ES2316382T3 - Secuencias gst del frijol de soja y su uso en la produccion de plantas resistentes a los herbicidas. - Google Patents

Secuencias gst del frijol de soja y su uso en la produccion de plantas resistentes a los herbicidas. Download PDF

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Abstract

Una Glutatión-S-transferasa (GST) que comprende la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 10 o una variante de GST que tiene al menos 80% de identidad con la misma cuando se calcula sobre la longitud completa de la SEQ ID NO. 10 con la condición de que dicha variante de GST no comprenda la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 36, y en la cual la GST o variante de GST sea capaz de conferir resistencia y/o tolerancia a un herbicida el cual comprende fomesafen y/o acifluorfen.

Description

Secuencias GST del fríjol de soja y su uso en la producción de plantas resistentes a los herbicidas.
La presente invención se relaciona entre otras, con secuencias de Glutatión-S-transferasa (GST) y su uso en métodos para la producción de plantas resistentes a los herbicidas. En particular los polinucleótidos según la invención pueden ser usados en métodos para la producción de plantas que son resistentes a los herbicidas que comprenden fomesafen y/o acifluorfen.
Las plantas que son sustancialmente "tolerantes" a un herbicida cuando son sometidas a éstos proporcionan una curva de dosis/respuesta que se desplaza a la derecha cuando se compara con aquella proporcionada por plantas parecidas no tolerantes similarmente sometidas. Tales curvas dosis/respuesta tienen puesto en el eje x del gráfico "dosis" y en el eje y "porcentaje de muerte", "efecto herbicida" etc. Las plantas tolerantes típicamente requerirán por lo menos dos veces más herbicida que las plantas parecidas no tolerantes para producir un determinado efecto herbicida. Las plantas que son sustancialmente "resistentes" al herbicida presentan pocas, o ningunas, lesiones necróticas, líticas, cloróticas u otras cuando son sometidas al herbicida a concentraciones e índices que son empleados típicamente por la comunidad agroquímica para matar malas hierbas en el campo. De aquí en lo adelante cuando sean usadas individualmente las palabras (i) "tolerante" y (ii) "resistente" significan "tolerante y/o resistente".
Las plantas resistentes a los herbicidas ya están disponibles en el arte por ejemplo, la ROUNDUP READY^{TM} Soja que es resistente a los herbicidas que tienen como sitio de acción la enzima 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintasa, tal como aquellos agroquímicos que contienen glifosato. Una de las ventajas de estas plantas es que el granjero puede aplicar los herbicidas a los campos que contienen los cultivos de plantas y malas hierbas usando "aplicación over the top", para matar las malas hierbas.
Otros ejemplos de productos para uso en métodos para la producción de plantas resistentes a los herbicidas son proporcionados en la Solicitud Internacional de Patente Número de Publicación WO 93/01294 y WO 99/14337. Aquí la resistencia se logra insertando en la planta un polinucleótido que proporciona la producción de una enzima glutatión-S-transferasa (GST) que está involucrada en la detoxificación del herbicida. En este contexto McGonigle y otros. (1998 Pesticide Biochemistry and Physiology. 62 pp15-25) describe plantas transgénicas que comprenden genes que codifican para GST de soja que son tolerantes a los herbicidas de cloroacetanilida y tiocarbamato. Se ha demostrado que las enzimas Glutatión-S-transferasas existen en varios organismos tales como bacterias, hongos, levaduras, plantas, mamíferos y peces y pueden existir como homo o heterodímeros con subunidades típicamente entre 24 y 30 kDa. Un ejemplo de una enzima Glutatión-S-transferasa conocida es el clon de ADNc Glicina max con el número de acceso EMBL A1440996. Sin embargo, para esta enzima no se conoce ningún dato en lo que se refiere a su actividad así como el herbicida sobre el cual actúa. Se ha demostrado que la detoxificación del herbicida se logra por la conjugación del herbicida con el glutatión (GSH) de tiol libre, un tripéptido (gamma-glutamil-cisteinil-glicina) dentro de la planta (Cole D.J. 1994 Pesticide Science. 42 pp209-222). Tal conjugación es catalizada por la GST. También se ha demostrado que la detoxificación de los herbicidas ocurre siguiendo la conjugación del herbicida con homoglutatión, el cual es el tiol predominante en algunas especies de leguminosas. El homoglutatión (hGSH) es también un tripéptido (gamma-glutamil-cisteinil-Beta-alanina) pero difiere de la GSH en la adición de Beta-alanina en vez de una glicina a la parte gamma-glutamil-cisteinil. La síntesis del homoglutatión (hGSH) es catalizada por la actividad de la enzima homoglutatión sintasa (hGSHS). La secuencia parcial de un hGSHS de Medicago truncatula ha sido publicada (Frendo y otros. 1999 Plant Journal. 17 pp215-219).
De este modo, la presente invención busca proporcionar entre otros, nuevos polinucleótidos que codifiquen para proteínas que puedan ser usadas en métodos para proporcionar plantas con altos niveles de resistencia a los herbicidas que comprenden fomesafen y/o acifluorfen.
Según la presente invención aquí se proporciona una Glutatión-S-transferasa (GST) que comprende la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 10 o una variante de GST que tenga al menos 80% de identidad con la condición de que dicha variante de GST no comprenda la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 36. (la cual corresponde a la secuencia del clon SE3.03B09 listada como SEQ ID No. 8 en la Solicitud Internacional de Patente Número de Publicación WO 00/18936). En una nueva realización de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 85% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 90% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 91% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 92% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 93% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 94% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 95% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 96% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 97% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 98% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de GST tiene al menos 99% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 10.
