ES2310853T3 - Peptidos citrulinados derivados de la fibrina reconocidos por autoanticuerpos especificos de la poliartritis reumatoide y usos de los mismos. - Google Patents

Peptidos citrulinados derivados de la fibrina reconocidos por autoanticuerpos especificos de la poliartritis reumatoide y usos de los mismos. Download PDF

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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
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    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/745Blood coagulation or fibrinolysis factors
    • C07K14/75Fibrinogen

Abstract

Péptido aislado reconocido por autoanticuerpos antiproteínas citrulinadas (AAPC) presentes en el suero de los pacientes afectados por poliartritis reumatoide (PR), caracterizado porque comprende al menos un resto citrulilo y porque se elige entre el grupo constituido por: a) un péptido definido por la secuencia X 1PAPPPISGGGYX 2AX 3 (ID SEC Nº: 1) en la que X 1, X 2 y X 3 representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X 2 o X 3 es un resto citrulilo; b) un péptido definido por la secuencia GPX 1VVEX 2HQSACKDS (ID SEC Nº: 2) en la que X 1 y X 2 representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X 1 o X 2 es un resto citrulilo; c) un péptido definido por la secuencia SGIGTLDGFX1HX2HPD (ID SEC Nº: 3) en la que X1 y X2 representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X 1 o X 2 es un resto citrulilo; d) un péptido definido por la secuencia VDIDIKIX1SCX2GSCS (ID SEC Nº: 4) en la que X1 y X2 representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X1 o X2 es un resto citrulilo; e) un péptido definido por la secuencia X1GHAKSX2PVX3GIHTS (ID SEC Nº: 12) en la que X1, X2 y X3 representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X1, X2 o X3 es un resto citrulilo; f) un péptido que comprende al menos 5 aminoácidos consecutivos, incluyendo al menos un resto citrulilo, de uno de los péptidos a) a e) anteriores.

Description

Péptidos citrulinados derivados de la fibrina reconocidos por autoanticuerpos específicos de la poliartritis reumatoide y usos de los mismos.
La presente invención se refiere a nuevos péptidos citrulinados reconocidos por autoanticuerpos específicos de la poliartritis reumatoide.
La poliartritis reumatoide (en lo sucesivo abreviada como "PR") es el más frecuente de los reumatismos inflamatorios crónicos. Se trata de una enfermedad autoinmune, y el suero de los pacientes afectados contiene autoanticuerpos de los que algunos son específicos y pueden constituir un marcador de esta enfermedad, lo que permite su diagnóstico incluso en estados precoces. Se han efectuado así investigaciones con vistas a identificar antígenos reconocidos por estos anticuerpos, con el fin de obtener preparaciones purificadas utilizables en técnicas clásicas de diagnóstico inmunológico.
Se ha demostrado que autoanticuerpos específicos de la PR reconocen diferentes variantes isoeléctricas de la (pro)filagrina (para revisión, véase por ejemplo SERRE y VINCENT, In: Autoantibodies, PETER and SHOENFELD Eds, Elsevier Science Publishers, 271-276, 1996). Estos autoanticuerpos han sido denominados por este motivo: "autoanticuerpos antifilagrina (AAF)". La Solicitud EP-0.511.116 describe la purificación y la caracterización de antígenos de la familia de las filagrinas reconocidos por estos anticuerpos y su uso en el diagnóstico de la poliartritis reumatoide.
Posteriormente, los epítopos de filagrina reconocidos por los AAF han sido identificados como regiones de la molécula de filagrina portadoras de restos citrulilo, resultantes de la transformación de restos arginilo por una peptidilarginina desiminasa (Girbal-Neuhauser E y col., J Immunol, 162, 585-94, 1999; Schellekens GA y col., J Clin Invest, 101, 273-81, 1998). El análisis de diversos péptidos sintéticos derivados de la secuencia de la filagrina humana ha demostrado que la desiminación (citrulinación) era necesaria para la constitución de epítopos reconocidos por los AAF, que hoy en día se denominan igualmente autoanticuerpos antiproteínas citrulinadas (AAPC). En la exposición que se ofrece a continuación se usará esta denominación.
Se ha observado igualmente que el entorno de los restos citrulilo desempeñaba también un papel importante (Girbal-Neuhauser E, 1999, citado anteriormente; Schellekens GA, 1998, citado anteriormente; Union A y col., Arthritis Rheum, 46, 1185-95, 2002); se han identificado algunos aminoácidos "permisivos" respecto de la fijación del anticuerpo y cuya naturaleza modula probablemente la afinidad de fijación del anticuerpo. Entre estos aminoácidos, los restos -gly-, -ser-, -his-, -thr- y -gln-, son los que se encuentran más a menudo en el entorno inmediato de los restos citrulilo de los péptidos "filagrina" citrulinados que, en la actualidad, se han identificado como portadores de epítopos reconocidos por los AAPC (Sebbag M y col., Rev Rhum, 68, 106, 2001).
