CZ299816B6 - Isonitrilové slouceniny pro výrobu polymeru, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny - Google Patents
Isonitrilové slouceniny pro výrobu polymeru, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny Download PDFInfo
- Publication number
- CZ299816B6 CZ299816B6 CZ0385899A CZ385899A CZ299816B6 CZ 299816 B6 CZ299816 B6 CZ 299816B6 CZ 0385899 A CZ0385899 A CZ 0385899A CZ 385899 A CZ385899 A CZ 385899A CZ 299816 B6 CZ299816 B6 CZ 299816B6
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- formula
- compound
- unsubstituted
- alkyl
- independently
- Prior art date
Links
- -1 Isonitrile compounds Chemical class 0.000 title claims description 67
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims description 13
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 title abstract description 29
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 58
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 54
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 33
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 30
- 125000003435 aroyl group Chemical group 0.000 claims description 22
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 claims description 18
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 17
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 17
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 14
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 14
- 125000000547 substituted alkyl group Chemical group 0.000 claims description 14
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 7
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 4
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 3
- 125000004183 alkoxy alkyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000001589 carboacyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 claims description 2
- 238000006452 multicomponent reaction Methods 0.000 abstract description 17
- 238000006058 Ugi-reaction Methods 0.000 abstract description 15
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 abstract description 14
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 abstract description 7
- 239000000427 antigen Substances 0.000 abstract description 4
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 abstract description 4
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 abstract description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 abstract 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 abstract 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 63
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 45
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 30
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 25
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 23
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 20
- XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N Cyanide Chemical compound N#[C-] XFXPMWWXUTWYJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 18
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 17
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 17
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 17
- 239000000047 product Substances 0.000 description 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 14
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 13
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 13
- 150000002527 isonitriles Chemical class 0.000 description 12
- 238000001644 13C nuclear magnetic resonance spectroscopy Methods 0.000 description 11
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 10
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 10
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 9
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 8
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 8
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 8
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N DMSO Substances CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 7
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 7
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000002585 base Substances 0.000 description 6
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 6
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 6
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 6
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 6
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 description 6
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 6
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 6
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 6
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 5
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical compound NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 5
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 5
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 5
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 5
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 5
- XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N Dimethoxyethane Chemical compound COCCOC XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SMWDFEZZVXVKRB-UHFFFAOYSA-N Quinoline Chemical compound N1=CC=CC2=CC=CC=C21 SMWDFEZZVXVKRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical class [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N Trichloro(2H)methane Chemical compound [2H]C(Cl)(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N 0.000 description 4
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 4
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 4
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 4
- 125000004057 biotinyl group Chemical group [H]N1C(=O)N([H])[C@]2([H])[C@@]([H])(SC([H])([H])[C@]12[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 4
- 150000001735 carboxylic acids Chemical class 0.000 description 4
- WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N formic acid ethyl ester Natural products CCOC=O WBJINCZRORDGAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 125000002485 formyl group Chemical class [H]C(*)=O 0.000 description 4
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 4
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 description 4
- 238000009830 intercalation Methods 0.000 description 4
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 4
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 4
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 4
- XHXFXVLFKHQFAL-UHFFFAOYSA-N phosphoryl trichloride Chemical compound ClP(Cl)(Cl)=O XHXFXVLFKHQFAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 4
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 4
- 229920001059 synthetic polymer Polymers 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 3
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 3
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N Pyrrolidine Chemical compound C1CCNC1 RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 3
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 3
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 3
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XSCHRSMBECNVNS-UHFFFAOYSA-N benzopyrazine Natural products N1=CC=NC2=CC=CC=C21 XSCHRSMBECNVNS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N diisopropylamine Chemical compound CC(C)NC(C)C UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000001153 fluoro group Chemical group F* 0.000 description 3
- 239000006260 foam Substances 0.000 description 3
- 229920000140 heteropolymer Polymers 0.000 description 3
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N hydrazine group Chemical group NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 3
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 3
- 125000005642 phosphothioate group Chemical group 0.000 description 3
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 3
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 3
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N tetrahydrofuran Natural products C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000005691 triesters Chemical class 0.000 description 3
- WMSUFWLPZLCIHP-UHFFFAOYSA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 9h-fluoren-9-ylmethyl carbonate Chemical compound C12=CC=CC=C2C2=CC=CC=C2C1COC(=O)ON1C(=O)CCC1=O WMSUFWLPZLCIHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WMRLMOBINDQAOE-UHFFFAOYSA-N (3-nitrophenyl)carbamic acid Chemical compound OC(=O)NC1=CC=CC([N+]([O-])=O)=C1 WMRLMOBINDQAOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AWOKSNNHYRGYIA-UHFFFAOYSA-N (4,5-dimethoxy-2-nitrophenyl)methyl carbamate Chemical compound COC1=CC(COC(N)=O)=C([N+]([O-])=O)C=C1OC AWOKSNNHYRGYIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WYRYVABMDMIKFR-UHFFFAOYSA-N (4-methoxyphenyl)methyl n-(2-aminoethyl)carbamate Chemical compound COC1=CC=C(COC(=O)NCCN)C=C1 WYRYVABMDMIKFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UHPQFNXOFFPHJW-UHFFFAOYSA-N (4-methylphenyl)-phenylmethanamine Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1C(N)C1=CC=CC=C1 UHPQFNXOFFPHJW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LOZWAPSEEHRYPG-UHFFFAOYSA-N 1,4-dithiane Chemical compound C1CSCCS1 LOZWAPSEEHRYPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IANQTJSKSUMEQM-UHFFFAOYSA-N 1-benzofuran Chemical compound C1=CC=C2OC=CC2=C1 IANQTJSKSUMEQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UPQQXPKAYZYUKO-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trichloroacetamide Chemical compound OC(=N)C(Cl)(Cl)Cl UPQQXPKAYZYUKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VMHIXLGLSGKOSK-UHFFFAOYSA-N 2-isocyano-n-tritylethanamine Chemical group C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(NCC[N+]#[C-])C1=CC=CC=C1 VMHIXLGLSGKOSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HAUGRYOERYOXHX-UHFFFAOYSA-N Alloxazine Chemical compound C1=CC=C2N=C(C(=O)NC(=O)N3)C3=NC2=C1 HAUGRYOERYOXHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 2
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 2
- SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N Indole Chemical compound C1=CC=C2NC=CC2=C1 SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002841 Lewis acid Substances 0.000 description 2
- 101710122864 Major tegument protein Proteins 0.000 description 2
- UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N Naphthalene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC=C21 UFWIBTONFRDIAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 2
- 101710148592 PTS system fructose-like EIIA component Proteins 0.000 description 2
- 101710169713 PTS system fructose-specific EIIA component Proteins 0.000 description 2
- PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N Phenazine Natural products C1=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3N=C21 PCNDJXKNXGMECE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N Piperazine Chemical compound C1CNCCN1 GLUUGHFHXGJENI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- KYQCOXFCLRTKLS-UHFFFAOYSA-N Pyrazine Chemical compound C1=CN=CC=N1 KYQCOXFCLRTKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KAESVJOAVNADME-UHFFFAOYSA-N Pyrrole Chemical compound C=1C=CNC=1 KAESVJOAVNADME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 101710199973 Tail tube protein Proteins 0.000 description 2
- YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N Thiophene Chemical compound C=1C=CSC=1 YTPLMLYBLZKORZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N [1,10]phenanthroline Chemical compound C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N acridine Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 2
- 230000002152 alkylating effect Effects 0.000 description 2
- 230000029936 alkylation Effects 0.000 description 2
- 238000005804 alkylation reaction Methods 0.000 description 2
- MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N anthracene Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 MWPLVEDNUUSJAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 2
- CUFNKYGDVFVPHO-UHFFFAOYSA-N azulene Chemical compound C1=CC=CC2=CC=CC2=C1 CUFNKYGDVFVPHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N benzothiazole Chemical compound C1=CC=C2SC=NC2=C1 IOJUPLGTWVMSFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WGQKYBSKWIADBV-UHFFFAOYSA-N benzylamine Chemical compound NCC1=CC=CC=C1 WGQKYBSKWIADBV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 2
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 description 2
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 2
- GTCAXTIRRLKXRU-UHFFFAOYSA-N carbamic acid methyl ester Natural products COC(N)=O GTCAXTIRRLKXRU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 description 2
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 2
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000001309 chloro group Chemical group Cl* 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- XLJMAIOERFSOGZ-UHFFFAOYSA-N cyanic acid Chemical compound OC#N XLJMAIOERFSOGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- TXCDCPKCNAJMEE-UHFFFAOYSA-N dibenzofuran Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3OC2=C1 TXCDCPKCNAJMEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IYYZUPMFVPLQIF-UHFFFAOYSA-N dibenzothiophene Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3SC2=C1 IYYZUPMFVPLQIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N diphenyl Chemical compound C1=CC=CC=C1C1=CC=CC=C1 ZUOUZKKEUPVFJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CTSPAMFJBXKSOY-UHFFFAOYSA-N ellipticine Chemical compound N1=CC=C2C(C)=C(NC=3C4=CC=CC=3)C4=C(C)C2=C1 CTSPAMFJBXKSOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002168 ethanoic acid esters Chemical class 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 2
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 2
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002687 intercalation Effects 0.000 description 2
- AWJUIBRHMBBTKR-UHFFFAOYSA-N isoquinoline Chemical compound C1=NC=CC2=CC=CC=C21 AWJUIBRHMBBTKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZLTPDFXIESTBQG-UHFFFAOYSA-N isothiazole Chemical compound C=1C=NSC=1 ZLTPDFXIESTBQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000007517 lewis acids Chemical class 0.000 description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 2
- TZIHFWKZFHZASV-UHFFFAOYSA-N methyl formate Chemical compound COC=O TZIHFWKZFHZASV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N monobenzene Natural products C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 2
- IDBIFFKSXLYUOT-UHFFFAOYSA-N netropsin Chemical compound C1=C(C(=O)NCCC(N)=N)N(C)C=C1NC(=O)C1=CC(NC(=O)CN=C(N)N)=CN1C IDBIFFKSXLYUOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012038 nucleophile Substances 0.000 description 2
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 2
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 2
- RDOWQLZANAYVLL-UHFFFAOYSA-N phenanthridine Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3C=NC2=C1 RDOWQLZANAYVLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002798 polar solvent Substances 0.000 description 2
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 2
- BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L potassium carbonate Chemical compound [K+].[K+].[O-]C([O-])=O BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 2
- 150000003141 primary amines Chemical group 0.000 description 2
- 239000003586 protic polar solvent Substances 0.000 description 2
- ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N psoralen Chemical compound C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OC=C2 ZCCUUQDIBDJBTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 2
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 238000003385 ring cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 150000003335 secondary amines Chemical class 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 230000001360 synchronised effect Effects 0.000 description 2
- ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N thiocyanic acid Chemical compound SC#N ZMZDMBWJUHKJPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- PYOKUURKVVELLB-UHFFFAOYSA-N trimethyl orthoformate Chemical compound COC(OC)OC PYOKUURKVVELLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N triphenylmethyl chloride Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(Cl)C1=CC=CC=C1 JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZFXBERJDEUDDMX-UHFFFAOYSA-N 1,2,3,5-tetrazine Chemical compound C1=NC=NN=N1 ZFXBERJDEUDDMX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JYEUMXHLPRZUAT-UHFFFAOYSA-N 1,2,3-triazine Chemical compound C1=CN=NN=C1 JYEUMXHLPRZUAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HTJMXYRLEDBSLT-UHFFFAOYSA-N 1,2,4,5-tetrazine Chemical compound C1=NN=CN=N1 HTJMXYRLEDBSLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BBVIDBNAYOIXOE-UHFFFAOYSA-N 1,2,4-oxadiazole Chemical compound C=1N=CON=1 BBVIDBNAYOIXOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YGTAZGSLCXNBQL-UHFFFAOYSA-N 1,2,4-thiadiazole Chemical compound C=1N=CSN=1 YGTAZGSLCXNBQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FYADHXFMURLYQI-UHFFFAOYSA-N 1,2,4-triazine Chemical compound C1=CN=NC=N1 FYADHXFMURLYQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UDGKZGLPXCRRAM-UHFFFAOYSA-N 1,2,5-thiadiazole Chemical compound C=1C=NSN=1 UDGKZGLPXCRRAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JIHQDMXYYFUGFV-UHFFFAOYSA-N 1,3,5-triazine Chemical compound C1=NC=NC=N1 JIHQDMXYYFUGFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YJTKZCDBKVTVBY-UHFFFAOYSA-N 1,3-Diphenylbenzene Chemical group C1=CC=CC=C1C1=CC=CC(C=2C=CC=CC=2)=C1 YJTKZCDBKVTVBY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BCMCBBGGLRIHSE-UHFFFAOYSA-N 1,3-benzoxazole Chemical compound C1=CC=C2OC=NC2=C1 BCMCBBGGLRIHSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WNXJIVFYUVYPPR-UHFFFAOYSA-N 1,3-dioxolane Chemical compound C1COCO1 WNXJIVFYUVYPPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IMLSAISZLJGWPP-UHFFFAOYSA-N 1,3-dithiolane Chemical compound C1CSCS1 IMLSAISZLJGWPP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OGYGFUAIIOPWQD-UHFFFAOYSA-N 1,3-thiazolidine Chemical compound C1CSCN1 OGYGFUAIIOPWQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KVGZZAHHUNAVKZ-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxin Chemical compound O1C=COC=C1 KVGZZAHHUNAVKZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AKAIWNDBVZJOAJ-UHFFFAOYSA-N 1,4-dithiine Chemical compound S1C=CSC=C1 AKAIWNDBVZJOAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VMLKTERJLVWEJJ-UHFFFAOYSA-N 1,5-naphthyridine Chemical compound C1=CC=NC2=CC=CN=C21 VMLKTERJLVWEJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VSOSXKMEQPYESP-UHFFFAOYSA-N 1,6-naphthyridine Chemical compound C1=CN=CC2=CC=CN=C21 VSOSXKMEQPYESP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MXBVNILGVJVVMH-UHFFFAOYSA-N 1,7-naphthyridine Chemical compound C1=NC=CC2=CC=CN=C21 MXBVNILGVJVVMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OZKOMUDCMCEDTM-UHFFFAOYSA-N 1,7-phenanthroline Chemical compound C1=CC=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=N1 OZKOMUDCMCEDTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FLBAYUMRQUHISI-UHFFFAOYSA-N 1,8-naphthyridine Chemical compound N1=CC=CC2=CC=CN=C21 FLBAYUMRQUHISI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HBBKKZVRZMEYOS-UHFFFAOYSA-N 1,8-phenanthroline Chemical compound N1=CC=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 HBBKKZVRZMEYOS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJCSVUVYIMRJCB-UHFFFAOYSA-N 1,9-phenanthroline Chemical compound C1=NC=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 AJCSVUVYIMRJCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OBOHMJWDFPBPKD-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro(diphenyl)methyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 OBOHMJWDFPBPKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 1-benzothiophene Chemical compound C1=CC=C2SC=CC2=C1 FCEHBMOGCRZNNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BAXOFTOLAUCFNW-UHFFFAOYSA-N 1H-indazole Chemical compound C1=CC=C2C=NNC2=C1 BAXOFTOLAUCFNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZKCAHQKNJXICB-UHFFFAOYSA-N 2,1-benzoxazole Chemical compound C1=CC=CC2=CON=C21 FZKCAHQKNJXICB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 2,3-Dihydrothiophene Chemical compound C1CC=CS1 OXBLVCZKDOZZOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JKTCBAGSMQIFNL-UHFFFAOYSA-N 2,3-dihydrofuran Chemical compound C1CC=CO1 JKTCBAGSMQIFNL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 2,3-dihydroxybutanedioic acid (2S,3S)-3,4-dimethyl-2-phenylmorpholine Chemical compound OC(C(O)C(O)=O)C(O)=O.C[C@H]1[C@@H](OCCN1C)c1ccccc1 VEPOHXYIFQMVHW-XOZOLZJESA-N 0.000 description 1
- SSNMISUJOQAFRR-UHFFFAOYSA-N 2,6-naphthyridine Chemical compound N1=CC=C2C=NC=CC2=C1 SSNMISUJOQAFRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JECYNCQXXKQDJN-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methylhexan-2-yloxymethyl)oxirane Chemical class CCCCC(C)(C)OCC1CO1 JECYNCQXXKQDJN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 2-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetic acid Chemical compound CC1=CN(CC(O)=O)C(=O)NC1=O TZDMCKHDYUDRMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000022 2-aminoethyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])N([H])[H] 0.000 description 1
- SMYCJQZKSKJEOX-UHFFFAOYSA-N 2-isocyano-n-[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl]ethanamine Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(NCC[N+]#[C-])(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 SMYCJQZKSKJEOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VBDBRROMHZXUIZ-UHFFFAOYSA-N 2-isocyanoethanamine Chemical compound NCC[N+]#[C-] VBDBRROMHZXUIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RSEBUVRVKCANEP-UHFFFAOYSA-N 2-pyrroline Chemical compound C1CC=CN1 RSEBUVRVKCANEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MGADZUXDNSDTHW-UHFFFAOYSA-N 2H-pyran Chemical compound C1OC=CC=C1 MGADZUXDNSDTHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SZTRCMOSUUQMBM-UHFFFAOYSA-N 2h-azepine Chemical compound C1C=CC=CC=N1 SZTRCMOSUUQMBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QMDFJHAAWUGVKQ-UHFFFAOYSA-N 2h-thiopyran Chemical compound C1SC=CC=C1 QMDFJHAAWUGVKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IILKUIMGKAFDBU-UHFFFAOYSA-N 3,3,3-triphenylpropane-1,2-diamine Chemical class C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(C(N)CN)C1=CC=CC=C1 IILKUIMGKAFDBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NEXGYFPJGTWVIO-UHFFFAOYSA-N 3-isocyanopropan-1-amine Chemical compound NCCC[N+]#[C-] NEXGYFPJGTWVIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 4',5'-Dihydropsoralen Natural products C1=C2OC(=O)C=CC2=CC2=C1OCC2 VXGRJERITKFWPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HRDXGYQCVPZEJE-UAKXSSHOSA-N 4-amino-5-bromo-1-[(2r,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one Chemical compound C1=C(Br)C(N)=NC(=O)N1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HRDXGYQCVPZEJE-UAKXSSHOSA-N 0.000 description 1
- NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 4H-1,2,4-triazole Chemical compound C=1N=CNN=1 NSPMIYGKQJPBQR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MRUWJENAYHTDQG-UHFFFAOYSA-N 4H-pyran Chemical compound C1C=COC=C1 MRUWJENAYHTDQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GDRVFDDBLLKWRI-UHFFFAOYSA-N 4H-quinolizine Chemical compound C1=CC=CN2CC=CC=C21 GDRVFDDBLLKWRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZAYHVCMSTBRABG-UHFFFAOYSA-N 5-Methylcytidine Natural products O=C1N=C(N)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 ZAYHVCMSTBRABG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- STRZQWQNZQMHQR-UAKXSSHOSA-N 5-fluorocytidine Chemical compound C1=C(F)C(N)=NC(=O)N1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 STRZQWQNZQMHQR-UAKXSSHOSA-N 0.000 description 1
- FSSLLCPWOYFMIB-UHFFFAOYSA-N 5-hex-1-enyl-1h-pyrimidine-2,4-dione Chemical compound CCCCC=CC1=CNC(=O)NC1=O FSSLLCPWOYFMIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JDBGXEHEIRGOBU-UHFFFAOYSA-N 5-hydroxymethyluracil Chemical compound OCC1=CNC(=O)NC1=O JDBGXEHEIRGOBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZAYHVCMSTBRABG-JXOAFFINSA-N 5-methylcytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C(C)=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 ZAYHVCMSTBRABG-JXOAFFINSA-N 0.000 description 1
- UJBCLAXPPIDQEE-UHFFFAOYSA-N 5-prop-1-ynyl-1h-pyrimidine-2,4-dione Chemical compound CC#CC1=CNC(=O)NC1=O UJBCLAXPPIDQEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AWFDCTXCTHGORH-HGHGUNKESA-N 6-[4-[(6ar,9r,10ar)-5-bromo-7-methyl-6,6a,8,9,10,10a-hexahydro-4h-indolo[4,3-fg]quinoline-9-carbonyl]piperazin-1-yl]-1-methylpyridin-2-one Chemical compound O=C([C@H]1CN([C@H]2[C@@H](C=3C=CC=C4NC(Br)=C(C=34)C2)C1)C)N(CC1)CCN1C1=CC=CC(=O)N1C AWFDCTXCTHGORH-HGHGUNKESA-N 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N Aziridine Chemical compound C1CN1 NOWKCMXCCJGMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010006654 Bleomycin Proteins 0.000 description 1
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M Carbamate Chemical compound NC([O-])=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N Carbazole Natural products C1=CC=C2C3=CC=CC=C3NC2=C1 UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091033380 Coding strand Proteins 0.000 description 1
- 235000017274 Diospyros sandwicensis Nutrition 0.000 description 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WRYCSMQKUKOKBP-UHFFFAOYSA-N Imidazolidine Chemical compound C1CNCN1 WRYCSMQKUKOKBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282838 Lama Species 0.000 description 1
- 238000005684 Liebig rearrangement reaction Methods 0.000 description 1
- 229930192392 Mitomycin Natural products 0.000 description 1
- NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N Mytomycin Chemical compound C1N2C(C(C(C)=C(N)C3=O)=O)=C3[C@@H](COC(N)=O)[C@@]2(OC)[C@@H]2[C@H]1N2 NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108010042309 Netropsin Proteins 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- WYNCHZVNFNFDNH-UHFFFAOYSA-N Oxazolidine Chemical compound C1COCN1 WYNCHZVNFNFDNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930040373 Paraformaldehyde Natural products 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 239000004952 Polyamide Substances 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- WTKZEGDFNFYCGP-UHFFFAOYSA-N Pyrazole Chemical compound C=1C=NNC=1 WTKZEGDFNFYCGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N Riboflavin Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N 0.000 description 1
- 239000002262 Schiff base Substances 0.000 description 1
- 150000004753 Schiff bases Chemical class 0.000 description 1
- BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N Selenium Chemical compound [Se] BUGBHKTXTAQXES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000004809 Teflon Substances 0.000 description 1
- 229920006362 Teflon® Polymers 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- DHXVGJBLRPWPCS-UHFFFAOYSA-N Tetrahydropyran Chemical compound C1CCOCC1 DHXVGJBLRPWPCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N Tetrazine Chemical compound C1=CN=NN=N1 DPOPAJRDYZGTIR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YPWFISCTZQNZAU-UHFFFAOYSA-N Thiane Chemical compound C1CCSCC1 YPWFISCTZQNZAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N Thiazole Chemical compound C1=CSC=N1 FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N Trifluoroethanol Chemical compound OCC(F)(F)F RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910007926 ZrCl Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 150000001335 aliphatic alkanes Chemical class 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000005119 alkyl cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000006242 amine protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 229940126575 aminoglycoside Drugs 0.000 description 1
- 125000004202 aminomethyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000538 analytical sample Substances 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- ZSIQJIWKELUFRJ-UHFFFAOYSA-N azepane Chemical compound C1CCCNCC1 ZSIQJIWKELUFRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HONIICLYMWZJFZ-UHFFFAOYSA-N azetidine Chemical compound C1CNC1 HONIICLYMWZJFZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001555 benzenes Chemical class 0.000 description 1
- JYZIHLWOWKMNNX-UHFFFAOYSA-N benzimidazole Chemical compound C1=C[CH]C2=NC=NC2=C1 JYZIHLWOWKMNNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005605 benzo group Chemical group 0.000 description 1
- BMWYMEQOMFGKSN-UHFFFAOYSA-N benzo[g]cinnoline Chemical compound N1=NC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 BMWYMEQOMFGKSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JWMUHTIFNGYNFA-UHFFFAOYSA-N benzo[g]isoquinoline Chemical compound C1=NC=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 JWMUHTIFNGYNFA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VFFLLOJLQMPSQE-UHFFFAOYSA-N benzo[g]quinazoline Chemical compound N1=CN=CC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 VFFLLOJLQMPSQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XEMRLVBSKVCUDL-UHFFFAOYSA-N benzo[g]quinoxaline Chemical compound N1=CC=NC2=CC3=CC=CC=C3C=C21 XEMRLVBSKVCUDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BJFLSHMHTPAZHO-UHFFFAOYSA-N benzotriazole Chemical compound [CH]1C=CC=C2N=NN=C21 BJFLSHMHTPAZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012964 benzotriazole Substances 0.000 description 1
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 description 1
- 239000004305 biphenyl Substances 0.000 description 1
- 235000010290 biphenyl Nutrition 0.000 description 1
- 229960001561 bleomycin Drugs 0.000 description 1
- OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O bleomycin A2 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 230000003327 cancerostatic effect Effects 0.000 description 1
- BKRRPNHAJPONSH-UHFFFAOYSA-N carbazole Chemical compound C1=CC=C2[C]3C=CC=CC3=NC2=C1 BKRRPNHAJPONSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N carbonic acid Chemical compound OC(O)=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004700 cellular uptake Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- JPBGLQJDCUZXEF-UHFFFAOYSA-N chromenylium Chemical compound [O+]1=CC=CC2=CC=CC=C21 JPBGLQJDCUZXEF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WCZVZNOTHYJIEI-UHFFFAOYSA-N cinnoline Chemical compound N1=NC=CC2=CC=CC=C21 WCZVZNOTHYJIEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000001085 cytostatic effect Effects 0.000 description 1
- DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N dcm dichloromethane Chemical compound ClCCl.ClCCl DEZRYPDIMOWBDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 229940043279 diisopropylamine Drugs 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 238000010894 electron beam technology Methods 0.000 description 1
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- KTWOOEGAPBSYNW-UHFFFAOYSA-N ferrocene Chemical compound [Fe+2].C=1C=C[CH-]C=1.C=1C=C[CH-]C=1 KTWOOEGAPBSYNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 1
- 230000022244 formylation Effects 0.000 description 1
- 238000006170 formylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229960000308 fosfomycin Drugs 0.000 description 1
- YMDXZJFXQJVXBF-STHAYSLISA-N fosfomycin Chemical compound C[C@@H]1O[C@@H]1P(O)(O)=O YMDXZJFXQJVXBF-STHAYSLISA-N 0.000 description 1
- JKFAIQOWCVVSKC-UHFFFAOYSA-N furazan Chemical compound C=1C=NON=1 JKFAIQOWCVVSKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 1
- 229910052732 germanium Inorganic materials 0.000 description 1
- GNPVGFCGXDBREM-UHFFFAOYSA-N germanium atom Chemical compound [Ge] GNPVGFCGXDBREM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 1
- JUINSXZKUKVTMD-UHFFFAOYSA-N hydrogen azide Chemical compound N=[N+]=[N-] JUINSXZKUKVTMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002460 imidazoles Chemical class 0.000 description 1
- 125000001841 imino group Chemical group [H]N=* 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N indole Natural products CC1=CC=CC2=C1C=CN2 PZOUSPYUWWUPPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N indolenine Natural products C1=CC=C2CC=NC2=C1 RKJUIXBNRJVNHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HOBCFUWDNJPFHB-UHFFFAOYSA-N indolizine Chemical compound C1=CC=CN2C=CC=C21 HOBCFUWDNJPFHB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 1
- 238000010884 ion-beam technique Methods 0.000 description 1
