ES2326705T3 - Produccion de enzimas lisosomicas en sistemas de expresion basados en plantas. - Google Patents

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Abstract

LA INVENCION SE REFIERE A LA PRODUCCION DE ENZIMAS LISOSOMALES RECOMBINANTES HUMANOS Y ANIMALES ENZIMATICAMENTE ACTIVOS QUE IMPLICA LA CONSTRUCCION Y EXPRESION DE ESTRUCTURAS RECOMBINANTES DE EXPRESION QUE COMPRENDEN SECUENCIAS CODIFICANTES DE ENZIMAS LISOSOMALES HUMANOS O ANIMALES EN UN SISTEMA DE EXPRESION VEGETAL. EL SISTEMA DE EXPRESION VEGETAL PROPORCIONA LA MODIFICACION POST-TRADUCCIONAL Y EL PROCESADO PRODUCIENDO UN PRODUCTO GENICO RECOMBINANTE QUE MUESTRA ACTIVIDAD ENZIMATICA. LA INVENCION SE DEMUESTRA MEDIANTE EJEMPLOS DE TRABAJO EN LOS QUE PLANTAS DE TABACO TRANSGENICAS QUE TIENEN ESTRUCTURAS RECOMBINANTES DE EXPRESION QUE COMPRENDEN SECUENCIAS NUCLEOTIDICAS DE LA HCG Y IDUA HUMANAS PRODUCEN GLUCOCEREBROSIDASA HUMANA Y AL - L - IDURONIDASA HUMANA MODIFICADAS, ENZIMATICAMENTE ACTIVAS. LOS ENZIMAS LISOSOMALES RECOMBINANTES PRODUCIDOS SEGUN LA INVENCION PUEDEN UTILIZARSE PARA VARIOS FINES, INCLUYENDO PERO SIN ESTAR LIMITADO A, LA TERAPIA DE SUSTITUCION DE ENZIMAS PARA EL TRATAMIENTODE ENFERMEDADES DE ALMACENAMIENTO LISOSOMAL HUMANAS Y ANIMALES.

Description

Producción de enzimas lisosómicas en sistemas de expresión basados en plantas.
1. Campo de la invención
La presente invención se refiere a la producción de enzimas lisosómicas humanas y animales en plantas que comprenden expresar la secuencia codificante genética de una enzima lisosómica humana o animal en un sistema de expresión en plantas. El sistema de expresión en plantas proporciona la modificación pos-traduccional y el procesamiento para producir proteína recombinante que tiene actividad enzimática.
La invención se demuestra en este documento mediante ejemplos de trabajo en los que plantas de tabaco transgénicas producen una glucocerebrosidasa humana modificada (hGC) y una \alpha-L-iduronidasa humana (IDUA), que son ambas enzimáticamente activas.
Las enzimas lisosómicas recombinantes producidas según la invención pueden usarse para una variedad de fines que incluyen, pero no se limitan a, terapia de sustitución de enzimas para el tratamiento terapéutico de enfermedades de almacenamiento lisosómico, investigación para el desarrollo de nuevas aproximaciones al tratamiento médico de enfermedades de almacenamiento lisosómico y procedimientos industriales que implican la hidrólisis de sustratos enzimáticos.
2. Antecedentes de la invención 2.1. Enfermedades de almacenamiento lisosómico
Los lisosomas, que están presentes en todas las células animales, son orgánulos citoplásmicos ácidos que contienen una colección de enzimas hidrolíticas. Estas enzimas funcionan en la degradación de sustratos macromoleculares interiorizados y endógenos. Cuando hay una deficiencia de enzima lisosómica, los sustratos sin degradar del enzima deficiente se acumulan gradualmente dentro de los lisosomas provocando un aumento progresivo en el tamaño y el número de estos orgánulos dentro de la célula. Esta acumulación dentro de la célula conduce finalmente a la disfunción del órgano y a la patología macroscópica de una enfermedad de almacenamiento lisosómico, dependiendo la enfermedad particular de la deficiencia de enzima particular. Se han caracterizado más de treinta enfermedades de almacenamiento lisosómico hereditarias distintas en seres humanos.
Algunos ejemplos de enfermedades de almacenamiento lisosómico (y sus enzimas deficientes asociadas) incluyen enfermedad de Fabry (\alpha-galactosidasa), enfermedad de Farber (ceramidasa), enfermedad de Gaucher (glucocerebrosidasa), gangliosidosis G_{ml} (\beta-galactosidasa), enfermedad de Tay-Sachs (\beta-hexosaminidasa), enfermedad de Niemann-Pick (esfingomielinasa), enfermedad de Schindler (\alpha-N-acetilgalactosaminidasa), síndrome de Hunter (iduronato-2-sulfatasa), síndrome de Sly (\beta-glucuronidasa), síndromes de Hurler y Hurler/Scheie (iduronidasa) y síndrome de células-I/San Filipo (transportador de manosa-6-fosfato).
Un tratamiento probado para enfermedades de almacenamiento lisosómico es la terapia de sustitución de enzimas en la que una forma activa de la enzima se administra directamente al paciente. Sin embargo, aportes abundantes, económicos y seguros de enzimas lisosómicas terapéuticas no están comercialmente disponibles para el tratamiento de ninguna de las enfermedades de almacenamiento lisosómico.
2.1.1. Enfermedad de Gaucher y tratamiento
La enfermedad de Gaucher es la enfermedad de almacenamiento lisosómico más común en seres humanos, encontrándose la mayor frecuencia en la población judía Ashkenazi. Aproximadamente de 5.000 a 10.000 personas en los Estados Unidos están aquejados por esta enfermedad (Grabowski, 1993, Adv. Hum. Genet. 21:377-441). La enfermedad de Gaucher resulta de una deficiencia de glucocerebrosidasa (hGC; glucosilceramidasa; \beta-glucosidasa ácida; EC 3.2.1.45). Esta deficiencia conduce a una acumulación del sustrato enzimático, glucocerebrósido, en células reticuloendoteliales de la médula ósea, el bazo y el hígado, dando como resultado complicaciones esqueléticas significativas tales como expansión de la médula ósea y deterioro óseo, y también hiperesplenismo, hepatomegalia, trombocitopenia, anemia y complicaciones pulmonares (Grabowski, 1993, supra; Lee, 1982, Prog. Clin. Biol. Res. 95:177-217; Brady y col., 1965, Biochem. Biophys. Res. Comm. 18:221-225).
La terapia de sustitución de hGC ha revolucionado el tratamiento y la atención médica de la enfermedad de Gaucher, llevando a una mejora significativa en la calidad de vida de muchos pacientes con enfermedad de Gaucher (Pastores y col., 1993, Blood 82:408-416; Fallet y col., 1992, Pediatr. Res. 31:496-502). Los estudios han mostrado que la administración intravenosa regular de hGC modificada específicamente (Ceredase^{TM}, Genzyme Corp.) puede dar como resultado mejoras espectaculares e incluso inversiones en las manifestaciones hepáticas, esplénicas y hematológicas de la enfermedad (Pastores y col., 1993, supra; Fallet y col., 1992, supra; Figueroa y col. 1992, N. Eng. J. Med. 327:1632-1636; Barton y col., 1991, N. Eng. J. Med. 324:1464-1470; Beutler y col., 1991, Blood 78:1183-1189). Las mejoras en las complicaciones esqueléticas y pulmonares asociadas son posibles, pero requieren dosis mayores de enzima durante periodos de tiempo más largos.
A pesar de los beneficios de la terapia de sustitución de hGC, la fuente y el alto coste de la enzima limitan seriamente su disponibilidad. Hasta recientemente, la única fuente comercial de hGC purificada ha sido la recogida de placentas humanas, mediante la cual diez a veinte kilogramos (kg) de placentas proporcionan sólo 1 miligramo (mg) de enzima. Se requieren de quinientos a dos mil kilogramos de placenta (equivalente a 2.000-8.000 placentas) para tratar a cada paciente cada dos semanas. Los costes actuales para la terapia de sustitución de HGC oscilan desde 55 \textdollar hasta 220 \textdollar/kg de peso corporal del paciente cada dos semanas, o desde 70.000 \textdollar hasta 300.000 \textdollar/año para un paciente de 50 kg. Debido a que la necesidad de terapia dura esencialmente durante la duración de la vida de un paciente, los costes de la enzima sola pueden superar 15.000.000 \textdollar durante 30 a 70 años de terapia.
Un segundo problema importante asociado al tratamiento de pacientes con enfermedad de Gaucher con glucocerebrosidasa aislada de tejido humano (y quizá incluso de otros tejidos animales) es el riesgo de exponer a los pacientes a agentes infecciosos que pueden estar presentes en las placentas reunidas, por ejemplo, virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), virus de la hepatitis, y otros.
Por consiguiente, se necesita una nueva fuente de hGC para reducir eficazmente el coste del tratamiento y para eliminar el riesgo de exponer a los pacientes con enfermedad de Gaucher a agentes infecciosos.
2.1.2. Síndrome de Hurler y tratamiento
El síndrome de Hurler es el más común del grupo de trastornos de almacenamiento lisosómico humano conocidos como las mucopolisacaridosis (MPS) que implican una incapacidad para degradar sulfato de dermatano y sulfato de heparano. Los pacientes con enfermedad de Hurler son deficientes en la enzima lisosómica \alpha-L-iduronidasa (IDUA) y la acumulación resultante de glucosaminoglucanos en los lisosomas de células afectadas conduce a una variedad de manifestaciones clínicas (Neufeld & Ashwell, 1980, The Biochemistry of Glycoproteins and Proteoglycans, ed. W.J. Lennarz, Plenum Press, NY; págs. 241-266) que incluyen retraso en el desarrollo, aumento de tamaño del hígado y el bazo, anomalías esqueléticas, retraso mental, rasgos faciales toscos, opacidad corneal y afectación respiratoria y cardiovascular. El síndrome de Hurler/Scheie (MPS I H/S) y el síndrome de Scheie (MPS IS) representan formas menos graves del trastorno, pero también implican deficiencias de IDUA. Los estudios moleculares en los genes y ADNc de pacientes con MPS I han llevado a una comprensión emergente del genotipo y el fenotipo clínico (Scott y col., 1990, Am. J. Hum. Genet. 47:802-807). Además, se han caracterizado tanto una forma canina como una felina de MPS I (Haskins y col., 1979, Pediat. Res. 13:1294-1297; Haskins y Kakkis, 1995, Am. J. Hum. Genet. 57:A39 Abstr. 194; Shull y col., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91:12937-12941) proporcionando un modelo in vivo eficaz para probar las aproximaciones terapéuticas.
Recientemente se informó de la eficacia de la sustitución de enzimas en el modelo canino de síndrome de Hurler usando IDUA humana generada en células CHO (Kakkis y col., 1995, Am. J. Hum. Genet. 57:A39 (Abstr.); Shull y col., 1994, supra). Dosis semanales de aproximadamente 1 mg administradas durante un periodo de 3 meses dieron como resultado niveles normales de la enzima en el hígado y el bazo, niveles más bajos, pero significativos, en el riñón y los pulmones y niveles muy bajos en el cerebro, corazón, cartílago y córnea (Shull y col., 1994, supra). Los exámenes de tejido mostraron la normalización del almacenamiento lisosómico en el hígado, el bazo y el riñón, pero no mostraron mejoras en el corazón, el cerebro y los tejidos de la córnea. Un perro se mantuvo en tratamiento durante 13 meses y estaba claramente más activo con mejora en las deformidades esqueléticas, rigidez articular, opacidad corneal y aumento de peso (Kakkis y col., 1995, supra. Un experimento de una única dosis mayor fue bastante prometedor y mostró actividad de IDUA detectable en el cerebro y el cartílago, además de en tejidos que previamente mostraron actividad a la dosis más baja. Los experimentos y ensayos de dosis mayores adicionales que implicaban una administración más larga están actualmente limitados por la disponibilidad de enzima recombinante. Estos experimentos subrayan el potencial de la terapia de sustitución para pacientes con enfermedad de Hurler y las graves restricciones tanto en ensayos caninos como humanos debidas a las limitaciones en la producción de enzima recombinante usando las tecnologías actuales.
2.2. Biosíntesis de enzimas lisosómicas
Las enzimas lisosómicas solubles comparten etapas iniciales de biosíntesis con las proteínas secretoras, es decir, la síntesis en el ribosoma, la unión del péptido señal N-terminal a la superficie del retículo endoplásmico rugoso (ER), el transporte al lumen del ER en el que se escinde el péptido señal y la adición de oligosacáridos a residuos de asparagina específicos (N-ligados), seguido por modificaciones adicionales de la proteína naciente en el aparato de Golgi (von Figura y Hasilik, 1986, Annu. Rev. Biochem. 55:167-193). Los oligosacáridos N-ligados pueden ser complejos, variados y heterogéneos, y pueden contener residuos con alto contenido de manosa. Las proteínas se someten a procesamiento adicional en un compartimento post-ER pre-Golgi y en el cis-Golgi para formar o una señal de reconocimiento dependiente del oligosacárido manosa-6-fosfato (M-6-P) N-ligado o independiente del oligosacárido M-6-P N-ligado para enzimas localizadas en el lisosoma (Kornfeld & Mellman, 1989, Ann. Rev. Cell Biol., 5:483-525; Kaplan y col., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74:2026). La presencia de la señal de reconocimiento de M-6-P da como resultado la unión de la enzima a receptores de M-6-P (MPR). Estas enzimas unidas permanecen en la célula, se empaquetan finalmente en lisosomas y, por tanto, se segregan desde proteínas dirigidas a a secreción o a la membrana plasmática.
Aunque muchas enzimas lisosómicas son solubles y son transportadas a lisosomas por MPRs, las proteínas integrales de membrana y las asociadas a la membrana (en particular hGC) son dirigidas y transportadas a lisosomas independientes del sistema M-6-P/MPR (Kornfeld & Mellman, 1989, Erickson y col., 1985). La hGC no se vuelve soluble después de la traducción, pero en su lugar se asocia a la membrana lisosómica por medios que no se han dilucidado (von Figura & Hasilik, 1986, Annu. Rev. Biochem. 55:167-193; Kornfeld y Mellman, 1989, Annu. Rev. Cell Biol. 5:483-525).
La hGC se sintetiza como un único polipéptido (58 kDa) con una secuencia señal (2 kDa) en el extremo amino. La secuencia señal se escinde cotraduccionalmente y la enzima se glicosila con un grupo heterogéneo de oligosacáridos tanto complejos como con alto contenido de manosa para formar un precursor. Los glicanos participan predominantemente en la conformación de proteínas. El precursor "con alto contenido de manosa", que tiene una masa molecular de 63 KDa, se procesa postraduccionalmente en el Golgi para dar un producto intermedio de 66 KDa, que entonces se modifica adicionalmente en el lisosoma para dar la enzima madura que tiene una masa molecular de 59 Kda (Jonsson y col., 1987, Eur. J. Biochem. 164:171; Erickson y col., 1985, J. Biol. Chem., 260:14319).
El polipéptido de hGC maduro está compuesto por 497 aminoácidos y contiene cinco secuencias consenso de aminoácidos de N-glicosilación (Asn-X-Ser/Thr). Cuatro de estos sitios están normalmente glicosilados. La glicosilación del primer sitio es esencial para la producción de proteína activa. Se han identificado cadenas de oligosacárido tanto con alto contenido de manosa como complejas (Berg-Fussman y col., 1993, J. Biol. Chem. 268:14861-14866). La hGC de placenta contiene 7% de carbohidrato, 20% del cual es del tipo con alto contenido de manosa (Grace & Grabowski, 1990, Biochem. Biophys. Res. Comm. 168:771-777). El tratamiento de hGC placentaria con neuraminidasa (dando una asialo-enzima) da como resultado un aumento de las velocidades de eliminación y captación por células hepáticas de rata con un aumento concomitante en la actividad enzimática hepática (Furbish y col., 1981, Biochim. Biophys. Acta 673:425-434). Esta hGC placentaria modificada con glicano se usa actualmente como un agente terapéutico en el tratamiento de la enfermedad de Gaucher. Los estudios bioquímicos y de mutagénesis dirigida han proporcionado un mapa inicial de regiones y residuos importantes para el plegamiento, la interacción con el activador y la localización del sitio activo (Grace y col., 1994, J. Biol. Chem. 269:2283-2291).
Se ha publicado la secuencia completa de ADN complementario (ADNc) para hGC (Tsuji y col., 1986, J. Biol. Chem. 261:50-53; Sorge y col., 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:7289-7293), y E. coli que contiene la secuencia de ADNc de hGC clonada a partir de células de fibroblasto, como se describe (Sorge y col.,1985, supra), está disponible en la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC) (nº de acceso 65696).
