ES2294935B1 - Secuencias peptidicas y nucleotidicas de anisakis spp., anticuerpos que reconocen dichas secuencias, y usos de los mismos. - Google Patents
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Abstract
Secuencias peptídicas y nucleotídicas de Anisakis spp., anticuerpos que reconocen dichas secuencias, y usos de los mismos. En la presente invención se proporcionan secuencias de péptidos, polipéptidos y proteínas que mantienen la antigenicidad de las moléculas nativas de Anisakis de las que derivan, así como los ácidos nucleicos que codifican dichas secuencias y anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos para dichos péptidos, polipéptidos o proteínas. Los péptidos, polipéptidos y proteínas descritos, así como los anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos frentes a dichos péptidos, polipéptidos y proteínas son útiles para desarrollar inmunoensayos para el serodiagnóstico de la anisakiosis humana y animal.
Description
Secuencias peptídicas y nucleotídicas de
Anisakis spp., anticuerpos que reconocen dichas secuencias, y
usos de los mismos.
Esta invención se refiere al campo del
diagnóstico, prevención y terapia de infecciones humanas y animales
por especies del género Anisakis. Esta invención también se
refiere a la detección de antígenos de Anisakis en
alimen-
tos.
tos.
El género Anisakis (familia
Anisakidae) incluye parásitos nematodos que pertenecen a
varias especies relacionadas. Mediante el uso de marcadores
morfológicos y genéticos/moleculares actualmente se reconocen 8
especies de Anisakis entre las que se incluyen: a) las
especies gemelas Anisakis simplex "en sentido estricto"
(Rudolphi, 1809), A. pegreffi
(Campana-Rouget y Biocca, 1955) y A. simplex
C (Nascetti et al., 1986, Mattiucci et al., 2002),
antiguamente incluidas en el complejo A. simplex; b) A.
typica (Diesing, 1860); c) A. physeteris (Baylis, 1923);
d) A. brevispiculata (Dollfus, 1966); e) A.
ziphidarum (Paggi et al., 1998); y f) A. paggiae
(Mattiucci et al. 2005).
Las especies de Anisakis alcanzan la
madurez sexual en el estómago de cetáceos y, menos frecuentemente,
en pinípedos. Estos mamíferos pueden infectarse por ingestión de a)
hospedadores paraténicos, es decir, peces (principalmente
teleósteos) y cefalópodos (principalmente calamares), que albergan
la tercera fase larvaria del parásito (L3), y b) por ingestión de
krill, como intermedio, que también alberga las larvas L3 (por
ejemplo, ballenas).
Al igual que los mamíferos marinos, los seres
humanos también pueden infectarse por larvas L3 de Anisakis
mediante la ingestión de peces y calamares crudos portadores del
parásito, lo cual produce una enfermedad clínica denominada
anisakiosis o anisakiasis. Con mucha frecuencia, varios platos de
pescado se consideran de alto riesgo para la infección con especies
de Anisakis. Estos incluyen el sushi y el sashimi japonés,
el arenque salteado o ahumado alemán, el gravlax escandinavo, el
lomi-lomi hawaiano, el cebiche sudamericano y los
boquerones en vinagre españoles ("pickled anchovies").
Cuando las larvas L3 de Anisakis infectan
a seres humanos, a menudo causan síntomas gastrointestinales que
pueden estar asociados con reacciones alérgicas de distinta
gravedad. Dependiendo de la localización de las larvas y los
síntomas dominantes, se han presentado cuatro formas clínicas
principales de anisakiosis (gástrica/gastroalérgica, intestinal,
extragastrointestinal y alérgica) en seres humanos. En la forma
gástrica (aguda) de anisakiosis, la larva penetra la pared gástrica
y frecuentemente se observa un curso clínico caracterizado por
dolor epigástrico agudo, náuseas y vómitos unas pocas horas después
de la ingestión de pescado que contenga larvas de Anisakis
L3 vivas. Los estudios endoscópicos frecuentemente revelan lesiones
consistentes en hemorragias puntiformes, petequias y erosión en el
sitio de penetración. Además, también pueden observarse síntomas
alérgicos (es decir, urticaria/angioedema y algunas veces
anafilaxis) en aproximadamente el 10% de los casos. La combinación
de infección gástrica y síntomas alérgicos se denominó
"anisakiosis gastroalérgica" (Daschner et al., 2000).
Algunos pacientes pueden desarrollar una forma subaguda o crónica
cuyas manifestaciones clínicas incluyen dolor epigástrico,
dispepsia, vómitos y anorexia, que puede persistir durante varios
meses o incluso años.
En la forma intestinal de la anisakiosis, la
larva penetra en la pared intestinal, frecuentemente a nivel del
íleon terminal. En los casos agudos, a menudo se observan la
presencia de dolor abdominal (habitualmente 24-48
horas después de la ingestión del pescado contaminado), acompañado
de náuseas, vómitos, hinchazón abdominal, induración y desviación
del ritmo intestinal establecido con estreñimiento o diarrea. La
observación macroscópica de los tejidos infectados en caso de
anisakiosis intestinal revela lesiones flemonosas caracterizadas
por edema local intenso, petequias, hiperemia e inflamación difusa
de la serosa y el mesenterio. Estas lesiones pueden ocasionar
obstrucción y dilatación proximal del intestino. En una cantidad
importante de pacientes, se puede encontrar líquido ascítico
abdominal con un alto contenido de eosinófilos. En la anisakiosis
intestinal subaguda o crónica, los cambios granulomatosos inducidos
por las larvas conducen a un engrosamiento de la pared, estenosis
luminal y síntomas abdominales
crónicos.
crónicos.
En la forma extragastrointestinal o ectópica, la
larva infectante de Anisakis atraviesa la pared
gastrointestinal, alcanzando la cavidad abdominal y migrando a
órganos y tejidos tales como pulmones, páncreas, hígado, etc. En
estos casos, los síntomas clínicos dependen de la localización
topográfica de la larva.
La forma de anisakiosis alérgica se reserva a
pacientes que tienen reacciones alérgicas después de la infección
con larvas de Anisakis, pero sin síntomas gástricos ni
intestinales. Frecuentemente, los primeros síntomas aparecen muy
pronto, en las primeras horas después de la ingestión del pescado
contaminado y el transcurso clínico sigue el patrón general para
las reacciones alérgicas de tipo I. Su gravedad varía desde una
simple urticaria o angioedema a shock anafiláctico.
Cuando las larvas de Anisakis están
presentes en el estómago, duodeno o colon, el examen endoscópico es
el método preferible para demostrar la infección. Esta técnica
también es útil para extraer las larvas por medio de las pinzas
asociadas al endoscopio, lo cual conduce a la curación del
paciente. No obstante, cuando: a) las larvas no están accesibles
para el examen endoscópico; b) las larvas están parcialmente
destruidas o no son visibles para el endoscopista; o c) los
síntomas predominantes son alérgicos, el método preferible para
confirmar la infección es demostrar la presencia de anticuerpos
específicos en el suero del paciente. Este último también es el
método preferido para demostrar infecciones previas por
Anisakis en individuos asintomáticos.
Entre las diferentes clases de anticuerpos que
se producen contra antígenos de Anisakis durante la
infección, los anticuerpos IgE son los más relevantes ya que: 1)
están implicados en las reacciones alérgicas de tipo I observadas
durante infecciones con Anisakis, y b) ésta es la clase de
inmunoglobulinas más relevante en términos de especificidad entre
las que están presentes en suero de pacientes infectados.
Desde la descripción del primer caso de
infección humana por una larva de Anisakis (Van Thiel,
1960), se han hecho numerosos intentos de desarrollar un ensayo
serológico sensible y específico para detectar anticuerpos
anti-Anisakis de diferentes clases.
Los primeros métodos para medir anticuerpos
anti-Anisakis en suero incluyeron aglutinación del látex
(Akao y Yoshimura, 1989); inmunodifusión doble e
inmunoelectroforesis (Petithory et al., 1986; Tsuji, 1990),
hemaglutinación indirecta (Asaishi et al., 1989; Tsuji,
1989); y ensayo de fijación del complemento (Oshima, 1972; Tsuji,
1989). Todos estos métodos tienen dos inconvenientes principales: a)
carecen de suficiente sensibilidad y especificidad y b) con estas
técnicas no es posible la determinación de anticuerpos IgE
(reagínicos).
Más recientemente, se pudieron realizar
determinaciones de IgE anti-Anisakis en sueros de pacientes
infectados con la introducción de otros inmunoensayos, por ejemplo,
pruebas de radioalergosorbencia (Desowitz et al., 1985;
Yamamoto et al., 1990), ensayos de inmunoabsorción vinculada
a enzimas (ELISA) (Rodero et al. 2002), enzimoinmunoensayos
fluorescentes (UniCap FEIA, Pharmacia & Upjohn Diagnostics AB,
Uppsala, Sweden) e inmunotransferencia (Del Pozo et al.,
1996; García et al., 1997), pero también se presentaron
problemas de sensibilidad y/o especificidad con estos métodos.
La dificultad principal para desarrollar métodos
serológicos útiles para el diagnóstico de Anisakiosis humana
radica en la obtención de antígenos del parásito (en nuestro caso
alergenos) que por una parte (i) sean reconocidos por anticuerpos
IgE presentes en los sueros de todos aquellos pacientes infectados,
y (ii) que la molécula completa (es decir, todos los epítopos
presentes en el alergeno seleccionado) sean específicos del género
Anisakis. De otro modo, se obtendría una baja sensibilidad
y/o reacciones cruzadas que condujesen a falsos positivos.
Se intentó mejorar el serodiagnóstico de
anisakiosis humana usando antígenos de excreción/secreción nativos
completos (ESA) de larvas de Anisakis spp. cultivadas in
vitro (Poggensee et al., 1989; Baeza et al.,
2004), o usando anticuerpos monoclonales para capturar antígenos
específicos diana de extractos brutos de larvas L3 de
Anisakis (Yagihashi et al., 1990; Ubeira e Iglesias,
2000). Sin embargo, los métodos ELISA basados en estas estrategias
también carecían de suficiente especificidad debido a la presencia
de epítopos de reacción cruzada (principalmente O- y
N-glicanos) presentes en las glicoproteínas de
Anisakis, incluyendo ESA.
En la presente invención se proporcionan
secuencias de péptidos, polipéptidos y proteínas que mantienen la
antigenicidad de las moléculas nativas de Anisakis de las que
derivan, así como los ácidos nucleicos que codifican dichas
secuencias y anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para dichos péptidos, polipéptidos o proteínas. Los péptidos,
polipéptidos y proteínas descritos, así como los anticuerpos o
fragmentos de los mismos específicos frentes a dichos péptidos,
polipéptidos y proteínas son útiles para desarrollar inmunoensayos
para el serodiagnóstico de la anisakiosis humana y animal,
careciendo de los inconvenientes de los métodos presentados
previamente.
previamente.
De esta manera, un primer aspecto de la presente
invención proporciona una secuencia de ácido nucleico aislada
(denominada en lo sucesivo secuencia de ácido nucleico de la
invención) seleccionada entre el siguiente grupo:
- a.
