FR2548212A2 - Peptides comportant un site immunogene du poliovirus et adns contenant des sequences nucleotidiques codant pour ces peptides - Google Patents
Peptides comportant un site immunogene du poliovirus et adns contenant des sequences nucleotidiques codant pour ces peptides Download PDFInfo
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Abstract
L'INVENTION CONCERNE UN FRAGMENT D'ADN CONTENANT AU PLUS 315 PAIRES DE NUCLEOTIDES, CARACTERISE EN CE QU'IL CODE POUR UN PEPTIDE SUSCEPTIBLE D'ETRE RECONNU PAR DES ANTICORPS ACTIFS A LA FOIS CONTRE LES PARTICULES "C" ET "D" D'UN MEME POLIOVIRUS ET CONTRE LE POLYPEPTIDE STRUCTURAL VP-1 DE LA CAPSIDE DE CE POLIOVIRUS. CE PEPTIDE CONTIENT NOTAMMENT LA SEQUENCE SUIVANTE: ASP ASN PRO ALA SER THR ASN LYS ASP LYS LEU
Description
Peptides comportant un site immunogène du poliovirus et
ADNs contenant des séquences nucléotidiques codant pour ces peptides.
ADNs contenant des séquences nucléotidiques codant pour ces peptides.
L'invention est relative à des peptides comportant un site immunogène du poliovirus et des fragments d'ADN contenant des séquences nucléotidiques codant pour ces peptides. L'invention concerne encore les principes vaccinants mettant en jeu de tels peptides, ces principes étant aptes à induire chez l'hôtes homme ou animal, la production d'anticorps actifs non seulement contre euxmêmes, mais encore contre les poliovirus infectieux entiers.
On a déjà décrit dans la demande de brevet français nO 82 02013 déposée le 8 février 1982 des fragments d'ADN codant pour un peptide immunogène susceptible d'induire in Vivo la synthèse d'anticorps antipoliovirus . Ces fragments d'ADN possèdent une longueur n'excédant pas celle d'un fragment d'ADN comportant de l'ordre de 1,2 kb (kilopaire de bases). Ces fragments sont plus particulièrement caractérisés en ce qu'ils contiennent une séquence nucléotidique codant pour la protéine VP-1, laquelle s'est avérée porter des déterminants antigéniques essentiels intervenant au niveau de l'immunogénicité du poliovirus infectieux correspondant.En effet ce peptide est susceptible de former des complexes antigcne-anticorps avec des sérums neutralisants monoclonaux ou polyclonaux obtenus à partir d'animaux auxquels avait été injecté du poliovirus entier (sérum de spécificité D).
Des séquences types d'ADN codant pour des peptides immunogènes du type sus-indiqué sont illustrées dans la succession des figures 1 et 2 ci-annexées, pour l'un d'entre eux,et et dans la succession des figures 3 et 4, éga- lement ci-annexées,pour un autre fragment d'ADN contenant la susdite séquence. Les emplacements de certains sites de restriction auxquels il sera fait référence dans ce qui suit sont également indiqués dans ces figures. Les numérotations des nucléotides successifs intervenant dans la constitution de ces ADN s'effectuent à partir de l'extrémité 5'.Pour ce qui est de la constitution de l'ADN clonable du poliovirus dont sont issus les susdits
ADN on se référera à l'article de Sylvie VAN DER WERF et autres auteurs, intitulé "lolecular cloning of the genome of poliovirus" dans Proc. Nat. Acad. Sci. USA, vol. 78, n0 10, pp. 59-83, 59-87, oct. 1981.
ADN on se référera à l'article de Sylvie VAN DER WERF et autres auteurs, intitulé "lolecular cloning of the genome of poliovirus" dans Proc. Nat. Acad. Sci. USA, vol. 78, n0 10, pp. 59-83, 59-87, oct. 1981.
L'invention découle de la découverte que des peptides correspondant à des séquences d'ADN contenues dans les précédentes, mais beaucoup plus petites que celles-ci, portaient néanmoins des déterminants antigéniques permettant leur utilisation dans la constitution de principes vaccinants efficaces contre les poliovirus correspondants. Parmi les peptides en question, on peut en isoler certains dont la taille est suffisamment réduite pour qu'ils soient directement accessibles par synthèse chimique.
L'invention fournit en outre la technique permettant la détermination,au sein des ADN de taillesrelativement importantesqui font l'objet de la demande de brevet français nO 82 02013,de celles des séquences d'ADN beaucoup plus petites auxquelles correspondent des peptides présentant des déterminants ou sites antigéniques les rendant aptes à être mis en oeuvre dans la production de principes vaccinants à l'égard de poliovirus correspondants entiers et infectieux.
A cet égard, la plus longue des séquences d'ADN selon l'invention est constituée par le fragment délimité à ses extrémités opposées par les sites XbaI situés dans les régions définies par les positions 2546 et 2861 de la fig. 1.
L'invention concerne plus particulièrement encore celles des séquences d'ADN contenues au sein de la précédente et qui codent un peptide susceptible d'être reconnu par des anticorps monoclonaux actifs à la fois contre les particules C et "D" originaires d'un même poliovirus et contre le polypeptide structural VP-1 de la capside du même poliovirus.
C'est de ce type d'anticorps monoclonaux qu'il s'agira en toutes circonstances dans l'exposé qui suit, sauf lorsqu'il sera spécifié autrement.
De tels anticorps sont obtenus à partir d'hybridomes, lesquels ont été obtenus par la réalisation d'une fusion entre des cellules spléniques d'un animal préalablement immunisé par un virus ou virion présentant une antigénicité "C" (obtenu notamment par chauffage pendant 1 heure à 560C du poliovirus infectieux correspondant à antigénicité "D") et des cellules myélomateuses appropriées, en mettant en oeuvre une technique en soi connue, par la culture des hybrides ou clones cellulaires obtenus et par la sélection des clones qui s'avèrent produire des anticorps monoclonaux actifs à la fois contre les virions à antigénicité "C", les virions homologues à antigénicité "D" et contre la protéine correspondante VP-1. Les poliovirus dont il est question sont avantageusement du type 1 (Mahoney).De tels anticorps monoclonaux (qui seront encore désignés dans ce qui suit sous l'expression "anticorps CD-VP-1" (ou "C3")), les hybrides cellulaires susceptibles de les produire et un procédé d'obtention de ces derniers ont été décrits dans la demande de brevet français nO 82 19338 déposée le 18 novembre 1982. Deux des hybrides cellulaires formés ont été dépo sés dans la Collection- Nationale de Culture de Nicro-
Organismes de l'INSTITUT PASTEUR de Paris (C.N.C.M.), respectivement sous les nO I-208 et n? I-209.
Organismes de l'INSTITUT PASTEUR de Paris (C.N.C.M.), respectivement sous les nO I-208 et n? I-209.
Cette séquence d'ADN selon l'invention présente la structure suivante
TCT AGA CAC GCT CTC CCA AAC ACT GAA
GCC AGT GGA CCA ACA CAC TCC AAG GAA ATT
CCG GCA CTC ACC GCA GTG GAA ACT GGG GCC
ACA AAT CCA CTA GTC CCT TCT GAT ACA GTG
CAA ACC AGA CAT STT GTA CAA CAT AGG TCA
AGG TCA GAG TCT AGC ATA GAG TCT TTC TTC
GCG CGG GGT GCA TGC GTG ACC ATT ATG ACC
GTG GAT AAC CCA GCT TCC ACC ACG AAT AAG
CAT AAG CTA TTT GCA GTG TGG AAG ATC ACT
TAT AAA GAT ACT GTC CAG TTA CGG AGG AAA
TTG GAG TTC TTC ACC TAT TCT
L'invention concerne naturellement toute séquence d'ADN codant pour un peptide ayant les propriétés immunogènes semblables à celles du peptide codé pr la susdite séquence nucléotidique En particulier tout triplet de cette séquence peut être remplacé, soit par un triplet distinct codant pour le même acide aminé ou pour un acide aminé distinct/ dans la mesure ot la substitution du second au premier dans le peptide codé par la séquence d'ADN en question,n'altérera pas fondamentalement les propriétés immunogènes - du peptide codé par la séquence d'ADN ainsi modifiée. En particulier, l'invention concerne toute séquence d'ADN de ce type codant pour un peptide susceptible d'etre reconnu par l'anticorps C3 sus-indiqué.
TCT AGA CAC GCT CTC CCA AAC ACT GAA
GCC AGT GGA CCA ACA CAC TCC AAG GAA ATT
CCG GCA CTC ACC GCA GTG GAA ACT GGG GCC
ACA AAT CCA CTA GTC CCT TCT GAT ACA GTG
CAA ACC AGA CAT STT GTA CAA CAT AGG TCA
AGG TCA GAG TCT AGC ATA GAG TCT TTC TTC
GCG CGG GGT GCA TGC GTG ACC ATT ATG ACC
GTG GAT AAC CCA GCT TCC ACC ACG AAT AAG
CAT AAG CTA TTT GCA GTG TGG AAG ATC ACT
TAT AAA GAT ACT GTC CAG TTA CGG AGG AAA
TTG GAG TTC TTC ACC TAT TCT
L'invention concerne naturellement toute séquence d'ADN codant pour un peptide ayant les propriétés immunogènes semblables à celles du peptide codé pr la susdite séquence nucléotidique En particulier tout triplet de cette séquence peut être remplacé, soit par un triplet distinct codant pour le même acide aminé ou pour un acide aminé distinct/ dans la mesure ot la substitution du second au premier dans le peptide codé par la séquence d'ADN en question,n'altérera pas fondamentalement les propriétés immunogènes - du peptide codé par la séquence d'ADN ainsi modifiée. En particulier, l'invention concerne toute séquence d'ADN de ce type codant pour un peptide susceptible d'etre reconnu par l'anticorps C3 sus-indiqué.
L'invention concerne encore toute séquence nucléotidique de plus faible longueur contenue dans la précédente, dès lors qu'elle code pour un peptide toujours encore susceptible d'être reconnu par l'anticorps C3.
Parmi les séquences d'ADN entrant dans le champ de l'invention, figurent celles qui contiennent les séquences nucléotidiques codant pour la séquence peptidique
His 65-Phe 105 définie ci-après et plus particulièrement encore la séquence nucléotidique 2671-2,92 du gène codant pour le polypeptide de structure VP-1 du poliovirus de la fig.l.
