ES2308776T3 - Metodo para la regulacion in vivo de la contractibilidad del musculo cardiaco. - Google Patents

Metodo para la regulacion in vivo de la contractibilidad del musculo cardiaco. Download PDF

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Abstract

SE DESCRIBE UN METODO PARA LA REGULACION DEL TRANSPORTE IN VIVO DE CALCIO EN EL MUSCULO CARDIACO DE ANIMALES QUE SUFREN DE INSUFICIENCIA CARDIACA CONGESTIVA. DE CONFORMIDAD CON EL METODO, LA ACTIVIDAD DE LA ATPASA DE CALCIO (QUE DISMINUYE A MEDIDA QUE SE DESARROLLA LA INSUFICIENCIA CARDIACA CONGESTIVA) Y LA CONTRACTIBILIDAD DEL MUSCULO CARDIACO AUMENTAN MEDIANTE LA ADMINISTRACION DE UN GEN QUE CODIFICA OPERATIVAMENTE EL ENZIMA EN EL CORAZON. SE PROPORCIONAN LOS SISTEMAS DE ADMINISTRACION (INCLUYENDO VECTORES DE EXPRESION RECOMBINANTES), ASI COMO METODOS PARA CONTROLAR LA EXPRESION Y EL EFECTO DEL PRODUCTO GENICO EN EL RENDIMIENTO CARDIACO.

Description

Método para la regulación in vivo de la contractibilidad del músculo cardiaco.
Campo de la invención
La invención se refiere a métodos para regular la contractilidad del músculo cardiaco. Más específicamente, la invención se refiere a métodos para incrementar in vivo los niveles de calcio ^{2++} ATPasa (SERCA2) del retículo sarcoplásmico (RS) mediante el transporte in vivo de un gen que codifica operativamente la proteína SERCA2.
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Estado de la técnica
La insuficiencia cardiaca congestiva es una de las principales causas de muerte entre los adultos de Estados Unidos. Si se compara con la isquemia cardiaca (un evento agudo resultante de la obstrucción o pérdida del aporte sanguíneo al corazón), la insuficiencia cardiaca congestiva es un evento relativamente insidioso asociado con la pérdida gradual de la contractilidad del músculo cardiaco y la adaptabilidad del corazón al estrés. En última instancia, ante la ausencia de un tratamiento efectivo, el corazón con ICC pierde su habilidad de bombear sangre a una tasa suficiente para satisfacer los requerimientos metabólicos del cuerpo.
Aunque las anormalidades en la función cardiaca que acompañan a la insuficiencia cardiaca congestiva (ICC) varían, la liberación disminuida de iones calcio ^{2++} desde el RS, requerida para la activación de las proteínas contráctiles, es una característica común del síndrome de la ICC. La importancia de esta pérdida puede comprenderse mejor en el contexto del papel que juega el transportador de calcio en el funcionamiento normal del corazón.
Brevemente, el RS es una estructura membranosa que rodea cada miofibrilla de músculo cardiaco. SERCA2 está contenida dentro de las membranas del RS y sirve para el transporte activo del 70 al 80% de los iones de calcio libres al interior del espacio intracelular del RS durante la relajación diastólica del músculo cardiaco. Muchos de los iones de calcio restantes disponibles para el transporte se sacan del citoplasma mediante un sistema de transporte de intercambio de sodio/calcio del RS así como, en menor medida, el transporte conducido por la hidrólisis del ATP CATALIZADA por la ión calcio ATPasa del sarcolema y a través de la absorción mitocondrial de calcio (Bassani, et al., J.Physiol. 453:591-608, 1992 y Carafoli, E., Ann.Rev.Biochem., 56:395-433, 1987).
Dado que tanto la actividad hidrolítica del ATP de SERCA2 como los niveles absolutos de ARNm de SERCA2 disminuyen en la ICC (Hasenfuss, et al., Circ.Res., 75:434-442, 1994 y Studer, et al., Circ.Res., 75:443-453, 1994), se ha postulado ampliamente que la alteración de la habilidad del corazón con ICC para recibir sangre a baja presión está directamente relacionada con retrasos en el transporte mediado por SERCA2 de iones calcio activadores de la contracción en el interior del RS, lo que da lugar a un enlentecimiento de la relajación diastólica del corazón (ver, p. ej., Grossman, W., N.Engl.J.Med., 325:1557-1564, 1991; Lorell, BH., Ann.Rev.Med., 42:411-436, 1991; y, Arai, et al., Circ.Res., 74:555-564, 1994). Estas observaciones, particularmente con respecto a la reducción de los niveles de ARNm que codifica para SERCA2, han sido confirmadas en humanos, así como en otras especies de mamíferos (ver, revisión sobre los niveles de ARNm de SERCA2 en humanos, Arai, et al., ver más arriba y Mercadier, et al., J.Clin.Invest., 85:305-309, 1990; también, revisión sobre la disminución de los niveles de ARNm de SERCA2 en tejido cardiaco hipertrófico en otras especies de mamíferos, ver, p. ej., Wang, et al., Am.J.Physiol., 267:H918-H924, 1994 [hurones]; Afzal and Dhella, Am.J.Physiol., 262:H868-H874, 1992 [roedores]; y, Feldman, et al., Circ.Res., 73:184-192, 1993 [roedores]).
La referencia Giordano et al. (1995) se refiere a la sobreexpresión in vitro de SERCA2 seguida de la transfección de miocitos cardiacos en cultivo con un vector que codifica SERCA2. No se ha divulgado ningún resultado respecto a la respuesta funcional por la sobreexpresión de SERCA2, excepto los obtenidos a través de la invención.
A pesar del interés en los últimos años sobre el papel del transporte de calcio en la ICC, las bases moleculares de la alteración de la actividad del transporte de calcio mediante SERCA2 se comprenden mal y no han sido todavía explotadas en un régimen para el tratamiento de la ICC. En cambio, las actuales modalidades terapéuticas para el síndrome de la ICC son altamente inespecíficas en el sentido de que no se dirigen directamente hacia los eventos bioquímicos y moleculares que se cree que acompañan, si no causan, las anormalidades en la función que conducen al fallo del corazón con ICC. Por ejemplo, el tratamiento farmacéutico de la ICC mediante la administración de fármacos análogos a la adrenalina, estimulan la contracción del músculo cardiaco, pero no corrigen el estado subyacente que causa la reducción en la contractilidad del músculo.
Además, la sustitución y/o incremento de los niveles in vivo de proteínas cardiacas es una alternativa interesante para el tratamiento y control de la progresión de la ICC en humanos. Sin embargo, lograr este objetivo mediante la introducción de proteínas o péptidos cardiacos dentro del tejido cardiaco es poco probable que tenga éxito. La cuestión principal es el riesgo de toxicidades potenciales, especialmente a dosis suficientes para producir una respuesta biológica a la proteína. Desde un punto de vista práctico, existe también el problema del coste asociado con el aislamiento y la purificación o síntesis de las proteínas. Además, el impacto clínico de las proteínas podría estar limitado por su relativamente corta vida media in vivo debido a la degradación por alguna proteasa presente el en tejido diana.
Por estos motivos, la introducción de una proteína dentro de un paciente mediante el transporte de un gen que expresará la proteína es una alternativa interesante para administrar la proteína en sí. Con este fin, se ha desarrollado una variedad de estrategias para la introducción de genes exógenos en células diana. La mayoría de los protocolos de terapias génicas propuestos hasta la fecha para usarse en humanos se han centrado en la transferencia génica ex vivo; p. ej., mediante la transfección retroviral de células para la implantación dentro del tejido diana (ver, p. ej., Anderson, WF, Science, 256:808-813, 1992 y Miller, AD, Nature, 357:455-460, 1992 [tratamiento de la deficiencia de adenosina deaminasa]). Sin embargo, se ha probado que la utilidad de tales protocolos es limitada por su relativa ineficiencia en la expresión proteica así como la accesibilidad limitada de los órganos y tejidos diana.
Los métodos de transporte de genes in vivo son, por lo tanto, un tema de gran interés en el estado de la técnica. Con este fin, se han desarrollado varios sistemas para alcanzar este objetivo, incluyendo la introducción de polinucleótidos "desnudos" (plásmidos), plásmidos unidos a virus, plásmidos que cointeriorizan con virus, así como la encapsulación y transporte de construcciones de genes dentro de liposomas.
Por ejemplo, un trabajo en el NIH publicado en 1984 que mostraba la inyección intrahepática de ADN desnudo de hepatitis de la ardilla clonado en un plásmido en ardillas producía tanto infección viral como formación de anticuerpos antivirales en las ardillas (Seeger, et al., Proc.Natl.Acad.Sci USA, 81:5849-5852, 1984). Varios años más tarde, Felgner, et al., publicaron que obtuvieron expresión de la proteína desde polinucleótidos "desnudos" (es decir, ADN o ARN no asociado con liposomas o un vector de expresión viral) inyectados dentro del tejido muscular óseo (Felgner, et al., Science, 247:1465, 1990; ver también, PCT application WO 90/11092). Felgner, et al., supusieron que las células musculares aceptarían y expresarían polinucleótidos eficientemente por la estructura única del tejido muscular, que está compuesto por células multinucleadas, retículo sarcoplásmico y un sistema tubular transversal que se extiende profundamente dentro de las células musculares.
Se han publicado otros sistemas similares para el transporte de genes directamente al interior del tejido diana por Stribling, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:11277-11281, 1992 (expresión proteica detectada tras el transporte por aerosol de un gen encapsulado en un liposoma); y, Tang, et al., Nature, 356:152-154, 1992 (inyección con una "pistola" de genes de un plásmido con el gen de la hGH unido a microesferas de oro en el interior de la piel de un ratón, dando lugar a la expresión de la proteína hGH sin provocar una respuesta inmune al gen inyectado). Aunque generalmente es efectiva para la producción de altos niveles de expresión proteica dentro de las células musculares, la inyección directa del ADN o ARN en el interior del tejido muscular para tratamientos a largo plazo requiere el uso de inyecciones repetidas para compensar la pérdida de expresión por la degradación de los genes. Este enfoque podría no sólo llevar mucho tiempo y ser caro, sino que también podría ser poco práctico para el tratamiento a largo plazo debido a la inflamación causada en el lugar de la inyección y cerca del mismo. Por consiguiente, aunque práctica a corto plazo o en tratamientos de emergencia, los medios menos invasivos para la introducción de genes expresables dentro de tejidos diana se preferirán generalmente a la inyección directa en el interior del tejido diana.
Además, la mayoría de los métodos para el transporte de genes in vivo libre de un vector de expresión recombinante, sufren de transfección ineficiente de la célula diana y de una expresión proteica relativamente baja. Por lo tanto, los vectores de expresión recombinantes (especialmente, los vectores no replicables) actualmente siguen siendo el vehículo preferido para el transporte de genes in vivo.
Los miocitos cardiacos se han mostrado como dianas apropiadas para el transporte de genes in vivo. Por ejemplo, una propuesta reciente para el tratamiento de la ICC podría ser remplazar y/o mejorar el número de receptores \beta_{2}-adrenérgicos activos en los miocitos del corazón con ICC. Estudios en ratón indican que el uso de técnicas de trasplante directas para introducir genes que codifican esos receptores conduce a un aumento in vivo de la contractilidad del músculo cardiaco incluso en ausencia de una fuente de adrenalina exógena (Lefkowitz, et al., Science, 264:582-586, 1994). Se ha demostrado que los vectores de adenovirus en particular, son vehículos exitosos para el transporte de genes a los miocitos cardiacos (ver, p. ej., Guzman, et al., Circ.Res., 73:1202-1207, 1993 y Muhlhauser, et al., Circulation, 88 (Part 2):1-475, 1993).
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Resumen de la invención
Los detalles de la realización preferida de la presente invención son los que se disponen en los dibujos adjuntos y en la descripción de más abajo. Una vez se conozcan los detalles de la invención, numerosas innovaciones adicionales y cambios se volverán obvios para un experto medio en el estado de la técnica.
La invención es un método para aumentar el transporte de calcio al interior del RS del músculo cardiaco mediante el incremento in vivo de la expresión de SERCA2 catalíticamente activa mediante la introducción de un polinucleótido que codifica operativamente SERCA2 dentro de ese tejido. La invención se especifica en las reivindicaciones adjuntas. En la realización preferida por su eficacia en la transfección de las células diana, el polinucleótido que codifica SERCA2 es transportado al interior del tejido cardiaco mediante un vector de expresión recombinante viral y no replicable, preferiblemente, una construcción de adenovirus. Como alternativa, el gen que codifica SERCA2 puede proporcionarse mediante la encapsulación en liposomas o mediante la administración de nucleótidos "desnudos". El transporte del gen de SERCA2 puede hacerse quirúrgicamente (p. ej., por la introducción directa del vector o de las células transfectadas en el interior del tejido diana) o mediante infusión intracoronaria.
La mejora del transporte de iones de calcio al RS proporcionada por el aumento de la actividad de SERCA2 en el RS regulará la activación de las contracciones miofibrilares en el corazón. De este modo, una ventaja particular del método de la invención es la ayuda que le proporcionará al corazón en el ajuste de las anomalías asociadas a la ICC, especialmente por el acortamiento de la fase temprana de la relajación diastólica del músculo cardiaco.
Un uso para el método de la invención es para la mejora a corto plazo de la ICC en pacientes que están esperando un tratamiento intervencionista (p. ej. trasplante) y/o los que están ya sometidos a un tratamiento para la ICC. Se espera también que el uso del método de la invención beneficie a pacientes con riesgo de, y que han comenzado a padecer, anomalías en la función cardiaca asociadas a la ICC.
Las especificaciones también describen que podrían generarse animales transgénicos para utilizarlos en el desarrollo de vectores que se emplearan y evaluaran su aplicación en los métodos aquí descritos. Se describen también métodos para controlar la eficacia de los métodos a emplear para el tratamiento de la ICC.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 es una mapa de un plásmido codificante para SERCA2 bajo el control de un operador de tetraciclina.
La Figura 2 es un mapa de un vector de expresión recombinante derivado de adenovirus que codifica para SERCA2.
La Figura 3 es un mapa de plásmido codificante para SERCA2 bajo el control de un enhancer (elemento potenciador) del CMV humano/ promotor de \beta-actina de pollo.
La Figura 4 es un Southern blot que muestra la presencia de ADN transgénico de SERCA2 de rata en muestras de tejido de ratón. Los Carriles 1-3 representan diferentes líneas de ratón transgénico fundador; el Carril 4 representa un ratón de control transgénico negativo; y el Carril 5 representa 1 ng de plásmido cortado con Ap1.
