DE19812020A1 - Reaktive, diodenlaser-kompatible Tandem-Farbstoffe als Marker für Biomoleküle und Arzneistoffe - Google Patents

Reaktive, diodenlaser-kompatible Tandem-Farbstoffe als Marker für Biomoleküle und Arzneistoffe

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Abstract

Die vorliegende Erfindung betrifft reaktive, wasserlösliche Farbstoffe auf der Grundlage von Cyanin-Farbstoffen bzw. von Quadratsäure-Farbstoffen und ihrer Derivate, die eine kovalente Bindung mit Biomolekülen wie z. B. Proteine, Lipide, Polynucleotide, DNA oder Drogen und Pharmaka eingehen können. Die reaktiven Moleküle bestehen aus zwei bzw. drei Untereinheiten, die kovalent miteinander verknüpft sind und von denen die eine Einheit bzw. zwei Einheiten als Donor und eine Einheit als Akzeptor fungiert, die durch eine oder mehrere kovalente Bindungen voneinander getrennt sind. Bei Anregung der Donoreinheit bzw. der Donormoleküle wird die Energie strahlungslos nach dem Förster-Mechanismus auf die Akzeptoreinheit übertragen und erst diese sendet Licht einer bestimmten Wellenlänge aus. Voraussetzung für die strahlungslose Energieübertragung zwischen dem Donor und Akzeptor ist, daß das Emissionsspektrum des Donors bzw. der Donormoleküle teilweise mit dem Absorptionsspektrum des Akzeptors überlappt. Da die Emissionswellenlänge des Akzeptors gegenüber jener des Donors bathochrom verschoben ist, resultiert daraus eine erhöhte Stokes-Verschiebung, die bei fluoreszenz-optischen Messungen von großer Bedeutung ist. Im Falle der Bis-Donor-Verbindungen ist auch eine Erhöhung des Extinktionskoeffizienten zu erwarten. Die Tandem-Farbstoffe dienen insbesondere der Fluoreszenzmarkierung von biologischen Materialien. Die markierten Moleküle können dann in optischen, insbesondere ...

Description

Die vorliegende Erfindung betrifft reaktive, wasserlösliche Farbstoffe auf der Grundlage von Cyanin-Farbstoffen bzw. von Quadratsäure-Farbstoffen und ihrer Derivate, die eine kovalenten Bindung mit Biomolekülen wie z. B. Proteine, Lipide, Polynucleotide, DNA oder Drogen und Pharmaka eingehen können. Die reaktiven Moleküle bestehen aus zwei bzw. drei Untereinheiten, die kovalent miteinander verknüpft sind und von denen die eine Einheit bzw. zwei Einheiten als Donor und eine Einheit als Akzeptor fungiert, die durch eine oder mehrere kovalente Bindungen voneinander getrennt sind. Bei Anregung der Donoreinheit bzw. der Donormoleküle wird die Energie strahlungslos nach dem Förster-Mechanismus auf die Akzeptoreinheit übertragen und erst diese sendet Licht einer bestimmten Wellenlänge aus. Voraussetzung für die strahlungslose Energieübertragung zwischen dem Donor und Akzeptor ist, daß das Emisssionspektrum des Donors bzw. der Donormokeküle teilweise mit dem Absorptionsspektrum des Akzeptors überlappt. Da die Emissionswellenlänge des Akzeptors gegenüber jener des Donors bathochrom verschoben ist, resultiert daraus eine erhöhte Stokes- Verschiebung, die bei fluoreszenz-optischen Messungen von großer Bedeutung ist. Im Falle der Bis-Donor-Verbindungen ist auch eine Erhöhung des Extinktionskoeffizienten zu erwarten. Die Tandem-Farbstoffe dienen inbesondere der Fluoreszenzmarkierung von biologischen Materialien. Die markierten Moleküle können dann in optischen, insbesonders fluoreszenz-optischen Bestimmungsverfahren eingesetzt werden. Typische Assays beruhen auf der Reaktion von farbstoffmarkierten Antigenen, Antikörpern oder DNA-Segmenten mit der jeweils komplementären Spezies.

Claims (4)

