JP2002503464A - ヒト短鎖ｔｎｆ受容体ファミリタンパク質 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 本発明は、ヒト短鎖ＴＮＦ受容体ファミリタンパク質（ＳＣＴＲ）及びＳＣＴＲを同定かつコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、発現ベクタ、宿主細胞、抗体、アゴニスト及びアンタゴニストを提供する。また本発明はＳＣＴＲの発現に関連する障害を治療或いは予防するための方法も提供する。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】 技術分野 本発明は短鎖ＴＮＦ受容体ファミリタンパク質の核酸配列およびアミノ酸配列
に関し、発生障害、生殖障害、腫瘍性障害および免疫学的障害の診断、治療およ
び予防におけるこれらの配列の使用法に関する。

【０００２】 背景技術 多くの真核細胞細胞膜は、構造的な支持、細胞および組織同一性、並びにその
環境内の細胞のための分泌に関するautocrine、paracrineおよびjuxtacrine特性
を与えるタンパク質を含む(McGowan, S.E. (1992) FASEB J. 6:2895-2904.)。膜
タンパク質（ＭＰ）の多様な生化学的な特性は、各個別の分子に属する多数の、
多くの場合に重複する役割を示している（Grant, D.S. and Kleinman. H.K. (19
97)EXS 79:317-333）。いくつかのＭＰが単離されているが、大部分のＭＰが互 いに、或いは細胞膜内および細胞膜下に存在する他の分子と如何に相互作用する
かは明らかになっていない。多くのＭＰは組織成長、細胞増殖、組織或いは細胞
分化、および細胞死に関連している（Taipale, J. and Keski-Oja, J.(1997) FA
SEB J. 11:51-59; and Eleftheriou, C.S. et al. (1991) Muiat. Res. 256:127
-138）。

【０００３】 またＭＰは、炎症反応の重要な伝達因子および制御因子としても作用する。白
血球は、血管外遊走中にリガンド−受容体結合により免疫伝達因子およびサイト
カイン生成のために初回刺激される（Pakianathan, D.R. (1995) J. Leukoc. Bi
ol. 57:699-702）。腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）は、免疫調節および炎症反応を媒介
する多面的なサイトカインである。ＴＮＦ関連サイトカインは、受容体モノマー
の凝集を引き起こすことにより、分化、増殖、ＮＦ−κＢ活性化および細胞死を
含む部分的に重複する細胞応答を発生する（Smith, C.A. et al.(1994) Cell 76
:959-962）。ＴＮＦにより引き起こされる細胞応答は、個別の細胞表面受容体と
の相互作用を通して開始される。腫瘍壊死因子受容体（ＴＮＦＲ）スーパーファ
ミリは６０ｋＤａおよび８０ｋＤａの形態のＴＮＦＲ（ＴＮＦＲＩおよびＴＮＦ
ＲＩＩ）、神経成長因子（ＮＧＦＲ）、ＣＤ４０、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＯＸ−
４０、４−１ＢＢ、Ｆａｓ、ＷＳＬ−Ｓ１、ＧＩＴＲ、ＴＲＩＣＫ−２Ａおよび
ＴＲＡＩＬ受容体を含む（Tartaglia. L.A. and Goeddel. D.V. (.1992)Immunol
. Today 13:151-153）。その分子は、細胞外アミノ末端ドメイン内の約４０アミ
ノ酸残機の多数のサイトカインに富む反復の存在（ＴＮＦＲ／ＮＧＦＲスーパー
ファミリのサイトカインに富む領域のサイン）により特徴付けられる。このドメ
イン内の平均的な相同性は種々のスーパーファミリメンバ間で約２５％である。
ＣＤ４０、４−１ＢＢ、ＯＸ−４０、ＷＳＬ−Ｓ１およびＧＩＴＲは一般に長さ
が３００アミノ酸未満（短鎖）であるのに対して、ＴＮＦＲＩ、ＴＮＦＲＩＩ、
ＣＤ３０、Ｆａｓ、ＷＳＬ−Ｓ１、ＴＲＩＣＫ−２ＡおよびＴＲＡＩＬ受容体は
長さが３００残基以上（長鎖）である。ＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３は、膜貫通
ドメインの前に切り詰められた膜貫通タンパク質ＷＳＬ−１Ｒ／ＬＡＲＤ−１の
可溶性のアイソフォームであると考えられる（Screaton, G.R. et al. (1997) P
roc. Natl. Acad. Sci. 94:4615-4619）。

【０００４】 シグナル伝達ＴＮＦＲリガンドのＴＮＦＲスーパーファミリタンパク質への結
合は、多くの場合に、アポトーシスとしても知られるプログラム細胞死に導く第
２メッセンジャカスケードを開始する。細胞死領域と呼ばれる配列モチーフはい
くつかのＴＮＦＲタンパク質において存在し、アポトーシスに導くシグナル伝達
に関連する重要な構造的エレメントである。平均的に７０〜８０アミノ酸の細胞
死ドメインは常にタンパク質の一端付近に局在する。このモチーフはＴＮＦＲ結
合タンパク質内にも見出される（Hofman, K. and Tschopp, J.(1995) FEBS Lett
. 371:321-323）。

【０００５】 他のＴＮＦＲスーパーファミリタンパク質は、リガンド−受容体相互作用を妨
害するか、或いはＴＮＦＲ第２メッセンジャ分子相互作用を防ぐかのいずれかに
より、アポトーシスを誘発する第２メッセンジャカスケードと拮抗する。さらに
ＴＮＦＲおよびＮＧＦＲは１つ以上のタイプのリガンドを結合し、それゆえＴＮ
ＦＲスーパーファミリのメンバは１つ以上のタイプのリガンドと相互作用する場
合がある（Armitage, R.J. (1994) Curr.Opin. Immunol. 6:407-413）。ＴＮＦ Ｒ遺伝子の不完全な発現は、アポトーシスのシグナル伝達および誘発を防ぐこと
ができる（Watanabe-Fukunaga, R et al. (1992) Nature,356:314-317; Nagata,
S. (1996) Behring. Inst. Mitt. 97:1-11; and Gruss, H.J. et al. (1996)An
n. Oncol. 7 suppl 4:19-26）。

【０００６】 新規の短鎖ＴＮＦ受容体スーパーファミリタンパク質およびそれをコードする
ポリヌクレオチドの発見は、発生障害、生殖障害、腫瘍性障害および免疫学的ｃ
障害の診断、治療および予防において有用な新規の組成物を提供することができ
、当分野における必要性を満足する。

【０００７】 発明の概要 本発明は、新規の短鎖の腫瘍開始因子受容体ファミリタンパク質（ＳＣＴＲ）
、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド、および発生障害、生殖障害、腫瘍性
障害および免疫学的障害の診断、治療および予防のためのこれらの組成物の使用
法の発見に基づいている。

【０００８】 本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメント
を含む実質的に精製されたポリペプチドを特徴とする。

【０００９】 さらに本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のアミノ酸配列、或いはＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：１のフラグメントに少なくとも９０％アミノ酸配列同一性を有する実質的
に精製された変異体を提供する。また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳ
ＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントからなるアミノ酸配列を含むポリペプチドを
コードする単離され、精製されたポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントからなるアミ
ノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドに少なくとも９０％
ポリヌクレオチド配列同一性を有する単離され、精製されたポリヌクレオチド変
異配列を含む。

【００１０】 さらに本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグ
メントからなるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
に厳密な条件下でハイブリダイズする単離され、精製されたポリヌクレオチド、
並びにＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントからな
るアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド相補的な単離
され、精製されたポリヌクレオチドを提供する。

【００１１】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のフラグメ
ントからなるポリヌクレオチド配列を含む単離され、精製されたポリヌクレオチ
ド、およびＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のフラグメントか
らなるポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドに少なくとも９０％ポリヌ
クレオチド配列同一性を有する単離され、精製されたポリヌクレオチド変異配列
とを提供する。また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
２のフラグメントからなるポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドに相補
的な単離され、精製されたポリヌクレオチドを提供する。

【００１２】 さらに本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグ
メントからなるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド
の少なくともフラグメントを含む発現ベクタを提供する。別の態様では、発現ベ
クタは宿主細胞に含まれる。

【００１３】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメ
ントからなるアミノ酸配列を含むポリペプチドを生成するための方法を提供し、
その方法は、（ａ）ポリペプチドの発現に適した条件下でＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１
或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントからなるアミノ酸配列を含むポリペ
プチドをコードするポリヌクレオチドの少なくともフラグメントを有する発現ベ
クタを含む宿主細胞を培養する過程と、（ｂ）その宿主細胞培養株からポリペプ
チドを回収する過程とを有する。

【００１４】 また本発明は、適当な医薬品担体とともに、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはその
フラグメントからなる配列を有する実質的に精製されたポリペプチドを含む医薬
品組成物を提供する。

【００１５】 さらに本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグ
メントからなる配列を含むポリペプチドに結合する精製された抗体、並びにその
ポリペプチドの精製されたアゴニスト及び精製されたアンタゴニストを提供する
。

【００１６】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメ
ントからなるアミノ酸配列を有する実質的に精製されたポリペプチドを含む医薬
品組成物の有効量を治療を要する被検者に投与する過程を含む、発生障害を治療
或いは予防するための方法を提供する。

【００１７】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメ
ントからなるアミノ酸配列を有する実質的に精製されたポリペプチドを含む医薬
品組成物の有効量を治療を要する被検者に投与する過程を含む、生殖障害を治療
或いは予防するための方法を提供する。

【００１８】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメ
ントからなるアミノ酸配列を有する実質的に精製されたポリペプチドを含む医薬
品組成物の有効量を治療を要する被検者に投与する過程を含む、腫瘍性障害を治
療或いは予防するための方法を提供する。

【００１９】 また本発明は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメ
ントからなるアミノ酸配列を有するポリペプチドのアンタゴニストの有効量を治
療を要する被検者に投与する過程を含む、免疫学的障害を治療或いは予防するた
めの方法を提供する。

【００２０】 また本発明は、核酸を含む生物学的サンプルにおいてＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或
いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントからなるアミノ酸配列を有するポリペ
プチドをコードするポリヌクレオチドを検出するための方法を提供し、その方法
は、（ａ）ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントを
含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の相補配列を生物学的サン
プルの核酸の少なくとも１つにハイブリダイズさせ、それよりハイブリダイゼー
ション複合体を形成する過程と、（ｂ）そのハイブリダイゼーション複合体を検
出する過程とを有し、ハイブリダイゼーション複合体の存在が生物学的サンプル
におけるＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフラグメントを含
むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの存在と相関をなしている。一態
様では、生物学的サンプルの核酸は、ハイブリダイズする前にポリメラーゼ連鎖
反応により増幅される。

【００２１】 発明を実施するための形態 本タンパク質、ヌクレオチド配列及び方法を記載する前に、本発明は記載され
る特定の方法、プロトコル、細胞株、ベクタ並びに薬剤に限定されず、変更され
る場合もあることを理解されたい。また本明細書で用いられる専門用語は、特定
の実施例を記載することのみを目的としており、本発明の範囲を制限することを
意図するわけではなく、本発明は添付の請求の範囲によってのみ限定されること
を理解されたい。

【００２２】 本明細書で用いられるように、添付の請求の範囲では、単数形の冠詞並びに「
その（前記）」は、文脈において異なるように明確に規定されない限り、複数の
指示物を含むことに注意されたい。従って例えば、「ある宿主細胞」が示すもの
は、複数のそのような宿主細胞を含んでおり、「その抗体」は当業者には既知の
１つ或いはそれ以上の抗体及びその等価物を示しており、他も同様である。

【００２３】 異なるように規定されなければ、本明細書で用いられる科学技術用語は、本発
明が属する分野の当業者に通常理解されているのと同じ意味である。本明細書で
記載される内容と類似或いは等価な任意の方法、装置並びに材料が本発明の検証
に際して用いられてもよいが、好適な方法、装置並びに材料は本明細書中に記載
される。本明細書に記載される全ての発行物は、本発明に関連して用いられる場
合がある発行物において報告される細胞株、ベクタ、方法論を記載及び開示する
ために、参照して本明細書の一部としている。本明細書に記載される内容は、本
発明が、先行発明によるそのような開示に先行して権利を与えられないことを容
認するものと解釈されるべきではない。

【００２４】 定義 「ＳＣＴＲ」は自然、合成、半合成或いは組換え体の何れかの任意のソースか
らの任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、ネズミ、ウマ及び好適にはヒトを含む
哺乳類から得られる実質的に精製されたＳＣＴＲのアミノ酸配列である。

【００２５】 「アゴニスト」は、ＳＣＴＲに結合される際に、ＳＣＴＲの量を増加するか、
或いは活性の期間を延長する分子のことである。アゴニストはタンパク質、核酸
、炭水化物或いはＳＣＴＲに結合し、その作用を調節する任意の他の分子を含む
場合がある。

【００２６】 「アレル」或いは「アレル配列」はＳＣＴＲをコードする遺伝子の代替形であ
る。アレルは、核酸配列における少なくとも１つの突然変異から生じ、変化した
ｍＲＮＡ或いはポリペプチドを生じ、その構造或いは機能は変化する場合もしな
い場合もある。任意の所与の遺伝子は、１つ或いは多くのアレル形を有する場合
もあれば、全く有さない場合もある。アレルを引き起こす通常の突然変異は一般
に、ヌクレオチドの自然の欠失、付加或いは置換に起因する。これらの種類の変
化はそれぞれ単独で、或いは他との組み合わせにおいて、所与の配列において１
回或いは２回以上生じる場合がある。

【００２７】 ＳＣＴＲをコードする「変化した」核酸配列は、同一或いは機能的に等価なＳ
ＣＴＲをコードするポリヌクレオチドをもたらす種々のヌクレオチドの欠失、挿
入或いは置換を含む。本定義には、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドのあ
る特定のオリゴヌクレオチドプローブを用いて容易に検出することができる場合
もできない場合もある多形性及びＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列に
対する通常の染色体位置とは異なる位置を有する、アレルへの不適当な或いは予
想外のハイブリダイゼーションが含まれる。またコードされたタンパク質は「変
化して」、サイレント変化を生成し、機能的に等価なＳＣＴＲをもたらすアミノ
酸残基の欠失、挿入或いは置換も含む場合もある。故意のアミノ酸置換は、ＳＣ
ＴＲの生物活性が保持される限り、残基の極性、電荷、可溶性、疎水性、親水性
並びにまた両親媒性における類似性に基づいて行うことができる。例えば、負に
帯電したアミノ酸はアスパラギン酸及びグルタミン酸を含み、正に帯電したアミ
ノ酸はリジン及びアルギニンを含み、同様の親水値を有する帯電していない極性
頭基（polar head group）有するアミノ酸はロイシン、イソロイシン及びバリン
、グリシン及びアラニン、アスパラギン及びグルタミン、セリン及びスレオニン
、フェニルアラニン及びチロシンを含む。

【００２８】 「アミノ酸」或いは「アミノ酸配列」は、オリゴペプチド、ペプチド、ポリペ
プチド或いはタンパク質配列及びそのフラグメント、並びに自然発生或いは合成
分子のことである。ＳＣＴＲのフラグメントは長さが約５〜約１５アミノ酸であ
り、ＳＣＴＲの生物学的活性或いは免疫学的活性を保持していることが好ましい
。「アミノ酸配列」は自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を示すものとして
表されるが、アミノ酸配列等の用語は、示されるタンパク質分子に関連する完全
な自然アミノ酸配列にそのアミノ酸配列を限定することを意味しない。

【００２９】 「増幅」は、核酸配列のさらなる複製の生成のことであり、一般に当分野にお
いて周知のポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）技術を用いて実行される（例えば、
Dieffenbach, C.W.及びG.S. Dveksler (1995) PCR Primer, a Lab. oratory Ma
nual, Cold Spring Harbor Press,Plainview, NY, pp. 1-5.を参照されたい）。

【００３０】 「アンタゴニスト」は、ＳＣＴＲに結合される際にＳＣＴＲの生物学的或いは
免疫学的活性を減少させる分子のことである。アンタゴニストはタンパク質、核
酸、炭水化物或いはＳＣＴＲに結合し、ＳＣＴＲの作用を減少させる任意の他の
分子を含む場合がある。

【００３１】 「抗体」は、エピトープ決定基を結合することができる、Ｆａ、Ｆ（ａｂ′） ₂ 及びＦｖのような無傷の分子及びそのフラグメントのことである。ＳＣＴＲポ リペプチドを結合する抗体は、免疫性抗原として対象の小さなペプチドを含む無
傷のポリペプチド或いはフラグメントを用いて作製ことができる。動物（例えば
マウス、ラット或いはウサギ）を免疫するために用いられるポリペプチド或いは
オリゴペプチドは、ＲＮＡの翻訳に由来するか、或いは化学的に合成され、所望
により担体タンパク質に結合することができる。ペプチドに化学的に結合される
通常用いられる担体は、ウシ血清アルブミン及びサイログロブリン、キーホール
リンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）を含む。その後結合されたペプチドを用いて
動物を免疫する。

【００３２】 「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の部分（すなわちエピトープ）
のことである。タンパク質或いはそのフラグメントを用いて宿主動物を免疫する
際、タンパク質の多くの領域が、タンパク質上の所与の領域或いは三次元構造体
に特異に結合する抗体の生成を誘発する場合がある。これらの領域或いは構造体
は抗原決定基と呼ばれる。抗原決定基は、抗体に結合するために、無傷の抗原（
すなわち免疫反応を誘発するために用いられるイムノゲン）と競合する場合があ
る。

【００３３】 「アンチセンス」は、特異なＤＮＡ或いはＲＮＡ配列に相補的なヌクレオチド
配列を含む任意の組成物である。用語「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖に相
補的な核酸鎖を示すために用いられる。アンチセンス分子はペプチド核酸を含み
、合成或いは転写を含む任意の方法により生成することができる。一度細胞内に
導入されれば、相補ヌクレオチドは細胞により生成される自然配列と結合し、二
重鎖を形成し、転写或いは翻訳のいずれかを遮断する。記号「負（マイナス）」
はアンチセンス鎖を示す際に用いられる場合があり、「正（プラス）」はセンス
鎖を示す場合に用いられることがある。

【００３４】 「生物学的活性」は、自然発生分子の構造的、調節的或いは生化学的機能を有
するタンパク質のことである。同様に「免疫学的活性」は自然、組換え或いは合
成ＳＣＴＲ、又はその任意のオリゴペプチドが、適当な動物或いは細胞において
特異な免疫反応を誘発し、かつ特異な抗体と結合する能力のことである。

