ES2227553T3 - Quimiocina beta-13 humana. - Google Patents
Quimiocina beta-13 humana.Info
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Abstract
SE PRESENTAN POLIPEPTIDOS DE QUIMIOCINA HUMANOS Y UN DNA (RNA) QUE CODIFICA TALES POLIPEPTIDOS DE QUIMIOCINA Y UN PROCEDIMIENTO PARA LA PRODUCCION DE TALES POLIPEPTIDOS MEDIANTE TECNICAS RECOMBINANTES. TAMBIEN SE PRESENTAN METODOS PARA LA UTILIZACION DE TALES POLIPEPTIDOS DE QUIMIOCINA EN EL TRATAMIENTO DE LA LEUCEMIA, TUMORES, INFECCIONES CRONICAS, ENFERMEDADES AUTOINMUNES, TRASTORNOS FIBROTICOS, CICATRIZACION DE HERIDAS Y PSORIASIS. TAMBIEN SE PRESENTAN ANTAGONISTAS CONTRA TALES POLIPEPTIDOS DE QUIMIOCINA Y SU USO COMO AGENTES TERAPEUTICOS PARA EL TRATAMIENTO DE LA ARTRITIS REUMATOIDEA, ENFERMEDADES INFLAMATORIAS E INFECCIOSAS AUTOINMUNES Y CRONICAS Y AGUDAS, REACCIONES ALERGICAS, FIEBRE INDEPENDIENTE DE LA PROSTAGLANDINA Y FALLO DE LA MEDULA OSEA. TAMBIEN SE PRESENTAN ENSAYOS DE DIAGNOSTICO PARA LA DETECCION DE ENFERMEDADES RELACIONADAS CON MUTACIONES EN LAS SECUENCIAS DE ACIDOS NUCLEICOS Y CONCENTRACIONES ALTERADAS DE LOS POLIPEPTIDOS. TAMBIEN SE PRESENTAN ENSAYOS DE DIAGNOSTICO PARA LADETECCION DE MUTACIONES EN LOS POLINUCLEOTIDOS QUE CODIFICAN LOS POLIPEPTIDOS DE QUIMIOCINA Y PARA DETECTAR NIVELES ALTERADOS DEL POLIPEPTIDO EN UN HUESPED.
Description
Quimiocina beta-13 humana.
Esta invención se refiere a polinucleótidos
recientemente identificados, a polipéptidos codificados por tales
polinucleótidos, al uso de tales polinucleótidos y polipéptidos, así
como a la producción de tales polinucleótidos y polipéptidos. Más en
particular, el polipéptido de la presente invención ha sido
identificado putativamente como polipéptido de quimiocina humana, a
veces llamado en adelante en el presente texto como quimiocina
beta-13 humana (Ck\beta-13). La
invención se refiere también a la inhibición de la acción de tales
polipéptidos.
Las quimiocinas, también denominadas citocinas de
intercrina, son una subfamilia de citocinas relacionadas
estructural y funcionalmente. Estas moléculas tienen un tamaño de
8-10 kD. En general, las quimiocinas muestran de un
20% a un 75% de homología en los aminoácidos, y se caracterizan por
cuatro restos de cisteína conservados que forman dos puentes
disulfuro. Basándose en la disposición de los dos primeros restos
de cisteína, las quimiocinas han sido clasificadas en dos
subfamilias, alfa y beta. En la subfamilia alfa, las dos primeras
cisteínas están separadas por un aminoácido y por ello se las
denomina como subfamilia
"C-X-C". En la subfamilia beta,
las dos cisteínas están en posiciones adyacentes y por ello se las
denomina subfamila "C-C". Hasta ahora se han
identificado en seres humanos al menos nueve miembros diferentes de
esta familia.
Las citocinas de intercrina muestran una amplia
variedad de funciones. Una característica típica es su capacidad
para desencadenar la migración quimiotáctica de tipos de células
diversos, incluyendo monocitos, neutrófilos, linfocitos T,
basófilos y fibroblastos. Muchas quimiocinas tienen actividad
proinflamatoria e intervienen en múltiples etapas durante una
reacción inflamatoria. Estas actividades incluyen la estimulación
de la liberación de histamina, liberación de enzima lisosómica y
leucotrieno, el aumento de la adherencia de células inmunitarias
diana a células endoteliales, el aumento de la unión de proteínas
de complemento, la inducción de la expresión de moléculas de
adhesión de granulocitos y receptores de complemento, y estallido
respiratorio. Además de su implicación en la inflamación, se ha
demostrado que ciertas quimiocinas muestran otras actividades. Por
ejemplo, la proteína inflamatoria de macrófago
(MIP-1) puede suprimir la proliferación de las
células troncales hematopoiéticas, el factor plaquetario 4
(PF-4) es un potente inhibidor del crecimiento de
las células endoteliales, la interleucina-8
(IL-8) favorece la proliferación de queratinocitos,
y el GRO es un factor de crecimiento autocrino para células de
melanoma.
En vista de las diversas actividades biológicas,
no es sorprendente que las quimiocinas hayan sido implicadas en
varias condiciones fisiológicas y patológicas, incluyendo el
tráfico de linfocitos, la cicatrización de las heridas, la
regulación hematopoiética y trastornos inmunológicos tales como
alergia, asma y artritis.
Los miembros de la rama
"C-C" ejercen su efecto sobre las células
siguientes: eosinófilos que destruyen parásitos para aminorar las
infecciones parasitarias y causan inflamación crónica en las vías
respiratorias; monocitos y macrófagos que suprimen la formación de
tumores en los vertebrados; linfocitos T que atraen células T y
basófilos que liberan histamina, que desempeña un papel en la
inflamación alérgica.
Aunque los miembros de la rama
C-C actúan de manera predominante sobre las células
mononucleares y los miembros de la rama
C-X-C actúan de manera predominante
sobre los neutrófilos, no se puede asignar una propiedad
quimioatrayente distinta a una quimiocina basándose en esta
directriz. Algunas quimiocinas de una familia muestran
características de la otra.
El polipéptido de la presente invención tiene la
región "C-C" de cisteína conservada, y tiene
homología de secuencia de aminoácidos respecto a quimiocinas
conocidas.
De acuerdo con un aspecto de la presente
invención, se proporcionan nuevos polipéptidos así como fragmentos,
análogos y derivados de los mismos, biológicamente activos y útiles
en diagnóstico o en terapia.
De acuerdo con otro aspecto de la presente
invención, se proporcionan moléculas de ácidos nucleicos aisladas
que codifican tales polipéptidos, incluyendo mRNAs, DNAs, cDNAs,
DNA genómico, así como fragmentos, análogos y derivados de los
mismos, biológicamente activos y útiles en diagnóstico o en
terapia.
De acuerdo con otro aspecto de la presente
invención, se proporcionan sondas de ácidos nucleicos que
comprenden moléculas de ácidos nucleicos de longitud suficiente
para hibridarse específicamente con secuencias de ácidos nucleicos
que codifican el polipéptido de la presente invención.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para preparar tal
polipéptido mediante técnicas recombinantes, que comprende
cultivar células hospedadoras procariotas y/o eucariotas
recombinantes, que contienen una secuencia de ácidos nucleicos que
codifica un polipéptido de la presente invención, bajo condiciones
que favorecen la expresión de dicha proteína y la subsiguiente
recuperación de dicha proteína.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para utilizar tales
polipéptidos, o polinucleótidos que codifican tales polipéptidos,
para fines terapéuticos, por ejemplo para tratar tumores sólidos,
infecciones crónicas, leucemia, enfermedades autoinmunitarias
mediadas por células T, infecciones parasitarias, soriasis, para
regular la hematopoyesis, para estimular la actividad del factor de
crecimiento, para inhibir la angiogénesis y para mejorar la
cicatrización de las heridas.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente
invención, se proporcionan anticuerpos contra tales
polipéptidos.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente
invención, se proporcionan antagonistas para tales polipéptidos, que
pueden ser usados para inhibir la acción de tales polipéptidos, por
ejemplo, en el tratamiento de ciertas enfermedades
autoinmunitarias, aterosclerosis, enfermedades inflamatorias e
infecciosas crónicas, reacciones alérgicas mediadas por histamina e
IgE, fiebre independiente de la prostaglandina, insuficiencia
medular, silicosis, sarcoidosis, artritis reumatoide y síndrome
hiper-eosinofílico.
De acuerdo con otro aspecto de la presente
invención, se proporciona un método para diagnosticar una
enfermedad o la susceptibilidad para una enfermedad relacionada con
una mutación en las secuencias de ácidos nucleicos de la presente
invención y a niveles alterados de la proteína codificada por tales
secuencias de ácidos nucleicos.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para utilizar tales
polipéptidos, o polinucleótidos que codifican tales polipéptidos,
para aplicaciones in vitro relacionadas con la investigación
científica, la síntesis de DNA y la elaboración de vectores de
DNA.
Estos y otros aspectos de la presente invención
han de resultar evidentes para un experto en la técnica a partir de
las presentes enseñanzas.
Los dibujos que siguen son ilustrativos de
realizaciones de la invención y se entiende que no limitan el
alcance de dicha invención, que queda comprendido por las
reivindicaciones.
La figura 1 representa la secuencia de cDNA y la
correspondiente secuencia de aminoácidos de
Ck\beta-13 deducida. Los 28 aminoácidos iniciales
representan la secuencia guía de forma que el polipéptido maduro
putativo comprende 65 aminoácidos. Se usan las abreviaturas
estándar de una letra para los aminoácidos. La secuenciación se
llevó a cabo usando un secuenciador de DNA automático 373 (Applied
Biosystems, Inc.).
La Figura 2 representa la homología de la
secuencia de aminoácidos entre Ck\beta-13 (parte
superior) y el polipéptido MIP-1\alpha humano
(parte inferior).
De acuerdo con un aspecto de la presente
invención, se proporcionan ácidos nucleicos aislados
(polinucleótidos) que codifican el polipéptido maduro que tiene la
secuencia deducida de aminoácidos de la Figura 1 (SEQ ID Nº: 2) o el
polipéptido maduro codificado por el cDNA del clon o los clones
depositados como nº de depósito en la ATCC 97113 el 28 de abril de
1995.
Los polinucleótidos que codifican
Ck\beta-13 han sido aislados de una genoteca de
cDNA de monocitos activados. Ck\beta-13 es un
miembro de la rama C-C de quimiocinas. Contiene un
marco de lectura abierto que codifica una proteína de 93 restos de
aminoácidos de los que aproximadamente los 28 primeros restos de
aminoácidos son la secuencia guía putativa, de forma que la proteína
madura comprende 65 aminoácidos. La proteína tiene homología
estructural respecto a los polipéptidos de quimiocina, y la
homología respecto al polipéptido MIP-1\alpha
humano con 33% de identidad y 53% de similitud sobre la secuencia
entera se usa solamente como ejemplo.
Los cuatro restos de cisteína conservados
espacialmente en las quimiocinas se encuentran en el polipéptido de
la presente invención, como puede verse en la Figura 1.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden estar en forma de RNA o en forma de DNA, el cual DNA incluye
cDNA, DNA genómico y DNA sintético. El DNA puede ser bicatenario o
monocatenario, y si es monocatenario puede ser la hebra
codificadora o la hebra no codificadora (antisentido). La secuencia
de codificación que codifica los polipéptidos maduros puede ser
idéntica a la secuencia de codificación mostrada en las Figuras 1
(SEQ ID Nº: 1) o la del clon o clones depositados, o puede ser una
secuencia codificadora diferente, la cual secuencia codificadora,
como resultado de la redundancia o degeneración del código
genético, codifica los mismos polipéptidos maduros que el DNA de la
Figura 1 (SEQ ID Nº: 1) o el cDNA depositado.
Los polinucleótidos que codifican el polipéptido
maduro de la Figura 1 (SEQ ID Nº 2) o el polipéptido maduro
codificado por el cDNA depositado, pueden incluir solamente la
secuencia de codificación para el polipéptido maduro; la secuencia
de codificación para el polipéptido maduro y secuencia de
codificación adicional tal como una secuencia guía o secretora o
una secuencia pro-proteína; la secuencia
codificadora para el polipéptido maduro (y opcionalmente secuencia
codificadora adicional) y secuencia no codificadora, tal como
intrones o secuencia no codificadora 5' y/o 3' de la secuencia
codificadora para los polipéptidos maduros.
Así pues, la expresión "polinucléotido que
codifica un polipéptido" abarca un polinucléotido que incluye
solamente secuencia de codificación para el polipéptido así como un
polinucléotido que incluye una secuencia adicional codificadora y/o
no codificadora.