La Figura 5 es un Northern blot que muestra la presencia de ARNm transgénico de SERCA2 en miocitos cardiacos provenientes de ratón. Los Carriles 1-2 representan el ratón de control transgénico negativo; y los Carriles 3-4 representan un ratón transgénico positivo.
La Figura 6 es un Western blot que muestra la expresión del transgen de SERCA2 en ratón. Los Carriles 1-2 representan la expresión de \alpha-actina sarcomérica; el Carril 3 es un marcador de peso molecular; y los Carriles 4-6 representan la expresión de SERCA2.
La Figura 7 es un Northern blot que muestra la presencia de ARNm de SERCA2 de rata en miocitos cardiacos provenientes de ratón transfectado con uno de varios adenovirus que codifican para SERCA2; es decir, vectores bajo el control de un promotor de CMV (HH-1; hh-2 y SAI-3) o el promotor de TK (TK). Una construcción control no contenía polinucleótidos de SERCA2 (ctrl). Los números entre paréntesis indican el número de unidades formadoras de colonias (ufc) de cada construcción y se determinaron mediante la infección de células L6 con construcciones de adenovirus durante 48 horas, se extrajo y se determinó el ARN celular total en geles, después se hibridó un ADNc de SERCA2 al ARN en el análisis Northern.
La Figura 8 representa la detección de los flujos de calcio en miocitos neonatales transfectados con el vector de adenovirus de la Figura 2 (se representan los valores medios con la Célula #27) y en miocitos neonatales no transfectados (se representan los valores medios con la Célula #42). Los flujos de calcio se midieron fluorométricamente y se expresaron en función del tiempo (eje de las x).
Descripción detallada de la invención
A lo largo de esta descripción, la realización preferida y los ejemplos mostrados deben considerarse como ejemplos, más que como limitaciones de la presente invención.
A. Definiciones
Se proporcionan las siguientes definiciones para simplificar la discusión de la invención. Los expertos medios en el estado de la técnica reconocerán, sin embargo, que estas definiciones podrían ampliarse para incluir equivalentes sin desviarse del ámbito u origen legítimo de la invención. Por esta razón, estas definiciones no deben ser interpretadas como limitantes de la invención.
1.
"Polinucleótido de SERCA2" se refiere a ADN o ARN y puede incluir cadenas codificantes y antisentido, según sea apropiado para los objetivos del tratamiento aplicado de acuerdo a la invención. Como se usa aquí, "polinucleótido" se refiere a un polímero de desoxirribonucleótidos o ribonucleótidos, en forma de un fragmento separado o como un componente de una construcción mayor. Una secuencia de polinucleótidos puede deducirse a partir del código genético, no obstante, se debe tener en cuenta la degeneración del código. Los polinucleótidos de la invención incluyen secuencias que están degeneradas como resultado del código genético, estas secuencias podrían determinarse fácilmente por un experto medio en la materia.
2.
"Codificación operativa" se refiere a un polinucleótido que ha sido modificado para incluir un promotor y otras secuencias necesarias para la expresión y, donde se desee, la secreción del producto de traducción deseado; p. ej., un péptido o proteína. Todos los aspectos de la invención pueden llevarse a cabo empleando vectores de expresión recombinantes conocidos. Preferiblemente, estos vectores incluirán ADNc que codifique los productos de traducción deseados. Por lo tanto, a no ser que el contexto lo requiera de otra manera, se asumirá que "polinucleótido" se refiere a secuencias que codifican operativamente que están contenidas en un vector de expresión recombinante adecuado, del cual se proporcionan aquí ejemplos.
3.
"Síntesis" se refiere al significado bien conocido de sintetizar secuencias de polinucleótidos y polipéptidos y puede incluir aislamiento y purificación de polinucleótidos y proteínas nativas.
4.
"Péptido" se refiere a pequeños péptidos, polipéptidos, oligopéptidos y proteínas que tienen un efecto biológico deseado in vivo.
5.
"Transporte" se refiere a medios conocidos de introducir polinucleótidos que codifican operativamente en un hospedador. Los expertos medios en la materia estarán familiarizados con, o podrán identificar fácilmente, estos medios de transporte; sin embargo, en cuanto a los medios de transporte particularmente útiles, podrían referirse como "Nuevos Sistemas de Transporte de Fármacos" (Marcel Dekker, 1992).
6.
"Hospedador" se refiere al receptor del tratamiento que se va a administrar de acuerdo con la invención. El hospedador puede ser cualquier vertebrado, aunque será preferiblemente un mamífero. Si es un mamífero, el hospedador será preferiblemente un humano, pero podría ser también ganado o un animal de compañía.
7.
"Tejido diana" se refiere al tejido del hospedador en el que se busca la expresión del polinucleótido que codifica operativamente.
8.
"Anticuerpo" se refiere a toda inmunoglobulina de cualquier clase, anticuerpos quiméricos, anticuerpos híbridos con doble o múltiple especificidad antigénica y fragmentos incluyendo fragmentos híbridos. También están incluidos dentro del significado de "anticuerpo" los conjugados de dichos fragmentos, y las llamadas proteínas de unión a antígenos (anticuerpos de cadena simple), como se describe, por ejemplo, en la patente estadounidense No. 4,704,692, y anticuerpos anti-idiopáticos (anticuerpos que se unen a otros anticuerpos) como se describe, por ejemplo, en la patente estadounidense No. 4,699,880.
9.
"Vector de expresión recombinante" se refiere a sistemas de polinucleótido(s) que codifican operativamente polipéptidos que se expresan en eucariotas o procariotas. Los métodos de expresión de secuencias de ADN que contengan secuencias eucariotas o virales en procariotas se conocen bien en el estado de la técnica. Como hospedadores pueden incluirse microorganismos, levaduras, insectos y mamíferos.
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B. Construcciones de polinucleótidos para utilizar en el método de la invención
La secuencia de nucleótidos para el ARNm de rata que codifica para SERCA2 se describe en Rohrer, et al., J.Biol.Chem., 263:6941-6944, 1988 (ARNm de rata que codifica para SERCA2) citando MacLennan, DH, Nature, ver más abajo (ADNc). El clon se obtiene mediante técnicas convencionales de hibridación como las descritas en Rohrer, et al., J.Biol.Chem., 266:8638-8646, 1991, que también expone los codones de iniciación y de terminaciónpara la transcripción del clon (ver Ejemplo 1).
La secuencia de nucleótidos de la isoforma de SERCA2 de la calcio ATPasa (es decir, la isoforma "lenta" del músculo esquelético si se compara con la isoforma "rápida" del músculo estriado) se conserva más del 90% entre las especies de mamíferos. Por lo tanto, SERCA2 ha sido bastante fácilmente identificada y secuenciada a partir de tejido muscular esquelético en especies de mamíferos no roedores, incluyendo humanos (GENBANK #J4025; ver también, GENBANK M23114-23116, M23277-23279, y Lytton and MacLennan, J. Biol. Chem., 263:15024-15031, 1998); así como en ratas y conejos (MacLennan, DH, Nature, 316:697-700, 1985, y GENBANK M33834, ver también, Lompre, et al., FEBS Lett., 249:35-41, 1989, y GENBANK X15635). Aunque un experto medio en la materia reconocerá que el uso del polinucleótido de SERCA2 humano sería mucho más preferible en tratamientos en humanos, el polinucleótido de SERCA2 de rata era más fácil de utilizar y se prefirió para los propósitos de los experimentos descritos en los ejemplos.
Se apreciará también por un experto medio en la materia que el método, el cual se describe aquí específicamente en relación con SERCA2, podría ser adaptado ventajosamente para utilizarse para el transporte de otras proteínas cardiacas cuya expresión y actividad estén dañadas en el corazón con ICC. En concreto, el gen que codifica el intercambiador de calcio/sodio en mamíferos es un candidato particularmente atractivo para el transporte al corazón, de la misma manera que se describe aquí para el transporte del polinucleótido de SERCA2.
Para obtener y utilizar las secuencias de SERCA2 que se incluyen en esta divulgación y aquellas conocidas en el estado de la técnica, el ADN y el ARN podrían sintetizarse también empleando un equipo de síntesis automática de ácidos nucleicos, bien conocido en el estado de la técnica. El uso de la conocida reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se prefiere particularmente para generar mezclas de polinucleótidos. Los ácidos nucleicos genómicos podrían prepararse por medios conocidos en el estado de la técnica como los protocolos descritos en Ausubel, et al., Current Protocols in Molecular Biology, Cap. 2 y 4 (Wiley Interscience, 1989). El ADNc puede sintetizarse según los medios conocidos en el estado de la técnica (ver, p. ej. Maniatis, et al., Molecular Cloning; A Laboratory Manual. (Cold Spring Harbor Lab, New York, 1982). Una librería de ADNc que contenga polinucleótidos de interés puede también cribarse por medios conocidos en el estado de la técnica.
Por ejemplo, estos medios incluyen, pero no se limitan a: 1) hibridación de sondas en las librerías genómicas o de ADNc para detectar secuencias de nucleótidos compartidas; 2) cribado de anticuerpos en librerías de expresión para detectar características estructurales compartidas y 3) síntesis mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El desarrollo de secuencias específicas de ADN codificante o fragmentos de las mismas, puede obtenerse mediante: 1) aislamiento de secuencias de ADN de doble cadena a partir del ADN genómico; 2) elaboración química de una secuencia de ADN que proporcione los codones necesarios para el polipéptido de interés; y 3) síntesis in vitro de una secuencia de ADN de doble cadena mediante transcripción inversa de un ARNm aislado de una célula donante eucariota. En este último caso, se forma finalmente una doble cadena de ADN complementaria a un ARNm lo que se denomina generalmente como ADNc.
Los procedimientos de hibridación son útiles para el cribado de clones recombinantes mediante el uso de una mezcla de sondas de oligonucleótidos marcadas donde cada sonda es potencialmente el complemento completo de una secuencia específica de ADN en la muestra de hibridación la cual incluye una mezcla heterogénea de dobles cadenas de ADN desnaturalizadas. Para este cribado, es preferible llevar a cabo la hibridación sobre cada cadena simple de ADN o sobre la cadena doble de ADN desnaturalizada. La hibridación es especialmente útil en la detección de clones de ADNc derivados de fuentes donde está presente una cantidad extremadamente baja de secuencias de ARNm relacionadas con el polipéptido de interés. En otras palabras, mediante el uso de condiciones restringidas de hibridación dirigidas a evitar uniones no específicas es posible, por ejemplo, permitir la visualización autorradiográfica de un clon específico de ADNc mediante la hibridación del ADN diana a esa única sonda en la mezcla.
Una librería de ADNc que se cree que contiene un polinucleótido de interés puede cribarse mediante la inyección de varios ARNm derivados de ADNc en el interior de oocitos, permitiendo que pase el tiempo suficiente para que ocurra la expresión de los productos del gen de ADNc, y evaluando la presencia del producto de expresión del ADNc deseado, por ejemplo, mediante el uso de anticuerpos específicos para un péptido codificado por el polinucleótido de interés o mediante el uso de sondas para los motivos repetidos y un patrón de expresión de tejido característico de un péptido codificado por el polinucleótido de interés. Como alternativa, una librería de ADNc puede cribarse indirectamente mediante la expresión de péptidos terapéuticos y/o inmunogénicos que tengan al menos un epítopo utilizando anticuerpos específicos contra los péptidos. Tales anticuerpos pueden ser tanto policlonales como monoclonales y son empleados para detectar los productos de expresión indicativos de la presencia del ADNc de interés.
Los procedimientos de cribado que dependen de la hibridación de ácidos nucleicos hacen posible el aislar cualquier secuencia génica de cualquier organismo, siempre que se disponga de la sonda adecuada. Las sondas de oligonucleótidos, que se corresponden con una parte de la secuencia que codifica la proteína en cuestión, pueden sintetizarse químicamente. Esto requiere que se conozca la secuencia de aminoácidos de tramos cortos de oligopéptidos. La secuencia de ADN que codifica la proteína puede deducirse del código genético, sin embargo, debe tenerse en cuenta la degeneración del código. Es posible llevar a cabo una reacción de adición con una mezcla cuando la secuencia está degenerada. Esto incluye una mezcla heterogénea de ADN de doble cadena desnaturalizado. Para tal cribado, la hibridación se realiza preferentemente sobre cada cadena simple de ADN o sobre el ADN de doble cadena desnaturalizado.
El polinucleótido de SERCA2 que se usa en la invención puede ser ADN o ARN, pero será preferiblemente una secuencia de ADN complementario (ADNc). Las secuencias del polinucleótido que se usan en la invención deben ser (a) expresables y (b) o bien no replicables o bien manipuladas por medios conocidos en el estado de la técnica para que no se repliquen dentro del genoma del hospedador. Preferiblemente, un polinucleótido que codifica operativamente para la proteína SERCA2 se empleará en la invención como parte de un vector de expresión recombinante, más preferentemente en una construcción de adenovirus.
Las ilustraciones de la preparación de polinucleótidos adecuados para usar en la siguiente invención y los ejemplos específicos mostrando como se realizan composiciones específicas de polinucleótidos se proporcionan más abajo. Será, no obstante, evidente para un experto medio en la materia que otros medios conocidos para preparar polinucleótidos no replicables pueden ser adecuados.
Los polinucleótidos incluyen derivados funcionales de polinucleótidos conocidos que codifican operativamente para la proteína SERCA2. Por "derivado funcional" se entiende un polinucleótido que codificará "fragmentos", "variantes", "análogos", o "derivados químicos" de SERCA2. Un "fragmento" de una molécula incluye cualquier péptido contenido en la molécula. Una "variante" de esa molécula se refiere una molécula que se produzca de forma natural substancialmente similar o bien a la molécula completa o bien a un fragmento de la misma. Un "análogo" de una molécula se refiere a una molécula no natural substancialmente similar o bien a la molécula completa o bien a un fragmento de la misma.
Como se emplea aquí, se dice que una molécula es un "derivado químico" de otra molécula cuando ésta contiene residuos químicos adicionales que no forman parte normalmente de la molécula. Tales residuos pueden mejorar la solubilidad, la absorción, la vida media biológica de la molécula, etc. Los residuos que se conocen en el estado de la técnica por ser capaces de mediar estos efectos se detallan, por ejemplo, en Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th Ed., Mack Publishing Co., Easton, Penn. (1980).
Los polinucleótidos de SERCA2 pueden conjugarse para usarse en asociación con otros polinucleótidos que codifiquen operativamente para proteínas reguladoras que controlen la expresión de estos polipéptidos o pueden contener secuencias de reconocimiento, promotoras o de secreción. Los expertos medios en el estado de la técnica serán capaces de seleccionar polinucleótidos reguladores e incorporarlos dentro de los polinucleótidos de SERCA2 de la invención sin demasiada experimentación. Por ejemplo, promotores adecuados para emplearse en sistemas roedores o humanos y su utilización se describen en Current Protocols in Molecular Biology, ver más arriba en Cap. 1.
