ES2264564T3 - Factor de crecimiento htter36. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION EXPONE POLIPEPTIDOS DEL FACTOR DE CRECIMIENTO HTTER36 Y POLINUCLEOTIDOS QUE CODIFICAN TALES POLIPEPTIDOS. SE PROPORCIONA IGUALMENTE UN PROCEDIMIENTO PARA LA PRODUCCION DE DICHOS POLIPEPTIDOS POR TECNICAS RECOMBINANTES ASI COMO USOS TERAPEUTICOS DE LOS POLIPEPTIDOS, QUE INCLUYEN LA ESTIMULACION DEL CRECIMIENTO Y DIFERENCIACION CELULARES, LA OSTEOFORMACION Y LA CURACION DE HERIDAS. SE REVELAN IGUALMENTE ANTAGONISTAS CONTRA DICHO POLIPEPTIDO Y SU USO COMO TERAPIA PARA EL TRATAMIENTO DE NEOPLASIAS Y PARA PREVENIR LA FORMACION DE MOLECULAS DE MATRIZ EXTRACELULAR EN EL HIGADO Y EL PULMON. SE EXPONEN IGUALMENTE ENSAYOS DIAGNOSTICOS PARA DETECTAR NIVELES ALTERADOS DEL POLIPEPTIDO DE LA PRESENTE INVENCION Y MUTACIONES EN LA SECUENCIA DEL ACIDO NUCLEICO QUE CODIFICAN LOS POLIPEPTIDOS DE LA PRESENTE INVENCION.
Description
Factor de crecimiento HTTER36.
Este invento se refiere a polinucleótidos recién
identificados, polipéptidos codificados por dichos polinucleótidos,
el uso de dichos polinucleótidos y polipéptidos, y también la
producción de dichos polinucleótidos y polipéptidos. El polipéptido
del presente invento ha sido supuestamente identificado como un
factor de crecimiento transformante humano. Más particularmente, el
polipéptido del presente invento ha sido supuestamente identificado
como un miembro de la superfamilia de factores beta de crecimiento
transformante, y a él se hace a veces referencia como
"HTTER36". El invento también se refiere a la inhibición de la
acción de dichos polipéptidos.
Este invento se refiere a unas moléculas
polinucleotídicas y polipeptídicas que están estructural y
funcionalmente relacionadas con el factor beta de crecimiento
transformante (TGF-\beta; del inglés,
transforming growth factor \beta). La
familia de factores beta de crecimiento transformante, de factores
de crecimiento peptídicos, incluye cinco miembros, denominados
TGF-\beta1 a TGF-\beta5, todos
los cuales forman homodímeros de aproximadamente 25 kDa. La familia
de TGF-\beta pertenece a una superfamilia
extendida y mayor de moléculas de señalización peptídicas que
incluye la sustancia inhibidora mulleriana [R. L. Cate et
al., Cell, 45: 685-698 (1.986)],
decapentaplegic [R. W. Padgett et al., Nature, 325:
81-84 (1.987)], factores morfogénicos óseos [J. M.
Wozney et al., Science, 242: 1.528-1.534
(1.988)], vg1 [D. L. Weeks y D. A. Melton, Cell, 51:
861-867 (1.987)], activinas [W. Vale et al.,
Nature, 321: 776-779 (1.986)] e inhibinas [A. J.
Mason et al., Nature, 318: 659-663 (1.985)].
Estos factores son similares al TGF-\beta en
cuanto a su estructura global pero sólo comparten aproximadamente
un 25% de identidad de aminoácidos con las proteínas de
TGF-\beta y entre sí. Se piensa que todas estas
moléculas desempeñan importantes funciones en la modulación del
crecimiento, el desarrollo y la diferenciación. La proteína del
presente invento, PGF, retiene los siete restos de cisteína
conservados en el dominio activo C-terminal de
TGF-\beta.
El TGF-\beta fue originalmente
descrito como un factor que inducía la proliferación de fibroblastos
renales normales de rata en agar blando en presencia de factor de
crecimiento epidérmico [A. B. Roberts et al., PNAS USA, 78:
5.339-5.343 (1.981)]. Se ha mostrado posteriormente
que TGF-\beta ejerce varios efectos diferentes
en una diversidad de células. Por ejemplo, el
TGF-\beta puede inhibir la diferenciación de
ciertas células de origen mesodérmico [J. R. Florini et al.,
J. Biol. Chem., 261: 16.509-16.513 (1.986)], inducir
la diferenciación de otras [S. M. Seyedine et al., PNAS USA,
82: 2.267-2.271 (1.985)] e inhibir potentemente la
proliferación de diversos tipos de células epiteliales (R. F.
Tucker, Science, 226: 705-707 (1.984)]. Esta última
actividad ha conducido a la especulación de que un papel
fisiológico importante del TGF-\beta es mantener
el estado de crecimiento reprimido de muchos tipos de células. En
consecuencia, es más probable que las células que pierden la
capacidad para responder a TGF-\beta presenten un
crecimiento incontrolado y se vuelvan tumorigénicas. En realidad,
ciertos tumores, tales como los retinoblastomas, carecen de
receptores detectables de TGF-\beta en su
superficie celular y no responden a TGF-\beta,
mientras que las células correspondientes normales expresan
receptores en su superficie durante su crecimiento y son fuertemente
inhibidas por TGF-\beta [A. Kim Chi et al.,
Science, 240: 196-198 (1.988)].
Más específicamente, el
TGF-\beta1 estimula el crecimiento de fibroblastos
renales normales de rata, independiente del anclaje [Roberts et
al., PNAS USA, 78: 5.339-5.343 (1.981)]. Desde
entonces, se ha mostrado que es un regulador mutifuncional del
crecimiento y la diferenciación celulares [Sporn et al.,
Science, 233: 532-534 (1.986)], siendo capaz de
diversos efectos tales como inhibir el crecimiento de varias líneas
celulares de cáncer humano [Roberts et al., PNAS USA, 82:
119-123 (1.985)], queratinocitos de ratón [Coffey
et al., Cancer Res., 48: 1.596-1.602 (1.988)
y linfocitos T y B [Kehrl et al., J. Exp. Med., 163:
1.037-1.050 (1.986)]. También inhibe la
proliferación precoz de células progenitoras hematopoyéticas [Goey
et al., J. Immunol., 143: 877-880 (1.989)],
estimula la inducción de la diferenciación de células mesenquimales
de músculo de rata y la subsiguiente producción de macromoléculas
específicas de cartílago [Seyedine et al., J. Biol. Chem.,
262: 1.946-1.949 (1.986)], causa una síntesis y una
secreción aumentadas de colágeno [Ignotz et al., J. Biol.
Chem., 261: 4.337-4,345 (1.986)], estimula la
formación de hueso [Noda et al., Endocrinology, 124:
2.991-2.995 (1.989)] y acelera la cicatrización de
heridas por incisión [Mustoe et al., Science, 237:
1.333-1.335 (1.987)].
Además, el TGF-\beta1 estimula
la formación de moléculas de matriz extracelular en el hígado y el
pulmón. Cuando los niveles de TGF-\beta1 son
superiores a los normales, tiene lugar la formación de fibra en la
matriz extracelular del hígado y el pulmón, lo que puede ser mortal.
Se producen niveles elevados de TGF-\beta1 a
causa de la quimioterapia y el trasplante de médula ósea como un
intento de tratar cánceres, tal como, por ejemplo, el cáncer de
mama.
Se aisló una segunda proteína, denominada
TGF-\beta2, de diversas fuentes, incluyendo hueso
desmineralizado, una línea celular de adenocarcinoma prostático
humano [Ikeda et al., Bio. Chem., 26:
2.406-2.410 (1.987)]. El
TGF-\beta2 compartía varias similitudes
funcionales con TGF-\beta1. Se sabe ahora que
estas proteínas son miembros de una familia de proteínas
moduladoras del crecimiento relacionadas que incluye
TGF-\beta3 [Ten-Dijke et
al., PNAS USA, 85: 4.715-4.719 (1.988)], la
sustancia inhibidora mulleriana y las inhibinas. El polipéptido del
presente invento ha sido supuestamente identificado como un miembro
de esta familia de proteínas moduladoras del crecimiento
relacionadas.
De acuerdo con un aspecto del presente invento,
se proporcionan nuevos polipéptidos maduros. Los polipéptidos del
presente invento son de origen humano.
De acuerdo con otro aspecto del presente
invento, se proporcionan moléculas de ácido nucleico aisladas que
codifican los polipéptidos del presente invento, incluyendo mRNAs,
cDNAs y DNAs genómicos.
De acuerdo con otro aspecto del presente
invento, se proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que
codifica un polipéptido maduro expresado por el cDNA humano
contenido en el nº de depósito 97349 de la ATCC.
De acuerdo con aún un aspecto más del presente
invento, se proporcionan procedimientos para producir dicho
polipéptido mediante técnicas recombinantes, que comprenden cultivar
células huésped procarióticas y/o eucarióticas recombinantes que
contienen una secuencia de ácido nucleico que codifica un
polipéptido del presente invento.
De acuerdo con aún un aspecto más del presente
invento, se proporcionan procedimientos para utilizar dichos
polipéptidos, o dichos polinucleótidos que codifican dichos
polipéptidos, para estimular el crecimiento y la diferenciación
celulares.
De acuerdo con aún un aspecto más del presente
invento, se proporcionan también sondas de ácido nucleico que
comprenden moléculas de ácido nucleico de longitud suficiente para
hibridarse específicamente con secuencias de ácido nucleico del
presente invento.
De acuerdo con aún un aspecto más del presente
invento, se proporcionan anticuerpos contra dichos polipéptidos.
De acuerdo con aún otro aspecto del presente
invento, se proporcionan antagonistas de dichos polipéptidos, que
pueden ser utilizados para inhibir la acción de dichos polipéptidos,
por ejemplo, en el tratamiento de una neoplasia de células cuyo
crecimiento es estimulado por el polipéptido del presente invento, y
evitar la formación de moléculas de matriz extracelular en el hígado
y el pulmón.
De acuerdo con aún otro aspecto del presente
invento, se proporcionan ensayos diagnósticos para detectar
enfermedades relacionadas con la sobreexpresión del polipéptido del
presente invento y mutaciones en las secuencias de ácido nucleico
que codifican dicho polipéptido.
De acuerdo con aún un aspecto más del presente
invento, se proporciona un procedimiento para utilizar dichos
polipéptidos, o dichos polinucleótidos que codifican dichos
polipéptidos, con fines in vitro relacionados con
investigación científica, síntesis de DNA y fabricación de vectores
de DNA.
Estos y otros aspectos del presente invento
deberían ser evidentes para los expertos en la técnica a partir de
las presentes enseñanzas.
Los dibujos siguientes son ilustrativos de
realizaciones del invento y no están destinados a limitar el alcance
del invento como es abarcado por las reivindicaciones:
La Figura 1 representa la secuencia de cDNA y la
correspondiente secuencia deducida de aminoácidos de HTTER36. Se
usan las abreviaturas estándares de una letra para los aminoácidos.
Se ha subrayado la supuesta secuencia señal.
La Figura 2 es una ilustración de la homología
comparativa de secuencias de aminoácidos entre HTTER36 (línea
superior) y el supuesto factor beta de crecimiento trasnformante,
"GDF-3", de Mus musculus (ID. SEC. nº
9).
De acuerdo con un aspecto del presente invento,
se proporciona un ácido nucleico (polinucleótido) aislado que
codifica el polipéptido maduro que tiene la secuencia deducida de
aminoácidos de la Figura 1 (ID. SEC. nº 2).
El polinucleótido de este invento se descubrió
en un banco de cDNA de tumores testiculares humanos. Está
estructuralmente relacionado con la superfamilia de genes de
TGF-\beta. Contiene un marco de lectura abierto
que codifica un polipéptido de 364 aminoácidos de los cuales, los
16 primeros aminoácidos son una supuesta secuencia líder, los 234
aminoácidos siguientes son una prosecuencia y los 114 últimos
aminoácidos son la región activa. HTTER36 muestra el mayor grado de
homología con GDF-3 a nivel de aminoácidos, con 69%
de identidad y 80% de similitud.
Los 16 primeros aminoácidos representan una
supuesta porción transmembrana de la que se piensa que es necesaria
para dirigir el polipéptido a zonas diana particulares para llevar a
cabo funciones biológicas como las descritas más adelante. La
porción transmembrana puede ser también escindida del
polipéptido.
