ES2259685T3 - Procedimiento para la inactivacion funcional reversible del sistema de reparacion del desapareamiento. - Google Patents
Procedimiento para la inactivacion funcional reversible del sistema de reparacion del desapareamiento.Info
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Abstract
Un procedimiento para incrementar la tasa de recombinación entre secuencias de DNA, no idénticas, presentes en un organismo procariótico, in vivo, el cual comprende: a) combinar, en una célula, una secuencia de DNA procedente de una primera especie o género, con una secuencia de DNA procedente de una segunda especie o género, en donde, la primera y segunda secuencias de DNA, tienen secuencias que son parcialmente homólogas y que tienen desapareamientos aptos para activar el sistema de reparación de desapareamiento enzimático de la célula, cuando el citado sistema es funcional, b) tratar el organismo, previamente o subsiguientemente a la etapa a), o previamente, simultáneamente y subsiguientemente a la etapa a) con un análogo de bases de la base nucleótida de origen natural, en una cantidad y durante un período de tiempo suficientes como para inhibir, de una forma reversible, el MRS de una célula, por lo menos parcialmente, y c) eliminar el análogo de bases, del organismo.
Description
Procedimiento para la inactivación funcional
reversible del sistema de reparación del desapareamiento.
La presente invención, se refiere a un
procedimiento para la inactivación funcional reversible del sistema
funcional de reparación del desapareamiento en organismos
precarióticos, y varias aplicaciones de éste. De una forma
particular, la presente invención, se refiere a un procedimiento
para la recombinación in vitro, de secuencias nucleótidas no
idénticas. La presente invención, se refiere, también, a un
procedimiento para la producción de organismos híbridos,
procarióticos, producidos mediante la recombinación in vivo,
de diferentes organismos, especies o géneros. La presente
invención, se refiere, también a un procedimiento para la
producción, en vivo, de genes híbridos, y proteínas
codificados por éstas.
La evolución, es la selección de las variantes
más idóneas, producidas mediante mutación y recombinación. La
mutación al azahar, produce nuevos alelos, mientras que, la
recombinación genética, produce nuevas combinaciones de alelos
preexistentes. Esta propiedad de la recombinación genética, mejora
la efectividad de la mutagénesis, debido al hecho de que, ésta,
permite la asociación de múltiples mutaciones adaptables, así, como
también su separación, de las mutaciones perjudiciales más
frecuentes. La eficacia de la recombinación genética, depende de la
identidad de la secuencia de DNA, compartida por las dos moléculas
recombinantes y de los sistemas celulares enzimáticos, involucrados
en la recombinación, y de sus ediciones (Redman and Wagner, 1993;
Matic et al., 1996). La recombinación entre DNAs que
difieren mediante mutaciones de puntos bien distanciados
(polimorfismo de secuencia), se reduce o se inhibe. Los cruzamientos
entre diferentes cepas y especies bacterianas, muestran el hecho de
que, la frecuencia de recombinación, decrece exponencialmente, con
el incremento de la divergencia de la secuencia genómica (Vulic
et al., 1997). El apareamiento de secuencias de DNA no
idénticas, tiene como resultado la generación de moléculas
heterodúplex desapareadas. Los pares de bases desapareados, se
reconocen por parte de los componentes del sistema de reparación del
desapareamiento (MRS, -del inglés: mismatch repair system-), el cual
actúa como un inhibidor de la recombinación entre secuencias de DNA,
no idénticas (Rayssiguier et al., 1989; Shen and Huang, 1989;
Worth Jr. et al., 1994); Zahrt et al., 1994; Matic
et al., 1995).
Esta función de MRS, juega un importante rol
interpretativo, en la integridad estructural de los cromosomas y del
aislamiento genético, entre diferentes especies bacterianas. Así,
por ejemplo, la inactivación de genes de MRS, incrementa en un valor
de 10-15 veces, la frecuencia de duplicaciones
cromosómicas, resultantes de la recombinación entre locus E.
coli rhsA y rshB (únicamente divergentes en un 0,8%) (Petit
et al., 1991) y en un valor de aproximadamente 10^{3}
veces, la conversión de genes, entre los genes de S. enterica
(serovariedad Typhimurium), tufA y tufB (divergentes en
aproximadamente un 1%) (Abdulkarim and Hughes, 1996). El MRS,
controla, también, la recombinación conjugacional y transductora
entre cepas y especies divergentes (Rayssiguier et al., 1989;
Shen and Huang, 1989; Worth Jr. et al., 1994); Zahrt et
al., 1994; Matic et al., 1995); Vultic et al.,
1997). Incluso una divergencia reducida, es suficiente como para
dificultar o impedir la recombinación. Así, por ejemplo, la
recombinación transductora entre dos serovariedades (Typhimurium y
typhi) de S. enterica, cuyos genomas difieren únicamente en
un 1-2%, al nivel de las secuencias de DNA, se
incrementa en un valor de 10^{2}-10^{3} veces,
en marcos de referencia genéticos deficientes de un MRS (Zhart et
al., 1994).
Tres genes, han mostrado su requerimiento, de
una forma específica, para el MRS, en E. coli: mutS, mutL y
mutH (Friedeberg et al., 1995). La inactivación de
diferentes genes del MRS, tiene un efecto distinto y característico
en la recombinación de interespecies (Rayssiguier et al,
1989; Stambuk y Radman, 1998; Denamur et al., 2000). El
efecto más fuerte de recombinación, se observa mediante la
inactivación de genes mutS y mutL, tal y como se describe, por
ejemplo, en las patentes estadounidenses US 4.956.415 y US
5.912.119. Por el contrario, la sobreproducción de proteínas,
reduce, de una forma severa, la frecuencia de recombinación, incluso
entre cepas bacterianas con divergencia genómica muy reducida (Vulic
et al., 1997). Así, de esta forma, procediendo a modificar la
actividad del MRS, es posible el interrumpir o establecer barreras
genéticas, entre diferentes especies bacterianas.
Cuando se genera diversidad genómica, mediante
recombinación, uno de los problemas mayores, con la recombinación,
en un sistema de referencia proficiente, reside en el hecho de que,
la divergencia de secuencia de DNA, restringe los acontecimientos de
recombinación, en las regiones genómicas de mayor similitud de
secuencia. Por consiguiente, la mayoría de los recombinantes, son
merodiploides, altamente inestables, a menudo, generados por un
cruzamiento desigual entre los operones de RNA ribosómico (rrn), los
cuales son, usualmente, casi idénticos, entre especies bacterianas
relacionadas. La inactivación del MRS, permite, no únicamente
mayores rendimientos productivos de interespecies recombinantes,
sino también, una mayor diversidad y una mayor estabilidad de los
híbridos. Las aplicaciones potenciales de esta estrategia, la cual
permite la creación de genomas interespecíficos de mosaicos, son
múltiples, en la investigación fundamental, en la ingeniería
genética y en medicina. Permitiendo la recombinación de genomas
enteros, pueden obtenerse los genomas de mosaicos con nuevas
recombinaciones de genes y operones (incluso con genes de mosaicos y
operones).
