DE4417169A1 - Rekombinante Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in glucosefreiem Medium - Google Patents
Rekombinante Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in glucosefreiem MediumInfo
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Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung von
Polyhydroxyalkanoaten in einem prokaryontischen Wirtsorganis
mus, der die für eine Biosynthese von Hydroxyalkanoat-Polymeren
verantwortlichen Gene enthält, durch Züchtung des Wirtsorganis
mus in einem Kulturmedium unter solchen Bedingungen, die zur
Bildung von Polyhydroxyalkanoaten durch den Wirtsorganismus
führen.
Polyhydroxybuttersäure (PHB und andere Polyhydroxyalkanoate
(PHA) sind natürliche Polyester, die in Reaktion auf Streßbe
dingungen von verschiedenen Bakterien gebildet und als intra
zelluläre Granulate angereichert werden (Anderson et al.,
Microbiol. Rev. 54 (1990), 450-472). Dabei werden durch
verschiedene Bakterien Hydroxyalkanoat -Homopolymere oder
-Copolymere erzeugt, die Monomere mit unterschiedlichen Ketten
längen, insbesondere C₃-C₁₂-Hydroxycarbonsäuren enthalten. Die
am besten charakterisierten PHA stammen aus Alcaligenes
eutrophus und Pseudomonas oleovorans. A. eutrophus erzeugt PHB
oder Copolymere von PHB, die Hydroxyalkanoat-Einheiten mit
einer Kettenlänge von 3 bis 5 Kohlenstoffatomen enthalten,
wobei Poly-3-hydroxybuttersäure und Poly-3-hydroxyvaleriansäure
die Hauptkomponenten sind. P. oleovorans erzeugt PHA-Copolyme
re, die aus Hydroxyalkanoaten mit 6 bis 12 Kohlenstoffatomen
aufgebaut sind.
In A. eutrophus wird PHB oder ein PHB-Copolymer aus Acetyl-
Coenzym A durch drei aufeinanderfolgende enzymatische Reaktio
nen erzeugt, die durch (i) β-Ketothiolase (phbA), (ii) Aceto
acetyl-CoA-Reduktase (phbB) und (iii) PHB-Synthase (phbC)
katalysiert werden.
Das diese drei Gene enthaltende phbcAB-Operon von A. eutrophus
A16 wurde in E.coli kloniert (Janes et al. (1990), Molecular
Characterization of the Poly-β-hydroxybutyrate Biosynthetic
Pathway of Alcaligenes eutrophus H16. In: Novel Biodegradable
Microbial Polymers (Dawes, E.A., Hrsg.) S. 175-190, Kluwer,
Dordrecht). Die Expression dieses Operons in rekombinanten
E.coli-Zellen führt bei Verwendung eines glucosehaltigen
Kulturmediums zur Bildung von 67 Gew.-% PHB bezüglich des
Trockengewichts der Zelle. Bei Subklonierung der Gene auf
diesem Operon in zwei verschiedene Plasmide, von denen eines
das phbA- und das phbB-Gen unter transkriptioneller Kontrolle
der lac-Promotor/Operator-Region enthält und das zweite das
phbC-Gen mit seiner natürlichen Promotorsequenz enthält, findet
man bei Züchtung eines mit diesen Plasmiden transformierten
rekombinanten E.coli in einem glucosehaltigen Kulturmedium, daß
sogar mehr als 90 Gew.-% des Trockengewichts der Zelle PHB
sind. (Kalousek et al., in Proceedings of the International
Symposium on Bacterial Polyhydroxyalkanoates, Schlegel, H.G.,
Steinbüchel. A, Hrsg., Golke Druck, Göttingen 1993.)
Es besteht ein erhebliches Interesse an der kommerziellen Ver
wertung von Polyhydroxyalkanoaten, da diese Polymere thermopla
stische Eigenschaften aufweisen, biologisch abbaubar sind und
aus erneuerbaren Kohlenstoffquellen erzeugt werden können. So
wird beispielsweise eine Glucose-verwendende Mutante von A.
eutrophus als Produktionsstamm zur Massenproduktion eines aus
β-Hydroxybuttersäure und β-Hydroxyvaleriansäure bestehenden
Copolyesters verwendet (PHB-co-HV). Dieser Copolyester ist
unter dem Warenzeichen Biopol seit 1982 kommerziell erhältlich.
Obwohl PHB und andere Polyhydroxyalkanoate ein großes Potential
als Quelle von erneuerbaren und biologisch abbaubaren thermo
plastischen und elastomeren Substanzen besitzen, ist ihr Preis
viel höher als der von aus Erdöl stammenden Kunststoffen, wie
etwa Polyethylen. Der wichtigste Faktor, der die Anwendung von
biologisch erzeugten PHA-Kunststoffen begrenzt, sind gegen
wärtig die Produktionskosten. Folglich besteht ein starkes
Bedürfnis, diese Produktionskosten zu verringern.
Hierzu wurden neue Bakterienstämme entwickelt, die anstelle der
sehr teuren Glucose, die am häufigsten als Medienzusatz zur
PHA-Erzeugung verwendet wird, andere Kohlehydrate wie Lactose,
Galactose und Saccharose enthalten (Steinbüchel (1991),
Polyhydroxyalkanoic Acids. In: Biomaterials (D. Byrom, Hrsg.),
pp. 123-213, MacMillan, Basingtoke). Page (FEMS Microbiol. 103
(1992), 149-157) beschreibt einen Azotobacter vinelandii Mutan
tenstamm, der ein PHB-co-HV-Copolymer bei Kultivierung auf ver
schiedenen nicht-raffinierten Zuckerquellen einschließlich
Rübenmolasse, Rohrmolasse und Maissirup erzeugt. Weiterhin
wurde vor kurzem gezeigt, daß PHB in genetisch manipulierten
Pflanzen erzeugt wird, die die Gene von A. eutrophus exprimie
ren (Poirier et al., FEMS Microbiol. Rev. 103 (1992), 137-146).
Der Nachteil aller aus dem Stand der Technik bekannten Ver
fahren zur Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten besteht jedoch
darin, daß PHA in Kulturmedien, die keine Glucose oder andere
Kohlehydrate als Kohlenstoffquelle enthalten, bisher nur in
geringer Ausbeute erzeugt werden konnten. Die der vorliegenden
Erfindung zugrundeliegende Aufgabe bestand somit darin, ein
Verfahren zur Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten bereitzu
stellen, bei dem man ein kostengünstiges Kulturmedium verwenden
kann und gleichzeitig das Polymer in hoher Ausbeute erhält.
Diese Aufgabe wird gelöst durch ein Verfahren zur Herstellung
von Polyhydroxyalkanoaten in einem prokaryontischen Wirts
organismus, der die für eine Biosynthese von Hydroxyalkanoat-
Polymeren erforderlichen Gene enthält, durch Kultivierung des
Wirtsorganismus in einem Medium unter solchen Bedingungen, die
zur Bildung von Polyhydroxyalkanoaten durch den Wirtsorganismus
führen, wobei das Verfahren dadurch gekennzeichnet ist, daß man
einen Wirtsorganismus, der mindestens eine Kopie eines Polyhy
droxyalkanoat -Synthasegens unter gesteigerter Expressionskon
trolle enthält, und ein im wesentlichen glucosefreies Kulturme
dium verwendet.
