ES2292493T3 - Metodo inmunoenzimatico de cuantificacion. - Google Patents

Metodo inmunoenzimatico de cuantificacion. Download PDF

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Abstract

Un anticuerpo policlonal para uso diagnóstico, caracterizado por el hecho de que reconoce la región que comprende los aminoácidos H486-S496 de PTEC, pero no reconoce el péptido PTECDelta16, concretamente PTEC sin motivo de fijación de ésteres de colesterol, caracterizado por el hecho de que dicho anticuerpo se produce después de unir el péptido consistente en Cys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser de PTEC (siendo H486-S496 la secuencia ID-5) a la proteína transportadora de KLH.

Description

Método inmunoenzimático de cuantificación.
Descripción del invento
Ámbito del invento: El presente invento hace referencia a Pruebas de laboratorio creadas para detectar y cuantificar la proteína transferidora de ésteres de colesterol (PTEC) contenida en muestras biológicas y sintéticas para uso clínico, con objeto de evaluar el riesgo de aterogénesis y para su uso en investigaciones relacionadas con la PTEC, aportándose en particular un anticuerpo policlonal para uso diagnóstico.
Antecedentes: En la década de 1970 se estableció una correlación definitiva entre los niveles y tipos de lipoproteínas y la cardiopatía. Se ha observado que los altos niveles de lipoproteínas de baja densidad (LDL) pueden ocasionar un aumento en la incidencia de la cardiopatía, y que la demora en la eliminación de estas partículas prolonga su tiempo de permanencia en el plasma, las expone a modificaciones estructurales e incrementa su interacción con las paredes arteriales. Además, las alteraciones de la apoliproteína B (Apo B) reducen la capacidad de estas partículas para fijarse a sus receptores, siendo por tanto mayormente reconocidas por los receptores macrofágicos. La incapacidad de los macrofágicos para regular la asimilación de las LDL ocasiona una acumulación de ésteres de colesterol y la formación de células espumosas, fenómeno éste que favorece la aparición de la aterogénesis.
La ateroesclerosis es un fenómeno que comienza en la infancia y la adolescencia y persiste toda la vida. Sus consecuencias, como la oclusión arterial y sus conocidas manifestaciones clínicas (infarto agudo de miocardio, accidentes vasculares cerebrales, gangrena de las extremidades inferiores, etc.), empiezan muchos años antes de que se detecten con la alteración de las paredes vasculares. Algunos pacientes con niveles lípidos séricos superiores a lo normal también presentan una mayor incidencia de este tipo de enfermedad, como es el caso de los diabéticos, nefrópatas o hiperlipidémicos congénitos, entre muchos otros. Para detectar la posibilidad de que a estos pacientes se les declare la ateroesclerosis y sus manifestaciones clínicas, se evalúan los llamados "factores de riesgo coronario". Estos factores indican el grado de exposición del individuo a circunstancias susceptibles de determinar un mayor riesgo de presentar enfermedades relacionadas con esta posibilidad; es decir, sirven para determinar el riesgo de aterogénesis. Los factores de riesgo coronario son como sigue:
\bullet Concentración elevada de lipoproteínas y colesterol total de baja densidad
\bullet Tensión arterial alta
\bullet Tabaquismo
\bullet Diagnóstico de cardiopatía isquémica
\bullet Hipoalfalipoproteinemia (bajos niveles de lipoproteínas de alta densidad o HDL)
\bullet Diabetes
\bullet Obesidad
\bullet Antecedentes familiares de cardiopatía prematura
\bullet Sexo masculino
\bullet Proteinuria
\bullet Hipertrigliceridemia.
Para comprobar si el paciente está expuesto a los factores de riesgo de la enfermedad coronaria se realizan entrevistas guiadas, exploraciones, determinaciones de lipidogramas, electrocardiogramas y radiografías torácicas. Si se sospecha una insuficiencia vascular periférica, se incluyen arteriografías y ecografías Doppler.
Los elementos considerados en esta evaluación se utilizan para la detección y el seguimiento de pacientes incluidos en los llamados "grupos de riesgo", compuestos por individuos que, debido a diferentes patologías, presentan uno, varios o todos los factores de riesgo coronario. Sin embargo, hay un gran número de personas en peligro de aterogénesis sin detectar detectado porque todavía no presentan las manifestaciones clínicas correspondientes y, por tanto, no están incorporadas a los grupos de riesgo. Como no hay un diagnóstico temprano de estos individuos, se pierden muchos años valiosos de prevención y, cuando las manifestaciones clínicas acaban apareciendo, el daño suele ser irreversible.
Además, los estudios que evalúan los factores de riesgo de aterogénesis, basándose en la concentración de lipoproteínas en el plasma de los pacientes incluidos en algún grupo de riesgo, son inconsistentes. Después están los pacientes incluidos en los grupos de riesgo que no presentan la descripción clínica típicamente indicativa del riesgo de aterogénesis, como evolución sin dolor con sólo una sensación de fatiga y falta de aire, y los que pasan inadvertidos porque se confunden sus síntomas con diversas patologías. En consecuencia, es preciso ampliar el reconocimiento del paciente, buscando manifestaciones atípicas.
También están los casos en que, aunque un individuo se halle expuesto a factores de riesgo, no se le manifiesta la ateroesclerosis. No todos los factores evaluables para determinar el riesgo de aterogénesis son fidedignos. Algunos de los más comentados se incluyen en el lipidograma, como los altos niveles de colesterol total y LDL, y los bajos niveles de HDL en la sangre, que sirven para calcular el índice aterógeno. Este índice es un parámetro arbitrario, considerado poco fiable para evaluar el riesgo de aterogénesis, según se ha comprobado experimentalmente. Así, por ejemplo, en pruebas con conejos sometidos a dietas altas en colesterol durante períodos largos se obtuvieron altos niveles de colesterol total, colesterol libre, colesterol esterificado y colesterol asociado a las LDL, bajos niveles de colesterol asociado a las HDL, hipertrigliceridemia, un alto porcentaje de esterificación y un alto índice aterógeno; sin embargo, no presentaron aterogénesis.
En conclusión, el método utilizado actualmente para evaluar el riesgo de aterogénesis presenta limitaciones graves. En primer lugar está la limitación del tamaño y el tipo de población con probabilidad de ser evaluada, debido a la inversión en tiempo y dinero precisa para las pruebas diagnósticas, lo cual dificulta la detección temprana de los individuos en peligro de aterogénesis que aún no se hallan en grupos de riesgo, y resta eficacia a la prevención de sus complicaciones. Segundo, aunque los parámetros diagnósticos utilizados ofrezcan un grado de certidumbre, casi todos son cualitativos; y algunos de carácter cuantitativo, los más importantes, son objeto de discusión en la actualidad y, por tanto, sólo puede hablarse de "una fuerte sospecha clínica de riesgo de ateroesclerosis", dado que los resultados no son completamente fidedignos. Tercero, poco se sabe sobre la homeostasis de lípidos en los humanos, y en los mamíferos en general, y no ha sido posible demostrar la existencia de una relación clara entre muchos de los parámetros considerados como factores de riesgo de aterogénesis y sus manifestaciones clínicas, por lo cual la determinación de dicho riesgo no puede asentarse en bases sólidas sin una auténtica comprensión de los factores que intervienen en la aterogénesis y de sus manifestaciones clínicas.