La presente invención se refiere además a
variantes de los polinucleótidos anteriormente descritos, que
codifican fragmentos, análogos y derivados del polipéptido que
tiene la secuencia deducida de aminoácidos de la Figura 1 (SEQ ID
Nº: 2) o el polipéptido codificado por el cDNA del clon o clones
depositados. Las variantes de los polinucleótidos pueden ser una
variante alélica de origen natural de los polinucleótidos o una
variante de los polinucleótidos que no es de origen natural.
Así pues, la presente invención incluye
polinucleótidos que codifican el mismo polipéptido maduro que se
muestra en las Figuras 1 (SEQ ID Nº: 2) o el mismo polipéptido
maduro codificado por el cDNA del clon o clones depositados, así
como variantes de tales polinucleótidos, las cuales variantes
codifican un fragmento, derivado o análogo del polipéptido de la
Figura 1 (SEQ ID Nº: 2) o el polipéptido codificado por el cDNA del
clon o clones depositados. Tales variantes de los nucleótidos
incluyen variantes de deleción, variantes de sustitución y
variantes de adición o inserción.
Como se ha indicado anteriormente en el presente
texto, los polinucleótidos pueden tener una secuencia codificadora
que es una variante alélica de origen natural de la secuencia
codificadora mostrada en la Figura 1 (SEQ ID Nº: 1) o la secuencia
codificadora del clon o clones depositados. Como es sabido en la
técnica, una variante alélica es una forma alternativa de una
secuencia de polinucleótidos que puede tener una sustitución,
deleción o adición de uno o más nucleótidos, que no altera
sustancialmente la función del polipéptido codificado.
La presente invención incluye también
polipéptidos en los que la secuencia codificadora para los
polipéptidos maduros puede estar fusionada en el mismo marco de
lectura con una secuencia de polinucleótidos que ayuda a la
expresión y secreción de un polipéptido a partir de una célula
hospedadora, por ejemplo una secuencia guía que funciona como
secuencia secretora para controlar el transporte de un polipéptido
desde la célula. El polipéptido que tiene una secuencia guía es una
preproteína y puede tener la secuencia guía segmentada por la
célula hospedadora para dar lugar a la forma madura del polipéptido.
Los polinucleótidos pueden también codificar una proproteína que es
la proteína madura más restos de aminoácidos 5' adicionales. Una
proteína madura que tiene una prosecuencia es una proproteína y es
una forma inactiva de la proteína. Una vez segmentada la
prosecuencia, queda una proteína activa madura.
Así, por ejemplo, los polinucleótidos de la
presente invención pueden codificar una proteína madura, o una
proteína que tiene una prosecuencia. o una proteína que tiene tanto
una prosecuencia como una presecuencia (secuencia guía).
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden también tener la secuencia codificadora fusionada en marco
con una secuencia marcadora que permite la purificación del
polipéptido de la presente invención. La secuencia marcadora puede
ser una etiqueta de hexahistidina suministrada por un vector
pQE-9 para proporcionar la purificación del
polipéptido maduro fusionado con el marcador en el caso de un
hospedador bacteriano, o, por ejemplo, la secuencia marcadora puede
ser una etiqueta de hemaglutinina (HA) cuando se usa un hospedador
de mamífero (p. ej. células COS-7). La etiqueta de
HA corresponde a un epítopo derivado de la proteína hemaglutinina de
la influenza (Wilson, I. et al., Cell, 37: 767 (1984)).
El término "gen" significa el segmento de
DNA implicado en la producción de una cadena de polipéptido.;
incluye regiones que preceden y que siguen a la región de
codificación (guía y trailer) así como secuencias
interpuestas (intrones) entre segmentos codificadores individuales
(exones).
Pueden usarse fragmentos del gen
Ck\beta-13 de longitud completa como sonda de
hibridación para una genoteca de cDNA para aislar el gen de longitud
completa y para aislar otros genes que tienen una elevada similitud
de secuencia con el gen o una actividad biológica similar. Las
sondas de este tipo tienen preferentemente al menos 30 bases y
pueden contener, por ejemplo, 50 bases o más. La sonda puede usarse
también para identificar un clon de cDNA correspondiente a un
transcrito de longitud completa y un clon o clones genómicos que
contienen el gen Ck\beta-13 completo, incluyendo
las regiones reguladora y promotora, exones, e intrones. Un ejemplo
de un cribado comprende aislar la región codificadora del gen
Ck\beta-13 usando la secuencia de DNA conocida,
para sintetizar una sonda de oligonucleótido. Los oligonucleótidos
marcados que tienen una secuencia complementaria a la del gen de la
presente invención se usan para cribar una genoteca de cDNA humano,
DNA genómico o mRNA, para determinar con qué miembros de la
genoteca se hibrida la sonda.
La presente invención se refiere además a
polinucleótidos que se hibridan con las secuencias anteriormente
descritas en el presente texto si hay al menos un 70%,
preferentemente al menos un 90%, y más preferentemente al menos un
95% de identidad entre las secuencias. La presente invención se
refiere en particular a polinucleótidos que se hibridan bajo
condiciones severas con los polinucleótidos anteriormente descritos
en el presente texto. Como se usa en este texto, la expresión
"condiciones severas" significa que la hibridación tendrá lugar
solamente si hay al menos un 95% y preferentemente al menos un 97%
de identidad entre las secuencias. Los polinucleótidos que se
hibridan con los polinucleótidos anteriormente descritos, en una
realización preferida codifican polipéptidos que retienen
sustancialmente la misma función biológica o actividad que el
polipéptido maduro codificado por el cDNA de la Figura 1 (SEQ ID
Nº: 1) o el cDNA o cDNAs depositados, es decir funcionan como un
polipéptido de quimiocina.
Alternativamente, los polinucleótidos pueden ser
polinucleótidos que tienen al menos 20 bases, preferentemente 30
bases y más preferentemente al menos 50 bases que se hibridan con
un polinucleótido de la presente invención y que tienen una
identidad con él, como se describió antes, y que pueden retener o
no la actividad. Por ejemplo, tales polinucleótidos pueden emplearse
como sondas para el polinucleótido de la SEQ ID Nº: 1, o para
variantes del mismo, por ejemplo, para la recuperación del
polinucleótido o como sonda para diagnóstico o como cebador de la
PCR.
Así, la presente invención se dirige a
polinucleótidos que tienen al menos un 70% de identidad,
preferentemente al menos un 90% y más preferentemente al menos un
95% de identidad respecto a un polinucleótido que codifica el
polipéptido de la SEQ ID Nº: 2 así como fragmentos del mismo, los
cuales fragmentos tienen al menos 30 bases, preferentemente al
menos 50 bases, y a los polipéptidos codificados por tales
polinucleótidos.
El depósito o depósitos mencionados en el
presente texto serán mantenidos bajo los términos del Tratado de
Budapest acerca del reconocimiento internacional del depósito de
microorganismos, con fines relativos a procedimientos de patente.
Estos depósitos se proporcionan meramente como conveniencia para
los expertos en la técnica y no suponen admitir que se requiera un
depósito bajo 35 U.S.C. párrafo 112. La secuencia de los
polinucleótidos contenidos en los materiales depositados, así como
la secuencia de aminoácidos de los polipéptidos codificados por
ellos, se incorporan al presente texto como referencia y son
reguladoras en el caso de cualquier conflicto con cualquier
descripción de secuencias del presente texto. Se puede requerir
licencia para hacer, usar o vender los materiales depositados y con
el presente no se otorga tal licencia.
La presente invención se refiere además a
polipéptidos que tienen la secuencia deducida de aminoácidos de la
Figura 1 (SEQ ID Nº: 2) o que tienen la secuencia de aminoácidos
codificada por el cDNA depositado, así como a fragmentos, análogos
y derivados de tales polipéptidos.
Los términos "fragmento", "derivado" y
"análogo", cuando se refieren al polipéptido de la Figura 1
(SEQ ID Nº: 2) o al codificado por el cDNA depositado, significan
un polipéptido que mantiene esencialmente la misma actividad o
función biológica que tal polipéptido. Así, un análogo incluye una
proproteína que puede activarse por segmentación de la porción de
proproteína para producir un polipéptido maduro activo. Un derivado
o fragmento puede incluir, por ejemplo, una variante de ayuste
(corte y empalme) que tiene menos restos de aminoácidos que el
polipéptido de la Figura 1 pero que todavía mantiene la
característica de actividad biológica de los polipéptidos de
quimiocina humana.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser polipéptidos recombinantes, polipéptidos naturales o
polipéptidos sintéticos, preferentemente polipéptidos
recombinantes.
El fragmento, derivado o análogo del polipéptido
de la Figura 1 (SEQ ID Nº: 2) o el codificado por los cDNAs
depositados puede ser (i) un fragmento, derivado o análogo en el
que uno o más de los restos de aminoácidos están sustituidos con un
resto de aminoácido conservado o no conservado (preferentemente un
resto de aminoácido conservado) y tal resto de aminoácido
sustituido puede ser o no un resto codificado por el código
genético, (ii) uno en el que uno o más de los restos de aminoácidos
incluyen un grupo sustituyente, (iii) uno en el que el polipéptido
maduro está fusionado con otro compuesto, tal como un compuesto
para incrementar la vida mitad del polipéptido (por ejemplo
polietilenglicol), o (iv) uno en el que los aminoácidos adicionales
están fusionados con el polipéptido maduro, tal como una secuencia
guía o secretora o una secuencia que es empleada para la
purificación del polipéptido maduro o una secuencia de proproteína.
Se considera que tales fragmentos, derivados y análogos están
dentro del alcance de los expertos en la técnica a partir de las
presentes enseñanzas.
Los polipéptidos y polinucleótidos de la presente
invención se proporcionan preferentemente en forma aislada, y
preferentemente se purifican hasta homogeneidad.
El término "aislado" significa que el
material se retira de su entorno original (p. ej. el entorno
natural si es de origen natural). Por ejemplo, un polinucleótido o
polipéptido de origen natural presente en un animal vivo no es
aislado, pero el mismo polinucleótido o polipéptido separado del
algo o de la totalidad de los materiales que coexisten en el
sistema natural, es aislado. Tales polinucleótidos podrían ser
parte de un vector y/o tales polinucleótidos o polipéptidos podrían
ser parte de una composición, y ser aún aislados, por cuanto tal
vector o composición no es parte de su entorno natural.
Los polipéptidos de la presente invención
incluyen el polipéptido de la SEQ ID Nº: 2 (en particular el
polipéptido maduro) así como polipéptidos que tienen al menos un
70% de similitud (preferentemente al menos 70% de identidad)
respecto del polipéptido de la SEQ ID Nº: 2 y más preferentemente al
menos 90% de similitud (preferentemente al menos 90% de identidad)
respecto al polipéptido de la SEQ ID Nº: 2, y aún más
preferentemente al menos 95% de similitud (preferentemente al menos
95% de identidad) respecto al polipéptido de la SEQ ID Nº: 2, y
también incluye porciones de tales polipéptidos que generalmente
contienen al menos 30 aminoácidos y más preferentemente al menos 50
aminoácidos.
Como es sabido en la técnica, la "similitud"
entre dos polipéptidos se determina comparando la secuencia de
aminoácidos y sus sustitutos de aminoácidos conservados de un
polipéptido con la secuencia de un segundo polipéptido.
Los fragmentos o porciones de los polipéptidos de
la presente invención pueden emplearse para producir el
correspondiente polipéptido de longitud completa mediante síntesis
de péptidos; por consiguiente, los fragmentos pueden ser empleados
como productos intermedios para producir los polipéptidos de
longitud completa. Los fragmentos o porciones de los polinucleótidos
de la presente invención pueden ser usados para sintetizar
polinucleótidos de longitud completa de la presente invención.
La presente invención se refiere también a
vectores que incluyen polinucleótidos de la presente invención,
células hospedadoras que se obtienen por ingeniería genética con
vectores de la invención, y la producción de polipéptidos de la
invención por técnicas recombinantes.
Las células hospedadoras se obtienen por
ingeniería genética (transducidas, transformadas o transfectadas)
con los vectores de esta invención que pueden ser, por ejemplo, un
vector de clonación o un vector de expresión. El vector puede
estar, por ejemplo, en forma de un plásmido, una partícula viral,
un fago, etc. Las células hospedadoras obtenidas por ingeniería
genética pueden ser cultivadas en un medio nutriente convencional
modificado de la forma apropiada para activar promotores,
seleccionar transformantes o amplificar los genes
Ck\beta-13. Las condiciones de cultivo, tales como
temperatura, pH y demás, son las usadas anteriormente con la célula
hospedadora elegida para la expresión, y será evidente para un
profesional con experiencia normal en la técnica.