El porcentaje de identidad de secuencia para proteínas se determina comparando dos secuencias óptimamente alineadas sobre una ventana de comparación, en la cual la porción de secuencia de aminoácidos en la ventana de comparación puede comprender adiciones o deleciones (por ejemplo brechas) en comparación con la secuencia inicial de referencia (que no comprende adiciones o deleciones) para un alineamiento óptimo de las dos secuencias. El porcentaje se calcula determinando el número de posiciones en las que se encuentra el residuo de aminoácido idéntico en ambas secuencias para dar el número de posiciones coincidentes, dividiendo el número de posiciones coincidentes entre el número total de posiciones en la ventana de comparación y multiplicando el resultado por 100 para dar el porcentaje de identidad de secuencia. Cuando se calcula el porcentaje de identidad de secuencia las secuencias pueden alinearse permitiendo hasta 3 brechas con la condición de que en lo que respecta a las brechas, un total de no más de 15 residuos de aminoácidos sean afectados. La alineación óptima de secuencias para la comparación también puede conducirse por implementaciones computarizadas de algoritmos conocidos. En una realización particular de la presente invención la identidad de la secuencia se calcula usando el algoritmo FASTA versión 3 que usa el método de Pearson y Lipman (Lipman, D.J. y Pearson, W.R. (1985) Rapid and Sensitive Protein Similarity Searches and Science. 227:1435-1441 y Pearson, W.R. y Lipman, D.J. (1988) Improved tools for biological sequence comparison. PNAS, 852444-2448) para buscar las similitudes entre la secuencia de referencia (también llamada la secuencia consultada) y cualquier grupo de secuencias (llamadas secuencias extensas). Los métodos que existen también en el arte que permiten calcular el porcentaje de identidad de secuencia entre las secuencias de polinucleótidos.
La proteína de puede diferir de la secuencia básica de la proteína GST (SEQ ID No. 10) por sustituciones conservativas o no-conservativas de aminoácidos. Una sustitución conservativa será entendida que significa que el aminoácido se reemplaza con un aminoácido con propiedades químicas ampliamente similares. En particular pueden hacerse sustituciones conservativas entre los aminoácidos dentro de los siguientes grupos:
(i) Alanina y Glicina;
(ii) Serina y Treonina;
(ii) Ácido Glutámico y Ácido Aspártico;
(iii) Arginina y Lisina;
(iv) Asparagina y Glutamina;
(v) Isoleucina y Leucina,
(vi) Valina y Metionina;
(vii) Fenilalanina y Triptófano.
En general, más sustituciones conservativas que no-conservativas serán posibles sin destruir las propiedades GST de las proteínas. Las variantes adecuadas de las proteínas de acuerdo con la presente invención pueden ser determinadas probando las propiedades de GST de la proteína usando métodos de rutina los cuales son bien conocidos por la persona experimentada en el arte. Tales variantes de proteínas también pueden sintetizarse químicamente usando técnicas estándares.
La presente invención además proporciona una GST o una variante como se describe anteriormente en la cuál dicha GST o la variante es capaz de conferir resistencia y/o tolerancia a un herbicida que comprende fomesafen y/o acifluorfen. El herbicida también puede comprender otros Difenil éteres o Sulfonilureas como el Clorimuron Etilo y/o Cloroacetanilidas como el acetoclor.
La invención presente todavía llega más allá proporcionando un polinucleótido que comprende una región que codifica para una GST o una variante de GST como se describió anteriormente. En una realización particular de la presente invención dicho polinucleótido comprende la secuencia descrita como SEQ ID No. 14.
En un aspecto adicional de la presente invención se proporciona una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 1, o una variante de la proteína que tiene al menos 80% de identidad con la cuál dicha proteína o variante es capaz de catalizar la adición de Beta-alanina sobre gamma glutamilcisteína. En una nueva realización de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 75% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 85% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 90% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 95% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 96% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 97% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 98% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene al menos 99% de identidad con la secuencia descrita como SEQ ID No. 1. La identidad de secuencia puede calcularse y las variantes de proteína creadas/identificadas de una manera análoga a la descrita anteriormente.
La presente invención aún proporciona adicionalmente una variante de la proteína como se describió en el párrafo precedente que tiene una Km para Beta-alanina la cual es menor que dichas variantes de Km para glicina cuando se calcula usando el mismo método. En una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene una Km para Beta-alanina que es menor o igual a alrededor de 1 mM y una Km para glicina que es mayor que 1 mM cuando se calcula usando el mismo método. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína tiene una Km para Beta-alanina la cual es menor o igual a alrededor de 0.8 mM y una Km para glicina que es mayor que 0.8 mM cuando se calcula usando el mismo método. La Km o la "Constante de Michaelis-Menten" es un parámetro cinético que indica la concentración del sustrato a la que la velocidad inicial de la reacción (Vo) es la mitad de la máxima. Los métodos para el cálculo de la Km son bien conocidos por las personas experimentadas en el arte.
La presente invención proporciona además una variante de proteína como se describió anteriormente que comprende una secuencia que contiene al menos la secuencia de una de las regiones de aminoácidos descritas en el grupo descrito como SEQ ID No. 2 (KKIQQELAKP); SEQ ID No. 3 (CFAGLWSL); SEQ ID No. 4 (VMKPQREGGGNNIYG) y SEQ ID No. 5 (AAYILMQRIFP). En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína comprende una secuencia la cual contiene al menos la secuencia de dos regiones de aminoácidos seleccionados del grupo descrito como SEQ ID No. 2, 3, 4 ó 5. En aún una realización adicional de la presente invención dicha variante de la proteína comprende una secuencia que contiene las secuencias de todas las regiones de aminoácidos descritas como SEQ ID No. 2, 3, 4 ó 5.
La presente invención aún proporciona adicionalmente un polinucleótido que comprende una región que codifica para la proteína o variante de la proteína como se describió anteriormente. En una realización adicional de la presente invención dicho polinucleótido comprende la secuencia descrita como SEQ ID No. 6.