Hay otros factores de posible utilidad para demostrar el riesgo de aterogénesis de una manera más fidedigna, como la determinación de los niveles de la proteína transferidora de ésteres de colesterol (PTEC) en el plasma. Esta proteína se ha estudiado mucho y, de todos los factores que intervienen en la homeostasis de los lípidos, es uno de los más conocidos. La PTEC desempeña un cometido importante en el metabolismo de las lipoproteínas y en la aparición de la enfermedad coronaria arterial, por cuanto tiende a generar altos niveles de LDL y de lipoproteínas de muy baja densidad (VLDL) que se asocian a la evolución de la ateroesclerosis (Marotti-KR, Castle-CK, Boyle-TP, Lin-AH, Murray-RW y Melchior-GW, 1993, Nature 364(6432):73-5). La PTEC es una proteína multifuncional que fomenta el intercambio de ésteres de colesterol entre las HDL y las LDL y el intercambio de ésteres de colesterol y triacilgliceroles entre las HDL y las VLDL; su efecto en el catabolismo de las HDL influye en su contenido de ésteres de colesterol y en su composición, tamaño y estructura esférica (Rye-KA, Hime-NJ y Barter-PJ, 1995. J. Biol. Chem. 270(1):
189-196) (Bruce-C, Chouinerd-RA y Tall-AR, 1998, Annu. Rev. Nutr. 18:297-330).
La PTEC también participa en la reutilización del colesterol depositado en los tejidos periféricos durante la lipólisis de las lipoproteínas (Jiang-XC, Moulin-P, Quinet-E, Goldberg-IJ, Yacoub-LK, Agellon-LB, Compton-D, Schnitzer-Polokoff-R y Tall-AR, 1991. J. Biol. Chem. 266(7):4631-9) (Nagashima-M, McLean-J y Lawn-R, 1988, J. Lipid. Res. 29:1643-1649) (Tall-A, 1995, Annu. Rev. Biochem. 64:235-257). Este transporte, al que damos el nombre de "transporte inverso del colesterol", confiere a la PTEC el carácter de proteína antiaterógena, y de ahí su importancia en la propensión o resistencia a la ateroesclerosis (Kondo-I, Berg-K, Drayna-D, Lawn-R, 1989, Clin. Genet. 35(1): 49-56) (Bruce-C, Chouinerd-RA y Tall-AR, 1998, Annu. Rev. Nutr. 18:297-330). De acuerdo con lo anterior, el factor determinante de su capacidad antiaterógena no es el nivel de las HDL del plasma, sino la distribución de los tamaños de su población, que presenta una sólida correlación con los niveles de la PTEC (Brown-ML, Inazu-A, Hesler-CB, Agellon-LB, Mann-C, Whitlock-ME, Marcel-YL, Milne-RW, Koizumi-J, Mabuchi-H, 1989, Nature 342(6248):
448-51).
En trabajos experimentales se ha observado que las especies mamíferas carentes de PTEC por naturaleza son resistentes a la aparición de la cardiopatía arterial.
Por el contrario, en individuos transgénicos de estas mismas especies que expresan PTEC puede observarse una disminución del tamaño y de los niveles de HDL. En consecuencia, la expresión de PTEC aumenta la propensión a sufrir cardiopatía arterial atribuible a la dieta (Rye-KA, Hime-NJ y Barter-PJ, 1995, J. Biol. Chem. 270(1): 189-196). De manera similar, se ha observado que los humanos con deficiencia genética de PTEC presentan niveles de HDL mucho más altos que los de los individuos normales (hipoalfalipoproteinemia). Estos individuos parecen tener una incidencia menor de cardiopatía (Inazu-A, Quinet-EM, Wang-S, Browun-ML, Stevenson-S, Barr-ML, Moulin-P y Tall-AR, 1992, Biochemistry 31(8):2352-8). Sin embargo, los ratones transgénicos con hipertrigliceridemia que expresan PTEC están protegidos contra la aterogénesis (Homanics-GE, de Silva-HV, Osada-J, Zhang-SH, Wong-H, Borensztajin-J y Maeda-N, 1995, J. Biol. Chem. 269:16376-16382).
De acuerdo con lo anterior, el carácter aterógeno o antiaterógeno de la PTEC se establece en correlación con el nivel de HDL y puede actuar como agente aterógeno mediante el aumento de los niveles de lipoproteínas de baja densidad, eliminando ésteres de colesterol de HDL para incorporarlos a LDL y VLDL. El carácter antiaterógeno de la PTEC se basa en su capacidad para acelerar la transferencia del colesterol presente en los tejidos periféricos a fin de incorporarlo a las HDL; es decir, contrarrestando el efecto aterógeno a través del "transporte inverso del colesterol". En consecuencia, podemos afirmar que, al evaluar los niveles de PTEC en correlación con la distribución de tamaños y contenidos de colesterol de las HDL, es posible establecer su capacidad aterógena o antiaterógena junto con el riesgo de aterogénesis en todos los tipos de dislipidemias. Partiendo del resultado de esta prueba, puede establecerse si es necesario proseguir con la evaluación de los restantes factores de riesgo. También puede realizarse el seguimiento de pacientes diagnosticados, evaluando la eficacia de los programas de prevención o, si procede, la eficacia de dietas y/o tratamientos.
Aunque existen referencias a otros sistemas de cuantificación de la PTEC contenida en el plasma, hasta la fecha, debido al tipo de equipo necesario, sólo se han establecido métodos de uso limitado por su complejidad técnica. Tal es el caso de la patente estadounidense US-05.770.355, registrada por Brocia, Robert W. en abril de 1998 con el título de "Equipo de pruebas cardiopáticas y método para determinar el factor de riesgo cardiopático y la eficacia del tratamiento de las cardiopatías". Esta patente requiere la síntesis de una partícula artificial y el uso de colesterol unido a una molécula fluorescente, lo cual limita su uso a laboratorios provistos del equipo necesario para medir la fluorescencia.
K. Saito et al: "Epitope mapping for the anti-rabbit cholesterol ester transfer protein monoclonal antibody that selectively inhibits triglyceride transfer", Journal of Lipid Research vol. 40, agosto de 1999, páginas 2013-2021, revela que los segmentos del terminal carboxílico de la PTEC (E465-S473) de humanos, y K485-S493 de conejos, ambos extendidos por al menos un residuo (sin especificar) más allá del terminal aminoácido o carboxílico, son responsables de la transferencia del éster de colesterol y de triglicérido.
La patente W0-36.139.168 revela un método para aumentar el colesterol HDL en un mamífero mediante el estímulo de una respuesta inmunitaria que inhibe las funciones de la PTEC. Se acoplaron péptidos de PTEC a portadores como la hemocianina de lapa californiana (KLH) o la ovoalbúmina, para aumentar la inmunogenia. Entre los epítopos utilizados se menciona el denominado H486-S496 de la PTEC acoplado a KLH (véase la reivindicación 5 y el Ejemplo 2 de la página 9, segundo párrafo).
El objeto subyacente del presente invento es aportar medios para detectar y cuantificar niveles de PTEC en muestras biológicas y sintéticas de una forma sencilla y rápida que permita mejorar la detección, el diagnóstico y el seguimiento de individuos en riesgo de ateroesclerosis, incluso en ausencia de manifestaciones clínicas relacionadas con esta patología y aunque no estén incorporados a grupos de riesgo. Esto se logrará mediante la incorporación del presente sistema a protocolos y equipos utilizados habitualmente en laboratorios clínicos humanos y veterinarios.
Descripción de las figuras
En la figura 1 se muestran pruebas del tipo inmunotransferencia con uso del anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496 contra plasma humano (vía A) y plasma de conejo (vía B). El anticuerpo policlonal anti-PETC H486-S496 reconoce la PTEC de -67 kDa; en pruebas efectuadas con extractos brutos procedentes de lípidos y tejidos perfundidos se obtuvo exactamente el mismo resultado; para descartar la posibilidad de falsos positivos en los que el anticuerpo reconoce la albúmina del plasma, en todas las pruebas se incluyeron controles contra la albúmina sérica bovina (BSA) (vía C). Como el resultado de estos controles es negativo, el anticuerpo policlonal reconoce la PTEC específicamente;
En la figura 2 se presenta un gráfico cuyos valores de la curva típica se obtuvieron utilizando péptido sintético H486-S496 y el resultado de la cuantificación de la PTEC en 25 muestras de plasma humano. Según estos resultados, los niveles de PTEC contenidos en el grupo de muestra oscilan entre 2 y 3 \mug/ml, equivalentes a 28-31 pM/ml. Estos resultados se obtuvieron con este sistema de cuantificación de la PTEC.