His 65-Phe 105 définie ci-après et plus particulièrement encore la séquence nucléotidique 2671-2,92 du gène codant pour le polypeptide de structure VP-1 du poliovirus de la fig.l.
D'autres séquences préférées d'ADN entrant dans le champ de l'invention sont celles qui codent pour les séquences peptidiques His 65 -Ile 110 définies ci-après, et plus particulièrement encore la séquence nucléotidique
Pro 95 -IlellO du même gène.
Pro 95 -IlellO du même gène.
L'invention concerne naturellement les polypeptides contenant les séquences peptidiques codées par les susdites séquences d'ADN. Elle concerne en particulier la séquence de formule
Ser Arg Asp Ala Leu Pro Asn Thr Glu
Ala Ser Gly Pro Thr Ris er Lys Glu lie
Pro Ala Leu Thr Ala Val Glu Thr Gly Ala
Thr Asn Pro Leu Val Pro Ser Asp Thr Val
Gln Thr Arg His Val Val Gln Ris Arg Ser
Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser Phe Phe
Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile Met Thr
Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr Asn Lys
Asp Lys Leu Phe Ala Val Trn Lys Ile Thr.
Ser Arg Asp Ala Leu Pro Asn Thr Glu
Ala Ser Gly Pro Thr Ris er Lys Glu lie
Pro Ala Leu Thr Ala Val Glu Thr Gly Ala
Thr Asn Pro Leu Val Pro Ser Asp Thr Val
Gln Thr Arg His Val Val Gln Ris Arg Ser
Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser Phe Phe
Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile Met Thr
Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr Asn Lys
Asp Lys Leu Phe Ala Val Trn Lys Ile Thr.
Tyr Lys Asp Thr Val Gln Leu Arg Arg Lys
Leu Glu Phe Phe Thr Tyr Ser
L'invention concerne également tout peptide présentant des propriétés immunogènes équivalentes dans les conditions qui ont déjà été indiquées en rapport avec les peptides codés par les séquences d'ADN ci-dessus définies.
Leu Glu Phe Phe Thr Tyr Ser
L'invention concerne également tout peptide présentant des propriétés immunogènes équivalentes dans les conditions qui ont déjà été indiquées en rapport avec les peptides codés par les séquences d'ADN ci-dessus définies.
A ce titre l'invention concerne plus particulièrement la séquence suivante, ci-après dite "séquence His 65-Phe 1C5".
Val Val Gl, @@
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
et Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe
100 ou dite ci-après "séquence His 65 - Ile 110"-
His Val Val Gln His
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
Met Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe Ala Val Trp Lys
100
île
11o
L'invention concerne plus particulièrement encore ceux des peptides qui contiennent la séquence peptidique suivante, ci-après dénommée Asp 93-Leu 104 : Asp Asn Pro
Ala Ser Thr Thr Asn Lys Asp Lys Leu.
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
et Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe
100 ou dite ci-après "séquence His 65 - Ile 110"-
His Val Val Gln His
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
Met Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe Ala Val Trp Lys
100
île
11o
L'invention concerne plus particulièrement encore ceux des peptides qui contiennent la séquence peptidique suivante, ci-après dénommée Asp 93-Leu 104 : Asp Asn Pro
Ala Ser Thr Thr Asn Lys Asp Lys Leu.
L'invention concerne naturellement aussi les vecteurs, notamment du type plasmides ou phages, contenant un insérat formé par l'une quelconque des séquences d'ADN, telles qu'elles ont été définies ci-dessus. Ces vecteurs modifiés peuvent être mis en oeuvre dans la transformation d'organismes cellulaires ou de micro-organismes appropriés, en yue d'induire la production par celle-ci de polypeptide, le cas échéant hybrides, contenant une séquence peptidique susceptible d'être reconnue par les anticorps monoclonaux
CD-PV1 ou C3 ou d'autres anticorps reconnaissant le virus infectieux. Ces polypeptides, le cas échéant hybrides, font également partie de l'invention.
CD-PV1 ou C3 ou d'autres anticorps reconnaissant le virus infectieux. Ces polypeptides, le cas échéant hybrides, font également partie de l'invention.
L'invention fournit encore un procédé permettant l'identification, au sein d'une séquence d'ADN normalement contenue à l'intérieur de l'ADN d'un poliovirus déterminé, de celles des séquences plus petites qui sont susceptibles de coder pour un peptide immunogène ou susceptibles d'être mises en oeuvre dans la fabrication d'un principe Immunogène permettant la production d'anticorps actifs contre le poliovirus entier correspondant.
Ce procédé est essentiellement caractérisé en ce que, partant d'un plasmide contenant un insérat formé par une séquence initiale reconnue comme devant contenir une séquence plus petite susceptible de coder pour un peptide immunogène ou susceptible d'entrer dans la constitution d'un principe immunogène, on linéarise ledit plasmide au niveau d'un site de restriction extérieur à ladite séquence plus petite, on émonde de façon contrôlée le plasmide linéarisé avec une enzyme exonucléolytique, telle que l'en- zyme Bal 31, on recircularise le plasmide au moyen d'une
ADN-ligase, on transforme un micro-organisme approprié, lui-même transformable par le vecteur correspondant et capable d'exprimer l'insérat contenu dans celui-ci > et on détecte parmi les produits d'expression de ce microorganisme l'éventuelle présence d'un peptide susceptible de porter le site immunogène du genre en question,par mise en contact desdits produits d'expression avec un anticorps monoclonal CD-'PVl) le cycle d'opérations qui vient d'être défini étant répété jusqu'à la disparition de la détection dudit peptide immunogène parmi les produits d'expression dudit micro-organisme transformé par le dernier plasmide recircularisé.
ADN-ligase, on transforme un micro-organisme approprié, lui-même transformable par le vecteur correspondant et capable d'exprimer l'insérat contenu dans celui-ci > et on détecte parmi les produits d'expression de ce microorganisme l'éventuelle présence d'un peptide susceptible de porter le site immunogène du genre en question,par mise en contact desdits produits d'expression avec un anticorps monoclonal CD-'PVl) le cycle d'opérations qui vient d'être défini étant répété jusqu'à la disparition de la détection dudit peptide immunogène parmi les produits d'expression dudit micro-organisme transformé par le dernier plasmide recircularisé.
Il est possible, au terme de chacun des cycles du procédé sus-défini, par exemple par comparaison des cartes de restriction du plasmide avant et après la susdite opération d'émondage, de déterminer celles des séquences d'ADN qui ont été éliminées entre deux émondages successifs et, par conséquent, lorsque cesse la possibilité de détection d'un peptide immunogène dans les conditions sus-indiquées, de corréler ce résultat à l'une des séquences supprimée au cours de l'opération d'émondage précédente,cette séquence supprimée d'ADN codant pour ledit peptide immunogène. La structure de la séquence supprimée (ou des séquences supprimées) peut naturellement découler des détermina tions de séquences nucléotidiques d'extrémités effectuées, avant et après l'émondage considéré.
Un tel principe sera illustré dans l'un des exemples de mise en oeuvre de l'invention dont la description suit. il sera également fait référence dans ce qui suit aux dessins dans lesquels - les fig. 1 à 4 Correspondent à des séquences déjà défi
nies dans ce qui précède; - les fig. 5a à 5h schématisent un mode de production d'un
précurseur obtenu à partir des clones pPV1-846 et
pPV1-120 décrits dans l'article de Sylvie VAN DER WERF
et autres auteurs déjà mentionné plus haut; - les fig. 6a à 6f représentent schématiquement les étapes
d'un mode de production d'un plasmide contenant ltessen-
tiel de l'information génétique de la séquence d'ADN,
telle qu'elle résulte des fig. 1 et 2;;
- la fig. 7 est une représentation schématique de la pro
duction du plasmide précédent et d'une étape supplémen
taire mise en jeu dans une première étape de la présente
invention, comme il résultera de la description qui
suit.
nies dans ce qui précède; - les fig. 5a à 5h schématisent un mode de production d'un
précurseur obtenu à partir des clones pPV1-846 et
pPV1-120 décrits dans l'article de Sylvie VAN DER WERF
et autres auteurs déjà mentionné plus haut; - les fig. 6a à 6f représentent schématiquement les étapes
d'un mode de production d'un plasmide contenant ltessen-
tiel de l'information génétique de la séquence d'ADN,
telle qu'elle résulte des fig. 1 et 2;;
- la fig. 7 est une représentation schématique de la pro
duction du plasmide précédent et d'une étape supplémen
taire mise en jeu dans une première étape de la présente
invention, comme il résultera de la description qui
suit.
- La figure 8 est une nouvelle reproduction de la
séquence codant pour VPl, précédée d'une partie de la
séquence codant pour VP3 et suivie par une partie de la
séquence codant pour NCVP3b. Cette séquence ne se
différencie essentiellement des parties de séquences
correspondantes apparaissant aux figures 1 a 4 que par
la numérotation des nucléotides. Cette numérotation est
conforme à celle résultant du "consensus" auquel se
réfèrent A.J.DORNER et al dans l'article intitulé
"Identification of the initiation site of po)iovirus
polyprotein synthesis" (Identification du site d' < ni-
tiation de la synthèse de la polyprotéine de poliovirus)
(Journal of Virology, Juin 1982, vol.42, NO 3, pp.l 017 - i 028)
Cette publication renvoie au projet MOIGEN du système SUMEX AIM de l'Université de Stanford en ce qui concerne les relations à établir entre la numérotation des séquences entièrement publiées et la numérotation adoptée dans la figure 8.
séquence codant pour VPl, précédée d'une partie de la
séquence codant pour VP3 et suivie par une partie de la
séquence codant pour NCVP3b. Cette séquence ne se
différencie essentiellement des parties de séquences
correspondantes apparaissant aux figures 1 a 4 que par
la numérotation des nucléotides. Cette numérotation est
conforme à celle résultant du "consensus" auquel se
réfèrent A.J.DORNER et al dans l'article intitulé
"Identification of the initiation site of po)iovirus
polyprotein synthesis" (Identification du site d' < ni-
tiation de la synthèse de la polyprotéine de poliovirus)
(Journal of Virology, Juin 1982, vol.42, NO 3, pp.l 017 - i 028)
Cette publication renvoie au projet MOIGEN du système SUMEX AIM de l'Université de Stanford en ce qui concerne les relations à établir entre la numérotation des séquences entièrement publiées et la numérotation adoptée dans la figure 8.
