JP2001510049A - 微生物および該微生物から得られるエステラーゼ - Google Patents

微生物および該微生物から得られるエステラーゼ

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ロバート・クリストファー・ブラウン
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Abstract

(57)【要約】 新規な微生物はラセミ体のN-ベンゾイル-2-アゼチジンカルボン酸メチルエステルから少なくとも99%エナンチオマー過剰率で(S)-N-ベンゾイル-2-アゼチジンカルボン酸を生成する能力により特徴付けられる。酵素が該微生物から得られ、同じ又は反対のエナンチオマー選択性を有する。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 (発明の分野) 本発明は、微生物および該微生物から得られる立体選択的エステラーゼに関す
る。
【0002】 (発明の背景) 生物分割は、一般的に、エナンチオマー的に純粋な化合物の製造に用いられる
ことが知られている方法である。しかしながら、特定の化合物の分割における特
定の生物触媒の利用可能性を予想することはほとんど不可能である。
【0003】 アゼチジン-2-カルボン酸および類似体はある種の治療薬の製造に有用なシン
トンである。シントンが化学的に合成される場合、それはラセミ体である。常套
の合成によれば、最終薬物も又エナンチオマーの混合物となり、エナンチオマー
の一つがあまり作用的でないのではないか、望ましくない副作用を引き起こすの
ではないかという当然の懸念を引き起こす。それゆえ、ラセミ体のシントンの2
つのエナンチオマーのどちらかが単離され得、次いでその残りがそれに基づいて
構築され得る合成法に手段を講ずる必要がある。
【0004】 これを行う効果的な方法は、酸のエステルの一エナンチオマーを選択的に加水
分解するための酵素を用いて一エナンチオマーとして酸を得、他方のエナンチオ
マーをエステルとして残すことである。混合物の成分はこうして容易に分けられ
得る。
【0005】 WO-A-9802568は、エナンチオマーに富むアゼチジン-2-カルボン酸
が新規かつ効果的な生物分割法によりエナンチオマー的に純粋な形で、高い収量
で得られ得ることを開示する。
【0006】 (発明の概要) 本発明によれば、新規な微生物は生物触媒作用、例えばWO-A-980256
8に開示されている方法のために有用な酵素を生成し、。驚くべきことに、アス
ペルギルス(Aspergillus)に属するある株が特に有用であることが見出された。
【0007】 アスペルギルス タマリイ(Aspergillus tamarii)(CMC 3242)として 識別される新規な微生物がイギリス、サリー、エガムの国際菌類学研究所にブダ
ペスト条約の規定に基づき1997年7月8日に寄託された。その受諾番号は IMI375930である。
【0008】 エステラーゼをコードしている遺伝子を単離し、配列を決定し(配列番号1を 参照されたい)、酵素のアミノ酸配列を得た(配列番号2を参照されたい)。本発 明は、上記の構造を有する化合物および、当業者に明らかであるように、同じ活
性を有するその断片に関する。新規な天然型酵素はラセミ体のN-ベンゾイル-2
-アゼチジンカルボン酸を転換する能力により特徴付けられ、(S)-2-アゼチジ ンカルボン酸を少なくとも99%eeで与える;新規な組換え型酵素は反対のエ
ナンチオマーをこれも又少なくとも99%eeで与える。これらの結果はここで
示される条件下で得られ得る。
【0009】 (発明の記述) 実例として、ラセミ体のN-アシラゼチジン-2-カルボン酸エステルの生物転 換による、エナンチオマーに富むN-アシラゼチジン-2-カルボン酸を得るため の方法において、新規な微生物と単離酵素を用い得る。
【0010】 「エナンチオマーに富んだ」により我々は、一方が他方よりも大きな比率 で、即ち少なくとも50%ee、好ましくは少なくとも70%eeおよびより好
ましくは少なくとも90%で存在するエナンチオマーの混合物のいずれかを意味
する。分割によりこれが達成されなければ、ee(エナンチオマー過剰率)はしば
しば結晶化により高められ得る。
【0011】 本発明による方法は、一の酸エステルエナンチオマーの対応する酸への選択的
な加水分解を含む。酸および残存エステルは容易に分離され得る。残存エステル
は(望まれない場合)回収され、ラセミ化され(例えばナトリウムメトキシドなど の塩基を用いて)、そして分割過程で再使用され得る。
【0012】 本発明における使用のための適当な基質はキラルな酸のエステルである。その
ような酸はナプロキセンなどのプロフェンを含む。
【0013】 言及され得るエステルは、アリール(例えばフェニル)又は直鎖若しくは環状ア
ルキル(特に低級アルキル)エステルを含む。言及され得る特別なエステルは、プ
ロピル、エチルおよび特にメチルエステルを含む。
【0014】 新規な微生物はラセミ体のN-ベンゾイルアゼチジンカルボン酸エステルの生 物分割により(S)-N-ベンゾイルアゼチジン-2-カルボン酸を生成するその能力
により特徴付けられる。酵素活性は常套の方法で同定され得る。驚くべきことに
、切断型酵素は反対のエナンチオマー特異性を有し、それによりラセミ体のエス
テル基質からどちらかのエナンチオマーを過剰に産生させることが見出された。
【0015】 酵素は全細胞型で又は単離型で用いられ得る。所望により当業者によく知られ
る方法により固定され得る。
【0016】 酵素は寄託された微生物から製造され得る。これとは別に、組換え技術によっ
ても製造され得る。
