ES2289780T3 - Dos receptores acoplados a proteina g humanos: gpcr 2 inducido por ebv (ebi-2) y gpcr de tipo edg-1. - Google Patents
Dos receptores acoplados a proteina g humanos: gpcr 2 inducido por ebv (ebi-2) y gpcr de tipo edg-1. Download PDFInfo
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Abstract
Un polinucleótido seleccionado del grupo constituido por: (a) polinucleótidos que codifican un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácidos codificada por el cADN contenido en el Depósito ATCC Nº 209003; (b) polinucleótidos que comprenden la secuencia de codificación del cADN contenido en el Depósito ATCC Nº 209003; (c) polinucleótidos que son al menos 90% idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de los (a) y (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de receptor acoplado a proteína G; (d) polinucleótidos que son al menos 95% idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de los (a) y (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de receptor acoplado a proteína G; y (e) polinucleótidos que comprenden una secuencia de nucleótidos que codifican un fragmento de un polipéptido codificado por un polinucleótido de uno cualquiera de los (a) a (d), en los que dicho fragmento tiene actividad de receptor acoplado a proteína G; o la cadena complementaria de tal polinucleótido, con la condición de que dicho polinucleótido no comprenda la siguiente secuencia de nucleótidos:
Description
Dos receptores acoplados a proteína G humanos:
GPCR 2 inducido por EBV (EBI-2) y GPCR de tipo
EDG-1.
Esta invención se refiere a polinucleótidos
identificados recientemente, a polipéptidos codificados por tales
polinucleótidos, al uso de tales polinucleótidos y polipéptidos, así
como a la producción de tales polinucleótidos y polipéptidos. Más
particularmente, el polipéptido de la presente invención es un
receptor acoplado a proteína G inducido por EBV humano
(EBI-2), al que también se hace referencia a veces
aquí como "GBR" o "GPCR" y colectivamente como
"GBRs". La invención se refiere también a inhibir la acción de
tales polipéptidos.
Se han identificado al menos nueve genes que se
activan aparentemente en respuesta a una infección por Virus
de Epstein-Barr (EBV). Uno de dos nuevos genes
identificados también en tales estudios de infecciones por EBV era
una nueva molécula de cADN de tipo GPCR denominada receptor acoplado
a proteína G inducido por EBV (EBI)-1.
Adicionalmente, se ha identificado previamente
un gen de diferenciación de endotelio (EDG) que se
obtuvo de células endoteliales humanas simuladas con PMA. Se han
identificado homólogos de rata y oveja de EDG-1, que
también son receptores acoplados a proteína G.
Está bien establecido que muchos procesos
biológicos significativos médicamente son mediados por proteínas
que participan en trayectorias de transducción de señal que implican
proteínas G y/o segundos mensajeros, por ejemplo, cAMP (Lefkowitz,
Nature, 351:353-354 (1991)). Se hace referencia aquí
a estas proteínas como proteínas que participan en trayectorias con
proteínas G o proteínas PPG. Algunos ejemplos de estas proteínas
incluyen los receptores de GPC, tales como los de agentes
adrenérgicos y dopamina (Kobilka, B.K. et al., PNAS,
84:46-50 (1987); Kobilka, B.K. et al.,
Science, 238:650-656 (1987); Bunzow, J.R. et
al., Nature, 336:783-787 (1988)), las propias
proteínas G, proteínas efectoras, por ejemplo, fosfolipasa C, adenil
ciclasa y fosfodiesterasa, y proteínas impulsoras, por ejemplo,
proteína quinasa A y proteína quinasa C (Simon, M.I. et al.,
Science, 252:802-8 (1991)).
Por ejemplo, en una forma de transducción de
señal, el efecto de unión de hormonas es activación de una enzima,
adenilato ciclasa, dentro de la célula. La activación de enzimas por
hormonas depende de la presencia del nucleótido GTP, y GTP influye
también en la unión de hormonas. Una proteína G conecta los
receptores de hormonas con adenilato ciclasa. Se ha mostrado que la
proteína G intercambia GTP por GDP unido cuando se activa por
receptores de hormonas. La forma que lleva GTP se une después a una
adenilato ciclasa activada. La hidrólisis de GTP a GDP, catalizada
por la propia proteína G, devuelve la proteína G a su forma básica
inactiva. Así, la proteína G sirve para un doble papel, como
compuesto intermedio que retransmite la señal de receptor a
efector, y como reloj que controla la duración de la señal.
La superfamilia de genes de proteínas de
membrana de receptores acoplados a proteína G se ha caracterizado
por tener siete dominios transmembrana putativos. Se cree que los
dominios representan hélices \alpha transmembrana conectadas por
lazos extracelulares o citoplásmicos. Una proteína G funcional es un
trímero que consiste en una subunidad alfa variable acoplada a
subunidades beta y gamma asociadas mucho más estrechamente y
constantes. Se ha identificado un amplio intervalo de ligandos (más
de veinte) que funcionan a través de GPCRs. En general, la unión de
un ligando apropiado a un GPCR conduce a la activación del receptor.
Los receptores acoplados a proteína G incluyen un amplio intervalo
de receptores activos biológicamente, tales como receptores
hormonas, víricos, factores de crecimiento y neurorreceptores. Tal
receptor activado inicia el ciclo regulador de la proteína G. Este
ciclo consiste en intercambio de GTP por GDP, disociación de las
subunidades alfa y beta/gamma, activación de la segunda trayectoria
de mensajero por un complejo de GTP y la subunidad alfa de la
proteína G y vuelta al estado de reposo por hidrólisis de GTP
mediante la actividad de GTP-asa innata de la
subunidad alfa de proteína G.
Se han caracterizado receptores acoplados a
proteína G por incluir estas siete extensiones hidrófobas
conservadas de aproximadamente 20 a 30 aminoácidos, que conectan al
menos ocho lazos hidrófilos divergentes. La familia de proteína G
de receptores acoplados incluye receptores de dopamina que se unen a
fármacos neurolépticos usados para tratar trastornos psicóticos y
neurológicos. Otros ejemplos de miembros de esta familia incluyen
receptores de calcitonina, adrenérgicos, endotelina, cAMP,
adenosina, muscarínicos, acetilcolina, serotonina, histamina,
trombina, quinina, hormona estimulante de folículos, opsinas y
rodopsinas, de olores, citomegalovirus, etc.
Muchos GPRs tienen residuos de cisteína
conservados simples en cada uno de los dos primeros lazos
extracelulares que forman enlaces disulfuro que se cree que
estabilizan la estructura de proteína funcional. Las 7 regiones
transmembrana se denominan TM1, TM2, TM3, TM4, TM5, TM6 y TM7. TM3
también está implicada en transducción de señal.
La fosforilación y lipidación (palmitilación o
farnesilación) de residuos de cisteína puede influir en la
transducción de señal de algunos GPRs. Muchos GPRs contienen lugares
de fosforilación potenciales dentro del tercer lazo citoplásmico
y/o el término carboxi. Para varios GPRs, tales como el
\beta-adrenorreceptor, la fosforilación por
proteína quinasa A y/o quinasas de receptor específicas, media en la
desensibilización del receptor.
Se cree que los lugares de unión de ligando de
GPRs comprenden un receptáculo hidrófilo formado por varios
dominios transmembrana de GPR, cuyo receptáculo está rodeado por
residuos hidrófobos de los GPRs. El lado hidrófilo de cada hélice
transmembrana de GPR está postulado para mirar hacia dentro y formar
el lugar de unión de ligando polar. Se ha implicado a TM3 en varios
GPRs por tener un lugar de unión de ligando, tal como incluyendo el
residuo de aspartato de TM3. Adicionalmente, las serinas de TM5, una
asparagina de TM6 y fenilalaninas o tirosinas de TM6 o TM7 también
están implicadas en unión a ligando.
Los GPRs pueden acoplarse intracelularmente por
proteínas G heterotrímeras a diversas enzimas intracelulares,
canales de iones y transportadores (véase Johnson et al.,
Endoc., Rev., 10:317-331 (1989)). Diferentes
subunidades \alpha de proteína G estimulan preferentemente
efectores particulares para modular diversas funciones biológicas
en una célula. La fosforilación de residuos citoplásmicos de GPRs se
ha identificado como un mecanismo importante para la regulación del
acoplamiento de proteína G de algunos GPRs.
Se encuentran receptores acoplados a proteína G
en numerosos lugares dentro de un hospedante mamífero, por ejemplo,
la dopamina es un neurotransmisor crítico en el sistema nervioso
central y es un ligando de receptor acoplado a proteína G.
Según un aspecto de la presente invención, se
proporcionan nuevos polipéptidos así como fragmentos y derivados de
ellos útiles activos biológicamente y diagnósticamente o
terapéuticamente. Los polipéptidos de la presente invención son de
origen humano.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporcionan moléculas de ácidos nucleicos aislados, incluyendo
mARNs, ADNs, cADNs y ADN genómico, así como análogos antisentido de
ellas y fragmentos útiles activos biológicamente y diagnósticamente
o terapéuticamente de ellas.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir tales
polipéptidos por técnicas recombinantes que comprende cultivas
células hospedantes procariotas y/o eucariotas recombinantes, que
contienen una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un
polipéptido de la presente invención, en condiciones que promueven
la expresión de dicha proteína, y recuperar a continuación dicha
proteína.
Según otro aspecto adicional aún de la presente
invención, se proporcionan anticuerpos contra tales
polipéptidos.
Según otra realización, se proporciona un
procedimiento para usar uno o más de los receptores según la
invención para examinar antagonistas y/o agonistas del receptor y/o
ligandos del receptor.
Según otra realización todavía, tales agonistas
pueden usarse para activar el polipéptido de la presente invención
para el tratamiento de estados relacionados con la infraexpresión
del polipéptido de la presente invención.
Según otro aspecto, tales antagonistas pueden
usarse para inhibir el polipéptido de la presente invención para
tratar estados asociados con la sobreexpresión del polipéptido de la
presente invención.
Según otro aspecto aún de la presente invención
como se define en las reivindicaciones, se proporcionan polipéptidos
sintéticos de origen no natural, aislados y/o recombinantes que son
fragmentos, fragmentos de consenso y/o secuencias que tienen
sustituciones de aminoácidos conservadoras, de al menos un dominio
transmembrana, de tal modo que los polipéptidos de la presente
invención pueden unirse a ligandos, o que pueden modular también,
cuantitativa o cualitativamente, unión a ligando del polipéptido de
la presente invención.
Según otro aspecto todavía de la presente
invención como se define en las reivindicaciones, se proporcionan
polipéptidos sintéticos o recombinantes, derivados de ellos de
sustitución conservadora, anticuerpos, anticuerpos
anti-idiotipo, composiciones y métodos que pueden
ser útiles como moduladores potenciales de la función de receptor
acoplado a proteína G, uniéndose a ligandos o modulando la unión de
ligandos, debido a sus propiedades biológicas esperadas, que pueden
usarse en aplicaciones de diagnóstico, terapéuticas y/o de
investigación.
Según otro objeto de la presente invención como
se define en las reivindicaciones, se proporcionan polipéptidos
sintéticos, aislados o recombinantes, que se diseñan para inhibir o
imitar diversos GPRs o fragmentos de ellos, como tipos y subtipos
de receptores.
Según otro objeto todavía de la presente
invención, se proporciona un ensayo de diagnóstico in vitro
para detectar una enfermedad o susceptibilidad a una enfermedad
relacionada con una mutación de una secuencia de ácidos nucleicos
que codifica un polipéptido de la presente invención.
Éstos y otros aspectos de la presente invención
deben ser evidentes para los expertos en la técnica a partir de las
presentes enseñanzas.
Los dibujos siguientes son ilustrativos de
realizaciones de la invención y no ha de entenderse que limiten el
alcance de la invención como se abarca por las reivindicaciones.
La Figura 1 muestra la secuencia de cADN (SEQ ID
NO: 1) y la correspondiente secuencia de aminoácidos deducida (SEQ
ID NO: 2) del receptor acoplado a proteína G inducido por EBV de la
presente invención. La secuencia de polinucleótido contiene una
secuencia de 2.249 nucleótidos que codifica un marco de lectura
abierto (ORF) de 342 aminoácidos. En la Figura 1, se usa la
abreviatura estándar de una letra para aminoácidos, para ilustrar
la secuencia de aminoácidos deducida. La determinación de secuencia
se realizó usando un determinador de secuencia de ADN automatizado
373 (Applied Biosystems, Inc.). Se predice que la precisión de la
determinación de secuencia es mayor del 97% de precisión.
La Figura 2 es una comparación de secuencias de
aminoácidos entre el receptor acoplado a proteína G inducido por
EBV (EBI-2) (línea superior, véase SEQ ID NO: 2) y
el receptor acoplado a proteína G EBI-1 humano
(línea inferior, SEQ ID NO: 17). Se usan las abreviaturas
estándares de una letra para representar los residuos de
aminoácidos de las secuencias de aminoácidos ilustradas. El
polipéptido de EBI-2 según la invención muestra una
identidad de aproximadamente el 25% y una similitud del 49% con la
secuencia de aminoácidos del gen de EBV-1 sobre una
extensión de aproximadamente 350 aminoácidos.
La Figura 3 muestra, como un ejemplo de
referencia, la secuencia de cADN (SEQ ID NO: 3) y la secuencia de
aminoácidos deducida correspondiente (SEQ ID NO: 4) del receptor
acoplado a proteína G de tipo EDG-1 de la presente
invención. La secuencia de polinucleótido contiene una secuencia de
1.637 nucleótidos que codifica un ORF de 260 aminoácidos. En la
Figura 3, se usa la abreviatura estándar de una letra para
aminoácidos, para ilustrar la secuencia de aminoácidos deducida. La
determinación de secuencia se realizó usando un determinador de
secuencia de ADN automatizado 373 (Applied Biosystems, Inc.). Se
predice que la precisión de la determinación de secuencia es mayor
del 97% de precisión.
La Figura 4 es una comparación de secuencias de
aminoácidos entre el receptor acoplado a proteína G de tipo
EDG-1 (línea superior, véase SEQ ID NO: 4) y el
receptor acoplado a proteína G huérfano EDG-1 (línea
inferior, SEQ ID NO: 18). Se usan las abreviaturas estándares de
una letra para representar los residuos de aminoácidos de las
secuencias de aminoácidos ilustradas. El polipéptido de tipo
EDG-1 según la invención muestra una identidad de
aproximadamente el 54% y una similitud del 73% con la secuencia de
aminoácidos del gen de receptor acoplado a proteína G huérfano
EDG-1 humano sobre dos regiones que totalizan
aproximadamente 120 aminoácidos.
Según un aspecto de la presente invención, se
proporciona un ácido nucleico aislado (polinucleótido) que codifica
el polipéptido maduro que tiene la secuencia de aminoácidos deducida
de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o el polipéptido maduro codificado
por el cADN del clon depositado como Depósito ATCC Nº 209003 el
28/4/97.
