FI114992B - Förfarande för att indikera målnukleinsyror - Google Patents

Förfarande för att indikera målnukleinsyror Download PDF

Info

Publication number
FI114992B
FI114992B FI955619A FI955619A FI114992B FI 114992 B FI114992 B FI 114992B FI 955619 A FI955619 A FI 955619A FI 955619 A FI955619 A FI 955619A FI 114992 B FI114992 B FI 114992B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
nucleic acid
probe
acid
melnucleic
nucleic acids
Prior art date
Application number
FI955619A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI955619A (sv
FI955619A0 (sv
Inventor
Rudolf Seibl
Viola Rosemeyer
Original Assignee
Roche Diagnostics Gmbh
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Roche Diagnostics Gmbh filed Critical Roche Diagnostics Gmbh
Publication of FI955619A0 publication Critical patent/FI955619A0/sv
Publication of FI955619A publication Critical patent/FI955619A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI114992B publication Critical patent/FI114992B/sv

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6853Nucleic acid amplification reactions using modified primers or templates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/682Signal amplification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/6823Release of bound markers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions

Claims (11)

1. Förfarande för att indikera mälnukleinsyror, kännetecknat av att det innefat-tar skeden, i vilka a) av länga nukleinsyrasekvenser produceras, beroende av mälsekvensen, 5 talrika nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, b) för nukleinsyrorna, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, eller för dess delar, utförs en amplifikation, c) mälnukleinsyran indikeras pä basis av en produkt eller en mellanprodukt som bildats i amplifikationen. 10
2. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av att talrika nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyra, produceras genom att avspjälka nukleinsyror som innehäller tvä delar B1 och B2, ooh nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyran, varvid del B1 kan hybridiseras med mälnukleinsyran eller med en del av den och kan avspjälkas, dä den är i 15 sadan form att den hybridiserats med mälnukleinsyran, och del B2 hybridiseras inte med mälnukleinsyran och kan inte avspjälkas, dä del B1 hybridiserats med mälnukleinsyran. v
: 3. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat av att nukleinsyrorna, vilka ‘"'i kan fungera som primers för templatnukleinsyran, amplifieras genom att hybri- : 20 disera en primer med templatnukleinsyran, genom att förlänga nukleinsyror, vilka f kan fungera som primers för templatnukleinsyran genom att använda templat- ·; nukleinsyra som templat, genom att hybridisera förlängningsprodukten med ·:·, nukleinsyra, som innehäller en icke-avspjälkbar del D1, som inte är komplementär över hela sin längd eller delvis komplementär tili förlängningsprodukten, som 25 bildas i förlängningen av nukleinsyran, vilken nukleinsyra kan fungera som primer ; för templatnukleinsyran och som innehäller del D2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, och nukleinsyra som innehäller delarna D1 och D2 avspjälks, som frigör nukleinsyror, vilka kan fungera som primers för templatnukleinsyran. 114992
4. Förfarande för att sensibelt indikera nukleinsyra A, kännetecknat av att a) mälnukleinsyran hybridiseras med en sadan sondnukleinsyra B, som innehäller del B1, vilken hybridiseras med mälnukleinsyran, samt del B2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, 5 b) sondnukleinsyra B avspjälks i del B1, c) sondnukleinsyrans avspjälkningsprodukt B', som innehäller del B2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran, hybridiseras med en sädan templatnukleinsyra C, som innehäller en del C2, som hybridiseras med avspjälkningsprodukten B' i del B2, samt en del C1, som inte hybridiseras med sondnukleinsyrans del B1, 10 d) avspjälkningsprodukt B' förlängs med en sädan nukleinsyradel B3, som är i sin helhet eller delvis komplementär till del C1, och e) amplifikatorsonden D hybridiseras i del B3 med förlängningsprodukten av avspjälkningsprodukten B', varvid nämnda sond D innehäller en del D1, som är homolog med C1 eller en del av den och kan avspjälkas, 15 f) mälnukleinsyra A indikeras pä basis av en produkt som bildats i ett av skedena b) - e).
5. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att sondnukleinsyra B ....; avspjälks med hjälp av RNas H.
• » : 6. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att amplifikatorsonden D : I 20 innehäller förutom del D1 en del D2, som inte hybridiseras med mälnukleinsyran : och som är homolog med B2 eller en del av den.
7. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att det dessutom innefattar skeden, i vilka f) amplifikatorsonden D avspjälks i del D1, ·’ 25 g) den genom avspjälkning producerade avspjälkningsprodukten D' hybridise- / ras med templatnukleinsyra E, som innehäller en del E2, som hybridiseras med avspjälkningsprodukten i del D2, samt med en sädan del E1, som inte hybridise-| ras med del D1, h) avspjälkningprodukten D' förlängs med en sädan nukleinsyradel D3, som är 30 komplementär till del E1, och 114992 i) amplifikatorsonden F hybridiseras selektivt med avspjälkningproduktens D' förlängningsprodukt i del D3, varvid nämnda sond F innehäller en del F1, som är homolog med C1 eller en del av den eller är homolog med E1 eller dess del, varvid F1 kan avspjälkas. 5
8. Förfarande enligt patentkrav 4, kännetecknat av att amplifikatorsonden D i del D1 avspjälks med Rnas H.
9. Förfarande för att producera en nukleinsyrasekvens, kännetecknat av att det innehäller skeden, i vilka a) man förlänger en första nukleinsyrasekvens med förlängningsomrädet, 10 b) en andra nukleinsyrasekvens hybridiseras, som är längre än den första nukleinsyrasekvensen och som innehäller en sekvens, som är homolog med den första nukleinsyrasekvensen, med förlängningsomrädets förlängningsprodukt, c) en andra nukleinsyrasekvens sönderdelas för att avlägsna helt och hället eller delvis den del som skall hybridiseras, 15 d) skedena a) - c) upprepas med sönderdelningsprodukter frän skede c).
10. Reagensförpackning för att sensibelt indikera mälnukleinsyror med förfaran- \ det enligt patentkrav 1, kännetecknad av att förpackningen innefattar ' ‘ a) nukleinsyra B, som innefattar delarna 1 och B2, varvid B1 är en avspjälkt del, : vilken är komplementär till en del av mälnukleinsyran, och B2 är en del, som inte :,· j 20 hybridiseras med mälnukleinsyran, * · k · b) nukleinsyra C, som innefattar delarna C1 och C2, varvid C1 är en ny nukleinsyraspecifik del och C2 är en del, som är komplementär till B2, i’ c) nukleinsyra D med del D1, varvid D1 är homolog med C1 eller dess del och kan avspjälkas.
11. Reagensförpackning enligt patentkrav 10, kännetecknad av att nukleinsyran .: D dessutom innehäller en del D2, som är homolog med B2 eller komplementär tili C2 eller dess del.
FI955619A 1994-11-23 1995-11-22 Förfarande för att indikera målnukleinsyror FI114992B (sv)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE4441626A DE4441626A1 (de) 1994-11-23 1994-11-23 Verfahren zum besonders sensitiven Nachweis von Nukleinsäuren
DE4441626 1994-11-23

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI955619A0 FI955619A0 (sv) 1995-11-22
FI955619A FI955619A (sv) 1996-05-24
FI114992B true FI114992B (sv) 2005-02-15

Family

ID=6533909

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI955619A FI114992B (sv) 1994-11-23 1995-11-22 Förfarande för att indikera målnukleinsyror

Country Status (8)

Country Link
US (1) US5783392A (sv)
EP (1) EP0718408B1 (sv)
JP (1) JP2807202B2 (sv)
AT (1) ATE247174T1 (sv)
CA (1) CA2163587C (sv)
DE (2) DE4441626A1 (sv)
ES (1) ES2203628T3 (sv)
FI (1) FI114992B (sv)