Las metodologías recombinantes tienen el potencial de proporcionar una fuente más segura y menos cara de enzimas lisosómicas para la terapia de sustitución. Sin embargo, la producción de enzimas activas, por ejemplo hGC, en un sistema heterólogo requiere el correcto direccionamiento al ER, y la glicosilación N-ligada apropiada a niveles o rendimientos que eviten la degradación basada en ER o la agregación. Debido a que las enzimas lisosómicas maduras deben glicosilarse para ser activas, los sistemas bacterianos no pueden usarse. Por ejemplo, la hGC expresada en E. coli es enzimáticamente inactiva (Grace & Grabowski, 1990, supra).
Los monómeros activos de hGC se han purificado a partir de células de insecto (células Sf9) y células de ovario de hámster chino (CHO) infectadas o transfectadas, respectivamente, con ADNc de hGC (Grace & Grabowski, 1990, supra; Grabowski y col., 1989, Enzyme 41:131-142). Recientemente se desveló un procedimiento para producir hGC recombinante en cultivos de células CHO y en cultivos de células de insecto en la patente de EE.UU. nº 5.236.838. La hGC recombinante producida en estos sistemas heterólogos tenía una masa molecular aparente que oscilaba desde 64 hasta 73 kDa y contenía del 5 al 15% de carbohidrato (Grace & Grabowski, 1990, supra; Grace y col., 1990, J. Biol. Chem. 265:6827-6835). Estas hGC recombinantes tenían propiedades cinéticas idénticas a la enzima natural aislada de placentas humanas, basándose en análisis que usan una serie de análogos del sustrato y del estado de transición, activadores lipídicos cargados negativamente, activadores proteicos (saposina C) e inhibidores covalentes basados en el mecanismo (Grace y col., 1994, supra; Berg-Fussman y col., 1993, supra; Grace y col., 1990, J. Biol. Chem. 265:6827-6835; Grabowski y col., 1989, supra). Sin embargo, tanto las células de insecto como las células CHO conservaron la mayoría de la enzima en vez de secretarla al medio, aumentando significativamente la dificultad y el coste de recoger la enzima pura (Grabowski y col., 1989, supra).
Por consiguiente, se necesita un sistema recombinante que pueda producir enzimas lisosómicas humanas o animales en una forma activa a menor coste y que serán apropiadamente dirigidas para facilitar la recuperación.
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2.3. Lisosomas mamíferos frente a vacuolas de plantas
Debido a que las plantas son eucariotas, los sistemas de expresión en plantas tienen ventajas respecto a los sistemas de expresión procariotas, particularmente con respecto al correcto procesamiento de productos génicos eucariotas. Sin embargo, a diferencia de las células animales, las células de plantas no poseen lisosomas. Aunque la vacuola de la planta parezca funcionalmente análoga al lisosoma, las plantas no contienen MPRs (Chrispeels, 1991, Ann. Rev. Pl. Phys. Pl. Mol. Biol. 42:21-53; Chrispeels y Tague, 1991, Intl. Rev. Cytol. 125:1-45) y los mecanismos de direccionamiento a las vacuolas pueden diferir significativamente de los de direccionamiento a lisosomas. Por ejemplo, el mecanismo predominante del direccionamiento a vacuolas en plantas no parece ser dependiente de glicanos, pero en su lugar parece que se basa en secuencias peptídicas C- o N-terminales (Gomez & Chrispeels, 1993, Plant Cell 5:1113-1124; Chrispeels & Raikhal, 1992, Cell 68:613-618; Holwerda y col., 1992, Plant Cell 4:307-318; Neuhaus y col., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:10362-10366; Chrispeels, 1991, supra; Chrispeels & Tague, 1991, supra; Holwerda y col., 1990, Plant Cell 2:1091-1106; Voelker y col., 1989, Plant Cell 1:95-104). Como resultado, las plantas no se han considerado como sistemas de expresión apropiados para enzimas lisosómicas que deben procesarse apropiadamente para producir un producto activo.
3. Resumen de la invención
La presente invención se refiere a la producción de enzimas lisosómicas humanas o animales en plantas, células de plantas o tejidos de plantas transformados o transfectados, e implica construir y expresar constructos de expresión recombinantes que comprenden secuencias codificantes de enzimas lisosómicas en un sistema de expresión en plantas. El sistema de expresión en plantas proporciona modificaciones cotraduccionales y postraduccionales apropiadas del péptido naciente requeridas para el procesamiento, por ejemplo, escisión de la secuencia señal, glicosilación y clasificación del producto de expresión de manera que se produzca una proteína enzimáticamente activa. Usando los procedimientos descritos en este documento, las enzimas lisosómicas recombinantes se producen en sistemas de expresión en plantas a partir de los cuales las enzimas lisosómicas recombinantes pueden aislarse y usarse para una variedad de fines. La presente invención se ejemplifica mediante la ingeniería genética de plantas de tabaco transgénicas con tres constructos de expresión de enzimas lisosómicas. Un constructo comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una glucocerebrosidasa humana (hGC) modificada, específicamente una hGC fusionada en su extremo C al péptido FLAG^{TM} de ocho aminoácidos (hGC:FLAG^{TM}). Otro constructo comprende la secuencia de nucleótidos que codifica una \alpha-L-iduronidasa humana (IDUA). El tercer constructo comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una glucocerebrosidasa humana (hGC). Las plantas de tabaco transgénicas que tienen los constructos de expresión producen enzimas lisosómicas que son enzimáticamente activas.
Los sistemas de expresión en plantas y las enzimas lisosómicas recombinantes producidas con el mismo tienen una variedad de usos que incluyen, pero no se limitan a: (1) la producción de enzimas lisosómicas enzimáticamente activas para el tratamiento de enfermedades de almacenamiento lisosómico; (2) la producción de proteínas alteradas o mutadas, enzimáticamente activas o de otro modo, que sirven de precursores o sustratos para el procesamiento in vivo o in vitro adicional para dar una forma industrial especializada para investigación o usos terapéuticos, tal como para producir una enzima terapéutica más eficaz; (3) la producción de anticuerpos contra enzimas lisosómicas para uso en el diagnóstico médico; y (4) uso en cualquier procedimiento comercial que implique la hidrólisis de sustratos.
4. Breve descripción de las figuras
Fig. 1. Constructo de expresión y vector de transformación de plantas del ADNc de hGC:FLAG^{TM}. El constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM} en un vector intermedio pBS se corta y se inserta en el sitio SstI del vector de transformación de plantas binario pBIB-KAN para formar el plásmido CTPro1:hGC:FLAG. R y L representan los bordes derecho e izquierdo del ADN-T, respectivamente, que delimitan con precisión el ADN insertado en el genoma de la planta. NPTII = marcador de selección de kanamicina, FL = epítopo FLAG^{TM}, pAnos = señal de poliadenilación/terminación, Pnos = secuencia promotora del gen nopalina sintetasa de Agrobacterium tumefaciens. Los cebadores de amplificación por PCR para hGC fueron: GC1 (5'TTGtcTAGaGTAAGCATCATGGCTGGC3') (SEQ ID NO:1); y GC4 (5'cacgaattCTGGCGACGCCACAGGTAGGTGTGA3') (SEQ ID NO:2); las secuencias derivadas de hGC están en mayúsculas; los sitios de restricción están subrayados. Enzimas de restricción: E, EcoRI; S, SstI; N, NotI; X, XbaI.
Figs. 2A-E. Transformación y generación de plantas de tabaco que llevan el constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM}. Fig. 2A. Transformación mediada por Agrobacterium de discos de hojas de tabaco. Los discos de hojas se inocularon con una suspensión de células de cepas de A. tumefaciens que llevaban el plásmido CTPro1:hGC:FLAG. Fig. 2B. Desarrollo de brotes en medio de selección 22 días pos-inoculación. Fig. 2C. Desarrollo de raíces en medio de enraizamiento 27 días pos-inoculación. El uso de medio de enraizamiento que contiene kanamicina diferenció claramente entre brotes transgénicos que formaron raíces y brotes "falsos positivos" que no formaron raíces en medio selectivo. Fig. 2D. Plantas transformadas tres semanas después de transferirlas a tierra. Fig. 2E. Planta transformada 10 semanas después de transferirla a tierra.
Fig. 3. Análisis por hibridación genómica de Southern de plantas control y transgénicas. El ADN genómico total se aisló de una planta control sin transformar (ST) y de transformantes independientes generados a partir de Nicotiana tabacum cv. Xanthi (X-1, X-8, X-9, X-11) y cv. VA116 (V1). De cinco a 10 \mug de ADN genómico total se digirieron con HindIII y se resolvieron en un gel de agarosa en TBE. El ADN se transfirió a una membrana de nitrocelulosa y se sondó con una secuencia de hGC:FLAG^{TM} marcada con ^{32}P de un fragmento de HindIII de 1,7 kb purificado en gel aislado del vector intermedio pBS que contenía el constructo de expresión MeGA:hGC:FLAG^{TM} (véase la Fig. 1).Fig. 4. Inducción de niveles de ARNm de hGC:FLAG^{TM} en plantas transgénicas. El ARN total se aisló mediante procedimientos habituales con guanidino-tiocianato a partir de tejidos de hojas ST y X-11 a 0 y 24 h después de la activación mecánica de genes (MGA). Se glioxilaron cinco \mug de ARN total, se separaron por tamaño en un gel de agarosa al 1,2%, se transfirieron a filtros NitroPure (MSI) y se sondaron con una secuencia génica de hGC:FLAG^{TM} marcada con ^{32}P a partir de un fragmento de HindIII de 1,7 kb purificado en gel aislado del vector intermedio pBS mostrado en la Fig. 1.
Las Figs. 5A-B. Inducción de la proteína de fusión hGC:FLAG^{TM} en plantas de tabaco transgénicas como se detectó por análisis de Western usando anticuerpos anti-FLAG^{TM} y anticuerpos anti-hGC. El tejido de hojas de X-11 se indujo mediante MGA a tiempo 0 a temperatura ambiente, se recogió a 2, 4, 8, 16 y 24 h y se congeló a -20ºC antes de la extracción. hGC:FLAG^{TM} se solubilizó moliendo el tejido en un molinillo de granos de café con nieve carbónica y se homogeneizó en Triton X-100 al 1%, taurocolato al 1%, citrato de sodio 25 mM pH 7,0, \beta-mercaptoetanol 4 mM y ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) 5 mM, seguido por dos ciclos de congelación y descongelación del homogeneizado. Se determinaron tanto la concentración de proteína como la actividad enzimática de extractos sin células. Fig. 5A. Se analizaron diez \mug de proteína soluble total mediante inmunotransferencia de Western usando anticuerpos anti-FLAG^{TM}. Carril 1, 24 ng de proteína de control marcada con FLAG^{TM}; carril 2, X-11 a tiempo 0; carril 3, X-11 a 2 h; carril 4, X-11 a 4 h; carril 5, X-11 a 8 h; carril 6, X-11 a 12 h; carril 7, X-11 a 24 h; carril 8, ST (planta de control) a 12 h. Fig. 5B. Se analizaron cuarenta \mug de proteína soluble total mediante inmunotransferencia de Western usando anticuerpos anti-hGC. Carril 1, ST a tiempo 0; carril 2, X-11 a tiempo 0; carril 3, X-11 a 2 h; carril 4, X-11 a 4 h; carril 5, X-11 a 8 h; carril 6, X-11 a 12 h, carril 7, X-11 a 24 h; carril 8, ST a 8 h. El nivel máximo de expresión de hGC:FLAG^{TM} se encontró entre 8-12 h pos-MGA.
Fig. 6. Actividad de \beta-glucosidasa total (\beta-glucosidasa y hGC de planta endógena) pos-MGA de tejido de hoja de X-11. Se ensayó un décimo de \mug de extracto sin células para la capacidad para convertir el sustrato fluorométrico, 4-metilumbeliferil-D-glucopiranósido (4MuGlc), en 4MU a 37ºC, como se mide en un fluorómetro (Hoefer DyNA Quant-200, Hoefer, Pharmacia, Biotech. Inc.) con excitación a 365 nm y emisión a 460 nm. UF = unidades de fluorómetro; tiempo = h pos-inducción (es decir, daño de tejido o MGA).
Figs. 7A-B. Purificación por afinidad de la proteína de fusión hGC:FLAG^{TM}. Fig. 7A. Gel de SDS-PAGE teñido con azul de Coomassie y análisis por Western de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con FLAG^{TM}. Carril 1, gel de SDS-PAGE teñido con azul de Coomassie de 0,1 \mug de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con FLAG^{TM}; Carril 2, análisis de Western usando anticuerpos anti-hGC en 0,1 \mug de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con FLAG^{TM}. Fig. 7B. Gel de SDS-PAGE teñido con azul de Coomassie y análisis de Western de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con ConA. Carril 1, gel de SDS-PAGE teñido con azul de Coomassie de 10 \mug de hGC:FLAG^{TM} purificado con ConA; Carril 2, análisis de Western de hGC:FLAG^{TM} purificado con ConA usando anticuerpos anti-FLAG^{TM}. Estos resultados indican que la proteína hGC:FLAG^{TM} purificada con ConA está glicosilada.
Fig. 8 Análisis de Western por inmunotransferencia por ranuras usando anticuerpos anti-FLAG^{TM} en fracciones de etapas de purificación de hGC:FLAG^{TM} usando tejido de planta 12 h pos-MGA. Carril A, proteína de control marcada con FLAG^{TM}: ranura 1, 1 ng; ranura 2, 6 ng; ranura 3, 8 ng; ranura 4, 18 ng; ranura 5, 60 ng. Carril B, fracciones del aislamiento de hGC:FLAG^{TM}: ranura 1, 0,5 \mul/80.000 \mul de proteína soluble de extracto crudo sin células; ranura 2, 0,5 \mul/80.000 \mul de proteína soluble de sobrenadante de sulfato de amonio (AS) al 33%; ranura 3, 2,5 \mul/5.000 \mul de proteína soluble de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con ConA. Carril C: ranura 1, 1 \mul de proteína soluble de extracto crudo de tejido de planta; ranura 2, 1 \mul de proteína soluble de sobrenadante de AS al 33%; ranura 3, 5 \mul de proteína soluble de hGC:FLAG^{TM} purificado por afinidad con ConA.
Fig. 9. Secuencia de nucleótidos del constructo hGC:FLAG^{TM} (SEQ ID NO:3) que se clonó y se expresó en cepas de tabaco X-11 y X-27. Las letras subrayadas en mayúsculas en tres posiciones representan cambios respecto a la secuencia en GENBANK (secuencia de ADNc del banco ATCC). Las letras en minúsculas representan adiciones a la secuencia de hGC, por ejemplo, el epítope FLAG^{TM}.
Fig. 10. Secuencia de aminoácidos deducida de la proteína de fusión hGC:FLAG^{TM} (SEQ ID NO:4). Las letras subrayadas en mayúsculas en dos posiciones representan cambios respecto a la secuencia de aminoácidos de hGC original desvelada por E. Neufled. Las letras en minúsculas representan adiciones a la secuencia de aminoácidos de hGC. Por ejemplo, dykddddk = el epítopo FLAG^{TM}.
Fig. 11. Secuencia de 456 bases que comprenden el promotor MeGA.
Fig. 12. Estrategia de construcción del vector de expresión de IDUA. Los constructos MeGA:IDUA y 35S^{ENH}:IDUA se insertaron en el sitio HindIII/SacI del vector binario pBIB-KAN. R y L representan los bordes derecho e izquierdo de ADN-T que delimitan con precisión el ADN insertado en el genoma de la planta, NPTII es el marcador de selección de kanamicina, pAnos es la señal de poliadenilación/terminación y Pnos un promotor del gen nopalina sintetasa de Agrobacterium tumefaciens. Los cebadores de PCR para IDUA fueron: ID1, (5'-CTAGtcta
gaATGCGTCCCCTGCGCCCCCGCG) (SEQ ID NO:6) y ID2, (5'GgaattcgagctcTCATGGATTGCCCGGGGATG) (SEQ ID NO:7); las secuencias de IDUA están escritas en mayúsculas, los sitios de restricción introducidos están subrayados. SP, péptido señal; IDUA, región codificante de IDUA humana; H, HindIII; S, SacI; X, XbaI.
Figs. 13A-C. Tabaco transgénico que expresa el constructo MeGA:IDUA. Fig. 13A. Germinación de semillas de primera generación en medio selectivo que muestra segregación de plantas de semillero resistentes y sensibles a kanamicina. Fig. 13B. Plantas jóvenes que contienen el constructo MeGA:IDUA (derecha) y plantas parentales sin transformar cultivadas en paralelo. Fig. 13C. Plantas completamente maduras que expresan IDUA en el invernadero.
