HUT69956A - Methode for inhibition of influenza virus by antiseuse oligonucleotides - Google Patents
Methode for inhibition of influenza virus by antiseuse oligonucleotides Download PDFInfo
- Publication number
- HUT69956A HUT69956A HU9300364A HU36493A HUT69956A HU T69956 A HUT69956 A HU T69956A HU 9300364 A HU9300364 A HU 9300364A HU 36493 A HU36493 A HU 36493A HU T69956 A HUT69956 A HU T69956A
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- oligonucleotide
- analog
- rna
- ucucccucuc
- oligonucleotide analog
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
- C12N15/1131—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
- C07K14/08—RNA viruses
- C07K14/11—Orthomyxoviridae, e.g. influenza virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/13—Decoys
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
- C12N2310/315—Phosphorothioates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/321—2'-O-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
- C12N2310/322—2'-R Modification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
- C12N2310/3521—Methyl
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
- C12N2310/3527—Other alkyl chain
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/30—Chemical structure
- C12N2310/35—Nature of the modification
- C12N2310/353—Nature of the modification linked to the nucleic acid via an atom other than carbon
- C12N2310/3533—Halogen
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2760/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses negative-sense
- C12N2760/00011—Details
- C12N2760/16011—Orthomyxoviridae
- C12N2760/16111—Influenzavirus A, i.e. influenza A virus
- C12N2760/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Virology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Description
KIVONAT
A találmány tárgya kompozíció és eljárás influenza A, B és C vírus fertőzések kezelésére és diagnosztizálására. A találmány értelmében oliognukleotidokat és oligonukleotid analógokat készítenek, amelyek specifikusan komplementerek a H2N2 virális RNS-sel, illetve a transzkripció indítóhelyekkel, transzláció indítóhelyekkel, 5*-nemtranszlatált szekvenciákkal, 3’-nemtranszlatált szekvenciákkal, infulenzavírus mRNS intron/exon kapcsolódásokkal, továbbá olyan RNS szekvenciákkal, amelyek a virális RNS hasításában vagy víruspakolásban vesznek részt. A kapott oligonukelotidok és oligonukleotid analógok influenza A, B vagy C fertőzésben szenvedő emberek és állatok kezelésére alkalmazhatók.
J
6 Közzétételi
PÉLDÁNY
Képviselő:
DANUBIA SZABADALMI ÉS VÉDJEGY IRODA KFT.
woG
ELJÁRÁS INFLUENZAVÍRUS GÁTLÁSÁRA ANTISZENSZ OLIGONUKLEOTIDOKKAL
ISIS PHARMACEUTICALS, INC., Carlsbad, Kalifornia,
Amerikai Egyesült Államok
Feltalálók:
COWSERT Lex M., Carlsbad
ECKER Dávid J., Carlsbad
Kalifornia, Amerikai Egyesült Államok
A bejelentés napja: 1991. 08. 13.
Elsőbbsége: 1990. 08. 14. (567 287)
Amerikai Egyesült Államok
A nemzetközi bejelentés száma: PCT/US91/05742
A nemzetközi közzététel száma: WO 92/03454
76829-7418-GI
A találmány tárgyát influenzavírus diagnosztizálása, kutatási reagensei és gyógyítása képezi. Pontosabban, a találmány a sejtek influenzavírusok által való megfertőzésében szerepet játszó bizonyos virális ribonukleinsavak és hírvivő ribonukleinsavak közötti antiszensz oligonukleotidok kölcsönhatásaival foglalkozik. Olyan oligonukleotidokat állítunk elő, amelyek az influenzavírusok virális RNS szegmenseihez, illetve bizonyos hírvivő RNS-ekhez hibridizálódnak, amelyek az influenzavírus NP, Ml, M2, NS1, NS2 vagy egyéb kulcsfehérjéit kódolják, beleértve az RNS polimerázt, a hemagglutinint, nukleoproteint vagy a neuraminidázt. Olyan oligonukleotidokat állítunk elő továbbá, amelyek az RNS illesztéséhez vagy a vírus pakolásához szükséges virális RNS szekvenciákhoz hibridizálódnak. Ezen oligonukleotidokról kiderült, hogy módosítják az RNS aktivitását; ennek eredménye a fertőzés, diagnózis, tünetenyhítés, terápiás hatás módosítása.
A történeti feljegyzések azt mutatják, hogy az influenzavírusok az emberek mortalitási és morbiditási fő okainak egyikét képezik. Szabályos időközönként jelentkeznek járványok, amelyeknek a súlyossága változó, de mindig jelentős számú megbetegedést és halálesetet okoznak, főleg az idősebb emberek körében. Az influenzajárványok okaként először R.E. Shope jelölte meg a vírusokat, aki kimutatta, hogy megszűrt nyállal az influenzafertőzés terjeszthető. Az influenzavírusokat jelenleg három csoportba osztják; A, B és C típusokra, belső antigén fehérjéik különbsége alapján.
Az influenzafertőzés akut tünetegyüttest okoz: fej3 • · 4 ·· · • •4 44··* • ··· ···· fájást, köhögést, lázat és általános gyengeséget. Súlyos esetekben, illetve korábbi eredetű tüdő- vagy keringési betegség megléte esetén kórházi kezelésre van szükség. A leggyakoribb szövődmény a közvetlen vírusfertőzés, illetve másodlagos bakteriális vagy virális fertőzés következtében fellépő tüdőgyulladás. Az influenzavírus-fertőzés klinikai jellemzőinek összefoglalása Douglas, R.G., New England Journal of Medicine, 322. 443-450 (1990) irodalmi helyen található .
Az antigén-sodródás következtében szabályos időközönként, általában évente új influenzavírus törzsek jelentkeznek, és beindítanak egy fertőzési ciklust, amely bejárja a világot. Nagyon keveset tudunk arról, hogy az egyes járványok hogyan indukálódnak. Nagyobb új influenzavírus altípusok ritkábban jelentkeznek, de egész világrészekre kiterjedő járványokat okozhatnak.
A súlyos komplikációknak kitett populációk esetén az influenzavírus elleni leghatékonyabb módszer a megelőzés. Hozzáférhető influenzavakcina használatával hatékony módon csökkenthetjük egy adott populációban a halálesetek számát, azonban a vírus állandóan változó természete miatt egy olyan vakcinának a kifejlesztése, amelynek megfelelő az összetétele ahhoz, hogy az adott pillanatban aktív összes vírustörzszsel szemben védelmet biztosítson, bonyolult és drága. Emellett a betegek együttműködési készsége a vakcinázásban általában nagyon csekély. Ezért nagyszámú, súlyos komplikációknak kitett beteg marad hatékony védelem nélkül.
Van néhány gyógyszer, amelyeknek van némi profilak4 • ·«· · · • · Λ · « ·· • ··· ···· tikus aktivitásuk az influenzavírus ellen. Egyik sem aktív azonban a B típusú vírussal szemben. Emellett általában nagyon korlátozott a terápiás felhasználásuk és nem használják széles körben a betegség kezelésére a tünetek fellépése után. Ezért világszerte igény van jobb terápiás hatóanyagokra az influenzavírus-fertőzés kezelésére.
Már ismertettek az influenzavírus gátlására antiszensz oligonukleotidok felhasználásával tett kísérleteket. Leiter és munkatársai foszfodiészter és foszforotioát oligonukleotidokat készítettek az influenza A és C vírusokkal szemben [Leiter, J., Agrawal, S., Palese, P. and Zamecnik, P.C., Proceeding of the National Academy of Sciences, USA, 87, 3430-3434 (1990)]. Ezek a kutatók csak a PB1 polimeráz gént, illetve a vRNS 3' régiójában az mRNS-t, valamint az mRNS 5' régióját célozták meg. Az influenza A vírus szekvencia-specifikus gátlását nem, jóllehet az influenza C vírusnak valamelyes specifikus gátlását megfigyelték. Más influenzavírus szegmenseket, illetve mRNS-eket nem céloztak meg.
Zerial és munkatársai leírták az influenza A vírus egy interkalálódó ágenshez kötött oligonukleotidokkal történő gátlását [Zerial, A., Thuong, N.T. and Helene, C., Nucleic Acids Research, 57, 9909-9919 (1987)]. Zerial és munkatársai nyolc vRNS szegmens 3' terminális szekvenciáját célozták meg. Oligonukleotid analógjukról leírták, hogy gátolja a vírus citopátiás hatását sejttenyészetben. A 169 787 számú európai szabadalmi leírás (Helene és munkatársai) interkalálódó csoporthoz kovalensen kötődő oligonukleotid vegyületeket közöl, amelyeknek nukleinsav-szekvenciája sze······· ·· • · · · · · ·· · • · · · · · ··· ·· ··· ·· ···
- 5 repet játszik egy nukleinsav replikációjában, illetve egy vagy több gén transzkripciójában/transzlációjában; továbbá olyan, interkalálódó csoporthoz kovalensen kötött oligonukleotidokat közöl, amelyek egy vírus vagy baktérium vagy parazita replikációjához, illetve fejlődéséhez szükséges szekvenciával komplementerek, valamint olyan, interkalálódó csoporthoz kovalensen kötött oligonukleotidokat ismertet, amelyek az influenza vagy herpesz vírus replikációjához vagy fejlődéséhez szükséges szekvenciával komplementerek vagy egy onkogénnel komplementerek.
A 82 110 494.0 számú európai szabadalmi bejelentésben (Krug és munkatársai) olyan oligonukleotidokat közölnek, amelyek egy 5'-metilezett lezáró struktúrát tartalmaznak, amely növeli az oligonukleotid affinitását az influenzavírus endonukleázhoz és transzkriptázhoz. Emellett a lezáró struktúrával rendelkező oligonukleotidokat módosítják, hogy megakadályozzák indító molekulaként való működésüket, például hosszuk 10 nukleotidnál kisebb; vagy meg vannak hoszszabbítva oly módon, hogy egy 3' terminális dezoximononukleotidot vagy egy 3' terminális 3’-O-metilezett ribonukleotidot tartalmaznak, vagy legalább 14, a cukor és/vagy bázisrészben és/vagy a nukleotid-kötésben módosított nukleotidot tartalmaznak.
Kabanov és munkatársai egy olyan oligonukleotidot szintetizáltak, amely komplementer az RNS polimeráz 3-at kódoló RNS hurokképző részével [Kabanov, A.V., Vinogradov, S.V., Ovcharenko, A.V., Krivonos, A.V., Melik-Nubarov, N.S., Kiselev, V.I. and Severin, E.S., FEBS, 259. 327-330 (1990)].
··· · ·· · ·· *·« * ··· · • · · · · · «·· ·· ·«· ♦♦ ·♦·
Oligonukleotidjukat egy undecil csoporthoz kötötték az 5' terminális foszfátcsoportnál. Azt találták, hogy oligonukleotid juk gátolta az influenza A vírus fertőzést MDCK sejtekben .
Jóllehet mindegyik említett kutató közölte, hogy elért némi sikert egy influenzavírus néhány funkciójának gátlásában, az influenzavírus megcélzására általános terápiás sémát még nem találtak. Emellett, jobb hatékonyságra is szükség van az influenzavírus elleni szerek esetén. Fennáll tehát az igény olyan antiszensz oligonukleotid analógok tervezésére, amelyek alkalmasak hatékony terápiás felhasználásra. Ezt a rég fennálló igényt nem elégítették ki az influenza antiszensz oligonukleotid terápiája területén végzett korábbi tevékenységek. Mások nem találták meg azokat a célpontokat, ahol az antiszensz oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok ésszerű alkalmazási mennyiség mellett terápiásán hatásosak.
A találmány célja olyan készítmények kidolgozása, amelyek influenzavírus-fertőzések kezeléséra alkalmazhatók állatoknál, különösen pedig embernél.
A találmány célja továbbá olyan antiszensz oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok előállítása, amelyek képesek az RNS vagy influenzavírusok funkcióit gátolni.
A találmány célja ezenkívül az influenzavírus-típusok diagnosztizálására szolgáló eszközök kidolgozása.
A találmány tárgyát tehát olyan oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok képezik, amelyek specifikusan hibridizálódnak az influenzavírusok RNS-ével. Az oligonuk7 • · ··· • · ♦ · · • · · · • · ·· • · · ··· ·« · leotidot vagy oligonukleotid analógot úgy tervezzük, hogy közvetlenül kötődjön az influenza RNS-hez antiszensz típusú kapcsolódás révén. Az oligonukleotidok és oligonukleotid analógok képesek az RNS működését gátolni: vagy a fehérjévé való transzlációját, a citoplazmába való átjutását, vagy bármely más olyan aktivitását, amely az általános biológiai funkciójához szükséges. Ha az RNS nem képes végrehajtani funkcióit, illetve azok egy részét, ennek eredménye az, hogy a vírus normális életciklusát szabályozó genomrész nem működik.
