ES2281932T3 - Procedimiento de produccion de acidos grasos ramificados por medio de plantas geneticamente modificadas. - Google Patents

Procedimiento de produccion de acidos grasos ramificados por medio de plantas geneticamente modificadas. Download PDF

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Abstract

Procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados, caracterizado porque dichos ácidos grasos ramificados se producen a partir de al menos una célula vegetal o a partir de semillas o a partir de una planta, comprendiendo el genoma de dicha célula vegetal o dichas semillas o dicha planta un ácido nucleico recombinante que codifica para una metil transferasa, una ciclopropano ácido graso sintasa, un metilmalonil-CoA o una malonil-CoA descarboxilasa.

Description

Procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados por medio de plantas genéticamente modificadas.
La presente invención se refiere a un procedimiento de producción de ácidos grasos de cadena alifática no lineal. El procedimiento de la invención se refiere más particularmente al uso de plantas modificadas genéticamente. Los ácidos grasos así producidos, en forma libre o no, eventualmente modificados por medio químico o enzimático, pueden utilizarse en la fabricación de diferentes productos industriales, especialmente de lubricantes de tipo aceite hidráulico o aceite de motor.
Los ácidos grasos son ácidos de cadena alifática larga generalmente comprendida entre 6 y 25 átomos de carbono. La cadena alifática puede ser lineal o no lineal (también denominada ramificada). Los ácidos grasos producidos de manera natural están presentes o bien en forma libre, o bien en forma esterificada, especialmente en forma de diglicéridos o triglicéridos. Los ácidos grasos se utilizan generalmente en diferentes tipos de industrias, especialmente para la preparación de bases lubricantes de origen natural o en detergentes, adyuvantes, o incluso en la constitución de biocarburantes. Para todas estas aplicaciones, resulta particularmente ventajoso poder utilizar ácidos grasos de origen natural, especialmente derivados de materia vegetal. Por tanto, se han descrito diferentes procedimientos de producción y de extracción de ácidos grasos a partir de plantas (especialmente de semilla de plantas) en la técnica anterior (véase especialmente Harrington et al, Ind. Eng. Chem. Prod. Res. Dev. 1985, Vol. 24, página 314; el documento FR 2 722 798). Además, la solicitud WO 94/13814 se refiere a células de plantas genéticamente modificadas por una enzima implicada en la transferencia de los ácidos grasos libres sobre el colesterol. Sin embargo, aunque esta solicitud permite modificar la composición de los triglicéridos, no permite de ninguna manera alterar la estructura de la cadena alifática de los ácidos grasos. Schmid K. (Plant Lipid Metabolism (1995,108) menciona la síntesis de ácidos grasos cíclicos (di-hidroesterculato) en células de tabaco modificadas genéticamente. No obstante, este documento no describe la producción de ácidos grasos ramificados, ni los medios correspondientes, ni las aplicaciones industriales.
Uno de los principales inconvenientes de los procedimientos anteriores que utilizan plantas, reside precisamente en la poca diversidad de los ácidos grasos que pueden obtenerse. Por tanto, las plantas producen de manera natural esencialmente ácidos grasos de cadena alifática lineal del tipo de C6 a C24. Ahora bien, los estudios realizados por la empresa solicitante han demostrado que para obtener una buena base lubricante, era particularmente ventajoso utilizar ácidos grasos de cadena alifática no lineal (o ramificada). Por tanto, el solicitante ha demostrado que el empleo de ácidos grasos (libres o no) de cadena alifática ramificada, permite obtener productos de tipo lubricante que presentan una buena estabilidad térmica, una buena resistencia a la oxidación, una buena viscosidad, una buena biodegradabilidad así como puntos de fusión (o puntos de fluidez) bajos.
Por tanto, existe una necesidad auténtica de disponer de procedimientos que permitan producir eficazmente ácidos grasos ramificados. La presente invención proporciona precisamente una solución ventajosa a estas necesidades describiendo procedimientos basados en la modificación genética de plantas.
Por tanto, un primer aspecto de la invención se refiere a un procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados por medio de plantas genéticamente modificadas.
Otro aspecto de la invención se refiere a plantas genéticamente modificadas que pueden producir ácidos grasos ramificados y a un procedimiento de preparación de tales plantas. Otro aspecto de la invención se refiere igualmente a células de plantas que contienen un ácido nucleico recombinante que codifica para un producto que induce o estimula la síntesis en dicha célula de ácidos grasos ramificados.
La presente invención se refiere igualmente al ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente y a cualquier vector que lo contenga.
Descripción detallada de la invención
La presente invención se refiere por tanto a un procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados a partir de plantas genéticamente modificadas, a plantas y células de plantas genéticamente modificadas que producen ácidos grasos ramificados, así como a ácidos nucleicos recombinantes y vectores que los contienen, utilizables para este fin.
En el sentido de la invención, por ácido graso ramificado se entiende cualquier ácido graso que tiene una cadena alifática ramificada auténtica. Tal como se entiende a partir del texto de la presente solicitud, el término "ramificado" se refiere en el sentido de la invención a ácidos grasos que tienen una o varias sustituciones, sobre una o varias posiciones distintas de la cadena alifática. Por tanto, simplemente la presencia de un ciclo en la cadena alifática no es suficiente para calificar a un ácido graso de ramificado según la invención. Se trata preferiblemente de un ácido graso que tiene una cadena alifática de C6 a C24, incluso más preferiblemente de C12 a C24. Ejemplos de tales ácidos, esencialmente en forma saturada y todavía no ramificada, son especialmente el ácido cáprico (C10), láurico (C12), mirístico (C14), palmítico (C16), esteárico (C18), eicosanoico (C20), docosanoico (C22), tetracosanoico (C24) y mezclas de los mismos. La cadena alifática de los ácidos grasos ramificados de la invención puede estar ramificada en una o varias posiciones por grupos diferentes. Ventajosamente, la cadena alifática comprende de una a cuatro ramificaciones localizadas en la parte central de la cadena alifática y/o en su parte terminal opuesta a la función ácida. Más preferiblemente, la o las ramificación/ramificaciones está(n) localizada(s) en uno o varios carbonos comprendidos entre las posiciones 8 y 15 de la cadena alifática. Además, el grupo ramificado puede ser cualquier grupo alquilo, preferiblemente un alquilo de C1 a C5, incluso más preferiblemente un metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, terc-butilo. Un grupo ramificado particularmente preferido es un grupo metilo. Ácidos grasos ramificados particulares en el sentido de la invención son, por ejemplo, el ácido 9-metiloctadecanoico; el ácido -10metiloctadecanoico; el ácido 9,12-dimetiloctadecanoico; el ácido 10,12-dimetiloctadecanoico; el ácido 9,13-dimetiloctadecanoico; el ácido 10,13-dimetiloctadecanoico; el ácido 9,12-dimetiloleico; el ácido 10,12-dimetiloleico; el ácido 9,13-dimetiloleico; el ácido 10,13-dimetiloleico o incluso el ácido 2,4,6,8-tetrametildecanoico.
Además, los ácidos grasos ramificados según la invención pueden ser ácidos grasos ramificados en forma libre o en forma de derivados. Puede tratarse especialmente de ésteres de ácido graso ramificado, tales como monoésteres, diésteres o triésteres del glicerol (triglicérido). En el caso de di- o triglicéridos, además no es necesario que la totalidad de los ácidos grasos presentes en la molécula estén ramificados. Por tanto, un triglicérido puede comprender 1, 2 ó 3 ácidos grasos ramificados. No obstante, es preferible que la proporción de ácidos grasos ramificados en los ésteres u otros derivados sea elevada.
Un primer objeto de la invención se refiere más particularmente a un procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados, caracterizado porque dichos ácidos grasos ramificados se producen a partir de al menos una célula vegetal o de un material vegetal o de una planta que comprende al menos una célula vegetal, comprendiendo dicha célula vegetal en su genoma un ácido nucleico recombinante que codifica para un producto que induce o estimula la síntesis de ácido(s) graso(s) ramificado(s).
En el sentido de la invención, se denomina "ácido nucleico recombinante" a cualquier ácido ribonucleico o desoxirribonucleico construido mediante técnicas de ingeniería genética. Puede tratarse particularmente de un ADN complementario, de un ADN genómico o de un ARN mensajero. Un ácido nucleico de este tipo puede ser además de diversos orígenes, especialmente bacteriano, viral, vegetal, de mamíferos, sintético o semisintético. Un ácido nucleico recombinante puede prepararse utilizando técnicas conocidas por el experto en la técnica, y especialmente mediante cribado de bancos de ácidos nucleicos con sondas apropiadas, mediante síntesis química (utilizando sintetizadores de ácidos nucleicos), mediante digestiones/ligaciones enzimáticas, etc., o cualquier combinación de estos métodos.
La presente invención puede ponerse en práctica con diferentes tipos de plantas, preferiblemente plantas cultivables en campos. Se trata ventajosamente de una planta oleaginosa, tal como por ejemplo la colza, el girasol, el cacahuete, la soja, el lino (oleaginoso) o incluso el maíz. Igualmente puede tratarse de una planta de tipo tabaco.
