HUT72842A - Multiple drug resistance gene of aureobasidium pullulans - Google Patents
Multiple drug resistance gene of aureobasidium pullulans Download PDFInfo
- Publication number
- HUT72842A HUT72842A HU9501115A HU9501115A HUT72842A HU T72842 A HUT72842 A HU T72842A HU 9501115 A HU9501115 A HU 9501115A HU 9501115 A HU9501115 A HU 9501115A HU T72842 A HUT72842 A HU T72842A
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- leu
- ser
- gly
- ile
- thr
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/37—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from fungi
Description
AMERIKAI EGYESÜLT ÁLLAMOK
A jelen találmány rekombináns DNS technológiával kapcsolatos. A találmány különösen, az Aureobasidium pullulans többszörös gyógyszer rezisztencia proteinjét kódoló nukleinsav klónozásával kapcsolatos.
A humán mdr-1 gén termék által közvetített többszörös gyógyszer rezisztenciát (multiple drog resistance = MDR) kezdetben a rák kemoterápiában felhasználha-2 r tó eszközök fejlesztése során észlelték (Fajo és munkatársai, 1987 Journal of Clinical Qncoloqy 5:1922-1927). Egy többszörös gyógyszer rezisztencia rákos sejtvonal számos citotoxikus vegyület magas szintje ellen mutat rezisztenciát. Gyakran ezek a citotoxikus vegyületek nem rendelkeznek közös szerkezeti tulajdonságokkal, valamint nem hatnak egymásra a sejtben levő közös céllal. Az ezen citotoxikus anyagokkal szembeni rezisztenciát egy kifelé irányuló ATP-függő pumpa közvetíti, mely pumpát az mdr-1 gén kódolja. Ezen mechanizmus révén, a sejten belül nem akkumulálódhat egy bizonyos citotoxikus vegyületek toxikus szintje.
Az MDR-szerű géneket számos eltérő organizmusban azonosították, ideértve számos baktérium fajt, a gyümölcslégy Drosophila melanogaster-t, Plasmodium falciparum-ot az élesztőgomba Saccharomyces cerevisiae-t, a Caenorhabditid elegans-t, a Leishmania donovanii-t, a tengeri szivacsokat, a növény Arabidopsis thaliana-t valamint a Homo sapiens-t is. A kiterjedt kutatás vegyületek számos csoportjáról kiderítette, hogy képes megváltoztatni a többszörös gyógyszer rezisztencia humán rákos sejt vonalak MDR fenotípusát érzékennyé téve ezeket a citotoxikus vegyületek hatásával szemben. Ezek a vegyületek - melyekre a találmányban MDR inhibitorokként utalunk - például a következőket foglalják magukba: a kálcium csatorna blokkolókat, az anti-arrhytmia szereket, a vérnyomáscsökkentő szereket, az antibiotikumokat, az antihisztaminokat, a lipofil kationokat, a diterpéneket, a detergenseket, a depressziót csökkentő szereket, és az antipsyhotikumokat (Gottesman and Pastan, 1993, Annual Review of Biochemistry 62:385-427). A humán MDR inhibitorok rák kemoterápiában való klinikai alkalmazása a kutatások fókuszába került.
Másik területen, bizonyos gomba fajok elleni gombaellenes vegyületek felfedezésével és fejlesztésével, szintén sikereket értek el. A Candida fajok képviselik a gombás fertőzések többségét, és az új gombaellenes vegyületekhez szkrinelési módszereket terveztek, melyekkel Candida ellenes vegyületeket lehet felfedezni. A gombaellenes szerek fejlesztése során az aktivitást általában a C. albicans elleni aktivitást alapul véve optimalizálták. Ennek következtében ezek a Candida ellenes vegyületek gyakran nem rendelkeznek klinikai szempontból jelentős aktivitással más gomba fajokkal szemben. Azonban, érdekes megjegyezni, hogy magasabb koncentrációkban bizonyos Candida ellenes vegyületek képesek más gomba fajokat is elpusztítani. Ez azt sugallja, hogy ezen Candida elleni vegyületek gombaellenes célja(i) jelen van(nak) ezekben a gomba fajokban is. Ezek az eredmények azt jelzik, hogy néhány gombafaj egy olyan természetes rezisztencia mechanizmussal rendelkezik, mely lehetővé teszi számukra, hogy gombaellenes vegyületek klinikailag alkalmazott koncentrációit is túléljék. A gombákban előforduló gombellenes vegyietekkel szembeni rezisztencia egy ilyen általános mechanizmusa még nem került leírásra.
A jelen találmányban leírásra kerül egy az Aureobasidium pullulans gombában levő MDR gén felfedezése. Az ezen gén által kódolt protein, melyet a találmány során AP-MDR-nek nevezünk, az MDR fenotípust biztosítja. A találmány biztosítja az AP-MDR-et kódoló izolált nukleinsav szekvenciát. Ezek a nukleinsav szekvenciák magukba foglalják a természetes DNS (dezoxiribonukleinsav) kódoló szekvenciát (a szekvencia listában szereplő 1. számú szekvencia részeként mutatjuk be), valamint bármely más izolált nukleinsav vegyületet, mely kódolja az AP-MDR-t. A találmány magába foglalja az AP-MDR-t kódoló nukleinsav szekvenciákat tartalmazó vektorokat és gazdasejteket. A jelen találmány továbbá az AP-MDR-t tisztított formában biztosítja. Az ΑΡ-MDR aminosav szekvenciáját a szekvencia lista 2. számú szekvenciájaként adjuk meg.
-4 A találmány egy másik megvalósulásában a találmány egy módszert biztosít a vegyület gomba MDR gátló aktivitásának meghatározására, mely a következőkkel jellemezhető:
a) egy élesztőgomba sejt tenyészetet szaporítunk, mely sejteket az AP-MDR expresszióját biztosító vektorral transzformáltuk (i) egy gombaellenes szer, mellyel szemben az említett élesztőgomba sejt rezisztens, de mellyel szemben az említett élesztőgomba sejt érzékeny ha nincs transzformált állapotban;
(ii) egy feltételezetten gomba MDR gátló aktivitással rendelkező vegyület jelenlétében; és
b) meghatározzuk az említett vegyület gomba MDR gátló aktivitását oly módon, hogy mérjük a gombaellenes szer említett élesztőgomba sejt növekedésére kifejtett gátló képességét.
A csatolt rajzon bemutatott restrikciós enzim hely és funkciós térkép egy megközelítő bemutatása a találmány során bemutatott pPSR3 plazmidnak, A restrikciós enzim hely információi nem teljesek. Egy adott típus több restrikciós enzim helye lehet a vektoron mint amennyit valójában bemutatunk a térképen.
1. ábra - A pPSR3 plazmid egy restrikziós enzim helye és funkciós térképe.
A találmány szerinti alkalmazásban az AP-MDR fogalma az Aureobasidium pullulans többszörös gyógyszer rezisztencia proteinjét jelenti.
A vektor kifejezés bármely némán replikálódó vagy integrálódó anyagot magába foglal, ideértve az ezekre való korlátozódás nélkül, a plazmidokat és a vírusokat (ideértve a fágokat is), melyek tartalmaznak egy olyan dezoxiribonukleinsav (DNS) molekulát, melyhez egy vagy több további DNS molekula adható. Ebbe a meghatározásba tartozik az expressziós vektor kifejezés is. A vektorokat vagy az «5 AP-MDR-t kódoló DNS vagy RNS amplifikálására és/vagy expresszálására használjuk vagy az AP-MDR-t kódoló DNS-sel vagy RNS-sel hibridizáló DNS vagy RNS amplifikálására.
Az expressziós vektor kifejezés olyan vektorokra utal, melyek tartalmaznak egy transzkripciós promotert (a későbbiekben promoter), valamint más egy az APMDR-t kódoló DNS szegment expressziójának irányítására pozícionált más szabályozó szekvenciát. A jelen találmány expressziós vektorai replikálható DNS szerkezetek, melyekben egy az AP-MDR-t kódoló DNS szekvencia működőképesen kapcsolódik megfelelő szabályozó szekvenciákhoz, melyek képesek az AP-MDR megfelelő gazdában való expressziójának befolyásolására. Ezek közé a megfelelő szabályozó szekvenciák közé tartoznak a promoterek, egy tetszés szerinti operátor szekvencia a transzkripció szabályozására, megfelelő mRNS riboszómális kötőhelyeket kódoló szekvencia és a transzkripció és transzláció terminációját szabályozó szekvenciák. A DNS régiók működőképesen kapcsolódnak amikor funkcionálisan kapcsolódnak egymáshoz. Például egy promoter működőképesen kapcsolódik egy DNS kódoló szekvenciához, ha szabályozza a szekvencia transzkripcióját, vagy egy riboszóma kötőhely működőképesen kapcsolódik egy kódoló szekvenciához ha úgy pozícionálták, hogy lehetővé tegye a transzlációt.
Az MDR gátló aktivitás kifejezés egy vegyület azon képességére utal, hogy egy gazdasejtben képes az MDR aktivitást gátolni, így megnövelheti a gombaellenes vegyület említett gazdasejt elleni gombaellenes aktivitását.
A jelen találmányban az AP-MDR szintetizálható az AP-MDR-t kódoló DNS expresszióját biztosító vektorokkal transzformált gazdasejtekkel. Az AP-MDR-t kódoló DNS lehet a természetes szekvencia, vegy lehet egy szintetikus szekvencia vagy lehet a kettő kombinációja (semi-szintetikus szekvencia). Ezen szekvenciák in vitro vagy in vivő transzkripciója és transzlációja eredményezi az AP-MDR termelését. Az
-6 AP-MDR-t kódoló szintetikus és szemi-szintetikus szekvenciák megszerkeszthetők a tudomány e területén jól ismert módszerekkel. Lásd Brown és munkatársai, (1979) Methods in Enzymoloqy, Academic Press, N.Y., 68:109-151. Az AP-MDR-t kódoló DNS vagy ennek részletei létrehozhatók egy hagyományos DNS szintetizáló készülék, mint amilyen az Applied Biosystems Model 380A vagy 380B DNS szintetizálok (a kereskedelemben beszerezhetők az Applied Biosystems, Inc.-tő, 850 Lincoln Center Drive, FosterCity, CA, 94404) segítségével.
A genetikai kód degeneráltságának köszönhetően a tudomány e területén jártas szakember felismeri, hogy számos, de meghatározott számú az AP-MDR-t kódoló DNS szekvencia szerkeszthető meg. Az összes ilyen DNS szekvenciát a jelen találmány biztosítja. Egy ilyen, az AP-MDR-t kódoló előnyben részesített DNS szekvencia az Aureobasidium pullulans természetes szekvenciája (1. számú szekvencia). Ezt a DNS szekvenciát előnyösen a pPSR3 plazmdiból nyerjük. A pPSR3 plazmid az Escherichia coli XL1-Blue/pPSR3 gazdasejtből nyerhető ki, melyet a Northern Régiónál Research Laboratory (NRRL) törzsgyűjteménynél deponáltak a United States Department of Agricultural Service-nél (1815 North University Street, Peoria, IL 61604) 1994 február 23-án és az NRRL B-21202 katalógusszámon szerezhető be. A pPSR3 plazmid restrikciós helyét és funkciós térképét a csatolt rajzok közöt az 1. ábraként mutatjuk be. Az AP-MDR-t kódoló DNS-t a pPSR3 plazmidból egy megközelítően 4,0 bázispár hosszúságú Sacl-Sphl restrikciós enzim fragmentről lehet kinyerni.