No obstante, para la recombinación, cada vez que
se utiliza una cepa o especie bacteriana nueva, los genes mutS y
mutL, deben inactivarse. Esto puede realizarse de uno forma muy
difícil, cuando estos gentes, no están identificados y cuando, las
herramientas genéticas para la inactivación, no se han desarrollado
para ciertas especies dadas. Además, la inactivación de los genes
del MRS, incrementa las tasas de mutación en un valor de
10^{2}-10^{3} superior, las cuales pueden no
desearse, una vez se ha obtenido una construcción deseada. La
alternativa, puede ser la inhibición/saturación del MRS, utilizando
algunos otros estudios o formas de enfocar el problema. Así, por
ejemplo, (i) el MRS, puede saturarse mediante unos errores excesivos
de replicación del DNA, en cepas de E. coli, que portan una
gen dnaQ defectuoso, que codifica para la actividad de lectura de
corrección de DNA-polimerasa de replicación
(PolIII)(Shaaper and Radman, 1989). (ii) la eficacia del MRS, ha
mostrado también, decrecer, como resultado de la titrimetría o
titulación, de las proteínas de reparación del desapareamiento, en
células que contienen desapareamientos de copias múltiples de DNA de
hebra individual, codificadas mediante retornes (Maas et al.,
1996). Las patentes estadounidenses US 5.965.415 y US 5.912.119,
describen procedimientos para la recombinación intergenérica e
interespecífica, en donde, el MSR, se inactiva transitoriamente,
mediante mutaciones en los genes del MRS y subsiguientes
restauración del MRS, utilizando una corrección mutante, o mediante
mutación del MRS, mediante la introducción de secuencias
nucleótidas, que comprenden un extenso número de desapareamientos.
No obstante, en el último caso, el componente enzimático del MRS,
aparentemente, se destruye y, la reactivación funcional del MRS,
requiere una resíntesis de las enzimas reparación. (iii) La
sobre-expresión de las proteínas del MRS, a partir
de especies bacterianas no relacionadas, puede también inhibir el
MRS del E. coli, y tiene como resultado una mutagénesis
incrementada (Prudhomme et al., 1991). El documento de
patente internacional WO 97/05 268, da a conocer un procedimiento
para incrementar la tasa de recombinación entre secuencias de DNA
parcialmente homólogas, procediendo a inactivar, de una forma
transitoria, el MRS, con una molécula de DNA, que soporte muchos
desapareamientos. No obstante, si bien la totalidad de los
procedimientos anteriormente mencionados, arriba, para la
inhibición/saturación de MRS, no requieren una inactivación de los
genes del MRS, es necesaria un modificación adicional de las
células, con objeto de reducir las tasas de mutación y
recombinación, una vez se hayan obtenido los recombinantes
requeridos.
Así, de este modo, el problema técnico
subyacente, el cual representa la base de la presente invención, es
el de proporcionar un procedimiento sencillo, para inactivar, o por
lo menos reducir, de una forma considerable, la actividad del MRS de
un organismo procariótico, con objeto de incrementar la tasa de
recombinación entre secuencias nucleótidas parcialmente homólogas,
es decir, secuencias nucleótidas no idénticas o divergentes, en el
organismo, evitando con ello la modificación adicional subsiguiente
de las células tratadas, con objeto de reducir las tasas de mutación
y de recombinación.
La presente invención, soluciona el problema
técnico en cuestión, procediendo a proporcionar un procedimiento
para la inactivación funcional, reversible, es decir, transitoria,
del sistema de reparación del desapareamiento (MRS), en un organismo
procariótico, procedimiento éste, el cual comprende el proceder a
someter el organismo a un agente, especialmente, a un análogo de
bases, capaz de inhibir parcialmente o completamente, el sistema de
reparación del desapareamiento del organismo, en una cantidad y
durante un período de tiempo suficientes, como para incrementar de
una forma reversible, la tasa de recombinación, entre secuencias
nucleótidas no idénticas, de una forma particular, secuencias de
DNA, presentes en el organismo y, en una forma de preferida de
presentación, eliminar subsiguientemente el agente, especialmente,
el análogo de bases, del organismo.
Así, de este modo, la presente invención,
proporciona medios para inactivar de una forma reversible el MRS,
los cuales, a su vez, permiten un número de aplicaciones de
utilidad, tales como el incrementar la tasa de recombinación de
secuencias nucleótidas, no idénticas. De este modo, la presente
invención, proporciona también procedimientos para incrementar la
tasa de recombinación, en un organismo procariótico, y
procedimientos para mutagenizar un organismo, con lo cual, el MRS,
se inactiva de una forma reversible, tal y como se describe
aquí.
En un aspecto de la presente invención, el
procedimiento de la presente invención, proporciona la ventaja de
que, mediante la inactivación reversible del MRS, de un organismo
procariótico, puede incrementarse de una forma reversible, la tasa
de recombinación entre secuencias de DNA, no idénticas, presentes en
el organismo, evitando la necesidad de manipulaciones subsiguientes
de las células tratadas, y manteniendo el MRS, genéticamente y
constantemente intacto.
En el contexto de la presente invención,
nucleótidos no idénticos o divergentes, de una forma particular,
secuencias de DNA, de una forma particularmente preferida,
secuencias de DNA de doble hebra, presentes en un organismo
precariótico, comprenden primeras secuencias, es decir, nucleótidos
autólogos, de una forma particular, secuencias de DNA, presentes en
el organismo, de una forma preferible, previamente a la toma de
segundas secuencias, y dichas segundas secuencias, introducidas en
este organismo, por ejemplo, mediante sexo natural, conjugación,
transducción, fusión artificial de células, o cualesquiera otros
medios conocidos en arte especializado de la técnica, tales como
los tratamientos eléctricos, biolísticos, o físicos. Por supuesto,
ambas, la primera y la segunda secuencia, pueden introducirse
simultáneamente en el organismo procariótico. Estas segundas
secuencias introducidas, no son idénticas, es decir que, debe
entenderse que, éstas, no son completamente idénticas u homólogas a
la segundas secuencias. De una forma particular, estas secuencias
parcialmente homólogas, tienen una significante porción de bases
desapareadas, por ejemplo, en una cantidad del hasta un 30%. Las
secuencias parcialmente homólogas, son capaces de activar el MRS, si
el MRS es funcional y no inactivado, inhibido o saturado. Se deja
que, las secuencias introducidas, se recombinen con las secuencias
autólogas de DNA, presentes en el organismo procariótico, debido al
sistema de reparación del desapareamiento, reversiblemente
inactivado. Una vez que la recombinación haya tenido lugar, el
agente utilizado en concordancia con la presente invención, puede
eliminarse, de tal forma que, el sistema de reparación del
desapareamiento, pueda recuperar su funcionalidad original. Una
ventaja de la inhibición o saturación transitorias del MRS, reside
en el hecho de que, después de la recombinación, las células
híbridas obtenidas, no tienen constitutivamente altas tasas de
mutación, debido a la inactivación permanente de los genes del
MRS.