- Un ácido nucleico que comprende la SEC ID Nº 1
- b.
- Un ácido nucleico que comprende el ácido nucleico complementario de la SEC ID Nº 1
- c.
- Un fragmento del ácido nucleico de la SEC ID Nº 1 que comprende la SEC ID Nº 15 ó 17
- d.
- Un ácido nucleico que comprende un fragmento de la SEC ID Nº 1 que codifica un tramo contiguo de 8 o más aminoácidos de la SEC ID Nº 2 capaz de ser reconocida por anticuerpos anti-Anisakis.
- e.
- Un ácido nucleico que comprende un fragmento de la SEC ID Nº 1 que codifica un tramo contiguo de 10 o más aminoácidos de la SEC ID Nº 2 capaz de ser reconocida por anticuerpos anti-Anisakis.
- f.
- Un ácido nucleico que comprende un fragmento de la SEC ID Nº 1 que codifica un tramo contiguo de 12 o más aminoácidos de la SEC ID Nº 2 capaz de ser reconocida por anticuerpos anti-anisakis.
\newpage
- g.
- Una secuencia nucleótidica que tiene una identidad de al menos el 70% con cualquiera de las secuencias de ácido nucleico descritas en los apartados (a) a (f). En una realización preferida de la invención, la secuencia nucleótidica tiene una identidad de al menos el 80% con cualquiera de las secuencias de ácido nucleico mencionadas previamente en los apartados (a) a (f) y, en una realización aún más preferida, dicha secuencia nucleótidica tiene una identidad de al menos el 90% con cualquiera de las secuencias de ácido nucleico mencionadas previamente en los apartados (a) a (f).
Un segundo aspecto de la presente invención
proporciona un polipéptido, péptido o proteína aislada (denominada
en lo sucesivo secuencia de aminoácidos de la invención)
seleccionada entre el siguiente grupo:
- a.
- Un polipéptido que comprende la SEC ID Nº 2
- b.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende la SEC ID Nº 16 ó 18
- c.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende un tramo contiguo de 8 o más aminoácidos capaz de ser reconocido por anticuerpos anti-Anisakis.
- d.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende un tramo contiguo de 10 o más aminoácidos capaz de ser reconocido por anticuerpos anti-Anisakis.
- e.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende un tramo contiguo de 12 o más aminoácidos capaz de ser reconocido por anticuerpos anti-anisakis.
- f.
- Una secuencia de aminoácidos que tiene una identidad de al menos el 70% con cualquiera de las secuencias de aminoácidos descritas en los apartados (a) a (e) en este punto. En una realización preferida de la invención, la secuencia de aminoácidos tiene una identidad de al menos el 80% con cualquiera de las secuencias de aminoácidos descritas previamente en los apartados (a) a (e) en este punto y, en una realización aún más preferida, dicha secuencia de aminoácidos tiene una identidad de al menos el 90% con cualquiera de las secuencias de aminoácidos descritas previamente en los apartados (a) a (e) en este punto.
Todos estos péptidos, polipéptidos o proteínas
pueden ser empleados para superar la dificultad principal de
desarrollar métodos serológicos útiles para el diagnóstico de la
anisakiosis humana, al proporcionar antígenos del parásito
específicos del género Anisakis y que son reconocidos por
los anticuerpos IgE presentes en los sueros de todos los pacientes
infectados por Anisakis.
Una realización preferida de la invención se
refiere a una secuencia de aminoácidos que pueda ser reconocido por
anticuerpos anti-Anisakis y que comprenda un fragmento con
un tramo contiguo de al menos 8 o más aminoácidos y con una
identidad de al menos el 70% con cualquier fragmento de la SEC ID Nº
2, seleccionado de entre las siguientes secuencias de
aminoácidos:
- a.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 7
- b.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 8
- c.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 9
- d.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 10
- e.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 11
- f.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 12
- g.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 13
- h.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 14
En un tercer aspecto, la secuencia de
aminoácidos de la invención se produce, pero sin limitamos a
cualquiera de las siguientes técnicas:
- a.
- Técnicas recombinantes
- b.
- Síntesis química y
- c.
- Purificación sustancial a partir de nematodos de la familia Anisakidae
Un cuarto aspecto de la invención se refiere a
un péptido, polipéptido o proteína que comprende dos o más de las
secuencias de aminoácidos de la invención.
Un quinto aspecto de la invención se refiere a
una molécula de ácido nucleico sintética o recombinante que
comprende una secuencia de ácido nucleico que codifica una o más de
las secuencias de aminoácidos de la inven-
ción.
ción.
Un sexto aspecto de la invención se refiere a
una secuencia de ácido nucleico o aminoácidos aislada de la
invención, marcada con una molécula de señalización. En una
realización preferida de la invención, dicha molécula marcadora se
selecciona, pero sin limitamos a cualquiera de las moléculas de
señalización del siguiente grupo:
- a.
- Radiactivas
- b.
- Enzimáticas
- c.
- Fluorescentes
- d.
- Luminiscentes
- e.
- Quimioluminiscentes
- f.
- Coloreadas
En una realización preferida de la invención, la
molécula de marcaje se selecciona, pero sin limitamos a cualquiera
de las moléculas de señalización del siguiente grupo:
- a.
- Biotina o sus derivados
- b.
- Derivados de nitrofenol
- c.
- Oro coloidal
- d.
- Látex
- e.
- Fluoresceína
Un séptimo aspecto de la invención se refiere a
un anticuerpo o fragmento del mismo (denominado en lo sucesivo
anticuerpo de la invención) capaz de interaccionar con cualquiera
de las secuencias de aminoácidos de la invención. También forman
parte de la presente invención las secuencias de ácido nucleico
capaces de codificar cualquiera de los anticuerpos de la
invención.
En una realización preferida, dicho anticuerpo
de la invención es el anticuerpo producido por la línea celular de
hibridoma con el número de depósito DSM ACC2793 depositado el 15 de
junio de 2006 en el "German Collection of Microorganisms and Cell
Cultures (DSMZ)" (de aquí en adelante anticuerpo UA3).
Una realización adicional se refiere a la línea
celular de hibridoma con número de depósito DSM ACC2793 con fecha
de depósito 15 de junio de 2006 depositada en la institución
DSMZ.
Una realización adicional de la invención se
refiere a las secuencias de reconocimiento de antígenos de
cualquiera de los anticuerpos de la invención, particularmente las
secuencias de reconocimiento de antígenos del anticuerpo
UA3.
UA3.
Otro aspecto de la invención proporciona una
secuencia de aminoácidos aislada de la invención, donde dicha
secuencia de aminoácidos está fusionada o acoplada químicamente a
un péptido, polipéptido o proteína adicional.
Otro aspecto de la invención se refiere a un
vector de expresión o sistema de expresión (denominado en lo
sucesivo sistema de expresión de la invención) que comprende una
secuencia de nucleótidos de la invención.
Otro aspecto de la invención proporciona una
célula hospedadora procariota o eucariota aislada (denominada en lo
sucesivo célula hospedadora de la invención) transformada o
transfectada con una secuencia de ácido nucleico de la invención o
con un vector o sistema de expresión de la invención.
Un octavo aspecto de la invención se refiere a
un método para producir un péptido, polipéptido o proteína
recombinante codificada por una secuencia de ácido nucleico de la
invención, donde dicho método comprende cultivar una célula
hospedadora de la invención en condiciones tales que se exprese y
se produzca dicha secuencia de nucleótidos y después aislar dicho
péptido, polipéptido o proteína.
Un noveno aspecto de la invención se refiere a
un método in vitro para detectar anticuerpos contra
Anisakis spp. en una muestra biológica aislada,
preferiblemente suero, que comprende:
\newpage
- a.
- poner en contacto una muestra biológica con una secuencia de aminoácidos de la invención, en condiciones suficientes como para formar un complejo inmunológico entre dicho polipéptido y los anticuerpos de la muestra, y
- b.
- detectar dicho complejo inmunológico.
En una realización preferida de la invención, el
método in vitro es un inmunoensayo o un inmunoensayo
enzimático.
Un décimo aspecto de la invención se refiere a
un método in vitro para detectar antígenos de
Anisakis spp. en una muestra, preferiblemente una muestra
biológica, o un extracto alimentario, que comprende:
- a.
- poner en contacto la muestra biológica o extracto alimentario con un anticuerpo de la invención, en condiciones suficientes para formar un complejo inmunológico entre dicho anticuerpo y los antígenos de la muestra y
- b.
- detectar dicho complejo inmunológico.
En una realización preferida, el anticuerpo de
la invención que se usa para detectar antígenos de Anisakis
spp. en una muestra in vitro es el anticuerpo UA3.
Un aspecto preferido de la invención se refiere
a un método in vivo para diagnosticar o pronosticar alergia
a Anisakis spp. en un sujeto, que comprende someter al sujeto
al péptido, polipéptido o proteína de la invención y controlar la
reacción del sujeto.
Un aspecto aún más preferido del método in
vivo de la invención para detectar anticuerpos contra
Anisakis spp. es por medio del uso del ensayo
Prick.
Otro aspecto preferido de la presente invención
es un kit (en lo sucesivo kit de la invención) adecuado para la
detección de antígenos de Anisakis spp. en una muestra
biológica o un extracto alimentario, que comprende:
- a)
- al menos un anticuerpo de la invención o sus fragmentos y
- b)
- un medio de detección para el complejo inmunológico.
También es un aspecto preferido de la presente
invención un kit adecuado para la detección de anticuerpos
anti-Anisakis spp. en una muestra biológica, preferiblemente
suero, que comprende:
- a)
- al menos un péptido, polipéptido o proteína de la invención y
- b)
- un medio de detección para el complejo inmunológico.
En una realización preferida, el medio de
detección usado en el kit de la invención consta de anticuerpos
secundarios marcados capaces de reconocer la formación del complejo
inmunológico.
En una realización más preferida, el medio de
detección usado en el kit de la invención es un reactivo secundario
marcado capaz de reconocer la formación del complejo
inmunológico.
Otro aspecto más de la invención se refiere al
uso de una secuencia de aminoácidos de la invención para la
fabricación de una composición farmacéutica para el tratamiento de
cualquier tipo de reacción alérgica a Anisakis spp. Una
realización preferida de la invención se refiere a la composición
farmacéutica tal cual.
Como se usa en este documento, "ácido
nucleico" o "molécula de ácido nucleico" se refiere a
cualquier polímero de nucleótidos compuesto por dos o más
subunidades que son desoxirribonucleótidos o ribonucleótidos,
unidas entre sí por puentes fosfodiéster. "Acidos nucleicos" o
"moléculas de ácido nucleico" incluyen ácido
desoxirribonucleico (ADN), ácido ribonucleico (ARN),
oligonucleótidos y fragmentos generados por reacción en cadena de
la polimerasa (PCR) o por otros métodos tales como ligamiento,
escisión, acción de endonucleasas y acción de exonucleasas. Como se
usa en este documento, el término "nucleótido" significa una
unidad monomérica de ADN o ARN que contiene un resto de azúcar
(pentosa), un fosfato y una base heterocíclica nitrogenada. Las
cuatro bases del ADN son adenina ("A"), guanina ("G"),
citosina ("C") y timina ("T"). Las cuatro bases del ARN
son A, G, C y uracilo ("U").