Una forma preferida especialmente de un polinucleótido de SERCA2 para usarse en la invención será aquella que se haya incorporado dentro de un vector de expresión recombinante. El uso de un vector de expresión recombinante prolongará la expresión del gen en el tejido diana.
Vectores de expresión recombinantes que sean adecuados se conocen bien en el estado de la técnica e incluyen los vectores descritos en Current Protocols in Molecular Biology, ver más arriba en Cap. 1. Dos vectores con promotor derivados de plásmidos preferidos especialmente son los vectores con el promotor pRSV (virus del sarcoma de Rous) y pCMV (citomegalovirus), especialmente el último. Esta preferencia se basa en la observación de que los mayores niveles de expresión se alcanzan en este contexto cuando se emplea el promotor de CMV.
Un protocolo adecuado para el aislamiento del promotor de RSV y su empleo en la construcción de un vector derivado de plásmido se describen en Gorman, et al., Proc. Natl. Acad. Sci, USA, 79:6777, (1982). Otros vectores preferidos derivados de plásmidos son pREP7 y pREV que están comercialmente disponibles en Invitrogen de San diego, California. Para la clonación de polinucleótidos, un plásmido especialmente adecuado para la producción de ARNm es el vector de clonación pSP64T descrito por Kreig, et al., Nucleic Acids Res., 12:7057-7070, (1984). Cualquier ADNc que contenga un codón de iniciación puede introducirse dentro de este plásmido y preparar ARNm a partir de los moldes de ADN expresado utilizando técnicas convencionales.
Los vectores particularmente útiles para la administración de cualquier polinucleótido de SERCA2 según la invención, son aquellos que contienen un promotor que puede ser "encendido" o "apagado" después de que el vector haya sido administrado al paciente.
Ejemplos especialmente eficaces de estos promotores son los promotores inducibles por antibióticos y los activados por receptores nucleares inducibles por ligando. Con respecto a los últimos, los receptores nucleares representan una familia de factores activadores de la transcripción que actúan uniéndose a secuencias específicas de ADN localizadas en los promotores diana conocidas como elementos respondedores. Miembros específicos de la familia de receptores nucleares incluyen las principales dianas intracelulares para pequeños ligandos lípido-solubles, como la vitamina D, y retinoides, así como hormonas esteroideas y tiroideas ("ligandos activadores"). Se han identificado los elementos respondedores específicos de las proteínas reguladoras del transporte de calcio, incluyendo los elementos respondedores a la hormona tiroidea (TREs), CAM quinasa y otros, que están también presentes en la región reguladora de SERCA2. Estos elementos respondedores específicos pueden usarse para controlar la transcripción de SERCA2 in vivo como se describe debajo. En concreto, la expresión del gen SERCA2 es especialmente sensible a la hormona tiroidea (Rohrer, et al., J. Biol. Chem., 266:8638-8646, 1991).
Los receptores nucleares activados por ligandos activadores específicos son muy apropiados para utilizarse como promotores en vectores de expresión en eucariotas ya que la expresión de los genes puede regularse simplemente mediante el control de la concentración de ligando disponible para el receptor. Por ejemplo, los promotores inducibles por glucocorticoides como los de la repetición terminal larga del virus del tumor mamario de ratón se han utilizado ampliamente en este aspecto porque los elementos respondedores a glucocorticoides se expresan en una amplia variedad de tipos celulares. Un sistema de expresión que aprovecha los elementos respondedores a glucocorticoides sensible a una amplia variedad de hormonas esteroideas (p. ej., dexametasona y progesterona) es un plásmido pGREtk (contiene uno o más elementos respondedores a glucocorticoides estimulantes de la tirosina amino transferasa de rata situados antes del promotor timidina quinasa del virus herpes simple en pBLCAT8+), transfectado en células HeLa (ver, Mader and White, Proc.Natl.Acad.Sci USA, 90:5603-5607, 1993 [pGRE2tk]; y, Klein-Hitpass, et al., Cell, 46:1053-1061, 1986 [pBLCAT8+]).
Otro promotor derivado de elementos respondedores a receptores nucleares (ERRN) especialmente adecuado para su uso en la invención es uno que es inducible por un compuesto de vitamina D_{3}, 1,25-dihidroxivitamina D_{3} y análogos no hipercalcémicos de la misma (colectivamente, "ligandos activadores de vitamina D_{3}"). Los promotores ERRN inducibles por los ligandos activadores de vitamina D_{3} contienen el receptor de la vitamina D_{3} (RVD) y elementos respondedores PurG(G/T)TCA que reconocen repeticiones directas separadas por tres pares de bases. Los elementos respondedores a la vitamina D_{3} se encuentran situados antes de los genes de osteocalcina humana y osteopontina de ratón; la transcripción de estos genes se activa con la unión del RVD (ver, p. ej., Morrison and Eximan, J.Bone Miner.Res., 6:893-899, 1991; y, Ferrara, et al., J.Biol.Chem., 269:2971-2981, 1994). Resultados experimentales recientes de la evaluación de un vector de expresión recombinante que contiene el RVD activador del gen de la osteopontina de ratón situado antes de un promotor de timidina quinasa (tk) de virus herpes simple truncado, sugieren que el ácido 9-cis-retinóico puede aumentar la respuesta del RVD a 1,25-hidroxivitamina D_{3} (ver, Carlberg, et al., Nature, 361:657-660, 1993).
Ferrara, et al. también describen promotores inducibles por vitamina D_{3} en vectores de expresión recombinantes utilizando múltiples copias de un RVD fuerte; en concreto, el RVD activador del gen de la osteopontina de ratón (compuesto por repeticiones directas de motivos de PurGTTCA separados por 3 pares de bases). Este RVD se ajusta a los motivos de consenso de PurGG/TTCA de los que se ha comprobado previamente que responden no sólo a la vitamina D_{3} sino también a la hormona tiroidea y/o al ácido retinóico. Se han insertado 3 copias del RVD de ratón dentro de pBLCAT8+; inmediatamente antes del promotor tk del virus herpes simple. La transfección del vector resultante VDREtk dentro de las células COS (produciendo un "sistema de expresión RVD") se ha comprobado que es particularmente útil en aquellas células COS que contienen el receptor nuclear de retinoide X (RXR) que se ha demostrado que actúa como un factor auxiliar para la unión de RDV a su elemento respondedor. Convenientemente, la 1,25-hidroxivitamina D3 y los análogos no hipercalcémicos de la misma se han aprobado para utilizarse en preparaciones tópicas por la United States Food and Drug Administration para el tratamiento de la soriasis y están disponibles comercialmente.
Las evaluaciones in vivo de los promotores ERRN indican que son inducibles en exposición sistémica a sus correspondientes elementos respondedores (ver, Tsou, et al., Exp.Cell.Res., 214:27-34, 1994). De este modo, el uso de un vector de expresión recombinante con un promotor ERRN para la administración y expresión de polinucleótidos de SERCA2 de acuerdo con la invención permite controlar la expresión, por ejemplo, activando la expresión cuando se necesite una dosis o inactivando la expresión en el caso de que ocurra una reacción adversa a la proteína o péptido expresados.
Otro "interruptor de encendido/apagado" bien caracterizado para su uso en vectores de expresión recombinantes es el sistema promotor regulado por antibióticos (tetraciclina). Los medios para la construcción de este sistema se conocen bien en el estado de la técnica; para revisar este aspecto, los expertos medios en el estado de la técnica que lo deseen pueden consultar Furth, et al., Proc.Natl.Acad.Sci. USA, 91:9302-9306, 1994 (control regulado por tetraciclina de la expresión génica en ratón transgénico); Fishman, et al., J.Clin.Invest., 93:1864-1868, 1993 (control con tetraciclina de la expresión génica cardiaca); y, Niwa, et al., Gene, 108:193-200, 1991 (uso del sistema promotor para transfectantes con una alta expresión). Un plásmido que codifica para SERCA2 bajo el control de un sistema promotor de tetraciclina se describe en el Ejemplo 4 y se muestra en la Figura 1.
Los diferentes vectores virales que pueden utilizarse en la invención incluyen adenovirus, virus herpes, vaccinia, o un virus ARN como un retrovirus. Los ejemplos de vectores retrovirales en los que puede insertarse un gen externo incluyen, pero no se limitan a: virus de la leucemia murina de Moloney (MoMuLV), virus del sarcoma murino de Harvey (HaMuSV), virus del tumor mamario de ratón (MuMTV), y virus del sarcoma de Rous (RSV). Varios vectores retrovirales adicionales pueden incluir múltiples genes. Todos estos vectores pueden transferir o incluir un gen para un marcador seleccionable de manera que las células transducidas puedan ser identificadas y generadas.
Ya que los retrovirus recombinantes son defectivos, requieren ayuda para producir partículas de vector infecciosas. Esta ayuda puede proporcionarse, por ejemplo, mediante el uso de líneas celulares auxiliares que contienen plásmidos que codifican para todos los genes estructurales del retrovirus bajo el control de secuencias reguladoras dentro de LTR. Estos plásmidos han perdido una secuencia de nucleótidos que permite el mecanismo de empaquetamiento para reconocer un transcrito de ARN para la encapsulación. Las líneas celulares auxiliares que tienen deleciones de la señal de empaquetamiento incluyen, pero no se limitan a: \Psi2, PA317 y PA12, por ejemplo. Estas líneas celulares producen viriones vacíos, ya que no se empaqueta ningún genoma. Si un vector retroviral se introduce dentro de estas células auxiliares en las que la señal de empaquetamiento está intacta, pero los genes estructurales se han remplazado por otros genes de interés, el vector puede empaquetarse y se produce un virión vector.
De los vectores de expresión de ADN, se prefieren los vectores de adenovirus por su eficiencia de transfección (hasta un 70% en miocitos cardiacos). Estos vectores se prefieren también por su habilidad para aceptar ADN exógeno de hasta 7.5 kb de tamaño, así como su susceptibilidad para la producción a títulos altos. Ventajosamente, los vectores de adenovirus sobreviven bien a la inyección intracoronaria (comparado, por ejemplo, con conjugados de polilisina de polinucleótidos de SERCA2).
Los adenovirus son virus de ADN lineal, de doble cadena, y se conocen al menos 42 serotipos diferentes. El serotipo 5 es el más frecuentemente usado como vector de expresión recombinante, normalmente con la mayoría de las regiones codificantes de las proteínas de fase temprana E1a y E1b eliminadas para prevenir la replicación (para una revisión en relación a la construcción de vectores de adenovirus con replicación deficiente, los expertos medios en la materia pueden dirigirse a Brody and Crystal, Annals NY Acad.Sci., 716:90-101, 1994. Se suele emplear la señal de poliadenilación del virus 40 de simio (SV40), con propagación en células 293 (una línea celular transformada derivada de células embrionarias de riñón humano). Estos vectores pueden producirse en títulos de hasta 10^{12} unidades formadoras de placas/ml.
Se muestra una construcción de adenovirus especialmente preferida para utilizar en la invención en la Figura 2. Como se detalla más adelante en el Ejemplo 4, la construcción se forma mediante la clonación del polinucleótido de SERCA2 dentro de un vector lanzadera que contiene un promotor, un polylinker (región de clonación) y secuencias parciales flanqueantes de adenovirus de las cuales se han eliminado las regiones que codifican para E1a y E1b. El plásmido resultante es entonces co-transfectado (mediante técnicas convencionales de precipitación de calcio/fosfato) dentro de células 293 con el plásmido JM17, un plásmido que contiene el genoma completo del adenovirus humano tipo 5 con un inserto adicional de 4.3 kb (el producto de construcción es demasiado grande para ser encapsulado). La recombinación homóloga de rescate da lugar a vectores adenovirales que codifican SERCA2 pero propagados en células 293 que han sido transformadas con proteínas de la fase temprana E1a y E1b. Preferentemente, los recombinantes producidos con éxito se purifican por placas previamente a la propagación, después se purifican aún más en gradiente de CsCl por doble ultracentrifugación. (ver, Ejemplo 4) para eliminar al máximo la contaminación de la cepa salvaje.
La operabilidad esperada in vivo de la construcción adenoviral mostrada en la Figura 2 no es mayor de 7 meses. Sin embargo, con la reconstitución de la función de la región codificante de E3 (que codifica para proteínas que proporcionan al virus una protección frente a la vigilancia inmunológica del hospedador), esta duración debería verse incrementada. La encapsulación de SERCA2 para el transporte con liposomas (como se describe en la Sección C más abajo) debería también limitar la destrucción inmunológica del virus, como si se utilizara una construcción de adenovirus replicable. Sin embargo, dados los riesgos que pueden estar asociados con la integración de ADN viral dentro del genoma del hospedador, el uso de esto vectores estará probablemente limitado a situaciones en la que la expresión a largo plazo de los productos del vector sea crítica para la supervivencia del paciente.
Mediante la inserción de una o más secuencias de interés dentro del vector viral, junto con otro gen que codifique el ligando para un receptor en una célula diana específica, por ejemplo, el vector puede volverse específico de diana. Los vectores retrovirales pueden hacerse específicos de diana mediante la inserción, por ejemplo, de un polinucleótido que codifica un azúcar, un glicolípido o una proteína.
Preferiblemente, la acción de evitar la transfección no específica de los vectores de expresión recombinantes de la invención en células miocardiacas aparte de los miocitos diana se logrará con el uso de promotores específicos cardiacos. Varios de estos promotores se conocen actualmente e incluyen la \beta-actina de ave (ver, el mapa del plásmido que codifica para SERCA2 en la Figura 3 y el Ejemplo 1). Los expertos medios en la materia sabrán, o podrán establecer fácilmente sin excesiva investigación, que otras secuencias específicas de polinucleótidos pueden insertarse dentro del genoma viral para permitir el transporte específico de diana del vector viral que contiene los polinucleótidos de SERCA2 de interés.
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C. Preparaciones farmacéuticas de polinucleótidos de SERCA2
Las composiciones de polinucleótidos de SERCA2 y las mezclas de polinucleótidos de SERCA2 pueden colocarse dentro de una suspensión, solución o emulsión farmacéuticamente aceptable. Los medios adecuados incluyen el medio salino y, para aquellos aspectos que no estén basados en células presentadoras de antígeno para el transporte de polinucleótidos de SERCA2 dentro del tejido diana, podrían emplearse preparaciones liposomales.