En una forma de presentación particularmente
preferida de la presente invención, las secuencias de DNA no
idénticas, se encuentran presentes en forma de genes, operones,
grupos de genes, cromosomas, plásmidos y/o genomas. Estas secuencias
de DNA, pueden ser secuencias de DNA de origen natural, o secuencias
de DNA genéticamente manipuladas.
La presente invención, permite a un incremento
muy significativo de la eficacia de la recombinación entre
secuencias de DNA no idénticas, que se inhibe, normalmente, mediante
el sistema de reparación del desapareamiento. La presente invención,
puede utilizarse, de una forma ventajosa, para facilitar la
generación de nueva biodiversidad, al nivel de los genes
individuales u operones, así como también de genomas enteros. La
inhibición química del MRS, con objeto de incrementar la eficacia
de la recombinación entre secuencias de DNA no idénticas, en
concordancia con la presente invención, nunca se ha utilizado
antes.
En una forma de presentación de la presente
invención, el organismo procariótico que comprende las secuencias
nucleótidas autólogas, pueden someterse a un análogo de bases, capaz
de inhibir el sistema de reparación de desapareamientos del
organismo, en una cantidad y durante un período de tiempo
suficientes, como para incrementar, de una forma reversible, la tasa
de recombinación, entre secuencias de DNA no idénticas, con dicho
análogo de bases. Así, de este modo, las segundas secuencias
nucleótidas que se introducen en el organismo que comprende las
secuencias nucleótidas autólogas, se introducen después del
tratamiento del organismo con el análogo de bases.
En otra forma de presentación particularmente
preferida de la presente invención, el organismo procariótico, se
trata con el análogo de bases, previamente, simultáneamente y
subsiguientemente a la introducción de las segundas secuencias en el
organismo, con el análogo de bases. Es también posible, el tratar el
organismo, con el análogo de bases, solamente después de introducir
las segundas secuencias en el organismo.
El período de tiempo suficiente para incrementar
reversiblemente la tasa se recombinación es, de una forma
preferible, inferior a 5 horas, de una forma particular, de 0,5 a 5
horas, de una forma preferible, de 1 a 4 horas y, de una forma
particular, de 1 hora.
Para el procedimiento descrito, pueden
utilizarse organismos eucarióticos, por ejemplo, un organismo
anfibio, animal, mamífero, o mamífero no humano. En el contexto de
la presente invención, el organismo, es un organismo procariótico,
en donde, el organismo es, de una forma preferible, un organismo
eubacteriano o arqueobacteriano. En una forma de presentación
particularmente preferida, el organismo eubacteriano, es
Escherichia coli, Streptococcus pneumoniae o Salmonella
typhimurium.
En una forma preferida de presentación de la
presente invención, el análogo de bases a ser utilizado en
concordancia con la presente invención, es una
2-aminopurina. De una forma general, podría
utilizarse una substancia química o una fuerza física.
En concordancia con la presente invención, el
análogo de bases que se prefiere de una forma particular, es un
análogo de bases de procedencia natural o un análogo de bases
sintetizado de bases nucleótidas de procedencia natural, tales como
la adenina, uridina, ciptosina, timidina o guanidina, como por
ejemplo, la 2-aminopurina o compuestos que tienen
las mismas características, tales como la
2-aminopurina, es decir, que son capaces de saturar
el sistema de reparación del desapareamiento y/o de interactivar con
enzimas y DNA o nucleótidos. En concordancia con la presente
invención, una secuencia nucleótida, de una forma particular, un
oligonucleótido, por ejemplo, un oligonucleótido que comprenda
pares de bases desapareadas, o un heterodúplex, no se consideran
como siendo agentes
químicos.
químicos.
Así, de este modo, la actividad MSR, en
concordancia con la presente invención, puede inhibirse en células
tratadas con análogos de bases, de una forma particular,
2-aminopurina, un análogo de bases de adenina el
cual se desaparea con citosina. La ventaja de la inhibición química,
reside en el hecho de que, ésta, proporciona una inhibición
transitoria y puede aplicarse fácilmente a diferentes especies de
bacterias y células eucarióticas, por ejemplo, células de mamíferos
humanos o no humanos.
En concordancia con una forma de presentación
preferida de la presente invención, el tratamiento con células de
Escherichia coli con 2-aminopurina
(2-AP), reduce la eficacia de sistema de reparación
del desapareamiento (MRS), procediendo a realizar una titulación o
titración y/o inactivar la proteína MutL. La consecuencia de esta
deficiencia transitoria del sistema de reparación del
desapareamiento, es un significante incremento (de 10^{4} veces),
en la frecuencia de recombinación entre secuencias de DNA no
idénticas. Esta forma enfocar el problema, tiene la ventaja de su
simplicidad, en comparación con todos los sistemas de
inhibición/saturación del MRS, conocidos en el arte especializado de
la técnica, debido al hecho de que, éste, no requiere ningún tipo de
manipulación genética de las células utilizadas. La presente
invención, por lo tanto, proporciona un procedimiento para una
inactivación funcional, reversible, del sistema de reparación del
desapareamiento.
En concordancia con una forma particularmente
preferida de presentación de la presente invención, las altas
concentraciones de 2-AP, provocan un efecto mutante
que sugiere una saturación del MRS. En una forma preferida de
presentación de la presente invención, se utilizan de 50 \mug/ml a
600 \mug/ml. En una forma de presentación adicional, de una forma
particular, se utilizan, por lo menos, 50 \mug/ml, de una forma
muy particular, por lo menos 75 \mug/ml, por menos 100 \mug/ml,
por lo menos 200 \mug/ml, por lo menos 300 \mug/ml, por lo menos
400 \mug/ml, por lo menos 500 \mug/ml, o por lo menos 600
\mug/ml, de 2-AP.
La presente invención, resuelve el problema
anteriormente expuesto, arriba, también, procediendo a proporcionar,
en un aspecto adicional de la presente invención, un procedimiento
para mutagenizar un organismo procariótico, procedimiento éste, el
cual, comprende el proceder a someter al organismo, a unas
condiciones que permitan la recombinación de homólogos, entre
secuencias de DNA, divergentes o no idénticas, presentes en el
organismo, someter el organismo a un agente capaz de saturar o de
inactivar, de una forma reversible, el MRS del organismo, en una
cantidad y durante un período de tiempo, suficientes como para
incrementar, de una forma reversible, la tasa de recombinación entre
secuencias no idénticas de DNA, en el organismo, tal y como se ha
descrito anteriormente, arriba y, en una forma preferida de
presentación, eliminando el agente, del organismo.