【0017】 本願により与えられたDNAおよびアミノ酸配列を用いて、当業者は本願によ
り開示されている遺伝子や酵素の断片又は変異体を容易に構築することが出来る
。例示された酵素の活性を保持するこれらの断片および変異体は、本発明の範囲
内にある。又、遺伝子コードの重複のために、様々な異なるDNA配列がこの中
で開示されているアミノ酸配列をコードし得る。同一又は類似の酵素をコードし
ているこれらの選択的DNA配列を作ることは当業者の技術範囲内にある。これ
らのDNA配列は本発明の範囲内にある。本願で用いられている、「本質的に同
じ」配列の意味することは実質的に活性に影響を及ぼさないアミノ酸の置換、欠
失、付加又は挿入を言う。活性を保持している断片もこの定義中に含まれる。
【0018】 本発明の遺伝子はよく知られる方法により単離され得、広く様々な宿主に導入
され得る。遺伝子の発現は直接的または間接的に酵素の細胞内合成および保持に
至る。遺伝子は微生物宿主に適当なベクターを経て導入され得る。
【0019】 遺伝子の安定した保持および発現のための条件下で、微生物宿主に遺伝子を導
入するために広く様々な方法が利用される。DNA構築物は遺伝子の発現のため
の転写および翻訳制御シグナル、その制御調節下の遺伝子および宿主微生物中の
DNA配列と類似のDNA配列(これにより組み込みが可能になる)、および/又
は宿主中で機能し得る複製システム(これにより組み込みや安定保持が可能にな る)を含み得る。
【0020】 転写の方向、即ちコード又はセンス配列の5’から3’の方向に、構築物は ある場合には転写調節部位、およびプロモーター(ここで調節部位はプロモータ
ーの5’又は3’のどちらにあってもよい)、リボゾーム結合部位、開始コドン
、開始コドンに同期するオープンリーディングフレームを有する構造遺伝子、停
止コドン、ある場合にはポリアデニル化シグナル配列、および終結部位を含み得
る。二重鎖としてのこの配列はそれ自体で微生物宿主の形質転換のために使用さ
れ得るが、たいていはマーカーを含むDNA配列と共に含まれる。
【0021】 開始部位の調節制御下に置かれるべく、遺伝子は、転写/翻訳開始部位と終結
部位の間に導入され得る。この構築物は、少なくとも一つの複製系を含み得るが
、一つ以上の複製系を含んでいてもよいプラスミドの中(プラスミド中、一つの 複製系はプラスミドの発生中にクローニングのために使用され、第2の複製系は
最終宿主において機能するために必要である)に含まれ得る。加えて、上述のよ うに一つ又はそれ以上のマーカーも存在し得る。組み込みが望まれる場合、プラ
スミドは望ましくは宿主遺伝子と相同の配列を含む。
【0022】 形質転換体は常套の方法に従って単離され得るが、たいていは、変更されてい
ない微生物や転換中の微生物が存在する時、それらに対して所望の微生物を選択
するために採られる選択技術を用いる。
【0023】 適当な宿主細胞は原核生物と真核生物を含む。一例は大腸菌である。
【0024】 以下の実施例は本発明を説明する。
【0025】 エステラーゼ含有株の同定 公知のエステラーゼ活性を有するカイロテック テクノロジー株コレクション
から選択された微生物株を、KH2PO4(7g/L)、K2HPO4(2g/L)、( NH4)2SO4(1g/L)、イースト抽出物(10g/L)、微量元素溶液(1ml /L)およびグルコース(10g/L)の水溶液から成る培地に生育させた。培地 は250mlの三角フラスコあたり25mLにて作成し、pH6.0(菌およびイ
ースト用)およびpH7.0(細菌用)に合わせ、その後121℃で20分間滅菌し
た。微量元素溶液は、CaCl2.2H2O(3.6g/L)、CoCl2.6H2O(2
.4g/L)、CuCl2.2H2O(0.85g/L)、FeCl3.6H2O(5.4g /L)、H3BO4(0.3g/L)、濃HCl(333ml/L)、MnCl2.4H2 O(2.0g/L)、Na2MoO4.2H2O(4.8g/L)、およびZnO(2.0g
/L)から成る。
【0026】 各株の100μl量のグリセロール貯蔵物をフラスコの中に接種し、25℃で
、ニュー ブランスウィック(New Brunswick)制御環境インキュベーター振とう 機(モデルNo.G-25)中で250rpmにて24から72時間生育させた。1
0mlの各培養物を次いで遠心分離により回収し、ペレットを4mLの50mM
KH2PO4(pH7.0)内に再懸濁した。
【0027】 シンチレーションバイアル中860μlの50mM KH2PO4(pH7.0
)を40μLの50%w/vN-ベンゾイル-2-アゼチジンカルボン酸メチルエス
テル(2.0g N-ベンゾイル2-アゼチジンカルボン酸メチルエステル+2mL
2O+0.02gトゥイーン80、4℃で10秒間15-18μmの超音波を かけ、3秒間停止させる超音波処理を10分間施した)および上述のように生育 させた100μLの再懸濁培養物と共に混合した。反応をニュー ブランスウィ
ック制御環境インキュベーター振とう機(モデルNo.G-25)中で25℃、25
0rpmにて遂行した。
【0028】 サンプルを7日まで植え継ぎ、HPLCにより転換に関して分析した。即ちサ
ンプルを適当に希釈し、20μlを5cmハイパーシルBDSC18カラム上へ
注入した。溶離バッファーは50%v/v MeOH+1g/L H3PO4であ
った。流速は1.5mL/分および検出は225nmにて行い、実施時間は3分 間であった。
【0029】 顕著な加水分解を与えるこれらの反応物に関して、エステルと生成物のエナン
チオマー過剰率(ee)を決定した。エステルのエナンチオマー過剰率(ee)をG