Puede encontrarse un polinucleótido que codifica
un polipéptido de EBI-2 de la presente invención en
una genoteca de cADN de células endoteliales de la vena umbilical,
células de leucocitos neutrófilos y células de corpus colosum. El
polinucleótido de esta invención se descubrió en una genoteca de
cADN derivada de células endoteliales de la vena umbilical. Como se
ha descrito antes, está relacionado estructuralmente con la familia
de receptor acoplado a proteína G. Contiene un marco de lectura
abierto que codifica una proteína de 343 residuos de
aminoácidos.
La presente solicitud describe además como
ejemplo de referencia un ácido nucleico aislado (polinucleótido)
que codifica el polipéptido maduro que tiene la secuencia de
aminoácidos deducida de la Figura 3 (SEQ ID NO: 4) o el polipéptido
maduro codificado por el cADN del clon depositado como Depósito ATCC
Nº 209004 el 28/4/97.
Puede encontrarse un polinucleótido que codifica
un polipéptido de receptor acoplado a proteína G de tipo
EDG-1 en una genoteca de cADN de neutrófilos
activados, células Raji tratadas con ciclohexamina, el linaje
celular de médula ósea RSR;11, células T activadas, amígdalas y
células sanguíneas de cordón umbilical positivas en CD34. Los
análisis de manchas de Northern indican que el gen de receptor de
tipo EDG-1 se expresa principalmente en leucocitos,
pero puede observarse también expresión en tejido de placenta, bazo,
timo, pulmón y páncreas. El polinucleótido se descubrió en una
genoteca de cADN derivado de neutrófilos activados. Como se ha
descrito antes, está relacionado estructuralmente con la familia de
receptor acoplado a proteína G. Contiene un marco de lectura
abierto que codifica una proteína de 261 residuos de
aminoácidos.
Como se ha indicado antes, gran cantidad de la
importancia atribuida a moléculas de GPCR tales como las de la
invención reivindicada actualmente radica en la diversidad de
funciones biológicas en las que participan. Por ejemplo, se piensa
que, por liberación de la subunidad alfa, la subunidad beta/gamma
puede jugar también un papel funcional en la regulación de
transducción de señal activando la trayectoria de transducción de
señal de ácido araquidónico mediante la activación de fosfolipasa
A_{2}. Además, las moléculas de GPCR y sus proteínas G asociadas
se han implicado en el acoplamiento de pigmentos visuales a
fosfodiesterasa de cGMP, movimiento de fosfatidil inositol (PI),
canales de señales de adenilil ciclasa y otras enzimas de membrana
integrales para proteínas transportadoras. Como resultado, se
evidente que nuevas moléculas de GPCR pueden probarse útiles en una
amplia variedad de aplicaciones farmacéuticas incluyendo
investigación y desarrollo. Por ejemplo, exámenes basados en
objetivos para pequeñas moléculas y otros factores valiosos
farmacológicamente tales pueden basarse en la activación de un GPCR
dado. Se ha observado también que péptidos cortos pueden funcionar
imitando al GPCR (denominados receptomiméticos). Además,
anticuerpos monoclonales producidos contra tales factores pueden
probarse útiles como agentes terapéuticos en un cierto número de
capacidades. Las aplicaciones terapéuticas y/o de diagnóstico
potenciales para tal factor pueden incluir diversas presentaciones
clínicas tales como enfermedad del corazón, enfermedad mental,
cáncer, aterosclerosis, restenosis, enfermedad de Alzheimer,
enfermedad de Parkinson y un cierto número de otras.
Por consiguiente, los polinucleótidos de la
presente invención pueden estar en forma de ARN o en forma de ADN,
cuyo ADN incluye cADN, ADN genómico y ADN sintético. El ADN puede
ser de doble cadena o de cadena sencilla, y, si es de cadena
sencilla, puede ser la cadena de codificación o la cadena no
codificante (antisentido). La secuencia de codificación que
codifica el polipéptido EBI-2 maduro puede ser
idéntica a la secuencia de codificación mostrada en la Figura 1
(SEQ ID NO: 1) o la del clon depositado o puede ser una secuencia de
codificación diferente, cuya secuencia de codificación, como
resultado del exceso o degeneración del código genético, codifica
el mismo polipéptido maduro que el ADN de la Figura 1 (SEQ ID NO: 1)
o el cADN depositado.
Los polinucleótidos que codifican el polipéptido
EBI-2 maduro de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o el
polipéptido EBI-2 maduro codificado por el cADN
depositado pueden incluir: sólo la secuencia de codificación para el
polipéptido maduro; la secuencia de codificación para el
polipéptido maduro y una secuencia de codificación adicional tal
como una secuencia líder o secretora o una secuencia de proproteína;
la secuencia de codificación para el polipéptido maduro (y
opcionalmente una secuencia de codificación adicional) y una
secuencia no codificante, tal como intrones o secuencia no
codificante 5' y/o 3' de la secuencia de codificación para el
polipéptido maduro.
Así, la expresión "polinucleótdo que codifica
un polipéptido" abarca un polinucleótido que que incluye sólo
secuencia de codificación para el polipéptido así como un
polinucleótido que incluye secuencia de codificación y/o no
codificante adicional.
La presente invención se refiere además a
variantes de los polinucleótidos descritos antes que codifican
fragmentos, análogos y derivados dentro de los límites de las
reivindicaciones del polipéptido que tiene la secuencia de
aminoácidos deducida de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o el polipéptido
codificado por el cADN del clon depositado. La variante de alguno
de estos dos polinucleótidos puede ser una variante alélica de
origen natural del polinucleótido o una variante de origen no
natural del polinucleótido.
Así, la presente invención incluye
polinucleótidos que codifican el mismo polipéptido maduro mostrado
en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o el mismo polipéptido maduro
codificado por el cADN del clon depositado así como variantes
dentro de los límites de las reivindicaciones de tales
polinucleótidos, cuyas variantes codifican un fragmento, derivado o
análogo del polipéptido de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o el
polipéptido codificado por el cADN del clon depositado. Tales
variantes de nucleótidos incluyen variantes de supresión, variantes
de sustitución y adición o variantes de inserción.
Como se ha indicado antes, el polinucleótido
puede tener una secuencia de codificación que sea una variante
alélica de origen natural de la secuencia de codificación mostrada
en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1) o de la secuencia de codificación del
clon depositado, siendo dicha variante al menos 30% idéntica a las
últimas secuencias. Como se conoce en la técnica, una variante
alélica es una forma alternativa de una secuencia de polinucleótido
que puede tener una sustitución, supresión o adición de uno o más
nucleótidos, que no altera sustancialmente la función del
polipéptido codificado.
La presente invención incluye también
polinucleótidos, en los que la secuencia de codificación para el
polipéptido maduro puede estar fusionada en el mismo marco de
lectura a una secuencia de polinucleótido que ayuda a la expresión
y secreción de un polipéptido desde una célula hospedante, por
ejemplo, una secuencia líder que funciona como una secuencia
secretora para controlar el transporte de un polipéptido desde la
célula. El polipéptido que tiene una secuencia líder es una
preproteína y puede tener la secuencia líder dividida por la célula
hospedante para formar la forma madura del polipéptido. Los
polinucleótidos pueden codificar también una proproteína que es la
proteína madura más residuos de aminoácidos 5' adicionales. Una
proteína madura que tiene una prosecuencia es una proproteína y es
una forma inactiva de la proteína. Una vez que se divide la
prosecuencia, queda una proteína madura aciva. Así, por ejemplo, el
polinucleótido de la presente invención puede codificar una proteína
madura, o una proteína que tiene una prosecuencia o una proteína
que tiene una prosecuencia y una presecuencia (secuencia
líder).
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden tener también la secuencia de codificación fusionada
enmarcada a una secuencia marcadora que permite la purificación del
polipéptido de la presente invención. La secuencia marcadora puede
ser una etiqueta de hexa-histidina suministrada por
un vector pQE-9 para proporcionar purificación del
polipéptido maduro fusionado a la marcadora en el caso de un
hospedante bacteriano, o, por ejemplo, la secuencia marcadora puede
ser una etiqueta de hemaglutinina (HA) cuando se usa un hospedante
mamífero, por ejemplo, células COS-7. La etiqueta
de HA corresponde a un epítope derivado de la proteína de
hemaglutinina de la gripe (Wilson, I. et al., Cell, 37:767
(1984)).
El término "gen" significa el segmento de
ADN implicado en la producción de una cadena de polipéptido; incluye
regiones precedentes y siguientes a la región de codificación
(líder y remolque) así como secuencias intermedias (intrones) entre
segmentos de codificación individuales (exones).
Pueden usarse fragmentos del gen de longitud
completa de la presente invención como sondas de hibridación para
un cADN o una genoteca genómica para aislar el ADN de longitud
completa y para aislar otros ADNs que tienen una alta similitud de
secuencias con el gen o actividad biológica similar. Las sondas de
este tipo tienen preferiblemente al menos 10, preferiblemente al
menos 15, y aún más preferiblemente al menos 30 bases, y pueden
contener, por ejemplo, al menos 50 o más bases. De hecho, pueden
utilizarse preferiblemente sondas de este tipo que tienen al menos
hasta 150 bases o más. La sonda puede usarse también para
identificar un clon de ADN correspondiente a un transcripto de
longitud completa y un clon o clones genómicos que contienen el gen
completo, incluyendo regiones reguladoras y promotoras, exones e
intrones. Un ejemplo de un examen comprende aislar la región de
codificación del gen usando la secuencia de ADN conocida para
sintetizar una sonda de oligonucleótido. Se usan oligonucleótidos
marcados que tienen una secuencia complementaria o idéntica a la
secuencia del gen o porción del gen de la presente invención para
examinar una genoteca de ADN genómico, a fin de determinar con qué
miembros de la genoteca se hibrida la
sonda.
sonda.
Se aprecia también que tales sondas pueden, y
preferiblemente se marcan, con un reactivo detectable analíticamente
para facilitar la identificación de la sonda. Los reactivos útiles
incluyen, aunque sin limitarse a ellos, radioactividad, colorantes
fluorescentes o enzimas capaces de catalizar la formación de un
producto detectable. Las sondas son así útiles para aislar copias
complementarias de ADN de otras fuentes o para examinar tales
fuentes para secuencias relacionadas.
La presente invención se refiere además a
polinucleótidos que se hibridan con las secuencias descritas antes
si hay al menos 90%, y más preferiblemente al menos 95%, de
identidad entre las secuencias. (Como se ha indicado antes, una
identidad del 70% incluiría dentro de tal definición un fragmento de
70 pb tomado de un polinucleótido de 100 pb, por ejemplo). La
presente invención se refiere particularmente a polinucleótidos que
se hibridan en condiciones rigurosas con los polinucleótidos
descritos anteriormente. Según se usa aquí, la expresión
"condiciones rigurosas" significa que la hibridación tendrá
lugar sólo si hay al menos 95%, y preferiblemente al menos 97%, de
identidad entre las secuencias. Los polinucleótidos que se hibridan
con los polinucleótidos descritos anteriormente codifican enzimas
que retienen sustancialmente la misma función biológica o actividad
que el polipéptido maduro codificado por el ADN de la Figura 1 (SEQ
ID NO: 2). Con referencia a identidad en el caso de hibridación,
como se conoce en la técnica, tal identidad se refiere a
complementariedad de segmentos de polinucleótidos.
El polinucleótido como se describe aquí puede
tener al menos 15 bases, preferiblemente al menos 30 bases, y más
preferiblemente al menos 50 bases que se hibridan con cualquier
parte de un polinucleótido de la presente invención y que tiene una
identidad con él, como se ha descrito antes, y que puede o no
retener actividad. Por ejemplo, tales polinucleótidos pueden
emplearse como sondas para los polinucleótidos de SEQ ID NO: 1, por
ejemplo, para recuperación del polinucleótido o como una sonda de
diagnóstico o como un cebador de PCR.
Así, la presente invención se dirige a
polinucleótidos que codifican un polipéptido que tiene actividad de
GPCR y al menos 90% de identidad y más preferiblemente al menos 95%
de identidad con un polinucleótido que codifica el polipéptido de
SEQ ID NO: 2. La presente solicitud describe fragmentos del mismo,
cuyos fragmentos tienen al menos 15 bases, preferiblemente al menos
30 bases, más preferiblemente al menos 50 bases y aún más
preferiblemente fragmentos que tienen hasta al menos 150 bases o
más, cuyos fragmentos son al menos 90% idénticos, preferiblemente
al menos 95% idénticos y aún más preferiblemente al menos 97%
idénticos a cualquier porción de un polinucleótido de la presente
invención.
El(los) depósitos a lo que se hace
referencia aquí se mantendrán bajo los términos del Tratado de
Budapest sobre el Reconocimiento internacional de los depósitos de
microorganismos con fines de procedimiento de patentes. Estos
depósitos se proporcionan simplemente por conveniencia a los
expertos en la técnica y no son una entrada que se requiere a un
depósito bajo 35 U.S.C. 112. La secuencia de los polinucleótidos
contenidos en los materiales depositados, así como la secuencia de
aminoácidos de los polipéptidos codificados por ellos, se incorporan
aquí como referencia y son predominantes en caso de cualquier
conflicto con cualquier descripción de secuencias presente. Puede
requerirse una autorización para hacer, usar o vender los materiales
depositados, y no se garantiza aquí tal autorización.
La presente invención se refiere además a
polipéptidos que tienen la secuencia de aminoácidos deducida de la
Figura 1 (SEQ ID NO: 2), así como fragmentos, análogos y derivados
de tales polipéptidos dentro de los límites de las
reivindicaciones.
Los términos "fragmento", "derivado" y
"análogo" cuando se hace referencia al polipéptido de la Figura
1 (SEQ ID NO: 2) o el codificado por el cADN depositado, significa
un polipéptido que o bien conserva sustancialmente la misma función
o actividad biológica de tal polipéptido, es decir, funciona como un
receptor acoplado a proteína G, o bien conserva la capacidad para
unirse al ligando o al receptor incluso aunque el polipéptido no
funcione como un receptor acoplado a proteína G como forma soluble
del receptor.
El polipéptido de la presente invención puede
ser un polipéptido recombinante, un polipéptido natural o un
polipéptido sintético, preferiblemente un polipéptido
recombinante.
Dentro de los límites de las reivindicaciones,
el fragmento, derivado o análogo del polipéptido de la Figura 1
(SEQ ID NO: 2) o el codificado por el cADN depositado puede ser: (i)
uno en el que uno o más de los residuos de aminoácidos están
sustituidos con un residuo de aminoácidos conservado o no conservado
(preferiblemente un residuo de aminoácidos conservado) y tal
residuo de aminoácidos puede ser o no uno codificado por el código
genético, o (ii) uno en el que uno o más de los residuos de
aminoácidos incluye un grupo sustituyente, o (iii) uno en el que el
polipéptido maduro está fusionado con otro compuesto, tal como un
compuesto para aumentar la vida media del polipéptido (por ejemplo,
polietilenglicol), o (iv) uno en el que los aminoácidos adicionales
están fusionados al polipéptido maduro, o (v) uno en el que un
fragmento del polipéptido es soluble, es decir, no unido a
membrana, aunque une todavía ligandos al receptor unido a la
membrana. Tales fragmentos, derivados y análogos se cree que están
dentro del alcance de los expertos en la técnica a partir de las
presentes enseñanzas.
