用的组合物及方法 | |
KR101599753B1 (ko) | Egfr 엑손21 l858r 유전자 다형 검출용 프라이머 및 그 용도 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20040609 |
|
A762 | Written abandonment of application |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A762 Effective date: 20070706 |