De acuerdo con otro aspecto del presente
invento, se proporcionan polinucleótidos aislados que codifican un
polipéptido maduro expresado por el cDNA humano contenido en el nº
de depósito 97349 de la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC;
del inglés, American Type Culture
Collection), 12301 Park Lawn Drive, Rockville, Maryland
20852, EE.UU., el 28 de Noviembre de 1.995. El material depositado
es un plásmido pBluescript SK(+) que contiene el cDNA de HTTER36 de
longitud completa, al que se hizo referencia como "PF230"
cuando se depositó.
El depósito se ha hecho bajo los términos del
Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento Internacional del
Depósito de Microorganismos con fines de Procedimiento de Patente.
La cepa será irrevocablemente, y sin restricción ni condición,
liberada al público tras la publicación de una patente. Se puede
requerir una licencia para usar o vender los materiales
depositados, y dicha licencia no es por ello concedida. Las
referencias a "polinucleótidos" a lo largo de esta memoria
descriptiva incluyen el DNA del depósito al que se hizo referencia
anteriormente.
El polinucleótido del presente invento puede
estar en forma de RNA o en forma de DNA, DNA que incluye cDNA, DNA
genómico y DNA sintético. El DNA puede ser de cadena doble o cadena
sencilla y, si es una cadena sencilla, puede ser la cadena
codificadora o la cadena no codificadora (antisentido). La secuencia
de codificación que codifica el polipéptido maduro puede ser
idéntica a la secuencia de codificación mostrada en la Figura 1 (ID.
SEC. nº 1) o puede ser una secuencia de codificación diferente que,
como resultado de la redundancia o degeneración del código genético,
codifica el mismo polipéptido maduro que el DNA de la Figura 1 (ID.
SEC. nº 1).
El polinucleótido que codifica el polipéptido
maduro de la Figura 1 (ID. SEC. nº 2) puede incluir, pero no se
limita a: sólo la secuencia de codificación del polipéptido maduro;
la secuencia de codificación del polipéptido maduro y una secuencia
de codificación adicional tal como una secuencia líder o secretora o
una secuencia de proproteína; la secuencia de codificación del
polipéptido maduro (y, opcionalmente, una secuencia de codificación
adicional) y una secuencia no codificadora, tal como intrones o una
secuencia no codificadora 5' y/o 3' de la secuencia de codificación
del polipéptido maduro.
Por lo tanto, la expresión "polinucleótido que
codifica un polipéptido" abarca un polinucleótido que incluye
sólo la secuencia de codificación del polipéptido así como un
polinucleótido que incluye una secuencia codificadora y/o no
codificadora adicional.
El presente invento describe además variantes de
los polinucleótidos anteriormente descritos que codifican
fragmentos, compuestos análogos y derivados del polipéptido que
tiene la deducida secuencia de aminoácidos de la Figura 1 (ID. SEC.
nº 2). La variante del polinucleótido puede ser una variante alélica
del polinucleótido presente en la naturaleza o una variante del
polinucleótido no presente en la naturaleza.
Por lo tanto, el presente invento describe
polinucleótidos que codifican un polipéptido maduro igual al
mostrado en la Figura 1 (ID. SEC. nº 2) así como variantes de
dichos polinucleótidos, variantes que codifican un fragmento,
derivado o compuesto análogo del polipéptido de la Figura 1 (ID.
SEC. nº 2). Dichas variantes nucleotídicas incluyen variantes por
deleción, variantes por sustitución y variantes por adición o
inserción.
Como se conoce en la técnica, una variante
alélica es una forma alternativa de una secuencia polinucleotídica,
que puede tener una sustitución, deleción o adición de uno o más
nucleótidos que no altera sustancialmente la función del polipéptido
codificado.
El presente invento también incluye
polinucleótidos cuya secuencia de codificación del polipéptido
maduro puede estar fusionada en el mismo marco de lectura con una
secuencia polinucleotídica que facilita la expresión y secreción de
un polipéptido por una célula huésped, tal como, por ejemplo, una
secuencia líder que actúa como una secuencia secretora para
controlar el transporte de un polipéptido por la célula. El
polipéptido que tiene una secuencia líder es una preproteína y
puede tener la secuencia líder escindida por la célula huésped para
formar la forma madura del polipéptido. Los polinucleótidos pueden
codificar también una proproteína que sea la proteína madura más
restos de aminoácido 5' adicionales. Una proteína madura que tiene
una prosecuencia es una proproteína y es una forma inactiva de la
proteína. Una vez que la prosecuencia es escindida, queda una
proteína madura activa. De este modo, por ejemplo, el polinucleótido
del presente invento puede codificar una proteína madura o una
proteína que tiene una prosecuencia o una proteína que tiene tanto
una prosecuencia como una presecuencia (secuencia líder).
Los polinucleótidos del presente invento pueden
tener también la secuencia de codificación fusionada en marco de
lectura con una secuencia marcadora que permite la purificación del
polipéptido del presente invento. En el caso de un huésped
bacteriano, la secuencia marcadora puede ser una etiqueta de
hexahistidina proporcionada por un vector pQE para permitir la
purificación del polipéptido maduro fusionado con el marcador, o,
por ejemplo, cuando se usa un huésped mamífero, por ejemplo,
células COS-7, la secuencia marcadora puede ser una
etiqueta de hemaglutinina (HA). La etiqueta de HA corresponde a un
epítopo derivado de la proteína hemaglutinina de influenzavirus [I.
Wilson et al., Cell, 37: 767 (1.984)].
El término "gen" significa el segmento de
DNA implicado en la producción de una cadena polipeptídica; incluye
regiones que preceden y siguen a la región de codificación (líder y
remolque) así como secuencias intermedias (intrones) entre segmentos
de codificación individuales (exones).
Pueden utilizarse fragmentos del gen HTTER36 de
longitud completa como sondas de hibridación para un banco de cDNA,
para aislar el gen de longitud completa y para aislar otros genes
que tengan una elevada similitud de secuencia con el gen o una
actividad biológica similar. Las sondas de este tipo tienen
preferiblemente al menos 15 bases y más preferiblemente al menos 30
bases, y, aún más preferiblemente, pueden contener, por ejemplo, al
menos 50 bases o más. La sonda puede ser también utilizada para
identificar un clon de cDNA que corresponda a un transcrito de
longitud completa, y un clon o clones genómicos que contengan el gen
HTTER36 completo incluyendo regiones reguladoras y promotoras,
exones e intrones. Un ejemplo de una exploración comprende aislar
la región de codificación del gen usando la secuencia de DNA
conocida para sintetizar una sonda oligonucleotídica. Se utilizan
oligonucleótidos marcados que tienen una secuencia complementaria a
la del gen del presente invento, para explorar un banco de cDNA,
DNA genómico o mRNA humanos con objeto de determinar con qué
miembros del banco se hibrida la sonda.
El presente invento se refiere además a
polinucleótidos que se hibridan con las secuencias anteriormente
descritas si hay al menos 90%, y más preferiblemente al menos 95%,
de identidad entre las secuencias. El presente invento se refiere
particularmente a polinucleótidos que se hibridan bajo condiciones
rigurosas con los polinucleótidos anteriormente descritos. Como se
usa aquí, la expresión "condiciones rigurosas" significa que
sólo se producirá la hibridación si hay al menos 95%, y
preferiblemente al menos 97%, de identidad entre las secuencias. Los
polinucleótidos que se hibridan en una realización preferida con
los polinucleótidos anteriormente descritos codifican polipéptidos
que conservan sustancialmente la misma actividad o función biológica
que el polipéptido maduro codificado por el cDNA de la Figura 1 (ID.
SEC. nº 1).
De esta manera, el presente invento se dirige a
polinucleótidos que tienen al menos 90%, y más preferiblemente al
menos 95%, de identidad con un polinucleótido que codifica el
polipéptido de la ID. SEC. nº 2 y a polinucleótidos complementarios
de los mismos, y a polipéptidos codificados por dichos
polinucleótidos.
El presente invento se refiere además a un
polipéptido que tiene la secuencia deducida de aminoácidos de la
Figura 1 (ID. SEC. nº 2), así como a fragmentos, compuestos análogos
y derivados de dicho polipéptido.
Las expresiones "fragmento",
"derivado" y "compuesto análogo", cuando hacen referencia
al polipéptido de la Figura 1 (ID. SEC. nº 2), significan un
polipéptido que conserva esencialmente la misma actividad o función
biológica que dicho polipéptido. De esta manera, un compuesto
análogo incluye una proproteína que puede ser activada por escisión
de la porción proproteínica para producir un polipéptido maduro
activo.
El polipéptido del presente invento puede ser un
polipéptido recombinante, un polipéptido natural o un polipéptido
sintético, preferiblemente un polipéptido recombinante.
El fragmento, derivado o compuesto análogo del
polipéptido de la Figura 1 (ID. SEC. nº 2) puede ser (i) uno en que
uno o más de los restos de aminoácido están sustituidos por un resto
de aminoácido conservado o no conservado (preferiblemente un resto
de aminoácido conservado) y dicho resto de aminoácido sustituido
puede ser o no uno codificado por el código genético, o (ii) uno en
que uno o más de los restos de aminoácido incluyen un grupo
sustituyente, o (iii) uno en que el polipéptido maduro esta
fusionado con otro compuesto, tal como un compuesto para aumentar
la semivida del polipéptido (por ejemplo, polietilenglicol), o (iv)
uno en que los aminoácidos adicionales están fusionados con el
polipéptido maduro, tal como una secuencia líder o secretora o una
secuencia que se emplea para la purificación del polipéptido maduro
o una secuencia proproteínica. Se considera que dichos fragmentos,
derivados y compuestos análogos están dentro del alcance de los
expertos en la técnica a partir de las presentes enseñanzas.
Los polipéptidos y polinucleótidos del presente
invento son preferiblemente proporcionados en forma aislada y,
preferiblemente, son purificados hasta homogeneidad.
El término "aislado" significa que el
material es separado de su ambiente original (por ejemplo, el
ambiente natural si está presente en la naturaleza). Por ejemplo,
un polinucleótido o polipéptido que se encuentra en la naturaleza y
está presente en un animal vivo no está aislado, pero el mismo
polinucleótido o polipéptido, separado de algunos o todos los
materiales coexistentes en el sistema natural, está aislado. Dichos
polinucleótidos podrían ser parte de un vector y/o dichos
polinucleótidos o polipéptidos podrían ser parte de una composición
y aún así estar aislados ya que dicho vector o composición no es
parte de su ambiente natural.
Los polipéptidos del presente invento incluyen
el polipéptido de la ID. SEC. nº 2 (en particular, el polipéptido
maduro) así como polipéptidos que tienen al menos 90% de similitud
(más preferiblemente, al menos 90% de identidad) con el polipéptido
de la ID. SEC. nº 2 y, aún más preferiblemente, al menos 95% de
similitud (aún más preferiblemente, al menos 95% de identidad) con
el polipéptido de la ID. SEC. nº 2.
Como se sabe en la técnica, la "similitud"
entre dos polipéptidos se determina comparando la secuencia de
aminoácidos y sus sustitutos de aminoácido conservados de un
polipéptido con la secuencia de un segundo polipéptido.
Pueden emplearse fragmentos o porciones de los
polipéptidos del presente invento para producir el correspondiente
polipéptido de longitud completa mediante síntesis peptídica; por lo
tanto, los fragmentos pueden ser empleados como productos
intermedios para producir los polipéptidos de longitud completa.
Pueden utilizarse fragmentos o porciones de los polinucleótidos del
presente invento para sintetizar polinucleótidos de longitud
completa del presente
invento.
invento.
El presente invento también se refiere a
vectores que incluyen polinucleótidos del presente invento, células
huésped que están genéticamente diseñadas con vectores del invento,
y la producción de polipéptidos del invento mediante técnicas
recombinantes.
Las células huésped son genéticamente diseñadas
(transducidas o transformadas o transfectadas) con los vectores de
este invento, los cuales pueden ser, por ejemplo, un vector de
clonación o un vector de expresión. El vector puede estar, por
ejemplo, en forma de un plásmido, una partícula vírica, un fago,
etc. Las células huésped diseñadas pueden ser cultivadas en medios
nutritivos convencionales modificados, según sea apropiado, para la
activación de promotores, selección de transformantes o
multiplicación de los genes del presente invento. Las condiciones
de cultivo, tales como temperatura, pH y similares, son las
previamente usadas con la célula huésped seleccionada para expresión
y serán evidentes para el técnico generalmente experto.