Más específicamente, los transportadores farmacéuticamente aceptables podrían incluir soluciones, suspensiones o emulsiones estériles acuosas y no acuosas. Ejemplos de disolventes no acuosos son propilenglicol, polietilenglicol, aceites vegetales como el aceite de oliva, y ésteres orgánicos inyectables como el etil oleato. Los transportadores acuosos incluyen agua, soluciones, emulsiones o suspensiones alcohólicas o acuosas, incluyendo medios salinos y tamponados. Los vehículos parenterales incluyen solución de cloruro sódico, dextrosa en Ringer, dextrosa y cloruro sódico, Ringer lactato o aceites fijadores. Los vehículos intravenosos incluyen reponedores de líquidos y nutrientes, reponedores de electrolitos (como los basados en dextrosa en Ringer), y otros similares. Además, una composición de polinucleótidos de SERCA2 puede liofilizarse utilizando medios bien conocidos en el estado de la técnica, para la posterior reconstitución y uso de acuerdo con la invención.
Además de los sistemas de transporte con vectores dirigidos discutidos más arriba, un sistema de dispersión coloidal puede utilizarse también para el transporte dirigido. Los sistemas de dispersión coloidal incluyen complejos de macromoléculas, nanocápsulas, microesferas, micropartículas y sistemas basados en lípidos que incluyen emulsiones de aceite en agua, micelas, micelas mixtas y liposomas. El sistema coloidal preferido de esta invención es un liposoma.
Los liposomas son vesículas artificiales de membrana que son útiles como vehículos de transporte in vitro e in vivo. Se ha observado que las vesículas unilamelares grandes (LUV), cuyo rango de tamaño de 0,2-4 \mum puede encapsular un porcentaje substancial de un tampón acuoso que contenga grandes macromoléculas. El ARN, ADN y viriones intactos pueden encapsularse dentro del interior acuoso y transportarse a las células en forma biológicamente activa (Fraley, et al., Trends Biochem. Sci., 6:77, 1981). Además de las células de mamíferos, los liposomas se han utilizado para el transporte de polinucleótidos que codifican operativamente en células de plantas, levaduras y bacterias. Para que un liposoma sea un vehículo eficiente de transferencia de genes, deben estar presentes las siguientes características: (1) encapsulación de los genes que codifican los polinucleótidos antisentido con una alta eficacia siempre que no comprometa su actividad biológica; (2) número sustancial de lugares de unión de forma preferente a la célula diana en comparación con las células no diana; (3) transporte del contenido acuoso de la vesícula al citoplasma de la célula diana con una alta eficiencia; y (4) expresión precisa y eficaz de la información genética (Mannino, et al., Biotechniques, 6:682, 1988).
La composición del liposoma es normalmente una combinación de fosfolípidos, en particular fosfolípidos con una alta temperatura de transición de fase, normalmente en combinación con esteroides, especialmente colesterol. Pueden emplearse otros fosfolípidos u otros lípidos. Las características físicas de los liposomas dependen del pH, fuerza iónica y la presencia de cationes divalentes.
Los ejemplos de lípidos útiles en la producción de liposomas incluyen compuestos de fosfatidil, como fosfatidilglicerol, fosfatidilserina, fosfatidiletanolamina, esfingolípidos, cerebrósidos y gangliósidos. Son particularmente útiles los diacilfosfatidilgliceroles, donde la porción lipídica contiene de 14 a 18 átomos de carbono, en particular de 16 a 18 átomos de carbono, y está saturada. Fosfolípidos ilustrativos serían fosfatidilcolina de huevo, fosfatidilcolina con dos ácidos palmíticos y fosfatidilcolina con dos ácidos esteáricos.
La forma de dirigir los liposomas puede clasificarse basándose en factores anatómicos y mecánicos. La clasificación anatómica se basa en el nivel de selectividad, por ejemplo, específico de órgano, específico de célula y específico de orgánulo. El dirigir de forma mecánica puede diferenciarse según si es de forma pasiva o activa. El dirigir de forma pasiva utiliza la tendencia natural de los liposomas para distribuirse a células del retículo endotelial (SRE) en órganos que contienen capilares sinusoidales. El dirigir de forma activa, por otro lado, incluye la alteración del liposoma mediante el acoplamiento del liposoma a un ligando específico como un anticuerpo monoclonal, azúcar, un glicolípido o una proteína, o mediante un cambio en la composición o tamaño del liposoma para lograr que se dirija a tipos de órganos o células diferentes de los lugares de localización a los que se uniría naturalmente.
La superficie del sistema de transporte dirigido puede modificarse de varias formas. En el caso de un sistema de transporte dirigido liposomal, grupos lipídicos pueden incorporarse dentro de la bicapa lipídica del liposoma para mantener el ligando diana en una asociación estable con la bicapa lipídica. Se pueden usar varios grupos de unión para unir las cadenas lipídicas al ligando diana.
Se espera que estas técnicas (y otras que se emplean convencionalmente para facilitar el transporte de fármacos) puedan adaptarse para la preparación de polinucleótidos de SERCA2 para su uso en los métodos de la invención por los expertos medios en la materia sin excesiva experimentación. En particular, aunque las propuestas discutidas en los párrafos precedentes, según el conocimiento de los inventores, no hayan sido previamente utilizadas para el transporte de polinucleótidos de SERCA2 a miocitos in vivo, se cree que son adecuadas para utilizarlas para ese fin. Se exponen más abajo ejemplos específicos que ilustran esta idoneidad.
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D. Método para la mejora in vivo de la actividad cardiaca de SERCA2
Para los objetivos de la invención, es suficiente que los polinucleótidos de SERCA2 se suministren a dosis suficiente para causar la expresión del péptido biológicamente activo codificado por el polinucleótido. Preferentemente, el nivel de expresión alcanzado será suficiente para remplazar sustancialmente la actividad endógena "normal" de SERCA2. De forma ventajosa, los polinucleótidos de SERCA2 estarán contenidos en un vector de expresión recombinante y formulados en una composición farmacéuticamente aceptable (como se describió en la Sección C, más arriba).
Los niveles y actividad "normales" de SERCA2 variarán entre individuos y no pueden, por lo tanto, ser cuantificados de forma absoluta para cada especie en particular. Sin embargo, se puede establecer y mantener un nivel de expresión deseado de SERCA2 para lograr fines terapéuticos específicos (una "cantidad terapéuticamente beneficiosa") dentro de unos límites clínicos aceptables mediante el seguimiento de los niveles de proteína SERCA2 pre y postratamiento, así como de los signos clínicos de la mejora de la contractilidad y función cardiaca en un corazón con ICC. Se describen los medios para el control de los niveles de SERCA2 más abajo en la Sección F.
Los signos clínicos de la mejora de la función cardiaca y del ajuste de la tensión cardiaca asociada a la ICC son conocidos para los expertos medios en el estado de la técnica relacionada con la cardiología y se pueden determinar, por ejemplo, mediante el control del flujo sanguíneo, el volumen de bombeo cardiaco y la presión ventricular (mediante, por ejemplo, una angiografía y una ecocardiografía), las tasas de transporte de calcio (mediante la evaluación in vitro de muestras de fluido cardiaco), estudios de tolerancia (mediante, por ejemplo, el control de la tasa cardiaca en respuesta a un estrés de sobrecarga de presión sobre el corazón) y signos clínicos generales de una reducción en los síntomas de la ICC (por ejemplo, mayor resistencia del hospedador y respiración más fácil). Las dosis administradas pueden modificarse para lograr fines terapéuticos particulares (p. ej., sobreexpresión de SERCA2 para estimular el transporte de calcio en hospedadores que presenten un estado de ICC aguda). Los rangos máximos y mínimos se definirán también mediante la extrapolación de los resultados de datos procedentes de animales no humanos, como los usados en los modelos descritos más arriba y en especies de grandes mamíferos.
El transporte del polinucleótido de SERCA2 se logrará, preferiblemente, mediante infusión intravenosa o intracoronaria (preferiblemente utilizando cateterización para minimizar el reflujo del polinucleótido en la raíz aórtica. De forma alternativa, para lograr una mayor expresión de SERCA2 de forma inmediata, se pueden inyectar los polinucleótidos de SERCA2 dentro de la pared intraventricular (a través, por ejemplo, de una técnica quirúrgica como la toracotomía) o se pueden introducir directamente dentro de un ventrículo (mediante, por ejemplo, cateterización angiográfica). Se controlará la expresión de SERCA2 a partir de ese momento y se repetirá el transporte si es necesario. Los hospedadores tratados deben también controlarse cuidadosamente por las reacciones adversas, como las respuestas inmunes a los polinucleótidos o a SERCA2, así como por la expresión excesiva de SERCA2 (como se indica, por ejemplo, mediante una excesiva prolongación de la diástole).
En general, sin embargo, basándose en los resultados expuestos en los Ejemplos de abajo, el riesgo de efectos citopáticos o de otros efectos adversos relacionados con el transporte de vectores de expresión recombinantes (adenovirus) con polinucleótidos de SERCA2 a miocitos in vivo parece ser bajo y puede minimizarse con la eliminación de los vectores de tipo salvaje contaminantes y otras reducciones en la inmunogenicidad del vector (como la encapsulación liposomal de los vectores).
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E. Modelos animales para evaluar el método de la invención
Se ha probado que la rata es un modelo experimental reproducible de la insuficiencia cardiaca congestiva el cual, a pesar de la falta de circulación colateral en el corazón de la rata, es aceptablemente predictivo de las condiciones de la ICC humana. En particular, las ratas que han sufrido una ligación quirúrgica de la arteria coronaria son particularmente buenos modelos de ICC tras infarto de miocardio en humanos. Los protocolos de experimentación para la producción y uso de ratas como modelos animales de ICC se han descrito en el estado de la técnica; como referencia, los expertos medios en la materia pueden remitirse a Pfieffer, et al., Am.J.Med., 76:99-103, 1984; Johns and Olsen, Ann.Surg., 140:675-682, 1954; y, Selye, et al., Angiology, 11:398-407, 1960.
Además, se ha desarrollado un modelo de animal transgénico que es especialmente predictivo del impacto sobre la función cardiaca en el corazón con ICC en el cual la actividad de SERCA2 se ha incrementado de acuerdo con el método de la invención. Un protocolo útil para reproducir estos animales transgénicos (que expresan un transgen de SERCA2) es descrito más abajo y se expone en el Ejemplo 1. El protocolo generalmente sigue técnicas convencionales para la introducción de transgenes expresables en mamíferos. los expertos medios en la materia estarán familiarizados con estas aplicaciones y serán capaces de aplicar las técnicas en el contexto de la presente invención sin excesiva experimentación.
Por ejemplo, las células diana embrionarias no humanas en varias etapas de desarrollo pueden usarse para introducir transgenes. Diferentes métodos son empleados dependiendo de la etapa de desarrollo de las células diana embrionarias no humanas. El zigoto es la mejor diana para la microinyección. En el ratón, los pronúcleos masculinos alcanzan el tamaño de aproximadamente 20 micrómetros de diámetro lo que permite la inyección reproducible de 1-2 pl de solución de ADN. El uso de zigotos como diana para la transferencia de genes tiene una importante ventaja ya que en la mayoría de los casos el ADN inyectado se incorporará dentro del gen del hospedador antes de su primera segmentación (Brinster, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:4438-4442, 1985). Como consecuencia, todas las células del animal transgénico no humano portarán el transgen incorporado. Esto, en general, se reflejará también en la transmisión eficiente del transgen a la descendencia del fundador ya que el 50% de las células germinales contendrán el transgen. La microinyección de zigotos es el método preferido para incorporar transgenes en la práctica de la invención.
La infección retroviral puede emplearse también para introducir un transgen dentro de un animal no humano. El embrión no humano en desarrollo puede cultivarse in vitro hasta la etapa de blastocisto. Durante este tiempo, los blastómeros pueden ser dianas para la infección retroviral (Jaenisch, Proc. Natl. Acad. Sci USA 73:1260-1264, 1976). La infección eficiente de los blastómeros se obtiene mediante el tratamiento enzimático para eliminar la zona pelúcida (Hogan, et al., Manipulating the Mouse Embryo, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1986). El sistema de vector viral usado para introducir el transgen es típicamente un retrovirus defectivo para la replicación que porta el transgen (Jahner, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82:6927-6931, 1985; Van der Putten, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:6148-6152). La transfección es fácil y eficientemente lograda mediante el cultivo de blastómeros sobre una monocapa de células productoras de virus (Van der Putten, ver más arriba; Steward, et al., EMBO J., 6:383-388, 1987).
Alternativamente, la infección se puede llevar a cabo en una etapa más tardía. Las células productoras o no de virus pueden inyectarse dentro del blastocele (Jahner, et al., Nature, 298:623-628, 1982). La mayoría de los fundadores serán mosaicos para el transgen ya que la incorporación del transgen ocurre sólo en un subconjunto de las células que forman el animal transgénico no humano. Además, el fundador puede contener varias inserciones retrovirales del transgen en diferentes posiciones del genoma las cuales segregarán en la descendencia. Asimismo, también es posible introducir transgenes dentro de la línea germinal, aunque con baja eficiencia, mediante la infección retroviral intrauterina del embrión a la mitad de la gestación (Jahner, et al., ver más arriba, 1982).
Un tercer tipo de célula diana para la introducción del transgen es la célula madre embrionaria (CME) no humana. Las CME se obtienen de la preimplantación de embriones no humanos cultivados in vitro y fusionados con embriones no humanos (Evans, et al., Nature, 292:154-156, 1981; Bradley, et al., Nature, 309:255-258, 1984; Gossler, et al., Proc. Natl. Acad. Sci USA, 83:9065-9069, 1986; y Robertson, et al., Nature, 322:445-448, 1986). Los transgenes pueden introducirse eficientemente dentro de las CME no humanas mediante la transfección del ADN o mediante transducción mediada por retrovirus. Estas CME transformadas pueden a partir de entonces combinarse con blastocistos procedentes de un animal no humano. Las CME a partir de ese momento colonizarán el embrión y contribuirán a la línea germinal del resultante animal quimérico (ver para revisión, Jaenisch, Science, 240:1468-1474, 1988).
Preferentemente, para su uso como modelo animal en el contexto aquí descrito, el transgen de elección será uno que incluya un promotor capaz de conducir a una expresión relativamente alta del nivel de SERCA2. Un promotor preferido para su uso en este aspecto es el enhancer de CMV humano unido a un promotor de \beta-actina (p. ej., de una especie aviar) que incluya un intrón de \beta-actina. Para la detección de la actividad de la expresión del transgen, una región codificante para el epítopo antigénico Flag descrito en otra parte más arriba se incluyó en la región del transgen que codifica para la región C-terminal de SERCA2. Como se describe en el Ejemplo 1, la progenie que expresa el transgen de los animales fundadores vive hasta la edad adulta; el transgen se espera que sea portado por, al menos, alrededor del 15% de la progenie de la línea fundadora.