La presente aún proporciona adicionalmente un polinucleótido que comprende una primera región que comprende un polinucleótido que codifica para una GST o variante de GST según la presente invención y una segunda región que comprende un polinucleótido que codifica para una proteína o variante de la proteína de acuerdo a la presente invención. En una realización adicional de la presente invención dicha primera región comprende un polinucleótido que codifica para la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 10 y dicha segunda región comprende un polinucleótido que codifica para la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 1. Las regiones pueden estar separadas por una región que proporciona un polipéptido para el autoprocesamiento que es capaz de separar tal como el polipéptido de autoprocesamiento descrito en US 5,846,767 o cualquier elemento que funcione similarmente. Como alternativa las regiones pueden separarse por una secuencia la cual actúa como un sitio diana para un elemento externo que es capaz de separar las secuencias de proteína. Como alternativa el polinucleótido puede proporcionar un poliproteína que comprende una pluralidad de funciones de proteína tales como una GST y una homoglutatión sintetasa según la invención. En una nueva realización de la presente invención las proteínas de la poliproteína pueden colocarse en tándem. En aún una realización adicional de la presente invención la poliproteína comprende una pluralidad de funciones de proteína que están separadas por secuencias enlazadoras.
La presente invención proporciona aún adicionalmente una construcción de ADN que comprende la secuencia de un promotor operable de planta operablemente enlazado a un polinucleótido operablemente enlazados a una región de terminación de la transcripción según la presente invención. En una realización adicional de la presente invención la construcción de ADN además comprende una región o una pluralidad de regiones que proporcionan el blanco del producto o de los productos de la proteína para una localización o localizaciones particulares. La construcción de ADN puede además comprender una región que proporciona para la producción de una proteína que actúa como un marcador de selección. El marcador de selección puede, en particular, conferir resistencia a la kanamicina; higromicina o gentamicina. Los marcadores de selección más apropiados incluyen genes que confieren resistencia a otros herbicidas como los herbicidas basados en glifosfato o resistencia a toxinas como la eutipina. Otras formas de selección también se encuentran disponibles como los sistemas de selección basados en hormona como el sistema de Multi Auto Transformación (MAT) de Hiroyrasu Ebinuma y otros. 1997. PNAS Vol. 94 pp2117-2121; sistemas de selección visual que usan la conocida proteína de fluorescencia verde, la \beta glucoronidasa y cualquier otro sistema de selección tal como el de manosa isomerasa, el de xilosa isomerasa y el de 2-deoxiglucosa (2-DOG). El promotor operable de planta de la construcción de ADN puede seleccionarse del grupo que consiste en Agrobacterium rhizogenes RolD; RolD/Fd; el inhibidor de proteasa de papa II; CaMV35S; CamV35S doble potenciado; FMV35S; NOS; OCS; Patatin; E9; el interruptor alcA/alcR.; el interruptor GST; el interruptor RMS; el oleosin; el promotor de la subunidad pequeña de la ribulosa bisfosfato carboxilasa-oxigenasa. Los terminadores que pueden usarse en las construcciones de acuerdo a la presente invención incluyen Nos, inhibidor de proteinasa II y el terminador del gen de la alfa-tubulina (EP-A 652,286). Es igualmente posible usar, en asociación con la secuencia de regulación del promotor, otras secuencias de regulación las cuales se sitúan entre el promotor y la secuencia que codifica para la proteína según la presente invención, tales como potenciadores transcripcionales o traduccionales, por ejemplo, el activador de traducción del virus del grabado del tabaco (TEV) descrito en la Solicitud Internacional de Patente, PCT número de publicación W0 87/07644 o la secuencia líder de la Glucanasa II. El polinucleótido que codifica para la proteína según la invención también puede ser codón-optimizado, o alterado por otra parte para potenciar por ejemplo, la transcripción una vez que es incorporado en el material de la planta. Tal optimización de codón también puede usarse para alterar la estructura secundaria predicha del transcripto de ARN producido en cualquier célula transformada, o para destruir la inestabilidad de los elementos crípticos de ARN presentes en el transcripto inalterado, de este modo aumentando la estabilidad y/o disponibilidad del transcripto en la célula transformada (Abler and Green. 1996. Plant Molecular Biology (32) pp63-78).
La presente invención todavía proporciona adicionalmente un método para proporcionar plantas que son resistentes y/o tolerantes a un herbicida difenil éter que comprende: (a) insertar en el material del genoma de la planta un polinucleótido o secuencia de polinucleótido que proporciona una GST o variante de GST como se describió anteriormente o una construcción de ADN como se describió anteriormente; y (b) regenerar plantas o partes de plantas de allí; y (c) aplicar a dichas plantas o partes de plantas una cantidad de dicho herbicida difenil éter que es fitotóxico a las plantas tipo control y seleccionar estas plantas o partes de plantas que son resistentes a dicho herbicida difenil éter. En una nueva realización de la presente invención el polinucleótido insertado en el material de la planta de acuerdo con el método de la oración precedente codifica para una secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID No. 10.
La presente invención todavía proporciona adicionalmente métodos como los descritos en el párrafo precedente en los cuáles dicho herbicida difenil éter comprende fomesafen y/o acifluorfen. La construcción polinucleótido/ADN puede ser incorporada en el material del genoma de la planta de acuerdo con la presente invención por técnicas de transformación de plantas las cuáles son bien conocidas por las personas experimentadas en el arte. Tales técnicas incluyen pero no se limitan a la transformación por partículas mediada por biolística. La transformación mediada por Agrobacterium, transformación de protoplastos (opcionalmente en presencia de polietilenglicoles); sonicación de tejidos de plantas, células o protoplastos en un medio que comprende el polinucleótido o vector; microinserción del polinucleótido o vector en el material totipotente de la planta (opcionalmente empleando la conocida técnica de "pelos" de carburo de silicio), electroporación y similares. Las técnicas que son específicamente optimizadas para un cultivo particular pueden ser empleadas para los propósitos de transformar un cultivo particular de acuerdo con la presente invención. Por ejemplo, cuando se transforma la soja puede ser preferible usar un método basado en uno descrito por Christou y otros (1990). Dan y otros (1999). Williams y otros (2000) y Hinchee y otros (1999). El método de transformación per se no es pertinente a la presente invención y la persona experta puede emplear cualquier método funcional apropiado para el cultivo diana.