Así, de este modo, la presente invención, se
refiere a un procedimiento para mutagenizar un organismo
procariótico, el cual comprende el proceder a introducir secuencias
de DNA parcialmente homólogas, en el organismo, someter el organismo
a unas condiciones que permitan la recombinación de homólogos entre
sus autólogos y las secuencias de DNA introducidas, con lo cual, el
organismo, se somete a un análogo de bases, capaz de inhibir el
sistema de reparación de desapareamientos del organismo, en una
cantidad y durante un período de tiempo suficientes, como para
incrementar de una forma reversible, la tasa de recombinación entre
los autólogos y las secuencias de DNA introducidas en el organismo
y, de una forma preferible, eliminando el análogo de bases, del
organismo. Tal y como se ha expuesto anteriormente, arriba, las
secuencias de DNA no idénticas, pueden ser genes, operones, grupos
de genes, cromosomas, plásmidos o genomas.
El procedimiento descrito anteriormente, arriba,
puede también utilizarse para incrementar la tasa de recombinación,
en un organismo, tal y como se ha especificado anteriormente,
arriba.
Así, de este modo, la presente invención, se
refiere, también, a un procedimiento para la recombinación in
vivo, el cual comprende el proceder a combinar, en una célula,
una secuencia de DNA procedente de una primera especie o género, con
un secuencia de DNA procedente de una segunda especie o género, en
donde, la primera y segunda secuencias de DNA, tienen secuencias que
son parcialmente homólogas y que tienen desapareamientos aptos para
activar el sistema de reparación de desapareamiento enzimático de
una célula, cuando el citado sistema es funcional, y en donde, el
sistema de reparación del desapareamiento, enzimático, se ha
desactivado de una forma reversible, en concordancia con la presente
invención, para capacitar la recombinación estable entre la primera
y segunda secuencias de DNA, produciendo con ello, en una forma
preferida de presentación, genes híbridos, genomas híbridos,
cromosomas híbridos, operones híbridos, plásmidos híbridos, o grupos
de genes híbridos. En una forma preferida de presentación, las
secuencias de DNA, pueden ser de doble hebra.
En una forma preferida de presentación del la
presente invención, el procedimiento anteriormente descrito, arriba,
de recombinación, las células del organismo procariótico de una
primera especie o un primer género, se fusionan a células de un
organismo procariótico de una segunda especie o un segundo género,
para combinar, en una célula, el DNA procedente de la primera
especie o género, con el DNA procedente de una segunda especie o
género, y en donde, las células del organismo de la segunda especie
o segundo género, comprenden un sistema de reparación del
desapareamiento, reversiblemente inactivado, en concordancia con la
presente invención.
En una forma de presentación adicionalmente
preferida, de la presente invención, se procede a cruzar un
organismo unicelular de una primera especie o de un primer género,
con un organismo celular de una segunda especie o de un segundo
género, para combinar, en una célula, una secuencia de DNA
procedente de una primera especie o género, con una secuencia de DNA
procedente de una segunda especie o género, y en donde, el sistema
de reparación del desapareamiento, enzimático, de por lo menos uno
de estos organismos, se ha inactivado de una forma reversible, en
concordancia con la presente invención.
En una forma de presentación adicionalmente
preferida de la presente invención, se procede a conjugar o
transducir una bacteria recipientaria de una primera especie o
género, con una bacteria donante de una segunda especie o género,
para recombinar, en una célula, una secuencia de DNA procedente de
una primera especie o género, con una segunda secuencia de DNA
procedente de una segunda especie o género, en donde, la bacteria
donante, tiene por lo menos una secuencia de DNA a ser transferida a
la bacteria recipientaria, y en donde, el sistema de reparación del
desapareamiento, enzimático, de por lo menos una de las bacterias
donante o recipientaria, se inactiva de una forma reversible, en
concordancia con la presente invención.
La invención, prefiere una forma adicional de
presentación, en la cual, las dos secuencias de DNA, se emplazan en
un organismo unicelular, para combinar, en una célula, una secuencia
de DNA procedente de una primera especie o género, con una segunda
secuencia de DNA procedente de una segunda especie o género, en
donde, el organismo, se inactiva de una forma reversible, en su
sistema de reparación del desapareamiento, enzimático, en
concordancia con la presente invención, y en donde, las secuencias
de DNA, son parcialmente homólogas, y derivan de dos organismos
diferentes.
Se prefiere, de una forma particular, el
proceder a utilizar uno de los procedimientos para la recombinación,
anteriormente descritos, arriba, en donde, se produce un gen híbrido
y/o su proteína codificada, mediante la selección de un gen híbrido
y/o su proteína codificada, después de la expresión en el organismo
procariótico.
En una forma preferida de presentación del
procedimiento anteriormente descrito, arriba, para la recombinación,
cada secuencia de DNA, se encuentra contenida en un plásmido
separado, y en donde, cada plásmido, se introduce en el organismo
procariótico.
En una forma de presentación particularmente
preferida de la presente invención, el procedimiento anteriormente
descrito, arriba, para la mutagenización de un organismo
procariótico, o para incrementar la tasa de recombinación de un
organismo procariótico, se prevé el hecho de que, las secuencias de
DNA introducidas, derivan de un organismo de una especie diferente
del organismo transformado con la secuencia de DNA introducida. Así,
de este modo, en concordancia con la presente invención, las
secuencias nucleótidas introducidas, pueden derivar de diferentes
especies, o también, de la misma especie, o incluso organismo, si se
compara con el organismo en el cual se ha introducido la secuencia
nucleótida.
En una forma de presentación adicionalmente
preferida de la presente invención, las secuencias nucleótidas
introducidas, se introducen en el organismo procariótico, mediante
transducción, cruzamientos conjugados, fusión artificial de células,
absorción química, física, eléctrica o biolística de las secuencias
nucleótidas.
En una forma de presentación adicionalmente
preferida de la presente invención, la recombinación de homólogos
entre los autólogos y las secuencias nucleótidas introducidas,
involucran el reemplazo de genes y la adición de genes.
En una forma particularmente preferida de
presentación de la presente invención, el sometimiento del organismo
procariótico a un agente capaz de inactivar o saturar el MRS, tiene
lugar previamente y/o simultáneamente y/o después de la introducción
de las secuencias divergente nucleótidas divergentes, es decir, de
las segundas secuencias nucleótidas, en el organismo.