Figs. 14A-B. Inducción del transgén de IDUA en tejidos de hoja de tabaco. El tejido de hoja de la planta transgénica IDUA-9 se indujo mediante escisión en tiras de 1,5 mm y se incubó a temperatura ambiente en toallas de papel húmedas en una bolsa de plástico cerrada herméticamente. El tejido se separó para el análisis (se almacenó a -80ºC para ARN, -20ºC para proteína) a 0, 2, 4, 8, 11 y 27 h pos-inducción. Fig. 14A. Análisis por transferencia de Northern de ARNm de IDUA de plantas de tabaco transgénicas. Se corrieron quince \mug de ARN total en gel de glioxal-agarosa, se transfirieron sobre membrana de nitrocelulosa y se hibridaron con ADNc de IDUA marcado con ^{32}P. Fig. 14B. Análisis por transferencia de Western de proteínas solubles totales (20 \mug) de extractos de hoja de tabaco usando anticuerpos para IDUA desnaturalizada sintetizada en células CHO. El carril de control representa IDUA sintetizada en células CHO (98 kDa bajo nuestras condiciones de gel). La IDUA sintetizada a partir de tabaco transgénico tiene un tamaño molecular de 92 kDa.
Fig. 15. Inmunodetección de IDUA secretada por plantas transgénicas en el tampón de incubación. Se hirvieron cincuenta \mul de tampón de incubación y se colocaron en ranuras sobre membrana OPTITRAN junto con IDUA de control sintetizada en células CHO. Los anticuerpos para IDUA desnaturalizada sintetizada en células CHO se usaron para detectar la IDUA.
Fig. 16. Actividad de IDUA en extractos de tejido y tampón de incubación a partir de tejido de plantas transgénicas IDUA-9. Panel A: el tejido de plantas IDUA-9 se indujo y se incubó en tampón, que se recogió y se sustituyó a diversos tiempos después de la inducción como se describe en el texto. Las cajas abiertas representan la actividad de IDUA en extractos preparados a partir de tejido inducido después de la incubación en tampón. Las cajas sombreadas representan la actividad de IDUA en el tampón de incubación. Panel B: se indujo tejido de planta IDUA-9 y se incubó sin tampón durante 34 horas después de las cuales se preparó un extracto a partir del tejido inducido. Se muestra la actividad de IDUA del extracto.
Fig. 17. Comparación de la actividad de IDUA en plantas de tabaco transgénicas IDUA-7, IDUA-8 e IDUA-9: Panel A: se indujo tejido de planta y se incubó en tampón, que se recogió y se sustituyó a diversos tiempos después de la inducción como se describe en el texto. Se representó la actividad de IDUA presente en el tampón de incubación recogido a diversos tiempos pos-inducción. Panel B: se indujo tejido de planta y se incubó sin tampón en ausencia de tampón de incubación durante 34 horas, después de las cuales se prepararon extractos a partir de los tejidos inducidos. Se muestran las actividades de IDUA de los extractos.
Fig. 18. Análisis de Western por transferencia por ranuras de IDUA secretada por la planta transgénica IDUA-9 después de tres adiciones y recogidas secuenciales de tampón de incubación; 24, 26 y 34 h pos-MGA. El tejido (1,5 g) se indujo y se incubó en una bolsa de plástico húmeda durante 24 h. Se usaron diez ml de tampón de incubación para lavar el tejido; esta fracción se indica como 24 h. Se añadió tampón recientemente preparado (10 ml) y se incubó a temperatura ambiente durante 2 h; esta fracción se indicó como 26 h. Se añadió tampón recientemente preparado (10 ml) al tejido y se incubó durante 8 h y esta fracción se indicó como 34 h. Se hirvieron cincuenta \mul de tampón de incubación de cada fracción y se colocaron en ranuras sobre membrana OPTITRAN y se analizaron con anticuerpos anti-IDUA.
Fig. 19. La secuencia de nucleótidos de la secuencia codificante de IDUA usada en el constructo de expresión MeGA:IDUA y 355^{ENH}:IDUA.
Fig. 20. La secuencia de aminoácidos deducida de la secuencia codificante de IDUA mostrada en la Fig. 19.
Fig. 21. Constructo de expresión y vector de transformación de plantas de ADNc de hGC. El constructo de expresión MeGA:hGC en un plásmido intermedio pBS se corta y se inserta en el sitio SstI del vector de transformación de plantas binario pBIB-KAN para formar el vector de transformación pCT50. Los cebadores de amplificación por PCR para la reconstrucción del extremo 3' de la región codificante de hGC fueron: GC23, que tiene la secuencia 5'GCCTATGCTGAGCACAAGTTACAG3' (SEQ ID NO:11); y GC37, cuya hebra complementaria tiene la secuencia 5'TTCCTTGAGCTCGTCACTGGCGACGCCACAGGTA3' (SEQ ID NO:12). Las otras abreviaturas y anotaciones mostradas son las mismas que las descritas para la Fig. 1.
5. Descripción detallada de la invención
La presente invención se refiere a la producción de enzimas lisosómicas recombinantes humanas o animales en plantas y en células de plantas y tejidos de plantas cultivados que implican: (1) construcción de constructos de expresión recombinantes que comprenden secuencias codificantes de enzimas lisosómicas y vectores de transformación que contienen los constructos de expresión; (2) transformar o transfectar células de plantas, tejidos de plantas o plantas con los vectores de transformación; (3) expresar las secuencias codificantes de enzimas lisosómicas en la célula de planta, tejido de planta o planta; y (4) detectar y purificar los productos de expresión que tienen actividad de enzima lisosómica.
Los sistemas de expresión en plantas y las enzimas lisosómicas recombinantes producidas con los mismos tienen una variedad de usos que incluyen, pero no se limitan a: (1) la producción de enzimas enzimáticamente activas para el tratamiento de enfermedades de almacenamiento lisosómico; (2) la producción de anticuerpos contra enzimas lisosómicas, anticuerpos que tendrían usos en el diagnóstico médico; (3) uso en cualquier procedimiento comercial que implica la hidrólisis de sustrato; y (4) la producción de proteínas modificadas o fragmentos de péptidos que sirven de precursores o sustratos para el procesamiento in vivo o in vitro adicional para dar una forma industrial especializada para investigación o usos terapéuticos, tal como para producir una enzima terapéutica con eficacia aumentada o especificidad de sustrato alterada. Estos productos de proteínas lisosómicas recombinantes expresados en plantas no necesitan ser enzimáticamente activos o de estructura idéntica a las enzimas lisosómicas o proteínas animales o humanas nativas correspondientes con el fin de ser útiles para investigación o aplicaciones industriales.
Los términos "enzima lisosómica" y "producto génico de enzima lisosómica", como se usan en este documento con respecto a cualquier enzima y producto tales producidos en un sistema de expresión en plantas, se refieren a un péptido recombinante expresado en una planta transgénica o célula de planta a partir de una secuencia de nucleótidos que codifica una enzima lisosómica humana o animal, una enzima lisosómica humana o animal modificada, o un fragmento, derivado o modificación de tal enzima. Las enzimas lisosómicas humanas o animales modificadas útiles incluyen, pero no se limitan a, enzimas lisosómicas humanas o animales que tienen una o varias adiciones, deleciones y/o sustituciones de aminoácido producidas naturalmente o introducidas artificialmente.
El término "secuencia codificante de enzima lisosómica", como se usa en este documento, se refiere a una secuencia de ADN o ARN que codifica una proteína o péptido, o un fragmento, derivado u otra modificación de los mismos, que presenta actividad enzimática detectable contra un sustrato de enzima lisosómica.
El término "enzimáticamente activa" se usa en este documento con respecto a cualquier enzima lisosómica recombinante producida en un sistema de expresión en plantas para significar que la enzima lisosómica recombinante puede hidrolizar o el sustrato natural o un sustrato análogo o sintético del mismo de la enzima lisosómica humana o animal correspondiente, a niveles detectables.
El término "enzimáticamente activa" también se usa en este documento con respecto a la hGC recombinante y la hGC modificada producida en un sistema de expresión en plantas para significar que tales hGCs pueden hidrolizar el sustrato de hGC nativa, es decir, N-acil-singosil-1-O-\beta-D-glucósido, de la hGC o que puede escindir el \beta-glucósido sintético, 4-metil-umbeliferil-\beta-D-glucósido (4MuGlc), a niveles detectables. De modo similar, el término como se aplica a IDUA producida en plantas y a IDUA modificada significa que tales IDUAs pueden hidrolizar el sustrato de IDUA nativa, es decir, sulfato de dermatano o sulfato de heparano, o pueden escindir el \alpha-glucósido sintético, 4-metilumbeliferil-\alpha-L-idurónido (4-MUI), a niveles detectables.
El término "transformante" como se usa en este documento se refiere a una planta, célula de planta o tejido de planta en el cual se ha introducido un constructo génico que comprende una secuencia codificante de enzima lisosómica mediante un procedimiento distinto de la transfección con un virus manipulado.
El término "transfectante" se refiere a una planta, célula de planta o tejido de planta que se ha infectado con un virus manipulado y mantiene establemente dicho virus en la célula infectada.
Una vez se identifica que un transformante o transfectante de planta expresa una enzima lisosómica recombinante, una realización no limitante de la invención implica la expansión clonal y el uso de ese transformante o transfectante en la producción y purificación de enzima lisosómica recombinante enzimáticamente activa. En otra realización no limitante de la invención, cada nueva generación de plantas de la progenie puede cribarse nuevamente para la presencia de secuencia de nucleótidos que codifica para una enzima lisosómica, dando tal cribado como resultado la producción por generaciones posteriores de plantas de cantidades recuperables de enzima lisosómica recombinante activa, y a partir de la cual se purifica luego la enzima.
La invención se divide en las siguientes secciones únicamente con el fin de descripción: (a) genes o secuencias codificantes para enzimas lisosómicas implicadas en enfermedades de almacenamiento lisosómico; (b) construcción de constructos de expresión recombinantes para expresar secuencias codificantes de enzimas lisosómicas en célula de planta; (c) construcción de vectores de transformación de plantas que comprenden los constructos de expresión; (d) transformación/transfección de plantas que pueden traducir y procesar productos de traducción primaria con el fin de expresar una enzima lisosómica recombinante enzimáticamente activa; (e) identificación y purificación de la enzima lisosómica recombinante así producida; (f) expansión del número de plantas transformadas o transfectadas; y (g) procedimientos para usar terapéuticamente la enzima lisosómica recombinante.
5.1. Genes o secuencias codificantes para enzimas implicadas en enfermedades de almacenamiento lisosómico
Las enzimas lisosómicas recombinantes producidas según esta invención tendrán una variedad de usos, siendo probablemente su uso más significativo en terapia de sustitución de enzimas para enfermedades de almacenamiento lisosómico. Estas enzimas lisosómicas incluyen, pero no se limitan a:
\alpha-N-acetilgalactosaminidasa (Warner y col., Biochem. Biophys. Res. Commun. 1990, 173:13-19; lipasa ácida; arilsulfatasa A; aspartilglicosaminidasa; ceramidasa; \alpha-L-fucosidasa (de Wet y col., 1984, DNA 3:437-447), \alpha-galactosidasa, \beta-galactosidasa, galactosilceramidasa, glucocerebrosidasa, \alpha-glucosidasa, \beta-glucuronidasa, heparina-N-sulfatasa, \beta-hexosaminidasa, iduronato sulfatasa, \alpha-L-iduronidasa, \alpha-manosidasa, \beta-manosidasa, sialidasa y esfingomielinasa. De estas enzimas, los ADNc se han clonado para \alpha-N-acetilgalactosaminidasa (Zhu & Goldstein, 1993, Gene 137:309-314); lipasa ácida (Amesis y col., 1994, Eur. J. Biochem 219:905-914); \alpha-galactosidasa (Eng & Desnick, 1994, Hum Mutat. 3:103-111); glucocerebrosidasa humana (hGC) (Sorge y col., 1985, supra); \alpha-L-iduronidasa (Scott y col., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:9695-9699); iduronato sulfatasa (Daniele y col., 1993, Genomics 16:755-757); \alpha-manosidasa (Schatzle y col., 1992, J. Biol. Chem 267:4000-4007); y sialidasa (Ferrari y col., 1994, Glycobiology 4:2047-2052).
Las secuencias de ácidos nucleicos que codifican enzimas lisosómicas que pueden usarse según la invención incluyen, pero no se limitan a, cualquier secuencia de ácidos nucleicos que codifica una enzima lisosómica, enzima lisosómica modificada, o equivalente funcional de las mismas que incluye, pero no se limitan a: (a) cualquier secuencia de nucleótidos que se hibrida selectivamente con el complemento de una secuencia codificante de una enzima lisosómica humana o animal bajo condiciones estrictas, por ejemplo, lavando en 0,1 x SSC/SDS al 0,1% a 68ºC (Ausubel y col., eds., 1989, Current Protocols in Molecular Biology, Vol. I, Greene Publishing Associates, Inc. y John Wiley & Sons, Inc., New York, en la página 2.10.3), y codifica un producto homólogo a la enzima lisosómica humana o animal; y/o (b) cualquier secuencia de nucleótidos que se hibrida con el complemento de la secuencia codificante humana o animal de enzimas lisosómicas bajo condiciones menos estrictas, tales como condiciones moderadamente estrictas, por ejemplo, lavando en 0,2 x SSC/SDS al 0,1% a 42ºC (Ausubel y col., 1989, supra), que sin embargo todavía codifica un producto génico homólogo que es enzimáticamente activo; y (c) cualquier secuencia codificante de nucleótidos que codifica de otra forma una proteína de cualquier organismo que puede hidrolizar un sustrato nativo de enzima lisosómica humana o animal o sustrato análogo.
La invención también incluye, pero no se limita a:
(a) vectores de ADN que contienen cualquiera de las secuencias codificantes de nucleótidos anteriores y/o sus complementos; (b) vectores de expresión y transformación de ADN que contienen constructos de expresión que comprenden cualquiera de las secuencias codificantes de nucleótidos anteriores asociadas operativamente a un elemento regulador que dirige la expresión de las secuencias codificantes en células de plantas o plantas; y (c) células de plantas o plantas genéticamente manipuladas que contienen cualquiera de las secuencias codificantes anteriores asociadas operativamente a un elemento regulador que dirige la expresión de las secuencias codificantes y/o antisentido en la célula de la planta. Como se usa en este documento, el término "elemento regulador" incluye, pero no se limita a, promotores inducibles y no inducibles, potenciadores, operadores y otros elementos conocidos para aquellos expertos en la materia que dirigen y/o regulan la expresión génica. La invención también incluye fragmentos, derivados u otras modificaciones de las secuencias de ADN descritas en este documento.
5.2. Vectores de transformación para dirigir la expresión de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas 5.2.1. Constructos de expresión de enzimas lisosómicas
Con el fin de expresar una enzima lisosómica en un sistema de expresión en plantas, la secuencia codificante de la enzima lisosómica se inserta en un constructo de expresión apropiado y el constructo de expresión se incorpora en un vector de transformación para transferirse a las células de la planta. El constructo de expresión se construye preferentemente de manera que la secuencia codificante de enzima lisosómica esté operativamente asociada a uno o más elementos reguladores que incluyen, por ejemplo, promotores y/o potenciadores necesarios para la transcripción y traducción de la secuencia codificante de la enzima lisosómica. Los procedimientos para construir los constructos de expresión y los vectores de transformación incluyen recombinación y manipulación genética in vitro estándar. Véanse, por ejemplo, las técnicas descritas en Weissbach y Weissbach, 1988, Methods For Plant Molecular Biology, Academic Press, capítulos 26-28.
Los elementos reguladores que pueden usarse en los constructos de expresión incluyen promotores que pueden ser heterólogos u homólogos a la célula de la planta. El promotor puede ser un promotor de planta o un promotor que no es de planta que puede dirigir altos niveles de transcripción de una secuencia ligada en células de plantas y plantas. Los ejemplos no limitantes de promotores de plantas que pueden usarse eficazmente en la práctica de la invención incluyen el virus del mosaico de la coliflor (CaMV) 35S, rbcS, el promotor de la proteína de unión a clorofila a/b, AdhI, NOS y HMG2, o modificaciones o derivados de los mismos. El promotor puede ser o constitutivo o inducible. Por ejemplo, y no a modo de limitación, un promotor inducible puede ser un promotor que promueve la expresión o aumenta la expresión de la secuencia de nucleótidos de enzimas lisosómicas después de la activación mecánica de genes (MGA) de la planta, tejido de planta o célula de planta. Un ejemplo no limitante de un promotor de planta inducible por MGA es MeGA (descrito más adelante).
Los constructos de expresión pueden modificarse adicionalmente según procedimientos conocidos para aquellos expertos en la materia para potenciar u optimizar la expresión génica heteróloga en plantas y células de plantas. Tales modificaciones incluyen, pero no se limitan a, mutar elementos reguladores de ADN para aumentar la fuerza del promotor o para alterar la propia secuencia codificante de enzimas lisosómicas. Otras modificaciones incluyen eliminar secuencias de intrón o secuencias no codificantes en exceso de los extremos 5' y/o 3' de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas con el fin de minimizar los efectos negativos asociados a una secuencia o distancia sobre la expresión de hGC, por ejemplo, minimizando o eliminando las secuencias desestabilizadoras de mensajes.
