ES2330187T3 - Matrices proteicas modificadas por factor de crecimiento para ingenieria de tejidos. - Google Patents

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Abstract

Una matriz reticulada adecuada para crecimiento o crecimiento invasivo celular, en la que al menos un injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería se une covalentemente o iónicamente a la matriz, en la que el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería comprende un primer dominio que comprende un factor bioactivo o un polisacárido, un segundo dominio, en el que el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería está unido a la matriz por el segundo dominio y un sitio de degradación enzimática o hidrolítica entre el primer domino y el segundo dominio.

Description

Matrices proteicas modificadas por factor de crecimiento para ingeniería de tejidos.
Campo de la invención
La invención se refiere al uso de matrices que contienen moléculas farmacéuticamente activas, que incluyen proteínas de fusión de moléculas farmacéuticamente activas, particularmente factores de crecimiento, mediante el uso de interacciones de unión por afinidad, para el uso en la reparación o regeneración tisular y/o la liberación controlada de las moléculas farmacéuticamente activas.
Antecedentes de la invención
Para la reparación o regeneración tisular, las células tienen que migrar a un lecho de herida, proliferar, expresar componentes de matriz o formar matriz extracelular y formar una conformación final de tejido. Con frecuencia tienen que participar múltiples poblaciones celulares en esta respuesta morfogénica, que incluye frecuentemente células vasculares y nerviosas. Se ha demostrado que las matrices mejoran en gran medida y, en algunos casos, se ha observado que son esenciales para que esto tenga lugar. Las matrices de crecimiento invasivo de células naturales están sometidas a remodelación por influencias celulares, todas basadas en proteólisis, por ejemplo, por plasmina (que degrada fibrina) y metaloproteinasas de matriz (que degradan colágeno, elastina, etc.). Tal degradación está altamente localizada y tiene lugar solamente después del contacto directo con la célula en migración. Además, el suministro de proteínas de señalización celular específicas tales como factores de crecimiento está regulado firmemente. En el modelo natural, no se usan matrices macroporosas de crecimiento invasivo de células, sino más bien matrices microporosas que las células pueden degradar, localmente y a demanda, cuando las células migran al interior de la matriz.
Previamente se han diseñado dispositivos de suministro controlado para factores de crecimiento basándose en el uso de heparina inmovilizada para secuestrar el factor de crecimiento de alguna forma. Por ejemplo, Edelman et al. han usado perlas de SEPHAROSE^{TM} conjugadas con heparina dentro de alginato. Las perlas sirven como depósitos que liberan factor de crecimiento de fibroblastos básico ("bFGF") lentamente basándose en la unión y disociación de bFGF con heparina.
Se ha demostrado que los péptidos bi-dominio, que contienen una secuencia de sustrato de factor XIIIa y una secuencia de péptido bioactivo, se pueden reticular en geles de fibrina y que este péptido bioactivo conserva su actividad celular in vitro (Schense, J.C., et al. (1999) Bioconj. Chem. 10: 75-81). Aunque los péptidos pueden imitar parcialmente la bioactividad de la proteína completa de la que se obtienen, esta bioactividad habitualmente es menor que la bioactividad de la proteína completa y, en ocasiones, es imposible imitar ciertas proteínas con solamente un péptido corto. Por lo tanto, sería deseable ser capaz de incorporar en la matriz la proteína entera, tal como un factor de crecimiento u otra molécula farmacéuticamente activa. El documento WO 98/43686 describe proteínas de fusión que contienen un dominio de sustrato de transglutaminasa tal como factor XIII, un dominio de sustrato y un factor bioactivo. Estos péptidos están unidos covalentemente a un sustrato de fibrina que tiene una estructura tridimensional capaz de soportar el crecimiento celular y los materiales resultantes son útiles en la promoción de crecimiento celular, cicatrización y regeneración tisular.
Aunque existen y se conocen sistemas de suministro para proteínas y factores de crecimiento, sigue habiendo una necesidad de una matriz para el uso en reparación tisular que promueva la migración celular y el crecimiento invasivo de tejido al interior de la matriz mediante el control de la presentación y liberación del factor de crecimiento a las células en migración y el control de los sitios de adhesión celular. La necesidad es particularmente grande para tales matrices de crecimiento invasivo que podrían presentar localmente factores de crecimiento y conservar su influencia y actividad localmente, a través de interacciones de afinidad con la matriz, como tiene lugar en la naturaleza.
Por lo tanto, es un objeto de la presente invención proporcionar matrices naturales, biodegradables para la reparación, regeneración y remodelación tisular que tengan incorporadas en las mismas factores de crecimiento que conservan la actividad de las moléculas de factor de crecimiento intactas.
Es un objeto adicional de la presente invención proporcionar matrices naturales, biodegradables para la liberación controlada y/o sostenida de factores de crecimiento.
Sumario de la invención
El asunto de la presente invención es una matriz reticulada adecuada para crecimiento celular o crecimiento invasivo de acuerdo con la reivindicación 1, un método para preparar una matriz de acuerdo con la reivindicación 16, un injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de acuerdo con la reivindicación 25 y la matriz de la presente invención para la reparación, regeneración o remodelación de tejidos y/o liberación de factores bioactivos.
Las realizaciones de la presente invención se reivindican en las respectivas reivindicaciones dependientes.
Las proteínas se incorporan en matrices poliméricas de proteína o polisacárido o geles para uso en reparación, regeneración y/o remodelación tisular y/o suministro de fármacos. Generalmente, las proteínas se pueden incorporar de tal forma que se liberan por degradación de la matriz, por acción enzimática y/o difusión. La presente invención se refiere a la liberación por degradación enzimática o hidrolítica. Como se demuestra por los ejemplos, un método es unir heparina a la matriz por métodos covalentes o no covalentes, para formar una heparina-matriz. La heparina une entonces de manera no covalente factores de crecimiento que se unen a heparina a la matriz de proteína. Si la proteína a unir no contiene una secuencia de unión a heparina nativa, se puede construir una proteína de fusión que contenga la secuencia de proteína nativa y un dominio de unión a heparina sintético. De acuerdo con la invención se construye una proteína de fusión que contiene una región o regiones reticulables y la secuencia de proteína nativa y esta proteína de fusión se puede secuestrar por reticulación de la misma para formar una matriz. El dominio de proteína o péptido de fusión contiene un enlace degradable que contiene sitios de escisión hidrolítica o enzimática. Esto permite variar la velocidad de suministro en diferentes localizaciones dentro de la matriz dependiendo de la actividad celular en esa localización y/o dentro de la matriz. Esta estrategia puede ser particularmente útil cuando se desee suministro de fármaco a largo plazo, por ejemplo, en el caso de regeneración de nervios, donde es deseable variar la velocidad de liberación de fármaco espacialmente como una función de regeneración, por ejemplo, rápidamente cerca de la interfaz de tejido vivo y más lentamente más hacia el interior de la zona de lesión. Los beneficios adicionales incluyen la menor dosis de fármaco total dentro del sistema de suministro y la regulación espacial de la liberación que permite que se libere un mayor porcentaje del fármaco en el momento de la mayor actividad celular. Los ejemplos demuestran proporciones o niveles optimizados de factor de crecimiento, dominio de unión a heparina y heparina o péptido de unión a heparina secuestrados dentro de la matriz que induce óptimamente el crecimiento invasivo del células y regeneración tisular.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 es un cromatograma de detección de fluorescencia de geles de fibrina que contienen péptido degradado por plasmina y sin péptido. Se muestra la cromatografía por exclusión de tamaño de un gel de fibrina degradado con el péptido \alpha_{2}PI_{1-7}-ATIII_{121-134} incorporado, añadiéndose el mismo péptido libre al gel de fibrina degradado que contiene péptido incorporado y péptido libre solo. El resto de leucina N-terminal está dansilado (abreviado dL). El péptido libre eluyó en tiempos más prolongados, que se corresponden a un peso molecular menor, de lo que lo hizo el péptido incorporado en el gel de fibrina durante la coagulación, demostrando la unión covalente a fibrina degradada y, por tanto, incorporación covalente por la acción de la actividad del factor XIIIa.
La Figura 2 es un gráfico del efecto del bFGF unido a matriz sobre la extensión de neurita de DRG a las 48 h. Se muestran los valores medios y la desviación típica de la media. (* indica p<0,05 en comparación con fibrina no modificada).
La Figura 3 es un gráfico del efecto de proteínas de fusión de \beta-NGF inmovilizadas sobre la extensión de neurita de DRG dentro de matrices de fibrina. Se muestran los valores medios y el error típico de la media. \blacksquare indica NGF nativo. \blacklozenge indica TG-P-NGF. \bullet indica TG-P_{i}-NGF. * indica p<0,0001 frente a fibrina no modificada con NGF en el medio de cultivo. Este resultado demuestra que el \beta-NGF unido a matriz mejora la extensión de neurita mediante matrices de fibrina frente a la misma concentración de NGF en el medio.
La Figura 4 es un gráfico de la cantidad de incorporación de proteína de fusión de \beta-NGF con sustrato de factor XIIIa exógeno en matrices de fibrina, cuantificada por ELISA directo, mediante el uso de \beta-NGF marcado con biotina. La eficacia de incorporación de la proteína de fusión de \beta-NGF era relativamente constante a lo largo del intervalo de concentraciones ensayado.
La Figura 5 es un gráfico de la incorporación de dLNQEQVSPLRGD (SEC ID Nº: 1) en geles de fibrina con Factor XIII exógeno añadido. Cuando se añadió 1 U/ml, el nivel de incorporación aumentó de tal forma que se pudo conseguir más de 25 mol de péptido/mol de fibrinógeno.
La Figura 6 es un gráfico de la incorporación del péptido bi-dominio, dLNQEQVSPLRGD (SEC ID Nº: 1) en adhesivo de fibrina no diluido. Se ensayaron tres kits separados y en cada caso se pudo observar un alto nivel de incorporación, que alcanzaba 25 mol de péptido/mol de fibrinógeno. La concentración de péptido exógeno requerida para la incorporación máxima fue al menos 5 mM, posiblemente debido a limitaciones de difusión dentro de la matriz de fibrina altamente densa que se crea. El nivel de incorporación fue muy uniforme, proporcionando cada kit un perfil de incorporación similar.
Descripción detallada de la invención
Como se describe en ese documento, se ha desarrollado un método para mejorar la reparación, regeneración o remodelación tisular, mediante el uso de matrices naturales que tienen factores de crecimiento incorporados en la misma de forma que se pueden liberar. Existen varias ventajas con respecto a las matrices de la técnica anterior: las matrices naturales son biocompatibles y biodegradables y se pueden formar in vitro o in vivo (no se reivindica la formación in vivo), en el momento del implante; se pueden incorporar proteínas de factor de crecimiento de longitud completa y pueden conservar la bioactividad completa; los factores de crecimiento se pueden incorporar de forma que se pueden liberar, mediante el uso de técnicas que proporcionan control sobre cómo y cuándo y hasta qué grado se liberan los factores de crecimiento, de tal forma que se puede usar la matriz para la reparación tisular directamente o indirectamente, mediante el uso de la matriz como un vehículo de liberación controlada.
