ES2344943T3 - Determinacion simultanea de la actividad inhibitoria de la proliferacion celular y la toxicidad utilizando citometria de flujo. - Google Patents

Determinacion simultanea de la actividad inhibitoria de la proliferacion celular y la toxicidad utilizando citometria de flujo. Download PDF

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Abstract

Un método para la determinación simultánea de actividad inhibitoria de la proliferación celular y de toxicidad celular de un compuesto químico de bajo peso molecular utilizando una muestra de células de mamífero en proliferación como sistema control, que se caracteriza por a) tratar dicha muestra de células que es una suspensión celular o células adherentes en un volumen predeterminado con dicho compuesto en al menos dos concentraciones predeterminadas diferentes; b) tratar dicha muestra de células con un primera tinción de colorante fluorescente específica de las células muertas o de las viables, y opcionalmente con una segunda tinción de colorante fluorescente de todas las células; c) añadir a dicha muestra de células una cantidad predeterminada de partículas de látex con un tamaño que oscila entre alrededor de 1 y alrededor de 20 μm a dicho volumen y opcionalmente teñir dichas partículas de látex con un tercer colorante fluorescente; d) determinar la proporción entre la cantidad de células totales y la cantidad de partículas de látex en dicha muestra; e) determinar, con los resultados del paso d) y mediante un análisis de citometría de flujo en dicha muestra, el número de células muertas o viables mediante la luz fluorescente emitida por dicho primer colorante fluorescente a una primera longitud de onda, el número de células totales por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un primer ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho segundo colorante fluorescente a una segunda longitud de onda, el número de partículas de látex por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un segundo ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho tercer colorante fluorescente a una tercera longitud de onda; f) y determinar con los resultados de los pasos d) y e) la actividad sobre la proliferación celular y la toxicidad de dicho compuesto.

Description

Determinación simultánea de la actividad inhibitoria de la proliferación celular y la toxicidad utilizando citometría de flujo.
La invención proporciona un método para la determinación simultánea de la actividad inhibitoria de la proliferación celular y la toxicidad de una sustancia que puede realizarse mientras se realiza un cribado de la actividad de tal sustancia en la inhibición de la proliferación.
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Antecedentes de la invención
La identificación de sustancias que son potentes inhibidores de la proliferación es de gran importancia en el descubrimiento de fármacos, especialmente en el área de la oncología. Existe una variedad de ensayos in vitro basados en células para la investigación de los efectos antiproliferativos de tales sustancias candidatas. Ejemplos de tales ensayos son, por ejemplo, el ensayo colorimétrico MTT, el ensayo de captación de timidina [^{3}H], y el ensayo WST (Johnston, P., en: Cellular Assays in HTS, Methods in Molecular Biology, Vol. 110, Janzen W.P. (Ed.), Humana Press, NJ, págs. 107-116; Bellamy, W.T., Drugs 44 (1992) 690-708). Respecto al desarrollo de fármacos, es necesario que tales ensayos puedan utilizarse en un cribado de alta eficiencia de un gran número de potenciales fármacos candidatos.
Para la determinación del estado de proliferación de las células hematopoyéticas, normalmente se pone en contacto la población celular con la sustancia en investigación y un reactivo capaz de generar luminiscencia en presencia de ATP y se detecta la luminiscencia como medida del estado de proliferación (US 2002/0146680). En la patente estadounidense Nº 5.972.639 se describe un ensayo para determinar el número de células en un cultivo celular mediante una medida de fluorescencia.
Sin embargo, tales ensayos son costosos en tiempo, proporcionan sólo resultados limitados, y no discriminan entre la inhibición de la proliferación y la inducción de muerte celular.
Por lo tanto, existe la necesidad de un ensayo que permita la determinación de la influencia de una sustancia sobre la proliferación y sobre la inducción de muerte celular de forma simple y simultánea. Además, existe la necesidad de que tales ensayos puedan realizarse de forma automática.
Chandrasekaran et al. (1995. Canc Chemother Pharmacol, 35, 489-495) describen la determinación mediante citometría de flujo del efecto citostático y citotóxico de la 3'-azido-3'-desoxitimidina. La distinción entre la citostasis y la citotoxicidad se realiza mediante experimentos adicionales que involucran entre otros la de incorporación BdRD. Dos muestras separadas se procesan separadamente.