Unter dem Begriff "gesteigerte Expressionskontrolle" im Sinne
der vorliegenden Erfindung ist eine Erhöhung der Expression des
Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens gegenüber dem nativen Gen in
einem glucosefreien Kulturmedium zu verstehen. Diese gestei
gerte Expressionskontrolle kann vorzugsweise dadurch erfolgen,
daß man
- (a) eine heterologe Transkriptionsregulationssequenz,
- (b) eine heterologe Translationsregulationssequenz oder
- (c) eine Kombination aus (a) und (b) verwendet.
Besonders bevorzugt ist es, einen Mikroorganismus zu verwenden,
der das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen in gesteigerter Kopien
zahl, z. B. auf einem extrachromosomalen Multicopy-Plasmid, und
unter Kontrolle einer heterologen Transkriptions- oder/und
Translationsregulationssequenz enthält.
Die vorliegende Erfindung beruht auf der überraschenden
Erkenntnis, daß bei Verwendung eines Mikroorganismus, der das
Polyhydroxybuttersäure-Synthasegen aus Alcaligenes eutrophus
unter gesteigerter Expressionskontrolle enthält, die z. B.
erreicht wird, indem die nativell Transkriptionsregulations
sequenz durch eine heterologe Transkriptionsregulationssequenz,
z. B. den E.coli lac-Promotor/Qperator, ersetzt wird, eine hohe
Synthese von Hydroxybuttersäurepolymeren auch bei Verwendung
eines im wesentlichen von Glucose und anderen Kohlehydraten
freien Kulturmediums möglich ist. Im Gegensatz dazu zeigt eine
E. coli-Zelle, die das Polyhydroxybuttersäure-Synthasegen unter
Kontrolle der "nativen" Transkriptionsregulationssequenz
enthält, unter gleichen Bedingungen eine ganz erheblich
geringere Bildung von Polyhydroxybuttersäure.
Durch die vorliegende Erfindung ist es möglich, Polyhydroxyal
kanoate in prokaryontischen Organismen unter Verwendung eines
im wesentlichen glucosefeien Mediums zu erzeugen, wodurch die
Herstellungskosten des Polymers signifikant, d. h. um einen
Faktor von bis zu 3, verringert werden können.
Das erfindungsgemäße Verfahren ist zur Herstellung von
"Hydroxyalkanoat-Polymeren" bzw. "Polyhydroxyalkanoaten"
geeignet, d. h. von Polyhydroxyfettsäure-Polymeren oder
-Copolymeren, in denen die Hydroxycarbonsäure -Monomereinheiten
eine Kettenlänge von vorzugsweise 3 bis 12 Kohlenstoffatomen
aufweisen. Besonders bevorzugt sind Polyhydroxybuttersäure und
Polyhydroxybuttersäure-Copolymere, insbesondere Polyhydroxybut
tersäure-Polyhydroxyvaleriansäure-Copolymere.
Der im erfindungsgemäßen Verfahren zur Bildung der Polyhydroxy
alkanoate verwendete prokaryontische Wirtsorganismus kann ein
an sich beliebiger Wirtsorganismus sein, vorausgesetzt, daß er
zur Bildung von Polyhydroxyalkanoaten unter den jeweiligen
Kultivierungsbedingungen in der Lage ist. Vorzugsweise ist der
Wirtsorganismus ein gram-negativer prokaryontischer Wirts
organismus. Besonders bevorzugt verwendet man E.coli als
Wirtsorganismus, da die Kultivierung von E.coli leicht und ohne
größere Schwierigkeiten auch in wenig komplexen Medien erfolgen
kann. Es kann jedoch auch bevorzugt sein, als Wirtsorganismus
diejenige Bakterienart zu verwenden, aus der das im erfindungs
gemäßen Verfahren eingesetzte Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen
ursprünglich stammt, z. B. Alcaligenes eutrophus.
Der Wirtsorganismus muß beim erfindungsgemäßen Verfahren minde
stens eine Kopie des Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens unter ge
steigerter Expressionskontrolle enthalten. In einer Ausfüh
rungsform der Erfindung wird hierzu ein Polyhydroxyalkanoat-
Synthasegen unter Kontrolle einer heterologen Transkriptions
regulationssequenz verwendet. Unter einer Transkriptions
regulationssequenz im Sinne der vorliegenden Erfindung ist eine
DNA-Sequenz zu verstehen, die einen Promotor, d. h. einen für
die Bindung der RNA-Polymerase verantwortlichen Bereich, sowie
gegebenenfalls einen Operator, d. h. einen für die Bindung eines
Repressors verantwortlichen Bereich und einen Enhancer, d. h.
einen für die Bindung eines Induktors verantwortlichen Bereich,
umfaßt. Unter einer "heterologen" Transkriptionsregulations
sequenz ist zu verstehen, daß die "native" Transkriptions
regulationssequenz soweit verändert wurde, daß eine effiziente
Transkription des Gens auch ohne Vorhandensein von Glucose oder
anderen Kohlehydraten im Medium stattfindet. Dies kann z. B.
durch partielle oder vollständige Deletion der nativen Promo
tor/Operator-Sequenzen des phbC-Gens und durch Insertion eines
heterologen Promotors, d. h. eines Promotors, der von einem
fremden Gen stammt, erfolgen.
Zweckmäßigerweise verwendet man einen heterologen Promotor, der
im jeweiligen Wirtsorganismus für eine effiziente Transkription
sorgen kann. Beispiele für derartige Promotoren sind dem
Fachmann auf dem Gebiet der Molekularbiologie geläufig.
Bevorzugte Beispiele sind Transkriptionsregulationssequenzen
aus E.coli oder E.coli-Phagen (z. B. Bacteriophage λ) oder davon
abgeleitete Transkriptionsregulationssequenzen, z. B. syn
thetische oder modifizierte Sequenzen. Besonders bevorzugt sind
induzierbare Transkriptionsregulationssequenzen, z. B. die
E.coli lac- oder trp-Transkriptionsregulationssequenz oder die
λ-PL-Transkriptionsregulationssequenz oder davon abgeleitete
Sequenzen (z. B. die synthetische tac-Transkriptionsregula
tionssequenz).
Um zu erreichen, daß die native Transkriptionsregulations
sequenz des Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens nicht mehr
funktionell ist, d. h. nicht mehr wie die native Sequenz bei
Abwesenheit von Glucose oder anderen Kohlehydraten reprimierbar
ist, werden die entsprechenden DNA-Abschnitte aus dem Trans
kriptionsregulationsbereich des phbC-Gens partiell oder
vollständig deletiert oder soweit verändert, daß sie nicht
länger funktionell sind. Vorzugsweise werden mindestens 100
Basenpaare, besonders bevorzugt mindestens 200 Basenpaare und
noch mehr bevorzugt mindestens 300 Basenpaare stromaufwärts des
Transkriptionsstarts deletiert. Am meisten bevorzugt wird der
gesamte 5′-seitige Bereich des Transkriptionsstarts deletiert.
Beim phbC-Gen aus Alcaligenes eutrophus wurde z. B. der Trans
kriptionsstart 307 bp stromaufwärts des phbC-ATG-Startkodons
identifiziert. Dementsprechend befindet sich die Transkrip
tionsregulationssequenz dieses Gens im Bereich stromaufwärts
des ATG-Startkodons. Für eine gesteigerte Expressionskontrolle
kann dieser Bereich teilweise oder vollständig deletiert
werden.