Los polipéptidos y polinucleótidos de la
presente invención se proporcionan preferiblemente en forma aislada,
y se purifican preferiblemente hasta homogeneidad.
El término "aislado" significa que el
material se separa de su entorno original (por ejemplo, el entorno
natural si es de origen natural). Por ejemplo, un polinucleótido o
polipéptido de origen natural presente en un animal vivo no está
aislado, pero el mismo polinucleótido o polipéptido, separado de
alguno o todos los materiales coexistentes en el sistema natural,
está aislado. Tales polinucleótidos podrían ser parte de un vector
y/o tales polinucleótidos o polipéptidos podrían ser parte de una
composición, y estar aún aislados en tal vector o composición si no
es parte de su entorno natural.
Los polipéptidos de la presente invención
incluyen el polipéptido de SEQ ID NO: 2 (en particular el
polipéptido maduro) así como polipéptidos que tienen al menos una
identidad del 90% con el polipéptido de SEQ ID NO: 2 y aún más
preferiblemente una identidad de al menos el 90% con el polipéptido
de SEQ ID NO: 2 y, dentro de los límites de las reivindicaciones,
incluyen también porciones de tales polipéptidos, conteniendo
generalmente tal porción del polipéptido al menos 30 aminoácidos y
más preferiblemente al menos 50 aminoácidos.
Como se sabe en la técnica, la "similitud"
entre dos polipéptidos se determina comparando la secuencia de
aminoácidos y sus sustitutos de aminoácidos conservados de un
polipéptido con la secuencia de un segundo polipéptido.
Los fragmentos o porciones de los polipéptidos
de la presente invención pueden emplearse para producir el
correspondiente polipéptido de longitud completa mediante síntesis
de péptidos; por tanto, los fragmentos pueden emplearse como
compuestos intermedios para producir los polipéptidos de longitud
completa. Los fragmentos o porciones de los polinucleótidos de la
presente invención pueden usarse para sintetizar polinucleótidos de
longitud completa de la presente invención.
La presente solicitud describe también un método
para identificar y/o aislar células, tejidos o clases de células o
tejidos, utilizando sondas de los polinucleótidos que codifican
polipéptido de receptor acoplado a proteína G EBI-2
o utilizando un anticuerpo específico para el receptor acoplado a
proteína G EBI-2, por ejemplo. Puesto que los
polipéptidos de receptor acoplado a proteína G EBI-2
según la invención tienen lugar en células endoteliales venosas,
células de leucocitos neutrófilos y células de corpus colosum, las
sondas o anticuerpos anteriores, por ejemplo, pueden utilizarse
para identificar y/o aislar tales células, tejidos o clases de
células o tejidos.
La presente invención se refiere también a
vectores que incluyen polinucleótidos de la presente invención,
células hospedantes que se proyectan genéticamente con vectores de
la invención y a la producción de polipéptidos de la invención por
técnicas recombinantes.
Las células hospedantes se proyectan
genéticamente (se transducen o transforman o transfectan) con los
vectores de esta invención, que pueden ser, por ejemplo, un vector
de clonación o un vector de expresión. El vector puede estar, por
ejemplo, en forma de un plásmido, una partícula vírica, un fago,
etc. Las células hospedantes proyectadas pueden cultivarse en
medios de nutrientes convencionales modificados según sea apropiado
para activar promotores, seleccionar transformantes o multiplicar
los genes de receptor acoplado a proteína G. Las condiciones de
cultivo, tales como temperatura, pH y similares, son las usadas
previamente con la célula hospedante seleccionada para expresión, y
serán evidentes para un técnico de experiencia ordinaria.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden emplearse para producir polipéptidos por técnicas
recombinantes. Así, por ejemplo, el polinucleótido puede incluirse
en uno cualquiera de una variedad de vectores de expresión para
expresar un polipéptido. Tales vectores incluyen secuencias de ADN
cromosómico, no cromosómico y sintético, por ejemplo, derivados de
SV40; plásmidos bacterianos; ADN de fago; baculovirus; plásmidos de
levadura; vectores derivados de combinaciones de plásmidos y ADN de
fago, ADN vírico tal como vacuna, adenovirus, virus de la viruela
aviar y pseudorrabias. Sin embargo, puede usarse cualquier otro
vector en tanto en cuanto sea replicable y viable en el
hospedante.
La secuencia de ADN apropiada puede insertarse
en el vector mediante una variedad de procedimientos. En general,
la secuencia de ADN se inserta en un(unos) lugar(es)
de endonucleasa de restricción apropiada por procedimientos
conocidos en la técnica. Se cree que tales procedimientos y otros
están dentro del alcance de los expertos en la técnica.
La secuencia de ADN en el vector de expresión se
enlaza operativamente a una(s) secuencia(s) de control
de expresión apropiada(s) (promotor) para dirigir la
síntesis de mARN. Como ejemplos representativos de tales
promotores, pueden mencionarse: promotor de LTR o SV40, el
lac o trp de E. coli, el promotor de fago
lambda P_{L} y otros promotores conocidos para controlar la
expresión de genes en células procariotas o eucariotas o sus virus.
El vector de expresión contiene también un lugar de unión de
ribosoma para iniciar la traducción y un terminador de
transcripción. El vector puede incluir también secuencias apropiadas
para multiplicar expresión.
Además, los vectores de expresión contienen
preferiblemente uno o más genes de marcadores seleccionables para
proporcionar un rasgo fenotípico para selección de células
hospedantes transformadas tales como dihidrofolato reductasa o
resistencia a neomicina para cultivo de células eucariotas, o tal
como resistencia a tetraciclina o ampicilina en E. coli.
El vector que contiene la secuencia de ADN
apropiada como se ha descrito anteriormente, así como un promotor o
secuencia de control apropiados, pueden emplearse para transformar
un hospedante apropiado a fin de permitir al hospedante expresar la
proteína.
Como ejemplos representativos de hospedantes
apropiados, pueden mencionarse: células bacterianas tales como
E. coli, Streptomyces, Salmonella typhimurium; células de
hongos, tales como levadura; células de insectos tales como
Drosophila S2 y Spodoptera Sf9; células de animales
tales como CHO, COS o melanoma de Bowes; adenovirus; células de
plantas, etc. Se cree que la selección de un hospedante apropiado
está dentro del alcance de los expertos en la técnica a partir de
las presentes enseñanzas.
Más particularmente, la presente invención
incluye también construcciones recombinantes que comprenden una o
más de las secuencias como se ha descrito antes ampliamente. Las
construcciones comprenden un vector, tal como un vector plásmido o
vírico, en el que se ha insertado una secuencia de la invención, en
orientación de avance o inversa. En un aspecto preferido de esta
realización, la construcción comprende además secuencias
reguladoras, incluyendo, por ejemplo, un promotor, enlazado
operativamente a la secuencia. Se conoce por los expertos en la
técnica un gran número de vectores y promotores adecuados, y están
disponibles comercialmente. Los siguientes vectores se proporcionan
a modo de ejemplo. Bacterianos: pQE70, pQE60, pQE-9
(Qiagen), pbs, pD10, phagescript, psiX174, pbluescript SK, pbsks,
pNH8A, pNH16a, pNH18A, pNH46A (Stratagene); ptrc99a,
pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5
(Pharmacia). Eucariotas: pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG
(Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmacia). No obstante,
puede usarse cualquier otro plásmido o vector en tanto en cuanto sea
replicable y viable en el hospedante.
Pueden seleccionarse regiones de promotor de
cualquier gen deseado usando vectores de CAT (cloranfenicol
transferasa) u otros vectores con marcadores seleccionables. Dos
vectores apropiados son PKK232-8 y PCM7. Los
promotores bacterianos nombrados particulares incluyen lacI, lacZ,
T3, T7, gpt, lambda P_{R}, P_{L} y trp. Los promotores
eucariotas incluyen CMV inmediato temprano, HSV timidina quinasa, SV
temprano y tardío, LTRs de retrovirus y
metalotienina-I de ratón. La selección del vector y
promotor apropiados está bien dentro del nivel de experiencia
ordinaria en la técnica.
En una realización adicional, la presente
invención se refiere a células hospedantes que contienen las
construcciones descritas antes. La célula hospedante puede ser una
célula eucariota superior, tal como una célula de mamífero, o una
célula eucariota inferior, tal como una célula de levadura, o la
célula hospedante puede ser una célula procariota, tal como una
célula bacteriana. La introducción de la construcción en la célula
hospedante puede efectuarse por transfección con fosfato cálcico,
transfección mediada por DEAE-Dextrano o
electroporación (Davis, L., Dibner, M., Battey, L., Basic Methods
in Molecular Biology (1986)).
Las construcciones en células hospedantes pueden
usarse de manera convencional para producir el producto génico
codificado por la secuencia recombinante. Alternativamente, los
polipéptidos de la invención pueden producirse sintéticamente por
sintetizadores de péptidos convencionales.
Pueden expresarse proteínas maduras en células
de mamíferos, células de levadura, bacterias u otras bajo el
control de promotores apropiados. Pueden emplearse también sistemas
de traducción exentos de células para producir tales proteínas
usando ARNs derivados de las construcciones de ADN de la presente
invención. Se describen vectores de clonación y expresión
apropiados de uso con hospedantes procariotas y eucariotas por
Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual,
Segunda Edición, Cold Spring Harbor, N.Y., (1989), cuya descripción
se incorpora aquí como referencia.
La transcripción del ADN que codifica los
polipéptidos de la presente invención por eucariotas superiores
aumenta insertando una secuencia de aumentador en el vector. Los
aumentadores son elementos de ADN que actúan cis, usualmente de
alrededor de 10 a 300 pb, que actúan sobre un promotor para aumentar
su transcripción. Los ejemplos incluyen el aumentador de SV40 en el
lado tardío de 100 a 270 pb del origen de replicación, un
aumentador de promotor temprano de citomegalovirus, el aumentador de
polioma en el lado tardío del origen de replicación y aumentadores
de adenovirus.
Generalmente, los vectores de expresión
recombinantes incluirán orígenes de replicación y marcadores
seleccionables que permiten la transformación de la célula
hospedante, por ejemplo, el gen de resistencia a ampicilina de E.
coli y el gen TRP1 de S. cerevisiae, y un promotor derivado
de un gen altamente expresado para dirigir la transcripción de una
secuencia estructural aguas abajo. Tales promotores pueden derivarse
de operones que codifican enzimas glicolíticas tales como
3-fosfoglicerato quinasa (PGK), factor \alpha,
fosfatasa ácida o proteínas de choque térmico, entre otros. La
secuencia estructural heteróloga se monta en fase apropiada con
secuencias de iniciación y terminación de la traducción y,
preferiblemente, una secuencia líder capaz de dirigir la secreción
de proteína traducida en el espacio periplásmico o medio
extracelular. Opcionalmente, la secuencia heteróloga puede
codificar una proteína de fusión que incluya un péptido de
identificación N-terminal que imparta
características deseadas, por ejemplo, estabilización o purificación
simplificada de producto recombinante expresado.
Se construyen vectores de expresión útiles para
uso bacteriano insertando una secuencia de ADN estructural que
codifica una proteína deseada junto con señales de iniciación y
terminación de la traducción adecuadas en fase de lectura operativa
con un promotor funcional. El vector comprenderá uno o más
marcadores seleccionables fenotípicos y un origen de replicación
para asegurar el mantenimiento del vector y, si es deseable,
proporcionar multiplicación dentro del hospedante. Los hospedantes
procariotas adecuados para transformación incluyen E. coli,
Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium y diversas especies
dentro de los géneros Pseudomonas, Strptomyces y Staphylococcus,
aunque también pueden emplearse otras como materia de elección.
Como ejemplo representativo pero no limitativo,
los vectores de expresión útiles para uso bacteriano pueden
comprender un marcador seleccionable y un origen bacteriano de
replicación derivado de plásmidos disponibles comercialmente que
comprenden elementos genéticos del muy conocido vector de clonación
pBR322 (ATCC 37017). Tales vectores comerciales incluyen, por
ejemplo, pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals,
Uppsala, Suecia) y GEM1 (Promega Biotec, Madison, WI, EE.UU.).
Estas secciones de "cadena principal" de pBR322 se combinan con
un promotor apropiado y la secuencia estructural a expresar.
Tras la transformación de una cepa hospedante
adecuada y el crecimiento de la cepa hospedante hasta una densidad
de células apropiada, se induce el promotor seleccionado por medios
apropiados (por ejemplo, cambio de temperatura o inducción química)
y se cultivan las células durante un período adicional.
Las células se cosechan típicamente por
centrifugación, se rompen por medios físicos o químicos y se retiene
el extracto crudo resultante para purificación adicional.
Las células microbianas empleadas en la
expresión de proteínas pueden romperse por cualquier método
conveniente, incluyendo ciclos de
congelación-descongelación, sonicación, rotura
mecánica o el uso de agentes de lisado de células, tales métodos
son muy conocidos por los expertos en la técnica.
Pueden emplearse también diversos sistemas de
cultivo de células de mamíferos para expresar proteína recombinante.
Los ejemplos de sistemas de expresión de mamíferos incluyen los
linajes COS-7 de fibroblastos de riñón de mono,
descritos por Gluzman, Cell, 23:175 (1981), y otros linajes
celulares capaces de expresar un vector compatible, por ejemplo,
los linajes celulares C127, 3T3, CHO, HeLa y BHK. Los vectores de
expresión de mamíferos comprenderán un origen de replicación, un
promotor adecuado y un aumentador, y también cualesquiera lugares
de unión de ribosomas necesarios, lugar de poliadenilación, donante
de empalme y lugares aceptores, secuencias de terminación de
transcripción y secuencias no transcritas flanqueantes 5'. Las
secuencias de ADN derivadas del empalme de SV40 y lugares de
poliadenilación pueden usarse para proporcionar los elementos
genéticos no transcritos requeridos.
Los polipéptidos de receptor acoplado a proteína
G pueden recuperarse y purificarse de cultivos de células
recombinantes por métodos que incluyen precipitación con sulfato
amónico o etanol, extracción con ácido, cromatografía de
intercambio aniónico o catiónico, cromatografía con fosfocelulosa,
cromatografía de interacción hidrófoba, cromatografía de afinidad,
cromatografía con hidroxilapatita y cromatografía con lectina.
Pueden usarse etapas de repliegue de proteína, según sea necesario,
para completar la configuración de la proteína madura. Finalmente,
puede emplearse cromatografía líquida de alta eficacia (HPLC) para
etapas de purificación finales.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser un producto purificado naturalmente, o un producto de
procedimientos sintéticos químicos, o producirse por técnicas
recombinantes a partir de un hospedante procariota o eucariota (por
ejemplo, por células bacterianas, de levadura, de plantas
superiores, de insectos y mamíferos en cultivo). Dependiendo del
hospedante empleado en un procedimiento de producción recombinante,
los polipéptidos de la presente invención pueden ser glicosilados o
pueden ser no glicosilados. Los polipéptidos de la invención pueden
incluir también un residuo de aminoácido metionina inicial.
El receptor acoplado a proteína G de la presente
invención puede emplearse en un procedimiento para examinar
antagonistas y/o agonistas del receptor.