Descripción de las secuencias
Secuencia ID-1. Secuencia de oligonucleótidos codificantes, compatible con los oligonucleótidos no codificantes de la secuencia ID-2 en multiplicaciones de la reacción en cadena de la polimerasa (RCP). Se corresponde con la secuencia procedente de las bases 1391 a 1414 del exón 15 del ácido ribonucleico mensajero (ARNm) de la PTEC. Tiene una longitud de 24 nt, un contenido del 45,8% de guanina-citosina (G-C) y una temperatura de fusión de 55,9ºC.
Secuencia ID-2. Secuencia de oligonucleótidos no codificantes, compatible con los oligonucleótidos codificantes de la secuencia ID- en multiplicaciones de la RCP. Es complementaria de la secuencia procedente de las bases 1852 a 1828 del exón 16 del ARNm de la PTEC. Tiene una longitud de 25 nt, un contenido del 48,0% de G-C y una temperatura de fusión de 55,3ºC.
Secuencia ID-3. Secuencia de nucleótidos del fragmento de PTEC recuperado del clon pMosBlue/PTEC3' y subclonado en pGex-2T, para generar el clon pGex-2T/PTEC3'. Al subclonar el fragmento de PTEC, tres nucleótidos del vector pMos (subrayado) se transportan de tal manera que el clon pGex-2T/PTEC3' incluye estos nucleótidos entre la región codificadora de glutatión-S transferasa (GST) y la codificadora de PTEC.
Secuencia ID-4. Secuencia de aminoácidos correspondiente a la sección PTEC de la proteína genotecnológica GST/PTECCOH, codificada por el clon pGex2T-PTEC 3'. Esta secuencia corresponde a los 33 residuos últimos de su terminal carboxílico, desde 1464 a S495, que comprende los residuos F481, L488, F491 y L495, importantes para mantener la actividad de transferencia de ésteres de colesterol (Tall-A, 1995, Annu. Rev. Biochem. 64:235-257). Este epítopo tiene un alto contenido de estructura de hélice \alpha y comprende la totalidad del motivo fijador de ésteres de colesterol (desde G473 hasta S496) (Matsunaga-A, Araki-K, Moriyama-K, Handa-K, Arakawa-F, Nishi-K, Sasaki-J y Arakawa-K, 1993, Biochem. Biophys. Acta. 1166(1):131-4) (Wang-S, Wang-X, Deng-L, Rassart-E, Milne-RW, Tall-AR, 1993, J. Biol. Chem. 268(3): 1955-9). El peso molecular (PM), el punto isoeléctrico (PI) y la carga a pH7 se obtuvieron con ayuda del programa DANstar (Lasergene).
Secuencia ID-5. Secuencia del péptido PTEC sintético H486-S496, diseñado para la producción del anti cuerpo policlonal IgY anti-PETC H486-S496. Este péptido tiene un residuo de cisteína en el extremo "N" que se utiliza para unirlo a la proteína transportadora. La estructura secundaria, recogida en un informe de Tall-A (1995), Annu. Rev. Biochem. 64:235-257, la hemos confirmado mediante los algoritmos de Chou-Fasman y Garnier-Robson. El péptido comprende tres de los cuatro residuos que revisten especial importancia para conservar la capacidad de fijación a lípidos neutros, concretamente los F481, L488, F491 y L495, indicados con letras negras. Los datos del peso molecular (PM), el punto isoeléctrico (PI) y la carga a pH7 se obtuvieron con ayuda del programa DANstar (Lasergene); el valor pH con el que el péptido se hace soluble en agua se obtuvo experimentalmente.
Descripción detallada del invento
El presente invento, descrito en la reivindicación 1, el equipo de la reivindicación 12, el método de las reivindicaciones 8 y 11, y el uso de la reivindicación 8, así como las presentes formas de realización, reflejan un sistema para detectar y cuantificar PTEC. El uso del presente sistema permite identificar, evaluar y realizar el seguimiento de pacientes con dislipidemias, cuyos efectos están relacionados con alteraciones del nivel de la PTEC presente en el plasma, para evaluar su riesgo de ateroesclerosis. El presente sistema se ha diseñado para uso en prácticas clínicas y/o investigaciones relacionadas con la PTEC. Pueden utilizarse muestras de orígenes diferentes, tanto biológico como sintético, preferiblemente plasma o suero, extractos celulares o procedentes de tejidos, medios de cultivo y antígenos purificados o semipurificados.
Proteína fusionada GST/PTECCOH
La proteína GST/PTECCOH tiene un peso aproximado de 67 kDa, de los cuales 3,7 kDa corresponden al terminal carboxílico de la PTEC, y el resto al glutatión-S transferasa. La proteína GST/PTECCOH se ha diseñado para utilizarla tanto en pruebas ELISA como de inmunotransferencia, a modo de patrón que permite identificar y cuantificar PTEC mediante el uso de anticuerpos dirigidos específicamente contra su terminal carboxílico.
La secuencia de la sección correspondiente a la PTEC, en la proteína fusionada GST/PTECCOH, se presenta como una secuencia ID-4. Ésta abarca los 33 residuos últimos del terminal carboxílico de la PTEC, desde 1464 hasta S495, tiene un elevado contenido de estructura de hélice \alpha y comprende la totalidad del motivo fijador de ésteres de colesterol (desde G473 hasta S496). En el diseño del patrón para las pruebas ELISA y de inmunotransferencia se escogió el extremo carboxílico de la PTEC porque comprende residuos P481, L488, F491 y L495 y porque se ha demostrado experimentalmente que estos residuos revisten especial importancia para mantener la actividad de transferencia de ésteres de colesterol (Wang-S, Kussie-P, Deng-L y Tall-A, 1995, J. Biol. Chem 270(2):612-618), (Jiang-X, Bruce-C, Cocke-T, Wang-S, Boguski-M y Tall-A, Biochem. 34:7258-7263) (Matsunaga-A, Araki-K, Moriyama-K, Handa-K, Arakawa-F, Nishi-K, Sasaki-J y Arakawa-K, 1993, Biochem. Biophys. Acta 1166(1): 131-4) (Wang-S, Wang-X, Deng-L, Rassart-E, Milne-RW, Tall-AR, 1993, J. Biol. Chem. 268(3):1955-9). De este modo, la cuantificación de PTEC sólo tendrá como patrón el carboxilo de PTEC que comprende los puntos necesarios para mantener su capacidad de fijación a los ésteres de colesterol.
Otra ventaja de utilizar este patrón es que no precisa la purificación de la PTEC procedente de fuentes naturales. La purificación de la proteína genotecnológica es más sencilla y rápida que la de la PTEC procedente de plasma; puede obtenerse más proteína genotecnológica de cultivos bacterianos que PTEC de plasma; la pureza de los preparados genotecnológicos es superior a la de las purificaciones del plasma, y una mayor pureza reduce el riesgo de falsos positivos y cuantificaciones erróneas. La generación de proteínas genotecnológicas puede realizarse en condiciones controladas, a diferencia de las muestras biológicas, que dependen de una gran cantidad de variables, incontrolables en su mayoría. Finalmente, la proteína genotecnológica únicamente induce el extremo carboxílico, y por tanto no sólo evita una reacción cruzada contra otras proteínas, sino también contra otros epítopos de
PTEC.