Entsprechende Veränderungen zum Erreichen einer gesteigerten
Expressionskontrolle können analog auch bei anderen PHA-
Synthasegenen im Bereich stromaufwärts des Transkriptionsstarts
durchgeführt werden. Am meisten bevorzugt wird dieser Bereich
vollständig deletiert und durch eine geeignete heterologe
Sequenz ersetzt.
In einer weiteren Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfah
rens wird ein Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen verwendet, das
zur gesteigerten Expressionskontrolle eine heterologe Trans
lationsregulationssequenz, d. h. eine Shine-Dalgarno-Sequenz
enthält. Vorzugsweise wird eine solche Shine-Dalgarno-Sequenz
verwendet, die zu einer wirksamen Bindung der ribosomalen RNA
des jeweiligen Wirtsorganismus und somit zu einer effizienten
Translationsinititation in der Lage ist. Vorzugsweise enthält
die Translationsregulationssequenz hierzu eine mindestens 5,
besonders bevorzugt mindestens 6 Nucleotide lange Basenfolge,
die zur Anti-Shine-Dalgarno-Sequenz am 3′-Ende der 16 S rRNA
des jeweiligen Wirtsorganismus komplementär ist. Besonders
bevorzugt umfaßt die Translationsregulationssequenz die zum 3′-
Ende der 16S rRNA von E.coli komplementäre Basenfolge 5′-
AAGGAG-3′, wobei das 3′-Ende dieser Basenfolge einen Abstand
von 6 bis 10 Nucleotiden, insbesondere 8 Nucleotiden, vom ATG-
Startkodon des Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens aufweist.
Zusätzlich kann die Translationsregulationssequenz strom
aufwärts der zur Anti-Shine-Dalgarno-Sequenz komplementären
Basenfolge, vorzugsweise unmittelbar stromaufwärts eine weitere
Basenfolge 5′-TTAACTTTA-3′ umfassen. Als besonders geeignet für
das erfindungsgemäße Verfahren hat sich die in Fig. 1 gezeigte
Translationsregulationssequenz von Gen 10 des Bakteriophagen T7
erwiesen. Weiterhin geeignet sind auch andere ribosomale
Bindungsstellen, wie sie z. B. in Winnacker, Gene und Klone,
Eine Einführung in die Gentechnologie (1985), VCH-Verlags
gesellschaft mbH, Weinheim, Bundesrepublik Deutschland, S 217
ff. angegeben sind.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform der vorliegenden
Erfindung wird die gesteigerte Expressionskontrolle dadurch er
reicht, daß sich das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen unter Kon
trolle einer heterologen Transkriptionsregulationssequenz und
einer heterologen Translationsregulationssequenz wie oben defi
niert befindet.
Das im vorliegenden Verfahren verwendete Polyhydroxyalkanoat-
Synthasegen kann aus einem beliebigen Organismus stammen, der
ein solches Synthasegen enthält. Wesentlich für das erfindungs
gemäße Verfahren ist, daß sich das Gen unter Kontrolle einer
heterologen Transkriptionsregulationssequenz befindet, d. h. daß
die Regulation der Genexpression durch die native Transkrip
tionsregulationssequenz nicht mehr funktionell aktiv ist.
Beispielsweise kann das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen aus Mi
kroorganismen der Gattungen Bacillus, Alcaligenes, Zoogloea,
Pseudomonas, Chromatium und Thiocystis stammen. Die Isolierung
und Charakterisierung von Polyhydroxyalkanoat-Biosynthesegenen
aus diesen Organismen wurde bereits beschrieben: Für Alcalige
nes eutrophus (siehe z. B. Slater et al., J. Bacteriol. 170
(1988), 4431-4436, Schubert et al., J. Bacteriol. 170 (1988),
5837-5847, Peoples und Sinkey, J. Biol. Chem. 264 (1989),
15293-15297, Janes et al., Molecular Characterization of the
Poly-β-Hydroxybutyrate Biosynthetic Pathway of Alcaligenes
eutrophus H16. In Novel Biodegradable Microbial Polymers
(Dawes, E.A., Hrsg.), S. 175-190, Kluwer, Dordrecht, Schubert
et al., J. Bacteriol. 173 (1991), 168-175); für Zoogloea
ramigera (Peoples et al., J. Biol. Chem. 262 (1987), 97-102,
Peoples und Sinskey, Mol. Microbiol. 3 (1989), 349-357); für
Pseudomonas olevorans (Husiman et al., J. Biol. Chem. 266
(1991), 2191-2198) und für Chromatium vinosum und Thiocystis
violacea (Liebergesell und Steinbüchel, Eur. J. Biochem. 209
(1992), 135-150; Liebergesell et al., FEMS Microbiol. Lett. 99
(1992), 227-232). Auf den Inhalt dieser Arbeiten wird hiermit
ausdrücklich Bezug genommen. Besonders bevorzugt stammt das
Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen aus Alcaligenes eutrophus.
Selbstverständlich umfaßt die vorliegende Erfindung auch die
Verwendung von Polyhydroxyalkanoat-Synthasegenen, die durch
rekombinante DNA-Techniken modifiziert worden sind.
Beim erfindungsgemäßen Verfahren wird ein Wirtsorganismus ver
wendet, der die für eine Biosynthese von Hydroxyalkanoat-
Polymeren erforderlichen Gene enthält, wobei das PHA-Syn
thasegen unter gesteigerter Expressionskontrolle steht. Die
Herstellung solcher Organismen erfolgt typischerweise durch
rekombinante DNA-Methoden, insbesondere durch Transformation
eines Ausgangsorganismus mit einer rekombinanten DNA, die das
PHA-Synthasegen unter Kontrolle einer heterologen Transkriptions-
oder/und Translationsregulationssequenz enthält. Diese
rekombinante DNA befindet sich vorzugsweise auf einem rekom
binanten Vektor, der weiterhin einen für den jeweiligen zu
verwendenden Wirtsorganismus geeigneten Replikationsursprung
sowie gegebenenfalls einen Selektionsmarker enthält. Die
Transformation von prokaryontischen Organismen durch geeignete
Vektoren gehört zum Allgemeinwissen eines Fachmanns auf dem
Gebiet der Molekularbiologie und braucht hier nicht näher
erläutert zu werden.
Der zur Transformation des Ausgangsorganismus verwendete rekom
binante Vektor kann beispielsweise ein Plasmidvektor, d. h. ein
zirkulärer extrachromosomaler Vektor, oder ein Bakteriophagen
vektor (z. B. ein Lambda-Vektor) oder ein filamentöser Bakterio
phagenvektor (M13, f1 und fd) oder ein Cosmidvektor sein (siehe
z. B. Sambrook et al., Molecular Cloning. A baboratory Manual,
2nd Ed. (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Kap. 1, 2,
3 und 4). Vorzugsweise wird als rekombinanter Vektor ein
Plasmidvektor, insbesondere ein Multi Copy-Plasmidvektor
verwendet.
