EA035893B1 - РЕКОМБИНАНТНЫЙ АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУСНЫЙ ВЕКТОР (rAAV), КОДИРУЮЩИЙ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНУЮ, СПЕЦИФИЧНУЮ В ОТНОШЕНИИ СЕТЧАТКИ ГУАНИЛАТЦИКЛАЗУ ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБНЫЙ ПРЕДОХРАНЯТЬ ИЛИ ВОССТАНАВЛИВАТЬ ОПОСРЕДОВАННУЮ КОЛБОЧКАМИ ФУНКЦИЮ ГЛАЗА МЛЕКОПИТАЮЩЕГО - Google Patents

РЕКОМБИНАНТНЫЙ АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУСНЫЙ ВЕКТОР (rAAV), КОДИРУЮЩИЙ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНУЮ, СПЕЦИФИЧНУЮ В ОТНОШЕНИИ СЕТЧАТКИ ГУАНИЛАТЦИКЛАЗУ ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБНЫЙ ПРЕДОХРАНЯТЬ ИЛИ ВОССТАНАВЛИВАТЬ ОПОСРЕДОВАННУЮ КОЛБОЧКАМИ ФУНКЦИЮ ГЛАЗА МЛЕКОПИТАЮЩЕГО Download PDF

Info

Publication number
EA035893B1
EA035893B1 EA201291103A EA201291103A EA035893B1 EA 035893 B1 EA035893 B1 EA 035893B1 EA 201291103 A EA201291103 A EA 201291103A EA 201291103 A EA201291103 A EA 201291103A EA 035893 B1 EA035893 B1 EA 035893B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
seq
mice
treated
mammal
vector
Prior art date
Application number
EA201291103A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201291103A1 (ru
Inventor
Шэннон Элизабет Бойе
Уилльям У. Хаузвирт
Сэнфорд Леон Бойе
Original Assignee
Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк. filed Critical Юниверсити Оф Флорида Рисерч Фаундейшн, Инк.
Publication of EA201291103A1 publication Critical patent/EA201291103A1/ru
Publication of EA035893B1 publication Critical patent/EA035893B1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C12N15/861—Adenoviral vectors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/51—Lyases (4)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/005—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'active' part of the composition delivered, i.e. the nucleic acid delivered
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00—Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02—Ophthalmic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86—Viral vectors
    • C12N15/864—Parvoviral vectors, e.g. parvovirus, densovirus
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88—Lyases (4.)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y406/00—Phosphorus-oxygen lyases (4.6)
    • C12Y406/01—Phosphorus-oxygen lyases (4.6.1)
    • C12Y406/01002—Guanylate cyclase (4.6.1.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14132—Use of virus as therapeutic agent, other than vaccine, e.g. as cytolytic agent
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/008—Vector systems having a special element relevant for transcription cell type or tissue specific enhancer/promoter combination
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00—Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/80—Vector systems having a special element relevant for transcription from vertebrates
    • C12N2830/85—Vector systems having a special element relevant for transcription from vertebrates mammalian

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicinal Preparation (AREA)

Abstract

Изобретение относится к рекомбинантному аденоассоциированному вирусному вектору (rAAV), кодирующему биологически активную, специфичную в отношении сетчатки гуанилатциклазу человека, который способен предохранять или восстанавливать опосредованную колбочками функцию глаза млекопитающего. Также изобретение относится к соответствующей композиции, содержащей заявленный вектор rAAV. Заявленные вектор и композиция используются в способе предотвращения, лечения или облегчения заболевания, расстройства, дисфункции или аномального состояния глаза млекопитающего; в способе повышения уровня биологически активной, специфичной в отношении сетчатки гуанилатциклазы в клетках сетчатки млекопитающего; в способе лечения или облегчения симптомов дистрофии сетчатки у млекопитающего. В частном случае изобретение направлено против врожденного амавроза Лебера типа 1 у млекопитающего.