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Resumen de la invención
La invención proporciona un método para la determinación simultánea de la actividad inhibitoria de la proliferación celular y de la toxicidad celular (inducción de muerte celular) de un compuesto químico de bajo peso molecular utilizando una muestra de células de mamífero en proliferación como sistema control, que se caracteriza por
a) tratar dicha muestra de células que es una suspensión celular o células adherentes en un volumen predeterminado con dicho compuesto en al menos dos concentraciones predeterminadas diferentes;
b) tratar dicha muestra de células con un primera tinción de colorante fluorescente específicamente de las células muertas o de las viables, y opcionalmente con una segunda tinción de colorante fluorescente de todas las células;
c) añadir a dicha muestra de células una cantidad predeterminada de partículas de látex con un tamaño que oscila entre alrededor de 1 y alrededor de 20 \mum a dicho volumen y opcionalmente teñir dichas partículas de látex con un tercer colorante fluorescente;
d) determinar la proporción entre la cantidad de células totales y la cantidad de partículas de látex en dicha muestra;
e) determinar, con los resultados del paso d) y mediante un análisis de citometría de flujo en dicha muestra, el número de células muertas o viables por la luz fluorescente emitida por dicho primer colorante fluorescente a una primera longitud de onda, el número de células totales por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un primer ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho segundo colorante fluorescente a una segunda longitud de onda, el número de partículas de látex por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un segundo ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho tercer colorante fluorescente a una tercera longitud de onda;
f) y determinar con los resultados de los pasos d) y e) la actividad sobre la proliferación celular y la toxicidad de dicho compuesto.
En una realización preferible de la invención, las células muertas están teñidas específicamente con un colorante fluorescente y el número de partículas de látex y de células se mide mediante la diferencia entre luz dispersada lateral y luz dispersada hacia delante.
En una realización más preferible de la invención, las células son células progenitoras CD34+ humanas.
En una realización preferible de la invención, el método se realiza en al menos cinco concentraciones diferentes de dicha sustancia en investigación, lo que preferiblemente permite el cálculo de los valores CI_{50} de la proliferación y de inducción de muerte celular. Preferiblemente, el rango de concentración está entre un factor de alrededor de 1 y 10.000.
Tras el tratamiento de las células con la sustancia en investigación, las células se cultivan bajo condiciones estándar que permitirían la proliferación celular. En una realización preferible de la invención, las células se cultivan en paralelo en múltiples dispositivos, preferiblemente en placas microtituladas multipocillo. Además, también se añaden las sustancias en investigación a estos dispositivos en las diferentes concentraciones, preferiblemente mediante métodos de dispensación automática.
Descripción detallada de la invención
Un crecimiento celular retrasado durante el cultivo de células en presencia de una sustancia que se sospecha es un inhibidor celular puede estar causado por muerte celular y/o inhibición de la proliferación celular. Por lo tanto, a partir de una mera determinación de la cantidad de células tras el cultivo no es posible concluir directamente la toxicidad y/o la actividad inhibitoria de la sustancia. Es necesario conocer las cantidades de células viable y muertas y su proporción respecto de la cantidad de células totales para llegar a tal conclusión. La invención proporciona un método para la determinación simultánea de estos parámetros de forma rápida. Además, el método de acuerdo con la invención puede realizarse de forma automática y por lo tanto permite una investigación a gran escala de la toxicidad y actividad inhibitoria de la proliferación de las sustancias.