Cにより決定した。サンプルのpHをNaOHを用いてpH9.5に調整し、エ チルアセテート中へ抽出し、Mg2SO4にて乾燥させ、25m×0.25mmキ ラシルDEX CBカラム上へ注入した。分析中のオーブンの温度を125℃に
維持した。生成物のエナンチオマー過剰率(ee)をHPLCにより決定した。サ
ンプルのpHをNaOHを用いてpH9.5に調整し、エチルアセテート中へ4 回抽出し、エステルを除去した。次いでpHをH3PO4を用いて1.5に調整し 、産物をエチルアセテート中へ抽出し、Mg2SO4にて乾燥させ、20μlを2
5cmのキラルセルODカラム上へ注入した。溶離バッファーは92:8:1
へプタン:プロパン-2-オール:トリフルオロ酢酸であった。流速は1.0mL /分であり、検出は254nmにて行った。
【0030】 初めのスクリーニングにおいて株アスペルギルス タマリイ(CMC3242)
は48時間の生物転換の後、添加基質の30%の転換を得た。残存エステルは9
9%ee過剰率の(R)-エナンチオマーであり、生成物は74%のee過剰率の(
S)-エナンチオマーであることが示された。上述のように、株はIMIに既に寄
託されている。
【0031】 アスペルギルス タマリイ CMC3242の発酵 胞子懸濁接種物を調製するために、アスペルギルス タマリイの培養物をPD
Aプレート(121℃で20分間滅菌し、50℃に冷却し、140mmペトリ皿 に注いだ39g/Lのジャガイモデキストロースアガー(オキソイドCM139)
)上に展開し、25℃で7日間インキュベートした。アスペルギルス タマリイ の胞子を次いで滅菌(121℃にて20分間滅菌した)10%w/v グリセロー
ル+0.1%w/v トゥイーン80に再懸濁した。1mLのサンプルを2mL のクリオバイアルに分注し、−80℃で保存した。
【0032】 以下の培地を発酵槽の中で使用した:KH2PO4(7g/L)、K2HPO4(2 g/L)、(NH4)2SO4(1g/L)、MgSO47H2O(1g/L)、微量元素溶
液(1mL/L)、ポリプロピレン グリコール(1mL/L)、イースト抽出物( 20g/L)およびスクロース(20g/L)。
【0033】 培地を各発酵槽当たり終体積が1.5Lとなるよう作成し、pHを6.0に調整
した後滅菌した(60分間121℃)。スクロースを50%w/v溶液として別に
滅菌し、冷却後、発酵槽に加えた。発酵槽に1mLの胞子懸濁物を接種した。温
度を25℃に保持し、pHを5.8から6.2の間に調整した。1000rpmで
振動させ、空気流を1.0L/分に設定した。100mLの34%w/v スク ロース+100mLの34%w/v イースト抽出物+1.7g/L(NH4)2S O4(121℃で60分間別々に滅菌した)の栄養分を48時間後に発酵槽に添加 した。72時間生育させた後発酵物をろ過により収集し、細胞ペーストとして- 20℃で貯蔵した。全湿バイオマス250gを収集した。細胞の活性は41.7 U/gであった(IU=1時間に産出される1mg生成物)。
【0034】 全細胞生物転換 凍結させた細胞ペースト(50g)を200mLの0.1M Na2HPO4/N aH2PO4バッファー(pH6.4)中で解凍した。モーターとすりこぎを用いて 細胞を粉砕した。反応物に100gのラセミ体のN-ベンゾイル-2-アゼチジン カルボン酸メチルエステルを添加し、体積を200mLの0.1M Na2HPO 4 /NaH2PO4バッファー(pH6.4)を用いて1000mLにした。反応を2
5℃で行い、pHを6.4に調整した。更に50gの細胞を4.5時間後に添加し
た。
【0035】 12時間後、生物転換汁をセライトパッドを通してろ過した。残存物をジクロ
ロメタン(500mL)を用いて洗浄し、2層のろ過物を分け、水性溶液を更なる
ジクロロメタン(4×750mL)を用いて抽出した。合わせたジクロロメタン溶
液を塩水(200mL)を用いて洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、ろ過し、溶媒を 真空中でエバポレートし、橙色のオイル(56.1g、56.1%回収、54%e e)を得た。原水溶液を酸性化し(pH2、濃HCl)、再びジクロロメタン(3×
750mL)で抽出した。有機(穏やかに乳化された)溶液を各回分離し、合わせ た。これらの合わせた抽出物を静置して(1時間)分離し、分液漏斗に通した。有
機相を塩水(100mL)で洗浄し、乾燥させ(MgSO4)、ろ過し、溶媒を真空 中でエバポレートし、半結晶化固体(33.7g、36%収量、94%ee)を産 出した。この半結晶化酸(33g)をエチルアセテート(75mL)中で20分間室
温にて攪拌し、白色固体(18g、55%収量、>99%ee)を吸引ろ過により
収集した。ろ過物を乾燥状態までエバポレートし、第2群の生成物を単離した( 2g、6%収量、>99%ee)。1Hnmr(CDCl3)は生成物の構造と一致 した。
【0036】 (S)-N-ベンゾイルアゼチジン-2-カルボン酸(5.90g、28.78mmo l)を水酸化ナトリウム水溶液(6.92g、0.173モル、92mL水中)に室 温にて攪拌しながら溶解した。反応物を75℃まで22時間加熱し、次いで室温
まで冷却させた。反応混合物をpH2に(濃HClにて)調整し、エチルアセテー
ト(3×100ml)を用いて抽出した。水溶液を次いで乾燥状態までエバポレー
トし、白色固体(13g)を得た。これを無水エタノール(150mL)中50℃に
て1時間スラリーにし、室温まで(〜1時間)冷却させた。吸引ろ過により塩を除
去し、エタノール溶液を乾燥状態までエバポレートし、白色固体(1.85g、4
7%収量)を得た。
【0037】 分離物を水(100ml)中に再溶解し、アンバーライト(Amberlite)IRA-6
7イオン交換樹脂(5g)を用いて30分間攪拌することにより中和した(pH7.
