ES2285792T3 - Receptores asociados a proteina g y usos para los mismos. - Google Patents
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Abstract
Un polipéptido aislado seleccionado del grupo consistente en: (a) un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:2; (b) un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:5; (c) un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:32; (d) un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:2; donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de SEC ID NO:2 y tiene una actividad flh84g5; (e) un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:5, donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de residuos de aminoácidos 109-130, 152-174, 197- 219, 360-380 o 396-416 de SEC ID NO:5 y tiene una actividad flh84g5; (f) un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:32; donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de SEC ID NO:32 y tiene una actividad flh84g5; (g) una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:2, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:1 bajo condiciones severas; (h) una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:5, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:4 bajo condiciones severas; (i) una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:32, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:31 bajo condiciones severas; (j) un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácido que es al menos 95% idéntica a la secuencia completa de aminoácido de SEC ID NO: 2, 5, o 32; y (k) un polipéptido que se codifica por una molécula de ácido nucleico que comprende una secuencia de ácido nucleico que es al menos 95% idéntica a la secuencia completa nucleótida de SEC ID NO: 1, 4, o 31, donde un polipéptido tiene una actividad flh84g5 que, cuando se expresa en oocitos, permite que L-carnitina produzca corriente de cloro activada por calcio.
Description
Receptores asociados a proteína G y usos para
los mismos.
Los receptores asociados a proteína G (GPCRs)
constituyen una clase principal de proteínas responsables para
convertir una señal en una células. GPCRs tienen tres dominios
estructurales: un dominio extracelular de aminoácido, un dominio
transmembránico que contiene siete segmentos transmembránicos, tres
curvas extracelulares, y tres curvas intracelulares, y un dominio
intracelular carboxi terminal. Tras la unión de un ligando con una
porción extracelular de un GPCR, se convierte una señal en la
célula que da como resultado un cambio en la propiedad biológica o
fisiológica de la células. GPCRs, junto con proteínas G y efectores
(enzimas intracelulares y canales modulados por proteínas G), son
los componentes de un sistema de señalización modular que conecta
el estado de segundos mensajeros intracelulares con las entradas
extracelulares.
Los genes GPCR y los productos de genes son
agentes potenciales causativos de enfermedades (Spiegel et
al., J. Clin. Invest. 92:1119:1125 (1993); McKusick et
al., J. Med. Genet. 30:1-26 (1993)). Defectos
específicos en el gen rhodopsin y el gen receptor vasopresina V2
han demostrado causar varias formas de retinitis pigmentosa
(Nathans et al., Annu, Rev. Genet. 26:403-424
(1992)), y diabetes insípida nefrogénica (Holtzman et al.,
Hum. Mol. Genet. 2:1201-1204 (1993)). Estos
receptores son de crítica importancia para el sistema nervioso
central y para los procesos fisiológicos periféricos. Los análisis
evolucionarios sugieren que los ancestros de estas proteínas se
desarrollaron originariamente en relación con los planes del cuerpo
complejo y de los sistemas nerviosos.
La superfamilia de proteína GPCR puede dividirse
en cinco familias: Familia I, receptores tipificados por rhodopsin
y el receptor \beta2 adrenérgico y actualmente representados por
más de 200 miembros únicos (Dohlman et al., Annu. Rev.
Biochem. 60:653-688 (1991)), Familia II, la
familia de receptor hormona paratiroidea/calcitonina/secretina
(Juppner et al., Science 254:1024-1026
(1991); Lin et al., Science
254:1022-1024 (1991); Familia III, la familiar
del receptor metabotrópico glutamato, importante en la chimiotaxis
y desarrollo de D. Discoideum (Klein et al., Science
241:1467-1472 (1988)); y Familia V, los
receptores de feromona en unión fúngica como STE2 (Kurjan, Annu.
Rev. Biochem. 61:1097-1129 (1992)).
También existen un pequeño número de otras
proteínas que presentan siete segmentos hidofóbicos putativos y
parecen no estar relacionadas con GPCRs; no han demostrado
asociarse con proteínas g. Drosohila expresa una proteína
específica de fotorreceptor, novia de sin siete (boss), una
proteína de siete segmentos transmembránicos que ha sido
exhaustivamente estudiada y que no muestra evidencia de ser un GPCR
(Hart et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
90:5047-5051 (1993). El gen encrespado (fz) en
Drosophila también parece ser una proteína con siete
segmentos transmembránicos. Como boss, fz no ha demostrado
asociaras con proteínas G (Vinson et al., Nature
338:263-264 (1989)).
Las proteínas G representan una familia de
proteínas heterotriméricas compuestas por subunidades \alpha,
\beta, e \gamma que se enlazan con nucleótidos de guanina.
Estas proteínas normalmente están unidas con los receptores de
superficie celular, es decir, los receptores que contienen siete
segmentos de membrana. Tras el enlace del ligando con el GPCR, se
transmite un cambio conformacional a la proteína G, que provoca que
la subunidad \alpha intercambie una molécula de enlace GDP por
una molécula GTP y que se disasocie de las subunidades \beta
\gamma. La forma enlazada a GTP de una subunidad \alpha
normalmente funciona como una molécula moduladores del efector,
llevando a la producción de segundos mensajeros, como cAMP (por
ejemplo, mediante la activación de adenil ciclasa), diacilglicerol
o inositos fosfatos. Se conocen más de 20 tipos diferentes de
subunidades \alpha en los humanos. Estas subunidades se asocian
con un conjunto más pequeño de subunidades \beta e \gamma.
Ejemplos de proteínas G de mamíferos incluyen Gi, Go, Gq y Gt. Las
proteínas G se describen de manera extensa en Lodish et al,
Molecular Cell Biology, (Scientific American Books, Inc., New
York, N.Y., 1995). GPCRs, proteínas G y efector unido a proteína G
y sistemas de segundo mensajero han sido revisados y estudiados en
The G-Protein Linked Receptor Fact Book,
Watson et al., eds., Academic Press (1994).
Los GPCRs son un objetivo principal para la
acción y desarrollo de los fármacos. Por consiguiente, resulta
valorable para el desarrollo del campo de la farmacéutica la
identificación y caracterización de los GPCRs previamente
desconocidos. La presente invención avanza el estado de la técnica
al proporcionar un GPCR humano previamente sin identificar.
Los receptores muscarínicos, así llamados porque
las acciones de acetilcolina sobre tales receptores son similares a
las producidas por la muscarina alcaloide de champiñón, median la
mayor parte de los efectos inhibidores y excitadores de la
acetilcolina neurotransmisora en el corazón, musculatura lisa,
glándulas y neuronas (tanto presinápticas como postsinápticas) en
el sistema autonómico y en el sistema nervioso central (Eglen, R.
and Watson, N. (1996) Pharmacology & Toxicology
78:59-68). Los receptores muscarínicos pertenecen a
la superfamilia de receptores que asocian proteína G (Wess, J.
et al. (1990) Comprehensive Medicinal Chemistry
3:423-491). Como el resto de receptores asociados a
proteína G, los receptores muscarínicos están pronosticados para
conformar un pliegue de proteína genérica consistente en siete
hélices de transmembrana hidrofóbica unidas por curvas
intracelulares y extracelulares, un dominio extracelular
amino-terminal, y un dominio citoplásmico
carboxil-terminal.
Los receptores muscarínicos de los mamíferos
muestra un alto grado de identidad secuencial, particularmente en
los dominios transmembránicos, compartiendo aproximadamente 145
aminoácidos no variantes (Wess, J. (1993) TIPS
14:308-313). Además, todos los receptores
muscarínicos de mamíferos contienen una enorme tercera curva
citoplásmica que, salvo para las porciones próximas a la membrana,
muestran virtualmente la falta de identidad de secuencia entre los
diferentes miembros de la familia (Bonner, T.I. (1989) Trends
Neurosci, 12:148-151). El enlace de ligando con
el receptor parece desencadenar cambios conformacionales dentro del
fajo helicoidal, que posteriormente se transmiten al dominio
citoplásmico, donde se da la interacción con las proteínas G
específicas.
Los estudios de clonación molecular han revelado
la existencia de cinco proteínas receptores muscarínicos de
mamífero molecularmente diferentes, denominados receptores
M_{1}-M_{5} (Bonner, T.I. (1989) Trends
Neurosci, 12:148-151; y Hulme, E.C et al
(1990) Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol.
30:633-673). El receptor M_{1} se expresa
principalmente en el cerebro (corteza cerebral, bulba olfativa,
tubérculo olfativo, prosencéfalo basal/separador, amígdala, e
hipocampo) y en glándulas exocrinas (Buckley, N.J. et al.
(1988) J. Neurosci. 8:4646-4652). El
receptor M_{2} se expresa en el cerebro (bulba olfativa,
prosencéfalo basal/separador, tálamo y amígdala), y en el íleo y el
corazón. El receptor M_{3} se expresa en el cerebro (corteza
cerebral, tubérculo olfativo, tálamo e hipocampo) el pulmón, el
íleo, y en glándulas exocrinas. El receptor M_{4} se expresa en
el cerebro (corteza cerebral, tubérculo olfativo, hipocampo y
estriado) y en el pulmón. Por último, el receptor M_{5} se expresa
principalmente en el cerebro (sustancia negra) (Hulme, E.C et
al. (1990) A Rev. Pharmac. Toxic
30:633-673).
Las dos enzimas con las que los receptores
muscarínicos interactúan más directamente son adenilato ciclass y
fosfolipasa C. Estudios con receptores clonados han demostrado que
los receptores muscarínicos M_{1}, M_{3} y M_{5} se asocian
con los tipos de proteínas G conocidos como Go (una proteína
estimuladora unida con fosfolipasa C) o Gq y que su activación da
como resultado la activación de fosfolipasa C. Los receptores
muscarínicos M_{2} y M_{4} se asocian con una proteína Gi (una
proteína inhibidora unida a adenilato ciclasa) y su activación da
como resultado la inhibición de adenilato ciclasa. Mediante las
rutas de conversión de estas señales, los receptores muscarínicos
son responsables de una variedad de funciones fisiológicas que
incluyen la regulación de liberación neurotransmisora (incluyendo
la liberación de acetilcolina) del cerebro, la regulación de enzimas
digestivas y la secreción de insulina en el páncreas, la regulación
de secreción de amilasa por la glándula parótida, y la regulación
de contracción en musculatura cardiaca y lisa (Caulfield, M.P.
(1993) Pharmac. Ther. 58:319-379).
L-carnitina
(4-N-trimetilamonio-3-hidroxi-ácido
butírico) juega un importante papel en la regulación de ácido graso
de larga cadena en musculatura del miocardio y del esqueleto
(Bremer, (1983) Pharmacol Rev. 63,
1420-1480; Bieber, (1988) Annu. Rev.
Biochem. 57:261-283; Fritz y
Arrigoni-Martelli, (1993) Trends Pharmacol.
Sci. 14, 355-360). Se encuentra
L-carnitina en todos los tejidos que incluyen el
cerebro, donde su concentración regional varía, encontrándose la
mayor parte en el cerebelo y el hipotálamo (Bresolin et al.,
81982) Exp. Neurol. 78, 285-292); Shug et
al., (1982) Life Sci. 31, 2869-2874).
También se ha demostrado que hay un transporte activo de
L-carnitina de la sangre al cerebro (Brooks y
McIntosh, (1975) Biochem. J. 148, 439-445).
Debido al principal paso metabólico para el proceso bionergético
del cerebro no es la oxidación de ácido graso mitocondiral, donde
L-carnitina juega un papel pivotal (Biweber, (1988)
Annu. Rev. Biochem. 57,261-283), se han
explorado funciones alternativas fisiológicas. Un número de piezas
experimentales de evidencia sugieren que este compuesto puede
actuar como un electromodulador potencial (Blum et al.,
(1971) J. Pharmacol. Exp. Ther. 178, 331-338;
Falchetto et al., (1971) Can. J. Physiol. Pharmacol.
49, 1-7; Fariello y Shug, (1981) Biochem.
Pharmacol. 30, 1012-1013; Huth et al.,
(1981) J. Neurochem. 36, 715-723; Shug et
al., (1982) Life Sci. 31,2869-2874;
Janiri y Tempesta (1983) Int. J. Clin. Pharmacol. Res. 3,
295-306; Zoccarato et al., (1983) Biochem.
Biophys. Acta 734,381-383; Hanuniemi y Kontro,
(1988) Neurochem. Res. 3, 317-323; Janiri
et al., (1991) J. Neural. Transm. 86,
135-146), a pesar de una función directa de
L-carnitina como un neurotransmisor del cerebro ha
sido descartada (Shug et al., (1982) Life Sci.
31,2869-2874). Un transporte activo de carnitina
inhibida por GABA en porciones de cerebro de ratas fue propuesto
por Fariello y Shug, (1981) Biochem. Pharmacol. 30,
1012-1013; y Huth et al., (1981) J.
Neurochem. 36, 715-723; y también la respuesta
de GABA fue inhibida por carnitina. (Hanuniemi y Kontro, (1988)
Neurochem. Res. 3, 317-323).
L-carnitina también demostró ejercer una actividad
colinomimética en neuronas colinoceptivas (Tempesta et al.,
(1982) Neuropharmacology 21, 1207-1210;
Janiri y Tempesta (1983) Int. J. Clin. Pharmacol. Res. 3,
295-306; Janiri et al., (1991) J. Neural
Tarnsm. 86, 135-146). L-carnitina es
un importante cofactor de carnitina acetiltransferasa (CAT), una
enzima que provoca la transferencia reversible de la molécula de
acetil a través de membranas mitocondriales de
L-carnitina a CoA (Bieber, (1988) Annu. Rev.
Biochem. 57, 261-283); por lo tanto, carnitina puede
estar involucrada en la formación de acetilcolina por medio de la
regulación del transporte de grupos de acetilo de la matriz
mitocondiral al citosol (White y Scates, (1990) Neurochem.
Res. 15, 597-601). Sin embargo, la actividad
CAT se localiza principalmente en la mitocondria y no muestra
ninguna localización preferencial regional en el cerebro (McCaman
et al., (1966) J. Biol.. Chem. 241,
930-934).
La invención se define en las reivindicaciones
adjuntas. La invención proporciona una nueva molécula de ácido
nucleico que codifica un polipéptido, aquí referido como
polipéptido o proteína flh84g5, que es capaz de, por ejemplo,
modular los efecto de un ligando GPCR, como acetilcolina o una
molécula similar a acetilcolina como carnitina, en un ligando
flh84g5 receptivo a las células, modulando señal/actividad
fosfolipasa C. Las moléculas de ácido nucleico que codifican un
polipéptido flh84g5 son aquí referidas como moléculas de ácido
nucleico flh84g5. Estas moléculas de ácido nucleico tienen elevada
homología secuencial con la familia muscarínica de receptores. En
una realización preferente, el polipéptido flh84g5 interactúa con
(por ejemplo, se enlaza con) una proteína que es un miembro de la
familia G de proteínas. Ejemplos de tales proteínas incluyen Go,
Gi, Gs, Gq y Gt. Estas proteínas se describen en Lodish H. et
al., Molecular Cell Biology, (Scientific American Books Inc.,
New York, N.Y., 1995); Dolphin A. C et al., (1987) Trends
Neurosci. 10:53; y Birnbaumer L. et al., (1992) Cell
71:1069.
En una realización preferente, el polipéptido
fih84g5 interactúa con (por ejemplo, se enlaza con) un ligando
flh84g5. Por ejemplo, acetilcolina es el neurotransmisor
predominante en las sinapsis simpáticas y parasimpáticas
pregancliónicas, así como en las sinapsis parasimpáticas
postgangliónicas y en algunas sinapsis simpáticas postgangliónicas.
Las sinapsis en la cuales acetilcolina es el neurotransmisor se
llaman sinapsis colinérgicas. Acetilcolina actúa para regular la
contracción de la musculatura lisa, ritmo del corazón, función
glandular tal como secreción de ácido gástrico, y función neural
como liberación de neurotransmisores del cerebro. El polipéptido
flh84g5 de la presente invención enlaza con un ligando flh84g5,
como acetilcolina o una molécula similar a acetilcolina como
carnitina, y sirve para mediar la señal a la célula inducida por el
ligando como acetilcolina o una molécula similar a acetilcolina
como carnitina. Por lo tanto, las moléculas flh84g5 pueden usarse
como objetivos para modular la función inducida por el ligando
flh84g5 y por lo tanto tratar los desórdenes asociados con, por
ejemplo, niveles anormales de ligando flh84g5, o actividad anormal
o aberrante de polipéptido flh84g5 o expresión de ácido
nucleico.
Por consiguiente, un aspecto de la invención
pertenece a un polipéptido aislado flh84g5 que consta de la
secuencia de aminoácido SEC ID No. 2, 5, o 32.
En otra realización, la invención pertenece a un
fragmento de un polipéptido que tiene una actividad flh84g5, de tal
modo que cuando se expresa en oocitos, permite que
L-carnitina provoque la corriente de cloruro de
calcio activado, constando el fragmento de la secuencia de
aminoácido de SEC ID NO: 2; donde el fragmento consta al menos de
15 aminoácidos contiguos de SEC ID NO: 2, la secuencia de
aminoácido de SEC ID NO: 5, donde el fragmento consta al menos de
15 aminoácidos contiguos de residuos de aminoácido
109-130, 152-174,
197-219, 360-380 o
396-416 de SEC ID NO: 5; o la secuencia de
aminoácido de SEC ID NO: 32; donde el fragmento consta al menos de
15 aminoácidos contiguos de SEC ID NO: 32. El polipéptido aislado
flh84g5 o porción del mismo puede modular una respuesta de ligando
flh84g5 en una célula sensible al ligando flh84g5.
Incluso en otra realización, el polipéptido es
al menos 95% idéntico a la secuencia de aminoácido entera de SEC DI
NO: 2, 5, o 32.
De manera alternativa, el polipéptido aislado
flh84g5 puede comprender una secuencia de aminoácido que se
codifica por unas secuencia de nucleótidos que hibridiza bajo
severas condiciones SEC ID NO: 1, 4 o 31, y que, cuando se expresan
en oocitos, provoca la corriente de cloruro de calcio activado, o
es al menos 95% idéntica a la secuencia de aminoácido entera de SEC
DI NO: 1, 4, o 31, como las variante alélicas y homólogas de
no-humanos y no-ratas de los
polipéptidos flh84g5 aquí descritos así como las variantes
genéticamente alteradas generadas por metodologías de ADN
recombinante. Es también preferible que las formas preferentes de
flh84g5 también tengan una o más de las actividades flh84g5 aquí
descritas.
Una porción biológicamente activa de flh84g5
puede incluir un dominio o motivo, preferentemente un dominio o
motivo que tenga una actividad flh84g5. El dominio puede ser un
dominio transmembránico. Una porción biológicamente activa de un
polipéptido flh84g5 que incluye un dominio transmembránico también
puede tener una de las siguientes actividades flh84g5: 1) puede
interactuar con (por ejemplo, enlazarse con) un ligando flh84g5,
como acetilcolina o una molécula similar a acetilcolina como
carnitina; 2) puede interactuar con (por ejemplo, enlazarse con)
una proteína G u otra proteína que naturalmente se enlaza con
flh84g5; 3) puede modular la actividad de un canal de ión (por
ejemplo, un canal de cloruro activado de calcio o un canal de
potasio o calcio); 4) puede modular ión citosólico, por ejemplo,
concentración de calcio; 5) puede modular la liberación de un
neurotransmisor, por ejemplo, acetilcolina o carnitina, de una
neurona, por ejemplo, una neurona presináptica; 6) puede modular
una respuesta de ligando flh84g5 en un ligando flh84g5 receptivo a
las células (por ejemplo, una célula de músculo suave o una célula
glandular) para, por ejemplo, afectar de manera beneficiosa al
ligando flh84g5 receptivo a las células, por ejemplo, una neurona;
7) puede ser un ligando de señal que se enlaza por medio de
movimiento fosfatidilinositol; y 8) puede modular, por ejemplo,
activar o inhibir, la actividad C de fosfolipasa.
El polipéptido flh84g5 (o proteína) o una
porción biológicamente activa del mismo como se ha definido
anteriormente puede estar operativamente unido con un polipéptido
no flh84g5 (por ejemplo, un polipéptido que comprende secuencias
heterólogas de amino ácido) para formar un polipéptido de fusión.
Además, el polipéptido flh84g5 o una porción biológicamente activa
del mismo puede incorporarse a una composición farmacéutica que
consta de un polipéptido y un portador farmacéuticamente
aceptable.
El polipéptido flh84g5 de la invención, o
porciones o fragmentos de los mismos, pueden usarse para preparar
anticuerpos flh84g5. Un péptido antigénico de flh84g5 puede constar
al menos de 8, al menos 10, al menos 15, al menos 20 o al menos 30
residuos de aminoácido de la secuencia de aminoácido mostrad en SEC
ID no. 2, 5, 0 32 y que comprende un epítope flh84g5 de tal modo
que un anticuerpos elevado contra el péptido forme un complejo
inmune específico con flh84g5. La invención además proporciona un
anticuerpo que específicamente se enlaza con flh84g5. El anticuerpo
puede ser monoclonal. El anticuerpo puede estar unido a una
sustancia detectable. Además, el anticuerpo puede incorporarse a
una composición farmacéutica que esté formada por el anticuerpo y
un portador faramacéuticamente aceptable.
Otro aspecto de la invención pertenece a
moléculas de ácido nucleico aislado (por ejemplo, cADN) que
comprenden una secuencia nucleótida que codifica un polipéptido
flh84g5 como se ha definido anteriormente. En realizaciones
particularmente preferentes, las moléculas de ácido nucleico
aislado comprenden la región codificadora de la secuencia
nucleótida de SEC ID NO: 1, 4, o 31. En otras realizaciones
particularmente preferentes, las moléculas de ácido nucleico
aislado de la invención comprenden una secuencia nucleótida que
codifica de manera natural las variante alélicas que se puedan dar,
variantes alteradas genéticamente y homólogos de no humanos y no
ratas de los polipéptidos flh84g5 aquí descritos. Tales moléculas
de ácido nucleico comprenden una secuencia nucleótida que es al
menos 95% idéntica a la secuencia nucleótida mostrada en la SEC ID
NO: 1, 4 o 31 o un complemento de la misma, y codifica un
polipéptido que, cuando se expresa en oocitos, permite que
L-carnitina provoque la corriente de cloruro de
calcio activado. Los polipéptidos preferentes flh84g5 de la
presente invención también poseen preferentemente una de las
actividades flh84g5 aquí descritas.
En otra realización, la molécula de ácido
nucleico aislado codifica un polipéptido donde el polipéptido
incluye una secuencia de aminoácido que es al menos 95% idéntica a
la secuencia nucleótida mostrada en la SEC ID NO: 2, 5 o 32.
En otra realización, la molécula de ácido
nucleico aislado codifica un polipéptido, cuando se expresa en
oocitos, permite que L-carnitina provoque la
corriente de cloruro de calcio activado y que incluye un dominio
transmembránico que comprende residuos de aminoácido
34-59, 73-91,
109-130, 152-174,
197-219, 360-380 o
396-416 de SEC ID NO: 2 que se muestran como
secuencias separadas designadas SEC ID Nos: 7, 8, 9, 10, 11, 12 y
13 (dominios transmembránicos humanos), respectivamente, o
residuos de aminoácido 34-59, 73-91,
109-130, 152-174,
197-219, 360-380 o
396-416 de SEC ID NO: 5 (dominios transmembránicos
de rata) que se muestran como secuencias separadas designadas SEC
ID Nos: 14, 15, 16, 17, 18, 19, y 20, o residuos de aminoácido
1-8, 26-47, 69-91,
114-136, 277-297, 0
313-333 de SEC ID NO: 32 que se muestran como
secuencias separadas designadas SEC ID Nos: 34, 35, 36, 37, 38 o
39, respectivamente.
La molécula de ácido nucleico aislado puede
codificar un polipéptido (por ejemplo, un polipéptido de fusión
flh84g5 como un polipéptido flh84g5 fusionado con un polipéptido
homólogo que tiene una o más de las siguientes actividades flh84g5:
1) puede interactuar con (por ejemplo, enlazarse con) un ligando
flh84g5, como acetilcolina o una molécula similar a acetilcolina
como carnitina; 2) puede interactuar con (por ejemplo, enlazarse
con) una proteína G u otra proteína que naturalmente se enlaza con
flh84g5; 3) puede modular la actividad de un canal de ión (por
ejemplo, un canal de cloruro activado de calcio o un canal de
potasio o calcio); 4) puede modular ión citosólico, por ejemplo,
concentración de calcio; 5) puede modular la liberación de un
neurotransmisor, por ejemplo, acetilcolina o carnitina, de una
neurona, por ejemplo, una neurona presináptica; 6) puede modular
una respuesta de ligando flh84g5 en un ligando flh84g5 receptivo a
las células (por ejemplo, una célula de músculo suave o una célula
glandular) para, por ejemplo, afectar de manera beneficiosa al
ligando flh84g5 receptivo a las células, por ejemplo, una neurona;
7) puede ser un ligando de señal que se enlaza por medio de
movimiento fosfatidilinositol; y 8) puede modular, por ejemplo,
activar o inhibir, la actividad C de fosfolipasa.
Otro aspecto de la invención pertenece a
vectores, por ejemplo, vectores de expresión recombinantes, que
contienen las moléculas de ácido nucleico de la invención y células
huésped en las cuales se han introducidos tales vectores. En una
realización, dicha células huésped se emplea para producir un
polipéptido flh84g5 cultivando la célula huésped en un medio
adecuado. Si se desea, el polipéptido flh84g5 puede aislarse del
medio o la célula huésped. Los animales no humanos transgénicos
pueden producirse de tal modo que un gen flh84g5 haya sido
introducido o alterado. El genoma del animal no humano puede
alterarse mediante la introducción de una molécula de ácido
nucleico de la invención que codifica flh84g5 como un transgen, o
un gen endógeno flh84g5 dentro del genoma del animal no humano
puede alterarse, por ejemplo, funcionalmente interrumpido, por
recombinación homóloga.
También se describen métodos para modular una
actividad celular mediada por flh84g5, por ejemplo, procesos
biológicos mediados por movimiento de fosfatidilinosito y
señalización; secreción de una molécula, por ejemplo, un
neurotransmisor de una célula del cerebro, o una enzima de un célula
glandular; o contracción de una célula de musculatura lisa, por
ejemplo, una célula de musculatura lisa ílea o célula cardiaca, por
ejemplo, un cardiomiocito. Tales métodos incluyen el contacto de la
célula con un agente que modula actividad de polipéptido flh84g5 o
expresión de ácido nucleico flh84g5 como una actividad mediada por
flh84g5 que se altera en relación a la misma actividad celular que
se da en la ausencia de un agente. En una realización preferente,
la célula (por ejemplo, una célula de musculatura lisa o una célula
neural) es capaz de responde a un ligando flh84g5 a través de una
ruta de señalización que implica un polipéptido flh84g5. El agente
que modula la actividad flh84g5 puede ser un agente que estimula la
actividad de polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico
flh84g5. Ejemplos de agentes que estimulan la actividad de
polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico flh84g5 incluyen
pequeñas moléculas, polipéptidos activos la actividad de
polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico flh84g5, y ácidos
nucleicos que codifican la actividad de polipéptido flh84g5o
expresión de ácido nucleico flh84g5 que han sido introducidos en la
célula. Ejemplos de agentes que inhiben la actividad o expresión de
la actividad de polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico
flh84g5 incluyen pequeñas moléculas, moléculas de ácido nucleico la
actividad de polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico
flh84g5 antisentido, y anticuerpos que específicamente se enlazan
con la actividad de polipéptido flh84g5o expresión de ácido
nucleico flh84g5. En una realización preferente, la célula está
presente dentro del sujeto y el agente se administra al sujeto.
La presente invención también pertenece al uso
de un compuesto capaz de contactar una célula que exprese
polipéptido la actividad de polipéptido flh84g5o expresión de ácido
nucleico flh84g5 y que se adapte para enlazarse con el polipéptido
en una suficiente concentración como para modular la actividad del
polipéptido en la fabricación de un medicamento para el tratamiento
de un sujeto que tenga un desorden caracterizado por la actividad
aberrante del polipéptido la actividad de polipéptido flh84g5 o
expresión de ácido nucleico flh84g5 o expresión de ácido nucleico,
seleccionado de un desorden del sistema nervioso, por ejemplo, un
desorden cognitivo, un desorden motriz, un desorden del sueño, un
desorden esquizoefectivo, un desorden que afecta los mecanismos de
generación de dolor, un desorden con la bebida, un desorden
alimenticio, un desorden relacionado con al musculatura lisa, por
ejemplo, el síndrome del intestino irritable, un desorden
relacionado con la musculatura cardiaca, por ejemplo, bradicardia,
o un desorden relacionado con las glándulas, por ejemplo,
xerostomia. El compuesto es selecconado de un anticuerpo que
específicamente se enlaza con un polipéptido la actividad de
polipéptido flh84g5o expresión de ácido nucleico flh84g5 como aquí
se ha definido y un polipéptido la actividad de polipéptido
flh84g5o expresión de ácido nucleico flh84g5, porción o variante
alélica que se da naturalmente de la misma como aquí se define.
También se describen métodos para detectar
mutaciones que se dan de manera natural o genéticas creadas de
manera recombinante en un gen la actividad de polipéptido flh84g5o
expresión de ácido nucleico flh84g5, determinando de este modo si
el sujeto con el gen mutado está en situación de riesgo para (o si
está predispuesto) un desorden caracterizado por la actividad
aberrante del polipéptido la actividad de polipéptido flh84g5o
expresión de ácido nucleico flh84g5 o expresión de ácido nucleico,
seleccionado de un desorden del sistema nervioso, un desorden
relacionado con la musculatura lisa, un desorden relacionado con la
musculatura cardiaca o un desorden relacionado con las glándulas.
En realizaciones preferentes, los métodos incluyen la detección, en
una muestra de células de un sujeto, de la presencia o ausencia de
una mutación genética caracterizada por una alteración que afecta
la integridad que codifica un polipéptido flh84g5, o la expresión
incorrecta del gen flh84g5, como el causado por una sustitución de
base de ácido nucleico, eliminación o adición, o grandes cambios de
secuencia provocados por una traslación genética, inversión o
inserción.
Otro aspecto de la invención pertenece a los
métodos para detectar la presencia de flh84g5, o variantes alélicas
del mismo, en una muestra biológica. En una realización preferente,
los métodos incluyen contacto de una muestra biológica (por
ejemplo, una muestra celular de musculatura lisa o del cerebro) con
un compuesto o un agente capaz de detectar polipéptido flh84g5 o
mARN flh84g5 de tal modo que la presencia de flh84g5 se detecte en
una muestra biológica. El compuesto o agente puede ser, por
ejemplo, una sonda de ácido nucleico etiquetada o etiquetable capaz
de enlazarse con el polipéptido flh84g5. La invención permite que
los métodos para diagnóstico de sujeto con, por ejemplo, un
desorden del sistema nervioso, un desorden relacionado con la
musculatura lisa, un desorden relacionado con la musculatura
cardiaca o un desorden relacionado con las glándulas, se base en al
detección de polipéptido flh84g5 o mARN. Tales métodos incluyen
contacto de una muestra biológica (por ejemplo, una muestra celular
de musculatura lisa o del cerebro) del sujeto con un agente capaz
de detectar polipéptido flh84g5 o mARN, determinando la cantidad de
polipéptido flh84g5 o mARN expresada en la célula o muestra de
tejido, en comparación con la cantidad de polipéptido flh84g5 o
mARN expresando en la célula o muestra de tejido para la muestra de
control. La muestra celular puede ser una muestra celular del
cerebro.