De acuerdo con la invención, una alícuota definida (predeterminada) de partículas de látex se añade a cada dispositivo de cultivo celular. En base al contaje de las partículas de látex durante el análisis de citometría de flujo, puede estimarse el volumen de líquido en el que se realiza todo el contaje. Por lo tanto, la invención proporciona un método para la determinación simultánea de la cantidad de células totales por unidad de volumen (lo que es una medida de la proliferación celular) y de la cantidad de células viables por unidad de volumen tras el cultivo en presencia de una sustancia que se sospecha es un inhibidor de la proliferación y/o que es toxico para las células del sistema control. La comparación de la cantidad de células totales con la cantidad de células muertas o células viables para diferentes concentraciones de la sustancia proporciona información sobre la relación entre la inhibición de la proliferación celular y la toxicidad de la sustancia. Esto puede deducirse inmediatamente de la Fig. 3. Si el porcentaje de células muertas respecto a las células totales aumenta significativamente mientras el número de células totales disminuye, esto indica una elevada toxicidad de la sustancia. Sin embargo, si el porcentaje de células muertas respecto a las células totales no aumenta significativamente al aumentar la concentración de sustancia mientras el número de células totales disminuye, entonces la sustancia muestra una baja toxicidad. Ejemplos de sustancias con una elevada toxicidad se muestran en la Fig. 3. El 5-fluorouracilo y la doxorubicina son sustancias que muestran toxicidad en paralelo a una significativa inhibición de la proliferación. Para el 5-fluorouracilo el porcentaje de células muertas respecto a las células totales está en el rango entre el 0 y el 25% para el rango de concentración de la sustancia en la que la inhibición de la proliferación se encuentra en más del 50%. Para la doxorubicina el porcentaje de células muertas aumenta con la concentración de sustancia hasta un 40% e incluso superior mientras la inhibición de la proliferación es de alrededor del 80%.
El proceso de cultivo de las células en proliferación, por ejemplo las células CD34, se realiza como se describe a continuación. Previamente al análisis de FACS, se añaden a cada dispositivo de pocillos (preferiblemente placas microtituladas o similares) el colorante fluorescente para la tinción de células viables o muertas y un número concreto de cuentas de látex, para teñir las células viables o muertas y contar las partículas de látex como medida del volumen de medio de cultivo celular analizado, respectivamente. Tras añadir las sustancias en investigación y tras realizar el cultivo de células en los diferentes dispositivos, la placa microtitulada se sitúa en un instrumento de dispensación automática que introduce alícuotas de la muestra de células de cada pocillo en la cámara de flujo del FACS. Se analiza un número concreto de cuentas de látex (proporcionando así información sobre el volumen de medio analizado), se detiene la medida y el robot de dispensación toma alícuotas del siguiente pocillo y se inicia el análisis de nuevo como anteriormente.
El término "sustancias en investigación" son sustancias de las que se sospecha que poseen una actividad inhibitoria de la proliferación o actividad citotóxica. Estas sustancias son compuestos químicos de bajo peso molecular. Los compuestos se utilizan en al menos dos concentraciones diferentes, preferiblemente, sin embargo, en más concentraciones, por ejemplo en cinco concentraciones diferentes o más. La razón para ello es que en base a los resultados de tales concentraciones diferentes, es posible investigar la inhibición de la proliferación y la inducción de muerte celular dependientes de la concentración muy fácilmente y decidir si la sustancia induce una muerte celular considerable y/o inhibe la proliferación. Mediante la comparación de estos valores, especialmente mediante la comparación de la dependencia de la concentración en la proliferación y en la inducción de muerte celular, es posible identificar sustancias candidatas potenciales que muestran por ejemplo una fuerte inhibición de la proliferación sin una considerable inducción de muerte celular. Además, realizando el método de la invención a diferentes concentraciones permite calcular los valores de CI_{50} tanto para la proliferación ("actividad proliferativa") como para la inducción de muerte celular ("toxicidad"). Las concentraciones y el rango de concentraciones dependen de la potencia deseada de la sustancia en investigación y también del tipo de células utilizadas en la investigación. Normalmente, el rango de concentraciones está en el rango micromolar y entre alrededor de 0,01 \muM/ml y 100 \muM/ml.
El término "célula" como se utiliza aquí describe células de mamífero en proliferación que son útiles como sistema control en los ensayos de proliferación. Tales células son bien conocidas en el estado de la materia y son, por ejemplo, las células progenitoras CD34+ y células madre humanas, linfocitos, fibroblastos/queratinocitos normales, células endoteliales y epiteliales normales, células de mamífero transformadas artificiales, células leucémicas y células de tumor sólido. La proliferación de tales células puede inhibirse mediante inhibidores conocidos como el paclitaxel, la doxorubicina o el 5-fluorouracilo.