Como se usa en este documento, una "molécula
de ácido nucleico aislada" es una molécula de ácido nucleico que
no está integrada en el ADN genómico de un organismo. Dicha
molécula de ácido nucleico puede separarse del ADN genómico de una
célula, puede producirse usando tecnología de ADN recombinante (por
ejemplo, amplificación por PCR, clonación, etc.) o puede
sintetizarse químicamente. La molécula de ácido nucleico aislada
puede obtenerse de su fuente natural como gen completo o una parte
del mismo capaz de formar un híbrido estable con ese gen. La
molécula de ácido nucleico puede ser monocatenaria o
bicatenaria.
Como se usa en este documento, "cebador" se
refiere a un oligonucleótido natural o sintético (que varia
preferiblemente de 15 a 40 nucleótidos de longitud) que puede
hibridar con un molde de ADN o ARN complementario para formar un
dúplex entre el cebador y el molde. Típicamente, un cebador es un
oligodesoxirribonucleótido monocatenario, y sirve como punto de
inicio de la síntesis de ácido nucleico por una polimerasa después
de la hibridación con una cadena de ADN o ARN.
Como se usa en este documento, la expresión
"secuencia de nucleótidos que codifica" se refiere a una
secuencia de ácido nucleico que dirige la expresión de un péptido,
polipéptido o proteína específica. Las secuencias de ácido nucleico
comprenden la secuencia de la cadena de ADN que se transcribe en ARN
y también la secuencia de ARN que se traduce en una proteína. Las
secuencias de ácido nucleico de la presente invención incluyen
tanto secuencias de ácido nucleico de longitud completa como
secuencias truncadas (que no tienen la longitud completa) derivadas
de la proteína de longitud completa. También están comprendidas las
variantes de la secuencia de nucleótidos que codifican el mismo
péptido, polipéptido o proteína que la secuencia nativa, que puede
construirse para proporcionar una preferencia de codones en una
célula hospedadora específica.
Como se usa en este documento, "el complemento
de" se refiere al concepto de una correspondencia inversa entre
regiones de dos cadenas polinucleotídicas o entre dos nucleótidos a
través de la formación de pares de bases. En consecuencia, una
"secuencia de bases complementarias" se refiere a una cadena
polinucleotídica en la que todas las bases pueden formar pares de
bases con una secuencia de bases en otra cadena polinucleotídica.
Como se sabe, un nucleótido de adenina puede formar pares de bases
con timina (A-T) o uracilo (A-U),
mientras que un nucleótido de citosina puede formar pares de bases
con guanina (C-G).
Como se usa en este documento, un "vector de
expresión" se refiere a un conjunto que es capaz de dirigir la
expresión de una secuencia o gen de interés. De acuerdo con la
presente invención, el vector de expresión puede ser cualquier
vector de expresión de ADN o ARN capaz de expresar antígenos de
Anisakis spp., tal como un plásmido o un fago.
Preferiblemente, el vector de expresión de acuerdo con la presente
invención es un plásmido (por ejemplo, pQE 31 y pTARGET).
Como se usa en este documento, el término
"plásmido" se refiere a cualquier molécula de ADN circular
autónoma capaz de replicarse en una célula independientemente del
ADN cromosómico, e incluye tanto los tipos de expresión como los
tipos de no expresión.
Como se usa en este documento, el término
"recombinante" se refiere a una molécula de ADN compuesta
preparada fuera de células vivas uniendo artificialmente fragmentos
de ADN naturales o sintéticos a moléculas de ADN que pueden
replicarse en una célula viva, o moléculas que son el resultado de
su replicación. El término "recombinante" también se refiere
en este documento a un péptido, polipéptido o una proteína que se
expresa usando una molécula de ADN recombinante.
Los términos "polipéptido" y
"proteína" se usan de forma indistinta en este documento para
designar una secuencia lineal de aminoácidos conectados entre sí por
enlaces amida entre el grupo alfa-amino de un
aminoácido y un grupo alfa-carboxi del aminoácido
adyacente. Los polipéptidos con una longitud de veinticinco
aminoácidos o menos se consideran "péptidos". Preferiblemente,
un polipéptido que está codificado por un cistrón se considera
una
"proteína".
"proteína".
Como se usa en este documento, la expresión
"fragmento de la secuencia de aminoácidos" significa una
porción de aminoácidos contiguos del péptido, polipéptido, proteína
o secuencia de aminoácidos especificada.
Como se usa en este documento, un "péptido,
polipéptido o proteína aislada" es un péptido, polipéptido o
proteína que está esencialmente exenta de contaminantes celulares,
tales como lípidos, carbohidratos u otras impurezas asociadas con el
polipéptido en la naturaleza. Un péptido, polipéptido o proteína
aislada puede purificarse de su medio natural por técnicas
cromatográficas convencionales. Los péptidos, polipéptidos y
proteínas aisladas también pueden obtenerse por métodos
recombinantes, o por síntesis química. Típicamente, se obtiene un
"polipéptido sustancialmente purificado" cuando se separa de
al menos el 50%, más preferiblemente al menos el 75% y aún más
preferiblemente al menos el 90% de otros polipéptidos con los que
coexiste de forma natural en una célula, tejido u
organismo.
organismo.
Como se usan en este documento, los términos
"aminoácido" y "aminoácidos" se refieren a todos los
L-alfa-aminoácidos de origen natural
o sus restos. La siguiente Tabla (Tabla 1) muestra el código de
tres letras y el código de una letra (recomendado por la Comisión
de Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-IUB) para la
denominación de los aminoácidos naturales:
Como se usa en este documento, el término
"mamífero" se refiere a cualquier animal clasificado como
mamífero, incluyendo seres humanos, ratones, ratas, mamíferos
marinos y animales domésticos y de granja. Preferiblemente, el
mamífero en este documento es el ser humano.
Como se usa en este documento, el término
"anticuerpo" se refiere a glicoproteínas de la familia de las
inmunoglobulinas, caracterizadas porque tienen propiedades de unión
a antígenos, y se producen por células plasmáticas. El término
"anticuerpo" incluye anticuerpos tanto monoclonales como
policlonales que pertenecen a cualquier clase de anticuerpos, por
ejemplo, IgG, IgD, IgM, IgA, IgE o derivados de los mismos.
Como se usa en este documento, la expresión
"anticuerpo monoclonal" se refiere a una composición de
anticuerpos que tiene una población de anticuerpos homogénea. No
pretende limitarse a una fuente particular del anticuerpo o a la
forma en la que se produce, e incluye anticuerpos y fragmentos de
los mismos producidos por fusión celular o por técnicas
recombinantes.
Como se usa en este documento, el término
"antígeno" se refiere a cualquier molécula o agente capaz de
inducir la producción de anticuerpos específicos cuando se
introduce en un hospedador inmunocompetente. Como se usa en este
documento, el término "antígeno" también se refiere a
cualquier molécula o agente susceptible de reconocerse por un
anticuerpo específico. Típicamente, pueden reconocerse como
antígenos péptidos, polipéptidos, proteínas, carbohidratos, lípidos,
ácidos nucleicos o combinaciones de estas moléculas. Estos
antígenos también pueden contener grupos químicos orgánicos e
inorgánicos unidos.
Como se usa en ese documento, el término
"epítopo" se refiere a la porción de un antígeno que se
reconoce por un anticuerpo (monoclonal o policlonal) o por el
receptor con especificidad de antígeno de una célula. Cuando el
antígeno es un péptido, polipéptido o una proteína, sus epítopos
pueden ser fragmentos de al menos 5 aminoácidos de la secuencia de
aminoácidos primaria, pero también regiones expuestas en la
superficie de la proteína plegada madura (estructura terciaria
tridimensional) compuestas por 5 o más aminoácidos. Típicamente,
los epítopos pueden clasificarse como epítopos de células B y
epítopos de células T basándose en los tipos de respuesta inmune
que provocan.
Como se usa en este documento, el término
"muestra biológica" se aplica a cualquier muestra de tejido o
fluido biológico que contiene uno o más de los ácidos nucleicos,
anticuerpos, péptidos, polipéptidos o proteínas de la presente
invención. En la presente invención, el término "muestra
biológica" también se aplica a cualquier muestra de tejido o
fluido biológico que pueda usarse como fuente para la determinación
de anticuerpos anti-Anisakis. Dichas muestras incluyen, pero
sin limitación, tejidos aislados, sangre, suero, plasma, líquido
cefalorraquídeo, líquido ascítico, líquido sinovial, saliva, orina
o heces. Las muestras biológicas también pueden incluir secciones
de tejidos tales como secciones congeladas tomadas para fines
histológicos. Una muestra biológica puede obtenerse a partir de
cualquier organismo eucariota, y preferiblemente de un mamífero tal
como una rata, ratón, conejo, mamíferos marinos, o un ser
humano.
Como se usa en este documento, el término
"muestra alimentaria" se refiere a cualquier muestra obtenida
de la amplia gama de materiales comestibles. Estas muestras
incluyen, pero sin limitación, trozos de pescado crudo, ahumado y
cocinado y alimentos que tienen materiales de pescado en su
composición. El término "muestra alimentaria" también incluye
alimentos para la nutrición de niños.
Como se usa en este documento, la expresión
"anticuerpos anti-Anisakis" se refiere a cualquier
clase o subclase de anticuerpos presentes en una muestra capaz de
reconocer al menos un epítopo que esté presente en los antígenos de
cualquiera de las especies del género Anisakis. La expresión
incluye anticuerpos producidos durante infecciones naturales o
experimentales de seres humanos y animales con el parásito, así
como anticuerpos monoclonales y policlonales producidos después de
la inmunización de seres humanos o animales con antígenos
recombinantes o sintéticos no purificados o sustancialmente
purificados, obtenidos a partir de especies del género
Anisakis. La expresión también incluye anticuerpos y
fragmentos de unión a antígenos producidos por técnicas
recombinantes, síntesis química o técnicas equivalentes.
Como se usa en este documento, la expresión
"porcentaje de identidad" se refiere al porcentaje de
aminoácidos o nucleótidos que ocupan la misma posición relativa
cuando dos secuencias de aminoácidos, o dos secuencias de ácido
nucleico se alinean una al lado de la otra. Para los fines de la
presente invención, un método adecuado para calcular el porcentaje
de identidad de secuencia entre dos secuencias de nucleótidos o
aminoácidos es usar el programa lalign de William Pearson que
aplica el algoritmo de Huang y Miller, publicado en Adv. Appl.
Math. (1991) 12: 337-357, e incorporado en este
documento como referencia. Este programa puede procesarse on
line en la dirección:
[http://www.ch.embnet.org/software/LALIGN_form.html].
