ES2216001T3 - Polipeptidos de quimioquina humana. - Google Patents
Polipeptidos de quimioquina humana.Info
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Abstract
SE MUESTRAN QUIMIOQUINAS HUMANAS Y DNA (RNA) QUE CODIFICA DICHOS POLIPEPTIDOS DE QUIMIOQUINA Y PROCESO PARA PRODUCIR DICHOS POLIPEPTIDOS MEDIANTE TECNICAS RECOMBINANTES. TAMBIEN SE MUESTRAN METODOS PARA UTILIZAR DICHOS POLIPEPTIDOS DE QUIMIOQUINA PARA EL TRATAMIENTO DE LA LEUCEMIA, TUMORES, INFECCIONES CRONICAS, ENFERMEDAD AUTOINMUNE, TRASTORNOS FIBROTICOS, CICATRIZACION DE HERIDAS Y PSORIASIS. TAMBIEN SE MUESTRAN ANTAGONISTAS CONTRA DICHOS POLIPEPTIDOS DE QUIMIOQUINA Y SU USO TERAPEUTICO PARA TRATAR LA ARTRITIS REUMATOIDE, ENFERMEDADES INFLAMATORIAS AUTOINMUNES, CRONICAS, E INFECCIOSAS, REACCIONES ALERGICAS, FIEBRE INDEPENDIENTE DE LA PROSTAGLANDINA Y FALLO DE LA MEDULA OSEA.
Description
Polipeptidos de quimioquina humana.
Esta invención se refiere a polinucleótidos
recién identificados, a polipéptidos codificados por estos
polinucleótidos, al uso de estos polinucleótidos y polipéptidos, así
como a la producción de estos polinucleótidos y polipéptidos. Más en
concreto, el polipéptido de la presente invención es una quimioquina
beta-4 humana, denominada a veces en lo sucesivo en
la presente "Ck\beta-4", y denominada
colectivamente "el polipéptido de quimioquina". La invención
también se refiere a inhibir la acción de este polipéptido.
Las quimioquinas son una superfamilia emergente
de pequeñas citoquinas segregadas que están relacionas desde el
punto de vista estructural y funcional. Todas la quimioquinas
muestran una homología del 25% al 75% al nivel de aminoácidos, y
contienen restos cisteína espacialmente conservados, como los
polipéptidos de la presente invención. Los miembros de la "rama
C-X-C" (según la posición de las
primeras dos cisteínas en el motivo conservado), también conocidos
como la familia del péptido activador de neutrófilos (NAP,
``neutrophil-activating
peptide)/IL-8, ejercen una actividad proinflamatoria
principalmente a través de su acción sobre neutrófilos (por
ejemplo, IL-8 y NAP-2), mientras que
los miembros de la familia de la "rama C-C"
parecen atraer a ciertas células mononucleares. Los miembros de la
"rama C-C" incluyen PF4, MIP, MCP y el
polipéptido de quimioquina de la presente invención.
Se han asignado numerosas actividades biológicas
a esta familia de quimioquinas. Las proteínas inflamatorias de
macrófagos 1\alpha y 1\beta son quimiotácticas para monocitos y
poblaciones de linfocitos diferenciadas (Schall, T.J., Cytokine,
3:165 (1991)), mientras que se ha descrito a MCP-1
como un quimioatrayente específico de monocitos (Matsushima, K.
et al., J. Exp. Med., 169:1485 (1989)). La función común de
esta familia de quimioquinas es su capacidad para estimular la
migración quimiotáctica de grupos diferenciados de células, por
ejemplo, células inmunológicas (leucocitos) y fibroblastos. Estas
quimioquinas también son capaces de activar ciertas células en esta
familia. La técnica anterior también incluye el documento US
5278287, que se refiere a la citoquina JE, y su uso.
Las células inmunológicas que responden a las
quimioquinas tienen un vasto número de funciones in vivo y,
por tanto, su regulación por estas quimioquinas es un área
importante en el tratamiento de una enfermedad.
Por ejemplo, los eosinófilos destruyen parásitos
para disminuir una infección parasitaria. Los eosinófilos también
son responsables de la inflamación crónica de los conductos
respiratorios del sistema respiratorio. Los macrófagos son
responsables de suprimir la formación de tumores en vertebrados.
Además, los basófilos liberan histamina que puede desempeñar un
papel importante en la inflamación alérgica. Por consiguiente, la
estimulación y la inhibición de estas células tiene amplias
aplicaciones terapéuticas.
Según un aspecto de la presente invención, se
proporciona un nuevo polipéptido que es Ck\beta-4,
así como sus fragmentos, análogos y derivados. Los polipéptidos de
la presente invención son de origen humano.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporcionan polinucleótidos (DNA o RNA) que codifican estos
polipéptidos.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporciona un proceso para producir estos polipéptidos mediante
técnicas recombinantes.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporciona un proceso para utilizar estos polipéptidos, o
polinucleótidos que codifican estos polipéptidos, para fines
terapéuticos, por ejemplo, para tratar tumores sólidos, infecciones
crónicas, enfermedades autoinmunológicas, psoriasas, asma, alergia,
para regular la hematopoyesis, y para estimular la curación de
heridas.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporcionan anticuerpos contra estos polipéptidos.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporcionan antagonistas/inhibidores de estos polipéptidos, que
pueden utilizarse para inhibir la acción de estos polipéptidos, por
ejemplo, en el tratamiento de enfermedades autoinmunológicas,
enfermedades infecciosas e inflamatorias crónicas, reacciones
alérgicas mediadas por histamina, fiebre independiente de
prostaglandinas, insuficiencia de la médula ósea, silicosis,
sarcoidosis, síndrome hipereosinófilo e inflamación pulmonar.
Estos y otros aspectos de la presente invención
deberían ser evidentes para los expertos en la técnica a partir de
las indicaciones de la presente.
Los siguientes dibujos son ilustrativos de las
realizaciones de la invención, y no se pretende que limiten el
alcance de la invención, según está incluido en las
reivindicaciones.
La figura 1 muestra la secuencia de cDNA y la
correspondiente secuencia de aminoácidos deducida de
Ck\beta-4. Los 24 aminoácidos iniciales
representan la secuencia conductora deducida de
Ck\beta-4, de forma que el polipéptido maduro
putativo comprende 72 aminoácidos. Se utiliza la abreviatura de una
letra convencional para aminoácidos.
La figura 2 muestra la homología en la secuencia
de aminoácidos entre Ck\beta-4 y el péptido maduro
de eotaxina (abajo).
Según un aspecto de la presente invención, se
proporcionan ácidos nucleicos aislados (polinucleótidos) que
codifican el polipéptido Ck\beta-4 maduro, que
tiene la secuencia de aminoácidos deducida de la figura 1, o el
polipéptido maduro codificado por el cDNA del clon depositado como
ATCC nº de depósito 75848, el 29 de julio, 1994.
El polinucleótido que codifica el
Ck\beta-4 se descubrió en un banco de cDNA
derivado de una vejiga urinaria humana. El
Ck\beta-4 está relacionado, desde el punto de
vista estructural, con la familia de quimioquinas. Contiene un marco
de lectura abierto que codifica una proteína de 116 restos
aminoácidos, de los cuales aproximadamente los primeros 24 restos
aminoácidos son la secuencia conductora putativa, de forma que la
proteína madura comprende 92 aminoácidos. La proteína muestra el
mayor grado de homología con la eotaxina, con un 20% de coincidencia
y 37% de similitud a lo largo de la secuencia codificadora completa.