En general, tales procedimientos de examen
implican proporcionar células apropiadas que expresan el receptor
sobre su superficie. En particular, se emplea un polinucleótido que
codifica el receptor de la presente invención para transfectar
células para expresar por ello el receptor acoplado a proteína G.
Tal transfección puede conseguirse por procedimientos como se ha
descrito anteriormente.
Un procedimiento de examen tal implica el uso de
melanóforos que se transfectan para expresar el receptor acoplado a
proteína G de la presente invención. Tal técnica de examen se
describe en el documento PCT WO 92/01810 publicado el 6 de Febrero
de 1992.
Así, por ejemplo, tal ensayo puede emplearse
para examinar un antagonista de receptor poniendo en contacto las
células de melanóforo que codifican el receptor acoplado a proteína
G con el ligando de receptor y un compuesto a examinar. La
inhibición de la señal generada por el ligando indica que un
compuesto es antagonista potencial del receptor, es decir, inhibe
la activación del receptor.
El examen puede emplearse para determinar un
agonista poniendo en contacto tales células con compuestos a
examinar y determinando si tal compuesto genera una señal, es decir,
activa el receptor.
Otras técnicas de examen incluyen el uso de
células que expresan el receptor acoplado a proteína G (por ejemplo,
células CHO transfectadas) en un sistema que mide los cambios del
pH extracelular causados por activación del receptor, por ejemplo,
como se describe en Science, volumen 246, páginas
181-296 (Octubre de 1989). Por ejemplo, pueden
ponerse en contacto agonistas o antagonistas potenciales con una
célula que expresa el receptor acoplado a proteína G y puede
medirse una segunda respuesta de mensajero, por ejemplo,
transducción de señal o cambios de pH, para determinar si el
agonista o antagonista potencial es eficaz.
Otra técnica de examen así implica introducir
ARN que codifica el receptor acoplado a proteína G en oocitos
xenopus para expresar transitoriamente el receptor. Los oocitos del
receptor pueden ponerse después en contacto en el caso de examen de
antagonista con el ligando del receptor y un compuesto a examinar,
seguido por detección de inhibición de una señal de calcio.
Otra técnica de examen implica expresar el
receptor acoplado a proteína G en la que el receptor está enlazado
a una fosfolipasa C o D. Como ejemplos representativos de tales
células, pueden mencionarse células endoteliales, células de
músculos lisos, células de riñón embrionarias, etc. El examen de un
antagonista o agonista puede conseguirse como se ha descrito antes
detectando la activación del receptor o la inhibición de la
activación del receptor a partir de la segunda señal de
fosfolipasa.
Otro método implica examinar antagonistas
determinando la inhibición de unión de ligando marcado a células
que tienen el receptor en su superficie. Tal método implica
transfectar una célula eucariota con ADN que codifica el receptor
acoplado a proteína G de tal modo que la célula exprese el receptor
en su superficie, y poner en contacto la célula con un antagonista
potencial en presencia de una forma marcada de un ligando conocido.
El ligando puede estar marcado, por ejemplo, mediante
radioactividad. Se mide la cantidad de ligando marcado unido a los
receptores, por ejemplo, midiendo la radioactividad de los
receptores. Si el antagonista potencial se une al receptor como se
determina por una reducción de ligando marcado que se une a los
receptores, se inhibe la unión de ligando marcado al receptor.
La presente invención proporciona también un
método para determinar si un ligando del que no se sabe que sea
capaz de unirse a un receptor acoplado a proteína G puede unirse a
tal receptor, que comprende poner en contacto una célula de
mamífero que expresa receptor acoplado a proteína G con el ligando
en condiciones que permitan la unión de ligandos al receptor
acoplado a proteína G, detectar la presencia de un ligando que se
una al receptor y determinar por ello si el ligando se une al
receptor acoplado a proteína G. Los sistemas descritos
anteriormente para determinar agonistas y/o antagonistas pueden
emplearse para determinar ligandos que se unen al receptor.
En general, los antagonistas para receptores
acoplados a proteína G que se determinan por procedimientos de
examen pueden emplearse para una variedad de propósitos
terapéuticos. Por ejemplo, tales antagonistas se han empleado para
tratamiento de hipertensión, angina de pecho, infarto de miocardio,
úlceras, asma, alergias, psicosis, depresión, jaqueca, vómitos,
apoplejía, trastornos de alimentación, dolores de cabeza por
jaqueca, cáncer e hipertrofia prostática benigna.
Los agonistas para receptores acoplados a
proteína G también son útiles para fines terapéuticos, tales como
el tratamiento de asma, enfermedad de Parkinson, fallo cardíaco
agudo, hipotensión, retención urinaria y osteoporosis.
Los ejemplos de antagonistas de receptor
acoplado a proteína G incluyen un anticuerpo o, en algunos casos,
un oligonucleótido, que se une al receptor acoplado a proteína G
pero no obtiene una segunda respuesta de mensajero de tal modo que
se impide la actividad del receptor acoplado a proteína G. Los
anticuerpos incluyen anticuerpos anti-idiotípicos
que reconocen determinantes únicos asociados generalmente con el
lugar de unión a antígeno de un anticuerpo. Los antagonistas
potenciales incluyen también proteínas que están estrechamente
relacionadas con el ligando del receptor acoplado a proteína G, es
decir, un fragmento del ligando, que ha perdido función biológica
y, cuando se une al receptor acoplado a proteína G, no obtiene
respuesta.
Un antagonista potencial incluye también una
construcción antisentido preparada mediante el uso de tecnología
antisentido. Puede usarse tecnología antisentido para controlar
expresión génica mediante formación de triple hélice o ADN o ARN
antisentido, ambos de cuyos métodos se basan en unión de un
polinucleótido a ADN o ARN. Por ejemplo, la porción de codificación
5' de la secuencia de polinucleótidos, que codifica los polipéptidos
maduros de la presente invención, se usa para diseñar un
oligonucleótido de ARN antisentido de aproximadamente 10 a 40 pares
de bases de longitud. Un oligonucleótido de ADN se diseña para ser
complementario con una región del gen implicado en transcripción
(triple hélice- véase Lee et al., Nucl. Acids Res., 6:3073
(1979); Cooney et al., Science 241:456 (1988); y Dervan
et al., Science 251:1360 (1991)), impidiendo por ello la
transcripción y la producción de receptor acoplado a proteína G. El
oligonucleótido de ARN antisentido se hibrida con el mARN in
vivo y bloquea la traducción de la molécula de mARN en el
receptor acoplado a proteína G (antisentido- Okano, J. Neurochem.,
56:560 (1991); Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene
Expression, CRC Press, Boca Raton, FL (1988)). Los oligonucleótidos
descritos antes también pueden entregarse a células de tal modo que
el ARN o ADN antisentido pueda expresarse in vivo para
inhibir la producción de receptor acoplado a proteína G.
Otro antagonista potencial es una pequeña
molécula que se une al receptor acoplado a proteína G, haciéndole
inaccesible a ligandos, de tal modo que se impide la actividad
biológica normal. Los ejemplos de moléculas pequeñas incluyen,
aunque sin limitarse a ellos, moléculas de péptidos o de tipo
péptido pequeñas.
Los antagonistas potenciales incluyen también
una forma soluble de un receptor acoplado a proteína G, por
ejemplo, un fragmento del receptor, que se une al ligando e impide
al ligando interactuar con receptores acoplados a proteína G unidos
a membrana.
El receptor acoplado a proteína G y antagonistas
o agonistas pueden emplearse en combinación con un vehículo
farmacéutico adecuado. Tales composiciones comprenden una cantidad
eficaz terapéuticamente del polipéptido, y un vehículo o excipiente
aceptable farmacéuticamente. Tal vehículo incluye, aunque sin
limitarse a ellos, solución salina, solución salina tamponada,
dextrosa, agua, glicerol, etanol y combinaciones de ellos. La
formulación debe adaptarse al modo de administración.
La descripción proporciona también un paquete o
juego farmacéutico que comprende uno o más recipientes llenos con
uno o más de los ingredientes de las composiciones farmacéuticas de
la invención. Puede asociarse con tal(es)
recipiente(s) un aviso en la forma prescrita por una agencia
gubernamental que regule la fabricación, uso o venta de productos
farmacéuticos o productos biológicos, cuyo aviso refleje la
aprobación por la agencia de la fabricación, uso o venta para
administración humana. Además, las composiciones farmacéuticas
pueden emplearse conjuntamente con otros compuestos
terapéuticos.
Las composiciones farmacéuticas pueden
administrarse de manera conveniente tal como mediante vías tópica,
intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, subcutánea, intranasal
o intradérmica. Las composiciones farmacéuticas se administran en
una cantidad que sea eficaz para tratamiento y/o profilaxis de la
indicación específica. En general, las composiciones farmacéuticas
se administrarán en una cantidad de al menos aproximadamente 10
g/kg de peso corporal y en muchos casos se administrarán en una
cantidad no superior a aproximadamente 8 mg/kg de peso corporal por
día. En muchos casos, la dosificación es de alrededor de 10 g/kg a
aproximadamente 1 mg/kg de peso corporal diariamente, teniendo en
cuenta las vías de administración, síntomas, etc.
Los polipéptidos de receptor acoplado a proteína
G y los antagonistas o agonistas que sean polipéptidos pueden
emplearse según la presente invención por expresión de tales
polipéptidos in vivo, a lo que se hace referencia a menudo
como "terapia génica".
Así, por ejemplo, pueden proyectarse células de
un paciente con un polinucleótido (ADN o ARN) que codifica un
polipéptido ex vivo, proporcionándose las células proyectadas
a un paciente a tratar con el polipéptido. Tales métodos son muy
conocidos en la técnica. Por ejemplo, pueden proyectarse células por
procedimientos conocidos en la técnica mediante el uso de una
partícula retrovírica que contenga ARN que codifica un polipéptido
de la presente invención.
De modo similar, pueden proyectarse células
in vivo para expresión de un polipéptido in vivo
mediante, por ejemplo, procedimientos conocidos en la técnica. Como
se sabe en la técnica, puede administrarse a un paciente una célula
productora para producir una partícula retrovírica que contenga ARN
que codifique el polipéptido de la presente invención, para
proyectar células in vivo y expresar el polipéptido in
vivo. Éstos y otros métodos para administrar un polipéptido de
la presente invención mediante tal método deben ser evidentes para
los expertos en la técnica a partir de las enseñanzas de la presente
invención. Por ejemplo, el vehículo de expresión para proyectar
células puede ser distinto de un retrovirus, por ejemplo, un
adenovirus que puede usarse para proyectar células in vivo
tras combinación con un vehículo de entrega adecuado.
Los retrovirus de los que pueden derivarse los
vectores plásmidos retrovíricos mencionados anteriormente incluyen,
aunque sin limitarse a ellos, el virus de leucemia de ratón de
Moloney, el virus de necrosis de bazo, retrovirus tales como virus
de sarcoma de Rous, virus de sarcoma de Harvey, virus de leucosis
aviar, virus de leucemia de mono gibón, virus de la
inmunodeficiencia humana, adenovirus, virus de sarcoma
mieloproliferativo y virus de tumor de mama. En una realización, el
vector plásmido retrovírico se deriva de virus de leucemia de ratón
de Moloney.
El vector incluye uno o más promotores. Los
promotores adecuados que pueden emplearse incluyen, aunque sin
limitarse a ellos, el LTR retrovírico, el promotor de SV40, y el
promotor de citomegalovirus (CMV) humano descrito en Miller et
al., Biotechniques, Vol. 7, Nº 9, 980-990 (1989)
o cualquier otro promotor (por ejemplo, promotores celulares tales
como promotores celulares eucariotas incluyendo, aunque sin
limitarse a ellos, los promotores de histona, pol III y
\beta-actina). Otros promotores víricos que pueden
emplearse incluyen, aunque sin limitarse a ellos, promotores de
adenovirus, promotores de timidina quinasa (TK) y promotores de
parvovurus B19. La selección de un promotor adecuado será evidente
para los expertos en la técnica a partir de las enseñanzas
contenidas aquí.
La secuencia de ácidos nucleicos que codifica el
polipéptido de la presente invención está bajo el control de un
promotor adecuado. Los promotores adecuados que pueden emplearse
incluyen, aunque sin limitarse a ellos, promotores adenovíricos,
tales como el promotor tardío principal adenovírico, o promotores
heterólogos, tales como el promotor de citomegalovirus (CMV); el
promotor del virus sincitial respiratorio (RSV); promotores
inducibles, tales como el promotor de MMT, el promotor de
metalotienina; promotores de choque térmico; el promotor de
albúmina; el promotor de ApoAI; promotores de globina humana;
promotores de timidina quinasa vírica, tales como el promotor de
timidina quinasa de Herpes Simplex; LTRs retrovíricos (incluyendo
los LTRs retrovíricos modificados descritos anteriormente); el
promotor de \beta-actina; y promotores de hormona
del crecimiento humano. El promotor también puede ser el promotor
nativo que controla el gen que codifica el polipéptido.
El vector plásmido retrovírico se emplea para
transducir linajes celulares de empaquetado para formar linajes
celulares productores. Los ejemplos de células de empaquetado que
pueden transfectarse incluyen, aunque sin limitarse a ellas, PE501,
PA317, \Psi-2, \Psi-AM, PA12,
T19-14X,
VT-19-17-H2,
\PsiCRE, \PsiCRIP, GP+E-86, GP+envAm12 y
linajes celulares de ADN como se describe en Miller, Human Gene
Therapy, Vol. 1, págs. 5-14 (1990), que se
incorpora aquí como referencia en su integridad. El vector puede
transducir las células de empaquetado mediante cualquier medio
conocido en la técnica. Tales medios incluyen, aunque sin limitarse
a ellos, electroporación, el uso de liposomas y precipitación con
CaPO_{4}. En una alternativa, el vector plásmido retrovírico puede
encapsularse en un liposoma, o acoplarse a un lípido, y
administrarse después a un hospedante.
El linaje celular productor genera partículas de
vector retrovírico infecciosas que incluyen la(s)
secuencia(s) de ácidos nucleicos que codifican los
polipéptidos. Tales partículas de vector retrovírico pueden
emplearse después para transducir células eucariotas, in
vitro o in vivo. Las células eucariotas transducidas
expresarán la(s) secuencia(s) de ácidos nucleicos que
codifican el polipéptido. Las células eucariotas que pueden
transducirse incluyen, aunque sin limitarse a ellas, células
estaminales embriónicas, células de carcinoma embriónico, así como
células estaminales hematopoyéticas, hepatocitos, fibroblastos,
mioblastos, queratinocitos, células endoteliales y células
epiteliales bronquiales.
Los receptores acoplados a proteína G son
ubicuos en el hospedante mamífero y son responsables de muchas
funciones biológicas, incluyendo muchas patologías. Por
consiguiente, es deseable encontrar compuestos que estimulen un
receptor acoplado a proteína G y compuestos que antagonicen con un
receptor acoplado a proteína G.
Esta invención proporciona además un método para
identificar compuestos que interactúan específicamente con, y se
unen a, los receptores acoplados a proteína G en la superficie de
una célula, que comprende poner en contacto una célula de mamífero
que comprende una molécula de ADN aislado que codifica el receptor
acoplado a proteína G con una pluralidad de compuestos, determinar
aquellos que se unen a la célula de mamífero, e identificar por
ello compuestos que interactúan específicamente con, y se unen a, un
receptor acoplado a proteína G humano de la presente invención.