1まで)。樹脂を吸引ろ過により除去し、ろ過物を乾燥状態までエバポレートし 、わずかにオフホワイトの固体(1.38g、収量)を得た。オフホワイトの固体 を還流MeOH(10mL)を用いて5分間懸濁し、室温まで冷却し、精製生成物
を吸引ろ過により収集した(905mg、31%収量、98%ee)。1Hnmr(
2O)は生成物の構造と一致した。
【0038】 全RNAの調製 125mlのアスペルギルス タマリイCMC3242培養物を30℃にて4
8時間インキュベートした。細胞をろ過(ホワットマン2.7μm GF/Dグラ
スミクロファイバー)により収集した。回収した細胞(12g湿重量)をRNas eフリーの乳棒、乳鉢へ液体N2と共に投入し、ホモジナイズした。ホモジナイ ズを28mlの抽出バッファーを加えながら3回繰り返した。懸濁液をRNas
e-フリーの遠心チューブに移し、細胞片を遠心分離 (5000g、30分、1 5℃)により回収した。懸濁物をきれいなRNaseフリーのチューブに移し、 そこで上清を16ゲージの注射針に少なくとも10回通すことによりDNAを破
砕した。6.5mlの分離溶液を13mlの超遠心分離チューブ中のセシウムト リフルオロアセテート6.0mlの上に層を成した。
【0039】 チューブを次いで「スィング-アウト」超遠心分離ローターの中に設置し、遠 心分離(125000g、15時間、20℃)によりRNAを分離するための勾配
を形成させた。勾配をRNAペレットのところまで吸引し、次いで100μlの
TEバッファーに再懸濁した。RNAを次いで65℃まで10分間加熱し、遠心
分離(16000g、10分間、20℃)により清澄化し、上清を100μlのT
Eと混合し、加熱と清澄化を繰り返した。上清のRNA濃度をエチジウムブロマ
イドを用いて蛍光により標準と比較して決定した。全RNA調製物をサンプルの
体積の1/10の3Mのナトリウムアセテートおよびサンプルの体積の2.5倍 の100%(v/v)エタノールにより沈殿させ、沈殿物を−20℃にて必要時ま
で保存した。
【0040】 mRNAの精製 全RNA沈殿物を遠心分離により(21000g、30分、4℃)回収し、ペレ
ットをRNaseフリーの70%(v/v)エタノールを用いて洗浄した(210 00g、10分間、4℃)。RNAのペレットを乾燥させ、300μlのTEバ ッファーに再懸濁した。再懸濁された全RNA調製物から、ファルマシア バイ
オテック クイックプレップ(Pharmacia Biotech Quick Prep) mRNA精製キ
ット#27-9254Bを用いて精製した。2つのオリゴ(dT)セルロースカラ ムを平衡化し、150μlのRNA調製物を3.85mlの溶離バッファーと混 合し、各カラムに加えた。mRNAを遠心分離(350g、2分、20℃)により
結合させ、残存汚染物を3×3ml高塩バッファーウォッシュ(350g、2分 、20℃)により除去した。続いて2回3mlの低塩バッファー(350g、2分
、20℃)を用いて洗浄した。結合させたmRNAを2×250μlの溶離バッ ファー(あらかじめ65℃に温めた)を添加することにより溶離し、遠心分離した
(350g、2分、20℃)。溶離mRNAを次いで10μlのグリコーゲン、ア
ンプル体積の1/10の酢酸カリウム溶液および1mlの100%(v/v)エタ
ノールを添加することにより沈殿させ、サンプルを-20℃で2時間静置し、沈 殿を完成させた。沈殿物を遠心分離により(21000g、30分、20℃)回収
した。mRNAペレットを70%(v/v)エタノールを用いて洗浄し(2100 0g、2分、20℃)、乾燥させた。mRNAペレットを次いで25μlのDE PC H2Oに再懸濁し、次のcDNA合成のために用意した。
【0041】 cDNAの合成 調製mRNAのcDNAへの変換はストラタジーン(Stratagene) ザップ-c
DNA合成キット#200400を用いて遂行した。第1鎖の合成をmRNAの
ポリA末端にポリd(T)-リンカープライマーを結合させることにより開始し、 第1鎖のcDNAをMMLV-RT(逆転写酵素)により逆転写させた。cDNA の合成を測定するために放射線標識した35P-dATPの取り込みを用いた。第 1鎖合成の完成時に、mRNAにニックを入れ、第2鎖の合成のためのプライマ
ーを作成し、DNAポリメラーゼにより終了した。オートラジオグラフにより2
.1Kbのコントロールに隣接するサイズの二重鎖cDNAの十分量が産生され たことを確認した。cDNA断片の調製は「平滑末端化」、リン酸化、EcoR
Iリンカーの結合および最終的にはXhoIの切断により終えられ、発現のため
の正確な方向づけを与える非対称断片を形成した。
【0042】 cDNAのサイズの分別 所望のcDNA断片が約83kDaの遺伝子産物(エステラーゼ)をコードする
と仮定すると、1.8-2.4kbのcDNA断片がクローニングやスクリーニン グのために好ましい。それゆえ、cDNAの各々のサイズのプールを作るために
、構造の異なるcDNA群をセファロースCI-2Bろ過カラムを通して断片化 した。cDNAおよび組み込まれなかった32P-dATPの溶離をガイガーカウ ンターにより測定した。基質はより小さい断片を保持するので、cDNA断片は
最大のものから最小のものへと溶離された。フェノール:クロロホルムを用いて
4つの溶離断片プールを抽出し(21000g、10分、20℃)、エタノールで
沈殿させた。沈殿したcDNAを遠心分離により回収し(21000g、30分 、4℃)、ペレットを乾燥させ、2.5μlのH2Oに再懸濁した。
【0043】 N-末端アミノ酸配列由来のオリゴヌクレオチドプライマー 天然型アスペルギルス タマリイCMC3242エステラーゼの精製から、あ
るN末端アミノ酸配列(配列番号3)がKPPQTKKであることが決定された。
この配列から、5つの変性オリゴヌクレオチドプライマー(配列番号4-8)を合 成した。他の3つの変性オリゴヌクレオチドプライマー(配列番号9-11)を別 のN末端配列、DQAQWFK(配列番号12)に基づいて合成した。
【0044】 ポリメラーゼ連鎖反応法(PCR) 合成ポリA(20)オリゴヌクレオチドプライマーと上記プライマーの各々を用い
て、PCRをアスペルギルス タマリイCMC3242から調製したcDNAに
基づいて遂行した。いろいろな温度およびMg2+濃度を用いて、いろいろなPC
R断片が得られた。1.5および2.5kbの間の断片を単離し、精製し、pCR
2.1(インビトロゲン リミテッド)およびpCR-スクリプト(ストラタジーン)
中にクローン化した。更に、PCR断片を平滑末端化し、pUC19に結合させ
た。結合反応物を大腸菌株INVαF’、XL1-ブルーMRF’およびDH5 αに各々形質転換させた。