Előnyös, ha specifikus virális RNS részeket veszünk célba az antiszensz támadásra. Úgy találtuk, hogy az NP, Ml, M2, NS1 és NS2 gének különösen alkalmasak e megközelítéshez. Az NP, Ml, M2, NS1 és NS2 expresszió gátlásáról feltételezhető, hogy különösen alkalmasak az influenzavírus-fertőzések kezelésére. Ez a gátlás diagnosztikai módszerek és kitek alapját is képezheti. Az influenzavírus RNS polimerázát, hemagglutininjét vagy neuraminidázát kódoló gének gátlása szintén nagyon hasznos az ilyen fertőzések kezelésében, emellett még az influenzavírus RNS illesztési vagy pakolási funkcióinak gátlása és a virális nukleoprotein gátlása is hasznos lehet. Az ilyen gátlások vagy interferenciák szintén képezhetik diagnosztikumok alapjait.
A vírusfertőzés befolyásolására szolgáló eljárás abban áll, hogy a kezelendő embert vagy állatot érintkezésbe hozzuk a vírus nukleinsavaival hibridizálódni képes oligonukleotiddal vagy oligonukleotid analóggal. Előnyösek azok az oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok, amelyek • ·· · ···
4444444·4 • ··· * »44· • 4 4 4 44 • 44 44 ··· ····· képesek hibridizálódni bármely vRNS szegmensről származó RNS-sel, illetve az NP, Ml, M2, NS1 vagy NS2 fehérjéket kódol mRNS-sel.
A mellékelt 1. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (+)RNS-e (mRNS), az 5-ös szegmensről szintetizálva.
A 2. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (-)RNS-e (mRNS), az 5-ös szegmensről szintetizálva.
A 3. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (+)RNS-e (mRNS), a 7-es szegmensről szintetizálva.
A 4. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (-)RNS-e (mRNS), a 7-es szegmensről szintetizálva.
Az 5. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (+)RNS-e (mRNS), a 8-as szegmensről szintetizálva.
A 6. ábrán látható az influenza A vírus (Ann Arbor H2N2) (-)RNS-e (mRNS), a 8-as szegmensről szintetizálva.
A 7. ábrán sematikusan ábrázoljuk egy 2'-helyettesített oligonukleotid kötődését, amely utánozza a celluláris RNS indító molekulát és gátolja az influenzavírust a 2. példában leírtak alapján.
Az antiszensz oligonukleotidok számos emberi betegség kezelésében nagyon ígéretes gyógyászati hatóanyagok. Az oligonukleotidok specifikus kötődnek a pre-mRNS vagy érett mRNS komplementer szekvenciáihoz, a Watson-Crick féle bázispárosodás törvényei szerint, gátolva ezzel a DNS-től a fehérje felé irányuló genetikai információáramlást. Az influenza vírusok esetében a fehérjék kódolásához szükséges információ nem a DNS-en található, hanem egy RNS genomban, ami
lehetővé teszi a genomiális anyag antiszensz típusú megcélzását. Számos újabb vizsgálat igazolta az antiszensz oligonukleotidok alkalmazhatóságát biokémiai eszközként célfehérjék tanulmányozásában [Rothenberg et al., J. NAtl. Cancer Inst., 81, 1539-1544 (1989); Zon, G., Pharmaceutical Research, 5, 539-549 (1988)]. Az oligonukleotid-kémiában elért legfrissebb eredmények következtében a nukleáz-rezisztens oligonukleotidok és javított sejtbehatolási képességgel rendelkező oligonukleotid analógok szintézise lehetővé vált, ezért megfontolható az antiszensz oligonukleotidok alkalmazása újtípusú gyógyászati hatóanyagokként.
Az influenzavírusok negatív szálú RNS vírusok. Genomjuk diszkrét (-)vRNS szegmensekből áll, ezeket vRNS-nek is nevezik. Például az influenza A vírus 8 (-)RNS szegmensből áll. Az 1. táblázat az ismert szegmensek részleges listája.
1. táblázat
INFLUENZA SZEGMENSEK
Szegmens Kódolt fehérje Helye a virionban
1 | PB2 | RNS polimeráz | Nukleokapszid |
2 | PB1 | RNS polimeráz | Nukleokapsz id |
3 | PA | RNS polimeráz | Nukleokapszid |
4 | HA | Hemagglutinin | Burok |
5 | NP | Nukleoprotein | Nukleokapszid |
6 | NA | Neuraminidáz | Burok |
7 | Ml | Membránf ehérje | Burok |
M2 | Nem-szerkezeti | Nincs jelen | |
8 | NS1 | Nem szerkezeti | Nincs jelen |
NS2 | Nem szerkezeti | Nincs jelen |
A vRNS szegmensek tárolják azokat a genetikai infor10 • ·♦ ·«· ·· · ··· t • ··· ·*·· • · · · · ·«· ·· ···*♦ mációkat, amelyek a virális mRNS [(+)RNS] szintéziséhez templátként szolgálnak. Tehát az influenzavírusokban a transzkripció templátja DNS helyett RNS.
Egy sejtet megfertőző influenzavírus életciklusát az alábbiakban lehet összefoglalni. A vírus a sejt felszínén egy receptorhoz kapcsolódik és bejut a sejtbe (internalizálódik). A vRNS genomiális szegmensei a sejtmagba kerülnek. A vírus számos fehérjét juttat az RNS-sel együtt az újonnan megfertőzött sejtekbe, beleértve azt a három fehérjét is, amelyek az RNS-dependens RNS polimerázt képezik (PB1, PB2, PA) , valamint egy nukleoproteint (NP) amely a három RNS polimerázzal együtt résztvesz az új RNS szintézisében. A vírus expresszálja a génjeit, hogy a fertőzött sejtben az RNS polimeráz és a nukleoprotein akciója hatására a létező sejtmechanizmusokkal kooperálva új fehérjéket állítson elő. A vírus polimeráz nem tartalmaz olyan aktivitást, amely iniciálná a mRNS szintézist, illetve a mRNS lezáró struktúrájának szintézisét vagy metilezését. Ezek a folyamatok általában szükségesek a gének expressziójához. Ehelyett a vírus egy celluláris mRNS-t használ, lehasítja az 5' lezáró struktúrát, valamint a lezáró struktúrától a mRNS 10-15 nukleotidját, és ezt használja indító molekulaként a saját mRNS-e szintézisének iniciálására. Ezt az egyedüláló mechanizmust használjuk ki a találmányban arra, hogy az influenzavírus specifikus gátlását elérjük.
Gyógyászati céllal egy feltételezetten influenzavírussal fertőzött állatot oly módon kezelünk, hogy a találmány szerinti oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot ·««
- 11 adagoljuk neki. A szakterületen jártas szakember számára nem probléma az optimális dózisnak, a dozírozás módszereinek és az ismétlés gyakoriságának meghatározása. Az ilyen kezelést általában addig folytatjuk, ameddig a gyógyulást vagy a betegség enyhülését el nem érjük.
Ismeretes, hogy a különböző influenzavírusok között a variánsra jellemző eltérések vannak. Míg egyes régiók nagyon hasonlóak az egyes fajoknál, némi különbség mégis fellép. Az ezeket a variációkat okozó változásokat az oligonukleotidok és oligonukleotid analógok esetén speciálisan figyelembe vesszük ebben a találmányban.
A találmány szerinti megoldásban oligonukleotidokat és oligonukleotid analógokat alkalmazunk az influenzavírus RNS működésének gátlására. Leírásunkban az oligonukleotid kifejezés olyan polinukleotidokra vonatkozik, amelyek a természetben előforduló bázisokból és furanozil csoportokból állnak, amelyeket természetes foszfodiészter kötések kapcsolnak össze. Ez a kifejezés vonatkozik a természetben előforduló fajtákra, valamint azokra a szintetikus fajtákra, amelyek a természetben alőforduló alegységekből vagy azok közeli homológjaiból állnak.
Az oligonukleotid analóg kifejezés olyan egységekre vonatkozik, amelyek az oligonukleotidokhoz hasonlóan működnek, de amelyek a természetben elő nem forduló részeket is tartalmaznak. Az oligonukleotid analógokban lehetnek megváltoztatott cukoregységek vagy cukrok közötti kötések. Ilyenek például a foszfor-tioát és más kéntartalmú kötések, amelyek használata ismert a szakterületen. Néhány előnyös •44* ve
4 4 44 ·4 • ··« 4♦ <*
4 44 4
444 44 444 444 megvalósítási mód szerint az oligonukleotidnak legalább néhány foszfodiészter kötését olyan struktúrával helyettesítjük, amely úgy működik, hogy fokozza a készítményeknek a sejtek azon régióiba való behatoló képességét, amelyekben a módosítandó RNS vagy DNS aktivitása található. Ezek a helyettesítések előnyösen foszfor-tioát kötéseket, metil-foszfonát kötéseket, illetve rövid szénláncú alkil- vagy cikloalkil-struktúrákat tartalmaznak. Más előnyös megvalósítási módok szerint a foszfodiészter kötéseket más struktúrákkal helyettesítjük, amelyek egyszerre lényegében nem-ionosak és akirálisak, illetve egyéb megvalósítási módok szerint olyan struktúrákkal helyettesíthetjük, amelyek királisak és enantiomer-specifikusak. A szakterületen jártas szakember ki tud választani más kötéseket is a találmány szerinti eljárásban való alkalmazás céljára.
Az oligonukleotid analógok lehetnek olyanok, amelyek legalább néhány módosított bázisformát tartalmaznak. Tehát a természetben általában található purin- és pirimidinszármazékok mellett más purin- és pirimidinszármazékok is használhatók. Hasonlóképpen, a nukleotid alegységek pentofuranozilrészein végzett módosítások is előfordulhatnak, mindaddig, amíg a találmány elvei érvényesülnek.
Az ilyen analógokat legjobban úgy írhatjuk le, hogy funkcionálisan felcserélhetők a természetes oligonukleotidokkal (illetve a természetes oligonukleotidok alapján szintetizált oligonukleotidokkal), de amelyekben egy vagy több, a természetes struktúráktól való eltérés található. Minden ilyen analógot a találmány oltalmi körébe tartozónak tar····«·« • ··· · «·« • · · « · ··· ·« 4·· ··
- 13 tünk, mindaddig, amíg hatékonyan hibridizálódnak az influenzavírus RNS-ével. A találmány szerinti oligonukleotidok és oligonukleotid analógok előnyösen 3-50 alegységet tartalmaznak. Előnyösebb, ha az ilyen oligonukleotidok és analógok 8-25 alegységből, még előnyösebb, ha 10-20 alegységből állnak. Egy alegység egy bázis-cukor kombinációt jelent, amely megfelelő módon kötődik a szomszédos alegységekhez foszfodiészter vagy egyéb kötéseken keresztül.
A találmány szerinti oligonukleotidokat és oligonukleotid analógokat egyszerűen és rutinszerűen készíthetjük a szilárd fázisú szintézis jól ismert módszerével. E szintézishez számos berendezés van forgalomban, beleértve az Applied Biosystems cég berendezését is. A szintézishez azonban bármely egyéb módszer is felhasználható. Az oligonukleotidok aktuális szintézise általában a szintetizáló személy gyakorlatától függ. Az is jól ismert, hogy hasonló technikák használhatók más oligonukleotid analógok szintéziséhez, például a foszfor-tioátok és az alkilezett származékok szintéziséhez .
A szakterületen jártas szakember számára nyilvánvaló, hogy a hírvivő RNS nem csak a fehérjék kódolásához szükséges információt tartalmazza a hárombetűs kódok formájában, hanem tartalmaz egyéb ribonukleotidokat is, amelyek a szakemberek számára ismertek, például az 5' nemtranszIálódő régiót, a 3'nemtranszlálódó régiót, valamint intron/exon kapcsolódási ribonukleotidokat. Tehát az oligonukleotidok és az oligonukleotid analógok a találmány szerint úgy formálhatók, hogy teljes egészében vagy részben ezekre a kapcsolódó ··· ribonukleotidokra, valamint az információhordozó ribonukleotidokra irányuljanak. Az előnyös megvalósítási módok szerint az oligonukleotid vagy az oligonukleotid analóg specifikusan hibridizálódik egy transzkripciós iniciációs helyhez, egy transzlációs iniciációs helyhez vagy egy intron/exon kapcsolódási ponthoz és a 3' nemtranszlálódó régióban található szekvenciához.
A találmány szerinti oligonukleotid specifikusan hibridizálódik az influenzavírus nukleinsavaihoz. Egy előnyös megvalósítási mód szerint az említett nukleinsav lehet az influenza A vagy az influenza B vírus 8 genomiális vRNS-e közül bármelyik, illetve az influenza C vírus 7 genomiális RNS szegmense közül bármelyik, illetve bármelyik említett génből származó (-I-)RNS (mRNS). A megfelelő szekvenciát vagy annak egy részét tartalmazó oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok jól használhatók a találmány szerinti eljárásban. Az 1. ábrán látható az influenza A vírus 5. szegmensének (+)RNS (mRNS) szekvenciája, a 2. ábrán pedig a (-)RNS (vRNS) szekvenciája. A 3. ábrán az influenzavírus 7. szegmensének (+)RNS (mRNS) szekvenciája látható, a 4. ábrán a (-)RNS (vRNS) szekvenciája látható. Az 5. ábrán az influenzavírus 8. szegmensének (+)RNS (mRNS) szekvenciája látható, a 6. ábrán pedig a (-)RNS (vRNS) szekvenciája látható.