Esta descripción proporciona un método para
detectar expresión del receptor acoplado a proteína G en la
superficie de una célula detectando la presencia de mARN que
codifica un receptor acoplado a proteína G, que comprende obtener
mARN total de la célula y poner en contacto el mARN obtenido así con
una sonda de ácido nucleico que comprende una molécula de ácido
nucleico de al menos 15 nucleótidos capaz de hibridarse
específicamente con una secuencia incluida dentro de la secuencia
de una molécula de ácido nucleico que codifica un receptor acoplado
a proteína G humano en condiciones de hibridación, detectar la
presencia de mARN hibridado con la sonda y detectar por ello la
expresión por la célula del receptor acoplado a proteína G.
Esta invención también está relacionada con el
uso del gen de receptor acoplado a proteína G como parte de un
ensayo de diagnóstico para detectar enfermedades o susceptibilidad a
enfermedades relacionadas con la presencia de genes de receptor
acoplado a proteína G mutados. Se hace referencia a tales
enfermedades como transformación de células, tales como tumores y
cánceres.
Pueden detectarse individuos que llevan
mutaciones en el gen de receptor acoplado a proteína G humano en el
nivel de ADN por una variedad de técnicas. Pueden obtenerse ácidos
nucleicos para diagnosis de células de un paciente, tal como de
sangre, orina, saliva, biopsia de tejidos y material de autopsia. El
ADN genómico puede usarse directamente para detección o puede
multiplicarse enzimáticamente usando PCR (Saiki et al.,
Nature, 324:163-166 (1980)) antes de análisis.
Puede usarse también con el mismo fin ARN o cADN. Como ejemplo,
pueden usarse cebadores de PCR complementarios del ácido nucleico
que codifica la proteína de receptor acoplado a proteína G para
identificar y analizar mutaciones de receptor acoplado a proteína G.
Por ejemplo, pueden detectarse supresiones e inserciones por un
cambio en el tamaño del producto multiplicado en comparación con el
genotipo normal. Pueden identificarse mutaciones puntuales
hibridando ADN multiplicado con ARN de receptor acoplado a proteína
G radiomarcado o, alternativamente, secuencias de ADN antisentido de
receptor acoplado a proteína G radiomarcado. Pueden distinguirse
secuencias emparejadas perfectamente de dúplex mal emparejados por
digestión con RNasa A o por diferencias de temperaturas de
fusión.
Puede conseguirse el ensayo genético basado en
diferencias de secuencias de ADN por detección de la alteración de
movilidad electroforética de fragmentos de ADN en geles con o sin
agentes desnaturalizantes. Pueden visualizarse pequeñas supresiones
e inserciones de secuencia por electroforesis en gel de alta
resolución. Pueden distinguirse fragmentos de ADN de secuencias
diferentes en geles de gradiente de formamida desnaturalizantes, en
los que se retardan en el gel las movilidades de diferentes
fragmentos de ADN en diferentes posiciones según sus temperaturas
de fusión o fusión parcial específicas (véase, por ejemplo, Myers
et al., Science, 230:1242 (1985)).
Pueden revelarse también cambios de secuencia en
localizaciones específicas por ensayos de protección con nucleasa,
tales como protección con RNasa y S1 o el método de división química
(por ejemplo, Cotton et al., PNAS, USA,
85:4397-4401 (1985)).
Así, puede conseguirse la detección de una
secuencia de ADN específica por métodos tales como hibridación,
protección con RNasa, división química, determinación de secuencia
de ADN directa o el uso de enzimas de restricción (por ejemplo,
polimorfismos de longitud de fragmento de restricción (RFLP)) y
manchas de Southern de ADN genómico.
Además de electroforesis en gel y determinación
de secuencia de ADN más convencionales, pueden detectarse también
mutaciones por análisis in situ.
La presente descripción se refiere también a un
ensayo de diagnóstico para detectar niveles alterados de formas
solubles de los polipéptidos de receptor de la presente invención en
diversos tejidos. Los ensayos usados para detectar niveles de los
polipéptidos de receptor soluble en una muestra derivada de un
hospedante son muy conocidos por los expertos en la técnica e
incluyen radioinmunoensayos, ensayos de unión competitiva, análisis
de manchas de Western y preferiblemente como ensayo ELISA.
Un ensayo ELISA comprende inicialmente preparar
un anticuerpo específico para antígenos de los polipéptidos de
receptor acoplado a proteína G, preferiblemente un anticuerpo
monoclonal. Además, se prepara un anticuerpo informador contra el
anticuerpo monoclonal. Se incorpora al anticuerpo informador un
reactivo detectable tal como radioactividad, fluorescencia o, en
este ejemplo, una enzima peroxidasa de rábano picante. Se separa
ahora una muestra de un hospedante y se incuba en un soporte sólido,
por ejemplo, una placa de poliestireno, que se une a las proteínas
de la muestra. Se cubren después cualesquiera lugares de unión de
proteína libres en la placa incubando con una proteína no
específica, tal como albúmina de suero de bovino. A continuación,
se incuba el anticuerpo monoclonal en la placa, durante cuyo tiempo
los anticuerpos monoclonales se incorporan a cualesquiera proteínas
de receptor acoplado a proteína G incorporadas a la placa de
poliestireno. Todo anticuerpo monoclonal no unido se separa por
lavado con tampón. El anticuerpo informador enlazado a peroxidasa de
rábano picante se pone ahora en la placa, produciendo la unión del
anticuerpo informador a cualquier anticuerpo monoclonal unido a
proteínas de receptor de proteína G. Se separa después por lavado el
anticuerpo informador no incorporado. Se añaden después a la placa
sustratos de peroxidasa, y la magnitud de color revelado en un
período de tiempo dado es una medición de la cantidad de proteínas
de receptor acoplado a proteína G presentes en un volumen dado de
muestra de paciente cuando se compara frente a una curva
estándar.
Las secuencias de la presente invención también
son valiosas para identificación de cromosomas. Se fija el objetivo
de la secuencia específicamente a, y puede hibridarse con, una
localización particular en un cromosoma humano individual. Además,
hay una necesidad actual de identificar lugares particulares en el
cromosoma. Hay pocos reactivos de marcado de cromosomas basados en
datos de secuencias reales (polimorfismos repetidos) para marcar
localización cromosómica. La representación de ADNs en cromosomas
según la presente invención es una primera etapa importante para
correlacionar esas secuencias con genes asociados con
enfermedad.
Brevemente, pueden representarse secuencias en
cromosomas preparando cebadores de PCR (preferiblemente de
15-25 pb) a partir del cADN. Se usa el análisis por
ordenador de la región no traducida 3' para seleccionar rápidamente
cebadores que no se extienden más de un exón en el ADN genómico,
complicando así el proceso de multiplicación. Estos cebadores se
usan después para examen de PCR de híbridos de células somáticas que
contienen cromosomas humanos individuales. Sólo aquellos híbridos
que contienen el gen humano correspondiente al cebador producirán
un fragmento multiplicado.
La representación de PCR de híbridos de células
somáticas es un procedimiento rápido para asignar un ADN particular
a un cromosoma particular. Usando la presente invención con los
mismos cebadores de oligonucleótidos, puede conseguirse la
sublocalización con paneles de fragmentos de cromosomas específicos
o agrupamientos de clones genómicos grandes de manera análoga.
Otras estrategias de representación que pueden usarse de modo
similar para representar en su cromosoma incluyen hibridación in
situ, preexamen con cromosomas clasificados por flujo marcados
y preselección por hibridación para construir genotecas de cADN
específicas para cromosomas.
Puede usarse la hibridación in situ con
fluorescencia (FISH) de un clon de cADN a una extensión cromosómica
metafásica para proporcionar una localización cromosómica precisa en
una etapa. Esta técnica puede usarse con cADN tan corto como de 50
o 60 bases. Para tener un análisis de esta técnica, véase Verma
et al., Human Chromosomes: a Manual of Basic Techniques,
Pergamon Press, Nueva York (1988).
Una vez que se ha representado una secuencia en
una localización cromosómica precisa, la posición física de la
secuencia en el cromosoma puede correlacionarse con datos de la
representación genética. Tales datos se encuentran, por ejemplo, en
V. McKusick, Mendelian Inheritance in Man (disponible en línea a
través de la Johns Hopkins University Welch Medical Library). La
relación entre genes y enfermedades que se ha representado en la
misma región cromosómica se identifica después mediante análisis de
enlaces (co-herencia de genes adyacentes
físicamente).
A continuación, es necesario determinar las
diferencias en el cADN o secuencia genómica entre individuos
afectados y no afectados. Si se observa una mutación en algunos o
todos los individuos afectados pero no en ningún individuo normal,
es probable que la mutación sea el agente causante de la
enfermedad.
Con la resolución actual de las técnicas de
representación física y representación genética, un cADN localizado
con precisión en una región cromosómica asociada con la enfermedad
podría ser uno entre 50 y 500 agentes causantes potenciales. (Esto
supone una resolución de representación de 1 megabase y un gen por
20 kb).
Los polipéptidos, sus fragmentos u otros
derivados, o análogos de ellos, o células que los expresan, pueden
usarse como inmunógeno para producir anticuerpos para ellos. Estos
anticuerpos pueden ser, por ejemplo, anticuerpos policlonales o
monoclonales. La presente invención incluye también anticuerpos
quiméricos, de cadena sencilla y humanizados, así como fragmentos
de Fab, o el producto de una genoteca de expresión de Fab. Pueden
usarse diversos procedimientos conocidos en la técnica para la
producción de tales anticuerpos y fragmentos.
Pueden obtenerse anticuerpos generados contra
los polipéptidos correspondientes a una secuencia de la presente
invención por inyección directa de los polipéptidos a un animal, o
administrando los polipéptidos a un animal, preferiblemente no
humano. El anticuerpo obtenido así se unirá después a los propios
polipéptidos. De esta manera, puede usarse incluso una secuencia
que codifica sólo un fragmento de los polipéptidos para generar
anticuerpos que se unan a los polipéptidos nativos totales. Tales
anticuerpos pueden usarse después para aislar el polipéptido de
tejido que expresa ese polipéptido.
Para preparar anticuerpos monoclonales, puede
usarse cualquier técnica que proporcione anticuerpos producidos por
cultivos de linajes celulares continuos. Los ejemplos incluyen la
técnica de hibridoma (Kohler y Milstein, 1975, Nature,
256:495-497), la técnica de trioma, la técnica de
hibridoma de células B humanas (Kozbor et al., 1983,
Immunology Today 4:72) y la técnica de hibridoma de EBV para
producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole et al.,
1985, en Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss,
Inc., págs. 77-96).
Pueden adaptarse técnicas descritas para la
producción de anticuerpos de cadena sencilla (Patente de los EE.UU.
4.946.778) para producir anticuerpos de cadena sencilla para
productos de polipéptidos inmunógenos de esta invención. También
pueden usarse ratones transgénicos para expresar anticuerpos
humanizados para productos de polipéptidos inmunógenos de esta
invención.
La presente invención se describirá
adicionalmente con referencia a los siguientes ejemplos; sin
embargo, ha de entenderse que la presente invención no está
limitada a tales ejemplos. Todas las partes o cantidades, salvo
especificación en contrario, son en peso.
Con el fin de facilitar la comprensión de los
siguientes ejemplos, se describirán ciertos métodos y/o términos
que aparecen frecuentemente.
"Plásmidos" se designan por una p minúscula
precedida y/o seguida por letras mayúsculas y/o números. Los
plásmidos de partida aquí están disponibles comercialmente,
disponbles públicamente en base restringida, o pueden construirse a
partir de plásmidos disponibles según procedimientos publicados.
Además, se conocen en la técnica plásmidos equivalentes a los
descritos y serán evidentes para el técnico experto
ordinariamente.
"Digestión" de ADN se refiere a división
catalítica del ADN con una enzima de restricción que actúa sólo en
ciertas secuencias del ADN. Las diversas enzimas de restricción
usadas aquí están disponibles comercialmente y se usaron sus
condiciones de reacción, cofactores y otros requisitos como sería
conocido por el técnico experto ordinariamente. Con fines
analíticos, se usa típicamente 1 \mug de plásmido o fragmento de
ADN con aproximadamente 2 unidades de enzima en aproximadamente 20
\mul de solución tampón. Con el fin de aislar fragmentos de ADN
para construcción de plásmidos, se digieren típicamente de 5 a 50
\mug de ADN con 20 a 250 unidades de enzima en un volumen mayor.
Se especifican por el fabricante tampones y cantidades de sustrato
apropiados para enzimas de restricción particulares. Se usan
ordinariamente tiempos de incubación de aproximadamente 1 hora a
37ºC, pero pueden variar según las instrucciones del suministrador.
Después de digerir, la reacción se somete a electroforesis
directamente en un gel de poliacrilamida para aislar el fragmento
deseado.
La separación por tamaños de los fragmentos
divididos se realiza usando un gel de poliacrilamida del 8 por
ciento descrito por Goeddel, D. et al., Nucleic Acids Res.,
8:4057 (1980).
"Oligonucleótidos" se refiere a un
polidesoxinucleótido de cadena sencilla o dos cadenas de
polidesoxinucleótido complementarias que pueden sintetizarse
químicamente. Tales oligonucleótidos sintéticos no tienen fosfato
5' y no se ligarán así a otro oligonucleótido sin añadir un fosfato
con un ATP en presencia de una quinasa. Un oligonucleótido
sintético se ligará a un fragmento que no se ha desfosforilado.
"Ligación" se refiere al proceso de
formación de enlaces fosfodiéster entre dos fragmentos de ácidos
nucleicos de cadena doble (Maniatis, T. et al., Id. pág.
146). Salvo que se proporcione otra cosa, la ligación puede
conseguirse usando tampones y condiciones conocidos con 10 unidades
a ligasa de ADN T4 ("ligasa") por 0,5 \mug de cantidades
aproximadamente equimolares de los fragmentos de ADN a ligar.
Salvo indicación en contrario, la transformación
se realizó como se describe en el método de Graham, F. y Van der
Eb, A., Virology, 52:456-457 (1973).
