CZ358499A3 - Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách - Google Patents

Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách Download PDF

Info

Publication number
CZ358499A3
CZ358499A3 CZ19993584A CZ358499A CZ358499A3 CZ 358499 A3 CZ358499 A3 CZ 358499A3 CZ 19993584 A CZ19993584 A CZ 19993584A CZ 358499 A CZ358499 A CZ 358499A CZ 358499 A3 CZ358499 A3 CZ 358499A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
seq
desaturase
fatty acid
sequence
expression
Prior art date
Application number
CZ19993584A
Other languages
English (en)
Inventor
Deborah Knutzon
Pradip Mukerji
Yung-Sheng Huang
Jennifer Thurmond
Sunita Chaudhary
Amanda Eun-Yeong Leonard
Original Assignee
Calgene Llc
Abbott Laboratories
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Calgene Llc, Abbott Laboratories filed Critical Calgene Llc
Priority to CZ19993584A priority Critical patent/CZ358499A3/cs
Publication of CZ358499A3 publication Critical patent/CZ358499A3/cs

Links

Landscapes

  • Acyclic And Carbocyclic Compounds In Medicinal Compositions (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)

Abstract

Popisují se kompozice a způsoby přípravy polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcemv rostlinách, v rostlinných částech av rostlinných buňkách, v takových jakojsou listy, kořeny, plodý a semena. Sekvence a konstrukce kódující desaturázy mastných kyselin zahrnující D5-, D6- aDl2-desaturázy se používají k vytvoření transgenních rostlin, rostlinných částí a buněk, které obsahují a exprimujíjeden nebo více transgenů kódujícíchjednu nebo více desaturáz. Exprese desaturáz s různými substrátovými specifitami v rostlinném systému umožňuje produkci polynenasycenýchmastných kyselin s dlouhým řetězcem, jakoje kyselina dokosahexaenová, ikosapentaenová, alinolenová, gamalinolenová, arachidová a podobně, ve velkém měřítku. Taková exprese umožňuje v rostlinách, v rostlinných částech a v tkáních změnit profil mastných kyselin. Manipulace profilů mastných kyselin umožňuje produkci komerčního množství nových rostlinných olejů a produktů.