Der beim erfindungsgemäßen Verfahren verwendete Wirtsorganismus
enthält die für eine Biosynthese von Hydroxyalkanoat-Polymeren
erforderliche Gene. Neben dem Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen
handelt sich dabei üblicherweise um ein β-Ketothiolasegen
oder/und ein Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen. Bei Verwendung eines
Wirtsorganismus, der eines oder beide dieser oben genannten
Gene nicht enthält, ist es zweckmäßig, das betreffende Gen bzw.
die betreffenden Gene in den Wirtsorganismus einzuführen, um
den Substratpool für die Polyhydroxyalkanoat-Synthase zu
erhöhen. In einer besonders bevorzugten Ausführungsform der
vorliegenden Erfindung enthält der Wirtsorganismus auch das β-
Ketothiolasegen oder/und das Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen unter
gesteigerter Expressionskontrolle.
Um eine gesteigerte Expressionskontrolle zu erreichen, können
das β-Ketothiolasegen oder/und das Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen
beim erfindungsgemäßen Verfahren - wie z. B. im nativen PHB-
Operon von Alcaligenes eutrophus - unter Kontrolle einer
einzigen Transkriptionsregulationssequenz stehen, vorausge
setzt, daß es sich um eine heterologe Transkriptionsregula
tionssequenz handelt, die gleich oder verschieden zu einer
heterologen Transkriptionsregulationssequenz für das PHA-
Synthasegen sein kann. Hierzu können z. B. das PHA-Synthasegen,
das β-Ketothiolasegen und das Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen im
Wirtsorganismus auf einem einzigen extrachromosomalen Plasmid
unter Kontrolle gleicher oder verschiedener Transkriptions
regulationssequenzen angeordnet sein. Andererseits kann der
Wirtsorganismus auch zwei verschiedene kompatible Plasmide mit
unterschiedlichen Replikationsursprüngen enthalten, wobei das
erste Plasmid das PHA-Synthasegen unter Kontrolle einer ersten
heterologen Transkriptionsregulationssequenz und das andere
Plasmid das β-Ketothiolasegen und das Acetoacetyl-CoA-Reduk
tasegen unter Kontrolle einer zweiten heterologen Transkrip
tionsregulationssequenz enthält, wobei die erste und die zweite
Transkriptionsregulationssequenz gleich oder verschieden sein
können.
Andererseits führt auch die Verwendung einer heterologen Trans
lationssequenz alleine schon zu einer gesteigerten Expressions
kontrolle.
Ein weiteres wesentliches Merkmal des erfindungsgemäßen Verfah
rens besteht darin, daß man ein im wesentlichen glucosefreies
Kulturmedium verwendet. Unter einem im wesentlichen glucose
freien Kulturmedium ist ein Medium zu verstehen, das weniger
als 0,01 Gew.-% Glucose, vorzugsweise weniger als 0,001 Gew.-%
Glucose, besonders bevorzugt weniger als 0,0001 Gew.-% Glucose
und am meisten bevorzugt überhaupt keine (als solche zugesetz
te) Glucose enthält. Weiterhin ist es bevorzugt, daß das
Kulturmedium im wesentlichen auch keine anderen Kohlehydrate,
z. B. Fructose, Lactose, Maltose, Saccharose und ähnliche Zucker
in gereinigter oder roher Form enthält. Auf diese Weise erzielt
man eine erhebliche Kostenverringerung bei der Fermentation des
Wirtsorganismus, ohne gleichzeitig eine drastische Einbuße der
PHB-Ausbeute in Kauf nehmen zu müssen.
Beispiele für geeignete Kulturmedien sind solche, die zur Züch
tung des jeweiligen Wirtsorganismus geeignet sind. Solche
Medien enthalten eine Stickstoff- und eine Kohlenstoffquelle,
wobei die Kohlenstoffquelle keine Glucose und vorzugsweise auch
kein anderer Zucker ist. Beispiele für geeignete Kohlenstoff
quellen sind Fleischextrakte, Bakterienextrakte, Hefenextrakte,
Casaminosäuren oder im wesentlichen zuckerfreie industrielle
Abwässer, die Aminosäuren oder/und Bestandteile von Mikroorga
nismen wie etwa Hefen und Bakterien enthalten. In einer
Ausführungsform der Erfindung verwendet man "Vollmedien", die
als Kohlenstoffquellen enzymatisch verdaute Fleisch-, Bakterien-
und/oder Hefeextrakte enthalten. Spezifische Beispiele hierfür
sind das bB-Medium, das NZCYM-Medium, NZYM-Medium, das NZM-
Medium, das Terrific-Broth-Medium, das SOB-Medium oder das YT-
Medium, deren Zusammensetzung in Sambrook et al., Molecular
Cloning. A Laboratory Manual, 2nd. Edition (1989), Cold Spring
Harbor, Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Appendix H)
beschrieben ist.
Bei Verwendung derartiger Medien ohne Glucosezusatz wurde
erfindungsgemäß eine Ausbeute von bis zu 70 Gew.-% PHB bezüg
lich des Trockengewichts der Zelle gefunden, während ein
Mikroorganismus, der das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen ohne
gesteigerte Expressionskontrolle enthält, unter vergleichbaren
Bedingungen maximal 10 Gew.-% PHB bildet.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform der vorliegenden
Erfindung kann man auch ein Mineralmedium (z. B. ein M9-Medium,
vgl. Sambrook et al., supra) verwenden, dem eine Kohlenstoff
quelle, wie etwa Casaminosäuren oder eine andere der oben
genannten C-Quellen in einem Anteil von 0,01 bis 1 Gew.-%,
besonders bevorzugt 0,02 bis 0,5 Gew.-% und am meisten bevor
zugt 0,05 bis 0,2 Gew.-% zugesetzt wird. Bei Verwendung eines
Mineralmediums ist es weiterhin bevorzugt, daß der pH-Wert-Be
reich von 6,5 bis 7,5 eingestellt wird. Bei Verwendung eines
Mineralmediums oder eines mit Mineralmedium (vorzugsweise im
Verhältnis von 2 : 1 bis 9 : 1) verdünnten Vollmediums erhält man
eine PHB-Ausbeute von bis zu 40 Gew.-% auf Basis des Gesamtzel
lentrockengewichts. Diese Ausbeute ist zwar etwas geringer als
die bei Verwendung eines Vollmediums. Aufgrund des geringeren
Preises eines Mineralmediums oder eines verdünnten Vollmediums
kann jedoch deren Verwendung in vielen Fällen bevorzugt sein.
Weitere Vorteile des erfindungsgemäßen Verfahrens sind, daß die
Kultivierung des Wirtsorganismus durch die gesteigerte Expres
sionskontrolle des Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens und der
anderen Gene des PHB-Operons überraschenderweise nicht beein
trächtigt wird und daß durch das erfindungsgemäße Verfahren
bereits während einer frühen Phase (ca. 2 bis 7 h) der Kulti
vierung des Wirtsorganismus eine höhere Produktbildung als bei
einem Wirtsorganismus ohne gesteigerte Expressionskontrolle in
einem glucosehaltigen Kulturmedium zu erkennen ist.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist eine re
kombinante DNA, die ein Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen unter
gesteigerter Expressionskontrolle, vorzugsweise unter Kontrolle
- (a) einer heterologen Transkriptionsregulationssequenz,
- (b) einer heterologen Translationsregulationssequenz oder
- (c) einer Kombination von (a) und (b) enthält.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein
rekombinanter Vektor, der mindestens eine Kopie einer erfin
dungsgemäßen rekombinanten DNA enthält. Vorzugsweise ist der
erfindungsgemäße Vektor ein extrachromosomaler zirkulärer
Plasmidvektor, der neben der erfindungsgemäßen rekombinanten
DNA einen mit dem jeweiligen Wirtsorganismus geeigneten
Replikationsursprung sowie gegebenenfalls einen Selektions
marker (z. B. ein Antibiotikumresistenzgen) enthält. Der
erfindungsgemäße Vektor ist ein prokaryontischer Vektor, d. h.
ein zur Expression des PHA-Synthasegens in einem prokaryonti
schen Wirtsorganismus geeigneter Vektor.