Los constructos de expresión pueden modificarse adicionalmente según procedimientos conocidos para aquellos expertos en la materia para añadir, eliminar o modificar de otro modo las secuencias de péptidos señal para alterar la escisión de péptidos señal o para aumentar o cambiar el destino de la enzima lisosómica expresada por el sistema de endomembrana de la planta. Por ejemplo, pero no a modo de limitación, el constructo de expresión puede manipularse específicamente para dirigir a la enzima lisosómica para la secreción, o la localización vacuolar, o la retención en el retículo endoplásmico (ER).
En una realización, el constructo de expresión puede manipularse para incorporar una secuencia de nucleótidos que codifica una señal que dirige a la enzima lisosómica a la vacuola de la planta. Por ejemplo, y no a modo de limitación, el dominio de 143 aminoácidos N-terminal derivado de la proteína vacuolar de plantas, proaleuraína (Holwerda y col., 1992, supra; Holwerda y col., 1990, supra) puede manipularse en el constructo de expresión para producir un producto de fusión de péptido señal-enzima lisosómica con la transcripción y la traducción. El péptido señal de proaleuraína dirigirá la enzima lisosómica a la vacuola de la célula de plantas, pero él mismo se escinde durante el tránsito por el sistema de endomembrana de la planta para generar la proteína madura.
En otra realización no limitante, un péptido señal puede manipularse en el constructo de expresión para dirigir a la enzima lisosómica para que sea secretada por la célula de la planta. Por ejemplo, y no a modo de limitación, el péptido señal de tabaco PR-1, que es una proteína secretada relacionada con la patogénesis (Cornelissen y col., 1986, EMBO J. 5:37-40) puede manipularse en el constructo de expresión para dirigir la secreción de la enzima lisosómica desde la célula de planta.
En una realización no limitante adicional, el péptido señal puede manipularse en el constructo de expresión para dirigir que la enzima lisosómica sea retenida dentro del ER. Tales enzimas lisosómicas retenidas por el ER pueden presentar patrones de glicosilación alterados, y quizá preferibles, como resultado del fallo del péptido en avanzar por el aparato de Golgi, dando así como resultado una falta de procesamiento de glicosilo posterior. Por ejemplo, y no a modo de limitación, una secuencia de nucleótidos puede manipularse en el constructo de expresión para dar como resultado la fusión de la secuencia de aminoácidos KDEL, es decir, Lys-Asp-Glu-Leu, con el extremo carboxilo de la enzima lisosómica. La secuencia KDEL da como resultado la retención de la enzima lisosómica en el ER (Pfeffer y Rothman, 1987, Ann. Rev. Biochem. 56:829-852).
El constructo de expresión puede modificarse adicionalmente según procedimientos conocidos para aquellos expertos en la materia para añadir secuencias codificantes que faciliten la purificación de la enzima lisosómica. En una realización no limitante, una secuencia de nucleótidos que codifica el epítopo diana de un anticuerpo monoclonal puede manipularse en el constructo de expresión en asociación operativa con los elementos reguladores y situarse de manera que el epítopo expresado se fusione con la enzima lisosómica. Por ejemplo, y no a modo de limitación, una secuencia de nucleótidos que codifica el epítopo marcador FLAG^{TM} (International Biotechnologies, Inc., IBI), que es un péptido marcador hidrófílico, puede insertarse mediante técnicas estándar en el constructo de expresión en un punto que se corresponde con el extremo carboxilo de la enzima lisosómica. El producto de fusión epítopo FLAG^{TM}-enzima lisosómica expresado puede detectarse luego y purificarse por afinidad usando anticuerpos anti-FLAG^{TM}.
En otra realización no limitante, una secuencia de nucleótidos puede manipularse en el constructo de expresión para proporcionar una secuencia de conector escindible entre la secuencia de péptidos de la enzima lisosómica y cualquier señal de direccionamiento, péptido indicador, marcador de selección o marcador de detección, como se describen anteriormente, que no se ha escindido de otro modo de la secuencia de péptidos de la enzima lisosómica durante el procesamiento de péptidos y el tráfico por el sistema de endomembrana de la planta. Una secuencia de conector tal puede seleccionarse de manera que pueda escindirse o química o enzimáticamente durante la purificación de la enzima lisosómica (Light y col., 1980, Anal. Biochem. 106:199-206).
5.2.2. Vectores de transformación de plantas
Los vectores de transformación de la invención pueden desarrollarse a partir de cualquier vector de transformación de plantas conocido en la técnica que incluye, pero no se limita a, la familia muy conocida de los plásmidos Ti de Agrobacterium y derivados de los mismos, que incluyen vectores tanto integrativos como binarios, y que incluyen, pero no se limitan a, pBIB-KAN, pGA471, pEND4K, pGV3850 y pMON505. También están incluidos ADN y ARN de virus de plantas que incluyen, pero no se limitan a, CaMV, geminivirus, virus del mosaico del tabaco y derivados manipulados de los mismos, cualquiera de los cuales puede servir eficazmente de vector para transferir una secuencia codificante de enzimas lisosómicas, o equivalente funcional de la misma, con elementos reguladores asociados, en células de plantas y/o mantener autónomamente la secuencia transferida. Además, pueden utilizarse elementos transponibles conjuntamente con cualquier vector para transferir la secuencia codificante y la secuencia reguladora a una célula de planta.
Para ayudar en la selección de transformantes y transfectantes, los vectores de transformación pueden modificarse preferentemente para que comprendan una secuencia codificante para un producto génico indicador o marcador de selección. Tal secuencia codificante para un indicador o marcador de selección debería estar preferentemente en asociación operativa con la secuencia codificante del elemento regulador descrito anteriormente.
Los genes indicadores que pueden ser útiles en la invención incluyen, pero no se limitan, al gen de \beta-glucuronidasa (GUS) (Jefferson y col., 1986, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83:8447) y el gen de luciferasa (Ow y col., 1986, Science 234:856). Las secuencias codificantes que codifican marcadores de selección que pueden ser útiles en la invención incluyen, pero no se limitan a, aquellas secuencias que codifican productos génicos que confieren resistencia a antibióticos, antimetabolitos o herbicidas que incluyen, pero no se limitan a, kanamicina, higromicina, estreptomicina, fosfinotricina, gentamicina, metotrexato, herbicidas de glifosato y sulfonilurea, e incluyen, pero no se limitan a, secuencias codificantes que codifican enzimas tales como neomicina fosfotransferasa II (NPTII), cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) e higromicina fosfotransferasa I (HPT, HYG).
5.3. Transformación/transfección de plantas
Puede utilizarse una variedad de sistemas de expresión en plantas para expresar la secuencia codificante de enzimas lisosómicas o su equivalente funcional. Las especies de plantas particulares pueden seleccionarse de cualquier especie dicotiledónea, monocotiledónea, gimnosperma, planta vascular o no vascular inferior, que incluyen cualquier cultivo de cereales u otro cultivo agrícolamente importante. Tales plantas incluyen, pero no se limitan a, alfalfa, Arabidopsis, espárrago, cebada, repollo, zanahoria, apio, maíz, algodón, pepino, lino, lechuga, colza, pera, guisantes, petunia, álamo, patata, arroz, soja, remolacha azucarera, girasol, tabaco, tomate, trigo y trébol blanco.
Los procedimientos por los que las plantas pueden transformarse o transfectarse son muy conocidos para aquellos expertos en la materia. Véase, por ejemplo, Plant Biotecnology, 1989, Kung & Arntzen, eds., Butterworth Publishers, cap. 1, 2. Los ejemplos de procedimientos de transformación que pueden usarse eficazmente en la invención incluyen, pero no se limitan a, transformación mediada por Agrobacterium de discos de hojas u otros tejidos de plantas, microinyección de ADN directamente en células de plantas, electroporación de ADN en protoplastos de células de plantas, fusión de liposomas o esferoplastos, bombardeo con microproyectiles y la transfección de células o tejidos de plantas con virus de plantas apropiadamente manipulados.
Los procedimientos de cultivo de tejidos de plantas necesarios para poner en práctica la invención son muy conocidos para aquellos expertos en la materia. Véase, por ejemplo, Dixon, 1985, Plant Cell Culture: A Practical Approach, IRL Press. Aquellos procedimientos de cultivo de tejidos que pueden usarse eficazmente para poner en práctica la invención incluyen la producción y el cultivo de protoplastos de plantas y suspensiones de células, la propagación de cultivos estériles de discos de hojas u otros tejidos de plantas en medios que contienen cepas manipuladas de agentes transformantes tales como, por ejemplo, cepas de Agrobacterium o de virus de plantas y la regeneración de plantas transformadas completas a partir de protoplastos, suspensiones de células y tejidos del callo.
La invención puede ponerse en práctica transformando o transfectando una planta o célula de planta con un vector de transformación que contiene un constructo de expresión que comprende una secuencia codificante para la enzima lisosómica y seleccionando transformantes o transfectantes que expresan la enzima lisosómica. Las células y tejidos de plantas transformadas o transfectadas pueden seleccionarse mediante técnicas muy conocidas para aquellos expertos en la materia que incluyen, pero no se limitan a, detectar productos de genes indicadores o seleccionar basándose en la presencia de uno de los marcadores de selección descritos anteriormente. Entonces, las células o tejidos de plantas transformadas o transfectadas se cultivan y a partir de los mismos se regeneran plantas completas. La integración y el mantenimiento de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas en el genoma de la planta puede confirmarse mediante técnicas estándar, por ejemplo, mediante análisis por hibridación de Southern, análisis por PCR, que incluye PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR), o ensayos inmunológicos para los productos proteicos esperados. Una vez se ha identificado un transformante o transfectante de planta tal, una realización no limitante de la invención implica la expansión clonal y el uso de ese transformante o transfectante en la producción de enzima lisosómica.
Como un ejemplo no limitante de un procedimiento de transformación, la transformación mediada por Agrobacterium de discos de hojas de plantas puede seguir procedimientos que son muy conocidos para aquellos expertos en la materia. Brevemente, los discos de hojas pueden cortarse de plantas de semillero cultivadas axénicamente, incubarse en una suspensión bacteriana, por ejemplo, 10^{9} ufc/ml, de A. tumefaciens que contiene un plásmido manipulado que comprende un marcador de selección tal como, por ejemplo, resistencia a kanamicina, y transferirse a medio de "formación de brotes" selectivo que contiene, por ejemplo, kanamicina, que bloqueará el crecimiento de bacterias y células de plantas sin transformar e inducirá la iniciación de brotes y la formación de hojas a partir de células transformadas. Los brotes se regeneran y luego se transfieren a medios selectivos para desencadenar la iniciación de raíces. La selección estricta de antibióticos en la etapa de enraizamiento es útil para permitir que sólo los brotes establemente transformados generen raíces. Las plántulas transgénicas pequeñas pueden ser transferidas luego a turba estéril, vermiculita o tierra y aclimatarse gradualmente para el crecimiento en el invernadero o en el campo.
5.4. Identificación y purificación del producto génico de enzimas lisosómicas
La transcripción de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas y la producción de la enzima lisosómica en plantas, tejidos de plantas o células de plantas transformados o transfectados pueden confirmarse y caracterizarse por una variedad de procedimientos conocidos para aquellos expertos en la materia. La transcripción de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas puede analizarse mediante técnicas convencionales que incluyen, pero no se limitan a, detectar la presencia de transcritos de ácido ribonucleico mensajero (ARNm) de enzimas lisosómicas en plantas o células de plantas transformadas o transfectadas usando análisis por hibridación de Northern o amplificación por RT-PCR.
La detección de la propia enzima lisosómica puede llevarse a cabo usando cualquiera de una variedad de técnicas convencionales que incluyen, pero no se limitan a, detectar la actividad de enzimas lisosómicas en extractos de plantas, por ejemplo, detectando la hidrólisis de o el sustrato natural de la enzima o un análogo del sustrato. Adicionalmente, la enzima lisosómica puede detectarse inmunológicamente usando anticuerpos monoclonales o policlonales, o fragmentos inmunorreactivos o derivados de los mismos, producidos contra la enzima, por ejemplo, por análisis por transferencia de Western, y determinación de la secuencia de aminoácidos limitada de la proteína.
La identificación indirecta de la producción de enzimas en una planta puede realizarse usando cualquier marcador detectable o indicador ligado a la enzima lisosómica. Por ejemplo, pero no a modo de limitación, el epítopo FLAG^{TM}, que puede ligarse a la enzima lisosómica, como se describe anteriormente, puede detectarse en tejidos y extractos de plantas usando anticuerpos monoclonales anti-FLAG M2 (IBI) conjuntamente con el sistema de detección quimioluminiscente Western Exposure^{TM} (Clontech).
La producción de enzima lisosómica en una planta transformada o transfectada puede confirmarse y caracterizarse adicionalmente por localización histoquímica cuyos procedimientos son muy conocidos para aquellos expertos en la materia. Véase, por ejemplo, Techniques of Immunocytochemistry, Vol I, 1982, Bullock y Petrusz, eds., Academic Press, Inc. Por ejemplo, pero no a modo de limitación, el tejido tanto recientemente obtenido, congelado como fijado e incluido puede seccionarse, y las secciones pueden sondarse tanto con anticuerpos primarios policlonales como monoclonales producidos contra la enzima lisosómica o, por ejemplo, anticuerpos monoclonales anti-FLAG^{TM}. Entonces, los anticuerpos primarios pueden detectarse mediante técnicas convencionales, por ejemplo, usando la técnica de estreptavidina conjugada con fosfatasa alcalina-proteína A biotinilada, o un anticuerpo secundario que posee un marcador detectable que se une al anticuerpo primario.
Los productos de expresión pueden purificarse adicionalmente y caracterizarse como se describe a continuación en las subsecciones.
5.4.1. Producción y purificación del producto génico de enzimas lisosómicas
Aquí se describe un procedimiento no limitante para producir y purificar la enzima lisosómica, estando la secuencia codificante de enzimas lisosómicas operablemente asociada a un promotor inducible en el constructo de expresión. La hoja u otro tejido o células de una planta o cultivo de células transgénico transformado o transfectado con este constructo de expresión puede procesarse para inducir la expresión de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas. Este procedimiento de inducción puede incluir inducir la activación de genes lisosómicos por uno o más procedimientos aplicados por separado o en combinación que incluyen, pero no se limitan a, daño físico u otra activación mecánica de genes (MGA) y aplicación de desencadenantes químicos o patogénicos u hormonas de plantas. Los niveles de activación de genes lisosómicos también pueden potenciarse en células o tejidos de plantas por factores tales como la disponibilidad de nutrientes, gases tales como O_{2} y CO_{2}, y luz o calor. Después de la inducción de la expresión, el tejido puede almacenarse, por ejemplo a -20ºC. Si la proteína lisosómica es dirigida para la localización dentro de la célula de planta, la pared celular de la planta deberá ser penetrada para extraer la proteína. Por consiguiente, el tejido de la planta puede molerse para dar un polvo fino, por ejemplo, usando un molinillo de tejidos y nieve carbónica, u homogeneizarse con un homogeneizador de tejido de vidrio esmerilado. Para resuspender la enzima lisosómica, las membranas de la planta deben solubilizarse usando un tampón de extracción que contiene un detergente, por ejemplo, un detergente biliar tal como taurocolato de sodio al 1% (p/v), en una disolución tamponada, por ejemplo citrato de sodio 25 mM, pH 7,0. Entonces, el homogeneizado puede clarificarse, por ejemplo, por centrifugación a 10.000 x g durante 30 min para producir un homogeneizado sin células.
La enzima lisosómica debe purificarse adicionalmente si va a ser útil como un reactivo terapéutico o para investigación. La enzima lisosómica puede purificarse a partir de extractos de plantas según procedimientos muy conocidos para aquellos expertos en la materia (Furbish y col., 1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74:3560-3563). Una vez se confirma la presencia de la enzima, puede aislarse de extractos de plantas mediante técnicas bioquímicas convencionales que incluyen, pero no se limitan a, precipitación diferencial con sulfato de amonio (AS), cromatografía de filtración en gel o cromatografía de afinidad, por ejemplo, utilizando unión hidrófoba, inmunológica o a lectina. En cada etapa del procedimiento de purificación, el rendimiento, la pureza y la actividad de la enzima pueden determinarse por uno o más ensayos bioquímicos que incluyen, pero no se limitan a: (1) detectar la hidrólisis del sustrato de la enzima o un análogo del sustrato; (2) análisis inmunológico usando un ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA); (3) análisis por electroforesis en gel de poliacrilamida-dodecilsulfato de sodio (SDS-PAGE); y (4) análisis de Western. La enzima puede purificarse alternativa o adicionalmente por cromatografía de afinidad en la que la enzima se une a su inhibidor que está ligado, por ejemplo, a un sustrato inerte.