Las células de plantas según la invención pueden ser cualquier célula de plantas tales como se definieron anteriormente en el presente documento. Puede tratarse más preferiblemente de una célula de planta cultivable, y que puede regenerar una planta. El término "material vegetal" designa cualquier parte de una planta tal como se definió anteriormente en el presente documento, que comprende al menos una célula. Puede tratarse de cualquier tejido de dicha planta, tal como especialmente semillas.
Por tanto, la célula o planta según la invención está genéticamente modificada, de manera que comprende en su genoma en forma libre o integrada, un ácido nucleico recombinante que codifica para un producto que induce o estimula la síntesis de ácido graso ramificado. Las plantas y células de plantas de la invención comprenden por tanto ácidos grasos de los que una fracción está constituida por ácidos grasos ramificados. Según las aplicaciones previstas, puede resultar ventajoso que esta fracción represente una proporción sustancial de los ácidos grasos totales. Ventajosamente, el ácido nucleico recombinante está presente en la célula en forma integrada al genoma de dicha célula, de manera que es más estable de manera segregacional.
Se denomina un producto como que induce la síntesis de ácido graso ramificado cuando permite a la célula de planta que lo contiene realizar una síntesis que no habría podido realizar en su ausencia. Se habla de un producto que estimula la síntesis de ácido graso ramificado, cuando se trata de un producto que permite a la célula de planta que lo contiene favorecer una vía de síntesis preexistente en dicha célula pero nada o poco explotada por la misma, por ejemplo, por motivos de estequiometría o de especificidad de sustrato. El ácido nucleico recombinante utilizado en la presente invención puede codificar más particularmente, para un producto que puede inducir una ramificación de los ácidos grasos producidos por la célula tras la síntesis o para un producto que permite realizar una ramificación concomitante a dicha síntesis. Además, estos dos enfoques pueden combinarse.
Los ácidos grasos se sintetizan por las células de plantas en el cloroplasto. Esta síntesis comprende varios ciclos repetitivos en el transcurso de los cuales se añaden unidades carbonadas sucesivamente entre sí para generar la cadena alifática grasa. Tras su síntesis, estos ácidos grasos lineales se exportan hacia el citoplasma en el que experimentan diferentes modificaciones tras la síntesis (o tras la elongación) y especialmente desaturación por enzimas denominadas desaturasas.
En un primer modo de realización, el ácido nucleico recombinante codifica para un producto que permite inducir o estimular la ramificación tras la síntesis de los ácidos grasos producidos por dicha célula de planta. Más particularmente, según este primer modo de realización de la invención, el ácido nucleico recombinante codifica para una enzima, por ejemplo, una metil transferasa o una ciclopropano ácido graso sintasa, que permite la transferencia de uno o varios grupos alquilo sobre el o los doble(s) enlace(s) de los ácidos grasos insaturados.
Los grupos alquilo transferidos pueden ser, tal como se indicó anteriormente en el presente documento, cualquier grupo alquilo que comprende de 1 a 5 átomos de carbono preferiblemente. Se trata ventajosamente de grupos alquilo que comprenden de 1 a 3 átomos de carbono y especialmente del grupo metilo, etilo, propilo o isopropilo.
Ventajosamente, el ácido nucleico recombinante codifica para una enzima heteróloga, es decir, una enzima procedente de un organismo distinto a una célula de planta. Más particularmente, la enzima utilizada procede ventajosamente de un microorganismo procariota o eucariota tal como, por ejemplo, una bacteria o una levadura.
Pueden mencionarse, a título ilustrativo de los ácidos nucleicos recombinantes según la invención, un ácido nucleico recombinante que codifica para la ciclopropano ácido graso sintasa, denominada CFAS. El ácido nucleico puede igualmente codificar para metil transferasa tal como, por ejemplo, SAM-metil transferasa, es decir, enzimas que pueden catalizar la transferencia de un grupo metilo desde la SAM (S-adenosil-metionina) hacia un ácido graso insaturado o más generalmente hacia un doble enlace de una cadena alifática. Un ácido nucleico recombinante particular en el sentido de la invención codifica, por ejemplo, para la ciclopropano ácido graso sintasa tal como se describe por Wang et al (Biochemistry 31(1992) 11020) o para cualquier enzima análoga a ésta última. En el sentido de la presente invención, se entiende por el término "análogo" cualquier enzima que tiene una o varias modificaciones estructurales con respecto a la enzima descrita anteriormente en el presente documento y que conserva una actividad de transferencia de grupo alquilo sobre los dobles enlaces de la cadena alifática. Estas modificaciones estructurales pueden ser mutaciones, deleciones, substituciones o adiciones de uno o varios aminoácidos. El término "análogo" comprende igualmente las secuencias homólogas obtenidas a partir de otros organismos. Otro "análogo" es una enzima producida por un ácido nucleico que se hibrida con toda o parte de la secuencia de la transferasa o la sintasa y que conserva una actividad de igual naturaleza. La hibridación se realiza ventajosamente en condiciones de rigurosidad normal, o más preferiblemente fuerte. Condiciones de hibridación rigurosa son por ejemplo: hibridación a 42ºC, formamida al 50%, 5 X SSC, 1 X Denhardt; lavado a 65ºC en 0,1 X SSC, SDS al 0,1%. Condiciones de hibridación no rigurosas son por ejemplo: hibridación a 37ºC, formamida al 40%, 5 X SSC, 1 X Denhardt; lavado a 50ºC en 1 X SSC, SDS al 0,1%. Las condiciones rigurosas están particularmente adaptadas cuando el ácido nucleico de prueba está presente en poca cantidad y/o en forma poco purificada. Las condiciones no rigurosas están más adaptadas cuando el ácido nucleico de prueba está presente en cantidades más importantes y se encuentra en forma significativamente representada en la muestra. Otras condiciones de hibridación se conocen bien por el experto en la técnica (véase especialmente Maniatis et al). Otro ejemplo particular de ácidos nucleicos recombinantes según la invención es un ácido nucleico recombinante que codifica para la metil-transferasa responsable de la síntesis del ácido 9-metil-10-hexadecenoico en Corynebacterium spp. (Niepel et al., J. Bact. 180 (1998) 4650) o en una variedad de algas (Carballeira et al., Lipids 32 (1997) 1271).
Además, este modo de realización que consiste en transferir un grupo alquilo sobre una cadena alifática recurre a grupos alquilo o donadores de alquilo presentes en dicha célula. Con respecto a esto, para la transferencia de un grupo metilo, las reservas de la célula están principalmente constituidas por el grupo SAM. Además, con el objetivo de mejorar aún la eficacia de esta reacción, y por tanto el rendimiento en ácidos grasos ramificados, un modo de realización particular consiste en introducir en la célula de planta, además del ácido nucleico que codifica para el producto definido anteriormente en el presente documento, un segundo ácido nucleico que codifica para una enzima implicada en la síntesis del dador de alquilo. Preferiblemente, se trata un ácido nucleico que codifica para una enzima de síntesis de SAM. Aún más preferiblemente, se trata de un ácido nucleico que codifica para la SAM sintetasa o un análogo de la misma. Este ácido nucleico puede introducirse por medio de un segundo ácido nucleico recombinante, de manera simultánea al primero o de manera secuencial. Según otro modo de puesta en práctica, los ácidos nucleicos que codifican para las dos enzimas están en el mismo ácido nucleico recombinante.
Según un segundo modo de realización de la presente invención, el ácido nucleico recombinante contenido en la célula de planta codifica para un producto que permite inducir o estimular la incorporación en la cadena alifática de ácido graso en curso de elongación, de grupos que generan una o varias ramificaciones. Según este segundo enfoque, no se trata ya de realizar una modificación tras la síntesis en los ácidos grasos producidos, sino de realizar una ramificación de manera concomitante a dicha síntesis.
Este modo de realización se obtiene preferiblemente forzando la célula de planta a utilizar, como sustrato para la síntesis de la cadena alifática, un grupo acil-CoA que comprende un número de átomos de carbono superior a 3, preferiblemente entre 4 y 8 en lugar de malonil-CoA. Ventajosamente, el sustrato utilizado es un grupo acil-CoA no lineal. Aún más preferiblemente, se trata de un grupo acil-CoA no lineal que permite la incorporación en la cadena alifática en curso de elongación de un grupo con un número impar de átomos de carbono. Esta estrategia permite por ejemplo obtener ácidos grasos ramificados denominados de múltiples ramas, tales como, por ejemplo, el ácido 2,4,6,8-tetrametildecanoico. Un ejemplo particular de sustrato de tipo acil-CoA es por ejemplo el metilmalonil-CoA. El metilmalonil-CoA es un grupo no lineal, que comprende 4 átomos de carbono, de los cuales tres sirven para la elongación. En este caso, con el objetivo de forzar a la planta a utilizar este sustrato para la síntesis de la cadena alifática, resulta particularmente ventajoso introducir en la célula de la planta un ácido nucleico recombinante que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa (E.C. Nº 4.1.1.9). El modo de acción de esta enzima, así como de manera más general la vía de síntesis de los ácidos grasos ramificados por las células modificadas según esta estrategia, se representa en la figure 1. Se entiende que en la presente invención puede utilizarse cualquier otra enzima análoga a la mencionada anteriormente en el presente documento que pueda forzar a la planta a utilizar un acil-CoA que comprende más de 3 átomos de carbono, preferiblemente de 4 a 8, como sustrato en la síntesis de las cadenas alifáticas de los ácidos grasos. A título de ejemplo particular de tales enzimas, puede mencionarse especialmente la malonil-CoA descarboxilasa cuya secuencia nucleotídica se ha descrito en la bibliografía (véanse los ejemplos), así como cualquier análogo de la misma.