Die Erfindung betrifft auch eine prokaryontische Zelle, die mit
einer erfindungsgemäßen rekombinanaten DNA oder mit einem
erfindungsgemäßen rekombinanten Vektor transformiert ist. Die
erfindungsgemäße prokaryontische Zelle ist vorzugsweise eine
gram-negative prokaryontische Zelle und ist besonders bevorzugt
eine E.coli-Zelle. Vorzugsweise enthält die erfindungsgemäße
prokaryontische Zelle weiterhin ein β-Ketothiolasegen oder/und
ein Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen unter gesteigerter Expres
sionskontrolle.
Die erfindungsgemäße rekombinante DNA kann zur Synthese von
Polyhydroxyalkanoaten in prokaryontischen Wirtsorganismen
verwendet werden. Ein hierfür geeigneter Wirtsorganismus
enthält vorzugsweise darüber hinaus ein β-Ketothiolasegen und
ein Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen.
Die Plasmide pSYN (E.coli BMH 71-18) und pUMS (E.coli DH5
alpha) wurden am 12.05.1994 bei der DSM - Deutsche Sammlung von
Mikroorganismen und Zellkulturen mbH, Mascheroder Weg 1b, 38124
Braunschweig unter den Nummern DSM 9202 (pSYN) und DSM 9201
(pUMS) hinterlegt.
Weiterhin wird die vorliegende Erfindung unter Bezugnahme auf
die folgenden Beispiele, Figuren und Sequenzprotokolle erläu
tert.
Es zeigen:
Fig. 1a eine schematische Darstellung des Plasmids p4A,
welches das komplette phbCAB-Operon unter Kontrolle
der nativen Transkriptionsregulationssequenz enthält,
Fig. 1b eine schematische Darstellung des Plasmids pUMS, wel
ches die Gene phbA und phbB unter Kontrolle des lac-
Promotor/Operators enthält,
Fig. 1c eine schematische Darstellung des Plasmids pDSP, wel
ches das phbC-Gen unter Kontrolle der nativen Trans
kriptionsregulationssequenz enthält,
Fig. 1d eine schematische Darstellung des Plasmids pSYN, wel
ches das phbC-Gen unter Kontrolle des lac-Promo
tor/Operators und der Shine-Dalgarno-Sequenz von Gen
10 des Bakteriophagen T7 enthält,
Fig. 2a eine schematische Darstellung des positiven Selek
tionsvektors pGS23, der die ribosomale Bindungsstelle
des Bacteriophagen T7 Gen 10 enthält,
Fig. 2b eine schematische Darstellung der Plasmide puc19-THIO
und pG5-THIO, die das phbA-Gen unter Kontrolle des
lac-Promotor/Operators und der nativen bzw. der T7
Gen 10 SD-Sequenz enthalten.
SEQ ID NO. 1: das synthetische Oligonukleotid (1),
SEQ ID NO. 2: das synthetische Oligonukleotid (2),
SEQ ID NO. 3: das synthetische Oligonukleotid (3),
SEQ ID NO. 4: das synthetische Oligonukleotid (4),
SEQ ID NO. 5: das synthetische Oligonukleotid (5),
SEQ ID NO. 6: das synthetische Oligonukleotid (6) und
SEQ ID NO. 7: das synthetische Oligonukleotid (7).
SEQ ID NO. 1: das synthetische Oligonukleotid (1),
SEQ ID NO. 2: das synthetische Oligonukleotid (2),
SEQ ID NO. 3: das synthetische Oligonukleotid (3),
SEQ ID NO. 4: das synthetische Oligonukleotid (4),
SEQ ID NO. 5: das synthetische Oligonukleotid (5),
SEQ ID NO. 6: das synthetische Oligonukleotid (6) und
SEQ ID NO. 7: das synthetische Oligonukleotid (7).
Als Ausgangsmaterial diente das Plasmid p4A, das alle drei Gene
des PHB-Operons aus Alcaligenes eutrophus unter Kontrolle ihrer
nativen Transkriptionsregulationssequenz in der in Fig. 1a ge
zeigten schematischen Anordnung enthält. Dieses Plasmid wurde
bereits von Janes et al. (1990), Molecular Characterization of
the Poly-β-hydroxybutyrate Biosynthetic Pathway of Alcaligenes
eutrophus H16. In: Novel Biodegradable Microbial Polymers
(Dawes, E.A., Hrsg.) S. 175-190, Kluwer, Dordrecht, beschrie
ben.
Zur Konstruktion von pUMS wurden die phbA- und phbB-Gene aus
dem Plasmid p4A in das Plasmid pUM1 kloniert, das ein Derivat
von pACYC184 (Chang und Cohen, J. Bacteriol. 134 (1978), 1141-
1156) ist, in dem das 0,5 kb PvuII-Fragment mit dem Kanamycin-
Resistenzgen durch das 0,8 kb PvuII-Fragment aus pUc19
(Yanisch-Perron et al., Gene 33 (1985), 103-119) ersetzt wurde,
auf dem sich die lac-Promotor-Operator-Sequenz befindet. Ein
2,3 kb PstI-Fragment des Plasmids p4A wurde nach partieller
Spaltung des Plasmids isoliert und in die PstI-Restriktions
stelle des Plasmids pUM1 insertiert. Die Ligationsmischung
wurde dann zur Transformation von E.coli CQ21 (Raab et al., J.
Mol. Biol. 199 (1988), 5-105) durch Elektroporation nach der
von Zabarovsky und Winberg (Nucleic Acids Res. 18 (1990), 5912)
beschriebenen Prozedur transformiert. Transformanten wurden auf
Platten mit 150 µg/ml Ampicillin selektioniert. Plasmid-DNA mit
Insertionen der erwarteten Größe wurden mit PstI gespalten,
wodurch drei Fragmente entstanden, die den ursprünglichen
Klonierungsvektor pUMI und die 480 bp und 1,8 kb PstI-Fragmente
aus dem Plasmid p4A darstellen. Die Orientierung des klonierten
phbA-, phbB-Fragments in dem resultierenden Plasmid pUMS wurde
durch Restriktionsspaltung mit KpnI bestimmt. Das erhaltene
Restriktionsmuster zeigte, daß das Plasmid das insertierte DNA-
Fragment in einer Orientierung enthält, die eine transkriptio
nelle Kontrolle beider Gensequenzen durch das lac-Promo
tor/Operator-System erlaubt (vgl. Fig. 1b).