Normalmente, las células se siembran en dispositivos paralelos y se propagan en suspensión. Normalmente, y por ejemplo, si se utilizan placas microtituladas de 96 pocillos para el cultivo de células CD34, se siembran entre 100 y 400 células/200 \mul por pocillo y se propagan preferiblemente hasta que han alcanzado alrededor de 10.000 células/200 \mul por pocillo bajo condiciones estándar (sin la sustancia en investigación). Para el cultivo de las células, se utilizan medios de cultivo convencionales, preferiblemente con factores de crecimiento añadidos.
El término "partículas de látex" como se utiliza aquí describe tales partículas de látex y su amplia utilización en la calibración de fluidos en los instrumentos automáticos de contaje celular. Tales partículas de látex se describen, por ejemplo, en la Patente Estadounidense Nº 3.977.995. Tales partículas de látex normalmente constan de látex sintético fabricado a partir de un copolímero de poliestiren polivinil tolueno o estiren divinil benzeno. El tamaño de las partículas normalmente oscila entre 1 y alrededor de 20 \mum y las partículas se añaden a la suspensión celular en una cantidad de 10.000 partículas/200 \mul.
La medida de los parámetros para la determinación de acuerdo con la invención se realiza mediante un análisis de citometría de flujo en un aparato en el que puede medirse la fluorescencia a diferentes longitudes de onda y la luz dispersada en diferentes ángulos, y correlacionarse con la cantidad de células que proporcionan tales señales. Los parámetros se determinan mientras las células de una muestra fluyen a través del instrumento analítico ya sea en paralelo o un parámetro inmediatamente tras otro (determinación simultánea). Preferiblemente, tal determinación se realiza mediante la utilización de un instrumento de análisis de FACS. La luz dispersada es mide en diferentes ángulos, preferiblemente como luz dispersada hacia delante (FSC) (ángulo máximo de la luz dispersada hasta 20º, preferiblemente inferior) y como luz dispersada lateral (SSC) (ángulo alrededor de 90º). Como el tamaño de las células y las partículas de látex puede no diferir considerablemente, su comportamiento en relación a la dispersión de la luz es considerablemente diferente, presumiblemente en base a la estructura interna y la forma de las células así como por su diferente índice refractivo. En base a esta diferencia, las células (viables/en proliferación, células viables en reposo y células muertas) pueden discriminarse fácilmente de las partículas de látex por un ángulo considerablemente diferente de la luz dispersada. SSC se refiere a las cuentas de látex y FSC se refiere a las células (véase la Fig. 2a). Sin embargo, también es posible teñir todas las células o todas las partículas de látex con colorantes fluorescentes y discriminar las partículas de látex y las células mediante la investigación de la luz fluorescente a diferentes longitudes de onda. La utilización de los parámetros medidos depende simplemente de las posibilidades y la comodidad que proporcione el aparato que se está utilizando. Si un aparato puede medir la luz fluorescente simultáneamente a tres o cuatro longitudes de onda fluorescentes diferentes, pueden marcarse las partículas de látex, todas las células y las células en división o muertas específicamente con colorantes fluorescentes. Por lo tanto, pueden utilizarse todas las combinaciones de luz dispersada y luz fluorescente para la medida de los parámetros, teniendo en cuenta que el parámetro de luz dispersada no es útil para una discriminación directa de las partículas de látex y las células muertas de las células viables y en proliferación, y las células viables y en reposo.
El término "colorante fluorescente que tiñe específicamente las células muertas o las células viables" como se utiliza aquí describe los colorantes que penetran sólo en las células muertas (por ejemplo el yoduro de propidio), o que se enriquecen sólo en las células viables (por ejemplo diacetato de fluoresceína). Si el contaje de todas las células es necesario, son útiles los colorantes fluorescentes para teñir células muertas así como los colorantes para teñir células viables (por ejemplo Hoechst 33342). Se han descrito numerosos colorantes fluorescentes útiles para el marcaje selectivo de las células viables o muertas (por ejemplo en el catálogo de Molecular Probes; http://www.molecularprobes.com/). Los colorantes fluorescentes se añaden en una cantidad adecuada, que es por ejemplo una concentración final de 1 \mug/ml.