Se han obtenido péptidos citrulinados muy numerosos reconocidos específicamente por AAPC y útiles en el diagnóstico de la PR a partir de la filagrina. Sin embargo, se ha observado igualmente que, aunque estrechamente específica de la PR, la reactividad de estos diferentes péptidos citrulinados frente a los AAPC era heterogénea, siendo péptidos diferentes reconocidos por sueros extraídos de sujetos diferentes. Esto implica que para obtener un reactivo de diagnóstico capaz de identificar la presencia de AAPC en una gran población es necesario asociar varios péptidos diferentes.
Paralelamente, se ha demostrado que los AAPC son secretados por los plasmocitos del tejido sinovial (Masson-Bessera C y col., Clin Exp Immunol, 119, 544-52, 2000) y son dirigidos específicamente contra formas citrulinadas de las cadenas \alpha y \beta de fibrina presentes en este tejido (Masson-Bessera C y col., J Immunol, 166, 4177-84, 2001).
El documento WO 01/02.437 y Sebbag y col. (Joint Bone Spine vol. 71, 2004, p. 493-502) divulgan el uso de derivados citrulinados de la fibrina para el diagnóstico de la poliartritis reumatoide. Nijenhuis y col. (Clinica Chimica Acta vol. 350, 2004, p. 17-34) discuten las ventajas de los péptidos citrulinados con respecto a las proteínas citrulinadas para el diagnóstico de la poliartritis reumatoide.
Los autores de la invención han emprendido, con el fin de caracterizar mejor los epítopos reconocidos por los AAPC, la identificación de los presentados por las cadenas \alpha y \beta de la fibrina. Con este fin han evaluado la reactividad de sueros que contienen AAPC frente a péptidos sintéticos citrulinados derivados de la secuencia de la cadena \alpha y de la secuencia de la cadena \beta de la fibrina. Teniendo en cuenta la heterogeneidad conocida de los perfiles de reacción de los péptidos citrulinados extraídos de la filagrina con los AAPC, los autores de la invención han usado mezclas de sueros elegidas de manera que contengan AAPC que representan los diferentes perfiles de reactividad observados en el caso de estos péptidos extraídos de la filagrina, con el fin de detectar todos los péptidos de la fibrina que pueden ser reconocidos por AAPC.
Los péptidos sometidos a ensayo se han obtenido a partir de la secuencia de la cadena \alpha y de la secuencia de la cadena \beta de la fibrina. En total, se han elegido 72 péptidos, de ellos 41 derivados de la cadena \alpha de la fibrina y 31 derivados de su cadena \beta. Entre los 72 péptidos citrulinados analizados, los autores de la invención han identificado 13 péptidos derivados de la secuencia de la cadena \alpha y 5 péptidos derivados de la de la cadena \beta de la fibrina como reactivos significativamente con una y/u otra de las mezclas de sueros sometidas a ensayo y así como portadores de epítopos reconocidos por algunos de los AAPC presentes en esta(s) mezcla(s).
Los autores de la invención han analizado a continuación individualmente cada uno de los 18 péptidos reactivos identificados con cada uno de los sueros constitutivos de las mezclas sometidas a ensayo. Este análisis ha confirmado, para la mayor parte de los péptidos sometidos a ensayo, la gran variabilidad interindividual de especificidad de los AAPC observada anteriormente en el caso de péptidos citrulinados derivados de la filagrina.
Por otra parte, esto ha permitido a los autores de la invención identificar péptidos que, de manera inesperada, poseen un espectro de reactividad con los AAPC mucho mayor que los comunicados hasta el presente en el caso de péptidos citrulinados derivados de la filagrina. En efecto, los autores de la invención han identificado 5 péptidos citrulinados (4 péptidos derivados de la cadena \alpha y 1 derivado de la cadena \beta de la fibrina), que son cada uno reconocidos individualmente por al menos el 40% de los sueros analizados y parecen así portadores de epítopos mayores. Entre estos péptidos, dos son reconocidos por la mayoría de los sueros y presentan además perfiles de reactividad complementarios que engloban la totalidad de los sueros analizados. Cada uno de estos sueros reconoce en efecto a uno y/u otro de estos péptidos. Esto sugiere que estos dos péptidos son portadores de motivos estructurales representativos de una muy amplia mayoría de los diferentes motivos reconocidos por los AAPC.