Los polinucleótidos del presente invento pueden
ser empleados para producir polipéptidos mediantes técnicas
recombinantes. De esta manera, por ejemplo, el polinucleótido puede
ser incluido en cualquiera de los diversos vectores de expresión
para la expresión de un polipéptido. Dichos vectores incluyen
secuencias de DNA cromosómico, no cromosómico y sintético, por
ejemplo, derivados de SV40; plásmidos bacterianos; DNA de fago;
baculovirus; plásmidos de levadura; vectores derivados de
combinaciones de plásmidos y DNA de fago, y DNA vírico tal como de
virus vaccinia, adenovirus, virus de la viruela aviar y virus de la
seudorrabia. Sin embargo, puede utilizarse cualquier otro vector con
tal que sea replicable y viable en el huésped.
La secuencia de DNA apropiada puede ser
insertada en el vector mediante diversos procedimientos. En general,
la secuencia de DNA es insertada en un(os) sitio(s)
para endonucleasa de restricción apropiado(s) mediante
procedimientos conocidos en la técnica. Se considera que dichos
procedimientos y otros están dentro del alcance de los expertos en
la técnica.
La secuencia de DNA en el vector de expresión
está operativamente unida a una(s) apropiada(s)
secuencia(s) de control de la expresión (promotor) para
dirigir la síntesis de mRNA. Como ejemplos representativos de dichos
promotores, pueden mencionarse: el promotor de SV40 o LTR, el operón
lac o trp de E. coli, el promotor P_{L} del
fago lambda y otros promotores conocidos por controlar la expresión
de genes en células procarióticas o eucarióticas o sus virus. El
vector de expresión también contiene un sitio de unión al ribosoma
para el inicio de la traducción, y un terminador de la
transcripción. El vector también puede incluir secuencias apropiadas
para multiplicar la expresión.
Además, los vectores de expresión contienen
preferiblemente uno o más genes marcadores seleccionables que
proporcionan un rasgo fenotípico para la selección de las células
huésped transformadas, tal como dihidrofolato reductasa o
resistencia a neomicina para un cultivo de células eucarióticas, o
tal como resistencia a tetraciclina o ampicilina en E.
coli.
El vector que contiene la apropiada secuencia de
DNA, como la anteriormente descrita, así como una apropiada
secuencia promotora o de control, puede ser empleado para
transformar un huésped apropiado con objeto de permitir que el
huésped exprese la proteína.
Como ejemplos representativos de huéspedes
apropiados, pueden mencionarse: células bacterianas, tales como
E. coli, Streptomyces y Salmonella typhimurium;
células fúngicas, tales como levaduras; células de insecto, tales
como S2 de Drosophila y Sf9 de Spodoptera; células de
animal, tales como CHO, COS y melanoma de Bowes; adenovirus;
células vegetales; etc. Se considera que la selección de un huésped
apropiado está dentro del alcance de los expertos en la técnica a
partir de las presentes enseñanzas.
Más particularmente, el presente invento también
incluye construcciones recombinantes que comprenden una o más de
las secuencias anteriormente descritas en términos generales. Las
construcciones comprenden un vector, tal como un plásmido o vector
viral, en el que se ha insertado una secuencia del invento en
orientación directa o inversa. En un aspecto preferido de esta
realización, la construcción comprende además secuencias reguladoras
que incluyen, por ejemplo, un promotor operativamente unido a la
secuencia. Los expertos en la técnica conocen un gran número de
vectores y promotores adecuados, y estos son comercialmente
asequibles. Los vectores siguientes se proporcionan a modo de
ejemplo: Bacterianos: pQE70, pQE60, pQE-9 (Qiagen),
pBS, pD10, Phagescript, psiX174, pBluescript SK, pbsks, pNH8A,
pNH16a, pNH18A, pNH46A (Stratagene); ptrc99a,
pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5
(Pharmacia); Eucarióticos: pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG
(Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmacia). Sin embargo,
puede utilizarse cualquier otro plásmido o vector con tal que sea
replicable y viable en el huésped.
Pueden seleccionarse regiones promotoras de
cualquier gen deseado utilizando vectores de CAT (cloranfenicol
transferasa) u otros vectores con marcadores seleccionables.
pKK232-8 y pCM7 son dos vectores apropiados. Los
promotores bacterianos mencionados particulares incluyen lacl, lacZ,
T3, T7, gpt, lambda P_{R}, P_{L} y trp. Los promotores
eucarióticos incluyen el promotor precoz inmediato de CMV, de
timidina quinasa de HSV, los promotores precoz y tardío de SV40, de
LTRs de retrovirus, y de metalotioneína I de ratón. La selección del
vector y el promotor apropiados está dentro del nivel de la
experiencia normal en la técnica.
En otra realización, el presente invento se
refiere a células huésped que contienen las construcciones
anteriormente descritas. La célula huésped puede ser una célula
eucariótica superior, tal como una célula de mamífero, o una célula
eucariótica inferior, tal como una célula de levadura, o la célula
huésped puede ser una célula procariótica, tal como una célula
bacteriana. La introducción de la construcción en la célula huésped
puede ser efectuada mediante transfección con fosfato cálcico,
transfección mediada por DEAE-dextrano, o
electroporación [L. Davis, M. Dibner e I. Battey, ``Basic Methods in
Molecular Biology (1.986)].
Las construcciones en células huésped pueden ser
utilizadas de una manera convencional para producir el producto
génico codificado por la secuencia recombinante. Alternativamente,
los polipéptidos del invento pueden ser sintéticamente producidos
mediante sintetizadores peptídicos convencionales.
Las proteínas maduras pueden expresarse en
células de mamífero, levaduras, bacterias u otras células bajo el
control de promotores apropiados. Pueden emplearse también sistemas
de traducción exentos de células para producir dichas proteínas
utilizando RNAs derivados de las construcciones de DNA del presente
invento. Sambrook et al., "Molecular Cloning: A Laboratory
Manual", segunda edición, Cold Spring Harbor, New York, EE.UU.
(1.989), cuyo descripción se incorpora aquí por referencia,
describen vectores de clonación y expresión apropiados para uso con
huéspedes procarióticos y eucarióticos.
La transcripción del DNA que codifica los
polipéptidos del presente invento por eucariontes superiores resulta
aumentada al insertar una secuencia potenciadora en el vector. Los
potenciadores son elementos de DNA de acción en cis, normalmente de
aproximadamente 10 a 300 pares de bases (bp; del inglés, base
pairs), que actúan sobre un promotor para aumentar su
transcripción. Los ejemplos incluyen el potenciador de SV40 en el
lado tardío del origen de replicación (100 a 270 bp), un
promotor/potenciador precoz del citomegalovirus, el potenciador del
poliomavirus en el lado tardío del origen de replicación, y
potenciadores del adenovirus.
Generalmente, los vectores de expresión
recombinantes incluirán orígenes de replicación y marcadores
seleccionables que permitan la transformación de la célula huésped,
tales como, por ejemplo, el gen de resistencia a ampicilina de
E. coli y el gen TRP1 de S. cerevisiae, y un promotor
derivado de un gen muy expresado para dirigir la transcripción de
una secuencia estructural cadena abajo. Dichos promotores pueden
proceder de operones que codifican enzimas glicolíticas tales como,
entre otras, 3-fosfoglicerato quinasa (PGK; del
inglés, 3-phosphoglycerate kinase), factor
alfa, fosfatasa ácida y proteínas de choque térmico. La secuencia
estructural heteróloga se ensambla en la fase apropiada con
secuencias de iniciación y terminación de la traducción y,
preferiblemente, una secuencia líder capaz de dirigir la secreción
de la proteína traducida al espacio periplásmico o el medio
extracelular. Opcionalmente, la secuencia heteróloga puede codificar
una proteína de fusión que incluya un péptido de identificación
N-terminal que imparta unas características
deseadas, tales como, por ejemplo, una estabilización o una
purificación simplificada del producto recombinante expresado.
Los vectores de expresión útiles para uso
bacteriano se construyen al insertar una secuencia de DNA
estructural que codifica una proteína deseada junto con señales
adecuadas de iniciación y terminación de la traducción en fase de
lectura operativa con un promotor funcional. El vector comprenderá
uno o más marcadores fenotípicos seleccionables y un origen de
replicación para asegurar el mantenimiento del vector y para
proporcionar, si fuera deseable, la multiplicación dentro del
huésped. Los huéspedes procarióticos adecuados para transformación
incluyen E. coli, Bacillus subtilis Salmonella typhimurium y
diversas especies de los géneros Pseudomonas, Streptomyces y
Staphylococcus, aunque también pueden emplearse otros
huéspedes como cuestión de elección.
Como un ejemplo representativo aunque no
restrictivo, los vectores de expresión útiles para uso bacteriano
pueden comprender un marcador seleccionable y un origen de
replicación bacteriano derivado de plásmidos comercialmente
asequibles que comprenden elementos genéticos del bien conocido
vector de clonación pBR322 (ATCC 37017). Dichos vectores
comerciales incluyen, por ejemplo, pKK223-3
(Pharmacia Fine Chemicals, Uppsala, Suecia) y GEM1 (Promega Biotec,
Madison, Wisconsin, EE.UU.). Estas secciones de "columna
vertebral" de pBR322 se combinan con un promotor apropiado y la
secuencia estructural que se va a expresar.
Después de la transformación de una cepa huésped
adecuada y el crecimiento de la cepa huésped hasta una densidad
celular apropiada, el promotor seleccionado es inducido por medios
apropiados (por ejemplo, cambio de temperatura o inducción química)
y las células son cultivadas durante un período adicional.
Las células son típicamente recolectadas por
centrifugación y son rotas por medios físicos o químicos, y el
extracto crudo resultante es conservado para una purificación
ulterior.
Las células microbianas empleadas en la
expresión de proteínas pueden ser rotas mediante cualquier método
conveniente, incluyendo ciclos de
congelación-descongelación, sonicación, rotura
mecánica o uso de agentes para lisis celular, métodos que son bien
conocidos por los expertos en la técnica.
También pueden emplearse diversos sistemas de
cultivo de células de mamífero para que se exprese la proteína
recombinante. Los ejemplos de sistemas de expresión de mamífero
incluyen las líneas COS-7 de fibroblastos renales
de mono, descritas por Gluzman, Cell, 23: 175 (1.981), y otras
líneas celulares capaces de expresar un vector compatible, tales
como, por ejemplo, las líneas celulares C127, 3T3, CHO, HeLa y BHK.
Los vectores de expresión de mamífero comprenderán un origen de
replicación, un promotor y un potenciador adecuados, y también
cualesquier sitios de unión al ribosoma, sitios de poliadenilación,
sitios dadores y aceptores de corte y empalme, secuencias de
terminación de la transcripción y secuencias no transcritas
flanqueadoras 5' necesarios. Pueden utilizarse secuencias de DNA
derivadas del sitio de corte y empalme de SV40, y sitios de
poliadenilación para proporcionar los elementos genéticos no
transcritos requeridos.
Los polipéptidos pueden ser recuperados y
purificados de los cultivos de células recombinantes mediante
métodos que incluyen precipitación con sulfato amónico o etanol,
extracción ácida, cromatografía de intercambio aniónico o
catiónico, cromatografía sobre fosfocelulosa, cromatografía de
interacción hidrófoba, cromatografía de afinidad, cromatografía
sobre hidroxilapatito y cromatografía sobre lectina. Pueden
utilizarse operaciones de replegadura proteica, según sean
necesarias, para completar la configuración de la proteína madura.
Finalmente, puede emplearse una cromatografía de alta eficacia en
fase líquida (HPLC; del inglés, high performance
liquid chromatography) para las operaciones de
purificación finales.
Los polipéptidos del presente invento pueden ser
un producto naturalmente purificado, o un producto de procedimientos
sintéticos químicos, o producidos mediante técnicas recombinantes a
partir de un huésped procariótico o eucariótico (por ejemplo, por
células de bacterias, de levaduras, de plantas superiores, de
insectos y de mamíferos en cultivo). Dependiendo del huésped
empleado en un procedimiento de producción recombinante, los
polipéptidos del presente invento pueden estar glicosilados o
pueden estar no glicosilados. Los polipéptidos del invento también
pueden incluir un resto inicial de aminoácido metionina.