Los siguientes ejemplos, listado de referencias y figuras se proporcionan para ayudar a mejorar la compresión de la presente invención, cuyo verdadero alcance se fija en las reivindicaciones anexas. Se debe entender que pueden realizarse modificaciones en los procedimientos indicados sin alejarse del espíritu de la invención.
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Descripción de las figuras
Figura 1 Análisis microscópico del crecimiento celular y la muerte celular en poblaciones de células CD34. las células CD34 estimuladas con citoquinas se cultivaron durante 4 y 7 días sin tratar o tratadas con un compuesto citotóxico.
Figura 2 Análisis de FACS de cuentas estándar, y de células CD34 estimuladas con citoquinas viables y muertas cultivadas durante 10 días. Las células se dejaron sin tratar (fila izquierda) o se trataron con un fármaco citotóxico que induce diferentes niveles de citotoxicidad.
Figura 3 Número de células y porcentaje de células muertas cuantificadas a partir de un análisis de FACS como se muestra en la Figura 2. Se muestran dos compuestos citotóxicos típicos, 5-fluorouracilo (0,1-100 \mumol/l) y doxorubicina (1-1000 ng/ml). El valor CI_{50} del análisis del número de células se corresponde a 0,34 \mumol/l y 0,67 ng/ml para el 5-fluorouracilo y la doxorubicina, respectivamente.
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Ejemplo
En un escenario experimental típico, se aíslan células CD34+ de sangre de cardón humana con una pureza elevada (>90%) mediante separación celular inmunomagnética, se alicuotan y se congelan en medio que contiene DMSO. Para el cultivo celular, las células CD34+ congeladas se descongelan y se siembran 200 células en 200 \mul de medio completo en un pocillo de una placa de 96 pocillos. El medio de cultivo celular básico consiste en medio IMDM suplementado con suero AB humano al 20% y antibióticos (pen./estrep.). Las células CD34+ se activan mediante la adición del siguiente cóctel de citoquinas: hu-SCF (100 ng/ml), hu-IL6 (10 ng/ml), hu-GM-CSF (100 U/ml), hu-TPO (25 ng/ml) y hu-EPO (5 U/ml). El cultivo se realiza en incubadores a 37ºC, humedad elevada y un 7% de CO_{2}.
Pueden utilizarse dos procedimientos experimentales diferentes: 1) adición del compuesto inhibidor previamente a la adición de suplementos al medio con citoquinas para que afecte preferentemente a las células en reposo, y 2) adición del compuesto inhibidor 4 días tras la activación de CD34 con citoquinas para que afecte preferentemente a las células activadas.
Como se muestra en la Figura 1, las células CD34 activadas y viables aparecen como células grandes esferoides tras un periodo de cultivo de 4 días (panel A). El número de células aumenta significativamente cuando las células se dejan crecer durante 3 días adicionales (panel C). Un fármaco citotóxico induce muerte celular en células CD34 que aparecen fragmentadas en las imágenes de microscopio tras un periodo de cultivo de 4 días (panel B), y el número de células fragmentadas aumenta sin que haya un aumento significativo del número de células (panel D).