Una vez solubilizadas, todas las fracciones que contienen enzimas pueden mantenerse, por ejemplo, mediante almacenamiento a 4ºC, y estabilizarse, si es necesario, por ejemplo, con \beta-mercaptoetanol 4 mM, EDTA 5 mM y/o posiblemente con altos niveles de glicerol o etilenglicol.
5.4.2. Procesamiento proteolítico del péptido señal
Con el fin de estudiar si el sistema de expresión en plantas reconoce eficazmente y escinde correctamente el péptido señal humano de la enzima lisosómica, la enzima producida por la planta puede purificarse y analizarse mediante secuenciación del extremo N. Por consiguiente, la enzima puede tratarse, por ejemplo, con Endo-F/N-glucanasa (Boehringer Mannheim) para eliminar los glicanos N-ligados, y el péptido resultante puede repurificarse mediante procedimientos descritos anteriormente. La pureza de la enzima puede determinarse basándose, por ejemplo, en SDS-PAGE teñido con plata. La banda que contiene la enzima puede cortarse del gel, el péptido eluirse de la misma y luego analizarse mediante secuenciación comercial del aminoácido N-terminal para determinar si se ha producido la correcta escisión del péptido señal. La escisión incompleta puede detectarse, por ejemplo, como una banda doble en SDS-PAGE, o como secuencias N-terminales mezcladas.
5.4.3. Glicosilación n-ligada en plantas frente a animales
Los oligosacáridos de enzimas lisosómicas humanas y animales nativas son estructuras de antena típicas que contienen N-acetilglucosamina, manosa y ácido siálico. El glicoconjugado asociado a la enzima lisosómica de la invención puede determinarse, por ejemplo, mediante estudios de unión a lectina (Reddy y col., 1985, Biochem. Med. 33:200-210, Cummings, 1994, Meth. Enzymol. 230:66-86).
Los glicanos de plantas no contienen ácido siálico, que es un azúcar terminal frecuente en glicanos de mamíferos. Además, los glicanos complejos de plantas son generalmente más pequeños y contienen un residuo \beta 1-2 xilosa unido a los residuos de manosa ligados a \beta del núcleo (Gomez y Chrispeels, 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:1829-1833).
La determinación de la composición y la estructura de los glicanos de la enzima lisosómica de la invención es de particular interés porque: (a) la composición de los glicanos indicará el estado del movimiento de la proteína por el Golgi; y (b) la presencia de un glicano complejo puede indicar si se desencadenará una respuesta antigénica en seres humanos.
Pueden usarse varias aproximaciones moleculares, genéticas y químicas para elevar la proporción de la forma con alto contenido de manosa de los glicanos en enzimas lisosómicas, haciéndolas más similares en estructura a la proteína humana nativa (Grabowski y col. 1995, Ann. Int. Med. 122:33-39; Berg-Fussman y col. 1993, J. Biol. Chem. 268:14861-14866). Por ejemplo, pero no a modo de limitación, el análogo de manosa, 1-desoximanojirimicina (dMM), inhibe la manosidasa I, la primera enzima específica para Golgi que participa en el procesamiento de glicanos. Los tejidos de plantas tratados con dMM producen glicoproteínas que carecen de fucosa y xilosa y mantienen un perfil de glicanos que concuerda con la inhibición en la etapa de manosidasa I (Vitale y col. 1989, Pl. Phys. 89:1079-1084). El tratamiento de tejidos de plantas que expresan enzimas lisosómicas con dMM puede ser útil para producir enzimas lisosómicas con un perfil de glicanos con alto contenido de manosa relativamente homogéneo. Tales enzimas lisosómicas deberían ser sumamente eficaces para uso en el tratamiento de enfermedades de almacenamiento lisosómico en seres humanos y animales.
5.5. Cultivo y propagación clonal de plantas transgénicas
Una vez se selecciona una planta transformada o transfectada que produce una cantidad útil de la enzima lisosómica recombinante de la invención, una realización de la invención contempla la producción de clones de esta planta tanto por procedimientos de reproducción asexual muy conocidos como por procedimientos de cultivo de tejidos de plantas habituales. Por ejemplo, los tejidos de una planta de interés pueden inducirse para que formen plantas genéticamente idénticas a partir de esquejes asexuales. Alternativamente, el tejido del callo y/o suspensiones de células pueden producirse a partir de una planta tal y subcultivarse. Posteriormente, a partir de la misma puede regenerarse un número elevado de plantas mediante transferencia al medio de cultivo regenerativo apropiado.
Alternativamente, la planta que produce la enzima lisosómica recombinante puede cruzarse como una línea parental, bien macho o hembra, con otra planta de la misma especie o variedad, cuya otra planta también puede o no ser transgénica para la secuencia codificante lisosómica para producir una generación F1. Los miembros de la generación F1 y las generaciones posteriores pueden probarse, como se describe anteriormente, para la herencia y el mantenimiento estables de la secuencia codificante de enzimas lisosómicas, además de para la producción de enzimas lisosómicas. Por tanto, se contempla un programa de cultivo por el cual la secuencia codificante de enzimas lisosómicas puede transferirse a otras cepas o variedades de plantas que tienen características agronómicas ventajosas, por ejemplo, mediante un programa de retrocruzamiento controlado. Por tanto, la invención engloba líneas parentales que comprenden la secuencia codificante de enzimas lisosómicas, además de todas las plantas en generaciones posteriores que descienden de un cruce en el que al menos una de los padres comprendía la secuencia codificante de enzimas lisosómicas. La invención engloba adicionalmente todas las semillas que comprenden la secuencia codificante de enzimas lisosómicas y a partir de las cuales pueden cultivarse tales plantas, y cultivos de tejido, que incluyen tejidos del callo, suspensiones de células y protoplastos que comprenden la secuencia codificante de enzimas lisosómicas, tanto si pueden regenerarse de nuevo como si no para dar plantas.
5.6. Procedimientos para uso terapéutico de enzimas lisosómicas
Las enzimas lisosómicas recombinantes de la invención son útiles para el tratamiento terapéutico de enfermedades de almacenamiento lisosómico proporcionando una cantidad terapéutica de una enzima lisosómica particular, o un derivado o modificación de la misma, a un paciente que padece una enfermedad de almacenamiento lisosómico o afección resultante de una deficiencia de la forma activa humana o animal correspondiente de esa enzima.
Por "cantidad terapéutica" se indica una cantidad de enzima lisosómica enzimáticamente activa que producirá un alivio significativo de síntomas clínicos de una enfermedad de almacenamiento lisosómico particular.
Una cantidad terapéutica produce "alivio significativo de síntomas clínicos" de la enfermedad de almacenamiento lisosómico particular si sirve para reducir uno o más de los efectos o síntomas patológicos de la enfermedad o para reducir la velocidad de progresión de uno o más de tales efectos o síntomas patológicos.
Puede determinarse un protocolo de dosificación y tratamiento eficaz mediante medios convencionales empezando con una baja dosis en animales de laboratorio y luego aumentando la dosificación a la vez que se controlan los efectos, y también variando sistemáticamente la pautade dosificación. La cantidad de enzima lisosómica recombinante que va a administrarse a un paciente que padece una enfermedad o afección lisosómica variará. Un médico puede tener en cuenta numerosos factores cuando determina una dosis óptima para un sujeto dado. Estos factores incluyen la estatura del paciente, la edad del paciente, la condición general del paciente, la enfermedad particular que está tratándose, la gravedad de la enfermedad, la presencia de otros fármacos en el paciente, y similares. Las dosificaciones de ensayo se elegirían después de considerar los resultados de estudios en animales y cualquier bibliografía clínica disponible con respecto a resultados pasados de terapia de sustitución para la enfermedad de almacenamiento lisosómico particular.
Por ejemplo, las cantidades terapéuticas de hGC e IDUA recombinantes y hGC e IDUA modificadas producidas según la invención pueden englobar en cada caso dosificaciones de entre aproximadamente 10 y aproximadamente 500 mg para un paciente de 70 kg por mes, dependiendo de la gravedad de los síntomas del paciente de la enfermedad de Gaucher o de Hurler.
La cantidad de enzima lisosómica recombinante de la invención administrada al paciente puede disminuirse o aumentarse según la actividad enzimática de la enzima lisosómica particular. Por ejemplo, la administración de una enzima lisosómica recombinante de la invención que se ha modificado para tener una actividad enzimática aumentada respecto a la enzima humana o animal nativa requerirá la administración de una menor cantidad al paciente que una enzima lisosómica humana o animal nativa que tiene menor actividad enzimática.
Además, la cantidad de enzima lisosómica recombinante administrada al paciente puede modificarse con el tiempo dependiendo de un cambio en la afección del paciente a medida que avanza el tratamiento, cuya determinación está dentro de las destrezas del médico que lo atiende.
La invención también proporciona formulaciones farmacéuticas para uso de la enzima lisosómica recombinante en el tratamiento de enfermedades de almacenamiento lisosómico. Las formulaciones comprenden una enzima lisosómica recombinante de la invención y un vehículo farmacéuticamente aceptable. Puede usarse una variedad de vehículos acuosos, por ejemplo, agua, agua tamponada, solución salina al 0,4%, glicina al 0,3% y similares. Las formulaciones farmacéuticas también pueden comprender componentes adicionales que sirven para prologar la vida útil de formulaciones farmacéuticas que incluyen conservantes, estabilizadores de proteínas y similares. Las formulaciones son preferentemente estériles y están libres de material particulado (para formas inyectables). Estas composiciones pueden esterilizarse mediante técnicas de esterilización convencionales muy conocidas.
Las composiciones pueden contener sustancias auxiliares farmacéuticamente aceptables según se requiera para aproximarse a condiciones fisiológicas tales como agentes tamponantes y de ajuste del pH, agentes de regulación de la toxicidad y similares, por ejemplo, acetato sódico, cloruro sódico, cloruro de potasio, cloruro de calcio, lactato de sodio, etc.
Las formulaciones pueden adaptarse para diversas formas de administración que incluyen intramuscularmente, subcutáneamente, intravenosamente y similares. Las formulaciones objeto también pueden formularse de manera que se proporcione la liberación sostenida de una enzima lisosómica. Los procedimientos actuales para preparar composiciones que pueden administrarse parenteralmente y los ajustes necesarios para la administración a sujetos serán conocidos o evidentes para aquellos expertos en la materia y se describen en más detalle en, por ejemplo, Remington's Pharmaceutical Science, 17th Ed. Mack Publishing Company, Easton, Pa. (1985).
La invención se ilustra en los ejemplos de trabajo descritos a continuación para la expresión de hGC en tabaco.
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6. Ejemplo 1 Producción y aislamiento de hGC modificada recombinante a partir de plantas de tabaco transgénicas
Las subsecciones a continuación describen la producción de una glucocerebrosidasa humana (hGC) modificada enzimáticamente activa en tabaco.
6.1. Construcción de un constructo de expresión de hGC modificado e inserción en un vector de transformación de plantas 6.1.1. Constructo de expresión de promotor:hGC
La E. coli que contiene la secuencia de ADNc de hGC clonada a partir de células de fibroblasto, como se describe (Sorge y col. 1985, supra), se obtuvo de la ATCC (nº de acceso 65696). Los cebadores de oligonucleótidos GC1 (correspondientes al extremo amino de la región codificante de hGC como se muestra en la Fig. 1) y GC4 (correspondientes al extremo carboxi de la región codificante de hGC) se usaron para amplificar la secuencia de ADNc de hGC usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El cebador GC1 se diseñó para incluir el codón de iniciación ATG de hGC y para generar un sitio de XbaI en 5'. El cebador GC4, complementario al ARNm de hGC, no incluye el codón de terminación para el gen y se diseño para generar un sitio de restricción EcoRI. El diseño del oligonucleótido GC4 también corrigió una base alterada en la secuencia de ATCC (GenBank/EMBL nº M11080), produciéndose así una secuencia de Arg-Arg-Gln en el extremo 5' del sitio en el que se insertará un epítopo FLAG^{TM}.
El fragmento de 1,9 kb generado por PCR se purificó mediante elución en gel de agarosa, se digirió con XbaI y EcoRI y se ligó en el plásmido similarmente digerido, Bluescript SK^{-} (Stratagene). Este vector de clonación se eligió debido a su pequeño tamaño (2,9 kb) y su amplia región de clonación múltiple.
El promotor MeGA, que comprende un fragmento de 456 pb (Fig. 11) (SEQ ID NO:5) como se modificó a partir del promotor HMG2 de tomate (Weissenborn y col. 1995, Phys. Plantarum 93:393-400), se usó para dirigir la expresión del gen de hGC. El promotor MeGA es inducible y tiene una baja expresión basal en tejidos de plantas sin estrés, pero está altamente inducido tanto en tejidos inmaduros como maduros mediante el procedimiento de activación mecánica de genes (MGA), o mediante una variedad de productos químicos que inducen las respuestas de defensa de las plantas. La MGA incluye, pero no se limita a, el corte mecánico en tiras de tejido de las hojas, por ejemplo, en tiras de 2 mm, seguido por el almacenamiento a temperatura ambiente en papel de cromatografía Whatman 3MM humedecido con agua estéril en una bolsa de plástico cerrada herméticamente. La expresión de un constructo MeGA:GUS se ha controlado en plantas de tabaco transgénicas desde la fase de planta de semillero hasta la floración y no mostró pérdida de actividad inducible cuando las plantas alcanzaron la madurez.
El promotor MeGA de 456 pb se amplificó por PCR usando cebadores que incorporaban un sitio de restricción NotI en el extremo 5' del fragmento y un sitio XbaI en el extremo 3' del promotor. Este fragmento también contenía la secuencia líder 5' no traducida de su secuencia de tomate nativa y, por tanto, proporcionó todos los elementos de 5' necesarios para la expresión de las secuencias de hGC fusionadas. Tras la amplificación, el fragmento se purificó en PAGE, se digirió con NotI y XbaI y se ligó en el plásmido que contenía la región codificante de hGC, que también se había digerido con NotI/XbaI, para producir una fusión MeGA:hGC.
6.1.2. Generación de un constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM}
Con el fin de facilitar la detección y la purificación del producto génico de hGC, una secuencia codificante del epítop FLAG^{TM} se fusionó manteniendo la pauta de lectura al extremo C de la secuencia codificante de hGC. El epítopo FLAG^{TM} (IBI) es el octapéptido Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (o DYKDDDDK) (SEQ ID NO:10) diseñado para ser un péptido marcador hidrófilo situado en una superficie de proteína para facilitar las interacciones de anticuerpos (Shelness, 1992, Epitope 1:11-17; Hopp y col. 1988, Bio/Tech. 6:1204-1210).
Se sintetizó un oligonucleótido de doble hebra (Fig. 1) que incorporaba: (a) un sitio de restricción EcoRI en 5' que crea una fusión que mantiene el marco de lectura con el sitio EcoRI del extremo C de hGC manipulado; (b) la región codificante del octapéptido FLAG^{TM}; (c) un codón de terminación tras el epítopo; y (d) un sitio SstI/EcoRI en 3'. El ADN que codifica FLAG^{TM} se purificó por PAGE, se digirió con EcoRI y el fragmento que codifica FLAG^{TM} se insertó en el sitio EcoRI del plásmido de MeGA:hGC, y se analizó la orientación del inserto.
La fusión de la traducción se analizó mediante transcripción in vitro usando T3 ARN polimerasa dirigida por el promotor T3 en el vector pBluescript SK^{-} tras la escisión del promotor MeGA, y la traducción in vitro en presencia de ^{35}S-metionina usando lisados de reticulocitos de conejo (BRL). El producto de traducción principal tenía aproximadamente 56-59 kDa, que coincide con el tamaño esperado del producto de fusión hGC:FLAG^{TM} (59 kDa). Además, el constructo de fusión hGC:FLAG^{TM} se secuenció completamente usando el sistema de didesoxi-secuenasa (USB). La secuencia de nucleótidos de la fusión hGC:FLAG^{TM} (SEQ ID NO:3) se muestra en la Fig. 9; la secuencia de aminoácidos deducida (SEQ ID NO:4) se muestra en la Fig. 10. La construcción alteró el residuo de aminoácido 545 a una arginina (R) y añadió diez residuos de aminoácido, que incluyen el octapéptido FLAG^{TM}, al extremo carboxi de hGC. Véase la Fig. 10.
6.1.3. Inserción del constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM} en un vector de transformación de plantas
El constructo de expresión MeGA:hGC:FLAG^{TM} se cortó del vector pBluescript mediante digestión con SstI y se ligó en el sitio de restricción correspondiente en la región de clonación múltiple del vector binario de plantas pBIB-KAN (Becker, 1990, Nucl. Acids Res. 18:203) para formar el plásmido CTPro1:hGC:FLAG^{TM}. Como se muestra en la Fig. 1, la inserción del constructo de expresión MeGA:hGC:FLAG^{TM} posicionó correctamente un terminador transcripcional de plantas para el constructo. Además, el vector binario lleva un gen NPTII dentro del ADN de transferencia (ADN-T) que permite la selección de células de plantas transformadas basándose en la resistencia a kanamicina. El plásmido manipulado se transformó en la cepa DH5\alpha de E. coli y se analizó la correcta inserción antes de la movilización a la cepa LBA4404 de Agrobacterium tumefaciens (Hoekma y col. 1983, Nature 303:179-180).