La secuencia de ADN que codifica
EBI-2, ATCC 209003, se multiplica inicialmente
usando cebadores de oligonucleótidos de PCR correspondientes a las
secuencias 5' de la proteína de EBI-2 tratada (menos
la secuencia de péptido señal) y las secuencias de vector 3' para
el gen de EBI-2. Los nucleótidos adicionales
correspondientes a EBI-2 se añadieron a las
secuencias 5' y 3' respectivamente. El cebador de oligonucleótido 5'
tiene la secuencia 5' CCGAG
GATCCATGCAAGCCGTCGACAAT 3' (SEQ ID NO: 5), contiene un lugar de enzima de restricción BamHI seguido por 18 nucleótidos de la secuencia de codificación de EBI-2 partiendo del aminoácido terminal supuesto del codón de la proteína tratada. La secuencia 3' 5' CCGAGGATCCTTACATTGGAGTCTCTTC 3' (SEQ ID NO: 6) contiene secuencias complementarias del lugar de BamHI y es seguida por 18 nucleótidos de EBI-2. Los lugares de enzimas de restricción corresponden a los lugares de enzimas de restricción en el vector de expresión bacteriano pQE-60. (Qiagen, Inc., Chatsworth, CA, 91311). El pQE-60 codifica resistencia a antibióticos (Amp'), un origen bacteriano de replicación (ori), un operador promotor regulable por IPTG (P/O), un lugar de unión a ribosoma (RBS), una etiqueta 6-His y lugares de enzimas de restricción. El pQE-60 se digirió después con BamhI. Las secuencias multiplicadas se ligaron en pQE-60 y se insertaron enmarcadas con la secuencia que codifica la etiqueta de histidina y el RBS. La mezcla de ligación se usó después para transformar cepa de E. coli M15/rep 4 (Qiagen, Inc.) por el procedimiento descrito en Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989). La M15/rep4 contiene copias múltiples del plásmido pREP4, que expresa el represor de lacI y confiere también resistencia a canamicina (Kan'). Se identificaron transformantes por su capacidad para crecer en placas de LB y se seleccionaron colonias resistentes a ampicilina/canamicina. El ADN plásmido se aisló y confirmó por análisis de restricción. Se desarrollaron durante la noche (O/N) clones que contenían las construcciones deseadas en cultivo líquido en medio LB suplementado con Amp (100 \mug/ml) y Kan (25 \mug/ml). El cultivo O/N se usó para inocular un cultivo grande en una relación de 1:100 a 1:250. Las células se desarrollaron hasta una densidad óptica 600 (O.D.^{600}) entre 0,4 y 0,6. Se añadió después IPTG ("isopropil-B-D-tiogalacto piranósido") hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG induce inactivando el represor de lacI, despejando el P/O que conduce a expresión génica aumentada. Las células se desarrollaron de 3 a 4 horas más. Se cosecharon después las células por centrifugación. El glóbulo de células se solubilizó en el agente caotrópico guanidina HCl 6 molar. Tras clarificar, se purificó de esta solución hSca-2 solubilizado por cromatografía en una columna de niquel-quelato en condiciones que permiten una unión estrecha por proteínas que contienen la etiqueta de 6-His (Hochuli, E. et al., J. Chromatography 411:177-184 (1984)). El hSca-2 (95% de pureza) se eluyó de la columna en guanidina HCl 6 molar pH 5,0 y, con el propósito de renaturalización se ajustó en guanidina HCl 3 molar, fosfato sódico 100 mM, glutationa 10 mmolar (reducida) y glutationa 2 mmolar (oxidada). Tras incubación en esta solución durante 12 horas, se dializó la proteína a fosfato sódico 10 mmolar.
GATCCATGCAAGCCGTCGACAAT 3' (SEQ ID NO: 5), contiene un lugar de enzima de restricción BamHI seguido por 18 nucleótidos de la secuencia de codificación de EBI-2 partiendo del aminoácido terminal supuesto del codón de la proteína tratada. La secuencia 3' 5' CCGAGGATCCTTACATTGGAGTCTCTTC 3' (SEQ ID NO: 6) contiene secuencias complementarias del lugar de BamHI y es seguida por 18 nucleótidos de EBI-2. Los lugares de enzimas de restricción corresponden a los lugares de enzimas de restricción en el vector de expresión bacteriano pQE-60. (Qiagen, Inc., Chatsworth, CA, 91311). El pQE-60 codifica resistencia a antibióticos (Amp'), un origen bacteriano de replicación (ori), un operador promotor regulable por IPTG (P/O), un lugar de unión a ribosoma (RBS), una etiqueta 6-His y lugares de enzimas de restricción. El pQE-60 se digirió después con BamhI. Las secuencias multiplicadas se ligaron en pQE-60 y se insertaron enmarcadas con la secuencia que codifica la etiqueta de histidina y el RBS. La mezcla de ligación se usó después para transformar cepa de E. coli M15/rep 4 (Qiagen, Inc.) por el procedimiento descrito en Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989). La M15/rep4 contiene copias múltiples del plásmido pREP4, que expresa el represor de lacI y confiere también resistencia a canamicina (Kan'). Se identificaron transformantes por su capacidad para crecer en placas de LB y se seleccionaron colonias resistentes a ampicilina/canamicina. El ADN plásmido se aisló y confirmó por análisis de restricción. Se desarrollaron durante la noche (O/N) clones que contenían las construcciones deseadas en cultivo líquido en medio LB suplementado con Amp (100 \mug/ml) y Kan (25 \mug/ml). El cultivo O/N se usó para inocular un cultivo grande en una relación de 1:100 a 1:250. Las células se desarrollaron hasta una densidad óptica 600 (O.D.^{600}) entre 0,4 y 0,6. Se añadió después IPTG ("isopropil-B-D-tiogalacto piranósido") hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG induce inactivando el represor de lacI, despejando el P/O que conduce a expresión génica aumentada. Las células se desarrollaron de 3 a 4 horas más. Se cosecharon después las células por centrifugación. El glóbulo de células se solubilizó en el agente caotrópico guanidina HCl 6 molar. Tras clarificar, se purificó de esta solución hSca-2 solubilizado por cromatografía en una columna de niquel-quelato en condiciones que permiten una unión estrecha por proteínas que contienen la etiqueta de 6-His (Hochuli, E. et al., J. Chromatography 411:177-184 (1984)). El hSca-2 (95% de pureza) se eluyó de la columna en guanidina HCl 6 molar pH 5,0 y, con el propósito de renaturalización se ajustó en guanidina HCl 3 molar, fosfato sódico 100 mM, glutationa 10 mmolar (reducida) y glutationa 2 mmolar (oxidada). Tras incubación en esta solución durante 12 horas, se dializó la proteína a fosfato sódico 10 mmolar.
La secuencia de ADN que codifica la proteína de
EBI-2 de longitud completa, ATCC 209003, se
multiplicó usando cebadores de oligonucleótidos de PCR
correspondientes a las secuencias 5' y 3' del gen.
El cebador 5' tiene la secuencia 5'
CCGAGGATCCGCCATCATGCAAGCCGTCGACAAT 3' (SEQ ID NO: 7) y contiene un
lugar de enzima de restricción BamHI (en negrilla) seguido por 6
necleótidos que parecen una señal eficaz para la iniciación de la
traducción en células eucariotas (Kozak, M., J. Mol. Biol.,
196:947-950 (1987) que está inmediatamente detrás
de los primeros 18 nucleótidos del gen de EBI-2 (el
codón de iniciación para la traducción "ATG" está
subrayado).
El cebador 3' tiene la secuencia 5'
CCGAGGATCCTTACATTGGAGTCTCTTC 3' (SEQ ID NO: 8) y contiene el lugar
de división para la endonucleasa de restricción BamHI y 18
nucleótidos complementarios de la secuencia traducida 3' de la
parte extracelular de EBI-2. Las secuencias
multiplicadas se aislaron en un gel de agarosa del 1% usando un
juego disponible comercialmente ("Geneclean" BIO 101 Inc., La
Jolla, Ca.). El fragmento se digirió después con las endonucleasas
BamHI y se purificó de nuevo en un gel de agarosa del 1%. Este
fragmento se denominó F2.
El vector pA2 (modificación del vector pVL941,
discutido después) se usa para la expresión de la proteína de
EBI-2 usando el sistema de expresión de baculovirus
(para tener un análisis véase: Summers, M.D. y Smith, G.E. 1987, A
manual of methods for baculovirus and insect cell culture
procedures, Texas Agriculural Experimental Station Bulletin No.
1555). Este vector de expresión contiene el promotor de polihedrina
fuerte del virus de la polihedrosis nuclear de Autographa
californica (AcMNPV) seguido por los lugares de reconocimiento para
las endonucleasas de restricción BamHI. Se usa el lugar de
poliadenilación del virus de los simios (SV) 40 para una
poliadenilación eficaz. Para una selección fácil de virus
recombinante, se inserta el gen de
beta-galactosidasa de E. coli en la misma
orientación que el promotor de polihedrina seguido por la señal de
poliadenilación del gen de polihedrina. Las secuencias de
polihedrina están flanqueadas a ambos lados por secuencias víricas
para la recombinación homóloga mediada por células de ADN vírico de
tipo natural co-transfectado. Podrían usarse muchos
otros vectores de baculovirus en lugar de pA2, tales como pRG1 y
pA2-GP, en cuyo caso se cambia en consecuencia el
cebador 5', y pAc373, pVL941 y pAcIM1 (Luckow, V.A. y Summers, M.D.,
Virology, 170:31-39).
El plásmido se digirió con la enzima de
restricción BamHI y se desfosforiló después usando fosfatasa
intestinal de becerro por procedimientos conocidos en la técnica.
Se aisló después el ADN en un gel de agarosa del 1% usando el juego
disponible comercialmente ("Geneclean" BIO 101 Inc., La Jolla,
Ca.). Este ADN vector se denominó V2.
El fragmento F2 y el plásmido desfosforilado V2
se ligaron con ligasa de ADN T4. Se transformaron después células
de E. coli HB101 y se identificaron bacterias que contenían
el plásmido (pBacEBI-2) con el gen de
EBI-2 usando la enzima BamHI. La secuencia del
fragmento clonado se confirmó por determinación de secuencia de
ADN.
Se co-transfectaron 5 \mug del
plásmido pBacEBI-2 con 1,0 \mug de un baculovirus
linealizado disponible comercialmente ("BaculoGold baculovirus
DNA", Pharmingen, San Diego, CA) usando el método de lipofección
(Felgner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA,
84:7413-7417 (1987)).
Se mezclaron 1 \mug de ADN de virus BaculoGold
y 5 \mug del plásmido pBacEBI-2 en un pocillo
estéril de una placa de microtitulación que contenía 50 \mul de
medio de Grace exento de suero (Life Technologies Inc.,
Gaithersburg, MD). Se añadieron después 10 \mul de lipofectina más
90 \mul de medio de Grace, se mezclaron y se incubaron durante 15
minutos a temperatura ambiente. Se añadió después gota a gota la
mezcla de transfección a las células de insecto Sf9 (ATCC CRL 1711)
sembradas en una placa de cultivo de tejidos de 35 mm con 1 ml de
medio de Grace sin suero. Se sacudió la placa de acá para allá para
mezclar la solución recién añadida. Se incubó después la placa
durante 5 horas a 27ºC. Después de 5 horas, la solución de
transfección se retiró de la placa y se añadió 1 ml de medio de
insectos de Grace suplementado con 10% de suero de becerro fetal.
Se devolvió la placa a un incubador y se continuó el cultivo a 27ºC
durante cuatro días.
Después de cuatro días, se recogió el
sobrenadante y se realizó un ensayo en placa similar a como se
describe por Summers y Smith (supra). Como modificación, se
usó un gel de agarosa con "Blue Gal" (Life Tecjnologes Inc.,
Gaithersburg) que permite un aislamiento fácil de las placas
coloreadas de azul. (Puede encontrarse también una descripción
detallada de un "ensayo en placa" en la guía del usuario para
cultivo de células de insectos y baculovirología distribuida por
Life Technologies Inc., Gaithersburg, páginas
9-10).
Cuatro días después de la dilución en serie, se
añadió el virus a las células y las placas coloreadas de azul se
picaron con la punta de una pipeta Eppendorf. El agar que contenía
los virus recombinantes se resuspendió después en un tubo Eppendorf
que contenía 200 \mul de medio de Grace. El agar se separó
mediante una centrifugación breve y se usó el sobrenadante que
contenía el baculovirus recombinante para infectar células Sf9
sembradas en placas de 35 mm. Cuatro días más tarde, se cosecharon
los sobrenadantes de estas placas de cultivo y se guardaron después
a 4ºC.
Se desarrollaron células Sf9 en medio de Grace
suplementado con 10% de FBS inactivado por calor. Se infectaron las
células con el baculovirus recombinante
V-EBI-2 con una multiplicidad de
infección (MOI) de 2. Seis horas más tardes se retiró el medio y se
sustituyó con medio SF900 II menos metionina y cisteína (Life
Technologies Inc., Gaithersburg). Se añadieron 42 horas más tarde 5
\muCi de ^{35}S-metionina y 5 \muCi de
^{35}S cisteína (Amersham). Las células se incubaron
adicionalmente durante 16 horas antes de cosecharse por
centrifugación y las proteínas marcadas se visualizaron por
SDS-PAGE y autorradiografía.
La expresión de plásmido EBI-2
HA se deriva de un vector pcDNAI/Amp (Invitrogen) que contiene: 1)
origen de replicación de SV40, 2) gen de resistencia a ampicilina,
3) origen de replicación de E. coli, 4) promotor de CMV
seguido por una región de polienlazador, un intrón de SV40 y lugar
de poliadenilación. Un fragmento de ADN que codifica el precursor
de EBI-2 completo y una etiqueta HA fusionada
enmarcada a su extremo 3' se clonó en la región de polienlazador
del vector, por tanto, la expresión de proteína recombinante se
dirige bajo el promotor de CMV. La etiqueta HA corresponde a un
epítope derivado de la proteína de hemaglutinina de la gripe como
se ha descrito previamente (I. Wilson, H. Niman, R. Heighten, A.
Cherenson, M. Connolly y R. Lemer, 1984, Cell 37:767 (1984)). La
infusión de la etiqueta HA en la proteína objetivo permite una
detección fácil de la proteína recombinante con un anticuerpo que
reconoce al epítope de HA.
La estrategia de construcción del plásmido se
describe como sigue:
La secuencia de ADN que codifica
EBI-2, ATCC 209003, se construyó por PCR usando dos
cebadores: el cebador 5' 5' CCGAGGATCCGCCATCATGCAAGCCGTCGACAAT 3'
(SEQ ID NO: 9) contiene un lugar de BamHI seguido por la secuencia
de codificación de EBI-2 partiendo del codón de
iniciación; la secuencia 3' 5' CCGATCTA
GATTAATCCCATACGACGTCCCAGACTACGCTCATTGGAGTCTCTTC 3' (SEQ ID NO: 10) contiene secuencias complementarias del lugar de XbaI, codón de detención de traducción, etiqueta HA y secuencia de codificación de EBI-2 (no incluyendo el codón de detención). Por tanto, el producto de PCR contiene un lugar de BamHI, una secuencia de codificación de EBI-2 seguida por la etiqueta HA fusionada enmarcada, un codón de detención de terminación de la traducción inmediatamente después de la etiqueta HA y un lugar de XbaI. El fragmento de ADN multiplicado por PCR y el vector, pcDNAI/Amp, se digirieron con enzima de restricción BamHI y XbaI y se ligaron. La mezcla de ligación se transformó en cepa SURE de E. coli (disponible de Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037), el cultivo transformado se puso en placas con medio de ampicilina y se seleccionaron colonias resistentes. Se aisló ADN plásmido de transformantes y se examinó por análisis de restricción la presencia del fragmento correcto. Para expresión del EBI-2 recombinante, se transfectaron células COS con el vector de expresión por el método de DEAE-DEXTRAN (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989)). La expresión de la proteína de EBI-2 HA se detectó por el método de radiomarcado e inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)). Se marcaron células durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Se recogió después el medio de cultivo y las células se lisaron con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, 1% de NP-40, 0,1% de SDS, 1% de NP-40, 0,5% de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5 (Wilson, I. et al., Id. 37:767 (1984)).Se precipitaron el lisado de células y el medio de cultivo con un anticuerpo monoclonal específico para HA. Las proteínas precipitadas se analizaron en geles del 15% de SDS-PAGE.