La presente invención todavía proporciona adicionalmente plantas o partes de plantas resistentes a los herbicidas obtenidas de acuerdo a los métodos descritos anteriormente. Tales plantas o partes de planta pueden seleccionarse del grupo que consiste de: melones; mangos; soja; algodón; tabaco; remolacha azucarera; colza oleaginosa; canola; lino; girasol; papa; tomate; alfalfa; lechuga; maíz; trigo; sorgo; centeno; bananos; cebada; avena; césped de hierba; césped de forraje; caña de azúcar; guisante; haba; arroz; pino; álamo; manzana; melocotones; uva; fresas; zanahoria; lechuga; berza; cebolla; cítrico; cereal; plantas de nuez u otros cultivos de horticultura. En una realización particular de la presente invención dichas plantas o partes de planta son las plantas o partes de la planta de soja (Glicina sp.).
La presente invención todavía proporciona adicionalmente un método de proporcionar una planta con una característica agronómica deseada adicional que comprende: (a) insertar en el material del genoma de la planta o parte de una planta como es descrito anteriormente un polinucleótido que proporciona la característica agronómica deseada; y regenerar plantas o partes de planta de dicho material; o (a) cruzar una primera planta o parte de planta como se describió anteriormente con una segunda planta que proporciona dicha característica agronómica deseada; y (b) seleccionar aquellas plantas resultantes que contienen dicha característica agronómica deseada adicional. Sería apreciado que la planta resultante de tal método contenga las características de las GSTs y/o homoglutatión sintetasa según la presente invención como se describió anteriormente junto con las características asociadas con dichas características agronómicas. En una realización adicional de la presente invención dicha característica agronómica deseada adicional proporciona la resistencia a un herbicida que comprende glifosato o una sal del mismo. La característica agronómica deseada adicional también puede ser seleccionada del grupo que consiste de: mayor resistencia al herbicida; resistencia al insecto; resistencia al nematodo; tolerancia al stress; rendimiento alterado; valor de nutricional alterado; cualidad alterada o cualquier otra característica agronómica deseable. En aún una realización adicional de la invención dicha característica agronómica adicional comprende la resistencia y/o tolerancia a insectos lograda por la producción de proteínas insecticidas tales como las lectinas o proteínas derivadas de Bacillus thuringiensis, Xenorhabdus sp. y de Photorabdus sp en la planta. En aún una realización adicional de la invención dicha característica agronómica adicional comprende la resistencia y/o tolerancia a nemátodos lograda por medio de la producción de proteínas nematicidas tales como los inhibidores de enzima, en la planta.
La presente invención todavía proporciona adicionalmente un método para controlar selectivamente las malas hierbas en un campo dicho campo comprendiendo la cosecha de las plantas y las malas hierbas dicho método comprende la aplicación a dicho de campo de una formulación agrícolamente aceptable de un agroquímico que comprende fomesafen y/o acifluorfen en la cual dicho cultivo de plantas son las plantas según la invención.
La invención será ahora descrita por vía de los siguientes ejemplos no limitantes con referencia a las figuras y secuencias enumeradas en las que:
La Figura 1 muestra un diagrama esquemático del vector de clonaje pMJB2.
La Figura 2 muestra un diagrama esquemático del vector de clonaje pMOG1051
La Figura 3 muestra un diagrama esquemático del vector binario pMOG800
La Figura 4 muestra un diagrama esquemático del vector pFT2 usado, para la transformación por medio de Agrobacterium, para transformar las plantas para dar la resistencia a los herbicidas.
Lista de secuencias
SEQ ID No.1.
Homoglutatión sintetasa de Glicina max.
SEQ ID Nos. 2 a 5.
Regiones de la proteína Homoglutatión sintetasa.
SEQ ID No. 6.
Secuencia polinucleotídica que codifica para la Homoglutatión sintetasa de Glicina max.
SEQ ID Nos. 7 a 10.
Glutatión-S-transferasas 2.6, 3.1, 3.2 y 3.3 respectivamente.
SEQ ID No. 11 a 14.
Polinucleótidos que codifican para las GSTs 2.6, 3.1, 3.2 y 3.3 respectivamente. (GST 3.3 también puede estar referida como GST 3.6).
SEQ ID Nos. 15 a 24.
Los cebadores.
SEQ ID Nos. 25 a 34.
La secuencia de soja derivada de la secuencia de ácidos nucleicos P32110; la secuencia de Fríjol Mungo U20809; la secuencia de Tabaco Q03663; la secuencia de papa derivada de la secuencia de ácidos nucleicos P32111; la secuencia de Arabidopsis P46421; la secuencia (genómica) de Arabidopsis P46421; la secuencia de Papaya AJ000923; la secuencia de Abeto AF051214; la secuencia de trigo AF004358; la secuencia de Abeto AF051238 respectivamente.
SEQ ID No. 35.
El cebador.
SEQ ID Nos 36 a 43.
Las secuencia de clones enumeradas como SEQ ID Nos. 8, 22, 7,21, 31, 15, 23 y 25 en la Solicitud Internacional de Patente Número de Publicación WO 00/18936.