Los polinucleótidos y polipéptidos del presente
invento pueden ser empleados como reactivos y materiales de
investigación para el descubrimiento de tratamientos y diagnósticos
de enfermedades humanas.
La especificidad de HTTER36 para células diana
puede ser explotada como un mecanismo para destruir la célula
diana. Por ejemplo, puede copularse (mediante una gran variedad de
métodos) HTTER36 o formas solubles del mismo con moléculas tóxicas:
por ejemplo, un producto radiofarmacéutico que inactiva células
diana. Estas fusiones de factor de
crecimiento-toxina matan la célula diana [y, en
ciertos casos, las células vecinas mediante una diversidad de
efectos "espectador" (en inglés, "bystander")]. Mesri
et al., J. Biol. Chem. 268: 4.853-62
(1.993), han publicado un ejemplo reciente de dichos genes de
fusiones toxínicas. Pueden también encapsularse HTTER36 y
fragmentos solubles del mismo y moléculas relacionadas en liposomas
y pueden conjugarse con anticuerpos que reconozcan y se unan a
antígenos tumoral o celularmente específicos, lo que proporcionaría
un medio para el "reconocimiento" de células.
De esta misma manera, pueden emplearse HTTER36 y
fragmentos solubles del mismo como compuestos antineoplásicos ya
que miembros de esta familia ejercen efectos antiproliferativos
sobre células transformadas. Para uso in vivo, el
polipéptido objetivo puede ser administrado de diversas maneras que
incluyen, pero no se limitan a, inyección, infusión, administración
tópica, administración parenteral, etc. La administración puede ser
en cualquier vehículo fisiológicamente aceptable, incluyendo
disolución salina tamponada con fosfato, disolución salina, agua
esterilizada, etc.
Un tratamiento significativo en que están
implicados HTTER36 y fragmentos solubles del mismo se refiere a la
cicatrización de heridas. Las composiciones del presente invento
pueden ser empleadas para tratar una gran variedad de heridas,
incluyendo sustancialmente todas las heridas cutáneas, heridas
corneales y lesiones en los órganos huecos con revestimiento
epitelial del organismo. Las heridas adecuadas para el tratamiento
incluyen las que resultan de traumas tales como quemaduras,
abrasiones y cortes, así como las de procedimientos quirúrgicos
tales como incisiones quirúrgicas e injertos de piel. Otros estados
adecuados para tratamiento con el polipéptido del presente invento
incluyen estados crónicos, tales como úlceras crónicas, úlceras
diabéticas, y otros estados no cicatrizantes (tróficos).
Pueden incorporarse HTTER36 y fragmentos
solubles del mismo a vehículos fisiológicamente aceptables para
aplicación al área afectada. La naturaleza de los vehículos puede
variar en gran medida y dependerá de la prevista zona de
aplicación. Para aplicación a la piel, se prefiere normalmente una
base para cremas o ungüentos; las bases adecuadas incluyen
lanolina, Silvadene (Marion; particularmente para el tratamiento de
quemaduras), Aquaphor (Duke Laboratories, South Norwalk,
Connecticut, EE.UU.) y similares. Si se deseara, sería posible
incorporar composiciones que contienen HTTER36 a vendajes y otras
vendas para heridas, para proporcionar una exposición continua de la
herida al péptido. También pueden utilizarse aplicaciones en
aerosol.
La concentración de HTTER36 en la composición de
tratamiento no es crítica pero debería ser la suficiente para
inducir la proliferación de células epiteliales. Las composiciones
pueden ser aplicadas tópicamente a la zona afectada, típicamente
como gotas oculares para el ojo o como cremas, ungüentos o lociones
para la piel. En el caso de los ojos, es deseable un tratamiento
frecuente, aplicándose normalmente en intervalos de 4 horas o
menos. Para la piel, es deseable mantener continuamente la
composición de tratamiento sobre la zona afectada durante la
cicatrización, con aplicaciones de la composición de tratamiento de
dos a cuatro veces al día o más frecuentemente.
La cantidad empleada del polipéptido objetivo
variará con el modo de administración, el empleo de otros compuestos
activos, y similares, estando generalmente en el intervalo de
aproximadamente 1 \mug a 100 \mug. El polipéptido objetivo
puede ser empleado con un vehículo fisiológicamente aceptable, tal
como disolución salina, disolución salina tamponada con fosfato, o
similar. La cantidad de compuesto empleada será determinada
empíricamente basándose en la respuesta de las células in
vitro y en la respuesta de animales experimentales a los
polipéptidos objetivos o a formulaciones que contengan los
polipéptidos objetivos.
Pueden emplearse HTTER36 y fragmentos solubles
del mismo para estimular el crecimiento de fibroblastos renales
normales de rata, independiente del anclaje.
Pueden emplearse HTTER36 y fragmentos solubles
del mismo como reguladores multifuncionales del crecimiento y la
diferenciación celulares, siendo capaces de efectos diversos tales
como inhibir el crecimiento de varias líneas celulares de cáncer
humano, y de linfocitos T y B.
También pueden emplearse HTTER36 y fragmentos
solubles del mismo para inhibir la proliferación precoz de células
progenitoras hematopoyéticas, estimular la inducción de la
diferenciación de células mesenquimales de músculo de rata y
estimular la producción de macromoléculas específicas de cartílago,
causando una síntesis y una secreción aumentadas de colágeno.
También pueden emplearse HTTER36 y fragmentos
solubles del mismo para estimular la formación de hueso.
Este invento describe un método de exploración
de compuestos para identificar compuestos antagonistas del
polipéptido del presente invento. Como un ejemplo, se incuba una
preparación de células o membranas de mamífero que expresan un
receptor de HTTER36 con un compuesto potencial y se mide la
capacidad del compuesto para generar una segunda señal desde el
receptor para determinar si es un antagonista eficaz. Dichos
sistemas de segundo mensajero incluyen, pero no se limitan a, cAMP
guanilato ciclasa, canales iónicos e hidrólisis de fosfoinositida.
Los antagonistas eficaces son también determinados mediante el
método anterior en que se detecta un compuesto antagonista que se
une al receptor pero no provoca una respuesta de segundo mensajero,
bloqueando por ello el receptor de HTTER36.
Otro ensayo para identificar posibles
antagonistas específicos para los receptores del polipéptido del
presente invento es un ensayo competitivo que comprende aislar
membranas plasmáticas que sobreexpresan un receptor del polipéptido
del presente invento, por ejemplo, células de carcinoma A431 humano.
Se añade una muestra de ensayo sucesivamente diluida en un medio
(el volumen es aproximadamente 10 microlitros) que contiene
^{125}I-HTTER36 10 nM a cinco microgramos de la
membrana plasmática en presencia del posible compuesto antagonista y
se incuba la mezcla durante 4 horas a 4ºC. Las mezclas de reacción
son diluidas y son hechas pasar inmediatamente a través de un
filtro Millipore. Luego se lavan rápidamente los filtros y se mide
la radiactividad unida en un contador de radiación gamma. Luego se
mide la cantidad de HTTER36 unido. Se lleva también a cabo un ensayo
testigo en ausencia del compuesto para determinar si los
antagonistas reducen la cantidad de HTTER36 unido.
Los posibles compuestos antagonistas incluyen un
anticuerpo.
Los antagonistas pueden ser empleados para
tratar neoplasias, por ejemplo, cánceres y tumores, en células cuyo
crecimiento es estimulado por el polipéptido del presente
invento.
Los antagonistas pueden ser también empleados
para evitar la estimulación de la formación de moléculas de matriz
extracelular en el hígado y el pulmón.
Los polipéptidos del presente invento o los
compuestos antagonistas pueden ser empleados en combinación con un
vehículo farmacéutico adecuado. Dichas composiciones comprenden una
cantidad terapéuticamente eficaz del polipéptido o el compuesto, y
un vehículo o excipiente farmacéuticamente aceptable. Dicho vehículo
incluye, pero no se limita a, disolución salina, disolución salina
tamponada, dextrosa, agua, glicerol, etanol y combinaciones de los
mismos. La formulación debería ajustarse al modo de
administración.
El invento también proporciona un conjunto o
sistema farmacéutico que comprende uno o más recipientes llenos con
uno o más de los ingredientes de las composiciones farmacéuticas del
invento. Asociado con dicho(s) recipiente(s)
puede haber un aviso en la forma prescrita por el organismo gubernativo que regula la fabricación, el uso o la venta de productos farmacéuticos o biológicos, aviso que refleja la aprobación de la fabricación, el uso o la venta para administración a seres humanos por parte del organismo. Además, los polipéptidos o compuestos del presente invento pueden ser empleados junto con otros compuestos terapéuticos.
puede haber un aviso en la forma prescrita por el organismo gubernativo que regula la fabricación, el uso o la venta de productos farmacéuticos o biológicos, aviso que refleja la aprobación de la fabricación, el uso o la venta para administración a seres humanos por parte del organismo. Además, los polipéptidos o compuestos del presente invento pueden ser empleados junto con otros compuestos terapéuticos.
Las composiciones farmacéuticas pueden ser
administradas de una manera conveniente, tal como por vía oral,
tópica, intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, subcutánea,
intranasal o intradérmica. Las composiciones farmacéuticas son
administradas en una cantidad que es eficaz para el tratamiento y/o
la profilaxis del estado específico. En general, son administradas
en una cantidad de al menos aproximadamente 10 mg/kg de peso
corporal y, en la mayoría de los casos, serán administradas en una
cantidad no superior a aproximadamente 8 mg/kg de peso corporal por
día. En la mayoría de los casos, la dosificación diaria es de
aproximadamente 10 mg/kg a aproximadamente 1 mg/kg de peso corporal
teniendo en cuenta las vías de administración, los síntomas,
etc.
Los polipéptidos, y los antagonistas que son
polipéptidos, pueden ser también empleados de acuerdo con el
presente invento mediante la expresión de dichos polipéptidos in
vivo, a lo que a menudo se hace referencia como "terapia
génica".
De esta manera, por ejemplo, pueden diseñarse
células de un paciente con un polinucleótido (DNA o RNA) que
codifica un polipéptido ex vivo, proporcionándose luego las
células diseñadas a un paciente que va a ser tratado con el
polipéptido. Dichos métodos son bien conocidos en la técnica y son
evidentes a partir de las presentes enseñanzas. Por ejemplo, pueden
diseñarse células mediante el uso de un vector plasmídico
retrovírico que contenga RNA que codifique un polipéptido del
presente invento.
Similarmente, pueden diseñarse células in
vivo para la expresión de un polipéptido in vivo
mediante, por ejemplo, procedimientos conocidos en la técnica. Por
ejemplo, una célula empaquetadora es transducida con un vector
plasmídico retrovírico que contiene RNA que codifica un polipéptido
del presente invento, para que la célula empaquetadora produzca
ahora partículas víricas infecciosas que contienen el gen de
interés. Éstas células productoras pueden ser administradas a un
paciente para el diseño de células in vivo y la expresión del
polipéptido in vivo. Estos y otros métodos para administrar
un polipéptido del presente invento mediante dicho método deberían
ser evidentes para los expertos en la técnica a partir de las
enseñanzas del presente invento.
Los retrovirus de los cuales pueden proceder los
vectores plasmídicos retrovíricos anteriormente mencionados
incluyen, pero no se limitan a, el virus de la leucemia murina de
Moloney, el virus de la necrosis esplénica, retrovirus tales como
el virus del sarcoma de Rous, el virus del sarcoma de Harvey, el
virus de la leucosis aviar, el virus de la leucemia del gibón, el
virus de la inmunodeficiencia humana, adenovirus, el virus del
sarcoma mieloproliferativo y el virus del tumor mamario. En una
realización, el vector plasmídico retrovírico procede del virus de
la leucemia murina de Moloney.
El vector incluye uno o más promotores. Los
promotores adecuados que pueden emplearse incluyen, pero no se
limitan a, la LTR retrovírica, el promotor de SV40, y el promotor
del citomegalovirus (CMV) humano descrito por Miller et al.,
Biotechniques, volumen 7, nº 9, 980-990 (1.989), o
cualquier otro promotor (por ejemplo, promotores celulares tales
como promotores celulares eucarióticos que incluyen, pero no se
limitan a, los promotores de histona, pol III y
\beta-actina). Otros promotores virales que pueden
ser empleados incluyen, pero no se limitan a, promotores de
adenovirus, promotores de timidina quinasa (TK; del inglés,
thymidine kinase) y promotores del parvovirus B19. La
selección de un promotor adecuado será evidente para los expertos en
la técnica a partir de las enseñanzas aquí contenidas.