Az AP-MDR-t kódoló DNS transzlációjának befolyásolásához a természetes, szintetikus, vagy szemi-szintetikus AP-MDR-t kódoló DNS szekvenciát inzertáljuk a nagyszámú, megfelelő expressziós vektorok bármelyikébe megfelelő restrikciós endonukleázok és DNS ligázok felhasználásával. A szintetikus és szemi-szintetikus AP-MDR-t kódoló DNS AP-MDR-ek megtervezhetők és a természetes AP- MDR-t
-7 kódoló nukleinsavak módosíthatók oly módon, hogy tartalmazzanak restrikciós endonukleáz hasítási helyeket az ezen vektorokból való izolálás és az ezen vektorokba való integrálás elősegítése céljából. Az adott, alkalmazott restrikciós endonukleázokat a felhasznált expressziós vektor restrikciós endonukleáz hasítási módja határozza meg (irányítja). A restrikciós enzim helyek úgy kerülnek kiválasztásra, hogy megfelelően orientálják az AP-MDR-t kódoló DNS-t a szabályozó szekvenciákkal az AP-MDR molekula megfelelő in-frame (kereten belüli) transzkripciójának és transzlációjának eléréséhez. Az AP-MDR-t kódoló DNS-t úgy kell pozícionálni, hogy megfelelő leolvasási keretben legyen az expressziós vektor promoterével és riboszóma kötő helyével, melyek mindegyike működőképes abban a gazdasejtben, amelyben az AP-MDR-t expresszálni kívánjuk.
Az AP-MDR élesztőgomba sejtekben, mint Saccharomyces cerevisiae sejtekben való expresszálását előnyben részesítjük. Az élesztőgomba gazdával való használathoz megfelelő promoter magába foglalja a 3-foszfoglicerát kináz promotereit (a pAP12DB ATCC 53231 plazmidon találták meg, és az 1990 junius 19én iktatott 4,935,350 számú US szabadalomban került leírásra) vagy más glikolitikus enzimeket, mint az enoláz (a pAC1 ATCC 39532 plazmidon találták meg), a gliceraldehid-3-foszfát dehidrogenáz (a pHcGAPCI ATCC 57091 plazmidból származik), a hexokináz, piruvát dekarboxiláz, foszfofruktokináz, glükóz-6-foszfát izomeráz, 3-foszfoglicerát mutáz, piruvát kináz, triózfoszfát izomeráz, foszfoglükóz izomeráz és a glükokináz. Az indukálható élesztőgomba promoterek rendelkeznek azzal a további előnnyel, hogy a transzkripciót a szaporodás körülményei szabályozzák. Az ilyen promoterek közé tartoznak az alkohol dehidrogenáz 2, az izocitokróm C, a savas foszfatáz, a nitrogén metabolizmussal kapcsolatos lebontó enzimek a metallotionein ( a pCL28XhoLHBPV ATCC 39475 plazmid vektor tartalmazza, 4,840,896 számú US szabadalom) a gliceraldehid 3-foszfát dehidrogenáz és a mai
-8 - .......
tóz és galaktóz hasznosításért felelős enzimek (GAL1 a pRY121 ATCC 37658 és a pPSR3 plazmidokon találták meg) promoter régiói. Az élesztőgomba expresszióban való alkalmazáshoz megfelelő vektorokat és promotereket R. Hitzeman és munkatársai írták le a 73,657A számú Európai Szabadalmi Közleményben. Élesztőgomba enhancereket, mint amilyen a Saccharomyces cerevisiae-bő\ származó UAS Gál enhancer (a YEpsec-hHbeta, ATCC 67024, plazmidon a CYC1 promoterrel együtt találták meg) szintén előnyösen lehet alkalmazni az élesztőgomba promoterekkel együtt.
Számos a jelen találmányban használható expressziós vektor ismert a tudomány e területén. A Saccharomyces cerevisiae-ben való használathoz például az YRp7 plazmid (ATCC-40053, Stinchcomb és munkatársai, 1979, Natúré 282:39; Kingsman és munkatársai, 1979, Gene 7:141; Tschemper és munkatársai, 1980, Gene 10:157) általánosan alkalmazott. Ez a plazmid tartalmazza a trp gént, mely egy szelekciós markért biztosít a triptofán jelenlétében szaporodni nem képes mutáns élesztőgomba törzshöz, például az ATCC-44076 vagy a PEP4-1 (Jones, 1977, Genetics 85:12).
Az AP-MDR egy Saccharomyces cerevisiae gazdasejtben való expresszálásához előnyben részesített vektor a pPSRr plazmid. A pPSR3 plazmid a pYES-2 S. cerevisiae plazmidból származik, mely tartalmazza a S. cerevisiae GAL1 promoter régiót. A pYES-2 plazmid beszerezhető az Invitrogen Corp.-tól (Sorrento Valley Blvd., San Diego CA 92121) a 825-20 katalógusszámon. A pPSR3 plazmidot a következők szerint szerkesztjük meg. Genom DNS-t izolálunk az Aureobasidium pulllulans-ból, majd részleges emésztésnek vetjük alá a Sau3AI restrikciós enzimmel. Ezt a részlegesen emésztett DNS-t ligáljuk a SuperCos 1 cozmid klónozó vektorba (Stratagene, LaJolla CA, 92037). A kozmid kiónok egyike, a cR106-20A, egy olyan DNS fragmentet tartalmazott, mely magas szekvencia homológiát mutat a hu-9 mán mdr-1 génnel. A cR106-20A kozmidot a BstXI és Sphl restrikciós endonukleázokkal emésztjük. Ez az emésztés felszabadít egy megközelítően 4500 bázispár hosszúságú DNS fragmentet, mely tartalmazza teljes AP-MDR nyílt leolvasási keretet és az AP-MDR promotert. Ezt a megközelítően 4500 bázispár hosszúságú DNS fragmentet géltisztításnak vetjük alá standard eljárásokat használva. A pYES-2 plazmidot is BstXi-gyel és Sphl-gyel emésztjük és a megközelítően 4500 bázispár hosszúságú BstXI-Sphl DNS fragmentet - mely tartalmazza az AP-MDR gént - ebbe a vektorba ligáljuk egy köztes plazmid létrehozása céljából. Ezután a köztes plazmidot emésztjük EcoRI-gyel és Sacl-gyel az Aureobasidium pullulans APMDR promoter régió eltávolítása céljából. Az AP-MDR nyílt leolvasási keretet tartalmazó kívánt vektor fragmentet a restrikciós endonukleáz emésztés által felszabadított fragmentektől géltisztítjuk. A kivágott régiót egy polimeráz lánc reakcióval (PCR) létrehozott DNS fragmenttel helyettesítjük, mely juxta pozícióba hozta az AP-MDR nyílt leolvasási keretet a pYES-2 plazmidból származó köztes plazmid Saccharomyces cerevisiae GAL1 promoterével.
A PCR fragmentet templátként a CR106-20A kozmidot felhasználva hozzuk létre a következő primereket használva:
5'-ACGCGAGATCTTCTCTCCAGTCAATCCCCACGCAATTGC-3' (3. számú szekvencia) és
5'-CCTGCGTCATCTTCAAGGGCGAGCTCATTCGGGTTCAAGAATCTTC-3' (4. számú szekvencia). A PCR fragmentet Sacl-gyel és EcoRI-gyel emésztjük és géltisztítjuk. A géltisztított fragmentet ezután A fenti EcoRI-Sacl-gyel emésztett köztes plazmidhoz ligáljuk. Ez az eljárás az AP-MDR nyílt leolvasási keretet megfelelő sorrendbe hozza a Saccharomyces cerevisiae GAL1 promoterével. A kapott plazmidot pPSR3 plazmidnak hívjuk. A pPSR3 plazmid hasznos az AP-MDR S. cerevisiae-ben való expressziójában.
-10A pPSR3 plazmid bemutatását az 1. ábrán adjuk meg. Ahogy fent említettük, ez a plazmid az AP-MDR-t kódoló DNS-t a Saccharomyces cerevisiae GAL1 promoterhez működőképesen kapcsolva tartalmazza (PgaH). A pPSR3 plazmid a cyc 1 élesztőgomba transzkripciós terminátort is tartalmazza az AP-MDR-t kódoló DNS 3' vége felé pozícionálva. A pPSR3 plazmid továbbá tartalmazza a ColE1 replikációs origót is (ColE1 őri), ami lehetővé teszi az Escherichia coli gazdasejtben való replikációt és az ampicillin rezisztencia gént (Amp) a plazmiddal transzformált és ampicillin jelenlétében szaporított E. coli sejtek szelektálását lehetővé téve. A pPSR3 plazmid továbbá tartalmazza az élesztőgomba 2μ replikációs origót (2μ őri) is, ami lehetővé teszi az élesztőgomba gazdasejtben való expressziót és az élesztőgomba URA3 gént az uracilt nem tartalmazó tápközegben szaporított a plazmidot tartalmazó S. cerevisiae szelekcióját lehetővé téve.
A jelen találmány tartalmaz egy olyan módszert is, mellyel egy az AP-MDR expresszálására képes rekombináns gazda sejtet lehet megszerkeszteni. Az említett módszer abból áll, hogy egy gazdasejtet egy az AP-MDR-t kódoló izolált DNS szekvenciát tartalmazó rekombináns DNS vektorral transzformálunk A jelen találmány továbbá magába foglal egy olyan módszert is, mely révén az AP-MDR expresszálását biztosítani képes vektorral transzformált rekombináns gazdasejtben az AP-MDR-t expresszáljuk; az említett módszer magába foglalja az említett transzformált gazdasejtek az expressziónak megfelelő körülmények közötti tenyésztését.
A találmány egy előnyben részesített megvalósulásában Saccharomyces cerevisiae INVScl vagy INVSc2 sejteket (beszerezhetők az Invitrogen Corp.-től, Sorrento Valley Blvd., San Diego CA 92121) használunk gazdasejtekként, de számos más sejtvonal felhasználható erre a célra. A transzformált gazdasejteket egy megfelelő táptalajra szélesztjük szelekciós nyomás alatt (uracilt nem tartalmazó mi-
nimál táptalaj). A tenyészeteket ezután az alkalmazott gazdasejtvonal számára megfelelő ideig és hőmérsékleten inkubáljuk.
Az élesztőgomba sejtek, mint a Saccharomyces cerevisiae sejtek, transzformálására használt technikák jól ismertek a tudomány e területén és megtalálhatók az olyan általános művekben mint az Ausubel és munkatársai, Current Protocols in Molecular Biology (1989), John Wiley & Sons, Now York, N.Y. és kiegészítőiben. A transzformált élesztőgomba tenyésztéséhez használt pontos körülmények az élesztőgomba sejtvonal természetétől és az alkalmazott vektoroktól függnek.