Description

Vynález enzymatických nenasycených popisuje modulační stupně enzymů a/nebo komponentů schopných změnit produkci polymastných kyselin s dlouhými řetězci (PUFA) v hostitelské rostlině. Příkladem použití vynálezu je produkce PUFA v rostlinách.
Dosavadní stav techniky
Dvě hlavní skupiny poly-nenasycených mastných kyselin (PUFA) jsou o3-mastné kyseliny, jejichž zástupcem je kyselina arachidonová, a ωβ-mastné kyseliny, které představuje kyselina ikosapentaenová. PUFA jsou důležitými komponenty plazmatické membrány buněk, kde se mohou vyskytovat v takových formách, jako jsou fosfolipidy. PUFA také slouží jako prekurzory jiných molekul, které jsou důležité pro člověka a zvířata, mezi něž patří prostacyklin, ikosanoidy, leukotrieny a prostaglandiny. PUFA jsou nezbytné pro správný vývoj, zvláště při vývoji mozku kojenců, tvoření a obnově tkáně.
Čtyři nejdůležitější PUFA s dlouhým řetězcem' zahrnují kyselinu dokosahexaenovou (DBA) a íkosapentaenovou (EPA), která se primárně nachází v různých typech rybího tuku, dále je to kyselina gama-linolenová (GLA), která se nachází v semenech řady rostlin, které zahrnují prvosenku (Oenothera biennis), brutnák lékařský (Borago officinalís) a černý rybíz (Ribes nigrům), a kyselina stearidonová (SDA), která se nachází mořských olejích a v semenech rostlin. GLA a další důležité PUFA s dlouhým řetězcem, jako je arachidonová (ARA) se nachází ve vláknitých houbách kyselina ARA se • · • · mohou izolovat z tkáně zvířat zahrnující játra a žlázy vylučující adrenalin.
V případě DHA existuje pro komerční produkci řada zdrojů zahrnující různé mořské organizmy, oleje získané z mořských ryb žijících v chladných vodách a z frakcí vaječného žloutku. V případě ARA se mohou pro komerční produkci použít mikroorganizmy zahrnující rod Mortierella, Entomophthora, Phytium a Porphyridium. Běžné zdroje SDA zahrnují rod Trichodesma a Echium. Komerční zdroje GLA zahrnují prvosenku, černý rybíz a brutník lékařský. Existuje však několik nevýhod, které jsou spojeny s komerční produkcí PUFA z přirozených zdrojů. Přirozené zdroje PUFA, jako jsou zvířata a rostliny, vykazují vysoce heterogenní složení olejů. Oleje získané z těchto zdrojů se musí za účelem separace jednoho nebo více požadovaných PUFA extenzívně čistit nebo vzniká olej, který je obohacen jedním nebo více PUFA. Přirozené zdroje jsou také vystaveny neřízené fluktuaci dostupnosti. Zásoby ryb mohou být také oslabeny nadměrným rybolovem. Rybí olej má nepříjemnou chuť a zápach, jehož odstranění není ekonomicky výhodné a takový produkt pak nemusí být přijatelný jako potravní doplněk. Zvířecí oleje a zvláště pak rybí oleje mohou hromadit látky znečišťující prostředí. Kolísání výtěžku z rybích a rostlinných zdrojů může ovlivňovat počasí a výskyt nemocí. Půda dostupná pro produkci alternativních plodin produkujících olej soutěží s expanzí lidské populace, což je spojeno s rostoucími potřebami produkce potravin na zbývající orné půdě. Plodiny, které produkují PUFA, jako je brutník lékařský, nebyly přizpůsobeny pěstování ve velkém a neprospívají dobře, jestliže se pěstují jako monokultura. Pěstování takových plodin není pak ve srovnání s lépe prospívajícími a lépe zavedenými kulturami ekonomické. Fermentace organizmů, jako je Mortierella, ve velkém měřítku je také nákladná. Přirozené tkáně zvířat obsahují malé množství ARA a těžko se • · • · · · • · zpracovávají. Mikroorganizmy, jako je Porphyridium a Mortiellera se těžko kultivují v komerčním měřítku.
Potravinové doplňky a farmaceutické formulace obsahující PUFA mají stejné nevýhody jako zdroje PUFA. Potravinové doplňky, jako jsou kapsule s rybím olejem, mohou obsahovat malé množství určitých požadovaných komponentů a tak je nutné je aplikovat ve vysokých dávkách. Vysoké dávky vedou k trávení velkého množství nežádoucích komponentů, které zahrnují znečišťující látky. Velká pozornost se musí věnovat podávání doplňků mastných kyselin. Nadměrný příjem může vést k supresi endogenních bíosyntetických cest a k soutěžení s jinými nezbytnými mastnými kyselinami v různých lipidových frakcích in vivo, což vede k nežádoucím výsledkům. Například eskymáci jejichž strava obsahuje velké množství ω3 mastných kyselin mají zvýšenou tendenci krvácet (US patent č. 4,874,603). Nepříjemná chuť a zápach doplňků je může činit nežádoucí a pro pacienta pak může být problém dodržovat léčební plán.
Na biosyntéze PUFA se podílí řada enzymů. Kyselina linolenová (LA, 18:2 Δ9, 12) se vyrábí z kyseliny olejové (18:1 Δ9) pomocí A12-desaturázy. GLA (18:3 Δ6, 9, 12) se vyrábí z kyseliny línolenové (LA, 18:1 Δ9, 12) pomocí Δ6desaturázy. Produkce ARA (20:4 Δ5, 8, 11, 14) z kyseliny dihomo-gama-linoleové (DGLA, 20:3 Δ8, 11, 14) se katalyzuje A5-desaturázou. U zvířat však nemůže dojít k desaturaci za pozicí Δ9 a proto nemohou převést kyselinu olejovou (18:1 Δ9) na kyselinu linolencvou (18:2 Δ912). Savci nemohou syntetizovat kyselinu α-linolenovou (ALA, 18:3 Δ9, 12, 15). Jiné eukaryonty zahrnující houby a rostliny mají enzymy, které způsobují desaturaci v polohách Δ21 a Δ15. Hlavní polynenasycené mastné kyseliny zvířat se proto získávají buď z potravin a/nebo desaturaci a elongací kyseliny linolenové (18:2 Δ9, 12) nebo a-linolenové (18:3 Δ9, 12, 15).
• · • · • · · · .· · .· ·*· ·· .....
· ··«. «..I ······· ,, .... ,. ,,
Uvažuje se, že polynenasycené mastné kyseliny se mohou použít ve výživě, ve farmacii a v průmyslu nebo pro jiné účely. Nákladné získávaní polynenasycených mastných kyselin z přirozených zdrojů a chemickou syntézou není dostatečné pro komerční potřeby. Proto je takový zájem o možnost získání genetického materiálu, který se podílí na biosyntéze PUFA z druhů, jenž přirozeně produkují mastné kyseliny, a o expresi izolovaného materiálu samotného nebo v kombinaci s heterogenním systémem, který se může manipulovat za účelem produkce komerčního množství PUFA.
Produkce gama-linoienové kyseliny pomocí Δβ-desaturázy se popisuje v dokumentu USPN 5,552,306 a USPN 5,614,393. Produkce 8,11-ikosadienové kyseliny za použití Mortierella alpina se popisuje v USPN 5,376,541. Produkce kyseliny dokosahexaenové pomocí dinoflagelat se popisuje v USPN 5,407,957. Klonování Δ6 desaturázy z brutníku lékařského se popisuje v publikaci PCT WO 96/21022. Klonování A9-desaturáz se popisuje ve zveřejněné patentové přihlášce PCT WO 91/13972, EP 0 550 162 Al, EP 0 561 569 A2, EP 0 644 263 A2 a EP 0 736 598 Al a USPN 5,057,419. Klonování A12-desaturáz z různých organizmů se popisuje v PCT publikaci WO 94/11516 a USPN 5,443,974. Klonování Δ15desaturáz z různých organizmů se popisuje v PCT publikaci WO 93/11245. Klonování A6-palmítoylacylové proteinové desaturázy z Thumbergia alata a její exprese v mikroorganizmu E. coli se popisuje v publikaci USPN 5,614,400. Exprese sojové stearylACP-desaturázy v transgenních embryích sóji za použiti promotoru 35S se popisuje v dokumentu USPN 5,443,974.
Podstata vynálezu
Popisují se nové kompozice a metody vhodné pro přípravu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem a desaturáz v rostlinách a v rostlinných buňkách. Metody zahrnují kultivaci hostitelské rostlinné buňky transformovanou • · · · expresívní kazetou, která je funkční v hostitelské rostlinné buňce. Expresívní kazeta, která obsahuje iniciační regulační oblast transkripce a translace a je spojená do čtecího rámce s 5'koncem sekvence DNA kódující polypeptid desaturázy, je schopna upravit produkci PUFA. Regulace exprese polypeptidů desaturázy poskytuje relativní zvýšení požadovaných desaturovaných PUFA, jako výsledek změněných koncentrací enzymů a substrátů, které jsou zahrnuty v biosyntéze PUFA. Zvláštní zájem se věnuje selektivnímu řízení produkce PUFA v rostlinné tkáni a/nebo v částech rostlin, jako jsou listy, kořeny, plody a semena. Vynález nachází použití například při produkci GLA, ARA, EPA a DHA ve velkém měřítku.
Vynález dále popisuje izolovanou nukleotidovou sekvenci nebo sekvenci polypeptidů, která je podstatně příbuzná nebo homologní s s nukleotidovými nebo polypeptidovýmí sekvencemi uvedenými v SEQ ID NO: 1 až SEQ ID NO: 52. Vynález dále popisuje způsoby použití sekvencí uvedených v SEQ ID NO: 1 až SEQ ID NO: 40 jako sond za účelem identifikace příbuzných sekvencí, jako komponentů expresívních systémů a jako komponentů systémů použitelných pří produkci transgenního oleje.
Vynález dále popisuje výživy, potravinářské doplňky nebo potravinářské doplňky ve formě kapaliny nebo pevné látky, které obsahují mastné kyseliny s dlouhým řetězcem podle vynálezu. Tyto výživy a doplňky jsou vhodné pro aplikaci lidem a zvířatům.
Výživy a doplňky podle vynálezu dále obsahují alespoň jeden makronutrient vybraný ze skupiny zahrnující, kokosový olej, sojový olej, olej kanoly, mono- a diglyceridy, glukózu, poživatelnou laktózu, elektrodialyzovanou syrovátku, elektrodialyzované netučné mléko, mléčnou syrovátku, sojový protein a jiné proteinové hydrolyzáty.
Výživy podle vynálezu mohou dále obsahovat alespoň jeden vitamin vybraný ze skupiny zahrnující vitaminy A, C, D, E a B i
komplex; a alespoň jeden minerál vybraný ze skupiny zahrnující vápník, hořčík, zinek, mangan, sodík, draslík, fosfor, měď, chlorid, jodid, selen a železo.
Vynález dále popisuje' způsob léčby pacienta, který trpí nedostatečným příjmem nebo produkcí poly-nenasycených mastných kyselin zahrnující aplikaci potravinové náhrady pacientovi podle vynálezu v množství, které je dostatečné pro léčbu pacienta.
Vynález dále popisuje kosmetické a farmaceutické kompozice materiálů podle vynálezu.
Vynález dále zahrnuje transgenní oleje na farmaceuticky přijatelných nosičích. Vynález se dále popisuje nutriční doplňky, kosmetická činidla a kojenecké výživy obsahující transgenní oleje.
Vynález dále zahrnuje způsob dosažení upravené biosyntézy polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem, která zahrnuje: kultivaci mikroba, který má buňky obsahující transgen, jenž kóduje produkt exprimovaný transgenem. Tento produkt desaturuje molekulu mastné kyseliny v poloze uhlíku 5,5 nebo 12 od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny, kde transgen je operativně spojen se sekvencí řídící expresi za podmínek, kdy dochází k expresi transgenu, přičemž se v buňkách změní biosyntéza polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem.
Vynález dále popisuje farmaceutické kompozice obsahující alespoň jeden nutrient vybraný ze skupiny zahrnující vitamin, minerál, sacharidy, cukr, aminokyselinu, volnou mastnou kyselinu, fosfolipid, antioxidant a fenolovou sloučeninu.
Definice:
Δδ-desaturáza: A5-desaturáza je enzym, který zavádí dvojnou vazbu mezi pátý a šestý uhlík od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
Δδ-desaturáza: Δ6 desaturáza je enzym, který zavádí dvojnou vazbu mezí šestý a sedmý uhlík od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
A9-desaturáza: Δ9 desaturáza je enzym, který zavádí dvojnou vazbu mezi devátý a desátý uhlík od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
A12-desaturáza: Δ12 desaturáza je enzym, který zavádí dvojnou vazbu mezi 12 a 13 uhlík od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
Mastné kyseliny: Mastné kyseliny je třída látek obsahující dlouhý uhlovodíkový řetězec a terminální karboxylovou skupinu. Mastné kyseliny zahrnují
Mastné kyseliny
12 : 0 Kys. laurová
16:0 Kys. palmitová
16:1 Kys. palmitolejová
18:0 Kys. stearová
18:1 Kys. olejová Δ9-18:!
18:2 Δ5,9 Kys. taxolejová Δ5,9-18:2
18:2 Δ6,9 Kys. 6,9- oktadekadienová Δ6,9-18:2
18:2 Kys. linolová Δ9,12-18:2 (LA)
18:3 Δ6, 9, 12 Kys. gama-linolová Δ6, 9, 12-18:3 (GLA)
18:3 Δ5,9,12 Kys. pinolenová Δ5,9,12-18:3
18 : 3 Kys. alfa-linolenová Δ9, 12,15-18:3 (ALA)
18:4 Kys. stearidonová Δ6,9,12,15-18:4 (SDA)
20:0 Kys. arachidonová
20:1 Kys. ikoscenová
22:0 Kys. behehová
22:1 Kys. eruková
22:2 Kys. dokasadíenová
« · • * • · · ♦ · « ' • · · · · · * * · · · · « · ·«·« · · »»
20:4 ω6 Kys. arachidonová Δ5,8,11,14-20:4(ARA)
20:3 ωβ ωβ-i kosatrienová dihomo-gama- linolenová Δ8,11,14-20:3(DGLA)
20:5 ω5 Ikosapentanová (timnodonová) Δ5,8,11,14,17- 20:5(EPA)
20:3 ω3 ω3-ikosatrienová Δ11,16,17-20:3
20:4 ω3 Ců3-ikosatetraenová Δ7,10,13,16,19-22:5 (co3DPA)
22 : 5 α>3 Dokosapentanová Δ7,10,13,16,19-22:5 (o3DPA)
22:6 ω3 Dokasahexanová (kervonová kyselina) Δ4,7,10,13,16,19- 22:6(DHA)
24 : 0 Lígnocerová kys.
Vzhledem k těmto definicím vynález popisuje nové sekvence DNA, konstrukce DNA, metody a kompozice, které umožňují modifikace obsahu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinných buňkách. Rostlinné buňky se transformují expresívní kazetou obsahující DNA kódující polypeptid schopný zvýšit množství jednoho nebo více PUFA v rostlinné buňce. Je nutné, aby se připravila integrační konstrukce, která umožňuje integraci expresívní kazety do genomu hostitelské buňky. Hostitelské buňky se manipulují za účelem exprese sense a antisense DNA, která kóduje polypeptid(y) , jenž vykazují desaturační aktivitu. Term! „desaturáza znamená polypeptid, který může desaturovat jednu nebo více masných kyselin za vzniku mono- nebo poly-nenasycených mastných kyselin nebo jejich prekurzorů. Termín „polypeptid znamená libovolný řetězec aminokyselin bez ohledu na délku nebo post-translační úpravu, například giykosylace nebo fosforylace. Substrát(y) exprimovaných enzymů se mohou produkovat v hostitelské buňce nebo se mohou dodávat exogenně.
• · • ·
Aby se v hostitelské buňce dosáhlo exprese, transformovaná DNA je operativně spojena s počátečním místem transkripce a translace a s terminačnímí regulačními oblastmi, které jsou v hostitelské buňce funkční. Konstrukce obsahující exprimovaný gen se mohou začlenit do genomu hostitelské buňky nebo se mohou v hostitelské buňce samostatně replikovat. V případě produkce kyseliny linolenové (LA) obecně používané expresívní kazety zahrnují kazetu, která poskytuje aktivitu Δ12desaturázy, zvláště v hostitelské buňce, které produkuje nebo může pohlcovat kyselinu olejovou. Obecně používané expresívní kazety vhodné pro produkci ALA zahrnují kazetu, která vykazuje Δ15 nebo ω3 desaturační aktivitu, zvláště v hostitelské buňce, která produkuje nebo pohlcuje LA. Obecně používané expresívní kazety vhodné pro produkci GLA nebo SDA zahrnují kazetu, která vykazuje Δ6 desaturační aktivitu, zvláště v hostitelské buňce, která produkuje nebo pohlcuje LA nebo ALA.. Produkce polynenasycené mastné kyseliny typu ω6, jako je LA nebo GLA, se upřednostňuje v rostlině, která je schopna produkovat ALA inhibici aktivity desaturázy typu Δ15 nebo ω3.
Hostitel vhodný pro produkci ALA se může odstranit, redukovat nebo získat inhibici aktivity desaturázy typu Δ15 nebo ω3 (obrázek č. 2). Toho lze dosáhnout přípravou expresívní kazety antisense Δ15 nebo ω3 transkriptů, porušením genu Δ15- nebo co3-desaturázy. Podobně produkce LA nebo ALA je zvýhodněna v rostlině, která vykazuje aktivitu Á6-desaturázy tím, že poskytuje expresívní kazetu nesmyslného Δ6 transkriptů tím, že se poruší gen A6-desaturázy.
Produkce kyseliny olejové se upřednostňuje v rostlinách, které vykazují aktivitu Δ12 desaturázy. Připraví se expresívní kazeta pro přípravou expresívní kazety antisense Δ12 transkriptů nebo porušením genu A12-desaturázy. Při produkci ARA obecně používaná expresívní kazeta poskytuje aktivitu Δ5 • · · · • · • «
desaturázy , zvláště v hostitelské buňce, která produkuje nebo pohlcuje DGLA. Produkce nenasycené mastné kyseliny typu ω6, jako je ARA, se upřednostňuje v rostlinách schopných produkovat ALA na základě inhibice aktivity desaturázy typu Δ15 nebo ω3. To je doprovázeno přípravou expresívní kazety pro nesmyslný transkript Δ15 nebo ω3 nebo porušením genu desaturázy Δ15 nebo ω3.
Produkce mastných kyselin v transgenních rostlinách
Produkce mastných kyselin v transgenní rostlině má několik výhod oproti izolaci z přirozených zdrojů, jako jsou ryby nebo rostliny. Produkce mastných kyselin v rekombinantních rostlinách poskytuje schopnost změnit přirozený profil mastných kyselin rostlin tím, že poskytuje nové dráhy syntézy v hostiteli, čímž dochází ke zvýšení množství požadované 'PUFA nebo jejích konjugovaných forem a ke snížení množství nežádoucích PUFA. Při produkci mastných kyselin v transgenních rostlinách také dochází k tomu, že exprese genů desaturázy probíhá v určitých tkáních a/nebo v částech rostlin, což způsobuje, že v těchto tkáních a/nebo v částech rostlin lze dosáhnout značně zvýšeného množství požadovaných PUFA, čímž získání PUFA s uvedených tkání se stává ekonomické. Požadovaná PUFA se může například exprimovat v semenech. Metody izolace olejů semen jsou v oboru dobře známy. Mimo poskytnutí zdroje požadovaných PUFA pro čištění, komponenty olejů semen se mohou manipulovat prostřednictvím exprese genů desaturázy, buď samotných nebo v kombinaci s jinými geny, jako jsou geny elongázy, přičemž vznikají oleje semen, které se mohou přidat do zvířecího mléka a/nebo do syntetického nebo semisyntetického mléka. Tak se mohou použít jako kojenecká výživa v případě, že kojení není možné nebo není žádoucí nebo v případě podvýživy nebo onemocnění kojenců i dospělých.
V případě produkce PUFAv závislosti na hostitelské buňce, na dostupnosti substrátu a na požadovaném konečném • · • · · · • · produktu(ech), na několika polypeptidech, zvláště desaturázách, je žádoucí použít polypeptidy, které katalyzují přeměnu kyseliny stearové na olejovou, LA na GLA, ALA na SDA, kyseliny olejové na LA, nebo LA na ALA. Tyto polypeptidy zahrnují enzymy, které desaturují v pozicích Δ6, Δ9, Δ12, Δ15 nebo ω3. Jestliže se vybírá specifický polypeptid vykazující desaturační aktivitu, je nutné zvažovat optimální pH polypeptidu, zda polypeptid je enzym omezený rychlostí nebo jeho komponent, zda používaná desaturáza je podstatná pro syntézu požadovaných mastných kyselin a/nebo jestli polypeptidy vyžadují ko-faktory. Exprimovaný polypeptid má přednostně parametry kompatibilní s biochemickým prostředím jeho polohy v hostitelské buňce. Polypeptid například může v hostitelské buňce soutěžit o substrát s jinými enzymy. Analyzuje se Km a specifická aktivita polypeptidu, za účelem zjištění, zda tyto hodnoty jsou určujícím kritériem vhodnosti daného polypeptidu při modifikaci produkce PUFA v dané hostitelské buňce. Polypeptid používaný v určité situaci je ten, který je za daných podmínek funkční v hostitelské buňce, ale v jiném případě to může být polypeptid vykazující aktivitu desaturázy, který je schopný modifikovat relativní produkci požadovaných PUFA. Na obrázku č. 1 je zobrazeno schéma syntézy kyseliny arachidonové (20:4 2 kyseij_ny palmitové (C16). Klíčový enzym v této dráze je A5-desaturáza, která přeměňuje kyselinu DH-y-linolenovou (DGLA, kyselina íkosatrienová) na ARA. Dále se zde ukazuje přeměna kyseliny alinolenové (ALA) na kyselinu stearidonovou pomocí Δ6desaturázy. Produkce dalších PUFA vedle ARA zahrnujících EPA a DHA je zobrazena na obr. č. 2. Klíčovým enzymem při syntéze kyseliny arachidonové (20:4 δ5'8,11'14) z kyseliny stearové (C18) je Δβ-desaturáza, která přeměňuje kyselinu linolenovou na kyselinu γ-linolenovou. Dále se zde ukazuje přeměna kyseliny alinolenové (ALA) na kyselinu stearidonovou pomocí Δ6• · • · · · • · desaturázy. Při produkci ARA se používá sekvence DNA kódující polypeptid vykazující aktivitu Á5-desaturázy. V určitých příkladech může se tato DNA spojit s expresívní kazetou, která poskytuje desaturázy. antisense používaných produkci polypeptidu, který má aktivitu Δ6Transkripční kazeta může poskytovat produkci produkt. Volba profilu PUFA sekvencí pro A15-transkripční kazet závisí částečně na v hostitelské buňce. V případě, že aktivita Δδ-desaturázy je omezující, pak nadměrná exprese samotné A5-desaturázy je dostačující ke zvýšení produkce ARA.
Zdroje polypeptidů vykazující desaturační aktivitu
Zdroje polypeptidů vykazující desaturační aktivitu a oligonukleotidů kódujících takové polypeptidy jsou organizmy, které produkují požadovanou poly-nenasycenou mastnou kyselinu. Mikroorganizmy, které mají schopnost produkovat ARA se mohou použít jako zdroje genů A5-desaturázy. Mikroorganizmy, které mají schopnost produkovat GLA nebo SDA se mohou použít jako zdroje genů Δ6- a/nebo A12-desaturázy. Takové mikroorganizmy například zahrnují ty organizmy patřící k rodu Mortierella, Conidiobolus, Pythlum, Phytophathora,
Porphyridium, Coidosporium, Mucor, Fusarium,
Rhodotorula a Entomophthora. V rodu Porphyridium je zajímavé Porphyridium cruentum. V rodu Mortierella zvláštní zájem budí Mortierella elongata, Mortierella exigua, Mortierella hygrophila, Mortierella ramanniana, var. angulispora a Mortierella alpina. V rodu Mucor zvláštní zájem budí Mucor circinelloides a Mucor javanicus.
DNA kódující požadované desaturázy se mohou identifikovat různým způsobem. Zdroj požadované desaturázy, například knihovna genomové DNA nebo cDNA z Mortierella, se mohou testovat detekovatelnými, enzymaticky nebo chemicky syntetizovanými sondami, které se mohou připravit z DNA, RNA
Penicillium, Aspergillus, • · • · nebo z nukleotidů, které se přirozeně nevyskytují, nebo ze směsi uvedených látek. Sondy se mohu syntetizovat enzymaticky z DNA známých desaturáz a jsou vhodné pro metody hybridizace za normální nebo snížené přísnosti. Oligonukleotidové sondy se mohou také použít jako zdroje testování a mohou se zakládat na sekvencích známých desaturáz zahrnujících sekvence, které jsou mezi známými desaturázami konzervativní, nebo na sekvencích peptidů získaných z požadovaného čištěného proteinu. Oligonukleotidové sondy založené na aminokyselinových sekvencích se mohou degenerovat, aby se zdůraznila degenerace genetického kódu nebo se mohou přeskupit ve prospěch preferovaných kodonů zdrojového organizmu. Oligonukleotidy se mohou použít jako primery pro PCR z reverzně přepisované mRNA ze známého nebo pochybného zdroje. Produkt PCR může mít celou délku cDNA nebo se může použít za vzniku sondy, která slouží pro získání cDNA v celé délce. V jiném případě požadovaný protein se může celý sekvenovat a uskuteční se celková syntéza DNA kódující uvedený polypeptid.
Jestliže je to nutné, izoluje se genomová DNA nebo cDNA, kterou je možné sekvenovat známými metodami. V oboru je známo, že takové metody sekvenování jsou chybné. Proto se stalo rutinou vícenásobné sekvenování jedné oblasti a stále je nutné počítat s měřitelnou četností chyb ve výsledné dedukované sekvenci, zvláště pak v oblastech, které vykazují repetice, extenzivní sekundární strukturu nebo neobvyklé složení baží, jako jsou oblasti s vysokým obsahem GC. Když vzniknou rozpory, může se provést opětné sekvenování a mohou se použít speciální metody. Uvedené speciální metody mohu zahrnovat změnu podmínek sekvenování za použití: různých teplot, různých enzymů, proteinů, které mění schopnost oligonukleotidů tvořit struktury vyššího řádu, změněných nukleotidů, jako je ITP nebo metylovaný dGTP, různého složení gelu například přidání formamidu, různých primerů nebo primerů lokalizovaných v různé vzdálenosti od problematické oblasti nebo různých templářů, • · • · jako jsou j ednořetězcové DNA. Může se také použít sekvenování mRNA.
Ve většině případů některé nebo všechny kódující sekvence polypeptidu vykazující desaturační aktivitu pocházejí z přirozeného zdroje. V některých situacích je nutné modifikovat celý nebo část kodonů například zesílit expresi použitím kodonů preferovaných hostitelem. Hostitelem preferované kodony se mohou stanovit z kodonů, které se vyskytují nejčastějí v proteinech, jenž se exprimují v určitém druhu hostitele v největším množství. Kódující sekvence polypeptidu vykazující desaturační aktivitu se může syntetizovat celá nebo její část. Celá DNA nebo její části se mohou také syntetizovat tak, aby se odstranily libovolné destabilizující sekvence nebo oblasti sekundární struktury, které se budou vyskytovat v přepsané mRNA. Celá nebo části DNA se mohou také syntetizovat za účelem změny složení baží na ty, které preferuje požadovaná buňka hostitele. Způsoby syntézy sekvencí a spojení sekvencí se uvádějí v literatuře. Za účelem získání mutací přirozeně se vyskytujících genů desaturázy, aby došlo k produkci polypeptidu, který vykazuje desaturační aktivitu in vivo s fyzikálními a kinetickými parametry, jenž více vyhovují funkci hostitelské buňky, se může použít mutageneze in vitro a selekce, místně řízená mutageneze nebo jiné způsoby požadovaných
Buňka pak vykazuje delší poločas rozpadu polynenasycených mastných kyselin a vyšší rychlost produkce.
Požadovaná cDNA mé méně než 60 % A+T, upřednostňuje se méně než 50 % A+T. V lokalizovaném měřítku v okně dvaceti párů baží se upřednostňuje, aby se zde nenacházely oblasti cDNA, které obsahují více jak 75 % A+T. V okně o 60 párech baží ae upřednostňuje, aby se zde nenacházely oblasti cDNA obsahující více jak 60 A+T, přičemž více se upřednostňuje, aby se zde nenacházely oblasti obsahující více než 55 % A+T.
Desaturáza organizmu Mortierella alpina • · * · • · • ·
Ve středu zájmu je Δ5-, Δ6- a A12-desaturáza organizmu
Mortierella alpina. A5-desaturáza ma
446 aminokyselin.
Aminokyselinová sekvence je zobrazena na obrázku č. 7. Gen kódující A5-desaturázu organizmu Mortierella alpina se může exprimovat v transgenních mikroorganizmech tak, že se docílí silnější syntézy ARA z DGLA. Mohou se také použít jiné DNA, které jsou v podstatě identické s DNA Á5-desaturázy organzimu Mortierella alpína nebo které kódují polypeptidy, jenž jsou v podstatě shodné s polypeptidem A5-desaturáza organizmu Mortierella alpina. Δβ-desaturáza organizmu Mortierella alpina má 457 aminokyselin a její předpokládaná molekulová hmotnost je 51 800. Aminokyselinová sekvence je zobrazena na obrázku č. 3. Gen kódující Δβ-desaturázu organizmu Mortierella alpina se může exprimovat v transgenních rostlinnách nebo ve zvířatech tak, že se docílí silnější syntézy GLA z kyseliny linolenové a kyseliny staearidonové (SDA) z ALA. Mohou se také použít jiné DNA, které jsou v podstatě identické s DNA Δβ-desaturázy organzimu Mortierella alpina nebo které kódují polypeptidy, jenž jsou v podstatě shodné s polypeptidem Δβ-desaturáza organizmu Mortierella alpina. A12-desaturáza organizmu Mortierella alpína má aminokyselinovou sekvenci zobrazenou na obrázku č
Mortierella
5. Gen kódující A12-desaturázu organizmu alpina se může exprimovat v transgenních rostlinnách tak, že se docílí silnější syntézy LA z kyseliny olejové. Mohou se také použít jiné DNA, které jsou v podstatě identické s DNA A12-desaturázy organzimu Mortierella alpina nebo které kódují polypeptidy, jenž jsou v podstatě shodné s polypeptidem A12-desaturáza organizmu Mortierella alpina
Termín „v podstatě shodné znamená aminokyselinovou sekvenci nebo sekvenci nukleové kyseliny vykazující za účelem zvýšené preference alespoň 60 %, 80 %, 90 % nebo 95 % homologii s aminokyselinovou sekvencí A5-desaturázy organizmu
Mortierella alpina nebo se sekvencí nukleové kyseliny kódující aminokyselinovou sekvenci. V případě polypeptidů je délka porovnávaných upřednostňuj e sekvencí obecně alespoň 16 aminokyselin, se alespoň 20 aminokyselin, více se upřednostňuje 35 aminokyselin. V případě nukleových kyselin délka porovnávaných sekvencí je obecně alespoň 50 nukleotidů, upřednostňuje se alespoň 60 nukleotidů a více se upřednostňuje alespoň 75 nukleotidů a nejvíce se upřednostňuje 110 nukleotidů. V typickém případě se homologie měří za použití softwaru pro sekvenční analýzu, jako je například Sequence Analysis software od Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, Wisconsin 53705, MEGAlign (DNAStar, lne., 1228 S. Park St., Madison, Wisconsin 53715) a MacVector (Oxford Molecular Group, 2105 S.Bascom Avenue, Suitě 200, Campbell, California 95008). Takový software páruje podobné sekvence, čímž přiřazuje různé stupně homologie různým substitucím, delecím a jiným modifikacím. Konzervativní substituce typicky zahrnují substituce v následující skupinách: glycín a alanin; valin, izoleucin a leucin; kyselina aspartová, kyselina a glutamin; serin a threonin; lyzin a a tyrozin. Substituce se mohou také provést na základě konzervativní hydrofobicity nebo hydrofílity (Kyte and Doolittle, J. Mol. Biol. 157:105-132, 1982) nebo na základě schopnosti předpovídat podobnou sekundární strukturu polypeptidu (Chou and Fasman, Adv. Enzymol. 47:45-148,1978).
glutamová, asparagin arginin; fenylalanin
Další desaturázy
Vynález popisuje příbuzné desaturázy pocházející ze stejného nebo jiného organizmu. Takové příbuzné desaturázy zahrnují varianty popsané Δ5-, Δ6- nebo A12-desaturázy vyskytující se ve stejném nebo odlišném specie Mortierella stejně jako homology popsané A5-desaturázy z jiných specie a • · • · * · vývojově příbuzné proteiny, které vykazují desaturační aktivitu. Vynález dále popisuje desaturázy, které, ačkoli nejsou v podstatě shodné s A5-desaturázou Mortierella alpína, desaturují molekulu mastné kyseliny v poloze 5., 6. nebo 12.
uhlíku od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny. Příbuzné desaturázy se mohou identifikovat na základě své schopnosti fungovat stejným způsobem jako popsané desaturázy, které jsou stále schopny účinně přeměnit DGLA na ARA, LA na GLA, ALA na SDA nebo olejovou kyselinu na LA. Příbuzné desaturázy se mohu také identifikovat na základě prohledávání sekvenčních databází. Pomocí hybridizace se sondou odvozenou z popsané desaturázy s knihovnou zkonstruovanou ze zdrojového organizmu nebo pomocí RT-PCR z mRNA ze zdrojového organizmu a primerů založených na popsané desaturáze, se hledají sekvence homologní s popsanou desaturázou. Takové desaturázy zahrnují lidské desaturázy, Dictyostelium discoideum a Phaeodactylum tricornum.
Oblasti polypeptidu desaturázy, které jsou důležité pro desaturační aktivitu, se mohou stanovit rutinní mutagenezí, expresí výsledných mutantních polypeptidů a stanovením jejich aktivit. Mutanti mohou zahrnovat delece, inzerce a bodové mutace nebo jejich kombinace. Typická funkční analýza začíná deleční mutagenezí za účelem stanovení N- a C-terminálních omezení proteinu nezbytných pro funkci proteinu. Pak se provedou vnitřní delece, inzerce nebo bodové mutace za účelem stanovení oblastí nezbytných pro funkce uvedeného proteinu. Dále se mohou použít jiné metody, jako je kazetová mutageneze nebo celková syntéza. Deleční mutageneze se provede například použitím exonukleáz, přičemž se postupně odstraní kódující oblasti 5' a 3' konců. Za účelem provedení takových postupů jsou dostupné kity. Po deleci je kódující oblast doplněna ligací oligonukleotidů obsahujících počáteční a terminační kodon. V jiném případě se oligonukleotidy kódující počáteční a konečný kodon začlení do kódující oblastí za použití různých • · · · · ·· · • » · · * · t
• · · · · · · ·· · · · · ·« ·· metod zahrnující místně řízenou mutagenezí, mutagenní PCR nebo ligaci k DNA, která je štěpena v existujících restrikčních místech. Vnitřní delece se mohou podobně vytvořit řadou metod, které zahrnují použití existujících restrikčních míst v DNA, použití mutagenních primerů prostřednictvím místně řízené mutageneze nebo mutagenní PCR nebo ligaci do DNA štěpené v existujích restrikčních místech. Vnitřní delece se mohou podobně provádět pomocí různých metod zahrnující použití existujících restrikčních míst v DNA použitím mutagenních primerů prostřednictvím místně řízené mutageneze nebo mutagenním PCR. Začlenění se provádí za použití metod, jako je linkrem vyhledávaná mutageneze, místně řízená mutageneze nebo mutagenní PCR. Bodové mutace se provádějí způsoby, jako je místně řízená mutageneze nebo mutagenní PCR.
Chemická mutageneze se může také používat při identifikaci oblastí polypeptidů desaturázy, které jsou důležité v případě aktivity. Mutovaná konstrukce se exprimuje a testuje se schopnost pozměněného proteinu fungovat jako desaturáza. Taková analýza struktury-funkce může stanovit, které oblasti se mohou deletovat, v kterých oblastech se toleruje inzerce a které bodové mutace dávají vzniku mutantnímu proteinu, který funguje v podstatě stejným způsobem jako přirozená desaturáza. Vynález popisuje všechny takové mutantní proteiny a nukleotidové sekvence kódující tyto proteiny.
Exprese genů desaturázy
Po té, co se získala DNA kódující polypeptid desaturázy, umístí se do vektoru schopného se replikovat v hostitelské buňce nebo se pomnožit in vitro způsobem, jako je PCR nebo dlouhé PCR. Replikační vektory mohou zahrnovat plazmidy, fágy, viry, kozmidy a podobně. Požadované vektory zahrnují vektory použitelné pří mutagenezí genu nebo při expresi genu v hostitelských buňkách. Metoda dlouhého PCR provádí in vitro propagaci velké konstrukce tak, že pozmění gen, aby došlo • « « « • « • · · · · «· · • « · · · · · • · « * · · · • · · · · · ·· ·· k mutagenezi nebo k přidání expresívních signálů. Může tak dojít k propagaci výsledných konstrukcí in vitro, aniž se použije replikační vektor nebo hostitelská buňka.
Za účelem exprese polypeptidu desaturázy, funkční transkripční a translační iniciační a terminační oblasti jsou operativně spojeny s DNA kódující polypeptid desaturázy. Iniciační a terminační oblasti transkripce a translace se odvodily z různých zdrojů, které zahrnují exprimovanou DNA, geny, o kterých se ví nebo se předpokládá, že se budou v požadovaném systému exprimovat, expresívní vektory, chemickou syntézu nebo endogenní lokus v hostitelské buňce. Exprese v rostlinné tkáni a/nebo v rostlinné části vykazuje určitou účinnost, zvláště, když tkáň nebo část rostliny je možné jednoduše sklidit. Takovou částí rostliny jsou semena, listy, plody, květy, kořeny atd.. Expresi je možné cílit do takové oblasti rostliny použitím specifických regulačních sekvencí, jako se popisují v dokumentech USPN 5,463,174, USPN 4,943,674, USPN 5,106,739, USPN 5,175,095, USPN 5,420,034, USPN 5,188,958 a USPN 5,589,379. V jiném případě exprimovaným proteinem může být enzym, který produkuje produkt, který se může začlenit přímo nebo po dalších úpravách do kapalné frakce z hostitelské rostliny. V tomto případě exprese genů desaturáz nebo nesmyslné transkripty desaturáz mohou změnit množství specifických PUFA nebo jejich derivátů, které se nacházejí v rostlinných částech a/nebo v rostlinných tkáních. Kódující oblast polypeptidu Á5-desaturázy se exprimuje buď samotná nebo s jinými geny, přičemž vznikají tkáně a/nebo části rostlinobsahujicí vyšší podíly požadovaných PUFA nebo ve kterých složení PUFA je blíže zastoupení zastoupení PUFA v lidském mléce (Príeto et al., přihláška PCT WO 95/24494). Terminační oblast se může získat z 3'oblasti genu, ze kterého se získala iniciační oblast nebo z odlišného genu. Je znám velký počet terminačních oblastí, které jsou použitelné v různých hostitelích stejného nebo odlišného rodu a druhu.
• · • c • · • · • · ♦ · · · · · fr · · • · · · · · · · ·· fr · ···» · . · · ···· ··· ·· ···· ·· ··
Terminační oblast se obvykle vybrala podle toho, zda je výhodná nebo ne, spíše než na základě určité vlastnosti.
Volba hostitelské buňky je zčásti ovlivněna profilem žádaných PUFA v transgenní buňce a přirozeným profilem hostitelské buňky. Při produkcí kyseliny linolenové z kyseliny olejové použití sekvence DNA kóduje polypeptid, který vukazuje aktivitu Á12-desaturázy. Při produkci GLA z kyseliny linolenové použitá sekvence DNA kóduje polypeptid, který vykazuje aktivitu Δβ-desaturázy. Při použití hostitelské buňky, která exprimuje aktivitu A12-desaturázy a nevykazuje aktivtu A15-desaturázy nebo jí byla tato aktivita odstraněna, se může použít expresívní kazeta, která poskytuje nadměrnou expresi Δβ-desaturázy, což je obecně dostatečné, aby se zvýšila produkce GLA v transgenní buňce. V případě, že hostitel exprimuje aktivitu A9-desaturázy, pak exprese Δ12- a Δβ-desaturázy může způsobit zvýšenou produkci GLA. V určitých případech, kdy exprese aktivity Δβ-desaturázyse spojí s expresí aktivity A12-desaturázy, je nutné, aby hostitelská buňka přirozeně vykazovala nízkou aktivitu A15-desaturázy nebo se mutovala, aby vykazovala tuto nízkou aktivitu Δ15desaturázy. V jiném případě hostitelská buňka vhodná pro expresi Δβ-desaturázy může vykazovat vysokou aktivitu Δ12desaturázy nebo se může za tímto účelem mutovat.
Exprese v hostitelské buňce může být dočasná nebo stabilní. K dočasné expresi dochází zavedením konstrukcí, které obsahují expresívní signály funkční v hostitelské buňce, ale uvedené konstrukce se nereplikují a řídce se v hostitelské buňce začleňují, nebo se hostitelská buňka nemnozí. Dočasné exprese lze také dosáhnout vyvoláním aktivity regulovatelného promotoru, který je operativně spojen s genem. Takové indukovatelné systémy často vykazují slabou expresi. Stabilní exprese se může dosáhnout zavedením konstrukce, která se může začlenit do hostitelského genomu nebo se může samostatně » · * » · • · v « v « replikovat v hostitelské buňce. Stabilní exprese genu se může vybrat použitím selekčního markéru, který se nachází konstrukci konstrukcí. markér. Když v expresívní s expresívní exprimuj ící začlenění konstrukce, k v hostitelském genomu prostřednictvím použití homologie s hostitelským se muže začleněním odstraněním nebo se transfekuje společně
Pak následuje selekce buněk je stabilní exprese výsledkem integraci konstrukcí může dojít náhodně nebo se může cílit konstrukcí obsahujících oblasti genomem, což je dostatečné pro rekombinaci s hostitelským lokusem. Jestliže jsou konstrukce cíleny do endogenního lokusu, pak endogenní lokus může poskytnout všechny nebo některé oblasti regulující transkripci nebo translaci.
Jestliže je nutné zesílení exprese polypeptidů desaturázy ve zdrojovém organizmu, může se použít několik metod. Do hostitelského organizmu se mohou zavést další geny kódující polypeptid desaturázy. Exprese z lokusu přirozené desaturázy také zesílit homologní rekombinaci, například silnějšího promotoru do hostitelského genomu, destabilizačních sekvencí buď z mRNA nebo z kódovaného proteinu delecí uvedené informace z hostitelského genomu nebo přidáním stabilizačních sekvencí k mRNA (USPN 4,910,141 a USPN 5,500,365).
Jestliže je nutné exprimovat více než jeden odlišný gen pak zavedené geny je možné pomnožit v hostitelské buňce za použití replikačních vektorů nebo začleněním do hostitelského genomu. Jestliže se z odděleného replikačního vektoru exprimují dva nebo více genů, je nutné, aby každý vektor vykazoval odlišný způsob replikace. Každá zavedená konstrukce, ať už se začleňuje nebo ne, by měla mít odlišný způsob selekce a neměla by být homologní s jinými konstrukcemi, což je podmínkou stabilní exprese a předchází se tak znovu uspořádání elementů mezi konstrukcemi. Správná volba regulačních oblastí, způsoby selekce a metoda propagace zavedené konstrukce se t · mohou stanovit experimentálně tak, že všechny zavedené geny se pro syntézu nutná transdukci, zavedení, elektroporaci, libovolnou jinou metodu, mohou exprimovat v síle, která je požadovaných produktů
Konstrukce obsahující gen se může zavést do hostitelské buňky standardním způsobem. Tyto metody zahrnují transformaci, fúzi protoplastů, lipofekci, transfekci, konjugaci, infekci, balistické mikroinjekce, zaškrabávání nebo kterou se zavádí gen do hostitelské buňky (USPN 4,743,548, USPN 4,795,855, USPN 5,068,193, USPN 5, 188,958, USPN
5,463,174, USPN 5,565,346 a USPN 5,565,347). Je výhodné, aby manipulovaná hostitelská buňka, která pohlcuje sekvencí DNA nebo uvedenou konstrukci, se označila jako „transformovaná nebo „rekombinantní. Hostitel bude obsahovat alespoň jednu kopii expresívní konstrukce. Může však obsahovat dvě kopie nebo více kopií v závislosti na tom, zda gen se začleňuje do genomu, amplifikuje se nebo je přítomen na extrachromozomálním elementu, který vykazuje více kopií.
Transformovaná hostitelská buňka se může identifikovat selekcí markéru, který je obsažen v zavedené konstrukci.
V jiném případě oddělená markerová konstrukce se může zavést do hostitelské buňky dohromady s požadovanou konstrukcí.
V typickém případě se vybraly transformovaní hostitelé na základě jejich schopnosti růst na selekčním médiu. Selekční média mohou obsahovat antibiotikum a může jim chybět faktor, který je nezbytný pro růst netransformovaného hostitele. Takovým faktorem může být nutrient nebo růstový faktor. Takový zavedený gen markéru může propůjčovat rezistenci na antibiotika nebo kódovat podstatný růstový faktor nebo enzym a umožňuje růst na selekčním médiu, když se exprimuje v transformované hostitelské buňce. Středem zájmu je rezistence na kanamycin a na aminoglykosid G418 (popisuje se v dokumentu USPN 5,034,322). Selekce transformovaného hostitele se může také vyskytnout v případě, že se může přímo » · · · 9 • * · · • · 9 « • 9 9 9 9· nebo nepřímo detekovat exprimovaný markerový protein. Markerový protein se může exprimovat samotný nebo jako fúze s jiným proteinem. Markerový protein se může detekovat na základě jeho enzymatické aktivity. β-galaktozidáza může přeměnit substrát X-gal na zbarvený produkt a luciferáza může přeměnit luciferin na produkt emitující světlo. Markerový protein se může detekovat produkcí světla nebo změnou charakteristik. Zelený fluorescenční protein Aeguorea victorie fluoreskuje, jestliže markerového proteinu například v proteinu se ozáří modrým světlem. K detekci nebo molekulárního tag přítomného Buňky se mohou použít protilátky, exprimující markerový .protein nebo tag se vyberou na základě vizuálního pozorování nebo způsobem, jako je FACS nebo panning za použití protilátek.
PUFA produkované za použití metod a kompozic se mohou najít v hostitelské rostlinné tkáni a/nebo v části rostliny jako volné mastné kyseliny nebo ve spojení s formami, jako jsou acylglyceroly, fosfolípidy, sulfolipidy nebo glykolipidy a mohou se extrahovat z hostitelské buňky různými způsoby, které jsou dobře známy v oboru. Takové způsoby mohou zahrnovat extrakci organickými rozpouštědly, sonikací, extrakci superkritickými tekutinami za použití například oxidu uhličitého. Dále se mohou použít fyzikální postupy, jako je tlak nebo kombinace obou způsobů. Zvláště zajímavá je extrakce hexanem, metanolem a chloroformem. Je-li to nutné, vodná vrstva se může okyselit, aby se protonizovaly negativně nabité části a tím se zvýšila parcionizace požadovaných produktů v organické vrstvě. Po extrakci se mohou organická rozpouštědla odstranit odpařením v proudu dusíku. Když se izolují v konjugovaných formách, produkty se mohou enzymaticky nebo chemicky štěpit, aby se uvolnila volná mastná kyselina nebo méně komplexní konjugát. Ty mohou být předmětem další manipulace za vzniku požadovaného konečného produktu.
tt a a a a a a • · · a · · · · • · · · β · · • a · « · · a • * a a a a a a ··
Konjugované formy mastných kyselin se štěpí hydroxidem draselným.
Čištění mastných kyselin
V případě, že je nezbytné další čištění, mohou se použít standardní metody. Takové metody mohou zahrnovat extrakci, aplikaci močoviny, frakční krystalizaci, HPLC, frakční destilaci, chromatografii na silikagelu, centrifugaci při vysokých rychlostech nebo destilaci nebo kombinace uvedených metod. Ochrana reakčních skupin, jako jsou kyselé nebo alkenylové skupiny, se může provést v libovolném kroku známých metod, například alkylace nebo jodizace. Používané metody obvykle zahrnují metylací mastných kyselin za vzniku metylesterů. Podobně lze ochranou skupinu odstranit v libovolném kroku. Čištění frakcí obsahujících ARA, DHA a EPA lze provést aplikací močovinou a/nebo frakční destilací.
Použití mastných kyselin
Existuje řada využití mastných kyselin podle vynálezu. Sondy založené na DNA podle vynálezu se mohou použít ve způsobech izolace příbuzných molekul nebo ve způsobech pro detekci organizmů exprimujících desaturázy. Při použití jako sondy DNA nebo oligonukleotidy musí být detekovatelné. To je obvykle doprovázeno zachycením značení buď na vnitřním místě, například začleněním upraveného zbytku, nebo na 5' nebo 3'konec. Takové značení je možné detekovat přímo, může vázat druhou molekulu, která je detekovatelně značená nebo se může vázat na neznačenou druhou molekulu a detakovatelně značenou terciální molekulu. Tento proces se může prodlužovat, pokud je to praktické, aby se dosáhlo uspokojivého detekčního signálu bez nežádoucí úrovně signálu pozadí. Sekundární, terciální e přemosťovací systémy mohou zahrnovat použití protilátek proti libovolné jiné molekule, zahrnující značení nebo jiné protilátky nebo mohou zahrnovat libovolné molekuly, které se
9999
99 99 99 ** ··»· ·»«· .· ’“· . ' ί . : :: i * ···· · · « · ·*·* ··· 99 9999 99 ·· vzájemně váží. Je to například systém biotinstreptavidin/avidin. Detakovatelné značení v typickém případě zahrnuje radioaktivní izotopy, molekuly, které chemicky nebo enzymaticky produkují nebo mění světlo, enzymy, které produkují detekovatelné reakční produkty, magnetické molekuly, fluorescenční molekuly nebo molekuly, které po navázání mění svou své fluorescenční nebo světlo-emitující charakteristiky. Příklady metod značení se popisují v publikaci USPN 5,011,770. V jiném případě navázání cílových molekul se může detekovat přímo měřením změn teploty roztoku při navázání sondy prostřednictvím izotermální titrační kalorimetrie nebo potažením sondy nebo cíle na povrch a detekcí změny rozptylu světla z povrchu, ke které dochází navázáním cíle nebo sondy. To se může provést systémem BIAcore.
PUFA podle vynálezu produkované rekombinantními způsoby se mohou použít v různých oblastech. Aplikace PUFA lidem a zvířatům v různých formách může vést ke zvýšenému množství PUFA ne pouze přidaným PUFA, ale také jejich metabolickými progeny.
Jestliže například inherentní dráha Δβ-desaturázy není u jednotlivce funkční, léčba pomocí GLA může vést ne pouze k ke zvýšenému množství GLA, ale také dalších produktů v dráze, jako je ARA a prostaglandiny (obrázek č. 1). Komplexní regulační mechanizmy mohou způsobit, že je nutné kombinovat různé PUFA nebo přidat různé konjugáty PUFA za účelem předejít, řídit nebo obejít takové mechanizmy, přičemž se u jedince dosáhne požadovaného množství specifického PUFA.
PUFA nebo jejich deriváty vyrobené popsanou metodou se mohou použít jako potravinové doplňky, zvláště v kojeneckých výživách, jsou vhodné pro pacienty intravenózní výživou nebo pří prevenci nebo léčbě podvýživy. Zvláště mastné kyseliny, jako je EPA se mohou používat při úpravách složení kojeneckých výživ, aby se lépe replikovalo složení PUFA lidského mateřského mléka. Převládajícími triglyceridy v mateřském
·· ·· e ř ·
O · ·· mléce jsou 1,3-di-oleoyl-2-palmitoyl- s 2-palmitoylglyceridy, které jsou lépe absorbovány než 2-oleoyl- nebo 2lineoylglyceridy (USPN 4,876,107). V typickém případě lidské mateřské mléko vykazuje profil mastných kyselin obsahující přibližně 0,15 % až 0,36 % DHA, přibližně 0,03 % až 0,13 % EPA, přibližně 0,30 až 0,88 % ARA, Přibližně 0,22% až 0,67 %
DGLA a přibližně 0,27 až 1,04% GLA.Preferovaný poměr GLA:DGLA:ARA v kojeneckých výživách je přibližně od 1:1:4 až přibližně 1:1:1. Množství olejů, které poskytují tyto poměry PUFA se mohou stanovit bez experimentů. PUFA nebo hostitelské buňky, které je obsahují se mohou také použít jako potravinové doplňky pro zvířata, aby se změnila tkáň zvířat nebo složení mastných kyselin v mléce, tak aby se více přiblížily těm, které jsou nutné pro aplikaci lidem nebo zvířatům.
Výživové přípravky
Vynález popisuje také výživové přípravky. Typický výživový přípravek podle vynálezu zahrnují libovolné potraviny nebo přípravky vhodné pro člověka. Mohou se aplikovat enterálně nebo parenterálně. Tyto přípravky po vstupu do těla (a) vyživují a staví tkáně nebo dodávají energii a/nebo (b) udržují, obnovují nebo podporují adekvátní nutriční statut nebo metabolickou funkci.
Nutriční kompozice podle vynálezu obsahuje alespoň jeden olej nebo jednu kyselinu, které se produkují v souladu s vynálezem, a mohou se vyskytovat v pevné nebo kapalné formě. Navíc kompozice může zahrnovat poživatelné makronutrienty, vitaminy a minerály v množství, které jsou nutné pro určité použití. Množství takových složek kolísá v závislosti na skutečnosti, zda kompozice je určená pro ' použití normálními zdravými kojenci, dětmi nebo dospělými jedinci, kteří tyto doplňky vyžadují ze zvláštních důvodů, jako je například jistý metabolický stav (například metabolická porucha).
• · ·
Příklady makronutrientů, které se mohou přidávat do kompozice zahrnují, ale nejsou omezeny na poživatelné tuky, sacharidy a proteiny. Příklady takových poživatelných tuků zahrnují, ale nejsou omezeny na kokosový olej, sojový olej a mono- a diglyceridy. Příklady takových sacharidů zahrnují, ale nejsou omezeny na glukózu, poživatelnou laktózu a hydrolyzovaný škrob. Dále se uvádějí příklady proteinů, které se mohou využít jako nutriční kompozice podle vynálezu. Jsou to například sojové proteiny, elektrodialyzovaná syrovátka, elektrodialyzované odtučněné mléko, mléčná syrovátka nebo hydrolyzáty těchto proteinů.
S ohledem na vitaminy a minerály do nutričních kompozic je možné přidat: vápník, fosfor, draslík, sodík, chlorid, hořčík, mangan, železo, měď, zinek, selen, jód a vitaminy A, E, D, C a komplex vitaminů B. Dále se mohou přidat jiné takové minerály a vitaminy.
Komponenty využívané v nutričních kompozicích podle vynálezu jsou semi-čištěného nebo čištěného původu. Termín „semi-čištěný nebo „čištěný znamená materiál, který se připravil čištěním přirozeného materiálu nebo syntézou.
Příklady nutričních kompozic podle vynálezu zahrnují, ale nejsou omezeny na kojenecké výživy, potravinové doplňky a rehydratační kompozice. Nutriční kompozice zahrnují, ale nejsou omezeny na ty, které využívají enterální nebo parenterální doplňky pro kojence, speciální kojenecké výživy, doplňky pro staré lidi doplňky pro lidi s gastrointestinálními problémy a/nebo s poruchami střebávání,
Výživové přípravky
Typický výživový přípravek podle vynálezu bude obsahovat poživatelné makronutrienty, vitaminy a minerály v množství, které je nutné pro určité použití. Množství takových látek kolísá v závislosti na skutečnosti, zda výživa je určena pro aplikaci normálním, zdravým jedincům, kteří jsou dočasně • · vystaveny stresu nebo jsou určeny subjektům, kteří mají specializované potřeby vzhledem k jistým chronickým nebo akutním sťádiím onemocnění (například metabolické poruchy). Odborníkům je zřejmé, že komponenty, které se využívají v nutričních kompozicích podle vynálezu pocházejí ze semičištěného nebo čištěného zdroje. Termín „semi-čištěný nebo „čištěný znamená materiál, který se připravil čištěním přirozeného materiálu nebo syntézou. Tyto metody jsou dobře známy v oboru (Code of Federal Regulations for Food
Ingredíents and Food Processing; Recommended Dietary Allowances, 10th Ed., National Academy Press, Washington, D.C., 1989).
V preferovaném provedení vynálezu jsou nutriční přípravky enterálním nutričním produktem, upřednostňuje se enterální nutriční produkt určený pro děti nebo dospělé. Vynález popisuje nutriční přípravek, který je vhodný pro výživu dospělých, kteří jsou vystaveni stresu. Výživa obsahuje vedle PUFA podle vynálezu, makronutrienty, vitaminy a minerály v množství, které poskytuje denní nutriční dávka pro dospělé j edince.
Makronutriční komponenty zahrnují poživatelné tuky, sacharidy a proteiny. Příklady poživatelných tuků jsou kokosový olej, sojový olej mono- a diglyceridy a oleje PUFA podle vynálezu. Příklady sacharidů jsou glukóza, poživatelné laktóza a hydrolyzovaný kukuřičný škrob. Typickým zdrojem proteinu je sojový protein, elektrodialyzované syrovátka nebo elektrodialyzované netučné mléko nebo mléčná syrovátka nebo hydrolyzáty uvedených proteinů. Mohou se použit jiné zdroje proteinů. Tyto makronutrienty se mohou přidat ve formě běžně přijatelných nutričních látek v množství, které odpovídá složení lidského mateřského mléka nebo energetickému základu, to znamená, že se uvedené množství vztahuje kalorický základ.
• · ···· ·· ·· ·· · · ··♦ ···· ···· ·*··*·· · · · * · j : · * • ···· ·»»<
···· ··· «· ···· ·· ·«
Metody tvoření kapalných a enterálních výživných příprajsouvků dobře známy v oboru a popisují se v příkladech provedení vynálezu.
Enterální formulace se může sterilizovat a následně používat ve formě „vhodný pro přímou konzumaci (RTF) nebo se mohou uchovávat v koncentrovaném roztoku nebo ve formě prášku. Prášek je možné připravit sušením enterálního přípravku roztřikem, který se připravuje podle shora uvedených metod. Přípravek se může rekonstituovat rehydratací koncentrátu. Kojenecké výživy a výživy pro dospělé jsou dobře známy v oboru a jsou běžně dostupné (např. Similac®, Ensure®, Jevity® a Alimentům® od firmy Ross Products Division, Abbott Laboratories). Olej nebo kyselina podle vynálezu se může přidat do libovolného přípravku v množství popsaném dále v textu.
Energetická hustota výživového přípravku, když je v kapalné formě, se může v typickém případě pohybovat v rozmezí 0,6 kcal až 3,0 kcal na mililitr. V pevné nebo práškové formě může nutriční doplněk obsahovat přibližně 1,2 až více než 9 kcal na gram, upřednostňuje se 3 až 7 kcal na gram. V obecném případě osmolalita kapalného produktu může být nižší než 700 mOsm. Více se upřednostňuje hodnota nižší než 660 mOsm.
Výživjyý přípravek v typickém případě zahrnuje vedle PUFA podle vynálezu, vitaminy a minerály, což napomáhá přijímat požadovanou minimální denní dávku těchto substancí. Vedle shora.uvedených PUFA může být nutné doplnit nutriční kompozici zinkem, mědí a kyselinou listovou a dalšími antioxidanty. Věří se, že uvedené látky také poskytují podporu stresovanému imunitnímu systému a tak přináší jedinci jistý benefit. Přítomnost zinku, mědi a kyseliny listové není nutná, aby se dosáhlo pozitivního účinku na imunitní supresi. Farmaceutická kompozice se může také doplnit uvedenými látkami.
• 9 • ·
9 9 9 9 9 9 · * · * 9«»· · · · · ···· ·· 9 9 9 9 9 * 999 9 · 9 · · · « * 9999 9 9 · 9 ······· ·· 9999 99 99
Ve více preferovaném provedení nutriční kompozice obsahuje vedle antioxidantního systému a komponentů PUFA zdroj sacharidů, kde alespoň 5 hmotnostních procent uvedených sacharidů tvoří nestravitelný oligosacharid. Ve více preferovaném provedení vynálezu nutriční kompozice navíc obsahuje protein taurin a karnitin.
PUFA nebo jejich deriváty, které se připravují popsanými způsoby, se mohou použít jako potravinové náhrady nebo doplňky zvláště pak u kojenecké výživy u pacientů vyživovaných intravenózně nebo při prevenci nebo léčbě podvýživy. V typickém případě lidské mateřské mléko vykazuje profil mastných kyselin obsahující přibližně 0,15 % až 0,36 % DHA, přibližně 0,03 % až 0,13 % EPA, přibližně 0,30 až 0,88 % ARA, Přibližně 0,22% až 0,67 % DGLA a přibližně 0,27 až 1,04% GLA. Převládajícími triglyceridy v mateřském mléce jsou 1,3-dioleoyl-2-palmitoyl s 2-palmitoylglyceridy, které jsou lépe absorbovány než 2-oleoyl nebo 2-lineoylglycerídy (USPN 4,876,107). Pak se mastné kyseliny, jako jsou ARA, DGLA, GLA a/nebo EPA připravované podle vynálezu, mohou použít při změně složení kojeneckých výživ, aby lépe napodobily zastoupení PUFA v lidském mateřském mléce. Olejová kompozice vhodná pro použití ve farmakologických nebo v potravinových doplňcích, zvláště pak u náhražek mateřského mléka nebo jeho doplňků, bude přednostně obsahovat jednu nebo více ARA, DGLA a GLA. Více se upřednostňuje, aby olej obsahoval přibližně 0,3 až 30 % ARA, přibližně 0,2 až 30 % DGLA a přibližně 0,2 až 30 % GLA.
Koncentrace a poměry ARA, DGLA a GLA se mohou upravit pro určité konečné použití. Když se připravuje doplněk mateřského mléka nebo jeho náhražka, olejová kompozice, která obsahuje dvě nebo více látek ze skupiny zahrnující ARA, DGLA a GLA je v poměru přibližně 1:19:30 až 6:1:0,2. Například mateřské mléko u zvířat vykazuje poměr ARA: DGLA: DGL, který kolísá v rozmezí 1:19:30 až 6:1:0,2. Preferují se poměry 1:1:1, 1:2:1 ·· ···· · · * · ·· · * • · · ···· ···· .····..;; .· · ; ϊ ; :
• ···· ···♦ ······· ·· ···· ·· «· a 1:1:4. Když se produkují PUFA v hostitelské buňce dohromady, je vhodné upravit rychlost a procenta přeměny prekurzorového substrátu, jako je GLA a DGLA na ARA, aby se tak přesně řídily poměry PUFA. 5 až 10 % rychlost konverze DGLA na ARA se může použít pro produkci poměru ARA : DGLA přibližně 1:19, zatímco rychlost konverze přibližně 75 až 80 % se může použít při produkci poměru ARA : DGLA 6:1. Proto se může použít jak v systému buněčné kultury nebo v hostitelském organizmu, regulace časování, rozsahu a specifity exprese desaturázy za účelem modulace množství a poměru PUFA. Oleje se mohou izolovat a rekombinovat v požadovaných koncentracích a v poměrech v závislosti na použitém expresívním systému, kterým je například buněčná kultura nebo zvíře exprimující olej (e) ve svém mléce. Množství olejů poskytující uvedené poměry PUFA se mohou stanovit následujícími standardními protokoly. PUFA nebo hostitelské buňky, které je obsahují, se mohu také použít jako doplňky krmivá pro zvířata, přičemž mění složení mastných kyselin v mléce nebo v tkáních na složení, které je přijatelnější pro aplikaci lidem nebo zvířatům.
V případě potravinového doplňku se mohou PUFA nebo jejich deriváty začlenit do potravinářských olejů, tuků nebo margarinů, které se tvoří tak, že při normálním použití recipient dostane požadované množství. PUFA se mohou také přidat do kojeneckých výživ, nutričních doplňků nebo jiných potravinářských produktů a mohu se použít jako protizánětlivé činidla nebo činidla, která snižují hladinu cholesterolu.
Farmaceutické kompozice
Vynález popisuje farmaceutickou kompozici obsahující jednu nebo více kyselin a/nebo výsledné oleje produkované podle zde popsaných metod. Taková farmaceutická kompozice může obsahovat jednu nebo více kyselin a/nebo olejů stejně jako standardní, netoxický farmaceuticky přijatelný nosič, adjuvans nebo vehikl, jako je například fyziologický roztok pufrovaný fosfátem, voda, etanol, polyoly, rostlinné oleje, smáčecí činidlo nebo emulze, jako je například emulze voda/olej. Kompozice může být v kapalné nebo pevné formě. Kompozice může být například ve formě tablet, kapsulí, poživatelné kapaliny nebo prášku, v injektovatelné formě nebo ve formě povrchově aplikované masti nebo krému.