También es importante que los cuatro restos cisteína conservados
espacialmente en las quimioquinas se encuentran en los polipéptidos
de la presente invención.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden estar en forma de RNA o en forma de DNA, incluyendo dicho DNA
cDNA, DNA genómico y DNA sintético. El DNA puede bicatenario o
monocatenario, y si es monocatenario puede ser la hebra codificadora
o la hebra no codificadora (antisentido). La secuencia codificadora
que codifica los polipéptidos maduros puede ser idéntica a la
secuencia codificadora que aparece en las figuras 1 y 2, o a la de
los clones depositados, o puede ser una secuencia codificadora
diferente, cuya secuencia codificadora, como resultado de la
redundancia o degeneración del código genético, codifica los mismos
polipéptidos maduros que el DNA de las figuras 1 y 2 o los cDNA
depositados.
Los polinucleótidos que codifican los
polipéptidos maduros de la figura 1, o los polipéptidos maduros
codificados por el cDNA depositado, pueden incluir: sólo la
secuencia codificadora del polipéptido maduro; la secuencia
codificadora del polipéptido maduro y otra secuencia codificadora,
como una secuencia conductora o secretora, o una secuencia de
proproteína; la secuencia codificadora del polipéptido maduro (y
opcionalmente otra secuencia codificadora) y una secuencia no
codificadora, como intrones o una secuencia 5' y/o 3' no
codificadora de la secuencia codificadora de los polipéptidos
maduros.
Por tanto, la expresión "polinucleótido que
codifica un polipéptido" incluye un polinucleótido que incluye
sólo la secuencia codificadora del polipéptido, así como un
polinucleótido que incluye otra secuencia codificadora y/o no
codificadora.
La presente invención se refiere además a
variantes de los polinucleótidos descritos en la presente
anteriormente que codifican fragmentos, análogos y derivados del
polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos deducida de la
figura 1, o el polipéptido codificado por el cDNA del clon
depositado. El variante de los polinucleótidos puede ser un variante
alélico de los polinucleótidos que aparece en la naturaleza o un
variante de los polinucleótidos que no aparece en la naturaleza.
Por tanto, la presente invención incluye
polinucleótidos que codifican los mismos polipéptidos maduros que
aparecen en el figura 1, o los mismos polipéptidos maduros
codificados por el cDNA de los clones depositados, así como los
variantes de estos polinucleótidos, en los que dichos variantes
codifican un fragmento, derivado o análogo del polipéptido de la
figura 1, o los polipéptidos codificados por el cDNA del clon
depositado. Estos variantes de nucleótidos incluyen variantes de
delección, variantes de sustitución y variantes de adición o
inserción.
Como se indicó en la presente anteriormente, los
polinucleótidos pueden tener una secuencia codificadora que es un
variante alélico que aparece en la naturaleza de la secuencia
codificadora que aparece en la figura 1, o de la secuencia
codificadora del clon depositado. Como se conoce en la técnica, un
variante alélico es una forma alternativa de una secuencia de
polinucleótido que puede tener una sustitución, deleción o adición
de uno o más nucleótidos, que no altera sustancialmente la función
del polipéptido codificado.
La presente invención también incluye
polinucleótidos, en los que la secuencia codificadora de los
polipéptidos maduros puede estar condensada, en el mismo marco de
lectura, con una secuencia de polinucleótido que ayuda en la
expresión y secreción de un polipéptido a partir de una célula
hospedante, por ejemplo, una secuencia conductora que actúa como
secuencia secretora para controlar el transporte de un polipéptido
desde la célula. El polipéptido que tiene una secuencia conductora
es una preproteína y la célula hospedante puede escindir la
secuencia conductora, para formar la forma madura de la polipéptido.
Los polinucleótidos también pueden codificar una proproteína que es
la proteína madura más otros restos aminoácidos 5'. Una proteína
madura que tiene una prosecuencia es una proproteína, y es una forma
inactiva de la proteína. Cuando la prosecuencia se escinde, lo que
queda es una proteína madura activa.
Así, por ejemplo, el polinucleótido de la
presente invención puede codificar una proteína madura, o una
proteína que tiene una prosecuencia, o una proteína que tiene una
prosecuencia y una presecuencia (secuencia conductora).
Los polinucleótidos de la presente invención
también pueden tener la secuencia codificadora condensada dentro del
marco con una secuencia marcadora que permite la purificación de los
polipéptidos de la presente invención. La secuencia marcadora puede
ser un marcador de hexa-histidina suministrado por
un vector pQE-9 para proporcionar la purificación
de los polipéptidos maduros condensados con el marcador en el caso
de un hospedante bacteriano o, por ejemplo, la secuencia marcadora
puede ser un marcador de hemaglutinina (HA) cuando se utiliza un
hospedante mamífero, por ejemplo células COS-7. El
marcador de HA se corresponde con un epitopo derivado de la proteína
de hemaglutinina de la gripe (Wilson, I. et al., Cell, 37:767
(1984)).
La presente invención se refiere, además, a
polinucleótidos que se hibridan con las secuencias descritas en la
presente anteriormente, si existe al menos 50% y preferiblemente 70%
de coincidencia entre las secuencias. La presente invención se
refiere, en particular, a polinucleótidos que se hibridan bajo
condiciones estrictas con los polinucleótidos descritos en la
presente anteriormente. Tal como se utiliza en la presente, la
expresión "condiciones estrictas" significa que la hibridación
se producirá sólo si existe al menos 95%, y preferiblemente al menos
97% de coincidencia entre las secuencias. Los polinucleótidos que se
hibridan con los polinucleótidos descritos en la presente
anteriormente en una realización preferida codifican polipéptidos
que mantienen sustancialmente la misma función o actividad biológica
que el polipéptido maduro codificado por el cDNA de la figura 1, o
el cDNA depositado.
El(los) depósito(s)
mencionado(s) en la presente se mantiene(n) bajo los
términos del Tratado de Budapest sobre el Reconocimiento
Internacional del Depósito de Microorganismos para fines de
Procedimientos de Patente. Estos depósitos se proporcionan
simplemente por conveniencia para los expertos en la técnica y no
son un reconocimiento de que se requiera un depósito bajo 35 U.S.C.
\NAK112. La secuencia de los polinucleótidos contenida en los
materiales depositados, así como la secuencia de aminoácidos de los
polipéptidos codificados por ellos, se incorporan en la presente
como referencia y son los que regulan en el caso de producirse
cualquier conflicto con cualquier descripción de las secuencias en
la presente. Puede requerirse una licencia para fabricar, usar o
vender los materiales depositados, y esta licencia no se concede por
la presente.
La presente invención se refiere además a
polipéptidos de quimioquina que tienen la secuencia de aminoácidos
deducida de la figura 1, o que tiene la secuencia de aminoácidos
codificada por el cDNA depositado, así como los fragmentos, análogos
y derivados de estos polipéptidos.
Los términos "fragmento," "derivado" y
"análogo", cuando se refieren a los polipéptidos de la figura
1, o a los codificados por el cDNA depositado, significan
polipéptidos que mantienen esencialmente la misma función o
actividad biológica que dichos polipéptidos. Por tanto, un análogo
incluye una proproteína que puede activarse mediante la escisión de
la porción de proproteína para producir un polipéptido maduro
activo.