Az AP-MDR a transzformált gazdasejtekből általános membrán kötött protein izolálási és tisztítási technikákkal izolálható és tisztítható, mely technikák jól ismertek a tudomány e területén átlagosan képzett szakember számára. Az izolált AP-MDR hasznos a szerkezet-alapú gyógyszer tervezési kísérletekben, az in vitro kötési vizsgálatokban és a poliklonális és monoklonális antitestek előállításában.
Az AP-MDR rekombináns DNS termelésének egy alternatívája a szilárd fázisú peptidszintézissel való szintézis. Ezt az eljárást a 4,617,149 számú US szabadalomban írták le, mely szabadalom a hivatkozás révén részét képezi a találmánynak. A polipeptidek szilárd fázisú kémiai szintézisének elvei jól ismertek a tudomány területén és megtalálhatók a tudomány általános irodalmában, pl. Dugas, H. and Penney, C., Bioorganic Chemistry (1981) Springer-Verlag, New York p54-92. Azonban a rekombináns eljárások előnyben részesülnek.
Az AP-MDR-t kódoló nukleinsav, RNS vagy DNS, vagy ezek része szintén hasznos lehet az AP-MDR mRNS, AP-MDR cDNS (komplementer DNS) vagy genom DNS diagnosztikai vizsgálatában felhasználható nukleinsav molekulák előállításában. Továbbá, az AP-MDR-t nem kódoló RNS vagy DNS nukleinsav, mely azonban képes az AP-MDR-t kódoló DNS-hez vagy RNS-hez hibridizálódni szintén hasznos lehet az ilyen diagnoisztikai vizsgálatokban. Ezek a nukleinsav molekulák ismert
-12módszerekkel jelölhetők kovalensen egy detektálható egységgel, mint egy fluoreszcensz csoporttal, egy radioaktív atommal vagy egy kemilumineszcensz csoporttal. Ezután a jelölt nukleinsav felhasználható hagyományos hibridizációs vizsgálatokban, mint pl. a Southern vagy a Northern hibridizációs vizsgálatokban, vagy polimeráz láncreakciós vizsgálatokban (PCR) a hibridizáló DNS, cDNS vagy RNS molekulák azonosítására. A PCR vizsgálat elvégezhető jelöletlen nukleinsav molekulákkal is. Az ilyen vizsgálatok az AP-MDR vektorok és transzformán sok azonosítására használhatók, valamint in vitro diagnózisban más organizmusokból származó AP-MDR-szerű mRNS, cDNS vagy genom DNS detektálására.
A 08/111680 számú US Szabadalmi Alkalmazás (mely a hivatkozás révén teljes egészében része a találmánynak) leírja a kombinálási terápia alkalmazását, mely magába foglalja egy igazolt aktivitás spektrummal rendelkező gombellenes anyag egy gomba MDR inhibitorral együtt gombás fertőzés elleni alkalmazását. Ez a kombinációs terápiás megközelítés lehetővé teszi a korábban csak korlátozott klinikailag alkalmazható gombaellenes aktivitást mutató adott gombaellenes vegyület gombaellenes aktivitási spektumának kiszélesítését. Hasonlóképpen, a demonstráltan gombaellenes aktivitással rendelkező vegyületek hatásossá tehetők egy gomba MDR inhibitorral oly módon, hogy ezen vegyületek gombaellenes aktivitása kiterjed a korábban rezisztens fajokra is. Az ilyen kombinációs terápiában hasznos vegyületek azonosítására a jelen találmány egy vizsgálati módszert biztosít az MDR gátló aktivitással rendelkező vegyületek azonosítására. Az AP-MDR-t expresszáló gazdasejtek kiváló eszközt biztosítanak a gomba MDR aktivitás inhibitoraiként hasznos vegyületek azonosításában. Általában a vizsgálat olyan élesztőgomba sejt tenyészetet hasznosít, melyet az AP-MDR expresszióját biztosító vektorral transzformáltunk. A gazdasejt általi AP-MDR expresszió lehetővé teszi a gazdasejt számára, hogy a gombaellenes vegyület jelenlétében szaporodjon, mellyel szemben a nem transz-13-
formált állapotban levő sejtek azonban érzékenyek. így a transzformált élesztőgomba sejttenyészetet i) egy gombaellenes anyag - mellyel szemben a nem transzformált élesztőgomba sejt érzékeny, de mellyel szemben a transzformált gazdasejt rezisztens - és ii) egy vegyület - mely feltételezetten MDR inhibitor - jelenlétében szaporítjuk. A feltételezett MDR inhibitor hatását úgy mérjük, hogy teszteljük, hogy a gombaellenes vegyület képes-e gátolni a transzformált élesztőgomba sejt szaporodását. Ez a gátlás akkor fordul elő, ha a feltételezett MDR inhibitor gátolja az APMDR azon képességét, hogy megakadályozza a gombaellenes vegyület élesztőgomba sejtre való hatását. Egy ilyen vizsgálatra illusztratív példa a 3. példa.
A találmány működésének még teljesebb bemutatására a következő példákat mutatjuk be, melyekkel nem szándékoztunk a találmány oltalmi körét korlátozni.
1. Példa
Az Aureobasidium pullulans MDR-t kódoló DNS-ének forrása
A pPSR3 plazmid izolálása
Az Escherichia coli XL1-Blue/pPSR3 liofilezett formáját a Northern Régiónál REsearch Laboratories-tól (NRRL)(Peoria, Illinois 61604) szerezzük be az NRRL B-21202 katalógusszámon. A pPSR3 plazmid az NRRL B-21202-ből izolálható a tudomány e területén képzett szakembere számára jól ismert technikákat használva. Lásd Sambrook és munkatársai, Molecular Cloning: A Laboratory Manual (1988), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY vagy Ausubel és munkatársai, Current Protocols in Molecular Biology (1989) John Wiley & Sons, New York, NY és a mellékletek.
• ·
2. példa
Az AP-MDR protein expresziója
Saccharomyces cerevisiae sejteket (Invitrogen Corp., San Diego CA 92191) a pPSR3 plazmiddal transzformáljuk a J.D. Beggs (1988, Natúré 275:104-109) által leírt technikát használva. A transzformált élesztőgomba sejteket YNB/CSM-Ura/raf (4 % raffinózzal kiegészített YNB/CSM-Ura [CSM-URA-val kiegészített (Bio 101, Inc) Yeast Nitrogéné Base (Difco Laboratories, Detroit, Ml)] táplevesben szaporítjuk 28 °C hőmérsékleten rázó inkubátorban, addig, míg a tápleves sejtekkel nem telítődik. Az AP-MDR expressziójának indukálásához a tenyészet egy részével szénforrásként raffinóz helyett inkább 2 % galaktózzal (YNB/CSM- Ura/gal) kiegészített YNB/CSM-Ura táplevest tartalmazó lombikot inokulálunk. Az inokulált lombikot 28 °C hőmérsékleten kb 16 órán keresztül inkubáljuk.
3. példa
Gombaellenesséqet kialakító vizsgálat
Megközelítően 1x10® Saccharomyces cerevisiae INVSc1/pPSR3 tenyészetet adunk az YNB/CSM-Ura/gal-t tartalmazó számos agarlemez mindegyikére. Az agar felszínét megszárítjuk egy bioprotektív burkolat alatt. A Saccharomyces cerevisiae INVSc1/pPSR3 sejtek expresszálják az AP-MDR aktivitást.
Egy olyan gombaellenes vegyületet, mellyel szemben a nem transzformált élesztőgomba sejt tipikusan érzékeny, mint pl. az R106I (5,057,493 számú US szabadalom, mely a hivatkozás révén része a találmánynak) 100 % etanolban feloldunk 1 vagy 7 mg/ml koncentrációban. Az 1 mg/ml koncentrációjú oldat 20 pl mennyiségét egy antibiotikum érzékeny teszt korongra helyezzük (Difco Laboratories, Detroit, Ml). A gombaellenes oldat hozzáadása után a korongot levegőn megszárítjuk egy » *· «*, ·♦*· · »» .· ··: .« : ' .· ···· ·» ; · ·
-15bioprotektív burkolat alatt. Ha a korong száraz egy Saccharomyces cerevisiae INVSc1/pPSR3 sejteket tartalmazó petri csésze felszínére helyezzük.
Az AP-MDR gátlásának képességére tesztelendő vegyületeket feloldjuk dimetil-szulfoxidban (DMSO). A DMSO-hoz adott vegyület mennyisége az egyes tesztelendő vegyület oldékonyságától függ. A tesztelendő vegyületet tartalmazó szuszpenzió 20 pl mennyiségét egy antibiotikum érzékenységi teszt lemezre (Difco Laboratories, Detroit, Ml) helyezzük. Az teszt vegyületet tartalmazó korongot levegőn bioprotektív burkolat alatt hagyjuk megszáradni. Ezután a korongot a Saccharomyces cerevisiae INVSc1/pPSR3 sejteket tartalmazó száraz petri lemezek felszínére helyezzük kb. 2 cm távolságra a gombaellenes anyagot tartalmazó korongtól. A kétféle korongot tartalmazó petri csészéket 28 °C hőmérsékleten inkubáljuk kb. 16 órán keresztül.
Ezen inkubációs periódus után a petri csészéket megvizsgáljuk a korongok körüli szaporodás gátlási zóna jelenlétére. A szaporodás gátlási zóna a teszt lemezen a gombaellenes anyagot tartalmazó korong közelében azt jelzi, hogy az MDR gátló aktivitásra tesztelendő vegyület blokkolja az AP-MDR aktivitását és lehetővé teszi, hogy a gombaellenes vegyület gátolja az élesztőgomba gazdasejt szaporodását. Az ilyen vegyületekről azt mondjuk, hogy MDR gátló aktivitással rendelkeznek. A kis zóna, vagy a szaporodás gátlási zóna hiánya azt jelzi, hogy a teszt vegyület nem blokkolja az MDR aktivitást és így az AP-MDR számára lehetővé válik, hogy hatással legyen a gombaellenes vegyületre, megakadályozva annak a gazdasejtre kifejtett aktivitását.
• •••a
SZEKVENCIA LISTA (1) ÁLTALÁNOS INFORMÁCIÓ:
(i) FELTALÁLÓ: Perry, Róbert B.
Skatrud, Paul L.
(ii) A TALÁLMÁNY CÍME: Többszörös gyógyszerrezisztencia gén
Aureobasidium pullulansból (iii) A SZEKVENCIÁK SZÁMA: 4 (iv) LEVELEZÉSI CÍM:
(A) CÍMZETT: Éli Lilly and Company (B) UTCA: Lilly Corporate Center (C) VÁROS: Indianapolis (D) ÁLLAM: Indiana (E) ORSZÁG: USA (F) IRÁNYÍTÓSZÁM: 46285 (v) SZÁMÍTÓGÉPES OLVASÁSI FORMA:
(A) A HORDOZÓ TÍPUSA: Floppy disk (B) SZÁMÍTÓGÉP: IBM PC kompatibilis (C) OPERÁCIÓS RENDSZER:: PC-DOS/MS-DOS (D) SOFTWARE: Patentln Release #1.0, #1.25 verzió (vi) A JELEN ALKALMAZÁS ADATAI:
(A) ALKALMAZÁSI SZÁM:
(B) IKTATÁSI DÁTUM:
(C) OSZTÁLYOZÁS:
(viii) ÜGYVÉDI/IRODA ADATOK:
(A) NÉV: Plánt, Thomas G.