Description

Основы создания изобретения Перекрестные ссылки на родственные заявки
В настоящем изобретении заявлен приоритет в соответствии с предварительной патентной заявкой Соединенных Штатов Америки № 61/327521, поданной 23 апреля 2010 г., проходящей в настоящее время экспертизу, полное содержание которой умышленно включено в настоящее описание в виде ссылки.
Сведения относительно федерального спонсирования исследования
Правительство Соединенных Штатов имеет определенные права на настоящее изобретение в соответствии с грантами под номерами EY 13729, EY11123 и EY08571 из Национальных Институтов Здоровья (NTH).
Наименования сторон по поводу соглашения в связи с совместными исследованиями
Не применимо к данному случаю.
Область изобретения
Настоящее изобретение в целом связано с областями молекулярной биологии и вирусологии и, в частности, со способами применения композиций рекомбинантного аденоассоциированного вируса (rAAV), которые экспрессируют по меньшей мере первый сегмент нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере первый терапевтический продукт гена, и, в частности, те продукты, которые применимы для профилактики, лечения или облегчения одного или нескольких симптомов заболеваний, расстройств, травм, повреждений или дисфункций глаза млекопитающего. В конкретных воплощениях в настоящем изобретении предложены композиции, включая векторы rAAV, которые экспрессируют биологически функциональный гуанилатциклазный пептид, полипептид или белок для его использования в одной или нескольких диагностических и/или терапевтических схемах лечения, включая, например, лечение одного или нескольких расстройств или заболеваний глаз млекопитающего и, в частности, для лечения наследственной сетчаточной слепоты, включая дистрофию сетчатки, такую как врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1), у человека. Предложены также способы получения лекарственных средств на основе гуанилатциклазного вектора rAAV для применения в генной терапии на основе вирусного вектора, включая, например, векторы rAAV-LCA1 для лечения или облегчения одного или нескольких симптомов гуанилатциклазного дефицита у человека.
Описание предшествующего уровня техники
Врожденный амавроз Лебера (LCA) (раньше назывался наследственным амаврозом Лебера), впервые описанный немецким офтальмологом доктором Теодором Лебером в 1869 г. как пигментная дистрофия сетчатки наследственного типа (или пигментный ретинит, RP), является наиболее ранней и самой тяжелой формой наследственной ретинопатии и насчитывает приблизительно 6% из всех наследуемых дистрофий сетчатки. LCA входит в группу дегенеративных заболеваний сетчатки и является наиболее частой причиной наследственной слепоты у детей. Данное аутосомно-рецессивное состояние обычно распознается при рождении или в течение первых месяцев жизни ребенка с полной слепотой или существенно нарушенным зрением, нормальным глазным дном и резко уменьшенной по амплитуде электроретинограммой (ERG) (см., например, Perrault et al., 1996). Несмотря на указанные функциональные дефициты, пациенты с LCA1 на годы сохраняют некоторое количество зрительных рецепторов палочек и колбочек сетчатки как в своей макулярной, так и в периферической зоне сетчатки. Симптомы данного заболевания включают в себя дисфункцию сетчатки, неустойчивые движения глазных яблок (нистагм), ослабленное зрение, слабую реакцию зрачка и в конечном итоге слепоту.
Посредством генетического анализа было показано, что мутации в гене гуанилатциклазы-1 (Gucy2d), относящиеся к локусу LCA1, являются причиной 20% всех опубликованных случаев LCA (см., например, Milam et al., 2003; Perrault et al., 1996; Perrault et al., 2000). Число пациентов, пораженных LCA1, приблизительно вдвое больше количества пациентов, страдающих версией данного заболевания (LCA2), связанной с наличием дефектов в белке (RPE65) в 65-кДа, специфичном для пигментного эпителия сетчатки, который в последнее время привлекает большое внимание специалистов в области генной терапии.
Согласно оценкам, 200000 американцев поражены наследственным амаврозом Лебера типа 1. Ген Gucy2d кодирует гуанилатциклазу (retGC1), которая экспрессируется в зрительных рецепторах мембран внешнего сегмента (см., например, Dizhoor et al., 1994; Liu et al., 1994) и играет роль в восстановительной фазе фотопреобразования. Считается, что мутации, которые уменьшают или аннулируют активность указанного фермента, создают биохимический эквивалент хронического оптического экспонирования палочковидных и колбочковидных зрительных фоторецепторов. LCA обычно рассматривается как следствие либо аномалии развития зрительных рецепторов (фоторецепторов), либо исключительно ранней дегенерации клеток, развитие которых прошло нормально. Локус (GUCY2D) LCA1 картирован на человеческой хромосоме 17р13.1 (LCA1) путем гомозиготного картирования.
Отсутствие предшествующего уровня техники
В настоящее время не существует эффективной профилактики или терапии, доступной для предотвращения или лечения LCA1 у человека.
- 1 035893
Краткое описание изобретения
В настоящем изобретении преодолены ограничения, имевшие место в предшествующем уровне техники, и предложены новые, неочевидные и полезные конструкции на основе rAAV, которые кодируют один или несколько терапевтических полипептидов млекопитающих, и, в частности, такие белки, пептиды, полипептиды гуанилатциклазного семейства, которые позволяют осуществлять профилактику, лечение и/или облегчение одного или нескольких заболеваний, расстройств или дисфункций у млекопитающих или же одного или нескольких их симптомов, которые обусловлены или отягощены нехваткой или отсутствием активности биологически активного полипептида гуанилатциклазы.
В частности, в настоящем изобретении предложены генетические конструкции, кодирующие один или несколько специфичных для сетчатки млекопитающих полипептидов гуанилатциклазы (retGC1), для применения при лечении таких состояний, как LCA1, а также других глазных расстройств, таких как рецессивная и доминантная формы палочко-колбочковой дистрофии, которая появляется в результате дефицита или отсутствия физиологически нормальных уровней гуанилатциклазного полипептида.
В одном из воплощений в настоящем изобретении предложен рекомбинантный аденоассоциированный вирусный вектор (rAAV), включающий в себя по меньшей мере первый полинуклеотид, который содержит промотор, оперативно связанный по меньшей мере с первым сегментом нуклеиновой кислоты, который кодирует по меньшей мере первый гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид. Предпочтительно, чтобы указанный промотор был фоторецептор-специфическим промотором (таким, например, как промотор человеческой родопсинкиназы) или убиквитарным промотором (таким, например, как промотор укороченного химерного CMV-куриного β-актина). Предпочтительно, чтобы указанный первый сегмент нуклеиновой кислоты кодировал по меньшей мере первый гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид млекопитающих, который включает в себя, по существу состоит или, альтернативно, состоит по меньшей мере из первой непрерывной области аминокислотной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 80%, приблизительно на 85% или приблизительно на 90% или более идентична по меньшей мере первой области последовательности, состоящей по меньшей мере приблизительно из 60, приблизительно из 70, приблизительно из 80, приблизительно из 90 или приблизительно из 100 или более смежных аминокислот последовательности, представленной в любой какой-нибудь одной или нескольких последовательностях гуанилатциклазных белков млекопитающих, приведенных в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11.
В определенных воплощениях указанный по меньшей мере первый сегмент нуклеиновой кислоты предпочтительно кодирует по меньшей мере первый гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид млекопитающих, который включает в себя по меньшей мере первую непрерывную область аминокислотной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 91%, приблизительно на 92%, приблизительно на 93%, приблизительно на 94% или приблизительно на 95% или более идентична по аминокислотной последовательности по меньшей мере первой области последовательности, состоящей по меньшей мере приблизительно из 100, приблизительно из 110, приблизительно из 120, приблизительно из 130, приблизительно из 140 или приблизительно из 150 или более смежных аминокислот последовательности, представленной в любой какой-нибудь одной или нескольких последовательностях гуанилатциклазных белков млекопитающих, приведенных в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11.
Предпочтительно, чтобы по меньшей мере первый сегмент нуклеиновой кислоты кодировал по меньшей мере один или несколько гуанилатциклазных белков, пептидов или полипептидов млекопитающих, каждый из которых предпочтительно включал бы в себя по меньшей мере первую непрерывную первичную аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 95%, по меньшей мере приблизительно на 96%, по меньшей мере приблизительно на 97%, по меньшей мере приблизительно на 98% или по меньшей мере приблизительно на 99% идентична по меньшей мере первой области последовательности, которая включает в себя по меньшей мере приблизительно 90, приблизительно 110, приблизительно 130, приблизительно 150 или приблизительно 170 или более смежных аминокислот по меньшей мере первого гуанилатциклазного белка, как показано в любой какой-нибудь одной или нескольких последовательностях гуанилатциклазных белков млекопитающих, приведенных в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11.
Предпочтительно, чтобы векторы rAAV согласно настоящему изобретению включали бы в себя по меньшей мере первый сегмент нуклеиновой кислоты, кодирующий по меньшей мере первый гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид, который включает в себя, по существу состоит или, альтернативно, состоит по меньшей мере из аминокислотной последовательности какой-нибудь одной или нескольких из последовательностей SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11, или полинуклеотидную последовательность, которая была бы комплементарна или специфически гибридизовалась бы с одной какой-нибудь или несколькими такими последовательностями в
- 2 035893 условиях, от жестких до очень жестких условий гибридизации. Предпочтительно, чтобы указанный первый гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид млекопитающих обладал гуанилатциклазной активностью in vitro и in vivo в трансформированных клетках млекопитающего и предпочтительно в трансформированных клетках-хозяевах человека. В особых аспектах указанные гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид будут проявлять значительную биологически активную гуанилатциклазную активность in vitro и in vivo в трансформированных клетках млекопитающего и предпочтительно в трансформированных клетках-хозяевах человека, когда указанный сегмент нуклеиновой кислоты, кодирующий указанные пептид, белок или полипептид, оперативно связан по меньшей мере с первым промотором, способным к экспрессии указанной последовательности в клетке-хозяине млекопитающего и предпочтительно человека.
Несмотря на то, что векторы rAAV согласно настоящему изобретению необязательно ограничены конкретным серотипом, в определенных воплощениях авторы настоящего изобретения считают, что благотворные результаты могут быть достигнуты при использовании вектора rAAV, который относится к одному или нескольким из следующих известных серотипов:
вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 1 (rAAV1), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 2 (rAAV2), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 3 (rAAV3), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 4 (rAAV4), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 5 (rAAV5), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 6 (rAAV6), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 7 (rAAV7), вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 8 (rAAV8) или вектор рекомбинантного аденоассоциированного вируса серотипа 9 (rAAV).
В определенных случаях применения векторы rAAV согласно настоящему изобретению могут быть само-комплементарными векторами rAAV (scAAV).
При тех воплощениях изобретения, при которых желателен фоторецептор-специфический промотор, описанные здесь векторы rAAV могут включать в себя по меньшей мере первый фоторецепторспецифический родопсинкиназный промотор. Примеры таких промоторов включают в себя человеческий родопсинкиназный промотор, который представлен в последовательности SEQ ID NO: 12. В определенных аспектах настоящего изобретения применение промоторной последовательности, которая включает в себя по меньшей мере приблизительно 20, по меньшей мере приблизительно 25, по меньшей мере приблизительно 30, по меньшей мере приблизительно 35, по меньшей мере приблизительно 40, по меньшей мере приблизительно 45 или по меньшей мере приблизительно 50 или более смежных нуклеотидов из последовательности SEQ ID NO: 12, является особенно предпочтительным, когда требуется тканеспецифическая (и, в частности, фоторецептор-специфическая) экспрессия терапевтической конструкции.
Сходным образом, при таких воплощениях, когда желателен убиквитарный промотор, описанные здесь векторы rAAV могут включать в себя по меньшей мере первый промотор укороченного химерного CMV-куриного β-актина. Примеры таких промоторов включают в себя промотор укороченного химерного CMV-куриного β-актина, который представлен в последовательности SEQ ID NO: 13. В определенных аспектах настоящего изобретения применение промоторной последовательности, которая включает в себя по меньшей мере приблизительно 20, по меньшей мере приблизительно 25, по меньшей мере приблизительно 30, по меньшей мере приблизительно 35, по меньшей мере приблизительно 40, по меньшей мере приблизительно 45 или по меньшей мере приблизительно 50 или более смежных нуклеотидов из последовательности SEQ ID NO: 13, является особенно предпочтительным, когда требуется тканенеспецифическая экспрессия терапевтического гена.
В некоторых воплощениях промоторная последовательность, используемая в описанных конструкциях терапевтического гена, может включать в себя, по существу состоять или, альтернативно, состоять из последовательности нуклеиновой кислоты, которая включает в себя по меньшей мере 55, приблизительно 60, приблизительно 65, приблизительно 70, приблизительно 75, приблизительно 80, приблизительно 85, приблизительно 90, приблизительно 95, приблизительно 100, приблизительно 105, приблизительно 110, приблизительно 115 или приблизительно 120 или более смежных нуклеотидов из промоторных последовательностей, представленных в последовательностях SEQ ID NO: 12 или SEQ ID NO: 13.
Описанные здесь векторы генной терапии могут также дополнительно и необязательно включать в себя одну или несколько вышележащих или низлежащих регуляторных последовательностей, таких как последовательность первого энхансера, оперативно связанная по меньшей мере с первым сегментом нуклеиновой кислоты, или область регуляции транскрипции, такая как посттрансляционный элемент вируса гепатита лесного североамериканского сурка. Конструкции согласно настоящему изобретению могут также дополнительно и необязательно включать в себя одну или несколько интронных последовательностей, оперативно связанных по меньшей мере с первым сегментом нуклеиновой кислоты, кодирующим терапевтическое средство.
- 3 035893
Сегменты нуклеиновой кислоты, кодирующие гуанилатциклазные белки, пептиды и полипептиды млекопитающих согласно настоящему изобретению, могут быть получены из природных, полусинтетических или полностью искусственных последовательностей, однако предпочтительно, чтобы они относились к таковым млекопитающих. Примеры источников последовательностей млекопитающих включают в себя, не ограничиваясь перечисленным, последовательности человека, любых приматов, кроме человека, заячьих, мышиных или крысиных, кошачьих, собачьих, свиных, овечьих, бычьих, лошадиных, козлиных, волчьих и т.д.
Описанные здесь векторы rAAV могут необязательно содержаться внутри инфекционной аденоассоциированной вирусной частицы, вириона или же внутри одной или нескольких из множества инфекционных частиц AAV. Как таковое, настоящее изобретение включает в себя также вирионы, вирусные частицы, а также изолированные клетки-хозяева, которые содержат одну или несколько из описанных здесь генетических конструкций rAAV. Особенно предпочтительные для осуществления настоящего изобретения клетки-хозяева включают в себя, не ограничиваясь перечисленным, изолированные клеткихозяева млекопитающих, которые включают в себя один или несколько из следующих элементов: вектор rAAV, вирион AAV или множество инфекционных вирусных частиц.
В других аспектах настоящее изобретение относится к новым и полезным композициям, которые включают в себя один или несколько из следующих компонентов: (a) вектора rAAV, вириона rAAV, инфекционных вирусных частиц rAAV, множества таких вирионов или инфекционных частиц, или изолированных клеток-хозяев млекопитающего, которые содержат указанные вектор, вирион, инфекционную частицу или их множество. Предпочтительно, чтобы такие композиции дополнительно и необязательно включали в себя один или несколько фармацевтически приемлемых буферов, носителей, наполнителей, разбавителей и т.п.,и могли бы дополнительно и необязательно включать в себя один или несколько липидов, липосом, липидных комплексов, этосом, ниосом, наночастиц, микрочастиц, липосфер, нанокапсул или любую их комбинацию. Предпочтительно, чтобы такие композиции были преимущественно составлены для введения в глаз человеку и могли бы быть использованы в терапии или профилактике, в частности в терапии или профилактике дистрофии, заболевания или расстройства сетчатки (такого как LCA1) у человека.
Как указано ниже, настоящее изобретение включает в себя также диагностические, терапевтические и профилактические наборы, которые включают в себя одну или несколько из описанных здесь конструкций вектора rAAV. Такие наборы могут дополнительно необязательно включать в себя один или несколько протоколов, режимов дозирования или инструкций для применения указанного компонента в диагностике, профилактике, лечении или облегчении одного или нескольких симптомов дистрофии, заболевания, расстройства или аномального состояния сетчатки у человека. В определенных аспектах рассматриваются, в частности, терапевтические наборы для лечения пациентов, у которых диагностирован врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA-1).
Настоящее изобретение относится также к применению одной или нескольких из описанных выше композиций на основе rAAV в терапии или в профилактике заболеваний или расстройств млекопитающего. Сходным образом, настоящее изобретение включает в себя применение описанных композиций в изготовлении лекарственного средства для диагностики, профилактики, лечения или облегчения одного или нескольких симптомов заболевания, расстройства, дисфункции или аномального состояния глаза млекопитающего и, в частности, для лечения или облегчения одного или нескольких симптомов врожденного амавроза Лебера типа 1 (LCA-1) у человека.
Настоящее изобретение относится также к способу предотвращения, лечения или облегчения одного или нескольких симптомов заболевания, дисфункции, расстройства, дефицита или аномального состояния у млекопитающего. Такой способ обычно включает в себя введение млекопитающему, в случае необходимости, эффективного количества описанной здесь композиции rAAV в течение периода, достаточного для предотвращения, лечения и/или облегчения одного или нескольких симптомов заболевания, дисфункции, расстройства, дефицита или аномального состояния у млекопитающего. У такого млекопитающего предпочтительно либо имеется, либо предполагается наличие, либо есть определенный риск развития, либо диагностировано по меньшей мере первое расстройство, заболевание или дистрофия сетчатки, включая, например, врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA-1), или же такое млекопитающее имеет определенный риск развития или у него диагностированы один или несколько дефицитов, дефектов или отсутствие биологически активного, функционального белка, пептида или полипептида гуанилатциклазы. Млекопитающее может быть любого возраста, однако более предпочтительно, чтобы оно было новорожденным, в неонатальном, детском или юношеском возрасте, и имело бы определенный риск развития или имело бы диагноз наследственной дистрофии сетчатки, такой как врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA-1).
Кроме того, настоящее изобретение включает в себя также способ доставки млекопитающему, в случае необходимости, терапевтически эффективного количества биологически активного пептида, полипептида или белка гуанилатциклазы млекопитающего. Такой способ обычно включает в себя по меньшей мере стадию введения в соответствующие клетки млекопитающего, в случае необходимости такого введения, эффективного количества одного или нескольких описанных здесь векторов rAAV в
- 4 035893 течение периода, достаточного для продуцирования на его основе биологически активного пептида, полипептида или белка гуанилатциклазы по меньшей мере в первой популяции клеток или по меньшей мере в первой ткани млекопитающего, в которую введен указанный вектор rAAV. При использовании указанного способа предпочтительно, чтобы нуждающееся в этом млекопитающее имело один или несколько дефектов, дефицитов или же существенное или полное отсутствие функционального, биологически активного белка retGC1 в одной или нескольких тканях внутри или в непосредственной близости от тела млекопитающего по сравнению с уровнем биологически активного белка retGC1 у млекопитающего в норме. В определенных приложениях настоящего способа многочисленные клетки из организма млекопитающего ex vivo или in vitro снабжают вектором rAAV, при этом указанный способ включает в себя, кроме того, дополнительную стадию последующего введения указанного множества клеток, снабженных вектором rAAV, по меньшей мере на участок первой ткани внутри или в непосредственной близости от тела млекопитающего. Например, указанное множество полученных клеток может быть введено по меньшей мере в первый участок внутри одного или обоих глаз млекопитающего, включая, например, введение путем прямой инъекции в сетчатку, в субретинальное пространство или в одну или в несколько тканей, окружающих сетчатку, или же в цельный глаз, или в ткани, окружающие глаз.
В конкретных аспектах введение конструкции с rAAV-регулируемым вектором гуанилатциклазного гена в клетку и его последующей экспрессией обеспечивает трансляцию функционального гуанилатциклазного пептида, белка или полипептида и в результате предохранение колбочковых фоторецепторов и восстановление опосредованной колбочками функции. Важно то, что такой способ обеспечивает возврат к нормальному зрительному восприятию в глазу млекопитающего и предпочтительно восстановление зрения.
Введение векторов rAAV согласно настоящему изобретению может быть частью однократной терапии или же может быть частью продолжительного режима терапии, повторяющейся два или более раз в течение жизни подвергаемого лечению субъекта. В определенных аспектах однократное введение конструкций rAAV вызывает поддерживаемое образование гуанилатциклазного белка с предохранением колбочковых фоторецепторов и восстановлением опосредованной колбочками функции и нормального зрительного восприятия в течение периода по меньшей мере в один месяц, по меньшей мере в два месяца, по меньшей мере в три или более месяцев после введения. Более предпочтительно, чтобы долговременная терапия или профилактика осуществлялись путем однократного введения или путем нескольких последовательных введений терапевтических конструкций в глаз млекопитающего в течение периода от нескольких месяцев до нескольких лет.
Предпочтительно, чтобы предохранение колбочковых фоторецепторов и восстановление опосредованной колбочками функции и нормального зрительного восприятия у млекопитающего происходили в течение периода по меньшей мере в четыре месяца, по меньшей мере в пять месяцев, по меньшей мере в шесть или более месяцев после введения. В определенных аспектах предохранение колбочковых фоторецепторов и восстановление опосредованной колбочками функции и нормального зрительного восприятия у млекопитающего происходили в течение периода по меньшей мере в один год, по меньшей мере в два года, по меньшей мере в три года или по меньшей мере в четыре или более года после завершения схемы лечения, которая включает в себя введение описанных здесь композиций. Кроме того, настоящее изобретение относится к способу повышения уровня биологически активного белка retGC1 в одной или нескольких клетках сетчатки млекопитающего, у которого имеется LCA1, подразумевается, что имеется LCA1, у которого диагностирован LCA1 или же есть определенный риск развития LCA1. Такой способ обычно включает в себя введение по меньшей мере в первую популяцию клеток сетчатки млекопитающего, в случае необходимости, одной или нескольких из описанных гуанилатциклазных векторных rAAV-конструкций в таком количестве и в течение такого периода, которые эффективны для повышения уровня биологически активного белка retGC1 в одну или несколько клеток сетчатки млекопитающего. Такой способ предусмотрен, в частности, для предотвращения, лечения или облегчения одного или нескольких симптомов дистрофии сетчатки у млекопитающего, и он предпочтительно может включать в себя прямое или опосредованное введение в сетчатку, в субретинальное пространство или в глаз млекопитающего одной или нескольких из описанных здесь терапевтических конструкций в таком количестве и в течение такого периода, которых достаточно для лечения или облегчения одного или нескольких симптомов дистрофии сетчатки у млекопитающего.
В настоящем изобретении представлены также композиции и способы предотвращения, лечения или облегчения симптомов дефицита гуанилатциклазного белка у млекопитающего и, в частности, способы лечения или уменьшения степени тяжести или выраженности дефицита у человека с проявлениями одного или нескольких из расстройств, связанных с дефицитом биологически активных полипептидов гуанилатциклазы. В широком смысле указанный способ включает в себя введение по меньшей мере первой генетической конструкции на основе rAAV, которая кодирует один или несколько гуанилатциклазных пептидов, полипептидов или белков, в составе фармацевтически приемлемого носителя, животному, в таком количестве и в течение такого периода, которых достаточно для лечения или облегчения дефицита у животного, которое предположительно страдает от такого расстройства или же от одного или нескольких его симптомов. Примеры гуанилатциклазных полипептидов, применимых при реализации на
- 5 035893 стоящего изобретения, включают в себя, но не ограничены, пептиды, полипептиды и белки, которые обладают гуанилатциклазной активностью и которые по существу идентичны по своей первичной аминокислотной последовательности любой из последовательностей, представленных последовательностями SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11 и их биологически функциональными эквивалентами или производными. Дополнительные примеры гуанилатциклазных пептидов, белков и полипептидов, применимых при реализации настоящего изобретения, но не ограниченных ими, являются таковые, которые содержат, по существу состоят или состоят из аминокислотной последовательности, кодируемой геном гуанилатциклазы млекопитающего, и, в частности, тех последовательностей, которые представлены последовательностями SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11 и их биологически функциональными эквивалентами или производными.
rAAV-гуанилатциклазные векторные композиции.
В первом воплощении настоящее изобретение относится к вектору rAAV, содержащему полипептид, который включает в себя по меньшей мере первый сегмент нуклеиновой кислоты, которая кодирует гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид и, в частности, гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид млекопитающего (или его биологически активный фрагмент или производное), оперативно связанный по меньшей мере с первым промотором, способным к экспрессии сегмента нуклеиновой кислоты в соответствующей клетке-хозяине, трансформированной таким вектором. В предпочтительных воплощениях указанный сегмент нуклеиновой кислоты кодирует гуанилатциклазный белок, пептид или полипептид млекопитающего и, в частности, гуанилатциклазный пептид, полипептид или белок человека, а в особенности пептид, полипептид или белок, который включает в себя по меньшей мере первую последовательность смежных аминокислот, которая по меньшей мере на 90% гомологична по меньшей мере последовательности первых 30 смежных аминокислот из одной или нескольких из аминокислотных последовательностей, представленных в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11, или ее биологически активному фрагменту или варианту.
Предпочтительно, чтобы указанный полипептид содержал по меньшей мере первую последовательность смежных аминокислот, которая по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 98% гомологична по меньшей мере последовательности первых 30, по меньшей мере 40, по меньшей мере 50, по меньшей мере 60, по меньшей мере 70 или по меньшей мере 80 смежных аминокислот из последовательности SEQ ID NO: 1, и более предпочтительно, чтобы указанный полипептид содержал по меньшей мере первую последовательность смежных аминокислот, которая по меньшей мере на 99% гомологична по меньшей мере последовательности из 90 смежных аминокислот из последовательности SEQ ID NO: 1.
Альтернативно, терапевтические конструкции согласно настоящему изобретению могут заключать в себе сегменты нуклеиновых кислот, которые кодируют гуанилатциклазные полипептиды любого вида млекопитающих, такие, например, как нуклеиновые кислоты, пептиды и полипептиды мышиных, приматов, заячьих, овечьих, свиных, бычьих, лошадиных, козлиных, собачьих, кошачьих и/или волчьих, или могут включать в себя модифицированные или подвергнутые сайт-специфическому мутагенезу сегменты нуклеиновых кислот, которые были исходно получены из одного или нескольких видов млекопитающих и генетически модифицированы, с тем, чтобы они могли быть экспрессированы в клетках человека так, чтобы их гуанилатциклазная активность сохранялась.
В других предпочтительных воплощениях указанные сегменты нуклеиновой кислоты для применения при осуществлении настоящего изобретения кодируют гуанилатциклазный полипептид млекопитающего и, в частности, человеческий гуанилатциклазный полипептид или его биологически активный фрагмент или вариант.
Полинуклеотиды, содержащиеся в векторах и в вирусных частицах согласно настоящему изобретению, предпочтительно включают в себя, как здесь описано, по меньшей мере первый конститутивный или индуцибельный промотор, оперативно связанный с сегментом нуклеиновой кислоты, кодирующей гуанилатциклазу. Такие промоторы могут быть гомологичными или гетерологичными промоторами и могут быть оперативно расположены выше сегмента нуклеиновой кислоты, кодирующего гуанилатциклазный полипептид, так, чтобы экспрессия сегмента, кодирующего гуанилатциклазу, была под контролем указанного промотора. Указанная конструкция может содержать единственный промотор или, альтернативно, могут быть использованы два или несколько промоторов для облегчения экспрессии последовательности ДНК, кодирующей гуанилатциклазу.
Примеры промоторов, используемых при осуществлении настоящего изобретения, включают в себя, но никоим образом не ограничены, такими промоторными последовательностями, которые являются оперативными в клетках-хозяевах, тканях и органах млекопитающих и, в частности, человека, такие, например, как убиквитарные промоторы, такие как промотор CMV, промотор, промотор β-актина, гибридный промотор CMV, гибридный промотор CMV-в-актина, укороченный промотор CMV, укороченный
- 6 035893 промотор β-актина, укороченный гибридный промотор CMV-β-актина, промотор EF1, промотор U1a или промотор U1b; или же один или несколько клеточно- или тканеспецифических промоторов (включая, например, фоторецептор-специфический промотор, такой как промотор родопсинкиназы [hGRK1]), или индуцибельный промотор, такой как Tet-индуцибельный промотор или промотор VP16-LexA.
В иллюстративных воплощениях полинуклеотид, кодирующий терапевтический полипептид, помещали под контроль убиквитарного укороченного гибридного промотора β-актина цыпленка (СВА) или под контроль промотора, специфичного в отношении фоторецепторных клеток, hGRK1), и использовали для получения терапевтически эффективных уровней кодируемого гуанилатциклазного полипептида в условиях, когда соответствующие клетки-хозяева были трансформированы указанной конструкцией, и в таких клетках экспрессировалась ДНК, кодирующая гуанилатциклазный полипептид. Пример подходящего промотора hGRK1 представлен последовательностью SEQ ID NO: 12, тогда как подходящий убиквитарный промотор, такой как укороченный гибридный промотор β-актина цыпленка (СВА), представлен последовательностью SEQ ID NO: 13.
Полинуклеотиды, содержащиеся в векторах и вирусных частицах согласно настоящему изобретению могут также дополнительно и необязательно включать в себя один или несколько нативных, синтетических, гомологичных, гетерологичных или гибридных энхансеров или 5'-регуляторных элементов, например природный энхансер, такой как энхансер CMV, или, альтернативно, синтетический энхансер. Клеточно- или тканеспецифичные энхансеры, включая, например, такие, которые усиливают экспрессию последовательностей оперативно связанных генов, также считаются особенно полезными в практическом осуществлении настоящего изобретения. Такие энхансеры могут включать в себя, но не ограничены, энхансеры, специфичные в отношении сетчатки, энхансеры, специфичные в отношении палочковидных зрительных фоторецепторов, энхансеры, специфичные в отношении колбочковидных зрительных фоторецепторов, энхансеры, специфичные в отношении колбочковидных зрительных клеток, и т.п.
Полинуклеотидные сегменты и сегменты нуклеиновых кислот, содержащиеся внутри векторов и вирусных частиц согласно настоящему изобретению, могут также дополнительно и необязательно включать в себя одну или несколько интронных последовательностей. В таких случаях указанная интронная последовательность(и) предпочтительно будут последовательностями млекопитающих и более предпочтительно человеческими последовательностями.
Последовательности ДНК, сегментов нуклеиновой кислоты и полинуклеотидов, содержащиеся внутри вектора, вириона, вирусной частицы, клетки-хозяева или композиции согласно настоящему изобретению, могут также дополнительно и необязательно включать в себя один или несколько нативных, синтетических, гомологичных, гетерологичных или гибридных посттранскрипционных или 3'-регуляторных элементов, оперативно расположенных относительно описанных здесь сегментов нуклеиновой кислоты, кодирующих гуанилатциклазу, чтобы обеспечить более высокий уровень экспрессии, большую стабильность и/или усиленную трансляцию кодируемых полипептидов. Одним из таких примеров является посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита лесного североамериканского сурка (WPRE), оперативно расположенный ниже гуанилатциклазного гена. Использование такого рода элементов в таких случаях хорошо известно специалистам в области молекулярной биологии.
В иллюстративных воплощениях настоящее изобретение относится к введению одного или нескольких биологически активных гуанилатциклазных белков, пептидов или полипептидов, которые содержат последовательность по меньшей мере приблизительно из 10, по меньшей мере приблизительно из 15, по меньшей мере приблизительно из 20, по меньшей мере приблизительно из 25, по меньшей мере приблизительно из 30, по меньшей мере приблизительно из 35, по меньшей мере приблизительно из 40, по меньшей мере приблизительно из 45, по меньшей мере приблизительно из 50, по меньшей мере приблизительно из 55, по меньшей мере приблизительно из 60, по меньшей мере приблизительно из 65, по меньшей мере приблизительно из 70, по меньшей мере приблизительно из 75, по меньшей мере приблизительно из 80, по меньшей мере приблизительно из 85, по меньшей мере приблизительно из 90, по меньшей мере приблизительно из 95 или по меньшей мере приблизительно из 100 или более смежных аминокислот из описанных здесь ниже полипептидных и пептидных последовательностей, и, в частности, тех полипептидов, которые приведены в одной из последовательностей SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, или SEQ ID NO: 11.
Сходным образом, в дополнительных иллюстративных воплощениях настоящее изобретение относится к введению одного или нескольких биологически активных гуанилатциклазных белков, пептидов или полипептидов, которые кодируются сегментом нуклеиновой кислоты, который включает в себя, по существу состоит или состоит по меньшей мере приблизительно из 10, по меньшей мере приблизительно из 20, по меньшей мере приблизительно из 30, по меньшей мере приблизительно из 40, по меньшей мере приблизительно из 50, по меньшей мере приблизительно из 60, по меньшей мере приблизительно из 70, по меньшей мере приблизительно из 80, по меньшей мере приблизительно из 90, по меньшей мере приблизительно из 100, по меньшей мере приблизительно из 110, по меньшей мере приблизительно из 120, по меньшей мере приблизительно из 130, по меньшей мере приблизительно из 140, по меньшей мере
- 7 035893 приблизительно из 150, по меньшей мере приблизительно из 160, по меньшей мере приблизительно из 170, по меньшей мере приблизительно из 180, по меньшей мере приблизительно из 190 или по меньшей мере приблизительно из 200, приблизительно из 250, приблизительно из 300, приблизительно из 350, приблизительно из 400, приблизительно из 450, приблизительно из 500, приблизительно из 550, приблизительно из 600, приблизительно из 650, приблизительно из 700, приблизительно из 750 или даже приблизительно из 800 или более смежных остатков нуклеиновой кислоты из описанных здесь ниже сегментов нуклеиновой кислоты и,. в частности, таких сегментов ДНК, которые кодируют любой какой-нибудь один или несколько гуанилатциклазных белков млекопитающих, включая, например, такие, которые приведены в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11.
Иллюстративные аденоассоциированные конструкции вирусных векторов и полинуклеотидов согласно настоящему изобретению включают в себя такие, которые включают в себя, по существу состоят или состоят по меньшей мере из первого сегмента нуклеиновой кислоты, который кодирует пептид или полипептид, который по меньшей мере приблизительно на 75%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 85%, по меньшей мере приблизительно на 90%, по меньшей мере приблизительно на 95%, по меньшей мере приблизительно на 96%, по меньшей мере приблизительно на 97%, по меньшей мере приблизительно на 98% или по меньшей мере приблизительно на 99% идентичен последовательности SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11, где указанный пептид или полипептид обладает гуанилатциклазной активностью, когда экспрессируется в выбранных клетках и/или тканях млекопитающего.
В определенных воплощениях указанные конструкции вирусных векторов и полинуклеотидов согласно настоящему изобретению будут предпочтительно включать в себя такие векторы и полинуклеотиды, которые включают в себя, по существу состоят или состоят по меньшей мере из первого сегмента нуклеиновой кислоты, который кодирует пептид или полипептид, который по меньшей мере приблизительно на 82%, по меньшей мере приблизительно на 84%, по меньшей мере приблизительно на 86%, по меньшей мере приблизительно на 88%, по меньшей мере приблизительно на 92% или по меньшей мере приблизительно на 94% идентичен одной или нескольким из последовательностей, отраженных в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11. Такие конструкции предпочтительно будут кодировать один или несколько биологически активных пептидов или полипептидов, которые обладают гуанилатциклазной активностью, когда экспрессируются в выбранных клетках и/или тканях млекопитающего и, в частности, в клетках и/или тканях человека.
Иллюстративные полинуклеотиды согласно настоящему изобретению включают в себя также такие последовательности, которые включают в себя, по существу состоят или состоят по меньшей мере из первого сегмента нуклеиновой кислоты, который по меньшей мере приблизительно на 75%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 85%, по меньшей мере приблизительно на 90%, по меньшей мере приблизительно на 95%, по меньшей мере приблизительно на 96%, по меньшей мере приблизительно на 97%, по меньшей мере приблизительно на 98% или по меньшей мере приблизительно на 99% идентичен последовательности нуклеиновой кислоты, которая кодирует любую какую-нибудь из последовательностей SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 или SEQ ID NO: 11, где указанный пептид или полипептид, кодируемый указанным сегментом нуклеиновой кислоты, обладает гуанилатциклазной активностью, когда экспрессируются в выбранных клетках и/или тканях млекопитающего.
Вирусные частицы и вирионы и содержащие их клетки-хозяева.
Другие аспекты настоящего изобретения относятся к частицам и вирионам rAAV, которые содержат гуанилатциклазные векторы rAAV согласно настоящему изобретению, к множеству таких частиц и вирионов, а также к фармацевтическим композициям и клеткам-хозяевам, которые содержат один или несколько описанных здесь гуанилатциклазных векторов rAAV, таким, например, как фармацевтические композиции гуанилатциклазных векторов или вирионов rAAV, которые предполагается вводить млекопитающим соответствующими путями введения, такими как внутримышечное, внутривенное введение, или путем прямой инъекции в выбранные клетки, ткани или органы млекопитающего, например в одну или несколько областей глаза выбранного млекопитающего. Обычно такие композиции будут составлены с фармацевтически приемлемыми эксципиентами, буферами, разбавителями, адъювантами или носителями, как описано здесь ниже, и могут дополнительно включать в себя одну или несколько композиций липосом, липидов, липидных комплексов, микросфер, микрочастиц, наносфер или наночастиц для облегчения введения в выбранные органы, ткани и клетки, для которых указанная терапия является желательной.
Дополнительные аспекты настоящего изобретения включают в себя клетки-хозяева млекопитающего, а также их множество, которые содержат один или несколько из векторов, вирионов или инфекцион- 8 035893 ных вирусных частиц, как здесь описано. Особенно предпочтительными клетками являются человеческие клетки-хозяева и, в частности, клетки тканей глаза человека, включая, например, клетки сетчатки.
Терапевтические наборы и фармацевтические композиции.
Терапевтические наборы для лечения или облегчения симптомов состояния, наступающего в результате дефицита гуанилатциклазы у млекопитающего, также являются частью настоящего изобретения. Иллюстративными наборами являются такие, которые предпочтительно включают в себя одну или несколько из описанных AAV-гуанилатциклазных конструкций векторов, вирионов или описанных здесь фармацевтических композиций, а также инструкции по использованию указанного набора. Применение таких наборов в способах лечения гуанилатциклазных дефицитов, в частности специфичной в отношении сетчатки гуанилатциклазы-1, является предпочтительным при лечении дефекта или дефицита retGC1 и при лечении дистрофий сетчатки, таких как LCA-1, у пораженного млекопитающего.
Другой важный аспект настоящего изобретения относится к применению описанных векторов, вирионов, композиций и клеток-хозяев, описанных в настоящем документе, при изготовлении лекарственных средств для лечения или облегчения симптомов дефицита гуанилатциклазы у млекопитающего, и в частности, у человека. Применение таких композиций для изготовления лекарственных средств и в способах лечения неврологических дефектов и/или дефектов центральной нервной системы, включая, например, состояния, являющиеся результатом дефицита или дефекта в GC1 сетчатки, такие, например, как дистрофии сетчатки, такие как LCA-1, обычно включает в себя введение млекопитающему, в частности человеку, в случае необходимости, одного или нескольких из описанных здесь вирусных векторов, вирионов, клеток-хозяев или композиций, содержащих один или более из перечисленных компонентов, в количестве и в течение периода, достаточного для лечения или облегчения симптомов такого дефицита у пораженного им млекопитающего. Указанные способы могут также охватывать профилактическое лечение животных, у которых подозревается наличие таких состояний, или введение таких композиций тем животным, у которых есть риск развития таких состояний либо на основании установления диагноза, либо до возникновения симптомов.
Другой аспект настоящего изобретения относится к композициям, которые включают в себя один или несколько описанных аденоассоциированных вирусных векторов, вирионов, вирусных частиц и клеток-хозяев, как здесь описано. Содержащие их фармацевтические композиции являются особенно предусмотренными для применения в терапии и, в частности, в изготовлении лекарственных средств для лечения пораженных животных, в частности человека.
Способы терапии.
Настоящее изобретение относится также к способам доставки терапевтически эффективных количеств гуанилатциклазного полипептида млекопитающему, в случае необходимости. Такие способы обычно включают в себя по меньшей мере стадию доставки или введения такому млекопитающему одной или нескольких из описанных здесь гуанилатциклазных композиций. Например, такой способ может включать в себя доставку такому млекопитающему одного или нескольких из векторов, вирионов, вирусных частиц, клеток-хозяев rAAV или фармацевтических композиций, как здесь описано. Предпочтительно, чтобы такая доставка или такое введение осуществлялось бы в количестве и в течение периода, обеспечивающих терапевтически эффективное количество одного или нескольких из описанных здесь полипептидов гуанилатциклазы выбранным клеткам, тканям или органам млекопитающего и, в частности, терапевтически эффективные уровни клеткам глаза млекопитающего. Такие способы могут включать в себя системную инъекцию (инъекции) терапевтического средства или могут даже включать в себя прямое или непрямое введение, инъекцию или внесение терапевтических композиций в конкретные клетки, ткани или органы млекопитающего.
Например, указанная терапевтическая композиция может быть доставлена млекопитающему путем прямой инъекции в ткани глаза или в сетчатку, или в субретинальное пространство, или же в один или несколько конкретных типов клеток внутри глаза млекопитающего.
Настоящее изобретение относится также к способам лечения, облегчения симптомов и уменьшения степени тяжести дефицита гуанилатциклазы у животного. Указанные способы обычно включают в себя по меньшей мере стадию доставки животному, в случае необходимости, одной или нескольких описанных здесь композиций гуанилатциклазных векторов rAAV в количестве и в течение периода, эффективных для лечения дефекта или дефицита полипептида retGC1 или для лечения дисфункции, происходящей в результате такого накопления или происходящей в результате уменьшения экспрессии или отсутствия достаточного количества биологически активного полипептида гуанилатциклазы у животного, включая дистрофии сетчатки, такие как LCA1, и т.п. Как описано выше, такие способы могут включать в себя системную инъекцию(и) терапевтического средства или могут даже включать в себя прямое или непрямое введение, инъекцию или внесение терапевтических композиций в конкретные клетки, ткани или органы млекопитающего.
Кроме того, настоящее изобретение относится к применению аденоассоциированных вирусных векторов, вирионов, вирусных частиц и клеток-хозяев и/или описанных здесь фармацевтических композиций в изготовлении лекарственного средства для лечения дефекта или дефицита гуанилатциклазы, дистрофии сетчатки или LCA1 или другого GC1-связαнного глазного заболевания, расстройства или
- 9 035893 дисфункции у млекопитающего. Такое применение может включать в себя системную или локализованную инъекцию, инфицирование или введение в одну или несколько клеток, тканей или органов млекопитающего. Такое применение, в частности, предусмотрено для человека, у которого либо имеется, либо предполагается наличие, либо есть определенный риск развития одной или нескольких дистрофий сетчатки, таких как LCA-1.
Краткое описание графического материала
Последующие фигуры образуют часть настоящего описания и включены в него для дальнейшей демонстрации определенных аспектов настоящего изобретения. Изобретение может быть лучше понято со ссылкой на последующее описание в сочетании с сопровождающими фигурами, где соответствующие номера ссылок способствуют идентификации соответствующих элементов, на которых:
на фиг. 1 приведены репрезентативные опосредованные колбочковидными (левая колонка) и палочковидными зрительными клетками (правая колонка) картины электроретинограмм (ERG) у мышей +/+ (верхние временные диаграммы), мышей, не обработанных GC1KO (средние временные диаграммы), и AAV-mGC1-обработанных мышей (нижние временные диаграммы). Сплошные линии записи приборасамописца соответствуют глазам, в которые инъецировали hGRK1-mGC1 (нижние временные диаграммы), и контралатеральным глазам, в которые такие инъекции не производились (средние временные диаграммы). Пунктирные линии записи самописца соответствуют глазам, в которые инъецировали smCBA-mGC1 (нижние временные диаграммы), и контралатеральным глазам, в которые такие инъекции не производились (средние временные диаграммы). Реакции колбочковидных зрительных клеток в глазах, обработанных AAV-mGC1, восстанавливались приблизительно до 45% от нормы;
на фиг. 2A и 2B приведены средние значения максимальных амплитуд фотопических бета-волн, относящихся к световой адаптации колбочек у мышей GC1KO, изогенных контролей +/+, smCBA-mGC1обработанных (фиг. 2A) и hGRK1-mGC1-обработанных (фиг. 2B) GdKO-мышей с течением времени. Реакция колбочковидных зрительных клеток GCLKO-мышей, обработанных как smCBA-mGC1, так и hGRK1-mGC1, приблизительно составляет 45% от нормального ответа по меньшей мере в течение 3 месяцев после инъекции;
на фиг. 3A-3C представлена полученная оптомоторным анализом иллюстрация того, что зрительнореактивное поведение восстанавливалось у мышей GC1KO, обработанных либо smCBA-mGC1, либо hGRK1-mGC1. M1-M9 соответствует девяти использованным для тестирования мышам. При проверке остроты зрения и контрастной чувствительности контрольных мышей +/+ (M1, M2), интактных мышей GC1KO (M3, M4), smCBA-mGC1-обработанных (M5, M6, M7) и hGRK1-mGC1-обработанных (М8, М9) мышей было выявлено, что поведение мышей было сродни таковому у мышей с нормальным зрением (фиг. 3B и 3C). Представлены средние значения по всем глазам +/+ (n=4), глазам GC1KO (n=9) и AAV-mGC1-обработанным глазам (n=5) (фиг. 3C). Для электрофизиологического сравнения приведены опосредованные колбочками ответные электроретинограммы (ERG) от каждой мыши (М1-М9) (фиг. 3A);
на фиг. 4A-4F показана экспрессия GC1 под действием AAV5-hGRK1-mGC1 в наружных сегментах мышей GC1KO (фиг. 4A). Отсутствие экспрессии GC1 наблюдается в необработанном контралатеральном контрольном глазу (фиг. 4B). Экспрессия GC1 под действием AAV5-smCBA-mGC1 в наружных фоторецепторных сегментах (фиг. 4C) и время от времени собственно в самих фоторецепторных клетках (белые стрелки на фиг. 4F). Отсутствие такой экспрессии GC1 наблюдается в необработанном контралатеральном контрольном глазу (фиг. 4D). Уровни терапевтической трансгенной экспрессии в AAV5-mGC1-обработанных глазах сходны с таковой, наблюдаемой в изогенных контрольных глазах +/+ (фиг. 4E). Все сетчатки брали у мышей через 3 месяца после обработки или у необработанных контрольных мышей соответствующих возрастов. Масштабные линейки на фиг. 4A = 100 мкм; на фиг. 4F = 25 мкм. OS = наружные сегменты, IS = внутренние сегменты, ONL = наружный ядерный слой;
на фиг. 5A-5D показана экспрессия аррестина колбочек в колбочковидных зрительных фоторецепторах мышей +/+, мышей GC1KO, AAV5-smCBA-mGC1-обработанных и AAV5-hGRK1-mGC1обработанных мышей. Необработанные сетчатки мышей GC1KO содержат характерные беспорядочные отслоившиеся наружные сегменты колбочек (фиг. 5B), тогда как у обработанных GC1KO наружные сегменты колбочек были интактными и распределение аррестина колбочек выглядело нормальным на срезах сетчатки у обработанных мышей GC1KO (фиг. 5C и 5D) и мышей +/+ (фиг. 5A). Все сетчатки были взяты у мышей через 3 месяца после обработки или у необработанных контролей соответствующих возрастов. Масштабные линейки на фиг. 5D = 100 мкм. OS = наружные сегменты, IS = внутренние сегменты, S = окончания синапсов;
на фиг. 6A-6D показаны результаты обработки AAV-mGC1 в отношении предохранения колбочковидных зрительных фоторецепторов в обработанных глазах по меньшей мере в течение 3 месяцев после обработки. Репрезентативные тотальные препараты сетчатки из исследования hGRK1-mGC1 (фиг. 6A: no TX = необработанные; фиг. 6C: TX = обработанные) и из исследования smCBA-mGC1 (фиг. 6B: no TX = необработанные; фиг. 6D: TX = обработанные), а также из контралатеральных глаз, в которые не осуществляли инъекции, окрашенных на предмет обнаружения аррестина колбочек, позволили выявить, что фоторецепторы колбочек защищены у мышей GC1KO, обработанных AAV-mGC1, по меньшей мере в течение 3 месяцев после обработки. Плотности клеток колбочковидных зрительных фо- 10 035893 торецепторов подсчитывали в центральных и нижерасположенных слоях сетчатки обработанных и не обработанных мышей. Значительные различия были обнаружены в обеих зонах после обработки каждым из вирусных векторов;
на фиг. 7 проиллюстрирован каскад фотопреобразования у позвоночных. Под действием стимуляции светом конформационные изменения в родопсине (R) вызывают каскад явлений, включая активацию трансдуцина (Т) и фосфодиэстеразы цГМФ (PDE), что в конечном счете приводит к гидролизу цГМФ. Такое уменьшение уровня внутриклеточного цГМФ вызывает закрытие воротных каналов циклических нуклеотидов (CNG) в наружных сегментах мембран фоторецепторов. Закрытие указанных каналов вызывает гиперполяризацию клетки и, следовательно, драматический спад уровня внутриклеточного кальция. Когда уровни кальция падают, несвязанный активирующий гуанилатциклазу белок (GCAP) свободен для стимуляции гуанилатциклазы (GC). GC играет роль в восстановительной фазе фотопреобразования, когда его целью является продуцирование цГМФ. Когда уровни цГМФ достаточно повышены под действием GC, цГМФ-воротные каналы вновь открываются, вызывая деполяризацию клетки и возврат к адаптированному к темноте состоянию;
на фиг. 8 приведена предсказанная структура и топология retGC1, которая проявляет гомологию с другими гуанилатциклазами с единственной трансмембранной областью петли, внутриклеточным и внеклеточным доменом. Кроме того, внутриклеточный домен разделен на киназоподобную область и каталитический домен. Кальций- и GCAP1-зависимая регуляция retGC1 регулируется через внутриклеточные домены (KHD). Когда концентрация кальция в клетке фоторецептора высокая (в темновом/деполяризованном состоянии), кальций-связанный GCAP1 предотвращает активацию retGC1. При световой стимуляции уровни кальция снижаются. Кальций высвобождается из GCAP1, тем самым позволяя GCAP1 активировать retGC1. Роль retGC1 заключается в том, чтобы продуцировать цГМФ;
на фиг. 9 изображены фоторецепторы колбочек у нормальных (WT) мышей и мышей GC1KO. В колбочках мышей WT, GC1 функционирует нормально, продуцируя цГМФ, который может эффективно повторно открывать CNG-воротные каналы и возвращать клетку в ее адаптированное к темноте/деполяризованное состояние. В фоторецепторах колбочек мышей GC1KO GC1 не способна продуцировать цГМФ. Это препятствует повторному открытию CNG-воротных каналов. Такие клетки являются, по существу, хронически гиперполяризованными (адаптированными к свету). Они не преобразуют свет для зрения (что подтверждается отсутствием ERG) и в конечном счете подвергнутся вырождению;
на фиг. 10 представлено выравнивание аминокислотной последовательности бычьей GC1 (bov GC1) и мышиной GC1 (mGC1) с включенной консенсусной последовательностью. Вариабельная область, локализованная в N-концевой части, выделена прямоугольником;
на фиг. 11 приведены карты двух иллюстративных векторов. Один из них содержит убиквитарный промотор smCBA, тогда как другой использует фоторецептор-специфический промотор, hGRK1;
на фиг. 12 представлен репрезентативный срез сетчатки глаза мышей GC1KO, в который инъецировали AAV5-smCBA-mGC1, и окрашенный на GC1 и на лецитин PNA, в которым в наружных сегментах колбочек выявляется экспрессия GC1 (верхний слой), так же как и в наружных сегментах палочек. Такая же картина была выявлена и в hGRK1-mGC1-инъецированных глазах;
на фиг. 13A-13C показано AAV-опосредованное восстановление функции сетчатки у мышей GC1KO.
Фиг. 13A: репрезентативные фотопические (опосредованные колбочками) картины электроретинограмм (ERG), полученных из глаз мышей GC1KO на сроке ~Р14, обработанных AAV5-hGRK1-mGC1, AAV5-smCBA-mGC1 или AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 или соответствующих по возрасту изогенных контролей GC1+/+. Картины электроретинограмм получали через 4 месяца (слева), 7 месяцев (посередине) и 9 месяцев (справа) после инъекции.
Фиг. 13B: средние значения амплитуд фотопических бета-волн, получаемых помесячно под действием стимула в 12 кд-ср/м2 (кандела-стерадиан/м2 (cds/m2)) у обработанных мышей GC1KO, необработанных мышей GC1KO и соответствующих по возрасту изогенных контрольных мышей GC1+/+.
Фиг. 13C: скотопические (опосредованные палочками) ответные реакции у обработанных и необработанных мышей GC1KO с течением времени. Значения представляют собой отношение амплитуд палочковидных бета-волн, получаемых при 5 кд-ср/м2 на обработанных и необработанных глазах. Все три вектора обеспечивали стабильную долговременную терапию мышам GC1KO, при этом обработка AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 была наиболее эффективной;
фиг. 14: мышей GC1KO, обработанных AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, забивали через 7 месяцев после инъекции. AAV5-smCBA-mGC1-обработанных и AAVS-hGRK1-mGC1-обработанных мышей забивали через 9 месяцев после инъекции. Их глаза, так же как и глаза ~11-месячных мышей GC1+/+, разрезали и сетчатку окрашивали антителами, полученными против GC1 (верхний ряд) и аррестина колбочек (нижний ряд). Все три терапевтических вектора осуществляли экспрессию GC1 исключительно в фоторецепторах мышей GC1KO. Некоторое утончение сетчатки наблюдалось у AAV5-hGRK1-mGC1обработанных мышей - результат, который можно скорее всего отнести за счет высокого титра указанного вектора. Экспрессия GC1 и плотность/морфология колбочек у мышей, обработанных AAV8(Y733F) и
- 11 035893 обработанных AAV5-smCBA, напоминала таковую, наблюдаемую у соответствующих по возрасту контрольных мышей GC1+/+. И наоборот, в сетчатках соответствующих по возрасту мышей GC1KO было выявлено отсутствие экспрессии GC1 и значительное уменьшение плотности колбочковидных зрительных клеток;
на фиг. 15 представлена картина вестерн-блоттинга сетчаток одной мыши GC1KO, которая была забита через 7,5 месяцев после инъекции AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1. С помощью антител против GC1 показано, что уровень AAV-опосредованной экспрессии GC1 в глазу обработанной мыши GC1KO сходен с таковым в глазу соответствующих по возрасту изогенных контрольных мышей GC1+/+. Уровни экспрессии активирующего гуанилатциклазу белка-1 (GCAP1) (биохимического партнера гуанилатциклазы) также оценивали у обработанных и необработанных мышей GC1KO, а также в контрольных глазах GC1+/+. В соответствии с прежними сообщениями, белок GCAP1 вызывал тормозящий эффект в необработанных глазах мышей GC1KO. AAV-опосредованная экспрессия GC1 вызывает повышенную экспрессию GCAP1, сходную с уровнями, наблюдаемыми у изогенных контрольных мышей GC1+/+;
на фиг. 16A и 16B представлены результаты, полученные на одной мыши GC1KO, которая была забита через 11 месяцев после инъекции AAV5-smCBA-mGC1 и цельные сетчатки которой окрашивали антителом, полученным против аррестина колбочек. С помощью иммуностатина было выявлено, что, за исключением верхнего слоя сетчатки, в глазу необработанной мыши GC1KO колбочки отсутствуют (фиг. 16A). AAV-опосредованная экспрессия GC1 предохраняет колбочковидные фоторецепторы по всей толщине сетчатки обработанного глаза (фиг. 16B) в течение по меньшей мере 11 месяцев (последний срок наблюдения);
на фиг. 17 проиллюстрированы данные по мышам GC1KO, которых инъецировали AAV8(733)hGRK1-mGC1 и забивали через 4 месяца и через 7 месяцев после инъекции. Мышей GC1KO, которых инъецировали AAV5-smCBA-mGC1 и AAV5-hGRK1-mGC1, забивали через 7 месяцев и через 10 месяцев после инъекции. Соответствующих по возрасту интактных мышей GC1KO использовали в качестве контролей. Оптические нервы из обработанных и необработанных глаз, а также части правого мозга и левого мозга, содержащие зрительные проводящие пути, были изолированы и использованы для воссоздания векторных геномов. При этом всегда AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 инъецировали мышам GC1KO в левый глаз, а оба вектора AAV5 инъецировали мышам GC1KO в правый глаз. Векторные геномы во всех случаях воссоздавали только из зрительных нервов обработанных глаз. По прошествии 10 месяцев после инъекции векторов AAV5 никаких векторных геномов из мозга воссоздать не удавалось. Наибольшее количество векторных геномов было воссоздано из мышей GC1KO, которых инъецировали сильным, быстродействующим вектором AAV8(733);
на фиг. 18A и 18B проиллюстрированы данные электроретинограмм (ERG) ОСТ и палочек/колбочек из мышей GCdko через 2 месяца после инъекции AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1;
на фиг. 19A и 19B проиллюстрированы данные репрезентативных электроретинограмм (ERG) палочек и колбочек из мышей GCdko через один месяц после инъекции AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1;
на фиг. 20A и 20B показаны стандарты RT-PCR в реальном времени. Интенсивность флуоресценции (логарифмические единицы по оси Y) отложена против пороговых значений Ст циклов (по оси X). Каждая панель представляет собой стандартные кривые (полученные путем серийного разведения тотальной кДНК сетчатки) для транскрипта GC1 и Gapdh с помощью кДНК сетчатки либо мышей дикого типа, GC1+/+ (a), либо мышей GC1KO, обработанных AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1. Стандартные кривые, полученные с использованием набора праймеров GC1 и Gapdh, были параллельны таковым при использовании любой матрицы, что указывает на сходную кинетику амплификации. Значение цикла Ст увеличивается с уменьшением количества матрицы;
на фиг. 21A и 21B представлена экспрессия GC1 и аррестина колбочек в сетчатке обработанных и необработанных мышей GC1KO и контрольных мышей GC1+/+.
Фиг. 21A: иммуногистохимию замороженных поперечных срезов сетчатки использовали для определения локализации экспрессии векторов GC1 (верхний ряд) и аррестина колбочек (нижний ряд) у мышей GC1KO, обработанных AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 (через 7 месяцев после инъекции), AAV5-smCBA-mGC1 (через 10 месяцев после инъекции) или AAV5-hGRK1-mGC1 (через 10 месяцев после инъекции), а также сетчатки 8-месячных необработанных мышей GC1KO и контрольных мышей GC1+/+. Ядра окрашивали с помощью DAPI. Все срезы визуализировали при 20х увеличении и экспонировали в одинаковых условиях.
Фиг. 21B: иммуноокрашивание цельных препаратов сетчатки от одной мыши GC1KO через 11 месяцев после обработки AAV5-smCBA-mGC1 (только одного глаза) антителом против аррестина колбочек выявило значительный предохранительный эффект в отношении фоторецепторов колбочек в обработанном глазу (внизу справа) по сравнению с необработанным контралатеральным контрольным глазом (внизу слева). Цельные препараты сетчатки были сориентированы сходным образом с их темпоральными частями в положении на 12 часах. Части цельных препаратов визуализировали при 10х увеличении и соединяли вместе для окончательной презентации. OS = наружные сегменты; ONL = наружный ядерный слой; INL = внутренний ядерный слой;
- 12 035893 на фиг. 22A и 22B представлены опосредованные колбочками электроретинограммы (ERG) обработанных и необработанных мышей GC1KO и необработанных контрольных глаз мышей GC1+/+.
Фиг. 22A: репрезентативные опосредованные колбочками электроретинограммы, полученные под действием светового стимула в 12 кд-ср/м2 из глаз мышей GC1KO, обработанных AAV5-hGRK1-mGC1, AAV5-smCBA-mGC1 или AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 (черная линия), или из глаз необработанных соответствующих по возрасту контрольных мышей GC1+/+. Показаны репрезентативные электроретинограммы, полученные между 4-месячным и 1-годичным интервалом после обработки (верхняя панель). Масштаб: ось y = 50 мкВ, ось x = 20 мс.
Фиг. 22B: максимальные амплитуды колбочковых бета-волн (вырабатываемые при 12 кд-ср/м2) рассчитывали для каждой мыши и усредняли помесячно для каждой группы обработки, а также для группы соответствующих по возрасту необработанных мышей GC1KO и контрольных мышей GC1+/+. Сравнения проводили между группами животных с n>3. Все AAV-обработанные группы статистически сравнивали с 6-месячным сроком после обработки. Глаза, обработанные вектором AAV5, статистически сравнивали с 9-месячным сроком после обработки;
на фиг. 23A и 23B представлены опосредованные палочками электроретинограммы (ERG) обработанных и необработанных мышей GC1KO и контрольных глаз мышей GC1+/+.
Фиг. 23A: амплитуды палочковых бета-волн (вверху слева) и амплитуды альфа-волн (вверху справа), полученные под действием стимула в 1 кд-ср/м2 в скотопических условиях, определяли в обработанных и необработанных глазах мышей GC1KO, обработанных вектором AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, вектором AAV5-hGRK1-mGC1 или вектором AAV5-smCBA-mGC1. Межмышиные соотношения обработанных и необработанных глаз получали путем деления максимума амплитуды альфа-волн или бета-волн в обработанных глазах на максимум амплитуды в необработанном глазу. Указанные соотношения усредняли помесячно во всех обрабатываемых группах. Сравнения проводили между группами животных с n>3. Все AAV-обработанные группы статистически сравнивали с 6-месячным сроком после обработки. Векторы AAV5 статистически сравнивали с 9-месячным сроком после обработки. Опосредованное вектором улучшение определяли по среднему отношению >0,8.
Фиг. 23B: репрезентативные опосредованные палочками электроретинограммы (ERG) от одной мыши GC1KO показали, что реакции палочек из глаза, обработанного AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, были выше таковых, регистрируемых из необработанного контралатерального контрольного глаза. Указанная реакция палочек из обработанного глаза восстанавливалась до ~50% таковой нормальной реакции палочек GC1+/+;
н фиг. 24A и 24B приведены уровни белка и транскрипта в случае обработанных и необработанных мышей GC1KO и контрольных мышей GC1+/+.
Фиг. 24A: иммуноблот лизатов сетчатки из глаза одной мыши GC1KO через 10 месяцев после обработки AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 и зондирования анти-ОШ- и анти-GCAP1-антителами. Антитело против β-актина использовали в качестве внутреннего контроля загрузки.
Фиг. 24B: полуколичественная RT-PCR в режиме реального времени нескольких транскриптов (GC1, GCAP1, GNAT2 и PDE6a) в одной сетчатке GC1KO, обработанной AAV5-smCBA-mGC1, в одной сетчатке GC1KO, обработанной вектором AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, и в отдельных необработанных сетчатках GC1KO или контрольных сетчатках GC1+/+. Образцы выполняли в трех повторах с использованием Gapdh-специфических праймеров в качестве стандарта. Данные представлены в виде кратных изменений уровней мРНК относительно контроля GC1+/+.
Описание иллюстративных воплощений
Иллюстративные воплощения настоящего изобретения описаны ниже. В интересах большей ясности изложения, в настоящем документе описаны не все признаки фактической реализации. Конечно, следует иметь в виду, что фактически при разработке любого такого воплощения разработчиками должно быть принято некоторое количество специфических для каждого воплощения решений для достижения конкретных целей, таких как соблюдение соответствия с ограничениями, связанными с особенностями системы и бизнеса, которые будут меняться от одного варианта реализации к другому. Более того, следует иметь в виду, что такие усилия разработчиков могут быть комплексными и времяемкими, но тем не менее они будут рутинными для специалистов в той области, к которой относится настоящее описание.
Аденоассоциированный вирус.
Аденоассоциированный вирус-2 (AAV) является человеческим парвовирусом, который может распространяться и как литический вирус, и как провирус (Cukor et al., 1984; Hoggan et al., 1972). Вирусный геном состоит из линейной одноцепочечной ДНК (Rose et al., 1969), составляющей в длину 4679 оснований (Srivastava et al, 1983), фланкированной инвертированными концевыми повторами из 145 оснований (Lusby et al., 1982). Для литического роста AAV требуется со-инфицирование вирусом-помощником (вирусом-хелпером). Либо аденовирус (Atchinson et al., 1965; Hoggan, 1965; Parks et al., 1967), либо вирус простого герпеса (Buller et al., 1981) можно наделить хелперной функцией (функцией помощника). Без хелпера AAV-специфическая репликация или экспрессия генов неочевидна (Rose and Koczot, 1972; Carter et al., 1983). В отсутствие хелпера AAV может персистировать в виде интегрированного провируса
- 13 035893 (Hoggan, 1965; Berns et al., 1975; Handa et al., 1977; Cheung et al., 1980; Berns et al., 1982).
Интеграция, по всей видимости, включает в себя рекомбинацию между концами AAV и хозяйскими последовательностями, и большинство последовательностей AAV остается интактными в составе провируса. Способность AAV интегрироваться в хозяйскую ДНК, по всей вероятности, является присущей ему от природы стратегией для надежного выживания последовательностей AAV в отсутствие вирусапомощника. Когда впоследствии клетки, несущие провирус AAV, суперинфицируют хелпером, с интегрированного генома AAV снимается блокада и возникает продуктивный литический цикл (Hoggan, 1965).
Последовательности AAV, клонированные в прокариотические плазмиды, являются инфекционными (Samulski et al., 1982). Например, когда плазмиду AAV/pBR322 дикого типа, pSM620, трансфицируют в человеческие клетки в присутствии аденовируса, последовательности AAV высвобождаются из плазмиды, и в результате получается нормальный литический цикл AAV (Samulski et al., 1982). Это дает возможность модифицировать последовательности AAV в рекомбинантной плазмиде, чтобы затем вырастить мутантный штамм вирусов путем трансфекции плазмиды в человеческие клетки (Samulski et al., 1983; Hermonat et al., 1984). AAV содержит по меньшей мере три фенотипически различные области (Hermonat et al., 1984). Область rep кодирует один или несколько белков, которые необходимы для репликации ДНК и для высвобождения из рекомбинантной плазмиды, тогда как области cap и lip нужны для кодирования капсидных белков AAV, и мутанты внутри этих областей способны к репликации ДНК (Hermonat et al., 1984). Показано, что концы AAV необходимы для репликации ДНК (Samulski et al., 1983).
Laughlin et al. (1983) описали конструкцию двух гибридных плазмид E.coli, каждая из которых содержит полную геномную ДНК AAV, и трансфекцию указанных рекомбинантных ДНК в линии клеток человека в присутствии хелперного рекомбинантного аденовируса для успешного высвобождения и репликации генома AAV (См. также Tratschin et al., 1984a; 1984b).
Аденоассоциированный вирус (AAV) является особенно привлекательным для переноса генов, поскольку он не вызывает какого бы то ни было патогенного ответа и может интегрироваться в хромасому клетки-хозяина (Kotin et al., 1990). Концевые повторы в AAV (TR) являются единственно существенными цис-компонентами для интеграции в хромосому (Muzyczka and McLaughin, 1988). Сообщалось, что указанные TR обладают промоторной активностью (Flotte et al., 1993). Они могут осуществлять промоцию переноса эффективного гена из цитоплазмы в ядро или повышать стабильность плазмидной ДНК и способны к более длительной экспрессии генов (Bartlett and Samulski, 1998). Исследования с использованием рекомбинантных ДНК плазмид, содержащих концевые повторы AAV, привлекли значительный интерес. Показано, что плазмиды на основе AAV способны к более высокому уровню и более длительной экспрессии трансгенов, чем идентичные плазмиды, лишенные концевых повторов AAV в большинстве клеток разных типов (Philip et al., 1994; Shafron et al., 1998; Wang et al., 1998).