Los polipéptidos de quimioquina de la presente
invención pueden ser polipéptidos recombinantes, polipéptidos
naturales o polipéptidos sintéticos, preferiblemente polipéptidos
recombinantes.
El fragmento, derivado o análogo de los
polipéptidos de la figura 1, o el codificado por el cDNA depositado
puede ser (i) uno en el que uno o más de los restos aminoácidos
están sustituidos por un resto aminoácido conservado o no conservado
(preferiblemente un resto aminoácido conservado), y este resto
aminoácido sustituido pueder ser o no ser codificado por el código
genético, (ii) uno en el que uno o más de los restos aminoácidos
incluyen un grupo sustituyente, (iii) uno en el que el polipéptido
maduro está condensado con otro compuesto, como un compuesto para
aumentar la semivida del polipéptido (por ejemplo,
polietilenglicol), o (iv) uno en el que los aminoácidos adicionales
están condensados con el polipéptido maduro, como una secuencia
conductora o secretora, o una secuencia que se emplea para la
purificación del polipéptido maduro o una secuencia de proproteína.
Se considera que estos fragmentos, derivados y análogos están dentro
del alcance de los expertos en el técnica a partir de las
indicaciones de la presentes.
Los polipéptidos y polinucleótidos de la presente
invención se proporcionan, preferiblemente, en una forma aislada, y
preferiblemente se purifican hasta alcanzar la homogeneidad.
El término "aislado" significa que el
material se retira de su medio original (por ejemplo, el medio
natural si aparece en la naturaleza). Por ejemplo, un polinucleótido
o polipéptido que aparece en la naturaleza presente en un animal
vivo no está aislado, pero el mismo polinucleótido o polipéptido,
separado de alguno o todos los materiales coexistentes en el sistema
natural, está aislado. Estos polinucleótidos pueden ser parte de un
vector y/o estos polinucleótidos o polipéptidos pueden ser parte de
una composición, y todavía estar aislados, puesto que este vector o
composición no es parte de su medio natural.
La presente invención también se refiere a
vectores que incluyen polinucleótidos de la presente invención,
células hospedantes que están modificadas genéticamente con vectores
de la invención, y la producción de polipéptidos de la invención
mediante técnicas recombinantes.
Las células hospedantes se modifican
genéticamente (se transducen, se trasforman o se transfectan) con
los vectors de esta invención que pueden ser, por ejemplo, un vector
de clonación o un vector de expresión. El vector puede estar, por
ejemplo, en forma de un plásmido, una partícula vírica, un fago,
etc. Las células hospedantes modificadas pueden cultivarse en
medios nutrientes convencionales modificados como resulte apropiado
para activar promotores, seleccionar transformantes o amplificar el
gen de Ck\beta-4. Las condiciones de cultivo, como
temperatura, pH y similares, son las previamente utilizadas con la
célula hospedante seleccionada para la expresión, y serán evidentes
para los expertos en la técnica.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden emplearse para producir polipéptidos mediante técnicas
recombinantes. Así, por ejemplo, el polinucleótido puede estar
incluido en uno cualquiera de una diversidad de vectores de
expresión para expresar un polipéptido. Estos vectores incluyen
secuencias de DNA cromosómico, no cromosómico y sintético, por
ejemplo, derivados de SV40; plásmidos bacterianos; DNA de fago;
baculovirus; plásmidos de levadura; vectores derivados de
combinaciones de plásmidos y DNA de fago, DNA vírico como vaccinia,
adenovirus, virus de viruela aviar y pseudorabia. Sin embargo puede
utilizarse cualquier otro vector siempre que sea replicable y viable
en el hospedante.
La secuencia de DNA apropiada puede insertarse en
el vector mediante una diversidad de procedimientos. En general, la
secuencia de DNA se inserta en un(os) sitio(s) de
endonucleasa de restricción apropiado(s) mediante
procedimientos conocidos en la técnica. Se considera que estos
procedimientos y otros están dentro del alcance de los expertos en
la técnica.
La secuencia de DNA en el vector de expresión
está unida operativamente con una(s) secuencia(s) de
control de la expresión apropiada(s) (promotor) para dirigir
la síntesis de mRNA. Como ejemplos representativos de estos
promotores, pueden mencionarse: el promotor SV40 o LTR, el
lac o trp de E. coli, el promotor P_{L} del
fago lambda y otros promotores conocidos por controlar la expresión
de genes en células procariotas o eucariotas o sus virus. El vector
de expresión también contiene un sitio de unión a ribosomas para el
inicio de la traducción y un terminador de la transcripción. El
vector también puede incluir secuencias apropiadas para amplificar
la expresión.
Además, los vectores de expresión contienen
preferiblemente uno o más genes marcadores seleccionables para
proporcionar un rasgo fenotípico para la selección de células
hospedantes transformadas, como la resistencia a la neomicina o
dihidrofolato-reductasa para un cultivo de células
eucariotas, o como la resistencia a tetraciclina o ampicilina en
E. coli.
El vector que contiene la secuencia de DNA
apropiada como se ha descrito en la presente anteriormente, así como
una secuencia de control o promotora apropiada, puede emplearse para
transformar un hospedante apropiado para permitir que el hospedante
exprese la proteína.
Como ejemplos representativos de los hospedantes
apropiados pueden mencionarse: células bacterianas, como E. coli,
Streptomyces, Salmonella typhimurium; células fúngicas, como
levaduras; células de insecto, como Drosophila y Sf9;
células animales como CHO, COS o melanoma de Bowes; células
vegetales, etc. Se considera que la selección de un hospedante
apropiado está dentro del alcance de los expertos en la técnica a
partir de las indicaciones en la presente.
Más concretamente, la presente invención también
incluye constructos recombinantes que comprenden una o más de las
secuencias como se describe extensamente anteriormente. Los
constructos comprenden un vector, como un vector plásmido o vírico,
en el cual se ha insertado una secuencia de la invención, en una
orientación directa o inversa. En un aspecto preferido de esta
realización, el constructo comprende además secuencias reguladoras,
incluyendo, por ejemplo, un promotor unido operablemente a la
secuencia. Los expertos en la técnica conocen un gran número de
vectores y promotores adecuados, y están disponibles en el mercado.
Se proporcionan los siguientes vectores como ejemplo. Bacterianos:
pQE70, pQE60, pQE-9 (Qiagen), pBS, pD10,
phagescript, psiX174, pbluescript SK, pbsks, pNH8a, pNH16a, pNH18A,
pNH46A (Stratagene); ptrc99a, pKK223-3,
pKK233-3, pDR540, pRIT5 (Pharmacia). Eucariotas:
pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG (Stratagene), pSVK3, pBPV, pMSG,
pSVL (Pharmacia). Sin embargo, puede utilizarse cualquier otro
plásmido o vector siempre que sean replicables y viables en el
hospedante.
Las regiones promotoras pueden seleccionarse a
partir de cualquier gen deseado utilizando vectores de CAT
(cloranfenicol-transferasa) u otros vectores con
marcadores seleccionables. Dos vectores apropiados con
pKK232-8 y pCM7. Los promotores bacterianos
nombrados de forma particular incluyen lacI, lacZ, T3, T7, gpt,
lambda P_{R}, P_{L} y trp. Los promotores eucariotas incluyen el
inmediato temprano de CMV, la timidina-quinasa de
HSV, el temprano y tardío de SV40, LTR de retrovirus, y
metalotioneína-I de ratón. La selección del vector y
promotor apropiado está dentro del nivel de un experto en la
técnica.