La secuencia de ácido nucleico que codifica el
polipéptido del presente invento está bajo el control de un
promotor adecuado. Los promotores adecuados que pueden emplearse
incluyen, pero no se limitan a, promotores adenovíricos, tal como
el promotor tardío principal adenovírico; y promotores heterólogos,
tal como el promotor del citomegalovirus (CMV); el promotor del
virus sincitial respiratorio (RSV; del inglés, respiratory
syncytial virus); promotores inducibles, tal como el
promotor de MMT, el promotor de metalotioneína; promotores de choque
térmico; el promotor de la albúmina; el promotor de ApoAI;
promotores de globina humana; promotores de timidina quinasa
vírica, tal como el promotor de la timidina quinasa del virus herpex
símplex; LTRs retrovíricas (incluyendo las LTRs retrovíricas
modificadas anteriormente descritas); el promotor de
\beta-actina; y promotores de la hormona del
crecimiento humana. El promotor también puede ser el promotor nativo
que controla el gen que codifica el polipéptido.
El vector plasmídico retrovírico se emplea para
transducir líneas celulares empaquetadoras para formar líneas
celulares productoras. Los ejemplos de células empaquetadoras que
pueden ser transfectadas incluyen, pero no se limitan a, las líneas
celulares PE501, PA317, psi-2,
psi-AM, PA12, T19-14X,
VT-19-17-H2,
psi-CRE, psi-CRIP,
GP+E-86, GP+envAM12 y DAN, como describe Miller en
"Human Gene Therapy", volumen 1, páginas 5-14
(1.990), que se incorpora aquí por referencia en su totalidad. El
vector puede transducir las células empaquetadoras por cualquier
medio conocido en la técnica. Dichos medios incluyen, pero no se
limitan a, electroporación, uso de liposomas y precipitación con
Ca-PO_{4}. En una alternativa, el vector
plasmídico retrovírico puede ser encapsulado en un liposoma, o
copulado con un lípido, y ser luego administrado a un huésped.
La línea celular productora genera partículas
retrovíricas infecciosas vector que incluyen la(s)
secuencia(s) de ácido nucleico que codifica(n) los
polipéptidos. Dichas partículas retrovíricas vector pueden ser luego
empleadas para transducir células eucarióticas, sea in vitro
o sea in vivo. Las células eucarióticas transducidas
expresarán la(s) secuencia(s) de ácido nucleico que
codifica(n) el polipéptido. Las células eucarióticas que
pueden ser transducidas incluyen, pero no se limitan a, células
pluripotenciales embrionarias y células de carcinoma embrionario,
así como células pluripotenciales hematopoyéticas, hepatocitos,
fibroblastos, mioblastos, queratinocitos, células endoteliales y
células epiteliales bronquiales.
Este invento también se refiere al uso del gen
del presente invento como un elemento diagnóstico. La detección de
una forma mutada del gen del presente invento permitirá el
diagnóstico de una enfermedad o la susceptibilidad a una enfermedad
que resulta de una subexpresión del polipéptido del presente
invento, por ejemplo, una incorrecta cicatrización de heridas y un
incorrecto funcionamiento neurológico.
Los individuos que portan mutaciones en el gen
humano del presente invento pueden ser detectados a nivel de DNA
mediante una diversidad de técnicas. Los ácidos nucleicos para el
diagnóstico pueden obtenerse de unas células del paciente, tal como
de sangre, orina, saliva, biopsia tisular y material de autopsia. El
DNA genómico puede ser utilizado directamente para la detección o
puede ser multiplicado enzimáticamente usando una reacción en
cadena de la polimerasa (PCR; del inglés, polymerase
chain reaction) [Saiki et al., Nature, 324:
163-166 (1.986)] antes del análisis. Puede también
utilizarse RNA o cDNA con el mismo fin. Como un ejemplo, pueden
utilizarse cebadores de PCR complementarios del ácido nucleico que
codifica un polipéptido del presente invento, para identificar y
analizar mutaciones del mismo. Por ejemplo, pueden detectarse
deleciones e inserciones por un cambio en el tamaño del producto
multiplicado en comparación con el genotipo normal. Pueden
identificarse mutaciones puntuales al hibridar el DNA multiplicado
con RNA radiomarcado o, alternativamente, con secuencias de DNA
antisentido radiomarcadas. Las secuencias perfectamente apareadas
pueden distinguirse de los dúplex desapareados por digestión con
RNasa A o por diferencias en las temperaturas de fusión.
Las diferencias de secuencia entre el gen de
referencia y los genes que tienen mutaciones pueden revelarse
mediante el método de secuenciación directa de DNA. Además, pueden
emplearse segmentos de DNA clonados, como sondas, para detectar
segmentos de DNA específicos. La sensibilidad de este método resulta
fuertemente potenciada cuando se combina con la PCR. Por ejemplo,
se usa un cebador de secuenciación con un producto de PCR de doble
cadena o una molécula molde de cadena sencilla generada mediante una
PCR modificada. La determinación de la secuencia es llevada a cabo
mediante procedimientos convencionales con nucleótidos radiomarcados
o mediante procedimientos de secuenciación automática con etiquetas
fluorescentes.
Puede llevarse a cabo un ensayo genético basado
en diferencias en las secuencias de DNA, mediante la detección de
una alteración en la movilidad electroforética de fragmentos de DNA
en geles con o sin agentes desnaturalizantes. Pueden visualizarse
pequeñas deleciones e inserciones en la secuencia mediante una
electroforesis de alta resolución en gel. Los fragmentos de DNA de
secuencias diferentes pueden distinguirse en geles con formamida
desnaturalizante en gradiente ya que las movilidades de los
diferentes fragmentos de DNA resultan retardadas en el gel, en
diferentes posiciones, de acuerdo con sus temperaturas de fusión
específica o fusión parcial [véase, por ejemplo, Myers et
al., Science, 230: 1.242 (1.985)].
Los cambios de secuencia en posiciones
específicas pueden también revelarse mediante ensayos de protección
de nucleasas, tal como la protección de RNasa y S1, o mediante el
método de escisión química [por ejemplo, Cotton et al., PNAS
USA, 85: 4.397-4.401 (1.985)].
De este modo, la detección de una secuencia de
DNA específica puede ser llevada a cabo mediante métodos tales como
hibridación, protección de RNasa, escisión química, secuenciación
directa de DNA o el uso de enzimas de restricción [por ejemplo,
polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP; del
inglés, restriction fragment length
polymorphisms)], y transferencia Southern de DNA
genómico.
Además de por la electroforesis en gel y la
secuenciación de DNA más convencionales, las mutaciones pueden ser
también detectadas por análisis in situ.
El presente invento también se refiere a ensayos
diagnósticos para detectar niveles alterados del polipéptido del
presente invento en diversos tejidos ya que una sobreexpresión de
las proteínas en comparación con muestras de tejidos testigo
normales permite detectar la presencia de ciertos estados morbosos,
tales como neoplasia, trastornos cutáneos, trastornos oculares e
inflamación. Los ensayos utilizados para detectar niveles del
polipéptido del presente invento en una muestra procedente de un
huésped son bien conocidos por los expertos en la técnica e
incluyen radioinmunoensayos, ensayos de unión competitiva, análisis
por transferencia Western y, preferiblemente, un ensayo de
inmunosorción con enzimas ligadas (ELISA; del inglés,
enzyme-linked immunosorption
assay). Un ensayo ELISA comprende inicialmente preparar un
anticuerpo específico para un antígeno del polipéptido del presente
invento, preferiblemente un anticuerpo monoclonal. Además, se
prepara un anticuerpo informador contra el anticuerpo monoclonal.
Al anticuerpo informador se fija un reactivo detectable, tal como un
agente radiactivo, un agente fluorescente o, en este ejemplo, una
enzima peroxidasa de rábano picante. Luego se extrae una muestra de
un huésped y se incuba sobre un soporte sólido, por ejemplo, una
placa de poliestireno, que se une a las proteínas de la muestra.
Luego se cubren todos los sitios ligantes de proteína libres de la
placa mediante incubación con una proteína inespecífica, tal como
albúmina sérica bovina. A continuación, se incuba el anticuerpo
monoclonal en la placa durante un tiempo que permite que los
anticuerpos monoclonales se fijen a los polipéptidos del presente
invento fijados a la placa de poliestireno. Todo anticuerpo
monoclonal no unido es eliminado por lavado con tampón. Luego se
pone en la placa el anticuerpo informador unido a peroxidasa de
rábano picante, lo que da lugar a la unión del anticuerpo
informador a todo anticuerpo monoclonal unido a polipéptidos del
presente invento. El anticuerpo informador no fijado es luego
eliminado por lavado. Luego se añaden sustratos de peroxidasa a la
placa, y la cantidad de color desarrollado en un período de tiempo
dado, cuando se compara con una curva patrón, es una medida de la
cantidad de proteína presente en un volumen dado de muestra de
paciente.
Puede también emplearse un ensayo competitivo
para determinar los niveles del polipéptido del presente invento en
una muestra procedente de los huéspedes. Dicho ensayo comprende
aislar membranas plasmáticas que sobreexpresan el receptor para el
polipéptido del presente invento. Luego se añade a las membranas
plasmáticas una muestra de ensayo que contiene los polipéptidos del
presente invento que han sido marcados y se incuba la mezcla durante
un período de tiempo establecido. A la mezcla de reacción también
se añade una muestra procedente de un huésped de la que se sospecha
que contiene el polipéptido del presente invento. Luego se hacen
pasar las mezclas de reacción a través de un filtro que es
rápidamente lavado y se mide después la radiactividad unida para
determinar la cantidad de competición por los receptores y, por lo
tanto, la cantidad de los polipéptidos del presente invento en la
muestra.
Los anticuerpos específicos para HTTER36 pueden
ser utilizados para el diagnóstico y la terapia del cáncer ya que
muchos tipos de células cancerosas suprarregulan a diversos miembros
de esta superfamilia durante el proceso de neoplasia o hiperplasia.
Estos anticuerpos se unen a, e inactivan, HTTER36. Los anticuerpos
monoclonales contra HTTER36 (y/o sus miembros familiares) tienen
utilidad clínica tanto para el diagnóstico como para la terapia de
ciertos trastornos que incluyen (pero no se limitan a) anormalidades
de crecimiento hiperplásico y neoplásico. La suprarregulación de la
expresión de factores de crecimiento por tejidos neoplásicos forma
la base de una diversidad de ensayos séricos que permiten detectar
aumentos de factor de crecimiento en la sangre de pacientes
afectados. Estos ensayos se aplican típicamente no sólo en
escenarios de diagnóstico sino también en escenarios de pronóstico
(para detectar la presencia de células tumorales ocultas después de
una cirugía, quimioterapia, etc.).
Además, las células malignas que expresan el
receptor de HTTER36 pueden ser detectadas utilizando HTTER36
marcado en un ensayo de unión a receptor, o mediante el uso de
anticuerpos contra el propio receptor de HTTER36. Las células
pueden distinguirse de acuerdo con la presencia y la densidad de
receptores para HTTER36, lo que proporciona un medio para predecir
la susceptibilidad de dichas células a las actividades biológicas de
HTTER36.
Las secuencias del presente invento son también
valiosas para la identificación de cromosomas. La secuencia se
dirige específicamente a, y puede hibridarse con, una posición
concreta de un cromosoma humano individual. Además, actualmente
existe la necesidad de identificar sitios concretos del cromosoma.
Pocos reactivos de marcación cromosómica basados en datos de
secuencias reales (polimorfismos de repetición) están actualmente
disponibles para la marcación de una posición cromosómica. El mapeo
de DNAs en cromosomas de acuerdo con el presente invento es una
primera operación importante en cuanto a correlacionar esas
secuencias con genes asociados con una enfermedad.
En resumen, las secuencias pueden ser mapeadas
en cromosomas preparando cebadores de PCR (preferiblemente de
15-25 bp) a partir del cDNA. Se utiliza un análisis
informático de la región no traducida 3' del gen para seleccionar
rápidamente cebadores que no abarquen más de un exón en el DNA
genómico, lo que complicaría el proceso de multiplicación. Luego se
utilizan estos cebadores para la exploración, por PCR, de híbridos
de células somáticas que contienen cromosomas humanos individuales.