Los kits para detectar flh84g5 en una muestra
biológica que incluye agentes capaces de detectar polipéptido
flh84g5 o mARN están dentro del alcance de la invención.
También se incluyen métodos, por ejemplo,
ensayos de análisis, para identificar un compuesto, por ejemplo, un
compuesto de test, para tratar un desorden caracterizado por la
expresión aberrante del polipéptido del ácido nucleico flh84g5 o
actividad del polipéptido, por ejemplo, un desorden del sistema
nervioso, un desorden relacionado con la musculatura lisa, un
desorden relacionado con la musculatura cardiaca o un desorden
relacionado con las glándulas. Estos métodos normalmente incluyen
ensayar la habilidad del compuesto o agente para modular la
expresión del gen flh84g5 o la actividad del polipéptido flh84g5
identificando de este modo un compuesto para el tratamiento de un
desorden caracterizado por la expresión aberrante del polipéptido
del ácido nucleico flh84g5 o actividad del polipéptido. En una
realización preferente, el método también implica el contacto de
una muestra biológica, por ejemplo, una muestra de célula o tejido,
por ejemplo, una muestra celular de cerebro o musculatura lisa,
obtenida a partir de un sujeto que tiene un desorden con un
compuesto o agente, determinando la cantidad de polipéptido
caracterizado por la expresión aberrante del polipéptido flh84g5
expresado y/o midiendo la actividad del polipéptido flh84g5 en la
muestra biológica, comparando la cantidad de polipéptido flh84g5
expresada en la muestra biológica y/o la actividad biológica de
flh84g5 medible en la célula con la de la muestra de control. Una
alteración en la cantidad de expresión de polipéptido flh84g5 o
actividad flh84g5 en la célula expuesta al compuesto o agente en
comparación con el control es indicativo de una modulación de la
expresión flh84g5o actividad flh84g5.
La invención también pertenece a los métodos
para identificar un compuesto o agente, por ejemplo, un compuesto o
agentes de test, que interactúa con (por ejemplo, se enlaza) un
polipéptido flh84g5. Estos métodos pueden incluir los pasos del
contacto del polipéptido flh84g5con el compuesto o agente bajo
condiciones que permiten el enlace del compuesto con el polipéptido
flh84g5 para formar un complejo y detectar la formación de un
complejo del polipéptido flh84g5 y el compuesto en el cual la
habilidad del compuesto para enlazarse con el polipéptido flh84g5
se indica mediante la presencia del compuesto en el complejo.
La invención además pertenece a los métodos para
identificar un compuesto o agente, por ejemplo, un compuesto o
agente de test, que modula, por ejemplo, estimula o inhibe, la
interacción del polipéptido flh84g5 con una molécula objetivo, por
ejemplo, acetilcolina o una molécula similar a la acetilcolina como
carnitina, o una proteína celular implicada en movimiento
fosfatidilinositol y señalización. En esto métodos el polipéptido
flh84g5 entra en contacto, en la presencia del compuesto o agente,
con la molécula objetivo bajo condiciones que permiten el enlace de
la molécula objetivo con el polipéptido flh84g5 para formar un
complejo. Una alteración, por ejemplo, un aumento o descenso, en la
formación compleja entre el polipéptido flh84g5 y la molécula
objetivo en comparación con la cantidad de complejo formado en la
ausencia del compuesto o agente es indicativo de la habilidad del
compuesto o agente para modular la interacción del polipéptido
flh84g5 con la molécula objetivo.
La Figura 1 representa el nucleótido humano
flh84g5 (SEC ID NO: 1) y secuencias de aminoácido (SEC ID NO: 2).
La región codificadora sin la región no traducida 5' y 3' del gen
humano flh84g5 se muestra en SEC ID NO: 3.
La Figura 2 representa el nucleótido de rata
flh84g5 (SEC ID NO: 4) y secuencias de aminoácido (SEC ID NO: 5).
La región codificadora sin la región no traducida 5' y 3' del gen
de rata flh84g5 se muestra en SEC ID NO: 6.
La Figura 3 representa el nucleótido de ratón
flh84g5 (SEC ID NO: 31) y secuencias de aminoácido (SEC ID NO: 32).
La región parcial codificadora sin la región no traducida 3' del
gen de ratón flh84g5 se muestra en SEC ID NO: 33.
La presente invención se basa en el
descubrimiento de nuevas moléculas, aquí referidas como ácido
nucleico flh84g5 y moléculas de polipéptido. En una realización,
las moléculas flh84g5 modulan la actividad de una o más proteínas
incluidas en una ruta de señalización neurotransmisora, por
ejemplo, una ruta de señalización de ligando flh84g5. En una
realización preferente, las moléculas flh84g5 de la presente
invención son capaces de modular la actividad de proteínas
incluidas en la ruta de señalización de ligando flh84g5 modulando
de este modo los efectos de un ligando flh84g5 sobre células
sensibles a un ligando flh84g5.
Como aquí se emplea, "células sensibles a un
ligando flh84g5" se refiere a células que tienen una función que
puede modularse (por ejemplo, estimularse o inhibirse) por un
ligando flh84g5, como acetilcolina o una molécula similar a la
acetilcolina como carnitina. Ejemplos de tales funciones incluyen
movilización de moléculas intracelulares que participan en una ruta
de transducción de señal, por ejemplo, fosfatidilinosito 4,
5-bisfosfato (PIP_{2}) o inositol 1, 4,
5-trifosfato (P_{3}), polarización de la membrana
de plasma, producción o secreción de moléculas, alteración en la
estructura de un componente celular, proliferación celular,
migración celular, diferenciación celular, y supervivencia celular.
Las células sensibles a un ligando flh84g5 preferentemente expresan
un receptor células sensibles a un ligando flh84g5. Ejemplos de
células sensibles a un ligando flh84g5 incluyen células neurales,
por ejemplo, células del sistema nervioso central y células del
sistema nervioso periférico (como neuronas simpáticas y
parasimpáticas); células de musculatura lisa, por ejemplo, células
de musculatura lisa en el tracto digestivo, el tracto urinario, los
vasos sanguíneos, las vías respiratorias y los pulmones o el útero;
células de musculatura cardiaca, por ejemplo, cardiomiocitos; y
células glandulares como células glandulares exocrinas, por
ejemplo, células glandulares pancreáticas, por ejemplo, células
beta pancriáticas, células glandulares lagrimales, células
glandulares del sudor, o células glandulares parótidas.
Dependiendo del tipo de célula, la respuesta
obtenida por un ligando flh84g5 es diferente. Por ejemplo, en
células neurales, un ligando flh84g5, como acetilcolina o moléculas
similar a acetilcolina como carnitina, regula los canales del ión,
y la señal neural para el radio de ruido. La inhibición o la
sobreestimulación de la actividad de las proteínas incluida en la
ruta de señalización del ligando flh84g5 o la expresión incorrecta
de un ligando flh84g5 puede dar lugar a la hipo o
hiper-polirización de la membrana plasmática neural
y a la señal neural perturbada para el radio de ruido, que a su vez
puede dar lugar a desordenes relacionados con el sistema nervioso.
Ejemplos de desordenes relacionados con el sistema nervioso
incluyen desordenes cognitivos, por ejemplo, desordenes de la
memoria y aprendizaje, como amnesia, apraxia, agnosia, disnomia
amnésica, desorientación espacial amnésica, síndrome
Kluver-Bucy, pérdida de memoria relacionada con el
Alzheimer (Eglen R.M. (1996) Pharmacol. And Toxicol.
78(2):59-68; Perry E.K. (1995) Brain and
Cognition 28(3):240-58) y pérdida de
habilidad para el aprendizaje; desordenes que afectan la
consciencia, por ejemplo, alucinaciones visuales, alteraciones
perceptuales, o delirio asociado con la demencia corporal Lewy;
desordenes esquizo-efectivos (Dean B. (1996) Mol.
Psychiatry 1(1):54-8), esquizofrenia
con cambios de humor (Bymaster F.P. (1997) J. Clin.
Psychiatry 58 (suppl.10):28-36; Yeomans J.S.
(1995) Neurophamacol. 12(1):3-16;
Reimann D. (1994) J. Psychiatric Res.
28(3):195-210), enfermedad depresiva
(primaria o secundaria); desordenes afectivos (Janowsky D.S. (1994)
Am. J. Med. Genetics 54(4):335-44);
desordenes del sueño (Kimura F. (1997) J. Neurophysiol.
77(2): 709-16), por ejemplo, anormalidades
en el sueño REM en pacientes que sufren, por ejemplo, depresiones
Reimann D. (1994) J. Psychiatric Res. 38 Suppl.
1:15-25; Bourgin P. (1995) Neuroreport
6(3):415-23), insominio, y anormalidades en
la temperatura corporal o depresión respiratoria durante el sueño
(Suman S.L (1995) Am. J. Physiol. 269 (2 Pt 2):
R308-17; Mallick B. N. (1997) Brain Res. 750
(1-2):311-7). Otros ejemplos de
desordenes relacionados con el sistema nerviosos incluyen
desordenes relacionados con los mecanismos de generación de miedo,
por ejemplo, miedo relacionado con el síndrome del intestino
irritable (Mitch C.H. (1997) J. Med. Chem.
40(4):538-46; Shannon H.E. (1997) J.
Pharmac. And Exp. Therapeutics
281(2):884-94; Bouaziz H. (1995)
Anesthesia and Analgesia
80(6):1140-4; o Guimaraes A.P. 81994)
Brain Res. 647(2):220-30) o dolor en
el pecho; desordenes motrices (Monassi C.R. (1997) Physiol. And
Behav. 62(1):53-9), por ejemplo,
desordenes motrices relacionados con la enfermedad de Parkinson
(Finn M. (1997) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
57(1-2):243-9; Mayorga A.J.
(1997) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
56(2):273-9); desordenes alimenticios, por
ejemplo, obesidad relacionada con la hipersecreción de insulina
(Macario M. (1997) J. Endocrinol. Invest.
20(1):8-12; Premawardhana L. D. 81994)
Clin. Endocrinol. 40(5):617-21); o
desordenes con las bebidas, por ejemplo, polidipsia diabética (Murzi
E. (1997) Brain Res.
752(1-2):184-8); Yang X.
(1994) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
49(1):1-6).
En la musculatura lisa, acetilcolina y molécula
similar a acetilcolina como carnitina regula (por ejemplo, estimula
o inhibe) la contracción. La inhibición o sobreestimulación de
proteínas implicadas en la acetilcolina y moléculas similar a
acetilcolina como carnitina señalando la ruta o expresión
incorrecta de acetilcolina y moléculas similar a acetilcolina como
carnitina pueden llevar a desordenes relacionados con la
musculatura lisa como síndrome del intestino irritable, enfermedad
diverticular, incontinencia urinaria, acalasia esofágica, o
enfermedad de obstrucción de las vías respiratorias crónica.
En la musculatura cardiaca, la acetilcolina y
molécula similar a acetilcolina como carnitina provoca una
reducción en el ritmo del corazón y en la contractilidad cardiaca.
La inhibición o sobreestimulación de la actividad de las proteínas
implicadas en la acetilcolina y molécula similar a acetilcolina
como carnitina señalando la ruta o expresión incorrecta de
acetilcolina y moléculas similar a acetilcolina como carnitina
pueden llevar a desordenes relacionados con la musculatura del
corazón, como bradicardia patológica o taquicardia, arritmia,
palpitación o fibrilación.
En glándulas como las glándulas exocrinas,
señalando la ruta o expresión incorrecta de acetilcolina y
moléculas similar a acetilcolina como carnitina regula la secreción
de enzimas y hormonas, por ejemplo, en la glándula parótida
señalando la ruta o expresión incorrecta de acetilcolina y
moléculas similar a acetilcolina como carnitina pueden provoca la
liberación de amilasa, y en el páncreas señalando la ruta o
expresión incorrecta de acetilcolina y moléculas similar a
acetilcolina como carnitina induce la liberación de enzimas
digestivas como la insulina. La inhibición o sobreestimulación de
la actividad de las proteínas implicadas en la acetilcolina y
molécula similar a acetilcolina como carnitina señalando la ruta o
expresión incorrecta de acetilcolina y moléculas similar a
acetilcolina como carnitina pueden llevar a desordenes relacionados
con las glándulas tales como xerostomia, diabetes mellitus.
En una realización preferente, las moléculas
flh84g5 son capaces de modular la activad de las proteínas G, así
como el metabolismo de fosfatidilinositol y el movimiento en
células sensibles al ligando flh84g5. Como aquí se emplea, una
"proteína G" es una proteína que participa, como una señal
secundaria, en una variedad de rutas de trasducción de señal
intracelulares, por ejemplo, en la acetilcolina que señaliza la
ruta principalmente por medio de metabolismo de fosfatidilinositol
y movimiento. Las proteínas G representan una familia de proteínas
heterotriméricas compuesta por subunidades \alpha, \beta, e
\gamma que se enlazan con nucleótidos de guanina. Estas proteínas
normalmente están unidas con los receptores de superficie celular,
es decir, los receptores que contienen siete segmentos de membrana.
Tras el enlace del ligando con el GPCR, se transmite un cambio
conformacional a la proteína G, que provoca que la subunidad a
intercambie una molécula de enlace GDP por una molécula GTP y que
se disasocie de las subunidades \beta \gamma. La forma enlazada
a GTP de una subunidad \alpha normalmente funciona como una
molécula moduladores del efector, llevando a la producción de
segundos mensajeros, como cAMP (por ejemplo, mediante la activación
de adenil ciclasa), diacilglicerol o inositos fosfatos. Se conocen
más de 20 tipos diferentes de subunidades \alpha en los humanos.
Estas subunidades se asocian con un conjunto más pequeño de
subunidades \beta e \gamma. Ejemplos de proteínas G de
mamíferos incluyen Gi, Go, Gq y Gt. Las proteínas G se describen de
manera extensa en Lodish et al, Molecular Cell
Biology, (Scientific American Books, Inc., New York, N.Y.,
1995).
Como aquí se emplea, "movimiento y metabolismo
de fosfatidilinositol" se refiere a las moléculas implicadas en
el movimiento y metabolismo de fosfatidilinositol 4,
5-bisfosfato (PIP_{2}) así como las actividades
de estas moléculas. PIP_{2} es un fosfolípido encontrado en el
folíolo de la membrana de plasma. El enlace de acetilcolina con un
receptor muscarínico activa la enzima de la membrana de plasma
fosfolipasa C que a su vez hidroliza PIP_{2} para producir
1,2-diacilglicerol (DAG) e inositol 1, 4,
5-trifosfato (P_{3}). Una vez formado P_{3}
puede difundirse a la superficie retícula endoplásmica donde se
puede enlazar con un recepto IP_{3}, por ejemplo, una proteína de
canal de calcio que contenga un punto de enlace IP_{3}. El enlace
IP_{3} puede provocar la apertura del canal, permitiendo que los
iones de calcio se liberen en el citoplasma. El IP_{3} también
puede ser fosforilatado por una quinasa específica para formar
inositol 1, 4, 5-tetrafosfato (IP_{4}), una
molécula que puede causar la entrada de calcio en el citoplasma
desde un medio extracelular. IP_{2} e IP_{4} puede
posteriormente hidrolizarse muy rápidamente con los productos
inactivos inositol 1,4-bifosfato (IP_{2}) e
inositol 1, 3, 4-trifosfato, respectivamente. Estos
productos inactivos puede reciclarse por la célula para sintetizar
PIP_{2}. El otro segundo mensajero producido por la hidrólisis de
PIP_{2}, es decir, 1,2-diacilglicerol (DAG),
permanece en la membrana celular donde puede servir para activar la
enzima proteína quinasa C. La proteína quinasa C se encuentra
normalmente soluble en el citoplasma de la célula, pero tras un
aumento en la concentración de calcio intracelular, esta enzima
puede moverse a la membrana plásmica donde puede activarse por DAG.
La activación de la proteína quinasa C en diferentes células da
como resultado varias respuestas celulares como fosforilación o
glucógeno cintaza, o la fosforilación de varios factores de
transcripción, por ejemplo, NF-Kb. Los términos
"actividad de fosfatidilinositol" como aquí se emplea, se
refiere a la actividad de PIP_{2} o uno de sus metabolitos.
Las moléculas de ácido nucleico flh84g5 se
identificaron mediante un análisis apropiado de bibliotecas cADN
(descritas con detalle en el Ejemplo I). La molécula de ácido
nucleico flh84g5 de rata se identificó analizando una biblioteca de
cADN de rata. Los clones positivos fueron secuenciados y las
secuencias parciales se analizaron mediante comparación con
secuencias en bases de datos de ácido nucleico: Este análisis
indicó que la secuencias eran homólogas a la familia muscarínica de
receptores. Un clon de rata más largo fue posteriormente aislado y
secuenciado. La molécula de ácido nucleico humana flh84g5 se
identificó analizando una biblioteca cADN de cerebelo humano
mediante el uso de sondas basadas en la secuencia de rata.
Debido a su habilidad para interactuar (por
ejemplo, enlazarse) con un ligando flh84g5, las proteínas G y otras
proteínas implicadas en la ruta de señalización del ligando
flh84g5, el polipéptido flh84g5 también es un polipéptido que
funciona en una ruta de señalización del ligando flh84g5.
La secuencia nucleótida del cADN humano flh84g5
y la secuencia de aminoácido prevista del polipéptido humano
flh84g5 se muestran en la Figura 1 y en la SEC ID NO: 1 y 2,
respectivamente. Un plásmido que contiene la completa secuencia de
longitud de nucleótido codificando flh84g5 humano se depositó con
ATCC® el 30 de septiembre de 1998 y se le asignó el Número de
Adquisición 98902. Este depósito se mantendrá bajo los términos del
Tratado de Budapest en el Reconocimiento Internacional del Depósito
para Microorganismos con fines de Procedimientos de Patentes. Este
depósito se hizo meramente como una conveniencia para aquellos
expertos en la técnica y no es un reconocimiento de que el depósito
es necesario bajo 35 U.S.0 112.
La secuencia nucleótida del cADN de rata flh84g5
y la secuencia de aminoácido prevista del polipéptido de rata
flh84g5 se muestran en la Figura 2 y en la SEC ID NOs: 4 y 5,
respectivamente.
La secuencia nucleótida del cADN de ratón
flh84g5 y la secuencia de aminoácido prevista del polipéptido de
ratón flh84g5 se muestran en la Figura 3 y en la SEC ID NOs: 31 y
32, respectivamente.
El gen humano flh84g5, que es aproximadamente
2689 nucleótidos de longitud, codifica un polipéptido de completa
longitud que tiene un peso molecular de aproximadamente 51.2 Kda y
que tiene aproximadamente 445 residuos aminoácidos en longitud. El
polipéptido humano flh84g5 se expresa al menos en el cerebro, en
particular, en regiones del cerebro como el cerebelo, corteza
cerebral, la médula, polo occipital, lóbulo frontal, el lóbulo
temporal, el putamen, el corpus callosum amígdala,
núcleo caudado, hipocampo, la sustancia negra, el núcleo
subtalámico y el tálamo; médula espinal, placenta, pulmones, bazo,
hígado, musculatura del esqueleto, riñón, y testículos. En base al
análisis estructural, los residuos de aminoácido
34-59 (SEC ID NO:7), 73-91 (SEC ID
NO:8), 109-130 (SEC ID NO:9),
152-174 (SEC ID NO:10), 197-219
(SEC ID NO:11), 360-380 (SEC ID NO:12), y
396-416 (SEC ID NO:13) comprenden dominios
transmembránicos. Como aquí se emplea, el término "dominio
transmembránico" se refiere al motivo de aminoácido estructural
que incluye una hélice hidrofóbica que abarca la membrana de
plasma. Un dominio transmembránico también incluye preferentemente
una serie de residuos de serina, treonina y tirosina conservadas.
Por ejemplo, los dominios transmembránicos entre residuos
109-130 (SEC ID NO:9), 197-219 (SEC
ID NO:11), 360-380 (SEC ID NO:12), y
396-416 (SEC ID NO:13), contienen residuos de
treonina y tirosina (localizados aproximadamente
1-2 giros helicoidales lejos de la superficie de
membrana), que son importantes para el ligando, por ejemplo,
acetilcolina y moléculas similar a acetilcolina como carnitina.
Otros residuos importantes en los dominios transmembránicos incluye
el residuo de aspartato conservado en el dominio transmembránico
entre los residuos 109-130 (SEC ID NO:9) y el
residuo de prolina conservado en el dominio transmembránico entre
los residuos 152-174 (SEC ID NO:10), que también son
importantes para el ligando, por ejemplo, un enlace con el ligando
flh84g5. Un experto en la materia apreciará fácilmente que el
inicio y el final del residuo de aminoácido recitado por varios
dominios/fragmentos de flh84g5 se basan en el análisis estructural
y que el real aminoácido de inicio/final para cada uno puede variar
por unos pocos aminoácidos de los que aquí se identifican.
El gen de rata flh84g5, que es aproximadamente
3244 nucleótidos en longitud, codifica un polipéptido de completa
longitud que tiene un peso molecular de aproximadamente 51.2 kDa y
que al menos tiene aproximadamente 445 residuos de aminoácido en
longitud. El polipéptido flh84g5 de rata se expresa en el cerebro.
Los residuos de aminoácido 34-59 (SEC ID NO:14),
73-91 (SEC ID NO:15), 109-130 (SEC
ID NO:16), 152-174 (SEC ID NO:17),
197-219 (SEC ID NO:18), 360-380 (SEC
ID NO:19) y 396-416 (SEC ID NO:20) comprenden
dominios transmembránicos.
El gen de rata flh84g5, que es aproximadamente
2218 nucleótidos en longitud, codifica un polipéptido de completa
longitud que tiene un peso molecular de aproximadamente 41.6 kDa y
que al menos tiene aproximadamente 362 residuos de aminoácido en
longitud. El polipéptido flh84g5 de rata se expresa en el cerebro.
Los residuos de aminoácido 1-8 (SEC ID NO:14),
26-47 (SEC ID NO:15), 69-91 (SEC ID
NO:16), 114-136 (SEC ID NO:17),
277-297 (SEC ID NO:18 y 313-333
(SEC ID NO:19) comprenden dominios transmembránicos.
El gen de ratón parcial flh84g5, que es al menos
aproximadamente 2218 nucleótidos en longitud, codifica un
polipéptido de completa longitud que tiene un peso molecular de al
menos aproximadamente 41.6 kDa y que al menos tiene al menos
aproximadamente 362 residuos de aminoácido en longitud. El
polipéptido flh84g5 de ratón se expresa en el cerebro. Los residuos
de aminoácido 1-8 (SEC ID NO:34),
26-47 (SEC ID NO:35), 69-91 (SEC ID
NO:36), 114-136 (SEC ID NO:37),
277-297 (SEC ID NO:38 y 313-333
(SEC ID NO:39) comprenden dominios transmembránicos.
El polipéptido flh84g5, una porción
biológicamente activa o fragmento de polipéptido o una variante
alélica del mismo puede tener una o más de las siguientes
actividades flh84g5: 1) puede interactuar con (por ejemplo,
enlazarse con) un ligando flh84g5, como acetilcolina o una molécula
similar a acetilcolina como carnitina; 2) puede interactuar con
(por ejemplo, enlazarse con) una proteína G u otra proteína que
naturalmente se enlaza con flh84g5; 3) puede modular la actividad de
un canal de ión (por ejemplo, un canal de cloruro activado de
calcio o un canal de potasio o calcio); 4) puede modular ión
citosólico, por ejemplo, concentración de calcio; 5) puede modular
la liberación de un neurotransmisor, por ejemplo, acetilcolina o
carnitina, de una neurona, por ejemplo, una neurona presináptica;
6) puede modular una respuesta de ligando flh84g5 en un ligando
flh84g5 receptivo a las células (por ejemplo, una célula de músculo
suave o una célula glandular) para, por ejemplo, afectar de manera
beneficiosa al ligando flh84g5 receptivo a las células, por
ejemplo, una neurona; 7) puede ser un ligando de señal que se
enlaza por medio de movimiento fosfatidilinositol; y 8) puede
modular, por ejemplo, activar o inhibir, la actividad C de
fosfolipasa.
Varios aspectos de la invención se describen con
mayor detalle en las siguientes subsecciones:
Un aspecto de la invención pertenece a las
moléculas de ácido nucleico aisladas que codifican flh84g5 o
porciones biológicamente activas del mismo, así como fragmentos de
ácido nucleico suficientes para usar como sondas de hibridización
para identificar ácido nucleico que codifica flh84g5 (por ejemplo
mARN flh84g5). Como aquí se emplea, el término "molécula de ácido
nucleico" pretende incluir moléculas de ADN (por ejemplo, ADN o
ADN genómico) y moléculas ARN (por ejemplo, mARN) y análogos del
ADN y ARN generados mediante el uso de análogos nucleótidos. La
molécula de ácido nucleico puede ser de único trenzado o de doble
trenzado, pero preferentemente es ADN de doble trenzado. Una
molécula de ácido nucleico "aislada" es aquella que está
separada de la moléculas de ácido nucleico que están presentes en
la fuente natural del ácido nucleico. Preferentemente, un ácido
nucleico "aislado" está libre de secuencias que naturalmente
flanquean el ácido nucleico (es decir, secuencias localizadas en
los extremos 5' y 3' del ácido nucleico) en el ADN genómico del
organismo del cual se deriva el ácido nucleico. Por ejemplo, en
varias realizaciones, la molécula de ácido nucleico aislada flh84g5
puede contener menos que aproximadamente 5 kb, 4 kb, 3 kb, 2 kb, 1
kb, 0.5 kb o 0.1 kb de secuencias nucleótidas que naturalmente
flanquean la molécula de ácido nucleico en ADN genómico de la
célula de la cual se deriva el ácido nucleico (por ejemplo, una
célula hipocampal). Además, una molécula de ácido nucleico
"aislada", como una molécula cADN, puede estar sustancialmente
libre de otro material celular, o medio de cultivo cuando se
produce mediante técnicas recombinantes, o precursores químicos u
otras sustancias químicas cuando se sintetizan químicamente.
Una molécula de ácido nucleicos de la presente
invención, por ejemplo, una molécula de ácido nucleico que tiene la
secuencia nucleótida SEC ID NO:1, 4, o 31, o una porción de la
misma, puede aislarse mediante técnicas estándar de biología
molecular y la información de secuencia aquí descrita. Por ejemplo,
un cADN flh84g5 humano puede aislarse de un biblioteca de hipocampo
humano usando toda o una porción de SEC ID NO:1, 4, o 31 como una
sonda de hibridización y técnicas estándar de hibridización (por
ejemplo, como se describe en Sambrook, J., Fritsh, E.F. y Maniatis,
T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd, ed., Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press,
Cold Spring Harbor, NY, 1989). Además, una molécula de ácido
nucleico que comprende todo y una porción de SEC ID NO:1, 4, o 31
puede aislarse por la reacción de cadena polimerasa usando
imprimadores de oligonucleótidos designados bajo la secuencia de
SEC ID NO:1, 4, o 31. Por ejemplo, mARN puede aislarse de células
del cerebro normales (por ejemplo, mediante el procedimiento de
extracción de guanidina-tiocianato de Chirgwin et
al. (1979) Biochemistry 18: 5294-5299) y se
puede preparar cADN usando transcriptasa inversa (por ejemplo,
Moloney MLV transcriptasa inversa, disponible en Gibco/BRL,
Bethesda, MD; o AMV transcriptasa inversa, disponible en Seikagaku
America Inc., St. Petersburg, FL). Los imprimadores sintéticos de
oligonucleótidos para amplificación PCR pueden diseñarse en base a
la secuencia nucleótida mostrada en SEC ID NO:1, 4, o 31. Un ácido
nucleico de la invención puede amplificarse usando cADN o, de
manera alternativa, ADN genómico, como un imprimador
oligonucleótido de muestra y apropiado para técnicas de
amplificación estándar PCR. El ácido nucleico amplificado puede
clonarse en un vector apropiado y caracterizado por el análisis de
secuencia ADN. Además, los oligonucleótidos correspondientes a la
secuencia nucleótida flh84g5 puede prepararse mediante técnicas
sintéticas estándar, por ejemplo, empleando un sintetizador de ADN
automatizado.
En una realización preferente, una molécula de
ácido nucleico aislada de la invención comprende la secuencia
nucleótida mostrada en SEC ID NO:1, 4, o 31.
La secuencia de SEC ID NO:1 corresponde al cADN
flh84g5 humano. Este cADN comprende secuencias que codifican el
polipéptido humano flh84g5 (es decir "la región codificadora",
de nucleótidos 291 a 1628 de SEC ID NO:1), así como secuencias no
traducidas 5' (nucleótidos 1 a 290 de SEC ID NO:1) y secuencias no
traducidas 3' (nucleótidos 1629 a 2689 de SEC ID NO:1). De manera
alternativa, la molécula de ácido nucleico puede constar sólo de la
región codificadora de SEC ID NO:1 (por ejemplo, nucleótidos 291 a
1628 de SEC ID NO:1, mostrados por separado como SEC ID NO:3). La
secuencia de SEC ID NO:4 corresponde con el cADN flh84g5 de rata.
Este cADN consta de secuencias que codifican el polipéptido de rata
flh84g5 (es decir, "la región codificadora", de nucleótidos
778 a 2112 de SEC ID NO:4), así como secuencias no traducidas 5'
(nucleótidos 1 a 777 de SEC ID NO:4) y secuencias no traducidas 3'
(nucleótidos 2113 a 3244 de SEC: 4). De manera alternativa, la
molécula de ácido nucleico puede constar sólo de la región
codificadora de SEC ID NO:4 (por ejemplo, nucleótidos 778 a 2112 de
SEC ID NO:4, mostrados por separado como SEC ID NO:6). La secuencia
de SEC ID NO:31 corresponde con el cADN flh84g5 de ratón parcial.
Este cADN consta de secuencias que codifican el polipéptido de
ratón parcial flh84g5 (es decir, "la región codificadora", de
nucleótidos 1 a 1089 de SEC ID NO:31) y secuencias no traducidas 3'
(nucleótidos 1090 a 2218 de SEC:31). De manera alternativa, la
molécula de ácido nucleico puede constar sólo de la región parcial
codificadora de SEC ID NO:31 (por ejemplo, nucleótidos 1 a 1089
mostrados por separado como SEC ID
NO:33).
NO:33).
En otra realización preferente, una molécula de
ácido nucleico aislada de la invención comprende molécula de ácido
nucleico que es complementaria de la secuencia de ácido nucleico
mostrada en SEC ID NO:1, 4, o 31.
Una molécula de ácido nucleico que es
complementaria con la secuencia de ácido nucleico mostrada en SEC
ID NO:1, 4, o 31 es aquella que sea lo suficientemente
complementaria con la secuencia nucleótida mostrada en la flh84g5
que pueda hibridizar con la secuencia nucleótida mostrada en SEC ID
NO: 1, 4 o 31, respectivamente, formando de este modo un dúplex
estable.
En otra realización preferente, una molécula de
ácido nucleico aislada de la invención comprende una secuencia
nucleótida que es al menos 95% idéntica a la secuencia nucleótida
mostrada en SEC ID NO: 1, 4 o 31. Preferentemente, tales moléculas
de ácido nucleico codifican variantes alélicas funcionalmente
activas o inactivas de flh84g5. En una realización adicional
preferente, una molécula de ácido nucleico de la invención
comprende una secuencia nucleótida mostrada en SEC ID NO:1, 4, o 31
o la secuencia nucleótida de la inserción de ADN del plásmido
depositado con ATCC® y el Número de Adquisición 98902, o una
porción de cualquiera de estas secuencias nucleótidas.