- IQPQWNKOIGAROB-UHFFFAOYSA-N isocyanate group Chemical group [N-]=C=O IQPQWNKOIGAROB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N isoxazole Chemical compound C=1C=NOC=1 CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- XJENLUNLXRJLEZ-UHFFFAOYSA-M lissamine rhodamine Chemical compound [Na+].C=12C=C(C)C(N(CC)CC)=CC2=[O+]C=2C=C(N(CC)CC)C(C)=CC=2C=1C1=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C1S([O-])(=O)=O XJENLUNLXRJLEZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000003120 macrolide antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 229940041033 macrolides Drugs 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 229960004857 mitomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- PQKWGMFFQVFFJZ-UHFFFAOYSA-N n'-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]ethane-1,2-diamine Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(NCCN)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 PQKWGMFFQVFFJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GINQYTLDMNFGQP-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylformamide;methylsulfinylmethane Chemical compound CS(C)=O.CN(C)C=O GINQYTLDMNFGQP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VAFIWTIWOOZYCZ-UHFFFAOYSA-N n-(2-aminoethyl)formamide Chemical compound NCCNC=O VAFIWTIWOOZYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JSVLQBYAIHXIQU-UHFFFAOYSA-N n-[2-(tritylamino)ethyl]formamide Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(NCCNC=O)C1=CC=CC=C1 JSVLQBYAIHXIQU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PKKRZJUOUMTUMN-UHFFFAOYSA-N n-[2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]amino]ethyl]formamide Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(NCCNC=O)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 PKKRZJUOUMTUMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UPBAOYRENQEPJO-UHFFFAOYSA-N n-[5-[[5-[(3-amino-3-iminopropyl)carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-4-formamido-1-methylpyrrole-2-carboxamide Chemical compound CN1C=C(NC=O)C=C1C(=O)NC1=CN(C)C(C(=O)NC2=CN(C)C(C(=O)NCCC(N)=N)=C2)=C1 UPBAOYRENQEPJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- SJGALSBBFTYSBA-UHFFFAOYSA-N oxaziridine Chemical compound C1NO1 SJGALSBBFTYSBA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHHKSVZZTYJVEG-UHFFFAOYSA-N oxepane Chemical compound C1CCCOCC1 UHHKSVZZTYJVEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AHHWIHXENZJRFG-UHFFFAOYSA-N oxetane Chemical compound C1COC1 AHHWIHXENZJRFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000006353 oxyethylene group Chemical group 0.000 description 1
- 229920002866 paraformaldehyde Polymers 0.000 description 1
- UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N phenylmethyl ester of formic acid Natural products O=COCC1=CC=CC=C1 UYWQUFXKFGHYNT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RLOWWWKZYUNIDI-UHFFFAOYSA-N phosphinic chloride Chemical compound ClP=O RLOWWWKZYUNIDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LFSXCDWNBUNEEM-UHFFFAOYSA-N phthalazine Chemical compound C1=NN=CC2=CC=CC=C21 LFSXCDWNBUNEEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920006112 polar polymer Polymers 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920002647 polyamide Polymers 0.000 description 1
- 229920000570 polyether Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920001343 polytetrafluoroethylene Polymers 0.000 description 1
- 239000004810 polytetrafluoroethylene Substances 0.000 description 1
- 239000005373 porous glass Substances 0.000 description 1
- 229910000027 potassium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QQONPFPTGQHPMA-UHFFFAOYSA-N propylene Natural products CC=C QQONPFPTGQHPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004805 propylene group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([*:1])C([H])([H])[*:2] 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- CPNGPNLZQNNVQM-UHFFFAOYSA-N pteridine Chemical compound N1=CN=CC2=NC=CN=C21 CPNGPNLZQNNVQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PBMFSQRYOILNGV-UHFFFAOYSA-N pyridazine Chemical compound C1=CC=NN=C1 PBMFSQRYOILNGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WVIICGIFSIBFOG-UHFFFAOYSA-N pyrylium Chemical compound C1=CC=[O+]C=C1 WVIICGIFSIBFOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JWVCLYRUEFBMGU-UHFFFAOYSA-N quinazoline Chemical compound N1=CN=CC2=CC=CC=C21 JWVCLYRUEFBMGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002390 rotary evaporation Methods 0.000 description 1
- 125000000467 secondary amino group Chemical group [H]N([*:1])[*:2] 0.000 description 1
- 229910052711 selenium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011669 selenium Substances 0.000 description 1
- 238000007086 side reaction Methods 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M sodium;chloride;hydrate Chemical class O.[Na+].[Cl-] HPALAKNZSZLMCH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 108010042747 stallimycin Proteins 0.000 description 1
- 125000000446 sulfanediyl group Chemical group *S* 0.000 description 1
- DHCDFWKWKRSZHF-UHFFFAOYSA-N sulfurothioic S-acid Chemical compound OS(O)(=O)=S DHCDFWKWKRSZHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 230000002522 swelling effect Effects 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N teixobactin Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H]1C(N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]2NC(=N)NC2)C(=O)N[C@H](C(=O)O[C@H]1C)[C@@H](C)CC)=O)NC)C1=CC=CC=C1 LMBFAGIMSUYTBN-MPZNNTNKSA-N 0.000 description 1
- DUCSJXVDQXAJBR-UHFFFAOYSA-N tert-butyl N-(2-aminoethyl)-N-formylcarbamate Chemical compound NCCN(C=O)C(=O)OC(C)(C)C DUCSJXVDQXAJBR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 229940040944 tetracyclines Drugs 0.000 description 1
- RAOIDOHSFRTOEL-UHFFFAOYSA-N tetrahydrothiophene Chemical compound C1CCSC1 RAOIDOHSFRTOEL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 description 1
- MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N texas red Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC(S(Cl)(=O)=O)=CC=C1C(C1=CC=2CCCN3CCCC(C=23)=C1O1)=C2C1=C(CCC1)C3=[N+]1CCCC3=C2 MPLHNVLQVRSVEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JWCVYQRPINPYQJ-UHFFFAOYSA-N thiepane Chemical compound C1CCCSCC1 JWCVYQRPINPYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BISQTCXKVNCDDA-UHFFFAOYSA-N thiepine Chemical compound S1C=CC=CC=C1 BISQTCXKVNCDDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XSROQCDVUIHRSI-UHFFFAOYSA-N thietane Chemical compound C1CSC1 XSROQCDVUIHRSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VOVUARRWDCVURC-UHFFFAOYSA-N thiirane Chemical compound C1CS1 VOVUARRWDCVURC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003556 thioamides Chemical class 0.000 description 1
- HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N thioanisole Chemical compound CSC1=CC=CC=C1 HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M thionine Chemical compound [Cl-].C1=CC(N)=CC2=[S+]C3=CC(N)=CC=C3N=C21 ANRHNWWPFJCPAZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930192474 thiophene Natural products 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 239000013638 trimer Substances 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 230000001790 virustatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 125000001834 xanthenyl group Chemical group C1=CC=CC=2OC3=CC=CC=C3C(C12)* 0.000 description 1
- 150000003952 β-lactams Chemical class 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D239/00—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
- C07D239/02—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings
- C07D239/24—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D239/28—Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, directly attached to ring carbon atoms
- C07D239/46—Two or more oxygen, sulphur or nitrogen atoms
- C07D239/52—Two oxygen atoms
- C07D239/54—Two oxygen atoms as doubly bound oxygen atoms or as unsubstituted hydroxy radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07C—ACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
- C07C291/00—Compounds containing carbon and nitrogen and having functional groups not covered by groups C07C201/00 - C07C281/00
- C07C291/10—Isocyanides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D405/00—Heterocyclic compounds containing both one or more hetero rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms, and one or more rings having nitrogen as the only ring hetero atom
- C07D405/02—Heterocyclic compounds containing both one or more hetero rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms, and one or more rings having nitrogen as the only ring hetero atom containing two hetero rings
- C07D405/12—Heterocyclic compounds containing both one or more hetero rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms, and one or more rings having nitrogen as the only ring hetero atom containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D473/00—Heterocyclic compounds containing purine ring systems
- C07D473/26—Heterocyclic compounds containing purine ring systems with an oxygen, sulphur, or nitrogen atom directly attached in position 2 or 6, but not in both
- C07D473/32—Nitrogen atom
- C07D473/34—Nitrogen atom attached in position 6, e.g. adenine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/001—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof by chemical synthesis
- C07K14/003—Peptide-nucleic acids (PNAs)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K5/00—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K5/04—Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
- C07K5/06—Dipeptides
- C07K5/06008—Dipeptides with the first amino acid being neutral
- C07K5/06017—Dipeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic
- C07K5/06026—Dipeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic the side chain containing 0 or 1 carbon atom, i.e. Gly or Ala
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S530/00—Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof
- Y10S530/81—Carrier - bound or immobilized peptides or proteins and the preparation thereof, e.g. biological cell or cell fragment as carrier
- Y10S530/812—Peptides or proteins is immobilized on, or in, an organic carrier
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S530/00—Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof
- Y10S530/81—Carrier - bound or immobilized peptides or proteins and the preparation thereof, e.g. biological cell or cell fragment as carrier
- Y10S530/812—Peptides or proteins is immobilized on, or in, an organic carrier
- Y10S530/815—Carrier is a synthetic polymer
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
- Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
- Y10T436/10—Composition for standardization, calibration, simulation, stabilization, preparation or preservation; processes of use in preparation for chemical testing
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Addition Polymer Or Copolymer, Post-Treatments, Or Chemical Modifications (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
Abstract
Isonitrilová sloucenina vzorce V, kde X má strukturu vzorce VI a PG nezávisle na sobe predstavují poprípade orthogonální chránicí skupiny, jako jsou aminové chránicí skupiny ze skupiny N-acylderivátu, N-sulfonylderivátu, N-alkylderivátu, N-silylderivátu, karbamátu nebo solí; zbytky R.sub.5.n. predstavují nezávisle na sobe vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované alkyl-, cykloalkyl-, alkoxyalkyl- nebo aryl-skupiny nebo heterocykly; zbytky U, W, K a Y predstavují nezávisle na sobe nesubstituované nebo substituované alkyl-, alkenyl-, alkinyl-, alkanoyl-, alkoxyalkanoyl-, cykloalkyl- nebo aryl-skupiny, nesubstituované nebo substituované heterocykly nebo skupinu NR.sub.5.n., pricemž R.sub.5.n. má výše uvedený význam; a, b, c, n, o a pjsou nezávisle na sobe celé císlo od 0 až 10. Tyto slouceniny jsou vhodné pro výrobu polymeru, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny, pomocí multikomponentních reakcí, speciálne Ugiho reakce. Vlastnosti polymeru mohou být prizpusobovány požadavkum pro použití jako antimediátorová neboantigenní terapeutika nebo diagnostika.
Description
Isonitrilovč sloučeniny pro výrobu polymerů, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny
Oblast techniky
Vynález se týká způsobu výroby polymerů, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny, pomocí muktikomponentních reakcí, speciálně Ugiho reakce.
to Dále se předložený vynález týká multifunkčních isonitrilů, způsobu jejich výroby ajejich použití v multikomponentních reakcích. Isonitrily tohoto druhu mohou být aplikovány ve způsobu podle vynálezu k výrobě polymerů, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny.
Dosavadní stav techniky
Multikomponentní reakce (MCRs) představují v organické syntéze cenný způsob. Aplikují se např. k výstavbě antibiotik, peptidů atd., to jest komplexních molekul s vysokým stupněm diversity. Při obvyklých MCRs jako např. při čtyřkomponentní reakci (4-CC) reagují isonitril, aldehyd, karboxylová . kyselina a amin na definovaný produkt. Jako isonitrily jsou přitom až doposud používány monofunkění sloučeniny, takže mnohotvárnost produktů multikomponentních reakcí tohoto druhuje omezena (srovnej Isonitrile Chemistry; I. Ugi (editor), Academie Press, New York, London 1971) a .odpovídající reakce je zakončena jakmile jednotlivé komponenty zreagovaly.
Regulačně působit na expresi genu pomocí polymerních peptidických nukleových kyselin (PNA) bylo poprvé popsáno v 60tých letech Svachkinem a spol. (R. A. Paégle, M. G. Plata, M. Yu. Lidak, S. A. Giller, Yu. P. Shvachkín v: Present State of the Chemotherapy of Malignant Tumors [ruský], Riga (1968), 103 ff; Přehledný článek: Yu. P. Shavachkin, G. P. Mishin, G. A.
Korshunova, Russian Chemical Reviews, 51, 1982, 178-188), V roce 1978 zavedli Zámečník a Stephenson pojmy „anti sen se“ (= antimediátorový) a „antigen“. Tyto pojmy popisují mechanismy jak je možné zasahovat do translace a transkripce genů (Proč. Nati. Acad. Sci. USA, 1978, 75, 280 a 285).
Při „antisense“ strategii se váže antimediátorová molekula na mRNA a zabraňuje tím její translaci k proteinu. Při antigen strategii se tvoří trojitý helix molekuly antigenu s dvoušroubovicovou DNA a tak se modifikuje transkripce do mRNA (E. Uhlmann, A. Peyman, Chem, Rev, 90, 1990, ' 544-584). V této souvislosti se různé látky v různých klinických fázích nalézají jako potencionální terapeutika pro virová onemocnění, rakovinu atd.
Dobrá antimediátorová molekula by mezi jiným měla vyhovovat následujícím požadavkům:
1. měla by bez přispění tzv. transfekčních činidel nebo liposomů vykazovat dobrou průchodnost buňkami a buněčnými jádry;
2. měla by k dosažení postačující Nevyužitelnosti vykazovat resistenci pro nukleasu a peptidasu a
3. měla by přesně rozeznat sekvenci přírodního antikodujícího řetězce.
Jako mnohoslibný antimediátorový a antigenový polymer se ukázala PNA popsaná Nielsenem a spol. (Science 1991, 254, 1497-1500; WO 92/20702), která nalezla různorodé použití jako mole50 ku lamě biologický nástroj. To se dá vyvozovat především z vysoké afinity PNA k anti kódujícímu řetězci (DNA, RNA) při velmi dobré sekvenční specificitě. PNA může v sekvencích podstatně lépe identifikovat nevhodná spojení než přírodní DNA nebo RNA. Na pyrímidin bohaté PNA řetězce jsou dáte sto navinout se na DNA-dvoušroubovici a vytvořit trojitý (PNA)2DNA helix.
-1 CZ 299816 B6
Takové struktury jsou potencionálními komplexními replikačními mimetiky a tím by mohlo být možné cíleně vkládat nebo vypojovat geny. Pro použití in vivo musí být však ještě některé vlastnosti PNA zlepšeny a optimalisovány. PNA není např. průchodná buňkami. Zmíněné tvoření trojitého (PNA)2DNA helixu nastává pouze u PNA-řetězců bohatých na pyrimidin a za nefysio5 logických solných koncentrací, PNA agregují a jsou ve vodě špatně rozpustné. PNA, sama jako polární polymer, se váže jak paralelně, tak také antiparalelně s podobnými vazebnými konstantami na cílovou strukturu DNA nebo RNA. Jsou publikovány také silné cytostatické účinky PNA (EP 0 672 677 A2).
io Jak se ukázalo, jsou nové zlepšené PNA nej efektivněji nalézány prozkoumáváním velkého množství variant (S. Jordán a spol., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 1997, 7, 681 a 687). Pro systematickou a rychlou přípravu mnoha analogů se jako optimální nejeví dosud popsané metody syntésy PNA, které spočívají na sekvenčních dvoukomponentních reakcích monomerů a monomery musí být v mnoha krocích syntetisovány z vhodných, komerčně Dostupných předstupňů (M. Egholm a spol. Journal of the American Chemical Society, (1992), 114, 1895).
Podstata vynálezu
Je proto úkolem předloženého vynálezu poskytnout komponentu, se kterou může být podstatně zvýšena diversita MCRs a zejména způsobu výroby polymerů, které vykazují nukleové báze jako postranní skupiny a mohou být vytvořeny komplexní molekuly, tj. komponentu, která může být zreagována při multikomponentní reakci. Takové komponenty musí splňovat následující předpoklady:
1. Musí být snadno a levně vyrobitelné.
2. V nich použité chránící skupiny musí být snadno tj. za mírných podmínek odštěpitelné.
3. V nich použité chránící skupiny musí být stabilní za reakčních podmínek obvyklých při přeměně jiných skupin.
4. Komponenty musí mít takovou strukturu, že se po odstranění chránící skupiny obnaží funkční skupiny, které jsou vhodné pro MCR, aniž jsou modifikovány jiné skupiny, např. také funkční skupiny komponent nebo reakčního partnera.