Como se usa en este documento, el término
"inmunoensayo" se refiere a un método para detectar un analito
en una muestra por medio de una reacción
antígeno-anticuerpo. Los analitos pueden ser
moléculas pequeñas (haptenos) o moléculas grandes, tales como
muchas proteínas plasmáticas. Con mucha frecuencia, el analito es
un anticuerpo que puede detectarse por medio de la unión específica
entre el anticuerpo y un ligando. Como se usa en este documento, el
término "inmunoensayo enzimático" (EIA) se refiere a un tipo
amplio de inmunoensayos, caracterizados porque al menos uno de los
reactivos está marcado con una enzima. Son EIA típicos los ensayos
de inmunoabsorción vinculados a enzimas (ELISAs) de los cuales hay
una serie de variantes. Si se desea una clasificación, o una
descripción detallada de formatos de inmunoensayo, véase: Price y
Newman (1997) Principles and Practice of Immunoassay, Macmillan
Reference LTD, New York; Tijssen (1985) Practice and theory of
enzyme immunoassays, En: Laboratory Techniques in Biochemistry and
Molecular Biology (R.H. Burdon and PH van Knippenberg, eds),
Elsevier, Amsterdam; Deshpande (1996) Enzyme immunoassays, from
concept to product development, Chapman & Hall, New York.
Como se usa en este documento, una
"composición farmacéutica" se refiere a una composición
química o biológica que es adecuada para administrarse a un
individuo mamífero. Típicamente, una composición farmacéutica
comprende una cantidad de un agente activo farmacológicamente
eficaz y un vehículo farmacéuticamente aceptable. Se describen
ejemplos de vehículos y formulaciones farmacéuticas adecuadas en
Remington's Pharmaceutical Sciences, 20ª edición, Mack Publishing
Company, Easton, 2000. Una composición farmacéutica puede
formularse específicamente para la administración por diferentes
vías incluyendo, pero sin limitación, la vía oral, parenteral,
intravenosa, intraarterial, subcutánea, intranasal, sublingual y
similares.
Como se usa en este documento, la expresión
"método de diagnóstico" se refiere a un método para la
identificación de un estado patológico en un animal o en un
individuo. Cuando dicho estado patológico se produce por un agente
infeccioso, frecuentemente el diagnóstico puede realizarse usando
un inmunoensayo (véase anteriormente) que permite la detección de
los antígenos liberados por el patógeno, o de los anticuerpos
inducidos en el hospedador por dicho patógeno. Los métodos de
diagnóstico de la presente invención incluyen ensayos in
vitro (tales como un ensayo ELISA, o el test de liberación de
histamina de los basófilos) y ensayos in vivo tales como las
pruebas cutáneas, por ejemplo, pero sin limitación, el ensayo de
pinchazo en la piel (prick-test),
intradermorreacciones, o las pruebas epicutáneas (por ejemplo, el
ensayo de parche), que se usan frecuentemente para el diagnóstico de
alergias. La expresión "métodos de diagnóstico" también
incluye a las pruebas de provocación, consistentes en la
administración controlada y gradual de la sustancia sospechosa de
provocar un cuadro alérgico a través de diferentes vías: oral,
conjuntival, nasal, bronquial, etc., para comprobar su tolerancia.
Una descripción más detallada de estos últimos métodos, puede verse
en: Comité de Reacciones Adversas a Alimentos: Metodología
diagnóstica en la alergia a alimentos. Alergología e Inmunología
Clínica, 14: 50-52 (1999), así como en diversos
manuales de la especialidad de Alergología e Inmunología
Clínica.
Clínica.
Como se usa en este documento, la expresión
"repeticiones de secuencia" se refiere a motivos repetitivos
en la secuencia de una proteína dada o de una molécula de ácido
nucleico. Las repeticiones de secuencia en las secuencias
polipeptídicas de la presente invención se realizaron usando el
programa RADAR (véase el Ejemplo Nº 12).
A menos que se definan de otro modo, todos los
términos técnicos y científicos usados en este documento tienen el
mismo significado que el entendido habitualmente por un
especialista habitual en la técnica a la que pertenece esta
invención. En la práctica de la presente invención pueden usarse
métodos y materiales similares o equivalentes a los descritos en
este documento. A lo largo de toda la descripción y las
reivindicaciones, la palabra "comprende" y sus variaciones no
pretenden excluir otras características técnicas, aditivos,
componentes o etapas. Otros objetos, ventajas y características de
la invención serán evidentes para los especialistas en la técnica
tras el examen de la descripción o pueden aprenderse por la
práctica de la invención. Los siguientes ejemplos se proporcionan a
modo de ilustración y no pretenden limitar la presente
invención.
Ejemplo
1
Se extrajeron manualmente larvas de Anisakis
simplex en la fase larvaria L3 (L3) de las vísceras y cavidad
peritoneal de la bacaladilla (Micromesistius poutassou) y se
almacenaron en nitrógeno líquido antes de comenzar la construcción
de la biblioteca de ADNc. Se obtuvo el ARN mensajero (ARNm) total a
partir de 1 g de larvas L3 de Anisakis simplex congeladas
usando el kit de aislamiento de ARNm Fast Track 2.0 (Invitrogen
S.A., Barcelona, España) de acuerdo con las instrucciones del
fabricante.
Se usaron cinco microgramos del ARN poli (A)+
obtenido para construir la biblioteca de ADNc de Anisakis
usando el kit ZAP-cDNA Gigapack III Gold Cloning
Kit (Stratagene, La Jolla, CA), siguiendo las instrucciones del
fabricante. De acuerdo con las instrucciones proporcionadas, el ARN
poli (A)+ de Anisakis simplex se convirtió primero en ADNc
bicatenario, después se ligó al vector de expresión
lambda-ZAP y el vector se empaquetó usando
extractos de empaquetamiento Gigapack III. Se usó como hospedador
la cepa XL1-Blue MRF' de E. coli. La
biblioteca resultante se amplificó, y contenía aproximadamente 1,3
x 10^{10} pfu/ml y un 1% de fagos no recombinantes.
Una vez amplificada, la biblioteca de ADNc de
A. simplex se sometió a un cribado inmunológico usando
anticuerpos monoclonales UA3. Siguiendo las recomendaciones
proporcionadas en el ZAP-cDNA Gigapack III Gold
Cloning Kit (Stratagene), se dejaron crecer células hospedadoras
XL1-Blue MRF' en caldo LB con suplementos, se
centrifugaron a 1000 x g, y el sedimento se resuspendió en
sulfato de magnesio 10 mM. A esta suspensión se le añadió una
alícuota de los fagos recombinantes y la mezcla se incubó 15
minutos a 37ºC para permitir que los fagos se unieran a las
células. Después, la suspensión celular con los fagos adheridos se
mezcló con agar NZY fundido (enfriado a aproximadamente 55ºC), y la
mezcla se extendió uniformemente sobre una placa de 150 mm de
diámetro, que contenía agar NZY recién vertido. Después de un
tiempo de incubación de aproximadamente 3 h a 42ºC para permitir
que comenzaran a formarse placas de fagos, se indujo la expresión de
proteínas recombinantes recubriendo las placas con filtros de
nitrocelulosa previamente impregnados en isopropil
tio-beta-D-galactósido
(IPTG) 10 mM en agua (Schleicher & Schuell, Dassel, Alemania).
Después, las placas se incubaron a 37ºC durante 3,5 h, después de
lo cual se retiraron cuidadosamente los filtros de nitrocelulosa que
contenían las placas de fago adsorbido y se bloquearon con BSA al
3% en TBS (Tris-HCl 50 mM, NaCl 150 mM, pH 7,5) a
37ºC durante 30 minutos y después se incubaron con anticuerpos
monoclonales (AcM) IgGilkappa UA3 (dilución 1:10.000 en TBS) a 4ºC
durante una noche. Los filtros de nitrocelulosa se lavaron en TBS
que contenía Tween 20 al 0,05% (TBS-T), y se
incubaron durante 2 h a temperatura ambiente con IgG de cabra
anti-conejo conjugada con fosfatasa alcalina a
1:10.000 (Pierce, Rockford, IL, USA). Después de lavar otra vez, se
visualizaron los complejos inmunes usando NBT (nitroazul de
tetrazolio) y BCIP (fosfato de
p-toluidina-5-bromo-4-cloro-3-indolil
fosfato) (Sigma Chemical Corp., St Louis, MO,
USA).
USA).
Después de identificar un ADNc que codificaba
una proteína reconocida por el AcM UA3 mediante el cribado
inmunológico sobre el vector lambda-ZAP intacto, se
purificó la placa de fago correspondiente (clon
UAR-H5). De acuerdo con las instrucciones
proporcionadas en el ZAP-cDNA Gigapack III Gold
Cloning Kit (Stratagene), se transfirió la porción central de las
placas positivas para el fago seleccionadas a un tubo de
microcentrifuga y se liberaron las partículas de fago recombinante
en tampón SM. Después, se realizó la escisión in vivo del
fagémido pBluescript del vector lambda-ZAP mediante
coinfección de células hospedadoras XL1-Blue MRF'
con el fago recombinante y el fago auxiliar ExAssist proporcionado
con el kit. Al final de este procedimiento, el fagémido pBluescript
escindido, obtenido empaquetado como partículas de fago
filamentosas, se usó para infectar células hospedadoras SOLR. Se
obtuvieron colonias de células SOLR transfectadas que contenían el
fagémido pBluescript bicatenario con el inserto de ADN donado de
interés dejando crecer las células en placas de agar
Luria-Bertani (LB) que contenían ampicilina (100
microgramos/ml). Se dejaron crecer colonias bacterianas individuales
en caldo LB-ampicilina y se purificó el ADN del
fagémido pBluescript usando un kit Perfectprep Plasmid Maxi
(Eppendorf). Se usaron los cebadores M13 directo (5' SEC ID Nº 19
3') e inverso (5' SEC ID Nº 20 3') de la secuencia de pBluescript
SK, así como varios cebadores internos, para la secuenciación
automática del ADN del fagémido usando el Big-Dye
Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit (PE Biosystems,
Foster City, CA) y un secuenciador de ADN Applied Biosystems 377 (PE
Biosystems). Se realizaron comparaciones de la secuencia de ADN y
de la secuencia deducida de aminoácidos con los bancos de datos
EMBL y SWISS-PROT usando el paquete de software
ExPASy (el Expert Protein Analysis System), servidor World Wide Web
(http://www.expasy.org/), del Swiss Institute of
Bioinformatics (Gasteiger et al., 2003). La secuencia de
nucleótidos descrita comprende una secuencia de 3288 nucleótidos,
representada por la secuencia de la SEC ID Nº: 1, y codifica una
secuencia de aminoácidos deducida de 1096 aminoácidos representada
por la SEC ID
Nº: 2.
Nº: 2.
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Ejemplo
2
En una realización preferida, se subclonó un
fragmento de ADN recombinante interno (SEC ID Nº: 15) que
corresponde a las posiciones de nucleótidos 1303 y 2139 de la SEC
ID Nº 1, que codifica una secuencia polipeptídica de 279 aminoácidos
(SEC ID Nº: 16), en el vector de expresión pQE-31
usando un kit QlAexpress Type IV (Qiagen, IZASA S.A., Barcelona,
España) de acuerdo con las instrucciones del fabricante, y usando
los sitios de restricción Sal I y Hind III en el sitio
de clonación múltiple de pQE-31. Está disponible
otra metodología similar en manuales tales como: Molecular Cloning:
a Laboratory Manual (Sambrook et al., 2001) o Current
Protocols in Molecular Biology (Ausubel et al., 1998).