A találmány szerinti eljárásban használható oligonukleotidok és oligonukleotid analógok az RNS valamelyik formájával komplementerek, jóllehet valamelyest eltérő mechanizmus szerint, és ezeket úgy terveztük, hogy az egyik RNS szekvenciával vagy annak egy részével szemben antiszen15 szék legyenek, különösen az 5., 7. vagy 8. szegmens szekvenciájával, amelyek az NP, Ml, M2, NS1 és NS2 fehérjékre vonatkozó információkat tartalmazzák. A használható oligonukleotidokat és oligonukleotid analógokat úgy is meg lehet tervezni, hogy komplementerek (azaz antiszenszek) legyenek az 1., 2., 3., 4. vagy 6. szegmenssel, amelyek az RNS polimerázra, a neuraminidázra vagy a hemagglutinin fehérjékre vonatkozó információkat tartalmazzák, illetve az RNS illesztésben vagy a víruspakolásban szerepet játszó RNS szekvenciákkal legyenek komplementerek. Tehát ezek közül az oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok közül előnyösen bármelyik használható a fentiek szerint, illetve bármely hasonló nukleotid, amelyet a szakterületen jártas szakember elő tud állítani az előnyös antiszensz célpontokról szerzett ismeretek alapján, azzal a céllal, hogy befolyásolja az influenzavírus-fertőzést. A találmány számos előnyös megvalósítási módját mutatjuk be az alábbi, nem korlátozó jellegű példákban. Az előnyösen módosítandó genomiális vagy mRNS fajták közé tartozik a vírus NP, Ml, M2, NS1 és NS2 fehérjéje. Más, előnyös cél-RNS-ek közé tartozik az 1., 2., 3., 4. vagy 6. szegmens, amelyek a polimeráz 3, polimeráz 1, polimeráz 2, hemagglutinin vagy neuraminidáz géneket vagy az illesztési, illetve pakoláshoz szükséges szekvenciákat tartalmazzák. A szakterületen jártas szakember számára nyilvánvaló, hogy a találmány szerinti megoldás általánosan használható. Ezen influenza RNS-ek gátlásától várható, hogy a betegség kezelésében jelentős terápiás előnyökkel rendelkeznek.
A találmány szerinti megoldást a következő példákkal szemléltetjük a korlátozás szándéka nélkül.
1. példa
Influenza A vírus (Ann Arbor H2N2 törzs) gátlása
Egy sorozat antiszensz oligonukleotid szekvenciát választottunk ki, amelyek komplementerek az influenza A vírus Ann Arbor H2N2 törzzsel. A kiválasztott oligonukleotid-szekvenciák komplementerek az 5., 7. és 8. szegmens vRNSével, valamint az ezekről a szegmensekről keletkező mRNSsel, amelyek az NP fehérjét (5. szegmens) , az Ml, M2 fehérjét (7. szegmens) és az NS1, NS2 fehérjéket (8. szegmens) kódolják. A kiválasztott szekvenciák és a pontos megcélzott régió a 2. táblázatban látható.
2. táblázat Influenza A, Ann Arbor H2N2 törzs elleni antiszensz oligonukleotidok
Szekv. I sz. | Szekvencia (5'-3') | Megcélzott RNS régió | ||||||
1250 | TTA | TCT | ACC | CTG | CTT | TTG | CT | 5. szegmens (+)RNS távoli 5' vég |
1251 | TGG | GAC | GCC | ATG | ATT | TTG | AT | 5. szegmens (+)RNS transzláció iniciációja |
1252 | TTT | GGT | GCC | TTG | GGA | CGC | CA | 5. szegmens (+)RNS transzláció iniciációja |
1253 | GGA | TCC | TTC | CCG | GCG | CTG | GG | 5. szegmens (+)RNS 292-es pozíció |
1254 | AGT | AGA | AAC | AAG | GGT | ATT | TT | 5. szegmens (+)RNS távoli 3' vég |
1255 | AAA | ATA | CCC | TTG | TTT | CTA | CT | 5. szegmens (-)RNS távoli 5' vég |
1256 | TGA | GTG | ACA | TCA | AAA | TCA | TG | 5. szegmens (-)RNS közeli 3' vég |
1257 | AGC | AAA | AGC | AG | GTA | GAT | AA | 5. szegmens (-)RNS távoli 3' vég |
1258 | AAT | ATC | TAC | CTG | CTT | TTG | CT | 7. szegmens (+)RNS távoli 5' vég |
1259 | TAG | AAG | ACT | CAT | CTT | TCA | AT | 7. szegmens (+)RNS transzláció iniciációja |
1260 | GAG | AGA | ACG | TAC | GTT | TCG | AC | 7. szegmens (+)RNS 5' illeszkedési pont |
1261 | TCG | GCT | TTG | AG | GGG | CCT | GA | 7. szegmens (+)RNS 74-es pozíció |
1262 | CTG | ATA | CGC | CTG | CAA | ATT | TT | 7. szegmens (+)RNS 3' illesztési pont |
1263 | AGT | AGA | AAC | AAG | TGA | GTT | TT | 7. szegmens (+)RNS távoli 3' vég |
1264 | AAA | ACT | ACC | TTG | TTT | CTA | CT | 7. szegmens (-)RNS távoli 5' vég |
1265 | TCA | GGC | CCC | CTC | AAA | GCC | GA | 7. szegmens (-)RNS közeli 3' vég |
1266 | AGC | AAA | AGC | AGG | TAG | ATA | TT | 7. szegmens (-)RNS távoli 3· vég |
1267 | TTT | GTC | ACC | CTG | CTT | TTG | CT | 8. szegmens (+)RNS távoli 5· vég |
1268 | GTG | TTA | TTA | TCC | ATT | ATG | TC | 8. szegmens (+)RNS transzláció iniciációja |
1269 | AGC | AAT | CTA | CCT | GAA | AGC | TT | 8. szegmens (+)RNS 5· illeszkedési pont |
1270 | TAG | TAT | GTC | CTG | GAA | GAG | AA | 8. szegmens (+)RNS 3· illeszkedési pont |
1271 | AGT | AGA | AAC | AAG | GGT | GTT | TT | 8. szegmens (+)RNS távoli 3’ vég |
1272 | AAA | ACA | CCC | TTG | TTT | CTA | CT | 8. szegmens (-)RNS távoli 5’ vég |
1273 | GCC | TCC | GCA | CCT | GCT | TCG | CG | 8. szegmens (-)RNS közeli 3' vég |
1274 | AGC | AAA | AGC | AGG | GTC | ACA | AA | 8. szegmens (-)RNS távoli 3' vég |
Az influenzavírusok gátlását a szakterületen jártas szakember számára ismert módszerekkel vizsgáltuk. Például az olyan sejtek, mint a humán embrionális tüdő sejtvonal (MRC5) vagy a Madin-Darby kutyavese (MDCK) sejtvonal könnyen fertőzhetők az influenzavírussal sejttenyészetben. A sejteket tenyésztettük, öblítettük és 0,001-0,01 fertőzési multiplicitással (M.O.I.) kezeltük a vírussal. Miután hagytuk, hogy a fertőzés lejátszódjon, a fölöslegben levő vírust lemostuk, és antiszensz oligonukleotid analógokat adtunk hozzá 25-50 μπιοί/ΐ koncentrációban, illetve a megfelelő hígításokban. Az egyes hígításokhoz három-három mélyedést használtunk. Az 5-7 napig tartó kezelés végén a vírussal fertőzött sejteket eltávolítottuk, homogenizáltuk, és az influenzavírus fertőzőképességét meghatároztuk oly módon, hogy mértük a keletkező tarfoltok számát, amelyek akkor keletkeztek, amikor a kivonat hígításait MRC5 sejtek rétegére szélesztettük. A pozitív hatóanyag hatásként határoztuk meg, ha a hatóanyaggal való kezelés következtében csökkent az influenzavírus fertőzőképessége. A kezeletlen kontrolihoz viszonyítva legalább tízszeres csökkenés várható.
2. példa
RNS indító molekula utánzók
Ismeretes, hogy az influenza által fertőzött sejtekben a vírus által kódolt mRNS transzkripciójához a sejtben levő RNS polimeráz és a virális RNS polimeráz között együttműködésre van szükség, mert a virális RNS polimerázból hiányzik az a képesség, hogy közvetlenül iniciálja a transz19
kripciót vagy helyesen zárja le, illetve metilezze az mRNS 5' végét. A virális polimeráz egy sejt eredetű RNS polimerázt hív segítségül, lehasítja a sejt eredetű mRNS első 10-15 nukleotidját, és arra használja, hogy beindítsa a saját mRNS-ének a transzkripcióját. A sejt eredetű mRNS alkotja az indító molekulát. A vizsgál metabolizmus egyedi volta lehetőséget nyújt arra, hogy olyan antiszensz oligonukleotidokkal gátoljuk a folyamatot, amelyek a (-)RNS (vRNS) szegmensek 3' végével komplementerek, és amelyek 10-15 nukleotid hosszan kinyúlnak az antiszensz oligonukleotid 5' oldalán, amint azt a 7. ábrán jelöljük.
Az említett megvalósítási módokban előnyösen használható antiszensz oligonukleotidok 2'-helyettesített oligonukleotidok, amelyek utánozzák az RNS szerkezetét és fokozzák a virális polimerázhoz való kötődést. A találmány néhány megvalósítási módjában általában előnyös, ha a kapcsoló cukoregységeknek a 2' pozíciója az oligonukleotidoknak vagy az oligonukleotid analógoknak legalább egy részében helyettesítve van. A következő szubsztituensek lehetnek előnyösek: OH, SH, F, 0CH3, OCN, O(CH2)nCH3, ahol n értéke 1 és 10 közötti, valamint egyéb, hasonló tulajdonságokkal rendelkező szubsztituensek. Az antiszensz oligonukleotid 5' végét adott esetben egy tipikus celluláris mRNS-hez vagy egy lezáró struktúra analóghoz hasonló szerkezetű véggel látjuk el. A szakterületen jártas szakember számára ismert néhány módszer lezáró struktúrával rendelkező oligonukleotidok előállítására. A lezáró struktúrával rendelkező oligonukleotidok előállítására szolgáló módszerek ismertek a szakterületen jártas szakember számára. Néhány, lezáró struktúrával rendelkező oligonukleotid előállítására vonatkozó eljárást ismertet a szakirodalom [Yisraeli and Méltón, Methods in Enzymology, 180, 42-50 (1989), valamint az ott idézett publikációk]. Adott esetben az antiszensz oligonukleotid egy 3' dezoxinukleotidot vagy más nukleotid analógot tartalmaz, amely nem hosszabbítható az RNS polimerázzal, mivel hiányzik róla a 3' hidroxil csoport, amelyet az enzim az RNS lánc hosszabbítására használ. Az ilyen láncterminációs inhibitorok használata számos biokémiai folyamatban általános. Láncterminációs oligonukleotidokat használnak például a DNS szekvencia meghatározásánál a Sanger-féle módszer esetében [Sanger, F., Nicklen, S., and A.R. Coulson, Proceeding of the National Academy of Sciences, USA, 74., 5463-5467 (1977)]. Ennek a módszernek az alkalmazásával az alábbi oligonukleotidokról véltük úgy, hogy jó célpontjai az antiszensz terápiának (szintetizáltuk, majd vizsgáltuk az antivirális aktivitásukat az 1. példában leírtak alapján):
UCUCCCUCUCAGAGCGAAAGCAGGTCAAUUAU
UCUCCCUCUCAGAGCGAAAGCAGGCAAACCAU UCUCCCUCUCAGAGCGAAAGCAGGTACTGATT UCUCCCUCUCAGCAAAACCUUCCCGGAAAUGA UCUCCCUCUCAGAGCAAAAGCAGGGUAGAUAA UCUCCCUCUCAGAGCAAAAGCAGGAGUGAAAA UCUCCCUCUCAGAGCAAAAGCAGGUAGAUAUU UCUCCCUCUCAGAGCAAAAGCAGGGUGACAAA • ··
3. példa
Az oligonukleotidok és oligonukleotid analógok szintézise és jellemzése
A módosítatlan oligonukleotidokat automatizált DNS szintatizátorral (Applied Biosystems model 380B) állítottuk elő, az ismert foszforamidit módszerrel, valamint jódos oxidációval. A β-ciano-etil-diizopropil-foszforamiditeket az Applied Biosystems-től vásároltuk (Foster City, CA). A foszfor-tioát oligonukleotidok esetében a standard oxidációs palackot egy olyannal helyettesítettük, amely 3H-1,2-benzoditiazol-3-on-l,1-dioxid 0,2 mol/l-es acetonitriles oldatát tartalmazta, azzal a céllal, hogy a foszfit kötéseket lépésenként alakítsuk át ként tartalmazó kötésekké. A kénbeviteli ciklus várakozási lépését 68 másodpercre növeltük, majd ezt követte a lezáró struktúrát bevivő lépés. A 2'-O-metil-foszfor-tioát oligonukleotidokat 2'-O-metil-B-cianoetil-diizopropil-foszforamiditek alkalmazásával szintetizáltuk (Chemgenes, Needham, MA), és a módosítatlan oligonukleotidok standard ciklusát, a tetrazol impulzus-bejuttatása utáni várakozási lépés kivételével 360 másodpercre növeltük. A 2'-dezoxiribonukleotidot használtuk a szintézis kezdő 3'-bázisaként. A kontrollált pórusméretű üvegoszlopról (Applied Biosystem) való lehasítás után, valamint a tömény ammónium-hidroxiddal 18 óra hosszat 55 °C-on végzett védőcsoport-eltávolítás után az oligonukleotidokat tisztítottuk, kétszer kicsapva 0,5 mol/1 NaCl-ból 2,5 térfogat etanollal. Az analitikai gélelektroforézist 20 % akrilamid, 8 mol/1 karbamid, 45 mmol/1 TRIS-borát puffer (pH=7,0) összetételű gélben vé····
- 22 geztük. Az oligonukleotidokat és foszfor-tioát analógjaikat azon az alapon ítéltük meg, hogy több mint 80 %-ban a teljes hosszúságú anyagot tartalmazzák-e.