Možné způsoby aplikace zahrnují například orální, rektální a parenterální aplikaci. Způsob aplikace bude samozřejmě záležet na požadovaném účinku. Jestliže se kompozice má použít pro léčbu drsné, suché nebo podrážděné kůže nebo při léčbě poraněné nebo popálené kůže nebo při ošetření kůže nebo vlasů, které jsou poškozeny nemocí, může se aplikovat povrchově.
Dávku kompozice aplikovaná pacientovi může stanovit odborník v závislosti na různých faktorech, jako je hmotnost pacienta, věk pacienta a stav imunitního systému atd..
S ohledem na formu kompozice může být například roztok, disperze, suspenze, emulze nebo sterilní prášek, který se pak může rekonstituovat.
Kompozice podle vynálezu se může dále kosmetické účely. Mohou se přidat do dříve kosmetických přípravků. Vytvoří se směs, která se může použít jako změkčovací kompozice.
Farmaceutické kompozice se mohou používat pro aplikaci komponentu PUFA jednotlivci. V hodné farmaceutické kompozice mohou obsahovat fyziologicky přijatelné sterilní vodné nebo nevodné roztoky, disperze, suspenze nebo emulze nebo sterilní prášky pro přípravu sterilních roztoků nebo disperzí. Příklady vhodných vodných nebo nevodných nosičů, ředidel, rozpouštědel nebo vehíklů zahrnují vodu, etanol, polyoly (propylenglykol, polyethylenglykol, glycerol a podobně), jejich vhodné směsi, rostlinné oleje (jako je olivový olej) a injektovatelné organické estery, jako je etyloleját. Vhodná těkavost se může udržovat v případě disperze například zachováním požadované velikosti částic a použitím povrchových činidel. Může být také využít pro existuj ících • * nutné použít izotonická činidla například cukry, chlorid sodný a podobně. Vedle takových inertních ředidel kompozice také může zahrnovat adjuvans, jako je smáčecí činidla, emulgátory a suspendační činidla, sladidla, příchutě a aroma.
Suspenze vedle aktivních sloučenin mohou obsahovat suspendační činidla, jako je například etoxylovaný izostearylalkohol, polyoxyetylensorbitol a sorbitanestery, mikrokrystalická celulóza, metahydroxid hliníku, bentonit, agar-agar a tragakant nebo směsi uvedených látek a podobně.
Pevné dávkovači formy, jako jsou tablety a kapsule se mohou připravit za použití metod dobře známých v oboru. PUFA podle vynálezu mohou tvořit tablety spolu s běžnými tabletovými bázemi, jako je laktóza, sacharóza a kukuřičný škrob v kombinaci s pojidlem, jako je arabská guma, kukuřičný škrob nebo želatina, dezintegrační činidla, jako je bramborový škrob nebo kyselina alginová a lubrikační prostředek, jako je kyselina stearová nebo stearát hořečnatý. Kapsule se mohou připravit začleněním těchto ekcipientů do želatinových kapsuli buď samotných nebo s antioxidanty a s komponenty PUFA. Množství antioxidantů a komponentů PUFA, které by se měly začlenit do farmaceutické kompozice by měly souhlasit se shora uvedeným průvodcem.
Termín „léčit znamená buď předcházet nebo redukovat výskyt nežádoucích stavů. Například léčit utlumení imunity znamená buď předcházet výskytu této suprese nebo redukovat stupeň takové suprese. Termíny „pacient a zaměnitelné a oba tyto termíny znamenají zvíře znamená libovolného teplokrevného savce, ale není omezen na psi, lidí, opice a bezocasé opice. Termín „přibližně znamená množství, které kolísá v daném rozmezí v závislosti na použití. Libovolné numerické číslo nebo rozmezí specifikované ve specifikacích by se mohlo upravovat podle shora uvedeného termínu.
.jedinec jsou Termín „zvíře • ·
Termín „dávka znamená množství nutriční nebo farmaceutické kompozice podávané pacientovi v jediné aplikaci a je navržena tak, aby se zavedlo účinné množství antioxidantů a strukturních triglyceridů. Odborníkům je zřejmé, že jediná dávka kapalného nutričního prášku by měla poskytnout shora uvedené množství antioxidantů a PUFA. Dávka by měla zahrnovat objem, který je schopen konzumovat typický dospělý jedinec při jedné aplikaci. Toto množství může široce kolísat v závislosti na věku, hmotnosti, pohlaví nebo zdravotním stavu pacienta. Obecně platí, že jedna dávka kapalného nutričního produktu by měla obsahovat objem 100 až 600 ml, upřednostňuje se 125 až 500 ml a nejvíce se preferuje 125 až 300 ml.
PUFA podle vynálezu se mohou také přidat do potravin dokonce tehdy, jestliže potravinové doplňky nejsou nutné. Kompozice se například mohou přidat do libovolného typu potravin, které se neomezují na margariny, upravená másla, sýry, mléko, jogurt, čokoláda, bonbony, sušenky, salátové oleje, tuky vhodné pro tepelné zpracování, maso, ryby a nápoje.
Farmaceutické aplikace
V případě farmaceutického použití (v lidské a veterinární medicíně) se mohou kompozice obecně aplikovat orálně nebo libovolným jiným způsobem, při kterém může dojít k úspěšné absorpci. To znamená například parenterálně (to je podkožně, do svalu nebo intravenózně), rektálně nebo vaginálně nebo povrchově, což může být například kožní mast nebo roztok. PUFA podle vynálezu se mohou aplikovat samostatně nebo v kombinaci s farmaceuticky přijatelným nosičem nebo ekcipientem. Jestliže jsou dostupné želatinové kapsule, stávají se preferovanou formou orální aplikace. Doplnění potravy, jak se popisuje shora v textu, se může také provádět orálním způsobem aplikace. Nesaturované kyseliny podle vynálezu se mohou aplikovat v konjugovaných formách nebo jako sole, estery, • « • · jako jsou normálního amidy nebo pro-formy léčiv mastných kyselin. Vynález popisuje libovolné farmaceuticky přijatelné sole. Zvláště se preferují sole sodíku, draslíku a litia. Dále se využívají Nalkylpolyhydroxaminové sole, jako je N-metylglukamin, který se popisuje v publikaci WO 96/33155. Preferovanými estery jsou etylestery. Jako pevné sole se mohou estery aplikovat ve formě tablet. V případě intravenózní aplikace se mohou PUFA nebo jejich deriváty začlenit do běžných formulací,
Intralipidy. Profil mastných kyselin v plazmě dospělého jedince je 6,64 až 9,46 % ARA, 1,45 až 3,11 % DGLA a 0,02 až 0,08 % GLA. Tyto PUFA nebo jiné metabolické prekurzory se mohou aplikovat buď samotné nebo ve směsi s jinými PUFA, aby se dosáhlo u pacienta normálního profilu mastných kyselin. Jestliže je to nutné jednotlivé komponenty formulací mohou být dostupné ve formě kitů, které jsou vhodné pro jediné nebo vícenásobné použití. Typická dávka určité mastné kyseliny je 0,1 mg až 20 mg nebo dokonce 100 g denně a upřednostňuje se 10 mg až 1, 2, 5 nebo 10 g denně nebo molární ekvivalentní množství jejich derivátů. Vynález dále popisuje parenterální nutriční kompozice obsahující přibližně 2 až 30 hmotnostních procent mastných kyselin vypočítaných jako triglyceridy. Preferují se kompozice, které obsahují přibližně 1 až 25 hmotnostních procent celkové kompozice PUFA jak GLA (USPN 5,196,198) . Do kompozice se mohou přidat jiné vitamíny a zvláště pak v tucích rozpustné vitaminy, jako je vitamin A, D, E a L-karnitin. Jestliže je to nutné mohou se přidat konzervační činidla, jako je například α-tokoferol, v typickém případě tvoří přibližně 0,1 hmotnostních procent.
Vhodné farmaceutické kompozice mohou obsahovat fyziologicky přijatelné sterilní vodné nebo nevodné roztoky, disperze, suspenze nebo emulze a sterilní prášky vhodné pro rekonstituci na sterilní injektovatelné roztoky nebo disperze. Příklady vhodných a nevodných nosičů, ředidel, rozpouštědel nebo vehiklů zahrnují vodu, etanol, polyoly (propylenglyol, • · ·· ·· · · • J · · « * t • · · · « « · • · · · · ·«·· ······ · · · · ·· < « >· polyetylenglykol, glycerol a podobně), jejich vhodné směsi, rostlinné oleje (jako je olivový olej) a injektovatelné organické estery, jako je etyloleát. Vhodnou fluiditu lze udržovat v případě disperzí například zachováním požadované velikosti částic nebo použitím povrchově aktivních činidel. Může být také nutné zahrnout izotonická činidla, například cukry, chlorid sodný a podobně. Vedle takových inertních ředidel kompozice může také zahrnovat adjuvans, jako jsou smáčecí činidla, emulgační a suspendační činidla, sladidla, příchutě a aroma.
Suspenze vedla aktivních látek mohou obsahovat suspendační činidla, jako je například etoxylované izostearylalkoholy, polyoxyetylensorbitol a sorbitanestery, mikrokrystalická celulóza, metahydroxid hlinitý, bentonit, agar-agar a tragakant nebo směsi uvedených látek a podobně.
Zvláště preferované kompozice obsahují estery diacetyltartarové kyseliny a mono- a diglyceridů rozpuštěné ve vodném médiu nebo v rozpouštědle. Estery diacetyltartarové kyseliny a mono- a diglyceridů mají hodnotu HLB přibližně 9 až 12 a jsou podstatně více hydrofilní, než existující antimikrobiální lipidy, které vykazují hodnoty HLB 2 až 4. Tyto existující hydrofóbní lipidy se nemohou tvořit ve formě vodných kompozic. Tyto lipidy se mohou rozpouštět ve vodném médiu v kombinaci s estery diacetyltartarové kyseliny a monoa diglyceridů. V souladu s tímto provedením vynálezu estery diacetyltartarové kyseliny a mono- a diglyceridů (například DATEM-C12:0) se taví s jinými aktivními antimikrobiálními lipidy (například 18:2 a 12:0 monoglyceriody) a mísí se za vzniku homogenní směsi. Homogenita umožňuje zvýšit antimikrobiální aktivitu. Směs se může zcela dispergovat ve vodě. To není možné bez přidání esterů diacetyltartarové kyseliny a mono- a diglyceridů. Dříve než se přidá voda se vše promíchá s dalšími monoglyceridy. Vodná kompozice se pak může míchat za sterilních podmínek s fyziologicky přijatelnými • · · · ředidly, konzervačními činidly, pufry nebo hnacími látkami, které jsou nutné pro vytvoření spreje nebo inhalační formy.
Vynález dále popisuje léčbu řady poruch pomocí mastných kyselin. Doplňování PUFA podle vynálezu se může použít při léčbě restenózy po angioplastice. Pomocí PUFA podle vynálezu lupénky se mohou léčit symptomy zánětů, revmatické artritidy a astma. Důkazy ukazují, že PUFA se mohou podílet na metabolizmu vápníku, což naznačuje, že PUFA podle vynálezu se mohou použít při léčbě nebo prevenci osteoporózy a kamenů v ledvinách nebo v močovém ústrojí.
PUFA podle vynálezu se mohou použít při léčbě zhoubného bujení. Ukázalo se, že maligní buňky vykazují změnu ve složení mastných kyselin. Navíc mastné kyseliny zpomalují růst uvedených buněk a způsobují jejich úmrtí a zvyšují jejich citlivost k chemoterapeutickým činidlům. Dále se popisuje, že GLA způsobuje re-expresi buněčných adhezivních molekul Ekaderinu v buňkách karcinomů, přičemž ztráta exprese uvedených molekul je spojena s agresivní tvorbou metastáz. Klinické testy intravénozní aplikace ve vodě rozpustných litných solí GLA pacientům se zhoubným bujení pankreasu ukazují podstatné zvýšení pacientů, kteří přežívají. Podávaní PUFA je také vhodné pro léčbu kachexie spojené se zhoubným bujením.
PUFA podle vynálezu se mohou také použít při léčbě cukrovky (USPN 4,826, 877; Horrobin et al. , Am. J. Clin. Nutr. Vol. 57 (Suppl.), 732S-737S). Změněný metabolizmus mastných kyselin a jejich složení se demonstruje u zvířat trpících cukrovkou. Tyto změny naznačují, že se podílí na komplikacích, které vznikají při dlouhodobém onemocnění cukrovkou. Tyto komplikace zahrnují retinopatii, neuropatii, nefropatii a poškození reprodukčního systému. Petrklíčový olej, který obsahuje GLA, je schopen bránit a napravit poškození nervů při dlouhodobě trvající cukrovce.
PUFA podle vynálezu se mohou používat při léčbě ekzémů, při redukci krevního tlaku. Nedostatečnost mastných kyselin se ··
projevuje ekzémy a studie naznačují, že GLA pozitivně působí na ekzémy. GLA se také podílejí na snížení vysokého tlaku spojeného se stresem. Ukázalo se, že GLA a DGLA inhibují agregaci destiček, způsobují vazodilaci, snižují hladinu cholesterolu a inhibují proliferaci hladkého svalstva stěn cév a vláknité tkáně (Brenner et al. , Adv. Exp. Med. Biol. Vol. 83, p.85-101, 1976). Aplikace GLA nebo DGLA samotného nebo v kombinaci s EPA snižuje nebo brání krvácení v gastrointestinálním traktu a jiným vedlejším účinkům, které jsou spojeny s aplikací nesteroidních protizánětlivých léčiv (USPN 4,666,701). GLA a DGLA také předchází nebo léčí endometriózu a premenstruální syndrom (USPN 4,758,592) a léčí myalgickou encefalomyelitidu a chronickou únavu po vírové infekci (USPN 5,116,871).
Další použití PUFA podle vynálezu zahrnuje použití při léčbě AIDS, roztroušené sklerózy, akutního respiračního syndromu, vysokého tlaku a zánětlivého onemocnění kůže. PUFA podle vynálezu se mohou také použít ve formulích určených pro celkové posílení a pro geriatrickou léčbu.
Veterinární aplikace
Je třeba poznamenat, že shora uvedené farmaceutické a výživné kompozice se mohou také aplikovat zvířatům, stejně jako lidem. Zvířata mohou mít stejné potřeby a stejné stavy jako lidé. Olej nebo kyseliny podle vynálezu se mohou používat jako doplňky nebo náhrady při krmení zvířat.
Přehled obrázků na výkresu
Obrázek č. 1 ukazuje možnou dráhu syntézy kyseliny arachidonové (20:4 Δ5, 8, 11, 14) a kyseliny stearadinové (18:4 Δ6, 9, 12, 15) z kyseliny palmitové (Ci6) z různých organizmů, které zahrnují řasy, Mortierella a lidi. Tyto PUFA mohou sloužit jako prekurzory jiných molekul důležitých pro • · • · · · · • · » · « člověka a jiná zvířata. Mezi uvedené molekuly patří prostacykliny, leukotrieny a prostaglandiny. Některé z nich jsou zde zobrazeny.
Obrázek č. 2 ukazuje možnou dráhu produkce PUFA vedle ARA, zahrnující EPA a DHA v případě různých organizmů.
Obrázek č. 3A až E ukazuje sekvenci DNA (SEQ ID NO: 1) Δβdesaturázy Mortierelle alpina a dedukovanou aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 2.
Obrázek č. 4 ukazuje uspořádání části aminokyselinové sekvence Δβ-desaturázy Mortierella alpina s jinými příbuznými sekvencemi (SEQ ID NOS: 7, 8, 9, 10, 11, 12 a 13).
Obrázek č. 5A až D ukazuje sekvenci DNA Al2-desaturázy (SEQ ID NO: 3) a dedukovanou aminokyselinovou sekvenci (SEQ ID
NO: 4) :
Obrázek č. 6 ukazuje dedukovanou aminokyselinovou sekvenci (SEQ ID NO: 14) fragmentu PCR (uvedeno v příkladu 1).
Obrázek č. 7A až D zobrazuje sekvenci DNA A5-desaturázy (SEQ ID NO: 5) Mortierella alpina.
Obrázek č. 8 zobrazuje uspořádání proteinové sekvence Δ5desaturázy (SEQ ID NO: 6) s Δβ-desaturázou a příbuzné sekvence (SEQ ID NO: 15, 16, 17, 18) .
Obrázek č. 9 ukazuje uspořádání proteinové sekvence Ma 29 a kontig 253538a.
Obrázek č. 10 ukazuje uspořádání proteinové sekvence Ma 524 a kontig 253538a.
Popis sekvencí:
SEQ ID NO: 1 ukazuje sekvenci DNA Δβ-desaturázy
Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 2 ukazuje aminokyselinovou sekvenci Δβdesaturázy Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 3 ukazuje sekvenci DNA A12-desaturázy
Mortierella alpina.
• ·
SEQ ID NO: 4 ukazuje aminokyselinovou sekvenci Δ12desaturázy Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 5 ukazuje DNA sekvenci A5-desaturázy
Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 7 až SEQ ID NO: 13 ukazují aminokyselinové sekvence, které jsou příbuzné Δβ-desaturázy Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 14 aminokyselinovou sekvenci PCR fragmentu uvedeného v příkladu 1.
SEQ ID NO: 15 až SEQ ID NO: 18 ukazují aminokyselinové sekvence, které jsou příbuzné Δ5- a Δβ-desaturázy Mortierella alpina.
SEQ ID NO: 19 až SEQ ID NO: 30 zobrazují sekvence primerů
PCR.
SEQ ID NO: 31 až SEQ ID NO: 37 zobrazují lidské nukleotidové sekvence
SEQ ID NO: 38 až SEQ ID NO: 44 zobrazují lidské peptidové sekvence.
SEQ ID NO: 45 až SEQ ID NO: 46 zobrazují nukleotidovou a aminokyselinovou sekvenci desaturázy Dictyostelium discoideum.
SEQ ID NO: 47 až SEQ ID NO: 50 ukazují nukleotidovou a dedukovanou aminokyselinovou sekvenci klonu cDNA
Schizochytrium.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Izolace nukleotidové sekvence Δ5 desaturázy z organizmu Mortierella alpina
Organizmus Mortierella alpina produkuje kyselinu arachidonovou (ARA, 20:4) z prekurzoru 20:3 pomocí Δ5desaturázy. Nukleotidové sekvence kódující A5-desaturázu pocházející z Mortierella alpina se získala pomocí amplifikace PCR za použití prvního řetězce cDNA Mortierella alpina a • · • · »· · · • · · · • · · « degenerovaných oligonukleotidových primerů odpovídájících aminokyselinovým sekvencím, které jsou mezi Δβ-desaturázami z Synechocystis a Spirulina konzervativní. Postup je následuj ící:
Celková RNA se izolovala ze třídenní kultury organizmu Mortierella alpina produkující PUFA za použití protokolu podle publikace Hoge et al. (1982) Experimental Mycology 6: 225-232. RNA se používala pro přípravu dvouřetězcové cDNA za použití systému lambda-ZipLox od firmy BLR. Postupuje se podle instrukcí výrobce. Několik velikostí cDNA organizmu Mortierella alpina se zabalilo odděleně za vzniku knihoven z různými inzerty průměrné velikosti. Knihovna s úplnou délkou zahrnuje přibližně 3 x 10s klonů, přičemž průměrná velikost inzertu je 1,77 kb. Knihovna vhodná pro sekvenování obsahuje přibližně 6 x 105 klonů, přičemž průměrná velikost inzertu je 1,1 kb.
za použití
Tsyn 5'NO: 19).
pg
Superscript celkové RNA se reverzně přepsalo RTázy firmy BLR a primerů CAAGCTTCTGCAGGAGCTCTTTTTTTTTTTTTTT-3' (SEQ ID
Degenerované oligonukleotidy se navrhly tak, aby byly vhodné pro oblasti, které jsou mezi dvěmi sekvencemi Δβ-desaturázy cyanobakterií konzervativní. Použily se specifické primery D6DESAT-F3 (SEQ ID NO: 20) (5'-CUACUACUACUACAYCAYACOTAYACOAAYAT-3') a
D6DESAT-R3 (SEQ ID NO: 21) (5'-CAUCAUCAUCAUOGGRAAOARRTGRTG-3') , kde Y=C+T, R=A+G a O=I+C. Amplifikace PCR se provedla v objemu 25 μΐ a reakce zahrnuje templát získaný ze 40 ng celkové RNA, 2 pM každého primerů, 200 μΜ každého deoxyribonukleotidového trifosfátu, 60 mM Tris-Cl, pH 8,5, 15 mM (NH^SO,}, 2 mM MgCl2. Vzorky se nejdříve denaturovaly při teplotě 95 °C po dobu 5 minut, pak se držely při teplotě 72 °C a přidalo se 0,2 jednotek Taq polymerázy. Podmínky PCR jsou následující: teplota 94 °C po dobu 1 minuty, teplota 45 °C po dobu 1,5 • · minuty, teplota 72 °C po dobu 2 minut. PCR proběhlo ve 35 cyklech. PCR prvního řetězce cDNA Mortierella alpina za použití těchto primerů produkuje reakční produkt o velikosti 550 bp. Porovnáním dedukované aminokyselinové sekvence PCR fragmentu Mortierella alpina se objevily oblasti homologie s . Srovnávané oblasti shody. Dedukovaná
A6-desaturázou (uvádí se na obrázku č. 4 vykazují pouze přibližně 28 % aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 14.
Produkt PCR se použil jako sonda pro izolaci odpovídajících klonů cDNA z knihovny Mortierella alpina. Nejdelší klon cDNA Ma29 se označil jako pCGN5521 a jeho oba řetězce se zcela sekvenovaly. cDNA je obsažena ve vektoru pZLl jako inzert o velikosti 1 481 bp (Bethesda Research
Laboratories ) a začíná s ATG, dále obsahuje otevřený čtecí rámec kódující 446 aminokyselin. Čtecí rámec obsahuje sekvenci dedukovanou z fragmentu PCR. Zjistilo se, že sekvence inzertu cDNA obsahuje oblasti homologní s A6-desaturázou (obrázek č. 8) . Například se zjistilo, že tři konzervativní histidinové boxy (které se pozorovaly v desaturázách vázaných na membráně (Okuley et al., (1994) The Plant Cell 6: 147-158) jsou přítomny v sekvenci Mortierella v polohách aminokyselin 171 až 175, 207 až 212 a 387 až 391 (obrázek č. 5A až 5D). Zjistilo se, že aminokyselinový motiv HXXHH, který je typický pro třetí histídínový box z desaturázy organizmu Mortierella, je QXXHH. Překvapivě N-konec kódovaného proteinu vykazuje podstatnou homologii s proteiny cytochromu b5. Tak klon cDNA Mortierella reprezentuje fúzi mezi cytochromem b5 a desaturázou mastné kyseliny. Vzhledem k tomu, že cytochrom b5 funguje jako donor elektronů při navázání desaturáz na membránu, je možné, že Nterminální doména cytochromu b5 tohoto desaturázového proteinu se účastní na jeho funkci. To může být výhodné při expresi desaturázy v heterogenních systémech při produkci PUFA.
• · • ·
Příklad č. 2: Izolace nukleotidové sekvence Δβ-desaturázy z organizmu Mortierella alpina
Náhodným sekvenováním klonů z knihovny cDNA organizmu M. alpina vhodné pro sekvenování popsané v příkladu 1 se získala sekvence nukleové kyseliny z parciálního klonu cDNA Ma524, která kóduje Δβ-desaturázu mastné kyseliny. Plazmidy obsahující cDNA se vystřihly následujícím způsobem:
gg fágu se kombinovalo se 100 μΐ kultury E. coliDHlOB(ZIP), která se kultivovala na kultivačním médiu ECLB s 10 μς/τηΐ kanamycinu, 0,2 % maltózy a 10 mM MgSO4. Kultivace proběhla při teplotě 37 °C po dobu 15 minut. Přidalo se 0,9 ml SOC a 100 μΐ bakterií se bezprostředně naneslo na každou plotnu obsahující 10 ECLB + 50 μς Pen. Doba 45 minut vhodná pro vzpamatování kultury nebyla nutná. Plotny se inkubovaly přes noc při teplotě 37 °C. Kolonie se vypíchly do kultivačního média ECLB + 50 μς Pen a inkubovaly se přes noc. Z této kultury se připravily zásobní roztoky s glycerolem a provedla se mini izolace DNA. Alikvót kultury používaný jako mini izolaci se uchovával jako zásobní roztok s glycerolem. Nanesení kultury na plotny s kultivačním médiem ECLB + 50 μς Pen/ml vedlo k tvorbě více kolonií a větší část kolonií obsahuje inzerty ve srovnání s plotnami, které obsahují 100 μg/ml Pen.
Náhodně se vypíchly kolonie a za použití sady pro mini izolaci a izolovala se plazmídová DNA. Z 5'konce inzertu cDNA se získala sekvence DNA a porovnala se z databází instituce National Center for Biotechnology Information (NCBI) za použití algoritmu BLASTX. Ma524 se identifikoval jako putativní Δβ-desaturáza založená na homologii sekvence DNA s dříve identifikovanými Δβ-desaturázami.
Z knihovny organizmu M. alpina se izoloval klon cDNA v plné délce. Četnost výskytu tohoto klonu se jeví být a málo (2x) menší ve srovnání s Ma29. Ma524 vykazuje podstatnou homologii s částí kosmídu Caenorhabditid elegans, WO6D2.4, • · fúzního proteinu cytochrom b5/desaturázy ze slunečnic a se dvěma Δβ-desaturázami pocházejících ze Synechocystis a Spirulina.
Navíc Ma524 vykazuje homologii s aminokyselinovou sekvencí Δβ-desaturázy brutnáka lékařského (PCT WO 96/21022). Ma524 tak kóduje Δβ-desaturázu, která je příbuzná Δβ-desaturáze brutnáku lékařského a řas.
Je však nutné poznamenat, že ačkoli aminokyselinové sekvence Ma524 a Δβ-desaturázy obsahuje oblasti homologie, složení baží cDNA je podstatně odlišné. Například se ukázalo, že cDNA brutnáku lékařského obsahuje 60 % A+T, některé oblasti obsahují 70 % A+T, zatímco Ma524 vykazuje průměrně 44% A+T, přičemž žádná oblast nepřesahuje 60
To může způsobit u zvířat, která expresi cDNA v mikroorganizmech nebo upřednostňují odlišné složení baží. Je známo, že k slabé expresi rekombinantních genů může dojít, když hostitel preferuje složení baží odlišné od složení zavedeného genu. Mechanizmy takové slabé exprese zahrnují sníženou stabilitu, skrytá místa sestřihu a/nebo translaci mRNA a podobně.
Příklad 3: Identifikace Δβ-desaturáz homologních s Δ6desaturázou organizmu Mortierella alpina
Pomocí algortímu BLASTX databáze „Expressed Sequence Tag („EST) prostřednictvím NCBI za použití aminokyselinové sekvence Ma524 se identifikovaly sekvence nukleové kyseliny, které kódují putativní Δβ-desaturázy. Několik sekvencí vykazuje podstatnou homologii. Zvláště dedukovaná aminokyselinová sekvence dvou sekvencí Arabidopsis thaliana (číslo uložení F13728 a T42806) vykazují homologii s dvěma různými oblastmi dedukované aminokyselinové sekvence Ma524. Vytvořily se následující primery:
ATTS4723-FOR (komplementární s F13728), SEQ ID NO: 22
5' CUACUACUACUAGGAGTCCTCTACGGTGTTTTG a • · ·· ·« ·· » · · · · · .· : · · ? ·· · : T42806-REV (komplementární s T42806) SEQ ID NO: 23
5' CAUCAUCAUCAUCAUATGATGCTCAAGCTGAAACTG.
Pět mikrogramů celkové RNA izolovaných z Arabidopsis thaliana se reverzně přepsala za použití Superscript Rtázy firmy BRL a primerů TSyn (5'CCAAGCTTCTGCAGGAGCTCTTTTTTTTTTTTTTT-3' ) a označila se jako SEQ ID NO: 24. PCR se provedla v objemu 50 μΐ, kde je obsaženo: templát získaný z 25 ng celkové RNA, 2 pM každého primerů, 200 μΜ deoxyribonukleotidového trifosfátu, 60 mM Tris-Cl, pH8,5, 15 mM (NH4)2SO4, 2 mM MgC12, 0,2 jednotek Taq polymerázy. Podmínky v zařízení „termocycler byly následující: 94 °C pod obu 30 vteřin, 50 °C po dobu 30 vteřin, 72 °C pod dobu 30 vteřin. PCR pokračovalo v 35 cyklech, pak následovalo další prodloužení při teplotě 72 °C po dobu 7 minut. Výsledkem PCR je fragment o přibližné velikosti 750 párů baží, který se subklónoval, označil se jako 12-5 a sekvenoval se. Každý konec tohoto fragmentu se vytvořil tak, aby odpovídal EST Arabidopsis, ze kterého se vytvořily primery PCR. Tato sekvence se pojmenovala 12-5. Dedukovaná aminokyselinová sekvence 12-5 se porovnávala se sekvencí Ma524 a EST z člověka (W28140), myši (W53753) a C.elegans (R05219) (obrázek č. 4). Na základě homologíe tyto sekvence reprezentují polypeptidy desaturázy. Geny se pak mohou vložit do expresívních vektorů a mohou se exprimovat v hostitelských buňkách a může se stanovit jejich specifická aktivita A6-desaturázy nebo jiné desaturázy způsobem popsaným dále v textu.
Příklad 4: Izolace nukleotidové sekvence Á12-desaturázy z organizmu Mortierella alpina
Na základě hromadění mastných kyselin se zdá pravděpodobné, že organizmus Mortierella alpina vykazuje desaturázu typu ωβ. ωβ-desaturáza je odpovědná za produkci kyseliny linolenové (18:2) z kyseliny olejové (18:1). Kyselina
46 • · «··« ·· • · «· · • » · · · • · · · • » · ···· ·«· *· ·· ·· »· • · · · · * 0 • · · - « · • · · · 4 » € • * · · · « ···· ·· ··
linolenová (18:2) je substrát pro A6-desaturázy. Tento
experiment se navrhl, aby se stanovilo, zda organizmus
Mortierella alpina polypeptid Δ12-desaturázy. Jestli ano,
pak se stanovila odpovídající nukleotídová sekvence.
Náhodná kolonie z knihovny vhodné pro sekvenování organizmu M. alpina Ma648 se sekvenovala a identifikovala jako putativní desaturáza založená na homologii DNA sekvence s předem identifikovanými desaturázami, jak se popisuje v případě Ma524 (příklad č. 2) . Dedukovaná aminokyselinová sekvence z 5'konce cDNA Ma648 vykazuje podstatnou homologii s mikrozomální ω6(Δ12) desaturázou sóji (číslo uložení #L43921) stejně jako s 12-hydroxylázou oleátu fazole (číslo uložení #U22378). Jestliže se porovnávala s dalšími sekvencemi desaturáz mastných kyselin ωβ(Δ12) a ω3(Δ15) pozorovala se také jistá homologie.
Příklad 5: Izolace nukleotidové sekvence reduktázy cytochromu b5 z Mortierella alpina.
Nukleová sekvence kódující reduktázu cytochromu b5 z Mortierella alpina se získala následujícím způsobem. Knihovna cDNA se zkonstruovala na základě celkové RNA izolované z Mortierella alpina, jak se popisuje v příkladu 1. Sekvence DNA se získala z 5'a 3' konce jednoho z klonů M12-27. Průzkum ve veřejných databankách s dotaz em na dedukovanou aminokyselinovou sekvenci 3'-konce M12-27 (obrázek č. 5) vykázala podstatnou homologii se známými sekvencemi reduktáz cytochromu b5. Oblast obsahující více jak 49 aminokyselin klonu Mortierella vykazuje 55 % shody (73 % homologie) s reduktázou cytochromu b5 z prasete (uvedeno na obrázku č. 4) .
Příklad 6: Exprese klonů desaturázy M. alpina v pekařských kvasinkách litia se provedla podle Enzymology, Vol. 194, p.
Transformace kvasinek
Transformace kvasinek acetátem standardních protokolů (Methods in
186-187, 1991). Kvasinky se kultivovaly v kultivačním médiu
YPD při teplotě 30 °C. Buňky se centrifugovaly, resuspendovaly se v TE a opět se centrifugovaly a resuspendovaly se v TE obsahujícím 100 mM acetát litný. Pak proběhla centrifugace a opět se buňky resuspendovaly v TE/acetát litný. Resuspendované kvasinky se inkubovaly při teplotě 30 °C po dobu 60 minut za stálého míchání. Přidala se DNA sloužící jako nosič a do zkumavek se připravily alikvoty kultury kvasinek. Dále se do zkumavek přidala transformující DNA a zkumavky se inkubovaly po dobu 30 minut při teplotě 30 °C. Přidal se roztok PEG (35 % (hmotnost/objem) PEG 4 000, 100 mM acetát litný, TE pH 7,5) a pak následuje inkubace po dobu 50 minut při teplotě 30 °C.
Uskutečnil se teplotní šok provedený při teplotě 42 °C po dobu 5 minut, buňky se centrifugovaly do peletu, promyly se TE, opět se centrifugovaly a resuspendovaly se v TE. Resuspendované buňky se pak nanesly na plotny se selektivním médiem.
Exprese desaturázy v transformovaných kvasinkách
Klony cDNA z organizmu Mortierella alpina se testovaly, zda vykazují v pekařských kvasinkách aktivitu desaturázy. Jako pozitivní kontrola se použila Á15-desaturáza kanoly (získaná pomocí PCR použitím prvního řetězce cDNA ze semen Brassica napus kultivar 212/86 za použití primerů založených na publikované sekvenci (Arondel et al. Science 258: 1353-1355)). Gen Al5-desaturázy a gen z cDNA klonů Ma29 se začlenil do expresívního vektoru pYES2 (Invitrogen) za vzniku plazmidů pCGR-2 a pCGR-4. Tyto plazmidy se transfekovaly do kvasinek S. cerevisíae kmen 334 a exprimovaly se po indukci galaktózou v přítomnosti substrátů, které umožňují detekci specifické • φ ··» · > · # 1 • · »· aktivity desaturázy. Kontrolním kmenem byl S. cerevisiae kmen 334 obsahující nezměněný vektor pYES2. Používané substráty, produkované produkty a indikované aktivity desaturázy byly: DGLA (konverze na ARA indikuje aktivitu Á5~desaturázy), kyselina linolenová (konverze na GLA indikuje aktivitu Δ6desaturázy, konverze na ALA indikuje aktivitu A15-desaturázy), kyselina olejová (endogenní substrát připravený kvasinkami S. cerevisiae, konverze na kyselinu linolenovou indikuje aktivitu A12-desaturázy, která kvasinkám S. cerevisiae chybí) nebo ARA (konverze na EPA indikuje aktivitu A17-desaturázy). Výsledky jsou uvedeny v tabulce č. 1 dále v textu. Lipidové frakce se extrahovaly následujícím způsobem:
Kultury se kultivovaly po dobu 48 až 52 hodin při teplotě 15 °C. Buňky se centrifugovaly, pelet se promyl sterilní ddH2O a znovu se centrifugací připravil pelet. Pelety se suspendovaly mícháním na vortexu v metanolu. Přidal se chloroform s tritridekanon (jako inertní standard). Směsi se inkubovaly alespoň jednu hodinu při teplotě místnosti nebo přes noc při teplotě 4 °C. Extrahovala se vrstva chloroformu a filtrovala se za použití Whatmanova filtru s jedním gramem nevodného síranu sodného za účelem odstranění partikulí a zbytku vody. Organická rozpouštědla se odpařila při teplotě 40 °C v proudu dusíku. Extrahované lipidy se pak derivatizovaly na metylestery mastných kyselin (FAME) a analyzovaly se chromatografií (GC) přidáním 2 ml 0,5 N hydroxidu draselného v metanolu. Zkumavka se uzavřela. Vzorky se zahřály na teplotu 95 °C až 100 °C po dobu 30 minut a ochladily se na teplotu místnosti. Pak se přidaly přibližně 2 ml 14 % fluoridu boritého v metanolu a zahřátí se opakovalo. Po té, co se extrahovaná lipidová směs ochladila, přidaly se 2 ml vody a 1 ml hexanu za účelem extrakce FAME pro analýzu GC. Procenta konverze se vypočítala dělením produkovaného produktu součtem produkovaného produktu a přidaného substrátu a pak násobeno 100. Pro výpočet procenta konverze kyseliny olejové, kam se • · ·* produkovaná kyselina kyseliny olejové a nepřidal žádný substrát, linolenová dělí součtem linolenové násobeno 100.
se celková produkované
Tabulka č. 1
Exprese desaturázy M. alpína v pekařských kvasinkách
Klón enzymatická aktivita % konverze substrátu
pCGR-2 A15-desaturáza kanoly Δ6 0 (18:2 až 18:3ω6
Δ15 16,3 (18:2 až 18:3ω3)
Δ5 2,0 (20:3 až 18:3ω3)
Δ17 2,8 (20:4 až 20:5ω3)
Δ12 1,8 (18:1 až 18:2ωβ)
pCGR-4 (M. alpina podobný Δ6, Ma29) Δ6 0
Δ15 0
Δ5 15,3
Δ17 0, 3
Δ12 3,3
PCGR-7 (M. alpína podobný Δ12, Ma648j Δ6 0
Δ15 3,8
Δ5 2,2
Δ17 0
Δ12 63,4
Kontrolní klón A15-desaturázy vykazuje 16,3 % konverzi substrátu. Klón pCGR-4 exprimující cDNA Ma29 přeměnil 15,3 % 20:3 substrátu na 20:4w6, což indikuje, že gen kóduje Δ5desaturázu. Pozadí (nespecifická konverze substrátu) se v tomto případě pohybuje mezi 0 až 3 %. Klón pCGR-5 exprimující cDNA Ma524 přeměnil 6% substrátu na GLA, což indikuje, že gen kóduje Δβ-desaturázu. Klón pCGR-7 exprimující
I μΜ, procento konverze
I ···· • · ·# • · · * • · · • » · · • « » ·» ···· cDNA Ma648 přeměnil 63,4% substrátu na LA, což indikuje, že gen kóduje A12-desaturázu.
Dále se zjistilo, že substrát v různých koncentracích inhíbuje aktivitu. Když se přidal substrát v koncentraci 100 kleslo ve srovnání s koncentrací substrátu 25 μΜ (uvedeno dále v textu). Tyto data ukazují, že desaturázy s různými specifitami substrátu se mohu exprimovat v heterogenním systému a používají se za účelem produkce polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem.
Tabulka č. 2 reprezentuje zajímavé mastné kyseliny, jako procento celkových lipidů extrahovatelných z kvasinkového hostitele S.cerevisiae 334 s indikovaným plazmidem. V růstovém médiu není obsažena žádná glukóza. Afinitní plynová chromatografie se používala k separaci lipidů. GC/MS se použila pro ověření identity produktu(ů). Očekávaný produkt Á15-desaturázy organizmu B. napas, což je ct-linolenová kyselina, se detekoval, když se exogenně přidal její substrát kyselina linolenová do indukované kvasinkové kultury. Toto zjištění naznačuje, že exprese desaturázového genu v kvasinkách produkuje funkční enzym a detekovatelné množství produktu za současných růstových podmínek. Oba exogenně přidané substráty se pohltily kvasinkami, ačkoli do kvasinek se začlenilo o trochu méně PUFA s delšími řetězci, což je kyselina díhomo-y-linolenová (20:3) spíše než kyseliny linolenové (18:2), když se přidaly ve volné formě, aby se indukovala kvasinková kultura. Kyselina γ-linolenová se v kvasinkách detekovala jako nové PUFA, když během indukce a exprese v S. cerevisiae 334 (pCGR-5) byla přítomna kyselina Přítomnost uvedené PUFA ukazuje aktivitu Δ6linolenová desaturázy
Kyselina linolenová se lipidech pocházejících z pCGR-5 (MA524). identifikovala v extrahovaných z exprese S. cerevisiae 334 (pCGR-7), cDNA MA648 z M. alpina se klasifikuje jako A12-desaturáza.
·· · · ·· ·· • ·· · · ·· · • · · « » · # • · · · < · » · « • · ·· '>1
G d
>
O
Xi
G oj Ό ·· O co G t—I CL,
Ol
*.
Ol kyselina vyjádřená jako procento celkových lipidů extrahovaných z kvasinek 'Γ>Ί
G £
* o
τ—1 4J
• . Ή
CO >G
rd CX
'1>Ί
G d
>
O
Xi
G
Ό
• · O
o G
C\1 CX
Ίο c
>o
G
O co i ·· >O o d Ol N
CO co >,
G d > o Xi G Ό O
I H ř- CX
c
d
>
o
CO x;
•» G
co Ό
o
G
CX '2 c
>o c
<D
OJ i—l
.. >o oo O r—1 N
Λ
O d
G
<T5 Ό Ή
d •H o
i—I C £ d
G 4-1 N >
n CO rd Xi
d d 1-1
E-i 2 Oj >
sr sr co
LO) cn co co
Ή
C
I-1 o
G
OJ -P ω c ω o >-< xí co o
LO) i—
LOJ o
co
Ol
I —Cř LO) O rG o <
CX ~ co o
LO)
O)
OJ
CO co
3*
I cř —
O LO) o <
Oj — cr
Ol rΟΊ cn o
xT
Ol co
LO)
I & --o CO O < CX
Γιο) χτ co
L0) co rI — & oi O r-J o < 0-1 — n
o o
xí c
•H d
o >
x;
d
G ♦H o
>
o c
o
CO r-H
>, Xi > 'Π3 'CCS O c '(3
4-> 0 > > >
d '<0 'Γ0 G 0 0 o
G c > (U L-l c G
4-1 4J o 1-1 Q) o O
ω CZ) G 0 i—1 1 Ό
n > (U G 0 •H o •H
G g 0 i—1 -r_| c G £ -G
CZ) •ΓΊ 0 i—I ♦H ni o U
tu G 1 i—1 tu -C d
2 c i—l -H a 4-1 -H G
i c o i—1 co Ό d
(U d n3
O Cn 0 d d G c fO d d
o o u G G •i—1 H G G c
v—l Ό «—1 •H -H i—! -H Ή •H
G G i—I i—I tu (V 1-ί i—1 i—1
(1) <U Ό tu tu d CZ) tu tu (U
d d d co ί>Ί d d d
tu 4-1 Σ>1 Xi Í>T ^*Ί
0 ΤΊ Xi Xi Xi x; Xi
1-1 Xi co CO
d i—l • ·
Ό ϊ—l Ol 00 co O)
•H CO Ή • · • . t—1 t“d
>G f~d I—) co co 1 co o o
Oj * :—1 i—1 a o i-H OJ Ol
• · · · • · « ·
Příklad 7: Exprese A5-desaturázy v rostlinách
Exprese v listech
Tento experiment se navrhla tak, aby se stanovilo, zda listy, kde se exprimuje Ma29 (což se stanovilo northernovou analýzou), budou schopny přeměnit exogenně aplikovanou DGLA (20:3) na ARA (20:4).
cDNA desaturázy Ma29 se modifikovala pomocí PCR tak, že se zavedlo restrikční místo vhodné pro klonování. Oblast kódující desaturázu se začlenila do kazety d35. Expresi řídí dvojitý promotor 35S vhodný zvláště pro expresi v listech rostliny Brassica (pCGN5525) podle standardních protokolů (USPN 5,424,200 a USPN 5,106,739). Transgenní rostliny Brassica obsahující pCGN525 se vytvořily podle následujících standarních protokolů (USPN 5,188,958 a USPN 5,463,174).
V prvním experimentu se použily tři rostliny: kontrolní LPOO4-1 a dvě transgenní 5525-23 a 5525-29. LP004 je odrůda rostliny Brassica s nízkým obsahem kyseliny linolenové. Listy z každé rostliny se použily pro jedno ze tří ošetření:.voda, GLA nebo DGLA. GLA a DGLA se získaly jako sole sodíku od firmy NuChek Prep a rozpustily se ve vodě v koncentraci 1 mg/ml. Alikvoty se držely v atmosféře dusíku a skladovaly se při teplotě -70°C. Listy se ošetřily kápnutím 50 μΐ uvedené látky. Kapka se jemně prstem v gumové rukavici rozetřela po celém povrchu listu. Aplikace se provedla přibližně 30 minut před koncem světelného cyklu, aby se minimalizovala foto-oxidace aplikovaných mastných kyselin. Po 6 dnech od ošetření se jeden list z každé skupiny rozdělil na polovinu podle středního žebra. Jedna polovina se promyla vodou, aby se odstranila nezačleněná mastná kyselina. Vzorky listů se lyofilizovaly přes noc a složení mastných kyselin se stanovilo plynovou chromatografií (GC) . Tyto výsledky jsou uvedeny v tabulce č. 3 .
í
Tabulka č. 3:
Analýza mastných kyselin v listech z transgenních rostlin Ma29 Brassica
o o CM ž? o O 10Ό o Ι0Ό 10Ό 0 0.02 9 10Ό O O 0.02 1_ 0.01 10Ό 0.01 10Ό 9 10Ό
:00 os in «η in Os cn 9 Os Os cn CM SO 9 Os 9
£ o O o ΜΊ m 0 9 V) v> V) <n m SO
20 o O 9 9 9 9 9 9 9 9 9 d d d d 9 d d
£ w* 5? o o o o o 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
ΓΌ CM Os m Os vn Os v> CM C* CM cn Os 9
9 £ in Os CM CM SO 'd CN SO 0 SO C* v> 1 00 Os
£ id Os o sd »d cd so sd sd sd CM id id cd 'd*
Tf -'t ι/Ί •’Τ Tf
OJD cn 00 cn CM CM SO CM 9 r- Os m CM
5? O O O O 9 <— so C- VI tT cn 9 9 9 9 9 9
00 9 9 CM CM CM 9 9 9 9 9 9*
CM SO SO SO 9 m Os CM SO OO CM V> SO C*
O S? c- 00 C- Os ΙΛ 00 CM Os SO SO CM SO σ. 9 9
00 so SO sd sd d Tt «d »d sd «d id ΓΏ cd sd sd
> 00 o r- SO so cn CM SO CM cn vs CM SO 00 c- 9
s? o o 00 00 00 c* 00 00 00 00 c* 00 Ox Os 00 00 SO c*
00 ó d 9 9 9 d 9 d 9 9 9 9 9 9 9 O 9
£ *r wn r* so l/S Os SO CM r* 00 ΠΊ cn 9
óó ž? v> iq 1.2 CM CM C*1 CM C*S cn v> 1.2 rn CH ir> so sq c-
SO m r- CM 00 9 CM SO v> Tt 00 9 00 ^r
£ ΟΊ <n o *— 9 »* Cd *-* cn OS CM »n Os m cn TT
00 cm (d CM CM CM CM CM CM CM CM »—1 (d CM CM (d CM
9 cn r- r* CM 9 r- Tf 00 «η CM 9 9 Os 9 9
so SO cn c**> *- O^ cn cn SO Γ*· CM CM ch SO TT SO 00 00
oo cm CM CM CM CM CM CM CM CM* CM* CM* CM CM fd cd CM CM
00 OS Os 00 os Os 9 r^· Os Os tj- m tT r- r-
£ o O O 9 w— 9 9 9 9 9 9 CM CM 9 9
so o o o 9’ 9’ O 9* 9 9 0 O 9 0 9 0 O 0 0
9 m o Γ*Ί CM Os 9 9 00 9 CM CM vs r- SO r-* SO cn
9 O\ o —- Os r- 00 c- c- —< SO Os rr SO 9 CM
so CM m Tj- cd cd CM CM CM cd cd cd CM CM CM cd cd cd
w*
J cn ”T m so r- 00 Os 9 CM cn v> sO r- 00 Os 9
VI cn cn cn cn cn cn rt TT 'T ι/Ί
Ή
0
o >Π ω < J
-P (1) β Vod GLA DG1
σ
LO
Ή
C >
O >u fC o
λ;
o a
I ro >υ
Π3 x:
I-1 g
X)
Π3
H
00 c* ir> c* en r- Tj- © en r* en © © 00 00
i? —4 CM CM CM RR CM »R CM CM RR
CM © © © © © © © © © © © © © © © © © ©
υ
O 00 SO Os 00 © Os c* SO en 00 Tf en sO F* Os CM Os r-
co co £ en en CM CM en 00 en en en en m en en Tf en en
CM o Ó ó © © *cí © © ó © © © © © O © © ©
CQ
SO vn «Ο Ό © 00 Os © Os tj· O o CM CM en
σι CM CO £ o o © en CM © CM CM CM CM en CM en CM
CM (S © © © © © © © © © © © © © © © © ©
s m CM m Ό Os CM •o en CM CM Os sr> c*
c £ o O © © © © © ** © © © © © © © © ©
st li CM cm © © ó © © rn © O O O O © ó ó © ó
o CM o CM O\ (M c* Tf ΜΊ rr o en en r> c* SO SO en
o £ CM OO CM OO OO SO CM © SO Os Os RR CM
CM SO so _ w *ci en SO en CM oo <n
x: υ CM
Ή í“4 Os © SO 00 c* 00 © © , en c* c* Os Os r- r^·
C 0 22:1 S? © 00 O © © 0.0
tm
ω s
C R. CM 00 «η © © © RR © en c* ^R © rR
o o © —* R* ·— CM RR «Μ *R © »-R CM
x CM CM o © © © © © © © © © © © © © O © © ©
X
N ΙΛ
x; ž? o © © © © © © © © © © © © © © © © ©
υ cm
tu
X
CO Ή Os SO *r> Ό RR c- t*. c* 00 00 SO SO r* o Tt C*
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM Os R* 00
i—1 © CM o' © © ó © © O o © © ó © O © © © ©
>
c en Os O sej ©
-H 5? o O © O © © © © © © © © CM Os SO F- en CM
sel cm © © © © © ©
^r CM RR CM RR rR CM sO wR RR
S? o © © © O © © © © © © © © © © © © ©
r CM © © © © © © © © © © ©
υ
'>Ί
c X w SPL en Tj- tr> so c* 00 © © r, CM en T}- SO c* 00 Os ©
en en ΠΊ en en Γ*Ί en '’ί tJ· tj-
cd
£ Ή c
<d ω
N >M Voda -a
nalý Oset GLA DG
Listy ošetřené GLA obsahovaly 1,56 až 2,4 hmotnostních procent GLA. Analýza mastných kyselin ukazuje, že složení lipidů v listech kontrolních a transgenních rostlin je v podstatě stejné. Listy kontrolních rostlin ošetřené DGLA obsahovaly 1,2 až 1,9 hmotnostních procent DGLA a množství ARA, které tvoří hodnotu pozadí (0,26 až 0,27 hmotnostních procent). Transgenní listy obsahovaly pouze 0,2 až 0,7 hmotnostních % DGLA, ale množství ARA se zvýšilo (0,74 až 1,1 hmotnostních procent), což ukazuje, že DGLA v těchto listech se přeměnila na ARA.
Exprese v semenech
Důvodem uvedeného experimentu je stanovení, zda konstrukce umožni pro semena ze se terminačního zavedla kodonu obsahující promotor napinu specifický expresi v semenech.
cDNA Ma29 se upravila pomocí PCR tak, upstream a downstream startovacího a klónovací místa Xhol za použití následujících primerů:
Madxho-forward:
5'-CUACUACUACUACTCGAGCAAGATGGGAACGGACCAAGG (SEQ ID NO:25) Madxho-reverzní:
5'-CAUCAUCAUCAUCTCGAGCTACTCTTCCTTGGACGGAG (SEQ ID NO: 26). Produkt PCR se sub-klónoval do pAMPl (GIBCOBRL) za použití systému ClonAmp (GOBCOBRL), přičemž vnikl pCGN5522. Sekvence Á5-desaturázy se ověřila sekvenováním obou řetězců.
V případě specifické exprese v semenech se kódující oblast Ma29 odštěpila od pCGN5522, jako fragment Xhol a začlenila do místa Sáli expresívní kazety napinu pCGN3223, za vzniku pCGN5528. Fragment restrikního enzymu Hind III pCGN5528 obsahující 5' regulační oblast napinu, kódující oblast Ma29 a 3'regulační oblast napinu se začlenila do restrikčního místa HindlII pCGN1557 za vzniku pCGN5531. Dvě kopií transkrípční jednotky napinu se začlenily jako tandem. Tato tandemová konstrukce umožňuje silnou expresi desaturáz v genetickém
I loku. PCGN5531 se začlenil do rostliny Brassica napus LP004 pomocí transformace zprostředkované mikroorganizmem Agrobacterium.
Složení mastných kyselin souboru dvaceti dozrálých semen T2 se analyzovalo pomocí GC. Tabulka č. 4 ukazuje výsledky získané v nezávislých transformovaných liniích, které se srovnávají se semeny netransformovaných rostlin LP004. Transgenní semena obsahující pCGN5531 obsahují dvě mastné kyseliny, které se nevyskytují v semenech kontrolních rostlin. Tyto kyseliny se identifikovaly na základě porovnání jejich eluce vzhledem ke kyselině olejové a linolenové jako kyselina taxoleová (5,9 až 18:2) a kyselina pinolenová (5,9, 12-18:3). Jsou to očekávané produkty působení Á5-desaturázy na kyselinu olejovou a linolenovou. V semenech transgenních rostlin se nepozorovaly jiné rozdíly ve složení mastných kyselin.
i lí~>
CN
H
C <D g
CL) co
C · -rd N1 CU . rc >u co rO Ή <~| d) >N Ό O fO i—I
E-ι ω
24:0 % 0.42 o* 04 © 0.30 0.26 0.31 o 0.21
ΟΊ 04 O o «Ο
o O O © ©
6i © © © © ©‘
o cn o* Os o •^r so
A) Tf Tt rf m
04 © ©' © © © © ©
CN cn o •O 04 &
ťS o o O O ©
04 © o © © ©
o 00 __1
o žS TJ- o **
04 **
o Os m 00 so co
d žS O Os o o OS os 00
64 «Μ © © © ©
ο*ϊ <O) 00 o rr <n Os Os
06 SO cn cn cn ττ cn co
·—
m
66
m o* 00 04 ΟΊ wo
CN o m 04 cn m cn Tf
© O O o © o ó
Os
<o
<n e o- 00 00 wo
*n ΟΊ Os 1/Ί os Os
OO 00* ,—1 O* O- 00 00* ©
04 04
CN o O* ΟΊ SO
O <r> Ol •^· © co
66 ’Τ wS wS
eíx
Os
m 00 04
ΟΊ ·—* SO 00 m Ό
00 69 so cn cn
SO so SO SO SO
o ir> m O* o* 00 00
66 O 04 cn rf 04 m uo
ΟΊ oS ΓΊ ΟΊ cn cn 04
V“> vs cn o* o* CO
SO o'' ·“< —— ·—« F-« i—-
o © © © © © ©
© SO so 00 00 SO
O 00 04 o* o- Os Os 00
c6 co cn cn rn co
_-
o
tl
c
o
© SO 00
04 so F— 04
O M μ
O ΠΊ m m m cn co
cl ΜΊ i/S IO> ά Ά Ό
sn <O Ol ΜΙ v-> wo
• · • · • ·
S rostlinami se provedla northernova analýza, aby se určily ty rostliny, které exprimují Ma29. Vyvíjející se embrya se izolovala přibližně 25 dní po antezi nebo, když se indukoval promotor napinu, a ponořila se do roztoku obsahujícího GLA nebo DGLA, jak se popisuje v příkladu 7. Analýza mastných kyselin v embryích se provedla pomocí GC. Podle protokolu upraveného pro listy, který se popisuje v příkladu 7, se stanovila síla konverze DGLA na ARA. Množství ARA začleněného do triglyceridů endogenní acetyltransferázou rostliny Brassica se pak hodnotilo analýzou GC, jako v příkladu 7.
Příklad 8: Exprese Δβ-desaturázy M. alpina v rostlině Brasica napus.
cDNA Ma524 se upravila pomocí PCR tak, aby se začlenily klónovací místa za použití následujících primerů:
Ma524PCR-l (SEQ ID NO: 27)
5'-CUACUACUACUATCTAGACTCGAGACCTATGGCTGCTGCTCCAGTGTG
Ma524PCR-2 (SEQ ID NO: 28)
5'-CAUCAUCAUCAUAGGCCTCGAGTTACTGCGCCTTACCCAT .
Tyto primery umožňují amplifikaci celé kódující oblasti a přidaných restrikčních míst Xbal a Xhol 5'-konce a Xhol a Stul restrikčních míst 3'-konce. Produkty PCR se subklónovaly do pAMPl (GIBCOBRL) za použití systému ClonAmp (GIBCOBRL) za vzniku pCGN5535 a sekvence Δβ-desaturázy se ověřila sekvenováním obou jejích řetězců.
V případě exprese, která specificky probíhá v semenech, se kódující oblast Ma524 odštěpila od pCGN5535 jako fragment restrikčního enzymu Xhol a začlenila se do restrikčího místa Sáli expresívní kazety napinu pCGN3223 za vzniku pCGN5536. Fragment pCGN5536 restrikčního enzymu Notl obsahující 5'regulační oblast napinu, kódující oblast Ma524 a 3'regulační oblast napinu se začlenila do restrikčního místa Notl pCGN1557 za vzniku pCGN5538. PCGN5538 , se zavedl do rostliny Brassica « * • ·
Δβ-desaturáza stearidonovou napus kultivaru LP004 pomocí transformace zprostředkované mikroorganizmem Agrobacterium.
Z 6 nezávislých transformantů rostoucích ve skleníku se sesbírala dozrálá semena T2. Složení mastných kyselin jednotlivých semen se analyzovalo plynovou chromotaografií (GC) . Tabulka č. 5 uvádí výsledky semen kontrolního kultivaru LP004 a šestí linií 5538. Všechny linie 5538 mimo #8 produkovaly semena obsahující GLA. Přítomnost GLA vyloučené v semenech se očekávala v inbredních semenech T2. Mimo GLA, M. alpina je schopna produkovat kyselinu (18:4) a jiné mastné kyseliny, které pravděpodobně jsou 6,9-18:2.
Shora uvedené výsledky ukazují, že v heterogenním systému se mohou exprimovat desaturázy, které jsou specifické ke třem odlišným substrátům a používají se při produkci nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem. Jako příklad se uvádí produkce ARA (20:4) z prekurzoru 20:3 (DGLA), produkce GLA (18:3) ze substrátu 18:2 a konverze substrátu 18:1 na 18:2, který je prekurzorem GLA.
i d·
CM
O xf
CM
CM
CM χΓ
CM
ΙΩ fO
Ti
O
Ή
CO to
T3
L cq
C •rd 1—| P co o D
ZZ
O
Ή c
C
Φ
ÍT co
C rc
H +J
N c
Φ e
φ co c
-H <—I CD CO 5% λ;
c υ
'Ll c
LO +J
CO • fO >U g <C (C λ; n i—I 'Li
Ή
Ό fC fC C
Η <
O
ČM
CM
O
CM xf
CO ód co σ» co ód
CM <30
CM ód
CD ód o
ód co o
ÓD
0.
ω
b- CM CN Xf CD P co CO xf co O CM 00 CN CO (D
CN o o CM CM CM CN CN CM T— CM Τ-
O cd cd cd Ó Ó Ó cd d ó Ó cd Ο
00 ID σ> xf T— t— σ> 00 CO co 03 CO to CO 5 P
in O co cd ID ID Ν’ ID CO co CO co ó co co CO
o o O cd O d Ó cd d o o o d
CN CM CN CM CM CM CO co co CM CM CM CN CN CM
o O o o O o o o O o o o o o o o
d cd ó cd cd cd o o cd o o d ó ó o d
CD p co P 03 co Ν’ T“ 03 co co co r- σ> P
CD o ID o co (O b- CD xf XT Xf ID Ν’ Ν’ Xf
d cd cd cd d Ó cd cd o o ó Ó d d
CO oo P CM CN to co 03 ID 00 Ν’ 0) oo CM
co xf CN cp co co CO N; co y— T~ o O xg
τ- x- v- X“ x~ Τ- γ- x- y— y— y— *- x-
Ο o o o o Ο Ο o o co o CD CO co o
CO CO CO Ν’ co
cd O O O o
xf b- ID CM CN ID χΤ Τ- 03 CN to m CM
p cp xf iq p N; o Ο Xf p o T“ y—
X- y— y— v- *“ y— T“ Τ- T-“ o ▼—
O Τ- o o Τ- O o <30 xf Ο b- Ν’ Ν’ co
Ο o Ο o xf o σ> 5— b- co
cd d o o P P cd ó r< cd
5“
b^ CD 00 CD ID CM CO b- CD co co co p ΙΩ Ν’ CM
o> co CN 00 Xf 03 CN p xf CD CM co σ> 00 v- 03
cd xf P Xf ID td CO P ó d T- 00 T-
V“ χ- Τ- χ~ Τ- Τ- X“ T— X“ CM V“ x“
o o O Ο o Ο Ο O o P CD O b* 00 P
cp cp p CD N; CM
y— y— cd T— x-
σ> Ol ID ID P co CO co CM Xf CO N* in Xf— <30
Ν’ ID CN CM 03 XT o p o y— oo co CD ID P
CN cd Ó cd CM y— CN CN cd CO od ID s cd ID
b- P P P P r- b. P CD CD CD CD CD CD
oo 03 co P co b- P 00 CD xf O> oo Ν’ Xf
b- o ID CM XT CM Ν’ b- ID XT xf CM 00 m Ν’ CM
cd cd cd cd cd co cd cd cd cd cd cd cd cd cd
co O) CM co oo co b- CD CM CM xf co CN b- CM
CN x- cd T“ X- τ- cd CM CM o o CN CM
O o o cd ó d Ó ο d d d d
co CN CM CM CM xf co Ν’ Ν’ P
co o νη CM o CM Ν' O o CD cp P 00 p p co
Ν’ xf Ν’ xf xf xf xf xf xf xf N N2 •N xf
τ- ι CM CO 1 Ύ ID 1 co 1 b- 1 σ> 1 o T— y_ CM co to 1 «? P
Ί .......tXf 1 o
o
o.
co <o
ID 'ί
CM
Μ-
CM
CM
CM
C\]
X β
β υ
Ή
C0
C0 β
β
CQ β
•Η
I—I 4-1 ω Ο β χ
υ
Ή β
β φ
σ>
Μ β
ω β
χ
Ν β
ω ε
φ ω
β •Η ι—1 φ
Μ
Υ
X
X υ
'5*1 β
X X ω • β >υ ε β β
X Ν ι—I β χ
X β β β
Η <
Ο
CM
CM
Ο
CM
Tf cq co π
cn co čo
CM όο
CM óo
Ol co' o
čó
CD o
<b
0.
ω
tn τ— co N“ tn CD CN b- Ν- CD CO D>
τ- τ- o τ- τ- τ- τ- τ- Τ- τ- τ- τ-
Ο) Ο o Ο Ο o Ο o Ο Ο Ó Ο Ο Ο Ο
σ> CO CM tn CD Ν’ h- r- co r- CD CM τΤ co CO
co O CM co co O CO co co CN CO CO CO co ó
o O o ó O ó d o O O ó d
CN CM CM CN CM CN CN CN CM CO CM CM CN
O O O o O O O o o o O O o o O
Ó O Ó o Ó O O ó d ó Ó d o d Ó
00 CM m O) tn N- 00 c- b* OO tn CD tn 00
*<r tn tn o Tf ’Ν' Ν' Ί- C0 Μ- Ν' M-
ó o o Ó o O ó Ο O ó O Ó d ó
oo CM CM CN tn CD CO 00 CO OO cn σ>
τ* t-j CM t- T- T o τ— T- τ— o o Ol σ>
τ- Τ- T“ τ- τ- τ- τ— d ó
Ο o Ο 00 O O CO Ο Ο Ν’ tn τ- o
CN CO -Ν’ CN CM CN Ο
O O O O d O o
tn n- N- CO cn co O) Ol CO τ— CD τ- cq
cg a> co O Ol co O) co cn O> τ— XJ-
d ó o d Ó
o xr o r- Tf o tn tn σ> co r^· o tn
CM r- oo o o co o> σ> o o
l< r< i< o co D> CD co T-
Γ'- σ> T“ co ΤΠ* CN CM tn CN σ> CO N-
h* Ν- 00 σ> CO tn O> σ> co Tt T- N- 00 cq O
co έο co o ó CD σ> σ> V“ 00 CM CN TJ- 00
τ- τ- T- CM
o Τ- o σ> co Ο tn Ο CO Tf CD O 00
Ο CN CD CD CM σ> r^ CD 00 co
CM τ- τ— T- τ— ó d O ci
r- CD 00 ΟΝ CM τ— CN σ> N- 00 co CM tn τ— 00
r- CD CD tn Tt cg O) τ- O 5 co Tf h* V D)
ó oi O f< l< r< bl l< fL tn CM
h- co N- CD CD h- <0 CD co CD CD CD CO tn
tn CO M- CN <n tn oo CO oo co
co tn tn CM tg 'Ν’ co CM σ> CD T-J cg co
co co co CO co co co CO CN CO co co
CN co O) τ- τ— τ- tn τ— σ> CN tT h- Tf
CN CM Τ- ΟΝ CM CN ΟΝ CN CM τ- CN CM CN CM co
O o Ο O d Ó O o O Ο ci d O O ó
σ> co CD CM T- N- CO CD tn 00 tn h-
tn CD tn r* N- CN co p cq ιη CD CD p cq co
O” Tf + ΤΓ NT Tf ’Ν' -Ν’ Tf M·' tn
00 1 Ol 1 o tj- τ— CM 1 CO 1 Ύ tn » <? r- I 00 Ol 1 o τ- T— CN 1
CO ι Ύ
00 00
co co
tn tn
tn tn
Μ- ó
O)
CM
O
CM
O tn •Mo
CM co i
4.61 0.22 3.07 63.62 0.3 16.46 7.67 • · ·
I 'Ν’
CN
M*
CM
CM
CM
Tabulka č. 5:
Analýza mastných kyselin semen z transgenních rostlin Brassíca Ma524
CM
CM
O
CM
5;
<30 co óo co co
CO
CM
CM čo
CO
O co o
cd
OL ω
4fc θ'* o*»
IO b- θ’ CO 03 cn b- b- cn co xr CO co M- b-
Τ- τ— τ* CM τ- T— T- τ- τ- τ- τ- τ- τ- T—
Ο ό ο ό O Ο d d Ο Ο Ο Ο Ο Ο d
CM b- χΤ 1O b- b- σ> CO co CM CO CO o tn
co •χτ co ό CO CO CM CM o CM CO co co CM CM
o ο ό O o d o O d o d d o
co CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CN CM CM CM
o Ο ο Ο O O O o O O o O o o o
O Ó ό ό Ó d O d d O d O d o o
V“ CO CM CO IO CM O) cn co 00 tn ’Ν' cn tr tn
Xt Ó Τ ΙΟ 1O IO CO xT xt O xT V Μ- M v
O d Ο O O O O d O d Ó O o o
b- Χί 00 CO T“ co cn XT tn T“ b- v co o o
T” Ο CM vL v— O CM X“ CM o V“ T- τ- o
Τ- Τ” τ- Ύ— v— *- τ— τ— τ- τ- τ- τ-
Ο τ— CM CO cn o CO CO Ο co Ο o Ο
χτ CM Ο to CM d CM xr CM O
Ο Ο ο ó O O O O o
o co b- 03 co xr CM •M v— τ- cn CN CM cn CM
xr ο cn ΙΟ co co IO O co Ο o T“ CM o cq
τ- ο ο c\i T— V d T~
Ο CO V“ r*- xr O CO CO b- τ- CO cn o co
<ο <ο Ο co o co 00 tn Ο τ— τ— cn b-
τ- b-’ ό td cri 00 d CO CN CM d o
Τ- T— τ—
co Ο CO χτ 03 co tn b- CM tn XT 5f— cn M- τ-
co CM ο ο N- co τ— tri <n CM to CM Ο
CM Ó co co <d xr xr T— cri CM cd τ- cri d
CM τ— CM CM *“ *“
O ιη ΙΟ co xr co b- 00 00 cn tn Ο o v—
CO ο CM 00 to O 00 co CM to o O co o
CM o T“ d d d d CM d o d CM o
b- cn co cq CO CM v— b- tn cn to o cn co
cn CM b- xr xT CM b- co co co CN M- tn co
tri CO CO IO co CO (O CM xf 03 o R co
co to CO co co co CO b- co co
co ΙΟ ΙΟ CO xT CM CO tn CD T~ •>í CO b- Μ- b-
cn 00 00 o 03 co b- co o CO CO cd o- T—
CM CO CM cd <\i to CM CO co’ CO co CO co
cn cn 00 co CO xr CM tn co CM co Τ'- T- τ— CM
Τ- CM Τ- CM CM CM d τ- CM CM CM CN CM CM CM
Ο ο Ο o Ó O Ο d d O ó O d d
cn CM CO to CO co co tn b- O) CO 03 tn cn CM
co CM CO 00 xr co tn Tj- b- tn cq Xf co tn
ο- tri xr xr id xf xf xf xf xf xr xt xl-
Ύ ΙΟ 1 «? r*- 1 co 1 cn o 1 τ- ι CM 1 co t Ύ to 1 9 r- 1 CO 1
t
J co
4.68 0.2 3.05 64.03 1.93 11.03 11.41 1.02 0.01 1.15 0.39 0.02 0.21 0.15 • «
ΓΌ
LO
Μ-
CM
O
CM
ČM
CM
O
CM <\i CM
LO
KS
s
O
<O CM
υ
Ή
CQ
co ÓÓ
L
cq co
ód
C T“
Ή
rH
+J ro
cn O O) co
ti ód T“
X CM
U ód
Ή r
c
c
<D CM
σ> ód
ω r—
c 05
σ cd
L
4-> ▼—
ód
IM
c
ω o
e ód
(V
w
£ <-
-H cd
l-1
<D
co p
44 cd ▼—
to ř*· o> co t— σ> 05 CO to co co co 00
τ- t— τ- T“ CM CM τ- T— CM co τ- o
Ο c> Ο o Ó cd Ο b b b b Ο b b
CO 00 CM tn to co CO T— Oi CO T—
CM co M M O rf M •M- to 05 Xf to to CM
Ó ó ó ó b cd O O O b o b b o
CM CM CM CM co τ- CM CM to t'- CM CM CM CM
O o O O o Ο O O o o o o o o
cd ó Ó Ó b cd O O b o b b o b
co CM CO tf) in T- to lO m CM to co
rf rf m w co tn to M to CM to M-
cd cd b o b cd o O o r— b b b o
05 lO to N- to O) co T- to T CM CM
σ> O) o p o t— O 05 M; 05 T-.
cd ó τ- τ- τ- o τ- b τ- τ- τ-
tO o o o Ο o Ο Ο o Ο o Ο Ο Ο
CM
cd
h- Tf r- co to N- co co CM CM CM co CM
O p M; co o o o co co co
τ- τ- t— CM τ- b b b τ- T- T~
co Ο Ο O o Ο CM o o Ο τ-
co O O o Ο o
l< Ó b b b b
CM CO r-- to 1O *f co m co T™ to τ— o b-
CO co σ> co M; rf co to co o 05 to p CM
CM cd CM M cd b b b 00 b τ— b
CM CM CM CM CM CM CM to CM CM τ- CM CM
O o O o O o O o o o Ο o o
p
r- rr C9 CO CO 00 p CO CO CM CM 00 CO
CM p p 00 •M* cd N- σ> rf O rj·
r< rf CM cd cd CM b co lO T— !< od cd í<
co co CO co co CO to to to CO co CO
T“ rf T- rf 00 05 lO 00 σ> ř* p oo
cd T— 1^. p cd σ> O) to V“ cd CD cd o rf
cd cd rf cd CO cd cd cd cd cd
CM co co lO to co CM 00 co rf 05 τ’-
cd CM CM CM co cd CM CM co co cd r“ CM cm
ó cd cd o O cd cd cd O cd o
b- lO τ- co V- 00 CM rr io co CM rf h- co
p 05 Ο) h- p p p p co to to rf p p
rf rf rf rf rf td od lO rf ''f
o CM CO m 00 σ> O CM CO
τ- T- 1 1 1 1 1 1 1 t t— O 1 1
ι 00 1 T“
CO to (O
IO
CO co lO in
CM h~ O T
O
CO
CO
O θ’ to o
CM CM O O O O to m O o o
CO ΙΟ «-:
4.69 0.19 3.22 64.62 0 23.16 0 1.35
4.58 0.2 3.4 68.75 0 20.17 0.01 0.02
LD c
lO 44 ω
σ
>u £ —I
re D- ω
44 N
1—1 '>1
£ l—1
£
£ C
Η
• · • · ·
CM
CM
CM
CM
Analýza mastných kyselin semen z transgenních rostlin Brassica Ma524
CM
CM
O
CM ’Μ’
CO
CO ód w
σ>
cq ód
CM co
CM ód o>
co“ o
ód co o
co
Q_ w
o CO o CO τ- Ο
σ» CO m
τ- CO o
Ο O ó
CM CM CM
O O o
O O ó
CO to
in 5T
ó O O
ττ CM co
CM v t^
*“ V
r·» O o
o o τ— to co
CM CO T-
Τ-
to Ο τ-
b- Ο
c\i ó
τ- to to
Ο to CO
θ’ r- CT)
T— CM τ-
m O Ο
o ó m σ> b-
in to
co co 00
b- co to
o 00 Ό-
CM co
cd CM
CM CM O
o O
m 00 CM
in iq IO
M- V
co O) O
I I
I • · • « • · • *
Příklad 9: Exprese A12-desaturázy M. alpina v rostlině
Brassica napus cDNA Ma648 se upravila pomocí PCR tak, aby se začlenily klónovací místa za použití následujících primerů:
Ma648PCR (SEQ ID NO: 29)
5'-CUACUACUACUAGGATCCATGGCACCTCCCAACACT
Ma648PCR-rev (SEQ ID NO: 30)
5'-CAUCAUCAUCAUGGTACCTCGAGTTACTTCTTGAAAAAGAC
Tyto primery umožňují amplifikací celé kódující oblasti a přidaných restrikčních míst BamHÍ 5'-konce a KpnI a Xhol restrikčních míst 3'-konce. Produkt PCR se sub-klónoval do pAMPl (GIBCOBRL) za použití systému ClonAmp (GIBCOBRL), přičemž vznikl pCGN5540. Sekvence A12-desaturázy se ověřila sekvenováním obou jejích řetězců.
V případě exprese, která specificky probíhá v semenech, se kódující oblast Ma648 odštěpila od pCGN5540, jako fragment restrikčních enzymů BamHÍ/Xhol a začlenila se mezi restrikční místa BglII a Xhol expresívní kazety napinu pCGN3223 za vzniku pCGN5542. Fragment pCGN5541 restrikčního enzymu Asp718 obsahující 5'regulační oblast napinu, kódující oblast Ma648 a 3'regulační oblast napinu se začlenila do restrikčního místa Asp718 pCGN5138 za vzniku pCGN5542. pCGN5542 se zavedl do dvou kultivarů rostliny Brassica napus pomocí transformace zprostředkované mikroorganizmem Agrobacterium. Použily se běžně dostupný kultivar kanoly SP30021 a malé množství kyseliny linolenové.
Z 19 nezávislých LP30108 z netransformovaných kontrol sesbírala dozrálá semena T2 rostoucích
Předpokládá
LP30108 obsahující transformantů a ve skleníku se se, že v těchto semenech se vylučuje transgen Á12-desaturázy. Složení mastných kyselin skupiny dvaceti semen se analyzovalo plynovou chromatografií. Tabulka č. 6 uvádí výsledky. Všechny transformované linie obsahovaly zvýšené množství produktu Δ12desaturázy 18:2. V těchto rostlinách se zjistilo nepodstatné • » · · » · · 4 » · ♦ « • * · 1 » · · <
zvýšení množství 18:3. Rostliny #11 a 16 vykazují v sebraných semenech nejvyšší akumulaci 18:2. Za účelem zkoumání vylučování množství 18:2 v semenech T2 a za účelem identifikace jednotlivých rostlin, které se vybraly pro vytvoření další generace, se provedla analýza poloviny semen. Semena se nechala klíčit přes noc, ve tmě, při teplotě 30 °C na filtračním papíře nasáklém vodou. Vnější děložní lístky se použily pro analýzu plynovou chromatografií a zbytek rostliny se kultivoval v půdě. Výsledky některých těchto analýz se uvádějí v tabulce č. 7. Jednotlivá semena T2 obsahující Δ12desaturázu M. alpina akumulovala až 60
18:2
Vzorek
97xxlll6#59 je příkladem rostliny s nulovým vylučováním. Dokonce i u rostlin, které akumulují nejvyšší množství 18:2, se množství 18:3 zvýšilo velmi málo. Tyto a jiné vybrané rostliny T2 se nechaly růst ve skleníku a na poli, aby se vytvořily semena T3.