Los polinucleótidos de la presente invención
pueden usarse para producir polipéptidos por técnicas recombinantes.
Así, por ejemplo, el polinucleótido puede ser incluido en uno
cualquiera de una diversidad de vectores de expresión para expresar
un polipéptido. Tales vectores incluyen secuencias de DNA
cromosómicas, no cromosómicas y sintéticas, p. ej. derivados de
SV40, plásmidos bacterianos, DNA de fago, baculovirus, plásmidos de
levaduras, vectores derivados de combinaciones de plásmidos y DNA
de fago, DNA viral tal como viruela vacuna, adenovirus, virus de la
viruela aviar, y seudorabia. Sin embargo, puede usarse cualquier
otro vector siempre y cuando sea replicable y viable en el
hospedador.
La secuencia de DNA apropiada puede ser insertada
en el vector por una diversidad de procedimientos. En general, la
secuencia de DNA se inserta en un sitio o sitios de endonucleasa de
restricción apropiados por procedimientos conocidos en la técnica.
Se considera que tales procedimientos y otros están al alcance de
los expertos en la técnica.
La secuencia de DNA en el vector de expresión
está operativamente ligada a una secuencia o secuencias de control
de la expresión apropiada (promotor) para dirigir la síntesis de
mRNA. Como ejemplos representativos de tales promotores, cabe
mencionar: promotor de LTR o de SV40, el lac o trp de
E. coli, el promotor P_{L} del fago lambda y otros
promotores conocidos que controlan la expresión de genes en células
procariotas o eucariotas o sus virus. El vector de expresión
contiene también un sitio de unión con el ribosoma para la
iniciación de la traducción y un terminador de la transcripción. El
vector puede también incluir secuencias apropiadas para amplificar
la expresión.
Además, los vectores de expresión contienen
preferentemente uno o más genes marcadores seleccionables, para
proporcionar un rasgo fenotípico para la selección de células
hospedadoras transformadas, tales como dihidrofolato reductasa o
resistencia a la neomicina para cultivo de células eucariotas, o
tales como resistencia a la tetraciclina o a la ampicilina en E.
coli.
El vector que contiene la secuencia de DNA
apropiada como se describió anteriormente en el presente texto, así
como un promotor o una secuencia de control apropiados, puede
emplearse para transformar un hospedador apropiado para permitir
que el hospedador exprese la proteína.
Como ejemplo representativos de hospedadores
apropiados, cabe mencionar: células bacterianas tales como E.
coli, Streptomyces, Salmonella typhimurium;
células fúngicas tales como levaduras; células de insectos tales
como Drosophila S2 y Spodoptera Sf9; cálulas animales tales
como CHO, COS o melanoma de Bowes; adenovirus; células vegetales;
etc. Se considera que la selección de un hospedador apropiado está
dentro del alcance de los expertos en la técnica a partir de las
enseñanzas del presente texto.
Más en particular, la presente invención incluye
además construcciones recombinantes que comprenden una o más de las
secuencias ampliamente descritas antes. Las construcciones
comprenden un vector, tal como un plásmido o un vector viral, en el
que ha sido insertada una secuencia de la invención, en una
orientación directa o inversa. En un aspecto preferido de esta
realización, la construcción comprende además secuencias
reguladoras incluyendo, por ejemplo, un promotor, unidas de forma
operativa a la secuencia. Los expertos en la técnica conocen un
gran número de vectores y promotores adecuados, y son disponibles
comercialmente. A título de ejemplo, se proporcionan los vectores
siguientes: Bacterianos: pQE70, pQE60, pQE-9
(Qiagen), pBS, pD10, Phagescript, psiX174, pBluescript SK, pBSKS,
pNH8A, pNH16a, pNH18A, pNH46A (Stratagene); pTRC99a,
pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5
(Pharmacia). Eucariotas: pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1, pSG
(Stratagene) pSVK3, pBPV, pMSG, pSVL (Pharmacia). Sin embargo, puede
usarse cualquier otro plásmido o vector siempre y cuando sean
replicables y viables en el hospedador.
Las regiones de promotor pueden seleccionarse
entre cualquier gen deseado usando vectores CAT (cloranfenicol
transferasa) u otros vectores con marcadores seleccionables. Dos
vectores apropiados son pKK232-8 y pCM7. Los
promotores bacterianos citados en particular incluyen lacI, lacZ,
T3, T7, gpt, lambda P_{R}, P_{L} y trp. Los promotores
eucarióticos incluyen CMV temprano inmediato, timidina quinasa de
HSV, SV40 temprano y tardío, LTRs de retrovirus, y
metalotioneína-I de ratón. La selección del vector y
promotor apropiados es propia del nivel de un experto normal en la
técnica.
En otra realización más, la presente invención se
refiere a las células hospedadoras que contienen las construcciones
anteriormente descritas. La célula hospedadora puede ser una célula
eucariota superior, tal como una célula de mamífero, o una célula
procariota inferior, tal como una célula de levadura, o la célula
hospedadora puede ser una célula procariota tal como una célula
bacteriana. La introducción de la construcción en la célula
hospedadora puede realizarse mediante transfección con fosfato
cálcico, transfección mediada por DEAE-dextrano, o
electroporación (Davis, L., Dibner, N., Battey, I., Basic Methods
in Molecular Bilogy, (1986)).
Las construcciones en células hospedadoras pueden
usarse de una manera convencional para preparar los producto génicos
codificados por las secuencias recombinantes. Alternativamente, los
polipéptidos de la invención pueden producirse por síntesis
mediante sintetizadores de péptidos convencionales.
Las proteínas maduras pueden expresarse en
células de mamífero, levaduras, bacterias u otras células, bajo el
control de promotores apropiados. También pueden emplearse sistemas
de traducción libres de células para producir tales proteínas
usando RNAs derivados de las construcciones de DNA de la presente
invención. Vectores de clonación y expresión apropiados para ser
usados con hospedadores eucarióticos y procarióticos, son descritos
por Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual,
2ª ed., Cold Spring Harbor, N.Y., (1989), cuya descripción se
incorpora al presente texto como referencia.
La transcripción del DNA que codifica los
polipéptidos de la presente invención por eucariotas superiores se
incrementa al insertar una secuencia potenciadora en el vector. Los
potenciadores son elementos de DNA de acción cis, normalmente de
aproximadamente 10 a 300 pb, que actúan sobre un promotor para
aumentar su transcripción. Los ejemplos incluyen el potenciador SV40
en el lado tardío del origen de replicación pb 100 a 270, un
potenciador del promotor temprano de citomegalovirus, el
potenciador de polioma en el lado tardío del origen de replicación,
y potenciadores de adenovirus.
Generalmente, los vectores de expresión
recombinantes incluirán orígenes de replicación y marcadores
seleccionables que permiten la transformación de la célula
hospedadora, p. ej. el gen de la resistencia a la ampicilina de los
genes TRP1 de E. coli y S. cerevisiae, y un promotor
derivado de un gen altamente expresado para la transcripción
directa de una secuencia estructural corriente abajo. Tales
promotores pueden derivarse de operones que codifican enzimas
glucolíticas tales como 3-fosfoglicerato quinasa
(PGK), factor \alpha, fosfatasa ácida, o proteínas de choque
térmico, entre otras. La secuencia estructural heteróloga se
ensambla en la fase apropiada con secuencias de iniciación y
terminación de la traducción, y, preferentemente, una secuencia
guía capaz de dirigir la secreción de la proteína traducida en el
espacio periplásmico o el medio extracelular. Opcionalmente, la
secuencia heteróloga puede codificar una proteína de fusión que
incluye un péptido de identificación N-terminal que
confiere las características deseadas, p. ej. la estabilización o
purificación simplificada del producto recombinante expresado.
Los vectores de expresión útiles para uso
bacteriano se construyen insertando una secuencia de DNA
estructural que codifica una proteína deseada, junto con señales
adecuadas de iniciación y terminación de la traducción en fase de
lectura operable con un promotor funcional. El vector comprenderá
uno o más marcadores seleccionables fenotípicos y un origen de
replicación para asegurar el mantenimiento del vector y, si se
desea, para proporcionar la amplificación dentro del hospedador.
Los hospedadores procarióticos para transformación adecuados
incluyen E. coli, Bacillus subtilis, Salmonella
typhimurium y varias especies pertenecientes a los géneros
Pseudomonas, Streptomyces y Staphylococcus,
aunque también pueden emplearse otros como cuestión de
elección.
Como ejemplo representativo pero no limitante,
los vectores de expresión útiles para uso bacteriano pueden
comprender un marcador seleccionable y un origen bacteriano de
replicación derivado de plásmidos disponibles comercialmente, que
comprenden elementos genéticos del bien conocido vector de
clonación pBR322 (ATCC 37017). Tales vectores comerciales incluyen,
por ejemplo, pKK223-3 (Pharmacia Fine Chemicals,
Uppsala, Suecia) y pGEM1 (Promega Biotec, Madison, WI, USA). Estas
secciones "esqueleto" de pBR322 se combinan con un promotor
apropiado y la secuencia estructural a expresar.
Después de la transformación de una cepa
hospedadora adecuada y el crecimiento de la cepa hospedadora hasta
una densidad celular apropiada, el promotor seleccionado es
inducido por medios apropiados (p. ej. desplazamiento de la
temperatura o inducción química) y las células se cultivan durante
un periodo adicional.
Las células se recolectan típicamente por
centrifugación, se rompen por medios físicos o químicos, y el
extracto crudo resultante se conserva para posterior
purificación.
Las células microbianas empleadas en la expresión
de proteínas pueden romperse por cualquier método conveniente,
incluyendo ciclos de congelación y descongelación, tratamiento con
ultrasonidos, rotura mecánica o el uso de agentes de lisis, y tales
métodos son bien conocidos por los expertos en la técnica.
También pueden emplearse varios sistemas de
cultivo de células de mamífero para expresar la proteína
recombinante. Los ejemplos de sistemas de expresión de mamífero
incluyen las líneas COS-7 de fibroblastos de riñón
de mono, descritas por Gluzman, Cell, 23: 175 (1981), y otras
líneas de células capaces de expresar un vector compatible, por
ejemplo las líneas de células C127, 3T3, CHO, HeLa y BHK. Los
vectores de expresión de mamíferos comprenderán un origen de
replicación, un promotor y potenciador adecuado y también cualquier
sitio necesario de unión con el ribosoma, sitio de poliadenilación,
sitios de donador y aceptor de ayuste, secuencias de terminación de
transcripcional y secuencias flanqueantes 5' no transcritas. Las
secuencias de DNA derivadas del ayuste de SV40, y sitios de
poliadenilación, pueden usarse para proporcionar los elementos
genéticos no trascritos requeridos.
Los polipéptidos pueden ser recuperados y
purificados de los cultivos de células recombinantes por métodos
que incluyen precipitación con sulfato amónico o etanol, extracción
con ácido, cromatografía de intercambio aniónico o catiónico,
cromatografía en fosfocelulosa, cromatografía de interacción
hidrófoba, cromatografía de afinidad, cromatografía en
hidroxilapatita y cromatografía en lectina. Pueden usarse etapas de
replegamiento de proteínas, si es necesario, para completar la
configuración de la proteína madura. Finalmente, puede emplearse
cromatografía de líquidos del alto rendimiento (HPLC) para las
etapas finales de purificación.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser un producto purificado naturalmente o un producto de
procedimientos de síntesis química, o ser producido por técnicas
recombinantes a partir de un hospedador procariota o eucariota (por
ejemplo, por células bacterianas, de levaduras, de vegetales
superiores, de insectos y de mamíferos, en cultivo). Dependiendo del
hospedador empleado en un procedimiento de producción recombinante,
los polipéptidos de la presente invención pueden ser glucosilados o
pueden ser no glucosilados. Los polipéptidos de la presente
invención pueden incluir también un resto de aminoácido metionina
inicial.
Los polinucleótidos y polipéptidos de la presente
invención pueden ser empleados como reactivos y materiales para
investigación para el descubrimiento de tratamientos y diagnósticos
para enfermedades humanas.
