FI114992B - Förfarande för att indikera målnukleinsyror - Google Patents
Förfarande för att indikera målnukleinsyror Download PDFInfo
- Publication number
- FI114992B FI114992B FI955619A FI955619A FI114992B FI 114992 B FI114992 B FI 114992B FI 955619 A FI955619 A FI 955619A FI 955619 A FI955619 A FI 955619A FI 114992 B FI114992 B FI 114992B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- nucleic acid
- probe
- acid
- melnucleic
- nucleic acids
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6853—Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/682—Signal amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/6823—Release of bound markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Claims (11)
1. Förfarande för att indikera mälnukleinsyror, kännetecknat av att det innefat-tar skeden, i vilka a) av länga nukleinsyrasekvenser produceras, beroende av mälsekvensen, 5 talrika nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, b) för nukleinsyrorna, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, eller för dess delar, utförs en amplifikation, c) mälnukleinsyran indikeras pä basis av en produkt eller en mellanprodukt som bildats i amplifikationen. 10
2. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av att talrika nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, produceras genom att avspjälka nukleinsyror som innehäller tvä delar B1 och B2, ooh nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyran, varvid del B1 kan hybridiseras med mälnukleinsyran eller med en del av den och kan avspjälkas, dä den är i 15 sadan form att den hybridiserats med mälnukleinsyran, och del B2 hybridiseras inte med mälnukleinsyran och kan inte avspjälkas, dä del B1 hybridiserats med mälnukleinsyran. v
: 3. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av att nukleinsyrorna, vilka ‘"'i kan fungera som primers för templatnukleinsyran, amplifieras genom att hybri- : 20 disera en primer med templatnukleinsyran, genom att förlänga nukleinsyror, vilka f kan fungera som primers för templatnukleinsyran genom att använda templat- ·; nukleinsyra som templat, genom att hybridisera förlängningsprodukten med ·:·, nukleinsyra, som innehäller en icke-avspjälkbar del D1, som inte är komplementär över hela sin längd eller delvis komplementär tili förlängningsprodukten, som 25 bildas i förlängningen av nukleinsyran, vilken nukleinsyra kan fungera som primer ; för templatnukleinsyran och som innehäller del D2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, och nukleinsyra som innehäller delarna D1 och D2 avspjälks, som frigör nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyran. 114992
4. Förfarande för att sensibelt indikera nukleinsyra A, kännetecknat av att a) mälnukleinsyran hybridiseras med en sadan sondnukleinsyra B, som innehäller del B1, vilken hybridiseras med mälnukleinsyran, samt del B2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, 5 b) sondnukleinsyra B avspjälks i del B1, c) sondnukleinsyrans avspjälkningsprodukt B', som innehäller del B2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, hybridiseras med en sädan templatnukleinsyra C, som innehäller en del C2, som hybridiseras med avspjälkningsprodukten B' i del B2, samt en del C1, som inte hybridiseras med sondnukleinsyrans del B1, 10 d) avspjälkningsprodukt B' förlängs med en sädan nukleinsyradel B3, som är i sin helhet eller delvis komplementär till del C1, och e) amplifikatorsonden D hybridiseras i del B3 med förlängningsprodukten av avspjälkningsprodukten B', varvid nämnda sond D innehäller en del D1, som är homolog med C1 eller en del av den och kan avspjälkas, 15 f) mälnukleinsyra A indikeras pä basis av en produkt som bildats i ett av skedena b) - e).
5. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att sondnukleinsyra B ....; avspjälks med hjälp av RNas H.
• » : 6. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att amplifikatorsonden D : I 20 innehäller förutom del D1 en del D2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran : och som är homolog med B2 eller en del av den.
7. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att det dessutom innefattar skeden, i vilka f) amplifikatorsonden D avspjälks i del D1, ·’ 25 g) den genom avspjälkning producerade avspjälkningsprodukten D' hybridise- / ras med templatnukleinsyra E, som innehäller en del E2, som hybridiseras med avspjälkningsprodukten i del D2, samt med en sädan del E1, som inte hybridise-| ras med del D1, h) avspjälkningprodukten D' förlängs med en sädan nukleinsyradel D3, som är 30 komplementär till del E1, och 114992 i) amplifikatorsonden F hybridiseras selektivt med avspjälkningproduktens D' förlängningsprodukt i del D3, varvid nämnda sond F innehäller en del F1, som är homolog med C1 eller en del av den eller är homolog med E1 eller dess del, varvid F1 kan avspjälkas. 5
8. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att amplifikatorsonden D i del D1 avspjälks med Rnas H.
