ES2355490T3 - Composiciones y métodos para la utilización terapéutica de una secuencia asociada con el gen atonal. - Google Patents

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ES2355490T3 ES00941220T ES00941220T ES2355490T3 ES 2355490 T3 ES2355490 T3 ES 2355490T3 ES 00941220 T ES00941220 T ES 00941220T ES 00941220 T ES00941220 T ES 00941220T ES 2355490 T3 ES2355490 T3 ES 2355490T3
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Huda Y. Zoghbi
Hugo Bellen
Nessan Birmingham
Bassem Hassan
Nissim Dept. of Cell and Animal Biology BEN-ARIE
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Abstract

Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para estimular el crecimiento terapéutico de las células mecanorreceptoras del oído interno en un animal, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.

Description

Composiciones y métodos para la utilización terapéutica de una secuencia asociada con el gen atonal.
Campo de la invención
La presente invención se refiere de manera general al campo del diagnóstico genético y de la terapia génica y, más particularmente, a la caracterización y utilización de una secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos asociada a atonal.
Antecedentes de la invención
Un intrincado patrón de interacciones en y entre las células dirige el desarrollo secuencial de las neuronas desde la división de las células progenitoras neuroepiteliales. Múltiples señales extracelular e intracelulares modelan este proceso. Entre las señales intracelulares clave están los factores de transcripción, los cuales inducen la expresión de una cascada de genes. Una subclase de factores de transcripción, perteneciente a la familia de proteínas con un motivo hélice-bucle-hélice básico (bHLH), es expresada muy temprano cuando se toma la decisión de proliferar o de diferenciarse. Esta función es particularmente crucial, ya que mutaciones en estos genes al principio del desarrollo pueden eliminar estructuras neurales completas.
En Drosophila, el gen atonal (ato), que es homólogo a Math1, Math2, Hath1 y Hath2, codifica una proteína bHLH esencial para el desarrollo de los órganos cordotonales (órganos sensoriales encontrados en la pared corporal, en las articulaciones y en las antenas que funcionan en la propriocepción, en el equilibrio y en la audición) (Eberl, 1999; McIver, 1985; van Staaden y Römer, 1998). Los CHOs pueblan el sistema nervioso periférico (SNP) de la pared corporal y las articulaciones (tórax, abdomen, esternón, alas, patas) y de las antenas (Moulins, 1976), proporcionando a la mosca una información sensorial muy similar a la que proporcionan el tacto y los mecanorreceptores en los vertebrados (McIver, 1985; Moulins, 1976). Boyan (Boyan, 1993) propuso que, en el curso de la evolución, diferentes CHOs se especializan para oír en diferentes insectos. Esta hipótesis fue confirmada recientemente por van Staaden y Römer (1998). En Drosophila, los CHOs del órgano de Johnston, situados en el segundo segmento de las antenas, funcionan en la audición de campo cercano (Dreller y Kirschner, 1993; Eberl, 1999) y en la geotaxis negativa.
Durante el desarrollo, ato se expresa en un grupo de células progenitoras a partir de las cuales son seleccionadas las células fundadoras de los CHO (Jarman y col., 1993). Probablemente el mismo funciona regulando la expresión de los genes necesarios para la especificación y el desarrollo del linaje de los CHO, ya que codifica una proteína con un motivo hélice-bucle-hélice básico (bHLH) que forma dímeros con la proteína "Daughterless" y se une a secuencias "E-box", activando de este modo los genes (Jarman y col., 1993). La especificidad de los CHO está codificada por el dominio básico de ato, el cual se requiere para la unión al ADN en las proteínas con bHLH (Chien y col., 1996; Davis y col., 1990; Jarman y Ahmed, 1998; Vaessin y col., 1990). El ato es necesario y suficiente para la generación de CHOs en la mosca: la pérdida de la función ato da lugar a la pérdida de CHOs, mientras que la expresión ectópica de ato produce la formación de CHOs ectópicos (Jarman y col., 1993). Las moscas adultas que carecen de la función atonal no coordinan, no vuelan y tienen una audición deficiente. La sobreexpresión del gen atonal de la mosca puede generar nuevas neuronas cordotonales, indicando que el gen atonal es esencial y suficiente para el desarrollo de esta población neuronal.
En los vertebrados, durante la miogénesis y la neurogénesis, la especificación del destino celular requiere factores de transcripción con un motivo hélice-bucle-hélice básico (bHLH). Math1 (homólogo 1 del atonal de ratón, " mouse atonal homolog-1") es uno de tales factores, y se expresa en el cerebro posterior, en la médula espinal dorsal, en la capa germinal externa del cerebelo, en el intestino, en las articulaciones, en el oído y en las células de Merkel de la piel (que funcionan como mecanorreceptores) (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1996; Ben-Arie y col., 1997). Los ratones heterozigotos para una deleción dirigida de Math1 (Math^{+/-}) son viables y tienen un aspecto normal, pero los ratones carentes (nulos) de Math1 (Math^{-/-}) mueren poco después de nacer y carecen de neuronas granulares cerebelosas.
Math1 es uno de los homólogos de ato más próximo conocidos, con un 82% de similitud de aminoácidos en el dominio bHLH y un 100% de conservación del dominio básico que determina la especificidad de reconocimiento de la diana (Ben-Arie y col., 1996; Chien y col., 1996). Math1 se expresa de manera transitoria en el SNC comenzando el día 9 embrionario (E9) en la porción dorsal del tubo neural. Math1 se expresa también en el labio rómbico del cuarto ventrículo del cerebro, donde nacen los precursores de las células granulares cerebelosas en E13-15 (Alder y col., 1996). Después de la proliferación y la diferenciación, estas células progenitoras migran para formar la capa granular externa (EGL) del primordio cerebeloso (Hatten y Heintz, 1995). Las células de la EGL proliferantes continúan expresando Math1 durante las tres primeras semanas post-natales, hasta poco antes de migrar a su destino adulto final para generar la capa granular interna (IGL) del cerebelo (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1996). Otro grupo de células, una pequeña población de precursores neuronales de la médula espinal dorsal, expresan Math1 durante E10-E14 (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1996). Estas células precursoras expresan también las proteínas con el homeodominio LIM (LH2A y LH2B), marcadores de la clase D1 de las interneuronas comisurales (Lee y col., 1998). Helms y Johnson (1998) informaron que la expresión de lacZ bajo el control de elementos reguladores de Math1 reproducía los patrones de expresión de Math1 en el cerebelo y en la médula espinal en desarrollo, y demostraron que Math1 se expresaba en precursores que dan lugar a una subpoblación de interneuronas comisurales dorsales.
Con el fin de determinar la función in vivo de Math1, los inventores generaron ratones (Math1^{-/-}) que carecían de la proteína MATH1. Esta mutación anulativa produce anormalidades cerebelosas importantes: la falta de proliferación y migración de las células granulares desde el labio rómbico en E14,5, y la ausencia de la EGL completa al nacimiento (Ben-Arie y col., 1997). No está claro si la agénesis de las neuronas granulares cerebelosas es debida un fallo de la especificación de los progenitores o a la incapacidad de las células para proliferar y/o diferenciarse. Los neonatos no pueden respirar y mueren poco después del nacimiento, pero no existen defectos macroscópicos en ninguno de los nervios craneales ni en los núcleos del tronco cerebral que puedan explicar el fallo respiratorio.
El hecho de que Math1 se exprese en el oído interno sugiere que la expresión de Math1 es necesaria para el desarrollo de los órganos auditivos o del equilibrio. El oído interno se forma inicialmente como un engrosamiento del ectodermo, denominado placoda ótica, entre los rombómeros 5 y 6 del cerebro posterior. La placoda ótica da lugar a neuronas del VIIIº nervio craneal y se invagina para dar lugar al otocisto, a partir del cual se desarrollará el oído interno. El oído interno maduro de los mamíferos contiene un órgano auditivo, la cóclea, y cinco órganos vestibulares: el utrículo, el sáculo y tres canales semicirculares. Los epitelios sensoriales de estos órganos constan de células pilosas mecanorreceptoras, células de soporte y terminaciones nerviosas. Las células pilosas sirven como mecanorreceptores para transformar las ondas sonoras y el movimiento de la cabeza en información auditiva y posicional. Las células pilosas y las células de soporte proceden ambas de una célula progenitora común y proliferan y se diferencian dentro del epitelio sensorial, con un número máximo de mitosis entre los días embrionarios 13 y 18 (E13-18) en los ratones. Aunque varios genes han sido implicados en el desarrollo del oído interno, tales como int2 (Mansour y col., 1993), pax2 (Torres y col., 1996) y Hmx3 (Wang y col., 1998), no se ha demostrado que se requiera ninguno de ellos específicamente para la génesis de las células pilosas.
El daño de las células pilosas es una causa común de la sordera y de la disfunción vestibular, que son en sí mismas enfermedades muy extendidas. Más de 28 millones de americanos tienen deterioro auditivo; los trastornos vestibulares afectan a la cuarta parte de la población general y a la mitad de nuestros ancianos, aproximadamente. Las delicadas células pilosas son vulnerables a la enfermedad, al envejecimiento y a los traumas medioambientales (esto es, a los antibióticos, las toxinas, el ruido elevado persistente). En los mamíferos, una vez que estas células han sido destruidas no pueden regenerarse. Por tanto, existe la necesidad de solucionar los problemas de los pacientes con discapacidad y pérdida auditiva degenerativa congénita, crónica o adquirida o con problemas de equilibrio, y de proporcionar composiciones, métodos y reactivos para ser utilizados en el tratamiento de la pérdida auditiva y de la función vestibular.
Como apoyo de las descripciones de la presente invención, otros autores han demostrado que Math1, después de una sobreexpresión, induce la producción significativa de células pilosas extra en el oído interno de ratas después del nacimiento (Zheng y Gao, 2000). Brevemente, aunque la determinación del destino se completa normalmente hacia el nacimiento en el caso de las células pilosas cocleares de los mamíferos, la sobreexpresión de Math1 en cultivos de explantes cocleares de ratas postnatales tiene como resultado células pilosas del oído adicionales que derivan de células epiteliales columnares situadas fuera del epitelio sensorial en la cresta epitelial mayor. Además, la conversión de células de soporte utriculares postnatales en células pilosas es facilitada por la expresión de Math1. La capacidad de Math1 para permitir la producción de células pilosas en el oído es una firme evidencia en apoyo de la invención reivindicada.
Resumen de la invención
La invención proporciona una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para estimular el crecimiento terapéutico de células mecanorreceptoras del oído interno en un animal, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
La invención proporciona una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para generar terapéuticamente células pilosas del oído interno, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
La invención proporciona una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con deterioro auditivo, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
La invención proporciona una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con trastornos del equilibrio, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
La invención proporciona una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con una enfermedad de las articulaciones, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
En realizaciones específicas, la administración de la secuencia de aminoácidos o de la secuencia de ácido nucleico es a través de un vector seleccionado de entre un vector adenovírico, un vector retrovírico, un vector adenoasociado, un plásmido o cualquier otro vector basado en ácidos nucleicos, un liposoma, un ácido nucleico, un péptido, un lípido, un carbohidrato y una combinación de dichos vectores. En una realización específica, dicho vector es un vector no vírico o un vector vírico. En otra realización específica dicho vector es una célula. En una realización preferida dicho vector es un vector adenovírico que contiene una secuencia promotora de IE de citomegalovirus y una secuencia señal de poliadenilación temprana de SV40. En otra realización específica, dicha célula es una célula humana. En una realización específica adicional dicha enfermedad de las articulaciones es osteoartritis. En otra realización específica, la célula contiene una alteración en una secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos asociada con
atonal.
En otra realización, la presente invención proporciona una composición que contiene una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal en combinación con un vector vírico como vehículo para la administración, donde dicho vehículo para la administración tiene como resultado el suministro de una cantidad terapéuticamente eficaz de dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal o de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal a una célula, y donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica un polipéptido que contiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR. En realizaciones específicas, dicho vehículo es el dominio de unión al receptor de una toxina bacteriana o cualquier molécula de fusión, o es un dominio de transducción de una proteína. En una realización específica, dicho dominio de transducción de una proteína procede del péptido TAT del
VIH.
La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de un deterioro auditivo, donde dicho organismo tiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo del deterioro auditivo, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo del deterioro auditivo, donde dicho organismo tiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo del desequilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo del desequilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo del desequilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de la osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de la osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de la osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. La composición puede ser utilizada para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
Otros objetos, características y ventajas adicionales serán obvios y finalmente más fácilmente comprendidos mediante la lectura de la siguiente especificación y mediante referencia a las figuras acompañantes que forman una parte de la misma, o a cualquiera de los ejemplos de las realizaciones actualmente preferidas de la invención que se presentan con fines descriptivos.
Descripción de las figuras
Las Figuras 1A y 1B demuestran la tinción con \beta-Gal (azul) del oído interno de embriones heterozigotos para Math1 según se describió anteriormente en la presente. La Figura 1A muestra la vesícula ótica (OV) en E12,5 y la Figura 1B el oído interno en E14,5 de embriones Math1^{+/\beta-Gal}. Los epitelios sensoriales se teñían positivamente en la cóclea (C), en el sáculo (S), en el utrículo (U) y en las ampollas del canal semicircular (SCA). Un diagrama esquemático del oído interno está representado al lado de la tinción como referencia, indicando el azul la localización de los epitelios sensoriales. Los aumentos originales de las imágenes tomadas bajo el microscopio fueron de x100 para la Figura 1A y de x50 para la Figura 1B.
Las Figuras 2A a 2F son micrografías electrónicas con barrido de los epitelios sensoriales del oído interno en E18,5 de ratones de tipo salvaje y de ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}. Los epitelios de los ratones de tipo salvaje estás mostrados en las Figuras 2A, 2C y 2E y los epitelios de los ratones nulos para el gen en las Figuras 2B, 2D y 2F. El órgano de Corti de la cóclea está mostrado e indicado en las Figuras 2A y 2B. En los ratones de tipo salvaje hay tres filas de células pilosas externas (1, 2, 3), una fila de células pilosas internas (I), todas con haces pilosos (HB). La membrana tectorial (TM), una estructura accesoria de la cóclea, puede observarse en la parte inferior. Por encima del epitelio sensorial están las células escamosas (SQ) con quinocilios rudimentarios (RK). En los ratones nulos para el gen (Figura 2B), hay solamente células escamosas. La crista ampullaris de un canal semicircular vertical está representada en las Figuras 2C y 2D. La crista de los ratones nulos para el gen es similar a la de los ratones de tipo salvaje en cuanto a forma global, incluyendo el septum (eminencia) cruciatum (EC), pero es más pequeña. La mácula del utrículo es el foco de las Figuras 2E y 2F. De nuevo la mácula de los ratones nulos para el gen es más pequeña que la de los ratones de tipo salvaje. Las barras de escala son según sigue: 10 \mum en las Figuras 2A y 2B, 50 \mum en las Figuras 2C y 2D y 100 \mum en las Figuras 2E y 2F.
Las Figuras 3A a 3F son micrografías ópticas de secciones transversales semifinas de los epitelios sensoriales del oído interno de ratones de tipo salvaje (Figuras 3A, 3C y 3E) y de ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Figuras 3B, 3D y 3F); todos los ratones fueron observados en E18,5. Según se observó en la cóclea de los ratones de tipo salvaje, Figura 3A, están presentes tres células pilosas externas (1, 2, 3) y una célula pilosa interna (I). Por el contrario, la cóclea de los ratones nulos para el gen (Figura 3B) tiene solamente células escamosas (SQ) en la misma región. Células pilosas (HC) y células de soporte (SC) están presentes en la crista ampullaris (Figura 3C) y en la mácula utricular (Figura 3E) de los ratones de tipo salvaje, pero en los ratones nulos para el gen están presentes únicamente las células de soporte (Figuras 3D y 3F). La crista fue cortada oblicuamente, lo que explica las múltiples capas de células pilosas de la Figura 3C. La membrana otolítica (OM), una estructura accesoria del utrículo, está presente en los ratones de tipo salvaje (Figura 3E) y en los ratones nulos para el gen (Figura 3F). Las barras de escala son igual a 100 \mum (Figuras 3A y 3B); 50 \mum (Figuras 3C y 3D) y 25 \mum (Figuras 3E y 3F).
Las Figuras 4A y 4B son micrografías electrónicas de transmisión de la mácula utricular de ratones de tipo salvaje y de ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} en el E18,5. La Figura 4A muestra que las células pilosas (HC) y las células de soporte (SC) están presentes en la mácula utricular de los ratones de tipo salvaje. En contraste, en los ratones nulos para el gen están presentes únicamente las células de soporte (Figura 4B). Las células pilosas tienen haces pilosos (HB) y las células de soporte tienen microvilli (MV). Las células pilosas son menos densas a los electrones y tienen más núcleos apicales que las células de soporte, pero solamente estas últimas tienen gránulos secretores (SG). Algunas células pilosas inmaduras (IM) son evidentes en los ratones de tipo salvaje pero no en los ratones nulos para el gen. La barra de escala es igual a 10 \mum en todas las figuras.
La Figuras 5A a 5F muestran el patrón de tinción de la Calretinina en los epitelios sensoriales del oído interno. Secciones del utrículo de individuos de la misma camada de tipo salvaje (Figuras 5A y 5C) y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Figuras 5B y 5D) en el E16,5 fueron contrateñidas con yoduro de propidio (rojo) para microscopía confocal. Se cortaron secciones de la crista ampullaris de ratones de tipo salvaje (Figura 5E) y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Figura 5F) en el E18,5 y fueron contrateñidas con DAPI (azul) para microscopía de inmunofluorescencia. La crista está cortada en un ángulo oblicuo, lo cual explica las múltiples capas de células pilosas (Figura 5E). La inmunotinción de la Calretinina (verde, flechas) es evidente en las células pilosas de los ratones de tipo salvaje (Figuras 5A, 5C y 5E), pero no en los ratones nulos para el gen (Figuras 5B, 5D y 5F). Las áreas dentro de un recuadro de las Figuras 5A y 5B indican las regiones ampliadas en las Figuras 5C y 5D. La barra de escala es igual a 100 \mum (Figuras 5A y 5B), 15 \mum (Figuras 5C y 5D) y un aumento original de x200 (Figuras 5E y 5F).
Las Figuras 6A y 6B muestran el patrón de expresión de Math1 en el cartílago articular de ratón utilizando el heterozigoto Math1^{+/\beta-Gal}. La Figura 6A muestra el patrón de tinción de una extremidad anterior de ratón P14 y demuestra la expresión en todas las articulaciones. La Figura 6B es un aumento (20x) de la articulación del codo del mismo ratón, que demuestra que Math1 se expresa exclusivamente en los condrocitos articulares no osificados.
Las Figuras 7A a 7C muestran la sustitución de la región codificadora de Math1 por el gen lacZ. La Figura 7A, parte superior, tiene un mapa del locus genómico de Math1. La región codificadora está mostrada como un recuadro negro. Los sitios de las sondas utilizadas para detectar los alelos de tipo salvaje y mutantes están mostrados como barras negras. El vector vectorizante está en el medio, con los sitios para recombinación homóloga indicados por Xs más grandes. En el locus diana mostrado en la parte inferior, lacZ es traducido bajo el control de elementos reguladores de Math1. La Figura 7B muestra un análisis de transferencia Southern de células madre embrionarias utilizando la sonda externa 3'. La banda superior representa el alelo wt y la banda inferior el alelo mutante diana (mut) en los clones diana. La Figura 7C muestra un análisis de transferencia Southern de ADN procedente de la progenie de los ratones heterozigotos, demostrando la presencia del alelo diana y la ausencia del alelo de tipo salvaje en ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (asteriscos). Las abreviaturas son según sigue: (A) ApaI; (H) HindIII; (RI) EcoRI; (S) SalI y (X) XbaI.
Las Figuras 8A a 8H muestran la expresión de Math1/lacZ y el fenotipo cerebeloso en ratones Math1^{+/\beta-Gal} y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}. La Figura 8A muestra la expresión de Math1/lacZ en el tubo neural dorsal en E9,5 y (Figura 8B) E10,5. La Figura 8C indica una sección del cerebro posterior en E10,5 que tiene expresión de Math1/lacZ en la porción dorsal (flechas). La Figura 8D muestra que en una sección de la médula espinal de un embrión E12,5, las células dorsales migran ventralmente (flechas). La Figura 8E muestra que la expresión en E14,5 se observa en los progenitores de la EGL en el labio rómbico y en las células migratorias que poblarán la EGL. La Figura 8F demuestra que en los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}, la expresión de Math1/lacZ está limitada a unas cuantas células del labio rómbico, que está reducido significativamente de tamaño. La Figura 8G muestra que en P0 se expresa Math1/lacZ en la EGL. La Figura 8H demuestra que la EGL está ausente en los ratones nulos para el gen. El aumento original de las Figuras 8C a 8H era de 100x.