- La figure 9 est une représentation schématique du plasmide pCW 119 . Elle illustre les positions relatives des délétions introduites dans d autres plasmides dont question plus loin et dérivés de DCW 119.
- La figure 10 illustre plus spécifiquement encore les positions de ces délétions vis-à-vis des sites de restriction déterminés dans le plasmide pCW 119.
Les techniques des constructions utilisées pour les différents plasmides sont classiques. Les ADN de plasmides ont chaque fois été clivés par les enzymes de restriction dans les conditions prévues par leurs fabricants respectifs. Les fragments d'ADN ont été analysés par électrophorèse dans un gel d'Agarose ou de polyacrylamide. Les extrémités saillantes 3' ont été transformées en extrémités franches par incubation des fragments d'ADN (0,1 mg/ml) avec 100 u/ml de polymérase
ADN I (fragment Klenow) de E.coli pendant 1 heure à 370C dans un milieu 10 mM Tris-HC1, pH 7,5 contenant 10 mM
MgCl2, 50 mM NaCl, 1 mx1 DTT en présence de 0.2 mN des premières paires de nucléotides.La digestion avec la nucléase sa 31 a été réalisée dans un milieu 20 rn
CaC12, 12 mM MgCl2, en mettant en oeuvre un rapport enzyme/DNA de 0,12 u par g. Après incubation pendant 15 minutes à 300C, on ajoute de 1'EDTA jusqu'à atteindre une concentration de 50 mM et le DNA est extrait avec du phénol et précipité avec de l'éthanol. Les reactions de ligation ont été réalisées dans 20 l d'un milieu 60 mM Tris-HCl, pH 7,5 , 10 mM MgC12, 10 mM DTT, 1 mM ATP pendant 18 heures à 150C, en utilisant 1 u de
T4 DNA Ligase par g de DNA. Les plasmides linéarisés ont, le cas échéant, été traités pendant 30 min. à 680C avec une phosphatase alkaline bactérienne (0,02 u par g DNA) avant ligation avec les fragments appropriés.
ADN I (fragment Klenow) de E.coli pendant 1 heure à 370C dans un milieu 10 mM Tris-HC1, pH 7,5 contenant 10 mM
MgCl2, 50 mM NaCl, 1 mx1 DTT en présence de 0.2 mN des premières paires de nucléotides.La digestion avec la nucléase sa 31 a été réalisée dans un milieu 20 rn
CaC12, 12 mM MgCl2, en mettant en oeuvre un rapport enzyme/DNA de 0,12 u par g. Après incubation pendant 15 minutes à 300C, on ajoute de 1'EDTA jusqu'à atteindre une concentration de 50 mM et le DNA est extrait avec du phénol et précipité avec de l'éthanol. Les reactions de ligation ont été réalisées dans 20 l d'un milieu 60 mM Tris-HCl, pH 7,5 , 10 mM MgC12, 10 mM DTT, 1 mM ATP pendant 18 heures à 150C, en utilisant 1 u de
T4 DNA Ligase par g de DNA. Les plasmides linéarisés ont, le cas échéant, été traités pendant 30 min. à 680C avec une phosphatase alkaline bactérienne (0,02 u par g DNA) avant ligation avec les fragments appropriés.
1. Hydrolyse des DNA clonés par des enzymes de restriction
1.1. L'ADN du plasmide pPVI-846 est hydrolysé complètement par EcoRI. La forme linéaire du DNA plasmidique ainsi obtenue (figure 5c) est hydrolysée par digestion partielle avec Kpn I; les framgsts obtenus (figure 5d) sont séparés par électrophorèse en gel d'agarose à 0,7 %.
1.1. L'ADN du plasmide pPVI-846 est hydrolysé complètement par EcoRI. La forme linéaire du DNA plasmidique ainsi obtenue (figure 5c) est hydrolysée par digestion partielle avec Kpn I; les framgsts obtenus (figure 5d) sont séparés par électrophorèse en gel d'agarose à 0,7 %.
Le fragment de taille 6,6 kbp est sélectionné.
il représente en effet la séquence du plasmide pBR322 du site EcoN au site Pst I, prolongée de celle du DNA correspondant à la séquence du poliovirus qui s'étend du nucléotide 1 au nucléotide 3064 (2e site KpnI).
1.2. L'ADN du clone pPVI-120 est hydrolysé dans une digestion complète par AvaI et EcoRI formant ainsi 2 fragments de tailles différentes (figure 5e ). L'ADN est hydrolysé ensuite partiellement par Kpn I. Les fragments ainsi obtenus (figure 5f) sont séparés par électrophorèse en gel d'agarose à 0,7 %.
Le fragment de taille 3,55 kbp est sélectionné. il représente en effet la séquence du cDNA du poliovirus allant du nucléotide 3064 (2e site Kpn I) au nucléotide 5650 environ, prolongée de celle des 752 paires de bases du segment Pst I-EcoRIdu plasmide pBR322.
2. Extraction des fragments de DNA des gels
2.1. Les fragments sont visualisés dans les gels par coloration au bromure d'éthidium; ceux de la taille voulue sont extraits des gels par électroélution en sac à dialyse.
2.1. Les fragments sont visualisés dans les gels par coloration au bromure d'éthidium; ceux de la taille voulue sont extraits des gels par électroélution en sac à dialyse.
2.2. Le matériel ainsi obtenu est purifié et concentré.
3. Recollage des fragments (recombinaison)
Les deux fragments sélectionnés provenant des clones pPVI-846 et pPVI-120 et décrits ci-dessus sont mélangés et recollés à l'aide de la DNA ligase du phage T4 . Les bouts collants formés aux points de coupure par EcoRI et KpnI et portés à chaque extrémité des deux fragments favorisent leur recollage et assurent que celui-ci ne puisse se faire que dans le sens désiré (figures 5g et 5h).
Les deux fragments sélectionnés provenant des clones pPVI-846 et pPVI-120 et décrits ci-dessus sont mélangés et recollés à l'aide de la DNA ligase du phage T4 . Les bouts collants formés aux points de coupure par EcoRI et KpnI et portés à chaque extrémité des deux fragments favorisent leur recollage et assurent que celui-ci ne puisse se faire que dans le sens désiré (figures 5g et 5h).
Le génome du plasmide 4UR322 est ainsi reconstitué sans modification ni délétion dans le plasmide recombinant.
En particulier, les régions nécessaires à sa réplication et à l'expression de la résistance à la tétracycline ne sont pas touchées.
4. Transformation de la souche E.coZi 1106
Les fragments des plasmides pPVI-846 et -120 recollés par leurs sites Kpn I et EcoRi sont mis en contact avec des bactéries competentes de souche .coZi 1106 dans les conditions de transformation. Les colonies de bactéries résistantes à la tétracycline et sensibles à l'ampicilline sont sélectionnées.
Les fragments des plasmides pPVI-846 et -120 recollés par leurs sites Kpn I et EcoRi sont mis en contact avec des bactéries competentes de souche .coZi 1106 dans les conditions de transformation. Les colonies de bactéries résistantes à la tétracycline et sensibles à l'ampicilline sont sélectionnées.
5. Analyse des nouveaux clones
5.1 Le DNA plasmidique des bactéries tétracycline résistantes est purifié. Sa masse est déterminée par électrophorèse en gel d'agarose. Elle est égale à celle du plasmide pBR322 augmentée des 5650 paires de bases du cDNA viral formé par recombinaison.
5.1 Le DNA plasmidique des bactéries tétracycline résistantes est purifié. Sa masse est déterminée par électrophorèse en gel d'agarose. Elle est égale à celle du plasmide pBR322 augmentée des 5650 paires de bases du cDNA viral formé par recombinaison.
5.2 L'hybridation in vitro des cDNA ainsi obtenus avec des sondes spécifiques provenant des clones pPVI-846 et pPVI-120 permet la vérification de la présence dans un seul clone recombinant du matériel génétique du poliovirus inséré originellement dans les deux clones parentaux.
5.3 L'analyse détaillée des nouveaux clones est effectuée par les méthodes utilisées antérieurement pour l'étude des clones déjà caractérisés (cartographie physique par enzymes de restriction, microscopie électronique, séquence nucléotidique, etc.).
5.4 Le cDNA porté par le plasmide recombinant (pPV1-X) ou pPV1-958 porte l'information génétique nécessaire à la synthèse de la protéine NCVPla (ou P1), précurseur des protéines de capside VP4 (nucléotides 743 à 950), VP2 (nucléotides 951 à 1766), VP3 (1767 à 2479) et VP1 (2480 à 3385), suivie de celles qui correspondent à la protéine NCVP3b (ou P2)(précursur notamment de la protéine NCVPX) et au début de la protéine NCVPlb (ou P3)
L'ensemble couvre environ 5650 des 744O bases du génome viral.
L'ensemble couvre environ 5650 des 744O bases du génome viral.
Le plasmide pPVI-846 a été déposé à la C.N.C.M. sous le n I-155 et le plasmide 120 sous le n I-156 le 19 mai 1981.
Le plasmide p7V1-958 obtenu contient dans son insérat la séquence nucléotidique qui code pour les protéines VPO (nucléotides 743 à 1766), VP3 (nucléotides 1767 à 2479) et
VPI (nucléotides 2480 à 3385) suivie de la séquence codant pour la protéine NCVP3D (nucléotides 3386 à 5100 et quelque) et du début de celle de la protéineNCVPlb.
VPI (nucléotides 2480 à 3385) suivie de la séquence codant pour la protéine NCVP3D (nucléotides 3386 à 5100 et quelque) et du début de celle de la protéineNCVPlb.
Partant du plasmide pPV1-958, on peut alors obtenir un fragment de cDNA codant pour VP1 en procédant comme suit.
ISOLEMENT ET RECLONAGE D'UN FRAGMENT DE cDNA RENFERMANT
LA SEQUENCE DE-VP1.
LA SEQUENCE DE-VP1.
La séquence de nucléotides qui code pour la protéine
VP1 est encadrée, dans le génome viral, et par conséquent aussi dans l'insérat porté par pPV1-958, de deux sites PstI > situés respectivement 237 nucléotides en amont (position 2243) et 32 nucléotides en aval (position 3417) du premier et du dernier nucléotide de cette séquence (cf. carte de restriction dans la susdite publication et fig. 1 et 2).