Z dvaceti nezávislých transformantů SP30021 a netransformovaných kontrolních rostlin rostoucích ve skleníku se sebrala zralá inbrední semena T2. Očekávalo se, že v těchto semenech se vylučuje transgen A12-desaturázy. Složení mastných kyselin skupiny dvaceti semen se analyzovalo plynovou chromatografií. Data jsou uvedena v tabulce č. 8. Všechny transformované linie obsahovaly zvýšené množství produktu Δ12desaturázy 18:2. Stejně jako v linii LP30108 s nízkým obsahem kyseliny linolenové, množství 18:3 se podstatně nezvýšilo. Semena #4 a 12 vykazují ve shromážděných semenech nejvyšší akumulaci 18:2. Za účelem zkoumání vylučování množství 18:2 v semenech T2 a za účelem identifikace jednotlivých rostlin, které se vybraly pro vytvoření další generace, se provedla analýza poloviny semen. Semena se nechala klíčit přes noc, ve tmě, při teplotě 30 °C na filtračním papíře nasáklém vodou. Vnější děložní lístky se použily pro analýzu GC a zbytek rostliny se kultivoval v půdě. Výsledky některých těchto
I analýz se uvádějí v tabulce č. 9. Vzorky 97xxll57 #88 a #18 jsou vzorky s nulovým vylučováním v případě 5542-SP30021-4 respektive 5542-SP30021-12. Tyto a jiné individuálně vybrané rostliny T2 se kultivovaly ve skleníku a na poli, přičemž vznikly semena T3.
I
CM
CM
Tj- co o> CM CO 00 m
co xf CO co m ó CM
O o o O o o o
CM ·<CO CO O Ó
CM
O v- cm m b- to b- to ř o 6 ó co co co
Tabulka
CM
Ó
CM o
o
CM co oo
CM co o
co co
V o
co co χ- ro O ™ o o
CM
Ó co
O
CO
CM
Tf bó ó
v— o> os CO CO CM x— O)
h- O) r~ tn ó r- CM
ó ó ó ó ó ó o
to tn tn CM CO T— O)
co h* co co co t— b- co
o O o o o ó ó
co co 00 tn CM CO
co h- tn in b- ó
o o o o ó Ó
co tn co co 05
c~ co xf CM
xf co CM
co co CO en os
to T“ T- co 00
co* Iří co CM X“
co Φ Φ co CO
σ> X— bco co co ó ó ó χ- r- rσ> o °° o o co co ó
m o>
o co 't r~ co cm co
IO Ifi 10 ^2 CO ó o ó 6 o
co CM co co to
co CO to cm' 05
CM CM CM
co CO S cn CO
co O) CJ5 05
T“ β o* co CO
co co co co CO
't ó
»O ó
xf CM co oo xf co
b- O cq co CM CM
CM xf xf co co co
co CM
X“ os co IO cn o
CM o ó ó 05 a
CO co co co IO IO
o 00 O CM CM 05 co CM co CM co co co CM V X“ CM tn o b-' CM in co σ> CM 05 CM CO CM 05 tn co CM M* σ> LO CM ’Μ’ CM o> co co b- CO CM b- tn 00 CM τ— co có CM
CM tn tn co CO co co Xf ▼“ τΤ co co CM
v- t— o r~ cq CO o xf o in O co CO 05 X
CM CM x- T— T- CM CM CM co CM ό v-
CO o> CM O>
CM O X“ CM
ó ó o O
r- 05 l·-
O ▼“ 05 xf to
h-‘ tri xf xf
5~ r- o> oo
CO V” τ- x—
o Ó Ο ó ó
tn CO CM 00
o co
co tri
CM IO Xf co CM CO
O CO 6 CM CM
O ó Ó O
to cn b- co CD r^.
T— CM 05 05 CM T—
co CO
CO T“ CO r· co co co co CO co T— t— X“ x— T—
Q OO 00 co co co oo 00 co 00 oo 00 00 00 00
1—1 O O o o o o o o o O o o o o o o
v* Τ- Τ- X“ v- x—
o O o o o o o o o Ο o Ο o O o O
C co co co co co co co co co CO co CO co co CO CO
ω 0. a. Q_ 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. Ol 0. Q. 0. CL 0.
s _1 -J _l —1 —1 _1 -J -J —1 _l -J _1
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM 1 CM
*M· •M“ - M* M* Μ- M* M* Μ M M* *M·
to to to to IO to to to to to IO to to to LO to
IO to to to to IO to to to to to to to IO to to
Al to CM O 00 CM 00 co Μ- r- 00 CO v o CM IO CM
CU CM CM to 00 CO co oo CO CO T“ CO to
co >o
00 05 o >< 00 05 O X co 05 o X 00 05 o X 00 05 o x— X 00 05 o χ— X 00 05 O χ— X 00 05 o X (0 X- >< «5 x— T— χ CO V v- χ CO T~ χ— X (O χ <0 χ CO x~ X <0 T“ χ
X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X b- X r~- X
05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 05 σ>
ΟΊ kO tO >υ
Tabulka
CN
Ο
CN
O
CN
O
O
CN
CO eo
CM »
<30
T~
O <30 <b
T~
O <£>
Q š
OT
Q.
W
Q
UJ _i
O >
O
T— to T“ <n
f- Ν’ c~ co
Ó o o o
<O to oo O)
<O CN co CO Ν’
O o o co O
eo to co NT
OJ eo 00 00 IO
ó Ó ó o X“
co co co Ν’ CN
T to to σ» <o
Ó ó ó o ó
to io co uo co
O) co CN eo CN
CO CN co N CN
CM r>- co co co
σ> u> eo T o
to eo IO 00 co
to IA CN
Ν' oo l''- to
CO T~ c- σ> IO
ó co rJ co
CN co CN
03 CN r~ cp
O o> CO co T~
Ύ— T“ T- CN
co CO CO r- CN
ó Τ- CN co d
Ο O o
co co CN CN CD
CN v— Ν’ co <o
O N- rJ co
V T— r- T— Τ'-
v- T- T“ T“ T-
CO co 00 CO
O o o O O
V“ τ-
O O o O Ο
CO CO co co co
CL O. Q_ Q. Q_
_J —1 _J -1 _l
CM CM CM CM CM
s ’Μ’ m 5 m m
uo uo <o m uo
co o cn
00 co co O) uo
CO CO CD CO co δ δ i δ s
0> 0) O) O) O)
CM
CM
CM
O
CM
O
CM
O
Ó
CM
CO
CO σ' o
r~
CM ód co o
Ó3
O co
t'- co o ’Μ’ ó CO co o M V ó
x— T“ co C·.
O O o o
o
w CD co
x— V“ 05 x—
x— v o
CM 00 m
r- CO r--.
o ó ci o
05 CM m b-
h- V“ CM oo
X- <\i CM X“
CO co 05
«5 CM o «5
cd cd od CM
co co CM
co co U5
CD in r- Τ-
ó CM 05 Ο
IC5 m co CO
CO T- 00 IÍ5
CM 00 r-- O
CM CM CM
M 00 «5 CM
Τ- τ- X“ CM
Ο Ο ó O
CM CO r- χ—
M·’ cp r- co
Μ2 +
Tabulka
oo t oo o x— o co CL _J O> τ- ι co o X“ O CO CL —1 O CM 1 CO O x— O co Q. _l 2 c o ,M co o Τ-
CM CM CM Ο
5 s s CO 0.
m 1X5 in -J
• ·
CM
CM
b- CO o IA 00 M; co m (D CM NT b- CD CO
CO CO cd <o <o M o co co co m- « o co co CO
O O o ó ó ó ó ó o o o o o o
t—I rTabulka
CM
O
CM
O
CM
O
O
CM
CO
CM óó o
co o
<b
O) M- T~ r— co x— CO CM CD M O M- m CM
o ▼· Ó τ- τ- τ- τ- τ- τ- O τ- •r· Ó
ó o Ο Ó Ο ó Ο ó Ο Ο Ο Ó Ο Ó
CM CO CO M CN co σ> T~ CM CD O) CM b- 3 M
T- O T“ o T” σ> o O O> O t— O q CO
T v T“ V“ ó ▼“· V” O τ- V“ Τ- T“ ci
m CM CO MT CM b- CM Tf ο in Ο 03 co
co CO b- CO b- o 00 CO co b- CO w> b- CO CO co
o O Ó Ó o o o o ó O o ó O o o
co CO b- IA M b- CM T“ CM T m- CO M* 00
o M* T— q T“ O co CM b* CD M* q M^ t— co
CM CM CM t— CM CN CM CM v* CN CM CM CM CM
M1 CO V b- co CN IA t- b- O> m CO CO CM CO
IA IO O ΙΛ ▼ζ CO M «Ο CM o> co b- b* IA b-
O CM σί CO CO CO iri b IO CM M* »A
<0 M1 5T co M1 M1 IO co M1 KA
M CO t— Μ- CO CO CO q V CD CM CO σ» CM
M- ^r- ia ΙΑ CN O) co CM <0 O CO lA σ> b- CO
Ó T“ 00 CO <3> σ> CO b-‘ M co r< CO LA co CM
uo M M M- M N M CO M* M M CO
CO co b- M σ> CD CN 00 lA b- 00 CD CO Ν’ b- O)
q b- o q 5— CO b- b- b- CO q cp co o t— q
CN T— CM CN t— CM ▼— T“ CM CN CM
m b* 00 tf) M CO co co CO m <n 00 LO cb co 00
Τ- Τ- ν- V CM Τ- τ- Τ-
o O Ο Ó O o Ο Ó Ο O o Ο O ci Ο Ο
cq CO co co IO b- co co M co co CO IO co 00 Μ
M* q q co X q M; q q M; q M; M; M O
M M2 M* M- M- Μ M·' IO
o CM co lA CO
m T m b- CO CT> T— V“ *- T—
00 CD co CD CO oo 00 00
o O O O O o o O O O O o o o O o
Ί- Τ- V Τ- ν- Τ- Τ- Τ- Τ- V“ Τ-
o o Ο Ο O o Ο Ο Ο Ο o Ο Ο o O Ο
co co CD CD CO CD CO CO CO CD CD CO CO co CO CO
CL 0. 0. Q_ Q. CL 0. CL CL Q. 0. Q. CL CL CL CL
—1 _J _J _J _J -J _l _J -J _) _J _J _J _J —1
CM CM CN CN CM CN CM CM CM CN CN CM CM CM < CM 1 CM
IO S •Ν’ IO 5 M· m Tř in Μ ΙΩ M· LO 5 IO rr to Μ* in M* m Μ- ΙΑ Μ- ΙΑ Μ- ΙΑ
m m W CO in to ΙΌ m to to to in m IA IA IA
• ·
CM
CM
O ó
CM
CN
ΓCO
CO o
óo o
<o
CM CO co p to σ> co to co o* co co tO CM CM
X co X o co co co co co co co co co CO co
Ó © ó d o o ó o ó o o d Ó o
Ο- CO i— CO 00 to to co co T— co co O“
Χ- x— X“ X“ x- v x— X“ CM x- ^r-
O O O ó O d d d d d d Ó d d d
xf CO co co M θ’ σ> O) xr Γ— v co co
x— CM p cn CM O T p o> o o o T- T-
x— T— X“ ó x— v X X- o x— T“ X“ x-
X γ- CM p co γ- CM cn CM co CM CM CM X cn
t- ιο cn o co ιο CO io co co co co co IO in
O o o o o O ó o ó o o ci ó o
co Γ- CO X x— CO 00 00 00 CM to IO co co cn
q ΙΟ O O XJ· to p x— O* co CM co
T— CM 00 CM X— O X“ x— x— T— CM T~ v- CM
CO co CM co o> CM CO IO 7“ CM 1— co Γ- 00
© o Υ- T- co «Ο p b- iq X CM T“ CM
σ> cd b-' ΙΟ CM Γ-’ cd ai o <o T“ f-‘ x‘
co co co co CO co co x X CO CO
<o b- γ- CD co x— b- σ> σ> cn co Tf Μ- CM co
CM o γο CM cn 00 p to 00 v X“ Ο- CO p
O co M X co CO x- CM d cn co κό co CM θ’
X θ’ co X θ’ o- co co co co co θ’ θ’
i— X“ x— X CO CM CO cn σ> cn θ’ O) b- ιο
T“ p CO q r- p p p p r— b- o b- o; p
CM X— T“ T“ x— X- x— ▼— T- x— CM x- X“ X—
r- co CM tO Η- ή- co b- cn co co co ιο co co
X x— CM X“ χ- χ- x— X“ Τ- τ- τ- x— Τ-
d d O d ο ο O d o Ο ο ó Ο d Ο
b- co CM b- to CM co co co θ’ b- IO b- CM IO
p co LO p x— p p M; q b- p p P CO CM
o- Ό- Μ2 θ’ X O* xr X X2
co >υ
Tabulka
Q
HH c
(D ε
o t— CM co M* IO
l CM 1 CO | Ύ p <? b- op cn t— TJ- X“ x—
x— X“ x— x— T“ t— T— T“ x—
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
O O O O O O O O O O O O o O O
O O O O O O O O O O O O o O O
co CO CO co CO CO CO CO CO co co CO co CO CO
CL 0. O. 0. 0. a. a 0. 0. 0. CL a a a a
w W ω ω ω ω co OT w ω ω ω ω ω ω
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
o- X X Ο- θ’ ’ί X X X X M; ’Μ'
to IO to IO ΚΟ ιο to IO IO IO IO to IO to to
to IO to in to to to in m io IO IO to to to
• · · ·
ΓΜ
CM
CM
O
CSI m
ΓO
CM
O
O
CM
CO
CM eo co o
co <6 o
<b
ΟΟ >υ
Tabulka
O
H £
(1)
00 CO b- CM o>
co CO co co co co
d Ó ó ó ó ó
t—· co co v*
’Γ- τ- τ- τ-
ó Ó ο o Ο Ο
CM cn cn ^- CM o
Γ CM T- CM t— xt
T“ v 5T*
b- CO CO CM
co co o co io CO
ó d ó ó O
V“ Ό; CM co co xt
io T O co in O
o T— ó V“ CM
▼— v V“ *“
<M CO CO b- o> O
CO σ> co co m
CM ÍCÍ co © cm’
co co co ’Τ CM
CO lO b* b- co T“
CO co cri O
CM ó co co CO
Ό* m ’φ o
T~ b- co co xj· b-
o> co cp xr
yt· T-
σ> b- co b- ▼—
v- V“ CM
d o O d d d
co co θ’ Y“ co co
CO T“ CM xt co
TT v xf
CO b- CO o> o
X- ▼j· ^J· ^- CM
T“ v— ▼—
CM CM CM CM CM
O O O o O
O O O o O
CO CO CO co co
CL 0. 0. 0. 0. v /<<
w w ω w ω SX o
CM CM CM CM CM o
Ό- co
o o ιο m io 0.
tn IO »O u> in ω
»··· * 9 rσ>
Tabulka
CM
CM
CM
O
CM
O
CM
O
O
CM
CO <30
CM «
óó o
óo co o
<b
Cl,
UJ >u
I-1 ^*Ί υ
CO CM co CM Μ- XJ· b- ID 10 CM 00 to
CO co CM O ó CM CO co IO 0 co
o Ó o O d d d O d d d
co co CM CM CD b- b- CO co 00 co
T“ CM CM CM O CM CO CD CM <0 CM 0
ó O O O O d d d O d d d
IO 03 03 03 O) co CM τ- to
00 03 CO CD b- V“ co 03 p ΟΝ CM p
Ó o O Ó d d O
co b- h- eo co 03 CM CO 00 10 00
xj· o CO ’Μ’ oo to co ID 10 co co to
Ó Ó Ó d ó d d d d d d d
b- co r- CD 03 co CO b- CM to CM 00
p co b-; CO co co CM CM 00 CM 0 r^- r*
co co v- 03 CM T— CM CM d d co
T“ T- T—
b- eo T t— Oi CM CM <O 00 CM co
σ» 00 Γ- IO IO 0 O 00 co
V o o IO 03 o> O> 03 CD 03 O> 00
IO IO IO V ’ί Ό CM
cd 00 co CO M- CM co co CM to CO CM
CM Γ- t^ b- CO CD co 0 b- co p ’Μ’
cd οο T— Ó d !< 00 03 d 03 r< T” co
CM CM CO CO co CM CM CM co CM CM CO 10
co co b- O> CM CO CO b- CM 00 CM
co co M- o CO 03 Γ- Y— iq CM
T- T“ CM Y” CO CM CM V“
CO CD to 03 00 IO ID r*· CM r- IO
τ- v τ- d τ-
ó o Ο O o d d Ο d d d Ο
io ID co 10 Ό- ID 10 ID p CO
b- 03 O to 0 O CD b- <0 T“ co
co CM Μ co CO co TT co
Ύ 5 5 Ύ 5 Ύ 5 Ύ
T“ V V“ T— ▼—
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
O O O O O O O O O O O O O
O O O O O O O O O O O O O
CO CO CO CO CO CO CO CO CO CO CO CO CO
0. CL CL Ol CL Q. Q_ CL CL Q- CL CL CL
ω ω ω ω co ω ω ω W W W ω W
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
Μ- Μ- 'M- ’ϋ- ’Φ tT
tO to to to to IO to to ID IO to to IO
to IO lO to to tO to to ID ID IO to IO
CO O O CM co O CD b- O co co r^· 00
CD to CO to 00 CO CD co 00 00
CD CD co 00 00 f^. 00 co co Γ- Γ- CD Γ-
<D ID ID to IO to to ID ID ΙΟ ΙΟ ID ΙΟ
T— t— X- V- V“ y- T- τ— T“ T- T-
>< X t— X V“ X X X T“ X T- X X X τ-· X T- X t— X
>< b- X b- X b- X h- 8 B X b* X b- X b- X r- X X Γ- X b-
03 03 03 CD 03 03 CD 03 O) O) CD 03 03
«φ • · « · * · •«·« «· • ·
LO cn >u
Tabulka
22:0 0.48 5 o co CM O 5 ó to co o co co d co d b- M- d CM o r- o CO CM d o> d co d
CM tn CM M- co b- tn co co N- co ▼“
O co CM Ó CM CM CM τ- X— CM CM CM CM
CM o O Ó ó Ó ο d O Ó O d o
CM m IO Γ- to CM CD co CO V T” 00
O co x-; M; CM CM CO o CO 00 CO T“ co
CM v x— x— v v
O b- m Μ- b- to CM co tn h* CD CM Μ-
O tn co CO IO o 00 m CO o tn tn tn b-
CM d o Ó o Ó d d ó o o d
CO CM co CO O) CD co Γ- CM CM tn
00 tn CM X“ tn t— CO CM ΟΟ CM CM o tn
v d ai X- T- CM 00 M·' CD T~ CM CM o
*” X“ ▼- V“
Cl <0 co V IO co co CM co CO co
ώ Τζ CM O) m O M1 co b; Ift m co
T“ CO CM o ó IO ai co od 00 cd CM
m U> IO IO •a M1 CM
co CO 00 co co X“ tn co CM tn co co Ό-
00 cd n b- X“ CO X“ co CM CM CD tn M- CD
CM o ai ó O CM CD CO CO CM v-’ CM
co CM co CO CO CM CO CO co CO CO tn
o 3 co M- b* co CM co co CO tn CO
00 co in tq to co tn CO b-
v *” CM T~ CM c\i T“ T“
τ- co co CD v- a> a> tn co h- co co
CO O Ο o o O τ- o o o O τ-
O o ó O Ο d d ó o d Ο d
o 'M' CO IO tn χ_ O) co T“ σ> co
co 00 CM co co CO M CD CM 00 O) O co co
v CM CO co co CO CM co CM CM CO co
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
v | 1 1 ▼J“ x— v— Χγ ▼” t— T“ T—
Q r— X— X— xr—
h-l CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
O o O O O O O o O O O o o
O o O O O O O o O O O o o
co co co co CO CO CO co CO CO CO co co
<D CL CL Q. CL Q_ 0L 0. CL CL CL Q_ CL CL
£ ω ω ω ω ω ω w W ω W CO ω ω
bd CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM 1 CM CM
•M* M* M Μ- M“ Μ- M- Μ- xr M- M“
to LO IO to to in m tn tn tn tn tn tn
to tn IO to to tn IO m tn tn tn tn tn
πΊ CD tn O to x— CO o tn N- co co co
Ct-I ω CO to M CO X“ tn CM tn tn
>o
1-1
b. b- b. b- b- b- Γ- r- b- N. b*
►>1 IO LO m to to tn IO ιο tn tn tn tn tn
υ v v 5“ t— x— V“ χ— V“ T t—
X X X X X X X X X X T X T— χ T“ χ
Q X b- X b* X r- X b* X b- X r- X b- X b- X h* X X r- X X b-
1—1 0> CD CD CD σ> o> CD CD σ> O) a> O) CD
·· · ·*··
9999
99
9 9 9 · « · « 9 ···'*♦ • · · 9 fi 9
9 9 * »» · ·· 9999 99 99
Příklad 10: Současná exprese Δ6- a A12-desaturáz v rostlině Brassica napus
Za účelem exprimovat Δ6- a A12-desaturázy ze stejné T-DNA se připravila konstrukce pro specifickou expresi v semenech.
Fragment restrikčního enzymu Notl pCGN5536 obsahující 5regulační oblast napinu, regulační oblast Ma524 a 3regulační oblast napinu se začlenil do restrikčního místa Notl pCGN5542 za vzniku pCGN5544. Expresívní moduly se orientovaly takovým způsobem, že směr transkripce Ma524 a Ma648 a markéru nptll je stejný.
PCGN5544 se zavedl do kultivaru rostliny Brassica napus LP30108 transformací zprostředkovanou mikroorganizmem Agrobacteríum.
Z šesnácti nezávislých transformantů LP30021 a netransformovaných kontrolních rostlin rostoucích ve skleníku se sebrala zralá inbrední semena T2. Očekávalo se, že v těchto semenech se vylučují transgeny Δ6- a A12-desaturázy. Složení mastných kyselin skupiny dvaceti semen se analyzovalo plynovou chromoatografií. Data jsou uvedena v tabulce č. 10. Všechny transformované linie (5544-LP30108-3) ve srovnání s kontrolou vykazují změnu složení oleje. Ve všech třech liniích (-3, -4, -11) vzniká GLA. Dvě linie ze tří (bez GLA) (-4, -11) vykazují zvýšené množství 18:2, což indikuje expresi A12-desaturázy. Množství GLA v rostlinách obsahujících zdvojenou konstrukci Δ6 + Δ12 (pCGN5544) bylo vyšší než množství v rosltinnách obsahujících pCGN5538 (samotné Δ6). Množství Δ6,9 18:2 se velmi snížilo v rostlinách obsahujících Δ6 + Δ12 ve srovnání s rostlinami, které obsahují samotný Δ6. Kombinace Δ6- a Δ12desaturáz na jedné T-DNA vede k akumulaci více GLA a méně vedlejších produktů, než při expresi samotné Δβ-desaturázy. Za účelem zkoumání vylučování množství GLA v semenech T2 a za účelem identifikace jednotlivých rostlin, které se pro vytvoření další generace, se provedla analýza poloviny semen.
• ·
Semena se nechala klíčit přes noc, ve tmě, při teplotě 30 °C na filtračním papíře nasáklém vodou. Vnější děložní lístky se použily pro analýzu plynovou chromatografií a zbytek rostliny se kultivoval v půdě. Výsledky některých těchto analýz se uvádějí v tabulce č. 11. Jak se očekávalo v případě populace T2, v jednotlivých semenech se vylučuje určité množství GLA a 18:2. V jednotlivých semenech se zjistil až 60 % obsah mastných kyselin. Vybraly se jednotlivé rostliny, které se nechaly růst ve skleníku a na poli, přičemž dochází k produkci semen T3.
Dobrým zdrojem GLA zahrnující Brassica, sóju, exprimující konstrukce podle
Typické maximálně 25 obsahují až v tabulce č.
zdroje, jako % GLA. Naopak 30 % GLA.
obsahují až mohou být transgenní rostliny slunečnice, kukuřici a světlici a vynálezu.
je brutník lékařský, produkují rostliny uvedené v tabulce č. 19
Dále, jednotlivá semena uvedená 60 % GLA.
CM
CM
O
CM
O
O
CM
X— CM xr CO co b- xT IO CM b- CD CO CM b-
xr •v V ó xT IO co o v θ’ M- IO O co
O o Ó O ó ó o o o ó o d O o
co CO oo CM M- r- IO co b- a> CM co co
χη CD CD p v-' O o 5> χη a> o σ> co O o CD
O τ- o x— o T o o x— τ— ci
oo CM co CM 00 ν- co co xT CO b- co b- 00 CO CD
CD b- b- CD h- α co ó CD co b- b- co CD b- co
Ó Ó Ó Ó Ó ó ó Ó ó ó o o d o O
Γo !-) >υ
Tabulka yfeo cd oó
CM
T- U3 ca -r<
CM
CD Ί w °1
V <0 <
«Ρ*
x— to τ- τ- CM p co CM co h- CD h- r- xT CD
Τ- CM Ο Ο CM o co O o co CO in h- CM x— CO
Ο d O ó O d Ó ó ó d o O d d O
to co co CD x— X— ř*. CO CM co co co v- to b-
p CD T- xr p IO CM v p M; p p ’Γ“ co
T“ CM X— X— CM CM T“ x— v-
r- CO CM CM 00 51- CO CO CM IO CM 00 CO CO IO
σ> CM o O σ> CM CO o T“ o co p p O co
o O 4 CM 00 o o to O CM χ- CM
T“ x- V CM CM co co T CO
CM
CM τΟ) <3 cm o> «i <©
T- <1 oo o
CD
oo xT co xr Μ- xT o> l·- p CO xr co
o O) τ— p xr CD CM tO χτ 00 co o CM p m
d co CM 4 CD cd CM CD v- d CM co oo uS χ— CO
co co CM xT CM CM m xT xr co CM CM co CD CM
o o O O O o O o o ν- CO CM o O u>
O τ- 5- o τ-
o ο o o Ο
CD D) 00 r*- in v O) co CM τ- CM co T-
σ> CD CM IO CD CM v CM p OO Ο) M 00 CD 00
σ> CO CD xr v- CD í< ’Μ2 O CD CD d cd
χτ CO CD χτ xr cd CO xT co xr CM CM xr v co
τ- to N. CD 00 CM CD CD Μ- m CM CD oo CD Tj*
Ο χ~ p h-. CM ▼“ CO p h* CD co CM CM CM xr
χ— CM x— x— CM CM Η ▼— CM CM CM Csi 57- CM
r-. O) CM xT 00 CO 00 CM 00 CD CM CM 00 CD O)
χ“ d CM τ- τ- CM CM O τ- O CM τ- τ- CM
o d d Ο Ο O d Ο O Ó Ο Ο d
’ΧΤ o CD O) P b- V“ oo o> M* co h-
p p CM p P p p p p h* p p oo
’Τ xr v xr xr xr xr 'M2 xr xr xr
o 5^ CM co xr IO CD o
’Γ“ CM CD γ- IO h- y— V X“ ▼“ T— x— CM
00 CD ιο oo CO CD 00 00 00 00 00 00 00
O O O o o o o O o o o o o o o O
ν- V“ ▼“ Τ- τ' Τ- τ- T™ τ-
Ο O o Ο o Ο Ο O o o o Ο o o o O
CO co CD co CD CO CO CD co co co CO co co co co
0. CL X 0. X CL CL X Q. CL 0. 0. 0. 0. CL CL
-J -J X _J X -J -J X —1 —I G
xr xr 4 V 4 xr xr 4 4 4 4 4 4 4 ( xr (
xr xr v xr M- xr xr •M· 4 ’Τ xr xr xr
LO IO IO <n IO ID to LO to to to to to to IO IO
m m IO io CO LO to IO to to to IO to to to IO
• ·
CM
CM
O
CM
O
Ó
CM oC7i γO c—I >U
Tabulka o<50 οο <50
CM
T- m cn'~ <3
CM O>
óo co 5?
T- <
oo o
<50 o?
co
M
M
O
CM
CO b~ cn co o;
CM
CM co bbl co in
CM σ>
oo cd c
o
V
O
CO
o.
o co >υ
Tabulka o
CM
O
Ó
CM
Xj
CM co
CM
OJ
CM
CO
CM »
oo o
éo co o
<b
Fl ω
>u
I-1 λ:
>1 υ
b~ OJ d CO oo d CD CD O (O b- o ID CO O CO CD Ó in ca d OJ oo d oo 00 d 00 co o co 00 d r*- o m 00 o 00 OO O xt OO d
CM 00 in T~ CO co CD w co co co CO 00 xf co
in σ> co h- σ> 00 CO co oj o oo co OJ b- OJ
d d ▼— d Ó d d O d d T“ d d d d d
XT co co co ID co xT CM oo OJ CD oo CD co OJ co
00 CM v- o CM ID O O w oo o ID ΙΟ cq o
d CM *“ v- d d T“ x— χ-
τ CM oo CM h-. F- b- in CO CM CM ιό
cg τη CM M; 00 CO CM x— T o
X“ X“ t— x- X“ x- V x- X- X“ x—
eq p co 00 CD co io OJ
eo d CM T“ *; io
to 00 co CO φ 00 icj
T io ID T T
CM OJ CO CM χ— F- ID 00
00 00 OJ co b* Τζ iq
d CM OJ IO 00 O to
to IO T io IO (0 IO
v— r- ID co CO CM ID co
^2 o O p T~ Ν' ID OJ
CM ID CD ib CO r< CM d
T- t- CM t- t- CM CM
00 F- <D ID h* CD Ν' CD
co xr O N; T- CD CD r-
ID C\i CM 5— ID ID σ>
CO CM CM t— t— T“
x— co ΤΟ O τη
O O O
CO OJ to X— CM Ό co IO CO OJ 00 x—
Τ- o o o o o o o co o o CM
Ο d © d © o d d o d d d
co cd b- CD ID 5^ 00 T“ 00 co D) D) 00
co oo 00 N; 00 ID co τ’- h- D> r- T ř*. CM cq
co co CD 4 b- 00 cd <O r< d CD CM d
CN ▼- T“ T- t— CM *” *”
00 h- CD CM r^- CO CD N- CD h- to X*· t— CO
CD ^7 CO V“ CM CO h- ř^ r* cq p p X ID o> cp
d v— T“ t— T~ M- d
ID CD CM ID CD T“ ID OJ co ID CD CD
τ- CN d CO t- CM O O o τ- o χ- CM τ- O
Ο O O d d O O o Ο o Ο O Ο d d
CO CD ID ID ID CD co co CM CO CN CD
ID CO *“ 00 O v- N- co CD in CM CD ID CM
CD oo 00 CD l< co CO M2 T !< CD M1 ID
O o O O o o O O o O o o o O O O
CN CM CM CN CM CM CN CM CM CM CM CM CN CM CM
00 00 00 00 00 00
O O O O o O O O O O O o o O O O
T“ τ- τ- τ- τ- τ-
O O O O Ο o O O O Ο Ο o Ο Ο O O
co co CO CO co CO co co co CO CO CO CO CO CO CO
Q_ Q_ 0. 0. 0. □. Q_ 0. D_ CL CL 0. CL CL CL 0.
-J —1 _l _l -J _l _l _j _l
xr 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 1 1
n· ID ID ID Xt ID N* ID M- in s s ’Ν’ ID s s 5 s 5 5 ID
ID ID ID ID ID IO ID ID ID ID ID m IO IO ID ID
ID CD r- 00 OJ O v- CN CO Ν’ IO co 00 CD
CD CD CD CD CD co h- N- N- h-
co co co co co co co co
co co co co co co co co
co co co co co co co co
t— >< >< v- >< X X >< t— χ X
>< r*. >< 2 b- >< r* X r- >< b~ X X hw
CD OJ OJ σ> CD OJ CD CD
co co co co co co co co
co co co co co co co co
co co co co co co co co
>< >< >< T— X X X X X
>< * N- X h- X X r^· X N- X b-
OJ OJ OJ CD OJ OJ OJ OJ
• · • · • · co >υ
Tabulka o
CM
O
O
CM •Móo
CM _
3ód <o
CO
CM cn
CM <30 cn co“ cm oo o
co
CD o
cb
Q t—( c
CD ε
CL co >o g
I-1
5b u
o l-l
3 3 CM co b- b- cn CM h- Ν’ CO 3 tO CO cn
CO CO 00 00 cn ID σ> co 00 cn CN 00 t— cn t— 3“
o o o O o o O ó 3 Ó ó 3- 3—
co CO CD oo 00 b~ cn 3 CO co CO w co cn iq N OO
CD CD b- <n cn ID u> ID CD Ν’ IO co n o to N
O O O o o Ó ó Ó Ó ó ó ó ó o ó ó
CM cn b- co O co cn CM 00 N* ID co n 00 oo
b- b- oo o CM N co CO n o co m o co N*
O o o T~ ó o Ó ó cd ó O ó o o
CO CM b- CM CM b- cn co CM 3“ r- CN CM cn co to co
T— 3 CM CM ID CM <n CM T~ N h* CN b- N co Ν’
CM T- T- CM T- CM 3“ T~‘ V“ T- 3- v’ Ί-· T-1
σ> σ> 00 co τ- 3“ 3“ b- CM b- r- h- IO V“ co
NT eo nt K N- ο o co co co b; n 3 co CO, n;
ia o cd o> 3 ó id cd CM* O CN O 3—
co N IO CN 3 «0 n CO CO CN co
o co CO <n n cn 3 m n cn cn b- CN CN CN oo N*
r*- 00 00 (O n; o cb co h- ó b- co 3— ó r^ CN CO
o cd o V“ CM CO oo 5T co 3 cb Ν’ CO ó CN oo
co CN CN CM CN CM CO CM N co CO CN
o m cm co o CM Ó
to CN CN CN co N2 CN CD co cn y~ h* CN 3— cq cd co CN od co to V oo CN Ν’ cn ó co
CO N <n cn b- CN N co
cq N; T-' cn iq
3— T- V ν-
00 to ID 00 3— to to τ-
o o O o Ó o o ο
cd ó Ó o’ ó cd
00 to cn CN CO cq co 00
cq o CM cq CO cd CN cq
Ν’ N2 cb Ν’ tri cd N
O o o O o o o O
CN CM CN CN CM CN CN CN
CO CO od od CO od od od
O O o O O o o o
▼— Τ- 3— 3— X““
O Ο o O o o o o
co co co co co co co co
0. Q. 0. 0. 0. 0. CL Q_
-I J -4 _l _J -J
Ν’ Ν’ Ň Ν’ Ν’ 1 N
Ν’ Ν’ Ν’ N Ν’ 3T N
to to to tO to to IO IO
tO IO IO to to to to IO
O v- CN CO Ν’ to CD h*
00 00 00 00 00 co co 00
CN co cn Ν’ M- xt 5T* IO to
N CN CN CO Xt xf OO O CN
oo id CN <b l< cn cd O
co CN Ν’ CN co CM CN co CO
N CN co σ> τ- T* V“ CN
cq CN CN N; Ο CM. iq N cq
*” 3—
σ> t— CO to CM 3-
o 3— Ó 3 T“
ó cd o cd O O O cd
N CM CD 00 co 00 O) co
Ν’ CO cq cq iq co iq CD ID
cb cb Ν’ cd cb cd cb cb
o IO IO to IO IO IO IO IO
CN 3“ 3— t— 3— T“ 3- 3-
oo od od od oo od oo od od
o o o O O O o o o
3” τ-
o O o o Ο o o o o
co co co co CO n co co co
0. 0. 0. 0. 0. CL Q_ Ol Q.
-J —í _J _i _j -1 _J
N Ν’ Ν’ Ň N Xt N Ν’ 1
N IO Ν’ ΙΟ 5 Ν’ IO 3 xf ID N IO N to Ν’ ΙΟ
IO IO ID io IO ID IO IO IO
oo co b- oo cn O CO Ν’
oo 3- T— CM CN CN CN
CO co co co CO co co CO CO
CO co co co co co co co co
CO co co co co co co co co
3“ X X X X T— X X X 3— X
>< r- X b- X r~- X b- X r^. X X r- X b-
cn cn <n <n cn cn σ> cn cn
co b- CM T— X CD CM X CO h- CN 3 X co h- CN 3— X co b- CM T— X CD b- CM X co b~ CM X co N. CN 3“ X
X b- X b- X X b* X b- X b- X b- X N.
<n cn <n σ> cn <n cn σ>
C\1 co >u
Tabulka o
CM
O
O
CM
M co
CM ~ < tn l'- co ód <o <,CM «
cd
CM x— ai «I
CM tt>
CO
ΡΜ dd oo o
ód co o
co c
0)
CL ω
>o
I-1 >1
U
Q
in h- co r- O) Tf
co σ> CD co CM OJ T“ 05
ó o O o Ó cd
1^ σ> w co CM r- a> Ti-
co m (O m O co co to
ó ó o o o o o O
CO o> f'· CM M- CM tn
σ» co M- o O ó o cd
cd o o Ó cd
00 05 co CO CM
τη co o co CM o
Ή CM CM X“
co co 05 v- ř*e co
ΙΛ cd τ- tf> CO o>
σ! co ΓΟ o> O o id
CO co co co
h* ▼— co co co
r^- O) V“ o co co tn
cd co σ> co ó ó
CM CM CM M- co tn
tn o tri x— tn tn cd CM r- 0 co CM r^ CM CM M- CO tri 'M- M- 0 co 00 CD CO CO 00 co co CM
co σ> <p M- r*. CD CO CO
O tn tn CM CM M;
CM T“ T“
CM 'M* t— CM CM T—
CM τ- ν- τ- T“ τ-
O Ο O Ο Ó Ο Ó Ο
ΙΌ h- CM tn CD M* CO
h*. cp 00 CO tn r- 00
t cd cd cd cd cd cd cd
tn tn 10 tn to tn tn tn
▼7 T- T— T- τ— T—
co co co 00 00 co
0 0 0 0 O O 0 O
7” ν- Τ- τ-
O Ο 0 Ο O O Ο O
co CO co co CO CO CO CO
Q_ Q_ CL CL CL Ol CL 0.
_1 _l _j -1 _1 -J
M- 4 4 M •M- tj-
’Μ’ M- M M“ M* M*
ΙΌ tn tn to tn tn tn tn
in tn to to tn tn m tn
m CO ř- 00 0 0 T“ CM
CM CM CM CM CM co CO co
co ¢0 co 00 co co co 00
í^. r- l·- h·. r- r- h- h-
CM CM CM CM CM CM CM CM
X X X t— X X“ X X“ X X X
X r- X t''- x r- X r*. X X r- X X
cd 05 05 CD 05 05 05 CD
• « • · · *
Příklad 11: Současná exprese Δ5- a Δβ-desaturáz M. alpina v rostlině Brassica napiš
Aby došlo v transgenní kanolek produkci kyseliny arachidonové (ARA), musí se do rostliny vnést aktivity obou desaturáz Δ5 a Δ6. Za účelem uskutečnit downstream charakterizaci a šlechtění, je výhodné mít obě aktivity na jedné T-DNA. Následující příklad ukazuje současnou expresi Δ5a Δβ-desaturáz.
Fragment restrikčního enzymu Asp718 pCGN5528 obsahující 5'regulační oblast napínu, regulační oblast Ma29 a 3'regulační oblast napinu se začlenil do restrikčního místa Asp718 pCGN5138 za vzniku pCGN5545. Fragment restrikčního enzymu Notl pCGN5536 obsahující 5'regulační oblast napinu, regulační oblast Ma524 a 3'regulační oblast napinu se začlenil do restrikčního místa Notl pCGN5545 za vzniku pCGN5546. Expresívní moduly se orientovaly takovým způsobem, že směr transkripce Ma524 a Ma648 a markéru nptll je stejný.
PCGN5546 se zavedl do kultivaru rostliny Brassica napus LP30108 transformací zprostředkovanou mikroorganizmem Agrobacterium.
Z třiceti nezávislých transformantů LP30108 a netransformovaných kontrolních rostlin rostoucích ve skleníku se sebrala zralá inbrední semena T2. Složení mastných kyselin skupiny dvaceti semen se analyzovalo plynovou chromatografií. Data jsou uvedena v tabulce č. 12. Všechny transformované linie vykazují expresi obou desaturáz. Jako důkaz je přítomnost Δ5'9 18:2 (jak je možné vidět v rostlinách obsahujících pCGN5531) a Δ6'9 18:2 a GLA (jak je možné vidět v rostlinách obsahujících pCGN5538).
o
CN
O d
CN
Νέο
CN a>
CN CN CN CN CN co CN co CN T“ Ν’ CN 00 CN σ> τ- UO cq IO cp X“ CO CN τ— CN to CN co v- co co CN
N io 00 co oo h- r*- Ο IO CO l·- OO r*- τ- co CN
00 r- OO o co ó O) co d <D O l-'- co 0)
d o d d d d ó o Ó d o ó Ó
m CN N CD Ν’ CN co Ν’ CN CN N IO IO CD CO
00 co τ- τ- co CO IO Ν’ CN CN o O o CN co IO
d o ο Ο d O d ó O d d d d o Ó
00 T“ cp CN co CN m Ν’ i^- N τ- h- N- CD Ν’
cp N; τ- N cp co N; U0 CN CO r~ ip uo CO
T“ T“ T— CN V“ T~ T“
mastných kyselin skupin s dvaceti semeny z rostlin 5546-LP30108
CN čó σ» co
ΓΜ čo σ>
co
CM čó o
čó (O o
čó
o> IO <0 00 eo co O) CM r*. co 05 Ο» CO CM T
CN T co 00 CM N- CM cp o> Ο» 10 o> o* CM CO
CN CM Ο» d ai IO T ri σ>
co co N- co CM r- co h- CN m CN CN Ν’ r- to co
co CN 05 CN O) co o CD 05 CD Ν’ Ν’ 00 r- IO
T- CD Ν’ co cd d T“ N CN 05 05 od co co ai
T“ v— CN τ- τ— T~
eo w o « có T— oo co
CM IO IO o> © d
co CM CM Τ- CN K σ>
Τ- CM Ο o CN IO
© Ο O d O O ©
co co 3 co CM 00 IO 05 co T“ T CM CO IO ř* CO
(O K. 3 c- N- 05 CM CM O cp CM co IO
CM © © T CM τ— T“ CM
CN N- 05 oo cq 05 10 CN ΙΟ p oo 05 05 UO CO
r-t O 00 Ν’ ó CN Ν’ σ> h* od (0 CD 05 CN CD T“
tn CO od o CD τ- co’ co CD CD UO CO Ν’
co CD r- Ο CD CD (O CD CO CD CD
0O CN uo cq τ- Ν’ σ> CN CO UO CN CD r- CN Ν’ CO
CN CN uo CN ο CN Ν' 00 τ- iq 00 CO τ- co CO h-
CN CN CN CN CN CN CN ΟΝ CN ΟΝ CN CN
co •Ν- UO Ν- IO Ν’ CO b- m Ν’ CD co CO r-
co Τ- τ— Τ- τ- τ- CN τ- τ- t— τ- τ- CN CN
o Ο O Ο Ο Ο Ο Ο Ο O Ο O Ο O O ó
00 τ- cn Ν’ CN UO Ν’ Ν’ 00 00 IO IO 00 Ν’ cq CO
oo cp CN CN IO O r- CN CN CN 05 N. Tj- o
3 N n·’ Ν’ Ν’ Ν1 Ν' Ν’ N Ν’ Ν’ N1
ro fO
N
I—I '5*1
1-1
Ό rc fC C
H <
C
d)
O τ- CN CO Ν’ uo CD
i CN | CO y CO 9 r^- oo O) τ— T- τ— T- v— T-
oo oo 00 oo 00 oo 00 00 00 00 00 00 00 00
o o o o O o o o o O o o o o o o
τ- τ- τ- τ- τ- τ- τ- τ-
Ο o O Ο Ο o o Ο o Ο Ο Ο o o o Ο
co CO CO co co co co O co co co CO co CO fO CO
CL Q_ Q_ 0. CL 0. Q. 0. CL CL CL CL CL CL 0. CL
_J _J _l _1 -J _J _J -J _J —l _j _l _J _J —1
CD CD CD CD CD (O CD CD CD CD ώ
Ν’ Ν’ Ν’ Ν’ N* Ν’ Ν’ T N* Ν' Ν’ Ν’ Ν’ Ν’ T Ν’
uo UO CO CO CO CO UO m IO UO UO CO IO IO m IO
uo CO CO co CO uo UO IO UO IO IO UO IO UO m UO
O
CN
O
Ó
CN <30
CN
O>
CN CO co CN co r— CO σ> Γ- oo CO CO co co
CN CN o CN o CN τ— οο T~ τ— CM CN CM
t- T“ Τ- V
CN 05 co Γ- oo Ι» CN tO 00 CN co 1^ CO CO
O) CO r- Γ- oo Ι- OO σ> τ— 00 cn CO 00 co
O O d Ο o Ο O o O d o d ó
co 03 co O) 00 co Γ- co 03 CN CO 03 co
Ν’ O Ν’ co CN co τ- o 03 Τ- CN 'M* Τ- Τ-
O d d d d d Ο d Ο d ó Ο Ο
co Γ- Ν’ oo r- r- to O 1— CO h* Ν’ CD
CN τ’- ΓΟ CN 00 p p o p p to CO CO
CN CN CN <- h G csi CN co t τ-’
mastných kyselin skupin s dvaceti semeny z rostlin 5546-LP30108
CO oo co o>
(O co n cn
CN cn «I
CN co p
CO
CM ěo o>
»o
CM oo o
<30 co o
co
CN CO CD co Γ— CN T co τ- to co
CO T- O> r- co 00 co co ΟΙ CM co
CN Ο» CO cd r— id cd id id cd
IO CN Tt CN co cn to Tj- CM CM
CO O CO CM CO o o 00 to co CM to co O
d T»·' d í< r< 1- cd cd od CD ó CD
CN T“ T— co
CN
Ο»
co IO co CD co io 00 σ> 00
co co CN CO Τ- co CN e Ι- p CN
d d o O Ο d o Ο o d ©
σ> o CM CO CD to ID T— co co 5 co 03 © CN CO V (D CD CM ΙΛ O ’Ρ· T“ ř*. o ID O CO 00 O
CO 00 to Tt CM a> P CN h- CM to h*
h* CD T“ o τ— Τ- T— CN O τ— D> v
IO o CD CM Ο CO CO r< CO in d to r<
CD CD to CD CO CD CD (O CD CO CD
to 'M' to 'M* to V 00 to 00 co ▼- 00 to
OO T— CO r- T— Ν’ co T— r— r- 00 co to
CM CM CM CM CM CM CN CN cd CN CM τ— CM CM
co to CD co o* CN CO CM CN to CM CM σ>
CM co CO d ’ζΤ CN CO r* CN Τ- •MT o
O o d O d O d d O Ο d d
CD CD r- CO CM T“ OO CN CM CO CD D> ’Μ’ σ>
O h* O tO σ> CN p M* OO 00 CM σ>
tri to ’ΤΤ to V to d cd to cd
d d x n i—I s2i G rH 42 d d G H <
Q
I—I
G (1)
h* 00 cn o T“ CN co Ν’ CO co r- OO σ> O
V” I | x— CN CN CN CN Ol CN CN cy CM CO
00 oo 00 00 00 00 CO 00 oo 00 1 CD 1 00
o o o O O O O O O o o o O O
τ- τ- τ- τ- T“ τ— τ-
Ο o Ο Ο Ο o o o o Ο o o o o
CO CO CO co n co co co co co co co CO co
OL 0. 0. 0. 0. 0. 0. Q_ 0. □. 0. CL CL Q_
_l I I _J -1 _l -1 _l _l _l _l _l -J _J
CD (O CD co co 1 CD 1 CD CD 1 CD 1 CD
to c& »n Ν’ CO Ν’ CO Ν’ CO 5 5 M· to M* IO s <r to to TT IO
IO CO to CO IO CO co IO to to cn to to to
• * ··· ···· «·«· ···· · · · · * · · · ♦ ········· · · · · · ···· w ······· ·····# ·· t*
Příklad 11: Současná exprese Δ5-, Δ6- a A12-desaturáz M. alpina v rostlině Brassica napiš
Za účelem optimální produkce kyseliny arachidonové (ARA) v transgenní kanole je nutné, aby v rostlině mimo aktivity Δ5 byly přítomny také aktivity desaturáz Δ6 a Δ12. Za účelem uskutečnit downstream charakterizaci a šlechtění, je výhodné mít všechny aktivity na jedné T-DNA. Následující příklad ukazuje současnou expresi Δ5-, Δ6- a A12-desaturáz.
Fragment restrikčního enzymu HindlII pCGN5528 obsahující 5'regulační oblast napínu, regulační oblast Ma29 a 3'regulační oblast napinu se začlenil do restrikčního místa HindlII pCGN5544 za vzniku pCGN5547. Expresívní moduly se orientovaly takovým způsobem, že směr transkripce Ma29, Ma524 a Ma648 a markéru nptll je stejný.
pCGN5547 se zavedl do kultivaru rostliny Brassica napus LP30108 transformací zprostředkovanou mikroorganizmem Agrobacterium.
Z třiceti nezávislých transformantů LP30108 a netransformovaných kontrolních rostlin rostoucích ve skleníku se sebrala zralá inbrední semena T2. Složení mastných kyselin skupiny dvaceti semen se analyzovalo plynovou chromatografií. Data jsou uvedena v tabulce č. 13. 27 z transformovaných linií vykazuje podstatnou akumulaci GLA a pozorovaná obecná množství GLA jsou vyšší než množství v rostlinách 5546, které neobsahují A12-desaturázu. A12-desaturáza se jeví být aktivní ve většině linií, což dokazuje skutečnost, že ve většině rostlin chybí detekovatelné množství Δ6,9 18:2 a hodnotítelné množství 18:2. Malé množství Δ5,9 18:2 je možné spatřit v rostlinách 5547, ačkoli uvedená množství jsou obecně menší než se pozorovalo v rostlinách 5546. To způsobila přítomnost A12-desaturázy, která účinně převádí 18:1 na 18:2, dříve než dojde k desaturaci v pozici Δ5.
CM ňi
CM
CM
CM
O
CM
O
O
CM
CO
CM
Tabulka č. 13
Analýza mastných kyselin skupin s dvaceti semeny z rostlin 5547-LP30108 cn co
QO (O o
cd
M β» CM
CM
CM
ČÓ o>
co*
CM »
CM
CO v o>
oo
ΤΟ co
ΤΟ <b o
CM
0 CM O d 0 d 0 ó O O 0 0 0 0 0 0 τ- Ο d 0 0
co co co CM CM O 0 0 0 0 0 CM 0 0
0 0 0 0 O 0 0
0 d d d d d d
CM m CM CO 00 CO CM co σ> co 0 xf x—
T— 0 V q q ▼“ q O τ- 0 σ> p co T— V“
Η' x— t- Ά Ά d t— d
CM 00 CO 00 00 CM o> cn co CM Xt co CO CO
00 r- b- co co oo co O> CO co co co q
d d d d d d d d d d d d d
r- co 0 CM co 00 10 CM CM co h- co co 00
0 0 O τ- CM xt CM CM CM co CM d 0 CO
d d d Ο d d d d d d d d d
xf 3 <0 <0 xt b- cn co m xt co Xt co C0
r- cp co q q q 3 r~ xf V“ co 0 xf q
CM t- t— τ- CM T— CM csi
5 eo 10 CD 0 CM T“ |T- 00 (O 10 10
3 00 T“ 00 10 co CM O σ> to A to
d co d 0 €0 IA T- 3 CM CO ID ΙΟ O T-
CM T“ V“ τ- CM T- CO CM
r- 10 v IO CM b- CM Ο) Xt co co co
co 00 xf co q ν- CM 00 τ- CO r- 00 0) O
CM CO cn t- έο d Ο d cn CM CM 0>
CM co CM co co CM 0 co co co CM CO CO CM
0 0 0 τ- V* O CM 0 0 0 0 0 0 O
Ο 0 O q
O o o' d
Τ- (O co CM ID CO CM CO 0 co co f- <0 O Xt
Ο Τ- 0 τ- CM τ- τ- CM CM 10 τ-
d Ο d Ο O* Ο Ο d d O d d Ο
CM r*- t— 0) σ> co 00 co t— Xf C0 CM b- 0>
x-; m CO to xf T co IO xf 0) CM T“ 10 q
xf T~ d d xr σ> CM Xf t— <0 xf CM b^
CO 10 in to co 3 xf Xf CM co
co cn co σ> co co to CM co CM CO co C0 co
CM CM 0 CM q 0 10 05 t— CO co co CM Oi
CM CM CM CM T“ CM CM CM CO CM CM CM CM CM
co co CM 10 xt IO to xf r~ b- co O> t0
d V Τ- τ- τ- τ- X“ X“ τ- X— Yt“ τ- τ- CM
0 Ο ο Ο Ο 0 0 Ο d d Ο Ο d d
00 « oo 10 σ> T“ b- co co co b* CO b- b-
co xf χξ co q V“ CM xf Xf CM <0 00 q q
iri xf xf xt Xt Xf xf xf xt Χί- xt Xt Xt
0 Τ- 0 0 O O 0 O 0 0 0 ο 0 0 0
d Ο d d d d d d d d d d d d d
0 v CM co xt 10
a CM co a 7 0 <? b- 00 cn T— t—
co 00 co 00 co co co co CO ώ CO 00 co
0 O 0 0 0 0 0 0 0 0 O o 0 0 0
V“ v- Y- Y“ v“ τ- τ- τ-
O O 0 0 0 0 O 0 0 0 O Ο Ο Ο 0
CO CO co co co co CO CO co co CO co CO co co
CL CL CL CL CL CL CL CL CL CL CL 0. CL 0. o.
-J | _J _1 _J —1 _J -I -I -J —1 _t _l _1
b- b- b- b- b- b. b- b- b- b- b- ti b- b- b-
xt xt xt xt M“ xt Xt xt Xf Xt xt Xt
m 10 in 10 0 0 10 10 to to to 10 m 10 10
to 10 10 LO 0 to 10 to to 10 10 m 10 10 10
• · · · • · · · • · « · • · « · co oo
CO o
i—1 o
co
Cb
I rx ld lT)
H i—i 4-) w
o
N ω
£ ω
ω
CM
CM
CM
CM
CM ď
CM
O
O
CM
X (30
CM
CO lO
CO
O « CM
CM
CM co <1.
CM od
P in
<1) υ o,
fd CM
> S
TS ω v- 03
3 -H CL CO
3 o
42 co
w
3
•H co
i—1 OJ V“
ω o
✓O CO
42
47 o
0 CN
'p*n X“
CO 3
C-1 •P CO
fO
£ Q h—1
3
42 N
t—1 '£>1 ω g
3 I-i
X fO y;
rO 3
Η
• · · 4 4 · ♦ ·
• « · · 4
• « · ·
• · · · • »
· · · • 4
* · « « · • · · · • ·
O o o o o O o O o o o o O o o O
CM O o o o o o O o o o o o o o o
O d
CO co co 03 co co x- co co 5 <33 1^. ř- co CM
10 LO CM CM τη CM CM x T“ <33 cq X“ CM
*” x— *“ d x- *“
CM CO co X 00 co co co co oo co r-
00 ¢0 o O σ> co O) 00 oo oo p 00 O) <33 o>
O ci x— d o O d d d ó d d d
O o co CM co LO CM co o 00 co co τ- CM
CM CM o o τ- h- x— CM Ο o
ó d ó d O d Ο d d o O
X CM CM ▼— LO co 03 w (33 CM T X
O CM b- cq CD cq h-· T~ cq O O O) O) cq F-
CM CM CM T— CM CM CM
10 O IO CM IO <o O 10 10 (0 Λ CO
R t t- co IO co o 03 cq rq 03 σ>
O T“ CM © © oo o oo ci O
CM τ— CM CM τ-
LO CO I- S- O) O) 03 oo X 10 co Ο) 03 co
CM CM r*· i— 00 LO X“ O co o o LO 00 o
X X“ CM xt co CM d d 00 d co d CO d
CM CM CM CM CM CO CM CM co co CM CM CO CM
O O o O O Φ o o o o O o O o
o
O O
O Τ- ι- IO o v o o o «Ο o CM 10 τ-
O Ο ρ CM O cq O o Ο
O © O o o O
03 CM co T- CO h* CO X oo X o> LO co co
<q CM cq CO co co p X co X r-~ ’ί cq to
x r< x— d co LO X“ 00 (33 d d CM CM LO
co co V io 'Μ’ LO XT CO x- CM LO IO
CM CM r- co X- h* X“ r— CM T- CM co co X O)
-- CM CO r— σ> CO h* t— h- CM CO CM 03 00
CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM CM
co CO o> CM CM h- 00 CO r- r-~ CM 00 r- Γ-
'ΐ- τ- X“ T~ τ- CM τ- v— Τ-
Ο O ó Ο ó Ó O d d Ο d Ο d Ο d
co LO CO co CM 00 LO co <33 X X O) co CM h*
cq cq cq CM cq lO o o CM cq cq o
CO c0 LO x- Μ- M- X X x- Μ1 x-
o o o o O o O o o o o O o o o
o ó o d O ó O d d o o O d o d
co h- 00 O) O CM co x- IO co r* 00 03 o
1 1 T 1 I CM CM CM CM CM O) CM CM CM CM co
oo 00 co co 00 co 00 oo ώ oo oo 00
o o o o O O O o o o o o o o o
τ- V“ V“ τ- τ- Τ-
o o Ο O O o o Ο Ο Ο o O o O o
co co CO co co co co CO co CO co co co co co
Q_ 0. 0. 0. 0. 0. CL o. 0. 0. 0. 0. 0. £L 0-
□ | _] _I _l —I _l _J _l _l _1 _l —J —1 -J
ri ri rl rl rl rl ri rl ti ht 1 r- 1
M“ m LO LO ’Μ’ LO 'M’ LO s 3 M (O χ- ιό X 10 X IO ^r LO LO M“ LO LO
LO LO LO LO LO LO LO in to to IO LO Lf) LO LO
• ··· ·· »·>» *» ·* ·* ·· β » 9 9 9 · 9 9 9 9
9 99 9 9 · 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
Příklad 13: Stereospecifická distribuce Δβ-desaturovaných olejů.
Tento experiment se navrhl za účelem zkoumání stereospecifické distribuce Δβ-desaturovaných olejů v semenech exprimujících pCGN5538 (Ma524 cDNA). Použily se tři vzorky semen:
1) semena netransformovaných rostlin B. napus kultivar LP004 (kontrola)
2) Semena T2 vylučující pCGN5538-LP004-19
3) Semena T2 vylučující pCGN5538-LP004-29
Při analýze se použil následující protokol:
1. Extrakce oleje ze semen
Padesát semen se umístilo do zkumavky o rozměrech 12 x 32 mm a drtila se skleněnou tyčinkou. Přidalo se 1,25 ml hexanu a směs se míchala na vortexu. Semena se extrahovala přes noc na míchačce. Extrakt se filtroval přes filtr zachycený na stříkačce o objemu 1 ml s velikostí pórů 0,2 mikronů. Extrakt se sušil v atmosféře dusíku. Výsledný olej se použil ke štěpení a derivatizaci celého olejového vzorku.
2. Štěpení
A. Štěpení kapalného oleje
Zásobní roztok lipázy (z Rhizopus arrhizus, Sigma, L4384) se naředil na přibližnou koncentraci 600 000 jednotek/ml za účelem dosáhnout 50 % štěpení TAG. Zásobní roztok lipázy se udržoval při teplotě 4 °C a umístil se na led. Množství reakčních činidel se může upravit podle množství oleje, který se bude štěpit.
Následující množství reakčních činidel je založeno na množství oleje, které se bude štěpit.- V tomto případě jsou to 2 mg. Do zkumavky se šroubujícím uzávěrem o rozměrech 12 x 32 cm se přidalo: 2 mg oleje, 200 μΐ 0,1 M tris HCl pH7, 40 μΐ 2,2 % (hmotnost/objem) CaCl2x2H2O a 100 μΐ 0,05 % (hmotnost/objem) žlučových solí. Materiál se míchal na vortexu a sonifikoval • · » · se, až se dosáhlo disperze oleje. Přidalo se 20 μΐ ředěné lipázy a směs se míchala na vortexu nepřerušovaně po dobu 1 minuty při teplotě místnosti. Vznikla bílá sraženina. Reakce se zastavila přidáním 100 μΐ 6M HCl a směs se zamíchala na vortexu. Přidalo se 500 μΐ CHC13:CH3OH (2:1)a směs se zamíchala na vortexu a držela se na ledu , zatímco probíhalo štěpení. Vzorky se znovu zamíchaly a centrifugovaly se za vzniku ostrého rozhraní vrstev. Spodní vrstva obsahující produkt štěpení se odstranila pasterovou pipetou a umístila se do zkumavky s víčkem o rozměrech 12 x 32 mm. Materiál se pak znovu extrahoval 300 μΐ CHCi3, míchal se na vortexu, centr!fugoval se a kombinoval se s dalšími spodními vrstvami.
Produkty štěpení se uchovávaly na ledu, jak jen to bylo možné.
Separace na HPLC se uskutečnila co nejdříve po štěpení, aby se minimalizovala migrace acylu.
B. Štěpení tuhého tuku
Postupuje se podle protokolu popsaného shora v textu pro štěpení kapalných olejů s tou výjimkou, že k 2 mg pevného tuku se přidalo 20 μΐ 11:0 metylesteru.
3. Separace na HPLC
Objem produktů štěpení se zmenšil sušením chloroformem na objem přibližně 200 μΐ. Každý vzorek se pak přenesl do zkumavky o rozměru 8 x 40 mm a 30 μΐ se zavedlo injekcí pro analýzu na HPLC.
Systém vysokovýkonné kapalné chromatografie je vybaven výparným detektorem rozptylu světla Varex ELSD IIA s teplotou v trubici 105 °C a s proudem dusíku 40 ml/min, automatickým dávkovačem vzorků Waters 712 Wisp, třemi moduly zavádění rozpouštědla Beckman 114M, řídící jednotkou Beckman 421A, pneumaticky ovládaným děličem toku Rheodyne a mikro-děličem frakcí Gilson. Chromatografická kolona má rozměry 220 x 4,6 mm • « a obsahuje normální fázovou křemičitou náplň o velikosti 5 mikronů od firmy Brownlee.
Použila se tato tři rozpouštědla:
A= hexan : toluen 1:1
B= toluen : etylacetát 3:1
C= 5 % kyselina mravenčí v etylacetátu
Profil gradientu byl následující:
Čas (min) funkce hodnota Doba trvání
Tok 0 2 ml/min
0% B 10
0% C 2
2 % C 25 6 min.
14 % C 2 1 min.
15 Konec programu
Chromtaografická standardní směs se připravila v rozpouštědla hexan:toluen v poměru 1:1 a obsahuje :
0,2 mg/ml triglyceridu 16:0 mg/ml 16:0 volnou mastnou kyselinu
0,2 mg/ml 16:0 smíšené izoméry (1,2-diacylglycerol a 1,3diacylglycerol)
0,2 mg/ml 3-monoacylglyecrol 16:0
0,2 mg/ml 2-monoacylglycerol 16:0
V případě každého vzorku se automaticky shromáždily frakce obsahující 2-mag pík metodou řízenou časovanými relátky. Časová prodleva se používá k synchronizaci detektoru s kolektorovým emitorem. Shromáždily se 2-mag píky a frakce se nechaly odpařit při teplotě místnosti přes noc.
Výsledky s kompozicí sn-2 se opírají o minimalizaci migrace acylu. To, že se na chromatografickém záznamu objevily 1-monoacetylglyceroiové a /nebo 3-monoacylglycerolové píky znamená, že došlo k migraci acylu.
• · • · • · · · · ···· ···· ··· ·· ···· ·· ··
4. Derivatizace
Za účelem derivatizovat celý olej se do zkumavky s víčkem o rozměrech 12 x 32 mm navážil 1 mg extrahovaného oleje. Přidal se 1 ml toluenu. Vzorek se míchal na vortexu a za účelem derivatizace se vzal alikvot o objemu 50 μΐ. Aby se vysušily 2-mag vzorky, přidalo se 50 μΐ toluenu. Do obou frakcí se přidalo 105 μΐ H2SO4/CH3OH @ 8,7 6 hmotnostních procent.
Zkumavka se dobře uzavřela a vzorek se ozářil světlem po dobu 1 hodiny při teplotě 95 °C. Vzorek se nechal ochladit a přidalo se 500 μΐ 10 % (hmotnost/objem) a 60 μΐ heptanu.
5. Analýza GLC
Plynová chromatografie se provedla na přístroji Hewlett
Packard model 6890, který je vybaven rozděleným/nerozděleným
kapilárním vstupem, detektorem FID, sériovým automatickým
dávkovačem vzorků 6890 a integrátorem 3392A Alpha Omega.
Nastavení kapilární kolony je následující:
A. Supelco Omegawax 250, délka 30 m, vnitřní průměr 0,25 mm,
tloušťka filmu 0, 25 μπι.
Vstup pro injektáž: 260 °C
Detektor 270 °C
Počáteční teplota 170 °C
Počáteční čas 1,5 min.
Rychlost 30 deg/min.
Konečná teplota 245 °C
Konečný čas 6,5 min.
Injektovatelný objem 1,5 μΐ
Tlak v hlavě kolony 0,175 Mpa
Dělící poměr 30
Plynový nosič He
Přídavný plyn n2
FID plyn H + vzduch
• · • · • · · · · · · · ·· · • ♦ · · · ······
P! -) ♦ ···· ···· yO ······· ······ · · * ·
Procentové složení metylesterů mastných kyselin se stanoví jako molová procenta. Když délka uhlíkatého řetězce je menší než 12, je nutné pro korekci výpočtu použít teoretické nebo empirické faktory.
6. Výpočet
Vypočítalo se průměrné rozdělení každé acylové skupiny v každé pozici sn-1 a sn-3.
Průměrné složení sn-1 a sn-3 = (3W0 složení - MAG složení)/2
WO je celý olej
MAG je monoacylglycerol
Výsledky uvedené analýzy jsou uvedeny v tabulce č. 14. GLA a Δ6'9 18:2 jsou pravidelně rozděleny mezi polohy sn-2 a sn1,3. Tato analýza nemůže rozpoznat mezi mastnými kyselinami v polohách sn-1 a sn-3.
« · • · • · ·
* Vypočteno z raag a ze složeni celého oleje pro každý analyzovaný vzorek K o 3 0» HS □ Φ' U) H O Nt fD 3 H' ω 2 i—1 ω 3 OJ Složení celého oleje 5538-29 h o 3 a o· 01 h> 0 N< Φ 3 H' 05 3 w 05 3 ' tu * 1 složeni celého oleje 5538-19 J T3 o 3 ω< n 3 O 0) H 0 N< Φ 3 H- ω 3 Η» 05 3 CJ ' * Složení celého oleje Složení sn2 % 3 F* O ♦
' Složení sn2 složení sn2 1
6.82 4.96 1.24 7.34 5.44 J _1 1.65 5.88 4.33 1.23 16:0
0.35 0.32 © k) **4 0.36 033 | _1 © k> *4 0.23 0.20 0.15 16:1
4.82 3.73 1.56 4.08 4.09 4.12 i 1 4.80 1 3.32 I © cl 18:0
54.21 1 54.92 56.35 57.66 57.51 57.21 i 1 71.55 69.29 ! 64.77 18:1
4.31 4.99 6.35 3.99 4.53 5.61 0.27 0.18 i _i 00Ό ta* op 'sO
9.24 12.11 17.85 8.58 ! 1 10.57 1 14.55 i 1 13.04 18.51 ! _1 29.45 -1 18:2
14.00 13.66 12.99 13.52 1 13.16 12.45 j _1 t o © CL 0.00 900 5 £ o\ JO ta* u
0.85 © 1.60 980 1.03 1.38 1.02 1.35 2.01 op cl
0.56 oco 0.38 0.59 0.50 0.32 60Ό 900 00Ό 18:4
1.42 66Ό 0.14 1.39 1.07 0.43 1.26 16Ό 0.21 20:0
1.47 III 0.40 r~ 1.07 001 1.47 1.17 0.57 20:1
Tabulka
Ω<
t—1
Příklad 14: Složení mastných kyselin v transgenních rostlinách
U Δ5 a Δ6 transgenních rostlin se analyzova obsah mastných kyselin.
Při extrakci olejů se použil následující protokol:
1. V případě každého vzorku se odvážilo dvakrát 400 mg semen.
2. Semena se rozdrtila tloučkem v misce. Tlouček a miska se dvakrát promyly 3 ml (2:1) (objem/objem) CHC13: CH3OH/MeOH.
Do skleněné zkumavky o objemu 20 ml se přidalo 6 ml (2:1) směsi (olej extrahovaný ve 12 ml, celkem 2:1).
3. Vzorky se míchaly na vortexu a umístily se do orbitální míchačky po dobu 2 hodin , přičemž se náhodně zamíchaly na vortexu.
4. Do každého vzorku se přidalo 5 ml 1M NaCl. Vzorek se zamíchal na vortexu a pak se centrifugoval při 2 000 ot/min. po dobu 5 minut. Za použití pasterovy pipety se odebrala spodní fáze.
5. Horní fáze se znovu extrahovala dalšími 5 ml. Vzorek se promíchal na vortexu a centrifugoval se při 2 000 ot./min. po dobu 5 min. Za použití pasterovy pipety se odebrala spodní fáze.
6. Za použití chlazení, při kterém dochází k odpařování, se v atmosféře dusíku odpařil CHC13:CH3OH/MeOH. Zkumavka obsahující extrahovaný olej se zatavila v atmosféře dusíku. V případě každého vzorku se extrahovalo přibližně 120 až 160 mg oleje.
Za účelem provedení analýzy GC-Ms se metylestery mastných kyselin rozpustily ve vhodném objemu hexanu a analyzovaly se za použití plynového chromatografu Hewlett-Packard 5890 Serie II Plus (Hewlett Packard, Palo Alto, CA) vybaveném křemičitou kapilární kolonou Omegawax 320 o rozměrech 30 m x 0,32 mm (vnitřní průměr) (Supelco, Bellefonte, PA) a hmotnostním selektivním detektorem Hewlett-Packard 5972 Series.
spekter se provedla na základě spektry uvedených v databázi
Interpretace hmotnostních porovnání s hmotnostními ·· · · · · · · • · · · · ·· · « · · · « · · chemických struktur NIST/EPA/NIH za použití MS Chem. Station (#G1036A) (Hewlett Packard).
Transgenní linie 5531-6 se analyzovaly ve dvou kopiích (A,B) a porovnávaly se s kontrolní linií LP004-6. Výsledné profily mastných kyselin se uvádí v tabulce č. 15.
Transgenní linie 5538-19 se analyzovaly ve dvou kopiích (A,B) a porovnávaly se s kontrolní linií LP004-6. Výsledné profily mastných kyselin se uvádí v tabulce č. 16.
• · · · • · ♦ · · · ·· ···» «· » «
Tabulka č. 15: Profil mastných kyselin
KONTROL. KONTROL. TRANSGEN TRANSGEN!
LP004-6A LP004-6B 5531-6A 5531-6B
LRL-2043 LRL-2044 LRL-2042 LRL-2045
001f0102.d 001f0103.d OOlfOlOl.d 001f0104.d
02:0
03:0
04:0 0.053 0.061
04:1
05:0 isomer
05:0
06:0 4.107 4.034 4.257 4.224
06:1 0.181 0.173 0.200 0.199
06:2 0.061 0.065 0.081 0.060
07:0
06:3 0.244 0.246 0.155 0.151
06:4
08:0 2.608 2.714 3.368 3.417
C18:lw9 65.489 66.454 59.529 59.073
C18:lw7 2.297 2.185 2.388 2.393
Cl 8:2 5,9 6.144 6.269
C18:2w6 19.828 18.667 18.872 19.059
C18.-3 5,9,12 0.469 0.496
C18:3w6 0.060
O8:3w3 1.587 1.578 1.428 1.418
C18:4w6
C18:4w3
C20:0 0.962 0.998 1.009 1.022
C20:lwll 1.336 1.335 1.058 1.065
C20:lw9
C20:lw7 0.076 0.080
C20:2w6 0.073 0.073 0.052
C20:3w6
• *
KONTROL. KONTROL. TRANSGEN. transgen;
LP004-6A LP004-6B 5531-6A 5531-6B
LRL-2043 LRL-2044 LRL-2042 LRL-2045
001f0102.d 001f0103.d OOlfOlOl.d 001f0104.d
C20:4w6
C20:3w3
C20:4w3
C20:5w3
C22:0(1.000) 0.542 0.558 0.463 0.467
C22:lwll 0.038
C22:lw9
C22:lw7 0.034
C21:5
C23:0 0.029
C22:4w6
C22:5w6
C22:5w3
C24:0 0.373 0.391 0.280 0.283
C22:6w3 0.314 0.317 0.223 0.212
C24:lw9
Celkem 100.00 100.00 100.00 100.00
• · · ·
Tabulka č. 16: Profil mastných kyselin
5538-19A 5538-19B LP004-6A LP004-6B
TRANSGEN. TRANSGEN T KONTROL. KONTROL.
LRL-2166 LRL-2167 LRL-2168 LRL-2169
C6:0 0.004 0.005
C8.0 0.007 0.007 0.004 0.005
00:0 0.012 0.012 0.008 0.008
02:0 0.020 0.020 0.011 0.012
03:0
04:0 0.099 0.108 0.050 0.050
C14:lw5
05:0 0.059 0.068 0.017 0.019
06:0 5.272 5.294 4.049 4.057
06:1 0.350 0.417 0.197 0.208
06:2 0.199 0.187 0.076 0.077
07:0 0.092 0.089 0.078 0.077
06:3 0.149 0.149 0.192 0.198
06:4 0.010
08:0 3.815 3.771 2.585 2.638
08:1 57.562 57.051 68.506 68.352
08:2 (6,9) 4.246 4.022
C18:2w6 10.900 11.589 19.098 19.122
C18:2w3 0.020 0.008 0.008 0.009
C18:3w6 12.565 12.595 0.013 0.015
C18:3w3 1.084 1.137 1.501 1.542
08:4 0.017 0.013 0.011 0.008
08:4 0.028 0.024
C20:0 1.138 1.104 0.937 0.943
C20:l 1.115 1.085 1.330 1.327
C20:2w6 0.150 0.143 0.068 0.071
C20:3w6 0.026 0.025 0.014 0.012
C20:4w6
C20:3w3
100
5538-19A 5538-19B LP004-6A LP004-6B
TRANSGEN. TRANSGEN. KONTROL. KONTROL.
LRL-2166 LRL-2167 LRL-2168 LRL-2169
C20:4w3
C20:5w3
C22:0 0.506 0.484 0.535 0.539
C22:l 0.017 0.020 0.032 0.032
C21:5 0.040 0.030 0.031
C22:4w6 0.038 0.064 0.015 0.014
C22:5w6
C22:5w3 0.023 0.018 0.021 0.017
C24:0 0.352 0.321 0.353 0.362
C22:6w3 0.009
C24:lw9 0.129 0.121 0.260 0.255
TOTAL 100.00 100.00 100.00 100.00
• ·
101 • ·· · « · * · • · * » fc * · • · · · · ♦ 9 · 9 9 9 9 9 9 9 9
Příklad 15: Kombinovaná exprese Δ6- a ΔΙΖ-desaturáz v rostlině B. napus, které se dosáhlo křížením
Křížily se rostliny obsahující buď Δ6- nebo Δ12desaturázu. U jednotlivých polovin semen F1 se analyzovalo složení mastných kyselin plynovou chromatografií. Data s každého takového křížení jsou uvedena v tabulce č. 17. Rodičovské rostliny, které se účastnily křížení, jsou 5538LP004-25-2-25 (exprimuje Δβ-desaturázu) a 5542-SP30021-10-16 (exprimuje Á12-desaturázu). Provedlo se reciproční křížení a výsledky pro 25 jednotlivých semen F1 jsou uvedeny dále v tabulce. Křížení se popisuje tak, že pohlaví prvního rodiče se označuje jako ženské. Obě skupiny křížení dávají přibližně stejné výsledky. V porovnání s rodičovskými rostlinami množství Δ5'9 18:2 se snížilo a množství GLA se zvýšilo. U většiny semen F1 došlo ke zvýšení množství Δ9'12 18:2. Je nutné poznamenat, že tato semena jsou F1 a obsahují tedy pouze jednu sadu každé desaturázy. V další generaci a při selekci homozygotních rostlin pro každou desaturázu může být obsah GLA F2 dokonce vyšší.
V některých situacích je výhodné kombinování vlastností provést křížením na jedné T-DNA. Zvláště, jestliže oba geny řídí stejný promotor (jako je to například v případě napinu), pak v případě tichého promotoru může být tento přístup výhodný ve srovnání s řešením, kdy se do jedné konstrukce začlení více cDNA.
V některých případech je však výhodné kombinovat více cDNA do jedné T-DNA. Výsledky jsou uvedeny v tabulce č. 17.
• · · · « · · * • » · « • · · ·
Οι ΟΙ οι Οι Ol οι ΟΙ cn cn cn cn Ol Ol cn cn cn Ol
Οι Α ΟΙ Α 2 2 2 2 οι Α 2 2 Ol A 2 cn A Ol A 2 cn cn A. cn A
ιο ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ IO ro IO IO ro ro ro N) to
ώ ώ 00 ώ ώ in ώ ώ ώ in in in in ώ ώ CO in
Τ3 Τ3 υ Ό Ό 0 Ό TJ T3 Ό o Ό Ό “0 0 Ό
co co 03 co 03 co 03 03 co co co co co CO co Ca) co
ο ο ο ο C3 ο Ο ο o o o o o o o O O
ο ο ο ο Ο ο Ο ο o o o o o o o O o
ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ ΙΟ Μ ΙΟ IO IO IO IO IO ro K) to
_k _k —k —k —k —k -J-k —k —k _k _k —k
_k —k —k _k *k _k —k 2i _Lk —,k «k 1 1 1 1
ο Ο Ο ο Ο ο Ο ο o o o o o o O o o
2k Α _k 2k _k _k —k _k —k
cn σι 03 03 Ο) α> 03 cn 03 cn CD 03 CD O) cn cn CD
X X X X X X X X X X X X X X X X X
οι οι Οι οι ΟΙ Οι ΟΙ οι Ol cn cn Ol cn cn cn cn Ol
οι ΟΙ Ol cn ΟΙ ΟΙ ΟΙ οι Ol cn cn cn Ol cn cn cn cn
co 03 co co 03 co οο co co ω co co co c*> Ca) co co
00 οο 00 οο 00 00 οο 00 00 oo 00 oo 00 00 00 oo 00
Γ~ Γ~ Γ- Γ“ Γ~ Γ Γ Γ~ Γ- r- r~ r~ r- Γ Γ“ Γ Γ
Ό Ό Ό Ό Τ3 Ό Ό 0 Ό Ό TJ 0 Ό “D Ό TJ TJ
ο ο ο ο ο Ο ο o o o o O o o o o o
ο ο ο ο ο Ο ο o o o o o o o o o o
Α Α Α Α Α Α Α A A A A A A -řk ÍA. A A
ΙΟ ίό ΙΟ ιό ιό ιό ιό IO ro IO IO ro 10 ro rb ro řó
οι Οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ ΟΙ οι Ol οι cn cn cn Ol cn cn cn cn
ΙΟ ιό ΙΟ ιό ιό ιό ιό IO tO IO ιό ro 10 ro rb IO IO
ΙΟ ΐό ιό ΙΟ ιό ιό ιό ro IO ιό ιό ro 10 ro rb ro ro
ΟΙ Οι tn ΟΙ Οι ΟΙ οι Ol cn Ol Ol U Ol Ol cn cn cn
’’*** —— '—
Α Α Α Α 03 ω CO A co c*> A co
ό Α ό _k 00 <1 ČO A č> ČO _k ČO
-χ -ο ίο οι Ο) Α Α A -1 cn A co 00 u co A
ο ο Ο ο ο Ο Ο o o o o p o o o o O
ό ό ο ο ό ό ό ó ó ó ó ó o ó ó ó O
οι σι σι οο σ> -4 σι O) 03 cn -4 O) -M <n 03 •o
ΙΟ Α _k _k —χ -k _k _k _k _A _k _k
ΙΟ Αι CO Α ČO Ο) <1 OJ in -*· CO OJ čn čn ČO oo Ol
Α Α co σ> CO 03 Ol co co co co 00 cn cn (O
ΙΟ CO 03 03 03 03 CO co co co co o Ca) co CO
οι 03 Οι Α Α CO A —k o co IO cn _k A
in 03 ό Α Α Ó <1 <1 ro Ol ó A O
Α σ> σ> CO Α Ό cn Ol A ~4 _k _k σ> —A· A CO
(D
M σ
o>
ό ω
oo ό
οο .Μ ο ο ο ο ο ο Α 0> 0>
ο ο ο ο ο ο
Ο Ο» Μ Α ο ο ο ο ο CO ΟΙ Μ ΟΙ ΟΙ ο ο ο ο Α σ>
to Ca> co co Ca) co co co co co ro co ro to Ca) Ca) co
00 M co ^k —A co A co co IO o co ro —λ
cn OJ ČO 00 o in ro čn co ČO A A ó óo ČO
A 00 CO OJ co 00 IO IO co co co A OJ 00 00 cn
K> -i. —λ «α _k —x K) IO M KS K)
M M •M po 09 ^1 cn co IO -o K> K) ro CO Φ
CO 00 ω 00 (O e O io io po co O
O 00 o A co co -M čo o O)
Ca) A co cn .cn cn co co A Ol co cn
£ ČO O) čn IO '_k _k čo to čn čo to co čn io
u> IO A K) α -o 00 cn IO -M cn co co čn IO co
o O o o o o _k _k _k _k _k _k _k
Lk čo čn Ča) óo čo O ČO čo ‘ v čo Čn Lk o ó ro
N) OJ OJ M co -1 Ό co 00 co IO A IO _k A to
O o O O o O O o o o o o o o o O o
ČO ŮJ <1 in óo čn in čn čn <1 P '~-J čn čn óo <1 in
co OJ _k o 00 00 00 00 A cn •o ^1 IO CO Ό
_k —k _k _k _k _k _k _X _k
ro to ro M io io čo Ča) io io io io io io io ro io
cn o —k 00 co oo A CO OJ -o cn 03 cn 00 •o IO oo
ο» <0 κ>
CO
ΙΟ οο ω
co
ΙΟ
Α
ΙΟ ο
ΙΟ ο
Η
QJ σ
C ι->
&>
ο<
<1 ο
ΓΌ
Η
OJ σ
c
Η-1
X
0) ο<
σι οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ cn οι οι ΟΙ οι σι σι σι σι σι σι Λη
σι οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ σι ΟΙ οι οι οι σι σι σι σι σι ►v UI (ti
00 ω 00 ω 00 οο οο 00 οο οο ω Ca> οο Oi
00 οο 00 00 οο ρ οο οο οο 00 00 00 00 00 Iv 1 1
Γ r1- γ- Γ* Γ- Γ~ Γ” Γ” Γ“ Γ~ ι Ι- ι Γ* I Γ* ι r_ ω Γ“
ϋ U Ό -ο Τ3 Τ3 υ 0 TJ Ό Ό -ο Ό Ό
ο ο ο ο ο ο ο ο Ο ο ο ο ο O oo O
ο ο ο ο ο ο ο ο Ο ο ο ο ο O O
4b Α Α Α Α Α Α Α Α Α Α Α Α -N. O NO 1
Ν> Ν5 Ν5 ΝΟ Ν0 ΝΟ Ν0 Ν) ΝΟ ΝΟ ΝΟ Μ NJ hO Ni tftl
σι | Οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ Οι Οι ρ Οι οι ΟΙ σι ΟΙ σι 1 1
Μ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ NJ ΝΟ ΝΟ Ni Ν0 N0 O NO t
Ni ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ Ni ΝΟ NO 1 NO σι
σι Οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ Ol Ol ΟΙ Οι οι ΟΙ σι ΟΙ σι σ>
X X X X X X X X X X X X X X
σι οι ΟΙ ΟΙ οι οι οι οι οι ΟΙ ΟΙ σι ΟΙ σι
σι οι ΟΙ οι ΟΙ οι οι οι θ’ ΟΙ ΟΙ σι ΟΙ σι
Α Α Α Α Α Α Α Α Α Α Α JL
ΝΟ ΝΟ ΝΟ Μ Ni ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ Ni Μ NO
ώ ώ ώ ώ ώ ώ ώ Č0 ώ ώ ώ ώ ώ ώ
0 Ό TJ Ό Ό Ό Ό Ο Ό Ό Ό Ό 0 0
οο ω ω ΟΟ ω CJ 00 Oi 00 00 οο 00 οο 00
ο ο ο Ο ο Ο Ο ο ο ο ο ο ο o
ο ο ο Ο ο Ο Ο ο ο ο ο ο ο o
Ν) Ν5 Ν5 Ni Ni ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ ΝΟ Ν0 ΝΟ NO
-J* γχ —X -J-X —χ —χ —χ —χ —χ _i
2b li li —X L. li li
Ο ρ ο ρ ο Ο ο ρ ο ο Ο Ο Ο o
li _i li li li li li
σ> 05 oj 05 σ> 05 σι σι 05 oj σ> σ> 05 OJ
**
ω ω OJ Oi Α 00 Α Α οο οο 4b 4b
οο Οι οι Α οι Ο to ω Li ΝΟ čo σι ρ Oi O NO
ω 00 CJ Oi Α Oi 00 οο 05 Οι όι <o CO 00
ο ο ο Ο ο Ο ο ο ο Ο ρ ρ ρ o p
ο ό ο Ο ό ό ό ό ό Ó ό ό ό ó p
Ni ω ω Α Α Α οι Α Α ΟΙ Α οο Α 4b 00
ΝΟ ΝΟ νο -X _i ΝΟ ΝΟ Μ _i _i Ni Ni
4b ώ ΟΙ 00 —* ΝΟ ΟΙ ti ω Α σ> CD 00 O ho
“* ω οι to 00 ΟΙ to οι ο Α 05 00 CD 00 4b
Α ω ω οο οο οο οο οο οο Α οο Oi οο 00 σ>
σι to <ο Α Μ oj ρ Α Ο 00 ρ 05 p OO
σι nj ΟΙ li 00 <1 Α ω Α ΝΟ 05 ίο NJ in 00 •M
οο oj Α Ni 00 ΟΙ οο Α 00 ΟΙ ΟΙ σ> A 00 4b 00
o O O o O O O o o O O o o O O O 00 >1
NJ NJ NO NO NJ NO NJ NJ NO N5 NJ NO NO NO A
00 to 00 CO CD CO oo 05 p 00 CO 00 -4 p
<o Ó 00 ói Lx NJ ó co -J 00 O A 05 ČO 00 C5
A —* NJ •M CO Ol oi CO —X 00 00 00 00 A
NO NI Ni NI NI -X NI NI «b
o wb co p CJ NJ O NI CO O CO NI O
CO Cd co A 00 00 05 O> o 00 (O cn CO in
-t - in _b NO CO cn A *NI 00 cn A A o 00
NJ bi NJ 05 NO A A ω co oi co A NJ ČO Ol co A -sl NJ 05 CO NJ CO NJ NJ 2 NJ ČO NO CO Ó 05 co ČO 05 NJ 05 -J O 05 o ČO NJ
o p O o o O O O O O O O O
co Ol Ol O O bi 00 05 <1 Ol <1 05 00 05 Ó
•Ό CO A čoo ČO Ol 05 Ol Ol CJ Ol 00 oi Ol NJ O
o O O o O o o O o O O o O O
ČO ČO ČO <1 <1 ČO Ó) 00 O čoo <1 <1 ČO <1
_x 00 co A co 00 ČO oo 05 CO oo NJ oi O
__x _i _x _i _i _i _i _i _x —X _i
A co co NJ co N5 NO A Č>0 ČO NO ó
A -.J A Ol CO 05 NJ Č0 M A NO 00 NJ 00 c> o
Π) ι—( σ ο» οο ό
e σ» co
MÍ οο νο '>
5° ro »
Μ t>
σ>
Ιο οο
co «χ
Ν)
Α
ΝΟ
Ο
Ó
ΝΟ
Ο
-ο ι—1 ο ω • »· · «
• · ·
cn ΟΙ Οι ΟΙ οι ΟΙ οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ ΟΙ οι ΟΙ ΟΙ οι ΟΙ ΟΙ
2 Οι tk 2 2 2 2 2 οι 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03 οι 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03 ΟΙ 03
Μ 1 ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ 00 00 00 οο 00 00 00 οο 00 ρ
ω C0 ώ Ó) ώ ώ Č0 Γ- Γ- Γ- Γ- Γ- Γ- Γ- Γ- Γ- Γ-
Ό 0 Ό Ό Ό “0 TJ Ό Ό Ό Ό Ό Ό Ό Ό Ό Ό
ω ω ω 03 03 οο 03 ο ο Ο ο ο ο Ο ο Ο Ο
ο ο ο Ο Ο ο Ο ο ο ο ο ο ο Ο ο Ο Ο
ο ο ο Ο Ο ο ο -tk -tk tk -tk tk tk tk -tk -tk tk
ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ t ΙΌ ΙΌ 1 ΙΌ 1 ΙΌ 1 ΙΌ ΙΌ 1 ΙΌ 1 ΙΌ ΙΌ ΙΌ
I 1 I I I I 2 σι Οι ΟΙ σι 03 ΟΙ Οι ΟΙ ΟΙ Οι
Ο ο Ο Ο _k σ Ο ο ΙΌ « ΙΌ I 1 ΙΌ 1 1 ΙΌ 1 1 ΙΌ 1 ΙΌ 1 1 ΙΌ 1 ΙΌ 1 1 ΙΌ 1 1 ΙΌ 1
* 1 1 I 1 I I IQ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ
03 03 03 03 03 σ> 03 σι ΟΙ σι ΟΙ Οι ΟΙ ΟΙ ΟΙ ΟΙ ΟΙ
X X X X X X X X X X X X X X X X X
οι ΟΙ ω οο ΟΙ οι ω 00 οι ΟΙ ω οο οι οι 03 00 οι οι 03 οο σι σι οο 00 Οι οι 03 οο σι σι •U ΙΌ I Οΐ 2 ΙΌ I σι σι ΙΌ I ΟΙ οι tk ΙΌ I οι ΟΙ tk ΙΌ Οΐ tn tk ΙΌ 1 ΟΙ οι -tk ΙΌ 1 ΟΙ οι •tk ΙΌ Οΐ ΟΙ -tk ΙΌ 1 ΟΙ ΟΙ -tk ΙΌ I
1 Γ~ 1 γ~ 1 r“· 1 Γ~ 1 ί— I Γ“ I Ι- ω ω ω ω ώ ω ω ώ ω ω
Ό ϋ “0 0 0 “0 ΤΟ “0 “0 Τ5 Ό Ό Ό Ό Ό Ό Ό
ο Ο ο ο ο ο Ο οο 00 ΟΟ 03 03 03 03 03 03 03
ο Ο ο ο ο ο Ο ο ο ο Ο Ο ο ο Ο ο ο
U Α Jk •ίκ jk ο ο ο ο ο ο ο Ο ο ο
I ΙΌ Μ Ν> ΙΌ I ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ
«χ «χ -k - X —k
ΟΙ I σι cn σι ΟΙ I σι σι 1 1 _L I 1 I _k 1 -k I
ΙΌ Μ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ Ο ρ ο Ο ο ρ Ο Ο Ο Ο
ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΓΌ ΙΌ _k \ 1 .X
ΟΙ σι σι σι ΟΙ σι ΟΙ σ> ο σ> 03 σ> 03 03 03 03 03
χ-ζ ***** ’**’** k>M*
U ω -U tk fx οο 03 tk U 03 ω 03 03 03
Ο ίο ο ’ο Ο ’ο ό CO ’ο ό CO 00 03 jk
Μ ω -Q —X σι tk ΙΌ οο 00 03 Ο) 00 —I ΟΙ CO
(D
Η σ
Η ω σ 2 I—' χ· £U
Ω<
I—1 -J σ>
ό
Ο Ο Ο ο Ο ρ Ο Ο Ο O O O O p O o p
ό Ο ο Č3 ο d Ο Ο d O O d d d d o o
00 03 ΟΙ 03 Μ 03 tk 03 -tk tk 4k oi Ol to tk to
-χ. -χ. -ο. ΙΌ ΙΌ ΙΌ _k ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ _k -X ΙΌ IQ
ΟΙ Α ’ρ Ο σι ΙΌ 00 03 ΙΌ Ó1 O K CD cn
1 -4, -tk -χ 00 •Ό 03 -tk co ΙΌ 03 03 CO -x -q
03 03 03 00 03 03 -tk -tk 03 tk 03 ω 03
03 οι —X —k 00 ~4 Ο ΙΌ o CO O tk 74 03 A 00 o
-tk Α 00 03 ο Ο 03 Ol ΙΌ CO <1 ΙΌ «k po <0 O C0
03 00 03 IQ 03 J οο ΙΌ ΙΌ CO tk 03 σι ΙΌ σι
ο .Μ ο
►tk ο ο ο dob ΟΙ (Λ Α Ο ο
Ο -X ο>
ο
03 CO 03 co 03 03 03 ΙΌ ΙΌ ΙΌ ΙΌ 03 co N) ΙΌ
03 po O —* 03 03 O O CO 00 CO O CO po
CO 03 ΙΌ 03 03 tk d 03 Ai d σι _x tn
03 σι 00 co Ol 00 03 tk 03 co co σι 03 ro
«X K> ro K3 a IQ |Q
P co co w cn Ol cn 00 <0 -M 0> O -M cn O
co d co C0 tk čn 0> 0> *4 tn Č0
co co <0 K3 -M ~kl A tn σ> 0> 00 -X co
ΟΒ
-*ι α>
«ο
CJl tk 00 Ol ΙΌ 00 03 tk Ol p čo -U pí Ol Ol 03 00 03 ΙΌ ΙΌ tk 03 03 ΙΌ 03 CO IQ cn C*J ΙΌ '2 ΙΌ A co co 00 co ΙΌ 03 00 ΙΌ ¢30 p ΙΌ 03 03
o O O o o O O O o ρ o o O O ρ
co CO CO 00 čo ČO tk 03 O tn A A Č33 Ól
co 00 CO co 03 -x ΙΌ <33 co χ. M cn CO 03 οο
o o O p o O O C3 O o o O O o
03 03 00 00 03 03 o ά> A ČO 00 ο o ó> 00 bo čo
03 00 ΙΌ co 03 CO co ΙΌ 03 03 σ> ČO oo 03 co