6.2. Introducción del constructo de expresión MeGA:hGC:FLAG^{TM} en tabaco y evaluación de la expresión de hGC: FLAG^{TM} 6.2.1. Generación de plantas de tabaco transgénicas que contienen el constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM}
La transformación mediada por Agrobacterium (Horsch y col. 1984, Science 223:496-498) se usó para integrar establemente la secuencia de ADN-T modificada que contenía el constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM} en el genoma de tabaco. Los discos de hojas cortados de plantas de semillero de tabaco cultivadas asépticamente (Nicotiana tabacum) cvs. Xanthi (una variedad no comercial) y VA116 (una variedad comercial curada en aire caliente) se incubaron brevemente en una suspensión bacteriana (10^{9} ufc/ml) de A. tumefaciens que contenía el plásmido manipulado (Fig. 2A) y se cocultivaron en placas que contenían un cultivo nodriza de células de tabaco cultivadas durante 48 h. Entonces, los discos de hojas se transfirieron a medio MS (Murashige & Skoog, 1962, Physiol. Plant. 15:473-497) que contenía 100 mg/l de kanamicina y zeatina 9,12 \muM, que es un medio de "formación de brotes" selectivo que bloquea el crecimiento de bacterias y células de plantas sin transformar y estimula la formación de brotes (Horsch y col., supra).
Los brotes se observaron tres semanas pos-inoculación (Fig. 2B) y se cortaron y se colocaron en medio de enraizamiento selectivo (100 mg/l de kanamicina, ácido indol-3-acético 10 \muM en medio MS). Después de 1 semana, las plántulas enraizadas (Fig. 2C) se transfirieron a tierra orgánica estéril y se colocaron en el invernadero (Fig. 2D). Los brotes adicionales se cortaron y enraizaron durante las 4 semanas siguientes sembrándose un total de 45 transformantes individuales (Fig. 2E). La presencia del constructo génico no pareció tener ningún efecto sobre el crecimiento o el desarrollo de estos transformantes.
6.2.2. Análisis de Southern de inserciones de MeGA:hGC:FLAG^{TM} en plantas transgénicas
La inserción estable del constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM} se confirmó por análisis por hibridación genómica de Southern. El ADN total se aisló de tejido de hojas de ocho regenerantes jóvenes y se digirió con HindIII, que sólo corta una vez el ADN introducido (véase la Fig. 1). El segundo sitio HindIII flanquea el ADN introducido y se localiza en el ADN genómico de la planta. Por tanto, cuando 3' del sitio HindIII se sondó con secuencias de ADNc de hGC (fragmento de HindIII de 1,7 kb a partir del vector intermedio pBluescript), cada fragmento debería tener un tamaño distinto y representar un acontecimiento de inserción independiente dentro del genoma de la planta.
Cinco de los ocho transformantes putativos probados mostraron insertos de hGC múltiples (Fig. 3). Cuatro de estas plantas (X-1, X-8, X-9 y X-11) se derivaron de la variedad cultivada Xanthi. Una planta (V-1) se derivó de la variedad cultivada VA116. El transformante X-8 tenía menos ADN cargado y mostró dos bandas con una exposición autorradiográfica más larga. Además, se detectaron altos niveles de hGC en otros transformantes para los que no se llevaron a cabo las hibridaciones de Southern, incluyendo una planta designada X-27.
6.2.3. Análisis de Northern de la activación transcripcional del transgén de MeGA:hGC:FLAG^{TM}
Como se describe anteriormente, el promotor MeGA es esencialmente inactivo en hojas no estresadas, pero se activa por MGA (véase la Fig. 4) o mediante tratamiento con productos químicos que inducen respuestas de defensa de las plantas. Con el fin de demostrar que las plantas transgénicas expresan ARNm de hGC:FLAG^{TM} en el patrón de expresión inducible esperado, el tejido de plantas transformadas se indujo por MGA, es decir, cortando en tiras el tejido de hojas en tiras de 2 mm, seguido por incubación en papel Whatman nº 1 humedecido con agua estéril dentro de una bolsa de plástico ZipLoc^{TM} y se incubó a temperatura ambiente durante 24 h. El ARN total se aisló mediante procedimientos habituales con guanidino-tiocianato del tejido de hojas de plantas sin transformar y transformadas inmediatamente con el corte (tiempo 0), o a 24 h después de MGA.
Como se muestra en la Fig. 4, los niveles de ARNm de hGC:FLAG^{TM} fueron indetectables en hojas de X-11 al tiempo 0, pero mostraron un aumento marcado en niveles de transcrito de hGC 24 h después de MGA. Un transcurso de tiempo más detallado de una segunda planta, V-1, mostró ARNm detectable antes de 4 h, niveles de ARN máximo a las 24 h y disminuyendo los niveles de ARNm a las 48 h. Además, los niveles de transcrito aumentaron en respuesta a desencadenantes de defensa químicos en comparación con MGA. Este patrón de expresión es exactamente el esperado de un constructo transgénico ligado al promotor MeGA (Park y col. 1992, Pl. Mol. Biol. 20:327-331; Yang y col. 1991, Pl. Cell 3:397-405).
6.2.4. Inmunodetección de la proteína de hGC:FLAG^{TM} en extractos de plantas transgénicas
Como se describe anteriormente, el constructo de fusión hGC:FLAG^{TM} se diseñó para utilizar el epítopo FLAG^{TM} para facilitar la detección y la purificación de la proteína de fusión hGC:FLAG^{TM}. Siete semanas después de plantarse las plantas en tierra, discos de hojas de 35 plantas de los 45 transformantes descritos anteriormente se recogieron (y de ese modo se dañaron) para inducir la expresión transgénica. Los extractos de los discos de hojas de plantas de control y plantas transgénicas se colocaron en ranuras sobre membranas de nitrocelulosa para el análisis por inmunotransferencia puntual. Los anticuerpos monoclonales (anti-FLAG M2, IBI) contra el epítopo FLAG^{TM}, conjuntamente con el sistema de detección quimioluminiscente Western Exposure^{TM} (Clontech, Inc.), se usaron para probar el material inmunorreactivo. De las 35 plantas probadas, 25 mostraron expresión transgénica significativa.
El análisis de Western de extractos de hojas dañadas de plantas sin transformar y plantas transformadas se probaron para la inmunorreactividad a anticuerpos policlonales producidos contra hGC (Fig. 5B). Estos anticuerpos no han mostrado unión a ninguna proteína mamífera distinta de la \beta-glucosidasa ácida, es decir, la glucocerebrosidasa de chimpancés. Los extractos de plantas transgénicas mostraron una fuerte inmunorreactividad mediante una única banda de proteína con una masa molecular aparente de aproximadamente 66-69 kDa (Fig. 5B). El tamaño de la proteína inmunorreactiva se redujo a aproximadamente 58 kDa después del tratamiento con N-glucanasa, que indica que la enzima estaba glicosilada. Las inmunotransferencias de Western análogas sondadas con anticuerpos anti-FLAG^{TM} mostraron bandas adicionales de masas moleculares similares (Fig. 5A), sugiriendo que tanto el anticuerpo policlonal para hGC como el anticuerpo anti-FLAG^{TM} reconocen el mismo producto de proteínas de fusión.
6.2.5. Actividad enzimática en extractos de tabaco
Los tejidos de plantas se probaron para la actividad de hGC usando un ensayo sensible y conveniente que se utiliza ampliamente en la investigación de la enfermedad de Gaucher (Grabowski y col. 1990, en: Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology, 25:385-414, CRC Press, Inc.). Este ensayo usa el sustrato fluorométrico, 4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranósido (4MuGlc) (el "ensayo con 4MuGlc"). Un aumento en la absorbancia a 460 nm resulta de la escisión de 4MuGlc e indica la presencia de actividad enzimática. El 4MuGlc también sirve de sustrato para \beta-glucosidasas de plantas endógenas que se han detectado en hojas de plantas tanto de control como transgénicas. Sin embargo, se usaron varias propiedades diferentes de hGC para distinguir entre la actividad de glucosidasa endógena y la actividad de hGC (TABLA 1). Las diferencias en la solubilidad, junto con el uso del sistema de afinidad anti-FLAG^{TM} para la purificación de hGC:FLAG^{TM}, se emplearon para solucionar el problema de separar hGC:FLAG^{TM} de las \beta-glucosidasas de plantas endógenas (Tabla 2, Fig. 8).
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TABLA 1 Comparaciones de \beta-glucosidasa de tabaco endógena y hGC:FLAG^{TM}
1
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6.2.6. Acumulación de proteína de hGC:FLAG^{TM} en tejidos de tabaco
Con el fin de determinar la mejor duración del tiempo de incubación pos-MGA para el rendimiento óptimo de la proteína de hGC:FLAG^{TM} y la actividad enzimática de hGC, los extractos se analizaron a partir de hojas transgénicas a 0, 2, 4, 8, 16 y 24 h pos-MGA. El tejido de planta (0,5 g) se molió usando nieve carbónica y un molinillo de granos de café. Para solubilizar el hGC:FLAG^{TM}, el tejido molido se resuspendió en 1,0 ml de tampón de extracción que contenía citrato de sodio 25 mM, pH 7,0, taurocolato de sodio al 1% (p/v), \beta-mercaptoetanol 4 mM y EDTA 5 mM. El homogeneizado se congeló en un baño de nieve carbónica/etanol durante 30 min y se descongeló a 4ºC durante 2 h. Se repitió este procedimiento de congelación-descongelación. Los restos de células se sedimentaron a 14.000 x g durante 15 min a 4ºC. El sobrenadante sin células se recogió y llevó a glicerol al 40% (v/v) con el fin de inhibir la desnaturalización de la proteína de hGC:FLAG^{TM}.
El análisis de Western se llevó a cabo en 10 \mug de proteína soluble a partir de extractos de hojas para probar la inmunorreactividad a anticuerpos policlonales producidos contra hGC (Fig. 5B) y anticuerpos monoclonales contra el epítopo FLAG^{TM} (Fig. 5A). El mayor nivel de inducción de la proteína de hGC:FLAG^{TM} se produjo entre 8 y 12 h pos-MGA.
Para determinar el tiempo óptimo pos-MGA para obtener el mayor nivel de actividad enzimática de hGC, 0,1 \mug de extractos de hojas se ensayaron usando el ensayo con 4MuGlc. La mayor actividad de hGC se encontró en extractos a partir de 12 h pos-daño del tejido (Fig. 6).
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6.3. Purificación de hGC:FLAG^{TM} de extractos de tabaco
Cuarenta gramos de tejido pos-dañado (12 h) se molieron para dar un fino polvo usando nieve carbónica y un molinillo de granos de café. Se añadieron cien ml de tampón de extracción y la muestra se transformó en una suspensión usando un Polytron (Brinkman Scientific). El extracto se congeló en un baño de nieve carbónica/etanol durante 1 h y se descongeló durante 16 h a 4ºC. Los restos de células se sedimentaron a 14.000 x g durante 30 min. El sobrenadante se filtró a través de 4 capas de estopilla y el filtrado se guardó. Una alícuota de 1 ml se almacenó en glicerol al 40% (v/v) para la posterior determinación de la proteína y la actividad enzimática de hGC, mientras que gradualmente se añadió sulfato de amonio (AS) con agitación al filtrado restante hasta la concentración final del 33% (p/v) y se incubó a 4ºC durante 1 h. El homogeneizado se aclaró por centrifugación a 14.000 x g durante 30 min. El sobrenadante se dializó durante toda la noche a 4ºC contra el siguiente tampón: citrato de sodio 0,1 M, pH 6,0, \beta-mercaptoetanol 4 mM y EDTA 5 mM. El sobrenadante se clarificó por centrifugación a 14.000 x g durante 30 min. El sobrenadante aclarado se concentró (Amicon, filtros YM30) hasta un volumen final de 5 ml, y 0,5 ml del sobrenadante de AS concentrado se guardaron para el análisis de la proteína y la actividad enzimática de hGC. El hGC:FLAG^{TM} en 1 ml de sobrenadante concentrado se purificó por cromatografía de afinidad usando una columna de afinidad anti-FLAG^{TM}.
Para utilizar el epítopo FLAG^{TM} para la purificación de la proteína de hGC:FLAG^{TM}, 1 ml de extracto de hojas preparado como anteriormente se aplicó a un 1 ml de columna de afinidad anti-FLAG^{TM} M2. La columna se equilibró previamente con solución salina tamponada con fosfato (PBS; 50 mM, pH 6,4) que contenía glicerol al 10% y \beta-mercaptoetanol 4 mM a 4ºC. Después de varios lavados con PBS, la proteína de hGC:FLAG^{TM} unida se eluyó con tres alícuotas de 1 ml de péptido FLAG^{TM} purificado (IBI), es decir, 1 ml a 500 \mug/ml, seguido por 2 x 1 ml a 250 \mug/ml. El material eluido se transfirió por ranuras sobre una membrana de nitrocelulosa y se probó para la inmunorreactividad al anticuerpo anti-FLAG^{TM} M2, y se analizó por SDS-PAGE y se tiñó con azul de Coomassie para determinar la pureza relativa (Fig. 7A). El material no inmunorreactivo se eluyó en la primera fracción ya que la liberación de la proteína de hGC:FLAG^{TM} unida requiere el equilibrado con el péptido. Como consecuencia, la segunda y tercera fracciones eluidas contuvieron la mayoría del material inmunorreactivo. El análisis por SDS-PAGE de proteína de hGC:FLAG^{TM} purificada con anti-FLAG^{TM} mostró una única banda que migraba conjuntamente con la proteína inmunorreactiva anti-FLAG^{TM} (Fig. 7A).
Con el fin de utilizar las propiedades de los glicanos presentes en la proteína de hGC:FLAG^{TM} para fines de purificación, la proteína de hGC:FLAG^{TM} también se aisló usando una columna de afinidad por concanavalina A (ConA) (Sigma). El extracto de tejido concentrado (1,5 ml) se cargó sobre un volumen de lecho de 1,5 ml de ConA en tampón de columna (citrato de sodio 0,1 M a pH 6,5, cloruro sódico 0,15 M). Se añadió un volumen igual de tampón de columna al extracto concentrado y se pasó por la columna dos veces a 4ºC. La columna de ConA se lavó tres veces con tampón de columna usando tres veces el volumen de tampón del lecho. La hGC:FLAG^{TM} unida se eluyó con 5 ml de \alpha-D-manopiranósido de metilo 0,1 M (Sigma) seguido por 5 ml de \alpha-D-manopiranósido de metilo 1 M. Las fracciones se recogieron y se ensayaron para el contenido de proteínas y la actividad enzimática de hGC. Todas las fracciones que contenían actividad enzimática de hGC se concentraron (Amicon, filtros YM30) a un volumen final de 0,5 ml. Para estabilizar la actividad enzimática de hGC de la proteína de hGC:FLAG^{TM}, el extracto concentrado se preparó al 40% (v/v) en glicerol y se almacenó a 4ºC. El análisis en SDS-PAGE de la proteína de hGC:FLAG^{TM} purificada con ConA (Fig. 7B) mostró una banda que migraba a 66-69 kd y tres bandas de menor masa molecular que se tiñeron igualmente con azul de Coomassie.
La determinación de la actividad enzimática y de proteína de fracciones de cada etapa en la purificación indica que el procedimiento más eficaz para purificar hGC:FLAG^{TM} era emplear cromatografía de afinidad por anti-FLAG^{TM} seguida por la cromatografía de afinidad por ConA (véanse la Tabla 2 y las Figs. 7A-B).
TABLA 2 Purificación de hGC:FLAG^{TM} de extractos de tabaco
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2
3
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6.4. Producción de proteína de HGC:FLAG^{TM} a partir de plantas de tabaco
Puede hacerse una estimación de la cantidad de hGC:FLAG^{TM} extraída por g de peso fresco de tejido de plantas de tabaco o por mg de proteína soluble a partir del análisis por transferencia por ranuras de Western de extractos crudos iniciales usando anti-FLAG^{TM}. Se extrajeron aproximadamente 2 mg/ml de proteína soluble por 0,5 g de peso fresco de tejido de plantas. El análisis por transferencia por ranuras de Western de 1 \mul de extracto crudo indica la presencia de aproximadamente 0,5 a 0,6 \mug de hGC:FLAG^{TM} (Fig. 8). Basándose en estos resultados, una única planta de tabaco madura que comprende aproximadamente 1,6 kg de peso fresco de tejido contendrá aproximadamente 2,5 g de hGC:FLAG^{TM} por planta. Por consiguiente, un acre estándar de tabaco plantado con 6.000 plantas podría producir potencialmente 15 kg de hGC:FLAG^{TM} (Tabla 3).