Diseño del péptido sintético PTEC H486-S496 y obtención del anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496
El sistema de detección y cuantificación de PTEC requiere el uso de un anticuerpo específicamente dirigido contra el punto de fijación de lípidos neutros para garantizar que sólo se detecte la PTEC que conserve este epítopo y que por consiguiente conserve la capacidad de fijación a lípidos neutros, incluidos los ésteres de colesterol. Debemos añadir aquí que, hasta ahora, se han dado a conocer numerosas mutaciones y ediciones alternativas de ésteres de colesterol, la mayoría de las cuales no se traducen, o se traducen en proteínas que no segregan plasma. Sólo una de estas variaciones de PTEC, procedente del exón nueve (PTEC\Delta9), se segrega deficientemente en el medio extracelular (Quinet-E, Yang-TP, Marinos-C y Tall-A, 1993, J. Biol. Chem 268(23):16891-16894).
Pese a la inactividad de esta versión del PTEC\Delta9 en la transferencia de lípidos, conserva el epítopo fijador de lípidos neutros y por tanto es detectable mediante el anticuerpo anti-PTEC H486-S496; sin embargo, como se sabe que se segrega deficientemente en el medio extracelular y no se conoce su presencia en el plasma, su efecto en la cuantificación de PTEC mediante este sistema será mínimo o nulo.
No obstante, durante los trabajos previos al presente documento localizamos otra versión de PTEC sin el motivo de fijación de ésteres de colesterol (PTEC\Delta16), y por tanto sin capacidad para la fijación de lípidos neutros. Esta versión de PTEC\Delta16 se encuentra en grandes cantidades en el plasma y podría ser detectada por anticuerpos dirigidos contra cualquier epítopo de la versión original de PTEC, excepto los anticuerpos dirigidos contra el motivo de fijación de ésteres de colesterol.
Por consiguiente, el anticuerpo generado para este sistema no debería reconocer la cuantificación de la variedad PTEC\Delta16 y debería evitar la generación de anticuerpos dirigidos contra cualquier otra proteína presente en el plasma de mamífero y contra cualquier otro epítopo PTEC; además, es una medida de seguridad que evita falsos positivos y cuantificaciones erróneas. Por esta razón se descartó su uso como antígeno para completar PTEC purificada de cualquier especie de mamífero, y en su lugar se diseñó un péptido sintético como antígeno. Un péptido sintético puede obtenerse con un alto grado de pureza y, según como se diseñe, permite generar anticuerpos contra un epítopo específico.
Para diseñar este péptido se secuenció el producto transcriptasa inversa-reacción en cadena de la polimerasa (TI-RCP), multiplicado con un par de oligonucleótidos provistos de secuencias ID-1 e ID-2. Esta secuencia se trasladó a una secuencia de aminoácidos y se analizó con ayuda del programa DNAstar (Lasergene), del cual se obtuvo la previsión del índice de hidrofobicidad del tipo Kyte-Doolittle, y la estructura secundaria con los algoritmos de Chou-Fasman y Garnier-Robson.
Partiendo de esta información y de las características requeridas para el presente sistema de cuantificación de PTEC, diseñamos el péptido sintético, teniendo en cuenta las consideraciones siguientes:
Debe incluirse en el motivo de fijación de lípidos neutros. Es decir, en los 26 residuos últimos del carboxilo PTEC (Wang-S, Deng-L, Milne-RS y Tall-AR, 1992, J. Biol. Chem. 267(25):17487-17490). De este modo, el anticuerpo sólo puede reconocer la versión de PTEC que comprende este epítopo.
Debe comprender el mayor número posible de residuos considerados importantes para mantener la capacidad de fijación de lípidos. Los residuos de F481, L488, F491 y L495, importantes en la actividad de transferencia de ésteres de colesterol, figuran entre los 26 aminoácidos del motivo de fijación de lípidos (Tall-A, 1995, Annu. Rev. Biochem. 64:235-257). Con esto, no sólo centramos el reconocimiento del anticuerpo contra el motivo de fijación de lípidos neutros, sino también contra los residuos de máxima importancia para el mantenimiento de esta capacidad.
Su secuencia no presenta homología con otros epítopos de PTEC ni con otras proteínas expresadas en mamíferos o gallinas. Aunque pueden obtenerse anticuerpos utilizando cualquier modelo animal que no exprese PTEC, para el anticuerpo que requiere este sistema es preferible recurrir a las gallinas y asegurar así una fuerte respuesta inmunitaria, debido a la diferencia filogénica. Por esta razón, el diseño del péptido no debe permitir la homología con proteínas expresadas en las gallinas. Por otra parte, el anticuerpo sólo debe reconocer PTEC y únicamente en un epítopo, por lo cual el péptido sintético no deberá tener homología con otras proteínas ni con ningún otro epitopo de PTEC.
Su tamaño debe permitir el mínimo número posible de márgenes de reconocimiento por el sistema inmunológico. Un péptido que cumpla esta condición permite generar anticuerpos policlonales capaces de reconocer epítopos específicos con exactitud igual o superior a la de un anticuerpo monoclonal.
Debe tener un residuo de cisteína en su extremo "N", para dirigir su fijación hacia la proteína transportadora. Un residuo de cisteína en el extremo "N" del péptido permite dirigir su fijación hacia una proteína transportadora, a fin de que queden expuestos todos los márgenes de reconocimiento del sistema inmunológico.
Debe estar en una región cuya respuesta inmunitaria se haya demostrado. En trabajos anteriores se demostró que el extremo carboxílico de la PTEC humana genera una respuesta inmunitaria que obtiene un anticuerpo monoclonal contra este motivo (Swenso-T, Hesler-CB, Browun-ML, Quinet-E, Trotta-PP, Haslanger-MF, Gaeta-FC, Marcel-yl, Miline-RW y Tall-AR, 1989, J. Biol. Chem. 264:14318-14326). Sin embargo, no se han determinado los márgenes de reconocimiento de este anticuerpo dentro de los 26 aminoácidos que comprenden este epítopo. Por ello, al no poder descartar la posibilidad de que existan márgenes no antigénicos en este epítopo y de que uno de ellos coincida con la secuencia de péptido sintético diseñada por nosotros, nuestro diseño se comprobó experimentalmente.
De acuerdo con lo anterior, diseñamos el péptido sintético PTEC H486-S496, cuya secuencia se expresa como secuencia ID-5, y que tiene las características siguientes: La secuencia del péptido se encuentra inserta en el motivo de fijación de ésteres de colesterol y corresponde a la secuencia de residuos H486 a S496 de PTEC de conejo; es decir, los once residuos últimos de la proteína, siendo por tanto incapaz de reconocer la versión PTEC\Delta16. Su secuencia comprende tres de los cuatro residuos que revisten especial importancia para el mantenimiento de la unión fijadora de lípidos: L488, F491 y L495. La secuencia del péptido sintético no tiene homología con otros epítopos de PTEC ni con otras proteínas de mamíferos o gallinas; en cambio, presenta una elevada homología con el terminal carboxílico de la PTEC de varias especies: 100% con conejos, humanos y monos, y 20% con el hámster. Como este péptido consta de sólo once residuos, únicamente presenta un margen de reconocimiento al sistema inmunitario. Se agregó un residuo de cisteína a la secuencia de PTEC original, para dirigir la fijación hacia la proteína transportadora. La capacidad antigénica del péptido sintético PTEC H486-S496 se demostró mediante la obtención del anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496.
A fin de obtener el anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496, el péptido PTEC H486-S496 se unió a la proteína transportadora de KLH. Se utilizó KLH en lugar de seroalbúmina bovina para evitar la generación de anticuerpos capaces de reconocer la albúmina presente en el plasma, ocasionando falsos positivos y cuantificaciones erróneas en los resultados de las pruebas. Los anticuerpos se obtienen en animales modelo, preferiblemente en gallinas blancas LEGHORN inoculadas subcutáneamente una vez a la semana según el protocolo normal de 63 días. El valor de los anticuerpos del plasma se determina mediante la técnica ELISA. Las inmunoglobulinas G (IgG) de los huevos se aíslan. Si se utilizan otros animales modelo, se aíslan las IgG del plasma. Aunque este anticuerpo puede obtenerse de varios animales modelo que no expresan PTEC, el valor del obtenido en las gallinas será mucho más alto.