Sólo los híbridos que contengan el gen humano que corresponde al
cebador producirán un fragmento multiplicado.
El mapeo de híbridos de células somáticas por
PCR es un procedimiento rápido para asignar un DNA particular a un
cromosoma particular. Utilizando el presente invento con los mismos
cebadores oligonucleotídicos, puede llevarse a cabo una
sublocalización con grupos de fragmentos de cromosomas específicos o
colecciones de clones genómicos grandes de una manera análoga.
Otras estrategias de mapeo que pueden ser similarmente utilizadas
para mapear su cromosoma incluyen hibridación in situ,
preexploración con cromosomas seleccionados en flujo y marcados y
preselección por hibridación para construir bancos de cDNA
específico de cromosoma.
Puede utilizarse la hibridación in situ
con fluorescencia (FISH; del inglés, fluorescence
in situ hybridization) de un clon de
cDNA con una extensión cromosómica en metafase, para proporcionar
una localización cromosómica precisa en una operación. Esta técnica
puede utilizarse con un cDNA tan pequeño como aquél de 50 ó 60
bases. Para una revisión de esta técnica, véase Verma et
al., "Human Chromosomes: A Manual of Basic Techniques",
Pergamon Press, New York, EE.UU. (1.988).
Una vez que una secuencia ha sido mapeada en una
posición cromosómica precisa, la posición física de la secuencia en
el cromosoma puede ser correlacionada con datos de mapas genéticos.
Dichos datos se encuentran, por ejemplo, en V. McKusick,
"Mendelian Inheritance in Man" (asequible en Internet del Johns
Hopkins University Welch Medical Library). Luego se identifica la
relación entre genes y enfermedades que han sido mapeadas en la
misma región cromosómica, por medio de un análisis de ligamientos
(herencia conjunta o genes físicamente adyacentes).
A continuación, es necesario determinar las
diferencias en la secuencia genómica o de cDNA entre individuos
afectados y no afectados. Si se observa una mutación en algunos o
todos los individuos afectados pero no en los individuos normales,
es probable entonces que la mutación sea el agente causativo de la
enfermedad.
Con la actual resolución de las técnicas de
mapeo físico y mapeo genético, un cDNA precisamente localizado en
una región cromosómica asociada con la enfermedad podría ser uno de
entre 50 y 500 posibles genes causativos (esto supone una resolución
de mapeo de 1 megabase y un gen por 20 kb).
Los polipéptidos, sus fragmentos u otros
derivados, o los compuestos análogos de los mismos, o las células
que los expresan pueden utilizarse como inmunógenos para producir
anticuerpos contra ellos. Estos anticuerpos pueden ser, por
ejemplo, anticuerpos policlonales o monoclonales. El presente
invento también incluye anticuerpos quiméricos, de cadena única y
humanizados, así como fragmentos Fab o el producto de un banco de
expresión de Fab. Para la producción de dichos anticuerpos y
fragmentos, pueden usarse diversos procedimientos conocidos en la
técnica.
Los anticuerpos generados contra los
polipéptidos que corresponden a una secuencia del presente invento
pueden ser obtenidos por inyección directa de los polipéptidos a un
animal o por administración de los polipéptidos a un animal,
preferiblemente no humano. El anticuerpo así obtenido se unirá
entonces a los propios polipéptidos. De esta manera, incluso una
secuencia que sólo codifique un fragmento de los polipéptidos puede
ser utilizada para generar anticuerpos que se unan a los
polipéptidos nativos completos. Dichos anticuerpos pueden ser luego
utilizados para aislar el polipéptido del tejido que expresa ese
polipéptido.
Para la preparación de anticuerpos monoclonales
puede utilizarse cualquier técnica que proporcione anticuerpos
producidos mediante cultivos continuos de líneas celulares. Los
ejemplos incluyen la técnica del hibridoma (Kohler y Milstein,
1.975, Nature, 256: 495-497), la técnica del trioma,
la técnica del hibridoma con células B humanas (Kozbor et
al., 1.983, Immunology Today 4: 72), y la técnica del
hibridoma-virus de Epstein-Barr
para producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole et al.,
1.985, en ``Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss,
Inc., páginas 77-96).
Las técnicas descritas para la producción de
anticuerpos de cadena única (Patente de EE.UU. nº 4.946.778) pueden
ser adaptadas para producir anticuerpos de cadena única contra
productos polipeptídicos inmunogénicos de este invento. Además,
pueden usarse ratones transgénicos para que expresen anticuerpos
humanizados contra productos polipeptídicos inmunogénicos de este
invento.
El presente invento será adicionalmente descrito
con referencia a los ejemplos siguientes; sin embargo, ha de
entenderse que el presente invento no se limita a tales ejemplos. A
menos que se especifique otra cosa, todas las partes y cantidades
son en peso.
Con objeto de facilitar la comprensión de los
ejemplos siguientes, se describirán ciertos métodos y/o términos que
aparecen frecuentemente.
Los "plásmidos" son designados mediante una
letra p minúscula precedida y/o seguida por letras mayúsculas y/o
números. Los presentes plásmidos de partida son comercialmente
asequibles o son públicamente asequibles sobre una base no
restringida, o pueden ser construidos a partir de plásmidos
disponibles de acuerdo con procedimientos publicados. Además,
plásmidos equivalentes a los descritos son conocidos en la técnica y
serán evidentes para el técnico de experiencia normal.
La "digestión" de DNA se refiere a la
escisión catalítica del DNA con una enzima de restricción que sólo
actúa sobre ciertas secuencias del DNA. Las diversas enzimas de
restricción aquí utilizadas son comercialmente asequibles, y sus
condiciones de reacción, cofactores y otros requisitos se utilizaron
del modo conocido por el técnico de experiencia normal. Para fines
analíticos, se usa típicamente 1 \mug de plásmido o fragmento de
DNA con aproximadamente 2 unidades de enzima en aproximadamente 20
\mul de disolución tampón. Con el fin de aislar fragmentos de DNA
para la construcción de plásmidos, se someten típicamente de 5 a 50
\mug de DNA a digestión con de 20 a 250 unidades de enzima en un
volumen mayor. Los tampones y cantidades de sustrato apropiados para
las enzimas de restricción concretas vienen especificados por el
fabricante. Se usan normalmente tiempos de incubación de
aproximadamente 1 hora a 37ºC, pero pueden variar de acuerdo con las
instrucciones del proveedor. Después de la digestión, la mezcla de
reacción es sometida directamente a electroforesis sobre un gel de
poliacrilamida para aislar el fragmento
deseado.
deseado.
La separación de los fragmentos escindidos, por
tamaños, es llevada a cabo utilizando un gel de poliacrilamida al 8
por ciento de la manera descrita por D. Goeddel et al.,
Nucleic Acids Res., 8: 4.057 (1.980).
"Oligonucleótidos" se refiere a un
polidesoxinucleótido de cadena sencilla o dos cadenas
polidesoxinucleotídicas complementarias que se pueden sintetizar
químicamente. Dichos oligonucleótidos sintéticos no tienen fosfato
5' y, por lo tanto, no se ligarán con otro oligonucleótido sin que
se añada un fosfato con un ATP en presencia de una quinasa. Un
oligonucleótido sintético se ligará con un fragmento que no haya
sido desfosforilado.
La "ligación" se refiere al proceso de
formación de enlaces fosfodiéster entre dos fragmentos de ácido
nucleico de cadena doble (T. Maniatis et al., ib., página
146). A menos que se disponga otra cosa, la ligación puede ser
llevada a cabo usando tampones y condiciones conocidos con 10
unidades de DNA ligasa de T4 ("ligasa") por 0,5 \mug de
cantidades aproximadamente equimolares de los fragmentos de DNA que
se van a ligar.
A menos que se afirme otra cosa, la
transformación fue llevada a cabo del modo descrito en el método de
F. Graham y A. Van der Eb, Virology, 52: 456-457
(1.973).
La secuencia de DNA que codifica HTTER36, ATCC
nº 97349, fue inicialmente multiplicada utilizando cebadores
oligonucleotídicos de PCR correspondientes a las secuencias 5' de la
proteína HTTER36 procesada y las secuencias vector 3' con respecto
al gen HTTER36. Se añadieron nucleótidos adicionales
correspondientes a HTTER36 a las secuencias 5' y 3',
respectivamente. El cebador oligonucleotídico 5' tiene la secuencia
5' GAAAGGATCCGCAGCCA
TCCCTGTCCCCAAACTTTCTTGT 3' (ID. SEC. nº 3) y contiene un sitio para la enzima de restricción BamHI (en letra negrita) seguido de 18 nucleótidos de la secuencia de codificación de HTTER36 a partir del nucleótido 791 de la Figura 1 (ID. SEC. nº 1). La secuencia 3', 5' TCCTTCTATTCAAGCTTCTGACATCCTACCCACACCCACA 3' (ID. SEC. nº 4), contiene secuencias complementarias de un sitio Hind III y va seguida de 15 nucleótidos de HTTER36 comenzando en el nucleótido 1.121, y un codón de parada. Los sitios para enzimas de restricción corresponden a los sitios para enzimas de restricción del vector de expresión bacteriano pQE-9 (Qiagen, Inc., Chatsworth, California, 91311, EE.UU.). pQE-9 codifica resistencia a antibióticos (Amp^{r}), un origen bacteriano de replicación (ori), un promotor/operador (P/O) regulable por IPTG, un sitio de unión al ribosoma (RBS; del inglés, ribosome binding site), una etiqueta de 6-His y sitios para enzimas de restricción. pQE-9 fue luego sometido a digestión con BamHI e Hind III. Las secuencias multiplicadas fueron ligadas en pQE-9 y fueron insertadas en marco con la secuencia que codifica la etiqueta de histidina y el RBS. La mezcla de ligación fue luego utilizada para transformar la cepa DH5 alfa de E. coli (Gibco BRL) mediante el procedimiento descrito por J. Sambrook et al., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory Press (1.989). Se identificaron los transformantes por su capacidad para crecer en placas LB y se seleccionaron las colonias resistentes a ampicilina/kanamicina. El DNA plasmídico fue aislado y fue confirmado por análisis de restricción. Los clones que contenían las construcciones deseadas fueron dejados crecer durante la noche (O/N; del inglés, overnight) en un cultivo líquido en medio LB complementado tanto con Amp (100 \mug/ml) como con Kan (25 \mug/ml). El cultivo O/N fue utilizado para inocular un cultivo grande en una relación de 1:100 a 1:250. Las células fueron cultivadas hasta una densidad óptica 600 (DO^{600}) de entre 0,4 y 0,6. Luego se añadió IPTG (isopropil-\beta-D-tiogalactopiranosido) hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG induce al inactivar el represor lacI, despejando el P/O que conduce a una expresión génica aumentada. Las células fueron cultivadas durante un periodo extra de 3 a 4 horas. Las células fueron luego recolectadas por centrifugación. El sedimento celular fue solubilizado en el agente caotrópico guanidina\cdotHCl 6 molar. Después del aclaramiento, el HTTER36 solubilizado fue purificado de esta disolución por cromatografía en una columna de quelato de níquel bajo unas condiciones que permiten una fuerte fijación por proteínas que contienen la etiqueta de 6-His [E. Hochuli et al., J. Chromatography 411: 177-184 (1.984)]. El HTTER36 (pureza de 85%) fue eluido de la columna con guanidina\cdotHCl 6 molar, pH de 5,0, y, con el fin de renaturalización, la disolución fue ajustada a guanidina\cdotHCl 3 molar, fosfato sódico 100 mM, glutatión (reducido) 10 molar y glutatión (oxidado) 2 molar. Después de una incubación en esta disolución durante 12 horas, la proteína fue dializada frente a fosfato sódico 10 molar.