TABLA 3 hGC:FLAG^{TM} extraíble por acre de tabaco
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7. Ejemplo 2 Producción y purificación de IDUA en plantas de tabaco transgénicas
Las subsecciones a continuación describen la producción de \alpha-L-iduronidasa (IDUA) humana recombinante enzimáticamente activa en plantas de tabaco transgénicas.
7.1. Construcción de un vector de transformación de plantas que contiene un constructo de expresión de IDUA 7.1.1. Constructo de expresión de IDUA
La primera etapa en la construcción del vector de transformación de plantas deseado era generar la región codificante de IDUA humana con sitio de restricción flanqueante apropiado para facilitar la fusión a promotores de plantas específicos y la inserción en vectores de transformación de plantas. E. Neufeld (Universidad de California, Los Angeles) proporcionó un clon de ADNc de IDUA humana de longitud completa. En este clon, la secuencia de ADNc de IDUA se insertó en el sitio EcoRI del plásmido pBS (Moskowitz y col. 1992, FASEB J. 6:A77; Murray, 1987, Methods in Enzymol. 149:25-42). Esta secuencia de ADNc de IDUA se ha expresado en líneas de células animales (Moskowitz y col. 1992, supra, 1987, supra) y muestra que contiene toda la información necesaria para producir IDUA enzimáticamente activa (Murray, 1987, supra). El ADNc de IDUA codifica una proteína de 653 aminoácidos (66 kDa) que incluye el péptido señal 26 del extremo amino que se escinde cuando pasa por la membrana del ER. Para ayudar en la inserción del ADNc de IDUA en el vector de la planta, se introdujeron sitios únicos XbaI y SacI flanqueantes por PCR usando en 5' el cebador ID1 y en 3' el cebador ID2, Pfu polimerasa (Stratagene, La Jolla, CA); como se muestra en la Figura 12. El fragmento de 1,9 kb generado por PCR se purificó por electroforesis en gel de agarosa, se digirió con XbaI y SacI y se ligó en pBS y pSP64poliA (Gibco, un vector para la transcripción/traducción in vitro). La secuencia codificante de IDUA amplificada por PCR se secuenció antes de la inserción en los constructos de expresión. Las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos deducidas de la secuencia codificante de IDUA amplificada se muestran en las Figs. 19 (SEQ ID NO:8) y 20 (SEQ ID NO:9), respectivamente. La secuencia codificante de IDUA amplificada por PCR se diferencia de la originalmente publicada por E. Neufeld en las posiciones 931 y 932. La secuencia de IDUA amplificada por PCR tiene el dinucleótido CG en lugar del GC original en esas posiciones. Por consiguiente, la secuencia de aminoácidos deducida de la IDUA amplificada por PCR tiene un residuo de glutamato en lugar de una glutamina en la posición 282. La transcripción in vitro de la secuencia de IDUA amplificada por PCR en un vector pSP64poliA:IDUA y la traducción in vitro mediada por lisados de reticulocitos de conejo del transcrito resultante produjeron proteína que tenía una masa molecular esperada para IDUA.
La región codificante de IDUA amplificada por PCR se insertó en 5' de dos promotores de plantas regulados de forma distinta: 1) el promotor MeGA y 2) el promotor 35S^{ENH}. Como se trató anteriormente, el promotor MeGA muestra poca o ninguna expresión en la mayoría de los tejidos de plantas, pero es fuertemente inducible dando como resultado una acumulación significativa de producto transgénico 12 a 48 horas después de la inducción del promotor MeGA. El promotor 35S^{ENH} es un promotor constitutivo de alto nivel ampliamente usado que está constituido por un promotor 35S de CaMV modificado que contiene un potenciador doble que se fusiona a un potenciador de traducción a partir del virus del mosaico del tabaco. Véase Cramer y col. 1996, "High-Level of Enzymatically Active Human Lysosomal Proteins in Transgenic Tobacco", Transgenic Plants: A production System for Industrial and Pharmaceutical Proteins, eds. Owens & Pen, John Wiley & Sons; Chrispeels, 1991, Annu. Rev. Plant Physiol. Plan. Biol. 42:21-53; y Haskins y col. 1979, Pediat. Res. 13:1294-1297. Cada promotor se ligó como un fragmento HindIII-XbaI en 5' del ADNc de IDUA (véase la Figura 12).
7.1.2. Vectores de expresión/transformación de IDUA
Durante las etapas de subclonaje y de análisis de vectores, los transformantes bacterianos que tenían cualquier vector que contenía el extremo 5' del ADNc de IDUA se recuperaron a frecuencias inferiores a las esperadas. Por ejemplo, se requirieron múltiples ligaciones y transformaciones de células DH5\alpha de E. coli competentes con pBS que contenían el ADNc de IDUA amplificado por PCR de 1,9 kb para generar menos de 100 transformantes. Entre los 70 transformantes analizados por análisis de restricción del ADN del plásmido, sólo 2 clones contuvieron el fragmento de 1,9 kb de tamaño apropiado. Uno de los dos clones se secuenció y se halló que contenía la secuencia codificante de IDUA completa. Se redujo el tamaño de la colonia de transformante que contenía IDUA. Estas eficiencias reducidas fueron independientes del vector plasmídico, la presencia o ausencia de promotor de plantas, la expresión de IDUA (sin fusionar al promotor bacterianamente activo) o el huésped bacteriano. El subclonaje independiente del extremo 3' frente al 5' del ADNc de IDUA localizó una región "odiosa" en el extremo 5' de la secuencia de IDUA. La estructura secundaria de ADN o el alto contenido de GC de esta región pueden producir intolerancia en organismos heterólogos. Este efecto del extremo 5' del ADNc de IDUA también ha sido notificado en sistemas de expresión en levaduras y en células animales. Sin embargo, estas limitaciones en la transformación de la secuencia de IDUA no impidieron el aislamiento y la caracterización satisfactorios de los constructos de transformación y expresión de IDUA
deseados.
Para ambos constructos de promotores, las fusiones de ADNc de promotor:IDUA se cortaron como fragmentos de HindIII/SacI y se ligaron en pBIB-KAN digerido con HindIII y SacI (Figura 12). pBIB-Kan es un vector de transformación de plantas grande (> 13 kb) que proporciona una señal de terminación/poliadenilación (pAnos) para el transgén introducido, un marcador de selección (NPTII o resistencia a kanamicina) para células de plantas transformadas y secuencias de borde de ADN-T que delimitan el ADN que va a transferirse (Becker, 1990, Nucl. Acids Res. 18:203). Los vectores recombinantes se propagaron en E. coli y se caracterizaron completamente antes de la transferencia a Agrobacterium tumefaciens. Un vector pBIB-KAN que contiene el constructo de expresión MeGA:IDUA usado en la transformación de ADN-T de plantas es pCT22.
7.2. Generación de tabaco transgénico que contiene los constructos de IDUA
La transformación mediada por Agrobacterium se usó para integrar establemente los constructos 35S^{ENH}:IDUA y MeGA:IDUA en el genoma de tabaco. Se cortaron aproximadamente 80 discos de hojas de plantas de semillero Nicotiana tabacum cvs. Xanthi cultivadas asépticamente para cada constructo génico y se inocularon con cultivos en suspensión de cepas de A. tumefaciens que contenían los vectores de expresión/transformación de IDUA. Tras un periodo de cocultivo de 48 horas, los discos de hojas se transfirieron a medio de selección que contenía kanamicina y hormonas que promueven la formación de brotes. Aunque generalmente aparecen numerosos brotes (4-10 por disco) 2-3 semanas después de la transferencia al medio de selección, los brotes transformados con IDUA aparecieron tarde, es decir, después de 3-5 semanas, y fueron pocos en número (0-1 por disco). La inducción de la formación de raíces también se retrasó en los brotes transformados con IDUA en comparación con brotes que contenían otros constructos transgénicos. Un rendimiento final de siete plántulas de 35S^{ENH}:IDUA y diez de MeGA:IDUA se transfirieron a la tierra. Una vez en la tierra, todas las plantas llegaron a la madurez con morfología normal, floración y producción de semillas. Las progenies que expresaban IDUA mostraron un ligero retraso en el crecimiento temprano (Fig. 13B), pero en la madurez plena fueron indistinguibles en tamaño y aspecto de las plantas sin transformar.
7.3. Caracterización por Southern de plantas transgénicas
Las plantas transgénicas se seleccionaron inicialmente basándose en la resistencia a kanamicina. La inserción estable del constructo génico MeGA:IDUA se confirmó por análisis por hibridación genómica de Southern. El ADN total se aisló de tejido de hojas de nueve plantas transgénicas y se digirió con HindIII y se analizó por hibridación de Southern usando el ADNc de IDUA como sonda. Los nueve transformantes putativos analizados mostraron de una a tres copias del inserto de IDUA y ninguna indicación de reordenamientos o deleciones. Este número de copias de transgenes es típico de tabaco transgénico manipulado con otros constructos mediante Agrobacterium.
7.4. Caracterización de la expresión de IDUA en plantas transgénicas 7.4.1. Inmunodetección de la proteína IDUA en extracto de plantas
Los anticuerpos preparados para la IDUA nativa y desnaturalizada a partir de células CHO se obtuvieron de E. Kakkis (Harbor-UCLA Medical Center, Los Angeles, CA). Mediante análisis por inmunotransferencia por ranuras y de Western en SDS-PAGE se encontró que los anticuerpos no reaccionaban con ninguna proteína en extractos de tejido de tabaco transgénico sin transformar o (sólo transformados con el vector) pBIB-Kan a partir de tejido de hojas sin inducir o inducido. Cuando la IDUA purificada de células CHO se sembró en extractos de tabaco sin transformar, no hubo disminución en el nivel de IDUA detectada con respecto al detectado en el tampón de extracción que contenía la misma concentración de IDUA purificada. Este hallazgo indica que el extracto de tabaco no inhibe la inmunodetección de IDUA.
Se recogieron tejidos de hojas de siete plantas transgénicas independientes, se homogeneizaron en un volumen 3X de tampón de extracción (PBS con Triton X100 al 0,1%, PMSF 200 \muM, pepstatina 1 \muM, leupeptina 4 \muM) y los extractos se clarificaron de restos de células por centrifugación a 12.000 X g durante 30 min. Veinticinco \mug de proteína soluble total de cada extracto se desnaturalizaron con calor y se colocaron en ranuras sobre membrana OPTITRAN (S&S). Se añadió proteína de IDUA purificada en cantidades que oscilaban de 20 ng a 400 ng a la membrana para servir de patrones de comparación. Basándose en la detección de anticuerpos usando quimioluminiscencia, no se encontró proteína de IDUA inmunorreactiva en los extractos de ninguna de las plantas transgénicas de 35S^{ENH}:IDUA. Este promotor constitutivo también expresó escasamente la proteína C humana (< 0,02% de proteína soluble). Basándose en estos hallazgos, las plantas que contenían 355^{ENH}:IDUA no se analizaron adicionalmente.
El promotor MeGA es inactivo en hojas de tabaco en ausencia de inducción. Para obtener la expresión de IDUA, las hojas se recogieron, se indujeron mediante daño mecánico y se incubaron a temperatura ambiente bajo alta humedad (es decir, las hojas dañadas se envolvieron en papel de filtro húmedo en bolsas cerradas herméticamente o se estratificaron en un recipiente con tampón cuidadosamente agitado sobre el tejido) para permitir la síntesis de novo del producto transgénico. En un cribado inicial de diez plantas que contenían MeGA:IDUA, los extractos de tejido se usaron para análisis por inmunotransferencia puntual por ranuras (véase anteriormente). Los extractos mostraron poco o ningún contenido de IDUA para todas las plantas. Los posteriores análisis revelaron que la IDUA se secretó a partir de las hojas y se filtró sobre el papel de filtro durante la etapa de incubación. Esto era algo sorprendente porque la recuperación de proteínas extracelulares de hoja intacta requiere generalmente infiltración de tampón inducida por vacío de la hoja (véase Parent & Asselin, 1987, Can. J. Bot. 62:564-569; Regalado & Ricardo, 1996, Plant Physiol. 110:227-232). Como se describe más adelante, el procedimiento de expresión se modificó posteriormente para incluir una etapa de incubación pos-inducción que implicara una rotación suave del tampón alrededor del tejido dañado que permitiera la recuperación de proteína de IDUA y la actividad en el tampón de incubación. Los posteriores análisis se centraron principalmente en una planta, IDUA-9, también conocida como CT40-9, ya que las pruebas preliminares muestran niveles detectables de actividad de IDUA y material inmunorreactivo de anti-IDUA. La IDUA-9 contiene 3 copias del constructo MeGA:IDUA.
7.4.2. El análisis de Northern muestra la activación del transgén MeGA:IDUA
Con el fin de demostrar la inducción del promotor MeGA y la acumulación de ARNm de IDUA, el ARN total se aisló (Rutter, 1981, J. Biol. Chem. 91:468-478) de hojas de IDUA-9 antes y después de la inducción. Como se muestra en la Figura 14A, el ARNm de IDUA del tamaño esperado (aproximadamente 2,2 kb) se detectó a bajos niveles basales en tejido sin inducir y mostró un aumento marcado 8 h pos-inducción y alcanzó un nivel máximo 27 h pos-inducción. Este patrón es similar a la cinética de inducción de transgenes vista con otros constructos dirigidos por MeGA (por ejemplo, hGC:FLAG^{TM}). Las especies de ARN hibridantes más pequeñas también se acumularon después de la inducción. No se han detectado ARN de masa molecular inferior análogos en plantas que expresan hGC:FLAG^{TM} y pueden ser únicos para la planta IDUA-9 o una consecuencia de la secuencia de IDUA.
7.4.3. Análisis de western de IDUA humana localizada en tabaco
Los tejidos de IDUA-9 inducidos también se usaron para extractos de proteínas. Los análisis por transferencia de Western mostraron que la IDUA derivada de CHO y la IDUA de tejido de tabaco migraron de forma muy parecida en SDS-PAGE (Figura 14B). La IDUA (92 kD) de extracto de tabaco de IDUA-9 migró ligeramente más rápido que la IDUA secretada de las células CHO. Esto es supuestamente debido a las diferencias en la composición de glicanos. Sin embargo, la similitud en el tamaño sugiere que la IDUA recombinante producida en el tabaco también estaba glicosilada.
7.4.4. La IDUA sintetizada en tabaco transgénico se secreta
Como se trató anteriormente, las células CHO secretan IDUA recombinante al medio. Para determinar si el tabaco también secreta IDUA recombinante al medio, el tejido de hojas de plantas IDUA-7, -8 y -9 transgénicas se indujo durante 0 a 34 h y se colocó en una placa de Petri de plástico con tampón de incubación (PBS). A 0 h, el tampón de incubación se usó para lavar el tejido inducido y el lavado se almacenó congelado. El tampón recientemente preparado se añadió al tejido inducido y se incubó a temperatura ambiente. A 8 h, el tampón se eliminó y se congeló. Se añadió tampón recientemente preparado al tejido inducido y se incubó adicionalmente. El tampón se eliminó 24 h pos-inducción. Se añadió tampón recientemente preparado al tejido inducido y se incubó adicionalmente. El tampón de incubación final se eliminó 34 h pos-inducción y un extracto de tejido se preparó a partir del tejido de hojas incubado. Se hirvieron cincuenta \mul de cada tampón de incubación y extracto de tejido y se colocaron en ranuras sobre membrana OPTITRAN. También se transfirió un intervalo de proteína de IDUA de control de 0 a 40 ng y la IDUA se detectó usando anticuerpos anti-IDUA. Como se muestra en la Figura 15, la proteína de IDUA estaba presente en el tampón de incubación tras la inducción en los tres tejidos transgénicos analizados. Esto indica que el tabaco transgénico secreta IDUA después de la síntesis.
7.4.5. La IDUA sintetizada en el tabaco es enzimáticamente activa
Uno de los factores más críticos en la evaluación de la utilidad de la IDUA recombinante sintetizada en plantas es si la IDUA es enzimáticamente activa. La actividad enzimática de hidrolasas lisosómicas humanas requiere la glicosilación y el plegamiento apropiados y los sistemas de expresión heterólogos frecuentemente dan como resultado la degradación localizada en el retículo endoplásmico o la acumulación de agregados insolubles e inactivos. Para determinar si la IDUA recombinante sintetizada en hojas transgénicas tiene actividad enzimática, se usó un ensayo fluorométrico sensible usando el sustrato 4-metilumbeliferil-\alpha-L-idurónido (4-MUI) (Calbiochem, La Jolla, CA) (véase Neufeld, E.F. 1991, Ann. Rev. Biochem. 60:257-280). Se mostró que los extractos de tabaco sin transformar no contenían actividad de IDUA endógena. Cuando la IDUA recombinante derivada de CHO se sembró en extractos crudos de hojas de tabaco sin transformar, no se encontró inhibición detectable de la actividad. Cuando los extractos de tejido de planta transgénica IDUA-9 se ensayaron, los extractos mostraron actividad de IDUA a niveles reproducibles, pero relativamente bajos (0,2 a 0,4 nmoles de 4-MU/h/g de tejido). Esto confirma que el tabaco tiene toda la maquinaria necesaria para sintetizar y procesar IDUA en una forma activa. De acuerdo con la distribución de IDUA mostrada por inmunodetección, las actividades de IDUA significativamente mayores se detectaron en la fracción secretada como se describe más adelante.