La presente invención, proporciona, también, un
procedimiento para la recombinación in vivo de secuencias de
DNA, homólogas, pero con bases desapareadas, en donde, las citadas
secuencias, se ponen conjuntamente en células o en un organismo
procariótico, cuyo sistema de reparación de desapareamiento,
enzimático, se ha activado de una forma reversible, es decir, de una
forma transitoria, mediante la aplicación transitoria del agente
definido anteriormente, arriba, durante un determinado transcurso de
tiempo, para obtener la recombinación entre las citadas secuencias
de DNA, por ejemplo, durante un transcurso de tiempo inferior a 5
horas, de una forma particular, durante un transcurso de tiempo
inferior a 1 hora.
Así, de este modo, la presente invención, se
refiere a un procedimiento de recombinación in vivo, es
decir, a un procedimiento para la producción de organismos
procarióticos recombinados, mediante cruzamiento, o cualquier otro
medio, para poner conjuntamente DNA procedente de diferentes
organismos procarióticos, o cualquier otro medio, y la recombinación
in vivo de un organismo procariótico de diferentes especies
y/o géneros, en donde, el cruzamiento, o el otro medio, y la
recombinación in vivo, se realizan entre un organismo de la
primera especie y/o de un primer género, y un organismo de una
segunda especie y/o de un segundo género, en donde, por lo menos uno
de estos dos organismos, comprenden un MRS reversiblemente
inactivado, en concordancia con la presente invención.
En una forma de presentación particularmente
preferida de la presente invención, la recombinación, es una
recombinación entre diferentes especies, es decir, una recombinación
interespecífica o una recombinación entre organismos de diferentes
géneros, es decir, una recombinación intergenérica.
La secuencias de DNA concernidas para la
recombinación, pueden ser cromosómicas o
extra-cromosómicas, por ejemplo, plásmidos, los
cuales permitan, en una forma particularmente preferida de
presentación, la recombinación entre genes individuales
clonados.
Mediante el procedimiento anteriormente
identificado, arriba, es posible el producir, de una forma
particular, células u organismos recombinados de bacterias en
concordancia con la presente invención, pero, por supuesto, también,
de levaduras, plantas o animales, organismo recombinados, éstos,
concebidos mediante ingeniería genética o modificados mediante
ingeniería genética.
En una forma particularmente preferida de
presentación, la presente invención, se refiere a un procedimiento
para la producción de bacterias, recombinadas mediante cruzamiento,
y a la recombinación de bacterias de diferentes especies y/o
géneros, en donde, se realiza una conjugación o transducción in
vivo, entre una bacteria recipientaria de una primera especie
y/o de un primer género, cuyo sistema de desapareamiento enzimático,
se ha inactivado de una forma reversible, en concordancia con la
presente invención, y bacterias donantes de una segunda especie y/o
de un segundo género, el cual, en una forma preferida de
presentación, comprende un rasgo o propiedad particular que se
desea, a ser transferido en la bacteria recipientaria. Es posible,
también, el inactivar de una forma reversible, el sistema de
reparación del desapareamiento en concordancia con la presente
invención, utilizando el procedimiento anteriormente identificado,
arriba, y un análogo de bases.
En una forma preferida de presentación de la
presente invención, las bacterias recipientarias, son también
defectivas en los sistemas enzimáticos de restricción del DNA.
En una forma de presentación particularmente
preferida del procedimiento de la presente invención, anteriormente
descrito, arriba, ambas cepas, se cruzan en presencia del análogo de
bases, inactivando, de una forma reversible, el sistema de
reparación del desapareamiento y, a continuación, se elimina el
análogo de bases.
En una forma particularmente preferida de la
presente invención, se procede a cruzar la capa de E. coli y
una cepa de Salmonella typhimurium, de las cuales, por lo
menos una, de una forma preferible, ambas, se inactiva(n) en
concordancia con la presente invención y, en su MRS enzimático. En
una forma de presentación todavía más preferida, se procede a
conjugar una bacteria donante del tipo Hrf, con una bacteria
recipientaria F^{-}.
El procedimiento anteriormente identificado,
arriba, para la producción de organismos procarióticos o células,
recombinados, de una forma particular, bacterias, es ventajoso, en
tanto que, ésta, crea nuevas cepas de bacterias que exhiben
propiedades ventajosas, siendo, por ejemplo, no tóxicas, o
convirtiéndose en apropiadas, para su uso en la producción de
vacunas.
La presente invención, se refiere, asimismo, a
un procedimiento para la producción de genes híbridos y sus
proteínas codificadas in vivo, a partir de dos genes
parcialmente homólogos, en donde, las células recombinadas, se
preparan a partir de células de un primer organismo procariótico, el
cual contiene un primer gen, y células de una segundo organismo
procariótico, el cual contiene un segundo gen, parcialmente
homólogo, y en donde, se procede a llevar a cabo un procedimiento
para la mutagénesis en concordancia con la presente invención, en la
célula recombinada y, el gen híbrido deseado, o su proteína
codificada, se seleccionan entre éstos. Este procedimiento, prevé
el hecho de que, en un organismo procariótico que comprende un MRS
inactivado en concordancia con la presente invención, se emplazan
conjuntamente dos secuencias de DNA, consistentes en genes
parcialmente homólogos, que derivan de dos organismos diferentes y,
después de la recombinación in vivo, el gen híbrido deseado
y, si se desea, después de la síntesis de proteínas in vivo,
se selecciona la proteína codificada. En concordancia con una forma
preferida de presentación de la presente invención, por lo menos dos
plásmidos que contienen por lo menos dos genes parcialmente
homólogos, que codifican para la misma función, pero que tienen
diferentes secuencias, se introducen en una célula que tiene un MRS
reversiblemente inactivado, en concordancia con la presente
invención, un gen híbrido, y, en una forma preferida de
presentación, después de la expresión, bajo condiciones
convencionales, la proteína híbrida, se selecciona, y, de una forma
preferible, se aísla. Los plásmidos, pueden introducirse en el
organismo procariótico, mediante procedimientos convencionales de
transformación.
La presente invención, se refiere, también, a un
procedimiento de mutagénesis inversa pretendida como objetivo, de un
gen, en un organismo procariótico, en donde, el gen, comprende un
base mutada, la cual se desea restablecer a como era, antes de la
mutación, en donde, el sistema de reparación del apareamiento, del
organismo, se inactiva de una forma reversible, en concordancia con
la presente invención, y se introduce un oligonucleótido consistente
en una secuencia de DNA, a ser restablecida, como era antes de la
mutación y, el mutante restablecido, se selecciona de entre los
mutantes.
Por supuesto, la presente invención, se refiere,
también, a productos obtenidos en concordancia con los
procedimientos de la presente invención, es decir, los organismos
procarióticos recombinados y/o mutagenizados, células, productos
genéticos, proteínas, genes, grupos de genes, operones, plásmidos,
cromosomas y genomas.
Formas preferidas adicionales de presentación de
la presente invención, vienen representadas por las
sub-reivindicaciones, las cuales son el objeto de
éstas.