(B) REGISZTRÁCIÓS SZÁM: 35,784 (C) REFERENCIA/DOKUMENTUM SZÁM: X9212 (ix) TELEKOMMUNIKÁCIÓS ADATOK:
(A) TELEFON: 317-276-2459 (B) TELEFAX: 317-276-1917 (2) AZ 1. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 3909 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLTÍPUS: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (xi) AZ 1. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ATG Met 1 | TCT Ser | TCT Ser | GCC Alá | GAC Asp 5 | GGC Gly | AGA Arg | CGA Arg | ACA Thr | GTT Val 10 | TCA Ser | TCT Ser | GAT Asp | TAT Tyr | GGC Gly 15 | CAT His | 48 |
CCA | CGA | CCT | TCA | ATG | GCC | AAC | GTC | GAA | GCG | GAT | CAC | AAC | TTT | GAG | ACG | 96 |
Pro | Arg | Pro | Ser | Met | Alá | Asn | Val | Glu | Alá | Asp | His | Asn | Phe | Glu | Thr | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
ACG | ACT | TTG | AAT | TCT | GCT | CAA | CCG | CGA | TCA | TGG | CAC | ACT | GAG | TTT | GTC | 144 |
Thr | Thr | Leu | Asn | Ser | Alá | Gin | Pro | Arg | Ser | Trp | His | Thr | Glu | Phe | Val | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
TTC | GTC | TCC | CGG | AAA | TTG | ATT | CAA | CAA | ATT | CTT | GGT | AAA | AAT | CCG | TTC | 192 |
Phe | Val | Ser | Arg | Lys | Leu | Ile | Gin | Gin | Ile | Leu | Gly | Lys | Asn | Pro | Phe | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
AAG | AGT | TCA | TAT | CTG | GAT | TTG | TTC | AAG | CTT | GTC | AAC | GAT | GCG | AAG | TCG | 240 |
Lys | Ser | Ser | Tyr | Leu | Asp | Leu | Phe | Lys | Leu | Val | Asn | Asp | Alá | Lys | Ser | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
AAG | GCC | GTT | CTT | TGG | GCT | GGC | ATA | CTG | TTG | GCA | ATA | GCT | GCT | GGT | TGT | 288 |
Lys | Alá | Val | Leu | Trp | Alá | Gly | Ile | Leu | Leu | Alá | Ile | Alá | Alá | Gly | Cys | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
CCA | TTG | CCC | ATC | ATT | GGC | TAT | ATT | TTC | GGC | CAG | ATC | ATT | ACT | TCT | TTC | 336 |
Pro | Leu | Pro | Ile | Ile | Gly | Tyr | Ile | Phe | Gly | Gin | Ile | 11 | Thr | Ser | Phe | |
100 | 105 | 110 | ||||||||||||||
CCG | CCT | CCG | GAA | GAT | GTT | CTG | CGA | GAT | AGA | CTG | TAT | CAG | CTT | GTT | GGT | 384 |
Pro | Pro | Pro | Glu | Asp | Val | Leu | Arg | Asp | Arg | Leu | Tyr | Gin | Leu | Val | Gly | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
GTC | GCT | TGT | GGC | TAC | TTT | ATC | GTT | ACG | ACT | GGA | TAT | GCA | ATT | GCG | TGG | 432 |
Val | Alá | Cys | Gly | Tyr | Phe | Ile | Val | Thr | Thr | Gly | Tyr | Alá | Ile | Alá | Trp | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
GGA | TTG | ACT | GGA | GAG | AAG | ATC | TCG | CGT | CGT | TTT | CGA | GAA | ACG | CTT | GTT | 480 |
Gly | Leu | Thr | Gly | Glu | Lys | Ile | Ser | Arg | Arg | Phe | Arg | Glu | Thr | Leu | Val | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
GAG | CGC | CTG | CTT | GGT | CTT | GAG | CAG | GCA | TAC | TTC | GAC | ATC | AAA | GAT | CCA | 528 |
Glu | Arg | Leu | Leu | Gly | Leu | Glu | Gin | Alá | Tyr | Phe | Asp | Ile | Lys | Asp | Pro | |
165 | 170 | 175 | ||||||||||||||
GAC | ATT | ACG | AAC | CTT | CTG | ACC | GAG | AAG | ATT | GAA | GCG | ATC | CAG | ATA | GGA | 576 |
Asp | Ile | Thr | Asn | Leu | Leu | Thr | Glu | Lys | Ile | Glu | Alá | Ile | Gin | Ile | Gly | |
180 | 185 | 190 | ||||||||||||||
ACA | TCT | GAA | AAA | GTC | GGC | ATA | TTC | ATC | CAG | TCG | ATC | AGC | TAC | TTC | GTT | 624 |
Thr | Ser | Glu | Lys | Val | Gly | Ile | Phe | Ile | Gin | Ser | Ile | Ser | Tyr | Phe | Val | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
GCT | GCC | TTT | ATT | GTT | GGG | TTC | ATC | TTG | AAC | GCC | AAA | CTC | ACC | GGT | ATT | 672 |
Alá | Alá 210 | Phe | Ile | Val | Gly | Phe 215 | Ile | Leu | Asn | Alá | Lys 220 | Leu | Thr | Gly | Ile | |
CTA | TTC | GCT | GCC | GTC | ATA | CCT | CTC | ATG | GCT | TTG | ATC | GTT | ACT | GTC | GGC | 720 |
Leu | Phe | Alá | Alá | Val | Ile | Pro | Leu | Met | Alá | Leu | Ile | Val | Thr | Val | Gly | |
225 | 230 | 235 | 240 | |||||||||||||
TCC | TCC | AGA | ATC | GCA | AAG | TAC | ACC | AAA | GCA | GCC | ACC | GAA | TAC | ACC | GAA | 768 |
Ser | Ser | Arg | Ile | Alá | Lys | Tyr | Thr | Lys | Alá | Alá | Thr | Glu | Tyr | Thr | Glu | |
245 | 250 | 255 | ||||||||||||||
GCC | GCT | GGA | AGG | ATC | GCT | GAA | AGT | GCT | ATC | CAT | GCT | GTC | AAG | GTT | GTG | 816 |
Alá | Alá | Gly | Arg | Ile | Alá | G1U | Ser | Alá | Ile | His | Alá | Val | Lys | Val | Val | |
250 | 265 | 270 | ||||||||||||||
CAG | GCT | TTT | GGC | ATG | GCC | GAA | AAT | CTC | AGC | AAA | GAA | CAC | TAC | CGT | CTG | 864 |
Gin | Alá | Phe | Gly | Met | Alá | Glu | Asn | Leu | Ser | Lys | Glu | His | Tyr | Arg | Leu | |
275 | 280 | 285 | ||||||||||||||
CTC | AAA | CTG | TCT | GCA | AGA | TAC | GCC | ATC | CGG | AAG | TCA | GTT | TCT | GCT | GCG | 912 |
Leu | Lys | Leu | Ser | Alá | Arg | Tyr | Alá | Ile | Arg | Lys | Ser | Val | Ser | Alá | Alá | |
290 | 295 | 300 | ||||||||||||||
TTC | ATG | CTT | GGC | TTG | GTC | TAT | TTT | ACT | GCT | TAC | AGT | GCC | AAT | GCG | CTT | 960 |
Phe | Met | Leu | Gly | Leu | Val | Tyr | Phe | Thr | Alá | Tyr | Ser | Alá | Asn | Alá | Leu | |
305 | 310 | 315 | 320 | |||||||||||||
GCC | rpmq-» | TGG | GAG | GGC | TCA | CGT | CTC | GCT | GCA | GAA | TCT | GGC | TCA | AAC | AAT | 1008 |
Alá | ?4;e | Trp | Glu | Gly | Ser | Arg | Leu | Alá | Alá | Glu | Ser | Gly | Ser | Asn | Asn | |
325 | 330 | 335 | ||||||||||||||
GCT | GGT | ACC | GTC | TAT | GCC | GTG | GTC | TTC | TTG | ATT | ATA | GAC | GCT | TCG | TTT | 1056 |
Alá | Gly | Thr | Val | Tyr | Alá | Val | Val | Phe | Leu | Ile | Ile | Asp | Alá | Ser | Phe | |
340 | 345 | 350 | ||||||||||||||
GTT | GTC | GGC | CAA | TTT | GGA | CCA | TTC | CTT | GGT | AGC | TTC | GCC | ACC | GCT | GCA | 1104 |
Val | Val | Gly | Gin | Phe | Gly | Pro | Phe | Leu | Gly | Ser | Phe | Alá | Thr | Alá | Alá | |
355 | 360 | 365 | ||||||||||||||
GCT | GCT | GGA | GAA | AGT | GTT | TAC | GAA | ATC | CTC | AAC | CAT | CCA | CAG | TCT | GAA | 1152 |
Alá | Alá | Gly | Glu | Ser | Val | Tyr | Glu | Ile | Leu | Asn | His | Pro | Gin | Ser | Glu | |
370 | 375 | 380 | ||||||||||||||
ATC | AAC | GTC | TAC | TCG | GAG | GCT | GGG | CAA | GAA | GCC | ACA | GAG | AGC | GAC | ATG | 1200 |
Ile | Asn | Val | Tyr | Ser | Glu | Alá | Gly | Gin | Glu | Alá | Thr | Glu | Ser | Asp | Met | |
385 | 390 | 395 | 400 | |||||||||||||
AAA | GCT | GAT | TTG | GTC | TTT | CGC | AAT | GTC | ACA | TTT | GTT | TAT | CCC | GCG | AGG | 1248 |
Lys | Alá | Asp | Leu | Val | Phe | Arg | Asn | Val | Thr | Phe | Val | Tyr | Pro | Alá | Arg | |
405 | 410 | 415 | ||||||||||||||
ACA | TCT | GCT | CGT | GCT | CTG | GAA | GAG | ATG | AGT | CTT | ATC | CTC | AAA | GCC | GGA | 1296 |
Thr | Ser | Alá | Arg | Alá | Leu | Glu | Glu | Met | Ser | Leu | Ile | Leu | Lys | Alá | Gly | |
420 | 425 | 430 | ||||||||||||||
CAG | ATG | AAC | GCG | ATT | GTC | GGC | ACG | AGT | GGT | TGC | GGC | AAA | AGC | ACT | CTT | 1344 |
Gin | Met | Asn | Alá | Ile | Val | Gly | Thr | Ser | Gly | Cys | Gly | Lys | Ser | Thr | Leu |
435 | 440 | 445 | ||||||||||||||
GTG | TCT | CTG | CTC | TTG | AGG | CTG | TAC | GAC | ATA | TCC | TCT | GGT | CAA | TTG | ACA | 1392 |
Val | Ser | Leu | Leu | Leu | Arg | Leu | Tyr | Asp | Ile | Ser | Ser | Gly | Gin | Leu | Thr | |
450 | 455 | 460 | ||||||||||||||
ΑΤΑ | GGA | AGC | CAT | GAT | ATC | AAG | GAC | TTC | AAC | GTA | AGG | AGT | TTG | AGA | AAA | 1440 |
Ile | Gly | Ser | Hís | Asp | Ile | Lys | Asp | Phe | Asn | Val | Arg | Ser | Leu | Arg | Lvs | |
465 | 470 | 475 | 480 | |||||||||||||
TAC | ACA | GCC | CTG | GTA | GAC | CAA | GAC | TCT | GTC | CTG | TTC | TCT | GGT | TCG | GTC | 1488 |