En otra realización, la presente invención se
refiere a células hospedantes que contienen los constructos
descritos anteriormente. La célula hospedante puede ser una célula
de eucariota superior, como una célula de mamífero, o una célula de
eucariota inferior, como una célula de levadura, o la célula
hospedante puede ser una célula procariota, como una célula
bacteriana. La introducción del constructo en la célula hospedante
puede realizarse mediante transfección con fosfato de calcio,
transfección mediada por DEAE-dextrano, o
electroporación (Davis, L., Dibner, M., Battey, I., Basic Methods in
Molecular Biology (1986)).
Los constructos en células hospedantes pueden
utilizarse de una manera convencional para producir el producto del
gen codificado por la secuencia recombinante. Como alternativa, los
polipéptidos de la invención pueden producirse de modo sintético
mediante sintetizadores de péptidos convencionales.
Las proteínas maduras pueden expresarse en
células de mamífero, levadura, bacterias u otras células bajo el
control de los promotores apropiados. Los sistemas de traducción
exentos de células también pueden emplearse para producir estas
proteínas utilizando RNA derivados de los constructos de DNA de la
presente invención. Los vectores de clonación y expresión apropiados
para utilizar con hospedantes procariotas y eucariotas se describen
en Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual,
2ª edición, Cold Spring Harbor, Nueva York (1989), cuya descripción
se incorpora en la presente como referencia.
La transcripción del DNA que codifica los
polipéptidos de la presente invención por eucariotas superiores
aumenta mediante la inserción de una secuencia potenciadora en el
vector. Los potenciadores son elementos de acción cis de DNA,
normalmente desde aproximadamente 10 a 300 pb, que actúan sobre un
promotor para aumentar su transcripción. Los ejemplos incluyen el
potenciador de SV40 en el lado tardío del origende la replicación pb
100 a 270, un potenciador promotor temprano de citomegalovirus, el
potenciador de polioma en el lado tardío del origen de replicación,
y potenciadores de adenovirus.
En general, los vectores de expresión
recombinante incluyen orígenes de replicación y marcadores
seleccionables que permiten la transformación de la célula
hospedante, por ejemplo, el gen de resistencia a la ampicilina de
E. coli y el gen TRP1 de S. cerevisiae, y un promotor
derivado de un gen de alta expresión para dirigir la transcripción
de una secuencia estructural cadena abajo. Estos promotores pueden
derivarse de operones que codifican enzimas glicolíticas, como
3-fosfoglicerato-quinasa (PGK),
factor \alpha, fosfatasa ácida o proteínas de choque térmico,
entre otras. La secuencia estructural heteróloga se ensambla en la
fase apropiada con secuencias de iniciación y terminación de la
transcripción y, preferiblemente, una secuencia conductora capaz de
dirigir la secreción de la proteína traducida hacia el espacio
periplásmico o el medio extracelular. Opcionalmente, la secuencia
heteróloga puede codificar una proteína de fusión que incluye un
péptido de identificación N-terminal que imparta las
características deseadas, por ejemplo, la estabilización o la
purificación simplificada del producto recombinante expresado.
Los vectores de expresión útiles para un uso
bacteriano se construyen insertando una secuencia de DNA estructural
que codifica una proteína deseada, junto con señales de iniciación y
terminación de la traducción adecuadas en fase de lectura operable
con un promotor funcional. El vector comprenderá uno o más
marcadores seleccionables fenotípicos y un origen de la replicación
para asegurar el mantenimiento del vector y, si resulta deseable,
para proporcionar la amplificación dentro del hospedante. Los
hospedantes procariotas adecuados para la transformación incluyen
E. coli, Bacillus subtilis, Salmonella typhimurium y diversas
especies del género Pseudomonas, Streptomyces y
Staphylococcus, aunque pueden emplearse otras según la
elección.
Como ejemplo representativo, pero no limitante,
los vectores de expresión útiles para uso bacteriano pueden
comprender un marcador seleccionable y un origen de la replicación
bacteriano derivados de plásmidos que están disponibles en el
mercado que comprendan elementos genéticos del vector de clonación
pBR322, muy conocido (ATCC 37017). Estos vectores comerciales
incluyen, por ejemplo, pKK223-3 (Pharmacia Fine
Chemicals, Uppsala, Suecia) y pGEM1 (Promega Biotec, Madison, WI,
EEUU). Estas secciones del "esqueleto" de pBR322 se combinan
con un promotor apropiado y la secuencia estructural que se va a
expresar.
Después de la transformación de una cepa
hospedante adecuada y el cultivo de la cepa hospedante hasta
alcanzar una densidad celular apropiada, el promotor seleccionado se
induce mediante medios apropiados (por ejemplo, cambio de la
temperatura o inducción química), y las células se cultivan durante
otro periodo más.
Las células se recogen, de forma típica, mediante
centrifugación, se rompen mediante medios físicos o químicos, y el
extracto bruto resultante se mantiene para su posterior
purificación.
Las células microbianas empleadas en la expresión
de las proteínas pueden romperse mediante cualquier método
conveniente, incluyendo ciclos de
congelación-descongelación, sonicación, ruptura
mecánica, o el uso de agentes lisantes de células, siendo estos
métodos muy conocidos por los expertos en la técnica.
También pueden emplearse diversos sistemas de
cultivo de células de mamíferos para expresar la proteína
recombinante. Los ejemplos de sistemas de expresión de mamífero
incluyen las líneas COS-7 de fibroblastos de riñón
de mono, descritas por Gluzman, Cell, 23:175 (1981), y otras líneas
celulares capaces de expresar un vector compatible, por ejemplo, las
líneas celulares C127, 3T3, CHO, HeLa y BHK. Los vectores de
expresión de mamífero comprenderán un origen de la replicación, un
promotor y potenciador adecuado, y también cualquier sitio de unión
a ribosomas, sitio de poliadenilación, sitios donantes y aceptores
de escisión, secuencias de terminación transcripcional, y secuencias
no trascritas flanqueantes 5' necesarios. Las secuencias de DNA
derivadas de la escisión de SV40 y los sitios de poliadenilación
pueden utilizarse para proporcionar los elementos genéticos no
transcritos requeridos.
El polipéptido de quimioquina puede recuperarse y
purificarse a partir de los cultivos celulares recombinantes
mediante métodos que incluyen precipitacion con sulfato de amonio o
etanol, extracción de ácidos, cromatografía de intercambio aniónico
o catiónico, cromatografía de fosfocelulosa, cromatografía de
interacción hidrófoba, cromatografía de afinidad, cromatografía de
hidroxilapatito y cromatografía de lectina. Pueden utilizarse etapas
de replegamiento de la proteína, si es necesario, para completar la
configuración de la proteína madura. Por último, puede emplearse una
cromatografía líquida de alta resolución (HPLC) para las etapas de
purificación finales.
El polipéptido de quimioquina de la presente
invención puede ser un producto purificado de forma natural o un
producto de procedimientos químicos sintéticos, o producido mediante
técnicas recombinantes a partir de un hospedante procariota o
eucariota (por ejemplo, por células bacterianas, de levadura, de
plantas superiores, de insecto y de mamífero en cultivo).