Las Figuras 9A a 9G muestran la expresión de Math1/lacZ en el oído interno y en el tronco cerebral y el análisis histológico del núcleo pontino ventral. La tinción con X-gal de la cresta utricular de Math1^{+/\beta-Gal} (Figura 9A), de los epitelios sensoriales del oído interno de Math1^{+/\beta-Gal} (Figura 9B) y de Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Figura 9C) en E18,5. La expresión de Math1/lacZ en la capa superior de células pilosas de los epitelios sensoriales (Figuras 9A y 9B) y el aspecto de cáliz característico (punta de flecha). En los ratones nulos para el gen la tinción con X-gal de las células epiteliales no es específica en ausencia de células pilosas (Figura 9C). Se demuestra la tinción con X-gal del cerebro completo de Math1^{+/\beta-Gal} (Figura 9D) y de Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Figura 9E) en E18,5. Hay tinción positiva del núcleo pontino (punta de flecha) y del cerebelo (flecha) en los ratones Math1^{+/\beta-Gal}, la cual está ausente o enormemente reducida en los mutantes nulos para el gen en el cerebelo y en el núcleo pontino (recuadro). Las Figuras 9F y 9G muestran la tinción con hematoxilina y eosina de secciones sagitales del puente de un ratón de tipo salvaje y de un mutante nulo para el gen (Figuras 9F y 9G, respectivamente), mostrando la pérdida del núcleo pontino ventral en los mutantes nulos para el gen. Los aumentos originales fueron según sigue: (A) 400x; (B y C) 1000x; (D y E) 8x; recuadro en D y E 100x; (F y G) 10x.
Las Figuras 10A a 10E demuestran que Math1/lacZ se expresa en los condrocitos de las articulaciones. La tinción con X-gal de embriones enteros en E12,5 (Figura 10A) y en E16,5 (Figura 10B) ilustra que Math1/lacZ se expresa en todas las articulaciones (Figura 10C). La sección horizontal a través de la articulación del codo de ratones Math1^{+/\beta-Gal} en E18,5 muestra que se expresa en condrocitos en reposo (flecha). La Figura 10D muestra una sección horizontal de la articulación húmero-radial en P10 que tiene expresión en los condrocitos articulares (punta de flecha) y en los condrocitos en reposo (flecha). La Figura 10E muestra un gran aumento de una sección de la articulación de la muñeca que indica que Math1/lacZ se expresa en los condrocitos articulares. El aumento original fue según sigue: (C) 10x; (D) 20x y (E) 40x.
Las Figuras 11A a 11L muestran la expresión de Math1/lacZ en células de Merkel. Con el fin de identificar las estructuras teñidas en la piel con pelo y sin pelo, embriones de la misma camada E16,5 fueron teñidos como montajes completos, seccionados y examinados microscópicamente. Se muestran secciones de las vibrisas (Figura 11A), de la almohadilla subplantar a bajo aumento (Figura 11B) y a alto aumento de la región marcada por una flecha en B (Figura 11C) y de piel con pelo (Figura 11D). En todas las secciones, la localización de las células teñidas fue según se esperaba de las células de Merkel. Con el fin de buscar defectos macroscópicos en los ratones nulos para el gen, se tomaron fotografías de primeros planos a través de un estereomicroscopio de ratones de la misma camada Math1^{+/\beta-Gal} (control, paneles E-H) y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (nulos para el gen, paneles I-L). La tinción en los ratones nulos para el gen parecía más potente debido a un efecto de la dosis en las vibrisas (E, I), en las articulaciones de los miembros (F, J) y en las almohadillas subplantares (G, K). En contraste, la intensidad de la tinción de los ratones nulos para el gen (J, L) era notablemente más débil que la de los ratones heterozigotos (F, H) en las cúpulas del tacto asociadas con la piel con pelo. Los aumentos originales fueron según sigue: (A) x200; (B) x50; (C) x400; (D) x500; (E)-(G)-(H)-(I)-(K)-(L) x32; (F)-(J) x16.
Las Figuras 12A a 12E muestran la ausencia de cúpulas del tacto teñidas para lacZ en ratones Tabby. Hembras Tabby/Tabby fueron cruzadas con machos Math1^{+/\beta-Gal} y su progenie fue teñida con X-gal y se determinó su género en el E16,5. Se detectó tinción alrededor de las vibrisas primarias del hocico en los embriones hembra heterozigotos para la mutación Tabby (Figura 12A) y en los embriones macho hemizigotos para la mutación (Figura 12B). Las vibrisas secundarias, que se sabe que varían en número en los mutantes Tabby (flechas negras), fueron también teñidas. La tinción de las cúpulas del tacto fue menos intensa en los embriones hembra Tabby/X (Figura 12D), que en los embriones Math1^{+/\beta-Gal} (wt para Tabby) (Figura 12C), ya que Tabby es una mutación semidominante. Sin embargo, se detectaron placas de cúpulas del tacto teñidas en un embrión hembra que llevaba un alelo de tipo salvaje en el locus de Tabby (Figuras 12A, flecha roja, y 12D). En contraste, un macho hemizigoto carecía completamente de tinción y de cúpulas del tacto, debido a la pérdida de los folículos pilosos que suprime el desarrollo de las células de Merkel (Figuras 12B y 12E).
Las Figuras 13A a 13F demuestran el análisis con marcadores de células de Merkel en ratones de tipo salvaje y en ratones nulos para Math1. Secciones de piel de ratones Math1^{+/+} y de ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} reaccionaron con anticuerpos contra MATH1 (Figuras 13A y 13B), citoqueratina 18 (Figuras 13C y 13D) y cromogranina A (Figuras 13E y 13F). Anticuerpos policlonales hacia MATH1 identificaron múltiples núcleos basales en los pocos folículos pilosos abdominales de los ratones de tipo salvaje (Figura 13A) pero no de los ratones mutantes (Figura 13B). Anticuerpos monoclonales hacia citoqueratina 18 y hacia cromogranina A identificaron células de Merkel en los ratones de tipo salvaje (Figuras 13C y 13E) y en los ratones mutantes (Figuras 13D y 13F). El aumento original fue de 100x.
Las Figuras 14A a 14G muestran que Math1 rescata la falta de neuronas cordotonales en embriones mutantes para ato de Drosophila. La Figura 14A muestra una vista dorsal del tórax de una mosca de tipo salvaje. Observar que existe una disposición regular de las cerdas o macroquetas. La Figura 14B muestra una vista similar de una mosca transgénica en la cual se sobreexpresó Math1 utilizando el sistema UAS/GAL4 (Brand y Perrimon, 1993). Esta expresión ectópica da lugar a numerosas cerdas extra que son órganos sensoriales externos (otro tipo de mecanorreceptores), no CHOs. CHOs ectópicos fueron producidos en muchas otras regiones. La Figura 14C muestra una vista lateral de dos agrupaciones abdominales que contienen 6 CHOs además de los órganos sensoriales externos, revelados por un anticuerpo específico neuronal (Mab 22C10). Los 5 CHOs laterales forman un grupo y el sexto está situado dorsalmente respecto al grupo. La Figura 14D presenta una vista similar de un embrión mutante para ato que muestra la ausencia de los CHOs. La Figura 14E demuestra que la expresión ubicua de Math1 induce nuevas neuronas de CHO en embriones mutantes para ato en la localización correcta. La Figura 14F muestra la hibridación in situ en un cerebro del tercer estadio ("instar") larvario en un montaje completo utilizando como sonda el ADNc de ato. Observar la expresión en los lóbulos ópticos en desarrollo (patrones de expresión "en herradura") y dos grupos punteados de células en el medio de los lóbulos cerebrales (puntas de flecha). La Figura 14G muestra que la expresión de Math1 en Drosophila induce la formación de CHOs en posiciones normales y ectópicas. El (+) indica la presencia de CHOs y (-) indica su ausencia. El número de (+) de la primera columna es utilizado para cuantificar el incremento relativo del número de CHOs observados cuando se expresa Math1.
Descripción detallada de la invención
El término "alteración", según se utiliza en la presente, se define como cualquier tipo de cambio o modificación en un ácido nucleico o en un aminoácido. Dicho cambio o modificación incluye cualquier mutación, deleción, reordenación, adición, en un ácido nucleico. Esto incluye el procesamiento post-transcripcional tal como la adición de un casquete 5', el procesamiento de intrones y la poliadenilación. Las mutaciones pueden ser mutaciones sin sentido, mutaciones con un sentido erróneo, desplazamiento del marco, o pueden dar lugar a un aminoácido truncado o pueden alterar la conformación del aminoácido. La alteración de un ácido nucleico puede estar presente en secuencias reguladoras o puede afectar a factores que actúan en trans. Pueden estar presentes también múltiples alteraciones. Dicho cambio o modificación incluye también cualquier cambio en un aminoácido incluyendo metilación, miristilación, acetilación, glucosilación, o un cambio en las señales asociadas con el procesamiento de dicho aminoácido, incluyendo señales de localización intracelular o intercelular y el corte de aminoácidos extraños. Dicha alteración puede afectar también a la degradación o al plegamiento de dicha proteína.
La secuencia de aminoácidos "asociada con atonal" tiene, o la secuencia de ácido nucleico "asociada con atonal" codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
El término "defecto", según se utiliza en la presente, se define como una alteración, mutación, tara o pérdida de la expresión de una secuencia asociada con atonal. Un técnico experto es consciente de que la pérdida de expresión afecta a los niveles de expresión de una secuencia asociada con atonal que no son significativos o detectables mediante los medios estándar de la técnica. Un técnico experto es también consciente de que la pérdida, o ausencia, de los niveles de expresión en un organismo adulto, tal como un ser humano, tiene lugar de forma natural y da lugar a un deterioro de la audición con el paso del tiempo. Por tanto, el término "defecto", según se utiliza en la presente, incluye la reducción o la pérdida de expresión natural de una secuencia asociada con atonal.
El término "administrar", según se utiliza en la presente, se define como llevar a un destino e incluye la administración con fines terapéuticos.
El término "vehículo para la administración", según se utiliza en la presente, se define como cualquier entidad que está asociada con la transferencia de otra entidad. Dicho vehículo para la administración es seleccionado del grupo que consta de un vector adenovírico, un vector retrovírico, un vector adenoasociado, un plásmido, un liposoma, un ácido nucleico, un péptido, un lípido, un carbohidrato y una combinación de los mismos.
El término "condición detectable", según se utiliza en la presente, se define como cualquier estado de salud o cualquier estatus de un animal, órgano o tejido caracterizado por síntomas específicos del desarrollo o patológicos. Ejemplos incluyen, pero no se limitan a, la pérdida de células pilosas, deficiencias en las neuronas granulares del cerebelo, deterioro de la audición, falta de equilibrio, enfermedad de las articulaciones, osteoartritis y proliferación anormal de células.
El término "heteróloga", según se utiliza en la presente, se define como una secuencia de ácido nucleico que es, o que está relacionada con, una secuencia de ácido nucleico que no existe de forma natural en un locus particular. En una realización alternativa, la secuencia de ácido nucleico heteróloga existe de forma natural en un locus particular, pero contiene una alteración molecular en comparación con el locus existente de forma natural. Por ejemplo, puede utilizarse un locus de tipo salvaje de una secuencia asociada con atonal para sustituir una copia defectuosa de la misma secuencia.
El término "trastorno del equilibrio", según se utiliza en la presente, se define como una condición médica en la que un organismo tiene deteriorado el equilibrio. En una realización específica, el deterioro es debido a un defecto de origen vestibular. En otra realización específica, el trastorno es un trastorno vestibular de percepción del equilibrio incluyendo, pero sin limitarse a, la enfermedad de Meniere, vértigo y laberintitis.
El término "inactivado", según se utiliza en la presente, se define como un estado en el cual se ha reducido o se ha eliminado completamente la expresión de una secuencia de ácido nucleico. Dicha inactivación puede tener lugar mediante la transferencia o la inserción de otra secuencia de ácido nucleico o mediante cualquier medio estándar en la técnica para influir sobre los niveles de expresión de una secuencia de ácido nucleico.
El término "precursoras", según se utiliza en la presente, se define como células progenitoras de las cuales deriva el origen y/o las propiedades de otras células.
El término "secuencia informadora regulable", según se utiliza en la presente, se define como cualquier secuencia que dirige la transcripción de otra secuencia y que ella misma está bajo el control regulador de un factor o estado extrínseco. Ejemplos de factores o estados extrínsecos incluyen, pero no se limitan a, la exposición a productos químicos, ácidos nucleicos, proteínas, péptidos, lípidos, carbohidratos, azúcares, luz, sonido, hormonas, tacto o un medio específico de un tejido. Ejemplos de secuencias informadoras regulables incluyen la secuencia promotora de GAL y la secuencia promotora/transactivadora de tetraciclina.
El término "secuencia reguladora", según se utiliza en la presente, se define como cualquier secuencia que controla directamente o indirectamente la transcripción de otra secuencia. Dicho control puede tener que ver con el inicio o con el cese de la transcripción o bien puede tener que ver con la cantidad o con la distribución tisular de la transcripción.
El término "secuencia informadora", según se utiliza en la presente, se define como cualquier secuencia que muestra expresión por una secuencia reguladora. Dicha secuencia informadora puede ser utilizada como un marcador en forma de ARN o de una proteína. Ejemplos de secuencias informadoras son la \beta-galactosidasa, la proteína fluorescente verde (GFP), la proteína fluorescente azul (BFP), neomicina, kanamicina, luciferasa, \beta-glucuronidasa y cloranfenicol transferasa (CAT). En un aspecto específico de la presente invención, la presencia y la cantidad del producto de la secuencia informadora, ya sea un ácido nucleico o un aminoácido, refleja el nivel de transcripción por la secuencia promotora que regula la misma.
El término "terapéuticamente eficaz", según se utiliza en la presente, se define como la cantidad requerida de un compuesto para mejorar algún síntoma asociado con una enfermedad. Por ejemplo, en el tratamiento del deterioro auditivo, un compuesto que mejore la audición en cualquier grado o que detenga cualquier síntoma del deterioro auditivo sería terapéuticamente eficaz. En el tratamiento de una enfermedad de las articulaciones, un compuesto que mejore la salud o el movimiento de una articulación en cualquier grado o que detenga cualquier síntoma de la enfermedad de las articulaciones, sería terapéuticamente eficaz. No se requiere una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto para curar la enfermedad, pero proporcionará un tratamiento para la enfermedad.
El término "vector", según se utiliza en la presente, se define como un vehículo biológico para la administración de una entidad específica. En una realización específica la entidad es un ácido nucleico asociado con atonal.
La invención se refiere a la utilización de una secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos asociada con atonal para el uso terapéutico de condiciones detectables tales como la pérdida de células pilosas, el deterioro auditivo, un trastorno del equilibrio, una enfermedad de las articulaciones y osteoartritis.
Las secuencias proporcionadas en la presente y los números de Acceso del GenBank correspondientes están listados entre paréntesis según sigue: SEC ID Nº:1 (NM_005172); SEC ID Nº:2 (NP_005163.1); SEC ID Nº:3 (AW413228); SEC ID Nº:4 (NM_009719); SEC ID Nº:5 (NP_033849.1); SEC ID Nº:6 (NM_009718); SEC ID Nº:7 (NP_033848.1); SEC ID Nº:8 (NM_009717); SEC ID Nº:9 (NP_033847.1); SEC ID Nº:10 (NM_007500); SEC ID Nº:11 (NP_031526.1); SEC ID Nº:12 (NM_007501); SEC ID Nº:13 (AW280518); SEC ID Nº:14 (AW236965); SEC ID Nº:15 (AW163683); SEC ID Nº:16 (AF134869); SEC ID Nº:17 (AAD31451.1); SEC ID Nº:18 (AJ012660); SEC ID Nº:19 (CAA10106.1); SEC ID Nº:20 (AJ012659); SEC ID Nº:21 (CAA10105.1); SEC ID Nº:22 (AF071223); SEC ID Nº:23 (AAC68868.1); SEC ID Nº:24 (U76208); SEC ID Nº:25 (AAC53029.1); SEC ID Nº:26 (U76210); SEC ID Nº:27 (AAC53033.1); SEC ID Nº:28 (U76209); SEC ID Nº:29 (AAC53032.1); SEC ID Nº:30 (U76207); SEC ID Nº:31 (AAC53028.1); SEC ID Nº:32 (AF036257); SEC ID Nº:33 (AAC15969.1); SEC ID Nº:34 (AF034778); SEC ID Nº:35 (AJ001178); SEC ID Nº:36 (CAA04572.1); SEC ID Nº:37 (Y07621); SEC ID Nº:38 (CAA68900.1); SEC ID Nº:39 (AF024536); SEC ID Nº:40 (AAB82272.1); SEC ID Nº:41 (D85188); SEC ID Nº:42 (BAA12738.1); SEC ID Nº:43 (D44480); SEC ID Nº:44 (BAA07923.1); SEC ID Nº:45 (D43694); SEC ID Nº:46 (BAA07791.1); SEC ID Nº:47 (D85845); SEC ID Nº:48 (BAA12880.1); SEC ID Nº:49 (U93171); SEC ID Nº:50 (AAB58669.1); SEC ID Nº:51 (U93170); SEC ID Nº:52 (AAB58668.1); SEC ID Nº:53 (U61152); SEC ID Nº:54 (AAB41307.1); SEC ID Nº:55 (U61151); SEC ID Nº:56 (AAB41306.1); SEC ID Nº:57 (U61148); SEC ID Nº:58 (AAB41305.1); SEC ID Nº:59 (U61149); SEC ID Nº:60 (AAB41304.1); SEC ID Nº:61 (U61150); SEC ID Nº:62 (AAB41303.1); SEC ID Nº:63 (L36646); SEC ID Nº:64 (AAA21879.1); SEC ID Nº:69 (AA625732).
La invención se refiere al tratamiento de un animal, incluyendo un ser humano, para estimular el crecimiento de las células mecanorreceptoras del oído interno, para generar células pilosas del oído interno, para tratar el deterioro auditivo o la falta de equilibrio y para tratar una enfermedad de las articulaciones. Se administra una cantidad terapéuticamente eficaz de una secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos asociada con atonal. En realizaciones específicas, dicha administración es mediante un vector seleccionado de un vector vírico (incluyendo bacteriófagos, virus animales y vegetales), un plásmido, un cósmido o cualquier otro vector basado en ácidos nucleicos, un liposoma, un ácido nucleico, un péptido, un lípido, un carbohidrato y una combinación de dichos vectores. En una realización específica, dicho vector vírico es un vector adenovírico, un vector retrovírico o un vector adenoasociado, incluyendo un vector lentivirus, un vector virus Herpes, un vector virus alfa, etc. Por tanto, el vector puede ser vírico o no vírico. En una realización preferida, dicho vector es un vector adenovírico que comprende una secuencia promotora de IE de citomegalovirus y una secuencia señal de poliadenilación temprana de SV40. En otra realización específica, dicha célula es una célula humana. En una realización específica adicional, dicha enfermedad de las articulaciones es osteoartritis. En una realización específica adicional, la célula contiene una alteración en una secuencia de aminoácidos asociada con atonal, donde dicha secuencia de aminoácidos tiene al menos un 80% de identidad con 20 residuos de aminoácidos contiguos aproximadamente de la SEC ID Nº:58.
La invención se refiere al tratamiento de un animal con necesidad de tratamiento de un deterioro auditivo, un trastorno del equilibrio, una enfermedad de las articulaciones, o con necesidad de estimulación del crecimiento de células mecanorreceptoras. Un factor de transcripción con una secuencia de aminoácidos con al menos un 80% de identidad, y más preferiblemente con al menos un 90% de identidad aproximadamente, con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR es suministrado a una célula del animal. En algunas realizaciones, la célula del animal está situada en el oído interno del animal. Preferiblemente, el factor de transcripción compite con atonal para unirse a la proteína "Daughterless" (Jarman y col., 1993) o compite con Math-1 para unirse a la proteína E47 (Akazawa y col. 1995).