GATTAATCCCATACGACGTCCCAGACTACGCTCATTGGAGTCTCTTC 3' (SEQ ID NO: 10) contiene secuencias complementarias del lugar de XbaI, codón de detención de traducción, etiqueta HA y secuencia de codificación de EBI-2 (no incluyendo el codón de detención). Por tanto, el producto de PCR contiene un lugar de BamHI, una secuencia de codificación de EBI-2 seguida por la etiqueta HA fusionada enmarcada, un codón de detención de terminación de la traducción inmediatamente después de la etiqueta HA y un lugar de XbaI. El fragmento de ADN multiplicado por PCR y el vector, pcDNAI/Amp, se digirieron con enzima de restricción BamHI y XbaI y se ligaron. La mezcla de ligación se transformó en cepa SURE de E. coli (disponible de Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037), el cultivo transformado se puso en placas con medio de ampicilina y se seleccionaron colonias resistentes. Se aisló ADN plásmido de transformantes y se examinó por análisis de restricción la presencia del fragmento correcto. Para expresión del EBI-2 recombinante, se transfectaron células COS con el vector de expresión por el método de DEAE-DEXTRAN (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989)). La expresión de la proteína de EBI-2 HA se detectó por el método de radiomarcado e inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)). Se marcaron células durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Se recogió después el medio de cultivo y las células se lisaron con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, 1% de NP-40, 0,1% de SDS, 1% de NP-40, 0,5% de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5 (Wilson, I. et al., Id. 37:767 (1984)).Se precipitaron el lisado de células y el medio de cultivo con un anticuerpo monoclonal específico para HA. Las proteínas precipitadas se analizaron en geles del 15% de SDS-PAGE.
Se obtienen fibroblastos de un sujeto por
biopsia de piel. El tejido resultante se pone en medio de cultivo
de tejidos y se separa en pequeños trozos. Se ponen pedazos pequeños
del tejido en una superficie húmeda de un matraz de cultivo de
tejidos, poniéndose en cada matraz aproximadamente diez trozos. Se
vuelve el matraz al revés, se cierra herméticamente y se deja a
temperatura ambiente durante la noche. Después de 24 horas a
temperatura ambiente, se invierte el matraz y los trozos de tejido
permanecen fijados al fondo del matraz y se añade medio reciente
(por ejemplo, medio de Ham F12, con 10% de FBS, penicilina y
estreptomicina). Se incuba después esto a 37ºC durante
aproximadamente una semana. En este momento, se añade medio reciente
y se cambia a continuación cada varios días. Después de dos semanas
más en cultivo, emerge una monocapa de fibroblastos. La monocapa se
tripsiniza y se cambia de escala a matraces mayores.
Se digiere con EcoRI y HindIII
pMV-7 (Kirschmeier, P.T. et al., DNA,
7:219-25 (1988)) flanqueado por las repeticiones
terminales largas del virus de sarcoma de ratón de Moloney, y se
trata a continuación con fosfatasa intestinal de becerro. El vector
lineal se fracciona en gel de agarosa y se purifica, usando perlas
de vidrio.
El cADN que codifica un polipéptido de la
presente invención se multiplica usando cebadores de PCR que
corresponden a las secuencias extremas 5' y 3' respectivamente. El
cebador 5' que contiene un lugar de EcoRI y el cebador 3' incluye
además un lugar de HindIII. Se añaden juntas cantidades iguales de
la cadena principal lineal del virus del sarcoma de ratón de
Moloney y el fragmento de EcoRI y HindIII multiplicado, en presencia
de ligasa de ADN T4. La mezcla resultante se mantiene en
condiciones apropiadas para ligación de los dos fragmentos. La
mezcla de ligación se usa para transformar bacterias HB101, que se
ponen después en placa en canamicina que contiene agar con el fin
de confirmar que el vector tenía el gen de interés insertado
apropiadamente.
El pA317 anfotrópico o células de empaquetado
GP+am12 se desarrollan en cultivo de tejidos hasta densidad
confluente en medio de Eagle modificado por Dulbecco (DMEM) con 10%
de suero de becerro (CS), penicilina y estreptomicina. Se añade
después al medio el vector MSV que contiene el gen y se transducen
las células de empaquetado con el vector. Las células de
empaquetado producen ahora partículas víricas infecciosas que
contienen el gen (se hace referencia ahora a las células de
empaquetado como células productoras).
Se añade medio reciente a las células
productoras transducidas y, a continuación, se cosecha el medio
desde una placa de 10 cm de células productoras confluentes. El
medio agotado, que contiene las partículas víricas infecciosas, se
filtra a través de un filtro de miliporos para separar células
productoras sueltas y se usa después este medio para infectar
células de fibroblastos. Se retira el medio de una placa de
fibroblastos sub-confluente y se sustituye
rápidamente con el medio de las células productoras. Este medio se
separa y se sustituye con medio reciente. Si el título del virus es
alto, se infectarán virtualmente todos los fibroblastos y no se
requiere selección. Si el título es muy bajo, es necesario usar un
vector retrovírico que tenga un marcador seleccionable, tal como
neo o his.
Los fibroblastos proyectados se inyectan después
en el hospedante, solos o después de haberse desarrollado hasta
confluencia en perlas de microvehículo de citodex 3. Los
fibroblastos producen ahora el producto proteínico.
La secuencia de ADN que codifica polipéptido de
tipo EDG-1, ATCC 209004, se multiplica inicialmente
usando cebadores de oligonucleótidos de PCR correspondientes a las
secuencias 5' de la proteína de polipéptido de tipo
EDG-1 elaborada (menos la secuencia de péptido
señal) y las secuencias del vector 3' para el gen de polipéptido de
tipo EDG-1. Se añadieron nucleótidos adicionales
correspondientes a EBI-2 a las secuencias 5' y 3'
respectivamente. El cebador de oligonucleótido 5' tiene la
secuencia 5' CCGAGGATCCATGAACGCCACGGGGACC 3' (SEQ ID NO: 11),
contiene un lugar de enzima de restricción BanHI seguido por 18
nucleótidos del polipéptido de tipo EDG-1 que
codifican una secuencia que parte del aminoácido terminal supuesto
del codón de proteína elaborado. La secuencia 3' 5'
CCGAGGATCCTCAGATGCTCCGCACGCT 3' (SEQ ID NO: 12) contiene secuencias
complementarias del lugar de BamHI y es seguida por 18 nucleótidos
de polipéptido de tipo EDG-1. Los lugares de enzimas
de restricción corresponden a los lugares de enzimas de restricción
en el vector de expresión bacteriano pQE-60 (Qiagen,
Inc., Chatsworth, CA; 91311). El pQE-60 codifica
resistencia a antibiótico (Amp'), un origen bacteriano de
replicación (ori), un operador promotor (P/O) regulable por IPTG,
un lugar de unión de ribosoma (RBS), una etiqueta
6-His y lugares de enzimas de restricción. Se
digirió después el pQE-60 con BamHI. Las secuencias
multiplicadas se ligaron en pQE-60 y se insertaron
enmarcadas con la secuencia que codifica la etiqueta de histidina y
el RBS. Se usó después la mezcla de ligación para transformar cepa
M15/rep 4 de E. coli (Qiagen, Inc.) por el procedimiento
descrito en Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A
Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press (1989). La M15/rep4
contiene copias múltiples del plásmido pREP4, que expresa el
represor de lacI y confiere también resistencia a canamicina
(Kan'). Se identifican transformantes por su capacidad para crecer
en placas LB y se seleccionaron colonias resistentes a
ampicilina/canamicina. Se aisló ADN plásmido y se confirmó por
análisis de restricción. Se desarrollaron durante la noche (O/N)
clones que contenían las construcciones deseadas en cultivo líquido
en medio LB suplementado con Amp (100 \mug/ml) y Kan (25
\mug/ml). El cultivo O/N se usa para inocular un gran cultivo en
una relación de 1:100 a 1:250. Las células se desarrollaron hasta
una densidad óptica 600 (O.D.^{600}) entre 0,4 y 0,6. Se añadió
después IPTG
("isopropil-B-D-tiogalacto
piranósido") hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG
induce inactivando el represor de lacI, despejando el P/O que
conduce a expresión génica aumentada. Las células se desarrollaron
de 3 a 4 horas más. Se cosecharon después las células por
centrifugación. El glóbulo de células se solubilizó en el agente
caotrópico guanidina HCl 6 molar. Tras clarificar, se purificó de
esta solución EBI-2 solubilizado por cromatografía
en una columna de niquel-quelato en condiciones que
permiten una unión estrecha por proteínas que contienen la etiqueta
de 6-His (Hochuli, E. et al., J.
Chromatography 411:177-184 (1984)). El
EBI-2 (95% de pureza) se eluyó de la columna en
guanidina HCl 6 molar pH 5,0 y, con el propósito de renaturalización
se ajustó en guanidina HCl 3 molar, fosfato sódico 100 mM,
glutationa 10 mmolar (reducida) y glutationa 2 mmolar (oxidada).
Tras incubación en esta solución durante 12 horas, se dializó la
proteína a fosfato sódico 10 mmolar.
La secuencia de ADN que codifica la proteína de
polipéptido de tipo EDG-1 de longitud completa, ATCC
209004, se multiplicó usando cebadores de oligonucleótidos de PCR
correspondientes a las secuencias 5' y 3' del gen:
El cabador 5' tiene la secuencia 5'
GCGAGGATCCGCCATCATGAACGCCACGGGGACC 3' (SEQ ID NO: 13) y contiene un
lugar de enzima de restricción BamHI (en negrilla) seguido por 6
necleótidos que parecen una señal eficaz para la iniciación de la
traducción en células eucariotas (Kozak, M., J. Mol. Biol.,
196:947-950 (1987) que está inmediatamente detrás
de los primeros 18 nucleótidos del gen de polipéptido de tipo
EDG-1 (el codón de iniciación para la traducción
"ATG" está subrayado).
El cebador 3' tiene la secuencia 5'
CCGAGGATCCTCAGATGCTCCGCACGCT 3' (SEQ ID NO: 14) y contiene el lugar
de división para la endonucleasa de restricción BamHI y 18
nucleótidos complementarios de la secuencia traducida 3' de la
parte extracelular de polipéptido de tipo EDG-1. Las
secuencias multiplicadas se aislaron en un gel de agarosa del 1%
usando un juego disponible comercialmente ("Geneclean" BIO 101
Inc., La Jolla, Ca.). El fragmento se digirió después con las
endonucleasas BamHI y se purificó de nuevo en un gel de agarosa del
1%. Este fragmento se denominó F2.
El vector pA2 (modificación del vector pVL941,
discutido después) se usa para la expresión de la proteína de
polipéptido de tipo EDG-1 usando el sistema de
expresión de baculovirus (para tener un análisis véase: Summers,
M.D. y Smith, G.E. 1987, A manual of methods for baculovirus and
insect cell culture procedures, Texas Agriculural Experimental
Station Bulletin No. 1555). Este vector de expresión contiene el
promotor de polihedrina fuerte del virus de la polihedrosis nuclear
de Autographa californica (AcMNPV) seguido por los lugares de
reconocimiento para las endonucleasas de restricción BamHI. Se usa
el lugar de poliadenilación del virus de los simios (SV) 40 para
una poliadenilación eficaz. Para una selección fácil de virus
recombinante, se inserta el gen de
beta-galactosidasa de E. coli en la misma
orientación que el promotor de polihedrina seguido por la señal de
poliadenilación del gen de polihedrina. Las secuencias de
polihedrina están flanqueadas a ambos lados por secuencias víricas
para la recombinación homóloga mediada por células de ADN vírico de
tipo natural co-transfectado. Podrían usarse muchos
otros vectores de baculovirus en lugar de pA2, tales como pRG1 y
pA2-GP, en cuyo caso se cambia en consecuencia el
cebador 5', y pAc373, pVL941 y pAcIM1 (Luckow, V.A. y Summers,
M.D., Virology, 170:31-39).
El plásmido se digirió con la enzima de
restricción BamHI y se desfosforiló después usando fosfatasa
intestinal de becerro por procedimientos conocidos en la técnica.
Se aisló después el ADN en un gel de agarosa del 1% usando el juego
disponible comercialmente ("Geneclean" BIO 101 Inc., La Jolla,
Ca.). Este ADN vector se denomina V2.
El fragmento F2 y el plásmido desfosforilado V2
se ligaron con ligasa de ADN T4. Se transformaron después células
de E. coli HB101 y se identificaron bacterias que contenían
el plásmido (pBacpolipéptido de tipo EDG-1) con el
gen de polipéptido de tipo EDG-1 usando la enzima
BamHI. La secuencia del fragmento clonado se confirmó por
determinación de secuencia de ADN.
Se co-transfectaron 5 \mug del
plásmido pBacpolipéptido de tipo EDG-1 con 1,0
\mug de un baculovirus linealizado disponible comercialmente
("BaculoGold baculovirus DNA", Pharmingen, San Diego, CA)
usando el método de lipofección (Felgner et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 84:7413-7417 (1987)).
Se mezclaron 1 \mug de ADN de virus BaculoGold
y 5 \mug del plásmido pBacpolipéptido de tipo
EDG-1 en un pocillo estéril de una placa de
microtitulación que contenía 50 \mul de medio de Grace exento de
suero (Life Technologies Inc., Gaithersburg, MD). Se añadieron
después 10 \mul de lipofectina más 90 \mul de medio de Grace,
se mezclaron y se incubaron durante 15 minutos a temperatura
ambiente. Se añadió después gota a gota la mezcla de transfección a
las células de insecto Sf9 (ATCC CRL 1711) sembradas en una placa de
cultivo de tejidos de 35 mm con 1 ml de medio de Grace sin suero.
Se sacudió la placa de acá para allá para mezclar la solución
recién añadida. Se incubó después la placa durante 5 horas a 27ºC.
Después de 5 horas, la solución de transfección se retiró de la
placa y se añadió 1 ml de medio de insectos de Grace suplementado
con 10% de suero de becerro fetal. Se devolvió la placa a un
incubador y se continuó el cultivo a 27ºC durante cuatro días.
Después de cuatro días, se recogió el
sobrenadante y se realizó un ensayo en placa similar a como se
describe por Summers y Smith (supra). Como modificación, se
usó un gel de agarosa con "Blue Gal" (Life Tecjnologes Inc.,
Gaithersburg) que permite un aislamiento fácil de las placas
coloreadas de azul. (Puede encontrarse también una descripción
detallada de un "ensayo en placa" en la guía del usuario para
cultivo de células de insectos y baculovirología distribuida por
Life Technologies Inc., Gaithersburg, páginas
9-10).