Dependiendo del hospedante empleado en un procedimiento de
producción recombinante, los polipéptidos de la presente invención
pueden estar glicosilados o pueden estar no glicosilados. Los
polipéptidos de la invención también pueden incluir un resto
aminoácido metionina inicial.
El polipéptido de quimioquina puede utilizarse
para inhibir la formación de colonias de células pluripotenciales de
la médula ósea como tratamiento protector adjunto durante la
quimioterapia del cáncer y para la leucemia.
El polipéptido de quimioquina también puede
utilizarse para inhibir la proliferación de queratinocitos
epidérmicos para el tratamiento de la psoriasis, que se caracteriza
por la hiperproliferación de queratinocitos.
El polipéptido de quimioquina también puede
utilizarse para tratar tumores sólidos mediante la estimulación de
la invasión y activación de las células de defensa del hospedante,
por ejemplo, células T citotóxicas y macrófagos. También puede
utilizarse para potenciar las defensas del hospedante contra
infecciones crónicas resistentes, por ejemplo, infecciones
micobacterianas mediante la atracción y activación de leucocitos
microbicidas.
El polipéptido de quimioquina también puede
utilizarse para tratar la enfermedad autoinmunológica y leucemias
linfocíticas inhibiendo la proliferación de células T a través de la
inhibición de la biosíntesis de IL2.
El Ck\beta-4 también puede
utilizarse en la curación de heridas, mediante el reclutamiento de
células inflamatorias de limpieza de residuos y de estimulación del
tejido conectivo, y también a través del control que ejerce sobre la
fibrosis mediada por TGF\beta escesivo. De esta manera, el
Ck\beta-4 también puede utilizarse para tratar
otros trastornos fibróticos, incluyendo cirrosis hepática,
osteoartritis y fibrosis pulmonar. Los polipéptidos de quimioquina
también aumentan la presencia de eosinófilos que tienen la función
diferenciada de matar las larvas de parásitos que invaden tejidos,
como en la esquistosomiasis, la triquinosis y la ascariasis. También
pueden utilizarse para regular la hematopoyesis, regulando la
activación y diferenciación de diversas células progenitoras
hematopoyéticas.
Las quimioquinas también pueden emplearse como
inhibidores de la angiogénesis y, por tanto, tienen efectos
antitumorales.
El polipéptido de quimioquina de la presente
invención también es útil para identificar otras moléculas que
tienen una actividad biológica similar. Un ejemplo de un ensayo de
selección con relación a esto es aislar la región codificadora de
los genes utilizando la secuencia de DNA conocida para sintetizar
sondas de oligonucleótidos. Se utiizan oligonucleótidos marcados que
tienen una secuencia complementaria con la de los genes de la
presente invención para seleccionar un banco de cDNA humano, DNA
genómico o mRNA, para determinar cuáles son los miembros del banco
que se hibridan con la sonda.
La presente invención también se refiere a
ensayos de diagnóstico para detectar niveles alterados de los
polipéptidos o el mRNA que proporciona el mensaje para dichos
polipéptidos, tanto cuantitativa como cualitativamente. Estos
ensayos son muy conocidos en la técnica, e incluyen un ensayo ELISA,
el radioinmunoensayo y RT-PCR. Los niveles de
polipéptidos, o sus mRNA, que se detectan en los ensayos pueden
emplearse para determinar la importancia de los polipéptidos en
diversas enfermedades, y para el diagnóstico de enfermedades en las
que unos niveles alterados de los polipéptidos pueden ser
significativos.
Esta invención proporciona un método para la
identificación de los receptores para los polipéptidos. El gen que
codifica los receptores puede identificarse mediante clonación de
expresión. Se prepara un RNA poliadenilado a partir de una célula
que responde a los polipéptidos, y un banco de cDNA creado a partir
de este RNA se divide en grupos y se utiliza para transfectar
células COS u otras células que no responden a los polipéptidos. Las
células transfectadas que se cultivan en placas de vidrio se exponen
a los polipéptidos marcados. Los polipéptidos pueden marcarse
mediante una diversidad de medios, incluyendo la yodación o la
inclusión de un sitio de reconocimiento para una
proteína-quinasa específica de sitio. Después de la
fijación y la incubación, las placas se someten a un análisis
autorradiográfico. Se identifican los grupos positivos y se
prepraran subgrupos y se retransfectan utilizando un proceso de
subagrupación y reselección iterativo, que produce, por último,
clones individuales que codifican el receptor putativo. Como enfoque
alternativo para la identificación de receptores, los polipéptidos
marcados pueden unirse mediante fotoafinidad con la membrana celular
o preparaciones de extractos que expresan la molécula del receptor.
El material enlazado se resuelve mediante análisis PAGE y se expone
a una película de rayos X. El complejo marcado que contiene los
receptores de los polipéptidos puede escindirse, separarse en
fragmentos peptídicos y someterse a una microsecuenciación de
proteínas. La secuencia de aminoácidos obtenida a partir de la
microsecuenciación se utiliza para diseñar una serie de sondas de
oligonucleótidos generados para seleccionar un banco de cDNA para
identificar los genes que codifican los receptores putativos.
Esta invención proporciona un método para
seleccionar fármacos para identificar los que potencian (agonistas)
o bloquean (antagonistas) la interacción de los polipéptidos con sus
receptores identificados. Un agonista es un compuesto que aumenta
las funciones biológicas naturales de los polipéptidos, mientras que
los antagonistas eliminan estas funciones. Como ejemplo, una
preparación de membranas o células de mamífero que exprese los
receptores de los polipéptidos se incuba con un polipéptido de
quimioquina marcado, por ejemplo, mediante radiactividad, en
presencia del fármaco. Entonces se mide la capacidad del fármaco
para potenciar o bloquear esta interacción.
Los antagonistas potenciales incluyen anticuerpos
o, en algunos casos, oligonucleótidos, que se unen a los
polipéptidos. Otro ejemplo de un antagonista potencial es un mutante
dominante negativo de los polipéptidos. Los mutantes dominantes
negativos son polipéptidos que se unen al receptor del polipéptido
de tipo salvaje, pero no pueden mantener la actividad biológica.
Un ensayo para detectar mutantes dominantes
negativos de los polipéptidos incluye un ensayo de quimiotaxis in
vitro en el que una cámara de quimiotaxis de múltiples pocillos
equipada con membranas de policarbonato exento de
polivinilpirrolidona se utiliza para medir la capacidad
quimioatrayente de los polipéptidos por los leucocitos en presencia
y ausencia de moléculas de antagonista/inhibidor o agonista
potenciales.