Este segundo modo de realización puede obtenerse igualmente modificando la especificidad de las enzimas implicadas en la síntesis de la cadena alifática grasa, especialmente modificando la especificidad de la enzima que impide la transferencia de malonil-CoA sobre el malonil-ACP, y en particular la especificidad de toda o parte de la ácido graso sintasa, de la acetil-CoA carboxilasa o de la acetil-CoA transacilasa. Con respecto a esto, la ácido graso sintasa está constituida por un complejo multienzimático y la modificación de su especificidad puede obtenerse mediante modificación de una, varias, o incluso todas las subunidades.
Además, tal como se indicó anteriormente en el presente documento, estos dos modos de realización pueden combinarse para generar células de plantas que pueden sintetizar ácidos grasos de cadena alifática ramificada tanto en la etapa de la elongación como tras la elongación.
Para la puesta en práctica de la presente invención, el ácido nucleico recombinante comprende ventajosamente regiones reguladoras, de tipo promotor, funcionales en las células de plantas y que permiten controlar la expresión de los ácidos nucleicos definidos anteriormente en el presente documento. Entre las regiones reguladoras de la transcripción utilizables en las plantas y en la puesta en práctica de la presente invención, pueden mencionarse, por ejemplo, las regiones asociadas al virus del mosaico de la coliflor (35S, 19S) o las regiones promotoras de genes estructurales tales como los genes de la nopalina sintasa (nos) o la octopina sintasa (ocp) o la manopina, la agropina o la proteína portadora de acilo (ACP). La estructura y la clonación de estas regiones diferentes se han descrito en la bibliografía. De manera más general, cualquier promotor que permita una expresión constitutiva, espacial o temporal de un ácido nucleico en una célula de planta puede utilizarse para la puesta en práctica de la presente invención. Con respecto a esto, es especialmente posible utilizar promotores que permiten una expresión localizada en ciertos tejidos o partes de la planta (semilla, polen, etc.), o promotores cuya actividad depende del estado de desarrollo de la planta (elongación, floración, etc.). Como promotor que tiene una expresión mayoritaria en las semillas puede mencionarse, por ejemplo, el promotor de la ACP, de la napina o los promotores descritos por Krebbers et al. (Plant Physiol. 87 (1988) 859). El empleo de tales promotores puede evitar cualquier posible efecto secundario inducido por una producción masiva y generalizada de ácidos grasos ramificados en la planta, e igualmente facilitar la recuperación de los ácidos grasos así producidos, concentrándolos en ciertas regiones de la planta.
Además, resulta igualmente ventajoso introducir en los ácidos nucleicos recombinantes según la invención, secuencias terminadoras localizadas en 3' que pueden derivarse o bien directamente del gen utilizado o bien proceder de regiones de otros genes, tales como especialmente los de la nopalina sintasa (nos) o incluso de la octopina sintasa (ocp) de la manopina, de la agropina o de la ACP.
Por tanto, el ácido nucleico recombinante que comprende ventajosamente una región reguladora de la transcripción, un gen o una región que codifica para un principio activo tal como se definió anteriormente en el presente documento, y regiones terminadoras en 3', se introduce ventajosamente en un vector plasmídico de clonación o de expresión.
Con respecto a esto, otro objeto de la invención se refiere más particularmente a un ácido nucleico recombinante que comprende:
- un ácido nucleico que codifica para un producto tal como se definió anteriormente en el presente documento,
- un promotor que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y que puede provocar una expresión de este ácido nucleico localizada en ciertos tejidos vegetales o ciertas partes vegetales, y,
- una región en 3' de terminación de la transcripción.
Más particularmente, el promotor comprendido en las construcciones genéticas de la invención es un promotor que puede provocar una expresión del ácido nucleico localizada en la semilla de la planta. El término "expresión localizada" significa que la expresión es especialmente más importante en el tejido afectado que en los otros tejidos vegetales. Sin embargo, se entiende que no se requiere una especificidad absoluta de la expresión, ya que se observa una expresión significativa en los tejidos investigados. El carácter localizado de la expresión según la invención es doblemente ventajoso ya que facilita por una parte la recuperación de los ácidos grasos ramificados y porque limita los riesgos de toxicidad (especialmente sobre el buen crecimiento y la reproducción) de los productos expresados en las plantas modificadas.
Los ácidos nucleicos recombinantes de la invención pueden comprender además señales de direccionamiento, que permiten mejorar el direccionamiento de las proteínas sintetizadas hacia los compartimientos celulares en los que ejercen su actividad. Cuando el producto sintetizado es un producto implicado en la transferencia de grupos alquilo sobre cadenas grasas tras la elongación, la proteína ejerce su actividad en el citoplasma y por tanto no necesita señales de direccionamiento particulares. Cuando el producto interviene sobre la propia síntesis de las cadenas grasas, ejerce su actividad en el seno de los cloroplastos y puede ser ventajoso utilizar una señal que permite el direccionamiento de este producto hacia el cloroplasto. Tales señales se conocen en la técnica anterior.
Otro objeto de la invención se refiere a un ácido nucleico recombinante que comprende:
- un ácido nucleico que codifica para una metil-transferasa que puede catalizar la transferencia de un grupo metilo hacia la cadena alifática de un ácido graso insaturado,
- un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y,
- una región en 3' de terminación de la transcripción.
En otro modo de realización particular, la invención tiene por objeto un ácido nucleico recombinante que comprende:
- un ácido nucleico que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa,
- un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y,
- una región en 3' de terminación de la transcripción.
Otro objeto de la presente invención se refiere igualmente a un vector que comprende un ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente en el presente documento. Un vector de este tipo puede derivarse especialmente del vector Ti. Los vectores de la invención pueden utilizarse para producir cantidades importantes de ácidos nucleicos recombinantes en las células, o para producir las enzimas correspondientes, o para transformar células vegetales.
La presente invención se refiere igualmente a cualquier célula de planta que comprende un ácido nucleico recombinante o un vector tal como se definieron anteriormente en el presente documento.
Los ácidos nucleicos recombinantes o vectores de la invención pueden introducirse en las plantas mediante cualquier técnica conocida por el experto en la técnica, y especialmente mediante técnicas químicas, físicas o biológicas. Las técnicas químicas implican, por ejemplo, el empleo de agentes transfectantes que facilitan la penetración celular. Las técnicas físicas son, por ejemplo, la electroporación, el bombardeo, las "pistolas génicas" ("gene guns"), etc. Una técnica biológica bien conocida y particularmente eficaz consiste en utilizar infiltraciones a vacío o co-cultivos, vectores virales o, preferiblemente, Agrobacterium tumefaciens, que permiten introducir material genético en las células de plantas por medio del plásmido Ti. Estas técnicas se conocen bien por el experto en la técnica. Tras la transformación, se seleccionan las células de plantas que realmente contienen el ácido nucleico según la invención. Estas células pueden mantenerse entonces en cultivo, eventualmente multiplicarse en cultivo, y utilizarse directamente para la producción de ácidos grasos ramificados (cultivos discontinuos ("batch"), semi-continuos ("fed batch"), etc.). Estas células pueden almacenarse igualmente con vistas a un uso posterior. Estas células pueden utilizarse igualmente para regenerar plantas transgénicas, según las técnicas clásicas de la biología vegetal.
Otro objeto de la invención se refiere por tanto a un procedimiento de preparación de una planta transgénica que puede producir ácidos grasos ramificados, que comprende la introducción de un ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente en el presente documento en una célula o parte de planta y la regeneración, a partir de estas células o partes de plantas, de una planta transgénica. Ventajosamente, la introducción se realiza utilizando agrobacterias. En un modo particular, la introducción se realiza sobre células de plantas o discos foliares. La regeneración se realiza mediante cualquier técnica conocida por el experto en la técnica.
Otro objeto de la invención se refiere a una planta transgénica cuyas células contienen un ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente y que codifica para las enzimas que permiten inducir o estimular la ramificación tras la síntesis de los ácidos grasos producidos por dicha célula de planta, o secuencias que permiten inducir o estimular la incorporación, en la cadena alifática de ácido graso en curso de elongación, de grupos ramificados.
Las plantas transgénicas de la invención contienen el ácido nucleico recombinante integrado de manera estable en su genoma, tanto en el de las células germinales como el de las células somáticas.
La invención se refiere igualmente a cualquier material vegetal procedente de una planta de este tipo, y especialmente las semillas.
La invención se refiere igualmente a un procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados mediante cultivo de una célula tal como se definió anteriormente en el presente documento y recuperación de los ácidos grasos producidos.
La invención se refiere igualmente a un procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados mediante cultivo celular de una célula de planta que comprende:
- el cultivo de estas células en un medio apropiado para su crecimiento,
- la extracción y la purificación de los ácidos grasos ramificados a partir de la biomasa celular, y especialmente a partir de estas células o del sobrenadante de dicho cultivo.
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La invención se refiere además a un procedimiento de preparación de ácidos grasos ramificados mediante extracción a partir de una planta transgénica cuyas células contienen un ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente en el presente documento, según el cual dichos ácidos grasos se recuperan a partir de cualquier parte de dicha planta, y especialmente de las semillas de dicha planta.