Durch eine partielle PstI-Spaltung des Plasmids p4A wurde ein
das phbC-Gen, das Ampicillin-Resistenzgen und den Replikations
ursprung enthaltendes 5,5 kb DNA-Fragment isoliert und reli
giert. Nach Elektroporation des Ligationsgemisches in E.coli
CQ21 wurde ein Plasmid erhalten, das ein 2,3 kb Deletionsklon
des Plasmids p4A ist. Dieses Plasmid wurde als pDSP bezeichnet
und ist schematisch in Fig. 1c dargestellt.
Unter Verwendung des Plasmids pDSP und der synthetischen
Oligonucleotide (1) 5′-GAACAATCAACATATGGCGACCGG-3′ und
(2) 5′-AATCCCGGGTAGGATCCCTTGGCTTTGACGTATCG- 3, wurde eine NdeI-
Restriktionsstelle einschließlich des Startkodons von phbC und
eine BamHI-Stelle stromabwärts des phbC-Gens von Plasmid pDSP
unter Verwendung der PCR-Technik eingeführt. Das PCR-Produkt
wurde anschließend mit NdeI- und BamHI gespalten und das 1767
bp NdeI-BamHI-Fragment wurde in die NdeI- und BamHI-Restrik
tionsstellen des Plasmids pGS23 insertiert, das ein positiver
Selektionsvektor auf Basis der Lambda-Lysiskassette mit dem
S105 amber-Allel zusammen mit den R- und Rz-Funktionen ist
(siehe Beispiel 4.2). Für eine positive Selektion des Inserts,
das das phbc-Gen in pGS23 enthält, wurde die Ligationsmischung
durch Elektroporation in den E.coli-Supressorstamm MS59
(Messing et al., Nucleic Acids Res. 9 (1981), 309-321) trans
formiert, der vollständig die S105-Funktion wieder herstellt.
Auf diese Weise konnte eine positive Selektion auf das inser
tierte Fragment des phbC-Gens in pGS23 mit einem Wirkungsgrad
von 100% durchgeführt werden.
Unter Verwendung des Plasmids pGS-SYN wurde ein Stopkodon TGA
an Kodon 590 im phbC-Gen mittels einer ortsspezifischen
Mutagenese unter Verwendung des mutagenen Oligonucleotids (3)
5′-CGGTACCCGGTCATGCCTTGGC-3′ gemäß Deng und Nickoloff (Anal.
Biochem. 200 (1992), 81) eingeführt.
Auf dem Plasmid pSYN befindet sich das phbC-Gen unter Kontrolle
des lac-Promotors und enthält - anstelle der nativen Transla
tionskontrollsequenz (vgl. Fig. 1c) - die Translationskontroll
sequenz von Gen 10 des Bakteriophagen T7 (vgl. Fig. 1d).
Zur Bestimmung des PHB-Gehalts von rekombinanten E.coli-Zellen
wurde PHB aus Proben von gefriergetrockneten Zellen durch
Methanolyse nach der Technik von Braunegg et al. (Appl.
Microbiol. Biotechnol. 6 (1978), 29-37) in das 3-Hydroxybutter
säure-methyl-esterderivat überführt. Dieser Ester wurde
gaschromatographisch mit einem Shimadzu C-4A-Gaschromatographen
analysiert, der mit einer Permaphase PEG 25 Mx-Kapillarsäule
(25 m × 0,32 mm, Perkin Elmer) und einem Flammenionisations
detektor ausgestattet war. Ein 2 µl Aliquot der organischen
Phase wurde unter Verwendung von Helium als Trägergas analy
siert. Die Temperaturen des Injektors und des Detektors waren
180°C bzw. 220°C. Zur wirksamen Abtrennung des Esters wurde ein
Temperaturprogramm verwendet (70°C für 1 Min., Temperatur
anstieg von 8°C pro Min., 200°C für 5 Min.). Unter diesen
Bedingungen waren die Retentionszeiten für 3 verschiedene 3-
Hydroxyalkanoatsäuremethylester-Standards wie folgt: C4 : 4,33
und C5 : 5,83.
Es wurde ein Vergleich folgender rekombinanter E.coli-Stämme
durchgeführt: (i) E.coli/Plasmid p4A, wo das phbCAB-Operon
unter nativer Expressionskontrolle ist, (ii) E.coli/Plasmide
pDSP und pUMS, wo die Expression der phbAB-Gene unter Kontrolle
des lac-Promotors und die Expression des phbC-Gens unter
nativer Expressionskontrolle ist und (iii) E.coli/Plasmide pSYN
und pUMS, wo die Expression des phbC-Gens unter Kontrolle des
lac-Promotors und der ribosomalen Bindungsstelle des T7-Gens 10
stattfindet.
Der Vergleich wurde in bB-Medium und bB-Medium + 1% Glucose
durchgeführt. Der die Plasmide enthaltende E.coli-Stamm war der
laci-Stamm MC4100 (Silhary et al. (1984), Experiments with
Genefusions. Cold Spring Harbor baboratory, New York, S. XI-
XII).
Die Ergebnisse dieser Versuche sind in Tabelle 1 dargestellt.
Proben zur Bestimmung der gaschromatographischen PHB-Erzeugung
wurden zu den angegebenen Zeiten entnommen.
Überraschenderweise wurde gefunden, daß bei Verwendung eines
unter Kontrolle einer heterologen Transkriptions- und Transla
tionsregulationssequenz stehenden phbC-Gens auch in einem
glucosefreien Medium eine starke PHB-Synthese gefunden wurde.
Weiterhin wurde ein Versuch zur PHB-Synthese in rekombinantem
E.coli unter Verwendung synthetischer Medien durchgeführt.
Die Ergebnisse dieses Versuchs sind in Tabelle 2 dargestellt.
Die angegebenen Medien enthalten pro Liter die folgenden Kompo
nenten:
Die Ergebnisse in den Tabellen 1 und 2 zeigen, daß ein Wirts
organismus, der das phbC-Gen unter gesteigerter Expressionskon
trolle enthält, auch in einem Medium ohne Zusatz von Glucose
signifikante Mengen an PHB erzeugt.
Erhöhung der β-Ketothiolase- und Acetoacetyl-CoA-Reduktase-
Aktivität durch Steigerung der Expressionskontrolle.
Es wurde die β-Ketothiolase- und Acetoacetyl-CoA-Reduktaseakti
vität folgender rekombinanter E.coli-Stämme durchgeführt:
- (i) E.coli/Plasmid p4A und
- (ii) E.coli/Plasmide pDSP und pUMS.
Der Vergleich wurde in LB-Medium und LB-Medium + 1% Glucose
durchgeführt. Der die Plasmide enthaltende E.coli-Stamm war der
laci-Stamm MC4100 (vgl. Beispiel 3).
Die Ergebnisse dieser Versuche sind in Tabelle 3 dargestellt.
Die Aktivitäten von β-Ketothiolase und Acetoacetyl-CoA-Reduk
tase aus dem Plasmid p4A sind in jeder Säule als 100% angege
ben. Die Aktivitäten von β-Ketothiolase und Acetoacetyl-CoA-
Reduktase in der löslichen Proteinfraktion wurden nach dem
Verfahren von Senior und Dawes (Biochem. J. 125 (1971), 55-68)
bestimmt. Eine Enzymeinheit U ist als Umsatz von 1 µmol
Substrat pro Minute definiert.