TCCCTGTCCCCAAACTTTCTTGT 3' (ID. SEC. nº 3) y contiene un sitio para la enzima de restricción BamHI (en letra negrita) seguido de 18 nucleótidos de la secuencia de codificación de HTTER36 a partir del nucleótido 791 de la Figura 1 (ID. SEC. nº 1). La secuencia 3', 5' TCCTTCTATTCAAGCTTCTGACATCCTACCCACACCCACA 3' (ID. SEC. nº 4), contiene secuencias complementarias de un sitio Hind III y va seguida de 15 nucleótidos de HTTER36 comenzando en el nucleótido 1.121, y un codón de parada. Los sitios para enzimas de restricción corresponden a los sitios para enzimas de restricción del vector de expresión bacteriano pQE-9 (Qiagen, Inc., Chatsworth, California, 91311, EE.UU.). pQE-9 codifica resistencia a antibióticos (Amp^{r}), un origen bacteriano de replicación (ori), un promotor/operador (P/O) regulable por IPTG, un sitio de unión al ribosoma (RBS; del inglés, ribosome binding site), una etiqueta de 6-His y sitios para enzimas de restricción. pQE-9 fue luego sometido a digestión con BamHI e Hind III. Las secuencias multiplicadas fueron ligadas en pQE-9 y fueron insertadas en marco con la secuencia que codifica la etiqueta de histidina y el RBS. La mezcla de ligación fue luego utilizada para transformar la cepa DH5 alfa de E. coli (Gibco BRL) mediante el procedimiento descrito por J. Sambrook et al., "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory Press (1.989). Se identificaron los transformantes por su capacidad para crecer en placas LB y se seleccionaron las colonias resistentes a ampicilina/kanamicina. El DNA plasmídico fue aislado y fue confirmado por análisis de restricción. Los clones que contenían las construcciones deseadas fueron dejados crecer durante la noche (O/N; del inglés, overnight) en un cultivo líquido en medio LB complementado tanto con Amp (100 \mug/ml) como con Kan (25 \mug/ml). El cultivo O/N fue utilizado para inocular un cultivo grande en una relación de 1:100 a 1:250. Las células fueron cultivadas hasta una densidad óptica 600 (DO^{600}) de entre 0,4 y 0,6. Luego se añadió IPTG (isopropil-\beta-D-tiogalactopiranosido) hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG induce al inactivar el represor lacI, despejando el P/O que conduce a una expresión génica aumentada. Las células fueron cultivadas durante un periodo extra de 3 a 4 horas. Las células fueron luego recolectadas por centrifugación. El sedimento celular fue solubilizado en el agente caotrópico guanidina\cdotHCl 6 molar. Después del aclaramiento, el HTTER36 solubilizado fue purificado de esta disolución por cromatografía en una columna de quelato de níquel bajo unas condiciones que permiten una fuerte fijación por proteínas que contienen la etiqueta de 6-His [E. Hochuli et al., J. Chromatography 411: 177-184 (1.984)]. El HTTER36 (pureza de 85%) fue eluido de la columna con guanidina\cdotHCl 6 molar, pH de 5,0, y, con el fin de renaturalización, la disolución fue ajustada a guanidina\cdotHCl 3 molar, fosfato sódico 100 mM, glutatión (reducido) 10 molar y glutatión (oxidado) 2 molar. Después de una incubación en esta disolución durante 12 horas, la proteína fue dializada frente a fosfato sódico 10 molar.
La secuencia de DNA que codifica la proteína
HTTER36, ATCC nº 97349, es multiplicada utilizando cebadores
oligonucleotídicos de PCR correspondientes a las secuencias 5' y 3'
del gen.
Los cebadores usados son:
5'
CAGGGATCCGCCATCATGCTTCGTTTCTTGCCAGA 3' (ID. SEC. nº 5)
contiene el sitio Bam HI subrayado, una señal eficaz para el inicio
de la traducción en células eucarióticas, un codón de inicio (letra
negrita) y 17 bp de la secuencia de codificación de HTTER36. El
cebador 3' tiene la secuencia 5'
CTTCGGTACCCATTTCTGACATCCTA
CCCACAC 3' (ID. SEC. nº 6) y contiene el sitio Asp718 subrayado y 23 nucleótidos complementarios del extremo 3' de la secuencia de HTTER36 comenzando en el nucleótido 1.126.
CCCACAC 3' (ID. SEC. nº 6) y contiene el sitio Asp718 subrayado y 23 nucleótidos complementarios del extremo 3' de la secuencia de HTTER36 comenzando en el nucleótido 1.126.
Las secuencias multiplicadas son aisladas en un
gel de agarosa al 1% usando un sistema comercialmente asequible
("Geneclean", BIO 101 Inc., La Jolla, California, EE.UU.). El
fragmento es luego sometido a digestión con las endonucleasas BamHI
y Asp718 y es luego purificado de nuevo en un gel de agarosa al 1%.
Este fragmento es denominado F2.
Se usa el vector pA2 (modificación del vector
pVL941, discutido más adelante) para la expresión de la proteína
HTTER36 usando el sistema de expresión baculovírico (para una
revisión, véase M. D. Summers y G. E. Smith, 1.987, "A manual of
methods for baculovirus vectors and insect cell culture
procedures", Texas Agricultural Experimental Station Bulletin nº
1.555). Este vector de expresión contiene el potente promotor de la
poliedrina del virus de la poliedrosis nuclear de Autographa
californica (AcMNPV), seguido de los sitios de reconocimiento
para las endonucleasas de restricción. Se utiliza el sitio de
poliadenilación del virus 40 de simios (SV40; del inglés,
simian virus 40) para una poliadenilación eficaz. Para
una sencilla selección del virus recombinante, se inserta el gen de
beta-galactosidasa de E. coli con la misma
orientación que el promotor de la poliedrina, seguido de la señal
de poliadenilación del gen de la poliedrina. Las secuencias de
poliedrina están flanqueadas en ambos lados por secuencias virales
para la recombinación homóloga celularmente mediada de DNA viral de
tipo silvestre cotransfectado. Podrían usarse muchos otros vectores
baculovíricos, tales como pAc373, pRG1, pVL941 y pAcIM1 (V. A.
Luckow y M. D. Summers, Virology, 170: 31-39).
El plásmido es sometido a digestión con las
enzimas de restricción BamHI y Asp718 y es luego desfosforilado
usando fosfatasa intestinal de ternera mediante procedimientos
conocidos en la técnica. El DNA es luego aislado en un gel de
agarosa al 1% usando el sistema comercialmente asequible
("Geneclean", BIO 101 Inc., La Jolla, California, EE.UU.). Este
vector es denominado V2.
El fragmento F2 y el plásmido V2 desfosforilado
son ligados con DNA ligasa de T4. Luego se transforman células
E. coli HB101 y se identifican las bacterias que contienen el
plásmido (pBacHTTER36) con el gen HTTER36 usando las enzimas de
restricción BamHI y Asp718. La secuencia del fragmento clonado es
confirmada por secuenciación de DNA.
Se cotransfectan 5 \mug del plásmido
pBacHTTER36 con 1,0 \mug de un baculovirus linealizado
comercialmente asequible ("DNA baculovírico BaculoGold™",
Pharmingen, San Diego, California, EE.UU.) usando el método de
lipofección [Felgner et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84:
7.413-7.417 (1.987)].
Se mezclan 1 \mug de DNA vírico BaculoGold™ y
5 \mug del plásmido pBacHTTER36 en un pocillo estéril de una
placa de microtitulación que contiene 50 \mul de medio de Grace
exento de suero (Life Technologies Inc., Gaithersburg, Maryland,
EE.UU.). Luego se añaden 10 \mul de lipofectina más 90 \mul de
medio de Grace, se mezcla todo y se realiza una incubación durante
15 minutos a temperatura ambiental. Luego se añade gota a gota la
mezcla de transfección a las células Sf9 de insecto (ATCC CRL 1711)
sembradas en una placa para cultivo tisular de 35 mm con 1 ml de
medio de Grace sin suero. La placa es sometida a un movimiento de
vaivén para mezclar la disolución recién añadida. La placa es luego
incubada durante 5 horas a 27ºC. Después de 5 horas, se retira la
disolución de transfección de la placa y se añade 1 ml de medio de
Grace para insectos complementado con suero de ternera fetal al
10%. Se pone de nuevo la placa en una incubadora y se continúa el
cultivo a 27ºC durante cuatro días.
Después de cuatro días, se recoge el
sobrenadante y se lleva a cabo un ensayo de placas similar al
descrito por Summers y Smith (supra). Se usa un gel de agarosa con
"Blue Gal" (Life Technologies Inc., Gaithersburg) como una
modificación, lo que permite un sencillo aislamiento de las placas
teñidas de azul (puede también hallarse una descripción detallada
de un "ensayo de placas" en la guía de usuario para cultivo de
células de insecto y baculovirología distribuida por Life
Technologies Inc., Gaithersburg, páginas 9-10).
Cuatro días después de la dilución sucesiva, se
añade el virus a las células y se recogen las placas teñidas de
azul con la punta de una pipeta Eppendorf. El agar que contiene los
virus recombinantes es luego resuspendido en un tubo Eppendorf que
contiene 200 \mul de medio de Grace. El agar es eliminado mediante
una breve centrifugación, y el sobrenadante que contiene el
baculovirus recombinante es usado para infectar células Sf9
sembradas en placas de 35 mm. Cuatro días más tarde, los
sobrenadantes de estas placas de cultivo son recolectados y son
luego guardados a 4ºC.
Se cultivan células Sf9 en medio de Grace
complementado con suero bovino fetal (FBS; del inglés, fetal
bovine serum) térmicamente inactivado, al 10%. Las
células son infectadas con el baculovirus recombinante
V-HTTER36 con una multiplicidad de infección (MOI;
del inglés, multiplicity of infection) de 2.
Seis horas más tarde, el medio es retirado y es sustituido por
medio SF900 II menos metionina y cisteína (Life Technologies Inc.,
Gaithersburg). 42 horas más tarde, se añaden 185.000 Bq de
^{35}S-metionina y 185.000 Bq de
^{35}S-cisteína (Amersham). Las células son
adicionalmente incubadas durante 16 horas antes de que sean
recolectadas por centrifugación, y las proteínas marcadas son
visualizadas por electroforesis en gel de
poliacrilamida-dodecilsulfato sódico
(SDS-PAGE; del inglés, sodium dodecyl
sulfate-polyacrylamide gel
electrophoresis) y autorradiografía.
Se usa pC1 para la expresión de la proteína
HTTER36. El plásmido pC1 es un derivado del plásmido
pSV2-dhfr (nº de acceso 37146 de la ATCC). Ambos
plásmidos contienen el gen dhfr de ratón bajo el control del
promotor precoz de SV40. Pueden seleccionarse células de ovario de
hámster chino u otras células que carecen de actividad
dihidrofolato y son transfectadas con estos plásmidos, mediante el
cultivo de las células en un medio selectivo (alpha minus MEM, Life
Technologies) complementado con el agente quimioterapéutico
metotrexato. La multiplicación de los genes DHFR en células
resistentes al metotrexato (MTX) está bien documentada (véanse, por
ejemplo, F. W. Alt, R. M. Kellems, J. R. Bertino y R. T. Schimke,
1.978, J. Biol. Chem. 253: 1.357-1.370; J. L. Hamlin
y C. Ma, 1.990, Biochem. et Biophys. Acta, 1.097:
107-143; y M. J. Page y M. A. Sydenham, 1.991,
Biotechnology, volumen 9, 64-68). Las células
cultivadas en concentraciones crecientes de MTX desarrollan
resistencia al fármaco al sobreproducir la enzima diana, DHFR, como
resultado de la multiplicación del gen DHFR. Si un segundo gen está
ligado al gen dhfr, resulta normalmente comultiplicado y
sobreexpresado. El estado de la técnica es desarrollar líneas
celulares que lleven más de 1.000 copias de los genes.
Posteriormente, cuando el metotrexato es retirado, las líneas
celulares contienen el gen multiplicado integrado en el(los)
cromosoma(s).
El plásmido pN346 contiene, para la expresión
del gen de interés, un potente promotor de la repetición terminal
larga (LTR; del inglés, long terminal repeat)
del virus del sarcoma de Rous (Cullen et al., Molecular and
Cellular Biology, Marzo de 1.985, 438-447) más un
fragmento aislado del potenciador del gen precoz inmediato del
citomegalovirus (CMV) humano (Boshart et al., Cell 41:
521-530, 1.985). Cadena abajo del promotor, están
los siguientes sitios de escisión por enzima de restricción única
que permiten la integración de los genes: BamHI, PvuII y NruI.