Los constructos antisentido preparados utilizando
tecnología antisentido también son antagonistas potenciales. La
tecnología antisentido puede utilizarse para controlar la expresión
génica a través de RNA o DNA antisentido o la formación de triples
hélices, basándose ambos métodos en la unión de un polinucleótido al
DNA o RNA. Por ejemplo, la porción codificadora 5' de la secuencia
del polinucleótido, que codifica los polipéptidos maduros de la
presente invención, se utiliza para diseñar un oligonucleótido de
RNA antisentido con una longitud desde aproximadamente 10 a 40 pares
de bases. Se diseña un oligonucleótido de DNA para que sea
complementario con una región del gen implicado en la transcripción
(triple hélice, véase Lee et al., Nucl. Acids Res., 6:3073
(1979); Cooney et al., Science, 241:456 (1988); y Dervan
et al., Science, 251:1360 (1991)), evitando con ello la
transcripción y la producción de los polipéptidos. El
oligonucleótido de RNA antisentido se hibrida con el mRNA in
vivo y bloquea la traducción de la molécula de mRNA en los
polipéptidos (antisentido, Okano, J. Neurochem, 56:560 (1991);
Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression,
CRC Press, Boca Raton, FL (1988)). Los oligonucleótidos descritos
anteriormente también pueden administrarse a las células de modo que
el DNA o RNA antisentido puede expresarse in vivo para
inhibir la producción de los polipéptidos.
Otro antagonista potencial es un derivado
peptídico de los polipéptidos que son análogos, modificados de forma
natural o sintética, de los polipéptidos, que han perdido la función
biológica pero que todavía reconocen y se unen a los receptores de
los polipéptidos para, con ello, bloquear de forma eficaz los
receptores. Los ejemplos de derivados peptídicos incluyen, pero no
se limitan a péptidos pequeños o moléculas de tipo peptídico.
Los antagonistas pueden emplearse para inhibir la
quimiotaxis y la activación de macrófagos y sus precursores, y de
neutrófilos, basófilos, linfocitos B y algunos subgrupos de células
T, por ejemplo, células T citotóxicas activadas y CD8 y células
asesinas naturales, en enfermedades infecciosas e inflamatorias
crónicas y autoinmunológicas. Los ejemplos de enfermedades
autoinmunológicas incluyen artritis reumatoide, esclerosis múltiple,
y diabetes dependiente de insulina. Algunas enfermedades infecciosas
incluyen silicosis, sarcoidosis, fibrosis pulmonar idiopática
evitando el reclutamiento y la activación de fagocitos
mononucleares, síndrome hipereosinófilo idiopático evitando la
producción y migración de eosinófilos, choque endotóxico evitando la
migración de macrófagos y su producción de los polipéptidos de
quimioquina de la presente invención. Los antagonistas también
pueden utilizarse para tratar la aterosclerosis, evitando la
infiltración de monocitos en la pared arterial.
Los antagonistas también pueden utilizarse para
tratar las reacciones alérgicas mediadas por histaminas, inhibiendo
la desgranulación de células cebadas y basófilos inducida por
quimioquina y la liberación de histamina.
Los antagonistas también pueden utilizarse para
tratar la inflamación, evitando la atracción de monocitos hacia el
área de la herida. También pueden utilizarse para regular las
poblaciones de macrófagos pulmonares normales, puesto que las
enfermedades pulmonares inflamatorias agudas y crónicas están
asociadas con el secuestro de fagocitos mononucleares en el
pulmón.
Los antagonistas también pueden utilizarse para
tratar la artritis reumatoide, evitando la atracción de monocitos
hacia el fluido sinovial en las articulaciones de los pacientes. El
influjo de monocitos y la activación desempeñan un papel importante
en la patogénesis de las artropatías degenerativas e
inflamatorias.
Los antagonistas pueden utilizarse para
interferir con las cascadas perjudiciales atribuidas,
principalmente, a IL-1 y TNF, que evita la
biosíntesis de otras citoquinas inflamatorias. De esta manera, los
antagonistas pueden utilizarse para evitar la inflamación. Los
antagonistas también pueden utilizarse para inhibir la fiebre
independiente de prostaglandinas inducida por quimioquinas.
Los antagonistas también pueden utilizarse para
tratar casos de insuficiencia de la médula ósea, por ejemplo, anemia
aplásica y síndrome mielodisplásico.
Los antagonistas también pueden utilizarse para
tratar el asma y la alergia, evitando la acumulación de eosinófilos
en el pulmón. Los antagonistas pueden emplearse en una composición
con un vehículo farmacéuticamente aceptable, por ejemplo, como se
describe en la presente a continuación.
Los polipéptidos de quimioquina y los agonistas o
antagonistas de la presente invención pueden emplearse junto con una
disolución tampón. Con el fin de aislar fragmentos de DNA para la
construcción de plásmidos, se digiere, de forma típica, desde 5 a 50
\mug de DNA con 20 a 250 unidades de enzima en un volumen mayor.
El fabricante especifica los tampones y las cantidades de sustrato
apropiados para las enzimas de restricción concretas. Normalmente se
utilizan unos tiempos de incubación de aproximadamente 1 hora a
37ºC, pero pueden variar según las instrucciones del suministrador.
Después de la digestión, la reacción se somete a una electroforesis
directamente sobre un gel de poliacrilamida para aislar el fragmento
deseado.
La separación por tamaño de los fragmentos
escindidos se realiza utilizando un gel de poliacrilamida al 8%
descrito por Goeddel, D. et al., Nucleic Äids Res., 8:4057
(1980).
"Oligonucleótidos" se refiere a un
polidesoxinucleótido monocatenario o a dos hebras de
polidesoxinucleótidos complementarias que pueden sintetizarse de
modo químico. Estos oligonucleótidos sintéticos no tienen
5'-fosfato y, por tanto, no se acoplan a otro
oligonucleótido sin añadir un fosfato con un ATP en presencia de una
quinasa. Un oligonucleótido sintético se acoplará a un fragmento que
no se ha desfosforilado.
"Acoplamiento" se refiere al proceso de
formar enlaces fosfodiéster entre dos fragmentos de ácidos nucleicos
bicatenarios (Maniatis, T., et al., Id., p. 146). A menos que
se indique lo contrario, el acoplamiento puede realizarse utilizando
tampones y condiciones conocidos con 10 unidades de
DNA-ligasa de T4 ("ligasa") por 0,5 \mug de
cantidades aproximadamente equimolares de los fragmentos de DNA que
se van a acoplar.
A menos que se indique lo contrario, la
transformación se realizó como se describe en el método de Graham,
F. y Van der Eb, A., Virology, 52:456-457
(1973).
La secuencia de DNA que codifica
Ck\beta-4, ATCC nº 75848, se amplifica
inicialmente utilizando cebadores de oligonucleótidos de PCR que se
corresponden con las secuencias 5' y 3' de la proteína
Ck\beta-4 procesada (menos la secuencia del
péptido señal putativo). Se añadieron otros nucleótidos que se
corresponden con Ck\beta-4 a las secuencias 5' y
3', respectivamente. El cebador de oligonucleótido 5' tiene la
secuencia 5' CCCGCATGC AAGCAGCAAGCAACTTT 3', y contiene
un sitio de enzima de restricción SphI (negrita) seguido de 17
nucleótidos de la secuencia codificadora de
Ck\beta-4 (subrayado) comenzando a partir del
segundo nucleótido de la secuencia codificadora para la proteína
madura. El codón ATG se incluye en el sitio SphI. En el siguiente
codón después de ATG, la primera base es del sitio SphI y las otras
dos bases se corresponden con la segunda y tercera base del primer
codón de la proteína madura putativa. Como consecuencia, la primera
base en este codón cambia de G a C, comparado con las secuencias
originales, produciendo una sustitución de E a Q en la proteína
recombinante. La secuencia 3', 5'
AAAGGATCCCATGTTCTTGACTTTTTTACT 3', contiene secuencias
complementarias al sitio BamHI (negrita) y están seguidas de 21
nucleótidos de secuencias específicas del gen que preceden al codón
de terminación. Los sitios de enzimas de restricción se corresponden
a los sitios de enzimas de restricción sobre el vector de expresión
bacteriana pQE-70 (Qiagen, Inc., 9259 Eton Avenue,
Chatsworth, CA, 91311). El pQE-70 codifica la
resistencia a antibióticos (Amp'), un origen de la replicación
bacteriano (ori), un promotor operador regulable por IPTG (P/O), un
sitio de unión a ribosomas (RBS), un marcador de
6-His, y sitios de enzimas de restricción. El
pQE-70 entonces se digiere con SphI y BamHI. Las
secuencias amplificadas se acoplaron en pQE-70 y se
insertaron dentro del marco con la secuencia que codifica el
marcador de histidina y el RBS. La figura 8 muestra una
representación esquemática de esta disposición. La mezcla de
acoplamiento entonces se utilizó para transformar la cepa de E.