Существует несколько факторов, которые ускорили исследователям изучение возможности использования rAAV в качестве экспрессирующего вектора. Одним из них является то, что требований, необходимых для доставки гена для его интеграции в хромосому хозяина, оказалось неожиданно мало. Необходимо иметь инвертированные концевые повторы (ITR) в 145 п.н., которые составляют только 6% генома AAV. Это оставляет в векторе место для присоединения ДНК-вставки размером в 4,5 т.н. Несмотря на то, что такая емкость может препятствовать AAV в доставке крупных генов, ее вполне достаточно для доставки антисмысловых конструкций согласно настоящему изобретению.
AAV, в силу его безопасности, является также хорошим выбором для доставки носителей. Существует относительно сложный механизм высвобождения: для мобилизации rAAV требуется не только аденовирус дикого типа, но также и гены AAV. Сходным образом, AAV не является патогенным и не ассоциирован с каким-либо заболеванием. Удаление вирусных кодирующих последовательностей минимизирует иммунные реакции на экспрессию вирусного генома, и следовательно, rAAV не вызывает воспалительного ответа. Следовательно, AAV является идеальным кандидатом для доставки кодирующих гуанилатциклазу полинуклеотидов согласно настоящему изобретению.
Продуцирование векторов.
Традиционные методики продуцирования векторов rAAV обычно основаны на трехкомпонентной системе. Одним компонентом указанной системы является провирусная плазмида, кодирующая упаковку рекомбинантной ДНК в виде rAAV. Такая рекомбинантная ДНК локализована в AAV-2 между инвертированными концевыми повторами (ITR) размером в 145 пар нуклеотидов (п.н.), которые являются минимальными цис-действующими последовательностями AAV-2, которые направляют репликацию и упаковку вектора. Вторым компонентом указанной системы является плазмида, кодирующая гены AAV-2, rep и cap. Ген rep в AAV-2 кодирует четыре белка Rep (Rep 78, 68, 52 и 40), которые для репликации генома rAAV действуют в транс-форме, расщепляют репликативные промежуточные соединения, а затем упаковывают одноцепочечные геномы rAAV. Ген cap в AAV-2 кодирует три структурных белка (VP1, VP2 и VP3), которые образуют вирусную капсулу (капсид). Поскольку AAV-2 сам по себе реплицируется неохотно, третьим компонентом упаковывающей системы rAAV является набор хелперных функций из другой вирусной ДНК. Указанные хелперные функции создают клеточное окружение, в котором мо- 14 035893 гут эффективно протекать процессы репликации и упаковки rAAV. Хелперные функции, обеспечиваемые аденовирусом (Ad), почти исключительно используются для продуцирования rAAV и кодируются генами E1a, E1b, E2a, E4orf6 и VA RNA. Несмотря на то, что первые два компонента указанной системы обычно вводят в клетки, в которых процессы репликации и упаковки осуществляются путем трансфекции, хелперные функции вводят путем суперинфицирования вирусом дикого типа Ad.
Традиционные технологии продуцирования rAAV ограничены их способностью продуцировать большие количества вектора в силу врожденной неэффективности их трансфекции. Серьезные трудности обнаруживаются также тогда, когда увеличивается масштаб трансфекции. Требованием к Ad дикого типа может быть также и уменьшение количества продуцируемого rAAV, поскольку Ad может конкурировать за клеточные и вирусные субстраты, которые необходимы для вирусной репликации, но присутствуют только в ограниченных количествах. Другой проблемой, обнаруживаемой в традиционных методиках продуцирования, является то, что суперинфицирование аденовирусом (Ad) требует разработки эффективных процедур очистки Ad от продуцируемого rAAV. Несмотря на то, что указанные процедуры очистки обычно являются успешными при элиминации примесей Ad из препаратов rAAV, они в то же время снижают титры rAAV. Необходимы также жесткие анализы на предмет определения наличия контаминации rAAV аденовирусом.
Для продуцирования rAAV используют процедуру двойной со-трансфекции, чтобы ввести векторную плазмиду rAAV для переноса генов вместе с pDG (Grimm et al., 1998). Хелперная плазмида AAV, несущая rep- и cap-гены AAV, а также хелперные гены Ad, необходима для репликации и упаковки rAAV в молярном отношении 1:1. Плазмидную ДНК, используемую при трансфекции, очищали согласно общеприменимой методике щелочного лизиса/градиента CsCl. Трансфекцию производили следующим образом: клетки 293 накануне эксперимента разделяли в соотношении 1:2 с тем, чтобы при трансфекции конфлюентность клеток составляла 75-80%. Десять 15-см планшетов трансфицировали в составе одной партии. Для получения CαPO4-преципитата 0,7 мг pDG смешивали со 180 мкг векторной плазмиды для переноса генов rAAV в общем объеме 12,5 мл 0,25 М CaCl2. Старую среду удаляли из-под клеток и образование CαPO4-преципитата инициировали путем добавления 12,5 мл 2x HBS (pH 7,05), который предварительно нагревали до 37°C, к раствору ,3HK-CaCl2. Указанную ДНК инкубировали в течение 1 мин и смесь переносили в 200 мл предварительно нагретой DMEM-10% ЭБС, затем образование преципитата останавливали. По 22 мл сразу же раскапывали в лунки каждого планшета и клетки инкубировали при 37°C в течение 48 ч. СаРО4-преципитат оставался в клеточной среде в течение всего периода инкубации, не влияя на жизнеспособность клеток. Через 48 ч после трансфекции клетки собирали путем центрифугирования при 1140xg в течение 10 мин. Затем клетки лизировали в 15 мл 0,15 М MGC12, 50 мМ Tris-HCl (pH 8,5) путем трехкратного замораживания/оттаивания в этаноле с сухим льдом и водяных банях с температурой 37°C. Бензоназу (Nycomed Pharma A/S, соответствующей степени очистки) добавляли к указанной смеси (в конечной концентрации 50 Ед./мл в конечной концентрации) и лизат инкубировали в течение 30 мин при 37°C. Лизат осветляли путем центрифугирования при 3,700xg в течение 20 мин и вируссодержащий супернатант дополнительно очищали, используя непрерывный градиент плотности.
Обычного непрерывного ступенчатого градиента достигают путем подслаивания и вытеснения менее плотного клеточного лизата йодиксанолом, 5,5-[(2-гидрокси-1-3-пропандиил)-бис-(ацетиламино)] бис-[ЫХ'-бис-(2,3-дигидроксипропил-2-4,6-трийодо-1,3-бензенкарбоксамидом], полученным с использованием 60% (вес./об.) стерильного раствора OptiPrep (Nycomed). Конкретно, 15 мл осветленного лизата переносили в центрифужную пробирку Quick-Seal Ultra-Clear 25x89 мм (Beckman) с помощью шприца, снабженного иглой 1/27x89 мм для спинномозговой пункции. Следует быть осторожными, во избежание пузырьков, которые могут мешать последующему заполнению и закупориванию пробирки. Перистальтический насос с различными скоростями, Model EP-1 (Bio-Rad), использовали для наслаивания в следующем порядке: 9 мл 15% йодиксанола и 1 М NaCl в буфере PBS-MK, содержащем феноловый красный (2,5 мкл 0,5% сток-раствора на 1 мл раствора йодиксанола); 5 мл 40% йодиксанола в буфере PBS-MK и, наконец, 5 мл 60% йодиксанола в буфере PBS-MK, содержащем феноловый красный (0,1 мкл/л). Пробирки закупоривали и центрифугировали на Ti-роторе типа 70 (Beckman) при 350000xg в течение 1 ч при 18°C. 4 мл прозрачного раствора на 40% ступени отсасывали, прокалывая пробирку сбоку шприцем, снабженным иглой 18 размера со скошенным концом. Фракцию йодиксанола дополнительно очищали методом обычной аффинной хроматографии на гепарин-агарозе.
Обычно для хроматографии предварительно набитую гепарин-агарозой 2,5-мл колонку типа I (Sigma) уравновешивали под действием ее собственного веса 20 мл буфера PBS-MK. Затем фракцию йодиксанола rAAV наносили на предварительно уравновешенную колонку и затем колонку промывали 10 мл буфера PBS-MK. rAAV элюировали тем же самым буфером, содержащим 1 М NaCl. После нанесения элюционного буфера первые 2 мл элюента отбрасывали и вирус собирали в последующих 3,5 мл элюционного буфера.
Затем вирус концентрировали и обессоливали путем центрифугирования через фильтр BIOMAX® 100 K (Millipore, Bedford, MA, USA) в соответствии с инструкциями производителя. Буфер с высоким содержанием соли заменяли путем повторных разведений концентрированного вируса лактированным
- 15 035893 раствором Рингера и воспроизведением титра как геном-содержащими частицами, так и инфекционными частицами rAAV. Для определения титра физических частиц использовали обычный дот-блот-анализ, количественный анализ конкурентной PCR (QC PCR) или более современный количественный анализ PCR в режиме реального времени (aRT-PCR) (Zolotukhin et al., 2002; Jacobson et al., 2006). Инфекционные титры определяются анализом инфекционных центров (ICA) и флуоресцентным клеточным анализом (FCA), который позволяет оценить экспрессию GFP (Zolotukhin et al., 2002).
Метод QC PCR основан на конкурентной ко-амплификации в реакционной пробирке специфической последовательности-мишени с плазмидой внутреннего стандарта известной концентрации. Он обеспечивает точное и быстрое количественное определение вирусных частиц. Внутренний стандарт должен иметь сайты распознавания праймера специфической матрицей. Как специфическая матрица, так и внутренний стандарт должны быть PCR-амплифицированы с одинаковой эффективностью, и должна быть обеспечена возможность анализировать PCR-амплифицированные продукты раздельно. Самым легким путем для того, чтобы проводить различие между матрицей и внутренним стандартом, является установление в указанных двух продуктах различий по размерам. Этого можно добиться, например, путем конструирования стандартов, имеющих одинаковую последовательность, в виде специфической мишени, но содержащей делецию. Затем предпринимают количественное определение путем сравнения сигнала PCR специфической матрицы со специфическим сигналом PCR, полученным с известной концентрацией конкурента (внутренний стандарт). Количественная PCR в режиме реального времени (qRT-PCR) является стандартным методом оценки концентрации ДНК неизвестного образца путем сравнения образования продукта PCR в режиме реального времени с известной стандартной ДНК.
Очищенный вирусный штамм сначала обрабатывают ДНКазой I для переваривания любой контаминирующей неупакованной ДНК. Десять из очищенных вирусных штаммов инкубировали 10 Ед. ДНКазы I (Boehringer, Ingelheim am Rhein, Germany) в 100 мкл реакционной смеси, содержащей 50 мМ Tris-HCl (pH 7,5), 10 мМ MGCl2 в течение 1 ч при 37°C. В конце реакции добавляли 10 мкл 10х буфера для протеиназы K (10 мМ Tris-HCl [pH 8,0], 10 мМ ЭДТА, 1% ДСН в конечной концентрации) с последующим добавлением 1 мкл протеиназы K (18,6 мг/мл, Boehringer). Смесь инкубировали при 37°C в течение 1 ч. Вирусную ДНК очищали путем хлороформ/фенольной экстракции (дважды) с последующей экстракцией хлороформом и этанольной преципитацией с использованием 10 мкг гликогена в качестве носителя. Осадок ДНК растворяли в 100 мкл воды. Каждая из реакционных смесей QC PCR содержала 1 мкл разбавленной вирусной ДНК и двукратные серийные разведения плазмидной ДНК внутреннего стандарта, такой как pdl-GFP. Было обнаружено, что наиболее достоверный разброс стандартной ДНК составляет от 1 до 100 пг. Затем аликвоты каждой из реакций изучали методом электрофореза в 2% агарозном геле, пока два этих продукта PCR не разделялись. Аналогичную картину геля, окрашенного бромидом этидия, отцифровывали с помощью системы ImageStore 7500 (UVP; Upland, CA, USA). Плотности полос мишени и конкурента в каждой дорожке измеряли с помощью системы анализа изображений ZERO-Dscan, версия 1.0 (Scanalytics, Rockville, MD, USA) и их отношение наносили в виде функции концентрации стандартной ДНК. Отношение, соответствующее 1,0, при котором число молекул вирусной ДНК равно числу молекул конкурентной ДНК, использовали для определения концентрации ДНК вирусного штамма.
Модификацию опубликованного ранее протокола (McLaughlin et al., 1988) использовали для определения способности вируса к инфицированию клеток C12, распаковке и репликации. Вкратце, клетки C2, содержащие интегрированные wtAAV rep- и cap-гены (Clark et al., 1995), помещали в 96-луночный планшет приблизительно при 75% конфлюентности, затем инфицировали Ad5 при M.O.I порядка 20. Одно из серийных разведений rAAV-sCNTF визуально оценивали с помощью флуоресцентного микроскопа. Высокочувствительный фильтр CHROMA #41012 HighQ FITC LP (Chroma Technology, Bellows Fall, VA, USA) использовали для мониторинга флуоресценции. Для расчета титра путем гибридизации клетки собирали и обрабатывали в основном так, как было описано ранее (McLaughlin et al., 1988).
Фармацевтические композиции.
В определенных воплощениях настоящее изобретение относится к составам из одной или нескольких описанных здесь rAAV-гуанилатциклазных композиций в фармацевтически приемлемых растворах для введения в клетку или в организм животного, отдельно или в сочетании с одним или несколькими другими терапевтическими средствами.
Должно быть понятно также, что в случае необходимости композиции пептидилнуклеиновой кислоты (PNA), РНК, ДНК или сегмента нуклеиновой кислоты, которые экспрессируют продукт терапевтического гена, как здесь описано, могут быть введены в сочетании с другими средствами, такими, например, как белки или полипептиды, или различные фармацевтически активные средства, включая одно или несколько системных или местных введений гуанилатциклазных полипептидов. На самом деле фактически нет ограничений для других компонентов, которые также могут быть включены, при том условии, что указанные дополнительные средства не вызывают существенных нежелательных побочных эффектов при контакте с клетками-мишенями или тканями-хозяевами. rAAV-направленные гуанилатциклазные композиции могут, таким образом, быть доставлены вместе с разными другими средствами, если это необходимо в том или ином конкретном случае. Такие композиции могут быть очищены от клеток- 16 035893 хозяев или других биологических источников или, альтернативно, могут, как здесь описано, быть синтезированы химическим путем. Сходным образом, такие композиции могут дополнительно содержать замещенные или дериватизированные композиции РНК, ДНК или ПНК.
Композиция растворов фармацевтически приемлемых эксципиентов и носителей хорошо известна специалистам в данной области, поскольку является разработкой подходящих режимов дозирования и схем лечения для применения описанных здесь конкретных композиций в различных схемах лечения, включая, например, пероральное, парентеральное, внутривенное, интраназальное, внутримышечное и прямое введение в одну или несколько клеток или типов тканей внутри организма животного, включая, например, глаз, сетчатку и субретинальную инъекцию и т.д.
Обычно указанные композиции могут содержать по меньшей мере приблизительно 0,1% или более активного соединения, хотя и процент активного ингредиента (ингредиентов) может, конечно, быть изменен и обычно может составлять приблизительно от 1 или 2% и приблизительно до 60 или 70% или более от веса или объема всей композиции. Естественно, что количество активного соединения (соединений) в каждой терапевтически используемой композиции может быть получено таким образом, чтобы подходящая дозировка содержалась в любой конкретной лекарственной форме композиции. Такие факторы, как растворимость, биодоступность, время полужизни, путь введения, срок годности продукта, а также другие фармакологические свойства, будут приниматься в расчет специалистами в области изготовления таких фармацевтических композиций, и, по существу, могут потребоваться разные дозы и схемы лечения.
При определенных обстоятельствах потребуется доставка описанных здесь фармацевтических композиций парентеральным путем, внутривенным, внутримышечным или даже, как описано, внутрибрюшинным путем (см., например, патенты США № 5543158; 5641515 и 5399363, каждый из которых специально и в полном объеме включен в настоящее описание в виде ссылки). Растворы активных соединений в виде свободного основания или фармакологически приемлемых солей могут быть получены в воде, смешанной соответствующим образом с поверхностно-активным веществом, таким как гидроксипропилцеллюлоза. Дисперсии могут быть получены также в глицерине, в жидких полиэтиленгликолях и их смесях, а также в маслах. При определенных условиях хранения и применения указанные препараты содержат консервант для предотвращения роста микроорганизмов.
Фармацевтические формы, подходящие для применения путем инъекций, включают в себя стерильные водные растворы или дисперсии и стерильные порошки для немедленного приготовления стерильных растворов для инъекций или дисперсий (см., например, патент США № 5466468, специально и в полном объеме включенный в настоящее описание в виде ссылки). Во всех случаях такая лекарственная форма должна быть стерильной и должна быть в такой степени жидкой, чтобы легко набиралась в шприц. Она должна быть стабильна в условиях производства и хранения и должна быть защищена от контаминирующего действия микроорганизмов, таких как бактерии и грибки. Носителем может быть раствор или дисперсионная среда, содержащая, например, воду, этанол, полиол (например, глицерин, пропиленгликоль и жидкий полиэтиленгликоль и т.п.), их подходящие смеси, и/или растительные масла. Подходящая текучесть может поддерживаться, например, использованием покрытия, такого как лецитин, в случае дисперсии поддержанием требуемого размера частиц и применением поверхностно-активных веществ. Предотвращения действия микроорганизмов можно добиться различными антибактериальными и противогрибковыми средствами, например парабенами, хлорбутанолом, фенолом, сорбиновой кислотой, тимерозалом и т.п. Во многих случаях будет предпочтительным включение изотонических средств, например сахаров или хлорида натрия. Пролонгированного всасывания инъецируемых композиций можно добиться применением в композициях средств, задерживающих абсорбцию, например, моностеарата и желатина алюминия.
Для парентерального введения в водном растворе, например, указанный раствор должен быть, если это необходимо, соответствующим образом забуферен, и жидкому растворителю сначала придают изотоничность достаточным количеством физиологического раствора или глюкозы. Конкретно, эти водные растворы являются особенно подходящими для внутривенного, внутримышечного, подкожного и внутрибрюшинного введения. В этой связи стерильная водная среда, которую можно использовать в свете настоящего описания, хорошо известна специалистам в данной области. Например, одна дозировка может быть растворена в 1 мл изотонического раствора NaCl и либо добавлена к 1000 мл жидкости гиподермоклиза, либо инъецирована в соответствующий участок инфузии (см., например, Remington's Pharmaceutical Sciences 15th Ed., p. 1035-1038 и 1570-1580). Определенные вариации в дозировке непременно возникнут, в зависимости от состояния субъекта, подвергаемого лечению. В любом случае определять подходящую дозу для того или иного субъекта будет лицо, отвечающее за назначение дозировки. Более того, для введения человеку препараты должны отвечать критериям стерильности, пирогенности и общей безопасности и стандартам чистоты, предъявляемым офисом биологических стандартов комиссии Соединенных Штатов Америки по контролю за лекарствами и питательными веществами (FDA).
Стерильные растворы для инъекций получают путем включения активных соединений в требуемых количествах в соответствующий растворитель, в случае необходимости, с разными другими перечисленными здесь ингредиентами, с последующей стерилизацией способом фильтрования. Обычно дисперсии
- 17 035893 получают путем включения различных стерилизованных активных ингредиентов в стерильный носитель, который содержит основную диспергирующую среду и другие ингредиенты из перечисленных выше. В случае стерильных порошков для получения стерильных растворов для инъекций предпочтительными способами являются технологии вакуумной сушки и лиофильной сушки, которые дают на выходе порошок из активного ингредиента плюс какого-нибудь дополнительного требуемого ингредиента из его предварительно отфильтрованного раствора.
Описанные здесь композиции могут быть составлены в нейтральной или солевой форме. Фармацевтически приемлемые соли включают в себя соли присоединения кислот (образованные со свободными аминогруппами белка) и соли, которые образованы с неорганическими кислотами, такими, например, как соляная или фосфорная кислоты, или с такими органическими кислотами, как уксусная, оксалиновая, винная, миндальная и т.п. Соли, образованные со свободными карбоксильными группами, могут быть получены также и из неорганических оснований, таких, например, как гидроксиды натрия, калия, аммония, кальция или гидроксиды железа, а также из таких органических оснований, как изопропиламин, триметиламин, гистидин, прокаин и т.п. При составлении композиции растворы будут вводиться таким способом, который соответствует дозировке композиции, и в таком количестве, чтобы они были терапевтически эффективны. Указанные композиции легко вводятся в различных лекарственных формах, таких как растворы для инъекций, капсулы с высвобождающимся лекарственным средством и т.д.
Здесь носитель включает в себя любой и все растворители, диспергирующие среды, наполнители, вещества для покрывающего слоя, разбавители, антибактериальные и противогрибковые средства, изотонические средства и средства, задерживающие всасывание, буферы, растворы носителей, суспензии, коллоиды и т.п. Применение таких сред и средств для активных фармацевтических веществ хорошо известно специалистам в данной области. За исключением случаев, когда какая-нибудь обычно используемая среда или средство несовместимы с активным ингредиентом, их применение в терапевтических композициях является предусмотренным. В указанные композиции могут быть включены также и добавочные активные ингредиенты.
Фраза фармацевтически приемлемый относится к молекулярным веществам и композициям, которые не вызывают аллергической или сходной с ней нежелательной реакции при введении человеку. Получение водной композиции, которая содержит белок в качестве активного ингредиента, хорошо известно в данной области. Обычно такие композиции получают в виде инъецируемых растворов или в виде жидких растворов или суспензий; могут быть получены также и твердые формы, предназначенные для растворения или суспендирования в жидкости перед инъецированием. Препарат может быть также эмульгирован.
Сравнение последовательностей, определение их идентичности и степени гомологии.
Для сравнения последовательностей и определения степени их гомологии обычно одну последовательность берут в качестве ссылочной последовательности, с которой сравнивают тестируемые последовательности. При использовании алгоритма сравнивания последовательностей тестируемую и ссылочную последовательности вводят в компьютер, если это необходимо, задают координаты подпоследовательностей и устанавливают параметры программы алгоритма последовательности. Затем может быть использован алгоритм сравнения последовательностей для вычисления процента идентичности для тестируемой последовательности(ей) по отношению к ссылочной последовательности на основании установленных параметров программы.
Оптимальное выравнивание последовательностей для сравнения может быть произведено, например, с помощью алгоритма локальной гомологии (см., например, Smith and Waterman, 1981), с помощью алгоритма гомологичного выравнивания (см., например, Needleman and Wunsch, 1970), с помощью метода поиска сравнительного сходства (см., например, Pearson and Lipman, 1988), путем компьютеризированного ввода алгоритмов, таких как GAP, BESTFIT, FASTA и TFASTA, в пакет компьютерного программного обеспечения Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, Madison, WI, USA или же путем визуального анализа. Одним из примеров алгоритма, который является подходящим для определения процента идентичности последовательностей и сходства последовательностей, является алгоритм BLAST (Altschul et al., 1990) и оценочная матрица BLOSUM62 (см., например, Henikoff and Henikoff, 1989). Программным обеспечением для осуществления BLAST-анализов является информация, общедоступная через Национальный Центр Информации по Биотехнологии (www.ncbi.nim.nih.gov/).
Помимо расчета процента идентичности последовательностей, алгоритм BLAST осуществляет также статистический анализ сходства между двумя последовательностями (см., например, Karlin and Altschul, 1993). Другим полезным примером алгоритма выравнивания последовательностей является программа PILEUP, которая создает возможность выравнивания множества последовательностей из группы родственных последовательностей с помощью прогрессивного попарного выравнивания. Может быть также построено дерево с выделением кластеров с общими признаками родства, используемое для реализации выравнивания. В программе PILEUP используется упрощение сравнительного метода прогрессивного выравнивания (см., например, Feng and Doolittle, 1987) и используется матрица общего выравнивания, сходная с таковой, описанной Higgins and Sharp (1989).
- 18 035893
Терапевтические и диагностические наборы.
Настоящее изобретение распространяется также на одну или несколько композиций совместно с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми эксципиентами, носителями, разбавителями, адъювантами и/или другими компонентами, которые могут быть использованы в составлении конкретных rAAV-гуанилатциклазных композиций и в изготовлении терапевтических средств для введения млекопитающему, в частности человеку, при одном или нескольких состояниях дефицита гуанилатциклазы, таких как описанная здесь дистрофия сетчатки наподобие LCA1. В частности, такие наборы могут включать в себя одну или несколько rAAV-направленных гуанилатциклазных композиций в сочетании с инструкциями по применению вирусного вектора в лечении таких расстройств у млекопитающего и обычно могут дополнительно включать в себя контейнеры, изготовленные для создания удобной коммерческой упаковки.
Как таковые, описанные здесь предпочтительные для введения фармацевтических композиций животные включают в себя млекопитающих, в частности человека. Другие предпочтительные животные включают в себя всех приматов, кроме человека; мышей, заячьих, жвачных животных, лошадей, овец, козлов, волков, зайцев, лис, поросят, собак, кошек и т.д. Такая композиция может включать в себя частично или в значительной мере очищенные rAAV-гуанилатциклазные композиции, либо отдельно, либо в сочетании с одним или несколькими дополнительными активными ингредиентами, которые могут быть получены из природных или рекомбинантных источников, или которые могут быть получены или природным путем или в результате химического синтеза, или же которые, альтернативно, могут быть получены in vitro из рекомбинантных клеток-хозяев, экспрессирующих сегменты ДНК, кодирующие такие дополнительные активные ингредиенты.
Могут быть получены также терапевтические наборы, которые содержат по меньшей мере одну из описанных здесь композиций, а также инструкции для применения указанной композиции в качестве терапевтического средства. Контейнерные устройства для таких наборов могут обычно включать в себя по меньшей мере одну ампулу, пробирку, флакон, бутылку, шприц или другие контейнерные устройства, в которые может быть помещена описанная здесь композиция (композиции) rAAV, и предпочтительно в подходящих кратных дозировках. При наличии второй гуанилатциклазной композиции такой набор может содержать также второе, отличающееся от первого, контейнерное устройство, в которое может быть помещена указанная вторая композиция. Альтернативно, может быть получен целый ряд гуанилатциклазных композиций в составе единой фармацевтической композиции, и она может быть упакована в одно контейнерное устройство, такое как ампула, флакон, шприц, бутылка, или другие подходящие единые контейнерные устройства. Наборы, предлагаемые в настоящем изобретении, обычно включают в себя устройства для помещения в них ампулы (ампул) в плотной защитной негерметичной оболочке для коммерческой продажи, такие, например, как инъекционные или литые пластиковые контейнеры, в которые помещают необходимую ампулу (ампулы).
Экспрессия в животных клетках.
Авторы настоящего изобретения считают, что полинуклеотид, содержащий непрерывную последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид гуанилатциклазы согласно настоящему изобретению, может быть использован для лечения одного или нескольких клеточных дефектов в трансформированных клетках-хозяевах. Такими клетками предпочтительно являются животные клетки, включая клетки млекопитающих, например клетки, полученные из организма человека или любого примата, кроме человека, или из организма одного или нескольких видов, включая, без ограничения, мышиные, собачьи, бычьи, лошадиные клетки, клетки заячьих, кошачьих, овечьих, козлиных, волчьих, заячьих, свиные клетки и т.д. Применение таких конструкций для лечения и/или облегчения одного или нескольких симптомов дистрофии сетчатки, таких как LCA1 или родственного ему заболевания, расстройства, состояния или дисфункции сетчатки или глаза у человека, который предположительно страдает таким расстройством или у которого имеется определенный риск развития такого расстройства, считается авторами настоящего изобретения особенно эффективным.
Клетки могут быть трансформированы одним или несколькими векторами rAAV, содержащими один или несколько представляющих интерес терапевтических гуанилатциклазных генов, таких, чтобы генетических конструкций, встроенных и экспрессируемых в клетках-хозяевах указанного животного, было достаточно для изменения, уменьшения, облегчения или предотвращения губительного или болезненного состояния (состояний) или одного или нескольких его симптомов, будь то ex vivo, in vitro, ex situ, in situ и/или in vivo.
Гуанилат циклаза.
Гуанилатциклаза (GC) (EC 4.6.1.2) является лиазой, которая катализирует превращение гуанозинтрифосфатов (ГТФ) в 3',5'-циклический гуанозинмонофосфат (цГМФ) и пирофосфат. Что касается альтернативно упоминаемых в литературе гуанилциклазы или гуанилилциклазы, то обе эти, мембраносвязанная (1 типа) и растворимая (2 типа), формы GC существуют.
Врожденный амовроз Лебера.
Врожденный амавроз Лебера (LCA) является аутосомной рецессивной группой заболеваний, которые представляют собой наиболее раннюю и наиболее тяжелую форму из всех наследственных дистро
- 19 035893 фий сетчатки. Первый ген, участвующий в запуске указанного генетически и клинически гетерогенного заболевания и, следовательно, приписываемый локусу LCA1, является специфичной для сетчатки гуанилатциклазой-1 (Gucy2d) (Perrault et al., 1996). Gucy2d кодирует специфичный для сетчатки белок гуанилатциклазу (retGC1), который экспрессируется в основном в наружных сегментах мембран фоторецепторов и играет роль в регуляции уровней цГМФ и Ca2+ внутри указанных клеток. После световой стимуляции уровни цГМФ внутри наружных сегментов фоторецепторов быстро уменьшаются в силу гидролиза под действием фосфодиэстеразы цГМФ (PDE). Такое уменьшение уровней цГМФ приводит к закрытию цГМФ-воротных каналов, уменьшению притока Ca2+ и гиперполяризации клетки. Такое уменьшение уровней внутриклеточного Ca2+ стимулирует восстановление светочувствительных фоторецепторов до адаптировавшегося к темноте состояния путем их взаимодействия с белками, активирующими гуанилатциклазу (GCAP), семейством кальций-связывающих белков, которые регулируют активность гуанилатциклазы (GC). В адаптированном к темноте фоторецепторе Ca2+-связанные белки GCAP ингибируют активность фермента GC. Однако при световой стимуляции свободные от Ca2+ (Ca2+-несвязанные) белки GCAP стимулируют активность фермента GC, которая вызывает повышение уровней цГМФ, раскрытие цГМФ-воротных каналов и возврат клетки в деполяризованное состояние. Предполагается, что мутации, которые уменьшают или упраздняют способность фермента GC восполнять внутриклеточный уровень цГМФ и повторное раскрытие цГМФ-воротных кальциевых каналов, что и имеет место при LCA1, создают биохимический эквивалент хронического воздействия света в палочковидных и колбочковидных фоторецепторах.
Мутации в Gucy2d насчитывают около 15% всех случаев LCA, что делает их лидирующей причиной данного заболевания. Число пациентов, пораженных LCA1, приблизительно вдвое больше, чем пораженных хорошо известной версией RPE65 данного заболевания (LCA2), формой, в отношении которой в настоящее время проводятся успешные клинические испытания AAV-опосредованной генной терапии, привлекающие внимание во всем мире. Диагноз LCA1 обычно устанавливают в течение нескольких первых месяцев жизни ребенка с полной слепотой или с очень ослабленным зрением, сильно стертой электроретинограммой (ERG) и маятникообразным нистагмом (Perrault et al., 1999; Chung and Traboulsi, 2009). Несмотря на подобный функциональный дефицит, у пациентов с LCA1 многие годы имеется нормальное дно (Perrault et al., 1999) и некоторое количество сохраненных палочковидных и колбочковидных фоторецепторов как в макулярной, так и в периферической зонах сетчатки (Milam et al., 2003; Simonelli et al., 2007; Pasadhika et al., 2009). С использованием оптической когерентной томографии спектральной области (SDOCT) для сканирования центральной макулярной и периферической областей в современных исследованиях было выявлено, что пациенты с LCA1 (в возрасте от 20 до 53 лет) имеют все 6 слоев сетчатки с пограничными соединениями внутренних/внешних сегментов зрительных фоторецепторов. Поддержание структуры сетчатки при LCA1 не похоже на другие формы заболевания, при которых имеет место значительное истончение сетчатки, которое с возрастом обычно ухудшается (Pasadhika et al., 2009). Поскольку сохранение структуры сетчатки одновременно не улучшает остроту зрения у пациентов с LCA1, считается, что им лучше следовать терапевтическим стратегиям будущего.
Животные модели.
Для оценки заместительной генной терапии были использованы две животные модели, несущие нулевые мутации в отношении гена retGC1, появляющегося природным путем цыпленка GUCY1*B и мышь, нокаутную по гену гуанилатциклазы-1 (GC1) (см., например, Williams et al., 2006; Haire et al., 2006). Цыпленок GUCY1*B, слепой с момента вылупления из яйца, отличается стертой скотопической (опосредованной палочками) и фотопической (опосредованной колбочками) картиной электроретинограммы (ERG) и дегенерацией сетчатки (см., например, Ulshafer et al., 1984; Huang et al., 1998; Semple-Rowland et al., 1998). Опосредованный лентивирусом перенос гена Gucy2d в сетчатку GUCY1*B восстанавливал зрение указанным животным, что выявляется в результате их зрительно-поведенческого тестирования и ERG (см., например, Williams et al., 2006). Несмотря на кратковременный терапевтический эффект, указанной терапии не хватило для осуществления длительной защиты структуры или функции сетчатки. Транзитная природа такого результата, полученная на видах, не являющихся млекопитающими, с интегрированным вирусным вектором, доставленным in ovo, свидетельствует о том, что необходимы поиски более подходящей трансляции для разработки клинических подходов.
Модель LCA1 на млекопитающих, мышах GC1KO, отличается дегенерацией колбочковидных фоторецепторов (см., например, Yang et al., 1999; Coleman et al., 2004). Подобно пациентам с LCA1, потеря функции колбочек у такой мышиной модели предшествует дегенерации колбочек (Yang et al., 1999). Кроме того, у них нарушена индуцируемая светом транслокация аррестина колбочек. Палочковидные фоторецепторы у этой модели не подверглись дегенерации и продолжают вырабатывать электрическую реакцию на свет (Yang et al., 1999), результат, скорее всего, связанный с наличием в этих клетках GC2, близкородственной ферменту GC1 (см., например, Lowe et al., 1995; Yang et al., 1995; Yang and Garbers, 1997; Karan et al., 2010). AAV-опосредованный перенос Gucy2d на постнатальную сетчатку GC1KO восстанавливал световую транслокацию аррестина колбочек в преобразованных клетках, но его не хватало для восстановления ERG-реакций колбочек или предотвращения дегенерации колбочек (Haire et al., 2006). В обоих указанных исследованиях, и на цыпленке, и на мыши, которые были проведены одними и
- 20 035893 теми же экспериментаторами, терапевтическая кДНК имела бычью природу, так как этот вид белков исторически используется в биохимических исследованиях по оценке функциональности GC1 (Otto-Bruc et al., 1997; Williams et al., 2006).
Определения
Если специально не указано иное, все используемые здесь технические и научные термины имеют такое же значение, которое обычно подразумевается под ними рядовыми специалистами в той области, к которой относится настоящее изобретение. Хотя при реализации или при тестировании настоящего изобретения могут быть использованы любые способы и композиции, сходные с теми или эквивалентные тем, которые здесь описаны, в настоящем изобретении представлены предпочтительные способы и композиции. В связи с настоящим изобретением ниже приведены следующие термины и определения.
В соответствии с давно существующими патентными правилами, в настоящем документе, включая и формулу изобретения, при употреблении слов в единственном числе подразумевается также и множественное число, например один или несколько.
Здесь термин приблизительно обычно должен пониматься как относящийся к обоим крайним числовым значениям, которыми обозначен числовой интервал значений. Например, приблизительно от 1 до 10 следует понимать как приблизительно 1 приблизительно до 10. Более того, здесь под всеми областями числовых значений следует понимать области, включающие в себя каждое из значений целых чисел внутри заданного интервала значений, а также каждую из их десятых долей. Под термином приблизительно здесь следует понимать примерно или около, и обычно это относится к значениям, приблизительно равным конкретному числовому значению, указанному внутри интервала числовых значений. Кроме того, под всеми заданными областями числовых значений следует понимать области, включающие в себя каждое из значений целых чисел внутри указанного интервала значений.
В соответствии с настоящим изобретением полинуклеотиды, сегменты нуклеиновых кислот и т.п. включают в себя, но не ограничены, молекулы ДНК (включая, но не ограничиваясь, геномные или внегеномные ДНК), гены, пептид-нуклеиновые кислоты (ПНК), РНК (включая, но не ограничиваясь, молекулы гРНК, мРНК и тРНК), нуклеозиды, а также соответствующие сегменты нуклеиновых кислот, которые либо получены из природных источников, либо синтезированы химическим путем, либо модифицированы, либо получены каким-нибудь другим способом, либо же полностью или частично синтезированы руками человека.
Здесь термин нуклеиновая кислота включает в себя один или несколько типов полидезоксирибонуклеотидов (содержащих 2-дезокси-О-рибозу). полирибонуклеотидов (содержащих D-рибозу), а также полинуклеотиды любого другого типа, которые являются N-гликозидом пуринового или пиримидинового основания, или же модифицированных пуриновых или пиримидиновых оснований (включая абазические sites). Здесь термин нуклеиновая кислота включает в себя полимеры рибонуклеозидов или дезоксирибонуклеозидов, которые ковалентно связаны обычно фосфодиэфирными связями между субъединицами, но в некоторых случаях фосфоротиоатами, метилфосфонатами и т.п. Нуклеиновые кислоты включают в себя одно- и двухцепочечные ДНК, так же как и одно- и двухцепочечные РНК. Иллюстративные нуклеиновые кислоты включают в себя, без ограничения, гДНК (gDNA); шпилечную РНК (hnRNA); мРНК; рРНК, тРНК, микро-РНК (миРНК), малые интерферирующие РНК (киРНК), малые ядрышковые РНК (мякРНК, или snORNA), малые ядерные РНК (мяРНК) и малую временную РНК (stPHK), и т.п., а также любую их комбинацию.
Здесь термин сегмент ДНК относится к молекуле ДНК, которая выделена в виде, свободном от суммарной геномной ДНК конкретного вида. Следовательно, сегмент ДНК, полученный из биологического образца с помощью описанных здесь композиций, относится к одному или нескольким сегментам ДНК, которые отделены от суммарной геномной ДНК конкретного вида, из которого они получены, или же очищены от нее. Включенными в термин сегмент ДНК являются сегменты ДНК и более мелкие фрагменты таких сегментов, а также рекомбинантные векторы, включая, например, плазмиды, космиды, фаги, вирусы и т.п.
Сходным образом, термин сегмент РНК относится к молекуле РНК, которая выделена в виде, свободном от суммарной геномной ДНК конкретного вида. Следовательно, сегменты РНК могут относиться к одному или нескольким сегментам РНК (либо нативной, либо синтетической природы), которые отделены от остальных молекул РНК или очищены от них. Включенными в термин сегмент РНК являются сегменты РНК и более мелкие фрагменты таких сегментов.
В контексте настоящего изобретения подразумевается, что термин экспрессия включает в себя сочетание внутриклеточных процессов, включая транскрипцию и трансляцию, претерпеваемую полинуклеотидом, таким как структурный ген, для синтеза кодируемого им пептида или полипептида.
Используемый здесь термин например используется в смысле в качестве примера, не подразумевая каких-либо ограничений, и не должен считаться относящимся только лишь к тем элементам, которые конкретно перечислены в данном описании.
Здесь термин промотор предназначен для того, чтобы в целом описать область или области последовательности нуклеиновой кислоты, которая осуществляет регуляцию транскрипции.
- 21 035893
Здесь термин регуляторный элемент предназначен для того, чтобы в целом описать область или области последовательности нуклеиновой кислоты, которая осуществляет регуляцию транскрипции. Иллюстративные регуляторные элементы включают в себя, но не ограничены, энхансеры посттрансляционные элементы, последовательности, осуществляющие контроль транскрипции, и т.п.
Здесь термин структурный ген предназначен для того, чтобы в целом описать полинуклеотид, такой как ген, который экспрессируется для продуцирования кодируемого пептида, полипептида, белка, рибозима, каталитической молекулы РНК или антисмысловой молекулы.
Здесь термин трансформация предназначен для того, чтобы в целом описать процесс введения последовательности экзогенного полинуклеотида (например, вирусного вектора, плазмиды или молекулы рекомбинантной ДНК или РНК) в клетку-хозяина или протопласт, в которых указанный экзогенный полинуклеотид встроен по меньшей мере в первую хромосому или способен к автономной репликации внутри трансформированной клетки. Трансфекция, электропорация и поглощение голой нуклеиновой кислоты - все это относится к примерам технологий, используемых для трансформации клетки-хозяина одним или несколькими полинуклеотидами.
Здесь подразумевается, что термин трансформированная клетка означает клетку-хозяина, комплемент нуклеиновой кислоты которой изменен в результате введения в клетку одного или нескольких экзогенных полинуклеотидов.
Здесь под термином трансгенная клетка обычно подразумевается любая клетка, которая получена или восстановлена из трансформированной клетки или получена из другой трансгенной клетки, или из предшественницы или потомка любого поколения такой трансформированной или трансгенной клеткихозяина.
Здесь под термином вектор обычно подразумевается молекула нуклеиновой кислоты (обычно содержащая ДНК), которая способна к репликации в клетке-хозяине и/или с которой может быть оперативно связан сегмент другой нуклеиновой кислоты, так, чтобы в общем осуществлялась репликация прикрепленного к ней сегмента. Плазмида, космида или вирус представляют собой иллюстративные векторы.
Термины по существу соответствуют, по существу гомологичный или по существу идентичный здесь относятся к характеристике нуклеиновой кислоты или аминокислотной последовательности, где выбранная последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность имеет по меньшей мере приблизительно 70 или приблизительно 75%-ную идентичность последовательности выбранной ссылочной последовательности нуклеиновой кислоты или ссылочной аминокислотной последовательности. Чаще выбранная последовательность и ссылочная последовательность будут иметь по меньшей мере приблизительно 76, приблизительно 77, приблизительно 78, приблизительно 79, приблизительно 80, приблизительно 81, приблизительно 82, приблизительно 83, приблизительно 84 или даже приблизительно 85%-ную степень идентичности и более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 86%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 87%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 88%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 89%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 90%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 91%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 92%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 93%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 94%-ную степень идентичности последовательностей или по меньшей мере приблизительно 95%ную степень идентичности последовательностей или более высокую степень идентичности. Еще более предпочтительно, чтобы высокогомологичные последовательности часто имели бы более чем по меньшей мере приблизительно 96%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 97%-ную степень идентичности последовательностей, по меньшей мере приблизительно 98%-ную степень идентичности последовательностей или по меньшей мере приблизительно 99%-ную степень идентичности последовательностей между выбранной последовательностью и ссылочной последовательностью, с которой ее сравнивают. Процент, или степень, идентичности последовательностей может быть вычислен через полную длину сравниваемых последовательностей или же может быть вычислен путем исключения малых делеций или добавлений, которые в сумме составляют менее чем приблизительно 25 % или около того в выбранной ссылочной последовательности. Ссылочная последовательность может быть подпоследовательностью более крупной последовательности, такой как часть гена, или фланкирующая последовательность, или повторяющаяся часть хромосомы.
Однако в случае гомологии последовательностей между двумя или несколькими полинуклеотидными последовательностями ссылочная последовательность и последовательность-мишень обычно содержат по меньшей мере приблизительно от 18 примерно до 25 идентичных смежных нуклеотидов, чаще по меньшей мере приблизительно от 26 приблизительно до 35 смежных нуклеотидов, которые идентичны друг другу, и даже еще чаще, но по меньшей мере приблизительно 40, приблизительно 50, приблизительно 60, приблизительно 70, приблизительно 80, приблизительно 90, или даже приблизительно 100 или около того смежных нуклеотидов, которые идентичны друг другу. Желательно, чтобы в случаях, когда
- 22 035893 требуются высокогомологичные фрагменты, степень общей идентичности последовательностей в процентах между двумя данными последовательностями составляла бы по меньшей мере приблизительно 80%-ную идентичность, предпочтительно по меньшей мере приблизительно 85%-ную идентичность и более предпочтительно приблизительно 90%-ную идентичность, приблизительно 91%-ную идентичность, приблизительно 92%-ную идентичность, приблизительно 93%-ную идентичность, приблизительно 94%-ную идентичность или даже приблизительно 95%-ную или более высокую идентичность, которую легко определить с помощью одного или нескольких из алгоритмов сравнения последовательностей, хорошо известных специалистам в данной области, таких, например, как аналитическая программа FASTA, описанная Pearson и Lipman (1988).
Термины идентичные или процент идентичности в отношении двух или нескольких последовательностей нуклеиновых кислот или полипептидов относятся к двум или нескольким последовательностям или подпоследовательностям, которые при сравнении и выравнивании на предмет максимального соответствия являются одинаковыми или которые имеют точно установленный процент аминокислотных остатков или нуклеотидов, которые являются одинаковыми, что определяется с помощью какого-нибудь из описанных ниже алгоритмов сравнения последовательностей, описанных ниже (или других доступных рядовым специалистам в данной области алгоритмов), или же в результате визуального анализа.
Фраза по существу идентичные в отношении двух нуклеиновых кислот относится к двум или нескольким последовательностям или субпоследовательностям, которые имеют по меньшей мере приблизительно 90%-ную, предпочтительно, 91%-ную, наиболее предпочтительно, приблизительно 92%-ную, приблизительно 93%-ную, приблизительно 94%-ную, приблизительно 95%-ную, приблизительно 96%-ную. приблизительно 97%-ную. приблизительно 98%-ную. приблизительно 98,5%-ную, приблизительно 99%-ную, приблизительно 99,1%-ную, приблизительно 99,2%-ную, приблизительно 99,3%-ную, приблизительно 99,4%-ную, приблизительно 99,5%-ную, приблизительно 99,6%-ную, приблизительно 99,7%-ную, приблизительно 99,8%-ную или приблизительно 99,9%-ную или более высокую степень идентичности нуклеотидных остатков, при их сравнении и выравнивании на предмет максимального соответствия, что определяется с помощью алгоритма сравнения последовательностей или же в результате визуального анализа. Такие по существу идентичные последовательности обычно считаются гомологичными без ссылок на их истинные источники.
Здесь термин образующиеся природным путем, используемый в отношении какого-нибудь объекта, относится к тому факту, что данный объект может быть обнаружен в природе. Например, полипептидная или полинуклеотидная последовательность, которая присутствует в организме (включая вирусы), которая может быть отделена от ее природного источника и которая умышленно не модифицирована человеком вручную в лаборатории, является образующейся природным путем. Здесь лабораторные штаммы грызунов, которые могут быть селективно выведены в соответствии с классической генетикой, считаются возникающими природным путем животными.
Здесь гетерологичный определяется в отношении предварительно определяемой последовательности ссылочного гена. Например, в отношении последовательности структурного гена гетерологичный промотор определяется как промотор, который в природе не встречается расположенным рядом со ссылочным структурным геном, но который помещают туда в результате лабораторных манипуляций. Сходным образом, гетерологичный ген или сегмент нуклеиновой кислоты определяется как ген или сегмент, который в природе в смежном положении с элементами ссылочных промоторов и/или энхансеров не встречается.
Здесь термин гомология относится к степени комплементарности между двумя или несколькими полинуклеотидными или полипептидными последовательностями. Слово идентичность может заменить слово гомология, если первая последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность имеет в точности такую же первичную последовательность, что и последовательность второй нуклеиновой кислоты или аминокислотной последовательности. Гомологичность последовательностей и идентичность последовательностей могут быть определены путем анализа двух или нескольких последовательностей с помощью алгоритмов и компьютерных программ, известных в данной области. Такие способы могут быть использованы для установления того, идентична ли или гомологична данная последовательность другой выбранной последовательности.
Здесь термин гомологичные, если он используется в отношении полинуклеотидов, относится к последовательностям, которые имеют по существу такую же нуклеотидную последовательность, несмотря на то, что получены они из разных источников. Обычно гомологичные последовательности нуклеиновых кислот получают из близкородственных генов или организмов, содержащих одну или несколько по существу сходных геномных последовательностей. В отличие от этого, аналогичный полинуклеотид является таковым, который выполняет такую же функцию, будучи при этом полинуклеотидом из другого вида или организма, но может иметь существенные отличия в первичной нуклеотидной последовательности, которая кодирует один или несколько белков или полипептидов, которые выполняют сходные функции или обладают сходной биологической активностью. Аналогичные полинуклеотиды часто могут быть получены из двух или нескольких организмов, которые не являются близкородственными (например, либо генетически, либо филогенетически).
- 23 035893
Здесь подразумевается, что термин полипептид охватывает полипептид в единственном числе, а также полипептиды в единственном числе, и указанный термин включает в себя любую цепь или цепи из двух или нескольких аминокислот. Таким образом, здесь термины, включая пептид, дипептид, трипептид, белок, фермент, аминокислотную цепь и непрерывную аминокислотную последовательность, но не ограничиваясь ими, все включены в определение полипептида, и термин полипептид может быть использован вместо - или взаимозаменяемым образом - с любым из указанных терминов. Указанный термин дополнительно включает в себя полипептиды, которые подвергаются одной модификации или нескольким посттрансляционным модификациям, включая, но не ограничиваясь ими, например, гликозилирование, ацетилирование, фосфорилирование, амидирование, дериватизацию, протеолитическое расщепление, посттрансяционный процессинг, или модификациям путем включения одной или нескольких не образующихся в природе аминокислот.
В данной области для полинуклеотидных и полипептидных структур существует общепринятая номенклатура. Например, однобуквенные и трехбуквенные сокращения широко используются для описания аминокислот: алании (A; Ala), аргинин (R; Arg), аспарагин (N; Asn), аспарагиновая кислота (D; Asp), цистеин (C; Cys), глутамин (Q; Gin), глутаминовая кислота (E; Glu), глицин (G; Gly), гистидин (H; His), изолейцин (I; Ile), лейцин (L; Leu), метионин (M; Met), фенилаланин (F; Phe), пролин (P; Pro), серин (S; Ser), треонин (T; Thr), триптофан (W; Trp), тирозин (Y; Tyr), валин (V; Val) и лизин (K; Lys). Описанные здесь аминокислотные остатки являются предпочтительными в форме их L''-изомера. Однако остатки в форме D''-изомера могут быть использованы вместо любого L-аминокислотного остатка при условии, что требуемые свойства данного полипептида сохраняются.
Здесь термин белок, или протеин, используется взаимозаменяемым образом с пептидом и полипептидом и включает в себя как пептиды, так и полипептиды, продуцируемые синтетическим, рекомбинантным путем или продуцируемые in vitro, а также пептиды и полипептиды, экспрессируемые in vivo после того, как последовательности нуклеиновых кислот вводят в организм животного-хозяина или в организм человека.
Термин полипептид предпочтительно используется в отношении аминокислотных цепей любой длины, включая цепи коротких пептидов приблизительно от 2 примерно до 20 аминокислотных остатков в длину, олигопептидов приблизительно от 10 примерно до 100 аминокислотных остатков в длину и полипептидов приблизительно от 100 примерно до 5000 или более аминокислотных остатков в длину.
Термин последовательность в применении к аминокислотам относится ко всем или к части аминокислот, расположенных в линейном порядке от N-конца до C-конца, внутри данной аминокислотной цепи, например в полипептиде или белке; подпоследовательность означает любой отрезок идущих подряд аминокислот внутри последовательности, например по меньшей мере из трех последовательных аминокислот внутри данной белковой или полипептидной последовательности. В отношении нуклеотидных и полинуклеотидных цепей последовательность и подпоследовательность имеют сходные значения, относящиеся к порядку нуклеотидов от 5'- к 3'-концу.
Здесь термин по существу гомологичные охватывает две или несколько последовательностей биологических молекул, которые по существу подобны друг другу на уровне первичной последовательности нуклеотидов. Например, в контексте двух или нескольких последовательностей нуклеиновых кислот по существу гомологичные может относиться по меньшей мере приблизительно к 75%-ной, предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 80%-ной и более предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 85%-ной или по меньшей мере приблизительно к 90%-ной идентичности и еще более предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 95%-ной, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 97%-ной идентичности, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 98%-ной идентичности, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно к 99%-ной идентичности и даже еще более предпочтительно к полной идентичности (т.е. к их 100%-ной идентичности или к их инвариантности).
Сходным образом, термин по существу идентичные охватывает здесь две или несколько последовательностей биологических молекул (и, в частности, полинуклеотидных последовательностей), которые на нуклеотидном уровне имеют высокую степень идентичности по отношению друг к другу. Например, в контексте двух или нескольких последовательностей нуклеиновых кислот по существу идентичные может относиться к последовательностям, которые по меньшей мере приблизительно на 80% и более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 85% или по меньшей мере приблизительно на 90% идентичны друг другу и даже еще более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 95%, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 97% идентичны, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 98% идентичны, более предпочтительно по меньшей мере приблизительно на 99% идентичны и даже еще более предпочтительно полностью идентичны (т.е. идентичные на 100%, или невырожденные).
Термин рекомбинантный указывает на то, что материал (например, полинуклеотид или полипептид) искусственно или синтетически (неприродным образом) изменен в результате вмешательства человека. Указанное вмешательство может быть осуществлено на таком материале в его природном окружении или состоянии или же когда он изъят из его природного окружения. В частности, например, после
- 24 035893 довательность промотора является рекомбинантной, если она продуцируется путем экспрессии сегмента нуклеиновой кислоты, сконструированного рукой человека. Например, рекомбинантная нуклеиновая кислота является таковой, которая создана путем рекомбинации нуклеиновых кислот, например, в процессе клонирования, перетасовки ДНК или других процедур или путем химического или иных типов мутагенеза; рекомбинантный полипептид или рекомбинантный белок является полипептидом или белком, который продуцируется в результате экспрессии рекомбинантной нуклеиновой кислоты; и рекомбинантный вирус, например рекомбинантный вирус AAV, продуцируется в результате экспрессии рекомбинантной нуклеиновой кислоты.
Здесь термин оперативно связанный относится к связи двух или нескольких полинуклеотидов или двух или нескольких последовательностей нуклеиновых кислот в функциональном взаимоотношении. Нуклеиновая кислота является оперативно связанной, когда она находится в функциональном взаимоотношении с последовательностью другой нуклеиновой кислоты. Например, промотор или энхансер является оперативно связанным с кодирующей последовательностью, если он действует на транскрипцию кодирующей последовательности. Оперативно связанный означает, что последовательности нуклеиновых кислот, являясь связанными, обычно являются примыкающими друг к другу или по существу смежными, и, если необходимо соединить две кодирующие последовательности белков, они являются примыкающими друг к другу в рамке считывания. Поскольку энхансеры обычно функционируют, когда отделены от промотора несколькими тысячами оснований и интронными последовательностями, которые могут быть разной длины, так и некоторые полинуклеотидные элементы могут быть оперативно связаны, но не быть смежными.
Транскрипционный регуляторный элемент относится к полинуклеотидной последовательности, которая активирует транскрипцию, отдельно или в сочетании с одной или несколькими другими последовательностями нуклеиновых кислот.
Транскрипционный регуляторный элемент может, например, содержать один или несколько промоторов, один или несколько элементов отклика, один или несколько негативных регуляторных элементов и/или один или несколько энхансеров.
Здесь сайт узнавания фактора транскрипции и сайт связывания фактора транскрипции относятся к полинуклеотидной последовательности(ям) или последовательности мотив(ов), которые идентифицированы как сайты взаимодействия специфических последовательностей одного или нескольких факторов транскрипции, часто принимающих форму прямого связывания ДНК-белок. Обычно сайты связывания фактора транскрипции могут быть идентифицированы методом футпринтинга ДНК, анализом по сдвигу пятна в геле и т.п. и/или могут быть предсказаны на основе известных мотивов консенсусных последовательностей или же другими способами, известными специалистам в данной области.
Единица транскрипции относится к полинуклеотидной последовательности, которая содержит по меньшей мере первый структурный ген, оперативно связанный по меньшей мере с первой цисдействующей промоторной последовательностью и необязательно оперативно связанный с одной или несколькими другими цис-действующими последовательностями нуклеиновых кислот, необходимыми для эффективной транскрипции последовательностей структурного гена, и по меньшей мере первый дистальный регуляторный элемент, что может оказаться необходимым для соответствующей тканеспецифической и развивающейся транскрипции последовательности структурного гена, оперативно расположенной под контролем элементов промотора и/или энхансера, а также любые дополнительные циспоследовательности, которые необходимы для эффективной транскрипции и трансляции (например, сайт (сайты) полиаденилирования, последовательность (последовательности), контролирующие стабильность мРНК, и т.п.
Термин по существу комплементарный, когда его используют для определения либо аминокислотных последовательностей, либо последовательностей нуклеиновых кислот, означает, что последовательность конкретного объекта, например олигонуклеотидная последовательность, является по существу комплементарной всей или части выбранной последовательности и, таким образом, будет специфически связываться с частью мРНК, кодирующей указанную выбранную последовательность. Обычно указанные последовательности как таковые будут высококомплементарны последовательности-мишени мРНК и будут иметь не более чем приблизительно 1, приблизительно 2, приблизительно 3, приблизительно 4, приблизительно 5, приблизительно 6, приблизительно 7, приблизительно 8, приблизительно 9 или приблизительно 10 или около того ошибочно спаренных оснований на протяжении комплементарной части последовательности. Во многих случаях может быть желательно, чтобы последовательности в точности совпадали, т.е. были бы полностью комплементарны той последовательности, с которой указанный олигонуклеотид специфически связывается, а следовательно, имеет ноль ошибочно спаренных оснований на протяжении комплементарного отрезка. Как таковые высококомплементарные последовательности будут обычно очень специфически связываться с областью последовательности-мишени мРНК и будут, следовательно, высокоэффективными в ослаблении и/или даже ингибировании трансляции последовательности-мишени мРНК в полипептидном продукте.
Существенная комплементарность последовательностей нуклеиновых кислот будет составлять более чем приблизительно 80%-ную комплементарность (или % точных совпадений) соответствующей
- 25 035893 последовательности нуклеиновой кислоты-мишени, с которой указанная нуклеиновая кислота специфически связывается, и более предпочтительно будет составлять более чем приблизительно 85%-ную комплементарность соответствующей последовательности-мишени, с которой указанная нуклеиновая кислота специфически связывается. В определенных аспектах, как описано выше, было бы желательно иметь даже более существенно комплементарные последовательности нуклеиновых кислот для применения при реализации настоящего изобретения, и в таких случаях последовательности нуклеиновых кислот будут приблизительно более чем на 90% комплементарны соответствующей последовательностимишени, с которой указанная нуклеиновая кислота специфически связывается, и могут в определенных воплощениях быть выше чем приблизительно на 95% комплементарны соответствующей последовательности-мишени, с которой указанная нуклеиновая кислота специфически связывается, и даже вплоть до и включая приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% и даже приблизительно 100% точных совпадений, комплементарных всей или части последовательностимишени, с которой указанная сконструированная нуклеиновая кислота специфически связывается. Процент сходства или процент комплементарности любой из описанных последовательностей нуклеиновых кислот может быть определен, например, путем сравнения информации о последовательностях с помощью компьютерной программы GAP, версия 6.0, доступной из Генетической Компьютерной Группы Университета в Висконсине (UWGCG). В программе GAP используется способ выравнивания Needleman и Wunsch (1970). Вкратце, в программе GAP сходство определяется как число выровненных символов (т.е. нуклеотидов или аминокислот), которые являются сходными, деленное на общее число символов в более короткой из двух указанных последовательностей.
Предпочтительные для программы GAP параметры по умолчанию включают в себя (1) унарную матрицу сравнения (содержащую значение 1 в случае идентичности и 0 в случае не идентичности) для нуклеотидов и матрицы сравнения Gribskov и Burgess (1986), (2) штраф 3.0 за каждый гэп и дополнительный штраф 0.10 за каждый символ в каждом гэпе и (3) отсутствие штрафа за концевые гэпы.
Здесь термины белок, полипептид и пептид используются взаимозаменяемым образом и включают в себя молекулы, которые включают в себя по меньшей мере одну амидную связь, соединяющую два или несколько аминокислотных остатка друг с другом. Несмотря на то, что указанные термины используются взаимозаменяемым образом, обычно пептид является относительно короткой молекулой (например, от 2 приблизительно до 100 аминокислотных остатков в длину), тогда как белок или полипептид являются относительно более длинным полимером (например, 100 или более остатков в длину). Тем не менее, если специально длина цепи не указана, термины пептид, полипептид и белок используются взаимозаменяемым образом.
Здесь термин пациент (также используемый взаимозаменяемым образом с терминами хозяин или субъект) относится к любому хозяину, который, как обсуждается в настоящем документе, может служить в качестве реципиента одной или нескольких из гуанилатциклазных композиций на основе rAAV. В определенных аспектах указанным реципиентом будет позвоночное животное, под которым подразумевается животное любого вида (предпочтительно вида млекопитающих, такого, каким является человек). В определенных воплощениях термин пациент относится к любому животному-хозяину, включая, но не ограничиваясь ими, человека и всех приматов, кроме человека; жвачных животных, собак, козлов, кур, ворон, зайцев, лошадей, кошек, кроликов, зайцев, волков, мышей, овец, поросят, racines, лис, и т.п., включая, без ограничения, одомашненных животных, стадных или кочующих животных, экзотических или зоологических видов, а также домашних животных, питомцев, а также любых животных, находящихся под надзором ветеринарного врача.
Здесь под термином носитель подразумевается любой растворитель(и), диспергирующая среда, вещество(а) для покрывающего слоя, разбавитель(и), буфер(ы), изотоническое(ие) средство(а), раствор(ы), суспензия(и), коллоид(ы), инертные составляющие или пр. или их сочетание, которое является фармацевтически приемлемым для введения соответствующему животному или в зависимости от обстоятельств приемлемым для диагностических целей. Применение одного или нескольких средств доставки конструкций для генной терапии, вирусных частиц, векторов и т.п. хорошо известно рядовым специалистам в области фармацевтики и конструирования молекул. За исключением случаев, когда какаянибудь обычно используемая среда или средство не совместимы с активным ингредиентом, их применение в профилактических и/или терапевтических композициях является предусмотренным. Один или несколько добавочных активных ингредиентов могут также быть включены в указанные композиции или могут вводиться совместно с одной или несколькими из описанных композиций.
Здесь под эффективным количеством специалистам в данной области следует понимать такое количество, которое обеспечивает терапевтический, профилактический или иной какой-нибудь благотворный эффект, оказываемый на пациента-реципиента.
Фразы изолированный или биологически чистый относятся к материалу, который является существенно или по существу свободным от компонентов, которые в норме сопровождают указанный материал, если он находится в своем нативном состоянии. Таким образом, предпочтительно, чтобы изолированные полинуклеотиды согласно настоящему изобретению не содержали материалов, которые в норме ассоциированы с указанными полинуклеотидами в их природном или in situ окружении.
- 26 035893
Связывание или присоединение относится к любому способу, известному в данной области, для функционального связывания одного или нескольких белков, пептидов, нуклеиновых кислот или полинуклеотидов, включая, без ограничения, рекомбинантное слияние, ковалентное связывание, дисульфидное связывание, ионное связывание, водородное связывание, электростатическое связывание и т.п.
Здесь термин плазмида или вектор относится к генетической конструкции, которая составлена из генетического материала (т.е. нуклеиновых кислот). Обычно плазмида или вектор содержит ориджин репликации, который является функциональным в бактериальных клетках-хозяевах, например в Escherichia coli, и селективные маркеры для детектирования бактериальных клеток-хозяев, включая плазмиду. Плазмиды и векторы согласно настоящему изобретению могут включать в себя один или несколько генетических элементов, расположенных, как здесь описано, в определенном порядке, так, чтобы встроенная кодирующая последовательность могла быть транскрибирована и транслирована в соответствующих экспрессирующих клетках. Кроме того, плазмида или вектор могут включать в себя один или несколько сегментов нуклеиновых кислот, генов, промоторов, энхансеров, активаторов, множественных сайтов клонирования или любое их сочетание, включая сегменты, которые получены из или изъяты из одного или нескольких природных и/или искусственных источников.
Термин последовательность, по существу такая, какая представлена в SEQ ID NO: X означает, что указанная последовательность в основном соответствует части SEQ ID NO: X и имеет относительно небольшое число нуклеотидов (или же аминокислотных остатков в случае полипептидных последовательностей), которые не идентичны нуклеотидам (или аминокислотам) или их биологически функциональному эквиваленту последовательности SEQ ID NO: X. Термин биологически функциональный эквивалент хорошо известен в данной области и в дальнейшем будет подробно здесь охарактеризован.
Соответственно, последовательности, которые имеют приблизительно от 85 до примерно 90%; или более предпочтительно приблизительно от 91 до примерно 95%; или еще более предпочтительно приблизительно от 96 до примерно 99% нуклеотидов, которые являются идентичными или функционально эквивалентными одной или нескольким из представленных здесь нуклеотидных последовательностей, считаются особенно полезными в реализации настоящего изобретения.
Подходящие для настоящего изобретения стандартные условия гибридизации включают в себя, например, гибридизацию в 50% формамиде, 5х растворе Денхардта, 5х SSC (раствор цитрата и хлорида натрия), 25 мМ фосфате натрия, 0,1% ДСН и 100 мкг/мл денатурированной ДНК спермы лосося при 42°C в течение 16 ч с последующими промываниями в течение 1 ч раствором 0,1 х SSC , 0,1% ДСН при 60°C для удаления требуемого количества фонового сигнала. Менее жесткие условия гибридизации для настоящего изобретения включают в себя, например, гибридизацию в 35% формамиде, 5х растворе Денхардта, 5х SSC, 25 мМ фосфате натрия, 0,1% ДСН и 100 мкг/мл денатурированной ДНК спермы лосося или ДНК Е.соН при 42°C в течение 16 ч с последующими промываниями 0,8х SSC , 0,1% ДСН при 55°C. Специалистам в данной области должно быть очевидно, что условия могут быть легко подогнаны для достижения требуемого уровня жесткости.