【0045】 形質転換した細胞を次いでアンピシリン(100μg/ml)、1mM IPT
GおよびXgal(50μg/ml)を含有するトリプトン ダイズブロースアガ
ー(オキソイド リミテッド.#CM129)上に広げた。N-ベンジルオキシカル
ボニル-2-アゼチジンカルボン酸で被覆される形質転換実施物は、ガラス(ボロ シリカ)ペトリ皿中のトリプトン ダイズブロースアガー添加補充物上に広げた 。
【0046】 大腸菌エステラーゼ発現形質転換体のスクリーニング 形質転換された大腸菌のコロニーへ、メチルN-ベンジルオキシカルボニル-( S)-フェニルアラニン、メチルN-ベンジスオキシカルボニル-2-アゼチジンカ ルボキシレート又はメチル(S)-ベンジルオキシカルボニル-2-アゼチジンカル ボキシレートを以下の各方法により被覆した。
【0047】 オキソイド バクトアガーを200mM KH2/K2HPO4(pH6.4)中溶
解しながら(〜60℃)1%(w/v)に調製し、トゥイーン80(〜0.5mg/m
l)とメチルN-ベンジルオキシカルボニル-(S)-フェニルアラニン(2mg/m l)を添加した。激しく揺り動かして乳濁液を生成した。一度冷却し(48℃)、 エステル懸濁液を大腸菌の形質転換コロニーの上に注いだ。プレートを室温にて
24-28時間放置し、クリアランスの範囲を観察した。
【0048】 この方法をメチルN-ベンジルオキシカルボニル-2-アゼチジンカルボキシレ ート(8mg/ml)およびメチル(S)-N-ベンジルオキシカルボニル-2-アゼチ
ジンカルボキシレート(8mg/ml)と共に100mM KH2/K2HPO4(p
H6.4)を用いる範囲でのみ変更して行った。
【0049】 組換えエステラーゼの単離 PCR形質転換物のオーバーレイは、ラセミ体のN-ベンジルオキシカルボニ ル-2-アゼチジンカルボキシレートにより被覆された際に所望のクリアランスゾ
ーンを与える147形質転換体を同定した。これら147の単離物の中で、(S)
-N-ベンジルオキシカルボニル-2-アゼチジンカルボキシレートを用いたオーバ
ーレイに関して10クローンが明確なクリアリングを生ずることが出来た。プラ
スミドDNAをこれらの10個の推定エステラーゼクローンから調製した。アガ
ロースゲル電気泳動は、10クローンがサイズと切断面に関して同じインサート
を持つことを示した。3.0kbのバンドはpCR-スクリプト クローニングベ
クター(2.9kb)と100bpのクローン化PCR断片を含んでいた;900 bpおよび2×350bpの明確なバンドはPCRインサートのXhoI断片で
あった。
【0050】 推定エステラーゼのDNA配列の分析 推定エステラーゼクローンのDNA配列の分析により1.5kbのインサート(
配列番号1)があることが示された。最長の推定オープンリーディングフレーム は1283bpにまでおよび、427アミノ酸残基のペプチド(配列番号2;約 43kDa)を翻訳する。N末端由来の配列の変換物のいずれかに相同の配列は 全く同定されなかった。実際のところは、クローン化断片内の配列換えと共に、
クローニングベクターの多くのクローニング部位内の欠失が起こった。先端が切
除されていることに加えて、推定の組換えエステラーゼが野生型のアスペルギル
スエステラーゼと反対の選択性を有することが示された。
【0051】 ポリリンカー(〜60bp)の欠失およびN−末端コード配列のいずれもが欠失
したことについて考え得る説明は、挿入部位付近のDNAの相同性により引起こ
されるステムループの形成によりもたらされる組換えであろう。大腸菌宿主DN
Aのミスマッチ修復機構は、プラスミドがうまく複製出来るようにステムループ
を開裂し、それによりPCRインサートの5’部位およびpCR-スクリプト ポリリンカー部位を削除し得る。
【0052】 配列表 (1)一般的な情報: (i)出願人: (A)名称:カイロテック テクノロジー リミテッド (B)ストリート:ケンブリッジ サイエンス パーク、ミル
トンロード (C)シティー:ケンブリッジ (D)ステート:N/A (E)国:イギリス (F)郵便番号(ZIP):シービー4 4ダブリュイー (ii)発明の名称:微生物および該微生物から得られるエステラ
ーゼ (iii)配列の数:12 (iv)コンピューターの読み取り: (A)媒体の種類:フロッピーディスク (B)コンピューター:IBM PC コンパチブル (C)オペレーティング システム:PC-DOS/MS-DO
S (D)ソフトウエア:パテンチン リリース #1.0、バー ジョン#1.30(EPO) (v)現在の出願の情報: 出願番号:WOは未知である。 (2)配列番号1の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:1532塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:DNA(genomic) (iii)ハイポセティカル:NO (iv)アンチセンス:NO (vi)オリジナルソース: (A)微生物:アスペルギルス タマリイ(Aspergillus tamar ii ) (ix)特徴: (A)名前/キー:CDS (B)場所:1..1281 (xi)配列番号1: ATG ACC ATG ATT ACG CCA AGC TCA GCC ATG GGA ATG TCG TCT ACA TTT 48
Met Thr Met Ile Thr Pro Ser Ser Ala Met Gly Met Ser Ser Thr Phe 1 5 10 15 GAA TTT GAG CGT GTC ATT ACC AAG GCG GTC GAG GAC CGC GTC ATT CCT 96
Glu Phe Glu Arg Val Ile Thr Lys Ala Val Glu Asp Arg Val Ile Pro 20 25 30 GGC GTC GTG CTG CTG GCC GAA AAC TCA TCG GGC TCG TAT CAC TAT GAA 144
Gly Val Val Leu Leu Ala Glu Asn Ser Ser Gly Ser Tyr His Tyr Glu 35 40 45 AAG GTA CTC GGC TAC AGC TCC ATC GAG GCG GGC AAC GAG AAA AAG CTC 192
Lys Val Leu Gly Tyr Ser Ser Ile Glu Ala Gly Asn Glu Lys Lys Leu 50 55 60 GAG CGC GAC AGC GTG TTC ACG TTC ATG TCC ATG ACC AAG TTC ATA ACA 240