La invención se refiere a un procedimiento de preparación de ácidos grasos ramificados a partir de una planta transgénica cuyas células contienen un ácido nucleico recombinante que comprende:
- el cultivo en campos de dichas plantas transgénicas;
- la recuperación de las semillas de dichas plantas;
- la extracción de los ácidos grasos a partir de estas semillas.
El procedimiento de la invención está particularmente adaptado a la producción de ácidos grasos metilados no cíclicos, especialmente de ácidos grasos en C16 o C18 que tienen uno o varios grupos metilo. A título de ejemplos preferidos, pueden mencionarse los ácidos metil-9-octadecanoico, metil-10-octadecanoico, metil-9-hexadecanoico y metil-10-hexadecanoico.
En los procedimientos de producción de ácidos grasos ramificados tal como se definieron anteriormente en el presente documento, puede realizarse una etapa facultativa de tratamiento de los ácidos grasos, con el fin de mejorar aún más las propiedades fisicoquímicas de estos compuestos. Por tanto, los procedimientos de la invención comprenden especialmente:
- una etapa de extracción de los ácidos grasos ramificados a partir de las células, semillas o plantas, y,
- una etapa de tratamiento de los ácidos grasos para mejorar sus propiedades fisicoquímicas.
La extracción puede realizarse mediante métodos clásicos conocidos por el experto en la técnica mencionados anteriormente en el presente documento.
Más preferiblemente, la etapa de tratamiento es una etapa de hidrogenación, realizada en condiciones habituales o fuertes, que conduce a la formación de ácidos grasos ramificados saturados. Más específicamente, la hidrogenación puede realizarse en las condiciones descritas por Christie W. W. (Topics in Lipid Chemistry, 1970, Vol. 1, FD Gunstone, ed. Londres: Logus Press), incorporada al presente documento como referencia, dado el caso en presencia de un catalizador de paladio.
La invención se refiere más generalmente al uso de una planta transgénica regenerada a partir de una célula tal como se definió anteriormente en el presente documento, para la producción de ácidos grasos ramificados.
La invención se refiere igualmente al uso de una planta o parte de una planta transgénica en la que al menos algunas de las células comprenden un ácido nucleico recombinante tal como se definió anteriormente en el presente documento, para la producción de ácidos grasos ramificados.
Los inventores han demostrado especialmente que los ésteres de ácidos grasos ramificados tal como se definen en la invención tenían una buena resistencia a la oxidación y puntos de fluidez bajos, y tenían por tanto propiedades ventajosas para su uso como lubricantes.
Los ésteres de ácidos grasos ramificados tal como se definieron anteriormente en el presente documento pueden utilizarse como lubricantes, especialmente para la preparación de composiciones de aceite, en particular de aceite de motor y de aceite hidráulico, especialmente en la sustitución de bases no convencionales o sintéticas (tales como ésteres, polialfaolefinas, etc.).
Una composición lubricante puede comprender ácidos grasos ramificados tal como se describieron anteriormente en el presente documento, y uno o varios aditivos, tales como especialmente agentes antidesgaste, modificadores de la presión, tensioactivos, etc.
La presente solicitud se describirá más en detalle con ayuda de los ejemplos siguientes, que deben considerarse como ilustrativos y no limitativos.
Leyenda de las figuras
Figura 1: esquema de la síntesis de los ácidos grasos en el cloroplasto de las células de planta.
Figura 2: representación de un ácido nucleico recombinante que comprende un gen que codifica para una transferasa bajo el control del promotor CaMV 35S (figura 2A) o nos (figura 2B).
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Figura 3: representación de un ácido nucleico recombinante que comprende un gen que codifica para la SAM sintasa.
Figura 4: mapa de restricción del gen cfa.
Figura 5: representación de un casete de regulación de un gen que puede estimular la producción de ácidos grasos ramificados.
Figura 6: esquema de construcción del casete de regulación del gen cfa.
Figura 7: construcción del vector pTDEcfa.
Figura 8: transformación de los discos foliares y regeneración de las plantas. A: co-cultivo de agrobacterias-discos foliares; B: 2ª semana de cultivo; C: 5ª semana de cultivo; D: arraigo de brotes; E: plántula a partir de esquejes in vitro.
Figura 9: representación de un ácido nucleico recombinante que comprende un gen que codifica para la malonil-CoA descarboxilasa.
Ejemplo A Construcción de una célula de planta genéticamente modificada que puede producir ácidos grasos ramificados mediante alquilación tras la elongación
Este ejemplo ilustra la construcción de plantas genéticamente modificadas que pueden producir ácidos grasos ramificados mediante alquilación tras la elongación, más particularmente mediante metilación tras la elongación. Particularmente, este ejemplo describe la inserción mediante ingeniería genética en el genoma de la planta de un gen o de un conjunto de genes que codifican para:
\bullet por una parte, una o varias transferasas, por ejemplo, metilasas o metiltransferasas (del tipo ciclopropano ácido graso sintasa, es decir CFA sintasa, por ejemplo) que pueden catalizar la adición de grupos metilo (u otros alquilos: etilo, propilo, isopropilo...) sobre los dobles enlaces de ácidos grasos insaturados; y,
\bullet por otra parte, de uno o varios genes que permiten aumentar el conjunto de grupos dadores de metilo (S-adenosil-metionina, es decir, SAM), especialmente del gen que codifica para la S-adenosil-metionina sintetasa (SAM sintetasa).
La construcción de estas plantas transgénicas según la invención se realiza según las etapas siguientes.
Etapa 1
Material vegetal utilizado
Las plantas modelo de tabaco de tipo SR1 (Horsch et al., 1985 Science, 22, 1229-1231) o BY2 (Nagata et al., 1992 Int. Rev. Of Cytol., 132, 1-30) se utilizan, en primer lugar, para realizar los experimentos. De hecho, estos dos especies modelo pueden transformarse fácilmente mediante Agrobacterium tumefaciens (Van Lijsebettens et al., 1986, J. Mol. Biol., 188,129-145; Shaul et al. 1986; Shaul et al., 1996 Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93, 4868-4872) y permiten la regeneración de plantas nuevas. Por supuesto todas las plantas oleaginosas tales como colza, girasol, cacahuete, soja, maíz, etc. pueden utilizarse de la misma manera.
Etapa 2
Constructos génicos
La transformación genética consiste en la introducción de un ácido nucleico recombinante que comprende un casete de expresión que comprende el gen a transferir, el promotor de expresión de este gen que podrá permitir una expresión constitutiva, espacial o temporal, y una región en 3' de terminación de la transcripción. A continuación se describen los diferentes elementos genéticos utilizados y la construcción de los ácidos nucleicos recombinantes correspondientes (figuras 2 y 3).
2.1. Selección y aislamiento de los ácidos nucleicos que codifican para las enzimas
En este ejemplo se utilizan ácidos nucleicos que codifican para metilasas o metiltransferasa que proceden de organismos procariotas o eucariotas y cuyas secuencias codificantes son análogas a la secuencia codificante de la ciclopropano ácido graso sintasa descrita por Wang et al. (1992 Biochemistry, 31, 11020-11028). Más particularmente, se aísla un ácido nucleico que codifica para la ciclopropano ácido graso sintasa y se verifica su secuencia.
Además, para mejorar la eficacia del procedimiento, en un modo de realización particular, puede utilizarse un segundo ácido nucleico, que codifica para la SAM sintetasa cuya secuencia nucleotídica está descrita por Peleman et al. (1989 Plant Cell, 1, 81-93).
2.2. Selección de las regiones promotoras
Para la construcción de los ácidos nucleicos recombinantes, pueden utilizarse diferentes tipos de promotores, y en particular cualquier promotor funcional en las plantas y que permite el control de la expresión de los genes.
Con respecto a esto, pueden citarse los promotores que permiten una expresión localizada en las semillas (o algunos tejidos de las semillas) de plantas, tales como especialmente el promotor del gen que codifica para la prolamina (Zhou et al, Transgenic Res. 2 (1993) 141), el promotor del gen que codifica para la lectina de guisantes (Pater et al., Plant J. 6 (1994) 133), el promotor del gen que codifica para las LEA ("Late Embryogenesis Abundant protein") (Goupil et al., Plant. Mol. Biol. 18 (1992) 1049), el promotor del gen que codifica para la familia de las proteínas napina (NAP) (Boutilier et al., Plant. Mol. Biol. 26 (1994) 1711), el promotor del gen que codifica para la gluterina del arroz (Zhao et al., Plant. Mol. Biol. 25 (1994) 429), el promotor del gen que codifica para la oleosina (Keddie et al., Plant. Mol. Biol. 19 (1992) 443), el promotor del gen que codifica para la familia S de las proteínas de almacenaje (promotor 2S del gen napA, promotor 11S o 12S del gen de la globulina), el promotor del gen que codifica para la beta-faseolina, la legumina, la conglutina gamma, la concanavalina A, la desaturasa Bn10 (Plant. Physiol. 104, 1167), la alfa/béta gliandina de trigo, la catalasa CatA del arroz, la alfa-kafirina de sorgo o además la Adh1 del maíz (Kyozuka et al., PlantCell 6 (1994) 799) o la proteína SBP65 del guisante (Dehaye et al., Plant Mol. Biol. 65 (1997) 605).