9. Förfarande för att producera en nukleinsyrasekvens, kännetecknat av att det innehäller skeden, i vilka a) man förlänger en första nukleinsyrasekvens med förlängningsomrädet, 10 b) en andra nukleinsyrasekvens hybridiseras, som är längre än den första nukleinsyrasekvensen och som innehäller en sekvens, som är homolog med den första nukleinsyrasekvensen, med förlängningsomrädets förlängningsprodukt, c) en andra nukleinsyrasekvens sönderdelas för att avlägsna helt och hället eller delvis den del som skall hybridiseras, 15 d) skedena a) - c) upprepas med sönderdelningsprodukter frän skede c).
10. Reagensförpackning för att sensibelt indikera mälnukleinsyror med förfaran- \ det enligt patentkrav 1, kännetecknad av att förpackningen innefattar ' ‘ a) nukleinsyra B, som innefattar delarna 1 och B2, varvid B1 är en avspjälkt del, : vilken är komplementär till en del av mälnukleinsyran, och B2 är en del, som inte :,· j 20 hybridiseras med mälnukleinsyran, * · k · b) nukleinsyra C, som innefattar delarna C1 och C2, varvid C1 är en ny nukleinsyraspecifik del och C2 är en del, som är komplementär till B2, i’ c) nukleinsyra D med del D1, varvid D1 är homolog med C1 eller dess del och kan avspjälkas.
11. Reagensförpackning enligt patentkrav 10, kännetecknad av att nukleinsyran .: D dessutom innehäller en del D2, som är homolog med B2 eller komplementär tili C2 eller dess del.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE4441626A DE4441626A1 (de) | 1994-11-23 | 1994-11-23 | Verfahren zum besonders sensitiven Nachweis von Nukleinsäuren |
DE4441626 | 1994-11-23 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
FI955619A0 FI955619A0 (sv) | 1995-11-22 |
FI955619A FI955619A (sv) | 1996-05-24 |
FI114992B true FI114992B (sv) | 2005-02-15 |
Family
ID=6533909
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
FI955619A FI114992B (sv) | 1994-11-23 | 1995-11-22 | Förfarande för att indikera målnukleinsyror |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US5783392A (sv) |
EP (1) | EP0718408B1 (sv) |
JP (1) | JP2807202B2 (sv) |
AT (1) | ATE247174T1 (sv) |
CA (1) | CA2163587C (sv) |
DE (2) | DE4441626A1 (sv) |
ES (1) | ES2203628T3 (sv) |
FI (1) | FI114992B (sv) |
Families Citing this family (31)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5846717A (en) * | 1996-01-24 | 1998-12-08 | Third Wave Technologies, Inc. | Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage |
US5994069A (en) * | 1996-01-24 | 1999-11-30 | Third Wave Technologies, Inc. | Detection of nucleic acids by multiple sequential invasive cleavages |
US6872816B1 (en) * | 1996-01-24 | 2005-03-29 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic acid detection kits |
ATE206764T1 (de) * | 1994-07-16 | 2001-10-15 | Roche Diagnostics Gmbh | Verfahren zum sensitiven nachweis von nukleinsäuren |
US6875572B2 (en) | 1996-01-24 | 2005-04-05 | Third Wave Technologies, Inc. | Nucleic acid detection assays |
US7122364B1 (en) | 1998-03-24 | 2006-10-17 | Third Wave Technologies, Inc. | FEN endonucleases |
US5985557A (en) * | 1996-01-24 | 1999-11-16 | Third Wave Technologies, Inc. | Invasive cleavage of nucleic acids |
US6706471B1 (en) | 1996-01-24 | 2004-03-16 | Third Wave Technologies, Inc. | Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage |
US20080160524A1 (en) * | 1996-01-24 | 2008-07-03 | Third Wave Technologies, Inc. | Methods and Compositions for Detecting Target Sequences |
US7195871B2 (en) * | 1996-01-24 | 2007-03-27 | Third Wave Technologies, Inc | Methods and compositions for detecting target sequences |