Cuatro días después de la dilución en serie, se
añadió el virus a las células y las placas coloreadas de azul se
picaron con la punta de una pipeta Eppendorf. El agar que contenía
los virus recombinantes se resuspendió después en un tubo Eppendorf
que contenía 200 \mul de medio de Grace. El agar se separó por una
centrifugación breve y se usó el sobrenadante que contenía los
baculovirus recombinantes para infectar células Sf9 sembradas en
placas de 35 mm. Cuatro días más tarde, se cosecharon los
sobrenadantes de estas placas de cultivo y se guardaron después a
4ºC.
Se desarrollaron células Sf9 en medio de Grace
suplementado con 10% de FBS inactivado por calor. Se infectaron las
células con el baculovirus recombinante
V-polipéptido de tipo EDG-1 con una
multiplicidad de infección (MOI) de 2. Seis horas más tarde se
retiró el medio y se sustituyó con medio SF900 II menos metionina y
cisteína (Life Technologies Inc., Gaithersburg). Se añadieron 42
horas más tarde 5 \muCi de ^{35}S-metionina y 5
\muCi de ^{35}S cisteína (Amersham). Las células se incubaron
adicionalmente durante 16 horas antes de cosecharse por
centrifugación y las proteínas marcadas se visualizaron por
SDS-PAGE y autorradiografía.
La expresión de plásmido polipéptido de tipo
EDG-1 HA se deriva de un vector pcDNAI/Amp
(Invitrogen) que contiene: 1) origen de replicación de SV40, 2) gen
de resistencia a ampicilina, 3) origen de replicación de E.
coli, 4) promotor de CMV seguido por una región de
polienlazador, un intrón de SV40 y lugar de poliadenilación. Un
fragmento de ADN que codifica el precursor de polipéptido de tipo
EDG-1 completo y una etiqueta HA fusionada
enmarcada a su extremo 3' se clonó en la región de polienlazador del
vector, por tanto, la expresión de proteína recombinante se dirige
bajo el promotor de CMV. La etiqueta HA corresponde a un epítope
derivado de la proteína de hemaglutinina de la gripe como se ha
descrito previamente (I. Wilson, H. Niman, R. Heighten, A.
Cherenson, M. Connolly y R. Lemer, 1984, Cell 37:767 (1984)). La
infusión de la etiqueta HA en la proteína objetivo permite una
detección fácil de la proteína recombinante con un anticuerpo que
reconoce al epítope de HA.
La estrategia de construcción del plásmido se
describe como sigue:
La secuencia de ADN que codifica polipéptido de
tipo EDG-1, ATCC 209004, se construyó por PCR usando
dos cebadores: el cebador 5' 5' CCGAGGATCCGCCATCATGAAGCCACGGGGACC
3' (SEQ ID NO: 15) contiene un lugar de BamHI seguido por la
secuencia de codificación de polipéptido de tipo
EDG-1 partiendo del codón de iniciación; la
secuencia 3' 5'
CCGATCTAGATCAATCCCATACGACGACGTCCCAGACTACGCTGATGTCCGCACGCT 3' (SEQ ID
NO: 16) contiene secuencias complementarias del lugar de XbaI,
codón de detención de traducción, etiqueta HA y secuencia de
codificación de polipéptido de tipo EDG-1 (no
incluyendo el codón de detención). Por tanto, el producto de PCR
contiene un lugar de BamHI, una secuencia de codificación de
polipéptido de tipo EDG-1 seguida por la etiqueta HA
fusionada enmarcada, un codón de detención de terminación de la
traducción después de la etiqueta HA y un lugar de XbaI. El
fragmento de ADN multiplicado por PCR y el vector, pcDNAI/Amp, se
digirieron con enzima de restricción BamHI y XbaI y se ligaron. La
mezcla de ligación se transformó en cepa SURE de E. coli
(disponible de Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines
Road, La Jolla, CA 92037), el cultivo transformado se puso en placas
con medio de ampicilina y se seleccionaron colonias resistentes. Se
aisló ADN plásmido de transformantes y se examinó por análisis de
restricción la presencia del fragmento correcto. Para expresión del
polipéptido de tipo EDG-1 recombinante, se
transfectaron células COS con el vector de expresión por el método
de DEAE-DEXTRAN (J. Sambrook, E. Fritsch, T.
Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring
Laboratory Press, (1989)). La expresión de la proteína de
polipéptido de tipo EDG-1 HA se detectó por el
método de radiomarcado e inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane,
Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory
Press (1988)). Se marcaron células durante 8 horas con
^{35}S-cisteína dos días después de la
transfección. Se recogió después el medio de cultivo y las células
se lisaron con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, 1% de
NP-40, 0,1% de SDS, 1% de NP-40,
0,5% de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5 (Wilson, I. et al., Id.
37:767 (1984)).Se precipitaron el lisado de células y el medio de
cultivo con un anticuerpo monoclonal específico para HA. Las
proteínas precipitadas se analizaron en geles del 15% de
SDS-PAGE.
Se obtienen fibroblastos de un sujeto por
biopsia de piel. El tejido resultante se pone en medio de cultivo
de tejidos y se separa en pequeños trozos. Se ponen pedazos pequeños
del tejido en una superficie húmeda de un matraz de cultivo de
tejidos, poniéndose en cada matraz aproximadamente diez trozos. Se
vuelve el matraz al revés, se cierra herméticamente y se deja a
temperatura ambiente durante la noche. Después de 24 horas a
temperatura ambiente, se invierte el matraz y los trozos de tejido
permanecen fijados al fondo del matraz y se añade medio reciente
(por ejemplo, medio de Ham F12, con 10% de FBS, penicilina y
estreptomicina). Se incuba después esto a 37ºC durante
aproximadamente una semana. En este momento, se añade medio reciente
y se cambia a continuación cada varios días. Después de dos semanas
más en cultivo, emerge una monocapa de fibroblastos. La monocapa se
tripsiniza y se cambia de escala a matraces mayores.
Se digiere con EcoRI y HindIII
pMV-7 (Kirschmeier, P.T. et al., DNA,
7:219-25 (1988)) flanqueado por las repeticiones
terminales largas del virus de sarcoma de ratón de Moloney, y se
trata a continuación con fosfatasa intestinal de becerro. El vector
lineal se fracciona en gel de agarosa y se purifica, usando perlas
de vidrio.
El cADN que codifica un polipéptido de la
presente invención se multiplica usando cebadores de PCR que
corresponden a las secuencias extremas 5' y 3' respectivamente. El
cebador 5' que contiene un lugar de EcoRI y el cebador 3' incluye
además un lugar de HindIII. Se añaden juntas cantidades iguales de
la cadena principal lineal del virus del sarcoma de ratón de
Moloney y el fragmento de EcoRI y HindIII multiplicado, en presencia
de ligasa de ADN T4. La mezcla resultante se mantiene en
condiciones apropiadas para ligación de los dos fragmentos. La
mezcla de ligación se usa para transformar bacterias HB101, que se
ponen después en placa en canamicina que contiene agar con el fin
de confirmar que el vector tenía el gen de interés insertado
apropiadamente.
El pA317 anfotrópico o células de empaquetado
GP+am12 se desarrollan en cultivo de tejidos hasta densidad
confluente en medio de Eagle modificado por Dulbecco (DMEM) con 10%
de suero de becerro (CS), penicilina y estreptomicina. Se añade
después al medio el vector MSV que contiene el gen y se transducen
las células de empaquetado con el vector. Las células de
empaquetado producen ahora partículas víricas infecciosas que
contienen el gen (se hace referencia ahora a las células de
empaquetado como células productoras).
Se añade medio reciente a las células
productoras transducidas y, a continuación, se cosecha el medio
desde una placa de 10 cm de células productoras confluentes. El
medio agotado, que contiene las partículas víricas infecciosas, se
filtra a través de un filtro de miliporos para separar células
productoras sueltas y se usa después este medio para infectar
células de fibroblastos. Se retira el medio de una placa de
fibroblastos sub-confluente y se sustituye
rápidamente con el medio de las células productoras. Este medio se
separa y se sustituye con medio reciente. Si el título del virus es
alto, se infectarán virtualmente todos los fibroblastos y no se
requiere selección. Si el título es muy bajo, es necesario usar un
vector retrovírico que tenga un marcador seleccionable, tal como
neo o his.
Los fibroblastos proyectados se inyectan después
en el hospedante, solos o después de haberse desarrollado hasta
confluencia en perlas de microvehículo de citodex 3. Los
fibroblastos producen ahora el producto proteínico.
Son posibles numerosas modificaciones y
variaciones de la presente invención a la luz de las enseñanzas
anteriores y, por tanto, dentro del alcance de las reivindicaciones
adjuntas, la invención puede practicarse de otro modo que como se
ha descrito particularmente.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: HUMAN GENOME SCIENCES, INC., ET AL.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Receptor acoplado a proteína G
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 18
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: HUMAN GENOME SCIENCES, INC.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 9410 KEY WEST AVENUE
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: ROCKVIKLLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: MARYLAND
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE:UU:
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 20850
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: DISDQUETE DE 3,5''
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PS/2
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: WORD PERFECT 5.1
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US98/09048
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 7 de Mayo de 1998
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: 08/852.824
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 7 de Mayo de 1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: A. ANDERS, BROOKES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 36.373
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: PF351PCT.LIC
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 301-309-8504
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 301-309-8439
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2249 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 342 AMINOÁCIDOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: AMINOÁCIDO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: PROTEÍNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1737 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 276 AMINOÁCIDOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: AMINOÁCIDO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: PROTEÍNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC ATGCAAGCCG TCGACAAT
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC TTACATTGGA GTCTCTTC
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC GCCATCATGC AAGCCGTCGA CAAT
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC TTACATTGGA GTCTCTTC
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC GCCATCATGC AAGCCGTCGA CAAT
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 55 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGATCTAGA TTAATCCCAT ACGACGTCCC AGACTACGCT CATTGGAGTC TCTTC
\hfill55
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC ATGAACGCCA CGGGGACC
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC TCAGATGCTC CGCACGCT
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGAGGATCC GCCATCATGA ACGCCACGGG GACC
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC TCAGATGCTC CGCACGCT
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGAGGATCC GCCATCATGA ACGCCACGGG GACC
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 55 PARES DE BASES
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ÁCIDO NUCLEICO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGATCTAGA TCAATCCCAT ACGACGTCCC AGACTACGCT GATGCTCCGC ACGCT
\hfill55
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 348 AMINOÁCIDOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: AMINOÁCIDO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: PROTEÍNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 381 AMINOÁCIDOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: AMINOÁCIDO
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CARÁCTER DE LA CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: PROTEÍNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (17)
1. Un polinucleótido seleccionado del grupo
constituido por:
(a) polinucleótidos que codifican un polipéptido
que comprende la secuencia de aminoácidos codificada por el cADN
contenido en el Depósito ATCC Nº 209003;
(b) polinucleótidos que comprenden la secuencia
de codificación del cADN contenido en el Depósito ATCC Nº
209003;
(c) polinucleótidos que son al menos 90%
idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de
los (a) y (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de
receptor acoplado a proteína G;
(d) polinucleótidos que son al menos 95%
idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de
los (a) y (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de
receptor acoplado a proteína G; y
(e) polinucleótidos que comprenden una secuencia
de nucleótidos que codifican un fragmento de un polipéptido
codificado por un polinucleótido de uno cualquiera de los (a) a (d),
en los que dicho fragmento tiene actividad de receptor acoplado a
proteína G;
o la cadena complementaria de tal
polinucleótido,
con la condición de que dicho polinucleótido no
comprenda la siguiente secuencia de nucleótidos:
2. Un polinucleótido seleccionado del grupo
constituido por:
(a) polinucleótidos que codifican un polipéptido
que comprende los aminoácidos 1 a 342 de SEQ ID NO: 2;
(b) polinucleótidos que codifican un polipéptido
que comprende los aminoácidos 2 a 342 de SEQ ID NO: 2;
(c) polinucleótidos que son al menos 90%
idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de
los (a) a (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de
receptor acoplado a proteína G;
(d) polinucleótidos que son al menos 95%
idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de
los (a) a (b) y que codifica un polipéptido que tiene actividad de
receptor acoplado a proteína G; y
(e) polinucleótidos que comprenden una secuencia
de nucleótidos que codifica un fragmento de un polipéptido
codificado por un polinucleótido de uno cualquiera de los (a) a (d),
en los que dicho fragmento tiene actividad de receptor acoplado a
proteína G;
o la cadena complementaria de tal
polinucleótido,
con la condición de que dicho polinucleótido no
comprenda la siguiente secuencia de nucleótidos:
3. El polinucleótido de las reivindicaciones 1ª
o 2ª, que es ADN.
4. El polinucleótido de las reivindicaciones 1ª
o 2ª, que es ARN.
5. Un método para fabricar un vector que
comprende insertar el polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1ª a 3ª en un vector.
6. Un vector que comprende el polinucleótido de
una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª.
7. Una célula hospedante recombinante que
comprende el polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1ª a 4ª o el vector de la reivindicación 6ª.
8. Un método para producir un polipéptido que
tiene actividad de receptor acoplado a proteína G, que comprende
expresar desde la célula hospedante recombinante de la
reivindicación 7ª el polipéptido codificado por dicho
polinucleótido.
9. Un polipéptido codificado por el
polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª u
obtenible por el método de la reivindicación 8ª.
10. Un anticuerpo contra el polipéptido de la
reivindicación 9ª.
11. Un antagonista contra el polipéptido de la
reivindicación 9ª, que comprende el anticuerpo de la reivindicación
10ª, una construcción antisentido que se hibrida específicamente con
el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª
o una forma soluble de dicho polipéptido.
12. Un procedimiento in vitro para
diagnosticar una enfermedad o una susceptibilidad a una enfermedad
relacionada con una infraexpresión del polipéptido de la
reivindicación 9ª, que comprende: determinar una mutación en una
secuencia de ácido nucleico que codifica dicho polipéptido.
13. Una composición farmacéutica que comprende
el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a
4ª, el polipéptido de la reivindicación 9ª, un ADN que codifica y es
capaz de expresar dicho polipéptido o el antagonista de la
reivindicación 11ª, y opcionalmente un vehículo aceptable
farmacéuticamente.
14. Una composición de diagnóstico que comprende
el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª
o el anticuerpo de la reivindicación 10ª.
15. Un procedimiento para examinar antagonistas
para el polipéptido de la reivindicación 9ª, que comprende:
(a) expresar dicho polipéptido en la superficie
de una célula;
(b) poner en contacto la célula con un ligando
de dicho polipéptido y un compuesto a examinar; y
(c) determinar si la señal generada por el
ligando es inhibida por dicho compuesto.
16. Un procedimiento para examinar agonistas
para el polipéptido de la reivindicación 9ª, que comprende:
(a) expresar dicho polipéptido en la superficie
de una célula;
(b) poner en contacto la célula con un ligando
de dicho polipéptido y un compuesto a examinar; y
(c) determinar si el compuesto genera una
señal.
17. Un procedimiento para determinar si un
ligando del que no se sabe que sea capaz de unirse al polipéptido
de la reivindicación 9ª puede unirse a dicho polipéptido que
comprende:
(a) poner en contacto una célula de mamífero que
expresa dicho polipéptido con un ligando potencial;
(b) detectar la presencia de un ligando que se
une a dicho polipéptido; y
(c) determinar si el ligando se une al
polipéptido de la reivindicación 9ª.
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