Předmětem vynálezu je isonitrílová sloučenina vzorce V
C^N-X-NPG (V),
Rs kde X má strukturu vzorce Vl • [Up-NR5PG]a
K„—Q—Yc~ (VI) |Wo- NR5PG]b a PG nezávisle na sobě představují popřípadě orthogonální chránící skupiny, jako jsou aminové chránící skupiny ze skupiny Λ-acylderivátů, V-sulfonylderivátů, A-alkylderivátů. TV—silyIderivátu, karbamátů nebo solí;
zbytky R5 představují nezávisle na sobě vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované 45 alkyl-, cykloalky]- alkoxyalkyl- nebo aryl-skupiny nebo heterocykly;
-2CZ 299816 B6 zbytky U, W, KaY představují nezávisle na sobě nesubstituované nebo substituované alkyl—, alkenyl- alkinyl- alkanoyl- alkoxyalkanoyl- cykloalkyl- nebo aryl-skupiny, nesubstituované nebo substituované heterocykly nebo skupinu NR5, přičemž R5 má výše uvedený význam;
a, b, c, n, o a p jsou nezávisle na sobě celé číslo od 0 až 10, přednostně 0 až 5; a
Q představuje nesubstituovanou nebo substituovanou alkyl- aryl- alkenyl- alkinyl- jednonebo více-mocný alkanoyl- cykloalkyl- alkoxyalkanoyl- cykloalkanoyl- nebo aroyl-skupinu, nebo nesubstituovaný nebo substituovaný heterocyklus nebo jednu ze skupin NR5, P, P(O), P(S), B, BRS, nebo SO2, přičemž R5 má výše uvedený význam a indexy a, b, o a p vykazují příslušně odpovídající hodnoty.
Tylo sloučeniny jsou vhodné pro výrobu sloučenin vzorce I
a-nh2 i
R,-G III
R2-C(O)-R3 . IV, a
C=N-X-NPG ‘ Γ (V), r5 .
spolu v prvním kroku popřípadě současně reagují, ... r. .
popřípadě se odstraní jedna nebo více chránících skupin a reakce se opakuje m-krát, přičemž po prvním kroku se použije produkt předchozího kroku místo sloučeniny vzorce Π, přičemž m je 0 nebo celé číslo od 1 do 1000, výhodně 1 až 300, přednostně l až 100, zejména 1 až 50, l až 30, 1 až 10 nebo 1 -5,
A je při Ugiho reakci obvyklý zbytek aminové složky jako je vodíkový atom, substituent, (cyklo-)alkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, fluorescenční značkovač, interkalátor, antibiotikum, spojovací článek vnitřního žlábku, spojovací článek vnějšího žlábku, biotinylový zbytek, interkalační zbytek, alky lační zbytek, steroid, lipid, polyamin, činidlo usnadňující příjem buněk, sacharid nebo oligosacharid, antimediátorový polymer, peptid, konjugát protilátky, syntetický polymer nebo odpovídajícím způsobem modifikovaný povrch,
-3CZ 299816 B6
Β je vodíkový atom, substituent, (cyklo_)alkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, fluorescenční značkovač, interkalátor, antibiotikum, spojovací článek vnitřního žlábku, spojovací článek vnějšího žlábku, biotinylový zbytek, interkalační zbytek, alkylační zby5 tek, stero id, lipid, póly amin, činidlo usnadňující příjem buněk, sacharid nebo oligosacharid, antimediátorový polymer, pepttd, konjugát protilátky, syntetický polymer nebo odpovídajícím způsobem modifikovaný povrch anebo zbytek X-NPG sloučeniny V,
Rj-G je voleno ze struktur následujících vzorců:
r ίΘ
Θ iP
4 | ©. | K | 1 | |
L | 1 | |||
I | --ZH | , Ri—: | 3—z 1 | |
R* ϊ | < | i | t L |
Θ ri® přičemž skupina Ri-G může být spojena se sloučeninou vzorce IV molekulárním „spacerem“ přes Rj nebo R nebo R4;
Ri a R jsou nezávisle na sobě při Ugi-ho reakci obvyklý zbytek kyselinové složky jako je H, substituent, (cyklo-)alkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, fluorescenční značkovač, interkalátor, antibiotikum, spojovací článek vnitřního žlábku, spojovací článek vnějšího žlábku, biotinylový zbytek, interkalační zbytek, alkylační zbytek, steroid, lipid, polyamin, sacharid nebo oligosacharid, antimediátorový polymer, peptid, konjugát protilátky, syntetický polymer nebo odpovídajícím způsobem modifikovaný povrch anebo zbytky odvozené od přírodních nebo syntetických nukleových bází;
L, Μ, T a Z nezávisle na sobě představují O, S nebo NR4, přičemž R4 znamená H, fluor, (cyklo-)alkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus nebo
-Ó(cyklo-)alkyl, -O-aroyl, -S(cyklo-)a1kyl, -S-aroyl;
R2 a R.3 jsou nezávisle na sobě při Ugi-ho reakci obvyklý zbytek oxokomponenty jako je H, substituent, (cyklo-)alkyl, (cyk1o-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, fluorescenční značkovač, interkalátor, antibiotikum, spojovací článek vnitřního žlábku, spojovací článek vnějšího žlábku, biotinylový zbytek, interkalační zbytek, alkylační zbytek, steroid, lipid, polyamin, sacharid nebo oligosacharid spojený aminovým „spacerem“, antimediátorová molekula, peptid, konjugát protilátky, syntetický polymer, modifikovaný povrch anebo rozvětvovací bod P, který je opět znova výchozím bodem pro další DNA- RNA-, PNA- nebo peptidový řetězec nebo další oligomer nebo polymer,
X vykazuje následující strukturu:
-4CZ 299816 B6 [Up-NR5PG]a
Kn-~Q—Y (Ví) [W0-NR5PG]b
PG nezávisle na sobě představují po případě ortogonální chránící skupiny, jako jsou aminové chránící skupiny ze skupiny TV-acylderivátů, 7V-sulfonylderivátů, W-alkylderivátů, A-silyl5 derivátů, karbamátů nebo solí;
zbytky R5 představují nezávisle na sobě vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované alkyl-, cykloalkyl-, alkoxyalkyl- nebo aryl-skupiny nebo heterocykly;
zbytky U, W, K a Y představují nezávisle na sobě vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované alkyl-, alkenyl-, alkinyl-, alkanoyl- alkoxyalkanoyl- cykloalkyl- nebo aryl-skupiny, nesubstituované nebo substituované heterocykly nebo skupinu NR5, přičemž R5 je jak je definováno v předchozím;
a, b, c, n, o a pjsou nezávisle na sobě celé číslo od 0 - 10, zvláště 0-5;
Q představuje nesubstituovanou nebo substituovanou alkyl-, aryl-, alkenyl-, alkinyl-, jednomocný nebo vícemocný alkanoyl-, cykloalkyl-, alkoxyalkanoyl- cykloalkanoyl- nebo aroyl-skupinu, nebo nesubstituovaný nebo substituovaný heterocyklus nebo jednu ze skupin NR5, P, P(O), P(S), Β, BR5, nebo SO2, přičemž Rj je jak je definováno v předchozím a indexy a, b, o a p nyní vykazuj í odpovídaj ící hodnoty;
F představuje oxo, thio, seleno nebo iminoskupiny a
J je voleno z následujících struktur, přičemž horní vertikální čárka představuje vazbu na Rt a spodní vertikální čárka vazbu k dusíkovému atomu hlavního řetězce polymeru v obecném vzorci I:
C===E E = M nebo L
Y
3===E E = L nebó M
E===P-R E.= MneboZ
R = OR6, SRe, R6
E= ==F
E - M, L nebo Z E = M, L nebo Z přičemž R^ představuje H, substituent, (cyklo—)a1kyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-jalkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, s tou podmínkou, že nejméně jeden ze zbytků R nebo Ri ve sloučenině vzorce I, je zbytkem odvozeným od přírodní nebo syntetické nukleové báze (patentový nárok 1).
-5CZ 299816 B6
V preferovaném provedení se způsob výroby vyznačuje tím, že fluorescenčními značkovači jsou fluorescein, Texaská červeň, Lissaminový rhodamin, cyanin nebo rhodamín, interkalátory jsou psoralen, akridin, fenanthrolin, kovový komplex fenanthrolinu nebo Ellipticin, antibiotiky jsou endiiny, β-laktamy, tetracykliny, anthracykliny, polyethery, mitomycinové typy, fosfomycinové typy, makrolidy, bleomycinové typy nebo aminoglykosid, spojnicí vnitřního žlábkuje Netropsin nebo Distamycin, polyaminem je polyamin spermíd lnového typu, anti med iátoro vým polymerem je DNA-řetězec (spojený 5' nebo 3') nebo RNA-řetězec (spojený 5' nebo 3') nebo fosfothioát, peptid má N- nebo C-terminální spojení, konjugát protilátky je vybrán z konjugátu protilátek, io které poskytují buněčně specifický příjem, vyžadují specifické systémy nosičů nebo ovlivňují endocytosu, syntetickým polymerem je CPG, Wang nebo Tentagel, přírodními nukleovými bázemi jsou adenin, thymin, guanin, cytosin nebo uráčil a syntetickými nukleobázemi jsou pseudouracil, 5-propinyluracil, 5-hexenyluracil, 5-fluorcytidin, 5-hydroxymethyluracil, 5-methylcytidin, 5-bromcytidin a sloučeniny následujících vzorců
přičemž R8 a R$ jsou nezávisle na sobě H, (cyklo-)alkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, chlor nebo fluor, R]0 je fluor, brom jod, cblor, alkinyl, (cyklo-)alkyl, aroyl, heteroaroyl nebo H a η = 1 - 20, vhodněji 1 - 10 a zvlášť zejména 1 - 5, přičemž postranní skupiny mohou být chráněny odborníkovi známými chránícími skupinami jako jsou např. tercbutylbenzoyl, p-methoxybenzy 1, isobutanoyl.
Všechny dosud a v dalším jmenované funkční jednotky jako antibiotika, spojovací článek žlábků, antimediátorové molekuly, steroidy, konjugáty protilátek, interkalátory a oligosacharidy mohou být na hlavní polymer vázány pomocí vhodně konstruovaného spojovacího článku (=spaceru).
Termínem vhodně se při Ugi-ho reakci míní alespoň jedna funkční skupina obsahující funkci ΟΧΟ-, kyselinovou, aminovou nebo isokyanovou. „Vhodně“ může ale znamenat i jiné funkční skupiny, pomocí kterých dokáže odborník spolu spojit dvě molekulární jednotky.
Chránící skupiny PG o sobě jsou obvyklé, snadno odštěpitelné (dočasné) chránící skupiny pro aminoskupiny. V jiném případě by k jejich odštěpení musely být použity drastické podmínky, které by mohly vést k nežádoucím vedlejším reakcím nebo dokonce k rozkladu reakčních produktů. Chránící skupiny PG představují zejména A-acylderiváty, Λ'-alkylderiváty nebo azidové skupiny a zvlášť jsou preferovány A-acyl- Λ-sul fonyl-, Λ'-alkyl-, N- silyl- chránící skupiny jako např. terč Boc- Alloc- Fmoc- Μοζ-, Z-, Tr- MMTr-. DMTr- Pixyl- TBDMS-chránicí skupiny, soli aminu.
Zbytky Rj představují nezávisle na sobě zejména vodíkové atomy, nebo nesubstituované či substituované alkyl- aryl- cykloalkyl- alkoxyalkyl- skupiny nebo heterocykly, zvláště stericky málo náročné skupiny jako alkyl, aryl, cykloalkyl, heterocykly a zejména vodíkové atomy a primární aminy jsou většinou reaktivnější než sekundární aminy [I. Ugi, Angew. Chem., 74, 9 (1962)].
Zbytky U, W, KaY představují nezávisle na sobě zejména nesubstituované či substituované alkyl- cykloalkyl- nebo aryl-skupiny, přednost mají zvláště skupiny jako je methylen-, ethylen-, propylen-, heptylen- oktylen-, nonylen-, oxymethylen-, oxyethylen-, cyklohexylfenylskupiny a heterocykly.
-6CZ 299816 B6
Indexy a, b, m, n, o a p jsou nezávisle na sobě především celá čísla od 0 do 50, silněji jsou preferována celá čísla od 0 do 20, respektive od 0 do 10 a ještě silněji celá čísla od 0 do 5 a zvláště pak od 0 do 3 a nejvíce se dává přednost, když a, b, p a o jsou Oaman 0, 1 nebo 2.
Zbytek Q představuje nejlépe nejméně jednu nesubstituovanou alkyl-, aroyl- nebo aryl-skupinu nebo nesubstituovaný či substituovaný heterocyklus a přednost mají zvláště skupiny jako je methylen- ethylen-, propylen-, oxymethylen-, oxyethylen-, dioxymethylen-, 1,2-dioxyethylen-, cyklohexyl- fenylskupiny, N a heterocykly.
Preferované sloučeniny vzorce V vykazují následující strukturu:
-7CZ 299816 B6
Sloučeniny vzorce V mohou být podle vynálezu připraveny tak, že sloučenina vzorce VII
HNR5-Kn-Q-Yc-NH2 [W0-NR5H]b (vii) se skupinami PG jak definováno v předchozím, které mohou být na sobě nezávislé, se ochrání obvyklým postupem, čímž se připraví sloučenina vzorce VIII
PGNRs-Kn-Q-Yc-NÉa
I [W0-NR5PG]b (vní) přičemž zbytky a indexy mají výše uvedený význam, a potom se sloučenina vzorce Vlil převede obvyklými postupy na isonitril vzorce V. Postupy tohoto druhu běžné pro přeměnu sloučenin vzorce VIII na isonitrily vzorce V popsal např. W. P. Weber, G. W. Gokel, Tetrahedron
Lett., 1972 1637; W. P. Weber, G. W. Gokel, I. K. Ugi, Angew. Chem., 84, 587 (1972); Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 11, 530 (1972). Sloučeniny vzorce VII jsou obchodně dostupné.
V dalším způsobu provedení se sloučenina vzorce VIII převede obvyklými formylačními činidly na sloučeninu vzorce IX:
-8CZ 299816 B6 (Up-NRsPG]a
PGNRs-Kn-Q-Yc-NHCHO [Wo-NR5PGJb (ix), která se pak za obvyklých podmínek převede na sloučeninu vzorce V, přičemž zbytky a indexy jsou definovány jako v předchozím. Formy láci obvyklými formylačními činidly tohoto druhu popsal např. U. Schóltkopf a spol., Liebigs Ann., 89, 351-360 (1977). Běžný způsob přeměny sloučeniny vzorce IX na sloučeninu vzorce V je odštěpení vody, jak popsali např. I. Hagendom, H. Tónjes, Pharmazie, 11, 409 (1956); I. Ugi, R. Meyer, Angew, Chem., 70, 702 (1958); Η. M. Walborsky, G. E. Niznik, J. Org. Chem., 37, 187 (1972); I. Ugi, W. Betz, U. Fetzer, K. Offermann, Chem. Ber. 94, 2814 (1961), I. Ugi, R. Obrecht, R. Herrmann, Synthesis 1985, 400to 402; G. Gokel, D. Marquarding, P. Hoffmann, I. Ugi v Isonitríle Chemistry, (vydavatel I. Ugi), Academie Press, New York, London 1971, 9. Přednostně se přitom aplikuje fosforoxychlorid a vhodná báze jako triethylamin nebo diisopropylamin.