Tyr | Thr | Alá | Leu | Val | Asp | Gin | Asp | Ser | Val | Leu | Phe | Ser | Gly | Ser | Val | |
485 | 490 | 495 | ||||||||||||||
CTT | GAA | AAC | ATC | AGT | TAT | GGA | CTT | GGT | GAA | CAT | TCA | TTA | TCA | GAC | GAT | 1536 |
Leu | Glu | Asn | Ile | Ser | Tvr | Gly | Leu | Gly | Glu | Hís | Ser | Leu | Ser | Asp | Asp | |
500 | 505 | 510 | ||||||||||||||
GTT | GTC | TTG | GAG | AGG | TGT | ACT | GAG | GCT | GCG | AAA | GCT | GCC | AAC | CTG | GAC | 1584 |
Val | Val | Leu | Glu | Arg | Cys | Thr | G1U | Alá | Alá | Lys | Alá | Alá | Asn | Leu | Asp | |
515 | 520 | 525 | ||||||||||||||
TTT | GTC | GAC | TTC | TTG | CCA | CAG | GGT | ATT | CAC | ACG | CGA | ATC | GGT | AAT | GGT | 1632 |
Phe | Val | Asp | Phe | Leu | Pro | Gin | Gly | Ile | Hís | Thr | Arg | Ile | Gly | Asn | Gly | |
530 | 535 | 540 | ||||||||||||||
GGC | TAT | ACG | AGT | CTC | TCG | GGT | GGT | CAG | AAC | CAG | AGG | ATT | TGC | TTG | GCT | 1680 |
Gly | Tyr | Thr | Ser | Leu | Ser | Gly | Gly | Gin | Asn | Gin | Arg | Ile | Cys | Leu | Alá | |
545 | 550 | 555 | 560 | |||||||||||||
CGA | GCC | CTG | GTC | AAG | AAG | GCT | GCT | CTA | CTT | CTG | CTA | GAT | GAG | CCG | ACC | 1728 |
Arg | Alá | Leu | Val | Lys | Lys | Pro | Alá | Leu | Leu | Leu | Leu | Asp | Glu | Pro | Thr | |
565 | 570 | 575 | ||||||||||||||
GCG | GCC | CTC | GAC | GCA | AAC | AGC | GAA | GGA | CTT | ATC | ATG | GAC | GCC | GTC | AAA | 1776 |
Alá | Alá | Leu | Asp | Alá | Asn | Ser | Glu | Gly | Leu | Ile | Met | Asp | Alá | Val | Lys | |
580 | 585 | 590 | ||||||||||||||
AGC | GTG | GCT | GCC | ACA | GGC | ACA | ACA | GTG | GTC | ATG | GTA | GCG | CAC | CGA | CTC | 1824 |
Ser | Val | Alá | Alá | Thr | Gly | Thr | Thr | Val | Val | Met | Val | Alá | Hís | Arg | Leu | |
595 | 600 | 605 | ||||||||||||||
TCC | ACT | GTG | TCA | GAC | TCG | CCC | AAC | ATC | GTG | CTC | ATG | GGT | GCA | GGC | AAG | 1872 |
Ser | Thr | Val | Ser | Asp | Ser | Pro | Asn | Ile | Val | Leu | Met | Gly | Alá | Gly | Lys | |
610 | 615 | 620 | ||||||||||||||
GTC | ATT | GAG | CAA | GGA | AAC | CAT | GAT | GAA | CTC | ATG | CAG | TTG | GAA | GGC | GCC | 1920 |
Val | Ile | Glu | Gin | Gly | Asn | Hís | Asp | Glu | Leu | Met | Gin | Leu | Glu | Gly | Alá | |
625 | 630 | 635 | 640 | |||||||||||||
TAC | TTC | AAT | CTT | ATC | CAG | GCG | CAA | CAA | CTA | AAT | GAT | GCA | GAT | GAG | TCA | 1968 |
Tyr | Phe | Asn | Leu | Ile | Gin | Alá | Gin | Gin | Leu | Asn | Asp | Alá | Asp | Glu | Ser | |
645 | 650 | 655 | ||||||||||||||
TCG | GCA | GAG | GTA | TCT | GCA | GCA | ACC | ACC | AGT | CAA | GTC | ACC | CCA | CAA | AAA | 2016 |
Ser | Alá | G1U | Val | Ser | Alá | Alá | Thr | Thr | Ser | Gin | Val | Thr | Pro | Gin | Lys | |
660 | 665 | 670 |
GCA Alá | AGC Ser | AAG Lys 675 | TCC Ser | GAA Glu | GAT Asp | TCG Ser | GCT Alá 680 | GCT Alá | rp <-«/-· Ser | AGT Ser | GAC Asp | ACC Thr 685 | GAG Glu | AGG | GTG Val | 2064 |
CCT | CCA | CAG | GCG | AAG | AAG | GAA | GAC | AAG | CCA | GCC | AAA | AAG | GCT | CGA | TTC | 2112 |
Pro | Pro | Gin | Alá | Lys | Lys | Glu | Asp | Lys | Pro | Alá | Lys | Lys | Alá | Gly | Phe | |
690 | 695 | 700 | ||||||||||||||
TGG | AAG | CTC | CTT | TTG | AGA | TGT | TTG | CGT | CTA | GCC | AAA | TCC | GAC | TCG | CCC | 2160 |
Trp | Lys | Leu | Leu | Leu | Arg | Cys | Leu | Arg | Leu | Alá | Lys | Ser | Asp | Ser | Pro | |
705 | 710 | 715 | 720 | |||||||||||||
ATC | ATC | GCT | CTG | GGT | CTC | GCT | GCC | TCA | ATC | GTA | TCG | GGT | GGC | ATC | ATT | 2208 |
Ile | Ile | Alá | Leu | Gly | Leu | Alá | Alá | Ser | Ile | Val | Ser | Gly | Gly | Ile | Ile | |
725 | 730 | 735 | ||||||||||||||
CTC | GGC | GAA | GCC | ATC | GTC | TTC | GGC | AAC | CTC | ATC | TCG | GTG | CTG | AAC | GAT | 2256 |
Leu | Gly | Glu | Alá | Ile | Val | Phe | Gly | Asn | Leu | Ile | Ser | Val | Leu | Asn | Asp | |
740 | 745 | 750 | ||||||||||||||
CTC | GAG | AGT | CCA | GAC | TTC | CGA | AGC | AGA | GCA | GAC | CTT | TTC | TCA | CTC | CTC | 2304 |
Leu | Glu | Ser | Pro | Asp | Phe | Arg | Ser | Arg | Alá | Asp | Leu | Phe | Ser | Leu | Leu | |
755 | 760 | 765 | ||||||||||||||
TTC | TTC | ATA | CTG | GCA | CTC | ATT | GCG | CTC | TTC | TCA | TAC | GCC | GGC | AAT | GGA | 2352 |
Phe | Phe | Ile | Leu | Alá | Leu | Ile | Alá | Leu | Phe | Ser | Tyr | Alá | Gly | Asn | Gly | |
770 | 775 | 780 | ||||||||||||||
TGC | TGT | TTC | GGT | ATC | GTC | TCT | TCA | CAT | TTT | GTC | GCC | AAA | ATT | CAA | CAT | 2400 |
Cys | Cys | Phe | Gly | Ile | Val | Ser | Ser | His | Phe | Val | Alá | Lys | Ile | Gin | His | |
785 | 790 | 795 | 800 | |||||||||||||
ATC | TCT | CTT | GCT | AGT | ATC | TTG | CGA | CAA | GAT | ATG | CAA | TGG | TTC | TCG | GGC | 2448 |
Ile | Ser | Leu | Alá | Ser | Ile | Leu | Arg | Gin | Asp | Met | Gin | Trp | Phe | Ser | Gly | |
805 | 810 | 815 | ||||||||||||||
CAG | TCA | GTG | CCT | TCA | CTC | ATG | AGC | AGT | CTC | AGC | TCA | GAT | GCT | GGT | CAG | 2496 |
Gin | Ser | Val | Pro | Ser | Leu | Met | Ser | Ser | Leu | Ser | Ser | Asp | Alá | Gly | Gin | |
820 | 825 | 830 | ||||||||||||||
CTT | GCT | TGC | TTG | TCC | GGA | GTG | GCT | ATT | GGC | ACC | ATA | TTC | ACG | GTG | TGT | 2544 |
Leu | Alá | Cvs | Leu | Ser | Gly | Val | Alá | Ile | Gly | Thr | Ile | Phe | Thr | Val | Cys | |
835 | 840 | 845 | ||||||||||||||
GTC | TCC | ATC | ACT | GGT | GGT | ATC | ATC | CTT | GCC | CAC | GTG | GTG | GCT | TGG | AAA | 2592 |
Val | Ser | Ile | Thr | Gly | Gly | Ile | Ile | Leu | Alá | HÍS | Val | Val | Alá | Trp | Lys | |
850 | 855 | 860 | ||||||||||||||
ATT | GCT | GTT | GTC | CTC | CTG | GCT | GCT | GTC | CCC | GTT | ATG | ATC | ACG | GCT | GGC | 2640 |
Ile | Alá | Val | Val | Leu | Leu | Alá | Alá | Val | Pro | Val | Met | Ile | Thr | Alá | Gly | |
865 | 870 | 875 | 880 | |||||||||||||
TAC | GTC | AGA | CTA | CGC | GTG | CTC | GCA | CTC | GCG | GAG | AGT | AGA | CAC | AGA | TCT | 2688 |
Tyr | val | Arg | Leu | Arg | Val | Leu | Alá | Leu | Alá | Glu | Ser | Arg | His | Arg | Ser | |
885 | 890 | 895 | ||||||||||||||
GCT | TAC | AAT | GAT | GCT | GCT | TCT | ATC | GCC | GCC | GAG | GCT | TGT | AGA | GGC | ATC | 2736 |
Alá | Tyr | Asn | Asp 900 | Alá | Alá | Ser | Ile | Alá 905 | Alá | Glu | Alá | Cys | Arg 910 | Gly | Ile | |
CGC | ACC | ATT | GCT | TCT | CTC | GGC | AGA | GAG | CGT | GGA | GTG | TCT | AGA | GCA | TCC | 2784 |
Arg | Thr | Ile | Alá | Ser | Leu | Gly | Arg | Glu | Arg | Gly | Val | Ser | Arg | Alá | Ser | |
915 | 920 | 925 | ||||||||||||||
AAC | GCA | GCG | GTC | AAA | GAG | CCA | TAC | GAC | AAG | GGC | ATC | CGA | TTC | ACC | TTG | 2832 |
Asn | Alá | Alá | Val | Lys | Glu | Pro | Tyr | Asp | Lys | Gly | Ile | Arg | Phe | Thr | Leu | |
930 | 935 | 940 | ||||||||||||||
ATT | ACC | AAT | ACC | TTG | CTG | GCC | TTG | AGT | TTC | TCA | ATC | ACT | TAC | TTT | GTA | 2880 |
Ile | Thr | Asn | Thr | Leu | Leu | Alá | Leu | Ser | Phe | Ser | Ile | Thr | Tyr | Phe | Val | |
945 | 950 | 955 | 960 | |||||||||||||
TAT | GCC | CTT | GCC | TAC | TGG | TGG | GGA | GCC | AAG | CAA | GTC | AGA | AAT | GGA | ACA | 2928 |
Tyr | Alá | Leu | Alá | Tyr | Trp | Trp | Gly | Alá | Lys | Gin | Val | Arg | Asn | Gly | Thr | |
965 | 970 | 975 | ||||||||||||||
TAC | AGT | CAA | TTG | GAC | TTT | TTC | ATT | GTT | CTT | CCT | GCT | CTT | CTG | TTC | TCT | 2976 |
Tyr | Ser | Gin | Leu | Asp | Phe | Phe | Ile | Val | Leu | Pro | Alá | Leu | Leu | Phe | Ser | |
980 | 985 | 990 | ||||||||||||||
GCG | CAG | AGC | GCT | GGA | CAG | ATC | TTC | AGT | CTG | TCA | CCA | GAG | ATG | TCG | CGT | 3024 |
Alá | Gin | Ser | Alá | Gly | Gin | Ile | Phe | Ser | Leu | Ser | Pro | Glu | Met | Ser | Arg | |