Естественно, настоящее изобретение охватывает также сегменты нуклеиновых кислот, которые являются комплементарными, по существу комплементарными и/или существенно комплементарными по меньшей мере одной или нескольким из специфических нуклеотидных последовательностей, специально здесь представленных. Последовательности нуклеиновых кислот, которые являются комплементарными, представляют собой такие последовательности, которые способны к спариванию основаниями, в соответствии со стандартными правилами комплементарности по Уотсону-Крику. Здесь термин комплементарные последовательности означает последовательности нуклеиновых кислот, которые существенно комплементарны, что может быть установлено путем такого же сравнения нуклеотидов, какое описано выше, или же так, как определено в связи со способностью гибридизоваться с одним или несколькими из описанных здесь специфических сегментов нуклеиновых кислот в относительно жестких условиях, таких как те, что описаны непосредственно выше.
Как описано выше, зонды и праймеры согласно настоящему изобретению могут иметь любую длину. Приписывая числовые значения последовательности, например, первому остатку 1, второму остатку 2 и т.д., можно предложить алгоритм, определяющий все зонды или праймеры, содержащиеся в данной последовательности: от n до n+y, где n является целым числом от 1 до последнего номера последовательности, y представляет собой длину зонда или праймера минус единица, n+y не превышает числа, соответствующего последнему номеру данной последовательности. Таким образом, для зонда или праймера из 25-пар оснований (т.е. 25-мерного, или 25-mer) набор зондов или праймеров соответствует основаниям от 1 до 25, основаниям от 2 до 26, основаниям от 3 до 27, основаниям от 4 до 28 и т.д. по всей длине указанной последовательности. Сходным образом, для зонда или праймера из 35-пар оснований (т.е. 35-мерного, или 35-mer) иллюстративные последовательности праймера или зонда включают в себя, без ограничения, последовательности, соответствующие основаниям от 1 до 35, основаниям от 2 до 36, основаниям от 3 до 37, основаниям от 4 до 38 и т.д. по всей длине указанной последовательности. Сходным образом, в случае 40-мерных зондов или праймеров последние могут соответствовать нуклеотидам от первой пары нуклеотидов до 40 п.н., от второй п.н. указанной последовательности до 41
- 27 035893
п.н., от третьей п.н. до 42 п.н. и т.д., тогда как для 50-мерных зондов или праймеров последние могут соответствовать нуклеотидной последовательности, распространяющейся от 1 до 50 п.н., от 2 до 51 п.н., от 3 до 52 п.н., от 4 до 53 п.н. и т.д.
В определенных воплощениях выгоднее будет использовать один или несколько сегментов нуклеиновых кислот согласно настоящему изобретению в сочетании с соответствующим детектируемым маркером (т.е. меткой), таким как в случае использования меченых полинуклеотидных зондов при определении наличия данной последовательности-мишени при анализе гибридизации. Широкое разнообразие соответствующих индикаторных соединений и композиций известно в данной области для мечения олигонуклеотидных зондов, включая, без ограничения, флуоресцентные, радиоактивные, ферментативные или другие лиганды, такие как авидин/биотин и т.п., которые могут быть обнаружены в соответствующим анализе. В конкретных воплощениях можно использовать также одну или несколько флуоресцентных меток или ферментативную метку, такую как уреаза, щелочная фосфатаза или пероксидаза, вместо радиоактивных или других, менее желательных в отношении окружающей среды реагентов. В случае ферментативных меток известны колориметрические, хромогенные или флуорогенные индикаторные субстраты, которые могут быть использованы для обеспечения способа детектирования образца, который становится видимым для человеческого глаза, или с помощью аналитических методов, таких как сцинтиграфия, флуориметрия, спектрофотометрия, и т.п., для идентификации специфической гибридизации с образцами, содержащими одну или несколько комплементарных или по существу комплементарных последовательностей нуклеиновых кислот. В случае так называемых мультиплексных анализов, когда одновременно или последовательно детектируют два или несколько меченых зонда, может оказаться желательным пометить первый олигонуклеотидный зонд первой меткой, имеющей первое свойство или параметр детектирования (например, максимум спектра эмиссии и/или возбуждения), которой помечен также и второй олигонуклеотидный зонд, меченный второй меткой, имеющей второе свойство или параметр детектирования, который является другим (т.е. отличается от таковых первой метки). Применение мультиплексных анализов, в частности, в контексте протоколов генетической амплификации/детектирования хорошо известно рядовым специалистам в области молекулярной генетики.
Примеры
Следующие примеры включены для демонстрации предпочтительных воплощений настоящего изобретения.
Специалистам в данной области должно быть очевидно, что технологии, описанные в последующих примерах, представляют собой технологии, раскрытые автором для лучшей реализации настоящего изобретения на практике, и, таким образом, можно считать, что они составляют предпочтительные варианты его реализации. Однако специалистам в данной области должно быть очевидно, в свете настоящего описания, и то, что в описанные специфические воплощения могут быть внесены многие изменения, и при этом будут получены сходные или подобные результаты, не выходящие за рамки концепции и объема правоприменения настоящего изобретения.
Пример 1. AAV-опосредственная генная терапия способствует сохранению зрительной функции и зрительно-реактивному поведению у мышиной модели LCA1.
В данном примере авторы настоящего изобретения оценивали то, может ли доставка видоспецифической (т.е. мышиной) версии retGC1 к колбочковидным клеткам постнатальных мышей GC1KO восстановить функцию указанных клеток. Векторы AAV серотипа 5 были использованы для доставки mGC1 к фоторецепторам мышей GC1KO в постнатальный день 14 (Р14). Электроретинограмму (ERG) и зрительно-поведенческое тестирование использовали для установления зрительной функции, а иммуноцитохимический анализ использовали для проверки экспрессии терапевтического трансгена, локализации аррестина в колбочках и плотности колбочковидных фоторецепторов в обработанных и не подвергнутых обработке глазах.
В данном примере показано, что вектор AAV, субретинально доставленный в один глаз мышей Р14 GC1KO, облегчает экспрессию retGC1 дикого типа, восстановление зрительной функции и поведения, а также защиту колбочковидных фоторецепторов. Через четыре недели после инъекции зрительную функцию (ERG) изучали в обработанных и в не подвергнутых обработке глазах. После этого ERG предпринимали каждые две недели, до 3-месячного срока после инъекции (последняя временная точка, в которой проводилась оценка). Мышей с положительной реакцией ERG, а также изогенных мышей дикого типа и не подвергнутых обработке контрольных мышей оценивали на предмет восстановления зрительного поведения путем тестирования оптокинетического рефлекса. В 3-месячный срок после инъекции всех животных забивали и их обработанные и необработанные сетчатки оценивали на предмет экспрессии GC1 и локализации аррестина колбочек.
Полученные результаты подтвердили также, что опосредованная колбочками функция восстанавливалась в обработанных глазах мышей GC1KO (амплитуды ERG составляли ~60% от нормальных). Более того, эффект обработки был стабильным по меньшей мере в течение 3 месяцев после введения. Тестирование поведения выявило устойчивое улучшение в опосредованном колбочками зрительном поведении, с реакциями у обработанных мышей, сходными или идентичными таковым у мышей дикого типа. Гистологически выявлена AAV-опосредованная экспрессия GC1 в фоторецепторах и восстановление
- 28 035893 транслокации аррестина колбочек у обработанных мышей. Кроме того, плотность колбочковидных клеток была выше в обработанных глазах, чем в контралатеральных контрольных глазах. Такой результат предполагает, что обработка способна защитить колбочковидные фоторецепторы по меньшей мере в течение трех месяцев после обработки. Это является первой демонстрацией того, что постнатальная генная терапия способна восстанавливать зрительную функцию и поведение и защищать структуру сетчатки у млекопитающих животных-моделей LCA1. Что важно, результаты были получены с использованием хорошо охарактеризованного, клинически релевантного вектора AAV; данные, полученные таким образом на животной модели in vivo, служат фундаментом для применения генной терапии на основе вектора AAV для лечения детей, пораженных LCA1.
Материалы и методы.
Экспериментальные животные.
Гетерозиготные эмбрионы GC1+/- получали из фонда криоконсервирования из Jackson Laboratory (Bar Harbor, ME, USA). Гетерозигот спаривали в условиях, обеспечиваемых авторами настоящего изобретения, с получением потомства GC1KO (-/-) и изогенных контрольных +/+ животных. Все мыши были скрещены в централизованных условиях в институте авторов настоящего изобретения при 12-часовом цикле смены света/темноты. Пищу и воду животным предоставляли в неограниченном количестве. Все исследования на животных были поддержаны местным Комитетом по биоэтике и проводились в соответствии с утвержденными правилами ARVO по использованию животных в офтальмологических испытаниях по изучению зрительной функции и в соответствии с правилами NIH.
Конструирование векторов AAV.
Векторы аденоассоциированного вируса (AAV5) серотипа 5 были использованы для доставки мышиной GC1 (mGC1), поскольку было показано, что они обеспечивают устойчивую эффективность трансдукции и более ранний запуск их экспрессии в фоторецепторах сетчатки, чем векторы AAV других серотипов (Yang et al., 2002). Как клеточно-специфический, так и убиквитарный промоторы были выбраны для осуществления экспрессии mGC1. Промотор клеточно-специфической связанной с G-белком рецепторной киназы 1 (GRK1), известный также как промотор родопсин-киназы, был выбран, в силу его способности специфически нацеливать устойчивую экспрессию трансгена в палочковидных и колбочковидных фоторецепторах при его использовании в сочетании с AAV (Khani et al., 2007). Убиквитарный промотор smCBA, который отличается картиной экспрессии в сетчатке, сходной с таковой, осуществляемой полноразмерным СВА, был выбран в силу его способности эффективного нацеливания на нейральную сетчатку (Haire et al., 2006). В полимеразной цепной реакции использовали следующий прямой праймер:
5'-AAAAGCGGCCGCATGAGCGCTTGGCTCCTGCCAGCC-3' (SEQ ID NO: 14) и следующий обратный праймер:
5'-AAAAGCGGCCGCTCACTTCCCAGTAAACTGGCCTGG-3' (SEQ ID NO: 15), которые были использованы для амплификации mGC1 из плазмиды, содержащей слияние mGC1-eGFP (Bhowmick et al., 2009). Полученный в результате фрагмент клонировали в плазмиду pCRblunt (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) и выверяли последовательность. AAV-векторная плазмида, содержащая smCBA, направляющий экспрессию mGC1 (pTR-smCBA-mGC1), была создана путем замены полноразмерного СВА на smCBA в плазмиде pTR-CBSB-hRPE65 (Jacobson et al., 2006) путем расщепления под действием EcoRI и последующего лигирования. Впоследствии hRPE65 был заменен на mGC1 путем расщепления под действием NotI и лигирования, что в результате привело к созданию pTR-smCBA-mGC1 (фиг. 11). AAV-векторная плазмида, содержащая человеческий промотор GRK1, направляющий экспрессию mGC1, pTR-GRKl-mGC1, была создана путем удаления hGFP из pTR-hGRK1-hGFP (Beltran et al., 2010) и замены ее на mGC1 путем расщепления под действием NotI и лигирования (фиг. 11). Векторы AAV были упакованы в соответствии с ранее опубликованными методами (Haire et al., 2006). Вирусные частицы ресуспендировали в сбалансированном солевом растворе (Alcon, Fort Worth, TX, USA) и титровали, используя количественную PCR в режиме реального времени (Jacobson et al., 2006). Полученные в результате титры составляли 4,69х1012 вирусных геномов на 1 мл (вг/мл) и 4,12х1013вг/мл для AAV5-smCBA-mGC1 и AAV5-hGRK1-mGC1 соответственно.
Субретинальные инъекции.
мкл AAV5-GRKl-mGC1 (4,12х1010 доставленных векторных геномов) или AAV5-smCBA-mGC1 (4,69х109 доставленных векторных геномов) доставляли субретинально в постнатальный день 14 (Р14) в правый глаз каждой мыши GC1KO, оставляя левый глаз в качестве контралатерального контроля. Субретинальные инъекции производили так, как описано выше (Timmers et al., 2001; Pang et al., 2006). Дальнейшие анализы проводили только у тех животных, которые получили сравнимые, успешные инъекции (>60% отслоения сетчатки и минимальные осложнения). Надежно установлено, что область отслоения сетчатки соответствует вирусной трансдукции (Cideciyan et al., 2008; Timmers et al., 2001).
Электроретинографические анализы.
Электроретинограммы (ERG) обработанных GC1KO (n=14) и изогенных контролей +/+ (n=2) регистрировали, используя контроль на основе PC и регистрирующий элемент (Toennies Multiliner Vision;
- 29 035893
Jaeger/Toennies, Hochberg, Germany), согласно ранее описанным способам, с незначительными модификациями (Haire et al., 2006). Начальные измерения ERG проводили через 4 недели после инъекции, а затем каждые 2 недели, до наступления 3-месячного срока после инъекции (последняя временная точка, оцениваемая в данном исследовании). Соответствующие по возрасту изогенные контроли +/+ изучали в дополнение к обработанным животным в каждой временной точке. Мышей адаптировали к темноте (более чем в течение 12 ч) и анестезировали смесью из 100 мг/кг кетамина, 20 мг/кг ксилазина и физиологического раствора в соотношении 1:1:5 соответственно. Зрачки расширяли, используя 1% тропикамид и 2,5% фенилэфрина гидрохлорид. Нагретую циркулирующую водяную баню использовали для поддержания температуры тела при 38°C. Гидроксипропилметилцеллюлозу 2,5% накладывали на каждый глаз для предотвращения дегидратации сетчатки. ERG в полном поле регистрировали, используя традиционные петельные сетчаточные электроды из золотой (платиновой) проволоки. Ссылочные и основные электроды размещали подкожно между глазами и в хвосте соответственно. Скотопические реакции палочек регистрировали в серии из семи белых вспышек с возрастающей интенсивностью (от 0,01 мкд-ср/м2 до 5 кд-ср/м2). Интервалы между стимулами, в случае стимулов низкой интенсивности, составляли 1,1 с. В случае трех стимулов самой высокой интенсивности (100 мкд-ср/м2, 1 кд-ср/м2 и 5 кд-ср/м2) интервалы между стимулами составляли 2,5, 5,0 и 20,0 с соответственно. Было зарегистрировано 10 ответных реакций, которые усредняли для каждой интенсивности. Затем мышей адаптировали к свету с интенсивностью белого фона в 100 кд-ср/м2 в течение 2 мин. Фотопические колбочковые ответные реакции регистрировали в серии из пяти белых вспышек с возрастающей интенсивностью (от 100 мкд-ср/м2 до 12 кд-ср/м2). Было зарегистрировано 50 ответных реакций, которые усредняли для каждой интенсивности. Все стимулы производились на фоне в 100 кд-ср/м2. Амплитуды бета-волн определяли как разницу между минимумами альфа-волн и последующими положительными пиками каждого колебательного сигнала.
Максимальные амплитуды фотопических бета-волн (которые получены при 12 кд-ср/м2) всех обработанных smCBA-mGC1 (n=6) и обработанных hGRK1-mGC1 (n=8) мышей GC1KO (как обработанные, так и необработанные глаза) и изогенных контрольных мышей +/+ усредняли и использовали для определения стандартных ошибок.
Такие расчеты проводили в каждой временной точке (от 4-недельного до 13-недельного срока после инъекции). Эти данные переносили в программу Sigma Plot для окончательного графического представления. Парный t-тест был использован для расчета значений P между обработанными и необработанными глазами внутри каждой группы промоторов (smCBA или hGRK1) и между каждой группой промоторов во времени (4-недельный срок после инъекции сравнивали с 3-месячным сроком после инъекции). Стандартный t-тест был использован для расчета значений P между глазами, обработанными smCBA-mGC1 и hGRK1-mGC1. Значимые различия были определены как значения P<0,05. Поскольку некоторые из мышей из каждой обработанной группы были временно отстранены от зрительноповеденческих исследований, общее число мышей, усредненное и представленное в каждой временной точке на фиг. 2A и 2B отличается. Три мыши из smCBA-mGd-обработанной группы были отправлены на оптомоторное тестирование, оставшихся n из 3 мышей использовали для анализа ERG во время измерений в 8-, 10- и 12-недельные сроки (фиг. 2A). Две мыши из hGRK1-mGC1-обработанной группы были отправлены на оптомоторное тестирование, оставшихся n из 6 мышей использовали для анализа ERG во время измерений в 6-, 8-, 10- и 12-недельные сроки (фиг. 2B). Все мыши были отправлены на зрительно-поведенческий анализ, измеряемый на 13-недельном сроке после инъекции, с их возвратом в лаборатории авторов настоящего изобретения (smCBA-mGC1: n=3, hGRK1-mGC1: n=2) после завершения зрительно-поведенческих анализов.
Оптомоторное тестирование.
Фотопическую остроту зрения и контрастную чувствительность обработанных и необработанных глаз мышей GC1KO оценивали с помощью двух-альтернативной парадигмы вынужденного выбора, как было описано ранее (см., например, Umino et al., 2008; Alexander et al., 2007). Для тестирования чувствительности индивидуальных глаз одного и того же животного авторы настоящего изобретения воспользовались тем фактом, что зрение мышей имеет минимальное бинокулярное перекрывани, и что левый глаз является более чувствительным к вращению по часовой стрелке, а правый - к вращению против часовой стрелки (Douglas et al., 2005). Таким образом, в оптомоторном протоколе авторов настоящего изобретения с разделением в случайном порядке острота и порог контрастной чувствительности каждого глаза определялись отдельно и одновременно через ступенчатые функции для получения корректных реакций в обоих направлениях, по часовой стрелке и против часовой стрелки. Корректное определение картин вращения в направлении по часовой стрелке проводилось прежде всего посредством зрительных сигналов, поступающих из левого глаза, а корректные реакции в направлении против часовой стрелки были получены из зрительных сигналов, поступающих из правого глаза. Остроту определяли как самый высокий выход пороговой реакции пространственной частоты (100% контрастность), а контрастную чувствительность определяли как 100, деленное на самый низкий процентный выход пороговой реакции контрастной чувствительности. В случае фотопической остроты начальный стимул составлял 0,200 синусои
- 30 035893 дальных циклов/градус с фиксированной 100% контрастностью. Для измерения фотопической контрастной чувствительности начальная картина была представлена в виде 100% контрастности, с фиксированной пространственной частотой в 0,128 циклов/градус. Фотопическое зрение измеряли при средней освещенности в 70 кд/м2. Остроту зрения и контрастную чувствительность измеряли для обоих глаз каждой мыши от четырех до шести раз в течение периода в 1 неделю. Соответствующие по возрасту изогенные контрольные животные +/+ (M1, M2) и интактные мыши GC1KO (M3, M4), наряду с smCBA-mGC1обработанными (M5, M6, M7) и hGRK1-mGC1-обработанными мышами (M8, M9), представлены на фиг. 3. Опосредованные колбочками амплитуды ERG, вырабатываемые в ответ на стимул в 12 кд-ср/м2 у всех мышей (M1-M9), представлены в дополнение к зрительно-поведенческим результатам. Непарные t-тесты были выполнены в отношении остроты и процентных показателей контрастной чувствительности для определения значимости полученных результатов. Обработка тканей:
Через три месяца после инъекции P14-обработанных мышей GC1KO и изогенных контрольных мышей +/+ адаптировали к темноте в течение 2 ч. Непосредственно после темновой адаптации мышей забивали под тусклым красным светом (>650 нм). Каемки инъецированных и неинъецированных глаз маркировали горячей иглой в положении 12:00 ч, чтобы облегчить ориентацию. Энуклеацию осуществляли под тусклым красным светом и глаза немедленно помещали в 4% параформальдегид. Глаза, которые должны были быть использованы для изготовления срезов из замороженной ткани, обрабатывали в соответствии с ранее описанными методами (Haire et al., 2006). Вкратце, из каждого глаза извлекали роговицу, оставляя хрусталик внутри остальной глазной чаши. Маленький W-образный надрез делали в склере рядом с ожогом в кайме для облегчения ориентации. После фиксации в течение ночи извлекали хрусталики и стекловидные тела. Г лазную чашу, содержащую оставшуюся сетчатку/RPE (вращающийся платиновый электрод), помещали в раствор 30% сахарозы в PBS по меньшей мере на 1 ч при 4°C. Затем глазные чаши помещали в композицию в криостате (Tissue Tek ОСТ 4583; Sakura Finetek, Inc., Torrance, CA, USA) и быстро замораживали в бане из сухого льда/этанола. Криостатом делали серийные срезы глаз толщиной 10 мкм (Microtome HM550; Walldorf, Germany). Глаза, которые должны были быть использованы для анализа тотального препарата, обрабатывали в соответствии с ранее описанными методами (Pang et al., 2010). Ориентацию устанавливали так, как было описано выше. После фиксации в течение ночи роговицу, хрусталики, стекловидное тело и пигментный эпителий сетчатки извлекали из каждого глаза, не повреждая сетчатку. Срез делали в самой верхней (дорсальной) части сетчатки, примыкающей к исходному месту ожога в кайме для поддержания ориентации.
Иммунохимия и микроскопия.
Срезы замороженной ткани сетчатки и тотальных препаратов промывали 3х в IX PBS. После указанных промываний образцы инкубировали в 0,5% Triton X-100(R) в течение 1 ч в темноте при комнатной температуре. Затем образцы блокировали в растворе 1% бычьего сывороточного альбумина (БСА) в PBS в течение 1 ч при комнатной температуре. Срезы сетчатки инкубировали в течение ночи при 37°C с кроличьим поликлональным антителом против GC1 (1:200, sc-50512, Santa Cruz Biotechnology, Inc., Santa Cruz, CA, USA) или с кроличьим поликлональным антителом против аррестина колбочек (Lumij 1:1000; предоставлено Dr. Cheryl Craft, University of Southern California, Los Angeles, CA, USA), разведенного в 0,3% Triton X-100(R)/1% БСА. Тотальные препараты сетчатки инкубировали в течение ночи при комнатной температуре с тем же самым антителом против аррестина колбочек, разведенным 1:1000 в 0,3% Triton X-100(R)/1% БСА. После первичной инкубации срезы сетчатки и тотальные препараты промывали 3х в 1X PBS.
Срезы сетчатки инкубировали в течение 1 ч при комнатной температуре с вторичными антителами IgG, меченными либо флуорофором Alexa-594, либо флуорофором Alexa-488 (Molecular Probes, Eugene, OR, USA) и разведенными 1:500 в 1X PBS. После инкубации с вторичными антителами срезы и тотальные препараты промывали в 1X PBS. Осуществляли контрастное окрашивание срезов сетчатки, используя для этого 4',6'-диамино-2-фенилиндол (DAPI), в течение 5 мин при комнатной температуре. После последнего промывания в 1X PBS и промывания водой срезы обрабатывали средой на водной основе (DAKO) и помещали под покровное стекло. Тотальные препараты сетчатки ориентировали на предметном стекле микроскопа таким образом, чтобы самая верхняя (дорсальная) часть сетчатки была установлена в положение, соответствующее 12:00 ч. Образцы обрабатывали в среде DAKO и помещали под покровное стекло.
Срезы сетчатки изучали методом конфокальной микроскопии (спектральный конфокальный микроскоп Leica TCS SP2 AOBS, снабженный программным обеспечением LCS Version 2.61, Build 1537 (Bannockburn, IL, USA)). Все изображения были сделаны при установке одинаковой экспозиции и при увеличении либо в 20х, либо в 63х. Длины волн возбуждения, используемые для DAPI, GC1 пятен аррестина колбочек, составляли, соответственно 405, 488 и 594 нм. Спектры испускания составляли соответственно 440-470, 500-535 и 605-660 нм. Тотальные препараты сетчатки изучали, используя флуоресцентный микроскоп с окуляром широкого поля обзора (Axioplan 2) (Zeiss, Thornwood, NY, USA), оборудованный камерой Qlmaging Retiga 4000R и программным обеспечением Qlmaging QCapture Pro software (Qlmaging, Inc., Surrey, ВС, Canada). Квадранты каждого тотального препарата были визуализированы при 5х при
- 31 035893 установке одинаковой экспозиции, после чего их вместе обрабатывали в программе Photoshop® (Version
7.0) (Adobe, San Jose, CA, USA).
Анализ изображений.
Плотность фоторецепторов колбочек изучали в тотальных препаратах сетчатки путем подсчета клеток, меченных вторичным флюорофором, направленным на антитело против аррестина колбочек в центральной и нижерасположенной сетчатке, с помощью программного обеспечения ImageJ® (National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA). Указанные показатели были получены при увеличении на файлах 5х TIFF, приведенных на фиг. 6. Пять квадратов (500 мкм2) помещали поверх идентичных областей в центральной и нижерасположенной сетчатке обработанных и необработанных глаз GC1KO. Для центральной сетчатки квадраты были расположены с равным эксцентриситетом вокруг головки глазного нерва во всех глазах (125 мкм). Фоторецепторы колбочек подсчитывали в каждой подходящей области сетчатки, значения усредняли, и определяли величины стандартных отклонений. Стандартный t-тест использовали для расчета значений P между заданными образцами. Значимость различий определяли как значение P<0,05.
Результаты.
Функция фоторецепторов (ERG) была восстановлена у AAV-обработанных мышей GC1KO.
Ранее сообщалось, что реакции колбочек у мышей GC1KO в 1-месячном возрасте слабо выражены. Здесь авторы настоящего изобретения показали, что P14-обработка (т.е. в постнатальный день 14) указанных мышей вектором AAV, несущим мышиный ген GC1 под контролем либо фоторецепторспецифического (hGRK1), либо убиквитарного (smCBA) промотора, приводит к существенному восстановлению фоторецепторной функции колбочек, что показано посредством ERG. Репрезентативные картины электроретинограмм колбочек (фиг. 1) (а также средние амплитуды фотопических бета-волн (фиг. 2A и 2B), полученные у hGRK1-mGC1-обработанных, smCBA-mGC1-обработαнных мышей, мышей GC1KO и изогенных контролей +/+) показали, что функция колбочек в обработанных глазах восстанавливалась приблизительно до 45% от нормы к четвертой неделе после инъекции. Подобно более ранним сообщениям, реакции колбочек в контралатеральных необработанных глазах были к этому времени нарушены. К 4-недельному сроку после инъекции средние значения амплитуд опосредованных колбочками бета-волн в smCBA-mGC1-обработанных глазах (65,1 мкВ) были значительно выше (P=0,006) таковых в необработанных глазах (3,9 мкВ). Среднее значение амплитуды опосредованных колбочками бетаволн в hGRK1-mGC1-обработанных глазах (59,1 мкВ) было значительно выше (P<0,001), чем таковые в необработанных глазах (3,2 мкВ). Уровень восстановления, достигаемый через 4 месяца после доставки фоторецептор-специфического вектора hGRK1-mGC1, незначительно отличался от такового, который достигался под действием убиквитарного промотор-содержащего вектора smCBA-mGC1 (P=0,604). Через 3 месяца после инъекции среднее значение амплитуды опосредованных колбочками бета-волн в smCBA-mGC1-обработанных глазах (53,3 мкВ) было значительно выше (P<0,001), чем в необработанных глазах (2,8 мкВ). Среднее значение амплитуды опосредованных колбочками бета-волн в hGRK1-mGC1обработанных глазах (45,3 мкВ) было значительно выше (P<0,001), чем в необработанных глазах (3,4 мкВ). Уровень восстановления, достигаемый через 3 месяца после доставки фоторецепторспецифического вектора GRK1-mGC1, незначительно отличался от такового, который достигался под действием убиквитарного промотор-содержащего вектора smCBA-mGC1 (P=0,331). Оба промотора за короткое время обеспечивали сходные уровни функционального восстановления колбочек в обработанных глазах мышей GC1KO. Важно то, что восстановление функции фоторецепторов колбочек оставалось стабильным в течение 3 месяцев (последняя временная точка, в которой проводилась оценка в настоящем исследовании (см. фиг. 1, 2A и 2B)). Не было обнаружено значимых различий в фотопических амплитудах бета-волн smCBA-mGC1-обработαнных или hGRK1-mGC1-обработанных глазах между 4-недельным и 3-месячным сроками после обработки (P=0,174 и 0,125 соответственно).
Латентность, или время до пика в ERG, которая является важным признаком в диагностике различных признаков расстройств сетчатки, включая другие формы LCA (Sun et al., 2010), была также определена. В то время как такой показатель нельзя получить на глазу GC1KO (в таких глазах отсутствуют реакции ERG), тем не менее можно сравнить времена до пика колбочковых бета-волн у AAV-mGC1обработанных и изогенных контрольных мышей +/+. Через 4 недели после инъекции, никаких значимых различий между временами до пика колбочковых бета-волн в обработанных и контрольных глазах мышей +/+ обнаружено не было (P=0,884); средние значения у AAV-mGC1-обработанных и контрольных глаз +/+ в этой временной точке составляли, соответственно, 50,8 и 50,4 мс. Через 3 месяца после инъекции также никаких значимых различий между указанными двумя группами не наблюдалось (P=0,697); средние значения по всем временам до пика колбочковых бета-волн в обработанных и контрольных глазах +/+ составляли, соответственно, 59,7 и 58,3 мс. Кинетика реакции колбочек в сетчатке у обработанных GC1KO (определяемая посредством измерений времени до пика) в указанные короткие сроки выглядела нормально.
Ранее сообщалось, что опосредованные палочками картины электроретинограмм у мышей GC1KO отличаются изменениями к 1-месячному сроку жизни со значительным ослаблением палочковых альфа- 32 035893 волн и бета-волн (Yang et al., 1999). Указанное ослабление выходит на плато к 5-месячному возрасту с ответами, приблизительно составляющими 50-70% от таковых у мышей дикого типа (WT). Хотя в некоторых случаях и наблюдалось AAV-mGC1-опосредованное улучшение в обработанных глазах мышей
GC1KO по сравнению с необработанными контролями (пример см. на фиг. 1), этот результат не сопоставим с результатом, наблюдаемым на уровне опосредованных колбочками реакций.
У AAV-обработанных мышей восстанавливалось зрительно-реактивное поведение.
Оптомоторный анализ позволил выявить, что глаза мышей GC1KO, обработанных либо smCBA-mGC1 (M5, M6, M7), либо hGRK1-mGC1 (M8, M9), реагировали значительно лучше, чем необработанные глаза, при всех фотопических, опосредованных колбочками, условиях. Необработанные глаза GC1KO реагировали слабо, с остротой зрения 0,163±0,040 циклов/градус (фиг. 3B и 3C, масштабная линейка, среднее ± s.d., n=9 глазам). Изогенные контрольные глаза GC1+/+ (M1, M2) реагируют значительно лучше со средней остротой зрения 0,418±0,046 циклов/градус (n=4 глазам). AAV-mGC1обработанные глаза (M5-M9) имеют среднюю остроту зрения 0,392±0,077 циклов/градус (n=5 глазам), уровень, по существу идентичный таковому контрольных глаз +/+, и значительно лучший, чем в случае необработанных глаз GC1KO (P<0,0001). Фотопическую контрастную чувствительность (фиг. 3B и 3C) сравнивали с результатами фотопической остроты зрения, при этом в AAV-mGC1-обработанных глазах (контрастная чувствительность 11,9±7,37, n=5 глазам) контрастная чувствительность оказалась почти идентичной таковой у мышей +/+ (11,94±3,03, n=4 глазам). Здесь тоже глаза GC1KO, обработанные AAV-mGC1 в постнатальный день 14 (P14), реагировали значительно лучше, чем необработанные глаза, контрастная чувствительность которых составляла 1,27±0,31 (n=9, P<0,0001). Во всех фотопических тестах необработанные глаза GC1KO имели очень слабые показатели, по существу эквивалентные отсутствию опосредованной колбочками функции. Статистические сравнения указанных измерений представлены в таблице 1. Опосредованные колбочками картины ERG всех GC1+/+ (M1, M2), GC1KO (M3, M4), smCBA-mGC1-обработанных (M5, M5, M7) и hGRK1-mGC1-обработанных (M8, M9) мышей, использованных в анализах на зрительно-реактивное поведение, представлены на фиг. 3A для сравнения зрительной функции (оптомоторное поведение) с функцией сетчатки (электрофизиология).
Функция палочек сетчатки (ERG) частично сохранена у мыши GC1KO. Исследования показали, что даже очень малые амплитуды ERG преводятся в стойкое зрительно-реактивное поведение (Williams et al., 2006). Фактически пациенты с LCA2, которые получали AAV-RPE65-терапию, обнаруживали восстановление зрительно-реактивного поведения, несмотря на полное отсутствие реакции ERG (Maguire et al., 2008). Оптомоторное тестирование выявило, что скотопические, т.е. опосредованные палочками, острота зрения и контрастная чувствительность глаз GC1KO очень сходны с контрольными +/+. По этой причине невозможно было на поведенческом уровне сравнить восстановление зрения в обработанных и необработанных глазах. Статистические сравнения указанных измерений представлены в таблице.
Статистические сравнение фотопических зрительных функций глаз у мышей WT, AAV-MGC1обработанных и необработанных глаз, измеряемых на уровне оптомоторного поведения
Фотопическая острота зрения Мыши дикого типа (WT) Обработанные Необработанные
Количество оценок Среднее Стандартное отклонение 4 0,4183 0,0456 WT по сравнению с обработанными WT по сравнению с необработанными Обработанные по сравнению с необработанными 5 0,3919 0,07731 Значение Р 0,5671 <0,0001 <0,0001 9 0, 163 0,03954 Не значимо * *
Фотопическая контрастная чувствительность Мыши дикого типа (WT) Обработанные Необработанные
Количество оценок Среднее Стандартное отклонение 4 11,94 3, 03 WT по сравнению с обработанными WT по сравнению с необработанными Обработанные по сравнению с необработанными 5 11,16 7,37 Значение Р 0,4186 <0,0001 <0,0001 *=р<0,0001 9 1,27 0, 31 Не значимо * *
Оба промотора, фоторецептор-специфический и убиквитарный, направляют экспрессию mGC1трансгена в палочках и колбочках мышей GC1KO:
Дефицит GC1 действует как на палочковидные, так и на колбочковидные фоторецепторы у пациентов с LCA1. Человеческий фоторецептор-специфический промотор RK, убиквитарный промотор smCBA были, следовательно, выбраны для данного исследования в качестве средства для нацеливания на оба
- 33 035893 этих типа клеток. Человеческий промотор RK был выбран в силу его малого размера и способности эффективно направлять трансгенную экспрессию в фоторецепторных клетках. Иммуноокрашивание сетчаток GC1KO через 3 месяца после AAV-hGRK1-mGC1-обработки позволило выявить, что указанный промотор устойчиво направлял экспрессию GC1 в наружных сегментах фоторецепторов. На репрезентативном изображении поперечного сечения сетчатки глаза, в который инъецировали указанный терапевтический вектор (фиг. 4A), показано интенсивное окрашивание GC1 в слое OS, тогда как в контралатеральном необработанном глазу из той же самой мыши, отсутствует какая бы то ни была экспрессия GC1 (фиг. 4B). Промотор smCBA также эффективно направляет экспрессию GC1 в фоторецепторных клетках. Фоторецепторы OS обнаружили устойчивую smCBA-опосредованную экспрессию GC1 в обработанных глазах (фиг. 4C) по сравнению с контралатеральным необработанным глазом (фиг. 4D). Уровни hGRK1и smCBA-опосредованной экспрессии GC1 близки к таковым, наблюдаемым в изогенных, контрольных +/+ глазах (фиг. 4E). Экспрессия GC1 в hGRK1-mGC1-обработαнных глазах была ограничена слоем OS. В smCBA-mGC1-обработанных глазах экспрессия GC1 была случайно обнаружена в тельцах наружного ядерного слоя фоторецепторных клеток (см., например, стрелки на фиг. 4F). Следует, однако, отметить, что ни одна промоторная конструкция не направляла экспрессию терапевтической GC1 за пределами фоторецепторных клеток. Такое отсутствие экспрессии вне мишени способствует развитию будущих клинических применений.
У AAV-mGC1-обработαнных мышей GC1KO была восстановлена транслокация аррестина колбочек.
Обработка AAV-mGC1 восстанавливала индуцируемую светом транслокацию аррестина в колбочковидные фоторецепторы в обработанной сетчатке мышей GC1KO. Репрезентативное иммуноокрашивание поперечных срезов обработанных, необработанных и +/+-сетчаток антителом, полученным против аррестина колбочек, показало, что аррестин колбочек локализован в наружных сегментах, внутренних сегментах, аксонах и синаптических окончаниях +/+, smCBA-mGC1-обработанных и hGRK1-mGC1обработанных колбочковидных фоторецепторов (фиг. 5A, 5C и 5D соответственно). И наоборот, в сетчатке необработанных мышей GC1KO аррестин колбочек оставался локализованным в основном в наружных сегментах колбочек (фиг. 5B). Этот результат согласуется с представлением, что колбочки в сетчатке мышей GC1KO являются хронически гиперполяризованными. В обработанных, адаптированных к темноте сетчатках было выявлено не только восстановление локализации аррестина колбочек, но также и заметная положительная регуляция белка по сравнению с необработанными контролями. Что важно, плотность колбочковидных клеток тоже заметно повышалась в обработанных глазах по сравнению с необработанными контролями (см., например, фиг. 5A-5C).
У AAV-mGC1-обработанных мышей GC1KO были сохранены фоторецепторы колбочек.
Анализ smCBA-mGC1- и hGRK-mGC1-обработанных и неинъецированных контралатеральных тотальных препаратов сетчатки через 3 месяца после инъекции терапевтического вектора, которые были окрашены антителом против аррестина колбочек, показал, что в результате обработки указанным терапевтическим вектором колбочковидные фоторецепторы сохранялись (фиг. 6). Подсчет колбочковидных фоторецепторов в низлежащих и центральных областях сетчатки в обработанных и необработанных тотальных препаратах сетчатки показал, что между ними имеется статистически значимое различие в плотности колбочковидных клеток в обработанных и необработанных глазах. Такой результат сопоставим с наблюдением, что прочное электрофизиологическое и зрительно-поведенческое восстановление является совершенно очевидным. P14-обработка мышей GC1KO одной из терапевтических конструкций способствовала сохранению структуры колбочковидных фоторецепторов по меньшей мере в течение трех месяцев.
Пример 2. Животные модели с двойным нокаутом GC1/GC2.
Важно отметить, что, хотя у мышей GC1KO задеты только колбочковидные фоторецепторы (палочки только частично теряют функцию и не подвергаются дегенерации), у пациентов с LCA1 наблюдается потеря функции палочек и их дегенерация. Предполагается, что причиной указанных различий может быть видоспецифическая разница в зависимости [системы] от GC2, близкородственной гуанилатциклазе 1 (GC1), которая экспрессирована в колбочковидных фоторецепторах. Мышиные палочки способны функционировать в отсутствие GC1 в основном за счет того, что GC2 способна восстанавливать активность; однако у человека это не так. GC1 необходима для функционирования палочек, поэтому происходит дегенерация палочек. Была создана мышиная модель с двойным нокаутом GC1/GC2, и на ней была показана потеря функции палочек (вдобавок к потере функции колбочек, как видно у GC1 K/O) (Baehr et al., 2007). Биохимическими исследованиями на этой модели было доказано, что GC2 является ферментом, обеспечивающим функцию палочек в отсутствие GC1. С другой стороны, именно мыши с двойным нокаутом GC1/GC2 более адекватно имитируют данное патологическое состояние у человека (поражаются и колбочки, и палочки) (Karan et al., 2010). Для проверки обоих векторов, rAAV-smCBA-mGC1 и rAAV-hGRK1-mGC1, на мыши с двойным нокаутом GC1/GC2 векторы rAAV доставляли в точности таким же образом и точно в такое же время (постнатально на 14-й день), что и в описанном выше исследовании мышей с нокаутом GC1. Анализ восстановления зрения как на физиологическом, так и на зрительно-поведенческом уровнях тоже предпринимали в точности таким же образом, как описано выше при исследовании мышей с нокаутом GC1. Особое внимание следует обратить на скотопические реакции
- 34 035893 (т.е. ответ палочек), поскольку у мышей с двойным нокаутом GC1/GC2, обработанных векторной конструкцией GC1, предполагается достичь измеряемого уровня восстановления функции палочек.
Пример 3. Гуманизированная мышиная животная модель LCA1.
В данном примере описано создание гуманизированной мышиной животной модели LCA1. В одном из воплощений указанная мышиная модель содержит нокаут GC1/GC2/GCAP1. GCAP1 является белком, который активирует GC1. Для создания системы in vivo, в которой может быть оценена функция человеческой GC1, экспрессируемой с вектора rAAV клинической категории, сконструированного для применения на человеке, использовали трансгенную мышь hGCAP1 с тройным нокаутом GC1/GC2/GCAP1. У указанной мыши зрительная функция осуществлялась только путем rAAVопосредованного взаимодействия hGC1 с hGCAP1 (т.е. эндогенная мышиная GCAP1 у нее отсутствует). Из такого исследования можно определить, необходим ли человеческий белок GCAP1 для стимуляции активности GC1 в модельной мыши, а также, может ли быть восстановлена функция колбочек и палочек, когда два этих человеческих полипептида восстановлены и экспрессированы у нечеловеческой (т.е. мышиной) модели данного заболевания. Для создания трансгенной мыши hGCAP1 с тройным нокаутом GC1/GC2/GCAP1 мышь с двойным нокаутом GC1/GC2 (Baehr et al., 2007) скрещивали с мышью с нокаутом GCAP1 (Mendez et al., 2001). Затем человеческий GCAP1 трансгенно экспрессировали у животной модели для получения трансгенной мыши hGCAP1 с тройным нокаутом GC1/GC2/GCAP1. Исследования, в которых указанным животным обеспечивали rAAV-направленную hGC1, проводили способом, по существу идентичным способам, использованным в случае изучения мышей с нокаутом GC1. Затем предпринимали анализ восстановления зрения как на физиологическом, так и на зрительноповеденческом уровнях и в точности таким же образом, как в случае исследования мышей с нокаутом GC1.
Пример 4. Иллюстративные векторные конструкции, применимые при осуществлении настоящего изобретения.
Карты указанных двух иллюстративных векторов представлены на фиг. 11. Один из них содержит неспецифический промотор smCBA, а другой содержит промотор GRK1, ограниченный палочками/колбочками. Оба они упакованы в AAV серотипа 5. Все дозы векторов, тестируемые на настоящий момент, сохраняются в сетчатке мыши. Затем когорты мышей GC1-/- подвергали субретинальному инъецированию в постнатальный день 14 (P14), а затем периодически анализировали методами ERG и фотопической оптокинетики на предмет зрительно-реактивного поведения (опосредованного колбочками). Поскольку у мышей GC1-/- сохранялась опосредованная палочками картина ERG, мониторинг сохранения функции был сфокусирован прежде всего на восстановлении функции колбочек. В связи с вектором smCBA картины электроретинограмм ERG оценивали через 4 недели после обработки и после этого каждые 2 недели вплоть до 12-13-недельного срока после обработки. Все 9 глаз обрабатывали у 9 мышей, реагировавших на лечение. Приведенные ниже результаты свидетельствуют о значительном восстановлении фотопических амплитуд ERG в глазах животных, у которых в необработанном контроле электроретинограмма по существу не регистрировалась, приблизительно до 50% от нормы в контралатеральных глазах, обработанных вектором.
Затем анализировали четырех мышей GC1-/- методом скотопической оптокинетики на предмет зрительно-реактивного поведения с целью определения различий между обработанными и необработанными контралатеральными глазами (показано ниже). Во всех четырех обработанных глазах (289, 290, 294, 295) наблюдалось значительное улучшение остроты зрения по сравнению с их парными контрольными глазами, и у трех из четырех животных значительно улучшилась контрастная чувствительность. Мыши 297 и 298 были контрольными мышами дикого типа, а мышь 299 была необработанной мышью GC1-/-. Полученные результаты показывают, что с помощью вектора достигается функциональное восстановление и восстановление поведения, опосредованного зрительной реактивностью колбочек, у животныхмоделей LCA1.
В связи с вектором GRK1, экспрессия которого ограничена палочками и колбочками, картины ERG оценивали у 14 мышей GC1-/-, обработанных на один глаз, через 4 недели после обработки, а дальше через каждые 2 недели вплоть до 12-13-недельного срока после обработки. 12 из 14 обработанных глаз у 12 животных реагировали на лечение. Приведенные результаты (показаны ниже) свидетельствуют о значительном восстановлении фотопических амплитуд ERG в глазах животных, у которых в необработанном контроле электроретинограмма по существу не регистрировалась, приблизительно до 40% от нормы в контралатеральных глазах, обработанных вектором.
Затем одну мышь GC1-/- (293) анализировали методом скотопической оптокинетики на предмет зрительно-реактивного поведения с целью определения различий между обработанными и необработанными контралатеральными глазами (показано ниже). У этой мыши наблюдалось значительное улучшение как остроты зрения, так и контрастной чувствительности в правом глазу, обработанном указанным вектором, по сравнению с их контрольным левым глазом. Реакции были почти эквивалентны таковым контрольных мышей дикого типа (297 и 298) и были значительно улучшены по сравнению с необработанной мышью GC1-/- (299). Было, следовательно, сделано заключение, что вектор GRK1 также вызывал функциональное восстановление и восстановление поведения, опосредованного зрительной реактивно- 35 035893 стью колбочек, у данной модели LCA1.
Пример 5. Специфическое нацеливание WTGC1 на колбочки улучшает восстановление.
Представленные выше данные определенно свидетельствуют, что функция колбочек и опосредованное колбочками зрительно-реактивное поведение может быть восстановлено промотором GRK1, ограниченным палочками/колбочками. Поскольку у человека при LCA1 обнаруживается как дефицит палочек, так и дефицит колбочек (в отличие от мышей GC1-/-, у которых прежде всего имеет место дефицит колбочек), необязательно в дальнейшем ограничивать экспрессию только специфичностью в отношении колбочек. Однако на мышиной модели существует один конечный колбочковый фенотип, который важен для изучения: в условиях адаптации к темноте не происходит нормальное перемещение аррестина колбочек из наружных сегментов колбочек во внутренние сегменты, аксоны и синаптические окончания, как это происходит в сетчатке мышей дикого типа. Поэтому были предприняты исследования с целью установления того, возможна ли также и коррекция биологического фенотипа таких клеток при обработке вектором глаз мышей GC1-/-. В приведенных результатах один глаз у мышей GC1-/- обрабатывали вектором GRK1, затем к 7-недельному сроку после инъекции мышей адаптировали к темноте. Затем обработанные (нижняя панель) и контрольные (верхняя панель) сетчатки изучали иммуногистохимически на предмет локализации аррестина в колбочках. В необработанной сетчатке GC1-/- (верхняя панель) аррестин колбочек в основном оставался в наружных сегментах (OS) колбочек и в синаптическом слое (SL). В отличие от этого, в контралатеральной обработанной сетчатке (нижняя панель) существенная фракция аррестина (~50%) была транслоцирована во внутренние сегменты и синаптические окончания. Следовательно, было сделано заключение, что обработка вектором восстанавливала также и корректную транслокацию аррестина колбочек.
Пример 6. Долгосрочная терапия LCA1 под действием rAAV-направленных генетических конструкций.
Приведенные выше примеры показали, что субретинальная инъекция векторов rAAV, содержащих кДНК мышиной GC1 (направляемую либо промотором фоторецептор-специфической человеческой родопсинкиназы [hGRK1], либо убиквитарным промотором [smCBA]), способна восстановить опосредованную колбочками функцию и зрительно-реактивное поведение, а также защищать фоторецепторы колбочек у мышей GC1KO по меньшей мере в течение трех месяцев.
В данном примере авторы настоящего изобретения оценивали возможность достижения длительной терапии на модели заболевания LCA1, воспроизведенного у грызунов. Кроме того, авторы настоящего изобретения изучали вопрос о том, возможно ли, чтобы доставка GC1 к фоторецепторам мышей (GCdko) с двойным нокаутом GC1/GC2, - модели, в которой происходит утрата структуры и функции палочек и колбочек и которая фенотипически похожа на человеческий LCA1, - осуществляла терапию указанных клеток.
Способы.
Субретинальные инъекции AAV5-hGRK1-mGC1, AAV5-smCBA-mGC1 или высокоэффективного капсидного мутанта по тирозину AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 были введены в один глаз мышей GC1KO или GCdko в период между постнатальным днем 14 (P14) и P25. Функцию фоторецепторов палочек и колбочек изучали электроретинографически. Локализацию терапевтической экспрессии GC1 и степень восстановления фоторецепторов колбочек изучали иммуногистохимически. Исследования по биораспределению были предприняты с целью оценки наличия векторных геномов в зрительных нервах и мозгу обработанных животных.
Результаты.
Функция фоторецепторов колбочек восстанавливалась у мышей GC1KO, обработанных всеми векторами, при этом наиболее эффективным оказался вектор AAV8(733). Реакции оставались стабильными по меньшей мере в течение 10 месяцев после обработки. Терапевтическая GC1 была обнаружена в фоторецепторных наружных сегментах. Через 10 месяцев после инъекции геномы векторов AAV5 и AAV8(733) обнаруживались только в оптических нервах обработанных глаз мышей GC1KO. AAV8(733)направленная mGC1 сохраняла функцию и палочек, и колбочек у обработанных мышей GCdko.
Заключение.
Длительной терапии достигали у мышей GC1KO, модели дефицита GC1 у млекопитающих, с помощью описанных здесь rAAV-векторных конструкций. Важно то, что терапевтический эффект достигался также и у мышей GCdko, у которых имитирован LCA1-фенотип палочек/колбочек. Полученные результаты служат надежной основой для генной терапии на основе rAAV-векторов с целью лечения дистрофий сетчатки, и в частности лечения LCA1.
Пример 7. Длительная защита колбочковидных фоторецепторов и восстановление функции колбочек под действием генной терапии у мышей GC1KO.
В предыдущих примерах было показано, что субретинально вводимые векторы AAV5, содержащие кДНК мышиной GC1, направляемую либо фоторецептор-специфическим промотором (hGRK1), либо убиквитарным промотором (smCBA), способны восстанавливать опосредованную колбочками функцию и зрительно-реактивное поведение, а также предохранять колбочковидные фоторецепторы у мышей GC1KO в течение трех месяцев. В данном примере, используя ту же самую мышиную модель, оценивали
- 36 035893 возможность длительной терапии. AAV5-hGRK1-mGC1, AAV5-smCBA-mGC1 или вектор высокоэффективного капсидного мутанта по тирозину, AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, вводили субретинально мышам GC1KO между постнатальным днем 14 (P14) и постнатальным днем 25 (P25). Функцию сетчатки изучали посредством электроретинограмм (ERG). Локализацию AAV-опосредованной экспрессии GC1 и выживаемость колбочек изучали иммуногистохимически и распределение векторных геномов за пределами сетчатки количественно оценивали посредством PCR зрительного нерва и ткани мозга. Функция колбочек восстанавливалась всеми протестированными векторами, при этом наиболее эффективным оказался вектор AAV8(Y733F). AAV-опосредованную экспрессию GC1 обнаруживали исключительно в фоторецепторах. Через 10 месяцев после инъекции геномы векторов AAV обнаруживались только в зрительном нерве обработанных глаз мышей. Эти результаты впервые продемонстрировали возможность достижения длительной терапии дефицита GC1 на животной модели млекопитающих.
Гуанилатциклаза-1 (GC1) сетчатки, кодируемая GUCY2D, выполняет ключевую функцию по фототрансдукции у позвоночных (Pugh et al., 1997). В результате светового стимула вторичный мессенджер циклический ГМФ (цГМФ) подвергается быстрому гидролизу под действием фосфодиэстераз (PDE6) внутри фоторецепторных клеток, что приводит к закрытию цГМФ-воротных катионных каналов и гиперполяризации клетки. Когда цитоплазматический уровень [Ca2+] падает ниже 50 нМ, GC1 активируется под действием малых Ca2+-связывающих белков, GCAP (белки, активирующие гуанилатциклазу). GC1 синтезирует цГМФ, который связывает и повторно открывает цГМФ-воротные каналы, возвращая фоторецептор в темновое, деполяризованное состояние (Pugh et al., 1997; Polans et al., 1996; Wensel, 2008; Lamb and Pugh, 2006; Arshavsky et al., 2002). Таким образом, GC1 играет жизненно важную роль в циклах свет/темнота и циклах восстановления, твердо закрепляя, посредством цГМФ, петлю обратной связи между уровнями внутриклеточного кальция и поляризационным состоянием фоторецепторов.
GC1 экспрессируется в наружных сегментах палочковидных и колбочковидных фоторецепторов сетчатки человека, обезьяны и мышей (Dizhoor et al., 1994; Liu et al., 1994; Haire et al., 2006). Подобно другим мембранным гуанилатциклазам, она содержит N'-концевую сигнальную последовательность, внеклеточный домен (ECD), единственный трансмембранный домен, киназоподобный гомологичный домен (KHD), димеризационный домен (DD) и C'-концевой каталитический домен (CCD) и, вероятнее всего, присутствует в виде гомомерных димеров (Yang and Garbers, 1997). Мутации в GUCY2D ассоциированы с рецессивным врожденным амаврозом Лебера типа 1 (LCA1), а также с доминантными и рецессивными формами палочко-колбочковой дистрофии, CORD6 и CORD соответственно (Perrault et al., 1996; Perrault et al., 2000; Kelsell et al., 1998; Perrault et al., 1998; Gregory-Evans et al., 2000; Weigell-Weber et al., 2000; Ugur et al., 2010). LCA1 представляет собой тяжелое, приводящее к слепоте, аутосомнорецессивное расстройство с ранним началом, характеризующееся стертой электроретинограммой (ERG), которая предшествует дегенерации фоторецептора (Perrault et al., 1999; Chung and Traboulsi, 2009). CORD6 является доминантным расстройством, характеризующимся прогрессирующей дегенерацией фоторецепторов, начинающейся с колбочек, вызывающей раннюю потерю остроты зрения, с последующей дегенерацией палочек, приводящей к прогрессирующей куриной слепоте и потере периферического зрения (Kelsell et al., 1998; Perrault et al., 1 98). CORD6-мутации ограничены димеризационным доменом (DD) и обычно вызывают повышение GCAP-опосредованной активации GC1 (Payne et al., 2001; Downes et al., 2001; Wilkie et al., 2000). Найденная в настоящее время рецессивная, вызывающая CORD мутация локализована в каталитическом домене (CD) гуанилатциклазы-1, и полагают, что она является причиной общего снижения функции этого фермента (Ugur et al., 2010). Вызывающие LCA1 мутации распределены по всей длине доменов ECD, KHD, DD и CCD гуанилатциклазы-1 (Karan et al., 2010). Такие мутации меняют структуру фермента и его стабильность, могут воздействовать на ретроградный транспорт других ассоциированных с мембраной белков и часто являются нулевыми.
Мыши GC1KO являются носителями нулевой мутации в Gucy2e, мышином гомологе GUCY2D. Подобно LCA1 у пациентов, потеря функции колбочек у данной модели предшествует дегенерации колбочек (Timmers et al., 2001). Палочки на 30-50% сохраняют свою функцию и не подвергаются процессу дегенерации в силу присутствия GC2, другой функциональной гуанилатциклазы в мышиных фоторецепторах (Yang and Garbers, 1997; Jacobson et al., 2006; Timmers et al., 2001; Cideciyan et al., 2008; Song et al., 2002). В предыдущих примерах было показано, что субретинальная инъекция векторов аденоассоциированного вируса (AAV) серотипа 5, содержащих кДНК мышиной GC1, направляемую либо промотором фоторецептор-специфической человеческой родопсинкиназы (hGRK1), либо убиквитарным промотором (smCBA), способна восстанавливать опосредованную колбочками функцию и зрительно-реактивное поведение, а также в течение трех месяцев защищать колбочковидные фоторецепторы у мышей GC1KO. В данном исследовании оценивали возможности AAV-опосредованной заместительной генной терапии в отношении длительного лечебного эффекта у мышей GC1KO. AAV5-hGRK1-mGC1 и AAV5-smCBA-mGC1, a также вектор высокоэффективного капсидного мутанта по тирозину, AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, вводили субретинально мышам GC1KO между постнатальным днем 14 (P14) и постнатальным днем 25 (P25). Эти результаты впервые продемонстрировали возможность достижения длительной терапии дефицита GC1 на животной модели млекопитающих. Биораспределение векторного генома оценивали также и в случае векторов на основе AAV5 и AAV8(733). Эти результаты
- 37 035893 обеспечивают прямой выход на развитие клинических испытаний в плане терапии LCA1 на основе вектора AAV (а возможно, и палочко-колбочковых дистрофий), а также помощь в создании стандартизованного вектора для широкого класса рецессивных дегенеративных процессов в сетчатке, опосредованных дефектами в фоторецептор-ассоциированных генах.
Материалы и методы.
Экспериментальные животные.
Мышей GC1KO и конгенных контрольных мышей +/+, полученных в результате гетерозиготных скрещиваний мышей GC1+/-, предоставленных компанией Jackson Laboratory (Bar Harbor, ME, USA), выводили и поддерживали в институте, где работают авторы настоящего изобретения, в помещении для содержания животных, с 12-часовым циклом чередования света/темноты. Пищу и воду животным предоставляли в неограниченном количестве. Все исследования на животных проводились в соответствии с утвержденными правилами ARVO по использованию животных в офтальмологических испытаниях по изучению зрительной функции и в соответствии с правилами NIH.
Конструирование векторов AAV.
Векторные плазмиды аденоассоциированного вируса (AAV5) серотипа 5, содержащие либо убиквитарный промотор (smCBA), либо промотор фоторецептор-специфической человеческой родопсинкиназы (hGRK1), направляющий кДНК мышиной GC1 (mGC1), были сконструированы в соответствии с описанными ранее способами (Boye et al., 2010). Сайт-направленный мутагенез экспонированных на поверхности тирозиновых остатков на капсиде AAV2 был описан ранее (Zhong et al., 2008). Сходные методы были использованы и для конструирования описанного здесь капсидного мутанта AAV8(Y733F). Все векторы были упакованы, очищены и оттитрованы в соответствии с ранее описанными методами (Zolotukhin et al., 2002; Jacobson et al., 2006). Полученные в результате титры AAV5-smCBA-mGC1, AAV5-hGRK1-mGC1 и AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 составляли 4,69х1012 векторных геномов на 1 мл (вг/мл), 4,12х1013 и 1,08х1013 вг/мл соответственно.
Субретинальные инъекции.
мкл AAV5-smCBA-mGC1 (4,69х109 векторных геномов), AAV5-hGRK1-mGC1 (4,12х 1010 векторных геномов) или AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 (1,08х 1010 векторных геномов) инъецировали субретинально в один глаз мыши GC1KO в период между постнатальным днем 14 (P14) и постнатальным днем 25 (P25). Контралатеральный глаз оставляли неинъецированным. Субретинальные инъекции производили так, как было описано ранее (Timmers et al., 2001). Дальнейшие анализы производили только у тех животных, которые получили сравнимые, успешные инъекции (>60% отслоения сетчатки с минимальными осложнениями). Приблизительно 75% всех когорт получили успешные инъекции. Твердо установлено, что область вирусной трансдукции по меньшей мере соответствует области отслоения сетчатки (Timmers et al., 2001; Cideciyan et al., 2008).
Электроретинографический анализ.
Электроретинограммы (ERG) обработанных GC1KO и подобранных по возрасту конгенных (+/+) контролей регистрировали, используя контроль на основе PC и регистрирующий элемент (Toennies Multiliner Vision; Jaeger/Toennies, Hochberg, Germany), согласно ранее описанным способам, с незначительными модификациями (Haire et al., 2006; Boye et al. 2010). Измерения у мышей GC1KO, обработанных AAV5-smCBA-mGC1 (n=10), мышей GC1KO, обработанных AAV5-hGRK1-mGC1 (n=6), мышей GC1KO, обработанных AAV8(Y733F) (n=6), и конгенных (+/+) контролей (n=8) начинали в разные дни, и, следовательно, длительность мониторинга каждой подгруппы мышей несколько отличалась. ERG обработанных мышей GC1KO проводили через 4 недели после инъекции, а затем каждый месяц, до 1 года после инъекции (AAV5-обработанные мыши) или до 9 месяцев после инъекции (AAV8[Y733F]обработанные мыши). Подобранных по возрасту конгенных (+/+) контрольных мышей отслеживали в течение 8 месяцев. Мышей выводили из эксперимента на разных стадиях его проведения с целью осуществления различных посмертных исследований (изучение биораспределения, иммуногистохимический анализ сетчатки, RT-PCR ткани сетчатки в режиме реального времени) или же по причине неожиданной болезни/смерти. Данные ERG были представлены только для групп животных при n>3. Следовательно, в данном исследовании сравниваются результаты 9-месячных наблюдений после инъекции для группы мышей, обработанных AAV5, и результаты 6-месячных наблюдений после инъекции для группы мышей, обработанных AAV8(Y733F). Обработанные мыши продолжали проявлять ERG-реактивность и после указанного периода, однако число образцов было уже значительно уменьшено, и статистический анализ утрачивал всякий смысл. В качестве подтверждения этого утверждения представлены репрезентативные опосредованные колбочками картины электроретинограмм от индивидуальной мыши через 1 год после обработки вектором AAV5 и через 9 месяцев после обработки вектором AAV8(Y733F). Скотопические (опосредованные палочками) и фотопические (опосредованные колбочками) записи электроретинограмм были получены регистрацией параметров, описанных ранее (Boye et al., 2010). Амплитуды бета-волн определяли как разницу между минимумом альфа-волны и последующим положительным пиком каждого колебательного сигнала. Опосредованные палочками реакции ERG у необработанных мышей GC1KO варьируют от животного к животному (Yang et al., 1999), и, следовательно, большие стандартные откло- 38 035893 нения наблюдались при усреднении амплитуд скотопических альфа- и бета-волн от разных животных. Данные ERG палочек представлены в виде отношения (среднее внутри-индивидуальных (т.е. парных глаз одного и того же животного) амплитуд альфа- и бета-волн палочек обработанного и необработанного глаза). Как таковые, любые значения выше 1 указывают на то, что обработка AAV-mGC1 улучшила реакцию палочек. Отношения вычисляли, используя амплитуды, вырабатываемые в ответ на стимул в 1 кд-ср/м2. Фотопические, опосредованные колбочками максимальные амплитуды бета-волн в инъецированных и неинъецированных глазах всех обработанных мышей GC1KO и конгенных (+/+) контрольных мышей, вырабатываемые при 12 кд-ср/м2, усредняли в каждой временной точке и использовали для определения стандартных ошибок. Все данные переносили в программу Sigma Plot для окончательного графического представления. Стандартный t-тест был использован для расчета значений P между группами данных. Значимые различия были определены как значения P<0,05.
Биораспределение.
Распределение векторной ДНК в тканях обработанных мышей GC1KO определяли в образцах, собранных при умерщвлении, в соответствии с описанными ранее методами с незначительными модификациями (Jacobson et al., 2006). Обработанных вектором мышей умерщвляли в следующих временных точках: AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1-обработанных мышей (через 4 месяца после инъекции: n=1; 7 месяцев после инъекции: n=1), AAV5-smCBA-mGC1 (7 месяцев после инъекции: n=1; 10 месяцев после инъекции: n=5), AAV5-hGRK1-mGC1 (7 месяцев после инъекции: n=1; 10 месяцев после инъекции: n=1). Контрольные ткани из подобранных по возрасту мышей GC1KO для 7-месячного срока после инъекции или 10-месячного срока после инъекции также оценивали, помимо экспериментальных животных. После умерщвления были использованы особые, новые хирургические пинцеты для энуклеации обработанных и необработанных глаз, которые сохраняли приблизительно 0,5 см проксимального зрительного нерва. Затем были использованы особые, новые анатомические ножницы для удаления зрительных нервов из глазных яблок, после чего их быстро замораживали в жидком азоте и переносили на хранение при -80°C, где они оставались вплоть до момента экстракции ДНК. Глазные яблоки погружали в 4% параформальдегид (PAF) и подготавливали для иммуногистохимического анализа (см. ниже).
Мозги извлекали1, и коронарный мозговой матрикс из нержавеющей стали (Harvard Apparatus, Holliston, MA, USA) использовали для выделения специфических зрительных зон. Правые и левые латеральные ядра коленца собирали у одной мыши на обрабатываемую группу (в последней временной точке), фиксировали в формалине и сохраняли на случай, если векторные геномы будут найдены в мозгу и потребуется иммуногистохимия. Отдельные порции правого и левого мозга, содержащие зрительные пути, собирали, быстро замораживали в жидком азоте и переносили на хранение при -80°C, где они оставались вплоть до момента экстракции ДНК. Были приняты предосторожности во избежание взаимного загрязнения при сборе тканей. Геномную ДНК экстрагировали из тканей в соответствии с инструкциями производителя (Qiagen DNeasy tissue kit). Результирующие концентрации ДНК определяли, используя биофотометр Eppendorf (Model 6131; Eppendorf, Hamburg, Germany). Количественные PCR проводили согласно описанным ранее методикам с незначительными модификациями (Jacobson et al., 2006; Song et al., 2002; Poirier et al., 2004).
Были созданы пары праймеров к сигнальной области полиаденилирования SV40 (SV40 polyA) в каждом векторном геноме, и построены стандартные кривые с использованием известных концентраций плазмидной ДНК, содержащей ту же самую последовательность-мишень SV40 polyA. Образцы ДНК анализировали в трех повторах. Чтобы исключить ложноотрицательные за счет ингибирования PCR, третий повтор скрепляли с плазмидной ДНК, содержащей мишень (SV40 polyA), в соотношении 100 копий/мкг геномной ДНК. Если детектировали >40 копий внесенной ДНК, образец считали приемлемым для передачи копий векторного генома. В некоторых случаях образцы, которые не удавалось внести, анализировали повторно, используя в реакциях PCR менее чем 1 мкг геномной ДНК, таким образом разбавляя ингибиторы PCR, вымываемые совместно с ДНК в экстрагированной ткани. Внесенное число копий уменьшалось пропорционально, чтобы поддерживать соотношение 100 копий/мкг ДНК. Критерии для передачи копий векторного генома были установлены в соответствии с описанными ранее методиками (Jacobson et al., 2006). Вкратце, более чем 100 копий генома/мкг считались положительными, а измеренная копия считалась отрицательной.
Подготовка тканей, иммуногистохимия и микроскопия.
При умерщвлении одновременно с исследованиями биораспределения, предпринятыми через 7 месяцев после инъекции [AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1] и через 10 месяцев после инъекции (AAV5-smCBA-mGC1 и AAV5-hGRK1-mGC1), каемку глаза обработанных мышей GC1KO, подобранных по возрасту мышей, необработанных мышей GC1KO, а также подобранных по возрасту конгенных мышей GC1+/+ маркировали нагретой иглой в положении 12 ч для облегчения ориентации. Необработанные мыши GC1KO и контрольные мыши GC1+/+ были одного возраста с AAV8(Y733F)-обработанными мышами (8-месячные на момент умерщвления). Глаза, подготовленные для изготовления срезов из замороженных тканей, обрабатывали и осуществляли иммуноокрашивание в соответствии с описанными ранее методами (Haire et al., 2006). Вкратце, срезы сетчатки толщиной 10 мкм инкубировали с антителами
- 39 035893 против GC1 (кроличьи поликлональные антитела, 1:200, sc-50512 Santa Cruz Biotechnology, USA) или мышиного аррестина колбочек (кроличьи поликлональные антитела LUMIj, 1:1000, предоставленные Dr. Cheryl Craft, University of Southern California, Los Angeles, CA, USA). После первичной инкубации наносили вторичные IgG-антитела Alexa-488 или Alexa-594 соответственно, выдерживали в течение 1 ч при комнатной температуре (1:500 в 1X PBS). Срезы окрашивали контрастным красителем 4',6'-диамино2-фенил-индолом (DAPI) в течение 5 мин при комнатной температуре. Через 11 месяцев после инъекции забивали одну мышь GC1KO, только один глаз которой обрабатывали конструкцией AAV5-smCBA-mGC1, и тотальные препараты сетчатки из обработанных и необработанных глаз подвергали обработке в соответствии с описанными ранее методами (Pang et al., 2010). Вкратце, тотальные препараты окрашивали антителами LUMIj (1:1000) с последующим окрашиванием вторичным IgGантителом Alexa-594 (1:500 в 1X PBS) и располагали на покровном стекле микроскопа таким образом, чтобы самая верхняя (дорсальная) часть сетчатки была установлена в положение, соответствующее 12:00 ч. Срезы сетчатки изучали методом конфокальной микроскопии (спектральный конфокальный микроскоп Leica TCS SP2 AOBS, снабженный программным обеспечением LCS Version 2.61, Build 1537 software). Изображения были получены при установке одинаковой экспозиции и при 20х увеличении. Тотальные препараты сетчатки изучали в флуоресцентном микроскопе с окуляром широкого поля обзора (Zeiss Axioplan 2), оборудованном камерой Qlmaging Retiga 4000R и программным обеспечением Qlmaging QCapture Pro software. Квадранты каждого тотального препарата были визуализированы при 10х при установке одинаковой экспозиции, после чего их вместе обрабатывали в программе Adobe Photoshop.
Иммуноблоттинг.
Через 7 месяцев после инъекции одну мышь, инъецированную конструкцией AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, и соответствующую ей по возрасту конгенную (контрольную) мышь GC1+/+ умерщвляли, осуществляли энуклеацию их глаз, которые помещали в 1X PBS. Сетчатки немедленно рассекали и подготавливали следующим образом. Индивидуальные сетчатки солюбилизировали в PBS (137 мМ NaCl, 2,7 мМ KC1, 10 мМ Na2HPO4, 1,8 мМ KH2PO4) с 1% Triton X-100 и полным протеиназным ингибитором (Roche) в течение 1 ч при 4°C с последующим центрифугированием при 14000 об/мин. Концентрацию белка в супернатанте определяли посредством ВСА (Pierce) и по 15 мкг каждого образца разделяли на 12% полиакриламидном геле (Bio-Rad), и переносили на мембраны Immobilon-FL и выдерживали в течение 1 ч в гибридизационном буфере (25 мМ Tris, 192 мМ глицин), содержащем 15% метанола. Блоты обрабатывали блокирующим буфером (Li-Cor) и метили в течение 1 ч мышиным моноклональным антителом, распознающим GC1 (IS4, 1:3000, предоставленным Dr. Kris Palcweski, Case Western University, USA.), и продуцировали кроличьи поликлональные антитела против GCAP1 (pAb UW14, 1:25,000, предоставленные Dr. Wolfgang Baehr, University of Utah) и бета-актина (1:5000, Abeam). Наносили вторичные антитела (козьи антитела, полученные против Ig мыши, конъюгированного с CW800, и козьи, антикроличьи антитела, конъюгированные с IR680), выдерживали в течение 1 ч и блоты визуализировали с помощью системы Odyssey Infrared Imaging System (Licor, Lincoln, NE, USA).
Количественное определение мРНК посредством rtPCR, извлечение генома сетчатки и иммуногистохимия зрительного нерва.
Индивидуально обработанные глаза с присоединенным зрительным нервом извлекали из мышей GC1KO через 1 год после обработки либо AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, либо AAV5-smCBA-mGC1, a также из подобранной по возрасту необработанной мыши GC1+/+. Сетчатки немедленно отсекали от глаз и быстро замораживали в жидком азоте. Зрительный нерв отделяли от глаз, фиксировали в 4% параформальдегиде в течение ночи при 4°C, погружали в 30% раствор сахарозы и выдерживали в течение 2 ч при 4°C, затем быстро замораживали в криостатной смеси (Tissue Tek® ОСТ 4583; Sakura Finetek USA, Inc., Torrance, CA, USA) в бане с сухим льдом/этанолом. Делали срезы зрительных нервов толщиной 10 мкм и окрашивали их в соответствии с ранее описанными методами (Boye et al., 2010). Сетчатки гомогенизировали в 350 мл буфера RLT (RNeasy® Protect Mini Kit, Qiagen, Inc., Valencia, CA, USA) плюс ВМЕ в течение 45 с. Образцы центрифугировали и лизат разделяли пополам (одна половина предназначалась для извлечения генома, а другая половина - для экстракции РНК) (Traint and Whitehead, 2009). Извлечение генома осуществляли так, как описано выше. Экстракцию РНК осуществляли с помощью набора RNeasy® Protect Mini Kit (Qiagen, Inc.). РНК подвергали обратной транскрипции (iScript® cDNA synthesis kit, Biorad Laboratories, Hercules, CA, USA) и использовали PCR в режиме реального времени (iQ SYBR® Green Supermix and MyiQ real-time PCR detection system interfaced with iCycler® thermal cycler, Biorad Laboratories), чтобы произвести количественное определение следующих специфических для сетчатки мРНК: гуанилатциклазы-1 (GC1), активирующего гуанилатциклазу белка-1 (GCAP1), α-трансдуцина колбочек (GNAT2), цГМФ-специфической альфа-субъединицы 3',5'-циклической фосфодиэстеразы (PDE6a) и гена домашнего хозяйства, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH).
- 40 035893
Были идентифицированы пары праймеров для GCAP1, GNAT2, PDEa и GAPDH, к таковым, которые были использованы у Baehr et al. (2007). Праймеры для мышиной GC1 (прямой праймер: 5'-GACCCTTCCTGCTGGTTCGATCCA-3' [SEQ ID NO: 16], обратный праймер: 5-CTGCATGTGTAGCAGCCTGTGCCTC-3' [SEQ ID NO: 17]) были сконструированы для фланкирующего экзона 5, участка поломки гена у GC1KOmouse (Yang et al., 1999), и был получен ампликон длиной в 151 п.н. Методом PCR получили ампликоны приемлемого размера в образцах сетчатки GC1+/+, а также AAV-mGC1-обработанной сетчатки GC1KO, но, как и ожидалось, не в необработанной сетчатке GC1KO. Идентичность ампликонов выверяли рестрикционным перевариванием под действием фермента Stul (NEB), который расщепляет внутреннюю область последовательности-мишени, с выходом фрагментов в 56 и 95 п.н. Метод PCR в режиме реального времени (rtPCR) с праймерами GC1 и GAPDH, при серийном разведении обратно транскрибированной ДНК (из обоих, GC1+/+ и AAV-mGC1-обработанного, образцов сетчатки GC1KO), давал одинаковый наклон, что указывает на то, что праймеры GC1 являются подходящими для количественного определения как эндогенного, так и опосредованного вектором GC1посредника (фиг. 20A и 20B).