Az ezen szintézissel kapott foszfor-tioát és foszfodiészter kötések arányát periodikusan ellenőriztük 31P-NMR spektroszkópiával. A spektrumot szobahőmérsékleten vettük fel, oldószerként deutérium-oxidot vagy szulfoxid-dg-ot használva. A foszfor-tioát minták általában egy százaléknál kevesebb foszfodiészter kötést tartalmaztak.
4. példa
Az oligonukleotid analógok azon képességükre nézve történő átvizsgálása, hogy mennyire gátolják a virálisan indukált citopatikus hatást (CPE)
Az antiszensz vegyületek antivirális hatását gyorsan meg lehet határozni oly módon, hogy ellenőrizzük az influenzavírus által indukált citopatikus hatás gátlását. Mivel ehhez a vizsgálathoz az egysejtréteg mikroszkópos vizsgálata szükséges, ezért végrehajtható mikrotitráló lemez mélyedéseiben, ezzel csökkentve a kezdeti vizsgálatokhoz szükséges oligonukleotid mennyiségét. Ezt a vizsgálati módszert az antivirális hatás gyors primer szűrővizsgálataként alkalmaztuk.
Az A/PR/8/34 típusú influenzavírust MDCK egysejtréteges kultúrákban, Eagles féle MÉM + 2 % borjúembrió-szérum összetételű táptalajba oltottuk át és előnövesztettük. Az antivirális vizsgálatokhoz a vírust táptalajban hígítot tuk 32 CCID5Q (50 %-os sejttenyészet fertőző dózis) értékre, ·· ·· · ··· ··
mélyedésenként 0,1 ml tenyészetben.
Összesen 32 oligonukleotid foszfor-tioát analógot készítettünk a 3. példában leírtak alapján és -20 °C-on tároltuk. Közvetlenül a felhasználás előtt a vegyületeket megolvasztottuk, és táptalajban sorozathigítást készítettünk belőlük 0,5 logio koncentrációkban, azaz 20, 6,4, 2,0, 0,6, 0,2 és 0,06 Mmol/l koncentrációban.
Az ismert Ribavirin nevű aktív vegyületetet az oligonukleotidokkal együtt értékeltük ki, ez volt a pozitív kontroll.
Az MDCK sejteket egysejtréteg formájában előnövesztettük COSTAR 96-mélyedéses szövettenyésztő lemezeken, alkalmas szövettenyésztő táptalaj alkalmazásával. Az antivirális vizsgálatokat úgy terveztük, hogy az egyes vegyületek hat koncentrációját értékeltük a kihívó vírussal szemben három párhuzamosban. A csak táptalajt tartalmazó sejtkontrollokat, a csak táptalajjal kezelt vírussal fertőzött sejtkontrollokat, és a nem fertőzött hatóanyag toxicitási kontrollokat (sejt és a hatóanyag) is felvittük az egyes lemezekre.
A gazdasejt tenyészeteket (a vizsgálati mélyedéseket és a hatóanyag toxicitási kontrollt) 18 óra hosszat 37 °C-on, 2 % CO2~t tartalmazó nedvesített atmoszférában előkezeltük mélyedésenként az egyes hatóanyag koncentrációkból vett 0,2 ml oldattal. Azokat a sejttenyésztő mélyedéseket, amelyek vírus kontrollok voltak, valamint a sejt kontrollokat ál-kezelésnek vetettük alá 18 óra hosszat a kísérleti táptalajjal (MEM+2% borjúembrió-szérum).
• ··· ·; · .· - ··· ·.·. · • ···
A 18 órás előkezelés után a folyadékokat eltávolítottuk a lemez mélyedéseiből és az egysejtrétegeket a táptalajjal öblítettük. Ezután mindegyik vizsgálati és vírus kontroll tenyészet mélyedést 0,1 ml vírusszuszpenzióval hoztuk érintkezésbe 1 óra hosszat 37 °C-on. A hatóanyag toxicitási és a sejt-kontroli tenyészeteket ál-kezelésnek vetettük alá mélyedésenként 0,1 ml táptalajjal.
A vírus adszorpciós periódus után a folyadékokat leszívtuk a mélyedésekről és az egysejtrétegeket táptalajjal mostuk, hogy minden nem adszorbeálódott vírust eltávolítsunk. A három párhuzamosban levő vírus-fertőzött tenyészetekhez és a két citotoxicitási kontrolihoz az egyes hatóanyag koncentrációkból 0,2 ml alikvot részeket adtunk. A kezeletlen vírus kontroll és sejt kontroll tenyészeteket 0,2 ml kísérleti táptalajjal tápláltuk. A lemezeket 37 °C-on inkubáltuk CO2 inkubátorban, ameddig maximális CPE (citopatogén hatás) nem volt észlelhető a vírus kontroll tenyészetekben (3 nap).
A sejttenyészet mélyedéseket mikroszkóposán vizsgáltuk a CPE és a hatóanyag toxicitás szempontjából. Az antivirális aktivitást úgy határoztuk meg, hogy kiszámítottuk a vírussal indukált, vírussal kezelt sejttenyészetekben a vírus-indukálta CPE gátlásának százalékát, a vírus-érték (VR) alapján. A VR az antivirális aktivitás standard súlyozott mérése, figyelembe véve mind a CPE gátlás, mind a hatóanyag toxicitás mértékét, és Ehrlich és munkatársai módszerének [Ann. N.Y. Acad. Sci., 130. 5-16 (1965)] módosításával határoztuk meg, az alábbiak szerint. A CPE mértékét az egyes
mikrotiter lemez mélyedésekben levő tenyészetekre az alábbi skála szerint határoztuk meg:
= a sejtek 100 %-át érinti a vírus;
3 = | a | sejtek | 75 | %-át | érinti | a | vírus; |
2 = | a | sejtek | 50 | %-át | érinti | a | vírus; |
1 = | a | sejtek | 25 | %-át | érinti | a | vírus; |
= nincs CPE; normális egysejtréteg;
u = nem kielégítő teszt (fertőzés, gyenge válasz) t = a hatóanyag toxikus a sejtekre;
CPE nem figyelhető meg;
p = a hatóanyag részlegesen toxikus a sejtekre; az egysejtréteg érintetlen, ezért a CPE megf igyelhet ő.
A VR-t úgy számítottuk ki, hogy a tenyésztő lemezen az egyes teszt-mélyedések és az azoknak megfelelő víruskontroli feljegyzett CPE értéke közötti számbeli különbség összegét 0,1-gyel szoroztuk. A részlegesen citotoxikus (p) hatóanyag koncentrációt tartalmazó teszt mélyedések, és az ezeknek megfelelő vírus kontrollok közötti numerikus különbséget feleztük.
Tapasztalataink szerint az 1,0 vagy nagyobb VR azt jelenti, hogy jelentős az antivirális aktivitás, és jól reprodukálható az ellenőrző in vitro tesztekben. Ezért minden olyan vegyületet, amely 1,0 vagy annál nagyobb VR értéket mutatott, aktívnak tekintettünk (+). Minden olyan hatóanyagot, amelynek a VR értéke 0,5-0,9 közötti, lehetséges vagy marginális aktivitásúnak tekintettünk (±), és minden olyan
- 26 ~ anyagot, amelynek a VR értéke 0,5 vagy annál kisebb, a mi vizsgálati rendszerünkben inaktívnak tekintettünk.
A CPE-t 50 %-kal csökkentő minimális gátló hatóanyag koncentrációt (MIC50 vagy ID50) úgy határoztuk meg, hogy egy regressziós elemző programot használtunk a féllogaritmikus görbeillesztéshez. Az érzékeny vírusokra nézve aktív hatóanyagok terápiás indexét úgy határoztuk meg, hogy a vizsgált vegyületek minimális citotoxikus koncentrációját a MICsq értékkel osztottuk.
Először nyolc kiválasztott influenza RNS célpont elleni foszfor-tioát analógot vizsgáltunk, két nonszensz kontrollal. Ezeknek az oligonukleotid analógoknak a szekvenciáját és célpontjait a 3. táblázatban mutatjuk be.
3. táblázat Antivirális aktivitásra vizsgált oligonukleotid analógok (foszfor-tioát)
Szekv. ISIS sz. sz. Szekvencia Célpont
1 | 2792 | AGC AAA | AGC AGG GTG ACA AA | vRNS, gátolja a 8. szegmens transzkripciój át |
2 | 2793 | AGC GAA | AGC AGG TAG ΑΤΑ TT | vRNS, gátolja a 7. szegmens transzkripcióját |
3 | 2794 | GTG TTT | GGA TCC ATT ATG TC | mRNS, nem-szerkezeti fehérjék AUG-je, 8. szegmens |
4 | 2795 | TAG AAG | ACT CAT CTT TCA AT | mRNS, mátrix fehérjék AUG-je, 7. szegmens |
5 | 2796 | GCA ATC | TAC CTG AAA GCT TG | mRNS, az NS-2 illeszkedési pontja, 8. szegmens |
6 | 2797 | AGA GAA | CGT ACG TTT CTA CC | mRNS, az M2 illeszkedési pontja, 7. szegmens |
7 | 2798 | AAA ACA | CCC TTG TTT CTA CT | vRNS, 5' vég pakolási szekvencia, 8. szegmens |
8 | 2799 | AAA ACT | ACC TTG TTT CTA CT | vRNS, 5’ vég pakolás! szekvencia, 7. szegmens |
9 | 2800 | GGG AAA | CCA ACG GAA ATA AG | Nonszens kontroll oligo |
10 | 2801 | CAA CCA | AAA AGA TAA TCT CA | Nonszensz kontroll |
oligo
A CPE-gátlási vizsgálatok eredményeinek összefoglalása a
4. táblázatban látható.
·
- 28 4. táblázat
Az ISIS vegyületek influenzavírus A/PR/8/34 típusa elleni antivirális aktivitása eredményeinek összefoglalása MDCK sejttenyészetben, CPE-gátlási vizsgálat alkalmazásával
ISIS sz. | VR1 | ID25q(Mmol/1) | MTC3(Mmol/l) | TI4 |
2792 | 1,0 | 13,92 | >20 | >1,43 |
2793 | 0 | - | >20 | - |
2794 | 1,1 | 12,58 | >20 | >1,59 |
2795 | 0,5 | - | >20 | - |
2796 | 0,5 | - | >20 | - |
2797 | 0,7 | 16,99 | >20 | >1,18 |
2798 | 0,7 | 19,98 | >20 | >1,0 |
2799 | 0,8 | - | >20 | - |
2800 | 3,5 | 1,11 | >20 | 17,95 |
2801 | 0,4 | - | >20 | - |
Ribavirin | 1 3,6 | 5,65 ~g/ml | 100 gg/ml | 17,69 |
1VR = Vírus Érték: A szelektív antivirális aktivitás mérése, amely figyelembe veszi a vírus által indukált citopatogén hatásokat (CPE) és a teszt vegyület által okozott citotoxicitás mértékét, Ehrlich és munkatársai módszerének módosításával meghatározva [Ann. N.Y. Acad. Sci., 130, 5-16 (1965)]. Tapasztalataink szerint az 1,0 vagy annál nagyobb VR érték határozott (+) antivirális aktivitást jelez, a 0,5-0,9-es VR érték gyenge vagy közepes (±) antivirális aktivitást jelent, és a <0,5 VR érték általában azt jelenti, hogy nincs (-) jelentős antivirális aktivitás.
2ID5q (MIC50) = Az a minimális hatóanyag koncentráció, amely a CPE-t 50 %-kal gátolja, féllogaritmikus görbeillesztéses regressziós elemzési program alkalmazásával számítva.
··
- 29 3MTC = Az a minimális hatóanyag koncentráció, amely egyáltalán citotoxicitást okoz (mikroszkópos megfigyelés). Az MTT-vel megfigyelt hatóanyag citotoxicitást a 7. táblázatban mutatjuk be.