Ejemplo 1 Aislamiento e identificación de ADNcs parciales que codifican para GSTs de soja
1.1 Se obtuvieron ADNcs parciales que codifican para GSTs de soja usando la reacción en cadena de la polimerasa reverso-transcriptasa (RT-PCR) con oligonucleótidos cebadores degenerados diseñados para las regiones conservadas dentro de las conocidas GSTs clase tau usando métodos de alineamiento conocidos en el arte. El ARN total se obtuvo de cultivos celulares de soja (Glicina max cv. Mandarin) usando el reactivo TRIZOL^{TM} (Life Technologies^{TM}) según las pautas de los fabricantes. La primera cadena de ADNc se obtuvo de 5 \mug de ARN total usando el oligonucleótido OG2 (SEQ ID No. 35) en conjunto con la reverso transcriptasa Superscript-II (Life Technologies^{TM}) usando los protocolos estándares proporcionados por el fabricante. Los oligonucleótidos cebadores degenerados CON2 (SEQ ID No. 17) y CON3 (SEQ ID No. 18) se usaron entonces en las reacciones de PCR independientes con el oligonucleótido cebador OG9 (SEQ ID No. 16) para amplificar parcialmente los genes que codifican para la GST a partir de la primera cadena de ADNc. 2 \mul de la primera cadena de ADNc sintetizada se usaron como plantilla en la reacción. Las condiciones de PCR usadas son (94ºC, 45 s; 51ºC, 30 s y 72ºC, 60 s) 35 ciclos usando la Taq ADN polimerasa suministrada por Life Technologies y un termociclador Techne. Los productos amplificados fueron ligados en el vector pCR2.1 (Invitrogen^{TM}) y transformados en células de E. coli INV F'.
1.2 Las colonias transformadas se seleccionaron en medio LB que contiene 100 ug ml-l de ampicilina y 40 ug ml de X-GAL. Los plásmidos se recuperaron a partir de cultivos de toda la noche de 5 ml, iniciado cada uno de 90 colonias blancas individuales (45 de cada reacción de RT inicial). Los diferentes plásmidos fueron sometidos entonces a análisis de restricción (EcoRI, SspI, SspI: SphI y RsaI) permitiendo agrupar los clones similares. Los distintos ADNcs fueron identificados por secuencia automatizada de ADN con los cebadores M13, usando un secuenciador automático de ADN ABI 377, y analizados por similitud con las secuencias de GST conocidas mediante la realización de búsquedas en bases de datos usando el algoritmo BLAST (Altschul S.F y otros, 1990).
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Ejemplo 2 Aislamiento e identificación del ADNc parcial que codifica para la homoglutatión sintetasa
2.1 Un ADNc de longitud parcial que codifica para la homoglutatión sintetasa fue obtenido por RT-PCR. Los oligonucleótidos cebadores degenerados MS-3 (el SEQ ID No.15) y OG9 (SEQ ID No. 16) se usaron para amplificar específicamente el clon deseado de primera cadena de ADNc, producido por cultivos celulares de soja como se describe anteriormente.
2.2 El producto de PCR obtenido se clonó en el vector pCR2.1 y fue secuenciado usando un secuenciador automático de ADN AB1377^{TM}. Los productos que exhiben homología con glutatión sintetasas relacionadas fueron identificados buscando en las bases de datos usando el algoritmo BLAST.
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Ejemplo 3 Construcción de la librería, aislamiento del clon y secuenciación
3.1 Se construyó una biblioteca de ADNc usando el sistema lambda ZAP-II (Stratagene). El ARN total se aisló de una suspensión celular de cultivos de 5 días de células soja (cv. Mandarin) usando reactivo TRIZOL^{TM}. El ARNm Poli A+ se aisló a partir de ARN total usando PolyATtract (Promega^{TM}) según los protocolos estándares suministrados. La biblioteca de ADNc se construyó según los siguientes protocolos estándares proporcionados por Stratagene^{TM}.
La tabla 1 más abajo muestra las características de la biblioteca de ADNc construida de una suspensión celular de cultivos de 5 días de células soja (cv. Mandarin).
1
3.2 Las secuencias parciales de ADNc identificadas en los ejemplos anteriores fueron marcadas con P^{32} usando el kit de marcaje Ready-to-go (Pharmacia^{TM}) y usadas para muestrear la biblioteca de ADNc de soja por ADNcs de longitud completa. Fueron muestreados 160,000 pfu y las colonias supuestas hibridaron de forma cruzada con las sondas sometidas a un muestreo secundario y terciario hasta que se observó pureza en la placa. El ADN de los plásmidos se recuperó de las reservas de placas puras usando protocolos de escisión in vivo suministrados por Stratagene^{TM}. Fueron identificados los ADNcs de longitud completa que codifican para GSTs y los ADNcs de longitud completa que codifican para la homoglutatión sintetasa.
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Ejemplo 4 Identificación de GSTs de soja con actividad sobre sustratos herbicidas 4.1 Expresión bacteriana de los clones de ADNc
Los ADNcs de longitud completa que codifican para homoglutatión sintetasa y glutatión S-transferasa se expresaron de forma independiente en E.coli usando el sistema de expresión pET (Novagen^{TM}).
4.2 Los sitios NdeI o NcoI fueron introducidos de forma apropiada en el extremo 5' de los ADNcs que codifican para la glutatión S-transferasa y BamHI en el extremo 3' usando PCR. El ADNc se clonó entonces en el pET-24a o pET-24d como es apropiado. Los plásmidos resultantes se introdujeron en E.coli BL21 (DE3) usando procedimientos estándares de transformación bacteriana conocidos por aquellos expertos en el arte. La expresión y purificación de la GST recombinante se realizó usando cromatografía de intercambio aniónico y cromatografía de afinidad S-Hexil-glutatión según los métodos conocidos en el arte (por ejemplo, Skipsey y otros, 1997). La actividad GST de la proteína recombinante purificada hacia CDNB, acetoclor, acifluorfen, etil clorimuron, fluorodifen, fomesafen y metolaclor en presencia de ambas glutatión y homoglutatión se realizó por medio de ensayos que se describen en Andrews y otros, 1997 y Skipsey y otros, 1997.