En este ejemplo, los promotores utilizados son el promotor 35S del virus de mosaico de la coliflor y el promotor del gen de la nopalina sintasa (nos): La estructura de estos promotores se ha descrito por ejemplo por Benfey y Chua (1990, Science, 250 959-966).
2.3. Selección de las regiones de terminación de la transcripción
En este ejemplo, les regiones de terminación de la transcripción utilizadas proceden o bien directamente del gen utilizado (figura 3), o bien de los genes de la nopalina sintasa (nos) y de la octopina sintasa (ocs).
2.4. Construcción de los ácidos nucleicos recombinantes (vectores)
Para construir los ácidos nucleicos recombinantes que permiten introducir los elementos mencionados anteriormente en el presente documento en las células de plantas, estos elementos genéticos se aíslan y se subclonan previamente en vectores de clonación de tipo pBR322 y pUC, que llevan marcadores que permiten la selección de los transformantes que proporcionan una resistencia a agentes citotóxicos tales como antibióticos, toxinas, etc. Los casetes de expresión se introducen a continuación en vectores binarios que comprenden las secuencias necesarias para la transformación de las plantas, en particular, el vector ADN-T. Este vector se utiliza para la transformación de las plantas y la estructura de los vectores que contienen las secuencias específicas de reconocimiento (RB y LB) se ha descrito ampliamente en la bibliografía (Libro de Hoekema, the binary Plant Vector Systems, Offsetdrukkerij Kanters B.V., Alblasserdam, 1985. Molecular genetics of the Bacteria-Plant Interaction, Puhler A. Ed., Springer-Verlag, NY, 1983. Plant Genetic Transformation and Gene expression: A Laboratory Manual Draper J., Scott R., Armitage P., y Walden R. Eds, Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1988. Kahl G. y Weising K., (1993) Genetic engineering of plant cells. En Biotechnology: Genetics Fundamentals and genetic Engineering. Rehm H.J., Reed G., Pühler A. y Stadler P. Eds, VCH Publishers Inc., Nueva York (USA) Vol 2, pp 547-659).
La estructura de los ácidos nucleicos recombinantes preparados de este modo se representa en las figuras 2 y 3.
En otro ejemplo particular, el vector binario pTDEcfa se construyó tal como sigue.
a) Clonación y caracterización del gen cfa que codifica para la ciclopropano ácido graso sintasa
Tras la lectura de los trabajos de Wang (Wang et al., 1992) se ha notado una ambigüedad relativa al tamaño del fragmento ClaI presente en el plásmido pAYW19. Además, Wang et al. (1992) presenta, en la estrategia de secuenciación, el fragmento ClaI con un sitio único de restricción para la enzima HindII en sentido 5' del sitio ClaI. Sin embargo, según la secuencia publicada este sitio aparece en sentido 3' del sitio ClaI. Por tanto en una primera etapa se ha realizado la verificación de la integridad y la caracterización de la estructura completa del gen cfa. A tal efecto, se ha realizado un mapa de restricción del gen cfa presente en el plásmido pAYW19 con diferentes enzimas de restricción. El análisis de los tamaños de los fragmentos obtenidos tras la restricción, electroforesis en gel de agarosa y coloración de los fragmentos con bromuro de etidio ha permitido trazar el mapa físico de este gen, presentado en la figura 4. Estos resultados se han confirmado por la secuenciación del fragmento en sentido 3' del sitio HindII. La secuencia completa y corregida del gen cfa se ha informatizado e introducido en un programa (DNAstrider) que permite estudiar los sitios de restricción.
b) Construcción del vector binario pTDEcfa
Este ejemplo describe la construcción del vector binario pTDEcfa que lleva un casete de expresión del gen cfa corregido, bordado con las regiones LB y RB del plásmido Ti. Este vector binario permite la transferencia, mediante A. tumefaciens, de dicho casete en el genoma de las células vegetales.
i) Construcción del plásmido pBSgus
Se construye el plásmido pBSgus mediante clonación del fragmento EcoRI-HindIII que procede del vector binario pTDE4 en el vector pBS (pBluescript, BRL) que sólo contiene muy poco del sitio de restricción. El fragmento EcoRI-HindII contiene el promotor p35S y el terminador 3'nos. Así el vector constituido, pBSgus, contiene los sitios únicos de restricción para las enzimas Ncol y Nrul. Estas dos enzimas permiten aislar el gen gus conservando la integridad de las secuencias reguladoras (p35S y 3'nos).
ii) Creación del casete de expresión del gen cfa corregido
El principio de esta etapa reside en la sustitución del gen gus del plásmido pBSgus por un sitio de clonación que comprende sitios únicos. Este casete se ha creado mediante PCR, a partir del pBSgus, y contiene el promotor p35S y el terminador 3'nos. Se han seleccionado los cebadores necesarios para la PCR de manera que se crea la estructura presentada en la figura 5. La elección de los dos sitios únicos de restricción está condicionada por la necesidad que estén ausentes del p35S, del 3'nos, del vector de clonación en el que la estructura va a integrarse y del gen cfa que va a integrarse entre las 2 secuencias reguladoras. Tras el análisis de las diferentes secuencias, se han identificado dos sitios posibles: Nhel y Nrul. Se ha realizado la construcción del casete tal como sigue (figura 6):
- Clonación del casete de regulación en el pGEMT para obtener el vector pGEM (35S-3'nos)
- Creación mediante PCR de los sitios Nhel en sentido 5' del gen cfa y Nrul en sentido 3'
- Clonación del producto de PCR en el vector pGEMT para obtener el vector pGEMcfa
- Secuenciación de los vectores pGEM (35S-3'nos) y pGEMcfa.
- Clonación del fragmento NheI-NruI que procede del vector pGEMcfa en el vector pGEM (35S-3'nos) en el que se ha eliminado el fragmento Nhel-Nrul. El vector obtenido mediante esta clonación se denomina pGEM (35S-cfa-3'nos).
- A partir del vector pGEM (35S-cfa-3'nos) se puede aislar un fragmento único EcoRI-HindII que comprende la secuencia (35S-cfa-3'nos).
Tras la optimización de las condiciones de PCR para la creación del casete de regulación (figura 6), ésta se ha clonado en el vector pGEM-T. Por lo tanto tras el análisis mediante restricción con diferentes enzimas el vector pGEM (35S-3'nos) está disponible en dos clones.
Del mismo modo, se ha obtenido el vector pGEMcfa y se han retenido dos clones.
La secuencia deseada de los vectores pGEM (35S-3'nos) y pGEMcfa se ha informatizado y luego introducido en el programa DNAstrider. Se han enviado dos clones para cada vector a la sociedad Génome express para secuenciación.
Los resultados de la secuenciación se han obtenido para los dos clones (2 y 3) que contienen teóricamente el vector pGEMcfa. Tras el alineamiento con la secuencia teórica, la secuencia del vector contenido en el clon 2 presenta varias mutaciones y por lo tanto este clon no podrá utilizarse para la continuación del trabajo. La secuencia del vector contenido en el clon 3 contiene una mutación, sin embargo esta mutación es una mutación denominada "muda" porque no tendrá efecto sobre la secuencia de la proteína CFA.
Los resultados relativos al clon 3 que contiene el vector pGEM (35S-3'nos) no son muy alentadores porque el vector contenido en este clon presenta varias mutaciones. Sin embargo estas mutaciones están relativamente alejadas de las secuencias indispensables para el buen funcionamiento del promotor p35S y del terminador 3'nos. Además, no se ha podido secuenciar el clon 4. Por lo tanto se ha realizado una nueva selección entre los clones contenidos en el vector pGEM (35S-3'nos) y se ha seleccionado el clon 10 para una análisis de su secuencia.
Así, se ha realizado la secuenciación del vector pGEM (35S-3'nos) contenido en el clon 10. Se ha utilizado el método de secuenciación mediante PCR con 3 cebadores (T7, SP6 y un cebador cercano de la secuencia poli CCC). Se ha comparado la secuencia obtenida con la secuencia teórica. Los 2 errores puestos en evidencia justo antes el sitio HinDIII parecen errores en la secuencia teórica y no de secuenciación, puesto que se encuentran de nuevo en las secuencias de los vectores pGEM (35S-3'nos) contenidos en los clones 3 y 4 anteriormente secuenciados.
Partiendo de la base de los resultados de secuencia, el fragmento Nhel-Nrul, que procede del vector pGEMcfa contenido en el clon 3, se ha clonado en el vector pGEM (35S-3'nos) contenido en el clon 10 al nivel de los sitios Nhel y Nrul. Se ha designado el vector obtenido pGEM (35s-cfa-3'nos). Entre los clones obtenidos, se ha realizado una selección mediante el uso de varias enzimas de restricción. Se conservó el clon 13 para la continuación de la clonación.
iii) Construcción del vector binario
El vector binario es un vector que comprende las secuencias LB y RB del plásmido Ti, necesarias para la transferencia de genes en las células vegetales mediante Agrobacterium tumefaciens. El vector binario pTDEcfa se ha construido tal como sigue (figura 7):
- Clonación del fragmento HindIII-EcoRI que procede del vector pGEM (35S-cfa-3'nos) 13 en el vector binario ptde4 en el que se ha eliminado el fragmento HindIII-EcoRI. El vector obtenido se denomina pTDEcfa. Entre los clones obtenidos, se ha realizado una selección mediante el uso de varias enzimas de restricción. Se conservó el clon 8 para realizar la triparental.