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F. Métodos para evaluar in vivo la expresión de SERCA2
Para el objetivo de evaluar la expresión de SERCA2, los polinucleótidos de SERCA2 que se van a introducir en un hospedador de acuerdo con la invención pueden ser modificados para incluir genes marcadores conocidos. Por ejemplo, el vector de ADN pRSV lac-Z descrito en Norton, et al., Mol. Cell. Biol., 5:281, 1985, puede producir \beta-galactosidasa con la expresión de la proteína. La luciferasa y la cloranfenicol acetil transferasa ("CAT"; ver, p. ej., Gorman, et al., más arriba, revisión de la construcción de un plásmido pRSV-CAT) pueden emplearse también. Otra molécula marcadora útil es el péptido antigénico Flag, el cual puede detectarse fácilmente mediante un inmunoensayo. La secuencia de 8 aminoácidos para el péptido antigénico Flag y por lo tanto las regiones codificantes son conocidas en el estado de la técnica; para referencias en este aspecto, los expertos medios en la materia pueden consultar Chiang, et al., Peptide Res., 6:62-64, 1993. La inserción de un gen marcador que codifique en el extremo C de la proteína SERCA2 (p. ej., mediante la inserción de un gen a unas 25 pb desde el codón de inicio) no interferirá con la actividad catalítica de SERCA2. Los medios para la detección de la expresión de estos genes marcadores se conocen en el estado de la técnica y no se describirán en detalle, aunque son resumidos más abajo.
Por ejemplo, SERCA2 expresada in vivo tras la introducción de un polinucleótido de SERCA2 de acuerdo con la invención puede ser detectada mediante inmunoensayos en los que la proteína SERCA2 puede utilizarse en una fase líquida o unida a un transportador en fase sólida. Además, la proteína SERCA2 que se utiliza en estos ensayos puede ser marcada para que sea detectable de varias formas. Asimismo, los anticuerpos para SERCA2 o un producto de un gen marcador pueden emplearse para detectar la expresión del polinucleótido de SERCA2 en muestras de análisis, como sangre o suero.
En resumen, esos anticuerpos pueden producirse mediante medios que son conocidos en el estado de la técnica. Por ejemplo, los anticuerpos que son específicos para SERCA2 o los productos de un gen marcador pueden producirse mediante inmunización de un no humano con SERCA2 antigénico o péptidos de genes marcadores. Tales péptidos pueden aislarse de fuentes nativas (ver, p. ej., el método empleado para aislar SERCA2 de rata publicado en Popovich, et al., Am.J.Physiol., 261:E377-E381, 1991) o pueden sintetizarse sin excesiva experimentación por métodos frecuentemente usados como protección t-BOC o FMOC de los grupos alfa-aminos.
Los métodos posteriores incluyen síntesis paulatina a través de la cual un único aminoácido se añade en cada paso comenzando en la terminación C del péptido (ver, Coligan, et al., Current Protocols in Immunology, Wiley Interscience, 991, Unit 9). Los péptidos que se emplean en este sentido pueden también sintetizarse por varios métodos conocidos de síntesis de péptidos en fase sólida, como los descritos por Merrifield, J. Am. Chem. Soc., 85:2149, 1962, y Steward and Young, Solid Phase Peptides Synthesis (Freeman, San Francisco, 27-62, 1969), usando un copoli(estireno-divinilbenceno) que contiene 0.1-1.0 mMol de aminas/g polímero.
Al terminarse la síntesis química, los péptidos pueden ser desprotegidos y segmentados a partir del polímero mediante tratamiento con anisol HF líquido al 10% durante aproximadamente 1/4-1 hora a 0ºC. Tras la evaporación de los reactivos, los péptidos se extraen a partir del polímero con una solución de ácido acético al 1% la cual es entonces liofilizada para extraer el material sin purificar. Éste puede ser normalmente purificado por técnicas como la filtración en gel Sephadex G-15 usando como disolvente ácido acético al 5%. La liofilización de fracciones apropiadas de la columna producirán el péptido homogéneo o los derivados del péptido, los cuales pueden entonces ser caracterizados mediante técnicas estándar como el análisis de aminoácidos, la cromatografía en capa fina, cromatografía líquida de alta resolución, espectroscopia de absorción ultravioleta, rotación molar, solubilidad, y cuantificados mediante la degradación de Edman en fase sólida. La capacidad antigénica de los péptidos de interés puede determinarse por técnicas convencionales para determinar la magnitud de la repuesta del anticuerpo de un animal que ha sido inmunizado con el péptido.
Una vez que se preparan los péptidos antigénicos SERCA2, los anticuerpos para el péptido inmunizante se producen mediante la introducción del péptido en un mamífero (como un conejo, ratón o rata). Se prefiere un protocolo de inmunización por inyección múltiple para su uso en animales inmunizados con el péptido antigénico (ver, p. ej., Langone, et al., eds., "Production of Antisera with Small Doses of Immunogen: Multiple Intradermal Injections", Methods of Enzymology (Acad. Press, 1981). Por ejemplo, una buena respuesta del anticuerpo puede obtenerse normalmente en conejos mediante inyección intradérmica de 1 mg de péptido antigénico emulsificado en el Adyuvante Completo de Freund seguido varias semanas después de una o más inyecciones del mismo antígeno en el Adyuvante Incompleto de Freund.
Si se desea, el péptido inmunogénico puede unirse a una proteína transportadora mediante conjugación empleando técnicas conocidas en el estado de la técnica. Estos transportadores comúnmente usados que están químicamente unidos a los péptidos incluyen la hemocianina de Megathura crenulata (KLH), tiroglobulina, albúmina sérica bovina (ASB) y toxina tetánica. El péptido unido se emplea entonces para inmunizar al animal (p. ej., un ratón o un conejo). Debido a que en este momento se considera que SERCA2 está ampliamente conservada entre especies de mamíferos, se prefiere el uso de una proteína transportadora para mejorar la inmunogenicidad de las proteínas SERCA2.
Los anticuerpos policlonales producidos por los animales pueden purificarse posteriormente, por ejemplo, mediante la unión y elución a partir de una matriz a la cual se une el péptido al cual se ha unido el anticuerpo. Los expertos medios en la materia conocen varias técnicas comunes en inmunología para purificar y/o concentrar anticuerpos policlonales, así como anticuerpos monoclonales (ver, por ejemplo, Coligan, et al., Unit 9, Current Protocols in Immunology, Wiley Interscience, 1991).
Por su especificidad y facilidad de producción, se prefiere el uso de anticuerpos monoclonales para la detección de la expresión de SERCA2. Para la preparación de anticuerpos monoclonales, se prefiere la inmunización de un ratón o una rata. El término "anticuerpo" como se usa en esta invención se entiende que incluye también moléculas intactas así como fragmentos de las mismas, como por ejemplo, Fab y F(ab')_{2}, las cuales son capaces de unirse al epítopo. También, en este contexto, el término "AcM de la invención" se refiere a anticuerpos monoclonales con especificidad para SERCA2 o productos de genes marcadores.
El método general empleado para la producción de hibridomas que secreten anticuerpos monoclonales ("AcM") es ya conocido (Kohler and Milstein, Nature, 256:495, 1975). Brevemente, como lo describen Kohler y Milstein, la técnica comprende linfocitos aislados a partir del drenaje regional de ganglios linfáticos de cinco pacientes diferentes con cáncer, respectivamente con melanoma, teratocarcinoma, cáncer de cérvix, glioma y cáncer de pulmón, que se obtuvieron a partir de muestras quirúrgicas, se mezclaron y posteriormente se fusionaron con SHFP-1. Los hibridomas se cribaron para la producción de anticuerpos que se unieran a líneas celulares cancerígenas.
La confirmación de la especificidad antigénica entre AcM puede lograrse utilizando técnicas de cribado relativamente rutinarias (como el ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas o "ELISA") para determinar el modelo de reacción básico del AcM de interés. También es posible evaluar un AcM para determinar si tiene la misma especificidad que un AcM específico para SERCA2 sin excesiva investigación determinando si el AcM que está siendo evaluado evita que un AcM de la invención se una al antígeno de interés aislado como se describió anteriormente. Si el AcM que se está evaluando compite con el AcM de la invención, como se demuestra por un descenso de la unión del AcM de la invención, entonces es probable que los dos anticuerpos monoclonales se unan al mismo epítopo o a uno muy similar.
Existe otra forma más de determinar si un AcM tiene la especificidad del AcM dirigido contra SERCA2 que consiste en preincubar el AcM de la invención con un antígeno con el cual reacciona normalmente, y determinar si la capacidad de unirse al antígeno del AcM que está siendo evaluado se inhibe. Si el AcM que está siendo evaluado se inhibe, entonces, con toda probabilidad, tiene la misma o muy similar especificidad de epítopo que el AcM específico para SERCA2.
Los anticuerpos monoclonales de SERCA2 que reconocen un epítopo compartido por MHC\alpha y MHC\beta serán particularmente útiles en determinar que la proteína SERCA2 detectada está, en lo esencial, inalterada estructuralmente. Tales AcM son descritos con suficiente detalle como para ser reproducidos por Dorn, et al., Am.J.Physiol., 267:H400-H405, 1994.
Los ejemplos de inmunoensayos que pueden emplearse para detectar la expresión de SERCA2 son los inmunoensayos competitivos y los no competitivos tanto en formato directo como indirecto. Ejemplos de estos inmunoensayos son el radioinmunoensayo (RIA), el ensayo tipo sándwich (ensayo inmunométrico) y el ensayo de Western blot. La detección de anticuerpos que se unen a SERCA2 o a un producto de un gen marcador puede realizarse utilizando inmunoensayos que se lleven a acabo de forma directa, indirecta o simultánea, incluyendo ensayos inmunohistoquímicos sobre muestras fisiológicas. Para su uso en este aspecto se prefieren especialmente los kits de ensayo que se encuentran comercialmente disponibles para la detección de productos de genes marcadores tales como lac-Z o \beta-gal (p. ej., \beta-galactosidasa).
La concentración de antígeno o anticuerpo que se va a utilizar variará dependiendo del tipo de inmunoensayo y de la naturaleza del marcador que se vaya a emplear. Sin embargo, a pesar del tipo de inmunoensayo que se vaya a usar, la concentración de antígeno o anticuerpo a emplear puede ser fácilmente determinada por un experto medio en la materia utilizando una experimentación rutinaria.
Tales antígenos o anticuerpos pueden unirse a muchos transportadores o vehículos diferentes y emplearse para detectar la presencia del anticuerpo o antígeno específicamente reactivo a estos. Ejemplos de conocidos transportadores incluyen cristal, poliestireno, cloruro de polivinilo, polipropileno, polietileno, policarbonato, dextrano, nylon, amilasas, celulosas naturales y modificadas, poliacrilamidas, agarosas y magnetita. La naturaleza del transportador para los objetivos aquí descritos puede ser bien soluble o insoluble. Los expertos medios en la materia conocerán otros transportadores adecuados para emplearse en este aspecto, o serán capaces de establecer cuáles son mediante una investigación rutinaria.
Existen muchos marcadores y métodos diferentes para el marcaje ya conocidos para un experto medio en la materia. Ejemplos de tipos de marcadores que pueden usarse en la presente invención incluyen enzimas, radioisótopos, metales coloidales, compuestos fluorescentes, compuestos quimioluminiscentes y compuestos bioluminiscentes.
De forma alternativa, los polinucleótidos de SERCA2 pueden detectarse (preferentemente en muestras de células diana obtenidas a través de técnicas convencionales para la extracción de biopsias de tejido cardiaco) mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) cuantitativa, ya conocida en el estado de la técnica y cuya técnica general se resume a continuación.
El ácido nucleico procedente de una muestra histológica de tejido, en forma purificada o no purificada, puede utilizarse como el ácido o ácidos nucleicos de inicio, dado que contiene, o se sospecha que contiene, la secuencia específica de ácido nucleico que incluye el ácido nucleico diana. De esta manera, el proceso puede emplear, por ejemplo, ADN o ARN, incluyendo ARN mensajero (ARNm), donde el ADN o ARN puede ser de cadena simple o doble. En el caso de que se emplee como molde ARN, se utilizarán las enzimas y/o las condiciones óptimas para la transcripción inversa del molde a ADN. Además, se puede emplear un híbrido de ADN-ARN que contenga un cadena de cada uno. También se puede utilizar una mezcla de ácidos nucleicos, o los ácidos nucleicos producidos en una reacción de amplificación previa, pudiendo emplearse los mismos o diferentes cebadores. La secuencia de nucleótidos que se va a amplificar puede ser una fracción de una molécula mayor o puede presentarse inicialmente como una molécula diferenciada, de manera que la secuencia específica constituye el ácido nucleico entero. No es necesario que la secuencia que se va a amplificar esté presente al comienzo en forma purificada; puede ser una fracción minoritaria dentro de una compleja mezcla, como la contenida dentro de todo el ADN humano.
En el caso de que la secuencia de nucleótidos diana de la muestra contenga dos cadenas, es necesario separar las cadenas del ácido nucleico antes de que puedan usarse como molde. La separación de las cadenas puede efectuarse bien como un paso de separación o bien simultáneamente con la síntesis de los productos de extensión que surgen a partir del cebador. Esta separación de cadenas puede llevarse a cabo empleando unas condiciones de desnaturalización adecuadas, con la ayuda de medios físicos, químicos o enzimáticos; la palabra "desnaturalización" incluye todos estos medios. Un método físico para separar las cadenas de los ácidos nucleicos consiste en calentar el ácido nucleico hasta que éste se desnaturalice. Una desnaturalización por calor típica puede implicar temperaturas que varían entre los 80º y los 105ºC durante tiempos que varían entre 1 y 10 minutos. La separación de cadenas puede inducirse también mediante una enzima del tipo de las conocidas como helicasas o por una enzima RecA, que tiene actividad helicasa, y que en presencia de riboATP se sabe que desnaturaliza el ADN. Las condiciones adecuadas para la reacción de separación de cadenas de ácidos nucleicos con helicasas se describen en Kuhn Hoffmann-Berling (CSH-Quantitative Biology, 43:63, 1978) y las técnicas para el uso de RecA se revisan en C. Radding (Ann. Rev. Genetics, 16:405-437, 1982).
Si el ácido nucleico que contiene el ácido nucleico diana que se va a amplificar es de cadena simple, su cadena complementaria se sintetiza mediante la adición de uno o dos oligonucleótidos cebadores. Si se utiliza un único cebador, el producto de extensión a partir del cebador se sintetiza en presencia del cebador, un agente para la polimerización y los cuatro nucleósidos trifosfato descritos más abajo. Este producto será complementario al ácido nucleico de cadena simple e hibridará con un ácido nucleico de cadena simple para formar una doble cadena con hebras de diferente longitud que pueden separarse en cadenas simples para producir dos cadenas simples complementarias y separadas. De forma alternativa, se pueden añadir dos cebadores al ácido nucleico de cadena simple y la reacción se llevará a cabo como se describe.