I. Matrices y Factores de Crecimiento A. Materiales de Matriz
La matriz se forma reticulando iónicamente, covalentemente o por combinaciones de los mismos uno o más materiales poliméricos para formar una matriz polimérica que tenga suficiente separación inter-polimérica para permitir el crecimiento invasivo o la migración al interior de la matriz de las células.
En la realización preferida, la matriz está formada por proteínas, más preferiblemente proteínas presentes de forma natural en el paciente en el que se va a implantar la matriz. La proteína más preferida es fibrina, aunque también se pueden usar otras proteínas tales como colágeno y gelatina. También se pueden usar polisacáridos y glucoproteínas. En algunas realizaciones, también es posible usar polímeros sintéticos que se pueden reticular por unión iónica o covalente.
El material de matriz preferiblemente es biodegradable por enzimas presentes de forma natural. La velocidad de degradación se puede manipular por el grado de reticulación y la inclusión de inhibidores de proteasa en la matriz.
B. Enlaces Degradables
Las proteínas que forman la matriz se pueden modificar mediante inclusión de enlaces degradables. Típicamente, estos serán sitios de escisión enzimática, tales como el sitio para escisión por trombina. Además, las proteínas de fusión o quimeras peptídicas, que se reticulan hasta geles de fibrina, se modifican adicionalmente para contener un sitio degradable entre el sitio de unión (es decir, un sustrato de factor XIIIa o domino de unión a heparina) y la proteína bioactiva (es decir, factor de crecimiento o enzima). Estos sitios pueden ser degradables por hidrólisis no específica (es decir, un enlace éster) o pueden ser sustratos para degradación enzimática específica (degradación proteolítica o de polisacáridos). Estos sitios degradables permiten la modificación por ingeniería de más liberación específica de factor bioactivo de geles de fibrina. Por ejemplo, la degradación basada en actividad enzimática permite controlar la liberación de factores bioactivos por un proceso celular en lugar de por difusión del factor a través del gel.
Los sitios de degradación permiten que se libere el factor bioactivo con poca o ninguna modificación en la secuencia de proteína primaria, lo que puede dar como resultado mayor actividad del factor. Además, permite controlar la liberación del factor por procesos específicos celulares, tales como proteólisis localizada, en lugar de difusión de algunos materiales porosos. Esto permite liberar factores a diferentes velocidades dentro del mismo material dependiendo de la localización de células dentro del material. La actividad proteolítica específica celular es vital en aplicaciones tales como regeneración de nervios, que tiene lugar a lo largo de largos periodos de tiempo. Esto también reduce la cantidad de factor de crecimiento total necesario, ya que su liberación está controlada por procesos celulares. La conservación de factor de crecimiento y su biodisponibilidad son distintas ventajas de aprovechar la actividad proteolítica específica celular con respecto al uso de dispositivos de liberación controlada de difusión que dan como resultado característicamente la pérdida de una cantidad significativa de factor bioactivo en una liberación explosiva inicial.
Las enzimas que se podrían usar para degradación proteolítica son numerosas. Los sitios degradables proteolíticamente podrían incluir sustratos para colagenasa, plasmina, elastasa, estromelisina o activadores de plasminógeno. Los sustratos ilustrativos se enumeran a continuación. P1-P5 indican las posiciones de aminoácidos 1-5 hacia el extremo amino de la proteína desde el sitio en el que tiene lugar la proteólisis. P1'-P4' indican las posiciones de aminoácidos 1-4 hacia el extremo carboxi de la proteína desde el sitio en el que tiene lugar la proteólisis.
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TABLA 1 Secuencias de sustrato de muestra para proteasa
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Sustratos de Polisacárido: La degradación enzimática puede tener lugar con sustratos de polisacáridos para enzimas tales como heparinasa, heparitinasa y condrotitinasa ABC. Cada una de estas enzimas tiene sustratos de polisacáridos. Debido a la presencia de heparina en todos los sistemas de unión a heparina, el sustrato para heparinasa ya está incorporado en estos sistemas.
Sustratos proteolíticos: Se podría añadir sustrato proteolítico durante la síntesis peptídica de la quimera peptídica o la quimera de heparina-péptido. La quimera de péptido de unión a heparina se podría modificar para contener una secuencia de degradación proteolítica insertando un sustrato de proteasa, tal como uno de los de plasmina que se han descrito anteriormente, entre el sustrato de factor XIIIa y el dominio de unión a heparina. La quimera de heparina-péptido se podría modificar para contener una secuencia de degradación proteolítica insertando un sustrato de proteasa, tal como uno de los de plasmina que se han descrito anteriormente, entre el sustrato de factor XIIIa y el domino de heparina. Se podría usar un sustrato con una alta K_{m} y una baja k_{cat} para ralentizar la escisión mientras que se ocupan sitios activos de la proteasa. Los sustratos de escisión diferentes a los de plasmina también se podrían usar para permitir que la liberación de los factores bioactivos sea independiente de la degradación de matriz.
Oligo-ésteres: Asimismo se podría insertar un domino de oligo-éster entre el sustrato de factor XIIIa y el domino de unión a heparina o el dominio de heparina de la quimera durante el paso de síntesis peptídica. Esto se podría conseguir mediante el uso de un oligo-éster tales como oligómeros de ácido láctico.
El sustrato de degradación no enzimática puede consistir en cualquier enlace que se someta a hidrólisis por un mecanismo catalizado por ácido o base. Estos sustratos pueden incluir oligo-ésteres tales como oligómeros de ácido láctico o glicólico. La velocidad de degradación de estos materiales se puede controlar mediante la elección de oligómero.
C. Heparina; Péptidos de Unión a Heparina
La matriz se puede modificar mediante la inclusión de heparina y/o fragmentos de unión a heparina, que se unen directamente o indirectamente a proteínas que se unen a heparina. En el último caso, el péptido se puede unir a heparina, que después está disponible para unirse a factores que incluyen un sitio de unión a heparina, o el propio péptido puede contener una porción de heparina que está unida por ciertos factores de crecimiento de unión a heparina. Los mismos se pueden unir al material de matriz mediante el uso de técnicas convencionales, como se analiza con más detalle a continuación.
En una realización preferida, la heparina se une a geles de fibrina no covalentemente usando un sistema de dos partes que consiste en una quimera peptídica y la propia heparina. La quimera peptídica consiste en dos dominios, un sustrato de factor XIIIa y un domino de unión a polisacárido. Una vez que la quimera peptídica se ha reticulado en el gel de fibrina, se une a la heparina (u otros polisacáridos) por interacciones no covalentes.
Se ha observado que numerosas proteínas tienen afinidad de unión a heparina. Algunas de estas proteínas y las secuencias de sus dominios de unión a heparina se enumeran más adelante en la Tabla 2. Éstas también se analizan en la sección relacionada con factores bioactivos que se pueden suministrar por la matriz polimérica.
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 2 Secuencias de unión a heparina
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D. Factores Bioactivos
Muchos factores de crecimiento que están implicados en la morfogénesis, tanto en el organismo en desarrollo como en el adulto, se unen a moléculas de matriz extracelular. Esta afinidad proporciona un modo de acción local del morfógeno, evitando influencias dístales incontroladas. La principal interacción de afinidad de matriz que está implicada en esta localización de influencia es para heparina y proteoglucanos de sulfato de heparina. Los factores de crecimiento que se unen a heparina incluyen la superfamilia del factor de crecimiento transformante ("TGF")-beta (que incluye las proteínas morfogénicas óseas, "BMP"), la familia del factor de crecimiento de fibroblastos ("FGF") y el factor de crecimiento epitelial vascular ("VEGF"), entre otros. En general, un factor de crecimiento que se considera que se une a heparina eluirá de una columna de afinidad de heparina a concentraciones de NaCl por encima de niveles fisiológicos (superiores o iguales a 140 mM). Los factores de crecimiento de "unión a heparina" adicionales incluyen interleucina-8, neurotrofina-6, factor de crecimiento epidérmico de unión a heparina, factor de crecimiento de hepatocitos, factor de crecimiento de tejido conectivo, midquina y molécula asociada a crecimiento de unión a heparina. Se ha demostrado que estos factores de crecimiento regulan la reparación tisular.
Los dominios de unión a heparina tienen lugar de forma natural en muchas familias diferentes de factores de crecimiento. Una de estas familias con uno o más miembros que se unen a heparina son los factores de crecimiento de fibroblastos (Presta, M., et al., (1992). Biochemical and Biophysical Research Communications. 185: 1098-1107). Los factores de crecimiento adicionales que se unen a heparina incluyen el factor de crecimiento transformante, factor morfogénico óseo, interleucina-8, neurotrofina-6, factor de crecimiento de células endoteliales vasculares, factor de crecimiento epidérmico de unión a heparina, factor de crecimiento de hepatocitos, factor de crecimiento de tejido conectivo, midquina y molécula asociada a crecimiento de unión a heparina (Götz, R., et al, (1994). Nature. 372: 266-269; Kaneda, N., et al, (1996) J. Biochem. 119: 1150-1156; Kiguchi, K., et al, (1998) Mol. Carcinogensis. 22: 73-83; Kinosaki, M., et al, (1998). Biochim. Biophys. Acta. 1384: 93-102; McCaffrey, T., et al, (1992) J. Cell. Physiol. 152: 430-440; Nolo, R., et al, (1996) Eur. J. Neurosci. 8: 1658-1665; Spillmann, D., et al, (1998). Journal of Biological Chemistry. 273: 15487-15493; Steffen, C., et al, (1998); Growth Factors. 15:199-213.
Tessler, S., et al, (1994) J. Biol. Chem. 269: 12456-12461). Estos factores han mostrado el potencial de mejorar la cicatrización en muchos tipos diferentes de tejido que incluyen vasculatura, piel, nervios e hígado. Por lo tanto, estos materiales se pueden usar para mejorar la cicatrización en muchas partes diferentes del cuerpo seleccionando el factor de crecimiento apropiado.
II. Métodos para la incorporación y/o Liberación de factores bioactivos
En la realización preferida para la incorporación de un factor de crecimiento u otra proteína bioactiva dentro de la matriz, la matriz está formada por fibrina y las moléculas exógenas incluyen un sustrato que se incorporará dentro de la fibrina durante la coagulación. Los péptidos exógenos de acuerdo con la invención están diseñados para incluir dos dominios, un dominio que es un sustrato para una enzima de reticulación tal como XIIIa. El factor XIIIa es una transglutaminasa que es activa durante la coagulación. Esta enzima, formada de manera natural a partir del factor XIII mediante escisión por trombina, funciona uniendo cadenas de fibrina entre sí por enlaces amida, formados entre cadenas laterales de glutamina y cadenas laterales de lisina. La enzima también funciona uniendo otras proteínas a fibrina durante la coagulación, por ejemplo, el inhibidor de la proteína alfa 2 plasmina. Se ha demostrado que el dominio N-terminal de esta proteína, específicamente la secuencia NQEQVSP (SEC ID Nº: 20) funciona como un sustrato eficaz para el factor XIIIa. Después, se puede seleccionar un dominio adicional de este péptido para que sea un factor bioactivo, tal como un péptido, o una proteína o un polisacárido (Sakiyama-Elbert, et al, (2000) J. Controlled Release 65: 389-402) y en este documento. Como tal, se pueden incorporar factores bioactivos exógenos dentro de la fibrina durante la coagulación por un sustrato de factor XIIIa.