4.3 La tabla 2 más abajo muestra la actividad de enzimas recombinantes. \pmSE, n=2, ND = No detectable, *Actividad nkat mg-1, **Actividad pkat mg-1
\newpage
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
\cr \cr \cr
\cr}
2
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Ejemplo 5 Identificación de Homoglutatión sintetasa activa 5.1 Expresión bacteriana del clon de ADNc
Sitios de enzimas de restricción 5' NcoI y 3' XhoI fueron introducidos en el ADNc de homoglutatión sintetasa por medio de PCR usando los cebadores MS4-Nco (SEQ ID No. 20). Además, el uso del cebador MS-4-HIS proporciona una cola de HIS C-terminal para ayudar a la purificación de la enzima.
5.2 El fragmento resultante de la PCR fue digerido con NcoI y XhoI y ligado en el pET-24d similarmente digerido. Este vector fue llamado pET-MS4-His. La purificación de la homoglutatión sintetasa se realizó usando el siguiente método. Las E.coli BL21 (DE3) que portaban el plásmido pET-MS4-His (sección 1.3) fueron crecidas a 30ºC hasta una DO_{600} = 0.5, luego se añadió isopropil-\beta-tiogalactósido (IPTG) a una concentración final de 0.1 mM. Posterior a una incubación de 3 horas las bacterias fueron colectadas por centrifugación, resuspendidas en tampón A (20 mM. Tris, 0.5 M NaCl, 5 mM. imidazol pH 8.0) y lisadas. Los restos celulares fueron removidos por centrifugación (10,000 g, 10 min) y el sobrenadante aplicado a una columna de 5 ml de ácido iminidiaceico (Sigma^{TM}), previamente cargado con NiSO_{4} y equilibrado en tampón A. La columna fue lavada con tampón A que contiene 20 mM de imidazol, seguido por tampón A que contiene 300 mM de imidazol para remover las proteínas unidas por afinidad.
5.3 La proteína eluida fue concentrada usando una columna de centrifugación Centriplus 30 (Amicon^{TM}) y resuspendida en tampón A previo a su aplicación a una columna quelante HiTrap de 1 ml (Pharmacia^{TM}), pre-cargada con NiSO_{4} y equilibrada como se describió anteriormente. La proteína unida por afinidad es recobrada entonces usando una concentración creciente de imidazol de 20-200 mM y la presencia de la homoglutatión sintetasa recombinante con cola de Histidina fue detectada usando anticuerpos para colas de Histidina de acuerdo a procedimientos conocidos. Las fracciones que contenían la homoglutatión sintetasa recombinante fueron agrupadas, concentradas usando columnas de centrifugación Centricon 30 y resuspendidas en 20 mM Tris-HCl pH 8.0, 1 mM DTT.
5.4 Se ensayó la actividad de la homoglutatión sintetasa en 250 mM Tris-HCl pH 8.0, 50 mM KCl, 20 mM MgCl_{2}, 5 mM DTT, 10 mM ATP, 1 mM \gamma-glutamilcisteína y 50 mM glicina o 10 mM \beta-alanina en un total de 100 \mul. Los controles experimentales no contenían la enzima o glicina/ \beta-alanina. Los ensayos se realizaron a 30ºC por 60 minutos, con alícuotas de 20 \mul removidas a intervalos de tiempo regulares. Entonces se realizó una derivatización monobromobimana en las alícuotas para determinar la presencia de o glutatión o homoglutatión de acuerdo con los métodos descritos por Cummins y otros, 1997.
TABLA 3 Características de la homoglutatión sintetasa recombinante
3
Ejemplo 6 Generación de plantas resistentes/tolerantes a los herbicidas
6.1 Las plantas con tolerancia incrementada a los herbicidas acifluorfen y fomesafen fueron obtenidas por expresión en la planta hospedero de ambos la GST 3.3 activa de soja y la homoglutatión sintetasa para incrementar además los niveles de homoglutatión, requeridos para potenciar la eficiencia de la función de GST 3.3.
6.2 La PCR, usando los oligonucleótidos cebadores hGSH-NcoI (SEQ ID No. 21) y hGSH-KpnI (SEQ ID No. 22) se usó para introducir un sitio 5' NcoI y un sitio 3' KpnI en el ADNc GST 3.6. El producto resultante de la PCR fue purificado, secuenciado, digerido con NcoI y KpnI y ligado en el vector pMJB2 (Figura 1). El cassette de expresión, que comprende el promotor doble potenciado CaMV35S: Glucanasa II líder, ADNc de hGSH sintetasa y terminador nos fue escindido entonces de pMJB2 usando HindIII/EcoRI y ligado en el vector binario pMOG800 similarmente digerido (Figura 3).
6.3 Los oligonucleótidos cebadores 3.6-BglII (SEQ ID No. 23) y 3.6 NcoI (SEQ ID N. 24) fueron usados para introducir los sitios NcoI y BglII en los extremos 5' y 3' del ADNc GST 3.6 respectivamente. El producto resultante de la PCR fue purificado, secuenciado y digerido con NcoI y BglII y sub-clonado en el vector pMOG1051 (Figura 2). El cassette de expresión que comprende el promotor RolD/Fd, ADNc de GST 3.3 y el terminador PI-II de papa fue escindido entonces de pMOG1051 usando BamHI y ligado en el único sitio BamHI en el vector binario pMOG800 (Figura 3) que porta el cassette de expresión de la homoglutatión sintetasa (ver adelante). La orientación del inserto fue determinada por PCR. El vector binario resultante, llamado pFT2 (Figura 4) fue secuenciado íntegramente para confirmar su autenticidad.