Debe señalarse que, por causa del diseño del péptido sintético utilizado como antígeno, el anticuerpo policlonal generado para este sistema únicamente reconoce residuos H486 a S496 presentes en el motivo de fijación de ésteres de colesterol. Este epítopo comprende tres de los cuatro residuos que revisten especial importancia para el mantenimiento de la capacidad fijadora de lípidos: L488, F491 y L495. Además, por tener un solo margen de reconocimiento, ofrece mayor exactitud que el anticuerpo monoclonal mencionado anteriormente. De acuerdo con el diseño del antígeno y las pruebas experimentales del anticuerpo, no reconoce la versión PTEC\Delta16, otras proteínas de mamífero o de gallina, ni otros epítopos de PTEC; pero sí reconoce las PTEC de otras especies, porque la región escogida en el diseño del antígeno está muy conservada en varias especies de mamíferos.
Sistema para la detección y cuantificación de PTEC
El objeto de este sistema es detectar y cuantificar PTEC en el máximo número posible de muestras, de una forma sencilla y rápida. Para ello se utiliza el clásico método ELISA (enzimoinmunoanálisis de adsorción). Como patrones de esta prueba se utiliza la proteína genotecnológica GST/PTECCOH y/o el péptido sintético PTEC H486-S496. El antígeno de control y las muestras a cuantificar, preferiblemente plasma o suero, se unen a la placa ELISA según los procedimientos habituales de los laboratorios clínicos.
Si se utilizan muestras de plasma o de suero, preferiblemente se requiere una de 20-5 pl que no necesite tratamiento previo. El nivel mínimo de detección de este sistema es 0,018 pM (1 pg) de PTEC, siendo el nivel máximo 360 pM (20 pg). La curva típica sugerida para el plasma humano y de conejo es:
(pM/100 \muL)
0,250
0,166
0,125
0,100
0,083
0,071
0,062
0,055
Se recomienda una dilución inicial de plasma o suero de 1:15.000, 100 \mul por pocillo. Esta dilución deberá ajustarse, si el nivel de PTEC de la muestra supera los límites de la curva.
Se utiliza anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496 como el de la reivindicación 1 a modo de anticuerpo primario exclusivamente para detectar el motivo responsable de la fijación de lípidos neutros a la PTEC, en los patrones y en las muestras. En función del origen del anticuerpo primario (gallina o mamífero) se escoge el anticuerpo secundario, preferiblemente comercial, unido a la peroxidasa, anti-IgY o anti-IgG, respectivamente. Para utilizar el anticuerpo primario en la técnica ELISA, la dilución preferible es 1:5000. El anticuerpo secundario debe ser preferiblemente comercial y unido a la peroxidasa, diluido como recomiende su fabricante.
El número máximo de muestras admisibles por duplicado en cada secuencia es 39, en un protocolo que comprenda la curva típica y un control negativo. Experimentalmente hemos descartado falsos positivos mediante el uso de una combinación de controles negativos, pero el control negativo debe incluirse por duplicado a fin de tener en cuenta el error experimental del usuario del sistema.
Como la PTEC está muy conservada en los mamíferos, este sistema es capaz de reconocer PTEC en el plasma de especies que expresen PTEC de forma natural, o de especies transgénicas que tengan este gen, a condición de que se conserve la homología con los 11 residuos últimos del terminal carboxílico. Por ello, este sistema se utiliza en trabajos clínicos humanos y veterinarios.
Equipo para cuantificar la proteína transferidora de colesterol en muestras biológicas
El sistema descrito es la base para el diseño de un equipo de diagnóstico, de uso rápido y sencillo en la determinación de niveles de PTEC de gran número de muestras, que no existe hasta la fecha. El equipo según el presente invento se define en la reivindicación 12 y está diseñado para uso clínico, preferiblemente utilizando muestras de plasma o suero procedentes de especies que expresen PTEC de forma natural, o de especies transgénicas que posean este gen. Deben conservar la homología en los 11 aminoácidos últimos del extremo carboxílico.
Este equipo puede adaptarse fácilmente a muestras de orígenes diferentes, biológicos y sintéticos, tanto para laboratorios clínicos humanos como veterinarios y para diversos usos de investigación.
Los componentes de este equipo son:
Soluciones
-PBS 10X
-Amortiguador de fijación, ph 9,6 50 mM (Na_{2}CO_{3} 35 mM+NaCO_{3} 15 mM+NaN_{3} 20 \mug/ml)
-Amortiguador de fosfato-citrato
\quad
Fosfato de Na- ácido cítrico 0,05 M, pH 5
Antígenos
Proteína genotecnológica GST/PTECCOH
Péptido sintético PTEC H486-S496
\vskip1.000000\baselineskip
Anticuerpo
-Primer anticuerpo
IgY o IgG Anti-PTEC H486-S496
\vskip1.000000\baselineskip
Procedimiento
1. El antígeno de control (GST/PTECCOH y/o PTEC H486-S496) y la curva típica se diluyen en 100 \mul de amortiguador de fijación.
2. Unir los antígenos y las muestras a la placa ELISA, incubando durante dos horas a 37ºC.
3. Eliminar los antígenos y bloquear con 200 \mul de ovoalbúmina 0,5 mg/ml, en un amortiguador de carbonato durante una hora a 37ºC. Al final de la incubación, lavar cuatro veces con 0,1% de tampón fosfato salino-Tween (PBST).
4. Incubar con 100 \mul de anti-PTEC H486-S496, en una dilución de 1:5000 en PBST, durante una hora, a 37º C. Al final de la incubación, lavar cuatro veces con PBST.
5. Incubar con 100 \mul del anticuerpo secundario unido a peroxidasa, anti-IgY o anti-IgG, según el caso, en la dilución recomendada por el fabricante en el PBST. Incubar durante una hora a 37ºC. Al final de la incubación, lavar cuatro veces con PBST y dos veces con H_{2}O.
6. Desarrollar con 100 \mul de sustrato para peroxidasa, preferiblemente ortofenilendiamina (OFD), en las condiciones recomendadas por el fabricante.
7. Incubar durante 20 minutos en la oscuridad, detener la reacción con 50 \mul de H_{2}SO_{4} 1,5 M para leer a 490 nm.
Todo el procedimiento se realiza con la placa ELISA cubierta, evitando las gradientes de temperatura.
Al incluir la cuantificación de PTEC entre los parámetros para diagnosticar el riesgo de aterogénesis, la certidumbre del diagnóstico aumenta significativamente por ser un parámetro cuantitativo que ha sido capaz de establecer una relación clara con muchos de los parámetros considerados como factores de riesgo de aterogénesis y sus manifestaciones clínicas. Por esta razón, a fin de facilitar la implementación del presente sistema en las clínicas, hemos diseñado el equipo anteriormente descrito. La facilidad de uso de este equipo permite aplicarlo sistemáticamente en la práctica clínica, e identificar a individuos que no presentan manifestaciones clínicas de ateroesclerosis ni figuran en los grupos de riesgo. Lo anterior facilita la detección de individuos en riesgo de aterogénesis no diagnosticado o con síndromes atípicos. Igualmente simplifica el diagnóstico y seguimiento de los pacientes, así como la evaluación de la eficacia de los tratamientos que se les dispensen.