1. Tandem-Farbstoffe der Struktur 1 bis 3, welche zur Fluoreszenzmarkierung von Proteinen, Nucleinsäuren, DNA, biologischen Zellen, Lipiden oder Pharmaka geeignet sind:
wobei
  • - A, B bzw. C für O, S bzw. N-R stehen, wobei R im N-R für einen aliphatischen oder aromatischen bzw. einem reaktiven aliphatischen oder aromatischen Rest wie (CH2)pCOOH oder (CH2)pNH2 steht, wobei p Werte von 1-12 annehmen kann,
  • - X, Y, U und V für ein Element aus der Gruppe Q, S, Se, bzw. der Strukturelemente NR und C(CH3)2 ausgewählt werden,
  • - die Substituenten R1 bis R10 für einen aliphatischen Rest von C1 bis C6 stehen können,
  • - zumindest einer der Substituenten R1 bis R10 für eine reaktive Gruppe steht, welche eine kovalente Verknüpfung des Farbstoffes mit den oben genannten Trägermolekülen ermöglicht. Die reaktiven Gruppe kann aus folgenden Funktionalitäten ausgewählt werden: Isothiocyanate, Isocyanate, Monochlortriazine, Dichlortriazine, Aziridine, Sulfonylhalogenide, N- Hydroxysuccinimidester, Imido-Ester, Glyoxal und Aldehyd für Amin- und Hydroxyl-Funktionen sowie Maleimide und Iodacetamide für Thiol-Funktionen. Diese reaktiven Gruppen können auch über Spacer-Gruppen der allgemeinen Struktur -(CH2)m- am eigentlichen Chromophor gebunden sein, wobei m Werte von 1 bis 18 einnehmen kann,
  • - zumindest eine der Substituenten R1 bis R10 für einen ionisierbaren Substituenten wie SO3⁻, COO⁻ oder NR3⁺ steht, der die hydrophilen Eigenschaften dieses Farbstoffes bestimmt,
  • - n Zahlenwerte von 1 bis 3 annehmen kann,
  • - S für Gruppierungen wie z. B. -(CH2)n-, -(CH2)n-Amid-(CH2)n- stehen kann,
  • - und die Substituenten R3 bis R10 auch für höher kondensierte aromatische oder heterocyclische Ringe stehen können.
2. Tandem-Farbstoffe der Struktur 4 und 5, welche zur Fluoreszenzmarkierung von Proteinen, Nucleinsäuren, DNA, biologischen Zellen, Lipiden oder Pharmaka geeignet sind:
wobei
  • - A, B bzw. C für O, S bzw. N-R stehen, wobei R im N-R für einen aliphatischen oder aromatischen bzw. einen reaktiven aliphatischen oder aromatischen Rest wie (CH2)pCOOH oder (CH2)pNH2 steht, wobei p Werte von l- 12 annehmen kann,
  • - X, Y, U und V für ein Element aus der Gruppe O, S, Se, bzw. aus den Strukturelemente NR und C(CH3)2 ausgewählt werden,
  • - die Substituenten R1 bis R10 für einen aliphatischen Rest von C1 bis C6 stehen können,
  • - zumindest einer der Substituenten R1 bis R10 für eine reaktive Gruppe steht, welche eine kovalente Verknüpfung des Farbstoffes mit den oben genannten Trägermolekülen ermöglicht. Die reaktiven Gruppe kann aus folgenden Funktionalitäten ausgewählt werden: Isothiocyanate, Isocyanate, Monochlortriazine, Dichlortriazine, Aziridine, Sulfonylhalogenide, N- Hydroxysuccinimidester, Imido-Ester, Glyoxal und Aldehyd für Amin- und Hydroxyl-Funktionen sowie Maleimide und Iodacetamide für Thiol-Funktionen.
    Diese reaktiven Gruppen können auch über Spacer-Gruppen der allgemeinen Struktur -(CH2)m- am eigentlichen Chromophor gebunden sein, wobei m Werte von 1 bis 18 einnehmen kann,
  • - zumindest eine der Substituenten R1 bis R10 für einen ionisierbaren Substituenten wie SO3⁻, COO⁻ oder NR3⁺ steht, der die hydrophilen Eigenschaften dieses Farbstoffes bestimmt,
  • - n Zahlenwerte von 1 bis 3 annehmen kann,
  • - S für Gruppierungen wie z. B. -(CH2)n-, -(CH2)n-Amid-(CH2)n- stehen kann, wobei n Werte von 1 bis 12 annehmen kann,
  • - F für eine (-CH=) oder mehrere konjugierte Gruppierungen (-CH=CH-CH=) bzw. für einen 2,3-Dihydroxy-cyclobuten-diylium-Ring steht,
  • - und die Substituenten R3 bis R10 auch für höher kondensierte aromatische oder heterocyclische Ringe stehen können.
3. Verwendung der Moleküle nach Anspruch (1) und (2) zur kovalenten Kopplung zwischen den oben angeführten funktionellen Gruppen und einer OH-, NH2- bzw. SH-Funktionen von Trägermolekülen in wässriger Lösung, die zu einer markierten Verbindung führt, die fluoreszente Eigenschaften aufweist.
4. Verwendung der in Anspruch (3) genannten markierten Verbindungen in fluoreszenzanalytischen qualitativen und quantitativen Bestimmungsverfahren.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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WO2002029407A2 (en) * 2000-10-04 2002-04-11 Amersham Biosciences Uk Ltd. Dye-labelled peptide and its diagnostic use

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* Cited by examiner, † Cited by third party
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WO2002029407A2 (en) * 2000-10-04 2002-04-11 Amersham Biosciences Uk Ltd. Dye-labelled peptide and its diagnostic use
WO2002029407A3 (en) * 2000-10-04 2002-08-01 Amersham Biosciences Uk Ltd Dye-labelled peptide and its diagnostic use

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