Con fines ejemplares, una molécula de ácido
nucleico puede comprender sólo una porción de la región
codificadora SEC ID NO: 1, 4 o 31, por ejemplo, un fragmento que
pueda usarse como una sonda o imprimador o un fragmento que
codifique una porción biológicamente activa de flh84g5. La
secuencia nucleótida determinada por la clonación del gen flh84g5
de un mamífero permite la generación de sondas e imprimadores
diseñados para uso de identificación y/o clonación de homólogos
flh84g5 en otros tipos de células, por ejemplo, de otros tejidos,
así como homólogos flh84g5 de otros mamíferos. La sonda o
imprimador normalmente consta de una región de secuencia nucleótida
que hibridiza bajo condiciones astringentes normalmente al menos
aproximadamente 12, preferentemente sobre 25, más preferentemente
sobre 40, 50 o 75 nucleótidos consecutivos de SEC ID NO: 1, 4 o 31,
o mutantes que ocurran naturalmente de los mismos. Los imprimadores
basados en la secuencia nucleótida en SEC ID NO: 1, 4 o 31 puede
usarse en reacciones PCR para clonar homólogas flh84g5. Las sondas
basadas en la secuencia nucleótida flh84g5 pueden usarse para
detectar las secuencias transcriptoras o genómicas que codifican
los mismos polipéptidos homólogos. La sonda puede además comprender
un grupo etiquetado unido, por ejemplo, el grupo de etiqueta puede
ser un radioisotopo, un compuesto fluorescente, una enzima, o un
cofactor de enzima. Tales sondas puede emplearse como una parte del
kit de test de diagnóstico para la identificación de células o
tejido que expresa de manera incorrecta un polipéptido flh84g5,
midiendo un nivel de un ácido nucleico que codifica flh84g5 en una
muestra de células de un sujeto por ejemplo, detectando niveles
mARN flh84g5 o determinando si el gen genómico flh84g5 has sido
mutado o eliminado.
En una realización, la moléculas de ácido
nucleico de la invención codifica un polipéptido o porción del
mismo que incluye una secuencia de aminoácido que es al menos 95%
idéntico a la secuencia de aminoácido entera de SEC ID NO: 2, 5, o
32 de tal modo que el polipéptido o porción del mismo mantiene la
habilidad para modular una respuesta al ligando flh84g5 en una
células sensible al ligando flh84g5 (por ejemplo, variantes que se
dan de manera natural de los polipéptidos de rata y humano flh84g5
aquí descritos).
Porciones de polipéptidos codificados por la
molécula de ácido nucleico flh84g5 de la invención son
preferentemente porciones biológicamente activas del polipéptido
flh84g5. Como aquí se emplea, el término "porción biológicamente
activa del polipéptido flh84g5" pretende incluir una porción,
por ejemplo, un dominio/motivo, de flh84g5 que tiene una o más de
las siguientes actividades flh84g5: 1) puede interactuar con (por
ejemplo, enlazarse con) un ligando flh84g5, como acetilcolina o una
molécula similar a acetilcolina como carnitina; 2) puede
interactuar con (por ejemplo, enlazarse con) una proteína G u otra
proteína que naturalmente se enlaza con flh84g5; 3) puede modular
la actividad de un canal de ión (por ejemplo, un canal de cloruro
activado de calcio o un canal de potasio o calcio); 4) puede
modular ión citosólico, por ejemplo, concentración de calcio; 5)
puede modular la liberación de un neurotransmisor, por ejemplo,
acetilcolina o carnitina, de una neurona, por ejemplo, una neurona
presináptica; 6) puede modular una respuesta de ligando flh84g5 en
un ligando flh84g5 receptivo a las células (por ejemplo, una célula
de músculo suave o una célula glandular) para, por ejemplo, afectar
de manera beneficiosa al ligando flh84g5 receptivo a las células,
por ejemplo, una neurona; 7) puede ser un ligando de señal que se
enlaza por medio de movimiento fosfatidilinositol; y 8) puede
modular, por ejemplo, activar o inhibir, la actividad C de
fosfolipasa.
Ensayos de enlace estándar, por ejemplo,
inmunoprecipitación y ensayos de levadura dos híbrida como aquí se
describen, pueden llevarse a cabo para determinar la habilidad de
un polipéptido flh84g5 o una porción biológicamente activa del
mismo para interactuar (por ejemplo, enlazarse) con una pareja de
enlace como una proteína G. Para determinar si un polipéptido
flh84g5 o una porción biológicamente activa del mismo puede modular
una respuesta al ligando flh84g5 en una célula sensible al ligando
flh84g5, tales células pueden transfectarse con un constructo que
lleve la sobreexpresión del ligando flh84g5 o una porción
biológicamente activa del mismo. Métodos para la preparación de
células sensibles al ligando flh84g5, por ejemplo células de
musculatura lisa o extractos de tales células son conocidos en la
técnica y se describen en Glukhova et al. (1987) Tissue
Cell 19 (5):657-63, Childs et al. (1992)
J. Biol. Chem. 267 (32):22853-9, y White
et al. (1996) J. Biol. Chem. 271
(25):15008-17. Las células pueden posteriormente ser
tratadas con un ligando flh84g5, y un efecto biológico de un
ligando flh84g5 en la células, como movimiento fosfatidilinositol o
concentración de calcio citosólico pueden medirse usando métodos
conocidos en la técnica (ver Hartzell H.C. et al., (1998)
Prog. Biophys. Mol. Biol. 52:165-247.). De
manera alternativa, animales transgénicos, por ejemplo, ratones que
sobreexpresen un polipéptido flh84g5 o una porción biológicamente
activa del mismo pueden usarse. Los tejidos de tales animales puede
obtenerse y tratarse con un ligando flh84g5. Por ejemplo, métodos
para la preparación de conjuntos de fibras musculares de piel de
detergente son conocidos en la técnica (Strauss et al.
(1992) Am. J. Physiol. 262:1437-45). La
capacidad de contraerse de estos tejidos en respuesta a un ligando
flh84g5 puede determinarse usando, por ejemplo, medidas de fuerza
isométrica como se describe en Strauss et al., supra.
De modo similar, para determinar si un polipéptido flh84g5 o una
porción biológicamente activa del mismo puede modular una respuesta
al ligando flh84g5 en una célula sensible al ligando flh84g5, como
una célula glandular, células glandulares, por ejemplo, células
glandularse parótidas crecidas en cultivo de tejido, pueden
transfectarse con un constructo que lleve la sobreexpresión del
ligando flh84g5 o una porción biológicamente activa del mismo. Las
células pueden posteriormente ser tratadas con un ligando flh84g5,
y el efecto del ligando flh84g5 sobre la secreción de amilasa de
tales células puede determinarse usando, por ejemplo, un ensayo
enzimático con un sustrato etiquetado. Los ensayos preferentes para
la actividad flh84g5 se basarán en el movimiento fosfatidilinositol
como aquellos desarrollados para las clases de receptores M1, M3 y
M5 (ver E. Watson et al. The G Protein Linked Receptor.
Facts Book (Academic Press, Boston, MA, 1994).
En una realización, la porción biológicamente
activa de flh84g5 comprende un dominio transmembránico.
Preferentemente, dominio transmembránico está codificado por una
molécula de ácido nucleico derivada de un humano y consta de
residuos de aminoácidos 34-59,
109-130, 152-174,
197-219, o 396-416 de SEC ID NO:2
que se muestran como secuencias separadas designadas SEC ID Nos: 7,
9, 10, 11 y 13, respectivamente, o los dominios transmembránicos de
rata (es decir, residuos de aminoácido 34-59,
109-130, 152-174,
197-219, o 396-416 de SEC ID NO:5
que se muestran como secuencias separadas designadas SEC ID Nos:
14, 15, 16, 17, 18, 19 y 20 respectivamente o, residuos de
aminoácido 1-8, 24-67,
69-91, 114-136,
277-297, 0 313-333 de SEC ID NO:32
que se muestran como secuencias separadas designadas SEC ID Nos:
34, 35, 36, 37, 38, o 39, respectivamente). Más preferentemente, el
dominio transmembránico codificado por la molécula de ácido nucleico
comprende residuos de aminoácido 360-380 de SEC ID
NO:2 que se muestra como una secuencia separada designada SEC ID
NO:12, o residuos de aminoácido 73-91 de SEC ID NO:2
que se muestra como una secuencia separada designada SEC ID NO:8.
En una realización preferente, la porción biológicamente activa del
polipéptido que incluye el dominio transmembránico puede modular la
actividad de la proteína G u otra pareja de enlace en una célula
y/o modula una respuesta de ligando flh84g5 en una célula sensible
al ligando flh84g5, por ejemplo, una célula del cerebro, para
afectar de este modo de manera beneficiosa a la célula. En una
realización preferente, la porción biológicamente activa comprende
un dominio transmembránico del flh84g5 humano como se representa
por los residuos de aminoácido 34-59 (SEC ID NO:
7), 73-91 (SEC ID NO: 8), 109-130
(SEC ID NO: 9), 152-174 (SEC ID NO: 10),
197-219 (SEC ID NO: 11), 360-380
(SEC ID NO: 12), y 396-416 (SEC ID NO: 13), un
dominio transmembránico de flh84g5 de rata de completa longitud
como se representa por los residuos de aminoácido
34-59 (SEC ID NO: 14), 73-91 (SEC
ID NO: 15), 109-130 (SEC ID NO: 16),
152-174 (SEC ID NO: 17), 197-219
(SEC ID NO: 18), 360-380 (SEC ID NO: 19), y
396-416 (SEC ID NO: 20), o un dominio
transmembránico de ratón parcial flh84g5 como se representa por los
residuos de aminoácido 1-8 (SEC ID NO: 34),
26-47 (SEC ID NO: 35), 69-91 (SEC
ID NO: 36), 114-136 (SEC ID NO: 37),
277-297 (SEC ID NO: 38) y 313-333
(SEC ID NO: 39). Los fragmentos adicionales de ácido nucleico que
codifican las porciones biológicamente activas de como se
representan por los residuos de aminoácido 34-59
(SEC ID NO: 14), 73-91 (SEC ID NO: 15),
109-130 (SEC ID NO: 16), 152-174
(SEC ID NO: 17), 197-219 (SEC ID NO: 18),
360-380 (SEC ID NO: 19), y 396-416
(SEC ID NO: 20) pueden prepararse mediante la aislamiento de una
porción de SEC ID NO: 1, 4 o 31, expresando la porción codificada
de polipéptido o péptido flh84g5 (por ejemplo, por expresión
recombinante in vitro) y analizando la actividad de
expresando la porción codificada de polipéptido o péptido
flh84g5.
La invención además comprende las moléculas de
ácido nucleico que difieren de la secuencia de ácido nucleico
mostrada en SEC ID NO: 1, 4 o 31 (y porciones de la misma) debido a
la degeneración del código genético y por lo tanto codifican el
mismo polipéptido flh84g5 como el codificado por la secuencia
nucleótida mostrada en SEC ID NO: 1, 4 o 31. En otra realización,
una molécula de ácido nucleico aislada de la invención tiene la
secuencia nucleótida que codifica un polipéptido que tiene una
secuencia aminoácido mostrada en SEC ID NO: 2, 5 y 32.
Además de la secuencia nucleótida flh84g5
mostrada en SEC ID NO: 1, 4 o 31, aquellos expertos en la técnica
apreciarán que los polimorfismos de la secuencia de ADN que
provocan cambios en la secuencia de aminoácido flh84g5 pueden
existir dentro de una población (por ejemplo, la población humana).
Tal polimorfismo genético en el gen flh84g5 puede existir entre
individuos dentro de una población debido a una variación alélica
natural. Como aquí se emplean, los términos "gen" y "gen
recombinante" se refieren a moléculas de ácido nucleico que
comprenden un marco de lectura abierto que codifica un polipéptido
flh84g5, preferentemente un polipéptido flh84g5 de un mamífero.
Tales variaciones alélicas incluyen tanto variantes alélicas
activas como no activas o variantes alélicas de actividad reducida,
los dos últimos tipos generalmente dando lugar a desórdenes
patológicos. Además, las moléculas de ácido nucleico que codifican
polipéptidos flh84g5 de otras especies tienen una secuencia de
ácido nucleico que difiere de la secuencia humana de SEC ID NO:1.
Las moléculas de ácido nucleico correspondientes a las variantes
alélicas naturales y a los homólogos no humanos de cADN flh84g5
humano de la invención pueden aislarse basándose en su homología
con el ácido nucleico flh84g5 humano aquí descrito empleando el
cADN humano, o una porción del mismo, como una sonda de
hibridización de acuerdo con las técnicas estándar de hibridización
bajo condiciones rigurosas de hibridización.
Como aquí se emplea, el término "hibridización
bajo condiciones rigurosas" pretende describir las condiciones
para hibridización y lavado bajo las cuales las secuencias
nucleótidas al menos 60% homólogas entre sí normalmente permanecen
hibridizadas entre sí. Preferentemente, las condiciones son tales
que las secuencias al menos aproximadamente 65%, más
preferentemente al menos aproximadamente 70%, e incluso más
preferentemente al menos aproximadamente 75% o más homólogas entre
sí normalmente permanecen hibridizadas entre sí. Tales condiciones
rigurosas son conocidas por aquellos expertos en a técnica y pueden
encontrarse en Current Protocols in Molecular Biology, John
Wiley & Sons, N.Y (1989), 6.3.1-6.3.6. Un
ejemplo preferente aunque no limitativo condiciones rigurosas de
hibridización son hibridización por 6X cloruro de sodio/citrato de
sodio (SCC) en aproximadamente 45°C, seguido de uno o más lavados
en 0.2 X SCC, 0.1% SDS en 50-65°C. Preferentemente,
la molécula de ácido nucleico aislada de la invención que hibridiza
bajo condiciones rigurosas a la secuencia de SEC ID NO:1
corresponde con la molécula de ácido nucleico que se da de manera
natural. Como aquí se emplea, una molécula de ácido nucleico "que
se da de manera natural" se refiere a una molécula de ADN o ARN
que tiene una secuencia nucleótida que se da u ocurre en la
naturaleza (por ejemplo, codifica un polipéptido natural). En una
realización, el ácido nucleico codifica un flh84g5 natural
humano.
Además de las variantes alélicas de la secuencia
flh84g5 que ocurren de manera natural que pueden existir en la
población, el experto en la técnica apreciará que se pueden
introducir cambios por mutación en la secuencia nucleótida de SEC
ID NO: 1, 4 o 31, provocando de este modo cambios en la secuencia
de aminoácido del polipéptido flh84g5 codificado, sin alterar la
habilidad funcional del polipéptido flh84g5. Por ejemplo, las
sustituciones nucleótidas que provocan las sustituciones de
aminoácido y residuos de aminoácido no esenciales pueden realizarse
en la secuencia de SEC ID NO: 1, 4, o 31. Un residuo de aminoácido
no esencial es un residuo que puede alterarse de la secuencia de
tipo salvaje de flh84g5 (por ejemplo, la secuencia de SEC ID NO: 2,
5, o 32) sin alterar la actividad de flh84g5, donde un residuo de
aminoácido esencial es necesario para la actividad flh84g5. Por
ejemplo, los residuos aminoácidos conservados, por ejemplo,
aspartatos, prolinas treoninas y tirosinas, en los dominios
transmembránicos de flh84g5 son más importantes para enlazarse con
un ligando flh84g5 y por lo tanto son residuos esenciales de
flh84g5. Otros residuos de aminoácido, sin embargo, (por ejemplo,
aquellas que no están conservadas o
semi-conservadas en el dominio transmembránico)
pueden no ser esenciales para la actividad y por lo tanto son más
dóciles de alteración sin alterar la actividad flh84g5.
Como consecuencia, otro aspecto de la invención
pertenece a moléculas de ácido nucleico que codifican polipéptidos
flh84g5 que contienen cambios en residuos de aminoácido que no son
esenciales para la actividad flh84g5. Tales polipéptidos flh84g5
difieren en secuencia de aminoácido de SEC ID NO: 2, 5 y 32 y
retienen al menos una de las actividades flh84g5 aquí descritas y
comprenden una secuencia nucleótida que codifica un polipéptido,
donde el polipéptido comprende una secuencia de aminoácido al menos
95% idéntica a la secuencia de aminoácido SEC ID NO: 2, 5 o 32.
Para determinar la identidad de porcentaje de
dos secuencias de aminoácido o dos secuencias de ácido nucleico
(por ejemplo, SEC ID NO: 2, 5 o 32 y una forma mutante de la
misma), las secuencias se alinean para fines de comparación óptima
(por ejemplo, se introducen huecos en uno o ambos de un primero y
segundo aminoácido o secuencia de ácido nucleico para alineación
óptima y secuencias no homólogas pueden ignorarse para fines
comparativos). En una realización, la longitud de una secuencia
referencial alineada para fines comparativos es al menos 30%,
preferentemente al menos 40%, más preferentemente al menos 50%,
incluso más preferentemente al menos 60%, e incluso más
preferentemente al menos 70%, 80%, o 90% de la longitud de la
secuencia de referencia (por ejemplo, cuando se alinean una segunda
secuencia con la secuencia de aminoácido flh84g5 de SEC ID NO: 2,
5, o 32, que tiene 177 residuos de aminoácido, al menos 80,
preferentemente al menos 100, más preferentemente al menos 120,
incluso más preferentemente al menos 140, e incluso más
preferentemente al menos 150, 160 o 170 residuos de aminoácido se
alinean). Los residuos de aminoácido o nucleótidos en posiciones de
aminoácido correspondientes o posiciones correspondientes se
comparan a continuación. Cuando una posición en la primera
secuencia se ocupa por el mismo residuo de aminoácido o nucleótido
que la posición correspondiente en la segunda secuencia, a
continuación las moléculas son idénticas en esa posición (como aquí
se emplea "identidad" de aminoácido o ácido nucleico es
equivalente a "homología" de aminoácido o ácido nucleico). La
identidad de porcentaje entre las dos secuencias es una función del
número de posiciones compartidas por las secuencias, teniendo en
cuenta el número de huecos, y la longitud de cada hueco, que
necesitan introducirse para el alineamiento óptimo de las dos
secuencias.
La comparación de las secuencias y determinación
de la identidad de porcentaje entre dos secuencias puede llevarse a
cabo usando un algoritmo matemático. En una realización, la
identidad de porcentaje entre dos secuencias de aminoácido se
determina usando el algoritmo Needleman y Wunsch (J. Mol.
Biol. (48):444-453 (1970)) que se ha incorporado
al programa GAP en el paquete software GCG (disponible en
http:www.geg.com), usando bien una matriz 62 Blossom o una matriz
PAM250, y peso de guceo de 16, 14, 12, 10, 8, 6, o 4 y un peso de
longitud de 1, 2, 3, 4, 5, o 6. En otra realización, la identidad
de porcentaje entre las secuencias nucleótidas se determina usando
el GAP en el paquete software GCG (disponible en http:www.geg.com),
usando un NWSgapdna. La matriz CMP y un peso de hueco de 40, 50,
60, 70, u 80 y un peso de longitud de 1, 2, 3, 4, 5, o 6. En otra
realización, la identidad de porcentaje entre dos secuencias de
aminoácido se determina usando el algoritmo de E. Meyers y W.
Miller (CABIOS, 4:11-17 (1989)) que se ha
incorporado al programa ALIGN (versión 2.0), usando una mesa de
residuo de peso PAM120, un hueco de longitud oculta de 12 y un
hueco oculto de 4.
Las secuencias de proteína y ácido nucleico de
la presente invención pueden además usarse como una "secuencia
pregunta" para llevar a cabo una búsqueda contra las bases de
datos del público para, por ejemplo, identificar otros miembro de
la familia o secuenciar relacionadas. Tales búsquedas pueden
llevarse a cabo usando los programas NBLAST y XBLAST (versión 2.0)
de Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol.
215:403-10. Las búsquedas de nucleótidos BLAST
pueden realizarse con el programa NBLAST, puntuación = 100,
longitud de onda = 12 para obtener secuencias nucleótidas homólogas
para moléculas de ácido nucleico flh84g5 de la invención. Las
búsquedas de proteína BLAST pueden llevarse a cabo con el programa
XBLAST, puntuación = 15, longitud de onda = 3 para obtener
secuencias de aminoácido homólogas para las moléculas de proteína
flh84g5 de la invención. Para obtener alineaciones con huecos para
fines comparativos, puede utilizarse BLAST con huecos como se
describe en Altschul, et al. (1997) Nucleic Acids
Res. 25(17):3389-3402. Cuando se utilizan
los programas BLAST y BLAST con huecos, pueden emplearse los
parámetros de fallo de los respectivos programas (por ejemplo,
XBLAST y NBLAST). Ver http://www.ncbi.nlm.nih.gov.
Una molécula de ácido nucleico que codifica un
polipéptido flh84g5 homólogo al polipéptido de SEC ID NO: 2, 5 o 32
puede crearse introduciendo uno o más sustituciones, adiciones o
eliminaciones de nucleótidos en la secuencia nucleótida SEC ID NO:
1, 4, o 31, respectivamente, de tal modo que una o más
sustituciones, adiciones o eliminaciones de aminoácido se
introduzcan en el polipéptido codificado. Las mutaciones pueden
introducirse en SEC ID NO: 1, 4, o 31 mediante técnicas estándar,
como mutagénesis dirigida al punto y mutagénesis mediada por PCR.
Preferentemente, las sustituciones de aminoácido conservadores se
realizan en uno o más residuos previstos no esenciales de
aminoácido. Una "sustitución de aminoácido conservadora" es
una en al cual el residuo de aminoácido se reemplaza con un residuo
de aminoácido que tiene una cadena similar. Las familias de
residuos de aminoácido que tienen cadenas laterales similares se han
identificado en la técnica. Estas familias incluyen aminoácidos con
cadenas laterales básicas (por ejemplo, lisina, arginina,
histidina), cadenas laterales ácidas (por ejemplo, ácido aspártico,
ácido glutámico), cadenas laterales polares no cargadas (por
ejemplo, glicina, asparagina, glutamina, serina, treonina,
tirosina, cisteina), cadenas laterales no polares (por ejemplo,
alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina,
metionina, triptofan), cadena laterales de rama beta (por ejemplo,
treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (por
ejemplo, tirosina, fenilalanina, triptofan, histidina). Por lo
tanto, un residuo de aminoácido previsto no esencial en flh84g5 es
preferentemente sustituido por otro residuo de aminoácido de la
misma familia de cadena lateral. De manera alternativa, en otra
realización, las mutaciones pueden introducirse de manera
arbitraria a lo largo de todo o parte de la secuencia codificadora
de flh84g5, como por mutagénesis por saturación, y los mutantes
resultantes pueden analizarse para una actividad flh84g5 aquí
descrita para identificar mutantes que retienen actividad flh84g5.
Tras la mutagénesis de SEC ID NO: 1, 4 o 31, el polipéptido
codificado puede expresarse de manera recombinante (por ejemplo,
como se describe en los Ejemplos 3 y 4) y la actividad del
polipéptido puede determinarse usando, por ejemplo, ensayos aquí
descritos.
Además de las moléculas de ácido nucleico que
codifican polipéptidos flh84g5 descritos anteriormente, se
proporcionan moléculas de ácido nucleico antisentido con las
mismas. Un ácido nucleico "antisentido" comprende una
secuencia nucleótida que es complementaria con un ácido nucleico
"sentido" que codifica un polipéptido, por ejemplo,
complementario con el trenzado codificador de la molécula cADN de
doble trenzado complementaria con una secuencia mARN. Como
consecuencia, un ácido nucleico antisentido puede unirse por medio
de hidrógeno a un ácido nucleico sentido. El ácido nucleico
antisentido puede ser complementario a un trenzado completo de
flh84g5, o sólo a una parte del mismo. En una realización, una
molécula de ácido nucleico antisentido es antisentido a una
"región codificadora" del trenzado codificador de una
secuencia nucleótida que codifica flh84g5.
El término "región codificadora" se refiere
a la región de la secuencia nucleótida que comprende codones que se
traducen a residuos de aminoácidos, por ejemplo, la completa región
codificadora de SEC ID NO: 1 comprende nucleótidos 291 a 1628
(mostrados por separado como SEC ID NO:3) y la región codificadora
de SEC ID NO:4 comprende nucleótidos 778 a 2112 (mostrados por
separado como SEC ID NO:6). En otra realización, la molécula de
ácido nucleico antisentido es antisentido para una "región no
codificadora" del trenzado codificador de una secuencia
nucléotida que codifica flh84g5. El término "región no
codificadora" se refiere a secuencias 5' y 3' que flanquean la
región codificadora que no se traduce a aminoácidos (es decir,
también referidas como regiones no traducidas 5' y
3').
3').
Dadas las secuencias trenzadas codificadores que
codifican flh84g5 aquí descritas (es decir, SEC ID NOS: 1, 4, o
31), ácidos nucleicos antisentido de la invención pueden diseñarse
de acuerdo con las normas de emparejamiento de base de Watson y
Crick. La molécula de ácido nucleico puede ser complementaria con
toda la región codificadora de flh84g5 mARN, pero preferiblemente
es un oligonucleótido que es antisentido con sólo una parte de la
región codificadora o no codificadora de flh84g5 mARN. Por ejemplo,
el oligonucleótido antisentido puede ser complementario con la
región que rodea el punto de inicio de translación de flh84g5 mARN.
Un oligonucleótido antisentido puede tener por ejemplo
aproximadamente 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 o 50 nucleótidos
de longitud. Un ácido nucleico antisentido puede construirse usando
síntesis química y reacciones de litigación enzimática mediante
procedimientos conocidos en la técnica. Por ejemplo, un ácido
nucleico antisentido (por ejemplo, un oligonucleótido antisentido)
puede sintetizarse químicamente usando nucleótidos que ocurren de
manera natural o nucleótidos modificados de varias formas diseñados
para aumentar la estabilidad biológica de la moléculas o para
aumentar la estabilidad física del dúplex formado entre los ácidos
nucleicos sentido y antisentido, por ejemplo, derivados
fosforotioato y nucleótidos sustituidos por acridina pueden
emplearse. Ejemplos de nucleótidos modificados que pueden usarse
para generar el ácido nucleico antisentido incluyen
5-fluoroucarcil, 5-bromouracil,
5-clorouracil, 5-iodouracil,
hipoxantina, xantina, 4-acetilcitosina,
5-(carboxihidroximetilo) uracil,
5-carboximetilaminometil-2-tiouridina,
5-carboximetilaminometiluracil, dihirouracil,
beta-D-galctosilqueosina, inosina,
N6-isopenteniladenina,
1-metilguanina, 1-metilinosina,
2,2-dimetilguanina, 2-metiladenina,
2-metilguanina, 3-metilcitosina,
5-metilcitosina, N6-adenina,
7-D-mannosilqueosina,
5'-metilaminometiluracil,
5-metoxilcitosina, N6-adenina,
7-metilguanina,
5-metilaminometiluracil,
5-metoxiaminometil-2-tiouracil,
beta-D-mannosilqueosina,
5'-metoxicarboximetiluracil,
5-metoxiuracil, 2-metiltioqueosina,
2-tiocitosina,
5-metil-2-tiouracil,
2-tiouracil,4-tiouracil,5-metiluracil,
uracil-5-ácido oxiacético metilester,
uracil-5-ácido oxiacético (v),
5-metil-2-tiouracil,
3-(3-amino-3-N-2-carboxipropilo)
uracil, (acp3)w, y 2,6-diaminopurina. De
manera alternativa, el ácido nucleico antisentido puede
introducirse biológicamente usando un vector de expresión en el
cual se haya subclonado un ácido nucleico en una orientación
antisentido (es decir, ARN transcrito del ácido nucleico insertado
será de una orientación antisentido con un ácido nucleico objetivo
de interés, descrito a continuación en la siguiente
subsección).
La molécula de ácido nucleico antisentido se
administra normalmente a un sujeto o se genera in situ de
tal modo que hibridice con o se enlace con mARN celular y/o ADN
genómico que codifica un polipéptido flh84g5 para inhibir de este
modo la expresión del polipéptido, por ejemplo, inhibiendo la
transcripción y/o translación. La hibridización puede ser por
complementariedad de nucleótido convencional para formar un dúplex
estable, o, por ejemplo, en el caso de una molécula de ácido
nucleico antisentido que se enlaza con dúplex de ADN, a través de
interacciones específicas en la ranura principal de la hélice
doble. Un ejemplo de una ruta de administración de una molécula de
ácido nucleico de la invención incluye inyección directa en la zona
del tejido. De manera alternativa, una molécula de ácido nucleico
antisentido puede modificarse para las células objetivo
seleccionadas y luego administrares sistemicamente. Por ejemplo,
para administración sistémica, una molécula antisentido puede
modificarse de tal modo que se enlace específicamente con un
receptor o antígeno expresado sobre una superficie de célula
seleccionada, por ejemplo, por unión de la molécula de ácido
nucleico antisentido con un péptido o anticuerpo que se enlace con
un receptor o antígeno de superficie celular. La molécula de ácido
nucleico antisentido también puede enviarse a células empleando los
vectores aquí descritos. Para conseguir suficientes concentraciones
intracelulares de las moléculas antisentido, los constructos del
vector en los cuales la molécula de ácido nucleico antisentido se
coloca bajo el control de un promotor fuerte pol II o pol III son
preferentes.
Una molécula de ácido nucleico antisentido puede
ser una molécula de ácido nucleico
\alpha-anomérico. Una molécula de ácido nucleico
\alpha-anomérico forma híbridos específicos de
doble trenzado con ARN complementario en el que, en oposición a las
usuales \beta-unidades, los trenzados corren
paralelos entre sí (Gaultier et al. (1987) Nucleic Acids.
Res. 15:6625-6641). La molécula de ácido
nucleico antisentido puede constar un
2'-o-metilribonucleótido (Inoue
et al. (1987) Nucleic Acids. Res.
15:6131-6148) o un análogo quimérico
ARN-ADN (Inoue et al. (1987) FEBS
Lett. 215:327-330).
Una molécula de ácido nucleico antisentido puede
ser un ribozima. Los ribozimas son moléculas catalíticas de ARN con
actividad ribonucleasa que son capaces de partir un ácido nucleico
de trenzado sencillo, como un mARN, con las cuales tienen una
región complementaria. Por lo tanto, ribozimas (por ejemplo,
ribozimas con cabella de martillo (descritos en Haselhoff y Gerlach
(1988) Nature 334:585-591)) pueden emplearse
APRA partir catalíticamente transripciones mARN fih84g5 para
inhibir de este modo la translación de mARN flh84g5. Un ribozima
que tienen especificidad para un ácido nucleico que codifica
flh84g5 puede diseñarse sobre la secuencia nucleótida de un cADN
flh84g5 aquí descrito (es decir SEC ID NO:1, 4, o 31). Por ejemplo,
un derivado de un Tetrahymena L-19 IVS RNA
puede construirse en el cual la secuencia nucleótida de la zona
activa sea complementaria con la secuencia nucleótida a ser partida
en un mARN que codifica flh84g5. Ver, por ejemplo, Cech et
al. Patente US Número 4,987,071 y Cech et al. Patente US
Número 5,116,742. De manera alternativa, mARN flh84g5 puede usarse
para seleccionar un ARN catalítico que tenga una actividad
ribonucleasa específica de un conjunto de moléculas ARN. Ver, por
ejemplo, Bartel, D. y Szostak J. W. (1993) Science
261:1411-1418.