995 | 1000 | 1005 | ||||||||||||||
GCT | GGT | GTC | GCC | GCT | CGC | AAC | GTC | TTT | GGG | CTA | CAT | GAT | CAG | AAG | CCG | 3072 |
A '·. a | Gly | Val | Alá | Alá | Arg | Asn | Val | Phe | Gly | Leu | His | Asp | Gin | Lys | Pro | |
1010 | 1015 | 1020 | ||||||||||||||
ACC | ATA | GTG | GAT | GTT | GAC | GCG | AAG | CAA | TCT | GGA | GCA | CTG | CCA | AGC | TCG | 3120 |
Thr | Ile | Val | Asp | Val | Asp | Alá | Lys | Gin | Ser | Gly | Alá | Leu | Pro | Ser | Ser | |
1025 | 1030 | 1035 | 1040 | |||||||||||||
ACC | TTG | TCT | ATT | CCT | ACT | CTA | GAG | GAC | AAG | GCA | AGT | CCA | TCA | TCT | GGA | 3168 |
Thr | Leu | Ser | Ile | Pro | Thr | Leu | G1U | Asp | Lys | Alá | Ser | Pro | Ser | Ser | Gly | |
1045 | 1050 | 1055 | ||||||||||||||
GGC | TGG | ATT | GAG | TTC | AAG | AAC | GTC | AGT | CTA | TGC | TAT | CCG | TCC | AAA | CCT | 3216 |
Gly | Trp | Ile | Glu | Phe | Lys | Asn | val | Ser | Leu | Cys | Tyr | Pro | Ser | Lys | Pro | |
1060 | 1065 | 1070 | ||||||||||||||
CAG | CAC | CCA | GCA | TTG | CAG | AAT | GTC | AAC | ATC | TCC | ATC | AGA | CCA | GGA | GAG | 3264 |
Gin | His | Pro | Alá | Leu | Gin | Asn | Val | Asn | Ile | Ser | Ile | Arg | Pro | Gly | Glu | |
1075 | 1080 | 1085 | ||||||||||||||
TTC | ATT | GCA | CTT | GTC | GGC | CCT | AGC | GGA | GCA | GGC | AAG | TCG | ACC | ATT | CTC | 3312 |
Phe | Ile | Alá | Leu | Val | Gly | Pro | Ser | Gly | Alá | Gly | Lys | Ser | Thr | Ile | Leu | |
1090 | 1095 | 1100 | ||||||||||||||
TCT | CTG | CTA | CAG | CGC | TTC | TAC | GAT | CCC | ACT | GCT | GGC | AGC | GTA | CAG | CTA | 3360 |
Ser | Leu | Leu | Gin | Arg | Phe | Tyr | Asp | Pro | Thr | Alá | Gly | Ser | Val | Gin | Leu | |
1105 | 1110 | 1115 | 1120 | |||||||||||||
GAT | GGG | CAG | GAC | ATC | CGC | GAG | GTT | GCT | GTA | CCA | CAA | CAC | AGA | GGT | CGA | 3408 |
Asp | Gly | Gin | Asp | Ile | Arg | Glu | Val | Alá | Val | Pro | Gin | His | Arg | Gly | Arg |
1125 | 1130 | 1135 | ||||||||||||||
TTG | GGG | CTG | GTA | CCT | CAA | GAG | CCA | GAC | CTC | TTC | CCT | GGC | TCG | ATC | TCC | 3456 |
Leu | Gly | Leu | Val | Pro | Gin | Glu | Pro | Asp | Leu | Phe | Pro | Gly | Ser | He | Ser | |
1140 | 1145 | 1150 | ||||||||||||||
TAC | AAC | ATC | GGC | TTG | GGC | GCA | GCG | CCA | GGT | CAG | TTG | GTG | ACG | AGA | GAT | 3504 |
Tyr | Asn | Ile | Gly | Leu | Gly | Alá | Alá | Pro | Gly | Gin | Leu | val | Thr | Arg | Asp | |
1155 | 1160 | 1165 | ||||||||||||||
GAT | ATC | GAG | AAG | ATT | TGC | GCA | AAG | TGT | GGC | ATT | CAC | GAG | TTC | ATC | ATG | 3552 |
Asp | Ile | Glu | Lys | He | Cvs | Alá | Lys | Cys | Gly | He | His | Glu | Phe | Ile | Met | |
1170 | 1175 | 1180 | ||||||||||||||
AGT | CTG | CCC | GAA | GGC | TAC | AGC | ACA | GAG | TGC | GGC | ACC | AAT | GGT | TCG | AAA | 3600 |
Ser | Leu | Pro | Glu | G1V | Tyr | Ser | Thr | Glu | Cys | Gly | Thr | Asn | Gly | Ser | Lys | |
1185 | 1190 | 1195 | 1200 | |||||||||||||
CTC | TCC | GGA | GGT | CAG | AAG | CAA | CGT | ATT | GCT | GTC | GCC | AGA | GCA | TTG | ATC | 3648 |
Leu | Ser | Gly | Gly | Gin | Lys | Gin | Arg | Ile | Alá | Val | Alá | Arg | Alá | Leu | He | |
1205 | 1210 | 1215 | ||||||||||||||
AGG | TCA | CCG | GAA | GTG | CTT | CTC | CTG | GAC | GAG | TAT | ACA | TCC | GCT | CTG | GAC | 3696 |
Arg | Ser | Pro | Glu | Val | Leu | Leu | Leu | Asp | Glu | Tyr | Thr | Ser | Alá | Leu | Asp | |
1220 | 1225 | 1230 | ||||||||||||||
GCC | CAC | TCC | GAG | CAA | CAG | ATC | AAA | GAA | GCA | GTT | GAT | GGA | GCC | AGT | GTG | 3744 |
Alá | His | Ser | Glu | Gin | Gin | He | Lys | Glu | Alá | Val | Asp | Gly | Alá | Ser | Val | |
1235 | 1240 | 1245 | ||||||||||||||
GAT | CGG | ACT | ACG | ATT | GTG | GTC | GCA | CAT | CGA | T ~ _ _ <J | TCC | ACG | GTG | CAG | AAC | 3792 |
Asp | Arg | Thr | Thr | He | Val | Val | Alá | His | Arg | Leu | Ser | Thr | Val | Gin | Asn | |
1250 | 1255 | 1260 | ||||||||||||||
GCA | GAT | AGA | ATC | TTT | GTG | TTT | GAT | GAT | GGA | CGT | GTG | GTG | GAG | GTT | GGT | 3840 |
Alá | Asp | Arg | Ile | Phe | Val | Phe | Asp | Asp | Gly | Arg | Val | Val | Glu | Val | Gly | |
1265 | 1270 | 1275 | 1280 | |||||||||||||
AGC | CAT | GCT | GAG | CTT | GTT | GCT | CAA | GGG | GGT | TTG | TAT | GCA | GGC | ATG | GTT | 3888 |
Ser | His | Alá | G1U | Leu | Val | Alá | Gin | Gly | Gly | Leu | Tyr | Alá | Gly | Met | Val | |
1285 | 1290 | 1295 | ||||||||||||||
CTG | GCG | CAG | ACA | CTC | ACA | TGA | 3909 | |||||||||
Leu | Alá | Gin | Thr 1300 | Leu | Thr |
(2) A 2. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMZŐI:
(A) HOSSZÚSÁGA 302 aminosav (B) TÍPUS: aminosav (C) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: protein (ix) A 2. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA;
Met 1 | Ser | Ser | Alá | Asp 5 | Gly | Arg | Arg | Thr | Val 10 | Ser | Ser | Asp | Tyr | Gly 15 | His |
Pro | Arg | Pro | Ser | Met | Alá | Asn | Val | Glu | Alá | Asp | His | Asn | Phe | Glu | Thr |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Thr | Thr | Leu | Asn | Ser | Alá | Gin | Pro | Arg | Ser | Trp | His | Thr | Glu | Phe | Val |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Phe | Val | Ser | Arg | Lys | Leu | Ile | Gin | Gin | Ile | Leu | Gly | Lys | Asn | Pro | Phe |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Lys | Ser | Ser | Tyr | Leu | Asp | Leu | Phe | Lys | Leu | Val | Asn | Asp | Alá | Lys | Ser |
6 5 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Lys | Alá | Val | Leu | Trp | Alá | Gly | Ile | Leu | Leu | Alá | Ile | Alá | Alá | Gly | Cys |
85 | 90 | 9 5 | |||||||||||||
Pro | Leu | Pro | Ile | Ile | Gly | Tyr | Ile | Phe | Gly | Gin | Ile | Ile | Thr | Ser | Phe |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Pro | Pro | Pro | Glu | Asp | Val | Leu | Arg | Asp | Arg | Leu | Tyr | Gin | Leu | Val | Gly |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Val | Alá | Cys | Gly | Tyr | Phe | Ile | Val | Thr | Thr | Gly | Tyr | Alá | Ile | Alá | Trp |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Gly | Leu | Thr | Gly | Glu | Lvs | Ile | Ser | Arg | Arg | Phe | Arg | Glu | Thr | Leu | Val |
145 | 50 | 155 | 160 | ||||||||||||
Glu | Arg | Leu | Leu | Gly | _^U | Glu | Gin | Alá | Tyr | Phe | Asp | Ile | Lys | Asp | Pro |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Asp | Ile | Thr | Asn | Leu | Leu | Thr | Glu | Lys | Ile | Glu | Alá | Ile | Gin | Ile | Gly |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Thr | Ser | Glu | Lys | Val | Gly | Ile | Phe | Ile | Gin | Ser | Ile | Ser | Tyr | Phe | Val |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Alá | Alá | Phe | Ile | Val | Gly | Phe | Ile | Leu | Asn | Alá | Lys | Leu | Thr | Gly | Ile |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Leu | Phe | Alá | Alá | Val | Ile | Pro | Leu | Met | Alá | Leu | Ile | Val | Thr | Val | Gly |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ser | Ser | Arg | Ile | Alá | Lys | Tyr | Thr | Lys | Alá | Alá | Thr | Glu | Tyr | Thr | Glu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Alá | Alá | Gly | Arg | Ile | Alá | Glu | Ser | Alá | Ile | His | Alá | Val | Lys | Val | Val |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Gin | Alá | Phe | Gly | Met | Alá | Glu | Asn | Leu | Ser | Lys | Glu | His | Tyr | Arg | Leu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Leu | Lys | Leu | Ser | Alá | Arg | Tyr | Alá | Ile | Arg | Lys | Ser | Val | Ser | Alá | Alá |
290 | 295 | 300 |
•25Phe Met
305
Alá Phe
Alá Gly
Val Val
Alá Alá
370
Ile Asn
385
Lys Alá
Thr Ser
Gin Met
Val Ser
450
Ile Gly
465
Tyr Thr
Leu Glu
Val Val
Phe Val
530
Gly Tyr
545
Arg Alá
Alá Alá
Ser Val
Leu Gly
Trp Glu