4TI = Terápiás index, úgy számítjuk ki, hogy a minimális citotoxikus hatóanyag koncentrációt az IDsQ-nel osztjuk.
Három vegyület, az ISIS 2792 (1. szekvencia) , az ISIS 2794 (3. szekvencia) és az ISIS 2800 (9. szekvencia) rendelkezett 1,0 vagy annál nagyobb vírus értékkel; de a legnagyobb értékkel rendelkező vegyiilet (ISIS 2800, 9. szekvencia) az egyik nonszensz kontroll volt.
Egy 22 analógból álló második sorozatot is készítettünk és vizsgáltunk. Ezeknek az oligonukleotidoknak a szekvenciáját és a célpontjait az 5. táblázatban mutatjuk be.
··
1
- 30 5. táblázat Antivirális aktivitásra vizsgált oligonukleotid analógok (foszfor-tioát)
Szekv. ISIS sz. sz. Szekvencia Célpont
11 | 3302 | GGG AAA CCA ACG GAA ATA AG | nonszensz kontroll |
12 | 3303 | CTT TCC ATA TTG AAT ATA AT | AUG 1. szegmens polimeráz 3 |
13 | 3304 | ACA TCC ATT CAA ATG GTT TG | AUG 2. szegmens, polimeráz 1 |
14 | 3305 | TCT TCC ATT TTG GAT CAG TA | AUG 3. szegmens, polimeráz 2 |
15 | 3306 | GCC TTC ATT TTG GTT GTT TT | AUG 4. szegmens, hemagglutinin |
16 | 3307 | GAC GCC ATG ATT TTG ATG TC | AUG 5. szegmens, nukleoprotein |
17 | 3308 | GGA TTC ATT TTA AAC CCC TG | AUG 6. szegmens, neuraminidáz |
18 | 3309 | AGA CTC ATC TTT CAA TAT CT | AUG 7. szegmens, mátrix fehérje |
19 | 3310 | GAT AGA GAG AAC GTA CGT TT | baloldali illesztési pont, 7. szegmens |
20 | 3311 | TCT GAT AGG CCT GCA AAT TT | jobboldali illesztési pont, 7. szegmens |
21 | 3312 | GGA TCC ATT ATG TCT TTG TC | AUG 8. szegmens, nemszerkezeti fehérje |
22 | 3313 | CAT GTC GGT TAG GTA ACG CG | illesztési ág, 8. szegmens |
23 | 3314 | GCA ATC TAC CTG AAA GCT TG | jobboldali illesztési pont, 8. szegmens |
24 | 3315 | AGC AGT ATC TCC TGG AAG AG | baloldali illesztési pont, 8. szegmens |
25 | 3316 | AAA ACG ACC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 1. szegmens |
26 | 3317 | AAA AAT GCC TTT TTC CTA CT | pakoló szekvencia, 2. szegmens |
27 | 3318 | AAA AGT ACC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 3. szegmens |
28 | 3319 | AAA ACA CCC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 4. szegmens |
29 | 3320 | AAA ATA CCC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 5. szegmens |
30 | 3321 | AAA AAC TCC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 6. szegmens |
31 | 3322 | AAA ACT ACC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, 7. szegmens |
32 | 3323 | AAA ACA CCC TTG TTT CTA CT | pakoló szekvencia, |
8. szegmens
- 31 ί··.
•·
A CPE-gátlási vizsgálatok eredményeinek összefoglalása a 6. táblázatban látható.
6. táblázat
Az ISIS vegyületek influenzavírus A/PR/8/34 típusa elleni antivirális aktivitása eredményeinek összefoglalása MDCK sejttenyészetben, CPE-gátlási vizsgálat alkalmazásával
ISIS VR1
ID2 50(Aímol/l) MTC3(Mmol/l) TI4
3302 | 1/1 | 12,7 | >20 | >1,6 | |
3303 | 0,8 | 14,7 | >20 | >1,4 | |
3304 | 0,8 | 17,4 | >20 | >1,2 | |
3305 | 2,0 | 3,9 | >20 | >5,2 | |
3306 | 2,6 | 2,0 | >20 | >9,8 | |
3307 | 3,2 | 1,8 | >20 | >11,4 | |
3308 | 2,6 | 3,1 | >20 | >6,6 | |
3309 | 2,1 | 4,5 | >20 | >1,6 | |
3310 | 1/1 | 12,7 | >20 | >1,6 | |
3311 | 2,8 | 1,0 | >20 | >19,8 | |
3312 | 1,6 | 7,0 | >20 | >2,8 | |
3313 | 2,3 | 3,7 | >20 | >5,5 | |
3314 | 1,2 | 12,8 | >20 | >1,6 | |
3315 | 2,6 | 2,1 | >20 | >9,6 | |
3316 | 1,3 | 8,1 | >20 | >2,5 | |
3317 | 1,3 | 12,4 | >20 | >1,6 | |
3318 | 1,2 | 12,7 | >20 | >1,6 | |
3319 | 3,6 | 0,9 | >20 | >23,5 | |
3320 | 1,1 | 11,3 | >20 | >1,8 | |
3321 | 2,7 | 2,4 | >20 | >8,3 | |
3322 | 2,1 | 2,9 | >20 | >1,4 | |
3323 | 1,0 | 14,2 | >20 | >1,4 | |
Ribavirin | 4,1 | 2,3 | Mg/ml | 32 Mg/ml | 13,9 |
(+ kontroll) Ribavirin | 3,9 | 2,6 | gg/ml | 32 Mg/ml | 12,2 |
1 VR = Vírus érték: A | szelektív | antivirális | aktivitás | mér- |
téke, amely figyelembe veszi az vírus által indukált citopatogén hatások (CPE) gátlásának mértékét, valamint a vizsgált vegyület által mutatott citotoxicitás fokát, Ehrlich és munkatársai módszerének módo-
sításával meghatározva [Ann. N.Y. Acad. Sci., 130,
5-16 (1965)]. Tapasztalataink szerint az 1,0 vagy annál nagyobb VR érték határozott (+) antivirális aktivitást jelez, a 0,5-0,9-es VR érték gyenge vagy közepes (±) antivirális aktivitást jelent, és a <0,5 VR érték általában azt jelenti, hogy nincs (-) jelentős antivirális aktivitás.
2ID5q (MIC5Q) = Az a minimális hatóanyag koncentráció, amely a CPE-t 50%-kal gátolja, féllogaritmikus görbeillesztéses regressziós elemzési program alkalmazásával számítva.
3MTC = Az a minimális hatóanyag koncentráció, amely egyáltalán citotoxicitást okoz (mikroszkópos megfigyelés) . Az MTT-vel megfigyelthatóanyag citotoxicitást a 7. táblázatban mutatjuk be.
4TI = Terápiás index, úgy számítjuk ki, hogy a minimális citotoxikus hatóanyag koncentrációt az ID5Q-nel osztjuk.
Az összes vizsgált hatóanyag aktív volt az influenza A vírussal szemben. Csak két vegyületnek, az ISIS 3303-nak (12. szekvencia) és az ISIS 3304-nek (13. szekvencia) volt 1-nél kisebb a vírus értéke. A leghatékonyabb vegyületek közé tartozott az ISIS 3307 (16. szekvencia; VR 3,2) és az ISIS 3319 (28. szekvencia; VR 3,6). A legnagyobb hatékonyságot és szelektivitást az ISIS 3311, (20. szekvencia; VR 2,8, ID50 1,0 Mmol/l és TI>19,8), valamint az ISIS 3319 mutatta (28. szekvencia, ID50 0,9 és TI>23,5). Az ID50 és TI értékeket az első tizedesjegyre kerekítettük a számítás
- 33 ·· *
•·· *· »·β után. Jóllehet a pozitív kontroll, a Ribavirin aktívabb volt, mint a vizsgált vegyületek a VR alapján, az ISIS 3311 (20. szekvencia) és az ISIS 3319 (28. szekvencia) sokkal hatékonyabb volt a kihívó vírussal szemben, mint a pozitív kontroll hatóanyag, amit a magasabb terápiás index is mutat.
4. példa
Oligonukleotidok citotoxicitásának MTT vizsgálata
Amellett, hogy a hatóanyag citotoxicitását kontroll sejttenyészeteken vizsgáltuk oly módon, hogy mikroszkóposán ellenőriztük a nagy morfológiai változásokat, a hatóanyag citotoxicitásának a mértékét mennyiségileg is meghatároztuk, MTT alkalmazásával. Ezzel a módszerrel a sejtek életképességét mérjük. A módszer a 3-(4,5-dimetil-tiazol-2-il)-2,5-difenil-tetrazólium-bromid) (MTT) redukcióján alapszik, amit az életképes gazdasejtek mitokondriuma végez, ekkor MTT-formazán keletkezik [T. Mossman, J. Immunoi. Methods, 65. 55 (1983)]. A hatóanyag citotoxicitási kontrollokat és a sejt kontrollokat MTT-vel, majd SDS-sel kezeltük az MTTformazán kristályok feloldása céljából. Az MTT-formazán kék színét spektrofotometriásán mértük 570 nm-en, egy automata lemezleolvasóval. A hatóanyag toxicitását (életképesség) úgy határoztuk meg, hogy az egyes hatóanyag citotoxicitási kontrollok abszorbanciáját (optikai sűrűség, O.D.) a sejt-kontroli átlagos O.D.-jával hasonlítottuk össze, és a kontroll százalékában fejeztük ki.
A vizsgált 32 vegyület közül egyik sem volt toxikus 20 μιηοΐ/ΐ koncentrációban, amely a vizsgált legmagasabb dó
A • · ·
- 34 zis volt, mikroszkópos kiértékelés alapján (4. és 5. táblázat), illetve az MTT vizsgálat alapján (7. és 8. táblázat).
7. táblázat
Hatóanyaggal kezelt MDCK sejt kontroll tenyészetek eletképessége1 az MTT vizsgálat alapján
Kontroll százaléka
Vegyület
sz. | 20 | 6,4 | 2,0 | 0,64 | 0,2 | 0,06[μπΐο1/1] |
2792 | 99 | 99 | 97 | 96 | 93 | 91 |
2793 | 98 | 100 | 96 | 96 | 92 | 91 |
2794 | >100 | >100 | >100 | >100 | 96 | 93 |
2795 | >100 | 99 | >100 | 98 | 91 | 90 |
2796 | 97 | >100 | 99 | 94 | 91 | 91 |
2797 | 98 | 99 | 98 | 94 | 90 | 91 |
2798 | 94 | 98 | 97 | 96 | 89 | 89 |
2799 | 96 | 99 | >100 | 98 | 93 | 93 |
2800 | >100 | 99 | 100 | 93 | 94 | 92 |
2801 | 98 | >100 | 100 | 98 | 92 | 93 |
320 | 100 | 32 | 10 | 3,2 | 1,0 [gg/ml] | |
Ribavirin | 56 | 58 | 63 | 78 | 86 | 94 |
^Életképesség (hatóanyag citotoxicitás) meghatározása oly módon, hogy összehasonlítjuk az egyes hatóanyagok citotoxicitási kontroll abszorbanciáját (optikai sűrűség, OD) a kezeletlen sejt kontroll tenyészetek átlagos OD-jával, majd a kontroll százalékában fejezzük ki.
8. táblázat Hatóanyaggal kezelt MDCK sejttenyészetek életképességének1 összehasonlítása az MTT vizsgálattal
A kontroll százaléka Vegyület
sz. | 20 | 6,4 | 2,0 | 0,64 | 0,2 | 0,06[gmol/l] |
3302 | 100 | 100 | 100 | 99 | 91 | 94 |
3303 | 100 | 100 | 100 | 96 | 93 | 89 |
3304 | 100 | 100 | 100 | 100 | 95 | 91 |
3305 | 97 | 100 | 100 | 99 | 96 | 92 |
3306 | 100 | 100 | 100 | 100 | 98 | 97 |
3307 | 95 | 100 | 100 | 100 | 100 | 100 |
3308 | 98 | 97 | 95 | 96 | 93 | 93 |
3309 | 96 | 93 | 97 | 94 | 93 | 96 |
3310 | 96 | 95 | 92 | 93 | 88 | 91 |
3311 | 90 | 88 | 89 | 92 | 92 | 93 |
3312 | 95 | 93 | 93 | 93 | 90 | 94 |
3313 | 96 | 97 | 96 | 96 | 94 | 92 |
3314 | 89 | 95 | 98 | 97 | 94 | 93 |
3315 | 89 | 95 | 95 | 96 | 97 | 93 |
3316 | 90 | 95 | 93 | 92 | 91 | 89 |
3317 | 94 | 92 | 93 | 91 | 91 | 89 |
3318 | 93 | 97 | 93 | 93 | 90 | 91 |
3319 | 94 | 99 | 97 | 99 | 97 | 97 |
3320 | 95 | 100 | 100 | 100 | 96 | 93 |
3321 | 98 | 98 | 99 | 97 | 99 | 92 |
3322 | 98 | 99 | 100 | 99 | 96 | 91 |
3323 | 100 | 100 | 100 | 100 | 99 | 100 |
320 | 100 | 32 | 10 | 3,2 | 1,0 [Mg/ml] | |
Ribavirin | 35 | 52 | 52 | 80 | 98 | 96 |
Ribavirin | 37 | 55 | 57 | 83 | 97 | 96 |
^•Életképesség (hatóanyag citotoxicitás) meghatározása oly módon, hogy összehasonlítjuk az egyes hatóanyagok citotoxicitási kontroll abszorbanciáját (optikai sűrűség, OD) a kezeletlen sejt kontroll tenyészetek átlagos OD-jával, majd a kontroll százalékában fejezzük ki.