De manera alternativa, la expresión de gen
flh84g5 puede ser inhibida por las secuencias nucleótidas de
selección de objetivo complementarias con la región reguladora del
flh84g5 (por ejemplo, promotor y/o aumentador flh84g5) para formar
triples estructuras helicoidales que previenen la transcripción del
gen flh84g5 en las células objetivo. Ver generalmente, Helene, C.
81991) Anticancer Drug Des.
6(6):569-84, C. et al. (1992) Ann.
N. Y. Acad. Sci 660:27-36; y Maher, L.J. (1992)
Bioassays 14(12):807-15.
Otro aspecto de la invención pertenece a
vectores, preferentemente vectores de expresión, que contienen un
ácido nucleico que codifica flh84g5 (o una porción del mismo). Como
aquí se emplea, el término "vector" se refiere a una molécula
de ácido nucleico capaz de transportar otro ácido nucleico con el
cual se ha unido. Un tipo de vector es un "plásmido", que se
refiere a un curva de ADN de doble trenzado circular en la cual
segmentos de ADN adicionales pueden ligarse. Otro tipo de vector es
un vector viral, donde segmentos de ADN adicionales pueden ligarse
en el genoma viral. Ciertos vectores son capaces de réplicas
autónomas en una célula huésped en la cual ellos se introducen (por
ejemplo, vectores bacteriales que tienen un origen bacterial de
réplica o vectores de mamíferos episomales). Otros vectores (por
ejemplo, vectores de mamíferos no episomales) se integran en el
genoma de la célula huésped tras la introducción en la célula
huésped, y de este modo se replican junto con el genoma huésped.
Además, ciertos vectores son capaces de dirigir la expresión de
genes con los cuales están operativamente unidos. Tales vectores se
refieren aquí como "vectores de expresión". En general, los
vectores de expresión de utilidad en técnicas de ADN recombinante
puede usarse de manera intercambiable como el plásmidos en la forma
más comúnmente usada del vector. Sin embargo, esta invención
pretende incluir tales formas de vectores de expresión, como
vectores virales (por ejemplo, retrovirus de réplica defectiva,
adenovirus y virus asociados a adeno), que sirven con funciones
equivalentes.
Los vectores de expresión recombinante de la
invención comprenden un ácido nucleico de la invención en una forma
adecuada para la expresión del ácido nucleico en una célula
huésped, que significa que los vectores de expresión recombinante
incluyen una o más secuencias reguladoras, seleccionadas en la base
a las células huésped que se usarán para la expresión. Dentro de un
vector de expresión recombinante, "unido operativamente"
pretende significar que la secuencia nucleótida de interés está
unida a la secuencia reguladora de tal manera que permita la
expresión de la secuencia reguladora (por ejemplo, un sistema de
transcripción/translación in vitro o en una célula huésped
cuando el vector se introduce en la célula huésped). El término
"secuencia reguladora" pretende incluir promotores,
aumentadores y otros elementos de control de expresión (por
ejemplo, señales de poliadenilación). Tales secuencias reguladoras
se describen, por ejemplo, en Goeddel; Gene Expression
Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San
Diego, CA (1990). Las secuencias reguladoras incluyen aquellas que
dirigen expresión directa de una secuencia nucleótida en muchos
tipos de célula huésped y aquellas que dirigen expresión de la
secuencia nucleótida sólo en ciertas células huésped (por ejemplo,
secuencias reguladoras específicas de tejido). Aquellos
especializados en la técnica apreciarán que el diseño del vector de
expresión puede depender de muchos factores como la elección de la
célula huésped que se va a transformar, el nivel de expresión del
polipéptido deseado, etc. Los vectores de expresión de la invención
puede introducirse en células huésped para producir de este modo
polipéptido o péptidos, incluyendo polipéptidos o péptidos de
fusión, codificados por ácidos nucleicos aquí descritos (por
ejemplo, polipéptidos flh84g5, formas mutantes de flh84g5,
polipéptidos de fusión y similares).
Los vectores de expresión recombinantes de la
invención pueden diseñarse para la expresión de flh84g5 en células
procarióticas o eucarióticas. Por ejemplo, flh84g5 puede expresarse
en células bacteriales como E. Coli, células de insecto (por
ejemplo, usando vectores de expresión baculovirus) células de
levadura o células de mamífiero. Células huésped adecuadas se
discuten a continuación en Goeddel; Gene Expression Technology:
Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA
(1990). De manera alternativa, el vector de expresión recombinante
puede transcribirse y trasladarse in vitro, por ejemplo
usando secuencias reguladoras promotoras T7 y polimerasa T7.
La expresión de polipéptidos en procariotas se
lleva a menudo a cabo en E. Coli con vectores que contienen
promotores constitutivos o provocables que dirigen la expresión de
los polipéptidos de fusión o no fusión. Los vectores de fusión
añaden un número de aminoácidos a polipéptido aquí codificado,
normalmente al término del amino del polipéptido recombinante.
Tales vectores de fusión normalmente tienen tres fines: 1) aumentar
la expresión de polipéptido recombinante; 2) aumentar la solubilidad
del polipéptido recombinante; y 3) ayudar a la purificación del
polipéptido recombinante actuando como un ligando en purificación
por afinidad. A menudo, en vectores de expresión de fusión, un
punto de partición proteolítica se introduce en la unión de la
molécula de fusión y el polipéptido recombinante para permitir la
separación del polipéptido recombinante de la molécula de fusión
seguido por la purificación del polipéptido de fusión. Tales
enzimas, y sus secuencias de reconocimiento cognado, incluyen
Factor Xa, trombina y enterokinasa. Típicos vectores de expresión
fusión incluyen pGEX (Pharmacia Biotech Inc; Smith, D. B. y
Johnson, K. S. (1998) Gene 67:31-40), pMAL (New
England Biolabs, Beverley, MA) y pRIT5 (Pharmacia, Piscataway, NJ)
que fusionan glutationa S-transferasa (GST),
proteína de enlace maltosa E, o proteína A, respectivamente, con el
polipéptido recombinante objetivo. En una realización, la secuencia
codificadora de flh84g5 se clona en el vector de expresión pGEX
para crear un vector que codifique un polipéptido de fusión que
comprenda, desde la terminal N a la terminal C, partición
GST-trombina punto flh84g5. El polipéptido de
fusión puede purfificarse mediante cromatografía de afinidad usando
resina glutationa-agarosa. flh84g5 recombinante no
fusionado con GST puede recuperarse de la partición del polipéptido
de fusión con trombina.
Ejemplos de vectores adecuados de expresión
E. Coli de no fusión incluyen pTrc (Amann et al.,
(1988) Gene 69:301-315) y pET 11 d (Studier et
al., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology
185, Academic Press, San Diego, California (1990) 60- 89). La
expresión de gen objetivo del vector pTrc se basa en la
transcripción de polimerasa ARN de un promotor híbrido de fusión
trp-lac. La expresión de gen objetivo del vector pET
11d se basa en la transcripción de un promotor de fusión T7
gn10-lac provocado por una polimerasa ARN viral
coexpresada (T7 gn1). Esta polimerasa viral es suministrada por
tensiones del huésped BL21(DE3) o HMS174(DE3) de un
prófago residente \lambda que esconde un gen T7 gnl bajo el
control transcripcional del promotor lacUV 5.
Una estrategia para maximizar la expresión de
polipéptido recombinante en E. Coli es expresar el
polipéptido en una bacteria huésped con una capacidad dañada para
partir proteolíticamente el polipéptido recombinante (Gottesman, S.
Gene Expresión Technology: Methods in Enzymology 185,
Academic Press, San Diego, California (1990)
119-128). Otra estrategia consiste en alterar la
secuencia de ácido nucleico del ácido nucleico que va a insertarse
en un vector de expresión para que los codones individuales de cada
aminoácido sean aquellos que preferentemente se usan en E.
Coli (Wada et al. (1992) Nucleic Acids Res.
20:2111-2118). Tal alteración de las secuencias de
ácido nucleico de la invención pueden llevarse a cabo mediante
técnicas de síntesis de ADN.
En otra realización, el vector de expresión
flh84g5 es un vector de expresión de levadura. Ejemplos de vectores
para expresión en levadura S. cerivisae incluyen pYepSecl
(Baldari, et al., (1987) Embo J.
6:229-234), pMFa (Kurjan y Herskowitz, (1982) Cell
30:933-943), pJRY88 (Schultz et al., (1987)
Gene 54:113-123) y pYES2 (Invitrogen
Corporation, San Diego, CA).
De manera alternativa, flh84g5 puede expresarse
en células de insecto usando, por ejemplo, vectores de expresión
baculovirus. Los vectores baculovirus disponibles para la expresión
de polipéptidos en células de insecto cultivados (por ejemplo,
células Sf 9) incluyen la serie pAc (Smith et al., (1983)
Mol. Cell Biol. 3:2156-2165) y la serie pVL
(Lucklow y Summers (1989) Virology
170:31-39).
En otra realización, un ácido nucleico de la
invención se expresa en células de mamífero usando un vector de
expresión de mamíferos. Ejemplos de vectores de expresión de
mamíferos incluyen p CDM 8 (Seed, B. (1987) Nature 329:840) y p
MTC2PC (Kaufman et al. (1987) EMBO J.
6:187-195). Cuando se usan en células de mamíferos,
las funciones de control de vectores de expresión a menudo se
facilitan por elementos reguladores virales. Por ejemplo, los
promotores comúnmente usados se derivan de polyoma, Adenovirus 2,
citomegalovirus y Simian Virus 40. Para otros sistemas de expresión
adecuadas tanto para células procarióticas como eucarióticas ver
capítulos 16 y 17 de Sambrook, J., Fritsh, E.F., y Maniatis, T.
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd. Ed., Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold
Spring Harbor, NY, 1989.
En otra realización, el vector de expresión
recombinante es capaz de dirigir la expresión del ácido nucleico
preferentemente en un tipo de célula particular (por ejemplo,
elementos reguladores específicos de tejido se usan para expresar
el ácido nucleico). Los elementos reguladores específicos de tejido
se usan son conocidos por aquellos especializados en la técnica.
Ejemplos no limitativos de promotores específicos de tejido
adecuados incluyen el promotor de albúmina (específico del hígado;
Pinkert et al. (1987) Genes Dev.
1:268-277), promotores específicos linfoides (Calame
y Eaton (1988) Adv. Immunol. 43:235-275), en
promotores particulares de receptores celulares T (Winoto y
Baltimore (1989) EMBO J. 8:729-733) e
inmunoglobulinas (Banerji et al. (1983) Cell
33:729-740; Queen y Baltimore (1983) Cell
33:741-748), promotores específicos de neurona (por
ejemplo, el promotor neurofilamento; Byrne y Ruddle (1989)
PNAS 86:5473-5477), promotores específicos
del páncreas (Edlund et al., (1985) Science
230:912-916), y promotores específicos de mamíferos
(por ejemplo, promotor de suero de leche; Patente US Número
4,873,316 y Publicación de Solicitud Europea No. 264,166). Los
promotores regulados en desarrollo también se incluyen, por
ejemplo, promotores de murina hox (Kessel y Gruss (1990)
Science 249:374-379) y el promotor
\alpha-fetoproteína (Campes y Tilghman (1989)
Genes Dev. 3:537-546).
La invención además proporciona un vector de
expresión recombinante que consta de una molécula de ADN de la
invención clonada en el vector de expresión en una orientación
antisentido. Es decir, la molécula de ADN está unida operativamente
con una secuencia reguladora de una manera que permite la expresión
(por transcripción de la molécula ADN) de una molécula ARN que es
antisentido a mARN flh84g5. Pueden elegirse Las secuencias
operativamente reguladoras unidas al ácido nucleico clonado en
orientación antisentido que dirijan la expresión continua de la
molécula antisentido ARN en una variedad de tipos de células, por
ejemplo promotores y/o potenciadores virales, o pueden elegirse
secuencias reguladoras que dirijan expresión específica de tejido
constituyentes o de tipo de célula de ARN antisentido. El vector de
expresión antisentido puede tener la forma de un plásmido
recombinante, fagémido o virus atenuado donde los ácidos nucleicos
se producen bajo el control de una región reguladora de elevada
eficiencia, cuya actividad puede estar determinada por el tipo de
célula en la cual el vector se introduce. Para una discusión de la
regulación de expresión de gen usando genes antisentido ver
Weintraub, H. et al., ARN antisentido como una herramienta
molecular para análisis genético, Reviews - Trends in
Genetics, Vol. (1) 1986.
Otro aspecto de la invención pertenece a las
célula huésped en las cuales un vector de expresión recombinante se
ha introducido. Los términos "célula huésped" y "células
huésped recombinante" se usan aquí de manera intercambiable. Se
entiende que tales términos se refieren no sólo a la célula sujeto
particular sino al progenie o progenie potencial de tal célula.
Debido a que ciertas modificaciones pueden darse en sucesivas
generaciones debido a mutación o a influencias medioambientales,
tal progenie puede que no sea de hecho idéntica a la célula
parental, pero aún así se incluyen en el alcance del término como
aquí se usa.
Una célula huésped puede ser una célula
procariótica o eucariótica. Por ejemplo, un polipéptido flh84g5
puede expresarse en células bacteriales como E. Coli,
células de insecto, células de levadura o mamíferos (como las
células de ovarios de hámster chino (CHO) o células COS). Otras
células huésped adecuadas son conocidas por aquellos expertos en la
técnica.
ADN vector puede introducirse en células
procarióticas o eucarióticas por medio de técnicas convencionales
de transformación o transfección. Como aquí se emplean, los
términos "transformación" y "transfección" pretenden
referirse a una variedad de técnicas para introducir ácido nucleico
exterior (por ejemplo, ADN) en una célula huésped, incluyendo
precipitación de fosfato de calcio o cloruro de calcio,
transfección mediada por DEAE-dextran, lipofección,
y electroporación. Métodos adecuados para transformar o transfectar
células huésped pueden encontrarse en Sambrook, et al.
(Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd. Ed., Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold
Spring Harbor, NY, 1989), y otros manuales de laboratorio.
Para transfección estable de células de
mamíferos, se conoce que, dependiendo del vector de expresión y
técnica de transfección empleada, sólo una pequeña fracción de
células puede integras el ADN externo en su genoma. Con el fin de
identificar y seleccionar estos integrantes, un gen que codifica un
marcador seleccionable (por ejemplo, resistencia a los
antibióticos) generalmente se introduce en células huésped junto
con el gen de interés. Marcadores seleccionables preferentes
incluyen aquellos que confieren resistencia a los fármacos, tales
como G418, higromicina y metotrexato. El ácido nucleico que
codifica un marcador seleccionable puede introducirse en una célula
huésped en el mismo vector que el que codifica flh84g5 o puede
introducirse en un vector separado. Las células establemente
transfectadas con el ácido nucleico introducido pueden
identificarse por selección de fármacos (por ejemplo, células que
han incorporado el gen marcador seleccionable sobrevivirán,
mientras que las otras células morirán).
Una célula huésped de la invención, como una
células huésped procariótica o eucariótica, pueden utilizarse para
producir (es decir, expresar) polipéptido flh84g5. Como
consecuencia, la invención también proporciona métodos para producir
polipéptido flh84g5 usando las células huésped de la invención. En
una realización, el método comprende el cultivo de las células
huésped de la invención (en las cuales el vector de expresión
recombinante que codifica flh84g5 se ha introducido) en un medio
adecuado hasta que flh84g5 se produce. En otra realización, el
método además comprende el aislamiento de flh84g5 del medio o célula
huésped.
Las células huésped de la invención pueden
usarse para producir animales transgénicos no humanos. Los animales
transgénicos no humanos pueden usarse en ensayos de análisis
diseñados para identificar agentes o compuestos, por ejemplo,
fármacos, medicamentos, etc., que son capaces de aliviar los
síntomas perjudiciales o desórdenes seleccionados tales como
desordenes del sistema nervioso, desordenes relacionados con la
musculatura lisa, desordenes relacionados con la musculatura
cardiaca, y desordenes relacionados con las glándulas. Por ejemplo,
en una realización, una célula huésped de la invención es un oocito
fertilizado o una célula madre embrionaria en al cual las secuencias
codificadora flh84g5 se han introducido. Tales células huésped
pueden usarse para crear animales transgénicos no humanos en Toso
cuales las secuencias exógenas flh84g5 se han introducido en su
genoma o animales recombinantes homólogos en los cuales secuencias
endógenas flh84g5 se han alterado. Tales animales son útiles para
el estudio de la función y/o actividad de flh84g5 y para
identificar y/o evaluar los moduladores de actividad flh84g5. como
aquí se emplea un "animal transgénico" es un animal no humano,
preferentemente un mamífero, más preferentemente un roedor como una
rata o un ratón, en el cual una o más células del animal incluyen
un transgen. Otros ejemplos de animales trangénicos incluyen
primates no humanos, ovejas, perros, vacas, cabras, pollos,
anfibios y similares. Un transgen es ADN exógeno que se integra en
el genoma de una célula desde la cual se desarrolla un animal
transgénico y que permanece en el genoma del animal maduro,
dirigiendo de este modo la expresión del producto gen codificado en
uno o más tipos de células o tejidos del animal transgénico. Como
aquí se emplea, un "animal homólogo recombinante" es un animal
no humano, preferentemente un mamífero, más preferentemente un
ratón, en el cual un gen endógeno flh84g5 se ha alterado por
recombinación homóloga entre el gen endógeno y una molécula ADN
exógena introducida en una células del animal, por ejemplo, una
célula embrionaria del animal, antes del desarrollo del animal.
Un animal transgénico puede crearse
introduciendo ácido nucleico que codifica flh84g5 en los pronúcleos
macho de un oocito fertilizado, por ejemplo, por microinyección,
infección retroviral, y permitiendo que el oocito se desarrolle en
un animal hembra pseudoembarazada adoptiva. La secuencia humana
flh84g5 cADN de SEC ID NO:1 puede introducirse como un transgen en
el genoma de un animal no humano. Además, la secuencia de rata
flh84g5 cADN de SEC ID NO:4 puede introducirse como un transgen en
el genoma de un animal diferente a la rata. Además, un homólogo no
humano del gen humano flh84g5, como un gen de ratón flh84g5, puede
aislarse en base a la hibridización del flh84g5 cADN humano o de
rata (descrito con más detalle en la subsección I anteriormente) y
usado como un transgen. Las secuencias intrónicas y señales de
poliadenilazión pueden también incluirse en el transgen para
aumentar la eficiencia de expresión del transgen. Una secuencia
reguladora específica del tejido puede estar operativamente unida
con el transgen flh84g5 para dirigir la expresión de polipéptido
flh84g5 a células particulares. Los métodos para generar animales
transgénicos por medio de manipulación y microinyección de
embriones, en particular animales como ratones, se han vuelto
convencionales en la técnica y se describen, por ejemplo, en
Patentes US Números 4,736,866 y 4,870,009, ambas por Leder et
al, Patente US Número 4,873,191 por Wagner et al., y en
Hogan B., Manipulating the Mouse Embryo, (Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1986). Métodos similares
se usan para la producción de otros animales trangénicos. Un animal
transgénico fundador puede identificarse en base a la presencia del
transgen flh84g5 en su genoma y/o expresión de mARN flh84g5 en
tejidos o células de animales. Un animal transgénico fundador puede
usarse posteriormente para criar animales adicionales que
transporten el transgen. Además, los animales transgénicos que
transportan un gen que codifica flh84g5 pueden además criarse para
otros animales transgénicos que transporten otros transgenes.
Para crear un animal homólogo recombinante, se
prepara un vector que contiene al menos una porción de un gen
flh84g5 en el cual se introducido una eliminación, adición o
sustitución para de ese modo alterar, por ejemplo, interrumpir
funcionalmente, el gen flh84g5. El gen flh84g5 puede ser un gen
humano (por ejemplo, de un clon genómico humano aislado de una
biblioteca genómica humana analizada con el cADN de SEC ID NO:1),
pero más preferentemente, es un gen de rata flh84g5 de SEC ID NO:4
o 31, u otro homólogo no humano de un gen humano flh84g5. Por
ejemplo, un gen de ratón flh84g5 puede aislarse de una biblioteca
ADN genómica de un ratón usando el flh84g5 cADN de SEC ID NO:1, 4 o
31 como una sonda. El gen de ratón flh84g5 puede usarse
posteriormente para construir un vector de recombinación homóloga
adecuado para alterar un gen endógeno flh84g5 en el genoma del
ratón. En una realización preferente, el vector se diseña de tal
modo que, tras la recombinación homóloga, el gen endógeno flh84g5
se interrumpe funcionalmente (es decir, ya no vuelve a codificar
una polipéptido funcional; también referido como un vector "knock
out"). De manera alternativa, el vector puede diseñarse de tal
modo que, tras la recombinación homóloga, el gen endógeno flh84g5
se mute o sino se altere pero que siga codificando polipéptido
funcional (por ejemplo, la región reguladora ascendente puede
alterarse para alterar de este modo la expresión del polipéptido
endógeno flh84g5). En el vector de recombinación homólogo, la
porción alterada del gen flh84g5 se flanquea en sus extremos 5' y
3' por ácido nucleico adicional del gen flh84g5 para permitir que
se ocurra la recombinación homóloga entre el gen exógeno flh84g5
llevado por el vector y un gen endógeno flh84g5 en una célula madre
embrionaria. El ácido nucleico adicional flanqueante flh84g5 es lo
suficientemente largo como para lograr una adecuada recombinación
homóloga al gen endógeno. Normalmente, se incluyen varios kilobases
de ADN flanqueante (en ambos extremos 5' y 3') en el vector (ver
por ejemplo, Thomas, K.R. y Capecchi, M.R. (1987) Cell 51:503 para
una descripción de vectores de recombinación homóloga). El vector
se introduce en una línea celular madre embrionaria (por ejemplo,
mediante electroporación) y se seleccionan las células en las
cuales el gen introducido flh84g5 se ha recombinado homólogamente
con el gen endógeno flh84g5 (ver por ejemplo, Li, E. et al.
(1992) Cell 69:915). Las células seleccionadas se inyectan
posteriormente en un blastocisto de un animal (por ejemplo, un
ratón) para formar quimeras de agregación (ver por ejemplo,
Bradley, A. en Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A
Practical Approach, E.J. Robertson, ed. (IRL, Oxford, 1987) pp.
113-152). Un embrión quimérico puede entonces
transplantarse en un animal hembra pseudoembarazada adoptiva y el
embrión puede llevarse a término. La acción de la progenie de
albergar el ADN homólogamente recombinado en sus células germen
puede usarse para criar animales en los cuales todas las células del
animal contengan el ADN homólogamente recombinado por la
transmisión de línea celular del transgen. Métodos para llevar a
cabo vectores de recombinación homóloga y animales recombinantes
homólogos se describen con más detalle en Bradley, A. (1991)
Current Opinión in Biotechnology 2:823-829 y en
Números de Publicación Internacional PCT WO 90/11354; WO 91/01140;
WO 92/0968; y WO 93/04169.
Los animales transgénicos no humanos pueden
producirse para que contengan sistemas seleccionados que permitan
la expresión regulada del transgen. Un ejemplo de tal sistema es el
sistema recombinasa cre/loxP, ver, por ejemplo, Lakso et
al. (1992) PNAS 89:6232-6236. Otro ejemplo de
sistema recombinasa es el sistema recombinasa FLP de
Saccharomyces cerevisiae (O'Gorman et al. (1991)
Science 251:1351-1355. Si un sistema
cre/loxP se usa para regular la expresión de un transgen,
los animales que contienen transgenes que codifican tanto la
recombinasa Cre como un polipéptido seleccionado son necesarios.
Tales animales pueden facilitarse por medio de la construcción de
animales transgénicos "dobles", por ejemplo, apareándose dos
animales transgénicos, uno conteniendo un transgen codificador de
un polipéptido seleccionado y otro conteniendo un transgen
codificador de una recombinasa.
Clones de animales transgénicos no humanos aquí
descritos también pueden producirse de acuerdo con los métodos
descritos en Wilmut, I. et al. 81997) Nature
385:810-813 y en Números de Publicación
Internacional PCT WO 97/07668 y WO 97/07669. En resumen, una
célula, por ejemplo, una célula somática, del animal transgénico
puede aislarse y provocar que el ciclo de crecimiento salga y la
fase G_{0} entre. La célula inactiva puede entonces fusionarse,
por ejemplo, por medio del uso de pulsos eléctricos, con un oocito
enucleado de un animal de la misma especie de la de la cela
inactiva se aísla. El oocito reconstruido se cultiva a continuación
de tal modo que desarrolle la mórula o blastocisto y luego se
transfiera a un animal hembra pseudoembarazada adoptiva. Las crías
nacidas de este animal hembra adoptiva serán unos clones del animal
del cual la célula, por ejemplo, célula somática, se ha aislado.
Otro aspecto de la invención pertenece a
polipéptidos flh84g5 aislados, y porciones biológicamente activas
de los mismos. La invención también permite que los fragmentos
polipéptidos adecuado para uso como inmunogenes provoquen
anticuerpos anti- flh84g5. Un polipéptido "aislado" o
"purificado" o una porción biológicamente activa del mismo
está sustancialmente libre de material celular cuando se produce
por técnicas de ADN recombinante, o precursores químicos otras
sustancias químicas cuando se sintetizan químicamente. Los términos
"sustancialmente libre de material celular" incluye
preparaciones de polipéptidos flh84g5 en las cuales el polipéptido
está separado de los componentes celulares de las células en los
cuales se produce naturalmente o por recombinación. En una
realización, los términos "sustancialmente libre de material
celular" incluye preparaciones de polipéptidos flh84g5 que
tienen menos de aproximadamente 30% (por peso en seco) de
polipéptidó no flh84g5 (también aquí referido como "polipéptido
contaminante"), más preferentemente menos de aproximadamente 20%
de polipéptido no flh84g5, aún más preferentemente menos de
aproximadamente 10% de polipéptido no flh84g5, y más
preferentemente menos de aproximadamente 5% de polipéptido no
flh84g5. Cuando el polipéptido flh84g5 o una porción biológicamente
activa del mismo se produce por recombinación, es también
sustancialmente libre de medio de cultivo, es decir, el medio de
cultivo representa menos de aproximadamente el 20%, más
preferentemente menos de aproximadamente 10% y más preferentemente
menos de aproximadamente 5% del volumen de la preparación de
polipéptido. Los términos "sustancialmente libre de precursores
químicos u otras sustancias químicas" incluyen preparaciones de
polipéptido flh84g5 en los cuales el polipéptido está separado de
los precursores químicos u otras sustancias químicas que participan
en la síntesis del polipéptido. En una realización, los términos
"sustancialmente libre de precursores químicos u otras sustancias
químicas" incluyen preparaciones de polipéptido flh84g5 que
tienen menos de aproximadamente 30% (por peso en seco) de
precursores químicos o sustancias químicas no flh84g5, más
preferentemente menos de aproximadamente 20% de precursores
químicos o sustancias químicas no flh84g5, aún más preferentemente
menos de aproximadamente 10% de precursores químicos o sustancias
químicas no flh84g5, y más preferentemente menos de aproximadamente
5% precursores químicos o sustancias químicas no flh84g5. En
realizaciones preferentes, los polipéptidos aislados o porciones
biológicamente activas de los mismos carecen de polipéptidos
contaminante del mismo animal del cual el polipéptido flh84g5 se
deriva. Normalmente, tales polipéptidos se producen por expresión
recombinante de, por ejemplo, un polipéptido flh84g5 humano en una
células no humana.
Un polipéptido flh84g5 aislado o una porción
biológicamente activa del mismo de la invención puede modular una
respuesta al ligando flh84g5 en una célula sensible al ligando
flh84g5 o puede ocurrir de manera natural, variante alélica no
funcional de un polipéptido flh84g5. En realizaciones preferentes,
el polipéptido o porción del mismo comprende una secuencia de
aminoácido que es lo suficientemente homóloga a una secuencia de
aminoácido de SEC ID NO: 2, 5, o 32 de tal modo que el polipéptido
o porción del mismo mantenga la habilidad para modular una
respuesta al ligando flh84g5 en una célula sensible al ligando
flh84g5. La porción del polipéptido es preferentemente una poción
biológicamente activa como aquí se describe. En otra realización
preferente, el polipéptido humano flh84g5 (es decir, residuos
aminoácidos 1-398 de SEC ID NO:2) o el polipéptido
de rata flh84g5 (es decir, residuos aminoácidos
1-445 de SEC ID NO:5 o residuos aminoácidos
1-401 de SEC ID NO:32) tiene una secuencia de
aminoácido mostrada en la SEC ID NO:2, 5, o 32, respectivamente, o
una secuencia de aminoácido que se codifica por la secuencia
nucleótida de la inserción de ADN del plásmido depositado con ATCC®
con el Número de Adquisición 98902. En otra realización preferente,
el polipéptido flh84g5 tiene una secuencia de aminoácido que está
codificada por una secuencia nucleótida que hibridiza, por ejemplo,
hibridiza bajo condiciones rigurosas, con la secuencia nucleótida de
la inserción de ADN del plásmido depositado con ATCC® con el
Número de Adquisición 98902. Incluso en otra realización
preferente, el polipéptido flh84g5 tiene una secuencia de
aminoácido que está codificada por una secuencia nucleótida que es
al menos aproximadamente 30-35%, preferentemente al
menos aproximadamente 40-45%, más preferentemente
al menos aproximadamente 50-55%, incluso más
preferentemente al menos aproximadamente 60-65%,
incluso más preferentemente al menos aproximadamente
70-75%, aún más preferentemente al menos
aproximadamente 80-85%, y ya más preferentemente al
menos aproximadamente 90-95% o más homóloga a la
secuencia nucleótida de la inserción de ADN del plásmido depositado
con ATCC® con el Número de Adquisición 98902. Los polipéptidos
preferentes de la presente invención también preferiblemente poseen
al menos una de las actividades flh84g5 aquí descritas. Por
ejemplo, un polipéptido flh84g5 preferente de la presente invención
incluye una secuencia de aminoácido codificada por una secuencia
nucleótida que hibridiza, por ejemplo, hibridiza bajo condiciones
rigurosas, con la secuencia nucleótida de la inserción de ADN del
plásmido depositado con ATCC® con el Número de Adquisición 98902 y
que puede modular una respuesta al ligando modular una respuesta al
ligando flh84g5 en una célula sensible al ligando flh84g5 en una
célula sensible al ligando flh84g5.
En otra realización, el polipéptido flh84g5 es
sustancialmente homólogo a la secuencia de aminoácido SEC ID NO:2,
5, o 32 y retiene la actividad funcional del polipéptido de SEC
ID:2, 5, o 32 e incluso difiere en la secuencia de aminoácido
debido a la variación alélica natural o mutagénesis, como se ha
descrito con detalles en la subsección I anteriormente. Por
consiguiente, el polipéptido flh84g5 es un polipéptido que
comprende una secuencia de aminoácido que es al menos 95% idéntica
a la secuencia completa de aminoácido de SEC ID NO:2, 5, o 32 y que
tiene al menos una de las actividades flh84g5 aquí descritas.