El polipéptido de la presente invención puede
emplearse para inhibir la formación de colonias de células
troncales de la médula ósea como tratamiento protector coadyuvante
durante la quimioterapia del cáncer. El polipéptido
Ck\beta-13 puede inhibir la proliferación y
diferenciación de células hematopoiéticas tales como las células
troncales de la médula ósea. El efecto inhibidor sobre la población
de células progenitoras comprometidas (por ejemplo granulocitos y
macrófago/monocitos) puede emplearse terapéuticamente para inhibir
la proliferación de células leucémicas.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
emplearse también para inhibir la proliferación de queratinocitos
epidérmicos para el tratamiento de la soriasis, que se caracteriza
por la hiper-proliferación de queratinocitos, ya
que se ha encontrado que las células de Langerhans de la piel
producen quimiocinas.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
emplearse también para tratar tumores sólidos, por ejemplo sarcoma
de Karposi, estimulando la invasión y activación de las células de
defensa del hospedador, p. ej. células T citotóxicas y macrófagos,
mediante quimiotaxis, e inhibiendo la angiogénesis de tumores.
También pueden emplearse para mejorar las
defensas del huésped contra las infecciones agudas y crónicas
resistentes, por ejemplo las infecciones micobacterianas, a través
de la atracción y la activación de leucocitos microbicidas.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
emplearse también para inhibir la proliferación de células T
mediante la inhibición de la biosíntesis de IL-2
para el tratamiento de enfermedades autoinmunitarias mediadas por
células T y leucemias linfocitarias.
El Ck\beta-13 puede emplearse
también para estimular la cicatrización de heridas y prevenir la
deformidad cicatricial durante la cicatrización de heridas, en
ambos casos a través del reclutamiento de células inflamatorias de
limpieza de residuos y promotoras de tejido conjuntivo y también a
través de su control de la excesiva fibrosis mediada por
TGF-\beta. De la misma forma, el
Ck\beta-13 puede emplearse también para tratar
otros trastornos fibróticos, incluyendo cirrosis hepática,
osteoartritis y fibrosis pulmonar.
Los polipéptidos de la presente invención
incrementan también la presencia de eosinófilos que tienen la
función distintiva de destruir las larvas de parásitos que invaden
los tejidos, como en la esquistosomiasis, la triquinosis y la
ascariasis.
También pueden emplearse para regular la
hematopoiesis, regulando la activación y diferenciación de varias
células progenitoras hematopoiéticas, por ejemplo para liberar
leucocitos maduros de la médula ósea después de la
quimioterapia.
El polipéptido de la presente invención puede
emplearse también para señalar como diana células no deseadas, tal
como en el tratamiento del cáncer, para la apoptosis.
Los polinucleótidos y los polipéptidos
codificados por tales polinucleótidos pueden utilizarse también
para propósitos in vitro relacionados con la investigación
científica, la síntesis del DNA y la elaboración de vectores de
DNA, y para diseñar terapéuticas y diagnósticos para el tratamiento
de enfermedades humanas.
El polipéptido puede usarse también para
movilizar células troncales de la médula ósea a la sangre
periférica, lo cual permite un fácil aislamiento de dichas células
troncales. Las células troncales aisladas pueden emplearse para la
colonización de la médula ósea después de una quimioterapia de dosis
alta.
Esta invención está también relacionada con el
uso del gen Ck\beta-13 como parte de un ensayo
diagnóstico para detectar enfermedades o la susceptibilidad hacia
enfermedades relacionadas con la presencia de mutaciones en las
secuencias de ácidos nucleicos que codifican un polipéptido de la
presente invención. Tales enfermedades están relacionadas con la
sub-expresión de los polipéptidos de quimiocina
humana, por ejemplo, tumores y cánceres.
Los individuos que llevan mutaciones en un gen de
la presente invención pueden ser detectados a nivel del DNA por una
diversidad de técnicas. Los ácidos nucleicos para diagnóstico
pueden obtenerse de las células de un paciente, por ejemplo a
partir de la sangre, orina, saliva, biopsia de tejidos y material de
autopsia. El DNA genómico puede usarse directamente para la
detección o puede ser amplificado enzimáticamente usando PCR (Saiki
et al., Nature, 324: 163-166 (1986)) antes
del análisis. El RNA o el cDNA pueden usarse también con el mismo
propósito. Como ejemplo, pueden usarse cebadores de PCR
complementarios del ácido nucleico que codifica
Ck\beta-13 para identificar y analizar mutaciones
de Ck\beta-13. Por ejemplo, pueden detectarse
deleciones e inserciones por un cambio en el tamaño del producto
amplificado en comparación con el genotipo normal. Pueden
identificarse mutaciones puntuales hibridando DNA amplificado con
RNA de Ck\beta-13 radiomarcado o,
alternativamente, secuencias de DNA antisentido de
Ck\beta-13 radiomarcadas. Las secuencias
perfectamente coincidentes pueden distinguirse de los dúpleces no
coincidentes por digestión con RNasa o por diferencias en las
temperaturas de fusión.
Pueden realizarse pruebas genéticas basadas en
diferencias de secuencia de DNA mediante la detección de la
alteración de la movilidad electroforética de fragmentos de DNA en
geles con o sin agentes desnaturalizantes. Las pequeñas deleciones
e inserciones de la secuencia pueden visualizarse mediante
electroforesis en gel de alta resolución. Los fragmentos de DNA de
secuencias diferentes pueden distinguirse en geles de gradiente de
formamida desnaturalizante en los que las movilidades de fragmentos
diferentes de DNA están retardadas en el gel en posiciones
diferentes de acuerdo con sus temperaturas de fusión o fusión
parcial específicas (véase, p. ej. , Myers et al., Science,
230: 1242 (1985)).
Los cambios de secuencia en localizaciones
específicas pueden también revelarse por ensayos de protección de
nucleasa, tales como protección de RNasa y S1 o el método de
segmentación química (p. ej. Cotton et al., PNAS, USA, 85:
4397-4401 (1985)).
Así, la detección de una secuencia de DNA
específica puede conseguirse por métodos tales como hibridación,
protección de RNasa, segmentación química, secuenciación directa de
DNA o el uso de enzimas de restricción (p. ej. polimorfismos de
longitud de fragmento de restricción (RFLP: Restriction Fragment
Length Polymorphisms)) y análisis de transferencia Southern de DNA
genómico.
Además de electroforesis en gel y secuenciación
de DNA más convencionales, las mutaciones pueden detectarse también
mediante análisis in situ.
La presente invención se refiere también a un
ensayo diagnóstico para detectar niveles alterados del polipéptido
de la presente invención en varios tejidos, ya que una
sobre-expresión del polipéptido en comparación con
muestras de tejido testigo normales puede detectar la presencia de
una enfermedad o la susceptibilidad para una enfermedad, por
ejemplo un tumor. Los ensayos usados para detectar niveles de un
polipéptido de la presente invención en una muestra derivada de un
hospedador son bien conocidos por los expertos en la técnica e
incluyen radioinmunoensayos, ensayos de unión competitiva, análisis
de transferencia Western, ensayos ELISA y ensayos tipo
sandwich. Un ensayo ELISA (Coligan et al., Current
Protocols in Immunology, 1 (2), capítulo 6 (1991)) comprende
inicialmente preparar un anticuerpo específico para un antígeno
Ck\beta-13, preferentemente un anticuerpo
monoclonal. Además se prepara un anticuerpo informador
("reportero") contra el anticuerpo monoclonal. Al anticuerpo
informador se le une un reactivo detectable tal como un reactivo
radiactivo, fluorescente o, en este ejemplo, una enzima peroxidasa
de rábano picante. Se saca una muestra del hospedador y se incuba
en un soporte sólido, p. ej. un disco de poliestireno, que une las
proteínas de la muestra. Cualquier sitio de unión libre de proteína
en el disco es entonces cubierto incubando con una proteína no
específica como BSA. A continuación, el anticuerpo monoclonal se
incuba en el disco, tiempo durante el cual los anticuerpos
monoclonales se unen a cualquier proteína
Ck\beta-13 unida al disco de poliestireno. Todo
el anticuerpo monoclonal no unido se elimina por lavado con tampón.
El anticuerpo informador unido a la peroxidasa de rábano picante se
pone ahora en el disco con el resultado de la unión del anticuerpo
informador a cualquier anticuerpo monoclonal unido al polipéptido
Ck\beta-13. El anticuerpo informador unido se
separa entonces por lavado. Después se añaden al disco sustratos de
peroxidasa y la cantidad de color desarrollada en un periodo de
tiempo dado es una medida de la cantidad de proteína
Ck\beta-13 presente en un volumen dado de muestra
del paciente cuando se compara frente a una curva patrón.
Puede emplearse un ensayo de competición en el
que anticuerpos específicos contra el polipéptido
Ck\beta-13 se fijan a un soporte sólido y el
polipéptido Ck\beta-13 marcado y una muestra
derivada del hospedador se hacen pasar sobre el soporte sólido y la
cantidad de marcador detectado, por ejemplo mediante cromatografía
de centelleo de líquidos, puede correlacionarse con la cantidad de
polipéptido Ck\beta-13 en la muestra.
Un ensayo sandwich es similar a un ensayo
ELISA. En un ensayo sandwich el polipéptido
Ck\beta-13 se hace pasar sobre un soporte sólido y
se une al anticuerpo fijado a un soporte sólido. Después se une un
segundo anticuerpo al polipéptido Ck\beta-13.
Después se hace pasar sobre el soporte sólido un tercer anticuerpo
que está marcado y es específico para el segundo anticuerpo, y se
une al segundo anticuerpo en una cantidad que puede ser determinada
cuantitativamente.
Esta invención proporciona un método para la
identificación de receptores para el polipéptido de la presente
invención. El gen que codifica el receptor puede ser identificado
por numerosos métodos conocidos por los expertos en la técnica, por
ejemplo separación por adsorción de ligando y clasificación de FACS
(Coligan et al., Current Protocols in Immun., 1 (2), capítulo
5 (1991)). Preferentemente se emplea clonación de expresión en
donde el RNA poliadenilado se prepara a partir de una célula
sensible a los polipéptidos, y una genoteca de cDNA creada a partir
de este RNA es dividida en agrupaciones y usada para transfectar
células COS u otras células que no son sensibles a los
polipéptidos. Las células transfectadas que se desarrollan en
portaobjetos de vidrio se exponen a los polipéptidos marcados. Los
polipéptidos pueden marcarse por diversos medios entre los que se
incluye yodación o inclusión de un sitio de reconocimiento para una
proteína quinasa específica del sitio. Después de la fijación e
incubación, los portaobjetos se someten a análisis
autorradiográfico. Los agrupamientos positivos se identifican y se
preparan sub-agrupamientos y se
re-transfectan usando un procedimiento iterativo de
sub-agrupamiento y re-selección,
dando eventualmente un clon o clones individuales que codifican el
receptor putativo.
Como planteamiento alternativo para la
identificación del receptor, los polipéptidos marcados pueden ser
unidos por fotoafinidad con preparados de membrana o extracto
celular que expresan la molécula de receptor. El material
entrecruzado se resuelve mediante análisis por PAGE y se expone a
película para rayos X. El complejo marcado conteniendo los
receptores de los polipéptidos puede ser cortado, resuelto en
fragmentos de péptido y sometido a microsecuenciación de proteínas.
La secuencia de aminoácidos obtenida de la microsecuenciación sería
usada para diseñar un conjunto de sondas de oligonucleótido
degenerado para seleccionar una genoteca de cDNA para identificar
los genes que codifican los receptores putativos.
Esta invención proporciona un método para cribar
o seleccionar compuestos para identificar agonistas y antagonistas
para el polipéptido de la presente invención. Un agonista es un
compuesto que se une y activa a un receptor para el polipéptido de
la presente invención, mientras que los antagonistas se unen e
inhiben tales receptores o simplemente compiten con
Ck\beta-13 por tales receptores. La quimiotaxis
puede ensayarse poniendo células, que son quimioatraídas por el
polipéptido de la presente invención, en la parte superior de un
filtro con poros de diámetro suficiente para admitir las células
(aproximadamente 5 \mum). Soluciones de agonistas potenciales se
ponen en el fondo de la cámara con un medio de control apropiado en
el compartimento superior, y así se mide un gradiente de
concentración del agonista contando las células que migran a la
membrana porosa, o a través de ella, a lo largo del tiempo.
Cuando se ensaya en relación con antagonistas, el
polipéptido de la presente invención se pone en la cámara del fondo
y se añade el antagonista potencial para determinar se si ha
impedido la quimiotaxis de las células.
Alternativamente, se incubaría un preparado de
células de mamífero o membranas que expresan los receptores de los
polipéptido con un polipéptido marcado de la presente invención, p.
ej. con radiactividad, en presencia del compuesto. Entonces podría
medirse la capacidad del compuesto para bloquear esta
interacción.