Glu Arg Asp Ser Val Phe Thr Phe Met Ser Met Thr Lys Phe Ile Thr 65 70 75 80 GCC ATT GTG GCC ATG CAG GCC GTC GAG CGT GGT CTC TGG GAC CTC GAT 288
Ala Ile Val Ala Met Gln Ala Val Glu Arg Gly Leu Trp Asp Leu Asp 85 90 95 GCC GAT GTC GCG CCT CTG CTG CCC GAA CTG GCG GCC CTG CCT GTC CTC 336
Ala Asp Val Ala Pro Leu Leu Pro Glu Leu Ala Ala Leu Pro Val Leu 100 105 110 AAG GGT TTC TCA GAC GAT GGC GTG CCC GAG CTG GTG CCG CGC GAG TCG 384
Lys Gly Phe Ser Asp Asp Gly Val Pro Glu Leu Val Pro Arg Glu Ser 115 120 125 GCC ATT ACG CTG CGC CAG CTG TTG TCG CAC ACG TCG GGC GCA GCC TAC 432
Ala Ile Thr Leu Arg Gln Leu Leu Ser His Thr Ser Gly Ala Ala Tyr 130 135 140 GAC TTC TTG TCG CCC GAT CTG ATC AAC TAC CAC GCG TGG GTA CGC AAG 480
Asp Phe Leu Ser Pro Asp Leu Ile Asn Tyr His Ala Trp Val Arg Lys 145 150 155 160 CAG CCT CCA TCG GCC GGT CTT GAG CAG CCA CCG GCA ATG ACT GTG GCA 528
Gln Pro Pro Ser Ala Gly Leu Glu Gln Pro Pro Ala Met Thr Val Ala 165 170 175 CCT CCG TCT GTT GAG GAG CGG TTC CGG TTT CCG CTC GTA TTC CAG CCT 576
Pro Pro Ser Val Glu Glu Arg Phe Arg Phe Pro Leu Val Phe Gln Pro 180 185 190 GGC CAA GGC TGG CAG TAC GGC TCG AGC CTG GAC TGG GTC GGC CGT CTT 624
Gly Gln Gly Trp Gln Tyr Gly Ser Ser Leu Asp Trp Val Gly Arg Leu 195 200 205 GTT GAA GCG CCT GGA CGC CAA GAC ACA GGG GCA AGA CTG AAG AAG GAA 672
Val Glu Ala Pro Gly Arg Gln Asp Thr Gly Ala Arg Leu Lys Lys Glu 210 215 220 GCA GGC ACC AAG CTG CCG TCG GTG CCT CTG GAA GAG ATT GTG ATC CGT 720
Ala Gly Thr Lys Leu Pro Ser Val Pro Leu Glu Glu Ile Val Ile Arg 225 230 235 240 GAT GTG CTC ACA CCC CTG GGG CTG CCT GCT GGC GCC TTG ACG TTC TCG 768
Asp Val Leu Thr Pro Leu Gly Leu Pro Ala Gly Ala Leu Thr Phe Ser 245 250 255 CCG GAG CGC TAT CCC GAC GTG TTC GCA CGA ATG TGG CCA TCG CTG CCC 816
Pro Glu Arg Tyr Pro Asp Val Phe Ala Arg Met Trp Pro Ser Leu Pro 260 265 270 GTG CGT GTC GGC AAC AAC GGT GCA CTG GAT GGC GGA CCA GTT GTG CAT 864
Val Arg Val Gly Asn Asn Gly Ala Leu Asp Gly Gly Pro Val Val His 275 280 285 GGT CCG TCC GTG TAC AAA AAG GCA CCT GCT GCT CTG GGC GGA CAG GGC 912
Gly Pro Ser Val Tyr Lys Lys Ala Pro Ala Ala Leu Gly Gly Gln Gly 290 295 300 ATG TAC GGC GAC ATG CCA TCG TTT TTC AAG GTG GCA CTC TCT ATT TTC 960
Met Tyr Gly Asp Met Pro Ser Phe Phe Lys Val Ala Leu Ser Ile Phe 305 310 315 320 CGC GAC GAC GGC AAG CTG CTG AAG CCC GAG TCA ACG AAG CTA TTC TTT 1008
Arg Asp Asp Gly Lys Leu Leu Lys Pro Glu Ser Thr Lys Leu Phe Phe 325 330 335 GAG CCG CAG CTG GCG TCC AAG GCC GCA CAC GCG GGC ATT ATG CAT GGC 1056
Glu Pro Gln Leu Ala Ser Lys Ala Ala His Ala Gly Ile Met His Gly 340 345 350 ACC GAG AAC TCT GGA TGG ATT ACT GGC GAT GTG CCC GAC ACC AAG GAG 1104
Thr Glu Asn Ser Gly Trp Ile Thr Gly Asp Val Pro Asp Thr Lys Glu 355 360 365 TAC TGC TGG AGT GTT GCT GGC CTT TTG GTG ACG GGC GAC TCG CAC CCA 1152
Tyr Cys Trp Ser Val Ala Gly Leu Leu Val Thr Gly Asp Ser His Pro 370 375 380 TTC CGG AAG AGG GGT GCT GTT CTG TGG GCC GGC GCG TTC AAC CTG ACA 1200
Phe Arg Lys Arg Gly Ala Val Leu Trp Ala Gly Ala Phe Asn Leu Thr 385 390 395 400 TGG ATC ATA GAC AAG GAG GCC GAT GTG TGC GCC GTG TTT GGA TCC AAC 1248