Las porciones biológicamente activas del
polipéptido flh84g5 incluyen péptidos que comprenden secuencias de
aminoácido derivadas de la secuencia de aminoácido del polipéptido
flh84g5, por ejemplo, la secuencia de aminoácido mostrada en SEC ID
NO:2, 5, o 32 o la secuencia de aminoácido de un polipéptido
homólogo al polipéptido flh84g5 o polipéptido de longitud completa
que es homólogo al polipéptido flh84g5, y demuestra al menos una
actividad del polipéptido flh84g5. Normalmente, las porciones
biológicamente activas (péptidos, por ejemplo, péptidos que son,
por ejemplo, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 50, 100
o más aminoácidos en longitud) comprenden un dominio o motivo, por
ejemplo, un dominio transmembránico, con al menos una actividad del
polipéptido flh84g5. Preferentemente, el dominio es un dominio
transmembránico derivado de un humano, representado por SEC ID NO:
7, 8, 9, 10, 11, 12 o 13 o las secuencias de rata correspondientes.
En una realización preferente, la porción biológicamente activa del
polipéptido que incluye el dominio transmembránico puede modular la
activada de una proteína G y/o modular una respuesta al ligando
flh84g5 en una células, por ejemplo, una respuesta sensible al
ligando flh84g5, por ejemplo, una célula del cerebro, para afectar
de este modo de manera beneficiosa la respuesta sensible al ligando
flh84g5. En una realización preferente, la porción biológicamente
activa comprende un dominio transmembránico de flh84g5 como el
representado por los residuos de aminoácido 34-59
(SEC ID NO:7), 73-91 (SEC ID NO:8),
109-130 (SEC ID NO:9), 152-174 (SEC
ID NO:10), 197-219 (SEC ID NO:11),
360-380 (SEC ID NO:12), y 396-416
(SEC ID NO:13), o las secuencias correspondientes de rata mostradas
en SEC ID Nos: 14-20 y 34-39.
Además, las porciones biológicamente activas, donde otras regiones
del polipéptido se eliminan, pueden preparase mediante técnicas de
recombinación y evaluarse para una o más actividades aquí
descritas. Preferentemente, las porciones biológicamente activas
del polipéptido flh84g5 incluyen uno o más de los dominios/motivos
seleccionados o porciones de los mismos que tienen actividad
biológica.
Los polipéptidos flh84g5 se producen
preferentemente por técnicas de ADN recombinante. Por ejemplo, una
molécula de ácido nucleico que codifica el polipéptido se clona en
una vector de expresión (como se ha descrito anteriormente), el
vector de expresión se introduce en una célula huésped (como se ha
descrito anteriormente) y el polipéptido flh84g5 se expresa en la
célula huésped. El polipéptido flh84g5 puede posteriormente
aislarse de las células mediante combinación de purificación
apropiada usando técnicas estándar de purificación de polipéptido.
Alternativas a la expresión recombinante, un polipéptido flh84g5,
proteína, o péptido pueden sintetizarse químicamente usando
técnicas estándar se síntesis de péptido. Además, el polipéptido
nativo flh84g5 puede aislarse de células (por ejemplo, células
hipocampales, células de sustancia negra, o células glandulares
parótidas), por ejemplo usando un anticuerpo
anti-flh84g5 (descrito más adelante).
La invención también proporciona flh84g5
quimérico o polipéptidos de fusión. Como aquí se emplea, un
"polipéptido quimérico" flh84g5, o "polipéptido de
fusión" comprende un polipéptido flh84g5 unido operativamente
con un polipéptido no flh84g5. Un "polipéptido flh84g5" se
refiere a un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácido
correspondiente a flh84g5, mientras que un "polipéptido no
flh84g5" se refiere a un polipéptido heterólogo que tiene una
secuencia de aminoácido correspondiente a un polipéptido que no es
sustancialmente homólogo al polipéptido flh84g5, por ejemplo, un
polipéptido que es diferente del polipéptido flh84g5 y que se
deriva del mismo o de diferente organismo. Dentro del polipéptido
de fusión, el término "operativamente unido" pretende indicar
que el polipéptido flh84g5 y el polipéptido no flh84g5 se fusionan
en estructura entre sí. El polipéptido no flh84g5 puede fusionarse
con la terminal N o la terminal C del polipéptido flh84g5. Por
ejemplo, en una realización el polipéptido de fusión es un
polipéptido de fusión GST en el cual las secuencias flh84g5 se
fusionan con la terminal G de las secuencias GST. Otros tipos de
polipéptidos de fusión incluyen, no se limitan a, polipéptidos de
fusión enzimática, por ejemplo fusiones
beta-galactosidasa, fusiones GAL de levadura
dos-híbridas, fusiones poli His y fusiones Ig.
Tales polipéptidos de fusión, en particular fusiones poli His,
pueden facilitar la purificación de flh84g5 recombinante. En otra
realización, el polipéptido de fusión es un polipéptido flh84g5 que
contienen una secuencia de señal heteróloga en su terminal N. En
ciertas células huésped, (por ejemplo, células huésped de
mamíferos), la expresión y/o secreccion de flh84g5 puede aumentar
por medio del uso de una secuencia de señal heteróloga.
Preferentemente, un flh84g5 quimérico o
polipéptido de fusión de la invención se produce mediante técnicas
estándar de ADN recombinante. Por ejemplo, fragmentos de ADN que
codifican las diferentes secuencias de polipéptido se ligan unidas
en estructura de acuerdo con técnicas convencionales, por ejemplo,
empleando términos con extremos despuntados o extremos que se
balancean para ligadura, restricción de digestión de enzima para
proporcionar los términos apropiados, completando extremos
cohesivos como sea adecuado, tratamiento de fosfatasa alcalina para
evitar la unión indeseable, y ligadura enzimática. En otra
realización, el gen de fusión puede sintetizarse mediante técnicas
convencionales que incluyen sintetizadores de ADN automatizados. De
manera alternativa, la amplificación PCR de los fragmentos de gen
puede llevarse a cabo usando imprimadores de anclaje que ocasionan
salientes complementarios entre dos fragmentos de gen consecutivos
que a continuación pueden templarse y reamplificarse para generar
secuencia de gen quiméricos (ver, por ejemplo, Current Protocols
in Molecular Biology, eds. Ausubel et al. John Wiley
& Sons: 1992). Además, muchos vectores de expresión están
disponibles en el mercado que ya codifican una molécula de fusión
(por ejemplo, un polipéptido GST). Un ácido nucleico que codifica
flh84g5 puede clonarse en tal vector de expresión que la molécula
de fusión se una en estructura con el polipéptido flh84g5.
La presente invención también pertenece a
homólogos a los polipéptidos flh84g5 que funcionan bien como un
agonista (mimético) flh84g5 o un antagonista flh84g5. En una
realización preferente, los agonistas y antagonistas flh84g5
estimulan o inhiben, respectivamente, un subgrupo de actividades
biológicas de la forma que se dan de manera natural del polipéptido
flh84g5. Por lo tanto, los efectos biológicos específicos pueden
obtenerse mediante tratamiento con un homólogo de función
determinada. En una realización, el tratamiento de un sujeto con un
homólogo que tenga un subgrupo de actividades biológicas de la
forma que se dan de manera natural del polipéptido tiene menos
efectos secundarios en un sujeto en relación con el tratamiento con
la forma que se da de manera natural del polipéptido flh84g5.
Los homólogos del polipéptido flh84g5 pueden
generarse por mutagénesis, por ejemplo, mutación de punto discreto
o partición del polipéptido flh84g5. Como aquí se emplea, el
término "homólogo" se refiere a una forma variante del
polipéptido flh84g5 que actúa como un agonista o antagonista de la
actividad del polipéptido flh84g5. Un agonista del polipéptido
flh84g5 puede retener sustancialmente las mismas, o un subgrupo de,
actividades biológicas del polipéptido flh84g5. Un antagonista del
polipéptido flh84g5 puede inhibir una o más actividades de la forma
que se da de manera natural del polipéptido flh84g5, mediante, por
ejemplo, enlace competitivo a un miembro descendente o ascendente
de la cascada flh84g5 que incluye el polipéptido flh84g5. Por lo
tanto, el polipéptido mamífero flh84g5 y homólogos del mismo de la
presente invención pueden ser bien reguladores positivos o
negativos de las respuestas al ligando flh84g5 en las células
sensibles al ligando flh84g5.
En una realización alternativa, homólogos del
polipéptido flh84g5 pueden identificarse analizando bibliotecas
combinatorias de mutantes, por ejemplo, mutantes de partición, del
polipéptido flh84g5 para actividad de polipéptido flh84g5 agonista
o antagonista. En una realización, una biblioteca variada de
variantes de flh84g5 se genera mediante mutagénesis combinatorial
en el nivel de ácido nucleico y se codifica mediante una biblioteca
de gen variado. Una biblioteca variada de variantes flh84g5 puede
producirse por, por ejemplo, enzimáticamente ligando una mezcla de
oligonucleótidos sintéticos en las secuencias de gen de tal modo que
un conjunto degenerado de secuencias potenciales flh84g5 se pueda
expresar en polipéptidos individuales, o de manera alternativa,
como un conjunto de mayor fusión (por ejemplo, para expresión del
fago) que contiene el conjunto de secuencias flh84g5 en el mismo.
Existen una variedad de métodos que pueden usarse para producir
bibliotecas de homólogos flh84g5 a partir de una secuencia
degenerada de oligonucleótido. La síntesis química de una secuencia
degenerada de gen puede llevarse a cabo en un sintetizador de ADN
automatizado, y el gen sintético puede posteriormente ligarse en un
vector de expresión adecuado. El uso de un sete degenerado de genes
permite el suministro, en una mezcla, de todas las secuencias que
codifican el conjunto deseado de secuencias potenciales flh84g5.
Métodos para sintetizar los oligonucleótidos degenerados se conocen
en la técnica (ver, por ejemplo, Narang, S.A. (1983)
Tetrahedron 39:3; Itakura et al. (1984) Annu. Rev.
Biochem. 53:323; Itakura et al. (1984) Science 198:1056;
Ike et al. 81983) Nucleic Acid Res. 11:477).
Además, bibliotecas de fragmentos del
codificador polipéptido flh84g5 pueden usarse para generar una
población variada de fragmentos flh84g5 para análisis y posterior
selección de homólogos de un polipéptido flh84g5. En una
realización, una biblioteca de fragmentos de secuencia codificadora
con una nucleasa bajo condiciones donde el corte sólo se da
aproximadamente una vez por molécula, la desanturalización del ADN
de doble trenzado, renaturalización del ADN para formar ADN de
doble trenzado que pueda incluir parejas sentido/antisentido a
partir de diferentes productos partidos, la retirada de porciones
sencillas trenzadas a partir de dúplex reformados por tratamiento
S1 nucleasa, y la unión de la biblioteca de fragmentos resultante en
un vector de expresión. Mediante este método, una biblioteca de
expresión puede derivarse que codifique terminal N, terminal C y
fragmentos interno de varios tamaños del polipéptido flh84g5.
En el campo se conocen varias técnicas para el
análisis de productos de gen de bibliotecas combinatorias hecha por
mutaciones de punto o partición, y para análisis de bibliotecas
cADN para productos de gen que tienen una propiedad seleccionada.
Tales técnicas son adaptables para análisis rápido de la
bibliotecas de gen generadas por mutagénesis combinatoria de
homólogos flh84g5. Las técnicas más usadas, que son susceptibles a
los análisis de elevado rendimiento, para analizar amplias
bibliotecas de gen normalmente incluyen clonación de biblioteca de
gen en vectores de expresión replicables, transformación de células
apropiadas con la biblioteca resultante de vectores, y expresión de
los genes combinatorios bajo condiciones en las cuales la detección
de una actividad deseada facilitar el aislamiento del vector que
codifica el gen cuyo producto se detectó. La mutagénesis recursiva
de conjunto (REM), una nueva técnica que potencia la frecuencia de
mutantes funcionales en las bibliotecas, puede usarse en
combinación con los ensayos de análisis par identificar homólogos
flh84g5 (Arkin y Yourvan (1992) PNAS 89:7811-7815;
Delgrave et al. (1993) Protein Engineering
6(3)327-331).
En una realización, los ensayos basados en
células pueden aprovecharse para analizar una biblioteca variada de
flh84g5. Por ejemplo, una biblioteca de vectores de expresión puede
transfectarse a una línea celular normalmente sensible al ligando
flh84g5. Las células transfectadas se ponen posteriormente en
contacto con el ligando flh84g5 y el efecto del mutante flh84g5
sobre la señalización por ligando flh84g5 puede detectarse por
ejemplo, por medida de concentración de calcio intracelular. El ADN
plásmido puede recuperarse posteriormente de las células que ganan
para la inhibición, o de manera alternativa, para la potenciación
de inducción de ligando flh84g5, y los clones individuales además
caracterizados.
Un polipéptido aislado flh84g5, o una porción
del mismo, puede usarse como un inmunogen para generar anticuerpos
que enlacen con flh84g5 usando técnicas estándar para la
preparación de anticuerpos monoclonales y policlonales. El
polipéptido de completa longitud flh84g5 puede usarse o, como
alternativa, la invención proporciona fragmentos de péptido
antigénicos de flh84g5 para uso como inmunogenes. El péptido
antigénico de flh84g5 comprende al menos 18 residuos de aminoácido
de la secuencia aminoácido mostrada en SEC ID NO:2, 5, o 32 y
comprende un epítope de flh84g5 de tal modo que un anticuerpo
levantado contra el péptido forma un complejo inmune especifico con
flh84g5. Preferentemente, el péptido antigénico comprende al menos
10 residuos de aminoácido, más preferentemente al menos 15
residuos de aminoácido, incluso más preferentemente al menos 20
residuos de aminoácido, y más preferentemente al menos 30 residuos
de aminoácido. Los epítopes preferentes comprendidos por el péptido
antigénico son las regiones de flh84g5 que están localizadas sobre
la superficie del polipéptido, por ejemplo, regiones
hidrofílicas.
Un inmunogen flh84g5 normalmente se usa para
preparar anticuerpos mediante la inmunización de un sujeto
adecuado, (por ejemplo, conejo, cabra, ratón u otro mamífero) con
un inmunogen. Una preparación inmunogénica apropieada puede
contener, por ejemplo, polipéptido flh84g5 expresado de manera
recombinante o un péptido flh84g5 químicamente sintetizado. La
preparación además incluye un adyuvante, como el adyuvante completo
o incompleto de Freund, o agente inmunoestimulador similar. La
inmunización de un sujeto adecuado con una preparación inmunogénica
flh84g5 provoca una respuesta de anticuerpo policlonal
anti-flh84g5.
Por consiguiente, otro aspecto de la invención
pertenece a anticuerpos anti-flh84g5. El término
"anticuerpo" como aquí se describe se refiere a moléculas de
inmunoglobulina y porciones biológicamente activas de moléculas de
inmunoglobulina, es decir, moléculas que contiene un punto de
enlace antígeno que específicamente se enlaza (inmunoreacciona con)
un antígeno, como flh84g5. Ejemplos de porciones inmunológicamente
activas de moléculas inmunoglobulina incluyen fragmentos
F(ab) y F(ab')_{2} que pueden generarse tratando el
anticuerpo con una enzima como pepsina. La invención proporciona
anticuerpos policlonales y monoclonales que se enlazan con flh84g5.
El término "anticuerpo monoclonal" o "composición de
anticuerpo monoclonal", como aquí se usa, se refiere a la
población de moléculas de anticuerpo que contienen sólo una especie
de punto de enlace antígeno capaz de inmunoreaccionar con un
epítope particular flh84g5. Una composición de anticuerpo
monoclonal por lo tanto expresa una única afinidad de enlace para
un polipéptido particular flh84g5 con el que inmunoreacciona.
Los anticuerpos policlonales anti- flh84g5
pueden prepararse como se ha descrito anteriormente inmunizando un
sujeto adecuado con un inmunogen flh84g5. El título de anticuerpo
anti-flh84g5 en el sujeto inmunizado puede
controlarse durante un periodo de tiempo mediante técnicas
estándar, como con una enzima unida al ensayo inmunosorbente
(ELISA) usando flh84g5 inmovilizado. Si se desea, las moléculas de
anticuerpo dirigidas contra flh84g5 pueden aislarse del mamfero
(por ejemplo, de la sangre) y purificarse posteriormente por
técnicas bien conocidas, como cromatografía de proteína A para
obtener la fracción IgG. En un momento adecuado después de la
inmunización, por ejemplo, cuando los títulos de anticuerpo anti-
flh84g5 están en su punto más elevado, la células que producen
anticuerpos pueden obtenerse a partir del sujeto y usarse para
preparar anticuerpos monoclonales mediante técnicas estándar, como
la técnica de hibridoma originalmente descrita por Kohler y
Milstein (1975) Nature 256:495-497) (ver
también, Brown et al. (1981) J. lmmunol.
127:539-46; Brown et al. (1980) J. Biol.
Chem. 255:4980-83; Yeh et al. (1982)
Int. J. Cancer 29:269-75), la técnica más
reciente de técnica de hibridoma de célula B humana (Kozbor et
al. (1983) Immunol. Today 4:72), la técnica
EBV-hibridoma (Cole et al. (1985),
Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R.I Liss,
Inc., pp-77-96) o técnicas trioma.
La tecnología para la producción de hibridomas de anticuerpo
monoclonal es bien conocida (ver generalmente R.H. Kenneth, in
Monoclonal Antibodies: A New Dimension in Biological Analyses,
Plenum Publishing Corp., New York, New York (1980): E.A. Lerner
(1981) Yale J. Biol. Med., 54:387-402; M.L.
Gefter et al. (1977) Somatic Cell Genet.
3:231-36). En resumen, una línea celular inmortal
(normalmente un mieloma) se fusiona con linfocitos (normalmente
esplenocitos) de un mamífero inmunizado con un inmunogen flh84g5
como se ha descrito anteriormente, y los sobrenadantes del cultivo
de la células hibridoma resultantes se analizan para identificar un
hibridoma que produce un anticuerpo monoclonal que enlaza con
flh84g5.
Cualquiera de los protocolos bien conocidos
empleados para fusionar linfocitos y líneas celulares
inmortalizadas pueden aplicarse con el fin de generar un anticuerpo
monoclonal anti-flh84g5 (ver, por ejemplo, G.Galfre
et al. (1977) Nature 266-55052; Gefter
et al. Somatic Cell Genet., cited supra;
Lerner, Yale J. Biol. Med., cited supra; Kenneth,
Monoclonal Antibodies, cited supra). Además, la
persona especializada en la materia apreciará que existen muchas
variaciones de tales métodos que también pueden ser útiles.
Normalmente, la línea celular inmortal (por ejemplo, una línea
celular mieloma) se deriva de la misma especie de mamífero que los
linfocitos. Por ejemplo, los hibridomas de murina pueden hacerse
fusionando linfocitos de un ratón inmunizado con una preparación
inmunogénica de la presente invención con una línea celular
inmortalizada de ratón. Las líneas celulares inmortales preferentes
son líneas celulares de mieloma de ratón que son sensibles al medio
de cultivo que contiene hipoxantina, aminopterina y timidian
("medio HAT"). Cualquier número de líneas celulares de mieloma
puede usarse como una pareja de fusión de acuerdo con técnicas
estándar, por ejemplo, el
PN3-NS1/1-Ag4-1,
P3-x63-Ag8.653 o
Sp2/O-Ag14 líneas de mieloma. Estas líneas de
mieloma están disponibles en ATCC®. Normalmente, las células de
mieloma de ratón sensibles a HAT se fusionan con espelenocitos de
ratón usando glicol polietileno ("PEG"). Las células de
hibridoma resultantes de la fusión se seleccionan posteriormente
usando el medio HAT, que mata las células no fusionadas y las
fusionadas de manera no productiva (los esplenocitos no fusionados
mueren varios días después debido a que no se transforman). Las
células de hibridoma que producen el anticuerpo monoclonal de la
presente invención se detectan analizando los sobrenadantes del
cultivo de hibridoma para anticuerpos que se enlazan con flh84g5,
por ejemplo, utilizando un ensayo estándar ELISA.
Como alternativa a la preparación de hibridomas
que segregan anticuerpos monoclonales, un anticuerpo monoclonal
anti-flh84g5 puede identificarse y aislarse
analizando una biblioteca de inmunoglobulina combinatoria
recombinante (por ejemplo, una biblioteca de expresión fago
anticuerpo). Kits para generar y analizar bibliotecas de expresión
fago anticuerpo están disponibles en el mercado (por ejemplo, the
Pharmacia Recombinant Phage Antibody System, Catalog No.
27-9400-01, y el Stratatagene
SurZAPTM Phage Display Kit, Catalog No. 240612). Además, ejemplos
de métodos y reagentes particularmente útiles para uso en generar y
analizar biblioteca de expresión de anticuerpo pueden encontrarse
en, por ejemplo, Ladner et al. U.S. Patent No. 5,223,409;
Kang et al., Publicación Internacional PCT, WO 92/18619;
Dower et al. Publicación Internacional PCT, WO 91/17271;
Winter et al. Publicación Internacional PCT, WO 92/20791;
Markland et al. Publicación Internacional PCT, WO 92/15679;
Breitling et al. Publicación Internacional PCT, WO 93/01288;
McCafferty et al. Publicación Internacional PCT, WO
92/01047; Garrard et al. Publicación Internacional PCT, WO
92/09690; Ladner et al. Publicación Internacional PCT, WO
90/0289; Fuchs et al. (1991) Bio/Technology
9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum.
Antibod. Hybridomas 3:81-85; Huse et al.
(1989) Science 246:1275—1281; Griffiths et al. (1993)
EMBO J 12:725-734; Hawkins et al.
(1992) J. Mol. Biol. 226:889-896; Clarkson
et al. (1991) Nature 352:624-628;
Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580;
Garrad et al. (1991) Bio/Technology
9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991)
Nuc. Acid. Res. 19:4133-4137; Barbas et
al. (1991) PNAS 88:7978-7982; y
McCafferty et al. Nature (1990)
348:552-554.
Además, los anticuerpos anti- flh84g5
recombinantes, como anticuerpos monoclonales humanizados y
quiméricos, comprenden tanto porciones humanas como no humanas, que
pueden hacerse utilizando técnicas de ADN recombinante, están
dentro del alcance de la invención. Tales anticuerpos monoclonales
humanizados pueden producirse mediante técnicas de ADN recombinante
conocidas en la técnica, por ejemplo, usando métodos descritos en
Robinson et al. Solicitud Internacional PCT Número
PCT/US86/02269; Akira, et al. Solicitud de Patente Europea
184,187; Taniguchi, M. Solicitud de Patente Europea 171,496;
Morrison et al. Solicitud de Patente Europea 173,494;
Neuberger et al. Publicación Internacional PCT No. WO
86/01533; Cabilly et al. Patente U.S Número 4,816,567;
Cabilly et al, Solicitud de Patente Europea 125,023;
Better et al. (1988) Science
240:1041-1043; Liu et al. (1987) PNAS
84:3439-3443; Liu et al. (1987) J.
Immunol. 139-3521-3526; Sun
et al. (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura
et al. (1987) Canc. Res. 47:999-1005;
Wood et al. (1985) Nature 314:446-449;
y Shaw et al. (1988) J. Natl. Cancer Inst.
80:1553-1559); Morrison, S. L. (1985)
Science 229:1202-1207; Oi et al.
(1986) BioTechniques 4:214; Winter U.S Patent 5,225,539;
Jones et al. (1986) Nature
321:552-525; Verhoeyan et al. (1988)
Science 239:1534; y Beidler et al. (1988) J.
Immunol. 141:4053-4060.
Un anticuerpo anti-flh84g5 (por
ejemplo, anticuerpo monoclonal) puede usarse para aislar flh84g5
mediante técnicas estándar, como cromatografía por afinidad o
inmunoprecipitación. Un anticuerpo anti-flh84g5
puede facilitar la purificación de flh84g5 natural de células y de
flh84g5 producido de manera recombinante expresado en células
huésped. Además, un anticuerpo anti-flh84g5 puede
usarse para detectar polipéptido flh84g5 (por ejemplo, en un lisado
celular o sobrenadante celular) con el fin de evaluar la abundancia
y el patrón de expresión del polipéptido flh84g5 o un fragmento del
polipéptido flh84g5. La detección de fragmentos circulares de un
polipéptido flh84g5 puede usarse para identificar movimiento de
flh84g5 en un sujeto. Los anticuerpos anti-flh84g5
pueden emplearse mediante diagnóstico para controlar los niveles de
polipéptido en tejido como parte de un procedimiento de test
clínico, por ejemplo, para determinar la eficacia de un régimen dado
de tratamiento. La detección puede facilitarse uniendo (por
ejemplo, uniendo físicamente) el anticuerpo con una sustancia
detectable. Ejemplos de sustancias detectables incluyen varias
enzimas, grupos prostéticos, materiales fluorescentes, materiales
luminiscentes, materiales bioluminiscentes, y materiales
radioactivos. Ejemplos de enzimas adecuadas incluyen peroxidasa de
rábano picante, fosfatasa alcalina,
\beta-galactosidasa, o acetilcolinesterasa;
ejemplos de complejos de grupo prostético adecuados incluyen
estreptavidina/biotina y avidina/biotina; ejemplos de materiales
fluorescentes adecuados incluyen umbelliferone, fluoresceína,
fluoresceína isotiocianato, rodamina, diclorotriazinilamina
fluoresceína, cloruro dansil o ficoeritrina; un ejemplo de material
luminiscente incluye luminol; ejemplos de materiales
bioluminiscente incluyen luciferaza, luciferina, y acuorina, y
ejemplos de materiales radioactivos adecuados incluyen ^{125}I,
^{131}I, ^{35}S o
^{3}H.
^{3}H.
Las moléculas de ácido nucleico flh84g5, los
polipéptidos flh84g5 (en particular fragmentos de flh84g5), los
moduladores flh84g5, y anticuerpos anti- flh84g5 (también referidos
aquí como "compuestos activos") de la invención pueden
incorporarse en composiciones farmacéuticas adecuada para la
administración a un sujeto, por ejemplo, un humano. Tales
composiciones normalmente comprende la moléculas de ácido nucleico,
polipéptido, modulador, o anticuerpo y un portador
parmacéuticamente aceptable. Como aquí se emplean, los términos
"portador farmacéuticamente aceptable" pretenden incluir
cualquiera o todos los disolventes, medios de dispersión,
coberturas, agentes antibacterianos y antihongos, agentes
isotónicos y retardantes de absorción, y similares, compatibles con
administración farmacéutica. El uso de tales medios y agentes para
las sustancias farmacéuticamente activas es bien conocido en la
técnica. Excepto en la medida en que el medio o agente convencional
sea compatible con el compuesto activo, tal medio puede usarse en
las composiciones de la invención. Compuestos activos
suplementarios pueden también incorporarse a las composiciones.
Una composición farmacéutica se formula para que
sea compatible con su supuesta ruta de administración. Ejemplos de
rutas de administración incluyen administración parenteral, por
ejemplo, intravenoso, intradérmico, subcutáneo, oral (por ejemplo,
inhalación), transdérmico (tópico), transmucosa, y administración
rectal. Soluciones o suspensiones usadas para aplicación
parenteral, intradérmica, o subcutánea pueden incluir los siguientes
componentes: un diluyente estéril como agua para inyección,
solución salina, aceites fijas, glicoles polietileno, glicerina,
glicol propileno u otros disolventes sintéticos; agentes
antibacterianos como alcohol benzilo o parabenos metilo;
antioxidantes como ácido ascórbico o bisulfito sódico; agentes
quelatantes como ácido etilenediaminetetraacético; búferes como
acetatos, citratos o fosfatos y agentes para el ajuste de tonicidad
como cloruro de sodio y dextrosa. El pH puede ajustarse con ácidos
y bases, como ácido hidroclórico o hidróxido de sodio. La
preparación parenteral puede incluirse en ampolla, jeringuillas
desechables o viales de dosis múltiples hechos de cristal o
plástico.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para
uso inyectable incluyen soluciones acuosas estériles (donde el agua
sea soluble) o dispersiones y polvos estériles para la preparación
extemporánea de soluciones inyectables estériles o dispersión. Para
administración intravenosa, portadores adecuados incluyen salina
fisiológica, agua bacterioestática, Cremophor EL^{TM} (BASF,
Parsippany, NJ) o salina de búfer fosfato (PBS). En todos los casos,
la composición debe ser estéril y debería se fluida hasta el punto
de que se pueda inyectar fácilmente. Debe ser estable bajo
condiciones de fabricación y almacenaje y debe protegerse de
acciones contaminantes y microorganismos como bacterias y hongos.
El portador puede ser un disolvente o medio en dispersión
conteniendo, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo,
glicerol, glicol propileno, y glicol polietileno líquido, y
similares), y mezclas adecuadas de los mismos. La fluidez adecuada
puede mantenerse, por ejemplo, mediante el uso de una capa como
lecitina, por el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en
el caso de dispersión y por el uso de surfactantes. La prevención
de la acción de microorganismos puede lograrse mediante varios
agentes antibacteriano y antihongos, por ejemplo, parabenos,
clorobutanol, fenol, ácido ascórbico, timerosal, y similares. En
muchos casos, resultará preferible incluir agentes isotónicos, por
ejemplo, azúcares, polialcoholes como manitol, sorbitol, cloruro
sódico en la composición. La absorción prolongada de la composición
inyectable puede llevarse a cabo incluyendo en la composición un
agente que retarde la absorción, por ejemplo, monoestearato de
aluminio y gelatina.
Las soluciones inyectables estériles pueden
prepararse incorporando el compuesto activo (por ejemplo, un
polipéptido flh84g5 o anticuerpo anti-flh84g5) en
la cantidad necesaria en un disolvente apropiado con uno o una
combinación de ingredientes de los arriba referenciados, en la
medida que sea necesaria, seguido por esterialización filtrada.
Generalmente, las dispersiones se preparan incorporando el
compuesto activo en un vehículo estéril que contiene un medio de
dispersión básico y los otros ingredientes necesarios de aquellos
anteriormente enumerados. En el caso de polvos estériles para la
preparación de soluciones inyectables estériles, los métodos
preferentes de preparación son el secado por aspiración y
liofilización que produce un polvo de ingrediente activo más
cualquier ingrediente adicional de una solución previamente
filtrada para esterilización del mismo.
Una composición generalmente incluye un
diluyente inerte o un portador comestible. Pueden introducirse en
cápsulas de gelatina o comprimirse en pastillas. Con el fin de
administración oral terapéutica, el compuesto activo puede
incorporarse con excipientes y usarse en forma de pastillas, gotas,
o cápsulas. La composición oral también puede prepararse usando un
portador fluido para uso como un enjuague bucal, donde el compuesto
en el portador fluido se aplica oralmente y se agita, expectora o
traga. Los agentes de enlace farmacéuticamente compatibles, y/o
materiales adyuvantes pueden incluirse como parte de la
composición. Las pastillas, píldoras, cápsulas, gotas y similares
pueden contener cualquiera de los siguientes ingredientes, o
compuestos de una naturaleza similar: un enlace tal como celulosa
microcristalina, goma tragancanto o gelatina; un excipiente como
levadura o lactosa, un agente desintegrador como ácido algínico,
Primogel, o levadura de maíz; un lubricante como estearato de
magnesio o Steorates; un glidante como dióxido de silicona coloidal;
un agente endulzador como sacarosa o sacarina; o un agente
saborizante como menta, metil salicilato, o saborizante de
naranja.
Para la administración por inhalación, los
compuesto se envían en la forma de un spray de aerosol de un envase
o dispensador a presión que contiene un propelante adecuado; por
ejemplo, un gas como dióxido de carbono, o un nebulizador.