Los ejemplos de antagonistas potenciales para el
polipéptido de la presente invención incluyen anticuerpos, o en
algunos casos oligonucleótidos, que se unen a los polipéptidos.
Otro ejemplo de un antagonista potencial es un mutante dominante
negativo de los polipéptidos. Los mutantes dominantes negativos son
polipéptidos que se unen al receptor del polipéptido de tipo
silvestre, pero no consiguen conservar actividad biológica.
Las construcciones antisentido preparadas usando
tecnología antisentido son también antagonistas potenciales. La
tecnología antisentido puede ser usada para controlar la expresión
génica mediante formación de triple hélice o DNA o RNA antisentido,
y ambos métodos están basados en la unión de un polinucleótido a
DNA o RNA. Por ejemplo, la porción codificadora 5' de la secuencia
del polinucleótido, que codifica los polipéptidos maduros de la
presente invención, se usa para diseñar un oligonucleótido de RNA
antisentido de aproximadamente 10 a 40 pares de bases de longitud.
Se diseña un oligonucleótido de DNA para que sea complementario de
una región del gen implicada en la transcripción (triple hélice,
véanse Lee et al., Nucl. Acids Res., 6: 3073 (1979); Cooney
et al., Science, 241: 456 (1988); y Dervan et al.,
Science, 251: 1360 (1991)), impidiendo así la transcripción y la
producción del polipéptido de la presente invención. El
oligonucleótido de RNA antisentido se hibrida con el mRNA in
vivo y bloquea la traducción de la molécula de mRNA a los
polipéptidos (antisentido - Okano, J. Neurochem., 56: 560 (1991);
Oligonucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expresion
(oligonucleótidos como inhibidores antisentido de la expresión
génica), CRC Press, Boca Raton, FL (1988)). Los oligonucleótidos
descritos anteriormente pueden también suministrarse a células de
forma que el RNA o DNA antisentido pueden expresarse in vivo
para inhibir la producción del polipéptido de la presente
invención.
Otro antagonista potencial es un derivado
peptídico de los polipéptidos, que es un análogo modificado natural
o sintéticamente del polipéptido que ha perdido la función
biológica pero que aún reconoce y se une a los receptores del
polipéptido para así bloquear eficazmente a los receptores. Los
ejemplos de derivados de péptido incluyen, pero no se limitan a
ellos, péptidos pequeños o moléculas similares a péptidos.
Los antagonistas pueden ser empleados para
inhibir la quimiotaxis y la activación de macrófagos y sus
precursores, y de neutrófilos, basófilos, linfocitos B y algunos
subconjuntos de células T, p. ej. células T citotóxicas activadas y
CD8 y células asesinas naturales, en ciertas enfermedades
infecciosas e inflamatorias autoinmunitarias y crónicas. Los
ejemplos de enfermedades autoinmunitarias incluyen esclerosis
múltiple y diabetes dependiente de la insulina.
Los antagonistas pueden también emplearse para
tratar enfermedades infecciosas entre las que se incluye la
silicosis, sarcoidosis, fibrosis pulmonar idiopática, impidiendo el
reclutamiento y la activación de fagocitos mononucleares. También
pueden emplearse para tratar el síndrome
hiper-eosinofílico idiopático impidiendo la
producción y la migración de eosinófilos. El choque endotóxico
puede también tratarse mediante los antagonistas, impidiendo la
migración de macrófagos y su producción del polipéptido de la
presente invención.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar la aterosclerosis, impidiendo la infiltración de monocitos
en la pared de la arteria.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar reacciones alérgicas mediadas por histamina y trastornos
inmunológicos, entre los que se incluyen reacciones alérgicas en
fase tardía, urticaria crónica, y dermatitis atópica, inhibiendo la
desgranulación mediada por quimiocina de células cebadas y
basófilos y la liberación de histamina. También pueden tratarse
reacciones alérgicas mediadas por IgE, tales como asma alérgica,
rinitis y eczema.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar inflamaciones crónicas y agudas impidiendo la atracción de
monocitos a la zona lesionada. También pueden emplearse para
regular las poblaciones de macrófagos pulmonares normales, ya que
las enfermedades pulmonares inflamatorias crónicas y agudas están
asociadas con el secuestro de fagocitos mononucleares en el
pulmón.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar la artritis reumatoide evitando la atracción de los
monocitos al líquido sinovial dentro de las articulaciones de los
pacientes. El aflujo y la activación de los monocitos desempeña un
papel importante en la patogénesis tanto de las artropatías
degenerativas como de las inflamatorias.
Los antagonistas pueden emplearse para interferir
con las cascadas nocivas atribuidas principalmente a la
IL-1 y al TNF que evita la biosíntesis de otras
citocinas inflamatorias. De esta manera, los antagonistas pueden
emplearse para prevenir la inflamación. Los antagonistas pueden
emplearse también para inhibir la fiebre independiente de la
prostaglandina inducida por quimiocinas.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar casos de insuficiencia de la médula ósea, por ejemplo anemia
aplásica y síndrome mielodisplásico.
Los antagonistas pueden emplearse también para
tratar el asma y la alergia previniendo la acumulación de
eosinófilos en el pulmón. Los antagonistas pueden emplearse también
para tratar la fibrosis de la membrana basal subepitelial, que es
una característica prominente del pulmón asmático.
Los antagonistas pueden emplearse en una
composición con un vehículo aceptable farmacéuticamente, p. ej.,
como se describen más adelante.
El polipéptido de la presente invención y los
agonistas y antagonistas pueden emplearse en combinación con un
vehículo farmacéutico adecuado. Tales composiciones comprenden una
cantidad terapéuticamente efectiva del polipéptido, y un vehículo o
excipiente aceptable farmacéuticamente. Tal vehículo incluye, pero
sin limitarse a ellos, solución salina, solución salina tamponada,
dextrosa, agua, glicerol, etanol y combinaciones de los mismos. La
formulación debe adecuarse al modo de administración.
La invención proporciona también un paquete o
kit farmacéutico que comprende uno o más recipientes que
contienen uno o más de los ingredientes de la composición
farmacéutica de la invención. Junto con dichos recipientes puede
acompañarse un prospecto en la forma prescrita por los organismos
oficiales que regulan la fabricación, el uso o la venta de
productos farmacéuticos o biológicos, el cual prospecto refleja la
aprobación, por el organismo oficial, de la fabricación, uso o
venta para administración a seres humanos. Además, los polipéptidos
y agonistas y antagonistas pueden emplearse junto con otros
compuestos terapéuticos.
Las composiciones farmacéuticas pueden ser
administradas de una manera conveniente tal como por las vías
tópica, intravenosa, intraperitoneal, intramuscular, intratumoral,
subcutánea, intranasal o intradérmica. Las composiciones
farmacéuticas se administran en una cantidad que es efectiva para
el tratamiento y/o la profilaxis de la indicación específica. En
general, los polipéptidos serán administrados en una cantidad de al
menos aproximadamente 10 \mug/kg de peso corporal y en la mayor
parte de los casos será administrada en una cantidad no superior a
aproximadamente 8 mg/kg de peso corporal y por día. En la mayoría
de los casos, la dosificación es de aproximadamente 10 \mug/kg de
peso corporal a aproximadamente 1 mg/kg de peso corporal al día,
teniendo en cuenta las vías de administración, los síntomas,
etc.
El polipéptido de la presente invención, y los
agonistas y antagonistas que son polipéptidos, pueden emplearse de
acuerdo con la presente invención mediante expresión de tales
polipéptidos in vivo, lo que se denomina frecuentemente
"terapia génica".
Así, por ejemplo, las células de un paciente
pueden ser modificadas por ingeniería genética con un
polinucleótido (DNA o RNA) que codifica un polipéptido ex
vivo, siendo después proporcionadas las células modificadas por
ingeniería genética a un paciente al que se ha de tratar con el
polipéptido. Tales métodos son bien conocidos en la técnica. Por
ejemplo, las células pueden ser modificadas por ingeniería genética
por procedimientos conocidos en la técnica, usando una partícula
retroviral que contiene RNA que codifica un polipéptido de la
presente invención.
De un modo similar, las células pueden ser
modificadas por ingeniería genética in vivo para la
expresión de un polipéptido in vivo, por ejemplo mediante
procedimientos conocidos en la técnica. Como es sabido en la
técnica, puede ser administrada a un paciente una célula productora
para producir una partícula retroviral que contiene RNA que
codifica el polipéptido de la presente invención para modificar por
ingeniería genética células in vivo. Estos y otros métodos
para administrar un polipéptido de la presente invención por tal
método deben ser evidentes para los expertos en la técnica a partir
de las enseñanzas de la presente invención. Por ejemplo, el vehículo
de expresión para modificar células por ingeniería química puede
ser distinto de un retrovirus, por ejemplo un adenovirus que puede
ser usado para modificar células por ingeniería química in
vivo después de la combinación con un vehículo de suministro
adecuado.
Los retrovirus a partir de los cuales pueden
derivarse los vectores de plásmido retroviral antes mencionados
incluyen, pero sin limitarse a ellos, el virus de la leucemia
murina de Moloney, virus de la necrosis del bazo, retrovirus tales
como el virus del sarcoma de Rous, virus del sarcoma de Harvey,
virus de la leucosis aviar, virus de la leucemia del mono gibón,
virus de la inmunodeficiencia humana, adenovirus, virus del sarcoma
mieloproliferativo, y virus del tumor de mama. En una realización,
el vector de plásmido retroviral se deriva del virus de la leucemia
murina de Maloney.
El vector incluye uno o más promotores. Los
promotores adecuados que pueden ser empleados incluyen, pero sin
limitarse a ellos, el LTR retroviral; el promotor de SV40; y el
promotor de citomegalovirus humano (CMV) descrito en Miller et
al., Biotechniques, vol. 7, nº 9, 980-990
(1989), o cualquier otro promotor (p. ej. promotores celulares
tales como promotores celulares eucarióticos que incluyen, pero sin
limitarse a ellos, los promotores histona, pol III y
\beta-actina). Otros promotores virales que pueden
emplearse incluyen, pero sin limitarse a ellos, promotores de
adenovirus, promotores de timidina quinasa (TK) y promotores de
parvovirus B19. La selección de un promotor adecuado será evidente
para los expertos en la técnica a partir de las enseñanzas
contenidas en el presente texto.
La secuencia de ácidos nucleicos que codifica el
polipéptido de la presente invención está bajo el control de un
promotor adecuado. Los promotores adecuados que pueden emplearse
incluyen, pero sin limitarse a ellos, promotores adenovirales tales
como el promotor tardío principal adenoviral; o promotores
heterólogos tales como el promotor del citomegalovirus (CMV); el
promotor del virus sincitial respiratorio (RSV); promotores
inducibles tales como el promotor MMT, el promotor de
metalotioneína; promotores del choque térmico; el promotor de la
albúmina; el promotor ApoAI; promotores de la globina humana;
promotores virales de timidina quinasa tales como el promotor de la
timidina quinasa del herpes simplex; LTRs retrovirales (incluyendo
los LTRs retrovirales modificados descritos anteriormente); el
promotor de \beta-actina; y promotores de la
hormona del crecimiento humana. El promotor puede ser también el
promotor nativo que controla los genes que codifican los
polipéptidos.
El vector de plásmido retroviral se emplea para
transducir las línes de células empaquetadoras (packaging
cells) para formar líneas de células productoras. Los ejemplos
de células empaquetadoras que pueden ser transfectadas incluyen,
pero sin limitarse a ellas, las líneas de células PE501, PA317,
\psi-2, \psi-AM, PA12,
T19-14X,
VT-19-17-H2,
\psi-CRE, \psi-CRIP,
GP+E-86, GP+envAm12 y DAN, como se describe en
Miller, Human Gene Therapy, vol. 1, p. 5-14
(1990).
El vector puede transducir las células
empaquetadoras por cualquier medio conocido en la técnica. Entre
estos medios se incluye, pero sin limitarse a ellos,
electroporación, el uso de liposomas, y precipitación con
CaPO_{4}. En una alternativa, el vector de plásmido retroviral
puede ser encapsulado en un liposoma, o acoplado a un lípido, y
después administrado a un hospedador.
La línea de células productoras genera partículas
infecciosas de vector retroviral que incluyen la secuencia o
secuencias de ácidos nucleicos que codifican los polipéptidos.