Ezen aktív anyagoknak a szelektivitása ennélfogva • <·
- 36 ~
nagyobb lehet, mint amit ezekkel a vizsgálatokai igazoltunk.
5. példa
RNS minikri a virion kialakulás gátlására
Az influenzavírus ciklusának egyik fontos része a virion kialakulása, összeszerelődése. Ebben a folyamatban a vírusnak választania kell a nyolc egyedi virális RNS szekvencia (vRNS) közül egyet, hogy azt egy komplett (fertőzőképes) virionba beépítse. Ennek a folyamatnak egy fontos része a vRNS szegmensek felismerése a virális fehérjék segítségével. A vRNS szegmensek 5’ végét úgy azonosították, mint a virális fehérjék kötődési helyét. A vRNS szegmensek 5’ végénél található ribonukleotid szekvencia megőrződött a nyolc szegmensben, és a 9. táblázatban látható.
9. táblázat (A bemutatott szekvencia az A/PR/8/34 influenzavírusból származik, az első 30 nukleotidot mutatjuk be)
SEG1 AGCGAAAGCAGGTCAATTATATTCAATATG
SEG2 AGCGAAAGCAGGCAAACCATTTGAATGGAT
SEG3 AGCGAAAGCAGGTACTGATCCAAAATGGAA
SEG4 AGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAAACAACCA
SEG5 AGCAAAAGCAGGGTAGATAATCACTCACTG
SEG6 AGCGAAAGCAGGGGTTTAAAATGAATCCAA
SEG7 AGCGAAAGCAGGTAGATATTGAAAGATGAG
SEG8 AGCAAAAGCAGGGTGACAAAGACATAATGG • · «
Emellett ezek a szekvenciák a különböző influenzavírus törzsekben nagymértékben konzervatív módon megmaradnak.
Amint a szekvenciákból látható, az első 12 bázis nagymértékben konzervatív mind a 8 szegmensben. így egy ezt a konzervatív régiót célzó oligonukleotid (pl. a 33. szekvencia) hatékony lesz.
Az influenza vRNS-k 5' vége potenciális RNS másodlagos struktúrájának elemzése arra utal, hogy minden szegmens végénél van egy erős másodlagos struktúra, amely fontos szerepet játszhat a proteinfelismerésben. Amint a 497 090 sz. amerikai egyesült államokbeli szabadalmi bejelentés és a PCT/US91/01822 sz. nemzetközi szabadalmi bejelentés ismerteti, bizonyos RNS-k és a proteinek közötti kölcsönhatás gátolható olyan oligonukleotidok vagy oligonukleotid analógok alkalmazásával, amelyek az RNS-nek legalább egy részét utánozzák. Ez feltételezhetően különösen hatékony, ha az illető RNS erős másodlagos struktúrával rendelkezik, ami az RNSutánzással kihasználható. A génexpresszió és a betegség állapota megbolygatható az ilyen RNS—protein kölcsönhatások megszakításával. Nem szükséges ismerni az aktuális RNSstruktúrát ahhoz, hogy a találmány szerinti megoldást gyakorlatba vegyük, csupán arra van szükség, hogy az illető RNS-szekvenciát egy RNS-kötő protein felismeri, és hogy ennek a kölcsönhatásnak fontos biológiai következményei vannak.
Az RNS-t utánzó oligonukleotidokat, amelyeket a 10. táblázatban mutatunk be, egységes 2'-0-metil- vagy 2’-0-me
- 38 til-foszfor-tioát analógok formájában szintetizálhatjuk, a
3. példa szerinti módon, és antivirális aktivitásukra nézve a 4. példa szerinti módon vizsgálhatók át.
10. táblázat
Szekv.
sz.
AGCGAAACCAGGTCAATTATATTCAATATG
AGCGAAAGCAGGCAAACCATTTGAATGGAT
AGCGAAAGCAGGTACTGATCCAAAATGGAA
AGCAAAAGCAGGGGAAAATAAAAACAACCA
AGCAAAAGCAGGGTAGATAATCACTCACTG
AGCGAAAGCAGGGGTTTAAAATGAATCCAA
AGCGAAAGCAGGTAGATATTGAAAGATGAG
AGCAAAAGCAGGGTGACAAAGACATAATGG
SZEKVENCIALISTA (1) Általános információ:
(i) Bejelentő:
(ii) Bejelentés címe: Influenzavírusok gátlása (iii) Szekvenciák száma: 41 (iv) Levelezési cím:
(A) Címzett:
(B) Utca:
(C) Város:
(D) Állam:
(E) Ország:
(F) Irányítószám:
(v) Komputerrel olvasható forma:
(A) Hordozó típusa:
(B) Komputer:
(C) Operátor rendszer:
(D) Software:
(vi) A jelen bejelentés adatai:
(A) A bejelentés száma:
(B) A bejelentés napja:
(C) Osztály:
(vii) Az elsőbbségi bejelentés adatai:
(A) A bejelentés száma:
(B) A bejelentés napja:
(viii) A képviselő adatai:
(A) Név:
(B) Regisztrálási szám:
• «
(C) Aktaszám:
(ix) Telekommunkikációs információk:
(A) Telefon:
(B) Telefax:
(2) Információk az 1. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 1. szekvencia:
AGCAAAAGCA GGGTGACAAA (2) Információk az 2. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 2. szekvencia:
AGCGAAAGCA GGTAGATATT (2) Információk az 3. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 3. szekvencia:
GTGTTTGGAT CCATTATGTC (2) Információk az 4. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 4. szekvencia:
TAGAAGACTC ATCTTTCAAT (2) Információk az 5. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav • 1 (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 5. szekvencia:
GCAATCTACC TGAAAGCTTG (2) Információk az 6. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 6. szekvencia:
AGAGAACGTA CGTTTCTACC (2) Információk az 7. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem
(
Μ ··· (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 7. szekvencia:
AAAACACCCT TGTTTCTACT (2) Információk az 8. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 8. szekvencia:
AAAACTACCT TGTTTCTACT (2) Információk az 9. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 9. szekvencia:
GGGAAACCAA CGGAAATAAG (2) Információk az 10. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 10. szekvencia:
CAACCAAAAA GATAATCTCA (2) Információk az 11. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 11. szekvencia:
GGGAAACCAA CGGAAATAAG (2) Információk az 12. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav
(C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 12. szekvencia:
CTTTCCATAT TGAATATAAT (2) Információk az 13. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 13. szekvencia:
ACATCCATTC AAATGGTTTG (2) Információk az 14. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem
(iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 14. szekvencia:
TCTTCCATTT TGGATCAGTA (2) Információk az 15. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 15. szekvencia:
GCCTTCATTT TGGTTGTTTT (2) Információk az 16. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 16. szekvencia:
GACGCCATGA TTTTGATGTC • -:
·· ..
- 47 (2) Információk az 17. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 17. szekvencia:
GGATTCATTT TAAACCCCTG (2) Információk az 18. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 18. szekvencia:
AGACTCATCT TTCAATATCT (2) Információk az 19. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav • 4 « ·« (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 19. szekvencia:
GATAGAGAGA ACGTACGTTT (2) Információk az 20. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 20. szekvencia:
TCTGATAGGC CTGCAAATTT (2) Információk az 21. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem ι
·· ♦ a*
(iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 21. szekvencia:
GGATCCATTA TGTCTTTGTC (2) Információk az 22. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 22. szekvencia:
CATGTCGGTT AGGTAACGCG (2) Információk az 23. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 23. szekvencia:
GCAATCTACC TGAAAGCTTG • 44
- 50 V··
(2) Információk az 24. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 24. szekvencia:
AGCAGTATGT CCTGGAAGAG (2) Információk az 25. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 25. szekvencia:
AAAACGACCT TGTTTCTACT (2) Információk az 26. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav
··· (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 26. szekvencia:
AAAAATGCCT TGTTCCTACT (2) Információk az 27. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 27. szekvencia:
AAAAGTACCT TGTTTCTACT (2) Információk az 28. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem : ’··ί ” ·: ··· ·· .· · · s
..... ...
(iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 28. szekvencia:
AAAACACCCT TGTTTCTACT (2) Információk az 29. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 29. szekvencia:
AAAATACCCT TGTTTCTACT (2) Információk az 30. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 30. szekvencia:
AAAAACTCCT TGTTTCTACT (2) Információk az 31. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 31. szekvencia:
AAAACTACCT TGTTTCTACT (2) Információk az 32. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 20 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: igen (xi) Szekvencia leírása: 32. szekvencia:
AAAACACCCT TGTTTCTACT (2) Információk az 33. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 12 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla
J) * .
• · (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 33. szekvencia:
AGCTAAAGCA GG (2) Információk az 34. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv> Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 34. szekvencia:
AGCGAAACCA GGTCAATTAT ATTCAATATG (2) Információk az 35. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem • ·
(xi) Szekvencia leírása: 35. szekvencia:
AGCGAAAGCA GGCAAACCAT TTGAATGGAT (2) Információk az 36. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 36. szekvencia:
AGCGAAAGCA GGTACTGATC CAAAATGGAA (2) Információk az 37. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 37. szekvencia:
AGCAAAAGCA GGGGAAAATA AAAACAACCA (2) Információk az 38. szekvenciához:
(D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 40. szekvencia:
AGCGAAAGCA GGTAGATATT GAAAGATGAG (2) Információk az 41. szekvenciához:
(i) Szekvencia-jellemzők:
(A) Hossz: 30 bázispár (B) Típus: nukleinsav (C) Szálszám: szimpla (D) Topológia: lineáris (ii) Molekula típusa: más nukleinsav (iii) Hipotetikus: nem (iv) Antiszensz: nem (xi) Szekvencia leírása: 41. szekvencia:
AGCAAAAGCA GGGTGACAAA GACATAATGG • ·
Claims (34)
- Sazbadalmi igénypontok1. Oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál influenzavírus ribonukleinsav (vRNS) 1., 2., 3., 4., 5., 6., 7. vagy 8. szegmens legalább egy részével vagy a megfelelő (+) ribonukleinsavval.
- 2. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál (-)RNS-sel.
- 3. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál (+)RNS-sel.
- 4. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál kettősszálú RNS-sel és háromszálű szerkezetet képez.
- 5. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál az említett szegmensek transzkripciós indítóhelyének, transzlációs indítóhelyének, 5' nemtranszIálódó szekvenciájának, 3' nemtranszlálódó szekvenciájának, illetve intron/exon kapcsolódási helyének legalább egy részével.
- 6. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy specifikusan hibridizál egy primer indítóhely legalább egy részével.
- 7. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy mintegy 3-50 alegységet tartalmaz.• Η *
- 8. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy mintegy 8-25 alegységet tartalmaz.
- 9. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy mintegy 10-20 alegységet tartalmaz.
- 10. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy farmakológiailag elfogadható hordozóban van jelen.
- 11. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.
- 12. A 11. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.
- 13. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy a következő szekvenciák valamelyikének legalább egy részét tartalmazza:
UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGTCAAUU AU; UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGCAAACC AU; UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGTACTGA TT; UCUCCCUCUC AGCAAAACCU UCCCGGAAAU GA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGGUAGAU AA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGAGUGAA AA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGUAGAUA UU vagy UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGGUGACA AA.• ·· • τ·' - 14. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy a következő szekvenciák valamelyikének legalább egy részét tartalmazza:5' 3'
TTA TCT ACC CTG CTT TTG CT; TGG GAC GCC ATG ATT TTG AT; TTT GGT GCC TTG GGA CGC CA; GGA TCC TTC CCC GCG CTG GG; AGT AGA AAC AAG GGT ATT TT; AAA ATA CCC TTG TTT CTA CT; TGA GTG ACA TAC AAA TCA TG; AGC AAA AGC AG GTA GAT AA; AAT ATC TAC CTG CTT TTG CT; TAG AAG ACT CAT CTT TCA AT; GAG AGA ACG TAC GTT TCG AC; TCG GCT TTG AG GGG CCT GA; CTG ATA GGC CTG CAA ATT TT; AGT AGA AAC AAG GTA GTT TT; AAA ACT ACC TTG TTT CTA CT; TCA GGC CCC CTC AAA GCC GA; AGC AAA AGC AGG TAG ATA TT; TTT GTC ACC CTG CTT TTG CT; GTG TTA GGA TCC ATT ATG TC; AGC AAT CTA CCT GAA AGC TT; TAG TAT GTC CTG GAA GAG AA; AGT AGA AAC AAG GGT GTT TT; AAA ACA CCC TTG TTT CTA CT; GCC TCC GCA CCT GCT TCG CG vagy ·····AGC AAA AGC AGG GTC ACA AA. - 15. A 13. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy farmakológiailag elfogadható hordozóban van jelen.