La presente invención tiene por objeto un péptido aislado reconocido por autoanticuerpos antiproteínas citrulinadas (AAPC) presentes en el suero de los pacientes afectados de poliartritis reumatoide, caracterizado porque comprende al menos un resto citrulilo y porque se elige en el grupo constituido por:
a) un péptido definido por la secuencia X_{1}PAPPPISGGGYX_{2}AX_{3} (ID SEC Nº: 1) en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{2} o X_{3} es un resto citrulilo;
b) un péptido definido por la secuencia GPX_{1}VVEX_{2}HQSACKDS (ID SEC Nº: 2) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
c) un péptido definido por la secuencia SGIGTLDGFX_{1}HX_{2}HPD (ID SEC Nº: 3) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
d) un péptido definido por la secuencia VDIDIKIX_{1}SCX_{2}GSCS (ID SEC Nº: 4) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
e) un péptido definido por la secuencia X_{1}GHAKSX_{2}PVX_{3}GIHTS (ID SEC Nº: 12) en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1}, X_{2} o X_{3} es un resto citrulilo;
f) un péptido que comprende al menos 5 aminoácidos consecutivos, preferentemente al menos 7 aminoácidos consecutivos y ventajosamente, de 8 a 14 aminoácidos consecutivos, incluyendo al menos un resto citrulilo, de uno de los péptidos a) a e) anteriores.
Los péptidos según la invención tienen un tamaño de al menos 5 aminoácidos, preferentemente un tamaño de 5 a 25 aminoácidos, y, de manera totalmente preferida, un tamaño de 10 a 20 aminoácidos.
Según una forma de realización preferida de un péptido según la invención se elige entre:
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 1 en la que al menos X_{3} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 2 en la que al menos X_{2} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 3 en la que al menos X_{2} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 4 en la que al menos X_{1} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 12 en la que al menos X_{3} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo.
De manera particularmente preferida, un péptido según la invención se elige entre:
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 1 en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} son restos citrulilo, o un péptido de al menos 16 aminoácidos que comprende dicha secuencia;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 2 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 3 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 4 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
- un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 12 en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo.
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Pueden obtenerse péptidos citrulinados conformes a la invención, por ejemplo, a partir de fragmentos de fibrina o de fibrinógeno naturales, recombinantes, o de síntesis, por la acción de la peptidil-arginina-deiminasa (PAD); pueden obtenerse igualmente por síntesis peptídica, incorporando directamente uno o varios restos citrulina en el péptido sintetizado.
Los péptidos citrulinados conformes a la invención engloban igualmente derivados de los péptidos ID SEC Nº: 1 a 4 y 12 o fragmentos de éstos, definidos anteriormente, llevando dichos derivados modificaciones destinadas a mejorar su reconocimiento por los AAPC: a modo de ejemplos de tales derivados, se citarán: péptidos ciclados; péptidos de tipo retro, en los que se encadenan L-aminoácidos según una secuencia inversa a la del péptido a reproducir; péptidos de tipo retro-inverso, constituidos por aminoácidos de la serie D (en lugar de aminoácidos de la serie L de péptidos naturales) encadenados según una secuencia inversa a la del péptido a reproducir.
Muy ventajosamente, se trata de péptidos en los que la función carboxilo (COOH) terminal se sustituye por una función carboxamida (CONH_{2}). En este marco, son péptidos particularmente preferidos aquellos en los que el resto C-terminal es un resto citrulilo cuya función carboxilo se sustituye por una función carboxamida.
La presente invención tiene igualmente por objeto todo péptido reconocido por los AAPC presentes en el suero de los pacientes afectados por poliartritis reumatoide y que contienen en su extremo C-terminal un resto citrulilo cuya función carboxilo se sustituye por una función carboxamida. Ventajosamente, dicho péptido contiene en su secuencia al menos otro resto citrulilo. Preferentemente, dicho péptido comprende de 5 a 25 aminoácidos.
La sustitución de la función carboxilo del resto citrulina C-terminal por una función carboxamida puede permitir aumentar la reactividad del péptido con los AAPC, o, llegado el caso, convertir en reactivos con los AAPC péptidos que no lo son naturalmente.