VP1 est encadrée, dans le génome viral, et par conséquent aussi dans l'insérat porté par pPV1-958, de deux sites PstI > situés respectivement 237 nucléotides en amont (position 2243) et 32 nucléotides en aval (position 3417) du premier et du dernier nucléotide de cette séquence (cf. carte de restriction dans la susdite publication et fig. 1 et 2).
Le découpage de pPV1-958 (fig. 6a) par l'enzyme de restriction PstI engendre donc une famille de fragments ayant des longueurs correspondant respectivement à 4,36 kb (corps du plasmide) et à 1,8 kb ; 0,43 kb ; 1,17 kb et environ 2,23 kb. Le fragment de 1,17 kb porte la séquence nucléotidique codant pour la fin de VP3 et la totalité de VPI. Ce dernier fragment commence par la séquence nucléotidique
G G T C C T C A T G T A et s'achève par la séquence
G T A C A C T G C A3,. On le sépare des autres fragments
PstI par électrophorèse en gel d'agarose. On prélève la bande du gel qui le contient, et on la soumet à une électroélution pour en extraire le DNA. On suit ltélectroélution par illumination aux ultraviolets après coloration du gel au bromure d'éthidium.Le fragment ainsi préparé correspond aux clé- otides du poliovirus 2243 à 3417. On l'insère par ligation avec de la DNA-ligase au site PstI du plasmide vecteur pBR-322 préalablement linéarisé par cette même enzyme Les plasmides recombinants qu'on a formés ainsi sont clonés dans la souche 1106 d'Escherichia coli (sélection des colo nies devenues résistantes à la tétracycline mais demeurées sensibles à l'ampicilline après transformation par le plas mide).
G G T C C T C A T G T A et s'achève par la séquence
G T A C A C T G C A3,. On le sépare des autres fragments
PstI par électrophorèse en gel d'agarose. On prélève la bande du gel qui le contient, et on la soumet à une électroélution pour en extraire le DNA. On suit ltélectroélution par illumination aux ultraviolets après coloration du gel au bromure d'éthidium.Le fragment ainsi préparé correspond aux clé- otides du poliovirus 2243 à 3417. On l'insère par ligation avec de la DNA-ligase au site PstI du plasmide vecteur pBR-322 préalablement linéarisé par cette même enzyme Les plasmides recombinants qu'on a formés ainsi sont clonés dans la souche 1106 d'Escherichia coli (sélection des colo nies devenues résistantes à la tétracycline mais demeurées sensibles à l'ampicilline après transformation par le plas mide).
L'analyse de leur ADN par cartographie aux enzymes de restriction permet d'identifier et de sélectionner les plasmides recombinants qui portent le fragment du cADN polioviral inséré dans le sens contraire aux aiguilles d'une montre par rapport à la carte de pBR-323, c'est-à- dire dans le même sens transcriptionnel que le gène de la S-lactamase (gène de la résistance à l'ampicilline).
faut noter que l'insertion du fragment 224,-3417 au site
PstI de pBR-322 interrompt la continuité de la séquence nucléotidique, et inactive donc le gène de la -lactamase du vecteur, mais ne permet cependant pas d'assure l'ex- pression des protéines poliovirales car elle entraine un changement de phase de lecture de l'insérat.
PstI de pBR-322 interrompt la continuité de la séquence nucléotidique, et inactive donc le gène de la -lactamase du vecteur, mais ne permet cependant pas d'assure l'ex- pression des protéines poliovirales car elle entraine un changement de phase de lecture de l'insérat.
On dénomme pSW-11 (fig. 6b), le plasmide ayant ces propriétés.
ELIMINATION DES SEQUENCES CODANT POUR LA PARTIE
TERMINALE DE VP3 : EMONDAGE DE VP1.
TERMINALE DE VP3 : EMONDAGE DE VP1.
Le plasmide pSW-11 contient, précédant, dans le sens transcriptionnel 5 - 3', la séquence de V?l, 237 nucléotides de cADN de poliovirus relevant de la séquence de VP3. Ces nucléotides excédentaires peuvent être enlevés d'au moins deux manières a) par traitement nagé du fragment PstI (préalablement extrait de pSW-11: fig. 6c) de 1,17 kb par l'enzyme oe restriction HaeII (digestion partielle au nucléotide 2467), puis sélection par électrophorèse du fragment HaeII-PstI de 0,95 kb (fig. 6d) (nucléotides polioviraux 2467 à 3417) et reclonage de ce fragment dans les plasmides appropriés.On peut faciliter le reclonage en accrochant de façon en soi connue aux extrémités du fragment émondé des adaptateurs ("linkers") synthétiques, courtes séquences de nucléotides contenant un site de restriction déterminé obtenu par synthèse, par exemple selon la technique décrite par R.H. SCELLER et al, Science, tome 196 (1977), pp. 177-180. Le type de 'linker" choisi dépend essentiellement du site de coupure de l'enzyme de restriction utilisée dans le vecteur d'expression.
b) par linéarisation du plasmide pSW-11 par digestion complète par l'enzyme PvuI, suivie d'un traitement exonucléolytique à l'enzyme Bxl 31, puis de l'addition éventuelle d'adapta- teurs ("linkers1,) synthétiques types (Biolabs, Collaborative Research) et de la recircularisation du plasmide par la DNA ligase.
On ouvre donc les molécules. On analyse par migration en électrophorèse en gel d'agarose leurs tailles pour identifier celles qui ont perdu environ 700 paires de bases(perte qui dans la figure 6e est symbolisée par un arc de cercle en pointillés), c'est-à-dire quelque 350 de part et d'autre du site PvuI, soit le fragment PvuI-PstI de pBR-322 plus la séquence de VP3 jusqu'à VP1, d'un côté,et et en une longueur similaire de pBR-322 allant de PvuI vers
EcoRI, de l'autre côté.
EcoRI, de l'autre côté.
De cette façon, on peut isoler un fragment dont l'une des extrémités coincide avec l'extrémité de la séquence d'ADN codant pour VP1 ; ou en tous les cas en est très proche.
En effet, le site PvuI se trouvait à 126 paires de bases (b) du site proximal PstI de la séquence du fragment
PstI de 1,17 kh et à 363 paires de bases de l'extrémité proximale du fragment de cDNA codant pour YP1, dans le plasmide pSW-11.
PstI de 1,17 kh et à 363 paires de bases de l'extrémité proximale du fragment de cDNA codant pour YP1, dans le plasmide pSW-11.
Après fixation éventuelle aux extrémités du fragment sélectionné de "linkers" contenant par exemple un site BglII au moyen d'une ligase, on sélectionne les plasmides dont la taille est de 4,8 à 5 kb (fig. 6f). On détermine ensuite ceux des plasmides qui ont conservé la séquence entière de VP1, tout en ayant perdu la totalité ou la quasi-totalité de VP3. On vérifie cela dans le cas où l'on a inséré un linker BglII en déterminant la séquence nuclé otidique'du fragment 8glII-PstI des plasmides sélectionnés.
Si l'on utilise la méthode de SANGER, on insère les fragments à séquencer dans la forme réplicative du phage M13 et on clone les phages recombinants ainsi constitués. On utilise ensuite leur ADN pour séquencer le fragment inséré, selon la technique décrite par SANGER. On peut aussi procéder à la détermination de la séquence nucléotidique conservée par la méthode décrite par MAXAM et GILBERT.
Le plasmide obtenu par émondage du plasmide pSW-11, notamment par la variante b du procédé décrit cidessus, mais sans introduction de linker Bg1II, a été dénommé pSW-119.
Les différences observées entre les plasmides pSW-11 et pSW-119 (ou pCW-119) résultent du schéma de la fig. 7. En particulier, le plasmide pSW-119 a perdu la plus grande partie de la partie de séquence que contenait encore le plasmide pSW-11 et qui code pour le polypeptide de structure VP3 du poliovirus.
Comme cela- a été indiqué dans la demande de brevet français nO 82 02013, le plasmide pSW-119 est capable d'exprimer une protéine de fusion VP1-ss-lactamase dans des souches de E. coli 1106 ou GC 26 (entre autres micro-organismes, tels que ceux envisagés dans la demande de brevet antérieur nO 82 02013). Cette protéine de fusion, ayant un poids moléculaire de 49.000 daltons, est spécifiquement immunoprécipitée par les anticorps monoclonaux
CD-VP1 (ou C3).
CD-VP1 (ou C3).
Un dérivé de pSW 119, pFS119,a été construit en remplaçant les séquences entre les sites BamHI et
Pst I de pBR 322 (nucléotides 375 -3 608) par les séquences correspondantes de pBR 327. Après marquage des protéines exprimées par le plasmide pFS 119 dans des bactéries Go 26 avec la (35S)méthionine, immunoprécipitation et analyse par électrophorèse sur gel de polyacrylamide, il a de nouveau été possible de reconnaître une protéine de fusion ayant un poids moléculaire de l'ordre de 49 000 daltons (p49),spécifiquement immunoprécipitée par
C3 ,parmi les produits d'expression dans GC 26.
Pst I de pBR 322 (nucléotides 375 -3 608) par les séquences correspondantes de pBR 327. Après marquage des protéines exprimées par le plasmide pFS 119 dans des bactéries Go 26 avec la (35S)méthionine, immunoprécipitation et analyse par électrophorèse sur gel de polyacrylamide, il a de nouveau été possible de reconnaître une protéine de fusion ayant un poids moléculaire de l'ordre de 49 000 daltons (p49),spécifiquement immunoprécipitée par
C3 ,parmi les produits d'expression dans GC 26.
On a également représenté dans la fig 7 la structure schématique du plasmide pFS-1019, tel qu'il a été obtenu par - digestion du plasmide pSW-119 ou pFS-119 - séparation par électrophorèse des fragments obtenus en
gel d'agarose, - sélection (par la taille des fragments concernés) de
celui des fragments dérivés de pSW-119 ou pCW-119 et
présentant la taille de celui-ci, cependant réduite
d'environ 315 paires de bases. On a de même recueilli
le petit fragment de 315 paires de bases Xbai-Xbai,
également obtenu à partir du milieu de digestion dans
les mêmes conditions.
gel d'agarose, - sélection (par la taille des fragments concernés) de
celui des fragments dérivés de pSW-119 ou pCW-119 et
présentant la taille de celui-ci, cependant réduite
d'environ 315 paires de bases. On a de même recueilli
le petit fragment de 315 paires de bases Xbai-Xbai,
également obtenu à partir du milieu de digestion dans
les mêmes conditions.