EP2055781B1 (en) | 1996-11-29 | 2011-10-26 | Third Wave Technologies, Inc. | FEN-1 endonucleases, mixtures and cleavage methods |
US8182991B1 (en) | 1997-11-26 | 2012-05-22 | Third Wave Technologies, Inc. | FEN-1 endonucleases, mixtures and cleavage methods |
JP2005500821A (ja) * | 2000-11-15 | 2005-01-13 | サード・ウェーブ・テクノロジーズ・インク | Fenエンドヌクレアーゼ |
US20020168667A1 (en) * | 2001-03-23 | 2002-11-14 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Antigen detecting agent and antigen detecting kit, antigen detecting apparatus and antigen detecting method using the same |
US20030003476A1 (en) * | 2001-03-23 | 2003-01-02 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Waste water inspecting agent and waste water inspecting apparatus using the same |
US7018795B2 (en) * | 2001-03-23 | 2006-03-28 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Hybridization probe and target nucleic acid detecting kit, target nucleic acid detecting apparatus and target nucleic acid detecting method using the same |
US7077982B2 (en) * | 2001-03-23 | 2006-07-18 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Molecular electric wire, molecular electric wire circuit using the same and process for producing the molecular electric wire circuit |
US20020168756A1 (en) * | 2001-03-23 | 2002-11-14 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Particle size variable reactor |
US20030179381A1 (en) * | 2002-03-18 | 2003-09-25 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Sensor, color sensor and apparatus for inspection using the same |
JP4294946B2 (ja) * | 2002-12-13 | 2009-07-15 | 富士フイルム株式会社 | 標的検出装置及び標的検出方法並びに標的検出用基材 |
US7076127B2 (en) * | 2003-01-14 | 2006-07-11 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Optical switch and safety apparatus using the same |
US7344834B2 (en) * | 2003-12-08 | 2008-03-18 | Cytyc Corporation | Method for DNA amplification using DNA blocking probes |
US20060115838A1 (en) * | 2004-10-19 | 2006-06-01 | Trevigen Inc. | Real-time detection of amplicons using nucleic acid repair enzymes |
KR100652903B1 (ko) * | 2005-12-21 | 2006-12-04 | 한국과학기술연구원 | 초흡수성 고분자를 함유한 제습제의 제조 방법 및 그 제조장치 |
NZ548731A (en) * | 2006-07-24 | 2008-12-24 | Zygem Corp Ltd | Isothermal detection methods and uses thereof |
CN101970677A (zh) * | 2008-01-08 | 2011-02-09 | 赛进有限公司 | 等温检测方法及其应用 |
CA2718011C (en) * | 2008-03-15 | 2015-05-19 | Hologic, Inc. | Compositions and methods for analysis of nucleic acid molecules during amplification reaction using footprint probes |
EP3643790A4 (en) * | 2017-06-23 | 2021-03-24 | Eiken Kagaku Kabushiki Kaisha | METHOD FOR NUCLEIC ACID DETECTION, PRIMER FOR NUCLEIC ACID DETECTION AND KIT FOR NUCLEIC ACID DETECTION |
KR20200054268A (ko) * | 2017-09-14 | 2020-05-19 | 알레레 샌디에고, 인크 | 이중-합텐 프로브를 이용한 재조합효소 폴리머라제 증폭의 검출 |
AR115698A1 (es) | 2018-07-05 | 2021-02-17 | Bayer Ag | Tieniloxazolonas y análogos de las mismas |
KR20210079316A (ko) | 2018-10-18 | 2021-06-29 | 바이엘 악티엔게젤샤프트 | 헤테로아릴아미노퀴놀린 및 유사체 |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683202A (en) * | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US5011769A (en) * | 1985-12-05 | 1991-04-30 | Meiogenics U.S. Limited Partnership | Methods for detecting nucleic acid sequences |
IL86724A (en) * | 1987-06-19 | 1995-01-24 | Siska Diagnostics Inc | Methods and kits for amplification and testing of nucleic acid sequences |
US4994368A (en) * | 1987-07-23 | 1991-02-19 | Syntex (U.S.A.) Inc. | Amplification method for polynucleotide assays |
CA1340807C (en) * | 1988-02-24 | 1999-11-02 | Lawrence T. Malek | Nucleic acid amplification process |