【００３５】 「相補的」或いは「相補性」は、塩基対による許容塩類及び温度条件下でのポ
リヌクレオチドの自然結合のことである。例えば、配列「Ａ−Ｇ−Ｔ」の場合、
相補配列「Ｔ−Ｃ−Ａ」に結合する。２つの一本鎖分子間の相補性は、核酸のあ
るものだけが結合する「部分的」であるか、或いは完全な相補性が一本鎖分子間
に存在する場合には完全である場合もある。核酸鎖間の相補性の度合いは、核酸
鎖間のハイブリダイゼーションの効率及び強度に著しく影響する。これは核酸鎖
間の結合に及びペプチド核酸（ＰＮＡ）分子の設計及び使用に依存する増幅反応
において特に重要である。

【００３６】 「所与のポリヌクレオチド配列を含む組成物」或いは「所与のアミノ酸配列を
含む組成物」は、所与のポリヌクレオチド配列或いはアミノ酸配列を含む任意の
組成物に幅広く用いられる。その組成物は乾燥状態或いは水溶液状態を含む。Ｓ
ＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列或いはそのフラグメントを含む組成物
はハイブリダイゼーションプローブとして用いることもできる。そのプローブは
凍結乾燥状態で保管され、炭水化物のような安定化剤と関連することもできる。
ハイブリダイゼーションでは、そのプローブは塩類（例えばＮａＣｌ）、界面活
性剤（例えばＳＤＳ）及び他の組成物（例えばデンハート液、粉乳、サケ精子Ｄ
ＮＡ等）を含む水溶液に分散される場合もある。

【００３７】 「コンセンサス配列」は、核酸配列のうち、不要な塩基を分解するために再配
列されているもの、或いは５´或いは３´方向にXL-PCR (Perkin Elmer, Norwal
k, CT)を用いて伸長され、再配列されているもの、或いはフラグメント構築用コ
ンピュータプログラム（例えばGELVIEW Fragment Assembly System、GCG, Madis
on WI）を用いて２つ以上のインサイト社クローンの重複配列から構築されてい るもののことである。ある配列は伸長及び構築のいずれもが施され、コンセンサ
ス配列を生成している。

【００３８】 「ポリヌクレオチドの発現と相関がある」は、ノーザン分析によるＳＣＴＲを
コードするポリヌクレオチドに類似のリボ核酸の存在の検出が、サンプルにおい
てＳＣＴＲをコードするｍＲＮＡの存在を示しており、それによりそのタンパク
質をコードするポリヌクレオチドからの転写物の発現と相関があることを示す。

【００３９】 「欠失」は、アミノ酸配列或いはヌクレオチド配列いずれかにおいて変化し、
１つ或いはそれ以上のアミノ酸残基或いはヌクレオチドが欠如することである。

【００４０】 「誘導体」は、ＳＣＴＲをコードする核酸配列或いはＳＣＴＲ又はコードされ
たＳＣＴＲの相補配列の化学修飾体のことである。そのような修飾の例示は、水
素をアルキル基、アシル基或いはアミノ基に置換することである。核酸誘導体は
、自然分子の生物学的及び免疫学的機能を保持するポリペプチドをコードする。
誘導体ポリペプチドは、グリコシレーション、ポリエチレングリコール形成（pe
gylation）或いは由来したポリペプチドの生物学的或いは免疫学的機能を保持す
る任意の類似のプロセスにより修飾されるポリペプチドである。

【００４１】 「相同性」は相補性の度合いのことである。部分的相同性或いは完全相同性（
すなわち同一）がある。部分的相同性配列は、同一配列が標的核酸にハイブリダ
イズするのを少なくとも部分的に抑制する配列であり、実用的な用語「実質的に
相同性の」を用いることが好ましい。完全に相補的な配列の標的配列へのハイブ
リダイゼーションの抑制は、低い厳密性の条件下でハイブリダイゼーション検定
法（サザンブロット或いはノーザンブロット、溶液ハイブリダイゼーション等）
を用いて検査することができる。実質的に相同的な配列或いはプローブは、低い
厳密性の条件下で完全に相同的な配列及びプローブの標的配列への結合と競合し
、それを抑制するであろう。低い厳密性の条件は非特異な結合が許容されるよう
な条件であることは言うまでもない。低い厳密な条件は、２つの配列の互いへの
結合が特異な（すなわち選択的な）相互作用であることを必要とする。非特異な
結合の欠如は、部分的な度合いの相補性さえ存在しない（例えば約３０％同一性
より小さい）第２の標的配列の使用により検査される場合もある。非特異な結合
が存在しない場合、そのプローブは第２の非相補的標的配列にハイブリダイズし
ないであろう。

【００４２】 「パーセント同一性」或いは「％同一性」という表現は、２以上のアミノ酸ま
たは核酸配列を比較する際の配列類似性のパーセンテージである。パーセント同
一性は、例えばMegAlignプログラム（DNASTAR, Inc., Madison WI）を用いるこ とによって電子工学的に求めることができる。このMegAlign^TMプログラムは、異
なる方法、例えばクラスタ法（clustal method）（例えばHiggins, D.G.及びP.M
. Sharp (1988) Gene 73:237-244参照）に従って２以上の配列のアライメントを
作成することができる。このクラスタ法のアルゴリズムでは、配列群を、全ての
配列の対について両配列間の距離を調べることによってクラスタ（集団）にグル
ープ分けする。このクラスタ群について、一対毎にアライメントをとり、次にグ
ループにおいてアライメントをとる。２つのアミノ酸配列、例えば配列Ａと配列
Ｂの間のパーセント類似性は、（配列Ａの長さ−配列Ａにおけるギャップ残基の
数−配列Ｂにおけるギャップ残基の数）／（配列Ａと配列Ｂとの間の残基の一致
の総数）×１００で計算する。２つのアミノ酸配列の間の類似性の差が低いか無
いケースは、パーセント類似性の計算に含められない。核酸配列間のパーセント
同一性も、他の周知の方法、例えばJotun Hein法（例えばHein J. (1990) Metho
ds Enzymol. 183: 626-645参照）によってカウント即ち計算することができる。
配列間の同一性は、他の周知の方法、例えばハイブリダイゼーション条件を変え
ることによっても決定することができる。

【００４３】 「ヒト人工染色体」（ＨＡＣ）は、大きさが６ｋｂから１０ＭｂのＤＮＡ配列
を含み、安定した有糸分裂染色体の分離及び保持に必要とされる全ての要素を含
む直鎖状の小染色体である(例えばHarrington, J.J. et al. (1997) Nat Genet.
15:345-355を参照されたい)。

【００４４】 「ヒト化抗体」は、ヒト抗体により似せるために非抗原結合領域内においてア
ミノ酸が置換されているが、その一方で元の結合能力を保持している抗体分子の
ことである。

【００４５】 「ハイブリダイゼーション」は、核酸の鎖が塩基対を介して相補鎖と結合する
任意のプロセスのことである。

【００４６】 ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なＧとＣ塩基との間、並びに相補
的なＡとＴ塩基との間に水素結合を形成することにより２つの核酸配列間に形成
される複合体のことである。これらの水素結合は、塩基スタッキング相互作用に
よりさらに安定化する場合もある。２つの相補的核酸配列は、逆平行形状におい
て水素結合する。ハイブリダイゼーション複合体は、溶液（例えばＣ₀ｔ或いは Ｒ₀ｔ分析）内に、又は溶液中に存在する一方の核酸配列と固形支持体（例えば 紙、膜、フィルタ、チップ、ピン、或いはスライドガラス、又は細胞或いはその
核酸が固定されている任意の他の適切な支持体）上に固定化される別の核酸配列
との間に形成することもできる。

【００４７】 「挿入」或いは「付加」は、自然発生分子に比べて、１つ或いはそれ以上のア
ミノ酸残基或いはヌクレオチドがそれぞれ加わるアミノ酸配列或いはヌクレオチ
ド配列における変化のことである。

【００４８】 「免疫応答」は、炎症、外傷、免疫疾患、又は感染症や遺伝病等と関連のある
状態を指すものである。これらの状態は、細胞や全身の防御系を活性化する様々
な因子、例えばサイトカイン、ケモカイン、及び他のシグナル伝達分子の産生に
よって特徴付けることができる。

【００４９】 「マイクロアレイ」は、紙、ナイロン或いは他の種類の膜、フィルタ、チップ
、スライドガラス或いは任意の他の適当な固形支持体のような支持体上に配列さ
れる個別のポリヌクレオチド或いはオリゴヌクレオチドからなるアレイのことで
ある。

【００５０】 「調節」は、ＳＣＴＲの生物学的活性の変更ことである。例えば調節により、
ＳＣＴＲのタンパク質活性、結合特性或いは生物学的、機能的或いは免疫学的特
性が増減するようになる。

【００５１】 「核酸」或いは「核酸配列」はオリゴヌクレオチド、ヌクレオチド或いはポリ
ヌクレオチド並びにそのフラグメント、一本鎖或いは二本鎖の場合があり、セン
ス鎖或いはアンチセンス鎖を表すゲノム或いは合成起源のＤＮＡ或いはＲＮＡ、
ペプチド核酸（ＰＮＡ）或いは任意のＤＮＡ様或いはＲＮＡ様物質のことである
。「フラグメント」は、長さが６０ヌクレオチドより長い核酸配列であり、長さ
が少なくとも１００ヌクレオチド或いは少なくとも１０００ヌクレオチド、さら
に少なくとも１０，０００ヌクレオチドであるフラグメントを含むことが最も好
ましい。

【００５２】 本明細書において、用語「機能的に関連する」又は「機能的に結び付いた」は
、機能的に関連する核酸配列を表す。プロモータは、そのプロモータがコードさ
れるポリペプチドの転写を調節している場合、コード配列の機能的に関連又は機
能的に結びついている。機能的に関連した、又は機能的に結びついた核酸配列は
近接して読み枠内に存在することができるが、ある種のゲノムの配列、例えばリ
プレッサー遺伝子は、コードされるポリペプチドに近接していないが、やはりそ
のポリペプチドの発現を調節するオペレーター配列に結合する。

【００５３】 「オリゴヌクレオチド」は、少なくとも約６ヌクレオチドから６０ヌクレオチ
ドの核酸配列、好ましくは約１５−３０ヌクレオチドの核酸配列、より好ましく
は２０−２５ヌクレオチドの核酸配列であり、ＰＣＲ増幅或いはハイブリダイゼ
ーション検定法において用いることができる。ここで用いる場合、オリゴヌクレ
オチドは、一般に当分野において定義されているような用語「アンプリマ」、「
プライマ」、「オリゴマ」及び「プローブ」と実質的に等価である。

【００５４】 「ペプチド核酸」（ＰＮＡ）は、リジンにおいて終端するアミノ酸残基のペプ
チドバックボーンに結合する、長さが少なくとも５ヌクレオチドからなるオリゴ
ヌクレオチドを含むアンチセンス分子或いは抗遺伝因子（anti-gene agent）こ とである。ＰＮＡはポリエチレングリコール化され、細胞の寿命を延長し、その
中で相補一本鎖ＤＮＡ及びＲＮＡを優先的に結合し、転写延長を停止する（例え
ばNielsen PE 等(1993) Anticancer Drug Des 8:53-63を参照されたい）。

【００５５】 「サンプル」は幅広い意味に用いられる。ＳＣＴＲをコードする核酸或いはそ
のフラグメント又はＳＣＴＲ自体を含むと予想される生物学的サンプルは、溶液
中に存在するか、或いは固形支持体、組織、組織転写物（tissue print）等に結
合されている体液、細胞からの抽出物、染色体、細胞器官或いは細胞から単離さ
れた膜、細胞、ゲノムＤＮＡ、ＲＮＡ或いはｃＤＮＡを含む。

【００５６】 「特異な結合」或いは「特異に結合する」は、タンパク質或いはペプチドとア
ゴニスト、抗体とアンタゴニストとの間の相互作用のことである。その相互作用
は、結合分子により識別されるタンパク質の特定の構造（すなわち抗原決定基或
いはエピトープ）の存在に依存する。例えば、抗体がエピトープ「Ａ」に対して
特異である場合には、標識された「Ａ」を含むある反応におけるエピトープＡ（
或いは遊離し、標識されないＡ）及びその抗体を含むタンパク質の存在が、その
抗体に結合される標識されたＡの量を減らすであろう。

【００５７】 「厳密な条件」は、ポリヌクレオチド配列と、特許請求の範囲に記載されたポ
リヌクレオチド配列との間のハイブリダイゼーションを許容する条件のことであ
る。適切なレベルの厳密な条件は、例えば、プレハイブリダイゼーション及びハ
イブリダイゼーション領域における塩又はホルムアミドの濃度、又はハイブリダ
イゼーション温度によって決定することができ、当分野でよく知られている。詳
述すると、厳密性は、塩の濃度を低下させること、ホルムアミドの濃度を上昇さ
せること、又はハイブリダイゼーション温度を高めることによって高めることが
できる。

【００５８】 例えば、高い厳密な条件の下でのハイブリダイゼーションは、約３７℃〜４２
℃における約５０％のホルムアミド濃度で生じるようになる。低い厳密な条件の
下でのハイブリダイゼーションは、約３０℃〜３５℃の温度での約３５％〜２５
％のホルムアミド濃度で生じるようになる。詳細には、高い厳密な条件の下での
ハイブリダイゼーションは、５０％のホルムアミド濃度、５Ｘ ＳＳＰＥ、０．
３％ＳＤＳ、及び２００μｇ／ｍｌの剪断された変性サケ精子ＤＮＡを用いて４
２℃で生じるようになる。低い厳密な条件の下でのハイブリダイゼーションは、
上記の条件で、温度を３５℃に下げ、ホルムアミド濃度を３５％にする際に生じ
るようになる。特定のレベルの厳密性に対応する温度範囲は、目的の核酸のプリ
ン対ピリミジン比を計算し、それに従って温度を調節することによってさらに狭
めることができる。上記の温度範囲及び条件の変更については当分野で周知であ
る。

【００５９】 「実質的に精製された」は、自然環境から除去されるか、単離されるか或いは
分離された核酸配列或いはアミノ酸配列のことであり、それらは自然に関連する
他の成分を少なくとも６０％、好適には７５％、最も好適には９０％含まないも
のである。

【００６０】 「置換」は、１つ或いはそれ以上のヌクレオチド或いはアミノ酸が、それぞれ
異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置き換えられることである。

【００６１】 「形質転換」は、外来ＤＮＡが侵入し、受容体細胞を変化させるプロセスを意
味する。それは当分野において周知の種々の方法を用いて自然或いは人工的条件
下で生じさせることができる。形質転換は、外来核酸配列を原核或いは真核宿主
細胞に挿入するための任意の既知の方法に基づく場合がある。その方法は形質転
換される宿主細胞に基づいて選択され、限定はしないが、ウイルス感染、電気穿
孔法、熱ショック、リポフェクション並びに粒子照射を含む場合がある。そのよ
うに「形質転換された」細胞は、安定に形質転換された細胞を含んでおり、その
細胞では挿入されたＤＮＡが、自動的に複製するプラスミド或いはその宿主染色
体の一部の何れかとして複製されることができる。またその細胞は、限られた期
間だけ挿入されたＤＮＡ或いはＲＮＡを一時的に発現する細胞も含む。

【００６２】 ここで用いるＳＣＴＲの「変異体」は、１つ或いはそれ以上のアミノ酸により
変更されるアミノ酸配列のことである。変異体は「保存的に」変化する場合があ
り、その場合置換されたアミノ酸は、例えばロイシンをイソロイシンに置き換え
る場合のように、類似の構造的及び化学的特性を有する。さらにまれにではある
が、変異体は、グリシンをトリプトファンに置き換える場合のように「非保存的
に」変化する場合がある。また類似の少数変異体は、アミノ酸欠失或いは挿入、
又はその両方を含む場合もある。生物学的及び免疫学的活性を無くすことなくア
ミノ酸残基が置換、挿入或いは欠失されるかを判定する際の指標は、当業者に周
知のコンピュータプログラム、例えばDNASTARソフトウエアを用いて見出すこと ができる。

【００６３】 発明 本発明は、新規の短鎖の腫瘍開始因子受容体ファミリタンパク質（ＳＣＴＲ）
、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド、および発生障害、生殖障害、腫瘍性
障害および免疫学的障害の診断、治療および予防のためのこれらの組成物の使用
法の発見に基づいている。

【００６４】 本発明のＳＣＴＲをコードする核酸は最初に、アミノ酸配列アライメントのコ
ンピュータ検索を用いて膀胱ｃＤＮＡライブラリ（ＢＬＡＤＮＯＴ０４）からの
インサイト社クローン１３２１８４４において同定された。コンセンサス配列、
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２は重複および／または伸長した核酸配列、インサイト社ク
ローン１３２１８８４（ＢＬＡＤＮＯＴ０４）、１９１９４３１（ＢＲＳＴＴＵ
Ｔ０１）、１４５０２１３および１４５０６４６（ＰＥＮＩＴＵＴ０１）、３１
８９１５７（ＴＨＹＭＮＯＮ０４）、１２０８７７１（ＢＲＳＴＮＯＴ０２）、
１２１９５５１（ＮＥＵＴＧＭＴ０１）および１３５８１５６（ＬＵＮＧＮＯＴ
０９）に由来した。

【００６５】 一実施例では、本発明は図１Ａ、１Ｂ、１Ｃ、１Ｄおよび１Ｅに示されるよう
なＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。ＳＣＴＲは
長さが２９１アミノ酸であり、残基Ｔ−２００において１つの潜在的なｃＡＭＰ
およびｃＧＭＰ依存リン酸化部位を、残基Ｓ−１３３およびＳ−２０６において
２つの潜在的なカゼインキナーゼＩＩリン酸化部位を、残基Ｓ−１１、Ｓ−２４
、Ｓ−２５およびＳ−２２８において４つの潜在的なプロテインキナーゼＣリン
酸化部位を、約残基Ｃ−１１２〜約残基Ｃ−２１０までに潜在的なＴＮＦＲスー
パーファミリのシステインに富む領域のサインを有する。図２Ａ、２Ｂおよび２
Ｃに示されるように、ＳＣＴＲは、ヒト４−１ＢＢ（ＧＩ ７２８７３８；ＳＥ
Ｑ ＩＤ ＮＯ：３）、ヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３（ＧＩ １６６９６９２
；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４）およびヒトアポトーシス誘発タンパク質ＴＲＩＣＫ−
２Ａ（ＧＩ ２４０７６５１：ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５）と化学的および構造的に
相同性がある。詳細にはＳＣＴＲは、ヒト４−１ＢＢおよびヒトＷＳＬ−Ｓ１／
ＬＡＲＤ−３と１３％同一性を共有する。さらに、システインに富む領域のサイ
ンを含む約残基１１２〜残基２３５のＳＣＴＲの内部領域は、ヒト４−１ＢＢお
よびヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３対応する領域とそれぞれ２６％および３６
％同一性を共有する。潜在的なｃＡＭＰおよびｃＧＭＰ依存プロテインキナーゼ
リン酸化部位も保存される。さらにＳＣＴＲ、ヒト４−１ＢＢおよびヒトＷＳＬ
−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３は、それぞれ類似の等電位点６．７、７．６および６．７
を有する。約ヌクレオチド４６２〜約ヌクレオチド４９５のＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
２のフラグメントは、オリゴヌクレオチドを設計するために、或いはハイブリダ
イゼーションプローブとして用いるために有用である。ノーザン分析は種々のラ
イブラリにおけるこの配列の発現を示しており、その少なくとも５３％は不死化
或いは癌性であり、その少なくとも２３％は免疫応答に関係する。特に、生殖組
織、神経組織、消化管組織、心血管組織および発生組織におけるＳＣＴＲの発現
に留意されたい。