La administración sistemática también puede
hacerse por medios transmucosales o transdérmicos. Para
administración transmucosal o transdérmica, penetrantes apropiados
con la barrera para extenderse se emplean en la formulación. Tales
penetrantes generalmente se conocen en la técnica, e incluyen, por
ejemplo, para la administración transmucosal, detergentes, sales
bilis, y ácido fusídico y derivados. La administración transmucosal
puede llevarse a cabo por medio del uso de sprays nasales o
supositorios. Para la administración transdérmico, los compuestos
activos se formulan en pomadas, ungüentos, geles, o cremas como
generalmente se conoce en la técnica.
Los compuestos también pueden prepararse en la
forma de supositorios (por ejemplo, con bases supositorias
convencionales como manteca de cacao y otros glicéridos) o enemas
de retención para envío rectal.
En una realización, los compuestos activos se
preparan con portadores que protegerán el compuesto contra la
eliminación rápida del cuerpo, como una formulación de liberación
controlada, incluyendo implantes y sistemas de envío
microcapsulados. Polímeros biodegradables y biocompatibles pueden
usarse, como acetato de vinilo etileno, polianhídridos, ácido
poliglicólico, colágeno, poliortoésteres, y ácido poliláctico.
Métodos para la preparación de tales formulaciones resultarán
aparentes para aquellos expertos en la técnica. Los materiales
también pueden obtenerse en el mercado de Alza Corporation y Nova
Pharmaceuticals, Inc. Las suspensiones de liposomas (incluyendo
liposomas dirigidos a células infectadas con anticuerpos
moniclonales con antígenos virales) también pueden emplearse como
portadores farmacéuticamente aceptables. Estos métodos pueden
prepararse de acuerdo con los métodos conocidos por aquellos
expertos en la técnica, por ejemplo, como se ha descrito en Patente
U.S Número 4,522,811.
Resulta especialmente ventajoso formular
composiciones orales y parenterales en forma de dosis unidad para
facilitar la administración y uniformidad de la dosis. La forma de
dosis unidad como aquí se emplea se refiere a unidades físicamente
discretas convenidas como dosis unitarias para el sujeto a ser
tratado; cada unidad contiene una cantidad predeterminada de
compuesto activo calculado para producir el efecto terapéutico
deseado en asociación con el portador farmacéutico necesario. La
descripción para las formas de unidad de dosis de la invención se
dictan y son directamente dependientes de las únicas
características de compuesto activo y el efecto terapéutico
particular a lograrse, y las limitaciones inherentes en la técnica
de los compuestos como un compuesto activo para el tratamiento de
individuos.
Las moléculas de ácido nucleico de la invención
pueden insertarse en vectores y usarse como vectores de terapia de
gen. Los vectores de terapia de gen pueden enviarse a un sujeto
mediante, por ejemplo, inyección intravenosa, administración local
(ver Patente U.S 5,328,470) o mediante inyección estereotáctico
(ver, por ejemplo, Chen et al. (1994) PNAS
91:3054-3057). La preparación farmacéutica del
vector de terapia de gen puede incluir el vector de terapia de gen
en diluyente aceptable, o puede comprender una matriz de liberación
lenta en la cual el vehículo de envío de gen está unida. De manera
alternativa, donde el vector de envío de gen completo puede
producirse intacto de células recombinantes, por ejemplo, vectores
retrovirales, la preparación farmacéutica puede incluir una o más
células que producen el sistema de envío de gen.
Las composiciones farmacéuticas pueden incluirse
en un envase, pack, o dispensador junto con instrucciones para la
administración.
Las moléculas de ácido nucleico, polipéptidos,
homólogos de polipéptidos, moduladores, y anticuerpos aquí
descritos pueden usarse en uno o más de los siguientes métodos: a)
ensayos de análisis de fármacos; b) ensayos de diagnóstico
particularmente en identificación de enfermedades, análisis
alélicos y pruebas farmacogenéticas; c) métodos de tratamiento; d)
farmacogenómica; y e) control de efectos durante ensayos clínicos.
Un polipéptido flh84g5 de la invención tiene una o más actividades
aquí descritas y por lo tanto pueden usarse, por ejemplo, para
modular una respuesta de ligando flh84g5 en un célula sensible al
ligando flh84g5, por ejemplo, en enlace con un ligando flh84g5 o
una pareja de enlace flh84g5 haciéndolo no estar disponible para
enlace con el polipéptido naturalmente presente flh84g5. Las
moléculas de ácido nucleico aisladas de la invención pueden usarse
para expresar polipéptido flh84g5 (por ejemplo, por medio de un
vector de expresión recombinante en una célula huésped o en
aplicaciones de terapia de gen), para detectar mutación genética
generada en un gen flh84g5, y para modular actividad flh84g5, como
se describe a continuación. Además, los polipéptidos flh84g5 pueden
usarse para analizar fármacos y componentes que modulan la
actividad del polipéptido flh84g5 así como para tratar desórdenes
caracterizados por la producción insuficiente de polipéptido
flh84g5 o formas de producción de polipéptido flh84g5 que han
disminuido su actividad en comparación con flh84g5 de tipo salvaje.
Además, los anticuerpos flh84g5 de la invención pueden usarse para
detectar y aislar un polipéptido flh84g5, en particular fragmentos
de flh84g5 presentes en una muestra biológica, y para modular
actividad de polipéptido flh84g5.
La invención proporciona métodos para
identificar compuestos o agentes que puede usarse para tratar
desórdenes caracterizados por (o asociados con) expresión anormal o
aberrante de ácido nucleico flh84g5 y/o actividad de polipéptido
flh84g5. Estos métodos también se refieren aquí como ensayos de
análisis de fármacos y normalmente incluyen el paso de analizar un
candidato/compuesto de gen o agentes para que sea un agonista o
antagonista de flh84g5 y específicamente para habilidad de
interactuar con (por ejemplo, enlazarse con) un polipéptido
flh84g5, para modular la interacción de un polipéptido flh84g5 y
una molécula objetivo, y/o para modular la expresión de ácido
nucleico flh84g5 y/o actividad de polipéptido flh84g5. Los
candidatos/compuestos de test o agentes que tienen una o más de
esta habilidades puede usarse como fármacos para tratar desórdentes
caracterizados por expresión anormal o aberrante de ácido nucleico
flh84g5 y/o actividad de polipéptido flh84g5. Los
candidatos/compuestos de test incluyen, por ejemplo, 1) péptidos
tales como péptidos solubles, incluyendo péptidos de fusión de cola
Ig y miembros de bibliotecas de péptido al azar (ver, por ejemplo,
Lam, K.S. et al. (1991) Nature
354:82-84; Houghten, R. et al. (1991)
Nature 354:84-86) y bibliotecas moleculares
derivadas de química combinatoria hechas de aminoácidos de
configuarción D-y/o L-; 2) fosfopéptidos (por
ejemplo, miembro de bibliotecas de fosfopéptidos dirigidos, al azar,
parcialmente degenerados, ver, por ejemplo, Songyang, Z. et
al. (1993) Cell 72:767-778); 3)
anticuerpos (por ejemplo, policlonales, monoclonales, humanizados,
anti-idiotípicos, quiméricos, y anticuerpos de
cadena sencilla, así como Fab, F(ab')_{2}, fragmentos de
biblioteca de expresión Fab, y fragmentos de enlace epítope de
anticuerpos); y 4) moléculas pequeñas orgánicas e inorgánicas (por
ejemplo, moléculas obtenidas de bibliotecas de productos naturales
y combinatorios).
En una realización, la invención proporciona
ensayos para análisis de candidatos/compuestos de test que
interactúa con (por ejemplo, se enlaza con) un polipéptido flh84g5.
Normalmente, los ensayos están basados en células recombinantes o
ensayos libres de células que incluyen los pasos de combinar un
polipéptido flh84g5 o un fragmento bioactivo del mismo, y un
candidato/teste compuesto, por ejemplo, bajo condiciones que
permiten la interacción de (por ejemplo, el enlace con) el
candidato/compuesto de test para el polipéptido flh84g5 o fragmento
del mismo para formar un complejo, y detectar la formación de un
complejo, en el cual la habilidad del compuesto candidato para
interactuar con (por ejemplo, enlazarse con) el polipéptido flh84g5
o fragmento del mismo se indica por la presencia del compuesto
candidato en el complejo. La formación de complejos entre el
polipéptido flh84g5 y el compuesto candidato puede cuantificarse,
por ejemplo, usando inmunoensayos estándar.
En otra realización, la invención proporciona
ensayos de análisis para identificar candidatos/compuestos de test
que modulan (por ejemplo, estimulan o inhiben) la interacción (y
con más posibilidades también actividad flh84g5) entre un
polipéptido flh84g5 y una molécula (molécula objetivo) con la cual
el polipéptido flh84g5 normalmente interactúa. Ejemplos de tales
moléculas objetivo incluyen polipéptidos en la misma ruta de
señalización que el polipéptido flh84g5, por ejemplo, polipéptidos
que pueden funcionar en dirección ascendente (incluyendo tanto
estimuladores como inhibidores de actividad) o en dirección
descendente del polipéptido flh84g5 en, por ejemplo, una ruta de
señalización de función cognitiva o en una ruta que implique
actividad flh84g5, por ejemplo, una proteína G u otro interactivo
implicado en movimiento fosfatidilinositol y/o activación
fosfolipasa C. Normalmente, los ensayos están basados en células
recombinates o son ensayos libres de células que incluyen los pasos
de combinar una célula que expresa un polipéptido flh84g5, o un
fragmento bioactivo del mismo, una molécula objetivo flh84g5 (por
ejemplo, un ligando flh84g5) y un candidato/compuesto de test, por
ejemplo, bajo condiciones en las cuales excepto por la presencia
del compuesto candidato, el polipéptido flh84g5 o la porción
biológicamente activa del mismo interactúa con (por ejemplo, se
enlaza con) la molécula objetivo, y detecta la formación de un
complejo que incluye el polipéptido flh84g5 y la molécula objetivo
o detecta la interacción/reacción del polipéptido flh84g5 y la
molécula objetivo. La detección de la formación del complejo puede
incluir cuantificación directa del complejo mediante, por ejemplo,
la medida de efectos inductivos del polipéptido flh84g5. Un cambio
estadísticamente importante, como un descenso, en la interacción
del flh84g5y la molécula objetivo (por ejemplo, en la formación de
un complejo entre el flh84g5 y la molécula objetivo) en la
presencia de un compuesto candidato (en relación a lo que se
detecta en la ausencia de un compuesto candidato) es indicativo de
la modulación (por ejemplo, estimulación o inhibición) del la
interacción entre el polipéptido flh84g5 y la molécula objetivo. La
modulación de la formación de complejos entre el polipéptido
flh84g5 y la molécula objetivo puede cuantificarse usando, por
ejemplo, inmunoensayos estándar.
Para llevar a cabo los ensayos de análisis de
fármacos libre de células, se desea inmovilizar bien el flh84g5 o
su molécula objetivo para facilitar la separación de complejos de
formas no complejas o de uno o ambos polipéptidos, así como para
acomodar la automatización del ensayo. La interacción (por ejemplo,
el enlace de) de flh84g5 con una molécula objetivo, en la presencia
y ausencia de un compuesto candidato, puede llevarse a cabo en un
vaso adecuado para contener reactantes. Ejemplos de tales vasos
incluyen placas microtítulo, tubos de test, y tubos
micro-centrífugos. En una realización, puede
proporcionarse un polipéptido de fusión que añada un dominio que
permite que el polipéptido se una a una matriz. Por ejemplo,
glutatione-S-transferasa/flh84g5
polipéptidos de fusión pueden absorberse en gotas de glutaniona
sefarosa (Sigma Chemical, St. Louis, MO) o glutaniona que derivó
placas de microtítulo, que se combinan posteriormente con los
lisados celulares (por ejemplo, 35 S-etiquetado) y
el compuesto candidato, y la mezcla incubada bajo condiciones
conductoras para formación de complejo (por ejemplo, en condiciones
fisiológicas para sal y pH). Tras la incubación, las gotas se lavan
para retirar cualquier etiqueta no enlazada, y la matriz inmovilizó
y determinó la radio etiqueta directamente, o en el sobrenadante
después de que los complejos se disasocien. De manear alternativa,
los complejos pueden disasociarse de la matriz, separarse por
SDS-PAGE, y el nivel de polipéptido de enlace
flh84g5 encontrado en la fracción de la gota cuantificada del gel
usando técnicas electroforéticas estándar.
Otra técnicas para inmovilizar polipéptidos o
matrices también pueden usarse en los ensayos de análisis de
fármacos de la invención. Por ejemplo, bien flh84g5 o su molécula
objetivo puede inmovilizarse utilizando la conjugación de biotina y
estreptavidina. Moléculas flh84g5 biotiniladas pueden preparase a
partir de biotina-NHS
(N-hidroxi-sucinimida) usando
técnicas bien conocidas en el campo (por ejemplo, kit de
biotinilización, Pierce Chemicals, Rockford, IL), y se
inmovilizaron en los pozos de placas de 96 pozos cubiertas por
estreptavidina (Pierce Chemical). De manera alternativa, los
anticuerpos reactivos con flh84g5 pero que interfieren con el
enlace del polipéptido o su molécula objetivo pueden derivarse a
los pozos de la placa, y flh84g5 puede quedar atrapado en los pozos
por la conjugación de anticuerpo. Como se ha descrito
anteriormente, las preparaciones de polipéptido de enlace flh84g5 y
un compuesto candidato se incuban en los pozos que presentan
flh84g5 de la placa, y la cantidad de complejo atrapada en el pozo
puede cuantificarse. Los métodos para detectar tales complejos,
además de los descritos anteriormente para los complejos
inmovilizados por GST, incluyen inmunodetección de complejos usando
anticuerpos reactivos con la molécula objetivo flh84g5, o que son
reactivos con el polipéptido flh84g5 y compiten con la molécula
objetivo; así como ensayos relacionados con enzima que se basan en
la detección de una actividad enzimática asociada con la molécula
objetivo.
Incluso en otra realización, la invención
proporciona un método para identificar un compuesto (por ejemplo,
un ensayo de análisis) capaz de usarse en el tratamiento de un
desorden caracterizado por (o asociado con) expresión anormal o
aberrante de ácido nucleico flh84g5 o actividad de polipéptido
flh84g5. Este método normalmente incluye el paso de ensayar la
habilidad del compuesto o agente para modular la expresión del
ácido nucleico flh84g5 o la actividad del polipéptido flh84g5
identificando de este modo un compuesto para el tratamiento de un
desorden caracterizado por la expresión anormal o aberrante de ácido
nucleico flh84g5 o actividad de polipéptido flh84g5. Los desórdenes
caracterizados por la expresión anormal o aberrante de ácido
nucleico flh84g5 o actividad de polipéptido flh84g5 se describen
aquí. Los métodos para ensayar la habilidad del compuesto o agente
para modular la expresión del ácido nucleico flh84g5 o la actividad
del polipéptido flh84g5 son normalmente ensayos basados en células.
Por ejemplo, las células que son sensibles a ligandos que convierte
la señal por medio de una ruta que implica flh84g5 pueden ser
inducidas a sobreexpreasar un polipéptido flh84g5 en la presencia o
ausencia de una compuesto candidato. Los compuestos candidatos que
producen un cambio estadísticamente significativo en respuesta
dependientes de flh84g5 (bien estimulación o inhibición) pueden
identificarse. En una realización, la expresión del ácido nucleico
flh84g5 o actividad de un polipéptido flh84g5 se modula en células y
los efectos de los compuesto candidatos sobre la lectura de interés
(como movimiento de fosfatidilinositol) se miden. Por ejemplo, la
expresión de genes que se regulan hacia arriba o hacia abajo en
respuesta a una señal en cascada dependiente de flh84g5 puede
analizarse. En realizaciones preferentes, las regiones reguladoras
de tales genes, por ejemplo, regiones propulsoras o potenciadoras
flanqueantes, se unen operativamente a un marcador detectable (como
luciferaza) que codifica un producto gen que puede detectarse
fácilmente. La fosforilación de flh84g5 o moléculas objetivo
flh84g5 también pueden medirse, por ejemplo, mediante
inmunoblot.
De manera alternativa, la modulación de
expresión flh84g5 (por ejemplo, compuesto que pueden usarse para
tratar un desorden caracterizado por la expresión anormal o
aberrante de ácido nucleico flh84g5 o actividad de polipéptido
flh84g5) puede identificarse en un método donde una célula está en
contacto con un compuesto candidato y la expresión de flh84g5 mARN
o polipéptido en la célula se determina. El nivel de expresión de
flh84g5 mARN o polipéptido en la presencia del compuesto candidato
se compara con el nivel de expresión de flh84g5 mARN o polipéptido
en la ausencia del compuesto candidato. El compuesto candidato
pueden identificarse posteriormente como un modulador de expresión
de ácido nucleico flh84g5 en base a esta comparación y puede usarse
para tratar un desorden caracterizado por la expresión aberrante de
ácido nucleico flh84g5. Por ejemplo, cuando al expresión de flh84g5
mARN o polipéptido es mayor (estadísticamente significativamente
mayor) en la presencia del compuesto candidato que en su ausencia,
el compuesto candidato se identifica como un estimulador de
expresión de ácido nucleico flh84g5. De manera alternativa, cuando
la expresión de ácido nucleico flh84g5 es menor (estadísticamente
significativamente menor) en la presencia del compuesto candidato
que en su ausencia, el compuesto candidato se identifica como un
inhibidor de expresión de ácido nucleico flh84g5. El nivel de
expresión de ácido nucleico el compuesto candidato se identifica
como un estimulador de expresión de ácido nucleico flh84g5 en las
células puede determinarse mediante métodos aquí descritos para
detectar el compuesto candidato se identifica como un estimulador
de expresión de ácido nucleico flh84g5 mARN o polipéptido.
En otro aspecto de la invención, los
polipéptidos flh84g5, o fragmentos de los mismos, pueden usarse
como "proteínas cebo" en ensayos de dos híbridos (ver, por
ejemplo, Patente US No. 5,283,317; Zervos et al. (1993)
Cell 72:223-232; Madura et al. (1993)
J. Biol. Chem. 268:12046-12054; Bartel et
al. (1993) Biotechniques 14:920-924;
Iwabuchi et al. (1993) Oncogene
8:1693-1696; y Brent WO 94/10300, para identificar
otras proteínas, que se enlazan o interactúan con flh84g5
("proteínas de enlace flh84g5" o
"flh84g5-bp") y modulan actividad de
polipéptido flh84g5. Dichas proteínas de enlace flh84g5 también
tienen más posibilidades de estar implicadas en la propagación de
señales emitidas por los polipéptidos flh84g5 como, por ejemplo,
elementos ascendentes y descendentes de la ruta flh84g5.
El sistema de dos híbridos se basa en la
naturaleza modular de la mayoría de los factores de trascripción,
que consisten en dominios de enlace ADN separable y activación.
Bartel, P. et al. "Using the Two-Hybrid
System to Detect Protein-Protein Interactions" en
Cellular Interactions in Development: A Practical Approach,
Hartley, D.A. ed. (Oxford University Press, Oxford, 1993) pp.
153-179. En resumen, el ensayo utiliza dos
constructos de ADN diferentes. En un construccto, el gen que
codifica flh84g5 se fusiona con u n gen que codifica el dominio de
enlace ADN de una factor de trascripción conocido (por ejemplo,
GAL-4). En el otro constructo, una secuencia de
ADN, de una biblioteca de secuencias ADN, que codifica una proteína
no identificada ("presa" o "muestra") se fusiona con un
gen que codifica el dominio de activación de un factor de
trascripción conocido. Si las proteínas "cebo" y la
"presa" son capaces de interactuar, in vivo, formando
un complejo dependiente de flh84g5, los dominios de enlace de ADN y
de activación del factor de trascripción se acercan en proximidad.
Esta proximidad permite la transcripción de un gen reportero (por
ejemplo, LacZ) que está operativamente unido con un punto regulador
de trascripción sensible al factor de trascripción. La expresión
del gen reportero puede detectarse en colonias celulares que
contiene el factor de trascripción funcional que puede aislarse y
usarse para obtener el gen clonado que codifica la proteína que
interactúa con flh84g5.
Los moduladores de actividad de polipéptido
flh84g5 y/o expresión de ácido nucleico flh84g5 identificadas de
acuerdo con estos ensayos de análisis de fármacos pueden usarse
para tratar, por ejemplo, desórdenes del sistema nervioso,
desórdenes relacionados con la musculatura lisa, desórdenes
relacionados con la musculatura cardiaca, y desórdenes relacionados
con las glándulas. Estos métodos de tratamiento incluyen los pasos
de administrar los moduladores de actividad de polipéptido flh84g5
y/o expresión de ácido nucleico, por ejemplo, en composición
farmacéutica como se ha descrito en la subsección IV anteriormente,
a un sujeto que necesite tal tratamiento, por ejemplo, un sujeto
con un desorden aquí descrito.
La invención además proporciona un método para
la detección de flh84g5, o fragmentos del mismo, en una muestra
biológica. El método incluye el contacto de la muestra biológica con
un compuesto o un agente capaz de detectar polipéptido flh84g5 o
mARN de tal modo que la presencia de flh84g5 se detecte en la
muestra biológica. Un agente preferente para la detección de
flh84g5 mARN es una sonda de ácido nucleico etiquetada o no
etiquetada capaz de hibridizar flh84g5 con mARN. La sonda de ácido
nucleico puede ser, por ejemplo, cADN flh84g5 de completa longitud
de SEC ID NO:1, 4, o 31, o una porción del mismo, como un
oligonucleótido de al menos 15, 30, 50, 100, 250, o 500 nucleótidos
en longitud suficientes como para hibridizar específicamente bajo
condiciones severas con flh84g5 mARN. Un agente preferente para
detectar polipéptido flh84g5 es un anticuerpo etiquetado o no
etiquetado capaz de enlazarse con polipéptido flh84g5. Los
anticuerpos pueden ser policlonales, o más preferentemente,
monoclonales. Un anticuerpo intacto, o un fragmento del mismo (por
ejemplo, Fab o F(ab')_{2}) puede usarse. El término
"etiquetado o etiquetable", con respecto a la sonda o
anticuerpo, pretende englobar el etiquetaje directo de la sonda o
anticuerpo por enlace (por ejemplo, enlace físicamente) una
sustancia detectable con la sonda o anticuerpo, así como etiquetaje
indirecto de la sonda o anticuerpo por reactividad con otro reagente
que está directamente etiquetado. Ejemplos de etiquetaje indirecto
incluye detección de un anticuerpo primario usando un anticuerpo
secundario etiquetado fluorescentemente y etiquetando el extremo de
una sonda de ADN con biotina de tal modo que puede detectarse con
estreptavidina fluorescentemente etiquetada. El término "muestra
biológica" pretende incluir tejidos, células y fluidos
biológicos aislados de un sujeto, así como tejidos, células y
fluidos presentes en un sujeto. Esto es, el método de detección de
la invención puede emplearse para detectar flh84g5 mARN o
polipéptido en una muestra tanto in vitro como in
vivo. Por ejemplo, las técnicas in vitro para la
detección de flh84g5 mARN incluyen hibridizaciones Northern e
hibridizaciones in situ. Las técnicas in vitro para
la detección de polipéptido flh84g5 incluyen ensayos
inmunoabsorbentes unidos a enzima (ELISAs), Western blots,
inmunoprecipitaciones e inmunofluorescencia. De manera alternativa,
el polipéptido flh84g5 puede detectarse in vivo en un sujeto
introduciendo en el sujeto un anticuerpo flh84g5 etiquetado. Por
ejemplo, el anticuerpo puede etiquetarse con un marcador
radioactivo cuya presencia y localización en un sujeto puede
detectarse mediante técnicas estándar de imagen. Particularmente
útiles son los métodos que detectan la variante alélica de flh84g5
expresada en un sujeto y métodos que detectan fragmentos de un
polipéptido flh84g5 en una muestra. La invención también comprende
kits para detectar la presencia de flh84g5 en una muestra
biológica. Por ejemplo, el kit puede comprender un compuesto o
agentes etiquetado o no etiquetado capaz de detectar polipéptido
flh84g5 o mARN en una muestra biológica; medios para determinar la
cantidad de flh84g5 en la muestra; y medios para comparar la
cantidad de flh84g5 en la muestra con un estándar. El compuesto o
agente puede estar empaquetado en un envase adecuado. El kit además
contiene instrucciones para uso del kit para detectar flh84g5 mARN
o polipéptido.
La invención permite que los métodos que pueden
usarse detecten las mutaciones que ocurren de manera natural en un
gen flh84g5, determinando de este modo si el sujeto con el gen
mutado corre riesgo de un desorden caracterizado por expresión
aberrante o anormal de ácido nucleico flh84g5 o actividad de
polipéptido flh84g5 como aquí se describe.
Los métodos incluyen la detección, en una
muestra de células de un sujeto, la presencia o ausencia de una
mutación genética caracterizada por al menos una alteración que
afecta la integridad de un gen que codifica un polipéptido flh84g5,
o la expresión equivocada del gen flh84g5. Por ejemplo, tales
mutaciones genéticas pueden detectarse averiguando o estableciendo
la existencia de al menos uno de 1) una eliminación de uno o más
nucleótidos de un gen flh84g5; 2) una adición de uno o más
nucleótidos de un gen flh84g5; 3) una sustitución de uno o más
nucleótidos de un gen flh84g5; 4) una recolocación de cromosomas de
un gen flh84g5; 5) una alteración en el nivel de una trascripción
mensajera ARN de un gen flh84g5; 6) modificación aberrante de un
gen flh84g5, como de un patrón de metilación de ADN genómico, 7) la
presencia de un patrón de escisión de tipo no salvaje de una
trascripción mensajera de ARN de un gen flh84g5, 8) un nivel de
tipo no salvaje de un polipéptido flh84g5, 9) pérdida alélica de un
gen flh84g5, y 10) modificación post-traslacional
inapropiada de un polipéptido flh84g5. Como aquí se describe,
existen un gran número de técnicas de ensayo conocidas en el campo
que pueden usarse para detectar mutaciones en un gen flh84g5.
En ciertas realizaciones, la detección de un
mutante incluye el uso de una sonda/imprimador en una reacción en
cadena de polimerasa (PCR) (ver, por ejemplo, Patente US Nos.
4,683,195 y 4,683,202), como un ancla PCR o RACE PCR, o, de manera
alternativa, en una reacción en cadena de litigación (LCR) (ver, por
ejemplo, Landegran et al. (1988) Science
241:1077-1080; y Nakazawa et al. (1994)
PNAS 91:360-364), y éste último puede ser
particularmente útil para detectar mutaciones de punto en el gen
flh84g5 (ver Abravaya et al. (1995) Nucleic Acids Res.
23:675-682). Este método puede incluir los pasos de
recoger una muestra de células de un paciente, aislar el ácido
nucleico (por ejemplo, genómico, mARN o ambos) de las células de la
muestra, poneer en contacto la muestra de ácido nucleico con uno o
más imprimadores que específicamente hibridizan con un gen flh84g5
bajo tales condiciones que la hibridización y amplificación del gen
flh84g5 (si esta presente) se da, y la detecta la presencia o
ausencia de un producto de amplificación, o detecta el tamaño del
producto de amplificación y compara la longitud con una muestra
de
control.
control.
En una realización alternativa, las mutaciones
en un gen flh84g5 de una célula muestra pueden identificarse
mediante alteraciones en patrones de segmentación de restricción de
enzimas. Por ejemplo, el ADN de la muestra y control se aísla, se
amplifica (opcionalmente), se digiere con una o más edonucleasas de
restricción, y los tamaños de longitud de fragmentos de determinan
mediante electroforesis de gel y se comparan. Las diferencias en
los tamaños de longitud de fragmento entre la muestra y el control
ADN indica las mutaciones en la muestra de ADN. Además, el uso de
ribozimas específicos de sencuencias (ver, por ejemplo, Patente US
No. 5,498,531) pueden usarase para marcar la presencia de
mutaciones específicas por el desarrollo o pérdida de un punto de
segmentación de ribozima.
En otra realización, cualquier variedad de
relaciones secuenciales conocida en la técnica puede usarse para
secuenciar directamente el gen flh84g5 y detectar mutaciones
mediante la comparación de la secuencia e la muestra flh84g5 con la
correspondiente secuencia (control) de tipo salvaje. Ejemplos de
relaciones secuenciales incluyen aquellas basadas en la técnicas
desarrolladas por Maxim y Gilbert ((1977) PNAS 74:560) o
Sanger ((1977) PNAS 74:5463). Una variedad de procedimientos
secuenciales automatizados pueden utilizarse cuando se llevan a
cabo ensayos de diagnóstico ((1995) Biotechniques 19:448),
incluyendo secuencias por espectometría de masa (ver, por ejemplo,
Publicación Internacional PCT No. WO 94/16101; Cohen et al.
(1996) Adv. Chormatogr. 36:127-162; y Griffin
et al. (1993) Appl. Biochem. Biotechnol.
38:147-159).
Otros métodos para la detección de mutaciones en
el gen flh84g5 incluyen métodos en los cuales la protección de
agentes de segmentación se usa para detectar bases mal emparejadas
en dúplex ARN/ARN o ARN/ADN (Myers et al. (1985)
Science 230:1242); Cotton et al. (1988) PNAS
85:4397; Saleeba et al. (1992) Meth. Enzymol.
217:286-295), movilidad electroforética ácido
nucleico mutante y de tipo salvaje se compara (Orita et al.
(1989) PNAS 86:2766; Cotton (1993) Mutat Res
285:125-144; y Hayashi (1992) Genet Anal Tech
Appl 9:73-79), y movimiento de fragmentos
mutantes o de tipo salvaje en geles de poliacrilamida que contienen
un gradiente denaturante se ensaya usando electroforesis de gel
gradiente denaturante (Myers et al. (1985) Science
313:495). Ejemplos de otras técnicas para detectar mutaciones de
punto incluyen, hibridización de oligonucleótido selectiva,
amplificación selectiva, y extensión de imprimador selectiva.
En otro aspecto la invención permite métodos
para el tratamiento de un sujeto, por ejemplo, un humano, que tiene
una enfermedad o desorden caracterizado por (o asociado con)
expresión aberrante o anormal de ácido nucleico flh84g5 y/o
actividad de polipéptido flh84g5. Estos métodos incluyen la
administración de un modulador flh84g5 (agonista o antagonista) al
sujeto de tal modo que el tratamiento tenga lugar. Los términos
"expresión aberrante o anormal de flh84g5" se refiere a la
expresión de un polipéptido flh84g5 de tipo no salvaje de actividad
flh84g5. Cuando el polipéptido flh84g5 está implicado en una ruta
que incluye liberación de modulación del neurotransmisor, por
ejemplo, acetilcolina o una molécula similar a la acetilcolina como
cranitina; modulación de contracción de musculatura lisa, por
ejemplo, función glandular exocrina, actividad o expresión
aberrante o anormal de flh84g5 interfiere con el neurotransmisor,
por ejemplo, acetilcolina o una molécula similar a la acetilcolina
como cranitina; musculatura lisa normal; y contracción de
musculatura cardiaca; y gándula normal, por ejemplo, función
glandular exocrina. Ejemplos no limitativos de desórdenes o
enfermedades caracterizadas por o asociadas con actividad o
expresión aberrante o anormal de flh84g5 incluyen desórdenes
relacionados con el sistema nervioso; por ejemplo, desórdenes
relacionados con el sistema nervioso central. Ejemplos de
desórdenes relacionados con el sistema nervioso incluyen desórdenes
cognitivos, por ejemplo, desordenes de la memoria y aprendizaje,
como amnesia, apraxia, agnosia, disnomia amnésica, desorientación
espacial amnésica, síndrome Kluver-Bucy, pérdida de
memoria relacionada con el Alzheimer (Eglen R.M. (1996)
Pharmacol. And Toxicol. 78(2):59-68;
Perry E.K. (1995) Brain and Cognition
28(3):240-58) y pérdida de habilidad para el
aprendizaje; desordenes que afectan la consciencia, por ejemplo,
alucinaciones visuales, alteraciones perceptuales, o delirio
asociado con la demencia corporal Lewy; desordenes
esquizo-efectivos (Dean B. (1996) Mol.