La invención, se expondrá, ahora, por vía de
ejemplos y de las figuras de acompañamiento.
Las figuras, muestran:
Figura
1
Influencia de la 2-aminopurina
(2-AP), en la eficacia de la recombinación conjugada
de las intraespecies E. coli Hfr x E. coli F^{-} e
interespecies S. typhimurium Hfr x E. coli F^{-}.
Las cepas recipientarias E. coli, eran, o bien mutS^{+} (A,
C), o bien mutS^{-} (B, D). Las frecuencias de recombinación para
el marcador seleccionado (Thr^{+}), se expresan por donante HFr,
después de substraer los inversores desapareados. Cada número,
representa la media (error standard +/-), de por lo menos tres
experimentos independientes.
Figura
2
Identificación del componente del sistema de
reparación del desapareamiento, el cual se satura o se inhibe
mediante tratamiento con 2-aminopurina
(2-AP). Las cepas recipientarias de E. coli,
eran, o bien ya sea mutS^{-} (A, B), o bien ya sea mutL^{-} (C,
D). La deficiencia de la reparación del desapareamiento, se
complementó con plásmidos que portaban genes mutS^{+} (A, B), o
mutL^{+} (C, D). La dosis utilizada de 2-AP, en
estos experimentos, era, siempre, de 300 mg/ml. Las frecuencias de
recombinación del marcador seleccionado (Thr^{+}), se expresan por
donante Hfr, después de substraer los inversores desapareados. Cada
número, representa la media (error standard +/-), de por lo menos
tres experimentos independientes.
Cepa donante | Genotipo | Referencia o fuente |
S. typhimurium LT2 SA965 | LeuBCD39 ara-7 | (Sanderson et al., 1972) |
E. coli K12 P4X | RelA1 spoT1 metB | (Kahn, 1968) |
MX0 | AsP4X, pero metB^{+} |
\vskip1.000000\baselineskip
Cepa recipientaria | Genotipo | Referencia o fuente |
AB1157 | Thr1 \hskip0.4cm leu6 \hskip0.4cm proA2 | (Bachmann, 1972) |
his4 \hskip0.5cm thi1 \hskip0.4cm argE3 | ||
lacY1 \hskip0.3cm galK2 \hskip0.2cm ara14 | ||
xyl5 \hskip0.4cm mtl1 \hskip0.4cm tsx33 \hskip0.4cm str31 | ||
supE44 | ||
MX1 | As AB11547, pero Na1R | |
MX2 | As NX1, pero Thr-34::Tn10 | Alelo thr, procedente del E. coli |
Genetic Stock Center, Yale | ||
University, New Haven, USA. | ||
MX3 | As NX1, pero Thr-3091::Tn10kan | Alelo thr, procedente del E. coli |
Genetic Stock Center, Yale | ||
University, New Haven, USA. | ||
MX4 | As NX2, pero _mutS::_ Sm-Sp | Alelo mutS, procedente de la |
colección de cepas de M. Radman | ||
MX5 | As NX3, pero mutL218::Tn10 | Alelo mutL (Pang. et al., 1985). |
\vskip1.000000\baselineskip
Plásmidos | Genotipo | Referencia o fuente |
PMQ341 | mutS^{+} CamR | (Wu y Marinus, 1994) |
PMQ339 | MutL^{+} CamR | (Wu y Marinus, 1994) |
\vskip1.000000\baselineskip
Medio:
Todos los cultivos, se cultivaron a una
temperatura de 37°C.
1.- Medio rico LB:
Bacto tryptona (DIFCO) 10 g; extracto de
levadura Batco (DIFCO) 5 g; NaCl 10 g; H_{2}O desionizada 1 l.
Valor pH ajustado a 7,0, con NaOH 1 M.
2.- Medio mínimo M63:
KH_{2}PO_{4} 13,6 g;
(NH_{4})_{2}SO_{4} 2 g; FeSO_{4} 7H_{2}O 0,5 mg,
H_{2}O desionizada 1 l. Valor pH ajustado a 7,0, con KOH. Después
de sometimiento a autoclave se procedió a añadir 1 ml de MgSO_{4}
7 H_{2}O y 10 ml de una solución al 20% de una fuente de carbono.
Se procedió a añadir aminoácidos y antibióticos, cuando era
necesario.
\newpage
Cuando se utilizó el medio en las placas, se
añadieron 15 g de agar (DIFCO) por litro. Todos los medios, se
esterilizaron mediante sometimiento a autoclave durante un
transcurso de tiempo de 30 minutos, a una temperatura de 120°C. Los
antibióticos, se añadieron siempre después del sometimiento al
autoclave. Las concentraciones finales en antibióticos, eran como
sigue: ácido nalidíxico (Sigma), 40 \mug/ml; espectinomicina
(Sigma), 100 \mug/ml; estreptomicina (Sigma), 75 \mug/ml;
canamicina (Sigma), 50 \mug/ml; tetraciclina (Sigma), 12,5
\mug/ml; y cloranfenicol (Sigma), 30 \mug/ml.
Los plásmidos que portaban genes mutS^{+} ó
mutL^{+}, se introdujeron, mediante eletrotransformación
(utilizando un aparato de microimpulsos del tipo BIO Rad micro
pulser), en la cepas MX4 y MX5, respectivamente.
Todas las cepas recipientarias, eran derivados
de la cepa E. coli K12 F^{-} AB1157, los cuales se habían
construido utilizando transducción mediatizada por P1 (Miller,
1972).