Thr Val
340
Gly Gin
355
Gly Glu
Val Tyr
Asp Leu
Alá Arg
420
Asn Alá
435
Leu Leu
Ser His
Alá Leu
Asn Ile
500
Leu Glu 515
Asp Phe
Thr Ser
Leu Val
Leu Asp
580
Alá Alá
595
Leu Val
310
Gly Ser
325
Tyr Alá
Phe Gly
Ser Val
Ser Glu
390
Val Phe
405
Alá Leu
Ile Val
Leu Arg
Asp Ile
470
Val Asp
485
Ser Tyr
Arg Cvs
Leu Pro
Leu Ser
550
Lys Lys
565
Alá Asn
Thr Gly
Tyr Phe
Arg Leu
Val Val
Pro Phe
360
Tyr Glu
375
Alá Gly
Arg Asn
Glu Glu
Gly Thr
440
Leu Tyr
455
Lys Asp
Gin Asp
Gly Leu
Thr Glu
520
Gin Gly
535
Gly Gly
Pro Alá
Ser Glu
Thr Thr
600
Thr Alá
Alá Alá
330
Phe Leu
345
Leu Gly
Ile Leu
Gin Glu
Val Thr
410
Met Ser
425
Ser Gly Asp Ile Phe Asn
Ser Val
490
Gly Glu
505
Alá Alá
Ile His Gin Asn Leu Leu
570
Gly Leu
585
Val Val
Tyr Ser
315
Glu Ser
Ile Ile
Ser Phe
Asn His
380
Alá Thr
395
Phe Val
Leu Ile
Cys Gly
Ser Ser
460
Val Arg
475
Leu Phe
His Ser
Lys Alá
Thr Arg
540
Gin Arg
555
Leu Leu
Ile Met
Met Val
Alá Asn
Gly Ser
Asp Alá
350
Alá Thr
365
Pro Gin
Glu Ser
Tyr Pro
Leu Lys
430
Lys Ser
445
Gly Gin
Ser Leu
Ser Gly
Leu Ser
510
Alá Asn
525
Ile Gly
Ile Cys
Asp Glu
Asp Alá
5'90
Alá His
605 .“La Leu
320
Asn Asn
3 5
Ser Phe
Alá Alá
Ser Glu
Asp Met
400
Alá Arg
415
Alá Gly
Thr Leu
Leu Thr
Arg L/s
480
Ser Val
495
Asp Asp
Leu Asp
Asn Gly
Leu Alá
560
Pro Thr
575
Val Lys
Arg Leu
Ser | Thr 610 | Val | Ser | Asp | Ser | Pro 615 | Asn | Ile | Val | Leu | Met 620 | Gly | Alá | Gly | Lys |
Val | Ile | Glu | Gin | Gly | Asn | His | Asp | Glu | Leu | Met | C-ln | Leu | Glu | Gly | Alá |
625 | 630 | 635 | 640 | ||||||||||||
Tyr | Phe | Asn | Leu | Ile | Gin | Alá | Gin | Gin | Leu | Asn | Asp | Alá | Asp | Glu | Ser |
645 | 650 | 655 | |||||||||||||
Ser | Alá | Glu | Val | Ser | Alá | Alá | Thr | Thr | Ser | C-ln | Val | Thr | Pro | Gin | Lys |
660 | 6 6 5 | 670 | |||||||||||||
Alá | Ser | Lvs | Ser | Glu | Asp | Ser | Alá | Alá | Ser | Ser | Asp | Thr | Glu | Thr | Val |
675 | 680 | 685 | |||||||||||||
Pro | Pro | Gin | Alá | Lys | Lys | Glu | Asp | Lys | Pro | Alá | Lys | Lys | Alá | Gly | Phe |
690 | 695 | 700 | |||||||||||||
Trp | Lys | Leu | Leu | Leu | Arg | Cys | Leu | Arg | Leu | Alá | Lys | Ser | Asp | Ser | Pro |
705 | 710 | 715 | 720 | ||||||||||||
Ile | Ile | Alá | Leu | Gly | Leu | Alá | Alá | Ser | Ile | Val | Ser | Gly | Gly | Ile | Ile |
725 | 730 | 735 | |||||||||||||
Leu | Gly | Glu | Alá | Ile | Val | Phe | Gly | Asn | Leu | Ile | Ser | Val | Leu | Asn | Asp |
740 | 745 | 750 | |||||||||||||
Leu | Glu | Ser | Pro | Asp | Phe | Arg | Ser | Arg | Alá | Asp | Leu | Phe | Ser | Leu | Leu |
755 | 760 | 765 | |||||||||||||
Phe | Phe | Ile | Leu | Alá | Leu | Ile | Alá | Leu | Phe | Ser | Tyr | Alá | Gly | Asn | Gly |
770 | 775 | 780 | |||||||||||||
Cys | Cys | Phe | Gly | Ile | Val | Ser | Ser | His | Phe | Val | Alá | Lys | Ile | Gin | His |
785 | 790 | 795 | 800 | ||||||||||||
Ile | Ser | Leu | Alá | Ser | Ile | Leu | Arg | Gin | Asp | Met | Gin | Trp | Phe | Ser | Gly |
805 | 810 | 815 | |||||||||||||
Gin | Ser | Val | Pro | Ser | Leu | Met | Ser | Ser | Leu | Ser | Ser | Asp | Alá | Gly | Gin |
820 | 825 | 830 | |||||||||||||
Leu | Alá | Cys | Leu | Ser | Gly | Val | Alá | Ile | Gly | Thr | Ile | Phe | Thr | Val | Cys |
835 | 840 | 845 | |||||||||||||
Val | Ser | Ile | Thr | Gly | Gly | Ile | Ile | Leu | Alá | His | Val | Val | Alá | Trp | Lys |
850 | 855 | 860 | |||||||||||||
Ile | Alá | Val | Val | Leu | Leu | Alá | Alá | Val | Pro | Val | Met | Ile | Thr | Alá | Gly |
865 | 870 | 875 | 880 | ||||||||||||
Tyr | Val | Arg | Leu | Arg | Val | Leu | Alá | Leu | Alá | Glu | Ser | Arg | His | Arg | Ser |
885 | 890 | 895 | |||||||||||||
Alá | Tyr | Asn | Asp | Alá | Alá | Ser | Ile | Alá | Alá | Glu | Alá | Cys | Arg | Gly | Ile |
900 | 905 | 910 |
Arg | Thr | Ile 915 | Alá | Ser | Leu | Gly | Arg 920 | Glu | Arg | Gly | Val | Ser 925 | Arg | Al a | Ser |
Asn | Alá | Alá | Val | Lys | Glu | Pro | Tyr | Asp | Lys | Gly | Ile | Arg | Phe | Thr | Leu |
930 | 935 | 940 | |||||||||||||
Ile | Thr | Asn | Thr | Leu | Leu | Alá | Leu | Ser | Phe | Ser | Ile | Thr | Tyr | Phe | Val |
945 | 950 | 955 | 960 | ||||||||||||
Tyr | Alá | Leu | Alá | Tyr | Trp | Trp | Gly | Alá | Lys | Gin | Val | Arg | Asn | Gly | Thr |
965 | 970 | 975 | |||||||||||||
Tyr | Ser | Gin | Leu | Asp | Phe | Phe | Ile | Val | Leu | Pro | Alá | Leu | Leu | Phe | Ser |
980 | 985 | 990 | |||||||||||||
Alá | Gin | Ser | Alá | Gly | Gin | Ile | Phe | Ser | Leu | Ser | Pro | Glu | Met | Ser | Arg |
995 | 1000 | 1005 | |||||||||||||
Alá | Gly | Val | Alá | Alá | Arg | Asn | Val | Phe | Gly | Leu | His | Asp | Gin | Lys | Pro |
1010 | 1015 | 1020 | |||||||||||||
Thr | Ile | Val | Asp | Val | Asp | Alá | Lys | Gin | Ser | Gly | Alá | Leu | Pro | Ser | Ser |
1025 | 1030 | 1035 | 1040 | ||||||||||||
Thr | Leu | Ser | Ile | Pro | Thr | Leu | Glu | Asp | Lys | Alá | Ser | Pro | Ser | Ser | Gly |
1045 | 1050 | 1055 | |||||||||||||
Gly | Trp | Ile | Glu | Phe | Lys | Asn | Val | Ser | Leu | Cys | Tyr | Pro | Ser | Lys | Pro |
1060 | 106Ξ | 1070 | |||||||||||||
Gin | His | Pro | Alá | Leu | Gin | Asn | Val | Asr | Ile | Ser | Ile | Arg | Pro | Gly | Glu |
1075 | 1080 | 1085 | |||||||||||||
Phe | Ile | Alá | Leu | Val | Gly | Pro | Ser | Gly | Alá | Gly | Lys | Ser | Thr | Ile | Leu |
1090 | 1095 | 1100 | |||||||||||||
Ser | Leu | Leu | Gin | Arg | Phe | Tyr | Asp | Pro | Thr | Alá | Gly | Ser | Val | Gin | Leu |
1105 | 1110 | 1115 | 1120 | ||||||||||||
Asp | Gly | Gin | Asp | Ile | Arg | Glu | val | Alá | Val | Pro | Gin | His | Arg | Gly | Arg |
1125 | 1130 | 1135 | |||||||||||||
Leu | Gly | Leu | Val | Pro | Gin | Glu | Pro | Asp | Leu | Phe | Pro | Gly | Ser | Ile | Ser |
1140 | 1145 | 1150 | |||||||||||||
Tyr | Asn | Ile | Gly | Leu | Gly | Alá | Alá | Pro | Gly | Gin | Leu | Val | Thr | Arg | Asp |
1155 | 1160 | 1165 | |||||||||||||
Asp | Ile | Glu | Lys | Ile | Cys | Alá | Lys | Cys | Gly | Ile | His | Glu | Phe | Ile | Met |
1170 | 1175 | 1180 | |||||||||||||
Ser | Leu | Pro | Glu | Gly | Tyr | Ser | Thr | Glu | Cys | Gly | Thr | Asn | Gly | Ser | Lys |
1185 | 1190 | 1195 | 1200 | ||||||||||||
Leu | Ser | Gly | Gly | Gin | Lys | Gin | Arg | Ile | Alá | Val | Alá | Arg | Alá | Leu | Ile |
1205 | 1210 | 1215 |
Arg | Ser | Pro | Glu | Val | Leu | Leu | Leu | Asp | Glu | Tvr | Thr | Ser Alá | Leu | Asp |
1220 | 1225 | 1230 | ||||||||||||
Alá | His | Ser | Glu | Gin | Gin | Ile | Lys | Glu | Alá | Val | Asp | Gly Alá | Ser | Val |
1235 | 1240 | 1245 | ||||||||||||
Asp | Arg | Thr | Thr | He | Val | Val | Alá | His | Arg | Leu | Ser | Thr Val | Gin | Asn |
1250 | 1255 | 1260 | ||||||||||||
Alá | Asp | Arg | He | Phe | Val | Phe | Asp | Asp | Gly | Arg | Val | Val Glu | Val | Gly |
1265 | 1270 | 1275 | 1280 | |||||||||||
Ser | His | Alá | Glu | Leu | Val | Alá | Gin | Gly | Gly | Leu | Tyr | Alá Gly | Met | Val |
1285 1290 1295
Leu Alá Gin Thr Leu Thr
1300 (2) A 3. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 39 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLTÍPUS: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris (ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (ix) A 3. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
ACGCGAGATC TTCTCTCCAG TCAATCCCCA CGCAATTGC 39 (2) A 4. SZÁMÚ SZEKVENCIA ADATAI:
(i) A SZEKVENCIA JELLEMEZŐI:
(A) HOSSZÚSÁG: 46 bázispár (B) TÍPUS: nukleinsav (C) SZÁLTÍPUS: egyszálú (D) TOPOLÓGIA: lineáris
(ii) A MOLEKULA TÍPUSA: DNS (ix) A 4. SZÁMÚ SZEKVENCIA LEÍRÁSA:
CCTGCGTCAT CTTCAAGGGC GAGCTCATTC GGGTTCAAGA ATCTTC 46
Claims (10)
- SZABADALMI IGÉNYPONTOK1. Egy izolált nukleinsav molekula, azzal jellemezve, hogy az Aureobasidium pullulans MDR-t kódolja.