Tales partículas de vector retroviral pueden emplearse entonces
para transducir células eucariotas, bien sea in vitro o bien
in vivo. Las células eucariotas transducidas expresarán la
secuencia o secuencias de ácidos nucleicos que codifican el
polipéptido. Las células eucariotas que pueden ser transducidas
incluyen, pero sin limitarse a ellas, células troncales (células
madre) embrionarias, células embrionarias de carcinoma, así como
células troncales hematopoiéticas, hepatocitos, fibroblastos,
mioblastos, queratinocitos, células endoteliales, y células
epiteliales bronquiales.
Las secuencias de la presente invención son
también valiosas para la identificación de cromosomas. La secuencia
está especialmente dirigida a una posición particular de un
cromosoma humano individual, y puede hibridarse con ella. Además,
actualmente existe la necesidad de identificar sitios particulares
en el cromosoma. Actualmente se dispone de pocos reactivos
marcadores de cromosomas basados en datos reales de secuencia
(polimorfismos de repetición) para marcar la posición cromosómica.
El cartografiado de DNAs a cromosomas de acuerdo con la presente
invención es un importante primer paso en la correlación de esas
secuencias con genes asociados con una enfermedad.
Brevemente, las secuencias pueden ser
cartografiadas en cromosomas preparando cebadores de PCR
(preferentemente de 15-25 pb) a partir del cDNA. El
análisis informático de la región no traducida 3' se usa para
seleccionar rápidamente cebadores que no abarquen más de un exón en
el DNA genómico, complicando así el proceso de amplificación. Estos
cebadores se usan después para la selección por PCR de híbridos de
células somáticas que contienen cromosomas humanos individuales.
Solamente los híbridos que contienen el gen humano correspondiente
al cebador darán un fragmento amplificado.
El cartografiado por PCR de híbridos de células
somáticas es un procedimiento rápido para asignar un DNA particular
a un cromosoma particular. Usando la presente invención con los
mismos cebadores de oligonucleótido, puede conseguirse la
sublocalización con paneles de fragmentos procedentes de cromosomas
específicos o agrupamientos de grandes clones genómicos de una
manera análoga. Otras estrategias de cartografiado que pueden
usarse igualmente para cartografiar su cromosoma incluyen la
hibridación in situ, la preselección con cromosomas marcados
clasificados por flujo (flow sorted) y preselección por
hibridación para construir genotecas de cDNA específicas del
cromosoma.
La hibridación in situ fluorescente (FISH)
de uno o más clones de cDNA con una diseminación cromosómica en
metafase puede usarse para proporcionar una localización
cromosómica precisa en una etapa. Esta técnica puede usarse con
cDNA tan corto como 500 o 600 bases. Para una revisión de esta
técnica, véase Verma et al., Human Chromosomes: a Manual
of Basic Techniques, Pergamon Press, Nueva York (1988).
Una vez que una secuencia ha sido cartografiada a
una localización cromosómica precisa, la posición física de la
secuencia en el cromosoma puede correlacionarse con los datos del
mapa genético. Tales datos se encuentran, por ejemplo, en V.
McKusick, Mendelian Inheritance in Man (disponible en línea a
través de Johns Hopkins University Welch Medical Library). La
relación entre genes y enfermedades que han sido cartografiadas con
la misma región cromosómica son entonces identificadas mediante
análisis de unión (co-herencia de genes adyacentes
físicamente).
A continuación, es necesario determinar las
diferencias en la secuencia de cDNA o genómica entre los individuos
afectados y no afectados. Si se observa una mutación en algunos o
todos los individuos afectados pero no en cualquier individuo
normal, es entonces probable que la mutación sea el agente causante
de la enfermedad.
Con la actual resolución de las técnicas de
cartografiado físico y cartografiado genético, un cDNA localizado
precisamente en una región cromosómica asociada con la enfermedad
podría ser uno entre 50 y 500 genes causantes potenciales (esto
supone una resolución de cartografiado de 1 megabase y un gen por
cada 20 kb).
Los polipéptidos, sus fragmentos u otros
derivados, o análogos de los mismos, o células que los expresan,
pueden ser usados como inmunógeno para producir anticuerpos contra
ellos. Estos anticuerpo pueden ser, por ejemplo, anticuerpos
policlonales o monoclonales. La presente invención incluye también
anticuerpos quiméricos, de cadena simple y humanizados, así como
fragmentos Fab, o el producto de una genoteca de expresión de Fab.
Pueden usarse varios procedimientos conocidos en la técnica para la
producción de tales anticuerpos y fragmentos.
Los anticuerpos generados contra los polipéptidos
que corresponden a una secuencia de la presente invención pueden
ser obtenidos por inyección directa de los polipéptidos a un
animal, o administrando los polipéptidos a un animal,
preferentemente no humano. El anticuerpo así obtenido se unirá
entonces él mismo a los polipéptidos. De esta manera, incluso una
secuencia que codifica solamente un fragmento de los polipéptidos
puede ser usada para generar anticuerpos que se unen a los
polipéptidos nativos completos. Tales anticuerpos pueden usarse
entonces para aislar los polipéptidos del tejido que expresa ese
polipéptido.
Para la preparación de anticuerpos monoclonales,
puede usarse cualquier técnica que proporcione anticuerpos
producidos por cultivos de líneas celulares continuas. Los ejemplos
incluyen la técnica de hibridoma (Kohler y Mildstein, 1975, Nature,
256: 495-497), la técnica de trioma, la técnica de
hibridoma de células B humanas (Kozbor et al., 1983,
Immunology Today 4:72), y la técnica de hibridoma de EBV para
producir anticuerpos monoclonales humanos (Cole et al.,
1985, en Monoclonal Antibodies and Cancer Therapie, Alan R. Liss,
Inc., p. 77-96).
Las técnicas descritas para la producción de
anticuerpos de cadena simple (patente de EE.UU. nº 4.946.778) puede
adaptarse para producir anticuerpos de cadena simple contra
productos de polipéptido inmunógenos de esta invención.
La presente invención se describirá con más
detalle con referencia a los ejemplos que siguen; sin embargo, se
ha de entender que la presente invención no está limitada a tales
ejemplos. Todas las partes y cantidades, a menos que se especifique
otra cosa, son en peso.
Para facilitar la comprensión de los ejemplos que
siguen, se describen ciertos métodos y/o términos que se presentan
frecuentemente.
Los "plásmidos" se designan mediante un p
minúscula precedida y/o seguida por letras mayúsculas y/o números.
Los plásmidos de partida en el presente texto son disponibles
comercialmente, o son disponibles públicamente sobre una base no
restringida, o bien pueden ser construidos a partir de plásmidos
disponibles de acuerdo con procedimientos publicados. Además,
plásmidos equivalentes a los descritos son conocidos en la técnica
y serán evidentes para un profesional con una experiencia
normal.
La "digestión" de DNA se refiere a la
segmentación catalítica del DNA con una enzima de restricción que
actúa solamente en determinadas secuencias del DNA. Las diversas
enzimas de restricción usadas aquí son disponibles comercialmente y
sus condiciones de reacción, cofactores y otros requerimientos
fueron usados de forma conocida por un profesional con experiencia
normal en la técnica. Para fines analíticos, típicamente se usa 1
\mug de plásmido o fragmento de DNA con aproximadamente 2
unidades de enzima en aproximadamente 20 \mul de solución tampón.
Con el fin de aislar fragmentos de DNA para la construcción de
plásmidos, típicamente se digieren de 5 a 50 \mug de DNA con 20 a
250 unidades de enzima en un volumen mayor. Los tampones y
cantidades de sustrato apropiadas para enzimas de restricción en
particular vienen especificados por el fabricante. Normalmente se
usan tiempos de incubación de aproximadamente 1 hora a 37ºC, pero
pueden variar de acuerdo con las instrucciones del suministrador.
Después de la digestión la mezcla de reacción se somete
directamente a electroforesis en un gel de poliacrilamida para
aislar el fragmento deseado.
La separación por tamaño de los fragmentos
segmentados se lleva a cabo usando gel de poliacrilamida al 8%
descrito por Goeddel, D. et al., Nucleic Acids Res., 8: 4057
(1980).
"Oligonucleótidos" se refiere a un
polidesoxinucleótido de cadena simple o bien a dos cadenas
complementarias de polidesoxinucleótido que pueden sintetizarse
químicamente. Tales oligonucleótidos sintéticos no tienen 5'
fosfato y por tanto no se ligarán a otro oligonucleótido sin añadir
un fosfato con un ATP en presencia de una quinasa. Un
oligonucleótido sintético se ligará a un fragmento que no haya sido
desfosforilado.
"Ligación" se refiere al proceso de
formación de uniones fosfodiéster entre dos fragmentos de ácido
nucleico de doble cadena (Maniatis, T., et al., Id. p. 146).
A menos que se provea otra cosa, la ligación puede realizarse
usando tampones y condiciones conocidas con 10 unidades T4 DNA
ligasa ("ligasa") por 0,5 \mug de cantidades aproximadamente
equimolares de los fragmentos de DNA que se han de ligar.
A menos que se indique otra cosa, la
transformación se realiza como se describe en el método de Graham,
F. y Van der Eb, A., Virology, 52: 456-457
(1973).
La secuencia de DNA que codifica
Ck\beta-13, ATCC nº 97113, se amplifica (se
multiplica) inicialmente usando cebadores de oligonucleótido para
PCR correspondientes a las secuencias terminales 5' y 3' de la
secuencia de ácidos nucleicos de Ck\beta-13
procesada (menos la secuencia del péptido señal putativo). Se
añaden nucleótidos adicionales correspondientes al gen Ck\beta- 13
a las secuencias terminales 5' y 3' respectivamente. El cebador de
oligonucleótido 5' tiene la secuencia 5' CCCGCATGCCCAACATGGAAGACAG
3' (SEQ ID Nº: 3) contiene un sitio para enzima de restricción SphI
(en negrita) seguido por 16 nucleótidos de la secuencia
codificadora de Ck\beta-13 partiendo del segundo
nucleótido de la secuencia que codifica la proteína madura. El codón
ATG está incluido en el sitio SphI. En el siguiente codón después
del ATG, la primera base es a partir del sitio SphI y las dos bases
restantes corresponden a la segunda y tercera bases del primer codón
(resto 29) de la proteína madura putativa. La 3' secuencia 5'
AAAGGATCCTTGGCTCAGCTTATTGAG 3' (SEQ ID Nº: 4) contiene secuencias
complementarias respecto a un sitio BamH1 (en negrita) y está
seguida por 18 nucleótidos de secuencias específicas del gen que
preceden al codón de terminación. Los sitios para la enzima de
restricción corresponden a los sitios para la enzima de restricción
en el vector de expresión bacteriano pQE-9 (Qiagen,
Inc. Chatsworth, CA). El vector pQE-9 codifica la
resistencia al antibiótico (Amp'), un origen de replicación
bacteriano (ori), un operador promotor regulable por IPTG (P/O), un
sitio de unión con el ribosoma (RBS), una etiqueta
6-His y sitios de enzima de restricción. El
pQE-9 se digiere después con SphI y BamH1. Las
secuencias amplificadas se ligan en pQE-9 y se
insertan en marco con la secuencia que codifica la etiqueta de
histamina y el RBS. La mezcla de ligación se usa después para
transformar la cepa de E. coli M15/rep 4 (Qiagen, Inc.) por
el procedimiento descrito por Sambrook, J. et al., Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989).
M15/rep4 contiene múltiples copias del plásmido pREP4, que expresa
el represor lacI y también confiere resistencia a la kanamicina
(Kan'). Los transformantes se identifican por su capacidad para
desarrollarse en placas LB y se seleccionan las colonias
resistentes a la ampicilina/kanamicina. El DNA del plásmido se aísla
y se confirma por análisis de restricción. Los clones que contienen
las construcciones deseadas se desarrollan durante la noche (O/N)
en cultivo líquido en medio LB suplementado tanto con Amp (100
ug/ml) como con Kan (25 ug/ml). El cultivo O/N se usa para inocular
un cultivo grande a razón de 1:100 a 1:250. Las células se
desarrollan hasta una densidad óptica a 600 nm (OD^{600}) entre
0,4 y 0,6. Después se añade IPTG
("isopropil-\beta-D-tiogalactopiranósido")
hasta una concentración final de 1 mM. El IPTG induce inactivando
al represor lacI, aclarando el P/O dando lugar a una expresión
génica incrementada. Las células se desarrollan otras 3 ó 4 horas
más. Después se recolectan las células por centrifugación. El
sedimento celular se solubiliza en el agente caotrópico guanidina
HCl 6 molar pH 5,0. Después de clarificar, la
Ck\beta-13 solubilizada se purifica de esta
solución mediante cromatografía en una columna de
níquel-quelato bajo condiciones que permiten la
unión estrecha mediante proteínas que contienen la etiqueta
6-His (Hochuli, E. et al., J. Chromatography
411: 177-184 (1984)). La
Ck\beta-13 (más del 98% de pureza) es eluida de
la columna en guanidina HCl 6M. La renaturalización de la proteína
fuera de GnHCl puede realizarse mediante varios protocolos
(Jaenicke, R. y Rudolph, R., Protein Structure - A Practical
Approach, IRL Press, Nueva York (1990)). Inicialmente, se utiliza
diálisis en etapas para eliminar el GnHCl. Alternativamente la
proteína purificada aislada de la columna de
Ni-quelato puede unirse a una segunda columna sobre
la que corre un gradiente lineal decreciente de GnHCl. La proteína
se deja renaturalizar mientras está unida a la columna y
subsiguientemente se eluye con un tampón que contiene imidazol 250
mM, NaCl 150 mM, Tris-HCl 25 mM pH 7,5 y 10% de
glicerol. Finalmente, la proteína soluble se dializa frente un
tampón de almacenamiento que contiene bicarbonato amónico 5 mM.