Результаты усредняли по трем повторным реакциям и обсчитывали, используя метод 2-AACm (Livak and Schmittgen, 2001) с использованием сигнала GAPDH, используемого для нормирования образцов, и образца GC1+/+, служащего в качестве калибратора. Стандартные отклонения рассчитывали из трех повторных реакций, проводимых для каждого образца. Данные представлены в виде кратного изменения в уровнях мРНК по отношению к образцу GC1+/+.
Результаты.
Длительная фоторецептор-специфическая экспрессия GC1.
Иммуноокрашивание антителом против GC1 выявило, что AAV-направленная экспрессия терапевтического белка, персистирует исключительно в фоторецепторах обработанных мышей GC1KO и в течение значительной части периода продолжительности жизни этих животных; в случае AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 - в течение по меньшей мере 7 месяцев, в случае AAV5-smCBA-mGC1 - в течение по меньшей мере 10 месяцев и в случае AAV5-hGRK1-mGC1 - в течение по меньшей мере 10 месяцев (фиг. 21A и 21B). Экспрессия GC1 была ограничена наружными сегментами палочек и колбочек, обработанных вектором AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, тогда как при обработке глаз вектором AAV5-smCBA-mGC1 она была обнаружена как в наружных сегментах, так и, хоть и реже, в тельцах фоторецепторных клеток - результат, сопоставимый с силой этого убиквитарного промотора по сравнению с фоторецептор-специфическим промотором, hGRK1 (Beltran et al., 2010). Рассматривали два примера утончения сетчатки. Первым примером была сетчатка GC1KO, обработанная вектором AAV5-smCBA-mGC1 (всего 4,69x109 доставленных векторных геномов). Наружный ядерный слой (ONL) был слегка утончен относительно такового, наблюдаемого в сетчатках необработанных мышей GC1KO или в контрольных сетчатках GC1+/+ (в обоих случаях мыши были в 8-месячном возрасте). Это может быть результатом повышенной экспрессии GC1, опосредованной промотором smCBA (Beltran et al., 2010).
Второй пример включал в себя сетчатку GC1KO, обработанную более концентрированным вектором AAV5-hGRK1-mGC1, и, как было показано ранее, фоторецептор-специфическую экспрессию GC1, но с более глубоким утончением наружного ядерного слоя. Следует отметить, что этот вектор был наиболее концентрированным из трех, которые были оценены в данном исследовании (4,12x 1010 доставленных векторных геномов по сравнению с 4,69x109 и 1,08x1010 соответственно для векторов AAV5-smCBA-mGC1 и AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1), и опять нужно отметить, что повышенная экспрессия GC1 может быть причиной наблюдаемого утончения. Эти результаты по меньшей мере свидетельствуют о том, что у этих мышей может наблюдаться дозолимитирующая токсичность. Экспрессия GC1 отсутствовала в сетчатке мышей GC1KO (фиг. 21A и 21B).
Длительная выживаемость колбочковидных фоторецепторов достигается с помощью AAVнаправленной GC1.
Колбочковидные фоторецепторы у обработанных и необработанных мышей GC1KO, а также у контрольных мышей GC1+/+ были идентифицированы путем окрашивания на предмет обнаружения аррестина колбочек. Изучали поперечные срезы сетчатки мышей, умерщвленных для исследования конечного биораспределения и тотальных препаратов сетчатки из глаз мышей GC1KO через 11 месяцев после обработки вектором AAV5-smCBA-mGC1 (только правого глаза). Здесь было показано, что плотность колбочковидных фоторецепторов была значительно снижена в необработанных сетчатках мышей GC1KO к 10-месячному сроку их жизни, и это подтверждает прежние сообщения о том, что у этой мышиной модели происходит топографически специфическая утрата колбочек (Coleman et al., 2004) (фиг. 21A и 21B). Путем анализа тотальных препаратов сетчатки мышей 11-месячного возраста было выявлено, что в необработанных сетчатках плотность колбочек очень снижена, с остаточными колбочками, обнаруживаемыми исключительно в самых верхних областях сетчатки, тогда как в парной, P14-обработанной сетчатке, повсеместно, за исключением малого пятна темпоральной ретины, которая, по всей видимости, оказалась не охваченной вектором во время субретинальной инъекции и поэтому не содержала трансгенного
- 41 035893 продукта, сохранялась значительно более высокая плотность колбочек. По сравнению с картиной, наблюдаемой в AAV5-обработαнных сетчатках, плотность и структура колбочек на поперечных срезах сетчатки AAV8(Y733F)-обработанных мышей выглядела качественно наиболее схожей с таковой, наблюдаемой в нормальной сетчатке мышей GC1 (фиг. 21A и 21B). Тогда как плотности колбочек были выше, чем в необработанных контрольных сетчатках, однако сами колбочки в AAV5-обработанных сетчатках выглядели несколько дезорганизованными - результат, который, скорее всего, можно объяснить некоторым общим беспорядком/утончением наружных ядерных слоев у этих мышей.
Долгосрочное восстановление функции фоторецептора (ERG) у AAV-обработанных мышей GC1KO.
В предыдущих примерах опосредованную колбочками функцию можно было восстановить у мышей GC1KO в течение 3 месяцев после P14-доставкu им вектора AAV5-smCBA-mGC1 или AAV5-hGRK1-mGC1 (Boye et al., 2010). Средние амплитуды фотопических бета-волн у обработанных мышей были частично восстановлены через 4 недели после инъекции и стабильно сохранялись в течение всего периода данного исследования. В данном примере сравнивали опосредованные колбочками реакции, наблюдаемые после окончания 9-месячного срока после обработки, с таковыми у мышей GC1KO, которых инъецировали в сроки между P14 и P25 идентичными векторами, которые были использованы в предыдущем исследовании. У всех остальных мышей, обработанных вектором AAV5-mGC1, по меньшей мере свыше 1 года после обработки продолжала проявляться поддающаяся измерению опосредованная колбочками функция. Репрезентативные картины электроретинограмм, полученные при 12 кд-ср/м2 от отдельных мышей, обработанных вектором AAV5-hGRK1-mGC1, представлены на фиг. 22A и 22B. Реакции колбочек были стабильными во времени и были значительно выше реакций, обнаруживаемых в необработанных контралатеральных контролях (р<0,001), что и предполагает, что восстановление функции колбочек в процессе жизни указанных животных возможно (фиг. 22A). В соответствии с предыдущим примером уровень восстановления, достигаемый после доставки вектора, содержащего фоторецептор-специфический промотор (hGRK1), в любой период после обработки незначительно отличался от такового, достигаемого при использовании вектора, содержащего убиквитарный промотор (smCBA). Репрезентативные картины электроретинограмм позволили выявить, что кинетика восстановленной ERG колбочек выглядела нормальной на всем протяжении исследования (фиг. 22B). Кроме того, в этом примере было показано, что восстановление функции колбочковидного фоторецептора было стабильным в течение по меньшей мере 6 месяцев после инъекции вектора AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1.
Амплитуды бета-волн колбочек у мышей GC1KO, которым инъецировали этот сильный, быстродействующий AAV8, капсидный мутант по тирозину, были выше таковых, наблюдаемых у мышей GC1KO, которым инъецировали любой из векторов AAV5 на любом сроке в процессе проведения исследования. Через 6 месяцев после обработки в последней временной точке, когда могло быть проведено параллельное сравнение действия всех векторов, наблюдалась существенная разница между амплитудами бета-волн колбочек в случае AAV8(Y733)-hGRK1-mGC1-обработанных по сравнению с AAV5-hGRK1-mGC1-обработанными мышами (p=0,033) и в случае AAV(Y733F)-hGRK1-mGC1 - по сравнению с AAV5-smCBA-mGC1-обработанными мышами (p=0,025). Репрезентативная картина электроретинограммы, полученной через 9 месяцев после инъекции вектора AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 (n=1), была значительно слабее таковой, полученной через 6 месяцев после инъекции.
В силу вариабельности в реакциях палочек между необработанными мышами GC1KO (от 50 до 70% у мышей WT в возрасте 5 месяцев (23)) статистическое сравнение средних показателей ответов палочек глаз обработанных мышей с таковыми необработанных является проблематичным. Однако амплитуды ERG палочек контралатеральных глаз одного и того же животного являются почти одинаковыми, поэтому здесь считали среднее (между глазами одной и той же мыши) отношение амплитуд альфа-волн и бетаволн палочек по сравнению с необработанными глазами, затем указанные отношения наносили на график в зависимости от времени (фиг. 23A и 23B). AAV-опосредованное восстановление функции палочек показано в виде отношений величиной >1,0. На фиг. 23A и 23B показано, что, за исключением одной временной точки (4 месяца после обработки), все средние отношения амплитуд бета-волн палочек в случае AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1-обработанных к таковым необработанных глаз >1,0. Отношения AAV5обработанных к необработанным глазам только иногда было >1,0. Сходным образом, отношения амплитуд альфа-волн палочек было неизменно выше у AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1-обработанных мышей, тогда как они часто ухудшались после обработки каким-нибудь из AAV5-векторов (фиг. 23B). Полученные результаты свидетельствуют, что, хотя терапевтический эффект в отношении палочек и был стабильным, вектор AAV8(Y733F) придавал мышам GC1KO наиболее стойкое опосредованное палочками функциональное улучшение (фиг. 23B). Репрезентативные опосредованные палочками скотопические картины ERG в ответ на стимул в 1 кд-ср/м2 были продемонстрированы у AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1обработанных мышей GC1KO 4 (через 6 месяцев после обработки), в контрольном контралатеральном глазу необработанных животных и у подобранных по возрасту контрольных животных GC1+/+. AAV8(Y733F)-опосредованные улучшения амплитуд ERG палочек ясно видны в данном эксперименте, и они указывают на то, что кроме амплитуд суб-дикого типа, кинетика реакций обработанных глаз сходна
- 42 035893 с таковой, наблюдаемой в контроле GC1+/+.
Биораспределение векторов.
Исследования по биораспределению были предприняты у мышей GC1KO, обработанных каждым из векторов, с целью установления того, возможно ли детектирование AAV5- или AAV8(Y733F)доставленных векторных геномов в зрительных нервах и/или в мозгу обработанных мышей по прошествии месячного периода. Мышей, которым инъецировали векторы AAV5, оценивали через 7 (n=2) и 10 (n=5) месяцев после обработки, а мышей, которым инъецировали AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1, оценивали через 4 (n=1) и 7 (n=1) месяцев после обработки. Изучали зрительные нервы в инъецированных и неинъецированных глазах, а также участки левого и правого мозга, которые содержат зрительные пути. Векторы AAV5 инъецировали в правый глаз мышей GC1KO. Соответственно, векторные геномы детектировали в правом зрительном нерве AAV5-обработанных мышей через 7 и через 10 месяцев после инъекции. Через 7 месяцев после инъекции векторные геномы детектировали также и в левом мозгу одной из мышей, которой инъецировали AAV5-hGRK1-mGC1. У этого животного в правом мозгу векторные геномы отсутствовали. Наблюдение, что правый (инъецированный) зрительный нерв и левый мозг были положительны, анатомически совместимо, поскольку левая полусфера преимущественно соединена с правым глазом.
Через 10 месяцев после инъекции AAV5-доставленные векторные геномы все еще детектировались в правом (инъецированном) зрительном нерве, но отсутствовали в обеих полусферах мозга. Вектор AAV8(Y733) инъецировали в левый глаз мышей GC1KO. Соответственно, AAV8(Y733F)-доставленные векторные геномы детектировали в левом зрительном нерве как через 4, так и через 7 месяцев после инъекции. Ни в одной из временных точек векторные геномы у мышей, обработанных AAV8(733), не детектировались ни в одной из полусфер мозга. В среднем большее число векторных геномов было детектировано в зрительных нервах глаз, в которые инъецировали вектор AAV5-GRK1-mGC1, по сравнению с таковыми, в которые инъецировали вектор AAV5-smCBA-mGC1. Этот результат, скорее всего, объясняется более высоким титром первого (4,12х 1013 вг/мл) по сравнению со вторым (4,69х1012 вг/мл).
Кроме того, только AAVS-hGRK1-mGC1-доставленные геномы детектировались в тканях мозга после окончания срока проведения настоящего исследования, и это еще одно наблюдение, которое, вероятнее всего, объясняется более высоким титром указанного вектора. Несмотря на тот факт, что использованный титр вектора AAV8 (Y733F)-hGRK1-mGC1 (1,08х1013 вг/мл) был меньше такового в случае вектора AAV5-hGRK1-mGC1, более высокое в среднем число векторных геномов было детектировано в зрительных нервах глаз, обработанных вектором AAV8(Y733F). Несмотря на то, что было известно, что вектор AAV5 является неэффективным для преобразования ганглиоцитов сетчатки мышей (Stieger et al., 2008), было показано, что AAV8 осуществляет трансдукцию клеток этого типа (Jacobson et al., 2006). Некоторое воздействие вектора на клетки сетчатки не является неожиданным, поскольку в процессе субретинальной инъекции шприц пронизывает внутреннюю сетчатку и поскольку у мышей отношение объема инъекции к общему объему глаза выше. Следовательно, обнаруженное наибольшее количество векторных геномов в зрительных нервах AAV8(Y733F)-обработанных глаз можно объяснить повышенной в отношении ганглиоцитов сетчатки аффинностью вектора AAV8(Y733F) по сравнению с вектором AAV5. Как и ожидалось, никаких следов геномов вектора AAV не было обнаружено в тканях интактных контрольных мышей GC1KO.
Обработка вектором AAV-mGC1 восстанавливает уровни GC1 и GCAP1 до уровней дикого типа в обработанной сетчатке мышей GC1KO.
Через 7 месяцев после инъекции вектора AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1 обработанные и необработанные одной мыши GC1KO и одной подобранной по возрасту контрольной мыши GC1+/+ использовали для изучения уровней экспрессии белков GC1 и GCAP1. Целью данного эксперимента было не сравнение уровней GC1 в обработанных группах животных, а, скорее, сравнение уровней вектор-опосредованной экспрессии GC1 с уровнями GC1 у животных дикого типа. Сходным образом авторы изобретения оценивали эффекты AAV-доставленной гуанилатциклазы-1 на экспрессию белка GCAP1. Как и ожидалось, фермент GC1 отсутствовал в необработанном глазу мыши GC1KO. И наоборот, уровни GC1 в AAV8(Y733F)-обработанном глазу приближались к таковым, наблюдаемым в норме в контроле GC1+/+ (фиг. 4). В соответствии с более ранними сообщениями о том, что постнатально у мышей GC1KO происходит отрицательная регуляция GCAP1, авторы изобретения показали, что в необработанной сетчатке мышей GC1KO происходила отрицательная регуляция GCAP1 по сравнению с контрольной GC1+/+ (39). Однако AAV8(Y733F)-опосредованная доставка GC1 приводит к повышению регуляции экспрессии GCAP1 в обработанной сетчатке мышей GC1KO. Уровни экспрессии белка GCAP1 также были сравнимы с уровнем, наблюдаемым у контрольных животных GC1+/+.
У обработанных мышей GC1KO присутствует мРНК GC1, а уровни мРНК GNAT2 повышены в сравнении с мышами GC1KO. С помощью пары праймеров GC1, которая фланкирует нарушение гена неомицина, локализованное внутри экзона 5 у мышей GC1KO (Timmers et al., 2001), оказалось возможно измерить уровень мРНК GC1 как у GC1+/+, так и у обработанных вектором мышей GC1KO. Интересно, что вторая пара праймеров GC1, нацеленная на экзон 18 и 19 фермента GC1, расположена существенно
- 43 035893 ниже нарушения гена, продуцируемого продуктом PCR в необработанном образце мышей GC1KO, и, следовательно, эти праймеры не используются. Через один год после обработки уровни мРНК в обработанных сетчатках были приблизительно в 7 раз (у AAV5-обработанных) и в 14 раз [у AAV8(YY733F)обработанных] выше, чем у подобранных по возрасту контрольных мышей GC1+/+ (фиг. 24A и 24B). Используя технологию восстановления нуклеиновых кислот, которая дает возможность равномерного разделения образца на две равные половины, одну для экстракции РНК, а другую для ДНК (Pang et al., 2011), измерили уровни мРНК и определили число векторных геномов внутри одного и того же образца. Было обнаружено, что высокие уровни мРНК GC1 в обработанных сетчатках соответствовали восстановлению многих векторных геномов; 1,57x107 векторных геномов/мкг ДНК в случае AAV8(Y733F) и 4,7х106 векторных геномов/мкг в случае AAV5. Несмотря на высокие уровни мРНК GC1 в обработанных сетчатках, никакой экспрессии GC1 не было обнаружено в зрительных нервах обработанных глаз. Такой результат дополнительно подтверждает представление, что векторы, которые были оценены в настоящем исследовании, не приводили к тому, чтобы экспрессия трансгена происходила вне мишени, на которую был направлен вектор. В соответствии с более ранними сообщениями о том, что редукция GCAP1 у мышей GC1KO является посттрансляционной (т.е. уровни мРНК являются неизменными), авторы изобретения не обнаружили существенного изменения от образца к образцу в уровнях мРНК GCAP1 (фиг. 24A и 24B).
В качестве начальной оценки обработки по другим специфическим РНК колбочек в этих образцах было оценено также и несколько других транскриптов. Для установления базового уровня для уровней трансдуцина α (GNAT2) РНК GNAT2 оценивали в необработанных образцах GC1KO и обнаружили, что ее уровень снижен по сравнению с таковым в контроле GC1+/+, - результат, вероятнее всего, связанный с утратой колбочковидных фоторецепторов в этих сетчатках (фиг. 24A и 24B). И наоборот, имело место повышение уровней мРНК GNAT2 в глазах, обработанных либо вектором AAV5, либо вектором AAV8(Y733F), - результат, который дополнительно подтверждает представление, что колбочковидные фоторецепторы защищены у мышей GC1KO, обработанных вектором AAV-mGC1. Уровни PDE6a в палочках были относительно неизменными от образца к образцу, вероятно, в силу того, что колбочковидные фоторецепторы у мышей GC1KO не подвергаются дегенерации (фиг. 24A и 24B).
В заключение, описанные здесь исследования показывают, что персистентная AAV-опосредованная экспрессия GC1 способна на долгий период восстанавливать функцию сетчатки и защищать колбочковидные фоторецепторы у мышей GC1KO. Когорты AAV5- и AAV8(Y733F)-обработанных мышей GC1KO были оценены в отношении ERG в течение 9 и 6 месяцев после инъекции соответственно. Хотя статистическое сравнение амплитуд ERG не продолжали проводить после временных точек в силу сокращения количества образцов, у всех обработанных мышей функциональное восстановление (ERG) продолжалось. Различные анализы, предпринятые на подгруппах указанных оставшихся мышей, однозначно указывали на продолжающееся терапевтическое воздействие. Указанное продолжительное терапевтическое воздействие подтверждалось на целом ряде различных уровней: 1) нахождение белка GC1 в обработанных глазах через 10 месяцев после обработки, 2) восстановление функции колбочек, измеряемое посредством ERG, через 12 месяцев после обработки, 3) повышенная выживаемость колбочек в обработанных глазах через 11 месяцев после обработки и 4) нахождение векторных геномов и мРНК GC1 в сетчатках через 12 месяцев после обработки. Если рассматривать в индивидуальном порядке, дискретные анализы, число используемых в таком анализе образцов было часто мало. Однако, когда все результаты этих анализов коррелировали с терапевтической эффективностью у мышей, проявляющих четкие признаки функционального восстановления, малое число образцов значительно повышало эффективность полученных результатов. Следовательно, в данном контексте очевидно, что терапевтический эффект распространяется и за пределы периода статистической оценки восстановления ERG. Это является первой демонстрацией долговременной терапии дефицита GC1 у животных моделей.
Восстановленные ERG колбочек наблюдались у AAV5- и AAV8(Y733)-обработанных мышей GC1KO соответственно в течение по меньшей мере 9 и 6 месяцев после обработки. Реакции были стабильными и значительно более высокими, чем реакции колбочек мышей GC1KO, на всем протяжении периода проведения настоящего исследования. Восстановление было наиболее выраженным у мышей, обработанных вектором AAV8(Y733F). Средние амплитуды бета-волн колбочек у AAV8(Y733F)обработанных мышей систематически приблизительно на 20 мкВ превышали таковые, регистрируемые у мышей GC1KO, обработанных стандартными векторами AAV5 (~55 и ~35 мкВ соответственно). Через 6 месяцев после обработки, последней временной точки, когда статистически сравнивали все векторы, указанная разница оставалась значимой. Этот результат подтверждает, что вектор AAV8(Y733F) стабильно восстанавливал структуру и функцию сетчатки у мыши rd10, модели, резистентной к лечению стандартными векторами AAV.
Определение количественных различий в амплитудах палочек между обработанными и необработанными глазами у мыши GC1KO является проблематичным в силу того, что у этой модели функция палочек частично поддерживается гуанилатциклазой-2 (GC2) (Sun et al., 2010). Поэтому реакции палочек на уровне ERG от животного к животному варьируют (от 30 до 50% от нормального). Следовательно, в
- 44 035893 отличие от случая, когда сравнивают реакции обработанных и необработанных колбочек, реакции обработанных палочек нельзя сравнивать с нулевым базовым уровнем. Тем не менее, парные глаза GC1KO имеют сравнимые амплитуды ERG палочек, и сравнение отношения показателей ERG палочек парных глаз одного и того же животного, один из которых обработан, а другой не обработан, обеспечивает обоснованный показатель для оценки эффектов лечения по функции палочек. Улучшение опосредованных палочками реакций у мышей GC1KO, обработанных вектором AAV8(Y733F), наблюдалось более систематически, чем таковое, регистрируемое у AAV5-обработанных мышей, как определялось при сравнении внутри-индивидуального отношения амплитуд альфа- и бета-волн палочек из обработанного и необработанного глаза. Это предполагает, что агрессивная экспрессия GC1 в глазу мыши GC1KO может дополнять частичный эффект GC2 в отношении функции палочек у мышей.
Долгосрочная выживаемость колбочковидных фоторецепторов (11 месяцев после инъекции) была продемонстрирована иммуноокрашиванием обработанных и необработанных тотальных препаратов сетчатки от одной мыши, обработанной вектором AAV5-smCBA-mGC1, антителом против аррестина сетчатки. Колбочки были идентифицированы во всем препарате обработанной сетчатки мыши GC1KO. Совершенно определенно также и то, что AAV5-smCBA-mGC1-обработанная сетчатка содержала больше колбочек, чем в необработанном глазу, что согласуется с данными прежних публикаций, при этом в необработанном глазу сохранялась лишь малая фракция колбочек в его самой верхней полусфере (Provost et al., 2005). Несмотря на то, что сохраненные колбочки в обработанной сетчатке мышей GC1KO на ультраструктурном уровне не исследовались (например, методом электронной микроскопии), наблюдаемое на уровне анализа ERG сохранение функциональной активности колбочек во времени свидетельствует о том, что их структура оставалась интактной. Долгосрочная защита колбочковидных фоторецепторов, опосредованная терапевтическим вектором AAV-GC1, имеет очевидную клиническую значимость, поскольку свидетельствует о потенциальной возможности защитить колбочки желтого пятна и восстановить пригодный уровень дневного/цветного зрения пациентам с дефицитом GC1.
AAV-опосредованная экспрессия GC1 персистировала по меньшей мере в течение 10 месяцев после обработки (последняя временная точка, в которой проводилась иммуногистохимическая оценка) и была локализована исключительно в фоторецепторах, независимо от используемого серотипа или от того, направлялась ли эта экспрессия фоторецептор-специфическим (hGRK1) или убиквитарным (smCBA) промотором. Наряду с тем, что экспрессия трансгена была ограничена типом клеток-мишеней, промотор hGRK1 был более специфичен в том отношении, что он направлял экспрессию исключительно внутри адекватного компартмента клеток-мишеней (в наружных сегментах фоторецепторов). Этот результат, наряду с другими удачными исследованиями с целью подтверждения правильности концепции применения указанного промотора, свидетельствует о том, что промотор hGRK1 следует принимать во внимание при создании клинического вектора AAV, нацеленного на фоторецепторы.
Иммуноокрашивание срезов сетчатки трансгенных мышей GC1KO через 10 месяцев после обработки вектором AAV5-smcBA-mGC1 позволило выявить умеренное истончение ONL по сравнению с таковым у мышей дикого типа и необработанных контрольных мышей GC1KO. Кроме того, в сетчатке белок GC1 эпизодически обнаруживался в клеточных тельцах фоторецепторов. Возможно, что сильный убиквитарный промотор smCBA направлял экспрессию GC1 на таком уровне, который превосходил возможности системы некоторых фоторецепторов, и что накопление трансгенного продукта в клеточных тельцах фоторецепторов вызывало инициированный стрессом апоптоз указанных клеток. Более драматичное истончение ONL наблюдалось y одной мыши, которой инъецировали вектор AAV5-hGRK1-mGC1. Когда n равно 1, нельзя с определенностью заключить, что истончение сетчатки имело место у всех мышей, обработанных таким вектором. Тем не менее, в соответствии с представлениями о токсичности при избыточной экспрессии следует отметить, что титр вектора AAV5-hGRK1-mGC1 был наиболее высоким среди трех векторов, оцениваемых в настоящем исследовании. Однако следует также отметить, что не было никакого накопления белка GC1 в клеточных тельцах фоторецепторов с высоким титром вектора AAV5-hGRK1-mGC1.
Несмотря на исключительно фоторецепторную природу AAV-опосредованной экспрессии GC1, авторов настоящего изобретения интересовала оценка распределения векторных геномов в тканях, расположенных вне субретинального пространства. Важно то, что эти данные были получены на заболевших животных. Это имеет значение, поскольку доказано, что характер векторной трансдукции в больной сетчатке отличается от такового в здоровой (Kolstad et al., 2010). Это дает основания предполагать, что картины биораспределения также могут быть разными. По этой причине важно было оценить распределение векторных геномов внутри спасенной животной модели как таковой (т.е. в организме субъектов, у которых проявилось четкое восстановление электроретинограмм). Хотя число образцов было ограничено, была собрана полезная информация о распределении AAV5- и AAV8(Y733F)-достαвленных геномах в зрительном нерве и в мозгу.
Это является первой оценкой биораспределения вектора AAV, содержащего экспонированную на поверхности капсида тирозиновую мутацию. AAV5- и AAV8(Y733F)-доставленные векторные геномы обнаруживались в зрительных нервах обработанных глаз во всех исследованных временных точках. Только в одной временной точке (через 7 месяцев после инъекции) AAV5-векторные геномы были обна
- 45 035893 ружены в мозгу обработанной мыши GC1KO. Геномы были обнаружены только в полусфере, противоположной тому глазу, в который была произведена инъекция. Этот результат противоречит тому, что было обнаружено Provost et al., 2005, которые сообщали об отсутствии AAV5-доставленной последовательности в мозгу субретинально инъецированных крыс и собак. Через 10 месяцев после инъекции никаких векторных геномов как из мозга мышей GC1KO, обработанных AAV5, так и из мозга мышей, обработанных вектором AAV8(Y733F), ни в одной временной точке получено не было. Однако в силу относительно малого количества анализируемых мышей нельзя однозначно исключить возможность того, что AAV5-доставленные геномы присутствуют в мозгу через 7 месяцев после инъекции или что AAV8(Y733F)-доставленные геномы никогда не присутствуют в мозгу обработанных мышей GC1KO.
Несмотря на получение векторных геномов из зрительных нервов глаз, иммуноокрашивание позволило выявить отсутствие экспрессии GC1 в зрительных нервах глаз, обработанных векторами AAV5-smCBA-mGC1 или AAV8(Y733F)-hGRK1-mGC1. В более раннем исследовании Stieger et al., (2005) была обнаружена экспрессия трансгена в зрительных нервах и в мозгу крыс и собак через 2 месяца и через 4 недели после субретинальной инъекции AAV8, содержащего зеленый флуоресцирующий белок (GFP). Если принять во внимание, что вектор AAV8(Y733F) содержал фоторецепторспецифический промотор hGRK1, а также обнаруженный ранее факт, что экспрессия GC1 ограничена фоторецепторами даже под контролем убиквитарного промотора, такого как smCBA, отсутствие экспрессии GC1 в зрительных нервах не покажется неожиданным. Stieger et al., (2005) встраивали в свой вектор сильный убиквитарный промотор CMV, чтобы направить экспрессию GFP, белка, который способен стабильно экспрессироваться во многих тканях при доставке посредством вирусных векторов.
Наряду с тем, что векторы AAV5 и AAV8 (Y733F) способны обеспечивать долгосрочную терапию мыши GC1KO, можно заметить очевидные преимущества, ассоциированные с применением вектора AAV8(Y733F). Первое и наиболее важное - вектор AAV8(Y733F) с фоторецептор-специфическим промотором придает значительно более высокую ERG-реактивность колбочкам обработанных им животных, чем любой из векторов AAV5. Причина этого может быть связана со способностью векторов AAV8 к трансдукции участков, лежащих снаружи инъецируемого пузырька жидкости в сетчатке грызунов, тогда как область сетчатки, преобразованная вектором AAV5, остается по большей части примыкающей к указанному пузырьку (47). Таким образом, AAV8(733F) может осуществлять трансдукцию в среднем более обширной области сетчатки по сравнению с векторами AAV5 и последовательно осуществлять трансдукцию все большего количества колбочек и вызывать сильную ERG-реакцию колбочек по всему полю за счет повышенной общей выживаемости колбочек и/или за счет повышенного уровня реакции на свет каждой из трансдуцированных колбочек либо за счет и того, и другого.
Пример 8. Иллюстративные полипептидные последовательности GC1 млекопитающих.
Иллюстративные аминокислотные последовательности, используемые на практике настоящего изобретения, включают в себя, без ограничения, одну или несколько аминокислотных последовательностей, которые кодируют биологически активный гуанилатциклазный белок млекопитающих. Такие последовательности включают в себя, без ограничения, последовательности человека, всех приматов, кроме человека, мышиные, бычьи и собачьи последовательности, такие как последовательности гуанилатциклазных белков, представленные в последовательностях SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10 и SEQ ID NO: 11, приведенных здесь ниже:
- 46 035893
Homo sapiens (человек; номер доступа в GenPept: NP 000171)
MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLGPWACDP IFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALARVSGLVGPVNPAA CRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFGWARVALVTAPQDLWVEAG RSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVTAVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAE ELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQLRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQE RRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARGVAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGG DEEPPFVLLDTDAAGDRLiFATYMIjDPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLE PGLVFLGFLLWGMGLAGAFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSR SSLGARSMSDIRSGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVAL YLGLFLARGAEGPAALWEGNLAWSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALERRGTLA GDVFSLAIIMQEWCRSAPYAMLELTPEEWQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVECILLMKQCWAEQP ELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDRLLTQMLP PSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEVVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKV ETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAVGTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVG LTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWL VGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHGISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS (SEQ ID NO:1)
Mus musculus (мышь; номер доступа в GenPept: NP 032218)
МЗАЮЬЬРАОСЬРаАСЕСУРАЕСЗРЗЗРЗЕУЬЕМРЕРОЬРаЬЬЫиЫиЬРЗРЗАЬЗАУРКУаУЬОРИА CDPIFARARPDLAARLAANRLNRDFALDGGPRFEVALLPEPCLTPGSLGAVSSALSRVSGLVGPVN PAACRPAELLAQEAGVALVPWGCPGTRAAGTTAPAVTPAADALYVLLRAFRWARVALITAPQDLWV EAGRALSTALRARGLPVALVTSMETSDRSGAREALGRIRDGPRVRWIMVMHSVLLGGEEQRYLLE AAEELALTDGSLVFLPFDTLHYALSPGPEALAAFVNSSQLRRAHDAVLTLTRRCPPGGSVQDSLRR AQEHQELPLDLNLKQVSPLFGTIYDAVFLLAGGVKRARTAVGGGWVSGASVARQVREAQVSGFCGV LGRTEEPSFVLLDTDASGEQLFATHLLDPVLGSLRSAGTPMHFPRGGPAPGPDPSCWFDPDVICNG GVEPGLVFVGFLLVIGMGLTGAFLAHYLRHRLLHMQMASGPNKIILTLEDVTFLHPPGGSSRKWQ GSRSSLATRSASDIRSVPSQPQESTNVGLYEGDWVWLKKFPGEHHMAIRPATKTAFSKLRELRHEN VALYLGLFLAGTADSPATPGEGILAWSEHCARGSLHDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGMRYL HHRGVAHGRLKSRNCVVDGRFVLKVTDHGHGRLLEAQRVLPEPPSAEDQLWTAPELLRDPSLERRG TLAGDVFSLAIIMQEWCRSTPYAMLELTPEEVIQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPMECIQLMTQCWA EHPELRPSMDLTFDLFKSINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELEQEKQKTDRLLTQ MLPPSVAEALKMGTSVEPEYFEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWDLLNDLYTLFDAIIGAHDV YKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAVGSFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAG WGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNMSTVRILRALDQGFQMECRGRTELKGKGIEDT YWLVGRLGFNKPIPKPPDLQPGASNHGISLQEIPPERRKKLEKARPGQFTGK (SEQ ID NO:2)
Rattus norvegicus (норвежская крыса; номер доступа в
GenPept: NP 077356)
MSAWLLPAGGFPGAGFCIPAWQSRSSLSRVLRWPGPGLPGLLLLLLLPSPSAFSAVFKVGVLGPWA CDPIFARARPDIAARLATDRLNRDLALDGGPWFEVTLLPEPCLTPGSLGAVSSALTRVSGLVGPVN PAACRPAELLAQEAGVALVPWGCPGTRAAGTTAPAVTPAADALYVLLKAFRWARVALITAPQDLWV EAGRALSTALRARGLPVALVTSMVPSDLSGAREALRRIRDGPRVRWIMVMHSVLLGGEEQRYLLE AAEELGLTDGSLVFLPFDTLHYALSPGPEALAAFVNSSKLRRAHDAVLTLTRRCPPGGSVQDSLRR AQEHQELPLDLDLKQVSPLFGTIYDAVFLLAGGVTRARAAVGGGWVSGASVARQMREAQVFGFCGI LGRTEEPSFVLLDTDAAGERLFTTHLLDPVLGSLRSAGTPVHFPRGAPAPGPDPSCWFDPDVICNG GVEPGLVFVGFLLVIWGLTGAFLAHYLRHRLLHMQMVSGPNKIILTLEDVTFLHPQGGSSRKVAQ GSRSSLATRSTSDIRSVPSQPQESTNIGLYEGDWVWLKKFPGEHHMAIRPATKMAFSKLRELRHEN VALYLGLFLAGTADSPATPGEGILAWSEHCARGSLHDLLAQRDIKLDWMFKSSLLLDLIKGMRYL HHRGVTVHGRLKSRNCWDGRFVLKVTDHGHGRLLEAQRVLPEPPSAEDQLWTAPELLRDPALERRG TLAGDVFSLGIIMQEWCRSTPYAMLELTPEEVIQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPMECIQLMAQCWA EHPELRPSMDLTFDLFKGINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELEQEKQKTDRLLTQ ΜΕΡΡ3νΑΕΑΙιΚΜαΤ3νΕΡΕΥΕΕΕ'νΤΙιΥΕ3Ώΐν0ΕΤΤΙ3ΑΜ3ΕΡΙΕννϋΙιΙ-ιΝ0ΙιΥΊ’]-ιΕϋΑΙΙ03Ηϋν YKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAVGSFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAG WGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNMSTVRILRALDQGFQMECRGRTELKGKGVEDT YWLVGRVGFNKPIPKPPDLQPGASNHGISLQEIPPERRKKLEKARPGQFTGK (SEQ ID NO :3)
- 47 035893
Bos taurus GC1 (бык; номер доступа в GenPept: NP 776973)
MTACTFLAGGLRDPGLCAPTRWSPSPPGLPPIPPRPRLRLRPPLLLLLLLPRSVLSAVFTVGVLGP WACDPIFARARPDLAARLAASRLNHAAALEGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALTRVSGLVGP VNPAACRPAELLAQEAGVALVPWGCPGTRAAGTTAPWTPAADALYALLRAFRWAHVALVTAPQDL WVEAGHALSTALRARGLPVALVTSMEPSDLSGAREALRRVQDGPRVRAVIMVMHSVLLGGEEQRCL LEAAE ELGLADGS LVFLPFDTLHYALS PGPDALAVLANSS QLRKAHDAVLTLTRHCPLGGSVRDS L RRAQEHRELPLDLNLQQVS PLFGTI YDS VFLLAGGVARARVAAGGGWVSGAAVARHIRDARVPGFC GALGGAEEPSFVLLDTDATGDQLFATYVLDPTQGFFHSAGTPVHFPKGGRGPGPDPSCWFDPDTIC NGGVEPSVVFIGFLLVVGMGLAGAFLAHYCRHRLLHIQMVSGPNKIILTLDDITFLHPHGGNSRKV AQGSRTSLAARSISDVRSIHSQLPDYTNIGLYEGDWVWLKKFPGDRHIAIRPATKMAFSKIRELRH ENVALYLGLFLAGGAGGPAAPGEGVLAWSEHCARGSLQDLLAQRDIKLDWMFKSSLLLDLIKGIR YLHHRGVAHGRLKSRNCWDGRFVLKVTDHGHGRLLEAQRVLPEPPSAEDQLWTAPELLRDPVLER RGTLAGDVFSLGIIMQEWCRSAPYAMLELTPEEWKRVQSPPPLCRPSVSIDQAPMECIQLMKQC WAEQPELRPSMDRTFELFKSINKGRKMNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDRLL TQMLPPSVAEALKMGTPVEPEYFEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEVVDLLNDLYTLFDAIIGSH DVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGHRHAAEIANMALDILSAVGTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCV AGWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNRSTVQILSALNEGFLTEVRGRTELKGKGAE ETYWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGASNHGISLHEIPPDRRQKLEKARPGQFSGK (SEQ ID NO:4)
Canis lupus familiaris (собака; номер доступа в GenPept:
NP 001003207)
MSACALLAGGLPDPRLCAPARWARSPPGVPGAPPWPQPRLRLLLLLLLLPPSALSAVFTVGVLGPW ACDPIFARARPDLAARLAAARLNRDAALEDGPRFEVTLLPEPCRTPGSLGAVSSALGRVSGLVGPV NPAACRPAELLAQEAGVALVPWSCPGTRAGGTTAPAGTPAADALYALLRAFRWARVALITAPQDLW VEAGRALSAALRARGLPVALVTTMEPSDLSGAREALRRVQDGPRVRAVIMVMHSVLLGGEEQRCLL QAAEELGLADGSLVFLPFDTLHYALSPGPEALAVLANSSQLRRAHDAVLILTRHCPPGGSVMDNLR RAQEHQELPSDLDLQQVSPFFGTIYDAVLLLAGGVARARAAAGGGWVSGATVAHHIPDAQVPGFCG TLGGAQEPPFVLLDTDAAGDRLFATYMLDPTRGSLLSAGTPVHFPRGGGTPGSDPSCWFEPGVICN GGVEPGLVFLGFLLWGMGLTGAFLAHYLRHRLLHIQMVSGPNKIILTLDDVTFLHPHGGSTRKW QGSRSSLAARSTSDIRSVPSQPLDNSNIGLFEGDWVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLRELRHE NWLYLGLFLGSGGAGGSAAGEGVLAWSEHCARGSLHDLLAQRDIKLDWMFKSSLLLDLIKGMRY LHHRGVAHGRLKSRNCWDGRFVLKVTDHGHARLMEAQRVLLEPPSAEDQLWTAPELLRDPALERR GTLPGDVFSLGIIMQEWCRSAPYAMLELTPEEWERVRSPPPLCRPSVSMDQAPVECIQLMKQCW AEHPDLRPSLGHIFDQFKSINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDRLLT QMLPPSVAEALKMGTPVEPEYFEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWDLLNDLYTLFDAIIGSHD VYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMALDILS AVGS FRMRHMPE VPVRIRIGLHSGPCVA GWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNMSTVRILHALDEGFQTEVRGRTELKGKGAED TYWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGASNHGISLQEIPLDRRWKLEKARPGQFSGK (SEQ ID NO:5)
Macaca mulatta (макака резус; предсказанная последовательность из ХР ООН 11670)
MTACARRAGGLPDPRLCGPARWAPALPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLGPWACDP IFSRARADLAARLAAARLNRDPDLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALTRVSGLVGPVNPAA CRPAELLAEEAGIALVPWGCPGTQAAGTTAPALTPAADALYALLRAFGWARVALVTAPQDLWVEAG HSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVTAVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAE ELGLTDGSLVFLPFDTVHYALSPGPEALAALANSSQLRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQE RRELP SDLNLQQVS PLFGT IYDAVFLLVRGVAEARAAAGGRWVSGAAVARHVWDAQVPGFCGDLGG DEEPPFVLLDTDAVGDRLFATYMLDPTRGSLLSAGTPMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLE PGLVFLGFLLWGMGLAGAFLAHYVRHQLLHIQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSR SSLAARSMSDVRSGPSQPTDSPNVGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVAL YLGLFLAQGAEGPAALWEGNLAWSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPE Р PRAEDQLWTAPELLRDPALERRGTLA GDVFSLAIIMQEWCRSAPYAMLELTPEEWQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVECIHLMKQCWAEQP
- 48 035893
ELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDRLLTQMLP PSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKV ETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAVGTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGWG LTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWL VGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHGISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS (SEQ ID NO:6).
Pongo abelii (суматрийский орангутанг; предсказанная последовательность из ХР_002827037)
MTACARRAGGLPDPGLCGPARWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR VSGLVGPVNPAACRPAELLADNPGIALVPWGCPWTQAEGTTAPCVTPAADALYALLRAFG WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG VAEAWAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDGEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLWGMGLAG AFLAHYVRHRLLHIQMVSGPNKIILTVNDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLAARSMSDIR SGPSQPLDSPNVGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL ARGAEGPAALWEGNLAWSEHCTRGSLQDLLSQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE RRGTLAGDVFSLAIIMQEWCRSAPYAMLELTPEEWQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC IHLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE WDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHG ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS (SEQ ID NO:7)
Callithrix jacchus (белоухая мармозетка; предсказанная последовательность из ХР_002747985)
MTACARRAGGLPDPGLCGPARWAPALSRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAQFTVGVLG PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPSLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPGTQAAGTTAPWTPAADALYALLRAFG WARVALVTAPQDLWVEAGLSLSTALRARGLPWSVTSMEPLDLSGAREALRKVRNGPRVT AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGREALAALVNSSQ LRRAHDAVLTLTRHCSSEGSVLDSLRKAQQRRELPSDLNLEQVSPLFGTIYDAWLLARG VADARAAVGGRWVSGAAVARHVWDAQASGFCGDLGRDEEPSFVLLDTDAAGDQLFATYML DPARGSLLSAGTPMHFPRGGPAPGPDPSCWFDPNNICDGGLEPGFIFLGFLLWGMGLAG ALLAHYVRHQLLHIQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGASRKVAQGSRSSLAAHSTSDIR SGPSQPSDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGEQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL AQGAEGPAALWEGNLAWSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPKAEDQLWTAPELLRDPALE RRGTLAGDVFSLGIIMQEWCRSAPYAMLELTPDEWQRVRSPPPLCRPFVSMDQAPVEC IHLMKQCWAEQPELRPSMDLTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE WDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGASNHG ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS(SEQ ID NO:8)
- 49 035893
Ailuropoda melanoleuca (гигантская панда; предсказанная последовательность из ХР 002921218)
MRACALLAGGLPYPRLCAPTRWAPARPGVSRALPWPRPRLRLLLLLLLRPPSVLSAVFTV GVLGPWACDPIFARARPDLXXXXXXXXXDALYVLLRAFRWARVALVTAPQDLWVEAGRAL SAALRARGLPVALVTTMEPSDLSGAREALRRVQHGPRVSAVIMVMHSVLLGGEEQRCLLQ AAEELGLADGSLVFLPFDTLHYALSPGPEALAALANSSQLRRAHDAVLTLTRHCPPGGSV MDSLRRAQERQELPSDLNLEQVSPLFGTIYDAVFLLAGGVARARAAAADSRVPGFCGALG GAEEPPFVLLDTDAAGDRFFATYVLDPTRGSLHSAGTPVHFPRGGGAPGPDPSCWFEPDS ICNGGVEPGLVFTGFLLWGMGLMGAFLAHYVRHRLLHIQMVSGPNKIILTLDDITFLHP QGGSARKWQGSRSSLAARSTSDVRSVPSQPSDGGNIGLYEGDWVWLKKFPGSQHIAIRP ATKTAFSKLRELRHENVALYLGLFLGGGEGGSAAAGGGMLAWSEHCTRGSLHDLLAQRD IKLDWMFKSSLLLDLIKGMRYLHHRGVAHGRLKSRNCWDGRFVLKVTDHGHGRLL.EAQK VLAEPPSAEDQLWTAPELLRDPALERRGTLAGDVFSLGIIMQEWCRSSPYAMLELSARE WQRVRSPPPLCRPSVSVDQAPAECIQLMKQCWAEQPELRPSLDRTFDQFKSINKGRKTN IIDSMLRMLEQYSSNLEGLIRERTEELELEKRKTDRLRAASLPSSVAEALKMGTPVEPEY FEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVAS GLPQRNGQRHAAEIANMALDILSAVGSFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGWGLTMPR YCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNMSTVRILRALDEGFQTEVRGRTELKGKGAEDTYW LVGXXXXXXXXPIPKPPDLQPGASNHGISLQEIPLDRRQKLEKARPGQFSGK (SEQ ID NO:9)
Monodelphis domestica (серый короткохвостый опоссум;
предсказанная последовательность из ХР_001369029)
MLVPSINGLFHHPPWCFPPLPLPLFFLFLLLLLPVPVLPATFTIGVLGPWSCDPIFSRAR PDLAARLAATRMNHDQALEGGPWFEVILLPE PCRTSGS LGALS Р S LARVS GLVGPVNPAA CHPAELLAQEAGVPLVPWGCPQGKARTTAPALPLALDALYALLRAFHWAKVALITAPQDL WVEAGQALAGGLRSRGLPVAMVTSLETTDLESAKNALKRVRDGPKVKVLIMVMHSVLLGG EEQRLLLEAAEELGLVEGTMVFLPFDTLHYALPPGPEALRPITNSSRLRKAHDAVLTLTR YCPKGSVSASLRQAQEHRELPLDL.KPQQVSPLFGTIYDAIYLLAGAVAGAQVAGGGGWVS GAAVARHIPNTLVSGFCGDLGGTKEPPFVLLDTDGMRDQLLPTYTLDPAQGVLHHAGNPI HFPHGGQGPGPDPPCWFDPNVICSGGIEPRFILLVILIIIGGGLWATLAYYVRRQLLHA QMVSGPNKMILTLEDITFFPRQGSSSRKATEGSRSSLIAHSASDMRSIPSQPPDNSNIGM YEGDWVWLKKFPGEHYTEIRPATKMAFSKLRELRHENVAVQMGLFLAGSMEGAAAGGLGG GILAWSEYCSRGSLQDLLIQRDIKLDWMFKSSLLLDLIKGLRYLHHRGVAHGRLKSRNC WDGRFVLKITDHAHGRLLEAQRVSLEPPQAEDRLWTAPELLRNEALERQGTLQGDVFSV GIIMQEWCRCEPYAMLELTPEEIIQKVQSPPPMCRPSVSVDQAPMECIQLMKQCWAEQP DLRPNMDTTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDKL LTQMLPPSVAEALKLGIPVEPEYFEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWDLLNDLYTLF DAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPKRNGQRHAAEIANMSLDILSSVGSFRMRHMPEVP VRIRIGLHSGPCVAGWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNLSTVKILQGLN EGFQIЕIRGRTE LKGKGVEDTYWLVGRKGFDKPIРIPPDLLPGASNHGIS LQEIPEDRRK KLEKARPGQPLGK (SEQ ID NO; 10)
Equus caballus (лошадь; предсказанная последовательность из ХР_001918412)
MVMHSVLLGGEEQRCLLEAAEELGLADGSLVFLPFDTLHYALSPGPEALAVLANNSQLRR AHDAVLTLTRHCPLGGSVLDSLRRAQEHQELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVYLLAGGVAR ARAAAGGSWVSGAAVAHHVRDAQVPGFCGALGGAEEPQFVLLDTDAAGDRLFATYMLDPT RGSLWSAGTPVHFPRGGRGPGPDPWCWFDPDDICNGGVEPRLVFIGFLLAVGMGLAGVFL AHYVRHRLLHIQMASGPNKIILTLDDITFLHPQGGSSRKVIQGSRSSLAARSVSDIRSVP SQPMDSSNIGLYEGDWVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLRELRHENVALYLGLFLAGG S S GAAAPREGMLAWS EHCARGS LHDLLAQRDIKLDWM FKS S LLLDLIKGMR YLHHRGVA HGRLKSRNCWDGRFVLKVTDHGHGRLLEAQKVLPEPPSAEDQLWTAPELLRDPALERQG TLAGDVFSLGIIIQEWCRSTPYAMLELTPEEWQRLQSPPPLCRPSVSMDQAPMECIQL MKQCWAEQPDLRPSMDRTFDLFKSINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTEELE
LEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKMGTPVEPEYFEEVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIEWD LLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMALDILSAVGSF RMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGWGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHVNMS TVRILRALDEGFQVEVRGRTELKGKGVEDTYWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGASNHGISL QEIPPERRQKLEKARPGQFSGK (SEQ ID NO:11)
Пример 9. Анализ последовательностей известных полипептидов GC1 млекопитающих.
Все данные по выравниванию GC1 получены с помощью аминокислотной последовательности для следующих видов: Bos taurus (жвачное животное; 1110 остатков), Canis lupus familiaris (собака; 1109 остатков), Mus musculus (мыши; 1108 остатков) и Homo sapiens (человек; 1103 остатков). Положения консенсуса и вариабельные области основаны на номерах остатков, соответствующих Bos Taurus, поскольку это самый длинный белок GC1, состоящий из 1110 остатков и не имеющий гэпов при выравнивании.
Сходство картин выравнивания белков GC1 из Bos taurus, Canis lupus familiaris, Mus musculus и Homo sapiens.
- 50 035893
Сходство
Консенсусные области GC1:
аминокислотные положения: 44-49, 55-90, 98-155, 164-321, 464-549, 561-604, 620-761, 813-1026, 1045-1054 и 1060-1110.
Вариабельные области:
аминокислотные положения: 4-43, 50-54, 91-97, 156-163, 322-463, 550-560, 605-619, 762-812, 10271044 и 1055-1059.
Другие характерные области GC1 при консенсусном выравнивании включают в себя следующие области:
(1) гомологичный киназе домен: аминокислотные положения от 531 до 541 консенсусной последовательности (известной тем, что она необходима для активности в фоторецепторах - см., например, Bereta et al., 2010);
(2) фосфорилированные сериновые остатки внутри гомологичного киназе домена мышиного белка GC1 (консенсус/положения в белке жвачного животного приведены в скобках): 530 (532), 532 (534), 533 (535) и 538 (540).
Пример 10. Нуклеотидная последовательность промотора smCBA.
Последовательность нуклеиновой кислоты иллюстративного человеческого промотора GRK1 (hGRK1), который был использован в описанных здесь исследованиях, представлен ниже:
GGGCCCCAGAAGCCTGGTGGTTGTTTGTCCTTCTCAGGGGAAAAGTGAGGCGGCCCCTTGGAGGAAGG
IGGCCGGGCAGAATGATCTAATCGGATTCCAAGCAGCTCAGGGGATTGTCTTTTTCTAGCACCTTCTTG
CCACTCCTAAGCGTCCTCCGTGACCCCGGCTGGGATTTAGCCTGGTGCTGTGTCAGCCCCGGTCTCCC
AGGGGCTTCCCAGTGGTCCCCAGGAACCCTCGACAGGGCCCGGTCTCTCTCGTCCAGCAAGGGCAGGG
ACGGGCCACAGGCCAAGGGC (SEQ ID NO:12)
Последовательность нуклеиновой кислоты иллюстративного промотора smCBA, который был использован в описанных здесь исследованиях, представлен ниже:
AATTCGGTACCCTAGTTATTAATAGTAATCAATTACGGGGTCATTAGTTCATAGCCCATATATGGA
GTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATT
GACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGT
GGACTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCC TATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTT TCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTT CTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATT ATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGA GGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTT TCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGT CGCTGCGACGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCT GACTGACCGCGTTACTCCCACAGGTGAGCGGGCGGGACGGCCCTTCTCCTCCGGGCTGTAATTAGC GCTTGGTTTAATGACGGCTTGTTTCTTTTCTGTGGCTGCGTGAAAGCCTTGAGGGGCTCCGGGAGC TAGAGCCTCTGCTAACCATGTTCATGCCTTCTTCTTTTTCCTACAGCTCCTGGGCAACGTGCTGGT TATTGTGCTGTCTCATCATTTTGGCAAAG (SEQ ID NO:13)
- 51 035893
Ссылки
Следующие ссылки, которые в определенной степени обеспечивают иллюстративные процедурные или иные подробности, дополнительно к тем, которые здесь описаны, специально включены в настоящее
описание в качестве ссылок.
Патент Соединенных Штатов Америки 4237224, опубликованный
2 декабря 1980.
Патент Соединенных Штатов Америки 4554101, опубликованный
19 ноября 1985.
Патент Соединенных Штатов Америки 4683195, опубликованный
28 июля 1987.
Патент Соединенных Штатов Америки 4683202, опубликованный
28 июля 1987.
Патент Соединенных Штатов Америки 4800159, опубликованный
24 января 1989.
Патент Соединенных Штатов Америки 4883750, опубликованный
28 ноября 1989.
Патент Соединенных Штатов Америки 4987071, опубликованный
22 января 1991.
Патент Соединенных Штатов Америки 5145684, опубликованный
8 сентября 1992.
Патент Соединенных Штатов Америки 5334711, опубликованный
2 августа 1994.
Патент Соединенных Штатов Америки 5354855, опубликованный
11 октября 1994.
Патент Соединенных Штатов Америки 5399363, опубликованный
21 марта 1995.
Патент Соединенных Штатов Америки 5466468, опубликованный
14 ноября 1995.
Патент Соединенных Штатов Америки 5543158, опубликованный
6 апреля 1996.
Патент Соединенных Штатов Америки 5552157, опубликованный
3 сентября 1996.
Патент Соединенных Штатов Америки 5565213, опубликованный
15 октября 1996.
Патент Соединенных Штатов Америки 5567434, опубликованный
22 октября 1996.
Патент Соединенных Штатов Америки 5602306, опубликованный
11 февраля 1997.
Патент Соединенных Штатов Америки 5631359, опубликованный
20 мая 1997.
Патент Соединенных Штатов Америки 5639940, опубликованный
17 июня 1997.
- 52 035893
Патент Соединенных Штатов Америки 5641515, опубликованный
24 июня 1997. Патент Соединенных Штатов Америки 5656016, опубликованный
12 августа 1997. Патент Соединенных Штатов Америки 5697899, опубликованный
16 декабря 1997. Патент Соединенных Штатов Америки 5720936, опубликованный
24 февраля 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5738868, опубликованный
14 апреля 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5741516, опубликованный
21 апреля 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5770219, опубликованный
23 июня 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5779708, опубликованный
14 июля 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5783208, опубликованный
21 июля 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5789655, опубликованный
4 , августа 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5795587, опубликованный
18 августа 1998. Патент Соединенных Штатов Америки 5797898, опубликованный
августа 1998.
Международная патентная заявка No. РСТ US87/00880.
Международная патентная заявка No. PCT/US88/10315.
Международная патентная заявка No. PCT/US89/01025.
Публикация международной патентной заявки No. WO 89/06700.
Публикация международной патентной заявки No. WO 91/03162.
Публикация международной патентной заявки No. WO 92/07065.
Публикация международной патентной заявки No. WO 93/15187.
Публикация международной патентной заявки No. WO 93/23569.
Публикация международной патентной заявки No. WO 94/02595.
Публикация международной патентной заявки No. WO 94/13688.
Публикация европейской патентной заявки No. ЕР 0329822.
Публикация европейской патентной заявки No. ЕР 0360257.
- 53 035893
Публикация европейской патентной заявки No. ЕР 92110298,4.
Публикация европейской патентной заявки No. 320308.
Заявка Великобритании No. 2202328.
Acland GM, Aguirre GD, Ray J, Zhang Q, Aleman TS, Cideciyan AV, Pearce-Kelling SE, Anand V, Zeng Y, Maguire AM, Jacobson SG, Hauswirth WW, Bennett J., Gene therapy restores vision in a canine model of childhood blindness, Nat. Genet., 28(1) : 92-5, 2001 .
Alexander JJ, Umino Y, Everhart D, Chang В, мин. SH, et al., Restoration of cone vision in a mouse model of achromatopsia, Nat. Med., 13: 685-687, 2007.
Alstrom, C.H. Heredo-retinopathia congenitalis monohybrida recessiva autosomalis: a genetical-statistical study in clinical collaboration with Olof Olson, Hereditas, 43: 1-178, 1957.
Arshavsky VY, Lamb TD, Pugh EN Jr, G proteins and phototransduction, Annu. Rev. Physiol., 64: 153-187, 2002.
Azadi S et al., RD3, the protein associated with Leber congenital amaurosis type 12, is required for guanylate cyclase trafficking in photoreceptor cells, Proc Natl Acad Sci USA, 107: 21 158-63, 2010.
Baehr W, aran S, Maeda T, Luo DG, Li S, Bronson JD, Watt GB, Yau KW, Frederick JM, Palczewski., The function of guanylate cyclase 1 and guanylate cyclase 2 in rod and cone photoreceptors, J. Biol. Chem., 282(12): 8837-47, 2007.
Bainbridge JW, Smith AJ, Barker SS, Robbie S, Henderson R, Balaggan К et al., Effect of gene therapy on visual function in Leber's congenital amaurosis, N. Engl. J. Med., 358: 22312239, 2008.
Beltran W, Boye SL, Boye SE, Chiodo V, Lewin AS et al., rAAV2/5 gene-targeting to rods: dose-dependent efficiency and complications associated with different promoters, Gene Ther., 17: 1162-1 174, 2010.
Bereta G, Wang B, Kiser PD, Baehr W, Jang GF, Palczewski K., A functional kinase homology domain is essential for the activity of photoreceptor guanylate cyclase 1, J. Biol. Chem.,
- 54 035893
285(3): 1899-908, 2010.
Bhowmick R, Li M, Sun J, Baker SA, Insinna C, Besharse JC, Photoreceptor IFT complexes containing chaperones, guanylyl cyclase 1 and rhodopsin, Traffic, 10: 648-63, 2009.
Boye SE, Boye SL, Pang J, Ryals R, Everhart D, Umino Y et al., Functional and behavioral restoration of vision by gene therapy in the guanylate cyclase-1 (GC1) knockout mouse, PLoS One, 5:el 1306, 2010.
Burns ME and Arshavsky VY, Beyond counting photons: trials and trends in vertebrate visual transduction, Neuron, 48: 387-401, 2005.
Camuzat, A.; Dollfus, H.; Rozet, J.-M.; Gerber, S.; Bonneau, D.; Bonnemaison, M.; Briard, M.-L.; Dufier, J.-L.; Ghazi, 1.; Leowski, C; Weissenbach, J.; Frezal, J.; Munnich, A.; Kaplan, J., A gene for Leber's congenital amaurosis maps to chromosome 17p, Hum. Molec. Genet, 4: 1447-1452, 1995.
Camuzat, A.; Rozet, J.-M.; Dollfus, H.; Gerber, S.; Perrault, I.; Weissenbach, J.; Munnich, A.; Kaplan, J., Evidence of genetic heterogeneity of Leber's congenital amaurosis (LCA) and mapping of LCA1 to chromosome 17pl3, //wm. Genet., 97: 798-801, 1996.
Chung DC and Traboulsi El, Leber congenital amaurosis: clinical correlations with genotypes, gene therapy trials update, and future directions, J. AAPOS., 13:587-92, 2009.
Cideciyan AV, Aleman TS, Boye SL, Schwartz SB, Kaushal S et al., Human gene therapy for RPE65 isomerase deficiency activates the retinoid cycle of vision but with slow rod kinetics. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105: 15112-7, 2008.
Cideciyan AV, Hauswirth WW, Aleman TS, Kaushal S, Schwartz SB, Boye SL et al., Vision one year after gene therapy for Leber congenital amaurosis, N Engl. J. Med., 361: 725-727, 2009.
Coleman JE and Semple-Rowland SL, GC1 deletion prevents lightdependent arrestin translocation in mouse cone photoreceptor cells, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 46: 12-6, 2005.
Coleman JE, Zhang Y, Brown GA, Semple-Rowland SL, Cone
- 55 035893 cell survival and downregulation of GCAP1 protein in the retinas of GC1 knockout mice, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 45: 3397-403, 2004.
Cremers, F. P. M.; van den Hurk, J. A. J. M.; den Hollander, A. I., Molecular genetics of Leber congenital amaurosis, Hum. Molec. Genet. 11: 1169-1176, 2002.
den Hollander Al, Roepman R, Koenekoop RK, Cremers RP Leber congenital amaurosis: genes, proteins and disease mechanisms, Prog Ret Eye Res 27:301-419, 2008.
Dizhoor AM, Lowe DG, Olshevskaya EV, Laura RP and Hurley JB, The human photoreceptor membrane guanylyl cyclase, RetGC, is present in outer segments and is regulated by calcium and a soluble activator, Neuron, 12: 1345-52, 1994.
Douglas RM, Alam NM, Silver BD, McGill TJ, Tschetter WW et al., Independent visual threshold measurements in the two eyes of freely moving rats and mice using a virtual-reality optokinetic system, Vis. Neuro., 22: 677-684, 2005.
Downes SM, Payne AM, Kelsell RE, Fitzke FW, Holder GE, Hunt DM et al., Autosomal dominant cone-rod dystrophy with mutations in the guanylate cyclase 2D gene encoding retinal guanylate cyclase-1.
Arch. Ophthalmol, 119: 1667-1673, 2001.
Ehara, H.; Nakano, C; Ohno, K.; Goto, Y.-L; Takeshita, K., New autosomal-recessive syndrome of Leber congenital amaurosis, short stature, growth hormone insufficiency, mental retardation, hepatic dysfunction, and metabolic acidosis, Am. J. Med. Genet. 71: 258-266, 1997.
Ek, J.; Kase, Β. F.; Reith, A.; Bjorkhem, I.; Pedersen, J. I., Peroxisomal dysfunction in a boy with neurologic symptoms and amaurosis (Leber disease): clinical and biochemical findings similar to those observed in Zellweger syndrome,J. Pediat. 108: 19-24, 1986.
Francois, J., Leber's congenital tapetoretinal degeneration, Int. Ophthal. Clin., 8: 929-947, 1968.
Gillespie, F. D., Congenital amaurosis of Leber, Am. J. Ophthal, 61: 874-880, 1966.
- 56 035893
Glushakova LG et al., Does recombinant adeno-associated virus-vectored proximal region of mouse rhodopsin promoter support only rod-type specific expression in vivo? Mol. Vis. 12: 298-309, 2006.
Gorczyca WA et al., Purification and physiological evaluation of a guanylate cyclase activating protein from retinal rods, Proc Natl Acad Sci USA, 91: 4014-8, 1994.
Haire SE, Pang J, Boye SL, Sokal I, Craft CM et al., Light-driven cone arrestin translocation in cones of postnatal guanylate cyclase-1 knockout mouse retina treated with AAV-GC 1 , Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 47(9): 3745-53, 2006.
Hanein, S.; Perrault, I.; Gerber, S.; Tanguy, G.; Barbet, F.; Ducroq, D.; Calvas, P.; Dollfus, H.; Hamel, C; Lopponen, T.; Munier, F.; Santos, L.; Shalev, S.; Zafeiriou, D.; Dufier, J.-L.; Munnich, A.; Rozet, J.-M.; Kaplan, J., Leber congenital amaurosis: comprehensive survey of the genetic heterogeneity, refinement of the clinical definition, and genotype-phenotype correlations as a strategy for molecular diagnosis, Hum. Mutat. 23: 306-317, 2004.
Hanein, S.; Perrault, I.; Olsen, P.; Lopponen, T.; Hietala, M.; Gerber, S.; Jeanpierre, M.; Barbet, F. ; Ducroq, D.; Hakiki, S.; Munnich, A.; Rozet, J.-M.; Kaplan, J., Evidence of a founder effect for the RETGC1 (GUCY2D) 2943DelG mutation in Leber congenital amaurosis pedigrees of Finnish origin, (Abstract)
Hum. Mutat., 20: 322-323, 2002.
Hauswirth W, Aleman TS, Kaushal S, Cideciyan AV, Schwartz SB, Wang L et al., Treatment of Leber congenital amaurosis due to RPE65 mutations by ocular subretinal injection of adenoassociated virus gene vector: short-term results of a phase I trial, Hum. Gene Ther., 19: 979-990, 2008.
Hayasaka, S.; Hara, S.; Mizuno, K.; Narisawa, K.; Tada, K., Leber's congenital amaurosis associated with hyperthreoninemia, Am. J. Ophthal, 101: 475-479, 1986.
Huang Y, Cideciyan AV, Papastergiou GI, Banin E, SempleRowland SL et al., Relation of optical coherence tomography to
- 57 035893 microanatomy in normal and rd chickens, Invest. Ophthalmol Vis. Sci., 39: 2405-16, 1998.
Jacobson SG et al., Safety in nonhuman primates of ocular AAV2-RPE65, a candidate treatment for blindness in Leber congenital amaurosis, Hum Gene Ther. 17: 845-58. 2006.
Jacobson SG, Acland GM, Aguirre GD, Aleman TS, Schwartz SB et al., Safety of recombinant adeno-associated virus type 2RPE65 vector delivered by ocular subretinal injection, Mol. Ther., 13: 1074-84, 2006.
Karan S, Frederick JM and Baehr W, Novel functions of photoreceptor guanylate cyclases revealed by targeted deletion, Mol. Cell. Biochem., 334: 141-55, 2010.
Khani SC, Pawlyk BS, Bulgakov OV, Kasperek E, Young JE, AAV-mediated expression targeting of rod and cone photoreceptors with a human rhodopsin kinase promoter, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 48: 3954-61, 2007.
Khanna, H.; Davis, E. E.; Murga-Zamalloa, C. A.; EstradaCuzcano, A.; Lopez, I.; den Hollander, A.I.; Zonneveld, Μ. N.; Othman, M.I.; Waseem, N.; Chakarova, C. F.; Maubaret, C; DiazFont, A. et al., A common allele in RPGRIP1L is a modifier of retinal degeneration in ciliopathies, Nature Genet., 41: 739745, 2009.
Kolstad KD et al., Changes in adeno-associated virusmediated gene delivery in retinal degeneration, Hum. Gene Ther, 21: 571-8, 2010.
Komaromy AM, Alexander JJ, Rowlan JS, Garcia MM, Chiodo VA, Kaya A et al Gene therapy rescues cone function in congenital achromatopsia. Hum Mol Genet. April 21 [Epub, в печати], 2010.
Lamb TD, Pugh EN Jr, Phototransduction, dark adaptation, and rhodopsin regeneration the proctor lecture,
Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 47: 5138-5152, 2006.
Lambert, S. R.; Sherman, S.; Taylor, D.; Kriss, A.; Coffey, R.; Pembrey, M., Concordance and recessive inheritance of Leber congenital amaurosis, Am. J. Med. Genet., 46: 275277, 1993.
- 58 035893
Leber, T., Ueber anomale formen der retinitis pigmentosa, Albrecht von Graefes Arch. Ophthal, 17: 314-340, 1871.
Leber, T., Ueber retinitis pigmentosa und angeborene amaurose, Albrecht von Graefes Arch. Ophthal. 15: 1-25, 1869.
Li T, Pawlyk BS, Bulgakov OV, Liu X, Xu X, Adamian M, Sun X, Khani SC, Berson EL, Sandberg M, Replacement gene therapy with a human RPGRIP1 sequence slows photoreceptor degeneration in a murine model of Leber congenital amaurosis, Hum. Gene Ther., 21(8): 993-1004, 2010.
Li W et al., Gene therapy following subretinal AAV5 vector delivery is not affected by a previous intravitreal AAV5 vector administration in the partner eye, Mol Vis., 14: 26775, 2009.
Liu X, Seno K, Nishizawa Y, Hayashi F, Yamazaki A et al., Ultrastructural localization of retinal guanylate cyclase in human and monkey retinas, Exp. Eye Res., 59: 761-8, 1994.
Liu, L, Barone I, Dai X, Lei B, Boye SL, Chiodo V, Chang B, Hauswirth WW, Strettoi E, Pang JJ, Gene therapy preserves inner retinal neurons and their connectivity in rdlO mice, a model of recessive retinitis pigmentosa with [Rho][upsilon][Epsilon][beta] mutations, Abstr. ARVO Annu. Meet, #3112, 2010.
Livak KJ and Schmittgen Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(Delta Delta C(T)) Method. Methods, 25: 402-8, 2001.
Lotery AJ et al. Adeno-associated virus type 5 transduction efficiency and cell-type specificity in the primate retina, Hum Gene Ther., 14: 1663-71, 2003.
Lowe DG, Dizhoor AM, Liu K, Gu Q, Spencer M et al., Cloning and expression of a second photoreceptor-specific membrane retina guanylyl cyclase (RetGC), RetGC-2, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92: 5535-9, 1995.
Maguire AM, Simonelli F, Pierce EA, Pugh Jr EN, Mingozzi F, Bennicelli J et al., Safety and efficacy of gene transfer for Leber's congenital amaurosis, N. Engl. J. Med, 358:/2240- 59 035893
2248, 2008.
Mah et al., Dual vectors expressing murine factor VIII result in sustained correction of hemophilia A mice,
Hum. Gene Ther., 14(2): 143-152, 2003.
Mancuso К et al Gene therapy for red-green colour blindness in adult primates, Nature 461: 784-7, 2009.
McCarty et al., Adeno-associated virus terminal repeat (TR) mutant generates self-complementary vectors to overcome the rate-limiting step to transfuction in vivo, Gene Ther., 10 (26) : 2112-2118, 2003.
Mendez A, Burns ME, Sokal 1, Dizhoor AM, Baehr W, Palczewski K, Baylor DA, Chen J., Role of guanylate cyclaseactivating proteins (GCAPs) in setting the flash sensitivity of rod photoreceptors, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 98(17): 9948-53, 2001.
Milam, A. H.; Barakat, M. R.; Gupta, N.; Rose, L.; Aleman, T. S.; Pianta, M. J.; Cideciyan, A. V.; Sheffield, V. C; Stone, E. M.; Jacobson, S.G., Clinicopathologic effects of mutant GUCY2D in Leber congenital amaurosis, Ophthalmology, 110: 549558, 2003.
Moore, A. T.; Taylor, D. S. I. A syndrome of congenital retinal dystrophy and saccade palsy--a subset of Leber's amaurosis, Brit. J. Ophthal, 68: 421-431, 1984.
Nakamura, M.; Ito, S.; Miyake, Y. Novel de novo mutation in CRX gene in a Japanese patient with Leber congenital amaurosis, Am. J. Ophthal, 134: 465-467, 2002.
Natkunarajah M et al., Assessment of ocular transduction using single-stranded and self-complementary recombinant adenoassociated virus serotype 2/8, Gene Ther., 15: 463-7, 2008.
Nickel, B.; Hoyt, C. S. Leber's congenital amaurosis. Is mental retardation a frequent associated defect? Arch. Ophthal, 100: 1089-1092, 1982.
Otto-Brac A, Buczylko J, Surgucheva I, Subbaraya I, Rudnicka-Nawrot M et al., Functional reconstitution of photoreceptor guanylate cyclase with native and mutant forms of guanylate cyclase-activating protein 1, Biochemistry, 36:
- 60 035893
4295-302, 1997.
Palczewski К et al., Molecular cloning and characterization of retinal photoreceptor guanylyl cyclaseactivating protein, Neuron 13: 395-404, 1994.
Pang J, Boye SE, Lei B, Boye SL, Everhart D, Ryals R, Umino Y, Rohrer B, Alexander J, Li J, Dai X, Li Q, Chang B, Barlow R, Hauswirth WW, Self-complementary AAV-mediated gene therapy restores cone function and prevents cone degeneration in two models of Rpe65 deficiency, Gene Ther., 17(7): 815-826, 2010.
Pang JJ, Boye SL, Kumar A, Dinculescu A, Deng W, Li J, Li Q, Rani A, Foster TC, Chang B, Hawes NL, Boatright JH, Hauswirth WW, AAV-mediated gene therapy for retinal degeneration in the rd 10 mouse containing a recessive PDEbeta mutation, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 49(10): 4278-83, 2008 .
Pang JJ, Chang B, Kumar A, Nusinowitz S, Noorwez SM, Li J, Rani A, Foster TC, Chiodo VA, Doyle T, Li H, Malhotra R, Teusner JT, McDowell JH, мин. SH, Li Q, Kaushal S, Hauswirth WW, Gene therapy restores vision-dependent behavior as well as retinal structure and function in a mouse model of RPE65 Leber congenital amaurosis, Mol. Ther., 13(3): 565-72. 2006.
Pang JJ, Dai X, Boye SE, Barone I, Boye SL, Mao S et al., Long-term retinal function and structure rescue using capsid mutant AAV8 vector in the rdlO mouse, a model of recessive retinitis pigmentosa, Mol. Ther. 19: 234-42, 2011.
Pang JJ, Dai X, Everhart D, 3, Lei B, Boye SL, Dinculescu A, Umino Y, Chang B, Barlow R, Hauswirth WW., Long-term rescue following gene therapy with capsid mutant AAV8 in the rdlO mouse, a model of recessive retinitis pigmentosa, ARVO Abstract 2527, Annu. Meet., 2010.
Pasadhika S, Fishman GA, Stone EM, Lindeman M, Zelkha R et al., Differential macular morphology in patients with RPE65, CEP290, GUCY2D and AIPL1 related Leber congenital amaurosis, Invest.
Ophthalmol Vis. Sci., 51(5): 2608-2614, 2010.
- 61 035893
Pawlyk BS et al., Replacement gene therapy with a human RPGRIP1 sequence slows photoreceptor degeneration in a murine model of leber congenital amaurosis, Hum Gene Ther., Apr 12 [Epub, в печати], 2010.
Payne AM, Morris AG, Downes SM, Johnson S, Bird AC, Moore AT et al., Clustering and frequency of mutations in the retinal guanylate cyclase (GUCY2D) gene patients with dominant cone-rod dystrophies, J Med Genet. 38: 611-614, 2001.
Perrault et al., Retinal-specific guanylate cyclase gene mutations in Leber's congenital amaurosis, Nat. Genet., 14(4): 461-4, 1996.
Perrault I, Rozet JM, Gerber S, Ghazi I, Ducroq D et al., Spectrum of retGC 1 mutations in Leber's congenital amaurosis, Eur. J. Hum. Genet., 8: 578-82, 2000.
Perrault I, Rozet JM, Gerber S, Ghazi I, Leowski C et al., Leber congenital amaurosis, Mol Genet. Metab., 68: 200-8, 1999.
Perrault, I.; Rozet, J. M.; Calvas, P.; Gerber, S.; Camuzat, A.; Dollfus, H.; Chatelin, S.; Souied, E.; Ghazi, I.; Leowski, C; Bonnemaison, M.; Le Paslier, D.; Frezal, J.; Dufier, J.-L.; Pittier, S.; Munnich, A.; Kaplan, J., Retinalspecific guanylate cyclase gene mutations in Leber's congenital amaurosis, Nature Genet, 14: 461-464, 1996.
Perrault, I.; Rozet, J.-M.; Gerber, S.; Ghazi, I.; Leowski, C; Ducroq, D.; Souied, E.; Dufier, J.-L.; Munnich, A.; Kaplan, J., Leber congenital amaurosis, Molec. Genet. Metab., 68: 200-208, 1999.
Petrs-Silva H, Dinculescu A, Li Q, мин. SH, Chiodo V, Pang JJ, et al. High-efficiency transduction of the mouse retina by tyrosine-mutant AAV serotype vectors, Mol. Ther. 17: 463-71, 2009.
Poirier, A et al. Toxicology and biodistribution studies of a recombinant adeno-associated virus 2-a-l antitrypsin vector, Preclinica 2: 43-51, 2004.
Polans A, Baehr W, Palczewski К Turned on by Ca2+! The physiology and pathology of Ca2+ binding proteins in the
- 62 035893 retina, Trends Neurosci 19: 547-554, 2006.
Provost N et al., Biodistribution of rAAV vectors following intraocular administration: evidence for the presence and persistence of vector DNA in the optic nerve and in the brain, Mol Ther., 11: 275-83, 2005.
Pugh EN Jr, Duda T, Sharma RK, Sitaramayya A Photoreceptor guanylate cyclases: a review, Biosci Rep., 17: 429-473, 1997.
Rahn, Ε. K.; Falls, Η. F.; Knaggs, J. G. ; Proux, D. J., Leber's congenital amaurosis with an Ehlers-Danlos-like syndrome: study of an American family, Arch. Ophthal, 79: 135141, 1968.
Riess, 0.; Weber, B.; Noeremolle, A.; Shaikh, R.A.; Hayden, M.R.; Musarella, M.A., Linkage studies and mutation analysis of the PDEB gene in 23 families with Leber congenital amaurosis, Hum. Mutat., 1:478-485, 1992.
Russell-Eggitt, I. M; Taylor, D. S. I.; Clayton, P. T.; Garner, A.; Kriss, A.; Taylor, J. F. N. Leber's congenital amaurosis-a new syndrome with a cardiomyopathy, Brit. J. Ophthal, 73: 250-254, 1989.
Schappert-Kimmi j ser, J.; Henkes, Η. E.; Van den Bosch, J. Amaurosis congenita (Leber), Arch. Ophthal, 61: 21 1-218, 1959.
Schroeder, R.; Mets, Μ. B.; Maumenee, I. H. Leber's congenital amaurosis: retrospective review of 43 cases and a new fundus finding in two cases, Arch. Ophthal., 105: 356-359, 1987 .
Schuil, J.; Meire, F. M; Delleman, J. W. Mental retardation in amaurosis congenita of Leber, Neuropediatrics, 29:294-297, 1998.
Semple-Rowland SL, Lee NR, Van Hooser JP, Palczewski K, Baehr W, A null mutation in the photoreceptor гуанилатциклаз gene causes the retinal degeneration chicken phenotype, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95: 1271-6, 1998.
Simonelli F, Ziviello C, Testa F, Rossi S, Fazzi E et al., Clinical and molecular genetics of Leber's congenital
- 63 035893 amaurosis: a multicenter study of Italian patients, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., 48: 4284-90, 2007.
Sohocki, Μ. M.; Bowne, S. J.; Sullivan, L. S. ; Blackshaw, S.; Серко, C. L.; Payne, A. M.; Bhattacharya, S. S.; Khaliq, S.; Mehdi, S. Q. ; Birch, D. G.; Harrison, W. R.; Elder, F. F. B.; Heckenlively, J. R.; Daiger, SP, Mutations in a new photoreceptor-pineal gene on 17p cause Leber congenital amaurosis, Nature Genet.. 24: 79-83, 2000.
Song S et al. Intramuscular administration of рекомбинанты adeno-associated virus 2 oc-1 antitrypsin (rAAVSERPINA1) vectors in a nonhuman primate model: safety and immunologic aspects, Mol. Then, 6: 329-335, 2002.
Sorsby, A.; Williams, С. E., Retinal aplasia as a clinical entity, Brit. Med. J. 1: 293-297, 1960.
Stephen R et al., Stabilizing function for myristoyl group revealed by the crystal structure of a neuronal кальци sensor, guanylate cyclase-activating protein 1, Structure 15: 1392-402, 2007.
Stieger К et al., Subretinal delivery of recombinant AAV serotype 8 vector in dogs results in gene transfer to neurons in the brain, Mol Ther. 16: 916-23, 2008.
Sun X, Pawlyk B, Xu X, Liu X, Bulgakov OV et al., Gene therapy with a promoter targeting both rods and cones rescues retinal degeneration caused by AIPL1 mutations, Gene Ther., 17: 117-31, 2010.
Surace EM and Auricchio A. Versatility of AAV vectors for retinal gene transfer, Vis. Res., 48: 353-359, 2007.
Tan MH, Smith AJ, Pawlyk B, Xu X, Liu X et al., Gene therapy for retinitis pigmentosa and Leber congenital amaurosis caused by defects in AIPL1: effective rescue of mouse models of partial and complete Aipll deficiency using AAV2/2 and AAV2/8 vectors, Hum. Mol. Genet., 18: 2099-114, 2009.
Timmers AM, Zhang H, Squitieri A, Gonzalez-Pola C, Subretinal injections in rodent eyes: effects on electrophysiology and histology of rat retina, Mol. Vis., 7:
- 64 035893
131-7, 2001.
Traint and Whitehead, Simultaneous Extraction of HighQuality PHK and ДНК from Small Tissue Samples, Heredity, 100: 246-250, 2009.
Ulshafer RJ, Allen C, Dawson WW and Wolf ED, Hereditary retinal degeneration in the Rhode Island Red chicken. I. Histology and ERG, Exp. Eye Res., 39: 125-35, 1984.