A. Uso de afinidad de heparina en la liberación de proteínas
Un modo sencillo de incorporar muchas proteínas bioactivas de interés en la cicatrización y regeneración en fibrina es unir la heparina por uno de los métodos descritos en este documento a los geles de fibrina y usar la heparina para secuestras proteínas de unión a heparina, tales como factores de crecimiento de unión a heparina. Esto se puede conseguir por uno de dos modos, indirectamente reticulando un péptido de unión a heparina en el gel de fibrina y uniendo la heparina a este péptido no covalentemente (usando un péptido bi-funcional que contiene un domino de unión a heparina y un sustrato de factor XIIIa) o acoplando directamente una quimera de heparina-péptido (donde la heparina se une químicamente a un péptido que contiene un sustrato de factor XIIIa). Sin tener en cuenta el método de incorporación, la heparina incorporada puede secuestrar después proteínas, tales como factores de crecimiento con afinidad de unión por heparina, en el gel de fibrina de una manera similar al modo en el que se secuestran en la matriz extracelular en la naturaleza. La heparina también puede proteger esos factores contra degradación proteolítica y prolongar su actividad hasta que se liberen de la matriz.
Incorporación de heparina mediante la incorporación de un péptido de unión a heparina
La unión de heparina, covalentemente o no covalentemente a geles de fibrina, añade una funcionalidad novedosa a estos materiales. La unión de heparina permite que la matriz de fibrina se una a proteínas de unión a heparina, que incluyen factores de crecimiento de una manera que no perjudique a la proteína y evite la difusión libre de la proteína desde el gel. Esto permite la liberación controlada de las proteínas de unión a heparina por uno de dos mecanismos, degradación del gel o unión de la proteína a alguna otra proteína de alta afinidad, tales como un receptor de superficie celular.
La heparina se puede unir a geles de fibrina no covalentemente usando un sistema de dos partes que consiste en una quimera peptídica y la propia heparina. La quimera peptídica consiste en dos dominios, un sustrato de factor XIIIa y un domino de unión a polisacárido. Una vez que la quimera peptídica está reticulada en el gel de fibrina, se une a la heparina (u otros polisacáridos) mediante interacciones no covalentes.
Para secuestrar factores de crecimiento que no se unen espontáneamente a heparina, es necesario modificar la proteína mediante la adición de una funcionalidad capaz de unirse a fibrina. Esto se puede conseguir de varios modos. A modo de ejemplo, esto se puede conseguir mediante la adición de un sustrato de factor XIIIa o añadiendo un dominio de unión a heparina a la proteína de fusión resultante.
La adición de un sustrato de factor XIIIa sintético se puede conseguir expresando una proteína de fusión que contiene la secuencia de factor de crecimiento nativo y un sustrato de factor XIIIa en el extremo amino o carboxilo de la proteína de fusión. Esta modificación se realiza a nivel de ADN. Las proteínas completas presentan dificultad ya que se sintetizan por síntesis química en fase sólida. La secuencia de ADN que codifica el factor de crecimiento está adaptada al uso óptimo de codón para expresión bacteriana. Después, la secuencia de ADN se determina para el sustrato de factor XIIIa deseado, mediante el uso de codones que tienen lugar frecuentemente en el ADN bacteriano.
Una serie de fragmentos génicos se diseña antes de la síntesis de ADN. Debido a la frecuencia de error de la mayoría de la síntesis de ADN, que contiene un error aproximadamente cada 50 pb, los genes se construyen para tener aproximadamente 100 pb de longitud. Esto reduce el número de colonias que se tiene que explorar para encontrar una que contenga la secuencia de ADN apropiada. La localización en la que un gen termina y comienza el siguiente se selecciona basándose en la existencia natural de sitios de corte por enzima de restricción únicos dentro del gen, dando como resultado fragmentos (u oligonucleótidos) de longitud variable. El proceso está fomentado enormemente por el uso de software que identifica la localización y frecuencia de sitios de enzimas de restricción dentro de una secuencia dada de ADN.
Una vez que se han diseñado exitosamente los fragmentos génicos, se incluyen sitios de enzimas de restricción comunes en los extremos de cada fragmento para permitir la ligación de cada fragmento en un plásmido de clonación. Por ejemplo, la adición de sitios EcoRI y HindIII a cada fragmento génico permite que se inserte en la región de clonación de polienlazador de pUC 19. Las cadenas sencillas 3' y 5' de cada fragmento génico se sintetizan después usando síntesis en fase sólida convencional con los extremos cohesivos apropiados para la inserción en el vector de clonación. Después de la escisión y desalación, los fragmentos monocatenarios se purifican por PAGE y se hibridan. Después de la fosforilación, los fragmentos hibridados se ligan en un vector de clonación, tal como pUC 19.
Después de la ligación, los plásmidos se introducen por transformación en células competentes de DH5-F' y se siembran en placas de Isopropil-D-Tiogalactopiranósido (IPTG)/5-Bromo-4-cloro-3-indolil-D-Galactopiranósido (X-gal) para explorar para inserción de los fragmentos génicos. Las colonias resultantes que contienen el fragmento génico después se exploran para la inserción de la longitud apropiada. Esto se consigue purificando el plásmido de colonias de células transformadas por un protocolo de minipreparación de lisis alcalina y digiriendo el plásmido con los sitios de enzima de restricción presentes en cada extremo del fragmento génico. Después de la detección de los fragmentos de la longitud apropiada por electroforesis en gel de agarosa, los plásmidos se secuencian.
Cuando se identifica un plásmido que contiene un fragmento génico con la secuencia apropiada, después el fragmento se recorta y se usa para ensamblar el gen completo. Cada vez se corta un plásmido con las enzimas en los puntos de inserción y se purifica de un gel de agarosa después de desfosforilación del plásmido. Entretanto, también se corta un segundo plásmido que contiene el fragmento a insertar y el fragmento a insertar se purifica de un gel de agarosa. Después, el ADN de inserto se liga en el plásmido desfosforilado. Este proceso se continúa hasta que esté ensamblado el gen completo. Después, el gen se mueve al interior de un vector de expresión, tal como pET 14b y se introduce por transformación en bacterias para la expresión. Después de esta ligación final, el gen completo se secuencia para confirmar que es correcto.
La expresión de la proteína de fusión se consigue cultivando las bacterias hasta que alcancen el crecimiento de fase semi-logarítmica e induciendo después la expresión de la proteína de fusión. La expresión se continúa durante aproximadamente 3 horas y después se recogen las células. Después de obtener un sedimento celular bacteriano, las células se lisan. Las membranas y restos celulares se eliminan por lavado del sedimento de lisado celular con Triton X100, dejando los cuerpos de inclusión en forma relativamente pura. La proteína de fusión se solubiliza usando altas concentraciones de urea y se purifica por cromatografía de afinidad de histidina. La proteína resultante después se renaturaliza gradualmente mediante diálisis frente a una cantidad lentamente decreciente de urea y se liofiliza.
Incorporación de heparina mediante la incorporación de una quimera de heparina-péptido
Se pueden incorporar injertos de polisacárido (quimera de heparina-péptido de sustrato de factor XIIIa) dentro de la fibrina durante la coagulación para proporcionar sitios de heparina inmovilizados para unirse a factores de crecimiento y ralentizar su liberación. La heparina (u otros polisacáridos tales como sulfato de heparano o sulfato de condroitina) se puede unir a fibrina directamente mediante el uso del factor XIIIa construyendo una quimera de heparina-péptido. Esta quimera contiene dos dominios, un domino peptídico que consiste en un sustrato de factor XIIIa y el dominio de polisacárido tal como heparina. Estas quimeras se preparan usando heparina modificada (u otro polisacárido), por ejemplo, que contiene un grupo reactivo único en un extremo para controlar el sitio en el que tiene lugar el acoplamiento del péptido en la molécula de heparina. Mediante el uso de un grupo funcional único en el péptido, tal como una cadena lateral presente solamente en el extremo del péptido donde se desea el acoplamiento, también se puede controlar la localización del acoplamiento en el péptido. También es posible incorporar el péptido de sustrato de factor XIIIa a lo largo de la cadena de heparina, en lugar de en el extremo, e incluso incorporar más de uno de tales péptidos por cadena de heparina, pero la estrategia preferida es incorporar un único péptido de sustrato de factor XIIIa en un extremo de la heparina. Después, estas quimeras se pueden reticular covalentemente en geles de fibrina durante la coagulación por la actividad enzimática del factor XIIIa, permitiendo la unión directa de heparina al gel de fibrina.
Papel de concentración de heparina en la determinación de la velocidad de liberación de proteínas
La determinación de las proporciones óptimas de factor de crecimiento: quimera de heparina-péptido o la proporción óptima de factor de crecimiento: heparina: péptido de unión a heparina así como la densidad óptima de la quimera de heparina-péptido o el péptido de unión a heparina incorporado en la fibrina es importante. A pesar de su afinidad relativamente fuerte por heparina, los factores de crecimiento de unión a heparina se disocian de la matriz en una escala de tiempo corta. Por lo tanto, un gran exceso de sitios de unión garantiza que el factor de crecimiento no difunda mucho antes de la unión de nuevo a la matriz. Este equilibro también permite la unión de factor de crecimiento libre a receptores de superficie celular que están en proximidad cercana al sitio de disociación. Este método de liberación controlada proporciona tanto una unión relativamente a largo plazo de factores de crecimiento como la rápida liberación de factores de crecimiento a células locales. Sin embargo, como se describe en este documento, no siempre es el caso que una alta proporción y, por tanto, una velocidad de liberación lenta, proporciona la respuesta biológica más deseable. Puede haber casos en los que sean deseables velocidades de liberación más rápidas, especialmente con algunos factores de crecimiento.
Se ha intentado predecir matemáticamente qué proporción de sitio de unión a factor de crecimiento es óptima para aplicaciones de crecimiento celular como se determina por liberación de factor de crecimiento muy lenta. Se demostró que la velocidad de liberación pasiva de factor de crecimiento desde la matriz se podría modular mediante la proporción de péptido y heparina al factor de crecimiento de unión a heparina, conduciendo mayores excesos de heparina y péptido de unión a heparina con respecto al factor de crecimiento de unión a heparina a liberación pasiva más lenta. Sin embargo, no siempre es posible usar tales métodos para predecir las características de liberación óptima. Por ejemplo, los ejemplos demuestran que BMP-2 se puede liberar ventajosamente de manera más rápida de un material con una proporción de heparina y péptido de unión a heparina a BMP-2 que es más próxima a equimolar. En algunos casos se obtienen mejores resultados con menores proporciones de heparina a factor de crecimiento.
La capacidad del sistema de suministro que contiene heparina de suministrar factores de crecimiento en una forma activa se ensayó en un modelo ectópico de formación ósea, en el que se implantaron matrices de fibrina que contenían el sistema de suministro y BPM-2 por vía subcutánea en ratas. En este modelo, las condiciones favorables para la formación ósea eran a proporciones bajas de heparina a factor de crecimiento de 1:1. La adición de mayores proporciones, tales como 5:1 o superior, era inhibidora para la formación ósea. Estos resultados eran inesperados basándose en estudios publicados previos y sugieren que proporciones bajas de heparina a factor de crecimiento tienen un uso imprevisto en el suministro de BMP-2. (Véase el ejemplo 5).