En una realización preferida de la presente invención, hay composiciones para tratar a un organismo de varias condiciones médicas, discutidas en la presente, que contienen una secuencia de ácido nucleico o una secuencia de aminoácidos asociada con atonal en combinación con un vehículo para la administración, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. Un técnico experto es consciente de que un organismo adulto, tal como un adulto humano, no expresa de forma natural atonal a niveles significativos o detectables, sino que expresa atonal en una etapa embrionaria del desarrollo (ver los Ejemplos). Por tanto, en una realización preferida, las composiciones para tratar a un organismo según se discute en la presente, incluyen composiciones para tratar a organismos que no contienen una mutación en una secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos de atonal pero en los cuales ya no se expresa atonal de forma natural a niveles significativos o detectables.
En otra realización de la presente invención, hay una composición que contiene una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal en combinación con un vehículo para la administración, donde dicho vehículo suministra una cantidad terapéuticamente eficaz de una secuencia de ácido nucleico o de una secuencia de aminoácidos asociada con atonal a una célula. En realizaciones específicas, dicho vehículo es el dominio de unión al receptor de una toxina bacteriana o cualquier molécula de fusión, o es un dominio de transducción de una proteína. En una realización específica, dicho dominio de transducción de una proteína procede del péptido TAT del VIH.
En otra realización de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de la pérdida de células pilosas, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de la pérdida de células pilosas, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de la pérdida de células pilosas, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
En otra realización de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo del deterioro auditivo, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo del deterioro auditivo, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo del deterioro auditivo, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
En otra realización de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de un trastorno del equilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de un trastorno del equilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de un trastorno del equilibrio, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
En otra realización de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de osteoartritis, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
En otra realización de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización específica, el defecto es una mutación o una alteración de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En otra realización específica, el defecto afecta a una secuencia reguladora de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de ácido nucleico que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización adicional de la presente invención, hay una composición para tratar a un organismo de una enfermedad de las articulaciones, donde dicho organismo contiene un defecto en una secuencia de aminoácidos que está asociada con la regulación de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
Sistemas de expresión basados en ácidos nucleicos 1. Vectores
Una persona con experiencia en la técnica estará bien equipada para construir un vector mediante técnicas recombinantes estándar, que están descritas en Sambrook y col., 1989 y Ausubel y col., 1994, incorporadas ambas a la presente por referencia.
El término "vector de expresión" se refiere a un vector que contiene una secuencia de ácido nucleico que codifica al menos parte de un producto génico capaz de ser transcrito. En algunos casos, las moléculas de ARN son posteriormente traducidas para dar una proteína, un polipéptido o un péptido. En otros casos, estas secuencias no son traducidas, por ejemplo en la producción de moléculas antisentido o ribozimas. Los vectores de expresión pueden contener una variedad de "secuencias control", las cuales se refieren a secuencias de ácido nucleico necesarias para la transcripción y posiblemente la traducción de una secuencia codificadora unida operativamente en un organismo huésped particular. Además de las secuencias control que gobiernan la transcripción y la traducción, los vectores y los vectores de expresión pueden contener secuencias de ácido nucleico que tienen también otras funciones y que están descritas infra.
a. Promotores e Intensificadores
Un "promotor" es una secuencia control que es una región de una secuencia de ácido nucleico en la cual están controlados el inicio y la velocidad de la transcripción. Puede contener elementos genéticos a los cuales pueden unirse proteínas y moléculas reguladoras tales como la ARN polimerasa y otros factores de transcripción. Un promotor puede ser o no utilizado junto con un "intensificador", que se refiere a una secuencia reguladora que actúa en cis implicada en la activación transcripcional de una secuencia de ácido nucleico.
Naturalmente, será importante emplear un promotor y/o un intensificador que dirija eficazmente la expresión del segmento de ADN en el tipo celular, en el orgánulo y en el organismo seleccionado para la expresión. Aquellas personas con experiencia en la técnica de la biología molecular conocen generalmente la utilización de promotores, intensificadores y de combinaciones de tipos celulares para la expresión de proteínas; por ejemplo, ver Sambrook y col. (1989), que se incorpora a la presente por referencia. Los promotores empleados pueden ser constitutivos, específicos de un tejido, inducibles y/o útiles bajo las condiciones apropiadas para dirigir un nivel de expresión elevado del segmento de ADN introducido, tal como es ventajoso en la producción a gran escala de proteínas y/o péptidos recombinantes. El promotor puede ser heterólogo o endógeno.
La identidad de los promotores o elementos específicos de un tejido, así como los ensayos para caracterizar su actividad, son bien conocidos por las personas expertas en la técnica. Ejemplos de tales regiones incluyen el gen LIMK2 humano (Nomoto y col., 1999), el gen del receptor 2 de somatostatina (Kraus y col., 1998), el gen de unión al ácido retinoico del epidídimo murino (Lareyre y col., 1999), CD4 humano (Zhao-Emonet y col., 1998), colágeno alfa 2 (XI) de ratón (Tsumaki y col., 1998), gen del receptor de dopamina D1A (Lee y col., 1997), factor de crecimiento similar a insulina II (Wu y col., 1997), molécula de adhesión celular plaquetaria-endotelial 1 humana (Almendro y col., 1996).
b. Señales de Inicio y Sitios Internos de Unión de Ribosomas
Puede requerirse también una señal de inicio específica para la traducción eficaz de secuencias codificadoras. Estas señales incluyen el codon de inicio ATG o secuencias adyacentes. Puede necesitarse la provisión de señales exógenas para el control de la traducción, incluyendo el codon de inicio ATG. Una persona con experiencia habitual en la técnica será capaz fácilmente de determinar esto y de proporcionar las señales necesarias. Es bien conocido que el codon de inicio debe estar "en marco" con el marco de lectura de la secuencia codificadora deseada para asegurar la traducción del inserto completo. Las señales exógenas para el control de la traducción y los codones de inicio pueden ser naturales o sintéticos. La eficacia de la expresión puede ser incrementada mediante la inclusión de elementos intensificadores de la transcripción apropiados.
En ciertas realizaciones de la invención, se utilizan elementos como los sitios internos de entrada de ribosomas (IRES) para crear mensajes multigénicos o policistrónicos. Los elementos IRES pueden estar ligados a marcos de lectura abiertos heterólogos. Múltiples marcos de lectura abiertos pueden ser transcritos juntos, cada uno de ellos separado por un IRES, creando mensajes policistrónicos. En virtud del elemento IRES, cada marco de lectura abierto es accesible a los ribosomas para una traducción eficaz. Múltiples genes pueden ser expresados eficazmente utilizando un único promotor/intensificador para transcribir un único mensaje (ver las Patentes de EE.UU. 5.925.565 y 5.935.819, incorporadas a la presente por referencia.
c. Sitios de Clonaje Múltiple
Los vectores pueden incluir un sitio de clonaje múltiple (MCS), que es una región de ácido nucleico que contiene múltiples sitios de enzimas de restricción, cualquiera de los cuales puede ser utilizado junto con la tecnología recombinante estándar para digerir el vector. (Ver Carbonelli y col., 1999, Levenson y col., 1998 y Cocea, 1997, incorporadas a la presente por referencia).
d. Sitios de Ayuste
La mayoría de las moléculas de ARN eucariótico transcritas experimentarán el ayuste del ARN para eliminar los intrones de los transcritos primarios. Los vectores que contienen secuencias genómicas eucarióticas pueden requerir sitios donantes y/o aceptores de ayuste para asegurar el procesamiento apropiado del transcrito para la expresión de la proteína. (Ver Chandler y col., 1997, incorporada a la presente por referencia).
e. Señales de Poliadenilación
En la expresión, se incluirá típicamente una señal de poliadenilación con el fin de efectuar una poliadenilación apropiada del transcrito. Realizaciones específicas incluyen la señal de poliadenilación de SV40 y/o la señal de poliadenilación de la hormona de crecimiento bovina, que son útiles y/o se sabe que funcionan bien en varias células diana.
f. Orígenes de Replicación
Con el fin de propagar un vector en una célula huésped, el mismo puede contener uno o más lugares origen de la replicación (a menudo denominados "ori"), que son secuencias de ácido nucleico específicas en las cuales se inicia la replicación.
g. Marcadores Seleccionables y Cribables
En ciertas realizaciones de la invención, las células contienen una construcción de ácido nucleico de la presente invención; una célula puede ser identificada in vitro o in vivo mediante la inclusión en el vector de expresión de un marcador. Tales marcadores conferirán a la célula un cambio identificable, permitiendo una fácil identificación de las células que contengan el vector de expresión. En general, un marcador seleccionable es uno que confiere una propiedad que permite la selección. Un marcador seleccionable positivo es aquel cuya presencia permite su selección, mientras que un marcador seleccionable negativo es aquel cuya presencia impide su selección. Un ejemplo de un marcador seleccionable positivo es un marcador de resistencia a un fármaco.
Normalmente, la inclusión de un marcador para la selección con un fármaco facilita el clonaje y la identificación de los transformantes; por ejemplo, los genes que confieren resistencia a neomicina, puromicina, higromicina, DHFR, GPT, zeocina e histidinol son marcadores seleccionables útiles. Además de los marcadores que confieren un fenotipo que permite la discriminación de los transformantes sobre la base de la implementación de condiciones, se contemplan también otros tipos de marcadores incluyendo los marcadores cribables tales como GFP o GFP intensificada, cuya base es el análisis colorimétrico. Alternativamente, pueden utilizarse enzimas cribables tales como la timidina quinasa (tk) o la cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) del virus del herpes simple. Una persona experta en la técnica sabrá también cómo emplear marcadores inmunológicos, posiblemente en conjunción con el análisis mediante FACS. Ejemplos adicionales de marcadores seleccionables y cribables son bien conocidos por las personas expertas en la técnica.
2. Sistemas de Expresión
Existen numerosos sistemas de expresión que contienen al menos una parte de, o todas, las composiciones discutidas anteriormente. Los sistemas basados en procariotas y/o eucariotas pueden ser empleados para ser utilizados con la presente invención con el fin de producir secuencias de ácidos nucleicos, o sus polipéptidos, proteínas y péptidos cognados. Muchos de tales sistemas están comercialmente y abiertamente disponibles.
El sistema de células de insecto/baculovirus puede producir un nivel elevado de expresión proteica de un segmento de ácido nucleico heterólogo, tal como está descrito en las Patentes de EE.UU. N^{os} 5.871.986, 4.879.236, incorporadas ambas a la presente por referencia, y que puede ser comprado, por ejemplo, bajo el nombre de MAXBAC® 2.0 en INVITROGEN® y de BACPACK^{TM} BACULOVIRUS EXPRESSION SYSTEM en CLONTECH®.
Otros ejemplos de sistemas de expresión son bien conocidos en la técnica.
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Detección de Ácidos Nucleicos
Además de su utilización para dirigir la expresión de proteínas, polipéptidos y/o péptidos asociados con atonal, las secuencias de ácido nucleico descritas en la presente tienen otras muchas utilizaciones. Por ejemplo, son útiles como sondas o cebadores o en cualquiera de los métodos para realizaciones que implican hibridación de ácidos nucleicos, amplificación de secuencias de ácidos nucleicos, detección de ácidos nucleicos y otros ensayos. Un técnico experto es consciente de las patentes siguientes en relación con los detalles de estos métodos:
Patente de EE.UU. Nº 5.840.873;
Patente de EE.UU. Nº 5.843.640; Patente de EE.UU. Nº 5.843.650; Patente de EE.UU. Nº 5.843.651;
Patente de EE.UU. Nº 5.843.633; Patente de EE.UU. Nº 5.846.708; Patente de EE.UU. Nº 5.846.709;
Patente de EE.UU. Nº 5.846.717; Patente de EE.UU. Nº 5.846.726; Patente de EE.UU. Nº 5.846.729;
Patente de EE.UU. Nº 5.846.783; Patente de EE.UU. Nº 5.849.481; Patente de EE.UU. Nº 5.849.483;
Patente de EE.UU. Nº 5.849.486; Patente de EE.UU. Nº 5.849.487; Patente de EE.UU. Nº 5.849.497;
Patente de EE.UU. Nº 5.849.546; Patente de EE.UU. Nº 5.849.547; Patente de EE.UU. Nº 5.851.770;
Patente de EE.UU. Nº 5.851.772; Patente de EE.UU. Nº 5.853.990; Patente de EE.UU. Nº 5.853.993;
Patente de EE.UU. Nº 5.853.992; Patente de EE.UU. Nº 5.856.092; Patente de EE.UU. Nº 5.858.652;
Patente de EE.UU. Nº 5.861.244; Patente de EE.UU. Nº 5.863.732; Patente de EE.UU. Nº 5.863.753;
Patente de EE.UU. Nº 5.866.331; Patente de EE.UU. Nº 5.866.336; Patente de EE.UU. Nº 5.866.337;
Patente de EE.UU. Nº 5.900.481; Patente de EE.UU. Nº 5.905.024; Patente de EE.UU. Nº 5.910.407;
Patente de EE.UU. Nº 5.912.124; Patente de EE.UU. Nº 5.912.145; Patente de EE.UU. Nº 5.912.148;
Patente de EE.UU. Nº 5.916.776; Patente de EE.UU. Nº 5.916.779; Patente de EE.UU. Nº 5.919.626;
Patente de EE.UU. Nº 5.919.630; Patente de EE.UU. Nº 5.922.574; Patente de EE.UU. Nº 5.925.517;
Patente de EE.UU. Nº 5.925.525; Patente de EE.UU. Nº 5.928.862; Patente de EE.UU. Nº 5.928.869;
Patente de EE.UU. Nº 5.928.870; Patente de EE.UU. Nº 5.928.905; Patente de EE.UU. Nº 5.928.906;
Patente de EE.UU. Nº 5.929.227; Patente de EE.UU. Nº 5.932.413; Patente de EE.UU. Nº 5.932.451;
Patente de EE.UU. Nº 5.935.791; Patente de EE.UU. Nº 5.935.825; Patente de EE.UU. Nº 5.939.291;
Patente de EE.UU. Nº 5.942.391; Solicitud Europea Nº 320 308; Solicitud Europea Nº 329 822; Solicitud del R.U. Nº 2 202 328; Solicitud de PCT Nº PCT/US87/00880; Solicitud de PCT Nº PCT/US89/01025; Solicitud de PCT WO 88/10315; Solicitud de PCT WO 89/06700; y Solicitud de PCT WO 90/07641.
Kits
Todos los materiales y/o reactivos esenciales requeridos para detectar en una muestra una secuencia seleccionada de la SEC ID Nº:1 a la SEC ID Nº:66, pueden estar reunidos en un kit. El mismo contendrá generalmente una sonda o cebadores diseñados para hibridar específicamente con ácidos nucleicos individuales de interés en la práctica de la presente invención, tales como las secuencias de ácido nucleico de la SEC ID Nº:1 a la SEC ID Nº:66. Pueden estar también incluidos enzimas adecuados para amplificar ácidos nucleicos, incluyendo varias polimerasas (transcriptasa inversa, Taq, etc.), desoxinucleótidos y tampones con el fin de proporcionar la mezcla de reacción necesaria para la amplificación. Tales kits pueden incluir también enzimas y otros reactivos adecuados para la detección de ácidos nucleicos o productos de amplificación específicos. Tales kits contendrán generalmente, en medios adecuados, recipientes distintos para cada reactivo o enzima individual así como para cada sonda o para cada par de cebadores.
Ácidos Nucleicos Asociados con Atonal A. Ácidos Nucleicos y Utilizaciones de los Mismos
El término "ácido nucleico" se referirá en general a al menos una molécula o una hebra de ADN, ARN o un derivado o imitación de los mismos, que contiene al menos una nucleobase tal como, por ejemplo, una base purínica o pirimidínica existente de forma natural encontrada en el ADN (por ejemplo, adenina "A", guanina "G", timina "T" y citosina "C") o en el ARN (por ejemplo, A, G, uracilo "U" y C). El término "ácido nucleico" incluye los términos "oligonucleótido" y "polinucleótido". El término "oligonucleótido" se refiere a al menos una molécula de entre 3 aproximadamente y 100 nucleobases de longitud aproximadamente. El término "polinucleótido" se refiere a al menos una molécula mayor de 100 nucleobases de longitud aproximadamente. Estas definiciones se refieren en general a al menos una molécula monocatenaria, pero en realizaciones específicas incluirá también al menos una cadena adicional que sea parcialmente, sustancialmente o totalmente complementaria a la al menos una molécula monocatenaria. Por tanto, un ácido nucleico puede incluir al menos una molécula bicatenaria o al menos una molécula tricatenaria que contenga una o más cadena(s) complementaria(s) o "complemento(s)" de una secuencia particular que contenga una cadena de la molécula. Según se utiliza en la presente, un ácido nucleico monocatenario puede ser designado por el prefijo "ss", un ácido nucleico bicatenario por el prefijo "ds" y un ácido nucleico tricatenario por el prefijo "ts". Nosotros describimos al menos un ácido nucleico que es complementario a un ácido nucleico asociado con atonal, por ejemplo al menos un ácido nucleico o un segmento de un ácido nucleico complementario a las secuencias de ácidos nucleicos mostradas en las SEC ID Nº:1 hasta la SEC ID Nº:66, de aquellas que son secuencias de ácidos nucleicos. Ácido(s) nucleico(s) que es(son) "complementario(s)" o "complemento(s)" es(son) aquel(los) que es(son) capaz(ces) de apareamiento de bases de acuerdo con las reglas estándar de complementariedad de Watson-Crick, Hoogsteen, o las reglas de complementariedad de unión inversa de Hoogsteen. Según se utiliza en la presente, el término "complementario(s)" o "complemento(s)" se refiere también a ácido(s) nucleico(s) que es(son) sustancialmente complementario(s), según puede ser determinado por la misma comparación de nucleótidos mostrada anteriormente. El término "sustancialmente complementario" se refiere a un ácido nucleico que contiene al menos una secuencia de nucleobases consecutivas, o de nucleobases semiconsecutivas si uno más restos de nucleobases no están presentes en la molécula, que es capaz de hibridar con al menos una cadena o un dúplice de ácido nucleico incluso si no todas las nucleobases forman pares de bases con su nucleobase correspondiente.
En ciertas realizaciones de la presente, un "gen" se refiere a un ácido nucleico que es transcrito. Según se utiliza en la presente, un "segmento génico" es un segmento de ácido nucleico de un gen. En ciertos aspectos, el gen incluye secuencias reguladoras implicadas en la transcripción o en la producción o composición del mensaje. En realizaciones particulares, el gen comprende secuencias transcritas que codifican una proteína, un polipéptido o un péptido. En otros aspectos particulares, el gen comprende un ácido nucleico asociado con atonal y/o codifica secuencias codificadoras de un polipéptido o un péptido asociado con atonal. Manteniendo la terminología descrita en la presente, un "gen aislado" puede comprender ácido(s) nucleico(s) transcrito(s), secuencias reguladoras, secuencias codificadoras, etcétera, aislados sustancialmente de otras secuencias similares, tales como otros genes, secuencias reguladoras, secuencias codificadoras de polipéptidos o péptidos, etc., existentes de forma natural. A este respecto, el término "gen" es utilizado por simplicidad para hacer referencia a un ácido nucleico que contiene una secuencia de nucleótidos que es transcrita y al complemento de la misma. En aspectos particulares, la secuencia de nucleótidos transcrita comprende al menos una unidad que codifica una proteína, un polipéptido y/o un péptido funcional. Como comprenderán los expertos en la técnica, este término de función "gen" incluye secuencias genómicas, secuencias de ARN o de ADNc o segmentos de ácido nucleico construidos más pequeños, incluyendo segmentos de ácido nucleico de una parte no transcrita de un gen, incluyendo, pero sin limitarse a, las regiones del promotor o del intensificador no transcritas de un gen. Segmentos de ácido nucleico de un gen construidos más pequeños pueden expresar, o pueden ser adaptados para que expresen utilizando la tecnología de manipulación de ácidos nucleicos, proteínas, polipéptidos, dominios, péptidos, proteínas de fusión, mutantes y/o similares.
En ciertas realizaciones, la secuencia de ácido nucleico es un ácido nucleico o un segmento de un ácido nucleico. Según se utiliza en la presente, el término "segmento de ácido nucleico", se refiere a fragmentos más pequeños de un ácido nucleico, tal como por ejemplo no limitante, los que codifican solamente parte de la secuencia del péptido o polipéptido asociada con atonal. Por tanto, un "segmento de ácido nucleico" puede comprender cualquier parte de
la(s) secuencia(s) génica(s) asociada(s) con atonal, desde 2 nucleótidos aproximadamente hasta la longitud completa de la región que codifica el péptido o el polipéptido asociado con atonal. En ciertas realizaciones, el "segmento de ácido nucleico" incluye la secuencia completa del(los) gen(es) asociado(s) con atonal. En realizaciones particulares, el ácido nucleico comprende cualquier parte de la SEC ID Nº:1 a la SEC ID Nº:66, o de 2 nucleótidos aproximadamente hasta la longitud completa de la secuencia descrita en la SEC ID Nº:1 a la SEC ID Nº:66.