V dalším způsobu provedení vycházeje ze sloučeniny vzorce X
Up-Ta
M-K„-Q‘Ym-NH2 15 Wo-Sb ΙΛ'· přičemž zbytky a indexy mají výše uvedený význam, se nejdříve formyluje aminová funkce např. některou svrchu jmenovanou metodou, následně pak se jedna nebo více funkcí Μ, T a S, které nezávisle na sobě znamenaj í halogeny nebo hydroxyfunkce, především chlor, brom a hydroxyl, pomocí obvyklých postupů přemění na jednu nebo více azidových funkcí, tyto azidy se běžnými postupy konvertují na odpovídající aminy a tyto se potom obvyklými způsoby opatří shora jmenovanými chránícími skupinami, aby se dospělo ke sloučeninám vzorce IX. Právě tak mohou být sloučeniny vzorce X po formylaci a konversi skupin Μ, T a S.na odpovídající azidy, např. podle nahoře jmenovaných metod, nejprve přeměněny na odpovídající isonitrily, azidové funkce jsou obvyklým způsobem konvertovány na aminy a potom opatřeny shora jmenovanými chránícími skupinami, aby se dospělo ke sloučeninám vzorce V.
Při jejich použití mohou být sloučeniny podle vynálezu nejdříve, např. v rámci obvyklé MCR, např. Ugiho nebo Passeriniho typu, podrobeny reakci se 2, 3 nebo více sloučeninami jako aldehy30 dy, aminy a karboxylovými kyselinami. Potom může být odštěpením nejméně jedné chránící skupiny uvolněna alespoň jedna funkční skupina, jako je aminová nebo hydrazinová skupina, která potom může být, např. v rámci další, v předchozím popsané MCR nebo klasické reakce dvou komponent, podrobena další reakci. Opakovaným nasazováním sloučenin podle vynálezu lze takto připravit velký počet vysoce komplexních molekul. Selektivním odštěpováním chráni35 cích skupin a přesně definovanými reakčními partnery je dále možné syntetizovat veliký počet jinak nedostupných nebo jen těžko dostupných molekul. Sloučeniny podle vynálezu mohou být dále použity pro přípravu peptidických polymerů nukleových kyselin (PNA).
V popise a v patentových nárocích jsou vzaty za základ následující definice:
-9CZ 299816 B6
Alkyl nebo „alk“ nebo „alkan“ také jako součásti slov: délka řetězce C] až C]Oo, preferuje se Ci až C2o, silněji se preferuje Ci až Cio, ještě silněji Cj až Cé a nejvíce pak Ci až C4, řetězec lineární nebo rozvětvený, substituovaný“(jak definováno níže) nebo nesubstituovaný; cykloalkyl nebo cykloalkan: velikost kruhu C3 až C2o, preferuje se C3 až C9, silněji se preferuje C3 až C7, nejvíce je preferován C5, C6 nebo C7, substituovaný (jak definováno níže) nebo nesubstituovaný.
Alkenyl: alkyl (nejméně se dvěma C) nebo cykloalkyl obsahující 1 až 5, nejlépe 1 nebo 2 konjugované nebo nekonjugované dvojné vazby. j io Alkinyl: alkyl (nejméně se dvěma C) nebo cykloalkyl obsahující 1 až 5, nejlépe 1 nebo 2 konjugované nebo nekonjugované trojné vazby.
Heterocyklus: tří- až sedmičlenné, nejlépe pěti- nebo šestičlenné heterocykly s 1, 2, 3 nebo případně 4 heteroatomy jako N, O nebo Sjako např. substituovaný (jak definováno níže) nebo nesubstituovaný oxiran, thiiran, aziridin, oxaziridin, oxetan, thietan, azetidin, tetrahydrofuran, dihydrofuran, tetrahydrothiofen, dihydrothiofen, pyrrolidin, dihydropyrrol, 1,3-dioxolan, 1,3dithiolan, imidazolidin, oxazolidin, thiazolidin, 2H-pyran, 4H-pyran, tetrahydropyran, 2H-thiopyran, 4//-thiopyran, tetrahydrothiopyran, piperidin, morfolin, 1,4-dioxin, 1,4—dioxan, 1,4dithiin, 1,4-dithian, piperazin, oxepan, thiepan, thiepin, ΙΗ-azepin, 2H-azepin, azepan.
Aroyl: zbytek substituovaného (jak definováno níže) nebo nesubstituovaného benzenu, naftalenu, anthracenu, bifenylu, trifenylu, azulenu, ferrocenu, cyklopropenylia.
Heteroaroyl: zbytek pěti- a šestičlenných aromatických heterocyklů s 1, 2 nebo 3 heteroatomy, jako je např. substituovaný (jak definovaný níže) pyrrol, furan, thiofen, pyrazol, isoxazol, isothiazol, imidazol, oxoazol, thiazol, 1,2,4-triazol, 1,2,4-oxadiazol, 1,2,4—thiadiazol, 1,2,5-oxadiazol, 1,2,5-thiadiazol, tetrazol, pyridin, pyrylium, thiapyrylium, pyridazin, pyrimidin, pyrazin, 1,2,3triazin, 1,2,4-triazin, 1,3,5-triazin, 1,2,3,4-tetrazin, 1,2,3,5-tetrazin, 1,2,4,5-tetrazin, indol, kumaron, thionaften, karbazol, dibenzofuran, dibenzothiofen, lH-indazol, indoxazol, benzo[d]30 isothiazol, anthranil, benzimidazol, benzoxazol, benzothiazol, benzotriazol, chinolin, isochinolin, benzopyrylium, thiabenzopyrylium, akridin, benzo[g]chinolin, benzo[g]isochinolin, benzo[c]chinolin, cinnolin, ftalazin, chinazolin, chinoxalin, fenazin, benzo[g]cinnolin, benzo[g]chinazolin, benzo[gjchinoxalin, 1,5-naftyridin, 1,6-naftyridin, 1,7—naftyridin, 1,8-naftyridin, 2,6-naftyridín, 2,7—naftyridin, 1,7-fenanthrolin, 1,8-fenanthrolin, 1,9-fenanthrolin, 1,10-fenanthrolin, indolizin, 4H-chinolizin, karbolin, ergolin, purin, pteridin, alloxazin, flavin.
Substituent nebo „substituovaný čím“: -H, -OH, Ra, -O- alkyl, -O-cykloalkyl, -O-aryl, -O-heteroaryl, -O-heterocyklus, -NH2, -NO2, -N3, -CNRaRbRc, -NRaRb, -[NRaRbRc]+, fluor, chlor, brom, ester α-, β- až ω-aminokyseliny, -NRaCORb, -NRaOXRb (X = -O. -NR, -POq^R, — SOo^R, — [NRaRbRc] ), —CORa, —COORa, —OCOORa, —CONRaRb, —OCÓNRaRb, —NRCCONRaRb, —Ra—O—Rt, — R<—NRaRb, —Ra—S—Rb, —Ra—SO—Rb, —Ra—S(O)2—Rb, —ORa—O—Rb, —NRaRb—O—Rc, —SO2—Ra, —SOii2)34—Ra—O—Rb, —CORa—O—Rb, —COORa—O—Rb, —OCORa—O—Rb, -OCOORa-O-Rb, -NRbCORa-Ó-Rb, -CONRaRb-O-Rc, -OCONRaRb-O-Rť, -NRcCONRaRbO—Rd, —NRaCORb—O—Rc, —ORa—S—Rb, —NRaRb—S—Rc, —SO]>2>34—Ra—S—Rb) —CORa—S—Rb, —OCORa—S—Rb, —NRaCORb—S—Rc, —CONRaRb—S—Rc, —NRaCONRbRc—S—R^, —ORa—NRbRc,
-NRaRb- NRcRd, -SOi^^Rb-NRbRc, -CORa-NRbRc, -COOR;-NRbRc, -OCORa-NRbRc, -OCOORa-NRbRc, -NR.CONRbRc-NRj, -NRaCOORb-N RcRd, -OCONRaRb-NRcR<b -NRaCONRbRc-NHRd, -NRaCOORb-NRcRd, -POORaORb, -NRcPOORaORb, přičemž Ra, Rb; Rc a R4 nezávisle na sobě mohou být, jak je shora definováno, alkyl, cykloalkyl, alkenyl, alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus, aralkyl, aralkenyt, nebo perhalogenalkyl a přitom Ra, Rb, Rc a R<i mohou být substituovány.
Způsob podle vynálezu se týká rovněž přípravy monomerů, oligomerů a polymerů, které jako postranní skupiny obsahují nukleové báze, zejména od peptidických nukleových kyselin (PNA) a
-10CZ 299816 B6 jejich variant, pomocí mu 1tikomponentních reakcí (MCR's), speciálně MCR's na bázi isokyanidů jako je Ugiho reakce. Přitom se nevychází z monomerů, jako při obvyklých postupech, nýbrž pracuje se s menšími stavebními kameny s tzv. submonomery. Zde představovaný způsob dovoluje zlepšenou synthesu dosud popsaných variant PNA a především rychlou syntézu nových dosud nepopsaných variant PNA s potenciálně zlepšenými a/nebo novými vlastnostmi. Na základě mu It i komponentní povahy tohoto způsobu je možná současná vestavba mnoha rozdílně utvářených zbytků kvaši kombinatomím způsobem, např. do polyamidové páteře PNA, stejně jako s vhodnými, dále níže popsanými stavebními kameny syntézy výstavba (PNA)?-, (PNA)(DNA)-, (PNA)(RNA)~, (PNA)(peptid)-, (PNA)2(DNA}~, (PNA)([oligo]sacharid), io (PNA)2(DNA)(peptid)-chiméry atd., jakož i výstavba změněných polymernich páteří PNA, jako např. thioamidů. Kratší oligomery nebo dokonce monomery připravené podle popsaného způsobu jsou potenciálně farmako logicky nebo agrochemicky relevantní úěinné látky,
Zde popsaný způsob spočívá na isokyanidem podporovaných mu 1tikomponentních reakcích (MCR's) typu kondensace čtyř komponent nebo Ugiho reakce [Isocyanide Chemistry, (vydavatel I, Ugi), Wiley, New York, 1971; I. Ugi, R. Karl v Comprehensive Organic Synthesís, (vydavatelé Β. M. Trošt, C. H. Heathcock), Vol. II, 1083 - 1109, Pergamon Press, New York 1991]. Při této reakci reagují jako edukty čtyři složky isokyanid, oxosloučenina (aldehydy nebo ketony), sloučeniny aminového typu (např. amoniak, primární aminy, sekundární aminy, hydrazin a deriváty, hydroxylamin a deriváty) a vhodná kyselinová složka (např. karboxylové kyseliny, monoesteiy kyseliny uhličité, voda, thiosulfát, selenovodík, azoimid, kyselina kyanatá, kyselina thiokyanatá) na jednotné produkty, jejichž centrální základní kostra podstatně závisí na kyselinové složce. Je pozoruhodné, že zbytky jednotlivých složek mohou být variovány v širokých mezích. Tak při Ugiho reakci stejně reagují stericky náročné nebo malé, aromatické, heteroaromatické, jak alifa25 tické nebo heterocyklické, elektronegativní nebo elektropositivní edukty. Příbuzné, na isokyanidech založených MCR's jsou Passeríní-ho reakce [I. Ugi v Isocyanide Chemistry (vydavatel I. Ugi), Wiley, New York, 1971], jakož i řada syntéz heterocyklů (S. Marcaccini, T. Torroba, OPPI, 143).
Sloučeniny, které lze podle vynálezu nasazovat vykazují např. následující struktury:
Iminy:
-11CZ 299816 B6
Karboxylové kyseliny:
/ X/COOH
COOH
Tyto sloučeniny mohou být uplatněny např. v následující reakci:
NH2
Pomocí způsobu podle vynálezu mohou být připraveny také homopolymery a heteropolymery obecného vzorce I jak je to uvedeno ve Schématu I.
Schéma I
Krok I:
A—ŇH2 + R,-G-H ,,/X + C^N-X-ŇPG r2 r3
xX
- 12 CZ 299816 Bó
Krok lil: opakuj krok í a II m krát, při tom
>
— —:—>
= A-NH2 z kroku I znamená
Způsob výroby homopolymerů a heteropolymerů obecného vzorce í se vyznačuje tím, že jsou navzájem synchronně, případně vícekrát, reakci podrobeny čtyři rozdílné sloučeniny s vhodnými funkčními skupinami. Po prvním kroku, tj. případně synchronně probíhající přeměně sloučenin
II, III, IV a V, je potom namísto sloučeniny vzorce II nasazován produkt právě předchozího kroku. Aby se dospělo k heteropolymerům, nemají sloučeniny ve všech syntetických krocích stejné zbytky nebo funkční skupiny.
Syntézy tříd sloučenin uvedených pod vzorcem I mohou být provedeny na plochách, v kapalné fázi nebo na polymemích nosičích.
Syntéza sloučenin vzorce I může dále probíhat na tak zvaných čipech:
přitom se připraví substrát, na který se nanese do první oblasti sloučenina vybraná ze sloučenin 15 vzorce Π, III, IV a V, které vykazují chránící skupiny, které mohou být odstraněny aktivátory;
tento krok je nyní opakován případně na jiných oblastech plochy s jinou / jinými ze sloučenin II,
III, IV a V, které mají odpovídající chránící skupinu / skupiny, oblast povrchu, která vykazuje jednu nebo více ze sloučenin II, III, IV a V, je vystavena působení aktivátoru, aby se odstranila nejméně jedna chránící skupina, tato oblast je vystavena jedné ze sloučenin II, III, IV nebo V, která opět vykazuje světlocitlivou chránící skupinu, a tento krok je opakován případně v jiných oblastech libovolnou kombinací sloučenin vzorců II, III, IV a V, substrát může přitom být polymerizovaným Langmuirovým Blodgettovým filmem, funkcionali25 zovaným sklem, germaniem, křemíkem, polymery, polytetrafluorethylenem, polystyrenem, galliumarsenitem nebo jejich kombinacemi;
jako aktivátory přicházejí v úvahu iontové paprsky, elektronové paprsky, γ-záření, rontgenové paprsky, ultrafialové záření, světlo, infračervené záření, mikrovlny, elektrické proudy, radiovlny ajejich kombinace.
Jako světlocitlivé chránící skupiny přicházejí v úvahu např. o-nitrobenzylderiváty, 6-nitroveratryloxykarbononyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl, cinnamoylderiváty ajejich směsi.
-13 CZ 299816 B6
Dále je s hlediska aplikovaných aktivátorů používaných substrátů, světlocitlivých chránících skupin a podmínek, za kterých jsou jednotlivé kroky prováděny, co do celkového obsahu brán zřetel na následující spisy: WO 90/15070, WO 91/07087, WO 92/10092, EP 0 728 520.
Výhody PNA-čipů proti DNA-čipům jsou mezi jinými podstatně lepší rozeznání mutací ve zkoumaných DNA, jakož i větší stabilita PNA-čipů ve srovnání s DNA-čipy.