Dependiendo de la tasa de proliferación de las células CD34+, la recogida y análisis del número de células y de la citotoxicidad se realiza tras un cultivo de las células de 9-10 días. El número de células y la citotoxicidad se analiza mediante la técnica de FACS. El número de células presentes en el pocillo se cuenta por comparación con un estándar interno de cuentas. A cada pocillo, que contiene un volumen de 200 \mul de medio, se añade una alícuota de 10.000 cuentas (FluoSpheres® de poliestireno, 15 \mum; Molecular Probes). Como se muestra en la Fig. 2, en una programación típica del instrumento de FACS, las células viables aparecen en una posición central/derecha de la dispersión hacia delante (FSC) y la dispersión lateral inferior (SSC) pero las cuentas estándar añadidas están presentes en una región con un FSC inferior y SSC superior (panel A). Una ventana, que se muestra como una región rectangular, se fija sobre las cuentas estándar, se cuenta un número concreto, se detiene el análisis y se calcula el volumen correspondiente de medio con células. El Panel E muestra el ensayo de viabilidad de las células CD34 analizadas en esta medida. Las células viables aparecen de nuevo en posición central/derecha de la dispersión hacia delante (FSC) y no muestran marcaje o muy poco con yoduro de propidio. Las pocas células muertas aparecen en posición izquierda o superior/izquierda en relación a la población de células viables. En la medida de FACS se realiza en este momento un contaje de las cuentas de la alícuota y se calcula el número de células presentes en el pocillo, mientras la citotoxicidad, el número de células muertas, se registra en paralelo durante esta medida (adición de yoduro de propidio; concentración final 1 \mug/ml). Con concentraciones crecientes de un compuesto citotóxico el número de células en el grupo de células muertas aumenta significativamente (Fig. 2 paneles F y G). A la mayor concentración inhibitoria y citotóxica se encuentran ya muy pocas células en el grupo de células viables y la mayoría de células han muerto como se hace evidente por el aumento de tinción con PI o la fragmentación (panel H).
Un ejemplo típico de cálculo del número de células CD34 y el porcentaje de células muertas en un pocillo se muestra en la Fig. 3 para dos compuestos citotóxicos, el 5-fluorouracilo y la doxorubicina. El número de células por pocillos se muestra como una barra para cada concentración analizada. Para el 5-fluorouracilo el número de células disminuye significativamente entre 0,3 y 1,0 \mumol/l y a la menor concentración de 1 ng/ml de doxorubicina el número de células ya es bajo. Utilizando un programa de cálculo de la CI_{50}, se calcularon los valores de CI_{50} para los compuestos inhibidores en 0,34 \mumol/l y 0,67 ng/ml para el 5-fluorouracilo y la doxorubicina, respectivamente. El aumento del porcentaje de células muertas obtenido en el análisis de la fracción celular positiva en PI (Fig.2 paneles de E a H) se muestra con una línea continua.

Claims (4)

1. Un método para la determinación simultánea de actividad inhibitoria de la proliferación celular y de toxicidad celular de un compuesto químico de bajo peso molecular utilizando una muestra de células de mamífero en proliferación como sistema control, que se caracteriza por
a) tratar dicha muestra de células que es una suspensión celular o células adherentes en un volumen predeterminado con dicho compuesto en al menos dos concentraciones predeterminadas diferentes;
b) tratar dicha muestra de células con un primera tinción de colorante fluorescente específica de las células muertas o de las viables, y opcionalmente con una segunda tinción de colorante fluorescente de todas las células;
c) añadir a dicha muestra de células una cantidad predeterminada de partículas de látex con un tamaño que oscila entre alrededor de 1 y alrededor de 20 \mum a dicho volumen y opcionalmente teñir dichas partículas de látex con un tercer colorante fluorescente;
d) determinar la proporción entre la cantidad de células totales y la cantidad de partículas de látex en dicha muestra;
e) determinar, con los resultados del paso d) y mediante un análisis de citometría de flujo en dicha muestra, el número de células muertas o viables mediante la luz fluorescente emitida por dicho primer colorante fluorescente a una primera longitud de onda, el número de células totales por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un primer ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho segundo colorante fluorescente a una segunda longitud de onda, el número de partículas de látex por unidad de volumen mediante la luz dispersada en un segundo ángulo o alternativamente mediante la luz fluorescente emitida por dicho tercer colorante fluorescente a una tercera longitud de onda;
f) y determinar con los resultados de los pasos d) y e) la actividad sobre la proliferación celular y la toxicidad de dicho compuesto.
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2. Un método de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza porque las células muertas se tiñen específicamente mediante un colorante fluorescente y el número de partículas de látex y las células se mide mediante la diferencia entre la luz dispersada lateral y la luz dispersada hacia el frente.
3. Un método de acuerdo con la reivindicación 1 o 2, que se caracteriza porque las células son células progenitoras CD34+ humanas.
4. Un método de acuerdo con las reivindicaciones de 1 a 3, que se caracteriza porque las células se cultivan en paralelo en múltiples dispositivos y las muestras se transfieren al instrumento de análisis mediante citometría de flujo a través de dispensación automática.
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