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Ejemplo 7 Transformación y Regeneración de planta
7.1 El vector binario pFT2 fue transformado en Agrobacterium tumefaciens cepa LBA 4404 usando el método de transformación de congelación descongelación proporcionado por Holsters y otros, 1978. La transformación de tabaco y regeneración de la planta entera fue realizada usando Nicotiana tabacum var. Samsun según los protocolos estándares detallados por Bevan, 1984. Los eventos de transformación se seleccionaron en medio MS que contiene kanamicina. Pueden ser empleados otros métodos de transformación para la transformación de otros cultivos, tales como la soja. Ejemplos de tales métodos son referidos a continuación.
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Ejemplo 8 Análisis de plantas transgénicas 8.1 Análisis por PCR de los transformantes
Se tomaron muestras de hojas de líneas transformadas y se extrajo ADNc según los métodos descritos por Edwards y otros, 1991. Los pares de oligonucleótidos cebadores SEQ ID No. 21 y SEQ ID No. 22 y SEQ ID. No. 23 SEQ ID No. 24 fueron usados para amplificar regiones específicas dentro de la homoglutatión sintetasa y GST 3.3 para permitir la detección de ambos transgenes dentro del material putativo de la planta transformada.
Los análisis siguientes fueron realizados en material positivo a PCR para confirmar la funcionalidad de los genes introducidos.
8.2 Análisis de la enzima
La actividad GST hacia el fomesafen en líneas transgénicas fue realizado de acuerdo a los métodos descritos en la publicación de Andrews y otros, 1997.
8.3 Actividad sintetasa de tiol libre
Las actividades glutatión y homoglutatión sintetasa fueron determinadas en las líneas transgénicas usando el ensayo descrito anteriormente.
8.4 Determinación de tiol libre
La presencia de tiol libre en las plantas transgénicas fue determinada usando el método de derivatización monobromobimana. El tejido (1 g) fue pesado con precisión, congelado en nitrógeno líquido, triturado a polvo fino y transferido a un tubo limpio que contiene 3 ml de HCl 0.1 M. Después de una incubación en hielo por 30 minutos con mezcla ocasional, la mezcla fue transferida a un tubo eppendorf y centrifugada (13,000 g, 3 min). Dos alícuotas de 100 \mul de sobrenadante fueron transferidas a tubos eppendorfs limpios, y se añadió 10 \mul de agua a uno y al otro se le añadió 1 mM de glutatión o homoglutatión (10 \mul). El tiol libre presente fue reducido por la adición de 10 \mul de NaOH 1M seguido por 10 \mul de NaOH que contenía 20 mg/ml NaBH_{4} y la solución fue incubada por 10 minutos a temperatura ambiente.
8.4.1 La reacción fue detenida por la adición de 120 \mul de HCl 3.6 M y las muestras centrifugadas (13,000 g, 5 min). El sobrenadante (100 \mul) fue transferido a un tubo fresco y 10 \mul de 5 mg ml de monobromobimana disueltos en acetonitrilo añadidos, seguido por 5 \mul de N-etilmorfolina al 35% v/v. Las muestras fueron puestas en la oscuridad por un período de 20 min, y la reacción fue parada por la adición de 880 \mul de ácido acético al 5% (5 \mul v/v). Una curva estándar fue preparada derivatizando glutatión o homoglutatión (0-20 mmol), y los conjugados S-bimana analizados por HPLC usando metodología conocida en el arte (Cummins y otros, 1997).
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Ejemplo 9 Pruebas de tolerancia a los herbicidas
9.1 A continuación del cultivo de tejidos, las plántulas resistentes a la kanamicina fueron transferidas a recipientes de 5 pulgadas que contienen abono para recipientes John Innes no. 3. Se les permitió a las plantas desarrollarse hasta aproximadamente un estadío 10 de hoja y se aplicó fomesafen a 10 g ai ha^{-1}, formulado con surfactante no iónico, al tejido aéreo usando un atomizador de pista. La evaluación visual de la fitotoxicidad/necrosis de la planta se realiza a los 5 días posteriores a la aplicación.
TABLA 4 Análisis de líneas de tabaco transgénicas
4
Ejemplo 10 Producción de líneas homocigóticas de plantas
10.1 Las líneas transgénicas de planta de una sola copia fueron identificadas por análisis con Southern blot según los métodos descritos por Sambrook, 1989 usando sondas apropiadas radiomarcadas. El análisis de segregación fue realizado en plantas que contenían un solo evento de inserción por germinación en medio MS que contiene kanamicina. La confirmación posterior de líneas homocigóticas puede ser realizada por retro cruzamiento de líneas transgénicas con tabaco tipo salvaje y análisis de segregación genética seguido por selección en kanamicina.
Referencias
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Cummins I., Moss S., Cole D.J y Edwards R (1997) Glutathione Transferases in Herbicide-resistant and Herbicide-Susceptible Black-grass (Alopecurus myosuroides). Pesticide Science 51 244-250.
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<110> ZENECA LIMITED
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<120> SECUENCIAS DE GST DE SOJA Y SU USO EN LA PRODUCCIÓN DE PLANTAS RESISTENTES A LOS HERBICIDAS
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<130> CASO ZENECA PPD50449/WO
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<140>
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<141>
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<150> GB9922346.3
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<151> 1999-09-21
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<160> 43
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<170> PatentIn Ver. 2.0
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<210> 1
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<211> 499
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<212> PRT
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<213> Glicina max
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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5
6
7
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<210> 2
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<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de secuencia artificial: Fragmento de Proteína.
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
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\hskip1cm
8
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<210> 3
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<211> 8
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de secuencia artificial: Fragmento de Proteína.