En ciertas realizaciones, el segmento de ácido nucleico puede ser una sonda o un cebador. Según se utiliza en la presente, una "sonda" es un ácido nucleico utilizado para la detección de otro ácido nucleico y tiene generalmente al menos 10 nucleótidos de longitud aproximadamente. Según se utiliza en la presente, un "cebador" es un ácido nucleico utilizado para la polimerización de otro ácido nucleico y generalmente tiene al menos 10 nucleótidos de longitud aproximadamente. Un ejemplo no limitante de esto sería la creación de segmentos de ácido nucleico de diferentes longitudes y de diferente composición de secuencias para sondas y cebadores basados en las secuencias descritas en la SEC ID Nº:1 a la SEC ID Nº:66, de aquellas que son secuencias de ácidos nucleicos.
El(los) ácido(s) nucleico(s) de la presente invención, independientemente de la longitud de la propia secuencia, puede(n) ser combinado(s) con otras secuencias de ácido nucleico, incluyendo, pero sin limitarse a, promotores, intensificadores, señales de poliadenilación, sitios para enzimas de restricción, sitios de clonaje múltiple, segmentos codificadores, etcétera, para crear una o más construcciones de ácido nucleico. Según se utiliza en la presente, una "construcción de ácido nucleico", es una molécula recombinante que contiene al menos dos segmentos de diferentes secuencias de ácido nucleico. La longitud total puede variar considerablemente entre las construcciones de ácido nucleico. Así, puede emplearse un segmento de ácido nucleico de casi cualquier longitud, estando limitada preferiblemente la longitud total por la facilidad de preparación o de utilización en el protocolo de ácidos nucleicos recombinantes deseado.
En ciertas realizaciones, la construcción de ácido nucleico es un vector recombinante. Según se utiliza en la presente, un "vector recombinante" es un ácido nucleico que contiene múltiples segmentos de ácidos nucleicos utilizado como vehículo para una secuencia de ácido nucleico de interés. En ciertos aspectos, el vector recombinante es un casete de expresión. Según se utiliza en la presente, un casete de expresión es un segmento de ácido nucleico que contiene un gen de interés que puede ser transferido entre diferentes vectores recombinantes por medios bien conocidos en la técnica.
Nosotros describimos uno o más vectores recombinantes que contienen secuencias de ácido nucleico que codifican una proteína, polipéptido o péptido asociado con atonal que incluye dentro de su secuencia de aminoácidos una secuencia de aminoácidos contigua de acuerdo con, o esencialmente según está mostrado en, la SEC ID Nº:2 a la SEC ID Nº:66, de aquellas secuencias que son secuencias de aminoácidos, correspondientes a la secuencia asociada con atonal de Homo sapiens o Mus musculus. Nosotros describimos un(os) vector(es) recombinante(s) que contiene(n) secuencias de ácido nucleico de otras especies que codifican una proteína, un polipéptido o un péptido asociado con atonal que incluye dentro de su secuencia de aminoácidos una secuencia de aminoácidos contiguos de acuerdo con, o esencialmente según está mostrado en, la SEC ID Nº:2 a la SEC ID Nº:66, de aquellas secuencias que son secuencias de aminoácidos. En aspectos particulares, los vectores recombinantes son vectores de ADN.
Se comprenderá también que las secuencias de aminoácidos o las secuencias de ácido nucleico pueden incluir residuos adicionales, tales como aminoácidos N- o C-terminales adicionales o secuencias 5' o 3' adicionales, o varias combinaciones de los mismos, y seguir siendo esencialmente como se describe en una de las secuencias reveladas en la presente, siempre que la secuencia cumpla los criterios expuestos anteriormente, incluyendo el mantenimiento de la actividad biológica de la proteína, el polipéptido o el péptido cuando concierne a la expresión de una composición proteinácea. La adición de secuencias terminales aplica particularmente a secuencias de ácido nucleico que pueden incluir, por ejemplo, varias secuencias no codificadoras flanqueando las porciones 5' y/o 3' de la región codificadora o que pueden incluir varias secuencias internas, por ejemplo intrones, que se sabe que tienen lugar en los genes.
Los vectores recombinantes y los segmentos de ácido nucleico aislados pueden por tanto incluir de diversas maneras estas propias regiones codificadoras, regiones codificadoras portadoras de alteraciones o modificaciones seleccionadas en la región codificadora básica, y pueden codificar polipéptidos o péptidos más grandes que incluyen no obstante tales regiones codificadoras o pueden codificar proteínas, polipéptidos o péptidos equivalentes biológicamente funcionales que tengan secuencias de aminoácidos variantes.
Nosotros describimos proteínas, polipéptidos o péptidos asociados con atonal equivalentes biológicamente funcionales o proteínas, polipéptidos o péptidos asociados con atonal. Tales secuencias pueden producirse como consecuencia de la redundancia de codones o de la equivalencia funcional que se sabe tiene lugar de forma natural en las secuencias de ácido nucleico o de las proteínas, polipéptidos o péptidos así codificados. Alternativamente, pueden crearse proteínas, polipéptidos o péptidos funcionalmente equivalentes mediante la aplicación de la tecnología del ADN recombinante, en los cuales pueden producirse cambios en la estructura de la proteína, el polipéptido o el péptido, sobre la base de la consideración de las propiedades de los aminoácidos que están siendo intercambiados. Los cambios diseñados por el hombre pueden ser introducidos, por ejemplo, mediante la aplicación de técnicas de mutagénesis dirigida a un sitio según se discute más adelante en la presente, por ejemplo para introducir mejoras o alteraciones de la antigenicidad de la proteína, el polipéptido o el péptido, o para analizar mutantes con el fin de examinar la actividad de la proteína, el polipéptido o el péptido asociado con atonal a nivel molecular.
Pueden prepararse proteínas, polipéptidos o péptidos de fusión, por ejemplo, en los que las regiones codificadoras asociadas con atonal estén alineadas dentro de la misma unidad de expresión con otras proteínas, polipéptidos o péptidos que tengan funciones deseadas. Ejemplos no limitantes de tales funciones deseadas de las secuencias de expresión incluyen los fines de purificación o inmunodetección para las secuencias de expresión añadidas, por ejemplo composiciones proteináceas que pueden ser purificadas mediante cromatografía de afinidad o el marcaje enzimático de las regiones codificadoras, respectivamente, EP 266.032, o a través de productos intermedios H-fosfonatos de desoxinucleósidos según está descrito por Froehler y col., Nucl. Acids Res., 14: 5399-5407, 1986.
Según se utiliza en la presente, un "organismo" puede ser un procariota, un eucariota, un virus, etcétera. Según se utiliza en la presente, el término "secuencia" incluye los términos "ácido nucleico" y "proteinácea" o "composición proteinácea". Según se utiliza en la presente, el término "composición proteinácea" incluye los términos "proteína", "polipéptido" y "péptido". Según se utiliza en la presente, "secuencia artificial" se refiere a una secuencia de un ácido nucleico no derivada de la secuencia que existe de forma natural en un locus genético, así como a las secuencias de proteínas, polipéptidos o péptidos codificadas por tal ácido nucleico. Una "secuencia sintética", se refiere a un ácido nucleico o a una composición proteinácea producidos mediante síntesis química in vitro, más que a la producción enzimática in vitro (esto es, una secuencia "producida enzimáticamente") o mediante producción biológica in vivo (esto es, una secuencia "producida biológicamente").
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Dosificación y Formulación
Las secuencias de ácido nucleico y las secuencias de aminoácidos (ingredientes activos) de esta invención pueden ser formuladas y administradas para tratar una variedad de estados de enfermedad, mediante cualquier medio que produzca el contacto del ingrediente activo con el lugar de acción del agente en el organismo de un animal. Las mismas pueden ser administradas mediante cualquier medio convencional disponible para ser utilizado junto con productos farmacéuticos, ya sea como ingredientes terapéuticos activos individuales o en combinación con ingredientes terapéuticos activos. Pueden ser administradas solas o con un vehículo farmacéuticamente aceptable seleccionado sobre la base de la vía de administración elegida y de la práctica farmacéutica estándar.
La dosificación administrada será una cantidad terapéuticamente eficaz del ingrediente activo y, por supuesto, variará dependiendo de factores conocidos tales como las características farmacodinámicas del ingrediente activo particular y de su modo y vía de administración; la edad, el sexo, la salud y el peso del receptor; la naturaleza y el grado de los síntomas; el tipo de tratamiento simultáneo, la frecuencia del tratamiento y el efecto deseado.
El ingrediente activo puede ser administrado oralmente en formas de dosificación sólidas tales como cápsulas, tabletas o polvos, o en formas de dosificación líquidas tales como elixires, jarabes, emulsiones y suspensiones. El ingrediente activo puede ser también formulado para administración parenteral mediante inyección, infusión rápida, absorción nasofaríngea o dermoabsorción. El agente puede ser administrado intramuscularmente, intravenosamente o como un supositorio. Además, las soluciones parenterales pueden contener conservantes tales como cloruro de benzalconio, metil- o propil-parabeno o clorobutanol. Vehículos farmacéuticos adecuados están descritos en Remington's Pharmaceuticals Sciences, un texto de referencia estándar en este campo.
Adicionalmente, pueden emplearse métodos farmacéuticos estándar para controlar la duración de la acción. Éstos son bien conocidos en la técnica e incluyen preparaciones de liberación controlada y pueden incluir macromoléculas apropiadas, por ejemplo polímeros, poliésteres, poliaminoácidos, polivinilo, pirrolidona, acetato de etilénvinilo, metil celulosa, carboximetil celulosa o sulfato de protamina. La concentración de las macromoléculas así como los métodos de incorporación, pueden ser ajustados para controlar la liberación. Adicionalmente, el agente puede ser incorporado a partículas de materiales poliméricos tales como poliésteres, poliaminoácidos, hidrogeles, poli(ácido láctico) o copolímeros de acetato de etilénvinilo. Además de ser incorporados, estos agentes pueden ser utilizados también para atrapar el compuesto en microcápsulas.
Las formas de dosificación farmacéutica útiles para la administración de los compuestos de esta invención pueden ser ilustradas según sigue.
Cápsulas: Las cápsulas son preparadas rellenando cápsulas estándar de gelatina dura de dos piezas cada una con una cantidad terapéuticamente eficaz de ingrediente activo en polvo, 175 miligramos de lactosa, 24 miligramos de talco y 6 miligramos de estearato de magnesio.
Cápsulas de Gelatina Blanda: Se prepara una mezcla de ingrediente activo en aceite de soja y se inyecta en gelatina por medio de una bomba de desplazamiento positivo, para formar cápsulas de gelatina blanda conteniendo una cantidad terapéuticamente eficaz del ingrediente activo. Las cápsulas son posteriormente lavadas y secadas.
Tabletas: Las tabletas son preparadas mediante procedimientos convencionales de tal manera que la unidad de dosificación sea una cantidad terapéuticamente eficaz del ingrediente activo, 0,2 miligramos de dióxido de silicio coloidal, 5 miligramos de estearato de magnesio, 275 miligramos de celulosa microcristalina, 11 miligramos de almidón de maíz y 98,8 miligramos de lactosa. Pueden aplicarse recubrimientos apropiados con el fin de incrementar la palatabilidad o de retrasar la absorción.
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Inyectable: Se prepara una composición parenteral adecuada para ser administrada mediante inyección, agitando un 1,5% en peso de los ingredientes activos en un 10% en volumen de propilén glicol y agua. La solución se hace isotónica con cloruro de sodio y se esteriliza.
Suspensión: Se prepara una suspensión acuosa para administración oral de tal manera que cada 5 mililitros contengan una cantidad terapéuticamente eficaz del ingrediente activo finamente dividido, 200 miligramos de carboximetil celulosa de sodio, 5 miligramos de benzoato de sodio, 1,0 gramo de solución de sorbitol U.S.P. y 0,025 miligramos de vainillina.
Por consiguiente, la composición farmacéutica de la presente invención puede ser administrada a través de varias vías y a lugares diferentes de un organismo animal para conseguir un efecto particular (ver, por ejemplo, Rosenfeld y col. (1991), supra; Rosenfeld y col. Clin. Res., 39(2), 311A (1991a); Jaffe y col., supra; Berkiner, supra). Una persona experta en la técnica reconocerá que aunque puede utilizarse más de una vía para la administración, una vía particular puede proporcionar una reacción más inmediata y más eficaz que otra vía. La administración local o sistémica puede ser llevada a cabo mediante administración que comprende la aplicación o la instilación de la formulación en las cavidades corporales, la inhalación o insuflación de un aerosol, o mediante introducción parenteral que comprende la administración intramuscular, intravenosa, peritoneal, subcutánea, intradérmica, así como
tópica.
La composición de la presente invención puede ser proporcionada en forma de dosificación unidad, donde cada unidad de dosificación, por ejemplo una cucharada, una tableta, una solución o un supositorio, contiene una cantidad predeterminada de la composición, sola o en combinación adecuada con otros agentes activos. El término "forma de dosificación unidad", según se utiliza en la presente, se refiere a unidades físicamente discretas adecuadas como dosis unitarias para sujetos humanos y animales, conteniendo cada unidad una cantidad predeterminada de las composiciones de la presente invención, solas o en combinación con otros agentes activos, calculada en una cantidad suficiente para producir el efecto deseado, en asociación con un diluyente, transportador o vehículo farmacéuticamente aceptable, cuando sea apropiado. Las especificaciones para las formas de dosificación unidad de la presente invención dependen del efecto particular que vaya a ser conseguido y de la farmacodinámica particular asociada con la composición farmacéutica en el huésped particular.
Estos métodos descritos en la presente no incluyen de ninguna manera todos ellos, y métodos adicionales adecuados para una aplicación específica serán obvios para el técnico con experiencia habitual. Además, la cantidad eficaz de las composiciones puede ser calculada adicionalmente por su analogía con compuestos que se sabe que ejercen el efecto deseado.
Los ejemplos siguientes se ofrecen a manera de ejemplo, y no tienen la intención de limitar de ninguna manera el ámbito de la invención.
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Ejemplo 1
Homólogo 1 del Atonal de Ratón (Math1)
Se ha encontrado que los presentes métodos para el tratamiento del deterioro auditivo no han solucionado el problema directamente, esto es, la regeneración de las poblaciones de células pilosas auditivas. La presente invención, en una realización preferida, está dirigida a un miembro de la familia bHLH, el gen Math1 u otra secuencia de ácido nucleico asociada con atonal, y su requerimiento para la generación de neuronas granulares cerebelosas y de células pilosas del oído interno. Este descubrimiento tiene amplias ramificaciones no sólo para comprender el neurodesarrollo, sino también para terapias utilizables en una variedad de enfermedades muy extendidas según se describe a continuación.
El homólogo 1 de atonal de ratón (Math1) se expresa en los precursores de las neuronas granulares cerebelosas; en unas cuantas células de la porción dorsal de la médula espinal en desarrollo; en el oído interno; en las células de Merkel (receptores del tacto de la piel) y en las articulaciones. La sobreexpresión de Math1 en una célula por lo demás diferenciada, puede inducir la formación de, o la diferenciación en, una célula similar a las células pilosas del oído interno progenitora o madura.
La expresión de Math1 en los precursores de las neuronas granulares cerebelosas sugiere que el mismo es requerido para la función del cerebelo y del cerebro. El cerebelo es esencial para la coordinación motora fina y la postura, y su disfunción altera el equilibrio, el lenguaje y el movimiento de los miembros. El desarrollo del cerebelo comienza típicamente en el día embrionario 9,5 (E9,5) aproximadamente, cuando un pequeño grupo de células del cerebro posterior prolifera y migra en dirección rostral para formar la capa granular externa, el tronco cerebral y las neuronas pontinas. Esta población de progenitores neuronales, que continúa expresando Math1, prolifera adicionalmente y migra internamente para formar las neuronas granulares cerebelosas que son la población neuronal predominante del cerebelo y del cerebro. Los ratones que no expresan Math1 carecen completamente de neuronas granulares cerebelosas y de sus precursores. Math1 es por tanto esencial para la generación de estas neuronas y proporciona a la muy escasa población de neuronas en E9,5 la capacidad de proliferar hasta billones y diferenciarse posteriormente (Ben-Arie y col., 1997). Estas funciones tienen ambas una gran importancia médica. El conocimiento de la proliferación normal proporciona la percepción necesaria para conocer la proliferación anormal, según se observa en el cáncer. Los tumores cerebelosos de tipo neuroectodérmico primitivos (por ejemplo, meduloblastoma) constituyen la enfermedad maligna sólida más común en niños. Las células que expresan Math1 contribuyen significativamente a estos tumores.
Math1 se expresa en el cartílago articular no osificado (ver la Figura 6) que degenera típicamente en osteoartritis. Esta es la forma más extendida de la artritis, con un 90% de personas por encima de los 40 años mostrando algún grado de osteoartritis en una o más articulaciones. Dadas las propiedades de Math1 en la generación y proliferación celular, su expresión artificial en las articulaciones afectadas puede permitir la regeneración de las células que constituyen el cartílago no osificado.
En la presente se describen composiciones y métodos para la utilización del gen Math1, de su homólogo humano (Hath1) o de cualquiera de sus homólogos, ortólogos, proteínas de fusión quiméricas o derivados de cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal adecuada o de cualquier otra secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. Con el fin de conocer las funciones de Math1 en mamíferos, el gen Math1 fue eliminado de un ratón utilizando una estrategia que permitía la detección de las células que expresaban Math1. Se describe la creación y la caracterización de ratones que pueden ser utilizados para someter a selección compuestos que podrían ser utilizados para disminuir o aumentar la expresión de Math1 en las células pilosas del oído interno y en otras células en las que está asociada la expresión de Math1.
Se describen también métodos para el estudio, la caracterización y el tratamiento de la proliferación neoplásica de origen neuroectodérmico, ya que la expresión de Math1 es esencial para la generación y la proliferación de las neuronas granulares cerebelosas. Además, se ha descubierto también que Math1 desempeña una función en el desarrollo de las células que producen el cartílago articular no osificado, que están asociadas con el desarrollo de la osteoartritis. Estos descubrimientos han dado lugar a un método para la selección de compuestos que pueden ser de ayuda para el tratamiento de la pérdida de células pilosas del oído interno y de otras enfermedades que tienen lugar debido a la pérdida funcional de Math1, tales como la osteoartritis.
Más particularmente, la presente invención proporciona un animal heterozigoto para la inactivación del gen Math1 o de otra secuencia de ácido nucleico asociada con atonal, en el cual al menos un alelo de Math1 o de otra secuencia de ácido nucleico asociada con atonal ha sido sustituido por la inserción de una secuencia de ácido nucleico heteróloga, donde la inactivación de Math1 o de la secuencia asociada con atonal impide la expresión del alelo de Math1 o del alelo asociado con atonal. El ratón puede ser utilizado posteriormente para generar ratones homozigotos para la inactivación de Math1 o de otro gen con una secuencia asociada con atonal y puede incluir además una segunda secuencia de ácido nucleico heteróloga, donde al menos uno de los genes heterólogos es utilizado para detectar la expresión dirigida por los elementos reguladores de Math1 o de la secuencia asociada con atonal. La inactivación completa o parcial de Math1 funcional o de la secuencia asociada con atonal puede ser detectada en, por ejemplo, células propriorreceptoras, en neuronas granulares y en sus células progenitoras o en células de cartílago no osificado.
Ejemplos de las secuencias de ácido nucleico heterólogas son secuencias informadoras tales como \beta-galactosidasa, proteína fluorescente verde (GFP), proteína fluorescente azul (BFP), neomicina, kanamicina, luciferasa, \beta-glucuronidasa y cloranfenicol transferasa (CAT). Math1 o la secuencia asociada con atonal pueden ser también sustituidos bajo el control de secuencias promotoras regulables o pueden ser secuencias promotoras específicas de tejido. Dichas secuencias promotoras pueden ser parciales o pueden contener el promotor completo.