Cuando las cadenas complementarias del ácido o ácidos nucleicos se separan, a pesar de si el ácido nucleico original era de cadena simple o doble, las cadenas separadas están listas para utilizarse como molde para la síntesis de cadenas de ácido nucleico adicionales. Esta síntesis se realiza bajo condiciones que permiten la hibridación de los cebadores a las cadenas molde. Generalmente, la síntesis tiene lugar en una solución acuosa tamponada, preferiblemente a un pH de 7-9, más preferiblemente sobre 8. Preferentemente, se añade un exceso molar (para ácidos nucleicos genómicos, normalmente sobre 10^{8}:1 cebador:molde) de los dos oligonucleótidos cebadores al tampón que contiene las cadenas molde separadas. Se entiende, sin embargo, que la cantidad de cadena complementaria puede no ser conocida si el proceso de la invención se utiliza para aplicaciones diagnósticas, de manera que la cantidad de cebador en comparación con la cantidad de cadena complementaria no puede determinarse con certeza. En la práctica, sin embargo, la cantidad de cebador que se añade generalmente estará en exceso molar sobre la cantidad de cadena complementaria (molde) cuando la secuencia que se va a amplificar está contenida en una mezcla de complicadas cadenas largas de ácidos nucleicos. Se prefiere un gran exceso molar para mejorar la eficiencia del proceso.
En algunos métodos de amplificación, los sustratos, por ejemplo, los desoxirribonucleótidos trifosfato dATP, dCTP, dGTP y dTTP, se añaden a la mezcla de síntesis, bien de forma separada o bien junto con los cebadores, en cantidades adecuadas y se calienta la solución resultante alrededor de 90-100ºC durante 1 a 10 minutos, preferentemente de 1 a 4 minutos. Tras este periodo de calentamiento, se deja enfriar la solución hasta temperatura ambiente, que es preferible para la hibridación del cebador. A la mezcla ya enfriada se le añade un agente adecuado para que ocurra una reacción efectiva de extensión a partir del cebador (llamado aquí "agente para la polimerización"), y se deja que se produzca la reacción bajo condiciones conocidas en el estado de la técnica. El agente para la polimerización puede añadirse también junto con los otros reactivos si es estable al calor. Esta reacción de síntesis (o amplificación) puede darse una temperatura ambiente hasta una temperatura por encima de la cual el agente para la polimerización deja de funcionar. Así, por ejemplo, si se emplea ADN polimerasa como agente, la temperatura generalmente no es mayor de 40ºC.
El agente para la polimerización puede ser cualquier compuesto o sistema con el que se logrará la síntesis de productos de extensión a partir del cebador, incluyendo enzimas. Enzimas adecuadas para este objetivo son, por ejemplo, la ADN polimerasa I de E. coli, la Taq polimerasa, el fragmento Klenow de la ADN polimerasa I de E. Coli, la ADN polimerasa T4, otras ADN polimerasas disponibles, muteinas de polimerasas, transcriptasa inversa, ligasa, y otras enzimas, incluyendo enzimas estables al calor (es decir, aquellas enzimas que realizan la extensión del cebador tras estar sometidas a temperaturas suficientemente elevadas como para causar la desnaturalización). Las enzimas adecuadas facilitarán la combinación de los nucleótidos de manera apropiada para formar los productos de extensión a partir del cebador que son complementarios a cada cadena de nucleótidos mutante. Generalmente, la síntesis se iniciará en el extremo 3' de cada cebador y avanzará en dirección 5' a lo largo de la cadena molde, hasta que la síntesis termine, produciendo moléculas de diferente longitud. Existen sin embargo agentes para la polimerización que inician la síntesis en el extremo 5' y avanzan en la otra dirección, empleando el mismo proceso descrito arriba.
La nueva cadena de nucleótidos mutante sintetizada y su cadena de ácido nucleico complementaria formarán una molécula de doble cadena bajo las condiciones de hibridación descritas arriba y este hibrido se usará en los siguientes pasos del proceso. En el siguiente paso, esta nueva molécula de doble cadena sintetizada se somete a condiciones de desnaturalización utilizando alguno de los procedimientos descritos anteriormente para dar lugar a moléculas de cadena simple.
El proceso anterior se repite con las moléculas de cadena simple. Si es necesario, se puede añadir un agente para la polimerización adicional, nucleósidos y cebadores, para que la reacción tenga lugar bajo las condiciones descritas más arriba. De nuevo, la síntesis se iniciará en un extremo de cada uno de los oligonucleótidos cebadores y avanzará a lo largo de las cadenas simples del molde para producir ácidos nucleicos adicionales. Tras este paso, la mitad de los productos de extensión consistirán en la secuencia del ácido nucleico específico limitada por los dos cebadores.
Los pasos de desnaturalización y síntesis de los productos de extensión pueden repetirse tantas veces como sea necesario para amplificar la secuencia de nucleótidos mutante diana hasta donde se requiera para su detección. La cantidad de secuencia de nucleótidos mutante producida se acumulará de manera exponencial.
El producto amplificado puede detectarse mediante análisis de Southern blot, sin usar sondas radioactivas. En este proceso, por ejemplo, se amplifica una pequeña muestra de ADN que contenga a un nivel muy bajo la secuencia de nucleótidos diana, y se analiza mediante la técnica de Southern blot. El uso de sondas o marcadores no radioactivos es facilitado por el alto nivel de la señal amplificada.
Un método preferido para la realización de la PCR cuantitativa es una técnica de PCR competitiva que se lleva a cabo utilizando un molde competidor que contiene una mutación inducida de una o más pares de bases, lo que da lugar a un competidor que se diferencia en la secuencia o en el tamaño del molde del gen diana. Uno de los cebadores esta biotinilado o, preferentemente, aminado de manera que una cadena (normalmente, la cadena antisentido) de los productos resultantes de la PCR puede inmovilizarse mediante uniones de tipo fuerte como amino-carboxil, amino-amino, biotina-estreptavidina, u otras uniones de este tipo, a un soporte de fase sólida que haya sido unido fuertemente a un reactivo apropiado. Más preferentemente, las uniones entre los productos de la PCR, el soporte de fase sólida y el reactivo serán de tipo covalente, así se volverán resistentes las uniones a la separación bajo condiciones desnaturalizantes.
Una vez que las cadenas aminadas o biotiniladas de los productos de la PCR se han inmovilizado, las cadenas complementarias que no se hayan unido se separan en un lavado alcalino desnaturalizante y se eliminan del medio de reacción. Los oligonucleótidos de secuencia específica ("SSO") correspondientes a la diana y los ácidos nucleicos competidores se marcan con un marcador de detección. Los SSO son entonces hibridados con las cadenas complementarias en ausencia de competición por la eliminación de las cadenas que no se unieron. Se añaden los reactivos adecuados para el ensayo y se mide el grado de hibridación mediante técnicas de ELISA apropiadas para el marcador de detección y medios de soporte de fase sólida utilizando preferentemente, un lector de microplacas de ELISA. Los valores medidos se comparan con los obtenidos del contenido del ácido nucleico diana, utilizando una curva estándar por separado derivada de las reacciones de PCR que amplifican los moldes incluyendo los moldes diana y los moldes competidores.
Este método tiene la ventaja de que es cuantitativo, no depende del número de ciclos de PCR y no está influenciado por la competencia entre las sondas SSO y la cadena complementaria en los productos de la PCR.
De forma alternativa, parte del paso de polimerización y toda la fase de hibridación pueden llevarse a cabo en un soporte de fase sólida. En este método, existe un cebador obtenido por la polimerización de nucleótidos (preferiblemente, un oligonucleótido) que es más capturado sobre una fase sólida que una cadena producto de la PCR. Los ácidos nucleicos diana y competidores producidos en la PCR se añaden entonces en solución a la fase sólida y se lleva a cabo una fase de polimerización. Las cadenas no unidas de los productos de polimerización se eliminan bajo las condiciones de desnaturalización descritas anteriormente.
El objetivo de determinar la proporción de ácido nucleido competidor puede lograrse mediante la detección de sondas marcadas de SSO utilizando métodos de medida apropiados (preferentemente, lectores de ELISA). La eficiencia de este método puede ser tan grande que la reacción en cadena en la fase de polimerización puede llegar a ser innecesaria, acortándose así el tiempo necesario para llevar a cabo el método. La exactitud del método se ve también incrementada porque los productos finales de la polimerización no tienen que transferirse de un tubo de reacción a un soporte de fase sólida para la hibridación, limitando así la pérdida o el daño de estos productos. Si es necesario para una muestra en particular, sin embargo, la PCR se puede emplear para amplificar los ácidos nucleicos diana y competidores en tubos de reacción separados, seguido de una polimerización final realizada sobre el soporte de fase sólida.
Las moléculas capaces de proporcionar señales diferentes y detectables indicativas de la formación de productos de la PCR unidos son conocidas para un experto medio en la materia (como los nucleótidos marcados con cromóforos que forman diferentes colores indicativos de la formación de productos de la PCR diana o competidores) y se pueden añadir a la solución de la reacción durante los últimos ciclos. La proporción de ácidos nucleicos diana y competidor puede determinarse mediante ELISA u otro método de medida apropiado y con reactivos que reaccionen con los marcadores de detección unidos al extremo 3' de los cebadores de hibridación inmovilizados. Este método puede adaptarse también para detectar si un gen particular está presente en la muestra (sin cuantificarlo) mediante la realización de un protocolo convencional de PCR no competitiva.
Los expertos medios en la materia conocerán, o podrán averiguar fácilmente, cómo seleccionar los cebadores adecuados para su uso en los métodos anteriormente descritos. Para más detalles respecto a las técnicas descritas anteriormente, se puede remitir a las publicaciones de Kohsaka, et al., Nuc.Acid.Res., 21:3469-3472, 1993; Bunn, et al., la patente estadounidense No. 5,213,961; y a Innis, et al., PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Acad.Press, 1990.
Los polinucleótidos de SERCA2 detectados como se describe más arriba pueden ser más ampliamente evaluados, detectados, clonados, secuenciados, etc., bien en solución o tras unirlos a un soporte sólido, por cualquier método normalmente aplicado para la detección de una secuencia específica de ADN como la PCR, la restricción oligomérica (Saiki, et al., Biol.Technology, 3:1008-1012, 1985), el análisis con sondas de oligonucleótidos alelo-específicos (ASO) (Conner, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 80:278, 1983), los ensayos de ligación de oligonucleótidos (OLA) (Landegren, et al., Science, 241:1077, 1988), y otros similares. Las técnicas moleculares para el análisis del ADN han sido revisadas y se conocen en el estado de la técnica (Landegren, et al., Science, 242:229-237, 1988).
Habiéndose descrito completamente la invención, se exponen más abajo ejemplos que ilustran su uso. Estos ejemplos, sin embargo, no deberían considerarse como limitantes del campo de la invención, que se define por las reivindicaciones adjuntas.
En los ejemplos, la abreviatura "min." se refiere a minutos, "hrs" y "h" se refiere a horas, y las unidades de medida (como "ml") se indican con las abreviaturas habituales.
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Ejemplo 1 Construcción de transgenes que codifican para SERCA2
Un mapa de una construcción de adenovirus bajo el control de un enhancer del citomegalovirus humano (CMV) y del promotor de la \beta-actina de pollo que codifica SERCA2 se muestra en la Figura 3. En resumen, la construcción se ha hecho utilizando un plásmido pCAGGS como material de inicio (descrito en Niwa, et al., Gene, 108:193-200, 1993). El plásmido contiene el sistema enhancer CMV/promotor \beta-actina.
La transcripción en el plásmido pCAGGS comienza en el primer exón \beta de pollo (longitud de 200 pb), seguido por el primer intrón y 92 pb del segundo exón \beta de pollo. A este fragmento, un clon genómico modificado del polinucleótido de SERCA2 de rata, modificado por el acortamiento del primer exón desde la posición 218 pb hasta la 398 pb seguido por el codón de iniciación en la posición 500, seguido por el primer intrón de SERCA2, el segundo exón, el segundo intrón y parte del tercer exón, se unió al extremo 3' del segundo exón de la \beta-actina de pollo. La parte restante del tercer exón de SERCA2 y las regiones codificantes se unieron en un marco de lectura al tercer exón unido. La construcción resultante por lo tanto contiene 1.8 kb del promotor CMV/\beta-actina, 4.0 kb de la secuencia codificadora de SERCA2 y 0.6 kb de la secuencia de los intrones. A través de la transfección del vector en miocitos neonatales, se confirmó que la construcción codificaba para SERCA2 de forma específica de tejido (cardiaco).
Para el control de la expresión transgénica, la construcción se modifica aún más para incluir un operador de tetraciclina (tetO). En este sentido, un transactivador quimérico denominado transactivador controlado por tetraciclina (tTA) el cual está constituido por la secuencia que codifica para los dominios de unión a tetraciclina (tet) del inhibidor bacteriano de tet, fusionado al dominio de transactivación de la proteína 16 del virus herpes simple (VP16), puede estimular considerablemente la transcripción de muy pocos promotores que contienen las secuencias de tetO. Debido a la alta afinidad a tTA y al hecho de que el tTA ocupado con tet no se une a tetO, la tetraciclina inhibe la transactivación dependiente de tTA. Así, en animales que tienen un transgen expresable bajo el control del sistema tetO, la exposición a la tetraciclina inhibe la expresión del transgen (ver, p. ej., los resultados publicados en Chiang and Roedor, Peptide Res., 6:62-64, 1993). La exposición a tetraciclina a niveles suficientes como para regular la actividad del transgen no conduce a alteraciones en la función cardiaca.
Con este fin, un plásmido (p. ej., p10-03) que contenga el sistema tetO se usará como una fuente de tetO (para ser liberada mediante digestión). El fragmento tetO se aísla sobre un gel de agarosa y se purifica. El fragmento tetO es entonces insertado en el extremo 5' del transgen de SERCA2 en lugar del promotor de CMV/\beta-actina. Se muestra un mapa del plásmido resultante en la Figura 1.
Los animales que expresan el transgen para la proteína VP16 y los animales que expresan el transgen de tetO/
SERCA2 se producen como se describe más arriba. Los animales se cruzan entonces para producir descendientes en los que la expresión de SERCA2 se regula mediante la exposición a tetraciclina (p. ej., a partir de un fluido fuente que contenga hidrocloruro de tet en una concentración de alrededor de 0.1 g/ml). Mediante el empleo de ratas como receptores del transgen y el mantenimiento de la línea fundadora en ratas Sprague-Dawley, se espera que la transmisión del transgen ocurra en al menos el 15% de la descendencia transgénica.