7.4.6. Secreción y recuperación de IDUA recombinante sintetizada en el tabaco
Una parte significativa de la IDUA recombinante producida en tabaco transgénico se recuperó en el tampón de incubación tras la inducción del constructo génico MeGA:IDUA (Fig. 15). Se determinó la localización de la mayoría de la IDUA activa después de la inducción e incubación. Esto se hizo comparando la actividad de IDUA y la inmunorreactividad anti-IDUA del extracto de tejido con la del tampón de incubación. Como se muestra en la Figura 16, había niveles mucho más altos de actividad de IDUA en el tampón de incubación que en el extracto de tejido después de la inducción e incubación. Además, la actividad de IDUA en el tampón de incubación mostró una fuerte correlación con la de la cantidad de material inmunorreactivo anti-IDUA hallado en el tampón de incubación, como se revela por los datos presentados en la Fig. 15. Por tanto, el tabaco transgénico que expresa IDUA secreta la mayoría de su IDUA activa (aproximadamente el 67%) en el tampón de incubación después de la inducción e incubación.
Basándose en ensayos de actividad y análisis de Western, la actividad específica de la IDUA secretada se estimó que era aproximadamente 64 U/\mug de proteína. En comparación, la enzima de IDUA purificada a partir de células CHO manipuladas tiene una actividad específica de aproximadamente 242 U/\mug de proteína.
La variación en los niveles de expresión transgénica es muy común en plantas transgénicas debido a efectos ``posicionales producidos por el sitio de inserción del transgén dentro del genoma huésped. Se examinaron los niveles de actividad de IDUA en tres plantas transgénicas que expresan IDUA independientes (es decir, IDUA-7, IDUA-8 e IDUA-9). Entre estas plantas transgénicas, la IDUA-9 tiene la mayor actividad de IDUA (Fig. 17). La cantidad relativa de IDUA activa que queda en la célula, como se refleja por la actividad presente en el extracto de tejido, después de 34 h de incubación osciló del 14% al 35% de la actividad total (Fig. 17).
Las tres plantas transgénicas anteriormente identificadas se identificaron en un cribado de aproximadamente cincuenta plantas independientemente transformadas. Esto es un cribado a escala relativamente pequeña. Es razonable esperar que los cribados a mayor escala de plantas manipuladas con IDUA proporcionen plantas que producirán IDUA activa a niveles superiores a los de las plantas desveladas en este documento.
7.4.7. Purificación y rendimiento de IDUA de tabaco transgénico
El rendimiento de la IDUA recombinante a partir de IDUA-9 se estimó que era aproximadamente 6 \mug/g de tejido fresco. Este cálculo aproximado se basó en el material presente en el tampón de incubación después de 34 h de incubación (véase la Fig. 18). Sin embargo, ni el procedimiento de inducción ni el de recuperación de IDUA usado se optimizó. Por tanto, es probable que puedan obtenerse mayores rendimientos de IDUA mediante la optimización de los procedimientos de inducción y recuperación. Debe observarse que las plantas de tabaco transgénicas dieron un promedio superior a 1 kg de peso fresco de hoja en la madurez, y que las hojas pueden recolectarse periódicamente de plantas cultivadas en invernadero durante más de un año. Por consiguiente, el cultivo de plantas de tabaco transgénicas tanto en el campo como en el invernadero ofrece un medio conveniente y eficaz para producir grandes cantidades de IDUA.
8. Ejemplo 3 Producción de plantas de tabaco transgénicas que contienen un constructo de expresión de hGC sin modificar
Un segmento del extremo 3' de la secuencia codificante de hGC se amplificó por PCR a partir del clon de ADNc en E. coli ATCC65696 (véase la Sección 6.1.1. supra) usando como cebador en 5' GC23 oligo, 5'GCCTATGCTGAG
CACAAGTTACAG3' (SEQ ID NO:11), cuyo extremo 5' se corresponde con el nucleótido 894 de la secuencia de hGC:FLAG mostrada en la Fig. 9, y como cebador en 3' GC37 oligo, cuya cadena complementaria tiene la secuencia 5'TTCCTTGAGCTCGtcaCTGGCGACGCCACAGGTA3' (SEQ ID NO:12), un sitio de restricción SacI se muestra subrayado y en minúscula se muestra un codón de terminación que conserva la pauta de lectura con la secuencia codificante de hGC amplificada. El sitio del cebador en 5' en la secuencia codificante de hGC está en 5' de un sitio de restricción SalI. Por consiguiente, el ADN amplificado se cortó con SalI y SacI y el fragmento SalI/SacI que contenía el extremo 3' de la secuencia codificante de hGC se insertó en el vector intermedio pBS que contenía el constructo de expresión MeGA:hGC:FLAG^{TM} (véase la Fig. 1 y la Sección 6.1.2. supra) que se había cortado con SalI y SacI. Se identificaron clones que habían sustituido el extremo 3' del constructo MeGA:hGC:FLAG^{TM} por el extremo 3' de la secuencia codificante de hGC dando un constructo de expresión MeGA:hGC. Esta construcción eliminó la adición de diez aminoácidos en el extremo carboxilo y corrigió la sustitución de aminoácidos en el residuo 545 en la fusión hGC:FLAG^{TM}, reconstruyéndose así una secuencia codificante de hGC sin modificar. El constructo de expresión MeGA:hGC se cortó del vector intermedio pBS mediante digestión con SacI y se insertó en el pBIB-KAN para formar el vector de transformación pCT54. En la Fig. 21 se muestra un esquema de la construcción del vector pCT54.
El Agrobacterium que contenía pCT54 se usó para transformar plantas y las plantas de tabaco transgénicas que contenían el constructo de expresión MeGA:hGC se produjeron según procedimientos descritos anteriormente. Las plantas de tabaco transgénicas que contenían el constructo de expresión MeGA:hGC se identificaron y se les asignó las designaciones CT54-1 a -40. Los análisis de la actividad enzimática de hGC y la presencia de hGC en los tejidos inducidos de plantas transgénicas se llevaron a cabo usando el ensayo enzimático descrito en la Sección 6.2.5. y el análisis por transferencia de Western usando anticuerpos anti-hGC descritos en la Sección 6.2.6. La purificación de la hGC producida en tejido de tabaco transgénico se lleva a cabo usando el procedimiento descrito en la Sección 6.3., excepto que se omitió la etapa de cromatografía de afinidad por anti-FLAG^{TM}, cuyo procedimiento se modifica adicionalmente según las estrategias y procedimientos conocidos en la técnica para purificar la enzima de hGC.
9. Depósito de materiales biológicos
Los siguientes materiales biológicos se han depositado en la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC) en 12301 Parklawn Drive, Rockville, MD. 20852, en cumplimiento con los requisitos del Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional del Depósito de Microorganismos a los fines del Procedimiento en Materia de Patentes en las fechas indicadas a continuación y se les asignó los números de acceso de ATCC indicados a continuación.
100
La presente invención no va a limitarse en alcance por el material biológico depositado ya que se pretende que las realizaciones depositadas sean ilustraciones de los aspectos individuales de la invención, y cualquier material biológico, o constructos que sean funcionalmente equivalentes, están dentro del alcance de esta invención. De hecho, diversas modificaciones de la invención, además de aquellas mostradas y descritas en este documento, serán evidentes para aquellos expertos en la materia a partir de la anterior descripción y los dibujos adjuntos. Tales modificaciones pretenden entrar dentro del alcance de las reivindicaciones adjuntas.
<110> Virginia Tech Intellectual Property, Inc.
\hskip1cm
Croptech Development Corp.
\hskip1cm
Radin, David N.
\hskip1cm
Cramer, Carole L.
\hskip1cm
Oishi, Karen K.
\hskip1cm
Weissenborn, Deborah L.
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<120> PRODUCCIÓN DE ENZIMAS LISOSÓMICAS EN SISTEMAS DE EXPRESIÓN BASADOS EN PLANTAS
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<130> P08216EP
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\vskip0.400000\baselineskip
<140> 96931569.6
\vskip0.400000\baselineskip
<141> 13-09-1996
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\vskip0.400000\baselineskip
<150> US 60/003.737
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 14-09-1995
\vskip1.000000\baselineskip
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<160> 12
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\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn versión 3.4
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
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<211> 27
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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\hskip1cm
5
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<210> 2
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<211> 33
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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<400> 2
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\hskip1cm
6
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<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1642
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Constructo de hGC:FLAG
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<400> 3
7
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<210> 4
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<211> 546
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Proteína de fusión de hGC:FLAG
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<400> 4
9
10
11
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<210> 5
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<211> 463
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Promotor MeGA
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
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12
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
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<211> 32
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
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\hskip1cm
13
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
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<211> 33
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
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\hskip1cm
14
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
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<211> 2067
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Secuencia de IDUA amplificada por PCR
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
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<211> 653
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Traducción de la secuencia de IDUA amplificada por PCR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
17
19
20
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<210> 10
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<211> 8
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Epítopo FLAG
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\hskip1cm
21
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<210> 11
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\hskip1cm
22
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<210> 12
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<211> 34
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\hskip1cm
23

Claims (44)

1. Un procedimiento para producir una enzima lisosómica enzimáticamente activa o enzima lisosómica modificada enzimáticamente activa en una planta transgénica que comprende:
(a) cultivar la planta transgénica que comprende un constructo de expresión recombinante que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una secuencia que codifica la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada y un promotor que regula la expresión de la secuencia de nucleótidos de manera que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada se expresa a partir del constructo de expresión por la planta transgénica; y
(b) recuperar la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada a partir de un órgano de la planta transgénica;
en el que la enzima lisosómica modificada tiene la secuencia de aminoácidos de la enzima lisosómica con una o varias sustituciones, adiciones y/o deleciones de aminoácido y el órgano es una hoja, tallo, raíz, flor, fruto o semilla.
2. El procedimiento según la reivindicación 1, en el que el promotor es un promotor inducible y cuyo procedimiento comprende adicionalmente, entre las etapas (a) y (b), la etapa de inducir el promotor inducible antes o después de recolectar la planta transgénica.
3. El procedimiento según la reivindicación 2, en el que el promotor inducible se induce por la activación mecánica de genes.
4. El procedimiento según la reivindicación 3, en el que el promotor inducible comprende la SEQ ID NO NO:5.
5. El procedimiento según la reivindicación 1, en el que la enzima lisosómica modificada comprende un péptido marcador detectable fusionado con el extremo amino o carboxilo de la enzima lisosómica.
6. El procedimiento según la reivindicación 5, en el que el péptido marcador detectable comprende la SEQ ID NO: 10.
7. El procedimiento según la reivindicación 1, en el que la planta transgénica es una planta de tabaco transgénica.
8. El procedimiento según cualquiera de las reivindicaciones 1, 4 y 7, en el que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada es una enzima lisosómica humana o enzima lisosómica humana modificada.
9. El procedimiento según la reivindicación 8, en el que la enzima lisosómica humana o enzima lisosómica humana modificada es una glucocerebrosidasa, glucocerebrosidasa modificada, \alpha-L-iduronidasa o \alpha-L-iduronidasa modificada.
10. Un constructo de expresión recombinante que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada enzimáticamente activa y un promotor que regula la expresión de la secuencia de nucleótidos en una célula de planta, en el que la enzima lisosómica modificada tiene la secuencia de aminoácidos de la enzima lisosómica con una o más sustituciones, adiciones y/o deleciones de amino-
ácido.
11. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 10, en el que el promotor es un promotor inducible.
12. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 11, en el que el promotor inducible está inducido por la activación mecánica de genes.
13. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 12, en el que el promotor inducible comprende la SEQ ID NO:5.
14. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 10, en el que la enzima lisosómica modificada comprende un péptido marcador detectable fusionado con el extremo amino ácido o carboxilo de la enzima lisosómica.
15. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 14, en el que el péptido marcador detectable comprende la SEQ ID NO:10.
16. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 10 ó 13, en el que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada es una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada humana.
17. El constructo de expresión recombinante de la reivindicación 16, en el que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada humana es una glucocerebrosidasa, glucocerebrosidasa modificada, \alpha-L-iduronidasa o \alpha-L-iduronidasa modificada.
18. Un vector de transformación de plantas que comprende el constructo de expresión recombinante de la reivindicación 16.
19. Un vector de transformación de plantas que comprende el constructo de expresión recombinante de la reivindicación 17.
20. Una célula, tejido u órgano de planta que comprende el constructo de expresión recombinante de la reivindicación 16.
21. Una célula, tejido u órgano de planta que comprende el constructo de expresión recombinante de la reivindicación 17.
22. Un plásmido que comprende la SEQ ID NO:3.
23. Un plásmido que comprende la SEQ ID NO:8.
24. Una planta o célula de planta transgénica que puede producir una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada enzimáticamente activa, cuya planta o célula de planta transgénica comprende un constructo de expresión recombinante que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada y un promotor que regula la expresión de la secuencia de nucleótidos en la planta o célula de planta transgénica, en la que la enzima lisosómica modificada tiene la secuencia de aminoácidos de la enzima lisosómica con una o más sustituciones, adiciones y/o deleciones de aminoácido.
25. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 24, en la que el promotor es un promotor inducible.
26. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 25, en la que el promotor inducible es inducido por la activación mecánica de genes.
27. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 26, en la que el promotor inducible comprende la SEQ ID NO:5.
28. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 24, en la que la enzima lisosómica modificada comprende un péptido marcador detectable fusionado con el extremo amino o carboxilo de la enzima lisosómica.
29. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 28, en la que el péptido marcador detectable comprende la SEQ ID NO:10.
30. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 24, en la que la planta o célula de planta transgénica es una planta de tabaco o célula de tabaco transgénica.
31. La planta o célula de planta transgénica de cualquiera de las reivindicaciones 24, 27 y 30, en la que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada es una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada humana.
32. La planta o célula de planta transgénica de la reivindicación 31, en la que la enzima lisosómica humana o enzima lisosómica humana modificada es una glucocerebrosidasa, glucocerebrosidasa modificada, \alpha-L-iduronidasa o \alpha-L-iduronidasa modificada.
33. Una hoja, tallo, raíz, flor o semilla de la planta transgénica de la reivindicación 31.
34. Una hoja, tallo, raíz, flor o semilla de la planta transgénica de la reivindicación 32.
35. Una planta que comprende una secuencia de ácidos nucleicos que comprende la SEQ ID NO:3 que puede producir una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada enzimáticamente activa.
36. Una planta que comprende una secuencia de ácidos nucleicos que comprende la SEQ ID NO:8 que puede producir una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada enzimáticamente activa.
37. Una enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada que es enzimáticamente activa y se produce según un procedimiento que comprende:
(a) cultivar una planta transgénica que tiene un constructo de expresión recombinante que comprende una secuencia de nucleótidos que codifica la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada y un promotor que regula la expresión de la secuencia de nucleótidos de manera que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada se expresa a partir del constructo de expresión por la planta transgénica; y
(b) recuperar la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada a partir de un órgano de la planta transgénica;
\newpage
en la que la enzima lisosómica modificada tiene la secuencia de aminoácidos de la enzima lisosómica con una o más sustituciones, adiciones y/o deleciones de aminoácido, y el órgano es una hoja, tallo, raíz, flor, fruto o semilla.
38. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 37, producida según el procedimiento en el que el promotor es un promotor inducible, y cuyo procedimiento comprende adicionalmente, entre las etapas (a) y (b), la etapa de inducir el promotor inducible antes o después de recolectar la planta transgénica.
39. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 38, producida según el procedimiento en el que el promotor inducible comprende la SEQ ID NO:5.
40. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 37, en la que la enzima lisosómica modificada comprende un péptido marcador detectable fusionado con el extremo amino ácido o carboxilo de la enzima lisosómica.
41. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 40, en la que el péptido marcador detectable comprende la SEQ ID NO:10.
42. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 37, producida según el procedimiento en el que la planta transgénica es una planta de tabaco transgénica.
43. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de cualquiera de las reivindicaciones 37, 39 y 42, en la que la enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada es una enzima lisosómica humana o enzima lisosómica humana modificada.
44. La enzima lisosómica o enzima lisosómica modificada de la reivindicación 43, en la que la enzima lisosómica humana o enzima lisosómica humana modificada es una glucocerebrosidasa o glucocerebrosidasa modificada, \alpha-L-iduronidasa o \alpha-L-iduronidasa modificada.
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