Výstavba řetězce DNA nebo RNA v A probíhá podle odborníkům známých postupů, jako je metoda triesterová, metoda H-fosfonátová nebo metoda fosfoamiditová, zejména podle standardio ní fosfoamiditové metody podle Carutherse [Μ. H. Caruthers a spol., J. Am. Chem. Soc.t 103,
3185 (1981)]. Jako spojovací stavební kámen ke spojení s obvyklou PNA syntetisovanou ve
Schématu I, může sloužit následující sloučenina:
HC) NPG přičemž X značí eventuálně substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl nebo heterocyklus,
PG je chránící skupina, která musí být kompatibilní se syntétisovaným DNA- nebo RNA- anebo jiným antimediátorovým polymemím řetězcem a představuje např. dimethoxytrityl, Fmoc, Moc,
5-dímethoxybenzyl karbamát, o- nebo m-nitrofenylkarbamát jako Nvoc nebo 3,4-dimethoxy-6nitrobenžylkarbamát nebo fenyl (o-nitrofenyl)methylkarbamát.
Výstavba peptidového řetězce v A probíhá podle odborníkům známých postupů, jako je
Merrifeld-ova metoda (E. Atherton, R. C. Sheppard, Solid Phase Peptide Synthesis - A Practical 25 Approach, IRL Press, New York, 1989). Jako spojovací stavební kámen ke spojení s obvyklou
PNA syntetiso vanou ve Schématu I, může sloužit každá přírodní nebo syntetická /V-chráněná aminokyselina. Po odštěpení chrámci skupiny je připojením se na peptidový řetězec připraven podle metodiky naznačené ve Schématu I řetězec PNA.
Výstavba řetězce oligosacharidu v A probíhá podle odborníkům známých postupů, jako např.
Schmidt-ovy trichloracetimidátové metody nebo štěpení epoxidového kruhu (P. Collins, R. Ferrier, Monosaccharides, Wiley, New York 1996,415-430). Jako spojovací stavební kámen ke spojení s obvyklou PNA syntetisovanou ve Schématu 1, může sloužit například sloučenina:
přičemž X značí eventuálně substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl nebo heterocyklus,
Y znamená nukleofil jako S, O, NR $ R = případně substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus nebo -CHPL, přičemž P a L nezávisle na sobě znamená -CN, -NC, -COOR, -PO(OR)2 nebo -SO2R,
PG je chránicí skupina, která musí být kompatibilní s řetězcem syntetisovaného oligosacharidu a 45 představuje např. dimethoxytrityl, Fmoc nebo Pmoc anebo Nvoc.
Skupina X ve vzorci V může být výchozím bodem pro další syntézu DNA, RNA, PNA nebo peptidu anebo jiného oligomeru či polymeru.
Výstavba řetězce DNA nebo RNA v X probíhá podle odborníkům známých postupů, jako je metoda triesterová, metoda H-fosfonátová nebo metoda fosfoamiditová, zejména podle
-14CZ 299816 B6 standardní fosfoamiditové metody podle Carutherse [Μ. H. Caruthers a spol., J. Am. Chem. Soc., 103, 3185 (1981)]. Jako spojovací stavební kámen ke spojení s obvyklou PNA syntetizovanou ve Schématu I, může sloužit následující sloučenina obecného vzorce CN-X-NPG:
OH c ξξξ= n přičemž hydroxyskupina slouží jako zakotvení pro následující anti med iátoro vou syntézu RNA / DNA nebo fosfothioátu.
ť
Výstavba peptidového řetězce nebo PNA řetězce v X probíhá podle odborníkům známých poštuio pů, jako je Merrifieldova metoda (E. Atherton, R. C. Sheppard, Solid Phase Peptide Synthesis A Practical Approach, IRL Press, New York, 1989) respektive metoda (PNA) popsaná ve Schématu I. Jako spojovací stavební kámen může sloužit každý isokyanid s chráněnou aminovou funkcí jako např. následující trifunkční isokyanid obecného vzorce CN-X-NPG:
BocHN
NHFmoc
Po dokončení Ugiho reakce s isokyanidem se např. odštěpí chránící skupina Fmoc a vystaví se peptidová nebo PNA řetězec. Po dokončení syntézy postranního řetězce se po odštěpení Boc chránící skupiny dále syntetizuje hlavní PNA řetězec.
Výstavba řetězce oligosacharidu v X probíhá podle odborníkům známých postupů, jako např. Schmidt-ovy trichloracetimidátové metody nebo štěpení epoxidového kruhu (P. Collins, R, Ferrier, Monosaccharides, Wiley, New York 1996, 415- 430). Jako spojovací stavební kámen může např. sloužit následující trifunkční isokyanid obecného vzorce CN-X-NPG:
přičemž glykosylace se uskuteční na volné hydroxyfunkci nebo může sloužit následující isokyanid obecného vzorce CN-X-NPG:
přičemž se glykosylace děje přes nukleofilní Y-skupinu,
X je substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus,
Y je nukleofíl jako S, O, NR s R = substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cyklo-)alkinyl, aroyl, heteroaroyl, heterocyklus nebo -CHPL, přičemž P a L nezávisle na sobě znamenají -CN, -NC, -COOR, -PO(OR)2 nebo -SO2R.
Výstavba řetězce DNA nebo RNA vX probíhá podle odborníkům známých postupů, jako je metoda triesterová, metoda H-fosfonátová nebo metoda fosfoamiditová, zejména podle standardní fosfoamiditové metody podle Carutherse [Μ, H. Caruthers a spol., J Am. Chem. Soc., 103,
3185 (1981)]. Jako spojovací stavební kámen ke spojení s obvyklou PNA syntetisovanou ve
Schématu I, může sloužit následující sloučenina obecného vzorce CN-X-NPG:
- 15 CZ 299816 B6
HC> NPG přičemž X značí substituovaný alkyl, cykloalkyl, (cyklo-)alkenyl, (cykl o-)alki nyl, aroyl, hetero- ;
aroyl nebo heterocyklus, :
PG je chránící skupina, která musí být kompatibilní se syntetisovaným DNA- nebo RNA- anebo jiným antimediátorovým polymemím řetězcem a představuje např. dimethoxytrityl, Fmoc, Moc,,
5-dimethoxybenzylkarbamát, o- nebo m-nitrofenylkarbamát jako Nvoc nebo 3,4-dimethoxy-6nitrobenzylkarbamát nebo fenyl(o-nitrofenyl)methylkarbamát, přičemž hydroxyskupina slouží jako zakotvení pro následující RNA / DNA nebo fosfothioátovou antimediátorovou syntézu.
Metody v kapalné fázi jsou používány zejména pro výstavbu kratších oligomerů, avšak ve větších množstvích, zatímco metody v tuhé fázi jsou vhodné pro výstavbu delších oligomerů v menších až větších množství a metody na plošných površích se hodí pro výstavbu delších oligomerů v malých množstvích.
Příklady provedení vynálezu
Experimentální podmínky syntézy v kapalné fázi
V kapalné fázi se podle Schématu í nechá reagovat aminová složka s oxokomponentou, kyselinovou složkou a vhodně substituovanou, na aminové skupině chráněnou isokyanaminovou komponentou. Přitom je výhodné spolu smísit po jednom ekvivalentu čtyř různých složek a tím je přivést k reakci. Výhodné je také předem zkondensovat amin a oxokomponentu na Schiffovu bázi. Jako rozpouštědla se hodí jak aproticky polární i nepolární, tak i proticky. polární rozpouštědla. Na základě rozpouštěcích schopností kyselinových komponent nukleových bází se především hodí protické, jakož i proticky polární rozpouštědla jako např. alkoholy jako voda, methanol, ethanol, propanol, ethylenglykol, glycerol, trifluorethanol a aproticky polární rozpouštědla jako např. pyridin, V-methylmorfolin, methy lenchlorid, chloroform, dirnethylformamidu dimethylsulfoxid, acetonitril, ethylenglykoldimethylether nebo také jejich směsi jako např. ethylenglykoldimethylether / glycerol nebo rozpouštědla podporující tvoření Schiffových bází jako trimethyl-orthoformiát. Acylační katalyzátory jako např. pyridin nebo 4-dimethylaminopyridin se ukázaly jako reakci podporující při Ugiho reakci. Také Lewisovy kyseliny jako ZnCl2, TiCl4,
ZrCp2Cl2 atd. se prokázaly jako látky podporující Ugiho reakci. Reakční teplota může obnášet
-20 °C a +100 °C, přednost.má však 10 až 40 °C. Reakční doba představuje podle reaktivity .
komponent sekundy až více dní. Výhodně se Ugiho reakce provádí koncentrovaně, to jest koncentrace jednotlivých komponent jsou 0,lM až 4M.
Experimentální podmínky syntézy v tuhé fázi
Polymery pro syntézu polymerů nukleových bází v tuhé fází mohou být např. polystyren, polyethylenglykol, kopolymery polyethylenglykol-polystyren, polyakrylamid, kontrolované poresní sklo (CPG), polyethylen, polypropylen, nylon, celulosa. Vhodné spojovací články jsou např. aminomethyl, 4-methylbenzhydrylamin (MBHA), 4-(2',4'-dimethyloxyfenyl-Fmoc-aminomethylj-fenoxyacetamido-norleucylaminomethyl (Rink Amide AM), 4-{2',4'-dimethyloxy- fenyl-Fmoc-aminomethyl)-fenoxyacetamidonorleucyl-MBHA (Rink Amide MBAH), 4-(2',4dimethyloxyfenyl-Fmoc-aminomethyl)fenoxy (Rink Amid), 9-Fmoc-amino-xanthen-3-yloxy (Sieber Amid), hydrazin-2-chlortrityl, 4-sulfamylbenzoyl AM, 4-sulfamylbutyryl AM, bis—(2— aminoethyl)-ethertrityl, l,3-bis-(aminomethyl)-fenyltrityl nebo pryskyřice osazené chráněnými V-koncovými aminokyselinami.
Edukty syntézy mohou být· k dispozici v nejrůznějších, v předešlém odstavci jmenovaných, rozpouštědlech kompatibilních s vlastnostmi bobtnání polymerů. Edukty se nasazují v 2 - 20
-16CZ 299816 B6 1 násobném přebytku vztaženo na násadu polymeru. Také Lewisovy kyseliny jako ZnCl2, TiCLj, ZrCp2Cl2 atd. se prokázaly jako látky podporující Ugiho reakci. Reakční teplota může obnášet -20 °C a + 100 °C, přednost má však 10 až 40 °C. Reakční doba představuje podle reaktivity komponent sekundy až více dní. Výhodně se Ugiho reakce provádí koncentrovaně, to jest koncentrace jednotlivých komponent jsou 0,lM až 4M.
Experimentální podmínky syntézy na plošném povrchu
Plošné povrchy musí být pro syntézu polymerů modifikovány spojovacími články. Možnými plošnými povrchyjsou např, skelné povrchy, povrchy polymerů jako je teflon, polyethylen, polyio propylen, nylon, celulosa. Výhodně jsou přes spojovací článek na povrch navázány fotocitlivé chránící skupiny. Po odstranění chránících skupin v selektivní oblasti povrchu, může být započato s výstavbou PNAs způsobem popsaným ve Schématu I. Je výhodné, když všechny chránící skupiny jednotlivých komponent jsou fotocitlivé, jak to ukazuje následující zobrazení.
Výhody a možná použití popisovaného vynálezu
Zde představovaný způsob výroby polymerů s nukleovými bázemi jako postranními skupinami za použití multikomponentních reakcí překonává všechny dosud popsané způsoby co do efektivity syntézy a přístupnosti nových PNAs. Dosud popsané varianty PNA mají mnoho nevýhod pro použití jako antimediátorové a antigenní účinné látky. Pomocí zde představovaného způsobu lze co nej efektivněji vyhledávat nové vylepšené varianty; Protože pří dosavadních způsobech byty na PNAs polymerisovány monomery připravované ve více stupních, je efektivita variací ve srovnání se zde představovaným způsobem podstatně menší. Při zde představovaném způsobu se připraví jedna monomemí jednotka ze čtyř různých složek v jednom kroku. Protože edukty Ugiho reakce jsou ve velké rozmanitosti obchodně dostupné nebo snadno získatelné jednoduše v jednom nebo dvou stupních z komerčně dostupných sloučenin, může být ve stejném čase při srovnatelném nákladu připraveno podstatně více variant.
Z monomeru nebo dimerů a trimerů připravených podle zde předloženého kombinatomího způsobu, mohou být připravována potentní virostatika nebo kancerostatika.
Příklady
V následujícím je uveden seznam použitých zkratek.
Alloc allyloxykarbonyl
Boc terc-butyloxykarbonyl
Boc20 di-Zcrc-bu tyl ester kyseliny pyrouhličité
DCM dichlormethan
DMF dimethylfonnamid
Dmt 4,4'-dimethoxytri fenyl methyl
Fmoc 9-fluorenylmethoxy karbonyl
FmocONSu 7V-(9-f1uorenylmethoxykarbonyloxy)-sukcinimid
Mmt 4-methoxytrifenylmethyl
Moz p-methoxybenzyloxykarbonyl
Pixyl 9-(9-fenyl)xanthenyl
TBDMS terč- butyldimethylsilyl
TFA trifluoroctová kyselina
Trt trifenylmethyl
Z benzyloxykarbonyl
- 17CZ 299816 B6
Obecný předpis pro syntézu 2-tritylamino-ethyIisokyanidových zbytků (X)
Příprava 2-tritylethylendiaminů
K 12,20 g (200 mmol) ethylendiaminu v 500 ml THF bylo při teplotě místnosti (dále RT) pomalu přikapáno 40 mmol příslušného tritylchloridu (trifenylmethylchlorid, 4-methoxytr i feny Imethy 1chlorid, 4,4'-dimcthoxytrifenylmethyl-chlorid), který byl rozpuštěn v 500 ml THF. Potom bylo 12 h mícháno při RT, rozpouštědlo bylo odpařeno na rotační odparce, olejovitý lehce žlutý až oranžový zbytek byl rozpuštěn v 500 ml esteru kyseliny octové a třikrát extrahován 250 ml nasyceného roztoku chloridu sodného. Organická fáze byla vysušena síranem sodným. Po io odstranění rozpouštědla se získá příslušný amin jako olej resp. pěna ve výtěžcích 50 až 95 %.
V-Trityl ethylendiamin C21H22N2 (288,42)
Rf = 0,21 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
V-(4-Monomethoxytrityl)ethylendiamin C22H24N2O (332,45)
RF = 0,21 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp, parami HCI)
V-(4,4'-DimethoxytrÍtyl)ethylendiamin C23H26N2O2 (362,48)
Ri = 0,22 (DCM/MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
Pří prava 2-tr ity lam inoethy I formám i d ů
190 mmol příslušného aminu bylo 12 h zahříváno k varu ve 300 ml ethylesteru kyseliny mravenčí (teplota olejové lázně 75 °C). Po odstranění přebytečného esteru na rotační odparce byl příslušný formamid získán jako stabilní resp. mazlavá, žlutá až oranžová pěna. Výtěžky leží mezi 80 a 90%.