Los experimentos de conjugación, se realizaron
bajo las condiciones anteriormente descritas, arriba (Rayssiguier
et al., 1989). Los cultivos realizados durante el transcurso
de toda una noche, de cepas donantes (2-4 x 10^{9}
células/ml) que comprendían la secuencia de DNA a ser introducida y
las cepas recipientarias que comprendían las secuencias de autólogas
de DNA, se diluyeron a un valor 50 veces, en medio fresco LB, con
2-aminopurina (Sigma), o sin ella, y se hicieron
crecer mediante una cuidadosa agitación (de una velocidad angular de
aproximadamente 150 revoluciones por minuto), con objeto de obtener
2-4 x 10^{6} células/ml. Con objeto de obtener la
concentración de células requerida, se requiere un tiempo de
incubación de aproximadamente 3 horas. Cuando las células se
trataron con 2-AP, el crecimiento, era ligeramente
inferior (la incubación, era de un tiempo aproximadamente 30 minutos
más largo), en comparación con el crecimiento sin
2-AP. Se prefiere el tratamiento con
2-AP de las cepas donante y recipientaria, antes del
apareamiento, puesto que, la 2-AP, debe incorporarse
en el DNA, durante la replicación, con objeto de saturar la
reparación del desapareamiento. Las dosis de 2-AP
sometidas a test de ensayo, eran de: 25 \mug/ml, 50 \mug/ml, 75
\mug/ml, 100 \mug/ml, 300 \mug/ml, y 600 \mug/ml. El efecto
del tratamiento con 2-AP, era ya significativo,
cuando se utilizaba una dosis de 2-AP de 50
\mug/ml. El efecto máximo, se observó a 100 \mug/ml de
2-AP, mientras que, incrementos adicionales en la
concentración de 2-AP, no incrementaban
adicionalmente la eficacia de la recombinación. Se prepararon
mezclas de apareamiento, procediendo a mezclar, conjuntamente,
bacterias Hfr y F^{-}, en un factor de relación de 1:1. Esta
mezcla se filtró a través de un filtro de microcelulosa, de un
tamaño de poro de 0,45 \mum, (de un diámetro de 2,5 cm),
utilizando un equipo de filtración mediante la acción de vacío
(MILLIPORE). Los filtros con mezclas de apareamiento, es decir,
mezclas con células que comprendían autólogos y secuencias
nucleótidas introducidas, se incubaron en una placa de agar de LB
fresco (con 2-aminopurina, o sin ella) precalentada
a una temperatura de 37°C. Después de un transcurso de tiempo de 60
minutos, los pares de apareamiento, se resuspendieron en MgSO_{4}
10^{-2} M, y se separaron mediante una vigorosa acción de
torbellino mediante vórtices y así, de este modo, diluyendo la
2-AP, a niveles inactivos. A continuación, las
mezclas de apareamiento, se colocaron en placas, en un medio, el
cual seleccionaba para los recombinantes deseados (fenotipo
Thr^{+}), y contra-seleccionaba ambas cepas
paternas, la donante (fenotipo Nal^{s}) y la recipientaria
(fenotipo THr^{-}), las cuales no contenían 2-AP.
Para este propósito, se procedió a utilizar el medio M9
(suplementado con arginina, histidina, leucina, prolina, y
triptófano (100 \mug/ml, de cada una), tiamina (30 \mug/ml),
glucosa (0,4%), y ácido nalidíxico (40 \mug/ml), para
contra-seleccionar las células donantes Hfr). No se
añadió treonina, al medio, con objeto de seleccionar los
recombinantes Thr^{+}. Los recombinantes, se clasificaron mediante
puntuación, después de un transcurso de tiempo de 48 horas, a una
temperatura de 37°C.
El efecto del tratamiento con
2-AP, en la recombinación, se demostró, en el
transcurso de la presente invención, utilizando el sistema bien
estudiado de recombinación de conjugación, entre S.
Typhimurium x E. coli (Stambuk y Radman, 1998);
Rayssiguier et al., 1989; Matic et al., 1995; Denamur
et al., 2000). La recombinación entre estas dos especies
bacterianas, las cuales tienen aproximadamente un 16% de divergencia
en sus secuencias genómicas, es muy reducida
(10^{-8}-10^{-7}; figura 1A), en comparación con
las recombinación intraespecies (aproximadamente 10^{-1}; figura
1C). La inactivación del gen mutS ó mutL, en células recipientarias
en concordancia con la presente invención, utilizando
2-AP, incrementa en un valor de
10^{3}-10^{4} veces, la frecuencia de la
recombinación interespecies (figura 1B, figura 2A y figura 2B).
La alta tasa de recombinación observada en los
experimentos de conjugación interespecies, no se incrementa de una
forma considerable, mediante el tratamiento con
2-AP, en el sistema de E. coli utilizado, en
ambos fondos, en el fondo de base del mutS^{+} (tipo salvaje), o
en el fondo de base del mutS^{-}. La figura 1B, muestra el hecho
de que, en un fondo de base del recipientario mutS^{-}, el efecto
de la 2-AP, no es tan pronunciado como en el fondo
de base de un tipo salvaje (figura 1A), debido al hecho de que, las
células mutS^{-}, exhiben ya unas altas tasas de recombinación,
debido al MRS que se ha inactivado genéticamente (mtS^{-}).
^{}
Así, de este modo, cuando las células
recipientarias del tipo salvaje, se habían tratado con 75, 100, 300
ó 600 \mug/ml de 2-AP (se ve un incremento de la
frecuencia de recombinación, de 50 a 600 \mug/ml de
2-AP), de una forma particular, por encima de 75
\mug/ml), la frecuencia de recombinación interespecies, se
incrementó en un valor de 10^{4} veces, mientras que, la de la
recombinación intraespecies, no se modificó (figura 1). Mediante la
introducción de plásmidos que portan genes que codifican para genes
mutS ó mutL, la proteína muL, se identificó como el componente del
MRS, el cual se somete a titulación o titración, o se inactiva
mediante el tratamiento con 2-AP (figura 2B).
Así, por lo tanto, puede concluirse el hecho de
que, el tratamiento de células de E. coli, con
2-AP, tiene como resultado un incremento transitorio
de la eficacia de recombinación entre las secuencias divergentes de
DNA, de una forma particular, mediante recombinación de homólogos,
mediante la saturación o la inhibición de un sistema de reparación
del desapareamiento, genéticamente intacto.
La presente invención, enseña cómo romper las
barreras genéticas, de una forma particular, en bacterias del tipo
salvaje, de una forma reversible. La rotura de las barreras
genéticas, permite una eficiente recombinación
inter-especies de genes, operones, o genomas,
produciendo una nueva gran escala de biodiversidad, la cual puede
ser una fuente útil de la innovación biotecnológica. El mecanismo
del incremento transitorio, en la recombinación de interespecies, de
hasta un valor de 10.000 veces, se muestra en el ejemplo
anteriormente facilitado, arriba: la substancia química utilizada,
la 2-aminopurina, produce un fenotipo reversible de
la deficiencia de reparación del desapareamiento del DNA, mediante
el agotamiento o reducción de la función MutL del citado sistema de
reparación del DNA. La gran ventaja de este procedimiento, con
respecto al uso de mutantes deficientes de reparación del
desapareamiento, reside en el hecho de que, el estado genéticamente
inestable, puede limitarse estrictamente, al tiempo de cruzamiento
de las interespecies: el agotamiento o reducción de la
2-aminopurina, devuelve la estabilidad genética.
Adicionalmente, el presente procedimiento, capacita para la
activación de la recombinación de interespecies, también en
organismos, en donde, los genes de reparación del desapareamiento,
son desconocidos, o no pueden manipularse genética-
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RecA-catalizadas, entre DNAs divergentes-, Proc
Natl Acad Sci Usa 91, 3238-3241.
23.- Wu, T,-H, y Marinus, M. G.
(1994). Dominant negative mutations en the mutS gene of
Escherichia coli, -Mutaciones negativas dominantes en el gen
mutS de Escherichia coli-, J Bacteriol 176,
5339-5400.