Antes de la clonación, se amplificó la secuencia
del fragmento de ADNc que corresponde a la SEC ID Nº: 15 mediante
PCR, y los extremos de la secuencia se modificaron usando el
fagémido pBluescript recombinante como molde y un conjunto de
cebadores directo (5' SEC ID Nº 21 3') e inverso (5' SEC ID Nº 22
3'), que contenían sitios de restricción Sal I y Hind
III. Esta modificación mediante PCR proporcionó secuencias de
nucleótidos específicas para las enzimas de restricción Sal I
y Hind III para que el inserto recombinante tuviera extremos
cohesivos con respecto al plásmido digerido. Las condiciones de PCR
para la amplificación y modificación de la secuencia del fragmento
de ADN correspondiente a la SEC ID Nº: 15 comprendió: un ciclo de
desnaturalización a 94ºC durante 4 minutos seguido por 35 ciclos de
(30 s de desnaturalización a 94ºC; 30 s de hibridación a 55ºC; y un
minuto de elongación a 72ºC), y un ciclo de elongación final de 72ºC
durante 7 minutos. Después de que acabara la PCR, se purificó el
ADN recombinante de Anisakis amplificado usando un kit de
purificación en gel QiaQuick (Qiagen). A continuación, un microgramo
del ADN plasmídico y 2 microgramos del ADN que codificaba el
fragmento a insertar se digirieron con las enzimas de restricción
Sal I y Hind III, de acuerdo con el tampón y las
condiciones de incubación recomendadas por el fabricante (Invitrogen
S.A., Barcelona, España). Finalmente, tanto el vector digerido como
el inserto de ADN se purificaron con el kit de purificación en gel
QiaQuick (Qiagen) y se ligaron en una proporción 1:3 entre el
vector y el inserto, usando ADN ligasa de T4 a 16ºC durante una
noche. La inserción del ADN recombinante de Anisakis simplex
de la SEC ID Nº: 15 entre los sitios Sal I y Hind III
del sitio de clonaje múltiple de pQE-31 originó un
marco abierto de lectura (ORF) plasmídico de 915 nucleótidos (SEC
ID Nº: 3), que codificó la secuencia de aminoácidos de la SEC ID
Nº: 4, la cual incluye la SEC ID Nº: 16 de Anisakis (porción
central) y dos secuencias de aminoácidos adicionales (colas): SEC ID
Nº 23 y SEC ID Nº 24, localizadas, respectivamente, en las
porciones amino y carboxilo terminales de la secuencia de
Anisakis clonada. La presencia de la señal de 6 x Histidina
en la porción amino del polipéptido codificado puede facilitar la
purificación de polipéptidos recombinantes, pero también pueden
usarse otros vectores y métodos de purificación según convenga.
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Ejemplo
3
La transformación de células M15 [pREP4] de
E. coli con el vector pQE-31 recombinante se
realizó de acuerdo con las instrucciones proporcionadas en el manual
(The QIAexpresionist: A handbook for high-level
expression and purification of 6xHis-tagged
proteins) del fabricante (Qiagen). De acuerdo con este protocolo, se
incubaron una alícuota de células M15 competentes preparadas
previamente y una alícuota de la mezcla de ligamiento en hielo
durante 20 minutos y después se incubaron a 42ºC durante 90
minutos. Después de dichas incubaciones, las células se
resuspendieron en caldo Psi y se incubaron durante 90 minutos a
37ºC. Después, las células M15 se sembraron en placas de agar LB
que contenían 25 microgramos por mililitro de kanamicina y 100
microgramos de ampicilina y se incubaron durante una noche a 37ºC.
Una colonia positiva se dejó crecer en caldo LB suplementado con
kanamicina y penicilina, se centrifugó y las células sedimentadas
se almacenaron en medio SOB que contenía glicerol a
-80ºC.
-80ºC.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
Para producir el polipéptido recombinante de
Anisakis recombinante del Ejemplo 2, las células M15
transformadas se descongelaron y dejaron crecer a 37ºC en caldo LB,
complementado con kanamicina y ampicilina, con agitación orbital
(200 r.p.m.) hasta alcanzar una DO_{600} de 0,5. Después se
indujo la expresión del polipéptido añadiendo IPTG 1 mM, y las
células se incubaron durante 4 h adicionales a 37ºC con las mismas
condiciones de agitación. Posteriormente, las células se
centrifugaron a 5000 x g y se almacenaron congeladas a -30ºC hasta
la purificación del polipéptido expresado, según se describe en el
Ejemplo 5. En estas condiciones de cultivo, las células M15
producen el polipéptido recombinante de la SEC ID Nº: 4 precipitado
en forma de cuerpos de inclusión.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
5
En una realización preferida, los cuerpos de
inclusión de las células M15 sedimentadas, obtenidas a partir de un
cultivo de 250 ml, se purificaron de acuerdo con las siguientes
etapas: a) el sedimento bacteriano se resuspendió en 15 ml de
reactivo B-PER (Pierce, Rockford, IL, USA) y se
agitó suavemente durante 10 minutos; b) la muestra se centrifugó a
15.000 x g y el sobrenadante, que contenía proteínas solubles, se
desechó; c) el sedimento que contenía los cuerpos de inclusión se
resuspendió en otros 15 ml de B-PER y a la
suspensión celular se le añadió lisozima a una concentración final
de 200 microgramos (Sigma-Aldrich, Madrid, España) y
se incubó a TA durante 5 minutos; d) la suspensión se diluyó con
100 ml de una dilución 1:10 de B-PER y las células
se resuspendieron empleando un agitador vortex; e) la
suspensión celular se centrifugó a 15.000 x g durante 15 minutos y
el sedimento se resuspendió en otros 100 ml de
B-PER y se agitó en el vortex; f) la
suspensión que contenía B-PER diluido se centrifugó
a 15.000 x g y el sedimento se resuspendió en 50 ml de un tampón de
desnaturalización que constaba de NaH_{2}PO_{4} 100 mM, Tris.Cl
10 mM y Urea 6 M, pH 8,0, y después se agitó en el vortex;
g) la suspensión se centrifugó a 15.000 x g durante 20 minutos y se
disolvió en 10 ml de un tampón de desnaturalización que constaba de
NaH_{2}PO_{4} 100 mM, Tris.Cl 10 mM y Urea 8 M, pH 8,0 (tampón
de carga); h) a la solución que contenía el péptido, se le
añadieron 2,5 ml de una suspensión de resina Ni- NTA al 50% (Qiagen)
y la mezcla se agitó en un agitador orbital durante 30 minutos a
TA. Después la suspensión de resina se cargó en una columna vacía, y
se lavó con dos volúmenes del tampón de carga; i) los polipéptidos
retenidos se eluyeron con una solución que contenía Tris.Cl 0,15 M,
pH 10,5, que contenía imidazol 250 mM, y se almacenó congelada a
-30ºC hasta su
uso.
uso.
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Ejemplo
6
En otra realización preferida, un fragmento
interno de 834 aminoácidos (SEC ID Nº: 17) correspondiente a las
posiciones de nucleótidos 1306-2139 de la SEC ID
Nº:1, que codifica la secuencia de aminoácidos del polipéptido
representado por la SEC ID Nº: 18, se subclonó en el vector pTARGET
(Promega). Para ello, la SEC ID Nº: 17 seamplificó mendiante PCR
empleando un conjunto de cebadores directo (5' SEC ID Nº 25 3') y
reverso (5' SEC ID Nº 26 3') y el vector pQE-31
transformado del Ejemplo 3 como molde. Las condiciones de PCR
fueron: un ciclo de desnaturalización a 94ºC durante 5 minutos,
seguido de 35 ciclos de (45 segundos de desnaturalización a 94ºC;
45 segundos de hibridación a 55ºC; y 1,5 minutos de elongación a
72ºC), y un ciclo de elongación final de 10 minutos a 72ºC. Los
productos de PCR se analizaron en un gel de agarosa al 2% y después
se donaron en el vector pTARGET. El ligamiento de
pTARGET y el inserto de Anisakis, y la transformación
de células JM109 competentes se realizaron como se indica en las
instrucciones del uso del producto. Se seleccionaron transformantes
JM 109 positivos por selección de colonias blancas usando placas de
agar LB suministradas con ampicilina/IPTG/X-Gal
como se describe por el fabricante.
En las condiciones experimentales descritas, la
Subclonación de la secuencia de ADNc correspondiente a la SEC ID
Nº: 17 en el vector pTARGET originó un ORF plasmídico de 846
nucleótidos (SEC ID Nº: 5) que codifica para la secuencia de 282
aminoácidos de la SEC ID Nº: 6, que incluye el polipéptido de
Anisakis de la SEC ID Nº: 17, y una secuencia adicional de 4
aminoácidos (SEQ ID Nº: 24) situada en la porción carboxilo
terminal de la SEC ID
Nº: 17.
Nº: 17.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
7
Se dejó crecer una colonia positiva de células
JM109 en caldo LB-ampicilina, se centrifugó a
15.000 x g durante 15 minutos y el sedimento se usó para la
extracción del ADN plasmídico usando el kit Plasmid Maxi (Qiagen).
Se inoculó un total de 50 microlitros (concentración de un
microgramo por microlitro) de ADN plasmídico sin endotoxinas en el
músculo cuádriceps de las dos patas de ratones Balb/c de
10-20 semanas de edad. Las inoculaciones se
realizaron usando una jeringa de insulina como se describe por
Leiro et al. (2002).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
8
Un inmunoensayo de acuerdo con la presente
invención puede ser cualquier inmunoensayo capaz de detectar la
presencia de anticuerpos anti-Anisakis en cualquier fluido
biológico procedente de un individuo o especie ani-
mal.
mal.
Los ejemplos de tipos de inmunoensayos incluyen
inmunoensayos en fase líquida y fase sólida, e inmunoensayos
competitivos y no competitivos en un formato directo o
indirecto.
Típicamente, la medición de los niveles de
anticuerpos anti-Anisakis específicos en un fluido
biológico, como por ejemplo en suero o plasma, puede realizarse por
métodos ELISA, como son los métodos ELISA descritos en este
ejemplo.
Las muestras de suero usadas en los métodos
ELISA de este ejemplo se obtuvieron a partir de individuos no
infectados (donantes de sangre sanos) y de individuos infectados
con el parásito Anisakis simplex. Los sueros se consideraron
positivos cuando se obtuvieron a partir de individuos que tenían una
historia reciente de haber comido pescado crudo y la presencia del
parásito pudo confirmarse por examen endoscópico.
\newpage
Se describe un método ELISA de captura
(UA3-ELISA) basado en la captura de antígenos
O-desglicosilados de Anisakis spp. específicos por
anticuerpos monoclonales UA3 inmovilizados.
El antígeno O-desglicosilado usado en
este inmunoensayo se obtuvo como se ha descrito previamente, y se
basa en el tratamiento de antígenos de Anisakis enteros con
NaOH 0,02 M a 50ºC durante 16 h, y neutralización adicional del pH
con HCl.