- 16. A 14. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy farmakológiailag elfogadható hordozóban van jelen.
- 17. A 13. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.
- 18. A 17. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.
- 19. A 14. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.
- 20. A 19. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.
- 21. Eljárás vélhetően influenzavírussal fertőzött ember és állatok kezelésére, azzal jellemezve, hogy a kezelendő személynek vagy állatnak olyan oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg hatásos mennyiségét adagoljuk, amely specifikusan hibridizál influenzavírus ribonukleinsav (vRNS) 1., <- 62 2., 3., 4., 5., 6., 7. vagy 8. szegmens legalább egy részével vagy a megfelelő (+) ribonukleinsavval.
- 22. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely specifikusan hibridizál (-)RNS-sel.
- 23. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely specifikusan hibridizál (+)RNS-sel.
- 24. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely specifikusan hibridizál kettősszálú RNS-sel és háromszálú szerkezetet képez.
- 25. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely specifikusan hibridizál az említett szegmensek transzkripciós indítóhelyének, transzlációs indítóhelyének, 5' nemtranszlálódó szekvenciájának, 3’ nemtranszlálódó szekvenciájának, illetve intron/exon kapcsolódási helyének legalább egy részével.
- 26. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely specifikusan hibridizál egy primer indítóhely legalább egy részével.
- 27. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely mintegy 3-50 alegységet tartalmaz.
- 28. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alt kalmazunk, amely mintegy 8-25 alegységet tartalmaz.
- 29. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amely mintegy 10-20 alegységet tartalmaz.
- 30. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot farmakológiailag elfogadható hordozóban alkalmazzuk.
- 31. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amelyben a nukleotidegységek közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.
- 32. A 21. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amelyben a nukleotidegységek közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.
- 33. Eljárás vélhetően influenzavírussal fertőzött ember és állatok kezelésére, azzal jellemezve, hogy a kezelendő személynek vagy állatnak olyan oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg hatásos mennyiségét adagoljuk, amely a következő szekvenciák valamelyikének legalább egy részét tartalmazza:
UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGTCAAUU AU; UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGCAAACC AU; UCUCCCUCUC AGAGCGAAAG CAGGTACTGA TT; UCUCCCUCUC AGCAAAACCU UCCCGGAAAU GA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGGUAGAU AA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGAGUGAA AA; UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGUAGAUA UU vagy 4'- 64 UCUCCCUCUC AGAGCAAAAG CAGGGUGACA AA. - 34. Eljárás vélhetően influenzavírussal fertőzött ember és állatok kezelésére, azzal jellemezve, hogy a kezelendő személynek vagy állatnak olyan oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg hatásos mennyiségét adagoljuk, amely a következő szekvenciák valamelyikének legalább egy részét tartalmazza:5’ 3 ’
TTA TCT ACC CTG CTT TTG CT; TGG GAC GCC ATG ATT TTG AT; TTT GGT GCC TTG GGA CGC CA; GGA TCC TTC CCC GCG CTG GG; AGT AGA AAC AAG GGT ATT TT; AAA ATA CCC TTG TTT CTA CT; TGA GTG ACA TAC AAA TCA TG; AGC AAA AGC AG GTA GAT AA; r AAT ATC TAC CTG CTT TTG CT; L- TAG AAG ACT CAT CTT TCA AT; GAG AGA ACG TAC GTT TCG AC; t. TCG GCT TTG AG GGG CCT GA; 9 CTG ATA GGC CTG CAA ATT TT; 1- AGT AGA AAC AAG GTA GTT TT; AAA ACT ACC TTG TTT CTA CT; TCA GGC CCC CTC AAA GCC GA; 9 AGC AAA AGC AGG TAG ATA TT; 1- TTT GTC ACC CTG CTT TTG CT; GTG TTA GGA TCC ATT ATG TC; t. AGC AAT CTA CCT GAA AGC TT; *4·- 66 jellemezve, hogy a 3., 5. vagy 10. táblázat szerinti szekvencia legalább egy részét tartalmazza.42. Oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy a 33. szekvencia legalább egy részét tartalmazza.43. A 41. vagy 42. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy farmakológiailag elfogadható hordozóban van jelen.44. A 41. vagy 42. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.45. A 41. vagy 42. igénypont szerinti oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg, azzal jellemezve, hogy az oligonukleotid nukleotidegységei közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.46. Eljárás vélhetően influenzavírussal fertőzött ember és állatok kezelésére, azzal jellemezve, hogy a kezelendő személynek vagy állatnak olyan oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg hatásos mennyiségét adagoljuk, amely a 3., 5. vagy 10. táblázat szerinti szekvencia legalább egy részét tartalmazza.47. Eljárás vélhetően influenzavírussal fertőzött ember és állatok kezelésére, azzal jellemezve, hogy a kezelendő személynek vagy állatnak olyan oligonukleotid vagy oligonukleotid analóg hatásos mennyiségét adagoljuk, amely a 33. szekvencia legalább egy részét tartalmazza.48. A 46. vagy 47. igénypont szerinti eljárás, azzal- 67 jellemezve, hogy az oligonukleotidőt vagy oligonukleotid analógot farmakológiailag elfogadható hordozóban alkalmazzuk.49. A 46. vagy 47. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amelyben a nukleotidegységek közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike kéntartalmú csoport.50. A 46. vagy 47. igénypont szerinti eljárás, azzal jellemezve, hogy olyan oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot alkalmazunk, amelyben a nukleotidegységek közötti kapcsoló csoportok legalább némelyike foszfor-tioát-tartalmú csoport.51. Eljárás gyógyszerkészítmények előállítására, azzal jellemezve, hogy valamely 1. igénypont szerinti oligonukleotidot vagy oligonukleotid analógot a gyógyszergyártásban szokásos hígító-, vivő- és/vagy egyéb segédanyagokkal összekeverve gyógyszerkészítménnyé alakítunk.A meghatalmazott:Λίί··GY oldoJL ^G oldoJLKÖZZÉTÉTELI-63 0036^PÉLDÁNX. ÍBRi '9/4Influenza A vírus Ann Arbor H2N2 törzsből származó (+)RNS (mRNS) a 6. szegmensről szintetizálva/ nukleoproteinSzekvencia 5' - 3· irányban
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US56728790A | 1990-08-14 | 1990-08-14 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9300364D0 HU9300364D0 (en) | 1993-05-28 |
HUT69956A true HUT69956A (en) | 1995-09-28 |
Family
ID=24266540
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9300364A HUT69956A (en) | 1990-08-14 | 1991-08-13 | Methode for inhibition of influenza virus by antiseuse oligonucleotides |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5580767A (hu) |
EP (1) | EP0543938A4 (hu) |
JP (1) | JPH06501843A (hu) |
KR (1) | KR970005274B1 (hu) |
AU (1) | AU652577B2 (hu) |
BR (1) | BR9106747A (hu) |
CA (1) | CA2089562A1 (hu) |
FI (1) | FI930628A (hu) |
HU (1) | HUT69956A (hu) |
NO (1) | NO930514L (hu) |
WO (1) | WO1992003454A1 (hu) |
Families Citing this family (84)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6369209B1 (en) | 1999-05-03 | 2002-04-09 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry |
US7119184B2 (en) * | 1991-08-12 | 2006-10-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry |
US5523389A (en) * | 1992-09-29 | 1996-06-04 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Inhibitors of human immunodeficiency virus |
GB2273932A (en) * | 1992-11-24 | 1994-07-06 | Stiefel Laboratories | Stable oligonucleotides |
CN1124980A (zh) * | 1993-03-31 | 1996-06-19 | 海布里顿公司 | 具有改良抗流感活性的经修饰寡核苷酸 |
US6576752B1 (en) | 1997-02-14 | 2003-06-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Aminooxy functionalized oligomers |
US6127533A (en) * | 1997-02-14 | 2000-10-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 2'-O-aminooxy-modified oligonucleotides |
US6172209B1 (en) | 1997-02-14 | 2001-01-09 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Aminooxy-modified oligonucleotides and methods for making same |
KR20010022452A (ko) | 1997-07-31 | 2001-03-15 | 추후제출 | 플라비바이러스 감염에 대한 재조합 다이머형 엔벨롭 백신 |
CA2487328A1 (en) | 1998-03-20 | 1999-09-30 | Benitec Australia Ltd. | Sirna for control of gene expression |
AUPP249298A0 (en) * | 1998-03-20 | 1998-04-23 | Ag-Gene Australia Limited | Synthetic genes and genetic constructs comprising same I |
US6841539B1 (en) | 1998-05-21 | 2005-01-11 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for topical delivery of oligonucleotides |
US6242589B1 (en) | 1998-07-14 | 2001-06-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Phosphorothioate oligonucleotides having modified internucleoside linkages |
US6277967B1 (en) | 1998-07-14 | 2001-08-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Carbohydrate or 2′-modified oligonucleotides having alternating internucleoside linkages |
US6867294B1 (en) * | 1998-07-14 | 2005-03-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Gapped oligomers having site specific chiral phosphorothioate internucleoside linkages |
US6077709A (en) | 1998-09-29 | 2000-06-20 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense modulation of Survivin expression |
US6335194B1 (en) | 1998-09-29 | 2002-01-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of survivin expression |
TR200604211T1 (tr) * | 1999-02-12 | 2007-02-21 | Daiichi Sankyo Company Limiteddaiichi Sankyo Company Limited | Yeni nükleosid ve oligonükleotid analoglarıYeni nükleosid ve oligonükleotid analogları |
JP4151751B2 (ja) * | 1999-07-22 | 2008-09-17 | 第一三共株式会社 | 新規ビシクロヌクレオシド類縁体 |
US6423885B1 (en) | 1999-08-13 | 2002-07-23 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organization (Csiro) | Methods for obtaining modified phenotypes in plant cells |
US6147200A (en) * | 1999-08-19 | 2000-11-14 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 2'-O-acetamido modified monomers and oligomers |
US6544958B2 (en) * | 2001-03-26 | 2003-04-08 | Her Majesty The Queen In Right Of Canada, As Represented By The Minister Of National Defence Of Her Majesty's Canadian Government | Therapy of respiratory influenza virus infection using free and liposome-encapsulated ribonucleotides |
US7452963B2 (en) * | 2001-03-27 | 2008-11-18 | Samuel Bogoch | Replikin peptides and antibodies therefore |
US7420028B2 (en) * | 2001-03-27 | 2008-09-02 | Samuel Bogoch | Replikins and methods of identifying replikin-containing sequences |
KR100906102B1 (ko) | 2001-03-27 | 2009-07-07 | 사무엘 보고치 | 레플리킨 펩타이드 및 그의 이용 |
US7189800B2 (en) * | 2001-03-27 | 2007-03-13 | Samuel Bogoch | Replikin peptides in rapid replication of glioma cells and in influenza epidemics |
US20060160759A1 (en) * | 2002-09-28 | 2006-07-20 | Jianzhu Chen | Influenza therapeutic |
US20040242518A1 (en) * | 2002-09-28 | 2004-12-02 | Massachusetts Institute Of Technology | Influenza therapeutic |
WO2005030800A2 (en) * | 2003-08-05 | 2005-04-07 | Avi Biopharma, Inc. | Oligonucleotide analog and method for treating flavivirus infections |
WO2005013905A2 (en) * | 2003-08-07 | 2005-02-17 | Avi Biopharma, Inc. | SENSE ANTIVIRAL COMPOUND AND METHOD FOR TREATING ssRNA VIRAL INFECTION |
US20050222068A1 (en) * | 2003-10-23 | 2005-10-06 | Mourich Dan V | Method and antisense composition for selective inhibition of HIV infection in hematopoietic cells |
US20050234002A1 (en) * | 2004-01-23 | 2005-10-20 | Mourich Dan V | Antisense oligomers and methods for inducing immune tolerance and immunosuppression |
KR101147147B1 (ko) | 2004-04-01 | 2012-05-25 | 머크 샤프 앤드 돔 코포레이션 | Rna 간섭의 오프 타겟 효과 감소를 위한 변형된폴리뉴클레오타이드 |
CA2571593C (en) | 2004-07-02 | 2015-04-21 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antibacterial method and compound |
US8129352B2 (en) | 2004-09-16 | 2012-03-06 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating ssRNA viral infection |
US8357664B2 (en) * | 2004-10-26 | 2013-01-22 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating influenza viral infection |
US7524829B2 (en) * | 2004-11-01 | 2009-04-28 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compounds and methods for treating a filovirus infection |
US7923207B2 (en) | 2004-11-22 | 2011-04-12 | Dharmacon, Inc. | Apparatus and system having dry gene silencing pools |
US7935811B2 (en) | 2004-11-22 | 2011-05-03 | Dharmacon, Inc. | Apparatus and system having dry gene silencing compositions |