Los péptidos citrulinados conformes a la invención engloban igualmente derivados de los péptidos ID SEC Nº: 1 a 4 y 12 o de fragmentos de éstos, como los definidos anteriormente, llevando dichos derivados modificaciones destinadas a facilitar su síntesis y/o a mejorar su estabilidad. A modo de ejemplo de dichos derivados, se citarán los péptidos que incluyen aminoácidos cuyos grupos carboxilo están esterificados o transformados en grupos amida y/o aminoácidos cuyo grupo aminado está alquilado, por ejemplo metilado o acetilado. Los grupos amina y carboxilo de los péptidos pueden estar presentes en forma de la sal correspondiente a la base o al ácido.
A partir de los péptidos citrulinados descritos anteriormente es también posible obtener péptidos mimotopos que comprenden al menos un resto citrulilo (péptido mimotopo citrulinado).
Estos péptidos mimotopos pueden obtenerse cribando bancos de péptidos citrulinados cuyas secuencias se definen a partir de las de los péptidos ID SEC Nº 1, 2, 3, 4, 12 de la presente invención, usados en este marco como "péptidos modelo".
Preferentemente, estos bancos de péptidos se realizan mediante síntesis de diferentes péptidos de tamaño comprendido entre 10 y 20, preferentemente entre 12 y 17 aminoácidos, en particular 15 aminoácidos. Cada uno de estos péptidos conserva al menos 2, preferentemente al menos 4, ventajosamente al menos 6, de manera particularmente preferida al menos 8 y muy ventajosamente al menos 10 aminoácidos, incluyendo al menos un resto citrulilo, de la secuencia del péptido modelo elegido en las mismas posiciones que en dicho péptido modelo, siendo las otras posiciones variables.
Estos bancos pueden cribarse ventajosamente como se describe en los ejemplos mostrados a continuación y sobre todo con ayuda de sueros representativos de diferentes perfiles de reactividad de AAPC, como los definidos en el Ejemplo 1 a continuación.
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Los procedimientos de síntesis de péptidos mimotopos son bien conocidos de por sí. Se hará referencia, por ejemplo, al capítulo 6 de "Chemical approaches to the synthesis of peptides and proteins", Paul Lloyd-Williams, Fernando Albericio and Ernest Giralt, CRC Press New York, 1997, "Peptides libraries", páginas 237-270.
Estos péptidos mimotopos citrulinados pueden usarse, solos o en combinación con otros péptidos citrulinados, y preferentemente en combinación con al menos uno de los otros péptidos de la invención, en una prueba de diagnóstico de la PR para reconocer los AAPC.
La presente invención tiene igualmente por objeto el uso de los péptidos según la invención, como los definidos anteriormente, para detectar la presencia de AAPC en una muestra biológica, en el marco del diagnóstico in vitro de la PR.
La presente invención tiene así por objeto composiciones antigénicas, útiles para detectar la presencia de AAPC en una muestra biológica en el marco del diagnóstico in vitro de la PR, composiciones que se caracterizan porque comprenden al menos un péptido según la invención.
Las composiciones según la invención pueden asociar entre sí diferentes péptidos elegidos entre los péptidos según la invención, o bien pueden asociar uno o varios péptidos según la invención con uno o varios péptidos citrulinados derivados sobre todo de la filagrina.
Según una forma de realización preferida de una composición antigénica según la invención, ésta comprende al menos un péptido de secuencia ID SEC Nº: 1 y al menos un péptido de secuencia ID SEC Nº: 2, como se definen anteriormente.
Esta composición posee un espectro de reactividad muy grande y puede permitir además detectar la PR en un estado precoz.
Ventajosamente, una composición según la invención puede comprender además un péptido de secuencia ID SEC Nº: 3 y/o un péptido de secuencia ID SEC Nº: 4 y/o un péptido de secuencia ID SEC Nº: 12, como los definidos anteriormente.
Las composiciones según la invención pueden, llegado el caso, presentarse en forma de composiciones multipeptídicas, en las que los péptidos constitutivos se asocian entre sí o a una molécula portadora generalmente por unión covalente. A modo de ejemplo, se citarán los multipéptidos antigénicos (MAP, por "multiple antigen peptides" descritos sobre todo por TAM (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 85, 5409-13, 1988)).
La presente invención tiene igualmente por objeto un procedimiento de detección de la presencia de AAPC en una muestra biológica, en el marco del diagnóstico in vitro de la PR, procedimiento que se caracteriza porque comprende:
- la puesta en contacto de dicha muestra biológica con al menos un péptido o una composición antigénica según la invención, según se define anteriormente, en condiciones que permiten la formación de un complejo antígeno/anticuerpo con los AAPC eventualmente presentes en dicha muestra;
- la detección, por todos los medios apropiados, del complejo antígeno/anticuerpo eventualmente formado.