Para realizar el ELISA de captura, se realizaron
las siguientes etapas: a) acoplamiento de anticuerpos monoclonales
UA3 purificados (100 microlitros/pocillo; concentración de
anticuerpos de 10 microgramos/ml) durante una noche; b) aspiración,
y después lavado de la placa ELISA con PBS tres veces; c)
aspiración, y después bloqueo de los pocillos de ELISA durante 1 h a
37ºC con una solución de PBS que contenía leche descremada en polvo
al 3% y Tween-20 al 0,2% (PBS-TM);
d) aspiración, y después incubación durante 1,5 h a 37ºC con 100
microlitros de suero humano no diluido; e) lavado tres veces con
200 microlitros por pocillo de PBS que contenía
Tween-20 al 0,2% (PBS-T); f)
incubación con 100 microlitros de una dilución 1:2500 de
anticuerpos monoclonales anti-IgE humana marcados
con FITC (Ingenasa, Madrid, España; el marcaje con FITC se llevó a
cabo de acuerdo con el método de Liddel y Cryer, 1991); g)
aspiración y lavado 3 veces con 200 microlitros/pocillo de
PBS-T; h) aspiración, e incubación con 100
microlitros de una dilución 1:1.500 de anticuerpos de conejo
anti-FITC conjugados con peroxidasa (Dako,
Barcelona, España); i) aspiración, y lavado con 200 microlitros por
pocillo de PBS-T; j) aspiración, e incubación con
sustrato para peroxidasa (Sigma Fast OPD, Sigma); k) lectura de
densidades ópticas (DO) a 492 nm en lector multipocillo (Molecular
Devices, Sunnyvale, CA).
En una realización preferida, el polipéptido
recombinante de la SEC ID Nº: 4 se usó para realizar un ELISA
indirecto para medir anticuerpos anti-Anisakis en sueros de
individuos infectados con Anisakis.
En este ejemplo se describe un método ELISA para
la determinación de anticuerpos IgE en muestras de suero humano,
pero también pueden medirse otras clases (IgA, IgG, IgM) y
subclases (IgAl, IgA2, IgG1, IgG2, IgG3 e IgG4) de anticuerpos
cambiando la especificidad de los anticuerpos
anti-humano secundarios. Del mismo modo, el
inmunoensayo también puede adaptarse para determinaciones de
anticuerpos en fluidos biológicos de otras especies animales (por
ejemplo, otros mamíferos, aves o peces) eligiendo los anticuerpos
secundarios anti-especie
apropiados.
apropiados.
En una realización preferida, el método para
realizar el ELISA indirecto (rUA3-ELISA) del
presente ejemplo se realizó de acuerdo con las siguientes etapas: a)
acoplamiento de las placas de ELISA con el antígeno recombinante de
Anisakis de la SEC ID Nº: 4 en Tris.Cl 0,1 M, pH 10,5; b)
aspiración, y después lavado de la placa de ELISA con PBS tres
veces; c) aspiración, y después bloqueo de los pocillos de ELISA
durante 1 h a 37ºC con una solución de solución salina tamponada con
Tris (TBS) que contenía leche descremada en polvo al 3% y
Tween-20 al 0,2% (TBS-TM); d)
aspiración, y después incubación de las placas durante 1,5 h a 37ºC
con 100 microlitros de suero humano no diluido; e) lavado tres
veces con 200 microlitros por pocillo de TBS que contenía
Tween-20 al 0,2% (TBS-T); f)
incubación con 100 microlitros de una dilución 1:2500 de
anticuerpos monoclonales anti-IgE humana marcados
con FITC (Ingenasa; marcado con FITC de acuerdo con el método de
Liddel y Cryer, 1991); g) aspiración, y después lavado 3 veces con
200 microlitros/pocillo de TBS-T; h) aspiración, y
después incubación con 100 microlitros de una dilución 1:1500 de
anticuerpos de conejo anti-FITC conjugados con
peroxidasa (Dako); i) aspiración, y después lavado con 200
microlitros por pocillo de PBS-T; j) aspiración, e
incubación con sustrato para peroxidasa (Sigma Fast OPD, Sigma); k)
lectura de las densidades ópticas (DO) a 492 nm en lector
multipocillo (Molecular
Devices).
Devices).
La siguiente Tabla I muestra la comparación de
los valores de IgE obtenidos para 22 muestras de suero positivas de
pacientes infectados con el nematodo Anisakis simplex,
ensayadas por los métodos de ELISA de captura
(UA3-ELISA) y ELISA indirecto
(rUA3-ELISA) descritos en el Ejemplo 8 de la
presente invención. La tabla muestra los valores medios de
absorbancia, medidos a 492 nm, para cada suero. Los valores de
corte (cut-off) para las determinaciones de
IgE fueron DO = 0,105 para el método UA3-ELISA y DO
= 0,049 para el método rUA3-ELISA. Nótese que la
muestra 2 fue sólo positiva por el método
rUA3-ELISA. Estos resultados demuestran que tanto
el método UA3-ELISA (sensibilidad del 95,45%) como
el método rUA3-ELISA (sensibilidad del 100%) son
métodos válidos para serodiagnóstico de infecciones humanas por
Anisakis spp.
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\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
9
En este ejemplo, se extrajo sangre de ratones
transfectados con pTARGET recombinante que codificaba el
polipéptido de la SEC ID Nº: 6 (véase el Ejemplo 7) con anestesia,
y el suero obtenido se ensayó en ELISA indirecto para determinar la
presencia de anticuerpos IgG1 reactivos con el polipéptido de la SEC
ID Nº: 4 inmovilizado en la placa de ELISA. El método ELISA fue el
mismo descrito en el Ejemplo 8b, con la excepción de que se usaron
anticuerpos de cabra anti-IgG de ratón marcados con
peroxidasa (Caltag Laboratories, Burlingame, CA, USA; dilución
1:3000) en lugar de reactivos anti-humano
secundarios. En este ejemplo, se ensayaron sueros de ratón a una
dilución
1:100.
1:100.
La siguiente Tabla II muestra la respuesta de
anticuerpos IgG1 obtenida en ratones BALB/c después de la
vacunación (por vía parenteral) con 100 microgramos/ratón del
plásmido p-TARGET recombinante que contenía el inserto de
ADN de Anisakis simplex que codifica el polipéptido de la SEC
ID Nº: 6. La extracción de sangre de los ratones se hizo un mes
después de la inmunización. La tabla muestra los valores medios de
absorbancia \pm SD para cada suero, medidos a 492 nm (tres
determinaciones independientes).
Estos resultados demuestran que una vacuna de
ADN recombinante que contiene una secuencia de ADN de
Anisakis (mostrado en este experimento por la SEC ID Nº: 6
de la presente invención) puede ser útil para la inducción de
anticuerpos anti-Anisakis in vivo. La inducción in
vivo de anticuerpos por vacunas es de interés para: a) la
inducción de protección inmunológica contra agentes infecciosos, y
b) para la prevención de reacciones
alérgicas.
alérgicas.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
10
El marcaje de los péptidos y polipéptidos de la
presente invención con una biomolécula o molécula química
detectable es útil para fines tales como diagnóstico in vivo
e in vitro e investigación de laboratorio. Hay muchos
marcadores y métodos diferentes para el marcaje conocidos por los
especialistas en la técnica (por ejemplo, Kessler (Ed).
Nonradiactive labeling and detection of biomolecules.
Springer-Verlag, Berlin 1992); Walker (Ed). The
protein protocols handbook. Humana Press, Totowa, New Jersey
(1996)).
Los ejemplos de los tipos de marcadores que
pueden usarse en la presente invención incluyen enzimas,
radioisótopos, compuestos fluorescentes, compuestos
quimioluminiscentes, compuestos bioluminiscentes y sustancias
cromogénicas incluyendo partículas coloreadas tales como oro
coloidal y partículas de látex.
En una realización preferida, los péptidos y
polipéptidos de la presente invención están radiomarcados con, pero
sin limitación, ^{32}P, ^{14}C, ^{3}H, ^{35}S, ^{125}I o
^{131}I. Los péptidos marcados pueden detectarse por métodos tales
como recuento de centelleo, espectrometría de rayos gamma o
autorradiografía.
En otra realización preferida, los péptidos y
polipéptidos de la presente invención pueden marcarse con la
luciferina de luciérnaga. El compuesto bioluminiscente puede estar
unido covalentemente al péptido o polipéptido seleccionado por
métodos convencionales, y el péptido o polipéptido marcado se puede
detectar cuando una enzima, por ejemplo, luciferasa, cataliza una
reacción con ATP que hace que la molécula bioluminiscente emita
fotones de
luz.
luz.
Los fluorógenos también son de amplio uso como
marcadores. Los ejemplos de fluorógenos incluyen fluoresceína y
derivados, rodamina, Rojo Texas, ficoeritrina, ficocianina y otros.
Generalmente, las moléculas de fluorógeno se detectan por un
detector de fluorescencia.
En otra realización preferida, los péptidos y
polipéptidos de la presente invención (por ejemplo, el polipéptido
de la SEC ID Nº: 4) pueden marcarse con biotina y capturarse en un
soporte sólido por un ligando de biotina específico como avidina o
estreptavidina. Una vez que se ha inmovilizado el polipéptido
marcado en el soporte sólido (por ejemplo, el pocillo de una placa
de ELISA), puede usarse para detectar anticuerpos contra el
polipéptido seleccionado realizando las incubaciones típicas y
etapas de lavado como las descritas en el Ejemplo 8b de la
presente
invención.
invención.
Como alternativa, los péptidos y polipéptidos de
la presente invención pueden marcarse con enzimas (por ejemplo,
peroxidasa, fosfatasa alcalina y otras enzimas que proporcionan una
reacción cromogénica o fluorogénica después de la adición del
sustrato apropiado). Pueden usarse péptidos y polipéptidos marcados
con enzimas seleccionadas, por ejemplo, para detectar anticuerpos
específicos que reconocen dichos péptidos o polipéptidos en un
método ELISA de captura, donde el anticuerpo a detectar se captura
primero por otro anticuerpo inmovilizado en un soporte sólido y el
péptido o polipéptido marcado, más el sustrato apropiado, se usan
para revelar que tuvo lugar la unión
anticuerpo-polipéptido.
En otra realización preferida más, los péptidos
y polipéptidos de la presente invención pueden marcarse con oro
coloidal para su uso en ensayos de inmunocromatografia de flujo
lateral, de acuerdo con métodos bien conocidos por los
especialistas en la técnica. Por ejemplo, se describen métodos para
producir partículas de oro de diversos tamaños y para la
conjugación de oro con proteínas en: Dykstra (Ed). A manual of
applied techniques for biological electron microscopy. Plenum Press.
New York (1993).
Además, en otra realización preferida, la
molécula de marcaje puede ser micropartículas magnéticas y el
sistema inmovilizado un imán.