_X -k -k _X _X —k _X —λ —k «X _k _k
ΙΌ 03 —x IQ ΙΌ ΙΌ ΙΌ 7-x 03 ΙΌ ώ ΙΌ 03 CO ώ ω tk
00 ΙΌ 03 00 00 00 CO 03 CO 03 cn CO 03 co 00 03 03
οο ο
·>
co
ΙΌ
ΙΌ ο
ό
ΙΌ ο
• · · ·φ ·
105 *· *· »♦ φφ * Φ · ♦ 9 9 · s i • · · · · Φ Φ * » · ♦ «·ΦΦ··Φ? Φ3 ► · · · ť » Φ * « ► φγ »ř» φφ ···< φφ r·
Příklad 16: Exprese desaturáz M. alpina v sóje
Desaturázy M. alpina se mohou použít při řízení produkce GLA a jiných PUFA v sóje za použití následujících expresívních konstrukcí. Existují dva způsoby, jak se může exogenní DNA začlenit do genomu sóji. Je to infekce mikroorganizmem Agrobacterium a vstřelování částic. Transformace pomocí vstřelování částic se popisuje v patentu US č. 5,503,998. Rostliny se mohou vybrat za použití markéru rezistence na glyfosfosát (4,971,908). Transformace sóji za použití mikroorganizmu Agrobacterium je dobře známa v oboru.
Za účelem specifické exprese v semenech se cDNA umístila tak, aby ji řídila 5'regulační oblast genu zásobního proteinu konglycininu alfa-typ beta Glycin max. Specifická oblast, kterou lze použít, tvoří nukleotidy 78-92 gi 169928 (Doyle, J.J., Schuler, M.A., Godette, W.D., Zenger, V., Beachy, R. N., and Slightom. J.L., 1986 J. Biol. Chem. 261 (20), 9228-9238).
Použitelná 3'regulační oblast pochází z genu ribolóza-1,5bifosfátkarboxyláza hrachu/malá podjednotka oxygenázy (rbcS). Použitelné specifické sekvence jsou nukleotidy 1 až 645 gi 169145 (Hunt, A.G. 1988 DNA 7: 329-336).
Protože semena sóji obsahují více 18:2 a endogenní aktivity Á12-desaturázy než účinek A12-desaturázy Mortierella při dosažení optimálního množství GLA se může testovat následujícím způsobem. Konstrukce obsahující cDNA Δβ-desaturázy se může použít, aby se zjistilo, zda Δ6'9 18:2 se produkuje spolu s GLA. Konstrukce obsahující A12-desaturázu se může použít za účelem zjištění, zda se v sóje může zvýšit množství 18:2. Konstrukce obsahující Δ6- a A12-desaturázy se může použít při produkci optimálního množství GLA. V jiném případě rostliny obsahující každou z desaturáz se mohou křížit, jestliže je nezbytné kombinovat mozna více rostlina Brassica, geny.
I
106 • · · · · ·· ···· · · ·*
Podobnou konstrukci lze připravit tak, aby se exprimovala samotná A5-desaturáza nebo v kombinaci s Δ12- a/nebo s Δ6desaturázami.
Příklad 17: Sekvence genu lidské desaturázy
Na základě homologíe mezi sekvencemi lidské cDNA a sekvencemi genu desaturázy Mortierella alpina se izolovala lidské desaturázy potencionálně sekvence genu v biosyntéze polynenasycených mastných kyselin zahrnutá s dlouhým řetězcem. Našly se tři konzervované histidinové boxy, o kterých se ví, že jsou konzervativní mezi desaturázami vázanými na membrány. Stejně jako u jiných desaturáz výzaných na membránu konečný motiv histidinového boxu HXXHH je QXXHH. Aminokyselinová sekvence putativních lidských desaturáz vykazuje homologii s Δ5, Δ6 a A12-desaturázami.
cDNA sekvence Δ5- a A6-desaturáz se použily pro průzkum databáze LifeSeq instituce Incyte Pharmaceuticals, lne., Palo Alto, California 94304. Sekvence A5-desaturázy se rozdělila do fragmentů 1) aminokyselina č. 1 až 150, 2) aminokyselina č. 151 až 300 a 3) aminokyselina č. 301 až 457. Tyto polypeptidové fragmenty se zkoumaly proti databázi za použití algoritmu „rblastn. Tento algoritmus obsahuje dotaz na sekvenci proteinu pro nukleotidovou sekvenční detabázi dynamicky překládanou do všech šesti čtecích rámců (obou řetězců).
Polypeptidové fragmenty 2 a 3 Δ5- a Δβ-desaturáz organizmu M. alpina vykazuje homologii se sekvencemi CloneID, jak je uvedeno v tabulce č. 18. CloneID reprezentuje jednotlivé sekvence z databáze Incyte LifeSeq. Po té co se zveřejnily výsledky „tblastn informace klonech se hledaly za podmínek přísnost >/= 50 a skóre produktu je </=100 při různých číslech CloneID. „Cloně Information Results uvádějí informace zahrnující ClusterID, CloneID, Library, HitID, popis Hit.
• «
107
Číslo ClusterID ukazuje informace o všech klonech, které patří do uvedeného ClusterID. Příkaz zařazení zařazuje všechny CloneID, které obsahují ClusterID. V případě zařazení GCG (Genetics Computer Group,
University Wisconsin Biotechnology Center, Madison, Wisconsin 53704) se používají následující nastavení:
0,8
Velikost slova Minimální překryv Přísnost
Minimum shody Maximum mezer Významnost mezer Významnost délky
Výsledky uspořádání GCG vykazují kontig vytvořený na základě sekvenčních informací v CloneID. „Kontig je uspořádání sekvencí DNA založené na oblastech homologie mezi těmito sekvencemi. Na základě seřazených sekvencí do kontigu se vytvořila nová sekvence. Identifikoval se kontig obsahující CloneID a nejednoznačné místa sekvence se editovala na základě seřazení CloneID (SEQ ID NO: 31 až SEQ ID NO: 35) za vzniku nejlepší možné sekvence. Postup se opakoval v případě všech šesti CloneID uvedených v tabulce č. 18. Tímto způsobem vzniká pět jedinečných kontigů. Editované sekvence 5 kontigu se přenesly do softwarového programu Sequencher (Gene Codes Corporation, Ann Arbor, Michigan 48 105). Sestavily se konsensus sekvence. Kontig 2511785 se překrývá s kontigem 3506132 a tento nový kontig se nazývá 2535 (SEQ ID NO: 37) . Kontigy z programu Sequencher se zkopírovaly v programu Sequence Analysis software package GCG.
Každý kontig se přeložil do všech šesti čtecích rámců v proteinových sekvencích. Sekvence Δ5(ΜΑ29) a Δ6(ΜΑ524) M. alpína se porovnaly s každým přeloženým kontigem za použití průzkumu FastA (průzkum podobnosti mezi dotazovanou sekvencí a • *
108 (nukleová kyselina nebo Homologie mezi těmito skupinou sekvencí stejného typu protein) podle Pearson a Lipman) sekvencemi naznačuje otevřené čtecí rámce každého kontigu. Homologie mezí Δ5 a Δβ M. alpina s kontigy 2535 a 3854933 se použily k vytvoření konečného kontigu nazvaného 25358a. Obrázek č. 9 je párování FastA konečného kontigu 253538a a MA29 a obrázek 10 je párování FastA konečného kontigu ,25358a a MA524. Sekvence DNA různých kontigu jsou přítomny v sekvencích SEQ ID NO: 31 až SEQ ID NO: 37. Různé peptidové sekvence jsou zobrazeny v SEQ ID NO:38 až SEQ ID NO: 44.
Ačkoli otevřený čtecí rámec se vytvořil spojováním dvou kontígů, kontig 2535 ukazuje, že zde existuje na začátku kontigu jediná sekvence, která se s kontigem 3854933 nepáruje. Proto je možné, že tyto kontigy vznikly z nezávislé desaturázy jako lidské geny.
Kontig 253538a obsahuje otevřený čtecí rámec kódující 432 aminokyselin. Začíná Gin (CAG) a končí stop kodonem (TGA). Kontig 253538 se spojuje se sekvencemi Δ5 a Δ6 M. alpina, což naznačuje, že jde buď o libovolnou desaturázu nebo o jiné známé desaturázy, které vzájemně sdílí homologii. jednotlivé kontigy uvedené v tabulce 18 stejně intermediální kontig 2535 a konečný kontig 253538a se mohou využívat k izolaci celých genů lidských desaturáz.
Tyto jako
Použití lidských desaturáz
Tyto lidské sekvence se mohou exprimovat v kvasinkách a v rostlinách za využití postupů popsaných v příkladech. V případě exprese v savčích buňkách a v transgenních zvířatech tyto geny mohou poskytovat odchylku kodonu. Tyto lidské sekvence se mohou také použít pro identifikaci příbuzných sekvencí desaturáz.
Tabulka č. 18
Sekce desaturáz CloneID z databáze Klíčové slovo
• · • ·
109 ······· ·· ···· ·· · ·
LifeSeq
151-300 Δ5 3808675 Desaturáza mastné kyseliny
301-446 Δ5 354535 Δ6
151-300 Δ6 3448789 Δ6
151-300 Δ6 1362863 Δ6
151-300 Δ6 2394760 Δ6
301-457 Δ6 3350263 Δ6
Příklad 18: Identifikace homologů Δ5- a Δβ-desaturáz
Sekvence nukleové kyseliny, která kóduje putativní Δ5desaturázu se identifikovala prostřednictvím průzkumu TBLASTIN exprimované sekvence tag databází prostřednictvím NCBI, kde se jako dotaz použijí aminokyseliny 100 až 446 klonu Ma29. Aby se zabránilo vzniku homologii založených na části cytochromu b5 na N-konci desaturázy, použila se zkrácená část sekvence Ma29. Dedukovaná aminokyselinová sekvence odvozená z Dictyostelium discoídeum (číslo uložení #C25549) ukazuje velmi podstatnou homologii s Ma29. Také vykazuje menší, ale stále podstatnou homologii s Ma524. Sekvence DNA se prezentuje jako SEQ ID NO: 45. Aminokyselinová sekvence se prezentovala jako SEQ ID NO: 4 6.
Příklad 19: Identifikace Δ5- a Δβ-homologů organizmu M. alpina v jiných organizmech produkujících PUFA.
Aby se našly desaturázy, které se podílejí na produkci PUFA, z celkové RNA izolované z Phaeodactylum tricornutum se zkonstruovala se cDNA knihovna. cDNA knihovna založená na plazmidu se zkonstruovala v pSPORTl (GIBCO-BRL) podle instrukci výrobce za použití běžně dostupné sady (GIBCO-BRL). Náhodné klony cDNA e sekvenovaly a sekvence nukleové kyseliny, které kódují putativní Δ5- nebo Δβ-desaturázu se identifikovaly průzkumem BLAST databází a porovnáním sekvencí • · • ·
110
Ma29 a Ma524. Z knihovny Phaeodactylum se identifikoval jeden klón s homologii k Ma29 a Ma524, nazval se 144-011-B12. Sekvence DNA je přítomna jako SEQ ID NO:47. Aminokyselinová sekvence je přítomna jako SEQ ID NO: 48.
Příklad 20: Identifikace Δ5- a Δβ-homologů organizmu M. alpina v jiných organizmech produkujících PUFA.
Aby se našly desaturázy, které se podílejí na produkci PUFA, z celkové RNA izolované z Schizochytrium sp. se zkonstruovala se cDNA knihovna. cDNA knihovna založená na plazmidu se zkonstruovala v pSPORTl (GIBCO-BRL) podle instrukcí výrobce za použití běžně dostupné sady (GIBCO-BRL). Náhodné klony cDNA e sekvenovaly a sekvence nukleové kyseliny, které kódují putativní Δ5- nebo Δβ-desaturázu se identifikovaly průzkumem BLAST databázi a porovnáním sekvencí Ma29 a Ma524.
Z knihovny Schizochytrium se identifikoval jeden klón s homologii k Ma29 a Ma524, nazval se 81-23-C7. Tento klón obsahuje inzert o velikosti přibližně 1 kb. Z každého konce klonu se získala částečná sekvence za použití univerzálních forward a reverzních sekvenačních primerů. Sekvence DNA z forward primerů je přítomna jako SEQ ID NO:49. Peptidové sekvence je přítomna jako SEQ ID NO: 50. Sekvence DNA z reverzního primerů je přítomna jako SEQ ID NO: 51.. Aminokyselinová sekvence z reverzního primerů je přítomna jako SEQ ID NO: 52.
Příklad 21: Výživné přípravky
PUFA, které se popisují v předchozích příkladech, se mohou použít v různých potravních doplňcích, v kojeneckých výživách, výživných náhradách atd..
I. Kojenecké výživy
A. Sojový výživa Isomil® obsahující železo ·· ···· ·· ·· ·· ·· ··· · · · · · * · · ni .· ···..: : .: :: :
• ···· ···· ······· · · · 9 9 · · 9 9 9
Použití: Používá se jako nápoj pro kojence, děti a dospělé s alergií nebo citlivostí na kravské mléko. Potrava pro pacienty s poruchami, kvůli, kterým nelze podávat laktózu: nedostatečnost laktázy, netolerance k laktóze a galaktosemie. Rysy:
• Obsahuje sojový proteinový izolát, aby se předešlo symptomům alergie nebo citlivosti na protein kravského mléka.
• Výživa neobsahuje laktózu, čímž se předejde průjmu spojeným s laktózou.
• Nízká osmolalita (240 mOsm/kg vody) redukuje nebezpečí osmotického průjmu.
• Duální sacharidy (z kukuřice a sacharóza), které se používají pro zvýšení absorpce sacharidů a omezení nebezpečí překročení absorpční kapacity poškozených střev.
• 1,8 mg železa (ve formě síranu železnatého) na 100 kalorií pomáhá předcházet nedostatečnosti železa.
• Obsahuje doporučenou dávku vitaminů a minerálů.
• Obsahuje rostlinné oleje, které poskytují doporučené množství podstatných mastných kyselin.
• Výživa má mléčně bílou barvu, konzistenci podobnou mléku a příjemné aroma.
Složky: (Pareve, ) 85 % vody, 4,9 % kukuřičného sirupu, 2,6 % cukru (sacharóza), 2,1 % sojový proteinový izolát, 1,4 % kokosový olej, 0,15 % citrát vápenatý, 0,11 % tribazický fosforečnan vápenatý, citrát draselný, monobazický fosforečnan draselný, chlorid draselný, mono- a diglyceridy, sojový lecitin, karagen, kyselina askorbová, L-methionin, chlorid hořečnatý, dibazický fosforečnan draselný, chlorid sodný, cholinchlorid, taurine, síran železitý, m-inositol, alfatokoferylacetát, sulfát zinečnatý, L-karnitin, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavin, pyridoxinhydrochlorid, «
0 0 0
0 0 0
0 0 0
112 kyselina folová, jodid draselný, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
B. Sojová výživa Isomyl® DF, která se aplikuje v případě průjmu
Použití: Vhodná pro krátkodobou aplikaci v případě průjmů u kojenců a batolat.
Rysy:
• První kojenecká výživa, která obsahuje přidanou vlákninu ze sóji a která se aplikuje specificky během průjmů.
• Na základě klinické studie se prokázalo, že redukuje trvání kašovité, vodnaté stolice během středně těžkých a těžkých stavů průjmu u kojenců.
• Uspokojuje nutriční potřeby kojenců.
• Sojový proteinový izolát s přidaným L-methioninem uspokojuje nebo překračuje požadavky kojenců na všechny podstatné aminokyseliny.
• Přípravek neobsahuje laktózu, čímž se předchází průjmům spojeným s laktózou.
• Nízká osmolalita (240 mOsm/kg vody) redukuje nebezpečí osmotického průjmu.
• Duální sacharidy (kukuřičný sirup a sacharóza), které se používají pro zvýšení absorpce sacharidů a omezení nebezpečí překročení absorpční kapacity poškozených střev.
• Splňuje nebo překračuje množství vitaminů a minerálů doporučených institucí Committee on Nutrition of the American Academy of Pediatrics.
• 1,8 mg železa (ve formě síranu železnatého) na 100 kalorií pomáhá předcházet nedostatečnosti železa.
• Obsahuje rostlinné oleje, které poskytují doporučené množství podstatných mastných kyselin.
Složky: (Pareve, ) 86 % vody, 4,8 % kukuřičného sirupu, 2,5 % cukru (sacharóza), 2,0 % sojový proteinový izolát, 2,1 % ·
113 sojového oleje, 1,4 % kokosový olej, 0,77 % sojové vlákniny,
0,12 % vápenatý, draselný, lecitin, citrát vápenatý, 0,11
0, 10 citrát draselný, chlorid draselný, monotribazický fosforečnan monobazický fosforečnan a diglyceridy, sojový karagen, kyselina askorbová, L-methionin, chlorid horečnatý, dibazický fosforečnan draselný, chlorid sodný, cholinchlorid, taurine, síran železitý, m-inositol, alfatokof erylacetát , síran zinečnatý, L-karnitin, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavin, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, jodid draselný, fylochinon, biotin, selenít sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
C. Sojová výživa Isomil® SF se železem bez sacharózy
Použití: Jako nápoj pro kojence, dětí a dospělé s alergií nebo citlivostí na kravské mléko. Potrava pro pacienty s poruchami, kvůli, kterým nelze podávat laktózu: nedostatečnost laktázy, netolerance k laktóze a sacharózu.
Rysy:
• Obsahuje sojový proteinový izolát, aby se předešlo symptomům alergie nebo citlivosti na protein kravského mléka.
• Výživa neobsahuje laktózu, čímž se předejde průjmu spojeným s laktózou (zdroj sacharidů je Polycose® Glucose Polymers).
• Neobsahuje sacharózu, čímž je vhodná pro pacienty, kteří netolerují sacharózu.
• Nízká osmolaiita (180 mOsm/kg vody) redukuje nebezpečí osmotického průjmu.
• 1,8 mg železa (ve formě síranu železnatého) na 100 kalorií pomáhá předcházet nedostatečnosti železa.
• Obsahuje doporučenou dávku vitaminů a minerálů.
• Obsahuje rostlinné oleje, které poskytují doporučené množství podstatných mastných kyselin.
114 • Výživa má mléčně bílou barvu, konzistenci podobnou mléku a příjemné aroma.
Složky: (Pareve) 75 % vody, 11,8 % hydrolyzovaného kukuřičného škrobu, 4,1 % sojového oleje, 4,1 % sojový proteinový izolát, 2,8 % kokosový olej, 1,0 % modifikovaného kukuřičného škrobu,
0,38 tribazický fosforečnan vápenatý, 0,17 citrát draselný, 0,13 % chlorid draselný, mono- a diglyceridy, sojový lecitin, karagen, kyselina askorbová, L-methionin, chlorid hořečnatý, uhličitan vápenatý, chlorid sodný, cholinchlorid, taurine, síran železitý, m-inositol, alfa-tokoferylacetát, sulfát zinečnatý, L-karnitin, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavin, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, síran hořečnatý, jodid draselný, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
D. Sojová výživa Isomyl®20 se železem, (pro přímou konzumaci) 20 kalorií na 0,0284 1
Použití: v případě, že je nutná sojová výživa
Složky: (Pareve, ) 85 % vody, 4,9 % kukuřičného sirupu, 2,6 % cukru (sacharóza), proteinový izolát, vápenatý, 0,11 %
2,1 % sojového oleje, 1,9 % sojový
1,4 % kokosový- olej, 0,15 % citrát tribazický fosforečnan vápenatý, citrát draselný, monobazický fosforečnan draselný, chlorid draselný, mono- a diglyceridy, sojový lecitin, karagen, kyselina askorbová, L-methionin, chlorid hořečnatý, dibazický fosforečnan draselný, chlorid sodný, cholinchlorid, taurine, síran železitý, m-inositol, alfa-tokoferylacetát, síran zinečnatý, L-karnitin, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavin, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, síran hořečnatý, jodid draselný, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
115 •» ···« ♦ * ·· ·· * · • · ' ···· · ft * · • · · » · · · ·»·· • · · · ·*»·
E. Kojenecká výživa Similac®
Použití: v případě, že je potřeba umělá kojenecká výživa:
jestliže je nutné přerušit krmení mateřským mlékem před
dosažením jednoho roku dítěte nebo jestliže je nutné doplnit kojení. Může se použít jako krmení, jestliže není možné krmení mateřským mlékem.
Rysy:
• Obsahuje protein vhodné kvality a množství zaručující dobrý růst. Protein je denaturován teplem, což redukuje nebezpečí krvácení v konečníku spojené s podáváním mléka.
• Obsahuje tuk ze směsi rostlinných olejů (dvakrát homogenizovaných), poskytuje kyselinu linolenovou, která je jednoduše absorbovatelná.
• Obsahuje sacharidy, jako je laktóza v poměru, který je podobný jako u lidského mléka.
• Nízký obsah renálních rozpuštěných látek, což minimalizuje stres vyvíjejících se orgánů.
• Existuje se ve formě prášku, koncentrovaného roztoku a ve formě vhodné pro přímé použití.
Složky: ( -D) voda, netučné mléko, laktóza, sojový olej, kokosový olej, mono- a diglyceridy, sojový lecitin, karagen, kyselina askorbová, cholinchlorid, tauríne, m-inosítol, alfatokoferylacetát, síran zinečnatý, niacinamid, síran železnatý, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitamínu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavín, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, síran hořečnatý, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
F. Kojenecká výživa pro předčasně narozené děti se železem Simílac®NeoCare
Použití: Vhodné pro předčasně narozené kojence, které vyžadují po propuštění z nemocnice speciální výživu. Similac NeoCare je nutričně kompletní výživa vyvinutá pro předčasně narozené
116 φφ φφφφ φφ φφ • · Λ φ · φ φ φφ· φ · φφ • φ * »· φφφφ kojence, která obsahuje další kalorie, protein, vitaminy a minerály potřebné pro vyvolání růstu a podporu vývoje.
Rysy:
• Redukuje potřebu kalorických a vitaminových doplňků. Ve srovnání s popsanou standardní výživou (20 kalorií na 0,0284 1) obsahuje více kalorií (22 kalorií na 0,0284 1).
• Obsahuje vysoce absorbovatelnou směs tuků s triglyceridy se středně dlouhými řetězci (MCT olej), které pomáhají uspokojit speciální trávicí potřeby předčasně narozených kojenců.
• Na 100 kalorií obsahuje vyšší množství proteinu, vitaminů a minerálů, aby se zvýšila počáteční dávka nutrientů podávaná v nemocnici.
• Obsahuje více vápníku a fosforu, což umožňuje mineralizaci kostí.
Složky: -D pevné částice kukuřičného sirupu, netučné mléko, laktóza, syrovátkový proteinový koncentrát, sojový olej, slunečnicový olej, frakcionovaný kokosový olej (triglyceridy se středně dlouhými řetězci), citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, uhličitan vápenatý, kyselina askorbová, chlorid hořečnatý, chlorid draselný, chlorid sodný, taurine, síran železitý, m-inositol, alfa-tokoferylacetát, síran zinečnatý, L-karnitin, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, riboflavin, beta-karoten, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, síran hořečnatý, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
G. Lidské mléko obohacené nízkým obsahem železa Similac Natural Care ve formě pro přímé použití, 24 kal. na 0,0284 1
Použití: Výrobek je určen pro smíchání s lidským mlékem nebo pro aplikaci, jako alternativa lidského mléka u kojenců s nízkou porodní hmotností.
• · • · · · • · ·
117
Složky: : -D voda, netučné mléko, hydrolyzovaný kukuřičný škrob, laktóza, syrovátkový proteinový koncentrát, sojový olej, slunečnicový olej, frakcionovaný kokosový olej (triglyceridy se středně dlouhými řetězci), kokosový olej, citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, uhličitan vápenatý,mono- a diglyceridy, sojový lecitin,karagen, cholin chlorid, taurine, m-inositol, alfa-tokoferylacetát, síran zinečnatý, L-karnitin, chlorid draselný, pantotenát vápenatý, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, kyselina folová, síran hořečnatý, fylochinon, biotin, selenit sodný, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Do těchto výživ je možné přidat PUFA podle vynálezu nebo je možné jimi nahradit některé složky uvedených výživ.
II. Výživné přípravky
A. ENSURE®
Použití: ENSURE je tekutá výživa obsahující malé množství zbytků připravená primárně jako orální nutriční doplněk, který se požívá s jídlem nebo mezi jednotlivými jídly nebo ve vhodném množství jako náhražka jídla. ENSURE neobsahuje laktózu a lepek a je vhodný pro použití při upravených dietách, jako jsou diety s nízkým obsahem cholesterolu. Ačkoli se primárně podává jako orální doplněk, může se aplikovat hadičkou.
Stav pacienta:
• Pacienti s upravenou dietou • Pacienti vysokého stáří se specifickými požadavky na potravu • Pacienti, kteří nedobrovolně ztrácí hmotnost • Pacienti po nemoci nebo po chirurgickém zákroku • Pacienti, kteří potřebují dietu s malým obsahem zbytků.
• · • · · · • *
118
Složky: -D voda, cukr (sacharóza), maltodextrin (kukuřičný), kaseinát vápenatý a sodný, slunečnicový olej, sojový proteinový izolát, sojový olej, kanolový olej, draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, citrát citrát sodný, umělé dibazický fosforečnan hořečnatý, chlorid hořečnatý, přísady, chlorid sodný, sojový lecitin, cholinchlorid, kyselina askorbová, karagen, síran zinečnatý, síran železnatý, alfa-tokoferylacetát, želatinová guma, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran hořečnatý, síran mědňatý, palmitat vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, kyselina folová, molybdát sodný, chlorid chrómu, biotin, jodid draselný, selenát sodný.
B. ENSURE®BARS
Použití: ENSURE BARS je celková, vyvážená výživa, která se používá jako doplněk mezi jednotlivými jídly nebo se podává s jídlem. Je lahodnou, nutričně bohatou alternativou jiných zákusků. ENSURE BAR obsahuje méně než 1 g laktózy v jedné tyčince (typ Chocolate Fudge Browníe neobsahuje lepek, typ Honey Graham Crunch obsahuje lepek).
Stav pacienta:
• Pacienti, kteří potřebují více kalorií, proteinů, vitaminů a minerálů.
• Zvláště vhodné pro lidi, kteří nepřijímají dostatek kalorií a nutrientů.
• Vhodné pro lidi, kteří jsou schopni žvýkat a polykat • Není vhodné pro lidi alergické na burské ořechy a jakoukoliv alergií na ořechy.
Složky:
Typ Honey Graham Crunch obsahuje kukuřičný sirup s vysokým obsahem fruktózy, sojový proteinový izolát, hnědý cukr, maltodextrin (kukuřičný), křupavá rýže (drcená rýže, cukr (sacharóza), sůl (chlorid sodný) a slad), ovesné otruby, • ·
119 částečně hydrogenované olej ze semen bavlníku a sojový olej, sojové polysacharidy, glycerin, syrovátkový proteinový koncentrát, polydextróza, fruktóza, kaseinát vápenatý, kakaový prášek, umělé příchutě, kanolový olej, slunečnicový olej, netučné sušené mléko, syrovátkový prášek, sojový lecitin, kukuřičný olej. Tyto tyčinky se vyrábějí v továrnách, kde se zpracovávají ořechy.
Vitamíny a minerály:
Tribazický fosforečnan vápenatý, dibazický fosforečnan draselný, oxid hořečnatý, sůl (chlorid sodný) , chlorid draselný, kyselina askorbová, fosforečnan železitý, alfatokoferylacetát, niacinamid, oxid zinečnatý, pantotenát vápenatý, glukonát mědňatý, síran manganatý, riboflavin, betakaroten, pyridoxinhydrochlorid, dusičan thiaminu, kyselina folová, biotin, chlorid chrómu, jodid draselný, selenát sodný, molybdenan sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Typ Honey Graham Crunch : Zdroj proteinů je směs sojového proteinového izolátu a mléčných proteinů.
Sojový proteinový izolát 74 %
Mléčné proteiny 26 %
Tuk:
Typ Honey Graham Crunch : Zdroj tuku je směs částečně hydrogenovaného oleje sóji a semen bavlníku, slunečnicového a kukuřičného oleje a sojového lecitinu.
Částečně hydrogenovaný olej sóji a semen bavlníku76 % slunečnicový olej 8 % olej kanoly 8 % kukuřičný olej 4 % sojový lecitin 4 % • · • ·
120
Sacharidy:
Typ Honey Graham Crunch : Zdroj sacharidů je kombinace kukuřičného sirupu s vysokým obsahem fruktózy, hnědý cukr, maltodextrin, med, křupavá rýže, glycerin, sojové polysacharidy a ovesné otruby.
kukuřičný sirup s vysokým obsahem fruktózy 24 % hnědý cukr 21 % maltodextrin 12 % med 11 % křupavá rýže 9 % glycerin 9 % sojový polysacharid 7 % ovesné otruby 7 %
C. ENSURE® HIGH PROTEIN
Použití: ENSURE® HIGH PROTEIN je koncentrovaná výživa v kapalném stavu s vysokým obsahem proteinů určená pro lidi, kteří vyžadují nadbytečný přísun kalorií, proteinu, vitaminů a minerálů. Může se aplikovat orálně, jako nutriční doplněk mezi jednotlivými jídly nebo se podává s jídlem. V určitém množství může nahradit jídlo. ENSURE® HIGH PROTEIN neobsahuje laktózu ani lepek a je vhodný pro aplikaci lidem po operaci, po zlomeninách krčku a pacientům, kde je nebezpečí vředů.
Stav pacienta:
• Přípravek je vhodný pro pacienta, který potřebuje větší přísun kalorií, proteinu, vitamínů, minerálů, jako jsou pacienti po chirurgickém zákroku nebo fraktuře krčku, pacienti trpícími tlakovými vředy a pacienti, kde se aplikuje dieta s nízkým obsahem cholesterolu.
Rysy:
• Nízký obsah nasycených tuků • Obsahuje 6 g celkového tuku a méně než 5 mg cholesterolu na jedno balení
9
121 • Bohatá a jemná chuť • Skvělý zdroj proteinů, vápníku a jiných podstatných vitamínů a minerálů • Vhodné při dietě s nízkým obsahem cholesterolu • Neobsahuje laktózu, snadno se tráví.
Složky:
Typ Vanilla Supreme: - -D voda, cukr (sacharóza), maltodextrin (kukuřičný), kaseinát vápenatý a sodný, slunečnicový olej, sojový proteinový izolát, sojový olej, kanolový olej, citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, citrát sodný, chlorid hořečnatý, dibazický fosforečnan hořečnatý, umělé přísady, chlorid sodný, sojový lecitin, cholinchlorid, kyselina askorbová, karagen, síran zinečnatý, síran železnatý, alfa-tokoferylacetát, želatinová guma, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, palmitat vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, kyselina folová, molybdát sodný, chlorid chrómu, biotin, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Zdroj proteinů je směs proteinů: kasein a sója. Kaseinát sodný a vápenatý Sojový proteinový izolát dvou vysoce biologicky hodnotných
Tuk:
Zdrojem tuku je směs tří olejů: slunečnicový olej, olej kanoly a sojový olej.
Slunečnicový olej 40 %
Olej kanoly 30 %
Sojový olej 30 %
122
Množství tuku v přípravku ENSURE® HIGH PROTEIN splňuje požadavky American Heart Association (AHA). 6 gramů tuku v přípravku ENSURE® HIGH PROTEIN reprezentuje 24 % celkového množství kalorií, přičemž 2,6 % tuku pochází z nasycených mastných kyselin a 7,9 % je z poly-nenasycených mastných kyselin. Tyto hodnoty splňují požadavky AHA, což znamená méně jak 30 % kalorií pochází z tuku, méně než 10 % kalorií pochází ze saturovaných mastných kyselin a méně než 10 % kalorií pochází z polynenasycených mastných kyselin.
Sacharidy:
Přípravek ENSURE® HIGH PROTEIN obsahuje kombinaci maltodextrinu a sacharózy. Střední sladkost a různé příchutě (vanilková, čokoládová, divokých bobulovin a banánu) plus VARI-FLAVORSO® Flavor Pacs v ořechu pekan, višně, jahody, citrón a pomeranč, pomáhá předcházet nepříznivé chuti.
Vanilková a jiné nečokoládové příchutě obsahují:
Sacharóza 60 %
Maltodextrin 40 %
Čokoládová příchuť obsahuje:
Sacharóza 70 %
Maltodextrin 30 %
D. ENSURE®LIGHT
Použití: Přípravek ENSURE LIGHT je výživa v kapalné formě obsahující malé množství tuků. Používá se jako orální nutriční doplněk podávaný mezi jednotlivými jídly nebo s jídly. Přípravek ENSURE LIGHT neobsahuje laktózu a lepek a je vhodný pro použití při upravené dietě, která zahrnuje diety s nízkým obsahem cholesterolu.
Stav pacientů:
• · • · • Je vhodný pro pacienty s normální hmotností a pacienty s nadváhou, které potřebují živiny navíc. Podává se ve formě doplňku, který obsahuje o 50 % méně tuku a o 20 % méně kalorií, než obsahuje přípravek ENSURE.
• Pro zdravé dospělé jedince, kteří se nestravují správným způsobem a potřebují výživu navíc.
Rysy:
• Obsahuje malé množství tuků a nasycených tuků.
• Obsahuje 3 g celkového tuku a méně než 5 mg cholesterolu • Přípravek má bohatou jemnou chuť • Je to skvělý zdroj vápníku a jiných podstatných vitamínů a minerálů • Přípravek je vhodný pro dietu s nízkým obsahem cholesterolu • Přípravek neobsahuje laktózu a snadno se tráví.
Složení:
Typ French Vanilla: - -D voda, cukr (sacharóza), maltodextrin (kukuřičný), kaseinát vápenatý a sodný, slunečnicový olej, sojový proteinový izolát, sojový olej, kanolový olej, chlorid hořečnatý, citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, citrát sodný, chlorid hořečnatý, dibazický fosforečnan hořečnatý, přirozené a umělé přísady, celulóza, gel, cholinchlorid, sojový lecitin, chlorid sodný, kyselina askorbová, karagen, celulózová guma, síran železnatý, alfatokoferylacetát,síran zinečnatý, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, palmitat vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, kyselina folová, molybdát sodný, chlorid chrómu, biotin, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
• · • ·
124
Zdrojem proteinu Kaseinát vápenatý je kaseinát vápenatý.
100 %
Tuk:
Zdrojem proteinu je směs dvou olejů: slunečnicového oleje a oleje kanoly.
Slunečnicový olej 70 %
Olej kanoly 30 %
Množství tuku v přípravku ENSURE LIGHT splňuje požadavky American Heart Association (AHA). 3 gramy tuku v přípravku
ENSURE LIGHT reprezentuje 13,5 % celkového množství kalorií, přičemž 1,4 % tuku je z nasycených mastných kyselina 2,6 % z poly-nenasycených mastných kyselin. Tyto hodnoty jsou v souladu s požadavky AHA, kdy méně než 30 % kalorií je z tuku a méně než 10 % kalorií pochází z nasycených mastných kyselin a méně než 10 % celkového množství kalorií pochází z polynenasycených mastných kyselin.
Sacharidy:
Přípravek ENSURE LIGHT obsahuje kombinace maltodextrinu a sacharózy. Čokoládová příchuť obsahuje také kukuřičný sirup. Střední sladkost a různé příchutě (vanilková, čokoládová, jahodová) plus VARI-FLAVORSO® Flavor Pacs v ořechu pekan, višně, jahody, citrón a pomeranč, pomáhá předcházet nepříznivé chuti.
Vanilková a jiné nečokoládové příchutě obsahují: Sacharóza 51 %
Maltodextrin 49 %
Čokoládová příchuť obsahuje: Sacharóza Kukuřičný sirup Maltodextrin % 26,5 % 26,5 % • · • ·
125
Vitamíny a minerály
Jedno balení (0,2272 1) ENSURE LIGHT poskytuje alespoň 25 %
RDI pro 24 klíčových vitamínů a minerálů.
Kofein:
Čokoládová příchuť obsahuje 2,1 mg kofeinu na 0,2272 1.
E. ENSURE PLUS®
Použití: přípravek ENSURE PLUS je vysokokalorická výživa v kapalné formě s nízkým obsahem zbytků. Používá se tam, kde je třeba dodat navíc kalorie a nutrienty, ale normální koncentraci proteinů. Přípravek slouží primárně jako orální nutriční doplněk, který se použije mezi jednotlivým jídlem nebo v přijatelném množství jako náhražka jídla. Přípravek ENSURE PLUS neobsahuje laktózu ani lepek. Ačkoli se přípravek primárně aplikuje orálně, může se zavádět i hadičkou.
Stav pacienta:
• Přípravek je vhodný pro pacienty, kteří vyžadují v omezeném objemu navíc kalorie a nutrienty, ale normální koncentraci proteinu • Přípravek je vhodný pro pacienty, kteří potřebují dosáhnout a udržet normální hmotnost.
Rysy:
• Bohatá a lahodná chuť • Dobrý zdroj podstatných vitamínů a minerálů
Složení:
Typ Vanilla: - -D voda, kukuřičný sirup, maltodextrin (kukuřičný), cukr (sacharóza), kukuřičný olej, kaseinát vápenatý a sodný, slunečnicový olej, sojový proteinový izolát, chlorid hořečnatý, citrát draselný, tribazický fosforečnan
126 vápenatý, sojový lecitin, přirozené a umělé příchutě, citrát sodný, chlorid draselný, cholinchlorid, kyselina askorbová, karagen, síran zinečnatý, síran mědňatý, síran železitý, alfatokoferylacetát, síran zinečnatý, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, palmitat vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, kyselina folová, molybdát sodný, chlorid chrómu, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Zdrojem proteinu jsou proteiny: kasein a sója Kaseinát vápenatý a sodný Sojový proteinový izolát dva vysoce biologicky hodnotné %
%
Tuk:
Zdrojem tuku je kukuřičný olej
Kukuřičný olej 100 %
Sacharidy:
Přípravek ENSURE PLUS obsahuje kombinaci maltodextrinu a sacharózy. Střední sladkost a různé příchutě (vanilková, čokoládová, jahodová-kávová, máslo burských oříšků a vaječný koňak) plus VARI-FLAVORSO® Flavor Pacs v ořechu pekan, višně, jahody, citrón a pomeranč, pomáhá předcházet nepříznivé chuti.
Vanilková, jahodová, kávová příchuť a příchuť másla burských oříšků obsahují:
Sacharóza 23 %
Maltodextrin 38 %
Kukuřičný sirup 39 %
Čokoládová příchuť a příchuť vaječného koňaku obsahují:
• · • · · · · • · · ·
127
Sacharóza Kukuřičný sirup Maltodextrin • · · « 9 · ······ · · · < · · %
% %
Vitamíny a minerály
Jedno balení (0,2272 1) ENSURE LIGHT poskytuje alespoň 15 %
RDI pro 25 klíčových vitamínů a minerálů.
Kofein:
Čokoládová příchuť obsahuje 3,1 mg kofeinu na 0,2272 1 a kávová příchuť obsahuje stopové množství kofeinu.
F. ENSURE PLUS®HN
Použití: Přípravek ENSURE PLUS HN je nutričně kompletní výživa v kapalinové formě s vysokým obsahem kalorií a dusíku vhodná pro lidi, které vyžadují přísun velkého množství kalorií a proteinu a mají omezenou toleranci na objem potravy. Mohou se aplikovat orálně nebo se zavádějí hadičkou. Přípravek neobsahuje laktózu ani lepek.
Stav pacienta:
• Vhodné pro pacienty se zvýšenou potřebou kalorií a proteinů, kteří jsou například po chirurgickém zákroku nebo poranění.
• Vhodné pro pacienty s omezenou tolerancí na objem a s časným pocitem sytosti.
Rysy:
• Přípravek je vhodný jako nutriční doplněk i jako celková výživa.
• Přípravek je vhodný pro orální aplikaci i pro zavádění hadičkou.
• 1,5 CaVml • Vysoký obsah dusíku.
128 • · · · · ···· ··»··· ·· » « · · · · ··
Vysoká hustota kalorií.
Složky:
Typ Vanila:
-D voda, maltodextrin (kukuřičný), kukuřičný olej, kaseinát vápenatý a sodný, cukr (sacharóza), sojový proteinový izolát, chlorid hořečnatý, citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, sojový lecitin, přirozené a cholinchlorid, kyselina síran zinečnatý, síran niacinamid, karagen, železitý, pantotenát umělé příchutě, citrát sodný, askorbová, taurin, L-karnitin, alfa-tokoferylacetát, vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, palmitat vitaminu A, kyselina folová, biotin, molybdát sodný, chlorid chrómu, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
G. ENSURE® POWDER
Použití: Přípravek ENSURE POWDER (rozpuštěný ve vodě) je výživa v kapalinové formě s nízkým obsahem zbytků určená pro aplikaci primárně jako orální nutriční doplněk, který se používá mezi jednotlivými jídly nebo s nimi. Uvedený přípravek neobsahuje laktózu ani lepek a je vhodný při upravených dietách zahrnujících diety s nízkým obsahem cholesterolu.
Stav pacienta:
• Přípravek je vhodný pro pacienty se zvláštní dietou.
• Přípravek je vhodný pro staré pacienty, kde existuje nebezpečí spojené s výživou.
• Přípravek je vhodný pro pacienty, kteří se zotavují z nemoci nebo z chirurgického zákroku.
• Přípravek je vhodný pro pacienty, kteří potřebují dietu s nízkým obsahem zbytků.
Rysy:
»· ·· ·« ·· • < · · » * * · • · · · · · » • ·
129 * · · · · ·»»·»· ·· ·«»· • Přípravek je příjemný, snadno se rozmíchá.
• Obsahuje malé množství nasyceného tuku.
• V jednom balení přípravek obsahuje 9g celkového tuku a méně než 5 mg cholesterolu.
• Přípravek obsahuje vysoký obsah vitamínů a minerálů.
• Přípravek je vhodný při dietě s nízkým obsahem cholesterolu.
• Přípravek neobsahuje laktózu a snadno se tráví.
Složení: - -D kukuřičný sirup, maltodextrin (kukuřičný), kukuřičný olej, kaseinát vápenatý a sodný, cukr (sacharóza), sojový proteinový izolát, umělé příchutě, chlorid hořečnatý, citrát draselný, tribazický fosforečnan vápenatý, chlorid draselný, sojový lecitin, citrát sodný, cholinchlorid, kyselina askorbová, síran zinečnatý, síran železitý, taurin, L-karnitin, alfa-tokoferylacetát, niacinamid, pantotenát vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, palmitat vitaminu A, kyselina folová, biotin, molybdát sodný, chlorid chrómu, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Zdroj proteinu je směs dvou vysoce biologicky hodnotných proteinů: kaseinu a sóji.
Kaseinát sodný a vápenatý 84 %
Sojový proteinový izolát 16 %
Tuk:
Zdrojem tuku je kukuřičný olej.
Kukuřičný olej 100 %
Sacharidy:
Přípravek ENSURE POWDER obsahuje kombinaci kukuřičného sirupu, maltodextrinu a sacharózy. Střední sladkost plus VARI-
130 ···· * « í • · · · * · ·· ·( « · · · · • * · · * · · «
FLAVORSO® Flavor Pacs v ořechu pekan, višně, j ahody, citrón a
pomeranč, pomáhá předcházet nepříznivé chuti.
Vanilková příchuť obsahuje:
Sacharóza 30 %
Maltodextrin 35 %
Kukuřičný sirup 35 %
H. ENSURE® PUDDING
Použití: Přípravek ENSURE PUDDING je nutriční doplněk
s vysokou hustotou nutrientů poskytující vyváženou výživu
v nekapalné formě. Používá se mezi jednotlivými jídly a spolu s nimi. Je vhodný pro výživu s upravenou konzistencí (například jemná, rozmělněná nebo zcela kapalná strava) nebo pro lidi s poruchami polykání. Uvedený přípravek neobsahuje lepek.
Stav pacienta:
• Přípravek je vhodný pro pacienty s dietou s upravenou konzistencí (například jemná, rozmělněná nebo zcela kapalná dieta).
• Vhodné pro pacienty s poruchami polykání.
Rysy:
• Bohatá a jemná, dobrá chuť.
• Dobrý zdroj podstatných vitamínů a minerálů. Nesmí se skladovat v chladničkách.
• Neobsahuje lepek.
Nutriční profil pro objem 0,142 ml: 250 kalorií, 10,9 % proteinů, celkový obsah tuků je 34,9 %, 54,2 % sacharidů.
Složení: : - -D netučné mléko, voda, cukr (sacharóza), částečně hydrogenovaný sojový olej, upravený potravinářský • ·
131 škrob, síran horečnatý, stearoyllaktylát sodný, dibazický fosforečnan sodný, umělé příchutě, kyselina askorbová, síran zinečnatý, síran železitý, alfa-tokoferylacetát, cholinchlorid, niacinamid, síran manganatý, pantotenát vápenatý, citrát draselný, síran mědňatý, palmitát vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, FD&C žlutá #6, kyselina folová, biotin, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Zdrojem proteinu je netučné mléko.
Netučné mléko 100 %
Tuk:
Zdrojem tuku je hydrogenovaný sojový olej.
Hydrogenovaný sojový olej 100 %
Sacharidy:
Přípravek ENSURE PUDDING obsahuje kombinaci sacharózy a upraveného potravinářského škrobu. Střední sladkost a různé příchutě (vanilková, čokoládová, skotské a ságová pomáhá předcházet nepříznivé chuti. Produkt obsahuje 9,2 gramů laktózy na každé balení.
Vanilková a jiné nečokoládové Sacharóza
Laktóza
Upravený potravinářský škrob
Čokoládová příchuť
Sacharóza
Laktóza
Upravený potravinářský škrob příchuti obsahují:
% %
% %
% %
«· · · ·· ·· • · · · · ·· · • · · · · · ·
132
I. ENSURE® WITH FIBER
Použití: Přípravek ENSURE® WITH FIBER je nutričně úplná výživa v kapalné formě, obsahující vlákninu určená pro lidi, pro něž je výhodná aplikace diety s vyšším obsahem vlákniny a nutrientů. Uvedený výrobek je vhodný pro lidi, které nevyžadují dietu s nízkým obsahem zbytků. Může se aplikovat orálně nebo se zavádí trubičkou. Výrobek se může použít jako nutriční doplněk normální stravy nebo ve vhodném množství jako její náhrada. Výrobek neobsahuje laktózu ani lepek a je vhodný pro použití při upravených dietách, které zahrnují také dietu s nízkým obsahem cholesterolu.
Stav pacienta:
• Pacient, pro něhož je výhodná dieta s vyšším obsahem vlákniny a nutrientů.
Rysy:
• Nový progresivní výrobek s nízkým obsahem nasycených tuků, s vyšším obsahem vitamínů a minerálů • V jednom balení obsahuje 6 g celkového tuku a méně než 5 mg cholesterolu.
• Má bohatou a jemnou chuť.
• Dobrý zdroj vlákniny.
• Výborný zdroj podstatných vitamínů a minerálů.
• Vhodný pro dietu s nízkým obsahem cholesterolu.
• Neobsahuje laktózu ani lepek.
Složení:
Typ Vanilla: - -D voda, maltodextrin (kukuřičný), cukr (sacharóza), kukuřičný olej, kaseinát vápenatý a sodný, ovesná vláknina, slunečnicový olej, olej kanola, sojový proteinový izolát, kukuřičný olej, sojová vláknina, tribazický fosforečnan vápenatý, chlorid hořečnatý, citrát draselný, • · • · · ·
133 • · • · · · · · ·
citrát draselný, celulózový gel, dibazický fosforečnan
draselný, citrát sodný, přirozené a umělé příchutě,
cholinchlorid, fosforečnan hořečnatý, kyselina askorbová,
celulózová guma, chlorid draselný, karagen, síran železitý, alfa-tokoferylacetát, pantotenát vápenatý, síran manganatý, síran mědňatý, palmitat vitaminu A, thiaminchloridhydrochlorid, pyridoxinhydrochlorid, riboflavin, kyselina folová, biotin, molybdát sodný, chlorid chrómu, jodid draselný, selenát sodný, fylochinon, vitamin D3 a cyanokobalamin.
Protein:
Zdrojem proteinu je směs dvou vysoce biologicky hodnotných proteinů: kaseinů a sóji.
Kaseinát sodný a vápenatý Sojový proteinový izolát 80 % 20 %
Tuk:
Zdroj tuku je směs tří olejů: slunečnicový olej, olej kanoly a
kukuřičný olej.
Slunenčnicový olej 40 %
Olej kanoly 40 %
Kukuřičný olej 20 %
Množství tuku v přípravku ENSURE WITH FIBER splňuje
požadavky American Heart Association (AHA). 6 gramů tuku
uvedeného výrobku reprezentuje 22 % celkového množství
kalorií, 2,01 % je tuk pocházející z nasycených mastných kyselin a 6,7 % pochází z poly-nenasycených mastných kyselin. Tyto hodnoty jsou v souladu s požadavky AHA, kdy méně než 30 % celkového množství kalorií pochází z tuku, méně než 10 % kalorií pochází z nasycených mastných kyselin a méně než 10 % celkového množství kalorií pochází z poly-nenasycených mastných kyselin.
• · • · • · ♦ « · · · · • · · 4 · · ·
134
Sacharidy:
Přípravek ENSURE WITH FIBER obsahuje kombinaci maltodextrinu a sacharózy. Střední sladkost a různé příchutě (vanilková, čokoládová a pekanové máslo) plus VARI-FLAVORSO® Flavor Pacs v ořechu pekan, višně, jahody, citrón a pomeranč, pomáhá předcházet nepříznivé chuti.
Vanilková a jiné nečokoládové příchutě
Sacharóza 25 %
Maltodextrin 66 %
Ovesná vláknina 7 %
Sojová vláknina 2 %
Čokoládová příchuť
Sacharóza 36 %
Maltodextrin 55 %
Ovesná vláknina 7 %
Sojová vláknina 2 %
Vláknina:
Směs vlákniny obsažené v přípravku ENSURE WITH FIBER obsahuje ovesnou vlákninu a sojový polysacharid. Výsledkem této směsi je, že jedno balení o objemu 0,22721 obsahuje přibližně 4 gramy celkové vlákniny. Poměr nerozpustné a rozpustné vlákniny je 95:5.
PUFA podle vynálezu mohou nahradit a/nebo doplnit různé nutriční doplňky popsané shora v textu.
J. Výživný produkt Oxepa™
Oxepa je enterální nutriční produkt s nízkým obsahem cukrů s vysokou kalorickou hustotou vhodný pro aplikaci pacientům které trpí ARDS a nebo jsou v ohrožení ARDS. Výrobek má jedinečnou kombinaci ingrediencí zahrnující patentovanou směs olejů obsahující ikosapentanovou kyselinu (EPA z rybího • · • ·
135 • · · · · · «· · · · · ·· ·· oleje), kyselinu γ-linolenovou (GLA pocházející z oleje brutnáku lékařského) a zvýšené množství antioxidantů.
Rozdělení kalorií:
• Kalorická hustota je vysoká 1,5 kal/ml (355 kal/8 fl.oz.), což minimalizuje objem nutný pro uspokojení nároků na energii.
• Rozdělení kalorií v produktu Oxepa je zobrazeno v tabulce č.
.
Tabulka č. 7: Rozdělení kalorií v produktu Oxepa
na 8 fl. oz. na litr % kal.
Kalorie 355 1 500 -
Tuk (g) 22,2 93,7 55,2
Sacharidy (g) 25 105,5 28,1
Protein (g) 14,8 62,5 16,7
Voda (g) 186 785
Tuk:
• Produkt Oxepa obsahuje 22,2 g tuku na jedno balení o objemu 8 fl. oz. (93,7 g/l).
• Zdroj tuku je směs olejů, která obsahuje 31,8 % oleje kanoly, 25 % triglyceridů se středně dlouhým řetězcem (MOT), 20 % oleje brutnáku lékařského, 20 % rybího oleje a 3,2 % sojového lecitinu. Typický profil mastných kyselin produktu Oxepa je uveden v tabulce č. 8.
• Produkt Oxepa poskytuje vyvážené množství poly-nenasycených, mono-nenasycených a nasycených mastných kyselin, jak se uvádí v tabulce č. 10.
• Triglyceridy se středně dlouhým řetězcem (MTC), které tvoří % směsi, umožňují vyprázdnění gastrického traktu , protože se absorbují ve střevním traktu, aniž se emulzifikují kyselinou žlučovou.
136 • · · · · · ·· ·· ·· ··· · · · · · ···· · · · · • ···· ··· • · · · · ···· ····«·· ·· »··· «· ··
PUFA podle vynálezu mohou nahrazovat nebo doplňovat různé komponenty mastných kyselin nutričního produktu Oxepa.
Tabulka č. 8: Typický profil mastných kyselin
% z celkového množství mastných kyselin g/8 fl. oz.* g/1*
Kyselina kapronová (6:0) 0,2 0, 04 0,18
Kyselina kaprylová (8:0) 14,69 3,1 13, 07
Kyselina kaprová (10:0) 11,06 2,33 9,87
Kyselina palmitová (16:0) 5,59 1,18 4,98
Kyselina palmitolejová (16:ln-7) 1,82 0,38 1, 62
Kyselina stearová (18:0) 1,84 0,39 1,64
Kyselina olejová (18:ln-9) 24,44 5,16 21,75
Kyselina linolová 16, 28 3,44 14,49
Kyselina a-linolová (18:3n-3) 3,47 0,73 3,09
Kyselina γ-linolová (18:3n-6) 4,82 1,02 4,29
Kyselina ikosapentanová (20:5n-3) 5,11 1,08 4,55
n-3- dokosapentanová (22:5n-3) 0,55 0,12 0,49
Kyselina Dokosahexanová (22:6n-3) 2,27 0,48 2,02
Jiné kyseliny 7,55 1,52 6, 72
*mastné kyseliny odpovídají přibližně 95 % celkového tuku
Tabulka č. 9: Profil tuk produktu Oxepa • · • ·
% celkových kalorií z tuku 55,2
Polynenasycené mastné kyseliny 31,44 g/1
Mononenasycené mastné kyseliny 25,53 g/1
Nasycené mastné kyseliny 32,38 g/1
Poměr n-6 ku n-3 1,75 : 1
Cholesterol 9,49 mg/8 fl.oz. 40,1 mg/1
Sacharidy:
• Obsah sacharidů je 25,0 g na 8 fl.oz. (105,5 g/1).
• Zdroje sacharidů jsou 45 % maltodextrinu (komplexní sacharid) a 55 % sacharózy (jednoduchý cukr). Oba sacharidy se jednoduše tráví a absorbují.
• Produkt Oxepa obsahuje vysoký obsah tuku a nízký obsah sacharidů, což minimalizuje tvorbu oxidu uhličitého (C02) . Vysoký obsah oxidu uhličitého může komplikovat odstavení pacientů, kteří jsou závislí na umělém dýchání. Nízký obsah sacharidů je také vhodný pro pacienty, u kterých může dojít k hyperglykémii vyvolané stresem.
• Produkt Oxepa neobsahuje laktózu.
Sacharidy, aminokyseliny proteinů a glycerolové části tuků se mohou v těle přeměnit na glukózu. Prostřednictvím tohoto procesu se uspokojují požadavky na cukry tkáně závislé na glukóze (jako je centrální nervový systém nebo buňky krve). Avšak potrava bez sacharidů může způsobit ketózu, což je nadměrný katabolizmus tkáňových proteinů a ztrátu tělních tekutin a elektrolytů. Těmto účinkům se dá předcházet, jestliže se požije denně 50 až 100 g stravitelných sacharidů, v případě, že je adekvátní kalorický příjem. Množství sacharidů v produktu Oxepa je také dostatečný pro minimalizaci glukoneogeneze, jestliže je uspokojena potřeba energie.
Protein:
• · · « ·« • · « ···· ··· ··«· · · · · · »
138 .· • Oxepa obsahuje 14,8 g proteinu na jedno balení o objemu 8 fl. oz. (62,5 g/1).
• Poměr celkového množství kalorií/obsahu dusíku (150:1) uspokojuje potřeby stresovaných pacientů.
• Oxepa poskytuje dostatek proteinu, aby způsobila anabolizmus a udržení nízké tělesné hmotnosti, aniž dojde respiračním problémům. Vysoký příjem proteinů se předpokládá u pacientů s respirační nedostatečností. Ačkoli proteiny mají malý účinek na produkci C02, dieta s vysokým obsahem proteinů napomáhá dýchání.
• Jako zdroj proteinů v produktu Oxepa se využívá 86,8 % kaseinátu sodného a 13,2 % kaseinátu vápenatého.
• Jak se uvádí v tabulce 11, profil aminokyselin proteinového systému v produktu Oxepa vyhovuje standardům v případě proteinů vysoké kvality, které vytvořila instituce National Academy of Sciences.
• Produkt Oxepa neobsahuje lepek.
• · • · «··· « v ·· • · · ···· · ···· · · · ·
139 · ···. ·
Sekvenční protokol (2) Informace o SEQ ID NO: <5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: : 1617 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY : DNA (genomová)
(xi) i Popis ; sekvence: SEQ ID NO: 1 :
CGACACTCCT TCCTTCTTCT CACCCGTCCT AGTCCCCTTC AACCCCCCTC TTTGACAAAG 60
ACAACAAACC ATGGCTGCTG CTCCCAGTGT GAGGACGTTT ACTCGGGCCG AGGTTTTGAA 120
TGCCGAGGCT CTGAATGAGG GCAAGAAGGA TGCCGAGGCA CCCTTCTTGA TGATCATCGA 180
CAACAAGGTG TACGATGTCC GCGAGTTCGT CCCTGATCAT CCCGGTGGAA GTGTGATTCT 240
CACGCACGTT GGCAAGGACG GCACTGACGT CTTTGACACT TTTCACCCCG AGGCTGCTTG 300
GGAGACTCTT GCCAACTTTT ACGTTGGTGA TATTGACGAG AGCGACCGCG ATATCAAGAA 360
TGATGACTTT GCGGCCGAGG TCCGCAAGCT GCGTACCTTG TTCCAGTCTC TTGGTTACTA 420
CGATTCTTCC AAGGCATACT ACGCCTTCAA GGTCTCGTTC AACCTCTGCA TCTGGGGTTT 480
GTCGACGGTC ATTGTGGCCA AGTGGGGCCA GACCTCGACC CTCGCCAACG TGCTCTCGGC 540
TGCGCTTTTG GGTCTGTTCT GGCAGCAGTG CGGATGGTTG GCTCACGACT TTTTGCATCA 600
CCAGGTCTTC CAGGACCGTT TCTGGGGTGA TCTTTTCGGC GCCTTCTTGG GAGGTGTCTG 660
CCAGGGCTTC TCGTCCTCGT GGTGGAAGGA CAAGCACAAC ACTCACCACG CCGCCCCCAA 720
CGTCCACGGC GAGGATCCCG ACATTGACAC CCACCCTCTG TTGACCTGGA GTGAGCATGC 780
GTTGGAGATG TTCTCGGATG TCCCAGATGA GGAGCTGACC CGCATGTGGT CGCGTTTCAT 840
GGTCCTGAAC CAGACCTGGT TTTACTTCCC CATTCTCTCG TTTGCCCGTC TCTCCTGGTG 900
CCTCCAGTCC attctctttg TGCTGCCTAA CGGTCAGGCC CACAAGCCCT CGGGCGCGCG 960
TGTGCCCATC TCGTTGGTCG AGCAGCTGTC GCTTGCGATG CACTGGACCT GGTACCTCGC 1.020
CACCATGTTC CTGTTCATCA AGGATCCCGT CAACATGCTG GTGTACTTTT TGGTGTCGCA 1080
GGCGGTGTGC GGAAACTTGT TGGCGATCGT GTTCTCGCTC AACCACAACG GTATGCCTGT 1140
GATCTCGAAG GAGGAGGCGG TCGATATGGA TTTCTTCACG AAGCAGATCA TCACGGGTCG 1200
TGATGTČCAC CCGGGTCTAT TTGCCAACTG GTTCACGGGT GGATTGAACT ATCAGATCGA 1260
GCACCACTTG TTCCCTTCGA TGCCTCGCCA CAACTTTTCA AAGATCCAGC CTGCTGTCGA 1320
GACCCTGTGC AAAAAGTACA ATGTCCGATA CCACACCACC GGTATGATCG AGGGAACTGC 1380
AGAGGTCTTT AGCCGTCTGA ACGAGGTCTC CAAGGCTGCC TCCAAGATGG GTAAGGCGCA 1440
• ·
GTAAAAAAAA AAACAAGGAC GTTTTTTTTC GCCAGTGCCT GTGCCTGTGC CTGCTTCCCT 1500 TGTCAAGTCG AGCGTTTCTG GAAAGGATCG TTCAGTGCAG TATCATCATT CTCCTTTTAC 1560 CCCCCGCTCA TATCTCATTC ATTTCTCTTA TTAAACAACT TGTTCCCCCC TTCACCG 1617 (2) Informace o SEQ ID NO: 2:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 457 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(li) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence : SEQ ID NO: 2:
Met Ala Ala Ala Pro Ser Val Arg Thr Phe Thr Arg Ala Glu Val Leu
1 5 10 15
Asn Ala Glu Ala Leu Asn Glu Gly Lys Lys Asp Ala Glu Ala Pro Phe
20 25 30
Leu Met Ile Ile Asp Asn Lys Val Tyr Asp Val Arg Glu Phe Val Pro
35 40 45
Asp His Pro Gly Gly Ser Val Ile Leu Thr His Val Gly Lys Asp Gly
50 55 60
Thr Asp Val Phe Asp Thr Phe His Pro Glu Ala Ala Trp Glu Thr Leu
65 70 75 80
Ala Asn Phe Tyr Val Gly Asp Ile Asp Glu Ser Asp Arg Asp Ile Lys
85 90 95
Asn Asp Asp Phe Ala Ala Glu Val Arg Lys Leu Arg Thr Leu Phe Gin
100 105 110
Ser Leu Gly Tyr Tyr Asp Ser Ser Lys Ala Tyr Tyr Ala Phe Lys Val
115 120 125
Ser Phe Asn Leu Cys Ile Trp Gly Leu Ser Thr Val Ile Val Ala Lys
130 135 140
Trp Gly Gin Thr Ser Thr Leu Ala Asn Val Leu Ser Ala Ala Leu Leu
145 150 155 160
Gly Leu Phe Trp Gin Gin Cys Gly Trp Leu Ala His Asp Phe Leu His
165 170 175
His Gin Val Phe Gin Asp Arg Phe Trp Gly Asp Leu Phe Gly Ala Phe
180 185 190
Leu Gly Gly Val Cys Gin Gly Phe Ser Ser Ser Trp Trp Lys Asp Lys
195 200 205
His Asn Thr His His Ala Ala Pro Asn Val His Gly Glu Asp Pro Asp
210 215 220
Ile Asp Thr His Pro Leu Leu Thr Trp Ser Glu His Ala Leu i Glu . Met
225 230 235 240
Phe Ser Asp Val Pro Asp Glu Glu Leu Thr Arg Met Trp Ser Arg Phe
245 250 255
• ·
I · · « · « · • · · ·
Met Val Leu Asn 260 Gin Thr 141 Pro • Ile • Leu • Ser 270 • · • · Phe • • · · · Ala
Trp Phe Tyr 265 Phe
Arg Leu Ser 275 Trp Cys Leu Gin Ser 280 Ile Leu Phe Val Leu 285 Pro Asn Gly
Gin Ala 290 His Lys Pro Ser Gly 295 Ala Arg Val Pro Ile 300 Ser Leu Val Glu
Gin Leu 305 Ser Leu Ala Met 310 His Trp Thr Trp Tyr 315 Leu Ala Thr Met Phe 320
Leu Phe Ile Lys Asp Pro 325 Val Asn Met Leu 330 Val Tyr Phe Leu Val 335 Ser
Gin Ala Val Cys 340 Gly Asn Leu Leu Ala 345 Ile Val Phe Ser Leu 350 Asn His
Asn Gly Met 355 Pro Val Ile Ser Lys 360 Glu Glu Ala Val Asp 365 Met Asp Phe
Phe Thr 370 Lys Gin Ile Ile Thr 375 Gly Arg Asp Val His 380 Pro Gly Leu Phe
Ala Asn 385 Trp Phe Thr Gly 390 Gly Leu Asn Tyr Gin 395 Ile Glu His His Leu 400
Phe Pro Ser Met Pro Arg 405 His Asn Phe Ser 410 Lys Ile Gin Pro Ala 415 Val
Glu Thr Leu Cys 420 Lys Lys Tyr Asn Val 425 Arg Tyr His Thr Thr 430 Gly Met
Ile Glu Gly Thr Ala Glu Val Phe Ser Arg Leu Asn Glu Val Ser Lys
445 • · · ·
435
Ala Ala Ser 450
Lys Met Gly Lys 455
440
Ala Gin
2) Informace o SEQ ID NO: 3:
(ii) (xi)
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1488 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární DRUH MOLEKULY: DNA (genomová)
Popis sekvence: SEQ ID NO: 3:
GTCCCCTGTC GCTGTCGGCA CACCCCATCC TCCCTCGCTC CCTCTGCGTT TGTCCTTGGC 60
CCACCGTCTC TCCTCCACCC TCCGAGACGA CTGCAACTGT AATCAGGAAC CGACAAATAC 120
ACGATTTCTT TTTACTCAGC ACCAACTCAA AATCCTCAAC CGCAACCCTT TTTCAGGATG 180
GCACCTCCCA ACACTATCGA TGCCGGTTTG ACCCAGCGTC ATATCAGCAC CTCGGCCCCA 240
AACTCGGCCA AGCCTGCCTT CGAGCGCAAC TACCAGCTCC CCGAGTTCAC CATCAAGGAG 300
ATCCGAGAGT GCATCCCTGC CCACTGCTTT GAGCGCTCCG GTCTCCGTGG TCTCTGCCAC 360
GTTGCCATCG ATCTGACTTG GGCGTCGCTC TTGTTCCTGG CTGCGACCCA GATCGACAAG 420
TTTGAGAATC CCTTGATCCG CTATTTGGCC TGGCCTGTTT ACTGGATCAT GCAGGGTATT 480 • · · · • · • ·
GTCTGCACCG GTGTCTGGGT 142 • · · • · · · « • • · * · • · · • · · · • · · · · · CTCGACCTCC • · • · • · • · 540
GCTGGCTCAC GAGTGTGGTC ATCAGTCCTT
AAGACCCTCA ACAACACAGT TGGTTGGATC TTGCACTCGA TGCTCTTGGT CCCCTACCAC 600
TCCTGGAGAA TCTCGCACTC GAAGCACCAC AAGGCCACTG GCCATATGAC CAAGGACCAG 660
GTCTTTGTGC CCAAGACCCG CTCCCAGGTT GGCTTGCCTC CCAAGGAGAA CGCTGCTGCT 720
GCCGTTCAGG AGGAGGACAT GTCCGTGCAC CTGGATGAGG AGGCTCCCAT TGTGACTTTG 780
TTCTGGATGG TGATCCAGTT CTTGTTCGGA TGGCCCGCGT ACCTGATTAT GAACGCCTCT 840
GGCCAAGACT ACGGCCGCTG GACCTCGCAC TTCCACACGT ACTCGCCCAT CTTTGAGCCC 900
CGCAACTTTT TCGACATTAT TATCTCGGAC CTCGGTGTGT TGGCTGCCCT CGGTGCCCTG 960
ATCTATGCCT CCATGCAGTT GTCGCTCTTG ACCGTCACCA AGTACTATAT TGTCCCCTAC 1020
CTCTTTGTCA ACTTTTGGTT GGTCCTGATC ACCTTCTTGC AGCACACCGA TCCCAAGCTG 1080
CCCCATTACC GCGAGGGTGC CTGGAATTTC CAGCGTGGAG CTCTTTGCAC CGTTGACCGC 1140
TCGTTTGGCA AGTTCTTGGA CCATATGTTC CACGGCATTG TCCACACCCA TGTGGCCCAT 1200
CACTTGTTCT CGCAAATGCC GTTCTACCAT GCTGAGGAAG CTACCTATCA TCTCAAGAAA 1260
CTGCTGGGAG AGTACTATGT GTACGACCCA TCCCCGATCG TCGTTGCGGT CTGGAGGTCG 1320
TTCCGTGAGT GCCGATTCGT GGAGGATCAG GGAGACGTGG TCTTTTTCAA GAAGTAAAAA 1380
AAAAGACAAT GGACCACACA CAACCTTGTC TCTACAGACC TACGTATCAT GTAGCCATAC 1440
CACTTCATAA AAGAACATGA GCTCTAGAGG CGTGTCATTC GCGCCTCC 1488
(2) Informace o SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 399 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO : 4:
Met 1 Ala Pro Pro Asn 5 Thr Ile Asp Ala Gly 10 Leu Thr Gin Arg His 15 Ile
Ser Thr Ser Ala 20 Pro Asn Ser Ala Lys 25 Pro Ala Phe Glu Arg 30 Asn Tyr
Gin Leu Pro 35 Glu Phe Thr Ile Lys 40 Glu Ile Arg Glu Cys 45 Ile Pro Ala
His Cys 50 Phe Glu Arg Ser Gly 55 Leu Arg Gly Leu Cys 60 His Val Ala Ile
Asp 65 Leu Thr Trp Ala Ser 70 Leu Leu Phe Leu Ala 75 Ala Thr Gin Ile Asp 80
Lys Phe Glu Asn Pro 85 Leu Ile Arg Tyr Leu 90 Ala Trp Pro Val Tyr 95 Trp
Ile Met Gin Gly 100 Ile Val Cys Thr Gly 105 Val Trp Val Leu Ala 110 His Glu
• · ···· ···· ···· · · · · · · ·
143 • ··· ···· • · ···· · · ··
Cys Gly His Gin Ser Phe 115
Gly Trp Ile Leu His Ser 130
Ile Ser His Ser Lys His 145 150
Gin Val Phe Val Pro Lys 165
Glu Asn Ala Ala Ala Ala 180
Asp Glu Glu Ala Pro Ile 195
Leu Phe Gly Trp Pro Ala 210
Tyr Gly Arg Trp Thr Ser 225 230
Pro Arg Asn Phe Phe Asp 245
Ala Leu Gly Ala Leu Ile 260
Val Thr Lys Tyr Tyr Ile 275
Val Leu Ile Thr Phe Leu 290
Arg Glu Gly Ala Trp Asn 305 310
Arg Ser Phe Gly Lys Phe 325
Thr His Val Ala His His 340
Glu Glu Ala Thr Tyr His 355
Tyr Asp Pro Ser Pro Ile 370
Cys Arg Phe Val Glu Asp 385 390
Ser Thr Ser Lys Thr Leu 120
Met Leu Leu Val Pro Tyr 135 140
His Lys Ala Thr Gly His 155
Thr Arg Ser Gin Val Gly 170
Val Gin Glu Glu Asp Met 185
Val Thr Leu Phe Trp Met 200
Tyr Leu Ile Met Asn Ala 215 220
His Phe His Thr Tyr Ser 235
Ile Ile Ile Ser Asp Leu 250
Tyr Ala Ser Met Gin Leu 265
Val Pro Tyr Leu Phe Val 280
Gin His Thr Asp Pro Lys 295 300
Phe Gin Arg Gly Ala Leu 315
Leu Asp His Met Phe His 330
Leu Phe Ser Gin Met Pro 345
Leu Lys Lys Leu Leu Gly 360
Val Val Ala Val Trp Arg 375 380
Gin Gly Asp Val Val Phe 395
Asn Asn Thr Val 125
His Ser Trp Arg
Met Thr Lys Asp 160
Leu Pro Pro Lys 175
Ser Val His Leu 190
Val Ile Gin Phe 205
Ser Gly Gin Asp
Pro Ile Phe Glu 240
Gly Val Leu Ala 255
Ser Leu Leu Thr 270
Asn Phe Trp Leu 285
Leu Pro His Tyr
Cys Thr Val Asp 320
Gly Ile Val His 335
Phe Tyr His Ala 350
Glu Tyr Tyr Val 365
Ser Phe Arg Glu
Phe Lys Lys
144 • ·
2) Informace o SEQ ID NO: 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1483 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: DNA (genomová) (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 5: GCTTCCTCCA GTTCATCCTC CATTTCGCCA CCTGCATTCT TTACGACCGT TAAGCAAGAT 60
GGGAACGGAC CAAGGAAAAA CCTTCACCTG GGAAGAGCTG GCGGCCCATA ACACCAAGGA 120
CGACCTACTC TTGGCCATCC GCGGCAGGGT GTACGATGTC ACAAAGTTCT TGAGCCGCCA 180
TCCTGGTGGA GTGGACACTC TCCTGCTCGG AGCTGGCCGA GATGTTACTC CGGTCTTTGA 240
GATGTATCAC GCGTTTGGGG CTGCAGATGC CATTATGAAG AAGTACTATG TCGGTACACT 300
GGTCTCGAAT GAGCTGCCCA TCTTCCCGGA GCCAACGGTG TTCCACAAAA CCATCAAGAC 360
GAGAGTCGAG GGCTACTTTA CGGATCGGAA CATTGATCCC AAGAATAGAC CAGAGATCTG 420
GGGACGATAC GCTCTTATCT TTGGATCCTT GATCGCTTCC TACTACGCGC AGCTCTTTGT 480
GCCTTTCGTT GTCGAACGCA CATGGCTTCA GGTGGTGTTT GCAATCATCA TGGGATTTGC 540
GTGCGCACAA GTCGGACTCA ACCCTCTTCA TGATGCGTCT CACTTTTCAG TGACCCACAA 600
CCCCACTGTC TGGAAGATTC TGGGAGCCAC GCACGACTTT TTCAACGGAG CATCGTACCT 660
GGTGTGGATG TACCAACATA TGCTCGGCCA TCACCCCTAC ACCAACATTG CTGGAGCAGA 720
TCCCGACGTG TCGACGTCTG AGCCCGATGT TCGTCGTATC AAGCCCAACC AAAAGTGGTT 780