Die Ergebnisse in der Tabelle 3 zeigen, daß ein Wirtsorganis
mus, der das phbA- und das phbB-Gen unter gesteigerter Ex
pressionskontrolle enthält, auch in einem Medium ohne Zusatz
von Glucose eine deutliche Erhöhung der von den jeweiligen
Genen codierten Enzymaktivität zeigt.
Konstruktion des positiven Selektionsvektors pGS23
Aus dem Plasmid pLS157 (Bläsi et al., EMBO J. 8 (1989), 3501- 3510) wurde die Lambda-Lysiskassette, die die Gene S, R und Rz enthält, auf einem 1456 bp EcoRI-BamHI-Fragment isoliert und in einem mit EcoRI und BamHI linearisierten M13mp18 Vektor inser tiert. Dann wurde an Codon 56 des S-Wildtypgens mittels einer Stellen-spezifischen Mutagenese unter Verwendung des syntheti schen Oligonucleotids (4) 5′-CACGAATGAACTAGGCGATAATGG-3′ nach der Methode von Kunkel et al. (Methods Enzymol. 154 (1987), 367-382) eine amber-Mutation eingeführt. Anschließend wurde eine NdeI-Restriktionsstelle innerhalb des Met-Codons 3 des S- Gens durch Stellen-spezifische Mutagenese unter Verwendung des Oligonucleotids (5) 5′-TTTCTGGCATATGCATGTCTTACCC-3′ herge stellt. Das resultierende S105 amber-Allel wurde als Nde-BamHI- Fragment in das Plasmid pET-3C (Rosenberg et al., Gene 56 (1987), 125-135) kloniert, so daß das Startcodon des 5105 amber-Allels an die Shine-Dalgarno-Sequenz des Bacteriophagen T7 Gen 10 angrenzt. Das mit der T7 Gens 10 Shine-Dalgarno- Sequenz versehene S105 amber-Allel wurde zusammen mit den R- und Rz-Genen auf einem XbaI-BamHI-Fragment reisoliert und in die XbaI- und BamHI-Stellen des Plasmids pUC19 kloniert. Im erhaltenen puc19-Derivat wurde die NdeI-Restriktionsstelle durch partielle Spaltung mit NdeI und anschliessende kurze Behandlung mit der Nuclease BaI31 eliminiert. Der resultierende positive Selektionsvektor pGS23 enthält eine singuläre NdeI-Re striktionsstelle, die sich am Met-Codon 1 des S105 am-Allels befindet (vgl. Fig. 2a).
Aus dem Plasmid pLS157 (Bläsi et al., EMBO J. 8 (1989), 3501- 3510) wurde die Lambda-Lysiskassette, die die Gene S, R und Rz enthält, auf einem 1456 bp EcoRI-BamHI-Fragment isoliert und in einem mit EcoRI und BamHI linearisierten M13mp18 Vektor inser tiert. Dann wurde an Codon 56 des S-Wildtypgens mittels einer Stellen-spezifischen Mutagenese unter Verwendung des syntheti schen Oligonucleotids (4) 5′-CACGAATGAACTAGGCGATAATGG-3′ nach der Methode von Kunkel et al. (Methods Enzymol. 154 (1987), 367-382) eine amber-Mutation eingeführt. Anschließend wurde eine NdeI-Restriktionsstelle innerhalb des Met-Codons 3 des S- Gens durch Stellen-spezifische Mutagenese unter Verwendung des Oligonucleotids (5) 5′-TTTCTGGCATATGCATGTCTTACCC-3′ herge stellt. Das resultierende S105 amber-Allel wurde als Nde-BamHI- Fragment in das Plasmid pET-3C (Rosenberg et al., Gene 56 (1987), 125-135) kloniert, so daß das Startcodon des 5105 amber-Allels an die Shine-Dalgarno-Sequenz des Bacteriophagen T7 Gen 10 angrenzt. Das mit der T7 Gens 10 Shine-Dalgarno- Sequenz versehene S105 amber-Allel wurde zusammen mit den R- und Rz-Genen auf einem XbaI-BamHI-Fragment reisoliert und in die XbaI- und BamHI-Stellen des Plasmids pUC19 kloniert. Im erhaltenen puc19-Derivat wurde die NdeI-Restriktionsstelle durch partielle Spaltung mit NdeI und anschliessende kurze Behandlung mit der Nuclease BaI31 eliminiert. Der resultierende positive Selektionsvektor pGS23 enthält eine singuläre NdeI-Re striktionsstelle, die sich am Met-Codon 1 des S105 am-Allels befindet (vgl. Fig. 2a).
Das Plasmid pTZ18-PHB (Slater et al., J. Bacteriol. 170 (1988),
4431-4436), das die PHB-Gene aus Alcaligenes eutrophus H16 ent
hält, wurde mit PstI und NruI gespalten. Das resultierende 1902
bp Fragment mit dem phbA-Gen wurde in puc19 insertiert, das
zuvor partiell mit PvuII und vollständig mit PstI gespalten
worden war. Im resultierenden Plasmid pUc19-THIO (Fig. 2b)
erfolgt die Transkription des phbA-Gens durch den lac-Promotor,
während die Translation durch die nativen phbA-Translations
initiationssignale erfolgt.
Unter Verwendung des Plasmids puc19-THIO und der synthetischen
Oligonucleotide (6) 5′-GGACTACACATATGACTG-3′ und (7)
5′-AATGGATCCTTATTTGCGCTCGAC-3′ als Primer wurde ein PCR-Produkt
erzeugt, das anschließend mit NdeI und BamHI gespalten wurde.
Das resultierende 1185 bp lange NdeI-BamHI-Fragment wurde in
die entsprechenden Restriktionsstellen des positiven Selek
tionsvektors pGS23 insertiert. Die Ligationsmischung wurde in
den E.coli-Supressorstamm MS59 (Messing et al. (1981) supra)
transformiert. Alle Plasmide, die aus Kolonien auf LB-Ampicil
lin-Platten erhalten wurden, hatten die Lambda-Lysis-Kassette
verloren und enthielten die phbA-Insertion. In pGS-THIO ist die
ribosomale Bindungssequenz des phbA-Gens durch die des Phagen
T7 Gen 10 ersetzt (vgl. Fig. 2b).
Die E.coli-Stämme MC4100/pUC-THIO und MC4100/pGS-THIO wurden
über Nacht in LB-Ampicillin-Medium kultiviert, abzentrifugiert,
durch Sonifizierung aufgeschlossen und in 20 mM Phosphatpuffer,
pH 7,2, 5 mM MgCl₂, 1 mM EDTA, 1 mM Dithiotreitol und 1 M
Glycerin resuspendiert. Die spezifische Aktivität der β-
Ketothiolase unter Verwendung der spektrophotometrischen
Methode von Davis et al. (J. Biol. Chem. 262 (1987), 82-89)
wurde in drei unabhängigen Messungen bestimmt. Dabei wurden in
E.coli MC4100/pUc19-THIO 33 ± 5 und in E.coli MC4100/pGS-THIO
63 ± 7 β-Ketothiolase-Einheiten pro mg Protein gefunden.