2-Tritylaminoethylformamid C22H22N2O (330,42)
Rf = 0,87 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
2-(4-M onomethoxytr ity 1 )am in oethy Iformamid
C23H34N2O2 (360,46)
RF = 0,86 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví.ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI) 'H-NMR (CDC13, 250, 133 MHz):
= 1,70 (br s, IH); 2,32 (tr, 2H, J= 6,0 Hz); 3,37 (m, 2H); 3,76 (s, 3H); 5,99 (br s, IH); 6,767,49 (m, 14 H); 8,17 (s, IH).
l3C-NMR (CDCI3, 62,896 MHz):
= 38,7 (CH2); 43,1 (CH2); 55,2 (CH3); 70,2 (C); 113,2 (CH); 126,4 (CH); 127,9 (CH); 128,3 (CH); 129,7 (CH); 137,8 (C); 145,9 (C); 158,0 (C); 164,7 (CHO).
2-(4,4'-Dimethoxytrityl)aminoethylformamid
C24H26N2O3 (390,49)
Rf = 0,92 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
Příprava 2-tritylaminoethylisonitrilů
180 mmol příslušného formamidu se rozpustí ve 250 ml methylenchloridu. Po přidání 400 ml
TEA se ochladí na 0 °C, pomalu se přikapé 180 mmol fosforoxychloridu a nechá se dále při této teplotě dvě hodiny míchat. Potom se pomalu za silného míchání při 20 °C přičiní 340 mmol uhličitanu sodného ve 150 ml vody a domíchává se ještě 30 min při RT. Vodná fáze se zředí na
-18CZ 299810 B0
400 ml a extrahuje se 150 ml DCM. Po promytí organické fáze nasyceným NaCI roztokem, vysušením nad uhličitanem draselným a odtažením rozpouštědla, resuttují příslušné isonitrily jako pěna ve výtěžku 85 až 95 %.
2-TrityIaminoethylisokyanid C22H20N2 (312,42)
Rf = 0,90 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
2-(4-Monomethoxytrityl)aminoethylisokyanid 10 C23H22N2O (342,44)
RF = 0,89 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
2-(4,4 -Dimethoxytrityl)amÍnoethylisokyanid C24H24N2O2 (342,47)
Rf = 0,95 (DCM / MeOH 5:1, v, v); skvrna se barví ninhydrinovým sprejem resp. parami HCI)
Obecný předpis pro syntézu N-acylethylisokyanidů 20 V-(Zerc-Butoxykarbonyl)ethylendiamin
K roztoku 2,0 mol ethylendiaminu v 700 ml THF bylo při RT během 12 až 48 h přikapáno 0,25 mol Boc2O v 500 ml THF. Roztok byl dekantován od vyloučené tuhé látky a rozpouštědlo bylo odtaženo. Zbytek a vyloučená tuhá látka byly rozpuštěny v 500 ml vody a vzniklá suspenze byla sfiltrována. Vodná fáze byla třikrát extrahována se 150 ml DCM, extrakt byl promyt kon25 centrovaným roztokem NaCI, vysušen a odpařen na rotační odparce. Vzniklo 36 g oleje (90 % vztaženo na Boc2O).
V-fterc-Butyloxykarbonyljaminoethylformamid
21,8 mol AM/m'-butyloxykarbonyl)ethylendiammu bylo rozpuštěno v 50 ml ethyl- nebo 30 methylesteru kyseliny mravenčí a jako katalyzátor byla přidána kyselina p-toluensulfonová. Tato směs byla po 12 h zahřívána k varu. Po odpaření roztoku na rotační odparce byl zbytek vzat do
100 ml DCM nebo esteru kyseliny octové, dvakrát promyt vodou, vysušen a rozpouštědlo bylo odtaženo. Bylo získáno 3,86 g oleje, který pozvolně vykrystalizoval (výtěžek 94 %).
T.t. 84 až 86 ŮC i
2- (A-/m-Butyloxykarbonyl)amÍnoethylisonitril
Příprava isonitrilu probíhá podle svrchu uvedeného předpisu. Téměř kvantitativně vzniká olej, který pozvolně vykrystalizuje.
'H-NMR (250 MHz, CDCb): 1,42 (s, 9H, CH3), 2,92 (m, 2H, CH2), 3,40 (m, 2H, CH2), 5,00 (s, 40 ΙΗ,ΝΗ).
I3C-NMR (62 MHz, CDCb: 28,1 (CH3); 38,1 (t, ‘J = 7,5 Hz, CHr-NC), 39,0 (CH2-NH), 80,0 (C), 155,8 (CO), 156,2 (t,1J = 5,5 Hz, NC).
Podle shora uvedených předpisů byly analogickým způsobem připraveny následující sloučeniny: 45
3- (;Y-/m’-Butyloxykarbonyl)aminopropylisonitril 'H-NMR (250 MHz, CDCb): 1,44 (s, 9H, CH3), 1,89 (m, 2H, CH2), 3,26 (q, 2H, 3J = 6,2 Hz,
CHJ, 3,46 (m, 2H, CHJ, 4,92 (s, 1H, NH).
I3C-NMR (62 MHz, CDCb): 28,2 (CH3); 29,4 (CH2); 38,1 (t, ]J = 7,6 Hz, CHr-NC), 39,0 (CH50 NH), 79,4 (C), 155,9 (CO), 156,4 (t,1J = 5,3 Hz, NC).
-19CZ 299816 B6
6-(7V-íerc-Butyloxykarbonyl)aminohexylisonitril ‘H-NMR (250 MHz, CDCh): 1,36 (m, 6H, CH2); 1,44 (s, 9H, CH3), 1,89 (m, 2H, CH2), 3,27 (q,
2H, CH2), 3,47 (m, 2H, CH2), 5,02,4,92 (2s, 1H, NH-CO-rotameiy).
nC-NMR (62 MHz, CDCIj): 28,2 (CH3), 28,3 (CH2), 29,5 (CH2), 30,5 (CH2), 38,2 (ζ 2J = 6,7
Hz, CH2-NC), 39,0 (CHr-NH), 77,4 (C), 156,2 (CO), 156,4 (t, 2J = 5,3 Hz, NC).
8_(X-terc-Butyloxykarbonyl)aminooktylisonitri] ]H_NMR (250 MHz, CDCh): 1,31 (m, 10H, CH3), 1,44 (s, 9H, CH3), 1,69 (m, 2H, CH2), 3,11 (m, 2H, CH2-NC), 3,37 (m, 2H, CH2-NHCO), 4,57 (s, IH, NH).
13ONMR (62 MHz, CDCh): 26,5 (CH3), 26,6 (CH2), 28,5 (CH3), 28,9 (CH2), 29,0 (CH2), 29,1 (CH2), 29,9 (CH2), 40,5 (CH^NC), 41,5 (CHr-NH), 77,4 (C), 156,6 (CO), 155,9 (NC).
/V-l-(4-Methoxybenzyloxykarbonyl)-N -2-formylethylendiamin:
Syntéza /V-(4-methoxybenzyloxykarbonyl)-ethylendiaminu podle předpisu [L. S. Richter, R. N,
Zuckermann, Bioorg. Med. Chem. Lett.,5, 1159-1162 (1995)], přičemž organická methylenchloridová fáze byla promyta 2 x 100 ml nasyceného roztoku kuchyňské soli. Výtěžek 7,1 g 64 % (literatura udává 6,0 g, 54 %),
7,1 g N-(4—Methoxybenzyloxykarbony))-ethyiendiaminu a na špičku špachtle 4-4 imethy lamin 020 pyridinu bylo 3 hodiny vařeno ve 100 ml ethylesteru kyseliny mravenčí. Přebytečný ethylester kyseliny mravenčí byl ve vakuu odtažen na rotační odparce. Zbylý tuhá látka byla vzata do 100 ml CH2C12 a vytřepána s 30 ml vody. Organická fáze byla vysušena Na2SO4 a ve vakuu odpařena na rotační odparce. Zbylý olej (6,53 g, výtěžek 81 %) po nějakém čase krystalisuje a je dostatečně čistý pro další reakci, 'H-NMR (250 MHz, CDCh): 3,37 (m, 4H), 3,80 (s, 3H), 5,02 (s, 2H), 5,28 (s, br, 1H), 6,32 (s, br, IH), 6,87 (m, 2H), 7,27 (m, 2H), 8,14 (s, br, IH).
nC-NMR (62 MHz, CDCh): 39,0,40,6, 55,3, 66,8,113,9, 128,4, 129,9, 159,7,161,8, 163,4. Rf(CH2CI2/MeOH 9/1): 0,6.
Λ-1 -(4-M ethoxy ben zy 1 oxy karbony 1)—2—isokyano- 1-am i noethan:
K 6,53 g A-l-(4-methoxybenzyloxykarbonyl)-/V-2-formylethylendiaminu (25,9 mmol a 10,85 ml triethylamínu (78 mmol) ve 100 ml CH2C12, temperovaným ledovou lázní, bylo pomalu během Ví h přikapáno 3,97 g POC13 (25,91 mmol) a směs byla po další 4 h při 0 °C míchána. Pomalu byl při 0 °C přikapán vodný roztok 5,51 g Na2CÓ3 ve 40 ml H2O, Nakonec bylo.po dobu
1 h mícháno při teplotě místnosti. Bylo zředěno dalšími 100 ml vody, organická fáze byla oddělena a vodná fáze byla extrahována 2x 50 ml CH2C12. Spojené organické fáze byly vysušeny MgSO4 a ve vakuu odpařeny na rotační odparce. Zbylo 6 g (99 %) červené tuhé látky, jejíž čistota je dostačující pro následující reakce. Analytický vzorek po překrystalisování z ethylacetátu poskytl bezbarvou tuhou látku.
’H-NMR (250 MHz, CDCh): 3,43 (m, 2H), 3,53 (m, 2H), 3,80 (s, 3H), 5,04 (s, 2H), 5,50 (s, br, IH), 6,88 (m, 2H), 7,28 (m, 2H).
l3C-NMR(62 MHz, CDCh): 40,2,41,8, 55,3, 66,9, 114,0, 128,1, 130,0, 156,4, 159,7. Rf(CH2Cl2/MeOH 9/1): 0,8.
Příklad 1 mmol. Thimínoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a 1 mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
-20CZ 299816 B6
C23H31N5O6 Mw: 473,53342
Ή-NMR (360 MHz / d6-DMSO): 1,35 (9H, s), 1,76 (3H, s), 2,95 - 3,1 (4H, m), 3,77 a 3,93 (2H, 5 2 x s {rotamery}), 4,46, 4,58, 4,62, 4,67, 4,80 (4H, 6 x s {rotamery}), 6,78 (IH, m), 7,21 - 7,39 (6H, m), 7,87 a 8,13 (IH, 2 x tr {rotamery}), 11,29 (IH, s, thimin-NH).
13C-NMR (62,9 MHz): 11,7, 28,1, 47,9, 48,8, 49,5, 77,5/107,9, 127,1, 127,4, 127,6, 128,2, 128,5, 136,1, 136,8, 142,2, 150,9, 155,5, 158,0, 164,3, 167,2.
ES-MS: 474,0 (m + H)+
Příklad 2 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a 15 l mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a výsledný produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
Příklad 3 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a 1 mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl
-21 CZ 299816 B6 odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
Příklad 4 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a 1 mmol isokyanídové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
Příklad 5
Polypropylenová multititrační deska s hlubokými jamkami (MTP = Multi Titer Plate) s objemem 1 ml na jamku, byla do každé jamky osazena thymin-l-octovou kyselinou v methanolu a l-isokyano-2-N-Zerc-butoxykarbonylethanem. Řádky A-H byly osazeny níže zobrazenými aminy a sloupce 1 - 12 níže zobrazenými oxokomponentami. Uzavřené MTP byly třepány při teplotě místnosti a vysrážené produkty byly odfiltrovány. Pro zvýšení výtěžků může být filtrát
-22CZ 299816 B6 zahuštěn na polovinu a znova vysrážené produkty odfiltrovány. Produkty byly charakterisovány HPLC-ES, DC a lH- / nC-NMR.
Osazení 96-ft/lTP:
Sloupce s oxokomponentou
Řádky s aminovými komponentami
-NH2
Na příklad v jamce H 10 se nalézá následující sloučenina:
-23CZ 299816 B6
Příklad 6
Příprava thiminpentameru:
C65H«N2|O20 Mw= 1488, 56 HPLC-EST-MS: odpovídá
Pro přípravu této sloučeniny na Fmoc-rinkamidové pryskyřici se postupuje podle následujícího schématu synthesy: i
1. Odstranění Fmoc-skupiny Rink-pryskyřice pomocí morfolinu.
2. Třepání takto upravené pryskyřice s acetonem, kyselinou thiminoctovou a A-l-(4-methoxýbenzyloxykarbonyl)-2-isokyano-l-aminoethan v DMSO / DMF.
3. Zakončovací krok s acetanhydridem v DMF.
4. Odstranění chránící skupiny Moz 5 % trifluoroctové kyseliny, 2,5 % thioanisolu, 2,5 % dimerkaptoethanu v CH2C12.
5. Neutralizace morfolinem.
6. Krok 2-5 opakovat 4 krát.
7. Odštěpení od pryskyřice 95% TFA.
Příklad 7
1 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
-24CZ 299816 B6
'H-NMR (250 MHz / d6-DMSO): 1,23 (6H, s), 1,37 (9H, s), 1,75 (3H, s), 2,95 - 3,17 (4H, m), 4,58 (2H, s), 4,73 (2H, s), 6,70 (IH, tr), 7,29-7,50 (6H, m), 11,25 (IH, d, thimin-NH). I3C-NMR (62,9 MHz): 12,2, 24,4, 28,5, 43,0, 47,4, 49,7, 62,9, 78,0, 108,0, 126,9, 127,5, 128,9, 128,2,138,8, 142,6, 151,4,156,1, 164,8, 169,9, 174,1.
ES-MS: 502,0 (m + H)+
Příklad 8 mmol Thiminoctové kyseliny, l mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a 1 mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
'H-NMR (360 MHz / d6-DMSO): 0,83 - 1,54 (8H, m), 1,37 (9H, s), 1,75 (3H, s), 2,24 (2H, m), 2,95 -3,17 (4H, m), 4,56 (2H, s), 4,73 (2H, s), 6,67 (IH, tr), 7,27-7,48 (6H, m), 11,28 (IH, s, thimin-NH).
I3C-NMR (62,9 MHz): 11,6, 22,0, 24,7, 28,0, 32,2, 46,6, 49,7, 65,2, 77,4, 107,8, 126,5, 126,9, 128,4,138,1,136,1,142,1,142,4, 151,0,155,5,157,1, 164,3,167,7, 172,7.
