JP2002522751A - 乳癌を診断、監視、病期決定、造影及び治療する新規な方法 - Google Patents

乳癌を診断、監視、病期決定、造影及び治療する新規な方法

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、乳癌を検出、診断、監視、病期決定、予知、造影及び治療する新規な方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 発明の分野 本発明は、癌、特に乳癌を検出、診断、監視、病期決定、予知、造影及び治療
するために新規に開発されたアッセイに一部関する。 背景技術 アメリカ人女性では、平均寿命を85歳として、その9人に1人が人生のある
時期に乳癌を発症する。年間、18万人以上の米国女性が乳癌と診断され、約4
6,000人がこの疾患で死亡する。
【0002】 どんな女性も乳癌に罹る危険がある。乳癌を発症する可能性は加齢とともに増
加する;癌が発見される女性の80%は50歳以上である。女性の発癌可能性を
高め得るいくつかの危険因子も存在する。この疾患の家族歴を有する女性、30
歳以後に最初の子供を産んだか、又は子供を産んだことのない女性、月経が早い
時期に始まった女性は、そのリスクが高い可能性がある。
【0003】 しかしながら、乳癌を発症する女性の70%以上で既知の危険因子がない。1
994年に発見されたBRCA1遺伝子との関連が考えられる乳癌の症例は10
%に満たない。研究者たちは、栄養、アルコール、運動、喫煙、及び経口避妊薬
のような他の因子が癌の予防に果たし得る役割について研究している。
【0004】 他の癌と同じように、乳癌が成功裡に治療される可能性が最も高いのは早期に
発見されるときである。乳房の特殊なX線写真であるマンモグラムは、全乳癌の
90%以上を検出し得る。乳癌は、早期に発見されれば、治癒の可能性は90%
以上である。治療オプションには、癌の病期(ステージ)により、外科手術、化
学療法、及び放射線療法がある。
【0005】 乳癌の検出、診断、監視、病期決定、予知及び造影するために使用される方法
は、患者のアウトカムにとってきわめて重要である。早期乳癌と診断された患者
の5年生存率は、遠隔転移乳癌と診断された患者の5年生存率に比較してずっと
高い。早期乳癌を検出するためのより高感度で特異的な新しい診断法が必要とさ
れているのは明らかである。
【0006】 乳癌患者は、初回治療後、及びアジュバント治療の間に綿密に監視され、治療
に対する応答性が判定され、持続性又は再発性の転移疾患が検出される。乳癌、
及びその再発及び進行を検出する、より高感度で特異的な乳癌マーカーに対する
ニーズがあるのも明らかである。
【0007】 乳癌を管理するもう1つの重要な工程は、患者の疾患の病期を決定することで
ある。病期決定には潜在的な予後価値があり、最適治療法を設計するための判断
基準を提供する。一般に、乳癌の病理学的な病期決定が臨床的な病期決定より好
ましいのは、前者がより正確な予後をもたらすからである。しかしながら、臨床
的病期決定も、病理学的病期決定と少なくとも同じくらい正確であったならば、
好ましいことであろう。なぜなら、病理学的評価のために組織を採取する侵襲的
な方法に依存しないからである。乳癌の病期決定は、様々な浸潤段階を差別化し
得る、細胞、組織又は体液内の新しいマーカーを検出することができれば、改善
されることだろう。
【0008】 本発明では、9種の乳癌特異遺伝子(Breast Specific Genes; BSG)を介
して乳癌を検出、診断、監視、病期決定、予知、造影及び治療する方法が提供さ
れる。9種のBSGは、SEQ ID NO:1〜9のいずれかのポリヌクレオ
チド配列を含んでなる遺伝子により発現されるネーティブタンパク質を特に意味
する。他のやり方では、本明細書で使用されるように、9種のBSGにより意味
されるものは、SEQ ID NO:1〜9のポリヌクレオチド配列のいずれか
を含んでなる遺伝子によりコードされるネーティブmRNAを意味するか、又は
それはSEQ ID NO:1〜9のポリヌクレオチド配列のいずれかを含んで
なる遺伝子そのものを意味する。
【0009】 本発明の他の目的、特徴、効果及び側面は、以下の説明から当業者に明らかに
なるだろう。しかしながら、以下の説明及び特定の実施例は、本発明の好ましい
態様を示すものであって、例示のためだけのものである。この開示される発明の
精神及び範囲のなかで様々な変更及び改良をすることは、以下の説明を読むこと
、及び本開示の他の部分を読むことから、当業者にはすぐに明らかであろう。 発明の要約 上記及び他の目的のために、細胞、組織又は体液のBSGのレベルを、正常な
ヒト対照の好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと比較したと
きの変化について分析することによって乳癌の存在を診断する方法を提供するこ
とが本発明の目的であり、ここでは正常なヒト対照に対する患者のBSGレベル
の変化が乳癌に関連づけられる。
【0010】 さらに提供されるのは、転移した乳癌を有する疑いのあるヒト患者を同定する
こと;そのような患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルをBSGについて分
析すること;そのような細胞、組織又は体液のBSGレベルを、正常なヒト対照
の好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと比較することによっ
て、転移したことが知られていないような癌を有する患者において転移乳癌を診
断する方法であり、ここでは正常なヒト対照に対する患者のBSGレベルの変化
が転移した癌に関連づけられる。
【0011】 本発明によりまた提供されるのは、乳癌を有するヒト患者を同定すること;そ
のような患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルをBSGについて分析するこ
と;そのような細胞、組織又は体液のBSGレベルを正常なヒト対照サンプルの
好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと比較することによって
、そのような癌を有するヒトの乳癌を病期決定する方法であり、ここでは正常な
ヒト対照に対する前記患者のBSGレベルの変化が進行しているか又は退縮して