Este procedimiento de detección puede ponerse en práctica gracias a un conjunto que comprende al menos un péptido o una composición antigénica según la invención, y, llegado el caso, tampones y reactivos apropiados para la constitución de un medio de reacción que permita la formación de un complejo antígeno/anticuerpo y/o de medios de detección de dicho complejo antígeno/anticuerpo.
Ventajosamente, dicho conjunto comprende un péptido o una composición antigénica según la invención, inmovilizado en un soporte sólido. A modo de ejemplos no limitativos de soportes sólidos utilizables, se citarán placas de microvaloración, conos del aparato VIDAS® (comercializado por BIOMERIEUX), bolas, microbolas o micropartículas, cintas, etc.
Dicho conjunto puede comprender igualmente muestras de referencia, como uno o varios sueros negativos y uno o varios sueros positivos.
La presente invención tiene también por objeto un procedimiento de detección de la presencia de AAPC en una muestra biológica, en el marco del diagnóstico in vitro de la PR, procedimiento que se caracteriza porque comprende:
- el suministro de un primer péptido citrulinado capaz de entrar en competencia para la unión a dichos AAPC con un péptido según la invención, como el definido anteriormente;
- la puesta en contacto de dicho primer péptido con dicha muestra biológica, en condiciones que permiten la formación de un complejo antígeno/anticuerpo con los AAPC eventualmente presentes en dicha muestra;
- la detección, por todos los medios apropiados, del complejo antígeno/anticuerpo eventualmente formado.
En particular, el primer péptido citrulinado capaz de entrar en competencia con un péptido según la invención es un péptido mimotopo citrulinado que puede obtenerse como se describe anteriormente.
La presente invención se comprenderá mejor con ayuda del complemento de descripción que se ofrecerá a continuación, que se refiere a ejemplos que ilustran la identificación de los péptidos según la invención y la puesta de manifiesto de su perfil de reactividad frente a los AAPC.
Ejemplo 1
Puesta de manifiesto de la heterogeneidad de la reacción de AAPC con péptidos citrulinados extraídos de filagrina y obtención de mezclas de sueros representativas de los diferentes perfiles de reactividad
Se han usado 90 sueros, que presentan AAPC detectables a la vez mediante ELISA y mediante inmunotransferencia en fibrinógeno humano desiminado in vitro (Masson-Bessera C, 2001, citado anteriormente; Nogueira L y col., Arthritis Res, 4, 90, 2002) pero también por inmunofluorescencia indirecta en criocortes de esófago de rata (Vincent C y col., Ann Rheum Dis, 48, 712-22, 1989) y por inmunotransferencia en filagrina epidérmica humana (Vincent C y col., J Rheumatol, 25, 838-46, 1998). La reactividad de estos 90 sueros multipositivos se ha analizado en ELISA con respecto a 5 péptidos citrulinados diferentes cuya reactividad frente a AAPC se había establecido previamente. Estos péptidos son los siguientes:
E12D ESSRDGSXHPRSHD (ID SEC Nº: 5)
T12E TGSSTGGXQGSHHE (ID SEC Nº: 6)
E12H EQSADSSXHSGSGH (ID SEC Nº: 7)
cfc6 SHQESTXGXSRGRSGRSGS (ID SEC Nº: 8)
cf48-65-4 TIHAHPGSXXGGRHGYHH (ID SEC Nº: 9)
(X designa un resto citrulilo).
Los péptidos E12D, T12E y E12H han sido descritos por Girbal-Neuhauser, E. y col. (1999). Los péptidos cfc6 y cf48-65-4 han sido descritos por Schellekens, G. y col. (1998).
El análisis por ELISA se ha efectuado según el protocolo descrito por Girbal-Neuhauser, E. y col. (1999)
Este análisis ha permitido identificar 12 perfiles de reactividad con respecto a los 5 péptidos.
Estos perfiles se resumen en la Tabla I a continuación.
TABLA I
1
Para que sean lo más representativas posible de los diferentes perfiles de reactividad de AAPC, las mezclas, denominadas en lo sucesivo mezclas: "A" y "B", se han constituido cada una mediante mezcla a partes iguales de 10 sueros que representan diferentes perfiles de reactividad en péptidos "filagrina".
La composición de estas dos mezclas se indica en la Tabla II a continuación.
TABLA II
2
Estas dos mezclas A y B son así representativas de la heterogeneidad de especificidad de los sueros AAPC+.