\newpage
Ejemplo
11
Pueden usarse moléculas de ácido nucleico
marcadas como sondas para detectar secuencias diana complementarias
en una mezcla de ácido nucleico compleja por métodos de hibridación
específicos tales como transferencia de Southern, de Northern, slot
blot y dot blot, hibridación in situ (ISH) y micromatrices
(microarrays). Los métodos para marcar moléculas de ácido
nucleico son bien conocidos en la técnica y pueden realizarse
usando diferentes agentes de marcaje incluyendo, pero sin
limitación: agentes radiactivos, colorantes fluorescentes, agentes
quimioluminiscentes; micropartículas; enzimas; marcadores
colorimétricos (tales como, por ejemplo, colorantes, oro coloidal y
similares); marcadores magnéticos y haptenos (tales como, por
ejemplo, biotina, dioxigenina (DIG) y otros para los que están
disponibles antisueros o anticuerpos monoclonales).
Las sondas marcadas de la presente invención
pueden usarse como herramientas de diagnóstico, por ejemplo, para
la detección de ADN de Anisakis spp. en tejidos humanos y/o
animales infectados, y para investigación.
En una realización preferida, las secuencias de
ácido nucleico seleccionadas de la presente invención pueden
marcarse con DIG por amplificación por PCR usando nucleótidos
marcados con DIG (Boehringer-Mannheim,
Alemania).
Como ejemplo, puede obtenerse una sonda de
secuencia de nucleótidos marcada con DIG seleccionada (482 pares de
bases), que corresponde a las posiciones de los nucleótidos 1490 y
1971 de la SEC ID Nº: 1, usando el vector pQE-31
transformado del Ejemplo 3 como molde, y un conjunto de cebadores
directo (5' SEC ID Nº: 27 3') e inverso (5' SEC ID Nº: 28 3'). Las
muestras tisulares a analizar, obtenidas a partir de biopsias
humanas o de animales infectados, pueden fijarse en
paraformaldehído al 4%, y después analizarse para detectar la
presencia de ADN de Anisakis spp. usando métodos ISH y la
sonda marcada con DIG anterior. Una descripción detallada de un
método para realizar el ISH del presente ejemplo ha sido descrita
por Leiro et al. (2001), que se incorporó en este documento
como
referencia.
referencia.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
12
En un aspecto de la presente invención, se
describen secuencias peptídicas que se reconocen por el anticuerpo
monoclonal UA3. Dichas secuencias peptídicas se reconocieron como
"repeticiones" de aminoácidos analizando la secuencia de
aminoácidos de la SEC ID Nº: 2 usando el programa RADAR
http://www.ebi.ac.uk/Radar/ en el EMBL-EBI
(European Bioinformatics Institute). Se sintetizaron químicamente
secuencias seleccionadas de 12 aminoácidos a partir de estas
"repeticiones" y se ensayaron en ELISA competitivo con
respecto a la inhibición de la unión de anticuerpos monoclonales
UA3 con el polipéptido recombinante de la SEC ID Nº: 4, inmovilizado
en los pocillos de una placa de ELISA.
La actividad inhibidora de péptidos que
corresponden a las secuencias de aminoácidos Nº:
7-11 se ensayaron en un ELISA de captura, siguiendo
las siguientes etapas típicas: a) unión del polipéptido de la SEC
ID Nº: 4 a los pocillos de una placa de ELISA durante una noche; b)
aspiración, y después bloqueo de los pocillos de ELISA durante 1 h
a 37ºC con tampón TBS que contenía leche descremada en polvo al 3% y
Tween-20 al 0,2% (TBS-TM); d)
aspiración, y después incubación durante 2 h a 37ºC con 100
microlitros de la dilución apropiada de mAb UA3 preincubado con el
péptido inhibidor a ensayar; d) lavado 3 veces con 200
microlitros/pocillo de TBS que contenía Tween-20 al
0,2% (TBS-T); e) incubación con 100 microlitros de
una dilución 1:3000 en PBS-TM de IgG de cabra
anti-ratón conjugada con peroxidasa (Nordic
Immunological Laboratory, Tilburg, The Netherlands); f) aspiración,
y lavado 3 veces con 200 microlitros/pocillo de
TBS-T; g) aspiración, y lavado con 200
microlitros/pocillo de PBS-T; h) aspiración, e
incubación con sustrato para peroxidasa (Sigma Fast OPD, Sigma); i)
lectura de las densidades ópticas (DO) a 492 nm en lector
multipocillo (Molecular Devices).
La siguiente Tabla III muestra los valores de
inhibición obtenidos para los péptidos sintéticos de las SEC ID Nº:
7-11 (ensayados a tres concentraciones) sobre la
unión del anticuerpo monoclonal UA3 al polipéptido de la SEC ID Nº:
4 inmovilizado en una placa de ELISA. Los resultados se expresaron
como el porcentaje de inhibición para cada dilución de péptido con
respecto al control (sin inhibición). ND: No hecho. Como se dedujo
de los resultados observados, el anticuerpo monoclonal UA3 tiene
preferencia por péptidos de las SEC ID Nº: 7 y 8, que difiere
solamente en un aminoácido.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
13
En otra realización preferida, se ensayó la
actividad inhibidora de la secuencias de aminoácidos (SEC ID Nº:
7-11) sobre la unión de anticuerpos IgE humanos
anti-Anisakis al polipéptido de la SEC ID Nº: 4 en un ELISA
indirecto competitivo del siguiente modo: a) unión del polipéptido
de la SEC ID Nº: 4 a los pocillos de una placa de ELISA durante una
noche; b) aspiración, y después bloqueo de los pocillos de ELISA
durante 1 h a 37ºC con tampón TBS que contiene leche descremada en
polvo al 3% y Tween-20 al 0,2%
(TBS-TM); d) aspiración, y después incubación
durante 2 h a 37ºC con 100 microlitros de una dilución 1:1 del
suero del paciente correspondiente y la solución peptídica en TBS
(1,5 X 10^{-3} M, concentración final para cada uno de los
péptidos anteriores); d) lavado 3 veces con 200 microlitros/pocillo
de TBS que contiene Tween-20 al 0,2%
(TBS-T); e) incubación con 100 microlitros de una
dilución 1:2500 de anticuerpos monoclonales
anti-IgE humana marcados con FITC; f) aspiración, y
después lavado 3 veces con 200 microlitros/pocillo de
TBS-T; g) aspiración, y después incubación con 100
microlitros de una dilución 1:1500 de anticuerpos de conejo anti-
FITC conjugados con peroxidasa (Dako); h) aspiración, y después
lavado con 200 microlitros/pocillo de PBS-T; i)
aspiración, e incubación con sustrato para peroxidasa (Sigma Fast
OPD, Sigma); j) lectura de las densidades ópticas (DO) a 492 nm en
un lector multipocillo (Molecular
Devices).
Devices).
La siguiente Tabla IV muestra la actividad
inhibidora de una mezcla de los péptidos sintéticos que
corresponden a las SEC ID Nº: 7-11 sobre la unión de
anticuerpos IgE presentes en sueros de cinco pacientes infectados
al polipéptido de la SEC ID Nº 4 inmovilizado en placas de ELISA.
La mezcla peptídica se ensayó a una concentración final de 1,5 x
10^{-3} M para cada péptido. Los resultados se expresaron como
porcentaje de inhibición de la mezcla peptídica con respecto al
control (inhibido con una mezcla de péptidos irrelevantes a la
misma concentración final). Como se observó en la Tabla, las
secuencias ensayadas fueron dianas para un intervalo del
25-74 por ciento de todos los anticuerpos IgE
anti-Anisakis presentes en los sueros de pacientes
infectados. Sin embargo, se entiende que probablemente otros
péptidos y polipéptidos recombinantes o sintéticos que comprenden
un tramo contiguo de 8 o más aminoácidos de la SEC ID Nº: 2, o
repeticiones de dichas secuencias, también pueden reconocerse por
anticuerpos anti-Anisakis de varios isotipos que están
presentes en sueros de pacientes infectados.
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
Ejemplo
14
En una realización preferida, los péptidos o
polipéptidos de la presente invención pueden usarse para inmunizar
un mamífero (tal como, por ejemplo, conejos, ovejas, cabras,
ratones o ratas) y los anticuerpos policlonales específicos
obtenidos pueden usarse para revelar la presencia de larvas de
Anisakis en tejidos infectados de seres humanos o animales.
Típicamente, el procedimiento para revelar antígenos de
Anisakis en tejidos con parásitos puede realizarse siguiendo
un método de inmunohistoquímica convencional de acuerdo con las
siguiente etapas generales: a) preparación de los portaobjetos que
contienen las secciones de tejidos incluidos en parafina; b)
bloqueo de los tejidos con TBS-TM o cualquier otro
reactivo de bloqueo; c) etapa de lavado; d) incubación con
anticuerpos policlonales anti-Anisakis; e) etapa de lavado;
f) incubación con anticuerpos secundarios marcados que reconocen
anticuerpos IgG de la especie animal usada para la inmunización (en
este ejemplo, la molécula de marcaje preferida es la enzima
peroxidasa, pero puede usarse cualquier otro marcador tal como, por
ejemplo, los indicados en el Ejemplo 10 de la presente invención,
para el marcaje de anticuerpos secundarios); g) etapa de lavado; h)
incubación con el sustrato enzimático apropiado (tal como, por
ejemplo H_{2}O_{2} + DAB); i) observación al microscopio.
En otra realización preferida, puede revelarse
la presencia de proteínas de Anisakis spp. que comprenden
las secuencias de aminoácidos de la presente invención en tejidos
infectados de seres humanos o animales usando el anticuerpo
monoclonal UA3 como anticuerpo primario, usando métodos de
inmunohistoquímica convencionales.
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Ejemplo
15
En otra realización preferida, los AcMs (ejemplo
el AcM UA3) y los anticuerpos policlonales obtenidos frente a los
péptidos, polipéptidos o proteínas de la presente invención pueden
ser utilizados para diseñar un método ELISA captura destinado a
detectar la presencia de antígenos de Anisakis en extractos
alimentarios que contengan pescado en su composición.