【００６６】 また本発明は、ＳＣＴＲ変異体を含む。好適なＳＣＴＲ変異体はＳＣＴＲアミ
ノ酸配列に少なくとも約８０％、より好ましくは少なくとも約９０％、最も好ま
しいＳＣＴＲ変異体はＳＣＴＲに少なくとも約９５％アミノ酸が同一である変異
体であり、ＳＣＴＲの少なくとも１つの機能的或いは構造的特徴を含む また本発明はＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドを含む。特定の実施例で
は本発明は、ＳＣＴＲをコードする、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の配列を含むポリヌ
クレオチドを含む。

【００６７】 また本発明は、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列の変異配列を含む
。詳細には、そのようなポリヌクレオチド変異配列は、ＳＣＴＲをコードするポ
リヌクレオチド配列に少なくとも約８０％、より好ましくは少なくとも約９０％
、最も好ましくは少なくとも約９５％のポリヌクレオチド配列同一性を有するで
あろう。本発明の特定の態様は、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に少なくとも約８０％、
より好ましくは少なくとも約９０％、最も好ましくは少なくとも約９５％のポリ
ヌクレオチド配列同一性を有するＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のポリヌクレオチド配列
の変異配列を含む。

【００６８】 遺伝子コードの縮重の結果として、ＳＣＴＲをコードする多数のヌクレオチド
配列が生成され、その中には任意の既知の自然発生遺伝子のヌクレオチド配列に
最低限の相同性を示すものもあることは当業者には理解されよう。このように本
発明は、可能なコドン選択に基いて組み合わせを選択することにより形成される
ようになるヌクレオチド配列のあらゆる可能な変異配列を考慮する。これらの組
み合わせは、自然発生ＳＣＴＲのヌクレオチド配列に適用されるような標準的な
トリプレット遺伝子コードに従って形成され、全てのそのような変形形態が明確
に開示されているものと考慮されたい。

【００６９】 ＳＣＴＲをコードするヌクレオチド配列及びその変異配列は、適当に選択され
た厳密な条件下で、自然発生ＳＣＴＲのヌクレオチド配列にハイブリダイズでき
ることが好ましいが、実質的に異なるコドン使用法を有するＳＣＴＲをコードす
るヌクレオチド配列或いはその誘導体を生成することが有利な場合もある。コド
ンを選択して、特定のコドンが宿主によって利用される頻度に応じて、ペプチド
の発現が特定の原核或いは真核発現宿主において生じる割合を増加してもよい。
コードされたアミノ酸配列を変更することなくＳＣＴＲをコードするヌクレオチ
ド配列及びその誘導体を実質的に変更する他の理由は、より長い半減期のような
、自然発生配列から生成された転写物より望ましい特性を有するＲＮＡ転写物を
生成することを含む。

【００７０】 また本発明は、合成化学的に完全に、ＳＣＴＲ及びその誘導体をコードするＤ
ＮＡ配列或いはそのフラグメントを生成することを含む。生成後、本特許出願の
出願時点で当分野において周知の薬剤を用いて、合成配列を、任意の多くの入手
可能な発現ベクタ及び細胞系に挿入することができる。さらに合成化学的に、Ｓ
ＣＴＲをコードする配列或いは任意のそのフラグメントに突然変異を導入するこ
ともできる。

【００７１】 また本発明にはに教示されるような種々の厳密性の条件下で請求されるヌクレ
オチド配列、詳細にはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のフラ
グメントに示されるヌクレオチド配列にハイブリダイズすることができるポリヌ
クレオチド配列が含まれる（例えば、Wahl,G.M及びS.L.Berger(1987;Methods En
zymol. Vol. 152:399-407)及びKimmel, A.R.(1987;Methods Enzymol. Vol 152:
507-511)を参照されたい）。

【００７２】 当分野において周知で、一般に入手可能なＤＮＡ配列決定のための方法が本発
明の任意の実施例を実行するために用いられる。これらの方法はDNA polymerase
I, Sequenase(US Biochemical Corp, Cleveland OH))のKlenow fragment、Taq
polymerase (Perkin Elmer)、耐熱性T7 polymerase (Amersham, Chicago IL)或 いはGibco BRL (Gaithersburg MD)により市販されているELONGASE Amplificatio
n Systemのような組換えポリメラーゼとプルーフリーディングエキソヌクレアー
ゼの組み合わせのような酵素を利用する。このプロセスはHamilton Micro Lab 2
200 (Hamilton, Reno NV), Peltier Thermal Cycler (PTC200; MJ Research, Wa
tertown MA) 及びABI Catalyst並びに373及び377 DNA sequencers (Perkin Elme
r)のような機器を用いて自動化することが好ましい。

【００７３】 ＳＣＴＲをコードする核酸配列は、部分ヌクレオチド配列を利用して、かつプ
ロモータ及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当分野において
既知の種々の方法を用いて伸長させることができる。例えば、用いられる場合が
ある１つの方法、「制限部位」ＰＣＲは、汎用プライマを用いて既知の位置に隣
接する未知の配列を回収する（例えばSarkar. G (1993) PCR Methods Applic 2:
318-322を参照されたい）。詳細には、ゲノムＤＮＡがリンカー配列に対するプ ライマ及び既知の領域に特異なプライマの存在下で最初に増幅される。その後増
幅された配列は、同じリンカープライマ及び第１のプライマに内在する別の特異
なプライマを用いて第２巡目のＰＣＲにかけられる。各回のＰＣＲの生成物は、
適当なＲＮＡポリメラーゼを用いて転写され、逆転写酵素を用いて配列決定され
る。

【００７４】 また逆ＰＣＲを利用して、既知領域に基づく多岐プライマを用いて配列を増幅
或いは伸長することもできる（Triglia T等(1988) Nucleic Acids Res 16:8186 ）。プライマはOLIGO4.06 Primer Analysis Software (National Biosciences I
nc, Plymouth MN)或いは別の適当なプログラムのような市販のソフトウエアを用
いて、長さが２２−３０ヌクレオチドになり、５０％以上のＧＣ含量を有し、さ
らに約６８−７２℃の温度で標的配列にアニールするように設計される。その方
法はいくつかの制限酵素を用いて、遺伝子の既知の領域に適当なフラグメントを
生成する。その際そのフラグメントは、分子内連結反応により環状にされ、ＰＣ
Ｒテンプレートとして用いられる。

【００７５】 用いられる場合がある別の方法は、ヒト及び酵母人工染色体ＤＮＡの既知の配
列に隣接するＤＮＡフラグメントをＰＣＲ増幅することを伴う捕獲ＰＣＲ（Lage
rstrom M 等(1991) PCR Methods Applic 1:111-19）である。この方法では、多 数の制限酵素消化及び連結を用いて、ＰＣＲを実行する前に遺伝子操作された二
本鎖配列をＤＮＡ分子の未知のフラグメントに配置することができる。

【００７６】 未知の配列を回収するために用いられることがある別の方法は当分野で公知で
ある（例えばParker JD 等 (1991; Nucleic Acids Res 19:3055-3060を参照され
たい)。さらにある方法はＰＣＲ、入れ子状プライマ及びPromoterFinderライブ ラリを用いて、ゲノムＤＮＡを歩行することができる（Clontech, Palo Alto CA
）。このプロセスによりライブラリをスクリーニングする必要がなくなり、イン
トロン／エクソン接合部を見つける際に有用である。

【００７７】 完全長ｃＤＮＡに対してスクリーニングする際に、より長いｃＤＮＡを含むよ
うに大きさを選択されたライブラリを用いることが好ましい。またランダムに初
回抗原刺激を受けたライブラリも、それらが遺伝子の５´及び上流領域を含むよ
り大きな配列を含むという点で好ましい。ランダムに初回抗原刺激を受けたライ
ブラリの使用は、オリゴｄ（Ｔ）ライブラリが完全長ｃＤＮＡを産生しない状況
では特に好ましい。ゲノムライブラリは５´非転写制御領域に配列を伸長するた
めに有用な場合がある。

【００７８】 市販の毛細管電気泳動系を用いて、配列決定或いはＰＣＲ生成物の大きさを解
析したり、或いはそのヌクレオチド配列を確認することもできる。詳細には毛細
管配列決定法は、電気泳動分離のための流動性ポリマ、レーザにより活性化され
る（各ヌクレオチドに対して１種類の）４つの異なる蛍光性染料及びＣＣＤカメ
ラによる放射波長の検出を用いる場合がある。出力／光強度が適当なソフトウエ
ア（例えばGenotyper及びSequence Navigator 、Perkin Elmer）を用いて電気信
号に変換され、サンプルの装填からコンピュータ解析及び電子データ表示までの
全プロセスがコンピュータ制御される。毛細管電気泳動法は、特定のサンプルの
限定された量内に存在する場合があるＤＮＡの小片の配列決定に特に好ましい。

【００７９】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列或いは
そのフラグメントが、適当な宿主細胞においてＳＣＴＲ、そのフラグメント或い
はその機能的等価物の発現をもたらすために組換えＤＮＡ分子に用いられる場合
がある。ゲノムコードの固有の縮重により、概ね同一か或いは機能的に等価なア
ミノ酸配列をコードする他のＤＮＡ配列が生成され、この配列を用いてＳＣＴＲ
をクローニングし、発現することもできる。

【００８０】 非自然発生コドンを有するＳＣＴＲをコードするヌクレオチド配列を生成する
ことが有利な場合もあることは当業者には理解されよう。例えば、特定の原核或
いは真核宿主により選択されたコドンを選択して、タンパク質発現の割合を増加
したり、或いは自然発生配列から生成される転写物より長い半減期のような所望
の特性を有するＲＮＡ転写物を生成することもできる。

【００８１】 本発明のヌクレオチド配列は、限定はしないが、遺伝子生成物のクローニング
、プロセッシング並びにまた発現を修飾する変更を含む種々の理由によりＳＣＴ
Ｒをコードする配列を変更するために、当分野において周知の方法を用いて遺伝
子操作することができる。遺伝子フラグメント及び合成オリゴヌクレオチドのラ
ンダムなフラグメント化及びＰＣＲ再構築によるＤＮＡ混合を用いて、ヌクレオ
チド配列を遺伝子操作することができる。例えば、位置指定突然変異誘発を用い
て、新しい制限部位の挿入、グリコシレーションパターンの変更、コドン優先度
の変更、スプライシング変異配列の生成或いは突然変異の導入等を行うこともで
きる。

【００８２】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲをコードする自然、修飾或いは組換えポリ
ヌクレオチドは、融合タンパク質をコードするために異種配列に結合されること
もできる。例えば、ＳＣＴＲ活性のインヒビタ用のペプチドライブラリをスクリ
ーニングするために、市販されている抗体により識別されるキメラＳＣＴＲタン
パク質をコードすることが有用な場合もある。また融合タンパク質は、ＳＣＴＲ
をコードする配列と異種タンパク質配列との間に位置する切断部位を含むように
遺伝子操作されることもでき、それによりＳＣＴＲは切断され、異種部分から離
れて精製されるようになる。

【００８３】 別の実施例では、当分野で周知の化学的方法を用いて、ＳＣＴＲをコードする
配列を、全体的に或いは部分的に合成することができる（例えばCaruthers MH 等 (1980) Nuc Acids Res Symp Ser 215-23, Horn T等(1980) Nuc Acids Res Sy
mp Ser 225-232を参照されたい）。別法では、タンパク質自体が、ＳＣＴＲのア
ミノ酸配列或いは一部を合成するために化学的方法を用いて生成される場合があ
る。例えばペプチド合成は種々の固相技術（例えばRoberge JY 等(1995) Scienc
e 269:202-204を参照されたい）を用いて実行することができ、自動合成は、例 えばABI 431A Peptide Synthesizer (Perkin Elmer)を用いることにより実現す ることができる。さらにＳＣＴＲのアミノ酸配列或いはその任意の一部は、直接
合成中に変更されるか、並びにまた他のタンパク質或いはその任意の一部からの
配列を用いる化学的方法により結合され、変異体ポリペプチドを生成することも
できる。

【００８４】 そのペプチドは、調製用高速液体クロマトグラフィにより実質的に精製される
ことができる（例えばChiez, R.M. and F.Z. Regnier (1990) Methods Enzymol.
182:392-421を参照されたい）。合成ペプチドの組成物は、アミノ酸分析或いは 配列決定により確認することができる（例えばCreighton, T. (1983) Proteins,
Structures. and. Molecular Prop..erties, WH Freeman and Co., New York,
NYを参照されたい）。

【００８５】 生物学的に有効なＳＣＴＲを発現するために、ＳＣＴＲをコードするヌクレオ
チド配列或いはその機能的等価物が、適当な発現ベクタ、すなわち挿入されたコ
ード化配列の転写及び翻訳のために必要なエレメントを含むベクタ内に挿入され
てもよい。

【００８６】 当業者に周知の方法を用いて、ＳＣＴＲをコードする配列及び適当な転写或い
は翻訳制御エレメントを含む発現ベクタを作製することができる。これらの方法
は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ組換えＤＮＡ技術、合成技術並びにｉｎ ｖｉｖｏゲノム
組換えを含む（例えば、Sambrook,等(1989) Molecular Cloning. A Laboratory Manual , Cold Spring Harbor Press, Plainview, NY, ch. 4, 8, and 16-17;並 びにAusubel, F.M.等(1995, and periodic supplements) Current Protocols in Molecular Biology , John Wiley & Sons, New York, NY, ch. 9, 13, and 16を
参照されたい）。

【００８７】 種々の発現ベクタ／宿主系を利用して、ＳＣＴＲをコードする配列を含有し、
発現する場合もある。これらは、限定はしないが、組換えバクテリオファージ、
プラスミド或いはコスミドＤＮＡ発現ベクタと形質転換されたバクテリア、酵母
発現ベクタと形質転換された酵母、ウイルス発現ベクタで感染した昆虫細胞系（
例えばバキュロウイルス）、ウイルス発現ベクタと形質転換された植物細胞系（
例えば、カリフラワーモザイクウイルスＣａＭＶ、タバコモザイクウイルスＴＭ
Ｖ）或いはバクテリア発現ベクタと形質転換された植物細胞系（例えば、Ｔｉ或
いはｐＢＲ３２２プラスミド）又は動物細胞系のような微生物を含む。本発明は
用いられる宿主細胞により制限されない。

【００８８】 「制御エレメント」或いは「調節配列」はベクタの非翻訳領域、すなわちエン
ハンサ、プロモータ並びに５´及び３´非翻訳領域であり、転写及び翻訳を実行
するために宿主細胞タンパク質と相互作用する。そのようなエレメントは強度及
び特異性において異なる場合がある。用いられるベクタ系及び宿主により、構成
的及び誘導性プロモータを含む、任意の数の適当な転写及び翻訳エレメントを用
いることができる。例えばバクテリア系においてクローニングする際に、Bluesc
ript ファージミド(Stratagene, LaJolla CA) のハイブリッドｌａｃＺプロモー
タ或いはpSport 1 プラスミド(Gibco BRL)等の誘導性プロモータを用いることが
できる。バキュロウイルスポリヘドリン（polyhedrin）プロモータは昆虫細胞に
用いられる。植物細胞のゲノムに由来するプロモータ或いはエンハンサ（例えば
熱ショック、ＲＵＢＩＳＣＯ及び貯蔵タンパク質遺伝子）或いは植物ウイルスに
由来するプロモータ或いはエンハンサ（例えばウイルス性プロモータ或いはリー
ダ配列）が、ベクタにクローニングされる場合もある。哺乳動物細胞系では、哺
乳動物遺伝子或いは哺乳動物ウイルスに由来するプロモータが好ましい。ＳＣＴ
Ｒをコードする配列の多数の複製を含む細胞株を発生させる必要がある場合には
、ＳＶ４０或いはＥＢＶ系のベクタを適当な選択可能マーカと共に用いることが
できる。

【００８９】 バクテリア系では、いくつかの発現ベクタが、ＳＣＴＲのための使用に応じて
選択されてもよい。例えば大量のＳＣＴＲが抗体を誘導するために必要とされる
とき、容易に精製される融合タンパク質を高レベルで発現させるベクタを用いる
ことができる。そのようなベクタは、限定するわけではないが、ＳＣＴＲをコー
ドする配列が、アミノ末端Ｍｅｔ及び後続のβ−ガラクトシダーゼの７残基に対
する配列の枠内のベクタに結合されることができ、ハイブリッドタンパク質が生
成される、多機能Ｅ．ｃｏｌｉクローニング及びBluescript(Stratagene)のよう
な発現ベクタ、並びにｐＩＮベクタ（Van Heeke & Schuster (1989) J Biol Che
m 264:5503-5509）等を含む。またｐＧＥＸベクタ（Promega, Madison WI）を用
いて、外来のポリペプチドをグルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）を
有する融合タンパク質として発現してもよい。一般にそのような融合タンパク質
は可溶性であり、グルタチオン−アガロースビードへの吸収及びそれに後続する
遊離グルタチオンの存在時の溶出により分離した細胞から容易に精製することが
できる。そのような系内で形成されるタンパク質はヘパリン、トロンビン或いは
第ＸＡ因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計され、対象のクローニングさ
れたポリペプチドが自由にＧＳＴ成分から遊離されるようにする。

【００９０】 酵母、サッカロミセス‐セレビジエでは、α因子、アルコールオキシダーゼ及
びＰＧＨのような構成的及び誘導性プロモータを含むいくつかのベクタを用いる
ことができる（例えば、Ausubel 等 (上記)及びGrant等(1987;Methods in Enzym
ology 153:516-544)を参照されたい）。