Comentarios
Los instrumentos generados en la creación de este equipo de cuantificación de PTEC admiten usos diversos. Los oligonucleótidos con secuencias ID-1 e ID-2 se diseñaron para multiplicaciones por RCP, pero también pueden utilizarse como sondas moleculares contra productos ADN y RCP que contengan su secuencia. El oligonucleótido con secuencia ID-2 también puede utilizarse como sonda contra el mensajero de la PTEC, pero no así el oligonucleótido con secuencia ID-1. Ambos pueden ser instrumentos para futuros trabajos, tanto en investigación como en tratamiento de pacientes afectados por dislipidemias, relacionados con la expresión de PTEC.
Los clones pMosBlue/CETP3' y pGex2T/CETP3' también pueden utilizarse para obtener sondas específicas contra productos ADN, ARNm y RCR de la PTEC. El clon pMosBlue/CETP3' puede utilizarse para subclonar el fragmento ADNc de PTEC en otros vectores con diferentes finalidades, desde la obtención de sondas y otras proteínas genotecnológicas hasta los protocolos experimentales para el tratamiento de pacientes afectados de dislipidemias relacionadas con PTEC. El clon pGex2T/CETP3'también puede utilizarse para subclonar y para obtener grandes cantidades de proteína genotecnológica GST/PTECCOH en forma soluble, por medio de un método sencillo y barato.
La proteína genotecnológica se ha diseñado para utilizarla como patrón en pruebas ELISA y de inmunotransferencia en la práctica clínica, a fin de identificar y cuantificar PTEC por medio de anticuerpos dirigidos específicamente contra el terminal carboxílico. En pruebas del tipo inmunotransferencia es un control y/o patrón positivo de fácil gestión, lo cual no sería posible con proteínas o con péptidos ligeros. La obtención de esta proteína fusionada o genotecnológica aporta un patrón para identificar y cuantificar PTEC más fidedigno que las purificadas a partir de fuentes naturales. Esta proteína genotecnológica también tiene aplicaciones en el campo de la investigación; por ejemplo, en estudios de estructuras con sistemas de alta resolución como la cristalografía de rayos X; en estudios de actividades, por contener el epítopo que otorga la capacidad de fijación en lípidos; en cromatografía de afinidades para la purificación de anticuerpos u otras moléculas similares al terminal carboxílico de PTEC; en la producción de anticuerpos contra el carboxilo de PTEC, sin necesidad de fijación a proteínas transportadoras, entre otras muchas.
El péptido sintético PTEC H486-S496 es útil no sólo para la producción de anticuerpos y como patrón en el protocolo ELISA, sino incluso como instrumento importante en estudios de estructuras y actividades.
El uso del presente sistema de detección y cuantificación de PTEC permite identificar, evaluar y realizar el seguimiento de pacientes con dislipidemias, cuyos efectos están relacionados con alteraciones del nivel de PTEC presente en el plasma, para evaluar el riesgo de aterogénesis. El presente sistema facilita la manipulación de gran número de muestras de forma rápida y sencilla, permitiendo el uso sistemático de esta prueba en laboratorios clínicos humanos y veterinarios, y ampliando así el tamaño de la población evaluable. Aunque utiliza preferiblemente muestras de plasma o suero, también puede adaptarse para extractos celulares o hísticos, medios de cultivo, antígenos purificados o semipurificados, etc., lo cual amplía enormemente su campo de uso en la investigación.
El uso de este equipo puede ampliarse a la investigación de hechos y fenómenos presentes en la homeostasis de lípidos, así como en el estudio de las características físicas, químicas y biológicas de PTEC y sus moléculas relacionadas, utilizando muestras obtenidas a partir de modelos experimentales biológicos o no biológicos, preferiblemente extractos de tejidos, órganos o células en cultivo, medios de cultivo, proteínas genotecnológicas y péptidos sintéticos.
Ejemplos de uso 1.- Diseño de oligonucleótidos
Tomando como modelo el conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus), se obtuvo ARN total del hígado utilizando el procedimiento descrito por Sumikawa-K, Parker-I y Miledi-R (1989, Methods in Neurosciences 1:30-45), aislándose el fragmento ARN poli(A*) mediante cromatografía por el método oligo(dt)-celulosa. El ADNc se sintetizó con el sistema comercial para TI-RCP (Perkin Elmer), utilizando ARNm del hígado. Para el protocolo TI-RCP se diseñó un conjunto de oligonucleótidos con ayuda del programa Mac Vector. El diseño de oligonucleótidos permite la multiplicación específica del extremo 3' del ADNc de las PTEC, lo cual es especialmente difícil dadas las características de la secuencia ADNc de las PTEC, siendo la más determinante su alto contenido de G-C (más del 65%). Como consecuencia de lo anterior, se establecieron los parámetros siguientes en el diseño de los oligonucleótidos utilizados en el protocolo RCP:
SECUENCIA: ADNc de PTEC de conejo, publicado por Nagashima-M, McLean-J y Lawn-R en 1988 (J. Lipid. Res. 29:1643-1649).
SECUENCIA ANALIZADA: desde el nucleótido 1 hasta el nucleótido 1870.
TAMAÑO DE LOS OLIGONUCLEÓTIDOS: desde 18 hasta 30 bases.
TEMPERATURA DE FUSIÓN: 55-80ºC.
CONTENIDO DE G-C: 45-55%.
TAMAÑO DEL PRODUCTO 400-1000 pb.
MÁXIMO NÚMERO DE COHERENCIA EN BASES CONSECUTIVAS:
\quad
Oligonucleótido respecto a oligonucleótido (cualquiera) = 4
\quad
Oligonucleótido respecto a oligonucleótido (sólo G-C) = 2
\quad
Extremo 3' respecto a extremo 3' = 2
NO SE ADAPTARON NI SE AÑADIERON PUNTOS DE RESTRICCIÓN.
\vskip1.000000\baselineskip
Este diseño sólo permite una opción de oligonucleótidos codificantes próximos al extremo 3' y una de oligonucleótidos no codificantes con la que es compatible. Las secuencias de este conjunto de oligonucleótidos se muestran como secuencia ID-1 (oligonucleótido codificante) y secuencia ID-2 (oligonucleótido no codificante). Este conjunto de oligonucleótidos genera un producto de 462 pb, desde la base 1391 hasta la 1852, que se extiende entre el extremo 3' del exón 15 y la región no codificante del exón 16 del ARNm de la PTEC. La temperatura para una alineación óptima es 59,9ºC, el porcentaje de G-C 60,4% y la temperatura de fusión 83,2ºC.
2.- Clonación del extremo terminal C de la PTEC
El producto RCP generado por este conjunto de oligonucleótidos se clonó en el vector pMosBlueT (Amersham). Esta estrategia hizo posible integrar los puntos de restricción de las bandas BamHI y Smal en el producto RCP, a fin de permitir su subclonación en el vector de expresión pGex-2T (Pharmacia LKB Biothec), en el marco correcto de orientación y lectura para la expresión de la proteína fusionada. Así se generaron dos plásmicos recombinados clonados con el extremo 3' del ADNc de PTEC, denominados clon pMosBlue/PTEC3' y clon pGex-2T/PTEC3'.
El clon pGex-2T/PTEC3' se transformó en la cepa bacteriana Escherichia coli DH5\alpha, para obtener proteínas genotecnológicas fusionadas al glutatión-S transferasa (GST). La cepa transformada se cultiva durante ocho horas a 37ºC, en 500 ml de medio de cultivo Super Luria al que se añaden 50 \mug/ml de ampicilina. La inducción del cultivo se conduce con 0,4 mM de isopropil-\beta-D-tio-galactósido (IPTG) durante tres horas. Después de la incubación, las bacterias se lisan mecánicamente y la proteína fusionada GST/PTECCOH se recupera en una columna de glutatión-agarosa (SIGMA) utilizando un protocolo conocido (Smith-DB y Corcoran-LM, 1995, Expression and Purification of Glutathion-S Transferase Fusion Proteins, en Short Protocols in Molecular Biology [Ausbet-MF, Brent-R, Kingston-RE, Moore-DDR, Seidman-JG y Strhl-K], WILEY, 3rd ed. pp 16.18-16.31).