La adición de factor XIII exógeno a preparaciones de fibrinógeno se puede usar para aumentar el número de péptidos de unión a heparina incorporados dentro de matrices de fibrina, permitiendo que el péptido de unión a heparina sirva como un sitio de inmovilización para heparina y como un sitio de adhesión celular. Este aumento de la concentración peptídica puede mejorar la capacidad de tales materiales de promover la extensión de neuritas y otras formas de migración celular, mediante el uso de dominios de unión a heparina como sitios de adhesión celular. Se ha demostrado que los péptidos de unión a heparina actúan como péptidos de adhesión y, como tales, pueden mejorar la velocidad de migración celular dentro de fibrina (Sakiyama, S. E., et al., (1999) FASEB J. 13: 2214-2224). Sin embargo, esta respuesta requería aproximadamente 8 moles de péptido incorporado por mol de fibrinógeno en el coágulo. Como tal, el uso de un gran número de estos péptidos de unión a heparina para unirse a heparina para el uso como un sitio de afinidad en la liberación sostenida de factores de crecimiento de unión a heparina puede eliminar el efecto de adhesión beneficioso del péptido de unión a heparina. Esta limitación se puede superar por incorporación de mayores niveles del péptido de unión a heparina exógeno, que se puede conseguir mediante la adición de mayores niveles de factor XIIIa a la preparación de fibrinógeno, permitiendo de este modo que el péptido tenga ambos efectos simultáneamente. La incorporación de péptido adicional a una proporción superior a 8 moles de péptido por mol de fibrinógeno (es decir, 25 moles de péptido por mol de fibrinógeno), por tanto, puede ser útil para permitir que los péptidos de unión a heparina sirvan como sitios de adhesión celular y como sitios de inmovilización de heparina para suministro de fármaco. Por ejemplo, el 5% de los sitios de unión a heparina se puede usar para inmovilizar la heparina para el suministro de fármaco y el otro 95% permanecería desocupado y libre para servir como dominios de adhesión celular, permitiendo de este modo que los péptidos de unión a heparina se usen como dominios de adhesión celular y como sitios de inmovilización de factor de crecimiento dentro del mismo material. Este uso dual de péptidos de unión a heparina se aprovecha del uso del factor XIIIa exógeno debido a que se ha demostrado que se tiene que incorporar un número relativamente alto de sitios de unión a heparina en la fibrina (8 moles de péptido por mol de fibrinógeno) para mejorar la adhesión celular y la migración dentro de matrices de fibrina.
Uso de péptidos bi-dominio para la incorporación de sitios de afinidad de heparina
Existen muchas posibles combinaciones de quimeras de péptido-péptido, con un sustrato de factor XIIIa en un dominio y un péptido de unión a heparina en el otro dominio. Estas diferentes combinaciones tendrán diferentes ventajas y desventajas. Por ejemplo, algunos sustratos de factor XIIIa se incorporan de manera más eficaz que otros. Adicionalmente, diferente péptidos de unión a heparina tienen diferente afinidad por la heparina. Una consideración adicional es la posible inmunogenicidad de los péptidos. Incluso aunque es posible utilizar secuencias peptídicas basadas en las secuencias de las proteínas humanas, la fusión entre estas dos secuencias humanas es nueva y nunca se ha observado por el sistema inmune de un paciente. Como tal, existe cierto riesgo de que una fusión de este tipo fuese inmunógena e indujera formación de anticuerpos contra una o la otra proteína o frente al propio sitio de fusión. En general, las secuencias peptídicas más cortas tendrán una menor tendencia de inducir respuestas antigénicas que las más largas. Como tal, la quimera con el sustrato de factor XIIIa de inhibidor de alfa 2 plasmina y el dominio de unión a heparina de antitrombina III induciría más probablemente una respuesta antigénica que el péptido bi-dominio correspondiente con un dominio de unión a heparina del factor plaquetario 4, por ejemplo.
Una estrategia adicional para reducir la probabilidad de que una quimera bi-dominio usada para inmovilizar heparina dentro de la red de fibrina sea inmunógena es formar directamente una quimera de péptido-heparina, con un sustrato de factor XIIIa, por ejemplo, del inhibidor de proteína alfa 2 plasmina, en un dominio, y una cadena de heparina como el otro dominio, con un enlace covalente entre ambos. De este modo, no existe ninguna secuencia peptídica natural en el sitio de fusión, de tal forma que el potencial de interacciones inmunológicas es muy bajo.
Uso de proteínas de fusión en la liberación de proteínas
También se puede considerar el uso de proteínas de fusión en la liberación de proteínas mediante la afinidad por heparina, ya que una fusión de una proteína bioactiva que no se une a heparina se puede construir con un dominio de unión a heparina, para preparar una proteína de fusión resultante que se una a heparina. Además, como una alternativa a la incorporación de proteínas bioactivas dentro de fibrina por su afinidad por heparina, las proteínas se pueden incorporar directamente mediante el uso del factor XIIIa. Esto es posible si poseen un dominio de sustrato para factor XIIIa, de forma natural o por incorporación con una proteína recombinante para formar una proteína de fusión con la proteína bioactiva y un dominio de sustrato de factor XIIIa.
La síntesis de cualquiera de las proteínas de fusión que se han descrito anteriormente se puede conseguir mediante el uso de técnicas de biología molecular. Para hacer esto, se puede crear una proteína de fusión que contenga toda la secuencia proteica de interés con una secuencia de reticulación o unión fusionada en el extremo amino o carboxilo o potencialmente en cualquier otro lugar dentro de la cadena de proteína. Esto se realiza a nivel de ADN, ya que las secuencias que codifican un sustrato de reticulación de factor XIIIa o un dominio de unión a heparina se pueden insertar en el comienzo o el final de los codones para la proteína original, por ejemplo. Cuando se expresan estas proteínas modificadas, contendrán el dominio adicional de interés en el extremo amino o carboxi o en cualquier otro lugar dentro del dominio de proteína principal. Mediante el uso de la maquinaria natural diseñada para síntesis proteica, se posibilita sintetizar y purificar grandes proteínas con alta fidelidad.
Usando técnicas de biología molecular convencionales, se pueden preparar proteínas de fusión de cualquier factor de crecimiento para el que se conoce la secuencia de proteína o de ADN, permitiendo la adición de dominios novedosos tales como dominios de unión a heparina o sustratos enzimáticos. Estas proteínas de fusión se pueden construir a fin de añadir un dominio novedoso en el extremo N o C de la proteína, por ejemplo, o dentro de la cadena proteica. Las modificaciones se realizan a nivel de ADN construyendo un gen que contiene tanto la secuencia de ADN que codifica el factor de crecimiento como la secuencia de ADN que codifica la secuencia de reticulación o de unión, por ejemplo, un dominio de unión a heparina. Después, este ADN se liga en un plásmido de expresión y se introduce por transformación en bacterias. Después de la inducción de la expresión, las bacterias producirán grandes cantidades de esta proteína de fusión. Después de la expresión, la proteína se tiene que purificar del lisado celular y replegar. La purificación con frecuencia se simplifica debido a la tendencia de proteínas de mamífero expresadas a alto nivel de formar cuerpos de inclusión en bacterias.
Diseño de proteínas de fusión para la incorporación
Se puede incorporar una proteína de fusión recombinante en los geles de fibrina mediante el uso de varios esquemas diferentes. En el primer diseño, un sustrato de factor XIIIa se ha incorporado directamente en la proteína. Cuando esta proteína modificada está presente durante la polimerización de la fibrina, se incorpora directamente en la matriz de fibrina de un modo similar a los péptidos bi-dominio. Un método separado implica proteínas de fusión que se han sintetizado para incorporar un dominio de unión a heparina. En este ejemplo, un péptido bi-dominio, heparina y la proteína de fusión de unión a heparina se incluyen en la mezcla de polimerización de fibrina. Durante la polimerización, el péptido bi-dominio se reticula en el gel de fibrina. Este péptido bi-dominio contendría una secuencia de sustrato de factor XIIIa además de una secuencia de unión a heparina. La heparina se une al péptido bi-dominio que se ha incorporado en el gel de fibrina y está atrapada en la matriz de fibrina. Esta heparina atrapada sirve para secuestrar la proteína de fusión de unión a heparina dentro del gel de fibrina por unión a los dominios de unión a heparina modificados por ingeniería. Se ha demostrado que esta incorporación es lo suficientemente estable para secuestrar el factor de crecimiento hasta que se elimine el péptido reticulado del gel por proteólisis controlada por células.
De acuerdo con la invención, esta técnica se modifica incorporando un sitio de degradación enzimática entre la secuencia de sustrato de factor XIIIa y la proteína de interés. Por selección cuidadosa de K_{m} y k_{cat} de este sitio de degradación enzimática, la degradación se podría controlar para que tuviera lugar antes o después de la matriz de proteína y/o utilizando enzimas similares o diferentes para degradar la matriz, ajustándose la colocación del sitio de degradación para cada tipo de proteína y aplicación. Esta nueva proteína se podría reticular directamente en la matriz de fibrina como se ha descrito anteriormente. Sin embargo, la incorporación de un sitio de degradación enzimática altera la liberación de la proteína durante la proteólisis. Cuando las proteasas obtenidas de células alcanzan la proteína secuestrada, pueden escindir la proteína modificada por ingeniería en el sitio de degradación recién formado. Los productos de degradación resultantes incluirían la proteína liberada, que ahora estaría prácticamente libre de cualquier secuencia de fusión modificada por ingeniería, así como cualquier fibrina degradada. Por lo tanto, la proteína libre ahora sería prácticamente idéntica en la secuencia primaria al factor de crecimiento nativo y potencialmente más bioactiva. Se usa un método similar con las proteínas de fusión de unión a heparina. Estas nuevas proteínas contendrían entonces el sitio de degradación de proteasa, así como el nuevo dominio de unión a heparina. Las proteínas de fusión de unión a heparina se secuestrarán en la matriz por la incorporación de heparina en la fibrina por la inmovilización covalente de péptidos de unión a heparina. De nuevo, con el nuevo sitio de degradación de proteasa añadido, la proteína liberada sería idéntica en la secuencia primaria a la proteína natural.
III. Métodos de Uso
Los polímeros descritos en este documento se pueden reticular para formar matrices para reparación, regeneración o remodelación de tejidos y/o liberación de factores bioactivos, antes de o en el momento del implante. En algunos casos será deseable inducir la reticulación en el sitio de administración (no reivindicado) para conformar la matriz al tejido en el sitio de implante. En otros casos será conveniente preparar la matriz antes del implante y, en el caso en el que la matriz incorpora heparina o péptidos de unión a heparina que se usan para unirse a otras moléculas bioactivas tales como factores de crecimiento, estos factores se pueden añadir a la matriz antes de o en el momento del implante. En algunos casos asimismo puede ser conveniente "rellenar" la matriz con estos factores bioactivos, cuando los factores cargados originalmente se han liberado.
La reticulación se puede conseguir mediante la adición de agente de reticulación exógeno o, en el caso en el que el polímero incluye un sustrato de factor XIIIa, durante procedimientos quirúrgicos o mediante adición de trombina localmente en el sitio de implante.
También se pueden añadir células a la matriz antes de o en el momento del implante o incluso posteriormente al implante, en o después de la reticulación del polímero para formar la matriz. Esto puede ser además o en lugar de la reticulación de la matriz para producir una separación intersticial diseñada para promover la proliferación o el crecimiento invasivo de células.