TGTCAACCAC ATCAACCAGC ACATGTTTGT TCCTTTCCTG TACGGACTGC TGGCGTTCAA 840
GGTGCGCATT CAGGACATCA ACATTTTGTA CTTTGTCAAG ACCAATGACG CTATTCGTGT 900
CAATCCCATC TCGACATGGC ACACTGTGAT GTTCTGGGGC GGCAAGGCTT TCTTTGTCTG 960
GTATCGCCTG ATTGTTCCCC TGCAGTATCT GCCCCTGGGC AAGGTGCTGC TCTTGTTCAC 1020
GGTCGCGGAC ATGGTGTCGT CTTACTGGCT GGCGCTGACC TTCCAGGCGA ACCACGTTGT 1080
TGAGGAAGTT CAGTGGCCGT TGCCTGACGA GAACGGGATC ATCCAAAAGG ACTGGGCAGC 1140
TATGCAGGTC GAGACTACGC AGGATTACGC ACACGATTCG CACCTCTGGA CCAGCATCAC 1200
TGGCAGCTTG AACTACCAGG CTGTGCACCA TCTGTTCCCC AACGTGTCGC AGCACCATTA 1260
TCCCGATATT CTGGCCATCA TCAAGAACAC CTGCAGCGAG TACAAGGTTC CATACCTTGT 1320
CAAGGATACG TTTTGGCAAG CATTTGCTTC ACATTTGGAG CACTTGCGTG TTCTTGGACT 1380
CCGTCCCAAG GAAGAGTAGA AGAAAAAAAG CGCCGAATGA AGTATTGCCC CCTTTTTCTC 1440
CAAGAATGGC AAAAGGAGAT CAAGTGGACA TTCTCTATGA AGA
1483 • ·· · · · · * • · · · · · ·
145 • ···· ··· ··· ··· ·· ···· ·· ·· (2) Informace o SEQ ID NO: 6:
i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 446 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Pop 'ÍS sek' vence: SEQ ID NO : 6
Met Gly Thr Asp Gin Gly Lys Thr Phe Thr Trp Glu Glu Leu Ala Ala
1 5 10 15
His Asn Thr Lys Asp Asp Leu Leu Leu Ala Ile Arg Gly Arg Val Tyr
20 25 30
Asp Val Thr Lys Phe Leu Ser Arg His Pro Gly Gly Val Asp Thr Leu
35 40 45
Leu Leu Gly Ala Gly Arg Asp Val Thr Pro Val Phe Glu Met Tyr His
50 55 60
Ala Phe Gly Ala Ala Asp Ala Ile Met Lys Lys Tyr Tyr Val Gly Thr
65 70 75 80
Leu Val Ser Asn Glu Leu Pro Ile Phe Pro Glu Pro Thr Val Phe His
85 90 95
Lys Thr Ile Lys Thr Arg Val Glu Gly Tyr Phe Thr Asp Arg Asn Ile
100 105 110
Asp Pro Lys Asn Arg Pro Glu Ile Trp Gly Arg Tyr Ala Leu Ile Phe
115 120 125
Gly Ser Leu Ile Ala Ser Tyr Tyr Ala Gin Leu Phe Val Pro Phe Val
130 135 140
Val Glu Arg Thr Trp Leu Gin Val Val Phe Ala Ile Ile Met Gly Phe
145 150 155 160
Ala Cys Ala Gin Val 165 Gly Leu Asn Pro Leu 170 His Asp Ala Ser His 175 Phe
Ser Val Thr His 180 Asn Pro Thr Val Trp 185 Lys Ile Leu Gly Ala 190 Thr His
Asp Phe Phe 195 Asn Gly Ala Ser Tyr 200 Leu Val Trp Met Tyr 205 Gin His Met
Leu Gly 210 His His Pro Tyr Thr 215 Asn Ile Ala Gly Ala 220 Asp Pro Asp Val
Ser 225 Thr Ser Glu Pro Asp 230 Val Arg Arg Ile Lys 235 Pro Asn Gin Lys Trp 240
9
9 9 9
Phe Val Asn 14 6 Phe 250 Val • 9 • · • • • 9 9 9 9 • · · • • • • • 9 Leu * 9 ' 9 9 • • 9 9 9 9' Tyr 255 9 9 • 9 Gly
His Ile Asn Gin His Met 245 Pro Phe
Leu Leu Ala Phe Lys Val Arg Ile Gin Asp Ile Asn Ile Leu Tyr Phe
260 265 270
Val Lys Thr Asn Asp Ala Ile Arg Val Asn Pro Ile Ser Thr Trp His
275 280 285
Thr Val Met Phe Trp Gly Gly Lys Ala Phe Phe Val Trp Tyr Arg Leu
290 295 300
Ile Val Pro Leu Gin Tyr Leu Pro Leu Gly Lys Val Leu Leu Leu Phe
305 310 315 320
Thr Val Ala Asp Met Val Ser Ser Tyr Trp Leu Ala Leu Thr Phe Gin
325 330 335
Ala Asn His Val Val Glu Glu Val Gin Trp Pro Leu Pro Asp Glu Asn
340 345 350
Gly Ile Ile Gin Lys Asp Trp Ala Ala Met Gin Val Glu Thr Thr Gin
355 360 365
Asp Tyr Ala His Asp Ser His Leu Trp Thr Ser Ile Thr Gly Ser Leu
370 375 380
Asn Tyr Gin Ala Val His His Leu Phe Pro Asn Val Ser Gin His His
385 390 395 400
Tyr Pro Asp Ile Leu Ala Ile Ile Lys Asn Thr Cys Ser Glu Tyr Lys
405 410 415
Val Pro Tyr Leu Val Lys Asp Thr Phe Trp Gin Ala Phe Ala Ser His
420 425 430
Leu Glu His Leu Arg Val Leu Gly Leu Arg Pro Lys Glu Glu
« 9
435 440 445
2) Informace o SEQ ID NO: 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 355 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETEZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 7:
147 • » · · * · • r * · · · · ···« * · · · • · ·«·· ·· · ·
Glu Val Arg Lys Leu Arg 1 5
Ser Ser Lys Ala Tyr Tyr 20
Trp Gly Leu Ser Thr Val 35
Leu Ala Asn Val Leu Ser 50
Cys Gly Trp Leu Ala His 65 70
Arg Phe Trp Gly Asp Leu 85
Gly Phe Ser Ser Ser Trp 100
Ala Pro Asn Val His Gly 115
Leu Thr Trp Ser Glu His 130
Glu Glu Leu Thr Arg Met 145 150
Trp Phe Tyr Phe Pro Xle 165
Gin Ser Ile Leu Phe Val 180
Gly Ala Arg Val Pro Ile 195
His Trp Thr Trp Tyr Leu 210
Val Asn Met Leu Val Tyr 225 230
Leu Leu Ala Ile Val Phe 245
Ser Lys Glu Glu Ala Val 260
Thr Leu Phe Gin Ser Leu 10
Ala Phe Lys Val Ser Phe 25
Ile Val Ala Lys Trp Gly 40
Ala Ala Leu Leu Gly Leu 55 60
Asp Phe Leu His His Gin 75
Phe Gly Ala Phe Leu Gly 90
Trp Lys Asp Lys His Asn 105
Glu Asp Pro Asp Ile Asp 120
Ala Leu Glu Met Phe Ser 135 140
Trp Ser Arg Phe Met Val 155
Leu Ser Phe Ala Arg Leu 170
Leu Pro Asn Gly Gin Ala 185
Ser Leu Val Glu Gin Leu 200
Ala Thr Met Phe Leu Phe 215 220
Phe Leu Val Ser Gin Ala 235
Ser Leu Asn His Asn Gly 250
Asp Met Asp Phe Phe Thr 265
Gly Tyr Tyr Asp 15
Asn Leu Cys Ile 30
Gin Thr Ser Thr 45
Phe Trp Gin Gin
Val Phe Gin Asp 80
Gly Val Cys Gin 95
Thr His His Ala 110
Thr His Pro Leu 125
Asp Val Pro Asp
Leu Asn Gin Thr 160
Ser Trp Cys Leu 175
His Lys Pro Ser 190
Ser Leu Ala Met 205
Ile Lys Asp Pro
Val Cys Gly Asn 240
Met Pro Val Ile 255
Lys Gin Ile Ile 270
Thr Gly Arg Asp Val His Pro Gly Leu Phe Ala Asn Trp Phe Thr Gly 275 280 285 • · • · • * * · • · • * • · · · · · ·
14 8 « • · · « • · • · • · • « · * · ·
Gly Leu 290 Asn Tyr Gin Ile Glu 295 His His Leu Phe Pro 300 Ser Met Pro Arg
His 305 Asn Phe Ser Lys Ile 310 Gin Pro Ala Val Glu 315 Thr Leu Cys Lys Lys 320
Tyr Asn Val Arg Tyr 325 His Thr Thr Gly Met 330 Ile Glu Gly Thr Ala 335 Glu
Val Phe Ser Arg 340 Leu Asn Glu Val Ser 345 Lys Ala Ala Ser Lys 350 Met Gly
I» · « · c ·
Lys Ala Gin 355
2) Informace o SEQ ID NO: 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 104 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(Xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 8:
Val 1 Thr Leu Tyr Thr 5 Leu Ala Phe Val Ala Ala Asn Ser Leu Gly Val
10 15
Leu Tyr Gly Val Leu Ala Cys Pro Ser Val Xaa Pro His Gin Ile Ala
20 25 30
Ala Gly Leu Leu Gly Leu Leu Trp Ile Gin Ser Ala Tyr Ile Gly Xaa
35 40 45
Asp Ser Gly His Tyr Val Ile Met Ser Asn Lys Ser Asn Asn Xaa Phe
50 55 60
Ala Gin Leu Leu Ser Gly Asn Cys Leu Thr Gly Ile Ile Ala Trp Trp
65 70 75 80
Lys Trp Thr His Asn Ala His His Leu Ala Cys Asn Ser Leu Asp Tyr
90 95
Gly Pro Asn Leu Gin His Ile Pro 100 • · · · • · • · (2) Informace o SEQ ID NO: 9:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
149
(A) DÉLKA: 252 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 9:
Gly Val 1 Leu Tyr Gly 5 Val Leu Ala Cys Thr 10 Ser Val Phe Ala His 15 Gin
Ile Ala Ala Ala Leu Leu Gly Leu Leu Trp Ile Gin Ser Ala Tyr Ile
20 25 30
Gly His Asp Ser Gly His Tyr Val Ile Met Ser Asn Lys Ser Tyr Asn
35 40 45
Arg Phe Ala Gin Leu Leu Ser Gly Asn Cys Leu Thr Gly Ile Ser Ile
50 55 60
Ala Trp Trp Lys Trp Thr His Asn Ala His His Leu Ala Cys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Asp Tyr Asp Pro Asp Leu Gin His Ile Pro Val Phe Ala Val Ser
85 90 95
Thr Lys Phe Phe Ser Ser Leu Thr Ser Arg Phe Tyr Asp Arg Lys Leu
100 105 110
Thr Phe Gly Pro Val Ala Arg Phe Leu Val Ser Tyr Gin His Phe Thr
115 120 125
Tyr Tyr Pro Val Asn Cys Phe Gly Arg Ile Asn Leu Phe Ile Gin Thr
130 135 140
Phe Leu Leu Leu Phe Ser Lys Arg Glu Val Pro Asp Arg Ala Leu Asn
145 150 155 160
Phe Ala Gly Ile Leu Val Phe Trp Thr Trp Phe Pro Leu Leu Val Ser
165 170 175
Cys Leu Pro Asn Trp Pro Glu Arg Phe Phe Phe Val Phe Thr Ser Phe
180 185 190
Thr Val Thr Ala Leu Gin His Ile Gin Phe Thr Leu Asn His Phe Ala
195 200 205
Ala. Asp Val Tyr Val Gly Pro Pro Thr Gly Ser Asp Trp Phe Glu Lys
210 215 220
Gin Ala Ala Gly Thr Ile Asp Ile Ser Cys Arg Ser Tyr Met Asp Trp
225 230 235 240
Phe Phe Gly Gly Leu Gin Phe Gin Leu Glu His His 245 250 • · ··· · • · « « · · · * « « * «· · * « · (2) Informace o SEQ ID NO: 10:
150
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 125 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii (xi ) ) DRUH MOLEKULY: peptid : SEQ I D NO: 10 :
Popis sekvence
Gly Xaa Xaa Asn Phe Ala Gly Ile Leu Val Phe Trp Thr Trp Phe Pro
1 5 10 15
Leu Leu Val Ser Cys Leu Pro Asn Trp Pro Glu Arg Phe Xaa Phe Val
20 25 30
Phe Thr Gly Phe Thr Val Thr Ala Leu Gin His Ile Gin Phe Thr Leu
35 40 45
Asn His Phe Ala Ala Asp Val Tyr Val Gly Pro Pro Thr Gly Ser Asp
50 55 60
Trp Phe Glu Lys Gin Ala Ala Gly Thr Ile Asp Ile Ser Cys Arg Ser
65 70 75 80
Tyr Met Asp Trp Phe Phe Cys Gly Leu Gin Phe Gin Leu Glu His His
85 90 95
Leu Phe Pro Arg Leu Pro Arg Cys His Leu Arg Lys Val Ser Pro Val
100 105 110
Gly Gin Arg Gly Phe Gin Arg Lys Xaa Asn Leu Ser Xaa
115 120 125
(2) Informace o SEQ ID NO: 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 131 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 11:
·· 0··0
Pro 1 Ala Thr Glu Val 5 Gly Gly 151 Leu Ala Trp 10 ♦ 1 Met • · ·· • · · I · • · • e • · • · • τ Phe ( · • • 0000 Tyr 15 0 • • 0 0 • Val
Ile Thr
Arg Phe Phe Leu Thr Tyr Val Pro Leu Leu Gly Leu Lys Ala Phe Leu
20 25 30
Gly Leu Phe Phe Ile Val Arg Phe Leu Glu Ser Asn Trp Phe Val Trp
35 40 45
Val Thr Gin Met Asn His Ile Pro Met His Ile Asp His Asp Arg Asn
50 55 60
Met Asp Trp Val Ser Thr Gin Leu Gin Ala Thr Cys Asn Val His Lys
65 70 75 80
Ser Ala Phe Asn Asp Trp Phe Ser Gly His Leu Asn Phe Gin Ile Glu
85 90 95
His His Leu Phe Pro Thr Met Pro Arg His Asn Tyr His Xaa Val Ala
100 105 110
Pro Leu Val Gin Ser Leu Cys Ala Lys His Gly Ile Glu Tyr Gin Ser
115 120 125
Lys Pro Leu
130
Informace o SEQ ID NO: 12:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 87 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ií) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 12:
Cys 1 Ser Pro Lys Ser 5 Ser Pro Thr Arg Asn 10 Met Thr Pro Ser Pro 15 Phe
Ile Asp Trp Leu 20 Trp Gly Gly Leu Asn 25 Tyr Gin Ile Glu His 30 His Leu
Phe Pro Thr 35 Met Pro Arg Cys Asn 40 Leu Asn Arg Cys Met 45 Lys Tyr Val
Lys Glu 50 Trp Cys Ala Glu Asn 55 Asn Leu Pro Tyr Leu 60 Val Asp Asp Tyr
Phe 65 Val Gly Tyr Asn Leu 70 Asn Leu Gin Gin Leu 75 Lys Asn Met Ala Glu 80
Leu Val Gin Ala Lys Ala Ala 85
9
9 9 9
9 • ·
152 (2) Informace o SEQ ID NO: 13:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 143 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: : 13:
Arg His 1 Glu Ala Ala Arg Gly 5 Gly Thr Arg 10 Leu Ala Tyr Met Leu Val· 15
Cys Met Gin Trp 20 Thr Asp Leu Leu Trp 25 Ala Ala Ser Phe Tyr Ser Arg 30
Phe Phe Leu Ser 35 Tyr Ser Pro Phe 40 Tyr Gly Ala Thr Gly Thr Leu Leu 45
Leu Phe 50 Val Ala Val Arg Val 55 Leu Glu Ser His Trp Phe Val Trp Ile 60
Thr Gin 65 Met Asn His Ile Pro 70 Lys Glu Ile Gly His Glu Lys His Arg 75 80
Asp Trp Ala Ser Ser Gin Leu 85 Ala Ala Thr 90 Cys Asn Val Glu Pro Ser 95
Leu Phe Ile Asp 100 Trp Phe Ser Gly His 105 Leu Asn Phe Gin Ile Glu His 110
His Leu Phe Pro 115 Thr Met Thr Arg 120 His Asn Tyr Arg Xaa Val Ala Pro 125
Leu Val 130 Lys Ala Phe Cys Ala 135 Lys His Gly Leu His Tyr Glu Val 140
(2) Informace o SEQ ID NO: 14:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 186 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(Xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 14:
• · • · • · • · · · · • · · · • ·
153 • • • · • ·
Leu His His Thr Tyr Thr Asn Ile Ala Gly Ala Asp Pro Asp Val Ser
1 5 10 15
Thr Ser Glu Pro Asp Val Arg Arg Ile Lys Pro Asn Gin Lys Trp Phe
20 25 30
Val Asn His Ile Asn Gin His Met Phe Val Pro Phe Leu Tyr Gly Leu
35 40 45
Leu Ala Phe Lys Val Arg Ile Gin Asp Ile Asn Ile Leu Tyr Phe Val
50 55 60
Lys Thr Asn Asp Ala Ile Arg Val Asn Pro Ile Ser Thr Trp His Thr
65 70 75 80
Val Met Phe Trp Gly Gly Lys Ala Phe Phe Val Trp Tyr Arg Leu Ile
Val Pro Leu Gin Tyr Leu Pro Leu Gly Lys Val Leu Leu Leu Phe Thr 100 105 110
Val Ala Asp Met Val Ser Ser Tyr Trp Leu Ala Leu Thr Phe Gin Ala 115 120 125
Asn Tyr Val Val Glu Glu Val Gin Trp Pro Leu Pro Asp Glu Asn Gly 130 135 140
Ile Ile Gin Lys Asp Trp Ala Ala Met Gin Val Glu Thr Thr Gin Asp
145 150 155 160
Tyr Ala His Asp Ser His Leu Trp Thr Ser Ile Thr Gly Ser Leu Asn
165 170 175
Tyr Gin Xaa Val His His Leu Phe Pro His
180 185
(2) Informace o SEQ ID NO: 15:
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 5 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 15:
His Xaa Xaa His His • · • · (2)
154
Informace o SEQ ID NO: 16:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 446 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 16:
Met 1 Ala Ala Gin Ile Lys 5 Lys Tyr Ile Thr Ser Asp Glu Leu Lys Asn
10 15
His Asp Lys Pro Gly Asp Leu Trp Ile Ser Ile Gin Gly Lys Ala Tyr
20 25 30
Asp Val Ser Asp Trp Val Lys Asp His Pro Gly Gly Ser Phe Pro Leu
35 40 45
Lys Ser Leu Ala Gly Gin Glu Val Thr Asp Ala Phe Val Ala Phe His
50 55 60
Pro Ala Ser Thr Trp Lys Asn Leu Asp Lys Phe Phe Thr Gly Tyr Tyr
65 70 75 80
Leu Lys Asp Tyr Ser Val Ser Glu Val Ser Lys Val Tyr Arg Lys Leu
85 90 95
• ·
155
Val Phe Glu Phe Ser Lys Met Gly Leu Tyr Asp Lys Lys Gly His Ile 100 105 110
Met Phe Ala Thr Leu Cys Phe Ile Ala Met Leu Phe Ala Met Ser Val 115 120 125
Tyr Gly Val Leu Phe Cys Glu Gly Val Leu Val His Leu Phe Ser Gly 130 135 140
Cys Leu Met Gly Phe Leu Trp Ile Gin Ser Gly Trp Ile Gly His Asp
145 150 155 160
Ala Gly His Tyr Met Val Val Ser Asp Ser Arg Leu Asn Lys Phe Met
165 170 175
Gly Ile Phe Ala Ala Asn Cys Leu Ser Gly Ile Ser Ile Gly Trp Trp 180 185 190
Lys Trp Asn His Asn Ala His His Ile Ala Cys Asn Ser Leu Glu Tyr 195 200 205
Asp Pro Asp Leu Gin Tyr Ile Pro Phe Leu Val Val Ser Ser Lys Phe 210 215 220
Phe Gly Ser Leu Thr Ser His Phe Tyr Glu Lys Arg Leu Thr Phe Asp
225 230 235 240
Ser Leu Ser Arg Phe Phe Val Ser Tyr Gin His Trp Thr Phe Tyr Pro
245 250 ' 255
Ile Met Cys Ala Ala Arg Leu Asn Met Tyr Val Gin Ser Leu Ile Met 260 265 270
Leu Leu Thr Lys Arg Asn Val Ser Tyr Arg Ala Gin Glu Leu Leu Gly 275 280 285
Cys Leu Val Phe Ser Ile Trp Tyr Pro Leu Leu Val Ser Cys Leu Pro 290 295 300
Asn Trp Gly Glu Arg Ile Met Phe Val Ile Ala Ser Leu Ser Val Thr
305 310 315 320
Gly Met Gin Gin Val Gin Phe Ser Leu Asn His Phe Ser Ser Ser Val
325 330 335
Tyr Val Gly Lys Pro Lys Gly Asn Asn Trp Phe Glu Lys Gin Thr Asp 340 345 350
Gly Thr Leu Asp Ile Ser Cys Pro Pro Trp Met Asp Trp Phe His Gly 355 360 365
Gly Leu Gin Phe Gin Ile Glu His His Leu Phe Pro Lys Met Pro Arg 370 375 380
Cys Asn Leu Arg Lys Ile Ser Pro Tyr Val Ile Glu Leu Cys Lys Lys
385 390 395 400
His Asn Leu Pro Tyr Asn Tyr Ala Ser Phe Ser Lys Ala Asn Glu Met
405 410 415
Thr Leu
Lys Pro
156 • · • · • • « • · · · • · · • • • • • · • · • · • • • • · • · • · • ·
Arg Thr Leu Arg Asn Thr Ala Leu Gin Ala Arg Asp Ile Thr
420 425 430
Leu Pro Lys Asn Leu Val Trp Glu Ala Leu His Thr
435 440 445
(2) Informace o SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 359 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 17:
Met Leu Thr 1 Ala Glu 5 Arg Ile Lys Phe Thr 10 Gin Lys Arg Gly Phe Arg 15
Arg Val Leu Asn Gin Arg Val Asp Ala Tyr Phe Ala Glu His Gly Leu
20 25 30
Thr Gin Arg Asp Asn Pro Ser Met Tyr Leu Lys Thr Leu Ile Ile Val
35 40 45
Leu Trp Leu Phe Ser Ala Trp Ala Phe Val Leu Phe Ala Pro Val Ile
50 55 60
Phe Pro Val Arg Leu Leu Gly Cys Met Val Leu Ala Ile Ala Leu Ala
65 70 75 80
Ala Phe Ser Phe Asn Val Gly His Asp Ala Asn His Asn Ala Tyr Ser
85 90 95
Ser Asn Pro His Ile Asn Arg Val Leu Gly Met Thr Tyr Asp Phe Val
100 105 110
Gly Leu Ser Ser Phe Leu Trp Arg Tyr Arg His Asn Tyr Leu His His
115 120 125
Thr Tyr Thr Asn Ile Leu Gly His Asp Val Glu Ile His Gly Asp Gly
130 135 140
Ala Val Arg Met Ser Pro Glu Gin Glu His Val Gly Ile Tyr Arg Phe
145 150 155 160
Gin Gin Phe Tyr Ile Trp Gly Leu Tyr Leu Phe Ile Pro Phe Tyr Trp
165 170 175
Phe Leu Tyr Asp Val Tyr Leu Val Leu Asn Lys Gly Lys Tyr His Asp
180 185 190
His Lys Ile Pro Pro Phe Gin Pro Leu Glu Leu Ala Ser Leu Leu Gly
195 200 205
Ile Lys Leu Leu Trp Leu Gly Tyr Val Phe Gly Leu Pro Leu Ala Leu 210 215 220 • · • · · · • · · · • · · 9 • ·
Gly 225 Phe Ser Ile 157 Ala 235 • • Ser Val • Thr • · • · Tyr 9 9 9 9 9 Met 240
Pro Glu Val 230 Leu Ile Gly
Thr Tyr Gly Ile Val 245 Val Cys Thr Ile Phe 250 Met Leu Ala His Val 255 Leu
Glu Ser Thr Glu 260 Phe Leu Thr Pro Asp 265 Gly Glu Ser Gly Ala 270 Ile Asp
Asp Glu Trp Ala Ile Cys Gin Ile Arg Thr Thr Ala Asn Phe Ala Thr
275 280 285
Asn Asn 2 90 Pro Phe Trp Asn Trp 295 Phe Cys Gly Gly Leu 300 Asn His Gin Val
Thr 305 His His Leu Phe Pro 310 Asn Ile Cys His Ile 315 His Tyr Pro Gin Leu 320
Glu Asn Ile Ile Lys 325 Asp Val Cys Gin Glu 330 Phe Gly Val Glu Tyr 335 Lys
Val Tyr Pro Thr 340 Phe Lys Ala Ala Ile 345 Ala Ser Asn Tyr Arg 350 Trp Leu
Glu Ala Met Gly Lys Ala Ser
355 (2) Informace o SEQ ID NO: 18:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 365 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(Xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 18:
Met 1 Thr Ser Thr Thr 5 Ser Lys Val Thr Phe 10 Gly Lys Ser Ile Gly 15 Phe
Arg Lys Glu Leu 20 Asn Arg Arg val Asn 25 Ala Tyr Leu Glu Ala 30 Glu Asn
Ile Ser Pro 35 Arg Asp Asn Pro Pro 40 Met Tyr Leu Lys Thr 45 Ala Ile Ile
Leu Ala 50 Třp Val Val Ser Ala 55 Trp Thr Phe Val Val 60 Phe Gly Pro Asp
Val 65 Leu Trp Met Lys Leu 70 Leu Gly Cys Ile Val 75 Leu Gly Phe Gly Val 80
Ser Ala Val Gly Phe 85 Asn Ile Ser His Asp 90 Gly Asn His Gly Gly 95 Tyr
158
Ser Lys Tyr Gin Trp Val Asn Tyr Leu Ser Gly Leu Thr His Asp Ala
100 105 110
Ile Gly Val Ser Ser Tyr Leu Trp Lys Phe Arg His Asn Val Leu His
115 120 125
His Thr Tyr Thr Asn Ile Leu Gly His Asp Val Glu Ile His Gly Asp
130 135 140
Glu Leu Val Arg Met Ser Pro Ser Met Glu Tyr Arg Trp Tyr His Arg
145 150 155 160
Tyr Gin His Trp Phe Ile Trp Phe Val Tyr Pro Phe Ile Pro Tyr Tyr
165 170 175
Trp Ser Ile Ala Asp Val Gin Thr Met Leu Phe Lys Arg Gin Tyr His
180 185 190
Asp His Glu Ile Pro Ser Pro Thr Trp Val Asp Ile Ala Thr Leu Leu
195 200 205
Ala Phe Lys Ala Phe Gly Val Ala Val Phe Leu Ile Ile Pro Ile Ala
210 215 220
Val Gly Tyr Ser Pro Leu Glu Ala Val Ile Gly Ala Ser Ile Val Tyr
225 230 235 240
Met Thr His Gly Leu Val Ala Cys Val Val Phe Met Leu Ala His Val
245 250 255
Ile Glu Pro Ala Glu Phe Leu Asp Pro Asp Asn Leu His Ile Asp Asp
260 265 270
Glu Trp Ala Ile Ala Gin Val Lys Thr Thr Val Asp Phe Ala Pro Asn
275 280 285
Asn Thr Ile Ile Asn Trp Tyr Val Gly Gly Leu Asn Tyr Gin Thr Val
290 295 300
His His Leu Phe Pro His Ile Cys His Ile His Tyr Pro Lys Ile Ala
305 310 315 320
Pro Ile Leu Ala Glu Val Cys Glu Glu Phe Gly Val Asn Tyr Ala Val
325 330 335
His Gin Thr Phe Phe Gly Ala Leu Ala Ala Asn Tyr Ser Trp Leu Lys
340 345 350
Lys Met Ser Ile Asn Pro Glu Thr Lys Ala Ile Glu Gin
355 360 365
2) Informace o SEQ ID NO: 19:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 35 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina • · • · ·« ···« · · · * ···· · · · · · · · (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 19:
CCAAGCTTCT GCAGGAGCTC TTTTTTTTTT TTTT 35 (2) Informace o SEQ ID NO: 20:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 32 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (iii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
(A) POPIS: (desc = „syntetický oligonukleotid
ix) ZNAKY: (A) Název/klíč: mise feature (B) Pozice: 21 (C) Jiné informace: / počet= 1 /poznámka= „N=inozin nebo
ix) cytozin ZNAKY: (A) Název/klíč: mise feature (B) Pozice: 27 (C) Jiné informace: / počet= 2 /poznámka= „N=inozin nebo
Xi) cytozin Popis sekvence: SEQ ID NO: 20:
CUACUACUAC UACAYCAYAC NTAYACNAAY AT 32 (2) Informace o SEQ ID NO: 21:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 27 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
160
(ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
(A) POPIS: (desc = „syntetický oligonukleofid
(ix) ZNAKY: (A) Název/klíč: mise feature (B) Pozice: 13 (C) Jiné informace: / počet= 1 /poznámka= „N=inozin nebo
(ix) cytozin ZNAKY: (A) Název/klíč: mise feature (B) Pozice: 19 (C) Jiné informace: / počet= 2 /poznámka= „N=inozin nebo
(Xi) cytozin Popis sekvence: SEQ ID NO: 21:
CAUCAUCAUC AUNGGRAANA RRTGRTG 27 (2) Informace o SEQ ID NO: 22:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 22:
CUACUACUAC UAGGAGTCCT CTACGGTGTT TTG 33 (2) Informace o SEQ ID NO: 23:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 33 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová • · • · · ···· ···· ···· · · · · · · *
161 · ···· ···
(ii) (xi) (D) TOPOLOGIE: lineární
DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
Popis sekvence: SEQ ID NO: 23:
CAUCAUCAUC AUATGATGCT CAAGCTGAAA CTG
(2) Informace o SEQ ID NO: 24:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 5 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 24:
Gin Xaa Xaa His His
5 (2) Informace o SEQ ID NO: 25:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 39 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 25:
CUACUACUAC UACTCGAGCA AGATGGGAAC GGACCAAGG 39 (2) Informace o SEQ ID NO: 26:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 39 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová • · ·«·· · '. ·· ·· · · ··· ···· » · · ♦ • · · · ·· · ···«
162 · · · · · ··«· ··»···· ·· ···· «· ·· (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 26:
CAUCAUCAUC AUCTCGAGCT ACTCTTCCTT GGGACGGAG 39 (2) Informace o SEQ ID NO: 27:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 47 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 27:
CUACUACUAC UATCTAGACT CGAGACCATG GCTGCTGCTC CAGTGTG 47 (2) Informace o SEQ ID NO: 28:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 40 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 28:
CAUCAUCAUC AUAGGCCTCG AGTTACTGCG CCTTACCCAT 40 (2) Informace o SEQ ID NO: 29:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 37párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: j ednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
163 (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 29:
CUACUACUA CUAGGATCCA TGGCACCTCC CAACACT
(2) Inf oj rmace o SEQ ID NO: 30:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 42 párů bázi (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ií) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 30:
CAUCAUCAU CAUGGTACCT CGAGTTACTT CTTGAAAAAG AC
(2) Informace o SEQ ID NO: 31:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 1219 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: jiné nukleové kyseliny kontig 2692004)
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 31:
(editovaný
GCACGCCGAC CGGCGCCGGG AGATCCTGGC AAAGTATCCA GAGATAAAGT CCTTGATGAA 60
ACCTGATCGC AATTTGATAT GGATTATAAT TATGATGGTT CTCACCCAGT TGGGTGCATT 120
TTACATAGTA AAAGACTTGG ACTGGAAATG GGTCATATTT GGGGCCTATG CGTTTGGCAG 180
TTGCATTAAC CACTCAATGA CTCTGGCTAT TCATGAGATT GCCCACAATG CTGCCTTTGG 240
CAACTGCAAA GCAATGTGGA ATCGCTGGTT TGGAATGTTT GCTAATCTTC CTATTGGGAT 300
TCCATATTCA ATTTCCTTTA AGAGGTATCA CATGGATCAT CATCGGTACC TTGGAGCTGA 360
TGGCGTCGAT GTAGATATTC CTACCGATTT TGAGGGCTGG TTCTTCTGTA CCGCTTTCAG 420
AAAGTTTATA TGGGTTATTC TTCAGCCTCT CTTTTATGCC TTTCGACCTC TGTTCATCAA 480 • · • « • · • · · ·
164 • · · · '
CCCCAAACCA ATTACGTATC TGGAAGTTAT CAATACCGTG GCACAGGTCA CTTTTGACAT 540
TTTAATTTAT TACTTTTTGG GAATTAAATC CTTAGTCTAC ATGTTGGCAG CATCTTTACT 600
TGGCCTGGGT TTGCACCCAA TTTCTGGACA TTTTATAGCT GAGCATTACA TGTTCTTAAA 660
GGGTCATGAA ACTTACTCAT ATTATGGGCC TCTGAATTTA CTTACCTTCA ATGTGGGTTA 720
TCATAATGAA CATCATGATT TCCCCAACAT TCCTGGAAAA AGTCTTCCAC TGGTGAGGAA 780
AATAGCAGCT GAATACTATG ACAACCTCCC TCACTACAAT TCCTGGATAA AAGTACTGTA 840
TGATTTTGTG ATGGATGATA CAATAAGTCC CTACTCAAGA ATGAAGAGGC ACCAAAAAGG 900
AGAGATGGTG CTGGAGTAAA TATCATTAGT GCCAAAGGGA TTCTTCTCCA AAACTTTAGA 960
TGATAAAATG GAATTTTTGC ATTATTAAAC TTGAGACCAG TGATGCTCAG AAGCTCCCCT 1020
GGCACAATTT CAGAGTAAGA GCTCGGTGAT ACCAAGAAGT GAATCTGGCT TTTAAACAGT 1080
CAGCCTGACT CTGTACTGCT CAGTTTCACT CACAGGAAAC TTGTGACTTG TGTATTATCG 1140
TCATTGAGGA AAAAAGCTAT TGTTTCACTC TTCGCCAGG ATGTCTGTCA TTTTATAAGC ATATCATTTA AAAAGCTTCT 1200 1219
(2) Informace o SEQ ID NO: 32:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 655 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(li) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
kontig 2153526)
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 32:
(editovaný
TTACCTTCTA CGTCCGCTTC TTCCTCACTT ATGTGCCACT ATTGGGGCTG AAAGCTTCCT 60
GGGCCTTTTC TTCATAGTCA GGTTCCTGGA AAGCAACTGG TTTGTGTGGG TGACACAGAT 120
GAACCATATT CCCATGCACA TTGATCATGA CCGGAACATG GACTGGGTTT CCACCCAGCT 180
CCAGGCCAGA TGCAATGTCC ACAAGTCTGC CTTCAATGAC TGGTTCAGTG GACACCTCAň 240
CTTCCAGATT GAGCACCATC TTTTTCCCAC GATGCCTCGA CACAATTACC ACAAAGTGGC 300
TCCCCTGGTG CAGTCCTTGT GTGCCAAGCA TGGCATAGAG TACCAGTCCA AGCCCCTGCT 360
GTCAGCCTTC GCCGACATCA TCCACTCACT AAAGGAGTCA GGGCAGCTCT GGCTAGATGC 420
CTATCTTCAC CAATAACAAC AGCCACCCTG CCCAGTCTGG AAGAAGAGGA GGAAGACTCT 480
GGAGCCAAGG CAGAGGGGAG CTTGAGGGAC AATGCCACTA TAGTTTAATA CTCAGAGGGG 540
GTTGGGTTTG GGGACATAAA GCCTCTGACT CAAACTCCTC CCTTTTATCT TCTAGCCACA 600
GTTCTAAGAC CCAAAGTGGG GGGTGGACAC AGAAGTCCCT AGGAGGGAAG GAGCT
655 • ♦ · · • · • · · · · • · · · ·
165 (2) Informace o SEQ ID NO: 33:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 304 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
kontig 2153526)
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 33:
(editovaný
GTCTTTTACT TTGGCAATGG CTGGATTCCT ACCCTCATCA CGGCCTTTGT CCTTGCTACC 60
TCTCAGGCCC AAGCTGGATG GCTGCAACAT GATTATGGCC ACCTGTCTGT CTACAGAAAA 120
CCCAAGTGGA ACCACCTTGT CCACAAATTC GTCATTGGCC ACTTAAAGGG TGCCTCTGCC 180
AACTGGTGGA ATCATCGCCA CTTCCAGCAC CACGCCAAGC CTAACATCTT CCACAAGGAT 240
CCCGATGTGA ACATGCTGCA CGTGTTTGTT CTGGGCGAAT GGCAGCCCAT CGAGTACGGC 300
AAGA 304 (2)
Informace o SEQ ID NO: 34:
i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 918 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina
(editovaný kontig 3854933) xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 34:
CAGGGACCTA CCCCGCGCTA CTTCACCTGG GACGAGGTGG CCCAGCGCTC AGGGTGCGAG 60
GAGCGGTGGC TAGTGATCGA CCGTAAGGTG TACAACATCA GCGAGTTCAC CCGCCGGCAT- 120
CCAGGGGGCT CCCGGGTCAT CAGCCACTAC GCCGGGCAGG ATGCCACGGA TCCCTTTGTG 180
GCCTTCCACA TCAACAAGGG CCTTGTGAAG AAGTATATGA ACTCTCTCCT GATTGGAGAA 240
CTGTCTCCAG AGCAGCCCAG CTTTGAGCCC ACCAAGAATA AAGAGCTGAC AGATGAGTTC 300
CGGGAGCTGC GGGCCACAGT GGAGCGGATG GGGCTCATGA AGGCCAACCA TGTCTTCTTC 360
CTGCTGTACC TGCTGCACAT CTTGCTGCTG GATGGTGCAG CCTGGCTCAC CCTTTGGGTC 420
TTTGGGACGT CCTTTTTGCC CTTCCTCCTC TGTGCGGTGC TGCTCAGTGC AGTTCAGGCC 480
CAGGCTGGCT GGCTGCAGCA TGACTTTGGG CACCTGTCGG TCTTCAGCAC CTCAAAGTGG 540 • ·
AACCATCTGC TACATCATTT TGTGATTGGC 166 CACCTGAAGG • • • · · · · · • · · # • · · · · · CAGTTGGTGG « * · • · 600
GGGCCCCCGC
AACCACATGC ACTTCCAGCA CCATGCCAAG CCCAACTGCT TCCGCAAAGA CCCAGACATC 660
AACATGCATC CCTTCTTCTT TGCCTTGGGG AAGATCCTCT CTGTGGAGCT TGGGAAACAG 720
AAGAAAAAAT ATATGCCGTA CAACCACCAG CACARATACT TCTTCCTAAT TGGGCCCCCA 780
GCCTTGCTGC CTCTCTACTT CCAGTGGTAT ATTTTCTATT TTGTTATCCA GCGAAAGAAG 840
TGGGTGGACT TGGCCTGGAT CAGCAAACAG GAATACGATG AAGCCGGGCT TCCATTGTCC 900
ACCGCAAATG CTTCTAAA 918
2)
Informace o SEQ ID NO: 35:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1686 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (ii) (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina kontig 3854933) (editovaný
(Xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: : 35:
GCCACTTAAA GGGTGCCTCT GCCAACTGGT GGAATCATCG CCACTTCCAG CACCACGCCA 60
AGCCTAACAT CTTCCACAAG GATCCCGATG TGAACATGCT GCACGTGTTT GTTCTGGGCG 120
AATGGCAGCC CATCGAGTAC GGCAAGAAGA AGCTGAAATA CCTGCCCTAC AATCACCAGC 180
ACGAATACTT CTTCCTGATT GGGCCGCCGC TGCTCATCCC CATGTATTTC CAGTACCAGA 240
TCATCATGAC CATGATCGTC CATAAGAACT GGGTGGACCT GGCCTGGGCC GTCAGCTACT 300
ACATCCGGTT CTTCATCACC TACATCCCTT TCTACGGCAT CCTGGGAGCC CTCCTTTTCC 360
TCAACTTCAT CAGGTTCCTG GAGAGCCACT GGTTTGTGTG GGTCACACAG ATGAATCACA 420
TCGTCATGGA GATTGACCAG GAGGCCTACC GTGACTGGTT CAGTAGCCAG CTGACAGCCA 480
CCTGCAACGT GGAGCAGTCC TTCTTCAACG ACTGGTTCAG TGGACACCTT AACTTCCAGA 540
TTGAGCACCA CCTCTTCCCC ACCATGCCCC GGCACAACTT ACACAAGATC GCCCCGCTGG 600
TGAAGTCTCT ATGTGCCAAG CATGGCATTG AATACCAGGA GAAGCCGCTA CTGAGGGCCC 660
TGCTGGACAT CATCAGGTCC CTGAAGAAGT CTGGGAAGCT GTGGCTGGAC GCCTACCTTC 720
ACAAATGAAG CCACAGCCCC CGGGACACCG TGGGGAAGGG GTGCAGGTGG GGTGATGGCC 780
AGAGGAATGA TGGGCTTTTG TTCTGAGGGG TGTCCGAGAG GCTGGTGTAT GCACTGCTCA 840
CGGACCCCAT GTTGGATCTT TCTCCCTTTC TCCTCTCCTT TTTCTCTTCA CATCTCCCCC 900
ATAGCACCCT GCCCTCATGG GACCTGCCCT CCCTCAGCCG TCAGCCATCA GCCATGGCCC 960 • ♦ · ·
TCCCAGTGCC TCCTAGCCCC TTCTTCCAAG 167 GAGCAGAGAG • · * • · · • • • · · · • · · · • · · · • · · · · · « GGGGTGGCTC • · • « • · • · 1020
GTGGCCACCG
TGTCCTACCT CCACTCTCTG CCCCTAAAGA TGGGAGGAGA CCAGCGGTCC ATGGGTCTGG 1080
CCTGTGAGTC TCCCCTTGCA GCCTGGTCAC TAGGCATCAC CCCCGCTTTG GTTCTTCAGA 1140
TGCTCTTGGG GTTCATAGGG GCAGGTCCTA GTCGGGCAGG GCCCCTGACC CTCCCGGCCT 1200
GGCTTCACTC TCCCTGACGG CTGCCATTGG TCCACCCTTT CATAGAGAGG CCTGCTTTGT 1260
TACAAAGCTC GGGTCTCCCT CCTGCAGCTC GGTTAAGTAC CCGAGGCCTC TCTTAAGATG 1320
TCCAGGGCCC CAGGCCCGCG GGCACAGCCA GCCCAAACCT TGGGCCCTGG AAGAGTCCTC 1380
CACCCCATCA CTAGAGTGCT CTGACCCTGG GCTTTCACGG GCCCCATTCC ACCGCCTCCC 1440
CAACTTGAGC CTGTGACCTT GGGACCAAAG GGGGAGTCCC TCGTCTCTTG TGACTCAGCA 1500
GAGGCAGTGG CCACGTTCAG GGAGGGGCCG GCTGGCCTGG AGGCTCAGCC CACCCTCCAG 1560
CTTTTCCTCA GGGTGTCCTG AGGTCCAAGA TTCTGGAGCA ATCTGACCCT TCTCCAAAGG 1620
CTCTGTTATC AGCTGGGCAG TGCCAGCCAA TCCCTGGCCA TTTGGCCCCA GGGGACGTGG 1680
GCCCTG 1686
(2) Informace o SEQ ID NO: 36:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1843 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (kontig 2535) (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 36:
GTCTTTTACT TTGGCAATGG CTGGATTCCT ACCCTCATCA CGGCCTTTGT CCTTGCTACC 60
TCTCAGGCCC AAGCTGGATG GCTGCAACAT GATTATGGCC ACCTGTCTGT CTACAGAAAA 120
CCCAAGTGGA ACCACCTTGT CCACAAATTC GTCATTGGCC ACTTAAAGGG TGCCTCTGCC 180
AACTGGTGGA ATCATCGCCA CTTCCAGCAC CACGCCAAGC CTAACATCTT CCACAAGGAT 240
CCCGATGTGA ACATGCTGCA CGTGTTTGTT CTGGGCGAAT GGCAGCCCAT CGAGTACGGC 300
AAGAAGAAGC TGAAATACCT GCCCTACAAT CACCAGCACG AATACTTCTT CCTGATTGGG 360
CCGCCGCTGC TCATCCCCAT GTATTTCCAG TACCAGATCA TCATGACCAT GATCGTCCAT 420
AAGAACTGGG TGGACCTGGC CTGGGCCGTC AGCTACTACA TCCGGTTCTT CATCACCTAC 480
ATCCCTTTČT ACGGCATCCT GGGAGCCCTC CTTTTCCTCA ACTTCATCAG GTTCCTGGAG 540
AGCCACTGGT TTGTGTGGGT CACACAGATG AATCACATCG TCATGGAGAT TGACCAGGAG 600
GCCTACCGTG ACTGGTTCAG TAGCCAGCTG ACAGCCACCT GCAACGTGGA GCAGTCCTTC 660
TTCAACGACT GGTTCAGTGG ACACCTTAAC TTCCAGATTG AGCACCACCT CTTCCCCACC 720
• ·
168
ATGCCCCGGC ACAACTTACA CAAGATCGCC CCGCTGGTGA AGTCTCTATG TGCCAAGCAT 780
GGCATTGAAT ACCAGGAGAA GCCGCTACTG AGGGCCCTGC TGGACATCAT CAGGTCCCTG 840
AAGAAGTCTG GGAAGCTGTG GCTGGACGCC TACCTTCACA AATGAAGCCA CAGCCCCCGG 900
GACACCGTGG GGAAGGGGTG CAGGTGGGGT GATGGCCAGA GGAATGATGG GCTTTTGTTC 960
TGAGGGGTGT CCGAGAGGCT GGTGTATGCA CTGCTCACGG ACCCCATGTT GGATCTTTCT 1020
CCCTTTCTCC TCTCCTTTTT CTCTTCACAT CTCCCCCATA GCACCCTGCC CTCATGGGAC 1080
CTGCCCTCCC TCAGCCGTCA GCCATCAGCC ATGGCCCTCC CAGTGCCTCC TAGCCCCTTC 1140
TTCCAAGGAG CAGAGAGGTG GCCACCGGGG GTGGCTCTGT CCTACCTCCA CTCTCTGCCC 1200
CTAAAGATGG GAGGAGACCA GCGGTCCATG GGTCTGGCCT GTGAGTCTCC CCTTGCAGCC 1260
TGGTCACTAG GCATCACCCC CGCTTTGGTT CTTCAGATGC TCTTGGGGTT CATAGGGGCA 1320
GGTCCTAGTC GGGCAGGGCC CCTGACCCTC CCGGCCTGGC TTCACTCTCC CTGACGGCTG 1380
CCATTGGTCC ACCCTTTCAT AGAGAGGCCT GCTTTGTTAC AAAGCTCGGG TCTCCCTCCT 1440
GCAGCTCGGT TAAGTACCCG AGGCCTCTCT TAAGATGTCC AGGGCCCCAG GCCCGCGGGC 1500
ACAGCCAGCC CAAACCTTGG GCCCTGGAAG AGTCCTCCAC CCCATCACTA GAGTGCTCTG 1560
ACCCTGGGCT TTCACGGGCC CCATTCCACC GCCTCCCCAA CTTGAGCCTG TGACCTTGGG 1620
ACCAAAGGGG GAGTCCCTCG TCTCTTGTGA CTCAGCAGAG GCAGTGGCCA CGTTCAGGGA 1680
GGGGCCGGCT GGCCTGGAGG CTCAGCCCAC CCTCCAGCTT TTCCTCAGGG TGTCCTGAGG 1740
TCCAAGATTC TGGAGCAATC TGACCCTTCT CCAAAGGCTC TGTTATCAGC TGGGCAGTGC 1800
CAGCCAATCC CTGGCCATTT GGCCCCAGGG GACGTGGGCC CTG 1843
Informace o SEQ ID NO: 37:
(i) (xi)
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 2257 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární
DRUH MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (editovaný kontig 253538a)
Popis sekvence: SEQ ID NO: 37:
CAGGGACCTA CCCCGCGCTA CTTCACCTGG GACGAGGTGG CCCAGCGCTC AGGGTGCGAG 60
GAGCGGTGGC TAGTGATCGA CCGTAAGGTG TACAACATCA GCGAGTTCAC CCGCCGGCAT 120
CCAGGGGGČT CCCGGGTCAT CAGCCACTAC GCCGGGCAGG ATGCCACGGA TCCCTTTGTG 180
GCCTTCCACA TCAACAAGGG CCTTGTGAAG AAGTATATGA ACTCTCTCCT GATTGGAGAA 240
CTGTCTCCAG AGCAGCCCAG CTTTGAGCCC ACCAAGAATA AAGAGCTGAC AGATGAGTTC 300
CGGGAGCTGC GGGCCACAGT GGAGCGGATG GGGCTCATGA AGGCCAACCA TGTCTTCTTC 360
CTGCTGTACC
TTTGGGACGT
GCCCAAGCTG
TGGAACCACC
TGGAATCATC
GTGAACATGC
AAGCTGAAAT
CTGCTCATCC
TGGGTGGACC
TTCTACGGCA
TGGTTTGTGT
CGTGACTGGT
GACTGGTTCA
CGGCACAACT
GAATACCAGG
TCTGGGAAGC
GTGGGGAAGG
GTGTCCGAGA
CTCCTCTCCT
TCCCTCAGCC
GGAGCAGAGA
ATGGGAGGAG
CTAGGCATCA
AGTCGGGCAG
GTCCACCCTT
CGGTTAAGTA
AGCCCAAACC
GGCTTTCACG
GGGGGAGTCC
GGCTGGCCTG
ATTCTGGAGC
TGCTGCACAT
CCTTTTTGCC
GATGGCTGCA
TTGTCCACAA
GCCACTTCCA
TGCACGTGTT
ACCTGCCCTA
CCATGTATTT
TGGCCTGGGC
TCCTGGGAGC
GGGTCACACA
TCAGTAGCCA
GTGGACACCT
TACACAAGAT
AGAAGCCGCT
TGTGGCTGGA
GGTGCAGGTG
GGCTGGTGTA
TTTTCTCTTC
GTCAGCCATC
GGTGGCCACC
ACCAGCGGTC
CCCCCGCTTT
GGCCCCTGAC
TCATAGAGAG
CCCGAGGCCT
TTGGGCCCTG
GGCCCCATTC
CTCGTCTCTT
GAGGCTCAGC
AATCTGACCC
CTTGCTGCTG
CTTCCTCCTC
ACATGATTAT
ATTCGTCATT
GCACCACGCC
TGTTCTGGGC
CAATCACCAG
CCAGTACCAG
CGTCAGCTAC
CCTCCTTTTC
GATGAATCAC
GCTGACAGCC
TAACTTCCAG
CGCCCCGCTG
ACTGAGGGCC
CGCCTACCTT
GGGTGATGGC
TGCACTGCTC
ACATCTCCCC
AGCCATGGCC
GGGGGTGGCT
CATGGGTCTG
GGTTCTTCAG
CCTCCCGGCC
GCCTGCTTTG
CTCTTAAGAT
GAAGAGTCCT
CACCGCCTCC
GTGACTCAGC
CCACCCTCCA
TTCTCCAAAG
169
GATGGTGCAG
TGTGCGGTGC
GGCCACCTGT
GGCCACTTAA
AAGCCTAACA
GAATGGCAGC
CACGAATACT
ATCATCATGA
TACATCCGGT
CTCAACTTCA
ATCGTCATGG
ACCTGCAACG
ATTGAGCACC
GTGAAGTCTC
CTGCTGGACA
CACAAATGAA
CAGAGGAATG
ACGGACCCCA
CATAGCACCC
CTCCCAGTGC
CTGTCCTACC
GCCTGTGAGT
ATGCTCTTGG
TGGCTTCACT
TTACAAAGCT
GTCCAGGGCC
CCACCCCATC
CCAACTTGAG
AGAGGCAGTG
GCTTTTCCTC
GCTCTGTTAT
CCTGGCTCAC
TGCTCAGTGC
CTGTCTACAG
AGGGTGCCTC
TCTTCCACAA
CCATCGAGTA
TCTTCCTGAT
CCATGATCGT
TCTTCATCAC
TCAGGTTCCT
AGATTGACCA
TGGAGCAGTC
ACCTCTTCCC
TATGTGCCAA
TCATCAGGTC
GCCACAGCCC
ATGGGCTTTT
TGTTGGATCT
TGCCCTCATG
CTCCTAGCCC
TCCACTCTCT
CTCCCCTTGC
GGTTCATAGG
CTCCCTGACG
CGGGTCTCCC
CCAGGCCCGC
ACTAGAGTGC
CCTGTGACCT
GCCACGTTCA
AGGGTGTCCT
CAGCTGGGCA • ** ·· • · · «
CCTTTGGGTC
AGTTCAGCAG
AAAACCCAAG
TGCCAACTGG
GGATCCCGAT
CGGCAAGAAG
TGGGCCGCCG
CCATAAGAAC
CTACATCCCT
GGAGAGCCAC
GGAGGCCTAC
CTTCTTCAAC
CACCATGCCC
GCATGGCATT
CCTGAAGAAG
CCGGGACACC
GTTCTGAGGG
TTCTCCCTTT
GGACCTGCCC
CTTCTTCCAA
GCCCCTAAAG
AGCCTGGTCA
GGCAGGTCCT
GCTGCCATTG
TCCTGCAGCT
GGGCACAGCC
TCTGACCCTG
TGGGACCAAA
GGGAGGGGCC
GAGGTCCAAG
GTGCCAGCCA • · · · • * » 9 » · · · * • · · · • · · ·
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1320
1380
1440
1500
1560
1620
1680
1740
1800
1860
1920
1980
2040
2100
2160
2220
ATCCCTGGCC ATTTGGCCCC AGGGGACGTG GGCCCTG
2257 • · ··*· · · ♦» ·« »· • · t · · · · *·«· • · · · · · · · «· · • »··· >«···· • · · · · ♦ · · · ······· ·« « 4 · · · · *·
170 (2) Informace o SEQ ID NO: 38:
i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 411 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: aminokyselina (translace kontigu
2692004)
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 38:
His Ala Asp Arg Arg Arg Glu Ile Leu Ala Lys Tyr Pro Glu Ile
1 5 10 15
Lys Ser Leu Met Lys Pro Asp Pro Asn Leu Ile Trp Ile Ile Ile
20 25 30
Met Met Val Leu Thr Gin Leu Gly Ala Phe Tyr Ile Val Lys Asp
35 40 45
Leu Asp Trp Lys Trp Val Ile Phe Gly Ala Tyr Ala Phe Gly Ser
50 55 60
Cys Ile Asn His Ser Met Thr Leu Ala Ile His Glu Ile Ala His
65 70 75
Asn Ala Ala Phe Gly Asn Cys Lys Ala Met Trp Asn Arg Trp Phe
80 85 90
Gly Met Phe Ala Asn Leu Pro Ile Gly Ile Pro Tyr Ser Ile Ser
95 100 105
Phe Lys Arg Tyr His Met Asp His His Arg Tyr Leu Gly Ala Asp
110 115 120
Gly Val Asp Val Asp Ile Pro Thr Asp Phe Glu Gly Trp Phe Phe
125 130 135
Cys Thr Ala Phe Arg Lys Phe Ile Trp Val Ile Leu Gin Pro Leu
140 145 150
Phe Tyr Ala Phe Arg Pro Leu Phe Ile Asn Pro Lys Pro Ile Thr
155 160 165
Tyr Leu Glu Val Ile Asn Thr Val Ala Gin Val Thr Phe Asp Ile
170 175 180
Leu Ile Tyr Tyr Phe Leu Gly Ile Lys Ser Leu Val Tyr Met Leu
185 190 195
Ala Ala Ser Leu Leu Gly Leu Gly Leu His Pro Ile Ser Gly His
200 205 210
Phe Ile Ala Glu His Tyr Met Phe Leu Lys Gly His Glu Thr Tyr
215 220 225
Ser Tyr Tyr Gly Pro Leu Asn Leu Leu Thr Phe Asn Val Gly Tyr
230 235 240
His Asn Glu His His Asp Phe Pro Asn Ile Pro Gly Lys Ser Leu
245 250 255
Pro Leu Val Arg Lys Ile Ala Ala Glu Tyr Tyr Asp Asn Leu Pro
260 265 270
His Tyr Asn Ser Trp Ile Lys Val Leu Tyr Asp Phe Val Met Asp
275 280 285
Asp Thr Ile Sér Pro Tyr Ser Arg Met Lys Arg His Gin Lys Gly
290 295 300
Glu Met Val Leu Glu ★ ★ ★ Ile Ser Leu Val Pro Lys Gly Phe Phe
305 310 315
Ser Lys Thr Leu Asp Asp Lys Met Glu Phe Leu His Tyr ★ ★ ★ Thr
320 325 330
* ★ ★ Asp Gin * * * Cys Ser Glu Ala Pro Leu Ala Gin Phe Gin Ser
335 340 345
Lys Ser Ser Val Ile Pro Arg Ser Glu Ser Gly Phe ★ ★ ★ Thr Val
350 355 360
• · · » · ·
171
Ser Leu Thr Leu Tyr 365 Cys Ser Val Ser Leu 370 Thr Gly Asn Leu ★ ★ ★ 375
Leu Val Tyr Tyr Arg His ★ ★ ★ Gly Cys Phe Thr His Val Cys His
380 385 390
Phe Ile Ser Ile Ser Phe Lys Lys Leu Leu Lys Ser Tyr Phe Ala
400 405 410
Arg
(2) Informace o SEQ ID NO: 39:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 218 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(11) (D) TOPOLOGIE: DRUH MOLEKULY: lineární aminokyselina (translace kontigu
(xi) 2153526) Popis sekvence: SEQ ID NO: 39:
Tyr Leu Leu Arg Pro Leu Leu Pro His Leu Cys Ala Thr Ile Gly
1 5 10 15
Ala Glu Ser Phe Leu Gly Leu Phe Phe Ile Val Arg Phe Leu Glu
20 25 30
Ser Asn Trp Phe Val Trp Val Thr Gin Met Asn His Ile Pro Met
35 40 45
His Ile Asp His Asp Arg Asn Met Asp Trp Val Ser Thr Gin Leu
50 55 60
Gin Ala Thr Cys Asn Val His Lys Ser Ala Phe Asn Asp Trp Phe
65 70 75
Ser Gly His Leu Asn Phe Gin Ile Glu His His Leu Phe Pro Thr
80 85 90
Met Pro Arg His Asn Tyr His Lys Val Ala Pro Leu Val Gin Ser
95 100 105
Leu Cys Ala Lys His Gly Ile Glu Tyr Gin Ser Lys Pro Leu Leu
110 115 120
Ser Ala Phe Ala Asp Ile Ile His Ser Leu Lys Glu Ser Gly Gin
125 130 135
Leu Trp Leu Asp Ala Tyr Leu His Gin + ★ ★ Gin Gin Pro Pro Cys
140 145 150
Pro Val Trp Lys Lys Arg Arg Lys Thr Leu Glu Pro Arg Gin Arg
155 160 165
Gly Ala ★ ★ ★ Gly Thr Met Pro Leu ★ ★ * Phe Asn Thr Gin Arg Gly
170 175 180
Leu Gly Leu Gly Thr ★ ★ * Ser Leu * * * Leu Lys Leu Leu Pro Phe
185 190 195
Ile Phe ★ ★ ★ Pro Gin Phe ★ ★ ★ Asp Pro Lys Trp Gly Val Asp Thr
200 205 210
Glu Val Pro Arg Arg Glu Gly Ala
215
172 (2) Informace o SEQ ID NO: 40:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 71 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: (translace kontigu 3506132) (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 40:
Val Phe Tyr Phe Gly Asn Gly Trp Ile Pro Thr Leu Ile Thr
1 5 10
Phe Val Leu Ala Thr Ser Gin Ala Gin Ala Gly Trp Leu Gin
20 25
Asp Tyr Gly His Leu Ser Val Tyr Arg Lys Pro Lys Trp Asn
35 40
Leu Val His Lys Phe Val Ile Gly His Leu Lys Gly Ala Ser
50 55
Asn Trp Trp Asn His Arg His Phe Gin His His Ala Lys Pro
65 70
Leu Gly Glu Trp Gin Pro Ile Glu Tyr Gly Lys Xxx
80 85
Ala
His
His
Ala
Asn
2)
Informace o SEQ ID NO: 41:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 306 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: aminokyselina (tra
3854933)
(xii) Popis sekvence: SEQ ID NO: 41:
kontigu
Gin 1 Arg Gly Pro Thr Cys Pro Arg 5 Glu Glu 20 Tyr Arg Phe Trp Thr Leu Trp 10 Val 25 Asp Glu Ile Asp Val Arg Ala Lys Gin 15 Val 30
Ser Gly
Tyr Asn Ile Ser Glu Phe Thr Arg Arg His Pro Gly Gly Ser Arg
35 40 45
Val Ile Ser His Tyr Ala Gly Gin Asp Ala Thr Asp Pro Phe Val
50 55 60
Ala Phe His Ile Asn Lys Gly Leu Val Lys Lys Tyr Met Asn Ser
65 70 75
Leu Leu Ile Gly Glu Leu Ser Pro Glu Gin Pro Ser Phe Glu Pro
80 85 90
Thr Lys Asn Lys Glu Leu Thr Asp Glu Phe Arg Glu Leu Arg Ala
95 100 105
Thr Val Glu Arg Met Gly Leu Met Lys Ala Asn His Val Phe Phe
- 110 115 120
Leu Leu Tyr Leu Leu His Ile Leu Leu Leu Asp Gly Ala Ala Trp
125 130 135
Leu Thr Leu Trp Val Phe Gly Thr Ser Phe Leu Pro Phe Leu Leu
140 145 150
- - ·. m a Val Gin Ala Gin Ala Gly Trp Leu
«* ···· ··
2)
173
Gin His Asp Phe 155 Gly His Leu Ser Val
Asn His Leu Leu 170 His His Phe Val Ile
Pro Ala Ser Trp 185 Trp Asn His Met His
Pro Asn Cys Phe 200 Arg Lys Asp Pro Asp
Phe Phe Ala Leu 215 Gly Lys Ile Leu Ser
Lys Lys Lys Tyr 230 Met Pro Tyr Asn His
Leu Ile Gly Pro 245 Pro Ala Leu Leu Pro
Ile Phe Tyr Phe 260 Val Ile Gin Arg Lys
Trp Ile Ser Lys 275 Gin Glu Tyr Asp Glu
Thr Ala Asn Ala 290 Ser 305 Lys
Informace ο
SEQ ID NO :
»> » » · · ··«· ···’ · 0 · 0 β- 0 β • » · 9 * ·· # 4 « • 0 0* «««· ··*♦ · · ··»♦ · ♦ 99
160 165
Phe Ser Thr Ser Lys Trp
175 Gly His 190 Leu His Lys Gly His Ala 180 Ala 195 Lys 210
Phe 205 Gin
Ile Asn Met His Pro Phe
220 225
Val Glu Leu Gly Lys Gin
235 240
Gin His Xxx Tyr Phe Phe
250 255
Leu Tyr Phe Gin Trp Tyr
265 270
Lys Trp Val Asp Leu Ala
280 285
Ala Gly Leu Pro Leu Ser
295 300
i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 566 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: aminokyselina (trans
2511785)
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 42:
kontigu
His Leu Lys Gly Ala Ser Ala Asn Trp Trp Asn His Arg His Phe
1 5 10 15
Gin His His Ala Lys Pro Asn Ile Phe His Lys Asp Pro Asp Val
20 25 30
Asn Met Leu His Val Phe Val Leu Gly Glu Trp Gin Pro Ile Glu
35 40 45
Tyr Gly Lys Lys Lys Leu Lys Tyr Leu Pro Tyr Asn His Gin His
50 55 60
Glu Tyr Phe Phe Leu Ile Gly Pro Pro Leu Leu Ile Pro Met Tyr
65 70 75
Phe Gin Tyr Gin Ile Ile Met Thr Met Ile Val His Lys Asn Trp
80 85 90
Val Asp Leu Ala Trp Ala Val Ser Tyr Tyr Ile Arg Phe Phe Ile
95 100 105
Thr Tyr Ile Pro Phe Tyr Gly Ile Leu Gly Ala Leu Leu Phe Leu
110 115 120
Asn Phe Ile Arg Phe Leu Glu Ser His Trp Phe Val Trp Val Thr
125 130 135
·» ····
Gin Met Asn His Ile 140 Val Met Glu Ile
Asp Trp Phe Ser Ser 155 Gin Leu Thr Ala
Ser Phe' Phe Asn Asp 170 Trp Phe Ser Gly
Glu His His Leu Phe 185 Pro Thr Met Pro
Ile Ala Pro Leu Val 200 Lys Ser Leu Cys
Tyr Gin Glu Lys Pro 215 Leu Leu Arg Ala
Ser Leu Lys Lys Ser 230 Gly Lys Leu Trp
Lys ★ ★ ★ Ser His Ser 245 Pro Arg Asp Thr
Trp Gly Asp Gly Gin 260 Arg Asn Asp Gly
Ser Glu Arg Leu Val 275 Tyr Ala Leu Leu
Leu Ser Pro Phe Leu 290 Leu Ser Phe Phe
Ser Thr Leu Pro Ser 305 Trp Asp Leu Pro
Ser Ala Met Ala Leu 320 Pro Val Pro Pro
Ala Glu Arg Trp Pro 335 Pro Gly Val Ala
Leu Pro Leu Lys Met 350 Gly Gly Asp Gin
Cys Glu Ser Pro Leu 365 Ala Ala Trp Ser
Leu Val Leu Gin Met 380 Leu Leu Gly Phe
Arg Ala Gly Pro Leu 400 Thr Leu Pro Ala
Arg Leu Pro Leu Val 415 His Pro Phe Ile
Gin Ser Ser Gly Leu 430 Pro Pro Ala Ala
Leu Ser ★ * ★ Asp Val 445 Gin Gly Pro Arg
Pro Asn Leu Gly Pro 460 Trp Lys Ser Pro
Ala Leu Thr Leu Gly 475 Phe His Gly Pro
Thr ★ ★ ★ Ala Cys Asp 490 Leu Gly Thr Lys
Leu + ★ ir Leu Ser Arg 505 Gly Ser Gly His
Trp Pro Gly Gly Ser 520 Ala His Pro Pro
Leu Arg Ser Lys Ile 535 Leu Glu Gin Ser
Leu Pro Leu Gly Ser Asp Ala Val Gly 550 Gly 565 Gin Pro Cys Xxx Gin Pro
• ··· · e · » • ···· ··« * · · * « ······· » · ····
Gin Glu Ala Tyr Arg 150
Cys Asn Val Glu Gin 165
Leu Asn Phe Gin Ile 180
His Asn Leu His Lys 195
Lys His Gly Ile Glu 210
Leu Asp Ile Ile Arg 225
Asp Ala Tyr Leu His 240
Gly Lys Gly Cys Arg 255
Leu Phe * * * Gly Val 270
Asp Pro Met Leu Asp 285
Ser His Leu Pro His 300
Leu Ser Arg Gin Pro 315
Pro Phe Phe Gin Gly 330
Ser Tyr Leu His Ser 345
Ser Met Gly Leu Ala 360
Gly Ile Thr Pro Ala 375
Gly Ala Gly Pro Ser 390
Leu His Ser Pro ★ 410
Arg Pro Ala Leu Leu 425
Leu Ser Thr. ,Arg Gly 440
Ala Gly Thr Ala Ser 455
Pro His His * * ♦ Ser 470
Ser Thr Ala Ser Pro 485
Gly Val Pro Arg Leu 500
Gin Gly Gly Ala Gly 515
Phe Pro Gin Gly Val 530
Pro Ser Pro Lys Ala 545
Pro Gly His Leu Ala 560
• · • · • ·
175 (2) Informace o SEQ ID NO: 43:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 619 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) (xi) DRUH MOLEKULY: 2535) Popis sekvence: aminokyselina (trans SEQ ID NO: 43:
Val Phe 1 Tyr Phe Gly Asn Gly Trp 5 Ile Pro Thr Leu Ile Thr Ala 10 15
Phe Val Leu Ala Thr Ser Gin Ala 20 Gin Ala Gly Trp Leu Gin His 25 30
Asp Tyr Gly His Leu Ser Val Tyr 35 Arg Lys Pro Lys Trp Asn His 40 45
Leu Val His Lys Phe Val Ile Gly 50 His Leu Lys Gly Ala Ser Ala 55 60
Asn Trp Trp Asn His Arg His Phe 65 Gin His His Ala Lys Pro Asn 70 75
Ile Phe His Lys Asp Pro Asp Val 8Ó Asn Met Leu His Val Phe Val 85 90
Leu Gly Glu Trp Gin Pro Ile Glu 95 Tyr Gly Lys Lys Lys Leu Lys 100 105
Tyr Leu Pro Tyr Asn His Gin His 110 Glu Tyr Phe Phe Leu Ile Gly 115 120
Pro Pro Leu Leu Ile Pro Met Tyr 125 Phe Gin Tyr Gin Ile Ile Met 130 135
Thr Met Ile Val His Lys Asn Trp 140 Val Asp Leu Ala Trp Ala Val 145 150
Ser Tyr Tyr Ile Arg Phe Phe Ile 155 Thr Tyr Ile Pro Phe Tyr Gly 160 165
Ile Leu Gly Ala Leu Leu Phe Leu 170 Asn Phe Ile Arg Phe Leu Glu 175 180
Ser His Trp Phe Val Trp Val Thr 185 Gin Met Asn His Ile Val Met 190 195
Glu Ile Asp Gin Glu Ala Tyr Arg 200 Asp Trp Phe Ser Ser Gin Leu 205 210
Thr Ala Thr Cys Asn Val Glu Gin 215 Ser Phe Phe Asn Asp Trp Phe 220 225
Ser Gly His Leu Asn Phe Gin Ile 230 Glu His His Leu Phe Pro Thr 235 240
Met Pro Arg His Asn Leu His Lys 245 Ile Ala Pro Leu Val Lys Ser 250 255
Leu Cys Ala Lys His Gly Ile Glu 260 Tyr Gin Glu Lys Pro Leu Leu 265 270
Arg Ala Leu Leu Asp Ile Ile Arg 275 Ser Leu Lys Lys Ser Gly Lys 280 285
Leu Trp Leu Asp Ala Tyr Leu His 290 Lys *** Ser His Ser Pro Arg 295 300
Asp Thr Val Gly Lys Gly Cys Arg 305 Trp Gly Asp Gly Gin Arg Asn 310 315
Asp Gly Leu Leu Phe *** Gly Val 320 Ser Glu Arg Leu Val Tyr Ala 325 330
Leu Leu Thr Asp Pro Met Leu Asp 335 Leu Ser Pro Phe Leu Leu Ser 340 345
Phe Phe Ser Ser His Leu Pro His 350 Ser Thr Leu Pro Ser Trp Asp 355 360
Leu Pro Ser Leu Ser Arg Gin Pro Ser Ala Met Ala Leu Pro Val ττη 375
kontigu ·· · · ·· · · • · · · · · · ·«·· • · · · · · · ···« • · · · ·· ·· ··
Pro Pro Ser Pro Phe Phe Gin Gly Ala Glu Arg Trp 385 Pro Pro Gly 390
380
Val Ala Leu Ser Tyr Leu His Ser Leu Pro Leu Lys Met Gly Gly
400 405 410
Asp Gin' Arg Ser Met Gly Leu Ala Cys Glu Ser Pro Leu Ala Ala
415 420 425
Trp Ser Leu Gly Ile Thr Pro Ala Leu Val Leu Gin Met Leu Leu
430 435 440
Gly Phe Ile Gly Ala Gly Pro Ser Arg Ala Gly Pro Leu Thr Leu
445 450 455
Pro Ala Trp Leu His Ser Pro * * ★ Arg Leu Pro Leu Val His Pro
460 465 470
Phe Ile Glu Arg Pro Ala Leu Leu Gin Ser Ser Gly Leu Pro Pro
475 480 485
Ala Ala Arg Leu Ser Thr Arg Gly Leu Ser ★ ★ ★ Asp Val Gin Gly
490 495 500
Pro Arg Pro Ala Gly Thr Ala Ser Pro Asn Leu Gly Pro Trp Lys
505 510 515
Ser Pro Pro Pro His His * * * Ser Ala Leu Thr Leu Gly Phe His
520 525 530
Gly Pro His Ser Thr Ala Ser Pro Thr * ★ ★ Ala Cys Asp Leu Gly
535 540 545
Thr Lys Gly Gly Val Pro Arg Leu Leu ★ 4r 1r Leu Ser Arg Gly Ser
550 555 560
Gly His Val Gin Gly Gly Ala Gly Trp Pro Gly Gly Ser Ala His
565 570 575
Pro Pro Ala Phe Pro Gin Gly Val Leu Arg Ser Lys Ile Leu Glu
580 585 590
Gin Ser Asp Pro Ser Pro Lys Ala Leu Leu Ser Ala Gly Gin Cys
595 600 605
Gin Pro Ile Pro Gly His Leu Ala Pro Gly Asp Val Gly Pro Xxx
610 615 620
2) Informace o SEQ ID NO: 44:
CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
DÉLKA: 757 aminokyselin TYP: aminokyselina DRUH ŘETĚZCE: není relevantní TOPOLOGIE: lineární aminokyselina (translace kontigu (A) (B) (C) (D)
DRUH MOLEKULY: 253538a)
(x i) F Opi S SI ekvence: S KQ ID NO: 44:
Gin Gly Pro Thr Pro Arg Tyr Phe Thr Trp Asp Glu Val Ala Gin
1 5 10 15
Arg Ser Gly Cys Glu Glu Arg Trp Leu Val Ile Asp Arg Lys Val
20 25 30
Tyr Asn Ile Ser Glu Phe Thr Arg Arg His Pro Gly Gly Ser Arg
35 40 45
Val Ile Ser His Tyr Ala Gly Gin Asp Ala Thr Asp Pro Phe Val
50 55 60
Ala Phe His Ile Asn Lys Gly Leu Val Lys Lys Tyr Met Asn Ser
65 70 75
Leu Leu Ile Gly Glu Leu Ser Pro Glu Gin Pro Ser Phe Glu Pro
80 85 90
Thr Lys Asn Lys Glu Leu Thr Asp Glu Phe Arg Glu Leu Arg Ala
95 100 105
Thr Val Glu Arg Met Gly Leu Met Lys Ala Asn His Val Phe Phe
110 115 120
Leu Leu Tyr Leu Leu His Ile Leu Leu Leu Asp Gly Ala Ala Trp
125 130 135
• · · · • · • * · · · · • · ···· «# * ·
Leu Thr'Leu Trp Val 140 Phe Gly Thr Ser Phe 145 Leu Pro Phe Leu Leu 150
Cys Ala Val Leu Leu Ser Ala Val Gin Gin Ala Gin Ala Gly Trp
155 160 165
Leu Gin His Asp Tyr Gly His Leu Ser Val Tyr Arg Lys Pro Lys
170 175 180
Trp Asn His Leu Val His Lys Phe Val Ile Gly His Leu Lys Gly
185 190 195
Ala Ser Ala Asn Trp Trp Asn His Arg His Phe Gin His His Ala
200 205 210
Lys Pro Asn Ile Phe His Lys Asp Pro Asp Val Asn Met Leu His
215 220 225
Val Phe Val Leu Gly Glu Trp Gin Pro Ile Glu Tyr Gly Lys Lys
230 235 240
Lys Leu Lys Tyr Leu Pro Tyr Asn His Gin His Glu Tyr Phe Phe
245 250 255
Leu Ile Gly Pro Pro Leu Leu Ile Pro Met Tyr Phe Gin Tyr Gin
260 265 270
Ile Ile Met Thr Met Ile Val His Lys Asn Trp Val Asp Leu Ala
275 280 285
Trp Ala Val Ser Tyr Tyr Ile Arg Phe Phe Ile Thr Tyr Ile Pro
290 295 300
Phe Tyr Gly Ile Leu Gly Ala Leu Leu Phe Leu Asn Phe Ile Arg
305 310 315
Phe Leu Glu Ser His Trp Phe Val Trp Val Thr Gin Met Asn His
320 325 330
Ile Val Met Glu Ile Asp Gin Glu Ala Tyr Arg Asp Trp Phe Ser
335 340 345
Ser Gin Leu Thr Ala Thr Cys Asn Val Glu Gin Ser Phe Phe Asn
350 355 360
Asp Trp Phe Ser Gly His Leu Asn Phe Gin Ile Glu His His Leu
365 370 375
Phe Pro Thr Met Pro Arg His Asn Leu His Lys Ile Ala Pro Leu
380 385 390
Val Lys Ser Leu Cys Ala Lys His Gly Ile Glu Tyr Gin Glu Lys
400 405 410
Pro Leu Leu Arg Ala Leu Leu Asp Ile Ile Arg Ser Leu Lys Lys
415 420 425
Ser Gly Lys Leu Trp Leu Asp Ala Tyr Leu His Lys ★ ★ ★ Ser His
430 435 440
Ser Pro Arg Asp Thr Val Gly Lys Gly Cys Arg Trp Gly Asp Gly
445 450 455
Gin Arg Asn Asp Gly Leu Leu Phe ie -k -ie Gly Val Ser Glu Arg Leu
460 465 470
Val Tyr Ala Leu Leu Thr Asp Pro Met Leu Asp Leu Ser Pro Phe
475 480 485
Leu Leu Ser Phe Phe Ser Ser His Leu Pro His Ser Thr Leu Pro
490 495 500
Ser Trp Asp Leu Pro Ser Leu Ser Arg Gin Pro Ser Ala Met Ala
505 510 515
Leu Pro Val Pro Pro Ser Pro Phe Phe Gin Gly Ala Glu Arg Trp
520 525 530
Pro Pro Gly Val Ala Leu Ser Tyr Leu His Ser Leu Pro Leu Lys
535 540 545
Met Gly Gly Asp Gin Arg Ser Met Gly Leu Ala Cys Glu Ser Pro
550 555 560
Leu Ala Ala Trp Ser Leu Gly Ile Thr Pro Ala Leu Val Leu Gin
565 570 575
Met Leu Leu Gly Phe Ile Gly Ala Gly Pro Ser Arg Ala Gly Pro
580 585 590
Leu Thr Leu Pro Ala Trp Leu His Ser Pro ★ O Arg Leu Pro Leu
595 600 605
Val His Fto Phe Ile Glu Arg Pro Ala Leu Leu Gin Ser Ser Gly
610 615 620
Leu Pro Pro Ala Ala Arg Leu Ser Thr Arg Gly Leu Ser + ★ -k Asp
625 630 635
Val Gin Gly Pro Arg Pro Ala Gly Thr Ala Ser Pro Asn Leu Gly
640 645 650
Pro Trp Lys Ser Pro Pro Pro His His ★ * ★ Ser Ala Leu Thr Leu
655 660 665
··· · · · · ··· *··» · · · * ·· • ·
178 • ·
Gly Phe His Gly Pro His Ser Thr Ala Ser Pro Thr Ala Cys
670 675 680
Asp Leu Gly Thr Lys Gly Gly Val Pro Arg Leu Leu ★ ★ ★ Leu Ser
685 690 695
Arg Gly Ser Gly His Val Gin Gly Gly Ala Gly Trp Pro Gly Gly
700 705 710
Ser Ala His Pro Pro Ala Phe Pro Gin Gly Val Leu Arg .Ser Lys
715 720 725
Ile Leu Glu Gin Ser Asp Pro Ser Pro Lys Ala Leu Leu Ser Ala
730 735 740
Gly Gin Cys Gin Pro Ile Pro Gly His Leu Ala Pro Gly Asp Val
745 750 755
Gly Pro Xxx
(2) Informace o SEQ ID NO: 45:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 746 nukleové kyseliny
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
ii) DRUH MOLEKULY: nukleová kyselina
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 45:
CGTATGTCAC TCCATTCCAA ACTCGTTCAT GGTATCATAA ATATCAACAC ATTTACGCTC 60 CACTCCTCTA TGGTATTTAC ACACTCAAAT ATCGTACTCA AGATTGGGAA GCTTTTGTAA 120 AGGATGGTAA AAATGGTGCA ATTCGTGTTA GTGTCGCCAC AAATTTCGAT AAGGCCGCTT 180 ACGTCATTGG TAAATTGTCT TTTGTTTTCT TCCGTTTCAT CCTTCCACTC CGTTATCATA 240 GCTTTACAGA TTTAATTTGT TATTTCCTCA TTGCTGAATT CGTCTTTGGT TGGTATCTCA 300 CAATTAATTT CCAAGTTAGT CATGTCGCTG AAGATCTCAA ATTCTTTGCT ACCCCTGAAA 360 GACCAGATGA ACCATCTCAA ATCAATGAAG ATTGGGCAAT CCTTCAACTT AAAACTACTC 420 AAGATTATGG TCATGGTTCA CTCCTTTGTA CCTTTTTTAG TGGTTCTTTA AATCATCAAG 480 TTGTTCATCA TTTATTCCCA TCAATTGCTC AAGATTTCTA CCCACAACTT GTACCAATTG 540 TAAAAGAAGT TTGTAAAGAA CATAACATTA CTTACCACAT TAAACCAAAC TTCACTGAAG 600 CTATTATGTC ACACATTAAT TACCTTTACA AAATGGGTAA TGATCCAGAT TATGTTAAAA 660 AACCATTAGC CTCAAAAGAT GATTAAATGA AATAACTTAA AAACCAATTA TTTACTTTTG 720 ACAAACAGTA ATATTAATAA ATACAA 746 (2) Informace o SEQ ID NO: 46:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 227 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 46:
• ·
Tyr Val 1 Thr Pro Phe Gin Thr Arg Ser Trp Tyr His Lys Tyr Gin 15
5 10
His Ile ' Tyr Ala Pro Leu Leu Tyr Gly Ile Tyr Thr Leu Lys Tyr
20 25 30
Arg Thr Gin Asp Trp Glu Ala Phe Val Lys Asp Gly Lys Asn Gly
35 40 45
Ala Ile Arg Val Ser Val Ala Thr Asn Phe Asp Lys Ala Ala Tyr
50 55 60
Val Ile Gly Lys Leu Ser Phe Val Phe Phe Arg Phe Ile Leu Pro
65 70 75
Leu Arg Tyr His Ser Phe Thr Asp Leu Ile Cys Tyr Phe Leu Ile
80 85 90
Ala Glu Phe Val Phe Gly Trp Tyr Leu Thr Ile Asn Phe Gin Val
95 100 105
Ser His Val Ala Glu Asp Leu Lys Phe Phe Ala Thr Pro Glu Arg
110 115 120
Pro Asp Glu Pro Ser Gin Ile Asn Glu Asp Trp Ala Ile Leu Gin
125 130 135
Leu Lys Thr Thr Gin Asp Tyr Gly His Gly Ser Leu Leu Cys Thr
140 145 150
Phe Phe Ser Gly Ser Leu Asn His Gin Val Val His His Leu Phe
155 . 160 165
Pro Ser Ile Ala Gin.Asp Phe Tyr Pro Gin Leu Val Pro Ile Val
170 175 180
Lys Glu Val Cys Lys Glu His Asn Ile Thr Tyr His Ile Lys Pro
185 190 195
Asn Phe Thr Glu Ala Ile Met Ser His Ile Asn Tyr Leu Tyr Lys
200 205 210
Met Gly Asn Asp Pro Asp Tyr Val Lys Lys Pro Leu Ala Ser Lys
215 220 225
Asp Asp * * *
(2) Informace o SEQ ID NO: 47:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 494 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(0) DRUH ŘETĚZCE: není relevant
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: nukleová kyselina
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 47:
TTTTGGAAGG NTCCAAGTTN ACCACGGANT NGGCAAGTTN ACGGGGCGGA AANCGGTTTT 60 CCCCCCAAGC CTTTTGTCGA CTGGTTCTGT GGTGGCTTCC AGTACCAAGT CGACCACCAC 120 TTATTCCCCA GCCTGCCCCG ACACAATCTG GCCAAGACAC ACGCACTGGT CGAATCGTTC 180 TGCAAGGAGT GGGGTGTCCA GTACCACGAA GCCGACCTCG TGGACGGGAC CATGGAAGTC 240 TTGCACCATT TGGGCAGCGT GGCCGGCGAA TTCGTCGTGG ATTTTGTACG CGACGGACCC 300 GCCATGTAAT CGTCGTTCGT GACGATGCAA GGGTTCACGC ACATCTACAC ACACTCACTC 360 ACACAACTAG TGTAACTCGT ATAGAATTCG GTGTCGACCT GGACCTTGTT TGACTGGTTG 420 GGGATAGGGT AGGTAGGCGG ACGCGTGGGT CGNCCCCGGG AATTCTGTGA CCGGTACCTG 480 GCCCGCGTNA AAGT 404 ··· «*·· ··· • · · * · * « · ··
180 · .... ...
(2) Informace o SEQ ID NO: 48:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 87 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
li) DRUH MOLEKULY: peptid
xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 48:
Phe 1 Trp Lys Xxx Pro Ser Xxx 5 Pro Arg Xxx Xxx Gin Val Xxx Gly
10 15
Ala Glu Xxx Gly Phe Pro Pro Lys Pro Phe Val Asp Trp Phe Cys
20 25 30
Gly Gly Phe Gin Tyr Gin Val Asp His His Leu Phe Pro Ser Leu
35 40 45
Pro Arg His Asn Leu Ala Lys Thr His Ala Leu Val Glu Ser Phe
50 55 60
Cys Lys Glu Trp Gly Val Gin Tyr His Glu Ala Asp Leu Val Asp
65 70 75
Gly Thr Met Glu Val Leu His His Leu Gly Ser Val Ala Gly Glu
65 70 75
Phe Val Val Asp Phe Val Arg Asp Gly Pro Ala Met
80 85
(2) Informace o SEQ ID NO: 49:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 520 nukleových kyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) DRUH MOLEKULY: nukleová kyselina (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 49:
GGATGGAGTT CGTCTGGATC GCTGTGCGCT ACGCGACGTG GTTTAAGCGT CATGGGTGCG 60 CTTGGGTACA CGCCGGGGCA GTCGTTGGGC ATGTACTTGT GCGCCTTTGG TCTCGGCTGC 120 ATTTACATTT TTCTGCAGTT CGCCGTAAGT CACACCCATT TGCCCGTGAG CAACCCGGAG 180 GATCAGCTGC ATTGGCTCGA GTACGCGCGG ACCACACTGT GAACATCAGC ACCAAGTCGT 240 GGTTTGTCAC ATGGTGGATG TCGAACCTCA ACTTTCAGAT CGAGCACCAC CTTTTCCCCA 300 CGGCGCCCCA GTTCCGTTTC AAGGAGATCA GCCCGCGCGT CGAGGCCCTC TTCAAGCGCC 360 ACGGTCTCCC TTACTACGAC ATGCCCTACA CGAGCGCCGT CTCCACCACC TTTGCCAACC 420 TCTACTCCGT CGGCCATTCC GTCGGCGACG CCAAGCGCGA CTAGCCTCTT TTCCTAGACC 480 TTAATTCCCC ACCCCACCCC ATGTTCTGTC TTCCTCCCGC 520 • «
181
2) Informace o SEQ ID NO: 50:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 153 aminokyselin
(B) TYP: aminokyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 50:
Met Glu Phe Val Trp Ile Ala Val Arg Tyr Ala Thr Trp Phe Lys
1 5 10 15
Arg His Gly Cys Ala Trp Val His Ala Gly Ala Val Val Gly His
20 25 30
Val Leu Val Arg Leu Trp Ser Arg Leu His Leu His Phe Ser Ala
- 35 40 45
Val Arg Arg Lys Ser His Pro Phe Ala Arg Glu Gin Pro Gly Gly
50 55 60
Ser Ala Ala Leu Ala Arg Val Arg Ala Asp His Thr Val Asn Ile
65 70 75
Ser Thr Lys Ser Trp Phe Val Thr Trp Trp Met Ser Asn Leu Asn
80 85 90
Phe Gin Ile Glu His His Leu Phe Pro Thr Ala Pro Gin Phe Arg
95 100 105
Phe Lys Glu Ile Ser Pro Arg Val Glu Ala Leu Phe Lys Arg His
110 115 120
Gly Leu Pro Tyr Tyr Asp Met Pro Tyr Thr Ser Ala Val Ser Thr
125 130 135
Thr Phe Ala Asn Leu Tyr Ser Val Gly His Ser Val Gly Asp Ala
140 145 150
Lys Arg Asp
2) Informace o SEQ ID NO: 51:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 429 nukleových kyselin
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: nukleová kyselina
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 51:
ACGCGTCCGC CCACGCGTCC GCCGCGAGCA ACTCATCAAG GAAGGCTACT TTGACCCCTC 60 GCTCCCGCAC ATGACGTACC GCGTGGTCGA GATTGTTGTT CTCTTCGTGC TTTCCTTTTG 120 GCTGATGGGT CAGTCTTCAC CCCTCGCGCT CGCTCTCGGC ATTGTCGTCA GCGGCATCTC 180 TCAGGGTCGC TGCGGCTGGG TAATGCATGA GATGGGCCAT GGGTCGTTCA CTGGTGTCAT 240 TTGGCTTGAC GACCGGTTGT GCGAGTTCTT TTACGGCGTT GGTTGTGGCA TGAGCGGTCA 300 TTACTGGAAA AACCAGCACA GCAAACACCA CGCAGCGCCA AACCGGCTCG AGCACGATGT 360 AGATCTCAAC ACCTTGCCAT TGGTGGCCTT CAACGAGCGC GTCGTGCGCA AGGTCCGACC 420
9 99 9 9 • · · ···· » * · * • · · · ·· · * a · ·
182 • · • · * « • ·
Informace o SEQ ID NO: 52:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 125 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: není relevantní (D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: peptid
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 52:
Arg Val Arg Pro Arg Val Arg Arg Glu Gin Leu Ile Lys Glu Gly
1 5 10 15
Tyr Phe Asp Pro Ser Leu Pro His Met Thr Tyr Arg Val Val Glu
20 25 30
Ile Val Val Leu Phe Val Leu Ser Phe Trp Leu Met Gly Gin Ser
35 40 45
Ser Pro Leu Ala Leu Ala Leu Gly Ile Val Val Ser Gly Ile Ser
50 55 60
Gin Gly Arg Cys Gly Trp Val Met His Glu Met Gly His Gly Ser
65 70 75
Phe Thr Gly Val Ile Trp Leu Asp Asp Arg Leu Cys Glu Phe Phe
65 70 75
Tyr Gly Vai Gly Cys Gly Met Ser Gly His Tyr Trp Lys Asn Gin
80 85 90
His Ser Lys His His Ala Ala Pro Asn Arg Leu Glu His Asp Val
95 100 105
Asp Leu Asn Thr Leu Pro Leu Val Ala Phe Asn Glu Arg Val Val
110 115 120
Arg Lys Val Arg Pro
125
• · · ·