La presente invención puede ser utilizada también como, o como parte de, un método para seleccionar un compuesto, en el que la administración del compuesto afecta a una condición del desarrollo y/o patológica, donde dicha condición es el resultado de la reducción de la expresión de Math1 o de la secuencia asociada con atonal, incluyendo el método la administración del compuesto a un ratón transgénico que es homozigoto para la inactivación de Math1 o de la secuencia asociada con atonal, donde al menos un alelo de Math1 o asociado con atonal es inactivado por la inserción de una secuencia de ácido nucleico heteróloga, donde la inactivación de Math1 o de la secuencia asociada con atonal impide la expresión del gen Math1 o del gen asociado con atonal, y la monitorización del ratón para detectar un cambio de la condición del desarrollo y/o patológica. Los tipos de condiciones patológicas que pueden ser examinados incluyen, pero no se limitan a, pérdida de células pilosas, pérdida de neuronas granulares cerebelosas o de sus precursores, falta de proliferación o de migración de las células granulares, falta de células de la capa granular externa cerebelosa, deterioro auditivo, trastorno del equilibrio, enfermedad de las articulaciones, osteoartritis, proliferación anormal de las células neuroectodérmicas neoplásicas y formación de meduloblastoma. Según se utiliza en la presente, la selección proporciona un compuesto que, mediante el incremento regulado de la expresión de una secuencia de ácido nucleico heteróloga, es un efector positivo y un compuesto que, mediante la disminución regulada de la expresión de una secuencia de ácido nucleico heteróloga, es un efector negativo.
Otra realización más de la presente invención es un método para estimular el crecimiento de las células mecanorreceptoras, que incluye la puesta en contacto de una célula con una proteína o un gen Math1 o con una proteína o un gen asociados con atonal en una cantidad eficaz para hacer que dicha célula exprese un marcador de las células pilosas del oído interno. Un ejemplo de marcador de las células pilosas para ser utilizado con el método es calretinina. La célula puede ser puesta en contacto con un vector que exprese Math1 o una secuencia de ácido nucleico o una secuencia de aminoácidos asociada con atonal. Vectores recombinantes que expresen Math1 o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal pueden incluir un vector adenovírico, un vector retrovírico, un vector adenoasociado, un plásmido, un liposoma, una proteína, un lípido, un carbohidrato y una combinación de dichos vectores. Math1 o la secuencia asociada con atonal puede estar bajo el control de, por ejemplo, una secuencia promotora de IE de citomegalovirus o de la secuencia promotora de IE de citomegalovirus y de una secuencia señal de poliadenilación temprana de SV40, o de cualquier otra combinación de secuencias promotoras, de secuencias intensificadoras y de poliadenilación apropiadas.
Además, se describe un método para el tratamiento del deterioro auditivo o de un trastorno del equilibrio que incluye la administración a un animal, incluyendo humanos, que tenga pérdida de audición o un trastorno del equilibrio, de una cantidad terapéuticamente eficaz de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico de Math1 o asociada con atonal. El deterioro auditivo o del equilibrio puede ser completo o parcial y puede afectar a un oído o a ambos oídos. En una realización preferida, existe una pérdida sustancial de audición. Los trastornos auditivos y del equilibrio pueden ser afectados separadamente o simultáneamente en el animal que va a ser tratado, y dicho trastorno auditivo y/o del equilibrio puede ser el resultado de un trauma, de una enfermedad, una condición relacionada con la edad o puede ser debido a la pérdida de células pilosas por cualquier razón.
La presente invención está dirigida también a una composición que incluye una proteína o un gen Math1 asociados con atonal en combinación con un vehículo para la administración, donde el vehículo para la administración hace que una cantidad terapéuticamente eficaz de Math1 o de la secuencia asociada con atonal sea administrada a una célula. El vehículo para la administración puede ser definido adicionalmente como un vector que contiene Math1 o una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal en una célula animal. El vector puede ser un vector retrovírico o un vector adenovírico o cualquier otro vector basado en ácidos nucleicos que puede ser incluso dispersado en una formulación farmacológicamente aceptable y utilizado para la administración intralesional. La composición puede ser incluso una proteína parcialmente o totalmente purificada que es suministrada utilizando un liposoma, una proteína, un lípido o un carbohidrato que estimule la entrada de la proteína de Math1 o asociada con atonal en la célula. Ejemplos de proteínas que pueden ser utilizadas como vehículos para la administración incluyen los dominios de unión al receptor (las regiones no catalíticas) de toxinas bacterianas tales como, por ejemplo, la Exotoxina A, la toxina del cólera y la toxina del Ricino, o dominios de transducción de proteínas tales como el de la proteína TAT del VIH (Schwarze y col., 1999) (ver el Ejemplo 22). La composición para administrar Math1 puede ser una proteína de fusión.
Un técnico experto es consciente de que los métodos para tratar animales como los descritos en la invención pueden ser in utero o después del nacimiento. El tratamiento puede ser administrado a un embrión y puede tener lugar ex vivo o in vivo.
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Ejemplo 2
Modelo Animal de Organogénesis
Un modelo animal eficaz de deficiencia en un gen que controle la organogénesis tendrá muy a menudo ambos alelos inactivados de manera estable, de tal manera que, mediante la embriogénesis, uno o más tejidos no puedan revertir a un alelo de tipo salvaje funcional. Un método para generar animales con un genotipo alterado es la vectorización de genes (Mansour y col., 1993), en los cuales la recombinación homóloga de la secuencia de ADN recién introducida (esto es, la secuencia o construcción vectorizante) y una secuencia de ADN diana específica que reside en el cromosoma, tiene como resultado la inserción de una porción de la secuencia de ADN recién introducida en la secuencia de ADN cromosómica diana. Este método es capaz de generar animales de cualquier genotipo deseado, y es especialmente útil para la alteración de genes (esto es, para "knock out") en una secuencia génica cromosómica específica mediante la inserción de un marcador seleccionable en el gen o la sustitución completa del gen por otra secuencia de
nucleótidos.
Para suprimir ("knock out") una secuencia genómica, debe estar disponible un fragmento clonado y definidos los límites intrón-exón dentro del fragmento (Mansour y col., 1993). Típicamente, la construcción vectorizante contiene un marcador seleccionable tal como Neo (resistencia a neomicina, ver Mansour y col., 1993) flanqueado por secuencias homólogas al ADN cromosómico diana, y después de una de estas secuencias flanqueantes el gen de la timidina quinasa del virus del herpes simple (TK-VHS, ver en general, McKnight y col., 1980). La construcción vectorizante es introducida mediante, por ejemplo, electroporación, en células madre embrionarias (ES) en las cuales la recombinación homóloga tiene como resultado la inserción del marcador de resistencia a neomicina (Neo), pero no del gen TK-VHS, en la secuencia de ADN cromosómico diana. Las células ES alteradas son resistentes a neomicina y TK-VHS^{-} y por tanto son capaces de crecer en presencia de los antibióticos G418 y ganciclovir. Las inserciones aleatorias contienen el gen TK-VHS y son por tanto sensibles a ganciclovir (Mansour y col.). Los clones de ES positivos son posteriormente microinyectados en blastocistos para generar ratones quiméricos para la línea germinal, que posteriormente son criados para obtener una progenie que es homozigota para el gen suprimido ("knock out"). Tales métodos generales para producir animales "knock out" han sido demostrados utilizando ratones. Genes de otros animales tales como ratas, cobayos, jerbos, hámsteres y conejos, pueden ser también utilizados siempre que estén disponibles datos suficientes de las secuencias de ADN para producir una construcción vectorizante apropiada para suprimir ("knock out") el gen de interés.
Aunque ato y Math1 comparten un alto grado de conservación de secuencias, existía una discrepancia aparente entre sus patrones de expresión y las consecuencias de la pérdida de su función. Mientras que ato se expresa principalmente en el SNP de la mosca y su ausencia produce la pérdida de casi todos los CHOs (Jarman y col., 1993), Math1 se expresa en el SNC y su pérdida da lugar a la ausencia de neuronas granulares cerebelosas, la mayor población neuronal del SNC (Ben-Arie y col., 1997). Con el fin de comprender mejor las relaciones funcionales entre ato y Math1, la presente invención describe la generación de un segundo alelo nulo para Math1 en ratones (Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}) mediante la sustitución de la región codificadora de Math1 por el gen de la \beta-galactosidasa (lacZ) y la realización de la búsqueda posterior de la expresión de ato en el SNC de la mosca de la fruta. Los ejemplos describen una relación funcional entre ato y Math1: ato se expresa en el cerebro de la mosca y la expresión de lacZ bajo el control de los elementos reguladores de Math1 (Math1/lacZ) no sólo replicaba el patrón de expresión conocido en el SNC (esto es, en el tubo neural, la médula espinal y el cerebelo), sino que aparecía en muchas otras células del SNP murino. La sobreexpresión de Math1 en Drosophila producía la formación de CHOs ectópicos, proporcionando pruebas adicionales de que ato y Math1 estaban conservados funcionalmente.
Las conexiones y la consistencia de la relación entre atonal de Drosophila y Math1 de ratón, sugiere que su utilización como sistemas modelo en la técnica está justificada. Se ha clonado y analizado una familia de homólogos en el ratón incluyendo MATH1, 2, 3, 4A, 4B, 4C y 5 (Azakawa y col., 1995; Bartholomä y Nave, 1994; Ben-Arie y col., 1997; Ben-Arie y col., 1996; Fode y col., 1998; Ma y col., 1998; McCormick y col., 1996; Shimizu y col., 1995; Takebayashi y col., 1997). Un homólogo de atonal de Xenopus, Xath1, ha sido expresado ectópicamente en Drosophila y se ha demostrado que se comporta de manera similar a ato (Kim y col., 1997). Además, la capacidad de Math1 para inducir la formación de CHOs ectópicos y para restaurar CHOs en los embriones mutantes para ato (ver el Ejemplo 13), es una prueba potente de que Math1, y particularmente su dominio básico, codifica una información de la identidad del linaje que no es probable que esté codificada por ato, y que las células de mamífero que expresan Math1 son funcionalmente similares y quizá estén relacionadas desde el punto de vista evolutivo con las células de Drosophila que requieren ato. Por tanto, las similitudes entre atonal de Drosophila, Xath1 de Xenopus y Math1 de ratón, indican que estos animales son sistemas de modelos animales comparables. Además, la extendida utilización de los ratones en particular como sistema modelo para humanos, sugiere también que, de manera similar, permitiría la utilización de la invención en humanos.
Con los avances de la genética molecular actualmente estándar en la técnica, las secuencias de humanos y de otras especies pueden ser utilizadas indistintamente en una variedad de organismos. Por ejemplo, el gen inducible de la rata hsp70 fue utilizado para producir ratones transgénicos que sobreexpresaban hsp70 inducible, permitiendo que los órganos de los ratones transgénicos fuera protegidos del daño isquémico (Marber y col., J. Clin. Invest. 95:1446-1456 (1995)) debido al incremento de hsp70 de rata. Secuencias de otros animales han sido intercambiadas, incluyendo intercambios entre humanos y roedores con el fin de desarrollar modelos en roedores para estudiar enfermedades humanas, esto es, enfermedades neurodegenerativas. Uno de tales ejemplos es la expresión del gen SCA1 humano, que codifica ataxina-1, en ratones (Burright, E.N. y col., Cell 82:937-948 (1995)). Se generaron ratones transgénicos que expresaban el gen SCA1 humano con un tracto CAG normal o expandido. Los datos ilustraban que las repeticiones de CAG expandidas se expresaban en cantidad suficiente en las células de Purkinje para producir degeneración y ataxia. Este ejemplo ilustra que puede establecerse un modelo en ratón para estudiar la ataxia espinocerebelosa de tipo 1, que es una enfermedad neurológica autosómica dominante heredada. Además del desarrollo de modelos en ratón, la Drosophila es un sistema modelo clave en este campo. Warrick y col. (1999) produjeron moscas transgénicas que coexpresaban hsp70 humana y una poliglutamina mutante humana (MJDtr-Q78). La expresión de la poliglutamina mutante humana MJDtr-Q78 sola en las moscas tenía como resultado la formación de grandes agregados en las neuronas. Sin embargo, la coexpresión con hsp70 humana tuvo como resultado la supresión de la agregación. Estos ejemplos ilustran que el intercambio de genes es una rutina en el campo de la genética molecular y los sistemas modelo proporcionan poderosas herramientas para caracterizar la función génica.
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Ejemplo 3
Generación de Ratones Transgénicos para Math1
Con el fin de detectar patrones de expresión de Math1 sutiles no identificados por la hibridación in situ de ARN, y para iluminar así adicionalmente la función de este gen durante el desarrollo embrionario, se generaron alelos nulos para Math1 (Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}) sustituyendo la región codificadora de Math1 por \beta-galactosidasa (\beta-Gal).
La construcción vectorizante, conteniendo un casete de lacZ y un casete de PGK-neo (Fig. 7A), fue utilizada para sustituir la región codificadora de Math1. Para eliminar la región codificadora completa de Math1, se generó una construcción vectorizante que contenía los fragmentos flanqueantes genómicos 5' y 3' según se describió anteriormente (Ben-Arie y col., 1997) flanqueando un casete de pSAbgal/PGK-neo (Friedrich y Soriano, 1991). La construcción es diseñada de tal manera que la expresión de lacZ está dirigida por los elementos de control de Math1 endógenos, mientras que un promotor de PGK independiente dirige la expresión del marcador seleccionable neo.
La construcción fue introducida por electroporación en células ES y la selección por neo se llevó a cabo con G418. Catorce de 76 clones (18%) experimentaron recombinación homóloga. Se llevó a cabo el genotipado de las células ES, del saco vitelino y de ADN de la cola utilizando análisis Southern del ADN digerido con EcoRI y las sondas descritas previamente (Ben-Arie y col., 1997). La construcción vectorizante fue introducida por electroporación en células madre embrionarias (ES); 14/76 clones (18%) mostraban una recombinación homóloga correcta en el locus de Math1 (Fig. 7B).
Tres líneas celulares de ES portadoras del alelo Math1^{+/\beta-Gal} fueron inyectadas en blastocistos del huésped para generar ratones quiméricos. Los ratones Math1^{+/\beta-Gal} fueron identificados y cruzados entre sí para generar homozigotos (Fig. 7C). La deleción de Math1 fue confirmada mediante análisis Southern utilizando sondas flanqueantes e internas (Fig. 7A).
Los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} mostraban todos ellos las características fenotípicas descritas en los ratones Math1^{-/-} (Ben-Arie y col., 1997; 2000).
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Ejemplo 4
Tinción con X-gal, Análisis Histológicos e Inmunohistoquímicos
Se determinó la etapa en la que estaban los embriones por la presencia del tapón vaginal, designándose como E0,5 la mañana en la apareció el tapón vaginal. Los embriones fueron extraídos del útero mediante disección, separados de las membranas extraembrionarias y colocados en solución salina tamponada con fosfato (PBS) fría. Los embriones fueron posteriormente fijados en paraformaldehído (PFA) al 4% en PBS durante 30 minutos y lavados en PBS frío. Se recogieron los sacos vitelinos o las colas antes de la fijación para la extracción de ADN y el genotipado. Se llevó a cabo un equilibrado para mejorar la penetrabilidad de los reactivos de tinción en NP40 0,02%, desoxicolato de sodio 0,01% en PBS durante 10 minutos a temperatura ambiente. Se llevó a cabo la tinción con X-gal del montaje completo (Bonnerot y Nicolas, 1993) durante 16-24 horas a 30ºC mientras se agitaba en el mismo tampón de equilibrado, que contenía también ferricianuro de potasio 5 mM, ferrocianuro de potasio 5 mM y 40 mg/ml de X-gal (disuelto en DMSO). Cuando se consiguió la intensidad de tinción deseada, normalmente en 18 horas, los embriones fueron lavados en PBS, post-fijados durante 30 minutos en formalina tamponada, deshidratados de manera seriada en etanol al 25, 50 y 70%, y almacenados a 4ºC.
Para el análisis histológico, los embriones fueron deshidratados adicionalmente en etanol al 80, 90 y 100%, tratados con Histoclear (National Diagnostics) e incluidos en Paraplast (Oxford Labware). Se cortaron secciones de 7 a 20 \mum utilizando un microtomo (Microme). La contratinción se realizó utilizando "Nuclear fast Red" (Vector Laboratories). La inmunohistoquímica se realizó según ha sido detallado previamente (Ben-Arie y col., 1997). Anticuerpos: Anti-citoqueratina 18 (DAKO) 1:20; Anti-Cromogranina A humana (DAKO) 1:100; Anti-MATH1 (ver más adelante) 1:200.
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Ejemplo 5
Patrones de Expresión en Ratones Transgénicos para Math1
Según se esperaba, la expresión de \beta-Gal en el cerebelo y en la médula espinal dorsal es idéntica a la de Math1, y lo que es más interesante, \beta-Gal se expresaba también en todo el epitelio de las vesículas óticas en E12,5 y en el epitelio sensorial del utrículo, el sáculo, los canales semicirculares y la cóclea en E14,5 y E15,5 (Figuras 1A y 1B). Los utrículos fueron obtenidos de ratones C57BL/129SVEV.
El análisis morfológico macroscópico del oído interno de los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} en E18,5, un día antes de la gestación completa, no reveló defectos obvios en la estructura general y en el tamaño en comparación con los individuos de la camada de tipo salvaje (wt). Las ramas del VIIIº nervio craneal estaban presentes y alcanzaban el epitelio, pero se habían degenerado debido a la ausencia de células pilosas.
Se examinaron con detalle los epitelios sensoriales. Se escindieron los utrículos y las cócleas de ratones de tipo salvaje, Math1^{+/\beta-Gal} y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} para permitir la visión de los epitelios sensoriales con la óptica de Nomarski. Estaban presentes haces pilosos en los órganos de los ratones de tipo salvaje y de los heterozigotos, pero estaban completamente ausentes en los individuos de la camada nulos para Math1. La microscopía de barrido electrónico (SEM) de la cóclea y de los órganos vestibulares confirmó la ausencia de haces pilosos en los ratones nulos para el gen (Figuras 2A a 2F). Con el fin de determinar si la falta de haces pilosos reflejaba la ausencia de células pilosas, se examinaron secciones transversales de los epitelios sensoriales de todos los órganos del oído interno utilizando microscopía óptica y microscopía de transmisión de electrones (MO y MTE, respectivamente) (Figuras 3A a 3F). MO y MTE se llevaron a cabo según se ha descrito previamente (Lysakowski y Goldberg, 1997). La preparación de los tejidos para MTE constaba de las etapas de tratamiento con osmio (1% de OsO_{4} en tampón cacodilato), deshidratación, secado al punto crítico, revestimiento con oro mediante bombardeo iónico y examen en un microscopio electrónico JEOL 35S.
La microscopía óptica reveló que los epitelios sensoriales de los ratones nulos para el gen eran considerablemente más delgados, carecían de la estratificación normal de los núcleos celulares y se teñían uniformemente, todo lo cual era consistente con la ausencia de células pilosas. La MTE distingue claramente entre las células pilosas y las células de soporte de los utrículos normales: la células pilosas tienen haces pilosos, un citoplasma menos denso a los electrones, núcleos más apicales y no tienen gránulos secretores (Figuras 4A y 4B). Los epitelios sensoriales de los mutantes nulos para el gen carecían totalmente de células pilosas pero tenían células de soporte con aspecto normal (Rüsch y col., 1998), incluyendo un citoplasma denso a los electrones, núcleos basales y gránulos secretores. Sin embargo, los ratones heterozigotos Math1^{+/\beta-Gal} conservaban las células pilosas.
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Ejemplo 6
Expresión de un Marcador Específico de Células Pilosas en Ratones Transgénicos para Math1
La falta de células pilosas en E18,5 puede ser debida a (1) la falta de progenitores de las células sensoriales, (2) la incapacidad de los progenitores para diferenciarse en células pilosas o (3) la incapacidad de las células pilosas para mantener los estados diferenciados, como se ha observado en ausencia del dominio POU del factor de transcripción Brn3c. La primera posibilidad es poco probable ya que los progenitores dan lugar a las células pilosas y también a las células de soporte. Con el fin de evaluar las posibilidades restantes, se examinó la expresión de los marcadores específicos de células pilosas calretinina y miosina VI. La calretinina es un miembro de la familia de proteínas que se unen al calcio y se expresa en las células pilosas que se están diferenciando (antes de la formación de los haces pilosos) y en las células pilosas del oído interno maduras y auditivas, pero no en las células de soporte. La expresión de calretinina en ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} y en ratones de tipo salvaje fue estudiada mediante inmunofluorescencia en secciones coronales de embriones E15,5, E16,5 y E18,5 (Figuras 5A a 5F).