Aunque en muchos casos será deseable implantar la matriz para promover el crecimiento o la proliferación celular, en algunos casos, los factores bioactivos se usarán para inhibir la velocidad de proliferación celular. Una aplicación específica es inhibir la formación de adhesiones después de cirugía.
Los siguientes ejemplos se incluyen para demostrar realizaciones preferidas de la invención. Aunque las composiciones y los métodos se han descrito en términos de realizaciones preferidas, será evidente para los especialistas en la técnica que se pueden aplicar variaciones a la composición, los métodos y en los pasos o en la secuencia de pasos del método descrito en este documento sin alejarse del concepto, espíritu y alcance de la invención.
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Ejemplo 1 Acoplamiento Indirecto de Heparina por un Péptido de Unión a Heparina para unirse a factor de crecimiento
Se sintetizó una quimera peptídica que contenía tanto un sustrato de factor XIIIa como un domino de unión a heparina por síntesis en fase sólida convencional. Un péptido de muestra es uno que contiene la siguiente secuencia dLNQEQVSPK(A)FAKLAARLYRKA (SEC ID Nº: 21), donde el extremo N del péptido contiene el sustrato de factor XIIIa y la secuencia en cursiva contiene un péptido modificado del dominio de unión a heparina de ATIII (dL indica dansil leucina, que se usa para permitir la detección del péptido por fluorescencia).
Se usó cromatografía de exclusión por tamaño para determinar la cantidad de péptido reticulado hasta geles de fibrina usando el método de incorporación que se ha desarrollado previamente. Un péptido bi-dominio que contiene el dominio de unión a heparina de antitrombina III y un marcador fluorescente se incorporaron en geles de fibrina durante la polimerización. El péptido libre se lavó de los geles y la red de fibrina se degradó con plasmina. Los productos de degradación se analizaron por cromatografía líquida de alto rendimiento (cromatografía de exclusión por tamaño) para determinar la cantidad de péptido (por fluorescencia) presente por mol de fibrinógeno (por absorbancia a UV). La señal de fluorescencia de geles modificados por péptido aparecía en un momento de elución anterior de lo que lo hizo la señal del péptido libre solo, indicando que todo el péptido presente en los geles modificados estaba reticulado hasta fibrina (FIGURA 1). La cuantificación basada en patrones de concentración conocida tanto para péptido como para redes de fibrina degradadas con plasmina mostró incorporación de 8,7 \pm 0,2 moles de péptido por mol de fibrinógeno (n=10).
Para evaluar esta estrategia para liberar factores de crecimiento de unión a heparina de matrices de crecimiento invasivo celular de fibrina que también comprenden un péptido bi-domino unido covalentemente, un domino del cual es un sustrato de factor XIIIa y un dominio del cual es un dominio de unión a heparina basado en antitrombina III, se cultivaron ganglios de raíz dorsal de manera tridimensional dentro de geles de fibrina en una diversidad de condiciones, como se muestra a continuación.
Protocolo de Reticulación para el uso de Péptidos de Unión a Heparina
1) Dializar fibrinógeno (8 mg/ml) frente a 4 l de solución salina tamponada con Tris (Tris 33 mM), pH 7,4 du rante 24 horas.
2) Filtrar a esterilidad fibrinógeno usando un filtro de jeringa de 0,2 \mum.
3) Preparar las siguientes soluciones peptídicas:
4
4) Preparar solución de trombina: 100 unidades en 5 ml de TBS.
5) Añadir 1,4 ml de fibrinógeno a cada solución de péptido.
6) Preparar geles: añadir 20 \mul de TBS + CaCl_{2} 50 mM, 40 \mul de solución de trombina (20 unidades/ml) y 340 \mul de solución de péptido + fibrinógeno. (las anteriores soluciones constituyen 6 geles).
7) Incubar a 37ºC durante 1 h.
8) Lavar 5 veces en 24 horas. Usar 1 ml de TBS las primeras 4 veces y medio neuronal la última vez.
9) Disecar ganglios de raíz dorsal embrionarios de pollos de 8 días.
10) Poner un ganglio en cada gel y poner a 37ºC durante 1 h.
11) Añadir 1 ml de medio neuronal a cada gel.
12) Cambiar medio después de 24 horas.
Los resultados de estos estudios con cultivo de ganglio de raíz dorsal se muestran en la Figura 2. Estos resultados muestran que la heparina y el péptido solo no aumentan la extensión de neuritas. Cuando se añade sin péptido y heparina, el bFGF no mejora el crecimiento de neuritas, demostrando que el protocolo de lavado usado es suficiente. La mejora de neuritas aumenta por la adición tanto de 1 \mug/ml como de 5 \mug/ml de bFGF unido de un modo dependiente de dosis. La adición de 1,0 \mug/ml de VEGF unido no aumentó la extensión de neuritas, sugiriendo que el efecto de bFGF no se debe a su capacidad de promover la angiogénesis.
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Ejemplo 2 Síntesis de Quimeras de Heparina-Péptido
Se sintetizó una quimera de heparina-péptido acoplando un péptido, que contenía el sustrato de factor XIIIa en el extremo N y una poli-lisina en el extremo C, a un oligosacárido de heparina, con un único grupo aldehído en un extremo, por aminación reductora. Se sintetiza un péptido con la siguiente secuencia, dLNQEQVSPLKKKG (SEC ID Nº: 22) por química de péptido en fase sólida convencional. Los oligosacáridos de heparina se preparan por degradación con ácido nitroso convencional de heparina, dando como resultado la formación de un aldehído en el terminal reductor del oligosacárido escindido. Durante el acoplamiento, el grupo amino de la cadena lateral de lisina ataca el aldehído en el extremo reductor del oligosacárido de heparina para formar una base de Schiff. Después, la base de Schiff se reduce para formar un producto estable. A continuación se proporciona un protocolo de acoplamiento de muestra. También se puede acoplar la heparina al sitio de sustrato de inhibidor de alfa 2 plasmina más sencillo NQEQVSP (SEC ID Nº: 20). Existe una amina primaria en este péptido solamente en el extremo N. Cuando se sintetiza el péptido, como habitualmente, en una resina de fase sólida, el extremo N se expone a quedar colgando y cuando la alfa amina en el extremo N está desprotegida, está disponible una amina primaria para la reacción. Se puede formar de manera sencilla una forma reactiva de heparina por escisión en ciertos ácidos, como se describe en Grainger, D., et al., (1988). J. Biomed Mat. Res. 22: 231-249, para formar un fragmento de heparina con un grupo aldehído terminal. Este aldehído reactivo se puede pasar sobre el péptido unido aún unido a la resina, condensarse sobre el mismo, para formar una quimera de péptido-heparina que está unida por una base de Schiff, que se puede reducir de forma sencilla por cianoborohidruro sódico para formar una amina secundaria, que es una forma más estable.
Se podrían usar otras estrategias. Por ejemplo, la heparina de aldehído se puede convertir en heparina amino primaria por reacción con un exceso de etilenodiamina y reducción de la base de Schiff de forma análoga a lo que se ha descrito anteriormente. La purificación de la etilenodiamina residual libre se puede conseguir por diálisis. Esta amino heparina se puede condensar en el grupo carboxilo C terminal escindiendo el péptido de la resina sólida con el grupo carboxilo en el resto E todavía protegido, seguido de activación del grupo carboxilo en el extremo C usando reactivos convencionales de síntesis peptídica, y después seguido de desprotección del grupo carboxilo en el resto E.
Protocolo de Acoplamiento
1)
Disolver 1,8 mM de péptido y 1,8 mM de heparina degradada por ácido nitroso en tampón borato 50 mM, pH 9. Dejar reaccionar durante 30 minutos.
2)
Añadir NaCNBH_{3} 160 mM y dejar reaccionar durante 12 horas.
3)
Añadir NaCNBH_{3} 240 mM y dejar reaccionar durante 12 horas.
4)
Ajustar pH a 7 con HCl diluido.
5)
Añadir NaCl hasta una concentración final de 1 M.
6)
Dializar frente a 4 l de agua desionizada durante 24 horas.
7)
Liofilizar para obtener producto de reacción.
8)
Analizar rendimiento de reacción por cromatografía de exclusión por tamaño.
9)
La purificación del producto deseado se consigue usando cromatografía de intercambio aniónico.
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Uso: Protocolo de Reticulación para uso de Quimeras de Heparina-Péptido
1) Dializar fibrinógeno (8 mg/ml) frente a 4 l de solución salina tamponada con Tris (Tris 33 mM), pH 7,4 durante 24 horas.
2) Filtrar a esterilidad fibrinógeno usando un filtro de jeringa de 0,2 \mum.
3) Preparar las siguientes soluciones de quimera:
5
4) Preparar solución de trombina: 100 unidades en 5 ml de TBS.
5) Añadir 1,4 ml de fibrinógeno a cada solución de quimera.
6) Preparar geles: añadir 20 \mul de TBS + CaCl_{2} 50 mM, 40 \mul de solución de trombina (20 unidades/ml) y 340 \mul de solución de quimera + fibrinógeno (las anteriores soluciones constituyen 6 geles).
7) Incubar a 37ºC durante 1 h.
8) Lavar 5 veces en 24 horas. Usar 1 ml de TBS las primeras 4 veces y medio neuronal la última vez.
9) Disecar ganglios de raíz dorsal embrionarios de pollos de 8 días.
10) Poner un ganglio en cada gel y poner a 37ºC durante 1 h.
11) Añadir 1 ml de medio neuronal a cada gel.
12) Cambiar medio después de 24 horas.
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Ejemplo 3 Sitios Degradables en Proteína de Fusión y en Quimera Peptídica proteínas de fusión de NGF que contienen sustrato de Factor XIIIa y un sitio de degradación de plasmina
Las proteína de fusión de \beta-NGF se expresaron con un sustrato de reticulación exógeno que permite que las proteínas de fusión de \beta-NGF se reticulen enzimáticamente hasta matrices de fibrina, lo que sirvió como el material de base para el sistema de suministro de fármaco. Un sustrato de plasmina se puso entre el sustrato de reticulación y el dominio de \beta-NGF en la proteína de fusión, que sirvió con un enlazador degradable y permitió que se liberara \beta-NGF de la matriz de una forma prácticamente idéntica a su secuencia nativa por escisión enzimática. Las proteínas de fusión de \beta-NGF se unieron covalentemente a la fibrina por la actividad de transglutaminasa del factor XIIIa y se ensayaron en un modelo in vitro de regeneración nerviosa para determinar la capacidad del sistema de suministro para liberar factores de crecimiento activos en respuesta a actividad enzimática asociada con células.
Síntesis génica
Se prepararon dos proteínas de fusión de \beta-NGF por expresión de proteína recombinante. Cada proteína contenía un sustrato de reticulación en el extremo N de la proteína que consistía en el sustrato de factor XIIIa de transglutaminasa (TG) del inhibidor de \alpha_{2}-plasmina, NQEQVSPL (SEC ID Nº: 23). Cada proteína de fusión de \beta-NGF también contenía la secuencia nativa de \beta-NGF en el extremo C de la proteína. Uno de dos sustratos de plasmina (P) se puso entre el sustrato de reticulación y el dominio de \beta-NGF de la proteína de fusión, un sustrato de plasmina funcional (LIK/MKP, donde / indica el sitio de escisión) o un sustrato de plasmina no funcional (LINMKP) en el que el resto de lisina en el sitio de escisión en el sustrato de plasmina se cambió a un resto de asparagina para convertir el sustrato de plasmina en no funcional. La proteína de fusión que contenía un sustrato de plasmina funcional se denominó TG-P-NGF y la proteína de fusión que contenía un sustrato de plasmina no funcional se denominó TG-P_{i}-NGF.