Le premier fragment sélectionné a été recircularisé au moyen d'une ligase, pour former le plasmide pFS 1019.
Après incorporation de celui-ci dans E.coli 1106, celle-ci a conduit à l'obtention d'une protéine de fusion tronquée, de 39.000 daltons, qui n'est plus reconnue par l'anticorps monoclonal CD-VP1 ou C3.
Au contraire, le petit fragment a extrémité XhaI de 315 nucléotides, conduit, lorsqu'il est réintroduit en phase dans un gène porté par un plasmide approprié, à un plasmide modifié capable de transformer E.coli 1106 pour rendre celle-ci capable d'exprimer une protéine hybride reconnue par les anticorps monoclonaux C3, Par exemple, cette réintroduction en phase peut être effectuée dans le gIne de ss S-lactamase de pBR-322.
La mise en phase adéquate peut, si besoin, être réalisée par la technique décrite dans la demande de brevet français n 78 32041 du 13 novembre 1978.
La réinsertion du fragment XbaI-XbaI, quel que soit son origine, dans le plasmide pFS 1019 conduit à nouveau à un plasmide dont les produits d'expression contiennent une pr-oteine reconnaissable par C3. Il en a particulièrement été ainsi en ce qui concerne le plasmide pCW 119 ,leguel a été obtenu par réinsertion dans le site XbaI de pFS 1019 d'un fragment XbaI.XbaI de mime taille et structure nucléotidique, isolé à partir de pPVl-366 également décrit dans la demande de brevet 81 09 968.
La séquence nucléotidique du fragment XbaI-XbaI (315 paires de nucléotides) a déjà été indiquée plus haut. De même a été indiquée plus haut la séquence pep-tidique du peptide Ser 23- Ser128.
On a représenté dans la figure 9 un schéma du plasmide pCW119, dans lequel la séquence codant pour la protéine VP 1 a été représentée par une zone hachurée délimitée par deux arcs de cercles. Les principaux sites considérés dans le cadre de la présente description sont également indiqués dans la figure 9.
La détermination et l'obtention de séquences peptidiques plus petites susceptibles de porter le site immunogène recherché (ou épitope reconnu par C3) ont été conduites de la façon suivante.
Le plasmide pCW 119 a été soumis à une digestion par l'enzyme de restriction Kpn I, ce qui l'a ouvert au niveau du site de restriction 3064 (par conséquent exté- rieur au fragment XbaI susdit). La mise en oeuvre du procédé défini ci-dessus, mettant en jeu des cycles répétés d'émondage avec l'enzyme Bal 31, a conduit à la perte de fragments successifs d'extrémités, dont ceux codant pour les susdites séquences "His 65-Phe 105" et "Asp 93-Leu 104".La délétion à partir des plasmides linéarisés des fragments contenant les séquences codant pour les séquences peptidiques qui viennent d'être mentionnées,s'est manifestée par la perte chez le plasmide postérieurement recircularisé (au moyen de T4-ADN-ligase) de sa capacité d'induire la production, par les bactéries transformées par lui, de séquences peptidiques susceptibles d'être reconnues par les anticorps monoclonaux CD
PVl ou C3
Afin de localiser avec davantage encore de précision l'épitcpe reconnu par C3, on a construit une série de plasmides dérivés de pCW 119 et comportant des délétions plus ou moins étendues de cette séquence. Les positions relatives des fragments délétés vis-à-vis des sites
XbaI (2546)et(2 861) sont schématisespar les arcs de cercles apparaissant dans la figure 9 .Les limites de ces délétions vers la gauche ont été déterminées par linéarisation des plasmides (à raison de 1 pg d'ADN) avec XbaI et par marquage avec l'enzyme de Klenow pendant une heure à 150C, en présence de S 32+ dATP (10 vCi) et de dGTP,dCTP et dTTP (à raison de 0,2 mM de chacun de ces derniers constituants). L'ADN marqué a ensuite été digéré au moyen des enzymes de restriction indiqués ci-après (conditions de digestion partielle lorsque l'on a recours à AluI) .Les fragments de restriction marqués ont ensuite été séparés sur un gel de polyacrylamide à 5 % et rendus visibles par autoradiographie.Les limites des délétions vers la droite ont été déduites de la taille des fragments délétés et confirmées par la présence ou l'absence des sites de restriction pour les enzymes
identifiés dans la partie supérieure de la fig. 10.
PVl ou C3
Afin de localiser avec davantage encore de précision l'épitcpe reconnu par C3, on a construit une série de plasmides dérivés de pCW 119 et comportant des délétions plus ou moins étendues de cette séquence. Les positions relatives des fragments délétés vis-à-vis des sites
XbaI (2546)et(2 861) sont schématisespar les arcs de cercles apparaissant dans la figure 9 .Les limites de ces délétions vers la gauche ont été déterminées par linéarisation des plasmides (à raison de 1 pg d'ADN) avec XbaI et par marquage avec l'enzyme de Klenow pendant une heure à 150C, en présence de S 32+ dATP (10 vCi) et de dGTP,dCTP et dTTP (à raison de 0,2 mM de chacun de ces derniers constituants). L'ADN marqué a ensuite été digéré au moyen des enzymes de restriction indiqués ci-après (conditions de digestion partielle lorsque l'on a recours à AluI) .Les fragments de restriction marqués ont ensuite été séparés sur un gel de polyacrylamide à 5 % et rendus visibles par autoradiographie.Les limites des délétions vers la droite ont été déduites de la taille des fragments délétés et confirmées par la présence ou l'absence des sites de restriction pour les enzymes
identifiés dans la partie supérieure de la fig. 10.
Les symboles utilisés dans cette dernière avaient la signification suivante
X = XbaI; H = HhaI; A = AluI; S = Sau3A; K = pnI
P = Psti. Les numéros indiqués correspondent -aux positions des nucléotides concernés vis-à-vis de la fig 8.
X = XbaI; H = HhaI; A = AluI; S = Sau3A; K = pnI
P = Psti. Les numéros indiqués correspondent -aux positions des nucléotides concernés vis-à-vis de la fig 8.
Les protéines de fusion tronquées exprimées par les plasmides pCW217, 213, 215, et 202 réagissent encore avec l'anticorps monoclonal neutralisant C3. En revanche, les protéines de fusion tronquées exprimées par les plasmides pCW216, 203, 218 et 223 ne sont plus reconnues par l'anticorps C3. La cartographie fine par enzymes de restriction a permis de déterminer que la plus grande délétion n'affectant pas la réactivité de la protéine tronquée avec C3 (pCW215) s'étend jusqu'au nucléotide 2792 (18X) et que la plus petite délétion se traduisant par une perte de réactivité de la protéine tronquée s'étend jusqu'aux nucléotides 2771-2782 (Thr-Lysr
98 108
Par conséquent, il peut être considéré que l'extrémité C-terminale de la séquence d'acides aminés constituant l'épitope neutralisant reconnu par C3 est localisée entre les acides aminés 95, 110, et plus particulièrement encore les acides aminés 98 et 104 de la protéine oeî. Cette région correspond par ailleurs à une zone hydrophile de la protéine.
98 108
Par conséquent, il peut être considéré que l'extrémité C-terminale de la séquence d'acides aminés constituant l'épitope neutralisant reconnu par C3 est localisée entre les acides aminés 95, 110, et plus particulièrement encore les acides aminés 98 et 104 de la protéine oeî. Cette région correspond par ailleurs à une zone hydrophile de la protéine.
INSERTION DE CES SEQUENCES D'ADN DANS UN VECTEUR
D'EXPRESSION
La séquence Xbai-Xbai ne comporte ni codon d'initiation, ni codon de terminaison. Elle ne comporte non plus ni promoteur pour sa transcription, ni signal de reconnaissance par les ribosomes (séquences de SHINE et
DALGARNO, décrite dans GIRARD et HIRTH, Virologie
Moléculaire, Edition Doin 1980, pp. 15-46 et 263-264).
D'EXPRESSION
La séquence Xbai-Xbai ne comporte ni codon d'initiation, ni codon de terminaison. Elle ne comporte non plus ni promoteur pour sa transcription, ni signal de reconnaissance par les ribosomes (séquences de SHINE et
DALGARNO, décrite dans GIRARD et HIRTH, Virologie
Moléculaire, Edition Doin 1980, pp. 15-46 et 263-264).
Pour la faire exprimer, il faut donc l'insérer en phase au milieu de la séquence nucléotidique 'et en tout cas derrière l'AUG d'initiation) d'un gène cloné avec son promoteur (ou auquel on adjoindra en amont, un promoteur étranger). L'utilisation de "linkers", comme décrit ci-dessus, permet d'envisager l'utilisation de plusieurs types de vecteurs d'expression différents selon le promoteur considéré: par exemple du type de ceux indiqués ciaprès à titre d'exemple.
a) Promoteurs bactériens
C'est notamment le cas des plasmides contenant la région promoteur-opérateur de-ltopéron lactose d'E coli (opéron lac), suivie de la partie 5' du gène de la ss -galactosidase. Ces vecteurs, du type pPC (CHARNAY et al, Nucleic Acid Research 1978, tome V, pp. 4 479-4494), permettent l'insertion de la séquence au site EcoRI situé à 21 nucléotides derrière l'AUG d'initiation de la ss- galactosidase. La protéine à laquelle ils donnent naissance comporte donc pour extrémité N terminale les sept (ou huit) premiers acides aminés de la ss -galactosidase bactérienne, suivis des acides aminés codés par ladite séquence.