Dieses Ergebnis zeigt, daß die Steigerung der Expressionskon
trolle des phbA-Gens durch Verwendung einer Kombination von
heterologer Transkriptionsregulationssequenz (lac-Promotor/Ope
rator) und heterologer Translationsregulationssequenz (T7 Gen
10 SD-Sequenz) weiter verbessert werden kann.
Claims (28)
1. Verfahren zur Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in
einem prokaryontischen Wirtsorganismus, der die für eine
Biosynthese von Hydroxyalkanoat-Polymeren erforderlichen
Gene enthält, durch Kultivierung des Wirtsorganismus in
einem Medium unter solchen Bedingungen, die zur Bildung
von Polyhydroxyalkanoaten durch den Wirtsorganismus
führen,
dadurch gekennzeichnet,
daß man einen Wirtsorganismus, der mindestens eine Kopie
eines Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens unter gesteigerter
Expressionskontrolle enthält, und ein im wesentlichen
glucosefreies Kulturmedium verwendet.
2. Verfahren nach Anspruch 1,
dadurch gekennzeichnet,
daß man einen gram-negativen prokaryontischen Wirts
organismus verwendet.
3. Verfahren nach Anspruch 1 oder 2,
dadurch gekennzeichnet,
daß man E.coli als Wirtsorganismus verwendet.
4. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen aus einem Mikroor
ganismus stammt, der aus den Gattungen Bacillus, Alcali
genes, Zoogloea, Pseudomonas, Chromatium und Thiocystis
ausgewählt wird.
5. Verfahren nach Anspruch 4,
dadurch gekennzeichnet,
daß das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen aus Alcaligenes
eutrophus stammt.
6. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 5,
dadurch gekennzeichnet,
daß man zur gesteigerten Expressionskontrolle des Poly
hydroxyalkanoat-Synthasegens
- (a) eine heterologe Transkriptionsregulationssequenz,
- (b) eine heterologe Translationsregulationssequenz oder
- (c) eine Kombination aus (a) und (b) verwendet.
7. Verfahren nach Anspruch 6,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen unter Kon
trolle einer heterologen Transkriptionsregulationssequenz
verwendet.
8. Verfahren nach Anspruch 7,
dadurch gekennzeichnet,
daß die heterologe Transkriptionsregulationssequenz, unter
deren Kontrolle sich das Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen
befindet, einen E.coli- oder E.coli-Phagenpromotor oder
einen davon abgeleiteten Promotor umfaßt.
9. Verfahren nach Anspruch 8,
dadurch gekennzeichnet,
daß die heterologe Transkriptionsregulationssequenz einen
E.coli lac-Promotor oder einen davon abgeleiteten Promotor
umfaßt.
10. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen unter Kon
trolle einer heterologen Translationsregulationssequenz
verwendet.
11. Verfahren nach Anspruch 10,
dadurch gekennzeichnet,
daß die heterologe Translationsregulationssequenz eine
mindestens 6 Nucleotide lange Basenfolge umfaßt, die zur
Anti-Shine-Dalgarno-Sequenz am 3′-Ende der 16S rRNA des
jeweiligen Wirtsorganismus komplementär ist.
12. Verfahren nach Anspruch 11,
dadurch gekennzeichnet,
daß die Translationsregulationssequenz die Basenfolge 5,-
AAGGAG-3′ umfaßt, wobei das 3′-Ende dieser Basenfolge
einen Abstand von 6-10 Nucleotiden vom ATG-Startcodon
des Polyhydroxyalkanoat-Synthasegens aufweist.
13. Verfahren nach Anspruch 11 oder 12,
dadurch gekennzeichnet,
daß die Translationsregulationssequenz stromaufwärts der
zur Anti-Shine-Dalgarno-Sequenz komplementären Basenfolge
eine weitere Basenfolge 5′-TTAACTTTA-3′ umfaßt.
14. Verfahren nach einem der Ansprüche 10 bis 13,
dadurch gekennzeichnet,
daß man die Translationsregulationssequenz von Gen 10 des
Bacteriophagen T7 verwendet.
15. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man einen Wirtsorganismus verwendet, der das Poly
hydroxyalkanoat-Synthasegen auf einem extrachromosomalen
Plasmid enthält.
16. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man einen Wirtsorganismus verwendet, der weiterhin ein
β-Ketothiolasegen oder/und ein Acetoacetyl-CoA-Reduktase
gen enthält.
17. Verfahren nach Anspruch 16,
dadurch gekennzeichnet,
daß man einen Wirtsorganismus verwendet, der das β-
Ketothiolasegen oder/und das Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen
unter gesteigerter Expressionskontrolle enthält.
18. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Kulturmedium verwendet, das im wesentlichen
frei von Kohlehydraten ist.
19. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Kulturmedium verwendet, das als Kohlenstoff
quelle enzymatisch verdaute Bakterien-, Fleisch- oder/und
Hefeextrakte, Casaminosäuren oder Gemische davon enthält.
20. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Kulturmedium verwendet, das als Kohlenstoff
quelle im wesentlichen zuckerfreie industrielle Abwässer
mit Aminosäuren oder/und Bestandteilen von Mikroorganismen
enthält.
21. Verfahren nach einem der vorhergehenden Ansprüche,
dadurch gekennzeichnet,
daß man ein Mineralmedium mit einem Gehalt einer Kohlen
stoffquelle von 0,05 bis 0,5 Gew.-% verwendet.
22. Verfahren nach Anspruch 21,
dadurch gekennzeichnet,
daß der pH-Wert des Mediums im Bereich von 6,5 bis 7,5
ist.
23. Rekombinante DNA,
dadurch gekennzeichnet,
daß sie ein Polyhydroxyalkanoat-Synthasegen unter gestei
gerter Expressionskontrolle umfaßt.
24. Rekombinante DNA nach Anspruch 23,
dadurch gekennzeichnet,
daß das Polyhydroxyalkanoat-Synthesegen unter Kontrolle
- (a) einer heterologen Transkriptionsregulationssequenz,
- (b) einer heterologen Translationsregulationssequenz oder
- (c) einer Kombination aus (a) und (b) ist.
25. Rekombinanter Vektor,
dadurch gekennzeichnet,
daß er mindestens eine Kopie einer rekombinanten DNA nach
Anspruch 23 oder 24 enthält.
26. Prokaryontische Zelle,
dadurch gekennzeichnet,
daß sie mit einer rekombinanten DNA nach Anspruch 23 oder
24 oder mit einem rekombinanten Vektor nach Anspruch 25
transformiert ist.
27. Prokaryontische Zelle nach Anspruch 26,
dadurch gekennzeichnet,
daß sie weiterhin ein β-Ketothiolasegen oder/und ein
Acetoacetyl-CoA-Reduktasegen unter gesteigerter Expres
sionskontrolle enthält.
28. Verwendung einer rekombinanten DNA nach Anspruch 23 oder
24 zur Synthese von Polyhydroxyalkanoaten in prokaryonti
schen Wirtsorganismen.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19944417169 DE4417169A1 (de) | 1994-05-17 | 1994-05-17 | Rekombinante Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in glucosefreiem Medium |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
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DE19944417169 DE4417169A1 (de) | 1994-05-17 | 1994-05-17 | Rekombinante Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in glucosefreiem Medium |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE4417169A1 true DE4417169A1 (de) | 1995-11-23 |
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ID=6518231
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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DE19944417169 Ceased DE4417169A1 (de) | 1994-05-17 | 1994-05-17 | Rekombinante Herstellung von Polyhydroxyalkanoaten in glucosefreiem Medium |
Country Status (1)
Country | Link |
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DE (1) | DE4417169A1 (de) |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
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