3.- Obtención de anticuerpos del tipo IgY anti-PTEC
Los péptidos unidos a la KLH se utilizaron para producir los anticuerpos, preferiblemente en gallinas, mediante un protocolo patrón de 63 días y con inoculaciones subcutáneas una vez por semana. Las inoculaciones consistieron en 200 \mug de BSA / 200 \mul de PBS + 200 \mul de aditivo Freund completo (Sigma Inmuno Chemicals) en la primera aplicación, y en 200 \mug de BSA / 150 \mul de PBS + 150 \mul de aditivo Freund incompleto (Sigma Inmuno Chemicals) en aplicaciones subsiguientes. El valor del anticuerpo del plasma se determinó mediante la técnica ELISA. Las IgY se aislaron de huevos recogidos durante dos semanas. Tanto la fijación como la producción de anticuerpos y la valoración mediante ELISA de la primera muestra de plasma se hicieron con ADI (Alpha Diagnostic International).
4.- Análisis de inmunotransferencia para la detección de PTEC
Las condiciones de uso del anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496 se normalizaron en pruebas del tipo inmunotransferencia contra plasma humano y de conejo, y extractos de lípidos brutos y disminuidos procedentes de tejidos perfundidos. Se utilizaron el anticuerpo primario en diluciones de 1:5.000 y el anticuerpo secundario antigallina IgG (H+L) conjugado con peroxidasa (PIRCE) 1:10.000. Los bloques y las incubaciones se realizaron con una suspensión de leche descremada en polvo al 2,5% en solución de trisborato salina (TBS-Tween) al 0,1% y a 37ºC durante una hora. La visualización se efectuó con sustrato SuperSignal (PIRCE) en placas autorradiográficas X-OMAT (Kodak), para la determinación cuantitativa o cualitativa de PTEC. En estas pruebas se utilizó BSA como control negativo. Para descartar la posibilidad de que el anticuerpo reconociera inespecíficamente la albúmina, cuyo peso molecular es próximo a la PTEC (~67 kDa), se incluyeron controles negativos con BSA. En todas las pruebas realizadas, el anticuerpo anti-PTEC H486-S496 reconoce específicamente las PTEC. Los resultados de estas pruebas pueden verse en la
figura 1.
5.- Análisis ELISA para la detección de PTEC
Se normalizaron las condiciones de uso del anticuerpo policlonal anti-PTEC H486-S496 en pruebas ELISA contra plasma humano y de conejo. Se utilizaron el anticuerpo primario en diluciones de 1:2.000 y el anticuerpo secundario antigallina IgG (H+L) conjugado con peroxidasa (PIRCE) 1:2.000. Los bloques y las incubaciones se realizaron con PBS-Tween al 0,1%, a temperatura ambiente y durante una hora. La visualización se efectuó con OFD (orto-fenilendiamina diclorhidrato, SIGMA). Las lecturas de la absorbencia se realizaron a 450 nm. En estas pruebas se utilizó BSA como control negativo. Para descartar la posibilidad de que el anticuerpo reconociera inespecíficamente la albúmina, se incluyeron controles negativos con BSA. Algunos resultados obtenidos con este sistema de cuantificación de PTEC se muestran en la figura 2.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
LISTA DE SECUENCIAS
\vskip1.000000\baselineskip
SECUENCIA DE IDENTIFICACIÓN 1 (secuencia de nucleótidos).
LOCUS:
PTEC conejo; 24 nt
DEFINICIÓN:
Oligonucleótido codificante, proteína transferidora de ésteres de colesterol (PTEC) de conejo, ARNm
FUENTE:
Oryctolagus cuniculus, desde ADNc hasta ARNm.
ORGANISMO:
Conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus)
Eukariota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Mammalia; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae; Oryctolagus
REFERENCIA:
Desde la base 1391 hasta la base 1414
COMENTARIOS:
Ubicación en el extremo 3' del exón 15, región codificante
100
\vskip1.000000\baselineskip
SECUENCIA DE IDENTIFICACIÓN 2 (secuencia de nucleótidos).
LOCUS:
PTEC conejo; 25 nt
DEFINICIÓN:
Oligonucleótido no codificante, proteína transferidora de ésteres de colesterol de conejo, ARNm
FUENTE:
Oryctolagus cuniculus, desde ADNc hasta ARNm.
ORGANISMO:
Conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus)
Eukariota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Mammalia; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae; Oryctolagus.
REFERENCIA:
Desde la base 1852 hasta la base 1828
COMENTARIOS:
Ubicación en la región no codificante del exón 16.
101
\newpage
IDENTIFICACIÓN 3 (secuencia de nucleótidos).
LOCUS:
pMosBlueT; 3 nt - PTEC de conejo, 472 nt
DEFINICIÓN:
Extremo 3' del ARNm de la proteína transferidora de ésteres de colesterol (PTEC) del conejo, con un codón de vector pMosBlueT en su extremo 5'. Fragmento subclonado del vector pMosBlueT al vector pGex-2T.
FUENTE:
Oryctolagus cuniculus, desde ADNc hasta ARNm.
ORGANISMO:
Conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus)
Eukariota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Mammalia; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae; Oryctolagus.
REFERENCIA:
Desde 1391 (exón 15) hasta la base 1852 (exón 16).
COMENTARIOS:
El codón de terminación PTEC se encuentra en la base 496 (con letras negras). La sección marcada pMos (subrayada) corresponde al codón transportado desde el vector pMosBlueT durante la subclonación en el vector pGex-2T.
1
\vskip1.000000\baselineskip
SECUENCIA DE IDENTIFICACIÓN 4 (secuencia de aminoácidos)
LOCUS:
PTEC conejo; 33 aa
DEFINICIÓN:
Sección correspondiente a PTEC en la proteína genotecnológica GST/PTECCOH.
FUENTE:
Oryctolagus cuniculus
ORGANISMO:
Conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus)
Eukariota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Mammalia; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae; Oryctolagus.
REFERENCIA:
Desde el residuo Ile 464 a Ser 496
COMENTARIOS:
Extremo carboxílico: motivo de fijación de ésteres de colesterol; alto contenido de estructura hélice \alpha; responsable de la actividad de transferencia de los ésteres de colesterol. Los residuos Phe 481, Leu 488, Phe 491 y Leu 495 se muestran en color negro.
Nº DE AA
33
\vskip1.000000\baselineskip
SECUENCIA PTEC EN GST/PTECCOH
102
\vskip1.000000\baselineskip
ESTRUCTURA
hélice \alpha
Peso molecular (daltonios)
3731,1
Punto isoeléctrico
3,99
\vskip1.000000\baselineskip
SECUENCIA DE IDENTIFICACIÓN 5 (secuencia de aminoácidos)
LOCUS:
PTEC conejo; 12 aa
DEFINICIÓN:
Secuencia sintética, trasladada desde la secuencia de nucleótidos del producto RCP, obtención mediante oligonucleótidos con secuencias ID-1 e ID-2.
FUENTE:
Oryctolagus cuniculus
ORGANISMO:
Conejo blanco de Nueva Zelanda (Oryctolagus cuniculus)
Eukariota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Mammalia; Eutheria; Lagomorpha; Leporidae; Oryctolagus.
REFERENCIA:
Desde el residuo His 486 hasta Ser 496 + cisteína en el extremo "N".
COMENTARIOS:
Extremo carboxílico; motivo de fijación de ésteres de colesterol; alto contenido de estructura hélice \alpha; responsable de la actividad de transferencia de los ésteres de colesterol. Los residuos Leu 488, Phe 491 y Leu 495 se muestran en color negro.