Psychiatry 1(1):54-8), esquizofrenia con
cambios de humor (Bymaster F.P. (1997) J. Clin. Psychiatry 58
(suppl.10):28-36; Yeomans J.S. (1995)
Neurophamacol. 12(1):3-16; Reimann D.
(1994) J. Psychiatric Res.
28(3):195-210), enfermedad depresiva
(primaria o secundaria); desordenes afectivos (Janowsky D.S. (1994)
Am. J. Med. Genetics 54(4):335-44);
desordenes del sueño (Kimura F. (1997) J. Neurophysiol.
77(2): 709-16), por ejemplo, anormalidades
en el sueño REM en pacientes que sufren, por ejemplo, depresiones
Reimann D. (1994) J. Psychiatric Res. 38 Suppl.
1:15-25; Bourgin P. (1995) Neuroreport
6(3):415-23), insominio, y anormalidades en
la temperatura corporal o depresión respiratoria durante el sueño
(Suman S.L (1995) Am. J. Physiol. 269 (2 Pt 2):
R308-17; Mallick B.N. (1997) Brain Res. 750
(1-2):311-7). Otros ejemplos de
desordenes relacionados con el sistema nerviosos incluyen
desordenes relacionados con los mecanismos de generación de miedo,
por ejemplo, miedo relacionado con el síndrome del intestino
irritable (Mitch C.H. (1997) J. Med. Chem.
40(4):538-46; Shannon H.E. (1997) J.
Pharmac. And Exp. Therapeutics
281(2):884-94; Bouaziz H. (1995)
Anesthesia and Analgesia
80(6):1140-4; o Guimaraes A.P. 81994)
Brain Res. 647(2):220-30) o dolor en
el pecho; desordenes motrices (Monassi C.R. (1997) Physiol. And
Behav. 62(1):53-9), por ejemplo,
desordenes motrices relacionados con la enfermedad de Parkinson
(Finn M. (1997) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
57(1-2):243-9; Mayorga A.J.
(1997) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
56(2):273-9); desordenes alimenticios, por
ejemplo, obesidad relacionada con la hipersecreción de insulina
(Macario M. (1997) J. Endocrinol. Invest.
20(1):8-12; Premawardhana L. D. 81994)
Clin. Endocrinol. 40(5):617-21); o
desordenes con las bebidas, por ejemplo, polidipsia diabética
(Murzi E. (1997) Brain Res.
752(1-2):184-8); Yang X.
(1994) Pharmacol. Biochem. & Behaviour
49(1):1-6). Aún más ejemplos de desórdenes o
enfermedades caracterizadas por o asociadas con la actividad o
expresión aberrante o anormal de flh84g5 incluyen desordenes
relacionados con la musculatura lisa como síndrome del intestino
irritable, enfermedad diverticular, incontinencia urinaria,
acalasia esofágica, o enfermedad de obstrucción de las vías
respiratorias crónica; desordenes relacionados con la musculatura
del corazón, como bradicardia patológica o taquicardia, arritmia,
palpitación o fibrilación; o desordenes relacionados con las
glándulas tales como xerostomia, diabetes mellitus. Los términos
"tratar" o "tratamiento" como aquí se emplean, se
refieren a la reducción o disminución de al menos un efecto o
síntoma adverso de un desorden o enfermedad, por ejemplo, desorden
o enfermedad caracterizada por o asociada con la actividad o
expresión aberrante o anormal de flh84g5.
Como aquí se emplea, un modulador flh84g5 es una
molécula que puede modular expresión de ácido nucleico flh84g5 y/o
actividad de polipéptido flh84g5. Por ejemplo, una modulador
flh84g5 puede modular, por ejemplo, regular por incremento
(activar/agonizar) o regular por disminuación
(suprimir/antagonizar), expresión de ácido nucleico flh84g5. En
otro ejemplo, un modulador flh84g5 puede modular (por ejemplo,
estimular/agonizar o inhibir/antagonizar) actividad de polipéptido
flh84g5. Si se desea tratar un desorden o enfermedad caracterizado
por (o asociado con) expresión aberrante o anormal de ácido
nucleico flh84g5 y/o actividad de polipéptido flh84g5 inhibiendo la
expresión de ácido nucleico flh84g5, un modulador flh84g5 puede ser
una molécula antisentido, por ejemplo, un ribozima, como aquí se
describe. Ejemplos de moléculas antisentido que pueden usarse para
inhibir expresión de ácido nucleico flh84g5 incluyen moléculas
antisentido que son complementarias con una porción de la región no
traducida 5' de SEC ID NO: 1 que también incluye el codón de inicio
y moléculas antisentido que son complementarias con una porción de
la región no traducida 3' de SEC ID NO: 1, 4 o 31. Un ejemplo de
molécula antisentido que es complementaria con una porción de la
región no traducida 5' de SEC ID NO: 1 y que también incluye el
codón de inicio es una molécula de ácido nucleico que incluye
nucleótidos que son complementarios con los nucleótidos 280 a 296
de SEC ID NO:1. Esta molécula antisentido tiene la siguiente
secuencia nucleótida: 5' CCTGCGGGGCCATGGAG 3' (SEC ID NO:21). Un
ejemplo de una molécula antisentido que es complementaria con una
porción de la región no traducida 3' de SEC ID NO: 1 es una
molécula de ácido nucleico que incluye nucleótidos que son
complementarios con los nucleótidos 1629 a 1645 de SEC ID NO:1.
Esta molécula antisentido tiene la siguiente secuencia: 5'
GTGGCCCACCAGAGCCT 3' (SEC ID NO:22). Un ejemplo adicional de una
molécula antisentido que es complementaria con una porción de la
región no traducida 3' de SEC ID NO: 1 es una molécula de ácido
nucleico que incluye nucleótidos que son complementarios con los
nucleótidos 1650 a 1666 de SEC ID NO:1. Esta molécula antisentido
tiene la siguiente secuencia: 5' CAGCCACGCCTCTCTCA 3' (SEQ ID
NO:23). Un ejemplo de una molécula antisentido que es
complementaria con una porción de la región no traducida 5' de SEC
ID NO: 4 y que también incluye el codón de inicio es una molécula
de ácido nucleico que incluye nucleótidos que son complementarios
con los nucleótidos 766 a 783 de SEC ID NO:4. Esta molécula
antisentido tiene la siguiente secuencia nucleótida: 5'
GCCTGCTGGGCCATGGAG 3' (SEC ID NO:24). Un ejemplo de una molécula
antisentido que es complementaria con una porción de la región no
traducida 3' de SEC ID NO: 4 es una molécula de ácido nucleico que
incluye nucleótidos que son complementarios con los nucleótidos
2113 a 2128 de SEC ID NO:4. Esta molécula antisentido tiene la
siguiente secuencia: 5' TGAGCAGCTGCCCCAC 3' (SEC ID NO:25). Un
ejemplo adicional de una molécula antisentido que es complementaria
con una porción de la región no traducida 3' de SEC ID NO: 4 es una
molécula de ácido nucleico que incluye nucleótidos que son
complementarios con los nucleótidos 2133 a 2148 de SEC ID NO:4.
Esta molécula antisentido tiene la siguiente secuencia: 5'
CTGAGGCCAGGCCCTT 3' (SEQ ID NO:26).
Un modulador flh84g5 que inhibe expresión de
ácido nucleico flh84g5 puede ser también una molécula pequeña u
otro fármaco, por ejemplo, una molécula pequeña o fármaco
identificado usando los ensayos de análisis aquí descritos, que
inhibe la expresión de ácido nucleico flh84g5. Si se desea tratar
una enfermedad o desorden caracterizado por (o asociado con)
expresión aberrante o anormal (no de tipo salvaje) de ácido
nucleico flh84g5 y/o actividad de polipéptido flh84g5 estimulando la
expresión de ácido nucleico flh84g5, un modulador flh84g5 puede
ser, por ejemplo, una molécula de ácido nucleico que codifica
flh84g5 (por ejemplo, una molécula de ácido nucleico que comprende
una secuencia nucleótida homóloga a la secuencia nucleótida de SEC
ID NO:1, 4, o 31) o una pequeña molécula u otro fármaco, por
ejemplo, una molécula pequeña (péptido) o fármaco identificado
usando los ensayos de análisis aquí descritos, que estimula la
expresión de ácido nucleico flh84g5.
De manera alternativa, si se desea tratar una
enfermedad o desorden caracterizado por (o asociado con) expresión
aberrante o anormal (no de tipo salvaje) de ácido nucleico flh84g5
y/o actividad de polipéptido flh84g5 inhibiendo la actividad de
polipéptido flh84g5, un modulador flh84g5 puede ser un anticuerpo
anti-flh84g5 o una molécula pequeña u otro fármaco,
por ejemplo, una molécula pequeña o fármaco identificado usando los
ensayos de análisis aquí descritos, que inhibe la actividad de
polipéptido flh84g5. Si se desea tratar una enfermedad o desorden
caracterizado por (o asociado con) expresión aberrante o anormal
(no de tipo salvaje) de expresión de ácido nucleico flh84g5 y/o
actividad de polipéptido flh84g5 estimulando la actividad de
polipéptido flh84g5, un modulador flh84g5 puede ser un polipéptido
activo flh84g5 o una porción del mismo (por ejemplo, un polipéptido
flh84g5 o una porción del mismo que tiene una secuencia de
aminoácido que es homóloga a la secuencia de aminoácido de SEC ID
NO: 2, 5, o 32 o una porción de la misma) o una molécula pequeña u
otro fármaco, por ejemplo, una molécula pequeña o fármaco
identificado usando los ensayos de análisis aquí descritos, que
estimula la expresión de ácido nucleico flh84g5.
Otros aspectos de la invención pertenece a
métodos para modular una actividad asociada a la célula. Estos
métodos incluyen el contacto de la célula con un agente (o una
composición que incluye la cantidad eficaz de un agente) que modula
la actividad de polipéptido flh84g5 o expresión de ácido nucleico
flh84g5 de tal modo que la actividad asociada con la célula se
altere en relación con la actividad asociada con la célula (por
ejemplo, metabolismo fosfatidilinositol) de la célula en ausencia
del agente. Como aquí se emplea, "una actividad asociada a la
célula" se refiere a una actividad o función normal o anormal de
una célula. Ejemplos de actividades asociadas a células incluyen
movimiento fosfatidilinositol, producción o secreción de moléculas,
como proteínas, contración, proliferación, migración,
diferenciación, y supervivencia celular. En una realización
preferente, la célula es célula neural del cerebro, por ejemplo, un
célula hipocampal. El término "alterado" como aquí se usa se
refiere a un cambio, por ejemplo, un aumento o un descenso, de una
actividad asociada a la célula particularmente movimiento
fosfatidilinositol y activación fosfolipasa C. En una realización,
el agente estimula actividad de polipéptido flh84g5 o expresión de
ácido nucleico flh84g5. Ejemplos de tales agentes estimulatorios
incluyen un polipéptido activo flh84g5, una molécula de ácido
nucleico que codifica flh84g5 que se ha introducido en la célula, y
un agente modulador que estimula actividad de polipéptido flh84g5 o
expresión de ácido nucleico flh84g5 y que se identifica usando los
ensayos de análisis de fármacos aquí descritos. En otra
realización, el agente inhibe la actividad de polipéptido flh84g5 o
expresión de ácido nucleico flh84g5. Ejemplos de tales agentes
inhibidores incluyen una molécula antisentido de ácido nucleico
flh84g5, un anticuerpo anti-flh84g5, y un agente
modulador que inhibe actividad de polipéptido flh84g5 o expresión
de ácido nucleico flh84g5 y que se identifica usando los ensayos de
análisis de fármacos aquí descritos. Los métodos moduladores pueden
llevarse a cabo in vitro (por ejemplo, cultivando la célula
con el agente),o de manera alternativa, in vivo (por
ejemplo, administrando el agente al sujeto). En una realización
preferente, los métodos moduladores se llevan a cabo in vivo,
es decir, la célula está presente dentro de un sujeto, por ejemplo,
un mamífero, por ejemplo, un humano, y el sujeto tiene un desorden
o enfermedad caracterizado por o asociado con la expresión
aberrante o anormal de actividad de polipéptido flh84g5 o expresión
de ácido nucleico flh84g5.
Una molécula de ácido nucleico, un polipéptido,
un modulador flh84g5, un compuesto, etc, empleados en los métodos
de tratamiento pueden incorporarse en una composición farmacéutica
apropiada aquí descrita y administrarse al sujeto a través de una
ruta que permita a la molécula, polipéptido, modulador, o compuesto
llevar a cabo su función. Ejemplos de rutas de administración
tabmién se describen aquí bajo la subsección VI.
Los compuestos de test/candidatos, o moduladores
que tienen un efecto estimulador o inhibidor sobre la actividad
flh84g5 (por ejemplo, expresión de gen flh84g5) como se identifica
por un ensayo de análisis aquí descrito puede administrarse a
individuos para tratar (profilácticamente o terapéuticamente)
desórdenes (por ejemplo, desórdenes) asociados con actividad
aberrante de flh84g5. En conjunción con dicho tratamiento, la
farmacogenómica (es decir, el estudio de la relación entre el
genotipo de un individuo y la respuesta del individuo a un compuesto
o fármaco externo) del individuo puede considerarse. Diferencias en
el metabolismo de terapéutica puede llevar a toxicidad severa o
fallo terapéutico alterando la relación entre la dosis y
concentración en sangre del fármaco famacológicamente activo. Por lo
tanto, la farmacogenómica del individuo permite la selección de
compuesto eficaces (por ejemplo, fármacos) para tratamientos
profilácticos o terapéuticos basados en la consideración del
genotipo del individuo. Tal farmacogenómica puede además emplearse
para determinar dosis apropiadas y regímenes terapéuticos. Por
consiguiente, la actividad de polipéptido flh84g5, expresión de
ácido nucleico flh84g5, o contenido de mutación de genes flh84g5 en
un individuo pueden determinarse para seleccionar de este modo
compuestos apropiados para tratamiento profiláctico o terapéutico
del individuo.
La farmacogenómica trata con variaciones
hereditarias clínicamente significativas en la respuesta a fármacos
debido a la disposición alterada del fármaco y a la acción anormal
en personas afectadas. Ver, por ejemplo, Eichelbaum, M. (1996)
Clin. Exp. Pharmacol. Physiol.
23(10-11):983-985 y Linder,
M.W. (1997) Clin. Chem. 43 (2):254-266. En
general, se pueden diferenciar dos tipos de condiciones
farmacogenéticas. Las condiciones genéticas transmitidas como un
único factor que altera el modo en el que los fármacos actúan en el
cuerpo (acción de fármaco alterado) o condiciones genéticas
transmitidas como factores unicos que alteran el modo en el que el
cuerpo actúa en el fármaco (metabolismo de fármaco alterado). Estas
condiciones farmacogenéticas pueden darse como defectos raros o
como polimorfismos. Por ejemplo, deficiencia dehidrogenasa
glucosa-6-fosfatasa (G6PD) es un
encimopatía común heredadaen la cual la principal complicación
clínica es hemólisis después de ingestión de fármacos oxidantes
(anti-malariales, sulfonamides, anlagésicos,
nitrofuranes) y consumo de alubias fava.
Como una realización ilustrativa, la actividad
de enzimas que metabolizan los fármacos es un principal
determinante de la intensidad y duración de la acción del fármaco.
El descubrimiento de polimorfismos genéticos de enzimas que
metabolizan fármacos (por ejemplo,
N-acetiltransferasa 2 (NAT 2) y citocromo P450
enzimas CYP2D6 y CYP2C19) ha proporcionado una explicación sobre
por qué algunos pacientes no obtienen los efectos esperados del
fármaco o muestran una respuesta al fármaco exagerada y toxicidad
grave tras tomar la dosis segura y estándar de un fármaco. Estos
polimorfismos se expresan en dos fenotipos en la población, el
metaboilzador extensivo (EM) y el metabolizador pobre (PM). La
prevalencia de PM es diferente entre las diferentes poblaciones.
Por ejemplo, el gen que codifica CYP2D6 es altamente polimórfico y
se han identificado varias mutaciones en PM, lo que lleva a la
ausencia de CYP2D6 funcional. Los metabolizadores pobres de CYP2D6
y CYP2C19 bastante a menudo experimentan respuesta exagerada al
fármaco y efectos secundarios cuando reciben dosis estándar. Si un
metabolito es la molécula terapéutica activa, PM no muestra
respuesta terapéutica, como se demostró para el efecto analgésico
de codeína mediada por su morfina de metabolito formada por CYP2D6.
Los otros extremos son los llamados metabolizadores ultrarápidos
que no responden a dosis estándar. Recientemente, la base molecular
de metabolismo ultrarápido se ha identificado debido a la
amplificación del gen CYP2D6.
Por lo tanto, la actividad del polipéptido
flh84g5, expresión de ácido nucleico flh84g5, o contenido de
mutación de genes flh84g5 en un individuo pueden determinarse para
seleccionar de este modo compuestos apropiados para tratamiento
profiláctico o terapéutico de un sujeto. Además, los estudios de
farmacogenómica pueden usarse para aplicar genotipos de alelos
polimórficos que codifican enzimas que metabolizan fármacos para la
identificación de fenotipo de sensibilidad a un fármaco de un
sujeto. Este conocimiento, cuando se aplica a dosis o selección de
fármacos, puede evitar las reacciones adversas o fallo terapéutico y
por lo tanto mejor la eficacia terapéutica o profiláctica cuando se
trata a un sujeto con un modulador flh84g5, como un modulador
identificado por uno de los ensayos de análisis ejemplares aquí
descritos.
El control de la influencia de compuestos (p.
ej., fármacos) en la expresión o actividad de flh84g5 (por ejemplo,
la habilidad para modular los efectos de ligando flh84g5 sobre
células sensibles al ligando flh84g5) puede aplicarse no sólo en
análisis básico de fármaco, sino también en ensayos clínicos. Por
ejemplo, la eficacia de un agente determinada por un ensayo de
análisis, como aquí se describe, para aumentar la expresión de gen
flh84g5, niveles de polipéptido, o sobrerregular la actividad
flh84g5, puede controlarse en ensayos clínicos de sujetos que
muestren expresión de gen flh84g5 disminuida, niveles de
polipéptido, o actividad flh84g5 subregulada. De manera
alternativa, la eficacia de un agente, determinada por un ensayo de
análisis para disminuir la expresión de gen flh84g5, niveles de
polipéptido, o subregular la actividad flh84g5, puede controlarse
en ensayos clínicos de sujetos que muestren expresión de gen
flh84g5 aumentada, niveles de polipéptido, o actividad flh84g5
sobrerregulada. En tales ensayos clínicos, la expresión o actividad
de flh84g5 y, preferentemente, otro genes que se han implicado en,
por ejemplo, un desorden relacionado con el sistema nervioso puede
usarse como una "lectura" o marcadores de la sensibilidad del
ligando flh84g5 de una célula particular.
Por ejemplo, y no como modo de limitación, los
genes, incluyendo flh84g5, que se modulan en células mediante
tratamiento con un compuesto (por ejemplo, fármaco o molécula
pequeña) que modula actividad flh84g5 (por ejemplo, identificada en
un ensayo de análisi como el aquí descrito) puede identificarse.
Por lo tanto, para estudiar el efcto de compuestos sobre desórdenes
SNC, por ejemplo, en un ensayo clínico, las células pueden aislarse
de ARN preparado y analizado para los niveles de expresión de
flh84g5 y otros genes implicados en el desorden. Los niveles de
expresión de gen (es decir, un patrón de expresión de gen) puede
cuantificarse mediante análisis de Western Blot o
RT-PCR, como aquí se ha descrito, o de manera
alternativa midiendo la cantidad de polipéptido producido, mediante
uno ovarios métodos aquí descritos, o midiendo los niveles de
actividad de flh84g5 u otros genes. De este modo, el patrón de
expresión del gen puede servir como un marcador, indicativo de la
respuesta fisiológica de las células con el compuesto. Por
consiguiente, este estado de respuesta puede determinarse antes, y
en varios puntos durante, del tratamiento del individuo con el
compuesto.
La presente invención permite un método para el
control de eficacia de tratamiento de un sujeto con un compuesto
(por ejemplo, un agonista, antagonista, peptidomimético,
polipéptido, péptido, ácido nucleico, molécula pequeña, u otro
fármaco candidato identificado por los ensayos de análisis aquí
descritos) comprendiendo los pasos de (i) obtener una muestra de
pre-administración de un sujeto antes de la
administración del compuesto; (ii) detectar el nivel de expresión
de un polipéptido flh84g5, mARN, o ADN genómico en la muestra de
preadministración; (iii) obtener una o más muestras
postadministración de un sujeto; (iv) detectar el nivel de expresión
o actividad del polipéptido flh84g5, mARN, o ADN genómico en las
muestras post-administración; (v) comparar el nivel
de expresión o actividad del polipéptido flh84g5, mARN, o ADN
genómico en la muestra preadministración con el polipéptido
flh84g5, mARN, o ADN genómico en la muestra o muestra
post-administración y (vi) alterar la
administración de un compuesto al sujeto como corresponda. Por
ejemplo, la administración aumentada del compuesto puede desearse
para aumentar la expresión o actividad de flh84g5 a niveles más
elevados de los detectados, es decir, para aumentar la eficacia del
agente. De manera alternativa, la administración disminuida del
agente puede desearse para disminuir la expresión o actividad
flh84g5 a niveles inferiores que los detectados, es decir, para
disminuir la eficacia del
compuesto.
compuesto.
Las porciones o fragmentos de las secuencias de
cADN aquí identifiadas (y las secuencias correspondientes de gen
completas) pueden usarse de numerosas maneras como reagentes
polinucleótidos. Por ejemplo, estas secuencias pueden usarse para:
(a) trazar el mapa de sus respectivos genes sobre un cromosoma; y
por lo tanto, localizar regiones de gen asociada a enfermedad
genética; (b) identificar un individuo a partir de una muestra
diminuta biológica (clasificación de tejido); y (c) ayudar en
identificación forense de una muestra biológica. Estas aplicaciones
se describen en subsecciones a continuación.
Una vez que la secuencia (o una porción de la
secuencia) de un gen se ha aislado, esta secuencia puede usarse
para trazar la localización de un gen en un cromosoma. Este proceso
se llama trazado de mapa de cromosomas. Por consiguiente, las
porciones o fragmentos del flh84g5, secuencias, aquí descritas,
pueden usarse para trazar el mapa de la localización del gen
flh84g5, respectivamente, en un cromosoma. El trazado de mapa de la
secuencia flh84g5 para cromosomas es un primer paso importante en
la correlación de estas secuencias con genes asociados con
enfermedad.
En resumen, el gen flh84g5 puede trazarse en el
mapa con un cromosoma preparando imprimadores PCR (preferentemente,
15-25 bp en longitud) de la secuencia flh84g5. Los
análisis por ordenador del flh84g5, la secuencia puede usarase para
seleccionar rápidamente imprimadores que no abarcan más de un exón
en el ADN genómico, por lo tanto complicando el proceso de
amplificación. Estos imprimadores pueden complicar el proceso de
amplificación. Estos imprimadores pueden usarse para análisis PCR
de híbridos de células somáticas que contienen cromosomas humanos
individuales. Sólo aquellos híbridos que contengan el gen humano
correspondiente a la secuencia flh84g5 producirán un fragmento
diferente.
Los híbridos de célula somática se preparan
fusionando células somáticas de diferentes mamíferos (por ejemplo,
células humanas y de ratones). Cuando los híbridos de células de
humanos y ratones crecen y se dividen, gradualmente pierden los
cromosomas humanos en orden arbitrario, pero retienen los
cromosomas de ratón. Usando un medio en el cual las células de
ratones no pueden crecer, porque carecen de una enzima particular,
pero las células humanas pueden, el cromosoma humano que contiene
el gen que codifica la enzima necesaria, será retenido. Usando este
medio, los paneles de líneas celulares híbridas pueden
establecerse. Cada línea celular en un panel contiene un único
cromosoma humano o un pequeño número de cromosomas humanos, y un
grupo completo de cromosomas de ratón, permitiendo un sencillo
trazado de mapa de genes individuales par cromosomas humanos
específicos. (D'Eustachio P. et al. (1983) Science
220:919-924). Los híbridos de células somáticas que
contienen sólo fragmentos de cromosomas humanos puede también
producirse usando cromosomas humanos con traslocaciones y
supresiones.
El trazado de mapa PCR de híbridos de células
somáticas es un procedimiento rápido para asignar una secuencia
particular a un cromosoma particular. Pueden asignarse tres o más
secuencias por día usando un único temporizador termal. Usando la
secuencia flh84g5 para diseñar imprimadores oligonucleótidos, la
sublocalización puede conseguirse con paneles de fragmentos de
cromosomas específicos. Otras estrategias de trazado de mapas que
pueden usarse de manera similar para trazar una secuencia flh84g5
con su cromosoma incluyen hibridización in situ (descrita en
Fan, Y. et al. (1990) PNAS, 87:6223-27),
pre-análisis con cromosomas etiquetados de tipo
fluido, y pre-selección por hibridización con
bibliotecas cADN específicas de cromosoma.
La hibridización fluorescente in situ
(FISH) de una secuencia de ADN con una extensión cromosomal de
metafase pueden además usarse para proporcionar una localización
precisa cromosomal en un paso. Las extensiones cromosomales pueden
hacerse usando células cuya división se ha bloqueado en metafase
por una sustancia química similar a la colcemida que interrumpe el
eje mitótico. Los cromosomas pueden tratarse brevemente con
tripsina, y luego tintarse con Giemsa. Una patrón de tiras claras y
oscuras se desarrolla en cada cromosoma, para que los cromosomas se
identifiquen de manera individual. La técnica FISH puede usarse con
una secuencia de ADN tan corto como 500 o 600 bases. Sin embargo,
los clones más grandes que 1,000 bases tienen una mayor
probabilidad de enlace con una única localización cromosomal con
suficiente intensidad de señal para la simple detección.
Preferentemente, 1,000 bases, y más preferentemente 2,000 bases
serán suficientes como para conseguir buenos resultados en una
cantidad razonable de tiempo. Para una revisión de esta técnica,
ver, Verma et al., Human Chromosomes: A Manual of Basic
Techniques (Pergamon Press, New York, 1988).
Los reagentes para trazado de mapa de cromosomas
pueden usarse individualmente para marcar un cromosoma sencillo o
un punto sencillo en dicho cromosoma, o paneles de reagentes pueden
usarse para marcar puntos múltiples y/o cromosomas múltiples. Los
reagentes correspondientes a regiones no codificadoras de los genes
son en realidad preferibles para fines de trazado de mapas. Las
secuencias de codificación tienen más posibilidades de conservarse
en las familias de genes, aumentando por lo tanto la opción de
hibridización cruzada durante el trazado de mapa cromosomal.
Una vez que la secuencia se ha trazado para una
localización cromosomal precisa, la posición física de la secuencia
del cromosoma puede correlacionarse con datos de mapa genético
(tales datos se encuentran, por ejemplo, en V. McKusick, Mendelian
Inheritance in Man, disponible on-line a través de
Johns Hopkins Welch Medical Library). La relación entre los genes y
enfermedades, trazados para la misma región cromosomal, pueden
luego identificarse por medio de análisis de enlace
(co-herencia de genes físicamente adyacentes),
descritos en, por ejemplo, Egeland, J. et al. (1987) Nature,
325:783-787.
Además, las diferencias en las secuencias de ADN
entre individuos afectados y no afectados con una enfermedad
asociada al gen flh84g5 pueden determinarse. Si se observa una
mutación en algunos o todos los individuos afectados pero no en los
individuos no afectados, entonces la mutación tiene posibilidades
de ser el agente causativo de la enfermedad particular. La
comparación de individuos afectados y no afectados generalmente
implica un primer vistazo a las alteraciones estructurales en los
cromosomas, como supresiones o traslocaciones que son visibles
desde las extensiones de cromosoma o detectables usando PCR basado
en esa secuencia de ADN. Por último, la secuencia completa de genes
de varios individuos puede llevarse a cabo para confirmar la
presencia de una mutación y para distinguir mutaciones de
polimorfismos.
Las secuencias de flh84g5 de la presente
invenció también pueden usarse para identificar individuos de
muestras biológicas diminutas. Las fuerzas armadas de Estados
Unidos, por ejemplo, está considerando el uso de polimorfismo de
longitud de fragmento de restricción (RFLP) para la identificación
de su personal. En esta técnica, un ADN genómico del individuo se
digiere con una o más enzimas de restricción, y se investiga en un
Southern Blot para producir tiras únicas para identificación. Este
método no sufre las limitaciones actuales de "Dog Tags" que
pueden perderse, cambiarse, o robarse, haciendo difícil la
identificación positiva. Las secuencias de la presente invención
son útiles como marcadores adicionales de ADN para RFLP (descrito
en Patente U.S 5,272,057). Además, las secuencias de la presente
invención puede usarse para proporcionar una técnica alternativa
que determina la secuencia real ADN
base-por-base de porciones
seleccioanadas de un genoma de individuo. Por lo tanto, las
secuencias fih84g5 aquí descritas pueden usarse para preparar de
dos imprimadores PCR de los extremos 3' y 5' de las secuencias.
Estos imprimadores pueden usarse para amplificar un ADN de
individuo y posteriormente secuenciarlo.
Los paneles de secuencias correspondientes de
ADN de individuos, preparados de esta manera, pueden proporcionar
identificaciones únicas individuales, ya que cada individuo tendrá
un único grupo de tales secuencias de ADN debido a las diferencias
alélicas. Las secuencias de la presente invención pueden usarse
para obtener tales secuencias de identificación a partir de
individuos y de tejido. Las secuencias flh84g5 de la invención
únicamente representan porciones del genoma humano. La variación
alélica se da en cierto grado en las regiones codificadoras de
estas secuencias, y en un grado mayor en la regiones no
codificadoras. Se estima que la variacion alélica entre los humanos
individuos se da con una frecuencia de aproximadamente una vez por
cada 500 bases. Cada una de las secuencias aquí descritas puede,
hasta cierto grado, usarse corn un éstandar con el cual ADN de un
individuo puede compararse para fines de identificación. Debido a
que grandes números de polimorfismos se dan en las regiones no
codificadoras, son necesarias menos secuencias para diferenciar
individuos. Las secuencias no codificadoras de SEC ID NO: 1, 4 y
31, puede proporcionar de manera cómoda identificación individual
positiva con un panel de quizás 10 a 10,000 imprimadores que cada
uno produce una secuencia amplificada no codificadora de 100 bases.
Si se predicen las secuencias codificadoras, como aquellas en SEC
ID NOS: 3, 6, y 33, y se usan, un número más apropiado de
imprimadores para la identificación individual positiva sería
500-2,000.