coli disponible en Qiagen, con la marca comercial M15/rep 4,
mediante el procedimiento descrito en Sambrook, J., et al.,
Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press
(1989). El M15/rep4 contiene múltiples copias del plásmido pREP4,
que expresa el represor lacI y también confiere resistencia a la
kanamicina (Kan'). Los transformantes se identifican por su
capacidad para crecer en placas LB, y se seleccionaron las colonias
resistentes a ampicilina/kanamicina. El DNA del plásmido se aisló y
se confirmó mediante análisis de restricción. Los clones que
contenían los constructos deseados se cultivaron durante la noche
(D/N) en cultivo líquido en medio LB suplementado con Amp (100
ug/ml) y Kan (25 ug/ml). El cultivo O/N se utilizó para inocular un
cultivo mayor con una proporción de 1:100 a 1:250. Las células se
cultivaron hasta una densidad óptica de 600 (DO^{600}) de entre
0,4 y 0,6. Entonces se añadió IPTG
("isopropil-B-D-tiogalactopiranósido")
hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG produce la inducción
mediante la inactivación del represor lacI, dejando libre el P/O, lo
cual conduce a una mayor expresión del gen. Las células se
cultivaron durante 3 a 4 horas más. Las células entonces se
recogieron mediante centrifugación. El sedimento celular se
solubilizó en el agente caotrópico HCl de guanidina 6 molar. Después
de la aclaración, el Ck\beta-4 solubilizado se
purificó a partir de esta disolución mediante cromatografía sobre
una columna de quelado de níquel bajo condiciones que permiten una
unión fuerte por proteínas que contienen el marcador de
6-His (Hochuli, E., et al., J.
Chromatography, 411:177-184 (1984)). El
Ck\beta-4 (>98% puro) se eluyó de la columna en
HCl de guanidina 6 molar, pH 5,0. La renaturalización de las
proteínas fuera del HCl de Gn puede lograrse mediante diversos
protocolos (Jaenicke, R. y Rudolph, R., Protein Structure - A
Practical Approach, IRL Press, Nueva York (1990)). Inicialmente, la
etapa de diálisis se utiliza para eliminar el HCl de Gn. Como
alternativa, la proteína purificada aislada a partir de la columna
de quelado de Ni puede unirse a una segunda columna, a través de la
cual se hace pasar un gradiente de HCl de Gn lineal decreciente. Se
deja que la proteína se renaturalice mientras está unida a la
columna, y posteriormente se eluye con un tampón que contiene
imidazol 250 mM, NaCl 150 mM, Tris-HCl 25 mM, pH
7,5, y glicerol al 10%. Por último, la proteína soluble se dializa
contra un tampón de conservación que contiene bicarbonato de amonio
5 mM.
La expresión del plásmido, el
Ck\beta-4 HA, se deriva del vector pcDNAI/Amp
(Invitrogen) que contiene: 1) un origen de la replicación de Sv40,
2) un gen de resistencia a la ampicilina, 3) un origen de la
replicación de E. coli, 4) un promotor de CMV, seguido de una
región de policonector, un intrón de SV40 y un sitio de
poliadenilación. Un fragmento de DNA que codifica el precursor
Ck\beta-4 completo y un marcador de HA condensado
dentro del marco con su extremo 3' se clonó dentro de la región del
policonector del vector y, por tanto, la expresión de la proteína
recombinante está dirigida por el promotor de CMV. El marcador de HA
se corresponde con un epitopo derivado de la proteína de
hemaglutinina de la gripe, como se ha descrito previamente (I.
Wilson, H. Niman, R. Heighten, A. Cherenson, M. Connolly y R.
Lerner, 1984, Cell, 37, 767). La infusión del marcador de HA hacia
la proteína diana permite la fácil detección de la proteína
recombinante con un anticuerpo que reconoce el epitopo de HA.
La estrategia de construcción del plásmido se
describe como sigue:
La secuencia de DNA que codifica el
Ck\beta-4, ATCC nº 75848, se construyó mediante
PCR en el
EST original clonado utilizando dos cebadores: el ce-
bador 5',5' GGAAAGCTTATGTGCTGTACCAAGA
GTTT 3', contiene un sitio HindIII, seguido de 20 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-4, comenzando a partir del codón de iniciación; la secuencia 3', 5' CGCTCTAGATTAAGCGTAGTCTG
GGACGTCGTATGGGTAACATGGTTCCTTGACT
TTTT 3', contiene secuencias complementarias con el sitio XbaI, el codón de terminación de la traducción, el marcador de HA y al menos 20 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-4 (que no incluye el codón de terminación). Por tanto, el producto de PCR contiene un sitio HindIII, la secuencia codificadora de Ck\beta-4 seguida de un marcador de HA condensado dentro del marco, un codón de terminación de la traducción junto al marcador de HA, y un sitio XbaI. El fragmento de DNA amplificado con PCR y el vector, pcDNAI/Amp, se digirieron con las enzimas de restricción HindIII y XbaI, y se acoplaron. La mezcla de acoplamiento se transformó en la cepa de E. coli SURE (disponible en Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037), el cultivo transformado se colocó en placas con medio de ampicilina y se seleccionaron las colonias resistentes. El DNA del plásmido se aisló a partir de los transformantes y se estudió mediante análisis de restricción para detectar la presencia del fragmento correcto. Para la expresión de Ck\beta-4 recombinante se transfectaron células COS con el vector de expresión mediante el método de DEAE-DEXTRAN (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press (1989)). La expresión de la proteína Ck\beta-4 HA se detectó mediante marcaje radiactivo y el método de inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)). Las células se marcaron durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Los medios de cultivo entonces se recogieron y las células se lisaron con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, NP-40 al 1%, SDS al 0,1%, NP-40 al 1%, DOC al 0,5%, Tris 50 mM, pH 7,5; Wilson, I. et al., Id., 37:767 (1984)). Tanto el lisado de células como los medios de cultivo se precipitaron con un anticuerpo monoclonal específico de HA. Las proteínas precipitadas se analizaron mediante SDS-PAGE.