Families Citing this family (31)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6872816B1 (en) * 1996-01-24 2005-03-29 Third Wave Technologies, Inc. Nucleic acid detection kits
US5846717A (en) * 1996-01-24 1998-12-08 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage
US5994069A (en) 1996-01-24 1999-11-30 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acids by multiple sequential invasive cleavages
ES2165402T3 (es) * 1994-07-16 2002-03-16 Roche Diagnostics Gmbh Procedimiento para la deteccion sensible de acidos nucleicos.
US6875572B2 (en) 1996-01-24 2005-04-05 Third Wave Technologies, Inc. Nucleic acid detection assays
US20080160524A1 (en) * 1996-01-24 2008-07-03 Third Wave Technologies, Inc. Methods and Compositions for Detecting Target Sequences
US7122364B1 (en) * 1998-03-24 2006-10-17 Third Wave Technologies, Inc. FEN endonucleases
US7195871B2 (en) * 1996-01-24 2007-03-27 Third Wave Technologies, Inc Methods and compositions for detecting target sequences
US5985557A (en) * 1996-01-24 1999-11-16 Third Wave Technologies, Inc. Invasive cleavage of nucleic acids
US6706471B1 (en) * 1996-01-24 2004-03-16 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage
JP4362150B2 (ja) 1996-11-29 2009-11-11 サード ウェーブ テクノロジーズ,インコーポレーテッド Fen−1エンドヌクレアーゼ、混合物、および開裂方法
US8182991B1 (en) 1997-11-26 2012-05-22 Third Wave Technologies, Inc. FEN-1 endonucleases, mixtures and cleavage methods
EP1341929A2 (en) * 2000-11-15 2003-09-10 Third Wave Technologies, Inc. Fen endonucleases
US7018795B2 (en) * 2001-03-23 2006-03-28 Fuji Photo Film Co., Ltd. Hybridization probe and target nucleic acid detecting kit, target nucleic acid detecting apparatus and target nucleic acid detecting method using the same
US20030003476A1 (en) * 2001-03-23 2003-01-02 Fuji Photo Film Co., Ltd. Waste water inspecting agent and waste water inspecting apparatus using the same
US7077982B2 (en) * 2001-03-23 2006-07-18 Fuji Photo Film Co., Ltd. Molecular electric wire, molecular electric wire circuit using the same and process for producing the molecular electric wire circuit
US20020168667A1 (en) * 2001-03-23 2002-11-14 Fuji Photo Film Co., Ltd. Antigen detecting agent and antigen detecting kit, antigen detecting apparatus and antigen detecting method using the same
US20020168756A1 (en) * 2001-03-23 2002-11-14 Fuji Photo Film Co., Ltd. Particle size variable reactor
US20030179381A1 (en) * 2002-03-18 2003-09-25 Fuji Photo Film Co., Ltd. Sensor, color sensor and apparatus for inspection using the same
JP4294946B2 (ja) * 2002-12-13 2009-07-15 富士フイルム株式会社 標的検出装置及び標的検出方法並びに標的検出用基材
US7076127B2 (en) * 2003-01-14 2006-07-11 Fuji Photo Film Co., Ltd. Optical switch and safety apparatus using the same
US7344834B2 (en) * 2003-12-08 2008-03-18 Cytyc Corporation Method for DNA amplification using DNA blocking probes
US20060115838A1 (en) * 2004-10-19 2006-06-01 Trevigen Inc. Real-time detection of amplicons using nucleic acid repair enzymes
KR100652903B1 (ko) * 2005-12-21 2006-12-04 한국과학기술연구원 초흡수성 고분자를 함유한 제습제의 제조 방법 및 그 제조장치
NZ548731A (en) * 2006-07-24 2008-12-24 Zygem Corp Ltd Isothermal detection methods and uses thereof
WO2009133473A2 (en) * 2008-01-08 2009-11-05 Zygem Corporation Limited Isothermal detection methods and uses thereof
MX2010010161A (es) * 2008-03-15 2011-03-21 Hologic Inc Star Composiciones y metodos para el analisis de moleculas de acido nucleico durante reacciones de amplificacion.
EP3643790A4 (en) * 2017-06-23 2021-03-24 Eiken Kagaku Kabushiki Kaisha METHOD FOR NUCLEIC ACID DETECTION, PRIMER FOR NUCLEIC ACID DETECTION AND KIT FOR NUCLEIC ACID DETECTION
RU2020110056A (ru) * 2017-09-14 2021-10-14 Эбботт Диагностикс Скарборо, Инк. Обнаружение рекомбиназной полимеразной амплификации с применением зонда с двойным гаптеном
CR20200640A (es) 2018-07-05 2021-02-15 Bayer Ag Substituted thiophenecarboxamides and analogues as antibacterials agents
TW202028186A (zh) 2018-10-18 2020-08-01 德商拜耳廠股份有限公司 雜芳基胺基喹啉及類似物