Para la inmunofluorescencia, los embriones fueron fijados durante 1,5 horas en paraformaldehído al 4%/PBS a 4ºC, sumergidos en sacarosa al 15%/PBS durante 5 horas y posteriormente en sacarosa al 30%/PBS durante una noche y congelados de forma instantánea en un baño de hielo seco con 2-metilbutano. Se cortaron secciones de 14 \mum en un criostato y se montaron sobre portaobjetos revestidos con gelatina. Las secciones fueron fijadas en los portas mediante inmersión durante 10 minutos en fijador de tejidos Streck (Streck Laboratories) y secado al aire. Las secciones fueron bloqueadas en un 30% de suero de cabra normal y un 0,3% de Triton X-100 en PBS durante 1 hora a temperatura ambiente (RT). Un anticuerpo policlonal de conejo anti-calretinina (Chemicon Laboratories) fue diluido 1:200 en solución de bloqueo e incubado durante una noche sobre las secciones a 4ºC. Las secciones fueron lavadas tres veces (20 minutos cada vez) en solución salina tamponada con fosfato (PBS) a temperatura ambiente. El anticuerpo secundario, anti-anticuerpo de conejo, Alexa 488 (Molecular Probes), fue diluido 1:400 en solución de bloqueo y utilizado para detectar calretinina. Las secciones fueron cubiertas e incubadas a temperatura ambiente durante 2 horas antes de ser lavadas y montadas en Vectashield conteniendo DAPI (Vector). Para la microscopía confocal, las secciones fueron tratadas con 25 \mug/ml de ARNasa antes de contrateñir con 50 \mug/ml de yoduro de propidio y montadas en Vectalshield sin DAPI. Las secciones teñidas fueron visualizadas bajo un microscopio confocal Bio-Rad 1024.
Las células positivas para calretinina eran claramente visibles en los epitelios sensoriales de los canales semicirculares y de los utrículos de los ratones de tipo salvaje, pero los embriones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} carecían de expresión de calretinina en los tres estados. Utilizando el modelo de ratón aquí descrito, los presentes inventores demostraron que las células pilosas no se desarrollan nunca en los epitelios sensoriales de los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}. La presencia de las membranas tectorial y otolítica (secretadas en parte por las células de soporte), junto con los resultados de la MET, sugería que las células restantes de los epitelios sensoriales de los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}, eran células de soporte funcionales.
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Ejemplo 7
La Expresión de Math1/lacZ Remeda la Expresión de Math1 en el SNC en Desarrollo
Se analizó el cerebelo en desarrollo en E14,5 y en el día post-natal 0 (P0) de ratones Math1^{+/\beta-Gal} y Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} mediante análisis de hibridación in situ de ARN.
Los análisis mostraron que el patrón de expresión del gen lacZ reproducía fidedignamente el patrón de expresión de Math1 observado mediante el análisis de hibridación in situ de ARN mostrado previamente (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1996) (Fig. 2A, B, E, G). Además, el fenotipo del cerebelo de los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Fig. 8F y 8H) era idéntico al observado en los ratones nulos para Math1 (Ben-Arie y col., 1997). En E14,5, los precursores de la EGL están presentes en el labio rómbico desde el cual migran sobre el primordio cerebeloso para poblar la EGL (Fig. 8E). Los ratones mutantes mostraban bastantes menos células de este tipo que los ratones heterozigotos (Fig. 8F). En P0, las neuronas de la capa granular externa (EGL) estaban completamente ausentes (Fig. 8H).
La expresión de Math1/lacZ en el cerebro posterior y en la médula espinal en desarrollo reproducía de manera similar el patrón de expresión de Math1 (Fig. 8C, 8D). La única diferencia notable entre los patrones de expresión establecidos por la hibridación in situ y la tinción de lacZ es que la expresión de \beta-galactosidasa persiste en las células de la médula espinal que se estaban diferenciando o migrando debido a la estabilidad de la proteína \beta-GAL (Fig. 8D). En resumen, el patrón de expresión en el tejido neural y el fenotipo del cerebelo asociados con la sustitución de la región codificadora de Math1 por lacZ, es consistente con los datos previamente publicados sobre la expresión de Math1 (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1997; Ben-Arie y col., 1996; Helms y Johnson, 1998), demostrando que los elementos de control endógenos no habían sido alterados por la inserción del gen lacZ. Además, muchos de los grupos de células que expresaban lacZ no detectados previamente resultaron patentes tras la tinción con X-gal de embriones completos y de secciones de embriones de ratones Math1^{+/\beta-Gal} (ver más adelante). Es probable que limitaciones en la resolución espacial de las técnicas de hibridación in situ de ARN utilizadas para detectar el transcrito en los estudios más antiguos, impidieran que estos sitios de expresión fueran distinguidos (Akazawa y col., 1995; Ben-Arie y col., 1996). Alternativamente, la estabilidad del producto del gen lacZ y la sensibilidad incrementada debido a la amplificación de la señal, nos permitieron identificar lugares con niveles de expresión relativamente bajos.
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Ejemplo 8
Math1/lacZ Se Expresa en los Epitelios Sensoriales del Oído Interno
Los órganos sensoriales del oído interno estaban entre los sitios de expresión de Math1/lacZ recién identificados, demostrados utilizando los métodos descritos en el Ejemplo 2. La expresión en la vesícula ótica fue detectada por primera vez en E12,5 y continuó siendo detectada hasta E18,5 en gran parte de los epitelios sensoriales (Bermingham y col., 1999) (Figuras 9A, 9B). Los mutantes nulos para el gen mostraban expresión de Math1/lacZ en el oído interno a lo largo de toda la embriogénesis (Fig. 9C). Los mutantes nulos para Math1 carecían de células pilosas en todos los órganos sensoriales (Bermingham y col., 1999), pero mantenían las células de soporte, las otras células derivadas del epitelio sensorial (Fig. 9C). Estas células de soporte parecían ser funcionales, sobre la base de su morfología y de la presencia de membranas superpuestas secretadas en parte por estas células. Aunque no se demostró la expresión de Math1 en los epitelios sensoriales del oído interno mediante el análisis de hibridación in situ del ARN, la completa ausencia de células pilosas del oído interno en los mutantes nulos para el gen deja poca duda sobre la autenticidad del patrón de expresión de Math1/lacZ.
El Math1 es claramente esencial para el desarrollo de las células pilosas en el oído interno. Su patrón de expresión y su función in vivo son semejantes a los del homólogo proneural de Math1, atonal (ato) (A.P. Jarman, Y. Grau, L.Y. Jan, Y.N. Jan, Cell 73, 1307-21 (1994)). El ato se expresa en un anillo de células epiteliales dentro del disco antenal de Drosophila. Algunas de estas células epiteliales se desarrollarán posteriormente a mecanorreceptores en el órgano de Johnston, que es necesario para la audición y para la geotaxis negativa. Es interesante indicar que las células progenitoras de los mecanorreceptores están ausentes en los mutantes de ato, mientras que solamente los mecanorreceptores, y no sus progenitores, están ausentes en los ratones nulos para Math1.
Sobre la base de las observaciones aquí realizadas, los presentes inventores han reconocido que se requiere Math1 para la especificación de las células pilosas del oído interno. En un sentido, Math1 actúa como un "pro-gen de células pilosas" en los epitelios sensoriales en desarrollo. Junto con dos estudios recientes, los presentes inventores han reconocido que los resultados aquí proporcionados proporcionan pruebas que apoyan un modelo de inhibición lateral para la determinación de las células pilosas y de las células de soporte (Haddon y col., 1998; Adam y col., 1998), en el cual la interacción de Delta, Notch y Serrate1 tiene como resultado la selección de células pilosas individuales a partir de agrupaciones de células competentes. Tal modelo supone que los epitelios sensoriales expresan un "gen pro-células pilosas" cuya función es esencial para la especificación del destino de las células pilosas.
La expresión ectópica de ato en la mosca de la fruta y de su homólogo Xath1 en Xenopus (Kim y col., 1997) puede reclutar células epiteliales hacia destinos neuronales específicos, y la expresión de Math1 en los epitelios del oído interno sugiere firmemente que la pérdida de un gen Math1 funcional es probablemente una causa común de la sordera y de la disfunción vestibular.
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Ejemplo 9
Math1/lacZ Se Expresa en los Núcleos del Tronco Cerebral
En el tronco cerebral, la tinción de Math1/lacZ aparecía desde E18,5 hasta P7 en el puente ventral de las regiones correspondientes a los núcleos pontinos (Fig. 9D y recuadro). Este hallazgo es consistente con la hipótesis de Akazawa y colaboradores de que las células positivas para Math1 del cerebro posterior en desarrollo son precursoras de las neuronas bulbo-pontinas (Akazawa y col., 1995). Tal tinción no aparecía en los mutante nulos para el gen (Fig. 9E y recuadro). Estos datos generaban la posibilidad de que la ausencia de tinción de lacZ en los núcleos pontinos podría ser debida a un fallo de sus precursores para migrar, proliferar y/o diferenciarse. Los núcleos pontinos ventrales fueron examinados tras la tinción con hematoxilina y eosina de las secciones y se encontró que estaban ausentes en el tronco cerebral de los ratones nulos para el gen (Fig. 9F, G). Además, la incapacidad para respirar de los ratones nulos para el gen recién nacidos podía ser debida a la ausencia de estas neuronas en el tronco cerebral.
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Ejemplo 10
Math1/lacZ Se Expresa en Condrocitos
Los heterozigotos Math1^{+/\beta-Gal} mostraban expresión de Math1 en el cartílago articular (Figuras 6A y 6B). La Figura 6A demuestra la expresión en todas las articulaciones de un miembro anterior. Tras un examen más exhaustivo de la articulación del codo, se observó que Math1 se expresaba exclusivamente en los condrocitos articulares no osificados.
La expresión de Math1/lacZ fue detectada en las articulaciones proximales en desarrollo, tales como las de la cadera y el hombro, tan pronto como en E12,5 (Fig. 10A). Se detectó tinción positiva con X-gal en etapas posteriores del desarrollo en un patrón proximal-distal progresivo que era paralelo al desarrollo normal de las articulaciones (Figura 10B). En las articulaciones, la expresión de Math1/lacZ sigue inmediatamente a la condensación mesenquimal, que comienza en E11,5. Las células mesenquimales condensadas se diferencian a condrocitos (Bi y col., 1999; Horton y col., 1993; Karsenty, 1998).
Los condrocitos se diferencian en tres fases principales durante la formación del hueso: reposo, proliferación e hipertrofia. Los condrocitos en reposo que pueblan el cartílago articular son referidos como condrocitos articulares (Buckwalter y Mankin, 1998; Poole, 1997). Antes del nacimiento, los condrocitos en reposo constituyen la población total de condrocitos de las articulaciones. Con el fin de establecer qué células expresaban Math1/lacZ, se tiñeron secciones de ratones Math1^{+/\beta-Gal} E18,5 y P7 con X-gal. Math1/lacZ se expresaba en los condrocitos en reposo de todas las articulaciones analizadas en E18,5; la Figura 10C muestra condrocitos en reposo en la articulación del codo y la Fig. 10D muestra los condrocitos en reposo, en proliferación y articulares de un ratón P7.
Las articulaciones de embriones E18,5 fueron examinadas con un anticuerpo anti-MATH1 preparado mediante los métodos siguientes. Un fragmento de EcoRI-HindIII que codificaba los 156 aminoácidos N-terminales del marco de lectura abierto de Math1 (Math1D) fue clonado en el vector de expresión pET 28a+ (Novagen). El fragmento Math1D fue expresado como una proteína de fusión con una marca de His ("His-tag"). La proteína MATH1D soluble fue purificada de acuerdo con las especificaciones del kit "His-tag" (Novagen) y se utilizaron 2 mg de proteína para inmunizar pollos (Cocalico Biologicals Inc.).
Se encontró expresión en condrocitos en reposo, mientras que no se observó expresión en los embriones nulos para el gen. Debe indicarse que ninguna célula del cartílago articular expresaba Math1/lacZ (Fig. 10E). La expresión de Math1/lacZ en los mutantes nulos para Math1 es similar a la de los ratones heterozigotos en E18,5, sugiriendo que no se requiere Math1 para el desarrollo de los condrocitos en reposo.
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Ejemplo 11
Math1/lacZ Se Expresa en las Células de Merkel
Hacia E14,5 células positivas para Math1/lacZ eran manifiestas alrededor de las vibrisas y en la piel de gran parte del cuerpo (Fig. 10B). En el tronco, las células teñidas estaban dispuestas en un patrón rayado definido por las crestas epidérmicas. Esta tinción era clara solamente en la piel con pelo, no en la piel lampiña. Todas las vibrisas primarias (mistaciales), incluyendo a las nasales laterales, las maxilares y los cuatro pelos grandes, eran positivos para Math1/lacZ. También se detectó tinción en las vibrisas secundarias, incluyendo las vibrisas labiales, las submentonales, las rinovibrisas y las vibrisas orbitales aisladas (supra-, infra- y post-orbitales) (Yamakado y Yohro, 1979). Hacia el E15,5 apareció tinción en grupos de células de las almohadillas subplantares.
Con el fin de identificar las células positivas para Math1/lacZ de las vibrisas, de la almohadilla subplantar y de la piel con pelo, examinamos histológicamente secciones procedentes de ratones Math1^{+/\beta-Gal} (Fig. 11A-D). Las secciones de las vibrisas mostraron que las células teñidas estaban localizadas hacia la mitad más apical del tallo del pelo, pero no estaban en el propio pelo. Secciones transversales de la almohadilla subplantar ilustraban la tinción de grupos de células en la capa epidérmica (Fig. 11B, C). Según se muestra en la Fig. 11D, las secciones de la piel del tronco identificaron grupos de células teñidas para Math1/lacZ. Las células teñidas estaban dispuestas en un patrón con forma de herradura centradas en una estructura elevada similar a un botón en la piel con pelo. Estas estructuras similares a un botón fueron identificadas como cúpulas del tacto o Haarscheiben (Pinkus, 1905), las cuales se caracterizan por una epidermis engrosada y una papila dérmica elevada con una red de capilares. Las cúpulas del tacto están asociadas con pelos guardianes grandes dispersos entre otros tipos de pelo de la capa. La distribución espacial de las células teñidas para Math1/lacZ, el momento de su aparición en E14,5 y su localización dentro de las almohadillas mistaciales de las vibrisas y en las cúpulas del tacto de la piel con pelo, sugerían que estas células corresponden a células de Merkel, células especializadas de la epidermis que forman complejos de mecanorreceptores de tipo I de adaptación lenta con neuritas (Munger, 1991).
Los resultados del análisis comparativo del patrón de expresión de Math1/lacZ en animales heterozigotos y homozigotos en E16,5, están mostrados en la Figura 11E-L. Los embriones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} mostraban un patrón de tinción similar al de sus compañeros de camada Math1^{+/\beta-Gal} en las vibrisas y en las almohadillas subplantares (Fig. 11 E-G, I-K). En contraste, la tinción en las cúpulas del tacto de la piel con pelo apenas era detectable en los embriones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal} (Fig. 11H, L). La reducción de la tinción en los animales nulos para el gen era también obvia en E18,5.
Con el fin de definir adicionalmente las células positivas para Math1/lacZ en la piel, se aparearon ratones
Math1^{+/\beta-Gal} con ratones Tabby. Tabby (Ta) es una mutación espontánea ligada a X que muestra un fenotipo similar en machos hemizigotos y en hembras homozigotas (Ferguson y col., 1997). Los mutantes Tabby carecen de folículos pilosos (tilótricos), de un subgrupo de células de Merkel que están asociadas con las cúpulas del tacto de la piel con pelo del tronco (Vielkind y col., 1995) y de algunas de las cinco vibrisas secundarias de la cabeza (Gruneberg, 1971). Por tanto, en un cruce de hembras Ta/Ta con un macho heterozigoto Math1^{+/\beta-Gal}, el 50% de la progenie masculina será Ta/Y:Math1^{+/\beta-Gal}, permitiéndonos determinar si las células positivas para Math1/lacZ corresponden a células de Merkel.
Hembras Ta/Ta fueron apareadas gestacionalmente con machos Math1^{+/\beta-Gal}, y los embriones fueron recogidos en E16,5. Se determinó el género de cada cría mediante PCR del ADN de la cola utilizando los cebadores (directo 5'-TGAAGCTTTTGGCTTTGAG-3'; SEC ID Nº:67, e inverso 5'-CCGCTGCCAAATTCTTTGG-3'; SEC ID Nº:68) lo cual dio lugar a un producto de 320 pb procedente del cromosoma X y un producto de 300 pb procedente del cromosoma Y (Liu y col, 1999). Las condiciones de la amplificación fueron: 92ºC/1 minuto, 55ºC/1 minuto, 72ºC/1 minuto durante 32 ciclos, con una etapa inicial de desnaturalización de 94ºC/7 minutos y una etapa final de extensión de 72ºC/7 minutos. Los productos de amplificación fueron separados en geles de agarosa al 2%. Los embriones teñidos con X-gal fueron valorados independientemente por 2 individuos y sólo entonces se consideró que los resultados coincidían con el género determinado.
Los machos y las hembras Tabby portadores del alelo Math1^{+/\beta-Gal} mostraban ambos tinción con X-gal en las vibrisas y en las almohadillas subplantares (Fig. 12A, B). El efecto de la mutación Tabby sobre el número de vibrisas secundarias estaba bastante claro: los machos hemizigotos carecían completamente de células positivas para Math1/lacZ en las vibrisas secundarias (típicamente ausentes en los mutantes Ta) y en el tronco (Fig. 12E). Las hembras que eran heterozigotas para Tabby mostraban una tinción poco uniforme en las cúpulas del tacto (aunque menos que las wt), como podría anticiparse en las hembras portadoras de una mutación en un gen que experimente inactivación aleatoria del cromosoma X (Fig. 12C, D). La localización y distribución de las células positivas, así como su ausencia en vibrisas seleccionadas y en el tronco de los machos Tabby, indicaban firmemente que Math1 se expresaba en las células de Merkel asociadas con los folículos centinela de las cúpulas del tacto de la piel con pelo.
Con el fin de determinar si el patrón de tinción de Math1/lacZ reflejaba el patrón de expresión normal de Math1, se llevó a cabo un análisis inmunohistoquímico de MATH1 en secciones de piel abdominal (ver el Ejemplo 2). Como se observa en las Figs. 13A y B, se detectaron células positivas para MATH1 alrededor de los folículos pilosos de los ratones Math1^{+/+} pero no de los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}. Se seleccionaron anticuerpos hacia dos marcadores de las células de Merkel para un análisis posterior: un anticuerpo anti-citoqueratina 18, que se expresa en los epitelios simples, y un anticuerpo hacia la cromogranina, que se localiza en los gránulos secretores de los tejidos neuroendocrinos, endocrinos y neuronales. La citoqueratina 18 (Fig. 13C, D) y la cromogranina A (Fig. 13E, F) confirmaron la identidad de las células positivas para Math1/lacZ como células de Merkel, pero no revelaron anormalidades de la tinción en los ratones Math1^{\beta-Gal/\beta-Gal}. Por tanto, Math1 no parece ser esencial para la génesis de las células de Merkel neuroendocrinas, en contraste con los tipos celulares neuronales puros como la EGL del cerebelo y los núcleos pontinos. Como los mutantes nulos para Math1 morían al nacer, no pudimos determinar si el grupo completo de células de Merkel estaba formado o si estaba afectada la integridad funcional de las células de Merkel en estos mutantes.
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Ejemplo 12
Math1 Rescata Parcialmente Células de los CHOs en Moscas en las que se Había Eliminado ato
Este ejemplo demuestra que los genes asociados con atonal pueden inducir el desarrollo de células del SNC en animales deficientes en un gen o en un producto génico nativo asociado con atonal. Este ejemplo demuestra también que los genes asociados con atonal pueden funcionar terapéuticamente en especies en las cuales no se expresan de forma nativa.
Dada la notable similitud entre en los patrones de expresión de ato y Math1, y sus dominios básicos idénticos, se analizó Math1 para ver si podría remedar los efectos de la sobreexpresión de ato mediante la producción de órganos cordotonales ectópicos según está descrito por los siguientes métodos. Moscas de tipo salvaje, conocidas también como moscas yw, fueron transformadas con una construcción UAS-Math1 según ha sido descrito (Brand y Perrimon, 1993). Para sobreexpresar Math1 en moscas de tipo salvaje yw, moscas UAS-Math1 fueron apareadas con moscas HS-Gal4. La progenie fue sometida a un golpe de calor según ha sido descrito previamente (Jarman y col., 1993). Para rescatar la pérdida de los órganos cordotonales en las moscas mutantes para ato, w; moscas UAS-Math1/UAS-Math1; ato1/TM6 fueron cruzadas con moscas w; HS-Gal4/Cyo; ato1/TM6. Se recogieron embriones durante 3 horas, se envejecieron durante 3 horas, se sometieron a un golpe de calor durante 30 minutos a 37ºC y se dejaron desarrollar durante las siguientes 12-15 horas. Los embriones fueron fijados en formaldehído al 4% en PBS con un 50% de heptano. Los embriones fueron lavados con etanol 100%, transferidos a PBT y teñidos con el mAb 22C10 según ha sido descrito previamente (Kania y col., 1995) para detectar neuronas del SNP. Las neuronas cordotonales fueron identificadas por su morfología y su posición características.