US20060166234A1 (en) | 2004-11-22 | 2006-07-27 | Barbara Robertson | Apparatus and system having dry control gene silencing compositions |
US20060240032A1 (en) * | 2005-03-31 | 2006-10-26 | Hinrichs David J | Immunomodulating compositions and methods for use in the treatment of human autoimmune diseases |
WO2006113743A2 (en) * | 2005-04-18 | 2006-10-26 | Massachusetts Institute Of Technology | Compositions and methods for rna interference with sialidase expression and uses thereof |
US20060293268A1 (en) * | 2005-05-05 | 2006-12-28 | Rieder Aida E | Antisense antiviral compounds and methods for treating foot and mouth disease |
US7790694B2 (en) * | 2005-07-13 | 2010-09-07 | Avi Biopharma Inc. | Antisense antibacterial method and compound |
US8067571B2 (en) | 2005-07-13 | 2011-11-29 | Avi Biopharma, Inc. | Antibacterial antisense oligonucleotide and method |
WO2007030691A2 (en) * | 2005-09-08 | 2007-03-15 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating picornavirus infection |
WO2007030576A2 (en) * | 2005-09-08 | 2007-03-15 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating picornavirus infection |
KR20080086440A (ko) * | 2005-11-01 | 2008-09-25 | 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 | 인플루엔자 바이러스 복제의 RNAi 억제 |
US8501704B2 (en) * | 2005-11-08 | 2013-08-06 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Immunosuppression compound and treatment method |
US7582615B2 (en) * | 2006-03-07 | 2009-09-01 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating arenavirus infection |
US8785407B2 (en) * | 2006-05-10 | 2014-07-22 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Antisense antiviral agent and method for treating ssRNA viral infection |
DK2024499T3 (da) * | 2006-05-10 | 2018-01-29 | Sarepta Therapeutics Inc | Oligonukleotidanaloger med kationiske intersubunit-koblinger |
ES2911034T3 (es) | 2006-08-08 | 2022-05-17 | Univ Bonn Rheinische Friedrich Wilhelms | Estructura y uso de oligonucleótidos 5' fosfato |
US8097419B2 (en) | 2006-09-12 | 2012-01-17 | Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc | Compositions and method for rapid, real-time detection of influenza A virus (H1N1) swine 2009 |
US9481912B2 (en) | 2006-09-12 | 2016-11-01 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Compositions and methods for detecting and identifying nucleic acid sequences in biological samples |
US8080645B2 (en) | 2007-10-01 | 2011-12-20 | Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc | Biological specimen collection/transport compositions and methods |
EP2081949B1 (en) | 2006-09-22 | 2014-12-10 | GE Healthcare Dharmacon, Inc. | Tripartite oligonucleotide complexes and methods for gene silencing by rna interference |
CN101553252A (zh) * | 2006-12-06 | 2009-10-07 | 诺华有限公司 | 包含来自于四株流感病毒的抗原的疫苗 |
US9683256B2 (en) | 2007-10-01 | 2017-06-20 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Biological specimen collection and transport system |
US11041215B2 (en) | 2007-08-24 | 2021-06-22 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | PCR ready compositions and methods for detecting and identifying nucleic acid sequences |
EP2185196B1 (en) | 2007-08-27 | 2014-06-11 | Longhorn Vaccines & Diagnostics, LLC | Immunogenic compositions and methods |
US10004799B2 (en) | 2007-08-27 | 2018-06-26 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Composite antigenic sequences and vaccines |
US11041216B2 (en) | 2007-10-01 | 2021-06-22 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Compositions and methods for detecting and quantifying nucleic acid sequences in blood samples |
WO2009085355A2 (en) | 2007-10-01 | 2009-07-09 | Longhorn Vaccines & Diagnostics Llc | Biological specimen collection and transport system and methods of use |
US8188060B2 (en) | 2008-02-11 | 2012-05-29 | Dharmacon, Inc. | Duplex oligonucleotides with enhanced functionality in gene regulation |
EP2297323A1 (en) | 2008-05-21 | 2011-03-23 | Hartmann, Gunther | 5' triphosphate oligonucleotide with blunt end and uses thereof |
US8034922B2 (en) * | 2008-08-22 | 2011-10-11 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Compositions and methods for modulating activity of capped small RNAs |
AU2009335740B2 (en) * | 2008-12-17 | 2016-04-21 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Antisense compositions and methods for modulating contact hypersensitivity or contact dermatitis |
DK2396032T3 (en) | 2009-02-10 | 2016-12-19 | Seqirus Uk Ltd | Influenza vaccines with reduced amounts of squalene |
AU2010319314C1 (en) * | 2009-11-13 | 2016-09-01 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Antisense antiviral compound and method for treating influenza viral infection |
KR102095478B1 (ko) | 2010-05-28 | 2020-04-01 | 사렙타 쎄러퓨틱스, 인코퍼레이티드 | 변형된 서브유니트간 결합 및/또는 말단 그룹을 갖는 올리고뉴클레오타이드 유사체 |
US8198429B2 (en) | 2010-08-09 | 2012-06-12 | Avi Biopharma, Inc. | Antisense antiviral compounds and methods for treating a filovirus infection |
US10017763B2 (en) | 2010-09-03 | 2018-07-10 | Sarepta Therapeutics, Inc. | dsRNA molecules comprising oligonucleotide analogs having modified intersubunit linkages and/or terminal groups |
EP2508530A1 (en) | 2011-03-28 | 2012-10-10 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Purification of triphosphorylated oligonucleotides using capture tags |
WO2013067873A1 (zh) * | 2011-11-09 | 2013-05-16 | 南京森楠生物技术研究有限公司 | 抗流行性感冒病毒的核酸、肽核酸及其制剂 |
KR20210081448A (ko) | 2011-11-18 | 2021-07-01 | 사렙타 쎄러퓨틱스, 인코퍼레이티드 | 기능적으로-변형된 올리고뉴클레오티드 및 이의 서브유니트 |
WO2013112916A1 (en) | 2012-01-26 | 2013-08-01 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Composite antigenic sequences and vaccines |
EP2712870A1 (en) | 2012-09-27 | 2014-04-02 | Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn | Novel RIG-I ligands and methods for producing them |
WO2015084846A1 (en) * | 2013-12-02 | 2015-06-11 | Brandeis University | High temperature selection of nucleotide-supported carbohydrate vaccines and resulting glycosylated oligonucleotides |
US9976136B2 (en) | 2015-05-14 | 2018-05-22 | Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc | Rapid methods for the extraction of nucleic acids from biological samples |
US11020417B2 (en) | 2015-06-04 | 2021-06-01 | Sarepta Therapeutics, Inc | Methods and compounds for treatment of lymphocyte-related diseases and conditions |
EP3423107A4 (en) * | 2016-03-02 | 2020-01-15 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University | PAN-GENOTYPIC AGENTS AGAINST INFLUENZA VIRUS AND METHODS OF USE THEREOF |
US11339392B2 (en) | 2016-03-02 | 2022-05-24 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Pan-genotypic agents against influenza virus and methods of using the same |
WO2018140354A1 (en) | 2017-01-24 | 2018-08-02 | University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Antisense oligonucleotides that inhibit influenza virus replication and uses thereof |
Family Cites Families (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0081099A3 (en) * | 1981-12-04 | 1983-08-10 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Capped oligonucleotide anti-viral agents |
NZ209840A (en) * | 1983-10-17 | 1988-11-29 | Kaji Akira | A method of inhibiting viral propagation by hybridising dna with the viral rna thus blocking its action |
US5190931A (en) * | 1983-10-20 | 1993-03-02 | The Research Foundation Of State University Of New York | Regulation of gene expression by employing translational inhibition of MRNA utilizing interfering complementary MRNA |
FR2568254B1 (fr) * | 1984-07-25 | 1988-04-29 | Centre Nat Rech Scient | Application d'oligonucleotides lies a un agent intercalant, notamment a titre de medicament |
US5194428A (en) * | 1986-05-23 | 1993-03-16 | Worcester Foundation For Experimental Biology | Inhibition of influenza virus replication by oligonucleotide phosphorothioates |
US5004810A (en) * | 1988-09-30 | 1991-04-02 | Schering Corporation | Antiviral oligomers |
US5166057A (en) * | 1989-08-28 | 1992-11-24 | The Mount Sinai School Of Medicine Of The City University Of New York | Recombinant negative strand rna virus expression-systems |
DE3929144A1 (de) * | 1989-09-02 | 1991-03-07 | Behringwerke Ag | Nachweis von influenza-a-virus durch polymerase-kettenreaktion (pcr) nach reverser transkription eines bereichs des viralen haemagglutinin-gens |
US5166195A (en) * | 1990-05-11 | 1992-11-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense inhibitors of the human immunodeficiency virus phosphorothioate oligonucleotides |
-
1991
- 1991-08-13 EP EP19910916802 patent/EP0543938A4/en not_active Ceased
- 1991-08-13 WO PCT/US1991/005742 patent/WO1992003454A1/en not_active Application Discontinuation
- 1991-08-13 US US07/955,718 patent/US5580767A/en not_active Expired - Lifetime
- 1991-08-13 BR BR919106747A patent/BR9106747A/pt not_active Application Discontinuation
- 1991-08-13 HU HU9300364A patent/HUT69956A/hu unknown
- 1991-08-13 JP JP3515319A patent/JPH06501843A/ja active Pending
- 1991-08-13 CA CA002089562A patent/CA2089562A1/en not_active Abandoned
- 1991-08-13 KR KR1019930700440A patent/KR970005274B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1991-08-13 AU AU85360/91A patent/AU652577B2/en not_active Ceased
-
1993
- 1993-02-12 FI FI930628A patent/FI930628A/fi not_active Application Discontinuation
- 1993-02-12 NO NO93930514A patent/NO930514L/no unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
FI930628A (fi) | 1993-03-24 |
EP0543938A1 (en) | 1993-06-02 |
EP0543938A4 (en) | 1993-11-10 |
NO930514D0 (no) | 1993-02-12 |
AU8536091A (en) | 1992-03-17 |
HU9300364D0 (en) | 1993-05-28 |
US5580767A (en) | 1996-12-03 |
CA2089562A1 (en) | 1992-02-15 |
FI930628A0 (fi) | 1993-02-12 |
WO1992003454A1 (en) | 1992-03-05 |
KR930701466A (ko) | 1993-06-11 |
BR9106747A (pt) | 1993-07-20 |
NO930514L (no) | 1993-04-02 |
KR970005274B1 (ko) | 1997-04-15 |
JPH06501843A (ja) | 1994-03-03 |
AU652577B2 (en) | 1994-09-01 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
HUT69956A (en) | Methode for inhibition of influenza virus by antiseuse oligonucleotides | |
EP0527906B1 (en) | Inhibition of influenza virus replication by oligonucleotides | |
JP4118348B2 (ja) | Gキャプ安定化したオリゴヌクレオチド | |
US6034233A (en) | 2'-O-alkylated oligoribonucleotides and phosphorothioate analogs complementary to portions of the HIV genome | |
Zerial et al. | Selective inhibition of the cytopathic effect of type A influenza viruses by oligodeoxynucleotides covalently linked to an intercalating agent | |
EP0664833B1 (en) | Therapeutic anti-hiv oligonucleotide and pharmaceutical | |
Shu et al. | Evidence for interspecies transmission and reassortment of influenza A viruses in pigs in southern China | |
AU697234B2 (en) | Antisense oligonucleotides and therapeutic use thereof in human immunodeficiency virus infection | |
CA2646026C (en) | Nucleic acid primers and probes for detecting human and avian influenza viruses | |
NZ263985A (en) | Oligonucleotide complementary to an essential amino acid sequence of influenza virus | |
US5442049A (en) | Oligonucleotides for modulating the effects of cytomegalovirus infections | |
CA2308852A1 (en) | Rnase l activators and antisense oligonucleotides effective to treat rsv infections | |
NZ255087A (en) | Hybrid oligonucleotide phosphorothioates and their use | |
HUT63430A (en) | Process for producing oligonucleotides influencing the effect of cytomegalovirus infection | |
US20160281089A1 (en) | Prevention of viral infectivity | |
US20030087851A1 (en) | Pharmaceutical composition for treating or preventing influenza, and novel oligonucleotide | |
CA2211877A1 (en) | Human immunodeficiency virus transcription inhibitors and methods of their use | |
US11046958B2 (en) | Antisense oligonucleotides that inhibit influenza virus replication and uses thereof | |
JPH10313872A (ja) | 抗インフルエンザウイルス剤 | |
AU736470C (en) | RNase L activators and antisense oligonucleotides effective to treat RSV infections | |
WO1999000147A1 (en) | Antigenomic oligodeoxynucleotides for treatment of infection by negative-stranded nonsegmented rna viruses | |
CA2396240A1 (en) | Methods for inhibiting/treating hiv infections and aids related symptoms | |
JPWO2021201996A5 (hu) |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
DFD9 | Temporary protection cancelled due to non-payment of fee |