Ejemplo 2
Identificación de péptidos citrulinados derivados de cadenas \alpha y \beta de la fibrina, que reaccionan con los AAPC
Los péptidos sometidos a ensayo se han obtenido a partir de la secuencia de la cadena \alpha y de la secuencia de la cadena \beta de la fibrina [parte correspondiente respectivamente a los restos 36-635 y 45-491 de las cadenas A(\alpha) (referencia NP Acceso: NP_068657) y B(\beta) (referencia SWISSPROT FIBB_HUMAN Prim. Acceso: P02675) del fibrinógeno]. Las secuencias de los restos 1 a 635 y 1 a 491 de las cadenas A(\alpha) y B(\beta) del fibrinógeno se representan igualmente respectivamente en la lista de secuencias en anexo en los números ID SEC Nº: 10 y ID SEC Nº: 11 y en la fig. 1A y B. Las secuencias indicadas en negrita en la fig. 1 son las de las secuencias de señal de proteínas seguidas de las de sus fibrinopéptidos (A y B, respectivamente).
Cada cadena \alpha o \beta de fibrina se ha segmentado en secuencias contiguas de 15 aminoácidos y se han elegido todos los péptidos que comprenden al menos un resto arginilo. En el caso de los péptidos en los cuales el resto arginilo se situaba en el extremo NH_{2}- o COOH-terminal, se ha elegido una segunda serie de péptidos de 15 aminoácidos, encabalgándose con los primeros, de forma que se recentra el resto arginilo terminal en la secuencia. Además, se ha sintetizado un péptido correspondiente a los restos 621-629 de la cadena \alpha de la fibrina. En total, se han elegido 72 péptidos, de ellos 41 derivados de la cadena \alpha de la fibrina y 31 derivados de su cadena \beta. Para cada uno de los péptidos, la forma con resto(s) arginilo (forma nativa) y la forma en la que todos los restos arginilo se han sustituido por restos citrulilo (forma citrulinada) se han sintetizado según el procedimiento en fase sólida de Merrifield con una pureza \geq 60% [Société NeoMPS (Estrasburgo, Francia)].
La lista de los péptidos citrulinados elegidos se da en la Tabla III a continuación:
TABLA III
3
La nomenclatura usada es la siguiente: nombre de origen de la cadena polipeptídica (\alpha o \beta) del fibrinógeno del que se deriva la secuencia, después posición en esta secuencia del resto amino-terminal del péptido - posición del resto carboxi-terminal del péptido. Estas posiciones están numeradas con respecto al extremo N-terminal del fibrinógeno. La mención Cit indica que se trata de una forma citrulinada del péptido. La posición del resto arginilo que se sustituye por un resto citrulilo se indica en índice. Sólo se presentan las formas citrulinadas de los péptidos.
Cada par de péptidos (citrulinado y no citrulinado) se ha sometido a ensayo en ELISA con una mezcla a partes iguales de 10 sueros que no presentan AAPC (mezcla de control) y con las 2 mezclas A y B descritas en el Ejemplo 1.
Los péptidos se han sometido a ensayo después de recubrimiento de placas de poliestireno irradiado (Nunc Maxisorp) en tres tampones diferentes (acetato pH 5,0, PBS pH 7,4 y carbonato pH 9,0), de manera que se optimicen las posibilidades de fijación pasiva de los péptidos (10 \mug/ml) que presentaban puntos isoeléctricos muy heterogéneos (que se extienden de 4 a 12 para las formas no citrulinadas). Cada par de péptidos (forma nativa y citrulinada) se ha sometido a ensayo en la misma placa y un par de péptidos de control -péptido "filagrina" citrulinado cfc6 y su correspondiente nativo cf0 (Schellekens GA, 1998, citado anteriormente)- se ha incluido durante cada experimentación, lo que ha permitido calcular un coeficiente de variación interensayos y efectuar las correcciones.
Después de saturación en PBS-BSA al 2%, se han incubado las mezclas de sueros diluidos al 1/50 en PBS 2 NaCl - BSA al 2% y después se ha revelado su fijación con IgG de cabra anti-IgG humana marcada con peroxidasa (Southern) diluidas al 1/1.000 en PBS BSA al 2%. Todas las incubaciones han tenido lugar durante 1 h a 4ºC y han ido seguidas seguido de lavados en PBS-Tween al 0,1%. La actividad de la peroxidasa se ha revelado mediante una solución de ortofenilendiamina (2 mg/ml - Sigma) en peróxido de hidrógeno (0,03% - Sigma). La reacción se ha interrumpido después 5 minutos con ácido sulfúrico 4 M y se ha medido la densidad óptica (DO) a 492 nm gracias a un espectrofotómetro automático (Multiskan, Thermo Labsystems).