C'est notamment le cas des plasmides contenant la région promoteur-opérateur de-ltopéron lactose d'E coli (opéron lac), suivie de la partie 5' du gène de la ss -galactosidase. Ces vecteurs, du type pPC (CHARNAY et al, Nucleic Acid Research 1978, tome V, pp. 4 479-4494), permettent l'insertion de la séquence au site EcoRI situé à 21 nucléotides derrière l'AUG d'initiation de la ss- galactosidase. La protéine à laquelle ils donnent naissance comporte donc pour extrémité N terminale les sept (ou huit) premiers acides aminés de la ss -galactosidase bactérienne, suivis des acides aminés codés par ladite séquence.
b) Promoteurs de phage
C'est notamment le cas des plasmides contenant la région promoteur-opérateur de l'opéron de gauche (PL) ou de l'opéron de droite (PR) du phage# .Ces vecteurs, respectivement du type pKC30 (ROSENBERG, Nature 1981, vol.292, p. 128) ou pCL47 (ZABEAU et STANLEY, The EMBO
Journal, 1982, tome I, pp.1217 - 1224)dérivés du pLK5 (ou RSS) et de pLG400, ce dernier étant décrit dans Cell, 1980, vol. 20, pp. 543-553) permettent d'effectuer l'insertion de ladite séquence au sein des séquences nucléotidiques codant respectivement pour l'extrémité
N-terminale du produit du gène N ou pour celle du produit du gène cro déposé le 8 février 1982 à la C.N.C.M. sous le n I-184. Ces systèmes de vecteurs sont propagées à 300C dans des bactéries lysogénisées par un phageS à répresseur thermosensible (cl 857) ou en présence de plasmides porteurs du même gène (cl 857) codant pour un répresseur thermosensible. Ils demeurent inactifs, du fait du répresseur, tant que la culture est maintenue à 30 C. Le transfert de la culture à 420C est suivi de l'activation des promoteurs de X (PL ou PR@ ports par le plasmide recombinant, du fait de l'inactivation du répresseur du gène cI 857.
C'est notamment le cas des plasmides contenant la région promoteur-opérateur de l'opéron de gauche (PL) ou de l'opéron de droite (PR) du phage# .Ces vecteurs, respectivement du type pKC30 (ROSENBERG, Nature 1981, vol.292, p. 128) ou pCL47 (ZABEAU et STANLEY, The EMBO
Journal, 1982, tome I, pp.1217 - 1224)dérivés du pLK5 (ou RSS) et de pLG400, ce dernier étant décrit dans Cell, 1980, vol. 20, pp. 543-553) permettent d'effectuer l'insertion de ladite séquence au sein des séquences nucléotidiques codant respectivement pour l'extrémité
N-terminale du produit du gène N ou pour celle du produit du gène cro déposé le 8 février 1982 à la C.N.C.M. sous le n I-184. Ces systèmes de vecteurs sont propagées à 300C dans des bactéries lysogénisées par un phageS à répresseur thermosensible (cl 857) ou en présence de plasmides porteurs du même gène (cl 857) codant pour un répresseur thermosensible. Ils demeurent inactifs, du fait du répresseur, tant que la culture est maintenue à 30 C. Le transfert de la culture à 420C est suivi de l'activation des promoteurs de X (PL ou PR@ ports par le plasmide recombinant, du fait de l'inactivation du répresseur du gène cI 857.
c) Promoteurs viraux
C'est en particulier le cas ce l'utilisation du virus SV40 comme vecteur. Dans ce cas, on utilise le promoteur viral tardif et l'on insère la séquence du poliovirus à la place de tout ou partie de la région codant pour les protéines tardives de SV40 (VPl ou VP2) Cn construit ainsi des ADN de SV40 substitues dans les- quels les séquences codant pour les protéines de capside de ce virus sont remplacées par la séquence codant pour le peptide immunogène.Ainsi l'insertion de ladite séquence, au besoin par l'intermédiaire de "linkers" appropriés à la place du fragment tardif HaeII-PstI de
SV40 (nucléotides de 767 à 1923), ou c'une partie de ce fragment aboutit à la création d'un gène chimérique possédant une séquence codant pour un peptide immunogène inducteur in vivo d'anticorps actifs à l'égard du poliovirus directement en aval de la portion N-terminale de la protéine VP2 du SV40.
C'est en particulier le cas ce l'utilisation du virus SV40 comme vecteur. Dans ce cas, on utilise le promoteur viral tardif et l'on insère la séquence du poliovirus à la place de tout ou partie de la région codant pour les protéines tardives de SV40 (VPl ou VP2) Cn construit ainsi des ADN de SV40 substitues dans les- quels les séquences codant pour les protéines de capside de ce virus sont remplacées par la séquence codant pour le peptide immunogène.Ainsi l'insertion de ladite séquence, au besoin par l'intermédiaire de "linkers" appropriés à la place du fragment tardif HaeII-PstI de
SV40 (nucléotides de 767 à 1923), ou c'une partie de ce fragment aboutit à la création d'un gène chimérique possédant une séquence codant pour un peptide immunogène inducteur in vivo d'anticorps actifs à l'égard du poliovirus directement en aval de la portion N-terminale de la protéine VP2 du SV40.
On peut procéder de même en substituant la séquence
VPl du poliovirus à celle du SV40 entre les sites EcoRI (1718) et Bam H1 (2469).
VPl du poliovirus à celle du SV40 entre les sites EcoRI (1718) et Bam H1 (2469).
d) Promoteurs de virus animaux portés par des plasmide
bactériens
C'est le cas des plasmides portant les promoteurs du gène de la thymidine-kinase du virus de l'herpès (pAGOj, du gène de l'antigène HBs du virus de l'hépatite (pAC-2 ou pAC-14) ou des gènes précoces ou tardifs de l'adénovirus 2 etc.. L'insertion d'une séquence immu- nogène selon l'invention derrière l'AUG du gène viral cloné avec son promoteur permet d'en assurer l'expres- sion dans la cellule animale (après transfectlon, micro- injection ou fusion cellules-protoplastes).
bactériens
C'est le cas des plasmides portant les promoteurs du gène de la thymidine-kinase du virus de l'herpès (pAGOj, du gène de l'antigène HBs du virus de l'hépatite (pAC-2 ou pAC-14) ou des gènes précoces ou tardifs de l'adénovirus 2 etc.. L'insertion d'une séquence immu- nogène selon l'invention derrière l'AUG du gène viral cloné avec son promoteur permet d'en assurer l'expres- sion dans la cellule animale (après transfectlon, micro- injection ou fusion cellules-protoplastes).
Les séquences @eptidiques ou "séquences selon l'invention" sont accessibles par synthèse chimique, par exemple en ayant recours à l'un des procédés classiques dont les conditions de mise en oeuvre sont rappelées ciaprès.
La synthèse des peptides en solution homogène et en phase solide est bien connue.
A cet égard, on pourra avoir recours au mode de synthèse en solution homogène décrit par HOUBEmsEYL dans l'ouvrage intitulé "ethode der Organischen
Chemie" (Méthode de la chimie organique) édité par E.
Chemie" (Méthode de la chimie organique) édité par E.
Wünsch., vol. 15-I et il, THIEME Stuttgart 1974.
Cette méthode de synthèse consiste à condenser successivement deux à deux les aminoacyles successifs dans l'ordre requis, ou à condenser des aminoacyles et des fragments préalablement formés et contenant déjà plusieurs résidus aminoacyles dans l'ordre approprié, ou encore plusieurs fragments préalablement ainsi préparés, étant entendu que l'on aura eu soin de protéger au préalable toutes les fonctions réactives portées par ces aminoacyles ou fragments à l'exception des fonctions amine de l'un et carboxyle de l'autre ou vice versa, qui doivent normalement intervenir dans la formation des liaisons peptidiques, notamment après activation de la fonction carboxyle, selon les méthodes bien connues dans la synthèse des peptides.En variante, on pourra avoir recours à des réactions de couplage mettant en jeu des réactifs de couplage classique, du type carbodiimide, tels que par exemple la 1-éthyl-3-(3-diméthyl- aminopropyl)-carbodiimide. Lorsque laminoacyle mis en oeuvre possède une fonction amine supplémentaire (cas de la lysine par exemple) ou une autre fonction acide (cas par exemple de l'acide glutamique), ces fonctions seront par exemple protégées, par des groupes carbobenzoxy ou t-butyloxycarbonyle, en ce qui concerne les fonctions amine, ou par des groupes t-butylester, en ce qui concerne les fonctions carboxyliques. il en ira de même de la protection de toute autre fonction réactive.Par exemple, lorsque l'un des aminoacyles considérés contient une fonction SH (par exemple le cystéine), on pourra avoir recours à un groupe acétamidométhyle ou paraméthoxybenzyle.
Dans le cas de la syntnèse progressive, acide aminé par acide aminé, la synthèse débute de préférence par la condensation de l'amino-acide C-terminal avec l'amino-acide qui correspond à l'aminoacyle voisin dans la séquence désirée et ainsi de suite, de proche en proche, jus;ulà l'acide aminé N-terminal. Selon une autre technique préférée de l'invention, on a recours à celle décrite tar R.D. MERRIFIELD dans l'article intitulé "Sol id phase peptide synthesis" (J. Am. Chem.
Soc., 45, 2149-2154).
Pour fabriquer une chaine peptidique selon le procédé de MERRIFIELD, on a recours à une résine polymère très poreuse, sur laquelle on fixe le premier aminoacide C-terminal de la chaine. Cet amino-acide est fixé sur la résine par l'intermédiaire de son groupe carboxylique et sa fonction amine est protégée, par exemple par le groupe t-butyloxycarbonyle.
Lorsque le premier amino-acide C-terminal est ainsi fixé sur la résine, on enlève le groupe protecteur de la fonction amine en lavant la résine avec un acide.
Dans le cas où le groupe protecteur de la fonction amine est le groupe t-butyloxycarbonyle, il peut être éliminé par traitement de la résine à l'aide d'acide trifluoroacétique.
On couple ensuite le deuxième amino-acide qui fournit le second amino-acyle de la séquence recherchée, à partir du résidu amino-acyle C-terminal sur la fonction amine déprotégée du premier amino-acide C-terminal fixé sur la chaine. De préférence, la fonction carboxyle de ce deuxième amino-acide est activée, par exemple par la dicyclohexylcarbodiimide, et la fonction amine est protégée, par exemple par le t-butyloxycarbonyle.
On obtient ainsi la première partie de la chaine peptidique recherchée, qui comporte deux aminoacides, et dont la fonction amine terminale est proté- aée. Comme précédemment, on déprotège la fonction amine et on peut ensuite procéder à la fixation du troisième aminoacyle, dans les conditions analogues à celles de l'addition du deuxième aminoacide C-terminal.
On fixe ainsi, les uns après les autres, les acides aminés, qui vont constituer la chaine peptidique sur le groupe amine chaque fois déprotégé au préalable de la portion de la chaine peptidique déjà formée, et qui est rattachée à la résine.