いる、又は寛解状態にある癌に関連づけられる。
【0012】 さらに提供されるのは、乳癌を有するヒトの乳癌を転移の発症について監視す
る方法である。この方法は、転移したことが知られていない乳癌を有するヒト患
者を同定すること;そのような患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルをBS
Gについて定期的に分析すること;そのような細胞、組織又は体液のBSGレベ
ルを正常なヒト対照サンプルの好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSG
レベルと比較することを含み、ここでは正常なヒト対照に対する患者のBSGレ
ベルの変化が転移した癌に関連づけられる。
【0013】 さらに提供されるのは、乳癌を有する患者のBSGのレベルを注視することに
よって、そのような癌を有するヒトの乳癌の段階変化を監視する方法である。こ
の方法は、そのような癌を有するヒト患者を同定すること、そのような患者由来
の細胞、組織又は体液のサンプルをBSGについて定期的に分析すること;その
ような細胞、組織又は体液のBSGレベルを正常なヒト対照サンプルの好ましく
は同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと比較することを含み、ここでは
正常なヒト対照に対する患者のBSGレベルの変化が進行しているか又は退行し
ている、又は寛解状態にある癌に関連づけられる。
【0014】 さらに提供されるのは、疾患又は病態を検出又は診断する目的で患者のBSG
の局在化を検出又は造影するために使用し得る、BSGに対する抗体、又はその
ような抗体のフラグメントである。そのような抗体は、ポリクローナル又はモノ
クローナルであり得るか、又は分子生物学の技術によって製造し得る。本文及び
本明細書を通して使用されるように、「抗体」という用語は、SELEXとして
言及され、当業者によく知られている in vitro 進化のプロトコールから派生す
るようなアプタマー及び単鎖オリゴヌクレオチドも包含することを意味する。抗
体は、多様な検出ラベルで標識され得るが、それには、限定しないが、放射性同
位体及び常磁性金属が含まれる。これらの抗体又はそのフラグメントはまた、B
SGの発現により特徴づけられる疾患の処置における治療薬として使用され得る
。治療応用では、抗体は、放射性同位体、酵素、毒素、薬物又はプロドラッグの
ような細胞毒性薬へ誘導化するか又は誘導化せずに使用し得る。
【0015】 本発明の他の目的、特徴、効果及び側面は、以下の説明から当業者に明らかに
なるだろう。しかしながら、以下の説明及び特定の実施例は、本発明の好ましい
態様を示すものであって、例示のためだけのものである。この開示される発明の
精神及び範囲のなかで様々な変更及び改良をすることは、以下の説明を読むこと
、及び本開示の他の部分を読むことから、当業者にはすぐに明らかであろう。 発明の詳細な説明 本発明は、BSGのレベルを正常なヒト対照のBSGレベルと比較することに
よって、癌を検出、診断、監視、病期決定、予知及び造影するための、定量的か
つ定性的な診断アッセイ及び方法に関する。本明細書で使用されるように、BS
Gのレベルとは、SEQ ID NO:1〜9のいずれかのポリヌクレオチド配
列を含んでなる遺伝子により発現されるネーティブなタンパク質のレベルを意味
する。他のやり方では、本明細書で使用されるように、BSGのレベルとは、S
EQ ID NO:1〜9のポリヌクレオチド配列のいずれでも含んでなる遺伝
子のいずれでもコードされるネーティブなmRNAのレベル、又はSEQ ID
NO:1〜9のポリヌクレオチド配列のいずれでも含んでなる遺伝子のレベル
を意味する。そのようなレベルは、好ましくは細胞、組織及び/又は体液の少な
くとも1つで測定され、正常及び異常なレベルの定量も含まれる。このように、
例えば、正常な対照の体液、細胞又は組織のサンプルに比較してBSGタンパク
質群の1つのレベルにおける変化を測定する、本発明による診断アッセイは、乳
癌を含む、癌の存在を診断するために使用され得る。「変化」とは、BSGレベ
ルの増加又は減少のいずれかを意味する。例えば、Mam001(SEQ ID
NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)及びMam005(S
EQ ID NO:3)のようなBSGでは、正常なヒト対照に比較したレベル
の増加が、乳癌、その癌の転移及び進行に関連しているのに対し、レベルの減少
は退縮及び/又は寛解に関連づけられる。BSG Mam002(SEQ ID
NO:1)では、正常なヒト対照に比較したレベルの減少が、乳癌、転移及び
進行に関連しているのに対し、増加は退縮及び/又は寛解に関連づけられる。9
種のBSGは、本発明の方法において、単独でか、又はその9種のすべて一緒に
か又は任意の組合せで測定され得る。
【0016】 本発明のすべての方法は、BSGだけでなく他の癌マーカーのレベルを測定す
ることも所望により包含し得る。BSGだけでなく、BRCA1のような他の癌
マーカーも当技術分野で知られている。 診断アッセイ 本発明は、細胞、組織又は体液のBSGのレベルを、正常なヒト対照の好まし
くは同一タイプの細胞、組織又は体液のBSGのレベルと比較したときの変化に
ついて分析することによって乳癌の存在を診断する方法を提供する。本明細書で
示されるように、正常なヒト対照に対して患者でMam001(SEQ ID
NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam005(SE
Q ID NO:3)のようなBSGのレベルが増加していることが乳癌の存在
に関連づけられるのに対し、正常なヒト対照に対して患者でMam002(SE
Q ID NO:1)のようなBSGのレベルが減少していることが乳癌の存在
に関連づけられる。
【0017】 本発明を限定しないが、一般に、定量的な診断アッセイでは、試験される患者
が癌を有することを示す陽性の結果とは、BSGのような癌マーカーの細胞、組
織又は体液レベルが、正常なヒト対照の好ましくは同一の細胞、組織又は体液よ
り少なくとも2倍高いか又は低い、最も好ましくは、少なくとも5倍高いか又は
低いものである。
【0018】 本発明はまた、まだ転移していない乳癌を有する患者の転移乳癌を、転移の発