【００９１】 植物発現ベクタが用いられる場合には、ＳＣＴＲをコードする配列の発現は、
いくつかのプロモータの任意のものにより行われる。例えばＣａＭＶの３５Ｓ及
び１９Ｓプロモータのようなウイルス性プロモータは単独で、或いはＴＭＶから
のω−リーダ配列と共に用いることができる（Takamatsu 等 (1987) EMBO J 6:3
07-311）。別法では、ＲＵＢＩＳＣＯの小サブユニットのような植物プロモータ
或いは熱ショックプロモータ（Coruzzi 等 (1984) EMBO J 3:1671-1680; Brogli
e 等 (1984) Science 224:838-843及びWinter J and Sinibaldi RM (1991) Resu
lts Probl Cell Differ 17:85-105）を用いる場合もある。これらの構成体は、 直接ＤＮＡ形質転換或いは病原体媒介形質移入により植物細胞内に導入されるこ
とができる。その技術は一般に入手できるいくつかの概説に記載される（例えば
、Hobbs S or Murry LE in McGraw Hill Yearbook of Science and Technology
(1992) McGraw Hill New York NY, pp. 191-196を参照されたい）。

【００９２】 また昆虫系もＳＣＴＲを発現するために用いることができる。例えばある系で
は、Autographa californica核多角体病ウイルス（ＡｃＮＰＶ）をベクタとして
用いて、ヨトウガ（Spodoptera frugiperda）細胞或いはイクラサキンウワバ幼 虫（Trichoplusia larvae）において外来遺伝子を発現する。ＳＣＴＲをコード する配列は、ポリヘドリン（polyhedrin）遺伝子のようなウイルスの非必須領域
にクローニングし、ポリヘドリンプロモータの制御下に置かれる。ＳＣＴＲをコ
ードする配列を有効に挿入することにより、ポリヘドリン遺伝子は非活性になり
、コートタンパク質を欠如する組換えウイルスが生成される。その後組換えウイ
ルスを用いて、ＳＣＴＲが発現される、例えばヨトウガ細胞或いはイクラサキン
ウワバ幼虫を感染させる（例えば、Engelhard EK 等 (1994), Proc Nat Acad Sc
i 91:3224-3227を参照されたい）。

【００９３】 哺乳類宿主細胞では、いくつかのウイルス性発現系が利用される場合がある。
アデノウイルスが発現ベクタとして用いられる場合には、ＳＣＴＲをコードする
配列は、後期プロモータ及び３連のリーダ配列からなるアデノウイルス転写／翻
訳複合体に結合される場合がある。ウイルスゲノムの非必須Ｅ１或いはＥ３領域
内の挿入により、感染した宿主細胞においてＳＣＴＲを発現することができる生
ウイルスを得ることができる（例えば、Logan and Shenk (1984) Proc Natl Aca
d Sci 81:3655-3659を参照されたい）。さらにラウス肉腫ウイルス（ＲＳＶ）エ
ンハンサのような転写エンハンサを用いて、哺乳動物宿主細胞内の発現を増加さ
せることができる。

【００９４】 またヒト人工染色体（ＨＡＣ）を用いて、プラスミドに含まれ、発現させるこ
とができるＤＮＡのより大きなフラグメントを送達することもできる。治療のた
め、６〜１０ＭのＨＡＣが構成され、従来の送達方法（リポソーム、ポリカチオ
ンアミノポリマ或いはベシクル）を用いて送達される。

【００９５】 また特異な開始シグナルを用いて、ＳＣＴＲをコードする配列のより効率的な
転写を達成することもできる。そのシグナルはＡＴＧ開始コドン及び隣接配列を
含む。ＳＣＴＲをコードする配列、その開始コドン及び上流配列が適当な発現ベ
クタ内に挿入される場合には、追加の転写或いは翻訳制御シグナルは不要である
。しかしながらコードする配列或いはその一部のみが挿入される場合には、ＡＴ
Ｇ開始コドンを含む外来の翻訳制御シグナルが与えられるべきである。さらに開
始コドンは、全挿入物を確実に転写するために、正確な読み枠内に置かれなけれ
ばならない。外来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の種々の
起源からなることができる。発現の効率は、論文に記載されるように、使用され
る特定の細胞系に適したエンハンサを含有することにより高められる場合がある
（例えば、Scharf D 等 (1994) Results Probl Cell Differ 20: 125-162を参照
されたい）。

【００９６】 さらに宿主細胞株は、挿入した配列の発現を調節できるように、或いは所望の
ように発現したタンパク質を処理できるように選択することができる。そのよう
なポリペプチドの調節は、限定はしないが、アセチル化、カルボキシル化、グリ
コシル化、リン酸化、脂質化或いはアシル化を含む。またタンパク質の「プレプ
ロ」形態を切断する翻訳後プロセッシングを用いて、正確な挿入、折りたたみ並
びにまた機能を促進することができる。翻訳後活性のために特異な細胞機構及び
特性機構を有する種々の宿主細胞（例えばＣＨＯ、ＨｅＬａ、ＭＤＣＫ、ＨＥＫ
２９３及びＷＩ３８）がAmerican Type Culture Collection（ATTC; Bethesda,
MD）から市販されており、外来タンパク質の正確な調節及びプロセッシングを確
実にするように選択することができる。

【００９７】 長期間組換え体タンパク質を歩留まり高く生産する場合、安定した発現が望ま
しい。例えば、ＳＣＴＲを安定して発現する細胞株は、複製或いは内性発現エレ
メントのウイルス起源及び同じ或いは別のベクタにおける選択可能マーカ遺伝子
を含む発現ベクタを用いて形質転換することができる。ベクタの導入に続いて、
細胞を強化培地内で１〜２日間成長させ、その後選択培地に切り替えるようにす
る。選択可能マーカの目的は、選択への耐性を与えることであり、その存在によ
り、導入された配列を有効に発現する細胞が成長し、回収されるようになる。安
定して形質転換された細胞の耐性クローンは、細胞タイプに適した組織培養技術
を用いて増殖させることができる。

【００９８】 任意の数の選択系を用いて、形質転換された細胞株を回収することができる。
これらは、限定はしないが、それぞれｔｋ^-細胞或いはａｐｒｔ^-細胞において用
いることができる単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（Wigler,M等(1977) C
ell 11:223-32）及びアデニンフォスフォリボシール転換酵素遺伝子（Lowy I等(
1980) Cell 22:817-23）含む。また代謝拮抗物質、抗生物質或いは除草剤耐性を
選択のための基準として用いることができる。例えば、ｄｈｆｒはメトトレキセ
ートへの耐性を与え（Wigler M等(1980)Proc Natl Acad Sci 77:3567-70）、ｎ ｐｔはアミノグリコシッドネオマイシン及びＧ−４１８への耐性を与え（Colber
e-Garapin F等(1981) J Mol Biol 150:1-14）、ａｌｓ或いはｐａｔはそれぞれ クロルスルフロン及びホスフィノトリシン（phosphinotricin）アセチル基転移 酵素への耐性を与える（Murry、前掲）。さらに選択可能遺伝子が記載されてお り、例えば、ｔｒｐＢにより細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用
できるようになり、ｈｉｓＤにより細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノール（
histinol）を利用できるようになる（Hartman S.C及びR.C Mulligan(1988)Proc
Natl Acad Sci 85:8047-51）。最近では、アントシアニン、β−グルクロニダー
ゼ及びその基質ＧＵＳ並びにルシフェラーゼ及びその基質ルシフェリンのような
マーカと共に可視マーカを使用することが普及しており、転換体を同定するのみ
ならず、特異なベクタ系に起因する一過性或いは安定したタンパク質発現の量を
定量するために幅広く用いられる（Rhodes CA等(1995) Methods Mol Biol 55:12
1-131）。

【００９９】 マーカ遺伝子発現の存否は、対象の遺伝子が存在することを示唆するが、その
存在及び発現は確認される必要がある。例えば、ＳＣＴＲをコードする配列がマ
ーカ遺伝子配列内に挿入される場合には、ＳＣＴＲをコードする配列を含む組換
え細胞は、マーカ遺伝子機能の欠如により同定されることができる。別法では、
マーカ遺伝子は、単一のプロモータの制御下でＳＣＴＲをコードする配列と直列
に配置される。誘導及び選択に応じたマーカ遺伝子の発現は通常、同様に直列型
遺伝子の発現を示す。

【０１００】 別法では、ＳＣＴＲをコードする核酸配列を含み、ＳＣＴＲを発現する宿主細
胞は、当業者に知られる種々の手順により同定されることができる。この手順は
、限定はしないが、核酸或いはタンパク質の検出並びにまた定量化のための膜、
溶液或いはチップ系技術を含むＤＮＡ−ＤＮＡ或いはＤＮＡ−ＲＮＡハイブリダ
イゼーション及びタンパク質バイオアッセイ或いはイムノアッセイ技術を含む。

【０１０１】 ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列の存在は、ＳＣＴＲをコードする
ポリヌクレオチドのプローブ或いはフラグメントを用いるＤＮＡ−ＤＮＡ或いは
ＤＮＡ−ＲＮＡハイブリダイゼーション或いは増幅により検出されることができ
る。核酸増幅系アッセイは、ＳＣＴＲをコードするＤＮＡ或いはＲＮＡを含む形
質転換体を検出するために、ＳＣＴＲをコードする配列に基づくオリゴヌクレオ
チド或いはオリゴマを使用することを伴う。

【０１０２】 ＳＣＴＲの発現を検出し、測定するための種々のプロトコルは、そのタンパク
質に対して特異なポリクローナル抗体或いはモノクローナル抗体のいずれかを用
いており、当業者には周知である。例えば酵素結合免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）、
ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、蛍光標示式細胞分取（ＦＡＣＥ）などである
。ＳＣＴＲにおける２つの非干渉性エピトープに反応するモノクローナル抗体を
用いる２部位のモノクローナル系イムノアッセイ（monoclonal-based immunoass
ay）が好ましいが、結合タンパク競合測定法が用いられてもよい（例えば、Hamp
ton R 等(1990, Serological Methods, a Laboratory Manual, APS Press, St.
Paul MN)及びMaddox DE 等 (1983, J Exp'Med 158:1211-1216を参照されたい)。

【０１０３】 幅広い標識及び接合技術が当業者には知られており、種々の核酸及びアミノ酸
検定法において用いることができる。ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドに
関連する配列を検出するための標識化ハイブリダイゼーション或いはＰＣＲプロ
ーブを生成するための手段は、オリゴ標識化、ニックトランスレーション、末端
標識化或いは標識化ヌクレオチドを用いるＰＣＲ増幅を含む。別法では、ＳＣＴ
Ｒをコードする配列或いはその任意の一部が、ｍＲＮＡプローブの生成のために
ベクタ内にクローニングされる場合もある。そのようなベクタが当分野において
知られ、市販されており、Ｔ７、Ｔ３或いはＳＰ６のような適当なＲＮＡポリメ
ラーゼ及び標識されたヌクレオチドを加えることによりｉｎ ｖｉｔｒｏでＲＮ
Ａプローブを合成するために用いることができる。これらの手順は種々の市販の
キット（Pharmacia&upjohn (Kalamazoo,MI)、Promega (Madison WI)及びUS Bioc
hemical Corp (Cleveland OH)）を用いて行われる。適当なリポータ分子或いは 標識が用いられる場合もあり、放射性核種、酵素、蛍光剤、化学発光剤或いは色
素生産剤並びに基質、コファクタ、インヒビタ、磁気粒子等を含む。

【０１０４】 ＳＣＴＲをコードするヌクレオチド配列と形質転換された宿主細胞は、細胞培
養からのタンパク質の発現及び回収のために適した条件下で培養されることがで
きる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用いられる配列並びにまた
ベクタにより、分泌されるか或いは細胞内に含有される。ＳＣＴＲをコードする
ポリヌクレオチドを含む発現ベクタは、原核細胞膜或いは真核細胞膜を介してＳ
ＣＴＲの分泌を促すシグナル配列を含むように設計することができることは当業
者には理解されよう。他の組換え構造を用いて、可溶性タンパク質の精製を容易
にするポリペプチド領域をコードするヌクレオチド配列にＳＣＴＲをコードする
配列を結合する場合もある。そのような精製を容易にする領域は、限定はしない
が、固定化金属上で精製できるようにするヒスチジン−トリプトファンモジュー
ルのような金属キレート化ペプチド、固定化免疫グロブリン上で精製できるよう
にするタンパク質Ａドメイン及びＦＬＡＧＳ伸長／親和性精製系（Immunex Corp
., Seatile, WA）において用いられるドメインを含む。精製ドメインとＳＣＴＲ
との間に第ＸＡ因子或いはエンテロキナーゼ（Invitrogen, San Diego, CA）に 対して特異な配列のような分割可能リンカー配列を含有することにより、精製が
容易になる場合もある。１つのそのような発現ベクタが、ＳＣＴＲ及びチオレド
キシン或いはエンテロキナーゼ切断部位に先行する６ヒスチジン残基をコードす
る核酸を含む融合タンパク質の発現をもたらす。ヒスチジン残基は、ＩＭＡＣ（
Porath, J. 等 (1992, Prot. Exp. Purif. 3:263-281)に記載されるような固定 化金属イオン親和性クロマトクグラフィ）において精製を容易にし、一方エンテ
ロキナーゼ切断部位は融合タンパク質からのＳＣＴＲを精製するための手段を提
供する（例えば、Kroll,D.J.等(1993;DNA Cell Biol. 12:441-453を参照された い)。

【０１０５】 組換え生成物に加えて、ＳＣＴＲのフラグメントは、固相技術（Merrifield J
(1963) J Am Chem Soc 85:2149-2154）を用いる直接ペプチド合成により生成さ
れる場合もある。タンパク質合成は手動技術を用いて或いは自動化により実行さ
れることができる。例えば、Applied Biosystems 431A Peptide Synthesizer (P
erkin Elmer)を製造者により提供される取扱説明書に従って用いることにより自
動合成を実現してもよい。ＳＣＴＲの種々のフラグメントは化学的に個別に合成
されるか、或いは化学的方法を用いて結合され、完全長分子を生成することがで
きる。

【０１０６】 治療 ＳＣＴＲとヒト４−１ＢＢ（ＧＩ ７２８７３８；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）、
ヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３（ＧＩ １６６９６９２；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
４）およびヒトアポトーシス誘発タンパク質ＴＲＩＣＫ−２Ａ（ＧＩ ２４０７
６５１：ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５）との間には化学的および構造的相同性がある。
さらにＳＣＴＲは腫瘍性組織、免疫学的組織、生殖組織、神経組織、消化管組織
、心血管組織および発生組織において発現される。それゆえＳＣＴＲは発生障害
、生殖障害、腫瘍性障害および免疫学的障害においてある役割を有するものと考
えられる。

【０１０７】 それゆえ一実施例では、ＳＣＴＲおよびそのフラグメントまたは誘導体が被検
者に投与され、発生障害を治療或いは予防することができる。用語「発生障害」
は、被検者の組織、器官或いは系（例えば脳、副腎、腎臓、骨格或いは生殖系）
の発生或いは機能に関連する任意の障害のことである。そのような障害は限定は
しないが、尿細管性アシドーシス、貧血症、クッシング症候群、軟骨形成不全性
小人症、デュシェンヌおよびベッカー型筋ジストロフィ、てんかん、性腺形成異
常症、ＷＡＧＲ症候群、スミス−マジェンニス（Smith-Magenis）症候群、脊髄 形成異常症候群、遺伝性粘膜上皮形成異常、遺伝性角皮症、シャルコー・マリー
ツース病および神経線維腫症のような遺伝性神経病、甲状腺不全症、水頭症、シ
ドナム舞踏病および脳性麻痺のような発作障害、脊椎披裂、および先天性緑内障
、白内障或いは感覚神経性聴力損失を含むことができる。

【０１０８】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメントまたは誘導体を発現するこ
とができるベクタを被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む発生障害
を治療或いは予防することができる。

【０１０９】 さらに別の実施例では、適当な医薬品担体とともに実質的に精製されたＳＣＴ
Ｒを含む医薬品組成物を被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む発生
障害を治療或いは予防することができる。

【０１１０】 さらに別の実施例では、ＳＣＴＲの活性を調節するアゴニストを被検者に投与
して、限定はしないが上記障害を含む発生障害を治療或いは予防することができ
る。

【０１１１】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメントまたは誘導体を被検者に投
与して生殖障害を治療或いは予防することができる。そのような生殖障害は、限
定はしないが、プロラクチン生成の障害、卵管障害、排卵異常および子宮内膜症
を含む不妊症、発情周期の破壊、月経周期の破壊、多嚢胞性卵巣症候群、卵巣過
剰刺激症候群、子宮内膜および卵巣の癌、自己免疫障害、子宮外妊娠、奇形発生
、乳房の癌、線維嚢胞性乳腺症、乳汁漏出症、精子形成の破壊、異常精子生理、
精巣の癌、前立腺の癌、前立腺肥大症、前立腺炎、男性乳房の癌および女性化乳
房症を含む。

【０１１２】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメントまたは誘導体を発現するこ
とができるベクタを被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む生殖障害
を治療或いは予防することができる。

【０１１３】 さらに別の実施例では、適当な医薬品担体とともに実質的に精製されたＳＣＴ
Ｒを含む医薬品組成物を被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む生殖
障害を治療或いは予防することができる。

【０１１４】 さらに別の実施例では、ＳＣＴＲの活性を調節するアゴニストを被検者に投与
して、限定はしないが上記障害を含む生殖障害を治療或いは予防することができ
る。

【０１１５】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメントまたは誘導体を被検者に投
与して腫瘍性障害を治療或いは予防することができる。そのような腫瘍性障害は
、限定はしないが、腺癌、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、及び奇形
癌、詳細には、副腎、膀胱、骨、骨髄、脳、乳房、子宮頚、胆嚢、神経節、消化
管、心臓、腎臓、肝臓、肺、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺、唾液
腺、皮膚、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、及び子宮の癌が含まれる。

【０１１６】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメントまたは誘導体を発現するこ
とができるベクタを被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む腫瘍性障
害を治療或いは予防することができる。

【０１１７】 さらに別の実施例では、適当な医薬品担体とともに実質的に精製されたＳＣＴ
Ｒを含む医薬品組成物を被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む腫瘍
性障害を治療或いは予防することができる。

【０１１８】 さらに別の実施例では、ＳＣＴＲの活性を調節するアゴニストを被検者に投与
して、限定はしないが上記障害を含む腫瘍性障害を治療或いは予防することがで
きる。