Detrás de estos sitios de clonación, el plásmido contiene codones de
parada de la traducción en los tres marcos de lectura seguidos del
intrón 3' y el sitio de poliadenilación del gen de preproinsulina
de rata. Pueden también usarse otros promotores muy eficaces para la
expresión, tales como, por ejemplo, el promotor de
\beta-actina humana, los promotores precoces o
tardíos de SV40 y las repeticiones terminales largas de otros
retrovirus, por ejemplo, HIV y HTLVI. Para la poliadenilación del
mRNA pueden también usarse otras señales, por ejemplo, de los genes
de la hormona del crecimiento humana o de la globina humana.
Las líneas celulares estables que llevan un gen
de interés integrado en el cromosoma pueden ser también
seleccionadas tras cotransfección con un marcador seleccionable tal
como gpt, G418 o higromicina. Al principio es ventajoso usar más de
un marcador seleccionable, por ejemplo, G418 más metotrexato.
El plásmido pN346 fue sometido a digestión con
la enzima de restricción BamHI y fue luego desfosforilado usando
fosfatasa intestinal de ternera mediante procedimientos conocidos en
la técnica. El vector fue luego aislado en un gel de agarosa al
1%.
La secuencia de DNA que codifica HTTER36, ATCC
nº 97349, fue multiplicada usando cebadores oligonucleotídicos de
PCR que correspondían a las secuencias 5' y 3' del gen.
El cebador 5' tiene la secuencia 5'
ACAGCGGATCCAGCCACC ATGCTTCGTTTCTTGCCA 3' (ID. SEC. nº
7) y contiene un sitio para la enzima de restricción BamHI (en
letra negrita) seguido de una señal eficaz para la traducción (M.
Kozak, supra) más los 18 primeros nucleótidos del gen (el codón de
iniciación para la traducción, "ATG", está subrayado.
El cebador 3' tiene la secuencia 5'
TCCTTCGGATCCCATTTCT GACATCCTACCCACACCCACA 3' (ID. SEC. nº 8)
y contiene el sitio de escisión para la endonucleasa de restricción
BamHI y 29 nucleótidos complementarios de la secuencia 3' traducida
y no traducida del gen.
Los fragmentos multiplicados fueron aislados en
un gel de agarosa al 1% del modo anteriormente descrito y fueron
luego sometidos a digestión con la endonucleasa BgIII y purificados
de nuevo después en un gel de agarosa al 1%.
El fragmento aislado y el vector desfosforilado
fueron luego ligados con DNA ligasa de T4. Luego se transformaron
células E. coli HB101 y se identificaron las bacterias que
contenían el plásmido pN346 insertado en la orientación correcta
usando la enzima de restricción BamHI. La secuencia del gen
insertado fue confirmada por secuenciación de DNA.
Para la transfección, se usaron células de
ovario de hámster chino que carecen de una enzima DHFR activa. Se
cotransfectaron 5 \mug del plásmido de expresión N346 con 0,5
\mug del plásmido pSVneo usando el método de la lipofectina
(Felgner et al., supra). El plásmido pSV2-neo
contiene un marcador seleccionable dominante, el gen neo de Tn5 que
codifica una enzima que confiere resistencia a un grupo de
antibióticos, incluido G418. Las células fueron sembradas en alpha
minus MEM complementado con 1 mg/ml de G418. Después de 2 días, las
células fueron tratadas con tripsina, sembradas en placas para
clonación de hibridomas (Greiner, Alemania) y cultivadas durante
10-14 días. Después de este periodo, se trataron
clones individuales con tripsina y se sembraron luego en placas
Petri de 6 pocillos usando diferentes concentraciones de metotrexato
(25 nM, 50 nM, 100 nM, 200 nM, 400 nM). Los clones que crecieron en
las mayores concentraciones de metotrexato fueron luego
transferidos a nuevas placas de 6 pocillos que contenían
concentraciones de metotrexato aún mayores (500 nM, 1 \muM, 2
\muM, 5 \muM). Se repitió el mismo procedimiento hasta que los
clones crecieron en una concentración de 100 \muM.
La expresión del producto génico deseado fue
analizada por transferencia Western y SDS-PAGE.
Se obtienen fibroblastos de un sujeto mediante
una biopsia de piel. El tejido resultante es puesto en un medio
para cultivo tisular y dividido en trozos pequeños. Se ponen
pequeños pedazos del tejido en una superficie húmeda de un matraz
para cultivo tisular; se ponen aproximadamente diez trozos en cada
matraz. El matraz es puesto boca abajo, cerrado herméticamente y
dejado a temperatura ambiental durante la noche. Después de 24
horas a temperatura ambiental, se invierte el matraz y los pedazos
de tejido quedan fijados al fondo del matraz, y se añade medio
fresco (por ejemplo, medio F12 de Ham con FBS al 10%, penicilina y
estreptomicina). Luego se incuba el conjunto a 37ºC durante
aproximadamente una semana. Tras este tiempo, se añade medio fresco
que es posteriormente cambiado cada varios días. Después de dos
semanas adicionales en cultivo, surge una monocapa de fibroblastos.
La monocapa es tratada con tripsina y pasada a una escala superior
usando matraces mayores.
pMV-7 [P. T. Kirschmeier et
al., DNA, 7: 219-25 (1.988)] flanqueado por las
repeticiones terminales largas del virus del sarcoma murino de
Moloney es sometido a digestión con EcoRI y HindIII y es
posteriormente tratado con fosfatasa intestinal de ternera. El
vector lineal es fraccionado en un gel de agarosa y es purificado
usando glóbulos de vidrio.
El cDNA que codifica un polipéptido del presente
invento es multiplicado usando cebadores de PCR que corresponden a
las secuencias terminales 5' y 3', respectivamente. El cebador 5'
contiene un sitio EcoRI y el cebador 3' incluye además un sitio
HindIII. Se añaden a la vez cantidades iguales de la "columna
vertebral" lineal del virus del sarcoma murino de Moloney y del
fragmento EcoRI e HindIII multiplicado, en presencia de DNA ligasa
de T4. La mezcla resultante es mantenida bajo unas condiciones
apropiadas para la ligación de los dos fragmentos. La mezcla de
ligación es usada para transformar bacterias HB101, las cuales son
luego sembradas en agar que contiene kanamicina con el fin de
confirmar que el vector tiene el gen de interés correctamente
insertado.
Las células empaquetadoras PA317 o GP+am12
anfotrópicas son hechas crecer en cultivo tisular hasta una densidad
confluente en medio Eagles modificado de Dulbecco (DMEM) con suero
fetal al 10%, penicilina y estreptomicina. Luego se añade el vector
MSV que contiene el gen al medio y se transducen las células
empaquetadoras con el vector. Las células empaquetadoras producen
ahora partículas víricas infecciosas que contienen el gen (se hace
ahora referencia a las células empaquetadoras como "células
productoras").
Se añade medio fresco a las células productoras
transducidas y posteriormente se recolecta el medio de una placa de
10 cm de células productoras confluentes. El medio agotado, que
contiene las partículas víricas infecciosas, es filtrado a través
de un filtro Millipore para eliminar células productoras sueltas, y
este medio es luego usado para infectar fibroblastos. El medio de
una placa subconfluente de fibroblastos es separado y es rápidamente
sustituido por el medio de las células productoras. Este medio es
separado y es sustituido por medio fresco. Si el título del virus
es elevado, casi todos los fibroblastos estarán entonces infectados
y no se requerirá selección alguna. Si el título es muy bajo, será
entonces necesario usar un vector retrovírico que tenga un marcador
seleccionable, tal como neo o his.
Los fibroblastos creados son luego inyectados al
huésped, solos o después de haber sido cultivados hasta confluencia
sobre glóbulos microportadores Cytodex 3. Los fibroblastos producen
ahora el producto proteico.
Son posibles numerosas modificaciones y
variaciones del presente invento a la luz de las anteriores
enseñanzas y, por lo tanto, dentro del alcance de las
reivindicaciones adjuntas, el invento puede ser llevado a la
práctica de forma distinta a la particularmente descrita.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: SOPPET, DANIEL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DEL INVENTO: FACTOR DE CRECIMIENTO HTTER36
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 9
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: CARELLA, BYRNE, BAIN, GILFILLAN, CECCHI, STEWART & OLSTEIN
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 6 BECKER FARM ROAD
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: ROSELAND
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: NEW JERSEY
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 07068-1739
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con ordenador personal IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn, emisión nº 1.0, versión nº 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: US
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN SOBRE EL ABOGADO/AGENTE DE PATENTES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Ferraro, Gregory D.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 36,134
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 325800-513
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN SOBRE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 201-994-1700
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 201-994-1744
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1.212 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 41..1.132
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 1:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 364 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAAAGGATCC GCAGCCATCC CTGTCCCCAA ACTTTCTTGT
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTTCTATT CAAGCTTCTG ACATCCTACC CACACCCACA
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGGGATCCG CCATCATGCT TCGTTTCTTG CCAGA
\hfill35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTCGGTACC CATTTCTGAC ATCCTACCCA CAC
\hfill33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACAGCGGATC CAGCCACCAT GCTTCGTTTC TTGCCA
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCTTCGGAT CCCATTTCTG ACATCCTACC CACACCCACA
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN SOBRE LA ID. SEC. nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 366 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID. SEC. nº 9:
Claims (16)
1. Un polinucleótido aislado, seleccionado del
grupo que consiste en:
- (a)
- polinucleótidos que codifican al menos la forma madura del polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de la ID. SEC. nº 2;
- (b)
- polinucleótidos que tienen la secuencia de nucleótidos de la ID. SEC. nº 1, que codifican al menos la forma madura del polipéptido;
- (c)
- polinucleótidos que codifican el polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de al menos la forma madura del polipéptido codificado por el cDNA contenido en ATCC 97349;
- (d)
- polinucleótidos que tienen la secuencia de codificación del cDNA contenido en ATCC 97349 que codifica al menos la forma madura del polipéptido;
- (e)
- polinucleótidos que tienen al menos 90% de identidad con un polinucleótido como el definido en cualquiera de (a) a (d) y que codifican un polipéptido que es capaz de estimular la diferenciación celular; y
- (f)
- polinucleótidos que codifican un polipéptido que es capaz de estimular la diferenciación celular y que es al menos 90% idéntico a un polipéptido codificado por un polinucleótido de cualquiera de (a) a (d);
o la cadena complementaria de dicho
polinucleótido.
2. El polinucleótido de la Reivindicación 1, que
es DNA.
3. El DNA de la Reivindicación 2, que es DNA
genómico.
4. El polinucleótido de la Reivindicación 1, que
es RNA.
5. Un vector que contiene el polinucleótido de
cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 4.
6. El vector de la Reivindicación 5, en el que
el polinucleótido está operativamente unido a secuencias de control
de la expresión que permiten la expresión en células huésped
procarióticas o eucarióticas.
7. Una célula huésped genéticamente diseñada con
el vector de la Reivindicación 5 ó 6.
8. Un procedimiento para producir un polipéptido
codificado por el polinucleótido de cualquiera de las
Reivindicaciones 1 a 4, que comprende: cultivar la célula huésped de
la Reivindicación 7 y recuperar del cultivo el polipéptido
codificado por dicho polinucleótido.
9. Un procedimiento para producir células
capaces de expresar un polipéptido codificado por el polinucleótido
de cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 4, que comprende diseñar
genéticamente células con el vector de la Reivindicación 5 ó 6.
10. Un polipéptido que tiene la secuencia de
aminoácidos codificada por un polinucleótido de acuerdo con
cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 4 o es obtenible mediante el
procedimiento de la Reivindicación 8.
11. Un anticuerpo que se une específicamente al
polipéptido de la Reivindicación 10.
12. Un antagonista/inhibidor del polipéptido de
la Reivindicación 10, que es un anticuerpo específico.
13. Una composición farmacéutica que comprende
el polinucleótido de cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 4, el
polipéptido de la Reivindicación 10 o un DNA que codifica y es capaz
de expresar dicho polipéptido in vivo o el
antagonista/inhibidor de la Reivindicación 12 y, opcionalmente, un
vehículo farmacéuticamente aceptable.
14. Una composición diagnóstica que comprende el
polinucleótido de cualquiera de las Reivindicaciones 1 a 4.
15. Uso del antagonista/inhibidor de la
Reivindicación 12 para la preparación de una composición
farmacéutica para el tratamiento de la neoplasia o para evitar la
formación de moléculas de matriz extracelular en el hígado o el
pulmón.
16. Un procedimiento diagnóstico que comprende
analizar una muestra procedente de un huésped en cuanto a la
presencia del polipéptido de la Reivindicación 10.
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