24.- Zahrt, T. C., Mora, G. C., y
Maloy, S. (1994). Inactivation of mismatch repair
overcomes the barrier to transduction between Salmonella
typhimurium and Salmonella typhi, -La inactivación de la
reparación del desapareamiento, supera la barrera de transducción
entre la Salmonella typhimurium y la Salmonella
typhi-, J Bacteriol 176, 1527-1529.
Claims (24)
1. Un procedimiento para incrementar la tasa de
recombinación entre secuencias de DNA, no idénticas, presentes en un
organismo procariótico, in vivo, el cual comprende:
- a)
- combinar, en una célula, una secuencia de DNA procedente de una primera especie o género, con una secuencia de DNA procedente de una segunda especie o género, en donde, la primera y segunda secuencias de DNA, tienen secuencias que son parcialmente homólogas y que tienen desapareamientos aptos para activar el sistema de reparación de desapareamiento enzimático de la célula, cuando el citado sistema es funcional,
- b)
- tratar el organismo, previamente o subsiguientemente a la etapa a), o previamente, simultáneamente y subsiguientemente a la etapa a) con un análogo de bases de la base nucleótida de origen natural, en una cantidad y durante un período de tiempo suficientes como para inhibir, de una forma reversible, el MRS de una célula, por lo menos parcialmente, y
- c)
- eliminar el análogo de bases, del organismo.
2. El procedimiento, según la reivindicación 1,
en donde, el organismo procariótico, es un organismo eubacteriano o
arqueobacteriano.
3. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 ó 2, en donde, el organismo eubacteriano, es Escherichia
coli.
4. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 a 3, en donde, las secuencias de DNA no idénticas, son genes,
operones, grupos de genes, cromosomas, plásmidos o genomas.
5. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 a 4, en donde, las secuencias de DNA, son secuencias de DNA de
origen natural, o secuencias de DNA manipuladas artificialmente.
6. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 a 5, en donde, el análogo de bases, es
2-aminopurina.
7. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 a 6, en donde, el período de tiempo suficiente para incrementar de
una forma reversible la tasa de recombinación, es inferior a 5
horas, de una forma preferible, de 1 hora.
8. El procedimiento, según las reivindicaciones
1 a 7, en donde, la cantidad de análogo de bases, suficiente como
para incrementar la tasa de recombinación de una forma irreversible,
es de 50 \mug/ml a 600 \mug/ml.
9. Un procedimiento para mutagenizar un
organismo procariótico, el cual comprende
la introducción de secuencias de DNA
parcialmente homólogas, con una porción de bases desapareadas, hasta
en un 30%, en el organismo, en el organismo,
el someter el organismo a unas condiciones que
permitan la recombinación de homólogos entre sus autólogos y las
secuencias de DNA introducidas.
con lo cual, el organismo, se somete a un
análogo de bases, de una base de nucleótidos de origen natural,
capaz de inhibir el sistema de reparación de desapareamiento del
organismo, en una cantidad y durante un período de tiempo
suficientes, como para incrementar de una forma reversible, la tasa
de recombinación entre los autólogos y las secuencias de DNA
introducidas en el organismo y,
10. El procedimiento, según la reivindicación 8,
en donde, las secuencias de DNA introducidas, se introducen el
organismo, mediante sexo natural, transducción, cruzamientos de
conjugación, fusión artificial de células, tratamiento químico,
físico, eléctrico o biolístico de las secuencias de DNA.
11. El procedimiento, según la reivindicación 9
ó 10, en donde, la recombinación de homólogos, entre los autólogos y
las secuencias de DNA introducidas, involucra el reemplazo de genes
y la adición de genes.
12. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 11, en donde, las secuencias de DNA
introducidas, derivan de un organismo o de una especie diferente a
la especie del organismo transformado con la secuencia de DNA
introducida.
13. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 12, en donde, el organismo procariótico, es
un organismo eubacteriano o arqueobacteriano.
14. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 13, en donde, el organismo eubacteriano, es
Escherichia coli.
15. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 14, en donde, las secuencias de DNA no
idénticas, son genes, operones, grupos de genes, cromosomas,
plásmidos o genomas.
16. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 15, en donde, el análogo de bases, es
2-aminopurina.
17. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 9 a 8, en donde, las secuencias de DNA, son de
doble hebra.
18. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17, en donde, la recombinación, es una
recombinación intergenérica y/o interespecífica.
19. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17 ó 18, en donde, células de un
organismo procariótico de una primera especie o un primer género, se
fusionan a células de un organismo procariótico de una segunda
especie o un segundo género, para combinar, en una célula, el DNA
procedente de la primera especie o género, con el DNA procedente de
una segunda especie o género, y en donde, las células del organismo
de la segunda especie o segundo género, comprenden un sistema de
reparación del desapareamiento, enzimático, reversiblemente
inactivado.
20. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17 ó 18, en donde se procede a cruzar
un organismo unicelular de una primera especie o de un primer
género, con un organismo celular de una segunda especie o de un
segundo género, para combinar, en una célula, una secuencia de DNA
procedente de una primera especie o género, con una secuencia de DNA
procedente de una segunda especie o género, y en donde, el sistema
de reparación del desapareamiento, enzimático, de por lo menos uno
de estos organismos, se ha inactivado de una forma reversible.
21. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17 ó 18, en donde, se procede a
conjugar o transducir una bacteria recipientaria de una primera
especie o género, con una bacteria donante de una segunda especie o
género, para combinar, en una célula, una secuencia de DNA
procedente de una primera especie o género, con una segunda
secuencia de DNA procedente de una segunda especie o género, en
donde, la bacteria donante, tiene por lo menos una secuencia de DNA
a ser transferida a la bacteria recipientaria, y en donde, el
sistema de reparación del desapareamiento, enzimático, de por lo
menos una de las bacterias donante y recipientaria, se inactiva de
una forma reversible.
22. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17 ó 18, en donde, dos secuencias de
DNA, se emplazan en un organismo unicelular, para combinar, en una
célula, una secuencia de DNA procedente de una primera especie o
género, con una segunda secuencia de DNA procedente de una segunda
especie o género, en donde, el organismo, se inactiva de una forma
reversible, en su sistema de reparación del desapareamiento,
enzimático, y en donde, las secuencias de DNA, son parcialmente
homólogas, y derivan de dos organismos diferentes.
23. El procedimiento, según una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 8 ó 17 ó 18, en donde, cada secuencia de
DNA, se encuentra contenida en un plásmido separado, y en donde,
cada plásmido, se introduce en el organismo.
24. Un procedimiento, pare la producción de un
gen híbrido y/o su proteína codificada, en donde se procede llevar a
cabo un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1
a 8 ó 17 a 23 y, el gen híbrido y/o su proteína codificada, se
produce mediante la selección de un gen híbrido y/o su proteína
codificada, después de la expresión, en el organismo.
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