Como se detalla más abajo, la expresión del transgen de SERCA2 en los animales receptores y su descendencia se confirmó mediante la detección del ARNm de SERCA2 y los niveles de proteína en muestras histológicas y de fluidos tomadas de los animales que son positivos para el transgen de SERCA2 con el promotor CMV/\beta-actina o bien para el transgen de SERCA2 con el tetO. En general, la expresión de cualquiera de los transgenes alcanza su máximo a los 10-14 días tras la activación de la transcripción, disminuyendo después.
Confirmando la presencia del transgen de ADN en los animales transgénicos, se muestran los resultados de un análisis de Southern blot del ADN genómico procedente de células de tejido obtenidas de la cola de los animales transgénicos en la Figura 4. En el análisis se utilizó como sonda un fragmento Ap1 de 800 pb (compuesto de 900 pb de la secuencia de la \beta-actina de pollo y 300 pb de la secuencia de SERCA2) derivado del plásmido pCMV- \beta-actina (Figura 3). Los Carriles 1-3 representan los resultados obtenidos de animales fundadores positivos para el transgen mostrando la presencia del polinucleótido de SERCA2; el Carril 4 representa los resultados obtenidos de un animal control; y, el Carril 5 muestra los resultados obtenidos de analizar 1 ng de plásmido SERCA2 con CMV/\beta-actina cortado con Ap1.
Confirmando la presencia del transgen de ARN en los animales transgénicos, se muestran los resultados de un análisis de Northern blot de ARN cardiaco obtenido de animales transgénicos con SERCA2 y animales control. En el análisis se utilizó como sonda fragmentos que se extienden entre los puntos de unión, en el plásmido de la Figura 3, entre la región codificante de \beta-actina y la región codificante de SERCA2 (comprendiendo 100 pb del primero y 126 pb del último). Las sondas comprenden la región codificante de SERCA2, empleándose también el ARN 28S y la cHSP (proteína de choque térmico) 70. Los Carriles 1 y 2 representan los resultados obtenidos de los animales control, mostrando una señal para SERCA2 pero no para el transgen; los Carriles 3 y 4 representan los resultados obtenidos de animales transgénicos que muestran señales para el polinucleótido de SERCA2 y para el transgen. En los animales transgénicos, el ARNm del transgen de SERCA2 se detecta sobre el 30% del nivel endógeno de ARNm de SERCA2, lo que es equivalente a los niveles de ARNm de SERCA2 en los animales control.
Confirmando la expresión de la proteína SERCA2 a través del transgen en los animales transgénicos, se muestran los resultados de un análisis de Western blot en la Figura 6. Los dos primeros carriles ilustran los patrones de unión observados cuando en el análisis se utilizó como sonda suero preinmune procedente de los animales y un AcM anti-\alpha-actina sarcomérica. El carril del medio contiene marcadores del peso molecular; la proteína de alrededor de 110,000 en cualquier otro carril representa SERCA2, con un carril no específico en los 70,000 MW y un carril de actina sobre los 43,000 MW. Los dos últimos carriles muestran el patrón observado cuando en el análisis se utilizó como sonda un AcM frente a SERCA2 de rata en una dilución 1:500. De esta forma, se obtiene un exceso de expresión de SERCA2 en estos animales transgénicos.
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Ejemplo 2 Modelos de sobrecarga de presión e hipertrofia cardiaca en animales transgénicos que expresan SERCA2 y en animales control
Para evaluar el impacto de la expresión adicional de SERCA2 en animales transgénicos positivos bajo condiciones que simulan las de los corazones con ICC, se trataron los animales según grupos de sexo, edad y peso para inducir estenosis cardiaca, para desarrollar constricción aórtico abdominal y para sufrir sobrecarga salina. Bajo tales condiciones, estos animales desarrollan hipertrofia cardiaca (HC) y anormalidades cardiacas asociadas con la sobrecarga de presión del corazón (OP), condiciones que predominan en el corazón con ICC. Para la especificidad de tejido cardiaco en la expresión del transgen, se emplearon animales transgénicos SERCA2 con CMV/\beta-actina.
En resumen, para desarrollar estos animales, los animales transgénicos (ratas con alrededor de 200-250 g de peso corporal), desarrollados como se describió en el Ejemplo 1, y los animales control se anestesian mediante el aislamiento de la aorta abdominal al nivel de la arteria celiaca y, en los animales transgénicos, por constricción quirúrgica de la aorta por encima de la arteria renal empleando un hemoclip de acero inoxidable (Edgard Weck & Co., North Carolina). Este último procedimiento da lugar a una reducción de la luz aórtica de aproximadamente el 50%.
Unos dos días después de la cirugía, se inyecta intramuscularmente a los animales transgénicos con la constricción aórtica dos veces a la semana con desoxicortisona suspendida en aceite de sésamo (25 mg/g de peso corporal) y se les administra un 1% de cloruro sódico en el agua de beber. Todos los animales son controlados mediante ultrasonidos cardiacos (ecocardiografía) para el desarrollo de HC, que generalmente aparece en 1-2 semanas tras la operación. Además, los animales sufren una fase de daño aguda por la imposición de la sobrecarga de presión.
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Ejemplo 3 Respuestas adaptativas de los animales transgénicos a las condiciones de la ICC
Los animales transgénicos evaluados a las 6 semanas de la cirugía sufrieron una disminución significativa en la transcripción del gen de SERCA2 (como se determinó mediante la detección de los niveles de ARNm para SERCA2), y típicamente comienzan a sufrir fallo cardiaco a las 10-12 semanas. Los niveles de ARNm y de proteína SERCA2 se determinaron por Northern y Western blot como se describió anteriormente o por otras técnicas de análisis (p.ej., la PCR, también descrita anteriormente). Los niveles de actividad enzimática (como los relacionados con los flujos de calcio del RS) y la función ventricular izquierda en los animales transgénicos y en los animales control pueden medirse como se describe más abajo. Los mismos parámetros para la función cardiaca pueden medirse de acuerdo con los protocolos descritos más abajo en otros modelos animales de ICC así como en humanos que reciben tratamiento de acuerdo con el método de la invención.
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Evaluación de la Función de la Contracción Cardiaca A. Protocolo para la Ecocardiografía para Determinar la Función Ventricular (in vivo)
Las imágenes de ecocardiografía se realizan en un modelo animal adecuado con un transductor de arreglo en fase y frecuencia dual que funciona a 7 Mhz y un equipo de ultrasonidos ACCUSON® 128 equipado con un sistema doppler integrado. El tiempo de las pruebas ecocardiográficas se relaciona con los registros electrocardiográficos simultáneos que se obtienen de los electrodos subcutáneos. La profundidad de la imagen se fija en 2 cm y el ángulo del sector en 60º lo que da una frecuencia de reproducción de imágenes de 50 imágenes/seg. La fuente de alimentación es de 75 dB. Las imágenes en 2D se pueden usar para seleccionar la posición adecuada del cursor para el registro en el modo M (que se obtiene a 1000 líneas/seg).
Los animales ligeramente anestesiados se colocan boca abajo y se toma la imagen a través del espacio intercostal izquierdo cerca del esternón. Las vistas del eje paraesternal largo y corto se obtienen y se graban en cinta de vídeo, y como se indicó anteriormente, las vistas 2D se emplean para guiar la posición del cursor para los registros en el modo M que se realizan a nivel ventricular medio. Todas las medidas relevantes se hacen a partir del registro en modo M guiado por 2D utilizando los criterios clínicos recomendados por la Sociedad Americana de Ecocardiografía. El grosor de la pared septal se mide a partir del borde anterior hasta el borde de salida al final de la diástole.
El endocardio de la pared posterior, identificado como la línea con la máxima curva sistólica, se mide desde el borde anterior de la pared posterior hasta el borde anterior del límite epicardial al final de la diástole. El tamaño del ventrículo izquierdo al final de la diástole (LVEDD) se mide a partir del borde de salida del septo intraventricular hasta el borde anterior de la pared posterior en el punto de máximo diámetro ventricular. El tamaño del ventrículo izquierdo al final de la sístole (LVESD) se mide empleando el mismo criterio en el punto de mínimo diámetro ventricular. El acortamiento fraccional (FS) como indicador de la función sistólica se calcula como [(LVEDD-LVESD)/(LVEDD)]º100.
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B. Protocolo para la Cateterización con Micromanómetro para Extraer Muestras de Fluido y para Determinar los Parámetros Hemodinámicos en el Corazón (in vivo)
Como se ilustra en ratón, los ratones adultos (controles y transgénicos, con o sin PO) con peso entre 20-30 g se anestesian con una mezcla de ketamina (100 mg/kg, IP) y xilacina (5 mg/kg, IP). Bajo el microscopio de disección se colocan los ratones en posición supina y se realiza una incisión en la línea media cervical para dejar expuestas la tráquea y las arterias carótidas.
Se hace pasar por la tráquea una aguja de punta roma y calibre 20 para que sirva como cánula traqueal que se conecta a un ventilador de volumen cíclico para roedores (Harvard Apparatus) con un volumen total de 0.2 ml y una tasa respiratoria de 100/min. Se determina la ventilación más adecuada a través de una inspección visual de la expansión del pecho. Tras la intubación, se canula una arteria carótida con un catéter relleno de un fluido (PE dilatado para intubar) para medir la presión aórtica. Se abre entonces el pecho y se coloca un micromanómetro 2F de alta fidelidad (Millar) a través de la válvula mitral y se asegura dentro del ventrículo izquierdo (VI).
Los parámetros hemodinámicos de controlan continuamente mientras que se mide la presión sistólica y diastólica del VI, la dP/dt máxima y mínima y la presión aórtica (utilizando, por ejemplo, un equipo de detección en línea). Los datos se obtienen a una tasa de 1500 muestras/seg y la respuesta de frecuencia del catéter de alta fidelidad es plana sobre los 10,000 Hz. Estas altas tasas de obtención de muestras se requieren para la medida precisa de dP/dt en ratón por su rápida frecuencia cardiaca (que varía entre 300-500/min).
El análisis fuera de línea de los parámetros hemodinámicos puede incluir la medida de la presión mínima y máxima del VI y de la presión aórtica, además del cálculo de la constante de tiempo de la declinación de la presión del VI (tau). La determinación del valor de tau, el cual refleja especialmente la fase inicial isovolumétrica de la relajación diastólica, está estrechamente relacionada con la función de SERCA2.
C. Protocolo para la Determinación del Acortamiento de Miocitos en Biopsias de Tejido Muscular Aislado (in vitro)
Como se indica en el protocolo en ratas, se extirpa el músculo papilar del ventrículo izquierdo, evitando la dilatación pasiva, en solución oxigenada de Tyrode que contiene 25 mM de BDM para minimizar la lesión por el corte y prevenir la contractura. Los extremos son unidos mediante puntos cortos de sutura de seda 5-0 a la pared ventricular y a los extremos de las válvulas evitando que queden demasiado forzados. Un extremo del músculo debe unirse a una varilla de cristal de un transductor de fuerza Isométrico Cambridge 400 (5 g de escala completa, 100 \mug de resolución) y el otro extremo unirlo al pequeño gancho de acero inoxidable en una etapa de traslación (Newport 423 \pm 1 \mum) para controlar la longitud muscular. Para una visualización conveniente, se colocará 1 ml del lecho a evaluar en el campo de visión del un microscopio estéreo Olympus SZ45. Se mantiene la temperatura del lecho a 33ºC.
El músculo estará entonces ajustado a una longitud no muy tensa a la cual la fuerza restante se registra en el canal del transductor, se elimina por lavado el BDM y los electrodos de estimulación bipolar se bajan hasta el lecho (utilizando, por ejemplo, un equipo estimulador de Gras). Los músculos se estimulan a 0.2 Hz (20% del umbral superior), y tras 30 minutos, el superfusato se cambiará de 0.5 a 2.0 mM [Ca^{2+}]. Todos los perfusatos se trataran con O_{2} al 100%. El desarrollo de la tensión isométrica de estado estable se medirá en los incrementos de la longitud muscular y se expresarán como fracciones de L_{máx} en las cuales el desarrollo de la tensión es máximo. Para corregir la corta longitud de las muestras de músculo empleadas (en la extrapolación de resultados al rendimiento del tejido muscular in vivo), la tensión de acortamiento en el momento de máxima tensión se mide usando pares de microesferas superficiales localizadas en el músculo y grabadas con una cámara de vídeo.
La posición de los marcadores se detecta y digitaliza preferentemente utilizando un NIH Image 1.47 en un Macintosh Centris 650 con un tablero para la captura de imágenes de vídeo. Corregir la escala de la longitud mediante el uso de tensión con respecto a cualquier longitud fija de referencia se ha demostrado que elimina el descenso del miembro de la curva de tensión-longitud.
La contractilidad se expresa como la pendiente de la relación isométrica presión/tensión, en la que la presión se calcula a partir de la tensión desarrollada (reposo total) dividida por el área del corte transversal del músculo. El área del corte transversal se estima tras evaluaciones mecánicas mediante la división del volumen del espécimen (determinado a partir de su peso) por la longitud de músculo descargado entre los extremos. La repetición de estos protocolos como una función de la concentración de Ca^{2+} extracelular entre 0.5 y 2.5 mM permitirá caracterizar la sensibilidad subyacente al Ca^{2+} de estas preparaciones.
Para caracterizar más profundamente la función de SERCA2 y el acoplamiento EC en estos experimentos, se estudia la función del bombeo mediante la medida del tiempo de relajación cuando el intercambio de Na/Ca se bloquea con solución Tyrode libre de Na y cuando la acumulación de calcio del retículo sarcoplásmico se bloquea con 10mM de cafeína. Cuando el intercambio de Na/Ca se cronometra, el tiempo de relajación se hace más lento en un 30%. Las propiedades de relajación de los músculos evaluados se determinarán en función de la longitud del músculo y del calcio a partir del rastreo de la tensión isométrica registrada en el gráfico de registro (p. ej., registrador Gould 2200) y el sistema de adquisición de datos microcomputerizado (disponible comercialmente en, por ejemplo, Strawberry Tree) a alta velocidad (40 mm/seg). Los parámetros medidos incluirán el tiempo hasta el momento máximo de tensión hasta el 90% de recuperación y la constante exponencial de tiempo del decrecimiento de la fuerza isométrica. Estas mediciones estarán también sujetas, y son corregibles, al artefacto descrito más arriba, ya que los estudios han demostrado que la relajación isométrica se prolonga significativamente cuando la longitud del músculo se controla para mantener la longitud del sarcómero en la constante del músculo central intacto.