Umino Y, Solessio E, Barlow RB, Speed, spatial, and temporal tuning of rod and cone vision in mouse, J.Neurosci., 28: 189-198, 2008.
Waardenburg, P. J.; Schappert-Kimmijser, J., On various recessive biotypes of Leber's congenital amaurosis, Acta Ophthal, 41:317-320, 1963.
Wagner, R. S.; Caputo, A. R.; Nelson, L. B.; Zanoni, D., High hyperopia in Leber's congenital amaurosis, Arch. Ophthal, 103: 1507-1509, 1985.
Weiss ER, et al., Species-specific differences in expression of G-protein-coupled receptor kinase (GRK) 7 and GRK1 in mammalian cone photoreceptor cells: implications for cone cell phototransduction, J. Neurosci., 21: 9175-84, 2001.
Wensel TG Signal transducing membrane complexes of photoreceptor outer segments, Vis Res. 48: 2052-2061, 2008.
Wilkie SE, Newbold FJ, Deery E, Walker CE, Stinton I, Ramamurthy V et al., Functional characterization of missense mutations at codon 838 in retinal guanylate cyclase correlates with disease severity in patients with autosomal dominant conerod dystrophy, Hum Mol Genet., 9: 3065-3073, 2000.
Williams GA and Jacobs GHCone-based vision in the aging mouse, Vision Res 47: 2037-46, 2007.
Williams ML, Coleman JE, Haire SE, Aleman TS, Cideciyan AV, Lentiviral expression of retinal guanylate cyclase-1 (RetGC 1) restores vision in an avian model of childhood blindness, PLoS. Med., 3:e201, 2006.
Yang GS, Schmidt M, Yan Z, Lindbloom JD, Harding TC et al., Virus-mediated transduction of murine retina with adenoassociated virus: effects of viral capsid and genome size, J.
- 65 035893
Virol, 76: 7651-60, 2002.
Yang RB and Garbers DL, Two eye guanylyl cyclases are expressed in the same photoreceptor cells and form homomers in preference to heteromers, J. Biol. Chem., 272: 13738-42, 1997.
Yang RB, Foster DC, Garbers DL, Fulle HJ, Two membrane forms of guanylyl cyclase found in the eye, Proc. Natl. Acad Sci. USA, 92: 602-6, 1995.
Yang RB and Garbers DL Two eye guanylyl cyclases are expressed in the same photoreceptor cells and form homomers in preference to heteromers, J. Biol. Chem., 272: 13738-13742, 1997 .
Yang RB, Robinson SW, Xiong WH, Yau KW, Birch DG et al., Disruption of a retinal guanylyl cyclase gene leads to conespecific dystrophy and paradoxical rod behavior, J. Neurosci., 19: 5889-97, 1999.
Yano, S.; Oda, K.; Watanabe, Y.; Watanabe, S.; Matsuishi,
T.; Kojima, K.; Abe, T.; Kato, H. Two sib cases of Leber congenital amaurosis with cerebellar vermis hypoplasia and multiple systemic abnormalities, Am. J. Med. Genet., 78: 429432, 1998.
Yin L, Greenberg K, Hunter JJ, Dalkara D, Kolstad KD, Masella BD et al., Intravitreal injection of AAV2 transduces macaque inner retina, Invest. Ophthalmol. Vis. Sci., Feb 10, 201 1.
Zernant, J.; Kulm, M.; Dharmaraj, S.; den Hollander, A.
I.; Perrault, I.; Preising, Μ. N.; Lorenz, B.; Kaplan, J.;
Cremers, F. P. M.; Maumenee, I.; Koenekoop, R. K;
Allikmets, R., Genotyping microarray (disease chip) for Leber congenital amaurosis: detection of modifier alleles, Invest.
Ophthal. Vis. Sci., 46: 3052-3059, 2005.
Zhang H, Huang W, Zhang H, Zhu X, Craft CM et al., Lightdependent redistribution of visual arrestins and transducin subunits in mice with defective phototransduction, Mol. Vis., 9: 231-7, 2003.
Zhong L, et al., Next generation of adeno-associated virus 2 vectors: point mutations in tyrosines lead to highefficiency transduction at lower doses. Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 105: 7827-32, 2008.
Zhu X, Li A, Brown B, Weiss ER, Osawa S, Craft CM, Mouse cone arrestin expression pattern: light induced translocation in cone photoreceptors, Mol. Vis., 8: 462-71, 2002.
Zolotukhin S et al., Production and purification of serotype 1, 2, and 5 recombinant adeno-associated viral vectors, Methods, 28(2): 158-67, 2002.
Все из описанных, а также заявленных здесь композиций и способов могут в свете настоящего описания быть осуществлены без излишнего экспериментирования. Несмотря на то, что композиции и способы согласно настоящему изобретению описаны здесь в терминах предпочтительных воплощений, рядовым специалистам в данной области следует иметь в виду, что в описанные здесь композиции и способы, а также в стадии или в последовательность выполнения стадий описанного здесь способа могут быть внесены определенные изменения, не выходящие за рамки концепции, замысла, истинного смысла и объема, охватываемого настоящим изобретением. Более конкретно, совершенно очевидно, что определенные средства, которые являются и химически, и физиологически родственными, могут заменить описанные здесь средства с получением таких же или сходных результатов. Все такого рода сходные замены
- 66 035893 и модификации, очевидные с точки зрения специалистов в данной области, считаются входящими в рамки концепции, замысла и объема, охватываемого настоящим изобретением, определяемым прилагаемой формулой изобретения.
Список последовательностей <110> University of Florida Research Foundation, Inc.
Boye, Shannon E.
Hauswirth, William W.
Boye, Sanford L.
<120> РЕКОМБИНАНТНЫЙ АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУСНЫЙ ВЕКТОР (RAAV), КОДИРУЮЩИЙ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНУЮ, СПЕЦИФИЧНУЮ В ОТНОШЕНИИ СЕТЧАТКИ ГУАНИЛАТЦИКЛАЗУ ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБНЫЙ ПРЕДОХРАНЯТЬ ИЛИ ВОССТАНАВЛИВАТБ ОПОСРЕДОВАННУЮ КОЛБОЧКАМИ ФУНКЦИЮ ГЛАЗА МЛЕКОПИТАЮЩЕГО <130> 36689.309 <150> US 61/327,521 <151> 2010-04-23 <160>18 <170> Patentin version 3.5 <210>1 <211>1103 <212> БЕЛОК <213> Homo sapiens <400>1
Met Thr Ala Cys Ala Arg Arg Ala Gly Gly Leu Pro Asp Pro Gly Leu 15 1015
Cys Gly Pro Ala Trp Trp Ala Pro Ser Leu Pro Arg Leu Pro Arg Ala 20 2530
Leu Pro Arg Leu Pro Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gln Pro Pro 35 4045
Ala Leu Ser Ala Vai Phe Thr Vai Gly Vai Leu Gly Pro Trp Ala Cys 50 5560
Asp Pro lie Phe Ser Arg Ala Arg Pro Asp Leu Ala Ala Arg Leu Ala 65 70 7580
Ala Ala Arg Leu Asn Arg Asp Pro Gly Leu Ala Gly Gly Pro Arg Phe 85 9095
Glu Vai Ala Leu Leu Pro Glu Pro Cys Arg Thr Pro Gly Ser Leu Gly
100 105110
Ala Vai Ser Ser Ala Leu Ala Arg Vai Ser Gly Leu Vai Gly Pro Vai
115 120125
Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala Glu Leu Leu Ala Glu Glu Ala Gly 130 135140
He Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys Pro Trp Thr Gin Ala Glu Gly Thr
145 150 155160
Thr Ala Pro Ala Vai Thr Pro Ala Ala Asp Ala Leu Tyr Ala Leu Leu
165 170175
Arg Ala Phe Gly Trp Ala Arg Vai Ala Leu Vai Thr Ala Pro Gin Asp 180 185190
Leu Trp Vai Glu Ala Gly Arg Ser Leu Ser Thr Ala Leu Arg Ala Arg
195 200205
Gly Leu Pro Vai Ala Ser Vai Thr Ser Met Glu Pro Leu Asp Leu Ser 210 215220
Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Lys Vai Arg Asp Gly Pro Arg Vai Thr 225 230 235240
Ala Vai He Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu Gly Gly Glu Glu Gin
245 250255
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Gly Leu Thr Asp Gly Ser 260 265270
Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr He His Tyr Ala Leu Ser Pro Gly 275 280285
Pro Glu Ala Leu Ala Ala Leu Ala Asn Ser Ser Gin Leu Arg Arg Ala
290 295300
His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr Arg His 305310
Cys Pro Ser Glu Gly Ser 315 320
Vai Leu Asp Ser Leu Arg Arg Ala 325
Gin Glu Arg Arg Glu Leu Pro Ser
330 335
Asp Leu Asn Leu Gin Gin Vai Ser 340
Pro Leu Phe Gly Thr He Tyr Asp 345 350
Ala Vai Phe Leu Leu Ala Arg Gly
355 360
Vai Ala Glu Ala Arg Ala Ala Ala 365
Gly Gly Arg Trp Vai Ser Gly Ala
370 375
Ala Vai Ala Arg His He Arg Asp 380
Ala Gin Vai Pro Gly Phe Cys Gly 385 390
Asp Leu Gly Gly Asp Glu Glu Pro
395 400
- 68 035893
Pro Phe Vai
Leu Leu Asp Thr Asp Ala Ala
405410
Gly Asp Arg Leu Phe Ala 415
Thr Tyr Met Leu Asp Pro Ala Arg Gly Ser Phe Leu Ser Ala Gly Thr 420 425430
Arg Met His Phe Pro Arg Gly Gly Ser Ala Pro Gly Pro Asp Pro Ser
435 440445
Cys Trp Phe Asp Pro Asn Asn lie Cys Gly Gly Gly Leu Glu Pro Gly
450 455460
Leu Vai Phe Leu Gly Phe Leu Leu Vai Vai Gly Met Gly Leu Ala Gly
465 470 475480
Ala Phe Leu Ala His Tyr Vai Arg His Arg Leu Leu His Met Gin Met
485 490495
Vai Ser Gly Pro Asn Lys He He Leu Thr Vai Asp Asp lie Thr Phe
500 505510
Leu His Pro His Gly Gly Thr Ser Arg Lys Vai Ala Gin Gly Ser Arg
515 520525
Ser Ser Leu Gly Ala Arg Ser Met Ser Asp He Arg Ser Gly Pro Ser
530 535540
Gin His Leu Asp Ser Pro Asn He Gly Vai Tyr Glu Gly Asp Arg Vai
545 550 555560
Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Asp Gin His He Ala He Arg Pro Ala
565 570575
Thr Lys Thr Ala Phe Ser Lys Leu Gin Glu Leu Arg His Glu Asn Vai 580 585590
Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu Ala Arg Gly Ala Glu Gly Pro Ala 595 600605
Ala Leu Trp Glu Gly Asn Leu Ala Vai Vai Ser Glu His Cys Thr Arg
610 615620
Gly Ser Leu Gin Asp Leu Leu Ala Gin Arg Glu He Lys Leu Asp Trp
625 630 635640
Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu He Lys Gly He Arg Tyr
645 650655
- 69 035893
Leu His His Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu Lys Ser Arg Asn Cys 660 665670 lie Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu Lys lie Thr Asp His Gly His Gly 675 680685
Arg Leu Leu Glu Ala Gln Lys Vai Leu Pro Glu Pro Pro Arg Ala Glu 690 695700
Asp Gln Leu Trp Thr Ala Pro Glu Leu Leu Arg Asp Pro Ala Leu Glu
705 710 715720
Arg Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp Vai Phe Ser Leu Ala lie lie Met
725 730735
Gln Glu Vai Vai Cys Arg Ser Ala Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu Thr 740 745750
Pro Glu Glu Vai Vai Gln Arg Vai Arg Ser Pro Pro Pro Leu Cys Arg
755 760765
Pro Leu Vai Ser Met Asp Gln Ala Pro Vai Glu Cys lie Leu Leu Met
770 775780
Lys Gln Cys Trp Ala Glu Gln Pro Glu Leu Arg Pro Ser Met Asp His
785 790 795800
Thr Phe Asp Leu Phe Lys Asn lie Asn Lys Gly Arg Lys Thr Asn lie
805 810815 lie Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gln Tyr Ser Ser Asn Leu Glu 820 825830
Asp Leu lie Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu Leu Glu Lys Gln Lys 835 840845
Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gln Met Leu Pro Pro Ser Vai Ala Glu Ala 850 855860
Leu Lys Thr Gly Thr Pro Vai Glu Pro Glu Tyr Phe Glu Gln Vai Thr
865 870 875880
Leu Tyr Phe Ser Asp lie Vai Gly Phe Thr Thr lie Ser Ala Met Ser
885 890895
Glu Pro lie Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp Leu Tyr Thr Leu Phe 900 905910
- 70 035893
Asp
Ala
915
Gly
His
Asp 920
Vai
Tyr
Lys
Vai
925
Thr
Gly
Asp
Ala
930
Tyr
Met
Vai
Ala
935
Gly
Leu
Arg 940
Gly
Arg
His
945
Ala
Ala
Ala
950
Met
Leu
Asp 955
Leu
Ala
Vai
960
Gly
Thr
Phe
Arg
Met
965
Arg
His
Met
Vai
Vai
970
Arg
975
Arg
Gly
Leu
His
980
Gly
Cys
Vai
985
Ala
Gly
Vai
Vai
Gly 990
Leu
Thr
Met
Arg 995
Tyr
Cys
Leu
Phe
Gly 1000
Asp Thr Vai Asn Thr
1005
Met
Thr
Thr
Leu
Phe
1010
Vai
1025
Arg 1040
Trp 1055
1070
1085
Gly <210>
<211>
<212>
<213>
<400:
Gly
Leu
1015
Tyr
Arg
His
Vai
1020
Leu
Gly
Gly
Leu
Asp
Leu
Arg
Ala
1030
Leu
Asp
Gly
Tyr 1035
Vai
Arg
Thr
Glu
Leu
1045
Lys
Gly
Lys
Gly
Ala
1050
Asp
Thr
Vai
Gly
Arg
Arg 1060
Gly
Phe
Lys
1065
Lys
Leu
Glu
Phe
1108
БЕЛОК
Mus muscuius
Met Ser Ala 1
Trp Leu 5
Leu
Cys Vai Pro
Ala Arg
Gly 1075
Arg 1090
Arg
Arg
Lys
His
Leu
Pro Ala
Gly
Gly Leu 10
Ser Phe
Gly 1080
1095
Lys
Ala
Leu
Arg
Pro Gly
Ser Arg
Ala Gly Phe 15
Vai Leu Arg
- 71 035893
2530
Trp Pro Arg Pro Gly Leu Pro Gly Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro 35 4045
Ser Pro Ser Ala Leu Ser Ala Vai Phe Lys Vai Gly Vai Leu Gly Pro 50 5560
Trp Ala Cys Asp Pro lie Phe Ala Arg Ala Arg Pro Asp Leu Ala Ala 65 70 7580
Arg Leu Ala Ala Asn Arg Leu Asn Arg Asp Phe Ala Leu Asp Gly Gly 85 9095
Pro Arg Phe Glu Vai Ala Leu Leu Pro Glu Pro Cys Leu Thr Pro Gly 100 105110
Ser Leu Gly Ala Vai Ser Ser Ala Leu Ser Arg Vai Ser Gly Leu Vai
115 120125
Gly Pro Vai Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala Glu Leu Leu Ala Gln
130 135140
Glu Ala Gly Vai Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys Pro Gly Thr Arg Ala
145 150 155160
Ala Gly Thr Thr Ala Pro Ala Vai Thr Pro Ala Ala Asp Ala Leu Tyr
165 170175
Vai Leu Leu Arg Ala Phe Arg Trp Ala Arg Vai Ala Leu lie Thr Ala 180 185190
Pro Gln Asp Leu Trp Vai Glu Ala Gly Arg Ala Leu Ser Thr Ala Leu
195 200205
Arg Ala Arg Gly Leu Pro Vai Ala Leu Vai Thr Ser Met Glu Thr Ser
210 215220
Asp Arg Ser Gly Ala Arg Glu Ala Leu Gly Arg lie Arg Asp Gly Pro
225 230 235240
Arg Vai Arg Vai Vai lie Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu Gly Gly
245 250255
Glu Glu Gln Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Ala Leu Thr 260 265270
Asp Gly Ser Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr Leu His Tyr Ala Leu
- 72 035893
275
280
285
Ser Pro Gly Pro Glu Ala Leu Ala Ala Phe Vai Asn Ser Ser Gln Leu
290 295300
Arg Arg Ala His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr Arg Arg Cys Pro Pro
305 310 315320
Gly Gly Ser Vai Gln Asp Ser Leu Arg Arg Ala Gln Glu His Gln Glu
325 330335
Leu Pro Leu Asp Leu Asn Leu Lys Gln Vai Ser Pro Leu Phe Gly Thr
340 345350 lie Tyr Asp Ala Vai Phe Leu Leu Ala Gly Gly Vai Lys Arg Ala Arg 355 360365
Thr Ala Vai Gly Gly Gly Trp Vai Ser Gly Ala Ser Vai Ala Arg Gln
370 375380
Vai Arg Glu Ala Gln Vai Ser Gly Phe Cys Gly Vai Leu Gly Arg Thr
385 390 395400
Glu Glu Pro Ser Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp Ala Ser Gly Glu Gln
405 410415
Leu Phe Ala Thr His Leu Leu Asp Pro Vai Leu Gly Ser Leu Arg Ser 420 425430
Ala Gly Thr Pro Met His Phe Pro Arg Gly Gly Pro Ala Pro Gly Pro
435 440445
Asp Pro Ser Cys Trp Phe Asp Pro Asp Vai lie Cys Asn Gly Gly Vai
450 455460
Glu Pro Gly Leu Vai Phe Vai Gly Phe Leu Leu Vai lie Gly Met Gly
465 470 475480
Leu Thr Gly Ala Phe Leu Ala His Tyr Leu Arg His Arg Leu Leu His
485 490495
Met Gln Met Ala Ser Gly Pro Asn Lys lie lie Leu Thr Leu Glu Asp 500 505510
Vai Thr Phe Leu His Pro Pro Gly Gly Ser Ser Arg Lys Vai Vai Gln
515 520525
Gly Ser Arg Ser Ser Leu Ala Thr Arg Ser Ala Ser Asp lie Arg Ser
- 73 035893
530
535
540
Vai
545
Pro
Gln
Pro
Gln
550
Glu
Thr
Asn
Vai
555
Gly
Leu
Tyr
Glu
Gly 560
Asp
Trp
Vai
Trp
Leu
565
Lys
Lys
Phe
Pro
Gly 570
Glu
His
His
Met
Ala
575
Arg
Pro
Ala
Thr
580
Lys
Thr
Ala
Phe
585
Lys
Leu
Arg
Glu
Leu
590
Arg
His
Glu
Asn
Vai
595
Ala
Leu
Tyr
Leu
Gly 600
Leu
Phe
Leu
Ala
Gly 605
Thr
Ala
Asp
Pro
610
Ala
Thr
Pro
Gly
Glu
615
Gly
Leu
Ala
Vai
620
Vai
Glu
His
Cys 625
Ala
Arg
Gly
Leu
630
His
Asp
Leu
Leu
Ala
635
Gln
Arg
Glu
Lys 640
Leu
Asp
Trp
Met
Phe
645
Lys
Leu
Leu
650
Leu
Asp
Leu
Lys
655
Gly
Met
Arg
Tyr
Leu
660
His
His
Arg
Gly
Vai
665
Ala
His
Gly
Arg
Leu
670
Lys
Arg
Asn
Cys 675
Vai
Vai
Asp
Gly
Arg 680
Phe
Vai
Leu
Lys
Vai
685
Thr
Asp
His
Gly
His
690
Gly
Arg
Leu
Leu
Glu
695
Ala
Gln
Arg
Vai
Leu
700
Pro
Glu
Pro
Pro
Ala
Glu
705
Asp
Gln
Leu
710
Trp
Thr
Ala
Pro
Glu
715
Leu
Leu
Arg
Asp
Pro
720
Leu
Glu
Arg
Arg
725
Gly
Thr
Leu
Ala
Gly 730
Asp
Vai
Phe
Leu
735
Ala
Met
Gln
740
Glu
Vai
Vai
Cys
Arg 745
Thr
Pro
Tyr
Ala
750
Met
Leu
Glu
Leu
Thr
755
Pro
Glu
Glu
Vai
Gln
Leu
Cys
770
Arg
Pro
Leu
Vai
775
760
Met
Asp
Arg
Gln
Vai
Ala
Arg
Pro
780
Pro
Pro
Pro
765
Met
Glu
Cys
Gln
Leu
Met
Thr
Gln
Cys
Trp
Ala
Glu
His
Pro
Glu
Leu
Arg
Pro
- 74 035893
785 790 795800
Met Asp Leu Thr Phe Asp Leu Phe Lys Ser He Asn Lys Gly Arg Lys
805 810815
Thr Asn He He Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gin Tyr Ser Ser
820 825830
Asn Leu Glu Asp Leu He Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu Gin Glu 835 840845
Lys Gin Lys Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gin Met Leu Pro Pro Ser Vai
850 855860
Ala Glu Ala Leu Lys Met Gly Thr Ser Vai Glu Pro Glu Tyr Phe Glu
865 870 875880
Glu Vai Thr Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai Gly Phe Thr Thr He Ser
885 890895
Ala Met Ser Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp Leu Tyr
900 905910
Thr Leu Phe Asp Ala He He Gly Ala His Asp Vai Tyr Lys Vai Glu 915 920925
Thr He Gly Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro Gin Arg Asn
930 935940
Gly Gin Arg His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ser Leu Asp He Leu
945 950 955960
Ser Ala Vai Gly Ser Phe Arg Met Arg His Met Pro Glu Vai Pro Vai
965 970975
Arg He Arg He Gly Leu His Ser Gly Pro Cys Vai Ala Gly Vai Vai
980 985990
Gly Leu Thr Met Pro Arg Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn Thr 995 10001005
Ala Ser Arg Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg He His Vai 1010 10151020
Asn Met Ser Thr Vai Arg He Leu Arg Ala Leu Asp Gin Gly Phe 1025 10301035
Gin Met Glu Cys Arg Gly Arg Thr Glu Leu Lys Gly Lys Gly He
1040 10451050
Glu Asp Thr Tyr Trp Leu Vai Gly Arg Leu Gly Phe Asn Lys Pro 1055 10601065 lie Pro Lys Pro Pro Asp Leu Gln Pro Gly Ala Ser Asn His Gly 1070 10751080 lie Ser Leu Gln Glu lie Pro Pro Glu Arg Arg Lys Lys Leu Glu 1085 10901095
Lys Ala Arg Pro Gly Gln Phe Thr Gly Lys 11001105 <210> 3 <211>1108 <212> БЕЛОК <213> Rattus norvegicus <400> 3
Met Ser Ala Trp Leu Leu Pro Ala Gly Gly Phe Pro Gly Ala Gly Phe
1015
Cys lie Pro Ala Trp Gln Ser Arg Ser Ser Leu Ser Arg Vai Leu Arg 20 2530
Trp Pro Gly Pro Gly Leu Pro Gly Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Pro 35 4045
Ser Pro Ser Ala Phe Ser Ala Vai Phe Lys Vai Gly Vai Leu Gly Pro 50 5560
Trp Ala Cys Asp Pro lie Phe Ala Arg Ala Arg Pro Asp Leu Ala Ala 65 70 7580
Arg Leu Ala Thr Asp Arg Leu Asn Arg Asp Leu Ala Leu Asp Gly Gly 85 9095
Pro Trp Phe Glu Vai Thr Leu Leu Pro Glu Pro Cys Leu Thr Pro Gly 100 105110
Ser Leu Gly Ala Vai Ser Ser Ala Leu Thr Arg Vai Ser Gly Leu Vai
115 120125
Gly Pro Vai Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala Glu Leu Leu Ala Gln
130 135140
Glu Ala Gly Vai Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys Pro Gly Thr Arg Ala
145 150 155160
- 76 035893
Ala Gly Thr Thr Ala Pro Ala Vai Thr Pro Ala Ala Asp Ala Leu Tyr
165 170175
Vai Leu Leu Lys Ala Phe Arg Trp Ala Arg Vai Ala Leu lie Thr Ala 180 185190
Pro Gln Asp Leu Trp Vai Glu Ala Gly Arg Ala Leu Ser Thr Ala Leu
195 200205
Arg Ala Arg Gly Leu Pro Vai Ala Leu Vai Thr Ser Met Vai Pro Ser 210 215220
Asp Leu Ser Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Arg lie Arg Asp Gly Pro
225 230 235240
Arg Vai Arg Vai Vai lie Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu Gly Gly
245 250255
Glu Glu Gln Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Gly Leu Thr 260 265270
Asp Gly Ser Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr Leu His Tyr Ala Leu 275 280285
Ser Pro Gly Pro Glu Ala Leu Ala Ala Phe Vai Asn Ser Ser Lys Leu
290 295300
Arg Arg Ala His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr Arg Arg Cys Pro Pro
305 310 315320
Gly Gly Ser Vai Gln Asp Ser Leu Arg Arg Ala Gln Glu His Gln Glu
325 330335
Leu Pro Leu Asp Leu Asp Leu Lys Gln Vai Ser Pro Leu Phe Gly Thr 340 345350 lie Tyr Asp Ala Vai Phe Leu Leu Ala Gly Gly Vai Thr Arg Ala Arg 355 360365
Ala Ala Vai Gly Gly Gly Trp Vai Ser Gly Ala Ser Vai Ala Arg Gln 370 375380
Met Arg Glu Ala Gln Vai Phe Gly Phe Cys Gly lie Leu Gly Arg Thr
385 390 395400
Glu Glu Pro Ser Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp Ala Ala Gly Glu Arg
405 410415
- 77 035893
Leu Phe Thr Thr His Leu Leu Asp Pro Vai Leu Gly Ser Leu Arg Ser
420 425430
Ala Gly Thr Pro Vai His Phe Pro Arg Gly Ala Pro Ala Pro Gly Pro 435 440445
Asp Pro Ser Cys Trp Phe Asp Pro Asp Vai lie Cys Asn Gly Gly Vai
450 455460
Glu Pro Gly Leu Vai Phe Vai Gly Phe Leu Leu Vai lie Vai Vai Gly
465 470 475480
Leu Thr Gly Ala Phe Leu Ala His Tyr Leu Arg His Arg Leu Leu His
485 490495
Met Gln Met Vai Ser Gly Pro Asn Lys lie lie Leu Thr Leu Glu Asp
500 505510
Vai Thr Phe Leu His Pro Gln Gly Gly Ser Ser Arg Lys Vai Ala Gln 515 520525
Gly Ser Arg Ser Ser Leu Ala Thr Arg Ser Thr Ser Asp lie Arg Ser 530 535540
Vai Pro Ser Gln Pro Gln Glu Ser Thr Asn lie Gly Leu Tyr Glu Gly 545 550 555560
Asp Trp Vai Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Glu His His Met Ala lie
565 570575
Arg Pro Ala Thr Lys Met Ala Phe Ser Lys Leu Arg Glu Leu Arg His
580 585590
Glu Asn Vai Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu Ala Gly Thr Ala Asp 595 600605
Ser Pro Ala Thr Pro Gly Glu Gly lie Leu Ala Vai Vai Ser Glu His
610 615620
Cys Ala Arg Gly Ser Leu His Asp Leu Leu Ala Gln Arg Asp lie Lys
625 630 635640
Leu Asp Trp Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu lie Lys Gly
645 650655
Met Arg Tyr Leu His His Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu Lys Ser
660 665670
- 78 035893
Arg Asn Cys Vai Vai 675
Asp Gly Arg Phe Vai Leu 680
Lys Vai Thr Asp His 685
Gly His Gly Arg Leu 690
Leu Glu Ala Gin Arg Vai 695
Leu Pro Glu Pro Pro 700
Ser Ala Glu Asp Gin 705
Leu Trp Thr Ala Pro Glu
710 715
Leu Leu Arg Asp Pro
720
Ala Leu Glu Arg Arg
725
Gly Thr Leu Ala Gly Asp
730
Vai Phe Ser Leu Gly 735
He He Met Gin Glu
740
Vai Vai Cys Arg Ser Thr 745
Pro Tyr Ala Met Leu 750
Glu Leu Thr Pro Glu
755
Glu Vai He Gin Arg Vai 760
Arg Ser Pro Pro Pro 765
Leu Cys Arg Pro Leu 770
Vai Ser Met Asp Gin Ala 775
Pro Met Glu Cys He 780
Gin Leu Met Ala Gin 785
Cys Trp Ala Glu His Pro
790 795
Glu Leu Arg Pro Ser
800
Met Asp Leu Thr Phe
805
Asp Leu Phe Lys Gly He 810
Asn Lys Gly Arg Lys
815
Thr Asn He He Asp 820
Ser Met Leu Arg Met Leu
825
Glu Gin Tyr Ser Ser 830
Asn Leu Glu Asp Leu 835
He Arg Glu Arg Thr Glu 840
Glu Leu Glu Gin Glu
845
Lys Gin Lys Thr Asp 850
Arg Leu Leu Thr Gin Met 855
Leu Pro Pro Ser Vai 860
Ala Glu Ala Leu Lys 865
Met Gly Thr Ser Vai Glu
870 875
Pro Glu Tyr Phe Glu
880
Glu Vai Thr Leu Tyr
885
Phe Ser Asp He Vai Gly 890
Phe Thr Thr He Ser
895
Ala Met Ser Glu Pro
900
He Glu Vai Vai Asp Leu
905
Leu Asn Asp Leu Tyr
910
Thr Leu Phe Asp Ala 915
He He Gly Ser His Asp 920
Vai Tyr Lys Vai Glu 925
- 79 035893
Thr
Gly
Asp
Ala
Tyr
930
Met
935
Vai
Ala
Gly
Leu
940
Pro
Gln
Arg
Asn
Gly 945
Gln
Arg
His
Ala
Ala
950
Glu
Ala
Asn
Met
955
Leu
Asp
Leu
960
Ala
Vai
Gly
Phe
965
Arg
Met
Arg
His
970
Met
Pro
Glu
Vai
Pro
975
Vai
Arg
Arg
980
Gly
Leu
His
Gly 985
Pro
Cys
Vai
Ala
Gly 990
Vai
Vai
Gly
Leu
Thr
995
Met
Pro
Arg
Tyr
Cys 1000
Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn Thr 1005
Ala
Arg
Met
Glu
Asn
Gln
Glu
Lys
1010
Thr
1015
Gly
Leu
Pro
Tyr
Arg 1020
His
Vai
Met
1025
Met
1040
Asp 1055
Pro
1070
1085
Ala
1100 <211>
<212>
<213>
Thr
Vai
Arg
Leu
Glu
Thr
Lys
Leu
Arg
Cys
Tyr
Pro
Gln
Pro
Arg
Gly
Trp
Leu
Pro
Glu
Gly
1110
БЕЛОК
Bos taurus
Met Thr Ala 1
Cys
Thr 5
Cys Ala Pro
Thr 20
Arg
Asp
Gln
Phe
Trp
1030
Arg 1045
Vai
1060
Leu
1075
Pro
1090
Phe
1105
Thr
Gly
Gln
Pro
Thr
Leu Ala
Arg
Ala
Leu
Asp 1035
Gln
Gly
Phe
Glu
Leu
Lys
Gly 1050
Lys
Gly
Vai
Arg
Vai
Gly
Phe
1065
Asn
Lys
Pro
Pro
Glu
Gly
Gly
Gly
Ala
Asn
His
Arg
Arg
Lys
Gly Leu 10
Pro Pro
1080
Lys 1095
Lys
Leu
Gly
Glu
Arg Asp
Gly Leu
Pro
Pro
Gly Leu 15
- 80 035893
Pro Pro Arg Pro Arg Leu Arg Leu Arg Pro Pro Leu Leu Leu Leu Leu 35 4045
Leu Leu Pro Arg Ser Vai Leu Ser Ala Vai Phe Thr Vai Gly Vai Leu 50 5560
Gly Pro Trp Ala Cys Asp Pro He Phe Ala Arg Ala Arg Pro Asp Leu 65 70 7580
Ala Ala Arg Leu Ala Ala Ser Arg Leu Asn His Ala Ala Ala Leu Glu 85 9095
Gly Gly Pro Arg Phe Glu Vai Ala Leu Leu Pro Glu Pro Cys Arg Thr 100 105110
Pro Gly Ser Leu Gly Ala Vai Ser Ser Ala Leu Thr Arg Vai Ser Gly
115 120125
Leu Vai Gly Pro Vai Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala Glu Leu Leu
130 135140
Ala Gin Glu Ala Gly Vai Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys Pro Gly Thr
145 150 155160
Arg Ala Ala Gly Thr Thr Ala Pro Vai Vai Thr Pro Ala Ala Asp Ala
165 170175
Leu Tyr Ala Leu Leu Arg Ala Phe Arg Trp Ala His Vai Ala Leu Vai 180 185190
Thr Ala Pro Gin Asp Leu Trp Vai Glu Ala Gly His Ala Leu Ser Thr
195 200205
Ala Leu Arg Ala Arg Gly Leu Pro Vai Ala Leu Vai Thr Ser Met Glu 210 215220
Pro Ser Asp Leu Ser Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Arg Vai Gin Asp
225 230 235240
Gly Pro Arg Vai Arg Ala Vai He Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu
245 250255
Gly Gly Glu Glu Gin Arg Cys Leu Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Gly 260 265270
Leu Ala Asp Gly Ser Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr Leu His Tyr
275 280285
- 81 035893
Ala Leu Ser Pro Gly Pro Asp Ala
290 295
Leu Ala Vai Leu Ala Asn Ser Ser
300
Gln Leu Arg Lys Ala His Asp Ala 305 310
Vai Leu Thr Leu Thr Arg His Cys
315 320
Pro Leu Gly Gly Ser Vai Arg Asp 325
Ser Leu Arg Arg Ala Gln Glu His
330 335
Arg Glu Leu Pro Leu Asp Leu Asn 340
Leu Gln Gln Vai Ser Pro Leu Phe
345 350
Gly Thr lie Tyr Asp Ser Vai Phe
355 360
Leu Leu Ala Gly Gly Vai Ala Arg 365
Ala Arg Vai Ala Ala Gly Gly Gly
370 375
Trp Vai Ser Gly Ala Ala Vai Ala 380
Arg His lie Arg Asp Ala Arg Vai 385 390
Pro Gly Phe Cys Gly Ala Leu Gly
395 400
Gly Ala Glu Glu Pro Ser Phe Vai 405
Leu Leu Asp Thr Asp Ala Thr Gly
410 415
Asp Gln Leu Phe Ala Thr Tyr Vai 420
Leu Asp Pro Thr Gln Gly Phe Phe 425 430
His Ser Ala Gly Thr Pro Vai His
435 440
Phe Pro Lys Gly Gly Arg Gly Pro 445
Gly Pro Asp Pro Ser Cys Trp Phe
450 455
Asp Pro Asp Thr lie Cys Asn Gly 460
Gly Vai Glu Pro Ser Vai Vai Phe 465 470 lie Gly Phe Leu Leu Vai Vai Gly 475 480
Met Gly Leu Ala Gly Ala Phe Leu 485
Ala His Tyr Cys Arg His Arg Leu
490 495
Leu His lie Gln Met Vai Ser Gly 500
Pro Asn Lys lie lie Leu Thr Leu 505 510
Asp Asp lie Thr Phe Leu His Pro
515 520
His Gly Gly Asn Ser Arg Lys Vai
525
Ala Gln Gly Ser Arg Thr Ser Leu
530 535
Ala Ala Arg Ser lie Ser Asp Vai 540
- 82 035893
Arg Ser lie His 545
Ser Gln Leu Pro Asp Tyr Thr Asn lie
550 555
Gly Leu Tyr
560
Glu Gly Asp Trp Vai Trp Leu Lys Lys 565
Phe Pro Gly Asp Arg His lie
570 575
Ala lie Arg Pro Ala Thr Lys Met 580
Ala Phe Ser Lys lie Arg Glu Leu 585 590
Arg His Glu Asn Vai Ala Leu Tyr
595 600
Leu Gly Leu Phe Leu Ala Gly Gly 605
Ala Gly Gly Pro Ala Ala Pro Gly
610 615
Glu Gly Vai Leu Ala Vai Vai Ser 620
Glu His Cys Ala Arg Gly Ser Leu 625 630
Gln Asp Leu Leu Ala Gln Arg Asp
635 640 lie Lys Leu Asp Trp Met Phe Lys 645
Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu lie
650 655
Lys Gly lie Arg Tyr Leu His His 660
Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu 665 670
Lys Ser Arg Asn Cys Vai Vai Asp
675 680
Gly Arg Phe Vai Leu Lys Vai Thr 685
Asp His Gly His Gly Arg Leu Leu
690 695
Glu Ala Gln Arg Vai Leu Pro Glu 700
Pro Pro Ser Ala Glu Asp Gln Leu 705 710
Trp Thr Ala Pro Glu Leu Leu Arg
715 720
Asp Pro Vai Leu Glu Arg Arg Gly 725
Thr Leu Ala Gly Asp Vai Phe Ser
730 735
Leu Gly lie lie Met Gln Glu Vai 740
Vai Cys Arg Ser Ala Pro Tyr Ala 745 750
Met Leu Glu Leu Thr Pro Glu Glu
755 760
Vai Vai Lys Arg Vai Gln Ser Pro 765
Pro Pro Leu Cys Arg Pro Ser Vai
770 775
Ser lie Asp Gln Ala Pro Met Glu 780
Cys lie Gln Leu Met Lys Gln Cys 785 790
Trp Ala Glu Gln Pro Glu Leu Arg
795 800
- 83 035893
Pro Ser Met Asp Arg Thr Phe Glu Leu Phe Lys Ser lie Asn Lys Gly
805 810815
Arg Lys Met Asn lie lie Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gln Tyr 820 825830
Ser Ser Asn Leu Glu Asp Leu lie Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu 835 840845
Leu Glu Lys Gln Lys Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gln Met Leu Pro Pro 850 855860
Ser Vai Ala Glu Ala Leu Lys Met Gly Thr Pro Vai Glu Pro Glu Tyr
865 870 875880
Phe Glu Glu Vai Thr Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai Gly Phe Thr Thr
885 890895
He Ser Ala Met Ser Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp
900 905910
Leu Tyr Thr Leu Phe Asp Ala He He Gly Ser His Asp Vai Tyr Lys 915 920925
Vai Glu Thr He Gly Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro Gln
930 935940
Arg Asn Gly His Arg His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ala Leu Asp
945 950 955960
He Leu Ser Ala Vai Gly Thr Phe Arg Met Arg His Met Pro Glu Vai
965 970975
Pro Vai Arg He Arg He Gly Leu His Ser Gly Pro Cys Vai Ala Gly
980 985990
Vai Vai Gly Leu Thr Met Pro Arg Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai 995 10001005
Asn Thr Ala Ser Arg Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg He 1010 10151020
His Vai Asn Arg Ser Thr Vai Gln He Leu Ser Ala Leu Asn Glu 1025 10301035
Gly Phe Leu Thr Glu Vai Arg Gly Arg Thr Glu Leu Lys Gly Lys 1040 10451050
Gly
Ala
1055
Glu
Glu
Thr
Tyr
Trp 1060
Leu
Vai
Gly
Arg
Arg 1065
Gly
Phe
Asn
Lys
Pro
1070
Pro
Lys
Pro
Pro
1075
Asp
Leu
Gln
Pro
Gly 1080
Ala
Asn
His
Gly 1085
Leu
His
Glu
1090
Pro
Pro
Asp
Arg 1095
Arg
Gln
Lys
Leu
Glu
1100
Lys
Ala
Arg
Pro
Gly 1105
Gln
Phe
Gly
Lys 1110
<210> 5
<211> 1109
<212> БЕЛОК
<213> Canis
<400> 5
Met Ser Ala
Cys
Ala 5
Leu
Leu
Ala
Gly
Gly 10
Leu
Pro
Asp
Pro
Arg 15
Leu
Cys
Ala
Pro
Ala 20
Arg
Trp
Ala
Arg
Pro
Pro
Gly
Vai
Pro
Gly
Ala
Pro
Pro
Trp 35
Pro
Gln
Pro
Arg
Leu 40
Arg
Leu
Leu
Leu
Leu 45
Leu
Leu
Leu
Leu
Pro 50
Pro
Ala
Leu
Ala
Vai
Phe
Thr
Vai 60
Gly
Vai
Leu
Gly
Pro 65
Trp
Ala
Cys
Asp
Pro
Phe
Ala
Arg
Ala 75
Arg
Pro
Asp
Leu
Ala 80
Ala
Arg
Leu
Ala
Ala 85
Ala
Arg
Leu
Asn
Arg 90
Asp
Ala
Ala
Leu
Asp
Gly
Pro
Arg
Phe
100
Glu
Vai
Thr
Leu
Leu
105
Pro
Glu
Pro
Cys
Arg 110
Thr
Pro
Gly
Leu
115
Gly
Ala
Vai
Ala
Leu
120
Gly
Arg
Vai
125
Gly
Leu
Vai
Gly 130
Pro
Vai
Asn
Pro
Ala
135
Ala
Cys
Arg
Pro
Ala
140
Glu
Leu
Leu
Ala
Gln
145
Glu
Ala
Gly
Vai
Ala
150
Leu
Vai
Pro
Trp
Cys
Pro
Gly
Thr
155
Arg
160
- 85 035893
Ala Gly Gly Thr Thr Ala Pro Ala 165
Gly Thr Pro Ala Ala Asp Ala Leu
170 175
Tyr Ala Leu Leu Arg Ala Phe Arg 180
Trp Ala Arg Vai Ala Leu He Thr 185 190
Ala Pro Gin Asp Leu Trp Vai Glu
195 200
Ala Gly Arg Ala Leu Ser Ala Ala 205
Leu Arg Ala Arg Gly Leu Pro Vai
210 215
Ala Leu Vai Thr Thr Met Glu Pro
220
Ser Asp Leu Ser Gly Ala Arg Glu 225 230
Ala Leu Arg Arg Vai Gin Asp Gly
235 240
Pro Arg Vai Arg Ala Vai He Met
245
Vai Met His Ser Vai Leu Leu Gly
250 255
Gly Glu Glu Gin Arg Cys Leu Leu 260
Gin Ala Ala Glu Glu Leu Gly Leu 265 270
Ala Asp Gly Ser Leu Vai Phe Leu
275 280
Pro Phe Asp Thr Leu His Tyr Ala
285
Leu Ser Pro Gly Pro Glu Ala Leu
290 295
Ala Vai Leu Ala Asn Ser Ser Gin
300
Leu Arg Arg Ala His Asp Ala Vai 305 310
Leu He Leu Thr Arg His Cys Pro
315 320
Pro Gly Gly Ser Vai Met Asp Asn
325
Leu Arg Arg Ala Gin Glu His Gin
330 335
Glu Leu Pro Ser Asp Leu Asp Leu 340
Gin Gin Vai Ser Pro Phe Phe Gly 345 350
Thr He Tyr Asp Ala Vai Leu Leu
355 360
Leu Ala Gly Gly Vai Ala Arg Ala 365
Arg Ala Ala Ala Gly Gly Gly Trp
370 375
Vai Ser Gly Ala Thr Vai Ala His 380
His He Pro Asp Ala Gin Vai Pro 385 390
Gly Phe Cys Gly Thr Leu Gly Gly
395 400
Ala Gin Glu Pro Pro Phe Vai Leu
405
Leu Asp Thr Asp Ala Ala Gly Asp
410 415
- 86 035893
Arg Leu Phe Ala Thr Tyr Met Leu Asp Pro Thr Arg Gly Ser Leu Leu
420 425430
Ser Ala Gly Thr Pro Vai His Phe Pro Arg Gly Gly Gly Thr Pro Gly
435 440445
Ser Asp Pro Ser Cys Trp Phe Glu Pro Gly Vai He Cys Asn Gly Gly 450 455460
Vai Glu Pro Gly Leu Vai Phe Leu Gly Phe Leu Leu Vai Vai Gly Met
465 470 475480
Gly Leu Thr Gly Ala Phe Leu Ala His Tyr Leu Arg His Arg Leu Leu
485 490495
His He Gin Met Vai Ser Gly Pro Asn Lys He He Leu Thr Leu Asp
500 505510
Asp Vai Thr Phe Leu His Pro His Gly Gly Ser Thr Arg Lys Vai Vai
515 520525
Gin Gly Ser Arg Ser Ser Leu Ala Ala Arg Ser Thr Ser Asp He Arg
530 535540
Ser Vai Pro Ser Gin Pro Leu Asp Asn Ser Asn He Gly Leu Phe Glu
545 550 555560
Gly Asp Trp Vai Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Asp Gin His He Ala
565 570575
He Arg Pro Ala Thr Lys Thr Ala Phe Ser Lys Leu Arg Glu Leu Arg
580 585590
His Glu Asn Vai Vai Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu Gly Ser Gly Gly
595 600605
Ala Gly Gly Ser Ala Ala Gly Glu Gly Vai Leu Ala Vai Vai Ser Glu
610 615620
His Cys Ala Arg Gly Ser Leu His Asp Leu Leu Ala Gin Arg Asp He
625 630 635640
Lys Leu Asp Trp Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu He Lys
645 650655
Gly Met Arg Tyr Leu His His Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu Lys
660 665670
- 87 035893
Ser Arg Asn Cys Vai 675
Vai Asp Gly Arg Phe Vai 680
Leu Lys Vai Thr Asp 685
His Gly His Ala Arg 690
Leu Met Glu Ala Gln Arg 695
Vai Leu Leu Glu Pro 700
Pro Ser Ala Glu Asp 705
Gln Leu Trp Thr Ala Pro
710 715
Glu Leu Leu Arg Asp
720
Pro Ala Leu Glu Arg
725
Arg Gly Thr Leu Pro Gly
730
Asp Vai Phe Ser Leu 735
Gly He He Met Gln 740
Glu Vai Vai Cys Arg Ser 745
Ala Pro Tyr Ala Met 750
Leu Glu Leu Thr Pro
755
Glu Glu Vai Vai Glu Arg 760
Vai Arg Ser Pro Pro 765
Pro Leu Cys Arg Pro 770
Ser Vai Ser Met Asp Gln 775
Ala Pro Vai Glu Cys 780
He Gln Leu Met Lys 785
Gln Cys Trp Ala Glu His
790 795
Pro Asp Leu Arg Pro
800
Ser Leu Gly His He 805
Phe Asp Gln Phe Lys Ser 810
He Asn Lys Gly Arg 815
Lys Thr Asn He He 820
Asp Ser Met Leu Arg Met
825
Leu Glu Gln Tyr Ser 830
Ser Asn Leu Glu Asp 835
Leu He Arg Glu Arg Thr 840
Glu Glu Leu Glu Leu
845
Glu Lys Gln Lys Thr 850
Asp Arg Leu Leu Thr Gln 855
Met Leu Pro Pro Ser 860
Vai Ala Glu Ala Leu 865
Lys Met Gly Thr Pro Vai
870 875
Glu Pro Glu Tyr Phe
880
Glu Glu Vai Thr Leu
885
Tyr Phe Ser Asp He Vai
890
Gly Phe Thr Thr He 895
Ser Ala Met Ser Glu
900
Pro He Glu Vai Vai Asp 905
Leu Leu Asn Asp Leu 910
Tyr Thr Leu Phe Asp 915
Ala He He Gly Ser His 920
Asp Vai Tyr Lys Vai 925
- 88 035893
Glu
Thr
930
Gly
Asp
Ala
Tyr 935
Met
Vai
Ala
Gly 940
Leu
Pro
Gln
Arg
Asn
945
Gly
Gln
Arg
His
Ala
950
Ala
Glu
Ala
Asn
955
Met
Ala
Leu
Asp
960
Leu
Ala
Vai
Gly 965
Phe
Arg
Met
Arg 970
His
Met
Pro
Glu
Vai
975
Pro
Vai
Arg
Arg 980
Gly
Leu
His
985
Gly
Pro
Cys
Vai
Ala
990
Gly
Vai
Vai
Gly
Leu
995
Thr
Met
Pro
Arg
Tyr 1000
Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn 1005
Thr
Ala
1010
Arg
Met
Glu
Thr
Gly
Leu
Pro
Vai
Asn
1025
Met
Thr
Vai
Phe
Gln
1040
Thr
Glu
Vai
Arg
Ala
Glu
1055
Asp
Thr
Tyr
Trp
Pro
Pro
Gly
Glu
1015
Tyr 1020
Arg
His
1070
1085
Lys 1100
Ala
Lys
Pro
Pro
Leu
Gln
Glu
Arg
Pro
Gly
Arg 1030
Gly 1045
Leu
1060
Asp 1075
1090
Gln
1105
Leu
His
Ala
Leu
1035
Asp
Glu
Gly
Arg
Vai
Leu
Pro
Phe
Thr
Gly
Gln
Leu
Glu
Leu
Lys 1050
Gly
Lys
Gly
Arg
Arg
Gly 1065
Phe
Asn
Lys
Pro
Gly
Ala
1080
Asn
His
Asp
Arg
Arg 1095
Trp
Lys
Leu
Gly
Lys <211>
<212>
<213>
1103
БЕЛОК
Macaca mulatta
Met Thr Ala 1
Cys
Ala Arg 5
Arg
Ala
Gly
Gly 10
Leu
Pro
Asp
Pro
Arg Leu 15
Cys Gly Pro
Ala 20
Arg Trp
Ala
Pro
Ala 25
Leu
Pro
Arg
Leu
Pro
Arg Ala
- 89 035893
Leu Pro Arg Leu Pro Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Gln Pro Pro 35 4045
Ala Leu Ser Ala Vai Phe Thr Vai Gly Vai Leu Gly Pro Trp Ala Cys 50 5560
Asp Pro He Phe Ser Arg Ala Arg Ala Asp Leu Ala Ala Arg Leu Ala 65 70 7580
Ala Ala Arg Leu Asn Arg Asp Pro Asp Leu Ala Gly Gly Pro Arg Phe 85 9095
Glu Vai Ala Leu Leu Pro Glu Pro Cys Arg Thr Pro Gly Ser Leu Gly 100 105110
Ala Vai Ser Ser Ala Leu Thr Arg Vai Ser Gly Leu Vai Gly Pro Vai
115 120125
Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala Glu Leu Leu Ala Glu Glu Ala Gly 130 135140
He Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys Pro Gly Thr Gln Ala Ala Gly Thr
145 150 155160
Thr Ala Pro Ala Leu Thr Pro Ala Ala Asp Ala Leu Tyr Ala Leu Leu
165 170175
Arg Ala Phe Gly Trp Ala Arg Vai Ala Leu Vai Thr Ala Pro Gln Asp 180 185190
Leu Trp Vai Glu Ala Gly His Ser Leu Ser Thr Ala Leu Arg Ala Arg
195 200205
Gly Leu Pro Vai Ala Ser Vai Thr Ser Met Glu Pro Leu Asp Leu Ser 210 215220
Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Lys Vai Arg Asp Gly Pro Arg Vai Thr 225 230 235240
Ala Vai He Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu Gly Gly Glu Glu Gln
245 250255
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Gly Leu Thr Asp Gly Ser 260 265270
Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr Vai His Tyr Ala Leu Ser Pro Gly
275 280285
- 90 035893
Pro Glu Ala Leu Ala Ala Leu Ala Asn Ser Ser Gln Leu Arg Arg Ala
290 295300
His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr Arg His Cys Pro Ser Glu Gly Ser
305 310 315320
Vai Leu Asp Ser Leu Arg Arg Ala Gln Glu Arg Arg Glu Leu Pro Ser
325 330335
Asp Leu Asn Leu Gln Gln Vai Ser Pro Leu Phe Gly Thr lie Tyr Asp 340 345350
Ala Vai Phe Leu Leu Vai Arg Gly Vai Ala Glu Ala Arg Ala Ala Ala
355 360365
Gly Gly Arg Trp Vai Ser Gly Ala Ala Vai Ala Arg His Vai Trp Asp
370 375380
Ala Gln Vai Pro Gly Phe Cys Gly Asp Leu Gly Gly Asp Glu Glu Pro
385 390 395400
Pro Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp Ala Vai Gly Asp Arg Leu Phe Ala
405 410415
Thr Tyr Met Leu Asp Pro Thr Arg Gly Ser Leu Leu Ser Ala Gly Thr 420 425430
Pro Met His Phe Pro Arg Gly Gly Ser Ala Pro Gly Pro Asp Pro Ser
435 440445
Cys Trp Phe Asp Pro Asn Asn lie Cys Gly Gly Gly Leu Glu Pro Gly
450 455460
Leu Vai Phe Leu Gly Phe Leu Leu Vai Vai Gly Met Gly Leu Ala Gly
465 470 475480
Ala Phe Leu Ala His Tyr Vai Arg His Gln Leu Leu His lie Gln Met
485 490495
Vai Ser Gly Pro Asn Lys lie lie Leu Thr Vai Asp Asp lie Thr Phe 500 505510
Leu His Pro His Gly Gly Thr Ser Arg Lys Vai Ala Gln Gly Ser Arg
515 520525
Ser Ser Leu Ala Ala Arg Ser Met Ser Asp Vai Arg Ser Gly Pro Ser
530 535540
- 91 035893
Gin Pro Thr Asp Ser Pro Asn Vai 545 550
Gly Vai Tyr Glu Gly Asp Arg Vai
555 560
Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Asp 565
Gin His He Ala He Arg Pro Ala
570 575
Thr Lys Thr Ala Phe Ser Lys Leu 580
Gin Glu Leu Arg His Glu Asn Vai 585 590
Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu
595 600
Ala Gin Gly Ala Glu Gly Pro Ala 605
Ala Leu Trp Glu Gly Asn Leu Ala
610 615
Vai Vai Ser Glu His Cys Thr Arg 620
Gly Ser Leu Gin Asp Leu Leu Ala 625 630
Gin Arg Glu He Lys Leu Asp Trp
635 640
Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu 645
Asp Leu He Lys Gly He Arg Tyr
650 655
Leu His His Arg Gly Vai Ala His 660
Gly Arg Leu Lys Ser Arg Asn Cys 665 670
He Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu
675 680
Lys He Thr Asp His Gly His Gly 685
Arg Leu Leu Glu Ala Gin Lys Vai
690 695
Leu Pro Glu Pro Pro Arg Ala Glu 700
Asp Gin Leu Trp Thr Ala Pro Glu 705 710
Leu Leu Arg Asp Pro Ala Leu Glu
715 720
Arg Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp 725
Vai Phe Ser Leu Ala He He Met
730 735
Gin Glu Vai Vai Cys Arg Ser Ala 740
Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu Thr 745 750
Pro Glu Glu Vai Vai Gin Arg Vai
755 760
Arg Ser Pro Pro Pro Leu Cys Arg 765
Pro Leu Vai Ser Met Asp Gin Ala
770 775
Pro Vai Glu Cys He His Leu Met 780
Lys Gin Cys Trp Ala Glu Gin Pro 785 790
Glu Leu Arg Pro Ser Met Asp His
795 800
- 92 035893
Thr Phe Asp Leu Phe Lys Asn He Asn Lys Gly Arg Lys Thr Asn He
805 810815
He Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gin Tyr Ser Ser Asn Leu Glu 820 825830
Asp Leu He Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu Leu Glu Lys Gin Lys 835 840845
Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gin Met Leu Pro Pro Ser Vai Ala Glu Ala
850 855860
Leu Lys Thr Gly Thr Pro Vai Glu Pro Glu Tyr Phe Glu Gin Vai Thr
865 870 875880
Leu Tyr Phe Ser Asp lie Vai Gly Phe Thr Thr lie Ser Ala Met Ser
885 890895
Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp Leu Tyr Thr Leu Phe 900 905910
Asp Ala He He Gly Ser His Asp Vai Tyr Lys Vai Glu Thr He Gly 915 920925
Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro Gin Arg Asn Gly Gin Arg 930 935940
His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ser Leu Asp He Leu Ser Ala Vai
945 950 955960
Gly Thr Phe Arg Met Arg His Met Pro Glu Vai Pro Vai Arg He Arg
965 970975
He Gly Leu His Ser Gly Pro Cys Vai Ala Gly Vai Vai Gly Leu Thr 980 985990
Met Pro Arg Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn Thr Ala Ser Arg
995 10001005
Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg He His Vai Asn Leu Ser 1010 10151020
Thr Vai Gly He Leu Arg Ala Leu Asp Ser Gly Tyr Gin Vai Glu 1025 10301035
Leu Arg Gly Arg Thr Glu Leu Lys Gly Lys Gly Ala Glu Asp Thr 1040 10451050
Phe
Trp 1055
Leu
Vai
Gly
Arg
Arg 1060
Gly
Phe
Asn
Lys
Pro
1065
Pro
Lys
Pro
Pro
1070
Asp
Leu
Gln
Pro
Gly 1075
Asn
His
Gly 1080
Leu
Gln
Glu
1085
Pro
Pro
Glu
Arg 1090
Arg
Arg
Lys
Leu
Glu
1095
Lys
Ala
Arg
Pro
Gly 1100
Gln
Phe <211>
<212>
<213>
1103
БЕЛОК
Pongo pygmaeus
Met 1
Thr
Ala
Cys
Ala 5
Arg
Arg
Ala
Gly
Gly 10
Leu
Pro
Asp
Pro
Gly 15
Leu
Cys
Gly
Pro
Ala 20
Arg
Trp
Ala
Pro
Leu
Pro
Arg
Leu
Pro
Arg
Ala
Leu
Pro
Arg 35
Leu
Pro
Leu
Leu
Leu 40
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu 45
Gln
Pro
Pro
Ala
Leu 50
Ala
Vai
Phe
Thr 55
Vai
Gly
Vai
Leu
Gly 60
Pro
Trp
Ala
Cys
Asp 65
Pro
Phe
Arg 70
Ala
Arg
Pro
Asp
Leu 75
Ala
Ala
Arg
Leu
Ala 80
Ala
Ala
Arg
Leu
Asn 85
Arg
Asp
Pro
Gly
Leu 90
Ala
Gly
Gly
Pro
Arg 95
Phe
Glu
Vai
Ala
Leu
100
Leu
Pro
Glu
Pro
Cys 105
Arg
Thr
Pro
Gly
Leu
Ala
Vai
Ala
Leu
Ala
110
Gly
115
Arg
120
Vai
Gly
Leu
Vai
125
Gly
Pro
Vai
Asn
Pro
130
Ala
Ala
Cys
Arg
Pro
135
Ala
Glu
Leu
Leu
Ala
140
Asp
Asn
Pro
Gly
Ala
Leu
Vai
Pro
145
Trp
150
Gly
Cys
Pro
Trp
Thr
155
Gln
Ala
Glu
Gly
Thr
160
- 94 035893
Thr Ala Pro Cys Vai Thr Pro Ala 165
Ala Asp Ala Leu Tyr Ala Leu Leu
170 175
Arg Ala Phe Gly Trp Ala Arg Vai 180
Ala Leu Vai Thr Ala Pro Gln Asp 185 190
Leu Trp Vai Glu Ala Gly Arg Ser
195 200
Leu Ser Thr Ala Leu Arg Ala Arg 205
Gly Leu Pro Vai Ala Ser Vai Thr
210 215
Ser Met Glu Pro Leu Asp Leu Ser 220
Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Lys 225 230
Vai Arg Asp Gly Pro Arg Vai Thr
235 240
Ala Vai He Met Vai Met His Ser
245
Vai Leu Leu Gly Gly Glu Glu Gln
250 255
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu 260
Glu Leu Gly Leu Thr Asp Gly Ser 265 270
Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr
275 280
He His Tyr Ala Leu Ser Pro Gly 285
Pro Glu Ala Leu Ala Ala Leu Ala
290 295
Asn Ser Ser Gln Leu Arg Arg Ala 300
His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr 305 310
Arg His Cys Pro Ser Glu Gly Ser
315 320
Vai Leu Asp Ser Leu Arg Arg Ala
325
Gln Glu Arg Arg Glu Leu Pro Ser
330 335
Asp Leu Asn Leu Gln Gln Vai Ser 340
Pro Leu Phe Gly Thr He Tyr Asp 345 350
Ala Vai Phe Leu Leu Ala Arg Gly
355 360
Vai Ala Glu Ala Trp Ala Ala Ala 365
Gly Gly Arg Trp Vai Ser Gly Ala
370 375
Ala Vai Ala Arg His He Arg Asp 380
Ala Gln Vai Pro Gly Phe Cys Gly 385 390
Asp Leu Gly Gly Asp Gly Glu Pro
395 400
Pro Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp
405
Ala Ala Gly Asp Arg Leu Phe Ala
410 415
- 95 035893
Thr Tyr Met Leu Asp Pro Ala Arg 420
Gly Ser Phe Leu Ser Ala Gly Thr 425 430
Arg Met His Phe Pro Arg Gly Gly
435 440
Ser Ala Pro Gly Pro Asp Pro Ser 445
Cys Trp Phe Asp Pro Asn Asn He
450 455
Cys Gly Gly Gly Leu Glu Pro Gly 460
Leu Vai Phe Leu Gly Phe Leu Leu 465 470
Vai Vai Gly Met Gly Leu Ala Gly
475 480
Ala Phe Leu Ala His Tyr Vai Arg 485
His Arg Leu Leu His He Gln Met
490 495
Vai Ser Gly Pro Asn Lys He He 500
Leu Thr Vai Asn Asp He Thr Phe 505 510
Leu His Pro His Gly Gly Thr Ser
515 520
Arg Lys Vai Ala Gln Gly Ser Arg 525
Ser Ser Leu Ala Ala Arg Ser Met
530 535
Ser Asp He Arg Ser Gly Pro Ser 540
Gln Pro Leu Asp Ser Pro Asn Vai 545 550
Gly Vai Tyr Glu Gly Asp Arg Vai
555 560
Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Asp 565
Gln His He Ala He Arg Pro Ala
570 575
Thr Lys Thr Ala Phe Ser Lys Leu 580
Gln Glu Leu Arg His Glu Asn Vai 585 590
Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu
595 600
Ala Arg Gly Ala Glu Gly Pro Ala 605
Ala Leu Trp Glu Gly Asn Leu Ala
610 615
Vai Vai Ser Glu His Cys Thr Arg 620
Gly Ser Leu Gln Asp Leu Leu Ser 625 630
Gln Arg Glu He Lys Leu Asp Trp
635 640
Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu 645
Asp Leu He Lys Gly He Arg Tyr 650 655
Leu His His Arg Gly Vai Ala His
660
Gly Arg Leu Lys Ser Arg Asn Cys
665 670
- 96 035893 lie Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu Lys 675 680 lie Thr Asp His Gly His Gly 685
Arg Leu Leu Glu Ala Gln Lys Vai
690 695
Leu Pro Glu Pro Pro Arg Ala Glu 700
Asp Gln Leu Trp Thr Ala Pro Glu 705 710
Leu Leu Arg Asp Pro Ala Leu Glu
715 720
Arg Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp 725
Vai Phe Ser Leu Ala lie lie Met
730 735
Gln Glu Vai Vai Cys Arg Ser Ala 740
Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu Thr 745 750
Pro Glu Glu Vai Vai Gln Arg Vai
755 760
Arg Ser Pro Pro Pro Leu Cys Arg
765
Pro Leu Vai Ser Met Asp Gln Ala
770 775
Pro Vai Glu Cys lie His Leu Met 780
Lys Gln Cys Trp Ala Glu Gln Pro 785 790
Glu Leu Arg Pro Ser Met Asp His
795 800
Thr Phe Asp Leu Phe Lys Asn lie 805
Asn Lys Gly Arg Lys Thr Asn lie
810 815 lie Asp Ser Met Leu Arg Met Leu 820
Glu Gln Tyr Ser Ser Asn Leu Glu 825 830
Asp Leu lie Arg Glu Arg Thr Glu
835 840
Glu Leu Glu Leu Glu Lys Gln Lys 845
Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gln Met
850 855
Leu Pro Pro Ser Vai Ala Glu Ala
860
Leu Lys Thr Gly Thr Pro Vai Glu 865 870
Pro Glu Tyr Phe Glu Gln Vai Thr
875 880
Leu Tyr Phe Ser Asp lie Vai Gly 885
Phe Thr Thr lie Ser Ala Met Ser
890 895
Glu Pro lie Glu Vai Vai Asp Leu
900
Leu Asn Asp Leu Tyr Thr Leu Phe
905 910
Asp Ala lie lie Gly Ser His Asp
915 920
Vai Tyr Lys Vai Glu Thr lie Gly 925
- 97 035893
Asp
Ala
930
Tyr
Met
Val
Ala
Gly
Leu
Pro
Gin
935
Arg
940
Asn
Gly
Gin
Arg
His
945
Ala
Ala
Glu
Ala
950
Asn
Met
Leu
Asp 955
Leu
Ala
Val
960
Gly
Thr
Phe
Arg
Met
965
Arg
His
Met
Pro
Glu
970
Val
Pro
Val
Arg
975
Arg
Gly
Leu
His
980
Gly
Pro
Cys
Val
985
Ala
Gly
Val
Val
Gly 990
Leu
Thr
Met
Pro
Arg 995
Tyr
Cys
Leu
Phe
Gly 1000
Asp Thr Val Asn Thr Ala Ser Arg 1005
Met
Glu
1010
Thr
Gly
Leu
Pro
1015
Tyr
Arg
His
Val
1020
Asn
Leu
Thr
Val
1025
Gly
Leu
Arg
Ala
1030
Leu
Asp
Gly
Tyr 1035
Gin
Val
Glu
Leu
Arg 1040
Gly
Arg
Thr
Glu
Leu
1045
Lys
Gly
Lys
Gly
Ala
1050
Glu
Asp
Thr
Phe
Trp 1055
Leu
Val
Gly
Arg
Arg 1060
Gly
Phe
Asn
Lys
Pro
1065
Pro
Lys
Pro
Pro
1070
Asp
Leu
Gin
Pro
Gly 1075
Asn
His
Gly 1080
Leu
Gin
Glu
1085
Pro
Pro
Glu
Arg 1090
Arg
Arg
Lys
Leu
Glu
1095
Lys
Ala
Arg
Pro
Gly 1100
Gin
Phe <211>
<212>
<213>
1103
БЕЛОК
Callithrix jacchus
Met Thr Ala 1
Cys
Ala Arg Arg 5
Ala
Gly
Gly 10
Leu
Pro Asp
Pro
Gly Leu 15
Cys Gly Pro
Ala 20
Arg Trp Ala
Pro
Ala 25
Leu
Arg Leu
Pro
Arg Ala
- 98 035893
Leu Pro Arg Leu Pro Leu Leu Leu
40
Leu Leu Leu Leu Leu Gln Pro Pro
Ala Leu Ser Ala Gln Phe Thr Vai
55
Gly Vai Leu Gly Pro Trp Ala Cys 60
Asp Pro lie Phe Ser Arg Ala Arg 65 70
Pro Asp Leu Ala Ala Arg Leu Ala
80
Ala Ala Arg Leu Asn Arg Asp Pro 85
Ser Leu Ala Gly Gly Pro Arg Phe 90 95
Glu Vai Ala Leu Leu Pro Glu Pro
100
Cys Arg Thr Pro Gly Ser Leu Gly 105 110
Ala Vai Ser Ser Ala Leu Ala Arg
115 120
Vai Ser Gly Leu Vai Gly Pro Vai
125
Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro Ala
130 135
Glu Leu Leu Ala Glu Glu Ala Gly 140 lie Ala Leu Vai Pro Trp Gly Cys 145 150
Pro Gly Thr Gln Ala Ala Gly Thr
155 160
Thr Ala Pro Vai Vai Thr Pro Ala
165
Ala Asp Ala Leu Tyr Ala Leu Leu
170 175
Arg Ala Phe Gly Trp Ala Arg Vai 180
Ala Leu Vai Thr Ala Pro Gln Asp 185 190
Leu Trp Vai Glu Ala Gly Leu Ser
195 200
Leu Ser Thr Ala Leu Arg Ala Arg 205
Gly Leu Pro Vai Vai Ser Vai Thr
210 215
Ser Met Glu Pro Leu Asp Leu Ser 220
Gly Ala Arg Glu Ala Leu Arg Lys 225 230
Vai Arg Asn Gly Pro Arg Vai Thr
235 240
Ala Vai lie Met Vai Met His Ser
245
Vai Leu Leu Gly Gly Glu Glu Gln
250 255
Arg Tyr Leu Leu Glu Ala Ala Glu 260
Glu Leu Gly Leu Thr Asp Gly Ser 265 270
Leu Vai Phe Leu Pro Phe Asp Thr
275 280 lie His Tyr Ala Leu Ser Pro Gly 285
- 99 035893
Arg Glu Ala Leu Ala Ala Leu Vai Asn Ser Ser Gin Leu Arg Arg Ala
290 295300
His Asp Ala Vai Leu Thr Leu Thr Arg His Cys Ser Ser Glu Gly Ser
305 310 315320
Vai Leu Asp Ser Leu Arg Lys Ala Gin Gin Arg Arg Glu Leu Pro Ser
325 330335
Asp Leu Asn Leu Glu Gin Vai Ser Pro Leu Phe Gly Thr He Tyr Asp 340 345350
Ala Vai Vai Leu Leu Ala Arg Gly Vai Ala Asp Ala Arg Ala Ala Vai
355 360365
Gly Gly Arg Trp Vai Ser Gly Ala Ala Vai Ala Arg His Vai Trp Asp
370 375380
Ala Gin Ala Ser Gly Phe Cys Gly Asp Leu Gly Arg Asp Glu Glu Pro
385 390 395400
Ser Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp Ala Ala Gly Asp Gin Leu Phe Ala
405 410415
Thr Tyr Met Leu Asp Pro Ala Arg Gly Ser Leu Leu Ser Ala Gly Thr 420 425430
Pro Met His Phe Pro Arg Gly Gly Pro Ala Pro Gly Pro Asp Pro Ser
435 440445
Cys Trp Phe Asp Pro Asn Asn He Cys Asp Gly Gly Leu Glu Pro Gly
450 455460
Phe He Phe Leu Gly Phe Leu Leu Vai Vai Gly Met Gly Leu Ala Gly
465 470 475480
Ala Leu Leu Ala His Tyr Vai Arg His Gin Leu Leu His lie Gin Met
485 490495
Vai Ser Gly Pro Asn Lys He He Leu Thr Vai Asp Asp He Thr Phe 500 505510
Leu His Pro His Gly Gly Ala Ser Arg Lys Vai Ala Gin Gly Ser Arg
515 520525
Ser Ser Leu Ala Ala His Ser Thr Ser Asp He Arg Ser Gly Pro Ser
530 535540
- 100 035893
Gln Pro Ser Asp Ser Pro Asn He 545 550
Gly Vai Tyr Glu Gly Asp Arg Vai
555 560
Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Glu 565
Gln His He Ala He Arg Pro Ala
570 575
Thr Lys Thr Ala Phe Ser Lys Leu 580
Gln Glu Leu Arg His Glu Asn Vai 585 590
Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu
595 600
Ala Gln Gly Ala Glu Gly Pro Ala 605
Ala Leu Trp Glu Gly Asn Leu Ala
610 615
Vai Vai Ser Glu His Cys Thr Arg 620
Gly Ser Leu Gln Asp Leu Leu Ala
625 630
Gln Arg Glu lie Lys Leu Asp Trp
635 640
Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu 645
Asp Leu He Lys Gly He Arg Tyr 650 655
Leu His His Arg Gly Vai Ala His 660
Gly Arg Leu Lys Ser Arg Asn Cys 665 670
He Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu
675 680
Lys He Thr Asp His Gly His Gly 685
Arg Leu Leu Glu Ala Gln Lys Vai
690 695
Leu Pro Glu Pro Pro Lys Ala Glu 700
Asp Gln Leu Trp Thr Ala Pro Glu 705 710
Leu Leu Arg Asp Pro Ala Leu Glu
715 720
Arg Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp 725
Vai Phe Ser Leu Gly He He Met 730 735
Gln Glu Vai Vai Cys Arg Ser Ala 740
Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu Thr 745 750
Pro Asp Glu Vai Vai Gln Arg Vai
755 760
Arg Ser Pro Pro Pro Leu Cys Arg 765
Pro Phe Vai Ser Met Asp Gln Ala
770 775
Pro Vai Glu Cys He His Leu Met
780
Lys Gln Cys Trp Ala Glu Gln Pro 785 790
Glu Leu Arg Pro Ser Met Asp Leu
795 800
- 101 035893
Thr Phe Asp Leu Phe Lys Asn He Asn Lys Gly Arg Lys Thr Asn He
805 810815
He Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gln Tyr Ser Ser Asn Leu Glu 820 825830
Asp Leu He Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu Leu Glu Lys Gln Lys 835 840845
Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gln Met Leu Pro Pro Ser Vai Ala Glu Ala 850 855860
Leu Lys Thr Gly Thr Pro Vai Glu Pro Glu Tyr Phe Glu Gln Vai Thr 865 870 875880
Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai Gly Phe Thr Thr He Ser Ala Met Ser
885 890895
Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp Leu Tyr Thr Leu Phe 900 905910
Asp Ala He He Gly Ser His Asp Vai Tyr Lys Vai Glu Thr He Gly 915 920925
Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro Gln Arg Asn Gly Gln Arg
930 935940
His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ser Leu Asp He Leu Ser Ala Vai
945 950 955960
Gly Thr Phe Arg Met Arg His Met Pro Glu Vai Pro Vai Arg He Arg
965 970975
He Gly Leu His Ser Gly Pro Cys Vai Ala Gly Vai Vai Gly Leu Thr 980 985990
Met Pro Arg Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn Thr Ala Ser Arg 995 10001005
Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg lie His Vai Asn Leu Ser 1010 10151020
Thr Vai Gly He Leu Arg Ala Leu Asp Ser Gly Tyr Gln Vai Glu 1025 10301035
Leu Arg Gly Arg Thr Glu Leu Lys Gly Lys Gly Ala Glu Asp Thr 1040 10451050
- 102 035893
Phe Trp 1055 Leu Vai Gly Arg Arg 1060 Gly Phe Asn Lys Pro 1065 Ile Pro Lys
Pro Pro 1070 Asp Leu Gln Pro Gly 1075 Ala Ser Asn His Gly 1080 lie Ser Leu
Gln Glu 1085 lie Pro Pro Glu Arg 1090 Arg Arg Lys Leu Glu 1095 Lys Ala Arg
Pro Gly Gln Phe Ser 1100 <210> 9 <211> 1012 <212> БЕЛОК <213> Ailuropoda melanoleuca <220>
<221> raise feature <222> (80)7.(88) <223> Xaa может быть любой образующейся в природе <220>
<221> raise feature <222> (964?..(971) <223> Хаа может быть любой образующейся в природе <400> 9
Met Arg Ala Cys 1
Ala Leu Leu Ala 5
Gly Gly Leu Pro 10
Tyr Pro Arg Leu
Cys Ala Pro Thr 20
Arg Trp Ala Pro
Ala Arg Pro Gly 25
Vai Ser Arg Ala 30
Leu Pro Trp Pro 35
Arg Pro Arg Leu 40
Arg Leu Leu Leu
Leu Leu Leu Leu 45
Arg Pro Pro Ser 50
Vai Leu Ser Ala
Vai Phe Thr Vai
Gly Vai Leu Gly
Pro Trp Ala Cys 65
Asp Pro lie Phe 70
Ala Arg Ala Arg 75
Pro Asp Leu Xaa
Xaa Xaa Xaa Xaa
Xaa Xaa Xaa Xaa 85
Asp Ala Leu Tyr 90
Vai Leu Leu Arg 95
Ala Phe Arg Trp
100
Ala Arg Vai Ala
Leu Vai Thr Ala 105
Pro Gln Asp Leu
110
- 103 035893
Trp Vai Glu Ala Gly 115
Arg Ala Leu Ser Ala Ala 120
Leu Arg Ala Arg Gly 125
Leu Pro Vai Ala Leu
130
Vai Thr Thr Met Glu Pro
135
Ser Asp Leu Ser Gly 140
Ala Arg Glu Ala Leu 145
Arg Arg Vai Gin His Gly
150 155
Pro Arg Vai Ser Ala
160
Vai He Met Vai Met
165
His Ser Vai Leu Leu Gly 170
Gly Glu Glu Gin Arg 175
Cys Leu Leu Gin Ala 180
Ala Glu Glu Leu Gly Leu 185
Ala Asp Gly Ser Leu 190
Vai Phe Leu Pro Phe
195
Asp Thr Leu His Tyr Ala 200
Leu Ser Pro Gly Pro 205
Glu Ala Leu Ala Ala
210
Leu Ala Asn Ser Ser Gin
215
Leu Arg Arg Ala His 220
Asp Ala Vai Leu Thr 225
Leu Thr Arg His Cys Pro
230 235
Pro Gly Gly Ser Vai
240
Met Asp Ser Leu Arg
245
Arg Ala Gin Glu Arg Gin
250
Glu Leu Pro Ser Asp 255
Leu Asn Leu Glu Gin
260
Vai Ser Pro Leu Phe Gly 265
Thr He Tyr Asp Ala 270
Vai Phe Leu Leu Ala
275
Gly Gly Vai Ala Arg Ala 280
Arg Ala Ala Ala Ala 285
Asp Ser Arg Vai Pro 290
Gly Phe Cys Gly Ala Leu 295
Gly Gly Ala Glu Glu 300
Pro Pro Phe Vai Leu 305
Leu Asp Thr Asp Ala Ala
310 315
Gly Asp Arg Phe Phe
320
Ala Thr Tyr Vai Leu
325
Asp Pro Thr Arg Gly Ser
330
Leu His Ser Ala Gly 335
Thr Pro Vai His Phe
340
Pro Arg Gly Gly Gly Ala 345
Pro Gly Pro Asp Pro 350
Ser Cys Trp Phe Glu 355
Pro Asp Ser lie Cys Asn 360
Gly Gly Vai Glu Pro 365
- 104 035893
Gly Leu Vai Phe Thr 370
Gly Phe Leu Leu Vai Vai 375
Gly Met Gly Leu Met 380
Gly Ala Phe Leu Ala 385
His Tyr Vai Arg His Arg
390 395
Leu Leu His lie Gln
400
Met Vai Ser Gly Pro
405
Asn Lys lie lie Leu Thr 410
Leu Asp Asp lie Thr 415
Phe Leu His Pro Gln
420
Gly Gly Ser Ala Arg Lys 425
Vai Vai Gln Gly Ser 430
Arg Ser Ser Leu Ala 435
Ala Arg Ser Thr Ser Asp 440
Vai Arg Ser Vai Pro 445
Ser Gln Pro Ser Asp 450
Gly Gly Asn lie Gly Leu 455
Tyr Glu Gly Asp Trp 460
Vai Trp Leu Lys Lys 465
Phe Pro Gly Ser Gln His
470 475 lie Ala lie Arg Pro 480
Ala Thr Lys Thr Ala
485
Phe Ser Lys Leu Arg Glu 490
Leu Arg His Glu Asn 495
Vai Ala Leu Tyr Leu
500
Gly Leu Phe Leu Gly Gly 505
Gly Glu Gly Gly Ser 510
Ala Ala Ala Gly Gly 515
Gly Met Leu Ala Vai Vai 520
Ser Glu His Cys Thr 525
Arg Gly Ser Leu His 530
Asp Leu Leu Ala Gln Arg 535
Asp lie Lys Leu Asp 540
Trp Met Phe Lys Ser 545
Ser Leu Leu Leu Asp Leu
550 555 lie Lys Gly Met Arg 560
Tyr Leu His His Arg
565
Gly Vai Ala His Gly Arg
570
Leu Lys Ser Arg Asn
575
Cys Vai Vai Asp Gly
580
Arg Phe Vai Leu Lys Vai 585
Thr Asp His Gly His 590
Gly Arg Leu Leu Glu 595
Ala Gln Lys Vai Leu Ala 600
Glu Pro Pro Ser Ala
605
Glu Asp Gln Leu Trp 610
Thr Ala Pro Glu Leu Leu
615
Arg Asp Pro Ala Leu 620
- 105 035893
Glu Arg Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp Vai 625 630
Met Gln Glu Vai Vai
645
Phe Ser Leu Gly He He
635 640
Cys Arg Ser Ser Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu
650 655
Ser Ala Arg Glu Vai Vai Gln Arg 660
Vai Arg Ser Pro Pro Pro Leu Cys 665 670
Arg Pro Ser Vai Ser Vai Asp Gln
675 680
Ala Pro Ala Glu Cys He Gln Leu 685
Met Lys Gln Cys Trp Ala Glu Gln
690 695
Pro Glu Leu Arg Pro Ser Leu Asp
700
Arg Thr Phe Asp Gln Phe Lys Ser 705 710
He Asn Lys Gly Arg Lys Thr Asn
715 720
He He Asp Ser Met Leu Arg Met 725
Leu Glu Gln Tyr Ser Ser Asn Leu
730 735
Glu Gly Leu He Arg Glu Arg Thr 740
Glu Glu Leu Glu Leu Glu Lys Arg 745 750
Lys Thr Asp Arg Leu Arg Ala Ala
755 760
Ser Leu Pro Ser Ser Vai Ala Glu
765
Ala Leu Lys Met Gly Thr Pro Vai
770 775
Glu Pro Glu Tyr Phe Glu Glu Vai 780
Thr Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai 785 790
Gly Phe Thr Thr He Ser Ala Met
795 800
Ser Glu Pro He Glu Vai Vai Asp 805
Leu Leu Asn Asp Leu Tyr Thr Leu
810 815
Phe Asp Ala lie lie Gly Ser His 820
Asp Vai Tyr Lys Vai Glu Thr lie 825 830
Gly Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser
835 840
Gly Leu Pro Gln Arg Asn Gly Gln 845
Arg His Ala Ala Glu He Ala Asn
850 855
Met Ala Leu Asp He Leu Ser Ala 860
Vai Gly Ser Phe Arg Met Arg His 865 870
Met Pro Glu Vai Pro Vai Arg He
875 880
- 106 035893
Arg
Gly
Leu
His
885
Gly
Cys
Val
890
Ala
Gly
Val
Val
Gly 895
Leu
Thr
Met
Arg 900
Tyr
Cys
Leu
Phe
Gly 905
Asp
Thr
Val
Thr
910
Ala
Arg
Met
Thr
915
Gly
Leu
920
Tyr
Arg
His
Val
925
Met
Thr
Val
930
Arg
Leu
Arg
Ala
935
Leu
Asp
Gly
Phe
940
Thr
Val
Arg 945
Gly
Arg
Thr
Leu
950
Lys
Gly
Lys
Gly
Ala
955
Asp
Thr
Tyr
Trp
960
Leu
Val
Gly
Xaa
Xaa
965
Xaa
Xaa
Xaa
Xaa
Xaa
970
Xaa
Lys 975
Asp
Leu
980
Gly
Ala
His
985
Gly
Leu
990 lie Pro Leu Asp Arg Arg Gin Lys Leu Glu Lys Ala Arg Pro Gly Gin 995 10001005
Phe Ser Gly Lys
1010 <210>10 <211>1093 <212> БЕЛОК <213> Monodelphis domestica <400>10
Met Leu Val Pro Ser lie Asn Gly 1 5
Leu Phe His His Pro Pro Trp Cys 10 15
Phe Pro Pro Leu Pro Leu Pro Leu
Phe Phe Leu Phe Leu Leu Leu Leu
30
Leu Pro Val Pro Val Leu Pro Ala
40
Thr Phe Thr He Gly Val Leu Gly 45
Pro Trp Ser Cys Asp Pro lie Phe 50 55
Ser Arg Ala Arg Pro Asp Leu Ala 60
Ala Arg Leu Ala Ala Thr Arg Met 65 70
Asn His Asp Gin Ala Leu Glu Gly
80
Gly Pro Trp Phe Glu Val lie Leu
Leu Pro Glu Pro Cys Arg Thr Ser
- 107 035893
95
Gly Ser Leu Gly Ala Leu Ser Pro
100
Ser Leu Ala Arg Val Ser Gly Leu
105 110
Val Gly Pro Val Asn Pro Ala Ala
115 120
Cys His Pro Ala Glu Leu Leu Ala 125
Gin Glu Ala Gly Val Pro Leu Val
130 135
Pro Trp Gly Cys Pro Gin Gly Lys 140
Ala Arg Thr Thr Ala Pro Ala Leu 145 150
Pro Leu Ala Leu Asp Ala Leu Tyr
155 160
Ala Leu Leu Arg Ala Phe His Trp 165
Ala Lys Val Ala Leu He Thr Ala
170 175
Pro Gin Asp Leu Trp Val Glu Ala 180
Gly Gin Ala Leu Ala Gly Gly Leu 185 190
Arg Ser Arg Gly Leu Pro Val Ala
195 200
Met Val Thr Ser Leu Glu Thr Thr
205
Asp Leu Glu Ser Ala Lys Asn Ala
210 215
Leu Lys Arg Val Arg Asp Gly Pro 220
Lys Val Lys Val Leu He Met Val 225 230
Met His Ser Val Leu Leu Gly Gly
235 240
Glu Glu Gin Arg Leu Leu Leu Glu 245
Ala Ala Glu Glu Leu Gly Leu Val
250 255
Glu Gly Thr Met Val Phe Leu Pro 260
Phe Asp Thr Leu His Tyr Ala Leu 265 270
Pro Pro Gly Pro Glu Ala Leu Arg
275 280
Pro He Thr Asn Ser Ser Arg Leu
285
Arg Lys Ala His Asp Ala Val Leu
290 295
Thr Leu Thr Arg Tyr Cys Pro Lys 300
Gly Ser Val Ser Ala Ser Leu Arg 305 310
Gin Ala Gin Glu His Arg Glu Leu
315 320
Pro Leu Asp Leu Lys Pro Gin Gin 325
Val Ser Pro Leu Phe Gly Thr He 330 335
Tyr Asp Ala He Tyr Leu Leu Ala
Gly Ala Val Ala Gly Ala Gin Val
- 108 035893
340 345350
Ala Gly Gly Gly Gly Trp Vai Ser Gly Ala Ala Vai Ala Arg His He 355 360365
Pro Asn Thr Leu Vai Ser Gly Phe Cys Gly Asp Leu Gly Gly Thr Lys
370 375380
Glu Pro Pro Phe Vai Leu Leu Asp Thr Asp Gly Met Arg Asp Gln Leu
385 390 395400
Leu Pro Thr Tyr Thr Leu Asp Pro Ala Gln Gly Vai Leu His His Ala
405 410415
Gly Asn Pro He His Phe Pro His Gly Gly Gln Gly Pro Gly Pro Asp 420 425430
Pro Pro Cys Trp Phe Asp Pro Asn Vai He Cys Ser Gly Gly He Glu
435 440445
Pro Arg Phe He Leu Leu Vai He Leu He He He Gly Gly Gly Leu
450 455460
Vai Vai Ala Thr Leu Ala Tyr Tyr Vai Arg Arg Gln Leu Leu His Ala
465 470 475480
Gln Met Vai Ser Gly Pro Asn Lys Met He Leu Thr Leu Glu Asp He 485 490495
Thr Phe Phe Pro Arg Gln Gly Ser Ser Ser Arg Lys Ala Thr Glu Gly 500 505510
Ser Arg Ser Ser Leu He Ala His Ser Ala Ser Asp Met Arg Ser He
515 520525
Pro Ser Gln Pro Pro Asp Asn Ser Asn He Gly Met Tyr Glu Gly Asp
530 535540
Trp Vai Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Glu His Tyr Thr Glu He Arg 545 550 555560
Pro Ala Thr Lys Met Ala Phe Ser Lys Leu Arg Glu Leu Arg His Glu
565 570575
Asn Vai Ala Vai Gln Met Gly Leu Phe Leu Ala Gly Ser Met Glu Gly
580 585590
Ala Ala Ala Gly Gly Leu Gly Gly Gly He Leu Ala Vai Vai Ser Glu
- 109 035893
595 600605
Tyr Cys Ser Arg Gly Ser Leu Gln Asp Leu Leu He Gln Arg Asp He 610 615620
Lys Leu Asp Trp Met Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu He Lys
625 630 635640
Gly Leu Arg Tyr Leu His His Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu Lys
645 650655
Ser Arg Asn Cys Vai Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu Lys He Thr Asp 660 665670
His Ala His Gly Arg Leu Leu Glu Ala Gln Arg Vai Ser Leu Glu Pro
675 680685
Pro Gln Ala Glu Asp Arg Leu Trp Thr Ala Pro Glu Leu Leu Arg Asn
690 695700
Glu Ala Leu Glu Arg Gln Gly Thr Leu Gln Gly Asp Vai Phe Ser Vai
705 710 715720
Gly He He Met Gln Glu Vai Vai Cys Arg Cys Glu Pro Tyr Ala Met
725 730735
Leu Glu Leu Thr Pro Glu Glu He He Gln Lys Vai Gln Ser Pro Pro 740 745750
Pro Met Cys Arg Pro Ser Vai Ser Vai Asp Gln Ala Pro Met Glu Cys
755 760765
He Gln Leu Met Lys Gln Cys Trp Ala Glu Gln Pro Asp Leu Arg Pro
770 775780
Asn Met Asp Thr Thr Phe Asp Leu Phe Lys Asn He Asn Lys Gly Arg
785 790 795800
Lys Thr Asn He He Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu Gln Tyr Ser
805 810815
Ser Asn Leu Glu Asp Leu He Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu Leu 820 825830
Glu Lys Gln Lys Thr Asp Lys Leu Leu Thr Gln Met Leu Pro Pro Ser 835 840845
Vai Ala Glu Ala Leu Lys Leu Gly He Pro Vai Glu Pro Glu Tyr Phe
- 110 035893
Glu Glu Vai Thr Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai Gly Phe Thr Thr lie
865 870 875880
Ser Ala Met Ser Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn Asp Leu
885 890895
Tyr Thr Leu Phe Asp Ala He He Gly Ser His Asp Vai Tyr Lys Vai 900 905910
Glu Thr He Gly Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro Lys Arg
915 920925
Asn Gly Gin Arg His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ser Leu Asp He 930 935940
Leu Ser Ser Vai Gly Ser Phe Arg Met Arg His Met Pro Glu Vai Pro
945 950 955960
Vai Arg He Arg He Gly Leu His Ser Gly Pro Cys Vai Ala Gly Vai
965 970975
Vai Gly Leu Thr Met Pro Arg Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Vai Asn 980 985990
Thr Ala Ser Arg Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg He His V 995 10001005
Asn Leu Ser Thr Vai Lys He Leu Gin Gly Leu Asn Glu Gly Phe
1010 10151020
Gin He Glu He Arg Gly Arg Thr Glu Leu Lys Gly Lys Gly Vai 1025 10301035
Glu Asp Thr Tyr Trp Leu Vai Gly Arg Lys Gly Phe Asp Lys Pro 1040 10451050
He Pro He Pro Pro Asp Leu Leu Pro Gly Ala Ser Asn His Gly 1055 10601065
He Ser Leu Gin Glu He Pro Glu Asp Arg Arg Lys Lys Leu Glu 1070 10751080
Lys Ala Arg Pro Gly Gin Pro Leu Gly Lys 10851090 <210>11 <2H>862 <212> БЕЛОК <213> Equus caballus <400>11
111 035893
Met Vai Met His Ser Vai Leu Leu
5
Gly Gly Glu Glu Gln Arg Cys Leu
15
Leu Glu Ala Ala Glu Glu Leu Gly 20
Leu Ala Asp Gly Ser Leu Vai Phe 25 30
Leu Pro Phe Asp Thr Leu His Tyr 35 40
Ala Leu Ser Pro Gly Pro Glu Ala 45
Leu Ala Vai Leu Ala Asn Asn Ser
55
Gln Leu Arg Arg Ala His Asp Ala 60
Vai Leu Thr Leu Thr Arg His Cys 65 70
Pro Leu Gly Gly Ser Vai Leu Asp
80
Ser Leu Arg Arg Ala Gln Glu His 85
Gln Glu Leu Pro Ser Asp Leu Asn 90 95
Leu Gln Gln Vai Ser Pro Leu Phe
100
Gly Thr He Tyr Asp Ala Vai Tyr 105 110
Leu Leu Ala Gly Gly Vai Ala Arg
115 120
Ala Arg Ala Ala Ala Gly Gly Ser 125
Trp Vai Ser Gly Ala Ala Vai Ala
130 135
His His Vai Arg Asp Ala Gln Vai 140
Pro Gly Phe Cys Gly Ala Leu Gly 145 150
Gly Ala Glu Glu Pro Gln Phe Vai
155 160
Leu Leu Asp Thr Asp Ala Ala Gly 165
Asp Arg Leu Phe Ala Thr Tyr Met
170 175
Leu Asp Pro Thr Arg Gly Ser Leu 180
Trp Ser Ala Gly Thr Pro Vai His 185 190
Phe Pro Arg Gly Gly Arg Gly Pro
195 200
Gly Pro Asp Pro Trp Cys Trp Phe 205
Asp Pro Asp Asp He Cys Asn Gly
210 215
Gly Vai Glu Pro Arg Leu Vai Phe 220
He Gly Phe Leu Leu Ala Vai Gly 225 230
Met Gly Leu Ala Gly Vai Phe Leu
235 240
- 112 035893
Ala His Tyr Vai Arg His Arg Leu Leu His
245 250 lie Gln Met Ala
Ser Gly 255
Pro Asn Lys lie lie Leu Thr Leu Asp Asp
260 265 lie Thr Phe Leu His
270
Pro
Gln Gly Gly Ser Ser Arg Lys Vai
275 280 lie Gln Gly Ser Arg Ser Ser Leu 285
Ala Ala Arg Ser Vai 290
Ser Asp lie Arg Ser Vai Pro Ser Gln Pro Met
295 300
Asp Ser Ser Asn lie Gly Leu Tyr 305 310
Glu Gly Asp Trp Vai Trp Leu Lys
315 320
Lys Phe Pro Gly Asp Gln His lie 325
Ala lie Arg Pro Ala Thr Lys Thr
330 335
Ala Phe Ser Lys Leu Arg Glu Leu 340
Arg His Glu Asn Vai Ala Leu Tyr 345 350
Leu Gly Leu Phe Leu Ala Gly Gly
355 360
Ser Ser Gly Ala Ala Ala Pro Arg 365
Glu Gly Met Leu Ala Vai Vai Ser
370 375
Glu His Cys Ala Arg Gly Ser Leu 380
His Asp Leu Leu Ala Gln Arg Asp 385 390 lie Lys Leu Asp Trp Met Phe Lys
395 400
Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu lie 405
Lys Gly Met Arg Tyr Leu His His
410 415
Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu 420
Lys Ser Arg Asn Cys Vai Vai Asp 425 430
Gly Arg Phe Vai Leu Lys Vai Thr
435 440
Asp His Gly His Gly Arg Leu Leu 445
Glu Ala Gln Lys Vai Leu Pro Glu
450 455
Pro Pro Ser Ala Glu Asp Gln Leu 460
Trp Thr Ala Pro Glu Leu Leu Arg 465 470
Asp Pro Ala Leu Glu Arg Gln Gly
475 480
Thr Leu Ala Gly Asp Vai Phe Ser 485
Leu Gly lie lie lie Gln Glu Vai
490 495
- 113 035893
Val Cys Arg Ser Thr Pro Tyr Ala 500
Met Leu Glu Leu Thr Pro Glu Glu
505 510
Val Val Gln Arg Leu Gln Ser Pro
515 520
Pro Pro Leu Cys Arg Pro Ser Val 525
Ser Met Asp Gln Ala Pro Met Glu
530 535
Cys lie Gln Leu Met Lys Gln Cys 540
Trp Ala Glu Gln Pro Asp Leu Arg 545 550
Pro Ser Met Asp Arg Thr Phe Asp
555 560
Leu Phe Lys Ser lie Asn Lys Gly 565
Arg Lys Thr Asn lie lie Asp Ser
570 575
Met Leu Arg Met Leu Glu Gln Tyr 580
Ser Ser Asn Leu Glu Asp Leu lie 585 590
Arg Glu Arg Thr Glu Glu Leu Glu
595 600
Leu Glu Lys Gln Lys Thr Asp Arg 605
Leu Leu Thr Gln Met Leu Pro Pro
610 615
Ser Val Ala Glu Ala Leu Lys Met 620
Gly Thr Pro Val Glu Pro Glu Tyr 625 630
Phe Glu Glu Val Thr Leu Tyr Phe
635 640
Ser Asp lie Val Gly Phe Thr Thr 645 lie Ser Ala Met Ser Glu Pro lie
650 655
Glu Val Val Asp Leu Leu Asn Asp 660
Leu Tyr Thr Leu Phe Asp Ala lie 665 670 lie Gly Ser His Asp Val Tyr Lys
675 680
Val Glu Thr lie Gly Asp Ala Tyr 685
Met Val Ala Ser Gly Leu Pro Gln
690 695
Arg Asn Gly Gln Arg His Ala Ala 700
Glu lie Ala Asn Met Ala Leu Asp 705 710 lie Leu Ser Ala Val Gly Ser Phe
715 720
Arg Met Arg His Met Pro Glu Val 725
Pro Val Arg lie Arg lie Gly Leu
730 735
His Ser Gly Pro Cys Val Ala Gly 740
Val Val Gly Leu Thr Met Pro Arg 745 750
- 114 035893
Tyr Cys Leu Phe Gly Asp Thr Val Asn Thr Ala Ser Arg Met Glu Ser
755 760765
Thr Gly Leu Pro Tyr Arg lie His Val Asn Met Ser Thr Val Arg He
770 775780
Leu Arg Ala Leu Asp Glu Gly Phe Gin Val Glu Val Arg Gly Arg Thr
785 790 795800
Glu Leu Lys Gly Lys Gly Val Glu Asp Thr Tyr Trp Leu Val Gly Arg
805 810815
Arg Gly Phe Asn Lys Pro He Pro Lys Pro Pro Asp Leu Gin Pro Gly
820 825830
Ala Ser Asn His Gly lie Ser Leu Gin Glu lie Pro Pro Glu Arg Arg
835 840845
Gin Lys Leu Glu Lys Ala Arg Pro Gly Gin Phe Ser Gly Lys 850 855860 <210>12 <211> 292 <212> ДНК <213> Homo sapiens <400>12 gggccccaga agcctggtgg ttgtttgtcc ttctcagggg aaaagtgagg cggccccttg60 gaggaagggg ccgggcagaa tgatctaatc ggattccaag cagctcaggg gattgtcttt120 ttctagcacc ttcttgccac tcctaagcgt cctccgtgac cccggctggg atttagcctg180 gtgctgtgtc agccccggtc tcccaggggc ttcccagtgg tccccaggaa ccctcgacag240 ggcccggtct ctctcgtcca gcaagggcag ggacgggcca caggccaagg go292
953
ДНК
Искусственная последовательность
Гибридный промотор CDA/CMV <210>
<211>
<212>
<213>
<220>
<223>
<400>
aattcggtac cctagttatt aatagtaatc aattacgggg tcattagttc atagcccata60 tatggagttc cgcgttacat aacttacggt aaatggcccg cctggctgac cgcccaacga120 cccccgccca ttgacgtcaa taatgacgta tgttcccata gtaacgccaa tagggacttt180 ccattgacgt caatgggtgg actatttacg gtaaactgcc cacttggcag tacatcaagt240
- 115 035893 gtatcatatg ccaagtacgc cccctattga cgtcaatgac ggtaaatggc ccgcctggca300 ttatgcccag tacatgacct tatgggactt tcctacttgg cagtacatct acgtattagt360 catcgctatt accatggtcg aggtgagccc cacgttctgc ttcactctcc ccatctcccc420 cccctcccca cccccaattt tgtatttatt tattttttaa ttattttgtg cagcgatggg480 ggcggggggg gggggggggc gcgcgccagg cggggcgggg cggggcgagg ggcggggcgg540 ggcgaggcgg agaggtgcgg cggcagccaa tcagagcggc gcgctccgaa agtttccttt600 tatggcgagg cggcggcggc ggcggcccta taaaaagcga agcgcgcggc gggcgggagt660 cgctgcgacg ctgccttcgc cccgtgcccc gctccgccgc cgcctcgcgc cgcccgcccc720 ggctctgact gaccgcgtta ctcccacagg tgagcgggcg ggacggccct tctcctccgg780 gctgtaatta gcgcttggtt taatgacggc ttgtttcttt tctgtggctg cgtgaaagcc840 ttgaggggct ccgggagcta gagcctctgc taaccatgtt catgccttct tctttttcct900 acagctcctg ggcaacgtgc tggttattgt gctgtctcat cattttggca aag953 <210>14 <211> 36 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Прямой праймер <400>14 aaaagcggcc gcatgagcgc ttggctcctg ccagcc36 <210>15 <211> 36 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Обратный праймер <400>15 aaaagcggcc gctcacttcc cagtaaactg gcctgg36 <210>16 <211> 24 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Прямой праймер <400>16 gacccttcct gctggttcga tcca24 <210>17 <211> 25 <212> ДНК
- 116 035893 <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Обратный праймер <400>17 ctgcatgtgt agcagcctgt gcctc <210>18 <211>992 <212> БЕЛОК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Консенсусная последовательность <400> 18
Met Ser Ala Ala Gly Gly Leu Gly 1 5
Cys Pro Arg Ala Pro Ser He Pro 10 15
Arg Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu 20
Ser Leu Ser Ala Vai Phe Vai Gly 25 30
Vai Leu Gly Pro Trp Ala Cys Asp
40
Pro He Phe Ala Arg Ala Arg Pro 45
Asp He Ala Ala Arg Leu Ala Ala
55
Arg Leu Asn Ala Leu Asp Gly Gly 60
Pro Arg Phe Glu Vai Ala Leu Leu 65 70
Pro Glu Pro Cys Thr Pro Gly Ser 75 80
Leu Gly Ala Vai Ser Ser Ala Ser 85
Arg Vai Ser Gly Leu Vai Gly Pro 90 95
Vai Asn Pro Ala Ala Cys Arg Pro 100
Ala Glu Leu Leu Ala Gln Glu Ala
105 110
Gly Vai Ala Leu Vai Pro Trp Gly
115 120
Vai Pro Gly Thr Arg Ala Ala Gly
125
Thr Thr Ala Pro Vai Thr Pro Ala
130 135
Ala Asp Ala Leu Tyr Leu Leu Arg 140
Ala Phe Arg Trp Ala Vai Ala Leu 145 150 lie Thr Ala Pro Gln Asp Leu Trp
155 160
Vai Glu Ala Gly Ala Leu Ser Thr
165
Ala Leu Arg Ala Arg Gly Leu Pro
170 175
Vai Ala Leu Vai Thr Ser Met Glu
Vai Arg Vai He Met Vai Met Gly
- 117 035893
180 185190
Ser Val Leu Leu Gly Gly Glu Glu Gin Arg Leu Leu Glu Ala Ala Glu 195 200205
Glu Leu Ala Leu Asp Gly Ser Leu Val Phe Leu Pro Phe Asp Thr Leu
210 215220
His Trp Ala Leu Ser Pro Gly Pro Asp Ala He Ala Asn Ser Ser Gin
225 230 235240
Leu Arg Lys Ala His Asp Ala Val Leu Thr Leu Thr Arg Cys Pro Gly
245 250255
Gly Ser Val Asp Ser Leu Arg Arg Ala Gin Glu His Glu Leu Pro Leu 260 265270
Asp Leu Asn Leu Gin Val Ser Pro Leu Phe Gly Thr He Tyr Asp Ala 275 280285
Val Phe Leu Leu Ala Gly Gly Thr Ala Thr Ala Gly Gly Gly Trp Val
290 295300
Ser Gly Ala Ala Val Ala Arg He Arg Asp Ala Val Gly Phe Cys Gly 305 310 315320
Leu Gly Glu Glu Pro Ser Phe Val Leu He Asp Thr Asp Ala Ser Gly
325 330335
Asp Gin Leu Phe Ala Thr His Leu Leu Asp Pro Gly Ser Ala Gly Thr 340 345350
Pro Met His Phe Pro Lys Gly Gly Ala Pro Gly Pro Asp Pro Ser Cys
355 360365
Trp Phe Asp Pro Asp He Cys Asn Gly Gly Val Glu Pro Leu Val Phe
370 375380
He Gly Phe Leu Leu Val He Gly Met Gly Leu Gly Ala Phe Leu Ala
385 390 395400
Phe Leu Ala His Tyr Arg His Arg Leu Leu His He Gin Met Ser Gly
405 410415
Pro Asn Lys He He Leu Thr Leu Asp Asp He Thr Phe Leu His Pro 420 425430
Gly Gly Ser Arg Lys Val Gin Gly Ser Arg Ser Ser Leu Ala Arg Ser
- 118 035893
435 440445
Ser Asp He Arg Ser He Ser Gln Asp Thr Asn He Gly Leu Tyr Glu
450 455460
Gly Asp Trp Vai Trp Leu Lys Lys Phe Pro Gly Asp His He Ala He
465 470 475480
Arg Pro Ala Thr Lys Ala Phe Ser Lys He Arg Glu Leu Arg His Glu
485 490495
Asn Vai Ala Leu Tyr Leu Gly Leu Phe Leu Ala Gly Ala Gly Ala Pro 500 505510
Ala Pro Gly Glu Gly He Leu Ala Vai Vai Ser Glu His Cys Ala Arg
515 520525
Gly Ser Leu Asp Leu Leu Ala Gln Arg Asp He Lys Leu Asp Trp Met
530 535540
Phe Lys Ser Ser Leu Leu Leu Asp Leu He Lys Gly He Arg Tyr Leu
545 550 555560
His His Arg Gly Vai Ala His Gly Arg Leu Lys Ser Arg Asn Cys Vai
565 570575
Vai Asp Gly Arg Phe Vai Leu Lys Vai Thr Asp His Gly His Gly Arg 580 585590
Leu Leu Glu Ala Gln Arg Vai Leu Pro Glu Pro Pro Ser Ala Glu Asp 595 600605
Gln Leu Trp Thr Ala Pro Glu Leu Leu Arg Asp Pro Leu Glu Arg Arg
610 615620
Arg Gly Thr Leu Ala Gly Asp Vai Phe Ser Leu Ala He He Met Gln
625 630 635640
Glu Vai Vai Cys Arg Ser Pro Tyr Ala Met Leu Glu Leu Thr Pro Glu
645 650655
Glu Vai He Arg Vai Ser Pro Pro Pro Leu Cys Arg Pro Vai Ser He 660 665670
Asp Gln Ala Pro Met Glu Cys He Gln Leu Met Gln Vai Trp Ala Glu
675 680685
Pro Glu Leu Arg Pro Ser Met Asp Thr Phe Asp Leu Phe Lys Ser He
- 119 035893
690 695 700
Asn Lys Gly Arg Lys Asn He lie Asp Ser Met Leu Arg Met Leu Glu
705 710 715 720
Gin Tyr Ser Ser Asn Leu Glu Asp Leu He Arg Glu Arg Thr Glu Glu
725 730 735
Leu Glu Glu Glu Lys Gin Lys Thr Asp Arg Leu Leu Thr Gin Met Leu
740 745 750
Pro Pro Ser Vai Ala Glu Ala Leu Lys Met Gly Thr Vai Glu Pro Glu
755 760 765
Tyr Phe Glu Glu Vai Thr Leu Tyr Phe Ser Asp He Vai Gly Phe Thr
770 775 780
Thr He Ser Ala Met Ser Glu Pro He Glu Vai Vai Asp Leu Leu Asn
785 790 795 800
Asp Leu Tyr Thr Leu Phe Asp Ala lie lie Gly Ala His Asp Vai Tyr
805 810 815
Lys Vai Glu Thr He Gly Asp Ala Tyr Met Vai Ala Ser Gly Leu Pro
820 825 830
Gin Arg Asn Gly Arg His Ala Ala Glu He Ala Asn Met Ala Leu Asp
835 840 845 lie Leu Ser Ala Vai Gly Ser Phe Arg Phe Arg Met Arg His Met Pro 850 855 860
Glu Vai Pro Vai Arg He Arg He Gly Leu His
865 870 875
Ser Gly Pro Cys Vai
880
Ala Gly Vai Vai
Gly Leu Thr Met Pro Arg Tyr Cys 885 890
Leu Phe Gly Asp 895
Thr Vai Asn Thr Ala
900
Ser Met Glu Ser Thr Gly Leu Pro Tyr Arg lie
905 910
His Vai Asn Ser 915
Thr Glu Leu Lys 930
Gly Phe Asn Lys
945
Ser Asn His Gly
Asp Arg Arg Lys
980
Thr Vai He Leu 920
Gly Lys Gly Glu 935
Pro lie Pro Lys
950
He Ser Leu His 965
Leu Glu Lys Ala
Ala Leu Gly Phe
Asp Thr Tyr Trp
940
Pro Pro Asp Leu
955
Gly He Ser Leu 970
Arg Pro Gly Gin 985
Glu Arg Gly Arg 925
Leu Vai Gly Arg
Gin Pro Gly Ala
960
Glu He Pro Pro
975
Phe Ser Gly Lys 990