AU623642B2 (en) * | 1988-03-24 | 1992-05-21 | University Of Iowa Research Foundation, The | Catalytic hybridization systems for the detection of nucleic acid sequences based on their activity as cofactors in catalytic reactions in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved |
AU672969B2 (en) * | 1992-03-10 | 1996-10-24 | United States of America, as represented by The Secretary, Department of Health & Human Services, The | Exchangeable template reaction |
DE4431269A1 (de) * | 1994-07-16 | 1996-01-18 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren zum sensitiven Nachweis von Nukleinsäuren |
-
1994
- 1994-11-23 DE DE4441626A patent/DE4441626A1/de not_active Ceased
-
1995
- 1995-11-21 EP EP95118269A patent/EP0718408B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-11-21 ES ES95118269T patent/ES2203628T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1995-11-21 AT AT95118269T patent/ATE247174T1/de active
- 1995-11-21 DE DE59510762T patent/DE59510762D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1995-11-22 FI FI955619A patent/FI114992B/sv not_active IP Right Cessation
- 1995-11-22 US US08/561,632 patent/US5783392A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-11-22 JP JP7328052A patent/JP2807202B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 1995-11-23 CA CA002163587A patent/CA2163587C/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
DE59510762D1 (de) | 2003-09-18 |
ES2203628T3 (es) | 2004-04-16 |
DE4441626A1 (de) | 1996-05-30 |
US5783392A (en) | 1998-07-21 |
FI955619A0 (sv) | 1995-11-22 |
CA2163587C (en) | 2005-07-12 |
EP0718408A2 (de) | 1996-06-26 |
JPH08205894A (ja) | 1996-08-13 |
CA2163587A1 (en) | 1996-05-24 |
JP2807202B2 (ja) | 1998-10-08 |
ATE247174T1 (de) | 2003-08-15 |
FI955619A (sv) | 1996-05-24 |
EP0718408A3 (de) | 1998-04-01 |
EP0718408B1 (de) | 2003-08-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
FI114992B (sv) | Förfarande för att indikera målnukleinsyror | |
FI114716B (sv) | Förfarande för sensibel påvisning av nukleinsyror | |
US6569647B1 (en) | Nucleic acid amplification method: ramification-extension amplification method (RAM) | |
US8632999B1 (en) | Nucleic acid amplification methods | |
US5876924A (en) | Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM) | |
CA2877368C (en) | Kit for isothermal dna amplification starting from an rna template | |
US20030175706A1 (en) | Nucleic acid amplification methods | |
AU2002220132A1 (en) | Nucleic acid amplification methods | |
US5474916A (en) | Promotor controlled specific amplification of nucleic acid sequences | |
CA2319757C (en) | Method for detection of nucleic acid target sequences involving in vitro transcription from an rna promoter | |
EP1606415A1 (en) | Lab-on-chip system for analyzing nucleic acid | |
USRE38442E1 (en) | Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM) | |
US20040137484A1 (en) | Nucleic acid amplification methods | |
US6001610A (en) | Method for the particularly sensitive detection of nucleic acids | |
CA2093647C (en) | Method for the sensitive detection of nucleic acids | |
EP4435117A1 (en) | Novel method for isothermal amplification of padlock probes for nucleic acid detection and phi29 dna polymerase variants | |
CA2381958A1 (en) | Method for amplification of nucleic acids | |
CN113930484A (zh) | 一种快速、特异、灵敏、抗降解的微流控rna芯片及方法 | |
JP2002223761A (ja) | 標的核酸検出法およびそのための試薬 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
HC | Name/ company changed in application |
Owner name: ROCHE DIAGNOSTICS GMBH |
|
FG | Patent granted |
Ref document number: 114992 Country of ref document: FI |
|
MM | Patent lapsed |