Utilizando el mismo enfoque descrito anteriormente, los estudios de contractilidad pueden llevarse a cabo también empleando trabéculas, largas, finas y uniformes, asiladas bajo un microscopio de disección del ventrículo izquierdo de ratas. Los estudios que han usado trabéculas proporcionarán más información sobre las alteraciones absolutas en el mecanismo de contracción diastólica independiente de artefacto debido a las series de elastancia del músculo no disponibles a partir de preparaciones convencionales de músculo papilar. Otras zonas de la pared del ventrículo izquierdo pueden usarse para aislar miocitos cardiacos para los estudios de detección del umbral y del flujo de Ca^{2+} intracelular.
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D. Protocolo para el Aislamiento de Miocitos Cardiacos y la Evaluación de los Niveles de los Flujos de Calcio (in vitro)
Los miocitos cardiacos pueden prepararse a partir de corazones de ratas adultas utilizando un método de perfusión de colagenasa. Los miocitos pueden mantenerse en ausencia o en presencia de suero fetal de ternero al 4% durante al menos 4 días y mantener las características morfológicas y metabólicas de los miocitos cardiacos adultos. A partir del corazón de una rata adulta, se pueden obtener 9-10x10^{6} miocitos viables.
Los miocitos cardiacos también pueden prepararse a partir de fragmentos de pared ventricular. Esto permitirá determinar la función miocítica, la función del músculo papilar y los parámetros relacionados con la expresión del gen de SERCA2 y la función de SERCA2, obtenido todo del mismo corazón. Con este fin, el tejido ventricular se tritura y se lava en un medio mínimo esencial (MEM) de Joklik modificado y libre de Ca^{2+} complementado con 25 mM de NaHCO_{3}; 3.4 mM de MgCl_{2}; 30 mM de taurina, y 2 mM de carnitina. El tejido se digiere entonces con un MEM que contiene 0.1% de colagenasa tipo II (Wortington); 0.1% de la fracción V de la BSA, y 25 \muM de CaCl_{2}. La digestión enzimática se continúa durante 30-40 minutos mientras se agita suavemente el tejido a 32ºC bajo oxigenación continua. La completa dispersión de las células se logra finalmente mediante una trituración suave con una pipeta serológica de calibre ancho.
Se filtran entonces las células con una malla de nylon de 300 \muM y se lavan. Los niveles de calcio se incrementan entonces de forma gradual hasta una concentración de campo de 1 \muM. Este procedimiento puede producir hasta 2x10^{6} células/corazón de las cuales el 60-70% son miocitos viables con forma de varilla que pueden emplearse en los estudios descritos más abajo.
Los miocitos cardiacos aislados de ratas adultas (no recubiertos) se suspenden en 10 ml de una solución que contiene 118 mM NaCl; 4.8 mM KCl; 1.2 mM de NaH_{2}PO_{4}; 1.2 mM de SO_{4}; 1 mN de CaCl_{2}; 11 mM de glucosa y 25 mM de ácido Na-N-2-hidroxietilpiperacina-N-2-etanosulfónico; 500 \mul de la suspensión celular se añaden a 1.5 ml de solución de Tyrode normal y se añaden 5 \mul de una solución 1 mM de acetometoximetil éster derivado de Indo I en DMSO. Las células se incuban a temperatura ambiente durante 15-20 minutos. Se seleccionan entonces las células para su estudio basándose en la uniformidad de la carga de Indo I y en la morfología celular con células con forma de varilla y buenas estriaciones. Se transfieren las células a una cámara pequeña de perfusión montada sobre la base de un microscopio Nikon Diaphot equipado con lentes de cuarzo. Se deja que las células se depositen en la base de la cámara de perfusión y se perfunde de forma continua a 5 ml/min con solución Tyrode a la que se le aplica una composición gaseosa de O_{2} al 90% y CO_{2} al 5% y se mantiene a 37ºC. Se lleva a las células a 0.2, 0.33, 1.0, 2.0 y 5.0 Hz con un electrodo externo de platino y se miden los flujos de calcio fluorométricamente. Se pueden llevar a cabo también estudios similares usando miocitos de ratas neonatales o de ratón. La infección de los miocitos neonatales con Adv SERCA2 reduce considerablemente el flujo de calcio.
Con respecto a los niveles de los flujos de calcio, el tiempo para tener una reducción máxima en los flujos de calcio ^{2+} se acortó significativamente en los miocitos transgénicos positivos para SERCA2 hasta un grado similar al observado in vitro (Ejemplo 5; Figura 8: p<0.05). Con respecto a las presiones ventriculares, la máxima presión conseguida en el ventrículo izquierdo (LVdP/dt máx) se incrementó significativamente en los animales transgénicos, mientras que a niveles mínimos, los músculos ventriculares mostraron una tendencia hacia una relajación diastólica más rápida en los animales transgénicos (n=3; si se compara con los controles donde n=5). Los niveles de ARNm y de proteína SERCA2 detectados en los animales se describen en el Ejemplo 1 y se muestran en las Figuras 5 y 6. Estos datos prueban el principio de que el transporte de calcio y la relajación diastólica del músculo cardiaco se ven afectados de forma beneficiosa por la aplicación del método de la invención en un modelo animal predictivo.
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Ejemplo 4 Construcción de un vector de adenovirus que expresa SERCA2
La construcción se formó mediante la clonación del polinucleótido de SERCA2 dentro de un vector lanzadera que contiene un promotor, un polylinker y unas secuencias adenovirales parciales flanqueantes de las que las regiones codificantes para E1a y E1b han sido eliminadas, el plásmido resultante se cotransfecta entonces (mediante técnicas convencionales de precipitación de calcio/fosfato) dentro de células 293 con el plásmido JM17, un plásmido que contiene el genoma del adenovirus tipo 5 humano completo con un inserto adicional de 4.3 kb (el producto de la construcción es demasiado grande para ser encapsulado; ver, Figura 2 [mapa del vector]). La recombinación homóloga de rescate da lugar a vectores de adenovirus que codifican para SERCA2 pero propagados en células 293 que han sido transformadas con las proteínas de fase temprana E1a y E1b.
Más específicamente, se construyó un vector de adenovirus defectivo para la replicación como se describe en Graham, EMBO J., 3:2917-2922, 1984. El vector tiene un límite de inserción de unas 5 kb. El transgen se clona dentro de un lugar XbaI de un plásmido lanzadera pAC1, que contiene secuencias 5' de adenovirus flanqueando un lugar XbaI. En este caso, el transgen incluye enhancers de SV40, un minigen que codifica para SERCA2 y o bien un promotor TK o bien un promotor CMV, siendo preferido este último. Cada enhancer de SV40 contiene 70 pb. Un promotor de CMV útil que contiene una fuente de plásmidos es pACCMVpLPA, donde 670 pb del promotor de CMV incluyen secuencias más allá del inicio de la transcripción seguidas de un lugar de clonación múltiple que facilita considerablemente el proceso de clonación (ver, para un descripción del plásmido pACCMVpLPA, McPhaul, et al., J.Biol.Chem., 268:26063-26066, 1993). En cada caso, el inicio de la transcripción estará en el promotor, cuyo tamaño total variará en función del promotor usado.
El promotor se une mediante la unión de extremos romos al clon de ADNc de SERCA2 de rata. El clon de SERCA2 contiene la secuencia codificante completa incluyendo las señales de terminación y de poliadenilación. El primer exón transcrito y no traducido del gen de SERCA2 se acortó por las primeras 232 pb. El extremo 5' del ARNm de SERCA2 que se corresponde con el primer exón contiene, por lo tanto, 268 pb 5'desde el inicio de traducción en lugar del primer exón de longitud completa. Un fragmento correspondiente con el exón de longitud completa contendría 500 pb 5' desde el punto de inicio de la traducción. El transgen de SERCA2 que se usa es, por lo tanto, 181 pb más corto que el ARNm de SERCA2 transcrito a partir de clon genómico.
Las células transfectadas se controlan por la evidencia de efectos citopáticos durante 10-14 días tras la transfección. Para identificar a los recombinantes exitosos, el sobrenadante de las placas que muestran un efecto citopático se trata con proteinasa k (50 mg/ml con dodecil sulfato de sodio al 0.5% y 20 mM de EDTA) a 56ºC durante 60 min., después de extraen con fenol/cloroformo y se precipitan con etanol. Los recombinantes exitosos se identifican con una PCR que usa cebadores complementarios al promotor del CMV y a las secuencias de poliadenilación del SV40 o al promotor TH para amplificar el inserto. Los cebadores se diseñan también para amplificar concomitantemente las secuencias adenovirales. La presencia del ARNm de SERCA2 en los transfectantes se confirma por análisis Northern como se muestra en la Figura 7; "HH-1", "HH-2" y "SA1-SA3" son las construcciones de CMV/SV40, mientras que "TK" es la construcción del promotor TK y "ctrl" indica una construcción control sin el polinucleótido de SERCA2.
Los recombinantes exitosos se someten entonces a dos rondas de purificación en placa. Las reservas virales se propagaron en células 293 hasta títulos que varían entre 10^{10} y 10^{12} partículas virales, después se purificaron mediante centrifugación en doble gradiente de CsCl de forma previa a su uso. Las células se infectaron con una confluencia del 80% y se recogieron a las 36-48 horas. Tras varios ciclos de congelación-descongelación, los restos celulares se separaron mediante centrifugación estándar y el virus se purificó aún más mediante ultracentrifugación en doble gradiente de CsCl (gradiente discontinuo de CsCl 1.33/1.45; cesio preparado en Tris 5 mM, EDTA 1 mM (pH 7.8) a 90,000x g durante 2 hrs., después a 105,000x g durante 18 hrs.).
Previamente a su uso in vivo, las reservas virales se desalinizaron mediante filtración en gel a través de columnas de SEPHAROSA® (es decir, G25 SEPHADEX®). Las reservas virales resultantes tenían un título viral final en el rango de 10^{10} a 10^{12} partículas virales. La construcción adenoviral fue altamente purificada; esto es, con ninguna contaminación detectable de partículas replicativas (cepa salvaje).
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Ejemplo 5 Evaluación in vitro de la función miocítica cardiaca tras la transfección con un vector de adenovirus que expresa SERCA2
Se midieron los flujos intracelulares de calcio en miocitos cardiacos aislados como se describió en el Ejemplo 3 y se transfectaron con construcciones de vectores de adenovirus hechos como se describe en el Ejemplo 4. En resumen, los miocitos cardiacos neonatales se transfectan con el vector adenoviral de SERCA2 y se midieron los flujos de calcio de la forma descrita en el Ejemplo 3 y se compararon con células control (sin transfectar). En la Figura 8, la célula #42 es representativa del comportamiento medio de los miocitos cardiacos neonatales transfectados (ADV). Como se muestra en la Figura 8, el tiempo hasta la reducción máxima en los flujos de calcio se acortó en un 33\pm19% (n=4; p\leq0.01) en las células transfectadas en comparación con las células control. Estos datos proporcionan la prueba de que los flujos de calcio mejoran en miocitos transfectados con SERCA2 ADV, un resultado que, si se midiera in vivo, promovería la relajación diastólica de forma más rápida en el músculo cardiaco (ver, Ejemplo 3).
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Ejemplo 6 Transfección in vivo con SERCA2/ADV de miocitos cardiacos en miocardio de cerdo y respuestas inmunes a la misma
Se modificó el vector SERCA2/ADV descrito en el Ejemplo 4 para incluir un gen que codifica operativamente para la \beta-galactosidasa como molécula marcadora. Un cerdo sin anestesiar, ventilado, de 40 kg, se sometió a una toracotomía y aislamiento de las arterias coronarias descendente anterior izquierda y circunfleja izquierda. Se insertó una aguja mariposa de calibre 26 dentro de la mitad izquierda anterior descendente (LAD) de la arteria coronaria y el vector (1.5 x 10^{5} partículas virales) se inyectó en un volumen de 2 ml. Se cerró entonces la caja torácica y se permitió al animal que se recuperara del procedimiento.
Cuatro días después de la operación, el animal fue sacrificado por medios humanos. Se sacó el corazón y se fijó con glutaraldehído perfundido, se seccionó y se incubó con X-gal durante 16,5 horas. Después de ser embebido y seccionado, el tejido se tiñó con eosina.
El análisis microscópico de las secciones de tejido (sección transmural de un lecho de LAD 72 horas después de la inyección intracoronaria del vector) confirmó que el 50-60% de las células fueron marcadas positivamente por la presencia de la molécula marcadora \beta-gal. El control negativo proveniente de áreas de miocardio lejanas del lugar de la inyección, donde el marcaje con \beta-gal no se observó. En este estudio, así como en repeticiones sucesivas del mismo mostrando la expresión génica tras 14 días (n=5), no se observó ninguna evidencia de inflamación o necrosis en los lugares de transfección.
Se han descrito diferentes realizaciones de la presente invención. Sin embargo, se comprenderá que varias modificaciones pueden ser introducidas sin salirse del origen y campo de la invención. De acuerdo a esto, se entiende que la invención no está limitada por las realizaciones específicas que ilustran la invención, sino sólo por el ámbito de protección ofrecido por las reivindicaciones adjuntas.
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Referencias citadas en la descripción
La lista de referencias citadas por el solicitante es, únicamente, para conveniencia del lector. No forma parte del documento de patente europea. Si bien se ha tenido gran cuidado al compilar las referencias, no pueden excluirse errores u omisiones y la OEP declina toda responsabilidad a este respecto.
Documentos de patente citados en la descripción
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Claims (7)

1. Uso de un polinucleótido que codifica operativamente para SERCA2 o un vector de expresión recombinante que contiene un polinucleótido que codifica operativamente para SERCA2, para la preparación de una composición farmacéutica adecuada para el transporte in vivo de los mismos a los miocitos cardiacos de un hospedador, en el tratamiento de la insuficiencia congestiva cardiaca, proporcionando una cantidad terapéuticamente beneficiosa de SERCA2 la cual se expresa de forma suficiente como para restaurar substancialmente la actividad normal de SERCA2 en los miocitos tratados.
2. Uso según la reivindicación 1 donde el vector de expresión recombinante es un virus de ADN.
3. Uso según la reivindicación 2 donde el virus de ADN es un adenovirus.
4. Uso según la reivindicación 3 donde el adenovirus es no replicativo.
5. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4 donde el vector de expresión recombinante o el polinucleótido está contenido en un sistema de dispersión coloidal.
6. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 donde el hospedador es humano.
7. Uso según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 donde el vector de expresión recombinante está diseñado para el transporte al interior del músculo cardiaco del hospedador.
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