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
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\hskip1cm
9
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<210> 4
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de secuencia artificial: Fragmento de Proteína
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<400> 4
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10
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<210> 5
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de secuencia artificial: Fragmento de Proteína
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<400> 5
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\hskip1cm
11
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<210> 6
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<211> 1854
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<212> ADN
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<213> Glicina max
\newpage
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<400> 6
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12
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<210> 7
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<211> 222
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<212> PRT
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<213> Glicina max
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
13
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<210> 8
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<211> 235
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<212> PRT
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<213> Glicina max
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<400> 8
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14
15
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<210> 9
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<211> 223
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<212> PRT
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<213> Glicina max
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<400> 9
16
17
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<210> 10
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<211> 232
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<212> PRT
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<213> Glicina max
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
18
19
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<210> 11
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<211> 885
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<212> ADN
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<213> Glicina max
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<400> 11
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20
200
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<210> 12
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<211> 899
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<212> ADN
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<213> Glicina max
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<400> 12
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21
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<210> 13
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<211> 840
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<212> ADN
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<213> Glicina max
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<400> 13
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22
220
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<210> 14
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<211> 918
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<212> ADN
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<213> Glicina max
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<400> 14
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23
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<210> 15
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
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<400> 15
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\hskip1cm
24
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<210> 16
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<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (16, 24)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> i
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2763
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de ácidos nucleicos derivada de SOJA P32110
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
34
35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1137
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de Fríjol mungo U20809
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2038
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de Tabaco Q03663
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<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
37
370
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2796
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de ácidos nucleicos derivada de Papa P32111
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
38
39
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1289
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de Arabidopsis P46421
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1339
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia genómica de Arabidopsis
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 968
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Secuencia de Papaya AJ000923
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
42
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1040
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Abeto AF051214
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
43
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 902
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Trigo AF004358
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
44
45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1127
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Abeto AF051238
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de secuencia artificial: Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 234
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
48
\vskip1.000000\baselineskip
49
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 222
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 895
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
51
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 895
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
52
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 977
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
53
54
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1006
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
55
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 885
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Glicina max
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
56
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 991
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
57

Claims (13)

1. Una Glutatión-S-transferasa (GST) que comprende la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 10 o una variante de GST que tiene al menos 80% de identidad con la misma cuando se calcula sobre la longitud completa de la SEQ ID NO. 10 con la condición de que dicha variante de GST no comprenda la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 36, y en la cual la GST o variante de GST sea capaz de conferir resistencia y/o tolerancia a un herbicida el cual comprende fomesafen y/o acifluorfen.
2. Un polinucleótido que comprende la región que codifica para una GST o variante de GST de acuerdo a la reivindicación 1.
3. Un polinucleótido de acuerdo a la reivindicación 2 que comprende la secuencia descrita como SEQ ID NO. 14.
4. Una proteína que comprende la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 1 o una variante de proteína que tiene al menos un 80% de identidad con la misma cuando se calcula sobre la longitud completa de la SEQ ID NO. 1, donde dicha proteína o variante es capaz de catalizar la adición de Beta-alanina sobre gamma glutamilcisteína y donde la variante tiene una Km para Beta-alanina la cual es menor que dichas variantes de Km para glicina cuando se calcula usando el mismo método.
5. Una variante de proteína de acuerdo a la reivindicación 4 cuya variante comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo descrito como SEQ ID NOs. 2, 3, 4 ó 5.
6. Un polinucleótido que comprende una región que codifica para una proteína o variante de proteína según las reivindicaciones 4 ó 5.
7. Un polinucleótido de acuerdo a la reivindicación 6 que comprende la secuencia descrita como SEQ ID NO. 6.
8. Un polinucleótido que comprende la primera región que comprende un polinucleótido según las reivindicaciones 2 ó 3 y una segunda región que comprende un polinucleótido según las reivindicaciones 6 ó 7.
9. Un polinucleótido de acuerdo a la reivindicación 8 donde dicha primera región comprende un polinucleótido que codifica para la secuencia de aminoácidos descrita como SEQ ID NO. 10 y dicha segunda región comprende un polinucleótido que codifica para un aminoácido descrito como SEQ ID NO. 1.
10. Un método de proporcionar plantas que sean resistentes y/o tolerantes a un herbicida difenil éter que comprende:
(a)
insertar en el material del genoma de la planta un polinucleótido o una secuencia de polinucleótido de acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 2, 3, 8 ó 9;
(b)
regenerar plantas o partes de plantas de la misma; y
(c)
aplicar a dichas plantas o partes de plantas una cantidad de dicho herbicida difenil éter el cual es fitotóxico a las plantas tipo control y seleccionar aquellas plantas o partes de plantas las cuales son resistentes a dicho herbicida difenil éter.
11. Plantas o partes de plantas, donde dichas plantas o partes de plantas son resistentes a los herbicidas difenil éter debido a la expresión de una GST de acuerdo a la reivindicación 1 codificada por una construcción de ADN que comprende un polinucleótido según cualquiera de las reivindicaciones 2, 3, 8 ó 9.
12. Un método para proporcionar una planta con una característica agronómica deseada adicional que comprende:
(a)
insertar en el material del genoma de la planta de una planta o parte de una planta de acuerdo a la reivindicación 11 un polinucleótido el cual proporciona una característica agronómica deseada adicional y regenerar plantas o partes de plantas de dicho material; o
(b)
el método de la reivindicación 10, seguido por el cruzamiento de la primera planta o parte de planta proporcionada por el paso (c) del método de la reivindicación 10 con una segunda planta la cual proporciona dicha característica agronómica deseada y seleccionar dichas plantas resultantes las cuáles contienen dicha característica agronómica deseada adicional.
13. Un método de controlar selectivamente las malas hierbas en un campo dicho campo comprendiendo plantas de cultivo y malas hierbas, dicho método comprendiendo aplicar a dicho campo una formulación agrícolamente aceptable de un agroquímico que comprende fomesafen y/o acifluorfen, donde dichas plantas de cosecha son las plantas de acuerdo a la reivindicación 11.
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