ES-MS: 542,0 (m + Hf
Příklad 9 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
-25CZ 299816 B6
C23H48N6O7
Mw = 520,67501.
lH-NMR (250 MHz / d6-DMSO):
l3C-NMR (62,9 MHz): 11,8, 23,7, 24,0, 28,1, 44,9, 45,6, 47,9, 49,8, 53,0, 54,4, 55,3, 66,1, 77,6, 107,8,142,3,150,9, 155,5, 164,3, 166,9,167,3, 167,9, 168,0.
ES-MS: 522 (m + H)+
Příklad 10
Provedení je analogické předchozím příkladům,
Isokyanidová složka: l-isokyano-3-;V-(/crc-butoxykarbonyl)propan. Oxokomponenta: paraformaldehyd.
Aminová složka: benzylamin.
Kyselinová složka: Y-(p“methoxybenzoyl)-Ag-adeninoctová kyselina.
C-^HagNsOg Mw = 630,71 ES-MS: 632 (m + H)+
Příklad 11 mmol Thiminoctové kyseliny, 1 mmol oxokomponenty, 1 mmol aminové komponenty a mmol isokyanidové komponenty bylo 24 h mícháno v 1 ml methanolu a vyloučený produkt byl odfiltrován. Výtěžky mohly být zvýšeny, když se filtrát zahustil na polovinu a podrobil ještě jedné filtraci.
-26CZ 299816 B6
C27H28N6Oi0 Mw = 596,56
Claims (4)
- PATENTOVÉ NÁROKY10 1. Isonitrilová sloučenina vzorce VC^N-X-NPG (V),R5 kde X má strukturu vzorce VI [Up--NR5PG]a-Kn-G-Yc- (VI) |S [W0~NR5PG]b a PG nezávisle na sobě představují popřípadě orthogonální chránící skupiny, jako jsou aminové chránící skupiny ze skupiny V-acylderivátů, V-sulfonylderivátů, V-alkylderivátů, TV—sí lylderi vátu, karbamátů nebo solí;20 zbytky Rs představují nezávisle na sobě vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované alkyl-, cykloalkyl-, alkoxyalkyl- nebo aryl-skupiny nebo heterocykly;zbytky U, W, Ka Y představují nezávisle na sobě nesubstituované nebo substituované alkyl-, alkenyl-, alkinyl- alkanoyl-, alkoxyalkanoyl- cykloalkyl- nebo aryl-skupiny, nesubstituované nebo substituované heterocykly nebo skupinu NR5, přičemž R5 má výše uvedený význam;25 a, b, c, n, o a p jsou nezávisle na sobě celé číslo od 0 až 10, přednostně 0 až 5; aQ představuje nesubstituovanou nebo substituovanou alkyl- aryl- alkenyl- alkinyl- jednonebo více-mocný alkanoyl-, cykloalkyl- alkoxyalkanoyl-, cykloalkanoyl- nebo aroyl-skupinu, nebo nesubstituovaný nebo substituovaný heterocyklus nebo jednu ze skupin NR5, P, P(O), P(S), B, BR5, nebo SO2, přičemž R5 má výše uvedený význam a indexy a, b, o a p vykazují příslušně30 odpovídající hodnoty.
- 2. Sloučenina vzorce V podle nároku 1, kde zbytky PG představují TV-acylderiváty nebo /V-alkylderiváty;-27CZ 299816 B6 zbytky R5 představují nezávisle na sobě vodíkové atomy, nesubstituované nebo substituované alkyl- nebo aryl-skupiny;zbytky U, W, Ka Y představují nezávisle na sobě nesubstituované nebo substituované alkyl-, cykloalkyl- nebo aryl-skupiny;5 a, b, c, n, o a p jsou nezávisle na sobě celé číslo od 0 až 5; aQ představuje nejméně jednu nesubstituovanou alkyl-, aroyl-, nebo aryl-skupinu, nebo nesubstituovaný nebo substituovaný heterocyklus.
- 3. Způsob výroby sloučeniny vzorce V podle nároku l, vyznačující se tím, že io sloučenina vzorce Vil (Up-ŇR5HlaHNRs-K^-Q-Yc-NHa [W0-NRsH]b (vn) se skupinami PG jak definováno v předchozím, které mohou být na sobě nezávislé, se ochrání obvyklým postupem, čímž se připraví sloučenina vzorce Vlil [Up-NRsPG]aPGNRs-Kn-Q-Ye-NHa 1S [Wo-NR5PG]b (VIII) a potom se sloučenina vzorce Vlil převede obvyklými postupy na ison itri 1 vzorce V. '
- 4. Způsob podle nároku 3, vyznačující se tím, že se sloučenina vzorce VIII 20 převede obvyklými formylačními činidly na sloučeninu vzorce IX:[Up-NRsPGlaPGNR5-Kn-Q-Yo-NHCHO [Wo-NRsPGjb nx).která se pak za obvyklých podmínek převede na sloučeninu vzorce V, přičemž zbytky a indexy mají výše uvedený význam.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19720165A DE19720165A1 (de) | 1997-05-14 | 1997-05-14 | Verfahren zur Herstellung von Polymeren, die Nucleobasen als Seitengruppen aufweisen |
DE19720216A DE19720216A1 (de) | 1997-05-14 | 1997-05-14 | Multifunktionelle Isonitrile und Verfahren zu deren Herstellung |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ385899A3 CZ385899A3 (cs) | 2000-04-12 |
CZ299816B6 true CZ299816B6 (cs) | 2008-12-03 |
Family
ID=26036538
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ0385899A CZ299816B6 (cs) | 1997-05-14 | 1998-05-14 | Isonitrilové slouceniny pro výrobu polymeru, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US6355726B1 (cs) |
EP (1) | EP0983290B1 (cs) |
JP (1) | JP2002500643A (cs) |
AU (1) | AU750974B2 (cs) |
CA (1) | CA2290614C (cs) |
CZ (1) | CZ299816B6 (cs) |
DE (1) | DE59810914D1 (cs) |
DK (1) | DK0983290T3 (cs) |
HU (1) | HU226867B1 (cs) |
IL (1) | IL132518A (cs) |
NO (1) | NO995551L (cs) |
WO (1) | WO1998051697A2 (cs) |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE10326303A1 (de) * | 2003-06-11 | 2004-12-30 | Celares Gmbh | Reagenzien zur Modifikation von Biopharmazeutika, deren Herstellung und Anwendung |
WO2005123140A2 (en) * | 2004-06-08 | 2005-12-29 | Alza Corporation | Preparation of macromolecular conjugates by four-component condensation reaction |
US7892737B2 (en) * | 2005-06-30 | 2011-02-22 | Life Technologies Corporation | Compositions, kits and methods pertaining to stability modulation of PNA oligomer/nucleic acid complexes |
DE102005041570A1 (de) * | 2005-09-01 | 2007-03-22 | Celares Gmbh | Hoch verzweigte Reagenzien zur Modifaktion von Biopharmazeutika, deren Herstellung und Anwendung |
DE102006039615A1 (de) * | 2006-08-24 | 2008-03-13 | Leibniz-Institut Für Pflanzenbiochemie | Esterelongationsverfahren zum sequenzgesteuerten Aufbau alternierender Peptid-Peptoid-Polymere (Peptid-Peptoid-Polymere) |
AU2013330344B2 (en) | 2012-09-17 | 2018-07-05 | W. R. Grace & Co.-Conn. | Chromatography media and devices |
WO2014169206A2 (en) | 2013-04-11 | 2014-10-16 | Carnegie Mellon University | Divalent nucleobase compounds and uses therefor |
WO2014169216A2 (en) * | 2013-04-11 | 2014-10-16 | Carnegie Mellon University | TEMPLATE-DIRECTED γPNA SYNTHESIS AND γPNA TARGETING COMPOUNDS |
WO2015168383A1 (en) | 2014-05-02 | 2015-11-05 | W. R. Grace & Co.-Conn. | Functionalized support material and methods of making and using functionalized support material |
EP3284795B1 (en) * | 2015-04-16 | 2023-08-02 | The School Corporation Kansai University | Use of a purine base-containing polymer as an anti-ice nucleation activator |
US10695744B2 (en) | 2015-06-05 | 2020-06-30 | W. R. Grace & Co.-Conn. | Adsorbent biprocessing clarification agents and methods of making and using the same |
WO2018058091A1 (en) | 2016-09-26 | 2018-03-29 | Carnegie Mellon University | Divalent nucleobase compounds and uses therefor |
CN114315835B (zh) * | 2021-11-30 | 2023-03-03 | 华南农业大学 | 一种6-苯甲基腺嘌呤半抗原、人工抗原、抗体及其制备方法和应用 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1995002566A1 (en) * | 1993-07-16 | 1995-01-26 | Ontogen Corporation | Synthesis of combinatorial arrays of organic compounds through the use of multiple component combinatorial array syntheses |
EP0672661A1 (de) * | 1994-03-14 | 1995-09-20 | Hoechst Aktiengesellschaft | Substituierte N-Ethyl-Glycinderivate zur Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden |
WO1996015143A1 (en) * | 1994-11-14 | 1996-05-23 | Chiron Corporation | SYNTHESIS OF PEPTIDE NUCLEIC ACIDS (PNAs) AND ANALOGUES VIA SUBMONOMER APPROACH |
CZ74396A3 (en) * | 1995-03-13 | 1996-10-16 | Hoechst Ag | Analogs of oligonucleotides and process for preparing thereof |
DE19532553A1 (de) * | 1995-09-04 | 1997-03-06 | Hoechst Ag | Verfahren zur Herstellung substituierter N-Ethyl-Glycinderivate |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE2942606A1 (de) * | 1979-10-22 | 1981-04-30 | Helmut Dipl.-Chem. Aigner | Verfahren zur herstellung von saeureamiden und anwendung des verfahrens |
US6087186A (en) * | 1993-07-16 | 2000-07-11 | Irori | Methods and apparatus for synthesizing labeled combinatorial chemistry libraries |
-
1998
- 1998-05-14 IL IL132518A patent/IL132518A/en not_active IP Right Cessation
- 1998-05-14 HU HU0002730A patent/HU226867B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1998-05-14 US US09/423,594 patent/US6355726B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1998-05-14 DE DE59810914T patent/DE59810914D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-05-14 CA CA2290614A patent/CA2290614C/en not_active Expired - Fee Related
- 1998-05-14 CZ CZ0385899A patent/CZ299816B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1998-05-14 JP JP54881498A patent/JP2002500643A/ja active Pending
- 1998-05-14 EP EP98928268A patent/EP0983290B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-05-14 WO PCT/EP1998/002860 patent/WO1998051697A2/de active IP Right Grant
- 1998-05-14 DK DK98928268T patent/DK0983290T3/da active
- 1998-05-14 AU AU80175/98A patent/AU750974B2/en not_active Ceased
-
1999
- 1999-11-12 NO NO995551A patent/NO995551L/no not_active Application Discontinuation
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1995002566A1 (en) * | 1993-07-16 | 1995-01-26 | Ontogen Corporation | Synthesis of combinatorial arrays of organic compounds through the use of multiple component combinatorial array syntheses |
EP0672661A1 (de) * | 1994-03-14 | 1995-09-20 | Hoechst Aktiengesellschaft | Substituierte N-Ethyl-Glycinderivate zur Herstellung von PNA und PNA-/DNA-Hybriden |
WO1996015143A1 (en) * | 1994-11-14 | 1996-05-23 | Chiron Corporation | SYNTHESIS OF PEPTIDE NUCLEIC ACIDS (PNAs) AND ANALOGUES VIA SUBMONOMER APPROACH |
CZ74396A3 (en) * | 1995-03-13 | 1996-10-16 | Hoechst Ag | Analogs of oligonucleotides and process for preparing thereof |
DE19532553A1 (de) * | 1995-09-04 | 1997-03-06 | Hoechst Ag | Verfahren zur Herstellung substituierter N-Ethyl-Glycinderivate |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
IL132518A (en) | 2007-05-15 |
HUP0002730A2 (hu) | 2000-12-28 |
JP2002500643A (ja) | 2002-01-08 |
WO1998051697A2 (de) | 1998-11-19 |
HU226867B1 (en) | 2009-12-28 |
CZ385899A3 (cs) | 2000-04-12 |
EP0983290B1 (de) | 2004-03-03 |
AU8017598A (en) | 1998-12-08 |
US6355726B1 (en) | 2002-03-12 |
NO995551D0 (no) | 1999-11-12 |
HUP0002730A3 (en) | 2003-07-28 |
NO995551L (no) | 2000-01-12 |
CA2290614A1 (en) | 1998-11-19 |
CA2290614C (en) | 2010-09-21 |
EP0983290A1 (de) | 2000-03-08 |
IL132518A0 (en) | 2001-03-19 |
AU750974B2 (en) | 2002-08-01 |
DK0983290T3 (da) | 2004-06-14 |
DE59810914D1 (de) | 2004-04-08 |
WO1998051697A3 (de) | 1999-05-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11608355B2 (en) | Technologies for oligonucleotide preparation | |
US11384105B2 (en) | Processes for preparing oligomers | |
US8309710B2 (en) | Use of N-alkyl imidazole for sulfurization of oligonucleotides with an acetyl disulfide | |
CZ299816B6 (cs) | Isonitrilové slouceniny pro výrobu polymeru, které obsahují nukleové báze jako postranní skupiny | |
JP2019523754A (ja) | ホスホロジアミダートモルホリノオリゴマーを調製するためのプロセス | |
CN104114542A (zh) | 三唑并嘧啶化合物的合成 | |
JP4012145B2 (ja) | ピロール−イミダゾールポリアミドの固相合成法 | |
KR102523522B1 (ko) | 포스포로디아미데이트 모르폴리노 올리고머의 제조 방법 | |
US20040198972A1 (en) | Processes for the preparation of oligonucleotides | |
WO2003051896A1 (en) | Cytidine libraries and compounds synthesized by solid-phase combinatorial strategies | |
Abramova et al. | Solid-phase-supported synthesis of morpholinoglycine oligonucleotide mimics | |
WO2003051898A1 (en) | Unusual nucleoside libraries, compounds, and preferred uses as antiviral and anticancer agents | |
EP2736916B1 (en) | Minor groove binder phosphoramidites and methods of use | |
US20100298530A1 (en) | Photoresponsive Base Having Triazole Skeleton | |
KR102523527B1 (ko) | 포스포로디아미데이트 모르폴리노 올리고머의 제조 방법 | |
JP7475056B2 (ja) | 光応答性ヌクレオチドアナログの製造方法 | |
DE19720165A1 (de) | Verfahren zur Herstellung von Polymeren, die Nucleobasen als Seitengruppen aufweisen | |
CN103232507B (zh) | 修饰核苷单体及其合成方法和应用 | |
Honzawa et al. | Synthesis and hybridization property of oligonucleotides containing carbocyclic oxetanocins | |
US6541626B2 (en) | Process for selective N-acylation of purine nucleosides | |
US20230235328A1 (en) | Novel morpholino oligonucleotide derivatives | |
US12435105B2 (en) | Technologies for oligonucleotide preparation | |
HK40069732A (en) | A substantially diastereomerically pure phosphoramidochloridate, a method and a pharmaceutical composition |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic | ||
MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20140514 |