Claims (17)

1. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující jednu nebo více nukleotidových sekvencí uvedených v SEQ ID NO: vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 5, kde uvedená jedna nebo více nukleotidových sekvencí je spojena s heterogenní nukleotidovou sekvencí.
2. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující jednu nebo více nukleotidových sekvencí uvedených v SEQ ID NO: vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 5, kde uvedená jedna nebo více nukleotidových sekvencí je operativně spojena se sekvencí, která řídí expresi a je funkční v rostlinné buňce.
3. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 2, kde uvedená nukleotidová sekvence vykazuje průměrný obsah A+T menší než přibližně 60 %.
4. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 2, kde uvedená nukleotidová sekvence se získala z hub.
5. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 4, kde uvedenou houbou je rod Mortierella.
6. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 5, kde uvedenou houbou je druh alpina.
7. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující nukleotidovou sekvenci, která kóduje polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 2, přičemž uvedená nukleotidová sekvence je operativně spojena se sekvencí, která řídí transkripci nebo expresi a je funkční v rostlinné buňce, kde uvedená nukleotidová sekvence kóduje funkčně aktivní polypeptid, jenž desaturuje molekulu mastné kyseliny v poloze 6-tého uhlíku od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
8. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující nukleotidovou sekvenci, která kóduje polypeptid obsahující
184 aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 4, kde uvedená nukleotidová sekvence je operativně spojená se sekvencí, která řídí transkripci a expresi a je funkční v rostlinné buňce, kde uvedená nukleotidová sekvence kóduje funkčně aktivní polypeptid, jenž desaturuje molekulu mastné kyseliny v poloze dvanáctého uhlíku od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny.
9. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující nukleotidovou sekvenci, která kóduje polypeptid obsahující aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 6, kde uvedená nukleotidová sekvence je operativně spojena se sekvencí řídící transkripci a expresi a je funkční v rostlinné buňce, přičemž uvedená nukleotidová sekvence kóduje funkčně aktivní polypeptid, který desaturuje molekulu mastné kyseliny v poloze pátého uhlíku od karboxylového konce uvedené molekuly mastné kyseliny.
10. Konstrukce nukleové kyseliny obsahující alespoň jednu nukleotidovou sekvenci, která kóduje funkčně aktivní desaturázu, jenž má aminokyselinovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: vybrané ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4 a SEQ ID NO: 6, přičemž uvedená nukleotidová sekvence je operativně spojená s promotorem, který je funkční v rostlinné buňce.
11. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 10, kde uvedená rostlinná buňka je buňka semene.
12. Konstrukce nukleové kyseliny podle nároku 11, kde uvedená rostlinná buňka je embryonální buňka.
13. Rekombinantní rostlinná buňka, vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jednu kopii sekvence DNA, která kóduje alespoň jednu funkčně aktivní desaturázu mastné kyseliny Mortierella alpina, což vede k produkci polynenasycené mastné kyseliny, přičemž aminokyselinová sekvence uvedené desaturázy mastné kyseliny je uvedena v SEQ ID NO: vybrané ze skupiny obsahující SEQ ID NO: 2, • 9
185
SEQ ID NO: 4 a SEQ ID NO: 6, přičemž uvedená buňka se transformovala vektorem, jenž obsahuje uvedenou sekvenci DNA a kde uvedená sekvence DNA je operativně spojená se
sekvencí řídící expresi. 14. Rekombinantní rostlinná buňka podle nároku 13, vyznačuj ící se tím, ž e polynenasycená mastná kyselina se vybrala ze skupiny zahrnující LA, ARA, GLA, DGLA, SDA a EPA. 15. Rekombinantní rostlinná buňka podle nároku 13, vyznačuj ící se tím, ž e je obohacena
mastnou kyselinou vybranou ze skupiny obsahující 18:1, 18:2, 18:3 a 18:4.
16. Rekombinantní rostlinná buňka podle nároku 15, vyznačující se t 1 m, že se vybrala ze skupiny zahrnující Brassica , sóju, světlící, kukuřici, len a slunečnici. 17. Rekombinantní rostlinná buňka podle nároku 16,
vyznačující se tím, že uvedená sekvence řídící expresi je pro uvedenou rostlinou buňku endogenní.
18. Jeden nebo více rostlinných olejů, vyznačující se tím, že jsou exprimovány rekombinantní rostlinnou buňkou podle nároku 16.
19. Způsob získání změněné biosyntézy polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem, vyznačující se tím, že zahrnuje pěstování rostliny mající buňky, které obsahují transgen kódující produkt exprese transgenu, který desaturuje molekulu mastné kyseliny v poloze pátého uhlíku od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny, kde uvedený transgen je operativně spojen se sekvencí řídící expresi za podmínek, kdy se uvedený transgen exprimuje, čímž se v uvedených buňkách mění biosyntéza polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem.
20. Způsob získání změněné biosyntézy polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem, vyznačující se • · • · • ·
186 tím, že zahrnuje kroky pěstování rostliny mající buňky, které obsahují jeden nebo více transgenů získaných z hub nebo řas, které kódují produkt exprese transgenů desaturující molekulu mastné kyseliny v poloze pátého, šestého nebo dvanáctého uhlíku od karboxylového konce molekuly mastné kyseliny, kde uvedený jeden nebo více transgenů je operativně spojen se sekvencí řídící expresi za podmínek, kdy se jeden nebo více uvedených transgenů exprimuje, čímž se mění v uvedených buňkách biosyntéza polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem.
21. Způsob podle nároků 19 nebo 20, vyznačující se tím, že polynenasycená mastná kyselina se vybrala ze skupiny zahrnující LA, ARA, GLA, DGLA, SDA a EPA.
Rostlinný olej nebo jeho frakce, vyzná č u j ící setím, že se produkuj 1 způsobem ; podél nároků 19 nebo 20. Způsob léčby a prevence podvýživy, vyzná č u j ící se tím, že zahrnuj e aplikaci uvedeného rostlinného oleje podle nároku 22 pacientovi, který potřebuje uvedenou léčbu nebo prevenci, v množství, jenž je dostatečné, aby způsobilo uvedenou léčbu nebo
prevenci.
24. Farmaceutická kompozice, v y z n a č u j í cl se tím, že obsahuje uvedený rostlinný olej nebo frakci podle nároku : 22 a farmaceuticky přijatelný nosič. 25. Farmaceutická kompozice podle nároku 24, v y z n a č u j í c í s e t í m, že je v kapalné nebo pevné formě. 26. Farmaceutická kompozice podle nároku 25, v y z n a č u jící se tí m, že' je ve formě kapsulí nebo tablet. 27. Farmaceutická kompozice podle nároku 24, v y z n a č u jící se tím, ž e dále obsahuj e
187 «· ··«· · · • · · · · « · · · · · alespoň jeden nutrient vybraný ze skupiny zahrnující vitamin, minerál, sacharid, aminokyselinu, volnou mastnou kyselinu, fosfolipid, antioxidant a fenolovou sloučeninu.
28. Výživový přípravek, vyznačující se tím, že obsahuje uvedený rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22.
29. Výživový přípravek podle vyznačující se tím, že skupiny obsahující kojeneckou výživu, potravinový doplněk a potravinovou náhradu.
nároku 28, se vybral ze
30. Výživový přípravek podle nároku vyznačující se tím, že se kojenecká výživa, potravinový doplněk a náhrada je v kapalné nebo pevné formě.
31. Kojenecká výživa, vyznačuj ící obsahuje uvedený rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22.
32. Kojenecká výživa podle nároku 31, vyznačující se tím, že dále obsahuje alespoň jeden makronutrient vybraný ze skupiny zahrnující kokosový olej, sojový olej, olej kanoly, mono- a diglyceridy, glukózu, poživatelnou laktózu, elektrodialyzovatelnou syrovátku, elektrodialyzované netučné mléko, mléčnou syrovátku, sojový protein a jiné proteinové hydrolyzáty.
29, uvedená potravinová se tím, podle z e ze nároku 32, dále obsahuje skupiny obsahující
33. Kojenecká výživa vyznačující se tím, alespoň jeden vitamin vybraný vitaminy A, C, D, E a B komplex a alespoň jeden minerál ze skupiny zahrnující vápník, hořčík, zinek, mangan, sodík, draslík, fosfor, měď, chlorid, jodid, selen a železo.
34. Potravinový doplněk, vyznačující se tím, ž e obsahuje uvedený rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22.
• ·
188
35. Potravinový doplněk podle vyznačující se tím, že nároku 34, dále obsahuje alespoň jeden makronutríent vybraný ze skupiny zahrnující kokosový olej, sojový olej, olej kanoly, mono- a diglyceridy, glukózu, poživatelnou laktózu, elektrodialyzovatelnou syrovátku, elektrodialyzovatelné netučné mléko, mléčnou syrovátku, sojový protein a jiné proteinové hydrolyzáty.
36. Potravinový doplněk podle nároku 35, dále obsahuje vyznačující se tím, alespoň jeden vitamin vybraný vitaminy A, C, D, E a P komplex a alespoň jeden minerál ze skupiny zahrnující vápník, hořčík, zinek, mangan, sodík, draslík, fosfor, měď, chlorid, jód, selen a železo.
ze skupiny obsahující
37. Potravinový podle doplněk vyznačující se tím, nebo zvířeti.
38. Potravinová náhrada, nároku 34 nebo 36, ž e se aplikuje člověku vyznačující se tím, ž e obsahuje uvedený rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22.
Potravinová náhrada podle vyznačující se tím, že alespoň jeden makronutríent vybraný ze kokosový olej, sojový olej, olej diglyceridy, glukózu, poživatelnou elektrodialyzovatelnou syrovátku, elektrodialyzovatelné netučné mléko, mléčnou syrovátku, sojový protein a jiné proteinové hydrolyzáty.
nároku 38, dále obsahuje skupiny zahrnující mono- a laktózu, kanoly,
40. Potravinová náhrada podle nároku 39, dále obsahuje skupiny obsahující z e ze vyznačující se tím, alespoň jeden vitamin vybraný vitaminy A, C, D, E a P komplex a alespoň jeden minerál ze skupiny zahrnující vápník, hořčík, zinek, mangan, sodík, draslík, fosfor, měď, chlorid, jód, selen a železo.
• ·
189
Potravinová náhrada podle nároku 38 nebo 40, vyznačující se tím, že se aplikuje člověku nebo zvířeti.
Způsob léčby pacienta, který trpí stavem způsobeným nedostatečným příjmem nebo produkcí polynenasycených mastných kyselin, vyznačující se tím, že se uvedenému pacientovi aplikuje uvedená potravinová náhrada podle nároku 38 nebo uvedený potravinový doplněk podle nároku 34 v množství fostatečném, aby způsobil uvedenou léčbu.
Způsob podle nároku 42, vyznačující se tím, že se uvedená potravinová náhrada nebo uvedený potravinový doplněk aplikuje enterálně nebo parenterálně.
Kosmetický přípravek, vyznačující se tím, že obsahuje uvedený rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22.
Kosmetický přípravek vyznačující se povrchově.
Farmaceutická kompozice podle t 1 m, nároku
44, že se aplikuje nároku 24, se aplikuje podle ž e vyznačující se tím, člověku nebo zvířeti.
Krmení pro zvířata, vyznačující se tím, že obsahuje rostlinný olej nebo jeho frakci podle nároku 22. Izolovaná nukleotidová sekvence obsahující nukleotidovou sekvenci vybranou ze skupiny zahrnující SEQ ID NO: 38 až SEQ ID NO: 44, kde uvedená nukleotidová sekvence se exprimuje v rostlinné buňce.
CZ19993584A 1998-04-10 1998-04-10 Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách CZ358499A3 (cs)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ19993584A CZ358499A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ19993584A CZ358499A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ358499A3 true CZ358499A3 (cs) 2000-05-17