症について診断する方法を提供する。本発明の方法では、転移した可能性がある
(が転移したことは知られていない)乳癌を有することが疑われるヒト癌患者が
同定される。このことは当業者に知られた様々な手段により達成される。例えば
、乳癌の場合、一般に患者は従来的な検出法に従って乳癌と診断される。
【0019】 本発明では、細胞、組織又は体液のBSGレベルの存在を決定することは、転
移していない乳癌と転移した乳癌とを区別するために特に有用である。現存の技
術では転移した乳癌と転移していない乳癌とを区別することが難しく、適切な治
療の選択はそのような知識にしばしば左右される。
【0020】 本発明では、そのような細胞、組織又は体液で測定される癌マーカーはBSG
であり、そのレベルが正常なヒト対照の好ましくは同一型の細胞、組織又は体液
のBSGレベルと比較される。つまり、観察される癌マーカーが血清のBSGで
あれば、このレベルが、好ましくは正常ヒト患者の血清のBSGレベルと比較さ
れる。正常なヒト対照に対して患者でMam001(SEQ ID NO:2)
、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam005(SEQ ID
NO:3)のようなBSGのレベルが増加していることが転移した乳癌に関連づ
けられるのに対し、正常なヒト対照に対して患者でMam002(SEQ ID
NO:1)のようなBSGが減少していることが転移した乳癌に関連づけられ
る。
【0021】 本発明を限定しないが、一般に、定量的な診断アッセイでは、試験されるか又
は監視される患者の癌が転移したことを示す陽性の結果とは、BSGのような癌
マーカーの細胞、組織又は体液レベルが、正常患者の好ましくは同一の細胞、組
織又は体液より少なくとも2倍高いか又は低い、最も好ましくは、少なくとも5
倍高いか又は低いものである。
【0022】 本明細書で使用される正常なヒト対照には、癌を有さないヒト患者、及び/又
はその患者由来の非癌性サンプルが含まれ;転移について診断又は監視する方法
では、正常なヒト対照は、好ましくは、転移してない乳癌を有すると信頼し得る
方法により判定されているヒト患者由来のサンプル、例えば同一の患者のより初
期のサンプルを含む。 病期決定(ステージング) 本発明はまたヒト患者の乳癌を病期決定する方法を提供する。
【0023】 本方法は、そのような癌を有するヒト患者を同定すること;そのような患者由
来の細胞、組織又は体液のサンプルをBSGについて分析することを含む。次い
で、この方法ではそのような細胞、組織又は体液のBSGレベルが正常なヒト対
称のサンプルの好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと比較さ
れ、ここでは正常なヒト対照に対して患者でMam001(SEQ ID NO
:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam005(SEQ
ID NO:3)のようなBSGのレベルが増加しているか、又はMam002
(SEQ ID NO:1)のようなBSGのレベルが減少していることが進行
している癌に関連づけられ、Mam001(SEQ ID NO:2)、Mam
004(SEQ ID NO:4)又はMam005(SEQ ID NO:3
)のようなBSGのレベルが減少しているか、又はMam002(SEQ ID
NO:1)のようなBSGのレベルが増加していることが退縮しているか又は
寛解状態にある癌に関連づけられる。 監視(モニタリング) さらに提供されるのは、乳癌を有するヒトの乳癌を転移の発症について監視す
る方法である。この方法は、転移したことが知られていないそのような癌を有す
るヒト患者を同定すること;そのような患者由来の細胞、組織又は体液のサンプ
ルをBSGについて定期的に分析すること;そのような細胞、組織又は体液のB
SGレベルを正常なヒト対照サンプルの好ましくは同一型の細胞、組織又は体液
のBSGレベルと比較することを含み、ここでは正常なヒト対照に対して患者で
Mam001(SEQ ID NO:2)、Mam004(SEQ ID NO
:4)又はMam005(SEQ ID NO:3)のようなBSGのレベルが
増加しているか、又はMam002(SEQ ID NO:1)のようなBSG
のレベルが減少していることが転移した癌に関連づけられる。
【0024】 本発明によりさらに提供されるのは、乳癌を有するヒトにおいてその癌の段階
変化を監視する方法である。この方法は、そのような癌を有するヒト患者を同定
すること;そのような患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルをBSGについ
て定期的に分析すること;そのような細胞、組織又は体液のBSGレベルを正常
なヒト対照サンプルの好ましくは同一型の細胞、組織又は体液のBSGレベルと
比較することを含み、ここでは正常なヒト対照に対して患者でMam001(S
EQ ID NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam
005(SEQ ID NO:3)のようなBSGのレベルが増加しているか、
又はMam002(SEQ ID NO:1)のようなBSGのレベルが減少し
ていることが段階において進行している癌に関連づけられ、Mam001(SE
Q ID NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam0
05(SEQ ID NO:3)のようなBSGのレベルが減少しているか、又
はMam002(SEQ ID NO:1)のようなBSGのレベルが増加して
いることが段階において退行しているか又は寛解状態にある癌に関連づけられる
る。
【0025】 そのような患者を転移の発症について監視することは定期的であり、好ましく
は四半期ベースでなされる。しかしながら、当該の癌、特定の患者、及び癌の段
階によっては頻度を増減してよい。 アッセイ技術 ある宿主に由来するサンプルにおいて、本発明のBSGのような遺伝子発現の
レベルを定量するために使用し得るアッセイ技術は、当業者によく知られている
。そのようなアッセイ方法には、ラジオイムノアッセイ、逆転写酵素PCR(R
T−PCR)アッセイ、免疫組織化学アッセイ、in situ ハイブリダイゼーショ
ンアッセイ、競合的結合アッセイ、ウェスタンブロット分析、ELISAアッセ