Lorsque la totalité de la chaine peptidique désirée est formée, on élimine les groupes protecteurs des différents aminoacides constituant la chaine peptidique et on détache le peptide de la résine par exemple à l'aide d'acide fluorhydrique.
DETECTION DE L'EXPRESSION DES SEQUENCES IMMUNOGENES
SELON L'INVENTION
L'expression des plasmides recombinants porteurs desdites séquences immunogènes et capables de les exprimer, c'est-à-dire d'effectuer la synthèse d'un peptide immunogène, est détectée par des techniques d'immunoprécipitation, en elles-mêmes connues et mettant de préférence en jeu des liquides d'ascite contenant les anticorps monoclonaux C3 ou sérum de lapin anti
VP1 (a VPl).
SELON L'INVENTION
L'expression des plasmides recombinants porteurs desdites séquences immunogènes et capables de les exprimer, c'est-à-dire d'effectuer la synthèse d'un peptide immunogène, est détectée par des techniques d'immunoprécipitation, en elles-mêmes connues et mettant de préférence en jeu des liquides d'ascite contenant les anticorps monoclonaux C3 ou sérum de lapin anti
VP1 (a VPl).
En ce qui concerne les séquences de plus petite taille et portant un épitope ou déterminant immunogénique, et plus particulièrement celles qui sont accessibles de façon relativement aisée par synthèse chimique,
il sera souhaitable, en vue d'accentuer leur @aractère
immunogène in vivo, de les coupler ou ''conjuguer'l Oc
façon covalente à une molécule porteuse, physiolo-
giquement acceptable et non toxique.
il sera souhaitable, en vue d'accentuer leur @aractère
immunogène in vivo, de les coupler ou ''conjuguer'l Oc
façon covalente à une molécule porteuse, physiolo-
giquement acceptable et non toxique.
A titre d'exemples de molécules porteuse
supports macromoléculaires entrant dans la constitu
tion des conjugés selon l'invention, on mentionnera
des protéines naturelles, telles que la texine
tétanique, l'ovalbumine, des sérums albumines, des hémocyanines, etc.
supports macromoléculaires entrant dans la constitu
tion des conjugés selon l'invention, on mentionnera
des protéines naturelles, telles que la texine
tétanique, l'ovalbumine, des sérums albumines, des hémocyanines, etc.
A titre de supports macromoléculaires synthé
tiques, on mentionnera par exemple des polylysine ou
des poly (D-L-alanine)-poly(L-lysine)
La littérature mentionne d'autres ires te ports macromoléculaires susceptibles d'être @ti@@sés, lesquels présentent en général un poids moléculaire supérieur @ 0.000.
tiques, on mentionnera par exemple des polylysine ou
des poly (D-L-alanine)-poly(L-lysine)
La littérature mentionne d'autres ires te ports macromoléculaires susceptibles d'être @ti@@sés, lesquels présentent en général un poids moléculaire supérieur @ 0.000.
Pour synthétiser les conjugués selon l'invention, on peut avoir recours à des procédés connus en soi, tel que celui décrit par FRANTZ et ROBERTSON dans Infect.
and Immunity, 33, 193-198 (1981), ou celui décrit dans
Applied and Environmental Microbiology, octobre 1981, vol. 42, n 4, 611-614 rar P. E. KAUFFMAN en utilisant le peptide et la molécule porteuse appropriée.
Applied and Environmental Microbiology, octobre 1981, vol. 42, n 4, 611-614 rar P. E. KAUFFMAN en utilisant le peptide et la molécule porteuse appropriée.
Dans la pratique, on utilisera avantageusement comme agent de couplage les composés suivants, cités à titre non limitatif : aldéhyde glutarique, chloroformiate d'éthyle, carbodiimides hydrosolubles [N-éthyl-N'(3-diméthylamino-propyl) carbodiimide, HCl], diisocyanates, bis-diazobenzidine, di- et trichloro-s-triazines, bromures de cyanogène, benzaquinone, ainsi que les agents de couplage mentionnés dans Scand. J. Immunol., 1978, vol. 8, p. 7-23 (AVRAMEAS, TERNYNCK, GUESDON).
On peut avoir recours à tout procédé de cou Dlage faisant intervenir d'une part une ou plusieurs fonctions réactives du peptide et d'autre part, une ou plusieurs fonctions réactives des molécules supports.
Avantageusement, il s'agit des fonctions carboxyle et amine, lesquelles peuvent donner lieu à une réaction de couplage en Drésence d'un agent de couplage du genre de ceux utilisés dans la synthèse des protéines, par exemple, le 1-éthyl-3-(3-diméthylaminorpopyl)-carbodii mide, le N-hydroxybenzotriazole, etc. On peut encore avoir recours àla glutaraldéhyde, notamment lorsqu'il s'agit de relier entre eux des groupes aminés respectivement portés par le peptide et la molécule support.
On mentionne ci-après à titre d'exemple le couplage du peptide Asp 93-Leu 104 à une molécule support constituée par l'hémocyanine(KLH) de l'anglais "Keyhole limpet hemocyanin" au moyen de glutaraldéhyde selon la méthode décrite par BOQUET, P. et Coll. (1982)
Molec. Immunol., 19,- 1541-1r49. Le couplage est fait à partir de proportions d'environ 2 mg de peptide pour 2,25 mg de l'hémocyanine.
Molec. Immunol., 19,- 1541-1r49. Le couplage est fait à partir de proportions d'environ 2 mg de peptide pour 2,25 mg de l'hémocyanine.
Le conjugué obtenu est immunoprécipitable par des anticorpsmonoclonaux C3.. Cette immunoprécipitation peut être suivie par marquage du conjugué avec 1251 en utilisant de la chloramine T. Etant donné que le peptide ne contient pas de résidus tyrosine, le marquage n'intervient qu'au niveau de la protéine support, de sorte que les propriétés antigéniques du peptide n'ont pas pu être modifiées.
L'immunogénicité de ces peptides peut également être renforcée, en produisant leur oligomérisation, par exemple en présence de glutaraldéhyde ou tout agent permettant la mise en jeu du counlage de fonctions réactives distinctes portées par chacun des peptides monomères; en particulier, l'invention concerne les oligomères immunogènes hydrosolubles ainsi obtenus, comprenant notamment de 2 à 10 motifs monomères.
D'une façon générale, l'invention concerne tous petits "peptides immunogènes" contenant moins de 20 résidus aminoacyle, de préférence moins de 15 résidus aminoacyle. Ces peptides Irmuogènes contiennent de préférence li séquence Asp 93-Leu 104 sus-indiquée ou toute séquence ayant une structure conformationnelle semblable.
L'invention ne se limite naturellement pas aux peptides particuliers qui ont été envisagés.
Comme il est bien connu de l'homme de l'art, certains résidus aminoacyle contenus dans les séquences considérées peuvent éventuellement être remplacés par d'autres résidus aminoacyle, dans la mesure où ceux-ci ne modifient pas sensiblement les configurations de surface des peptides formés,et leur aptitude, notamment après leur couplage avec le smmort macromoléculaire, à réagir avec les anticorps dirigés contre les poliovirus.A cet égard, on mentionnera par exemple les éventuelles substitutions du groupe alanyle par le groupe glycyle ou vice-versa, la substitution possible des résidus iso-asparagiques par des résidus aspartiques, glutamine ou isoglutamine, la substitution des groupes valine par les groupes alanine, leucine ou glycine, la substitution des groupes lysine par des groupes norleucine ou encore arginine, etc., sous réserve que soit chaque fois vérifiée la capacité des peptides modifiés d'induire des anticorps susceptibles de neutraliser le poliovirus entier ou d'être reconnus par les anticorps monoclonaux CD-VPl. il est naturellement entendu que tous ces équivalents possibles entrent dans le champ des revendications ci-après.
PROPRIETES DES PEPTIDES SELON L'INVENTION.
Les peptides selon l'invention, et plus particulièrement les peptides conjugués formés,sont capables d'induire in Vivo la production d'anticorps selon les techni ques classiques. On peut les faire réagir avec les anticorps antipoliovirus. ils induisent la synthèse d'anticorps antipoliovirus, lorsqu'ils sont inoculés à l'animal.
Par ailleurs on peut les utiliser comme réactifs pour le diagnostic et le titrage des anticorps antipoliomyélitiques. Dans leur utilisation comme réactifs pour un diagnostic, on peut avoir recours à des techniques classiques, par exemple à la technique ELISA. On rappelle ci-après le principe d'une telle méthode.Elle comprend, par exemple, les étapes suivantes - dépôt de quantités déterminées du peptide selon l'inven
tion dans les puits d'une microplaque du type de celle
utilisée pour la mise en oeuvre de la méthode ELISA ; - introduction de dilutions croissantes du sérum contentant,
le cas échéant, les anticorps à détecter, voire à doser,
dans les puits de cette microplaque ; - incubation et interruption de la réaction, par exemple par
addition d'une solution d'acide sulfurique ; - lavage poussé de la microplaque avec un tampon approprié ;; - introduction d'anticorps marqués dirigés contre les pre
miers, le marquage étant fait au moyen d'une enzyme capable
d'hydrolyser un substrat choisi parmi ceux pour lesquels
cette hydrolyse se manifeste par une variation d'absorban
ce pour une radiation de longueur d'onde donnée, - mesure de la variation d'absorbance et - détermination, de préférence vis-à-vis de mesures sem
blables faites vis-à-vis d'un témoin, de la teneur en
anticorps du sérum étudié.
tion dans les puits d'une microplaque du type de celle
utilisée pour la mise en oeuvre de la méthode ELISA ; - introduction de dilutions croissantes du sérum contentant,
le cas échéant, les anticorps à détecter, voire à doser,
dans les puits de cette microplaque ; - incubation et interruption de la réaction, par exemple par
addition d'une solution d'acide sulfurique ; - lavage poussé de la microplaque avec un tampon approprié ;; - introduction d'anticorps marqués dirigés contre les pre
miers, le marquage étant fait au moyen d'une enzyme capable
d'hydrolyser un substrat choisi parmi ceux pour lesquels
cette hydrolyse se manifeste par une variation d'absorban
ce pour une radiation de longueur d'onde donnée, - mesure de la variation d'absorbance et - détermination, de préférence vis-à-vis de mesures sem
blables faites vis-à-vis d'un témoin, de la teneur en
anticorps du sérum étudié.