Family

ID=5466955

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ19993584A CZ358499A3 (cs) 1998-04-10 1998-04-10 Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách

Country Status (1)

Country Link
CZ (1) CZ358499A3 (cs)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU720725B2 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids
ES2403154T3 (es) Métodos y composiciones para la síntesis de ácidos grasos poliinsaturados de cadena larga en plantas
AU726807B2 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids
WO1998046765A9 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids
WO1998046764A9 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids in plants
MXPA99009329A (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids
WO1998046763A9 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids
WO2000020603A1 (en) Altered fatty acid biosynthesis in insect cells using delta five desaturase
CZ358499A3 (cs) Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem v rostlinách
US7745694B1 (en) Methods and compositions for synthesis of long chain polyunsaturated fatty acids in plants
CZ358299A3 (cs) Izolovaná nukleová kyselina
CZ358399A3 (cs) Způsoby a kompozice pro syntézu poly-nenasycených mastných kyselin s dlouhými řetězci
MXPA99009327A (es) Metodos y composiciones para la sintesis de acidos grasos poli-insaturados de cadena larga
MXPA99009328A (es) Métodos y composiciones para la síntesis deácidos grasos poli-insaturados de cadena larga en plantas

Legal Events

Date Code Title Description
PD00 Pending as of 2000-06-30 in czech republic