La secuencia de proteína a expresar es la siguiente:
1000
donde la región en cursiva es el marcador histidina obtenido del vector de expresión y la región subrayada es el sitio de escisión por trombina. Los restos son la secuencia de sustrato de reticulación para factor XIIIa y la región doblemente subrayada indica el sustrato de plasmina.
\newpage
El plásmido de clonación usado para el ensamblaje de genes era pUC 18. La secuencia de ADN del gen es la siguiente de 5' a 3':
6
Para sintetizar la proteína de fusión de \beta-NGF por expresión de proteína recombinante, se clonó el gen que codifica la proteína. Una vez que se hubieron diseñado los fragmentos génicos, se añadieron sitios Eco RI y Hind III al extremo de cada fragmento, para permitir la clonación de estos fragmentos en el polienlazador de clonación de pUC 18 (Gibco, Basel, Suiza). Los oligonucleótidos monocatenarios 3' y 5' de cada fragmento génico se sintetizaron por Microsynth (Balgach, Suiza) con extremos cohesivos para los dos sitios de restricción de clonación. Los oligonucleótidos monocatenarios se purificaron usando electrofóresis en gel de poliacrilamida desnaturalizante (PAGE), la banda de mayor peso molecular para cada fragmento se extrajo del gel y se hibridaron los correspondientes fragmentos oligonucleotídicos 3' y 5'. Los fragmentos hibridados se fosforilaron con T4 ADN cinasa (Boehringer Mannheim, Rotkreuz, Suiza) y se ligaron en pUC18. Después de la ligación, los plásmidos se introdujeron por transformación en células competentes de DH5-F' y se sembraron en placas de isopropil-D-tiogalactopiranósido (IPTG)/5-bromo-4-cloro-3-indolil-D-galactopiranósido (X-gal)/ampicilina (Amp) para explorar para la inserción de los fragmentos génicos en el plásmido. Los plásmidos de colonias que contenían fragmentos génicos insertados se secuenciaron para identificar colonias que contenían fragmentos génicos con la secuencia correcta. Después de que se hubiera obtenido la secuencia correcta para cada fragmento génico, los fragmentos se ensamblaron para formar el gen completo para la proteína de fusión. En resumen, los plásmidos que contenían el fragmento 2 se digirieron con las enzimas Eco RV y Hind III (Boehringer Mannheim) y los fragmentos se purificaron por PAGE no desnaturalizante. Los plásmidos que contenían el fragmento 1 se digirieron con las enzimas Eco RV y Hind III, se desfosforilaron con fosfatasa alcalina (Boehringer Mannheim) y los plásmidos digeridos se purificaron por electrofóresis en gel de agarosa. El fragmento 2 se ligó en los plásmidos digeridos que contenían el fragmento 1 para obtener un plásmido que contenía tanto los fragmentos 1 como 2. Este plásmido se introdujo por transformación en células competentes de DH5-F' y se sembró en placas de Amp. Las colonias resultantes se exploraron para plásmidos que contenían ambos fragmentos y estos plásmidos se secuenciaron. Este proceso se repitió hasta que se ensambló el gen completo para la proteína de fusión de \beta-NGF.
El gen para la proteína de fusión TG-P_{i}-NGF se preparó a partir del gen de TG-P-NGF por mutagénesis dirigida. Se realizó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para modificar la región del gen de proteína de fusión que codifica el sustrato de plasmina, usando cebadores que contenían la modificación deseada del gen. Usando el gen de TG-P-NGF como un molde, se realizaron dos reacciones, una con el cebador A y el cebador B y otra con el cebador C y el cebador D.
Cebador A
AACAGCTATG ACCATG (M13 inverso)
Cebador B
GTTTCATGTT GATCAGCGGC AGT
Cebador C
TGATCAACAT GAAACCCGTG GAA
Cebador D
GTAAAACGACG GCCAGT (M13) (SEC ID Nº: 26-29) Los productos de las dos reacciones se purificaron por electrofóresis en gel de agarosa y se usaron como cebadores para la tercera reacción. Los cebadores A y D también se añadieron a la tercera reacción para ampliar el producto deseado. El producto de reacción final se digirió con Eco RI y Hind III y se purificó por electroforesis en gel de agarosa. El fragmento de PCR se clonó en pUC18 y se secuenció para identificar el producto de PCR correcto.
Expresión de Proteína
El gen completo para cada una de las proteínas de fusión de \beta-NGF se digirió de pUC18 y se ligó en el vector de expresión pET14b (Novagen, Madison, Wisconsin). El vector de expresión se introdujo por transformación en el hospedador de expresión, BL21 (DE3) pLysS para permitir la regulación estrecha de la expresión de proteína de fusión. La proteína de fusión se expresó cultivando el E. coli hasta que alcanzó el crecimiento de fase semi-logarítmica (densidad óptica a 600 nm de 0,4-0,6) e induciendo después la expresión de proteína por la adición de IPTG 0,4 mM al medio de cultivo. Las bacterias se recogieron después de 2 h por centrifugación a 5500 xg. Después de la recogida, las células se suspendieron en 1/10 del volumen de cultivo de Tris HCl 20 mM, NaCl 250 mM, pH 8,0. Se añadieron lisozima (0,4 mg/ml) y ADNasa (5 ng/ml) a las células recogidas y la solución se incubó a 37ºC durante 30 minutos. Los cuerpos de inclusión se recogieron del lisado celular por centrifugación a 10.000 xg durante 15 min. El sedimento que contenía los cuerpos de inclusión se resuspendió en 40 ml/l de volumen de cultivo de tampón de unión (imidazol 5 mM, NaCl 0,5 M, Tris HCl 20 mM, pH 7,9) que contenía clorhidrato de guanidina (GuHCl) 6 M a temperatura ambiente durante 90 min. El material insoluble en la solución se recogió por centrifugación durante 20 min a 20.000 xg y el sobrenadante, que contenía la proteína de fusión solubilizada, se guardó para purificación
adicional.
Purificación de Proteína
La proteína de fusión contenía un marcador histidina escindible por trombina para la purificación en el extremo N de la proteína, debido a que el gen de la proteína de fusión de \beta-NGF se insertó en pET14b entre los sitios Nde I y Bam HI. Se usó la cromatografía de afinidad de níquel para purificar la proteína de fusión de \beta-NGF. Se introdujo resina His Bind^{TM} (Novagen) en una columna de cromatografía (2,5 ml de volumen de lecho por litro de volumen de cultivo), se cargó con Ni^{++} y se equilibró con tampón de unión que contenía GuHCl 6 M (de acuerdo con las instrucciones del fabricante). El sobrenadante, que contenía la proteína de fusión, se filtró con un filtro de jeringa de 5 \mum y se cargó en la columna. La columna se lavó con 10 volúmenes de columna de tampón de unión que contenía urea 8 M y 6 volúmenes de columna de tampón de lavado (imidazol 20 mM, NaCl 0,5 M, Tris HCl 20 mM, pH 7,9) que contenía urea 8 M. La proteína de fusión se eluyó con 4 volúmenes de columna de tampón de elución (imidazol 1 mM, NaCl 0,5 M, Tris HCl 20 mM, pH 7,9) que contenía urea 8 M. La presencia de proteína de fusión de \beta-NGF en las fracciones de elución se confirmó por dodecilsulfato sódico (SDS)-PAGE.
Replegamiento de Proteína
La proteína de fusión de \beta-NGF se replegó añadiendo un exceso de 5 veces de tampón de replegamiento helado (Tris HCl 20 mM, NaCl 250 mM, glutatión reducido 2 mM y glutatión oxidado 002 mM, pH 8,0) a la proteína de fusión de \beta-NGF purificada lentamente, hasta que se consiguió una concentración final de urea de 1,3 M. La proteína de fusión se replegó durante 48 h a 4ºC con agitación. La proteína de fusión replegada se dializó frente a un exceso de 50 veces de tampón de almacenamiento (Tris HCl 20 mM, NaCl 500 mM, pH 8,0) que contenía glicerol al 10% a 4ºC durante una noche. La proteína de fusión se concentró por centrifugación usando concentradores Vivaspin^{TM} (límite de PM 5000, Vivascience, Lincoln, RU) hasta una concentración de aproximadamente 300-400 \mug/ml, como se mide por el ensayo de Bradford.
Incorporación de Proteína de Fusión de \beta-NGF en Matrices de Fibrina
Para determinar la eficacia de la incorporación de proteína de fusión de \beta-NGF en matrices de fibrina, la proteína de fusión TG-P_{i}-NGF se marcó con biotina para permitir la cuantificación de \beta-NGF por un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) directo. Se añadió un exceso molar de 20 veces de Sulfo-N-hidroxisuccinimida (NHS)-LC Biotina (Pierce, Lausanne, Suiza) a la proteína de fusión de \beta-NGF en solución salina tamponada con fosfato (PBS, tampón fosfato 0,01 M, 8 g/l de NaCl, 0,2 g/l de KCl, pH 7,4) a una concentración de 1 mg/ml de una solución madre de 10 mg/ml de biotina en N,N-dimetilformamida (disuelta durante 10 min a 37ºC). La reacción se dejó avanzar durante 2 h a temperatura ambiente. Después, la biotina no reaccionada se eliminó por cromatografía de nitración en gel usando una columna PD-10 (Amersham Pharmacia, Dubendorf, Suiza).
Se adsorbió una cantidad conocida de \beta-NGF marcado en placas de 96 pocillos durante una noche en tampón de recubrimiento (NaHCO_{3} 0,1 M, pH 8) a 4ºC. Los pocillos se bloquearon con albúmina sérica bovina al 1% (BSA) en PBS durante 2 h a temperatura ambiente. Los pocillos se lavaron 3 veces en PBS con Tween-20 al 0,5% (tampón PBS). Se diluyó estreptavidina conjugada con peroxidasa de rábano rusticano (HRP) hasta 1 \mug/ml en PBS y se añadió a cada pocillo durante 1 h. Los pocillos se lavaron 3 veces con tampón PBST y después se incubaron en solución de revelado de ABTS (ácido 2,2'-Azino-bis(3-etilbenz-tiazolina-6-sulfónico)) (NaC_{2}H_{3}O_{2} 0,1 M, NaH_{2}PO_{4} 0,05 M, ABTS al 0,1%, H_{2}O_{2} al 0,01%, pH 42). Después de 1-5 minutos, la reacción se detuvo añadiendo un volumen igual de SDS al 0,6% y se midió la absorbancia de cada pocillo a 405 nm usando un lector de placa El311SX de Bio-Tek Instruments (Winooski, Vermont). Se preparó una curva patrón de la concentración de \beta-NGF frente a la absorbancia a 405 nm usando estas mediciones del ensayo de ELISA directo.