イ及びプロテオミック・アプローチが含まれる。上記のなかで、生物学的流体に
おける遺伝子の発現タンパク質を診断するためにしばしば好ましいのはELIS
Aである。
【0026】 ELISAアッセイは、先ず、市販品から容易に入手し得ない場合は、BSG
に対する特異抗体、好ましくはモノクローナル抗体を製造することを含む。さら
に、一般に、BSGと特異的に結合するレポーター抗体が製造される。このレポ
ーター抗体には、放射活性、蛍光、又は酵素の試薬のような検出可能な試薬、例
えば西洋ワサビペルオキシダーゼ酵素又はアルカリホスファターゼが付けられる
【0027】 ELISAを実行するには、BSGに特異的な抗体を、この抗体に結合する固
形支持体、例えばポリスチレンディッシュ上でインキュベートする。さらにウシ
血清アルブミンのような非特異的なタンパク質とインキュベートすることによっ
て、ディッシュ上のフリーなタンパク質結合部位がカバーされる。次に、分析す
べきサンプルをこのディッシュの中でインキュベートすると、その間に、ポリス
チレンディッシュに付いた特異抗体にBSGが結合する。未結合のサンプルを緩
衝液で洗い落とす。BSG特異的に向けられて西洋ワサビペルオキシダーゼに結
合したレポーター抗体をディッシュに入れると、BSGに結合したモノクローナ
ル抗体にこのレポーター抗体が結合する。結合しなかったレポーター抗体を洗い
流す。比色基質を含むペルオキシダーゼ活性用の試薬をディッシュに加える。B
SG抗体に連結した固定化ペルオキシダーゼにより発色した反応生成物が産生さ
れる。ある一定時間において発現した色の量は、サンプルに存在するBSGタン
パク質の量に比例している。一般に、標準曲線を参照にして定量的な結果を得る
【0028】 競合アッセイを利用することも可能であり、ここでは固形支持体及び標識され
たBSGに付いたBSGの特異抗体と宿主由来のサンプルを固形支持体に通過さ
せ、固形支持体に付いた検出ラベルの量をサンプル中のBSG量に相関させる。
【0029】 核酸法は、BSGのmRNAを乳癌のマーカーとして検出するために使用し得
る。ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)及び、リガーゼ連鎖反応(LCR)及び核
酸配列ベースの増幅(NASABA)のような他の核酸法が、様々な悪性疾患の
診断及び監視用に悪性腫瘍細胞を検出するために使用し得る。例えば、逆転写酵
素PCR(RT−PCR)は、数千もの他のmRNA種の複雑な混合物において
特定のmRNA集団の存在を検出するために使用し得る強力な技術である。RT
−PCRでは、先ず酵素の逆転写酵素を使用してmRNA種が相補DNA(cD
NA)へ逆転写される;次いでこのcDNAを標準的なPCR反応において増幅
する。このようにRT−PCRの増幅により、ある単一のmRNA種の存在を示
し得る。従って、このmRNAがそれを産生する細胞にごく特異的であれば、R
T−PCRを使用して特定タイプの細胞の存在を同定し得る。
【0030】 固形支持体上にアレイ配列された(即ち、グリッディング)クローン又はオリ
ゴヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションを使用して、当該遺伝子の発現
を検出すること、及びその発現レベルを定量することが可能になる。このアプロ
ーチでは、BSG遺伝子をコードするcDNAが基質に固定されている。この基
質は好適なタイプのものであり得るが、限定せずに、ガラス、ニトロセルロース
、ナイロン又はプラスチックを包含する。BSG遺伝子をコードするDNAの少
なくとも一部分を基質に付け、次いで分析物とインキュベートするが、これは関
心対象の組織から単離された、RNA又はそのRNAの相補DNA(cDNA)
であり得る。基質に結合したDNAと分析物とのハイブリダイゼーションは、様
々な手段により検出及び定量され得るが、それには限定せずに、分析物又はハイ
ブリッド検出用に設計された二次分子を放射活性標識すること又は蛍光標識する
ことが含まれる。遺伝子発現レベルの定量は、分析物由来のシグナル強度を既知
の標準から決定された強度と比較してなされる。標準は、標的遺伝子のin vitro
転写、収率の定量、及びその材料を使用して標準曲線を作成することによって得
られる。
【0031】 プロテオミック・アプローチでは、二次元(2D)電気泳動が当技術分野でよ
く知られた技術である。血清のようなサンプルから各タンパク質を単離すること
は、通常ポリアクリルアミドゲル上で、様々な特性によりタンパク質を連続的に
分離することによってなされる。先ず、タンパク質は電流を使用してサイズによ
り分離される。電流はすべてのタンパク質に均等に作用するので、より小さいタ
ンパク質はより大きいタンパク質よりゲル上を遠く移動する。第二の次元では最
初に対して垂直な電流を適用し、サイズではなく、各タンパク質の担う特定の電
荷に基づいてタンパク質が分離される。異なる配列を有する2つのタンパク質が
サイズと電荷の両方で一致することはないので、2D分離の結果は、四角いゲル
上に各タンパク質が特有のスポットを占めることになる。化学品又は抗体のプロ
ーブでスポットを分析するか、又は後続のタンパク質のミクロ配列決定により、
サンプル内のある特定タンパク質の相対量やタンパク質の同一性が明らかになる
【0032】 上記の試験は、多種多様な患者の細胞、体液及び/又は組織生検及び剖検材料
に由来するような組織抽出物(ホモジェネート又は可溶化組織)から派生したサ
ンプルに対して実施し得る。本発明に有用な体液には、血液、尿、唾液、又は他
の身体分泌物又はそれらの誘導物が含まれる。血液は、白血球、血漿、血清、又
は血液の誘導物を包含し得る。 In vivo の抗体使用 BSGに対する抗体は、乳房の疾患を有する患者にin vivoでも使用し得る。
特に、BSGに対する抗体は、乳房の疾患を有する疑いのある患者へ、診断及び
/又は治療の目的で注射され得る。例えば、インジウム−111で標識した抗体
−キレート剤は、癌胎児性抗原を発現する腫瘍の放射免疫シンチグラフィー造影
での使用が記述されている(Sumerdon et al., Nucl. Med. Biol. 1990, 17: 24
5-254)。特にこのような抗体−キレート剤は、再発性の結腸直腸癌を有する疑
いのある患者の腫瘍を検出するのに使用されてきた(Griffin et al., J. Clin.