- 2. Az 1. igénypont szerinti nukleinsav molekula, azzal jellemezve, hogy DNS-t jelent.
- 3. A 2. igénypont szerinti nukleinsav molekula, azzal jellemezve, hogy az 1. számú szekvenciával rendelkezik.
- 4. Az 1. igénypont szerinti nukleinsav molekula vagy annak egy része, azzal jellemezve, hogy egy detektálható egységgel megjelöltük.
- 5. A 4. igénypont szerinti nukleinsav molekula, azzal jellemezve, hogy a detektálható egységet egy fluoreszcensz jelölést, egy radioaktív atomot, és egy kemilumineszcensz jelölést magába foglaló csoportból szelektáljuk.
- 6. Egy replikálható vektor, azzal jellemezve, hogy az 1., 2., vagy 3. igénypontok szerinti nukleinsavat tartalmazza.
- 7. Egy gazdasejt, azzal jellemezve, hogy a 6. igénypont szerinti vektort tartalmazza.
- 8. Egy gazdasejt, azzal jellemezve, hogy a 7. igénypont szerinti vektort tartalmazza.
- 9. Egy tisztított formában levő protein, azzal jellemezve, hogy a 2. számú szekvencia kódolja.
- 10. Eljárás egy vegyület gomba MDR gátló aktivitásának meghatározására, azzal jellemezve, hogya) egy élesztőgomba sejt tenyészetet szaporítunk, mely sejteket az AP-MDR expresszióját biztosító vektorral transzformáltuk β· «ο ·--» » ·· * * V · ·♦·«♦ • ··· « ·♦»· ··* · v*e «« >· (i) egy gombaellenes szer, mellyel szemben az említett élesztőgomba sejt rezisztens, de mellyel szemben az említett élesztőgomba sejt érzékeny ha nincs transzformált állapotban;(ii) egy feltételezetten gomba MDR gátló aktivitással rendelkező vegyület jelenlétében; ésb) meghatározzuk az említett vegyület gomba MDR gátló aktivitását oly módon, hogy a gombaellenes szer említett élesztőgomba sejt növekedésére kifejtett gátló képességét mérjük.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US08/232,537 US5516655A (en) | 1994-04-20 | 1994-04-20 | Multiple drug resistance gene of Aureobasidium pullulans |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9501115D0 HU9501115D0 (en) | 1995-06-28 |
HUT72842A true HUT72842A (en) | 1996-05-28 |
Family
ID=22873532
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9501115A HUT72842A (en) | 1994-04-20 | 1995-04-19 | Multiple drug resistance gene of aureobasidium pullulans |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5516655A (hu) |
EP (1) | EP0678578A3 (hu) |
JP (1) | JPH07303489A (hu) |
AU (1) | AU684142B2 (hu) |
CA (1) | CA2147110A1 (hu) |
HU (1) | HUT72842A (hu) |
IL (1) | IL113405A0 (hu) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5773214A (en) * | 1995-02-27 | 1998-06-30 | Eli Lilly And Company | Multiple drug resistance gene of aspergillus flavus |
US5705352A (en) * | 1995-02-27 | 1998-01-06 | Eli Lilly And Company | Multiple drug resistance gene of Aspergillus fumigatus |
US5914246A (en) * | 1996-03-08 | 1999-06-22 | Eli Lilly And Company | Multiple drug resistance gene of Aspergillus fumigatus |
US5786463A (en) * | 1996-03-08 | 1998-07-28 | Eli Lilly And Company | Multiple drug resistance gene of Cryptococcus neoformans |
US5945324A (en) * | 1997-12-23 | 1999-08-31 | Eli Lilly And Company | Multiple drug resistance gene ATRC of aspergillus nidulans |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US492546A (en) * | 1893-02-28 | Combined copy-holder and folio-indicator for type-writers | ||
US5057493A (en) * | 1988-07-19 | 1991-10-15 | Takara Shuzo Co., Ltd. | Novel antibiotics r106 |
CA2098198A1 (en) * | 1990-12-18 | 1992-06-18 | Ann Christie King | Agents for potentiating the effects of antitumour agents and combating multiple drug resistance |
-
1994
- 1994-04-20 US US08/232,537 patent/US5516655A/en not_active Expired - Fee Related
-
1995
- 1995-04-13 CA CA002147110A patent/CA2147110A1/en not_active Abandoned
- 1995-04-17 IL IL11340595A patent/IL113405A0/xx unknown
- 1995-04-18 EP EP95302542A patent/EP0678578A3/en not_active Withdrawn
- 1995-04-18 AU AU16506/95A patent/AU684142B2/en not_active Ceased
- 1995-04-19 JP JP7093674A patent/JPH07303489A/ja active Pending
- 1995-04-19 HU HU9501115A patent/HUT72842A/hu unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US5516655A (en) | 1996-05-14 |
AU684142B2 (en) | 1997-12-04 |
JPH07303489A (ja) | 1995-11-21 |
EP0678578A2 (en) | 1995-10-25 |
HU9501115D0 (en) | 1995-06-28 |
IL113405A0 (en) | 1995-07-31 |
AU1650695A (en) | 1995-11-02 |
CA2147110A1 (en) | 1995-10-21 |
EP0678578A3 (en) | 1996-12-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
NO327054B1 (no) | Polypeptid som bindes til TRAF2, samt fremgangsmate for fremstilling og isolering og identifisering derav og DNA-sekvens, vektor, transformerte eukaryote eller prokariote vertsceller, antistoffer, farmasoytisk sammensetning anvendelse derav. | |
Hwang et al. | Isolation of a cDNA encoding a UV-damaged DNA binding factor defective in xeroderma pigmentosum group E cells | |
EP0637334A1 (fr) | Peptides ayant une activite de facteur d'echange du gdp, sequences d'acides nucleiques codant pour ces peptides, preparation et utilisation | |
AU6589098A (en) | Methods for screening for antimicrobials utilizing ((aarc)) and compositions thereof | |
CA2347120A1 (en) | Nlk1 -interacting proteins | |
HUT72842A (en) | Multiple drug resistance gene of aureobasidium pullulans | |
JPH07502883A (ja) | 新規なシクロフィリン類、関連タンパク質類および用途 | |
US5773214A (en) | Multiple drug resistance gene of aspergillus flavus | |
US6307035B1 (en) | BRCA1 associated polynucleotide (BAP-1) and uses therefor | |
US6228615B1 (en) | Multiple drug resistance gene atrD of Aspergillus nidulans | |
WO1996029433A1 (en) | Rest protein and dna | |
CA2315943A1 (en) | Multiple drug resistance gene atrc of aspergillus nidulans | |
US5705352A (en) | Multiple drug resistance gene of Aspergillus fumigatus | |
WO1998005968A9 (en) | Brca1 associated protein (bap-1) and uses therefor | |
US5786463A (en) | Multiple drug resistance gene of Cryptococcus neoformans | |
US5691187A (en) | Anti-fungal agents and methods of identifying and using the same | |
US5770717A (en) | Nucleic acid encoding a stress-responsive subunit of human RNA polymerase II | |
WO1998020021A1 (en) | Nucleotide and amino acid sequences of c4-2, a tumor suppressor gene, and methods of use thereof | |
KR20020047289A (ko) | 인간 타이로신키나제 에이치씨케이에 결합하는 인간단백질 및 그것을 코드하는 유전자 | |
US5914246A (en) | Multiple drug resistance gene of Aspergillus fumigatus | |
JP2000007699A (ja) | ウズラのh1ヒストン及びその遺伝子 | |
JP2000106878A (ja) | マンデル酸分解酵素系の調節遺伝子及びその発現産物、並びにその発現産物と結合するdna領域 | |
MXPA98008006A (en) | Novedoso transcription factor, tfiib, of candida albicans, sequence of nucleic acids that codify thereof, and methods of selective classification of growth inhibitors of candida albic | |
WO1998045326A1 (en) | Cell zinc finger polynucleotides and splice variant polypeptides encoded thereby |