Se disolvió fibrinógeno sin plasminógeno en agua y se dializó frente a solución salina tamponada con Tris (TBS, Tris 33 mM, 8 g/l de NaCl, 0,2 g/l de KCl) a pH 7,4 durante 24 h. La proteína de fusión de \beta-NGF se incubó con Ca^{++} 5 mM y 4 unidades NIH/ml de trombina durante 1 h a 37ºC para eliminar el marcador histidina usado para la purificación. La solución de proteína de fusión de \beta-NGF se mezcló en proporción igual con fibrinógeno a una concentración de 8 mg/ml y se polimerizó a 37ºC durante 60 min. Las matrices de fibrina se lavaron 5 veces a lo largo de 24 h y cada lavado se registró para determinar la cantidad total de \beta-NGF eliminado por lavado de la matriz. Después de 24 h, las matrices de fibrina que contenían \beta-NGF se degradaron con 0,1 U de plasmina porcina. La cantidad de \beta-NGF en los lavados y remanente en la matriz se cuantificó como se ha descrito anteriormente por ELISA directo y se construyó una curva patrón de \beta-NGF para cada ELISA realizado.
Se realizó una transferencia de Western para mostrar directamente que las proteínas de fusión de \beta-NGF estaban acopladas covalentemente a matrices de fibrina. Se prepararon y lavaron matrices de fibrina como se describe en el ensayo de cuantificación de incorporación. Las matrices se lavaron 5 veces a lo largo de 24 h y después se degradaron con plasmina, como se ha descrito anteriormente. Los productos de degradación se separaron por SDS-PAGE usando un gel desnaturalizante al 13,5%. Las proteínas del gel se transfirieron a una membrana de difluoruro de polivinilideno (PVDF) de Inmobilion-P^{TM} activada (Millipore, Volketswil, Suiza) con una corriente de 400 mA durante 1 h. La membrana se secó durante una noche. Las proteínas se transfirieron a la membrana, incluyendo el marcador de peso molecular, se visualizaron por tinción con Ponceau S al 0,2%. La unión de proteína no específica a la membrana se bloqueó con BSA al 3% en TBS durante 2 h. La membrana se incubó con anticuerpo de cabra anti-\beta-NGF humano (R&D Systems, Minneapolis, Minnesota) a una concentración de 0,2 \mug/ml en BSA al 3% durante 1 h. La membrana se lavó 3 veces con TBS durante 5 min y se incubó con el anticuerpo secundario, anti-inmunoglobulinas de cabra de conejo conjugado con HRP (Dako Diagnostics, Zug, Suiza) a una concentración de 0,5 \mug/ml en BSA al 3% durante 30 min. La membrana se lavó 3 veces con TBS y después se incubó durante 5 min con un sustrato de HRP quimioluminiscente mejorado (Pierce, Lausanne, Suiza) diluido 1:5 en PBS. El exceso de líquido se eliminó de la membrana y se cubrió con plástico y se expuso a película de rayos X durante
5-60 s.
De hecho, se observó un aumento del peso molecular para proteínas de fusión de \beta-NGF que estaban presentes durante la polimerización de matrices de fibrina), aunque en el caso de \beta-NGF que carecía de un sustrato de reticulación, no se observó \beta-NGF en la matriz después del lavado. Este resultado mostró directamente que la proteína de fusión de \beta-NGF estaba inmovilizada covalentemente dentro de matrices de fibrina durante la polimerización por la actividad transglutaminasa del factor XIIIa.
Bioactividad de Proteína de Fusión de \beta-NGF Inmovilizada
Para determinar la capacidad de proteína de fusión de \beta-NGF inmovilizada covalentemente de suministrase de un modo controlado, se incorporaron proteínas de fusión de \beta-NGF en matrices de fibrina durante la polimerización y se ensayó la capacidad de estas matrices de mejorar la extensión de neuritas in vitro usando DRG de pollo. Se observó que TG-P-NGF mejora la extensión de neuritas en más del 350% frente a la fibrina no modificada sin NGF presente en el medio de cultivo y hasta el 50% con respecto a la fibrina no modificada con 10 ng/ml de NGF nativo en el medio (Figura 3). TG-P_{i}-NGF, que contenía un sustrato de plasmina no funcional, no se pudo escindir de la matriz de fibrina por plasmina en una forma nativa y no mejoró significativamente la extensión de neuritas frente al NGF nativo en el medio de cultivo, cuando se inmovilizó covalentemente dentro de matrices de fibrina a cualquiera de las concentraciones ensayadas. Sin embargo, TG-P-NGF, que contenía un sustrato de plasmina funcional, se pudo escindir de la matriz por plasmina de un modo muy similar al NGF nativo y se observó que mejoraba la extensión de neuritas, incluso en comparación con dosis similares de NGF nativo presente en el medio de cultivo. Se observó un efecto de dosis-respuesta para la proteína de fusión de TG-P-NGF, consiguiéndose una dosis óptima cuando estaba presente 1-5 \mug/ml de proteína de fusión de \beta-NGF en la mezcla de polimerización. Estos resultados demostraron que la proteína de fusión de TG-P-NGF era bioactiva cuando estaba inmovilizada dentro de matrices de fibrina, sugiriendo que se podría liberar en una forma activa por degradación de matriz asociada con células. A pesar de la menor actividad de las proteínas de fusión de \beta-NGF en el ensayo de actividad de células PC12, cuando la proteína de fusión de \beta-NGF degradable por plasmina se acoplaba covalentemente a fibrina, promovió mayores niveles de extensión de neuritas que la misma dosis de NGF nativo en el medio de cultivo. Estos resultados también sugirieron que para que las proteínas de fusión de \beta-NGF sean completamente activas, se tienen que liberar de la matriz de fibrina de una forma similar a la de su estructura nativa.
Eficacia de Reticulación de Proteína de Fusión de \beta-NGF
Para determinar la eficacia de la incorporación de proteína de fusión de \beta-NGF en matrices de fibrina, la proteína se marcó con biotina y se realizó un ELISA directo en matrices de fibrina que contenían proteína de fusión de \beta-NGF marcada con biotina en la mezcla de polimerización. Se incorporaron proteínas de fusión de \beta-NGF marcadas con biotina en matrices de fibrina durante la polimerización. Después del lavado para eliminar cualquier proteína de fusión de \beta-NGF no unida, las matrices se degradaron con plasmina y se cuantificó la cantidad de \beta-NGF en las matrices degradadas y en los lavados. El porcentaje de la proteína de fusión de \beta-NGF incorporada en la matriz de fibrina se muestra en la Figura 4 como una función de la concentración de \beta-NGF en la mezcla de polimerización. A lo largo del intervalo de concentraciones de proteína de fusión de \beta-NGF ensayado, se incorporó el 50-60% de la proteína de fusión durante la polimerización de la matriz de fibrina. Este resultado demostró que se incorporaron proteínas de fusión de \beta-NGF en matrices de fibrina de manera eficaz mediante la acción del factor XIIIa.
Proteína de fusión de \beta-NGF con un dominio de unión a heparina y un sitio de degradación de plasmina
El NGF se puede expresar como proteína de fusión en E. coli, que contiene un dominio de unión a heparina en el extremo N, un sustrato de plasmina en el centro y la secuencia de NGF en el extremo C de la proteína. Esto se consigue construyendo un gen sintético que contiene el ADN que codifica la proteína de fusión deseada. La secuencia de proteína a expresar es la siguiente:
1001
donde la región en cursiva es el marcador Histidina obtenido del vector de expresión y la región subrayada es el sitio de escisión por trombina. El subrayado discontinuo indica la secuencia de unión a heparina y el subrayado doble indica el sustrato de plasmina.
El plásmido de clonación usado para el ensamblaje de genes era pUC 18. La secuencia de ADN del gen es la siguiente de 5' a 3':
7
Este gen se inserta entre los sitios EcoRI y HindIII en la región de clonación de polienlazador de pUC 18, como se muestra en el mapa.
Después del ensamblaje, este gen se inserta en el vector de expresión. Después se realizan la expresión y purificación como se ha descrito anteriormente.
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Ejemplo 4 Proteínas de Fusión de factores de crecimiento que se unen espontáneamente a heparina A. Biosíntesis de proteínas de fusión de sustrato de Factor XIIIa con NGF
El NGF se puede expresar como una proteína de fusión en E. coli, que contiene un sustrato de factor XIIIa en el extremo N y la secuencia de \beta-NGF humano en el extremo C de la proteína. Esto se consigue construyendo un gen sintético que contiene el ADN que codifica la proteína de fusión deseada. La secuencia de proteína a expresar es la siguiente:
1002
donde la región en cursiva es el marcador Histidina obtenido del vector de expresión y la región subrayada es el sitio de escisión por trombina. Los restos son la secuencia de sustrato de reticulación para el factor XIIIa.
El plásmido de clonación usado para el ensamblaje de genes era pUC 18, que es el mismo que pUC 19 excepto porque se invierte la secuencia de la región de clonación de polienlazador. A continuación hay un mapa de pUC 19, que se obtuvo de New England Biolabs. La secuencia de ADN del gen es la siguiente de 5' a 3':
8
Este gen se inserta entre los sitios EcoRI y HindIII en la región de clonación de polienlazador de pUC 18, como se muestra en el mapa. Después del ensamblaje de genes, este gen se inserta en el vector de expresión pET 14b entre los sitios NdeI y BamHI. A continuación hay un mapa del vector pET 14b, que se obtuvo de Novagen. Después de la inserción del gen en el vector de expresión, el plásmido se introduce por transformación en células competentes de BL21(DE3)pLysS. Las células se cultivan hasta que alcanzan una DO de aproximadamente 0,6, después se inducen para expresar la proteína de fusión con IPTG (concentración final en solución 0,4 mM). La expresión se continúa durante 2-3 horas. Las células se ponen en hielo durante 5 minutos y después se recogen por centrifugación a 5000 x g durante 5 min a 4ºC. Se resuspenden en 0,25 de volumen de cultivo de Tris-HCl 50 mM frío pH 8,0 a 25ºC. Las células se centrifugan como anteriormente y el sedimento se congela. Las células se lisan después de la descon-
gelación.
El lisado celular se centrifuga y el sobrenadante se desecha. El sedimento se resuspende en Triton X100. La solución después se centrifuga y se desecha el sobrenadante. El sedimento se resuspende en urea 6 M y la proteína de fusión se purifica por cromatografía de afinidad de histidina. El marcador histidina se puede escindir por trombina durante la polimerización y lavar de los geles durante el procedimiento de lavado convencional.
B. Biosíntesis de proteínas de fusión de dominio de unión a heparina de NGF
El NGF se puede expresar como una proteína de fusión en E. coli, que contiene un dominio de unión a heparina en el extremo N y la secuencia de NGF en el extremo C de la proteína. Esto se consigue construyendo un gen sintético que contiene el ADN que codifica la proteína de fusión deseada. La secuencia de proteína a expresar es la si-
guiente:
1003
donde la región en cursiva es el marcador Histidina obtenido del vector de expresión y la región subrayada es el sitio de escisión por trombina. La región subrayada con un subrayado discontinuo es la secuencia de unión a heparina.
El plásmido de clonación usado para el ensamblaje de genes era pUC 18. La secuencia de ADN del gen es la siguiente de 5' a 3':
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Este gen se inserta entre los sitios EcoRI y HindIII en la región de clonación de polienlazador de pUC 18, como se muestra en el mapa. Después del ensamblaje, este gen se inserta en el vector de expresión. Después se realizan la expresión y purificación como se ha descrito anteriormente.