Onc. 1991, 9: 631-640)。磁気共鳴映像(MRI)に使用される標識として常
磁性イオンの付いた抗体についても記述されてきた(Lauffer, R. B., Magnetic
Resonance in Medicine, 1991, 22: 339-342)。BSGに対して向けられた抗
体も同様のやり方で使用し得る。BSGに対する標識抗体は、患者の診断又は病
態の病期決定の目的で、乳癌のような乳房の疾患を有する疑いのある患者へ注射
され得る。使用される標識は、用いられる造影のモダリティに応じて選択される
。例えば、インジウム−111、テクネチウム−99m又はヨウ素−131のよ
うな放射活性標識は、二次元スキャン又はシングルフォトンエミッションコンピ
ュータ断層撮影法(SPECT)に使用し得る。フッ素−19のような陽電子放
射標識は、陽電子放射断層撮影法に使用し得る。ガドリニウム(III)又はマ
ンガン(II)のような常磁性イオンは、磁気共鳴映像に使用し得る。乳房の内
部又は乳房の外部に標識を定位することで疾患の広がりを決定することが可能に
なる。乳房内の標識の量により乳房内における癌の有無を判定することも可能に
なる。
【0033】 乳癌と診断された患者にとっては、BSGに対する抗体を注射することが治療
上の利益をもたらし得る。抗体はその治療効果を単独で発揮するかもしれない。
他のやり方では、抗体は、その治療効果を増強させるために薬物、毒素又は放射
性核種のような細胞毒性薬に結合される。薬物−モノクローナル抗体については
、例えば Garnett and Baldwin, Cancer Research 1986, 46: 2407-2412 により
、当技術分野で記述されてきた。モノクローナル抗体に毒素を結合して様々な癌
種の治療に使用することも Pastan et al., Cell 1986, 47: 641-648 に記述さ
れている。イットリウム−90で標識したモノクローナル抗体については、正常
組織に対する毒性を制限しながら腫瘍へ最大用量をデリバリーすることが記述さ
れている(Goodwin and Meares, Cancer Supplement 1997, 80: 2675-2680)。
限定しないが、銅−67、ヨウ素−131及びレニウム−186を含む、他の細
胞毒性の放射性核種もBSGに対する抗体の標識に使用し得る。
【0034】 上記in vivoの方法に使用し得る抗体には、ポリクローナル及びモノクローナ
ル抗体と分子生物学の技術により製造される抗体がいずれも含まれる。抗体フラ
グメント、及びSELEXとして言及され、当業者によく知られている in vitr
o 進化のプロトコールから派生するようなアプタマー及び単鎖オリゴヌクレオチ
ドも使用し得る。
【0035】
【実施例】
本発明は以下の実施例によりよく詳しく説明される。以下の実施例は特定の態
様に関連して本発明を具体的に説明するためにのみ提供される。これら典型的な
実施例は、本発明の特定の側面を説明するが、限定的なことを示したり、開示さ
れた発明の範囲を制限するものではない。 実施例1. diaDexus LLC,サンタクララ、CAが開発したデータマイニング
用のCancer Leads Automatic Search Pack
age(CLASP)を使用して、Incyte Pharmaceutica
ls,パロアルト、CAより入手可能なLIFESEQデータベースのデータを
体系的に分析することにより、BSGの同定を実施した。
【0036】 CLASPは以下の工程を実施する: 標的臓器における対応ESTの(他の全臓器と比較した)アバンダンスレベル
に基づいて、高度に発現されている臓器特異的な遺伝子を選択すること。
【0037】 高度に発現されている臓器特異的遺伝子のそれぞれについて、正常、腫瘍組織
、罹患組織及び腫瘍又は疾患に関連した組織ライブラリーにおける発現レベルを
分析すること。
【0038】 成分ESTが腫瘍ライブラリーに専ら又はより頻繁に見出されたことを示す候
補遺伝子を選択すること。 CLASPにより、乳癌の診断に有用な高度に発現されている臓器及び癌特異
遺伝子を同定することが可能になる。
【0039】
【表1】
【0040】 以下の実施例は、詳しく説明される場合を除くと、当業者によく知られていて
常法となっている標準技術を使用して実施した。以下の実施例にある定常的な分
子生物学の技術は、Sambrook et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUA
L, 2nd. Ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.
Y. (1989) のような標準実験マニュアルに記載の通りに実施し得る。 実施例2:遺伝子発現の比較定量 蛍光Taqmanプローブを用いるリアルタイム定量PCRは、TaqDNA
ポリメラーゼの5’-3’ヌクレアーゼ活性を利用する定量的な検出系である。
この方法では、5’のレポーター色素と下流の3’消光色素で標識された内部蛍
光オリゴヌクレオチドプローブ(Taqman)が使用される。PCRの間に、
Taq DNAポリメラーゼの5’−3’ヌクレアーゼ活性によりレポーターが
放出され、次いでModel 7700 Sequence Detectio
n System(PE Applied Biosystems,フォスター
シティ、CA,アメリカ)のレーザー検出器によりその蛍光を検出し得る。
【0041】 内因性対照物を増幅して、反応に加えられるサンプルRNAの量を標準化し、
逆転写酵素(RT)の効率を正規化するのに使用した。この内因性対照物として
使用したのは、シクロフィリン、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナ
ーゼ(GAPDH)又は18SリボソームRNA(rRNA)のいずれかである
。試験した全サンプル間の相対量を算出するために、1つのサンプルの標的RN
Aレベルを比較結果の基準値(キャリブレータ)として使用した。「キャリブレ
ータ」に対する相対量は、標準曲線を使用するか又は比較法(User Bul
letin #2:ABI PRISM 7700 Sequence Det
ection System)により得ることができる。乳房特異マーカー(B
SM)である、Mam001(SEQ ID NO:2)、Mam002(SE
Q ID NO:1)、Mam004(SEQ ID NO:4)及びMam0
05(SEQ ID NO:3)の正常組織及び癌組織の組織分布及びレベルを
評価するために、癌及び対等の(matched)正常隣接組織(NAT)と、対等で
ない(unmatched)癌及び正常組織から全RNAを抽出した。次いで、逆転写酵
素を用いて第一のcDNA鎖を製造し、Mam001(SEQ ID NO:2