Claims (2)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Рекомбинантный аденоассоциированный вирусный вектор (rAAV), включающий полинуклеотид, который содержит специфичный в отношении зрительного фоторецептора промотор человеческой родопсинкиназы, функционально связанный с сегментом нуклеиновой кислоты, которая кодирует биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека, который включает аминокислотную последовательность, идентичную по меньшей мере приблизительно на 90% смежным 80 аминокислотам последовательности SEQ ID NO: 1, причем указанный вектор способен предохранять или восстанавливать опосредованную колбочками функцию глаза млекопитающего.
    2. Вектор rAAV по п.1, где биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 95% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
    3. Вектор rAAV по п.1, где биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 98% идентична последовательности SEQ ID NO: 1.
    4. Вектор rAAV по п.1, где биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека содержит 100 смежных аминокислот последовательности SEQ ID NO: 1.
    5. Вектор rAAV по п.1, где биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека содержит 125 смежных аминокислот последовательности SEQ ID NO: 1.
    6. Вектор rAAV по п.1, где биологически активный, специфичный в отношении сетчатки полипептид гуанилатциклазы человека содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1.
    7. Вектор rAAV по любому из пп.1-6, в котором специфичный в отношении зрительного фоторецептора промотор человеческой родопсинкиназы содержит по меньшей мере 30 смежных пар нуклеотидов последовательности SEQ ID NO: 12.
    8. Вектор rAAV по любому из пп.1-6, в котором специфичный в отношении зрительного фоторецептора промотор человеческой родопсинкиназы содержит по меньшей мере 40 смежных пар нуклеотидов последовательности SEQ ID NO: 12.
    9. Вектор rAAV по любому из пп.1-6, в котором специфичный в отношении зрительного фоторецептора промотор человеческой родопсинкиназы содержит по меньшей мере 60 смежных пар нуклеотидов последовательности SEQ ID NO: 12.
    10. Вектор rAAV по любому из пп.1-6, в котором специфичный в отношении зрительного фоторецептора промотор человеческой родопсинкиназы содержит нуклеотидную последовательность SEQ ID NO: 12.
    11. Вектор rAAV по любому из предшествующих пунктов, дополнительно содержащий энхансер или последовательность интрона млекопитающего.
    12. Вектор rAAV по любому из предшествующих пунктов, который является рекомбинантным вектором аденоассоциированного вируса серотипа 5 (rAAV5).
    13. Вектор rAAV по любому из пп.1-11, который является рекомбинантным вектором аденоассоциированного вируса серотипа 8 (rAAV8).
    14. Вектор rAAV по п.13, который является рекомбинантным вектором аденоассоциированного вируса серотипа 8 (Y733F).
    15. Вектор rAAV по любому из пп.1-14, где у млекопитающего имеется риск развития или диагностирован дефицит биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в клетках глаза по сравнению с его уровнем у нормального млекопитающего.
    16. Вектор rAAV по любому из пп.1-14, где млекопитающее является новорожденным человеком, человеком в неонатальном, детском или юношеском возрасте, у которого имеется риск развития или диагностирована наследственная дистрофия сетчатки, такая как врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1).
    17. Вектор rAAV по любому из пп.1-14, где у млекопитающего имеется риск развития или диагностировано заболевание, расстройство, дисфункция или аномальное состояние глаза, обусловленные дефицитом биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в клетках глаза по сравнению с его уровнем у нормального млекопитающего.
    18. Вектор rAAV по п.17, где заболеванием, расстройством, дисфункцией или аномальным состоянием является врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1).
    19. Композиция, которая способна предохранять или восстанавливать опосредованную колбочками функцию глаза млекопитающего, содержащая:
    (1) вектор rAAV по любому из предшествующих пунктов;
  2. (2) фармацевтически приемлемый буфер, носитель, наполнитель или разбавитель.
    20. Композиция по п.19, дополнительно содержащая липид, липосому, липидный комплекс, этосому, ниосому, наночастицу, микрочастицу, липосферу, нанокапсулу или любую их комбинацию.
    21. Композиция по п.19 или 20, составленная в форме, подходящей для введения в глаз млекопи
    - 121 035893 тающего.
    22. Композиция по любому из пп.19-21, где у млекопитающего имеется риск развития или диагностирован дефицит биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы.
    23. Композиция по любому из пп.19-21, где млекопитающее является новорожденным человеком, человеком в неонатальном, детском или юношеском возрасте, у которого имеется риск развития или диагностирована наследственная дистрофия сетчатки, такая как врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1).
    24. Композиция по любому из пп.19-21, где у млекопитающего имеется риск развития или диагностировано заболевание, расстройство, дисфункция или аномальное состояние глаза, обусловленные дефицитом биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в клетках глаза по сравнению с его уровнем у нормального млекопитающего.
    25. Композиция по п.24, где заболеванием, расстройством, дисфункцией или аномальным состоянием является врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1).
    26. Способ предотвращения, лечения или облегчения симптомов заболевания, расстройства, дисфункции или аномального состояния глаза млекопитающего, обусловленных дефицитом биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в клетках глаза по сравнению с его уровнем у нормального млекопитающего, где способ включает введение в клетки глаза млекопитающего, нуждающегося в этом, эффективного количества вектора по любому из пп.1-14 или композиции по любому из пп.19-21.
    27. Способ по п.26, где указанный вектор вводят в клетки глаза млекопитающего ex vivo или in vitro, после чего указанные клетки вводят в участок внутри одного или обоих глаз млекопитающего путем прямой инъекции в сетчатку или в окружающую ее ткань.
    28. Способ по любому из пп.26, 27, где млекопитающее страдает врожденным амаврозом Лебера типа 1 (LCA1).
    29. Способ повышения уровня биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в одной или нескольких клетках сетчатки млекопитающего, у которого предполагается наличие LCA1, либо диагностирован LCA1, либо есть риск развития LCA1, где способ включает введение вектора по любому из пп.1-14 или композиции по любому из пп.19-21 в клетки сетчатки млекопитающего в количестве и в течение периода, эффективных для увеличения уровня биологически активного, специфичного в отношении сетчатки полипептида гуанилатциклазы в одной или нескольких клетках сетчатки млекопитающего.
    30. Способ лечения или облегчения одного или нескольких симптомов дистрофии сетчатки у млекопитающего, включающий прямое введение в сетчатку или субретинальное пространство млекопитающего вектора по любому из пп.1-14 или композиции по любому из пп.19-21 в количестве и в течение периода, эффективных для лечения или облегчения одного или несколько симптомов дистрофии сетчатки у млекопитающего.
    31. Способ по п.30, где у млекопитающего диагностирован врожденный амавроз Лебера типа 1 (LCA1).
EA201291103A 2010-04-23 2011-04-22 РЕКОМБИНАНТНЫЙ АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУСНЫЙ ВЕКТОР (rAAV), КОДИРУЮЩИЙ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНУЮ, СПЕЦИФИЧНУЮ В ОТНОШЕНИИ СЕТЧАТКИ ГУАНИЛАТЦИКЛАЗУ ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБНЫЙ ПРЕДОХРАНЯТЬ ИЛИ ВОССТАНАВЛИВАТЬ ОПОСРЕДОВАННУЮ КОЛБОЧКАМИ ФУНКЦИЮ ГЛАЗА МЛЕКОПИТАЮЩЕГО EA035893B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US32752110P 2010-04-23 2010-04-23
PCT/US2011/033669 WO2011133933A2 (en) 2010-04-23 2011-04-22 Raav-guanylate cyclase compositions and methods for treating leber's congenital amaurosis-1 (lca1)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201291103A1 EA201291103A1 (ru) 2013-10-30
EA035893B1 true EA035893B1 (ru) 2020-08-27