- El clon que contiene el vector pTDEcfa (clon 8) se ha utilizado para preparar una cantidad de ADN que se ha probado en un experimento de inmunotransferencia tipo Southern. En este experimento, la sonda que revela mediante hibridación ADN-ADN la presencia del gen cfa se ha realizado a partir del vector inicial pAYW19. Mediante este experimento, se ha podido comprobar mediante el uso de varias enzimas de restricción que el gen cfa está bien integrado en el vector binario entre las 2 secuencias reguladoras: promotor y terminador.
El vector binario se ha transferido a continuación en la bacteria A. tumefaciens, en las condiciones habituales.
Etapa 3
Transformación del vegetal
En un primer momento, protoplastos, células vegetales, tejidos o plantas de tabaco se transforman genéticamente mediante los ácidos nucleicos recombinantes descritos anteriormente en el presente documento, mediante el uso de métodos de transferencia indirecta con la ayuda de un vector tal como las agrobacterias (por ejemplo Agrobacterium tumefaciens: C58C1Rif: pGV2260; Deblaere et al., 1985) o mediante el uso de los métodos de transformación directa (electroporación, bombardeo de partículas, infiltración a vacío, etc., (Kahl y Weising, 1993).
En el caso del uso de transferencia de gen indirecto, las agrobacterias contienen un plásmido que posee las regiones vir (plásmido Ti desarmado) necesarias para la transferencia del ADN-T en las células vegetales.
En una primera etapa facultativa, se transforman las células mediante un ácido nucleico recombinante (figura 3) que codifica para la SAM sintetasa. Luego se seleccionan los transformantes que poseen un potencial elevado de metilación.
Estas líneas, o células aún no transformadas, se transforman genéticamente a continuación con la perspectiva de incluir en su genoma un ácido nucleico recombinante que contiene el gen que codifica para la CFA sintasa descrita anteriormente en el presente documento.
El protocolo utilizado para realizar estas transformaciones se ha descrito por Van Lijsebettens et al. (1986 J. Mol. Biol., 188, 129-145) o catalogado en la bibliografía (Plant Genetic Transformation and Gene Expression: A Laboratory Manual. Draper J., Scott R., Amritage P., y Walden R. Eds, Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1988; Kahl G. Y Weiding K. (1993) Genetic engineering of plant cells. En Biotechnology: Genetics Fundamentals and genetic Engineering. Rehm H.J., Reed G., Pühler A. y Stadler P. Eds, VCH Publishers Inc., Nueva York (USA) Vol. 2, págs. 547-659).
En un ejemplo particular, se han utilizado las células no diferenciadas de tabaco variedad BY2 para la transformación genética. Estas células se cultivan in vitro en medio nutritivo líquido. Cada 10 días, se toman 10 ml de células para inocular 100 ml del medio en un erlenmeyer de 500 ml. El erlenmeyer se coloca sobre un agitador orbital a la velocidad de 140 rpm, en la oscuridad y a 24ºC. Se ha realizado la transformación en células de 3 días de edad. Se toman 2 ml de células y se inoculan con 100 \mul de un cultivo de agrobacterias transformantes de 24 h de edad. La densidad óptica a \lambda=600 nm del cultivo de agrobacterias utilizadas se ajusta a 1,5 unidades. El co-cultivo de agrobacterias/células vegetales se realiza en pequeñas placas de petri durante 2 días a 24ºC y en la oscuridad. Tras el co-cultivo, las células vegetales se aclaran abundantemente con medio nutritivo para eliminar el máximo de agrobacterias. A continuación, las células vegetales se ponen en cultivo en un medio sólido (gelificado). Este medio comprende cefotaxima que permite eliminar el resto de las agrobacterias. Contiene igualmente kanamicina que permite seleccionar las células vegetales que han incluido en su genoma el fragmento LB-RB del vector binario y que expresan el gen que proporciona resistencia a la kanamicina.
Después de 2 a 3 semanas de cultivo se han desarrollado las células vegetales resistentes a la kanamicina. En esta fase se puede tomar una cantidad de biomasa suficiente para ponerla en cultivo en medio líquido para acelerar la producción de biomasa, conservando la presión de selección (kanamicina-cefotaxima). Tras varios ciclos de cultivo y para una parte de la biomasa, se ha eliminado la presión de selección en el medio de cultivo para poder comparar los perfiles lipídicos de esta suspensión con aquellos obtenidos a partir de células de control cultivadas en las mismas condiciones, sin presión de selección.
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Mediante este método, se ha conseguido por lo tanto obtener una suspensión celular resistente a la kanamicina. La presencia del gen que codifica para la CFA en el material genético de esta suspensión se ha confirmado igualmente. Por eso, se han realizado extracciones de ADN (Dellaporta et al. Plant Mol. Biol. Rep. 1 (1983) 19) y se ha llevado a cabo una prueba PCR que utiliza cebadores específicos del gen cfa. El resultado positivo de la PCR muestra la presencia de una banda de tamaño previsto que corresponde al gen cfa.
En otro ejemplo particular, se han preparado discos foliares de 0,5 cm de diámetro a partir de tabaco variedad SR1 cultivado in vitro y transformado. En resumen, se han cultivado los discos 24 en un medio sólido (gelificado) de desdiferenciación celular. A continuación se han inoculado mediante inmersión en un cultivo de agrobacterias transformantes de 24 h de edad y cuya densidad óptica a \lambda=600 nm se ha ajustado a 1 unidad.
Etapa 4
Cultivo y selección de las plantas transformadas
Las células vegetales transformadas por los vectores que contienen los constructos descritas anteriormente en el presente documento se regeneran a continuación a partir de células aisladas, de callos o de discos foliares mediante el uso de las técnicas habituales de cultivos de plantas (Plant Cell Culture: A pratical Approach. Dixon R.A. ed., IRL Press, Oxford, Washington DC., 1985). Las células y plantas transformadas se ponen en cultivo según los procedimientos habituales y descritos en la bibliografía. La selección de las células y plantas transformadas se efectúa en el momento de su cultivo, sobre medio selectivo que contiene un antibiótico o toxina específicos del casete introducido.
En un ejemplo particular, los discos foliares descritos anteriormente en el presente documento se han enjugado sobre un papel secante estéril y luego puesto en co-cultivo 2 días a 24ºC y en la oscuridad sobre el mismo medio sólido de desdiferenciación celular. Tras el co-cultivo, se han aclarado los discos ½ hora en el medio de inducción de los brotes, que contiene cefotaxima y kanamicina. Finalmente, la inducción de los brotes se ha realizado sobre este mismo medio sólido. Cada semana los discos se toman, se aclaran y se ponen de nuevo en cultivo sobre el mismo medio preparado recientemente.
Después de 4 a 5 semanas, los brotes que se desarrollan, se toman y se ponen en cultivo sobre un medio de enraizamiento que contiene cefotaxima y kanamicina.
Las diferentes etapas de esta transformación se ilustran en la figura 8.
Se ha obtenido una cincuentena de brotes mediante este método, de los cuales una veintena se ha enraizado en medio selectivo. Estas plántulas se multiplican mediante esquejes para producir bastante biomasa como para efectuar las verificaciones PCR que ponen en evidencia la presencia del gen cfa y para extraer los lípidos totales.
Etapa 5
Análisis de los transformantes
A continuación se analizan los transformantes producidos de este modo a varios niveles:
a) - Análisis directo que confirma la presencia del gen en la célula vegetal o la planta, realizada o bien mediante inmunotransferencia tipo Southern o análisis PCR que necesitan extracciones de ADN genómico. (Protocolo descrito en el Sambrook y/o el Current Protocol).
Sambrook J., Fritsch E.F. y Maniatis T. en Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Irwin N., Ford N., Nolan C. y Ferguson M. eds, Cold Spring Habor Laboratory Press. 1989.
Current protocols in Molecular Biology. Ausubel F.M. Brent R. Kingston R.E., Moore D.D., Seidman J.G., Smith J.A. y Struhl K. eds, Current Protocols Inc Wiley, Massachusetts..., Vol. 1: Molecular Biology- Techniques. 1994 y Vol. 2: Molecular Biology- Laboratory. 1994.
b) - Análisis del producto génico, es decir, ARNm mediante inmunotransferencia tipo Northern y que confirma la transcripción del gen (Protocolo descrito en el Sambrook y/o el Current Protocol mencionados anteriormente en el presente documento).
c) - Análisis de la proteína sintetizada, la enzima (que confirma la traducción del gen en proteína) y que permite asegurarse de la funcionalidad de ésta (dosificación enzimática inmunotransferencia, inmunotransferencia tipo Western).
La dosificación de la SAM sintetasa y de la reserva SAM en las células se realiza más particularmente según el protocolo descrito por Mathur y Sachar (1981 FEBS Lett., 287, 113-117).
La dosificación de la CFA sintasa en las células y plantas de tabaco se realiza según el protocolo descrito por Taylor y Cronan (1979 Biochemistry, 18, 3292-3300).
d) - El análisis y la identificación de los triglicéridos sintetizados se realizan mediante el uso de técnicas cromatográficas de tipo HPLC, CG-EM o mediante RMN tras extracción utilizando los protocolos descritos en la bibliografía.