La expresión del plásmido,
Ck\beta-13 HA se deriva de un vector pcDNAI/Amp
(Invitrogen) que contiene: 1) origen de replicación de SV40, 2) gen
de resistencia a la ampicilina, 3) origen de replicación de E.
coli, 4) promotor de CMV seguido por una región de
polienlazador, un intrón de SV40 y sitio de poliadenilación. Un
fragmento de DNA que codifica el precursor de
Ck\beta-13 entero y una etiqueta HA fusionada en
marco a su extremo 3', es clonado en la región de polienlazador del
vector, y por tanto la expresión de la proteína recombinante es
dirigida bajo el promotor de CMV. La etiqueta HA corresponde a un
epítopo derivado a partir de la proteína hemaglutinina de la
influenza como se ha descrito anteriormente (I. Wilson, H. Niman, R.
Heighten, A. Cherenson, M. Connolly y R. Lerner, 1984, Cell 37,
767). La infusión de etiqueta HA a la proteína diana permite la
fácil detección de la proteína recombinante con un anticuerpo que
reconoce el epítopo de HA.
La estrategia de construcción del plásmido se
describe de la forma siguiente:
La secuencia de DNA que codifica
Ck\beta-13, ATCC nº 97113, se construye mediante
PCR usando
dos cebadores: el 5' cebador 5' AAAAAGCTTAACA
TAGGCTCGCCTACAGACT 3' (SEQ ID Nº: 5) con-
tiene un sitio HindIII seguido por 18 nucleótidos
de la secuencia codificadora de Ck\beta-13 partien-
do de la posición menos 3 relativa al codón de iniciación; la secuencia 3' 5'CGCTCTAGATTAAGCGTA
GTCTGGGACGTCGTATGGGTATTGGCTCAGCT
TATTGAGAAT 3' (SEQ ID Nº: 6) contiene secuencias complementarias a un sitio XbaI, codón de parada de la traducción (subrayado), etiqueta HA y los últimos 21 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-13 (no incluyendo el codón de parada). Por tanto, el producto de la PCR contiene un sitio HindIII, secuencia codificadora de Ck\beta-13 seguida por la etiqueta HA fusionada en marco, un codón de parada para terminación de la traducción a continuación de la etiqueta HA, y un sitio XbaI. El fragmento de DNA amplificado por PCR y el vector, pcDNA3/Amp, se digieren con enzima de restricción HindIII y XbaI y se ligan. La mezcla de ligación se transforma en la cepa de E. coli SURE (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA), el cultivo transformado se cultiva en placas con medio de ampicilina y se seleccionan las colonias resistentes. El DNA de plásmido se aisla de los transformantes y se examina por análisis de restricción para ver la presencia del fragmento correcto. Para la expresión del polipéptido Ck\beta-13 recombinante, las células COS son transfectadas con el vector de expresión por el método DEAE-DEXTRANO (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989)). La expresión de la proteína Ck\beta-13 HA se detecta por métodos de radiomarcaje e inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1988)). Las células se marcan durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Después se recogen los medios de cultivo y las células se lisan con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, 1% de NP-40, 0,1% de SDS, 1% de NP-40, 0,5% de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5) (Wilson, I. et al., Id. 37: 767 (1984)). Tanto el lisado de células como el medio de cultivo se precipitan con anticuerpo monoclonal específico para HA. Las proteínas precipitadas se analizan mediante SDS-PAGE.
dos cebadores: el 5' cebador 5' AAAAAGCTTAACA
TAGGCTCGCCTACAGACT 3' (SEQ ID Nº: 5) con-
tiene un sitio HindIII seguido por 18 nucleótidos
de la secuencia codificadora de Ck\beta-13 partien-
do de la posición menos 3 relativa al codón de iniciación; la secuencia 3' 5'CGCTCTAGATTAAGCGTA
GTCTGGGACGTCGTATGGGTATTGGCTCAGCT
TATTGAGAAT 3' (SEQ ID Nº: 6) contiene secuencias complementarias a un sitio XbaI, codón de parada de la traducción (subrayado), etiqueta HA y los últimos 21 nucleótidos de la secuencia codificadora de Ck\beta-13 (no incluyendo el codón de parada). Por tanto, el producto de la PCR contiene un sitio HindIII, secuencia codificadora de Ck\beta-13 seguida por la etiqueta HA fusionada en marco, un codón de parada para terminación de la traducción a continuación de la etiqueta HA, y un sitio XbaI. El fragmento de DNA amplificado por PCR y el vector, pcDNA3/Amp, se digieren con enzima de restricción HindIII y XbaI y se ligan. La mezcla de ligación se transforma en la cepa de E. coli SURE (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA), el cultivo transformado se cultiva en placas con medio de ampicilina y se seleccionan las colonias resistentes. El DNA de plásmido se aisla de los transformantes y se examina por análisis de restricción para ver la presencia del fragmento correcto. Para la expresión del polipéptido Ck\beta-13 recombinante, las células COS son transfectadas con el vector de expresión por el método DEAE-DEXTRANO (J. Sambrook, E. Fritsch, T. Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1989)). La expresión de la proteína Ck\beta-13 HA se detecta por métodos de radiomarcaje e inmunoprecipitación (E. Harlow, D. Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Laboratory Press, (1988)). Las células se marcan durante 8 horas con ^{35}S-cisteína dos días después de la transfección. Después se recogen los medios de cultivo y las células se lisan con detergente (tampón RIPA (NaCl 150 mM, 1% de NP-40, 0,1% de SDS, 1% de NP-40, 0,5% de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5) (Wilson, I. et al., Id. 37: 767 (1984)). Tanto el lisado de células como el medio de cultivo se precipitan con anticuerpo monoclonal específico para HA. Las proteínas precipitadas se analizan mediante SDS-PAGE.
La secuencia de DNA que codifica la proteína
Ck\beta-13 de longitud completa, ATCC nº 97113,
se amplifica usando cebadores de oligonucleótido para PCR
correspondientes a las secuencias 5' y 3' del gen:
El cebador 5' tiene la secuencia 5'
AAAGGAT
CCGCCACCATGGCTCGCCTACAGACT 3' (SEQ
ID Nº: 7) y contiene un sitio para la enzima de restricción BamHI (en negrita) seguido por 6 nucleótidos que parecen una señal eficiente para la iniciación de la traducción en células eucarióticas (Kozak, M., J. Mol. Biol., 196: 947-950 (1987)) y los 18 primeros nucleótidos del gen Ck\beta-13 (el codón de iniciación para la traducción "ATG" está subrayado).
CCGCCACCATGGCTCGCCTACAGACT 3' (SEQ
ID Nº: 7) y contiene un sitio para la enzima de restricción BamHI (en negrita) seguido por 6 nucleótidos que parecen una señal eficiente para la iniciación de la traducción en células eucarióticas (Kozak, M., J. Mol. Biol., 196: 947-950 (1987)) y los 18 primeros nucleótidos del gen Ck\beta-13 (el codón de iniciación para la traducción "ATG" está subrayado).
El cebador 3' tiene la secuencia 5'
AAAGGTACCTCATTGGCTCAGCTTATT 3' (SEQ ID Nº: 8) y contiene el sitio de
segmentación para la endonucleasa de restricción Asp718 y 18
nucleótidos complementarios a la secuencia no traducida 3' del gen
Ck\beta-13. Las secuencias amplificadas se aíslan
de un gel de 1% de agarosa usando un kit disponible
comercialmente ("Geneclean", BIO 101 Inc., La Jolla, Ca.). El
fragmento se digiere después con las endonucleasas BamHI y Asp718 y
después se purifican otra vez en un gel de 1% de agarosa. Este
fragmento se designa F2.
El vector pRG1 (modificación del vector pVL941,
que se discute más adelante) se usa para la expresión de la
proteína Ck\beta-13 usando el sistema de
expresión de baculovirus (para una revisión véase: Summers, M. D. y
Smith, G. E., 1987, A manual of methods for baculovirus vectors and
insect cell culture procedures, Texas Agricultural Experimental
Station Bulletin nº: 1555). Este vector de expresión contiene el
promotor fuerte de polihedrina del virus de la polihedrosis nuclear
de la Autographa californica (AcMNPV) seguido por los sitios de
reconocimiento para las endonucleasas de restricción BamHI y Asp718.
El sitio de poliadenilación del virus de simio (SV)40 se usa
para una poliadenilación eficiente. Para una fácil selección de
virus recombinantes, el gen de la
beta-galactosidasa de E. coli es insertado en
la misma orientación que el promotor de polihedrina seguido por la
señal para la poliadenilación del gen de la polihedrina. Las
secuencias de la polihedrina están flanqueadas en ambos lados por
secuencias virales para la recombinación homóloga mediada por la
célula de DNA viral de tipo silvestre
co-transfectado. Podrían usarse otros muchos
vectores de baculovirus en vez de pRG1, tales como pAc373, pVL941 y
pACIM1 (Luckow, V. A, y Summers, M. D., Virology, 170:
31-39).
El plásmido es digerido con las enzimas de
restricción BamHI y Asp718 y después es desfosforilado usando
fosfatasa intestinal de ternera, por procedimientos conocidos en la
técnica. Después se aísla el DNA de un gel de 1% de agarosa usando
el kit disponible comercialmente ("Geneclean" BIO 101
Inc., La Jolla, Ca.). Este DNA vector se designa V2.
El fragmento F2 y el plásmido desfosforilado V2
son ligados con DNA ligasa de T4. Las células HB101 de E.
coli son después transformadas y se identifican las bacterias
que contenían el plásmido
(pBac-Ck\beta-13) con el gen
Ck\beta-13 usando las enzimas BamHI y Asp718. La
secuencia del fragmento clonado se confirma mediante secuenciación
del DNA.
Se co-transfectan 5 \mug del
plásmido pBac-Ck\beta-13 con 1,0
\mug de un baculovirus linealizado disponible comercialmente
("BaculoGold™ baculovirus DNA", Pharmingen, San Diego, CA.)
usando el método de lipofección (Felgner et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 84: 7413-7417 (1987)).
Se mezclan 1 \mug de DNA de baculovirus
BaculoGold™ y 5 \mug del plásmido
pBac-Ck\beta-13 en un pocillo
estéril de una placa de microtítulo que contiene 50 \mul de medio
de Grace libre de suero (Life Technologies Inc., Gaithersburg, MD).
Después se añaden 10 \mul de lipofectina más 90 \mul de medio
de Grace, se mezcla y se incuba durante 15 minutos a temperatura
ambiente. Después, la mezcla de transfección se añade gota a gota a
las células de insecto Sf9 (ATCC CRL 1711) sembradas en una placa
de cultivo de tejidos de 35 mm con 1 ml de medio de Grace sin
suero. La placa se bambolea hacia atrás y hacia delante para
mezclar la solución recién añadida. Después se incuba la placa
durante 5 horas a 27ºC. Al cabo de 5 horas la solución de
transfección se retira de la placa y se añade 1 ml de medio de Grace
para insectos suplementado con 10% de suero de ternera fetal. La
placa se pone de nuevo en un incubador y el cultivo
continúa a 27ºC durante cuatro días.
continúa a 27ºC durante cuatro días.
Al cabo de cuatro días, se recoge el sobrenadante
y se lleva a cabo un ensayo en placas similar al descrito por
Summers y Smith (supra). Como modificación se usa un gel de
agarosa con "Blue Gal" (Life Technologies Inc., Gaithersburg)
que permite un fácil aislamiento de las placas teñidas de azul.