\newpage
Si un panel de reagentes de secuencias flh84g5
aquí descrito se emplea para generar una única base de datos de
identificación para un individuo, aquellos mismos reagentes pueden
usarse posteriormente para identificar tejido de tal individuo.
Usando la única base de datos de identificación, la identificación
positiva del individuo, vivo o muerto, puede realizarse a partir de
muestras de tejido extremadamente pequeñas.
Las técnicas de identificación basadas en ADN
pueden también usarse en biología forense. La biología forense es
un campo científico que emplea la clasificación genética de
evidencia biológica encontrada en la escena del crimen como un
medio para identificar de manera positiva, por ejemplo, un
perpetrador de un crimen. Para hacer tal identificación, puede
emplearse tecnología PCR para amplificar secuencias de ADN tomadas
de muestras biológicas muy pequeñas como tejidos, por ejemplo, pelo
o piel, fluidos corporales, por ejemplo, sangre, saliva, o semen
encontrado en una escena del crimen. La secuencia amplificada puede
compararse posteriormente con una estándar, permitiendo de este
modo la identificación del origen de la muestra biológica.
Las secuencias de la presente invención pueden
usarse para proporcionar reagentes polinucleótidos, por ejemplo,
imprimadores PCR, dirigidos a locus específicos en el genoma
humano, que puede mejorar la fiabilidad de identificaciones
forenses basadas en ADN mediante, por ejemplo, proporcionando otro
"marcador de identificación" (es decir, otra secuencia de ADN
que es única a un individuo particular). Como se ha descrito
anteriormente, la información de secuencia de base real puede
usarse para identificación como una alternativa precisa para
patrones formados por fragmentos genados por enzima de restricción.
Las secuencias dirigidas a regiones no codificadoras de SEC ID
NO:1, 4 y 31 son particularmente apropiadas para este uso ya que
números más elevados de polimorfismos ocurren en las regiones no
codificadoras, haciendo más fácil diferenciar individuos usando esta
técnica. Ejemplos de reagentes polinucleótidos incluyen las
secuencias flh84g5 o porciones de las mismas, por ejemplo,
fragmentos derivados de las regiones no codificadoras SEC ID NO:1,
4 y 31, que tienen una longitud de al menos 20 bases,
preferentemente al menos 30 bases.
Las secuencias flh84g5 aquí descritas pueden
además usarse para proporcionar reagentes polinucleótidos, por
ejemplo, sondas etiquetadas o etiquetables que pueden usarse en,
por ejemplo, una técnica de hibridización in situ, para
identificar un tejido específico, por ejemplo, tejido de cerebro.
Esto puede resultar muy útil en casos donde un patólogo forense se
encuentra con un tejido de origen desconocido. Paneles como las
sondas flh84g5 pueden usarse para identificar tejido por especies
y/o por tipo de órgano.
De un modo similar, estos reagentes, por
ejemplo, imprimadores o sondas flh84g5 pueden usarse para analizar
contaminación en el cultivo de tejido (es decir, analizar la
presencia de una mezcla de tipos diferentes de células en un
cultivo).
Esta invención se ilustra además por medio de
los siguientes ejemplos que no deben considerarse como
limitativos.
Ejemplo
1
En este ejemplo, se identificaron moléculas de
ácido nucleico flh84g5 analizando bibliotecas de cADN apropiadas.
Más específicamente, una corteza frontal oligo
dT-impreso biblioteca cADN se colocó en placas y
las colonias se recobieron en placas de 96 pozos. Las colonias se
cultivaron, los plásmidos se prepararon de cada pozo, y el extremo
5' de cada secuencia de inserción. Después del recorte automatizado
de las secuencias no-inserción, las secuencias
nucleótidas se compararon con las bases de datos de proteínas
públicas usando el programa de comparación secuencial BLAST
(BLASTN1.3MP, Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403).
Tras la revisión de los resultados de esta comparación secuencial,
se identificó un único clon, designado 84g5, cuya similaridad más
elevada fue con el receptor de acetilcolina de rata muscarínica M1
(mACHR M1; GenBank^{TM} Número de Adquisición P08482). El clon
que contiene esta secuencia se recuperó de la placa de 96 pozos, el
plásmido se preparó usando métodos estándar y la inserción se
secuenció por completo usando técnicas estándar "contigging".
Un análisis de repetición BLAST usando la secuencia completa de
inserción de nuevo mostró que la secuencia es una base de datos de
proteína con la mayor similaridad correspondiente a GenBank^{TM}
Número de Adquisición P08482. Esta secuencia y la secuencia de
inserción se compararon usando el programa GAP y el paquete de
sofware GCG usando un peso de hueco de 5.000 y un peso de longitud
de 0.100. El resultado mostró un 27.9% de identidad y 49.01% de
similaridad entre las dos secuencias con la inserción de 4 huecos
para alineación de secuencia optimizada. La alineación indicó que
el clon 84g5 no se extiende por completo a través de la secuencia
P08482, aparentemente perdiendo aproximadamente 30 residuos de
aminoácidos en la región terminal N de la molécula. Una sonda que
abarca residuos 143-249 de SEC ID NO:31 se usó para
reanalizar la misma biblioteca de cortez frontal. Esto dio como
resultado la identificación de la secuencia flh84g5 de rata de
longitud completa mostrada en SEC ID NO:4. El análisis BLAST de
bases de datos públicas de nucleótidos reveló las secuencias
humanas no equivalentes. Sólo un único ratón EST se identificó
(GenBank^{TM} Número de Adquisición P08482) que es similar al clon
flh84g5 entre los residuos 1101 y
1650.
1650.
La molécula de ácido nucleico humana flh84g5 se
identificó analizando una biblioteca cADN de cerebelo humano usando
el fragmento de restricción Nci I/Not I del cADN de rata
como una sonda. Los análisis BLAST de proteínas y bases de datos de
ácido nucleico en el dominio público de nuevo demostró que la
molécula de ácido nucleico flh84g5 es más similar a las secuencias
mACHR m1. La alineación también reveló que la molécula de ácido
nucleico mAChR-6 codifica un polipéptido de
completa longitud mACHR.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Blots Northern de tejido múltiple de cerebro
humano (MTN), blots humanos MTN, I, II, y III, y blots de rata MTN
(Clontech, Palo Alto, CA), que contiene 2 ug de poli A+ARN por ruta
se sondaron con la secuencia nucleótida flh84g5 (fragmento de
restricción Nci I/Not I). Los filtros se prehibridizaron en
10 ml de solución de hibridización Express Hyb (Clontech, Palo
Alto, CA) a 68°C durante 1 hora, después de los cuales 100 ng de
sonda etiquetada ^{32}P se añadió. La sunda se generó usando kit
Stratagene-Prime, Número de Catálogo 300392
(Clontech, Palo Alto, CA). La hibridización se llevó a cabo para
proceder a 68°C durante aproximadamente 2 horas. Los filtros se
lavaron en una solución 0.05% SDS/2X SSC durante 15 minutos a
temperatura ambiente y después dos veces con solución 0.1% SDS/1X
SSC durante 20 minutos y después se expusó a capa de
autoradiografía durante la noche a 80°C con una pantalla. Los
tejidos humanos examinados incluyeron: corazón, cerebro (regiones
del cerebro examinadas incluyeron el cerebelo, corteza cerebral, la
médula, polo occipital, lóbulo frontal, el lóbulo temporal, el
putamen, el corpus callosum amígdala, núcleo caudado,
hipocampo, la sustancia negra, el núcleo subtalámico y el tálamo),
placenta, pulmón, hígado, musculatura del esqueleto, hígado,
páncreas, bazo, timo, próstata, testículos, ovarios, intestino
delgado, colon, leucocito de sangre periférico, estómago, tiroides,
médula espinal, nódulo linfático, tráquea, glándula adrenal y
médula
ósea.
ósea.
Hubo una fuerte hibridización con el cerebro
humano completo, las siguentes regiones de cerebro humano: el
cerebelo, corteza cerebral, la médula, polo occipital, lóbulo
frontal, el lóbulo temporal, el putamen, el corpus
callosum amígdala, núcleo caudado, hipocampo, la sustancia
negra, el núcleo subtalámico y el tálamo; y el cerebro de la rata
indicacndo que aproximadamente 3 kb trascripción de gen flh84g5 se
expresa en estos tejidos. También hubo hibridización con la médula
espinal humana.
Para análisis in situ, el cerebro de una
rata adulta Sprague-Dawley se retiró y se congeló en
hielo seco. Secciones del cerebro de diez micrometros de grosor se
fijaron posteriormente con 4% formaldehído en DEPC tratado salina
búferfosfato IX a temperatura ambiente durante 10 minutos antes de
enjuagarse dos veces en DEPC salina búfer fosfato IX y una vez en
0.1 M trietanolamina-HCI (pH 8.0). Tras la
incubación en 0.25% anhídrido acético-0.1 M
trietanolamina-HCI durante 10 minutos, las secciones
se enjuagaron en DEPC 2X SSC (IX SSC es 0.15 M NaCl más 0.015 M
citrato sódico). El tejido fue posteriormente deshidratado usando
una serie de lavados de etanol, se incubó en 100% cloroformo
durante 5 minutos, y después de enjuagó en 100% etanol durante 1
minuto y 95% etanol durante minuto para posteriormente dejarse
secar al aire.
Las hibridizaciones se llevaron a cabo con
sondas cARN de ^{35}S-radioetiquetado (5 X
10^{7} cpm/ml) que codifican un fragmento 474-bp
del gen de rata (generado con imprimadores PCR F,
5'-CAAGAACCCTTTAAGCCAAG (SEC ID NO:27), y R,
5'-GAAGAAGGTAACGCTGAGGA (SEC ID NO:28) y fragmento
529-bp del gen de rata (generado con imprimadores
PCR F, 5'-CAGAACCCCCAGATGCC (SEC ID NO:29), y R,
5'-TAGTGGCACAGTGGGTAGAG (SEC ID NO:30)). Las sondas
se incubaron en la presencia de una solución que contenía 600 mM
NaCl, 10 mM Tris (pH 7.5), 1 mM EDTA, 0.01% ADN esperma de salmón
cortado, 0.01% levadura tARN, 0.05% levadura ARN total tipo X1, 1 X
solución de Denhardt, 50% formadida, 10% sulfato dextran, 100 mM
dithiothreitol, 0.1% sulfato dodecil sódico (SDS), y 0.1%
trifulsato sódico durante 18 horas a 55°C.
Después de la hibridización, los portaobjetos se
lavaron con 2 X SCC. Las secciones se incubaron secuencialmente a
37°C en TNE (una solución que contenía 10 mM
Tris-HCI (pH. 7.6), 500 mM NaCl, y 1 mM EDTA),
durante 10 minutos, en TNE con 10 \mug de ARNasa por ml duranet
30 minutos, y finalmente en TNE durante 10 minutos. Los
portaobjetos se enjuagaron posteriormente con 2 X SSC a temperatura
ambiente, se lavaron con 2 X SCC a 50°C durante 1 hora, se lavaron
con 0.02 X SCC a 55°C durante 1 hora, y 0.2 X SCC a 60°C durante 1
hora. Las secciones fueron después deshidratadas rápidamente a
través de etanol serial-0.3M concentraciones de
acetato sódico antes de secarse al aire y se expone a carrete de
imagen científica Kodak Biomax MR durante 24 horas y a continuación
se meten en NB-2 fotoemulsión y se expuso a 4°C
durante 7 días antes de desarrollarse y se tiñeron con
contador.
La hibridización significativa se vio en un
número de regiones del cerebro. Estas incluían la corteza,
putamen caudado, hipocampo, tálamo y cerebelo. Los análisis
de estas regiones a gran escala mostraron que se observó un
etiquetaje significante sobre los cuerpos celulares de
neuronas.
\newpage
Ejemplo
3
En este ejemplo, flh84g5 se expresa como un
polipéptido de fusión (GST) recombinante
glutaniona-S-transferasa en E.
Coli y el polipéptido de fusión se aisló y caracterizó.
Específicamente, flh84g5 se fusiona con GST y este polipéptido de
fusión se expresa en E. Coli, por ejemplo, variedad PEB199.
Como los polipéptidos humanos y de rata flh84g5 se preven ser
aproximadamente 51.3 kDa, respectivamente, y GST se pronostica ser
77.3 kDa y 77.2 kDa, respectivamente, en peso molecular. Expresión
del GST-polipéptido de fusión flh84g5 en PEB199 se
provoca con IPTG. El polipéptido de fusión recombinante se purifica
de lisados bacterianos crudos de la variedad PEB199 mediante
cromatografía de afinidad en gutas de glutaniona. Usando análisis
electroforéticos de gel de poliacrilamina del polipéptido
purificados de los lisados bacteriano, se determina el peso
molecular del polipéptido de fusión
resultante.
resultante.
Ejemplo
4
Para expresar el gen flh84g5 en células COS, se
usa el vector pcADN/Amp por Invitrogen Corporation (San Diego, CA).
Este vector contiene un origen SV40 de réplica, un gen de
resistencia ampicilina, un origen de réplica E. Coli, un
impulsor CMV seguido de una región polienlace, y un nitrón SV40 y
punto de poliadenilización. Un fragmento ADN que codifica el
polipéptido completo flh84g5 y una etiqueta HA (Wilson et
al. (1984) Cell 37:767) fusionada en el interior de sus
estructura de su extremo 3' del fragmento se clona en la región
polienlace del vector, colocando de este modo la expresión del
polipéptido recombinante bajo el control del impulsor CMV.
Para construir el plásmido, la secuencia de ADN
flh84g5 se amplifica mediante PCR usando dos imprimadores. El
imprimador 5' contiene el punto de restricción de interés seguido
de aproximadamente veinte nucleótidos de secuencia codificadora
flh84g5 que comienza del codón de iniciación; la secuencia 3'
extremo contiene secuencias complementarias con otro punto de
restricción de interés, un codón de freno de traslación, la etiqueta
HA y los últimos 20 nucleótidos de la secuencia codificadora
flh84g5. El fragmento amplificado PCR y el vector pCADN/Amp se
digieren con las enzimas de restricción apropiadas y el vector se
defosforiliza usando la enzima CIAP (New England Biolabs, Beverly,
MA). Preferentemente, los dos puntos de restricción elegidos son
diferentes para que el gen flh84g5 se inserte en la orientación
correcta. La mezcla de unión se transforma en células E.
coli (variedades HB101, DH5a, SURE, disponible en Stratagene
Cloning Systems, La Jolla, CA, pueden usarse), el cultivo
transformado se coloca en placas sobre placas de medio ampicilina,
y se seleccionaron las colonias resistentes. El plásmido ADN se
aisló de transformantes y se examinó mediante análisis de
restricción para la presencia del fragmento correcto.
Posteriormente, las células COS se transfectan
con el flh84g5-pcADN/Amp ADN plásmido usando los
métodos de co-precipitación de fosfato o cloruro de
calcio, transfección mediada por DEAE-Dextran,
lipofección, o electroporación. Otros métodos adecuados para
transfectar células huésped pueden encontrarse en Sambrook, J.,
Fritsch, E.F. y Maniatis, T. Molecular Cloning: A Laboratory
Manual, 2nd, ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring
Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989. La expresión
de polipéptido flh84g5 se detecta mediante radioetiquetaje
(^{35}S-metionina o
^{35}S-cistéina disponible en NEN, Boston, MA,
puede usarse) e inmunoprecipitación (Harlow, E. Y Lane, D.
Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1988) usando un
anticuerpo monoclonal específico HA. En resumen, las células se
etiquetan durante 8 horas con ^{35}S-metionina (o
^{35}S-cistéina). Los medios de cultivo se
recogen posteriormente y las células se lisan usando detergentes
(búfer RIPA, 150 Mm NaCl, 1% NP-40, 0.1% SDS, 0.5%
DOC, 50 Mm Tris, pH. 7.5). Tanteo el lisado celular como el medio
de cultivo se precipitan con un anticuerpo monoclonal específico
HA. Los polipéptidos precipitados se analizan posteriormente
mediante SDS-PAGE.
De manera alternativa, el ADN que contiene la
secuencia codificadora flh84g5 se clona directamente en el
polienlace del vector pCADN/Amp usando los puntos de restricción
adecuados. El plásmido resultante se transfecta a células COS de la
manera anteriormente descrita, y la expresión del polipéptido
flh84g5 se detecta mediante radioetiquetaje e inmunoprecipitación
usando un anticuerpo monoclonal específico flh84g5.
Ejemplo
5
En este ejemplo, las secuencias de aminoácido de
los polipéptidos flh84g5 humanos y de rata se compararon con las
secuencias de aminoácidos de los polipéptidos conocidos y se
identificaron varios motivos.
El polipéptido humano flh84g5, cuya secuencia de
aminoácido se muestra en la Figura 1 (SEC ID NO:2), es un
polipéptido nuevo que incluye 445 residuos de aminoácido. El
polipéptido humano flh84g5 contiene siete dominios transmembránicos
entre los residuos de aminoácidos 34-59 (SEQ ID
NO:7), 73-91 (SEC ID NO:8), 109-130
(SEC ID NO:9), 152-174 (SEC ID NO:10),
197-219 (SEC ID NO:11), 360-380
(SEC ID NO:12), y 396-416 (SEC ID NO:13). La
secuencia nucleótida del flh84g5 humano se usó en un estudio de
base de datos usando el programa BLASTN (BLASTN1.3MP, Altschul
et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403). Los blancos más
cercanos fueron mACHR M1 humano, de rata, ratón, y cerdo
(GenBank^{TM} Número de Adquisición P11229, P08482, P12657, y
PO4761, respectivamete). La similitud más elevada es 32/70
identidades de aminoácido.
El polipéptido de rata flh84g5, cuya secuencia
de aminoácido se muestra en la Figura 2 (SEC ID NO:5), es un
polipéptido nuevo que incluye 445 residuos de aminoácido. El
polipéptido de rata flh84g5 contiene siete dominios
transmembránicos entre los residuos de aminoácidos
34-59 (SEQ ID NO:14), 73-91 (SEC ID
NO:15), 109-130 (SEC ID NO:16),
152-174 (SEC ID NO:17), 197-219 (SEC
ID NO:18), 360-380 (SEC ID NO:19), y
396-416 (SEC ID NO:20), que corresponden con los
dominios transmembránicos de polipéptido flh84g5 humano
1-7 (SEC ID NOS: 7-13). La secuencia
nucleótida de rata flh84g5 se usó en un estudio de base de datos
usando el programa BLASTN (BLASTN1.3MP, Altschul et al.
(1990) J. Mol. Biol. 215:403). Los blancos más cercanos
fueron mACHR M1 humano, de rata, ratón, y cerdo (GenBank^{TM}
Número de Adquisición P11229, P08482, P12657, y PO4761,
respectivamete). La similitud más elevada es 32/70 identidades de
aminoácido. Los trazados de hidropatía indicaron que los dominios
transmembránicos del polipéptido de rata flh84g5 son similares a
los de la rata mACHR M1. Las cisteínas (residuos 63 y 44 de SEC ID
NO:5) que dan lugar a enlaces de disolfuro intramolecular también
se conservan.
Ejemplo
6
Plásmido cADN de rata flh84g5 se subclonó en
pGEMHEA. CADN en pGEMHEA después se linearizó con AfIII y se
trascribió in vitro usando polimerasa T7 ARN. Los oocitos
Xenopus libres de folículo aislados se microinyectaron con
10 ng de flh84g5 cARN (en un volumen de 10 nl). Los oocitos se
mantuvieron en solución ND96 que contenía 96 mM NaCl, 2 mM KC, 1.8
mM CaCl_{2}, 1 mM MgCl_{2}, 5 mM HEPES (pH=7.6) durante al
menos 48 horas antes del uso. Ca++ endógenos activaron corrientes
Cl en oocitos obtenidos por carnitina se midieron usando un método
de enganche de voltaje de dos electrodos estándar
(TEC-03 amplificador, npi) en un potencial de
sujección de -80 mV. Los electrodos se llenaron con 3 M KCI y
tuvieron reistencias de 0.5-3.0 \Omega. La cámara
de grabación (aproximadamente 100 \mul en volumen) se perfusionó
continuamente por gravedad con ND96. Se aplicaron varias
concentraciones de carnitina a oocitos durante 30-60
segundo por prefusión.
La elevación de Ca^{++} citosólicos en occitos
por GPCRs enganchado a movimiento PI dará como resultado la
activación de Ca^{++} endógeno corrientes CI activadas. Las
corrientes CI externas resultantes también dependen de
concentraciones Ca^{++} extracelulares. En oocitos inyectados con
flh84g5 cARN, L-carnitina produce tal corriente CI
activada Ca^{++} (Imax=3-6 \muA) en una manera
dependiente de concentración, con un EC50 de 3 mM. Mientras se
inyectan oocitos en agua, elevadas concentraciones de
L-carnitina (hasta 10 mM) no producen ninguna
corriente. 10 mM L-carnitina evocaron corrientes
más pequeñas que las vistas con L-carnitina. El
análogo de L-carnitina (10 mM) también produce
corrientes pequeñas.
0.1-1.0 mM Ach, GABA,
5-HT, NE, Glu, y DA no producen ninguna corriente
en oocitos inyectados con flh84g5 ARN. Además,
L-carnitina que obtuvo corrientes en oocitos no
puede bloquearse por la atropina antagonista muscarínica (100
\muM).
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: MILLENNIUM PHARMACEUTICALS, INC.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 640 MEMORIAL DRIVE
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: CAMBRIDGE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: MASSACHUSETTS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: US
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (CP): 02139
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- TELEFAX:
\vskip0.800000\baselineskip
- (II)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: RECEPTORES ASOCIADOS A PROTEINA G Y USOS DE LOS MISMOS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 39
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: LAHIVE & COCKFIELD, LLP
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 28 STATE STREET
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: BOSTON
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: MASSACHUSETTS
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: US
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CP: 02109-1875
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE DE ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- INFORMACIÓN DE SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US98/
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 04 DECEMBER 1998
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- INFORMACIÓN PREVIA A LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: USSN 08/985,090
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 04 DECEMBER 1997
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: USSN 09/042,780
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 17 MARCH 1998
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: MANDRAGOURAS, AMY E.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 36,207
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: MNI-032CP2PC
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (617)227-7400
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (617)742-4214
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2689 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 291..1625
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:2
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 445 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1335 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..1335
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL SEC ID NO:3:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:4.
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3244 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 778..2112
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 445 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1338 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..1335
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL SEC ID NO:7:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL SEC ID NO:8:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACION PARA SEC ID NO:9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:9:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:10:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:12:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:13:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:14:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:15:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL SEC ID NO:16:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL SEC ID NO:17:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:18:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:19:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:20:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCTGCGGGGC CATGGAG
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTGGCCCACC AGAGCCT
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGCCACGCC TCTCTCA
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCCTGCTGGG CCATGGAG
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGAGCAGCTG CCCCAC
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTGAGGCCAG GCCCTT
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAAAACCCCT TTAAGCCAAG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAAGAAGGTA ACGCTGAGGA
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGAACCCCC ACCAGATGCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAGTGGCACA GTGGGTAGAG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2218 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERISTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 119..1204
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD. 362 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:32.
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1086 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..1086
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:36:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:37:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:37:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:38:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGIA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:38:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEC ID NO:39:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN SECUENCIAL: SEC ID NO:39:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (16)
1. Un polipéptido aislado seleccionado del grupo
consistente en:
- (a)
- un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:2;
- (b)
- un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:5;
- (c)
- un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:32;
- (d)
- un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:2; donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de SEC ID NO:2 y tiene una actividad flh84g5;
- (e)
- un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:5, donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de residuos de aminoácidos 109-130, 152-174, 197-219, 360-380 o 396-416 de SEC ID NO:5 y tiene una actividad flh84g5;
- (f)
- un fragmento de polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:32; donde el fragmento comprende al menos 15 aminoácidos constiguos de SEC ID NO:32 y tiene una actividad flh84g5;
- (g)
- una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:2, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:1 bajo condiciones severas;
- (h)
- una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:5, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:4 bajo condiciones severas;
- (i)
- una variante alélica que ocurre de manera natural de un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido SEC ID NO:32, y tiene una actividad flh84g5 donde el polipéptido se codifica por una molécula de ácido nucleico que hibridiza con una molécula de ácido nucleico que comprende la SEC ID NO:31 bajo condiciones severas;
- (j)
- un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácido que es al menos 95% idéntica a la secuencia completa de aminoácido de SEC ID NO: 2, 5, o 32; y
- (k)
- un polipéptido que se codifica por una molécula de ácido nucleico que comprende una secuencia de ácido nucleico que es al menos 95% idéntica a la secuencia completa nucleótida de SEC ID NO: 1, 4, o 31,
donde un polipéptido tiene una
actividad flh84g5 que, cuando se expresa en oocitos, permite que
L-carnitina produzca corriente de cloro activada
por
calcio.
2. Un polipéptido como el reivindicado en la
reivindicación 1, que además comprende secuencias de aminoácido
heterólogas.
3. Un anticuerpo que de manera selectiva se
enlaza con un polipéptido como el reivindicado en la reivindiación
2.
4. Una molécula de ácido nucleico aislado que
codifica un polipéptido tal y como se define en cualquiera de los
párrafos (a) a (i) de la reivindicación 1.
5. Una molécula de ácido nucleico como la
reivindicada en la reivindicación 4, que además comprende bien
secuencias de ácido nucleico de vector, o secuencias de ácido
nucleico que codifican un polipéptido heterólogo.
6. Una célula huésped que contiene la molécula
de ácido nucleico de las reivindicaciones 4 o 5, siendo dicha
célula huésped opcionalmente una célula de mamífero, por ejemplo
una célula huésped de mamífero no humano.
7. Un ácido nucleico aislado como el
reivindicado en la reivindicación 4, que se selecciona del grupo
consistente en:
- (a)
- una molécula de ácido nucleico que comprende la región codificadora de SEC ID NO:1;
- (b)
- una molécula de ácido nucleico que comprende la región codificadora de SEC ID NO:4;
- (c)
- una molécula de ácido nucleico que comprende la región codificadora de SEC ID NO:31;
- (d)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:7 y tiene una actividad flh84g5;
- (e)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:8 y tiene una actividad flh84g5;
- (f)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:9 y tiene una actividad flh84g5;
- (g)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:10 y tiene una actividad flh84g5;
- (h)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:11 y tiene una actividad flh84g5;
- (i)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:12 y tiene una actividad flh84g5;
- (j)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:13 y tiene una actividad flh84g5;
- (k)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:14 y tiene una actividad flh84g5;
- (l)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:15 y tiene una actividad flh84g5;
- (m)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:16 y tiene una actividad flh84g5;
- (n)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:17 y tiene una actividad flh84g5;
- (o)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:18 y tiene una actividad flh84g5;
- (p)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:19 y tiene una actividad flh84g5;
- (q)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:20 y tiene una actividad flh84g5;
- (r)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:34 y tiene una actividad flh84g5;
- (s)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:35 y tiene una actividad flh84g5;
- (t)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:36 y tiene una actividad flh84g5;
- (u)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:37 y tiene una actividad flh84g5;
- (v)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:38 y tiene una actividad flh84g5;
- (w)
- una molécula de ácido nucleico que codifica un polipéptido que comprende la secuencia de aminoácido de SEC ID NO:39 y tiene una actividad flh84g5;
- (x)
- una molécula de ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleótida que es al menos 95% idéntica a la secuencia nucleótida completa de SEC ID NO:1, 4, o 31, o un complemento de las mismas, donde la molécula de ácido nucleico codifica un polipéptido que tiene una actividad flh84g5; y
- (y)
- una molécula de ácido nucleico aislado que codifica un polipéptido que comprende una secuencia de aminoácido que es al menos 95% idéntica a la secuencia nucleótida completa de SEC ID NO:2, 5, o 32,
\newpage
donde un polipéptido tiene una
actividad flh84g5 que, cuando se expresa en oocitos, permite que
L-carnitina produzca corriente de cloro activada
por
calcio.
8. Un método para la producción de un
polipéptido como el reivindicado en la reivindicación 1,
comprendiendo el método del paso de cultivo de célula huésped de la
reivindicación 6 bajo condiciones en las cuales la molécula de
ácido nucleico se expresa.
9. Un método para detectar la presencia de un
polipéptido como el reivindicado en la reivindicación 1 en una
muestra, comprendiendo el método de los pasos de:
- (i)
- poner en contacto la muestra con un anticuerpo que de manera selectiva se enlaza con el polipéptido; y
- (ii)
- determinar si el anticuerpo se enlaza con el polipéptido en la muestra.
10. Un método para detectar la presencia de una
molécula de ácido nucleico como se reivindica en la reivindicación
4, comprendiendo el método de los pasos de:
- (i)
- poner en contacto la muestra con una sonda o imprimador de ácido nucleico que de manera selectiva hibridiza la molécula de ácido nucleico; y
- (ii)
- determinar si la sonda o imprimador de ácido nucleico se enlaza con la molécula de ácido nucleico en la muestra;
opcionalmente donde la muestra
comprende moléculas ARN y está en contacto con una sonda de ácido
nucleico.
11. Un kit que comprende
- a)
- reagentes usados para los métodos de las reivindicaciones 9 o 10, donde los agentes comprenden un compuesto que es un anticuerpo que de manera selectiva se enlaza con un polipéptido tal y como se reivindica en la reivindicación 1; o
- b)
- una molécula de ácido nucleico de la reivindicación 4 o 7, o un complemento de la misma e instrucciones para su uso.
12. Un método para identificar un compuesto que
se enlaza con un polipéptido como el reivindicado en la
reivindicación 1, constante el método de:
- (i)
- poner en contacto el polipéptido, o una célula que expresa el polipéptido con un compuesto de examen; y
- (ii)
- determinar si el polipéptido se enlaza con el compuesto de examen.
13. Un método como el reivindicado 12, donde el
enlace del compuesto de test con el polipéptido se mezcla mediante
un método seleccionado del grupo consistente en:
- (a)
- detección de enlace mediante detección directa del enlace de test compuesto/polipéptido;
- (b)
- detección de enlace usando un ensayo de enlace de competición; y
- (c)
- detección de enlace usando un ensayo para actividad flh84g5.
14. Un compuesto capaz de poner en contacto la
célula que expresa un polipéptido como el reivindicado en la
reivindicación 1, y adapatarse para enlazarse con el polipéptido en
una concentración suficiente para modular la actividad del
polipéptido, para uso como un medicamento, donde dicho compuesto se
selecciona del grupo consistente en un anticuerpo que
específicamente se enlaza con un polipéptido de la reivindicación 1
y un polipéptido flh84g5, porción o variante alélica que ocurre de
manera natural del mismo como se define en la reivindicación 1.
15. Uso de un compuesto de la reivindicación 14
en la fabricación de un medicamenteo para el tratamiento de una
condicición seleccionada del grupo consistente en desorden del
sistema nervioso, un desorden cognitivo, un desorden del sueño, un
desorden motriz, un desorden esquizoefectivo, un desorden que
afecta los mecanismos de generación de dolor, un desorden con la
bebida, un desorden alimenticio, un desorden relacionado con al
musculatura lisa, por ejemplo, el síndrome del intestino irritable,
un desorden relacionado con la musculatura cardiaca, bradicardia, o
un desorden relacionado con las glándulas y xerostomia.
16. Uso, como se reivindica en la reivindicación
14, donde el uso da como resultado bien un aumento o un descenso en
metabolismo fosfatidilinositol.
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US08/985,090 US5882893A (en) | 1997-12-04 | 1997-12-04 | Nucleic acids encoding muscarinic receptors and uses therefor |
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