Family

ID=44533055

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201291103A EA035893B1 (ru) 2010-04-23 2011-04-22 РЕКОМБИНАНТНЫЙ АДЕНОАССОЦИИРОВАННЫЙ ВИРУСНЫЙ ВЕКТОР (rAAV), КОДИРУЮЩИЙ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНУЮ, СПЕЦИФИЧНУЮ В ОТНОШЕНИИ СЕТЧАТКИ ГУАНИЛАТЦИКЛАЗУ ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБНЫЙ ПРЕДОХРАНЯТЬ ИЛИ ВОССТАНАВЛИВАТЬ ОПОСРЕДОВАННУЮ КОЛБОЧКАМИ ФУНКЦИЮ ГЛАЗА МЛЕКОПИТАЮЩЕГО
EA202091105A EA202091105A1 (ru) 2010-04-23 2011-04-22 Композиции гуанилатциклазы и способы лечения врожденного амавроза лебера типа 1 (lca1)

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA202091105A EA202091105A1 (ru) 2010-04-23 2011-04-22 Композиции гуанилатциклазы и способы лечения врожденного амавроза лебера типа 1 (lca1)

Country Status (27)

Country Link
US (3) US9816108B2 (ru)
EP (3) EP4056700A1 (ru)
JP (4) JP5897549B2 (ru)
KR (3) KR20200047642A (ru)
CN (2) CN105821079B (ru)
AU (1) AU2011242527B2 (ru)
BR (1) BR112012026730A8 (ru)
CA (1) CA2796399C (ru)
CL (1) CL2012002969A1 (ru)
CO (1) CO6640236A2 (ru)
CY (1) CY1123008T1 (ru)
DK (2) DK3486320T3 (ru)
EA (2) EA035893B1 (ru)
ES (2) ES2911185T3 (ru)
HR (1) HRP20190144T1 (ru)
HU (1) HUE041571T2 (ru)
IL (2) IL222651B (ru)
LT (1) LT2561067T (ru)
MX (1) MX351865B (ru)
NZ (1) NZ602897A (ru)
PL (2) PL2561067T3 (ru)
PT (2) PT3486320T (ru)
RS (1) RS58434B1 (ru)
SG (4) SG184876A1 (ru)
SI (1) SI2561067T1 (ru)
TR (1) TR201901377T4 (ru)
WO (1) WO2011133933A2 (ru)

Families Citing this family (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120322861A1 (en) 2007-02-23 2012-12-20 Barry John Byrne Compositions and Methods for Treating Diseases
WO2013075008A1 (en) 2011-11-16 2013-05-23 University Of Florida Research Foundation Inc. Aav dual vector systems for gene therapy
EP3292875B1 (en) 2012-06-19 2020-05-27 University of Florida Research Foundation, Inc. Compositions and methods for treating diseases
FR3008618A1 (fr) * 2013-07-19 2015-01-23 Univ Paris Curie Utilisation de composes pour restaurer la reponse a la lumiere des cellules de la retine
CN110606874B (zh) 2013-07-22 2024-04-19 费城儿童医院 用于基因转移到细胞、器官和组织中的变异aav和组合物、方法及用途
JP6827320B2 (ja) 2013-08-05 2021-02-10 アカデミシュ・ジークンホイス・ライデン・ハー・オー・デー・エン・ライドス・ユニヴェルシタイル・メディシュ・セントルム ＬＣＡ−８及び進行性ＲＰを治療するための組換えＡＡＶ−Ｃｒｕｍｂｓホモログ組成物及び方法
GB201420139D0 (en) 2014-11-12 2014-12-24 Ucl Business Plc Factor IX gene therapy
BR112017027956A2 (pt) 2015-06-23 2018-08-28 Childrens Hospital Philadelphia fator ix modificado e composições, métodos e usos para a transferência de gene para células, órgãos e tecidos
AU2018261769B2 (en) * 2017-05-05 2024-03-14 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for expressing Otoferlin
EP3675913A4 (en) 2017-08-28 2021-06-02 University of Florida Research Foundation, Incorporated METHODS AND COMPOSITIONS FOR TREATMENT OF CONE-ROD DYSTROPHY
CA3082586A1 (en) * 2017-11-15 2019-05-23 The Regents Of The University Of Michigan Viral vectors comprising rdh12 coding regions and methods of treating retinal dystrophies
JP7287611B2 (ja) 2018-02-07 2023-06-06 学校法人日本医科大学 改良型アデノ随伴ウイルスベクター
US11660353B2 (en) 2018-04-27 2023-05-30 Decibel Therapeutics, Inc. Compositions and methods for treating sensorineural hearing loss using otoferlin dual vector systems
US20220213494A1 (en) 2019-02-15 2022-07-07 Thomas W. Chalberg Dual leucine zipper kinase inhibitors for gene therapy
JP2024016295A (ja) * 2020-11-30 2024-02-07 タカラバイオ株式会社 二価の陽イオンを利用した非エンベロープウイルスの製造方法
CN112852976B (zh) * 2021-03-17 2023-10-31 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所 蛋鸡ncs1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记及其应用
AU2022310166A1 (en) * 2021-07-14 2024-02-29 Meiragtx Uk Ii Limited Retgc gene therapy

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2002082904A2 (en) * 2001-04-13 2002-10-24 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Method of treating or retarding the development of blindness

Family Cites Families (54)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4237224A (en) 1974-11-04 1980-12-02 Board Of Trustees Of The Leland Stanford Jr. University Process for producing biologically functional molecular chimeras
US4554101A (en) 1981-01-09 1985-11-19 New York Blood Center, Inc. Identification and preparation of epitopes on antigens and allergens on the basis of hydrophilicity
US4883750A (en) 1984-12-13 1989-11-28 Applied Biosystems, Inc. Detection of specific sequences in nucleic acids
US4683195A (en) 1986-01-30 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4800159A (en) 1986-02-07 1989-01-24 Cetus Corporation Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences
US4987071A (en) 1986-12-03 1991-01-22 University Patents, Inc. RNA ribozyme polymerases, dephosphorylases, restriction endoribonucleases and methods
AU622104B2 (en) 1987-03-11 1992-04-02 Sangtec Molecular Diagnostics Ab Method of assaying of nucleic acids, a reagent combination and kit therefore
AU622426B2 (en) 1987-12-11 1992-04-09 Abbott Laboratories Assay using template-dependent nucleic acid probe reorganization
DE68908054T2 (de) 1988-01-21 1994-03-10 Genentech Inc Verstärkung und nachweis von nukleinsäuresequenzen.
CA1340807C (en) 1988-02-24 1999-11-02 Lawrence T. Malek Nucleic acid amplification process
CA1340323C (en) 1988-09-20 1999-01-19 Arnold E. Hampel Rna catalyst for cleaving specific rna sequences
US5549910A (en) 1989-03-31 1996-08-27 The Regents Of The University Of California Preparation of liposome and lipid complex compositions
AU637800B2 (en) 1989-08-31 1993-06-10 City Of Hope Chimeric dna-rna catalytic sequences
US5252334A (en) 1989-09-08 1993-10-12 Cygnus Therapeutic Systems Solid matrix system for transdermal drug delivery
AU6505690A (en) 1989-09-26 1991-04-28 Richard R Behringer Erythroid-specific gene expression system
US5466468A (en) 1990-04-03 1995-11-14 Ciba-Geigy Corporation Parenterally administrable liposome formulation comprising synthetic lipids
US6365730B1 (en) 1990-06-19 2002-04-02 Gene Shears Pty. Limited DNA-Armed ribozymes and minizymes
JP3218637B2 (ja) 1990-07-26 2001-10-15 大正製薬株式会社 安定なリポソーム水懸濁液
JP2958076B2 (ja) 1990-08-27 1999-10-06 株式会社ビタミン研究所 遺伝子導入用多重膜リポソーム及び遺伝子捕捉多重膜リポソーム製剤並びにその製法
CA2093664C (en) 1990-10-12 2003-07-29 Fritz Eckstein Modified ribozymes
US5145684A (en) 1991-01-25 1992-09-08 Sterling Drug Inc. Surface modified drug nanoparticles
US5399363A (en) 1991-01-25 1995-03-21 Eastman Kodak Company Surface modified anticancer nanoparticles
DE4216134A1 (de) 1991-06-20 1992-12-24 Europ Lab Molekularbiolog Synthetische katalytische oligonukleotidstrukturen
PT620849E (pt) 1992-01-07 2003-11-28 Elan Pharm Inc Modelos animais transgenicos para a doenca de alzheimer
US5652094A (en) 1992-01-31 1997-07-29 University Of Montreal Nucleozymes
WO1993023569A1 (en) 1992-05-11 1993-11-25 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method and reagent for inhibiting viral replication
EP1251170A3 (en) 1992-07-17 2002-10-30 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Method and reagent for treatment of NF-kappaB dependent animal diseases
US5543158A (en) 1993-07-23 1996-08-06 Massachusetts Institute Of Technology Biodegradable injectable nanoparticles
US5631359A (en) 1994-10-11 1997-05-20 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. Hairpin ribozymes
US5639940A (en) 1994-03-03 1997-06-17 Pharmaceutical Proteins Ltd. Production of fibrinogen in transgenic animals
US5789655A (en) 1994-05-13 1998-08-04 The Regents Of The University Of California Transgenic animals expressing artificial epitope-tagged proteins
US5741516A (en) 1994-06-20 1998-04-21 Inex Pharmaceuticals Corporation Sphingosomes for enhanced drug delivery
US5795587A (en) 1995-01-23 1998-08-18 University Of Pittsburgh Stable lipid-comprising drug delivery complexes and methods for their production
US5697899A (en) 1995-02-07 1997-12-16 Gensia Feedback controlled drug delivery system
IE80468B1 (en) 1995-04-04 1998-07-29 Elan Corp Plc Controlled release biodegradable nanoparticles containing insulin
US5738868A (en) 1995-07-18 1998-04-14 Lipogenics Ltd. Liposome compositions and kits therefor
US5656016A (en) 1996-03-18 1997-08-12 Abbott Laboratories Sonophoretic drug delivery system
US5797898A (en) 1996-07-02 1998-08-25 Massachusetts Institute Of Technology Microchip drug delivery devices
US5783208A (en) 1996-07-19 1998-07-21 Theratech, Inc. Transdermal drug delivery matrix for coadministering estradiol and another steroid
US5779708A (en) 1996-08-15 1998-07-14 Cyberdent, Inc. Intraosseous drug delivery device and method
EP0977841A2 (en) 1997-04-21 2000-02-09 University Of Florida Materials and methods for ribozyme treatment of retinal diseases
ATE402254T1 (de) * 1998-05-28 2008-08-15 Us Gov Health & Human Serv Aav5 vektoren und deren verwendung
CN1381579A (zh) * 2001-04-18 2002-11-27 上海博德基因开发有限公司 一种多肽——鸟苷酸环化酶－13.53和编码这种多肽的多核苷酸
US20030003582A1 (en) * 2001-05-08 2003-01-02 Tranzyme, Inc. Trans-viral vector mediated gene transfer to the retina
JP2007520996A (ja) * 2003-01-15 2007-08-02 ミレニアム・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド ４４３９０、５４１８１、２１１、５６８７、８８４、１４０５、６３６、４４２１、５４１０、３０９０５、２０４５、１６４０５、１８５６０、２０４７、３３７５１、５２８７２、１４０６３、２０７３９、３２５４４、４３２３９、４４３７３、５１１６４、５３０１０、１６８５２、１５８７、２２０７、２２２４５、２３８７、５２９０８、６９１１２、１４９９０、１８５４７、１１５、５７９、１５９８５、１５６２５、７６０、１８６０３、２３９５、２５５４、８６７５、３２７２０、４８０９、１４３０３、１６８１６、１７８２７、３２６２０、５７７、６１９、１４２３、２１５８、８２６３、１５４０２、１６２０９、１６３８６、２１１６５、３０９１１、４１８９７、１６４３、２５４３、９６２６、１３２３１、３２４０９、８４２６０、２８８２、８２０３、３２６７８または５５０５３を用いて泌尿器科障害を処置するための方法および組成物
EP1616965A1 (en) * 2004-07-16 2006-01-18 AXXAM S.r.l. Methods and assays for detecting guanylate cyclase activity
WO2006036465A2 (en) 2004-09-03 2006-04-06 University Of Florida Compositions and methods for treating cystic fibrosis
US7943374B2 (en) * 2005-08-21 2011-05-17 Markus Hildinger Super-size adeno-associated viral vector harboring a recombinant genome larger than 5.7 kb
WO2007078599A2 (en) 2005-12-16 2007-07-12 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Functional arrays for high throughput characterization of gene expression regulatory elements
WO2007127428A2 (en) 2006-04-28 2007-11-08 University Of Florida Research Foundation, Inc. Double-stranded/self-complementary vectors with a truncated cba promoter and methods of gene delivery
CA2694091A1 (en) * 2007-10-01 2009-04-09 Alcon Research, Ltd. Self complementary aav-mediated delivery of interfering rna molecules to treat or prevent ocular disorders
US8312249B1 (en) 2008-10-10 2012-11-13 Apple Inc. Dynamic trampoline and structured code generation in a signed code environment
FR2957821B1 (fr) 2010-03-24 2014-08-29 Inst Francais Du Petrole Nouvelle zone de regeneration du catalyseur divisee en secteurs pour unites catalytiques regeneratives

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2002082904A2 (en) * 2001-04-13 2002-10-24 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Method of treating or retarding the development of blindness

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BOYE S E, BOYE S L, PANG J, RYALS R, EVERHART D, UMINO Y, NEELEY A W, BESHARSE J, BARLOW R, HAUSWIRTH W W: "Functional and behavioral restoration of vision by gene therapy in the guanylate cyclase-1 (GC1) knockout mouse.", PLOS ONE, US, vol. 5, no. 6, 25 June 2010 (2010-06-25), US, pages E11306 - E11306-14, XP002642412, ISSN: 1932-6203, DOI: 10.1371/JOURNAL.PONE.0011306 *
DATABASE UniProt 1 July 1993 (1993-07-01), "RecName: Full=Retinal guanylyl cyclase 1; Short=RETGC-1; EC=4.6.1.2; AltName: Full=Guanylate cyclase 2D, retinal; AltName: Full=Rod outer segment membrane guanylate cyclase; Short=ROS-GC; Flags: Precursor;", XP002661107, Database accession no. Q02846 *
DATABASE UniProt 1 October 1996 (1996-10-01), "RecName: Full=Guanylyl cyclase GC-E; EC=4.6.1.2; AltName: Full=Guanylate cyclase 2E; Flags: Precursor;", XP002661108, Database accession no. P52785 *
FANSHENG KONG, WENSHENG LI, XIA LI, QINXIANG ZHENG, XUFENG DAI, XIANGTIAN ZHOU, SANFORD L. BOYE, WILLIAM W. HAUSWIRTH, JIA QU, JI-: "Self-complementary AAV5 vector facilitates quicker transgene expression in photoreceptor and retinal pigment epithelial cells of normal mouse.", EXPERIMENTAL EYE RESEARCH., ACADEMIC PRESS LTD., LONDON., vol. 90, no. 5, 1 May 2010 (2010-05-01), LONDON., pages 546 - 554, XP002661105, ISSN: 0014-4835, DOI: 10.1016/J.EXER.2010.01.011 *
HAIRE SHANNON E ET AL: "Light-driven cone arrestin translocation in cones of postnatal guanylate cyclase-1 knockout mouse retina treated with AAV-GC1.", INVESTIGATIVE OPHTHALMOLOGY & VISUAL SCIENCE, ASSOCIATION FOR RESEARCH IN VISION AND OPHTHALMOLOGY|, US, vol. 47, no. 9, 1 September 2006 (2006-09-01), US, pages 3745 - 3753, XP002661104, ISSN: 0146-0404, DOI: 10.1167/iovs.06-0086 *
J PANG, S E BOYE, B LEI, S L BOYE, D EVERHART, R RYALS, Y UMINO, B ROHRER, J ALEXANDER, J LI, X DAI, Q LI, B CHANG, R BARLOW, W W : "Self-complementary AAV-mediated gene therapy restores cone function and prevents cone degeneration in two models of Rpe65 deficiency.", GENE THERAPY, NATURE PUBLISHING GROUP, LONDON, GB, vol. 17, no. 7, 1 July 2010 (2010-07-01), GB, pages 815 - 826, XP002661106, ISSN: 0969-7128, DOI: 10.1038/GT.2010.29 *

Also Published As

Publication number Publication date
SG184876A1 (en) 2012-11-29
CA2796399A1 (en) 2011-10-27
JP5897549B2 (ja) 2016-03-30
WO2011133933A2 (en) 2011-10-27
RS58434B1 (sr) 2019-04-30
NZ602897A (en) 2014-09-26
EA202091105A1 (ru) 2020-12-30
CO6640236A2 (es) 2013-03-22
JP6533246B2 (ja) 2019-06-19
US20130210895A1 (en) 2013-08-15
CN102918152A (zh) 2013-02-06
PL3486320T3 (pl) 2022-05-09
SG10201913135YA (en) 2020-02-27
KR20190060881A (ko) 2019-06-03
CN105821079A (zh) 2016-08-03
DK3486320T3 (da) 2022-04-11
EP4056700A1 (en) 2022-09-14
PT3486320T (pt) 2022-03-30
HUE041571T2 (hu) 2019-05-28
KR20130095643A (ko) 2013-08-28
DK2561067T3 (en) 2019-03-11
AU2011242527B2 (en) 2016-05-19
EP2561067A2 (en) 2013-02-27
TR201901377T4 (tr) 2019-02-21
HRP20190144T1 (hr) 2019-03-22
WO2011133933A3 (en) 2012-01-05
IL264649B (en) 2021-01-31
US20180100165A1 (en) 2018-04-12
PT2561067T (pt) 2019-02-04
SG10201502759TA (en) 2015-06-29
ES2711256T3 (es) 2019-04-30
EP3486320A1 (en) 2019-05-22
US20220186260A1 (en) 2022-06-16
IL222651B (en) 2019-02-28
EA201291103A1 (ru) 2013-10-30
ES2911185T3 (es) 2022-05-18
LT2561067T (lt) 2019-03-12
CA2796399C (en) 2021-08-24
CY1123008T1 (el) 2021-10-29
JP2013526854A (ja) 2013-06-27
MX2012012367A (es) 2012-11-16
CN105821079B (zh) 2021-10-26
JP2019107037A (ja) 2019-07-04
KR20200047642A (ko) 2020-05-07
KR101984145B1 (ko) 2019-05-30
BR112012026730A8 (pt) 2018-07-03
PL2561067T3 (pl) 2019-05-31
IL222651A0 (en) 2012-12-31
EP3486320B1 (en) 2022-01-19
BR112012026730A2 (pt) 2015-09-22
CL2012002969A1 (es) 2013-05-31
SI2561067T1 (sl) 2019-04-30
EP2561067B1 (en) 2018-11-14
MX351865B (es) 2017-10-30
US9816108B2 (en) 2017-11-14
SG10201800541SA (en) 2018-03-28
JP2017114914A (ja) 2017-06-29
JP2015091273A (ja) 2015-05-14
CN102918152B (zh) 2016-04-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20220186260A1 (en) Raav-guanylate cyclase compositions and methods for treating leber&#39;s congenital amaurosis-1 (lca1)
JP6827320B2 (ja) ＬＣＡ−８及び進行性ＲＰを治療するための組換えＡＡＶ−Ｃｒｕｍｂｓホモログ組成物及び方法
AU2011242527A1 (en) rAAV-guanylate cyclase compositions and methods for treating Leber&#39;s congenital amaurosis-1 (LCA1)
EP2872183B1 (en) Aav-mediated gene therapy for rpgr x-linked retinal degeneration
Stieger et al. Adeno-associated virus mediated gene therapy for retinal degenerative diseases
US20200172929A1 (en) Gene therapy for ocular disorders
IL301057A (en) Recombinant adeno-associated virus encoding GJB2 and uses thereof
US20160256571A1 (en) Invention
AU2018203034B2 (en) rAAV-guanylate cyclase compositions and methods for treating Leber&#39;s congenital amaurosis-1 (LCA1)
US20240016955A1 (en) Dual-aav vector delivery of pcdh15 and uses thereof
CA3190866A1 (en) Gene therapies for lysosomal disorders
WO2022011099A1 (en) Modified hexosaminidase and uses thereof