La reactividad específica de las mezclas de sueros con respecto a los péptidos citrulinados correspondía a la diferencia entre la DO obtenida con el péptido citrulinado y la obtenida con el péptido nativo correspondiente (delta DO). Los resultados corresponden a la media de 2 determinaciones. Todo péptido citrulinado que permite obtener una delta DO superior a 0,250 para al menos una de las dos mezclas A y B después de recubrimiento en al menos uno de los tres tampones, se ha considerado como reactivo.
Entre los 72 péptidos citrulinados analizados, 13 péptidos derivados de la secuencia de la cadena \alpha de la fibrina y 5 péptidos derivados de la de la cadena \beta se han revelado como portadores de epítopos reconocidos por los AAPC. Entre estos péptidos, 6 péptidos eran muy reactivos (delta DO \geq 1,5), 8 péptidos lo eran de manera media (0,5 \leq delta DO < 1,5) y 4 péptidos lo eran poco (0,25 \leq delta DO < 0,5). Los otros péptidos citrulinados han revelado ser poco o nada reactivos (0,0 \leq delta DO < 0,25). No se ha observado ninguna reactividad con la mezcla de control, lo que permite identificar los péptidos reactivos como portadores de epítopo(s) reconocido(s) por los AAPC.
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(Tabla pasa a página siguiente)
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Los resultados obtenidos para los 18 péptidos reactivos se presentan en la Tabla IV a continuación:
TABLA IV
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TABLA IV (continuación)
5
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Ejemplo 3
Perfil de reactividad de los péptidos citrulinados que reaccionan con los AAPC
Los 14 péptidos portadores de los epítopos más reactivos (delta DO \geq 0,5 para una u otra de las mezclas de suero (A y B) con al menos uno de los tres tampones de recubrimiento) se han sometido a ensayo independientemente con los 20 sueros constitutivos de las mezclas A y B, con el fin de evaluar el perfil de reactividad de cada uno de estos péptidos. Las pruebas se han efectuado en ELISA en las mismas condiciones que en el Ejemplo 2 anterior, salvo que, para cada par de péptidos, se ha elegido como tampón de recubrimiento el que haya permitido obtener la más alta reactividad frente a este péptido durante el cribado (el tampón en el que la suma de las delta DO obtenidas respectivamente para las mezclas A y B de sueros era máxima). Además, las diluciones de los sueros se han ajustado de tal manera que tengan una avidez equivalente para el fibrinógeno desiminado entero. Así, para cada suero, se ha elegido la dilución que permite obtener una DO de 1 en ELISA en el fibrinógeno desiminado (Nogueira L, 2002, citado anteriormente). Las diluciones se escalonaron del 1/20 al 1/2700.
Los resultados se ilustran en la Tabla V a continuación.
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(Tabla pasa a página siguiente)
6
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Ejemplo 4
Comparación de la reactividad del péptido \beta60-74Cit_{60,72,74} según que su función C-terminal sea un carboxilo (COOH) o una carboxamida (CONH_{2})
Se han recubierto placas ELISA con el péptido \beta60-74Cit_{60,72,74} cuya función C-terminal del resto citrulilo carboxi-terminal no está amidada (forma que lleva una función COOH terminal, en lo sucesivo designada como "forma no amidada"), con el péptido \beta60-74Cit_{60,72,74} cuya función C-terminal del resto citrulilo carboxi-terminal está amidada (forma que lleva una función CONH_{2} terminal, en lo sucesivo designada como "forma amidada") y el péptido no citrulinado \beta60-74 (cuya función C-terminal del resto arginilo carboxi-terminal no está amidada), todos diluidos en PBS. Las mezclas A y B de sueros descritos en el ejemplo 1 se han sometido a ensayo según el procedimiento descrito en el ejemplo 2. Como en el ejemplo 2, la reactividad específica del péptido en forma no amidada o en forma amidada correspondía a la diferencia entre la DO obtenida con estos dos péptidos citrulinados y la obtenida con el péptido no citrulinado \beta60-74. La reactividad de la forma amidada del péptido parece claramente más intensa que la de la forma no amidada que era, sin embargo, significativa. Los resultados corresponden a la media de dos experimentos, cada uno de los cuales comprende dos determinaciones. Los resultados se presentan en la Tabla VI a continuación.
TABLA VI
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Referencias citadas en la descripción
Esta lista de referencias citadas por el solicitante pretende únicamente ayudar al lector y no forma parte del documento de patente europeo. Aun cuando se ha puesto el mayor esmero en su elaboración, no pueden excluirse errores u omisiones y la EPO declina toda responsabilidad a este respecto.