【０１１９】 別の実施例では、ＳＣＴＲのアンタゴニストを被検者に投与して免疫学的障害
を治療或いは予防することができる、そのような免疫学的障害は、限定はしない
が、ＡＩＤＳ、アジソン病、成人呼吸窮迫症候群、アレルギー、強直性脊椎炎、
アミロイド症、貧血症、喘息、アテローム性動脈硬化症、自己免疫性溶血性貧血
、自己免疫性甲状腺炎、気管支炎、胆嚢炎、接触性皮膚炎、クローン病、アトピ
ー性皮膚炎、皮膚筋炎、糖尿病、肺気腫、結節性紅斑、萎縮性胃炎、糸球体腎炎
、グッドパスチャー症候群、痛風、グレーブス病、橋本甲状腺炎、過好酸球増加
症、過敏性腸症候群、紅班性狼瘡、多発性硬化症、重症筋無力症、心筋または心
膜の炎症、変形性関節炎、骨粗鬆症、膵炎、多発筋炎、リウマチ性関節炎、強皮
症、シェーグレン症候群、全身性アナフィラキシ、全身性紅班性狼瘡、全身性硬
化症、潰瘍性大腸炎、ウェルナー症候群、及び癌、血液透析、体外循環の合併症
、ウイルス感染、細菌感染、真菌感染、寄生虫感染、原虫感染、及び蠕虫感染；
及び外傷を含む場合もある。そのような免疫障害は、限定はしないが、上記障害
を含む場合もある。一態様では、ＳＣＴＲを特異に結合する抗体を、アンタゴニ
ストとして直接、或いはＨＰＬＭを発現する細胞或いは組織に医薬品因子を運ぶ
ためのターゲッティング或いは送達機構として間接的に用いることもできる。

【０１２０】 別の実施例では、ＳＣＴＲ或いはそのフラグメント又は誘導体を発現すること
ができるベクタを被検者に投与して、限定はしないが上記障害を含む免疫障害を
治療或いは予防することができる。

【０１２１】 他の実施例では、本発明のタンパク質、アンタゴニスト、抗体、アゴニスト、
相補配列或いはベクタの任意のものが、他の適当な治療薬剤と組み合わせて投与
される場合もある。併用療法において用いるのに適した薬剤の選択は、従来の製
薬原理に基づいて当業者により行われることができる。治療薬剤の組み合わせは
相互依存的に作用し、上記種々の疾患の治療及び予防に影響を与えるようになる
。このアプローチを用いて、少ない投与量の薬剤で治療有効度を達成し、それに
より有害な副作用に対する危険性を低減することができる。

【０１２２】 ＳＣＴＲのアンタゴニストは当業者に広く知られた方法を用いて生成されるこ
とができる。詳細には、精製されたＳＣＴＲを用いて抗体を生成するか、或いは
医薬品因子のライブラリをスクリーニングし、ＳＣＴＲと特異に結合するものを
同定することができる。

【０１２３】 ＳＣＴＲに対する抗体は当業者に周知の方法を用いて産生することができる。
そのような抗体は、限定はしないが、ポリクローナル、モノクローナル、キメラ
、一本鎖、Ｆａｂフラグメント及びＦａｂ発現ライブラリにより生成されるフラ
グメントを含む場合がある。中和性抗体（ダイマ形成を抑制する抗体）が特に治
療上の使用に適している。

【０１２４】 抗体を産生する場合、ヤギ、ウサギ、ラット、マウス、ヒト等を含む種々の宿
主を、ＳＣＴＲ或いはその任意のフラグメント又は免疫原特性を有するオリゴペ
プチドを注射することにより免疫することができる。宿主種に応じて、種々のア
ジュバントを用いて免疫学的反応を高めることができる。そのようなアジュバン
トは、限定はしないが、フロイントアジュバント、水酸化アルミニウムのような
ミネラルゲル、及びリゾレシチン、プルロニックポリオル、ポリアニオン、ペプ
チド、油乳剤、キーホールリンペットヘモシアニン及びジニトロフェノールのよ
うな表面活性物質を含む。ヒトに用いられるアジュバントの中では、ＢＣＧ（カ
ルメット−ゲラン杆菌）及びコリネバクテリウム‐パルヴムが特に好ましい。

【０１２５】 ＳＣＴＲに対する抗体を誘発するために用いられるオリゴペプチド、ペプチド
、或いはフラグメントは、少なくとも５アミノ酸からなるアミノ酸配列を有し、
より好ましくは少なくとも１０アミノ酸からなるアミノ酸配列を有する。それら
は自然タンパク質のアミノ酸配列の一部と同一であり、小さな自然発生分子から
なる完全なアミノ酸配列を含むことが好ましい。ＳＣＴＲアミノ酸の短い伸展部
はキーホールリンペットヘモシアニンのような別のタンパク質の伸展部及びキメ
ラ分子に対して生成される抗体と融合されることもできる。

【０１２６】 ＳＣＴＲに対するモノクローナル抗体は、培養中の持続細胞株による抗体分子
の生成を実現する任意の技術を用いて調製することができる。これらの技術は、
限定はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術及びＥＢ
Ｖ−ハイブリドーマ技術を含む（Koehler等(1975) Nature 256:495-497、Kozbor
等 (1985) J.Immunol Methods 81:31-42、Cote等(1983) Proc Natl Acad Sci 8
0:2026-2030、Cole, S.P 等 (1984) Mol. Cell Biol.62:109-120）。

【０１２７】 さらに「キメラ抗体」を生成するために開発された技術、適当な抗原特異性及
び生物活性を有する分子を得るためのマウス抗体遺伝子のヒト抗体遺伝子へのス
プライシングを用いることができる（Morrison 等(1984) Proc Natl Acad Sci 8
1:6851-6855: Neuberger 等(1984) Nature 312:604-608; Takeda 等(1985) Natu
re 314:452-454）。別法では、一本鎖抗体の生成のために記載される技術を、当
分野で知られた方法を用いて適合して、ＳＣＴＲ特異性一本鎖抗体を生成しても
よい。関連する特異性を有するが、個別のイディオタイプ組成物からなる抗体が
、ランダムに組み合わせた免疫グロビンライブラリからの鎖混合により生成され
ることもできる（Burton D.R.(1991)Proc Natl Acad Sci 88:10134-10137）。

【０１２８】 また抗体は、リンパ球集団においてin vivoで生成を誘発することにより、或 いは組換え免疫グロブリンライブラリ又は論文（Orlandi 等(1989, Proc Natl A
cad Sci 86:3833-3837、Winter G and Milstein C (1991; Nature 349:293-299)
に開示されるような非常に特異的な結合剤のパネルをスクリーニングすることに
より生成することもできる。

【０１２９】 またＳＣＴＲに対する特異な結合部位を含む抗体フラグメントを発生させるこ
ともできる。例えば、そのようなフラグメントは、限定はしないが、抗体分子の
ペプシン消化により生成することができるＦ（ａｂ´）２フラグメント及びＦ（
ａｂ´）２フラグメントのジスルフィド架橋を還元することにより生成すること
ができるＦａｂフラグメントを含む。別法では、Ｆａｂ発現ライブラリを、所望
の特異性を有するモノクローナルＦａｂフラグメントを迅速にしかも容易に同定
できるように作製してもよい（Huse WD 等 (1989) Science 256:1275-1281）。

【０１３０】 種々のイムノアッセイを用いて、所望の特異性を有する抗体を同定するために
スクリーニングすることができる。確立された特異性を有するポリクローナル抗
体或いはモノクローナル抗体のいずれかを用いる結合タンパク競合測定法或いは
免疫放射測定法用の種々のプロトコルが、当分野では周知である。そのようなイ
ムノアッセイは典型的には、ＳＣＴＲとその特異的抗体との間の複合形成体を測
定することを含む。２つの非干渉性ＳＣＴＲエピトープに反応するモノクローナ
ル抗体を利用する２部位モノクローナル系イムノアッセイが好ましいが、結合タ
ンパク質競合測定法を用いることもできる(Maddox、前掲)。

【０１３１】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド或いはその
任意のフラグメント又は相補配列を治療のために用いる場合もある。一態様では
、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドに対する相補配列が、ｍＲＮＡの転写
を遮断することが望ましい状況において用いられる。詳細には、細胞は、ＳＣＴ
Ｒをコードするポリヌクレオチドに相補的な配列と形質転換されることができる
。このように相補分子或いはフラグメントを用いて、ＳＣＴＲ活性を調節するか
、或いは遺伝子機能の調節を実現することができる。そのような技術は当分野で
は周知であり、センス或いはアンチセンスオリゴヌクレオチド又はより大きなフ
ラグメントを、ＳＣＴＲをコードする配列のコード化或いは調節領域に沿った種
々の位置から設計することができる。

【０１３２】 レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス或いはワクシニアウイル
スに、また種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベクタが、標的となる器官、
組織或いは細胞集団にヌクレオチド配列を送達するために用いられる場合がある
。当業者には周知の方法を用いて、ＳＣＴＲをコードする遺伝子のポリヌクレオ
チドに相補的な核酸配列を発現するベクタを作製することができる（例えばSamb
rook 等(前掲)及びAusubel 等 (前掲)を参照されたい）。

【０１３３】 ＳＣＴＲをコードする遺伝子は、細胞或いは組織を、ＳＣＴＲをコードする高
レベルのポリヌクレオチド或いはそのフラグメントを発現する発現ベクタと形質
転換することにより遮断されるようになる。そのような作製物は、翻訳できない
センス或いはアンチセンス配列を細胞内に導入するために用いられる。ＤＮＡ内
に統合されない場合であっても、そのようなベクタは、内因性ヌクレアーゼによ
り無能にされるまで、ＲＮＡ分子を転写し続けることができる。一過性の発現は
、非複製ベクタを用いて一ヶ月或いはそれ以上の間持続し、適当な複製エレメン
トがベクタ系の一部であるならさらに長く持続するようになる。

【０１３４】 上記のように遺伝子発現の修飾は、ＳＣＴＲをコードする遺伝子の制御、５´
或いは調節領域（シグナル配列、プロモータ、エンハンサ及びイントロン）に対
する相補配列或いはアンチセンス分子（ＤＮＡ、ＲＮＡ或いはＰＮＡ）を設計す
ることにより得られるようになる。転写開始部位、例えば開始部位からの位置−
１０と＋１０との間に由来するオリゴヌクレオチドが好ましい。同様に「三重ら
せん」塩基対技術を用いて抑制を実現することができる。二重らせんの能力の抑
制がポリメラーゼ、転写因子或いは調節分子を結合するのに十分に開放されるよ
うになるため、三重らせん対は有用である。三重ＤＮＡを用いる最近の治療の進
歩は、論文（Gee JE 等(1994)In: Huber BE and BI Carr, Molecular and Immun ologic Approaches, Futura Publishing Co. Mt Kisco NY, pp.163-177)に記載 されている。また相補配列或いはアンチセンス分子は、転写物がリボソームに結
合するのを防ぐことによりｍＲＮＡの翻訳を遮断するように設計することができ
る。

【０１３５】 リボザイム、すなわち酵素ＲＮＡ分子が、ＲＮＡの特異な切断を触媒するため
に用いられる場合がある。リボザイム作用の機構は、相補的標的ＲＮＡへのリボ
ザイム分子の配列特異性ハイブリダイゼーションを伴い、それにヌクレオチド鎖
切断分割が伴う。用いられる例は、ＳＣＴＲをコードする配列のヌクレオチド鎖
切断分割に特異にしかも有効に触媒作用することができる遺伝子操作されたハン
マヘッドモチーフリボザイムを含む。

【０１３６】 任意の潜在的なＲＮＡ標的内の特異なリボザイム切断部位は、配列を含むリボ
ザイム切断部位ＧＵＡ、ＧＵＵ及びＧＵＣに対して標的分子を走査することによ
り最初に同定される。一度同定されれば、切断部位を含む標的遺伝子の領域に対
応する１５〜２０の間のリボヌクレオチドの短いＲＮＡ配列は、オリゴヌクレオ
チドを無能にする副次構造的な特徴に対して評価されることができる。また候補
標的の適合性も、リボヌクレアーゼ保護アッセイを用いて相補的なオリゴヌクレ
オチドとのハイブリダイゼーションに対する容易性を検査することにより評価す
ることができる。

【０１３７】 本発明の相補的リボ核酸分子及びリボザイムは、核酸分子の合成に関して当分
野で知られた任意の方法により調製することができる。これらは、固相ホスホラ
ミダイト化学合成のようなオリゴヌクレオチドを化学的に合成するための方法を
含む。別法では、ＲＮＡ分子は、ＳＣＴＲをコードするＤＮＡ配列のin vitro及
びin vivo転写により生成することができる。そのようなＤＮＡ配列は、Ｔ７或 いはＳＰ６のような適当なＲＮＡポリメラーゼプロモータを用いて種々のベクタ
内に組み込むことができる。別法では、これらのｃＤＮＡ作成物は、相補ＲＮＡ
を合成し、細胞株、細胞或いは組織内に構成的に或いは誘導的に導入することが
できる。

【０１３８】 ＲＮＡ分子を修飾して細胞内安定性及び半減期を改善することもできる。可能
な修飾は、限定はしないが、分子の５´並びにまた３´末端でのフランキング配
列の付加、或いは分子のバックボーンにおけるホスホジエステラーゼ連鎖ではな
くホスホロチオネート或いは２´Ｏ−メチルの使用を含む。この概念はＰＮＡの
生成に固有のものであり、イノシン、キュェオシン及びワイブトシン並びにアセ
チル−、メチル−、チオ−、及び内因性エンドヌクレアーゼにより容易には識別
されないアデニン、シチジン、グアニン、チミン及びウリジンの同様に修飾され
た形成体のような従来にはない塩基を含有することにより、これら分子の全体に
拡張されることができる。

【０１３９】 細胞或いは組織内にベクタを導入するために多くの方法が利用可能であり、in vivo、in vitro及びex vivoで使用するのに同様に適している。ex vivo治療の 場合、ベクタは、患者から取り出された基幹細胞内に導入され、同じ患者に戻さ
れる自家移植物に対してクローンのように繁殖することができる。形質移入、リ
ポソーム注射或いはポリカチオンアミノポリマによる送達は、当分野で周知の方
法を用いて実現することができる（例えばGoldman, C.K. 等(1997）Nature Biot
echnology 15:462-466を参照されたい)。

【０１４０】 上記治療方法の任意の方法は、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル
、そして最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、治療を要する被検体に適用
されることができる。

【０１４１】 本発明のさらに別の実施例は、上記任意の治療効果のために、製薬的に許容可
能な担体と共に用いられる医薬品組成物の投与に関連する。そのような医薬品組
成物は、ＳＣＴＲ、ＳＣＴＲに対する抗体、擬態、アゴニスト、アンタゴニスト
或いはＳＣＴＲのインヒビタからなることができる。組成物は単独で、或いは限
定はしないが、食塩水、緩衝食塩水、デキストロース及び水を含む任意の滅菌の
生体適合性医薬品担体において投与されることがある、安定化化合物のような少
なくとも１つの他の薬剤との組み合わせて投与されることができる。これらの組
成物は単独で、或いは他の薬剤、薬物或いはホルモンと組み合わせて患者に投与
してもよい。

【０１４２】 本発明に用いられる医薬品組成物は、限定はしないが、経口、静脈内、筋肉内
、動脈内、骨髄内、クモ膜下、心室内、経皮、皮下、腹膜内、鼻腔内、腸内、局
所、舌下、直腸手段を含む任意の経路により投与されることができる。

【０１４３】 活性処方成分に加えて、これらの医薬品組成物は、製薬的に用いることができ
るプレパラートへの活性化合物の処理を容易にする医薬品添加物及び補助剤を含
む適当な製薬的に許容可能な担体を含む場合もある。さらに製剤及び投与に関す
る技術についての詳細は、Remington's Pharmaceutical Sciences(Maack Publis
hing Co. Easton PA)の最新版に見出される。

【０１４４】 経口投与の場合の医薬品組成物は、経口投与に適した投与量の当分野で周知の
製薬的に許容可能な担体を用いて調剤することができる。そのような担体により
、医薬品組成物は、患者が経口摂取するための錠剤、丸剤、糖衣剤、カプセル剤
、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー、懸濁剤等として調剤されることができ
る。

【０１４５】 経口投与するための医薬品調剤は、活性化合物と固形の医薬品添加物とを混合
して、選択的にはその混合物を細かく砕いて、さらに所望に応じて、錠剤或いは
糖衣剤コアを得るために適当な補助剤を加えた後、顆粒剤の混合物を処理して得
られるようになる。適当な医薬品添加物は、ラクトース、スクロース、マンニト
ール或いはソルビトールを含む糖、トウモロコシ、小麦、米、じゃがいも或いは
他の植物からのデンプン、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロ
ース或いはカルボキシルメチルセルロースナトリウムのようなセルロース、及び
アラビアゴム及びトラガカントゴムを含むゴム、並びにゼラチン及びコラーゲン
のようなタンパク質を含む炭水化物或いはタンパク質賦形剤である。必要なら、
架橋結合されたポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸或いはアルギン酸ナト
リウムのようなその塩を含む、崩壊剤或いは可溶化剤が加えられてもよい。

【０１４６】 糖衣剤コアは濃縮糖液のような適当なコーティングと共に用いられ、その濃縮
糖液はアラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル（carbop
ol gel）、ポリエチレングリコール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び
適当な有機溶剤或いは溶剤混合物を含む場合もある。染料或いは色素が製品識別
、或いは活性化合物の量、すなわち投与量を特徴付けるために、錠剤或いは糖衣
錠コーティングに加えられる場合もある。

【０１４７】 経口投与される医薬品製剤は、ゼラチンからなる押込嵌合式のプッシュフィッ
トカプセル剤、並びにゼラチン及びグリコール或いはソルビトールのようなコー
ティングからなる軟らかく封止されたソフトシールカプセル剤を含む。プッシュ
フィットカプセル剤は、ラクトース或いはデンプンのような賦形剤或いは結合剤
、タルク或いはステアリン酸マグネシウムのような潤滑剤、さらに選択的に安定
化剤と混合された活性処方成分を含むことができる。ソフトカプセル剤では、活
性化合物は、脂肪油、パラフィン油、或いは安定化剤を用いる場合も用いない場
合があるが液体ポリエチレングリコールのような適当な溶液内に溶解或いは懸濁
される場合がある。

【０１４８】 非経口投与のための医薬品製剤は、活性化合物の水溶液を含む。注射するため
に、本発明の医薬品組成物は、水溶液内で、好ましくはハンクス溶液、リンガー
溶液或いは生理緩衝食塩水のような生体適合性緩衝液内で調製される。水性の注
入懸濁液は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール或いはデ
キストランのように、懸濁液を増粘する物質を含む場合がある。さらに活性化合
物の懸濁液は、適当な油性の注射懸濁液として調製される場合もある。適当な親
油性溶剤或いは溶媒は、ゴマ油のような脂肪油、或いはオレイン酸エチル又はト
リグリセリドのような合成脂肪酸エステル、或いはリポソームを含む。選択に応
じて懸濁液は、高濃縮の溶液の調製を可能とするために化合物の可溶性を増加さ
せる適当な安定化剤或いは薬剤を含む場合もある。