EST original clonado utilizando dos cebadores: el ce-
bador 5',5' GGAAAGCTTATGTGCTGTACCAAGA
GTTT 3', contiene un sitio HindIII, seguido de 20 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-4, comenzando a partir del codón de iniciación; la secuencia 3', 5' CGCTCTAGATTAAGCGTAGTCTG
GGACGTCGTATGGGTAACATGGTTCCTTGACT
TTTT 3', contiene secuencias complementarias con el sitio XbaI, el codón de terminación de la traducción, el marcador de HA y al menos 20 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-4 (que no incluye el codón de terminación). Por tanto, el producto de PCR contiene un sitio HindIII, la secuencia codificadora de Ck\beta-4 seguida de un marcador de HA condensado dentro del marco, un codón de terminación de la traducción junto al marcador de HA, y un sitio XbaI. El fragmento de DNA amplificado con PCR y el vector, pcDNAI/Amp, se digirieron con las enzimas de restricción HindIII y XbaI, y se acoplaron. La mezcla de acoplamiento se transformó en la cepa de E. coli SURE (disponible en Stratagene Cloning Systems, 11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037), el cultivo transformado se colocó en placas con medio de ampicilina y se seleccionaron las colonias resistentes. El DNA del plásmido se aisló a partir de los transformantes y se estudió mediante análisis de restricción para detectar la presencia del fragmento correcto. Para la expresión de Ck\beta-4 recombinante se transfectaron células COS con el vector de expresión mediante el método de DEAE-DEXTRAN (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press (1989)). La expresión de la proteína Ck\beta-4 HA se detectó mediante marcaje radiactivo y el método de inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1988)). Las células se marcaron durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Los medios de cultivo entonces se recogieron y las células se lisaron con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, NP-40 al 1%, SDS al 0,1%, NP-40 al 1%, DOC al 0,5%, Tris 50 mM, pH 7,5; Wilson, I. et al., Id., 37:767 (1984)). Tanto el lisado de células como los medios de cultivo se precipitaron con un anticuerpo monoclonal específico de HA. Las proteínas precipitadas se analizaron mediante SDS-PAGE.
Son posibles numerosas modificaciones y
variaciones de la presente invención a la luz de las anteriores
indicaciones y, por tanto, dentro del alcance de las
reivindicaciones adjuntas, la invención puede ponerse en práctica de
una manera diferente a la descrita de modo concreto.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Li, et al.
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Polipéptidos de quimioquina humanos
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 2
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA LA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Carella, Byrne, Bain, Gilfillan, Cecchi, Stewart y Olstein
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 6 Becker Farm Road
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Roseland
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Nueva Jersey
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EEUU
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 07068
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FORMA DE LECTURA POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TIPO MEDIO: disquete de 3,5 pulgadas
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PS/2
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: Wordperfect 5.1
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: presentado con la presente
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii) DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Ferraro, Gregory D.
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 36.134
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/REGISTRO: 325800-183
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 201-994-1700
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 201-994-1744
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 291 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO:2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 96 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:2:
Claims (16)
1. Un polinucleótido aislado seleccionado del
grupo que consiste en
(a) polinucleótidos que codifican al menos la
forma madura del polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos
deducida que aparece en la figura 1;
(b) polinucleótidos que tienen la secuencia
codificadora que aparece en la figura 1 que codifican al menos la
forma madura del polipéptido;
(c) polinucleótidos que codifican el polipéptido
que tiene la secuencia de aminoácidos de al menos la forma madura
del polipéptido codificado por el cDNA contenido en ATCC 75848;
(d) polinucleótidos que tienen la secuencia
codificadora del cDNA contenido en ATCC 75848 que codifican al menos
la forma madura del polipéptido;
(e) polinucleótidos que codifican un fragmento de
un polipéptido codificado por un polinucleótido de una cualquiera de
(a) a (d), en el que dicho fragmento tiene actividad
Ck\beta-4; y
(f) polinucleótidos que tienen al menos 95% de
coincidencia de secuencia con un polinucleótido según se define en
una cualquiera de (a) a (e), y que codifica un polipéptido que tiene
actividad Ck\beta-4;
o la hebra complementaria de dicho
polinucleótido.
2. El polinucleótido de la reivindicación 1, que
es DNA.
3. El DNA de la reivindicación 2, que es DNA
genómico.
4. El polinucleótido de la reivindicación 1, que
es RNA.
5. Un vector que contiene el polinucleótido de
una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4.
6. El vector de la reivindicación 5, en el que el
polinucleótido está unido operativamente a secuencias de control de
la expresión que permiten la expresión en células hospedantes
procariotas o eucariotas.
7. Una célula hospedante modificada genéticamente
con el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4, o con el vector de la reivindicación 5 ó 6.
8. Un proceso para producir un polipéptido que
tiene actividad Ck\beta-4 que comprende cultivar
la célula hospedante de la reivindicación 7 y recuperar a partir del
cultivo el polipéptido codificado por dicho polinucleótido.
9. Un proceso para producir células capaces de
expresar un polipéptido que tiene actividad
Ck\beta-4, que comprende modificar genéticamente
células con el vector de la reivindicación 5 ó 6.
10. Un polipéptido que tiene la secuencia de
aminoácidos codificada por un polinucleótido de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 4, o que puede obtenerse mediante el
proceso de la
\hbox{reivindicación 8.}
11. Un anticuerpo que es específico del
polipéptido de la reivindicación 10.
12. Un antagonista/inhibidor contra el
polipéptido de la reivindicación 10, en el que dicho
antagonista/inhibidor es un anticuerpo de la reivindicación 11, o un
constructo antisentido que se hibrida de forma específica con
transcriptos de un polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4.
13. Una composición farmacéutica que comprende el
polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, el
polipéptido de la reivindicación 10, o el antagonista/inhibidor de
la reivindicación 12, y opcionalmente un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
14. Una composición de diagnóstico que comprende
el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
4.
15. El uso del polipéptido de la reivindicación
10, o del polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1
a 4, para la preparación de una composición farmacéutica para el
tratamiento protector durante la quimioterapia del cáncer, y para la
leucemia, para el tratamiento de la psoriasis, tumores sólidos,
enfermedades autoinmunológicas, leucemia linfocítica, trastornos
fibróticos, para la curación de heridas, para la defensa contra
infecciones crónicas resistentes, para matar las larvas de
parásitos, para la regulación de la hematopoyesis, para la
inhibición de la angiogénesis, y para el tratamiento del asma o la
alergia.
16. El uso del antagonista/inhibidor de la
reivindicación 12 para la preparación de una composición
farmacéutica para el tratamiento de enfermedades autoinmunológicas,
y enfermedades infecciosas e inflamatorias crónicas.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP94927207A EP0777494B1 (en) | 1994-08-23 | 1994-08-23 | Human chemokine polypeptides |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
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ES2216001T3 true ES2216001T3 (es) | 2004-10-16 |
Family
ID=8218845
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
ES94927207T Expired - Lifetime ES2216001T3 (es) | 1994-08-23 | 1994-08-23 | Polipeptidos de quimioquina humana. |
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DK (1) | DK0777494T3 (es) |
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PT (1) | PT777494E (es) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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KR101919170B1 (ko) | 2010-11-19 | 2018-11-15 | 에자이 알앤드디 매니지먼트 가부시키가이샤 | 중화 항-ccl20 항체 |
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1994
- 1994-08-23 EP EP99126093A patent/EP1006188B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-08-23 PT PT94927207T patent/PT777494E/pt unknown
- 1994-08-23 ES ES94927207T patent/ES2216001T3/es not_active Expired - Lifetime
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Publication number | Publication date |
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