En una realización todavía más preferida, el
método ELISA captura para la determinación de antígenos de Anisakis
en un extracto alimentario se puede llevar a cabo de acuerdo con
las siguientes etapas: a) acoplamiento de anticuerpos policlonales
anti-Anisakis (100 microlitros/pocillo; concentración de
anticuerpos de 10 microgramos/ml) durante una noche; b) aspiración,
y después lavado de la placa ELISA con PBS tres veces; c)
aspiración, y después bloqueo de los pocillos de ELISA durante 1 h
a 37ºC con una solución de PBS que contenga leche descremada en
polvo al 3% y Tween-20 al 0,2%
(PBS-TM); d) aspiración, y después incubación
durante una noche a 4ºC y agitación orbital, con 100 microlitros
del correspondiente extracto alimentario (sobrenadante obtenido por
homogenización de la muestra en PBS y posterior centrifugación a
3.000 g durante 30 minutos); e) lavado tres veces con 200
microlitros por pocillo de PBS que contenga
Tween-20 al 0,2% (PBS-T); f)
incubación con 100 microlitros de una dilución 1:2500 de
anticuerpos monoclonales UA3 marcados con biotina (marcaje
realizado según se describe en la referencia Walker (1996)); g)
aspiración y lavado 3 veces con 200 microlitros/pocillo de
PBS-T; h) aspiración, e incubación con 100
microlitros de una dilución 1:1.500
avidina-peroxidasa (Pierce, Rockford, IL, USA); i)
aspiración, y lavado con 200 microlitros por pocillo de
PBS-T; j) aspiración, e incubación con sustrato
para peroxidasa (Sigma Fast OPD, Sigma); k) lectura de densidades
ópticas (DO) a 492 nm en lector multipocillo (Molecular Devices,
Sunnyvale,
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Compostela
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\vskip0.400000\baselineskip
<120> Secuencias peptídicas y
nucleotidicas de Anisakis spp., anticuerpos que reconocen
dichas secuencias, y usos de los mismos.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> ES1596.2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3288
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(3288)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Región codificante de la secuencia
antigénica de la SEQ ID nº 2 de Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1096
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1096)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoácidica deducida de
la SEQ ID Nº 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 915
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(915)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OERF PQE31 (marco de lectura abierto
del plásmido PQE31)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 305
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(305)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoácidica deducida de
la SEQ ID Nº 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 846
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(846)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OERF Ptarget (marco de lectura
abierto del plásmido Ptarget)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 282
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(282)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia aminoácidica deducida de
la SEQ ID Nº 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(12)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Val Gln Lys Tyr Gly Thr Glu Phe Cys Asn
Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(12)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Val Gln Lys Tyr Gly Gln Glu Phe Cys Asn
Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(12)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Val Gln Arg Tyr Gly Thr Gln Phe Cys Lys
Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(12)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ile Arg Lys Tyr Gly Val Thr Tyr Cys Asn
Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(12)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ile Ala Arg Tyr Gly Ala Glu Phe Cys Gln
Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Leu Gln Lys Tyr Gly Ala Glu Phe Cys Asn
Lys Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Tyr Gly Glu Gln Phe Cys Ser Ser Met
Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(9)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido antigénico de
Anisakis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Asn Arg Leu Gly Ala Ala Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 838
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(838)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Fragmento nucleotídico de la SEQ ID
Nº 1 que codifica la secuencia antigenica SEQ ID Nº 16 de
Anisakis spp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 279
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Peptide
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1).(279)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> secuencia antigénica aminoácidica
deducida de la SEQ ID Nº 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 834
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(834)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Fragmento nucleotídico de la SEQ ID
Nº 1 que codifica la secuencia antígenica SEQ ID Nº 18 de
Anisakis spp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 278
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(278)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> secuencia antigénica aminoácidica
deducida de la SEQ ID Nº 17
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttgtaaaacg acggccagtg
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcctttgtcga tactggtact
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgagagagagt cgacatgatg cacaaatgct taaagtc
\hfill37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(36)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgagagagaaa gctttcgcca aggatcctgt tgcgga
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(22)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Met Arg Gly Ser His His His His His His Thr
Asp Pro His Ala Ser}
\sac{Ser Val Pro Arg Val Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Anisakis spp.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> PEPTIDE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(4)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Leu Ile Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptgcacaaatg cttaaagtcg g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcagctaatta agcttcgcca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptgaatggtgg tgaccacaaa
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> primer
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggatcaaaa gtctctcctg g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (27)
1. Secuencia de ácido nucleico aislada
seleccionada de cualquiera de las siguientes:
- a.
- Un ácido nucleico que comprende la SEC ID Nº 1
- b.
- Un ácido nucleico que comprende el complemento de la SEC ID Nº 1
- c.
- Un fragmento del ácido nucleico de la SEC ID Nº 1 que comprende la SEC ID Nº 15 o la SEC ID Nº 17.
- d.
- Un ácido nucleico que comprende un fragmento de la SEC ID Nº 1 que codifica para cualquiera de las SEC ID Nº 4 o 7-14.
- e.
- Un ácido nucleico que tiene una identidad de al menos el 70% con cualquiera de las secuencias de ácido nucleico descritas previamente.
2. Polipéptido, péptido o proteína aislada
codificada por cualquiera de las secuencias de ácido nucleico
aisladas de la reivindicación 1, seleccionado entre el siguiente
grupo:
- a.
- Un polipéptido, proteína o péptido que comprende la SEC ID Nº 2
- b.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende la SEC ID Nº 16 o la SEC ID Nº 18.
- c.
- Un fragmento de la SEC ID Nº 2 que comprende cualquiera de las SEC ID Nº 4 o 7-14.
- d.
- Un polipéptido, péptido o proteína que tiene una identidad de al menos el 70% con cualquiera de las secuencias de polipéptidos, proteínas o péptidos descritas previamente.
3. El péptido, polipéptido o proteína aislada de
acuerdo con la reivindicación
2(a)-2(d) o la secuencia de ácido
nucleico aislada de acuerdo con la reivindicación
1(a)-1(e), que presente una identidad
de al menos el 80% con cualquiera de estas secuencias.
4. El polipéptido, péptido o proteína aislada de
acuerdo con la reivindicación
2(a)-2(d) o en la secuencia de ácido
nucleico aislada de acuerdo con la reivindicación
1(a)-1(e), que presente una identidad
de al menos el 90% con cualquiera de estas secuencias.
5. Péptido, polipéptido o proteína aislada que
consiste en una secuencia de aminoácidos de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones
2(c)-2(d), 3 ó 4, seleccionada entre
el siguiente grupo:
- a.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 7
- b.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 8
- c.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 9
- d.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 10
- e.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 11
- f.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 12
- g.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 13
- h.
- Una secuencia de aminoácidos que comprende la SEC ID Nº 14.
6. Una secuencia de ácido nucleico aislada capaz
de codificar cualquiera de los péptidos de la reivindicación
anterior.
7. Un péptido, polipéptido o proteína que
comprende dos o más de las secuencias de aminoácidos de una
cualquiera de las reivindicaciones 2-5.
8. Una secuencia de ácido nucleico que codifica
un péptido, polipéptido o proteína de la reivindicación 7.
9. Un anticuerpo o un fragmento del mismo capaz
de reconocer cualquier péptido, polipéptido o proteína de
cualquiera de las reivindicaciones 2-5.
\newpage
10. Un anticuerpo según la reivindicación
anterior, donde dicho anticuerpo es el anticuerpo monoclonal UA3
producido por la línea celular de hibridoma con el número de
depósito DSM ACC2793.
11. Línea celular de hibridoma con número de
depósito DSM ACC2793 caracterizado porque produce el
anticuerpo monoclonal UA3 específico frente a la SEC ID Nº 2.
12. Una secuencia de ácido nucleico o secuencia
de aminoácidos aislada de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1-8, donde dicha secuencia de
ácido nucleico o de aminoácidos está marcada con una molécula de
señalización.
13. La secuencia de ácido nucleico o secuencia
de aminoácidos aislada de acuerdo con la reivindicación 12, donde
dicha molécula de marcaje se selecciona entre el siguiente
grupo:
- a.
- Radiactiva
- b.
- Enzimática
- c.
- Fluorescente
- d.
- Luminiscente
- e.
- Quimioluminiscente
- f.
- Haptenos
- g.
- Coloreada.
14. La secuencia de ácido nucleico o secuencia
de aminoácidos aislada de acuerdo con la reivindicación anterior,
donde dicha molécula de marcaje se selecciona entre el siguiente
grupo:
- a.
- Biotina o sus derivados
- b.
- Derivado de nitrofenol
- c.
- Oro coloidal y
- d.
- Látex.
15. Un péptido, polipéptido o proteína aislada
de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 2 a 5,
fusionada o unida químicamente a un péptido, polipéptido o proteína
adicional.
16. Un vector de expresión o sistema de
expresión que comprende una secuencia de nucleótidos de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 1, 3-4, 6 o
8.
17. Una célula hospedadora procariota o
eucariota aislada transformada o transfectada con una secuencia de
ácido nucleico de una cualquiera de las reivindicaciones 1,
3-4, 6, o 8 ó con el vector o sistema de expresión
de la reivindicación 16.
18. Un método para elaborar un péptido,
polipéptido o proteína de acuerdo con una cualquiera de las
reivindicaciones 2-5, por cualquiera de las
siguientes técnicas:
- a.
- Técnicas recombinantes
- b.
- Síntesis química
- c.
- Purificación sustancial de nematodos de la familia Anisakidae.
19. Un método para elaborar un péptido,
polipéptido o proteína de acuerdo con una cualquiera de las
reivindicaciones 2-5 que comprende cultivar la
célula hospedadora de la reivindicación 17 en condiciones tales que
se exprese dicha secuencia de nucleótidos, y producir y después
aislar dicho péptido, polipéptido o proteína.
20. Un método in vitro para detectar
anticuerpos contra Anisakis spp. en una muestra biológica
que comprende:
- a.
- poner en contacto la muestra biológica, preferiblemente suero, con un péptido, polipéptido o proteína de una cualquiera de las reivindicaciones 2-5, 7 ó 13, en condiciones suficientes para formar un complejo inmunológico entre dicho polipéptido y los anticuerpos de la muestra, y
- b.
- detectar dicho complejo inmunológico.
21. El método de la reivindicación 20, en el que
dicho método es un inmunoensayo o un inmunoensayo enzimático.
22. Un método in vitro para detectar
antígenos de Anisakis spp. en una muestra biológica o en un
extracto alimentario que comprende:
- a.
- poner en contacto la muestra biológica, o el extracto alimentario con un anticuerpo de cualquiera de las reivindicaciones 9-10, en condiciones suficientes para formar un complejo inmunológico entre dicho anticuerpo y los antígenos de la muestra, y
- b.
- detectar dicho complejo inmunológico.
23. El método in vitro de acuerdo con la
reivindicación 22, en el que el anticuerpo usado para formar un
complejo inmunológico es UA3.
24. Una composición inmunológica que comprende
un péptido, polipéptido o proteína de acuerdo con una cualquiera de
las reivindicaciones 2-5, 7 o una secuencia de
nucleótidos de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones
1, 3-4, 6, 8 ó 10.
25. Uso de un péptido, polipéptido o proteína de
acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones
2-5 o 7, para la fabricación de un medicamento para
el tratamiento de alergia a Anisakis spp.
26. Un kit adecuado para la detección de
anticuerpos anti-Anisakis spp. en una muestra biológica que
comprende un péptido, polipéptido o proteína de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 2-5, 7 ó 13.
27. Un kit adecuado para la detección de
antígenos de Anisakis spp en una muestra biológica, o en un
extracto alimentario que comprende un anticuerpo o fragmentos del
mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones
9-10.
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PCT/ES2007/070130 WO2008006927A1 (es) | 2006-07-13 | 2007-07-12 | Secuencias peptídicas y nucleotídicas de anisakis spp. anticuerpos que reconocen dichas secuencias y usos de los mismos |
AT07803657T ATE544856T1 (de) | 2006-07-13 | 2007-07-12 | Peptid- und nukleotidsequenzen von anisakis spp. und ihre verwendung |
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IGLESIAS R. et al. Monoclonal Antibodies against diagnostic Anisakis simplex antigens. Parasitology Research. 1997, Vol 83, páginas 755-761. Página 756, columna 1; página 757, columna 2, párrafo 3; página 759, columnas 1-2; página 760, columna 2. * |
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