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4683202A (en) * 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US5011769A (en) * 1985-12-05 1991-04-30 Meiogenics U.S. Limited Partnership Methods for detecting nucleic acid sequences
IL86724A (en) * 1987-06-19 1995-01-24 Siska Diagnostics Inc Methods and kits for amplification and testing of nucleic acid sequences
US4994368A (en) * 1987-07-23 1991-02-19 Syntex (U.S.A.) Inc. Amplification method for polynucleotide assays
CA1340807C (en) * 1988-02-24 1999-11-02 Lawrence T. Malek Nucleic acid amplification process
EP0365627B1 (en) * 1988-03-24 1993-12-22 University Of Iowa Research Foundation Catalytic hybridization systems for the detection of nucleic acid sequences based on their activity as cofactors in catalytic reactions in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved
EP0631636A1 (en) * 1992-03-10 1995-01-04 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA as represented by the SECRETARY OF THE DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES Exchangeable template reaction
DE4431269A1 (de) * 1994-07-16 1996-01-18 Boehringer Mannheim Gmbh Verfahren zum sensitiven Nachweis von Nukleinsäuren

Also Published As

Publication number Publication date
FI955619A (sv) 1996-05-24
JPH08205894A (ja) 1996-08-13
EP0718408A3 (de) 1998-04-01
EP0718408B1 (de) 2003-08-13
CA2163587A1 (en) 1996-05-24
JP2807202B2 (ja) 1998-10-08
ES2203628T3 (es) 2004-04-16
DE4441626A1 (de) 1996-05-30
DE59510762D1 (de) 2003-09-18
US5783392A (en) 1998-07-21
FI955619A0 (sv) 1995-11-22
EP0718408A2 (de) 1996-06-26
CA2163587C (en) 2005-07-12
ATE247174T1 (de) 2003-08-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI114992B (sv) Förfarande för att indikera målnukleinsyror
FI114716B (sv) Förfarande för sensibel påvisning av nukleinsyror
US6569647B1 (en) Nucleic acid amplification method: ramification-extension amplification method (RAM)
US8632999B1 (en) Nucleic acid amplification methods
US5876924A (en) Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM)
CA2877368C (en) Kit for isothermal dna amplification starting from an rna template
US20030175706A1 (en) Nucleic acid amplification methods
AU2002220132A1 (en) Nucleic acid amplification methods
US5474916A (en) Promotor controlled specific amplification of nucleic acid sequences
CN106574304B (zh) 基于链侵入的dna扩增方法
CA2319757C (en) Method for detection of nucleic acid target sequences involving in vitro transcription from an rna promoter
WO2004079002A1 (en) Lab-on-chip system for analying nucleic acid
USRE38442E1 (en) Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM)
US20040137484A1 (en) Nucleic acid amplification methods
US6001610A (en) Method for the particularly sensitive detection of nucleic acids
CA2093647C (en) Method for the sensitive detection of nucleic acids
CA2381958A1 (en) Method for amplification of nucleic acids
CN113930484A (zh) 一种快速、特异、灵敏、抗降解的微流控rna芯片及方法
JP2002223761A (ja) 標的核酸検出法およびそのための試薬

Legal Events

Date Code Title Description
HC Name/ company changed in application

Owner name: ROCHE DIAGNOSTICS GMBH

FG Patent granted

Ref document number: 114992

Country of ref document: FI

MM Patent lapsed