【０１４９】 局所或いは鼻腔投与の場合、特定の障壁を浸透させるのに適した浸透剤が調製
において用いられる。そのような浸透剤は当分野で一般に知られている。

【０１５０】 本発明の医薬品組成物は、当分野において知られた、例えば、従来の混合、溶
解、顆粒化、糖衣形成、微粒子化、乳状化、カプセル化、封入（entrapping）或
いは凍結乾燥処理による方法で製造される。

【０１５１】 医薬品組成物は塩類として提供され、限定はしないが、塩酸、硫酸、酢酸、乳
酸、酒石酸、リンゴ酸、琥珀酸等の多くの酸を用いて形成することができる。塩
類は、対応する遊離塩基形の場合より、水性或いはプロトン性溶剤において可溶
性を有する傾向がある。他の場合に好ましい製剤は、使用前に緩衝剤と結合され
たｐＨ範囲４．５−５．５の１ｍＭ−５０ｍＭヒスチジン、０．１％−２％スク
ロース、２％−７％マンニトールの任意のもの或いは全てを含む凍結乾燥粉末で
ある。

【０１５２】 医薬品組成物が調製された後、それらは適当な容器に入れられ、指示された条
件の治療のためにラベルを貼付される。ＳＣＴＲの投与の場合、そのようなラベ
ル貼付は、投与の量、頻度並びに方法を含むであろう。

【０１５３】 本発明に用いるために適した医薬品組成物は、活性処方成分が目的を果たすた
めの有効な量だけ含まれる組成物を含む。有効な量を投与することは、当業者の
能力内で果たすことができる。

【０１５４】 任意の化合物の場合、製薬的に有効な量は、例えば腫瘍性細胞の細胞培養アッ
セイ、或いは通常マウス、ウサギ、イヌ或いはブタの動物標本のいずれかにおい
て最初に見積もられる。また動物標本を用いて、所望の濃縮範囲及び投与の経路
が確定される。その後その情報を用いて、ヒトに投与するための有効な量及び経
路を確定することができる。

【０１５５】 製薬的に有効な量は、症状或いは状態を改善する、例えばＳＣＴＲ或いはその
フラグメント、ＳＣＴＲの抗体、アゴニスト、アンタゴニスト、或いはＳＣＴＲ
のインヒビタの主成分の量である。そのような化合物の治療に対する有効度及び
毒性は、細胞培養或いは実験動物における標準的な製薬的手順、例えばＥＤ５０
（集団の５０％において製薬的に有効な量）及びＬＤ５０（集団の５０％が致死
する量）により確定することができる。治療効果と毒性効果の投与量比が治療指
数であり、比ＬＤ５０／ＥＤ５０として表すことができる。大きな治療指数を示
す医薬品組成物が望ましい。細胞培養アッセイ及び動物実験から得られるデータ
は、ヒトに投与するための量の範囲を処方する際に用いられる。そのような化合
物の投与量は、毒性が非常に少ないか或いは全くなくＥＤ５０を含む血中濃度の
範囲内にあることが好ましい。投与量は、用いられる投与形態、患者の感度及び
投与経路によりこの範囲内で変化する。

【０１５６】 厳密な投与量は、治療を要する患者に関連する要因により医師によって確定さ
れるであろう。量及び投与を調整して、十分なレベルの活性成分を与えたり、或
いは所望の効果を維持することもある。考慮される場合がある要因は疾患状態の
重症度、被検者の健康状態、患者の年齢、体重及び性別、食事、投与の時間及び
頻度、薬物の組み合わせ、反応への敏感度、並びに治療に対する耐性／反応を含
む。特定の製剤の半減期及びクリアランス率に応じて、３〜４日毎、毎週或いは
２週間毎に一度、長時間作用性の医薬品組成物が投与される場合もある。

【０１５７】 通常の投与量は０．１μｇ〜１００，０００μｇまで変化し、投与の経路にも
よるが、全投与量は約１ｇまでである。詳細な投与量及び送達の方法に関する手
引きは文献に与えられており、一般に当分野の開業医が利用できる。当業者は、
タンパク質或いはそのインヒビタの場合とは異なる製剤を、ヌクレオチドの場合
に用いるであろう。同様にポリヌクレオチド或いはポリペプチドの送達は特定の
細胞、状態、位置等に対して特異であろう。

【０１５８】 診断 別の実施例では、ＳＣＴＲを特異に結合する抗体を、ＳＣＴＲの発現により特
徴付けられる状態或いは疾患の診断のために、又はＳＣＴＲ、アゴニスト、アン
タゴニスト或いはインヒビタを用いて治療中の患者をモニタするための検定法に
おいて用いることができる。診断のために有用な抗体は、治療の場合に上記した
方法と同様の方法で調製することができる。ＳＣＴＲに対する診断検定法は、抗
体及び標識を用いて、ヒト体液或いは細胞又は組織の抽出物においてＳＣＴＲを
検出する方法を含む。抗体は、修飾しても修飾しなくても用いることができ、リ
ポータ分子と共有結合或いは非共有結合の何れかで結合することにより標識され
ることができる。当分野において知られる種々のリポータ分子を用いることがで
き、そのいくつかが上記される。

【０１５９】 ＳＣＴＲを測定するためのＥＬＩＳＡ、ＲＩＡ及びＦＡＣＳを含む種々のプロ
トコルが当分野において知られており、ＳＣＴＲ発現の変更されたレベル或いは
異常なレベルを診断するための方法を提供する。ＳＣＴＲ発現のための正常或い
は標準的な値は、正常な哺乳動物被検者、好ましくはヒトから取り出された体液
或いは細胞抽出物を複合体形成に適した条件下でＳＣＴＲに対する抗体と結合す
ることにより確立される。標準的な複合体形成量は種々の方法により定量するこ
とができるが、光計測による手段が好ましい。被検者において発現したＳＣＴＲ
の量、制御及び疾患、生検組織からのサンプルが標準値と比較される。標準値と
被検者値との間の偏差が疾患を診断するためのパラメータを確立する。

【０１６０】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドを診断のた
めに用いることができる。用いられるポリヌクレオチドはオリゴヌクレオチド配
列、アンチセンスＲＮＡ及びＤＮＡ分子及びＰＮＡを含む。ポリヌクレオチドを
用いて、ＳＣＴＲの発現が疾患と相関をなす可能性がある生検組織の遺伝子発現
を検出かつ定量することができる。診断検定法を用いて、ＳＣＴＲの存否及び過
剰発現を識別することができ、さらに治療処置中のＳＣＴＲレベルの調節をモニ
タすることができる。

【０１６１】 一態様では、ＳＣＴＲ或いは密接に関連する分子をコードするゲノム配列を含
むポリヌクレオチド配列を検出することができるＰＣＲプローブを用いるハイブ
リダイゼーションにより、ＳＣＴＲをコードする核酸配列を同定することができ
る。非常に特異な領域、例えば５´調節領域内の１０個の特有のヌクレオチド、
或いは特異性の低い領域、例えば特に３´コード化領域の何れかからなるプロー
ブの特異性及びそのハイブリダイゼーション或いは増幅の厳密性（最大、高、中
間或いは低）が、そのプローブがＳＣＴＲをコードする自然発生配列、アレルの
みを同定するか、或いは関連する配列を同定するかを確定するであろう。

【０１６２】 またプローブは関連する配列の検出に用いることもでき、ＳＣＴＲをコードす
る配列の任意のものからのヌクレオチドの少なくとも５０％を含むことが好まし
い。本発明のハイブリダイゼーションプローブはＤＮＡ或いはＲＮＡであり、Ｓ
ＥＱ ＩＤ ＮＯ：２の配列に、或いはプロモータ、エンハンサエレメント及び自
然発生ＳＣＴＲのイントロンを含むゲノム配列に由来する。

【０１６３】 ＳＣＴＲをコードするＤＮＡのための特異なハイブリダイゼーションプローブ
を生成するための手段は、ＳＣＴＲ或いはＳＣＴＲ誘導体をコードする核酸配列
を、ｍＲＮＡプローブの生成のためにベクタにクローニングする過程を含む。そ
のようなベクタは当分野では周知で、市販されており、適当なＲＮＡポリメラー
ゼ及び適当な標識化ヌクレオチドを加えることによりin vitroでＲＮＡプローブ
を合成するために用いることができる。ハイブリダイゼーションプローブは、種
々のリポータ群、例えば³²Ｐ或いは³⁵Ｓのような放射性核種、又はアビジン／ビ
オチン結合系等を介してプローブに結合されるアルカリ性フォスファターゼのよ
うな酵素標識により標識されることができる。

【０１６４】 ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列はＳＣＴＲの発現に関連する障害
の診断のために用いることができる。そのような障害は、限定はしないが、その
ような障害は限定はしないが、尿細管性アシドーシス、貧血症、クッシング症候
群、軟骨形成不全性小人症、デュシェンヌおよびベッカー型筋ジストロフィ、て
んかん、性腺形成異常症、ＷＡＧＲ症候群、スミス−マジェンニス（Smith-Mage
nis）症候群、脊髄形成異常症候群、遺伝性粘膜上皮形成異常、遺伝性角皮症、 シャルコー・マリーツース病および神経線維腫症のような遺伝性神経病、甲状腺
不全症、水頭症、シドナム舞踏病および脳性麻痺のような発作障害、脊椎披裂、
および先天性緑内障、白内障或いは感覚神経性聴力損失を含む発生障害と、プロ
ラクチン生成の障害、卵管障害、排卵異常および子宮内膜症を含む不妊症、発情
周期の破壊、月経周期の破壊、多嚢胞性卵巣症候群、卵巣過剰刺激症候群、子宮
内膜および卵巣の癌、自己免疫障害、子宮外妊娠、奇形発生、乳房の癌、線維嚢
胞性乳腺症、乳汁漏出症、精子形成の破壊、異常精子生理、精巣の癌、前立腺の
癌、前立腺肥大症、前立腺炎、男性乳房の癌および女性化乳房症を含む生殖障害
と、腺癌、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、及び奇形癌、具体的には
、副腎、膀胱、骨、骨髄、脳、乳房、子宮頚、胆嚢、神経節、消化管、心臓、腎
臓、肝臓、肺、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺、唾液腺、皮膚、脾
臓、精巣、胸腺、甲状腺、及び子宮の癌のような腫瘍性障害と、ＡＩＤＳ、アジ
ソン病、成人呼吸窮迫症候群、アレルギー、強直性脊椎炎、アミロイド症、貧血
症、喘息、アテローム性動脈硬化症、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性甲状腺
炎、気管支炎、胆嚢炎、接触性皮膚炎、クローン病、アトピー性皮膚炎、皮膚筋
炎、糖尿病、肺気腫、結節性紅斑、萎縮性胃炎、糸球体腎炎、グッドパスチャー
症候群、痛風、グレーブス病、橋本甲状腺炎、過好酸球増加症、過敏性腸症候群
、紅班性狼瘡、多発性硬化症、重症筋無力症、心筋または心膜の炎症、変形性関
節炎、骨粗鬆症、膵炎、多発筋炎、リウマチ性関節炎、強皮症、シェーグレン症
候群、全身性アナフィラキシ、全身性紅班性狼瘡、全身性硬化症、潰瘍性大腸炎
、ウェルナー症候群、及び癌、血液透析、体外循環の合併症、ウイルス感染、細
菌感染、真菌感染、寄生虫感染、原虫感染、及び蠕虫感染；及び外傷のような免
疫障害とを含む。ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチド配列は、サザン分析或
いはノーザン分析、ドットブロット、又は他の膜系技術において、又はＰＣＲ技
術において、又は変更されたＳＣＴＲ発現を検出するために患者生検からの体液
或いは組織を利用するディップスティック、ｐｉｎ、ＥＬＩＳＡ検定法或いはマ
イクロアレイにおいて用いることができる。そのような定性的或いは定量的方法
は当分野において周知である。

【０１６５】 特定の態様では、ＳＣＴＲをコードするヌクレオチド配列は、種々の癌、特に
上記したような癌の活性化或いは誘発を検出する検定法において有用である。Ｓ
ＣＴＲをコードするヌクレオチド配列は標準的な方法において標識され、ハイブ
リダイゼーション複合体の形成に適した条件下で患者からの体液或いは組織サン
プルに加えられることができる。適当な時間インキュベートした後、サンプルは
洗浄され、そのシグナルが定量され、標準値と比較される。生検された或いは抽
出されたサンプルのシグナルの量が比較制御サンプルのシグナルの量から著しく
変更されている場合には、そのヌクレオチド配列はサンプル内のヌクレオチド配
列とハイブリダイズされており、サンプル内のＳＣＴＲをコードするヌクレオチ
ド配列の変更レベルの存在が関連する疾患の存在を示す。またそのような検定法
を用いて、動物実験、臨床試験或いは個々の患者の治療をモニタする際に特定の
治療措置の有効度を評価することができる。

【０１６６】 ＳＣＴＲの発現に関連する疾患を診断する基準を与えるために、発現に対する
正常或いは標準値が確立される。これは、動物或いはヒトいずれかの正常な被検
者から取り出された体液或いは細胞抽出物を、当分野で周知の複合体形成に適し
た条件下でＳＣＴＲをコードする配列或いはそのフラグメントと結合することに
より与えられる。標準的なハイブリダイゼーションは、正常な被検者から得られ
た値を、既知の量の実質的に精製されたポリヌクレオチドが用いられる実験から
得られた値と比較することにより定量することができる。正常サンプルから得ら
れた標準値が、疾患の症状がある被検者のサンプルから得られた値と比較される
。標準値と被検者値との間の偏差を用いて、疾患状態の存在を立証する。

【０１６７】 一度疾患が確定され、治療プロトコルが開始されれば、その患者の発現のレベ
ルが正常な患者において観測されるレベルに接近し始めるか否かを評価するため
に、ハイブリダイゼーション検定法が規則的に繰り返される。継続的な検定法か
ら得られる結果を用いて、数日から数ヶ月の期間に渡る治療の有効度を示すこと
ができる。

【０１６８】 癌の場合、個々の患者からの生検組織内の異常な量の転写物の存在が、疾患の
発生に対する素因を示すか、或いは実際の臨床的な症状が発生する前に疾患を検
出するための手段を提供する。この種のより決定的な診断により、専門医は、予
防措置或いは初期段階での積極的な治療を行うことができ、それにより癌の発生
を予防したり、或いは進行するのを防ぐこともできる。

【０１６９】 ＳＣＴＲをコードする配列から設計されるオリゴヌクレオチドに対するさらな
る診断上の使用は、ＰＣＲの使用を含む場合がある。そのようなオリゴマは化学
的に合成されるか、酵素的に生成されるか、或いはin vitroで生成されてもよい
。オリゴマは、ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドのフラグメント、或いは
ＳＣＴＲをコードするポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドのフラグメ
ントを含み、特異な遺伝子或いは条件の同定のために最適化された条件下で用い
られることが好ましい。同一の２つのオリゴマ、入れ子状の組のオリゴマ、或い
はオリゴマの縮重プールであっても、密接に関連するＤＮＡ或いはＲＮＡ配列を
検出並びにまた定量するために低い厳密な条件下で用いることができる。

【０１７０】 またＳＣＴＲの発現を定量するために用いることができる方法は、ヌクレオチ
ドの放射標識或いはビオチン標識、或いは制御核酸の相互増幅並びに実験結果が
書き込まれる標準曲線を含む（Melby, P.C. 等 (1993) J. Immunol. Methods, 1
59:235-244; Duplaa, C. 等 (1993) Anal. Blochem. 229-236）。多数サンプル を定量する速度は、ＥＬＩＳＡフォーマットの検定法を実行することにより加速
することができ、その際対象のオリゴマは種々の希釈法において表され、スペク
トル光計測反応或いは色計測反応が迅速な定量化がもたらされる。

【０１７１】 さらに別の実施例では、ここで記載されたポリヌクレオチド配列の任意のもの
に由来するオリゴヌクレオチド或いはその長寸のフラグメントをマイクロアレイ
の標的として用いることもできる。マイクロアレイを用いて、多数の遺伝子の発
現レベルを同時にモニタし（転写画像を生成するために）、遺伝子変異配列、突
然変異及び多形性を同定することができる。この情報は、遺伝子機能を確定し、
疾患の遺伝的基礎を理解し、かつ疾患を診断し、また治療薬剤の活性を発生及び
モニタするために用いることができる。

【０１７２】 一実施例では、当分野で周知の方法を用いてマイクロアレイが準備、使用及び
解析される（例えばBrennan, T.M. et al. (1995) U.S. Patent NO. 5,474,796;
Schena, M. et al. (1996)Proc. Natl. Acad. Sci. 93:10614-10619; Baldesch
weiler et al. (1995) PCT applicationWO95/251116; Shalon, D. et al. (1995
) PCT application WO95/35505; Heller, R.A. et al.(1997) Proc. Natl. Acad
. Sci. 94:2150-2155; and Heller, M.J. et al. (1997) U.S. Patent No.5,605
,662を参照されたい）。

【０１７３】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲをコードする核酸配列を用いて、自然発生
ゲノム配列をマッピングするために有用なハイブリダイゼーションプローブを生
成することもできる。その配列は特定の染色体に或いは染色体の特異領域に、又
は例えばヒト人工染色体（ＨＡＣ）、酵母菌人工染色体（ＹＡＣ）、細菌性人工
染色体（ＢＡＣ）、細菌性Ｐ１構造体或いは単一染色体ｃＤＮＡライブラリのよ
うな人工染色体構造にマッピンクされてもよい（例えばPrice, C.M. (1993) Blo
od Rev. 7:127-134; and Trask, B.J. (1991) Trends Genet.7:149-154を参照さ
れたい）。

【０１７４】 蛍光in situハイブリダイゼーションは、他の物理的な染色体マッピング技術 及び遺伝マップデータと相関をなす（例えばHeinz-Ulrich, et al.(1995) in Me
yers, R.A. (ed.) Molecular.Biology and Biotechnology, VCH Publishers New
York, NY, pp. 965-968を参照されたい）。遺伝子マップデータの例は種々の科
学雑誌或いはOnline Mendelian Inheritance in Man（ＯＭＩＭ）に見出すこと ができる。物理的染色体マップ上のＳＣＴＲをコードする遺伝子の位置と特定の
疾患或いは特定の疾患に対する素因との間の相関は、その遺伝的疾患に関連する
ＤＮＡの領域の境界を定めることを可能にする。本発明のヌクレオチド配列を用
いて、正常者と保菌者、すなわち感染した個体との間の遺伝子配列の差を検出す
ることができる。