Les séquences d'ADN selon l'invention peuvent elles-mêmes être utilisées comme sondes d'hybridation permettant la détection de la présence d'ARN viral ou du cADN correspondant dans un échantillon biologique. Cette méthode impliquera par conséquence l'extraction préalable de l'ARN ou ADN de l'échantillon biologique et sa mise en contact dans des conditions permettant l'hybridation avec la séquence d'ADN selon l'invention marquée par un traceur radio-actif ou par une enzyme, notamment du genre de celles qui sont aptes à hydrolyser un substrat du t@r- sus-indiqué.
L'invention concerne naturellement toutes les séquences d'ADN équivalentes conduisant à des produits d'expression doués de propriétés immunologiques équivalentes, en ce que les anticorps induits par tes produits d'exp7 e - sion de ces sequences équivalentes sont à même le r-agir avec les produits d'expression des fragments d'ADN p particulièrement décrits et vice versa. En particulier, l'invention s'étend à des séquences d'ADN pouvant différer de celles qui ont te plus particulièrement décrites, part des délétions, additions ou substitutions d'acides nu- cliques, pour autant que les propriétés immunologiques des produits d'expression soient équivalentes.
L'invention concerne encore un procédé d'obtention d'un peptide immunogène tel que ci-dessus défini comprenant les étapes que sont 17 insertion d'une séquence d'ADN conforme à l'invention dans un vecteur approprié, la transformation d'un micro-organisme transformable tar le vecteur ainsi modifié et capable d'exprimer la susdite séquence d'insertion, la récupérai ion des protéines synthé tisées et 1 ' isolement de la fraction peptidique contenant le peptide selon l'invention, celui-ci pouvant être détec- t, le cas échéant après un fractionnement en fonction des poids moléculaires, par des anticorps actifs à la fois contre les particules "C" et "D" d'un même poliovirus et contre le poliopeptide structural VP-1 de la capside le ce poliovirus.
L'invention concerne naturellement égaiement tout vecteur contenant une séquence d'insertion conforme à 1' invention 3sous le contré le d'un promoteur permettant l'expression de cet insérat dans un micro-organisme trans formable par ce Vecteur.
Enfin l'invention concerne les micro-organismes transformés par un tel vecteur, aptes à produire une protéine reconnue par des anticorps actifs à la fois contre les particules .tc et "D" d'un même poliovirus et contre le polypeptide structural VP-1 de la capside de ce poliovirus.
Comme il va de soi et comme Il résulte d'ailleurs déjà de ce qui précède, l'invention ne se limite nullement à ceux de ses modes d'application et de réalisation qui ont été plus spécialement envisagés ; elle en embrasse au contraire toutes les variantes, notamment celles consistant en des séquences peptidiques correspondantes provenant d'autres souches de poliovirus, que ce soit de souches de type 1 ou encore de souches de types 2 ou 3.
A titre d'exemple, on mentionnera les séquences correspondantes(ou équivalentes) de l'ADN codant pour la protéine
VP1 de la souche Sabin. La séquence peptidique de la souche Sabin qui correspond à la séquence His 65 - Ala 106 de VP-1 dans la souche Mahoney, se distingue de celleci par des résidus aminoacyle distincts aux positions visées par les numéros indiqués ci-après - 88 (Ala), 90 (Ile), 95 (Ser), 98 (Lys) et 106 (Thr
au lieu de Ala).
VP1 de la souche Sabin. La séquence peptidique de la souche Sabin qui correspond à la séquence His 65 - Ala 106 de VP-1 dans la souche Mahoney, se distingue de celleci par des résidus aminoacyle distincts aux positions visées par les numéros indiqués ci-après - 88 (Ala), 90 (Ile), 95 (Ser), 98 (Lys) et 106 (Thr
au lieu de Ala).
il va de soi que les peptides qui comportent les différentes substitutions d'amino-acides qui ont été envisagées, constituent des équivalents de ceux plus sépcifiquement définis dans les revendications. Ces peptides sont donc, comme tels, également protégés par les revendications.
Claims (5)
1 - Fragment d'ADN selon la revendication 1 du brevet principal contenant au plus 315 paires de nucléotides, caractérisé en ce que lesdites 315 paires de nucléotides correspondent à celles qui sont contenues dans le fragment délimité par des extrémités XbaI en position 2546-2861 de l'ADN du poliovirus type I et en ce qu'il code pour un peptide susceptible d'être reconnu par des anticorps actifs à la fois contre les particules "C" et "D" d'un même poliovirus et contre le polypeptide strucural VP-1 de la capside de ce poliovirus.
2 - Fragment d'ADN contenant la séquence de la revendication 1, caractérisé par la séquence de structure
TCT AGA GAC GCT ClC CCA AAC ACT GAA
GCC AGT GGA CCA ACA CAC TCC AAG GAA ATT
CCG GCA CTC ACC GCA GTG CAA ACT GGG GCC
ACA AAT CC,, CTA GTC CCT TCT GAT ACA CTC
CAA ACC AGA CAT GTT GTA CAA CAT AGG TCA
AGG TCA GAG TCT AGC ATA GAG TCT TTC TTC
GCG CGG GGT GCA TGC GTC ACC ATT ATG ACC
- GTG GAT AAC CCA GCT TCC ACC ACG AAT AAG
CAT AAG CTA TTT GCA GTG TGG AAG ATC ACT
TAT AAA CAT ACT GTC CAG TTA CGG ACC AAA
TTG GAG TTC TTC ACC TAT TCT 3 - Fragment d'ADN selon la revendication 1 caractérisé en ce qu'il comporte moins de 315 paires de bases et en ce qu'il est contenu dans la séquence définie par la revendication 2.
- - Fragment d'ADN selon la revendication 1 ou la revendication 3 contenant la séquence nucléotidique codant pour la séquence peptidique His 65-Phe 105
His Val Val Gln His
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
Met Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe
100 5 - Fragment selon la revendication 1 ou la revendication 3 codant pour la séquence peptidique
iis Val Val Gln Bis
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
et Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe Ala Val Trn Lys
100
île
110 6 - Fragment selon l'une quelconque des revendications 7 à 3, caractérisé en ce qu'il contient une séquence nucléotidique codant pour le peptide Asp 93-Leu 104 :
Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr Asn Lys Asp Lys Leu.
7 - Procédé permettant l'identification, au sein d'une séquence d'ADN normalement contenue à l'intérieur de l'ADN d'un poliovirus déterminé, de celles des séquences plus petites qui sont susceptibles de coder pour un peptide portant un déterminant ou site antigénique permettant la production d'anticorps actifs contre le poliovirus entier, caractérisé en ce que, partant d'un plasmide contenant un inséra t formé par une séquence initiale reconnue comme devant contenir une séquence plus petite susceptible de coder pour un peptide immunogène ou susceptible d'entrer dans la constitution d'un principe immunogène, on linéarise ledit plasmide au niveau d'un site de restriction extérieur à ladite séquence plus petite, on émonde de façon contrôlée le plasmide iinéaris avec une enzyme exonucléolytique, telle que l'enzyme Bal 31 on rec@rcularise le plasmide au moyen d'une ADN-ligase, on transforme un mieroorga- nisme approprié, lui-même transformable par le vecteur correspondant et capable d'exprimer l'insérat contenu dans celui-ci, et on n détecte parmi les produits d'expres- sion de ce microorganisme l'éventuelle présence d'un peptide susceptible de porter le site immunogène du genre en question, par mise n contact desdits produits d'expression avec un anticorps moncclonal CD-VP1, le cycle d'opé- rations qui vient d'être défini étant répété jusqu'à la disparition de la détection dudit peptide immunogène parmi les produits d'expression dudit microorganisme transformé par le dernier plasmide recircularisé.
8 - Polypeptide contenant une séquence peptidique codée par la séquence d'ADN selon l'une quelconque des revendications 1 à 5 et susceptible d'être reconnue par des anticorps monoclonaux actifs à la fois contre les particules "C" et "D" originaires d'un même poliovirus et contre le polypeptide structural VP-1 de la capside du même poliovirus.
9 - Polypeptide constitué par la séquence de formule
Ser Arg Asu Ala Leu Pro Asn Thr Glu
Ala Ser Glv Pro Thr ils Ser Lys Glu Ile
Pro Ala Leu Thr Ala Val Glu Thr Gly Ala
Thr Asn Pro Leu Val Pro Ser Asn Thr Val
Gln Thr Arg ilis Val Val Gin His Arg Ser
Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser Phe Phe
Ala Arg Gly Ala Cus Val Thr Ile Met Thr
Val Asp Asn Pro Ala Scr Thr Thi' Asn Lys
As Lys Leu Phe Ala Val Trn Lys Ile Thr.
Tyr Lys Asp Thr Val Gln Leu Arg Arq Lys
Leu Glu Phe Phe Thr Tyr Ser 10 - Polypeptide contenant la séquence
His Val Val Gln His
Arg Ser Arg Ser Glu Ser Ser Ile Glu Ser
70
Phe Phe Ala Arg Gly Ala Cys Val Thr Ile
80
Met Thr Val Asp Asn Pro Ala Ser Thr Thr
90
Asn Lys Asp Lys Leu Phe
100
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US06/634,881 US4694072A (en) | 1982-11-30 | 1983-11-30 | Peptides comprising an immunogenic site of poliovirus and DNAS containing nucleotide sequences coding for these peptides |
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Citations (3)
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WO1982004067A1 (fr) * | 1981-05-19 | 1982-11-25 | Girard Marc | Fragments d'adn portant des parties de l'information genetique des poliovirus, notamment du type pv1, et procede pour leur obtention |
EP0086707A1 (fr) * | 1982-02-08 | 1983-08-24 | Institut Pasteur | Fragments d'ADN codant pour un peptide immunogène susceptible d'induire in vivo la synthèse d'anticorps anti-poliovirus |
-
1983
- 1983-06-29 FR FR838310778A patent/FR2548212B1/fr not_active Expired - Lifetime
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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WO1982003632A1 (fr) * | 1981-04-20 | 1982-10-28 | Massachusetts Inst Technology | Adnc representant des sequences virales arn |
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EP0086707A1 (fr) * | 1982-02-08 | 1983-08-24 | Institut Pasteur | Fragments d'ADN codant pour un peptide immunogène susceptible d'induire in vivo la synthèse d'anticorps anti-poliovirus |
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