Estos experimentos permiten comprobar que los ácidos nucleicos recombinantes son funcionales, que pueden introducirse en las células de plantas, que dichas células pueden regenerarse, y que estas células producen efectivamente ácidos grasos ramificados. A continuación estos ácidos pueden recuperarse directamente en las semillas de las plantas correspondientes, mediante las técnicas de extracción conocidas.
En un ejemplo particular, se han extraído los lípidos de las plantas obtenidas anteriormente (semillas, hojas o suspensiones celulares) mediante el uso de la técnica descrita por Browse et al. (Anal. Biochem. 152 (1986) 141). Los lípidos obtenidos se han transesterificado mediante el método de Fisher y Cherry (Lipids 18 (1983) 589). Este método utiliza el hidróxido de tetrametil ammonio al 20% en metanol. Es no destructivo, eficaz y se presta perfectamente a la metanolisis de los aceites inhabituales. Los esteres metílicos de ácidos grasos obtenidos de este modo se han analizado a continuación mediante cromatografía en fase gaseosa.
En primer lugar se han realizado los análisis de lípidos sobre extractos de suspensiones celulares BY2 transformadas y no transformadas de 7 días de edad y cultivadas en las mismas condiciones (medio de selección sin presión, agitación 140 rpm, 24ºC, oscuridad). Estos análisis han permitido validar el método de extracción de los lípidos totales sobre las suspensiones celulares.
A continuación, la comparación de los extractos de lípidos obtenidos a partir de suspensiones celulares de BY2 y a partir de hojas de tabaco SR1 transformadas y no transformadas en diferentes condiciones (con o sin presión de selección, con o sin luz, de 7 o 14 días de edad), pone en evidencia, en el material vegetal transformado, la presencia de compuestos que tienen la estructura de ácidos grasos ramificados según la invención.
La análisis mediante espectrometría de masas de las muestras obtenidas confirma que los ácidos grasos obtenidos comprenden efectivamente ácidos grasos ramificados en el sentido de la invención, es decir que poseen al menos una sustitución de naturaleza no-cíclica. Estos resultados muestran especialmente la presencia de los ácidos 9- (y/o 10-) metiloctadecanoico y/o 9-(y/o 10-)metilhexadecanoico.
Etapa 6
Tratamiento de los ácidos grasos ramificados
En una etapa facultativa, los ácidos grasos ramificados producidos por los materiales vegetales de la invención se tratan de manera que mejoren sus propiedades fisicoquímicas, especialmente sus propiedades lubricantes.
En un ejemplo particular, este tratamiento comprende la hidrogenación de los ácidos grasos, con miras a aumentar la proporción de ácidos grasos ramificados y obtener así composiciones que tienen una resistencia a la oxidación aumentada y puntos de flujo bajos. Esta hidrogenación se realiza en las condiciones conocidas por el experto en la técnica.
Ejemplo B Construcción de una célula de planta genéticamente modificada que puede producir ácidos grasos ramificados multiramas) durante la elongación
Este ejemplo ilustra la construcción de plantas genéticamente modificadas que pueden producir ácidos grasos ramificados multiramificados. En particular, este ejemplo describe la inserción mediante ingeniería genética en el genoma de la planta de un gen o de un conjunto de genes que conduce la planta a utilizar un acil-CoA no lineal que tiene un número de átomos de carbono superior a 3 (el metilmalonil CoA por ejemplo) en lugar del malonil CoA para obtener ácidos grasos ramificados denominados multiramificados tales como el ácido 2, 4, 6, 8-tetrametildecanoico. Dado que la síntesis de los ácidos grasos se produce en los cloroplastos, el ácido nucleico recombinante insertado comprende ventajosamente un gen que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa (E.C. Nº 4.1.1.9) de modo que esta enzima es activa al nivel cloroplástico o a otro nivel de la célula. Esto se obtiene o bien mediante introducción del ácido recombinante en los cloroplastos, o bien mediante inserción de un péptido de transito que permite el direccionamiento de la proteína en este compartimiento.
La construcción de estas plantas transgénicas según la invención se efectúa según las etapas siguientes (figura 9).
Etapa 1
Material vegetal utilizado
El material vegetal utilizado es idéntico al descrito en el ejemplo A.
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Etapa 2
Construcctos génicos
La transformación genética consiste en la introducción de una casete de expresión que comprende el gen a transferir, el promotor de expresión de este gen que podrá permitir una expresión constitutiva, espacial o temporal y una secuencia nucleotídica adicional que codifica para un péptido de transito que permite el direccionamiento de la proteína en un compartimento celular en el que será activa.
2.1. Selección y aislamiento de los ácidos nucleicos que codifican para las enzimas
Uso del gen que codifica para la malonil-CoA descarboxilasa cuya secuencia nucleotídica se describe por Kolattukudy et al. (1987) o cualquier otra secuencia nucleotídica análoga que procede de otros organismos o microorganismos procariotas o eucariotas.
Kolattukudy P.E. Rogers L.M., Poulose A.J., Jang S.H., Kim Y.S., Cheesbrough T.M. y Liggitt D.H.(1987) Developmental pattern of the expression of malonyl-CoA decarboxylase gène and the production of unique lipids in the goose uropygial glands. Arch. Biochem. Biophys., 256, 446-454.
Fernandese N.D. y Kolattukudy P.E. (1996) Cloning, sequencing and characterization of a fatty acid synthase-encoding gene from Mycobacterium tuberculosis var. bovis BCG. Gene, 170, 95-99.
En algunos casos, componentes de la síntesis de ácidos grasos se encuentran en los cloroplastos u otros orgánulos. En este caso, la enzima sintetizada: malonil-CoA descarboxilasa, debe transportarse a los cloroplastos para ser activa. Deberá añadirse a los constructos génicos una secuencia de ADN que codifica para un péptido de transito operacional y reconocido por la planta receptora. Estos péptidos de transito son en general secuencias líderes que deberán combinadarse con la secuencia nucleotídica del gen asociado a un promotor específico. Estas secuencias "señal" pueden representarse por cualquier otra secuencia nucleotídica derivada de un gen que se expresa en el citoplasma antes de llegar a su compartimento de reacción apropiado. El ADN de estos péptidos de tránsito pueden proceder de otras plantas. Puede ser, por ejemplo, el péptido de transito de la pequeña subunidad de la RUBISCO de soja o las secuencias que codifican para los 6 o 12 aminoácidos terminales de la pequeña subunidad madura de la RUBISCO de guisante y mencionados en la patente de Calgene WO 94/29467 (Esquema de tipo 4).
2.2. Selección de las regiones promotoras
En este ejemplo, los promotores utilizados son el promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor y el promotor del gen de la nopalina sintasa (nos). La estructura de estos promotores se ha descrito por ejemplo por Benfey y Chua (1990, Science, 250 959-966).
2.3. Selección de las regiones de terminación de la transcripción
En este ejemplo, les regiones de terminación de la transcripción utilizadas proceden de los genes de la nopalina sintasa (nos) y de la octopina sintasa (ocs)(figura 9).
2.4. Construcción de los ácidos nucleicos recombinantes (vectores)
Para construir los ácidos nucleicos recombinantes que permiten introducir los elementos mencionados anteriormente en el presente documento en las células de plantas, estos elementos genéticos se aíslan y se subclonan previamente en vectores de clonación de tipo pBR322 y pUC, que llevan marcadores que permiten la selección de los transformantes que proporcionan una resistencia a agentes citotóxicos tales como antibióticos, toxinas, etc. a continuación se introducen los casetes de expresión en vectores binarios que contienen las secuencias necesarias para la transformación de las plantas, en particular, el vector ADN-T. Este vector se utiliza para la transformación de las plantas y se ha descrito ampliamente en la bibliografía la estructura de los vectores que contienen las secuencias específicas de reconocimiento (RB y LB) (Libro de Hoekema, the binary Plant Vector Systems, Offsetdrukkerij Kanters B.V., Alblasserdam, 1985. Molecular genetics of the Bacteria-Plant Interaction, Puhler A. Ed., Springer-Verlag, NY, 1983. Plant Genetic Transformation and Gene expression: A Laboratory Manual Draper J., Scott R., Armitage P., y Walden R. Eds, Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1988. Kahl G. y Weising K., (1993) Genetic engineering of plant cells. En Biotechnology: Genetics Fundamentals and genetic Engineering. Rehm H.J., Reed G., Pühler A. y Stadler P. Eds, VCH Publishers Inc., Nueva York (USA) Vol 2, págs. 547-659).
La estructura de los ácidos nucleicos recombinantes preparados de este modo se representa en la figura 9.
Etapa 3
Transformación del vegetal
En primer lugar, se transforman genéticamente protoplastos, células vegetales, tejidos o plantas de tabaco mediante los ácidos nucleicos recombinantes descritos anteriormente en el presente documento, mediante el uso de métodos de transferencia indirecta con la ayuda de un vector tal como las agrobacterias (por ejemplo Agrobacterium tumefaciens: C58C1Rif: pGV2260; Deblaere et al., 1985) o mediante el uso de los métodos de transformación directa (electroporación, bombardeo de partículas, infiltración a vacío, etc., (Kahl y Weising, 1993).