【０１７５】 染色体標本のin situハイブリダイゼーション及び確立された染色体マーカを 用いる連鎖分析のような物理的マッピング技術が、遺伝子マップを拡張するため
に用いることができる。マウスのような別の哺乳動物種の染色体上の遺伝子の配
置が、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であっても、関連するマーカを明ら
かにできる場合もある。新規の配列は、物理的なマッピングにより染色体腕或い
はその一部に割り当てることができる。これは、位置クローニング或いは他の遺
伝子発見技術を用いる疾患遺伝子を検索する研究者に貴重な情報を与える。一度
疾患或いは症候群が、特定のゲノム領域、例えばＡＴから１１ｑ２２−２３まで
への遺伝子連鎖により自然のまま局在されていれば、その領域に対する任意の配
列マッピングが、さらなる研究のための関連或いは調節遺伝子を表すことができ
る(例えばGatti等(1998) Nature 336:577-580を参照されたい)。また本発明のヌ
クレオチド配列を用いて、正常個体と保菌者、すなわち感染個体との間における
転座、逆位等により染色体位置内の差を検出することができる。

【０１７６】 本発明の別の実施例では、ＳＣＴＲ、その触媒作用或いは免疫原性フラグメン
ト又はオリゴペプチドを用いて、種々の薬物スクリーニング技術の任意のものに
おいて化合物のライブラリをスクリーニングすることができる。そのようなスク
リーニングにおいて用いられるフラグメントは溶液中に遊離するか、固形支持体
に付着するか、細胞表面上に支持されるか、或いは細胞内に配置されてもよい。
ＳＣＴＲと被試験因子との間に形成される結合複合体が測定される場合もある。

【０１７７】 薬物スクリーニングに用いる場合がある別の技術は、対象のタンパク質への適
当な結合親和性を有する化合物の高スループットスクリーニングを実現する（例
えばGeysen, et al. (1984) PCT application WO84/03564を参照されたい）。こ
の方法では、ＳＣＴＲに適用されるような、多数の異なる小さな検査化合物がプ
ラスチックピン或いはある他の表面のような固体支持体上で合成される。検査化
合物はＳＣＴＲ或いはそのフラグメントと反応し、洗浄される。その後結合され
たＳＣＴＲが当分野で周知の方法により検出される。また精製されたＳＣＴＲは
、上記の薬物スクリーニング技術において用いるためのプレート上に直接コーテ
ィングされることもできる。別法では、非中和性抗体を用いて、ペプチドを捕捉
し、それを固体支持体上に固定化することもできる。

【０１７８】 別の実施例では、ＳＣＴＲを特異に結合することができる中和性抗体がＳＣＴ
Ｒを結合するための検査化合物と競合する、競合薬物スクリーニングアッセイを
使用する。このようにして、抗体を用いて、ＳＣＴＲと１つ或いはそれ以上の抗
原決定基を共有するあらゆるペプチドの存在を検出することができる。

【０１７９】 さらに別の実施例では、その新規の技術が、限定はしないがトリプレット遺伝
子コード及び特異な塩基対相互作用のような特性を含む現在知られているヌクレ
オチド配列の特性に依存する場合には、ＳＣＴＲをコードするヌクレオチド配列
を、将来開発されるあらゆる分子生物学技術において用いることができる。

【０１８０】 以下の例は、本発明を例示するために与えるものであり、本発明を制限するも
のではない。

【０１８１】

【実施例】

１ ＢＬＡＤＮＯＴ０４ｃＤＮＡライブラリの作製 ＢＬＡＤＮＯＴ０４ｃＤＮＡライブラリは、自己加害の銃創により死亡した２
８歳白人男性から得られた微視的に正常な膀胱組織から作製された。

【０１８２】 冷凍組織をBrinkmann Homogenizer Polytron-PT 3000（Brinkmann Instrument
s, INC., Westbury, NJ）を用いて、グアニジウムイソチオシアネートの中でホ モジナイズし溶解した。この溶解産物を、Beckman L8-70M超遠心分離器（Beckma
n Instruments）においてBeckman SW28ロータを用いて、５．７Ｍの塩化セシウ ムクッションを用いて周囲温度で１８時間、１分当たり２５，０００回転の回転
数で遠心分離した。そのＲＮＡは、０．３Ｍの酢酸ナトリウム及び２．５倍量の
エタノールを用いて沈殿させ、ＲＮＡアーゼの無い水に再懸濁され、３７℃でＤ
Ｎアーゼ処理された。ＲＮＡ抽出および沈殿は上記のように繰返された。その後
ｍＲＮＡをOLIGOTEX kit（QIAGEN, Chatsworth, CA）を用いて単離し、ｃＤＮＡ
ライブラリの作製のために用いた。

【０１８３】 このｍＲＮＡをSUPERSCRIPT Plasmid System(Cat. # 18248-013, Gibco /BRL)
における推奨プロトコルに従って取り扱った。ｃＤＮＡ合成はNotI-oligo d(T) プライマを用いて開始された。二本鎖ｃＤＮＡが平滑末端化され、EcoRIアダプ タに結合され、NotIで消化され、Sepharose CL4B column (Catalog #275105-0 I
; Pharmacia)上に分画され、その４００ｂｐを超えるｃＤＮＡが、pINCY I ベク
タ(Incyte)のNotIおよび EcoRI 部位に結合された。その後プラスミドpSport1が
DH5αコンピテント細胞（Cat.#18258-012; Gibco/BRL）に形質転換された。

【０１８４】 ２ ｃＤＮＡクローンの単離及び配列決定 プラスミドＤＮＡは細胞から放出され、Miniprep 96 plasmid Kit (Catalog #
26173; QIAGEN, Inc.)を用いて精製した。推奨プロトコルを用いたが、以下の点
を変更した。１）２５mg/Lのカルベニシリン及び０．４%のグリセロールと共に １mlの滅菌Terrific Broth（Catalog#22711, Gibco/BRL）において細菌を培養し
た。２）植菌の後、培地を１９時間インキュベートし、インキュベーション終了
時にその細胞を０．３ｍｌの溶解バッファに溶解した。３）イソプロパノール沈
殿後、そのプラズミドＤＮＡペレットを０．１ｍｌの蒸留水に再懸濁した。プロ
トコルの最終ステップの終了後、サンプルを９６穴ブロックに移し、４℃で保管
した。

【０１８５】 このｃＤＮＡの配列決定は、Peltier Thermal Cyclers （PTC200 from MJ Res
earch, Watertown, MA）及びApplied Biosystems 377 DNA Sequencing Systems と組み合わせてHamilton Micro Lab 2200 （Hamilton, Reno, NV）を用いてSang
er F.及びA.R. Coulsonの方法（1975, J. Mol. Biol.94:441f）により行われ、 読み枠が決定された。

【０１８６】 ３ ｃＤＮＡクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索 配列表のヌクレオチド配列及び、それらから類推されるアミノ酸配列を問い合
わせ配列として用いて、例えばGenBank、SwissProt、BLOCKS、及びPima IIのよ うなデータベースを検索した。これらのデータベースには既に同定された配列が
注釈付きで含められており、BLAST（Basic Local Alignment Toolを表す）を用 いて相同性（類似性）を有する領域をこのデータベースのなかから検索した（Al
tschul. S.F. (1993) J. Mol. Evol. 36:290-300; Altschulら(1990) J. Mol. B
iol. 215:403-10）。

【０１８７】 BLASTは、ヌクレオチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを作成して配 列の類似性を決定する。そのアライメントの局所的性質のために、BLASTは厳密 な一致、すなわち原核生物（細菌）や真核生物（動物、菌類、又は植物）を起源
とする相同体を求める際に特に有効である。一次配列パターンや二次構造ギャッ
プの問題を処理する際には、参照して本明細書の一部としているSmith R.F.及び
T.F. Smith（1992, Protein Engineering 5:35-51）に記載のアルゴリズムのよ うな他のアルゴリズムを用いることができる。本明細書に開示された配列の長さ
は少なくとも４９ヌクレオチドであり、不必要な塩基は１２％以下である（この
場合、Ａ、Ｃ、Ｇ、又はＴではなく、Ｎが記録される）。

【０１８８】 BLAST法は、参照して本明細書の一部としているKarlin. S.及びS.F. Altschul
（1993: Proc. Nat. Acad. Sci. 90:5873-7）に詳細に記載されているように、 問い合わせ配列とデータベースの配列の一致を検索し、発見したあらゆる配列の
一致の統計的有意性を評価して、ユーザが選択した有意性の閾値を満たす一致の
みを報告する。本出願での閾値は、ヌクレオチドで１０^-25、ペプチドで１０^-8 に設定した。

【０１８９】 インサイト社ヌクレオチド配列が霊長類（ｐｒｉ）、齧歯類（ｒｏｄ）及び哺
乳動物（ｍａｍ）配列の場合にＧｅｎＢａｎｋデータベースに対して検索され、
その後同じクローンから推定されたアミノ酸配列が、GenBank機能タンパク質デ ータベース、哺乳動物（ｍａｍｐ）、脊椎動物（ｖｒｔｐ）及び真核生物（ｅｕ
ｋｐ）に対して相同性を検索された。

【０１９０】 ４ ノーザン分析 ノーザン分析は、遺伝子の転写物の存在を検出するために用いられる実験技術
であり、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞タイプまたは組織に由来する
ＲＮＡが結合した膜とのハイブリダイゼーションを行う（例えば、Sambrook, 前
掲, ch. 7及びAusubel, F.M. et al. 前掲, ch. 4 and 16を参照されたい）。

【０１９１】 BLAST（Altschul, S.F. 1993及び1990, 前出）を用いる類似のコンピュータ技
術を用いて、GenBank又はLIFESEQ^TMデータベース（Incyte Pharmaceuticals）の
ようなデータベースにおける同一或いは関連する分子を検索した。この分析は、
多くの膜系ハイブリダイゼーションと比較して非常に高速である。さらにコンピ
ュータ検索の感度を変更して、ある一致が正確な一致か、相同的であるかの分類
を決定することができる。

【０１９２】 検索の基準値は、積スコア（product score）であり、これは以下の式で定義 されるものである。 （配列の一致率（％）×最大BLASTスコア（％））／１００ この積スコアは、２つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一致の両方を
考慮している。例えば、積スコアが４０の場合は、一致は誤差が１〜２％の範囲
で正確であり、スコアが７０の場合は正確に一致している。相同な分子は、通常
積スコアとして１５〜４０を示すものを選択することにより同定されるが、スコ
アの低いものも関連する分子として同定することもできる。

【０１９３】 ノーザン分析の結果は、ＳＣＴＲをコードする転写物が発生するライブラリの
リストとして報告される。配列の存在量（abundance）及び存在率（percent abu
ndance）のリストも報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映
し、存在率は、存在量をｃＤＮＡライブラリ内で検出された配列の総数で割った
値である。

【０１９４】 ５ ＳＣＴＲをコードする配列の延長 インサイト社クローン１３２１８４４の核酸配列を用いて、部分ヌクレオチド
配列を完全長まで伸長するためにオリゴヌクレオチドプライマを設計した。１つ
のプライマを合成してアンチセンス方向の伸長を開始し、他のプライマを合成し
てセンス方向の配列を伸長した。プライマを用いて、対象の領域に対する新規で
未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを「外側に」発生させる既知の配列
の伸長を容易にした。初期プライマが、OLIGO 4.06 (National Biosciences)或 いは他の適当なプログラムを用いてｃＤＮＡから設計され、長さが約２２〜３０
のヌクレオチドになり、５０％以上のＧＣ含有物を有し、約６８〜７２℃の温度
で標的配列にアニーリングするようにした。ヘアピン構造及びプライマ−プライ
マ２量体化をもたらすことになるヌクレオチドの伸展は避けられた。

【０１９５】 選択されたヒトｃＤＮＡライブラリ（Gibco/BRL）を用いて配列を伸長した。 ２つ以上の伸長が必要或いは望まれる場合には、既知領域をさらに伸長させるた
めに、追加のプライマの組が設計される。

【０１９６】 XL-PCR kit (Perkin Elmer)の取扱説明書に従って、酵素及び反応混合物を完 全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られた。各プライマを４０ｐｍ
ｏｌかつキット全ての他の成分を推奨された濃度で開始する場合、ＰＣＲがPelt
ier Thermal Cycler (PTC200; MJ Research, Watertown MA)を用いて、 ステップ１ １分間９４℃（初期変性） ステップ２ １分間６５℃ ステップ３ ６分間６８℃ ステップ４ １５秒間９４℃ ステップ５ １分間６５℃ ステップ６ ７分間６８℃ ステップ７ さらに１５サイクル間ステップ４−６の繰返し ステップ８ １５秒間９４℃ ステップ９ １分間６５℃ ステップ１０ ７分１５秒間６８℃ ステップ１１ １２サイクル間ステップ８−１０の繰返し ステップ１２ ８分間７２℃ ステップ１３ ４℃（保持） のパラメータで実行された。

【０１９７】 反応混合物の５−１０μｌ部分標本が低濃度（約０．６−０．８％）アガロー
スミニゲル上で電気泳動法により分析され、どの反応物が配列の伸長に成功した
かを判定した。最も大きな生成物を含むと考えられる帯がゲルから切除され、QI
A Quick^TM (QIAGEN Inc.Chatsworth, CA)を用いて精製され、再結合及びクロー ニングを容易にするためにクレノウ酵素を用いて、オーバーハングから切除され
た。

【０１９８】 エタノール沈殿後、その生成物は１３μｌの連結緩衝液中に再溶解され、１μ
ｌＴ４−ＤＮＡリガーゼ（１５ユニット）及び１μｌＴ４ポリヌクレオチドキナ
ーゼが加えられ、その混合物は２〜３時間室温で、或いは１６℃で一晩の間イン
キュベートされた。コンピテントＥ．ｃｏｌｉ細胞（４０μｌの適当な媒質内に
ある）が３μｌの連結混合物と形質転換され、８０μｌのＳＯＣ媒質内で培養さ
れた（例えばSambrook、前掲、付録Ａ p.2を参照されたい）。３７℃で１時間イ
ンキュベートした後、Ｅ．ｃｏｌｉ混合物が、２ｘＣａｒｂを含むLuria Bertan
i (LB)-agar (Sambrook、前掲、付録Ａ p.1を参照されたい)上に蒔かれた。翌日
、いくつかのコロニーが各プレートから無作為に選び取られ、適当な市販の滅菌
９６穴微量定量プレートの個々のウエル内に置かれた１５０μｌの液体ＬＢ／２
ｘＣａｒｂ媒質内で培養された。その翌日、各５μｌの一晩おいた培養株が有菌
の９６穴プレートに移され、水で１：１０に希釈された後、５μｌの各サンプル
がＰＣＲアレイに移された。

【０１９９】 ＰＣＲ増幅の場合、４ユニットのｒＴｔｈＤＮＡポリメラーゼ、ベクタプライ
マ及び伸長反応のために用いられる１つ或いは両方の遺伝子特異的プライマを含
む１８μｌの濃縮ＰＣＲ反応混合物（３．３ｘ）が各ウエルに加えられた。増幅
は、 ステップ１ ６０秒間９４℃ ステップ２ ２０秒間９４℃ ステップ３ ３０秒間５５℃ ステップ４ ９０秒間７２℃ ステップ５ さらに２９サイクルの間ステップ２−４の繰返し ステップ６ １８０秒間７２℃ ステップ７ ４℃（保持） の条件で実行された。

【０２００】 ＰＣＲ反応物の部分標本が、分子重量マーカと共にアガロースゲル上で処理さ
れた。ＰＣＲ生成物の大きさが、元の部分ｃＤＮＡと比較され、適当なクローン
が選択され、プラスミドに結合され、そして配列決定された。

【０２０１】 同様にして、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のヌクレオチド配列を用いて、上記手順、
５´伸長用に設計されたオリゴヌクレオチド及び適当なゲノムライブラリを用い
て５´調節配列を得る。

【０２０２】 ６ 個々のハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２に基づくハイブリダイゼーションプローブを用いて、ｃ
ＤＮＡ、ｍＲＮＡ並びにゲノムＤＮＡをスクリーニングする。約２０塩基対から
なるオリゴヌクレオチドの標識について特に記載されるが、より大きなｃＤＮＡ
フラグメントの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌクレオチドをOLIGO 4.
06（National Bioscience）のような最新のソフトウェアを用いてデザインし、 ５０ｐｍｏｌの各オリゴマと、２５０μＣｉの[γ‐³²Ｐ]アデノシン三リン酸（
Amersham）及びＴ４ポリヌクレオチドキナーゼ（DuPont NEN、Boston MA）とを 組み合わせて用いることにより標識する。標識されたオリゴヌクレオチドを、Se
phadex G-25超精細樹脂カラム（Pharmacia & Upjohn）を用いて精製する。毎分
１０⁷カウントの標識されたプローブを含むアリコットを、エンドヌクレアーゼ （AseI，Bgl II，EcoRI，Pst I，Xba1或いはPvuII；DuPont NEN）の１つを用い て切断したヒトゲノムＤＮＡの典型的な膜系ハイブリダイゼーション分析におい
て用いる。

【０２０３】 各消化物からのＤＮＡを、０．７％アガロースゲル上で分画して、ナイロン膜
（Nytran Plus, Schleicher & Schuell, Durham NH）に転写する。ハイブリダイ
ゼーションは４０℃で１６時間行われる。非特異的シグナルを取り除くため、ブ
ロットを、０．１ｘクエン酸ナトリウム食塩水及び０．５％ドデシル硫酸ナトリ
ウムまでの徐々に厳密性が増す条件で順次室温にて洗浄する。XOMAT AR^TMフィル
ム（Kodak, Rochester, NY）を、Phosphoimager cassette（Molecular Dynamics
, Sunnyvale, CA）においてブロットに数時間露光した後、ハイブリダイゼーシ ョンパターンを視覚的に比較する。

【０２０４】 ７ マイクロアレイ マイクロアレイ用のオリゴヌクレオチドを作製するために、本明細書に記載の
ヌクレオチド配列を、ヌクレオチド配列の３´末端からコンピュータアルゴリズ
ムを用いて調査する。このアルゴリズムは、その遺伝子に固有で、ハイブリダイ
ゼーションに適した範囲内のＧＣ含量を有し、かつハイブリダイゼーションを妨
げるような予想される２次構造が存在しない、所定の長さの各オリゴマを同定す
る。このアルゴリズムは、長さ２０ヌクレオチドの２０個の配列特異的オリゴヌ
クレオチド（２０量体）を同定する。各配列の中央の１個のヌクレオチドだけが
変化している点を除いて一致しているオリゴヌクレオチドの組を作製する。この
プロセスはマイクロアレイにおける各遺伝子について繰り返され、２０個の２０
量体の組が二組、光照射化学プロセスを用いてシリコンチップの表面上で合成さ
れ配列される（Chee, M、前掲）。