)、Mam002(SEQ ID NO:1)、Mam004(SEQ ID
NO:4)及びMam005(SEQ ID NO:3)のそれぞれに特異的な
プライマ−及びTaqmanプローブを使用して、ポリメラーゼ連鎖反応を実施
した。この結果は、ABI PRISM 7700 Sequence Det
ectorを使用して得られる。以下の数字は、それぞれのキャリブレータに比
較した、Mam001(SEQ ID NO:2)、Mam002(SEQ I
D NO:1)、Mam004(SEQ ID NO:4)及びMam005(
SEQ ID NO:3)の相対発現レベルである。 SEQ ID NO:2;クローンID:1730886;遺伝子ID:238
469(Mam001)の測定 表2に示す数字は、精巣(キャリブレータ)に比較した12種の正常組織にお
けるMam001(SEQ ID NO:2)の相対発現レベルである。これら
のRNAサンプルは、市販品から入手したものと様々な個人の特定組織由来のサ
ンプルをプールして産生したものである。
【0042】
【表2】
【0043】 表2の相対発現レベルは、Mam001(SEQ ID NO:2)のmRN
A発現が正常な乳房及び精巣のプールでは検出されるものの、分析した他の10
種の正常組織プールでは検出されないことを示す。上記の結果は、Mam001
(SEQ ID NO:2)のmRNA発現が乳房組織にごく特異的であり、精
巣にも見出されることを示す。男性特有の組織における発現は女性特有の組織の
癌を検出することに無関係である。
【0044】 表2に示す組織は様々な個人からプールされたサンプルである。表3に示す組
織は各個人から得たものであり、プールされたものではない。従って、表2に示
されるmRNA発現レベルについての数値は、表3に示される数値と直接は比較
し得ない。
【0045】 表3に示される数字は、24対の対等サンプルにおける、精巣(キャリブレー
タ)に比較したMam001(SEQ ID NO:2)の相対発現レベルであ
る。各対等の対には、同一の個人に由来する、特定組織の癌サンプルとその同一
組織の正常隣接組織(NAT)サンプルが含まれる。
【0046】
【表3】
【0047】 8種の異なる組織を代表する表3の48サンプルのなかで、発現が見られるの
は乳房組織だけである。上記の結果は、表2に示した正常サンプルについて得ら
れた組織特異性の結果を追認する。表2及び表3は、16種のヒト組織型で合わ
せて全60種のサンプルを表す。乳房及び精巣を除く14種の異なる組織型を代
表する36個のサンプルではMam001(SEQ ID NO:2)のmRN
Aは検出されなかった(表2及び3)。乳房組織以外でMam001(SEQ
ID NO:2)が検出されるのは他の1つの組織型(精巣)だけであり、それ
もプールされた組織サンプルだけであって(表2)、対等の精巣癌サンプルでは
検出されない(表3)。
【0048】 同一の個人由来の乳癌サンプルと正常隣接組織のmRNA発現レベルを比較し
たものを表3に示す。11の乳癌組織サンプルのうち、Mam001(SEQ
ID NO:2)が対応する正常隣接組織に比べてより高いレベルで発現されて
いるのは2つ(Mam A06X及びMam 162X)である。乳癌における
Mam001(SEQ ID NO:2)の発現レベルが正常隣接組織に比較し
て低いのは4つの対等サンプル(Mam B011X、Mam 603X/CO
34、Mam 42DN及びMam S123)である。発現が検出されなかっ
たのは1つの対等サンプルセット(Mam 47XP)である。同等レベル又は
近似レベルの発現が検出されたのは他の4つの対等サンプルである(Mam S
079、Mam S516、Mam S699及びMam S997)。しかし
ながら、癌の重量が増加すると、上記の例では発現の総量も全体に増加する可能
性がある。
【0049】 11個体の6つで見られた高レベルの組織特異性と増加又は同等の発現は、M
am001(SEQ ID NO:2)がmRNAを用いて乳癌細胞を検出する
ための診断マーカーになることを裏付けている。 SEQ ID NO:1;クローンID:2740238;遺伝子ID:242
151(Mam002)の測定 表4に示す数字は、胸腺(キャリブレータ)に比較した12種の正常組織にお
けるMam002(SEQ ID NO:1)の相対発現レベルである。これら
のRNAサンプルは、市販品から入手したものと様々な個人の特定組織由来のサ
ンプルをプールして産生したものである。
【0050】
【表4】
【0051】 表2の相対発現レベルは、Mam002(SEQ ID NO:1)のmRN
A発現が正常な乳房のプールでは高レベルで検出されるものの、分析した他の1
1種の正常組織プールではごく低いレベルで検出されることを示す。上記の結果
は、Mam002(SEQ ID NO:2)のmRNA発現が乳房組織にごく
特異的であることを示す。
【0052】 表4に示す組織は様々な個人からプールされたサンプルである。表5に示す組
織は各個人から得たものであり、プールされたものではない。従って、表4に示
されるmRNA発現レベルについての数値は、表5に示される数値と直接は比較
し得ない。
【0053】 表5に示される数字は、27対の対等サンプルにおける、胸腺(キャリブレー
タ)に比較したMam002(SEQ ID NO:1)の相対発現レベルであ
る。各対等の対には、同一の個人に由来する、特定組織の癌サンプルとその同一
組織の正常隣接組織(NAT)サンプルが含まれる。さらに、正常組織由来の2
つの非対等乳房サンプルと、1つの非対等卵巣癌及び1つの正常(非癌性)卵巣
サンプルも試験した。
【0054】
【表5】
【0055】 9種の異なる組織を代表する表5の58サンプルのなかで、最高の発現が見ら
れるのは乳房組織である。発現を示す非乳房組織のなかで試験した大多数の乳房
サンプルに匹敵する発現を示したのは1つのサンプル(End 4XA)だけで
ある。このサンプルは子宮内膜組織であり、これは女性特有の組織である。上記
の結果は、表4に示した正常サンプルについて得られた組織特異性の結果を追認
する。表4及び表5は、17種のヒト組織型で合わせて全70種のサンプルを表
す。乳房を除く11種の異なる組織型を代表する22個のサンプルではMam0
02(SEQ ID NO:1)のmRNAは検出されなかった(表4及び5)
【0056】 同一の個人由来の乳癌サンプルと正常隣接組織のmRNA発現レベルを比較し
たものを表5に示す。13の対等乳癌組織のうち、Mam002(SEQ ID
NO:1)が対応する正常隣接組織に比べてより高いレベルで発現されている
のは3つ(サンプル:Mam S127、Mam 162X及びMam S07
9)である。乳癌におけるMam002(SEQ ID NO:1)の発現レベ