(Una descripción detallada de un "ensayo en placa" puede
encontrarse también en la guía del usuario para cultivo de células
de insectos y baculovirología distribuida por Life Technologies
Inc., Gaithersburg, páginas 9 y 10).
Cuatro días después de la dilución en serie, los
virus se añaden a las células y las placas teñidas de azul se pican
con la punta de una pipeta Eppendorf. El agar que contiene los
virus recombinantes se resuspende después en un tubo Eppendorf que
contiene 200 \mul de medio de Grace. El agar se elimina mediante
una breve centrifugación y el sobrenadante conteniendo los
baculovirus recombinantes se usa para infectar células Sf9
sembradas en discos de 35 mm. Cuatro días después los sobrenadantes
de estos discos de cultivo se recolectan y se almacenan a 4ºC.
La células Sf9 se desarrollan en medio de Grace
suplementado con 10% de FBS inactivado térmicamente. Las células se
infectan con los baculovirus recombinantes
V-Ck\beta13 a una multiplicidad de infección (MOI)
de 2. Seis horas más tarde el medio se elimina y se reemplaza con
medio SF900 II más metionina y cisteína (Life Technologies Inc.,
Gaithersburg). 42 horas más tarde se añaden 5 \muCi de
^{35}S-metionina y 5 \muCi de
^{35}S-cisteína (Amersham). Las células se siguen
incubando durante 16 horas antes de recolectarlas por centrifugación
y las proteínas marcadas se visualizan mediante
SDS-PAGE y autorradiografía.
Se obtienen fibroblastos de un sujeto mediante
biopsia de la piel. El tejido resultante se pone en medio para
cultivo de tejidos y se separa en porciones pequeñas. Se ponen
trozos pequeños del tejido sobre la superficie húmeda de un matraz
de cultivo de tejidos; aproximadamente se ponen diez piezas en cada
matraz. El matraz se voltea de arriba a abajo, se cierra
herméticamente y se deja a temperatura ambiente durante la noche.
Después de 24 a temperatura ambiente, el matraz se invierte y los
trozos de tejido quedan fijados al fondo del matraz y se añade medio
fresco (p. ej. medio F12 de Ham, con 10% de FBS, penicilina y
estreptomicina). Después se incuba a 37ºC durante aproximadamente
una semana. Al cabo de ese tiempo se añade medio fresco y se cambia
posteriormente cada varios días. Después de otras dos semanas en
cultivo, surge una monocapa de fibroblastos. La monocapa es
tripsinada y se pasa en escamas a matraces más grandes.
El pMV-7 (Kirschmeier, P. T.
et al., DNA, 7: 219-25 (1988)) flanqueado
por las repeticiones terminales largas del virus del sarcoma de
Moloney, se digiere con EcoRI y HindIII y subsiguientemente se
trata con fosfatasa intestinal de ternera. El vector lineal se
fracciona en gel de agarosa y se purifica usando esferas de
vidrio.
El cDNA que codifica un polipéptido de la
presente invención es amplificado usando cebadores de PCR que
corresponden a las secuencias terminales 5' y 3' respectivamente.
El cebador 5' que contiene un sitio EcoRI y el cebador 3' incluye
además un sitio HindIII. Se mezclan cantidades iguales del esqueleto
lineal del virus del sarcoma murino de Moloney y el fragmento
amplificado EcoRI y HindIII en presencia DNA ligasa de T4. La
mezcla resultante se mantiene bajo condiciones apropiadas para la
ligación de los dos fragmentos. La mezcla de ligación se usa para
transformar bacterias HB101, que después se ponen en placa sobre
agar con kanamicina con el fin de confirmar que el vector tenía el
gen de interés apropiadamente insertado.
El pA317 anfotrópico o células empaquetadoras
GP+am12 se desarrollan en cultivo de tejidos hasta densidad de
confluencia en medio de Eagle modificado por Dulbecco (DMEM) con
10% de suero de ternera (CS), penicilina y estreptomicina. El
vector MSV que contiene el gen se añade después al medio y las
células empaquetadoras son transducidas con el vector. Las células
empaquetadoras producen ahora partículas virales infecciosas que
contienen el gen (las células empaquetadoras se denominan ahora
células productoras).
Se añade medio fresco a las células productoras
transducidas y subsiguientemente el medio se recolecta de una placa
de 10 cm de células productoras confluentes. El medio usado, que
contiene las partículas virales infecciosas, se filtra a través de
un filtro millipore para eliminar las células productoras
desprendidas y este medio se usa después para infectar células de
fibroblasto. Se elimina el medio de una placa
sub-confluente de fibroblastos y rápidamente se le
reemplaza con el medio procedente de las células productoras. Este
medio se elimina y se reemplaza con medio fresco. Si el título del
virus es elevado, entonces prácticamente todos los fibroblastos
estarán infectados y no se requerirá selección. Si es título es muy
bajo, es necesario entonces usar un vector retroviral que tenga un
marcador seleccionable, tal como neo o his.
Los fibroblastos construidos por ingeniería
genética se inyectan entonces en el hospedador, bien sea solos o
después de haber sido desarrollados hasta confluencia en esferas
microportadoras cytodex 3. Los fibroblastos producen ahora el
producto de proteína.
Numerosas modificaciones y variaciones de la
presente invención son posibles a la luz de las anteriores
enseñanzas y, por consiguiente, dentro del alcance de las
reivindicaciones anexas, la invención puede llevarse a la práctica
de manera distinta a la descrita en particular.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: LI ET AL.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TITULO DE LA INVENCIÓN: QUIMIOCINA HUMANA BETA 13
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NUMERO DE SECUENCIAS: 8
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCION PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: HUMAN GENOME SCIENCES, INC.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 9410 KEY WEST AVENUE
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: ROCKVILLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: MD
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAIS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CP: 20850
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disco blando
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: Patent In Release 1.0, versión 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NUMERO DE SOLICITUD: 95 92 3767.8-
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 6 de junio de 1995
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACION:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Vossius and Partner
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NUMERO DE REGISTRO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NUMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: B2960 EPS3
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACION PARA TELECOMUNICACIÓN
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELEFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FAX:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 282 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 93 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCGCATGCC CAACATGGAA GACAG
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGATCCT TGGCTCAGCT TATTGAG
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAAAGCTTA ACATAGGCTC GCCTACAGAC T
\hfill31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 60 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCTCTAGAT TAAGCGTAGT CTGGGACGTC GTATGGGTAT TGGCTCAGCT TATTGAGAAT
\hfill60
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D):
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGATCCG CCACCATGGC TCGCCTACAG ACT
\hfill33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGTACCTC ATTGGCTCAG CTTATT
\hfill26
Claims (21)
1. Un polinucleótido elegido entre el grupo
formado por:
- (a)
- polinucleótidos que codifican al menos la forma madura del polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos deducida que se muestra en la SEQ ID Nº: 2;
- (b)
- polinucleótidos que tienen la secuencia codificadora que se muestra en la SEQ ID Nº: 1, que codifica al menos la forma madura del polipéptido;
- (c)
- polinucleótidos que codifican el polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de al menos la forma madura del polipéptido codificado por el cDNA contenido en ATCC 97113;
- (d)
- polinucleótidos que tienen la secuencia codificadora del cDNA contenido en ATCC 97113, que codifica al menos la forma madura del polipéptido;
- (e)
- polinucleótidos que codifican un fragmento de un polipéptido codificado por un polinucleótido según uno cualquiera de los apartados (a) a (d), en donde dicho fragmento tiene actividad quimiotáctica;
- (f)
- polinucleótidos que codifican un fragmento de polipéptido de al menos 30 o al menos 50 restos de aminoácidos de un polipéptido codificado por un polinucleótido según uno cualquiera de los apartados (a) a (d), en donde dicho fragmento tiene actividad quimiotáctica; y
- (g)
- polinucleótidos al menos un 70% idénticos a un polinucleótido como se define en uno cualquiera de los apartados (a) a (f), y que codifica un polipéptido que tiene actividad quimiotáctica;
o la cadena complementaria de dicho
polinucleótido.
2. El polinucleótido según la reivindicación 1ª,
que es DNA.
3. El DNA según la reivindicación 2ª, que es DNA
genómico.
4. El polinucleótido según la reivindicación 1ª,
que es RNA.
5. Un vector que contiene el polinucleótido según
una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª.
6. El vector según la reivindicación 5ª, en el
que el polinucleótido está unido operativamente a secuencias de
control de la expresión que permiten la expresión en células
hospedadoras procarióticas o eucarióticas.
7. Una célula hospedadora construida mediante
ingeniería genética con el vector según la reivindicación 5ª o
6ª.
8. Un procedimiento para preparar un polipéptido
que tiene actividad quimiotáctica, que comprende cultivar la célula
hospedadora según la reivindicación 7ª y recuperar del cultivo el
polipéptido codificado por dicho polinucléotido.
9. Un procedimiento para preparar células capaces
de expresar un polipéptido que tiene actividad quimiotáctica, que
comprende construir por ingeniería genética células con el vector
según las
reivindicaciones 5ª o 6ª.
reivindicaciones 5ª o 6ª.
10. Un polipéptido que tiene la secuencia de
aminoácidos codificada por un polinucleótido según una cualquiera de
las reivindicaciones 1ª a 4ª, o que puede obtenerse mediante el
procedimiento según la reivindicación 8ª.
11. Un anticuerpo contra el polipéptido según la
reivindicación 10ª.
12. Una molécula de ácido nucleico que se hibrida
específicamente bajo condiciones severas con un polinucleótido según
una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª.
13. Un antagonista/inhibidor contra el
polipéptido según la reivindicación 10ª, en el que dicho
antagonista/inhibidor es un anticuerpo o una construcción
antisentido que se híbrida bajo condiciones rigurosas con un
material de transcripción de un polinucleótido según una cualquiera
de las reivindicaciones 1ª a 4ª.
14. Una composición farmacéutica que comprende el
polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 1ª a 4ª,
el polipéptido según la reivindicación 10ª o un DNA que codifica
dicho polipéptido y es capaz de expresarlo in vivo, o el
antagonista según la reivindicación 13ª, y opcionalmente un
vehículo aceptable farmacéuticamente.
15. Una composición para diagnóstico que
comprende el polinucleótido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1ª a 4ª, la molécula de ácido nucleico según la
reivindicación 12ª, o el anticuerpo según la reivindicación 11ª.
16. El uso del polipéptido según la
reivindicación 10ª o del polinucleótido según una cualquiera de las
reivindicaciones 1ª a 4ª para preparar una composición farmacéutica
para tratar tumores sólidos, infecciones crónicas, leucemia,
enfermedades autoinmunitarias mediadas por células T, infecciones
parasitarias, soriasis, para regular la hematopoiesis, para
estimular la actividad del factor de crecimiento, para inhibir la
angiogénesis o para favorecer la cicatrización de las heridas.
17. El uso del antagonista según la
reivindicación 13ª para la preparación de una composición
farmacéutica para el tratamiento de enfermedades autoinmunitarias,
aterosclerosis, enfermedades crónicas inflamatorias o infecciosas,
reacciones alérgicas mediadas por histamina o IgE, fiebre
independiente de la prostaglandina, insuficiencia de la médula ósea,
silicosis, sarcoidosis, artritis reumatoide o síndrome
hiper-eosinofílico.
18. Un procedimiento in vitro para
diagnosticar una enfermedad o la susceptibilidad para una enfermedad
relacionada con una sobre-expresión del polipéptido
según la reivindicación 10ª, que comprende determinar una mutación
en la secuencia de ácidos nucleicos que codifica dicho
polipéptido.
19. Un procedimiento de diagnóstico que comprende
analizar la presencia del polipéptido según la reivindicación 10ª en
una muestra derivada de un hospedador.
20. Un procedimiento para identificar un agonista
para el polipéptido según la reivindicación 10ª, que comprende:
- (a)
- combinar un compuesto que se desea cribar y una mezcla de reacción que contiene células bajo condiciones en las que las células normalmente migran en respuesta al polipéptido según la reivindicación 10ª; y
- (b)
- determinar la magnitud de la migración de las células para identificar si el compuesto es eficaz como agonista.
21. El procedimiento según la reivindicación 20ª,
en el que el polipéptido según la reivindicación 10ª es añadido a la
combinación de la etapa (a), y la determinación de la magnitud de
la migración identifica un compuesto eficaz como antagonista.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/US1995/007294 WO1996039521A1 (en) | 1995-06-06 | 1995-06-06 | Human chemokine beta-13 |
Publications (1)
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