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\bullet FR-0.411.782 [0062]
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<170> PatentIn versión 3.3
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<223> Péptido citrulinado
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13
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<223> Péptido citrulinado
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<221> misc_feature
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<222> (8) .. (8)
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<223> X = resto citrulilo
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<223> Péptido citrulinado
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<221> misc_feature
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<222> (7)..(7)
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<213> Secuencia artificial
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<223> Péptido citrulinado
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<222> (7) .. (7)
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Claims (10)

1. Péptido aislado reconocido por autoanticuerpos antiproteínas citrulinadas (AAPC) presentes en el suero de los pacientes afectados por poliartritis reumatoide (PR), caracterizado porque comprende al menos un resto citrulilo y porque se elige entre el grupo constituido por:
a)
un péptido definido por la secuencia X_{1}PAPPPISGGGYX_{2}AX_{3} (ID SEC Nº: 1) en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{2} o X_{3} es un resto citrulilo;
b)
un péptido definido por la secuencia GPX_{1}VVEX_{2}HQSACKDS (ID SEC Nº: 2) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
c)
un péptido definido por la secuencia SGIGTLDGFX_{1}HX_{2}HPD (ID SEC Nº: 3) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
d)
un péptido definido por la secuencia VDIDIKIX_{1}SCX_{2}GSCS (ID SEC Nº: 4) en la que X_{1} y X_{2} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1} o X_{2} es un resto citrulilo;
e)
un péptido definido por la secuencia X_{1}GHAKSX_{2}PVX_{3}GIHTS (ID SEC Nº: 12) en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} representan cada uno un resto citrulilo o un resto arginilo y al menos uno de los restos X_{1}, X_{2} o X_{3} es un resto citrulilo;
f)
un péptido que comprende al menos 5 aminoácidos consecutivos, incluyendo al menos un resto citrulilo, de uno de los péptidos a) a e) anteriores.
2. Péptido según la reivindicación 1,
caracterizado porque se elige entre el grupo constituido por:
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 1 en la que al menos X_{3} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 2 en la que al menos X_{2} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 3 en la que al menos X_{2} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 4 en la que al menos X_{1} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 12 en la que al menos X_{3} es un resto citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dicho resto citrulilo.
3. Péptido según la reivindicación 2,
caracterizado porque se elige entre el grupo constituido por:
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 1 en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} son restos citrulilo, o un péptido de al menos 16 aminoácidos que comprende dicha secuencia;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 2 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 3 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 4 en la que X_{1} y X_{2} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 5 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo;
-
un péptido definido por la secuencia ID SEC Nº: 12 en la que X_{1}, X_{2} y X_{3} son restos citrulilo, o un péptido que comprende un fragmento de al menos 10 aminoácidos consecutivos de dicha secuencia que contiene dichos restos citrulilo.
4. Péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, en el que la función carboxilo (COOH) terminal se sustituye por una función carboxamida (CONH_{2}).
5. Uso de un péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 para detectar la presencia de AAPC específicos de la PR en una muestra biológica.
6. Composición antigénica, caracterizada porque comprende al menos un péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
7. Composición antigénica según la reivindicación 6, caracterizada porque comprende un péptido de secuencia ID SEC Nº: 1 y un péptido de secuencia ID SEC Nº: 2 según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
8. Composición antigénica según una cualquiera de las reivindicaciones 6 ó 7, caracterizada porque comprende un péptido de secuencia ID SEC Nº: 3 y/o un péptido de secuencia ID SEC Nº: 4 y/o un péptido de secuencia ID SEC Nº: 12, según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
9. Procedimiento de detección de la presencia de AAPC en una muestra biológica, procedimiento que se caracteriza porque comprende:
-
la puesta en contacto de dicha muestra biológica con al menos un péptido según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 o una composición antigénica según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 8, en condiciones que permiten la formación de un complejo antígeno/anticuerpo con los AAPC eventualmente presentes en dicha muestra;
-
la detección, por todos los medios apropiados, del complejo antígeno/anticuerpo eventualmente formado.
10. Procedimiento de detección de la presencia de AAPC en una muestra biológica, procedimiento que se caracteriza porque comprende:
-
el suministro de un primer péptido citrulinado capaz de entrar en competencia para la unión a dichos AAPC con un péptido como el definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4;
-
la puesta en contacto de dicho primer péptido con dicha muestra biológica en condiciones que permiten la formación de un complejo antígeno/anticuerpo con los AAPC eventualmente presentes en dicha muestra;
-
la detección, por todos los medios apropiados, del complejo antígeno/anticuerpo eventualmente formado.
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