La expresión de Math1 durante el desarrollo pupal mediante golpe de calor utilizando el sistema UAS-Gal4 (Brand y Perrimon, 1993) tuvo como resultado órganos sensoriales externos supernumerarios en el notum (Fig. 14A, B) y en la lámina del ala, según se había descrito para ato (Jarman y col., 1993) y para los genes del complejo Achaete-Scute (AS-C) (Brand y Perrimon, 1993; Rodriguez y col., 1980). La expresión de Math1 en las moscas, igual que la de ato, producía órganos cordotonales ectópicos (Fig. 8G), aunque con menor eficacia. Sin embargo, la sobreexpresión de los genes AS-C no tenía como resultado órganos cordotonales ectópicos (Jarman y col., 1993). Math1 tiene por tanto una especificidad funcional similar a la de ato.
Como varios intensificadores de ato son dependientes de ato (Sun y col., 1998), pueden ser activados por Math1, lo cual daría lugar por tanto a la especificación ectópica de los CHOs. Con el fin de determinar si Math1 podía sustituir la función de ato en las moscas, y para excluir la posibilidad de que la producción de CHOs por Math1 fuera debida a la activación de ato, se expresó Math1 en embriones mutantes para ato. Los mutantes carecían todos ellos de neuronas cordotonales (Fig. 14C), pero la sobreexpresión de Math1 rescataba parcialmente la pérdida de estas neuronas (Fig. 14D) de manera similar a ato (Chien y col., 1996).
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Ejemplo 13
Significación de atonal y de Math1 en el SCN y en el SNP
A lo largo de los últimos años se ha hecho un progreso significativo para desvelar las funciones de las proteínas bHLH en la neurogénesis de los vertebrados. Los genes que codifican bHLH neural de los vertebrados fueron aislados y caracterizados ya que se había demostrado previamente que se requerían para la neurogénesis homólogos de Drosophila tales como los genes ato o AS-C (Anderson, 1995; Guillemot, 1046 1995; Lee, 1997; Takebayashi y col., 1997). En efecto, se demostró que varios genes eran proneurales debido a que su ausencia producía un fallo en la especificación de los neuroblastos o precursores de los órganos sensoriales (SOP), mientras que su sobreexpresión daba lugar al reclutamiento de precursores neuronales supernumerarios (Ghysen y Dambly-Chaudiere, 1989). Con la excepción de neurogenina (Ngn) 1 y 2 (Fode y col., 1998; Ma y col., 1998), permanece incierto cuál de los homólogos de vertebrados desempeña funciones similares a las de sus equivalentes de Drosophila, y qué función precisa desempeñan las diferentes proteínas bHLH en el desarrollo neural. En Drosophila se requiere ato para el desarrollo de un subgrupo específico de órganos sensoriales, los órganos cordotonales (Jarman y col., 1993). Los CHOs son mecanosensores internos del SNP (McIver, 1985). Por tanto, ato y los CHOs proporcionan un excelente sistema en el que determinar no sólo la relación molecular y relativa al desarrollo entre la neurogénesis de invertebrados y vertebrados con respecto a la función de los genes proneurales, sino también la conservación evolutiva de la función y la especificación de los órganos sensoriales. En el ratón se han clonado y analizado siete homólogos de ato: los Homólogos de Atonal de Ratón (MATH) 1, 2, 3, 4A (conocido también como Ngn2), 4B (Ngn3), 4C (Ngn1) y 5 (Akazawa y col., 1995; Bartholomä y Nave, 1994; Ben-Arie y col., 1997, 1996; Fode y col., 1998; Ma y col., 1998; McCormick y col., 1996; Shimizu y col., 1995; Takebayashi y col., 1997). La mayoría de ellos se expresan durante la neurogénesis en el SNC y en el SNP. Estos homólogos varían en el grado de conservación de sus secuencias y pueden ser divididos en tres grupos. El grupo más distantemente relacionado, las neurogeninas, incluye Ngn 1, 2 y 3. Estos productos génicos comparten, de media, un 53% de identidad en el dominio bHLH con ATO. Son expresados en su mayoría en células progenitoras de los ganglios sensoriales y del SNC mitóticas. Un trabajo reciente sugiere que estos genes pueden desempeñar una función en la determinación de los neuroblastos y pueden por tanto ser auténticos genes proneurales (Fode y col., 1998; Ma y col., 1998). El segundo grupo incluye MATH2 y MATH3, que comparten un 57% de identidad en el dominio bHLH con ATO. Se ha postulado que estas proteínas funcionan en las células neurales post-mitóticas (Bartholomä y Nave, 1994; Shimizu y col., 1995). La expresión de Math2 está limitada al SNC, mientras que Math3 se expresa en el SNC y en los ganglios del trigémino y de la raíz dorsal. El tercer grupo incluye MATH1 y MATH5, que comparten un 67% y un 71% de identidad con el dominio bHLH de ATO, respectivamente. Es de destacar que ambos genes codifican un dominio básico idéntico al de ATO. Y lo que es más interesante, se demostró el que dominio básico de ATO era suficiente, en el contexto de otra proteína proneural (SCUTE), para sustituir la pérdida de la función de ato (Chien y col., 1996). Inicialmente se demostró que Math1 se expresaba en los precursores de la EGL del cerebelo y en la médula espinal dorsal (Ben-Arie y col., 1997, 1996). Math5 se expresaba en los progenitores en división de la retina en desarrollo y en el ganglio vagal (Brown y col., 1998). Con la excepción de la expresión de Math5 en la retina neural, estas observaciones encierran una paradoja: ninguno de los homólogos de vertebrados parecía expresarse en los órganos o tejidos periféricos similares a aquellos en los que se expresaba ato. Jarman y col. (1993) describieron que ato se expresaba en el SNC. En los ejemplos descritos en la presente se muestra que, además de en el centro de proliferación interno del lóbulo óptico, ato se expresaba en una pequeña placa de células anteriomedial en cada lóbulo del cerebro (Fig. 8F). Ya que permanece incierto, sin embargo, qué función precisa desempeña ato en el desarrollo del SNC de Drosophila, ha sido difícil discutir que ato y sus homólogos de vertebrados muestran una conservación funcional. Nuestros experimentos revelan lugares de expresión de Math1 no caracterizados previamente. Según se esperaba, encontramos que la expresión de Math1/lacZ en el SNC correspondía a la de Math1, pero también encontramos que Math1 se expresaba en la piel, en las articulaciones y en el oído interno, en un paralelismo sorprendente con la expresión de ato en la mosca. Además, la expresión en el oído (epitelio sensorial) y en la piel (células de Merkel) está limitada a estructuras sensoriales cuya función es convertir estímulos mecánicos en señales electroquímicas neuronales. Es importante señalar que en Drosophila, ato parece desempeñar dos funciones simultáneamente. Se requiere no sólo para seleccionar los precursores de los CHOs (función proneural), sino también para especificar estos precursores como precursores de CHO (función de identidad del linaje) (Jarman y Ahmed, 1998; Jarman y col., 1993). La especificidad de la expresión de Math1 en la periferia hace tentador especular que el mismo puede también dotar a células específicas de identidades de linaje muy específicas para distinguirlas funcionalmente de otras estructuras sensoriales. La capacidad de Math1 para inducir la formación de CHOs ectópicos y para restaurar CHOs en embriones mutantes para ato, apoya la noción de que Math1, y particularmente su dominio básico, codifica una información sobre la identidad del linaje no diferente de la codificada por ato. Esto sugiere que las células de mamífero que expresan Math1, al menos en el oído y en la piel, son funcionalmente similares y quizá están evolutivamente relacionadas con las células de Drosophila que requieren ato. Además, la expresión de Math5 en la retina neural sugiere que las funciones de atonal en la mosca están llevadas a cabo por dos genes en el ratón: el desarrollo de algunos mecanorreceptores está bajo el control de Math1 y el desarrollo de la retina está posiblemente bajo el control de Math5. Es interesante observar que en el nematodo C. elegans totalmente secuenciado, se identificó solamente un homólogo de atonal, lin-32 (Zhao y Emmons, 1995). Mutantes con el alelo u282 de lin-32 son insensibles al tacto, lo cual refuerza el argumento de la conservación evolutiva de la función de atonal en la mecanorrecepción. El patrón de expresión de Math1/lacZ en los núcleos pontinos sugería que esta región debe ser evaluada cuidadosamente en los mutantes nulos para el gen. Aunque originalmente no se detectaron defectos en el puente de los ratones nulos para Math1 (Ben-Arie y col., 1997), un análisis más minucioso reveló la falta de núcleos pontinos en este lugar. Estas neuronas derivan del labio rómbico (Altman y Bayer, 1996) igual que las neuronas de la EGL, que están también ausentes en los ratones nulos para Math1. Aunque es posible deducir paralelismos entre la expresión de Math1 y ato en la piel y en el oído, no está claro que este sea el caso para las articulaciones. Se requiere la expresión de ato en las articulaciones de la mosca para la formación de los CHOs de las patas. En contraste, Math1 se expresa en condrocitos en reposo y articulares que no tienen ninguna función neural descrita, y para los cuales no existe paralelismo en la mosca. Pudiera ser que la expresión de Math1 en el cartílago indicara una nueva función para un gen mecanosensorial, o simplemente podría reflejar similitudes en los acontecimientos moleculares subyacentes al desarrollo de los diferentes tipos celulares que expresan Math1. Alternativamente, los CHOs podrían también funcionar como elementos estructurales de las articulaciones de la mosca, o bien el cartílago articular podría tener una capacidad mecanorreceptora o transductora no descrita todavía. No existe ninguna evidencia en este punto para apoyar una u otra de estas posibilidades. El análisis de las funciones de ato y Math1 aumentará nuestro conocimiento del desarrollo neural y de la conservación evolutiva de la función sensorial. Los sitios y la especificidad de la expresión de Math1 pueden hacer que el mismo sea adecuado como una herramienta para terapia génica o para procedimientos de activación génica en enfermedades tales como la pérdida auditiva y la osteoartritis que son debidas a un daño relacionado con la edad o a un daño medioambiental.
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Ejemplo 14
Administración de un Ácido Nucleico Asociado con Atonal Utilizando Adenovirus
Los adenovirus humanos son virus tumorales de ADN bicatenario con tamaños del genoma de 36 kb aproximadamente. Los adenovirus han sido ampliamente estudiados y bien caracterizados como sistema modelo para la expresión de genes eucarióticos, lo cual hace que sean un sistema atractivo para el desarrollo de adenovirus como sistema para la transferencia de genes. Este grupo de virus es fácil de crecer y manipular y pueden presentar un amplio rango de huéspedes in vitro e in vivo. En células infectadas líticamente, los adenovirus son capaces de anular la síntesis de proteínas del huésped, dirigiendo la maquinaria celular para sintetizar grandes cantidades de proteínas víricas, y de producir cantidades copiosas de virus.
La región E1 del genoma incluye E1A y E1B, que codifican proteínas responsables de la regulación de la transcripción del genoma del virus, además de unos cuantos genes celulares. La expresión de E2, incluyendo E2A y E2B, permite la síntesis de funciones replicativas del virus, por ejemplo de la proteína de unión a ADN, de ADN polimerasa y de una proteína terminal que estimula la replicación. Los productos del gen E3 impiden la citolisis por las células T citotóxicas y por el factor de necrosis tumoral, y parecen ser importantes para la propagación vírica. Las funciones asociadas con las proteínas E4 incluyen la replicación de ADN, la expresión de genes tardíos y la inactivación de la célula huésped. Los productos de los genes tardíos incluyen la mayor parte de las proteínas de la cápside de los viriones, y éstos son expresados solamente después de que haya tenido lugar la mayor parte del procesamiento de un único transcrito primario a partir del promotor tardío principal. El promotor tardío principal (MLP) muestra una elevada eficacia durante la fase tardía de la infección.
Como parece requerirse solamente una pequeña porción del genoma vírico en cis, los vectores derivados de adenovirus ofrecen un excelente potencial para la sustitución de fragmentos grandes de ADN cuando se utilizan junto con líneas celulares tales como las células 293. Se han desarrollado líneas celulares de riñón embrionario humano transformadas con Ad5 para proporcionar las proteínas víricas esenciales en trans. Los inventores razonaron por tanto que las características de los adenovirus los convertían en buenos candidatos para ser utilizados en la vectorización hacia células deficientes en Math1 in vivo. En otra realización, estas construcciones incluyen una secuencia de ácido nucleico de Hath1 o cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
Las ventajas particulares de un sistema de adenovirus para administrar proteínas foráneas a una célula incluyen: (i) la capacidad para sustituir fragmentos relativamente grandes de ADN vírico por ADN foráneo; (ii) la estabilidad estructural de los adenovirus recombinantes; (iii) la seguridad de la administración de adenovirus a humanos; (iv) la falta de cualquier asociación conocida de la infección adenovírica con el cáncer o con enfermedades malignas; (v) la capacidad para obtener títulos elevados del virus recombinante y (vi) la elevada infectividad de los adenovirus.
Una ventaja de los vectores adenovíricos sobre los retrovíricos es un nivel más elevado de expresión génica. Adicionalmente, la replicación de los adenovirus es independiente de la replicación de los genes del huésped, a diferencia de las secuencias retrovíricas. Como los genes transformantes de la región E1 de adenovirus pueden ser fácilmente eliminados y continúan proporcionando vectores de expresión eficaces, se cree que el riesgo oncogénico de los vectores adenovíricos es despreciable.
En general, los sistemas de transferencia de genes adenovíricos están basados en adenovirus recombinantes: adenovirus manipulados que son convertidos en incompetentes para la replicación por la deleción de una porción de su genoma, tal como E1, y que todavía conservan su competencia para la infección. Proteínas foráneas relativamente grandes pueden ser expresadas cuando se realizan deleciones adicionales en el genoma adenovírico. Por ejemplo, adenovirus con deleciones en las regiones E1 y E3 son capaces de llevar hasta 10 kb de ADN foráneo y pueden ser cultivados hasta títulos elevados en células 293. Sorprendentemente, es posible la expresión duradera de transgenes después de la infección adenovírica. La utilización del sistema de transferencia de genes adenovírico puede ser más útil para la administración de Math1 a células del cartílago naciente o dañado de las articulaciones. En particular, el adenovirus con Math1 puede ser utilizado para suministrar Math1 a, y conferir la expresión del gen Math1 a, cartílago articular no osificado que haya sido dañado como consecuencia de la osteoartritis.
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Ejemplo 15
Construcciones de Math1-Adenovirus
Pueden construirse viriones recombinantes para la expresión controlada de Math1 con el fin de aprovechar las ventajas de los vectores adenovíricos tales como un título elevado, un amplio rango de dianas, una transducción eficaz y la no integración en las células diana para la transformación de células en células pilosas. En una realización, estas construcciones incluyen una secuencia de ácido nucleico de Hath1 o cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. En una realización de la invención, se crea un adenovirus independiente del cooperador, defectuoso en replicación, que expresa secuencias de Math1 de tipo salvaje bajo el control del promotor de citomegalovirus humano o del promotor de metalotionina.
Las funciones de control sobre los vectores de expresión son proporcionadas a menudo por virus cuando se desea la expresión en células de mamífero. Por ejemplo, promotores comúnmente utilizados derivan de polioma, adenovirus 2 y virus 40 de simio (SV40). Los promotores temprano y tardío del virus SV40 son particularmente útiles, ya que ambos son obtenidos fácilmente a partir del virus como un fragmento que contiene también el origen de replicación vírico de SV40. Pueden utilizarse también fragmentos de SV40 más pequeños o más grandes siempre que esté incluida la secuencia de 250 pb aproximadamente que se extiende desde el sitio de HindIII hacia el sitio de BglI situado en el origen de replicación vírico. Además, es también posible, y a menudo deseable, utilizar secuencias promotoras o de control asociadas normalmente con la secuencia del gen Math1, concretamente el promotor de Math1, siempre que tales secuencias de control sean compatibles con los sistemas de la célula huésped o de la célula diana. Una de tales células diana está situada en el oído interno de un paciente humano con necesidad de células pilosas del oído
interno.
Un origen de replicación puede ser proporcionado por la construcción del vector para que incluya un origen exógeno, que puede derivar de SV40 o de otra fuente vírica (por ejemplo, polioma, adeno, VSV, VPB), o puede ser proporcionado por el mecanismo de replicación cromosómica de la célula huésped. Si el vector está integrado en el cromosoma de la célula huésped, este último es a menudo suficiente.
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Ejemplo 16
Administración de un Ácido Nucleico Asociado con Atonal Utilizando Retrovirus
Otro procedimiento para la administración de genes aprovecha la capacidad natural de los virus para penetrar en las células, llevando con ellos su propio material genético. Los retrovirus son prometedores como vectores para la administración de genes debido a su capacidad para integrar sus genes en el genoma del huésped, transfiriendo una gran cantidad de material genético foráneo, infectando un amplio espectro de especies y tipos celulares, y debido a que son fácilmente empaquetados en líneas celulares especiales. Los retrovirus pueden ser particularmente útiles para la administración de Math1 a las células pilosas del oído interno que tengan una expresión reducida de Math1, o que tengan necesidad de una sobreexpresión de Math1.
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Ejemplo 17
Construcciones Retrovíricas con Math1
El marco de lectura abierto (ORF) de Math1 fue cortado de pBluescript mediante digestión con EcoRI-XbaI. El fragmento fue purifica en gel y se hizo de extremos romos utilizando ADN polimerasa Klenow. El vector retrovírico pLNCX (adquirido a CLONTECH) fue linealizado con HpaI y ligado en el fragmento del ORF de Math1. La ligadura fue transformada en células de E. coli competentes para la transformación. Las colonias resistentes a antibiótico resultantes fueron analizadas para determinar la presencia de la construcción correcta.
El clonaje, la reproducción y la propagación de vectores de expresión retrovíricos son conocidos por los expertos en la técnica. Un ejemplo de transferencia génica y de un sistema de expresión retrovíricos que ha sido utilizado para expresar Math1 está constituido por los vectores de expresión pLNCX, pLXSN y LAPSN de CLONTECH. Para la propagación de estos vectores pueden utilizarse las líneas celulares de empaquetamiento PT67 y EcoPack. Para más información sobre el cultivo de células de mamífero, pueden utilizarse las referencias generales siguientes: Culture of Animal Cells, Tercera Edición, editado por R.I. Freshney (Wiley-Liss, 1993); y Current Protocols in Molecular Biology, ed. por F.M. Ausubel y col. (Greene Publishing Associates and Wiley & Sons, 1994), porciones relevantes de las cuales son incorporadas a la presente por referencia.
En otra realización, estas construcciones podrían ser construidas con una secuencia de ácido nucleico de Hath1 o con cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal.
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Ejemplo 18
Mantenimiento de Líneas Celulares de Empaquetamiento
Se describe brevemente el mantenimiento de líneas celulares de empaquetamiento, tales como las líneas celulares de empaquetamiento 293 y PT67. Un vial de células congeladas es transferido desde N_{2} líquido a un baño de agua a 37ºC hasta que se descongela. Con el fin de evitar el choque osmótico a las células y para maximizar la supervivencia celular, se añade al tubo 1 ml de DMEM (Medio de Eagle Modificado de Dulbecco) y se transfiere la mezcla a un tubo de 15 ml. Se añaden otros 5 ml de DMEM y se mezclan las células. Después de repetir estas etapas, el volumen final en el tubo debe ser de 12 ml aproximadamente. A continuación, las células son centrifugadas a 500 x g durante 10 minutos. Finalmente, el sobrenadante es retirado y las células son resuspendidas en medio de mantenimiento según se describe en la etapa siguiente. De forma general, las células son mantenidas en DMEM (con alta concentración de glucosa: 4,5 g/l) conteniendo un 10% de Suero Bovino Fetal (FBS) y L-glutamina 4 mM. Si se desea, o si es necesario, pueden añadirse 100 U/ml de penicilina/100 \mug/ml de estreptomicina. Se recomienda que sean sembradas a 3-5 x 10^{5} por placa de 100 mm y pasadas cada 2 ó 3 días, cuando alcanzan un 70-80% de confluencia (la confluencia es de 3-4 x 10^{6} por placa de 100 mm). La línea celular PT67, por ejemplo, tiene un tiempo de duplicación muy corto (<16 horas) y debe ser pasada antes de que las células sean confluentes. El tiempo de duplicación de las células EcoPack-293 es de 24-36 horas.