ルが正常隣接組織に比較して低いのは8人のサンプル(Mam 12X、Mam
42DN、Mam 59X、Mam B011X、Mam S516、Mam
S854、Mam S967及びMam S123)である。同等レベル又は
近似レベルの発現が検出されたのは他の3つの対等サンプル(サンプル:Mam
A06X、Mam S699及びMam S997)である。
【0057】 この高レベルの組織特異性は、Mam002(SEQ ID NO:1)がm
RNAを用いて乳癌細胞を検出するための診断マーカーになることを裏付けてい
る。乳房組織は、この遺伝子の発現がこれまでに検出された唯一の有意な源であ
る。13の対等サンプルのうち8つが正常隣接組織より癌においてより低い発現
を有する。従って、この遺伝子の発現減少が癌の存在の診断となる可能性がある
。 SEQ ID NO:4;クローンID:2613064;遺伝子ID:270
52(Mam004)の測定 表6に示す数字は、乳房(キャリブレータ)に比較した12種の正常組織にお
けるMam004(SEQ ID NO:4)の相対発現レベルである。これら
のRNAサンプルは、市販品から入手したものと様々な個人の特定組織由来のサ
ンプルをプールして産生したものである。
【0058】
【表6】
【0059】 表6の相対発現レベルは、Mam004(SEQ ID NO:4)のmRN
A発現が正常な乳房と、肺、前立腺、精巣及び心臓を含む他の組織のプールで検
出されることを示す。上記の結果は、正常な乳房組織においてより高く発現され
るものの、Mam004(SEQ ID NO:4)のmRNA発現が乳腺に特
異的はないことを示す。
【0060】 表6に示す組織は様々な個人からプールされたサンプルである。表7に示す組
織は各個人から得たものであり、プールされたものではない。従って、表6に示
されるmRNA発現レベルについての数値は、表3に示される数値と直接は比較
し得ない。
【0061】 表7に示される数字は、23対の対等サンプルにおける、乳房(キャリブレー
タ)に比較したMam004(SEQ ID NO:4)の相対発現レベルであ
る。各対等の対には、同一の個人に由来する、特定組織の癌サンプルとその同一
組織の正常隣接組織(NAT)サンプルが含まれる。
【0062】
【表7】
【0063】 7種の異なる組織を代表する表7の46サンプルのなかで、発現が最も高いの
は乳房組織、特に癌である。乳房サンプルに見られるものに匹敵する発現が見ら
れるのは、4つの肺サンプルの1つ(サンプル23)、4つの腎臓サンプルの1
つ(サンプル21)、及び6つの子宮内膜サンプルの1つ(サンプル19)であ
る。表6及び表7は、16種のヒト組織型で合わせて全58種のサンプルを表す
。乳房を除く7種の異なる組織型を代表する20個のサンプルではMam004
(SEQ ID NO:4)のmRNAは検出されなかった(表6及び7)。
【0064】 同一の個人由来の乳癌サンプルと正常隣接組織のmRNA発現レベルを比較し
たものを表7に示す。11の乳癌組織のうち、Mam004(SEQ ID N
O:4)が対応する正常隣接組織に比べてより高いレベルで発現されているのは
8つ(Mam 12X、Mam 603X、Mam 59X、Mam 162X
、Mam S079、Mam S123、Mam S516及びMam S99
7)である。乳癌におけるMam004(SEQ ID NO:4)の発現レベ
ルが正常隣接組織に比較して低いのは2つの対等サンプル(Mam 42DN及
びMam S699)である。発現が検出されなかったのは1つの対等サンプル
セット(Mam 12B)である。
【0065】 正常隣接組織に比較して大多数の対等癌サンプルで発現が上昇していることは
、Mam004(SEQ ID NO:4)がmRNAを用いて乳癌細胞を検出
するための診断マーカーになることを裏付けている。 SEQ ID NO:3;クローンID:y155b03;遺伝子ID:348
845(Mam005)の測定 表8に示す数字は、精巣(キャリブレータ)に比較した12種の正常組織にお
けるMam005(SEQ ID NO:3)の相対発現レベルである。これら
のRNAサンプルは、市販品から入手したものと様々な個人の特定組織由来のサ
ンプルをプールして産生したものである。
【0066】
【表8】
【0067】 表2の相対発現レベルは、Mam005(SEQ ID NO:3)のmRN
A発現が正常な乳房及び精巣のプールでは検出されるものの、分析した他の10
種の正常組織プールでは有意なレベルで検出されないことを示す。上記の結果は
、Mam005(SEQ ID NO:3)のmRNA発現が乳房組織にごく特
異的であり、精巣にも見出されることを示す。男性特有の組織における発現は女
性特有の組織の癌を検出することに無関係である。
【0068】 表8に示す組織は様々な個人からプールされたサンプルである。表9に示す組
織は各個人から得たものであり、プールされたものではない。従って、表8に示
されるmRNA発現レベルについての数値は、表9に示される数値と直接は比較
し得ない。
【0069】 表9に示される数字は、46対の対等サンプルにおける、精巣(キャリブレー
タ)に比較したMam005(SEQ ID NO:3)の相対発現レベルであ
る。各対等の対には、同一の個人に由来する、特定組織の癌サンプルとその同一
組織の正常隣接組織サンプルが含まれる。さらに、正常組織由来の2つの非対等
乳房サンプルと、1つの非対等卵巣癌及び1つの正常(非癌性)卵巣サンプルも
試験した。
【0070】
【表9】
【0071】 14種の異なる組織を代表する表9の96サンプルのなかで、有意な発現が見
られるのは乳房組織だけである。上記の結果は、表8に示した正常サンプルにつ
いて得られた組織特異性の結果を追認する。表8及び表9は、18種のヒト組織
型で合わせて全108種のサンプルを表す。乳房及び精巣を除く16種の異なる
組織型を代表する67個のサンプルではMam005(SEQ ID NO:3
)のmRNAはまったく検出されなかったか、又はごく低いレベルの検出しかな
かった(表8及び9)。
【0072】 同一の個人由来の乳癌サンプルと正常隣接組織のmRNA発現レベルを比較し
たものを表9に示す。18組の癌及び正常サンプルのうち、Mam005(SE
Q ID NO:3)が対応する正常隣接組織に比べてより高いレベルで発現さ
れているのは10組(Mam A06X、Mam 162X、Mam S079
、Mam S516、Mam S854、Mam S967、Mam S997
、Mam 14DN、Mam S621及びMam S918)である。乳癌に
おけるMam005(SEQ ID NO:3)の発現レベルが正常隣接組織に
比較して低いのは8つの癌及び正常隣接組織サンプル(Mam 12X、Mam
42DN、Mam 59X、Mam B011X、Mam S123、Mam