Nº DE AA
12
\vskip1.000000\baselineskip
PTEC PÉPTIDO H486-S496 Cys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser
ESTRUCTURA
hélice \alpha
Peso molecular (daltonios)
1373,9
Punto isoeléctrico
5,09
SOLUBLE EN H_{2}O pH9,5
<110> Universidad Nacional Autónoma de México
\hskip1cm Alonso García, Ana Lucía
\hskip1cm Mas Oliva, Jaime
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Sistema para la cuantificación de la proteína transferidora de ésteres de colesterol en muestras sintéticas y biológicas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> PCT 00053
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140> PCT/MX 00/00053
\vskip0.400000\baselineskip
<141> 2000-12-13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> MX 99ll575
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 1999-12-13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Oryctolagus cuniculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido codificante, proteína transferidora de ésteres de colesterol (PTEC) de conejo, ARNm.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Desde la base 1391 hasta la base 1414. Ubicación en el extremo 3' del exón 15, región codificante.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskip
tcatcaaccc cgagattatc actc
\hfill
24
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<210> 2
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<211> 25
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<212> ADN
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<213> Oryctolagus cuniculus
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<220>
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<223> Oligonucleótido no codificante, proteína transferidora de ésteres de colesterol de conejo, ARNm.
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<220>
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<223> Desde la base 1852 hasta la base 1828. Ubicación en la región no codificante del exón 16.
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<400> 2
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\hskip-.1em\dddseqskip
tcgtttactt gagaggcaga gagag
\hfill
25
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<210> 3
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<211> 475
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<212> ADN
<2l3> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: Extremo 3' del ARNm de la proteína transferidora de ésteres de colesterol del conejo, desde la base 1391 (exón 15) hasta la base 1852 (exón 16), con un codón de vector pMosBlueT en su extremo 5'.
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<220>
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<223> Fragmento subclonado del vector pMosBlueT al vector pGex-2T. El primer codón (GAT) corresponde al codón transportado desde el vector pMosBlueT durante la subclonación en el vector pGex-2T.
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<220>
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<221> exón
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<222> (4)..(42)
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<223> 3' exón 15.
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<220>
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<221> exón
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<222> (43)..(117)
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<223> Región codificante del exón 16. El codón de paro de la PTEC (TAG) se encuentra en la base 496.
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<400> 3
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2
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<210> 4
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<211> 33
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: Sección correspondiente a PTEC en la proteína genotecnológica GST/PTECCOH. Desde el residuo Ile 464 a Ser 496.
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<220>
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<223> Terminal carboxílico, motivo de fijación de ésteres de colesterol, responsable de la actividad de transferencia de los ésteres de colesterol.
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> HÉLICE
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<222> (1)..(33)
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<223> Alto contenido de estructura hélice \alpha; peso molecular 3731,1 daltonios; punto isoeléctrico 3,99.
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<400> 4
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3
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<210> 5
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<211> 12
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la secuencia artificial: Secuencia sintética, trasladada desde la secuencia de nucleótidos del producto RCP, obtención mediante oligonucleótidos con secuencias 1 y 2.
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<220>
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<223> Desde el residuo His 486 hasta Ser 496 + cisteína en el extremo "N".
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<220>
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<221> FIJACIÓN
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<222> <2)..(l2)
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<223> Terminal carboxílico, motivo de fijación de ésteres de colesterol, responsable de la actividad de transferencia de los ésteres de colesterol. Se muestran los residuos Leu 488, Phe 491 y Leu 495.
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<220>
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<221> HÉLICE
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<222> (2)..(12)
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<223> Alto contenido de estructura hélice \alpha; peso molecular 1373,9 daltonios, punto isoeléctrico 5,09, soluble en H_{2}O pH 9.5.
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<400> 5
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\sa{Cys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser}

Claims (16)

1. Un anticuerpo policlonal para uso diagnóstico, caracterizado por el hecho de que reconoce la región que comprende los aminoácidos H486-S496 de PTEC, pero no reconoce el péptido PTEC\Delta16, concretamente PTEC sin motivo de fijación de ésteres de colesterol, caracterizado por el hecho de que dicho anticuerpo se produce después de unir el péptido consistente en Cys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser de PTEC (siendo H486-S496 la secuencia ID-5) a la proteína transportadora de KLH.
2. El anticuerpo policlonal de la reivindicación 1, caracterizado por el hecho de que es un anticuerpo del tipo IgY.
3. Un método inmunoenzimático para detectar y cuantificar la proteína transferidora de ésteres de colesterol en muestras biológicas y sintéticas, caracterizado por el hecho de que las muestras se ponen en contacto con el anticuerpo policlonal de una de las reivindicaciones 1 o 2.
4. El método de la reivindicación 3, caracterizado por el hecho de que el anticuerpo policlonal es del tipo IgY.
5. El método de una de las reivindicaciones 3 a 4, caracterizado por el hecho de que el anticuerpo policlonal de cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2 se utiliza como anticuerpo primario.
6. El método de una de las reivindicaciones 3 a 5, caracterizado por el hecho de que se utiliza un anticuerpo secundario unido a la peroxidasa para hacer evidente la reacción.
7. El método de una de las reivindicaciones 3 a 6, caracterizado por el hecho de que la proteína de fusión compuesta de proteína GST, fusionada en el extremo "N" de la PTEC de conejo, consistente en los residuos I464-S496 (Ile Asn Pro Gen Ile Ile Thr Leu Asp Gey Cys Leu Leu Leu Gln Met Asp Phe Gly Phe Pro Lys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser), y/o el péptido sintético His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser, se utilizan como patrón.
8. Uso del péptido sintético Cys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser unido a la proteína transportadora de KLH para la generación de anticuerpos policlonales de una de las reivindicaciones 1 o 2.
9. El uso de la reivindicación 8, obteniéndose el anticuerpo policlonal mediante inoculación de animales modelo, preferiblemente la gallina.
10. Uso del anticuerpo policlonal de cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2 en inmunoanálisis, preferiblemente ELISA o inmunotransferencia (Western-Blot).
11. Un método in vitro para diagnosticar el riesgo de aterogénesis o dislipidemia, caracterizado por el hecho de que la fase de la detección y cuantificación de la proteína transferidora de ésteres de colesterol en muestras biológicas y sintéticas se realiza poniendo las muestras en contacto con el anticuerpo policlonal de cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2 para diagnosticar el riesgo de aterogénesis o dislipidemia.
12. Un equipo para diagnosticar el riesgo de aterogénesis, basado en la cuantificación de los niveles de PTEC en el plasma, caracterizado por el hecho de contener: a) la proteína genotecnológica de la proteína GST, fusionada en el extremo "N" de la PTEC de conejo, consistente en los residuos I464-S496 (Ile Asn Pro Glu Ile Ile Thr Leu Asp Gly Cys Leu Leu Leu Gln Met Asp Phe Gln Phe Pro Lys His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser) y/o el péptido sintético His Leu Leu Val Asp Phe Leu Gln Ser Leu Ser, y b) como anticuerpo primario, el anticuerpo policlonal de cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2.
13. El equipo de la reivindicación 12, caracterizado por el hecho de que comprende un anticuerpo secundario unido a una enzima, preferiblemente peroxidasa, para hacer evidente la reacción.
14. El equipo de la reivindicación 12, caracterizado por el hecho de que se utiliza en la detección y cuantificación de PTEC en muestras biológicas y sintéticas.
15. El equipo de la reivindicación 12, caracterizado por el hecho de que está diseñado para utilizarlo en la práctica clínica humana y veterinaria.
16. El equipo de la reivindicación 12, caracterizado por el hecho de que se utiliza en la detección, evaluación y seguimiento de pacientes con dislipidemia y/o riesgo de aterogénesis.
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