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Ejemplo 5 Suministro de BMP2 de matrices de Fibrina con péptidos Bi-dominio para afinidad por Heparina
Se ha demostrado que el factor morfogénico óseo unido a la matriz de fibrina es capaz de controlar la liberación de este factor y cuando esta matriz se implanta por vía subcutánea se forma hueso ectópico. Aunque este procedimiento es diferente de la formulación ósea dentro de un defecto óseo, proporciona un método adecuado para ensayar la capacidad de controlar la liberación de un factor de crecimiento bioactivo in vivo.
Se sintetizaron geles de fibrina con un péptido bi-domino diferente con la secuencia LNQEQVSPK(A)FAKLAARLYRKA (SEC ID Nº: 36). Este péptido se obtiene de la secuencia de sustrato de Factor XIIIa para el inhibidor de \alpha_{2}-plasmina en el primer dominio y un mimético del dominio de unión a heparina de antitrombina III en el segundo dominio. La BMP-2 es una proteína de unión a heparina y se unirá a la secuencia proporcionada anteriormente. Los geles se polimerizaron en presencia del péptido (a 1 mM), heparina y BMP-2 humana recombinante en proporciones de heparina a BMP-2 de 1:1 y 40:1.
Se crearon geles de control que tenían cantidades equivalentes de la proteína morfogénica, BMP-2, pero que carecían de la heparina y el péptido bi-dominio. Después, estos geles se implantaron por vía subcutánea en ratas y se dejaron permanecer durante dos semanas. Cuando las matrices se extrajeron, se observó de poco a nada de hueso de los geles que no contenían el sistema de liberación de péptido-heparina, mientras que los geles que contenían el sistema mostraron una formación ósea significativa.
\newpage
Esto se observa del mejor modo en la masa de las matrices eliminadas que se muestra en la Tabla 3.
10
El sistema de liberación mejoró la formación de hueso ectópico dentro de la matriz, demostrando la viabilidad del sistema de liberación in vivo.
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Ejemplo 6 Incorporación de Péptido con Factor XIII exógeno
El fibrinógeno purificado como se obtiene por métodos de precipitación convencionales contiene pequeñas cantidades de factor XIIIa endógeno que actúa como un reactivo de limitación en la incorporación del péptido bi-dominio. Esto se demostró mediante el uso de fibrinógeno purificado, en el que fue posible incorporar los péptidos bi-domino a concentraciones de hasta 8,2 mol de péptido/mol de fibrinógeno basándose en la concentración de factor XIIIa endógeno. Se demostró que la adición de factor XIIIa exógeno mejora el nivel de la incorporación de péptido. Esto es particularmente pertinente para el control de la concentración de péptido bi-dominio dentro del gel, que, a su vez, afectará a la adhesión celular y determinará el límite superior para la incorporación de heparina y factor de crecimiento. En algunos casos puede ser ventajoso aumentar la adhesión celular, concentraciones de heparina o factor de crecimiento más allá de las posibles con fibrinógeno purificado convencional.
Se usó el factor XIII exógeno, purificado de plasma agrupado, para incorporar el péptido bi-dominio, dLNQEQVSPLRGD (SEC ID Nº: 1) en los geles. Se añadió 1 U de factor XIII exógeno por ml de gel de fibrina y se analizó el nivel de péptido bi-dominio incorporado covalentemente mediante análisis cromatográfico. Los resultados se muestran en la Figura 5. Cuando se añadió 1 U/ml de factor XIII exógeno, el nivel de incorporación alcanzó 25 mol de péptido/mol de fibrinógeno. Este nivel de incorporación está próximo al límite teórico basado en el número de posibles sitios de unión.
También se demostró la capacidad del péptido bi-dominio, dLNQEQVSPLRGD (SEC ID Nº: 1), de incorporarse en kits de adhesivo de fibrina disponibles en el mercado. Se obtuvieron kits Tissucol y después se fraccionaron en múltiples muestras. Se añadió péptido bi-dominio exógeno hasta 6 mM y se midió el nivel de incorporación mediante análisis cromatográfico (Figura 6). El nivel de incorporación de péptido se ensayó a lo largo de un amplio intervalo de concentraciones de péptido bi-dominio iniciales para tres kits separados. Cuando se midió el nivel de incorporación, se observó que tuvo lugar la máxima incorporación a concentraciones superiores a péptido exógeno 5 mM. Puede ser que en estas matrices altamente densas, la difusión comience a desempeñar un papel en el proceso de incorporación. Sin embargo, se observó un nivel muy elevado de incorporación alcanzando el nivel al menos 25 mol de péptido/mol de fibrinógeno. Además, existe una variabilidad significativa en la composición de kits de adhesivo de fibrina con un amplio intervalo de concentraciones posibles de proteína presente. Sin embargo, esto claramente no afectó a la incorporación del péptido bi-dominio significativamente ya que el perfil de incorporación era similar para los tres kits ensayados.

Claims (33)

1. Una matriz reticulada adecuada para crecimiento o crecimiento invasivo celular, en la que al menos un injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería se une covalentemente o iónicamente a la matriz,
en la que el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería comprende
un primer dominio que comprende un factor bioactivo o un polisacárido,
un segundo dominio, en el que el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería está unido a la matriz por el segundo dominio y
un sitio de degradación enzimática o hidrolítica entre el primer domino y el segundo dominio.
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2. La matriz de la reivindicación 1, en la que el factor bioactivo es un péptido.
3. La matriz de la reivindicación 2, en la que el péptido comprende al menos un dominio de unión a heparina.
4. La matriz de la reivindicación 1, en la que el factor bioactivo es un factor de crecimiento o una proteína.
5. La matriz de la reivindicación 4, en la que el factor bioactivo es un factor de crecimiento de unión a heparina.
6. La matriz de la reivindicación 5, en la que el factor de crecimiento de unión a heparina se selecciona entre el grupo que consiste en factor de crecimiento transformante beta, proteínas morfogénicas óseas, factor de crecimiento de fibroblastos, factor de crecimiento epitelial vascular, interleucina-8, neurotrofina-6, factor de crecimiento epidérmico de unión a heparina, factor de crecimiento de hepatocitos, factor de crecimiento de tejido conectivo, midquina, moléculas asociadas a crecimiento de unión a heparina y mezclas de los mismos.
7. La matriz de la reivindicación 1, en la que el factor bioactivo es una enzima.
8. La matriz de la reivindicación 1, en la que el polisacárido se selecciona entre el grupo que consiste en heparina, sulfato de heparina y sulfato de condroitina.
9. La matriz de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, donde la matriz se selecciona entre el grupo que consiste en proteínas, polisacáridos, glucoproteínas y materiales sintéticos.
10. La matriz de la reivindicación 9, donde la matriz comprende fibrina.
11. La matriz de la reivindicación 1, en la que el sitio de degradación es un sitio de degradación enzimática, que se escinde por una enzima seleccionada entre el grupo que consiste en plasmina y metaloproteinasa de matriz.
12. La matriz de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, en la que el segundo dominio es un domino de sustrato para una enzima de reticulación.
13. La matriz de la reivindicación 12, en la que el segundo dominio comprende un domino de sustrato de transglutaminasa.
14. La matriz de la reivindicación 13, en la que el segundo dominio es un dominio de sustrato de factor XIIIa.
15. La matriz de la reivindicación 14, en la que el segundo dominio comprende la SEC ID Nº: 20.
16. Un método para preparar una matriz que comprende los pasos de
a.
proporcionar al menos una matriz capaz de formar una matriz reticulada,
donde la matriz se selecciona entre el grupo que consiste en proteínas, polisacáridos, glucoproteínas y materiales sintéticos.
b.
añadir un injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería a la matriz,
donde el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería comprende
un primer dominio que comprende un factor bioactivo o un polisacárido,
un segundo dominio y
un sitio de degradación enzimática o hidrolítica entre el primer domino y el segundo dominio y
c. reticular la matriz, de tal forma que la matriz se una al segundo dominio del injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería.
\vskip1.000000\baselineskip
17. El método de la reivindicación 16, en el que el factor bioactivo se selecciona entre el grupo que consiste en péptidos, factores de crecimiento y enzimas.
18. El método de la reivindicación 17, en el que el factor bioactivo es un factor de crecimiento de unión a heparina.
19. El método de la reivindicación 18, en el que el factor de crecimiento de unión a heparina se selecciona entre el grupo que consiste en factor de crecimiento transformante beta, proteínas morfogénicas óseas, factor de crecimiento de fibroblastos, factor de crecimiento epitelial vascular, interleucina-8, neurotrofina-6, factor de crecimiento epidérmico de unión a heparina, factor de crecimiento de hepatocitos, factor de crecimiento de tejido conectivo, midquina, moléculas asociadas a crecimiento de unión a heparina y mezclas de los mismos.
20. El método de la reivindicación 17, en el que el factor bioactivo es péptido que comprende al menos un dominio de unión a heparina.
21. El método de la reivindicación 16, en el que el polisacárido se selecciona entre el grupo que consiste en heparina, sulfato de heparano y sulfato de condroitina.
22. El método de cualquiera de las reivindicaciones 16 a 21, en el que el segundo dominio es un dominio de sustrato para una enzima de reticulación.
23. El método de la reivindicación 23, en el que el segundo dominio comprende un dominio de sustrato de transglutaminasa.
24. El método de la reivindicación 23, en el que el segundo dominio comprende un dominio de sustrato de Factor XIIIa.
25. Un injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería, que comprende un primer dominio que comprende un factor de crecimiento o un polisacárido, un segundo dominio que comprende una región reticulable que es capaz de reticular el injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería a una matriz y un sitio de degradación enzimática o hidrolítica entre el primer y el segundo dominio.
26. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de la reivindicación 25, en el que el factor bio-activo es un factor de crecimiento de unión a heparina.
27. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de la reivindicación 25, en el que el factor de crecimiento se selecciona entre el grupo que consiste en factor de crecimiento transformante beta, proteínas morfogénicas óseas, factor de crecimiento de fibroblastos, factor de crecimiento epitelial vascular, interleucina-8, neurotrofina-6, factor de crecimiento epidérmico de unión a heparina, factor de crecimiento de hepatocitos, factor de crecimiento de tejido conectivo, midquina, moléculas asociadas a crecimiento de unión a heparina y mezclas de los mismos.
28. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de la reivindicación 25, en el que el polisacárido se selecciona entre el grupo que consiste en heparina, sulfato de heparano y sulfato de condroitina.
29. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de cualquiera de las reivindicaciones 25 a 28, en el que el sitio de degradación es un sitio de degradación enzimática, que se escinde por una enzima seleccionada entre el grupo que consiste en plasmina y metaloproteinasas de matriz.
30. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de cualquiera de las reivindicaciones 25 a 29, en el que el segundo dominio es un dominio de sustrato para una enzima de reticulación.
31. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de la reivindicación 30, en el que el segundo dominio comprende un domino de sustrato de transglutaminasa.
32. El injerto de proteína o polisacárido modificado por ingeniería de la reivindicación 31, en el que el segundo dominio comprende un dominio de sustrato de Factor XIIIa.
33. La matriz de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 para la reparación, regeneración o remodelación de tejidos y/o liberación de factores bioactivos.
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