Las células son pasadas eliminando el medio y lavando las mismas una vez con PBS. Después del tratamiento con 1-2 ml de una solución de tripsina-EDTA durante 0,5-1 minuto, se añaden de 5 a 10 ml de medio y suero para detener la tripsinización. Las células son dispersadas suavemente, pero exhaustivamente, mediante pipeteo y son resuspendidas. Alternativamente, una porción predeterminada de las células es sembrada de nuevo en una placa de 100 mm en ml de medio, seguido por rotación o agitación de la placa para distribuir las células uniformemente. Es habitual una proporción de hasta 1:20 para las células PT67 o EcoPack-293.
En general, el porcentaje de células PT67 o EcoPack-293 capaz de empaquetar vectores retrovíricos disminuye lentamente con los pases continuados de la línea celular. Por tanto, las células de empaquetamiento deben ser seleccionadas de nuevo después de 2 meses de crecimiento en cultivo. Alternativamente, pueden adquirirse células nuevas con un título elevado a, por ejemplo, CLONTECH, o soluciones madre con un bajo número de pases pueden ser congeladas, almacenadas y descongeladas para incrementar el rendimiento de virus.
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Ejemplo 19
Métodos de Utilización de un Vector Retrovírico
El protocolo siguiente es utilizado para transfectar el vector retrovírico para la producción de virus, la infección de células diana y la selección de clones estables. Otros métodos y vectores pueden ser también utilizados con la presente invención para expresar Math1, tales como los descritos en Retroviruses, ed. por J.M. Coffin & H.E. Varmus (1996, Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY) y Current Protocols in Molecular Biology, ed. por F.M. Ausubel y col. (1994, Greene Publishing Associates and Wiley & Sons), que se incorporan a la presente por referencia.
Brevemente, la transfección del vector retrovírico en células PT67 fue según sigue. Se clonó Math1 en pLNX según se describió anteriormente en la presente. Las células de empaquetamiento fueron sembradas a una densidad de 5-7 x 10^{5} células por placa de 100 mm, 12-24 horas antes de la transfección. Una-dos horas antes de la transfección, el medio fue sustituido por medio nuevo. Puede añadirse cloroquina 25 \muM justo antes de la transfección. La cloroquina aumenta la eficacia de la transfección 2-3 veces. Puede prepararse una solución madre de cloroquina 25 mM en agua destilada y esterilizarse por filtración.
Cada placa de 100 mm es transfectada con 10-15 \mug de ADN plasmídico utilizando el método deseado, empleando, por ejemplo, procedimientos estándar con fosfato de calcio (Kit de transfección "CalPhos Mammalian Transfection Kit", #K2050-1). El volumen final de la mezcla de transfección no debe ser superior a 1 ml. La solución de transfección es añadida al medio y la placa es rotada para asegurar una distribución uniforme. Alrededor de 8 horas después de la transfección, puede realizarse un tratamiento de choque con glicerol para aumentar la captación de ADN. De 10 a 24 horas después de la transfección, el medio fue retirado y las células fueron lavadas dos veces con PBS, antes de añadir 5 ml de DMEM conteniendo un 10% de FBS. El cultivo fue incubado durante 12-48 horas adicionales para permitir el incremento del título de virus. El título de virus alcanza un máximo de 48 horas después de la transfección y es generalmente al menos un 30% del máximo entre las 24 y 72 horas después de la transfección.
Alternativamente, pueden seleccionarse también líneas celulares productoras de virus estables. Para obtener líneas celulares productoras de virus estables, las células de empaquetamiento transfectadas son sembradas en un medio de selección 2-3 días después de la transfección. Para la selección con G418 de células resistentes a neomicina, las células son seleccionadas en presencia de G418 (0,5 mg/ml "activo") durante una semana. Pueden utilizarse también vectores portadores de otros marcadores seleccionables, tales como Puro, Bleo o Hyg, para obtener poblaciones de células productoras de virus estables. Son comunes poblaciones celulares productoras de viriones que producen títulos de 10^{5}-10^{6} partículas de virus recombinantes por ml. En general, 10^{5}-10^{6} partículas de virus recombinantes por ml son adecuadas para la mayoría de los fines. Para algunos estudios pueden requerirse títulos de clones más elevados. En este caso, después de la selección con el antibiótico, se seleccionan clones individuales utilizando, por ejemplo, cilindros para clones o la dilución limitante, antes de la propagación. El título vírico puede ser determinado de una variedad de formas; uno de tales métodos se describe en la presente a continuación. El título vírico producido por líneas celulares de empaquetamiento productoras de virus estables o transfectadas de manera transitoria es determinado según sigue. Células NIH/3T3 son sembradas un día antes de comenzar el procedimiento de titulación. Las células son sembradas en placas de 6 pocillos a una densidad de 5 x 10^{4}-1 x 10^{5} células por pocillo y se añaden 4 ml de medio por pocillo. El medio conteniendo virus es recogido de las células de empaquetamiento y se añade polibreno a una concentración final de 4 \mug/ml. El medio es esterilizado por filtración a través de un filtro de 0,45 \mum. El polibreno es un policatión que reduce la repulsión de cargas entre el virus y la membrana celular. El filtro debe ser de acetato de celulosa o polisulfónico (baja unión de proteínas) pero no de nitrocelulosa. La nitrocelulosa se une a las proteínas de la membrana retrovírica y por consiguiente destruye el virus. Se preparan diluciones seriadas según sigue: normalmente son suficientes seis diluciones seriadas de 10 veces. Para diluir el virus, utilizar medio fresco conteniendo 4 \mug/ml de polibreno. A continuación, las células diana NIH/3T3 son infectadas mediante la adición a los pocillos de medio conteniendo virus. Después de 48 horas, las células NIH/3T3 son teñidas. El título de virus corresponde al número de colonias presentes a la mayor dilución que contiene colonias, multiplicado por el factor de dilución. Por ejemplo, la presencia de cuatro colonias en la dilución 10^{5} representaría un título vírico de 4 x 10^{5}.
Para la infección de las células, se siguió el procedimiento siguiente. Las células diana fueron sembradas 12-18 horas antes de la infección a una densidad celular de 3-5 x 10^{5} por placa de 100 mm. Para la infección de células que pueden ser utilizadas en un ensayo biológico, las células control pueden ser tratadas con un virus sin inserto producido bajo condiciones idénticas. La infección semimáxima tiene lugar generalmente después de 5-6 horas de exposición de las células al virus, teniendo lugar la infección máxima después de 24 de exposición aproximadamente. La transcripción inversa y la integración del retrovirus reales tienen lugar en las 24-36 horas de infección, dependiendo de la cinética de crecimiento de las células. Puede observarse expresión a las 24 horas, y alcanza un máximo a las 48 horas aproximadamente. Alternativamente, las infecciones pueden ser llevadas a cabo de manera secuencial, separadas 12 horas aproximadamente. La infección secuencial aumenta generalmente la eficacia de la infección y también incrementa el número de copias de virus. Se recomienda un mínimo de 12 horas entre cada infección con el fin de asegurar que los receptores celulares no estén ocupados por la envoltura del virus.
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Ejemplo 20
Ensayos de Selección
Finalmente, la presente invención proporciona también métodos para la selección de sustancias candidato que están basados en ensayos de células completas, en análisis in vivo y en líneas celulares transformadas o inmortales en las cuales se emplea un gen informador para conferir a sus huéspedes recombinantes un fenotipo fácilmente detectable que aparezca únicamente bajo condiciones en las cuales se expresaría, se subexpresaría o se sobreexpresaría Math1. En general, los genes informadores codifican un polipéptido no producido de otro modo por la célula huésped que es detectable mediante análisis, por ejemplo mediante un análisis cromogénico, flurométrico, radioisotópico o espectrofotométrico. En la presente invención, el gen Math1 ha sido sustituido por \beta-galactosidasa en un ratón.
Se presenta aquí un ejemplo de un ensayo de selección de la presente invención. Células que expresan Math1 son cultivadas en pocillos de microvaloración, seguido por la adición de proporciones molares seriadas de la molécula candidato pequeña a una serie de pocillos, y la determinación del nivel de la señal después de un periodo de incubación que sea suficiente para demostrar, por ejemplo, la expresión de calretinina en controles incubados únicamente con el vehículo utilizado para resuspender o disolver el compuesto. Los pocillos que contienen proporciones variables del candidato son posteriormente evaluados para detectar la activación de la señal. Los candidatos que demuestren un incremento relacionado con la dosis de la transcripción o de la expresión del gen informador, son posteriormente seleccionados para una evaluación adicional como agentes terapéuticos clínicos. Puede observarse estimulación de la transcripción en ausencia de Math1 expresado, en cuyo caso el compuesto candidato podría ser un estimulante positivo de la diferenciación de las células pilosas. Alternativamente, el compuesto candidato podría proporcionar estimulación únicamente en presencia de bajos niveles de Math1, lo cual sugeriría que el mismo funciona estabilizando la formación de dímeros de Math1 o la interacción de Math1 con uno o más factores de transcripción. Compuestos candidato de cualquiera de las clases podrían ser agentes terapéuticos útiles que estimularían la producción de células pilosas del oído interno y satisfarían de este modo la necesidad de pacientes con pérdida auditiva o con deterioro del control del equilibrio.
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Ejemplo 21
Transfección de Células con Vectores Retrovíricos Conteniendo Math1
La presente invención proporciona células huésped recombinantes transformadas o transfectadas con un polinucleótido que codifica Math1, así como células transgénicas derivadas de esas células transformadas o transfectadas. En otra realización, estas construcciones podrían ser construidas con una secuencia de ácido nucleico de Hath1 o con cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. Una célula huésped recombinante de la presente invención es transfectada con un polinucleótido que contiene una secuencia de ácido nucleico de Math1 funcional o un gen Math1 quimérico. Los métodos para transformar o transfectar células con polinucleótidos exógenos, tales como moléculas de ADN, son bien conocidos en el oficio e incluyen técnicas tales como la transfección mediada por fosfato de calcio o por DEAE-dextrano, la fusión de protoplastos, la electroporación, la transfección mediada por liposomas, la microinyección directa y la infección con adenovirus.
La expresión de Math1 utilizando construcciones recombinantes puede ser utilizada para dirigir la administración de Math1 a células que tengan necesidad de ello. Una persona con experiencia en esta técnica puede elegir diferentes combinaciones de promotor-vector para dirigir la expresión de Math1 en diferentes tipos celulares. En algunos casos, el resultado deseado podría no ser una proteína sino ARN, y los vectores recombinantes incluirían aquéllos con insertos presentes en orientación directa o inversa. Además, pueden diseñarse algunos vectores, por ejemplo retrovirus o sistemas de recombinación artificiales, con el fin de incorporar secuencias a un genoma celular o vírico para conseguir la expresión constitutiva o inducible de una proteína o de ARN.
Muchos de los vectores y huéspedes están disponibles comercialmente y tienen características específicas que facilitan la expresión o la purificación posterior. Por ejemplo, secuencias de ADN que van a ser expresadas como proteínas aparecen a menudo como una fusión con secuencias no relacionadas que codifican marcas de polihistidina o HA, FLAG, myc y otras marcas epitópicas para la purificación y la detección inmunoquímicas, o sitios de fosforilación, o sitios de reconocimiento de proteasas o dominios proteicos adicionales tales como glutation S-transferasa (GST), proteína de unión a maltosa (MBP) (New England Biolabs), etcétera, que facilitan la purificación. Pueden diseñarse también vectores que contengan elementos para poliadenilación, ayuste y terminación, de tal manera que la incorporación de secuencias de ADN genómico existentes de forma natural que contengan intrones y exones pueda ser producida y procesada, o de tal manera que intrones y otras señales reguladoras no relacionados requieran el procesamiento del ARN antes de la producción de ARNs maduros, traducibles. Las proteínas producidas en los sistemas anteriormente descritos son sometidas a una variedad de modificaciones post-traduccionales tales como glucosilación, fosforilación, proteolisis o procesamiento específicos o no específicos.
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Ejemplo 22
Administración de Math1 como una Secuencia de Aminoácidos
Se ha descrito recientemente un péptido (11 aminoácidos) derivado del VIH que cuando es fusionado a proteínas de longitud completa e inyectado a ratones, permite una dispersión rápida hacia el núcleo de todas las células del organismo (Schwarze y col., 1999). Schwarze y col. produjeron proteínas de fusión con Tat que variaban en tamaño de 15 a 120 kDa. Ellos documentaron una captación rápida de las proteínas de fusión por los núcleos de las células de todo el animal y la conservación de la actividad funcional de dichas proteínas.
En una realización de la presente invención, hay construcciones que contienen la secuencia de ácido nucleico de Tat o de Tat-HA unida operativamente a la secuencia de ácido nucleico de Math1. En otra realización, estas construcciones incluyen una secuencia de ácido nucleico de Hath1 o cualquier secuencia de ácido nucleico asociada con atonal. Los vectores son expresados en cultivos bacterianos y la proteína de fusión es purificada. Esta proteína Tat-Math1 purificada o la proteína Tat-Hath1 purificada es inyectada al animal para determinar la eficacia del sistema de administración de Tat al oído interno, la piel, el cerebelo, el tronco cerebral, la médula espinal y las articulaciones. Se lleva a cabo un análisis para determinar el potencial de la proteína Tat-Math1/Tat-Hath1 en la regeneración de las células pilosas y en la regeneración neuronal. Éste es un procedimiento terapéutico viable, por derecho propio o en asociación con otros métodos o genes.
Debe comprenderse que los métodos para la selección de compuestos que afectan a la expresión de Math1 descritos en la presente, son útiles a pesar de que no puedan encontrarse candidatos eficaces, ya que tiene utilidad práctica para conocer qué efector corriente arriba es necesario para la transcripción de Math1.
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Patentes
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Patente de EE.UU. Nº 5.843.640, publicada el 1 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.843.650, publicada el 1 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.843.651, publicada el 1 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.843.663, publicada el 1 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.708, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.709, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.717, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.726, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.729, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.846.783, publicada el 8 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.481, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.483, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.486, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.487, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.497, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.546, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.849.547, publicada el 15 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.851.770, publicada el 22 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.851.772, publicada el 22 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.853.990, publicada el 29 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.853.993, publicada el 29 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.853.992, publicada el 29 de Diciembre de 1998.
Patente de EE.UU. Nº 5.856.092, publicada el 5 de Enero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.858.652, publicada el 12 de Enero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.861.244, publicada el 19 de Enero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.863.732, publicada el 26 de Enero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.863.753, publicada el 26 de Enero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.866.331, publicada el 2 de Febrero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.866.336, publicada el 2 de Febrero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.866.337, publicada el 2 de Febrero de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.900.481, publicada el 4 de Mayo de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.905.024, publicada el 18 de Mayo de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.910.407, publicada el 8 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.912.124, publicada el 15 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.912.145, publicada el 15 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.912.148, publicada el 15 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.916.776, publicada el 29 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.916.779, publicada el 29 de Junio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.919.626, publicada el 6 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.919.630, publicada el 6 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.922.574, publicada el 13 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.925.517, publicada el 20 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.925.525, publicada el 20 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.928.862, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.928.869, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.928.870, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.928.905, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.928.906, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.929.227, publicada el 27 de Julio de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.932.413, publicada el 3 de Agosto de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.932.451, publicada el 3 de Agosto de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.935.791, publicada el 10 de Agosto de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.935.825, publicada el 10 de Agosto de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.939.291, publicada el 17 de Agosto de 1999.
Patente de EE.UU. Nº 5.942.391, publicada el 24 de Agosto de 1999.
Solicitud Europea Nº 320 308.
Solicitud Europea Nº 329 822.
Solicitud del R.U. Nº 2 202 328.
Solicitud PCT Nº PCT/US87/00880.
Solicitud PCT Nº PCT/US89/01025.
Solicitud PCT WO 88/10315.
Solicitud PCT WO 89/06700.
Solicitud PCT WO 90/07641.
Una persona experta en la técnica apreciará fácilmente que la presente invención está bien adaptada para llevar a cabo los objetivos y obtener los fines y ventajas mencionados así como aquéllos inherentes a la misma. Las secuencias, mutaciones, complejos, métodos, tratamientos, composiciones farmacéuticas, procedimientos y técnicas descritos en la presente son actualmente representativos de las realizaciones preferidas y tienen la intención de ser ejemplares y no están destinados a ser limitaciones de su alcance.

Claims (26)

1. Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para estimular el crecimiento terapéutico de las células mecanorreceptoras del oído interno en un animal, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
2. Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la generación terapéutica de células pilosas del oído interno, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
3. Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con deterioro auditivo, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
4. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de la reivindicación 2 ó 3 que es formulada para inyección en el oído de dicho animal.
5. Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con un trastorno del equilibrio, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
6. Una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para el tratamiento de un animal con una enfermedad de las articulaciones, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
7. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de la reivindicación 6 en la que dicha enfermedad de las articulaciones es osteoartritis.
8. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, que es formulada para ser administrada mediante un vehículo para la administración.
9. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de la reivindicación 8, donde dicho vehículo para la administración es seleccionado de un vector adenovírico, un vector retrovírico, un vector vírico adenoasociado, un plásmido, un liposoma, un ácido nucleico, un péptido, un lípido, un carbohidrato y una combinación de los mismos.
10. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de la reivindicación 8, en la que dicho vehículo para la administración es un vector vírico o un vector no vírico.
11. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de la reivindicación 8, en la que dicho vehículo para la administración es una célula.
12. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, que es la secuencia de aminoácidos o la secuencia de ácido nucleico de Math1 o Hath1.
13. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, donde dicho animal es un humano.
14. La secuencia de aminoácidos o de ácido nucleico de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13, la cual está destinada para ser administrada después, antes o al mismo tiempo que la administración de una segunda secuencia de ácido nucleico que codifica otro producto génico terapéutico.
15. Una composición que contiene una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal en combinación con un vector vírico como vehículo para la administración, donde dicho vehículo para la administración tiene como resultado la administración de una cantidad terapéuticamente eficaz de dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal o de dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal a una célula, y donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal es, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que contiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMH-
GLNHAFDQLR.
16. La composición de la reivindicación 15, en la que dicho vehículo para la administración es seleccionado de un vector adenovírico, un vector retrovírico, un vector adenoasociado o una combinación de los mismos.
\newpage
17. Una composición que contiene:
(a)
una secuencia de aminoácidos asociada con atonal en combinación con un vehículo para la administración, conteniendo dicho vehículo para la administración un dominio de unión al receptor de una toxina bacteriana o un dominio de transducción de una proteína, y donde dicho vehículo para la administración tiene como resultado la administración de una cantidad terapéuticamente eficaz de dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal a una célula, y donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal es un polipéptido que contiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR; o
(b)
una secuencia de ácido nucleico que codifica dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal y dicho vehículo para la administración.
18. La composición de la reivindicación 17, en la que una secuencia de ácido nucleico que codifica dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal está unida operativamente a una secuencia de ácido nucleico que codifica un dominio de unión al receptor de una toxina bacteriana.
19. La composición de la reivindicación 17, en la que una secuencia de ácido nucleico que codifica dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal está unida operativamente a una secuencia de ácido nucleico que codifica un dominio de transducción de una proteína.
20. Una proteína de fusión que comprende una secuencia de aminoácidos asociada con atonal o un fragmento de la misma y una secuencia de aminoácidos deseada, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal es una secuencia de aminoácidos que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
21. Una secuencia de ácido nucleico que codifica la proteína de fusión de la reivindicación 20.
22. Utilización de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la fabricación de un medicamento para estimular el crecimiento terapéutico de las células mecanorreceptoras del oído interno de un animal, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
23. Utilización de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la fabricación de un medicamento para la generación terapéutica de células pilosas del oído interno, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
24. Utilización de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la fabricación de un medicamento para tratar a un animal del deterioro auditivo, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
25. Utilización de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la fabricación de un medicamento para tratar a un animal de un trastorno del equilibrio, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
26. Utilización de una secuencia de aminoácidos o de una secuencia de ácido nucleico asociada con atonal para la fabricación de un medicamento para tratar a un animal de una enfermedad de las articulaciones, donde dicha secuencia de aminoácidos asociada con atonal tiene, o dicha secuencia de ácido nucleico asociada con atonal codifica, un polipéptido que tiene al menos un 80% de identidad con la secuencia AANARERRRMHGLNHAFDQLR.
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