Trp Ile Ile Asp Lys Glu Ala Asp Val Cys Ala Val Phe Gly Ser Asn 405 410 415 TAC CAG CCG CCA GGC GAC CAG CAG GCA AGG CGC TGATGCGGCA GTGGGAGGAG 1301
Tyr Gln Pro Pro Gly Asp Gln Gln Ala Arg Arg 420 425 TTTGTCTACT CGCAAGCCAA GACGGCGAAG CTGTAGGCGG GAGGTATATG TCACAGTTTT 1361 GTCAAGTCTC AAGTTTGGAT AATATATTAA AAATGTAAAT TGCAGTAAAT TTCAAAAAAA 1421 AAAAAAAAAA ACTCGAGGGG GGGGGATCCG TCGGAAATAC AGGAACGCAC GCTGGATGGC 1481 CCTTCGCTGG GATGGTGAAA CCATGAAAAA TGGTAGCTTC AGTGGATTAA G 1532 2)配列番号2の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:427アミノ酸 (B)種類:アミノ酸 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:タンパク質 (xi)配列番号2: Met Thr Met Ile Thr Pro Ser Ser Ala Met Gly Met Ser Ser Thr Phe 1 5 10 15 Glu Phe Glu Arg Val Ile Thr Lys Ala Val Glu Asp Arg Val Ile Pro 20 25 30 Gly Val Val Leu Leu Ala Glu Asn Ser Ser Gly Ser Tyr His Tyr Glu 35 40 45 Lys Val Leu Gly Tyr Ser Ser Ile Glu Ala Gly Asn Glu Lys Lys Leu 50 55 60 Glu Arg Asp Ser Val Phe Thr Phe Met Ser Met Thr Lys Phe Ile Thr 65 70 75 80 Ala Ile Val Ala Met Gln Ala Val Glu Arg Gly Leu Trp Asp Leu Asp 85 90 95 Ala Asp Val Ala Pro Leu Leu Pro Glu Leu Ala Ala Leu Pro Val Leu 100 105 110 Lys Gly Phe Ser Asp Asp Gly Val Pro Glu Leu Val Pro Arg Glu Ser 115 120 125 Ala Ile Thr Leu Arg Gln Leu Leu Ser His Thr Ser Gly Ala Ala Tyr 130 135 140 Asp Phe Leu Ser Pro Asp Leu Ile Asn Tyr His Ala Trp Val Arg Lys 145 150 155 160 Gln Pro Pro Ser Ala Gly Leu Glu Gln Pro Pro Ala Met Thr Val Ala 165 170 175 Pro Pro Ser Val Glu Glu Arg Phe Arg Phe Pro Leu Val Phe Gln Pro 180 185 190 Gly Gln Gly Trp Gln Tyr Gly Ser Ser Leu Asp Trp Val Gly Arg Leu 195 200 205 Val Glu Ala Pro Gly Arg Gln Asp Thr Gly Ala Arg Leu Lys Lys Glu 210 215 220 Ala Gly Thr Lys Leu Pro Ser Val Pro Leu Glu Glu Ile Val Ile Arg 225 230 235 240 Asp Val Leu Thr Pro Leu Gly Leu Pro Ala Gly Ala Leu Thr Phe Ser 245 250 255 Pro Glu Arg Tyr Pro Asp Val Phe Ala Arg Met Trp Pro Ser Leu Pro 260 265 270 Val Arg Val Gly Asn Asn Gly Ala Leu Asp Gly Gly Pro Val Val His 275 280 285 Gly Pro Ser Val Tyr Lys Lys Ala Pro Ala Ala Leu Gly Gly Gln Gly 290 295 300 Met Tyr Gly Asp Met Pro Ser Phe Phe Lys Val Ala Leu Ser Ile Phe 305 310 315 320 Arg Asp Asp Gly Lys Leu Leu Lys Pro Glu Ser Thr Lys Leu Phe Phe 325 330 335 Glu Pro Gln Leu Ala Ser Lys Ala Ala His Ala Gly Ile Met His Gly 340 345 350 Thr Glu Asn Ser Gly Trp Ile Thr Gly Asp Val Pro Asp Thr Lys Glu 355 360 365 Tyr Cys Trp Ser Val Ala Gly Leu Leu Val Thr Gly Asp Ser His Pro 370 375 380 Phe Arg Lys Arg Gly Ala Val Leu Trp Ala Gly Ala Phe Asn Leu Thr 385 390 395 400 Trp Ile Ile Asp Lys Glu Ala Asp Val Cys Ala Val Phe Gly Ser Asn 405 410 415 Tyr Gln Pro Pro Gly Asp Gln Gln Ala Arg Arg 420 425 2)配列番号3の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:7アミノ酸 (B)種類:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:ペプチド (v)断片の種類:N末端 (xi)配列番号3: Lys Pro Pro Gln Thr Lys Lys 1 5 2)配列番号4の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (xi)配列番号4: AARCCNCCNC ARACNAARAA R 21 2)配列番号5の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:23塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (xi)配列番号5: AAAARCCNCC NCARACNAAR AAR 23 2)配列番号6の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:24塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (xi)配列番号6: AAAAARCCNC CNCARACNAA RAAR 24 2)配列番号7の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (ix)特徴: (A)名称/キー:misc difference (B)場所:置換(1..21、「n」) (C)他の情報:/標準名=「イノシトール」 (xi)配列番号7: AANCCNCCNC ANACNAANAA N 21 2)配列番号8の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:19塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (xi)配列番号8: ACCNCCNCAR ACNAARAAR 19 2)配列番号9の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:20塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide” (xi)配列番号9: GAYCARGCNC ARTTYAARCC 20 2)配列番号10の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:21塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide”
(xi)配列番号10: AGAYCARGCN CARTTYAARC C 21 2)配列番号11の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:22塩基対 (B)種類:核酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:他の核酸 (A)ディスクリプション: /desc=“Oligonucleotide”
(xi)配列番号11: AAGAYCARGC NCARTTYAAR CC 22 2)配列番号12の情報: (i)配列の種類: (A)長さ:7アミノ酸 (B)種類:アミノ酸 (C)鎖の数:一本鎖 (D)トポロジー:直鎖 (ii)分子の種類:ペプチド (v)断片の種類:N−末端 (xi)配列番号12: Asp Gln Ala Gln Trp Phe Lys 1 5
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 9/18 C12P 41/00 C12P 17/10 (C12N 1/19 41/00 C12R 1:66) //(C12N 1/19 C12N 15/00 ZNAA C12R 1:66) 5/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM ,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM) ,AL,AM,AT,AU,AZ,BA,BB,BG, BR,BY,CA,CH,CN,CU,CZ,DE,D K,EE,ES,FI,GB,GE,GH,GM,HR ,HU,ID,IL,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU,L V,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI, SK,SL,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,U S,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 ロバート・クリストファー・ブラウン イギリス、シービー4・4ダブリューイ ー、ケンブリッジ、ミルトン・ロード、ケ ンブリッジ・サイエンス・パーク、カイロ テック・テクノロジー・リミテッド (72)発明者 スティーブン・ジョン・クリフォード・テ イラー イギリス、シービー4・4ダブリューイ ー、ケンブリッジ、ミルトン・ロード、ケ ンブリッジ・サイエンス・パーク、カイロ テック・テクノロジー・リミテッド Fターム(参考) 4B024 AA03 BA11 CA01 DA06 HA01 4B050 CC03 DD03 LL05 4B064 AE48 CA02 CA05 CA19 CB03 CC24 4B065 AA26X AA60Y AB01 AC14 BD33 CA17 CA31

Claims (9)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 IMI375930として入手される微生物の特徴を有する
    微生物。
  2. 【請求項2】 ラセミ体のN-ベンゾイル-2-アゼチジンカルボン酸メチル エステルから少なくとも99%のエナンチオマー過剰率で(S)-N-ベンゾイル- 2-アゼチジンカルボン酸を生成する能力により特徴付けられる微生物。
  3. 【請求項3】 エステラーゼ活性を有する、請求項1記載の微生物から得ら
    れ得る酵素又は、同じ若しくは反対のエナンチオマー選択性を有するその断片。
  4. 【請求項4】 N-ベンゾイルアゼチジン-2-カルボン酸メチルエステルの エナンチオマーを加水分解することができる、配列番号2に示されるアミノ酸配
    列を含む酵素又はその断片。
  5. 【請求項5】 固定型の、請求項3又は請求項4に記載の酵素。
  6. 【請求項6】 請求項4記載の酵素をコードしている単離ヌクレオチド。
  7. 【請求項7】 配列番号1に示される配列の全部又は一部を有する、請求項
    6記載のヌクレオチド。
  8. 【請求項8】 請求項4記載の酵素を発現するよう形質転換された微生物。
  9. 【請求項9】 請求項1、2および8のいずれかに記載の微生物を培養する
    ことを含む、請求項3記載の酵素を製造するための方法。
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