S127、Mam S699及びMam S699F)である。発現が検出さ
れなかったのは2つの対等サンプルである。
【0073】 18の対等な癌及び正常隣接組織サンプルのうち10で見られた高レベルの組
織特異性及び過剰発現は、Mam005(SEQ ID NO:3)がmRNA
を用いて乳癌細胞を検出するための診断マーカーになることを裏付けている。
【配列表】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 35/00 C07K 16/32 C07K 16/32 C12Q 1/02 C12Q 1/02 1/68 ZNAA 1/68 ZNA A61K 49/02 A (72)発明者 レシポン,ハーヴ アメリカ合衆国カリフォルニア州94115, サン・フランシスコ,フォートゥナ・アベ ニュー 85 (72)発明者 カファーキー,ロバート アメリカ合衆国カリフォルニア州95134, サン・ホセ,エラン・ヴィレッジ・レイン 350,アパートメント 218 Fターム(参考) 4B063 QA19 QQ02 QQ03 QQ79 QQ96 QR48 QS33 QX01 4C085 AA13 AA19 AA26 AA27 BB01 CC21 GG01 HH03 HH07 KA03 KA28 KA29 KB07 KB09 KB12 KB15 KB18 LL18 4H045 AA11 BA10 BA50 BA71 CA40 DA76 EA28

Claims (14)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 患者において乳癌の存在を診断する方法であって、 (a)前記患者の細胞、組織又は体液におけるBSGのレベルを測定すること
    ;及び (b)測定されたBSGのレベルを正常なヒト対照由来の細胞、組織又は体液
    のBSGのレベルと比較することを含んでなり、正常なヒト対照に対する患者の
    測定されたBSGレベルの変化が乳癌の存在に関連づけられる、前記方法。
  2. 【請求項2】 乳癌を有する患者の転移乳癌を診断する方法であって、 (a)転移したことが知られていない乳癌を有する患者を同定すること; (b)前記患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルにおけるBSGのレベル
    を測定すること;及び (c)測定されたBSGレベルを正常なヒト対照の細胞、組織又は体液型のB
    SGレベルと比較することを含んでなり、正常なヒト対照に対する患者の測定B
    SGレベルの変化が転移した乳癌に関連づけられる、前記方法。
  3. 【請求項3】 患者の乳癌を病期決定する方法であって、 (a)乳癌を有する患者を同定すること; (b)前記患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルにおけるBSGのレベル
    を測定すること;及び (c)測定されたBSGレベルを正常なヒト対照サンプルの細胞、組織又は体
    液型のBSGレベルと比較することを含んでなり、正常なヒト対照に対する前記
    患者の測定されたBSGレベルの変化が、進行しているか又は退縮している、又
    は寛解状態にある癌に関連づけられる、前記方法。
  4. 【請求項4】 乳癌を有する患者の乳癌を転移の発症について監視する方法
    であって、 (a)転移したことが知られていない乳癌を有する患者を同定すること; (b)前記患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルにおけるBSGレベルを
    定期的に測定すること;及び (c)測定されたBSGレベルを正常なヒト対照の細胞、組織又は体液型のB
    SGレベルと比較することを含んでなり、正常なヒト対照に対する患者のBSG
    レベルの変化が転移した癌に関連づけられる、前記方法。
  5. 【請求項5】 乳癌を有する患者の乳癌の段階変化を監視する方法であって
    、 (a)乳癌を有する患者を同定すること; (b)前記患者由来の細胞、組織又は体液のサンプルにおけるBSGレベルを
    定期的に測定すること;及び (c)測定されたBSGレベルを正常なヒト対照の細胞、組織又は体液型のB
    SGレベルと比較することを含んでなり、正常なヒト対照に対する患者の測定さ
    れたBSGレベルの変化が、段階において進行している、段階において退行して
    いる、又は寛解状態にある癌に関連づけられる、前記方法。
  6. 【請求項6】 前記患者における乳癌の存在、転移又は進行に関連づけられ
    る変化が、患者の測定されたBSGレベルの増加であって、BSGがMam00
    1(SEQ ID NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又は
    Mam005(SEQ ID NO:3)を含む、請求項1、2、3、4又は5
    に記載の方法。
  7. 【請求項7】 前記患者における乳癌の存在、転移又は進行に関連づけられ
    る変化が、患者の測定されたBSGレベルの減少であって、BSGがMam00
    2(SEQ ID NO:1)を含む、請求項1、2、3、4又は5に記載の方
    法。
  8. 【請求項8】 前記患者における乳癌の退縮又は寛解に関連づけられる変化
    が、患者の測定されたBSGレベルの減少であって、BSGがMam001(S
    EQ ID NO:2)、Mam004(SEQ ID NO:4)又はMam
    005(SEQ ID NO:3)を含む、請求項3又は5に記載の方法。
  9. 【請求項9】 前記患者における乳癌の退縮又は寛解に関連づけられる変化
    が、患者の測定されたBSGレベルの増加であって、BSGがMam002(S
    EQ ID NO:1)を含む、請求項3又は5に記載の方法。
  10. 【請求項10】 BSGがMam001(SEQ ID NO:2)、Ma
    m004(SEQ ID NO:4)又はMam005(SEQ ID NO:
    3)を含む、前記BSGに対する抗体。
  11. 【請求項11】 請求項10に記載の抗体を患者へ投与することを含んでな
    る、患者の乳癌を造影する方法。
  12. 【請求項12】 前記抗体が常磁性イオン又は放射性同位体で標識されてい
    る、請求項11に記載の方法。
  13. 【請求項13】 請求項10に記載の抗体を患者へ投与することを含んでな
    る、患者の乳癌を治療する方法。
  14. 【請求項14】 抗体が細胞毒性薬に結合している、請求項13に記載の方
    法。
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