En el caso del uso de transferencia de gen indirecta, las agrobacterias contienen un plásmido que posee las regiones vir (plásmido Ti desarmado) necesarias para la transferencia del ADN-T en las células vegetales.
Las células se transforman genéticamente para incluir en su genoma un ácido nucleico recombinante (figura 9) que contiene el gen que codifica para la malonil-CoA descarboxilasa descrita anteriormente en el presente documento.
El protocolo utilizado para realizar estas transformaciones se ha descrito por Van Lijsebettens et al. (1986 J. Mol. Biol., 188, 129-145) o catalogado en la bibliografía (Plant Genetic Transformation and Gene Expression: A Laboratory Manual. Draper J., Scott R., Amritage P., y Walden R. Eds, Blackwell Scientific Publications, Oxford, 1988; Kahl G. Y Weiding K. (1993) Genetic engineering of plant cells. En Biotechnology: Genetics Fundamentals and genetic Engineering. Rehm H.J., Reed G., Pühler A. y Stadler P. Eds, VCH Publishers Inc., Nueva York (USA) Vol. 2, pp 547-659).
Etapa 4
Cultivo y selección de las plantas transformadas
Las células vegetales transformadas por les vectores que contienen los constructos descritos anteriormente en el presente documento se regeneran a continuación a partir de células aisladas, de callos o de discos foliares mediante el uso de las técnicas habituales de cultivos de plantas (Plant Cell Culture: A pratical Approach. Dixon R.A. ed., IRL Press, Oxford, Washington DC., 1985). Las células y plantas transformadas se ponen en cultivo según los procedimientos habituales y descritos en la bibliografía. La selección de las células y plantas transformadas se efectúa en el momento de su cultivo, sobre medio selectivo que contiene un antibiótico o toxina específicos del casete introducido.
Etapa 5
Análisis de los transformantes
Los transformantes producidos de este modo se analizan a continuación a varios niveles:
a) - Análisis directo que confirma la presencia del gen en la célula vegetal o la planta, realizada o bien mediante inmunotransferencia tipo Southern o bien mediante análisis PCR que necesitan extracciones de ADN genómico según un Protocolo descrito en:
- Sambrook J., Fritsch E.F. y Maniatis T. en Molecular Cloning. A Laboratory Manual. Irwin N., Ford N., Nolan C. y Ferguson M. eds, Cold Spring Habor Laboratory Press. 1989 o,
- Current protocols in Molecular Biology. Ausubel F. M. Brent R. Kingston R.E., Moore D.D., Seidman J.G., Smith J.A. y Struhl K. eds, Current Protocols Inc Wiley, Massachusetts..., Vol. 1: Molecular Biology - Techniques. 1994 y Vol. 2: Molecular Biology - Laboratory. 1994.
b) - Análisis del producto génico, es decir, ARNm mediante inmunotransferencia tipo Northern y que confirma la transcripción del gen (Protocolo descrito en el Sambrook y/o el Current Protocol mencionados anteriormente en el presente documento).
c) - Análisis de la proteína sintetizada, la enzima (que confirma la traducción del gen en proteína) y que permite asegurarse de la funcionalidad de ésta (dosificación enzimática inmunotransferencia, inmunotransferencia tipo Western).
d) Dosificación de la Malonil-CoA descarboxilasa según el protocolo descrito por Kolattuduky et al. (1987): Developmental pattern of the expression of Malonyl-CoA decarboxylase gene and the production of unique lipids in the goose uropygial glands. Arch. Biochem. Biophys., 256, 446-454.
e) - El análisis y la identificación de los triglicéridos sintetizados se realizan mediante el uso de técnicas cromatográficas de tipo HPLC, CG-EM o mediante RMN tras extracción utilizando los protocolos descritos en la bibliografía.
Estos experimentos permiten comprobar que los ácidos nucleicos recombinantes son funcionales, que se pueden introducir en las células de plantas, que dichas células se pueden regenerar, y que estas células producen efectivamente ácidos grasos ramificados. A continuación estos ácidos pueden recuperarse directamente en las semillas de las plantas correspondientes, mediante las técnicas de extracción conocidas.

Claims (16)

1. Procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados, caracterizado porque dichos ácidos grasos ramificados se producen a partir de al menos una célula vegetal o a partir de semillas o a partir de una planta, comprendiendo el genoma de dicha célula vegetal o dichas semillas o dicha planta un ácido nucleico recombinante que codifica para una metil transferasa, una ciclopropano ácido graso sintasa, un metilmalonil-CoA o una malonil-CoA descar-
boxilasa.
2. Procedimiento según la reivindicación 1, caracterizado porque además comprende una etapa de extracción de los ácidos grasos ramificados.
3. Procedimiento según la reivindicación 2, caracterizado porque comprende además una etapa de tratamiento de los ácidos grasos ramificados extraídos.
4. Procedimiento según una de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque dicho ácido nucleico recombinante codifica para un producto que permite inducir o estimular la ramificación tras la síntesis de los ácidos grasos producidos por dicha célula.
5. Procedimiento según la reivindicación 4, caracterizado porque el ácido nucleico recombinante codifica para una enzima que permite la transferencia de uno o más grupos alquilo sobre el/los doble(s) enlace(s) de los ácidos grasos insaturados.
6. Procedimiento según una de las reivindicaciones 1 a 5, caracterizado porque la célula vegetal comprende además un ácido nucleico recombinante que codifica para la SAM sintetasa.
7. Procedimiento según una de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque el ácido nucleico recombinante codifica para una enzima que permite forzar a dicha célula de planta a utilizar un sustrato que comprende un número de átomos de carbono superior a 3 para la síntesis de la cadena alifática.
8. Procedimiento según la reivindicación 7, caracterizado porque el ácido nucleico recombinante codifica para una enzima que puede forzar a la planta a utilizar un acil-CoA no lineal.
9. Célula de planta que comprende un ácido nucleico recombinante que comprende
-
una secuencia de ADN que codifica para un péptido de transito operacional y reconocido por la planta receptora y que permite el direccionamiento de la proteína en los cloroplastos;
-
un ácido nucleico que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa que permite forzar a una célula de planta a utilizar un sustrato que comprende un número de átomos de carbono superior a 3 como sustrato para la síntesis de la cadena alifática;
-
un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y
-
una región en 3' de terminación de la transcripción,
o un vector que comprende un ácido nucleico recombinante de este tipo.
10. Célula de planta según la reivindicación 9, caracterizada porque se trata de una célula de planta oleaginosa, seleccionada preferiblemente entre la colza, el girasol, el cacahuete, la soja, el lino y el maíz.
11. Planta transgénica caracterizada porque contiene al menos una célula según la reivindicación 9 ó 10.
12. Procedimiento de producción de ácidos grasos ramificados mediante cultivo celular de una célula de planta según cualquiera de las reivindicaciones 9 ó 10, y que comprende:
-
el cultivo de estas células en un medio apropiado para su crecimiento,
-
la extracción y la purificación de los ácidos grasos ramificados a partir de estas células o del sobrenadante de dicho cultivo.
13. Procedimiento de preparación de ácidos grasos ramificados a partir de una planta transgénica cuyas células contienen un ácido nucleico recombinante que comprende
-
una secuencia de ADN que codifica para un péptido de transito operacional y reconocido por la planta receptora y que permite el direccionamiento de la proteína en los cloroplastos;
\newpage
-
un ácido nucleico que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa que permite forzar a una célula de planta a utilizar un sustrato que comprende un número de átomos de carbono superior a 3 como sustrato para la síntesis de la cadena alifática;
-
un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y
-
una región en 3' de terminación de la transcripción.
-
el cultivo en campos de dichas plantas transgénicas,
-
la recuperación de las semillas de dichas plantas,
-
la extracción de los ácidos grasos a partir de estas semillas.
14. Uso de una planta transgénica según la reivindicación 11, regenerada a partir de una célula según cualquiera de las reivindicaciones 9 ó 10, para la producción de ácidos grasos ramificados.
15. Uso de una planta o parte de una planta transgénica en la que al menos algunas de las células comprenden un ácido nucleico recombinante que comprende
-
una secuencia de ADN que codifica para un péptido de transito operacional y reconocido por la planta receptora y que permite el direccionamiento de la proteína en los cloroplastos;
-
un ácido nucleico que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa que permite forzar a una célula de planta a utilizar un sustrato que comprende un número de átomos de carbono superior a 3 como sustrato para la síntesis de la cadena alifática;
-
un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y
-
una región en 3' de terminación de la transcripción,
para la producción de ácidos grasos ramificados.
16. Procedimiento de preparación de una planta transgénica que puede producir ácidos grasos ramificados, que comprende la introducción de un ácido nucleico recombinante que comprende
-
una secuencia de ADN que codifica para un péptido de transito operacional y reconocido por la planta receptora y que permite el direccionamiento de la proteína en los cloroplastos;
-
un ácido nucleico que codifica para una malonil-CoA descarboxilasa que permite forzar a una célula de planta a utilizar un sustrato que comprende un número de átomos de carbono superior a 3 como sustrato para la síntesis de la cadena alifática;
-
un promotor funcional en las células vegetales que controla la expresión de dicho ácido nucleico, y
-
una región en 3' de terminación de la transcripción, en una célula o parte de planta y la regeneración, a partir de estas células o partes de plantas, de una planta transgénica.
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