【０２０５】 マイクロアレイ用のプローブ配列は、ポリペプチドを含むシグナル配列のため
の遺伝子コーディングに共通の保存されたタンパク質モチーフを有する配列を見
つけるために、種々のｃＤＮＡライブラリに由来する多数のクローンをスクリー
ニングすることにより選択することができる。一実施例では、ｃＤＮＡライブラ
リから同定された配列が、適当な解析プログラム、例えばBlock 2 Bioanalysis
Program (Incyte, Palo Alto, CA)を用いて、保存されたタンパク質モチーフを 有するそれらの遺伝子配列を同定するために解析される。Swiss-Prot Database 及びPROSITEに含まれる配列情報に基づくこのモチーフ解析プログラムは、ゲノ ム或いはｃＤＮＡ配列から翻訳された未だ特徴付けられていないタンパク質の機
能を決定する方法である（例えばBairoch, A. et al. (1997) Nucleic Acids Re
s. 25:217-221;及びAttwood, T. K. et al. (1997) J. Chem. Inf. CornpUt. Sc
i. 37:417-424を参照されたい）。PROSITEを用いて、極端に配列が異なるために
保存されたモチーフを用いて検出することができない機能的或いは構造的なドメ
インを同定することができる。その方法は重量マトリクス（weight matrices） に基づく。この方法により同定されたモチーフはその後、一致の確率の分布の測
定値を得るために、SWISS-PROTデータベースに対して較正される。

【０２０６】 別の実施例では、隠れマルコフモデル（ＨＭＭ）を用いて、共有されたモチー
フ、詳細にはコンセンサス配列を見つける（Pearson, W.R. and D.J. Lipman (1
988) Proc. Natl. Acad. Sci. 85:2444-2448; and Smith, T.F. and M.S. Water
man (1981) J. Mol. Biol. 147:195-197）。ＨＭＭは最初に音声認識パターンを
試験するために開発されたが、現在、タンパク質及び核酸配列を解析するために
、またタンパク質構造をモデリングするために生物学の分野で用いられている（
Krogh, A. et al. (1994) J. Mol. Biol. 235:1501-1531; and Coilin, M. et a
l. (1993) Protein Sci. 2:305-314）。ＨＭＭは形に関する確率的な基礎を有し
、アミノ酸或いはヌクレオチドのための位置特異スコアを用いる。そのアルゴリ
ズムは新たに同定された配列からの情報を取りこむまで継続し、そのモチーフ解
析の能力を高める。

【０２０７】 化学的な結合手順及びインクジェット装置を用いて、基質の表面上にアレイエ
レメントを合成することができる（例えば前掲のBaldeschweilerを参照されたい
）。ドット或いはスロットブロットに類似のアレイを用いてエレメントを配列し
、熱的、ＵＶ、機械的或いは化学的結合手順、又は真空システムによりエレメン
トを基質表面に結合することもできる。典型的なアレイは手作業で、或いは利用
可能な方法及び機械を用いて作製し、任意の適当な数のエレメントを含むことが
できる。ハイブリダイゼーション後、マイクロアレイを洗浄してハイブリダイズ
していないプローブを取り除き、スキャナーを用いて蛍光のレベル及びパターン
を決定する。走査画像を調べて、マイクロアレイ上の各オリゴヌクレオチド配列
の相補性の程度及び相対的な量を求める。

【０２０８】 別法では完全長ｃＤＮＡ或いは発現した配列タグ（Expressed Sequence Tag：
ＥＳＴ）がマイクロアレイのエレメントを構成する。本発明のヌクレオチド配列
の１つに対応するか、或いは本発明に関連するｃＤＮＡライブラリから無作為に
選択された完全長ｃＤＮＡ或いはＥＳＴが、適当な基質、例えばスライドガラス
上に配列される。ｃＤＮＡは、例えばＵＶ架橋結合を用いて、熱及び化学的に、
その乾燥することによりスライドガラスに固定される（Schena, M. et al. (199
5) Science 270:467-470, and Shalon, D. et al. (1996) Genome Res. 6:639-6
45を参照されたい）。基質上のエレメントにハイブリダイズさせるために、蛍光
プローブが準備され、使用される。その基質が上記の手順により解析される。

【０２０９】 ８ 相補的ポリヌクレオチド ＳＣＴＲをコードする配列或いはその任意の一部に対して相補的な配列は、自
然発生のＳＣＴＲの発現を低減又は阻害するために用られる。約１５〜約３０個
の塩基対を含むオリゴヌクレオチドの使用について特に記載されるが、より小さ
な配列或いはより大きな配列フラグメントの場合でも概ね同じ方法を用いること
ができる。Oligo4.06ソフトウェア及びＳＣＴＲのコーディング配列を用いて、 適切なオリゴヌクレオチドを設計することができる。転写を阻害するためには、
最も固有の５′配列から相補的なオリゴヌクレオチドをデザインし、これを用い
てプロモータがコーディング配列に結合するのを阻害する。翻訳を阻害するため
には、相補的なオリゴヌクレオチドをデザインして、リボソームがＳＣＴＲをコ
ードする転写物に結合するのを防ぐ。

【０２１０】 ９ ＳＣＴＲの発現 ＳＣＴＲの発現は、ｃＤＮＡを適切なベクタ内にサブクローニングし、そのベ
クターを宿主細胞に移入することによって達成される。このベクタは、適当なプ
ロモータ、例えば対象のｃＤＮＡと動作可能に関連するクローニング部位のβガ
ラクトシダーゼ上流を含む（例えばSambrook, supra, pp. 404-433; and Rosenb
erg, M. et al. (1983) Methods Enzymol. 101:123-138を参照されたい）。

【０２１１】 単離された形質移入菌株を、ＩＰＴＧを用いて標準的な方法で誘導し、初めの
βガラクトシダーゼの８残基、約５〜１５残基のリンカー、及び完全長タンパク
質からなる融合タンパク質を作製する。このシグナル配列が細菌増殖培地へのＳ
ＣＴＲの分泌を誘導し、この培地を以下に記載の活性のアッセイにおいて直接用
いることができる。

【０２１２】 １０ ＳＣＴＲの活性の実証 短鎖ＴＮＦ受容体ファミリタンパク質（ＳＣＴＲ）のための検定法は、形質移
入された細胞株においてアポトーシスの防止或いは誘発を測定する。ＳＣＴＲは
、ＣＯＳ７、ＨｅＬａ或いはＣＨＯのような哺乳動物細胞株をＳＣＴＲをコード
する真核発現ベクタと形質転換することにより発現させることができる。真核発
現ベクタは市販されており、それらを細胞の導入するための技術は当業者にはよ
く知られている。細胞株がＳＣＴＲを発現できるのに適した条件下で形質転換し
た後、ＳＣＴＲ発現ベクタを導入した細胞、導入していない細胞が４８〜７２時
間インキュベートされる。その後位相差顕微鏡を用いて、形質転換された細胞と
制御細胞との分裂指数を比較する。アポトーシスを阻止することによりＳＣＴＲ
が細胞増殖を刺激する分裂指数の上昇はＳＣＴＲ活性を示す。同様にＳＣＴＲが
アポトーシスを刺激する細胞数の減少はＳＣＴＲ活性を示す。

【０２１３】 １１ ＳＣＴＲ特異的抗体の産生 標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、ＰＡＧＥ電
気泳動法（例えばHarrington, M.G. (1990) Methods Enzymol. 182:488-495を参
照されたい）または他の精製技術を用いて実質的に精製されたＳＣＴＲを用いる
。ＳＣＴＲアミノ酸配列をDNAStarソフトウエア（DNASTAR社）を用いて解析して
免疫原性の高い領域を決定し、対応するオリゴペプチドを当業者が周知の手段に
より合成して、当業者に周知の方法で抗体を産生するために用いる。Ｃ末端付近
或いは隣接する親水性領域内のエピトープのような、適切なエピトープの選択方
法は当分野において周知である（例えばAusubel et al. 前掲, ch. 11を参照さ れたい.）。

【０２１４】 典型的にはオリゴペプチドは長さ１５残基で、ｆｍｏｃ（フルオレニルメトキ
シカルボニル）化学作用を用いるApplied Biosystems Peptide Synthesizer Mod
el 431Aを用いて合成され、M-maleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide ester（
MBS: Ausubel等、前出）と反応することによりキーホールリンペットヘモシアニ
ン(KLH, Sigma, St.Louis, MO)に結合される。ウサギは、完全なフロイントアジ
ュバント内でオリゴペプチド−ＫＬＨ複合体で免疫される。その結果生じる抗血
清は、例えば、プラスチックにペプチドを結合し、１％ＢＳＡで遮断し、ウサギ
抗血清と反応させ、洗浄し、さらに放射ヨウ素標識されたヤギ抗ウサギＩｇＧと
反応させることにより、抗ペプチド活性に対して検査される。

【０２１５】 １２ 特異的抗体を用いる自然発生ＳＣＴＲの精製 自然発生或いは組換えＳＣＴＲは、ＳＣＴＲに対して特異な抗体を用いる免疫
親和性クロマトグラフィにより実質的に精製される。免疫親和性カラムが、ＳＣ
ＴＲ抗体を、CnBr-activated Sepharose (Pharmacia＆Upjohn)のような活性化さ
れたクロマトグラフ樹脂に共有結合させることにより構成される。結合後、製造
者の取扱説明書に従って樹脂は遮断及び洗浄される。

【０２１６】 ＳＣＴＲを含む培地を免疫親和性カラム上を通過させ、カラムは、ＳＣＴＲを
選択吸収させる条件下（例えば洗浄剤中に高イオン強度緩衝剤を入れたもの）で
洗浄される。カラムは、抗体／ＳＣＴＲ結合を分裂させる条件下（ｐＨ２〜３の
緩衝剤或いは尿素或いはチオシアネートイオンのような高濃度のカオトロープ）
で溶出され、ＳＣＴＲが回収される。

【０２１７】 １３ ＳＣＴＲと相互作用する分子の同定 ＳＣＴＲ或いはその生物学的活性フラグメントが、¹²⁵I Bolton-Hunter試薬(B
olton AE 等(1973) Biochem J 133:529)を用いて標識される。多穴プレートのウ
エル内に以前に配列された候補分子が、標識されたＳＣＴＲでインキュベートさ
れ、洗浄され、標識されたＳＣＴＲ複合体を有する任意のウエルが検定される。
種々のＳＣＴＲ濃度から得られたデータを用いて、数、親和性及びＳＣＴＲと候
補分子との関係を示す値を計算する。

【０２１８】 上記明細書中に記載された全ての特許出願及び特許は参照して本明細書の一部
としている。記載された本発明の方法及びシステムの種々の変更例及び変形例は
、本発明の範囲及び精神から逸脱することなく当業者には明らかとなろう。本発
明は特定の好適な実施例に関連して記載されてきたが、請求される本発明はその
ような特定の実施例に不当に制限されるべきでないことを理解されたい。実際に
、本発明を実施するために記載された形態の種々の変更例は、分子生物学或いは
関連する分野の当業者には明らかであり、以下の請求の範囲内に入るものと考慮
されたい。

【配列表】

【図面の簡単な説明】

【図１Ａ】 ＳＣＴＲのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）および核酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）を示す。そのアライメントはMacDNASIS PRO software (Hitachi
Software Engineering Co. Ltd., San Bruno, CA)を用いて生成された。

【図１Ｂ】 ＳＣＴＲのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）および核酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）を示す。そのアライメントはMacDNASIS PRO software (Hitachi
Software Engineering Co. Ltd., San Bruno, CA)を用いて生成された。

【図１Ｃ】 ＳＣＴＲのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）および核酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）を示す。そのアライメントはMacDNASIS PRO software (Hitachi
Software Engineering Co. Ltd., San Bruno, CA)を用いて生成された。

【図１Ｄ】 ＳＣＴＲのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）および核酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）を示す。そのアライメントはMacDNASIS PRO software (Hitachi
Software Engineering Co. Ltd., San Bruno, CA)を用いて生成された。

【図１Ｅ】 ＳＣＴＲのアミノ酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１）および核酸配列（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２）を示す。そのアライメントはMacDNASIS PRO software (Hitachi
Software Engineering Co. Ltd., San Bruno, CA)を用いて生成された。

【図２Ａ】 DNASTARTM software (DNASTAR Inc, Madison WI)のマルチシーケンスアライメ
ントプログラムを用いて生成された、ＳＣＴＲ（１３２１８４４；ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：１）、ヒト４−１ＢＢ（ＧＩ ７２８７３８；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）、
ヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３（ＧＩ １６６９６９２；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
４）およびヒトアポトーシス誘発タンパク質ＴＲＩＣＫ−２Ａ（ＧＩ ２４０７
６５１：ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５）間のアミノ酸配列アライメントを示す。

【図２Ｂ】 DNASTARTM software (DNASTAR Inc, Madison WI)のマルチシーケンスアライメ
ントプログラムを用いて生成された、ＳＣＴＲ（１３２１８４４；ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：１）、ヒト４−１ＢＢ（ＧＩ ７２８７３８；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）、
ヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３（ＧＩ １６６９６９２；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
４）およびヒトアポトーシス誘発タンパク質ＴＲＩＣＫ−２Ａ（ＧＩ ２４０７
６５１：ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５）間のアミノ酸配列アライメントを示す。

【図２Ｃ】 DNASTARTM software (DNASTAR Inc, Madison WI)のマルチシーケンスアライメ
ントプログラムを用いて生成された、ＳＣＴＲ（１３２１８４４；ＳＥＱ ＩＤ
ＮＯ：１）、ヒト４−１ＢＢ（ＧＩ ７２８７３８；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３）、
ヒトＷＳＬ−Ｓ１／ＬＡＲＤ−３（ＧＩ １６６９６９２；ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：
４）およびヒトアポトーシス誘発タンパク質ＴＲＩＣＫ−２Ａ（ＧＩ ２４０７
６５１：ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５）間のアミノ酸配列アライメントを示す。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｐ 37/02 Ｃ０７Ｋ 14/705 43/00 １１１ 16/28 Ｃ０７Ｋ 14/705 Ｃ１２Ｎ 1/15 16/28 1/19 Ｃ１２Ｎ 1/15 1/21 1/19 Ｃ１２Ｐ 21/02 Ｃ 1/21 Ｃ１２Ｑ 1/68 Ａ 5/10 Ｇ０１Ｎ 33/566 Ｃ１２Ｐ 21/02 33/50 Ｍ Ｃ１２Ｑ 1/68 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ Ｇ０１Ｎ 33/566 Ａ６１Ｋ 37/02 // Ｇ０１Ｎ 33/50 Ｃ１２Ｎ 5/00 Ａ (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＺ，ＵＧ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ) ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ， ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，Ｄ Ｋ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＥ，ＧＨ，ＧＭ，ＨＲ ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ， ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，Ｌ Ｖ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＮＯ，ＮＺ ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ， ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＵＡ，ＵＧ，Ｕ Ｓ，ＵＺ，ＶＮ，ＹＵ，ＺＷ (72)発明者 コーレイ、ニール・シー アメリカ合衆国カリフォルニア州94040・ マウンテンビュー・＃30・デールアベニュ ー 1240 (72)発明者 ラル、プリーティ アメリカ合衆国カリフォルニア州95054・ サンタクララ・ラスドライブ 2382

Claims (22)

【特許請求の範囲】
1. 【請求項１】 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはそのフラグメントからなるア
   ミノ酸配列を含む実質的に精製されたポリペプチド。
2. 【請求項２】 請求項１のアミノ酸配列に少なくとも９０％アミノ酸同一
   性を有する実質的に精製された変異体。
3. 【請求項３】 請求項１のＳＣＴＲをコードする単離され、精製されたポ
   リヌクレオチド配列。
4. 【請求項４】 請求項３のポリヌクレオチド配列に少なくとも９０％ポリ
   ヌクレオチド同一性を有する単離され、精製されたポリヌクレオチド変異配列。
5. 【請求項５】 請求項３のポリヌクレオチド配列に厳密な条件下でハイブ
   リダイズする単離され、精製されたポリヌクレオチド。
6. 【請求項６】 請求項３のポリヌクレオチド配列に相補的な配列を有する
   単離され、精製されたポリヌクレオチド。
7. 【請求項７】 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２のフラ
   グメントからなるポリヌクレオチド配列を含む単離され、精製されたポリヌクレ
   オチド。
8. 【請求項８】 請求項７のポリヌクレオチドに少なくとも９０％ポリヌク
   レオチド同一性を有する単離され、精製されたポリヌクレオチド変異配列。
9. 【請求項９】 請求項７のポリヌクレオチドに相補的な配列を有する単離
   され、精製されたポリヌクレオチド。
10. 【請求項１０】 請求項３のポリヌクレオチド配列の少なくともフラグメ
    ントを含む発現ベクタ。
11. 【請求項１１】 請求項１０の発現ベクタを含む宿主細胞。
12. 【請求項１２】 ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１或いはＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：１のフ
    ラグメントからなる配列を含むポリペプチドを生成するための方法であって、 ａ）前記ポリペプチドの発現に適した条件下で請求項１１の宿主細胞を培養す
    る過程と、 ｂ）前記宿主細胞培養株から前記ポリペプチドを回収する過程とを有すること
    を特徴とする方法。
13. 【請求項１３】 適当な医薬品担体とともに請求項１のポリペプチドを含
    む医薬品組成物。
14. 【請求項１４】 請求項１のポリペプチドに特異に結合する精製された抗
    体。
15. 【請求項１５】 請求項１のポリペプチドの精製されたアゴニスト。
16. 【請求項１６】 請求項１のポリペプチドの精製されたアンタゴニスト。
17. 【請求項１７】 請求項１３の医薬品組成物の有効量を治療を要する被検
    者に投与する過程を含む発生障害を治療或いは予防するための方法。
18. 【請求項１８】 請求項１３の医薬品組成物の有効量を治療を要する被検
    者に投与する過程を含む生殖障害を治療或いは予防するための方法。
19. 【請求項１９】 請求項１３の医薬品組成物の有効量を治療を要する被検
    者に投与する過程を含む腫瘍性障害を治療或いは予防するための方法。
20. 【請求項２０】 請求項１６のアンタゴニストの有効量を治療を要する被
    検者に投与する過程を含む免疫学的障害を治療或いは予防するための方法。
21. 【請求項２１】 核酸材料を含む生物学的サンプルにおいてＳＥＱ ＩＤ
    ＮＯ：１のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを検
    出するための方法であって、 （ａ）前記生物学的サンプルの前記核酸材料の少なくとも１つに請求項６のポ
    リヌクレオチドをハイブリダイズさせ、それによりハイブリダイゼーション複合
    体を形成する過程と、 （ｂ）前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程とを有し、前記ハイ
    ブリダイゼーション複合体の存在が前記生物学的サンプルにおいて前記ポリペプ
    チドをコードするポリヌクレオチドの存在と相関をなすことを特徴とする方法。
22. 【請求項２２】 前記生物学的サンプルの前記核酸材料が、ハイブリダイ
    ゼーション前にポリメラーゼ連鎖反応により増幅されることを特徴とする請求項
    ２１に記載の方法。